JPS59148798A - ビオチンヌクレオチド誘導体 - Google Patents
ビオチンヌクレオチド誘導体Info
- Publication number
- JPS59148798A JPS59148798A JP2251683A JP2251683A JPS59148798A JP S59148798 A JPS59148798 A JP S59148798A JP 2251683 A JP2251683 A JP 2251683A JP 2251683 A JP2251683 A JP 2251683A JP S59148798 A JPS59148798 A JP S59148798A
- Authority
- JP
- Japan
- Prior art keywords
- biotin
- compound
- group
- nucleotide
- derivative
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Granted
Links
Landscapes
- Saccharide Compounds (AREA)
Abstract
(57)【要約】本公報は電子出願前の出願データであるた
め要約のデータは記録されません。
め要約のデータは記録されません。
Description
発明の背景
技術分野
本発明は、一般に、ビオチンヌクレオチド誘導体に関す
る。さらに具体的には、本発明は、ヌクレオチドの塩基
以外の部分にビオチンを結合させてなるビオチンヌクレ
オチド誘導体に関する。本発明は、捷た、このようなビ
オチンヌクレオチド誘導体の製造法にも関する。 先行技術 ビオチンはビタミンB複合体の一つであってビタミンH
とも呼ばれ、多くの動植物の生育に必要な物質である。 一方、ビオチンは卵白中のアビジンと強力に相互作用を
行なうことが知られており、その点に着目してビオチン
をその誘導体の形で利用するものとしてたとえばビオチ
ン−アビジン試薬がある。これは、細胞あたりの抗原密
度の測定、ラジオイムノアッセイおよびエンザイムイム
ノアツセイ等の生化学試薬として応用されている。また
、ビオチンと核酸とを結合させた、感染および遺伝疾患
の診断用DNAプローブが開発され(Proc。 Natj、Acad、Sci、USA 78.6633
−6637(1981) ) 、市販化されるに至っ
ている。このDNAゾローブにおける、ビオチンヌクレ
オチド誘導体の製造は、シチジントリホスフェート(d
CTP)のビオチン誘導体をシチジントリホスフェート
の代わりに使用して酵素的にDNAあるいはRNAを鋳
型にして行なったものである。 しかし、本発明省らの昶るところによれば、このように
して製造されるビオチンヌクレオチド誘導体には下記の
ような問題点がある。 イ、ヌクレオチi″の塩基部分にビオチンを含有するた
め1史用オリゴヌクレオチド固有の融解温度(Tm値)
に変化を生じる。 口、シトシン誘導体の合成が困難である(上記文献より
)。 ノ\ 任意でかつ定められた塩基配列をもつDNAの合
成が困難である。 これらの理由によって、現段階でのビオチン−ヌクレオ
チド銹導体は、その応用範囲が狭く、有用性が限定され
ているのが現状である。 発明の概要 要旨 本発明は上記の点に解決を与えることを目的とし、特定
のオリゴデオキシリボヌクレオチドのヌクレオチド塩基
以外の特定部位にビオチンを結合させてなるビオチンヌ
クレオチド誘導体によってこの目的を達成しようとする
ものである。 従って、本発明によるビオチンヌクレオチド誘導体は下
式〔ν旧で示されるピオチンーオリゴデオキシリボヌク
レオテト°であること、を特徴とするものである。 また、本発明によるビオチンヌクレオチド誘導体の製造
法は、下式[VDで示されるオリゴヌクレオチド誘導体
の末端アミン基にビオチンを結合させて下式〔■〕で示
されるビオチン−オリゴデオキシリボヌクレオチドを得
ること、を特徴とするものである。 /′″\ 〔■〕 〔ただし、mおよびnはそれぞれOまたは任意の自然数
であり、R1は2価の直鎖または分岐鎖の炭化水素残基
であり、Bはヌクレオチドを構成する塩基である(Bが
複数個存在するときは、それらは同一でも異なってもよ
い)。〕 効果 本発明者らの合成したビオチン−オリゴデオキシリボヌ
クレオチドは、前記核酸用非放射性アフイニテイプロー
プの短所を回避することができて、下記のような長所を
もつものである。 イ、ヌクレオチドの塩基部分にビオチンを含有しないの
で融解温度(Tm値)に変化を生じることがなくて安定
である。 口、いかなる塩基配列をもつビオチン−オリゴヌクレオ
チドも合成可能である。 ハ、プローブとして短鎖オリゴマーで十分である。 二、合成が非常に簡単であって、大量合成が可能である
。 ホ、ゾライマ−(鋳型合成の際のDNA断片)としても
利用できる。 このような長所があるところから、本発明によればビオ
チンヌクレオチド誘導体の利用方法の拡大も考えられる
。すなわち、例えば、ビオチン−オリゴヌクレオチドは
非放射性核酸用アフイニテイゾローズとして、あるいは
ゾライマーとして利用可能であることは前記したところ
であ7つて、そり検出方法も抗体による沈降、酵素の活
性測定、アビジン−セファロースによるアフイニテイカ
ラム螢光性染色体による可視化等々、多様であり、また
放射性プローブ(32p)に比べて被曝の危険、コスト
、廃棄物の処理および保存性等の点で有利である。 ビオチンヌク−レオチド誘導体(Vll)本発明による
ビオチンヌクレオチド誘導体は、前記の式(uTI’)
で示されるものである。 シPの3′−および5′−水酸基を除いたデオキシリポ
ヌクレオシド残基を示すのに慣用されているものであっ
て、具体的には下記の構造のものである。 置換基Bはヌクレオチドを構成する塩基を示じぐiA常
はアデニン、チミン、シトシンまたはグアニンである。 化合物IJII:]中にBが複数個存在するときは、そ
れらは同一でも異なってもよい。 mおよびnは、それぞれ0または自然数を示す。 本発明ピオチンオリゴヌクレオチP誘導体の重合度がm
+nで表示されているのは、本発明の好ましい製造法で
重合度がそ几ぞれmおよびnのフラクションを縮合させ
ていることによるものである(詳細後記)。その場合の
mは実用的には0〜6、特に1〜4、nは実用的にはO
〜40、特にO−加、である。 基R1は、化合物[¥fDの核酸部分とビオチン部分と
を連結する二価の直鎖または分岐鎖の炭化水素残基であ
る。これは、特に炭素数2〜20程度の直鎖または分岐
鎖のアルキレン基が適当である。好祉しいR1は、炭素
数2〜6のアルキレン基である。 化合物い’10の合成 一般的説咀 化合物[VIl)、すなわち本発明によるビオチンヌク
レオチド誘導体、は合目的的な任意の方法によって合成
することができる。 一つの好ましい方法は、前記の式〔ν1〕のオリゴヌク
レオチ)4誘導体、すなわちオリゴデオキシヌクレオチ
ドの5′−末端リン酸基に基&1を介して一級アミン基
が導入されたもの、のアミノ基にピオチ/を結合させる
ことからなるものである。 一方、式[VI)の化合物は、オリゴヌクレオチrの合
成および生成オリゴヌクレオチドの5′−水酸基延長上
での一級アミン基の導入からなる方法で合成することが
できる。 第1図は、この好ましい合成法の一例を示すフローチャ
ートである。フローチャート中の記号は、下記の意味を
持つ(その意義ないし詳細は、後記した通りである)。 ROリン酸基を保護する置換基であって、通常オルトク
ロロフェニル基が用いラレる。 R1二価の炭化水素残基である。 R25′−末端水酸基の保護基であって、通常ジメトキ
シトリチル基が用いられる。 R3他のすべての保護基が安定な条件で容易に脱離され
て、リン酸ジエステルを与えることができる+を換基で
あって、通常シアノエチル基が用いられる。 R4アミノ基の保険基であって、通常トリフルオロアセ
