KR20120106935A - 암의 치료를 위한 진단 방법 및 조성물 - Google Patents

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로라 샌더스
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Abstract

본원에 예를 들어 암을 비롯한 혈관신생 장애의 진단 및 치료에 유용한 방법 및 조성물이 개시된다.

Description

암의 치료를 위한 진단 방법 및 조성물{DIAGNOSTIC METHODS AND COMPOSITIONS FOR TREATMENT OF CANCER}
[관련 출원]
본 출원은 그 개시문의 전체 내용이 모든 목적을 위해 본원에 참고로 도입되는, 2009년 7월 13일자로 출원된 미국 특허 가출원 제61/225120호 및 2010년 6월 4일자로 출원된 미국 특허 가출원 제61/351733호를 우선권으로 주장한다.
[본 발명의 분야]
본 발명은 예를 들어 암을 비롯한 혈관신생 장애의 치료에 유용한 진단 방법 및 조성물에 관한 것이다.
혈관신생 장애, 예컨대 암은 인간 건강에 가장 치명적인 위협 중의 하나이다. 미국에서만 매년 1백 3십만명 정도의 새로운 암 환자가 발생하고, 이는 심혈관계 질환 다음으로 두 번째 주요 사망 원인이며, 사망자 4명 중의 대략 1명이 암 환자인 것으로 추정된다. 이러한 사망의 대부분은 고형 종양으로 인한 것이다. 특정 암의 경우에는 의학적 치료에 유의한 진보가 있었지만, 모든 암에 대한 전반적인 5년 생존율은 지난 20년 동안 약 10％만 개선되었다. 암 또는 악성 종양은 제어되지 않는 방식으로 신속하게 전이 및 성장하기 때문에 제시간에 이를 검출하고 치료하는 것은 극도로 어려운 일이다.
암 유형에 따라, 환자는 전형적으로 화학요법, 방사선 및 항체-기재의 약물을 비롯하여 이들에게 이용가능한 여러가지 치료 옵션을 갖는다. 상이한 치료 처방으로 인한 임상 결과를 예측하는데 유용한 진단 방법은 이러한 환자들의 임상적 관리에 크게 이로울 것이다. 여러 연구에서 예를 들어 돌연변이-특이적 검정, 마이크로어레이 분석, qPCR 등에 의해 유전자 발현과 특정 암 유형의 확인과의 상관관계가 조사된 바 있다. 이러한 방법은 환자가 나타내는 암을 확인하고 분류하는데 유용할 수 있다. 그러나, 임상 결과에 따른 유전자 발현의 예측 또는 예후 가치에 대해 알려져 있는 것은 훨씬 더 적다.
따라서, 각각 환자를 위한 최적의 치료 처방을 위한 객관적인 재생가능한 방법에 대한 필요가 있다.
[본 발명의 개요]
본 발명의 방법은 예를 들어 환자를 위한 최적의 치료 과정을 선택할 때, 특정 치료 처방으로 개별 환자를 치료하는 경우 그 성공 가능성을 예측할 때, 질환 진행을 평가할 때, 치료 효능을 모니터링할 때, 개별 환자에 대한 예후를 결정할 때, 및 특정 요법, 예를 들어 항혈관신생 요법 (예를 들어, 항암 요법 포함)으로부터 이익을 얻는 개체의 소질을 평가할 때를 비롯한 다양한 환경에서 사용될 수 있다.
본 발명은 부분적으로 요법제 (예를 들어, 항혈관신생 요법제 (예를 들어, 항암 요법제 포함))의 효능에 대한 지표로서 바이오마커의 사용을 기반으로 한다. 보다 구체적으로, 본 발명은 요법제 (예를 들어, 항혈관신생 요법제 (예를 들어, 항암 요법제 포함))의 효능을 예측하기 위해 18S rRNA, ACTB, RPS13, VEGFA, VEGFC, VEGFD, Bv8, PlGF, VEGFR1/Flt1, VEGFR2, VEGFR3, NRP1, sNRP1, 포도플라닌, Prox1, VE-카드헤린 (CD144, CDH5), robo4, FGF2, IL8/CXCL8, HGF, THBS1/TSP1, Egfl7, NG3/Egfl8, ANG1, GM-CSF/CSF2, G-CSF/CSF3, FGF9, CXCL12/SDF1, TGFβ1, TNFα, Alk1, BMP9, BMP10, HSPG2/페를레칸, ESM1, Sema3a, Sema3b, Sema3c, Sema3e, Sema3f, NG2, ITGa5, ICAM1, CXCR4, LGALS1/갈렉틴1, LGALS7B/갈렉틴7, 피브로넥틴, TMEM100, PECAM/CD31, PDGFβ, PDGFRβ, RGS5, CXCL1, CXCL2, robo4, LyPD6, VCAM1, 콜라겐 IV, Spred-1, Hhex, ITGa5, LGALS1/갈렉틴1, LGALS7/갈렉틴7, TMEM100, MFAP5, 피브로넥틴, 피불린 2, 피불린 4/Efemp2, HMBS, SDHA, UBC, NRP2, CD34, DLL4, CLECSF5/CLEC5a, CCL2/MCP1, CCL5, CXCL5/ENA-78, ANG2, FGF8, FGF8b, PDGFC, cMet, JAG1, CD105/엔도글린, Notch1, EphB4, EphA3, EFNB2, TIE2/TEK, LAMA4, NID2, Map4k4, Bcl2A1, IGFBP4, VIM/비멘틴, FGFR4, FRAS1, ANTXR2, CLECSF5/CLEC5a 및 민클/CLEC4E/CLECSF9로부터 선택된 하나 이상의 유전자의 발현 수준(들)의 증가 또는 감소를 측정하는 것을 기반으로 한다.
본 발명의 한 실시양태는 VEGF 길항제 이외의 항암 요법제 또는 VEGF 길항제에 부가한 항암 요법제로의 치료로부터 이익을 얻을 수 있는 환자를 확인하는 방법을 제공한다. 방법은 환자로부터 수득한 샘플에서 표 1에 열거된 하나 이상의 유전자의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 하나 이상의 유전자의 증가된 발현 수준은 환자가 VEGF 길항제 이외의 항암 요법제 또는 VEGF 길항제에 부가한 항암 요법제로의 치료로부터 이익을 얻을 수 있다는 것을 나타낸다.
본 발명의 또 다른 실시양태는 VEGF 길항제 이외의 항암 요법제 또는 VEGF 길항제에 부가한 항암 요법제로의 치료로부터 이익을 얻을 수 있는 환자를 확인하는 방법을 제공한다. 방법은 환자로부터 수득한 샘플에서 표 1에 열거된 하나 이상의 유전자의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 하나 이상의 유전자의 감소된 발현 수준은 환자가 VEGF 길항제 이외의 항암 요법제 또는 VEGF 길항제에 부가한 항암 요법제로의 치료로부터 이익을 얻을 수 있다는 것을 나타낸다.
본 발명의 추가의 실시양태는 VEGF 길항제 이외의 항암 요법제 또는 VEGF 길항제에 부가한 항암 요법제로의 치료에 대한 암을 앓고 있는 환자의 반응성을 예측하는 방법을 제공한다. 방법은 환자로부터 수득한 샘플에서 표 1에 열거된 하나 이상의 유전자의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 하나 이상의 유전자의 증가된 발현 수준은 환자가 VEGF 길항제 이외의 항암 요법제 또는 VEGF 길항제에 부가한 항암 요법제로의 치료에 대해 반응성일 가능성이 더 크다는 것을 나타낸다.
본 발명의 또 다른 실시양태는 VEGF 길항제 이외의 항암 요법제 또는 VEGF 길항제에 부가한 항암 요법제로의 치료에 대한 암을 앓고 있는 환자의 반응성을 예측하는 방법을 제공한다. 방법은 환자로부터 수득한 샘플에서 표 1에 열거된 하나 이상의 유전자의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 하나 이상의 유전자의 감소된 발현 수준은 환자가 VEGF 길항제 이외의 항암 요법제 또는 VEGF 길항제에 부가한 항암 요법제로의 치료에 대해 반응성일 가능성이 더 크다는 것을 나타낸다.
본 발명의 또 다른 실시양태는 암 환자가 VEGF 길항제 이외의 항암 요법제 또는 VEGF 길항제에 부가한 항암 요법제로부터 이익을 나타낼 가능성을 결정하는 방법을 제공한다. 방법은 환자로부터 수득한 샘플에서 표 1에 열거된 하나 이상의 유전자의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 하나 이상의 유전자의 증가된 발현 수준은 환자가 VEGF 길항제 이외의 항암 요법제 또는 VEGF 길항제에 부가한 항암 요법제로부터 이익을 얻을 가능성이 증가하였다는 것을 나타낸다.
본 발명의 또 다른 실시양태는 암 환자가 VEGF 길항제 이외의 항암 요법제 또는 VEGF 길항제에 부가한 항암 요법제로부터 이익을 나타낼 가능성을 결정하는 방법을 제공한다. 방법은 환자로부터 수득한 샘플에서 표 1에 열거된 하나 이상의 유전자의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 하나 이상의 유전자의 감소된 발현 수준은 환자가 VEGF 길항제 이외의 항암 요법제 또는 VEGF 길항제에 부가한 항암 요법제로부터 이익을 얻을 가능성이 증가하였다는 것을 나타낸다.
본 발명의 추가의 실시양태는 환자에서 암을 치료하는 방법을 제공한다. 방법은 환자로부터 수득한 샘플이 참조 샘플과 비교하여 표 1에 열거된 하나 이상의 유전자의 증가된 발현 수준을 갖는지 결정하는 것, 및 환자에게 유효량의 VEGF 길항제 이외의 항암 요법제 또는 VEGF 길항제에 부가한 항암 요법제를 투여하여 암을 치료하는 것을 포함한다.
본 발명의 또 다른 실시양태는 환자에서 암을 치료하는 방법을 제공한다. 방법은 환자로부터 수득한 샘플이 참조 샘플과 비교하여 표 1에 열거된 하나 이상의 유전자의 감소된 발현 수준을 갖는지 결정하는 것, 및 환자에게 유효량의 VEGF 길항제 이외의 항암 요법제 또는 VEGF 길항제에 부가한 항암 요법제를 투여하여 암을 치료하는 것을 포함한다.
본 발명의 일부 실시양태에서, 환자로부터 수득한 샘플은 조직, 전혈, 혈액-유래 세포, 혈장, 혈청, 및 이들의 조합으로부터 선택된다. 본 발명의 일부 실시양태에서, 발현 수준은 mRNA 발현 수준이다. 본 발명의 일부 실시양태에서, 발현 수준은 단백질 발현 수준이다.
본 발명의 일부 실시양태에서, 방법은 적어도 표 1에 열거된 제2, 제3, 제4, 제5, 제6, 제7, 제8, 제9, 제10, 제11, 제12, 제13, 제14, 제15, 제16, 제17, 제18, 제19 또는 제20 유전자의 발현을 검출하는 것을 더 포함한다.
본 발명의 일부 실시양태에서, 방법은 환자에게 VEGF 길항제 이외의 항암 요법제를 투여하는 것을 더 포함한다. 본 발명의 일부 실시양태에서, 항암 요법제는 항체, 소분자 및 siRNA로부터 선택된다. 본 발명의 일부 실시양태에서, 항암 요법제는 EGFL7 길항제, NRP1 길항제 및 VEGF-C 길항제로부터 선택된 구성원이다. 본 발명의 일부 실시양태에서, EGFL7 길항제는 항체이다. 본 발명의 일부 실시양태에서, NRP1 길항제는 항체이다. 본 발명의 일부 실시양태에서, VEGF-C 길항제는 항체이다.
본 발명의 일부 실시양태에서, 방법은 환자에게 VEGF 길항제를 투여하는 것을 더 포함한다. 본 발명의 일부 실시양태에서, VEGF 길항제는 항-VEGF 항체이다. 본 발명의 일부 실시양태에서, 항-VEGF 항체는 베바시주맙이다. 본 발명의 일부 실시양태에서, 항암 요법제 및 VEGF 길항제는 동시에 투여된다. 본 발명의 일부 실시양태에서, 항암 요법제 및 VEGF 길항제는 순차적으로 투여된다.
본 발명의 또 다른 실시양태는 환자가 VEGF 길항제 이외의 항암 요법제 또는 VEGF 길항제에 부가한 항암 요법제로의 치료로부터 이익을 얻을 수 있는지 여부를 결정하기 위한 키트를 제공한다. 키트는 표 1에 열거된 하나 이상의 유전자에 특이적으로 혼성화할 수 있는 폴리뉴클레오티드를 포함하는 어레이 및 VEGF 길항제에 부가한 항암 요법제로의 치료에 대한 환자의 반응성을 예측하기 위해 하나 이상의 유전자의 발현 수준을 결정하는데 상기 어레이를 사용하기 위한 설명서를 포함하고, 여기서 참조 샘플에서 하나 이상의 유전자의 발현 수준과 비교하여 하나 이상의 유전자의 발현 수준의 증가는 환자가 VEGF 길항제에 부가한 항암 요법제로의 치료로부터 이익을 얻을 수 있다는 것을 나타낸다.
본 발명의 추가의 실시양태는 환자가 VEGF 길항제 이외의 항암 요법제 또는 VEGF 길항제에 부가한 항암 요법제로의 치료로부터 이익을 얻을 수 있는지 여부를 결정하기 위한 키트를 제공한다. 키트는 표 1에 열거된 하나 이상의 유전자에 특이적으로 혼성화할 수 있는 폴리뉴클레오티드를 포함하는 어레이 및 VEGF 길항제에 부가한 항암 요법제로의 치료에 대한 환자의 반응성을 예측하기 위해 하나 이상의 유전자의 발현 수준을 결정하는데 상기 어레이를 사용하기 위한 설명서를 포함하고, 여기서 참조 샘플에서 하나 이상의 유전자의 발현 수준과 비교하여 하나 이상의 유전자의 발현 수준의 감소는 환자가 VEGF 길항제에 부가한 항암 요법제로의 치료로부터 이익을 얻을 수 있다는 것을 나타낸다.
본 발명의 또 다른 실시양태는 암 환자로부터 수득한 샘플에서 표 1에 열거된 하나 이상의 유전자의 발현 수준을 결정하기 위해 상기 하나 이상의 유전자의 발현 수준을 검출하기 위한 화합물의 세트를 제공한다. 세트는 표 1에 열거된 하나 이상의 유전자에 특이적으로 혼성화할 수 있는 하나 이상의 화합물을 포함하고, 여기서 참조 샘플에서 하나 이상의 유전자의 발현 수준과 비교하여 하나 이상의 유전자의 발현 수준의 증가는 환자가 VEGF 길항제에 부가한 항암 요법제로의 치료로부터 이익을 얻을 수 있다는 것을 나타낸다. 본 발명의 일부 실시양태에서, 화합물은 폴리뉴클레오티드이다. 본 발명의 일부 실시양태에서, 폴리뉴클레오티드는 표 2에 열거된 3개의 서열을 포함한다. 본 발명의 일부 실시양태에서, 화합물은 단백질, 예를 들어 항체이다.
본 발명의 또 다른 실시양태는 암 환자로부터 수득한 샘플에서 표 1에 열거된 하나 이상의 유전자의 발현 수준을 결정하기 위해 상기 하나 이상의 유전자의 발현 수준을 검출하기 위한 화합물의 세트를 제공한다. 세트는 표 1에 열거된 하나 이상의 유전자에 특이적으로 혼성화할 수 있는 하나 이상의 화합물을 포함하고, 여기서 참조 샘플에서 하나 이상의 유전자의 발현 수준과 비교하여 하나 이상의 유전자의 발현 수준의 감소는 환자가 VEGF 길항제에 부가한 항암 요법제로의 치료로부터 이익을 얻을 수 있다는 것을 나타낸다. 본 발명의 일부 실시양태에서, 화합물은 폴리뉴클레오티드이다. 본 발명의 일부 실시양태에서, 폴리뉴클레오티드는 표 2에 열거된 3개의 서열을 포함한다. 본 발명의 일부 실시양태에서, 화합물은 단백질, 예를 들어 항체이다.
본 발명의 한 실시양태는 뉴로필린-1 (NRP1) 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 수 있는 암을 앓고 있는 환자를 확인하는 방법을 제공한다. 방법은 환자로부터 수득한 샘플에서 TGFβ1, Bv8, Sema3A, PlGF, LGALS1, ITGa5, CSF2, 비멘틴, CXCL5, CCL2, CXCL2, Alk1 및 FGF8로부터 선택된 하나 이상의 유전자의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 하나 이상의 유전자의 증가된 발현 수준은 환자가 NRP1 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 수 있다는 것을 나타낸다.
본 발명의 또 다른 실시양태는 뉴로필린-1 (NRP1) 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 수 있는 암을 앓고 있는 환자를 확인하는 방법을 제공한다. 방법은 환자로부터 수득한 샘플에서 Prox1, RGS5, HGF, Sema3B, Sema3F, LGALS7, FGRF4, PLC, IGFB4 및 TSP1로부터 선택된 하나 이상의 유전자의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 하나 이상의 유전자의 감소된 발현 수준은 환자가 NRP1 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 수 있다는 것을 나타낸다.
본 발명의 추가의 실시양태는 NRP1 길항제로의 치료에 대한 암을 앓고 있는 환자의 반응성을 예측하는 방법을 제공한다. 방법은 환자로부터 수득한 샘플에서 TGFβ1, Bv8, Sema3A, PlGF, LGALS1, ITGa5, CSF2, 비멘틴, CXCL5, CCL2, CXCL2, Alk1 및 FGF8로부터 선택된 하나 이상의 유전자의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 하나 이상의 유전자의 증가된 발현 수준은 환자가 NRP1 길항제로의 치료에 대해 반응성일 가능성이 더 크다는 것을 나타낸다.
본 발명의 또 다른 추가의 실시양태는 NRP1 길항제로의 치료에 대한 암을 앓고 있는 환자의 반응성을 예측하는 방법을 제공한다. 방법은 환자로부터 수득한 샘플에서 Prox1, RGS5, HGF, Sema3B, Sema3F, LGALS7, FGRF4, PLC, IGFB4 및 TSP1로부터 선택된 하나 이상의 유전자의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 하나 이상의 유전자의 감소된 발현 수준은 환자가 NRP1 길항제로의 치료에 대해 반응성일 가능성이 더 크다는 것을 나타낸다.
본 발명의 또 다른 실시양태는 환자가 NRP1 길항제로의 치료로부터 이익을 나타낼 가능성을 결정하는 방법을 제공한다. 방법은 환자로부터 수득한 샘플에서 TGFβ1, Bv8, Sema3A, PlGF, LGALS1, ITGa5, CSF2, 비멘틴, CXCL5, CCL2, CXCL2, Alk1 및 FGF8로부터 선택된 하나 이상의 유전자의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 하나 이상의 유전자의 증가된 발현 수준은 환자가 NRP1 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 가능성이 증가하였다는 것을 나타낸다.
본 발명의 또 다른 실시양태는 환자가 NRP1 길항제로의 치료로부터 이익을 나타낼 가능성을 결정하는 방법을 제공한다. 방법은 환자로부터 수득한 샘플에서 Prox1, RGS5, HGF, Sema3B, Sema3F, LGALS7, FGRF4, PLC, IGFB4 및 TSP1로부터 선택된 하나 이상의 유전자의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 하나 이상의 유전자의 감소된 발현 수준은 환자가 NRP1 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 가능성이 증가하였다는 것을 나타낸다.
본 발명의 또 다른 실시양태는 NRP1 길항제의 치료 효능을 최적화하는 방법을 제공한다. 방법은 환자로부터 수득한 샘플에서 TGFβ1, Bv8, Sema3A, PlGF, LGALS1, ITGa5, CSF2, 비멘틴, CXCL5, CCL2, CXCL2, Alk1 및 FGF8로부터 선택된 하나 이상의 유전자의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 하나 이상의 유전자의 증가된 발현 수준은 환자가 NRP1 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 가능성이 증가하였다는 것을 나타낸다.
본 발명의 또 다른 실시양태는 NRP1 길항제의 치료 효능을 최적화하는 방법을 제공한다. 방법은 환자로부터 수득한 샘플에서 Prox1, RGS5, HGF, Sema3B, Sema3F, LGALS7, FGRF4, PLC, IGFB4 및 TSP1로부터 선택된 하나 이상의 유전자의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 하나 이상의 유전자의 감소된 발현 수준은 환자가 NRP1 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 가능성이 증가하였다는 것을 나타낸다.
본 발명의 추가의 실시양태는 환자에서 세포 증식성 장애를 치료하는 방법을 제공한다. 방법은 환자로부터 수득한 샘플이 참조 샘플과 비교하여 TGFβ1, Bv8, Sema3A, PlGF, LGALS1, ITGa5, CSF2, 비멘틴, CXCL5, CCL2, CXCL2, Alk1 및 FGF8로부터 선택된 하나 이상의 유전자의 증가된 발현 수준을 갖는지 결정하는 것, 및 환자에게 유효량의 NRP1 길항제를 투여하여 세포 증식성 장애를 치료하는 것을 포함한다.
본 발명의 또 다른 실시양태는 환자에서 세포 증식성 장애를 치료하는 방법을 제공한다. 방법은 환자로부터 수득한 샘플이 참조 샘플과 비교하여 Prox1, RGS5, HGF, Sema3B, Sema3F, LGALS7, FGRF4, PLC, IGFB4 및 TSP1로부터 선택된 하나 이상의 유전자의 감소된 발현 수준을 갖는지 결정하는 것, 및 환자에게 유효량의 NRP1 길항제를 투여하여 세포 증식성 장애를 치료하는 것을 포함한다.
본 발명의 일부 실시양태에서, 환자로부터 수득한 샘플은 조직, 전혈, 혈액-유래 세포, 혈장, 혈청, 및 이들의 조합으로부터 선택된 구성원이다. 본 발명의 일부 실시양태에서, 발현 수준은 mRNA 발현 수준이다. 본 발명의 일부 실시양태에서, 발현 수준은 단백질 발현 수준이다. 본 발명의 일부 실시양태에서, NRP1 길항제는 항-NRP1 항체이다.
본 발명의 일부 실시양태에서, 방법은 환자에게 VEGF 길항제를 투여하는 것을 더 포함한다. 본 발명의 일부 실시양태에서, VEGF 길항제 및 NRP1 길항제는 동시에 투여한다. 본 발명의 일부 실시양태에서, VEGF 길항제 및 NRP1 길항제는 순차적으로 투여한다. 본 발명의 일부 실시양태에서, VEGF 길항제는 항-VEGF 항체이다. 본 발명의 일부 실시양태에서, 항-VEGF 항체는 베바시주맙이다.
본 발명의 또 다른 실시양태는 NRP1 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 수 있는 암을 앓고 있는 환자를 확인하는 방법을 제공한다. 방법은 환자로부터 수득한 샘플에서 PlGF의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 PlGF의 증가된 발현 수준은 환자가 NRP1 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 수 있다는 것을 나타낸다.
본 발명의 또 다른 실시양태는 NRP1 길항제로의 치료에 대한 암을 앓고 있는 환자의 반응성을 예측하는 방법을 제공한다. 방법은 환자로부터 수득한 샘플에서 PlGF의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 PlGF의 증가된 발현 수준은 환자가 NRP1 길항제로의 치료에 대해 반응성일 가능성이 더 크다는 것을 나타낸다.
본 발명의 또 다른 실시양태는 환자가 NRP1 길항제로의 치료로부터 이익을 나타낼 가능성을 결정하는 방법을 제공한다. 방법은 환자로부터 수득한 샘플에서 PlGF의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 PlGF의 증가된 발현 수준은 환자가 NRP1 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 가능성이 증가하였다는 것을 나타낸다.
본 발명의 또 다른 실시양태는 NRP1 길항제의 치료 효능을 최적화하는 방법을 제공한다. 방법은 환자로부터 수득한 샘플에서 PlGF의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 PlGF의 증가된 발현 수준은 환자가 NRP1 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 가능성이 증가하였다는 것을 나타낸다.
본 발명의 추가의 실시양태는 환자에서 세포 증식성 장애를 치료하는 방법을 제공한다. 방법은 환자로부터 수득한 샘플이 참조 샘플과 비교하여 PlGF의 증가된 발현 수준을 갖는지 결정하는 것, 및 환자에게 유효량의 NRP1 길항제를 투여하여 세포 증식성 장애를 치료하는 것을 포함한다.
본 발명의 다른 추가의 실시양태는 뉴로필린-1 (NRP1) 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 수 있는 암을 앓고 있는 환자를 확인하는 방법을 제공한다. 방법은 환자로부터 수득한 샘플에서 Sema3A의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 Sema3A의 증가된 발현 수준은 환자가 NRP1 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 수 있다는 것을 나타낸다.
본 발명의 다른 추가의 실시양태는 NRP1 길항제로의 치료에 대한 암을 앓고 있는 환자의 반응성을 예측하는 방법을 제공한다. 방법은 환자로부터 수득한 샘플에서 Sema3A의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 Sema3A의 증가된 발현 수준은 환자가 NRP1 길항제로의 치료에 대해 반응성일 가능성이 더 크다는 것을 나타낸다.
본 발명의 또 다른 실시양태는 환자가 NRP1 길항제로의 치료로부터 이익을 나타낼 가능성을 결정하는 방법을 제공한다. 방법은 환자로부터 수득한 샘플에서 Sema3A의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 Sema3A의 증가된 발현 수준은 환자가 NRP1 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 가능성이 증가하였다는 것을 나타낸다.
본 발명의 또 다른 실시양태는 NRP1 길항제의 치료 효능을 최적화하는 방법을 제공한다. 방법은 환자로부터 수득한 샘플에서 Sema3A의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 Sema3A의 증가된 발현 수준은 환자가 NRP1 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 가능성이 증가하였다는 것을 나타낸다.
본 발명의 또 다른 실시양태는 환자에서 세포 증식성 장애를 치료하는 방법을 제공한다. 방법은 환자로부터 수득한 샘플이 참조 샘플과 비교하여 Sema3A의 증가된 발현 수준을 갖는지 결정하는 것, 및 환자에게 유효량의 NRP1 길항제를 투여하여 세포 증식성 장애를 치료하는 것을 포함한다.
본 발명의 또 다른 실시양태는 뉴로필린-1 (NRP1) 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 수 있는 암을 앓고 있는 환자를 확인하는 방법을 제공한다. 방법은 환자로부터 수득한 샘플에서 TGFβ1의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 TGFβ1의 증가된 발현 수준은 환자가 NRP1 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 수 있다는 것을 나타낸다.
본 발명의 추가의 실시양태는 NRP1 길항제로의 치료에 대한 암을 앓고 있는 환자의 반응성을 예측하는 방법을 제공한다. 방법은 환자로부터 수득한 샘플에서 TGFβ1의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 TGFβ1의 증가된 발현 수준은 환자가 NRP1 길항제로의 치료에 대해 반응성일 가능성이 더 크다는 것을 나타낸다. 본 발명의 일부 실시양태에서, 방법은 환자에게 유효량의 NRP1 길항제를 투여하는 것을 더 포함한다.
본 발명의 다른 추가의 실시양태는 환자가 NRP1 길항제로의 치료로부터 이익을 나타낼 가능성을 결정하는 방법을 제공한다. 방법은 환자로부터 수득한 샘플에서 TGFβ1의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 TGFβ1의 증가된 발현 수준은 환자가 NRP1 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 가능성이 증가하였다는 것을 나타낸다.
본 발명의 다른 추가의 실시양태는 NRP1 길항제의 치료 효능을 최적화하는 방법을 제공한다. 방법은 환자로부터 수득한 샘플에서 TGFβ1의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 TGFβ1의 증가된 발현 수준은 환자가 NRP1 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 가능성이 증가하였다는 것을 나타낸다.
본 발명의 다른 추가의 실시양태는 환자에서 세포 증식성 장애를 치료하는 방법을 제공한다. 방법은 환자로부터 수득한 샘플이 참조 샘플과 비교하여 TGFβ1의 증가된 발현 수준을 갖는지 결정하는 것, 및 환자에게 유효량의 NRP1 길항제를 투여하여 세포 증식성 장애를 치료하는 것을 포함한다.
본 발명의 일부 실시양태에서, NRP1 길항제는 항-NRP1 항체이다. 본 발명의 일부 실시양태에서, 방법은 환자에게 VEGF-A 길항제를 투여하는 것을 더 포함한다. 본 발명의 일부 실시양태에서, VEGF-A 길항제 및 NRP1 길항제는 동시에 투여한다. 본 발명의 일부 실시양태에서, VEGF-A 길항제 및 NRP1 길항제는 순차적으로 투여한다. 본 발명의 일부 실시양태에서, VEGF-A 길항제는 항-VEGF-A 항체이다. 본 발명의 일부 실시양태에서, 항-VEGF-A 항체는 베바시주맙이다.
본 발명의 또 다른 실시양태는 TGFβ1, Bv8, Sema3A, PlGF, LGALS1, ITGa5, CSF2, 비멘틴, CXCL5, CCL2, CXCL2, Alk1 및 FGF8로부터 선택된 하나 이상의 유전자의 발현 수준을 결정하기 위한 키트를 제공한다. 키트는 TGFβ1, Bv8, Sema3A, PlGF, LGALS1, ITGa5, CSF2, 비멘틴, CXCL5, CCL2, CXCL2, Alk1 및 FGF8로부터 선택된 하나 이상의 유전자에 특이적으로 혼성화할 수 있는 폴리뉴클레오티드를 포함하는 어레이 및 NRP1 길항제로의 치료에 대한 환자의 반응성을 예측하기 위해 하나 이상의 유전자의 발현 수준을 결정하는데 어레이를 사용하기 위한 설명서를 포함하고, 여기서 참조 샘플에서 하나 이상의 유전자의 발현 수준과 비교하여 하나 이상의 유전자의 발현 수준의 증가는 환자가 NRP1 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 수 있다는 것을 나타낸다.
본 발명의 또 다른 실시양태는 Prox1, RGS5, HGF, Sema3B, Sema3F, LGALS7, FGRF4, PLC, IGFB4 및 TSP1로부터 선택된 하나 이상의 유전자의 발현 수준을 결정하기 위한 키트를 제공한다. 키트는 Prox1, RGS5, HGF, Sema3B, Sema3F, LGALS7, FGRF4, PLC, IGFB4 및 TSP1로부터 선택된 하나 이상의 유전자에 특이적으로 혼성화할 수 있는 폴리뉴클레오티드를 포함하는 어레이 및 NRP1 길항제로의 치료에 대한 환자의 반응성을 예측하기 위해 하나 이상의 유전자의 발현 수준을 결정하는데 어레이를 사용하기 위한 설명서를 포함하고, 여기서 참조 샘플에서 하나 이상의 유전자의 발현 수준과 비교하여 하나 이상의 유전자의 발현 수준의 감소는 환자가 NRP1 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 수 있다는 것을 나타낸다.
본 발명의 또 다른 실시양태는 암 환자로부터 수득한 샘플에서 TGFβ1, Bv8, Sema3A, PlGF, LGALS1, ITGa5, CSF2, 비멘틴, CXCL5, CCL2, CXCL2, Alk1 및 FGF8로부터 선택된 하나 이상의 유전자의 발현 수준을 결정하기 위해 상기 하나 이상의 유전자의 발현 수준을 검출할 수 있는 화합물의 세트를 제공한다. 세트는 TGFβ1, Bv8, Sema3A, PlGF, LGALS1, ITGa5, CSF2, 비멘틴, CXCL5, CCL2, CXCL2, Alk1 및 FGF8로부터 선택된 하나 이상의 유전자에 특이적으로 혼성화할 수 있는 하나 이상의 화합물을 포함하고, 여기서 참조 샘플에서 하나 이상의 유전자의 발현 수준과 비교하여 하나 이상의 유전자의 발현 수준의 증가는 환자가 NRP1 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 수 있다는 것을 나타낸다. 본 발명의 일부 실시양태에서, 화합물은 폴리뉴클레오티드이다. 본 발명의 일부 실시양태에서, 폴리뉴클레오티드는 표 2에 열거된 3개의 서열을 포함한다. 본 발명의 일부 실시양태에서, 화합물은 예를 들어 항체를 포함하는 단백질이다.
본 발명의 추가의 실시양태는 암 환자로부터 수득한 샘플에서 Prox1, RGS5, HGF, Sema3B, Sema3F, LGALS7, FGRF4, PLC, IGFB4 및 TSP1로부터 선택된 하나 이상의 유전자의 발현 수준을 결정하기 위해 상기 하나 이상의 유전자의 발현 수준을 검출할 수 있는 화합물의 세트를 제공한다. 세트는 Prox1, RGS5, HGF, Sema3B, Sema3F, LGALS7, FGRF4, PLC, IGFB4 및 TSP1로부터 선택된 하나 이상의 유전자에 특이적으로 혼성화할 수 있는 하나 이상의 화합물을 포함하고, 여기서 참조 샘플에서 하나 이상의 유전자의 발현 수준과 비교하여 상기 하나 이상의 유전자의 발현 수준의 감소는 환자가 NRP1 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 수 있다는 것을 나타낸다. 본 발명의 일부 실시양태에서, 화합물은 폴리뉴클레오티드이다. 본 발명의 일부 실시양태에서, 폴리뉴클레오티드는 표 2에 열거된 3개의 서열을 포함한다. 본 발명의 일부 실시양태에서, 화합물은 예를 들어 항체를 포함하는 단백질이다.
본 발명의 또 다른 실시양태는 혈관 내피 성장 인자 C (VEGF-C) 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 수 있는 암을 앓고 있는 환자를 확인하는 방법을 제공한다. 방법은 환자로부터 수득한 샘플에서 VEGF-C, VEGF-D, VEGFR3, FGF2, RGS5/CDH5, IL-8, CXCL1 및 CXCL2로부터 선택된 하나 이상의 유전자의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 하나 이상의 유전자의 증가된 발현 수준은 환자가 VEGF-C 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 수 있다는 것을 나타낸다.
본 발명의 또 다른 실시양태는 VEGF-C 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 수 있는 암을 앓고 있는 환자를 확인하는 방법을 제공한다. 방법은 환자로부터 수득한 샘플에서 VEGF-A, CSF2, Prox1, ICAM1, ESM1, PlGF, ITGa5, TGFβ, Hhex, Col4a1, Col4a2 및 Alk1로부터 선택된 하나 이상의 유전자의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 하나 이상의 유전자의 감소된 발현 수준은 환자가 VEGF-C 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 수 있다는 것을 나타낸다.
본 발명의 또 다른 실시양태는 VEGF-C 길항제로의 치료에 대한 암을 앓고 있는 환자의 반응성을 예측하는 방법을 제공한다. 방법은 환자로부터 수득한 샘플에서 VEGF-C, VEGF-D, VEGFR3, FGF2, RGS5/CDH5, IL-8, CXCL1 및 CXCL2로부터 선택된 하나 이상의 유전자의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 하나 이상의 유전자의 증가된 발현 수준은 환자가 VEGF-C 길항제로의 치료에 대해 반응성일 가능성이 더 크다는 것을 나타낸다.
본 발명의 추가의 실시양태는 VEGF-C 길항제로의 치료에 대한 암을 앓고 있는 환자의 반응성을 예측하는 방법을 제공한다. 방법은 환자로부터 수득한 샘플에서 VEGF-A, CSF2, Prox1, ICAM1, ESM1, PlGF, ITGa5, TGFβ, Hhex, Col4a1, Col4a2 및 Alk1로부터 선택된 하나 이상의 유전자의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 하나 이상의 유전자의 감소된 발현 수준은 환자가 VEGF-C 길항제로의 치료에 대해 반응성일 가능성이 더 크다는 것을 나타낸다.
본 발명의 다른 추가의 실시양태는 환자가 VEGF-C 길항제로의 치료로부터 이익을 나타낼 가능성을 결정하는 방법을 제공한다. 방법은 환자로부터 수득한 샘플에서 VEGF-C, VEGF-D, VEGFR3, FGF2, RGS5/CDH5, IL-8, CXCL1 및 CXCL2로부터 선택된 하나 이상의 유전자의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 하나 이상의 유전자의 증가된 발현 수준은 환자가 VEGF-C 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 가능성이 증가하였다는 것을 나타낸다.
본 발명의 다른 추가의 실시양태는 환자가 VEGF-C 길항제로의 치료로부터 이익을 나타낼 가능성을 결정하는 방법을 제공한다. 방법은 환자로부터 수득한 샘플에서 VEGF-A, CSF2, Prox1, ICAM1, ESM1, PlGF, ITGa5, TGFβ, Hhex, Col4a1, Col4a2 및 Alk1로부터 선택된 하나 이상의 유전자의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 하나 이상의 유전자의 감소된 발현 수준은 환자가 VEGF-C 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 가능성이 증가하였다는 것을 나타낸다.
본 발명의 다른 추가의 실시양태는 VEGF-C 길항제의 치료 효능을 최적화하는 방법을 제공한다. 방법은 환자로부터 수득한 샘플에서 VEGF-C, VEGF-D, VEGFR3, FGF2, RGS5/CDH5, IL-8, CXCL1 및 CXCL2로부터 선택된 하나 이상의 유전자의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 하나 이상의 유전자의 증가된 발현 수준은 환자가 VEGF-C 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 가능성이 증가하였다는 것을 나타낸다.
본 발명의 다른 추가의 실시양태는 VEGF-C 길항제의 치료 효능을 최적화하는 방법을 제공한다. 방법은 환자로부터 수득한 샘플에서 VEGF-A, CSF2, Prox1, ICAM1, ESM1, PlGF, ITGa5, TGFβ, Hhex, Col4a1, Col4a2 및 Alk1로부터 선택된 하나 이상의 유전자의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 하나 이상의 유전자의 감소된 발현 수준은 환자가 VEGF-C 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 가능성이 증가하였다는 것을 나타낸다.
본 발명의 또 다른 실시양태는 환자에서 세포 증식성 장애를 치료하는 방법을 제공한다. 방법은 환자로부터 수득한 샘플이 참조 샘플과 비교하여 VEGF-C, VEGF-D, VEGFR3, FGF2, RGS5/CDH5, IL-8, CXCL1 및 CXCL2로부터 선택된 하나 이상의 유전자의 증가된 발현 수준을 갖는지 결정하는 것, 및 환자에게 유효량의 VEGF-C 길항제를 투여하여 세포 증식성 장애를 치료하는 것을 포함한다.
본 발명의 또 다른 실시양태는 환자에서 세포 증식성 장애를 치료하는 방법을 제공한다. 방법은 환자로부터 수득한 샘플이 참조 샘플과 비교하여 VEGF-A, CSF2, Prox1, ICAM1, ESM1, PlGF, ITGa5, TGFβ, Hhex, Col4a1, Col4a2 및 Alk1로부터 선택된 하나 이상의 유전자의 감소된 발현 수준을 갖는지 결정하는 것, 및 환자에게 유효량의 VEGF-C 길항제를 투여하여 세포 증식성 장애를 치료하는 것을 포함한다.
본 발명의 일부 실시양태에서, 환자로부터 수득한 샘플은 조직, 전혈, 혈액-유래 세포, 혈장, 혈청, 및 이들의 조합으로부터 선택된다. 본 발명의 일부 실시양태에서, 발현 수준은 mRNA 발현 수준이다. 본 발명의 일부 실시양태에서, 발현 수준은 단백질 발현 수준이다. 본 발명의 일부 실시양태에서, VEGF-C 길항제는 항-VEGF-C 항체이다.
본 발명의 일부 실시양태에서, 방법은 환자에게 VEGF-A 길항제를 투여하는 것을 더 포함한다. 본 발명의 일부 실시양태에서, VEGF-A 길항제 및 VEGF-C 길항제는 동시에 투여한다. 본 발명의 일부 실시양태에서, VEGF-A 길항제 및 VEGF-C 길항제는 순차적으로 투여한다. 본 발명의 일부 실시양태에서, VEGF-A 길항제는 항-VEGF-A 항체이다. 본 발명의 일부 실시양태에서, 항-VEGF-A 항체는 베바시주맙이다.
본 발명의 또 다른 실시양태는 VEGF-C 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 수 있는 암을 앓고 있는 환자를 확인하는 방법을 제공한다. 방법은 환자로부터 수득한 샘플에서 VEGF-C의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 VEGF-C의 증가된 발현 수준은 환자가 VEGF-C 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 수 있다는 것을 나타낸다.
본 발명의 또 다른 실시양태는 VEGF-C 길항제로의 치료에 대한 암을 앓고 있는 환자의 반응성을 예측하는 방법을 제공한다. 방법은 환자로부터 수득한 샘플에서 VEGF-C의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 VEGF-C의 증가된 발현 수준은 환자가 VEGF-C 길항제로의 치료에 대해 반응성일 가능성이 더 크다는 것을 나타낸다.
본 발명의 또 다른 실시양태는 환자가 VEGF-C 길항제로의 치료로부터 이익을 나타낼 가능성을 결정하는 방법을 제공한다. 방법은 환자로부터 수득한 샘플에서 VEGF-C의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 VEGF-C의 증가된 발현 수준은 환자가 VEGF-C 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 가능성이 증가하였다는 것을 나타낸다.
본 발명의 또 다른 실시양태는 VEGF-C 길항제의 치료 효능을 최적화하는 방법을 제공한다. 방법은 환자로부터 수득한 샘플에서 VEGF-C의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 VEGF-C의 증가된 발현 수준은 환자가 VEGF-C 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 가능성이 증가하였다는 것을 나타낸다.
본 발명의 추가의 실시양태는 환자에서 세포 증식성 장애를 치료하는 방법을 제공한다. 방법은 환자로부터 수득한 샘플이 참조 샘플과 비교하여 VEGF-C의 증가된 발현 수준을 갖는지 결정하는 것, 및 환자에게 유효량의 VEGF-C 길항제를 투여하여 세포 증식성 장애를 치료하는 것을 포함한다.
본 발명의 다른 추가의 실시양태는 VEGF-C 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 수 있는 암을 앓고 있는 환자를 확인하는 방법을 제공한다. 방법은 환자로부터 수득한 샘플에서 VEGF-D의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 VEGF-D의 증가된 발현 수준은 환자가 VEGF-C 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 수 있다는 것을 나타낸다.
본 발명의 다른 추가의 실시양태는 VEGF-C 길항제로의 치료에 대한 암을 앓고 있는 환자의 반응성을 예측하는 방법을 제공한다. 방법은 환자로부터 수득한 샘플에서 VEGF-D의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 VEGF-D의 증가된 발현 수준은 환자가 VEGF-C 길항제로의 치료에 대해 반응성일 가능성이 더 크다는 것을 나타낸다.
본 발명의 또 다른 실시양태는 환자가 VEGF-C 길항제로의 치료로부터 이익을 나타낼 가능성을 결정하는 방법을 제공한다. 방법은 환자로부터 수득한 샘플에서 VEGF-D의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 VEGF-D의 증가된 발현 수준은 환자가 VEGF-C 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 가능성이 증가하였다는 것을 나타낸다.
본 발명의 또 다른 실시양태는 VEGF-C 길항제의 치료 효능을 최적화하는 방법을 제공한다. 방법은 환자로부터 수득한 샘플에서 VEGF-D의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 VEGF-D의 증가된 발현 수준은 환자가 VEGF-C 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 가능성이 증가하였다는 것을 나타낸다.
본 발명의 또 다른 실시양태는 환자에서 세포 증식성 장애를 치료하는 방법을 제공한다. 방법은 환자로부터 수득한 샘플이 참조 샘플과 비교하여 VEGF-D의 증가된 발현 수준을 갖는지 결정하는 것, 및 환자에게 유효량의 VEGF-C 길항제를 투여하여 세포 증식성 장애를 치료하는 것을 포함한다.
본 발명의 또 다른 실시양태는 VEGF-C 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 수 있는 암을 앓고 있는 환자를 확인하는 방법을 제공한다. 방법은 환자로부터 수득한 샘플에서 VEGFR3의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 VEGFR3의 증가된 발현 수준은 환자가 VEGF-C 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 수 있다는 것을 나타낸다.
본 발명의 추가의 실시양태는 VEGF-C 길항제로의 치료에 대한 암을 앓고 있는 환자의 반응성을 예측하는 방법을 제공한다. 방법은 환자로부터 수득한 샘플에서 VEGFR3의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 VEGFR3의 증가된 발현 수준은 환자가 VEGF-C 길항제로의 치료에 대해 반응성일 가능성이 더 크다는 것을 나타낸다.
본 발명의 다른 추가의 실시양태는 환자가 VEGF-C 길항제로의 치료로부터 이익을 나타낼 가능성을 결정하는 방법을 제공한다. 방법은 환자로부터 수득한 샘플에서 VEGFR3의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 VEGFR3의 증가된 발현 수준은 환자가 VEGF-C 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 가능성이 증가하였다는 것을 나타낸다.
본 발명의 추가의 실시양태는 VEGF-C 길항제의 치료 효능을 최적화하는 방법을 제공한다. 방법은 환자로부터 수득한 샘플에서 VEGFR3의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 VEGFR3의 증가된 발현 수준은 환자가 VEGF-C 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 가능성이 증가하였다는 것을 나타낸다.
본 발명의 다른 추가의 실시양태는 환자에서 세포 증식성 장애를 치료하는 방법을 제공한다. 방법은 환자로부터 수득한 샘플이 참조 샘플과 비교하여 VEGFR3의 증가된 발현 수준을 갖는지 결정하는 것, 및 환자에게 유효량의 VEGF-C 길항제를 투여하여 세포 증식성 장애를 치료하는 것을 포함한다.
본 발명의 또 다른 실시양태는 VEGF-C 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 수 있는 암을 앓고 있는 환자를 확인하는 방법을 제공한다. 방법은 환자로부터 수득한 샘플에서 FGF2의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 FGF2의 증가된 발현 수준은 환자가 VEGF-C 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 수 있다는 것을 나타낸다.
본 발명의 또 다른 실시양태는 VEGF-C 길항제로의 치료에 대한 암을 앓고 있는 환자의 반응성을 예측하는 방법을 제공한다. 방법은 환자로부터 수득한 샘플에서 FGF2의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 FGF2의 증가된 발현 수준은 환자가 VEGF-C 길항제로의 치료에 대해 반응성일 가능성이 더 크다는 것을 나타낸다.
본 발명의 또 다른 실시양태는 환자가 VEGF-C 길항제로의 치료로부터 이익을 나타낼 가능성을 결정하는 방법을 제공한다. 방법은 환자로부터 수득한 샘플에서 FGF2의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 FGF2의 증가된 발현 수준은 환자가 VEGF-C 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 가능성이 증가하였다는 것을 나타낸다.
본 발명의 또 다른 실시양태는 VEGF-C 길항제의 치료 효능을 최적화하는 방법을 제공한다. 방법은 환자로부터 수득한 샘플에서 FGF2의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 FGF2의 증가된 발현 수준은 환자가 VEGF-C 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 가능성이 증가하였다는 것을 나타낸다.
본 발명의 추가의 실시양태는 환자에서 세포 증식성 장애를 치료하는 방법을 제공한다. 방법은 환자로부터 수득한 샘플이 참조 샘플과 비교하여 FGF2의 증가된 발현 수준을 갖는지 결정하는 것, 및 환자에게 유효량의 VEGF-C 길항제를 투여하여 세포 증식성 장애를 치료하는 것을 포함한다.
본 발명의 다른 추가의 실시양태는 VEGF-C 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 수 있는 암을 앓고 있는 환자를 확인하는 방법을 제공한다. 방법은 환자로부터 수득한 샘플에서 VEGF-A의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 VEGF-A의 감소된 발현 수준은 환자가 VEGF-C 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 수 있다는 것을 나타낸다.
본 발명의 다른 추가의 실시양태는 VEGF-C 길항제로의 치료에 대한 암을 앓고 있는 환자의 반응성을 예측하는 방법을 제공한다. 방법은 환자로부터 수득한 샘플에서 VEGF-A의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 VEGF-A의 감소된 발현 수준은 환자가 VEGF-C 길항제로의 치료에 대해 반응성일 가능성이 더 크다는 것을 나타낸다.
본 발명의 또 다른 실시양태는 환자가 VEGF-C 길항제로의 치료로부터 이익을 나타낼 가능성을 결정하는 방법을 제공한다. 방법은 환자로부터 수득한 샘플에서 VEGF-A의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 VEGF-A의 감소된 발현 수준은 환자가 VEGF-C 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 가능성이 증가하였다는 것을 나타낸다.
본 발명의 또 다른 실시양태는 VEGF-C 길항제의 치료 효능을 최적화하는 방법을 제공한다. 방법은 환자로부터 수득한 샘플에서 VEGF-A의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 VEGF-A의 감소된 발현 수준은 환자가 VEGF-C 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 가능성이 증가하였다는 것을 나타낸다.
본 발명의 또 다른 실시양태는 환자에서 세포 증식성 장애를 치료하는 방법을 제공한다. 방법은 환자로부터 수득한 샘플이 참조 샘플과 비교하여 VEGF-A의 감소된 발현 수준을 갖는지 결정하는 것, 및 환자에게 유효량의 VEGF-C 길항제를 투여하여 세포 증식성 장애를 치료하는 것을 포함한다.
본 발명의 또 다른 실시양태는 VEGF-C 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 수 있는 암을 앓고 있는 환자를 확인하는 방법을 제공한다. 방법은 환자로부터 수득한 샘플에서 PlGF의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 PlGF의 감소된 발현 수준은 환자가 VEGF-C 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 수 있다는 것을 나타낸다.
본 발명의 추가의 실시양태는 VEGF-C 길항제로의 치료에 대한 암을 앓고 있는 환자의 반응성을 예측하는 방법을 제공한다. 방법은 환자로부터 수득한 샘플에서 PlGF의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 PlGF의 감소된 발현 수준은 환자가 VEGF-C 길항제로의 치료에 대해 반응성일 가능성이 더 크다는 것을 나타낸다.
본 발명의 다른 추가의 실시양태는 환자가 VEGF-C 길항제로의 치료로부터 이익을 나타낼 가능성을 결정하는 방법을 제공한다. 방법은 환자로부터 수득한 샘플에서 PlGF의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 PlGF의 감소된 발현 수준은 환자가 VEGF-C 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 가능성이 증가하였다는 것을 나타낸다.
본 발명의 다른 추가의 실시양태는 VEGF-C 길항제의 치료 효능을 최적화하는 방법을 제공한다. 방법은 환자로부터 수득한 샘플에서 PlGF의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 PlGF의 감소된 발현 수준은 환자가 VEGF-C 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 가능성이 증가하였다는 것을 나타낸다.
본 발명의 다른 추가의 실시양태는 환자에서 세포 증식성 장애를 치료하는 방법을 제공한다. 방법은 환자로부터 수득한 샘플이 참조 샘플과 비교하여 PlGF의 감소된 발현 수준을 갖는지 결정하는 것, 및 환자에게 유효량의 VEGF-C 길항제를 투여하여 세포 증식성 장애를 치료하는 것을 포함한다.
본 발명의 일부 실시양태에서, VEGF-C 길항제는 항-VEGF-C 항체이다. 본 발명의 일부 실시양태에서, 방법은 환자에게 VEGF-A 길항제를 투여하는 것을 더 포함한다. 본 발명의 일부 실시양태에서, VEGF-A 길항제 및 VEGF-C 길항제를 동시에 투여한다. 본 발명의 일부 실시양태에서, VEGF-A 길항제 및 VEGF-C 길항제를 순차적으로 투여한다. 본 발명의 일부 실시양태에서, VEGF-A 길항제는 항-VEGF-A 항체이다. 본 발명의 일부 실시양태에서, 항-VEGF-A 항체는 베바시주맙이다.
본 발명의 또 다른 실시양태는 VEGF-C, VEGF-D, VEGFR3, FGF2, RGS5/CDH5, IL-8, CXCL1 및 CXCL2로부터 선택된 하나 이상의 유전자의 발현 수준을 결정하기 위한 키트를 제공한다. 키트는 VEGF-C, VEGF-D, VEGFR3, FGF2, RGS5/CDH5, IL-8, CXCL1 및 CXCL2로부터 선택된 하나 이상의 유전자에 특이적으로 혼성화할 수 있는 폴리뉴클레오티드를 포함하는 어레이 및 VEGF-C 길항제로의 치료에 대한 환자의 반응성을 예측하기 위해 하나 이상의 유전자의 발현 수준을 결정하는데 어레이를 사용하기 위한 설명서를 포함하고, 여기서 참조 샘플에서 하나 이상의 유전자의 발현 수준과 비교하여 하나 이상의 유전자의 발현 수준의 증가는 환자가 VEGF-C 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 수 있다는 것을 나타낸다.
본 발명의 또 다른 실시양태는 VEGF-A, CSF2, Prox1, ICAM1, ESM1, PlGF, ITGa5, TGFβ, Hhex, Col4a1, Col4a2 및 Alk1로부터 선택된 하나 이상의 유전자의 발현 수준을 결정하기 위한 키트를 제공한다. 키트는 VEGF-A, CSF2, Prox1, ICAM1, ESM1, PlGF, ITGa5, TGFβ, Hhex, Col4a1, Col4a2 및 Alk1로부터 선택된 하나 이상의 유전자에 특이적으로 혼성화할 수 있는 폴리뉴클레오티드를 포함하는 어레이 및 VEGF-C 길항제로의 치료에 대한 환자의 반응성을 예측하기 위해 하나 이상의 유전자의 발현 수준을 결정하는데 어레이를 사용하기 위한 설명서를 포함하고, 여기서 참조 샘플에서 하나 이상의 유전자의 발현 수준과 비교하여 하나 이상의 유전자의 발현 수준의 감소는 환자가 VEGF-C 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 수 있다는 것을 나타낸다.
본 발명의 추가의 실시양태는 암 환자로부터 수득한 샘플에서 VEGF-C, VEGF-D, VEGFR3, FGF2, RGS5/CDH5, IL-8, CXCL1 및 CXCL2로부터 선택된 하나 이상의 유전자의 발현 수준을 결정하기 위해 상기 하나 이상의 유전자의 발현 수준을 검출할 수 있는 화합물의 세트를 제공한다. 세트는 VEGF-C, VEGF-D, VEGFR3, FGF2, RGS5/CDH5, IL-8, CXCL1 및 CXCL2로부터 선택된 하나 이상의 유전자에 특이적으로 혼성화할 수 있는 하나 이상의 화합물을 포함하고, 여기서 참조 샘플에서 하나 이상의 유전자의 발현 수준과 비교하여 하나 이상의 유전자의 발현 수준의 증가는 환자가 VEGF-C 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 수 있다는 것을 나타낸다. 본 발명의 일부 실시양태에서, 화합물은 폴리뉴클레오티드이다. 본 발명의 일부 실시양태에서, 화합물은 단백질, 예를 들어 항체이다.
본 발명의 또 다른 실시양태는 암 환자로부터 수득한 샘플에서 VEGF-A, CSF2, Prox1, ICAM1, ESM1, PlGF, ITGa5, TGFβ, Hhex, Col4a1, Col4a2 및 Alk1로부터 선택된 하나 이상의 유전자의 발현 수준을 결정하기 위해 상기 하나 이상의 유전자의 발현 수준을 검출할 수 있는 화합물의 세트를 제공한다. 세트는 VEGF-A, CSF2, Prox1, ICAM1, ESM1, PlGF, ITGa5, TGFβ, Hhex, Col4a1, Col4a2 및 Alk1로부터 선택된 하나 이상의 유전자에 특이적으로 혼성화할 수 있는 하나 이상의 화합물을 포함하고, 여기서 참조 샘플에서 하나 이상의 유전자의 발현 수준과 비교하여 하나 이상의 유전자의 발현 수준의 감소는 환자가 VEGF-C 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 수 있다는 것을 나타낸다. 본 발명의 일부 실시양태에서, 화합물은 폴리뉴클레오티드이다. 본 발명의 일부 실시양태에서, 화합물은 단백질, 예를 들어 항체이다.
본 발명의 한 실시양태는 EGF-유사-도메인, 멀티플 7 (EGFL7) 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 수 있는 암을 앓고 있는 환자를 확인하는 방법을 제공한다. 방법은 환자로부터 수득한 샘플에서 VEGF-C, BV8, CSF2, TNFα, CXCL2, PDGF-C 및 민클로부터 선택된 하나 이상의 유전자의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 하나 이상의 유전자의 증가된 발현 수준은 환자가 EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 수 있다는 것을 나타낸다.
본 발명의 또 다른 실시양태는 EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 수 있는 암을 앓고 있는 환자를 확인하는 방법을 제공한다. 방법은 환자로부터 수득한 샘플에서 Sema3B, FGF9, HGF, RGS5, NRP1, FGF2, CXCR4, cMet, FN1, 피불린 2, 피불린 4/EFEMP2, MFAP5, PDGF-C, Sema3F 및 FN1로부터 선택된 하나 이상의 유전자의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 하나 이상의 유전자의 감소된 발현 수준은 환자가 EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 수 있다는 것을 나타낸다.
본 발명의 추가의 실시양태는 EGFL7 길항제로의 치료에 대한 암을 앓고 있는 환자의 반응성을 예측하는 방법을 제공한다. 방법은 환자로부터 수득한 샘플에서 VEGF-C, BV8, CSF2, TNFα, CXCL2, PDGF-C 및 민클로부터 선택된 하나 이상의 유전자의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 하나 이상의 유전자의 증가된 발현 수준은 환자가 EGFL7 길항제로의 치료에 대해 반응성일 가능성이 더 크다는 것을 나타낸다.
본 발명의 또 다른 실시양태는 EGFL7 길항제로의 치료에 대한 암을 앓고 있는 환자의 반응성을 예측하는 방법을 제공한다. 방법은 환자로부터 수득한 샘플에서 Sema3B, FGF9, HGF, RGS5, NRP1, FGF2, CXCR4, cMet, FN1, 피불린 2, 피불린 4/EFEMP2, MFAP5, PDGF-C, Sema3F 및 FN1로부터 선택된 하나 이상의 유전자의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 하나 이상의 유전자의 감소된 발현 수준은 환자가 EGFL7 길항제로의 치료에 대해 반응성일 가능성이 더 크다는 것을 나타낸다.
본 발명의 또 다른 실시양태는 환자가 EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 나타낼 가능성을 결정하는 방법을 제공한다. 방법은 환자로부터 수득한 샘플에서 VEGF-C, BV8, CSF2, TNFα, CXCL2, PDGF-C 및 민클로부터 선택된 하나 이상의 유전자의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 하나 이상의 유전자의 증가된 발현 수준은 환자가 EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 가능성이 증가하였다는 것을 나타낸다.
본 발명의 다른 추가의 실시양태는 환자가 EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 나타낼 가능성을 결정하는 방법을 제공한다. 방법은 환자로부터 수득한 샘플에서 Sema3B, FGF9, HGF, RGS5, NRP1, FGF2, CXCR4, cMet, FN1, 피불린 2, 피불린 4/EFEMP2, MFAP5, PDGF-C, Sema3F 및 FN1로부터 선택된 하나 이상의 유전자의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 하나 이상의 유전자의 감소된 발현 수준은 환자가 EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 가능성이 증가하였다는 것을 나타낸다.
본 발명의 또 다른 실시양태는 EGFL7 길항제의 치료 효능을 최적화하는 방법을 제공한다. 방법은 환자로부터 수득한 샘플에서 VEGF-C, BV8, CSF2, TNFα, CXCL2, PDGF-C 및 민클로부터 선택된 하나 이상의 유전자의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 하나 이상의 유전자의 증가된 발현 수준은 환자가 EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 가능성이 증가하였다는 것을 나타낸다.
본 발명의 다른 추가의 실시양태는 EGFL7 길항제의 치료 효능을 최적화하는 방법을 제공한다. 방법은 환자로부터 수득한 샘플에서 Sema3B, FGF9, HGF, RGS5, NRP1, FGF2, CXCR4, cMet, FN1, 피불린 2, 피불린 4/EFEMP2, MFAP5, PDGF-C, Sema3F 및 FN1로부터 선택된 하나 이상의 유전자의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 하나 이상의 유전자의 감소된 발현 수준은 환자가 EGFL7 길항제로의 치료의 이익을 얻을 가능성이 증가하였다는 것을 나타낸다.
본 발명의 또 다른 실시양태는 환자에서 세포 증식성 장애를 치료하는 방법을 제공한다. 방법은 환자로부터 수득한 샘플이 참조 샘플과 비교하여 VEGF-C, BV8, CSF2, TNFα, CXCL2, PDGF-C 및 민클로부터 선택된 하나 이상의 유전자의 증가된 발현 수준을 갖는지 결정하는 것, 및 환자에게 유효량의 EGFL7 길항제를 투여하여 세포 증식성 장애를 치료하는 것을 포함한다.
본 발명의 추가의 실시양태는 환자에서 세포 증식성 장애를 치료하는 방법을 제공한다. 방법은 환자로부터 수득한 샘플이 참조 샘플과 비교하여 Sema3B, FGF9, HGF, RGS5, NRP1, FGF2, CXCR4, cMet, FN1, 피불린 2, 피불린 4/EFEMP2, MFAP5, PDGF-C, Sema3F 및 FN1로부터 선택된 하나 이상의 유전자의 감소된 발현 수준을 갖는지 결정하는 것, 및 환자에게 유효량의 EGFL7 길항제를 투여하여 세포 증식성 장애를 치료하는 것을 포함한다.
본 발명의 일부 실시양태에서, 환자로부터 수득한 샘플은 조직, 전혈, 혈액-유래 세포, 혈장, 혈청, 및 이들의 조합으로부터 선택된다. 본 발명의 일부 실시양태에서, 발현 수준은 mRNA 발현 수준이다. 본 발명의 일부 실시양태에서, 발현 수준은 단백질 발현 수준이다. 본 발명의 일부 실시양태에서, EGFL7 길항제는 항-EGFL7 항체이다.
본 발명의 일부 실시양태에서, 방법은 환자에게 VEGF-A 길항제를 투여하는 것을 더 포함한다. 본 발명의 일부 실시양태에서, VEGF-A 길항제 및 EGFL7 길항제는 동시에 투여한다. 본 발명의 일부 실시양태에서, VEGF-A 길항제 및 EGFL7 길항제는 순차적으로 투여한다. 본 발명의 일부 실시양태에서, VEGF-A 길항제는 항-VEGF-A 항체이다. 본 발명의 일부 실시양태에서, 항-VEGF-A 항체는 베바시주맙이다.
본 발명의 추가의 실시양태는 EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 수 있는 암을 앓고 있는 환자를 확인하는 방법을 제공한다. 방법은 환자로부터 수득한 샘플에서 VEGF-C의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 VEGF-C의 증가된 발현 수준은 환자가 EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 수 있다는 것을 나타낸다.
본 발명의 또 다른 실시양태는 EGFL7 길항제로의 치료에 대한 암을 앓고 있는 환자의 반응성을 예측하는 방법을 제공한다. 방법은 환자로부터 수득한 샘플에서 VEGF-C의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 VEGF-C의 증가된 발현 수준은 환자가 EGFL7 길항제로의 치료에 대해 반응성일 가능성이 더 크다는 것을 나타낸다.
