KR101608734B1 - L-아미노산을 생산하는 미생물 및 이를 이용하여 l-아미노산을 생산하는 방법 - Google Patents
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Abstract
미생물의 파지 수용체의 활성을 불황성화시킴으로써, L-아미노산의 생산능이 향상된 재조합 미생물 및 이를 이용하는 L-아미노산을 생산하는 방법을 제공한다. 상기 재조합 미생물을 이용하여 높은 효율로 L-아미노산을 생산하는 것이 가능하다.
Description
본 발명은 L-아미노산을 생산하는 재조합 미생물 및 상기 재조합 미생물을 이용한 L-아미노산을 생산하는 방법에 관한 것이다.
아미노산 등 유용 산물의 대량생산을 위해 미생물을 이용한 다양한 발효 방법이 이용되고 있으며, 이러한 미생물을 이용한 성공적인 발효를 위해 균주개발, 발효조건 확립 등 다양한 기술들이 개발되어 왔다. 특히 유용 산물의 대량생산을 위한 숙주 균주의 개발을 위해 특정 유전자의 과발현 또는 저발현을 유도하려는 많은 시도가 행해지고 있다.
한편 박테리아를 이용한 발효 생산에서 파지(phage)의 오염으로 인해 유용 산물의 생산이 감소할 수 있다. 파지의 오염은 주로 파지 수용체(Phage receptor)를 통해 이루어지는데, 파지 수용체란 파지가 박테리아 표면에 부착할 수 있는 단백질, 지질 다당체 등을 의미한다. 대장균의 경우, 다양한 파지에 의해 공격을 당하며 각각의 파지에 대한 수용체도 연구가 비교적 잘 되어 있다. 그러나 파지 수용체와 L-아미노산 생산성과의 관계에 대해서는 충분한 연구가 진행되지 않은 실정이다.
이에 본 발명자들은 대장균 취약점 중 하나인 파지 오염으로 인한 L-아미노산 생산의 감소라는 위험성을 줄이기 위해, 파지 수용체로 잘 알려진 유전자들을 선택하여 각각을 불활성화시킨 후, 그에 의한 L-아미노산 생산성에 대한 영향을 확인함으로써 이를 L-아미노산 생산 균주에 적용하여 본 발명을 완성하게 되었다.
일 양상은 파지 수용체가 불활성화된, L-아미노산을 생산하는 에세리키아 속 재조합 미생물을 제공하는 것이다.
다른 양상은 상기 미생물을 이용한 L-아미노산을 생산하는 방법을 제공하는 것이다.
일 양상은 NfrA, NfrB,또는 NfrA 및 NfrB 의 활성이 불활성화된, L-아미노산을 생산하는 재조합 미생물을 제공한다.
본 명세서의 용어 "NfrA"는 박테리오파지 N4(bacteriophage N4)의 수용체를 구성하는 것으로, 이는 박테리아의 세포막 단백질일 수 있으며, 예를 들면 외막(outer membrane) 단백질의 구성단위(subunit)일 수 있다. 상기 단백질 NfrA는 예를 들면 서열번호 40의 아미노산 서열을 포함할 수 있다. 상기 NfrA는 예를 들면 서열번호 40의 아미노산 서열 또는 이와 상동성이 예를 들면 80% 이상, 85% 이상, 90% 이상, 또는 95% 이상인 아미노산 서열을 가지는 것일 수 있다. 상기 단백질 NfrA를 암호화하는 유전자 서열은 상기 서열번호 40의 아미노산을 암호화하는 폴리뉴클레오티드 서열을 포함할 수 있다. 상기 단백질 NfrA를 암호화하는 유전자 서열은 예를 들면 nfrA 유전자(NCBI Gene ID:12930896) 서열일 수 있으며, 예를 들면 서열번호 39의 폴리뉴클레오티드 서열 또는 이와 상동성이 예를 들면 80% 이상, 85% 이상, 90% 이상, 또는 95% 이상인 폴리뉴클레오티드 서열을 가질 수 있다.
용어 "NfrB"는 박테리오파지 N4(bacteriophage N4)의 수용체를 구성하는 것으로, 이는 박테리아의 세포막 단백질일 수 있으며, 예를 들면 내막(inner membrane) 단백질의 구성단위(subunit)일 수 있다. 상기 NfrB는 예를 들면 서열번호 42의 아미노산 서열을 포함할 수 있다. 상기 NfrB는 예를 들면 서열번호 42의 아미노산 서열 또는 이와 상동성이 예를 들면 80% 이상, 85% 이상, 90% 이상, 또는 95% 이상인 아미노산 서열을 가지는 것일 수 있다. 상기 단백질 NfrB를 암호화하는 유전자 서열은 상기 서열번호 42의 아미노산을 암호화하는 폴리뉴클레오티드 서열을 포함할 수 있다. 상기 단백질 NfrB를 암호화하는 유전자 서열은 예를 들면 nfrB 유전자(NCBI Gene ID:12933943) 서열일 수 있으며, 예를 들면 서열번호 41의 폴리뉴클레오티드 서열 또는 이와 상동성이 예를 들면 80% 이상, 85% 이상, 90% 이상, 또는 95% 이상인 폴리뉴클레오티드 서열을 가질 수 있다.
또한 상기 L-아미노산을 생산하는 재조합 미생물은 NfrA, NfrB 또는 NfrA 및 NfrB 활성이 불활성화된 미생물에서 Tsx, FhuA, 또는 Tsx 및 FhuA의 활성이 추가로 불활성화된 것일 수 있다.
용어 "Tsx"는 뉴클레오시드 채널(nucleoside channel), 즉 뉴클레오시드에 특이적인 채널을 구성하는 것으로, 파지 T6 및 콜리신 K(colicin K)의 수용체를 구성할 수 있다. 상기 Tsx는 예를 들면 서열번호 45의 아미노산 서열 또는 이와 상동성이 예를 들면 80% 이상, 85% 이상, 90% 이상, 또는 95% 이상인 아미노산 서열을 포함할 수 있다. 상기 단백질 Tsx를 암호화하는 유전자 서열은 상기 서열번호 45의 아미노산을 암호화하는 폴리뉴클레오티드 서열을 포함할 수 있다. 예를 들면 상기 단백질 Tsx를 암호화하는 유전자 서열은 tsx 유전자(NCBI Gene ID:12934188) 서열일 수 있으며, 서열번호 44의 폴리뉴클레오티드 서열 또는 이와 상동성이 예를 들면 80% 이상, 85% 이상, 90% 이상, 또는 95% 이상인 폴리뉴클레오티드 서열을 가질 수 있다.
용어 "FhuA"는 박테리아의 외막 단백질에서 (Fe3 +)페리크롬, 또는 알보마이신(albomycin) 및 리파마이신(rifamycin)과 같은 항생제를 수송하는 등의 여러 기능을 하는 단백질로 파지 T1, T5 및 파이80(phi80)의 수용체일 수 있다. 상기 FhuA는 예를 들면 서열번호 47의 아미노산 서열 또는 이와 상동성이 예를 들면 80% 이상, 85% 이상, 90% 이상, 또는 95% 이상인 아미노산 서열을 포함할 수 있다. 상기 단백질 FhuA를 암호화하는 유전자 서열은 상기 서열번호 47의 아미노산을 암호화하는 폴리뉴클레오티드 서열을 포함할 수 있다. 상기 단백질 FhuA를 암호화하는 유전자 서열은 예를 들면 fhuA 유전자 서열(NCBI Gene ID:12930751)일 수 있으며, 서열번호 47의 폴리뉴클레오티드 서열 또는 이와 상동성이 예를 들면 80% 이상, 85% 이상, 90% 이상, 또는 95% 이상인 폴리뉴클레오티드 서열을 가질 수 있다.
용어 "상동성"은 두 아미노산 서열 간의 동일성을 나타내는 것으로, 점수(score), 동일성(identity) 및 유사도(similarity) 등의 매개 변수(parameter)들을 계산하는 BLAST 2.0를 이용하는, 당업자에게 잘 알려진 방법으로 결정될 수 있다.
용어 "재조합 미생물(recombinant microorganism)"은 유전적으로 조작된 미생물일 수 있다. 유전공학에 의해 제조된 미생물, 예를 들면 유전공학 방법에 의해 미생물 내로 외인성(exogenous) 핵산이 도입되거나, 미생물의 내인성(endogenous) 유전자의 서열 또는 위치가 변형된 것일 수 있다.
용어, "L-아미노산"은 일반적으로 아미노기와 카르복시기가 동일한 탄소 원자에 결합되어 있는 생물의 몸을 구성하는 단백질의 기본 구성단위를 의미한다. 예를 들면 L-류신, L-페닐알라닌, L-라이신, L-쓰레오닌, L-발린, L-이소류신, L-트립토판 및 L-메티오닌으로 구성된 군으로부터 선택될 수 있으며, 예를 들면 L-트립토판 또는 L-쓰레오닌일 수 있다.
본 명세서에서 사용된 용어 효소 또는 폴리펩티드의 "불활성화"는 미생물 중의 언급된 단백질이 전혀 발현되지 않거나, 또는 발현되더라도 전혀 활성을 가지지 않는 것 또는 내재적 활성에 비해 약화된 것을 의미한다. 용어 "내재적 활성"이란 미생물이 천연의 상태, 즉 미생물이 본래 가지고 있었던, 유전자 변형을 거치지 않은 단백질의 활성을 의미한다.
상기 단백질 NfrA, 단백질 NfrB, 단백질 Tsx, 단백질 FhuA의 활성이 불활성화되는 것은 상기 단백질들을 암호화하는 각 유전자의 변이, 제거 또는 파괴에 의한 것일 수 있다. 상기 "유전자의 변이, 제거 또는 파괴"는 유전자가 발현되지 않거나 발현량이 감소되거나 발현되어도 효소 활성을 나타내지 않거나 활성이 감소되도록, 유전자의 일부 또는 전부가, 또는 그 프로모터, 그 터미네이터 영역 등의 조절인자의 일부 또는 전부가 변이, 치환, 삭제되거나 유전자에 하나 이상의 염기가 삽입되는 것을 말한다. 상기 유전자의 제거 또는 파괴는 상동재조합과 같은 유전자 조작, 돌연변이 유발, 분자 진화를 통해 달성될 수 있다. 세포가 복수개의 같은 유전자를 포함하거나 2개 이상의 다른 폴리펩티드 동종 상동유전자(paralog)를 포함하는 경우, 하나 또는 그 이상의 유전자가 제거 또는 파괴될 수 있다. 본 발명의 일 구체예에서 본 발명이 제시한 유전자를 불활성시키기 위해 람다 레드 재조합효소를 이용한 돌연변이 제작 기법을 사용할 수 있다.
상기 재조합 미생물은 본 발명에서 제시한 단백질들의 활성을 각각 또는 조합하여 제거하거나 감소시킴으로써, 활성이 불활성화되기 전보다 L-아미노산 생산성이 증가되어, L-아미노산 생산 용도로 바람직하게 사용될 수 있다.