チル基が用いられる。 qnより小さい任意の自然数。 m O’jたけ任意の自然数。 n oおよび任意の自然数。 B 塩基を示す。 B′ 保険された塩基を示すが、通常はR6−ベンゾイ
ルアデニン、N−イソブチリルグアニン、R6−ベンゾ
イルシトシンおよびチミン(すなわち、保護不要)より
選択される。 〆〜[F]スペーサーを介)また担体であって、通常は
下記のものである。 ) CH2N)(COCH2CH2− BIOT’ビメチン活性エステル 一般にオリゴヌクレオチド合成法としては、トリエステ
ル法、ホスファイト法およびそれぞれの固相法および液
相法がある。本発明者らは既に固相法によるオリゴヌク
レオM立しており、化合物〔■〕の合成には本発明者ら
の下記の方法が好ましい。 TetrAhedron Letters 1979+
3635(1979)Nucleic Ac1ds R
e5erch 8+ 5473(1980)Nucle
ic Ac1cls Re5erch 8+ 5491
(1980)Nuclejc Ac1ds Re5er
ch 8+ 5507(1980)Nucleic A
c1ds Re5erch Syrnposium 5
eries7、 281(1980) 1だ、上記で合成したオリゴヌクレオチドの5′−水酸
基にリン酸基を介して一級アミン基を導入する方法すな
わち、化合物[VDの合成法としては、たとえば本発明
者らの%願昭57−138’136号明細畳記載の方法
がある。 化合物〔■〕の合成法をその一実施態様について示せば
、下記のAI)である。すなわち、第1図に示したよう
に、化合物CDの保護基R3を除去したものと化合物〔
I〕の保険基R2を除去したものとを縮合させ、これら
の操作をくり返すととによって、化合物[11D’r合
成する。オリゴヌクレオチド化合物[11Dの合成法は
、上記の通り公知である。 一方、本発明者らの方法(特願昭57−1.38136
号明細書参照)に従って、式〔■〕の化合物を合成する
。すなわち、化合物〔I〕のR2を除去して5′−水酸
基化合物とし、これにリン酸化剤(たとえば、ホスホジ
トリアゾリド、ホスホジクロリドまたはホスホジベンゾ
トリアシリr等)を作用させてリン酸化し、ついでアミ
ン基が保護されているアミノアルコール化合物R2−N
H−R−OH[この化合物はオメガ−アミノアルコール
(NH2−R1−0H)のアミノ基をR2で保険するこ
とにより得ることができる〕を縮合させることにより、
化合物CIVIを得ることができる(詳細は該明細書参
照)。 この化合物〔■〕の保護基R3を除去し、化合物(ll
l)の保護基R2を除去したものと4=編合させて、化
合物〔v、lを合成する。縮合は、化合物〔■〕の合成
の際の縮合と本質的には変らない方法で行なうことがで
きる。 このようにして合成された化合物〔■〕の保護基をすべ
て除去すれば、化合物〔臂〕が得られる。保護基C0R
4基、リン酸トリエステル中のオルト−クロロフェニル
基および塩基部分のアシル基は、0.5Mのテトルメチ
ルグアニジンービリジン−2=カルボアルドキシムのジ
オキザンー水(9: 1゜(v//v))溶液で処理後
、アルカリ処理(濃アンモニア水)を行なうことより除
去される。R4がトリフルオロアセチル基の場合は、ア
ンモニア処理により充分脱離されるが、オルトニトロフ
ェニルスルフェニル基である場合はメルカゾトエタノー
ル処理が必要である。R4として他の保護基を用いた場
合は、オリゴヌクレオチ1部分が安定な条件で、さらに
別の処理を加えることも可能である。 なお、デオキシオリゴリボヌクレオチドの合成法は既に
各種のものが公知であって、保護基のイJ姓類およびそ
の導入ないし除去ならひに縮合その他について上記以外
の詳細は核酸の化学合成に関する成肯や総説たとえば「
ヌクレオシド・ヌクレオチドの合成」 (丸善1977
年)、「核酸有機化学」(化学同人1979年)、「核
酸」(朝食書店1979年)、Tetrahedron
1井、3143 (1978)、有合化、34.723
(1978)および化学の領域、33.566 (1
979)等を参照することができる。 化合物〔■〕の合成 ビオチン−オリゴデオキシリボヌクレオチド(化合物[
’vll〕)は、上記化合物〔〜II)の5′−末端延
長上の一級アミノ基にビオチンを結合させることによっ
て得ることができる。 両者の結合はビオチンのカルボキシル基と化合物〔■〕
のアミン基との間の脱水によるアミド結合の形成を実現
することのできる任意の方法によって行なうことができ
る。化合物[Vl〕中にビオチンのカルボキシル基との
反応が可能なアミノ基または水改基が存在するときは、
それらを適当に保穫した状態でこの反応を行なうことが
できる。従って、本発明で「式い1〕で示されるオリゴ
ヌクレオチド誘導体の末端アミン基にビオチンを結合さ
せて式〔■〕で示されるビオチン−オリゴヌクレオチド
を得る」という表現は、化合物〔■〕がこのように保護
されている場合をも包含するものである。 1だ、この表現は、ビオチンがその機能的誘導体の形に
ある場合をも包含するものである。ビオチンの機能的誘
導体の具体例は、その酸ハライドまたはその活性エステ
ルである。 このようl−に味でのアミン基とビオチンとの結合を行
なわせる一つの好ましい方法は、アミノ基とビオチン活
性エステルとの反応によることからなるものである。ビ
オチン活性エステルが好ましいのは、一般に、オリゴヌ
クレオチドの塩基部分のアミン基とは反応しないで5′
−水酸基末端延長上の一級アミノ基とのみ選択的に反応
し、しかも反応操作が簡便だからである。「ビオチン活
性エステル」とは他の官能基(通常アミノ基)と反応し
やすいエステル結合を持つビオチン誘導体を意味し、具
体的にはスクシンイミド−、バラニトロフェニル−、ペ
ンシトリアゾリド−12,4,5−トリクロロフェニル
−エステル等がある。前二者が好ましい。 アミノ基とビオチンとの結合全行なわせる他の好ましい
方法の一つは、両者の結合を縮合剤の存在下に行なうこ
とからなるものである。縮合剤とし−ご適当なものの例
を挙げれば、ジシクロヘキシカルボジイミド、カルボニ
ルイミダシーツへ ウッドワード試薬11 K”等があ
る。ジシクロへキシルカルボジイミドが好せしい。 いずれの方法による場合にも、反応方法は合目的的な任
意のものでありうる。所与の反応系に対する具体的な反
応方法は、後記実験例および各種の成沓、たとえば、「
ペゾチド合成」 (丸善1975年)および[タン・ξ
り質の化学IVJ (1977年)を参照して適当に
定めればよい。 実験例 1)フローチャート 第2図のフローチャートに従って、本発明化合物(同図
の化合物(10)を製造した。 第2図で、記号は次の意味を持つ。 B′ ベンゾイル化アデニ/ B アデニン DMTr ジメトキシトリチル CH2−NHCOCH2C)I2− ROオルトクロロフェニル Et エチル CE−シアンエチル 2 n′2 12 2)化合物〔■〕(第2図の[相])の合盛実験1−1 ジメトキシトリチルアデノシン/樹脂(Cり ’](樹
脂は相体に過ぎないが、樹脂に担持された目的化合物は
外観的には)射面そのものと変らないので、樹脂に相持
された当該化合物を以下において単に樹脂と呼ぶことに
する) 300mg (0,033mmol)をインプ
ロノぞノール−塩化メチレン(15: 85、V/’V
) g液10m1で3回洗浄後、臭化亜鉛の19、OM
のインクロパノールー塩化メチレン溶液8mlで5分間
ずつ4回反応(脱トリチル化)させて樹脂[(’2))
を得る。樹脂C<Q)3をイソプロノミノール−塩化メ
チレン溶液10m1で3回洗浄し、これにジヌクレオチ
ド[(、J):]1150mg(0,1mmol)のピ
リジン溶液を添加後、共沸させて系を無水とし、メシチ
レンスルホニルニトロトリアゾリド(以下MS NTと
記す) 150mg (0,5mmol)と無水ピリジ
ン2mlとを添加して90分間反応(縮合)させる。反
応後、♂リジンlomlで3回洗浄し、触媒液(約10
