JPWO2019175260A5 - - Google Patents
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Description
治療方法
アルツハイマー病(AD)などのタウオパチーに罹患している成人ヒトは、髄腔内又は脳室内投与経路などの任意の好適な投与経路を介して、治療に有効な本開示のオリゴヌクレオチドの化合物、例えば、配列番号1に相当する核酸塩基配列を有し、且つ本開示に従って修飾されたオリゴヌクレオチドを投与される。好適な投与経路は、静脈内若しくは皮下投与経路などの全身投与又は髄腔内若しくは脳室内投与経路を介したCNSへの直接的な投与を含んでもよい。治療は、ADなどのタウオパチーの1つ以上の症状が改善するまで、又は例えば、タウタンパク質レベルが低減されるまで継続される。
以下に、本願の当初の特許請求の範囲に記載の発明を付記する。
[発明1]
式(I):
(式中、
Rは、H又は正に荷電した対イオンであり、
Bは、核酸塩基であり、
R 1 は、-(CR’ 2 ) 2 OCR’ 3 であり、且つ
R’は、それぞれの場合において独立して、H又はFである)の1個以上のヌクレオチドを含むMAPT遺伝子の少なくとも一部と相補的なオリゴヌクレオチド。
[発明2]
前記オリゴヌクレオチドの各ヌクレオチドが、式(I)のヌクレオチドである、発明1に記載のオリゴヌクレオチド。
[発明3]
前記オリゴヌクレオチドが、2~40個のヌクレオチドを含む、発明1に記載のオリゴヌクレオチド。
[発明4]
前記オリゴヌクレオチドが、2~26個の式(I)のヌクレオチドを含む、発明1に記載のオリゴヌクレオチド。
[発明5]
前記オリゴヌクレオチドが、5~10個の式(I)のヌクレオチドを含む、発明1に記載のオリゴヌクレオチド。
[発明6]
Bが、式(I)の少なくとも1個のヌクレオチドにおいて未修飾核酸塩基である、発明1に記載のオリゴヌクレオチド。
[発明7]
Bが、式(I)の少なくとも1個のヌクレオチドにおいて修飾核酸塩基である、発明1に記載のオリゴヌクレオチド。
[発明8]
Bが、式(I)の各ヌクレオチドにおいて未修飾核酸塩基である、発明1に記載のオリゴヌクレオチド。
[発明9]
Bが、式(I)の各ヌクレオチドにおいて修飾核酸塩基である、発明1に記載のオリゴヌクレオチド。
[発明10]
各R’が、式(I)の少なくとも1個のヌクレオチドにおいてHである、発明1に記載のオリゴヌクレオチド。
[発明11]
各R’が、式(I)の各ヌクレオチドにおいてHである、発明1に記載のオリゴヌクレオチド。
[発明12]
R 1 が、式(I)の少なくとも1個のヌクレオチドにおいて-(CH 2 ) 2 OCH 3 である、発明1に記載のオリゴヌクレオチド。
[発明13]
R 1 が、式(I)の各ヌクレオチドにおいて-(CH 2 ) 2 OCH 3 である、発明1に記載のオリゴヌクレオチド。
[発明14]
前記オリゴヌクレオチドがさらに、式(II):
(式中、
Yは、S又はOであり、
Rは、H又は正に荷電した対イオンであり、
Bは、核酸塩基であり、
R 2 は、-CR’ 3 、-CR’ 2 OCR’ 3 、-(CR’ 2 ) 3 OCR’ 3 又は-(CR’ 2 ) 1~2 CR’ 3 であるか、又はR 2 は、-(CR’ 2 ) 2 OCR’ 3 であり、且つYはOであり、且つ
R’は、それぞれの場合において独立して、H又はFである)の1個以上のヌクレオチドを含む、発明1~13のいずれか一つに記載のオリゴヌクレオチド。
[発明15]
前記オリゴヌクレオチドが、式(II)(式中、R 2 は、-CR’ 3 である)の少なくとも1個のヌクレオチドを含む、発明14に記載のオリゴヌクレオチド。
[発明16]
前記オリゴヌクレオチドが、式(II)(式中、R 2 は、-(CR’ 2 ) 1~2 OCR’ 3 である)の少なくとも1個のヌクレオチドを含む、発明14に記載のオリゴヌクレオチド。
[発明17]
前記オリゴヌクレオチドが、式(II)(式中、R 2 は、-(CR’ 2 ) 1~2 CR’ 3 である)の少なくとも1個のヌクレオチドを含む、発明14に記載のオリゴヌクレオチド。
[発明18]
Bが、式(II)の少なくとも1個のヌクレオチドにおいて修飾核酸塩基である、発明14に記載のオリゴヌクレオチド。
[発明19]
Yが、式(II)の少なくとも1個のヌクレオチドにおいてSである、発明14に記載のオリゴヌクレオチド。
[発明20]
Yが、式(II)の少なくとも1個のヌクレオチドにおいてOである、発明14に記載のオリゴヌクレオチド。
[発明21]
Yが、式(II)の各ヌクレオチドにおいてSである、発明14に記載のオリゴヌクレオチド。
[発明22]
Yが、式(II)の各ヌクレオチドにおいてOである、発明14に記載のオリゴヌクレオチド。
[発明23]
前記オリゴヌクレオチドがさらに、式(IIIa)又は式(IIIb):
(式中、
Yは、S又はOであり、
Rは、H又は正に荷電した対イオンであり、且つ
Bは、核酸塩基である)の1個以上のヌクレオチドを含む、発明1~22のいずれか一つに記載のオリゴヌクレオチド。
[発明24]
前記オリゴヌクレオチドがさらに、式(V’):
(式中、
Yは、S又はOであり、
Rは、H又は正に荷電した対イオンであり、
Bは、それぞれの場合において独立して、天然若しくは未修飾核酸塩基又は修飾核酸塩基であり、
Aは、-(CR’’R’’) 1~2 -であり、且つ
R’’は、それぞれの場合において独立して、H、F又はMeである)の1個以上のヌクレオチドを含む、発明1~23のいずれか一つに記載のオリゴヌクレオチド。
[発明25]
前記オリゴヌクレオチドが、式(VI):
5’X-Y-Z3’ (VI)
(式中、
X、Y及びZの各々は、2~10個のヌクレオチドを含むドメインであり、前記X及びZドメインの少なくとも1つは、少なくとも1個の式(I)のヌクレオチドを含み、且つ前記Yドメインのヌクレオチドの各々は、2’-デオキシヌクレオチドである)のコンストラクトにおいて配置される、発明1~24のいずれか一つに記載のオリゴヌクレオチド。
[発明26]
前記オリゴヌクレオチドが、18~22個のヌクレオチドを含む、発明24に記載のオリゴヌクレオチド。
[発明27]
前記X及びZドメインがそれぞれ、5~10個のヌクレオチドを含む、発明24に記載のオリゴヌクレオチド。
[発明28]
前記Yドメインが、5~10個のヌクレオチドを含む、発明24に記載のオリゴヌクレオチド。
[発明29]
前記X及びZドメインがそれぞれ、5~10個のヌクレオチドを含み、且つ前記Yドメインが、5~10個のヌクレオチドを含む、発明24に記載のオリゴヌクレオチド。
[発明30]
前記X及びZドメインがそれぞれ、5個のヌクレオチドを含み、且つ前記Yドメインが、10個のヌクレオチドを含む、発明24に記載のオリゴヌクレオチド。
[発明31]
前記X及びZドメインの各ヌクレオチドが、式(I)のヌクレオチドである、発明24に記載のオリゴヌクレオチド。
[発明32]
前記Xドメインの少なくとも1個のヌクレオチド及び前記Zドメインの少なくとも1個のヌクレオチドがそれぞれ、独立して、式(II)のヌクレオチド、式(IIIa)のヌクレオチド、及び式(IIIb)のヌクレオチドからなる群から選択される、発明24に記載のオリゴヌクレオチド。
[発明33]
前記X及びZドメインの少なくとも1個のヌクレオチドの各々が、同じヌクレオチドである、発明32に記載のオリゴヌクレオチド。
[発明34]
前記Yドメインの各ヌクレオチドが、チオホスフェートサブユニット間結合を介して連結される、発明24に記載のオリゴヌクレオチド。