상기 재조합 미생물은 에세르키아(Escherichia) 속, 엔테로박터(Enterbacter) 속, 어위니아(Erwinia) 속, 세라티아(Serratia) 속, 프로비덴시아(Providencia) 속, 코리네박테리움(Corynebacterium) 속 및 브레비박테리움(Brevibacterium) 속에 속하는 미생물 일 수 있다. 예를 들면 에세르키아(Escherichia) 속에 속하는 미생물일 수 있다. 상기 에세르키아 속 미생물은 대장균(Escherichia coli)일 수 있으며, 예를 들면 대장균 KCCM11501P일 수 있다. 상기 대장균 KCCM11501P는 쓰레오닌 생산균주인 KCCM10910P를 모균주로 하여 nfrA 유전자 및 nfrB 유전자를 모두 결손시킨 균주(KCCM10910PΔnfrAB)로, 모균주 KCCM10910P 대비 당소비능이 증가하는 것을 확인하였다. 상기 균주를 'CA03-8253P'이라 명명한 후 부다페스트 조약 하에 2013년 12월 13일자로 한국미생물보존센터(KCCM)에 기탁하여 기탁번호 KCCM11501P를 부여받았다.
다른 양상은 상기 L-아미노산을 생산하는 재조합 미생물을 배양하는 단계; 및 배양물로부터 L-아미노산을 회수하는 단계를 포함하는, L-아미노산을 생산하는 방법을 제공한다.
상기 L-아미노산을 생산하는 재조합 미생물에 대해서는 전술한 바와 같다.
상기 L-아미노산은 예를 들면 L-류신, L-페닐알라닌, L-라이신, L-쓰레오닌, L-발린, L-이소류신, L-트립토판 및 L-메티오닌으로 구성된 군으로부터 선택될 수 있으며, 예를 들면 L-쓰레오닌 또는 L-트립토판일 수 있다. 상기 배양은 당업계에 알려진 적당한 배지와 배양조건에 따라 이루어질 수 있다. 통상의 기술자라면 선택되는 미생물에 따라 배지 및 배양조건을 용이하게 조정하여 사용할 수 있다. 배양 방법은 회분식, 연속식, 유가식, 또는 이들의 조합 배양을 포함할 수 있다.
상기 배지는 다양한 탄소원, 질소원 및 미량원소 성분을 포함할 수 있다.
상기 탄소원은, 예를 들면, 포도당, 자당, 유당, 과당, 말토오스, 전분, 셀룰로오스와 같은 탄수화물, 대두유, 해바라기유, 피마자유, 코코넛유와 같은 지방, 팔미트산, 스테아린산, 리놀레산과 같은 지방산, 글리세롤 및 에탄올과 같은 알코올, 아세트산과 같은 유기산, 또는 이들의 조합을 포함할 수 있다. 상기 배양은 글루코스를 탄소원으로 하여 수행될 수 있다. 상기 질소원은, 펩톤, 효모 추출물, 육즙, 맥아 추출물, 옥수수 침지액(CSL), 및 대두밀과 같은 유기 질소원 및 요소, 황산암모늄, 염화암모늄, 인산암모늄, 탄산암모늄 및 질산암모늄과 같은 무기 질소원, 또는 이들의 조합을 포함할 수 있다. 상기 배지는 인의 공급원으로서, 예를 들면, 인산이수소칼륨, 인산수소이칼륨 및 상응하는 소듐-함유 염, 황산마그네슘 또는 황산철과 같은 금속염을 포함할 수 있다. 또한, 아미노산, 비타민, 및 적절한 전구체 등이 배지에 포함될 수 있다. 상기 배지 또는 개별 성분은 배양액에 회분식 또는 연속식으로 첨가될 수 있다.
또한, 배양 중에 수산화암모늄, 수산화칼륨, 암모니아, 인산 및 황산과 같은 화합물을 미생물 배양액에 적절한 방식으로 첨가하여 배양액의 pH를 조정할 수 있다. 또한, 배양 중에 지방산 폴리글리콜 에스테르와 같은 소포제를 사용하여 기포 생성을 억제할 수 있다. 배양액의 호기 상태를 유지하기 위하여, 배양액 내로 산소 또는 산소-함유 기체 (예, 공기)를 주입할 수 있다. 배양액의 온도는 통상 20℃ 내지 45℃일 수 있다. 배양기간은 원하는 L-아미노산의 생성량이 얻어질 때까지 지속될 수 있으며, 예를 들면 10 내지 160 시간일 수 있다.
용어 "배양물"은 상기 재조합 미생물을 포함한 배양원액일 수 있으며, 균체를 제거한 배양 상등액 또는 배양물의 희석액일 수 있다. 상기 조성물은 L-아미노산의 생산성을 증가시키기 위한 성분을 추가로 포함할 수 있다. 예를 들면 탄소원, 질소원, 또는 미량의 원소 성분을 포함할 수 있다.
상기 배양물로부터 L-아미노산을 회수하는 방법은 배양방법, 예를 들어 회분식, 연속식 또는 유가식 배양 방법 등에 따라 당해 분야에 공지된 적합한 방법을 이용하여 배양물로부터 생산된 L-아미노산을 수집 또는 회수할 수 있다.
일 양상에 따른 단백질 NfrA, 단백질 NfrB, 단백질 Tsx, 단백질 FhuA로 이루어진 군으로부터 선택되는 하나 이상의 단백질의 활성이 제거 또는 감소된 미생물은 L-아미노산 생산을 위해 이용될 수 있다.
다른 양상에 따른 L-아미노산 생산용 조성물 또는 L-아미노산을 생산하는 방법에 의하면, L-아미노산을 효율적으로 생산할 수 있다.
이하 본 발명을 실시예에 의해 보다 상세하게 설명한다. 그러나 이들 실시예는 본 발명을 예시적으로 설명하기 위한 것으로 본 발명의 범위가 이들 실시예에 의해 제한되는 것은 아니다.
실시예
1.
KCCM10910P
기반 파지 수용체가 불활성화된
쓰레오닌
생산 균주 제작
파지 수용체가 불활성화된 쓰레오닌 생산 균주를 제작하기 위해 모균주로 KCCM10910P (한국 등록특허 제10-0966324호)를 사용하였으며, 각 파지 수용체에 관한 유전자의 불활성화용 카세트를 제작하여 형질전환시켰다.
1-1.
nfrA
유전자가 불활성화된
쓰레오닌
균주 제작
nfrA 유전자가 불활성화된 균주 제작을 위해, nfrA 불활성화용 카세트를 제작하였다. 이 카세트는 Datsenko KA 등이 개발한 람다 레드 재조합효소(lambda Red recombinase)를 이용한 돌연변이 제작 기법인 1단계 불활성화(one step inactivation) 방법을 사용한 것으로(Proc Natl Acad Sci USA., (2000) 97:6640 -6645) 유전자 내부로의 삽입을 확인하기 위한 마커로는 pUCprmfmloxC의 클로람페니콜(Chloramphenicol) 유전자를 사용하였다 (대한민국 공개특허:2009-007554).
nfrA 유전자(서열번호 39)의 일부분과 pUCprmfmloxC 유전자의 클로람페니콜 내성 유전자의 일부 염기서열을 갖는 DNA를 얻기 위해 서열번호 2와 3 프라이머를 이용하여 약 1.1kb DNA 단편을 얻었다. 이를 위해 PCR premix kit(BIONEER사 제품, 이하 동일함)를 사용하여 중합효소 연쇄반응(polymerase chain reaction, 이하 "PCR"이라 약칭함)을 수행하였으며. 조건은 95℃에서 30초의 변성(denaturation), 56℃에서 30초의 어닐링(annealing) 및 72℃에서 1분의 신장(elongation)으로 이루어진 사이클을 27회 반복 수행하였다. 상기 PCR 결과물을 0.8% 아가로스 겔에서 전기영동한 후 용리(鎔離)하고 수득하여 이를 주형으로 서열번호 1과 4의 프라이머를 이용하여 위와 같은 조건으로 PCR을 수행하여 약 1.2kb의 DNA 단편을 얻었으며, 이를 0.8% 아가로스 겔에서 전기영동한 후 용리하고 수득하여 최종적으로 nfrA 불활성화 카세트를 제작하였다.
nfrA가 불활성화된 쓰레오닌 균주를 제작하기 위하여 Datsenko KA 등이 개발한 방법 (Proc Natl Acad Sci USA., (2000) 97:6640-6645)에 따라 pKD46으로 형질 전환된 대상 쓰레오닌 생산균주 KCCM10910P을 컴피턴트한 상태로 제조 후, 상기 획득된 nfrA 불활성화 카세트 DNA를 도입하여 형질전환시켰다.
얻어진 균주는 클로람 페니콜 내성을 가지고 있는 LB 플레이트에서 선별하였다. 이는 지놈 상의 불활성화 카세트의 nfrA 상동 서열 양쪽 바깥 쪽의 DNA 서열을 갖는 서열번호 5와 6의 프라이머를 이용하여 PCR 결과물의 사이즈가 2.8kb에서 1.5kb로 줄어드는 콜로니를 선별하였다.
클로람페니콜 내성을 가진 1차 재조합 균주는 pKD46을 제거한 후, pJW168을 도입하여 클로람페니콜 마커 유전자를 균체로부터 제거한 (Gene, (2000) 247,255-264). 최종 균주는 프라이머 5와 6을 이용한 PCR을 통해 얻어진 DNA의 결과물이 0.4kb로 사이즈가 줄어드는 것을 확인하여 제작되었다. 이를 통해 nfrA 유전자가 불활성화된 L-쓰레오닌 생산균주, KCCM10910PΔnfrA를 제작하였다.
1-2.
nfrB
유전자가 불활성화된
쓰레오닌
균주 제작
nfrB(서열번호 41) 유전자가 불활성화된 균주를 제작하기 위하여 nfrB 불활성화용 카세트를 제작하였다. nfrB 불활성화용 카세트는 상기 실시예 1-1의 nfrA 불활성화 카세트 제작과 같은 방법으로 제작되었으며, 서열번호 8, 9의 프라이머를 이용하여 약 1.1kb의 DNA 단편을 얻었고, 서열번호 7, 10을 이용하여 약 1.2kb의 DNA 단편을 제작하였다.
nfrB가 불활성화된 쓰레오닌 균주의 제작 방법은 상기 실시예 1-1과 동일한 방법으로 이루어졌으며, 서열번호 11과 12의 프라이머를 이용하여 PCR 결과물의 사이즈를 확인하여 nfrB가 불활성화된 L-쓰레오닌 생산균주, KCCM10910PΔnfrB를 제작하였다.
1-3.
nfrAB
유전자가 불활성화된
쓰레오닌
균주 제작
nfrAB(서열번호 43) 유전자가 불활성화된 균주 제작을 위해, 상기 1-1에 기술된 nfrA 불활성화 카세트 제작과 같은 방법으로 nfrAB 불활성화용 카세트를 제작하였다. 사용 프라이머로 서열번호 2, 9를 이용하여 약 1.1kb의 DNA 단편을 얻었고, 서열번호 1, 10을 이용하여 약 1.2kb의 DNA 단편을 제작하였다.
nfrAB가 불활성화된 쓰레오닌 균주의 제작 방법은 상기 실시예 1-1과 동일한 방법으로 방법으로 이루어졌으며, 서열번호 5과 12의 프라이머를 이용하여 PCR 결과물의 사이즈를 확인하였으며, 최종적으로 nfrAB가 불활성화된 L-쓰레오닌 생산균주 KCCM10910PΔnfrAB를 제작하였다.