본 발명의 또 다른 실시양태는 환자가 EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 나타낼 가능성을 결정하는 방법을 제공한다. 방법은 환자로부터 수득한 샘플에서 VEGF-C의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 VEGF-C의 증가된 발현 수준은 환자가 EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 가능성이 증가하였다는 것을 나타낸다.
본 발명의 또 다른 실시양태는 EGFL7 길항제의 치료 효능을 최적화하는 방법을 제공한다. 방법은 환자로부터 수득한 샘플에서 VEGF-C의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 VEGF-C의 증가된 발현 수준은 환자가 EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 가능성이 증가하였다는 것을 나타낸다.
본 발명의 추가의 실시양태는 환자에서 세포 증식성 장애를 치료하는 방법을 제공한다. 방법은 환자로부터 수득한 샘플이 참조 샘플과 비교하여 VEGF-C의 증가된 발현 수준을 갖는지 결정하는 것, 및 환자에게 유효량의 EGFL7 길항제를 투여하여 세포 증식성 장애를 치료하는 것을 포함한다.
본 발명의 또 다른 실시양태는 EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 수 있는 암을 앓고 있는 환자를 확인하는 방법을 제공한다. 방법은 환자로부터 수득한 샘플에서 BV8의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 BV8의 증가된 발현 수준은 환자가 EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 수 있다는 것을 나타낸다.
본 발명의 또 다른 실시양태는 EGFL7 길항제로의 치료에 대한 암을 앓고 있는 환자의 반응성을 예측하는 방법을 제공한다. 방법은 환자로부터 수득한 샘플에서 BV8의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 BV8의 증가된 발현 수준은 환자가 EGFL7 길항제로의 치료에 대해 반응성일 가능성이 더 크다는 것을 나타낸다.
본 발명의 또 다른 실시양태는 환자가 EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 나타낼 가능성을 결정하는 방법을 제공한다. 방법은 환자로부터 수득한 샘플에서 BV8의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 BV8의 증가된 발현 수준은 환자가 EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 가능성이 증가하였다는 것을 나타낸다.
본 발명의 또 다른 실시양태는 EGFL7 길항제의 치료 효능을 최적화하는 방법을 제공한다. 방법은 환자로부터 수득한 샘플에서 BV8의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 BV8의 증가된 발현 수준은 환자가 EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 가능성이 증가하였다는 것을 나타낸다.
본 발명의 다른 추가의 실시양태는 환자에서 세포 증식성 장애를 치료하는 방법을 제공한다. 방법은 환자로부터 수득한 샘플이 참조 샘플과 비교하여 BV8의 증가된 발현 수준을 갖는지 결정하는 것, 및 환자에게 유효량의 EGFL7 길항제를 투여하여 세포 증식성 장애를 치료하는 것을 포함한다.
본 발명의 또 다른 실시양태는 EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 수 있는 암을 앓고 있는 환자를 확인하는 방법을 제공한다. 방법은 환자로부터 수득한 샘플에서 CSF2의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 CSF2의 증가된 발현 수준은 환자가 EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 수 있다는 것을 나타낸다.
본 발명의 또 다른 실시양태는 EGFL7 길항제로의 치료에 대한 암을 앓고 있는 환자의 반응성을 예측하는 방법을 제공한다. 방법은 환자로부터 수득한 샘플에서 CSF2의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 CSF2의 증가된 발현 수준은 환자가 EGFL7 길항제로의 치료에 대해 반응성일 가능성이 더 크다는 것을 나타낸다.
본 발명의 추가의 실시양태는 환자가 EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 나타낼 가능성을 결정하는 방법을 제공한다. 방법은 환자로부터 수득한 샘플에서 CSF2의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 CSF2의 증가된 발현 수준은 환자가 EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 가능성이 증가하였다는 것을 나타낸다.
본 발명의 추가의 실시양태는 EGFL7 길항제의 치료 효능을 최적화하는 방법을 제공한다. 방법은 환자로부터 수득한 샘플에서 CSF2의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 CSF2의 증가된 발현 수준은 환자가 EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 가능성이 증가하였다는 것을 나타낸다.
다른 추가의 실시양태는 환자에서 세포 증식성 장애를 치료하는 방법을 제공한다. 방법은 환자로부터 수득한 샘플이 참조 샘플과 비교하여 CSF2의 증가된 발현 수준을 갖는지 결정하는 것, 및 환자에게 유효량의 EGFL7 길항제를 투여하여 세포 증식성 장애를 치료하는 것을 포함한다.
본 발명의 또 다른 실시양태는 EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 수 있는 암을 앓고 있는 환자를 확인하는 방법을 제공한다. 방법은 환자로부터 수득한 샘플에서 TNFα의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 TNFα의 증가된 발현 수준은 환자가 EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 수 있다는 것을 나타낸다.
본 발명의 또 다른 실시양태는 EGFL7 길항제로의 치료에 대한 암을 앓고 있는 환자의 반응성을 예측하는 방법을 제공한다. 방법은 환자로부터 수득한 샘플에서 TNFα의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 TNFα의 증가된 발현 수준은 환자가 EGFL7 길항제로의 치료에 대해 반응성일 가능성이 더 크다는 것을 나타낸다.
본 발명의 또 다른 실시양태는 환자가 EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 나타낼 가능성을 결정하는 방법을 제공한다. 방법은 환자로부터 수득한 샘플에서 TNFα의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 TNFα의 증가된 발현 수준은 환자가 EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 가능성이 증가하였다는 것을 나타낸다.
본 발명의 또 다른 실시양태는 EGFL7 길항제의 치료 효능을 최적화하는 방법을 제공한다. 방법은 환자로부터 수득한 샘플에서 TNFα의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 TNFα의 증가된 발현 수준은 환자가 EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 가능성이 증가하였다는 것을 나타낸다.
본 발명의 추가의 실시양태는 환자에서 세포 증식성 장애를 치료하는 방법을 제공한다. 방법은 환자로부터 수득한 샘플이 참조 샘플과 비교하여 TNFα의 증가된 발현 수준을 갖는지 결정하는 것, 및 환자에게 유효량의 EGFL7 길항제를 투여하여 세포 증식성 장애를 치료하는 것을 포함한다.
본 발명의 다른 추가의 실시양태는 EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 수 있는 암을 앓고 있는 환자를 확인하는 방법을 제공한다. 방법은 환자로부터 수득한 샘플에서 Sema3B의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 Sema3B의 감소된 발현 수준은 환자가 EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 수 있다는 것을 나타낸다.
본 발명의 다른 추가의 실시양태는 EGFL7 길항제로의 치료에 대한 암을 앓고 있는 환자의 반응성을 예측하는 방법을 제공한다. 방법은 환자로부터 수득한 샘플에서 Sema3B의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 Sema3B의 감소된 발현 수준은 환자가 EGFL7 길항제로의 치료에 대해 반응성일 가능성이 더 크다는 것을 나타낸다.
본 발명의 또 다른 실시양태는 환자가 EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 나타낼 가능성을 결정하는 방법을 제공한다. 방법은 환자로부터 수득한 샘플에서 Sema3B의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 Sema3B의 감소된 발현 수준은 환자가 EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 가능성이 증가하였다는 것을 나타낸다.
본 발명의 또 다른 실시양태는 EGFL7 길항제의 치료 효능을 최적화하는 방법을 제공한다. 방법은 환자로부터 수득한 샘플에서 Sema3B의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 Sema3B의 감소된 발현 수준은 환자가 EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 가능성이 증가하였다는 것을 나타낸다.
본 발명의 또 다른 실시양태는 환자에서 세포 증식성 장애를 치료하는 방법을 제공한다. 방법은 환자로부터 수득한 샘플이 참조 샘플과 비교하여 Sema3B의 감소된 발현 수준을 갖는지 결정하는 것, 및 환자에게 유효량의 EGFL7 길항제를 투여하여 세포 증식성 장애를 치료하는 것을 포함한다.
본 발명의 또 다른 실시양태는 EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 수 있는 암을 앓고 있는 환자를 확인하는 방법을 제공한다. 방법은 환자로부터 수득한 샘플에서 FGF9의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 FGF9의 감소된 발현 수준은 환자가 EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 수 있다는 것을 나타낸다.
본 발명의 추가의 실시양태는 EGFL7 길항제로의 치료에 대한 암을 앓고 있는 환자의 반응성을 예측하는 방법을 제공한다. 방법은 환자로부터 수득한 샘플에서 FGF9의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 FGF9의 감소된 발현 수준은 환자가 EGFL7 길항제로의 치료에 대해 반응성일 가능성이 더 크다는 것을 나타낸다.
본 발명의 다른 추가의 실시양태는 환자가 EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 나타낼 가능성을 결정하는 방법을 제공한다. 방법은 환자로부터 수득한 샘플에서 FGF9의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 FGF9의 감소된 발현 수준은 환자가 EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 가능성이 증가하였다는 것을 나타낸다.
본 발명의 다른 추가의 실시양태는 EGFL7 길항제의 치료 효능을 최적화하는 방법을 제공한다. 방법은 환자로부터 수득한 샘플에서 FGF9의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 FGF9의 감소된 발현 수준은 환자가 EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 가능성이 증가하였다는 것을 나타낸다.
본 발명의 또 다른 실시양태는 환자에서 세포 증식성 장애를 치료하는 방법을 제공한다. 방법은 환자로부터 수득한 샘플이 참조 샘플과 비교하여 FGF9의 감소된 발현 수준을 갖는지 결정하는 것, 및 환자에게 유효량의 EGFL7 길항제를 투여하여 세포 증식성 장애를 치료하는 것을 포함한다.
본 발명의 또 다른 실시양태는 EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 수 있는 암을 앓고 있는 환자를 확인하는 방법을 제공한다. 방법은 환자로부터 수득한 샘플에서 HGF의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 HGF의 감소된 발현 수준은 환자가 EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 수 있다는 것을 나타낸다.
본 발명의 또 다른 실시양태는 EGFL7 길항제로의 치료에 대한 암을 앓고 있는 환자의 반응성을 예측하는 방법을 제공한다. 방법은 환자로부터 수득한 샘플에서 HGF의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 HGF의 감소된 발현 수준은 환자가 EGFL7 길항제로의 치료에 대해 반응성일 가능성이 더 크다는 것을 나타낸다.
본 발명의 추가의 실시양태는 환자가 EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 나타낼 가능성을 결정하는 방법을 제공한다. 방법은 환자로부터 수득한 샘플에서 HGF의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 HGF의 감소된 발현 수준은 환자가 EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 가능성이 증가하였다는 것을 나타낸다.
본 발명의 추가의 실시양태는 EGFL7 길항제의 치료 효능을 최적화하는 방법을 제공한다. 방법은 환자로부터 수득한 샘플에서 HGF의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 HGF의 감소된 발현 수준은 환자가 EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 가능성이 증가하였다는 것을 나타낸다.
본 발명의 다른 추가의 실시양태는 환자에서 세포 증식성 장애를 치료하는 방법을 제공한다. 방법은 환자로부터 수득한 샘플이 참조 샘플과 비교하여 HGF의 감소된 발현 수준을 갖는지 결정하는 것, 및 환자에게 유효량의 EGFL7 길항제를 투여하여 세포 증식성 장애를 치료하는 것을 포함한다.
본 발명의 또 다른 실시양태는 EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 수 있는 암을 앓고 있는 환자를 확인하는 방법을 제공한다. 방법은 환자로부터 수득한 샘플에서 RGS5의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 RGS5의 감소된 발현 수준은 환자가 EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 수 있다는 것을 나타낸다.
본 발명의 또 다른 실시양태는 EGFL7 길항제로의 치료에 대한 암을 앓고 있는 환자의 반응성을 예측하는 방법을 제공한다. 방법은 환자로부터 수득한 샘플에서 RGS5의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 RGS5의 감소된 발현 수준은 환자가 EGFL7 길항제로의 치료에 대해 반응성일 가능성이 더 크다는 것을 나타낸다.
본 발명의 추가의 실시양태는 환자가 EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 나타낼 가능성을 결정하는 방법을 제공한다. 방법은 환자로부터 수득한 샘플에서 RGS5의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 RGS5의 감소된 발현 수준은 환자가 EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 가능성이 증가하였다는 것을 나타낸다.
본 발명의 추가의 실시양태는 EGFL7 길항제의 치료 효능을 최적화하는 방법을 제공한다. 방법은 환자로부터 수득한 샘플에서 RGS5의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 RGS5의 감소된 발현 수준은 환자가 EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 가능성이 증가하였다는 것을 나타낸다.
본 발명의 다른 추가의 실시양태는 환자에서 세포 증식성 장애를 치료하는 방법을 제공한다. 방법은 환자로부터 수득한 샘플이 참조 샘플과 비교하여 RGS5의 감소된 발현 수준을 갖는지 결정하는 것, 및 환자에게 유효량의 EGFL7 길항제를 투여하여 세포 증식성 장애를 치료하는 것을 포함한다.
본 발명의 다른 추가의 실시양태는 EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 수 있는 암을 앓고 있는 환자를 확인하는 방법을 제공한다. 방법은 환자로부터 수득한 샘플에서 NRP1의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 NRP1의 감소된 발현 수준은 환자가 EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 수 있다는 것을 나타낸다.
본 발명의 또 다른 실시양태는 EGFL7 길항제로의 치료에 대한 암을 앓고 있는 환자의 반응성을 예측하는 방법을 제공한다. 방법은 환자로부터 수득한 샘플에서 NRP1의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 NRP1의 감소된 발현 수준은 환자가 EGFL7 길항제로의 치료에 대해 반응성일 가능성이 더 크다는 것을 나타낸다.
본 발명의 또 다른 실시양태는 환자가 EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 나타낼 가능성을 결정하는 방법을 제공한다. 방법은 환자로부터 수득한 샘플에서 NRP1의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 NRP1의 감소된 발현 수준은 환자가 EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 가능성이 증가하였다는 것을 나타낸다.
본 발명의 또 다른 실시양태는 EGFL7 길항제의 치료 효능을 최적화하는 방법을 제공한다. 방법은 환자로부터 수득한 샘플에서 NRP1의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 NRP1의 감소된 발현 수준은 환자가 EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 가능성이 증가하였다는 것을 나타낸다.
본 발명의 또 다른 실시양태는 환자에서 세포 증식성 장애를 치료하는 방법을 제공한다. 방법은 환자로부터 수득한 샘플이 참조 샘플과 비교하여 NRP1의 감소된 발현 수준을 갖는지 결정하는 것, 및 환자에게 유효량의 EGFL7 길항제를 투여하여 세포 증식성 장애를 치료하는 것을 포함한다.
본 발명의 또 다른 실시양태는 EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 수 있는 암을 앓고 있는 환자를 확인하는 방법을 제공한다. 방법은 환자로부터 수득한 샘플에서 FGF2의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 FGF2의 감소된 발현 수준은 환자가 EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 수 있다는 것을 나타낸다.
본 발명의 또 다른 실시양태는 EGFL7 길항제로의 치료에 대한 암을 앓고 있는 환자의 반응성을 예측하는 방법을 제공한다. 방법은 환자로부터 수득한 샘플에서 FGF2의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 FGF2의 감소된 발현 수준은 환자가 EGFL7 길항제로의 치료에 대해 반응성일 가능성이 더 크다는 것을 나타낸다.
본 발명의 추가의 실시양태는 환자가 EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 나타낼 가능성을 결정하는 방법을 제공한다. 방법은 환자로부터 수득한 샘플에서 FGF2의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 FGF2의 감소된 발현 수준은 환자가 EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 가능성이 증가하였다는 것을 나타낸다.
본 발명의 추가의 실시양태는 EGFL7 길항제의 치료 효능을 최적화하는 방법을 제공한다. 방법은 환자로부터 수득한 샘플에서 FGF2의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 FGF2의 감소된 발현 수준은 환자가 EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 가능성이 증가하였다는 것을 나타낸다.
본 발명의 다른 추가의 실시양태는 환자에서 세포 증식성 장애를 치료하는 방법을 제공한다. 방법은 환자로부터 수득한 샘플이 참조 샘플과 비교하여 FGF2의 감소된 발현 수준을 갖는지 결정하는 것, 및 환자에게 유효량의 EGFL7 길항제를 투여하여 세포 증식성 장애를 치료하는 것을 포함한다.
본 발명의 다른 추가의 실시양태는 EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 수 있는 암을 앓고 있는 환자를 확인하는 방법을 제공한다. 방법은 환자로부터 수득한 샘플에서 CXCR4의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 CXCR4의 감소된 발현 수준은 환자가 EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 수 있다는 것을 나타낸다.
본 발명의 또 다른 실시양태는 EGFL7 길항제로의 치료에 대한 암을 앓고 있는 환자의 반응성을 예측하는 방법을 제공한다. 방법은 환자로부터 수득한 샘플에서 CXCR4의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 CXCR4의 감소된 발현 수준은 환자가 EGFL7 길항제로의 치료에 대해 반응성일 가능성이 더 크다는 것을 나타낸다.
본 발명의 또 다른 실시양태는 환자가 EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 나타낼 가능성을 결정하는 방법을 제공한다. 방법은 환자로부터 수득한 샘플에서 CXCR4의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 CXCR4의 감소된 발현 수준은 환자가 EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 가능성이 증가하였다는 것을 나타낸다.
본 발명의 또 다른 실시양태는 EGFL7 길항제의 치료 효능을 최적화하는 방법을 제공한다. 방법은 환자로부터 수득한 샘플에서 CXCR4의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 CXCR4의 감소된 발현 수준은 환자가 EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 가능성이 증가하였다는 것을 나타낸다.
본 발명의 또 다른 실시양태는 환자에서 세포 증식성 장애를 치료하는 방법을 제공한다. 방법은 환자로부터 수득한 샘플이 참조 샘플과 비교하여 CXCR4의 감소된 발현 수준을 갖는지 결정하는 것, 및 환자에게 유효량의 EGFL7 길항제를 투여하여 세포 증식성 장애를 치료하는 것을 포함한다.
본 발명의 또 다른 실시양태는 EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 수 있는 암을 앓고 있는 환자를 확인하는 방법을 제공한다. 방법은 환자로부터 수득한 샘플에서 cMet의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 cMet의 감소된 발현 수준은 환자가 EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 수 있다는 것을 나타낸다.
본 발명의 또 다른 실시양태는 EGFL7 길항제로의 치료에 대한 암을 앓고 있는 환자의 반응성을 예측하는 방법을 제공한다. 방법은 환자로부터 수득한 샘플에서 cMet의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 cMet의 감소된 발현 수준은 환자가 EGFL7 길항제로의 치료에 대해 반응성일 가능성이 더 크다는 것을 나타낸다.
본 발명의 또 다른 실시양태는 환자가 EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 나타낼 가능성을 결정하는 방법을 제공한다. 방법은 환자로부터 수득한 샘플에서 cMet의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 cMet의 감소된 발현 수준은 환자가 EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 가능성이 증가하였다는 것을 나타낸다.
본 발명의 또 다른 실시양태는 EGFL7 길항제의 치료 효능을 최적화하는 방법을 제공한다. 방법은 환자로부터 수득한 샘플에서 cMet의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 cMet의 감소된 발현 수준은 환자가 EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 가능성이 증가하였다는 것을 나타낸다.
본 발명의 추가의 실시양태는 환자에서 세포 증식성 장애를 치료하는 방법을 제공한다. 방법은 환자로부터 수득한 샘플이 참조 샘플과 비교하여 cMet의 감소된 발현 수준을 갖는지 결정하는 것, 및 환자에게 유효량의 EGFL7 길항제를 투여하여 세포 증식성 장애를 치료하는 것을 포함한다.
본 발명의 다른 추가의 실시양태는 EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 수 있는 암을 앓고 있는 환자를 확인하는 방법을 제공한다. 방법은 환자로부터 수득한 샘플에서 FN1의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 FN1의 감소된 발현 수준은 환자가 EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 수 있다는 것을 나타낸다.
본 발명의 다른 추가의 실시양태는 EGFL7 길항제로의 치료에 대한 암을 앓고 있는 환자의 반응성을 예측하는 방법을 제공한다. 방법은 환자로부터 수득한 샘플에서 FN1의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 FN1의 감소된 발현 수준은 환자가 EGFL7 길항제로의 치료에 대해 반응성일 가능성이 더 크다는 것을 나타낸다.
본 발명의 또 다른 실시양태는 환자가 EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 나타낼 가능성을 결정하는 방법을 제공한다. 방법은 환자로부터 수득한 샘플에서 FN1의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 FN1의 감소된 발현 수준은 환자가 EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 가능성이 증가하였다는 것을 나타낸다.
본 발명의 또 다른 실시양태는 EGFL7 길항제의 치료 효능을 최적화하는 방법을 제공한다. 방법은 환자로부터 수득한 샘플에서 FN1의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 FN1의 감소된 발현 수준은 환자가 EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 가능성이 증가하였다는 것을 나타낸다.
본 발명의 또 다른 실시양태는 환자에서 세포 증식성 장애를 치료하는 방법을 제공한다. 방법은 환자로부터 수득한 샘플이 참조 샘플과 비교하여 FN1의 감소된 발현 수준을 갖는지 결정하는 것, 및 환자에게 유효량의 EGFL7 길항제를 투여하여 세포 증식성 장애를 치료하는 것을 포함한다.
본 발명의 또 다른 실시양태는 EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 수 있는 암을 앓고 있는 환자를 확인하는 방법을 제공한다. 방법은 환자로부터 수득한 샘플에서 피불린 2의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 피불린 2의 감소된 발현 수준은 환자가 EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 수 있다는 것을 나타낸다.
본 발명의 추가의 실시양태는 EGFL7 길항제로의 치료에 대한 암을 앓고 있는 환자의 반응성을 예측하는 방법을 제공한다. 방법은 환자로부터 수득한 샘플에서 피불린 2의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 피불린 2의 감소된 발현 수준은 환자가 EGFL7 길항제로의 치료에 대해 반응성일 가능성이 더 크다는 것을 나타낸다.
본 발명의 다른 추가의 실시양태는 환자가 EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 나타낼 가능성을 결정하는 방법을 제공한다. 방법은 환자로부터 수득한 샘플에서 피불린 2의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 피불린 2의 감소된 발현 수준은 환자가 EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 가능성이 증가하였다는 것을 나타낸다.
본 발명의 다른 추가의 실시양태는 EGFL7 길항제의 치료 효능을 최적화하는 방법을 제공한다. 방법은 환자로부터 수득한 샘플에서 피불린 2의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 피불린 2의 감소된 발현 수준은 환자가 EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 가능성이 증가하였다는 것을 나타낸다.
본 발명의 다른 추가의 실시양태는 환자에서 세포 증식성 장애를 치료하는 방법을 제공한다. 방법은 환자로부터 수득한 샘플이 참조 샘플과 비교하여 피불린 2의 감소된 발현 수준을 갖는지 결정하는 것, 및 환자에게 유효량의 EGFL7 길항제를 투여하여 세포 증식성 장애를 치료하는 것을 포함한다.
본 발명의 또 다른 실시양태는 EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 수 있는 암을 앓고 있는 환자를 확인하는 방법을 제공한다. 방법은 환자로부터 수득한 샘플에서 피불린 4의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 피불린 4의 감소된 발현 수준은 환자가 EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 수 있다는 것을 나타낸다.
본 발명의 또 다른 실시양태는 EGFL7 길항제로의 치료에 대한 암을 앓고 있는 환자의 반응성을 예측하는 방법을 제공한다. 방법은 환자로부터 수득한 샘플에서 피불린 4의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 피불린 4의 감소된 발현 수준은 환자가 EGFL7 길항제로의 치료에 대해 반응성일 가능성이 더 크다는 것을 나타낸다.
본 발명의 추가의 실시양태는 환자가 EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 나타낼 가능성을 결정하는 방법을 제공한다. 방법은 환자로부터 수득한 샘플에서 피불린 4의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 피불린 4의 감소된 발현 수준은 환자가 EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 가능성이 증가하였다는 것을 나타낸다.
본 발명의 추가의 실시양태는 EGFL7 길항제의 치료 효능을 최적화하는 방법을 제공한다. 방법은 환자로부터 수득한 샘플에서 피불린 4의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 피불린 4의 감소된 발현 수준은 환자가 EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 가능성이 증가하였다는 것을 나타낸다.
본 발명의 다른 추가의 실시양태는 환자에서 세포 증식성 장애를 치료하는 방법을 제공한다. 방법은 환자로부터 수득한 샘플이 참조 샘플과 비교하여 피불린 4의 감소된 발현 수준을 갖는지 결정하는 것, 및 환자에게 유효량의 EGFL7 길항제를 투여하여 세포 증식성 장애를 치료하는 것을 포함한다.
본 발명의 다른 추가의 실시양태는 EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 수 있는 암을 앓고 있는 환자를 확인하는 방법을 제공한다. 방법은 환자로부터 수득한 샘플에서 MFAP5의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 MFAP5의 감소된 발현 수준은 환자가 EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 수 있다는 것을 나타낸다.
본 발명의 또 다른 실시양태는 EGFL7 길항제로의 치료에 대한 암을 앓고 있는 환자의 반응성을 예측하는 방법을 제공한다. 방법은 환자로부터 수득한 샘플에서 MFAP5의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 MFAP5의 감소된 발현 수준은 환자가 EGFL7 길항제로의 치료에 대해 반응성일 가능성이 더 크다는 것을 나타낸다.
본 발명의 또 다른 실시양태는 환자가 EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 나타낼 가능성을 결정하는 방법을 제공한다. 방법은 환자로부터 수득한 샘플에서 MFAP5의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 MFAP5의 감소된 발현 수준은 환자가 EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 가능성이 증가하였다는 것을 나타낸다.
본 발명의 또 다른 실시양태는 EGFL7 길항제의 치료 효능을 최적화하는 방법을 제공한다. 방법은 환자로부터 수득한 샘플에서 MFAP5의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 MFAP5의 감소된 발현 수준은 환자가 EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 가능성이 증가하였다는 것을 나타낸다.
본 발명의 또 다른 실시양태는 환자에서 세포 증식성 장애를 치료하는 방법을 제공한다. 방법은 환자로부터 수득한 샘플이 참조 샘플과 비교하여 MFAP5의 감소된 발현 수준을 갖는지 결정하는 것, 및 환자에게 유효량의 EGFL7 길항제를 투여하여 세포 증식성 장애를 치료하는 것을 포함한다.
본 발명의 추가의 실시양태는 EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 수 있는 암을 앓고 있는 환자를 확인하는 방법을 제공한다. 방법은 환자로부터 수득한 샘플에서 PDGF-C의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 PDGF-C의 감소된 발현 수준은 환자가 EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 수 있다는 것을 나타낸다.
본 발명의 다른 추가의 실시양태는 EGFL7 길항제로의 치료에 대한 암을 앓고 있는 환자의 반응성을 예측하는 방법을 제공한다. 방법은 환자로부터 수득한 샘플에서 PDGF-C의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 PDGF-C의 감소된 발현 수준은 환자가 EGFL7 길항제로의 치료에 대해 반응성일 가능성이 더 크다는 것을 나타낸다.
본 발명의 다른 추가의 실시양태는 환자가 EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 나타낼 가능성을 결정하는 방법을 제공한다. 방법은 환자로부터 수득한 샘플에서 PDGF-C의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 PDGF-C의 감소된 발현 수준은 환자가 EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 가능성이 증가하였다는 것을 나타낸다.
본 발명의 다른 추가의 실시양태는 EGFL7 길항제의 치료 효능을 최적화하는 방법을 제공한다. 방법은 환자로부터 수득한 샘플에서 PDGF-C의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 PDGF-C의 감소된 발현 수준은 환자가 EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 가능성이 증가하였다는 것을 나타낸다.
본 발명의 또 다른 실시양태는 환자에서 세포 증식성 장애를 치료하는 방법을 제공한다. 방법은 환자로부터 수득한 샘플이 참조 샘플과 비교하여 PDGF-C의 감소된 발현 수준을 갖는지 결정하는 것, 및 환자에게 유효량의 EGFL7 길항제를 투여하여 세포 증식성 장애를 치료하는 것을 포함한다.
본 발명의 또 다른 실시양태는 EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 수 있는 암을 앓고 있는 환자를 확인하는 방법을 제공한다. 방법은 환자로부터 수득한 샘플에서 Sema3F의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 Sema3F의 감소된 발현 수준은 환자가 EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 수 있다는 것을 나타낸다.
본 발명의 또 다른 실시양태는 EGFL7 길항제로의 치료에 대한 암을 앓고 있는 환자의 반응성을 예측하는 방법을 제공한다. 방법은 환자로부터 수득한 샘플에서 Sema3F의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 Sema3F의 감소된 발현 수준은 환자가 EGFL7 길항제로의 치료에 대해 반응성일 가능성이 더 크다는 것을 나타낸다.
본 발명의 추가의 실시양태는 환자가 EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 나타낼 가능성을 결정하는 방법을 제공한다. 방법은 환자로부터 수득한 샘플에서 Sema3F의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 Sema3F의 감소된 발현 수준은 환자가 EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 가능성이 증가하였다는 것을 나타낸다.
본 발명의 추가의 실시양태는 EGFL7 길항제의 치료 효능을 최적화하는 방법을 제공한다. 방법은 환자로부터 수득한 샘플에서 Sema3F의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 Sema3F의 감소된 발현 수준은 환자가 EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 가능성이 증가하였다는 것을 나타낸다.
본 발명의 다른 추가의 실시양태는 환자에서 세포 증식성 장애를 치료하는 방법을 제공한다. 방법은 환자로부터 수득한 샘플이 참조 샘플과 비교하여 Sema3F의 감소된 발현 수준을 갖는지 결정하는 것, 및 환자에게 유효량의 EGFL7 길항제를 투여하여 세포 증식성 장애를 치료하는 것을 포함한다.
본 발명의 일부 실시양태에서, EGFL7 길항제는 항-EGFL7 항체이다. 본 발명의 일부 실시양태에서, 방법은 환자에게 VEGF-A 길항제를 투여하는 것을 더 포함한다. 본 발명의 일부 실시양태에서, VEGF-A 길항제 및 EGFL7 길항제는 동시에 투여한다. 본 발명의 일부 실시양태에서, VEGF-A 길항제 및 EGFL7 길항제는 순차적으로 투여한다. 본 발명의 일부 실시양태에서, VEGF-A 길항제는 항-VEGF-A 항체이다. 본 발명의 일부 실시양태에서, 항-VEGF-A 항체는 베바시주맙이다.
본 발명의 또 다른 실시양태는 VEGF-C, BV8, CSF2, TNFα, CXCL2, PDGF-C 및 민클로부터 선택된 하나 이상의 유전자의 발현 수준을 결정하기 위한 키트를 제공한다. 키트는 VEGF-C, BV8, CSF2, TNFα, CXCL2, PDGF-C 및 민클로부터 선택된 하나 이상의 유전자에 특이적으로 혼성화할 수 있는 폴리뉴클레오티드를 포함하는 어레이 및 EGFL7 길항제로의 치료에 대한 환자의 반응성을 예측하기 위해 하나 이상의 유전자의 발현 수준을 결정하는데 어레이를 사용하기 위한 설명서를 포함하고, 여기서 참조 샘플에서 하나 이상의 유전자의 발현 수준과 비교하여 하나 이상의 유전자의 발현 수준의 증가는 환자가 EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 수 있다는 것을 나타낸다.
본 발명의 또 다른 실시양태는 Sema3B, FGF9, HGF, RGS5, NRP1, FGF2, CXCR4, cMet, FN1, 피불린 2, 피불린 4/EFEMP2, MFAP5, PDGF-C, Sema3F 및 FN1로부터 선택된 하나 이상의 유전자의 발현 수준을 결정하기 위한 키트를 제공한다. 키트는 Sema3B, FGF9, HGF, RGS5, NRP1, FGF2, CXCR4, cMet, FN1, 피불린 2, 피불린 4/EFEMP2, MFAP5, PDGF-C, Sema3F 및 FN1로부터 선택된 하나 이상의 유전자에 특이적으로 혼성화할 수 있는 폴리뉴클레오티드를 포함하는 어레이 및 EGFL7 길항제로의 치료에 대한 환자의 반응성을 예측하기 위해 하나 이상의 유전자의 발현 수준을 결정하는데 어레이를 사용하기 위한 설명서를 포함하고, 여기서 참조 샘플에서 하나 이상의 유전자의 발현 수준과 비교하여 하나 이상의 유전자의 발현 수준의 감소는 환자가 EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 수 있다는 것을 나타낸다.
본 발명의 또 다른 실시양태는 VEGF-C, BV8, CSF2, TNFα, CXCL2, PDGF-C 및 민클로부터 선택된 하나 이상의 유전자의 발현 수준을 검출할 수 있는 화합물의 세트를 제공한다. 세트는 VEGF-C, BV8, CSF2, TNFα, CXCL2, PDGF-C 및 민클로부터 선택된 하나 이상의 유전자에 특이적으로 혼성화할 수 있는 하나 이상의 화합물을 포함하고, 여기서 참조 샘플에서 하나 이상의 유전자의 발현 수준과 비교하여 하나 이상의 유전자의 발현 수준의 증가는 환자가 EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 수 있다는 것을 나타낸다. 본 발명의 일부 실시양태에서, 화합물은 폴리뉴클레오티드이다. 본 발명의 일부 실시양태에서, 폴리뉴클레오티드는 표 2에 열거된 3개의 서열을 포함한다. 본 발명의 일부 실시양태에서, 화합물은 단백질, 예를 들어 항체이다.
본 발명의 추가의 실시양태는 Sema3B, FGF9, HGF, RGS5, NRP1, FGF2, CXCR4, cMet, FN1, 피불린 2, 피불린 4/EFEMP2, MFAP5, PDGF-C, Sema3F 및 FN1로부터 선택된 하나 이상의 유전자의 발현 수준을 검출할 수 있는 화합물의 세트를 제공한다. 세트는 Sema3B, FGF9, HGF, RGS5, NRP1, FGF2, CXCR4, cMet, FN1, 피불린 2, 피불린 4/EFEMP2, MFAP5, PDGF-C, Sema3F 및 FN1로부터 선택된 하나 이상의 유전자에 특이적으로 혼성화하는 하나 이상의 화합물을 포함하고, 여기서 참조 샘플에서 하나 이상의 유전자의 발현 수준과 비교하여 하나 이상의 유전자의 발현 수준의 감소는 환자가 EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 수 있다는 것을 나타낸다. 본 발명의 일부 실시양태에서, 화합물은 폴리뉴클레오티드이다. 본 발명의 일부 실시양태에서, 폴리뉴클레오티드는 표 2에 열거된 3개의 서열을 포함한다. 본 발명의 일부 실시양태에서, 화합물은 단백질, 예를 들어 항체이다.
상기 및 다른 본 발명의 실시양태가 하기 상세한 설명에 추가로 기재된다.
도 1은 다양한 종양 이종이식편 모델에서 종양 성장을 억제하는데 있어 항-VEGF 항체 및 항-NRP1 항체로의 조합 치료의 효능을 보여주는 표이다.
도 2는 마커 RNA 발현 (qPCR)의 상관관계에 대한 p- 및 r-값 및 항-VEGF 항체 및 항-NRP1 항체로의 조합 치료의 효능을 보여주는 표이다.
도 3은 항-VEGF 항체 및 항-NRP1 항체로의 조합 치료의 개선된 효능 대 TGFβ1 (형질전환 성장 인자 β1)의 상대적 발현을 보여주는 그래프이다.
도 4는 항-VEGF 항체 및 항-NRP1 항체로의 조합 치료의 개선된 효능 대 Bv8/프로키네티신 2의 상대적 발현을 보여주는 그래프이다.
도 5는 항-VEGF 항체 및 항-NRP1 항체로의 조합 치료의 개선된 효능 대 Sema3A (세마포린3A)의 상대적 발현을 보여주는 그래프이다.
도 6은 항-VEGF 항체 및 항-NRP1 항체로의 조합 치료의 개선된 효능 대 PlGF (태반 성장 인자)의 상대적 발현을 보여주는 그래프이다.
도 7은 항-VEGF 항체 및 항-NRP1 항체로의 조합 치료의 개선된 효능 대 LGALS1 (갈렉틴-1)의 상대적 발현을 보여주는 그래프이다.
도 8은 항-VEGF 항체 및 항-NRP1 항체로의 조합 치료의 개선된 효능 대 ITGa5 (인테그린 알파 5)의 상대적 발현을 보여주는 그래프이다.
도 9는 항-VEGF 항체 및 항-NRP1 항체로의 조합 치료의 개선된 효능 대 CSF2/GM-CSF (콜로니 자극 인자 2/과립구 대식세포 콜로니-자극 인자)의 상대적 발현을 보여주는 그래프이다.
도 10은 항-VEGF 항체 및 항-NRP1 항체로의 조합 치료의 개선된 효능 대 Prox1 (프로스페로-관련 호메오박스 1)의 상대적 발현을 보여주는 그래프이다.
도 11은 항-VEGF 항체 및 항-NRP1 항체로의 조합 치료의 개선된 효능 대 RGS5 (G-단백질 신호전달 5의 조절제)의 상대적 발현을 보여주는 그래프이다.
도 12는 항-VEGF 항체 및 항-NRP1 항체로의 조합 치료의 개선된 효능 대 HGF (간세포 성장 인자)의 상대적 발현을 보여주는 그래프이다.
도 13은 항-VEGF 항체 및 항-NRP1 항체로의 조합 치료의 개선된 효능 대 Sema3B (세마포린 3B)의 상대적 발현을 보여주는 그래프이다.
도 14는 항-VEGF 항체 및 항-NRP1 항체로의 조합 치료의 개선된 효능 대 Sema3F (세마포린 3F)의 상대적 발현을 보여주는 그래프이다.
도 15는 항-VEGF 항체 및 항-NRP1 항체로의 조합 치료의 개선된 효능 대 LGALS7 (갈렉틴-7)의 상대적 발현을 보여주는 그래프이다.
도 16은 다양한 종양 이종이식편 모델에서 종양 성장을 억제하는데 있어 항-VEGF-A 항체 및 항-VEGF-C 항체로의 조합 치료의 효능을 보여주는 표이다.
도 17은 마커 RNA 발현 (qPCR)의 상관관계에 대한 p- 및 r-값 및 항-VEGF-A 항체 및 항-VEGF-C 항체로의 조합 치료의 효능을 보여주는 표이다.
도 18은 항-VEGF-A 항체 및 항-VEGF-C 항체로의 조합 치료의 개선된 효능 대 VEGF-A의 상대적 발현을 보여주는 그래프이다.
도 19는 항-VEGF-A 항체 및 항-VEGF-C 항체로의 조합 치료의 개선된 효능 대 VEGF-C의 상대적 발현을 보여주는 그래프이다.
도 20은 항-VEGF-A 항체 및 항-VEGF-C 항체로의 조합 치료의 개선된 효능 대 VEGF-D의 상대적 발현을 보여주는 그래프이다.
도 21은 항-VEGF-A 항체 및 항-VEGF-C 항체로의 조합 치료의 개선된 효능 대 VEGFR3의 상대적 발현을 보여주는 그래프이다.
도 22는 항-VEGF-A 항체 및 항-VEGF-C 항체로의 조합 치료의 개선된 효능 대 FGF2의 상대적 발현을 보여주는 그래프이다.
도 23은 항-VEGF-A 항체 및 항-VEGF-C 항체로의 조합 치료의 개선된 효능 대 CSF2 (콜로니 자극 인자 2)의 상대적 발현을 보여주는 그래프이다.
도 24는 항-VEGF-A 항체 및 항-VEGF-C 항체로의 조합 치료의 개선된 효능 대 ICAM1의 상대적 발현을 보여주는 그래프이다.
도 25는 항-VEGF-A 항체 및 항-VEGF-C 항체로의 조합 치료의 개선된 효능 대 RGS5 (G-단백질 신호전달 5의 조절제)의 상대적 발현을 보여주는 그래프이다.
도 26은 항-VEGF-A 항체 및 항-VEGF-C 항체로의 조합 치료의 개선된 효능 대 ESM1의 상대적 발현을 보여주는 그래프이다.
도 27은 항-VEGF-A 항체 및 항-VEGF-C 항체로의 조합 치료의 개선된 효능 대 Prox1 (프로스페로-관련 호메오박스 1)의 상대적 발현을 보여주는 그래프이다.
도 28은 항-VEGF-A 항체 및 항-VEGF-C 항체로의 조합 치료의 개선된 효능 대 PlGF의 상대적 발현을 보여주는 그래프이다.
도 29는 항-VEGF-A 항체 및 항-VEGF-C 항체로의 조합 치료의 개선된 효능 대 ITGa5의 상대적 발현을 보여주는 그래프이다.
도 30은 항-VEGF-A 항체 및 항-VEGF-C 항체로의 조합 치료의 개선된 효능 대 TGF-β의 상대적 발현을 보여주는 그래프이다.
도 31은 다양한 종양 이종이식편 모델에서 종양 성장을 억제하는데 있어 항-VEGF-A 항체 및 항-EGFL7 항체로의 조합 치료의 효능을 보여주는 표이다.
도 32는 마커 RNA 발현 (qPCR)의 상관관계에 대한 p- 및 r-값 및 항-VEGF-A 항체 및 항-EGFL7 항체로의 조합 치료의 효능을 보여주는 표이다.
도 33은 항-VEGF-A 항체 및 항-EGFL7 항체로의 조합 치료의 개선된 효능 대 Sema3B의 상대적 발현을 보여주는 그래프이다.
도 34는 항-VEGF-A 항체 및 항-EGFL7 항체로의 조합 치료의 개선된 효능 대 FGF9의 상대적 발현을 보여주는 그래프이다.
도 35는 항-VEGF-A 항체 및 항-EGFL7 항체로의 조합 치료의 개선된 효능 대 HGF의 상대적 발현을 보여주는 그래프이다.
도 36은 항-VEGF-A 항체 및 항-EGFL7 항체로의 조합 치료의 개선된 효능 대 VEGF-C의 상대적 발현을 보여주는 그래프이다.
도 37은 항-VEGF-A 항체 및 항-EGFL7 항체로의 조합 치료의 개선된 효능 대 RGS5의 상대적 발현을 보여주는 그래프이다.
도 38은 항-VEGF-A 항체 및 항-EGFL7 항체로의 조합 치료의 개선된 효능 대 NRP1의 상대적 발현을 보여주는 그래프이다.
도 39는 항-VEGF-A 항체 및 항-EGFL7 항체로의 조합 치료의 개선된 효능 대 FGF2의 상대적 발현을 보여주는 그래프이다.
도 40은 항-VEGF-A 항체 및 항-EGFL7 항체로의 조합 치료의 개선된 효능 대 CSF2의 상대적 발현을 보여주는 그래프이다.
도 41은 항-VEGF-A 항체 및 항-EGFL7 항체로의 조합 치료의 개선된 효능 대 Bv8의 상대적 발현을 보여주는 그래프이다.
도 42는 항-VEGF-A 항체 및 항-EGFL7 항체로의 조합 치료의 개선된 효능 대 CXCR4의 상대적 발현을 보여주는 그래프이다.
도 43은 항-VEGF-A 항체 및 항-EGFL7 항체로의 조합 치료의 개선된 효능 대 TNFa의 상대적 발현을 보여주는 그래프이다.
도 44는 항-VEGF-A 항체 및 항-EGFL7 항체로의 조합 치료의 개선된 효능 대 cMet의 상대적 발현을 보여주는 그래프이다.
도 45는 항-VEGF-A 항체 및 항-EGFL7 항체로의 조합 치료의 개선된 효능 대 FN1의 상대적 발현을 보여주는 그래프이다.
도 46은 항-VEGF-A 항체 및 항-EGFL7 항체로의 조합 치료의 개선된 효능 대 피불린 2의 상대적 발현을 보여주는 그래프이다.
도 47은 항-VEGF-A 항체 및 항-EGFL7 항체로의 조합 치료의 개선된 효능 대 피불린 4의 상대적 발현을 보여주는 그래프이다.
도 48은 항-VEGF-A 항체 및 항-EGFL7 항체로의 조합 치료의 개선된 효능 대 MFAP5의 상대적 발현을 보여주는 그래프이다.
도 49는 항-VEGF-A 항체 및 항-EGFL7 항체로의 조합 치료의 개선된 효능 대 PDGF-C의 상대적 발현을 보여주는 그래프이다.
도 50은 다양한 종양 이종이식편 모델에서 종양 성장을 억제하는데 있어 항-VEGF 항체 및 항-NRP1 항체로의 조합 치료의 효능을 보여주는 표이다.
도 51은 마커 RNA 발현 (qPCR)의 상관관계에 대한 p- 및 r-값 및 항-VEGF 항체 및 항-NRP1 항체로의 조합 치료의 효능을 보여주는 표이다.
도 52는 항-VEGF 항체 및 항-NRP1 항체로의 조합 치료의 개선된 효능 대 Sema3B의 상대적 발현을 보여주는 그래프이다.
도 53은 항-VEGF 항체 및 항-NRP1 항체로의 조합 치료의 개선된 효능 대 TGFβ의 상대적 발현을 보여주는 그래프이다.
도 54는 항-VEGF 항체 및 항-NRP1 항체로의 조합 치료의 개선된 효능 대 FGFR4의 상대적 발현을 보여주는 그래프이다.
도 55는 항-VEGF 항체 및 항-NRP1 항체로의 조합 치료의 개선된 효능 대 비멘틴의 상대적 발현을 보여주는 그래프이다.
도 56은 항-VEGF 항체 및 항-NRP1 항체로의 조합 치료의 개선된 효능 대 Sema3A의 상대적 발현을 보여주는 그래프이다.
도 57은 항-VEGF 항체 및 항-NRP1 항체로의 조합 치료의 개선된 효능 대 PLC의 상대적 발현을 보여주는 그래프이다.
도 58은 항-VEGF 항체 및 항-NRP1 항체로의 조합 치료의 개선된 효능 대 CXCL5의 상대적 발현을 보여주는 그래프이다.
도 59는 항-VEGF 항체 및 항-NRP1 항체로의 조합 치료의 개선된 효능 대 ITGa5의 상대적 발현을 보여주는 그래프이다.
도 60은 항-VEGF 항체 및 항-NRP1 항체로의 조합 치료의 개선된 효능 대 PlGF의 상대적 발현을 보여주는 그래프이다.
도 61은 항-VEGF 항체 및 항-NRP1 항체로의 조합 치료의 개선된 효능 대 CCL2의 상대적 발현을 보여주는 그래프이다.
도 62는 항-VEGF 항체 및 항-NRP1 항체로의 조합 치료의 개선된 효능 대 IGFB4의 상대적 발현을 보여주는 그래프이다.
도 63은 항-VEGF 항체 및 항-NRP1 항체로의 조합 치료의 개선된 효능 대 LGALS1의 상대적 발현을 보여주는 그래프이다.
도 64는 항-VEGF 항체 및 항-NRP1 항체로의 조합 치료의 개선된 효능 대 HGF의 상대적 발현을 보여주는 그래프이다.
도 65는 항-VEGF 항체 및 항-NRP1 항체로의 조합 치료의 개선된 효능 대 TSP1의 상대적 발현을 보여주는 그래프이다.
도 66은 항-VEGF 항체 및 항-NRP1 항체로의 조합 치료의 개선된 효능 대 CXCL1의 상대적 발현을 보여주는 그래프이다.
도 67은 항-VEGF 항체 및 항-NRP1 항체로의 조합 치료의 개선된 효능 대 CXCL2의 상대적 발현을 보여주는 그래프이다.
도 68은 항-VEGF 항체 및 항-NRP1 항체로의 조합 치료의 개선된 효능 대 Alk1의 상대적 발현을 보여주는 그래프이다.
도 69는 항-VEGF 항체 및 항-NRP1 항체로의 조합 치료의 개선된 효능 대 FGF8의 상대적 발현을 보여주는 그래프이다.
도 70은 다양한 종양 이종이식편 모델에서 종양 성장을 억제하는데 있어 항-VEGF-A 항체 및 항-VEGF-C 항체로의 조합 치료의 효능을 보여주는 표이다.
도 71은 마커 RNA 발현 (qPCR)의 상관관계에 대한 값 및 항-VEGF-A 항체 및 항-VEGF-C 항체로의 조합 치료의 효능을 보여주는 표이다.
도 72는 항-VEGF-A 항체 및 항-VEGF-C 항체로의 조합 치료의 개선된 효능 대 VEGF-A의 상대적 발현을 보여주는 그래프이다.
도 73은 항-VEGF-A 항체 및 항-VEGF-C 항체로의 조합 치료의 개선된 효능 대 VEGF-C의 상대적 발현을 보여주는 그래프이다.
도 74는 항-VEGF-A 항체 및 항-VEGF-C 항체로의 조합 치료의 개선된 효능 대 VEGF-C의 상대적 발현을 보여주는 그래프이다.
도 75는 항-VEGF-A 항체 및 항-VEGF-C 항체로의 조합 치료의 개선된 효능 대 VEGF-D의 상대적 발현을 보여주는 그래프이다.
도 76은 항-VEGF-A 항체 및 항-VEGF-C 항체로의 조합 치료의 개선된 효능 대 VEGFR3의 상대적 발현을 보여주는 그래프이다.
도 77은 항-VEGF-A 항체 및 항-VEGF-C 항체로의 조합 치료의 개선된 효능 대 ESM1의 상대적 발현을 보여주는 그래프이다.
도 78은 항-VEGF-A 항체 및 항-VEGF-C 항체로의 조합 치료의 개선된 효능 대 ESM1의 상대적 발현을 보여주는 그래프이다.
도 79는 항-VEGF-A 항체 및 항-VEGF-C 항체로의 조합 치료의 개선된 효능 대 PlGF의 상대적 발현을 보여주는 그래프이다.
도 80은 항-VEGF-A 항체 및 항-VEGF-C 항체로의 조합 치료의 개선된 효능 대 IL-8의 상대적 발현을 보여주는 그래프이다.
도 81은 항-VEGF-A 항체 및 항-VEGF-C 항체로의 조합 치료의 개선된 효능 대 IL-8의 상대적 발현을 보여주는 그래프이다.
도 82는 항-VEGF-A 항체 및 항-VEGF-C 항체로의 조합 치료의 개선된 효능 대 CXCL1의 상대적 발현을 보여주는 그래프이다.
도 83은 항-VEGF-A 항체 및 항-VEGF-C 항체로의 조합 치료의 개선된 효능 대 CXCL1의 상대적 발현을 보여주는 그래프이다.
도 84는 항-VEGF-A 항체 및 항-VEGF-C 항체로의 조합 치료의 개선된 효능 대 CXCL2의 상대적 발현을 보여주는 그래프이다.
도 85는 항-VEGF-A 항체 및 항-VEGF-C 항체로의 조합 치료의 개선된 효능 대 CXCL2의 상대적 발현을 보여주는 그래프이다.
도 86은 항-VEGF-A 항체 및 항-VEGF-C 항체로의 조합 치료의 개선된 효능 대 Hhex의 상대적 발현을 보여주는 그래프이다.
도 87은 항-VEGF-A 항체 및 항-VEGF-C 항체로의 조합 치료의 개선된 효능 대 Hhex의 상대적 발현을 보여주는 그래프이다.
도 88은 항-VEGF-A 항체 및 항-VEGF-C 항체로의 조합 치료의 개선된 효능 대 Col4a1 및 Col4a2의 상대적 발현을 보여주는 그래프이다.
도 89는 항-VEGF-A 항체 및 항-VEGF-C 항체로의 조합 치료의 개선된 효능 대 Col4a1 및 Col4a2의 상대적 발현을 보여주는 그래프이다.
도 90은 항-VEGF-A 항체 및 항-VEGF-C 항체로의 조합 치료의 개선된 효능 대 Alk1의 상대적 발현을 보여주는 그래프이다.
도 91은 항-VEGF-A 항체 및 항-VEGF-C 항체로의 조합 치료의 개선된 효능 대 Alk1의 상대적 발현을 보여주는 그래프이다.
도 92는 항-VEGF-A 항체 및 항-VEGF-C 항체로의 조합 치료의 개선된 효능 대 민클의 상대적 발현을 보여주는 그래프이다.
도 93은 다양한 종양 이종이식편 모델에서 종양 성장을 억제하는데 있어 항-VEGF-A 항체 및 항-EGFL7 항체로의 조합 치료의 효능을 보여주는 표이다.
도 94는 마커 RNA 발현 (qPCR)의 상관관계에 대한 p- 및 r-값 및 항-VEGF-A 항체 및 항-EGFL7 항체로의 조합 치료의 효능을 보여주는 표이다.
도 95는 항-VEGF-A 항체 및 항-EGFL7 항체로의 조합 치료의 개선된 효능 대 Sema3B의 상대적 발현을 보여주는 그래프이다.
도 96은 항-VEGF-A 항체 및 항-EGFL7 항체로의 조합 치료의 개선된 효능 대 FGF9의 상대적 발현을 보여주는 그래프이다.
도 97은 항-VEGF-A 항체 및 항-EGFL7 항체로의 조합 치료의 개선된 효능 대 HGF의 상대적 발현을 보여주는 그래프이다.
도 98은 항-VEGF-A 항체 및 항-EGFL7 항체로의 조합 치료의 개선된 효능 대 VEGF-C의 상대적 발현을 보여주는 그래프이다.
도 99는 항-VEGF-A 항체 및 항-EGFL7 항체로의 조합 치료의 개선된 효능 대 FGF2의 상대적 발현을 보여주는 그래프이다.
도 100은 항-VEGF-A 항체 및 항-EGFL7 항체로의 조합 치료의 개선된 효능 대 Bv8의 상대적 발현을 보여주는 그래프이다.
도 101은 항-VEGF-A 항체 및 항-EGFL7 항체로의 조합 치료의 개선된 효능 대 TNFa의 상대적 발현을 보여주는 그래프이다.
도 102는 항-VEGF-A 항체 및 항-EGFL7 항체로의 조합 치료의 개선된 효능 대 cMet의 상대적 발현을 보여주는 그래프이다.
도 103은 항-VEGF-A 항체 및 항-EGFL7 항체로의 조합 치료의 개선된 효능 대 FN1의 상대적 발현을 보여주는 그래프이다.
도 104는 항-VEGF-A 항체 및 항-EGFL7 항체로의 조합 치료의 개선된 효능 대 피불린 2의 상대적 발현을 보여주는 그래프이다.
도 105는 항-VEGF-A 항체 및 항-EGFL7 항체로의 조합 치료의 개선된 효능 대 EFEMP2/피불린 4의 상대적 발현을 보여주는 그래프이다.
도 106은 항-VEGF-A 항체 및 항-EGFL7 항체로의 조합 치료의 개선된 효능 대 MFAP5의 상대적 발현을 보여주는 그래프이다.
도 107은 항-VEGF-A 항체 및 항-EGFL7 항체로의 조합 치료의 개선된 효능 대 PDGF-C의 상대적 발현을 보여주는 그래프이다.
도 108은 항-VEGF-A 항체 및 항-EGFL7 항체로의 조합 치료의 개선된 효능 대 Fras1의 상대적 발현을 보여주는 그래프이다.
도 109는 항-VEGF-A 항체 및 항-EGFL7 항체로의 조합 치료의 개선된 효능 대 CXCL2의 상대적 발현을 보여주는 그래프이다.
도 110은 항-VEGF-A 항체 및 항-EGFL7 항체로의 조합 치료의 개선된 효능 대 민클의 상대적 발현을 보여주는 그래프이다.
[발명의 상세한 설명]
I. 도입
본 발명은, 예를 들어 VEGF 길항제 이외의 항암 요법제 또는 VEGF 길항제에 부가한 항암 요법제를 포함한 항혈관신생 요법제로의 치료로부터 이익을 얻을 수 있는 환자를 확인하기 위한 방법 및 조성물을 제공한다. 본 발명은 18S rRNA, ACTB, RPS13, VEGFA, VEGFC, VEGFD, Bv8, PlGF, VEGFR1/Flt1, VEGFR2, VEGFR3, NRP1, sNRP1, 포도플라닌, Prox1, VE-카드헤린 (CD144, CDH5), robo4, FGF2, IL8/CXCL8, HGF, THBS1/TSP1, Egfl7, NG3/Egfl8, ANG1, GM-CSF/CSF2, G-CSF/CSF3, FGF9, CXCL12/SDF1, TGFβ1, TNFα, Alk1, BMP9, BMP10, HSPG2/페를레칸, ESM1, Sema3a, Sema3b, Sema3c, Sema3e, Sema3f, NG2, ITGa5, ICAM1, CXCR4, LGALS1/갈렉틴1, LGALS7B/갈렉틴7, 피브로넥틴, TMEM100, PECAM/CD31, PDGFβ, PDGFRβ, RGS5, CXCL1, CXCL2, robo4, LyPD6, VCAM1, 콜라겐 IV (a1), 콜라겐 IV (a2), 콜라겐 IV (a3), Spred-1, Hhex, ITGa5, LGALS1/갈렉틴1, LGALS7/갈렉틴7, TMEM100, MFAP5, 피브로넥틴, 피불린 2, 및 피불린 4/Efemp2로부터 선택된 하나 이상의 유전자의 발현의 증가 또는 감소를 측정하는 것이 VEGF 길항제 이외의 항혈관신생 요법제 또는 VEGF 길항제에 부가한 항혈관신생 요법제로의 치료에 대한 환자의 반응성 또는 민감성을 모니터링하거나 또는 환자가 VEGF 길항제 이외의 항혈관신생 요법제 또는 VEGF 길항제에 부가한 항혈관신생 요법제로의 치료로부터 이익을 얻거나 또는 나타낼 가능성을 결정하는데 유용하다는 발견을 기반으로 한다. 적합한 항혈관신생 요법은, 예를 들어 NRP1 길항제, VEGF-C 길항제, 또는 EGFL7 길항제로의 치료를 포함한다.
II. 정의
본원에서 기재하거나 언급하는 기술 및 절차는 일반적으로 널리 이해되고 있으며, 당업자에 의해 통상적인 방법론, 예를 들어 광범위하게 사용되는 문헌 [Sambrook et al., Molecular Cloning: A Laboratory Manual 3rd. edition (2001) Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor, N.Y. CURRENT PROTOCOLS IN MOLECULAR BIOLOGY (F. M. Ausubel, et al. eds., (2003))]; 연속간행물 [METHODS IN ENZYMOLOGY (Academic Press, Inc.): PCR 2: A PRACTICAL APPROACH (M. J. MacPherson, B. D. Hames and G. R. Taylor eds. (1995))]; [Harlow and Lane, eds. (1988) ANTIBODIES, A LABORATORY MANUAL, and ANIMAL CELL CULTURE (R. I. Freshney, ed. (1987))]; [Oligonucleotide Synthesis (M. J. Gait, ed., 1984)]; [Methods in Molecular Biology, Humana Press; Cell Biology: A Laboratory Notebook (J. E. Cellis, ed., 1998)]; [Academic Press; Animal Cell Culture (R. I. Freshney), ed., 1987)]; [Introduction to Cell and Tissue Culture (J. P. Mather and P. E. Roberts, 1998)]; [Plenum Press; Cell and Tissue Culture: Laboratory Procedures (A. Doyle, J. B. Griffiths, and D. G. Newell, eds., 1993-8)]; [J. Wiley and Sons; Handbook of Experimental Immunology (D. M. Weir and C. C. Blackwell, eds.)]; [Gene Transfer Vectors for Mammalian Cells (J. M. Miller and M. P. Calos, eds., 1987)]; [PCR: The Polymerase Chain Reaction, (Mullis et al., eds., 1994)]; [Current Protocols in Immunology (J. E. Coligan et al., eds., 1991)]; [Short Protocols in Molecular Biology (Wiley and Sons, 1999)]; [Immunobiology (C. A. Janeway and P. Travers, 1997)]; [Antibodies (P. Finch, 1997)]; [Antibodies: A Practical Approach (D. Catty., ed., IRL Press, 1988-1989)]; [Monoclonal Antibodies: A Practical Approach (P. Shepherd and C. Dean, eds., Oxford University Press, 2000)]; [Using Antibodies: A Laboratory Manual (E. Harlow and D. Lane (Cold Spring Harbor Laboratory Press, 1999)]; [The Antibodies (M. Zanetti and J. D. Capra, eds., Harwood Academic Publishers, 1995)]; 및 [Cancer: Principles and Practice of Oncology (V. T. DeVita et al., eds., J.B. Lippincott Company, 1993)]에 기재되어 있는 방법론을 이용하여 보편적으로 사용되고 있다.
달리 정의되지 않는 한, 본원에 사용된 전문 학술 용어는 본 발명이 속하는 분야의 당업자가 통상적으로 이해하는 바와 동일한 의미를 갖는다. 문헌 [Singleton et al., Dictionary of Microbiology and Molecular Biology 2nd ed., J. Wiley & Sons (New York, N.Y. 1994)] 및 [March, Advanced Organic Chemistry Reactions, Mechanisms and Structure 4th ed., John Wiley & Sons (New York, N.Y. 1992)]은 당업자에게 본 출원에서 사용된 많은 용어에 관한 일반적인 지침을 제공한다. 특허 출원, 특허 공보를 포함하는 본원에 인용된 모든 참고문헌, 및 진뱅크 승인 번호은, 이들 각각의 개별 참고문헌이 구체적 및 개별적으로 참고로 도입되는 것으로 명시된 것처럼 본원에 참고로 도입된다.
본 명세서를 이해하기 위한 목적으로, 하기 정의가 적용될 것이고 적절할 경우에는 언제라도 단수형으로 사용된 용어는 또한 복수도 포함할 것이고, 그 반대의 경우도 마찬가지이다. 하기 기재된 임의의 정의가 본원에서 참고문헌으로 포함된 임의의 문헌과 모순되는 경우에는 하기 정의가 우선한다.
"개체", "대상체" 또는 "환자"는 척추동물이다. 특정 실시양태에서, 척추동물은 포유동물이다. 포유동물은 가축 (예를 들어, 소), 경주용 동물, 애완동물 (예를 들어, 고양이, 개 및 말), 영장류, 마우스 및 래트를 포함하지만 이에 제한되지는 않는다. 특정 실시양태에서, 포유동물은 인간이다.
본원에 사용된 용어 "샘플" 또는 "시험 샘플"은 예를 들어 물리적, 생화학적, 화학적 및/또는 생리학적 특징을 기초로 하여 특성화 및/또는 확인되는 세포성 및/또는 다른 분자 엔티티를 함유하는 관심 있는 대상체로부터 얻거나 상기 대상체로부터 유래된 조성물을 나타낸다. 한 실시양태에서, 상기 정의는 생물학적 기원의 혈액 및 다른 액체 샘플 및 조직 샘플, 예를 들어 생검 표본 또는 조직 배양물 또는 그로부터 유래된 세포를 포함한다. 조직 샘플의 공급원은 신선하고/하거나 냉동되고/되거나 보존된 장기 또는 조직 샘플 또는 생검 또는 흡인물로부터의 고체 조직, 혈액 또는 임의의 혈액 성분, 체액, 및 대상체의 임신 또는 발생 중 임의의 시점으로부터의 세포 또는 혈장일 수 있다.
