JPH10507370A - Ｃ型肝炎ウイルス（ｈｃｖ）によってコードされるｒｎａ依存性ｒｎａポリメラーゼおよび末端ヌクレオチジルトランスフェラーゼ活性のイン・ビトロでの再生法 - Google Patents

Abstract

(57)【要約】 本発明は、Ｃ型肝炎ウイルスと会合したＲＮＡ依存性のＲＮＡポリメラーゼ活性のイン・ビトロでの再生法である。この方法は、ＮＳ５Ｂに含まれる配列を反応混合物に用いることを特徴とする。ＮＳ５Ｂタンパク質のもう一つの特徴である末端ヌクレオチジルトランスフェラーゼ活性も、この方法を用いて再生することができる。この方法は、明らかに均一になるまで精製したまたは過剰産生生物の抽出物に含まれるＮＳ５Ｂがリボヌクレオチドの異種または同種のＲＮＡ分子の３′末端への付加を触媒することができることを利用している。本発明は、ＮＳ５Ｂに含まれる配列を含んでなる組成物、および治療目的で、ＮＳ５Ｂと会合した酵素活性を阻害する化合物を選択することができる酵素試験を設定するためのこれらの組成物の使用にも関する。図は、培養した真核および原核細胞でのＣ型肝炎ウイルスＲＮＡ依存性のＲＮＡポリメラーゼおよび末端ヌクレオチジルトランスフェラーゼを産生する方法に用いるプラスミドを示している。

Description

【発明の詳細な説明】 Ｃ型肝炎ウイルス（ＨＣＶ）によってコードされるＲＮＡ依存性ＲＮＡポリメラ ーゼおよび末端ヌクレオチジルトランスフェラーゼ活性のイン・ビトロでの再生 法 説明 本発明は、Ｃ型肝炎ウイルス（ＨＣＶ）の分子生物学およびウイルス学に関す る。更に具体的には、本発明の目的は、ＨＣＶによって産生されるＲＮＡ依存性 ＲＮＡポリメラーゼ（ＲｄＲｐ）および末端ヌクレオチジルトランスフェラーゼ （ＴＮＴアーゼ）活性、ＨＣＶ ＲｄＲｐおよびＴＮＴアーゼの発現法、治療目 的でこれらの酵素活性を阻害し、従ってＨＣＶウイルスの複製を妨害する化合物 を同定するための、ＨＣＶによってコードされるＲｄＲｐおよびＴＮＴアーゼ活 性をイン・ビトロで試験する方法である。 知られているように、Ｃ型肝炎ウイルス（ＨＣＶ）は、非Ａ、非Ｂ型肝炎（Ｎ ＡＮＢ）の主要な病因物質である。ＨＣＶは、輸血後のＮＡＮＢウイルス性肝炎 の少なくとも９０％および突発性ＮＡＮＢ肝炎の５０％を引き起こすものと推定 されている。血液供与者の選択、および輸血に用いられる血液の免疫学的特性決 定には大きな進歩が見られたが、輸血を受けるヒトの中には未だ多数のＨＣＶ感 染（世界中で毎年百万人以上の感染）が見られる。ＨＣＶ感染者の約５０％が、 ５〜４０年の期間以内に肝硬変を発症する。更に、最近の臨床研究によれば、慢 性ＨＣＶ感染症と肝細胞癌の発症との間に相関があることが示唆されている。 ＨＣＶは、約９．４ｋｂのＲＮＡ陽性ゲノムを含むエンベロープのあるウイル スである。このウイルスはFlaviviridae科の一員であり、他の構成部員はフラビ ウイルスおよびペスチウイルスである。ＨＣＶのＲＮＡゲノムは、最近になり遺 伝子地図が作成された。世界の他の部分で単離されたＨＣＶゲノムからの配列を 比較したところ、これらの配列は極端に異種性であることがあることが判った。 ＨＣＶゲノムの大半は、９０３０〜９０９９個のヌクレオチドの間で変化するこ とができるオープン・リーディング・フレーム（ＯＲＦ）によって占められてい る。このＯＲＦは単一のウイルス性ポリタンパク質をコードし、その長さは３０ １０〜３０３３個のアミノ酸の間で変化することができる。ウイルスの感染サイ クルの間に、ポリタンパク質は、ウイルスの複製に必要な個々の遺伝子生成物に タンパク質分解的に加工される。ＨＣＶ構造タンパク質をコードする遺伝子は、 ＯＲＦの５′−末端に位置し、非構造タンパク質をコードする領域はＯＲＦの残 りの部分を占める。 構造タンパク質は、Ｃ（コア、２１ｋＤａ）、Ｅ１（エンベロープ、ｇｐ３７ ）、およびＥ２（ＮＳ１、ｇｐ６１）からなる。Ｃは、２１ｋＤａの非グリコシ ル化タンパク質であり、ウイルス性のヌクレオカプシドを形成していると思われ る。タンパク質Ｅ１は約３７ｋＤａの糖タンパク質であり、外側ウイルスエンベ ロープの構造タンパク質であると考えられる。６１ｋＤａのもう一つの膜糖タン パク質であるＥ２は、ウイルスの外側エンベロープにおける第二の構造タンパク 質であると思われる。 非構造領域は、２４ｋＤａの疎水性タンパク質であるＮＳ２（ｐ２４）から始 まり、その機能は知られていない。ポリタンパク質のＮＳ２に続く６８ｋＤａの タンパク質であるＮＳ３は、最初の２００アミノ末端アミノ酸におけるセリンプ ロテアーゼドメイン、およびカルボキシ末端におけるＲＮＡ−依存性ＡＴＰアー ゼドメインの２種類の機能的ドメインを有することが予言されている。ＮＳ４に 相当する遺伝子領域は、それぞれ６および２６ｋＤａの２種類の疎水性タンパク 質ＮＳ４Ａ（ｐ６）およびＮＳ４Ｂ（ｐ２６）をコードするが、これらのタンパ ク質の機能は未だ解明されていない。ＮＳ５に相当する遺伝子も、それぞれ５６ および６５ｋＤａの２種類のタンパク質ＮＳ５Ａ（ｐ５６）およびＮＳ５Ｂ（ｐ ６５）をコードする。 様々な分子生物学的検討は、宿主細胞の小胞体と会合したプロテアーゼである シグナルペプチダーゼが非構造領域における、すなわちＣ／Ｅ１、Ｅ１／Ｅ２お よびＥ２／ＮＳ２の部位でのタンパク質分解性加工に関与していることを示して いる。ＨＣＶのウイルス的にコードされたプロテアーゼ活性は、ＮＳ２とＮＳ３ 斗野開裂に関与しているものと思われる。このプロテアーゼ活性は、セリンプロ テアーゼドメインを含むＮＳ２の部分とＮＳ３の部分とを両方共含んでなる領域 に含まれるが、同一の触媒機構は用いない。ＮＳ３に含まれるれりプロテアーゼ はＳ３とＮＳ４Ａ、ＮＳ４ＡとＮＳ４Ｂ、ＮＳ４ＢとＮＳ５Ａ、およびＮＳ５Ａ とＮＳ５Ｂとの間の結合の開裂に関与している。 