JPWO2015099112A1 - 熱安定性が向上したフラビン結合型グルコースデヒドロゲナーゼ - Google Patents
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Abstract
Description
しかしながら、センサーチップの作製時における過酷な熱条件に供する可能性を想定すると、さらなる熱安定性を付与する試みが継続的に求められている。
(1)配列番号1で示されるアミノ酸配列、配列番号1で示されるアミノ酸配列と70%以上同一なアミノ酸配列、または該アミノ酸配列(配列番号1で示されるアミノ酸配列または配列番号1で示されるアミノ酸配列と70%以上同一なアミノ酸配列)において1もしくは数個のアミノ酸が欠失、置換または付加されたアミノ酸配列からなり、以下よりなる群から選択されるアミノ酸に対応する位置で1つまたはそれ以上のアミノ酸置換を有し、前記置換を行う前と比較して、熱安定性が向上していることを特徴とするFAD−GDH:
配列番号1記載のアミノ酸配列における66位のアミノ酸
配列番号1記載のアミノ酸配列における68位のアミノ酸
配列番号1記載のアミノ酸配列における88位のアミノ酸
配列番号1記載のアミノ酸配列における158のアミノ酸
配列番号1記載のアミノ酸配列における233位のアミノ酸、
配列番号1記載のアミノ酸配列における385位のアミノ酸、
配列番号1記載のアミノ酸配列における391位のアミノ酸、および
配列番号1記載のアミノ酸配列における557位のアミノ酸。
(2)配列番号1で示されるアミノ酸配列、配列番号1で示されるアミノ酸配列と70%以上同一なアミノ酸配列、または
配列番号1で示されるアミノ酸配列または配列番号1で示されるアミノ酸配列と70%以上同一なアミノ酸配列において1もしくは数個のアミノ酸が欠失、置換または付加されたアミノ酸配列からなり、以下よりなる群から選択されるアミノ酸に対応する位置で1つまたはそれ以上のアミノ酸置換を有することを特徴とするFAD−GDH:
配列番号1記載のアミノ酸配列における66位に対応する位置のアミノ酸がチロシンである、
配列番号1記載のアミノ酸配列における68位に対応する位置のアミノ酸がグリシンである、
配列番号1記載のアミノ酸配列における88位に対応する位置のアミノ酸がアラニンである、
配列番号1記載のアミノ酸配列における158位に対応する位置のアミノ酸がヒスチジンである、
配列番号1記載のアミノ酸配列における233位に対応する位置のアミノ酸がアルギニンである、
配列番号1記載のアミノ酸配列における385位に対応する位置のアミノ酸がスレオニンである、
配列番号1記載のアミノ酸配列における391位に対応する位置のアミノ酸がイソロイシンである、および
配列番号1記載のアミノ酸配列における557位に対応する位置のアミノ酸がバリンである。
(3)以下に表されるFAD−GDH活性を有するタンパク質を構成するアミノ酸配列において66位のアスパラギン残基に対応する位置のアミノ酸がチロシンに置換された改変タンパク質であるFAD−GDH:
配列番号1記載のアミノ酸配列からなり、FAD−GDH活性を有するタンパク質、または
配列番号1のアミノ酸配列において、66位のアスパラギン残基に対応する位置のアミノ酸残基以外のアミノ酸の1もしくは数個のアミノ酸が欠失、置換または付加されたアミノ酸からなり、FAD−GDH活性を有するタンパク質。
(4)以下に表されるFAD−GDH活性を有する親タンパク質を構成するアミノ酸配列において68位のアスパラギン残基に対応する位置のアミノ酸がグリシンに置換された改変タンパク質であるFAD−GDH:
配列番号1記載のアミノ酸配列からなり、FAD−GDH活性を有するタンパク質、または
配列番号1のアミノ酸配列において、68位のアスパラギン残基に対応する位置のアミノ酸残基以外のアミノ酸の1もしくは数個のアミノ酸が欠失、置換または付加されたアミノ酸からなり、FAD−GDH活性を有するタンパク質。
(5)以下に表されるFAD−GDH活性を有する親タンパク質を構成するアミノ酸配列において88位のシステイン残基に対応する位置のアミノ酸がアラニンに置換された改変タンパク質であるFAD−GDH:
配列番号1記載のアミノ酸配列からなり、FAD−GDH活性を有するタンパク質、または
配列番号1のアミノ酸配列において、88位のシステイン残基に対応する位置のアミノ酸残基以外のアミノ酸の1もしくは数個のアミノ酸が欠失、置換または付加されたアミノ酸からなり、FAD−GDH活性を有するタンパク質。
(6)以下に表されるFAD−GDH活性を有する親タンパク質を構成するアミノ酸配列において158位のスレオニン残基に対応する位置のアミノ酸がヒスチジンに置換された改変タンパク質であるFAD−GDH:
配列番号1記載のアミノ酸配列からなり、FAD−GDH活性を有するタンパク質、または
配列番号1のアミノ酸配列において、158位のスレオニン残基に対応する位置のアミノ酸残基以外のアミノ酸の1もしくは数個のアミノ酸が欠失、置換または付加されたアミノ酸からなり、FAD−GDH活性を有するタンパク質。
(7)以下に表されるFAD−GDH活性を有するタンパク質を構成するアミノ酸配列において233位のグルタミン残基に対応する位置のアミノ酸がアルギニンに置換された改変タンパク質であるFAD−GDH:
配列番号1記載のアミノ酸配列からなり、FAD−GDH活性を有するタンパク質、または
配列番号1のアミノ酸配列において、233位のグルタミン残基に対応する位置のアミノ酸残基以外のアミノ酸の1もしくは数個のアミノ酸が欠失、置換または付加されたアミノ酸からなり、FAD−GDH活性を有するタンパク質。
(8)以下に表されるフラビン結合型グルコースデヒドロゲナーゼ活性を有するタンパク質を構成するアミノ酸配列において385位のアラニン残基に対応する位置のアミノ酸がスレオニンに置換された改変タンパク質であるフラビン結合型グルコースデヒドロゲナーゼ:
配列番号1記載のアミノ酸配列からなり、フラビン結合型グルコースデヒドロゲナーゼ活性を有するタンパク質、または
配列番号1のアミノ酸配列において、385位のアラニン残基に対応する位置のアミノ酸残基以外のアミノ酸の1もしくは数個のアミノ酸が欠失、置換もしくは付加されたアミノ酸からなり、フラビン結合型グルコースデヒドロゲナーゼ活性を有するタンパク質。
(9)以下に表されるフラビン結合型グルコースデヒドロゲナーゼ活性を有するタンパク質を構成するアミノ酸配列において391位のロイシン残基に対応する位置のアミノ酸がイソロイシンに置換された改変タンパク質であるフラビン結合型グルコースデヒドロゲナーゼ:
配列番号1記載のアミノ酸配列からなり、フラビン結合型グルコースデヒドロゲナーゼ活性を有するタンパク質、または
配列番号1のアミノ酸配列において、391位のロイシン残基に対応する位置のアミノ酸残基以外のアミノ酸の1もしくは数個のアミノ酸が欠失、置換もしくは付加されたアミノ酸からなり、フラビン結合型グルコースデヒドロゲナーゼ活性を有するタンパク質。
(10)以下に表されるFAD−GDH活性を有するタンパク質を構成するアミノ酸配列において557位のロイシン残基に対応する位置のアミノ酸がバリンに置換された改変タンパク質であるFAD−GDH:
配列番号1記載のアミノ酸配列からなり、FAD−GDH活性を有するタンパク質、または
配列番号1のアミノ酸配列において、557位のロイシン残基に対応する位置のアミノ酸残基以外のアミノ酸の1もしくは数個のアミノ酸が欠失、置換または付加されたアミノ酸からなり、FAD−GDH活性を有するタンパク質。
(11)配列番号1で示されるアミノ酸配列、または配列番号1で示されるアミノ酸配列と70%以上同一なアミノ酸配列、または
配列番号1で示されるアミノ酸配列または配列番号1で示されるアミノ酸配列と70%以上同一なアミノ酸配列において1もしくは数個アミノ酸が欠失、置換または付加されたアミノ酸配列に対応する位置のアミノ酸が、以下のいずれかに記載されるアミノ酸残基であるFAD−GDH:
配列番号1記載のアミノ酸配列における66位のアスパラギンに対応する位置のアミノ酸がチロシンであり、かつ、68位のアスパラギンに対応する位置のアミノ酸がグリシンである。
配列番号1記載のアミノ酸配列における88位のシステインに対応する位置のアミノ酸がアラニンであり、66位のアスパラギンに対応する位置のアミノ酸がチロシンであり、かつ、68位のアスパラギンに対応する位置のアミノ酸がグリシンである、
配列番号1記載のアミノ酸配列における88位のシステインに対応する位置のアミノ酸がアラニンであり、かつ、158位のスレオニンに対応する位置のアミノ酸がヒスチジンである、
配列番号1記載のアミノ酸配列における88位のシステインに対応する位置のアミノ酸がアラニンであり、かつ、233位のグルタミンに対応する位置のアミノ酸がアルギニンである、または
配列番号1記載のアミノ酸配列における88位のシステインに対応する位置のアミノ酸がアラニンであり、557位のロイシンに対応する位置のアミノ酸がバリンであし、かつ、559位のセリンに対応する位置のアミノ酸がリジンである。
(12)以下の(I)および/または(II)の性質を備え上記(1)〜(11)のいずれか1項に記載のFAD−GDH:
(I)pH7.0、40℃、15分間の熱処理後に50%以上の残存活性率を有する。
(II)D−グルコースへの反応性に対するD−キシロースへの反応性の割合(Xyl/Glc(%))が2%以下である。
(III)変異を導入した後の比活性が変異を導入する前の比活性と比べて60%以上である。
(13)上記(1)〜(12)のいずれか1項に記載のFAD−GDHをコードするFAD−GDH遺伝子。
(14)上記(13)に記載のFAD−GDH遺伝子をベクターDNAに挿入したことを特徴とする組換え体DNA。
(15)上記(14)記載の組換え体DNAが導入されている宿主細胞。
(16)FAD−GDHを製造する方法であり、以下の工程を含む方法:
上記(15)に記載の宿主細胞を培養する工程、
前記宿主細胞中に含まれるFAD−GDH遺伝子を発現させる工程、および
(a前記培養物からFAD−GDHを単離する工程。
(17)上記(1)〜(12)のいずれか1項に記載のFAD−GDHを用いるグルコース測定方法。
(18)上記(1)〜(12)のいずれか1項に記載のFAD−GDHを含むグルコースアッセイキット。
(19)上記(1)〜(12)のいずれか1項に記載のFAD−GDHを含むグルコースセンサー。
本発明のFAD−GDHは、電子受容体存在下でグルコースの水酸基を酸化してグルコノ−δ−ラクトンを生成する反応を触媒する。
本発明のFAD−GDHの活性は、この作用原理を利用し、例えば、電子受容体としてフェナジンメトサルフェート(PMS)および2,6−ジクロロインドフェノール(DCIP)を用いた以下の系を用いて測定することができる。
(反応1) D−グルコ−ス + PMS(酸化型)
→ D−グルコノ−δ−ラクトン + PMS(還元型)
(反応2) PMS(還元型) + DCIP(酸化型)
→ PMS(酸化型) + DCIP(還元型)
本発明のFAD−GDHの活性は、以下の手順に従って測定する。100mM リン酸緩衝液(pH7.0) 2.05mL、1M D−グルコース溶液 0.6mLおよび2mM DCIP溶液 0.15mLを混合し、37℃で5分間保温する。次いで、15mM PMS溶液 0.1mLおよび酵素サンプル溶液0.1mLを添加し、反応を開始する。反応開始時、および経時的な吸光度を測定し、酵素反応の進行に伴う600nmにおける吸光度の1分間あたりの減少量(ΔA600)を求め、次式に従いGDH活性を算出する。この際、GDH活性は、37℃において濃度200mMのD−グルコース存在下で1分間に1μmolのDCIPを還元する酵素量を1Uと定義する。