1-4.
tsx
유전자가 불활성화된
쓰레오닌
균주 제작
tsx (서열번호 44) 유전자가 불활성화된 균주를 제작하기 위하여 상기 1-1에 기술된 nfrA 불활성화 카세트 제작과 같은 방법으로 tsx 불활성화용 카세트를 제작하였다. 사용 프라이머는 서열번호 13, 14을 이용하여, 약 1.1kb의 DNA 단편을 얻었고, 서열번호 15, 16을 이용하여 약 1.2kb의 DNA 단편을 제작하였다.
tsx가 불활성화된 쓰레오닌 균주의 제작 방법은 상기 실시예 1-1과 동일한 방법으로 방법으로 이루어졌으며, 서열번호 17과 18의 프라이머를 이용하여 PCR 결과물의 사이즈를 확인하였으며, 최종적으로 L-쓰레오닌 생산균주 KCCM10910P Δtsx를 제작하였다.
1-5.
fhuA
유전자가 불활성화된
쓰레오닌
균주 제작
fhuA (서열번호 46) 유전자가 불활성화된 균주를 제작하기 위하여 fhuA 불활성화용 카세트를 제작하였다. 이 카세트는 상기 기술된 기법인 1단계 불활성화(one step inactivation) 방법을 이용하도록 제작되었으며, fhuA와 상동성을 갖는 염기서열의 DNA 단편을 얻기 위해 각각 서열번호 19와 20, 21과 22를 이용하여 PCR 결과물을 얻었다. 또한 클로람페니콜 내성을 갖는 염기서열을 포함하는 DNA 단편을 획득하기 위해 서열번호 23과 24을 이용하여 PCR 결과물을 얻었다. 이렇게 얻은 세 개의 PCR 결과물을 0.8% 아가로스 겔(agarose gel)에서 전기영동한 후 용리하여 수득하고, 이 세 개의 결과물을 주형으로 하여 서열번호 19와 22를 사용하여 PCR을 수행하여 fhuA 불활성화 카세트를 제작하였다
fhuA가 불활성화된 쓰레오닌 균주를 제작하기 위하여 상기 실시예 1-1과 동일한 방법으로 방법으로 이루어졌으며, 서열번호 25와 26의 프라이머를 이용하여 PCR 결과물의 사이즈를 확인하여 최종적으로 fhuA가 불활성화된 L-쓰레오닌 생산균주 KCCM10910PΔfhuA를 제작하였다.
1-6.
lamB
유전자가 불활성화된
쓰레오닌
균주 제작
lamB 유전자(서열번호 48)가 불활성화된 균주를 제작하기 위하여 상기 실시예 1-1에서 기술된 방법으로 서열번호 27, 28을 이용하여 약 1.1kb의 DNA 단편을 얻었고, 서열번호 29, 30을 이용하여 약 1.2kb의 DNA 단편을 제작하였다.
lamB가 불활성화된 쓰레오닌 균주의 제작 방법은 상기 실시예 1-1에 기술된 방법과 동일한 방법으로 이루어졌으며, 서열번호 31과 32의 프라이머를 이용하여 PCR 결과물의 사이즈를 확인하여 최종적으로 lamB가 불활성화된 L-쓰레오닌 생산균주 KCCM10910PΔlamB를 제작하였다.
1-7.
btuB
유전자가 불활성화된
쓰레오닌
균주 제작
btuB 유전자(서열번호 50) 가 불활성화된 균주를 제작을 위해 상기 실시예 1-1에서 기술된 방법으로 btuB 불활성화용 카세트를 제작하였다. 사용 primer는 서열번호 33, 34을 이용하여 약 1.1kb의 DNA 단편을 얻었고, 서열번호 35, 36을 이용하여 약 1.2kb의 DNA 단편을 제작하였다.
btuB가 불활성화된 쓰레오닌 균주를 제작하기 위하여 쓰레오닌 균주의 제작 방법은 상기 실시예 1-1에 기술된 방법과 동일한 방법으로 이루어졌으며, 서열번호 37와 38의 프라이머를 이용하여 PCR 결과물의 사이즈를 확인하여, 최종적으로 btuB가 불활성화된 L-쓰레오닌 생산균주 KCCM10910PΔbtuB를 제작하였다.
실시예2
. 재조합 미생물의 L-
쓰레오닌
생산성 비교
상기 실시예 1에서 제조한 재조합 미생물들을 표 1의 쓰레오닌 역가 배지를 이용하여 삼각플라스크에서 배양하여 L-쓰레오닌 생산성을 확인하였다.
조성물 | 농도 (리터당) |
포도당 | 70 g |
KH2PO4 | 2 g |
(NH4)2SO4 | 27.5 g |
MgSO4·7H2O | 1 g |
FeSO4·7H2O | 5 mg |
MnSO4·4H2O | 5 mg |
DL-메티오닌 | 0.15 g |
효모 추출물 | 2 g |
탄산칼슘 | 30 g |
pH | 6.8 |
33℃ 배양기에서 LB 고체 배지 중에 밤새 배양한 실시예 1에서 제작된 대장균 7종의 균주 및 KCCM10910P를 각각 표 1의 25 mL 역가 배지에 한 백금이씩 접종한 다음, 이를 33℃ 200rpm의 배양기에서 48시간 동안 배양하였다.
균주 | 사용당 (g/L) | L-쓰레오닌 (g/L) |
30hr | 48hr | |
KCCM 10910P (모균주) | 22 | 34.5 |
KCCM 10910P ΔnfrA | 26 | 34.5 |
KCCM 10910P ΔnfrB | 26 | 34.4 |
KCCM 10910P ΔnfrAB | 26 | 34.4 |
KCCM 10910P Δtsx | 25 | 34.4 |
KCCM 10910P ΔfhuA | 24 | 34.5 |
KCCM 10910P ΔlamB | 20 | 34.5 |
KCCM 10910P ΔbtuB | 21 | 34.5 |
표 2에 기재된 바와 같이 nfrA, nfrB, nfrAB, tsx 및 fhuA 각 불활성화 균주는 모균주인 KCCM10910P 대비 당소모 속도가 향상되면서 48hr 수율이 떨어지지 않는 것을 확인하였다. 반면, lamB와 btuB 불활성화 균주는 모균주 대비 당소모 속도가 유사하거나 소폭 떨어지고, 48시간 배양시 쓰레오닌 농도도 모두 유사한 것을 확인하였다. nfrA, nfrB, 및 nfrAB 불활성화 균주들은 배양 결과가 동일하게 나타났으며, 두 유전자 중 어느 하나만 결손한 경우와 두 유전자를 동시에 결손한 경우 모두 같은 결과를 보이는 것을 확인하였다.
실시예3. 유효 변이 조합 균주 제작 및 L-쓰레오닌 생산능 비교
3-1 nfrAB, fhuA 동시 불활성화, nfrAB, tsx 동시 불활성화 및 nfrAB, tsx, fhuA 동시 불활성화 균주 제작
당 소비능이 증가된 nfrAB, fhuA, tsx의 불활성화 특징을 조합한 경우의 당 소모능 추가 향상 여부를 확인하기 위하여, KCCM10910PΔnfrABΔfhuA와 KCCM10910PΔnfrABΔtsx 및 KCCM10910PΔnfrABΔtsxΔfhuA를 제작하였다. 이를 위하여 실시예 1-3 제작된 KCCM10910PΔnfrAB를 기반으로 실시예 1에서 제작한 방법과 같은 방법으로 fhuA및 tsx를 각각 동시 불활성화시킨 균주를 제작하였다(KCCM10910PΔnfrABΔfhuA 및 KCCM10910PΔnfrABΔtsx). 또한 KCCM10910PΔnfrABΔtsx를 기반으로 fhuA를 불활성화시켜, 최종적으로 KCCM10910PΔnfrABΔtsxΔfhuA를 제작하였다.
표 2에서 확인한 바와 같이 nfrA, nfrB, nfrAB 불활성화 균주들은 그 효과가 동일하다고 판단되므로, 유효 변이 통합 균주 제작에서는 nfrAB가 불활성화를 기반으로 tsx, fhuA 불활성화를 진행하였다. 그러나 그 효과는 nfrA나 nfrB만 불활성화시킨 경우와 두 유전자 동시 불활성화시킨 경우 모두 동일할 것으로 생각할 수 있다.
3-2. 유효 변이 조합 균주의 L-
쓰레오닌
생산능
비교
앞에서 제작된 유효 변이 통합주의 L-쓰레오닌 생산능을 비교하기 위하여 표 1의 배지를 이용하여 앞에 기술된 방법과 동일하게 배양을 진행하였으며, 그 결과는 표 3과 같다
균주 | 사용당 (g/L) | L-쓰레오닌 (g/L) |
30hr | 48hr | |
KCCM10910P (모균주) | 22 | 34.5 |
KCCM10910P ΔnfrAB | 26 | 34.4 |
KCCM10910P ΔnfrAB ΔfhuA | 28 | 34.5 |
KCCM10910P ΔnfrAB Δtsx | 28 | 34.4 |
KCCM10910P ΔnfrAB Δtsx ΔfhuA | 29 | 34.5 |
당 소비능이 증가된 nfrAB, fhuA, tsx의 불활성화 특징을 조합하여 제작한 KCCM10910PΔnfrABΔfhuA 균주와 KCCM10910PΔnfrABΔtsx 균주, KCCM10910PΔnfrABΔtsxΔfhuA 균주의 역가 평가 결과, nfrAB 단독 변이에 fhuA나 tsx를 추가로 불활성화시켰을 경우 당 소비능이 증가함을 확인하였다. 이에 당 소비능이 증가된 것으로 보이는 상기 형질 전환된 대장균 KCCM10910PΔnfrAB를 'CA03-8253P'로 명명하고 KCCM 11501P 으로 20013년 12월 13일에 한국미생물보존센터(Korean Culture Center of Microorganisms, KCCM)에 기탁하였다(수탁번호 KCCM 11501P).
실시예4
.
KCCM
-10132 기반 파지 수용체 불활성화 균주 제작 및
쓰레오닌
생산능
비교
4-1.
KCCM
-10132 기반
phage
receptor
불활성화 균주 제작
실시예 1과 실시예 3과 같은 방법으로 실시예 1에서 제작된 7종의 불활성화 카세트를 이용하여 동일하게 KCCM-10132 균주를 기반으로 하여, 파지 수용체 불활성화 균주 10종을 제작하였다(표 4). KCCM-10132 균주는 한국등록특허제10-0270510호에 기술된 균주로 대장균 유래 쓰레오닌 생산능이 부여된 균주이다.
4-2.
KCCM
-10132 기반
phage
receptor
불활성화 균주 제작
쓰레오닌
생산능
비교
실시예 2에 기술된 방법으로 표 1의 배지를 이용하여 실시예 4-1에서 제작된 KCCM-10132기반 파지 수용체 불활성화 균주 10종과 모균주 KCCM-10132의 쓰레오닌 생산능을 비교 평가 진행하였다.