mg)のジメチルアミノピリジン(以下DMAP )を
含む無水酢酸−ビリジ7(1:9、ff/V))溶液1
0m1ヲ添加し10分間反応させて未反応5′−水酸基
をアセチル化して保画し、これをピリジンで洗浄して、
化合物〔■’](n=2)を得る。以上のような操作を
6回くり返して、化合物〔(、す](n=12)を得る
。 一方、5′−ヒドロキシ−ジヌクレオチド〔(5)〕8
800mg(0,71mmo f)とオルトクロo 7
1 二)Lzホスホジトリアゾリドとを後者のジオキサ
ン溶液(1,0mmol、 6m1)中で2時間反応さ
せ、続いてトリフルオロアセチル−6−アミンヘキサノ
ール300mg (1,4mmol)および1−メチル
−イミダゾール115mg (1,4mmol)を加え
てさらに2時間反応させる。反応終了後、溶媒を留去し
、残漬をクロロホルムに溶解した後、水、0.5Mリン
酸三水素ナトリウム水溶液、飽和炭酸水素ナトリウム水
溶液および5%の塩化ナトリウム水溶液でそれぞれ洗浄
し、無水硫酸ナトリウムで乾燥する。クロロホルム層を
濃縮後、シリカゲルカラムで精製(溶出液として0〜4
%のメタノール含有クロロホルムを使用)シ、溶出液を
濃縮後インタン中に滴下し粉末状の化合物[(6))を
得る。 上記で合成した化合物〔(す:] (n = 12 )
i15mL(3,45μmo、l)を前述と同様の方
法で脱トリチル化したもの〔■〕に、化合物((,6)
) 60mg (0,04rn mo l )をトリエ
チルアミン−ピリジン−水(1:3:1、V/V )溶
液3mlで処理(脱シアノエチル化)した化合物[(8
))を加え、無水にしたのち、MSNT50mg(0,
2mmol)およびピリジン1mlを加え90分間反応
(縮合)させ、反応終了後ピリジンおよびメタノールで
洗浄し、乾燥して、完全に保護されたオリゴヌクレオチ
ド誘導体〔■〕を得る。 オリゴヌクレオチド誘導体〔(す) 15 mg f:
0.5Mテトラメチルグアニジン−ピリジン−2−カル
ボアルドキシメイトのジオキサン−水(9:1、(V/
V)溶液200μlを加え、遠沈管中、室温−?l’2
4時間反応させる。反応後、濃アンモニア水(2,5m
1)を加えて密閉し、50′Cで一夜反応させる。 反応終了後、fV5過し、P液を濃縮後、水に溶解させ
てからエーテルで抽出を行なう。水1@を濃縮後、セフ
ァデックスG−50(φ1.5XI20cm、溶出液は
0.05Mの重炭酸トリエチルアンモニウム緩衝液pH
7,5)で脱塩精製しペンタデカアデニル酸誘導体〔θ
ψ〕を得た。 また同様の方法で実験1−2.1−3および1−4のよ
うなオリゴヌクレオチド誘導体を得た。 以上で合成した化合物を第1表に示す。 第1表 ただし、この表でAはアデニン、Tはチミン、Gはグア
ニ/、Cはシトシンを示す。 これら4MmQ化合物の高速液体クロマトグラフィーの
結果を第3図に示す。A−Dは、それぞれ実験1−1〜
1−4の化合物についての図である。 3)ビオチン−ペンタデカアデニル酸〔(す〕の製造実
験2−1 上記実験1−1で合成したペンタデカアデニル酸誘導体
〔(ゆ〕約1.00Dを0.1M炭1#水素ナトリウム
水浴液(pH8,3) 10μlに溶解し、ビオチンス
クシンイくドエステルのジメチルホルムアミド溶液10
ti 1 (数百倍過剰に相当)を加えて4℃で一夜
または室温で4時間反応させて、ビオチン−ペンタデカ
アデニル酸
る。さらに具体的には、本発明は、ヌクレオチドの塩基
以外の部分にビオチンを結合させてなるビオチンヌクレ
オチド誘導体に関する。本発明は、捷た、このようなビ
オチンヌクレオチド誘導体の製造法にも関する。 先行技術 ビオチンはビタミンB複合体の一つであってビタミンH
とも呼ばれ、多くの動植物の生育に必要な物質である。 一方、ビオチンは卵白中のアビジンと強力に相互作用を
行なうことが知られており、その点に着目してビオチン
をその誘導体の形で利用するものとしてたとえばビオチ
ン−アビジン試薬がある。これは、細胞あたりの抗原密
度の測定、ラジオイムノアッセイおよびエンザイムイム
ノアツセイ等の生化学試薬として応用されている。また
、ビオチンと核酸とを結合させた、感染および遺伝疾患
の診断用DNAプローブが開発され(Proc。 Natj、Acad、Sci、USA 78.6633
−6637(1981) ) 、市販化されるに至っ
ている。このDNAゾローブにおける、ビオチンヌクレ
オチド誘導体の製造は、シチジントリホスフェート(d
CTP)のビオチン誘導体をシチジントリホスフェート
の代わりに使用して酵素的にDNAあるいはRNAを鋳
型にして行なったものである。 しかし、本発明省らの昶るところによれば、このように
して製造されるビオチンヌクレオチド誘導体には下記の
ような問題点がある。 イ、ヌクレオチi″の塩基部分にビオチンを含有するた
め1史用オリゴヌクレオチド固有の融解温度(Tm値)
に変化を生じる。 口、シトシン誘導体の合成が困難である(上記文献より
)。 ノ\ 任意でかつ定められた塩基配列をもつDNAの合
成が困難である。 これらの理由によって、現段階でのビオチン−ヌクレオ
チド銹導体は、その応用範囲が狭く、有用性が限定され
ているのが現状である。 発明の概要 要旨 本発明は上記の点に解決を与えることを目的とし、特定
のオリゴデオキシリボヌクレオチドのヌクレオチド塩基
以外の特定部位にビオチンを結合させてなるビオチンヌ
クレオチド誘導体によってこの目的を達成しようとする
ものである。 従って、本発明によるビオチンヌクレオチド誘導体は下
式〔ν旧で示されるピオチンーオリゴデオキシリボヌク
レオテト°であること、を特徴とするものである。 また、本発明によるビオチンヌクレオチド誘導体の製造
法は、下式[VDで示されるオリゴヌクレオチド誘導体
の末端アミン基にビオチンを結合させて下式〔■〕で示
されるビオチン−オリゴデオキシリボヌクレオチドを得
ること、を特徴とするものである。 /′″\ 〔■〕 〔ただし、mおよびnはそれぞれOまたは任意の自然数
であり、R1は2価の直鎖または分岐鎖の炭化水素残基
であり、Bはヌクレオチドを構成する塩基である(Bが
複数個存在するときは、それらは同一でも異なってもよ
い)。〕 効果 本発明者らの合成したビオチン−オリゴデオキシリボヌ
クレオチドは、前記核酸用非放射性アフイニテイプロー
プの短所を回避することができて、下記のような長所を
もつものである。 イ、ヌクレオチドの塩基部分にビオチンを含有しないの
で融解温度(Tm値)に変化を生じることがなくて安定
である。 口、いかなる塩基配列をもつビオチン−オリゴヌクレオ
チドも合成可能である。 ハ、プローブとして短鎖オリゴマーで十分である。 二、合成が非常に簡単であって、大量合成が可能である
。 ホ、ゾライマ−(鋳型合成の際のDNA断片)としても
利用できる。 このような長所があるところから、本発明によればビオ
チンヌクレオチド誘導体の利用方法の拡大も考えられる
。すなわち、例えば、ビオチン−オリゴヌクレオチドは
非放射性核酸用アフイニテイゾローズとして、あるいは
ゾライマーとして利用可能であることは前記したところ
であ7つて、そり検出方法も抗体による沈降、酵素の活
性測定、アビジン−セファロースによるアフイニテイカ
ラム螢光性染色体による可視化等々、多様であり、また
放射性プローブ(32p)に比べて被曝の危険、コスト
、廃棄物の処理および保存性等の点で有利である。 ビオチンヌク−レオチド誘導体(Vll)本発明による
ビオチンヌクレオチド誘導体は、前記の式(uTI’)
で示されるものである。 シPの3′−および5′−水酸基を除いたデオキシリポ
ヌクレオシド残基を示すのに慣用されているものであっ
て、具体的には下記の構造のものである。 置換基Bはヌクレオチドを構成する塩基を示じぐiA常
はアデニン、チミン、シトシンまたはグアニンである。 化合物IJII:]中にBが複数個存在するときは、そ