[発明35]
前記オリゴヌクレオチドが、一本鎖である、発明1~34のいずれか一つに記載のオリゴヌクレオチド。
[発明36]
前記オリゴヌクレオチドが、アンチセンスオリゴヌクレオチドである、発明35に記載のオリゴヌクレオチド。
[発明37]
前記オリゴヌクレオチドの前記核酸塩基配列が、配列番号1に相当する、発明1~36のいずれか一つに記載のオリゴヌクレオチド。
[発明38]
前記オリゴヌクレオチドが、式(VI):
5’X-Y-Z3’ (VI)
(式中、
前記X及びZドメインはそれぞれ、5個のヌクレオチドを含み、各ヌクレオチドは、式(II):
(式中、
Yは、Sであり、
Rは、Hであり、
Bは、核酸塩基であり、
R 2 は、(CR’ 2 ) 2 OCR’ 3 であり、各R’は、Hであり;且つ
前記Yドメインは、それぞれホスホロチオエート結合を介して連結された10個のヌクレオチドを含み且つそれぞれ2’-デオキシヌクレオチドを含む)の構造を有する)のコンストラクトにおいて配置される、発明37に記載のオリゴヌクレオチド。
[発明39]
式(VI):
5’X-Y-Z3’ (VI)
(式中、
X-Y-Zは、18~22個のヌクレオシドの配列を含むキメラオリゴヌクレオチドであり、且つ任意選択によりリガンド標的化基に対して5’及び/又は3’末端でコンジュゲートされ;
Xは、3~10ヌクレオシド長である修飾ヌクレオシドの配列を含むドメインであり;
Zは、3~10ヌクレオシド長である修飾ヌクレオシドの配列を含むドメインであり;且つ
Yは、チオホスフェートサブユニット間結合を介して連結された2~10個の2’-デオキシ-ヌクレオシドの配列を含むドメインである)によって表されるMAPT遺伝子の少なくとも一部と相補的なキメラオリゴヌクレオチド。
[発明40]
前記Yドメインが、6~10個のヌクレオシド長である、発明39に記載のキメラオリゴヌクレオチド。
[発明41]
前記X及び/又はZドメインが、N3’→P5’ホスホロアミダート又はN3’→P5’チオホスホロアミダートサブユニット間結合を介して連結された修飾ヌクレオシドの配列を含む、発明39に記載のキメラオリゴヌクレオチド。
[発明42]
前記Yドメインが、少なくとも1つのホスホジエステルサブユニット間結合を含む、発明39に記載のキメラオリゴヌクレオチド。
[発明43]
前記Yドメインが、チオホスフェートサブユニット間結合、及び任意選択により、1個又は2個のホスホジエステルサブユニット間結合を介して連結された2’-デオキシ-ヌクレオシドからなる、発明39に記載のキメラオリゴヌクレオチド。
[発明44]
前記Xドメインが、修飾ヌクレオシドを含み、前記修飾が、独立して、2’-F、2’-F-N3’→P5’、2’-OMe、2’-OMe-N3’→P5’、2’-O-メトキシエトキシ、2’-O-メトキシエトキシ-N3’→P5’、立体構造的に制限されたヌクレオシド、2’-OH-N3’→P5’チオホスホロアミダート及び2’-OH-N3’→P5’ホスホロアミダートからなる群から選択される、発明39に記載のキメラオリゴヌクレオチド。
[発明45]
Zの機能ドメインが、修飾ヌクレオシドを含み、前記修飾が、2’-F、2’-F-N3’→P5’、2’-OMe、2’-OMe-N3’→P5’、2’-O-メトキシエトキシ、2’-O-メトキシエトキシ-N3’→P5’、立体構造的に制限されたヌクレオシド、2’-OH-N3’→P5’チオホスホロアミダート及び2’-OH-N3’→P5’ホスホロアミダートからなる群から選択される、発明39に記載のキメラオリゴヌクレオチド。
[発明46]
前記X及び/又はZドメインが、N3’→P5’ホスホロアミダートサブユニット間結合を介して連結された1個以上の2’-デオキシ-ヌクレオシドを含む、発明39に記載のキメラオリゴヌクレオチド。
[発明47]
前記X及びZドメインが、1個以上の2’-アラビノ-F及び/又は2’-リボ-F修飾ヌクレオシドを含み、各前記ヌクレオシドが、独立して、N3’→P5’ホスホロアミダート又はN3’→P5’チオホスホロアミダートサブユニット間結合の少なくとも1つを介して連結される、発明39に記載のキメラオリゴヌクレオチド。
[発明48]
前記X及びZドメインが、1個以上の2’-OMe修飾ヌクレオシドを含み、各前記ヌクレオシドが、独立して、N3’→P5’ホスホロアミダート、N3’→P5’チオホスホロアミダート、又はチオホスフェートサブユニット間結合の少なくとも1つを介して連結される、発明39に記載のキメラオリゴヌクレオチド。
[発明49]
前記X及びZドメインの各々における前記修飾ヌクレオシドが、チオホスフェートサブユニット間結合を介して連結された2’-OMe修飾ヌクレオシドであり、且つ前記修飾ヌクレオシドが、5-メチルシトシン核酸塩基を含むが、任意選択によりシトシンを含まない、発明39に記載のキメラオリゴヌクレオチド。
[発明50]
前記修飾ヌクレオシドが、2,6-ジアミノプリン核酸塩基を含むが、任意選択によりアデニンを含まない、発明39に記載のキメラオリゴヌクレオチド。
[発明51]
前記修飾ヌクレオシドが、5-メチルウラシル核酸塩基を含むが、任意選択によりウラシルを含まない、発明39に記載のキメラオリゴヌクレオチド。
[発明52]
前記修飾ヌクレオシドが、2,6-ジアミノプリン核酸塩基を含むが、アデニン及び5-メチルウラシル核酸塩基、並びに任意選択によりウラシルを含まない、発明39に記載のキメラオリゴヌクレオチド。
[発明53]
前記Yドメインが、6~8個の2’-デオキシ-ヌクレオシドを含む、発明39に記載のキメラオリゴヌクレオチド。
[発明54]
前記X及びZドメインの各々における前記修飾ヌクレオシドが、チオホスフェートサブユニット間結合を介して任意選択により連結された2’-OMe修飾ヌクレオシド及び立体構造的に制限されたヌクレオシドを含み、且つ前記2’-OMe修飾ヌクレオシドが、5-メチルシトシン核酸塩基を含むが、任意選択によりシトシンを含まない、発明39に記載のキメラオリゴヌクレオチド。
[発明55]
前記X及びZドメインの各々における前記修飾ヌクレオシドが、2’-OMe及び立体構造的に制限されたヌクレオシドを含む、発明39に記載のキメラオリゴヌクレオチド。
[発明56]
前記X及びZドメインの各々における前記修飾ヌクレオシドが、立体構造的に制限されたヌクレオシドを含み、且つ少なくとも1個の修飾ヌクレオシドが、N3’→P5’ホスホロアミダート又はN3’→P5’チオホスホロアミダートサブユニット間結合を含む、発明39に記載のキメラオリゴヌクレオチド。
[発明57]
前記Yドメインが、7~8個の2’-デオキシ-ヌクレオシドを含む、発明39に記載のキメラオリゴヌクレオチド。
[発明58]
前記2’-OMe修飾ヌクレオシドが、5-メチルウラシル核酸塩基を含むが、任意選択によりウラシルを含まない、発明39に記載のキメラオリゴヌクレオチド。
[発明59]
前記Yドメインが、9~10個の2’-デオキシ-ヌクレオシドを含む、発明39に記載のキメラオリゴヌクレオチド。
[発明60]
前記X及びZドメインが、式(A1):
(式中、
Aは、それぞれの場合において独立して、NH又はOであり;
Bは、それぞれの場合において独立して、未修飾又は修飾核酸塩基であり;
Wは、それぞれの場合において独立して、OR又はSRであり、Rは、H又は正に荷電した対イオンであり;
R’及びR’’はそれぞれ、それぞれの場合において独立して、H、F、Cl、OH、OMe、Me、及びO-メトキシエトキシからなる群から選択され;
R’’’は、Hであるか、又はR’及びR’’’を合わせて-O-CH 2 -又は-O-(CH 2 ) 2 -を形成し、且つ