本発明のFAD−GDHは、配列番号1で示されるアミノ酸配列、または該アミノ酸配列と同一性の高い、例えば、好ましくは70%以上、より好ましくは75%以上、さらに好ましくは80%以上、さらに好ましくは85%以上、さらに好ましくは90%以上、最も好ましくは95%以上同一なアミノ酸配列、または該アミノ酸配列において1もしくは数個のアミノ酸が欠失、置換または付加されたアミノ酸配列からなり、配列番号1記載のアミノ酸配列における66位、68位、88位、158位、233位、385位、391位および557位から選択されるアミノ酸に対応する位置で、1つまたはそれ以上のアミノ酸置換を有することを特徴とする。
好ましくは、本発明のFAD−GDHにおける、上述の66位に対応する位置でのアミノ酸置換とは、上述の66位に対応する位置でのアミノ酸がチロシンに置換される置換であり、68位に対応する位置でのアミノ酸置換とは、上述の68位に対応する位置でのアミノ酸がグリシンに置換される置換であり、88位に対応する位置でのアミノ酸置換とは、上述の88位に対応する位置でのアミノ酸がアラニンに置換される置換であり、158位に対応する位置でのアミノ酸置換とは、上述の158位に対応する位置でのアミノ酸がヒスチジンに置換される置換であり、233位に対応する位置でのアミノ酸置換とは、上述の233位に対応する位置でのアミノ酸がアルギニンに置換される置換であり、385位に対応する位置でのアミノ酸置換とは、上述の385位に対応する位置でのアミノ酸がスレオニンに置換される置換であり、391位に対応する位置でのアミノ酸置換とは、上述の391位に対応する位置でのアミノ酸がイソロイシンに置換される置換であり、557位に対応する位置でのアミノ酸置換とは、上述の557位に対応する位置でのアミノ酸がバリンに置換される置換である。なお、配列番号1においては、本発明の置換を有さない66位のアミノ酸はアスパラギンであり、68位のアミノ酸はアスパラギンであり、88位のアミノ酸はシステインであり、158位のアミノ酸はスレオニンであり、233位のアミノ酸はグルタミンであり、557位のアミノ酸はロイシンである。
目的とするアミノ酸置換導入方法としては、例えばランダムに変異を導入する方法あるいは想定した位置に部位特異的変異を導入する方法が挙げられる。前者の方法としては、エラープローンPCR法(Techniques,1,11−15,(1989))や、増殖の際、プラスミドの複製にエラーを起こしやすく、改変を生じやすいXL1−Redコンピテントセル(STRATAGENE社製)を用いる方法等がある。また、後者の方法として、目的とするタンパク質の結晶構造解析により立体構造を構築し、その情報をもとに目的の効果を付与すると予想されるアミノ酸を選択し、市販のQuick Change Site Directed Mutagenesis Kit(STRATAGENE社製)等により部位特異的変異を導入する方法がある。あるいは、後者の方法として、目的とするタンパク質と相同性の高い公知のタンパク質の立体構造を用いて、目的の効果を付与すると予想されるアミノ酸を選択し、部位特異的変異を導入する方法もある。
本発明における耐熱性の向上は、本明細書中に記載の活性測定方法及び熱安定性測定方法に記載した条件において評価される。なお、本明細書における熱処理時のpHは7.0であるが、これは本発明のFAD−GDHが血液中のグルコース(血糖値)を測定する目的で開発されたものであり、血液のpHが中性付近であることによる。このように実用になるべく近い条件で評価を行うことによって、より有用な酵素の取得が可能となる。
本発明のFAD−GDHを効率よく取得するためには、遺伝子工学的手法を利用するのが好ましい。本発明のFAD−GDHをコードする遺伝子(以下、FAD−GDH遺伝子)を取得するには、通常一般的に用いられている遺伝子のクローニング方法を用いればよい。例えば、公知のFAD−GDHを出発物質とし、それを改変することにより本発明のFAD−GDHを取得するには、FAD−GDH生産能を有する公知の微生物菌体や種々の細胞から、常法、例えば、Current Protocols in Molecular Biology (WILEY Interscience,1989)記載の方法により、染色体DNA又はmRNAを抽出することができる。さらにmRNAを鋳型としてcDNAを合成することができる。このようにして得られた染色体DNA又はcDNAを用いて、染色体DNA又はcDNAのライブラリーを作製することができる。
出発物質であるFAD−GDH遺伝子の変異処理は、企図する変異形態に応じた、公知の任意の方法で行うことができる。すなわち、FAD−GDH遺伝子あるいは当該遺伝子の組み込まれた組換え体DNAと変異原となる薬剤とを接触・作用させる方法;紫外線照射法;遺伝子工学的手法;又は蛋白質工学的手法を駆使する方法等を広く用いることができる。
上記変異処理に用いられる変異原となる薬剤としては、例えば、ヒドロキシルアミン、N−メチル−N’−ニトロ−N−ニトロソグアニジン、亜硝酸、亜硫酸、ヒドラジン、蟻酸、若しくは5−ブロモウラシル等を挙げることができる。
この接触・作用の諸条件は、用いる薬剤の種類等に応じた条件を採ることが可能であり、現実に所望の変異をMucor属由来FAD−GDH遺伝子において惹起することができる限り特に限定されない。通常、好ましくは0.5〜12Mの上記薬剤濃度において、20〜80℃の反応温度下で10分間以上、好ましくは10〜180分間接触・作用させることで、所望の変異を惹起可能である。紫外線照射を行う場合においても、上記の通り常法に従い行うことができる(現代化学、p24〜30、1989年6月号)。
なお、上記遺伝子改変法の他に、有機合成法又は酵素合成法により、直接所望の熱安定性に優れた改変FAD−GDH遺伝子を合成することもできる。