他の（＋）−鎖ＲＮＡウイルスと同様に、ＨＣＶの複製は最初に相補性の（− ）−ＲＮＡ鎖が合成され、これが次に後代の（＋）−鎖ＲＮＡ分子産生の鋳型と して働くことによって進行すると考えられている。ＲＮＡ依存性ＲＮＡポリメラ ーゼ（ＲｄＲｐ）は、これらの両段階に関与しているものと仮定されてきた。総 てのＲＮＡ依存性ＲＮＡポリメラーゼに含まれるアミノ酸配列は、ＮＳ５領域に あると認めることができる。これにより、ＮＳ５領域はウイルス複製機構の成分 を含んでいることが示唆される。ウイルスによりコードされるポリメラーゼは、 抗ウイルス化合物によって阻害するための重要な標的であると従来から考えられ てきた。しかしながら、具体的なＨＣＶの場合には、そのような物質の研究は、 ウイルス感染の適当なモデル系（例えば、培養における細胞の感染、または入手 しやすい動物モデル）、および機能的なＲｄＲｐ酵素試験法のいずれもが欠けて いたため極めて困難であった。 意外なことには、この重大な制限は、本発明による方法を採用することによっ て解消することができ、これがまた下記の説明から明らかになる他の利益も付与 することを見出だした。 本発明の目的は、ＨＣＶ ＮＳ５Ｂタンパク質に含まれる配列を使用する、Ｈ ＣＶＫＲＮＡ依存性ＲＮＡポリメラーゼ活性をイン・ビトロで再生する方法であ る。ＮＳ５Ｂタンパク質のもう一つの特性である末端ヌクレオチジルトランスフ ェラーゼ活性も、この方法を用いて再生することができる。この方法は、ＮＳ５ Ｂの配列を含むタンパク質は、真核または原核性の異種系のいずれでも発現する ことができること、すなわち明らかに均一になるまで精製したまたは過剰に生成 する生体の抽出物に含まれるＮＳ５Ｂの配列を含む組換えタンパク質は、鋳型依 存性（ＲｄＲｐ）または鋳型とは独立して（ＴＮＴアーゼ）外来ＲＮＡ分子の３ ′末端へのリボヌクレオチドの付加を触媒することができることを利用している 。 本発明は、新規な組成物であって、配列がＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１またはそれ に含まれているまたはそれから誘導される配列であるタンパク質を含んでなるこ とを特徴とするものにも敷衍される。この配列は、総てのＲＮＡウイルスが高度 の変異性を示すように、様々なＨＣＶ単離物で変化し得ることが理解されている 。この新規な組成物はＨＣＶウイルスに必要なＲｄＲｐ活性を有し、そのゲノム を複製する。 本発明の目的は、ＲｄＲｐのインヒビターおよびＴＮＴアーゼのインヒビター などのＮＳ５Ｂと会合した酵素活性を阻害する化合物を治療目的で同定すること ができる酵素試験法を作成するためのこの組成物の使用である。 この点までは、本発明の一般的説明は行なった。下記の例により、具体的態様 を更に詳細に説明し、その目的、特徴、利点および操作の方法を一層明確に理解 してもらうことにする。 図１は、バキュロウイルス発現ベクターへのＨＣＶｃＤＮＡの転移に用いるプ ラスミド構築物を示す。 図２は、それぞれＨＣＶ ＲＮＡ依存性ＲＮＡポリメラーゼのＤ−ＲＮＡ基質 のイン・ビトロでの合成に用いるプラスミド［ｐＴ７−７（ＤＣｏＨ）］および E．coli 細胞におけるＨＣＶ ＲＮＡ依存性ＲＮＡポリメラーゼの発現に用いる プラスミド［ｐＴ７−７（ＮＳ５Ｂ）］を示している。 図３は、Ｄ−ＲＮＡの（＋）および（−）鎖の略図を示す。転写体は、ＤＣｏ Ｈ ｍＲＮＡのコード領域を含んでいる。ＤＮＡ−オリゴヌクレオチドａ、ｂお よびｃをデザインして、新規に合成したアンチセンスＲＮＡでアニールし、ＤＮ Ａ／ＲＮＡハイブリッドをＲＮアーゼＨで開裂させた。略図の株に、それぞれオ リゴヌクレオチドａ、ｂおよびｃとのＲＮＡ（−）ハイブリッドのＲＮアーゼ消 化によって生成される予想ＲＮＡ断片の大きさを示している。寄託物 それぞれ、受理番号ＮＣＩＭＢ４０７２７、４０７２８、４０７２９および４ ０７３０号で、ザ・ナショナル・コレクションズ・オブ・インダストリアル・ア ンド・マリーン・バクテリア・リミテド（ＭＣＩＭＢ）、アバディーン、スコッ トランド、英国に１９９５年５月９日に登録した、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１、Ｓ ＥＱ ＩＤ ＮＯ：２、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１２の転写のためのｃＤＮＡおよ びＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１を含むプラスミドｐＢａｃ５Ｂ、ｐＢａｃ２５、ｐＴ ７．７ＤＣｏＨおよびｐＴ７．７ＮＳ５Ｂを用いて形質転換したC．coli DH1 バ クテリア。例１ Spodoptera frugiperda クローン９（Ｓｆ９）の培養細胞でのＨＣＶ ＲｄＲｐ ／ＴＮＴアーゼの発現の方法 昆虫の培養細胞での異種遺伝子の発現のための系、例えばバキュロウイルスベ クターで感染したSpodoptera frugiperda クローン９（Ｓｆ９）細胞は、当該技 術分野で知られている（V.A．Luckow、ヒト遺伝子生成物の発現のためのバキュ ロウイルス系(Baculovirus systems for the expression of human gene produc ts)、（1993）Current Opinion in Biotechnology 4，pp．564-572）。異種遺伝 子は、通常はBombix mori 核ポリヘドロシスウイルスのAutographa Californica 核ポリヘドロシスウイルスの強力なポリヘドリンプロモーターの制御下に置かれ ている。同種組換えによるバキュロウイルスにおける所望な部位における異種Ｄ ＮＡの導入法も、当該技術分野で知られている（D.R．O'Reilly，L.K．Miller， V.A．