aは、3~9の整数であり、
R’、R’’及びR’’’がそれぞれHである場合、AはNHであり、且つ任意選択によりAがOである場合、WはSRである)によって表されるヌクレオチドを含む、発明39に記載のキメラオリゴヌクレオチド。
[発明61]
前記X及び/又はZドメインが、1個以上のオリゴヌクレオチドを含み、前記修飾が、2’-O-メトキシエトキシ-N3’→P5’である、発明39に記載のキメラオリゴヌクレオチド。
[発明62]
前記Xドメインが、1個以上のオリゴヌクレオチドを含み、前記修飾が2’-O-メトキシエトキシ-N3’→P5’である、発明39に記載のキメラオリゴヌクレオチド。
[発明63]
前記Zドメインが、1個以上のオリゴヌクレオチドを含み、前記修飾が2’-O-メトキシエトキシ-N3’→P5’である、発明39に記載のキメラオリゴヌクレオチド。
[発明64]
前記オリゴヌクレオチドの前記核酸塩基配列が、配列番号1に相当する、発明39に記載のキメラオリゴヌクレオチド。
[発明65]
MAPT遺伝子配列の少なくとも一部と相補的な配列を有するキメラオリゴヌクレオチドであって、前記オリゴヌクレオチドが、式(VII):
5’-X’-Y’-Z’-3’ (VII)
(式中、
X’-Y’-Z’は、16~22個のヌクレオシドの配列を含むキメラオリゴヌクレオチドであり、且つ任意選択により5’及び/又は3’末端でコンジュゲートされ;
X’は、3~10ヌクレオシド長である修飾ヌクレオシドの配列を含むドメインであり;
Z’は、3~10ヌクレオシド長である修飾ヌクレオシドの配列を含むドメインであり;且つ
Y’は、サブユニット間結合を介して連結された2~4個の2’-デオキシ-ヌクレオシドの配列を含むドメインであり、
前記X’及び/又はZ’ドメインは、N3’→P5’ホスホロアミダート又はN3’→P5’チオホスホロアミダートサブユニット間結合を介して連結された修飾ヌクレオシドの配列を含む)によって表されるコンストラクトを含む、キメラオリゴヌクレオチド。
[発明66]
前記Y’ドメインが、チオホスフェートサブユニット間結合、及び任意選択により、1個のホスホジエステルサブユニット間結合を介して連結された2’-デオキシ-ヌクレオシドからなる、発明65に記載のキメラオリゴヌクレオチド。
[発明67]
前記X’ドメインが、9~10個のヌクレオシド長である、発明65に記載のキメラオリゴヌクレオチド。
[発明68]
前記X’ドメインが、修飾ヌクレオシドを含み、前記修飾が、2’-F、2’-F-N3’→P5’、2’-OMe、2’-OMe-N3’→P5’、2’-O-メトキシエトキシ、2’-O-メトキシエトキシ-N3’→P5’、及び立体構造的に制限されたヌクレオシドからなる群から選択される、発明65に記載のキメラオリゴヌクレオチド。
[発明69]
前記Z’ドメインが、修飾ヌクレオシドを含み、前記修飾が、2’-F、2’-F-N3’→P5’、2’-OH、2’-OMe、2’-OMe-N3’→P5’、2’-O-メトキシエトキシ、2’-O-メトキシエトキシ-N3’→P5’、及び立体構造的に制限されたヌクレオシドからなる群から選択される、発明65に記載のキメラオリゴヌクレオチド。
[発明70]
前記X’及び/又はZ’ドメインが、1個以上の2’-アラビノ-F及び/又は2’-リボ-F修飾ヌクレオシドを含む、発明65に記載のキメラオリゴヌクレオチド。
[発明71]
前記X’及び/又はZ’ドメインにおける前記修飾ヌクレオシドが、2’-OMe及び立体構造的に制限されたヌクレオシドを含む、発明65に記載のキメラオリゴヌクレオチド。
[発明72]
前記X’及び/又はZ’ドメインにおける前記修飾ヌクレオシドが、立体構造的に制限されたヌクレオシド及びN3’→P5’修飾を含む、発明65に記載のキメラオリゴヌクレオチド。
[発明73]
前記配列が、表Bにおいて2~4個のヌクレオチドYドメインを有するものから選択される、発明65に記載のキメラオリゴヌクレオチド。
[発明74]
前記オリゴヌクレオチドの前記核酸塩基配列が、配列番号1に相当する、発明65に記載のキメラオリゴヌクレオチド。
[発明75]
MAPT遺伝子配列の少なくとも一部と相補的な配列を有するオリゴヌクレオチドであって、前記オリゴヌクレオチドが、以下の式(A):
(式中、
X A は、NH又はOであり、
Yは、OR又はSRであり、Rは、H又は正に荷電した対イオンであり、
B A は、それぞれの場合において独立して、天然若しくは未修飾核酸塩基又は修飾核酸塩基であり、
R A ’及びR A ’’はそれぞれ、それぞれの場合において独立して、H、F、OH、OMe、Me、O-メトキシエトキシから選択され、且つ
R A ’’’は、Hであるか、又はR A ’及びR A ’’’を合わせて-O-CH 2 -又は-O-(CH 2 ) 2 -を形成する)の1個以上のヌクレオチドを含む、オリゴヌクレオチド。
[発明76]
R A ’及びR A ’’’がHであり;且つR A ’’がFである、発明75に記載のオリゴヌクレオチド。
[発明77]
R A ’及びR A ’’がHであり;且つR A ’’’がF、OH、H又はOMeである、発明75に記載のオリゴヌクレオチド。
[発明78]
X A がNHであり;B A が未修飾又は修飾核酸塩基であり;R A ’及びR A ’’’を合わせて、立体構造的に制限されたヌクレオシド(例えば、-O-CH 2 -又は-O-(CH 2 ) 2 -)を形成し;且つRA’’がHである、発明75に記載のオリゴヌクレオチド。
[発明79]
R A ’及びR A ’’の少なくとも1つが、Hである、発明75に記載のオリゴヌクレオチド。
[発明80]
B A がプリン核酸塩基であるとき、R A ’及びR A ’’の少なくとも1つは、OH又はFであり、且つ/又はB A がピリミジン核酸塩基であるとき、R A ’及びR A ’’の少なくとも1つは、OMe、OH又はFである、発明75に記載のオリゴヌクレオチド。
[発明81]
前記修飾核酸塩基が、5-メチルシトシン、2,6-ジアミノプリン、5-メチルウラシル、及びg-クランプから選択される、発明75に記載のオリゴヌクレオチド。
[発明82]
MAPT遺伝子配列と相補的な配列を有するオリゴヌクレオチドであって、前記オリゴヌクレオチドが、以下の式(IX):
(式中、
Rは、H又は正に荷電した対イオンであり、
B B は、それぞれの場合において独立して、天然若しくは未修飾核酸塩基又は修飾核酸塩基であり、
R B ’及びR B ’’はそれぞれ、それぞれの場合において独立して、H、F、OH、OMe、Me、O-メトキシエトキシから選択され、且つ
R B ’’’は、Hであるか、又はR B ’及びR B ’’’を合わせて-O-CH 2 -又は-O-(CH 2 ) 2 -を形成する)の10個以上のヌクレオチドを含む、オリゴヌクレオチド。
[発明83]
R B ’及びR B ’’’がHであり;且つR B ’’がFである、発明82に記載のオリゴヌクレオチド。
[発明84]
R B ’及びR B ’’がHであり;且つR B ’’’がF、OH、H又はOMeである、発明82に記載のオリゴヌクレオチド。
[発明85]
B B が未修飾又は修飾核酸塩基であり;R B ’及びR B ’’’を合わせて、立体構造的に制限されたヌクレオシド(例えば、-O-CH 2 -又は-O-(CH 2 ) 2 -)を形成し;且つR B ’’がHである、発明82に記載のオリゴヌクレオチド。
[発明86]
R B ’及びR B ’’の少なくとも1つが、Hである、発明82に記載のオリゴヌクレオチド。
[発明87]