용어 "샘플" 또는 "시험 샘플"은 공급받은 후에 시약을 처리하거나 가용화하거나, 특정 성분, 예를 들어 단백질 또는 폴리뉴클레오티드를 풍부하게 하거나 또는 절편화를 목적으로 반-고체 또는 고체 매트릭스 중에 매립하는 것과 같은 임의의 방법으로 조작된 생물학적 샘플을 포함한다. 본원의 목적상, 조직 샘플의 "절편"은 조직 샘플의 단일 부분 또는 조각, 예를 들어 조직 샘플로부터 절단된 조직 또는 세포의 박편을 나타낸다.
샘플은 원발성 또는 배양된 세포 또는 세포주, 세포 상등액, 세포 용해물, 혈소판, 혈청, 혈장, 유리체액, 림프액, 활액, 여포액, 정액, 양수, 젖, 전혈, 혈액-유래 세포, 소변, 뇌척수액, 타액, 가래, 눈물, 땀, 점액, 종양 용해물, 및 조직 배양 배지, 조직 추출물, 예를 들어 균질화된 조직, 종양 조직 및 세포 추출물, 및 이들의 조합을 포함하지만 이에 제한되지는 않는다.
한 실시양태에서, 샘플은 임상 샘플이다. 또 다른 실시양태에서, 샘플은 진단 분석에 사용된다. 일부 실시양태에서, 샘플은 원발성 또는 전이성 종양으로부터 수득하였다. 조직 생검은 종양 조직의 대표적인 조각을 얻기 위해 종종 사용된다. 다르게는, 종양 세포는 관심 종양 세포를 함유하는 것으로 공지되어 있거나 그렇게 여겨지는 조직 또는 유체의 형태로 간접적으로 수득될 수 있다. 예를 들어, 폐암 병변의 샘플은 절제, 기관지경 검사, 미세침 흡인, 기관지 찰과술에 의해, 또는 가래, 흉수 또는 혈액으로부터 얻을 수 있다.
한 실시양태에서, 샘플은 항혈관신생 요법 이전에 대상체 또는 환자로부터 수득하였다. 또 다른 실시양태에서, 샘플은 VEGF 길항제 요법 이전에 대상체 또는 환자로부터 수득하였다. 또 다른 실시양태에서, 샘플은 항-VEGF 항체 요법 이전에 대상체 또는 환자로부터 수득하였다. 또 다른 실시양태에서, 샘플은 VEGF 길항제 요법으로의 하나 이상의 치료 이후에 대상체 또는 환자로부터 수득하였다.
한 실시양태에서, 샘플은 항혈관신생 요법으로의 하나 이상의 치료 이후에 대상체 또는 환자로부터 수득하였다. 또 다른 실시양태에서, 샘플은 항-VEGF 항체로의 하나 이상의 치료 이후에 대상체 또는 환자로부터 수득하였다. 일부 실시양태에서, 샘플은 암이 전이되기 전에 환자로부터 수득하였다. 특정 실시양태에서, 샘플은 암이 전이된 후에 환자로부터 수득하였다.
본원에 사용된 "참조 샘플"은 비교 목적으로 사용되는 임의의 샘플, 표준물, 또는 수준을 나타낸다. 한 실시양태에서, 참조 샘플은 동일 대상체 또는 환자 신체의 건강하고/하거나 질환에 걸리지 않은 부분 (예를 들어, 조직 또는 세포)으로부터 수득하였다. 또 다른 실시양태에서, 참조 샘플은 동일 대상체 또는 환자 신체의 미처치 조직 및/또는 세포로부터 수득하였다. 또 다른 실시양태에서, 참조 샘플은 대상체 또는 환자가 아닌 개체의 신체의 건강하고/하거나 질환에 걸리지 않은 부분 (예를 들어, 조직 또는 세포)으로부터 수득하였다. 또 다른 실시양태에서, 참조 샘플은 대상체 또는 환자가 아닌 개체의 신체의 미처치 조직 및/또는 세포 부분으로부터 수득하였다.
특정 실시양태에서, 참조 샘플은 시험 샘플이 수득된 때와 상이한 하나 이상의 시점에서 동일 대상체 또는 환자로부터 수득된 단일 샘플 또는 조합된 다중 샘플이다. 예를 들어, 참조 샘플은 시험 샘플이 수득된 때보다 더 이른 시점에 동일 대상체 또는 환자로부터 수득하였다. 이러한 참조 샘플은, 참조 샘플이 암의 초기 진단 동안 수득하고 시험 샘플은 이후에 암이 전이성이 된 시점에 수득된 경우에 유용할 수 있다.
특정 실시양태에서, 참조 샘플은 대상체 또는 환자가 아닌 하나 이상의 개체로부터 수득된, 용어 "샘플"에서 상기 정의된 바와 같은 모든 유형의 생물학적 샘플을 포함한다. 특정 실시양태에서, 참조 샘플은 대상체 또는 환자가 아닌, 혈관신생 장애 (예를 들어, 암)를 갖는 하나 이상의 개체로부터 수득하였다.
특정 실시양태에서, 참조 샘플은 대상체 또는 환자가 아닌 하나 이상의 건강한 개체로부터의 조합된 다중 샘플이다. 특정 실시양태에서, 참조 샘플은 대상체 또는 환자가 아닌 질환 또는 장애 (예를 들어, 혈관신생 장애, 예를 들어 암)를 갖는 하나 이상의 개체로부터의 조합된 다중 샘플이다. 특정 실시양태에서, 참조 샘플은 대상체 또는 환자가 아닌 하나 이상의 개체로부터 모은 혈장 또는 혈청 샘플 또는 종양 조직으로부터 모은 RNA 샘플이다. 특정 실시양태에서, 참조 샘플은 대상체 또는 환자가 아닌 질환 또는 장애 (예를 들어, 혈관신생 장애, 예를 들어 암)를 갖는 하나 이상의 개체로부터 모은 혈장 또는 혈청 샘플 또는 종양 조직으로부터 모은 RNA 샘플이다.
유전자 또는 바이오마커의 발현 수준/양은 mRNA, cDNA, 단백질, 단백질 단편 및/또는 유전자 카피 수를 포함하지만 이에 제한되지는 않은, 당업계 공지의 임의의 적합한 기준을 기초로 하여 정성적으로 및/또는 정량적으로 결정될 수 있다. 특정 실시양태에서, 제1 샘플에서 유전자 또는 바이오마커의 발현 수준/양은 제2 샘플에서의 발현/양과 비교하여 증가된다. 특정 실시양태에서, 제1 샘플에서 유전자 또는 바이오마커의 발현 수준/양은 제2 샘플에서의 발현/양과 비교하여 감소된다. 특정 실시양태에서, 제2 샘플은 참조 샘플이다. 유전자의 발현 수준/양을 결정하기 위한 추가의 개시내용은 본원에서 하기 본 발명의 방법하에 및 실시예 1 및 2에 기재된다.
특정 실시양태에서, 용어 "증가"는 당업계 공지의 표준 방법, 예컨대 본원에 기재된 방법으로 검출할 때 참조 샘플과 비교하여 단백질 또는 핵산의 수준에서 5％, 10％, 20％, 25％, 30％, 40％, 50％, 60％, 70％, 80％, 85％, 90％, 95％, 96％, 97％, 98％, 99％ 이상 전체적으로 증가하는 것을 나타낸다. 특정 실시양태에서, 용어 증가는 샘플에서 유전자 또는 바이오마커의 발현 수준/양에 있어서 참조 샘플에서 각각의 유전자 또는 바이오마커의 발현 수준/양의 약 1.5배, 1.75배, 2배, 3배, 4배, 5배, 6배, 7배, 8배, 9배, 10배, 25배, 50배, 75배 또는 100배 이상인 증가를 나타낸다.
특정 실시양태에서, 용어 "감소"는 당업계 공지의 표준 방법, 예컨대 본원에 기재된 방법으로 검출할 때 참조 샘플과 비교하여 단백질 또는 핵산의 수준에서 5％, 10％, 20％, 25％, 30％, 40％, 50％, 60％, 70％, 80％, 85％, 90％, 95％, 96％, 97％, 98％, 99％ 이상 전체적으로 감소하는 것을 나타낸다. 특정 실시양태에서, 용어 감소는 샘플에서 유전자 또는 바이오마커의 발현 수준/양에 있어서 참조 샘플에서 각각의 유전자 또는 바이오마커의 발현 수준/양의 약 0.9배, 0.8배, 0.7배, 0.6배, 0.5배, 0.4배, 0.3배, 0.2배, 0.1배, 0.05배 또는 0.01배 이상인 감소를 나타낸다.
"검출"은 직접적 및 간접적 검출을 포함하는, 임의의 수단의 검출을 포함한다.
특정 실시양태에서, "상관관계가 있다" 또는 "상관관계가 있는"은 제1분석 또는 프로토콜의 성능 및/또는 결과를 제2분석 또는 프로토콜의 성능 및/또는 결과와 임의의 방식으로 비교하는 것을 의미한다. 예를 들어, 제2 프로토콜의 수행시에 제1분석 또는 프로토콜의 결과를 이용할 수 있고/있거나 제1분석 또는 프로토콜의 결과를 이용하여 제2분석 또는 프로토콜을 수행해야 하는지의 여부를 결정할 수 있다. 유전자 발현 분석 또는 프로토콜의 실시양태와 관련하여, 유전자 발현 분석 또는 프로토콜의 결과를 이용하여 특정 치료 처방을 수행해야 하는지의 여부를 결정할 수 있다.
"뉴로필린" 또는 "NRP"는, 문헌 [Rossignol et al. (2000) Genomics 70:211-222]에 기재된 바와 같이, 집합적으로 뉴로필린-1 (NRP1), 뉴로필린-2 (NRP2) 및 그의 이소형 및 변이체를 나타낸다. 뉴로필린은 120 내지 130 kDa 비-티로신 키나제 수용체이다. 다수의 NRP-1 및 NRP-2 스플라이스 변이체 및 가용성 이소형이 있다. 뉴로필린의 기본 구조는 5개의 도메인을 포함한다: 3개의 세포외 도메인 (a1a2, b1b2 및 c), 막횡단 도메인 및 세포질성 도메인. a1a2 도메인은 2개의 디술피드 브릿지를 형성하는 4개의 시스테인 잔기를 일반적으로 함유하는 보체 성분 C1r 및 C1s (CUB)와 상동성이다. b1b2 도메인은 응고 인자 V 및 VIII와 상동성이다. c 도메인의 중앙부는 메프린 (meprin), A5 및 수용체 티로신 포스파타제 μ 단백질과의 상동성 때문에 MAM으로 명명된다. a1a2 및 b1b2 도메인은 리간드 결합을 담당하는 반면, c 도메인은 동종이량체화 또는 이종이량체화에 있어 결정적이다. 문헌 [Gu et al. (2002) J. Biol. Chem. 277:18069-76]; [He and Tessier-Lavigne (1997) Cell 90:739-51].
"뉴로필린-매개 생물학적 활성" 또는 "NRP-매개 생물학적 활성"은 일반적으로, 뉴로필린-1 및/또는 뉴로필린-2가 실질적 역할을 하는 생리적 또는 병리학적 사건을 나타낸다. 이러한 활성의 비제한적 예는 배아 신경계 발생 또는 뉴런 재생 동안의 액손 안내, 혈관신생 (혈관 모델링 포함), 종양생성 및 종양 전이이다.
"NRP1 길항제" 또는 "NRP1-특이적 길항제"는 하나 이상의 NRP 리간드, 예를 들어 VEGF, PlGF, VEGF-B, VEGF-C, VEGF-D, Sema3A, Sema3B, Sema3C, HGF, FGF1, FGF2, 갈렉틴-1에 대한 그의 결합을 포함하나 이에 제한되지는 않는 NRP-매개 생물학적 활성을 중화, 차단, 억제, 폐지, 감소 또는 방해할 수 있는 분자를 나타낸다. NRP1 길항제는 항-NRP1 항체 및 그의 항원-결합 단편 및 NRP1의 소분자 억제제를 비제한적으로 포함한다. 본원에 사용된 용어 "NRP1 길항제"는 특히, NRP1에 결합하고 NRP1 활성을 중화, 차단, 억제, 폐지, 감소 또는 방해할 수 있는 분자, 예컨대 항체, 항체 단편, 다른 결합 폴리펩티드, 펩티드 및 비-펩티드 소분자를 포함한다. 따라서, 용어 "NRP1 활성"은 특히 NRP1의 NRP1-매개 생물학적 활성을 포함한다. 특정 실시양태에서, NRP1 길항제는 NRP1의 발현 수준 또는 생물학적 활성을 10％, 20％, 30％, 40％, 50％, 60％, 70％, 80％, 90％ 이상 또는 이를 초과하여 감소 또는 억제한다.
"항-NRP1 항체"는 NRP1에 충분한 친화도 및 특이성으로 결합하는 항체이다. "항-NRP1B 항체"는 NRP1의 응고 인자 V/VIII 도메인 (b1b2)에 결합하는 항체이다. 특정 실시양태에서, 선택된 항체는 정상적으로, NRP1에 대해 충분히 결합 친화도를 가질 것이고, 예를 들어 항체는 100 nM 내지 1 pM의 Kd 값으로 인간 NRP1에 결합할 수 있다. 항체 친화도는 예를 들어 표면 플라즈몬 공명 기반 검정 (예컨대 PCT 출원 공보 번호 WO2005/012359에 기재되어 있는 비아코어(BIAcore) 검정); 효소-연결된 면역흡착 검정 (ELISA); 및 경쟁 검정 (예를 들어, RIA)으로 결정할 수 있다. 특정 실시양태에서, 항-NRP1 항체는 NRP1 활성이 관여하는 질환 또는 상태를 표적화하고 이를 방해하는데 있어서의 치료제로서 사용될 수 있다. 또한, 상기 항체를 대상으로 하여 다른 생물학적 활성 검정을 수행하여, 예를 들어 그의 치료제로서의 효과를 평가할 수 있다. 이러한 검정은 당업계에 공지되어 있고, 표적 항원 및 항체의 의도된 용도에 따라 달라진다. 이것의 예는 HUVEC 억제 검정, 종양 세포 성장 억제 검정 (예를 들어, WO 89/06692에 기재된 바와 같음), 항체-의존성 세포성 세포독성 (ADCC) 및 보체-매개 세포독성 (CDC) 검정 (미국 특허 번호 5,500,362), 및 효능작용 활성 또는 조혈 검정 (WO 95/27062 참조)을 포함한다. 항-NRP1 항체는 일반적으로 다른 뉴로필린, 예컨대 NRP2에 결합하지 않을 것이다. 한 실시양태에서, 본 발명의 항-NRP1B 항체는 바람직하게는 하기 CDR 아미노산 서열을 포함하는 경쇄 가변 도메인을 포함한다: CDRL1 (RASQYFSSYLA), CDRL2 (GASSRAS) 및 CDRL3 (QQYLGSPPT). 예를 들어, 항-NRP1B 항체는 PCT 공보 번호 WO2007/056470의 서열 5의 경쇄 가변 도메인 서열을 포함한다. 본 발명의 항-NRP1B 항체는 바람직하게는 하기 CDR 아미노산 서열을 포함하는 중쇄 가변 도메인을 포함한다: CDRH1 (GFTFSSYAMS), CDRH2 (SQISPAGGYTNYADSVKG) 및 CDRH3 (ELPYYRMSKVMDV). 예를 들어, 항-NRP1B 항체는 PCT 공보 번호 WO2007/056470의 서열 6의 중쇄 가변 도메인 서열을 포함한다. 또 다른 실시양태에서, 항-NRP1B 항체는 PCT 공보 번호 WO2007/056470 또는 US 공보 번호 US2008/213268에 따라 생성된다.
용어 "EGFL7" 또는 "EGF-유사-도메인, 멀티플 7"은 임의의 천연 또는 변이체 (천연 또는 합성 모두) EGFL7 폴리펩티드를 나타내기 위해 본원에서 교환가능하게 사용된다. 용어 "천연 서열"은 자연 발생 말단절단 또는 분비 형태 (예를 들어, 세포외 도메인 서열), 자연 발생 변이체 형태 (예를 들어, 다르게 스플라이싱된 형태) 및 자연 발생 대립유전자 변이체를 명확하게 포함한다. 용어 "야생형 EGFL7"은 일반적으로 자연 발생 EGFL7 단백질의 아미노산 서열을 포함하는 폴리펩티드를 나타낸다. 용어 "야생형 EGFL7 서열"은 일반적으로 자연 발생 EGFL7에서 발견되는 아미노산 서열을 나타낸다.
"EGFL7 길항제" 또는 "EGFL7-특이적 길항제"는 EGFL7-매개 HUVEC 세포 부착 또는 HUVEC 세포 이동을 포함하나 이에 제한되지는 않는 EGFL7-매개 생물학적 활성을 중화, 차단, 억제, 폐지, 감소 또는 방해할 수 있는 분자를 나타낸다. EGFL7 길항제는 항-EGFL7 항체 및 그의 항원-결합 단편, 및 EGFL7의 소분자 억제제를 비제한적으로 포함한다. 본원에 사용된 용어 "EGFL7 길항제"는 특히 EGFL7에 결합하고 EGFL7 활성을 중화, 차단, 억제, 폐지, 감소 또는 방해할 수 있는 분자, 예컨대 항체, 항체 단편, 다른 결합 폴리펩티드, 펩티드 및 비-펩티드 소분자를 포함한다. 따라서, 용어 "EGFL7 활성"은 특히 EGFL7의 EGFL7-매개 생물학적 활성을 포함한다. 특정 실시양태에서, EGFL7 길항제는 EGFL7의 발현 수준 또는 생물학적 활성을 10％, 20％, 30％, 40％, 50％, 60％, 70％, 80％, 90％ 이상 또는 이를 초과하여 감소 또는 억제한다.
"항-EGFL7 항체"는 EGFL7에 충분한 친화도 및 특이성으로 결합하는 항체이다. 특정 실시양태에서, 선택된 항체는 정상적으로, EGFL7에 대해 충분히 결합 친화도를 가질 것이고, 예를 들어 항체는 100 nM 내지 1 pM의 Kd 값으로 인간 EGFL7에 결합할 수 있다. 항체 친화도는 예를 들어 표면 플라즈몬 공명 기반 검정 (예컨대 PCT 출원 공보 번호 WO2005/012359에 기재되어 있는 비아코어 검정); 효소-연결된 면역흡착 검정 (ELISA); 및 경쟁 검정 (예를 들어, RIA)으로 측정할 수 있다. 특정 실시양태에서, 항-EGFL7 항체는 EGFL7 활성이 관여하는 질환 또는 상태를 표적화하고 이를 방해하는데 있어 치료제로서 사용될 수 있다. 또한, 상기 항체를 대상으로 하여 다른 생물학적 활성 검정을 수행하여, 예를 들어 그의 치료제로서의 효과를 평가할 수 있다. 이러한 검정은 당업계에 공지되어 있고, 표적 항원 및 항체의 의도된 용도에 따라 달라진다. 이것의 예는 HUVEC 세포 부착 및/또는 이동의 억제, 종양 세포 성장 억제 검정 (예를 들어, WO 89/06692에 기재된 바와 같음), 항체-의존성 세포성 세포독성 (ADCC) 및 보체-매개 세포독성 (CDC) 검정 (미국 특허 번호 5,500,362), 및 효능작용 활성 또는 조혈 검정 (WO 95/27062 참조)을 포함한다. 일부 실시양태에서, 본 발명의 항-EGFL7 항체는 하기 CDR 아미노산 서열을 포함하는 경쇄 가변 도메인을 포함한다: CDRL1 (KASQSVDYSGDSYMS), CDRL2 (GASYRES) 및 CDRL3 (QQNNEEPYT). 일부 실시양태에서, 본 발명의 항-EGFL7 항체는 하기 CDR 아미노산 서열을 포함하는 경쇄 가변 도메인을 포함한다: CDRL1 (RTSQSLVHINAITYLH), CDRL2 (RVSNRFS) 및 CDRL3 (GQSTHVPLT). 일부 실시양태에서, 본 발명의 항-EGFL7 항체는 바람직하게는 하기 CDR 아미노산 서열을 포함하는 중쇄 가변 도메인을 포함한다: CDRH1 (GHTFTTYGMS), CDRH2 (GWINTHSGVPTYADDFKG) 및 CDRH3 (LGSYAVDY). 일부 실시양태에서, 본 발명의 항-EGFL7 항체는 바람직하게는 하기 CDR 아미노산 서열을 포함하는 중쇄 가변 도메인을 포함한다: CDRH1 (GYTFIDYYMN), CDRH2 (GDINLDNSGTHYNQKFKG) 및 CDRH3 (AREGVYHDYDDYAMDY).
용어 "혈관 내피 성장 인자-C", "VEGF-C", "VEGFC", "VEGF-관련 단백질", "VRP", "VEGF2" 및 "VEGF-2"는 교환가능하게 사용되고, VEGF 부류의 구성원을 나타내며, 이는 2가지 이상의 세포 표면 수용체 부류, 티로신 키나제 VEGF 수용체 및 뉴로필린 (Nrp) 수용체에 결합하는 것으로 알려져 있다. 3가지 VEGF 수용체 중에서, VEGF-C는 VEGFR2 (KDR 수용체) 및 VEGFR3 (Flt-4 수용체)에 결합하여 수용체 이량체화 (문헌 [Shinkai et al., J Biol Chem 273, 31283-31288 (1998)]), 키나제 활성화 및 자가인산화 (문헌 [Heldin, Cell 80, 213-223 (1995)]; [Waltenberger et al., J. Biol Chem 269, 26988-26995 (1994)])를 유발할 수 있다. 인산화된 수용체는 다중 기질의 활성화를 유도하여 혈관신생 및 림프관신생을 유발한다 (문헌 [Ferrara et al., Nat Med 9, 669-676 (2003)]). 종양 세포에서 VEGF-C의 과다발현은 종양-관련 림프관신생을 촉진시켜 국소 림프절로의 전이를 향상시키는 것으로 나타났다 (문헌 [Karpanen et al., Faseb J 20, 1462-1472 (2001)]; [Mandriota et al., EMBO J 20, 672-682 (2001)]; [Skobe et al., Nat Med 7, 192-198 (2001)]; [Stacker et al., Nat Rev Cancer 2, 573-583 (2002)]; [Stacker et al., Faseb J 16, 922-934 (2002)]). VEGF-C 발현은 또한 다수의 인간 암에서 종양-관련 림프관신생 및 림프절 전이와 서로 관련이 있다 ([Achen et al., 2006, 상기문헌]에서 검토). 또한, VEGF-C-매개 신호전달의 차단은 마우스에서 종양 림프관신생 및 림프절 전이를 저해하는 것으로 나타났다 (문헌 [Chen et al., Cancer Res 65, 9004-9011 (2005)]; [He et al., J. Natl Cancer Inst 94, 8190825 (2002)]; [Krishnan et al., Cancer Res 63, 713-722 (2003)]; [Lin et al., Cancer Res 65, 6901-6909 (2005)]).
"혈관 내피 성장 인자-C", "VEGF-C", "VEGFC", "VEGF-관련 단백질", "VRP", "VEGF2" 및 "VEGF-2"는 전장 폴리펩티드 및/또는 전장 폴리펩티드의 활성 단편을 나타낸다. 한 실시양태에서, 활성 단편은 미국 특허 번호 6,451,764 (그의 전체 개시문이 명백하게 본원에 참고로 도입됨)의 서열 3에 나타낸 전장 아미노산 서열의 전체 419개 미만의 아미노산을 갖는 전장 아미노산 서열의 임의의 부분을 포함한다. 이러한 활성 단편은 VEGF-C 생물학적 활성을 함유하고, 성숙한 VEGF-C를 포함하나 이에 제한되지는 않는다. 한 실시양태에서, 전장 VEGF-C 폴리펩티드는 단백질가수분해 프로세싱되어 VEGF-C 폴리펩티드의 성숙한 형태 (또한 성숙한 VEGF-C로 지칭됨)를 생성한다. 이러한 프로세싱은 완전하게-프로세싱된 성숙한 형태를 생성하는 신호 펩티드의 절단 및 아미노-말단 펩티드의 절단 및 카르복실-말단 펩티드의 절단을 포함한다. 실험적 증거는 전장 VEGF-C, VEGF-C의 부분적으로-프로세싱된 형태 및 VEGF-C의 완전하게 프로세싱된 성숙한 형태가 VEGFR3 (Flt-4 수용체)에 결합할 수 있다는 것을 입증한다. 그러나, VEGFR2에 대한 고친화도 결합은 오직 VEGF-C의 완전하게 프로세싱된 성숙한 형태에서 일어난다.
VEGF-C 폴리펩티드에 관한 용어 "생물학적 활성" 및 "생물학적 활성"은 전장 및/또는 성숙한 VEGF-C와 관련된 물리적/화학적 특성 및 생물학적 기능을 나타낸다. 일부 실시양태에서, VEGF-C "생물학적 활성"은 Flt-4 수용체 (VEGFR3)에 결합하고 그의 인산화를 자극하는 능력을 갖는다는 것을 의미한다. 일반적으로, VEGF-C는 Flt-4 수용체의 세포외 도메인에 결합하여 그의 세포내 티로신 키나제 도메인을 활성화 또는 억제할 것이다. 결과적으로, 수용체에 대한 VEGF-C의 결합은 생체내 또는 시험관내에서 VEGF-C에 대한 Flt-4 수용체를 갖는 세포의 증식 및/또는 분화 및/또는 활성화를 향상 또는 억제할 수 있다. Flt-4 수용체에 대한 VEGF-C의 결합은 경쟁 결합 방법, 예컨대 RIA, ELISA, 및 다른 경쟁 결합 검정을 포함하는 통상적인 기술을 이용하여 결정할 수 있다. 리간드/수용체 복합체는 여과, 원심분리, 유동 세포측정 (예를 들어, 문헌 [Lyman et al., Cell, 75:1157-1167 [1993]]; [Urdal et al., J. Biol. Chem., 263:2870-2877 [1988]]; 및 [Gearing et al., EMBO J., 8:3667-3676 [1989]] 참조) 등과 같은 분리 방법을 이용하여 확인할 수 있다. 결합 연구로부터의 결과는 결합 데이터의 임의의 통상적인 그래프 표현, 예컨대 스캐차드(Scatchard) 분석 (문헌 [Scatchard, Ann. NY Acad. Sci., 51:660-672 [1949]]; [Goodwin et al., Cell, 73:447-456 [1993]]) 등을 이용하여 분석할 수 있다. VEGF-C가 Flt-4 수용체의 인산화를 유도하므로, 통상적인 티로신 인산화 검정은 또한 Flt-4 수용체/VEGF-C 복합체의 형성의 지표로 사용될 수 있다. 다른 실시양태에서, VEGF-C "생물학적 활성"은 KDR 수용체 (VEGFR2)에 결합하는 능력, 혈관 투과성 뿐만 아니라 내피 세포의 이동 및 증식을 갖는 것을 의미한다. 특정 실시양태에서, KDR 수용체에 대한 VEGF-C의 결합은 생체내 또는 시험관내에서 VEGF-C에 대한 KDR 수용체를 갖는 내피 세포의 혈관 투과성 뿐만 아니라 이동 및/또는 증식 및/또는 분화 및/또는 활성화를 향상 또는 억제할 수 있다.
용어 "VEGF-C 길항제"는 VEGF-C 활성을 중화, 차단, 억제, 폐지, 감소 또는 방해할 수 있는 분자를 나타내기 위해 본원에 사용된다. 특정 실시양태에서, VEGF-C 길항제는 혈관신생, 림프 내피 세포 (EC) 이동, 증식 또는 성인 림프관신생, 특히 종양 림프관신생 및 종양 전이를 조절하는 VEGF-C의 능력을 중화, 차단, 억제, 폐지, 감소 또는 방해할 수 있는 분자를 나타낸다. VEGF-C 길항제는 VEGF-C에 특이적으로 결합하여 하나 이상의 수용체, 항-VEGF-C 수용체 항체 및 VEGF-C 수용체 길항제, 예컨대 VEGFR2 및 VEGFR3의 소분자 억제제에 대한 그의 결합을 격리시키는, 항-VEGF-C 항체 및 그의 항원-결합 단편, 수용체 분자 및 유도체를 비제한적으로 포함한다. 본원에 사용된 용어 "VEGF-C 길항제"는 특히 VEGF-C에 결합하고 VEGF-C 활성을 중화, 차단, 억제, 폐지, 감소 또는 방해할 수 있는 분자, 예컨대 항체, 항체 단편, 다른 결합 폴리펩티드, 펩티드, 및 비-펩티드 소분자를 포함한다. 따라서, 용어 "VEGF-C 활성"은 특히 VEGF-C의 VEGF-C-매개 생물학적 활성 (본원에서 상기 규정된 바와 같음)을 포함한다.
용어 "항-VEGF-C 항체" 또는 "VEGF-C에 결합하는 항체"는 항체가 VEGF-C를 표적화하는데 있어서 진단제 및/또는 치료제로서 유용하도록 충분한 친화도로 VEGF-C와 결합할 수 있는 항체를 나타낸다. 항-VEGF-C 항체는 예를 들어 대리인 문서 PR4291에 기재되어 있고, 이 특허 출원의 전체 내용은 명백하게 본원에 참고로 도입된다. 한 실시양태에서, 관련되지 않은 비-VEGF-C 단백질에 항-VEGF-C 항체가 결합하는 정도는, 예를 들어 방사선면역분석 (RIA)에 의해 측정시, VEGF-C에 대한 항체의 결합의 약 10％ 미만이다. 특정 실시양태에서, VEGF-C에 결합하는 항체는 ≤ 1 μM, ≤ 100 nM, ≤ 10 nM, ≤ 1 nM 또는 ≤ 0.1 nM의 해리 상수 (Kd)를 갖는다. 특정 실시양태에서, 항-VEGF-C 항체는 상이한 종으로부터의 VEGF-C 사이에 보존된 VEGF-C의 에피토프에 결합한다.
본원에 사용된 용어 "VEGF" 또는 "VEGF-A"는 문헌 [Leung et al. (1989) Science 246:1306] 및 [Houck et al. (1991) Mol. Endocrin, 5:1806]에 기재된 바와 같은 165-아미노산 인간 혈관 내피 세포 성장 인자 및 관련 121-, 189- 및 206-아미노산 인간 혈관 내피 세포 성장 인자 및 그의 자연 발생 대립유전자 및 프로세싱된 형태를 나타낸다. 용어 "VEGF"는 또한 비-인간 종, 예를 들어 마우스, 래트 또는 영장류로부터의 VEGF를 나타낸다. 때때로, 특정 종으로부터의 VEGF는 인간 VEGF의 경우에는 hVEGF, 뮤린 VEGF의 경우에는 mVEGF 등과 같은 용어로 표시된다. 용어 "VEGF"는 또한 165-아미노산 인간 혈관 내피 세포 성장 인자의 아미노산 8 내지 109 또는 아미노산 1 내지 109를 포함하는 폴리펩티드의 말단절단 형태를 나타내는데 사용된다. VEGF의 임의의 상기 형태들에 대한 언급은 본 출원에서 예를 들어 "VEGF (8-109)", "VEGF (1-109)" 또는 "VEGF165"에 의해 확인될 수 있다. "말단절단된" 천연 VEGF에 대한 아미노산 위치는 천연 VEGF 서열에 표시된 바와 같이 넘버링된다. 예를 들어, 말단절단된 천연 VEGF에서의 아미노산 위치 17 (메티오닌)은 또한 천연 VEGF에서의 위치 17 (메티오닌)이다. 말단절단된 천연 VEGF는 KDR 및 Flt-1 수용체에 대해 천연 VEGF와 대등한 결합 친화도를 갖는다.
"VEGF 생물학적 활성"은 임의의 VEGF 수용체에 대한 결합 또는 임의의 VEGF 신호전달 활성, 예컨대 정상적 및 비정상적인 혈관신생 및 혈관형성 둘 모두의 조절 (문헌 [Ferrara and Davis-Smyth (1997) Endocrine Rev. 18:4-25]; [Ferrara (1999) J. Mol. Med. 77:527-543]); 배아 혈관형성 및 혈관신생의 촉진 (문헌 [Carmeliet et al. (1996) Nature 380:435-439]; [Ferrara et al. (1996) Nature 380:439-442)]; 및 여성 생식기에서의 순환적 혈관 증식 및 골 성장 및 연골 형성을 위한 순환적 혈관 증식의 조정 (문헌 [Ferrara et al. (1998) Nature Med. 4:336-340]; [Gerber et al. (1999) Nature Med. 5:623-628])을 포함한다. VEGF는 혈관신생 및 혈관형성에 있어서의 혈관신생 인자인 것 이외에도 다형질성 성장 인자로서 다른 생리적 과정, 예컨대 내피 세포 생존, 혈관 투과성 및 혈관확장, 단핵구 화학주성 및 칼슘 유입에 있어서 여러가지 생물학적 효과를 나타낸다 ([Ferrara and Davis-Smyth (1997), 상기 문헌] 및 문헌 [Cebe-Suarez et al. Cell. Mol. Life Sci. 63:601-615 (2006)]). 또한, 몇가지 비-내피 세포 유형, 예컨대 망막 색소 상피 세포, 췌장관 세포 및 쉬반(Schwann) 세포에 대한 VEGF의 유사분열촉진 효과가 최근 연구에서 보고되었다. 문헌 [Guerrin et al. (1995) J. Cell Physiol. 164:385-394]; [Oberg-Welsh et al. (1997) Mol. Cell. Endocrinol. 126:125-132]; [Sondell et al. (1999) J. Neurosci. 19:5731-5740].
"VEGF 길항제" 또는 "VEGF-특이적 길항제"는 VEGF에 결합하거나, VEGF 발현 수준을 감소시키거나, 또는 하나 이상의 VEGF 수용체에 대한 VEGF 결합 및 VEGF-매개 혈관신생 및 내피 세포 생존 또는 증식을 포함하는 (이에 제한되지는 않음) VEGF 생물학적 활성을 중화, 차단, 억제, 폐지, 감소 또는 방해할 수 있는 분자를 나타낸다. VEGF에 특이적으로 결합하는 폴리펩티드, 항-VEGF 항체 및 그의 항원-결합 단편, VEGF에 특이적으로 결합하여 하나 이상의 수용체에 대한 그의 결합을 격리시키는 수용체 분자 및 유도체, 융합 단백질 (예를 들어, VEGF-트랩 (리제네론(Regeneron)) 및 VEGF121-겔로닌 (페레그린(Peregrine))이 본 발명의 방법에 유용한 VEGF-특이적 길항제로서 포함된다. VEGF-특이적 길항제는 또한 VEGF 폴리펩티드의 길항제 변이체, VEGF에 대한 안티센스 뉴클레오염기 올리고머, VEGF에 대한 작은 RNA 분자, RNA 압타머, 펩티바디, 및 VEGF에 대한 리보자임을 포함한다. VEGF-특이적 길항제는 또한 VEGF에 결합하는 비펩티드 소분자를 포함하고, VEGF 생물학적 활성을 차단, 억제, 폐지, 감소 또는 방해할 수 있다. 따라서, 용어 "VEGF 활성"은 구체적으로 VEGF의 VEGF-매개 생물학적 활성을 포함한다. 특정 실시양태에서, VEGF 길항제는 VEGF의 발현 수준 또는 생물학적 활성을 10％, 20％, 30％, 40％, 50％, 60％, 70％, 80％, 90％ 이상 또는 이를 초과하여 감소 또는 억제한다.
"항-VEGF 항체"는 VEGF에 충분한 친화도 및 특이성으로 결합하는 항체이다. 특정 실시양태에서, 선택된 항체는 정상적으로, VEGF에 대해 충분히 결합 친화도를 가질 것이고, 예를 들어 항체는 100 nM 내지 1 pM의 Kd 값으로 hVEGF와 결합할 수 있다. 항체 친화도는 예를 들어 표면 플라즈몬 공명 기반 검정 (예컨대 PCT 출원 공보 번호 WO2005/012359에 기재된 바와 같은 비아코어 검정); 효소-연결된 면역흡착 검정 (ELISA); 및 경쟁 검정 (예를 들어, RIA)으로 결정할 수 있다.
특정 실시양태에서, 항-VEGF 항체는 VEGF 활성이 관여하는 질환 또는 상태를 표적화하고 이를 간섭하는데 있어서의 치료제로서 사용될 수 있다. 또한, 상기 항체를 대상으로 하여 다른 생물학적 활성 검정을 수행하여, 예를 들어 그의 치료제로서의 효과를 평가할 수 있다. 이러한 검정은 당업계에 공지되어 있고, 표적 항원 및 항체의 의도된 용도에 따라 달라진다. 이것의 예는 HUVEC 억제 검정, 종양 세포 성장 억제 검정 (예를 들어, WO 89/06692에 기재된 바와 같음), 항체-의존성 세포성 세포독성 (ADCC) 및 보체-매개 세포독성 (CDC) 검정 (미국 특허 번호 5,500,362), 및 효능작용 활성 또는 조혈 검정 (WO 95/27062 참조)을 포함한다. 항-VEGF 항체는 통상적으로 다른 VEGF 상동체, 예컨대 VEGF-B 또는 VEGF-C에도 결합하지 않을 것이고, 다른 성장 인자, 예컨대 PlGF, PDGF 또는 bFGF에도 결합하지 않을 것이다. 한 실시양태에서, 항-VEGF 항체는 하이브리도마 ATCC HB 10709에 의해 생성되는 모노클로날 항-VEGF 항체 A4.6.1과 동일한 에피토프에 결합하는 모노클로날 항체이다. 다른 실시양태에서, 항-VEGF 항체는 베바시주맙 (BV; 아바스틴(AVASTIN)®)이라고 공지된 항체를 포함하나 이에 제한되지는 않은, 문헌 [Presta et al. (1997) Cancer Res. 57:4593-4599]에 따라 생성되는 재조합 인간화 항-VEGF 모노클로날 항체이다.
"rhuMAb VEGF" 또는 "아바스틴®"으로서 공지되기도 한 항-VEGF 항체 "베바시주맙 (BV)"은 문헌 [Presta et al. (1997) Cancer Res. 57:4593-4599]에 따라서 생성된 재조합 인간화 항-VEGF 모노클로날 항체이다. 이것은 돌연변이된 인간 IgG1 프레임워크 영역, 및 인간 VEGF의 그의 수용체에 대한 결합을 차단하는 뮤린 항-hVEGF 모노클로날 항체 A.4.6.1로부터의 항원-결합 상보성-결정 영역을 포함한다. 베바시주맙의 아미노산 서열의 대략 93％ (대부분의 프레임워크 영역 포함)는 인간 IgG1로부터 유래되고, 서열의 약 7％는 뮤린 항체 A4.6.1로부터 유래된다. 베바시주맙은 분자량이 약 149,000 달톤이고 글리코실화된다. 베바시주맙 및 다른 인간화 항-VEGF 항체는 2005년 2월 26일자로 허여된 미국 특허 번호 6,884,879 (전체 개시문이 명백하게 본원에 참고로 도입됨)에 추가로 기재되어 있다.
가장 잘 특징규명된 2종의 VEGF 수용체는 VEGFR1 (또한, Flt-1이라고도 공지됨) 및 VEGFR2 (또한, KDR 및 FLK-1 (뮤린 동족체)이라고도 공지됨)이다. 각 VEGF 부류 구성원에 대한 각 수용체의 특이성은 다양하지만, VEGF-A는 Flt-1 및 KDR 둘 모두에 결합한다. 전장 Flt-1 수용체는 7개의 Ig 도메인을 갖는 세포외 도메인, 막횡단 도메인, 및 티로신 키나제 활성을 지닌 세포내 도메인을 포함한다. 세포외 도메인은 VEGF의 결합에 관여하고, 세포내 도메인은 신호 전달에 관여한다.
VEGF에 특이적으로 결합하는 VEGF 수용체 분자 또는 그의 단편이, VEGF 단백질에 결합하여 그를 격리시킴으로써 VEGF 단백질이 신호전달을 하지 못하도록 하는 VEGF 억제제로서 사용될 수 있다. 특정 실시양태에서, VEGF 수용체 분자 또는 그의 VEGF 결합 단편은 가용성 형태, 예를 들어 sFlt-1이다. 가용성 형태의 수용체는 VEGF와 결합함으로써 VEGF 단백질의 생물학적 활성에 대한 억제 효과를 발휘하여 VEGF 단백질이 표적 세포 표면상에 존재하는 이것의 천연 수용체와 결합하는 것을 저해한다. 또한, VEGF 수용체 융합 단백질이 포함되는데, 이것의 예는 아래에 기재되어 있다.
키메라 VEGF 수용체 단백질은 2종 이상의 상이한 단백질로부터 유래된 아미노산 서열을 갖는 수용체 분자로서, 이중 1종 이상은 VEGF와 결합하여 그의 생물학적 활성을 억제할 수 있는 VEGF 수용체 단백질 (예를 들어, flt-1 또는 KDR 수용체)이다. 특정 실시양태에서, 본 발명의 키메라 VEGF 수용체 단백질은 단지 2개의 상이한 VEGF 수용체 분자로부터 유래된 아미노산 서열로 이루어지고; 그러나 flt-1 및/또는 KDR 수용체의 세포외 리간드-결합 영역으로부터의 1, 2, 3, 4, 5, 6, 또는 7개 모두의 Ig-유사 도메인을 포함하는 아미노산 서열이 다른 관련되지 않은 단백질로부터의 아미노산 서열, 예를 들어 면역글로블린 서열에 연결될 수 있다. Ig-유사 도메인과 조합되는 다른 아미노산 서열은 당업자에게 매우 명백할 것이다. 키메라 VEGF 수용체 단백질의 예에는, 가용성 Flt-1/Fc, KDR/Fc 또는 Flt-1/KDR/Fc (VEGF 트랩으로서 공지되기도 함)이 포함되나 이에 제한되지는 않는다. (예를 들어, PCT 출원 공보 번호 WO97/44453 참조).
가용성 VEGF 수용체 단백질 또는 키메라 VEGF 수용체 단백질은 막횡단 도메인을 통해 세포의 표면에 고정되지 않는 VEGF 수용체 단백질을 포함한다. 이와 같이 가용성 형태의 VEGF 수용체, 예를 들어 키메라 수용체 단백질은 VEGF와 결합하여 이것을 불활성화시키면서도 막횡단 도메인을 포함하지 않기 때문에 일반적으로는 해당 분자가 발현되는 세포의 세포막과 결합되지 않는다.
추가의 VEGF 억제제는 예를 들어, WO 99/24440, PCT 국제 출원 PCT/IB99/00797, WO 95/21613, WO 99/61422, 미국 특허 번호 6,534,524, 미국 특허 번호 5,834,504, WO 98/50356, 미국 특허 번호 5,883,113, 미국 특허 번호 5,886,020, 미국 특허 번호 5,792,783, 미국 특허 번호 6,653,308, WO 99/10349, WO 97/32856, WO 97/22596, WO 98/54093, WO 98/02438, WO 99/16755, 및 WO 98/02437 (이들 모두의 전문이 본원에 참고로 도입된다)에 기재되어 있다.
본원에 사용된 용어 "B20 시리즈 폴리펩티드"는 VEGF에 결합하는 항체를 포함하는 폴리펩티드를 나타낸다. B20 시리즈 폴리펩티드는 미국 공보 번호 20060280747, 미국 공보 번호 20070141065 및/또는 미국 공보 번호 20070020267 (이들 특허 출원서의 내용은 명백하게 본원에 참고로 도입됨)에 기재된 B20 항체 또는 B20-유래의 항체의 서열로부터 유래된 항체를 포함하지만 이에 제한되지는 않는다. 한 실시양태에서, B20 시리즈 폴리펩티드는 미국 공보 번호 20060280747, 미국 공보 번호 20070141065 및/또는 미국 공보 번호 20070020267에 기재된 바와 같은 B20-4.1이다. 또 다른 실시양태에서, B20 시리즈 폴리펩티드는 미국 특허 출원 60/991,302에 기재된 B20-4.1.1이고, 상기 문헌의 전체 개시내용은 명백하게 본원에 참고로 도입된다.
본원에 사용된 용어 "G6 시리즈 폴리펩티드"는 VEGF에 결합하는 항체를 포함하는 폴리펩티드를 나타낸다. G6 시리즈 폴리펩티드는 미국 공보 번호 20060280747, 미국 공보 번호 20070141065 및/또는 미국 공보 번호 20070020267에 기재된 G6 항체 또는 G6-유래의 항체의 서열로부터 유래된 항체를 포함하지만 이에 제한되지는 않는다. 미국 공보 번호 20060280747, 미국 공보 번호 20070141065 및/또는 미국 공보 번호 20070020267에 기재된 G6 시리즈 폴리펩티드는 G6-8, G6-23 및 G6-31을 포함하지만 이에 제한되지는 않는다.
추가의 항체에 대해서는, 미국 특허 번호 7,060,269, 6,582,959, 6,703,020; 6,054,297; WO98/45332; WO 96/30046; WO94/10202; EP 0666868B1; 미국 특허 출원 공보 번호 2006009360, 20050186208, 20030206899, 20030190317, 20030203409, 및 20050112126; 및 문헌 [Popkov et al., Journal of Immunological Methods 288:149-164 (2004)]을 참조한다. 특정 실시양태에서, 다른 항체는 잔기 F17, M18, D19, Y21, Y25, Q89, I91, K101, E103, 및 C104를 포함하거나, 또는 다르게는 잔기 F17, Y21, Q22, Y25, D63, I83 및 Q89를 포함하는 인간 VEGF 상의 기능적 에피토프에 결합하는 것을 포함한다.
다른 항-VEGF 항체 및 항-NRP1 항체도 또한 공지되어 있으며, 예를 들어 문헌 [Liang et al., J Mol Biol 366, 815-829 (2007)] 및 [Liang et al., J Biol Chem 281, 951-961 (2006)], PCT 공보 번호 WO2007/056470 및 PCT 출원 번호 PCT/US2007/069179에 기재되어 있고, 이들 특허 출원의 개시내용은 명백하게 본원에 참고로 도입된다.
용어 "표지"가 본원에 사용된 경우, 이것은 시약, 예컨대 핵산 프로브 또는 항체에 직접 또는 간접적으로 접합되거나 융합된 화합물 또는 조성물을 나타내고, 그와 접합되거나 융합된 시약의 검출을 용이하게 한다. 표지는 그 자체가 검출가능할 수도 있고 (예를 들어, 방사성 동위원소 표지 또는 형광 표지), 또는 효소 표지의 경우에는 기질 화합물 또는 조성물의 검출가능한 화학적 변경을 촉매할 수도 있다.
"소분자"는 본원에서 분자량이 약 500 달톤 미만인 것으로 정의된다.
본원에서 구별없이 사용된 바와 같이, "폴리뉴클레오티드" 또는 "핵산"은 임의의 길이의 뉴클레오티드의 중합체를 나타내고, DNA 및 RNA를 포함한다. 뉴클레오티드는 데옥시리보뉴클레오티드, 리보뉴클레오티드, 변형된 뉴클레오티드 또는 염기 및/또는 그의 유사체, 또는 DNA 또는 RNA 폴리머라제에 의해 또는 합성 반응에 의해 중합체 내로 혼입될 수 있는 임의의 기질일 수 있다. 폴리뉴클레오티드는 변형된 뉴클레오티드, 예를 들어 메틸화 뉴클레오티드 및 그의 유사체를 포함할 수 있다.
본원에서 사용된 바와 같이, 일반적으로 "올리고뉴클레오티드"는 일반적으로 길이가 약 200개 미만의 뉴클레오티드 (반드시 이러한 것은 아님)인 짧은, 일반적으로 단일 가닥인 일반적으로 합성 폴리뉴클레오티드를 나타낸다. 용어 "올리고뉴클레오티드" 및 "폴리뉴클레오티드"는 상호 배타적이지 않다. 폴리뉴클레오티드에 대한 상기 기재는 올리고뉴클레오티드에 동일하고 완전하게 적용가능하다.
특정 실시양태에서, 폴리뉴클레오티드는 다양한 엄격도 조건하에 유전자에 특이적으로 혼성화할 수 있다. 혼성화 반응의 "엄격도"는 당업자에 의해 쉽게 결정될 수 있고, 일반적으로 프로브 길이, 세척 온도 및 염 농도에 따른 실험적 계산치이다. 일반적으로, 프로브가 길수록 적당한 어닐링을 위해 더 높은 온도가 필요하고, 프로브가 짧을 수록 보다 낮은 온도가 필요하다. 일반적으로, 혼성화는 상보적 가닥들이 자신들의 융점보다 낮은 환경에 존재할 때 다시 어닐링되는 변성된 DNA의 능력에 의존적이다. 프로브와 혼성화 서열 사이에서 원하는 상동성 정도가 높을 수록, 사용될 수 있는 상대적 온도가 더 높다. 그 결과, 보다 높은 상대 온도는 반응 조건을 보다 엄격하게 만드는 경향이 있고, 보다 낮은 온도는 덜 엄격하게 만드는 경향이 있다. 혼성화 반응의 엄격도에 대한 추가의 세부사항 및 설명에 대해서는 문헌 [Ausubel et al., Current Protocols in Molecular Biology, Wiley Interscience Publishers, (1995)]을 참조한다.
엄격한 조건 또는 고엄격도 조건은 (1) 세척시 낮은 이온 강도 및 높은 온도, 예를 들어 50℃에서 0.015 M 염화나트륨/0.0015 M 시트르산나트륨/0.1％ 나트륨 도데실 술페이트를 사용하거나, (2) 혼성화 동안에 42℃에서 포름아미드, 예를 들어 0.1％ 소 혈청 알부민/0.1％ 피콜(Ficoll)/0.1％ 폴리비닐피롤리돈/750 mM 염화나트륨, 75 mM 시트르산나트륨을 함유하는 50 mM 인산나트륨 완충제 (pH 6.5)를 함유하는 50％ (v/v) 포름아미드와 같은 변성제를 사용하거나, 또는 (3) 42℃에서 50％ 포름아미드, 5xSSC (0.75 M NaCl, 0.075 M 시트르산나트륨), 50 mM 인산나트륨 (pH 6.8), 0.1％ 피로인산나트륨, 5x덴하르트(Denhardt's) 용액, 초음파처리된 연어 정자 DNA (50 ㎍/mL), 0.1％ SDS 및 10％ 덱스트란 술페이트를 사용하고 42℃에서 0.2xSSC (염화나트륨/시트르산나트륨) 및 55℃에서 50％ 포름아미드 중에 세척한 후에, 55℃에서 EDTA가 함유된 0.1xSSC로 이루어진 고엄격도 세척을 수행하는 것에 의해 확인할 수 있다.
중간 정도의 엄격한 조건은 문헌 [Sambrook et al., Molecular Cloning: A Laboratory Manual, New York: Cold Spring Harbor Press, 1989]에 기재된 바와 같이 확인될 수 있으며, 상기한 것보다 덜 엄격한 세척 용액 및 혼성화 조건 (예를 들어, 온도, 이온 강도 및 ％SDS)의 사용을 포함한다. 중간 정도의 엄격한 조건의 예는 20％ 포름아미드, 5xSSC (150 mM NaCl, 15 mM 시트르산삼나트륨), 50 mM 인산나트륨 (pH 7.6), 5x 덴하르트 용액, 10％ 덱스트란 술페이트 및 20 mg/ml의 변성되고 전단된 연어 정자 DNA를 포함하는 용액 중에서 37℃에서 밤새 인큐베이션한 후, 필터를 약 37-50℃에서 1xSSC로 세척하는 것이다. 당업자라면, 프로브 길이 등과 같은 인자에 맞춰 필요한 온도, 이온 강도 등을 조정하는 방법을 인지할 것이다.
"단리된" 핵산 분자는 폴리펩티드 핵산의 천연 공급원에서 그와 통상적으로 회합되는 1종 이상의 오염 핵산 분자로부터 확인 및 분리된 핵산 분자이다. 단리된 핵산 분자는 자연계에서 발견되는 형태 또는 세팅 이외의 것이다. 따라서, 단리된 핵산 분자는 천연 세포에 존재하는 것과 같은 핵산 분자와 구별된다. 그러나, 단리된 핵산 분자는 폴리펩티드를 통상적으로 발현하는 세포 내에 함유되고, 예를 들어 천연 세포의 염색체 위치와는 상이한 염색체 위치에 있는 핵산 분자를 포함한다.
"프라이머"는 일반적으로 표적 서열에 혼성화함으로써 관심있는 샘플에 잠재적으로 존재하는 표적에 결합한 후, 표적에 상보성인 폴리뉴클레오티드의 중합을 촉진하는, 일반적으로 유리 3'-OH 기를 갖는 짧은 단일 가닥의 폴리뉴클레오티드이다.
용어 "하우스키핑(housekeeping) 유전자"는 세포 기능의 유지에 필수적인 활성을 갖는 단백질을 코딩하는 일군의 유전자를 나타낸다. 상기 유전자는 전형적으로 모든 세포 유형에서 유사하게 발현된다.
본원에 사용된 용어 "바이오마커"는 일반적으로, 포유동물 조직 또는 세포 중에서 또는 그 위에서의 발현이 표준 방법 (또는 본원에 개시된 방법)에 의해 검출될 수 있고, 혈관형성 억제에 기초한 치료 처방, 예를 들어 항혈관신생 작용제, 예를 들어, VEGF-특이적 억제제에 대한 포유동물 세포 또는 조직의 감수성에 대해 예측, 진단 및/또는 예후하는 것인, 유전자, 단백질, 당질 구조체, 또는 당지질을 비롯한 분자를 나타낸다. 특정 실시양태에서, 이러한 바이오마커의 발현은 참조 샘플에 대해 관찰된 것보다 더 높거나 더 낮은 것으로 결정된다. 이러한 바이오마커의 발현은 고효율의 멀티플렉스화된 면역검정, 예를 들어 룰즈 베이스드 메디슨, 인크.(Rules Based Medicine, Inc.) 또는 메조 스케일 디스커버리(Meso Scale Discovery)로부터 상업적으로 이용가능한 것을 사용함으로써 결정할 수 있다. 바이오마커의 발현은 또한 예를 들어 PCR 또는 FACS 검정, 면역조직화학적 검정 또는 유전자 칩-기반 검정을 사용함으로써 결정될 수 있다.
본원에 사용된 용어 "어레이" 또는 "마이크로어레이"는 기판 상에 혼성화가능한 어레이 요소, 바람직하게는 폴리뉴클레오티드 프로브 (예를 들어, 올리고뉴클레오티드)가 정렬된 배열을 나타낸다. 상기 기판은 고체 기판, 예를 들어 유리 슬라이드, 또는 반-고체 기판, 예를 들어 니트로셀룰로스 막일 수 있다. 뉴클레오티드 서열은 DNA, RNA, 또는 이들의 임의의 치환일 수 있다.
본원에 사용된 "유전자", "표적 유전자", "표적 바이오마커", "표적 서열", "표적 핵산" 또는 "표적 단백질"은 검출을 원하는, 관심있는 폴리뉴클레오티드 또는 단백질이다. 일반적으로, 본원에 사용된 "주형"은 표적 뉴클레오티드 서열을 함유하는 폴리뉴클레오티드이다. 일부 경우에, 용어 "표적 서열", "주형 DNA", "주형 폴리뉴클레오티드", "표적 핵산", "표적 폴리뉴클레오티드" 및 이들의 변이체가 교환가능하게 사용된다.
본원에 사용된 "증폭"은 일반적으로 원하는 서열의 다중 카피를 생산하는 과정을 나타낸다. "다중 카피"란 2개 이상의 카피를 의미하는 것이다. "카피"가 반드시 주형 서열에 대한 완전한 서열 상보성 또는 동일성을 의미하는 것이 아니다. 예를 들어, 카피는 뉴클레오티드 유사체, 예를 들어 데옥시이노신, 의도적인 서열 변경 (예를 들어, 주형에 혼성화가능하지만 상보성이지는 않은 서열을 포함하는 프라이머를 통해 도입되는 서열 변경), 및/또는 증폭 동안 발생하는 서열 오류를 포함할 수 있다.
"천연 서열" 폴리펩티드는 자연계로부터 유래된 폴리펩티드와 동일한 아미노산 서열을 갖는 폴리펩티드를 포함한다. 따라서, 천연 서열 폴리펩티드는 임의의 포유동물로부터의 자연 발생 폴리펩티드의 아미노산 서열을 가질 수 있다. 이러한 천연 서열 폴리펩티드는 자연계로부터 단리될 수도 있고, 또는 재조합 또는 합성 수단에 의해 생성될 수도 있다. 구체적으로, 용어 "천연 서열" 폴리펩티드는 폴리펩티드의 자연 발생 말단절단 또는 분비 형태 (예를 들어, 세포외 도메인 서열), 폴리펩티드의 자연 발생 변이체 도메인 (예를 들어, 다르게 스플라이싱된 형태) 및 자연 발생 대립유전자 변이체를 포함한다.
"단리된" 폴리펩티드 또는 "단리된" 항체는 천연 환경의 성분으로부터 확인 및 분리 및/또는 회수된 것이다. 이것의 천연 환경의 오염 성분은 폴리펩티드에 대한 진단 또는 치료 용도를 방해하는 물질이고, 효소, 호르몬 및 기타 단백질성 또는 비-단백질성 용질을 포함할 수 있다. 특정 실시양태에서, 폴리펩티드는 (1) 로우리(Lowry) 방법으로 결정시에 폴리펩티드를 95 중량％ 초과로, 또는 99 중량％ 초과로, (2) 스피닝 컵 서열분석기를 사용함으로써 N-말단 또는 내부 아미노산 서열의 잔기 15개 이상을 수득하는데 충분한 정도로, 또는 (3) 쿠마시 블루(Coomassie blue) 또는 은 염색을 사용한 환원 또는 비-환원 조건하에서의 SDS-PAGE에 의해 균일한 것으로 나타날 때까지 정제될 것이다. 단리된 폴리펩티드는 재조합 세포 내의 계내 폴리펩티드를 포함하는데, 이는 상기 폴리펩티드의 천연 환경의 1종 이상의 성분이 존재하지 않을 것이기 때문이다. 그러나, 통상적으로, 단리된 폴리펩티드는 1회 이상의 정제 단계를 통해 제조될 것이다.
폴리펩티드 "변이체"는 천연 서열 폴리펩티드와 약 80％ 이상의 아미노산 서열 동일성을 갖는 생물학적 활성 폴리펩티드를 의미한다. 이러한 변이체는 예를 들어 하나 이상의 아미노산 잔기가 폴리펩티드의 N- 또는 C-말단에 부가되거나 결실된 폴리펩티드를 포함한다. 통상적으로, 변이체는 천연 서열 폴리펩티드와 약 80％ 이상의 아미노산 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90％ 이상의 아미노산 서열 동일성, 훨씬 더 바람직하게는 약 95％ 이상의 아미노산 서열 동일성을 가질 것이다.
용어 "항체"는 가장 광범위한 의미로 사용되고, 구체적으로는 모노클로날 항체 (전장 모노클로날 항체 포함), 폴리클로날 항체, 다중-특이적 항체 (예를 들어, 이중특이적 항체), 및 원하는 생물학적 활성을 나타내는 한은 항체 단편이 포함된다.
본원에 사용된 용어 "모노클로날 항체"는 실질적으로 동종인 항체 집단으로부터 수득된 항체를 지칭하며, 즉, 이 집단을 구성하는 개별 항체는 소량으로 존재할 수 있는 가능한 돌연변이, 예를 들어 자연 발생 돌연변이를 제외하고는 동일하다. 따라서, 수식어구 "모노클로날"은 항체의 특징을 별개의 항체의 혼합물이 아니라는 것으로 나타낸다. 특정 실시양태에서, 이러한 모노클로날 항체는 전형적으로 표적에 결합하는 폴리펩티드 서열을 포함하는 항체를 포함하고, 표적 결합 폴리펩티드 서열은 복수개의 폴리펩티드 서열로부터 단일 표적 결합 폴리펩티드 서열의 선별을 포함하는 과정에 의해 수득하였다. 예를 들어, 선별 과정은 복수개의 클론, 예컨대 하이브리도마 클론, 파지 클론 또는 재조합 DNA 클론의 풀로부터 독특한 클론을 선별하는 것일 수 있다. 선별된 표적 결합 서열은 예를 들어 표적에 대한 친화도 개선, 표적 결합 서열의 인간화, 세포 배양물 중 그의 생성 개선, 생체내에서의 그의 면역원성 감소, 다중특이적 항체의 생성 등을 위해 추가로 변경될 수 있고, 변경된 표적 결합 서열을 포함하는 항체도 본 발명의 모노클로날 항체임을 이해해야 한다. 전형적으로 상이한 결정자 (에피토프)에 대한 상이한 항체를 포함하는 폴리클로날 항체 제제와는 반대로, 모노클로날 항체 제제의 각각의 모노클로날 항체는 항원상의 단결정자에 대한 것이다. 모노클로날 항체 제제는 이것의 특이성에 더하여 전형적으로 다른 이뮤노글로불린에 의해 오염되지 않았다는 점에서 유리하다.
수식어구 "모노클로날"은 항체의 특징을 실질적으로 동종인 항체 집단으로부터 수득된 것으로 나타내며, 임의의 특정한 방법을 통한 항체 생성이 필요하다는 것으로 해석되어서는 안된다. 예를 들어, 본 발명에 따라 사용될 모노클로날 항체는 예를 들어, 하이브리도마 방법 (예를 들어, 문헌 [Kohler and Milstein, Nature, 256:495-97 (1975)]; [Hongo et al., Hybridoma, 14(3):253-260 (1995)]; [Harlow et al., Antibodies: A Laboratory Manual, (Cold Spring Harbor Laboratory Press, 2nd ed. 1988)]; [Hammerling et al., in: Monoclonal Antibodies and T-Cell Hybridomas 563-681 (Elsevier, N.Y., 1981)]), 재조합 DNA 방법 (예를 들어, 미국 특허 번호 4,816,567 참조), 파지-디스플레이 기술 (예를 들어, 문헌 [Clackson et al., Nature, 352: 624-628 (1991)]; [Marks et al., J. Mol. Biol. 222: 581-597 (1992)]; [Sidhu et al., J. Mol. Biol. 338(2): 299-310 (2004)]; [Lee et al., J. Mol. Biol. 340(5): 1073-1093 (2004)]; [Fellouse, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 101(34): 12467-12472 (2004)]; 및 [Lee et al., J. Immunol. Methods 284(1-2): 119-132 (2004)] 참조), 및 인간 이뮤노글로불린 서열을 코딩하는 인간 이뮤노글로불린 로커스 또는 유전자의 일부 또는 전부를 갖는 동물에서 인간 또는 인간-유사 항체를 생산하는 기술 (예를 들어, WO 1998/24893; WO 1996/34096; WO 1996/33735; WO 1991/10741; 문헌 [Jakobovits et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 90: 2551 (1993)]; [Jakobovits et al., Nature 362: 255-258 (1993)]; [Bruggemann et al., Year in Immunol. 7:33 (1993)]; 미국 특허 번호 5,545,807; 5,545,806; 5,569,825; 5,625,126; 5,633,425; 및 5,661,016; [Marks et al., Bio/Technology 10: 779-783 (1992)]; [Lonberg et al., Nature 368: 856-859 (1994)]; [Morrison, Nature 368: 812-813 (1994)]; [Fishwild et al., Nature Biotechnol. 14: 845-851 (1996)]; [Neuberger, Nature Biotechnol. 14: 826 (1996)]; 및 [Lonberg and Huszar, Intern. Rev. Immunol. 13: 65-93 (1995)] 참조)을 포함하는 다양한 기술에 의해 제조할 수 있다.