れらは同一でも異なってもよい。 mおよびnは、それぞれ0または自然数を示す。 本発明ピオチンオリゴヌクレオチP誘導体の重合度がm
+nで表示されているのは、本発明の好ましい製造法で
重合度がそ几ぞれmおよびnのフラクションを縮合させ
ていることによるものである(詳細後記)。その場合の
mは実用的には0〜6、特に1〜4、nは実用的にはO
〜40、特にO−加、である。 基R1は、化合物[¥fDの核酸部分とビオチン部分と
を連結する二価の直鎖または分岐鎖の炭化水素残基であ
る。これは、特に炭素数2〜20程度の直鎖または分岐
鎖のアルキレン基が適当である。好祉しいR1は、炭素
数2〜6のアルキレン基である。 化合物い’10の合成 一般的説咀 化合物[VIl)、すなわち本発明によるビオチンヌク
レオチド誘導体、は合目的的な任意の方法によって合成
することができる。 一つの好ましい方法は、前記の式〔ν1〕のオリゴヌク
レオチ)4誘導体、すなわちオリゴデオキシヌクレオチ
ドの5′−末端リン酸基に基&1を介して一級アミン基
が導入されたもの、のアミノ基にピオチ/を結合させる
ことからなるものである。 一方、式[VI)の化合物は、オリゴヌクレオチrの合
成および生成オリゴヌクレオチドの5′−水酸基延長上
での一級アミン基の導入からなる方法で合成することが
できる。 第1図は、この好ましい合成法の一例を示すフローチャ
ートである。フローチャート中の記号は、下記の意味を
持つ(その意義ないし詳細は、後記した通りである)。 ROリン酸基を保護する置換基であって、通常オルトク
ロロフェニル基が用いラレる。 R1二価の炭化水素残基である。 R25′−末端水酸基の保護基であって、通常ジメトキ
シトリチル基が用いられる。 R3他のすべての保護基が安定な条件で容易に脱離され
て、リン酸ジエステルを与えることができる+を換基で
あって、通常シアノエチル基が用いられる。 R4アミノ基の保険基であって、通常トリフルオロアセ
チル基が用いられる。 qnより小さい任意の自然数。 m O’jたけ任意の自然数。 n oおよび任意の自然数。 B 塩基を示す。 B′ 保険された塩基を示すが、通常はR6−ベンゾイ
ルアデニン、N−イソブチリルグアニン、R6−ベンゾ
イルシトシンおよびチミン(すなわち、保護不要)より
選択される。 〆〜[F]スペーサーを介)また担体であって、通常は
下記のものである。 ) CH2N)(COCH2CH2− BIOT’ビメチン活性エステル 一般にオリゴヌクレオチド合成法としては、トリエステ
ル法、ホスファイト法およびそれぞれの固相法および液
相法がある。本発明者らは既に固相法によるオリゴヌク
レオM立しており、化合物〔■〕の合成には本発明者ら
の下記の方法が好ましい。 TetrAhedron Letters 1979+
3635(1979)Nucleic Ac1ds R
e5erch 8+ 5473(1980)Nucle
ic Ac1cls Re5erch 8+ 5491
(1980)Nuclejc Ac1ds Re5er
ch 8+ 5507(1980)Nucleic A
c1ds Re5erch Syrnposium 5
eries7、 281(1980) 1だ、上記で合成したオリゴヌクレオチドの5′−水酸
基にリン酸基を介して一級アミン基を導入する方法すな
わち、化合物[VDの合成法としては、たとえば本発明
者らの%願昭57−138’136号明細畳記載の方法
がある。 化合物〔■〕の合成法をその一実施態様について示せば
、下記のAI)である。すなわち、第1図に示したよう
に、化合物CDの保護基R3を除去したものと化合物〔
I〕の保険基R2を除去したものとを縮合させ、これら
の操作をくり返すととによって、化合物[11D’r合
成する。オリゴヌクレオチド化合物[11Dの合成法は
、上記の通り公知である。 一方、本発明者らの方法(特願昭57−1.38136
号明細書参照)に従って、式〔■〕の化合物を合成する
。すなわち、化合物〔I〕のR2を除去して5′−水酸
基化合物とし、これにリン酸化剤(たとえば、ホスホジ
トリアゾリド、ホスホジクロリドまたはホスホジベンゾ
トリアシリr等)を作用させてリン酸化し、ついでアミ
ン基が保護されているアミノアルコール化合物R2−N
H−R−OH[この化合物はオメガ−アミノアルコール
(NH2−R1−0H)のアミノ基をR2で保険するこ
とにより得ることができる〕を縮合させることにより、
化合物CIVIを得ることができる(詳細は該明細書参
照)。 この化合物〔■〕の保護基R3を除去し、化合物(ll
l)の保護基R2を除去したものと4=編合させて、化
合物〔v、lを合成する。縮合は、化合物〔■〕の合成
の際の縮合と本質的には変らない方法で行なうことがで
きる。 このようにして合成された化合物〔■〕の保護基をすべ
て除去すれば、化合物〔臂〕が得られる。保護基C0R
4基、リン酸トリエステル中のオルト−クロロフェニル
基および塩基部分のアシル基は、0.5Mのテトルメチ
ルグアニジンービリジン−2=カルボアルドキシムのジ
オキザンー水(9: 1゜(v//v))溶液で処理後
、アルカリ処理(濃アンモニア水)を行なうことより除
去される。R4がトリフルオロアセチル基の場合は、ア
ンモニア処理により充分脱離されるが、オルトニトロフ
ェニルスルフェニル基である場合はメルカゾトエタノー
ル処理が必要である。R4として他の保護基を用いた場
合は、オリゴヌクレオチ1部分が安定な条件で、さらに
別の処理を加えることも可能である。 なお、デオキシオリゴリボヌクレオチドの合成法は既に
各種のものが公知であって、保護基のイJ姓類およびそ
の導入ないし除去ならひに縮合その他について上記以外
の詳細は核酸の化学合成に関する成肯や総説たとえば「
ヌクレオシド・ヌクレオチドの合成」 (丸善1977
年)、「核酸有機化学」(化学同人1979年)、「核
酸」(朝食書店1979年)、Tetrahedron
1井、3143 (1978)、有合化、34.723
(1978)および化学の領域、33.566 (1
979)等を参照することができる。 化合物〔■〕の合成 ビオチン−オリゴデオキシリボヌクレオチド(化合物[
’vll〕)は、上記化合物〔〜II)の5′−末端延
長上の一級アミノ基にビオチンを結合させることによっ
て得ることができる。 両者の結合はビオチンのカルボキシル基と化合物〔■〕
のアミン基との間の脱水によるアミド結合の形成を実現
することのできる任意の方法によって行なうことができ
る。化合物[Vl〕中にビオチンのカルボキシル基との
反応が可能なアミノ基または水改基が存在するときは、
それらを適当に保穫した状態でこの反応を行なうことが
できる。従って、本発明で「式い1〕で示されるオリゴ
ヌクレオチド誘導体の末端アミン基にビオチンを結合さ
せて式〔■〕で示されるビオチン−オリゴヌクレオチド
を得る」という表現は、化合物〔■〕がこのように保護
されている場合をも包含するものである。 1だ、この表現は、ビオチンがその機能的誘導体の形に
ある場合をも包含するものである。ビオチンの機能的誘
導体の具体例は、その酸ハライドまたはその活性エステ
ルである。 このようl−に味でのアミン基とビオチンとの結合を行
なわせる一つの好ましい方法は、アミノ基とビオチン活
性エステルとの反応によることからなるものである。ビ
オチン活性エステルが好ましいのは、一般に、オリゴヌ
クレオチドの塩基部分のアミン基とは反応しないで5′
−水酸基末端延長上の一級アミノ基とのみ選択的に反応
し、しかも反応操作が簡便だからである。「ビオチン活
性エステル」とは他の官能基(通常アミノ基)と反応し
やすいエステル結合を持つビオチン誘導体を意味し、具
体的にはスクシンイミド−、バラニトロフェニル−、ペ
ンシトリアゾリド−12,4,5−トリクロロフェニル
−エステル等がある。前二者が好ましい。 アミノ基とビオチンとの結合全行なわせる他の好ましい
方法の一つは、両者の結合を縮合剤の存在下に行なうこ