本発明のFAD−GDHは、公知のFAD−GDHを改変することにより取得することもできる。公知のFAD−GDHの由来微生物の好適な例としては、ケカビ亜門、好ましくはケカビ綱、より好ましくはケカビ目、さらに好ましくはケカビ科に分類される微生物を挙げることができる。具体的には、ムコール(Mucor)属、アブシジア(Absidia)属、アクチノムコール(Actinomucor)属、シルシネラ(Circinella)属由来のFAD−GDH等が挙げられる。
Mucor属に分類される微生物であって、具体的な好ましい微生物の例としては、Mucor prainii、Mucor javanicus、Mucor circinelloides f. circinelloides、Mucor guilliermondii、Mucor hiemalis f. silvaticus、Mucor subtilissimus、Mucor dimorphosporus等が挙げられる。より具体的には、特許文献5に記載のMucor prainii、Mucor javanicus、Mucor circinelloides f. circinelloides、Mucor guilliermondii NBRC9403、Mucor hiemalis f. silvaticus NBRC6754、Mucor subtilissimus NBRC6338、Mucor RD056860、Mucor dimorphosporus NBRC5395等が挙げられる。Absidia属に分類される微生物であって、具体的な好ましい微生物の例としては、Absidia cylindrospora、Absidia hyalosporaを挙げることができる。より具体的には、特許文献5に記載のAbsidia cylindrospora、Absidia hyalosporaを挙げることができる。Actinomucor属に分類される微生物であって、具体的な好ましい微生物の例としては、Actinomucor elegansを挙げることができる。より具体的には、特許文献5に記載のActinomucor elegansを挙げることができる。Circinella属に分類される微生物であって、具体的な好ましい微生物の例としては、Circinella minor、Circinella mucoroides、Circinella muscae、Circinella rigida、Circinella simplex、Circinella umbellataを挙げることができる。より具体的には、Circinella minor NBRC6448、Circinella mucoroides NBRC4453、Circinella muscae NBRC6410、Circinella rigida NBRC6411、Circinella simplex NBRC6412、Circinella umbellata NBRC4452、Circinella umbellata NBRC5842、Circinella RD055423及びCircinella RD055422を挙げることができる。なお、NBRC菌株およびRD菌株はNBRC(独立行政法人製品評価技術基盤機構 バイオテクノロジーセンター)の保管菌株である。
上述のように得られた本発明のFAD−GDH遺伝子を、常法により、バクテリオファージ、コスミド、又は原核細胞若しくは真核細胞の形質転換に用いられるプラスミド等のベクターに組み込み、各々のベクターに対応する宿主細胞を常法により、形質転換又は形質導入をすることができる。
原核宿主細胞の一例としては、エシェリシア属に属する微生物、例えば大腸菌K−12株、エシェリヒア・コリーBL21(DE3)、エシェリヒア・コリーJM109、エシェリヒア・コリーDH5α、エシェリヒア・コリーW3110、エシェリヒア・コリーC600等(いずれもタカラバイオ社製)が挙げられる。それらを形質転換し、または、それらに形質導入して、DNAが導入された宿主細胞(形質転換体)を得る。こうした宿主細胞に組み換えベクターを移入する方法としては、例えば宿主細胞がエシェリヒア・コリーに属する微生物の場合には、カルシウムイオンの存在下で組み換えDNAの移入を行う方法などを採用することができる、更にエレクトロポレーション法を用いても良い。更には市販のコンピテントセル(例えばECOS Competent エシェリヒア・コリーBL21(DE3);ニッポンジーン製)を用いても良い。
本発明のFAD−GDHは、上述のように取得した本発明のFAD−GDHを生産する宿主細胞を培養し、前記宿主細胞中に含まれるFAD−GDH遺伝子を発現させ、次いで、前記培養物からFAD−GDHを単離することにより、製造すればよい。
上記宿主細胞を培養する培地としては、例えば、酵母エキス、トリプトン、ペプトン、肉エキス、コーンスティープリカーあるいは大豆若しくは小麦ふすまの浸出液等の1種以上の窒素源に、塩化ナトリウム、リン酸第1カリウム、リン酸第2カリウム、硫酸マグネシウム、塩化マグネシウム、塩化第2鉄、硫酸第2鉄あるいは硫酸マンガン等の無機塩類の1種以上を添加し、さらに必要により糖質原料、ビタミン等を適宜添加したものが用いられる。
培地の初発pHは、限定されないが、例えば、pH6〜9に調整することができる。
培養は、10〜42℃の培養温度、好ましくは25℃前後の培養温度で4〜24時間、さらに好ましくは25℃前後の培養温度で4〜8時間、通気攪拌深部培養、振盪培養、静置培養等により実施すればよい。
本発明はまた、本発明のFAD−GDHを含むグルコースアッセイキットを開示し、本発明のFAD−GDHを用いて血中のグルコース(血糖値)を測定することができる。
本発明のグルコースアッセイキットには、少なくとも1回のアッセイに十分な量の本発明に従う改変型FAD−GDHを含む。典型的には、本発明のグルコースアッセイキットは、本発明の改変型FAD−GDHに加えて、アッセイに必要な緩衝液、メディエーター、キャリブレーションカーブ作製のためのグルコース標準溶液を含む。本発明のグルコース測定法やグルコースアッセイキットに用いる改変型FAD−GDHは、種々の形態で、例えば、凍結乾燥された試薬として、または適切な保存溶液中に溶解されて提供することができる。