구체적으로, 본원에서의 모노클로날 항체는 중쇄 및/또는 경쇄의 일부가 특정 종으로부터 유래되거나 특정 항체 클래스 또는 하위클래스에 속하는 항체의 상응하는 서열과 동일하거나 상동성이고, 쇄(들)의 나머지 부분은 또 다른 종으로부터 유래되거나 또 다른 항체 클래스 또는 하위클래스에 속하는 항체의 상응하는 서열과 동일하거나 상동성인 "키메라" 항체, 및 원하는 생물학적 활성을 나타내는 한은 이러한 항체의 단편을 포함한다 (미국 특허 번호 4,816,567 및 문헌 [Morrison et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 81:6851-6855 (1984)]). 키메라 항체는 항체의 항원 결합 영역이 예를 들어 마카쿠 원숭이를 관심 항원으로 면역화하여 생성된 항체로부터 유래된 프리마티즈드(PRIMATIZED)® 항체를 포함한다.
달리 나타내지 않는 한, 표현 "다가 항체"는 3개 이상의 항원 결합 부위를 포함하는 항체를 나타낸다. 특정 실시양태에서, 다가 항체는 3개 이상의 항원 결합 부위를 갖도록 조작되고, 일반적으로 천연 서열 IgM 또는 IgA 항체가 아니다.
비-인간 (예를 들어, 뮤린) 항체의 "인간화" 형태는 비-인간 이뮤노글로불린에서 유래된 최소 서열을 함유하는 키메라 항체이다. 한 실시양태에서, 인간화 항체는 수용자의 HVR로부터의 잔기가 원하는 특이성, 친화도 및/또는 능력을 갖는 마우스, 래트, 토끼 또는 비-인간 영장류와 같은 비-인간 종 (공여자 항체)의 HVR의 잔기로 대체된 인간 이뮤노글로불린 (수용자 항체)이다. 일부 경우에, 인간 이뮤노글로불린의 FR 잔기를 상응하는 비-인간 잔기로 대체한다. 추가로, 인간화 항체는 수용자 항체 또는 공여자 항체에서는 발견되지 않는 잔기를 포함할 수도 있다. 이러한 변형은 항체 성능이 추가로 개선되도록 이루어질 수 있다. 일반적으로, 인간화 항체는 하나 이상, 전형적으로는 2개의 가변 도메인을 실질적으로 모두 포함할 것이고, 여기서 모든 또는 실질적으로 모든 초가변 루프는 비-인간 이뮤노글로불린의 그것에 상응하고 모든 또는 실질적으로 모든 FR은 인간 이뮤노글로불린 서열의 그것이다. 또한, 인간화 항체는 임의로 이뮤노글로불린 불변 영역 (Fc) 중 적어도 일부, 전형적으로는 인간 이뮤노글로불린의 적어도 일부를 포함할 것이다. 보다 상세한 내용은, 예를 들어 문헌 [Jones et al., Nature 321:522-525 (1986)]; [Riechmann et al., Nature 332:323-329 (1988)]; 및 [Presta, Curr. Op. Struct. Biol. 2:593-596 (1992)]을 참조한다. 또한, 예를 들어 문헌 [Vaswani and Hamilton, Ann. Allergy, Asthma & Immunol. 1:105-115 (1998)]; [Harris, Biochem. Soc. Transactions 23:1035-1038 (1995)]; [Hurle and Gross, Curr. Op. Biotech. 5:428-433 (1994)]; 및 미국 특허 번호 6,982,321 및 7,087,409를 참조한다.
"인간 항체"는 인간에 의해 생성된 항체의 아미노산 서열에 상응하는 아미노산 서열을 갖고/거나 본원에 개시된 바와 같은 인간 항체 제조 기술 중 임의의 것을 이용하여 제조된 것이다. 인간 항체의 이러한 정의에서 비-인간 항원 결합 잔기를 포함하는 인간화 항체는 명확하게 제외된다. 인간 항체는 파지 디스플레이 라이브러리를 비롯한 당업계에 공지된 각종 기술을 사용하여 생성할 수 있다. 문헌 [Hoogenboom and Winter, J. Mol. Biol., 227:381 (1991)]; [Marks et al., J. Mol. Biol., 222:581 (1991)]. 또한, 문헌 [Cole et al., Monoclonal Antibodies and Cancer Therapy, Alan R. Liss, p. 77 (1985)]; [Boerner et al., J. Immunol., 147(1):86-95 (1991)]에 기재된 방법도 인간 모노클로날 항체의 제조에 이용가능하다. 또한 문헌 [van Dijk and van de Winkel, Curr. Opin. Pharmacol., 5: 368-74 (2001)]을 참조한다. 인간 항체는 항원 시험접종에 반응하여 이러한 항체를 생성하도록 변형되었으나 내인성 유전자좌는 무력화시킨 트랜스제닉 동물, 예를 들어 면역화된 제노마우스에게 항원을 투여하여 제조될 수 있다 (예를 들어, 제노마우스(XENOMOUSE)TM 기술에 관한 미국 특허 번호 6,075,181 및 6,150,584 참조). 또한, 인간 B-세포 하이브리도마 기술을 통해 생성된 인간 항체에 관해서는 예를 들어 문헌 [Li et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 103:3557-3562 (2006)]을 참고한다.
항체의 "가변 영역" 또는 "가변 도메인"은 항체의 중쇄 또는 경쇄의 아미노-말단 도메인을 나타낸다. 중쇄의 가변 도메인은 "VH"로서 지칭될 수 있다. 경쇄의 가변 도메인은 "VL"로서 지칭될 수 있다. 이들 도메인은 일반적으로 항체의 가장 가변적인 부분이고, 항원-결합 부위를 함유한다.
용어 "가변"은 가변 도메인의 특정 부분들이 항체들 사이에서 광범위한 서열 상이성을 나타낸다는 사실을 나타내고, 각 특정 항체의 특정 항원에 대한 결합 및 특이성에서 사용된다. 그러나, 가변성이 항체 가변 도메인 전반에 걸쳐 고르게 분포되어 있는 것은 아니다. 이것은 경쇄 가변 도메인과 중쇄 가변 도메인 둘 모두에서 초가변 영역 (HVR)이라 불리는 3개의 절편에 집중되어 있다. 가변 도메인의 보다 고도로 보존된 부분은 프레임워크 영역 (FR)이라 불린다. 천연 중쇄 및 경쇄 각각의 가변 도메인은 주로 베타-시트 배위를 취하며 3개의 HVR에 의해 연결되어 있는 4개의 FR 영역을 포함하는데, 이것은 베타-시트 구조를 연결하고, 일부 경우에는 상기 베타-시트 구조의 일부를 형성하는 루프를 형성한다. 각 쇄에서의 HVR들은 FR 영역에 의해 근접하게 위치되어 있고, 다른 쇄로부터의 HVR과 함께 항체의 항원 결합 부위 형성에 기여한다 (문헌 [Kabat et al., Sequences of Proteins of Immunological Interest, Fifth Edition, National Institute of Health, Bethesda, MD (1991)] 참조). 불변 도메인은 항체를 항원에 결합시키는데는 직접 관여하지 않지만, 항체 의존적 세포 독성에서의 항체 참여와 같은 다양한 이펙터 기능을 나타낸다.
"항체 단편"은 바람직하게는 항원 결합 영역을 포함하는 무손상 항체의 일부를 포함한다. 항체 단편의 예는 Fab, Fab', F(ab')2 및 Fv 단편, 디아바디, 선형 항체, 단일-쇄 항체 분자, 및 항체 단편들로부터 형성된 다중특이적 항체를 포함한다.
"Fv"는 완전한 항원-결합 부위를 함유하는 최소 항체 단편이다. 한 실시양태에서, 2-쇄 Fv 종은 1개의 중쇄 및 1개의 경쇄 가변 도메인이 단단하게 비공유적으로 회합된 이량체로 이루어진다. 단일쇄 Fv (scFv) 종에서, 1개의 중쇄 및 1개의 경쇄 가변 도메인은 경쇄 및 중쇄가 2-쇄 Fv 종에서와 유사한 "이량체" 구조로 회합할 수 있도록 가요성 펩티드 링커에 의해 공유적으로 연결될 수 있다. 이러한 형태에서, 각 가변 도메인의 3개의 HVR은 상호작용하여 VH-VL 이량체 표면의 항원 결합 부위를 규정한다. 전체적으로, 6개의 HVR이 항체에 항원 결합 특이성을 부여한다. 그러나, 단일 가변 도메인 (또는 항원에 특이적인 3개의 HVR 만을 포함하는 Fv의 절반)일지라도 전체 결합 부위보다 친화도가 낮긴 하지만 항원을 인식하고 결합하는 능력을 갖는다.
Fab 단편은 중쇄 및 경쇄 가변 도메인을 함유하고, 또한 경쇄의 불변 도메인과 중쇄의 제1 불변 도메인 (CH1)을 함유한다. Fab' 단편은 항체 힌지 영역으로부터의 하나 이상의 시스테인을 포함하는 중쇄 CH1 도메인의 카르복시 말단에 수개의 잔기가 부가되었다는 점에서 Fab 단편과 상이하다. 본원에서, Fab'-SH는 불변 도메인의 시스테인 잔기(들)에 유리 티올 기를 보유하는 Fab'에 대한 명칭이다. F(ab')2 항체 단편은 원래 Fab' 단편들 사이에 힌지 시스테인을 갖는, Fab' 단편들의 쌍으로서 생성되었다. 항체 단편의 다른 화학적 커플링이 또한 공지되어 있다.
용어 "초가변 영역", "HVR" 또는 "HV"가 본원에서 사용되는 경우, 이것은 서열에서 초가변이고/거나 구조적으로 규정된 루프를 형성하는 항체 가변 도메인의 영역을 나타낸다. 일반적으로, 항체는 6개의 HVR; VH 내에 3개 (H1, H2, H3) 및 VL 내에 3개 (L1, L2, L3)를 포함한다. 천연 항체에서, H3 및 L3은 6개의 HVR 중에서 가장 높은 다양성을 나타내고, 특히 H3은 항체에 정밀한 특이성을 부여하는데 특유의 역할을 수행한다고 여겨진다. 예를 들어, 문헌 [Xu et al., Immunity 13:37-45 (2000)]; [Johnson and Wu, in Methods in Molecular Biology 248:1-25 (Lo, ed., Human Press, Totowa, NJ, 2003)]을 참조한다. 실제로, 중쇄만으로 이루어진 자연 발생 카멜리드(camelid) 항체는 경쇄의 부재 하에 기능적이고 안정하다. 예를 들어, 문헌 [Hamers-Casterman et al., Nature 363:446-448 (1993)]; [Sheriff et al., Nature Struct. Biol. 3:733-736 (1996)]을 참조한다.
"프레임워크" 또는 "FR" 잔기는 본원에 정의된 바와 같은 HVR 잔기 이외의 가변 도메인 잔기이다.
"친화도 성숙" 항체는 변경(들)을 보유하지 않는 모 항체와 비교하여 항원에 대한 항체의 친화도를 개선시키는, 하나 이상의 HVR에 하나 이상의 변경을 갖는 항체이다. 한 실시양태에서, 친화도 성숙 항체는 표적 항원에 대한 나노몰 또는 심지어 피코몰의 친화도를 갖는다. 친화도 성숙 항체는 당업계에 공지된 특정 절차를 이용하여 생성할 수 있다. 예를 들어, 문헌 [Marks et al. Bio/Technology 10:779-783 (1992)]은 VH 및 VL 도메인 셔플링(shuffling)에 의한 친화도 성숙을 기재하고 있다. HVR 및/또는 프레임워크 잔기의 무작위 돌연변이 유발은 예를 들어 문헌 [Barbas et al. Proc Nat. Acad. Sci. USA 91:3809-3813 (1994)]; [Schier et al. Gene 169:147-155 (1995)]; [Yelton et al. J. Immunol. 155:1994-2004 (1995)]; [Jackson et al., J. Immunol. 154(7):3310-9 (1995)]; 및 [Hawkins et al., J. Mol. Biol. 226:889-896 (1992)]에 기재되어 있다.
본원에서의 용어 "Fc 영역"은 이뮤노글로불린 중쇄의 C-말단 영역, 예를 들어 천연 서열 Fc 영역 및 변이체 Fc 영역을 정의하는데 사용된다. 이뮤노글로불린 중쇄의 Fc 영역의 경계는 달라질 수 있지만, 인간 IgG 중쇄 Fc 영역은 일반적으로 위치 Cys226에서의 아미노산 잔기로부터, 또는 Pro230으로부터 이것의 카르복실 말단까지의 스트레치인 것으로 정의된다. Fc 영역의 C-말단 리신 (EU 넘버링 시스템에 따른 잔기 447)은 예를 들어 항체의 생성 또는 정제 동안 또는 항체의 중쇄를 코딩하는 핵산의 재조합 조작으로 제거될 수 있다. 따라서, 무손상 항체의 조성물은 모든 K447 잔기가 제거된 항체 집단, K447 잔기가 제거되지 않는 항체 집단, 및 K447 잔기가 존재하는 항체와 존재하지 않는 항체들의 혼합물을 갖는 항체 집단을 포함할 수 있다.
"기능적 Fc 영역"은 천연 서열 Fc 영역의 "이펙터 기능"을 보유한다. 예시적인 "이펙터 기능"은 C1q 결합; CDC; Fc 수용체 결합; ADCC; 식세포작용; 세포 표면 수용체 (예를 들어, B 세포 수용체; BCR)의 하향 조절 등을 포함한다. 상기 이펙터 기능은 일반적으로 Fc 영역이 결합 도메인 (예를 들어, 항체 가변 도메인)과 결합할 것을 필요로 하고, 예를 들어 본원의 정의에서 개시된 바와 같은 다양한 검정을 사용하여 평가할 수 있다.
"천연 서열 Fc 영역"은 자연계에서 발견된 Fc 영역의 아미노산 서열과 동일한 아미노산 서열을 포함한다. 천연 서열 인간 Fc 영역은 천연 서열 인간 IgG1 Fc 영역 (비-A 및 A 동종이형); 천연 서열 인간 IgG2 Fc 영역; 천연 서열 인간 IgG3 Fc 영역; 및 천연 서열 인간 IgG4 Fc 영역 뿐만 아니라 이들의 자연 발생 변이체를 포함한다.
"변이체 Fc 영역"은 하나 이상의 아미노산 변형, 바람직하게는 하나 이상의 아미노산 치환(들)을 통하여 천연 서열 Fc 영역과는 상이한 아미노산 서열을 포함한다. 바람직하게는, 변이체 Fc 영역은 천연 서열 Fc 영역 또는 모 폴리펩티드의 Fc 영역과 비교하여 하나 이상의 아미노산 치환을 갖고, 예를 들어 천연 서열 Fc 영역 또는 모 폴리펩티드의 Fc 영역에서 약 1 내지 약 10개의 아미노산 치환, 바람직하게는 약 1 내지 약 5개의 아미노산 치환을 갖는다. 본원에서의 변이체 Fc 영역은 천연 서열 Fc 영역 및/또는 모 폴리펩티드의 Fc 영역과의 상동성이 바람직하게 약 80％ 이상, 가장 바람직하게는 그와의 상동성이 약 90％ 이상, 보다 바람직하게는 그와의 상동성이 약 95％ 이상일 것이다.
"Fc 수용체" 또는 "FcR"은 항체의 Fc 영역에 결합하는 수용체를 기재한다. 일부 실시양태에서, FcR은 천연 인간 FcR이다. 일부 실시양태에서, FcR은 IgG 항체에 결합하는 수용체 (감마 수용체)이고, FcγRI, FcγRII 및 FcγRIII 하위클래스의 수용체를 포함하며, 이들은 이들 수용체의 대립유전자 변이체 및 다르게 스플라이싱된 형태를 포함한다. FcγRII 수용체는 FcγRIIA ("활성화 수용체") 및 FcγRIIB ("억제 수용체")를 포함하는데, 이들은 그의 세포질 도메인에서 주로 차이가 나는 유사한 아미노산 서열을 갖는다. 활성화 수용체 FcγRIIA는 그의 세포질 도메인에 면역수용체 티로신-기재의 활성화 모티프 (ITAM)를 함유한다. 억제 수용체 FcγRIIB는 그의 세포질 도메인에 면역수용체 티로신 기재의 억제 모티프 (ITIM)를 함유한다. (예를 들어, 문헌 [Daeron, Annu. Rev. Immunol. 15:203-234 (1997)] 참조). FcR은 예를 들어 문헌 [Ravetch and Kinet, Annu. Rev. Immunol 9:457-92 (1991)]; [Capel et al., Immunomethods 4:25-34 (1994)]; 및 [de Haas et al., J. Lab. Clin. Med. 126:330-41 (1995)]에서 검토된다. 추후로 확인될 것을 포함하는 다른 FcR이 본원의 용어 "FcR"에 포함된다.
용어 "Fc 수용체" 또는 "FcR"은 또한 모체 IgG의 태아로의 전달 (문헌 [Guyer et al., J. Immunol. 117:587 (1976)] 및 [Kim et al., J. Immunol. 24:249 (1994)]) 및 이뮤노글로불린의 항상성 조절을 담당하는 신생아 수용체 FcRn을 포함한다. FcRn에 대한 결합을 측정하는 방법은 공지되어 있다 (예를 들어, 문헌 [Ghetie and Ward., Immunol. Today 18(12):592-598 (1997)]; [Ghetie et al., Nature Biotechnology, 15(7):637-640 (1997)]; [Hinton et al., J. Biol. Chem. 279(8):6213-6216 (2004)]; WO 2004/92219 (Hinton et al.) 참조).
인간 FcRn 고친화도 결합 폴리펩티드의 인간 FcRn에 대한 생체내 결합 및 혈청 반감기는, 예를 들어 인간 FcRn을 발현하는 트랜스제닉 마우스 또는 형질감염된 인간 세포주에서, 또는 변이체 Fc 영역을 갖는 폴리펩티드를 투여한 영장류에서 검정할 수 있다. WO 2000/42072 (Presta)에는 FcR에 대한 결합이 개선되거나 감소된 항체 변이체가 기재되어 있다. 또한, 예를 들어 문헌 [Shields et al. J. Biol. Chem. 9(2):6591-6604 (2001)]을 참조한다.
"인간 이펙터 세포"는 하나 이상의 FcR을 발현하고 이펙터 기능을 수행하는 백혈구이다. 특정 실시양태에서, 세포는 적어도 FcγRIII을 발현하고 ADCC 이펙터 기능(들)을 수행한다. ADCC를 매개하는 인간 백혈구의 예는 말초혈 단핵 세포 (PBMC), 천연 킬러 (NK) 세포, 단핵구, 세포독성 T 세포 및 호중구를 포함한다. 이펙터 세포는 천연 공급원, 예를 들어 혈액으로부터 단리될 수 있다.
"항체-의존성 세포-매개 세포독성" 또는 "ADCC"는 특정 세포독성 세포 (예를 들어, NK 세포, 호중구 및 대식세포) 상에 존재하는 Fc 수용체 (FcR)와 결합된 분비형 Ig가 이들 세포독성 이펙터 세포가 항원-보유 표적 세포에 특이적으로 결합할 수 있게 하고, 이후에 표적 세포를 세포독소로 사멸시킬 수 있게 하는 세포독성의 형태를 나타낸다. ADCC를 매개하는 주요 세포인 NK 세포는 FcγRIII 만을 발현하는 반면에, 단핵구는 FcγRI, FcγRII 및 FcγRIII을 발현한다. 조혈 세포 상에서의 FcR 발현은 문헌 [Ravetch and Kinet, Annu. Rev. Immunol 9:457-92 (1991)]의 페이지 464, 표 3에 요약되어 있다. 관심 분자의 ADCC 활성을 평가하기 위해서, 미국 특허 번호 5,500,362 또는 5,821,337 또는 미국 특허 번호 6,737,056 (Presta)에 기재된 바와 같은 시험관내 ADCC 검정을 수행할 수 있다. 이러한 검정에 유용한 이펙터 세포는 PBMC 및 NK 세포를 포함한다. 다르게는 또는 추가로, 관심있는 분자의 ADCC 활성은 문헌 [Clynes et al. PNAS (USA) 95:652-656 (1998)]에 개시된 바와 같은 동물 모델에서 생체내 평가할 수 있다.
"보체 의존성 세포독성" 또는 "CDC"는 보체 존재 하에 표적 세포의 용해를 나타낸다. 고전적인 보체 경로의 활성화는 보체 시스템의 제1 성분 (C1q)이 동족 항원에 결합된 항체 (적절한 서브클래스의 항체)에 결합함으로써 개시된다. 보체 활성화를 평가하기 위해, 예를 들어 문헌 [Gazzano-Santoro et al., J. Immunol. Methods 202:163 (1996)]에 기재되어 있는 바와 같은 CDC 검정을 수행할 수 있다. 변경된 Fc 영역 아미노산 서열을 갖는 폴리펩티드 변이체 (변이체 Fc 영역을 갖는 폴리펩티드) 및 증가되거나 감소된 C1q 결합 능력을 갖는 폴리펩티드 변이체는 예를 들어 미국 특허 번호 6,194,551 B1 및 WO 1999/51642에 기재되어 있다. 또한, 예를 들어 문헌 [Idusogie et al. J. Immunol. 164: 4178-4184 (2000)]을 참조한다.
용어 "Fc 영역-포함 항체"는 Fc 영역을 포함하는 항체를 나타낸다. Fc 영역의 C-말단 리신 (EU 넘버링 시스템에 따른 잔기 447)은 예를 들어 항체의 정제 동안, 또는 항체를 코딩하는 핵산의 재조합 조작에 의해 제거될 수 있다. 따라서, 본 발명에 따른 Fc 영역을 갖는 항체를 포함하는 조성물은 K447을 갖는 항체, 모든 K447 잔기가 제거된 항체, 또는 K447 잔기가 존재하거나 존재하지 않는 항체들의 혼합물을 포함할 수 있다.
"차단" 항체 또는 "길항제" 항체는 이것이 결합하는 항원의 생물학적 활성을 억제하거나 감소시키는 항체이다. 예를 들어, VEGF-특이적 길항제 항체는 VEGF와 결합하여 혈관 내피 세포 증식을 유도하거나 혈관 투과성을 유도하는 VEGF의 능력을 억제한다. 특정 차단 항체 또는 길항제 항체는 항원의 생물학적 활성을 실질적으로 또는 완전히 억제한다.
본원에서 사용된 바와 같이, "치료" (및 "치료하다" 또는 "치료하는"과 같은 변형 형태)는 치료할 개체 또는 세포의 천연 과정을 변경시키려는 시도의 임상적 개입을 지칭하고, 임상 병리의 예방을 위해 또는 임상 병리의 과정 동안 수행될 수 있다. 바람직한 치료 효과는 질환의 발생 또는 재발 방지, 증상의 호전, 질환의 임의의 직접 또는 간접적인 병리적 결과의 축소, 전이의 예방, 질환 질행 속도의 감소, 질환 상태의 호전 또는 완화, 및 차도 또는 개선된 예후를 포함한다. 일부 실시양태에서, 본 발명의 방법 및 조성물은 질환 또는 장애의 발생을 지연시키거나 질환 또는 장애의 진행을 지연시키는데 사용된다.
"유효량"은 필요한 투여량에서 필요한 기간 동안 원하는 치료 또는 예방 결과를 달성하는데 효과적인 양을 나타낸다.
본 발명의 물질/분자의 "치료 유효량"은 개체병 상태, 연령, 성별 및 체중, 및 개체에서 원하는 반응을 유발하는 물질/분자의 능력과 같은 인자에 따라 달라질 수 있다. 치료 유효량은 물질/분자의 임의의 독성 또는 유해한 효과를 치료상 유익한 효과가 능가하는 양을 포함한다. 치료 유효량은 또한 이익, 예를 들어 임상적 이익을 부여하기에 충분한 양을 포함한다.
"예방 유효량"은 원하는 예방 결과 달성에 필요한 용량 및 이러한 기간 동안 효과적인 양을 나타낸다. 전형적으로, 예방 용량은 질환의 보다 초기 단계 이전 또는 보다 초기 단계의 대상체에서 사용되기 때문에 예방 유효량은 치료 유효량보다 적을 것이지만 반드시 이러한 것은 아니다. 예방 유효량은 이익, 예를 들어 임상적 이익을 부여하기에 충분한 양을 포함한다.
전암성, 양성, 조기 또는 말기 종양의 경우, 치료 유효량의 혈관신생 억제제는 암 세포의 수 감소, 원발성 종양의 크기 감소, 말초 장기로의 암 세포 침윤의 억제 (즉, 어느 정도 지연되고 바람직하게는 정지하는 것), 종양 전이의 억제 (즉, 어느 정도 지연되고 바람직하게는 정지하는 것), 종양 성장 또는 종양 진행의 어느 정도의 억제 또는 지연, 및/또는 장애와 관련된 하나 이상의 증상의 어느 정도의 경감을 유도할 수 있다. 약물이 기존 암 세포의 성장을 예방하고/하거나 기존 암 세포를 사멸시킬 수 있는 정도라면, 이것은 세포증식 억제성 및/또는 세포독성일 수 있다. 암 요법의 경우, 생체내 효능은 예를 들어 생존 기간, 질환 진행까지의 시간 (TTP), 반응률 (RR), 반응 지속기간, 및/또는 삶의 질을 평가하여 측정될 수 있다.
"억제하다"는 참조물과 비교하여 활성, 기능, 및/또는 양을 감소 또는 저하시키는 것이다. 특정 실시양태에서, "감소" 또는 "억제"는 20％ 이상의 전반적 감소를 야기하는 능력을 의미한다. 또 다른 실시양태에서, "감소" 또는 "억제"는 50％ 이상의 전반적 감소를 야기하는 능력을 의미한다. 또 다른 실시양태에서, "감소" 또는 "억제"는 75％, 85％, 90％, 95％ 이상의 전반적 감소를 야기하는 능력을 의미한다. 감소 또는 억제는 치료할 장애의 증상, 전이의 존재 또는 크기, 원발성 종양의 크기, 또는 혈관신생 장애에서 혈관의 크기 또는 수를 지칭할 수 있다.
"장애"은 포유동물이 해당 장애에 걸리기 쉽게 하는 병적 상태를 포함하여 만성 및 급성 장애 또는 질환을 포함하는 (이에 제한되지는 않음), 치료로부터 이익을 얻게 될 임의의 상태이다. 장애는 혈관신생 장애를 포함한다. 본원에 사용된 "혈관신생 장애"는 비정상적인 혈관신생 또는 비정상적인 혈관 투과성 또는 누출이 관련된 임의의 상태를 나타낸다. 본원에서 치료될 혈관신생 장애의 비-제한적 예는 악성 및 양성 종양; 비-백혈병 및 림프양 악성종양; 및 특히 종양 (암) 전이를 포함한다.
"비정상적인 혈관신생"은 이환된 상태에서 또는 이환된 상태를 야기하도록 새로운 혈관이 과도하게 또는 달리 부적절하게 성장할 때 (예를 들어, 의학적 관점에서 바람직하지 않은 혈관신생의 위치, 타이밍, 정도 또는 발현) 발생한다. 일부 경우에, 과도하거나, 제어되지 않거나 달리 부적절한 혈관신생은 이환된 상태를 악화시키거나 또는 이환된 상태를 유발하는데 일조하는 새로운 혈관 성장이 있는 경우에 일어난다. 신규한 혈관은 병든 조직에 양분을 공급하고, 정상 조직을 파괴하고, 암의 경우, 신규한 혈관은 종양 세포가 순환계 내로 벗어나서 다른 기관에 머무르게 할 수 있다 (종양 전이). 비정상적인 혈관신생이 관여하는 장애의 예는 암, 특히 혈관성 고형 종양 및 전이성 종양 (결장암, 폐암 (특히 소세포 폐암) 또는 전립선암 포함), 안구 혈관신생에 의해 유발되는 질환, 특히 당뇨병성 실명, 망막병증, 원발성 당뇨병성 망막증 또는 연령-관련 황반 변성, 맥락막 신생혈관형성 (CNV), 당뇨병성 황반 부종, 병적 근시, 폰 히펠-린다우병 (von Hippel-Lindau disease), 눈의 히스토플라스마증 (histoplasmosis), 중심 망막 정맥 폐쇄 (CRVO), 각막 신생혈관형성, 망막 신생혈관형성 및 조홍; 건선, 건선성 관절염, 혈관모세포종, 예컨대 혈관종; 염증성 신장 질환, 예컨대 사구체신염, 특히 사구체간질증식성 사구체신염, 용혈성 요독성 증후군, 당뇨병성 신장병증 또는 고혈압성 신경화증; 다양한 염증성 질환, 예컨대 관절염, 특히 류마티스 관절염, 염증성 장 질환, 건선, 유육종증, 폐쇄성 동맥경화증 및 이식후 발생하는 질환, 자궁내막증 또는 만성 천식 및 다른 상태를 포함하나 이에 제한되지는 않는다.
"비정상적인 혈관 투과성"은 이환된 상태에서 또는 이환된 상태를 야기하도록 혈관과 혈관외 구획 사이의 유체, 분자 (예를 들어, 이온 및 영양물질) 및 세포 (예를 들어, 림프구)의 유동이 과도하거나 부적절할 때 (예를 들어, 의학적 관점에서 바람직하지 않은 혈관 투과성의 위치, 타이밍, 정도 또는 발현) 발생한다. 비정상적인 혈관 투과성은 맥관계를 통한 이온, 물, 영양물질, 또는 세포의 과도하거나 달리 부적절한 "누출"을 일으킬 수 있다. 일부 경우에, 과도하거나 비제어되거나 달리 부적절한 혈관 투과성 또는 혈관 누출은 예를 들어 뇌 종양을 포함한 종양과 관련된 부종을 포함하는 질환 상태; 악성 종양과 관련된 복수; 메이그스 (Meigs) 증후군; 폐렴; 신 증후군; 심낭 삼출; 흉막 삼출; 심혈관 질환, 예를 들어 심근 경색 및 졸중 후의 상태와 관련된 투과성 등을 악화하거나 유도한다. 본 발명에서는 비정상적인 혈관 투과성 또는 누출과 관련된 질환 및 장애가 발병하였거나 발병할 위험이 있는 환자를 치료하는 것을 고려한다.
용어 "세포 증식성 장애" 및 "증식성 장애"는 어느 정도의 비정상적인 세포 증식과 관련된 장애를 나타낸다. 한 실시양태에서, 세포 증식성 장애는 암이다. 한 실시양태에서, 세포 증식성 장애는 종양이다.
본원에 사용된 "종양"은 모든 신생물 세포 성장 및 증식 (악성 또는 양성 모두) 및 모든 전암성 및 암성 세포 및 조직을 나타낸다. 본원에서 지칭되는 바와 같이, 용어 "암", "암성", "세포 증식성 장애", "증식성 장애" 및 "종양"은 상호 배타적인 것이 아니다.
용어 "암" 및 "암성"은 조절되지 않는 세포 성장을 전형적인 특징으로 하는 포유동물에서의 생리적 상태를 지칭하거나 기재한다. 암의 예는 암종, 림프종, 아세포종, 육종, 및 백혈병 또는 림프양 악성종양을 포함하지만 이에 제한되지는 않는다. 이러한 암의 보다 특정한 예는 편평 세포 암 (예를 들어, 상피성 편평 세포 암), 폐암, 예를 들어 소세포 폐암, 비소세포 폐암, 폐의 선암종 및 폐의 편평 상피암, 복막암, 간세포암, 위암(gastric 또는 stomach cancer), 예를 들어 위장암 및 위장 간질 암, 췌장암, 교아세포종, 자궁경부암, 난소암, 간암, 방광암, 요로암, 간종양, 유방암, 결장암, 직장암, 결장직장암, 자궁내막 또는 자궁 암종, 침샘 암종, 신장암 또는 신암, 전립선암, 외음부암, 갑상선암, 간 암종, 항문 암종, 음경 암종, 흑색종, 표재성 확산 흑색종, 악성 검은사마귀 흑색종, 말단성 흑점양 흑색종, 결절성 흑색종, 다발성 골수종 및 B-세포 림프종 (예를 들어, 저등급/여포성 비호지킨 림프종 (NHL); 소 림프구성 (SL) NHL; 중등급/여포성 NHL; 중등급 미만성 NHL; 고등급 면역모세포성 NHL; 고등급 림프모구성 NHL; 고등급 소 비-분할 세포 NHL; 거대 질환 NHL; 외투 세포 림프종; AIDS-관련 림프종 및 발덴스트롬 마크로글로불린혈증); 만성 림프구성 백혈병 (CLL); 급성 림프모구성 백혈병 (ALL); 모발 세포 백혈병; 만성 림프모구성 백혈병; 및 이식 후 림프구증식 장애 (PTLD), 및 모반증과 관련된 비정상적인 혈관 증식, 부종 (예컨대, 뇌 종양과 관련된 부종), 메이그스 증후군, 뇌, 및 두경부암, 및 관련 전이를 포함하지만 이에 제한되지는 않는다. 특정 실시양태에서, 본 발명의 항체로 치료할 수 있는 암은 유방암, 결장직장암, 직장암, 비소세포 폐암, 교아세포종, 비호지킨 림프종 (NHL), 신세포암, 전립선암, 간암, 췌장암, 연조직 육종, 카포시 육종, 경동맥 암종, 두경부암, 난소암, 중피종, 및 다발성 골수종을 포함한다. 일부 실시양태에서, 암은 소세포 폐암, 교모세포종, 신경모세포종, 흑색종, 유방 암종, 위암, 결장직장암 (CRC) 및 간세포 암종으로 이루어진 군으로부터 선택된다. 또한, 일부 실시양태에서, 암은 비소세포 폐암, 결장직장암, 교모세포종 및 유방 암종 (이들 암의 전이 형태 포함)으로 이루어진 군으로부터 선택된다.
용어 "항암 요법"은 암 치료에 유용한 요법을 나타낸다. 항암 치료제의 예는 예를 들어 화학요법제, 성장 억제제, 세포독성제, 방사선 요법에 사용되는 작용제, 항혈관신생 작용제, 세포자멸제, 항튜불린제, 및 암 치료를 위한 다른 작용제, 예를 들어 항-HER-2 항체, 항-CD20 항체, 표피 성장 인자 수용체 (EGFR) 길항제 (예를 들어, 티로신 키나제 억제제), HER1/EGFR 억제제 (예를 들어, 에를로티닙 (타르세바(Tarceva)TM)), 혈소판 유래 성장 인자 억제제 (예를 들어, 글리벡(Gleevec)TM (이마티닙 메실레이트)), COX-2 억제제 (예를 들어, 셀레콕시브), 인터페론, 시토카인, ErbB2, ErbB3, ErbB4, PDGFR-베타, BlyS, APRIL, BCMA 또는 VEGF 수용체(들) 표적 중 하나 이상과 결합하는 길항제 (예를 들어, 중화 항체), TRAIL/Apo2, 및 다른 생물활성 및 유기 화학제 등을 포함하지만 이에 제한되지는 않는다. 이들의 조합 역시 본 발명에 포함된다.
"혈관신생 인자 또는 작용제"는 혈관의 발생을 자극하는데 관여하는, 예를 들어 혈관신생, 내피 세포 성장, 혈관의 안정성 및/또는 혈관형성 등을 촉진하는 성장 인자 또는 그의 수용체이다. 예를 들어 혈관신생 인자는, 예를 들어 VEGF 및 VEGF 부류의 구성원 및 그의 수용체 (VEGF-B, VEGF-C, VEGF-D, VEGFR1, VEGFR2 및 VEGFR3), PlGF, PDGF 부류, 섬유모세포 성장 인자 부류 (FGF), TIE 리간드 (안지오포이에틴, ANGPT1, ANGPT2), TIE1, TIE2, 에프린, Bv8, 델타-유사 리간드 4 (DLL4), Del-1, 섬유모세포 성장 인자: 산성 (aFGF) 및 염기성 (bFGF), FGF4, FGF9, BMP9, BMP10, 폴리스타틴, 과립구 콜로니-자극 인자 (G-CSF), GM-CSF, 간세포 성장 인자 (HGF)/산란 인자 (SF), 인터류킨-8 (IL-8), CXCL12, 렙틴, 미드카인, 뉴로필린, NRP1, NRP2, 태반 성장 인자, 혈소판-유래 내피 세포 성장 인자 (PD-ECGF), 혈소판-유래 성장 인자, 특히 PDGF-BB, PDGFR-알파 또는 PDGFR-베타, 플레이오트로핀 (PTN), 프로그라눌린, 프롤리페린, 형질전환 성장 인자-알파 (TGF-알파), 형질전환 성장 인자-베타 (TGF-베타), 종양 괴사 인자-알파 (TNF-알파), Alk1, CXCR4, Notch1, Notch4, Sema3A, Sema3C, Sema3F, Robo4 등을 포함하나, 이에 제한되지는 않는다. 이것은 혈관신생을 촉진하는 인자, 예컨대 ESM1 및 페를리칸을 더 포함할 것이다. 이것은 또한 상처 치유를 가속화하는 인자, 예컨대 성장 호르몬, 인슐린-유사 성장 인자-I (IGF-I), VIGF, 표피 성장 인자 (EGF), EGF-유사 도메인, 멀티플 7 (EGFL7), CTGF 및 그의 부류의 구성원, 및 TGF-알파 및 TGF-베타를 포함할 것이다. 예를 들어, 문헌 [Klagsbrun and D'Amore (1991) Annu. Rev. Physiol. 53:217-39]; [Streit and Detmar (2003) Oncogene 22:3172-3179]; [Ferrara & Alitalo (1999) Nature Medicine 5(12):1359-1364]; [Tonini et al. (2003) Oncogene 22:6549-6556] (예를 들어, 공지된 혈관신생 인자를 열거한 표 1); 및 [Sato (2003) Int. J. Clin. Oncol. 8:200-206]을 참조한다.
"항혈관신생 작용제" 또는 "혈관신생 억제제"는 혈관신생, 혈관형성, 또는 바람직하지 않은 혈관 투과성을 직접적으로 또는 간접적으로 억제하는 적은 분자량의 물질, 폴리뉴클레오티드 (예를 들어, 억제성 RNA (RNAi 또는 siRNA) 포함), 폴리펩티드, 단리된 단백질, 재조합 단백질, 항체, 또는 이들의 접합체 또는 융합 단백질을 나타낸다. 항혈관신생 작용제는 혈관신생 인자 또는 그의 수용체에 결합하고 이것의 혈관신생 활성을 차단하는 작용제를 포함한다는 것을 이해해야 한다. 예를 들어, 항혈관신생 작용제는 상기 정의된 바와 같은 혈관신생제에 대한 항체 또는 다른 길항제, 예를 들어 VEGF-A 또는 VEGF-A 수용체 (예를 들어, KDR 수용체 또는 Flt-1 수용체)에 대한 항체, 항-PDGFR 억제제, VEGF 수용체 신호전달을 차단하는 소분자 (예를 들어, PTK787/ZK2284, SU6668, 수텐트(SUTENT)®/SU11248 (수니티닙 말레이트), AMG706, 또는 예를 들어 국제 특허 출원 WO 2004/113304에 기재된 것들)이다. 항혈관신생 작용제는 하기 작용제들: VEGF 억제제, 예를 들어 VEGF-특이적 길항제, EGF 억제제, EGFR 억제제, 에르비툭스® (세툭시맙, 임클론 시스템즈, 인크.(ImClone Systems, Inc.), 미국 뉴저지주 브랜치버그), 벡티빅스® (파니투무맙, 암젠(Amgen), 미국 캘리포니아주 싸우전드 오크스), TIE2 억제제, IGF1R 억제제, COX-II (시클로옥시게나제 II) 억제제, MMP-2 (매트릭스-메탈로프로테이나제 2) 억제제, 및 MMP-9 (매트릭스-메탈로프로테이나제 9) 억제제, CP-547,632 (화이자 인크.(Pfizer Inc.), 미국 뉴욕주), 액시티닙 (화이자 인크.; AG-013736), ZD-6474 (아스트라제네카(AstraZeneca)), AEE788 (노파르티스(Novartis)), AZD-2171), VEGF 트랩 (리제네론/아벤티스(Aventis)), 바타라닙 (또한, PTK-787, ZK-222584로도 알려져 있음: 노파르티스 & 셰링 A G(Schering A G)), 마쿠젠(Macugen) (페갑타닙 옥타소듐, NX-1838, EYE-001, 화이자 인크./길레드(Gilead)/아이테크(Eyetech)), IM862 (사이트란 인크.(Cytran Inc.), 미국 워싱턴주 커클랜드); 및 리보자임(Ribozyme: 미국 콜로라도주 볼더) 및 키론(Chiron: 미국 캘리포니아주 에머리빌)으로부터 입수한 합성 리보자임인 안지오자임, 및 이들의 조합물을 포함하나, 이에 제한되지는 않는다. 다른 혈관신생 억제제는 트롬보스폰딘1, 트롬보스폰딘2, 콜라겐 IV 및 콜라겐 XVIII를 포함한다. VEGF 억제제는 미국 특허 번호 6,534,524 및 6,235,764 (둘 모두의 전문이 모든 목적을 위해 본원에서 참고로 도입된다)에 개시되어 있다. 항혈관신생 작용제는 또한 천연 혈관신생 억제제, 예를 들어 안지오스타틴, 엔도스타틴 등을 포함한다. 예를 들어, 문헌 [Klagsbrun and D'Amore (1991) Annu. Rev. Physiol. 53:217-39]; [Streit and Detmar (2003) Oncogene 22:3172-3179] (예를 들어, 악성 흑색종에서의 항혈관신생 요법을 열거한 표 3); [Ferrara & Alitalo (1999) Nature Medicine 5(12):1359-1364]; [Tonini et al. (2003) Oncogene 22:6549-6556] (예를 들어, 공지된 항혈관신생 인자를 열거한 표 2); 및 [Sato (2003) Int. J. Clin. Oncol. 8:200-206] (예를 들어, 임상 시험에서 사용된 항혈관신생 작용제를 열거한 표 1)을 참조한다.
용어 "항혈관신생 요법"은 항혈관신생 작용제를 투여하는 것을 포함하는, 혈관신생을 억제하는데 유용한 요법을 나타낸다.
본원에 사용된 용어 "세포독성제"는 세포의 기능을 억제 또는 저해하고/하거나 세포 사멸 또는 파괴를 야기하는 물질을 나타낸다. 상기 용어는 방사능 동위원소 (예를 들어, At211, I131, I125, Y90, Re186, Re188, Sm153, Bi212, P32, Pb212, 및 Lu의 방사능 동위원소), 화학요법제 (예를 들어, 메토트렉세이트, 아드리아마이신, 빈카 알칼로이드 (빈크리스틴, 빈블라스틴, 에토포시드), 독소루비신, 멜팔란, 미토마이신 C, 클로람부실, 다우노루비신 또는 기타 삽입성 작용제, 효소 및 그의 단편, 예컨대 뉴클레오티드분해 효소, 항생제, 및 독소, 예컨대 박테리아, 진균, 식물 또는 동물 기원의 소분자 독소 또는 효소 활성 독소, 예를 들어 그의 단편 및/또는 변이체, 및 하기 개시한 다양한 항종양제 또는 항암제를 포함한다. 다른 세포독성제는 하기 기재되어 있다. 종양치사제는 종양 세포의 파괴를 야기한다.
"독소"는 세포의 성장 또는 증식에 해로운 영향을 미칠 수 있는 임의의 물질이다.
"화학요법제"는 암 치료에 유용한 화학적 화합물이다. 화학요법제의 예는 알킬화제, 예컨대 티오테파 및 시클로스포스파미드 (사이톡산(CYTOXAN)®); 알킬 술포네이트, 예컨대 부술판, 임프로술판 및 피포술판; 아지리딘, 예컨대 벤조도파, 카르보쿠온, 메트우레도파 및 우레도파; 에틸렌이민 및 메틸아멜라민 (알트레타민, 트리에틸렌멜라민, 트리에틸렌포스포라미드, 트리에틸렌티오포스포라미드 및 트리메틸로멜라민 포함); 아세토게닌 (특히 불라타신 및 불라타시논); 델타-9-테트라히드로칸나비놀 (드로나비놀, 마리놀(MARINOL)®); 베타-라파콘; 라파콜; 콜히친; 베툴린산; 캄포테신 (합성 유사체 토포테칸 (하이캄틴(HYCAMTIN)®) 포함), CPT-11 (이리노테칸, 캄프토자르(CAMPTOSAR)®), 아세틸캄토테신, 스코폴렉틴, 및 9-아미노캄프토테신); 브리오스타틴; 칼리스타틴; CC-1065 (그의 아도젤레신, 카르젤레신 및 비젤레신 합성 유사체 포함); 포도필로톡신; 포도필린산; 테니포시드; 크립토파이신 (특히 크립토파이신 1 및 크립토파이신 8); 돌라스타틴; 두오카르마이신 (합성 유사체, KW-2189 및 CB1-TM1 포함); 엘류테로빈; 판크라티스타틴; 사르코딕티인; 스폰지스타틴; 질소 머스타드, 예컨대 클로람부실, 클로나파진, 클로로포스파미드, 에스트라무스틴, 이포스파미드, 메클로레타민, 메클로레타민 옥시드 히드로클로라이드, 멜팔란, 노벰비친, 페네스테린, 프레드니무스틴, 트로포스파미드, 우라실 머스타드; 니트로소우레아, 예컨대 카르무스틴, 클로로조토신, 포테무스틴, 로무스틴, 니무스틴 및 라님누스틴; 항생제, 예컨대 에네디인 항생제 (예를 들어, 칼리케아미신, 특히 칼리케아미신 감마1I 및 칼리케아미신 오메가I1 (예를 들어, 문헌 [Nicolaou et al., Angew. Chem Intl. Ed. Engl., 33: 183-186 (1994)] 참조); CDP323, 경구 알파-4 인테그린 억제제; 다이네미신 (다이네미신 A 포함); 에스페라마이신; 및 네오카르지노스타틴 발색단 및 관련 발색단백질 에네디인 항생제 발색단), 아클라시노마이신, 악티노마이신, 아우쓰라마이신, 아자세린, 블레오마이신, 칵티노마이신, 카라비신, 카르미노마이신, 카르지노필린, 크로모마이신, 닥티노마이신, 다우노루비신, 데토루비신, 6-디아조-5-옥소-L-노르류신, 독소루비신 (아드리아마이신(ADRIAMYCIN)®, 모르폴리노-독소루비신, 시아노모르폴리노-독소루비신, 2-피롤리노-독소루비신, 독소루비신 HCl 리포솜 주사 (독실(DOXIL)®), 리포솜 독소루비신 TLC D-99 (미오세트(MYOCET)®), PEG화 리포솜 독소루비신 (카엘릭스(CAELYX)®) 및 데옥시독소루비신 포함), 에피루비신, 에소루비신, 이다루비신, 마르셀로마이신, 미토마이신, 예컨대 미토마이신 C, 미코페놀산, 노갈라마이신, 올리보마이신, 페플로마이신, 포르피로마이신, 푸로마이신, 쿠엘라마이신, 로도루비신, 스트렙토니그린, 스트렙토조신, 투베르시딘, 우베니멕스, 지노스타틴, 조루비신; 항대사제, 예컨대 메토트렉세이트, 겜시타빈 (겜자르(GEMZAR)®), 테가푸르 (우프토랄(UFTORAL)®), 카페시타빈 (제로다(XELODA)®), 에포틸론, 및 5-플루오로우라실 (5-FU); 콤브레타스타틴; 엽산 유사체, 예컨대 데노프테린, 메토트렉세이트, 프테로프테린, 트리메트렉세이트; 퓨린 유사체, 예컨대 플루다라빈, 6-머캅토퓨린, 티아미프린, 티오구아닌; 피리미딘 유사체, 예컨대 안시타빈, 아자시티딘, 6-아자우리딘, 카르모푸르, 시타라빈, 디데옥시우리딘, 독시플루리딘, 에노시타빈, 플록스우리딘; 안드로겐, 예컨대 칼루스테론, 드로모스타놀론 프로피오네이트, 에피티오스타놀, 메피티오스탄, 테스토락톤; 항부신제, 예컨대 아미노글루테티미드, 미토탄, 트릴로스탄; 엽산 보충제, 예컨대 프롤린산; 아세글라톤; 알도포스파미드 글리코시드; 아미노레불린산; 에닐우라실; 암사크린; 베스트라부실; 비산트렌; 에다트렉세이트; 데포파민; 데메콜신; 디아지쿠온; 엘포르니틴; 엘립티늄 아세테이트; 에포틸론; 에토글루시드; 질산갈륨; 히드록시우레아; 렌티난; 로니다이닌; 메이탄시노이드, 예컨대 메이탄신 및 안사미토신; 미토구아존; 미토크산트론; 모피단몰; 니트라에린; 펜토스타틴; 페나메트; 피라루비신; 로소크산트론; 2-에틸히드라지드; 프로카르바진; PSK® 다당류 복합체 (미국 오레곤주 유진 소재의 JHS 내츄럴 프로덕츠(JHS Natural Products)); 라족산; 리족신; 시조피란; 스피로게르마늄; 테누아존산; 트리아지쿠온; 2,2',2'-트리클로로트리에틸아민; 트리코테센 (특히 T-2 독소, 베라쿠린 A, 로리딘 A 및 안귀딘); 우레탄; 빈데신 (엘디신(ELDISINE)®, 필데신(FILDESIN)®); 다카르바진; 만노무스틴; 미토브로니톨; 미토락톨; 피포브로만; 가시토신; 아라비노시드 ("Ara-C"); 티오테파; 탁소이드, 예를 들어, 파클리탁셀 (탁솔(TAXOL)®, 브리스톨-마이어스 스퀴브 온콜로지(Bristol-Myers Squibb Oncology), 미국 뉴저지주 프린스톤), 파클리탁셀의 알부민-처리된 나노입자 제제 (아브락산(ABRAXANE)TM), 및 도세탁셀 (탁소테레(TAXOTERE)®, 론-프랑 로러(Rhome-Poulene Rorer), 프랑스 안토니); 클로란부실; 6-티오구아닌; 머캅토퓨린; 메토트렉세이트; 백금 유사체, 예컨대 시스플라틴, 옥살리플라틴 (예를 들어, 엘록사틴(ELOXATIN)®) 및 카르보플라틴; 빈블라스틴 (벨반(VELBAN)®), 빈크리스틴 (온코빈(ONCOVIN)®), 빈데신 (엘디신®, 필데신®), 및 비노렐빈 (나벨빈(NAVELBINE)®)을 비롯한, 튜불린 중합이 미세소관을 형성하는 것을 방지하는 빈카; 에토포시드 (VP-16); 이포스파미드; 미토크산트론; 류코보린; 노반트론; 에다트렉세이트; 다우노마이신; 아미노프테린; 이반드로네이트; 토포이소머라제 억제제 RFS 2000; 디플루오로메틸오르니틴 (DMFO); 레티노이드, 예컨대 레티노산 (벡사로텐 (타르그레틴(TARGRETIN)®) 포함); 비스포스포네이트, 예컨대 클로드로네이트 (예를 들어, 보네포스(BONEFOS)® 또는 오스탁(OSTAC)®), 에티드로네이트 (디드로칼(DIDROCAL)®), NE-58095, 졸레드론산/졸레드로네이트 (조메타(ZOMETA)®), 알렌드로네이트 (포사맥스(FOSAMAX)®), 파미드로네이트 (아레디아(AREDIA)®), 틸루드로네이트 (스켈리드(SKELID)®), 또는 리세드로네이트 (악토넬(ACTONEL)®); 트록사시타빈 (1,3-디옥솔란 뉴클레오시드 시토신 유사체); 안티센스 올리고뉴클레오티드, 특히 이상 세포 증식에 관여하는 신호전달 경로에서 유전자의 발현을 억제하는 것, 예를 들어 PKC-알파, Raf, H-Ras, 및 표피 성장 인자 수용체 (EGF-R) (예를 들어, 에를로티닙 (타르세바TM); 및 세포 증식을 감소시키는 VEGF-A; 백신, 예컨대 테라토프(THERATOPE)® 백신 및 유전자 요법 백신, 예를 들어 알로벡틴(ALLOVECTIN)® 백신, 류벡틴(LEUVECTIN)® 백신, 및 박시드(VAXID)® 백신; 토포이소머라제 1 억제제 (예를 들어, 루르토테칸(LURTOTECAN)®); rmRH (예를 들어, 아바렐릭스(ABARELIX)®); BAY439006 (소라페닙; 바이엘(Bayer)); SU-11248 (수니티닙, 수텐트®, 화이자); 페리포신, COX-2 억제제 (예를 들어, 셀레콕시브 또는 에토리콕시브), 프로테오좀 억제제 (예를 들어, PS341); 보르테조밉 (벨케이드(VELCADE)®); CCI-779; 티피파르닙 (R11577); 오라페닙, ABT510; Bcl-2 억제제, 예컨대 오블리머센 나트륨 (게나센스(GENASENSE)®); 픽산트론; EGFR 억제제; 티로신 키나제 억제제; 세린-트레오닌 키나제 억제제, 예컨대 라파마이신 (시롤리무스, 라파문(RAPAMUNE)®); 파르네실트랜스퍼라제 억제제, 예컨대 로나파르닙 (SCH 6636, 사라사르(SARASAR)TM); 및 상기 임의의 작용제의 제약상 허용되는 염, 산 또는 유도체; 및 2개 이상의 상기 작용제의 조합물, 예컨대 CHOP (시클로포스파미드, 독소루비신, 빈크리스틴, 및 프레드니솔론의 조합 요법에 대한 약어) 및 FOLFOX (5-FU 및 류코보린과 조합된 옥살리플라틴 (엘록사틴TM)을 이용한 치료 요법에 대한 약어), 및 상기 임의의 작용제의 제약상 허용되는 염, 산 또는 유도체; 및 2개 이상의 상기 작용제의 조합물을 포함한다.
본원에 정의된 바와 같은 화학요법제는 암의 성장을 촉진할 수 있는 호르몬의 효과를 조절, 감소, 차단 또는 억제하는 작용을 하는 "항호르몬제" 또는 "내분비 치료제"를 포함한다. 이들은 그 자체가 호르몬일 수 있고, 항-에스트로겐 및 선택적인 에스트로겐 수용체 조절제 (SERM), 예를 들어 타목시펜 (예를 들어, 놀바덱스(NOLVADEX)® 타목시펜), 랄록시펜, 드롤록시펜, 4-히드록시타목시펜, 트리옥시펜, 케옥시펜, LY117018, 오나프리스톤, 및 파레스톤(FARESTON)ㆍ토레미펜; 부신에서 에스트로겐 생성을 조절하는 효소 아로마타제를 억제하는 아로마타제 억제제, 예를 들어 4(5)-이미다졸, 아미노글루테티미드, 메가스(MEGASE)® 메게스트롤 아세테이트, 아로마신(AROMASIN)® 엑세메스탄, 포르메스타니, 파드로졸, 리비소르(RIVISOR)® 보로졸, 페마라(FEMARA)® 레트로졸, 및 아리미덱스(ARIMIDEX)® 아나스트로졸; 및 항-안드로겐, 예컨대 플루타미드, 닐루타미드, 비칼루타미드, 류프롤리드 및 고세렐린; 및 트록사시타빈 (1,3-디옥솔란 뉴클레오시드 시토신 유사체); 안티센스 올리고뉴클레오티드, 특히 이상 세포 증식에 연루된 신호전달 경로 중의 유전자의 발현을 억제하는 것, 예를 들어 PKC-알파, Raf 및 H-Ras; 리보자임, 예컨대 VEGF 발현 억제제 (예를 들어, 안지오자임(ANGIOZYME)® 리보자임) 및 HER2 발현 억제제; 백신, 예컨대 유전자 요법 백신, 예를 들어 알로벡틴® 백신, 류벡틴® 백신, 및 박시드® 백신; 프로류킨(PROLEUKIN)® rIL-2; 루르토테칸® 토포이소머라제 1 억제제; 아바렐릭스® rmRH; 비노렐빈 및 에스페라마이신 (미국 특허 번호 4,675,187 참조), 및 이들 중 임의의 것의 제약상 허용되는 염, 산 또는 유도체; 및 이들 중 2종 이상의 조합물을 포함하지만 이에 제한되지는 않는다.
본원에서 사용된 "성장 억제제"는 시험관내 또는 생체내에서 세포의 성장을 억제하는 화합물 또는 조성물을 나타낸다. 한 실시양태에서, 성장 억제제는 항체가 결합하는 항원을 발현하는 세포의 증식을 방지 또는 감소시키는 성장 억제 항체이다. 또 다른 실시양태에서, 성장 억제제는 S기에서 세포의 백분율을 유의하게 감소시키는 것일 수 있다. 성장 억제제의 예는 세포 주기 진행을 (S기 이외의 다른 단계에) 차단하는 작용제, 예컨대 G1 정지 및 M기 정지를 유도하는 작용제를 포함한다. 통상적인 M기 차단제는 빈카 (빈크리스틴 및 빈블라스틴), 탁산 및 토포이소머라제 II 억제제, 예컨대 독소루비신, 에피루비신, 다우노루비신, 에토포시드 및 블레오마이신을 포함한다. G1을 정지시키는 작용제, 예를 들어 DNA 알킬화제, 예컨대 타목시펜, 프레드니손, 다카르바진, 메클로레타민, 시스플라틴, 메토트렉세이트, 5-플루오로우라실 및 ara-C는 S기 정지로까지 이어질 수도 있다. 추가의 정보는 문헌 [Mendelsohn and Israel, eds., The Molecular Basis of Cancer, Chapter 1, entitled "Cell cycle regulation, oncogenes, and antineoplastic drugs" by Murakami et al. (W.B. Saunders, Philadelphia, 1995)] (예를 들어, p. 13)에서 찾아볼 수 있다. 탁산 (파클리탁셀 및 도세탁셀)은 둘 모두 주목에서 유래된 항암 약물이다. 유럽형 주목에서 유래된 도세탁셀 (탁소테레®, 론-프랑 로러)은 파클리탁셀 (탁솔®, 브리스톨-마이어스 스퀴브)의 반합성 유사체이다. 파클리탁셀 및 도세탁셀은 튜불린 이량체로부터의 미세소관 어셈블리를 촉진하고, 탈중합을 방지함으로써 미세소관을 안정화시켜서 세포에서의 유사분열 억제를 야기한다.
"방사선 요법"은, 정상적으로 기능하거나 세포를 파괴시키는 능력이 완전히 제한되도록 세포에 대한 충분한 손상을 유도시키기 위해 지정된 감마선 또는 베타선을 사용하는 것을 나타낸다. 당업계에는 투여량 및 치료의 지속시간을 결정하는 수많은 방법이 공지되어 있음을 이해할 것이다. 전형적인 치료는 1회 투여로 제공되며, 전형적인 투여량은 1일 당 10 내지 200 단위 (그레이(Gray))의 범위이다.
용어 "제약 제제"는, 활성 성분의 생물학적 활성이 효과적이도록 하는 형태로 존재하며 제제가 투여될 대상체에게 허용될 수 없게 독성인 추가의 성분을 함유하지 않는 제제를 나타낸다. 이러한 제제는 멸균성일 수 있다.
"멸균" 제제는 무균 상태이거나 또는 모든 살아있는 미생물 및 이들의 포자가 존재하지 않는다.
1종 이상의 추가의 치료제와의 "조합" 투여는 동시 (공동) 투여 및 임의의 순서의 연속 또는 순차 투여를 포함한다.
본원에서, 용어 "동시"는 2종 이상의 치료제의 투여가 적어도 일부의 투여 시간이 중첩되는 경우를 지칭하는데 사용된다. 따라서, 동시 투여는 1종 이상의 다른 작용제(들)을 불순차적으로 투여한 후에 연속하여 1종 이상의 작용제(들)을 투여하는 경우의 투약법을 포함한다.
"만성" 투여는 급성 방식과는 반대로 연장된 기간의 시간 동안 초기 치료 효과 (활성)를 유지하기 위해 연속 방식으로 작용제(들)을 투여하는 것을 나타낸다. "간헐적" 투여는 중단없이 연속적으로 행해지지는 않지만 특성상 주기적인 치료법이다.
본원에서 사용된 바와 같이, "담체"는 사용되는 투여량 및 농도에서 그에 노출되는 세포 또는 포유동물에게 무독성인 제약상 허용되는 담체, 부형제 또는 안정화제를 포함한다. 종종, 생리학상 허용되는 담체는 수성 pH 완충 용액이다. 생리적으로 허용되는 담체의 예는 완충제, 예컨대 포스페이트, 시트레이트, 및 기타 유기산; 항산화제, 예를 들어 아스코르브산; 저분자량 (약 10개 잔기 미만) 폴리펩티드; 단백질, 예컨대 혈청 알부민, 젤라틴 또는 이뮤노글로불린; 친수성 중합체, 예컨대 폴리비닐피롤리돈; 아미노산, 예컨대 글리신, 글루타민, 아스파라긴, 아르기닌 또는 리신; 모노사카라이드, 디사카라이드 및 기타 탄수화물, 예를 들어 글루코스, 만노스 또는 덱스트린; 킬레이팅제, 예컨대 EDTA; 당 알콜, 예컨대 만니톨 또는 소르비톨; 염 형성 반대이온, 예컨대 나트륨; 및/또는 비이온성 계면활성제, 예컨대 트윈TM 폴리에틸렌 글리콜 (PEG) 및 플루로닉스TM를 포함한다.
"리포솜"은 약물 (예컨대, 항-VEGF 항체 또는 항-NRP1 항체)을 포유동물에게 전달하기 위해 유용한 다양한 유형의 지질, 인지질 및/또는 계면활성제로 구성된 소낭이다. 통상적으로, 리포솜의 성분들은 생체막의 지질 배열과 유사한 이중층 형태로 배열되어 있다.
본원에서, 용어 "진단"은 분자 또는 병리 상태, 질환 또는 상태의 확인, 예를 들어 암의 확인을 지칭하거나, 또는 특정 치료 처방으로부터 이익을 얻을 수 있는 암 환자의 확인을 지칭하는데 사용된다.
본원에서, 용어 "예후"는 항암 요법제로부터 이익을 얻을 가능성의 예측을 나타내는데 사용된다.