Luckow,（1992）バキュロウイルス発現ベクター−実験室便覧(Baculovirus Expression Vectors-A Laboratory Manual)、W.H．Freeman and Company、ニュ ーヨーク）。 プラスミドベクターｐＢａｃ５ＢおよびｐＢａｃ２５はｐＢｌｕｅＢａｃIII （Invitrogen）の誘導体の誘導体であり、バキュロウイルス発現ベクターにおけ るＮＳ４Ｂおよび他の非構造ＨＣＶタンパク質をコードする遺伝子の転写の目的 で構築された。これらのプラスミドは図１に模式的に示され、その構築は例８に 詳記されている。ＨＣＶ−ＢＫ単離物のゲノムに相当するｃＤＮＡの選択された 断片（ＨＣＶ−ＢＫ；Takamizawa．A.，Mori，C.，Fuke，I.，Manabe，S.，Mura kami，S.，Fujita，J.，Onishi，E,，Andoh，T.，Yoshida，I.およびOkayama，H .,（1991）ヒトキャリヤーから単離したＣ型肝炎ウイルスゲノムの構造および組 織(Structure and Organization of the Hepatitis C Virus Genome Isolated f rom Human Carriers)，J．Virol.，65，1105-1113）を、核ポリヘドロシスウイ ルスの強力なホリヘドリンプロモーター下でクローニングし、バキュロウイルス ベクター中で同種組換えができる配列によってフランクした。 ｐＢａｃ５Ｂを構築するため、ＨＣＶポリタンパク質のアミノ酸２４２０〜３ ０１０をコードするｃＤＮＡ領域を含み、ＮＳ５Ｂタンパク質（ＳＥＱ ＩＤＮ Ｏ：１）に相当するＰＣＲ生成物をｐＢｌｕｅ ＢａｃIII のＢａｍＨＩとＨｉ ｎｄIII 部位の間でクローニングした。ＰＣＲセンスオリゴヌクレオチドは翻訳 開始シグナルを含み、元のＨＣＶ終止コドンは、翻訳終止の働きを行なう。 ｐＢａｃ２５はｐＢｌｕｅＢａｃIII （Invitrogen）の誘導体であり、ＨＣＶ −ＢＫポリタンパク質のアミノ酸８１０〜３０１０（ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２） をコードするｃＤＮＡ領域がＮｃｏＩおよびＨｉｎｄIII 制限部位の間でクロー ニングされたものである。 Spodoptera frugiperda クローニング９（Ｓｆ９）細胞およびバキュロウイル ス組換えキットは、Invitrogenから購入した。細胞を皿上でまたは１０％ウシ胎 児血清(Gibco)を含む完全Grace 昆虫培地(Gibco)中で２７℃の懸濁液で成育させ た。バキュロウイルスのトランスフェクション、組換えおよび選択は、製造業者 が推奨する方法で行なった。組換えバキュロウイルスクローンＢａｃ２５および Ｂａｃ５Ｂは、所望なＨＣＶｃＤＮＡを含むものを単離した。 タンパク質の発現のため、Ｓｆ９細胞を、細胞当たり約５個のウイルス流しの 割合で２×１０⁶個の細胞／ｍｌの密度で組換えバキュロウイルスＢａｃ２５ま たはＢａｃ５Ｂに感染させた。感染から４８〜７２時間後、Ｓｆ９細胞をペレッ ト化し、リン酸緩衝食塩水（ＰＢＳ）で１回洗浄し、１ｍＭジチオスレイトール （ＤＴＴ）、１ｍＭフッ化フェニルメチルスルホニル(ＰＭＳＦ、Sigma)および ４ｍｇ／ｍｌロイペプチンを含む緩衝液Ａ（１０ｍＭ Ｔｒｉｓ／Ｃｌ ｐＨ８ ，１．５ｍＭ ＭｇＣｌ₂，１０ｍＭ ＮａＣｌ）に慎重に再懸濁した（７．５ ×１０⁷個／ｍｌ）。総ての下記の段階は、氷上で行なった。３０分間膨潤させ た後、きっちりと取り付けた乳棒を用いてダウンスホモゲナイザー中で２０往復 させることによって細胞を破壊した。グリセロール、並びに洗剤Nonidet P-40（ ＮＰ４０）および３−［（３−クロラミドプロピル）−ジメチル−アンモニオ］ −１−プロパンスルホネート（ＣＨＡＰＳ）を、それぞれ１０％（ｖ／ｖ）、１ ％（ｖ／ｖ）および０．５％（ｗ／ｖ）の最終濃度となるまで加え、細胞抽出物 を氷上で時折攪拌を行ないながら更に１時間インキュベーションした。核を１０ ００×ｇで１０分間遠心分離することによってペレット化し、上清を集めた。ペ レットを、上記濃度のグリセロールおよび洗剤を含む緩衝液Ａ（７．５×１０⁷ 個の核当たり０．５ｍｌ）にダウンスホモゲナイザー中で２０往復させることに よって再懸濁させた後、氷上で１時間インキュベーションした。核を再ペレット 化した後、両上清を合わせて、８０００×ｇで１０分間遠心分離し、ペレットを 廃棄した。生成する粗製細胞質抽出物を用いて、直接ＲｄＲｐ活性を測定し、ま たはスクロースグラディエント上で更に精製した（例５を参照されたい）。 Ｓｆ９細胞を組換えバキュロウイルスＢａｃ２５またはＢａｃ５Ｂで感染させ ることにより、予想したＨＣＶタンパク質を発現する。実際に、Ｓｆ９細胞をＢ ａｃ２５で感染させた後、性格に加工したＨＣＶ ＮＳ２（２４ｋＤａ）、ＮＳ ３（６８ｋＤａ）、ＮＳ４Ｂ（２６ｋＤａ）、ＮＳ４Ａ（６ｋＤａ）、ＮＳ５Ａ （５６ｋＤａ）およびＮＳ５Ｂ（６５ｋＤａ）タンパク質を、ＳＤＳ−ポリアク リルアミドゲル電気泳動（ＳＤＳ−ＰＡＧＥ）および免疫染色によって細胞溶解 物中に検出することができる。Ｓｆ９細胞をＢａｃ５Ｂで感染させた後には、真 のＮＳ５Ｂ（６５ｋＤａ）に大きさの点で相当する１個のＨＣＶでコードされた タンパク質だけが、ＳＤＳ−ＰＡＧＥの後に免疫染色またはクーマシーブルー染 色を行なうことによって検出される。例２ 合成ＲＮＡ鋳型／基質上の組換えＨＣＶＲｄＲｐの試験法 ＲｄＲｐ試験法は、新規なＲＮＡ生成物に取り込まれた標識したヌクレオチド の検出に基づいている。ＲｄＲｐ活性を測定するためのイン・ビトロ試験法は、 Ｓｆ９粗製細胞質抽出物または精製したタンパク質画分１〜５μｌを含む総容量 ４０μｌ中で行なった。