本発明はまた、本発明のFAD−GDHを用いるグルコースセンサーを開示する。電極としては、カーボン電極、金電極、白金電極などを用い、この電極上に本発明のFAD−GDHを固定化する。固定化方法としては、架橋試薬を用いる方法、高分子マトリックス中に封入する方法、透析膜で被覆する方法、光架橋性ポリマー、導電性ポリマー、酸化還元ポリマーなどがあり、あるいはフェロセンあるいはその誘導体に代表される電子メディエーターとともにポリマー中に固定あるいは電極上に吸着固定してもよく、またこれらを組み合わせて用いてもよい。典型的には、グルタルアルデヒドを用いて本発明のFAD−GDHをカーボン電極上に固定化した後、アミン基を有する試薬で処理してグルタルアルデヒドをブロッキングする。
[試験例]
(1)各種の改変型FAD−GDHを発現する酵母形質転換体の作製
特許文献7に記載の方法に準じ、配列番号2のMucor prainii由来FAD−GDH遺伝子(野生型MpGDH遺伝子)をコードする組換え体プラスミド(pYES2C−Mp(野生型))を取得した。
得られた組換え体プラスミドpYE2C−Mpを鋳型として、各アミノ酸置換導入用の合成ヌクレオチド、KOD−Plus−(東洋紡績社製)を用い、以下の条件でPCR反応を行った。
すなわち、10×KOD−Plus−緩衝液を5μl、dNTPが各2mMになるよう調製されたdNTPs混合溶液を5μl、25mMのMgSO4溶液を2μl、鋳型となるpYE2C−Mpを50ng、上記合成オリゴヌクレオチドをそれぞれ15pmol、KOD−Plus−を1Unit加えて、滅菌水により全量を50μlとして「反応液」を調製した。サーマルサイクラー(エッペンドルフ社製)を用いて、調製した反応液を94℃で2分間インキュベートし、続いて、「94℃、15秒」−「55℃、30秒」−「68℃、8分」のサイクルを30回繰り返した。
その後、S.cerevisiae用形質転換キット(Invitrogen社製)を用いて、pYE2C−Mp(野生型)、および各種変異が導入されたpYES2C−Mp(改変型、例えば、実施例1におけるpYE2C−Mp−N66Y/N68G、pYE2C−Mp−C88A等)をInv−Sc株(Invitrogen社製)に形質転換することにより、野生型MpGDHを発現する酵母形質転換体Sc−Mp(野生型)株、および各種の改変型MpGDHを発現する酵母形質転換株Sc−Mp(改変型、例えば、実施例1におけるSc−Mp−N66Y/N68G、Sc−Mp−C88A等)株をそれぞれ取得した。
酵母形質転換体Sc−Mp(野生型)、および、各種の酵母形質転換体Sc−Mp(改変型、例えば、実施例1におけるSc−Mp−N66Y/N68G、Sc−Mp−C88A等)を、各々、5mLの前培養用液体培地[0.67%(w/v)アミノ酸不含有イーストニトロゲンベース(BD)、0.192%(w/v)ウラシル不含有酵母合成ドロップアウト培地用添加物(sigma社製)、2.0%(w/v)ラフィノース]中で、30℃にて24時間培養した。その後、前培養液1mLを4mLの本培養用液体培地[0.67%(w/v)アミノ酸不含有イーストニトロゲンベース、0.192%(w/v)ウラシル不含有酵母合成ドロップアウト培地用添加物、2.5%(w/v)D−ガラクトース、0.75%(w/v)ラフィノース]に加えて、30℃で16時間培養する。この培養液を遠心分離(10,000×g、4℃、3分間)により菌体と培養上清に分離し、培養上清液を熱安定性の評価に用いた。
FAD−GDHの熱安定性評価は、まず、上述のように回収した評価対象のFAD−GDHを含む培養上清液を約1U/mlになるように酵素希釈液(100mM リン酸カリウム緩衝液(pH7.0))にて希釈する。そして、この酵素溶液(0.1ml)を2本用意し、そのうち1本は4℃で保存し、もう1本には、40℃、15分間の加温処理を施した。
加温処理後、各サンプルのFAD−GDH活性を測定し、4℃で保存したものの酵素活性を100としたときの、40℃、15分間処理後の活性値を「活性残存率(%)」として算出した。この活性残存率(%)を、各種FAD−GDHの耐熱性評価の指標とした。
野生型MpGDHを発現するSc−Mp(野生型)株の培養上清を用いて、野生型MpGDHの熱安定性を評価した結果、野生型MpGDHの40℃、15分熱処理後の残存活性率は42.4%であった。よって、各種改変型MpGDHの熱処理後の残存活性率が42.4%より高かった場合に、MpGDHの熱安定性が向上していると判断することができる。
基質特異性についても、熱安定性と同様に、上記(2)の方法に従って回収した各種酵母培養上清液を用いて評価を行った。まず、上述の活性測定法の基質をD−グルコースから同モル濃度のマルトースまたはD−キシロースとした系に変えてそれぞれの基質に対する活性を測定した。そして、これらの値から、「D−グルコースへの反応性に対するマルトースへの反応性の割合(Mal/Glc(%))」および「D−グルコースへの反応性に対するD−キシロースへの反応性の割合(Xyl/Glc(%))」を算出した。
Sc−Mp(野生型)株にて発現させた野生型MpGDHの(Mal/Glc(%))および(Xyl/Glc(%))は、それぞれ0.8%、1.4%であった。このような基質特異性は、従来知られたその他のFAD-GDHと比較しても非常に優れており、測定目的物質であるD−グルコースを精度よく測定できることが期待される。
上記試験例で記述した方法に従って、pYE2C−Mp(野生型)を鋳型プラスミドとして、表1に示した配列番号の合成ヌクレオチドの組み合わせでPCR反応を行った。次いで、増幅されたDNAを含むベクターを用いて大腸菌JM109株を形質転換し、生育したコロニーが保持するプラスミドDNA中のMpGDHをコードするDNAの塩基配列決定を行うことにより、配列番号1に記載のアミノ酸配列の66位のアスパラギンがチロシン及び68位のアスパラギンがグリシンに、88位のシステインがアラニンに、158位のスレオニンがヒスチジンに、233位のグルタミンがアルギニンに、557位のロイシンがバリン及び559位のセリンがリジンに置換された組換え体プラスミドであるpYE2C−Mp−N66Y/N68G、pYE2C−Mp−C88A、pYE2C−Mp−T158H、pYE2C−Mp−Q233R、pYE2C−Mp−L557V/S559Kをそれぞれ取得した。