본원에서, 용어 "예측" 또는 "예상"은 환자가 특정 항암 요법제에 대하여 유리하게 또는 불리하게 반응성일 가능성을 나타내는데 사용된다. 한 실시양태에서, 예측 또는 예상은 이러한 반응의 정도에 관한 것이다. 한 실시양태에서, 예측 또는 예상은 환자가 치료, 예를 들어 특정 치료제를 사용한 치료 이후에 질환의 재발 없이 특정 기간 동안 생존하거나 개선되는지의 여부 및/또는 그러할 확률과 관련이 있다. 본 발명의 예측 방법은 임의의 특정 환자에 대한 가장 적절한 치료 처방을 선택하여 치료를 결정하는데 임상적으로 사용될 수 있다. 본 발명의 예측 방법은 환자가 치료 처방, 예를 들어 주어진 치료 처방, 예를 들어 주어진 치료제 또는 조합물의 투여, 수술적 개입, 스테로이드 치료 등에 유리하게 반응할 것인지의 여부 또는 치료 처방 수행 후에 환자의 장기간 생존이 가능한지의 여부를 예측할 때 유용한 도구이다.
환자의 반응성은 (1) 질환 진행의 어느 정도까지의 억제, 예를 들어 지연 및 완전한 성장 정지, (2) 병변 크기의 감소, (3) 인접한 말초 장기 및/또는 조직으로의 질환 세포 침윤의 억제 (즉, 감소, 지연 또는 완전한 정지), (4) 질환 확산의 억제 (즉, 감소, 지연 또는 완전한 정지), (5) 장애와 관련된 하나 이상의 증상의 어느 정도까지의 완화, (6) 처치 후 무병 상태를 보이는 기간의 증가, 및/또는 (8) 처치 후 주어진 시점에서의 사망률 감소를 포함하지만 이에 제한되지는 않은, 환자에 대한 이익을 나타내는 임의의 종점을 이용하여 평가할 수 있다.
용어 "이익"은 가장 광범위한 의미로 사용되고, 임의의 바람직한 효과를 지칭하며, 구체적으로는 본원에 정의된 바와 같은 임상적 이익을 포함한다.
임상적 이익은 다양한 종점, 예를 들어 질환 진행의 어느 정도까지의 억제, 예를 들어 지연 및 완전한 성장 정지, 질환 에피소드 및/또는 증상의 수 감소, 병변 크기의 감소, 인접한 말초 장기 및/또는 조직으로병 세포 침윤의 억제 (즉, 감소, 지연 또는 완전한 정지), 질환 확산의 억제 (즉, 감소, 지연 또는 완전한 정지), 질환 병변을 퇴행시키거나 제거할 수는 있지만 반드시 그래야 하는 것은 아닌 자가면역 반응의 감소, 장애와 관련된 하나 이상의 증상의 어느 정도까지의 완환, 처치 후 무병 상태, 예를 들어 무진행 생존을 보이는 기간의 증가, 전체 생존의 증가, 반응율의 증가, 및/또는 처치 후 주어진 시점에서의 사망률 감소를 평가하여 측정할 수 있다.
용어 "내성 암" 또는 "내성 종양"은 암 요법 과정 전반에 걸쳐 적어도 VEGF 길항제를 포함하는 암 요법에 대해 완전히 반응하지 않거나, 반응이 상실되거나 또는 반응 저하를 나타내는 암, 암성 세포 또는 종양을 나타낸다. 특정 실시양태에서, 내성 종양은 항-VEGF 항체 요법에 내성이 있는 종양이다. 한 실시양태에서, 항-VEGF 항체는 베바시주맙이다. 특정 실시양태에서, 내성 종양은 적어도 VEGF 길항제를 포함하는 암 요법에 반응하지 않을 가능성이 있는 종양이다.
"재발된"은 상기 병든 상태로의 환자의 병의 회귀, 특히 명백한 회복 또는 부분적 회복후 증상의 복귀를 나타낸다. 달리 나타내지 않는 한, 재발된 상태는 VEGF 길항제 및 화학요법 치료를 포함하나 이에 제한되지는 않는 이전 치료 전의 병으로 복귀하는 과정 또는 병으로의 복귀를 나타낸다. 특정 실시양태에서, VEGF 길항제는 항-VEGF 항체이다.
III. 본 발명의 방법
본 발명은 부분적으로 VEGF 길항제 이외의 또는 VEGF 길항제에 부가한 항혈관신생 요법 또는 치료제의 효능과 상관관계가 있는 특정 유전자 또는 바이오마커의 사용을 기반으로 한다. 적합한 VEGF 길항제 이외의 또는 VEGF 길항제에 부가한 요법 또는 치료제는 NRP1 길항제, EGFL7 길항제 또는 VEGF-C 길항제를 포함하나 이에 제한되지는 않는다. 따라서, 개시된 방법은 환자를 치료하는데 있어 적절하거나 효과적인 요법을 평가하는데 유용한 데이터 및 정보를 수득하기 위한, 편리하고, 효율적이며, 잠재적으로는 비용면에서도 효과적인 수단을 제공한다. 예를 들어, 조직 또는 세포 샘플을 수득하기 위해 암 환자에서 생검을 수행할 수 있고, 샘플을 다양한 시험관내 검정으로 검사하여 하나 이상의 바이오마커의 발현 수준이 참조 샘플에서 발현 수준과 비교하여 증가 또는 감소하였는지 결정할 수 있다. 표 1에 열거된 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49, 50, 51, 52, 53, 54, 55, 56, 57, 58, 59, 60, 61, 62, 63, 64, 65, 66, 67, 68, 69, 70, 71, 72, 73, 74, 75, 76, 77, 78, 79, 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 또는 94개 이상의 유전자의 발현 수준이 증가 또는 감소하였다면, 환자는 VEGF 길항제 이외의 또는 VEGF 길항제에 부가한 요법 또는 치료제로의 치료로부터 이익을 얻을 가능성이 있다.
유전자 또는 바이오마커의 발현 수준/양은 mRNA, cDNA, 단백질, 단백질 단편 및/또는 유전자 카피수를 포함하나 이에 제한되지는 않는, 당업계에 공지된 임의의 적합한 기준을 바탕으로 결정될 수 있다.
샘플에서 다양한 유전자 또는 바이오마커의 발현을 여러가지 방법으로 분석할 수 있는데, 이러한 방법 중 많은 것들이 당업계에 공지되어 있으며 당업자가 이해하고 있는 것이고, 면역조직화학법 및/또는 웨스턴 블롯팅 분석, 면역침전법, 분자 결합 검정법, ELISA, ELIFA, 형광 활성화 세포 분류법 (FACS) 등, 정량적 혈액-기재의 검정법 (예를 들어, 혈청 ELISA) (예를 들어, 단백질 발현 수준을 검사하기 위함), 생화학적 효소 활성 검정법, 계내 혼성화, 노던 분석 및/또는 mRNA의 PCR 분석 및 유전자 및/또는 조직 어레이 분석으로 수행될 수 있는 매우 다양한 검정법들 중 임의의 1종을 포함하지만 이에 제한되지는 않는다. 유전자 및 유전자 생성물의 상태를 평가하는 전형적인 프로토콜은 예를 들어 문헌 [Ausubel et al. eds., 1995, Current Protocols In Molecular Biology]의 유닛 2 (노던 블롯팅), 유닛 4 (서던 블롯팅), 유닛 15 (이뮤노블롯팅) 및 유닛 18 (PCR 분석)에 기재되어 있다. 멀티플렉스화된 면역분석, 예를 들어 룰즈 베이스드 메디슨(Rules Based Medicine) 또는 메조 스케일 디스커버리 (MSD)로부터 입수가능한 것도 사용될 수 있다.
특정 실시양태에서, 샘플에서 유전자 또는 바이오마커의 발현 수준/양이 참조 샘플에서 유전자 또는 바이오마커의 발현 수준/양보다 더 높은 경우, 샘플에서 유전자 또는 바이오마커의 발현 수준/양은 참조 샘플 중의 발현/양과 비교하여 증가된 것이다. 유사하게, 샘플에서 유전자 또는 바이오마커의 발현 수준/양이 참조 샘플에서 유전자 또는 바이오마커의 발현 수준/양보다 낮은 경우, 샘플에서 유전자 또는 바이오마커의 발현 수준/양은 참조 샘플 중의 발현/양과 비교하여 감소된 것이다.
특정 실시양태에서, 샘플은 검정한 RNA 또는 단백질의 양에 있어서의 차이 및 사용된 RNA 또는 단백질 샘플의 품질에 있어서의 변동 둘다에 대해 정상화된다. 주지되어 있는 하우스키핑 유전자, 예를 들어 ACTB를 비롯한, 특정의 정상화 유전자의 발현을 측정하고 그를 도입함으로써 상기와 같은 정상화를 달성할 수 있다. 다르게는, 정상화는 검정된 유전자 또는 그의 대형 서브세트 모두의 평균 또는 중간 신호를 기초로 할 수 있다 (전역 정상화 접근법). 유전자마다, 환자 종양 mRNA 또는 단백질의 측정된 정상화 양을 참조 세트에서 확인된 양과 비교한다. 각 환자마다 시험된 종양 1개 당 각 mRNA 또는 단백질에 대해 정상화된 발현 수준은 참조 세트에서 측정된 발현 수준의 백분율(％)로서 표현될 수 있다. 분석할 특정 환자 샘플에서 측정된 발현 수준은 이러한 범위 내의 일부 백분위수에 포함될 것이며, 이는 당업계에 주지된 방법으로 결정될 수 있다.
특정 실시양태에서, 유전자의 상대적 발현 수준은 다음과 같이 결정된다:
상대적 발현 유전자1 샘플1 = 2 exp (Ct 하우스키핑 유전자 - Ct 유전자1) (Ct는 샘플에서 결정됨).
상대적 발현 유전자1 참조 RNA = 2 exp (Ct 하우스키핑 유전자 - Ct 유전자1) (Ct는 참조 샘플에서 결정됨).
정상화된 상대적 발현 유전자1 샘플1 = (상대적 발현 유전자1 샘플1 / 상대적 발현 유전자1 참조 RNA) x 100.
Ct는 임계값 사이클이다. Ct는 반응 내에서 생성된 형광이 임계값 선을 넘는 사이클 수이다.
모든 실험은 다양한 조직 공급원 (예를 들어, 클론테크(Clontech) (미국 캘리포니아주 마운틴 뷰)로부터의 참조 RNA #636538)으로부터 RNA의 종합 혼합물인 참조 RNA로 정상화된다. 동일한 참조 RNA를 각각의 qRT-PCR 운행에 포함시켜서 상이한 실험 운행 사이의 결과 비교를 허용한다.
표적 유전자 또는 바이오마커를 포함하는 샘플은 당업계에 공지되어 있고 관심 암의 특정 유형 및 위치에 적절한 방법으로 수득될 수 있다. 정의 부분을 참조한다. 예를 들어, 암성 병변의 샘플은 절제술, 기관지경술, 미세 바늘 흡인술, 기관지 브러싱으로 수득될 수도 있고, 또는 가래, 흉수 또는 혈액으로부터 수득될 수도 있다. 유전자 또는 유전자 생성물은 암 또는 종양 조직으로부터, 또는 다른 신체 샘플, 예를 들어 소변, 가래, 혈청 또는 혈장으로부터 검출될 수 있다. 암성 샘플에서 표적 유전자 또는 유전자 생성물의 검출에 관해 상기 논의된 것과 동일한 기술이 다른 신체 샘플에도 적용될 수 있다. 암 세포는 암 병변으로부터 벗겨져서 이러한 신체 샘플 중에 나타날 수 있다. 이러한 신체 샘플을 스크리닝함으로써 이들 암에 관한 간단한 조기 진단을 달성할 수 있다. 또한, 요법의 진행은 이러한 신체 샘플을 표적 유전자 또는 유전자 생성물에 대해 시험함으로써 보다 쉽게 모니터링될 수 있다.
조직 제제를 암 세포에 대해 풍부하게 하는 수단은 당업계에 공지되어 있다. 예를 들어, 조직을 파라핀 또는 동결 절편으로부터 단리할 수 있다. 또한, 암 세포는 유세포 분석 또는 레이저 포획 미세절제법에 의해 정상 세포로부터 분리될 수도 있다. 이러한 기술, 뿐만 아니라 정상 세포로부터 암성 세포를 분리해 내는 다른 기술이 당업계에 공지되어 있다. 암 조직이 정상 세포로 고도로 오염되어 있는 경우에는, 오염 및/또는 가양성/가음성 결과를 최소화하는 기술 (이중 일부는 본원에서 하기 기재됨)이 공지되어 있기는 하지만, 표지 유전자 또는 단백질 발현 프로파일의 검출이 더욱 어려울 수 있다. 예를 들어, 샘플은 또한 관심 암 세포와는 관련이 있지만 상응하는 정상 세포와는 관련이 없는 것으로 공지된 바이오마커, 또는 그와 반대되는 경우의 바이오마커의 존재에 대해 평가될 수 있다.
특정 실시양태에서, 샘플 내 단백질의 발현은 면역조직화학 ("IHC") 및 염색 프로토콜을 이용하여 검사한다. 조직 절편의 면역조직화학 염색은 샘플 내 단백질의 존재를 평가 또는 검출하는 신뢰할 수 있는 방법으로 나타난 바 있다. 면역조직화학 기술은 프로브에 대한 항체를 사용하고, 일반적으로는 발색 또는 형광 방법을 통해 계내에서 세포 항원을 가시화한다.
조직 샘플은 통상의 방법으로 고정 (즉, 보존)될 수 있다 (예를 들어, 문헌 ["Manual of Histological Staining Method of the Armed Forces Institute of Pathology," 3rd edition (1960) Lee G. Luna, HT (ASCP) Editor, The Blakston Division McGraw-Hill Book Company, New York; The Armed Forces Institute of Pathology Advanced Laboratory Methods in Histology and Pathology (1994) Ulreka V. Mikel, Editor, Armed Forces Institute of Pathology, American Registry of Pathology, Washington, D.C.] 참조). 당업자는 샘플이 조직학적으로 염색되거나 달리 분석되는 목적에 따라 고정제를 선택할 수 있음을 알 것이다. 당업자는 또한 고정시키는 시간의 길이는 조직 샘플의 크기 및 사용된 고정제에 따라 달라질 것임을 알 것이다. 예를 들어, 중성 완충된 포르말린, 보우인(Bouin) 또는 파라포름알데히드를 사용하여 샘플을 고정시킬 수 있다.
일반적으로, 샘플을 먼저 고정시킨 후에 농도가 상승하는 일련의 알콜을 통해 탈수시켜서 조직 샘플이 절편화될 수 있도록 파라핀 또는 다른 절편화 매질로 침윤 및 포매시킨다. 다르게는, 조직을 절편화하여 수득된 절편을 고정시킬 수 있다. 예를 들어, 조직 샘플을 통상의 방법으로 파라핀에 포매시키고 처리할 수 있다 (예를 들어, ["Manual of Histological Staining Method of the Armed Forces Institute of Pathology", 상기 문헌] 참조). 사용될 수 있는 파라핀의 예는 파라플라스트(Paraplast), 브롤로이드(Broloid) 및 티슈메이(Tissuemay)를 포함하지만 이에 제한되지는 않는다. 조직 샘플이 포매되면, 샘플을 마이크로톰 등으로 절편화시킬 수 있다 (예를 들어, ["Manual of Histological Staining Method of the Armed Forces Institute of Pathology", 상기 문헌] 참조). 이러한 절차의 예를 들어, 절편의 두께는 약 3 ㎛ 내지 약 5 ㎛의 범위일 수 있다. 절편화되면, 절편을 여러가지 표준 방법을 통해 슬라이드에 부착시킬 수 있다. 슬라이드 접착제의 예는 실란, 젤라틴, 폴리-L-리신 등을 포함하지만 이에 제한되지는 않는다. 예를 들어, 파라핀 포매된 절편은 양으로 하전된 슬라이드 및/또는 폴리-L-리신으로 코팅된 슬라이드에 부착될 수 있다.
파라핀이 포매재로서 사용된 경우, 조직 절편을 일반적으로 탈파라핀화하고 물에 재수화시킨다. 조직 절편은 통상적인 여러가지 표준 방법을 통해 탈파라핀화될 수 있다. 예를 들어, 크실렌 및 점차적으로 농도가 감소하는 일련의 알콜을 사용할 수 있다 (예를 들어, ["Manual of Histological Staining Method of the Armed Forces Institute of Pathology", 상기 문헌] 참조). 다르게는, 시판되는 탈파라핀화 비-유기 작용제, 예를 들어 Hemo-De7 (CMS, 미국 텍사스주 휴스톤)을 사용할 수 있다.
특정 실시양태에서, 샘플 제조 이후에 조직 절편을 IHC를 이용하여 분석할 수 있다. IHC는 추가의 기술, 예컨대 형태적 염색 및/또는 형광 계내 혼성화와 함께 수행될 수 있다. 2가지 일반적인 IHC 방법인 직접 및 간접 검정을 이용할 수 있다. 첫번째 분석에 따르면, 표적 항원에 대한 항체의 결합을 직접 결정한다. 이러한 직접 검정은 추가의 항체 상호작용 없이도 가시화될 수 있는 표지된 시약, 예를 들어 형광 태그 또는 효소-표지된 1차 항체를 사용한다. 전형적인 간접 검정에서는, 미접합 1차 항체가 항원에 결합한 후, 표지된 2차 항체가 상기 1차 항체에 결합한다. 2차 항체가 효소 표지에 접합된 경우, 항원이 가시화되도록 발색 또는 형광 기질을 첨가한다. 여러 2차 항체가 1차 항체 상의 상이한 에피토프와 반응할 수 있기 때문에 신호 증폭이 발생한다.
면역조직화학에 사용되는 1차 및/또는 2차 항체는 전형적으로 검출가능한 잔기로 표지될 것이다. 수많은 표지가 이용가능하고, 이들은 일반적으로 하기 카테고리로 분류될 수 있다:
(a) 방사성 동위원소, 예를 들어 35S, 14C, 125I, 3H, 및 131I. 항체는 예를 들어 문헌 [Current Protocols in Immunology, Volumes 1 and 2, Coligen et al., Ed. Wiley-Interscience, New York, New York, Pubs. (1991)]에 기재된 기술을 이용하여 방사성 동위원소로 표지할 수 있고, 방사능은 섬광 계수를 이용하여 측정할 수 있다.
(b) 콜로이드성 금 입자.
(c) 형광 표지, 예를 들어 (이에 제한되지는 않음) 희토류 킬레이트 (유로퓸 킬레이트), 텍사스 레드(Texas Red), 로다민, 플루오레세인, 댄실, 리사민(Lissamine), 움벨리페론, 피코크리테린, 피코시아닌 또는 시판되는 형광단, 예를 들어 스펙트럼 오렌지7(SPECTRUM ORANGE7) 및 스펙트럼 그린7(SPECTRUM GREEN7) 및/또는 상기 물질 중 임의의 하나 이상의 유도체. 형광 표지는 예를 들어 [Current Protocols in Immunology, 상기 문헌]에 개시된 기술을 이용하여 항체에 접합될 수 있다. 형광은 형광계를 사용하여 정량할 수 있다.
(d) 다양한 효소-기질 표지가 이용가능하고, 미국 특허 번호 4,275,149는 이들 중 일부에 대한 개관을 제공한다. 효소는 일반적으로 발색 기질의 화학적 변경을 촉매하며, 이는 다양한 기술을 이용하여 측정할 수 있다. 예를 들어, 효소는 기질에서의 색상 변화를 촉매할 수 있고, 이는 분광학적으로 측정할 수 있다. 다르게는, 효소는 기질의 형광 또는 화학발광을 변경시킬 수 있다. 형광의 변화를 정량하는 기술은 상기 기재되어 있다. 화학발광 기질은 화학적 반응에 의해 전자적으로 여기된 후에 측정 (예를 들어, 화학발광계 사용)할 수 있는 광을 방출하거나 에너지를 형광 수용자에게 제공할 수 있다. 효소 표지의 예는 루시페라제 (예를 들어, 반딧불이 루시페라제 및 박테리아 루시페라제; 미국 특허 번호 4,737,456), 루시페린, 2,3-디히드로프탈라진디온, 말레이트 데히드로게나제, 우레아제, 퍼옥시다제, 예를 들어 양고추냉이 퍼옥시다제 (HRPO), 알칼리성 포스파타제, β-갈락토시다제, 글루코아밀라제, 리소자임, 사카라이드 옥시다제 (예를 들어, 글루코스 옥시다제, 갈락토스 옥시다제, 및 글루코스-6-포스페이트 데히드로게나제), 헤테로시클릭 옥시다제 (예를 들어, 우리카제 및 크산틴 옥시다제), 락토퍼옥시다제, 마이크로퍼옥시다제 등을 포함한다. 효소를 항체에 접합시키는 기술이 문헌 [O'Sullivan et al., Methods for the Preparation of Enzyme-Antibody Conjugates for use in Enzyme Immunoassay, in Methods in Enzym. (ed. J. Langone & H. Van Vunakis), Academic press, New York, 73:147-166 (1981)]에 기재되어 있다.
효소-기질 조합의 예는 예를 들어 다음을 포함한다:
(i) 양고추냉이 퍼옥시다제 (HRPO)와 기질로서의 수소 퍼옥시다제 (여기서, 수소 퍼옥시다제는 염료 전구체 (예를 들어, 오르토페닐렌 디아민 (OPD) 또는 3,3',5,5'-테트라메틸 벤지딘 히드로클로라이드 (TMB))를 산화시킴);
(ii) 알칼리성 포스파타제 (AP)와 발색 기질로서의 파라-니트로페닐 포스페이트; 및
(iii) β-D-갈락토시다제 (β-D-Gal)와 발색 기질 (예를 들어, p-니트로페닐-β-D-갈락토시다제) 또는 형광발생 기질 (예를 들어, 4-메틸움벨리페릴-β-D-갈락토시다제).
수많은 다른 효소-기질 조합이 당업자에게 이용가능하다. 이들의 일반적인 검토를 위해, 미국 특허 번호 4,275,149 및 4,318,980을 참조한다. 때때로, 표지는 항체에 간접적으로 접합된다. 당업자는 이를 달성하기 위한 각종 기술을 알 것이다. 예를 들어, 항체는 비오틴과 접합될 수 있고, 상기 언급된 4가지 넓은 카테고리의 표지 중 임의의 것이 아비딘과 접합될 수도 있고, 또는 그 반대의 경우도 가능하다. 비오틴은 아비딘에 선택적으로 결합하기 때문에, 표지는 이러한 간접적인 방식으로 항체와 접합될 수 있다. 다르게는, 표지와 항체의 간접 접합을 달성하기 위해서, 항체는 작은 합텐과 접합되고, 상기 언급된 표지의 여러 유형 중 하나가 항-합텐 항체와 접합된다. 따라서, 표지와 항체의 간접적인 접합이 달성될 수 있다.
앞서 논의된 샘플 제조 절차 외에도, IHC 이전, IHC 동안 또는 IHC 이후에 조직 절편을 추가로 처리하는 것이 바람직할 수 있다. 예를 들어, 조직 샘플을 시트레이트 완충제 중에서 가열하는 것과 같은 에피토프 복구 방법이 수행될 수 있다 (예를 들어, 문헌 [Leong et al. Appl. Immunohistochem. 4(3):201 (1996))] 참조).
임의의 차단 단계 후에, 조직 절편을 1차 항체가 조직 샘플 중의 표적 단백질 항원에 결합하기에 적합한 조건하에 충분한 기간 동안 1차 항체에 노출시킨다. 이를 달성하기에 적절한 조건은 통상적인 실험으로 결정할 수 있다. 항체가 샘플에 결합하는 정도는 상기 논의된 검출가능한 표지 중 어느 하나를 사용하여 결정한다. 특정 실시양태에서, 표지는 발색 기질, 예컨대 3,3'-디아미노벤지딘 발색원의 화학적 변경을 촉매하는 효소 표지 (예를 들어, HRPO)이다. 한 실시양태에서, 효소 표지는 1차 항체에 특이적으로 결합하는 항체에 접합된다 (예를 들어, 1차 항체는 토끼 폴리클로날 항체이고, 2차 항체는 염소 항-토끼 항체임).
이와 같이 제조한 시료를 장착하여 커버 글라스를 덮을 수 있다. 이어서, 예를 들어 현미경을 사용하여 슬라이드 평가를 수행하고, 당업계에서 통상적으로 사용되는 염색 강도 기준을 이용할 수 있다. 염색 강도 기준은 다음과 같이 평가될 수 있다:
Figure pct00001
일부 실시양태에서, 약 1+ 이상의 염색 패턴 스코어가 진단 및/또는 예측된다. 특정 실시양태에서, IHC 검정에서 약 2+ 이상의 염색 패턴 스코어가 진단 및/또는 예측된다. 다른 실시양태에서, 약 3+ 이상의 염색 패턴 스코어가 진단 및/또는 예측된다. 한 실시양태에서, 종양 또는 결장 선종으로부터의 세포 및/또는 조직을 IHC를 사용하여 검사하는 경우, 염색은 일반적으로 (샘플 중에 존재할 수 있는 기질 또는 주위 조직에 반대되는 것으로서) 종양 세포 및/또는 조직에서 측정 또는 평가되는 것으로 이해된다.
대안적 방법에서, 샘플을 항체-바이오마커 복합체 형성에 충분한 조건하에서 상기 바이오마커에 특이적인 항체와 접촉시킨 후에 상기 복합체를 검출할 수 있다. 바이오마커의 존재는 수많은 방법, 예를 들어 혈장 및 혈청을 포함하는 다양한 조직 및 샘플을 검정하기 위한 웨스턴 블롯팅 및 ELISA 절차로 검출할 수 있다. 이러한 검정 포맷을 이용한 광범위한 면역검정 기술이 이용가능하고, 예를 들어 미국 특허 번호 4,016,043, 4,424,279 및 4,018,653을 참조한다. 이들은 비-경쟁 유형의 단일-부위 및 2-부위 또는 "샌드위치" 검정 뿐만 아니라, 통상적인 경쟁적 결합 검정을 둘 모두 포함한다. 또한, 상기 분석은 표지된 항체의 표적 바이오마커에 대한 직접 결합을 포함한다.
그 중에서 샌드위치 검정이 가장 유용하고, 통상적으로 사용되는 검정이다. 샌드위치 검정 기술의 다수의 변형이 존재하고, 이들은 모두 본 발명에 포함된다. 간락하게, 전형적인 정방향 검정에서, 표지되지 않은 항체는 고체 기질 상에 고정되고, 시험될 샘플을 결합된 분자와 접촉시킨다. 적합한 기간의 인큐베이션 후에, 항체-항원 복합체의 형성을 허용하기에 충분한 기간 동안, 검출가능한 신호를 생성할 수 있는 리포터 분자로 표지된, 항원에 특이적인 2차 항체를 첨가하고, 항체-항원-표지된 항체의 또 다른 복합체의 형성에 충분한 시간을 허용하면서 인큐베이션한다. 임의의 반응하지 않은 물질을 세척하고, 리포터 분자에 의해 생성된 신호의 관찰에 의해 항원의 존재를 결정한다. 결과는 가시적 신호의 간단한 관찰에 의해 정성될 수 있거나, 또는 공지된 양의 바이오마커를 함유하는 대조군 샘플과 비교하여 정량될 수 있다.
정방향 검정에 대한 변형은 동시 검정을 포함하며, 여기서 샘플 및 표지된 항체 둘 모두가 결합된 항체에 동시에 첨가된다. 이들 기술은 쉽게 명백해질 임의의 근소한 변형을 포함하여 당업자에게 공지되어 있다. 전형적인 정방향 샌드위치 검정에서, 바이오마커에 특이성을 갖는 1차 항체는 고체 표면에 공유 또는 수동 결합된다. 고체 표면은 전형적으로 유리 또는 중합체이고, 가장 일반적으로 사용되는 중합체는 셀룰로스, 폴리아크릴아미드, 나일론, 폴리스티렌, 폴리비닐 클로라이드 또는 폴리프로파일렌이다. 고체 지지체는 튜브, 비드, 마이크로플레이트의 디스크의 형태, 또는 면역검정 수행에 적합한 임의의 다른 표면일 수 있다. 결합 과정은 당업계에 공지되어 있고, 일반적으로 가교 공유 결합 또는 물리적 흡착으로 이루어지고, 중합체-항체 복합체는 시험 샘플 제조시에 세척하였다. 이후, 시험할 샘플의 분취액을 고체 상 복합체에 첨가하고, 항체에 존재하는 임의의 서브유닛의 결합을 허용하기에 적합한 조건 (예를 들어, 실온 내지 40℃, 예를 들어 25℃ 내지 32℃ 포함)하에 충분한 기간 동안 (예를 들어, 2분 내지 40분 또는 더 편리하다면 밤새) 인큐베이션한다. 인큐베이션 기간 후, 항체 서브유닛 고체 상을 세척하여 건조시키고, 바이오마커의 일부에 특이적인 2차 항체와 함께 인큐베이션한다. 2차 항체는 분자 마커에 대한 2차 항체의 결합을 표시하는데 사용되는 리포터 분자에 연결된다.
다른 방법은 샘플 중의 표적 바이오마커를 고정화시킨 후, 리포터 분자로 표지되어 있거나 그렇지 않을 수 있는 특이성 항체에 고정화된 표적을 노출시키는 것을 포함한다. 표적의 양 및 리포터 분자 신호의 강도에 따라, 결합된 표적은 항체로 직접 표지함으로써 검출할 수 있다. 다르게는, 1차 항체에 특이적인 2차 표지된 항체를 표적-1차 항체 복합체에 노출시켜 표적-1차 항체-2차 항체 3원 복합체를 형성시킨다. 상기 복합체는 리포터 분자에 의해 방출되는 신호에 의해 검출된다. 본 명세서에서 사용된 "리포터 분자"는 그의 화학적 성질에 의해 항원 결합된 항체의 검출을 허용하는 분석적으로 확인가능한 신호를 제공하는 분자를 나타낸다. 이러한 유형의 검정에서 가장 일반적으로 사용되는 리포터 분자는 효소, 형광단 또는 방사선핵종 함유 분자 (즉, 방사성 동위원소) 및 화학발광 분자이다.
효소 면역검정의 경우에, 효소는 일반적으로 글루타르알데히드 또는 퍼요오데이트에 의해 2차 항체에 접합된다. 그러나, 쉽게 인지될 바와 같이, 당업자가 쉽게 이용가능한 다양한 여러가지 접합 기술이 존재한다. 통상적으로 사용되는 효소는 특히 양고추냉이 퍼옥시다제, 글루코스 옥시다제, -갈락토시다제 및 알칼리성 포스파타제를 포함한다. 특이적 효소와 함께 사용될 기질은 일반적으로 상응하는 효소에 의한 가수분해시에 검출가능한 색상 변화가 생성되는 것으로서 선택된다. 적합한 효소의 예는 알칼리성 포스파타제 및 퍼옥시다제를 포함한다. 상기한 발색 기질 보다는 형광 생성물을 생성하는 형광 기질을 사용하는 것이 또한 가능하다. 모든 경우에, 효소-표지된 항체가 1차 항체-분자 마커 복합체에 첨가되어 결합한 후, 과량의 시약을 세척하여 제거하였다. 이어서, 적절한 기질을 함유하는 용액을 상기 항체-항원-항체의 복합체에 첨가한다. 기질은 2차 항체에 연결된 효소와 반응하여 정성적인 가시적 신호를 생성할 것이고, 이는 샘플 내에 존재하는 바이오마커의 양을 표시하도록 일반적으로는 분광학적으로 추가로 정량될 수 있다. 다르게는, 플루오레세인 및 로다민과 같은 형광 화합물이 이들의 결합 능력을 변경시키지 않으면서 항체에 화학적으로 커플링될 수 있다. 특정 파장의 광을 사용한 검사에 의해 활성화될 때, 형광색소-표지된 항체는 광 에너지를 흡수하여 분자를 여기가능 상태로 유도한 후, 광학현미경으로 가시적으로 검출가능한 특징적인 색상에서 광을 방출한다. EIA에서와 같이, 형광 표지된 항체는 1차 항체-분자 마커 복합체에 결합하도록 허용된다. 결합되지 않은 시약을 세척해 낸 후, 남아있는 3원 복합체를 적절한 파장의 광에 노출시키고, 관찰된 형광은 관심있는 분자 마커의 존재를 나타낸다. 면역형광 및 EIA 기술 둘 모두 당업계에 널리 확립되어 있다. 그러나, 다른 리포터 분자, 예를 들어 방사성 동위원소, 화학발광 또는 생체발광 분자를 사용할 수도 있다.
상기 기재된 기술은 또한 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49, 50, 51, 52, 53, 54, 55, 56, 57, 58, 59, 60, 61, 62, 63, 64, 65, 66, 67, 68, 69, 70, 71, 72, 73, 74, 75, 76, 77, 78, 79, 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 또는 94개 이상의 표적 유전자 (여기서, 표적 유전자는 표 1에 열거된 유전자임)의 발현을 검출하는데 사용될 수 있는 것으로 여겨진다.
본 발명의 방법은 조직 또는 세포 샘플에서 표 1에 열거된 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49, 50, 51, 52, 53, 54, 55, 56, 57, 58, 59, 60, 61, 62, 63, 64, 65, 66, 67, 68, 69, 70, 71, 72, 73, 74, 75, 76, 77, 78, 79, 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 또는 94개 이상의 표적 유전자의 존재 및/또는 mRNA의 발현을 검사하는 프로토콜을 추가로 포함한다. 세포 내의 mRNA의 평가 방법은 널리 공지되어 있고, 예를 들어 상보성 DNA 프로브를 사용하는 혼성화 검정 (예컨대 하나 이상의 유전자에 특이적인 표지된 리보프로브를 사용하는 계내 혼성화, 노던 블롯팅 및 관련 기술) 및 다양한 핵산 증폭 검정 (예컨대 하나 이상의 유전자에 특이적인 상보성 프라이머를 사용하는 RT-PCR, 및 다른 증폭 유형의 검출 방법, 예를 들어 분지형 DNA, SISBA, TMA 등)을 포함한다.
포유동물로부터의 조직 또는 세포 샘플을 노던, 도트 블롯팅 또는 PCR 분석을 이용하여 mRNA에 대해 편리하게 검정할 수 있다. 예를 들어, RT-PCR 검정, 예컨대 정량적 PCR 검정은 당업계에 공지되어 있다. 본 발명의 예시적인 실시양태에서, 생물학적 샘플에서 표적 mRNA를 검출하는 방법은 하나 이상의 프라이머를 사용한 역전사에 의해 샘플로부터 cDNA를 생성하는 단계, 표적 폴리뉴클레오티드를 센스 및 안티센스 프라이머로서 사용하여 상기와 같이 생성된 cDNA를 증폭시킴으로써 그안의 표적 cDNA를 증폭시키는 단계, 및 폴리뉴클레오티드 프로브를 사용하여 증폭된 표적 cDNA의 존재를 검출하는 단계를 포함한다. 일부 실시양태에서, 표 2에 열거된 서열을 포함하는 프라이머 및 프로브는 표 1에 열거된 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49, 50, 51, 52, 53, 54, 55, 56, 57, 58, 59, 60, 61, 62, 63, 64, 65, 66, 67, 68, 69, 70, 71, 72, 73, 74, 75, 76, 77, 78, 79, 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 또는 94개 이상의 표적 유전자의 발현을 검출하는데 사용된다. 또한, 이러한 방법은 생물학적 샘플에서 표적 mRNA의 수준을 결정 (예를 들어, "하우스키핑" 유전자, 예컨대 액틴 부류 구성원의 비교 대조군 mRNA 서열 수준을 동시에 검사하여 결정함)하는 하나 이상의 단계를 포함할 수 있다. 임의로, 증폭된 표적 cDNA의 서열을 결정할 수 있다.
본 발명의 임의의 방법은 마이크로어레이 기술에 의해 조직 또는 세포 샘플 중의 mRNA, 예컨대 표적 mRNA를 검사 또는 검출하는 프로토콜을 포함한다. 핵산 마이크로어레이를 사용함으로써, 시험 및 대조군 조직 샘플로부터의 시험 및 대조군 mRNA 샘플을 역전사시키고 표지하여 cDNA 프로브를 생성한다. 이어서, 프로브를 고체 지지체에 고정된 핵산의 어레이에 혼성화시킨다. 상기 어레이를 이 어레이의 각 구성원의 서열 및 위치를 알 수 있게 배열한다. 예를 들어, 그의 발현이 항혈관신생 요법이 보이는 증가된 또는 감소된 임상적 이익과 서로 관련성이 있는 것인 유전자의 선택물을 고체 지지체 상에 배열할 수 있다. 특정 어레이 구성원을 갖는 표지된 프로브의 혼성화는, 프로브가 유래된 샘플이 상기 유전자를 발현함을 나타낸다. 질환 조직의 차등적 유전자 발현 분석은 가치있는 정보를 제공할 수 있다. 마이크로어레이 기술에서는 단일 실험 내에서 수천 개 유전자의 mRNA 발현 프로파일을 평가하기 위해 핵산 혼성화 기술 및 전산화 기술을 이용한다. (예를 들어, 2001년 10월 11일자로 공개된 WO 01/75166 참조; (예를 들어, 어레이 제작의 논의에 대해서는 미국 특허 번호 5,700,637, 미국 특허 번호 5,445,934, 및 미국 특허 번호 5,807,522, 문헌 [Lockart, Nature Biotechnology, 14:1675-1680 (1996)]; [Cheung, V.G. et al., Nature Genetics 21(Suppl):15-19 (1999)] 참조)). DNA 마이크로어레이는, 유리 또는 다른 기판에서 직접 합성되거나 이것으로 스팟팅되는 유전자 단편을 함유하는 미니어처 어레이이다. 수천개의 유전자는 통상적으로 단일 어레이로 나타낸다. 통상적인 마이크로어레이 실험은 1) 샘플로부터 단리된 RNA로부터 형광 표지된 표적의 제조 단계, 2) 표지된 표적의 마이크로어레이로의 혼성화 단계, 3) 어레이의 세척, 염색 및 스캐닝 단계, 4) 스캐닝된 영상의 분석 단계, 및 5) 유전자 발현 프로파일의 생성 단계를 포함한다. 현재, 2가지 주요 유형의 DNA 마이크로어레이가 사용된다: 올리고뉴클레오티드 (통상적으로, 25 내지 70머) 어레이 및 cDNA로부터 제조된 PCR 생성물을 함유하는 유전자 발현 어레이. 어레이를 형성하는 경우, 올리고뉴클레오티드는 미리 제작되어 표면에 스팟팅되거나, 또는 표면에서 직접 합성될 수 있다 (계내).
아피메트릭스 진칩(Affymetrix GeneChip)® 시스템은, 유리 표면 상에서 올리고뉴클레오티드를 직접 합성하여 제작되는 어레이를 포함하는 시판되는 마이크로어레이 시스템이다. 프로브/유전자 어레이: 올리고뉴클레오티드 (일반적으로 25머)는 반도체-기재 포토리소그래피 및 고체상 화학적 합성 기술의 조합에 의해 유리 웨이퍼 상에서 직접 합성된다. 각각의 어레이는 최대 400,000개의 상이한 올리고를 함유하고, 각각의 올리고는 수백만개의 카피로 존재한다. 올리고뉴클레오티드 프로브는 어레이상의 공지된 위치에서 합성되기 때문에, 혼성화 패턴 및 신호 강도는 아피메트릭스 마이크로어레이 스위트(Affymetrix Microarray Suite) 소프트웨어에 의해 유전자 정체성 및 상대적인 발현 수준의 면으로 해석될 수 있다. 각각의 유전자는 어레이에서 일련의 상이한 올리고뉴클레오티드 프로브에 의해 나타난다. 각각의 프로브 쌍은 완전 매치 올리고뉴클레오티드 및 미스매치 올리고뉴클레오티드로 이루어진다. 완전 매치 프로브는 특정 유전자에 대해 정확하게 상보적인 서열을 갖기 때문에 유전자 발현을 결정한다. 미스매치 프로브는 중심 염기 위치에서의 단일 염기 치환에 의해 완전 매치 프로브과 상이하여 표적 유전자 전사체의 결합을 방해한다. 이것은 완전 매치 올리고에 대해 측정된 신호에 기여하는 백그라운드 및 비-특이적 혼성화를 결정하는 것을 돕는다. 마이크로어레이 스위트 소프트웨어는 완전 매치 프로브의 혼성화 강도로부터 미스매치 프로브의 혼성화 강도를 감하여 각 프로브 세트에 대한 절대 강도 값 또는 특이적 강도 값을 결정한다. 프로브는 진뱅크 및 다른 뉴클레오티드 정보보관소의 최근 정보를 기초로 선택한다. 상기 서열은 유전자의 3' 말단의 독특한 영역을 인식한다고 여겨진다. 진칩 혼성화 오븐 ("회전식(rotisserie)" 오븐)을 사용하여 한번에 최대 64개 어레이의 혼성화를 수행한다. 플루이딕스 스테이션(fluidics station)은 프로브 어레이의 세척 및 염색을 수행한다. 이는 완벽하게 자동화되어 있고, 4가지 모듈을 함유하며, 각 모듈에는 하나의 프로브 어레이가 들어간다. 각 모듈은 미리 프로그래밍된 플루이딕스 프로토콜을 이용하여 마이크로어레이 스위트 소프트웨어를 통해 독립적으로 제어된다. 스캐너는 공초점 레이저 형광 스캐너이며, 이는 프로브 어레이에 결합된 표지된 cRNA에 의해 방출되는 형광 강도를 측정한다. 마이크로어레이 스위트 소프트웨어에 의한 컴퓨터 워크스테이션은 플루이딕스 스테이션 및 스캐너를 제어한다. 마이크로어레이 스위트 소프트웨어는 프로브 어레이에 대해 미리 프로그래밍된 혼성화, 세척 및 염색 프로토콜을 이용하여 최대 8개의 플루이딕스 스테이션을 제어할 수 있다. 또한, 상기 소프트웨어는 혼성화 강도 데이터를 수득하고 이것을 적절한 알고리즘을 이용하여 각 유전자에 대한 존재/부재 신호로 전환한다. 마지막으로, 상기 소프트웨어는 실험들 사이의 비교 분석에 의해 유전자 발현의 변화를 검출하고, 결과를 텍스트 파일 형식으로 구성하며, 이를 사용하여 다른 소프트웨어 프로그램으로 추가의 데이터 분석을 수행할 수 있다.
조직 또는 세포 샘플에서 선택된 유전자 또는 바이오마커의 발현은 또한 기능적 또는 활성-기재의 검정으로 검사될 수 있다. 예를 들어, 바이오마커가 효소인 경우, 당업계에 공지된 검정을 수행함으로써 조직 또는 세포 샘플에서 주어진 효소 활성의 존재를 결정 또는 검출할 수 있다.
본 발명의 키트는 다수의 실시양태를 갖는다. 특정 실시양태에서, 키트는 용기, 상기 용기 상의 라벨, 및 상기 용기 내에 함유된 조성물 (여기서, 조성물은 표 1에 열거된 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49, 50, 51, 52, 53, 54, 55, 56, 57, 58, 59, 60, 61, 62, 63, 64, 65, 66, 67, 68, 69, 70, 71, 72, 73, 74, 75, 76, 77, 78, 79, 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 또는 94개 이상의 유전자에 상응하는 하나 이상의 표적 폴리펩티드 서열에 결합하는 하나 이상의 1차 항체를 포함하고, 용기 상의 라벨은 조성물이 하나 이상의 유형의 포유동물 세포에서 하나 이상의 표적 단백질의 존재를 평가하는데 사용될 수 있다는 것을 나타냄), 및 하나 이상의 유형의 포유동물 세포에서 하나 이상의 표적 단백질의 존재를 평가하는데 항체를 사용하기 위한 설명서를 포함한다. 키트는 조직 샘플을 제조하고 항체 및 프로브를 조직 샘플의 동일한 절편에 적용하기 위한 지시서 및 물질의 세트를 추가로 포함할 수 있다. 키트는 1차 및 2차 항체 둘 모두를 포함할 수 있고, 여기서 2차 항체는 표지, 예를 들어 효소 표지에 접합된다
또 다른 실시양태는 용기, 상기 용기 상의 라벨, 및 상기 용기 내에 함유된 조성물 (여기서, 조성물은 엄격한 조건하에 표 1에 열거된 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49, 50, 51, 52, 53, 54, 55, 56, 57, 58, 59, 60, 61, 62, 63, 64, 65, 66, 67, 68, 69, 70, 71, 72, 73, 74, 75, 76, 77, 78, 79, 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 또는 94개 이상의 유전자의 폴리뉴클레오티드 서열에 혼성화하는 하나 이상의 폴리뉴클레오티드를 포함하고, 상기 용기 상의 라벨은 조성물이 하나 이상의 유형의 포유동물 세포에서 하나 이상의 표적 유전자의 존재 및/또는 발현 수준을 평가하는데 사용될 수 있다는 것을 나타냄), 및 하나 이상의 유형의 포유동물 세포에서 하나 이상의 표적 RNA 또는 DNA의 존재 및/또는 발현 수준을 평가하는데 폴리뉴클레오티드를 사용하기 위한 설명서를 포함하는 키트이다. 일부 실시양태에서, 키트는 표 2에 열거된 서열을 포함하는 폴리뉴클레오티드 프라이머 및 프로브를 포함한다.
키트 중의 다른 임의의 성분은 1종 이상의 완충제 (예를 들어, 차단 완충제, 세척 완충제, 기질 완충제 등), 다른 시약, 예를 들어 효소 표지에 의해 화학적으로 변경되는 기질 (예를 들어, 발색원), 에피토프 복구 용액, 대조군 샘플 (양성 및/또는 음성 대조군), 대조군 슬라이드(들) 등을 포함한다.
IV. 제약 제제
본 발명의 방법의 경우, 항-NRP1, 항-EGFL7 항체, 항-VEGF-C 항체 또는 항-VEGF 항체의 치료 제제는 원하는 정도의 순도를 갖는 항체를 임의의 생리학상 허용되는 담체, 부형제 또는 안정화제와 혼합하여 동결건조된 제제 또는 수용액의 형태로 보관용으로 제조한다 (문헌 [Remington's Pharmaceutical Sciences 16th edition, Osol, A. Ed. (1980)]). 허용되는 담체, 부형제 또는 안정화제는 사용되는 투여량 및 농도에서 수용자에게 비독성이고, 완충제, 예컨대 포스페이트, 시트레이트 및 기타 유기산; 항산화제, 예를 들어 아스코르브산 및 메티오닌; 보존제 (예컨대 옥타데실디메틸벤질 암모늄 클로라이드; 헥사메토늄 클로라이드; 벤즈알코늄 클로라이드, 벤즈에토늄 클로라이드; 페놀, 부틸 또는 벤질 알콜; 알킬 파라벤, 예컨대 메틸 또는 프로필 파라벤; 카테콜; 레조르시놀; 시클로헥산올; 3-펜탄올; 및 m-크레졸); 저분자량 (약 10개 잔기 미만) 폴리펩티드; 단백질, 예를 들어 혈청 알부민, 젤라틴 또는 이뮤노글로불린; 친수성 중합체, 예컨대 폴리비닐피롤리돈; 아미노산, 예컨대 글리신, 글루타민, 아스파라긴, 히스티딘, 아르기닌 또는 리신; 모노사카라이드, 디사카라이드 및 기타 탄수화물, 예를 들어 글루코스, 만노스 또는 덱스트린; 킬레이트화제, 예컨대 EDTA; 당, 예컨대 수크로스, 만니톨, 트레할로스 또는 소르비톨; 염-형성 반대이온, 예컨대 나트륨; 금속 착체 (예를 들어, Zn-단백질 착체); 및/또는 비-이온성 계면활성제, 예컨대 트윈(TWEEN)TM, 플루로닉스(PLURONICS)TM 또는 폴리에틸렌 글리콜 (PEG)을 포함한다.
본원에서의 제제는 치료될 특정 적응증에 필요하다면 1가지를 초과하는 활성 화합물, 바람직하게는 서로에게 역효과를 일으키지 않는 보완적인 활성이 있는 것들을 또한 함유할 수 있다. 예를 들어, 면역억제제를 추가로 제공하는 것이 바람직할 수 있다. 이러한 분자는 의도된 목적에 유효한 양으로 조합되어 적합하게 존재한다.
활성 성분은 예를 들어 코아세르베이션 기술에 의해 또는 계면 중합에 의해 제조된 마이크로캡슐, 예를 들어, 각각 히드록시메틸셀룰로스 또는 젤라틴-마이크로캡슐 및 폴리-(메틸메타크릴레이트) 마이크로캡슐 내에, 콜로이드성 약물 전달 시스템 (예를 들어, 리포솜, 알부민 마이크로스피어, 마이크로에멀젼, 나노입자 및 나노캡슐) 내에, 또는 매크로에멀젼 내에 포획될 수 있다. 이러한 기술은 문헌 [Remington's Pharmaceutical Sciences 16th edition, Osol, A. Ed. (1980)]에 개시되어 있다.
서방성 제제를 제조할 수 있다. 서방성 제제의 적합한 예로는 항체를 함유하는 고체 소수성 중합체의 반투과성 매트릭스가 포함되고, 이 매트릭스는 성형품, 예를 들어, 필름 또는 마이크로캡슐의 형태이다. 서방성 매트릭스의 예는 폴리에스테르, 히드로겔 (예를 들어, 폴리(2-히드록시에틸-메타크릴레이트) 또는 폴리(비닐알콜)), 폴리락티드 (미국 특허 번호 3,773,919), L-글루탐산 및 γ 에틸-L-글루타메이트의 공중합체, 비-분해성 에틸렌-비닐 아세테이트, 분해성 락트산-글리콜산 공중합체, 예컨대 루프론 데포(LUPRON DEPOT)TM (락트산-글리콜산 공중합체 및 류프롤리드 아세테이트로 이루어진 주사가능한 미소구), 및 폴리-D-(-)-3-히드록시부티르산을 포함한다. 에틸렌-비닐 아세테이트 및 락트산-글리콜산과 같은 중합체는 100일을 초과하여 분자를 방출할 수 있는 반면, 특정 히드로겔은 단백질을 더 짧은 기간 동안 방출한다. 캡슐화된 항체가 신체 내에서 장기간 동안 유지되는 경우, 37℃에서 습도에 노출된 결과로 항체가 변성되거나 응집되어, 생물학적 활성의 손실 및 면역원성의 가능한 변화가 초래될 수 있다. 수반된 메카니즘에 따라 안정화를 위한 합리적인 전략이 고안된다. 예를 들어, 응집 메카니즘이 티오-디술피드 상호교환을 통한 분자간 S-S 결합 형성인 것으로 발견되면, 안정화는 술프히드릴 잔기의 변형, 산성 용액으로부터의 동결건조, 수분 함량의 제어, 적절한 첨가제의 사용 및 특정 중합체 매트릭스 조성물의 개발에 의해 달성될 수 있다.
V. 치료 용도
본 발명은 환자로부터 수득한 샘플이 표 1에 열거된 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49, 50, 51, 52, 53, 54, 55, 56, 57, 58, 59, 60, 61, 62, 63, 64, 65, 66, 67, 68, 69, 70, 71, 72, 73, 74, 75, 76, 77, 78, 79, 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 또는 94개 이상의 유전자의 증가된 또는 감소된 발현 수준을 갖는지 결정하는 단계, 및 환자에게 유효량의 항암 요법제를 투여하여 종양, 암 또는 세포 증식성 장애를 치료하는 단계를 포함하는, 환자에서 혈관신생 장애 (예를 들어, 비정상적인 혈관신생 또는 비정상적인 혈관 누출을 특징으로 하는 장애)를 치료하는 방법을 포함한다. 항암 요법제는, 예를 들어 NRP1 길항제, EGFL7 길항제, 또는 VEGF-C 길항제일 수 있다.
본원에서 치료될 혈관신생 장애의 예는 암, 특히 혈관성 고형 종양 및 전이성 종양 (결장암, 폐암 (특히 소세포 폐암) 또는 전립선암 포함), 안구 혈관신생에 의해 유발되는 질환, 특히 당뇨병성 실명, 망막병증, 원발성 당뇨병성 망막병증 또는 연령-관련 황반 변성, 맥락막 신생혈관형성 (CNV), 당뇨병성 황반 부종, 병적 근시, 폰 히펠-린다우병, 눈의 히스토플라스마증, 중심 망막 정맥 폐쇄 (CRVO), 각막 신생혈관형성, 망막 신생혈관형성 및 조홍; 건선, 건선성 관절염, 혈관모세포종, 예컨대 혈관종; 염증성 신장 질환, 예컨대 사구체신염, 특히 사구체간질증식성 사구체신염, 용혈성 요독성 증후군, 당뇨병성 신장병증 또는 고혈압성 신경화증; 다양한 염증성 질환, 예컨대 관절염, 특히 류마티스 관절염, 염증성 장 질환, 건선, 유육종증, 폐쇄성 동맥경화증 및 이식후 발생하는 질환, 자궁내막증 또는 만성 천식 및 다른 상태; 예를 들어 종양 (예를 들어, 뇌 종양 포함)과 관련된 부종을 포함하는 질환 상태; 악성종양과 관련된 복수; 메이그스 증후군; 폐렴; 신 증후군; 심낭 삼출; 흉막 삼출; 심혈관 질환, 예컨대 심근경색 및 졸중 후의 상태와 관련된 투과성 등을 포함하나 이에 제한되지는 않는다.
본원에서 치료하고자 하는 암의 예에는 암종, 림프종, 모세포종, 육종 및 백혈병이 포함되지만, 이에 제한되지는 않는다. 이러한 암의 보다 특정한 예에는 편평 세포 암, 폐암 (소세포 폐암, 비소세포 폐암, 폐의 선암종 및 폐의 편평세포 암종 포함), 복막암, 간세포암, 위암 (위장암 포함), 췌장암, 교모세포종, 자궁경부암, 난소암, 간암, 방광암, 간세포암, 유방암, 결장암, 결장직장암, 자궁내막 또는 자궁 암종, 타액선 암종, 신장암 또는 신암, 간암, 전립선암, 외음부암, 갑상선암, 간 암종 및 각종 유형의 두경부암, 및 B-세포 림프종 (저등급/여포성 비호지킨 림프종 (NHL); 소 림프구성 (SL) NHL; 중등급/여포성 NHL; 중등급 미만성 NHL; 고등급 면역모세포성 NHL; 고등급 림프모구성 NHL; 고등급 소 비-분할 세포 NHL; 거대 질환 NHL; 외투 세포 림프종; AIDS-관련 림프종; 및 발덴스트롬 마크로글로불린혈증 포함); 만성 림프구성 백혈병 (CLL); 급성 림프모구성 백혈병 (ALL); 모발상 세포 백혈병; 만성 림프모구성 백혈병; 및 이식 후 림프구증식 장애 (PTLD) 및 모반증과 관련된 비정상적인 혈관 증식, 부종 (예컨대, 뇌 종양과 관련된 부종), 및 메이그스 증후군이 포함된다. 보다 특히, 본 발명의 항체에 의해 치료할 수 있는 암에는 유방암, 결장직장암, 직장암, 비소세포 폐암, 비호지킨 림프종 (NHL), 신세포암, 전립선암, 간암, 췌장암, 연조직 육종, 카포시 육종, 경동맥 암종, 두경부암, 흑색종, 난소암, 중피종 및 다발성 골수종이 포함된다. 일부 실시양태에서, 암은 내성 암일 수 있다. 일부 실시양태에서, 암은 재발성 암일 수 있다.
다양한 질환, 예컨대 종양을 치료하는데 사용되는 경우, NRP1 길항제, EGFL7 길항제 또는 VEGF-C 길항제는 동일한 또는 유사한 질환에 적합한 하나 이상의 다른 치료제와 조합될 수 있을 것으로 생각된다. 예를 들어, 암을 치료하는데 사용되는 경우, NRP1 길항제, EGFL7 길항제 또는 VEGF-C 길항제는 통상적인 항암 요법, 예컨대 수술, 방사선요법, 화학요법 또는 이들의 조합과 함께 사용될 수 있다.
특정 측면에서, NRP1 길항제, EGFL7 길항제 또는 VEGF-C 길항제와의 조합 암 요법에 유용한 다른 치료제는 다른 항혈관신생 작용제를 포함한다. 다수의 항혈관신생 작용제가 당업계에서 확인되었고 공지되어 있으며, 문헌 [Carmeliet and Jain (2000) Nature 407(6801):249-57]에 열거된 것을 포함한다.
한 측면에서, NRP1 길항제, EGFL7 길항제 또는 VEGF-C 길항제는 VEGF 길항제 또는 VEGF 수용체 길항제, 예컨대 항-VEGF 항체, VEGF 변이체, 가용성 VEGF 수용체 단편, VEGF 또는 VEGFR을 차단할 수 있는 압타머, 중화 항-VEGFR 항체, VEGFR 티로신 키나제의 억제제 및 임의의 이들의 조합과 함께 사용된다. 다르게는 또는 또한, 2개 이상의 NRP1 길항제, EGFL7 길항제 또는 VEGF-C 길항제는 환자에게 공동-투여될 수 있다. 바람직한 실시양태에서, 항-NRP1 항체는 항-VEGF 항체와 함께 사용되어 부가적인 또는 상승적인 효과를 생성한다. 또 다른 바람직한 실시양태에서, 항-EGFL7 항체는 항-VEGF 항체와 함께 사용되어 부가적인 또는 상승적인 효과를 생성한다. 추가의 바람직한 실시양태에서, 항-VEGF-C 항체는 항-VEGF 항체와 함께 사용되어 부가적인 또는 상승적인 효과를 생성한다. 바람직한 항-VEGF 항체에는 항-hVEGF 항체 A4.6.1과 동일한 에피토프와 결합하는 항체가 포함된다. 보다 바람직하게, 항-VEGF 항체는 베바시주맙 또는 라니비주맙이다.
본 발명의 방법의 일부 다른 측면에서, NRP1 길항제, EGFL7 길항제 또는 VEGF-C 길항제와의 조합 종양 요법에 유용한 다른 치료제는 종양 성장에 관여하는 다른 인자, 예컨대 EGFR, ErbB2 (또한 Her2로 공지되어 있음), ErbB3, ErbB4, 또는 TNF의 길항제를 포함한다. 바람직하게는, 본 발명의 항-NRP1 항체, 항-EGFL7 항체 또는 VEGF-C 항체는 하나 이상의 티로신 키나제 수용체, 예컨대 VEGF 수용체, FGF 수용체, EGF 수용체 및 PDGF 수용체를 표적으로 하는 소분자 수용체 티로신 키나제 억제제 (RTKI)와 함께 사용될 수 있다. 다수의 치료 소분자 RTKI는 당업계에 공지되어 있고, 바탈라닙 (PTK787), 에를로티닙 (타르세바®), OSI-7904, ZD6474 (자크티마(ZACTIMA)®), ZD6126 (ANG453), ZD1839, 수니티닙 (수텐트®), 세막사닙 (SU5416), AMG706, AG013736, 이마티닙 (글리벡®), MLN-518, CEP-701, PKC-412, 라파니팁 (GSK572016), 벨케이드®, AZD2171, 소라페닙 (넥사바르(NEXAVAR)®), XL880, 및 CHIR-265를 포함하나 이에 제한되지는 않는다.
본 발명의 방법은 또한 NRP1 길항제, EGFL7 길항제, 또는 VEGF-C 길항제를 단독으로 또는 제2 치료제 (예컨대, 항-VEGF 항체)와 함께 및 추가로 하나 이상의 화학요법제와 함께 사용하는 것을 포함할 수 있다. 다양한 화학요법제는 본 발명의 조합된 치료 방법에 사용될 수 있다. 고려되는 화학요법제의 예시적 및 비-제한적 목록은 상기 본원에 제공된다.
본 발명의 방법에 있어서, NRP1 길항제, EGFL7 길항제 또는 VEGF-C 길항제가 제2 치료제와 공동-투여되는 경우, 제2 치료제가 먼저 투여된 후에 NRP1 길항제, EGFL7 길항제 또는 VEGF-C 길항제가 투여될 수 있다. 그러나, NRP1 길항제, EGFL7 길항제 또는 VEGF-C 길항제의 동시 투여 또는 우선 투여가 또한 고려된다. 제2 치료제에 적합한 투여량은 현재 사용되는 것이고, 작용제 및 NRP1 길항제, EGFL7 길항제 또는 VEGF-C 길항제의 조합된 작용 (상승작용) 때문에 낮출 수 있다.
본 발명의 방법이 환자에게 항체를 투여하는 것을 포함하는 경우, 질환의 유형 및 중증도에 따라, 약 1 ㎍/kg 내지 50 mg/kg (예를 들어, 0.1-20 mg/kg)의 항체가 환자로의 투여에 대한 초기 후보 투여량이다 (예를 들어, 1회 이상의 별도의 투여 또는 연속 주입에 의해 투여됨). 상기 언급된 인자에 따라, 전형적인 1일 투여량은 약 1 ㎍/kg 내지 약 100 mg/kg 이상의 범위일 수 있다. 수일 또는 그보다 오랜 기간에 걸친 반복 투여의 경우, 상태에 따라서 치료는 질환 증상이 원하는 수준으로 저해될 때까지 지속된다. 그러나, 다른 투여 처방이 유용할 수 있다. 바람직한 측면에서, 항체는 약 5 mg/kg 내지 약 15 mg/kg 범위의 용량에서 2주 내지 3주 마다 투여된다. 한 측면에서, 항체는 약 5 mg/kg, 7.5 mg/kg, 10 mg/kg 또는 15 mg/kg의 용량에서 2주 내지 3주 마다 투여된다. 이러한 투약 처방은 화학요법 처방과 함께 사용될 수 있다. 일부 측면에서, 화학요법 처방은 전통적인 고-용량 간헐적 투여를 포함한다. 일부 다른 측면에서, 화학요법제는 예정된 중단없이 보다 적은 용량을 보다 자주 투여한다 ("메트로놈 화학요법"). 본 발명의 요법의 진행은 통상적인 기술 및 검정에 의해 쉽게 모니터링된다.