균주 | 사용당 (g/L) | L-쓰레오닌 (g/L) |
30hr | 48hr | |
KCCM-10132 (모균주) | 32 | 20.2 |
KCCM-10132 ΔnfrA | 35 | 20.2 |
KCCM-10132 ΔnfrB | 35 | 20.1 |
KCCM-10132 ΔnfrAB | 36 | 20.2 |
KCCM-10132 Δtsx | 35 | 20.2 |
KCCM-10132 ΔfhuA | 36 | 20.1 |
KCCM-10132 ΔlamB | 31 | 20.2 |
KCCM-10132 ΔbtuB | 30 | 20.1 |
KCCM-10132 ΔnfrAB ΔfhuA | 38 | 20.2 |
KCCM-10132 ΔnfrAB Δtsx | 38 | 20.1 |
KCCM-10132 ΔnfrAB Δtsx ΔfhuA | 39 | 20.2 |
표 4에 기재된 바와 같이 nfrA, nfrB, nfrAB, tsx, fhuA 불활성화 균주는 모균주인 KCCM-10132 대비 당소모 속도가 향상되면서 48hr 수율이 떨어지지 않는 것을 확인하였다. 반면, lamB와 btuB 불활성화 균주는 모균주 대비 당소모 속도가 유사하거나 소폭 지연되었고 48시간 배양시 쓰레오닌 농도는 유사한 것을 확인하였다. 또한 nfrAB, fhuA와 nfrAB, tsx 동시 불활성화 균주, nfrAB, tsx, fhuA 동시 불활성화주는 nfrAB 단독 불활성화주 대비 당소모 속도가 개선되는 것으로 확인되었다.
실시예
5.
KCCM11166P
기반 파지 수용체 불활성화 균주 제작 및 트립토판
생산능
비교
5-1.
KCCM11166P
기반
phage
receptor
불활성화 균주 제작
실시예 1에서 제작된 7종의 불활성화 카세트를 이용하여 실시예 1과 같은 방법으로 KCCM11166P (대한민국 등록특허 10-1261147)을 기반으로 하여 파지 수용체가 불활성화된 트립토판 생산 균주 7종을 제작하였다.
5-2.
KCCM11166P
기반
phage
receptor
불활성화 균주 제작 트립토판
생산능
비교
실시예 5-1에서 제작된 KCCM11166P 기반 파지 수용체가 불활성화된 트립토판 생산 균주 7종의 생산능을 평가하기 위해 표 5의 배지를 이용하여 진행하였다. 이를 위하여 균체를 백금이로 접종한 후, LB 고체 배지에서 밤새 배양하고, 표 5에서와 같은 조성을 갖는 25ml의 플라스크 역가 배지에 한 백금이 씩 접종하였다. 균주 접종 후 37℃, 200rpm에서 48시간 동안 배양하고, 그로부터 얻어진 결과를 표 6에 나타내었다.
조성물 | 농도 (리터당) |
포도당 | 60 g |
K2HPO4 | 1 g |
(NH4)2SO4 | 10 g |
MgSO4·7H2O | 1 g |
NaCl | 1 g |
구연산나트륨 | 5 g |
효모액기스 | 2 g |
탄산칼슘 | 40 g |
페닐알라닌 | 0.15 g |
타이로신 | 0.1 g |
pH | 6.8 |
균주 | 사용당 (g/L) | OD | L-트립토판 (g/L) |
33hr | 48hr | ||
KCCM11166P | 56.8 | 14.0 | 7.2 |
KCCM11166P ΔnfrA | 59.5 | 13.5 | 7.2 |
KCCM11166P ΔnfrB | 59.5 | 13.5 | 7.2 |
KCCM11166P ΔnfrAB | 59.5 | 13.5 | 7.2 |
KCCM11166P Δtsx | 60.2 | 14.3 | 7.1 |
KCCM11166P ΔfhuA | 59.5 | 13.7 | 7.1 |
KCCM11166P ΔlamB | 57.0 | 14.0 | 7.2 |
KCCM11166P ΔbtuB | 56.2 | 13.0 | 7.1 |
표 6에서 나타내는 바와 같이 nfrA, nfrB, nfrAB, tsx, fhuA의 결실의 경우 균주의 트립토판 생산량은 유사하고 당소모 속도가 증가한 것을 확인할 수 있다. 반면 lamb, btuB의 경우에는 트립토판 생산량이나 당소모 속도의 변화가 보이지 않았다.
실시예6. 유효 변이 조합 균주 제작 및 L-트립토판 생산능 비교
6-1.
nfrAB
,
fhuA
동시 불활성화,
nfrAB
,
tsx
동시 불활성화 및
nfrAB
,
tsx
, fhuA 동시 불활성화된 L-트립토판 생산 균주 제작
당 소모능이 증가된 nfrAB, fhuA, tsx의 불활성화 특징을 조합한 경우의 당 소모능 추가 향상 여부를 트립토판 생산 균주에서 확인하기 위하여 KCCM11166PΔnfrABΔfhuA와 KCCM11166PΔnfrABΔtsx, KCCM11166PΔnfrABΔtsxΔfhuA를 제작하였다.
6-2. 유효 변이 조합 균주의 L-트립토판
생산능
비교
상기 6-1에서 제작된 3종 균주의 L-트립토판 생산능을 비교하기 위하여 표 5의 배지를 이용하여 실시예 5에 기술된 방법과 동일하게 배양을 진행하였으며, 그 결과는 다음 표7과 같다.
균주 | 사용당 (g/L) | OD | L-트립토판 (g/L) |
33hr | 48hr | ||
KCCM11166P | 56.8 | 14.0 | 7.2 |
KCCM11166P ΔnfrAB | 59.5 | 13.5 | 7.2 |
KCCM11166P ΔnfrAB Δtsx | 61.0 | 14.0 | 7.2 |
KCCM11166P ΔnfrAB ΔfhuA | 60.5 | 13.8 | 7.1 |
KCCM11166P ΔnfrAB Δtsx ΔfhuA | 62.0 | 14.0 | 7.2 |
제작된 유효 변이 조합 트립토판 생산 균주들의 역가 평가 결과, nfrAB 단독 변이에 fhuA와 tsx를 추가 불활성화시켰을 때 nfrAB 단독 변이 대비 당소모능이 증가함을 확인하였다.
이상의 설명으로부터, 본 발명이 속하는 기술분야의 당업자는 본 발명이 그 기술적 사상이나 필수적 특징을 변경하지 않고서 다른 구체적인 형태로 실시될 수 있음을 이해할 수 있다. 이와 관련하여, 본 명세서에서 기술한 실시예 및 실험예 들은 모든 면에서 예시적인 것이며 본 발명의 범위를 제한하는 것은 아닌 것으로 이해되어야 한다. 본 발명의 범위는 전술한 상세한 설명보다는 후술되는 특허청구범위의 의미 및 범위, 그리고 그 등가 개념으로부터 도출되는 모든 변경 또는 변형된 형태가 본 발명의 범위에 포함되는 것으로 해석되어야 한다.
<110> CJ CheilJedang Corporation
<120> Microorganisms producing L-amino acids and process for producing
<130> PN104120
<160> 51
<170> KopatentIn 2.0
<210> 1
<211> 70
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> primer for inactivating nfrA
<400> 1
atgaaggaga ataaccttaa tcgcgtcatc ggatggtctg gtttactgct gacgtcttta 60
ttgagtacca 70
<210> 2
<211> 71
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> primer for inactivating nfrA
<400> 2
gacgtcttta ttgagtacca gcgcactcgc agacaatatc ggcaccagcg taggtgacac 60
tatagaacgc g 71
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<211> 70
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> primer for inactivating nfrA
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gatgggtacc 70
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<211> 70
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> primer for inactivating nfrA
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<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> primer for inactivating nfrA
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<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> primer for inactivating nfrA
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<211> 70
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> primer for inactivating nfrB
<400> 7
gtggactggc ttcttgatgt ttttgctacc tggctctacg gcttaaaagt aatcgcgata 60
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<211> 70
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<213> Artificial Sequence
<220>
<223> primer for inactivating nfrB
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<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> primer for inactivating nfrB
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<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> primer for inactivating nfrB
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<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> primer for inactivating nfrB
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<213> Artificial Sequence
<220>
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<213> Artificial Sequence
<220>
<223> primer for inactivating tsx
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<213> Artificial Sequence
<220>
<223> primer for inactivating tsx
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<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> primer for inactivating tsx
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aacagtggca tacatatgaa aaaaacatta ctggcagccg gtgcggtact ggcgctctct 60
tcgtctttta 70
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<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> primer for inactivating tsx
<400> 16
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gccgttgccg 70
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<213> Artificial Sequence
<220>
<223> primer for inactivating tsx
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ttttataata ggctcctctg 20
<210> 18
<211> 18
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> primer for inactivating tsx
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<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> primer for inactivating fhuA
<400> 19
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<213> Artificial Sequence
<220>
<223> primer for inactivating fhuA
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cgcgttctat agtgtcacct cgtgtagcta agcgcttctt 40
<210> 21
<211> 40
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> primer for inactivating fhuA
<400> 21
ggtacccatc agatccacta cttcgttgtg ggctgactac 40
<210> 22
<211> 21
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> primer for inactivating fhuA
<400> 22
ttagaaacgg aaggttgcgg t 21
<210> 23
<211> 21
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> primer for inactivating fhuA
<400> 23
gccgccagct gaagctttac c 21
<210> 24
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<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> primer for inactivating fhuA
<400> 24
tagtggatct gatgggtacc 20
<210> 25
<211> 21
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> primer for inactivating fhuA
<400> 25
cttcaggaac gctcagattg c 21
<210> 26
<211> 21
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> primer for inactivating fhuA
<400> 26
cggaatgatt cgtgtattcc t 21
<210> 27
<211> 70
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> primer for inactivating lamB
<400> 27
acgaccgaag ctgccgccgt tgaaatcagc aggaacggct ttgccgaagt tagtggatct 60
gatgggtacc 70
<210> 28
<211> 71
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> primer for inactivating lamB
<400> 28
gtaatgtctg ctcaggcaat ggctgttgat ttccacggct atgcacgttc taggtgacac 60
tatagaacgc g 71
<210> 29
<211> 71
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> primer for inactivating lamB
<400> 29
ttaccaccag atttccatct gggcaccgaa ggtccactcg tcgctgtcgc cacgaccgaa 60