さらに、これらの熱安定性が向上しているFAD−GDHは、高い基質特異性も維持されていることがわかった。すなわち、表1に記載するような本発明の熱安定性向上変異を有する改変型酵素は、野生型FAD-GDHが有する基質特異性に対し負の影響を与えることなく、場合によっては、野生型酵素の基質特異性を上回るようなものも含み得ることがわかった。
次に、実施例2に示すような変異を多重的に有する変異体を作製し、それらにおける熱安定性向上効果を検証した。具体的には、上記試験例で記述した方法に従って、pYE2C−Mp−C88Aを鋳型プラスミドとし、表2に記載の配列番号の合成ヌクレオチドの組み合わせでPCR反応を行った。次いで、増幅されたDNAを含むベクターを用いて大腸菌JM109株を形質転換し、生育したコロニーが保持するプラスミドDNA中のMpGDHをコードするDNAの塩基配列決定を行うことにより、88位のシステインがアラニンに置換されたことを特徴とし、さらに別のアミノ酸置換を兼ね備えた下記の多重変異体を作製した。具体的には、配列番号1に記載のアミノ酸配列の88位のシステインがアラニンに置換され、66位のアスパラギンがチロシンに置換され、かつ、68位のアスパラギンがグリシンに置換された3重変異体、88位のシステインがアラニンに置換され、かつ、158位のスレオニンがヒスチジンに置換された2重変異体、88位のシステインがアラニンに置換され、かつ、233位のグルタミンがアルギニンに置換された2重変異体、88位のシステインがアラニンに置換され、557位のロイシンがバリンに置換され、かつ、559位のセリンがリジンに置換された3重変異体をコードする組換え体プラスミドであるpYE2C−Mp−C88A/N66Y/N68G、pYE2C−Mp−C88A/T158H、pYE2C−Mp−C88A/Q233R、pYE2C−Mp−C88A/L557V/S559Kを、それぞれ取得した。
さらに、該多重変異体では高い基質特異性も維持または向上されていることがわかり、特にC88A/N66Y/N68G及びC88A/T158Hにおいては、野生型の基質特異性を上回ることがわかった。
次に、実施例3に示すような単変異を有する変異体を作製し、それらにおける熱安定性向上効果を検証した。具体的には、上記試験例で記述した方法に従って、pYE2C−Mp(野生型)を鋳型プラスミドとし、表3に記載の配列番号の合成ヌクレオチドの組み合わせでPCR反応を行った。次いで、増幅されたDNAを含むベクターを用いて大腸菌JM109株を形質転換し、生育したコロニーが保持するプラスミドDNA中のMpGDHをコードするDNAの塩基配列決定を行うことにより、配列番号1に記載のアミノ酸配列の66位のアスパラギンがチロシンに、68位のアスパラギンがグリシンに、391位のロイシンがイソロイシンに、557位のロイシンがバリンに、559位のセリンがリジンに、385位のアラニンがスレオニンに置換された変異体をコードする組換え体プラスミドであるpYE2C−Mp−N66Y、pYE2C−Mp−N68G、pYE2C−Mp−L391I、pYE2C−Mp−L557V、pYE2C−Mp−S559K、pYE2C−Mp−A385Tをそれぞれ取得した。
さらに、これら変異体ではXyl/Glc(%)がすべて2%以下であり、高い基質特異性も維持または向上されていることがわかった。
次に、実施例1及び3で取得した各変異体(N66Y/N68G、C88A、T158H、Q233R、L557V/S559K、L391I、A385T)のタンパク質量あたりの活性(比活性)を測定した。具体的には、以下の操作を行った。実施例1及び3と同様にして取得した各変異体の酵母培養上清液を遠心式フィルターユニット(Amicon Ultra 10K、MERCK MILLIPORE社製)により濃縮後、20mMのリン酸カリウム緩衝液(pH6.0)に置換した。濃縮した酵母培養上清液をSDS−PAGEで確認すると、FAD−GDHに相当するバンド以外はほぼ見られないため、酵母培養上清液中にはほとんど夾雑タンパク質は存在していないことがわかった。よって、濃縮した該酵母培養上清液を用いて、GDH活性及び280nmの吸光度(A280)によりタンパク質濃度を測定し、それぞれの変異体における比活性(U/A280)を測定した。その後、同様にして測定した変異導入前(野生型)の比活性を100としたときの各変異体における比活性の割合を「相対比活性」として算出し、比活性の評価に用いた。つまり、相対比活性が100より大きいときは変異導入前より比活性が向上したとみなし、100より小さいときには変異導入前より比活性が低下したとみなすことができる。なお、変異体C88Aについて、本方法の粗酵素液を用いて測定した比活性より算出した相対比活性は125であったが、Superdex 200 10/300GL(GEヘルスケアバイオサイエンス社製)のカラムにより精製したC88Aの相対比活性は119であることから、本方法により算出した相対比活性の値は、精製酵素で測定した相対比活性の値と相関していると判断した。
また、特許文献7で記述されている、耐熱性が向上したケカビ由来FAD-GDHの変異体V232E、T387A、I545Tについても、上記と同様にして相対比活性を測定し、さらに試験例(2)、(3)に従って熱安定性及び基質特異性の評価を行った。
一方、本発明の耐熱性向上変異体であるN66Y/N68G、C88A、T158H、Q233R、L557V/S559K、L391IまたはA385Tでは、いずれも相対比活性が60%以上に保持されており、さらに、前述のとおり、該変異体はXyl/Glc(%)がすべて2%より低く、高い基質特異性も維持されていることがわかる。