Ｂａｃ２５またはＢａｃ５Ｂに感染したＳｆ９細胞の未 分画または精製細胞質抽出物を、ＨＣＶＲｄＲｐの供給源として用いることがで きる。ＨＣＶには関係しないタンパク質を発現する組換えバキュロウイルス構築 物に感染した細胞から得たＳｆ９細胞抽出物を、ネガティブ・コントロールとし て用いることができる。下記の補足物を反応混合物に加えた（最終濃度）：２０ ｍＭ Ｔｒｉｓ／Ｃｌ ｐＨ７．５，５ｍＭ ＭｇＣｌ₂，１ｍＭ ＤＴＴ，２ ５ｍＭ ＫＣｌ，１ｍＭ ＥＤＴＡ，１核種を５〜１０μＣｉ［³²Ｐ］ＮＴＰ（ 特に断らない限り、ＧＴＰ、３０００Ｃｉ／ミリモル、Amersham、を用いた）、 それぞれ０．５ｍＭのＮＴＰ（すなわち、特に断らない限り、ＣＴＰ、ＵＴＰ、 ＡＴＰ）、２０Ｕ ＲＮアシン(Promega)、０．５μｇＲＮＡ−基質（約４ピコ モル；最終濃度１００ｎＭ）、２μｇのアクチノマイシンＤ(Sigma)。反応物を 室温で２時間インキュベーションし、等容量の２×Proteinase K(ＰＫ、Boehrin ger Mannheim)緩衝液（３００ｍＭ ＮａＣｌ、１００ｍＭ Ｔｒｉｓ／Ｃｌｐ Ｈ７．５、１％ｗ／ｖＳＤＳ）を加えて反応を停止し、３７℃でＰＫ５０μｇで 半時間処理した。ＲＮＡ生成物をＰＣＡ抽出し、エタノールで沈澱し、７Ｍ尿素 を含む５％ポリアクリルアミドゲル上で電気泳動によって分析した。 本発明者らが通常試験（Ｄ−ＲＮＡ）に用いたＲＮＡ基質は、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１２に記載の配列を有し、典型的には下記のように線形化したプラスミド ｐＴ７−７（ＤＣｏＨ）をＴ７ポリメラーゼでイン・ビトロでの転写によって得 た。 プラスミドｐＴ７−７（ＤＣｏＨ）（図２）をＤＣｏＨコード配列の末端に含 まれるユニークＢｇｌII制限部位で線形化し、Ｔ７ポリメラーゼ(Stratagene)を 用いて、製造業者によって記載された手続きにより転写した。転写は、ＤＮアー ゼＩ(Promega)５Ｕ／１０μｌを加えて停止した。混合物を更に１５分間インキ ュベーションし、フェノール／クロロホルム／イソアミルアルコール（ＰＣＡ） で抽出した。取り込まれないヌクレオチドは、１ｍｌSephadex G50紡糸カラム(s pun column)を介するゲル濾過によって除去した。ＰＣＡによる抽出およびエタ ノール沈澱の後、ＲＮＡを乾燥し、水に再溶解し、その濃度を２６０ｎｍでの光 学密度によって決定した。 下記の実験から明らかになるように、Ｄ−ＲＮＡ以外の他のＲＮＡ分子を本発 明のＲｄＲｐ分析に用いることができる。 前記のＨＣＶＲｄＲｐ試験により、放射能標識した反応生成物の特徴的パター ンが得られ、基質ＲＮＡと同時移行する一つの標識生成物は、ネガティブ・コン トロールを含む総ての反応物に見られた。このＲＮＡ種は、銀染色によって可視 化することもでき、従って投入基質ＲＮＡに双頭すると考えられ、バキュロウイ ルスに感染したＳｆ９細胞の細胞質抽出物に含まれる末端ヌクレオチジルトラン スフェラーゼ活性によって標識されるものと思われる。ＨＣＶに関係しないタン パク質を発現する組換えバキュロウイルス構築物に感染した細胞ではなく、Ｂａ ｃ２５またはＢａｃ５Ｂに感染したＳｆ９細胞の細胞質抽出物を用いて行なった 反応では、基質ＲＮＡより速やかに移動する追加のバンドが観察された。この後 者の反応生成物は、オートラジオグラフィだけによって検出することができ、銀 染色によっては検出することができないので、高い特異活性に表しきされている ことが判った。この新規な生成物は、ＲＮＡを加えない対照反応からは見られな かったので、外部から加えたＲＮＡ鋳型から誘導されることが判った。興味深い ことには、基質ＲＮＡより速やかに移動する標識した種の形成は、ＨＣＶ３′− 未翻訳領域を含んでいるまたはいないに関わらず、様々な鋳型ＲＮＡ分子で一貫 して見られた。肝臓に特異的な転写補助因子ＤＣｏＨの３９９個のヌクレオチド ｍＲＮＡ（Ｄ−ＲＮＡ）は、本発明者らのＲｄＲｐにおいて効率的に受容される 基質であることが判った。 Ｂａｃ２５またはＢａｃ５Ｂに感染した細胞抽出物による反応で生成した新規 な種の性質を画定するため、下記の一連の実験を行なった。(i) 反応混合物を ＲＮＡアーゼまたはNuclease P1 で処理した。これにより、放射性バンドは完全 に消失するので、標識生成物はいずれもＲＮＡ分子であると結論した。(ii) ４ 種のヌクレオチド三リン酸のいずれかを反応混合物から除くと、投入ＲＮＡだけ が標識されたことから、一層速やかに移動する種は重合反応の生成物であること が示唆された。(iii) 試験からＭｇ²⁺イオンを除くと、反応が完全にブロック され、新規なＲＮＡの合成も、投入ＲＮＡの標識も見られなかった。(iv) 試験 を放射能標識した投入ＲＮＡと未標識ヌクレオチドとで行なうと、標識生成物は 標準的条件下で得られたものと識別できなかった。この結果から、新規なＲＮＡ 生成物は、最初の投入ＲＮＡ分子から生成すると結論した。 まとめると、これらのデーターは、Ｂａｃ２５またはＢａｃ５Ｂに感染したＳ ｆ９細胞の抽出物は新たなＲＮＡ合成を触媒する新規なマグネシウムに依存する 酵素活性を含んでいることを示している。この活性は、加えたＲＮＡの存在によ って変化するが、加えたプライマーまたは投入したＲＮＡ分子の供給元とは無関 係であることが示された。更に、Ｂａｃ２５またはＢａｃ５Ｂに感染したＳｆ９ 細胞の抽出物によって生成した生成物は同一であると思われるので、記載した実 験は、観察され他ＲｄＲｐ活性はＨＣＶＮＳ５Ｂタンパク質によってコードされ ることを示している。例３ ＨＣＶ ＲｄＲｐ ＲＮＡ生成物の特性決定の方法 下記の方法を用いて、新たに合成したＲＮＡ生成物の構造的特徴を解明した。 本発明者らの標準的な電気泳動条件下（５％ポリアクリルアミド、７Ｍ尿素）で は、新規なＲＮＡ生成物の大きさは約２００ヌクレオチドであると思われた。