とからなるものである。縮合剤とし−ご適当なものの例
を挙げれば、ジシクロヘキシカルボジイミド、カルボニ
ルイミダシーツへ ウッドワード試薬11 K”等があ
る。ジシクロへキシルカルボジイミドが好せしい。 いずれの方法による場合にも、反応方法は合目的的な任
意のものでありうる。所与の反応系に対する具体的な反
応方法は、後記実験例および各種の成沓、たとえば、「
ペゾチド合成」 (丸善1975年)および[タン・ξ
り質の化学IVJ (1977年)を参照して適当に
定めればよい。 実験例 1)フローチャート 第2図のフローチャートに従って、本発明化合物(同図
の化合物(10)を製造した。 第2図で、記号は次の意味を持つ。 B′ ベンゾイル化アデニ/ B アデニン DMTr ジメトキシトリチル CH2−NHCOCH2C)I2− ROオルトクロロフェニル Et エチル CE−シアンエチル 2 n′2 12 2)化合物〔■〕(第2図の[相])の合盛実験1−1 ジメトキシトリチルアデノシン/樹脂(Cり ’](樹
脂は相体に過ぎないが、樹脂に担持された目的化合物は
外観的には)射面そのものと変らないので、樹脂に相持
された当該化合物を以下において単に樹脂と呼ぶことに
する) 300mg (0,033mmol)をインプ
ロノぞノール−塩化メチレン(15: 85、V/’V
) g液10m1で3回洗浄後、臭化亜鉛の19、OM
のインクロパノールー塩化メチレン溶液8mlで5分間
ずつ4回反応(脱トリチル化)させて樹脂[(’2))
を得る。樹脂C<Q)3をイソプロノミノール−塩化メ
チレン溶液10m1で3回洗浄し、これにジヌクレオチ
ド[(、J):]1150mg(0,1mmol)のピ
リジン溶液を添加後、共沸させて系を無水とし、メシチ
レンスルホニルニトロトリアゾリド(以下MS NTと
記す) 150mg (0,5mmol)と無水ピリジ
ン2mlとを添加して90分間反応(縮合)させる。反
応後、♂リジンlomlで3回洗浄し、触媒液(約10
mg)のジメチルアミノピリジン(以下DMAP )を
含む無水酢酸−ビリジ7(1:9、ff/V))溶液1
0m1ヲ添加し10分間反応させて未反応5′−水酸基
をアセチル化して保画し、これをピリジンで洗浄して、
化合物〔■’](n=2)を得る。以上のような操作を
6回くり返して、化合物〔(、す](n=12)を得る
。 一方、5′−ヒドロキシ−ジヌクレオチド〔(5)〕8
800mg(0,71mmo f)とオルトクロo 7
1 二)Lzホスホジトリアゾリドとを後者のジオキサ
ン溶液(1,0mmol、 6m1)中で2時間反応さ
せ、続いてトリフルオロアセチル−6−アミンヘキサノ
ール300mg (1,4mmol)および1−メチル
−イミダゾール115mg (1,4mmol)を加え
てさらに2時間反応させる。反応終了後、溶媒を留去し
、残漬をクロロホルムに溶解した後、水、0.5Mリン
酸三水素ナトリウム水溶液、飽和炭酸水素ナトリウム水
溶液および5%の塩化ナトリウム水溶液でそれぞれ洗浄
し、無水硫酸ナトリウムで乾燥する。クロロホルム層を
濃縮後、シリカゲルカラムで精製(溶出液として0〜4
%のメタノール含有クロロホルムを使用)シ、溶出液を
濃縮後インタン中に滴下し粉末状の化合物[(6))を
得る。 上記で合成した化合物〔(す:] (n = 12 )
i15mL(3,45μmo、l)を前述と同様の方
法で脱トリチル化したもの〔■〕に、化合物((,6)
) 60mg (0,04rn mo l )をトリエ
チルアミン−ピリジン−水(1:3:1、V/V )溶
液3mlで処理(脱シアノエチル化)した化合物[(8
))を加え、無水にしたのち、MSNT50mg(0,
2mmol)およびピリジン1mlを加え90分間反応
(縮合)させ、反応終了後ピリジンおよびメタノールで
洗浄し、乾燥して、完全に保護されたオリゴヌクレオチ
ド誘導体〔■〕を得る。 オリゴヌクレオチド誘導体〔(す) 15 mg f:
0.5Mテトラメチルグアニジン−ピリジン−2−カル
ボアルドキシメイトのジオキサン−水(9:1、(V/
V)溶液200μlを加え、遠沈管中、室温−?l’2
4時間反応させる。反応後、濃アンモニア水(2,5m
1)を加えて密閉し、50′Cで一夜反応させる。 反応終了後、fV5過し、P液を濃縮後、水に溶解させ
てからエーテルで抽出を行なう。水1@を濃縮後、セフ
ァデックスG−50(φ1.5XI20cm、溶出液は
0.05Mの重炭酸トリエチルアンモニウム緩衝液pH
7,5)で脱塩精製しペンタデカアデニル酸誘導体〔θ
ψ〕を得た。 また同様の方法で実験1−2.1−3および1−4のよ
うなオリゴヌクレオチド誘導体を得た。 以上で合成した化合物を第1表に示す。 第1表 ただし、この表でAはアデニン、Tはチミン、Gはグア
ニ/、Cはシトシンを示す。 これら4MmQ化合物の高速液体クロマトグラフィーの
結果を第3図に示す。A−Dは、それぞれ実験1−1〜
1−4の化合物についての図である。 3)ビオチン−ペンタデカアデニル酸〔(す〕の製造実
験2−1 上記実験1−1で合成したペンタデカアデニル酸誘導体
〔(ゆ〕約1.00Dを0.1M炭1#水素ナトリウム
水浴液(pH8,3) 10μlに溶解し、ビオチンス
クシンイくドエステルのジメチルホルムアミド溶液10
ti 1 (数百倍過剰に相当)を加えて4℃で一夜
または室温で4時間反応させて、ビオチン−ペンタデカ
アデニル酸
〔0〕を合成する。
反応の確認は、高速液体クロマトグラフィーおよび20
チポリアクリルアミドゲル電気泳動で行なった。またそ
の際、反応性の比較のため上記で合成したオリゴヌクレ
オチド〔■〕を脱保護して得た5′−水酸基をもつ化合
物〔◇多〕も同様にビオチンスクシンイミドエステルと
反応させる。 上記実験1−2.1−3および1−4で合成した化合物
〔[相]〕についても実験2−1と同様な操作を行なっ
て各々について化合物〔(D〕を製造する。 寸た、反応の比較のため5′−水酸基をもつ化合物〔(
多〕をも製造し、化合物〔θ秒〕とビオチン活性エステ
ルとを各々反応させる。このときの実験全各々実験2−
2.2−3および2−4とした。 実験2で製造した化合物を第2表に示す。 ただし、この表でAはアデニン、Tはチミン、Gはグア
ニン、Cはシトシンを示す。 以上の結果を第4および5図(高速液体クロマトグラフ
ィーの結果)および嬉6および7図(電気泳動の結果)
に示す。 第4図は高速液体クロマトグラフィーの溶出パターンを
示すものである。図中1は何れも反応前の化合物そのも
のの、2は何れもビオチンと化合物を振付したものの、
3は倒れも化合物とビオチン活性エステルとを反応させ
たもののクロマトグラムである。イは実験2−1で式〔
(多コの化合物、口は実験1−1で式〔(ゆ〕である化
合物、ハは実験2−2で式
チポリアクリルアミドゲル電気泳動で行なった。またそ
の際、反応性の比較のため上記で合成したオリゴヌクレ
オチド〔■〕を脱保護して得た5′−水酸基をもつ化合
物〔◇多〕も同様にビオチンスクシンイミドエステルと
反応させる。 上記実験1−2.1−3および1−4で合成した化合物
〔[相]〕についても実験2−1と同様な操作を行なっ
て各々について化合物〔(D〕を製造する。 寸た、反応の比較のため5′−水酸基をもつ化合物〔(
多〕をも製造し、化合物〔θ秒〕とビオチン活性エステ
ルとを各々反応させる。このときの実験全各々実験2−
2.2−3および2−4とした。 実験2で製造した化合物を第2表に示す。 ただし、この表でAはアデニン、Tはチミン、Gはグア
ニン、Cはシトシンを示す。 以上の結果を第4および5図(高速液体クロマトグラフ
ィーの結果)および嬉6および7図(電気泳動の結果)
に示す。 第4図は高速液体クロマトグラフィーの溶出パターンを
示すものである。図中1は何れも反応前の化合物そのも
のの、2は何れもビオチンと化合物を振付したものの、
3は倒れも化合物とビオチン活性エステルとを反応させ
たもののクロマトグラムである。イは実験2−1で式〔