B B がプリン核酸塩基であるとき、R B ’及びR B ’’の少なくとも1つは、OH又はFであり、且つ/又はB B がピリミジン核酸塩基であるとき、R B ’及びR B ’’の少なくとも1つは、OMe、OH又はFである、発明82に記載のオリゴヌクレオチド。
[発明88]
前記修飾核酸塩基が、5-メチルシトシン、2,6-ジアミノプリン、5-メチルウラシル、及びg-クランプから選択される、発明82に記載のオリゴヌクレオチド。
[発明89]
発明1~88のいずれかに記載のオリゴヌクレオチド及び薬学的に許容される賦形剤を含む医薬組成物。
[発明90]
前記組成物が、髄腔内又は脳室内送達に好適である、発明89に記載の医薬組成物。
[発明91]
CNS細胞におけるMAPT遺伝子発現を阻害する方法であって、前記細胞を発明1~90のいずれかに記載のオリゴヌクレオチド又は組成物と接触させることを含む、方法。
[発明92]
CNS細胞におけるMAPT mRNAの転写を阻害する方法であって、前記細胞を発明1~90のいずれかに記載のオリゴヌクレオチド又は組成物と接触させることを含む、方法。
[発明93]
タウオパチーを有する対象を治療する方法であって、前記対象に治療有効量の発明1~90のいずれかに記載のオリゴヌクレオチド又は組成物を投与することを含む、方法。
[発明94]
前記タウオパチーが、アルツハイマー病である、発明93に記載の方法。
[発明95]
MAPT遺伝子と複合体を形成した前記オリゴヌクレオチドが、>37℃の融解温度(Tm)を有する、発明1~94のいずれかに記載のオリゴヌクレオチド。
[発明96]
タウオパチーを有する対象を治療する方法であって、前記対象に治療有効量の発明1~90のいずれかに記載のオリゴヌクレオチド又は組成物を投与することを含む、方法。
[発明97]
前記タウオパチーが、アルツハイマー病である、発明96に記載の方法。
[発明98]
CNS細胞においてMAPT mRNAの発現を阻害する方法であって、前記細胞を発明1~90のいずれかに記載のオリゴヌクレオチドを含むオリゴヌクレオチド又は組成物と接触させることを含み、前記オリゴヌクレオチドが、前記MAPT mRNAの少なくとも一部と相補的であるか又はハイブリダイズする核酸塩基配列を含有する、方法。
[発明99]
タウオパチーを有する対象を治療する方法であって、前記対象に治療有効量の発明1~90のいずれかに記載の前記オリゴヌクレオチドを含むオリゴヌクレオチド又は組成物を投与することを含み、前記オリゴヌクレオチドが、前記MAPT遺伝子配列の少なくとも一部と相補的であるか又はハイブリダイズする核酸塩基配列を含有する、方法。
[発明100]
前記タウオパチーが、アルツハイマー病である、発明99に記載の方法。
[発明101]
標的核酸と発明1~90のいずれかに記載の前記オリゴヌクレオチドを含むオリゴヌクレオチド又は組成物を含むアンチセンス化合物を接触させることによってMAPT遺伝子の発現を調節する方法であって、前記オリゴヌクレオチドが、前記MAPT遺伝子の少なくとも一部と相補的であるか又はハイブリダイズする核酸塩基配列を含有する、方法。
[発明102]
前記MAPT遺伝子の一部が、エクソン5である、発明98、99及び101のいずれかに記載の方法。
アルツハイマー病(AD)などのタウオパチーに罹患している成人ヒトは、髄腔内又は脳室内投与経路などの任意の好適な投与経路を介して、治療に有効な本開示のオリゴヌクレオチドの化合物、例えば、配列番号1に相当する核酸塩基配列を有し、且つ本開示に従って修飾されたオリゴヌクレオチドを投与される。好適な投与経路は、静脈内若しくは皮下投与経路などの全身投与又は髄腔内若しくは脳室内投与経路を介したCNSへの直接的な投与を含んでもよい。治療は、ADなどのタウオパチーの1つ以上の症状が改善するまで、又は例えば、タウタンパク質レベルが低減されるまで継続される。
以下に、本願の当初の特許請求の範囲に記載の発明を付記する。
[発明1]
式(I):
Rは、H又は正に荷電した対イオンであり、
Bは、核酸塩基であり、
R 1 は、-(CR’ 2 ) 2 OCR’ 3 であり、且つ
R’は、それぞれの場合において独立して、H又はFである)の1個以上のヌクレオチドを含むMAPT遺伝子の少なくとも一部と相補的なオリゴヌクレオチド。
[発明2]
前記オリゴヌクレオチドの各ヌクレオチドが、式(I)のヌクレオチドである、発明1に記載のオリゴヌクレオチド。
[発明3]
前記オリゴヌクレオチドが、2~40個のヌクレオチドを含む、発明1に記載のオリゴヌクレオチド。
[発明4]
前記オリゴヌクレオチドが、2~26個の式(I)のヌクレオチドを含む、発明1に記載のオリゴヌクレオチド。
[発明5]
前記オリゴヌクレオチドが、5~10個の式(I)のヌクレオチドを含む、発明1に記載のオリゴヌクレオチド。
[発明6]
Bが、式(I)の少なくとも1個のヌクレオチドにおいて未修飾核酸塩基である、発明1に記載のオリゴヌクレオチド。
[発明7]
Bが、式(I)の少なくとも1個のヌクレオチドにおいて修飾核酸塩基である、発明1に記載のオリゴヌクレオチド。
[発明8]
Bが、式(I)の各ヌクレオチドにおいて未修飾核酸塩基である、発明1に記載のオリゴヌクレオチド。
[発明9]
Bが、式(I)の各ヌクレオチドにおいて修飾核酸塩基である、発明1に記載のオリゴヌクレオチド。
[発明10]
各R’が、式(I)の少なくとも1個のヌクレオチドにおいてHである、発明1に記載のオリゴヌクレオチド。
[発明11]
各R’が、式(I)の各ヌクレオチドにおいてHである、発明1に記載のオリゴヌクレオチド。
[発明12]
R 1 が、式(I)の少なくとも1個のヌクレオチドにおいて-(CH 2 ) 2 OCH 3 である、発明1に記載のオリゴヌクレオチド。
[発明13]
R 1 が、式(I)の各ヌクレオチドにおいて-(CH 2 ) 2 OCH 3 である、発明1に記載のオリゴヌクレオチド。
[発明14]
前記オリゴヌクレオチドがさらに、式(II):
Yは、S又はOであり、
Rは、H又は正に荷電した対イオンであり、
Bは、核酸塩基であり、
R 2 は、-CR’ 3 、-CR’ 2 OCR’ 3 、-(CR’ 2 ) 3 OCR’ 3 又は-(CR’ 2 ) 1~2 CR’ 3 であるか、又はR 2 は、-(CR’ 2 ) 2 OCR’ 3 であり、且つYはOであり、且つ
R’は、それぞれの場合において独立して、H又はFである)の1個以上のヌクレオチドを含む、発明1~13のいずれか一つに記載のオリゴヌクレオチド。
[発明15]
前記オリゴヌクレオチドが、式(II)(式中、R 2 は、-CR’ 3 である)の少なくとも1個のヌクレオチドを含む、発明14に記載のオリゴヌクレオチド。
[発明16]
前記オリゴヌクレオチドが、式(II)(式中、R 2 は、-(CR’ 2 ) 1~2 OCR’ 3 である)の少なくとも1個のヌクレオチドを含む、発明14に記載のオリゴヌクレオチド。
[発明17]
前記オリゴヌクレオチドが、式(II)(式中、R 2 は、-(CR’ 2 ) 1~2 CR’ 3 である)の少なくとも1個のヌクレオチドを含む、発明14に記載のオリゴヌクレオチド。
[発明18]
Bが、式(II)の少なくとも1個のヌクレオチドにおいて修飾核酸塩基である、発明14に記載のオリゴヌクレオチド。
[発明19]
Yが、式(II)の少なくとも1個のヌクレオチドにおいてSである、発明14に記載のオリゴヌクレオチド。
[発明20]
Yが、式(II)の少なくとも1個のヌクレオチドにおいてOである、発明14に記載のオリゴヌクレオチド。
[発明21]
Yが、式(II)の各ヌクレオチドにおいてSである、発明14に記載のオリゴヌクレオチド。