항체 조성물은 우수한 의료 행위에 일관되는 방식으로 제형화, 투약 및 투여될 것이다. 이와 관련하여 고려할 인자에는 치료할 특정 장애, 치료받을 특정 포유동물, 개별 환자의 임상적 상태, 장애의 원인, 작용제의 전달 부위, 투여 방법, 투여 스케줄, 및 의료 전문인에게 공지된 다른 인자가 포함된다. 투여될 항체의 "치료 유효량"은 이같은 고려사항에 의해 좌우될 것이고, 질환 또는 장애를 방지하거나, 완화시키거나, 또는 치료하는데 필요한 최소량이다. 반드시 그럴 필요는 없지만, 임의로, 항체는 문제의 장애를 예방 또는 치료하는데 현재 사용되는 하나 이상의 작용제와 함께 제제화된다. 이러한 다른 작용제의 유효량은 제제 내에 존재하는 항체의 양, 장애 또는 치료의 유형, 및 상기 논의된 다른 요인들에 의해 좌우된다. 일반적으로, 이들은 이전에 사용되던 것과 동일한 투여량 및 투여 경로로 사용되거나, 이전에 사용되던 투여량의 약 1 내지 99％로 사용된다. 일반적으로, 질환 또는 장애의 경감 또는 치료는 이러한 질환 또는 장애와 관련된 하나 이상의 증상 또는 의학적 문제를 줄이는 것을 포함한다. 암의 경우, 치료 유효량의 약물은 암 세포의 수 감소, 종양 크기의 감소, 말초 장기로의 암 세포 침윤의 억제 (즉, 어느 정도 감소되고/되거나 정지하는 것), 종양 전이의 억제, 종양 성장의 어느 정도의 억제, 및/또는 암과 관련된 하나 이상의 증상의 어느 정도의 경감 중 하나 또는 이들의 조합을 달성할 수 있다. 약물이 기존 암 세포의 성장을 예방하고/하거나 기존 암 세포를 사멸시킬 수 있는 정도라면, 이것은 세포증식 억제성 및/또는 세포독성일 수 있다. 일부 실시양태에서, 본 발명의 조성물을 사용하여 특정 대상체 또는 포유동물에서 질환 또는 장애의 발생 또는 재발을 예방할 수 있다.
상기한 설명에서, 본 발명을 특정 실시양태를 들어 설명하였지만, 그것으로 한정되는 것은 아니다. 실제로, 본원에 제시되고 기재된 것에 부가한 본 발명의 각종 변형은 전술된 기재로부터 당업자에게 명백해질 것이고, 첨부된 특허청구범위 내에 속할 것이다. 명세서 전반에 걸쳐 언급된 모든 참조 문헌 및 이에 언급된 참조 문헌은 모든 목적을 위해 그의 전문이 명백하게 본원에 참고로 도입된다.
실시예
실시예 1 종양 억제 활성을 갖는 작용제의 확인
모든 연구는 NIH에 의해 발행된 실험실용 동물의 관리 및 사용에 대한 지침 (NIH 공개 85-23, 1985년 개정)에 따라 수행하였다. 동물 실험 윤리 위원회 (IACUC)는 모든 동물 프로토콜을 승인하였다.
연구는 표준화 기술을 이용하여, 예를 들어 유방암 모델, 예를 들어 MDA-MB231, MX1, BT474, MCF7, KPL-4, 66c14, Fo5 및 MAXF583; 결장암 모델, 예를 들어 LS174t, DLD-1, HT29, SW620, SW480, HCT116, colo205, HM7, LoVo, LS180, CXF243 및 CXF260; 폐암 모델, 예를 들어 A549, H460, SKMES, H1299, MV522, Calu-6, 루이스 폐 암종, H520, NCI-H2122, LXFE409, LXFL1674, LXFA629, LXFA737, LXFA1335 및 1050489; 난소암 모델, 예를 들어 OVCAR3, A2780, SKOV3 및 IGROV-1; 췌장암 모델, 예를 들어 BxPC3, PANC1, MiaPaCa-2, KP4 및 SU8686; 전립선암 모델, 예를 들어 PC3, DU145; 뇌암 모델, 예를 들어 U87MG (교모세포종), SF295 (교모세포종) 및 SKNAS (신경모세포종); 간암 모델, 예를 들어 Hep3B, Huh-7 및 JHH-7; 흑색종 모델, 예를 들어 A2058, A375, SKMEL-5, A2058 및 MEXF989; 신암 모델, 예를 들어 Caki-1, Caki-2 및 786-0; 유잉 육종 및 골암, 예를 들어 MHH-ES-1; 위암 모델, 예를 들어 SNU5; 횡문근육종 모델, 예를 들어 A673 및 SXF463; 골수종 모델, 예를 들어 OPM2-FcRH5; 및 B 세포 림프종, 예를 들어 WSU-DLCL2; 및 비뇨기 암 방광 모델, 예를 들어 BXF1218 및 BXF1352를 비롯한 적합한 종양 모델로 수행하였다. 간략하게, 인간 종양 세포는 각각의 시험 마우스의 오른쪽 옆구리에 피하 이식하였다. 종양 이식 당일에, 종양 세포를 수확하고, 5 x 107개 세포/mL의 농도에서 PBS에 재현탁시켰다. 각각의 시험 마우스에 1 x 107개 종양 세포를 오른쪽 옆구리에 피하 이식하고, 종양 성장을 모니터링하였다.
종양 성장은 120-180 mm3에 근접한 평균 크기로 모니터링하였다. 연구 제1일에, 마우스를 종양 크기에 의해 3개의 시험 군 (1개의 대조군 및 2개의 처리군)으로 분류하였다. 종양 부피는 하기 식을 사용하여 계산하였다:
Figure pct00002
여기서, w = 종양의 폭 (mm) 및 l = 종양의 길이 (mm).
모든 치료는 복막내 투여하였다. 마우스를 5-10 mg/kg의 각각의 대조군 항체, VEGF 활성을 차단하는 작용제, 또는 VEGF 활성을 차단하는 작용제 및 시험 작용제의 조합으로 10-20주까지 동안 매주 2회 처리하였다. 조합 처리군의 경우, 항혈관신생 작용제를 항-VEGF 항체와 동시에 투여하거나 또는 항-VEGF 항체와 순차적으로 투여하였다. 시험 작용제 및 항-VEGF 항체를 순차적으로 투여하는 경우, 시험 작용제는 항-VEGF 항체 투여 30분전 이후에 또는 항-VEGF 항체 투여 30분후 이전에 투여한다. 각각의 투여량은 체중 20 그램 당 0.2 mL의 부피 (10 mL/kg)로 전달하고, 동물의 체중에 대해 스케일링하였다.
종양 부피를 캘리퍼를 사용하여 매주 2회 기록하였다. 그의 종양의 종점 크기 (일반적으로 1000 mm3)로의 도달 또는 연구의 결론 중 먼저 일어난 시점에 각각의 동물을 안락사시켰다. 종양을 수확하고, 밤새 10％ NBF에서 고정시킨 후에 70％ 에탄올로 고정시키고, 이후에 파라핀에 포매시키거나, 또는 2분 내에 액체 질소에서 동결시키고, 이후에 -80℃에 보관하였다.
종점까지의 시간 (TTE)을 하기 식으로부터 계산하였다:
Figure pct00003
여기서, b는 log-변환된 종양 성장 데이타 세트의 선형 회귀에 의해 수득한 선의 절편이고, m은 기울기이다.
종점에 도달한 동물에게 연구 마지막 날과 동일한 TTE 값을 할당하였다. 우연한 (NTRa) 또는 알려지지 않은 원인 (NTRu)으로 인한 NTR (비-치료-관련) 사망으로 분류된 동물을 TTE 연산 (및 모든 추가의 분석)에서 제외하였다. TR (치료-관련) 사망 또는 NTRm (전이로 인한 비-치료-관련 사망)으로 분류된 동물에게 사망 당일과 동일한 TTE 값을 할당하였다.
처리 결과는 종양 성장 지연 (TGD)에 의해 평가하였으며, 이를 대조군과 비교하여 처리군에서 중간 종점까지의 시간 (TTE)의 증가로 규정하고, 다음과 같이 계산하거나:
Figure pct00004
(일로 표시), 또는
대조군의 중간 TTE의 백분율로 규정하고, 다음과 같이 계산하였다:
Figure pct00005
여기서, T = 처리군에 대한 중간 TTE 및 C = 대조군에 대한 중간 TTE.
Δ％ TGD는 상기와 같이 계산하였다: C = 대조군 (항-VEGF-A 치료를 단독으로 투여한 군), 및 T = 처리군 (항-VEGF 및 시험 작용제의 조합을 투여한 군). 로그 순위 시험을 이용하여 2개 군의 TTE 값 사이의 차이의 유의성을 분석하였다. 양방향 통계적 분석은 유의 수준 p = 0.05에서 수행하였다. "1"의 값은 치료가 종양 진행을 추가로 지연시켰음을 나타낸다. "0"의 값은 치료가 종양 진행을 추가로 지연시키지 않았음을 나타낸다.
실시예 2 치료의 효능에 대한 바이오마커의 확인
하기 표 1에 열거된 하나 이상의 유전자의 유전자 발현 분석은 실시예 1에서 상기 기재된 종양 모델 실험으로부터 수득한 종양 샘플 상에서 qRT-PCR을 이용하여 수행하였다.
Figure pct00006
Figure pct00007
동결된 재료로부터, 최대 3 mm 측면 길이의 작은 큐브를 시판 시약 및 장치 (RNeasy®, 티슈라이저(Tissuelyzer), 둘 모두 퀴아젠 인크.(Qiagen Inc., 독일))를 사용하여 가용화시켰다. 칼럼 정제 후에, RNA를 H2O로 용리하고, 글리코겐 및 아세트산나트륨의 첨가 후에 에탄올로 침전시켰다. RNA를 30분 이상 동안 원심분리에 의해 펠릿화하고, 80％ 에탄올로 2회 세척하고, 건조 후에 펠릿을 H2O에 재현탁시켰다. RNA 농도를 분광광도계 또는 생물분석기 (애질런트(Agilent), 미국 캘리포니아주 포스터 시티)를 사용하여 평가하고, 이후의 유전자 발현 분석에서 반응 당 50 ng의 전체 RNA를 사용하였다. 유전자 특이적 프라이머 및 프로브 세트를 qRT-PCR 발현 분석을 위해 설계하였다. 프라이머 및 프로브 세트 서열은 하기 표 2에 열거되어 있다.
Figure pct00008
Figure pct00009
Figure pct00010
Figure pct00011
Figure pct00012
Figure pct00013
Figure pct00014
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Figure pct00027
Figure pct00028
Figure pct00029
실시예 3 항-NRP1 항체의 종양 억제 활성
모든 연구는 NIH에 의해 발행된 실험실용 동물의 관리 및 사용에 대한 지침 (NIH 공개 85-23, 1985년 개정)에 따라 수행하였다. 동물 실험 윤리 위원회 (IACUC)는 모든 동물 프로토콜을 승인하였다.
연구는 표준화 기술을 사용하여 하기 인간 종양 모델로 수행하였다: LS174t, A549, H1299, MV522, MDA-MB231, HT29, SKMES. 인간 종양 세포를 각각의 시험 마우스의 오른쪽 옆구리에 피하 이식하였다. 예를 들어, H1299의 경우, 이종이식을 배양된 H1299 인간 비소세포 폐 암종 세포 (10％ 열-불활성화 태아 소 혈청, 100 단위/mL 페니실린 G, 100 ㎍/mL 스트렙토마이신 술페이트, 0.25 ㎍/mL 암포테리신 B, 1 mM 피루브산나트륨, 2 mM 글루타민, 10 mM HEPES, 0.075％ 중탄산나트륨, 및 25 ㎍/mL 겐타미신을 함유하는 RPMI-1640 배지에서 mid-log 상까지 성장시킴) 또는 A549 인간 폐 선암종 세포 (10％ 열-불활성화 태아 소 혈청, 100 단위/mL 페니실린 G, 100 ㎍/mL 스트렙토마이신 술페이트, 0.25 ㎍/mL 암포테리신 B, 2 mM 글루타민, 1 mM 피루브산나트륨, 및 25 ㎍/mL 겐타미신을 함유하는 카인(Kaighn)의 변형된 햄(Ham) F12 배지에서 배양함)로부터 개시하였다. 종양 이식 당일에, H1299 세포를 수확하고, 5 x 107개 세포/mL의 농도로 PBS에 재현탁시켰다. 각각의 시험 마우스에 1 x 107개 H1299 종양 세포를 오른쪽 옆구리에 피하 이식하였다. A549 종양의 경우, A549 세포를 5 x 107개 세포/mL의 농도로 100％ 매트리겔(Matrigel)TM 매트릭스 (BD 바이오사이언시즈(BD Biosciences), 미국 캘리포니아주 산 호세)에 재현탁시켰다. A549 세포 (0.2 mL 중 1 x 107개)를 각각의 시험 마우스의 오른쪽 옆구리에 피하 이식하고, 종양 성장을 모니터링하였다. 대안적 예로서, LXFA629 종양의 단편을 각각의 시험 마우스의 오른쪽 옆구리에 피하 이식하고, 종양 성장을 모니터링하였다.
종양 성장은 120-180 mm3에 근접한 평균 크기로 모니터링하였다. 연구 제1일에, 개별 종양 크기는 126 내지 196 mm3 범위이고, 동물을 종양 크기에 의해 3개의 시험 군 (1개의 대조군 및 2개의 처리군)으로 분류하였다. 종양 부피를 하기 식을 사용하여 계산하였다:
Figure pct00030
여기서, w = 종양의 폭 (mm) 및 l = 종양의 길이 (mm).
모든 치료는 복막내 투여하였다. 종양을 5-10 mg/kg의 각각의 대조군 항체, VEGF-A 활성을 차단하는 작용제 (항-VEGF-A 항체 B20-4.1, 5 mg/kg), 또는 VEGF-A 활성을 차단하는 작용제 및 NRP1 활성을 차단하는 작용제 (항-NRP1 항체, 10 mg/kg)의 조합으로 10-20주까지 동안 매주 2회 처리하였다. 조합 처리군의 경우, 항-NRP1 항체는 항-VEGF-A 항체 투여 30분후 이전에 투여한다. 각각의 투여량은 체중 20 그램 당 0.2 mL의 부피 (10 mL/kg)로 전달하고, 동물의 체중에 대해 스케일링하였다.
종양 부피를 캘리퍼를 사용하여 매주 2회 기록하였다. 그의 종양의 종점 크기 (일반적으로 1000 mm3)로의 도달 또는 연구의 결론 중 먼저 일어난 시점에 각각의 동물을 안락사시켰다.
종점까지의 시간 (TTE)을 하기 식으로부터 계산하였다:
Figure pct00031
여기서, b는 log-변환된 종양 성장 데이타 세트의 선형 회귀에 의해 수득한 선의 절편이고, m은 기울기이다.
종점에 도달하지 않은 동물에게 연구 마지막 날과 동일한 TTE 값을 할당하였다. 우연한 (NTRa) 또는 알려지지 않은 원인 (NTRu)으로 인한 NTR (비-치료-관련) 사망으로 분류된 동물을 TTE 연산 (및 모든 추가의 분석)에서 제외하였다. TR (치료-관련) 사망 또는 NTRm (전이로 인한 비-치료-관련 사망)으로 분류된 동물에게 사망 당일과 동일한 TTE 값을 할당하였다. 종양을 수확하고, 밤새 10％ NBF에서 고정시킨 후에 70％ 에탄올로 고정시키고, 이후에 파라핀에 포매시키거나, 또는 2분 내에 액체 질소에서 동결시키고, 이후에 -80℃에 보관하였다.
처리 결과는 종양 성장 지연 (TGD)에 의해 평가하였으며, 이를 대조군과 비교하여 처리군에서 중간 종점까지의 시간 (TTE)의 증가로 규정하고, 다음과 같이 계산하거나:
Figure pct00032
(일로 표시), 또는
대조군의 중간 TTE의 백분율로 규정하고, 다음과 같이 계산하였다:
Figure pct00033
여기서, T = 처리군에 대한 중간 TTE 및 C = 대조군에 대한 중간 TTE.
Δ％ TGD는 상기와 같이 계산하였다: C = 대조군 (항-VEGF-A 치료를 단독으로 투여한 군), 및 T = 처리군 (항-VEGF-A 및 항-NRP1 치료의 조합을 투여한 군). 로그 순위 시험을 이용하여 2개 군의 TTE 값 사이의 차이의 유의성을 분석하였다. 양방향 통계적 분석은 유의 수준 p = 0.05에서 수행하였다. "1"의 값은 치료가 종양 진행을 추가로 지연시켰음을 나타낸다. "0"의 값은 치료가 종양 진행을 추가로 지연시키지 않았음을 나타낸다.
항-NRP1 항체 및 항-VEGF-A 항체의 조합 치료는 항-VEGF 치료 단독과 비교하여 MDA-MB231, HT29, SKMES 및 H1299 종양에서 종양 진행을 추가로 지연시켰다 (도 1).
실시예 4 항-NRP1 항체 치료의 효능에 대한 바이오마커의 확인
유전자 발현 분석은 실시예 3에서 상기 기재된 종양 모델 실험으로부터 수득한 동결된 종양 샘플 상에서 qRT-PCR을 이용하여 수행하였다. 동결된 재료로부터, 최대 3 mm 측면 길이의 작은 큐브를 시판 시약 및 장치 (RNeasy®, 티슈라이저, 둘 모두 퀴아젠 인크., 독일)를 사용하여 가용화시켰다. 칼럼 정제 후에, RNA를 H2O로 용리하고, 글리코겐 및 아세트산나트륨의 첨가 후에 에탄올로 침전시켰다. RNA를 30분 이상 동안 원심분리에 의해 펠릿화하고, 80％ 에탄올로 2회 세척하고, 건조 후에 펠릿을 H2O에 재현탁시켰다. RNA 농도를 분광광도계 또는 생물분석기 (애질런트, 미국 캘리포니아주 포스터 시티)를 사용하여 평가하고, 이후의 유전자 발현 분석에서 반응 당 50 ng의 전체 RNA를 사용하였다.
상기 실시예 1에 열거된 유전자 특이적 프라이머 및 프로브 세트를 18S rRNA, 인간 및 마우스 RPS13 (하우스키핑 유전자), NRP1 (막횡단 형태 단독, 및 막횡단 및 가용성 형태), Sema3A, Sema3B, Sema3F, PlGF, TGFβ1, HGF, Bv8, RGS5, Prox1, CSF2, LGALS1, LGALS7 및 ITGa5의 qRT-PCR 발현 분석에 사용하였다.
NRP1, Sema3A, Sema3B, Sema3F, PlGF, TGFβ1, HGF, Bv8, RGS5, Prox1, CSF2, LGALS1, LGALS7 및 ITGa5의 상대적 발현 수준을 결정하였다. 예를 들어, NRP1의 상대적 발현 수준을 다음과 같이 계산하였다:
상대적 발현 NRP1 샘플 = 2 exp (Ct [(18SrRNA+RPS13)/2] - Ct NRP1) (Ct는 샘플에서 결정되고, 여기서 Ct는 임계값 사이클임). Ct는 반응 내에서 생성된 형광이 임계값 선을 넘는 사이클 수이다.
상이한 반응 플레이트로부터의 결과의 비교를 허용하기 위해, 이어서 상대적 발현을 모든 실험 진행에서 동일한 내부 참조 RNA에 대한 상대적 발현에 대한 분수로서 이에 100을 곱하여 계산하였다:
정상화된 상대적 발현 NRP1 샘플 = (상대적 발현 NRP1 샘플/상대적 발현 NRP1 참조 RNA) x 100 (여기서, 상대적 발현 NRP1 참조 RNA = 2 exp (Ct [(18SrRNA+RPS13)/2] - Ct NRP1) (Ct는 참조 RNA에서 결정됨)).
이 연산을 사용하여, qRT-PCR 반응에서 임의의 신호를 갖는 샘플은 '1' 초과의 값을 갖고, '1' 미만의 값을 갖는 샘플은 특정 분석물에 대해 '음성'으로 분류하였다.
마커 RNA 발현 (qPCR)의 상관관계에 대한 p- 및 r-값 및 조합 치료 효능은 도 2에 나타내었다.
유전자 발현 분석으로부터의 결과는 도 3-15에 나타내었다. 도 3-15 각각에서, 검정된 유전자의 상대적 발현을 검사된 7가지 상이한 종양 모델에 의해 나타난 종양 성장 지연의 변화율(％) (Δ％ TGD)과 비교하였다.
항-VEGF-A 항체와 조합된 항-NRP1 항체로의 치료에 반응한 종양 모델은 조합 치료에 반응하지 않은 종양 모델과 비교하여 보다 높은 수준의 TGFβ1, Bv8, Sema3A, PlGF, LGALS1, ITGa5 및 CSF2를 발현하였다 (도 3-9 참조).
항-NRP1 항체 및 항-VEGF-A 항체로의 조합 치료에 반응성인 종양 모델은 또한 조합 치료에 반응하지 않은 종양 모델과 비교하여 보다 낮은 수준의 Prox1, RGS5, HGF, Sema3B, Sema3F 및 LGALS7을 발현하였다 (도 10-15 참조).
실시예 5 항-VEGF-C 항체의 종양 억제 활성
모든 연구는 NIH에 의해 발행된 실험실용 동물의 관리 및 사용에 대한 지침 (NIH 공개 85-23, 1985년 개정)에 따라 수행하였다. 동물 실험 윤리 위원회 (IACUC)는 모든 동물 프로토콜을 승인하였다.
연구는 표준화 기술을 사용하여 하기 인간 종양 모델로 수행하였다: A549, MDA-MB231, H460, BxPC3, DLD-1, HT29, SKMES, MV522 및 PC3. 인간 종양 세포를 각각의 시험 마우스의 오른쪽 옆구리에 피하 이식하였다. 예를 들어, A549의 경우, 이종이식을 배양된 A549 인간 비소세포 폐 암종 세포 (10％ 열-불활성화 태아 소 혈청, 100 단위/mL 페니실린 G, 100 ㎍/mL 스트렙토마이신 술페이트, 0.25 ㎍/mL 암포테리신 B, 1 mM 피루브산나트륨, 2 mM 글루타민, 10 mM HEPES, 0.075％ 중탄산나트륨, 및 25 ㎍/mL 겐타미신을 함유하는 RPMI-1640 배지에서 mid-log 상까지 성장시킴) 또는 A549 인간 폐 선암종 세포 (10％ 열-불활성화 태아 소 혈청, 100 단위/mL 페니실린 G, 100 ㎍/mL 스트렙토마이신 술페이트, 0.25 ㎍/mL 암포테리신 B, 2 mM 글루타민, 1 mM 피루브산나트륨, 및 25 ㎍/mL 겐타미신을 함유하는 카인의 변형된 햄 F12 배지에서 배양함)로부터 개시하였다. 종양 이식 당일에, A549 세포를 수확하고, 5 x 107개 세포/mL의 농도로 PBS에 재현탁시켰다. 각각의 시험 마우스에 1 x 107개 A549 종양 세포를 오른쪽 옆구리에 피하 이식하였다. A549 종양의 경우, A549 세포를 5 x 107개 세포/mL의 농도로 100％ 매트리겔TM 매트릭스 (BD 바이오사이언시즈, 미국 캘리포니아주 산 호세)에 재현탁시켰다. A549 세포 (0.2 mL 중 1 x 107개)를 각각의 시험 마우스의 오른쪽 옆구리에 피하 이식하고, 종양 성장을 모니터링하였다.
종양 성장은 120-180 mm3에 근접한 평균 크기로 모니터링하였다. 연구 제1일에, 개별 종양 크기는 126 내지 196 mm3 범위이고, 동물을 종양 크기에 의해 3개의 시험 군 (1개의 대조군 및 2개의 처리군)으로 분류하였다. 종양 부피를 하기 식을 사용하여 계산하였다:
Figure pct00034
여기서, w = 종양의 폭 (mm) 및 l = 종양의 길이 (mm).
모든 치료는 복막내 투여하였다. 종양을 5-10 mg/kg의 각각의 대조군 항체, VEGF-A 활성을 차단하는 작용제 (항-VEGF-A 항체 B20-4.1, 5 mg/kg), 또는 VEGF-A 활성을 차단하는 작용제 및 VEGF-C 활성을 차단하는 작용제 (항-VEGF-C 항체, 10 mg/kg)의 조합으로 10-20주까지 동안 매주 2회 처리하였다. 조합 처리군의 경우, 항-VEGF-C 항체는 항-VEGF-A 항체 투여 30분후 이전에 투여한다. 각각의 투여량은 체중 20 그램 당 0.2 mL의 부피 (10 mL/kg)로 전달하고, 동물의 체중에 대해 스케일링하였다.
종양 부피를 캘리퍼를 사용하여 매주 2회 기록하였다. 그의 종양의 종점 크기 (일반적으로 1000 mm3)로의 도달 또는 연구의 결론 중 먼저 일어난 시점에 각각의 동물을 안락사시켰다. 종양을 수확하고, 밤새 10％ NBF에서 고정시킨 후에 70％ 에탄올로 고정시키고, 이후에 파라핀에 포매시키거나, 또는 2분 내에 액체 질소에서 동결시키고, 이후에 -80℃에 보관하였다.
종점까지의 시간 (TTE)을 하기 식으로부터 계산하였다:
Figure pct00035
여기서, b는 log-변환된 종양 성장 데이타 세트의 선형 회귀에 의해 수득한 선의 절편이고, m은 기울기이다.
종점에 도달하지 않은 동물에게 연구 마지막 날과 동일한 TTE 값을 할당하였다. 우연한 (NTRa) 또는 알려지지 않은 원인 (NTRu)으로 인한 NTR (비-치료-관련) 사망으로 분류된 동물을 TTE 연산 (및 모든 추가의 분석)에서 제외하였다. TR (치료-관련) 사망 또는 NTRm (전이로 인한 비-치료-관련 사망)으로 분류된 동물에게 사망 당일과 동일한 TTE 값을 할당하였다.
처리 결과는 종양 성장 지연 (TGD)에 의해 평가하였으며, 이를 대조군과 비교하여 처리군에서 중간 종점까지의 시간 (TTE)의 증가로 규정하고, 다음과 같이 계산하거나:
Figure pct00036
(일로 표시), 또는
대조군의 중간 TTE의 백분율로 규정하고, 다음과 같이 계산하였다:
Figure pct00037
여기서, T = 처리군에 대한 중간 TTE 및 C = 대조군에 대한 중간 TTE.
Δ％ TGD는 상기와 같이 계산하였다: C = 대조군 (항-VEGF-A 치료를 단독으로 투여한 군), 및 T = 처리군 (항-VEGF-A 항체 및 항-VEGF-C 항체 치료의 조합을 투여한 군). 로그 순위 시험을 이용하여 2개 군의 TTE 값 사이의 차이의 유의성을 분석하였다. 양방향 통계적 분석은 유의 수준 p = 0.05에서 수행하였다. "1"의 값은 치료가 종양 진행을 추가로 지연시켰음을 나타낸다. "0"의 값은 치료가 종양 진행을 추가로 지연시키지 않았음을 나타낸다.
항-VEGF-C 항체 및 항-VEGF-A 항체의 조합 치료는 항-VEGF-A 항체 치료 단독과 비교하여 A549 및 H460 종양에서 종양 진행을 추가로 지연시켰다 (도 16).
실시예 6 항-VEGF-C 항체 치료의 효능에 대한 바이오마커의 확인
유전자 발현 분석은 실시예 5에서 상기 기재된 종양 모델 실험으로부터 수득한 동결된 종양 샘플 상에서 qRT-PCR을 이용하여 수행하였다. 동결된 재료로부터, 최대 3 mm 측면 길이의 작은 큐브를 시판 시약 및 장치 (RNeasy®, 티슈라이저, 둘 모두 퀴아젠 인크., 독일)를 사용하여 가용화시켰다. 칼럼 정제 후에, RNA를 H2O로 용리하고, 글리코겐 및 아세트산나트륨의 첨가 후에 에탄올로 침전시켰다. RNA를 30분 이상 동안 원심분리에 의해 펠릿화하고, 80％ 에탄올로 2회 세척하고, 건조 후에 펠릿을 H2O에 재현탁시켰다. RNA 농도를 분광광도계 또는 생물분석기 (애질런트, 미국 캘리포니아주 포스터 시티)를 사용하여 평가하고, 이후의 유전자 발현 분석에서 반응 당 50 ng의 전체 RNA를 사용하였다.
유전자 특이적 프라이머 및 프로브 세트를 18S rRNA, 인간 및 마우스 RPS13 (하우스키핑 유전자), VEGF-C, VEGF-A, VEGF-D, VEGFR3, FGF2, CSF2, ICAM1, RGS5/CDH5, ESM1, Prox1, PlGF, ITGa5 및 TGF-β의 qRT-PCR 발현 분석을 위해 설계하였다. 프라이머 및 프로브 세트 서열은 표 2에 열거되어 있다.
VEGF-C, VEGF-A, VEGF-D, VEGFR3, FGF2, CSF2, ICAM1, RGS5/CDH5, ESM1, Prox1, PlGF, ITGa5 및 TGF-β의 상대적 발현 수준을 결정하였다. 예를 들어, VEGF-C의 상대적 발현 수준은 다음과 같이 계산하였다:
상대적 발현 VEGF-C 샘플 = 2 exp (Ct [(18SrRNA+RPS13)/2] - Ct VEGF-C) (Ct는 샘플에서 결정되고, 여기서 Ct는 임계값 사이클임). Ct는 반응 내에서 생성된 형광이 임계값 선을 넘는 사이클 수이다.
상이한 반응 플레이트로부터의 결과의 비교를 허용하기 위해, 이어서 상대적 발현을 모든 실험 진행에서 동일한 내부 참조 RNA에 대한 상대적 발현에 대한 분수로서 이에 100을 곱하여 계산하였다:
정상화된 상대적 발현 VEGF-C 샘플 = (상대적 발현 VEGF-C 샘플 / 상대적 발현 VEGF-C 참조 RNA) x 100 (여기서, 상대적 발현 VEGF-C 참조 RNA = 2 exp (Ct [(18SrRNA+RPS13)/2] - Ct VEGF-C) (Ct는 참조 RNA에서 결정됨).
이 연산을 사용하여, qRT-PCR 반응에서 임의의 신호를 갖는 샘플은 '1' 초과의 값을 갖고, '1' 미만의 값을 갖는 샘플은 특정 분석물에 대해 '음성'으로 분류하였다.
마커 RNA 발현 (qPCR)의 상관관계에 대한 p- 및 r-값 및 조합 치료 효능은 도 17에 나타내었다.
유전자 발현 분석으로부터의 결과는 도 18-30에 나타내었다. 도 18-30 각각에서, 검정된 유전자의 상대적 발현을 검사된 7가지 상이한 종양 모델에 의해 나타난 종양 성장 지연의 변화율(％) (Δ％ TGD)과 비교하였다. 항-VEGF-A 항체와 조합된 항-VEGF-C 항체로의 치료에 반응한 종양 모델은 조합 치료에 반응하지 않은 종양 모델과 비교하여 보다 높은 수준의 VEGF-C, VEGF-D, VEGFR3, FGF2 및 RGS5/CDH5를 발현하였다 (도 19-22 및 25 참조).
항-VEGF-C 항체 및 항-VEGF-A 항체로의 조합 치료에 반응성인 종양 모델은 또한 조합 치료에 반응하지 않은 종양 모델과 비교하여 보다 낮은 수준의 VEGF-A, CSF2, Prox1, ICAM1, ESM1, PlGF, ITGa5 및 TGFβ를 발현하였다 (도 18, 23-24, 및 26-30 참조).
실시예 7 항-EGFL7 항체의 종양 억제 활성
모든 연구는 NIH에 의해 발행된 실험실용 동물의 관리 및 사용에 대한 지침 (NIH 공개 85-23, 1985년 개정)에 따라 수행하였다. 동물 실험 윤리 위원회 (IACUC)는 모든 동물 프로토콜을 승인하였다.
연구는 표준화 기술을 사용하여 하기 인간 종양 모델로 수행하였다: A549, MDA-MB231, H460, BxPC3, SKMES, SW620, H1299, MV522 및 PC3. 인간 종양 세포를 각각의 시험 마우스의 오른쪽 옆구리에 피하 이식하였다. 예를 들어, A549의 경우, 이종이식을 배양된 A549 인간 비소세포 폐 암종 세포 (10％ 열-불활성화 태아 소 혈청, 100 단위/mL 페니실린 G, 100 ㎍/mL 스트렙토마이신 술페이트, 0.25 ㎍/mL 암포테리신 B, 1 mM 피루브산나트륨, 2 mM 글루타민, 10 mM HEPES, 0.075％ 중탄산나트륨, 및 25 ㎍/mL 겐타미신을 함유하는 RPMI-1640 배지에서 mid-log 상까지 성장시킴) 또는 A549 인간 폐 선암종 세포 (10％ 열-불활성화 태아 소 혈청, 100 단위/mL 페니실린 G, 100 ㎍/mL 스트렙토마이신 술페이트, 0.25 ㎍/mL 암포테리신 B, 2 mM 글루타민, 1 mM 피루브산나트륨, 및 25 ㎍/mL 겐타미신을 함유하는 카인의 변형된 햄 F12 배지에서 배양함)로부터 개시하였다. 종양 이식 당일에, A549 세포를 수확하고, 5 x 107개 세포/mL의 농도로 PBS에 재현탁시켰다. 각각의 시험 마우스에 1 x 107개 A549 종양 세포를 오른쪽 옆구리에 피하 이식하였다. A549 종양의 경우, A549 세포를 5 x 107개 세포/mL의 농도로 100％ 매트리겔TM 매트릭스 (BD 바이오사이언시즈, 미국 캘리포니아주 산 호세)에 재현탁시켰다. A549 세포 (0.2 mL 중 1 x 107개)를 각각의 시험 마우스의 오른쪽 옆구리에 피하 이식하고, 종양 성장을 모니터링하였다.
종양 성장은 120-180 mm3에 근접한 평균 크기로 모니터링하였다. 연구 제1일에, 개별 종양 크기는 126 내지 196 mm3 범위이고, 동물을 종양 크기에 의해 3개의 시험 군 (1개의 대조군 및 2개의 처리군)으로 분류하였다. 종양 부피를 하기 식을 사용하여 계산하였다:
Figure pct00038
여기서, w = 종양의 폭 (mm) 및 l = 종양의 길이 (mm).
모든 치료는 복막내 투여하였다. 종양을 5-10 mg/kg의 각각의 대조군 항체, VEGF-A 활성을 차단하는 작용제 (항-VEGF-A 항체 B20-4.1, 5 mg/kg), 또는 VEGF-A 활성을 차단하는 작용제 및 EGFL7 활성을 차단하는 작용제 (항-EGFL7 항체, 10 mg/kg)의 조합으로 10-20주까지 동안 매주 2회 처리하였다. 조합 처리군의 경우, 항-EGFL7 항체는 항-VEGF-A 항체 투여 30분후 이전에 투여한다. 각각의 투여량은 체중 20 그램 당 0.2 mL의 부피 (10 mL/kg)로 전달하고, 동물의 체중에 대해 스케일링하였다.
종양 부피를 캘리퍼를 사용하여 매주 2회 기록하였다. 그의 종양의 종점 크기 (일반적으로 1000 mm3)로의 도달 또는 연구의 결론 중 먼저 일어난 시점에 각각의 동물을 안락사시켰다. 종양을 수확하고, 밤새 10％ NBF에서 고정시킨 후에 70％ 에탄올로 고정시키고, 이후에 파라핀에 포매시키거나, 또는 2분 내에 액체 질소에서 동결시키고, 이후에 -80℃에 보관하였다.
종점까지의 시간 (TTE)을 하기 식으로부터 계산하였다:
Figure pct00039
여기서, b는 log-변환된 종양 성장 데이타 세트의 선형 회귀에 의해 수득한 선의 절편이고, m은 기울기이다.
종점에 도달하지 않은 동물에게 연구 마지막 날과 동일한 TTE 값을 할당하였다. 우연한 (NTRa) 또는 알려지지 않은 원인 (NTRu)으로 인한 NTR (비-치료-관련) 사망으로 분류된 동물을 TTE 연산 (및 모든 추가의 분석)에서 제외하였다. TR (치료-관련) 사망 또는 NTRm (전이로 인한 비-치료-관련 사망)으로 분류된 동물에게 사망 당일과 동일한 TTE 값을 할당하였다.
처리 결과는 종양 성장 지연 (TGD)에 의해 평가하였으며, 이를 대조군과 비교하여 처리군에서 중간 종점까지의 시간 (TTE)의 증가로 규정하고, 다음과 같이 계산하거나:
Figure pct00040
(일로 표시), 또는
대조군의 중간 TTE의 백분율로 규정하고, 다음과 같이 계산하였다:
Figure pct00041
여기서, T = 처리군에 대한 중간 TTE 및 C = 대조군에 대한 중간 TTE.
Δ％ TGD는 상기와 같이 계산하였다: C = 대조군 (항-VEGF-A 치료를 단독으로 투여한 군), 및 T = 처리군 (항-VEGF-A 항체 및 항-VEGF-C 항체 치료의 조합을 투여한 군). 로그 순위 시험을 이용하여 2개 군의 TTE 값 사이의 차이의 유의성을 분석하였다. 양방향 통계적 분석은 유의 수준 p = 0.05에서 수행하였다. "1"의 값은 치료가 종양 진행을 추가로 지연시켰음을 나타낸다. "0"의 값은 치료가 종양 진행을 추가로 지연시키지 않았음을 나타낸다.
항-EGFL7 항체 및 항-VEGF-A 항체의 조합 치료는 항-VEGF-A 항체 치료 단독과 비교하여 MDA-MB231, H460 및 H1299 종양에서 종양 진행을 추가로 지연시켰다 (도 31).
실시예 8 항-EGFL7 항체 치료의 효능에 대한 바이오마커의 확인
유전자 발현 분석은 실시예 7에서 상기 기재된 종양 모델 실험으로부터 수득한 동결된 종양 샘플 상에서 qRT-PCR을 이용하여 수행하였다. 동결된 재료로부터, 최대 3 mm 측면 길이의 작은 큐브를 시판 시약 및 장치 (RNeasy®, 티슈라이저, 둘 모두 퀴아젠 인크., 독일)를 사용하여 가용화시켰다. 칼럼 정제 후에, RNA를 H2O로 용리하고, 글리코겐 및 아세트산나트륨의 첨가 후에 에탄올로 침전시켰다. RNA를 30분 이상 동안 원심분리에 의해 펠릿화하고, 80％ 에탄올로 2회 세척하고, 건조 후에 펠릿을 H2O에 재현탁시켰다. RNA 농도를 분광광도계 또는 생물분석기 (애질런트, 미국 캘리포니아주 포스터 시티)를 사용하여 평가하고, 이후의 유전자 발현 분석에서 반응 당 50 ng의 전체 RNA를 사용하였다.
유전자 특이적 프라이머 및 프로브 세트를 18S rRNA, 인간 및 마우스 RPS13 (하우스키핑 유전자), cMet, Sema3B, FGF9, FN1, HGF, MFAP5, EFEMP2/피불린 4, VEGF-C, RGS5, NRP1, FBLN2, FGF2, CSF2, PDGF-C, BV8, CXCR4 및 TNFa의 qRT-PCR 발현 분석을 위해 설계하였다. 프라이머 및 프로브 세트 서열은 표 2에 열거되어 있다.
cMet, Sema3B, FGF9, FN1, HGF, MFAP5, EFEMP2/피불린 4, VEGF-C, RGS5, NRP1, FBLN2, FGF2, CSF2, PDGF-C, BV8, CXCR4 및 TNFa의 상대적 발현 수준을 결정하였다. 예를 들어, VEGF-C의 상대적 발현 수준은 다음과 같이 계산하였다:
상대적 발현 VEGF-C 샘플 = 2 exp (Ct [(18SrRNA+RPS13)/2] - Ct VEGF-C) (Ct는 샘플에서 결정되고, 여기서 Ct는 임계값 사이클임). Ct는 반응 내에서 생성된 형광이 임계값 선을 넘는 사이클 수이다.
상이한 반응 플레이트로부터의 결과의 비교를 허용하기 위해, 이어서 상대적 발현을 모든 실험 진행에서 동일한 내부 참조 RNA에 대한 상대적 발현에 대한 분수로서 이에 100을 곱하여 계산하였다:
정상화된 상대적 발현 VEGF-C 샘플 = (상대적 발현 VEGF-C 샘플 / 상대적 발현 VEGF-C 참조 RNA) x 100 (여기서, 상대적 발현 VEGF-C 참조 RNA = 2 exp (Ct [(18SrRNA+RPS13)/2] - Ct VEGF-C) (Ct는 참조 RNA에서 결정됨).
이 연산을 사용하여, qRT-PCR 반응에서 임의의 신호를 갖는 샘플은 '1' 초과의 값을 갖고, '1' 미만의 값을 갖는 샘플은 특정 분석물에 대해 '음성'으로 분류하였다.
마커 RNA 발현 (qPCR)의 상관관계에 대한 p- 및 r-값 및 조합 치료 효능은 도 32에 나타내었다.
유전자 발현 분석으로부터의 결과는 도 33-49에 나타내었다. 도 33-49 각각에서, 검정된 유전자의 상대적 발현을 검사된 9가지 상이한 종양 모델에 의해 나타난 종양 성장 지연의 변화율(％) (Δ％ TGD)과 비교하였다. 항-VEGF-A 항체와 조합된 항-EGFL7 항체로의 치료에 반응한 종양 모델은 조합 치료에 반응하지 않은 종양 모델과 비교하여 보다 높은 수준의 VEGF-C, BV8, CSF2 및 TNFα를 발현하였다 (도 36, 40, 41, 및 43 참조).
항-VEGF-C 항체 및 항-EGFL7 항체로의 조합 치료에 반응성인 종양 모델은 또한 조합 치료에 반응하지 않은 종양 모델과 비교하여 보다 낮은 수준의 Sema3B, FGF9, HGF, RGS5, NRP1, FGF2, CXCR4, cMet, FN1, 피불린 2, 피불린 4, MFAP5, PDGF-C 및 Sema3F를 발현하였다 (도 33-35, 37-39, 42, 및 44-49 참조).
실시예 9 항-NRP1 항체의 종양 억제 활성
모든 연구는 NIH에 의해 발행된 실험실용 동물의 관리 및 사용에 대한 지침 (NIH 공개 85-23, 1985년 개정)에 따라 수행하였다. 동물 실험 윤리 위원회 (IACUC)는 모든 동물 프로토콜을 승인하였다.
연구는 표준화 기술을 사용하여 하기 인간 종양 모델로 수행하였다: MDA-MB231, H1299, SKMES, HT29, 1050489, A2780, U87MG, MV522, LS174t, A549 및 Caki-2. 인간 종양 세포를 각각의 시험 마우스의 오른쪽 옆구리에 피하 이식하였다. 예를 들어, H1299의 경우, 이종이식을 배양된 H1299 인간 비소세포 폐 암종 세포 (10％ 열-불활성화 태아 소 혈청, 100 단위/mL 페니실린 G, 100 ㎍/mL 스트렙토마이신 술페이트, 0.25 ㎍/mL 암포테리신 B, 1 mM 피루브산나트륨, 2 mM 글루타민, 10 mM HEPES, 0.075％ 중탄산나트륨, 및 25 ㎍/mL 겐타미신을 함유하는 RPMI-1640 배지에서 mid-log 상까지 성장시킴) 또는 A549 인간 폐 선암종 세포 (10％ 열-불활성화 태아 소 혈청, 100 단위/mL 페니실린 G, 100 ㎍/mL 스트렙토마이신 술페이트, 0.25 ㎍/mL 암포테리신 B, 2 mM 글루타민, 1 mM 피루브산나트륨, 및 25 ㎍/mL 겐타미신을 함유하는 카인의 변형된 햄 F12 배지에서 배양함)로부터 개시하였다. 종양 이식 당일에, H1299 세포를 수확하고, 5 x 107개 세포/mL의 농도로 PBS에 재현탁시켰다. 각각의 시험 마우스에 1 x 107개 H1299 종양 세포를 오른쪽 옆구리에 피하 이식하였다. A549 종양의 경우, A549 세포를 5 x 107개 세포/mL의 농도로 100％ 매트리겔TM 매트릭스 (BD 바이오사이언시즈, 미국 캘리포니아주 산 호세)에 재현탁시켰다. A549 세포 (0.2 mL 중 1 x 107개)를 각각의 시험 마우스의 오른쪽 옆구리에 피하 이식하고, 종양 성장을 모니터링하였다. 또 다른 예로서, 1050489 종양의 단편을 각각의 시험 마우스의 오른쪽 옆구리에 피하 이식하고, 종양 성장을 모니터링하였다.
종양 성장은 120-180 mm3에 근접한 평균 크기로 모니터링하였다. 연구 제1일에, 개별 종양 크기는 126 내지 196 mm3 범위이고, 동물을 종양 크기에 의해 3개의 시험 군 (1개의 대조군 및 2개의 처리군)으로 분류하였다. 종양 부피를 하기 식을 사용하여 계산하였다:
Figure pct00042
여기서, w = 종양의 폭 (mm) 및 l = 종양의 길이 (mm).
모든 치료는 복막내 투여하였다. 종양을 5-10 mg/kg의 각각의 대조군 항체, VEGF-A 활성을 차단하는 작용제 (항-VEGF-A 항체 B20-4.1, 5 mg/kg), 또는 VEGF-A 활성을 차단하는 작용제 및 NRP1 활성을 차단하는 작용제 (항-NRP1 항체, 10 mg/kg)의 조합으로 10-20주까지 동안 매주 2회 처리하였다. 조합 처리군의 경우, 항-NRP1 항체는 항-VEGF-A 항체 투여 30분후 이전에 투여한다. 각각의 투여량은 체중 20 그램 당 0.2 mL의 부피 (10 mL/kg)로 전달하고, 동물의 체중에 대해 스케일링하였다.
종양 부피를 캘리퍼를 사용하여 매주 2회 기록하였다. 그의 종양의 종점 크기 (일반적으로 1000 mm3)로의 도달 또는 연구의 결론 중 먼저 일어난 시점에 각각의 동물을 안락사시켰다.
종점까지의 시간 (TTE)을 하기 식으로부터 계산하였다:
Figure pct00043
여기서, b는 log-변환된 종양 성장 데이타 세트의 선형 회귀에 의해 수득한 선의 절편이고, m은 기울기이다.
종점에 도달하지 않은 동물에게 연구 마지막 날과 동일한 TTE 값을 할당하였다. 우연한 (NTRa) 또는 알려지지 않은 원인 (NTRu)으로 인한 NTR (비-치료-관련) 사망으로 분류된 동물을 TTE 연산 (및 모든 추가의 분석)에서 제외하였다. TR (치료-관련) 사망 또는 NTRm (전이로 인한 비-치료-관련 사망)으로 분류된 동물에게 사망 당일과 동일한 TTE 값을 할당하였다. 종양을 수확하고, 밤새 10％ NBF에서 고정시킨 후에 70％ 에탄올로 고정시키고, 이후에 파라핀에 포매시키거나, 또는 2분 내에 액체 질소에서 동결시키고, 이후에 -80℃에 보관하였다.
처리 결과는 종양 성장 지연 (TGD)에 의해 평가하였으며, 이를 대조군과 비교하여 처리군에서 중간 종점까지의 시간 (TTE)의 증가로 규정하고, 다음과 같이 계산하거나:
Figure pct00044
(일로 표시), 또는
대조군의 중간 TTE의 백분율로 규정하고, 다음과 같이 계산하였다:
Figure pct00045
여기서, T = 처리군에 대한 중간 TTE 및 C = 대조군에 대한 중간 TTE.
Δ％ TGD는 상기와 같이 계산하였다: C = 대조군 (항-VEGF-A 치료를 단독으로 투여한 군), 및 T = 처리군 (항-VEGF-A 및 항-NRP1 치료의 조합을 투여한 군). 로그 순위 시험을 이용하여 2개 군의 TTE 값 사이의 차이의 유의성을 분석하였다. 양방향 통계적 분석은 유의 수준 p = 0.05에서 수행하였다. "1"의 값은 치료가 종양 진행을 추가로 지연시켰음을 나타낸다. "0"의 값은 치료가 종양 진행을 추가로 지연시키지 않았음을 나타낸다.
항-NRP1 항체 및 항-VEGF-A 항체의 조합 치료는 항-VEGF 치료 단독과 비교하여 MDA-MB231, H1299, SKMES, HT29, 1050489, A2780 및 U87MG 종양에서 종양 진행을 추가로 지연시켰다 (도 50).
실시예 10 항-NRP1 항체 치료의 효능에 대한 바이오마커의 확인
유전자 발현 분석은 실시예 9에서 상기 기재된 종양 모델 실험으로부터 수득한 동결된 종양 샘플 상에서 qRT-PCR을 이용하여 수행하였다. 동결된 재료로부터, 최대 3 mm 측면 길이의 작은 큐브를 시판 시약 및 장치 (RNeasy®, 티슈라이저, 둘 모두 퀴아젠 인크., 독일)를 사용하여 가용화시켰다. 칼럼 정제 후에, RNA를 H2O로 용리하고, 글리코겐 및 아세트산나트륨의 첨가 후에 에탄올로 침전시켰다. RNA를 30분 이상 동안 원심분리에 의해 펠릿화하고, 80％ 에탄올로 2회 세척하고, 건조 후에 펠릿을 H2O에 재현탁시켰다. RNA 농도를 분광광도계 또는 생물분석기 (애질런트, 미국 캘리포니아주 포스터 시티)를 사용하여 평가하고, 이후의 유전자 발현 분석에서 반응 당 50 ng의 전체 RNA를 사용하였다.
상기 실시예 1에 열거된 유전자 특이적 프라이머 및 프로브 세트를 18S rRNA, RPS13, HMBS, ACTB 및 SDHA (하우스키핑 유전자) 및 SEMA3B, TGFB1, FGFR4, 비멘틴, SEMA3A, PLC, CXCL5, ITGa5, PLGF, CCL2, IGFBP4, LGALS1, HGF, TSP1, CXCL1, CXCL2, Alk1 및 FGF8의 qRT-PCR 발현 분석에 사용하였다.
SEMA3B, TGFB1, FGFR4, 비멘틴, SEMA3A, PLC, CXCL5, ITGa5, PLGF, CCL2, IGFBP4, LGALS1, HGF, TSP1, CXCL1, CXCL2, Alk1 및 FGF8의 상대적 발현 수준을 결정하였다. 예를 들어, SEMA3B의 상대적 발현 수준은 다음과 같이 계산하였다:
상대적 발현 SEMA3B 샘플 = 2 exp (Ct [(HK1+HK2+HKx)/x] - Ct SEMA3B) (여기서, HK는 하우스키핑 유전자 (예를 들어, 18sRNA, ACTB, RPS13, HMBS, SDHA, 또는 UBC)이고, x는 데이터를 정상화하는데 사용된 하우스키핑 유전자의 총 개수임) (Ct는 샘플에서 결정되고, 여기서 Ct는 임계값 사이클임). Ct는 반응 내에서 생성된 형광이 임계값 선을 넘는 사이클 수이다.
상이한 반응 플레이트로부터의 결과의 비교를 허용하기 위해, 이어서 상대적 발현을 모든 실험 진행에서 동일한 내부 참조 RNA에 대한 상대적 발현에 대한 분수로 계산하였다:
정상화된 상대적 발현 SEMA3B 샘플 = (상대적 발현 SEMA3B 샘플 / 상대적 발현 SEMA3B 참조 RNA) (여기서, 상대적 발현 SEMA3B 샘플 = 2 exp (Ct [(HK1+HK2+HKx)/x] - Ct SEMA3B) (Ct는 참조 RNA에서 결정됨).
마커 RNA 발현 (qPCR)의 상관관계에 대한 p- 및 r-값 및 조합 치료 효능은 도 51에 나타내었다.
유전자 발현 분석으로부터의 결과는 도 52-69에 나타내었다. 도 52-69 각각에서, 검정된 유전자의 상대적 발현을 검사된 7가지 상이한 종양 모델에 의해 나타난 종양 성장 지연의 변화율(％) (Δ％ TGD)과 비교하였다.
항-VEGF-A 항체와 조합된 항-NRP1 항체로의 치료에 반응한 종양 모델은 조합 치료에 반응하지 않은 종양 모델과 비교하여 보다 높은 수준의 TGFβ1, 비멘틴, Sema3A, CXCL5, ITGa5, PlGF, CCL2, LGALS1, CXCL2, Alk1 및 FGF8을 발현하였다 (도 53, 55-56, 58-61, 63, 및 66-69 참조).
항-NRP1 항체 및 항-VEGF-A 항체로의 조합 치료에 반응성인 종양 모델은 또한 조합 치료에 반응하지 않은 종양 모델과 비교하여 보다 낮은 수준의 Sema3B, FGRF4, PLC, IGFB4, HGF 및 TSP1을 발현하였다 (도 52, 54, 57, 62, 및 64-65 참조).
실시예 11 항-VEGF-C 항체의 종양 억제 활성
모든 연구는 NIH에 의해 발행된 실험실용 동물의 관리 및 사용에 대한 지침 (NIH 공개 85-23, 1985년 개정)에 따라 수행하였다. 동물 실험 윤리 위원회 (IACUC)는 모든 동물 프로토콜을 승인하였다.
연구는 표준화 기술을 사용하여 하기 인간 종양 모델로 수행하였다: A549, MDA-MB231, H460, BxPC3, DLD-1, HT29, SKMES, MV522, PC3, LXFE409, LXFL1674, LXFA629, LXFA737, LXFA1335, CXF243, CXF260, MAXF583, MEXF989, BXF1218, BXF1352 및 SXF463. 인간 종양 세포를 각각의 시험 마우스의 오른쪽 옆구리에 피하 이식하였다. 예를 들어, A549의 경우, 이종이식을 배양된 A549 인간 비소세포 폐 암종 세포 (10％ 열-불활성화 태아 소 혈청, 100 단위/mL 페니실린 G, 100 ㎍/mL 스트렙토마이신 술페이트, 0.25 ㎍/mL 암포테리신 B, 1 mM 피루브산나트륨, 2 mM 글루타민, 10 mM HEPES, 0.075％ 중탄산나트륨, 및 25 ㎍/mL 겐타미신을 함유하는 RPMI-1640 배지에서 mid-log 상까지 성장시킴) 또는 A549 인간 폐 선암종 세포 (10％ 열-불활성화 태아 소 혈청, 100 단위/mL 페니실린 G, 100 ㎍/mL 스트렙토마이신 술페이트, 0.25 ㎍/mL 암포테리신 B, 2 mM 글루타민, 1 mM 피루브산나트륨, 및 25 ㎍/mL 겐타미신을 함유하는 카인의 변형된 햄 F12 배지에서 배양함)로부터 개시하였다. 종양 이식 당일에, A549 세포를 수확하고, 5 x 107개 세포/mL의 농도로 PBS에 재현탁시켰다. 각각의 시험 마우스에 1 x 107개 A549 종양 세포를 오른쪽 옆구리에 피하 이식하였다. A549 종양의 경우, A549 세포를 5 x 107개 세포/mL의 농도로 100％ 매트리겔TM 매트릭스 (BD 바이오사이언시즈, 미국 캘리포니아주 산 호세)에 재현탁시켰다. A549 세포 (0.2 mL 중 1 x 107개)를 각각의 시험 마우스의 오른쪽 옆구리에 피하 이식하고, 종양 성장을 모니터링하였다. 또 다른 예로서, LXFA629 종양의 단편을 각각의 시험 마우스의 오른쪽 옆구리에 피하 이식하고, 종양 성장을 모니터링하였다.
종양 성장은 120-180 mm3에 근접한 평균 크기로 모니터링하였다. 연구 제1일에, 개별 종양 크기는 126 내지 196 mm3 범위이고, 동물을 종양 크기에 의해 3개의 시험 군 (1개의 대조군 및 2개의 처리군)으로 분류하였다. 종양 부피를 하기 식을 사용하여 계산하였다:
Figure pct00046
여기서, w = 종양의 폭 (mm) 및 l = 종양의 길이 (mm).
모든 치료는 복막내 투여하였다. 종양을 5-10 mg/kg의 각각의 대조군 항체, VEGF-A 활성을 차단하는 작용제 (항-VEGF-A 항체 B20-4.1, 5 mg/kg), 또는 VEGF-A 활성을 차단하는 작용제 및 VEGF-C 활성을 차단하는 작용제 (항-VEGF-C 항체, 10 mg/kg)의 조합으로 10-20주까지 동안 매주 2회 처리하였다. 조합 처리군의 경우, 항-VEGF-C 항체는 항-VEGF-A 항체 투여 30분후 이전에 투여한다. 각각의 투여량은 체중 20 그램 당 0.2 mL의 부피 (10 mL/kg)로 전달하고, 동물의 체중에 대해 스케일링하였다.
종양 부피를 캘리퍼를 사용하여 매주 2회 기록하였다. 그의 종양의 종점 크기 (일반적으로 1000 mm3)로의 도달 또는 연구의 결론 중 먼저 일어난 시점에 각각의 동물을 안락사시켰다. 종양을 수확하고, 밤새 10％ NBF에서 고정시킨 후에 70％ 에탄올로 고정시키고, 이후에 파라핀에 포매시키거나, 또는 2분 내에 액체 질소에서 동결시키고, 이후에 -80℃에 보관하였다.
종점까지의 시간 (TTE)을 하기 식으로부터 계산하였다:
Figure pct00047
여기서, b는 log-변환된 종양 성장 데이타 세트의 선형 회귀에 의해 수득한 선의 절편이고, m은 기울기이다.
종점에 도달하지 않은 동물에게 연구 마지막 날과 동일한 TTE 값을 할당하였다. 우연한 (NTRa) 또는 알려지지 않은 원인 (NTRu)으로 인한 NTR (비-치료-관련) 사망으로 분류된 동물을 TTE 연산 (및 모든 추가의 분석)에서 제외하였다. TR (치료-관련) 사망 또는 NTRm (전이로 인한 비-치료-관련 사망)으로 분류된 동물에게 사망 당일과 동일한 TTE 값을 할당하였다.
처리 결과는 종양 성장 지연 (TGD)에 의해 평가하였으며, 이를 대조군과 비교하여 처리군에서 중간 종점까지의 시간 (TTE)의 증가로 규정하고, 다음과 같이 계산하거나:
Figure pct00048
(일로 표시), 또는
대조군의 중간 TTE의 백분율로 규정하고, 다음과 같이 계산하였다:
Figure pct00049
여기서, T = 처리군에 대한 중간 TTE 및 C = 대조군에 대한 중간 TTE.
Δ％ TGD는 상기와 같이 계산하였다: C = 대조군 (항-VEGF-A 항체 치료를 단독으로 투여한 군), 및 T = 처리군 (항-VEGF-A 항체 및 항-VEGF-C 항체 치료의 조합을 투여한 군). 로그 순위 시험을 이용하여 2개 군의 TTE 값 사이의 차이의 유의성을 분석하였다. 양방향 통계적 분석은 유의 수준 p = 0.05에서 수행하였다. "1"의 값은 치료가 종양 진행을 추가로 지연시켰음을 나타낸다. "0"의 값은 치료가 종양 진행을 추가로 지연시키지 않았음을 나타낸다.
항-VEGF-C 항체 및 항-VEGF-A 항체의 조합 치료는 항-VEGF-A 항체 치료 단독과 비교하여 A549, H460, LXFA629, CXF243, BXF1218 및 BXF1352 종양에서 종양 진행을 추가로 지연시켰다 (도 70).
실시예 12 항-VEGF-C 항체 치료의 효능에 대한 바이오마커의 확인
유전자 발현 분석은 실시예 11에서 상기 기재된 종양 모델 실험으로부터 수득한 동결된 종양 샘플 상에서 qRT-PCR을 이용하여 수행하였다. 동결된 재료로부터, 최대 3 mm 측면 길이의 작은 큐브를 시판 시약 및 장치 (RNeasy®, 티슈라이저, 둘 모두 퀴아젠 인크., 독일)를 사용하여 가용화시켰다. 칼럼 정제 후에, RNA를 H2O로 용리하고, 글리코겐 및 아세트산나트륨의 첨가 후에 에탄올로 침전시켰다. RNA를 30분 이상 동안 원심분리에 의해 펠릿화하고, 80％ 에탄올로 2회 세척하고, 건조 후에 펠릿을 H2O에 재현탁시켰다. RNA 농도를 분광광도계 또는 생물분석기 (애질런트, 미국 캘리포니아주 포스터 시티)를 사용하여 평가하고, 이후의 유전자 발현 분석에서 반응 당 50 ng의 전체 RNA를 사용하였다.
유전자 특이적 프라이머 및 프로브 세트를 18S rRNA, RPS13, HMBS, ACTB 및 SDHA (하우스키핑 유전자) 및 VEGF-A, PLGF, VEGF-C, VEGF-D, VEGFR3, IL-8, CXCL1, CXCL2, Hhex, Col4a1, Col4a2, Alk1, ESM1 및 민클의 qRT-PCR 발현 분석을 위해 설계하였다. 프라이머 및 프로브 세트 서열은 표 2에 열거되어 있다.
VEGF-A, PLGF, VEGF-C, VEGF-D, VEGFR3, IL-8, CXCL1, CXCL2, Hhex, Col4a1, Col4a2, Alk1, ESM1 및 민클의 상대적 발현 수준을 결정하였다. 예를 들어, VEGF-C의 상대적 발현 수준은 다음과 같이 계산하였다:
상대적 발현 VEGF-C 샘플 = 2 exp (Ct [(HK1+HK2+HKx)/x] - Ct VEGF-C) (여기서, HK는 하우스키핑 유전자 (예를 들어, 18S rRNA, RPS13, HMBS, ACTB 및 SDHA)이고, x는 데이터를 정상화하는데 사용된 하우스키핑 유전자의 총 개수임) (Ct는 샘플에서 결정되고, 여기서 Ct는 임계값 사이클임). Ct는 반응 내에서 생성된 형광이 임계값 선을 넘는 사이클 수이다.
상이한 반응 플레이트로부터의 결과의 비교를 허용하기 위해, 이어서 상대적 발현을 모든 실험 진행에서 동일한 내부 참조 RNA에 대한 상대적 발현에 대한 분수로 계산하였다:
정상화된 상대적 발현 VEGF-C 샘플 = (상대적 발현 VEGF-C 샘플 / 상대적 발현 VEGF-C 참조 RNA) (여기서, 상대적 발현 VEGF-C 샘플 = 2 exp (Ct [(HK1+HK2+HKx)/x] - Ct VEGF-C) (Ct는 참조 RNA에서 결정됨).
마커 RNA 발현 (qPCR)의 상관관계에 대한 값 및 조합 치료 효능은 도 71에 나타내었다.
유전자 발현 분석으로부터의 결과는 도 72-92에 나타내었다. 도 72-92 각각에서, 검정된 유전자의 상대적 발현을 검사된 7가지 상이한 종양 모델에 의해 나타난 종양 성장 지연의 변화율(％) (Δ％ TGD)과 비교하였다. 항-VEGF-A 항체와 조합된 항-VEGF-C 항체로의 치료에 반응한 종양 모델은 조합 치료에 반응하지 않은 종양 모델과 비교하여 보다 높은 수준의 VEGF-C, VEGF-D, VEGFR3, IL-8, CXCL1 및 CXCL2를 발현하였다 (도 73-76 및 80-85 참조).
항-VEGF-C 항체 및 항-VEGF-A 항체로의 조합 치료에 반응성인 종양 모델은 또한 조합 치료에 반응하지 않은 종양 모델과 비교하여 보다 낮은 수준의 VEGF-A, PlGF, Hhex, Col4a1, Col4a2, Alk1 및 ESM1을 발현하였다 (도 72, 77-79, 및 86-92 참조).