(多コの化合物、口は実験1−1で式〔(ゆ〕である化
合物、ハは実験2−2で式
〔0〕である化合物、二は実
験1−2で式〔q@〕である化合物について上記のよう
な操作を行なった際のクロマトグラムを示す。なおピー
ク上の数値は保持時間を示す。 第5図は高速液体クロマトグラフィーの浴出ノミターン
を示すものである。図中の1は倒れも反応前の化合物そ
のものの、2は何れもビオチンと化合物を混合したもの
の、3は何れも化合物とビオチン活性エステルとを反応
させたもののクロマトグラムである。ホは実験2−・3
で式〔(オ〕の化合物、へは実験1−3で式〔[相]〕
である化合や、トは実験2−4で式〔(!恥の化合物の
、チは実験1−4で式〔◇φ〕の化合物について上記の
ような操作を行なった際のクロマトグラムを示す。なお
、ピーク上の数値は保持時間を示す。 第6図は電気泳動の結果を示すものである。(a)、<
C)、(e)および(g)は、各々実験2−2の〔0抄
〕、1−2の〔(1−9〕、2−1の〔Q3)〕および
1−1の〔(1ψ〕の化合物の結果を示す。1だ、(b
)、(d)、(f)および(h)は各々実験2−2の〔
O■〕、1−2の〔(Φ〕、2−1の〔0多〕および1
−1の〔(ユ〕の各々の化合物とビオチン活性エステル
とを反応させた後の結果を示す、。 XCはキシレンシアツールの、BPBii;’ロモフェ
ノールズルーのバンドをそれぞれ示し、ともに電気泳動
の標識として用いるものである。なお図中で上がマイナ
ス側、下がプラス側を示す。 第7図は′「d気泳動の結果を示すものである。(j)
。 (1)、(n)および<p)は各々実験1−4の〔[相
]〕、2−4の〔@〕、1−3の〔[相]〕お工び2−
3の
験1−2で式〔q@〕である化合物について上記のよう
な操作を行なった際のクロマトグラムを示す。なおピー
ク上の数値は保持時間を示す。 第5図は高速液体クロマトグラフィーの浴出ノミターン
を示すものである。図中の1は倒れも反応前の化合物そ
のものの、2は何れもビオチンと化合物を混合したもの
の、3は何れも化合物とビオチン活性エステルとを反応
させたもののクロマトグラムである。ホは実験2−・3
で式〔(オ〕の化合物、へは実験1−3で式〔[相]〕
である化合や、トは実験2−4で式〔(!恥の化合物の
、チは実験1−4で式〔◇φ〕の化合物について上記の
ような操作を行なった際のクロマトグラムを示す。なお
、ピーク上の数値は保持時間を示す。 第6図は電気泳動の結果を示すものである。(a)、<
C)、(e)および(g)は、各々実験2−2の〔0抄
〕、1−2の〔(1−9〕、2−1の〔Q3)〕および
1−1の〔(1ψ〕の化合物の結果を示す。1だ、(b
)、(d)、(f)および(h)は各々実験2−2の〔
O■〕、1−2の〔(Φ〕、2−1の〔0多〕および1
−1の〔(ユ〕の各々の化合物とビオチン活性エステル
とを反応させた後の結果を示す、。 XCはキシレンシアツールの、BPBii;’ロモフェ
ノールズルーのバンドをそれぞれ示し、ともに電気泳動
の標識として用いるものである。なお図中で上がマイナ
ス側、下がプラス側を示す。 第7図は′「d気泳動の結果を示すものである。(j)
。 (1)、(n)および<p)は各々実験1−4の〔[相
]〕、2−4の〔@〕、1−3の〔[相]〕お工び2−
3の
〔0〕の化合物の結果を示す。また、(i)、(k
)、(m)および(0)は各々実験1−4の〔σ◇〕、
2−4の〔σ多〕、1−3の〔[相]〕および2−3の
〔(の〕の各々の化合物とビオチン活性エステルとを反
応させた後の結果を示す。 BPBは上記と同じ意味、また図中で上がマイナス側J
がプラス側を示す。 高速液体クロマトグラフィーによる結果(第4図および
5図)からみれば、弐6つで示される5′−水酸基をも
つ化合物(第4図イー1、第4図)・−1、第5図示−
1および第4図イー1)はビオチンと反応せず(第4図
イ”−3、第4図バー3、第5図ホー3、および第4図
イー1)、終始単一ピークのt’tである。それに対し
てオリゴヌクレオチド誘導体〔式[相]〕はビオチンと
反応させると、高速液体クロマトグラフィーの溶出パタ
ーンに変化が生じて、原料のピーク(第4図ローLi4
図ニー1、第5図へ−1および第5図チー1)はなくな
っており、ビオチン活性エステルと反応して新しい化合
物(第4図ロー3、第4図ニー3、第5図へ−3および
第5図チー3)ができていることがわかる。な廿、第4
〜5し10、二、へおよびチの2はビオチン活性エステ
ルと化合物〔αΦ〕とを混合し、第4〜5図イ、ハ、ホ
およびトの2はビオチン活性エステルと5′−水酸4f
:もつ化合物〔(l珍〕とを混合して実際に行なった反
応の前後の溶出ノミターンと対比させたものであるが、
これらを見比べてみても一級アミン基を有する化合物〔
(ゆ〕はビオチン活性エステルと選択的に反応し、5′
−水酸基をもつ化合物〔(呻〕とは反応していないこと
がわかる。 一方第6図および第7図の′電気泳動の結果から、5′
−水酸基化合物とビオチン活性エステルとの反応を見る
と((a) ・(b)、(e) ・(f)、(k)’−
(1)および(0)・(p)参照)、反応前((a)、
(、)、<1)および(p))の・々ンドの位置と反応
後(b)、(f)、(k)および(0))の・ぐンドの
位置に相違が見られないことより、ビオチンとの反応は
生じていないことがわかる。また、−級アミン基を有す
るオリゴヌクレオチド((C)・(d)、(g)・(h
)、(i)・(j)および(ハ)・(n)参照)とビオ
チン活性エステルとの反応を見ると、反応前((C)、
(g)、(j)および(n))のバンドの位置と反応後
((d)、(h)、(i)および(111))のバンド
の位16とが異なっており、ビオチンと反応しているこ
とがわかる。 以上の結果より、上記で合成した一級アミン基を有する
化合物は、ビオチン活性エステルと選択的に反応してい
るこ/とがわかる。
)、(m)および(0)は各々実験1−4の〔σ◇〕、
2−4の〔σ多〕、1−3の〔[相]〕および2−3の
〔(の〕の各々の化合物とビオチン活性エステルとを反
応させた後の結果を示す。 BPBは上記と同じ意味、また図中で上がマイナス側J
がプラス側を示す。 高速液体クロマトグラフィーによる結果(第4図および
5図)からみれば、弐6つで示される5′−水酸基をも
つ化合物(第4図イー1、第4図)・−1、第5図示−
1および第4図イー1)はビオチンと反応せず(第4図
イ”−3、第4図バー3、第5図ホー3、および第4図
イー1)、終始単一ピークのt’tである。それに対し
てオリゴヌクレオチド誘導体〔式[相]〕はビオチンと
反応させると、高速液体クロマトグラフィーの溶出パタ
ーンに変化が生じて、原料のピーク(第4図ローLi4
図ニー1、第5図へ−1および第5図チー1)はなくな
っており、ビオチン活性エステルと反応して新しい化合
物(第4図ロー3、第4図ニー3、第5図へ−3および
第5図チー3)ができていることがわかる。な廿、第4
〜5し10、二、へおよびチの2はビオチン活性エステ
ルと化合物〔αΦ〕とを混合し、第4〜5図イ、ハ、ホ
およびトの2はビオチン活性エステルと5′−水酸4f
:もつ化合物〔(l珍〕とを混合して実際に行なった反
応の前後の溶出ノミターンと対比させたものであるが、
これらを見比べてみても一級アミン基を有する化合物〔
(ゆ〕はビオチン活性エステルと選択的に反応し、5′
−水酸基をもつ化合物〔(呻〕とは反応していないこと
がわかる。 一方第6図および第7図の′電気泳動の結果から、5′
−水酸基化合物とビオチン活性エステルとの反応を見る
と((a) ・(b)、(e) ・(f)、(k)’−
(1)および(0)・(p)参照)、反応前((a)、
(、)、<1)および(p))の・々ンドの位置と反応
後(b)、(f)、(k)および(0))の・ぐンドの
位置に相違が見られないことより、ビオチンとの反応は
生じていないことがわかる。また、−級アミン基を有す