[発明22]
Yが、式(II)の各ヌクレオチドにおいてOである、発明14に記載のオリゴヌクレオチド。
[発明23]
前記オリゴヌクレオチドがさらに、式(IIIa)又は式(IIIb):
Yは、S又はOであり、
Rは、H又は正に荷電した対イオンであり、且つ
Bは、核酸塩基である)の1個以上のヌクレオチドを含む、発明1~22のいずれか一つに記載のオリゴヌクレオチド。
[発明24]
前記オリゴヌクレオチドがさらに、式(V’):
Yは、S又はOであり、
Rは、H又は正に荷電した対イオンであり、
Bは、それぞれの場合において独立して、天然若しくは未修飾核酸塩基又は修飾核酸塩基であり、
Aは、-(CR’’R’’) 1~2 -であり、且つ
R’’は、それぞれの場合において独立して、H、F又はMeである)の1個以上のヌクレオチドを含む、発明1~23のいずれか一つに記載のオリゴヌクレオチド。
[発明25]
前記オリゴヌクレオチドが、式(VI):
5’X-Y-Z3’ (VI)
(式中、
X、Y及びZの各々は、2~10個のヌクレオチドを含むドメインであり、前記X及びZドメインの少なくとも1つは、少なくとも1個の式(I)のヌクレオチドを含み、且つ前記Yドメインのヌクレオチドの各々は、2’-デオキシヌクレオチドである)のコンストラクトにおいて配置される、発明1~24のいずれか一つに記載のオリゴヌクレオチド。
[発明26]
前記オリゴヌクレオチドが、18~22個のヌクレオチドを含む、発明24に記載のオリゴヌクレオチド。
[発明27]
前記X及びZドメインがそれぞれ、5~10個のヌクレオチドを含む、発明24に記載のオリゴヌクレオチド。
[発明28]
前記Yドメインが、5~10個のヌクレオチドを含む、発明24に記載のオリゴヌクレオチド。
[発明29]
前記X及びZドメインがそれぞれ、5~10個のヌクレオチドを含み、且つ前記Yドメインが、5~10個のヌクレオチドを含む、発明24に記載のオリゴヌクレオチド。
[発明30]
前記X及びZドメインがそれぞれ、5個のヌクレオチドを含み、且つ前記Yドメインが、10個のヌクレオチドを含む、発明24に記載のオリゴヌクレオチド。
[発明31]
前記X及びZドメインの各ヌクレオチドが、式(I)のヌクレオチドである、発明24に記載のオリゴヌクレオチド。
[発明32]
前記Xドメインの少なくとも1個のヌクレオチド及び前記Zドメインの少なくとも1個のヌクレオチドがそれぞれ、独立して、式(II)のヌクレオチド、式(IIIa)のヌクレオチド、及び式(IIIb)のヌクレオチドからなる群から選択される、発明24に記載のオリゴヌクレオチド。
[発明33]
前記X及びZドメインの少なくとも1個のヌクレオチドの各々が、同じヌクレオチドである、発明32に記載のオリゴヌクレオチド。
[発明34]
前記Yドメインの各ヌクレオチドが、チオホスフェートサブユニット間結合を介して連結される、発明24に記載のオリゴヌクレオチド。
[発明35]
前記オリゴヌクレオチドが、一本鎖である、発明1~34のいずれか一つに記載のオリゴヌクレオチド。
[発明36]
前記オリゴヌクレオチドが、アンチセンスオリゴヌクレオチドである、発明35に記載のオリゴヌクレオチド。
[発明37]
前記オリゴヌクレオチドの前記核酸塩基配列が、配列番号1に相当する、発明1~36のいずれか一つに記載のオリゴヌクレオチド。
[発明38]
前記オリゴヌクレオチドが、式(VI):
5’X-Y-Z3’ (VI)
(式中、
前記X及びZドメインはそれぞれ、5個のヌクレオチドを含み、各ヌクレオチドは、式(II):
Yは、Sであり、
Rは、Hであり、
Bは、核酸塩基であり、
R 2 は、(CR’ 2 ) 2 OCR’ 3 であり、各R’は、Hであり;且つ
前記Yドメインは、それぞれホスホロチオエート結合を介して連結された10個のヌクレオチドを含み且つそれぞれ2’-デオキシヌクレオチドを含む)の構造を有する)のコンストラクトにおいて配置される、発明37に記載のオリゴヌクレオチド。
[発明39]
式(VI):
5’X-Y-Z3’ (VI)
(式中、
X-Y-Zは、18~22個のヌクレオシドの配列を含むキメラオリゴヌクレオチドであり、且つ任意選択によりリガンド標的化基に対して5’及び/又は3’末端でコンジュゲートされ;
Xは、3~10ヌクレオシド長である修飾ヌクレオシドの配列を含むドメインであり;
Zは、3~10ヌクレオシド長である修飾ヌクレオシドの配列を含むドメインであり;且つ
Yは、チオホスフェートサブユニット間結合を介して連結された2~10個の2’-デオキシ-ヌクレオシドの配列を含むドメインである)によって表されるMAPT遺伝子の少なくとも一部と相補的なキメラオリゴヌクレオチド。
[発明40]
前記Yドメインが、6~10個のヌクレオシド長である、発明39に記載のキメラオリゴヌクレオチド。
[発明41]
前記X及び/又はZドメインが、N3’→P5’ホスホロアミダート又はN3’→P5’チオホスホロアミダートサブユニット間結合を介して連結された修飾ヌクレオシドの配列を含む、発明39に記載のキメラオリゴヌクレオチド。
[発明42]
前記Yドメインが、少なくとも1つのホスホジエステルサブユニット間結合を含む、発明39に記載のキメラオリゴヌクレオチド。
[発明43]
前記Yドメインが、チオホスフェートサブユニット間結合、及び任意選択により、1個又は2個のホスホジエステルサブユニット間結合を介して連結された2’-デオキシ-ヌクレオシドからなる、発明39に記載のキメラオリゴヌクレオチド。
[発明44]
前記Xドメインが、修飾ヌクレオシドを含み、前記修飾が、独立して、2’-F、2’-F-N3’→P5’、2’-OMe、2’-OMe-N3’→P5’、2’-O-メトキシエトキシ、2’-O-メトキシエトキシ-N3’→P5’、立体構造的に制限されたヌクレオシド、2’-OH-N3’→P5’チオホスホロアミダート及び2’-OH-N3’→P5’ホスホロアミダートからなる群から選択される、発明39に記載のキメラオリゴヌクレオチド。
[発明45]
Zの機能ドメインが、修飾ヌクレオシドを含み、前記修飾が、2’-F、2’-F-N3’→P5’、2’-OMe、2’-OMe-N3’→P5’、2’-O-メトキシエトキシ、2’-O-メトキシエトキシ-N3’→P5’、立体構造的に制限されたヌクレオシド、2’-OH-N3’→P5’チオホスホロアミダート及び2’-OH-N3’→P5’ホスホロアミダートからなる群から選択される、発明39に記載のキメラオリゴヌクレオチド。
[発明46]
前記X及び/又はZドメインが、N3’→P5’ホスホロアミダートサブユニット間結合を介して連結された1個以上の2’-デオキシ-ヌクレオシドを含む、発明39に記載のキメラオリゴヌクレオチド。
[発明47]
前記X及びZドメインが、1個以上の2’-アラビノ-F及び/又は2’-リボ-F修飾ヌクレオシドを含み、各前記ヌクレオシドが、独立して、N3’→P5’ホスホロアミダート又はN3’→P5’チオホスホロアミダートサブユニット間結合の少なくとも1つを介して連結される、発明39に記載のキメラオリゴヌクレオチド。
[発明48]
前記X及びZドメインが、1個以上の2’-OMe修飾ヌクレオシドを含み、各前記ヌクレオシドが、独立して、N3’→P5’ホスホロアミダート、N3’→P5’チオホスホロアミダート、又はチオホスフェートサブユニット間結合の少なくとも1つを介して連結される、発明39に記載のキメラオリゴヌクレオチド。
[発明49]