gctgccgccg t 71
<210> 30
<211> 71
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> primer for inactivating lamB
<400> 30
atgatgatta ctctgcgcaa acttcctctg gcggttgccg tcgcagcggg cgtaatgtct 60
gctcaggcaa t 71
<210> 31
<211> 20
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> primer for inactivating lamB
<400> 31
cctacatttg acagccgttg 20
<210> 32
<211> 20
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> primer for inactivating lamB
<400> 32
cacacaaagc ctgtcacagg 20
<210> 33
<211> 70
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> primer for inactivating btuB
<400> 33
gtggttcaga aggtgtagct gccagacaag gtgtattccc gtcctgcagt tagtggatct 60
gatgggtacc 70
<210> 34
<211> 70
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> primer for inactivating btuB
<400> 34
gcccggatac tctcgtcgtt actgctaacc gttttgaaca gccgcgcagc taggtgacac 60
tatagaacgc 70
<210> 35
<211> 70
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> primer for inactivating btuB
<400> 35
gactccggcg tcggtgggtt gtcggtctat aaacaccagc acggtgggac gtggttcaga 60
aggtgtagct 70
<210> 36
<211> 70
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> primer for inactivating btuB
<400> 36
gctgacggcg tgttccgtca cggcattttc cgcttgggca caggatacca gcccggatac 60
tctcgtcgtt 70
<210> 37
<211> 18
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> primer for inactivating btuB
<400> 37
atctggttct catcatcg 18
<210> 38
<211> 20
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> primer for inactivating btuB
<400> 38
gcataaatgt aatggagatc 20
<210> 39
<211> 2973
<212> DNA
<213> Escherichia coli str.K-12 substr.W3110
<220>
<221> gene
<222> (1)..(2973)
<223> nfrA
<400> 39
atgaaggaga ataaccttaa tcgcgtcatc ggatggtctg gtttactgct gacgtcttta 60
ttgagtacca gcgcactcgc agacaatatc ggcaccagcg cagaagagct ggggctgagc 120
gattatcgcc attttgttat ttatccccgt ctcgataaag cgctgaaggc acagaaaaat 180
aacgacgaag caaccgccat ccgcgaattt gaatatatac accagcaggt gccggataat 240
attccgctga ctttatacct tgcggaagcc tatcgccatt ttggtcatga tgaccgggcg 300
cggctgttgc ttgaggatca actgaaacgt cacccaggag atgcccgact tgagcgcagt 360
ctggcggcta ttccggttga agtgaaaagc gttacgacag ttgaagaact gcttgcccag 420
caaaaagcgt gcgatgctgc gccgaccctg cgttgtcgca gtgaagtcgg gcagaatgcc 480
ctgcggctgg cacagttacc tgtcgccaga gcgcaactga acgatgcgac gtttgctgca 540
tcgccggaag gaaaaacgct gcgaaccgat ctgctgcaac gggcaatcta cctgaaacaa 600
tggtcccagg cagatacgct atacaatgaa gcacgccagc agaacacatt aagcgcggca 660
gaacgccgtc agtggtttga cgtgcttctt gccgggcagc tggacgatcg gatcctggca 720
ctgcaatcac aggggatctt caccgatcct cagtcatata ttacttacgc gaccgcgctg 780
gcttatcgtg gcgaaaaagc acgcctccag cattatctca ttgaaaataa gccactattt 840
accacggacg cacaagagaa aagttggctc tatctgttat ctaaatacag cgctaacccc 900
gttcaggcgt tggcgaatta tacggtacag tttgccgaca accgccagta tgttgttggc 960
gcgacgctac cggtgctgtt aaaagaaggt cagtacgacg cagcgcaaaa actgctcgcc 1020
accctccccg ccaatgaaat gcttgaggag cgttatgctg tcagcgtggc gacccgtaac 1080
aaggctgaag ctctgcgtct ggcacgattg ctgtatcagc aagaaccggc aaatcttacc 1140
cgcctggatc aactaacctg gcaactgatg cagaacgagc agtcacgcga agctgccgat 1200
ttattgctgc aacgctatcc tttccagggc gatgcgcgtg tcagccagac tttaatggcg 1260
cgactggcgt ctctgctgga aagtcatcct tacctggcaa cgccggcgaa ggtggcgatt 1320
ttatcgaaac ccttaccgct ggcggagcaa cgtcagtggc aaagtcagtt gccgggtatt 1380
gcagataatt gcccggcaat agttcgcttg ctgggcgata tgtcgccttc ctacgatgcc 1440
gccgcctgga accgtctggc aaagtgttat cgggacacgc tacccggtgt ggcgttgtat 1500
gcatggcttc aggccgaaca acgacaaccg agcgcctggc aacatcgtgc ggtagcctat 1560
caggcgtatc aggttgagga ctacgccacc gcactggcgg cctggcagaa aatcagtctt 1620
cacgacatga gcaatgagga tctgcttgct gctgccaata ccgcccaggc ggcaggaaat 1680
ggtgcggctc gcgatcgctg gctacaacag gcagaaaaac gtggactggg aagcaatgcc 1740
ctctactggt ggctgcatgc gcaacgttac attcctggtc agccggaact cgcactgaac 1800
gatctcacgc gctcaatcaa tattgcgcct tctgccaacg cttacgttgc gcgggcgaca 1860
atttatcgcc aacgtcataa tgtcccggcc gcggtgagtg atttgcgcgc cgcgctggaa 1920
ctggaaccga ataatagcaa cacccaggca gcgcttggtt acgccttgtg ggatagcggt 1980
gatatcgcac agtcgcggga aatgctcgaa ccggcgcata aagggcttcc ggacgatccg 2040
gcactgatcc gacaactggc ctacgtgaac cagcgtctgg atgacatgcc tgcgacgcag 2100
cactacgccc ggctggtgat tgatgacatt gataatcagg cgctgataac cccactgacc 2160
ccagaacaaa atcaacaacg cttcaatttc cgccgtttgc atgaggaggt cggtcgccgc 2220
tggacgttca gtttcgattc ttccatcggc ttgcgttccg gcgcaatgag taccgctaac 2280
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gagtaccgca tcggacgcaa tatgctgctg gaaggcgacc tgctctcagt ttatagccgc 2400
gtctttgccg ataccggaga aaacggggtg atgatgccgg tgaaaaatcc gatgtccggc 2460
accggtctgc gctggaagcc gctgcgcgat cagatctttt tcatcgccgt cgaacagcag 2520
ttgccgctga acggccaaaa tggcgcatcc gataccatgc tgcgcgccag cgcctcattc 2580
tttaatggcg gcaaatacag cgacgaatgg cacccgaacg gttcaggctg gtttgcccaa 2640
aacctgtacc tcgatgcggc gcaatatatc cgccaggata ttcaggcgtg gacggcagat 2700
tatcgcgtca gctggcatca gaaggtagct aacggacaga ctattgagcc ttacgctcac 2760
gttcaggaca acggctatcg tgataaaggc actcagggcg cgcagcttgg cggagtcggg 2820
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ctcggcgtcg agtatcaaca tacctttaag gcgattaatc aacgtaacgg agagcgcaac 2940
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<210> 40
<211> 990
<212> PRT
<213> Escherichia coli str. K-12 substr.W3110
<400> 40
Met Lys Glu Asn Asn Leu Asn Arg Val Ile Gly Trp Ser Gly Leu Leu
1 5 10 15
Leu Thr Ser Leu Leu Ser Thr Ser Ala Leu Ala Asp Asn Ile Gly Thr
20 25 30
Ser Ala Glu Glu Leu Gly Leu Ser Asp Tyr Arg His Phe Val Ile Tyr
35 40 45
Pro Arg Leu Asp Lys Ala Leu Lys Ala Gln Lys Asn Asn Asp Glu Ala
50 55 60
Thr Ala Ile Arg Glu Phe Glu Tyr Ile His Gln Gln Val Pro Asp Asn
65 70 75 80
Ile Pro Leu Thr Leu Tyr Leu Ala Glu Ala Tyr Arg His Phe Gly His
85 90 95
Asp Asp Arg Ala Arg Leu Leu Leu Glu Asp Gln Leu Lys Arg His Pro
100 105 110
Gly Asp Ala Arg Leu Glu Arg Ser Leu Ala Ala Ile Pro Val Glu Val
115 120 125
Lys Ser Val Thr Thr Val Glu Glu Leu Leu Ala Gln Gln Lys Ala Cys
130 135 140
Asp Ala Ala Pro Thr Leu Arg Cys Arg Ser Glu Val Gly Gln Asn Ala
145 150 155 160
Leu Arg Leu Ala Gln Leu Pro Val Ala Arg Ala Gln Leu Asn Asp Ala
165 170 175
Thr Phe Ala Ala Ser Pro Glu Gly Lys Thr Leu Arg Thr Asp Leu Leu
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Gln Arg Ala Ile Tyr Leu Lys Gln Trp Ser Gln Ala Asp Thr Leu Tyr
195 200 205
Asn Glu Ala Arg Gln Gln Asn Thr Leu Ser Ala Ala Glu Arg Arg Gln
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Trp Phe Asp Val Leu Leu Ala Gly Gln Leu Asp Asp Arg Ile Leu Ala
225 230 235 240
Leu Gln Ser Gln Gly Ile Phe Thr Asp Pro Gln Ser Tyr Ile Thr Tyr
245 250 255
Ala Thr Ala Leu Ala Tyr Arg Gly Glu Lys Ala Arg Leu Gln His Tyr
260 265 270
Leu Ile Glu Asn Lys Pro Leu Phe Thr Thr Asp Ala Gln Glu Lys Ser
275 280 285
Trp Leu Tyr Leu Leu Ser Lys Tyr Ser Ala Asn Pro Val Gln Ala Leu
290 295 300
Ala Asn Tyr Thr Val Gln Phe Ala Asp Asn Arg Gln Tyr Val Val Gly
305 310 315 320
Ala Thr Leu Pro Val Leu Leu Lys Glu Gly Gln Tyr Asp Ala Ala Gln
325 330 335
Lys Leu Leu Ala Thr Leu Pro Ala Asn Glu Met Leu Glu Glu Arg Tyr
340 345 350
Ala Val Ser Val Ala Thr Arg Asn Lys Ala Glu Ala Leu Arg Leu Ala
355 360 365
Arg Leu Leu Tyr Gln Gln Glu Pro Ala Asn Leu Thr Arg Leu Asp Gln
370 375 380
Leu Thr Trp Gln Leu Met Gln Asn Glu Gln Ser Arg Glu Ala Ala Asp
385 390 395 400
Leu Leu Leu Gln Arg Tyr Pro Phe Gln Gly Asp Ala Arg Val Ser Gln
405 410 415
Thr Leu Met Ala Arg Leu Ala Ser Leu Leu Glu Ser His Pro Tyr Leu
420 425 430
Ala Thr Pro Ala Lys Val Ala Ile Leu Ser Lys Pro Leu Pro Leu Ala
435 440 445
Glu Gln Arg Gln Trp Gln Ser Gln Leu Pro Gly Ile Ala Asp Asn Cys
450 455 460
Pro Ala Ile Val Arg Leu Leu Gly Asp Met Ser Pro Ser Tyr Asp Ala
465 470 475 480
Ala Ala Trp Asn Arg Leu Ala Lys Cys Tyr Arg Asp Thr Leu Pro Gly
485 490 495
Val Ala Leu Tyr Ala Trp Leu Gln Ala Glu Gln Arg Gln Pro Ser Ala
500 505 510
Trp Gln His Arg Ala Val Ala Tyr Gln Ala Tyr Gln Val Glu Asp Tyr
515 520 525
Ala Thr Ala Leu Ala Ala Trp Gln Lys Ile Ser Leu His Asp Met Ser
530 535 540
Asn Glu Asp Leu Leu Ala Ala Ala Asn Thr Ala Gln Ala Ala Gly Asn