るオリゴヌクレオチド((C)・(d)、(g)・(h
)、(i)・(j)および(ハ)・(n)参照)とビオ
チン活性エステルとの反応を見ると、反応前((C)、
(g)、(j)および(n))のバンドの位置と反応後
((d)、(h)、(i)および(111))のバンド
の位16とが異なっており、ビオチンと反応しているこ
とがわかる。 以上の結果より、上記で合成した一級アミン基を有する
化合物は、ビオチン活性エステルと選択的に反応してい
るこ/とがわかる。
第1図は、本発明の化合物を合成する方法の一例を示す
フローチャートである。 第2図は、実験例で示した本発明化合物の製造法のフロ
ーチャートである。 第5図示−1は、実験例で示した化合物[VDの高速液
体クロマトグラフィーの結果を示す図である。 第4〜5図は、いずれも高速液体クロマトグラフィーの
溶出)ξターンを示す図である。 第6〜7図は、いずれも電気泳動の結果を示す図である
。 53 図 う氷 ↑矛 B1 間(イδ() 54 図 仔、衿晴間C今) 65 図 −1へ−1トー1 ナー1−2 5 2 510 5+0 5 J: 吸 −2へ−2ト 2 2
左 72及
0 8.6 ε 寸 起 く 510 510 5 1匹 F−3−3トー3 ナー39.2
11.0 2 56 図
フローチャートである。 第2図は、実験例で示した本発明化合物の製造法のフロ
ーチャートである。 第5図示−1は、実験例で示した化合物[VDの高速液
体クロマトグラフィーの結果を示す図である。 第4〜5図は、いずれも高速液体クロマトグラフィーの
溶出)ξターンを示す図である。 第6〜7図は、いずれも電気泳動の結果を示す図である
。 53 図 う氷 ↑矛 B1 間(イδ() 54 図 仔、衿晴間C今) 65 図 −1へ−1トー1 ナー1−2 5 2 510 5+0 5 J: 吸 −2へ−2ト 2 2
左 72及
0 8.6 ε 寸 起 く 510 510 5 1匹 F−3−3トー3 ナー39.2
11.0 2 56 図
Claims (1)
- 【特許請求の範囲】 1下式[:VIDで示されるビオチンーオリゴデオキシ
リポヌクレオチPであることを特徴とする、ビオチンヌ
クレオチド誘導体。 1 〔〜l■〕 〔ただし、mおよびnはそれぞれ0また・は任意の自然
数であり、R1は2価の直鎖または分岐鎖の炭化水素残
基であシ、BはヌクレオチPを構成する塩基である(B
が複数個存在するときは、それらは同一でも異なっても
よい)。〕・2塩基Bがアデニン、チミン、シトシンお
よびグアニンからなる群より選ばれたものである、特許
請求の範囲第1項記載のとオリゴヌクレオチド誘導体。 3R1が炭素数2〜20のぼ鎖または分岐鎖のアルキレ
ン基である、特許請求の範囲第1項または第2項記載の
ビオチンヌクレオチド誘導体。 4 mがOまたは6までの自然数、nが0筐たは40ま
での自然数である、特許請求の範囲第1〜3項のいずれ
か一項に記載のビオチンヌクレオチド誘導体。 5下式[VDで示されるオリゴヌクレオチド誘導体の末
端アミン基にビオチンを結合させて下式〔■〕で示され
るビオチンーオリゴデオキシリポヌクオチPを得ること
を特徴とする、ビオチンヌクレオチド誘導体の製造法。 /−\ HN NH I 〔V旧 6;アミノ基とビオチンとの結合をアミノ基とビオチン
活性エステルとの反応によって行なう、特許請求の範囲
第5項記載の方法。 7、ビオチン活性エステルがビオチンスクシンイミトマ
たハヒオチンー)ぞラニトロフェニルエステルである、
特許請求の範囲第6項記載の方法。 8、アミン基とビオチンとの結合を縮合剤の作用下に行
なう、特許請求の範囲第5項記載の製造法。 9、縮合剤がジシクロへキシルカルボジイミドである、
特許請求の範囲第8項記載の#進法。
Priority Applications (6)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
JP2251683A JPS59148798A (ja) | 1983-02-14 | 1983-02-14 | ビオチンヌクレオチド誘導体 |
US06/578,678 US4605735A (en) | 1983-02-14 | 1984-02-09 | Oligonucleotide derivatives |
EP84101392A EP0119448B1 (en) | 1983-02-14 | 1984-02-10 | Oligonucleotide derivatives and production thereof |
CA000447146A CA1212914A (en) | 1983-02-14 | 1984-02-10 | Oligonucleotide derivatives and production thereof |
DE8484101392T DE3463384D1 (en) | 1983-02-14 | 1984-02-10 | Oligonucleotide derivatives and production thereof |
US06/855,710 US4849336A (en) | 1983-02-14 | 1986-04-25 | Oligonucleotide derivatives and production thereof |
Applications Claiming Priority (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
JP2251683A JPS59148798A (ja) | 1983-02-14 | 1983-02-14 | ビオチンヌクレオチド誘導体 |
Publications (2)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
JPS59148798A true JPS59148798A (ja) | 1984-08-25 |
JPH0314319B2 JPH0314319B2 (ja) | 1991-02-26 |
Family
ID=12084928
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
JP2251683A Granted JPS59148798A (ja) | 1983-02-14 | 1983-02-14 | ビオチンヌクレオチド誘導体 |
Country Status (1)
Country | Link |
---|---|
JP (1) | JPS59148798A (ja) |
Cited By (7)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
JPH03500773A (ja) * | 1987-10-28 | 1991-02-21 | ハワード・フローレイ・インスティテュト・オブ・イクスペリメンタル・フィジオロジー・アンド・メディシン | オリゴヌクレオチド‐ポリアミド コンジュゲート |
WO2007142202A1 (ja) | 2006-06-06 | 2007-12-13 | Panasonic Corporation | ヌクレオチド鎖修飾方法 |
WO2010061922A1 (ja) | 2008-11-27 | 2010-06-03 | 独立行政法人理化学研究所 | 新規MutSタンパク質およびそれを用いた変異の判定方法 |
WO2010113452A1 (ja) | 2009-03-31 | 2010-10-07 | 凸版印刷株式会社 | 遺伝子型の識別方法 |
WO2011122501A1 (ja) | 2010-03-29 | 2011-10-06 | 凸版印刷株式会社 | 標的塩基配列の識別方法 |
EP2415878A1 (en) | 2003-12-25 | 2012-02-08 | Riken | Method of amplifying nucleic acid and method of detecting mutated nucleic acid using the same |