前記X及びZドメインの各々における前記修飾ヌクレオシドが、チオホスフェートサブユニット間結合を介して連結された2’-OMe修飾ヌクレオシドであり、且つ前記修飾ヌクレオシドが、5-メチルシトシン核酸塩基を含むが、任意選択によりシトシンを含まない、発明39に記載のキメラオリゴヌクレオチド。
[発明50]
前記修飾ヌクレオシドが、2,6-ジアミノプリン核酸塩基を含むが、任意選択によりアデニンを含まない、発明39に記載のキメラオリゴヌクレオチド。
[発明51]
前記修飾ヌクレオシドが、5-メチルウラシル核酸塩基を含むが、任意選択によりウラシルを含まない、発明39に記載のキメラオリゴヌクレオチド。
[発明52]
前記修飾ヌクレオシドが、2,6-ジアミノプリン核酸塩基を含むが、アデニン及び5-メチルウラシル核酸塩基、並びに任意選択によりウラシルを含まない、発明39に記載のキメラオリゴヌクレオチド。
[発明53]
前記Yドメインが、6~8個の2’-デオキシ-ヌクレオシドを含む、発明39に記載のキメラオリゴヌクレオチド。
[発明54]
前記X及びZドメインの各々における前記修飾ヌクレオシドが、チオホスフェートサブユニット間結合を介して任意選択により連結された2’-OMe修飾ヌクレオシド及び立体構造的に制限されたヌクレオシドを含み、且つ前記2’-OMe修飾ヌクレオシドが、5-メチルシトシン核酸塩基を含むが、任意選択によりシトシンを含まない、発明39に記載のキメラオリゴヌクレオチド。
[発明55]
前記X及びZドメインの各々における前記修飾ヌクレオシドが、2’-OMe及び立体構造的に制限されたヌクレオシドを含む、発明39に記載のキメラオリゴヌクレオチド。
[発明56]
前記X及びZドメインの各々における前記修飾ヌクレオシドが、立体構造的に制限されたヌクレオシドを含み、且つ少なくとも1個の修飾ヌクレオシドが、N3’→P5’ホスホロアミダート又はN3’→P5’チオホスホロアミダートサブユニット間結合を含む、発明39に記載のキメラオリゴヌクレオチド。
[発明57]
前記Yドメインが、7~8個の2’-デオキシ-ヌクレオシドを含む、発明39に記載のキメラオリゴヌクレオチド。
[発明58]
前記2’-OMe修飾ヌクレオシドが、5-メチルウラシル核酸塩基を含むが、任意選択によりウラシルを含まない、発明39に記載のキメラオリゴヌクレオチド。
[発明59]
前記Yドメインが、9~10個の2’-デオキシ-ヌクレオシドを含む、発明39に記載のキメラオリゴヌクレオチド。
[発明60]
前記X及びZドメインが、式(A1):
Aは、それぞれの場合において独立して、NH又はOであり;
Bは、それぞれの場合において独立して、未修飾又は修飾核酸塩基であり;
Wは、それぞれの場合において独立して、OR又はSRであり、Rは、H又は正に荷電した対イオンであり;
R’及びR’’はそれぞれ、それぞれの場合において独立して、H、F、Cl、OH、OMe、Me、及びO-メトキシエトキシからなる群から選択され;
R’’’は、Hであるか、又はR’及びR’’’を合わせて-O-CH 2 -又は-O-(CH 2 ) 2 -を形成し、且つ
aは、3~9の整数であり、
R’、R’’及びR’’’がそれぞれHである場合、AはNHであり、且つ任意選択によりAがOである場合、WはSRである)によって表されるヌクレオチドを含む、発明39に記載のキメラオリゴヌクレオチド。
[発明61]
前記X及び/又はZドメインが、1個以上のオリゴヌクレオチドを含み、前記修飾が、2’-O-メトキシエトキシ-N3’→P5’である、発明39に記載のキメラオリゴヌクレオチド。
[発明62]
前記Xドメインが、1個以上のオリゴヌクレオチドを含み、前記修飾が2’-O-メトキシエトキシ-N3’→P5’である、発明39に記載のキメラオリゴヌクレオチド。
[発明63]
前記Zドメインが、1個以上のオリゴヌクレオチドを含み、前記修飾が2’-O-メトキシエトキシ-N3’→P5’である、発明39に記載のキメラオリゴヌクレオチド。
[発明64]
前記オリゴヌクレオチドの前記核酸塩基配列が、配列番号1に相当する、発明39に記載のキメラオリゴヌクレオチド。
[発明65]
MAPT遺伝子配列の少なくとも一部と相補的な配列を有するキメラオリゴヌクレオチドであって、前記オリゴヌクレオチドが、式(VII):
5’-X’-Y’-Z’-3’ (VII)
(式中、
X’-Y’-Z’は、16~22個のヌクレオシドの配列を含むキメラオリゴヌクレオチドであり、且つ任意選択により5’及び/又は3’末端でコンジュゲートされ;
X’は、3~10ヌクレオシド長である修飾ヌクレオシドの配列を含むドメインであり;
Z’は、3~10ヌクレオシド長である修飾ヌクレオシドの配列を含むドメインであり;且つ
Y’は、サブユニット間結合を介して連結された2~4個の2’-デオキシ-ヌクレオシドの配列を含むドメインであり、
前記X’及び/又はZ’ドメインは、N3’→P5’ホスホロアミダート又はN3’→P5’チオホスホロアミダートサブユニット間結合を介して連結された修飾ヌクレオシドの配列を含む)によって表されるコンストラクトを含む、キメラオリゴヌクレオチド。
[発明66]
前記Y’ドメインが、チオホスフェートサブユニット間結合、及び任意選択により、1個のホスホジエステルサブユニット間結合を介して連結された2’-デオキシ-ヌクレオシドからなる、発明65に記載のキメラオリゴヌクレオチド。
[発明67]
前記X’ドメインが、9~10個のヌクレオシド長である、発明65に記載のキメラオリゴヌクレオチド。
[発明68]
前記X’ドメインが、修飾ヌクレオシドを含み、前記修飾が、2’-F、2’-F-N3’→P5’、2’-OMe、2’-OMe-N3’→P5’、2’-O-メトキシエトキシ、2’-O-メトキシエトキシ-N3’→P5’、及び立体構造的に制限されたヌクレオシドからなる群から選択される、発明65に記載のキメラオリゴヌクレオチド。
[発明69]
前記Z’ドメインが、修飾ヌクレオシドを含み、前記修飾が、2’-F、2’-F-N3’→P5’、2’-OH、2’-OMe、2’-OMe-N3’→P5’、2’-O-メトキシエトキシ、2’-O-メトキシエトキシ-N3’→P5’、及び立体構造的に制限されたヌクレオシドからなる群から選択される、発明65に記載のキメラオリゴヌクレオチド。
[発明70]
前記X’及び/又はZ’ドメインが、1個以上の2’-アラビノ-F及び/又は2’-リボ-F修飾ヌクレオシドを含む、発明65に記載のキメラオリゴヌクレオチド。
[発明71]
前記X’及び/又はZ’ドメインにおける前記修飾ヌクレオシドが、2’-OMe及び立体構造的に制限されたヌクレオシドを含む、発明65に記載のキメラオリゴヌクレオチド。
[発明72]
前記X’及び/又はZ’ドメインにおける前記修飾ヌクレオシドが、立体構造的に制限されたヌクレオシド及びN3’→P5’修飾を含む、発明65に記載のキメラオリゴヌクレオチド。
[発明73]
前記配列が、表Bにおいて2~4個のヌクレオチドYドメインを有するものから選択される、発明65に記載のキメラオリゴヌクレオチド。
[発明74]
前記オリゴヌクレオチドの前記核酸塩基配列が、配列番号1に相当する、発明65に記載のキメラオリゴヌクレオチド。
[発明75]
MAPT遺伝子配列の少なくとも一部と相補的な配列を有するオリゴヌクレオチドであって、前記オリゴヌクレオチドが、以下の式(A):
X A は、NH又はOであり、
Yは、OR又はSRであり、Rは、H又は正に荷電した対イオンであり、
B A は、それぞれの場合において独立して、天然若しくは未修飾核酸塩基又は修飾核酸塩基であり、
R A ’及びR A ’’はそれぞれ、それぞれの場合において独立して、H、F、OH、OMe、Me、O-メトキシエトキシから選択され、且つ