こ れは、ＲＮＡ転写の内部開始または未成熟終止によると思われた。しかしながら 、異なるＲＮＡ基質を用いてＲｄＲｐ試験法によって誘導された生成物は総てそ れぞれの鋳型よりも著しく速やかに移動することが判ったので、これらの可能性 は極めて疑わしいと思われた。電気泳動中の温度および分析ゲル中のアクリルア ミドの濃度を増加させると、ＲｄＲｐ生成物の移動挙動は著しく異なったものと なる。従って、例えば１０％アクリルアミド、７Ｍ尿素を含むゲル系を用いて高 温で分離を行なった場合には、ＲｄＲｐ生成物は、投入ＲＮＡの長さの少なくと も二倍に相当する位置では投入基質ＲＮＡよりも遅く移動した。同様な効果は、 メチルヒドロキシ−水銀（ＣＨ₃ＨｇＯＨ、１０ｍＭ）のようなＲＮＡ変性剤を ＲｄＲｐ生成物に加えた後、低比率／低温ゲル上で電気泳動を行なったときにも 見られた。これらの観察結果は、ＲｄＲｐ生成物が広汎な二次構造を有すること を示唆している。 本発明者らは、様々な特異性の各種のリボヌクレアーゼに対する生成物分子の 感受性について検討した。生成物を、ＲＮアーゼＡで処理して完全に分解した。 一方、これが、一本鎖の特異的ヌクレアーゼＲＮアーゼＴ１に対して驚くほど耐 性を有することが判った。投入ＲＮＡは、６０ＵのＲＮアーゼＴ１と共に２２℃ で１０分間インキュベーションした後には完全に分解し、同じゲルの銀染色を行 なったところ、鋳型のみならずＳｆ９細胞の細胞質抽出物に通常検出することが できる総ての他のＲＮＡもＲＮアーゼＴ１でインキュベーション中に完全に加水 分解した。対照的に、ＲｄＲｐ生成物は変化しないままであり、ＲＮアーゼＴ１ で長時間インキュベーションした後にもごく僅かしか影響を受けなかった。従っ て、ＲＮアーゼＴ１で２時間処理した後、標識した生成物分子はゲル中のその最 初の位置に検出することはできなかった。代わりに、投入した鋳型ＲＮＡと同様 な電気泳動の移動度を有する新たなバンドが出現した。同様な効果はＲＮアーゼ Ｔ１消化を１時間行なったときにも見られたが、異なる温度、例えば２２℃では ＲｄＲｐ生成物はほとんど変化しないままであったが、３７℃では、これは最初 の基質と同時移動する新規な生成物に転換した。 これらの観察結果に対する説明は、投入ＲＮＡはＨＣＶ ＲｄＲｐの鋳型とし て作用し、３′−ＯＨを用いて、アンチセンス鎖が共有的に結合しているセンス （鋳型）鎖からなる二重のＲＮＡ「ヘアピン」分子を生じるターン−または「コ ピー−バック」機構による相補性鎖の合成の下準備を行なう。このような構造に より、ポリアクリルアミドゲル上のＲｄＲｐ生成物の異常な電気泳動の移動度、 並びに一本鎖の特異的ヌクレアーゼに対する高い耐性が説明される。回転するル ープは塩基対であるべきではなく、従ってヌクレアーゼの影響を受けやすいもの であるべきである。従って、ＲＮアーゼＴ１で処理すると、センスおよびアンチ センス鎖の共有結合が加水分解されて、二本鎖ＲＮＡ分子が生じる。変性けける 電気泳動中に、２本の鎖は分離して、新たに合成されたアンチセンス鎖であって 、長さが最初のＲＮＡ鋳型と同様なものだけが検出可能なままとなる。この機構 は、特にこの種の生成物がイン・ビトロで幾つかの他のＲＮＡポリメラーゼによ 生成するということを考慮すれば、可能性があると思われる。 下記の実験は、ポリメラーゼ反応中に標識されＲＮアーゼＴ１処理によって明 らかに放出されたＲＮＡ生成物が投入した鋳型に対してアンチセンス配向を示す ことを示す目的で設計した。このため、本発明者らは、投入した鋳型ＲＮＡ分子 の３個の分離した配列（図２）に相当するオリゴデオキシリボヌクレオチドであ る、Ｄ−ＲＮＡのヌクレオチド１７０〜１９５（ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３）に相 当するオリゴヌクレオチドａ、ヌクレオチド２８６〜３０９（ＳＥＱ ＩＤ Ｎ Ｏ：４）に相補性のオリゴヌクレオチドｂ、ヌクレオチド３３１〜３５４（ＳＥ Ｑ ＩＤ ＮＯ：５）に相補性のオリゴヌクレオチドｃを合成した。これらを用 いて、ポリメラーゼ反応の生成物とのＤＮＡ／ＲＮＡハイブリッドを生成させ、 それらをＲＮアーゼＨ消化を受けられるようにした。最初に、完全なＲｄＲｐ生 成物をハイブリダイゼーションに用いた。しかしながら、この構造は熱安定性が 高すぎて、特異的なハイブリッドは全く形成されなかった。従って、ヘアピンＲ ＮＡをＲＮアーゼＴ１で前処理し、５分間沸騰して変性させた後、それぞれのオ リゴヌクレオチドの存在下で室温まで放冷した。予想されたように、ハイブリッ ドのＲＮアーゼＨへの暴露により、特異的な開裂生成物が生じた。オリゴヌクレ オチドａ方向への開裂により、長さが約１７０および２２０個のヌクレオチドの 生成物を生じ、オリゴヌクレオチドｂは約２９０および１１０個のヌクレオチド の生成物を生じ、オリゴヌクレオチドｃは約３３０および６５個のヌクレオチド の断片を生じた。これらの断片は予想した大きさを有するので（図３を参照され たい）、結果はＨＣＶ ＮＳ５Ｂによって媒介されたＲＮＡ合成は、ヘアピン様 ＲＮＡ二重体を生成するコピー−バック機構によって進行することを示している 。例４ 合成ＲＮＡ基質上での組換えＨＣＶ ＴＮＴアーゼの試験法 ＴＮＴアーゼ試験法は、ＲＮＡ基質の３′ヒドロキシル基に対する標識したヌ クレオチドの鋳型とは独立した取り込みの検出に基づいている。この試験法のＲ ＮＡ基質（Ｄ−ＲＮＡ）は、典型的には例２に記載したように線形かしたプラス ミドｐＴ７−７ＤＣＯＨのＴ７ポリメラーゼによるイン・ビトロ転写によって得 た。しかしながら、Ｄ−ＲＮＡ以外の任意の他のＲＮＡ分子を用いて、本発明の ＴＮＴアーゼ試験法を行うこともできる。 ＴＮＴアーゼ活性を決定するためのイン・ビトロ試験法は、Ｓｆ９粗製細胞質 抽出物または精製したタンパク質画分１〜５μｌを含む総容量が４０μｌで行っ た。