545 550 555 560
Gly Ala Ala Arg Asp Arg Trp Leu Gln Gln Ala Glu Lys Arg Gly Leu
565 570 575
Gly Ser Asn Ala Leu Tyr Trp Trp Leu His Ala Gln Arg Tyr Ile Pro
580 585 590
Gly Gln Pro Glu Leu Ala Leu Asn Asp Leu Thr Arg Ser Ile Asn Ile
595 600 605
Ala Pro Ser Ala Asn Ala Tyr Val Ala Arg Ala Thr Ile Tyr Arg Gln
610 615 620
Arg His Asn Val Pro Ala Ala Val Ser Asp Leu Arg Ala Ala Leu Glu
625 630 635 640
Leu Glu Pro Asn Asn Ser Asn Thr Gln Ala Ala Leu Gly Tyr Ala Leu
645 650 655
Trp Asp Ser Gly Asp Ile Ala Gln Ser Arg Glu Met Leu Glu Pro Ala
660 665 670
His Lys Gly Leu Pro Asp Asp Pro Ala Leu Ile Arg Gln Leu Ala Tyr
675 680 685
Val Asn Gln Arg Leu Asp Asp Met Pro Ala Thr Gln His Tyr Ala Arg
690 695 700
Leu Val Ile Asp Asp Ile Asp Asn Gln Ala Leu Ile Thr Pro Leu Thr
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Pro Glu Gln Asn Gln Gln Arg Phe Asn Phe Arg Arg Leu His Glu Glu
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Val Gly Arg Arg Trp Thr Phe Ser Phe Asp Ser Ser Ile Gly Leu Arg
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Ser Gly Ala Met Ser Thr Ala Asn Asn Asn Val Gly Gly Ala Ala Pro
755 760 765
Gly Lys Ser Tyr Arg Ser Tyr Gly Gln Leu Glu Ala Glu Tyr Arg Ile
770 775 780
Gly Arg Asn Met Leu Leu Glu Gly Asp Leu Leu Ser Val Tyr Ser Arg
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Val Phe Ala Asp Thr Gly Glu Asn Gly Val Met Met Pro Val Lys Asn
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Phe Phe Ile Ala Val Glu Gln Gln Leu Pro Leu Asn Gly Gln Asn Gly
835 840 845
Ala Ser Asp Thr Met Leu Arg Ala Ser Ala Ser Phe Phe Asn Gly Gly
850 855 860
Lys Tyr Ser Asp Glu Trp His Pro Asn Gly Ser Gly Trp Phe Ala Gln
865 870 875 880
Asn Leu Tyr Leu Asp Ala Ala Gln Tyr Ile Arg Gln Asp Ile Gln Ala
885 890 895
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Gly Glu Arg Asn Asn Ala Phe Leu Thr Ile Gly Val His Trp
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<210> 41
<211> 2238
<212> DNA
<213> Escherichia coli str.K-12 substr.W3110
<220>
<221> gene
<222> (1)..(2238)
<223> nfrB
<400> 41
gtggactggc ttcttgatgt ttttgctacc tggctctacg gcttaaaagt aatcgcgata 60
acgttagcgg tcatcatgtt catcagcggg ctggacgatt tttttattga tgtcgtctac 120
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acccataaat ggacctccag cctgacgctg aactactttc tctggcgcga ccgcaaaggg 1080
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actggcgata cccgctcgtt gcgcccgtta ggtcaaattc tgctggaaaa tcaggtcatc 1500
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tcaatgctga tgcaggggct gattagcgcc gagcagctgg cacaggcgct ggcagagcaa 1620
aacggcgtgg cgtgggaatc catcgatgcc tggcagatcc cttcctcgct gattgccgaa 1680
atgccggcct ccgtggcgct gcattatgcg gtactgccgc tgcgtctgga aaatgacgag 1740
ttaattgtcg gcagtgaaga tggtattgac ccggtttcgc tggcggccct gacgcgtaaa 1800
gtcggacgca aagtgcgtta cgtcattgtt ctgcggggac aaattgtcac agggttacgt 1860
cactggtatg cacgccgacg cggtcacgat ccgcgggcaa tgttgtacaa tgcggttcag 1920
catcagtggc tcacggaaca gcaggccggt gaaatctggc ggcaatatgt gccgcatcag 1980
ttcctgttcg ccgaaatact gaccacgctc ggtcatatta atcgttcagc aattaacgtg 2040
ttgttattgc gccatgaacg cagttctctg ccgctcggca agtttttggt caccgaaggc 2100
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atgcaatcac tattactcaa agcaggttta aacacagaac aggttgcgca actggagtcc 2220
gaaaatgaag gagaataa 2238
<210> 42
<211> 745
<212> PRT
<213> Escherichia coli str.K-12 substr.W3110
<400> 42
Met Asp Trp Leu Leu Asp Val Phe Ala Thr Trp Leu Tyr Gly Leu Lys
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Val Ile Ala Ile Thr Leu Ala Val Ile Met Phe Ile Ser Gly Leu Asp
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Asp Phe Phe Ile Asp Val Val Tyr Trp Val Arg Arg Ile Lys Arg Lys
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Thr Gly Val Ile Gly Asn Met Ala Glu Leu Ala Ala Thr Thr Leu Asp
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Tyr Glu Asn Tyr His Ile Phe Val Gly Thr Tyr Pro Asn Asp Pro Asp
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Thr Gln Arg Asp Val Asp Glu Val Cys Ala Arg Phe Pro Asn Val His
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Lys Val Val Cys Ala Arg Pro Gly Pro Thr Ser Lys Ala Asp Cys Leu
130 135 140
Asn Asn Val Leu Asp Ala Ile Thr Gln Phe Glu Arg Ser Ala Asn Phe
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Ala Phe Ala Gly Phe Ile Leu His Asp Ala Glu Asp Val Ile Ser Pro
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Met Glu Leu Arg Leu Phe Asn Tyr Leu Val Glu Arg Lys Asp Leu Ile
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Gln Ile Pro Val Tyr Pro Phe Glu Arg Glu Trp Thr His Phe Thr Ser
195 200 205
Met Thr Tyr Ile Asp Glu Phe Ser Glu Leu His Gly Lys Asp Val Pro
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Val Arg Glu Ala Leu Ala Gly Gln Val Pro Ser Ala Gly Val Gly Thr
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Cys Phe Ser Arg Arg Ala Val Thr Ala Leu Leu Ala Asp Gly Asp Gly
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Ile Ala Phe Asp Val Gln Ser Leu Thr Glu Asp Tyr Asp Ile Gly Phe
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Arg Leu Lys Glu Lys Gly Met Thr Glu Ile Phe Val Arg Phe Pro Val
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Val Asp Glu Ala Lys Glu Arg Glu Gln Arg Lys Phe Leu Gln His Ala
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Arg Thr Ser Asn Met Ile Cys Val Arg Glu Tyr Phe Pro Asp Thr Phe
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Ser Thr Ala Val Arg Gln Lys Ser Arg Trp Ile Ile Gly Ile Val Phe
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Gln Gly Phe Lys Thr His Lys Trp Thr Ser Ser Leu Thr Leu Asn Tyr
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Phe Leu Trp Arg Asp Arg Lys Gly Ala Ile Ser Asn Phe Val Ser Phe
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Leu Ala Met Leu Val Met Ile Gln Leu Leu Leu Leu Leu Ala Tyr Glu
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Ser Leu Trp Pro Asp Ala Trp His Phe Leu Ser Ile Phe Ser Gly Ser
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Ala Trp Leu Met Thr Leu Leu Trp Leu Asn Phe Gly Leu Met Val Asn
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Ser Ala Glu Gln Leu Ala Gln Ala Leu Ala Glu Gln Asn Gly Val Ala
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580 585 590
Ser Leu Ala Ala Leu Thr Arg Lys Val Gly Arg Lys Val Arg Tyr Val
595 600 605
Ile Val Leu Arg Gly Gln Ile Val Thr Gly Leu Arg His Trp Tyr Ala
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Arg Arg Arg Gly His Asp Pro Arg Ala Met Leu Tyr Asn Ala Val Gln
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Ile Asn Arg Ser Ala Ile Asn Val Leu Leu Leu Arg His Glu Arg Ser
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690 695 700
Glu Thr Leu Asp Arg Val Leu Thr Ile Gln Arg Glu Leu Gln Val Ser
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Met Gln Ser Leu Leu Leu Lys Ala Gly Leu Asn Thr Glu Gln Val Ala
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<213> Escherichia coli str.K-12 substr.W3110
<220>
<221> gene
<222> (1)..(6088)
<223> nfrAB
<400> 43
gtggactggc ttcttgatgt ttttgctacc tggctctacg gcttaaaagt aatcgcgata 60
acgttagcgg tcatcatgtt catcagcggg ctggacgatt tttttattga tgtcgtctac 120
tgggtacgcc gcattaaacg caagttgagt gtttatcgcc gctacccgcg aatgagttac 180
cgcgaactgt ataaaccaga tgaaaaaccg ttagcgatta tggttccggc gtggaatgaa 240
acgggcgtca tcggcaatat ggccgagctg gcggcgacca cgctcgacta cgaaaactat 300
catatctttg ttggcaccta ccccaacgac cccgatactc agcgtgatgt tgacgaagtg 360
tgcgctcgct tcccgaatgt gcataaggta gtctgcgcgc gtcctggccc caccagcaaa 420
gccgactgtc tgaacaacgt gctggacgcc atcacccaat ttgagcgtag cgccaatttc 480
gcttttgctg gttttattct gcatgacgcc gaagatgtga tttcaccgat ggaattgcgt 540
ctgttcaact atctggtcga gcgtaaagat ctgattcaga tcccggtgta tccgttcgaa 600
cgcgaatgga cgcacttcac cagcatgact tacattgatg agttttcaga gctgcatggc 660
aaagatgttc cggtgcgtga agccctcgcc ggacaagtgc ccagcgcagg cgtcggcacc 720
tgtttcagcc gccgcgccgt gaccgcactg ttagctgacg gtgacggtat tgctttcgac 780
gtgcagagtc ttactgaaga ttacgacatt ggcttccgcc tgaaagaaaa aggtatgacg 840