실시예 13 항-EGFL7 항체의 종양 억제 활성
모든 연구는 NIH에 의해 발행된 실험실용 동물의 관리 및 사용에 대한 지침 (NIH 공개 85-23, 1985년 개정)에 따라 수행하였다. 동물 실험 윤리 위원회 (IACUC)는 모든 동물 프로토콜을 승인하였다.
연구는 표준화 기술을 사용하여 하기 인간 종양 모델로 수행하였다: A549, MDA-MB231, H460, BxPC3, SKMES, SW620, H1299, MV522 및 PC3. 인간 종양 세포를 각각의 시험 마우스의 오른쪽 옆구리에 피하 이식하였다. 예를 들어, A549의 경우, 이종이식을 배양된 A549 인간 비소세포 폐 암종 세포 (10％ 열-불활성화 태아 소 혈청, 100 단위/mL 페니실린 G, 100 ㎍/mL 스트렙토마이신 술페이트, 0.25 ㎍/mL 암포테리신 B, 1 mM 피루브산나트륨, 2 mM 글루타민, 10 mM HEPES, 0.075％ 중탄산나트륨, 및 25 ㎍/mL 겐타미신을 함유하는 RPMI-1640 배지에서 mid-log 상까지 성장시킴) 또는 A549 인간 폐 선암종 세포 (10％ 열-불활성화 태아 소 혈청, 100 단위/mL 페니실린 G, 100 ㎍/mL 스트렙토마이신 술페이트, 0.25 ㎍/mL 암포테리신 B, 2 mM 글루타민, 1 mM 피루브산나트륨, 및 25 ㎍/mL 겐타미신을 함유하는 카인의 변형된 햄 F12 배지에서 배양함)로부터 개시하였다. 종양 이식 당일에, A549 세포를 수확하고, 5 x 107개 세포/mL의 농도로 PBS에 재현탁시켰다. 각각의 시험 마우스에 1 x 107개 A549 종양 세포를 오른쪽 옆구리에 피하 이식하였다. A549 종양의 경우, A549 세포를 5 x 107개 세포/mL의 농도로 100％ 매트리겔TM 매트릭스 (BD 바이오사이언시즈, 미국 캘리포니아주 산 호세)에 재현탁시켰다. A549 세포 (0.2 mL 중 1 x 107개)를 각각의 시험 마우스의 오른쪽 옆구리에 피하 이식하고, 종양 성장을 모니터링하였다.
종양 성장은 120-180 mm3에 근접한 평균 크기로 모니터링하였다. 연구 제1일에, 개별 종양 크기는 126 내지 196 mm3 범위이고, 동물을 종양 크기에 의해 3개의 시험 군 (1개의 대조군 및 2개의 처리군)으로 분류하였다. 종양 부피를 하기 식을 사용하여 계산하였다:
Figure pct00050
여기서, w = 종양의 폭 (mm) 및 l = 종양의 길이 (mm).
모든 치료는 복막내 투여하였다. 종양을 5-10 mg/kg의 각각의 대조군 항체, VEGF-A 활성을 차단하는 작용제 (항-VEGF-A 항체 B20-4.1, 5 mg/kg), 또는 VEGF-A 활성을 차단하는 작용제 및 EGFL7 활성을 차단하는 작용제 (항-EGFL7 항체, 10 mg/kg)으로 10-20주까지 동안 매주 2회 처리하였다. 조합 처리군의 경우, 항-EGFL7 항체는 항-VEGF-A 항체 투여 30분후 이전에 투여한다. 각각의 투여량은 체중 20 그램 당 0.2 mL의 부피 (10 mL/kg)로 전달하고, 동물의 체중에 대해 스케일링하였다.
종양 부피를 캘리퍼를 사용하여 매주 2회 기록하였다. 그의 종양의 종점 크기 (일반적으로 1000 mm3)로의 도달 또는 연구의 결론 중 먼저 일어난 시점에 각각의 동물을 안락사시켰다. 종양을 수확하고, 밤새 10％ NBF에서 고정시킨 후에 70％ 에탄올로 고정시키고, 이후에 파라핀에 포매시키거나, 또는 2분 내에 액체 질소에서 동결시키고, 이후에 -80℃에 보관하였다.
종점까지의 시간 (TTE)을 하기 식으로부터 계산하였다:
Figure pct00051
여기서, b는 log-변환된 종양 성장 데이타 세트의 선형 회귀에 의해 수득한 선의 절편이고, m은 기울기이다.
종점에 도달하지 않은 동물에게 연구 마지막 날과 동일한 TTE 값을 할당하였다. 우연한 (NTRa) 또는 알려지지 않은 원인 (NTRu)으로 인한 NTR (비-치료-관련) 사망으로 분류된 동물을 TTE 연산 (및 모든 추가의 분석)에서 제외하였다. TR (치료-관련) 사망 또는 NTRm (전이로 인한 비-치료-관련 사망)으로 분류된 동물에게 사망 당일과 동일한 TTE 값을 할당하였다.
처리 결과는 종양 성장 지연 (TGD)에 의해 평가하였으며, 이를 대조군과 비교하여 처리군에서 중간 종점까지의 시간 (TTE)의 증가로 규정하고, 다음과 같이 계산하거나:
Figure pct00052
(일로 표시), 또는
대조군의 중간 TTE의 백분율로 규정하고, 다음과 같이 계산하였다:
Figure pct00053
여기서, T = 처리군에 대한 중간 TTE 및 C = 대조군에 대한 중간 TTE.
Δ％ TGD는 상기와 같이 계산하였다: C = 대조군 (항-VEGF-A 항체 치료를 단독으로 투여한 군), 및 T = 처리군 (항-VEGF-A 항체 및 항-VEGF-C 항체 치료의 조합을 투여한 군). 로그 순위 시험을 이용하여 2개 군의 TTE 값 사이의 차이의 유의성을 분석하였다. 양방향 통계적 분석은 유의 수준 p = 0.05에서 수행하였다. "1"의 값은 치료가 종양 진행을 추가로 지연시켰음을 나타낸다. "0"의 값은 치료가 종양 진행을 추가로 지연시키지 않았음을 나타낸다.
항-EGFL7 항체 및 항-VEGF-A 항체의 조합 치료는 항-VEGF-A 항체 치료 단독과 비교하여 MDA-MB231, H460 및 H1299 종양에서 종양 진행을 추가로 지연시켰다 (도 93).
실시예 14 항-EGFL7 항체 치료의 효능에 대한 바이오마커의 확인
유전자 발현 분석은 실시예 13에서 상기 기재된 종양 모델 실험으로부터 수득한 동결된 종양 샘플 상에서 qRT-PCR을 이용하여 수행하였다. 동결된 재료로부터, 최대 3 mm 측면 길이의 작은 큐브를 시판 시약 및 장치 (RNeasy®, 티슈라이저, 둘 모두 퀴아젠 인크., 독일)를 사용하여 가용화시켰다. 칼럼 정제 후에, RNA를 H2O로 용리하고, 글리코겐 및 아세트산나트륨의 첨가 후에 에탄올로 침전시켰다. RNA를 30분 이상 동안 원심분리에 의해 펠릿화하고, 80％ 에탄올로 2회 세척하고, 건조 후에 펠릿을 H2O에 재현탁시켰다. RNA 농도를 분광광도계 또는 생물분석기 (애질런트, 미국 캘리포니아주 포스터 시티)를 사용하여 평가하고, 이후의 유전자 발현 분석에서 반응 당 50 ng의 전체 RNA를 사용하였다.
유전자 특이적 프라이머 및 프로브 세트를 18S rRNA, RPS13, ACTB, HNBS 및 SDHA (하우스키핑 유전자) 및 FRAS1, cMet, Sema3B, FGF9, FN1, HGF, MFAP5, EFEMP2/피불린 4, VEGF-C, CXCL2, FBLN2, FGF2, PDGF-C, BV8, TNFa 및 민클의 qRT-PCR 발현 분석을 위해 설계하였다. 프라이머 및 프로브 세트 서열은 표 2에 열거되어 있다.
FRAS1, cMet, Sema3B, FGF9, FN1, HGF, MFAP5, EFEMP2/피불린 4, VEGF-C, CXCL2, FBLN2, FGF2, PDGF-C, BV8, TNFa 및 민클의 상대적 발현 수준을 결정하였다. 예를 들어, VEGF-C의 상대적 발현 수준은 다음과 같이 계산하였다:
상대적 발현 VEGF-C 샘플 = 2 exp (Ct [(HK1+HK2+HKx)/x] - Ct VEGF-C) (여기서, HK는 하우스키핑 유전자 (예를 들어, 18S rRNA, RPS13, HMBS, ACTB 및 SDHA)이고, x는 데이터를 정상화하는데 사용된 하우스키핑 유전자의 총 개수임) (Ct는 샘플에서 결정되고, 여기서 Ct는 임계값 사이클임). Ct는 반응 내에서 생성된 형광이 임계값 선을 넘는 사이클 수이다.
상이한 반응 플레이트로부터의 결과의 비교를 허용하기 위해, 이어서 상대적 발현을 모든 실험 진행에서 동일한 내부 참조 RNA에 대한 상대적 발현에 대한 분수로서 이에 100을 곱하여 계산하였다:
정상화된 상대적 발현 VEGF-C 샘플 = (상대적 발현 VEGF-C 샘플 / 상대적 발현 VEGF-C 참조 RNA) x 100 (여기서, 상대적 발현 VEGF-C 샘플 = 2 exp (Ct [(HK1+HK2+HKx)/x] - Ct VEGF-C) (Ct는 참조 RNA에서 결정됨).
마커 RNA 발현 (qPCR)의 상관관계에 대한 p- 및 r-값 및 조합 치료 효능은 도 94에 나타내었다.
유전자 발현 분석으로부터의 결과는 도 95-110에 나타내었다. 도 95-110 각각에서, 검정된 유전자의 상대적 발현을 검사된 9가지 상이한 종양 모델에 의해 나타난 종양 성장 지연의 변화율(％) (Δ％ TGD)과 비교하였다. 항-VEGF-A 항체와 조합된 항-EGFL7 항체로의 치료에 반응한 종양 모델은 조합 치료에 반응하지 않은 종양 모델과 비교하여 보다 높은 수준의 VEGF-C, CXCL2, PDGF-C, BV8, TNFα 및 민클을 발현하였다 (도 98, 100, 101, 107, 109-110 참조).
항-VEGF-A 항체 및 항-EGFL7 항체로의 조합 치료에 반응성인 종양 모델은 또한 조합 치료에 반응하지 않은 종양 모델과 비교하여 보다 낮은 수준의 FRAS1, cMet, Sema3B, FGF9, FN1, HGF, MFAP5, EFEMP2/피불린 4, 피불린 2 및 FGF2를 발현하였다 (도 95-97, 99, 102-106, 및 108 참조).
비공식 서열 목록
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SEQUENCE LISTING <110> GENENTECH, INC. SCHMIDT, Maike <120> Diagnostic Methods and Compositions for Treatment of Cancer <130> P4332R1WO <141> 2010-07-12 <150> US 61/351,733 <151> 2010-06-04 <150> US 61/225,120 <151> 2009-07-13 <160> 576 <210> 1 <211> 21 <212> DNA <213> Artificial sequence <220> <223> sequence is synthesized <400> 1 agtccctgcc ctttgtacac a 21 <210> 2 <211> 19 <212> DNA <213> Artificial sequence <220> <223> sequence is synthesized <400> 2 ccgagggcct cactaaacc 19 <210> 3 <211> 23 <212> DNA <213> Artificial sequence <220> <223> sequence is synthesized <400> 3 cgcccgtcgc tactaccgat tgg 23 <210> 4 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial sequence <220> <223> sequence is synthesized <400> 4 gaaggctttt ggtctccctg 20 <210> 5 <211> 23 <212> DNA <213> Artificial sequence <220> <223> sequence is synthesized <400> 5 ggtgtgcact tttattcaac tgg 23 <210> 6 <211> 19 <212> DNA <213> Artificial sequence <220> <223> sequence is synthesized <400> 6 agggcttacc tgtacactg 19 <210> 7 <211> 27 <212> DNA <213> Artificial sequence <220> 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<211> 20 <212> DNA <213> Artificial sequence <220> <223> sequence is synthesized <400> 526 cacgaaggat gctgataacg 20 <210> 527 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial sequence <220> <223> sequence is synthesized <400> 527 accaccaacc tcctgttagc 20 <210> 528 <211> 26 <212> DNA <213> Artificial sequence <220> <223> sequence is synthesized <400> 528 caactgtatg tgcaaatgcg ctctca 26 <210> 529 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial sequence <220> <223> sequence is synthesized <400> 529 ttgcaatgct gggtatgaag 20 <210> 530 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial sequence <220> <223> sequence is synthesized <400> 530 agccttgtag aagcctggtc 20 <210> 531 <211> 27 <212> DNA <213> Artificial sequence <220> <223> sequence is synthesized <400> 531 aacgaggttt catatgccaa gcttgtc 27 <210> 532 <211> 26 <212> DNA <213> Artificial sequence <220> <223> sequence is synthesized <400> 532 cagaattcat aatgaataac acagga 26 <210> 533 <211> 17 <212> DNA <213> Artificial sequence <220> <223> sequence is synthesized <400> 533 cagccagcca gatttgg 17 <210> 534 <211> 25 <212> DNA <213> Artificial sequence <220> <223> sequence is synthesized <400> 534 gaatggaggt tgggaagatg gcttc 25 <210> 535 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial sequence <220> <223> sequence is synthesized <400> 535 ttgccacgta ctatggtgct 20 <210> 536 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial sequence <220> <223> sequence is synthesized <400> 536 ccataacaag ccagagttgg 20 <210> 537 <211> 25 <212> DNA <213> Artificial sequence <220> <223> sequence is synthesized <400> 537 tcatcatgtc ctggagggct cttct 25 <210> 538 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial sequence <220> <223> sequence is synthesized <400> 538 tgggaagtct gctgtctcaa 20 <210> 539 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial sequence <220> <223> sequence is synthesized <400> 539 aatagctacg atggctgcaa 20 <210> 540 <211> 25 <212> DNA <213> Artificial sequence <220> <223> sequence is synthesized <400> 540 cacagccaca gaatgtacca atggg 25 <210> 541 <211> 18 <212> DNA <213> Artificial sequence <220> <223> sequence is synthesized <400> 541 ccctgcgtac attgatgc 18 <210> 542 <211> 21 <212> DNA <213> Artificial sequence <220> <223> sequence is synthesized <400> 542 gctctcatcc ttgtcagagg t 21 <210> 543 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial sequence <220> <223> sequence is synthesized <400> 543 acagctccgt gcacacgcct 20 <210> 544 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial sequence <220> <223> sequence is synthesized <400> 544 gaggcatgca gtatctggag 20 <210> 545 <211> 19 <212> DNA <213> Artificial sequence <220> <223> sequence is synthesized <400> 545 ctcggtcacc agcacattt 19 <210> 546 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial sequence <220> <223> sequence is synthesized <400> 546 ctcggaagtg catccaccgg 20 <210> 547 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial sequence <220> <223> sequence is synthesized <400> 547 gtacgtcagc ctggagagaa 20 <210> 548 <211> 22 <212> DNA <213> Artificial sequence <220> <223> sequence is synthesized <400> 548 attggtaaca ttgccattga ac 22 <210> 549 <211> 25 <212> DNA <213> Artificial sequence <220> <223> sequence is synthesized <400> 549 aaagtggcgc tggatcaaca actct 25 <210> 550 <211> 21 <212> DNA <213> Artificial sequence <220> <223> sequence is synthesized <400> 550 gaatgaattc aaccaaatcg c 21 <210> 551 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial sequence <220> <223> sequence is synthesized <400> 551 caggagagca cttgggagtt 20 <210> 552 <211> 24 <212> DNA <213> Artificial sequence <220> <223> sequence is synthesized <400> 552 tcccaccaca cagagagagg atgc 24 <210> 553 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial sequence <220> <223> sequence is synthesized <400> 553 ttgtccaccc aactatgtcc 20 <210> 554 <211> 19 <212> DNA <213> Artificial sequence <220> <223> sequence is synthesized <400> 554 cgtgatatcc tggcatgtg 19 <210> 555 <211> 21 <212> DNA <213> Artificial sequence <220> <223> sequence is synthesized <400> 555 tgcgctcgca cttcgtttct g 21 <210> 556 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial sequence <220> <223> sequence is synthesized <400> 556 agccttacct caccacttgc 20 <210> 557 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial sequence <220> <223> sequence is synthesized <400> 557 ataggcagtc cggtagatgg 20 <210> 558 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial sequence <220> <223> sequence is synthesized <400> 558 cggacacaga gcctgcagca 20 <210> 559 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial sequence <220> <223> sequence is synthesized <400> 559 attcccatga gtgcttggat 20 <210> 560 <211> 21 <212> DNA <213> Artificial sequence <220> <223> sequence is synthesized <400> 560 cacagtgctc tcctgttgtg t 21 <210> 561 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial sequence <220> <223> sequence is synthesized <400> 561 ctgtctgcac tgccagcgga 20 <210> 562 <211> 21 <212> DNA <213> Artificial sequence <220> <223> sequence is synthesized <400> 562 gcagatcact tctaccacac g 21 <210> 563 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial sequence <220> <223> sequence is synthesized <400> 563 ctggccactg tccttattca 20 <210> 564 <211> 24 <212> DNA <213> Artificial sequence <220> <223> sequence is synthesized <400> 564 tgatataaca ccatccctcc gcca 24 <210> 565 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial sequence <220> <223> sequence is synthesized <400> 565 ggcaataaac cgaggacttc 20 <210> 566 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial sequence <220> <223> sequence is synthesized <400> 566 tcaagtgctg ctctgtgatg 20 <210> 567 <211> 22 <212> DNA <213> Artificial sequence <220> <223> sequence is synthesized <400> 567 cgtgctacgg accctgctga aa 22 <210> 568 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial sequence <220> <223> sequence is synthesized <400> 568 gagacaaggt ggcagcctat 20 <210> 569 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial sequence <220> <223> sequence is synthesized <400> 569 tgttattgcc cgtaatctgg 20 <210> 570 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial sequence <220> <223> sequence is synthesized <400> 570 cgggaagctg cggtacaccc 20 <210> 571 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial sequence <220> <223> sequence is synthesized <400> 571 gctggaacat ggaattaccc 20 <210> 572 <211> 19 <212> DNA <213> Artificial sequence <220> <223> sequence is synthesized <400> 572 gtactgcggg tggaacatt 19 <210> 573 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial sequence <220> <223> sequence is synthesized <400> 573 accagcaacc ctgccagcaa 20 <210> 574 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial sequence <220> <223> sequence is synthesized <400> 574 gtccatgcca ctaagcatgt 20 <210> 575 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial sequence <220> <223> sequence is synthesized <400> 575 acagcttcct cgatgcttct 20 <210> 576 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial sequence <220> <223> sequence is synthesized <400> 576 ccctgcccat tcggaggaag 20

Claims (286)

  1. 환자로부터 수득한 샘플에서 표 1에 열거된 하나 이상의 유전자의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 상기 하나 이상의 유전자의 증가된 발현 수준은 환자가 VEGF-A 길항제 이외의 항암 요법제 또는 VEGF-A 길항제에 부가한 항암 요법제로의 치료로부터 이익을 얻을 수 있다는 것을 나타내는 것인, VEGF-A 길항제 이외의 항암 요법제 또는 VEGF-A 길항제에 부가한 항암 요법제로의 치료로부터 이익을 얻을 수 있는 환자를 확인하는 방법.
  2. 환자로부터 수득한 샘플에서 표 1에 열거된 하나 이상의 유전자의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 상기 하나 이상의 유전자의 감소된 발현 수준은 환자가 VEGF-A 길항제 이외의 항암 요법제 또는 VEGF-A 길항제에 부가한 항암 요법제로의 치료로부터 이익을 얻을 수 있다는 것을 나타내는 것인, VEGF-A 길항제 이외의 항암 요법제 또는 VEGF-A 길항제에 부가한 항암 요법제로의 치료로부터 이익을 얻을 수 있는 환자를 확인하는 방법.
  3. 암을 앓고 있는 환자로부터 수득한 샘플에서 표 1에 열거된 하나 이상의 유전자의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 상기 하나 이상의 유전자의 증가된 발현 수준은 환자가 VEGF-A 길항제 이외의 항암 요법제 또는 VEGF-A 길항제에 부가한 항암 요법제로의 치료에 대해 반응성일 가능성이 더 크다는 것을 나타내는 것인, VEGF-A 길항제 이외의 항암 요법제 또는 VEGF-A 길항제에 부가한 항암 요법제로의 치료에 대한 암을 앓고 있는 환자의 반응성을 예측하는 방법.
  4. 암을 앓고 있는 환자로부터 수득한 샘플에서 표 1에 열거된 하나 이상의 유전자의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 상기 하나 이상의 유전자의 감소된 발현 수준은 환자가 VEGF-A 길항제 이외의 항암 요법제 또는 VEGF-A 길항제에 부가한 항암 요법제로의 치료에 대해 반응성일 가능성이 더 크다는 것을 나타내는 것인, VEGF-A 길항제 이외의 항암 요법제 또는 VEGF-A 길항제에 부가한 항암 요법제로의 치료에 대한 암을 앓고 있는 환자의 반응성을 예측하는 방법.
  5. 암 환자로부터 수득한 샘플에서 표 1에 열거된 하나 이상의 유전자의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 상기 하나 이상의 유전자의 증가된 발현 수준은 환자가 VEGF-A 길항제 이외의 항암 요법제 또는 VEGF-A 길항제에 부가한 항암 요법제로부터 이익을 얻을 가능성이 증가하였다는 것을 나타내는 것인, 암 환자가 VEGF-A 길항제 이외의 항암 요법제 또는 VEGF-A 길항제에 부가한 항암 요법제로부터 이익을 나타낼 가능성을 결정하는 방법.
  6. 암 환자로부터 수득한 샘플에서 표 1에 열거된 하나 이상의 유전자의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 상기 하나 이상의 유전자의 감소된 발현 수준은 환자가 VEGF-A 길항제 이외의 항암 요법제 또는 VEGF-A 길항제에 부가한 항암 요법제로부터 이익을 얻을 가능성이 증가하였다는 것을 나타내는 것인, 암 환자가 VEGF-A 길항제 이외의 항암 요법제 또는 VEGF-A 길항제에 부가한 항암 요법제로부터 이익을 나타낼 가능성을 결정하는 방법.
  7. 환자로부터 수득한 샘플에서 표 1에 열거된 하나 이상의 유전자의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 상기 하나 이상의 유전자의 증가된 발현 수준은 환자가 VEGF-A 길항제 이외의 항암 요법제 또는 VEGF-A 길항제에 부가한 항암 요법제로부터 이익을 얻을 가능성이 증가하였다는 것을 나타내는 것인, 암 치료에 대한 치료 효능을 최적화하는 방법.
  8. 환자로부터 수득한 샘플에서 표 1에 열거된 하나 이상의 유전자의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 상기 하나 이상의 유전자의 감소된 발현 수준은 환자가 VEGF-A 길항제 이외의 항암 요법제 또는 VEGF-A 길항제에 부가한 항암 요법제로부터 이익을 얻을 가능성이 증가하였다는 것을 나타내는 것인, 암 치료에 대한 치료 효능을 최적화하는 방법.
  9. 환자로부터 수득한 샘플이 참조 샘플과 비교하여 표 1에 열거된 하나 이상의 유전자의 증가된 발현 수준을 갖는지 결정하는 것, 및
    상기 환자에게 유효량의 VEGF-A 길항제 이외의 항암 요법제 또는 VEGF-A 길항제에 부가한 항암 요법제를 투여하여 암을 치료하는 것
    을 포함하는, 환자에서 암을 치료하는 방법.
  10. 환자로부터 수득한 샘플이 참조 샘플과 비교하여 표 1에 열거된 하나 이상의 유전자의 감소된 발현 수준을 갖는지 결정하는 것, 및
    상기 환자에게 유효량의 VEGF-A 길항제 이외의 항암 요법제 또는 VEGF-A 길항제에 부가한 항암 요법제를 투여하여 암을 치료하는 것
    을 포함하는, 환자에서 암을 치료하는 방법.
  11. 제1항 내지 제10항 중 어느 한 항에 있어서, 환자로부터 수득한 샘플이 조직, 전혈, 혈액-유래 세포, 혈장, 혈청 및 이들의 조합으로 이루어진 군으로부터 선택된 구성원인 방법.
  12. 제1항 내지 제10항 중 어느 한 항에 있어서, 발현 수준이 mRNA 발현 수준인 방법.
  13. 제1항 내지 제10항 중 어느 한 항에 있어서, 발현 수준이 단백질 발현 수준인 방법.
  14. 제1항 내지 제10항 중 어느 한 항에 있어서, 적어도 표 1에 열거된 제2 유전자의 발현을 검출하는 것을 더 포함하는 방법.
  15. 제14항에 있어서, 적어도 표 1에 열거된 제3 유전자의 발현을 검출하는 것을 더 포함하는 방법.
  16. 제15항에 있어서, 적어도 표 1에 열거된 제4 유전자의 발현을 검출하는 것을 더 포함하는 방법.
  17. 제16항에 있어서, 적어도 표 1에 열거된 제5 유전자의 발현을 검출하는 것을 더 포함하는 방법.
  18. 제17항에 있어서, 적어도 표 1에 열거된 제6 유전자의 발현을 검출하는 것을 더 포함하는 방법.
  19. 제18항에 있어서, 적어도 표 1에 열거된 제7 유전자의 발현을 검출하는 것을 더 포함하는 방법.
  20. 제19항에 있어서, 적어도 표 1에 열거된 제8 유전자의 발현을 검출하는 것을 더 포함하는 방법.
  21. 제20항에 있어서, 적어도 표 1에 열거된 제9 유전자의 발현을 검출하는 것을 더 포함하는 방법.
  22. 제21항에 있어서, 적어도 표 1에 열거된 제10 유전자의 발현을 검출하는 것을 더 포함하는 방법.
  23. 제1항 내지 제8항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 환자에게 유효량의 VEGF-A 길항제 이외의 항암 요법제를 투여하는 것을 더 포함하는 방법.
  24. 제23항에 있어서, 항암 요법제가 항체, 소분자 및 siRNA로 이루어진 군으로부터 선택된 구성원인 방법.
  25. 제23항에 있어서, 항암 요법제가 EGFL7 길항제, NRP1 길항제 및 VEGF-C 길항제로 이루어진 군으로부터 선택된 구성원인 방법.
  26. 제25항에 있어서, EGFL7 길항제가 항체인 방법.
  27. 제25항에 있어서, NRP1 길항제가 항체인 방법.
  28. 제25항에 있어서, VEGF-C 길항제가 항체인 방법.
  29. 제9항, 제10항 및 제23항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 환자에게 VEGF-A 길항제를 투여하는 것을 더 포함하는 방법.
  30. 제29항에 있어서, VEGF-A 길항제가 항-VEGF-A 항체인 방법.
  31. 제30항에 있어서, 항-VEGF-A 항체가 베바시주맙인 방법.
  32. 제29항에 있어서, 항암 요법제 및 VEGF-A 길항제를 동시에 투여하는 방법.
  33. 제29항에 있어서, 항암 요법제 및 VEGF-A 길항제를 순차적으로 투여하는 방법.
  34. 표 1에 열거된 하나 이상의 유전자에 특이적으로 혼성화할 수 있는 폴리뉴클레오티드를 포함하는 어레이 및
    VEGF-A 길항제에 부가한 항암 요법제로의 치료에 대한 환자의 반응성을 예측하기 위해 상기 하나 이상의 유전자의 발현 수준을 결정하는데 상기 어레이를 사용하기 위한 설명서
    를 포함하고, 여기서 참조 샘플에서 상기 하나 이상의 유전자의 발현 수준과 비교하여 상기 하나 이상의 유전자의 발현 수준의 증가는 환자가 VEGF-A 길항제 이외의 항암 요법제 또는 VEGF-A 길항제에 부가한 항암 요법제로의 치료로부터 이익을 얻을 수 있다는 것을 나타내는 것인, 환자가 VEGF-A 길항제 이외의 항암 요법제 또는 VEGF-A 길항제에 부가한 항암 요법제로의 치료로부터 이익을 얻을 수 있는지 여부를 결정하기 위한 키트.
  35. 표 1에 열거된 하나 이상의 유전자에 특이적으로 혼성화할 수 있는 폴리뉴클레오티드를 포함하는 어레이 및
    VEGF-A 길항제에 부가한 항암 요법제로의 치료에 대한 환자의 반응성을 예측하기 위해 상기 하나 이상의 유전자의 발현 수준을 결정하는데 상기 어레이를 사용하기 위한 설명서
    를 포함하고, 여기서 참조 샘플에서 상기 하나 이상의 유전자의 발현 수준과 비교하여 상기 하나 이상의 유전자의 발현 수준의 감소는 환자가 VEGF-A 길항제 이외의 항암 요법제 또는 VEGF-A 길항제에 부가한 항암 요법제로의 치료로부터 이익을 얻을 수 있다는 것을 나타내는 것인, 환자가 VEGF-A 길항제 이외의 항암 요법제 또는 VEGF-A 길항제에 부가한 항암 요법제로의 치료로부터 이익을 얻을 수 있는지 여부를 결정하기 위한 키트.
  36. 표 1에 열거된 하나 이상의 유전자에 특이적으로 혼성화할 수 있는 하나 이상의 화합물을 포함하고, 여기서 참조 샘플에서 상기 하나 이상의 유전자의 발현 수준과 비교하여 상기 하나 이상의 유전자의 발현 수준의 증가는 환자가 VEGF-A 길항제 이외의 항암 요법제 또는 VEGF-A 길항제에 부가한 항암 요법제로의 치료로부터 이익을 얻을 수 있다는 것을 나타내는 것인, 표 1에 열거된 하나 이상의 유전자의 발현 수준을 검출하기 위한 화합물의 세트.
  37. 표 1에 열거된 하나 이상의 유전자에 특이적으로 혼성화하는 하나 이상의 화합물을 포함하고, 여기서 참조 샘플에서 상기 하나 이상의 유전자의 발현 수준과 비교하여 상기 하나 이상의 유전자의 발현 수준의 감소는 환자가 VEGF-A 길항제 이외의 항암 요법제 또는 VEGF-A 길항제에 부가한 항암 요법제로의 치료로부터 이익을 얻을 수 있다는 것을 나타내는 것인, 표 1에 열거된 하나 이상의 유전자의 발현 수준을 검출하기 위한 화합물의 세트.
  38. 제36항 또는 제37항에 있어서, 화합물이 폴리뉴클레오티드인 화합물의 세트.
  39. 제38항에 있어서, 폴리뉴클레오티드가 표 2에 열거된 3개의 서열을 포함하는 것인 화합물의 세트.
  40. 제36항 또는 제37항에 있어서, 화합물이 단백질인 화합물의 세트.
  41. 제40항에 있어서, 단백질이 항체인 화합물의 세트.
  42. 암을 앓고 있는 환자로부터 수득한 샘플에서 TGFβ1, Bv8, Sema3A, PlGF, LGALS1, ITGa5, CSF2, 비멘틴, CXCL5, CCL2, CXCL2, Alk1 및 FGF8로 이루어진 군으로부터 선택된 하나 이상의 유전자의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 상기 하나 이상의 유전자의 증가된 발현 수준은 환자가 뉴로필린-1 (NRP1) 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 수 있다는 것을 나타내는 것인, NRP1 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 수 있는 암을 앓고 있는 환자를 확인하는 방법.
  43. 암을 앓고 있는 환자로부터 수득한 샘플에서 Prox1, RGS5, HGF, Sema3B, Sema3F, LGALS7, FGRF4, PLC, IGFB4 및 TSP1로 이루어진 군으로부터 선택된 하나 이상의 유전자의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 상기 하나 이상의 유전자의 감소된 발현 수준은 환자가 뉴로필린-1 (NRP1) 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 수 있다는 것을 나타내는 것인, NRP1 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 수 있는 암을 앓고 있는 환자를 확인하는 방법.
  44. 암을 앓고 있는 환자로부터 수득한 샘플에서 TGFβ1, Bv8, Sema3A, PlGF, LGALS1, ITGa5, CSF2, 비멘틴, CXCL5, CCL2, CXCL2, Alk1 및 FGF8로 이루어진 군으로부터 선택된 하나 이상의 유전자의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 상기 하나 이상의 유전자의 증가된 발현 수준은 환자가 NRP1 길항제로의 치료에 대해 반응성일 가능성이 더 크다는 것을 나타내는 것인, NRP1 길항제로의 치료에 대한 암을 앓고 있는 환자의 반응성을 예측하는 방법.
  45. 암을 앓고 있는 환자로부터 수득한 샘플에서 Prox1, RGS5, HGF, Sema3B, Sema3F, LGALS7, FGRF4, PLC, IGFB4 및 TSP1로 이루어진 군으로부터 선택된 하나 이상의 유전자의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 상기 하나 이상의 유전자의 감소된 발현 수준은 환자가 NRP1 길항제로의 치료에 대해 반응성일 가능성이 더 크다는 것을 나타내는 것인, NRP1 길항제로의 치료에 대한 암을 앓고 있는 환자의 반응성을 예측하는 방법.
  46. 환자로부터 수득한 샘플에서 TGFβ1, Bv8, Sema3A, PlGF, LGALS1, ITGa5, CSF2, 비멘틴, CXCL5, CCL2, CXCL2, Alk1 및 FGF8로 이루어진 군으로부터 선택된 하나 이상의 유전자의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 상기 하나 이상의 유전자의 증가된 발현 수준은 환자가 NRP1 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 가능성이 증가하였다는 것을 나타내는 것인, 환자가 NRP1 길항제로의 치료로부터 이익을 나타낼 가능성을 결정하는 방법.
  47. 환자로부터 수득한 샘플에서 Prox1, RGS5, HGF, Sema3B, Sema3F, LGALS7, FGRF4, PLC, IGFB4 및 TSP1로 이루어진 군으로부터 선택된 하나 이상의 유전자의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 상기 하나 이상의 유전자의 감소된 발현 수준은 환자가 NRP1 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 가능성이 증가하였다는 것을 나타내는 것인, 환자가 NRP1 길항제로의 치료로부터 이익을 나타낼 가능성을 결정하는 방법.
  48. 환자로부터 수득한 샘플에서 TGFβ1, Bv8, Sema3A, PlGF, LGALS1, ITGa5, CSF2, 비멘틴, CXCL5, CCL2, CXCL2, Alk1 및 FGF8로 이루어진 군으로부터 선택된 하나 이상의 유전자의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 상기 하나 이상의 유전자의 증가된 발현 수준은 환자가 NRP1 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 가능성이 증가하였다는 것을 나타내는 것인, NRP1 길항제의 치료 효능을 최적화하는 방법.
  49. 환자로부터 수득한 샘플에서 Prox1, RGS5, HGF, Sema3B, Sema3F, LGALS7, FGRF4, PLC, IGFB4 및 TSP1로 이루어진 군으로부터 선택된 하나 이상의 유전자의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 상기 하나 이상의 유전자의 감소된 발현 수준은 환자가 NRP1 길항제로의 치료의 이익을 얻을 가능성이 증가하였다는 것을 나타내는 것인, NRP1 길항제의 치료 효능을 최적화하는 방법.
  50. 환자로부터 수득한 샘플이 참조 샘플과 비교하여 TGFβ1, Bv8, Sema3A, PlGF, LGALS1, ITGa5, CSF2, 비멘틴, CXCL5, CCL2, CXCL2, Alk1 및 FGF8로 이루어진 군으로부터 선택된 하나 이상의 유전자의 증가된 발현 수준을 갖는지 결정하는 것, 및
    상기 환자에게 유효량의 NRP1 길항제를 투여하여 세포 증식성 장애를 치료하는 것
    을 포함하는, 환자에서 세포 증식성 장애를 치료하는 방법.
  51. 환자로부터 수득한 샘플이 참조 샘플과 비교하여 Prox1, RGS5, HGF, Sema3B, Sema3F, LGALS7, FGRF4, PLC, IGFB4 및 TSP1로 이루어진 군으로부터 선택된 하나 이상의 유전자의 감소된 발현 수준을 갖는지 결정하는 것, 및
    상기 환자에게 유효량의 NRP1 길항제를 투여하여 세포 증식성 장애를 치료하는 것
    을 포함하는, 환자에서 세포 증식성 장애를 치료하는 방법.
  52. 제42항 내지 제51항 중 어느 한 항에 있어서, 환자로부터 수득한 샘플이 조직, 전혈, 혈액-유래 세포, 혈장, 혈청 및 이들의 조합으로 이루어진 군으로부터 선택된 구성원인 방법.
  53. 제42항 내지 제51항 중 어느 한 항에 있어서, 발현 수준이 mRNA 발현 수준인 방법.
  54. 제42항 내지 제51항 중 어느 한 항에 있어서, 발현 수준이 단백질 발현 수준인 방법.
  55. 제42항 내지 제49항 중 어느 한 항에 있어서, 환자에게 NRP1 길항제를 투여하는 것을 더 포함하는 방법.
  56. 제42항 내지 제51항 및 제55항 중 어느 한 항에 있어서, NRP1 길항제가 항-NRP1 항체인 방법.
  57. 제50항, 제51항 및 제55항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 환자에게 VEGF-A 길항제를 투여하는 것을 더 포함하는 방법.
  58. 제57항에 있어서, VEGF-A 길항제 및 NRP1 길항제를 동시에 투여하는 방법.
  59. 제57항에 있어서, VEGF-A 길항제 및 NRP1 길항제를 순차적으로 투여하는 방법.
  60. 제57항에 있어서, VEGF-A 길항제가 항-VEGF-A 항체인 방법.
  61. 제60항에 있어서, 항-VEGF-A 항체가 베바시주맙인 방법.
  62. 암을 앓고 있는 환자로부터 수득한 샘플에서 PlGF의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 PlGF의 증가된 발현 수준은 환자가 NRP1 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 수 있다는 것을 나타내는 것인, NRP1 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 수 있는 암을 앓고 있는 환자를 확인하는 방법.
  63. 환자로부터 수득한 샘플에서 PlGF의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 PlGF의 증가된 발현 수준은 환자가 NRP1 길항제로의 치료에 대해 반응성일 가능성이 더 크다는 것을 나타내는 것인, NRP1 길항제로의 치료에 대한 암을 앓고 있는 환자의 반응성을 예측하는 방법.
  64. 환자로부터 수득한 샘플에서 PlGF의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 PlGF의 증가된 발현 수준은 환자가 NRP1 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 가능성이 증가하였다는 것을 나타내는 것인, 환자가 NRP1 길항제로의 치료로부터 이익을 나타낼 가능성을 결정하는 방법.
  65. 환자로부터 수득한 샘플에서 PlGF의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 PlGF의 증가된 발현 수준은 환자가 NRP1 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 가능성이 증가하였다는 것을 나타내는 것인, NRP1 길항제의 치료 효능을 최적화하는 방법.
  66. 환자로부터 수득한 샘플이 참조 샘플과 비교하여 PlGF의 증가된 발현 수준을 갖는지 결정하는 것, 및
    상기 환자에게 유효량의 NRP1 길항제를 투여하여 세포 증식성 장애를 치료하는 것
    을 포함하는, 환자에서 세포 증식성 장애를 치료하는 방법.
  67. 암을 앓고 있는 환자로부터 수득한 샘플에서 Sema3A의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 Sema3A의 증가된 발현 수준은 환자가 뉴로필린-1 (NRP1) 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 수 있다는 것을 나타내는 것인, NRP1 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 수 있는 암을 앓고 있는 환자를 확인하는 방법.
  68. 암을 앓고 환자로부터 수득한 샘플에서 Sema3A의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 Sema3A의 증가된 발현 수준은 환자가 NRP1 길항제로의 치료에 대해 반응성일 가능성이 더 크다는 것을 나타내는 것인, NRP1 길항제로의 치료에 대한 암을 앓고 있는 환자의 반응성을 예측하는 방법.
  69. 환자로부터 수득한 샘플에서 Sema3A의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 Sema3A의 증가된 발현 수준은 환자가 NRP1 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 가능성이 증가하였다는 것을 나타내는 것인, 환자가 NRP1 길항제로의 치료로부터 이익을 나타낼 가능성을 결정하는 방법.
  70. 환자로부터 수득한 샘플에서 Sema3A의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 Sema3A의 증가된 발현 수준은 환자가 NRP1 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 가능성이 증가하였다는 것을 나타내는 것인, NRP1 길항제의 치료 효능을 최적화하는 방법.
  71. 환자로부터 수득한 샘플이 참조 샘플과 비교하여 Sema3A의 증가된 발현 수준을 갖는지 결정하는 것, 및
    상기 환자에게 유효량의 NRP1 길항제를 투여하여 세포 증식성 장애를 치료하는 것
    을 포함하는, 환자에서 세포 증식성 장애를 치료하는 방법.
  72. 암을 앓고 있는 환자로부터 수득한 샘플에서 TGFβ1의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 TGFβ1의 증가된 발현 수준은 환자가 뉴로필린-1 (NRP1) 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 수 있다는 것을 나타내는 것인, NRP1 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 수 있는 암을 앓고 있는 환자를 확인하는 방법.
  73. 암을 앓고 있는 환자로부터 수득한 샘플에서 TGFβ1의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 TGFβ1의 증가된 발현 수준은 환자가 NRP1 길항제로의 치료에 대해 반응성일 가능성이 더 크다는 것을 나타내는 것인, NRP1 길항제로의 치료에 대한 암을 앓고 있는 환자의 반응성을 예측하는 방법.
  74. 환자로부터 수득한 샘플에서 TGFβ1의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 TGFβ1의 증가된 발현 수준은 환자가 NRP1 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 가능성이 증가하였다는 것을 나타내는 것인, 환자가 NRP1 길항제로의 치료로부터 이익을 나타낼 가능성을 결정하는 방법.
  75. 환자로부터 수득한 샘플에서 TGFβ1의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 TGFβ1의 증가된 발현 수준은 환자가 NRP1 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 가능성이 증가하였다는 것을 나타내는 것인, NRP1 길항제의 치료 효능을 최적화하는 방법.
  76. 환자로부터 수득한 샘플이 참조 샘플과 비교하여 TGFβ1의 증가된 발현 수준을 갖는지 결정하는 것, 및
    상기 환자에게 유효량의 NRP1 길항제를 투여하여 세포 증식성 장애를 치료하는 것
    을 포함하는, 환자에서 세포 증식성 장애를 치료하는 방법.
  77. 제62항 내지 제65항, 제67항 내지 제70항 및 제72항 내지 제75항 중 어느 한 항에 있어서, 환자에게 NRP1 길항제를 투여하는 것을 더 포함하는 방법.
  78. 제62항 내지 제77항 중 어느 한 항에 있어서, NRP1 길항제가 항-NRP1 항체인 방법.
  79. 제66항, 제71항, 제76항 및 제77항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 환자에게 VEGF-A 길항제를 투여하는 것을 더 포함하는 방법.
  80. 제79항에 있어서, VEGF-A 길항제 및 NRP1 길항제를 동시에 투여하는 방법.
  81. 제79항에 있어서, VEGF-A 길항제 및 NRP1 길항제를 순차적으로 투여하는 방법.
  82. 제79항에 있어서, VEGF-A 길항제가 항-VEGF-A 항체인 방법.
  83. 제82항에 있어서, 항-VEGF-A 항체가 베바시주맙인 방법.
  84. TGFβ1, Bv8, Sema3A, PlGF, LGALS1, ITGa5, CSF2, 비멘틴, CXCL5, CCL2, CXCL2, Alk1 및 FGF8로 이루어진 군으로부터 선택된 하나 이상의 유전자에 특이적으로 혼성화할 수 있는 폴리뉴클레오티드를 포함하는 어레이 및
    NRP1 길항제로의 치료에 대한 환자의 반응성을 예측하기 위해 상기 하나 이상의 유전자의 발현 수준을 결정하는데 상기 어레이를 사용하기 위한 설명서
    를 포함하고, 여기서 참조 샘플에서 상기 하나 이상의 유전자의 발현 수준과 비교하여 상기 하나 이상의 유전자의 발현 수준의 증가는 환자가 NRP1 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 수 있다는 것을 나타내는 것인, TGFβ1, Bv8, Sema3A, PlGF, LGALS1, ITGa5, CSF2, 비멘틴, CXCL5, CCL2, CXCL2, Alk1 및 FGF8로 이루어진 군으로부터 선택된 하나 이상의 유전자의 발현 수준을 결정하기 위한 키트.
  85. Prox1, RGS5, HGF, Sema3B, Sema3F, LGALS7, FGRF4, PLC, IGFB4 및 TSP1로 이루어진 군으로부터 선택된 하나 이상의 유전자에 특이적으로 혼성화할 수 있는 폴리뉴클레오티드를 포함하는 어레이 및
    NRP1 길항제로의 치료에 대한 환자의 반응성을 예측하기 위해 상기 하나 이상의 유전자의 발현 수준을 결정하는데 상기 어레이를 사용하기 위한 설명서
    를 포함하고, 여기서 참조 샘플에서 상기 하나 이상의 유전자의 발현 수준과 비교하여 상기 하나 이상의 유전자의 발현 수준의 감소는 환자가 NRP1 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 수 있다는 것을 나타내는 것인, Prox1, RGS5, HGF, Sema3B, Sema3F, LGALS7, FGRF4, PLC, IGFB4 및 TSP1로 이루어진 군으로부터 선택된 하나 이상의 유전자의 발현 수준을 결정하기 위한 키트.
  86. TGFβ1, Bv8, Sema3A, PlGF, LGALS1, ITGa5, CSF2, 비멘틴, CXCL5, CCL2, CXCL2, Alk1 및 FGF8로 이루어진 군으로부터 선택된 하나 이상의 유전자에 특이적으로 혼성화할 수 있는 하나 이상의 화합물을 포함하고, 여기서 참조 샘플에서 상기 하나 이상의 유전자의 발현 수준과 비교하여 상기 하나 이상의 유전자의 발현 수준의 증가는 환자가 NRP1 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 수 있다는 것을 나타내는 것인, TGFβ1, Bv8, Sema3A, PlGF, LGALS1, ITGa5, CSF2, 비멘틴, CXCL5, CCL2, CXCL2, Alk1 및 FGF8로 이루어진 군으로부터 선택된 하나 이상의 유전자의 발현 수준을 검출할 수 있는 화합물의 세트.
  87. Prox1, RGS5, HGF, Sema3B, Sema3F, LGALS7, FGRF4, PLC, IGFB4 및 TSP1로 이루어진 군으로부터 선택된 하나 이상의 유전자에 특이적으로 혼성화할 수 있는 하나 이상의 화합물을 포함하고, 여기서 참조 샘플에서 상기 하나 이상의 유전자의 발현 수준과 비교하여 상기 하나 이상의 유전자의 발현 수준의 감소는 환자가 NRP1 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 수 있다는 것을 나타내는 것인, Prox1, RGS5, HGF, Sema3B, Sema3F, LGALS7, FGRF4, PLC, IGFB4 및 TSP1로 이루어진 군으로부터 선택된 하나 이상의 유전자의 발현 수준을 검출할 수 있는 화합물의 세트.
  88. 제86항 또는 제87항에 있어서, 화합물이 폴리뉴클레오티드인 화합물의 세트.
  89. 제88항에 있어서, 폴리뉴클레오티드가 표 2에 열거된 3개의 서열을 포함하는 것인 화합물의 세트.
  90. 제86항 또는 제87항에 있어서, 화합물이 단백질인 화합물의 세트.
  91. 제90항에 있어서, 단백질이 항체인 화합물의 세트.
  92. 암을 앓고 있는 환자로부터 수득한 샘플에서 VEGF-C, VEGF-D, VEGFR3, FGF2, RGS5/CDH5, IL-8, CXCL1 및 CXCL2로 이루어진 군으로부터 선택된 하나 이상의 유전자의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 상기 하나 이상의 유전자의 증가된 발현 수준은 환자가 혈관 내피 성장 인자 C (VEGF-C) 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 수 있다는 것을 나타내는 것인, VEGF-C 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 수 있는 암을 앓고 있는 환자를 확인하는 방법.
  93. 암을 앓고 있는 환자로부터 수득한 샘플에서 VEGF-A, CSF2, Prox1, ICAM1, ESM1, PlGF, ITGa5, TGFβ, Hhex, Col4a1, Col4a2 및 Alk1로 이루어진 군으로부터 선택된 하나 이상의 유전자의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 상기 하나 이상의 유전자의 감소된 발현 수준은 환자가 VEGF-C 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 수 있다는 것을 나타내는 것인, VEGF-C 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 수 있는 암을 앓고 있는 환자를 확인하는 방법.
  94. 암을 앓고 있는 환자로부터 수득한 샘플에서 VEGF-C, VEGF-D, VEGFR3, FGF2, RGS5/CDH5, IL-8, CXCL1 및 CXCL2로 이루어진 군으로부터 선택된 하나 이상의 유전자의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 상기 하나 이상의 유전자의 증가된 발현 수준은 환자가 VEGF-C 길항제로의 치료에 대해 반응성일 가능성이 더 크다는 것을 나타내는 것인, VEGF-C 길항제로의 치료에 대한 암을 앓고 있는 환자의 반응성을 예측하는 방법.
  95. 암을 앓고 있는 환자로부터 수득한 샘플에서 VEGF-A, CSF2, Prox1, ICAM1, ESM1, PlGF, ITGa5, TGFβ, Hhex, Col4a1, Col4a2 및 Alk1로 이루어진 군으로부터 선택된 하나 이상의 유전자의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 상기 하나 이상의 유전자의 감소된 발현 수준은 환자가 VEGF-C 길항제로의 치료에 대해 반응성일 가능성이 더 크다는 것을 나타내는 것인, VEGF-C 길항제로의 치료에 대한 암을 앓고 있는 환자의 반응성을 예측하는 방법.
  96. 환자로부터 수득한 샘플에서 VEGF-C, VEGF-D, VEGFR3, FGF2, RGS5/CDH5, IL-8, CXCL1 및 CXCL2로 이루어진 군으로부터 선택된 하나 이상의 유전자의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 상기 하나 이상의 유전자의 증가된 발현 수준은 환자가 VEGF-C 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 가능성이 증가하였다는 것을 나타내는 것인, 환자가 VEGF-C 길항제로의 치료로부터 이익을 나타낼 가능성을 결정하는 방법.
  97. 환자로부터 수득한 샘플에서 VEGF-A, CSF2, Prox1, ICAM1, ESM1, PlGF, ITGa5, TGFβ, Hhex, Col4a1, Col4a2 및 Alk1로 이루어진 군으로부터 선택된 하나 이상의 유전자의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 상기 하나 이상의 유전자의 감소된 발현 수준은 환자가 VEGF-C 길항제로의 치료의 이익을 얻을 가능성이 증가하였다는 것을 나타내는 것인, 환자가 VEGF-C 길항제로의 치료로부터 이익을 나타낼 가능성을 결정하는 방법.
  98. 환자로부터 수득한 샘플에서 VEGF-C, VEGF-D, VEGFR3, FGF2, RGS5/CDH5, IL-8, CXCL1 및 CXCL2로 이루어진 군으로부터 선택된 하나 이상의 유전자의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 상기 하나 이상의 유전자의 증가된 발현 수준은 환자가 VEGF-C 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 가능성이 증가하였다는 것을 나타내는 것인, VEGF-C 길항제의 치료 효능을 최적화하는 방법.
  99. 환자로부터 수득한 샘플에서 VEGF-A, CSF2, Prox1, ICAM1, ESM1, PlGF, ITGa5, TGFβ, Hhex, Col4a1, Col4a2 및 Alk1로 이루어진 군으로부터 선택된 하나 이상의 유전자의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 상기 하나 이상의 유전자의 감소된 발현 수준은 환자가 VEGF-C 길항제로의 치료의 이익을 얻을 가능성이 증가하였다는 것을 나타내는 것인, VEGF-C 길항제의 치료 효능을 최적화하는 방법.
  100. 환자로부터 수득한 샘플이 참조 샘플과 비교하여 VEGF-C, VEGF-D, VEGFR3, FGF2, RGS5/CDH5, IL-8, CXCL1 및 CXCL2로 이루어진 군으로부터 선택된 하나 이상의 유전자의 증가된 발현 수준을 갖는지 결정하는 것, 및
    상기 환자에게 유효량의 VEGF-C 길항제를 투여하여 세포 증식성 장애를 치료하는 것
    을 포함하는, 환자에서 세포 증식성 장애를 치료하는 방법.
  101. 환자로부터 수득한 샘플이 참조 샘플과 비교하여 VEGF-A, CSF2, Prox1, ICAM1, ESM1, PlGF, ITGa5, TGFβ, Hhex, Col4a1, Col4a2 및 Alk1로 이루어진 군으로부터 선택된 하나 이상의 유전자의 감소된 발현 수준을 갖는지 결정하는 것, 및
    상기 환자에게 유효량의 VEGF-C 길항제를 투여하여 세포 증식성 장애를 치료하는 것
    을 포함하는, 환자에서 세포 증식성 장애를 치료하는 방법.
  102. 제92항 내지 제101항 중 어느 한 항에 있어서, 환자로부터 수득한 샘플이 조직, 전혈, 혈액-유래 세포, 혈장, 혈청 및 이들의 조합으로 이루어진 군으로부터 선택된 구성원인 방법.
  103. 제92항 내지 제101항 중 어느 한 항에 있어서, 발현 수준이 mRNA 발현 수준인 방법.
  104. 제92항 내지 제101항 중 어느 한 항에 있어서, 발현 수준이 단백질 발현 수준인 방법.
  105. 제92항 내지 제99항 중 어느 한 항에 있어서, 환자에게 VEGF-C 길항제를 투여하는 것을 더 포함하는 방법.
  106. 제92항 내지 제10항 및 제105항 중 어느 한 항에 있어서, VEGF-C 길항제가 항-VEGF-C 항체인 방법.
  107. 제100항, 제101항 및 제105항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 환자에게 VEGF-A 길항제를 투여하는 것을 더 포함하는 방법.
  108. 제107항에 있어서, VEGF-A 길항제 및 VEGF-C 길항제를 동시에 투여하는 방법.
  109. 제107항에 있어서, VEGF-A 길항제 및 VEGF-C 길항제를 순차적으로 투여하는 방법.
  110. 제107항에 있어서, VEGF-A 길항제가 항-VEGF-A 항체인 방법.
  111. 제110항에 있어서, 항-VEGF-A 항체가 베바시주맙인 방법.
  112. 암을 앓고 있는 환자로부터 수득한 샘플에서 VEGF-C의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 VEGF-C의 증가된 발현 수준은 환자가 VEGF-C 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 수 있다는 것을 나타내는 것인, VEGF-C 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 수 있는 암을 앓고 있는 환자를 확인하는 방법.
  113. 암을 앓고 있는 환자로부터 수득한 샘플에서 VEGF-C의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 VEGF-C의 증가된 발현 수준은 환자가 VEGF-C 길항제로의 치료에 대해 반응성일 가능성이 더 크다는 것을 나타내는 것인, VEGF-C 길항제로의 치료에 대한 암을 앓고 있는 환자의 반응성을 예측하는 방법.
  114. 환자로부터 수득한 샘플에서 VEGF-C의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 VEGF-C의 증가된 발현 수준은 환자가 VEGF-C 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 가능성이 증가하였다는 것을 나타내는 것인, 환자가 VEGF-C 길항제로의 치료로부터 이익을 나타낼 가능성을 결정하는 방법.
  115. 환자로부터 수득한 샘플에서 VEGF-C의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 VEGF-C의 증가된 발현 수준은 환자가 VEGF-C 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 가능성이 증가하였다는 것을 나타내는 것인, VEGF-C 길항제의 치료 효능을 최적화하는 방법.
  116. 환자로부터 수득한 샘플이 참조 샘플과 비교하여 VEGF-C의 증가된 발현 수준을 갖는지 결정하는 것, 및
    상기 환자에게 유효량의 VEGF-C 길항제를 투여하여 세포 증식성 장애를 치료하는 것
    을 포함하는, 환자에서 세포 증식성 장애를 치료하는 방법.
  117. 암을 앓고 있는 환자로부터 수득한 샘플에서 VEGF-D의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 VEGF-D의 증가된 발현 수준은 환자가 VEGF-C 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 수 있다는 것을 나타내는 것인, VEGF-C 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 수 있는 암을 앓고 있는 환자를 확인하는 방법.
  118. 암을 앓고 있는 환자로부터 수득한 샘플에서 VEGF-D의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 VEGF-D의 증가된 발현 수준은 환자가 VEGF-C 길항제로의 치료에 대해 반응성일 가능성이 더 크다는 것을 나타내는 것인, VEGF-C 길항제로의 치료에 대한 암을 앓고 있는 환자의 반응성을 예측하는 방법.
  119. 환자로부터 수득한 샘플에서 VEGF-D의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 VEGF-D의 증가된 발현 수준은 환자가 VEGF-C 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 가능성이 증가하였다는 것을 나타내는 것인, 환자가 VEGF-C 길항제로의 치료로부터 이익을 나타낼 가능성을 결정하는 방법.
  120. 환자로부터 수득한 샘플에서 VEGF-D의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 VEGF-D의 증가된 발현 수준은 환자가 VEGF-C 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 가능성이 증가하였다는 것을 나타내는 것인, VEGF-C 길항제의 치료 효능을 최적화하는 방법.
  121. 환자로부터 수득한 샘플이 참조 샘플과 비교하여 VEGF-D의 증가된 발현 수준을 갖는지 결정하는 것, 및
    상기 환자에게 유효량의 VEGF-C 길항제를 투여하여 세포 증식성 장애를 치료하는 것
    을 포함하는, 환자에서 세포 증식성 장애를 치료하는 방법.
  122. 암을 앓고 있는 환자로부터 수득한 샘플에서 VEGFR3의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 VEGFR3의 증가된 발현 수준은 환자가 VEGF-C 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 수 있다는 것을 나타내는 것인, VEGF-C 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 수 있는 암을 앓고 있는 환자를 확인하는 방법.
  123. 암을 앓고 있는 환자로부터 수득한 샘플에서 VEGFR3의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 VEGFR3의 증가된 발현 수준은 환자가 VEGF-C 길항제로의 치료에 대해 반응성일 가능성이 더 크다는 것을 나타내는 것인, VEGF-C 길항제로의 치료에 대한 암을 앓고 있는 환자의 반응성을 예측하는 방법.
  124. 환자로부터 수득한 샘플에서 VEGFR3의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 VEGFR3의 증가된 발현 수준은 환자가 VEGF-C 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 가능성이 증가하였다는 것을 나타내는 것인, 환자가 VEGF-C 길항제로의 치료로부터 이익을 나타낼 가능성을 결정하는 방법.
  125. 환자로부터 수득한 샘플에서 VEGFR3의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 VEGFR3의 증가된 발현 수준은 환자가 VEGF-C 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 가능성이 증가하였다는 것을 나타내는 것인, VEGF-C 길항제의 치료 효능을 최적화하는 방법.
  126. 환자로부터 수득한 샘플이 참조 샘플과 비교하여 VEGFR3의 증가된 발현 수준을 갖는지 결정하는 것, 및
    상기 환자에게 유효량의 VEGF-C 길항제를 투여하여 세포 증식성 장애를 치료하는 것
    을 포함하는, 환자에서 세포 증식성 장애를 치료하는 방법.
  127. 암을 앓고 있는 환자로부터 수득한 샘플에서 FGF2의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 FGF2의 증가된 발현 수준은 환자가 VEGF-C 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 수 있다는 것을 나타내는 것인, VEGF-C 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 수 있는 암을 앓고 있는 환자를 확인하는 방법.
  128. 암을 앓고 있는 환자로부터 수득한 샘플에서 FGF2의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 FGF2의 증가된 발현 수준은 환자가 VEGF-C 길항제로의 치료에 대해 반응성일 가능성이 더 크다는 것을 나타내는 것인, VEGF-C 길항제로의 치료에 대한 암을 앓고 있는 환자의 반응성을 예측하는 방법.
  129. 환자로부터 수득한 샘플에서 FGF2의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 FGF2의 증가된 발현 수준은 환자가 VEGF-C 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 가능성이 증가하였다는 것을 나타내는 것인, 환자가 VEGF-C 길항제로의 치료로부터 이익을 나타낼 가능성을 결정하는 방법.
  130. 환자로부터 수득한 샘플에서 FGF2의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 FGF2의 증가된 발현 수준은 환자가 VEGF-C 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 가능성이 증가하였다는 것을 나타내는 것인, VEGF-C 길항제의 치료 효능을 최적화하는 방법.
  131. 환자로부터 수득한 샘플이 참조 샘플과 비교하여 FGF2의 증가된 발현 수준을 갖는지 결정하는 것, 및
    상기 환자에게 유효량의 VEGF-C 길항제를 투여하여 세포 증식성 장애를 치료하는 것
    을 포함하는, 환자에서 세포 증식성 장애를 치료하는 방법.
  132. 암을 앓고 있는 환자로부터 수득한 샘플에서 VEGF-A의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 VEGF-A의 감소된 발현 수준은 환자가 VEGF-C 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 수 있다는 것을 나타내는 것인, VEGF-C 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 수 있는 암을 앓고 있는 환자를 확인하는 방법.
  133. 암을 앓고 있는 환자로부터 수득한 샘플에서 VEGF-A의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 VEGF-A의 감소된 발현 수준은 환자가 VEGF-C 길항제로의 치료에 대해 반응성일 가능성이 더 크다는 것을 나타내는 것인, VEGF-C 길항제로의 치료에 대한 암을 앓고 있는 환자의 반응성을 예측하는 방법.
  134. 환자로부터 수득한 샘플에서 VEGF-A의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 VEGF-A의 감소된 발현 수준은 환자가 VEGF-C 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 가능성이 증가하였다는 것을 나타내는 것인, 환자가 VEGF-C 길항제로의 치료로부터 이익을 나타낼 가능성을 결정하는 방법.
  135. 환자로부터 수득한 샘플에서 VEGF-A의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 VEGF-A의 감소된 발현 수준은 환자가 VEGF-C 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 가능성이 증가하였다는 것을 나타내는 것인, VEGF-C 길항제의 치료 효능을 최적화하는 방법.
  136. 환자로부터 수득한 샘플이 참조 샘플과 비교하여 VEGF-A의 감소된 발현 수준을 갖는지 결정하는 것, 및
    상기 환자에게 유효량의 VEGF-C 길항제를 투여하여 세포 증식성 장애를 치료하는 것
    을 포함하는, 환자에서 세포 증식성 장애를 치료하는 방법.
  137. 암을 앓고 있는 환자로부터 수득한 샘플에서 PlGF의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 PlGF의 감소된 발현 수준은 환자가 VEGF-C 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 수 있다는 것을 나타내는 것인, VEGF-C 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 수 있는 암을 앓고 있는 환자를 확인하는 방법.
  138. 암을 앓고 있는 환자로부터 수득한 샘플에서 PlGF의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 PlGF의 감소된 발현 수준은 환자가 VEGF-C 길항제로의 치료에 대해 반응성일 가능성이 더 크다는 것을 나타내는 것인, VEGF-C 길항제로의 치료에 대한 암을 앓고 있는 환자의 반응성을 예측하는 방법.