R A ’’’は、Hであるか、又はR A ’及びR A ’’’を合わせて-O-CH 2 -又は-O-(CH 2 ) 2 -を形成する)の1個以上のヌクレオチドを含む、オリゴヌクレオチド。
[発明76]
R A ’及びR A ’’’がHであり;且つR A ’’がFである、発明75に記載のオリゴヌクレオチド。
[発明77]
R A ’及びR A ’’がHであり;且つR A ’’’がF、OH、H又はOMeである、発明75に記載のオリゴヌクレオチド。
[発明78]
X A がNHであり;B A が未修飾又は修飾核酸塩基であり;R A ’及びR A ’’’を合わせて、立体構造的に制限されたヌクレオシド(例えば、-O-CH 2 -又は-O-(CH 2 ) 2 -)を形成し;且つRA’’がHである、発明75に記載のオリゴヌクレオチド。
[発明79]
R A ’及びR A ’’の少なくとも1つが、Hである、発明75に記載のオリゴヌクレオチド。
[発明80]
B A がプリン核酸塩基であるとき、R A ’及びR A ’’の少なくとも1つは、OH又はFであり、且つ/又はB A がピリミジン核酸塩基であるとき、R A ’及びR A ’’の少なくとも1つは、OMe、OH又はFである、発明75に記載のオリゴヌクレオチド。
[発明81]
前記修飾核酸塩基が、5-メチルシトシン、2,6-ジアミノプリン、5-メチルウラシル、及びg-クランプから選択される、発明75に記載のオリゴヌクレオチド。
[発明82]
MAPT遺伝子配列と相補的な配列を有するオリゴヌクレオチドであって、前記オリゴヌクレオチドが、以下の式(IX):
Rは、H又は正に荷電した対イオンであり、
B B は、それぞれの場合において独立して、天然若しくは未修飾核酸塩基又は修飾核酸塩基であり、
R B ’及びR B ’’はそれぞれ、それぞれの場合において独立して、H、F、OH、OMe、Me、O-メトキシエトキシから選択され、且つ
R B ’’’は、Hであるか、又はR B ’及びR B ’’’を合わせて-O-CH 2 -又は-O-(CH 2 ) 2 -を形成する)の10個以上のヌクレオチドを含む、オリゴヌクレオチド。
[発明83]
R B ’及びR B ’’’がHであり;且つR B ’’がFである、発明82に記載のオリゴヌクレオチド。
[発明84]
R B ’及びR B ’’がHであり;且つR B ’’’がF、OH、H又はOMeである、発明82に記載のオリゴヌクレオチド。
[発明85]
B B が未修飾又は修飾核酸塩基であり;R B ’及びR B ’’’を合わせて、立体構造的に制限されたヌクレオシド(例えば、-O-CH 2 -又は-O-(CH 2 ) 2 -)を形成し;且つR B ’’がHである、発明82に記載のオリゴヌクレオチド。
[発明86]
R B ’及びR B ’’の少なくとも1つが、Hである、発明82に記載のオリゴヌクレオチド。
[発明87]
B B がプリン核酸塩基であるとき、R B ’及びR B ’’の少なくとも1つは、OH又はFであり、且つ/又はB B がピリミジン核酸塩基であるとき、R B ’及びR B ’’の少なくとも1つは、OMe、OH又はFである、発明82に記載のオリゴヌクレオチド。
[発明88]
前記修飾核酸塩基が、5-メチルシトシン、2,6-ジアミノプリン、5-メチルウラシル、及びg-クランプから選択される、発明82に記載のオリゴヌクレオチド。
[発明89]
発明1~88のいずれかに記載のオリゴヌクレオチド及び薬学的に許容される賦形剤を含む医薬組成物。
[発明90]
前記組成物が、髄腔内又は脳室内送達に好適である、発明89に記載の医薬組成物。
[発明91]
CNS細胞におけるMAPT遺伝子発現を阻害する方法であって、前記細胞を発明1~90のいずれかに記載のオリゴヌクレオチド又は組成物と接触させることを含む、方法。
[発明92]
CNS細胞におけるMAPT mRNAの転写を阻害する方法であって、前記細胞を発明1~90のいずれかに記載のオリゴヌクレオチド又は組成物と接触させることを含む、方法。
[発明93]
タウオパチーを有する対象を治療する方法であって、前記対象に治療有効量の発明1~90のいずれかに記載のオリゴヌクレオチド又は組成物を投与することを含む、方法。
[発明94]
前記タウオパチーが、アルツハイマー病である、発明93に記載の方法。
[発明95]
MAPT遺伝子と複合体を形成した前記オリゴヌクレオチドが、>37℃の融解温度(Tm)を有する、発明1~94のいずれかに記載のオリゴヌクレオチド。
[発明96]
タウオパチーを有する対象を治療する方法であって、前記対象に治療有効量の発明1~90のいずれかに記載のオリゴヌクレオチド又は組成物を投与することを含む、方法。
[発明97]
前記タウオパチーが、アルツハイマー病である、発明96に記載の方法。
[発明98]
CNS細胞においてMAPT mRNAの発現を阻害する方法であって、前記細胞を発明1~90のいずれかに記載のオリゴヌクレオチドを含むオリゴヌクレオチド又は組成物と接触させることを含み、前記オリゴヌクレオチドが、前記MAPT mRNAの少なくとも一部と相補的であるか又はハイブリダイズする核酸塩基配列を含有する、方法。
[発明99]
タウオパチーを有する対象を治療する方法であって、前記対象に治療有効量の発明1~90のいずれかに記載の前記オリゴヌクレオチドを含むオリゴヌクレオチド又は組成物を投与することを含み、前記オリゴヌクレオチドが、前記MAPT遺伝子配列の少なくとも一部と相補的であるか又はハイブリダイズする核酸塩基配列を含有する、方法。
[発明100]
前記タウオパチーが、アルツハイマー病である、発明99に記載の方法。
[発明101]
標的核酸と発明1~90のいずれかに記載の前記オリゴヌクレオチドを含むオリゴヌクレオチド又は組成物を含むアンチセンス化合物を接触させることによってMAPT遺伝子の発現を調節する方法であって、前記オリゴヌクレオチドが、前記MAPT遺伝子の少なくとも一部と相補的であるか又はハイブリダイズする核酸塩基配列を含有する、方法。
[発明102]
前記MAPT遺伝子の一部が、エクソン5である、発明98、99及び101のいずれかに記載の方法。
Claims (33)
- 式(VI):
5’X-Y-Z3’ (VI)
(式中、
X-Y-Zは、18~22個のヌクレオシドの配列を含むキメラオリゴヌクレオチドであり、且つ任意選択によりリガンド標的化基に対して5’及び/又は3’末端でコンジュゲートされ;
Xは、3~10ヌクレオシド長である修飾ヌクレオシドの配列を含むドメインであり;
Zは、3~10ヌクレオシド長である修飾ヌクレオシドの配列を含むドメインであり;且つ
Yは、チオホスフェートサブユニット間結合を介して連結された2~10個の2’-デオキシ-ヌクレオシドの配列を含むドメインであり、
前記オリゴヌクレオチドは、配列番号3、配列番号4、配列番号5及び配列番号6に示される塩基配列の少なくとも1つと親和性を示すものである)によって表されるMAPT遺伝子の少なくとも一部と相補的なキメラオリゴヌクレオチド。 - 前記Yドメインが、6~10個のヌクレオシド長である、請求項1に記載のキメラオリゴヌクレオチド。
- 前記X及び/又はZドメインが、N3’→P5’ホスホロアミダート又はN3’→P5’チオホスホロアミダートサブユニット間結合を介して連結された修飾ヌクレオシドの配列を含む、請求項1に記載のキメラオリゴヌクレオチド。
- 前記Yドメインが、少なくとも1つのホスホジエステルサブユニット間結合を含む、請求項1に記載のキメラオリゴヌクレオチド。
- 前記Yドメインが、チオホスフェートサブユニット間結合、及び任意選択により、1個又は2個のホスホジエステルサブユニット間結合を介して連結された2’-デオキシ-ヌクレオシドからなる、請求項1に記載のキメラオリゴヌクレオチド。