gaaatttttg tccgttttcc ggtggtggac gaagccaaag aacgcgagca gcgtaaattt 900
ttacagcacg cgcggacatc aaacatgatc tgcgtgcgcg aatatttccc cgataccttt 960
tcgactgcgg ttcgacaaaa atcccgctgg atcatcggca ttgttttcca aggctttaaa 1020
acccataaat ggacctccag cctgacgctg aactactttc tctggcgcga ccgcaaaggg 1080
gcaatcagta actttgtcag cttcctcgcg atgctggtga tgatccagct tttgctgttg 1140
ctggcgtatg aaagtttgtg gcccgatgcc tggcatttcc tttctatttt cagcggcagc 1200
gcatggttaa tgaccctgct gtggctaaac tttggtttga tggttaaccg catcgtgcag 1260
cgggtgattt tcgttactgg ctactacggc ctgacgcagg ggctgctttc cgtcctgcgt 1320
cttttctggg gcaacctgat taacttcatg gccaactggc gcgcgctaaa acaggtactt 1380
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actggcgata cccgctcgtt gcgcccgtta ggtcaaattc tgctggaaaa tcaggtcatc 1500
actgaagaac aactcgatac agcactgcgt aatcgcgtcg aaggtctacg cctgggcggt 1560
tcaatgctga tgcaggggct gattagcgcc gagcagctgg cacaggcgct ggcagagcaa 1620
aacggcgtgg cgtgggaatc catcgatgcc tggcagatcc cttcctcgct gattgccgaa 1680
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ttaattgtcg gcagtgaaga tggtattgac ccggtttcgc tggcggccct gacgcgtaaa 1800
gtcggacgca aagtgcgtta cgtcattgtt ctgcggggac aaattgtcac agggttacgt 1860
cactggtatg cacgccgacg cggtcacgat ccgcgggcaa tgttgtacaa tgcggttcag 1920
catcagtggc tcacggaaca gcaggccggt gaaatctggc ggcaatatgt gccgcatcag 1980
ttcctgttcg ccgaaatact gaccacgctc ggtcatatta atcgttcagc aattaacgtg 2040
ttgttattgc gccatgaacg cagttctctg ccgctcggca agtttttggt caccgaaggc 2100
gttatcagcc aggaaacgtt ggatcgcgtc ctgacaattc aacgcgaatt acaagtttcg 2160
atgcaatcac tattactcaa agcaggttta aacacagaac aggttgcgca actggagtcc 2220
gaaaatgaag gagaataacc ttaatcgcgt catcggatgg tctggtttac tgctgacgtc 2280
tttattgagt accagcgcac tcgcagacaa tatcggcacc agcgcagaag agctggggct 2340
gagcgattat cgccattttg ttatttatcc ccgtctcgat aaagcgctga aggcacagaa 2400
aaataacgac gaagcaaccg ccatccgcga atttgaatat atacaccagc aggtgccgga 2460
taatattccg ctgactttat accttgcgga agcctatcgc cattttggtc atgatgaccg 2520
ggcgcggctg ttgcttgagg atcaactgaa acgtcaccca ggagatgccc gacttgagcg 2580
cagtctggcg gctattccgg ttgaagtgaa aagcgttacg acagttgaag aactgcttgc 2640
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tgcatcgccg gaaggaaaaa cgctgcgaac cgatctgctg caacgggcaa tctacctgaa 2820
acaatggtcc caggcagata cgctatacaa tgaagcacgc cagcagaaca cattaagcgc 2880
ggcagaacgc cgtcagtggt ttgacgtgct tcttgccggg cagctggacg atcggatcct 2940
ggcactgcaa tcacagggga tcttcaccga tcctcagtca tatattactt acgcgaccgc 3000
gctggcttat cgtggcgaaa aagcacgcct ccagcattat ctcattgaaa ataagccact 3060
atttaccacg gacgcacaag agaaaagttg gctctatctg ttatctaaat acagcgctaa 3120
ccccgttcag gcgttggcga attatacggt acagtttgcc gacaaccgcc agtatgttgt 3180
tggcgcgacg ctaccggtgc tgttaaaaga aggtcagtac gacgcagcgc aaaaactgct 3240
cgccaccctc cccgccaatg aaatgcttga ggagcgttat gctgtcagcg tggcgacccg 3300
taacaaggct gaagctctgc gtctggcacg attgctgtat cagcaagaac cggcaaatct 3360
tacccgcctg gatcaactaa cctggcaact gatgcagaac gagcagtcac gcgaagctgc 3420
cgatttattg ctgcaacgct atcctttcca gggcgatgcg cgtgtcagcc agactttaat 3480
ggcgcgactg gcgtctctgc tggaaagtca tccttacctg gcaacgccgg cgaaggtggc 3540
gattttatcg aaacccttac cgctggcgga gcaacgtcag tggcaaagtc agttgccggg 3600
tattgcagat aattgcccgg caatagttcg cttgctgggc gatatgtcgc cttcctacga 3660
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aaatggtgcg gctcgcgatc gctggctaca acaggcagaa aaacgtggac tgggaagcaa 3960
tgccctctac tggtggctgc atgcgcaacg ttacattcct ggtcagccgg aactcgcact 4020
gaacgatctc acgcgctcaa tcaatattgc gccttctgcc aacgcttacg ttgcgcgggc 4080
gacaatttat cgccaacgtc ataatgtccc ggccgcggtg agtgatttgc gcgccgcgct 4140
ggaactggaa ccgaataata gcaacaccca ggcagcgctt ggttacgcct tgtgggatag 4200
cggtgatatc gcacagtcgc gggaaatgct cgaaccggcg cataaagggc ttccggacga 4260
tccggcactg atccgacaac tggcctacgt gaaccagcgt ctggatgaca tgcctgcgac 4320
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attctttaat ggcggcaaat acagcgacga atggcacccg aacggttcag gctggtttgc 4860
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cgtcgcgcac ggcattctcg agtattaa 6088
<210> 44
<211> 885
<212> DNA
<213> Escherichia coli str.K-12 substr.W3110
<220>
<221> gene
<222> (1)..(885)
<223> tsx
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atgaaaaaaa cattactggc agccggtgcg gtactggcgc tctcttcgtc ttttactgtc 60
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tacgaagcat tcgctaaaaa agactggttc gacttctatg gttatgcgga tgcgccggta 240
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ttcaaagagt ggtacttcgc gaacaactac atttacgaca tgggtcgtaa taaagatggt 420
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<212> PRT
<213> Escherichia coli str.K-12 substr.W3110
<400> 45
Met Lys Lys Thr Leu Leu Ala Ala Gly Ala Val Leu Ala Leu Ser Ser
1 5 10 15
Ser Phe Thr Val Asn Ala Ala Glu Asn Asp Lys Pro Gln Tyr Leu Ser
20 25 30
Asp Trp Trp His Gln Ser Val Asn Val Val Gly Ser Tyr His Thr Arg
35 40 45
Phe Gly Pro Gln Ile Arg Asn Asp Thr Tyr Leu Glu Tyr Glu Ala Phe
50 55 60
Ala Lys Lys Asp Trp Phe Asp Phe Tyr Gly Tyr Ala Asp Ala Pro Val
65 70 75 80
Phe Phe Gly Gly Asn Ser Asp Ala Lys Gly Ile Trp Asn His Gly Ser
85 90 95
Pro Leu Phe Met Glu Ile Glu Pro Arg Phe Ser Ile Asp Lys Leu Thr
100 105 110
Asn Thr Asp Leu Ser Phe Gly Pro Phe Lys Glu Trp Tyr Phe Ala Asn
115 120 125
Asn Tyr Ile Tyr Asp Met Gly Arg Asn Lys Asp Gly Arg Gln Ser Thr
130 135 140
Trp Tyr Met Gly Leu Gly Thr Asp Ile Asp Thr Gly Leu Pro Met Ser
145 150 155 160
Leu Ser Met Asn Val Tyr Ala Lys Tyr Gln Trp Gln Asn Tyr Gly Ala
165 170 175
Ala Asn Glu Asn Glu Trp Asp Gly Tyr Arg Phe Lys Ile Lys Tyr Phe
180 185 190
Val Pro Ile Thr Asp Leu Trp Gly Gly Gln Leu Ser Tyr Ile Gly Phe
195 200 205
Thr Asn Phe Asp Trp Gly Ser Asp Leu Gly Asp Asp Ser Gly Asn Ala
210 215 220
Ile Asn Gly Ile Lys Thr Arg Thr Asn Asn Ser Ile Ala Ser Ser His
225 230 235 240
Ile Leu Ala Leu Asn Tyr Asp His Trp His Tyr Ser Val Val Ala Arg
245 250 255
Tyr Trp His Asp Gly Gly Gln Trp Asn Asp Asp Ala Glu Leu Asn Phe
260 265 270
Gly Asn Gly Asn Phe Asn Val Arg Ser Thr Gly Trp Gly Gly Tyr Leu
275 280 285
Val Val Gly Tyr Asn Phe
290
<210> 46
<211> 2244
<212> DNA
<213> Escherichia coli str.K-12 substr.W3110
<220>
<221> gene
<222> (1)..(2244)
<223> fhuA
<400> 46
atggcgcgtt ccaaaactgc tcagccaaaa cactcactgc gtaaaatcgc agttgtagta 60
gccacagcgg ttagcggcat gtctgtttat gcacaggcag cggttgaacc gaaagaagac 120
actatcaccg ttaccgctgc acctgcgccg caagaaagcg catgggggcc tgctgcaact 180
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cgcgctgaaa ttatgcgtgg cccggtttcc gtgctttacg gtaaaagcag tcctggcggc 540
ctgttgaata tggtcagcaa gcgtccgacc accgaaccgc tgaaagaagt tcagtttaaa 600
gccggtactg acagcctgtt ccagactggt tttgacttta gcgattcgtt ggatgatgac 660
ggtgtttact cttatcgcct gaccggtctt gcgcgttctg ccaatgccca gcagaaaggg 720
tcagaagagc agcgttatgc tattgcaccg gcgttcacct ggcgtccgga tgataaaacc 780
aattttacct tcctttctta cttccagaac gagccggaaa ccggttatta cggctggttg 840
ccgaaagagg gaaccgttga gccgctgccg aacggtaagc gtctgccgac agactttaat 900
gaaggggcga agaacaacac ctattctcgt aatgagaaga tggtcggcta cagcttcgat 960
cacgaattta acgacacctt tactgtgcgt cagaacctgc gctttgctga aaacaaaacc 1020
tcgcaaaaca gcgtttatgg ttacggcgtc tgctccgatc cggcgaatgc ttacagcaaa 1080
cagtgtgcgg cattagcgcc agcggataaa ggccattatc tggcacgtaa atacgtcgtt 1140
gatgatgaga agctgcaaaa cttctccgtt gatacccagt tgcagagcaa gtttgccact 1200
ggcgatatcg accacaccct gctgaccggt gtcgacttta tgcgtatgcg taatgacatc 1260
aacgcctggt ttggttacga cgactctgtg ccactgctca atctgtacaa tccggtgaat 1320
accgatttcg acttcaatgc caaagatccg gcaaactccg gcccttaccg cattctgaat 1380
aaacagaaac aaacgggcgt ttatgttcag gatcaggcgc agtgggataa agtgctggtc 1440
accctaggcg gtcgttatga ctgggcagat caagaatctc ttaaccgcgt tgccgggacg 1500
accgataaac gtgatgacaa acagtttacc tggcgtggtg gtgttaacta cctgtttgat 1560
aatggtgtaa caccttactt cagctatagc gaatcgtttg aaccttcttc gcaagttggg 1620
aaggatggta atattttcgc accgtctaaa ggtaagcagt atgaagtcgg cgtgaaatat 1680
gtaccggaag atcgtccgat tgtagttact ggtgccgtgt ataatctcac taaaaccaac 1740
aacctgatgg cggaccctga gggttccttc ttctcggttg aaggtggcga gatccgcgca 1800
cgtggcgtag aaatcgaagc gaaagcggcg ctgtcggcga gtgttaacgt agtcggttct 1860