Ｂａｃ２５またはＢａｃ５Ｂに感染したＳｆ９細胞の未分画または精製した 細胞質抽出物をＨＣＶ ＴＮＴアーゼの供給源として用いた。ＨＣＶに関係しな いタンパク質を発現する組換えバキュロウイルス構築物に感染した細胞から得た Ｓｆ９細胞抽出物を、ネガティブコントロールとして用いることができる。下記 の補足物を反応混合物に加えた（最終濃度）：２０ｍＭ Ｔｒｉｓ／Ｃｌ ｐＨ ７．５，５ｍＭ ＭｇＣｌ₂，１ｍＭ ＤＴＴ，２５ｍＭ ＫＣｌ，１ｍＭ Ｅ ＤＴＡ，１核種を５〜１０μＣｉ［³²Ｐ］ＮＴＰ（特に断らない限り、ＧＴＰ、 ３０００Ｃｉ／ミリモル、Amersham、を用いた）、２０Ｕ ＲＮアシン(Promega )、０．５μｇＲＮＡ−基質（約４ピコモル；最終濃度１００ｎＭ）、２μｇの アクチノマイシンＤ(Sigma)。反応物を室温で２時間インキュベーションし、等 容量の２×Proteinase K(ＰＫ、Boehringer Mannheim)緩衝液（３００ｍＭ Ｎ ａＣｌ、１００ｍＭ Ｔｒｉｓ／Ｃｌ ｐＨ７．５、１％ｗ／ｖＳＤＳ）を加え て反応を停止し、３７℃でＰＫ５０μｇで半時間処理した。ＲＮＡ生成物をＰＣ Ａ抽出し、エタノールで沈澱し、７Ｍ尿素を含む５％ポリアクリルアミドゲル上 で電気泳動によって分析した。例５ スクロースグラディエント沈降によるＨＣＶ ＲｄＲｐ／ＴＮＴアーゼの精製法 線形の０．３〜１．５Ｍのスクロースグラディエントを、洗剤を含む緩衝剤Ａ で調製した（例１を参照されたい）。Ｂａｃ５ＢまたはＢａｃ２５（約８×１０⁷ 個の細胞に相当）に感染したＳｆ９細胞の抽出物２ｍｌまでを、１２ｍｌのグ ラディエントに装填した。遠心分離を、Beckman SW40ローターを用いて３９００ ０×ｇで２０時間行った。０．５ｍｌずつの画分を集め、活性を試験した。ウェ スターンブロット法によって同定したＮＳ５Ｂタンパク質は、予想外の高沈降計 数で密度勾配中を移動することが判った。ウイルスタンパク質およびリボソーム は、同じグラディエント画分中で同時沈降することが判った。この特異な挙動に より、グラディエントの最上部に止まっている細胞質タンパク質の主要量からウ イルスタンパク質を分離することができた。ＲｄＲｐ活性試験から、ＲｄＲｐ活 性はＮＳ５Ｂタンパク質と同時沈降することが明らかになった。末端ヌクレオチ ジルトランスフェラーゼ活性（ＴＮＴアーゼ）も、これらの画分に含まれていた 。例６ Ｓｆ９細胞からＨＣＶ ＴＮＴアーゼ／ＲｄＲｐの精製法 全細胞抽出物を、Ｂａｃ５Ｂ組換えバキュロウイルスに感染したＳｆ９細胞１ ｇから作成する。凍結した細胞を、２０ｍＭ Ｔｒｉｓ／ＨＣｌ ｐＨ７．５、 １ｍＭ ＥＤＴＡ、１０ｍＭ ＤＴＴ、１ｍＭ ＰＭＳＴを補足した５０％グリ セロール（Ｎ緩衝液）を含む緩衝液１０ｍｌ中で氷上で解凍する。次に、Triton X-100およびＮａＣｌを、それぞれ２％および５００ｍＭの最終濃度まで加え、 細胞の破壊を促進する。ＭｇＣｌ₂（１０ｍＭ）およびＤＮアーゼＩ（１５μｇ ／ｍｌ）を加えた後、混合物を室温で３０分間拡販する。次に、抽出物を、Beck man 遠心分離機中９０Ｔｉローターを用いて４０，０００ｒｐｍで４℃で３０分 間超遠心によって透明しする。透明にした抽出物を、２０ｍＭ Ｔｒｉｓ／ＨＣ ｌ ｐＨ７．５、１ｍＭ ＥＤＴＡ、１０ｍＭ ＤＴＴ、２０％グリセロール、 ０．５％Triton X-100（ＬＧ緩衝液）を含む緩衝液で希釈し、ＮａＣｌ濃度を３ ００ｍＭに調整して、３００ｍＭ ＮａＣｌを含むＬＧ緩衝液中で平衡にしたDE AE-Sepharose Fast Flow５ｍｌでバッチ毎にインキュベーションする。次に、マ トリックスをカラムに投入し、２倍容量の同じ緩衝液で洗浄する。流出液(flow- through)およびDEAE-Sepharose Fast Flowカラムの初流をＬＧ緩衝液で１：３に 希釈して、１００ｍＭ ＮａＣｌを含むＬＧ緩衝液で平衡にしたHeparin-Sephar ose CL6B カラム（１０ｍｌ）に装填する。Heparin-Sepharose CL6Bを十分に洗 浄し、結合タンパク質をＬＧ緩衝液中１００ｍＭ〜１Ｍ ＮａＣｌの線形の１０ ０ｍｌグラディエントで溶出する。ＳＤＳ−ＰＡＧＥの銀−および免疫−染色に よって判定されたＮＳ５Ｂを含む画分をプールしてＬＧ緩衝液で希釈し、ＮａＣ ｌ濃度を５０ｍＭに調整する。希釈した画分を次に、５０ｍＭ ＮａＣｌを含む ＬＧ緩衝液で平衡にしたMono Q-FPLC カラム（１ｍｌ）に装填する。タンパク質 を、ＬＧ緩衝液中５０ｍＭ〜１Ｍ ＮａＣｌの線形グラディエント（２０ｍｌ） で溶出する。ＳＤＳ−ＰＡＧＥの銀−および免疫−染色によって判定されたＮＳ ５Ｂを含む画分をプールして、１００ｍＭ ＮａＣｌを含むＬＧ緩衝液に対して 透析する。広汎な透析の後、プールした画分を、１００ｍＭ ＮａＣｌを含むＬ Ｇ緩衝液で平衡にしたPoyU-Sepharose CL6B （１０ｍｌ）に装填した。PoyU-Sep harose CL6B を十分に洗浄し、結合したタンパク質を、ＬＧ緩衝液中１００ｍＭ 〜１Ｍ ＮａＣ１までの線形の１００ｍｌのグラディエントで溶出した。ＳＤＳ −ＰＡＧＥの銀−および免疫−染色によって判定されたＮＳ５Ｂを含む画分をプ ールして、１００ｍＭ ＮａＣｌを含むＬＧ緩衝液に対して透析し、液体窒素中 に保管した後、活性を試験した。 精製したタンパク質ＮＳ５Ｂを含む画分を、両活性の存在について試験した。 ＲｄＲｐおよびＴＮＴアーゼ活性は、同じ画分に見出だされた。これらの結果は 、両活性であるＲＮＡ依存性のＲＮＡポリメラーゼおよび末端リボヌクレオチド トランスフェラーゼは、ＨＣＶ ＮＳ５Ｂタンパク質の関数であることを示して いる。 本発明者らは、精製したＮＳ５Ｂを、非飽和基質濃度における４種類のリボヌ クレオチド三リン酸のそれぞれを用いて、末端ヌクレオチジルトランスフェラー ゼ活性について試験した。