なお、本発明の熱安定性が向上した変異酵素の中には、本明細書中に開示するように、本発明者らが先に見出した特許第4648993号公報に記載のケカビ由来FAD−GDHと同様、グルコースへの高い基質特異性も兼ね備え、D−キシロース等の糖化合物が夾雑する条件下でも正確にD−グルコース値を測定できるものも含まれていることがわかった。
さらに、本発明の変異体は比活性も高く維持されていることがわかった。血糖センサへの用途においては、より比活性の高い酵素が望まれる。比活性の高い酵素を用いることで、センサ上での反応性が向上し、より短い時間での測定が可能になる。また、使用する酵素量の低減によるコストの削減や、夾雑物質によるノイズの低減等の利点も期待されることから、比活性の高い酵素の開発は、産業上非常に有用である。
Claims (19)
- 配列番号1で示されるアミノ酸配列、配列番号1で示されるアミノ酸配列と70%以上同一なアミノ酸配列、または
配列番号1で示されるアミノ酸配列または配列番号1で示されるアミノ酸配列と70%以上同一なアミノ酸配列において1もしくは数個のアミノ酸が欠失、置換または付加されたアミノ酸配列からなり、以下よりなる群から選択されるアミノ酸に対応する位置で1つまたはそれ以上のアミノ酸置換を有し、前記置換を行う前と比較して、熱安定性が向上していることを特徴とする、フラビン結合型グルコースデヒドロゲナーゼ:
配列番号1記載のアミノ酸配列における66位のアミノ酸
配列番号1記載のアミノ酸配列における68位のアミノ酸
配列番号1記載のアミノ酸配列における88位のアミノ酸
配列番号1記載のアミノ酸配列における158のアミノ酸
配列番号1記載のアミノ酸配列における233位のアミノ酸、
配列番号1記載のアミノ酸配列における385位のアミノ酸、
配列番号1記載のアミノ酸配列における391位のアミノ酸、および
配列番号1記載のアミノ酸配列における557位のアミノ酸。 - 配列番号1で示されるアミノ酸配列、配列番号1で示されるアミノ酸配列と70%以上同一なアミノ酸配列、または
配列番号1で示されるアミノ酸配列または配列番号1で示されるアミノ酸配列と70%以上同一なアミノ酸配列において1もしくは数個のアミノ酸が欠失、置換または付加されたアミノ酸配列からなり、以下よりなる群から選択されるアミノ酸に対応する位置で1つまたはそれ以上のアミノ酸置換を有することを特徴とする、フラビン結合型グルコースデヒドロゲナーゼ:
配列番号1記載のアミノ酸配列における66位に対応する位置のアミノ酸がチロシンである、
配列番号1記載のアミノ酸配列における68位に対応する位置のアミノ酸がグリシンである、
配列番号1記載のアミノ酸配列における88位に対応する位置のアミノ酸がアラニンである、
配列番号1記載のアミノ酸配列における158位に対応する位置のアミノ酸がヒスチジンである、
配列番号1記載のアミノ酸配列における233位に対応する位置のアミノ酸がアルギニンである、
配列番号1記載のアミノ酸配列における385位に対応する位置のアミノ酸がスレオニンである、
配列番号1記載のアミノ酸配列における391位に対応する位置のアミノ酸がイソロイシンである、および
配列番号1記載のアミノ酸配列における557位に対応する位置のアミノ酸がバリンである。 - 以下に表されるフラビン結合型グルコースデヒドロゲナーゼ活性を有するタンパク質を構成するアミノ酸配列において66位のアスパラギン残基に対応する位置のアミノ酸がチロシンに置換された改変タンパク質であるフラビン結合型グルコースデヒドロゲナーゼ:
配列番号1記載のアミノ酸配列からなり、フラビン結合型グルコースデヒドロゲナーゼ活性を有するタンパク質、または
配列番号1のアミノ酸配列において、66位のアスパラギン残基に対応する位置のアミノ酸残基以外のアミノ酸の1もしくは数個のアミノ酸が欠失、置換または付加されたアミノ酸からなり、フラビン結合型グルコースデヒドロゲナーゼ活性を有するタンパク質。 - 以下に表されるフラビン結合型グルコースデヒドロゲナーゼ活性を有する親タンパク質を構成するアミノ酸配列において68位のアスパラギン残基に対応する位置のアミノ酸がグリシンに置換された改変タンパク質であるフラビン結合型グルコースデヒドロゲナーゼ:
配列番号1記載のアミノ酸配列からなり、フラビン結合型グルコースデヒドロゲナーゼ活性を有するタンパク質、または
配列番号1のアミノ酸配列において、68位のアスパラギン残基に対応する位置のアミノ酸残基以外のアミノ酸の1もしくは数個のアミノ酸が欠失、置換または付加されたアミノ酸からなり、フラビン結合型グルコースデヒドロゲナーゼ活性を有するタンパク質。 - 以下に表されるフラビン結合型グルコースデヒドロゲナーゼ活性を有する親タンパク質を構成するアミノ酸配列において88位のシステイン残基に対応する位置のアミノ酸がアラニンに置換された改変タンパク質であるフラビン結合型グルコースデヒドロゲナーゼ:
配列番号1記載のアミノ酸配列からなり、フラビン結合型グルコースデヒドロゲナーゼ活性を有するタンパク質、または
配列番号1のアミノ酸配列において、88位のシステイン残基に対応する位置のアミノ酸残基以外のアミノ酸の1もしくは数個のアミノ酸が欠失、置換または付加されたアミノ酸からなり、フラビン結合型グルコースデヒドロゲナーゼ活性を有するタンパク質。 - 以下に表されるフラビン結合型グルコースデヒドロゲナーゼ活性を有する親タンパク質を構成するアミノ酸配列において158位のスレオニン残基に対応する位置のアミノ酸がヒスチジンに置換された改変タンパク質であるフラビン結合型グルコースデヒドロゲナーゼ:
配列番号1記載のアミノ酸配列からなり、フラビン結合型グルコースデヒドロゲナーゼ活性を有するタンパク質、または