  139. 환자로부터 수득한 샘플에서 PlGF의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 PlGF의 감소된 발현 수준은 환자가 VEGF-C 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 가능성이 증가하였다는 것을 나타내는 것인, 환자가 VEGF-C 길항제로의 치료로부터 이익을 나타낼 가능성을 결정하는 방법.
  140. 환자로부터 수득한 샘플에서 PlGF의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 PlGF의 감소된 발현 수준은 환자가 VEGF-C 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 가능성이 증가하였다는 것을 나타내는 것인, VEGF-C 길항제의 치료 효능을 최적화하는 방법.
  141. 환자로부터 수득한 샘플이 참조 샘플과 비교하여 PlGF의 감소된 발현 수준을 갖는지 결정하는 것, 및
    상기 환자에게 유효량의 VEGF-C 길항제를 투여하여 세포 증식성 장애를 치료하는 것
    을 포함하는, 환자에서 세포 증식성 장애를 치료하는 방법.
  142. 제112항 내지 제115항, 제117항 내지 제120항, 제122항 내지 제125항, 제127항 내지 제130항, 제132항 내지 제135항 및 제137항 내지 제140항 중 어느 한 항에 있어서, 환자에게 VEGF-C 길항제를 투여하는 것을 더 포함하는 방법.
  143. 제112항 내지 제142항 중 어느 한 항에 있어서, VEGF-C 길항제가 항-VEGF-C 항체인 방법.
  144. 제116항, 제121항, 제126항, 제131항, 제136항, 제141항 및 제142항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 환자에게 VEGF-A 길항제를 투여하는 것을 더 포함하는 방법.
  145. 제144항에 있어서, VEGF-A 길항제 및 VEGF-C 길항제를 동시에 투여하는 방법.
  146. 제144항에 있어서, VEGF-A 길항제 및 VEGF-C 길항제를 순차적으로 투여하는 방법.
  147. 제144항에 있어서, VEGF-A 길항제가 항-VEGF-A 항체인 방법.
  148. 제147항에 있어서, 항-VEGF-A 항체가 베바시주맙인 방법.
  149. VEGF-C, VEGF-D, VEGFR3, FGF2, RGS5/CDH5, IL-8, CXCL1 및 CXCL2로 이루어진 군으로부터 선택된 하나 이상의 유전자에 특이적으로 혼성화할 수 있는 폴리뉴클레오티드를 포함하는 어레이 및
    VEGF-C 길항제로의 치료에 대한 환자의 반응성을 예측하기 위해 상기 하나 이상의 유전자의 발현 수준을 결정하는데 상기 어레이를 사용하기 위한 설명서
    를 포함하고, 여기서 참조 샘플에서 상기 하나 이상의 유전자의 발현 수준과 비교하여 상기 하나 이상의 유전자의 발현 수준의 증가는 환자가 VEGF-C 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 수 있다는 것을 나타내는 것인, VEGF-C, VEGF-D, VEGFR3, FGF2, RGS5/CDH5, IL-8, CXCL1 및 CXCL2로 이루어진 군으로부터 선택된 하나 이상의 유전자의 발현 수준을 결정하기 위한 키트.
  150. VEGF-A, CSF2, Prox1, ICAM1, ESM1, PlGF, ITGa5, TGFβ, Hhex, Col4a1, Col4a2 및 Alk1로 이루어진 군으로부터 선택된 하나 이상의 유전자에 특이적으로 혼성화할 수 있는 폴리뉴클레오티드를 포함하는 어레이 및
    VEGF-C 길항제로의 치료에 대한 환자의 반응성을 예측하기 위해 상기 하나 이상의 유전자의 발현 수준을 결정하는데 상기 어레이를 사용하기 위한 설명서
    를 포함하고, 여기서 참조 샘플에서 상기 하나 이상의 유전자의 발현 수준과 비교하여 상기 하나 이상의 유전자의 발현 수준의 감소는 환자가 VEGF-C 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 수 있다는 것을 나타내는 것인, VEGF-A, CSF2, Prox1, ICAM1, ESM1, PlGF, ITGa5, TGFβ, Hhex, Col4a1, Col4a2 및 Alk1로 이루어진 군으로부터 선택된 하나 이상의 유전자의 발현 수준을 결정하기 위한 키트.
  151. VEGF-C, VEGF-D, VEGFR3, FGF2, RGS5/CDH5, IL-8, CXCL1 및 CXCL2로 이루어진 군으로부터 선택된 하나 이상의 유전자에 특이적으로 혼성화할 수 있는 하나 이상의 화합물을 포함하고, 여기서 참조 샘플에서 상기 하나 이상의 유전자의 발현 수준과 비교하여 상기 하나 이상의 유전자의 발현 수준의 증가는 환자가 VEGF-C 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 수 있다는 것을 나타내는 것인, VEGF-C, VEGF-D, VEGFR3, FGF2, RGS5/CDH5, IL-8, CXCL1 및 CXCL2로 이루어진 군으로부터 선택된 하나 이상의 유전자의 발현 수준을 검출할 수 있는 화합물의 세트.
  152. VEGF-A, CSF2, Prox1, ICAM1, ESM1, PlGF, ITGa5, TGFβ, Hhex, Col4a1, Col4a2 및 Alk1로 이루어진 군으로부터 선택된 하나 이상의 유전자에 특이적으로 혼성화할 수 있는 하나 이상의 화합물을 포함하고, 여기서 참조 샘플에서 상기 하나 이상의 유전자의 발현 수준과 비교하여 상기 하나 이상의 유전자의 발현 수준의 감소는 환자가 VEGF-C 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 수 있다는 것을 나타내는 것인, VEGF-A, CSF2, Prox1, ICAM1, ESM1, PlGF, ITGa5, TGFβ, Hhex, Col4a1, Col4a2 및 Alk1로 이루어진 군으로부터 선택된 하나 이상의 유전자의 발현 수준을 검출할 수 있는 화합물의 세트.
  153. 제151항 또는 제152항에 있어서, 화합물이 폴리뉴클레오티드인 화합물의 세트.
  154. 제153항에 있어서, 폴리뉴클레오티드가 표 2에 열거된 3개의 서열을 포함하는 것인 화합물의 세트.
  155. 제151항 또는 제152항에 있어서, 화합물이 단백질인 화합물의 세트.
  156. 제155항에 있어서, 단백질이 항체인 화합물의 세트.
  157. 암을 앓고 있는 환자로부터 수득한 샘플에서 VEGF-C, BV8, CSF2, TNFα, CXCL2, PDGF-C 및 민클로 이루어진 군으로부터 선택된 하나 이상의 유전자의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 상기 하나 이상의 유전자의 증가된 발현 수준은 환자가 EGF-유사-도메인, 멀티플 7 (EGFL7) 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 수 있다는 것을 나타내는 것인, EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 수 있는 암을 앓고 있는 환자를 확인하는 방법.
  158. 암을 앓고 있는 환자로부터 수득한 샘플에서 Sema3B, FGF9, HGF, RGS5, NRP1, FGF2, CXCR4, cMet, FN1, 피불린 2, 피불린 4/EFEMP2, MFAP5, PDGF-C, Sema3F 및 FN1로 이루어진 군으로부터 선택된 하나 이상의 유전자의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 상기 하나 이상의 유전자의 감소된 발현 수준은 환자가 EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 수 있다는 것을 나타내는 것인, EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 수 있는 암을 앓고 있는 환자를 확인하는 방법.
  159. 암을 앓고 있는 환자로부터 수득한 샘플에서 VEGF-C, BV8, CSF2, TNFα, CXCL2, PDGF-C 및 민클로 이루어진 군으로부터 선택된 하나 이상의 유전자의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 상기 하나 이상의 유전자의 증가된 발현 수준은 환자가 EGFL7 길항제로의 치료에 대해 반응성일 가능성이 더 크다는 것을 나타내는 것인, EGFL7 길항제로의 치료에 대한 암을 앓고 있는 환자의 반응성을 예측하는 방법.
  160. 암을 앓고 있는 환자로부터 수득한 샘플에서 Sema3B, FGF9, HGF, RGS5, NRP1, FGF2, CXCR4, cMet, FN1, 피불린 2, 피불린 4/EFEMP2, MFAP5, PDGF-C, Sema3F 및 FN1로 이루어진 군으로부터 선택된 하나 이상의 유전자의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 상기 하나 이상의 유전자의 감소된 발현 수준은 환자가 EGFL7 길항제로의 치료에 대해 반응성일 가능성이 더 크다는 것을 나타내는 것인, EGFL7 길항제로의 치료에 대한 암을 앓고 있는 환자의 반응성을 예측하는 방법.
  161. 환자로부터 수득한 샘플에서 VEGF-C, BV8, CSF2, TNFα, CXCL2, PDGF-C 및 민클로 이루어진 군으로부터 선택된 하나 이상의 유전자의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 상기 하나 이상의 유전자의 증가된 발현 수준은 환자가 EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 가능성이 증가하였다는 것을 나타내는 것인, 환자가 EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 나타낼 가능성을 결정하는 방법.
  162. 환자로부터 수득한 샘플에서 Sema3B, FGF9, HGF, RGS5, NRP1, FGF2, CXCR4, cMet, FN1, 피불린 2, 피불린 4/EFEMP2, MFAP5, PDGF-C, Sema3F 및 FN1로 이루어진 군으로부터 선택된 하나 이상의 유전자의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 상기 하나 이상의 유전자의 감소된 발현 수준은 환자가 EGFL7 길항제로의 치료의 이익을 얻을 가능성이 증가하였다는 것을 나타내는 것인, 환자가 EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 나타낼 가능성을 결정하는 방법.
  163. 환자로부터 수득한 샘플에서 VEGF-C, BV8, CSF2, TNFα, CXCL2, PDGF-C 및 민클로 이루어진 군으로부터 선택된 하나 이상의 유전자의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 상기 하나 이상의 유전자의 증가된 발현 수준은 환자가 EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 가능성이 증가하였다는 것을 나타내는 것인, EGFL7 길항제의 치료 효능을 최적화하는 방법.
  164. 환자로부터 수득한 샘플에서 Sema3B, FGF9, HGF, RGS5, NRP1, FGF2, CXCR4, cMet, FN1, 피불린 2, 피불린 4/EFEMP2, MFAP5, PDGF-C, Sema3F 및 FN1로 이루어진 군으로부터 선택된 하나 이상의 유전자의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 상기 하나 이상의 유전자의 감소된 발현 수준은 환자가 EGFL7 길항제로의 치료의 이익을 얻을 가능성이 증가하였다는 것을 나타내는 것인, EGFL7 길항제의 치료 효능을 최적화하는 방법.
  165. 환자로부터 수득한 샘플이 참조 샘플과 비교하여 VEGF-C, BV8, CSF2, TNFα, CXCL2, PDGF-C 및 민클로 이루어진 군으로부터 선택된 하나 이상의 유전자의 증가된 발현 수준을 갖는지 결정하는 것, 및
    상기 환자에게 유효량의 EGFL7 길항제를 투여하여 세포 증식성 장애를 치료하는 것
    을 포함하는, 환자에서 세포 증식성 장애를 치료하는 방법.
  166. 환자로부터 수득한 샘플이 참조 샘플과 비교하여 Sema3B, FGF9, HGF, RGS5, NRP1, FGF2, CXCR4, cMet, FN1, 피불린 2, 피불린 4/EFEMP2, MFAP5, PDGF-C, Sema3F 및 FN1로 이루어진 군으로부터 선택된 하나 이상의 유전자의 감소된 발현 수준을 갖는지 결정하는 것, 및
    상기 환자에게 유효량의 EGFL7 길항제를 투여하여 세포 증식성 장애를 치료하는 것
    을 포함하는, 환자에서 세포 증식성 장애를 치료하는 방법.
  167. 제157항 내지 제166항 중 어느 한 항에 있어서, 환자로부터 수득한 샘플이 조직, 전혈, 혈액-유래 세포, 혈장, 혈청 및 이들의 조합으로 이루어진 군으로부터 선택된 구성원인 방법.
  168. 제157항 내지 제166항 중 어느 한 항에 있어서, 발현 수준이 mRNA 발현 수준인 방법.
  169. 제157항 내지 제166항 중 어느 한 항에 있어서, 발현 수준이 단백질 발현 수준인 방법.
  170. 제157항 내지 제164항 중 어느 한 항에 있어서, 환자에게 EGFL7 길항제를 투여하는 것을 더 포함하는 방법.
  171. 제157항 내지 제166항 및 제170항 중 어느 한 항에 있어서, EGFL7 길항제가 항-EGFL7 항체인 방법.
  172. 제165항, 제166항 및 제170항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 환자에게 VEGF-A 길항제를 투여하는 것을 더 포함하는 방법.
  173. 제172항에 있어서, VEGF-A 길항제 및 EGFL7 길항제를 동시에 투여하는 방법.
  174. 제172항에 있어서, VEGF-A 길항제 및 EGFL7 길항제를 순차적으로 투여하는 방법.
  175. 제172항에 있어서, VEGF-A 길항제가 항-VEGF-A 항체인 방법.
  176. 제175항에 있어서, 항-VEGF-A 항체가 베바시주맙인 방법.
  177. 암을 앓고 있는 환자로부터 수득한 샘플에서 VEGF-C의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 VEGF-C의 증가된 발현 수준은 환자가 EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 수 있다는 것을 나타내는 것인, EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 수 있는 암을 앓고 있는 환자를 확인하는 방법.
  178. 암을 앓고 있는 환자로부터 수득한 샘플에서 VEGF-C의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 VEGF-C의 증가된 발현 수준은 환자가 EGFL7 길항제로의 치료에 대해 반응성일 가능성이 더 크다는 것을 나타내는 것인, EGFL7 길항제로의 치료에 대한 암을 앓고 있는 환자의 반응성을 예측하는 방법.
  179. 환자로부터 수득한 샘플에서 VEGF-C의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 VEGF-C의 증가된 발현 수준은 환자가 EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 가능성이 증가하였다는 것을 나타내는 것인, 환자가 EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 나타낼 가능성을 결정하는 방법.
  180. 환자로부터 수득한 샘플에서 VEGF-C의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 VEGF-C의 증가된 발현 수준은 환자가 EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 가능성이 증가하였다는 것을 나타내는 것인, EGFL7 길항제의 치료 효능을 최적화하는 방법.
  181. 환자로부터 수득한 샘플이 참조 샘플과 비교하여 VEGF-C의 증가된 발현 수준을 갖는지 결정하는 것, 및
    상기 환자에게 유효량의 EGFL7 길항제를 투여하여 세포 증식성 장애를 치료하는 것
    을 포함하는, 환자에서 세포 증식성 장애를 치료하는 방법.
  182. 암을 앓고 있는 환자로부터 수득한 샘플에서 BV8의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 BV8의 증가된 발현 수준은 환자가 EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 수 있다는 것을 나타내는 것인, EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 수 있는 암을 앓고 있는 환자를 확인하는 방법.
  183. 암을 앓고 있는 환자로부터 수득한 샘플에서 BV8의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 BV8의 증가된 발현 수준은 환자가 EGFL7 길항제로의 치료에 대해 반응성일 가능성이 더 크다는 것을 나타내는 것인, EGFL7 길항제로의 치료에 대한 암을 앓고 있는 환자의 반응성을 예측하는 방법.
  184. 환자로부터 수득한 샘플에서 BV8의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 BV8의 증가된 발현 수준은 환자가 EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 가능성이 증가하였다는 것을 나타내는 것인, 환자가 EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 나타낼 가능성을 결정하는 방법.
  185. 환자로부터 수득한 샘플에서 BV8의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 BV8의 증가된 발현 수준은 환자가 EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 가능성이 증가하였다는 것을 나타내는 것인, EGFL7 길항제의 치료 효능을 최적화하는 방법.
  186. 환자로부터 수득한 샘플이 참조 샘플과 비교하여 BV8의 증가된 발현 수준을 갖는지 결정하는 것, 및
    상기 환자에게 유효량의 EGFL7 길항제를 투여하여 세포 증식성 장애를 치료하는 것
    을 포함하는, 환자에서 세포 증식성 장애를 치료하는 방법.
  187. 암을 앓고 있는 환자로부터 수득한 샘플에서 CSF2의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 CSF2의 증가된 발현 수준은 환자가 EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 수 있다는 것을 나타내는 것인, EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 수 있는 암을 앓고 있는 환자를 확인하는 방법.
  188. 암을 앓고 있는 환자로부터 수득한 샘플에서 CSF2의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 CSF2의 증가된 발현 수준은 환자가 EGFL7 길항제로의 치료에 대해 반응성일 가능성이 더 크다는 것을 나타내는 것인, EGFL7 길항제로의 치료에 대한 암을 앓고 있는 환자의 반응성을 예측하는 방법.
  189. 환자로부터 수득한 샘플에서 CSF2의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 CSF2의 증가된 발현 수준은 환자가 EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 가능성이 증가하였다는 것을 나타내는 것인, 환자가 EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 나타낼 가능성을 결정하는 방법.
  190. 환자로부터 수득한 샘플에서 CSF2의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 CSF2의 증가된 발현 수준은 환자가 EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 가능성이 증가하였다는 것을 나타내는 것인, EGFL7 길항제의 치료 효능을 최적화하는 방법.
  191. 환자로부터 수득한 샘플이 참조 샘플과 비교하여 CSF2의 증가된 발현 수준을 갖는지 결정하는 것, 및
    상기 환자에게 유효량의 EGFL7 길항제를 투여하여 세포 증식성 장애를 치료하는 것
    을 포함하는, 환자에서 세포 증식성 장애를 치료하는 방법.
  192. 암을 앓고 있는 환자로부터 수득한 샘플에서 TNFα의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 TNFα의 증가된 발현 수준은 환자가 EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 수 있다는 것을 나타내는 것인, EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 수 있는 암을 앓고 있는 환자를 확인하는 방법.
  193. 암을 앓고 있는 환자로부터 수득한 샘플에서 TNFα의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 TNFα의 증가된 발현 수준은 환자가 EGFL7 길항제로의 치료에 대해 반응성일 가능성이 더 크다는 것을 나타내는 것인, EGFL7 길항제로의 치료에 대한 암을 앓고 있는 환자의 반응성을 예측하는 방법.
  194. 환자로부터 수득한 샘플에서 TNFα의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 TNFα의 증가된 발현 수준은 환자가 EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 가능성이 증가하였다는 것을 나타내는 것인, 환자가 EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 나타낼 가능성을 결정하는 방법.
  195. 환자로부터 수득한 샘플에서 TNFα의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 TNFα의 증가된 발현 수준은 환자가 EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 가능성이 증가하였다는 것을 나타내는 것인, EGFL7 길항제의 치료 효능을 최적화하는 방법.
  196. 환자로부터 수득한 샘플이 참조 샘플과 비교하여 TNFα의 증가된 발현 수준을 갖는지 결정하는 것, 및
    상기 환자에게 유효량의 EGFL7 길항제를 투여하여 세포 증식성 장애를 치료하는 것
    을 포함하는, 환자에서 세포 증식성 장애를 치료하는 방법.
  197. 암을 앓고 있는 환자로부터 수득한 샘플에서 Sema3B의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 Sema3B의 감소된 발현 수준은 환자가 EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 수 있다는 것을 나타내는 것인, EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 수 있는 암을 앓고 있는 환자를 확인하는 방법.
  198. 암을 앓고 있는 환자로부터 수득한 샘플에서 Sema3B의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 Sema3B의 감소된 발현 수준은 환자가 EGFL7 길항제로의 치료에 대해 반응성일 가능성이 더 크다는 것을 나타내는 것인, EGFL7 길항제로의 치료에 대한 암을 앓고 있는 환자의 반응성을 예측하는 방법.
  199. 환자로부터 수득한 샘플에서 Sema3B의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 Sema3B의 감소된 발현 수준은 환자가 EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 가능성이 증가하였다는 것을 나타내는 것인, 환자가 EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 나타낼 가능성을 결정하는 방법.
  200. 환자로부터 수득한 샘플에서 Sema3B의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 Sema3B의 감소된 발현 수준은 환자가 EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 가능성이 증가하였다는 것을 나타내는 것인, EGFL7 길항제의 치료 효능을 최적화하는 방법.
  201. 환자로부터 수득한 샘플이 참조 샘플과 비교하여 Sema3B의 감소된 발현 수준을 갖는지 결정하는 것, 및
    상기 환자에게 유효량의 EGFL7 길항제를 투여하여 세포 증식성 장애를 치료하는 것
    을 포함하는, 환자에서 세포 증식성 장애를 치료하는 방법.
  202. 암을 앓고 있는 환자로부터 수득한 샘플에서 FGF9의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 FGF9의 감소된 발현 수준은 환자가 EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 수 있다는 것을 나타내는 것인, EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 수 있는 암을 앓고 있는 환자를 확인하는 방법.
  203. 암을 앓고 있는 환자로부터 수득한 샘플에서 FGF9의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 FGF9의 감소된 발현 수준은 환자가 EGFL7 길항제로의 치료에 대해 반응성일 가능성이 더 크다는 것을 나타내는 것인, EGFL7 길항제로의 치료에 대한 암을 앓고 있는 환자의 반응성을 예측하는 방법.
  204. 환자로부터 수득한 샘플에서 FGF9의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 FGF9의 감소된 발현 수준은 환자가 EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 가능성이 증가하였다는 것을 나타내는 것인, 환자가 EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 나타낼 가능성을 결정하는 방법.
  205. 환자로부터 수득한 샘플에서 FGF9의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 FGF9의 감소된 발현 수준은 환자가 EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 가능성이 증가하였다는 것을 나타내는 것인, EGFL7 길항제의 치료 효능을 최적화하는 방법.
  206. 환자로부터 수득한 샘플이 참조 샘플과 비교하여 FGF9의 감소된 발현 수준을 갖는지 결정하는 것, 및
    상기 환자에게 유효량의 EGFL7 길항제를 투여하여 세포 증식성 장애를 치료하는 것
    을 포함하는, 환자에서 세포 증식성 장애를 치료하는 방법.
  207. 암을 앓고 있는 환자로부터 수득한 샘플에서 HGF의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 HGF의 감소된 발현 수준은 환자가 EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 수 있다는 것을 나타내는 것인, EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 수 있는 암을 앓고 있는 환자를 확인하는 방법.
  208. 암을 앓고 있는 환자로부터 수득한 샘플에서 HGF의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 HGF의 감소된 발현 수준은 환자가 EGFL7 길항제로의 치료에 대해 반응성일 가능성이 더 크다는 것을 나타내는 것인, EGFL7 길항제로의 치료에 대한 암을 앓고 있는 환자의 반응성을 예측하는 방법.
  209. 환자로부터 수득한 샘플에서 HGF의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 HGF의 감소된 발현 수준은 환자가 EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 가능성이 증가하였다는 것을 나타내는 것인, 환자가 EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 나타낼 가능성을 결정하는 방법.
  210. 환자로부터 수득한 샘플에서 HGF의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 HGF의 감소된 발현 수준은 환자가 EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 가능성이 증가하였다는 것을 나타내는 것인, EGFL7 길항제의 치료 효능을 최적화하는 방법.
  211. 환자로부터 수득한 샘플이 참조 샘플과 비교하여 HGF의 감소된 발현 수준을 갖는지 결정하는 것, 및
    상기 환자에게 유효량의 EGFL7 길항제를 투여하여 세포 증식성 장애를 치료하는 것
    을 포함하는, 환자에서 세포 증식성 장애를 치료하는 방법.
  212. 암을 앓고 있는 환자로부터 수득한 샘플에서 RGS5의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 RGS5의 감소된 발현 수준은 환자가 EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 수 있다는 것을 나타내는 것인, EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 수 있는 암을 앓고 있는 환자를 확인하는 방법.
  213. 암을 앓고 있는 환자로부터 수득한 샘플에서 RGS5의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 RGS5의 감소된 발현 수준은 환자가 EGFL7 길항제로의 치료에 대해 반응성일 가능성이 더 크다는 것을 나타내는 것인, EGFL7 길항제로의 치료에 대한 암을 앓고 있는 환자의 반응성을 예측하는 방법.
  214. 환자로부터 수득한 샘플에서 RGS5의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 RGS5의 감소된 발현 수준은 환자가 EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 가능성이 증가하였다는 것을 나타내는 것인, 환자가 EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 나타낼 가능성을 결정하는 방법.
  215. 환자로부터 수득한 샘플에서 RGS5의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 RGS5의 감소된 발현 수준은 환자가 EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 가능성이 증가하였다는 것을 나타내는 것인, EGFL7 길항제의 치료 효능을 최적화하는 방법.
  216. 환자로부터 수득한 샘플이 참조 샘플과 비교하여 RGS5의 감소된 발현 수준을 갖는지 결정하는 것, 및
    상기 환자에게 유효량의 EGFL7 길항제를 투여하여 세포 증식성 장애를 치료하는 것
    을 포함하는, 환자에서 세포 증식성 장애를 치료하는 방법.
  217. 암을 앓고 있는 환자로부터 수득한 샘플에서 NRP1의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 NRP1의 감소된 발현 수준은 환자가 EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 수 있다는 것을 나타내는 것인, EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 수 있는 암을 앓고 있는 환자를 확인하는 방법.
  218. 암을 앓고 있는 환자로부터 수득한 샘플에서 NRP1의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 NRP1의 감소된 발현 수준은 환자가 EGFL7 길항제로의 치료에 대해 반응성일 가능성이 더 크다는 것을 나타내는 것인, EGFL7 길항제로의 치료에 대한 암을 앓고 있는 환자의 반응성을 예측하는 방법.
  219. 환자로부터 수득한 샘플에서 NRP1의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 NRP1의 감소된 발현 수준은 환자가 EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 가능성이 증가하였다는 것을 나타내는 것인, 환자가 EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 나타낼 가능성을 결정하는 방법.
  220. 환자로부터 수득한 샘플에서 NRP1의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 NRP1의 감소된 발현 수준은 환자가 EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 가능성이 증가하였다는 것을 나타내는 것인, EGFL7 길항제의 치료 효능을 최적화하는 방법.
  221. 환자로부터 수득한 샘플이 참조 샘플과 비교하여 NRP1의 감소된 발현 수준을 갖는지 결정하는 것, 및
    상기 환자에게 유효량의 EGFL7 길항제를 투여하여 세포 증식성 장애를 치료하는 것
    을 포함하는, 환자에서 세포 증식성 장애를 치료하는 방법.
  222. 암을 앓고 있는 환자로부터 수득한 샘플에서 NRP1의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 NRP1의 감소된 발현 수준은 환자가 EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 수 있다는 것을 나타내는 것인, EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 수 있는 암을 앓고 있는 환자를 확인하는 방법.
  223. 암을 앓고 있는 환자로부터 수득한 샘플에서 NRP1의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 NRP1의 감소된 발현 수준은 환자가 EGFL7 길항제로의 치료에 대해 반응성일 가능성이 더 크다는 것을 나타내는 것인, EGFL7 길항제로의 치료에 대한 암을 앓고 있는 환자의 반응성을 예측하는 방법.
  224. 환자로부터 수득한 샘플에서 NRP1의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 NRP1의 감소된 발현 수준은 환자가 EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 가능성이 증가하였다는 것을 나타내는 것인, 환자가 EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 나타낼 가능성을 결정하는 방법.
  225. 환자로부터 수득한 샘플에서 NRP1의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 NRP1의 감소된 발현 수준은 환자가 EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 가능성이 증가하였다는 것을 나타내는 것인, EGFL7 길항제의 치료 효능을 최적화하는 방법.
  226. 환자로부터 수득한 샘플이 참조 샘플과 비교하여 NRP1의 감소된 발현 수준을 갖는지 결정하는 것, 및
    상기 환자에게 유효량의 EGFL7 길항제를 투여하여 세포 증식성 장애를 치료하는 것
    을 포함하는, 환자에서 세포 증식성 장애를 치료하는 방법.
  227. 암을 앓고 있는 환자로부터 수득한 샘플에서 FGF2의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 FGF2의 감소된 발현 수준은 환자가 EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 수 있다는 것을 나타내는 것인, EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 수 있는 암을 앓고 있는 환자를 확인하는 방법.
  228. 암을 앓고 있는 환자로부터 수득한 샘플에서 FGF2의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 FGF2의 감소된 발현 수준은 환자가 EGFL7 길항제로의 치료에 대해 반응성일 가능성이 더 크다는 것을 나타내는 것인, EGFL7 길항제로의 치료에 대한 암을 앓고 있는 환자의 반응성을 예측하는 방법.
  229. 환자로부터 수득한 샘플에서 FGF2의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 FGF2의 감소된 발현 수준은 환자가 EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 가능성이 증가하였다는 것을 나타내는 것인, 환자가 EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 나타낼 가능성을 결정하는 방법.
  230. 환자로부터 수득한 샘플에서 FGF2의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 FGF2의 감소된 발현 수준은 환자가 EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 가능성이 증가하였다는 것을 나타내는 것인, EGFL7 길항제의 치료 효능을 최적화하는 방법.
  231. 환자로부터 수득한 샘플이 참조 샘플과 비교하여 FGF2의 감소된 발현 수준을 갖는지 결정하는 것, 및
    상기 환자에게 유효량의 EGFL7 길항제를 투여하여 세포 증식성 장애를 치료하는 것
    을 포함하는, 환자에서 세포 증식성 장애를 치료하는 방법.
  232. 암을 앓고 있는 환자로부터 수득한 샘플에서 CXCR4의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 CXCR4의 감소된 발현 수준은 환자가 EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 수 있다는 것을 나타내는 것인, EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 수 있는 암을 앓고 있는 환자를 확인하는 방법.
  233. 암을 앓고 있는 환자로부터 수득한 샘플에서 CXCR4의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 CXCR4의 감소된 발현 수준은 환자가 EGFL7 길항제로의 치료에 대해 반응성일 가능성이 더 크다는 것을 나타내는 것인, EGFL7 길항제로의 치료에 대한 암을 앓고 있는 환자의 반응성을 예측하는 방법.
  234. 환자로부터 수득한 샘플에서 CXCR4의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 CXCR4의 감소된 발현 수준은 환자가 EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 가능성이 증가하였다는 것을 나타내는 것인, 환자가 EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 나타낼 가능성을 결정하는 방법.
  235. 환자로부터 수득한 샘플에서 CXCR4의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 CXCR4의 감소된 발현 수준은 환자가 EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 가능성이 증가하였다는 것을 나타내는 것인, EGFL7 길항제의 치료 효능을 최적화하는 방법.
  236. 환자로부터 수득한 샘플이 참조 샘플과 비교하여 CXCR4의 감소된 발현 수준을 갖는지 결정하는 것, 및
    상기 환자에게 유효량의 EGFL7 길항제를 투여하여 세포 증식성 장애를 치료하는 것
    을 포함하는, 환자에서 세포 증식성 장애를 치료하는 방법.
  237. 암을 앓고 있는 환자로부터 수득한 샘플에서 cMet의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 cMet의 감소된 발현 수준은 환자가 EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 수 있다는 것을 나타내는 것인, EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 수 있는 암을 앓고 있는 환자를 확인하는 방법.
  238. 암을 앓고 있는 환자로부터 수득한 샘플에서 cMet의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 cMet의 감소된 발현 수준은 환자가 EGFL7 길항제로의 치료에 대해 반응성일 가능성이 더 크다는 것을 나타내는 것인, EGFL7 길항제로의 치료에 대한 암을 앓고 있는 환자의 반응성을 예측하는 방법.
  239. 환자로부터 수득한 샘플에서 cMet의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 cMet의 감소된 발현 수준은 환자가 EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 가능성이 증가하였다는 것을 나타내는 것인, 환자가 EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 나타낼 가능성을 결정하는 방법.
  240. 환자로부터 수득한 샘플에서 cMet의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 cMet의 감소된 발현 수준은 환자가 EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 가능성이 증가하였다는 것을 나타내는 것인, EGFL7 길항제의 치료 효능을 최적화하는 방법.
  241. 환자로부터 수득한 샘플이 참조 샘플과 비교하여 cMet의 감소된 발현 수준을 갖는지 결정하는 것, 및
    상기 환자에게 유효량의 EGFL7 길항제를 투여하여 세포 증식성 장애를 치료하는 것
    을 포함하는, 환자에서 세포 증식성 장애를 치료하는 방법.
  242. 암을 앓고 있는 환자로부터 수득한 샘플에서 FN1의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 FN1의 감소된 발현 수준은 환자가 EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 수 있다는 것을 나타내는 것인, EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 수 있는 암을 앓고 있는 환자를 확인하는 방법.
  243. 암을 앓고 있는 환자로부터 수득한 샘플에서 FN1의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 FN1의 감소된 발현 수준은 환자가 EGFL7 길항제로의 치료에 대해 반응성일 가능성이 더 크다는 것을 나타내는 것인, EGFL7 길항제로의 치료에 대한 암을 앓고 있는 환자의 반응성을 예측하는 방법.
  244. 환자로부터 수득한 샘플에서 FN1의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 FN1의 감소된 발현 수준은 환자가 EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 가능성이 증가하였다는 것을 나타내는 것인, 환자가 EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 나타낼 가능성을 결정하는 방법.
  245. 환자로부터 수득한 샘플에서 FN1의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 FN1의 감소된 발현 수준은 환자가 EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 가능성이 증가하였다는 것을 나타내는 것인, EGFL7 길항제의 치료 효능을 최적화하는 방법.
  246. 환자로부터 수득한 샘플이 참조 샘플과 비교하여 FN1의 감소된 발현 수준을 갖는지 결정하는 것, 및
    상기 환자에게 유효량의 EGFL7 길항제를 투여하여 세포 증식성 장애를 치료하는 것
    을 포함하는, 환자에서 세포 증식성 장애를 치료하는 방법.
  247. 암을 앓고 있는 환자로부터 수득한 샘플에서 피불린 2의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 피불린 2의 감소된 발현 수준은 환자가 EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 수 있다는 것을 나타내는 것인, EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 수 있는 암을 앓고 있는 환자를 확인하는 방법.
  248. 암을 앓고 있는 환자로부터 수득한 샘플에서 피불린 2의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 피불린 2의 감소된 발현 수준은 환자가 EGFL7 길항제로의 치료에 대해 반응성일 가능성이 더 크다는 것을 나타내는 것인, EGFL7 길항제로의 치료에 대한 암을 앓고 있는 환자의 반응성을 예측하는 방법.
  249. 환자로부터 수득한 샘플에서 피불린 2의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 피불린 2의 감소된 발현 수준은 환자가 EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 가능성이 증가하였다는 것을 나타내는 것인, 환자가 EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 나타낼 가능성을 결정하는 방법.
  250. 환자로부터 수득한 샘플에서 피불린 2의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 피불린 2의 감소된 발현 수준은 환자가 EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 가능성이 증가하였다는 것을 나타내는 것인, EGFL7 길항제의 치료 효능을 최적화하는 방법.
  251. 환자로부터 수득한 샘플이 참조 샘플과 비교하여 피불린 2의 감소된 발현 수준을 갖는지 결정하는 것, 및
    상기 환자에게 유효량의 EGFL7 길항제를 투여하여 세포 증식성 장애를 치료하는 것
    을 포함하는, 환자에서 세포 증식성 장애를 치료하는 방법.
  252. 암을 앓고 있는 환자로부터 수득한 샘플에서 피불린 4의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 피불린 4의 감소된 발현 수준은 환자가 EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 수 있다는 것을 나타내는 것인, EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 수 있는 암을 앓고 있는 환자를 확인하는 방법.
  253. 암을 앓고 있는 환자로부터 수득한 샘플에서 피불린 4의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 피불린 4의 감소된 발현 수준은 환자가 EGFL7 길항제로의 치료에 대해 반응성일 가능성이 더 크다는 것을 나타내는 것인, EGFL7 길항제로의 치료에 대한 암을 앓고 있는 환자의 반응성을 예측하는 방법.
  254. 환자로부터 수득한 샘플에서 피불린 4의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 피불린 4의 감소된 발현 수준은 환자가 EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 가능성이 증가하였다는 것을 나타내는 것인, 환자가 EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 나타낼 가능성을 결정하는 방법.
  255. 환자로부터 수득한 샘플에서 피불린 4의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 피불린 4의 감소된 발현 수준은 환자가 EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 가능성이 증가하였다는 것을 나타내는 것인, EGFL7 길항제의 치료 효능을 최적화하는 방법.
  256. 환자로부터 수득한 샘플이 참조 샘플과 비교하여 피불린 4의 감소된 발현 수준을 갖는지 결정하는 것, 및
    상기 환자에게 유효량의 EGFL7 길항제를 투여하여 세포 증식성 장애를 치료하는 것
    을 포함하는, 환자에서 세포 증식성 장애를 치료하는 방법.
  257. 암을 앓고 있는 환자로부터 수득한 샘플에서 MFAP5의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 MFAP5의 감소된 발현 수준은 환자가 EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 수 있다는 것을 나타내는 것인, EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 수 있는 암을 앓고 있는 환자를 확인하는 방법.
  258. 암을 앓고 있는 환자로부터 수득한 샘플에서 MFAP5의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 MFAP5의 감소된 발현 수준은 환자가 EGFL7 길항제로의 치료에 대해 반응성일 가능성이 더 크다는 것을 나타내는 것인, EGFL7 길항제로의 치료에 대한 암을 앓고 있는 환자의 반응성을 예측하는 방법.
  259. 환자로부터 수득한 샘플에서 MFAP5의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 MFAP5의 감소된 발현 수준은 환자가 EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 가능성이 증가하였다는 것을 나타내는 것인, 환자가 EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 나타낼 가능성을 결정하는 방법.
  260. 환자로부터 수득한 샘플에서 MFAP5의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 MFAP5의 감소된 발현 수준은 환자가 EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 가능성이 증가하였다는 것을 나타내는 것인, EGFL7 길항제의 치료 효능을 최적화하는 방법.
  261. 환자로부터 수득한 샘플이 참조 샘플과 비교하여 MFAP5의 감소된 발현 수준을 갖는지 결정하는 것, 및
    상기 환자에게 유효량의 EGFL7 길항제를 투여하여 세포 증식성 장애를 치료하는 것
    을 포함하는, 환자에서 세포 증식성 장애를 치료하는 방법.
  262. 암을 앓고 있는 환자로부터 수득한 샘플에서 PDGF-C의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 PDGF-C의 감소된 발현 수준은 환자가 EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 수 있다는 것을 나타내는 것인, EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 수 있는 암을 앓고 있는 환자를 확인하는 방법.
  263. 암을 앓고 있는 환자로부터 수득한 샘플에서 PDGF-C의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 PDGF-C의 감소된 발현 수준은 환자가 EGFL7 길항제로의 치료에 대해 반응성일 가능성이 더 크다는 것을 나타내는 것인, EGFL7 길항제로의 치료에 대한 암을 앓고 있는 환자의 반응성을 예측하는 방법.
  264. 환자로부터 수득한 샘플에서 PDGF-C의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 PDGF-C의 감소된 발현 수준은 환자가 EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 가능성이 증가하였다는 것을 나타내는 것인, 환자가 EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 나타낼 가능성을 결정하는 방법.
  265. 환자로부터 수득한 샘플에서 PDGF-C의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 PDGF-C의 감소된 발현 수준은 환자가 EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 가능성이 증가하였다는 것을 나타내는 것인, EGFL7 길항제의 치료 효능을 최적화하는 방법.
  266. 환자로부터 수득한 샘플이 참조 샘플과 비교하여 PDGF-C의 감소된 발현 수준을 갖는지 결정하는 것, 및
    상기 환자에게 유효량의 EGFL7 길항제를 투여하여 세포 증식성 장애를 치료하는 것
    을 포함하는, 환자에서 세포 증식성 장애를 치료하는 방법.
  267. 암을 앓고 있는 환자로부터 수득한 샘플에서 Sema3F의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 Sema3F의 감소된 발현 수준은 환자가 EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 수 있다는 것을 나타내는 것인, EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 수 있는 암을 앓고 있는 환자를 확인하는 방법.
  268. 암을 앓고 있는 환자로부터 수득한 샘플에서 Sema3F의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 Sema3F의 감소된 발현 수준은 환자가 EGFL7 길항제로의 치료에 대해 반응성일 가능성이 더 크다는 것을 나타내는 것인, EGFL7 길항제로의 치료에 대한 암을 앓고 있는 환자의 반응성을 예측하는 방법.
  269. 환자로부터 수득한 샘플에서 Sema3F의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 Sema3F의 감소된 발현 수준은 환자가 EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 가능성이 증가하였다는 것을 나타내는 것인, 환자가 EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 나타낼 가능성을 결정하는 방법.
  270. 환자로부터 수득한 샘플에서 Sema3F의 발현 수준을 결정하는 것을 포함하고, 여기서 참조 샘플과 비교하여 샘플에서 Sema3F의 감소된 발현 수준은 환자가 EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 가능성이 증가하였다는 것을 나타내는 것인, EGFL7 길항제의 치료 효능을 최적화하는 방법.
  271. 환자로부터 수득한 샘플이 참조 샘플과 비교하여 Sema3F의 감소된 발현 수준을 갖는지 결정하는 것, 및
    상기 환자에게 유효량의 EGFL7 길항제를 투여하여 세포 증식성 장애를 치료하는 것
    을 포함하는, 환자에서 세포 증식성 장애를 치료하는 방법.
  272. 제177항 내지 제180항, 제182항 내지 제185항, 제187항 내지 제190항, 제192항 내지 제195항, 제197항 내지 제200항, 제202항 내지 제205항, 제207항 내지 제210항, 제212항 내지 제215항, 제217항 내지 제220항, 제222항 내지 제225항, 제227항 내지 제230항, 제232항 내지 제235항, 제237항 내지 제240항, 제242항 내지 제245항, 제247항 내지 제250항, 제252항 내지 제255항, 제257항 내지 제260항, 제262항 내지 제265항 및 제267항 내지 제270항 중 어느 한 항에 있어서, 환자에게 EGFL7 길항제를 투여하는 것을 더 포함하는 방법.
  273. 제177항 내지 제272항 중 어느 한 항에 있어서, EGFL7 길항제가 항-EGFL7 항체인 방법.
  274. 제181항, 제186항, 제191항, 제196항, 제201항, 제206항, 제211항, 제216항, 제221항, 제226항, 제231항, 제236항, 제241항, 제246항, 제251항, 제256항, 제261항, 제266항, 제271항 및 제272항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 환자에게 VEGF-A 길항제를 투여하는 것을 더 포함하는 방법.
  275. 제274항에 있어서, VEGF-A 길항제 및 EGFL7 길항제를 동시에 투여하는 방법.
  276. 제274항에 있어서, VEGF-A 길항제 및 EGFL7 길항제를 순차적으로 투여하는 방법.
  277. 제274항에 있어서, VEGF-A 길항제가 항-VEGF-A 항체인 방법.
  278. 제277항에 있어서, 항-VEGF-A 항체가 베바시주맙인 방법.
  279. VEGF-C, BV8, CSF2, TNFα, CXCL2, PDGF-C 및 민클로 이루어진 군으로부터 선택된 하나 이상의 유전자에 특이적으로 혼성화할 수 있는 폴리뉴클레오티드를 포함하는 어레이 및
    EGFL7 길항제로의 치료에 대한 환자의 반응성을 예측하기 위해 상기 하나 이상의 유전자의 발현 수준을 결정하는데 상기 어레이를 사용하기 위한 설명서
    를 포함하고, 여기서 참조 샘플에서 상기 하나 이상의 유전자의 발현 수준과 비교하여 상기 하나 이상의 유전자의 발현 수준의 증가는 환자가 EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 수 있다는 것을 나타내는 것인, VEGF-C, BV8, CSF2, TNFα, CXCL2, PDGF-C 및 민클로 이루어진 군으로부터 선택된 하나 이상의 유전자의 발현 수준을 결정하기 위한 키트.
  280. Sema3B, FGF9, HGF, RGS5, NRP1, FGF2, CXCR4, cMet, FN1, 피불린 2, 피불린 4/EFEMP2, MFAP5, PDGF-C, Sema3F 및 FN1로 이루어진 군으로부터 선택된 하나 이상의 유전자에 특이적으로 혼성화할 수 있는 폴리뉴클레오티드를 포함하는 어레이 및
    EGFL7 길항제로의 치료에 대한 환자의 반응성을 예측하기 위해 상기 하나 이상의 유전자의 발현 수준을 결정하는데 상기 어레이를 사용하기 위한 설명서
    를 포함하고, 여기서 참조 샘플에서 상기 하나 이상의 유전자의 발현 수준과 비교하여 상기 하나 이상의 유전자의 발현 수준의 감소는 환자가 EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 수 있다는 것을 나타내는 것인, Sema3B, FGF9, HGF, RGS5, NRP1, FGF2, CXCR4, cMet, FN1, 피불린 2, 피불린 4/EFEMP2, MFAP5, PDGF-C, Sema3F 및 FN1로 이루어진 군으로부터 선택된 하나 이상의 유전자의 발현 수준을 결정하기 위한 키트.
  281. VEGF-C, BV8, CSF2, TNFα, CXCL2, PDGF-C 및 민클로 이루어진 군으로부터 선택된 하나 이상의 유전자에 특이적으로 혼성화할 수 있는 하나 이상의 화합물을 포함하고, 여기서 참조 샘플에서 상기 하나 이상의 유전자의 발현 수준과 비교하여 상기 하나 이상의 유전자의 발현 수준의 증가는 환자가 EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 수 있다는 것을 나타내는 것인, VEGF-C, BV8, CSF2, TNFα, CXCL2, PDGF-C 및 민클로 이루어진 군으로부터 선택된 하나 이상의 유전자의 발현 수준을 검출할 수 있는 화합물의 세트.
  282. Sema3B, FGF9, HGF, RGS5, NRP1, FGF2, CXCR4, cMet, FN1, 피불린 2, 피불린 4/EFEMP2, MFAP5, PDGF-C, Sema3F 및 FN1로 이루어진 군으로부터 선택된 하나 이상의 유전자에 특이적으로 혼성화하는 하나 이상의 화합물을 포함하고, 여기서 참조 샘플에서 상기 하나 이상의 유전자의 발현 수준과 비교하여 상기 하나 이상의 유전자의 발현 수준의 감소는 환자가 EGFL7 길항제로의 치료로부터 이익을 얻을 수 있다는 것을 나타내는 것인, Sema3B, FGF9, HGF, RGS5, NRP1, FGF2, CXCR4, cMet, FN1, 피불린 2, 피불린 4/EFEMP2, MFAP5, PDGF-C, Sema3F 및 FN1로 이루어진 군으로부터 선택된 하나 이상의 유전자의 발현 수준을 검출할 수 있는 화합물의 세트.
  283. 제281항 또는 제282항에 있어서, 화합물이 폴리뉴클레오티드인 화합물의 세트.
  284. 제283항에 있어서, 폴리뉴클레오티드가 표 2로부터의 3개의 서열을 포함하는 것인 화합물의 세트.
  285. 제281항 또는 제282항에 있어서, 화합물이 단백질인 화합물의 세트.
  286. 제285항에 있어서, 단백질이 항체인 화합물의 세트.
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Families Citing this family (25)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO2011153224A2 (en) * 2010-06-02 2011-12-08 Genentech, Inc. Diagnostic methods and compositions for treatment of cancer
WO2012151574A1 (en) * 2011-05-05 2012-11-08 Duke University Methods of developing a prognosis for pancreatic cancer and predicting responsiveness to cancer therapeutics
JP2015505245A (ja) * 2011-12-29 2015-02-19 ベイラー リサーチ インスティテュートＢａｙｌｏｒ Ｒｅｓｅａｒｃｈ Ｉｎｓｔｉｔｕｔｅ 川崎病のためのバイオマーカー
RU2659173C2 (ru) 2012-01-13 2018-06-28 Дженентек, Инк. Биологические маркеры для идентификации пациентов для лечения антагонистами vegf
AU2013240234B2 (en) * 2012-03-30 2017-04-27 Genentech, Inc. Diagnostic methods and compositions for treatment of cancer
CA2871385A1 (en) * 2012-06-26 2014-01-03 F. Hoffmann-La Roche Ag Blood plasma biomarkers for bevacizumab combination therapies for treatment of breast cancer
JP2015533127A (ja) 2012-10-08 2015-11-19 セント ジュード チルドレンズ リサーチ ホスピタルＳｔ． Ｊｕｄｅ Ｃｈｉｌｄｒｅｎ’ｓ Ｒｅｓｅａｒｃｈ Ｈｏｓｐｉｔａｌ ニューロピリン１：セマフォリン軸を介した、制御性ｔ細胞の安定性および機能の制御に基づく療法
CA2916394A1 (en) * 2013-07-23 2015-01-29 Genentech, Inc. Model of colorectal cancer
CN103911451A (zh) * 2014-04-11 2014-07-09 蒋晓东 筛选抗血管生成靶向药物治疗肺癌目标人群的方法
TR201909951T4 (tr) * 2014-07-18 2019-07-22 Sanofi Sa Kanser olduğundan şüphelenilen bir hastanın aflibersept ile tedavisinin sonucunun öngörülmesine yönelik yöntem.
CA2969402C (en) * 2014-12-03 2019-06-11 Samsung Life Public Welfare Foundation Antibody binding to neuropilin 1 and use thereof
WO2017066659A1 (en) * 2015-10-16 2017-04-20 The Trustees Of Columbia University In The City Of New York Jag1 expression predicts therapeutic response in nash
US11154598B2 (en) * 2016-03-29 2021-10-26 Université de Paris Compositions comprising secreted extracellular vesicles of cells expressing NFATC4 useful for the treatment of cancer
JP2019515670A (ja) * 2016-04-15 2019-06-13 ジェネンテック， インコーポレイテッド がんをモニタリングし治療するための方法
US11499973B2 (en) 2016-05-17 2022-11-15 Duke University Methods of predicting responsiveness of a cancer to a VEGF targeting agent and methods of prognosing and treating cancer
EP3467508A4 (en) * 2016-06-03 2020-04-29 Samsung Life Public Welfare Foundation ANTI-NRP1 ANTIBODY SCREENING METHOD
CN106282376A (zh) * 2016-09-27 2017-01-04 上海交通大学医学院附属第九人民医院 一种用于检测bmp9基因表达的反义rna探针
JP2020503872A (ja) * 2017-01-09 2020-02-06 セカルナ・ファーマシューティカルズ・ゲーエムベーハー・ウント・コ・カーゲー Ｎｒｐ１の発現を阻害するオリゴヌクレオチド
KR20190134631A (ko) 2017-03-01 2019-12-04 제넨테크, 인크. 암의 진단 및 치료 방법
CN109828111A (zh) * 2017-11-23 2019-05-31 复旦大学附属肿瘤医院 MFAP5在制备筛选α干扰素干预肝癌敏感人群标志物的制剂中的用途
CN109828114A (zh) * 2017-11-23 2019-05-31 复旦大学附属肿瘤医院 MFAP5蛋白作为筛选α干扰素治疗肝癌敏感人群的试剂盒中的方法及应用
KR20210044257A (ko) * 2018-08-17 2021-04-22 에프. 호프만-라 로슈 아게 심방 세동의 평가에서의 순환 bmp10 (골형성 단백질 10)
CN110893238A (zh) * 2018-09-13 2020-03-20 常州大学 抑制血管内皮生长因子活性和表达量的物质在制备抑制淋巴结转移的产品中的应用
KR20210082207A (ko) 2018-10-23 2021-07-02 리제너론 파아마슈티컬스, 인크. 항-npr1 항체 및 이의 용도
CN112213495B (zh) * 2020-09-18 2022-10-28 广州中医药大学第三附属医院(广州中医药大学第三临床医学院、广州中医药大学附属骨伤科医院、广州中医药大学骨伤科研究所) 一种辅助诊断或诊断股骨头坏死的标志物

Family Cites Families (76)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US3773919A (en) 1969-10-23 1973-11-20 Du Pont Polylactide-drug mixtures
US4018653A (en) 1971-10-29 1977-04-19 U.S. Packaging Corporation Instrument for the detection of Neisseria gonorrhoeae without culture
US4016043A (en) 1975-09-04 1977-04-05 Akzona Incorporated Enzymatic immunological method for the determination of antigens and antibodies
US4275149A (en) 1978-11-24 1981-06-23 Syva Company Macromolecular environment control in specific receptor assays
US4318980A (en) 1978-04-10 1982-03-09 Miles Laboratories, Inc. Heterogenous specific binding assay employing a cycling reactant as label
US4424279A (en) 1982-08-12 1984-01-03 Quidel Rapid plunger immunoassay method and apparatus
US4816567A (en) 1983-04-08 1989-03-28 Genentech, Inc. Recombinant immunoglobin preparations
US4675187A (en) 1983-05-16 1987-06-23 Bristol-Myers Company BBM-1675, a new antibiotic complex
US4737456A (en) 1985-05-09 1988-04-12 Syntex (U.S.A.) Inc. Reducing interference in ligand-receptor binding assays
US6548640B1 (en) 1986-03-27 2003-04-15 Btg International Limited Altered antibodies
IL85035A0 (en) 1987-01-08 1988-06-30 Int Genetic Eng Polynucleotide molecule,a chimeric antibody with specificity for human b cell surface antigen,a process for the preparation and methods utilizing the same
JP3040121B2 (ja) 1988-01-12 2000-05-08 ジェネンテク，インコーポレイテッド 増殖因子レセプターの機能を阻害することにより腫瘍細胞を処置する方法
US5700637A (en) 1988-05-03 1997-12-23 Isis Innovation Limited Apparatus and method for analyzing polynucleotide sequences and method of generating oligonucleotide arrays
GB8823869D0 (en) 1988-10-12 1988-11-16 Medical Res Council Production of antibodies
US5143854A (en) 1989-06-07 1992-09-01 Affymax Technologies N.V. Large scale photolithographic solid phase synthesis of polypeptides and receptor binding screening thereof
DE69133566T2 (de) 1990-01-12 2007-12-06 Amgen Fremont Inc. Bildung von xenogenen Antikörpern
US6150584A (en) 1990-01-12 2000-11-21 Abgenix, Inc. Human antibodies derived from immunized xenomice
US6075181A (en) 1990-01-12 2000-06-13 Abgenix, Inc. Human antibodies derived from immunized xenomice
US5625126A (en) 1990-08-29 1997-04-29 Genpharm International, Inc. Transgenic non-human animals for producing heterologous antibodies
KR100272077B1 (ko) 1990-08-29 2000-11-15 젠팜인터내셔날,인코포레이티드 이종 항체를 생산할 수 있는 전이유전자를 가진 인간이외의 동물
US5545806A (en) 1990-08-29 1996-08-13 Genpharm International, Inc. Ransgenic non-human animals for producing heterologous antibodies
US5633425A (en) 1990-08-29 1997-05-27 Genpharm International, Inc. Transgenic non-human animals capable of producing heterologous antibodies
US5661016A (en) 1990-08-29 1997-08-26 Genpharm International Inc. Transgenic non-human animals capable of producing heterologous antibodies of various isotypes
US6582959B2 (en) 1991-03-29 2003-06-24 Genentech, Inc. Antibodies to vascular endothelial cell growth factor
US20030206899A1 (en) 1991-03-29 2003-11-06 Genentech, Inc. Vascular endothelial cell growth factor antagonists
WO1994004679A1 (en) 1991-06-14 1994-03-03 Genentech, Inc. Method for making humanized antibodies
CA2103059C (en) 1991-06-14 2005-03-22 Paul J. Carter Method for making humanized antibodies
HU221343B1 (en) 1992-10-28 2002-09-28 Genentech Inc Use of anti-vegf antibodies for the treatment of cancer
US6177401B1 (en) 1992-11-13 2001-01-23 Max-Planck-Gesellschaft Zur Forderung Der Wissenschaften Use of organic compounds for the inhibition of Flk-1 mediated vasculogenesis and angiogenesis
US5635388A (en) 1994-04-04 1997-06-03 Genentech, Inc. Agonist antibodies against the flk2/flt3 receptor and uses thereof
US5807522A (en) 1994-06-17 1998-09-15 The Board Of Trustees Of The Leland Stanford Junior University Methods for fabricating microarrays of biological samples
IL117645A (en) 1995-03-30 2005-08-31 Genentech Inc Vascular endothelial cell growth factor antagonists for use as medicaments in the treatment of age-related macular degeneration
KR20050085971A (ko) 1995-04-27 2005-08-29 아브게닉스, 인크. 면역화된 제노마우스 유래의 인간 항체
AU2466895A (en) 1995-04-28 1996-11-18 Abgenix, Inc. Human antibodies derived from immunized xenomice
US5880141A (en) 1995-06-07 1999-03-09 Sugen, Inc. Benzylidene-Z-indoline compounds for the treatment of disease
PT848755E (pt) 1995-09-08 2003-12-31 Genentech Inc Proteina relacionada com o vegf
GB9624482D0 (en) 1995-12-18 1997-01-15 Zeneca Phaema S A Chemical compounds
EP0885198B1 (en) 1996-03-05 2001-12-19 AstraZeneca AB 4-anilinoquinazoline derivatives
US6100071A (en) 1996-05-07 2000-08-08 Genentech, Inc. Receptors as novel inhibitors of vascular endothelial growth factor activity and processes for their production
HRP970371A2 (en) 1996-07-13 1998-08-31 Kathryn Jane Smith Heterocyclic compounds
CN1230185A (zh) 1996-07-13 1999-09-29 葛兰素集团有限公司 双环芳杂环化合物用作蛋白质酪氨酸激酶的抑制剂
EP2314625B1 (en) 1996-12-03 2014-05-07 Amgen Fremont Inc. Transgenic mammals having human Ig loci including plural VH and Vkappa regions and antibodies produced therefrom
US20020032315A1 (en) 1997-08-06 2002-03-14 Manuel Baca Anti-vegf antibodies
DE69842174D1 (de) 1997-04-07 2011-04-21 Genentech Inc Verfahren zur Herstellung humanisierter Antikörper durch randomisierte Mutagenese
US6884879B1 (en) 1997-04-07 2005-04-26 Genentech, Inc. Anti-VEGF antibodies
ES2273415T3 (es) 1997-04-07 2007-05-01 Genentech, Inc. Anticuerpos anti-vegf.
JP2002511852A (ja) 1997-05-07 2002-04-16 スージェン・インコーポレーテッド 蛋白質キナーゼ活性の調節剤としての２−インドリノン誘導体
AU734009B2 (en) 1997-05-30 2001-05-31 Merck & Co., Inc. Novel angiogenesis inhibitors
ES2289791T3 (es) 1997-08-22 2008-02-01 Astrazeneca Ab Derivados de oxindolilquinazolina como inhibidores de la angiogenesis.
WO1999016755A1 (en) 1997-09-26 1999-04-08 Merck & Co., Inc. Novel angiogenesis inhibitors
WO1999024440A1 (en) 1997-11-11 1999-05-20 Pfizer Products Inc. Thienopyrimidine and thienopyridine derivatives useful as anticancer agents
DK1034298T3 (da) 1997-12-05 2012-01-30 Scripps Research Inst Humanisering af murint antistof
US6194551B1 (en) 1998-04-02 2001-02-27 Genentech, Inc. Polypeptide variants
JP2002510481A (ja) 1998-04-02 2002-04-09 ジェネンテック・インコーポレーテッド 抗体変異体及びその断片
AU759226B2 (en) 1998-05-29 2003-04-10 Sugen, Inc. Pyrrole substituted 2-indolinone protein kinase inhibitors
UA60365C2 (uk) 1998-06-04 2003-10-15 Пфайзер Продактс Інк. Похідні ізотіазолу, спосіб їх одержання, фармацевтична композиція та спосіб лікування гіперпроліферативного захворювання у ссавця
US6737056B1 (en) 1999-01-15 2004-05-18 Genentech, Inc. Polypeptide variants with altered effector function
ES2694002T3 (es) 1999-01-15 2018-12-17 Genentech, Inc. Polipéptido que comprende una región Fc de IgG1 humana variante
US6703020B1 (en) 1999-04-28 2004-03-09 Board Of Regents, The University Of Texas System Antibody conjugate methods for selectively inhibiting VEGF
TWI262914B (en) 1999-07-02 2006-10-01 Agouron Pharma Compounds and pharmaceutical compositions for inhibiting protein kinases
US20020081597A1 (en) 2000-03-31 2002-06-27 Genentech, Inc. Compositions and methods for detecting and quantifying gene expression
US6998234B2 (en) * 2000-11-03 2006-02-14 Oncotech, Inc. Methods for cancer prognosis and diagnosis relating to tumor vascular endothelial cells
AR042586A1 (es) 2001-02-15 2005-06-29 Sugen Inc 3-(4-amidopirrol-2-ilmetiliden)-2-indolinona como inhibidores de la protein quinasa; sus composiciones farmaceuticas; un metodo para la modulacion de la actividad catalitica de la proteinquinasa; un metodo para tratar o prevenir una afeccion relacionada con la proteinquinasa
US7217797B2 (en) 2002-10-15 2007-05-15 Pdl Biopharma, Inc. Alteration of FcRn binding affinities or serum half-lives of antibodies by mutagenesis
JP4810427B2 (ja) 2003-05-22 2011-11-09 アボット・ラボラトリーズ インダゾール、ベンズイソオキサゾールおよびベンズイソチアゾールキナーゼ阻害剤
CA2526085A1 (en) 2003-05-30 2005-01-06 Genentech, Inc. Treatment with anti-vegf antibodies
US20050106667A1 (en) 2003-08-01 2005-05-19 Genentech, Inc Binding polypeptides with restricted diversity sequences
US7758859B2 (en) 2003-08-01 2010-07-20 Genentech, Inc. Anti-VEGF antibodies
JP5599136B2 (ja) * 2004-04-14 2014-10-01 ジェネンテック， インコーポレイテッド 血管の発達を調節するための、ｅｇｆｌ７アンタゴニストを含む組成物
US20060009360A1 (en) 2004-06-25 2006-01-12 Robert Pifer New adjuvant composition
JP2007070633A (ja) 2005-09-06 2007-03-22 Lg Electronics Inc 印刷用インキと蛍光体スラリー組成物、これを用いる印刷機及びプラズマディスプレイパネル並びにその製造方法
UA96139C2 (uk) 2005-11-08 2011-10-10 Дженентек, Інк. Антитіло до нейропіліну-1 (nrp1)
ITRM20060337A1 (it) * 2006-06-27 2007-12-28 Biosoot Srl Gene tem8 (tumor endotelial marker 8) e sue forme di espressione ed usi diagnostici e terapeutici
WO2008128233A1 (en) * 2007-04-15 2008-10-23 University Of Chicago Methods and compositions concerning the vegfr-2 gene (kinase domain receptor, kdr)
JP2011502513A (ja) * 2007-11-09 2011-01-27 ジェネンテック， インコーポレイテッド 癌患者における診断用途のための方法および組成物
US20100029491A1 (en) * 2008-07-11 2010-02-04 Maike Schmidt Methods and compositions for diagnostic use for tumor treatment

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