WO2013035875A1 (ja) | 2011-09-08 | 2013-03-14 | 独立行政法人理化学研究所 | プライマーセット及びそれを用いた標的核酸配列の増幅方法並びに変異核酸の検出方法 |
Citations (1)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
JPS57209297A (en) * | 1981-04-17 | 1982-12-22 | Univ Yale | Modified nucleotide, manufacture and use |
-
1983
- 1983-02-14 JP JP2251683A patent/JPS59148798A/ja active Granted
Patent Citations (1)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
JPS57209297A (en) * | 1981-04-17 | 1982-12-22 | Univ Yale | Modified nucleotide, manufacture and use |
Cited By (10)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
JPH03500773A (ja) * | 1987-10-28 | 1991-02-21 | ハワード・フローレイ・インスティテュト・オブ・イクスペリメンタル・フィジオロジー・アンド・メディシン | オリゴヌクレオチド‐ポリアミド コンジュゲート |
EP2415878A1 (en) | 2003-12-25 | 2012-02-08 | Riken | Method of amplifying nucleic acid and method of detecting mutated nucleic acid using the same |
US8206902B2 (en) | 2003-12-25 | 2012-06-26 | Riken | Method of amplifying nucleic acid and method of detecting mutated nucleic acid using the same |
WO2007142202A1 (ja) | 2006-06-06 | 2007-12-13 | Panasonic Corporation | ヌクレオチド鎖修飾方法 |
WO2010061922A1 (ja) | 2008-11-27 | 2010-06-03 | 独立行政法人理化学研究所 | 新規MutSタンパク質およびそれを用いた変異の判定方法 |
WO2010113452A1 (ja) | 2009-03-31 | 2010-10-07 | 凸版印刷株式会社 | 遺伝子型の識別方法 |
US9523119B2 (en) | 2009-03-31 | 2016-12-20 | Toppan Printing Co., Ltd. | Method of distinguishing genotypes |
WO2011122501A1 (ja) | 2010-03-29 | 2011-10-06 | 凸版印刷株式会社 | 標的塩基配列の識別方法 |
WO2013035875A1 (ja) | 2011-09-08 | 2013-03-14 | 独立行政法人理化学研究所 | プライマーセット及びそれを用いた標的核酸配列の増幅方法並びに変異核酸の検出方法 |
US9586987B2 (en) | 2011-09-08 | 2017-03-07 | Kabushiki Kaisha Dnaform | Primer set for isothermal amplication of a target nucleic acid sequence |
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
JPH0314319B2 (ja) | 1991-02-26 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
US4849336A (en) | Oligonucleotide derivatives and production thereof | |
US4667025A (en) | Oligonucleotide derivatives | |
US5278043A (en) | Ruthenium-lumazine energy transfer systems | |
Haralambidis et al. | Preparation of base-modified nucleosides suitable for non-radioactive label attachment and their incorporation into synthetic oligodeoxyribonucleotides | |
US5367066A (en) | Oligonucleotides with selectably cleavable and/or abasic sites | |
US5545730A (en) | Multifunctional nucleic acid monomer | |
EP0241363B1 (fr) | Dérivés de nucléosides et leur utilisation pour la synthèse d'oligonucléotides | |
DE60034354T2 (de) | Verbindungen zum schutz von hydroxylgruppen und ihre anwendung | |
JPH04507402A (ja) | 架橋オリゴヌクレオチド | |
JPH09504805A (ja) | 活性ヌクレオシドホスホラミダイト、その製法及びその使用 | |
JPH04503059A (ja) | 5′―ビオチン化オリゴヌクレオチド製造用の試剤 | |
JPS59148798A (ja) | ビオチンヌクレオチド誘導体 | |
JPH0211597A (ja) | Dnaまたはrna配列を含有するルテニウム複合化合物 | |
JPH0435480B2 (ja) | ||
JPH01500353A (ja) | 2′‐デオキシアデノシン誘導体を含む核酸検出用プローブ | |
JPH0374239B2 (ja) | ||
JPS5993099A (ja) | オリゴヌクレオチド誘導体およびその製造法 | |
Belagaje et al. | Polymer supported synthesis of oligonucleotides by a phosphotriester method | |
JPS60166695A (ja) | オリゴヌクレオチド誘導体およびその製造法 | |
JPS61171497A (ja) | ルア−・ヌクレオチド | |
JPS60166694A (ja) | オリゴヌクレオチド誘導体およびその製造法 | |
Wahl | Synthesis and purification of oligodeoxyribonucleotides | |
Misra et al. | Fluorescent labelling of ribonucleosides at 2′-terminus; Comparative fluorescence studies | |
JPS6299392A (ja) | 新規リボヌクレオシド誘導体およびその用途 | |
JPH07165786A (ja) | 5位置換ウリジン類、その製造方法及びその用途 |