これらの結果は、明らかに、ＵＴＰは好ましいＴＮＴ アーゼ基質であり、投入ＲＮＡの供給源とは無関係にＡＴＰ、ＣＴＰおよびＧＴ Ｐであることを示した。例７ ホモポリマー性ＲＮＡ鋳型上の組換えＨＣＶ ＲｄＲｐの試験法 これまで、本発明者らは、ＨＣＶ ＮＳ５ＢがＲＮＡ−依存性のＲＮＡポリメ ラーゼ活性を有し、相補性ＲＮＡ鎖の合成が鋳型によって開始される反応である ことを記載してきた。興味深いことには、ＲｄＲｐｋ供給源としてのＢａｃ５Ｂ またはＢａｃ２５に感染したＳｆ９細胞の未分画細胞質抽出物を用いて、プライ マーとして外部から加えたオリゴヌクレオチドを用いる相補性ＲＮＡ鎖の合成を 観察することはできなかった。本発明者らは、未分画抽出物中に含まれることの 確かな豊富なＡＴＰ依存性のＲＮＡ−ヘリカーゼによるも野とすることができる と推論した。従って、本発明者らは、この問題を精製したＮＳ５Ｂを用いて解明 しようとした。 最初に、本発明者らは、精製したＮＳ５Ｂポリメラーゼがホモポリマー性ＲＮ Ａ鋳型上でプライマーに依存するやり方でＲＮＡを合成することができるかどう かを画定しようとし、このような鋳型は分子内ヘアピンを形成することができな いものであり、従って本発明者らは、相補性ＲＮＡ鎖の合成は厳密にプライマー 依存性であると予想した。従って、本発明者らは、ポリ（Ａ）鋳型に依存するＵ ＭＰ組み込みを測定し、ポリメラーゼ反応のプライマーとしてオリゴ（ｒＵ）₁₂ およびオリゴ（ｄＴ）_{12 〜18}の両方を評価した。放射性ＵＭＰの取り込みは、下 記のようにして測定した。標準的反応（１０〜１００μｌ）は、２０ｍＭ Ｔｒ ｉｓ／ＨＣｌ ｐＨ７．５，５ｍＭ ＭｇＣｌ₂，１ｍＭ ＤＴＴ，２５ｍＭ ＫＣｌ，１ｍＭ ＥＤＴＡ，２０Ｕ ＲＮアシン(Promega)、１μＣｉ［³²Ｐ］ ＵＴＰ（４００Ｃｉ／ミリモル、Amersham）、または１μＣｉ［³Ｈ］ＵＴＰ（ ５５Ｃｉ／ミリモル、Amersham）、１０μＭ ＵＴＰ、および１０μｇ／ｍｌポ リ（Ａ）またはポリ（Ａ）／オリゴ（ｄＴ）_{12 〜18}を含む緩衝液で行った。オリ ゴ（Ｕ）₁₂（１μｇ／ｍl）を、プライマーに加えた。ポリＡおよびポリＡ／オ リゴｄｔ_{12 〜18}は、Pharmacia から購入した。オリゴ（Ｕ）₁₂はGensetから得た 。最終的なＮＳ５Ｂ酵素濃度は１０〜１００ｎＭであった。これらの条件下で、 反応は３時間まで直線的に進行した。２２℃で２時間インキュベーションした後 、試料をＤＥ８１フィルター(Whatman)に置くことによって反応を停止し、フィ ルターを１Ｍ Ｎａ₂ＨＰＯ₄／ＮａＨ₂ＰＯ₄、ｐＨ７．０で十分に洗浄し、水で 濯ぎ、風乾して、最後にフィルターに結合した放射能をシンチレーションβ−カ ウンターで測定した。あるいは、イン・ビトロで合成した放射性生成物を０．２ Ｍピロリン酸ナトリウム中キャリヤーｔＲＮＡ１００μｇを有する１０トリクロ ロ酢酸で沈澱し、０．４５μｍWhatman GF/Cフィルター上に集め、真空乾燥して 、シンチレーション流体中でカウントした。 幾らかの［³²Ｐ］ＵＭＰまたは［³Ｈ］ＵＭＰの取り込みはプライマーの不在 でも検出可能であり、本発明者らの精製したＮＳ５Ｂと会合した末端ヌクレオチ ジルトランスフェラーゼ活性によるものと思われるが、２０％までの生成物の取 り込みは、オリゴ（ｒＵ）₁₂が反応混合物にプライマーとして含まれるときにの み観察された。意外なことには、オリゴ（ｄＴ）_{12 〜18}も、低効率ではあるが、 ポリ（Ａ）−依存性のポリ（Ｕ）合成のプライマーとして機能することができた 。 ＮＳ５ＢのＲｄＲｐ活性を測定するのに好適な他の鋳型／プライマーとしては 、放射性ＧＴＰの存在下でのポリ（Ｃ）／オリゴ（Ｇ）またはポリ（Ｃ）／オリ ゴ（ｄＧ）、放射性ＣＴＰの存在下でのポリ（Ｇ）／オリゴ（Ｃ）またはポリ（ Ｇ）／オリゴ（ｄＣ）、放射性ＡＴＰの存在下でのポリ（Ｕ）／オリゴ（Ａ）ま たはポリ（Ｕ）／オリゴ（ｄＡ）、放射性ＣＴＰの存在下でのポリ（Ｉ）／オリ ゴ（Ｃ）またはポリ（Ｉ）／オリゴ（ｄＣ）が挙げられる。例８ E ．coli 中でのＨＣＶ ＲｄＲｐ／ＴＮＴアーゼの発現法 図２および例８に記載のプラスミドｐＴ７−７（ＮＳ５Ｂ）を構築して、ＳＥ Ｑ ＩＤ ＮＯ：１に記載の配列を有するＨＣＶタンパク質断片をE．coli で発 現させた。このようなタンパク質断片は、上記のようにＮＳ５ＢのＲｄＲｐおよ びＴＮＴアーゼを含んでいる。ＮＳ５ＢをコードするＨＣＶ ｃＤＮＡの断片を 、分子生物学の実施について知られており、例８に詳記されている方法を用いて 、バクテリオファージＴ７φ１０プロモーターの下流およびファージＴ７遺伝子 １０タンパク質の最初のＡＴＧコドンと共にフレームにクローニングした。ｐＴ ７−７（ＮＳ５Ｂ）プラスミドも、プラスミドｐＴ７−７（ＮＳ５Ｂ）で形質転 換したE．coli 細胞の選択のマーカーとして用いることができるｂ−ラクタマー ゼ酵素の遺伝子を含んでいる。 次に、プラスミドｐＴ７−７（ＮＳ５Ｂ）を、Ｔ７プロモーターを含む発現ベ クターにクローニングした遺伝子の高水準発現に通常用いられるE.coli BL21(DE 53)株に形質転換した。E．coli のこの株において、Ｔ７遺伝子ポリメラーゼは バクテリオファージ1 DE53上に担持され、BL21細胞の染色体に組み込まれる（St udier and Moffatt,クローニングした遺伝子の直接的で、選択的な高水準発現に 対するバクテリオファージＴ７ＲＮＡポリメラーゼの使用(Use of bacteriophag e T7 RNA polymerase to direct selective high-level expression of cloned genes．(1986)，J．Mol．Biol．189，p．113-130）。