tatacttaca ccgatgcgga atacaccacc gatactacct ataaaggcaa tacgcctgca 1920
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tcaggtctga cgctgggcac cggtggtcgt tatactggct ccagttatgg tgatccggct 2040
aactccttta aagtgggaag ttatacggtc gtggatgcgt tagtacgtta tgatctggcg 2100
cgagtcggca tggctggctc caacgtggcg ctgcatgtta acaacctgtt cgatcgtgaa 2160
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<400> 47
Met Ala Arg Ser Lys Thr Ala Gln Pro Lys His Ser Leu Arg Lys Ile
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Ala Val Val Val Ala Thr Ala Val Ser Gly Met Ser Val Tyr Ala Gln
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Ala Ala Val Glu Pro Lys Glu Asp Thr Ile Thr Val Thr Ala Ala Pro
35 40 45
Ala Pro Gln Glu Ser Ala Trp Gly Pro Ala Ala Thr Ile Ala Ala Arg
50 55 60
Gln Ser Ala Thr Gly Thr Lys Thr Asp Thr Pro Ile Gln Lys Val Pro
65 70 75 80
Gln Ser Ile Ser Val Val Thr Ala Glu Glu Met Ala Leu His Gln Pro
85 90 95
Lys Ser Val Lys Glu Ala Leu Ser Tyr Thr Pro Gly Val Ser Val Gly
100 105 110
Thr Arg Gly Ala Ser Asn Thr Tyr Asp His Leu Ile Ile Arg Gly Phe
115 120 125
Ala Ala Glu Gly Gln Ser Gln Asn Asn Tyr Leu Asn Gly Leu Lys Leu
130 135 140
Gln Gly Asn Phe Tyr Asn Asp Ala Val Ile Asp Pro Tyr Met Leu Glu
145 150 155 160
Arg Ala Glu Ile Met Arg Gly Pro Val Ser Val Leu Tyr Gly Lys Ser
165 170 175
Ser Pro Gly Gly Leu Leu Asn Met Val Ser Lys Arg Pro Thr Thr Glu
180 185 190
Pro Leu Lys Glu Val Gln Phe Lys Ala Gly Thr Asp Ser Leu Phe Gln
195 200 205
Thr Gly Phe Asp Phe Ser Asp Ser Leu Asp Asp Asp Gly Val Tyr Ser
210 215 220
Tyr Arg Leu Thr Gly Leu Ala Arg Ser Ala Asn Ala Gln Gln Lys Gly
225 230 235 240
Ser Glu Glu Gln Arg Tyr Ala Ile Ala Pro Ala Phe Thr Trp Arg Pro
245 250 255
Asp Asp Lys Thr Asn Phe Thr Phe Leu Ser Tyr Phe Gln Asn Glu Pro
260 265 270
Glu Thr Gly Tyr Tyr Gly Trp Leu Pro Lys Glu Gly Thr Val Glu Pro
275 280 285
Leu Pro Asn Gly Lys Arg Leu Pro Thr Asp Phe Asn Glu Gly Ala Lys
290 295 300
Asn Asn Thr Tyr Ser Arg Asn Glu Lys Met Val Gly Tyr Ser Phe Asp
305 310 315 320
His Glu Phe Asn Asp Thr Phe Thr Val Arg Gln Asn Leu Arg Phe Ala
325 330 335
Glu Asn Lys Thr Ser Gln Asn Ser Val Tyr Gly Tyr Gly Val Cys Ser
340 345 350
Asp Pro Ala Asn Ala Tyr Ser Lys Gln Cys Ala Ala Leu Ala Pro Ala
355 360 365
Asp Lys Gly His Tyr Leu Ala Arg Lys Tyr Val Val Asp Asp Glu Lys
370 375 380
Leu Gln Asn Phe Ser Val Asp Thr Gln Leu Gln Ser Lys Phe Ala Thr
385 390 395 400
Gly Asp Ile Asp His Thr Leu Leu Thr Gly Val Asp Phe Met Arg Met
405 410 415
Arg Asn Asp Ile Asn Ala Trp Phe Gly Tyr Asp Asp Ser Val Pro Leu
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Leu Asn Leu Tyr Asn Pro Val Asn Thr Asp Phe Asp Phe Asn Ala Lys
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Asp Pro Ala Asn Ser Gly Pro Tyr Arg Ile Leu Asn Lys Gln Lys Gln
450 455 460
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465 470 475 480
Thr Leu Gly Gly Arg Tyr Asp Trp Ala Asp Gln Glu Ser Leu Asn Arg
485 490 495
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500 505 510
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Tyr Ser Glu Ser Phe Glu Pro Ser Ser Gln Val Gly Lys Asp Gly Asn
530 535 540
Ile Phe Ala Pro Ser Lys Gly Lys Gln Tyr Glu Val Gly Val Lys Tyr
545 550 555 560
Val Pro Glu Asp Arg Pro Ile Val Val Thr Gly Ala Val Tyr Asn Leu
565 570 575
Thr Lys Thr Asn Asn Leu Met Ala Asp Pro Glu Gly Ser Phe Phe Ser
580 585 590
Val Glu Gly Gly Glu Ile Arg Ala Arg Gly Val Glu Ile Glu Ala Lys
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Ala Ala Leu Ser Ala Ser Val Asn Val Val Gly Ser Tyr Thr Tyr Thr
610 615 620
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Gln Val Pro Lys His Met Ala Ser Leu Trp Ala Asp Tyr Thr Phe Phe
645 650 655
Asp Gly Pro Leu Ser Gly Leu Thr Leu Gly Thr Gly Gly Arg Tyr Thr
660 665 670
Gly Ser Ser Tyr Gly Asp Pro Ala Asn Ser Phe Lys Val Gly Ser Tyr
675 680 685
Thr Val Val Asp Ala Leu Val Arg Tyr Asp Leu Ala Arg Val Gly Met
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Ala Gly Ser Asn Val Ala Leu His Val Asn Asn Leu Phe Asp Arg Glu
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Arg Gln Val Val Ala Thr Ala Thr Phe Arg Phe
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<212> DNA
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aacgaatgtg aaacttatgc tgaattaaaa ttgggtcagg aagtgtggaa agagggcgat 240
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gctaccgatc cggccttccg tgaagcaaac gtgcagggta aaaacctgat cgaatggctg 360
ccaggctcca ccatctgggc aggtaagcgc ttctaccaac gtcatgacgt tcatatgatc 420
gacttctact actgggatat ttctggtcct ggtgccggtc tggaaaacat cgatgttggc 480
ttcggtaaac tctctctggc agcaacccgc tcctctgaag ctggtggttc ttcctctttc 540
gccagcaaca atatttatga ctataccaac gaaaccgcga acgacgtttt cgatgtgcgt 600
ttagcgcaga tggaaatcaa cccgggcggc acattagaac tgggtgtcga ctacggtcgt 660
gccaacttgc gtgataacta tcgtctggtt gatggcgcat cgaaagacgg ctggttattc 720
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actgactcga tgacctcgca gggtaaaggg ctgtcgcagg gttctggcgt tgcatttgat 840
aacgaaaaat ttgcctacaa tatcaacaac aacggtcaca tgctgcgtat cctcgaccac 900
ggtgcgatct ccatgggcga caactgggac atgatgtacg tgggtatgta ccaggatatc 960
aactgggata acgacaacgg caccaagtgg tggaccgtcg gtattcgccc gatgtacaag 1020
tggacgccaa tcatgagcac cgtgatggaa atcggctacg acaacgtcga atcccagcgc 1080
accggcgaca agaacaatca gtacaaaatt accctcgcac aacaatggca ggctggcgac 1140
agcatctggt cacgcccggc tattcgtgtc ttcgcaacct acgccaagtg ggatgagaaa 1200
tggggttacg actacaccgg taacgctgat aacaacgcga acttcggcaa agccgttcct 1260
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Arg Ser Gly Ile Gly Trp Thr Gly Ser Gly Gly Glu Gln Gln Cys Phe
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65 70 75 80
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100 105 110
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115 120 125
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Asn Asn Asn Gly His Met Leu Arg Ile Leu Asp His Gly Ala Ile Ser
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20 25 30
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35 40 45
Val Thr Arg Gln Asp Ile Asp Arg Trp Gln Ser Thr Ser Val Asn Asp
50 55 60
Val Leu Arg Arg Leu Pro Gly Val Asp Ile Thr Gln Asn Gly Gly Ser
65 70 75 80
Gly Gln Leu Ser Ser Ile Phe Ile Arg Gly Thr Asn Ala Ser His Val
85 90 95
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100 105 110
Ser Ala Asp Leu Ser Gln Phe Pro Ile Ala Leu Val Gln Arg Val Glu
115 120 125
Tyr Ile Arg Gly Pro Arg Ser Ala Val Tyr Gly Ser Asp Ala Ile Gly
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Gly Val Val Asn Ile Ile Thr Thr Arg Asp Glu Pro Gly Thr Glu Ile
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Ser Ala Gly Trp Gly Ser Asn Ser Tyr Gln Asn Tyr Asp Val Ser Thr
165 170 175
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245 250 255
Ser Pro Leu Leu Asp Thr Arg Lys Leu Tyr Ser Gln Ser Trp Asp Ala
260 265 270
Gly Leu Arg Tyr Asn Gly Glu Leu Ile Lys Ser Gln Leu Ile Thr Ser
275 280 285
Tyr Ser His Ser Lys Asp Tyr Asn Tyr Asp Pro His Tyr Gly Arg Tyr
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595 600 605
Ser Gly Ser Tyr Thr Phe
610
Claims (8)
- L-아미노산 생산능을 갖는 미생물에서 NfrA, NfrB, 또는 NfrA 및 NfrB의 활성이 불활성화되어 L-아미노산 생산성이 향상된, L-아미노산을 생산하는 에세리키아(Escherichia) 속 재조합 미생물.
- 청구항 1에 있어서, 상기 NfrA는 서열번호 40의 아미노산 서열을 포함하고, 상기 NfrB는 서열번호 42의 아미노산 서열을 포함하는 것인 L-아미노산을 생산하는 에세리키아 속 재조합 미생물.
- 청구항 1에 있어서, 상기 미생물은 Tsx, FhuA, 또는 Tsx 및 FhuA의 활성이 추가로 불활성화된 L-아미노산을 생산하는 에세리키아 속 재조합 미생물.
- 청구항 3에 있어서, 상기 Tsx는 서열번호 45의 아미노산 서열을 포함하고, 상기 FhuA는 서열번호 47의 아미노산 서열을 포함하는 L-아미노산을 생산하는 에세리키아 속 재조합 미생물.
- 청구항 1에 있어서, 상기 L-아미노산은 L-쓰레오닌 또는 L-트립토판인 것인 L-아미노산을 생산하는 에세리키아 속 재조합 미생물.
- 청구항 1에 있어서, 상기 미생물은 대장균(Escherichia coli)인 것인 L-아미노산을 생산하는 에세리키아 속 재조합 미생물.
- 청구항 1 내지 6 중 어느 한 항의 재조합 미생물을 배양하는 단계; 및
배양물로부터 L-아미노산을 회수하는 단계를 포함하는, L-아미노산을 생산하는 방법. - 청구항 7에 있어서, 상기 L-아미노산은 L-쓰레오닌 또는 L-트립토판인 것인 L-아미노산을 생산하는 방법.
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JOURNAL OF BACTERIOLOGY, vol.191(2), pp.525-532(2009)* |
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