- 前記Xドメインが、修飾ヌクレオシドを含み、前記修飾が、独立して、2’-F、2’-F-N3’→P5’、2’-OMe、2’-OMe-N3’→P5’、2’-O-メトキシエトキシ、2’-O-メトキシエトキシ-N3’→P5’、立体構造的に制限されたヌクレオシド、2’-OH-N3’→P5’チオホスホロアミダート及び2’-OH-N3’→P5’ホスホロアミダートからなる群から選択される、請求項1に記載のキメラオリゴヌクレオチド。
- Zの機能ドメインが、修飾ヌクレオシドを含み、前記修飾が、2’-F、2’-F-N3’→P5’、2’-OMe、2’-OMe-N3’→P5’、2’-O-メトキシエトキシ、2’-O-メトキシエトキシ-N3’→P5’、立体構造的に制限されたヌクレオシド、2’-OH-N3’→P5’チオホスホロアミダート及び2’-OH-N3’→P5’ホスホロアミダートからなる群から選択される、請求項1に記載のキメラオリゴヌクレオチド。
- 前記X及び/又はZドメインが、N3’→P5’ホスホロアミダートサブユニット間結合を介して連結された1個以上の2’-デオキシ-ヌクレオシドを含む、請求項1に記載のキメラオリゴヌクレオチド。
- 前記X及びZドメインが、1個以上の2’-アラビノ-F及び/又は2’-リボ-F修飾ヌクレオシドを含み、各前記ヌクレオシドが、独立して、N3’→P5’ホスホロアミダート又はN3’→P5’チオホスホロアミダートサブユニット間結合の少なくとも1つを介して連結される、請求項1に記載のキメラオリゴヌクレオチド。
- 前記X及びZドメインが、1個以上の2’-OMe修飾ヌクレオシドを含み、各前記ヌクレオシドが、独立して、N3’→P5’ホスホロアミダート、N3’→P5’チオホスホロアミダート、又はチオホスフェートサブユニット間結合の少なくとも1つを介して連結される、請求項1に記載のキメラオリゴヌクレオチド。
- 前記X及びZドメインの各々における前記修飾ヌクレオシドが、チオホスフェートサブユニット間結合を介して連結された2’-OMe修飾ヌクレオシドであり、且つ前記修飾ヌクレオシドが、5-メチルシトシン核酸塩基を含むが、任意選択によりシトシンを含まない、請求項1に記載のキメラオリゴヌクレオチド。
- 前記修飾ヌクレオシドが、2,6-ジアミノプリン核酸塩基を含むが、任意選択によりアデニンを含まない、請求項1に記載のキメラオリゴヌクレオチド。
- 前記修飾ヌクレオシドが、5-メチルウラシル核酸塩基を含むが、任意選択によりウラシルを含まない、請求項1に記載のキメラオリゴヌクレオチド。
- 前記修飾ヌクレオシドが、2,6-ジアミノプリン核酸塩基を含むが、アデニン及び5-メチルウラシル核酸塩基、並びに任意選択によりウラシルを含まない、請求項1に記載のキメラオリゴヌクレオチド。
- 前記Yドメインが、6~8個の2’-デオキシ-ヌクレオシドを含む、請求項1に記載のキメラオリゴヌクレオチド。
- 前記X及びZドメインの各々における前記修飾ヌクレオシドが、チオホスフェートサブユニット間結合を介して任意選択により連結された2’-OMe修飾ヌクレオシド及び立体構造的に制限されたヌクレオシドを含み、且つ前記2’-OMe修飾ヌクレオシドが、5-メチルシトシン核酸塩基を含むが、任意選択によりシトシンを含まない、請求項1に記載のキメラオリゴヌクレオチド。
- 前記X及びZドメインの各々における前記修飾ヌクレオシドが、2’-OMe及び立体構造的に制限されたヌクレオシドを含む、請求項1に記載のキメラオリゴヌクレオチド。
- 前記X及びZドメインの各々における前記修飾ヌクレオシドが、立体構造的に制限されたヌクレオシドを含み、且つ少なくとも1個の修飾ヌクレオシドが、N3’→P5’ホスホロアミダート又はN3’→P5’チオホスホロアミダートサブユニット間結合を含む、請求項1に記載のキメラオリゴヌクレオチド。
- 前記Yドメインが、7~8個の2’-デオキシ-ヌクレオシドを含む、請求項1に記載のキメラオリゴヌクレオチド。
- 前記2’-OMe修飾ヌクレオシドが、5-メチルウラシル核酸塩基を含むが、任意選択によりウラシルを含まない、請求項1に記載のキメラオリゴヌクレオチド。
- 前記Yドメインが、9~10個の2’-デオキシ-ヌクレオシドを含む、請求項1に記載のキメラオリゴヌクレオチド。
- 前記X及びZドメインが、式(A1):
Aは、それぞれの場合において独立して、NH又はOであり;
Bは、それぞれの場合において独立して、未修飾又は修飾核酸塩基であり;
Wは、それぞれの場合において独立して、OR又はSRであり、Rは、H又は正に荷電した対イオンであり;
R’及びR’’はそれぞれ、それぞれの場合において独立して、H、F、Cl、OH、OMe、Me、及びO-メトキシエトキシからなる群から選択され;
R’’’は、Hであるか、又はR’及びR’’’を合わせて-O-CH2-又は-O-(CH2)2-を形成し、且つ
aは、3~9の整数であり、
R’、R’’及びR’’’がそれぞれHである場合、AはNHであり、且つ任意選択によりAがOである場合、WはSRである)によって表されるヌクレオチドを含む、請求項1に記載のキメラオリゴヌクレオチド。 - 前記X及び/又はZドメインが、1個以上のオリゴヌクレオチドを含み、前記修飾が、2’-O-メトキシエトキシ-N3’→P5’である、請求項1に記載のキメラオリゴヌクレオチド。
- 前記Xドメインが、1個以上のオリゴヌクレオチドを含み、前記修飾が2’-O-メトキシエトキシ-N3’→P5’である、請求項1に記載のキメラオリゴヌクレオチド。
- 前記Zドメインが、1個以上のオリゴヌクレオチドを含み、前記修飾が2’-O-メトキシエトキシ-N3’→P5’である、請求項1に記載のキメラオリゴヌクレオチド。
- 前記オリゴヌクレオチドの前記核酸塩基配列が、配列番号1、配列番号40、配列番号41、又は配列番号42に相当する、請求項1に記載のキメラオリゴヌクレオチド。
- 請求項1~26のいずれかに記載のオリゴヌクレオチド及び薬学的に許容される賦形剤を含む医薬組成物。
- 前記組成物が、髄腔内又は脳室内送達に好適である、請求項27に記載の医薬組成物。
- CNS細胞におけるMAPT遺伝子発現を阻害する方法であって、前記細胞を請求項1~28のいずれかに記載のオリゴヌクレオチド又は組成物と接触させることを含む、方法。
- CNS細胞におけるMAPT mRNAの転写を阻害する方法であって、前記細胞を請求項1~28のいずれかに記載のオリゴヌクレオチド又は組成物と接触させることを含む、方法。
- MAPT遺伝子と複合体を形成した前記オリゴヌクレオチドが、>37℃の融解温度(Tm)を有する、請求項1~28のいずれかに記載のオリゴヌクレオチド。
- CNS細胞においてMAPT mRNAの発現を阻害する方法であって、前記細胞を請求項1~28のいずれかに記載のオリゴヌクレオチドを含むオリゴヌクレオチド又は組成物と接触させることを含み、前記オリゴヌクレオチドが、前記MAPT mRNAの少なくとも一部と相補的であるか又はハイブリダイズする核酸塩基配列を含有する、方法。
- 標的核酸と請求項1~28のいずれかに記載の前記オリゴヌクレオチドを含むオリゴヌクレオチド又は組成物を含むアンチセンス化合物を接触させることによってMAPT遺伝子の発現を調節する方法であって、前記オリゴヌクレオチドが、前記MAPT遺伝子の少なくとも一部と相補的であるか又はハイブリダイズする核酸塩基配列を含有する、方法。
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