配列番号1のアミノ酸配列において、158位のスレオニン残基に対応する位置のアミノ酸残基以外のアミノ酸の1もしくは数個のアミノ酸が欠失、置換または付加されたアミノ酸からなり、フラビン結合型グルコースデヒドロゲナーゼ活性を有するタンパク質。 - 以下に表されるフラビン結合型グルコースデヒドロゲナーゼ活性を有するタンパク質を構成するアミノ酸配列において233位のグルタミン残基に対応する位置のアミノ酸がアルギニンに置換された改変タンパク質であるフラビン結合型グルコースデヒドロゲナーゼ:
配列番号1記載のアミノ酸配列からなり、フラビン結合型グルコースデヒドロゲナーゼ活性を有するタンパク質、または
配列番号1のアミノ酸配列において、233位のグルタミン残基に対応する位置のアミノ酸残基以外のアミノ酸の1もしくは数個のアミノ酸が欠失、置換もしくは付加されたアミノ酸からなり、フラビン結合型グルコースデヒドロゲナーゼ活性を有するタンパク質。 - 以下に表されるフラビン結合型グルコースデヒドロゲナーゼ活性を有するタンパク質を構成するアミノ酸配列において385位のアラニン残基に対応する位置のアミノ酸がスレオニンに置換された改変タンパク質であるフラビン結合型グルコースデヒドロゲナーゼ:
配列番号1記載のアミノ酸配列からなり、フラビン結合型グルコースデヒドロゲナーゼ活性を有するタンパク質、または
配列番号1のアミノ酸配列において、385位のアラニン残基に対応する位置のアミノ酸残基以外のアミノ酸の1もしくは数個のアミノ酸が欠失、置換もしくは付加されたアミノ酸からなり、フラビン結合型グルコースデヒドロゲナーゼ活性を有するタンパク質。 - 以下に表されるフラビン結合型グルコースデヒドロゲナーゼ活性を有するタンパク質を構成するアミノ酸配列において391位のロイシン残基に対応する位置のアミノ酸がイソロイシンに置換された改変タンパク質であるフラビン結合型グルコースデヒドロゲナーゼ:
配列番号1記載のアミノ酸配列からなり、フラビン結合型グルコースデヒドロゲナーゼ活性を有するタンパク質、または
配列番号1のアミノ酸配列において、391位のロイシン残基に対応する位置のアミノ酸残基以外のアミノ酸の1もしくは数個のアミノ酸が欠失、置換もしくは付加されたアミノ酸からなり、フラビン結合型グルコースデヒドロゲナーゼ活性を有するタンパク質。 - 以下に表されるフラビン結合型グルコースデヒドロゲナーゼ活性を有するタンパク質を構成するアミノ酸配列において557位のロイシン残基に対応する位置のアミノ酸がバリンに置換されたことを特徴とする改変タンパク質であるフラビン結合型グルコースデヒドロゲナーゼ:
配列番号1記載のアミノ酸配列からなり、フラビン結合型グルコースデヒドロゲナーゼ活性を有するタンパク質、または
配列番号1のアミノ酸配列において、557位のロイシン残基に対応する位置のアミノ酸残基以外のアミノ酸の1もしくは数個のアミノ酸が欠失、置換または付加されたアミノ酸からなり、フラビン結合型グルコースデヒドロゲナーゼ活性を有するタンパク質。 - 配列番号1で示されるアミノ酸配列、または配列番号1で示されるアミノ酸配列と70%以上同一なアミノ酸配列、または
配列番号1で示されるアミノ酸配列または配列番号1で示されるアミノ酸配列と70%以上同一なアミノ酸配列において1もしくは数個アミノ酸が欠失、置換または付加されたアミノ酸配列に対応する位置のアミノ酸が、以下のいずれかに記載されるアミノ酸残基であるフラビン結合型グルコースデヒドロゲナーゼ:
配列番号1記載のアミノ酸配列における66位のアスパラギンに対応する位置のアミノ酸がチロシンであり、かつ、68位のアスパラギンに対応する位置のアミノ酸がグリシンである、
配列番号1記載のアミノ酸配列における88位のシステインに対応する位置のアミノ酸がアラニンであり、66位のアスパラギンに対応する位置のアミノ酸がチロシンであり、かつ、68位のアスパラギンに対応する位置のアミノ酸がグリシンである、
配列番号1記載のアミノ酸配列における88位のシステインに対応する位置のアミノ酸がアラニンであり、かつ、158位のスレオニンに対応する位置のアミノ酸がヒスチジンである、
配列番号1記載のアミノ酸配列における88位のシステインに対応する位置のアミノ酸がアラニンであり、かつ、233位のグルタミンに対応する位置のアミノ酸がアルギニンである、または
配列番号1記載のアミノ酸配列における88位のシステインに対応する位置のアミノ酸がアラニンであり、557位のロイシンに対応する位置のアミノ酸がバリンであり、かつ、559位のセリンに対応する位置のアミノ酸がリジンである。 - 以下の(I)および/または(II)の性質を備える請求項1〜11のいずれか1項に記載のフラビン結合型グルコースデヒドロゲナーゼ:
(I)pH7.0、40℃、15分間の熱処理後に50%以上の残存活性率を有する、
(II)D−グルコースへの反応性に対するD−キシロースへの反応性の割合(Xyl/Glc(%))が2%以下である。 - 請求項1〜12のいずれか1項に記載のフラビン結合型グルコースデヒドロゲナーゼをコードするフラビン結合型グルコースデヒドロゲナーゼ遺伝子。
- 請求項13に記載のフラビン結合型グルコースデヒドロゲナーゼ遺伝子をベクターDNAに挿入した組換え体DNA。
- 請求項14記載の組換え体DNAが導入されている宿主細胞。
- フラビン結合型グルコースデヒドロゲナーゼを製造する方法であり、以下の工程を含む方法:
請求項15に記載の宿主細胞を培養する工程、
前記宿主細胞中に含まれるフラビン結合型グルコースデヒドロゲナーゼ遺伝子を発現させる工程、および
前記培養物からフラビン結合型グルコースデヒドロゲナーゼを単離する工程。 - 請求項1〜12のいずれか1項に記載のフラビン結合型グルコースデヒドロゲナーゼを用いるグルコース測定方法。
- 請求項1〜12のいずれか1項に記載のフラビン結合型グルコースデヒドロゲナーゼを含むグルコースアッセイキット。
- 請求項1〜12のいずれか1項に記載のフラビン結合型グルコースデヒドロゲナーゼを含むグルコースセンサー。
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