興味深い遺伝子からの発現 は、以前に記載された(Studier and Moffatt，1986)手続きによる成長培地にイ ソプロピルチオガラクトシド（ＩＰＴＧ）の添加によって誘発される。従って、 ＲｄＲｐを含む組換えＮＳ５Ｂタンパク質断片は、宿主細胞の封入体に産生され る。組換えＮＳ５Ｂタンパク質は、E．coli BL21(DE53)抽出物の粒状画分から精 製し、当該技術分野で知られている手続きによって再折り畳みをすることができ る（D.R．Thatcher and A，Hichcok，バイオテクノロジーにおけるタンパク質の 折り畳み(Protein folding in Biotechnology(1994)、「タンパク質折り畳みの 機構(Mechanism of protein folding)」R.H．Pain 編、IRL PRESS，p.229-255） 。あるいは、組換えＮＳ５Ｂタンパク質は、細菌の成長培地の温度を２０℃以 下に低下させることによって可溶性タンパク質として産生することができた。従 って、可溶性タンパク質は、実質的に例５に記載のE．coli の溶解生成物から精 製することができた。例９ 図におけるプラスミドの詳細な構築 ＨＣＶ−ＢＫ単離物のゲノム（ＨＣＶＢＫ）に相当するｃＤＮＡの選択された 断片を、核ポリヘドロシスウイルスの強力なポリヘドリンプロモーター下でクロ ーニングし、バキュロウイルスベクター中で同種組換えができる配列によってフ ランクした。 ｐＢａｃ５Ｂは、ヌクレオチド７５９０〜９３６６を含んでなるＨＣＶ−ＢＫ 配列を含み、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１記載されたＮＳ５Ｂタンパク質をコードす る。このプラスミドを得るために、ｃＤＮＡ断片を、それぞれ配列５′−ＡＡＧ ＧＡＴＣＣＡＴＧＴＣＡＡＴＧＴＣＣＴＡＣＡＣＡＴＧＧＡＣ−３′（ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６）、および５′−ＡＡＴＡＴＴＣＧＡＡＴＴＣＡＴＣＧＧＴＴＧ ＧＧＧＡＧＣＡＧＧＴＡＧＡＴＧ−３′（ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：７）を有する合 成オリゴヌクレオチドを用いるＰＣＲによって生成した。次に、ＰＣＲ生成物を クレノウＤＮＡポリメラーゼで処理し、５′末端でＢａｍＨＩで消化した後、Ｂ ｌｕｅｓｃｒｉｐｔＳＫ（＋）ベクターのＢａｍＨＩおよびＳｍａＩ部位の間で クローニングした。次いで、興味深いｃＤＮＡ断片を制限酵素ＢａｍＨＩおよび ＨｉｎｄIII で消化し、ｐＢｌｕｅＢａｃIII ベクター(Invitrogen)の同一部位 に再連結した。 ｐＢａｃ２５は、ヌクレオチド２７５９〜９４１６を含んでなるＨＣＶ−ＢＫ ｃＤＮＡ領域を含み、ＨＣＶ−ＢＫポリタンパク質のアミノ酸８１０〜３０１０ （ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２）をコードする。この構築物は、下記のようにして得 た。最初に、ヌクレオチド２７５９〜３５７８を含んでなるＨＣＶ−ＢＫ配列を 含む８２０ｂｐ ｃＤＮＡ断片をｐＣＤ（３８−９．４）からＮｃｏＩで消化す ることによって得て（Tomei L.，Failla，C.，Santolini，E.，De Francesco，R ．and La Monica，N．(1993)、ＮＳ３はＣ型肝炎ウイルスポリタンパク質の加工 に必要なセリンプロテアーゼである(NS3 is a Serine Protease Rquired for Pr ocessing of Hepatitis C Virus Polyprotein)，J．Virol.，67，4017-4026）、 ｐＢｌｕｅＢａｃIII ベクター(Invitrogen)のＮｃｏＩ部位においてクローニン グし、ｐＢａｃＮＣＯと呼ばれるプラスミドを生じた。ヌクレオチド１９５９〜 ９４１６を含んでなるＨＣＶ−ＢＫ配列を含むｃＤＮＡ断片はｐＣＤ（３８−９ ．４）からＮｏｔＩおよびＸｂａＩで消化することによって得て、Ｂｌｕｅｓｃ ｒｉｐｔＳＫ（＋）ベクターの同じ部位にクローニングして、ｐＢｌｓＮＸと呼 ばれるプラスミドを得た。ヌクレオチド３３０４〜９４１６を含んでなるＨＣＶ −ＢＫ配列を含むｃＤＮＡ断片は、ＳａｃIIおよびＨｉｎｄIII で消化すること によってｐＢｌｓＮＸから得て、ｐＢｌｓＮＸプラスミドの同じ部位にクローニ ングし、プラスミドｐＢａｃ２５を得た。 ｐＴ７−７（ＤＣｏＨ）は、肝細胞核因子１ａａのラット二量体化補助因子の 全コード領域（３１６個のヌクレオチド）を含む（ＤＣｏＨ；Mendel，D.B.，Kh avari，P.A.，Conley，P.B.，Graves，M.K.，Hansen，L.P.，Admon，A.およびCr abtree，G.R．(1991),哺乳動物のホメオドメインタンパク質の二量体化を制御す る補助因子の特性決定(Characterization of a Cofactor that Regulates Dimer ization of a Mammalian Homeodomain Protein)，Science 254，1762-1767; Gen Bank受付番号：Ｍ８３７４０）。ラットＤＣｏＨのコード配列に相当するｃＤＮ Ａ断片を、それぞれ配列ＴＧＧＣＴＧＧＣＡＡＧＧＣＡＣＡＣＡＧＧＣＴ（ＳＥ Ｑ ＩＤ ＮＯ：８）およびＡＧＧＣＡＧＧＧＴＡＧＡＴＣＴＡＴＧＴＣ（ＳＥ Ｑ ＩＤ ＮＯ：９）を有する合成オリゴヌクレオチドＤｐｒ１およびＤｐｒ２ を用いるＰＣＲによって増幅した。このようにして得られたｃＤＮＡ断片を、E. coli 発現ベクターｐＴ７−７のＳｍａＩ制限部位にクローニングした。ｐＴ７ −７発現ベクターは、β−ラクタマーゼ遺伝子および複製のＣｏｌ Ｅ１起源の 他に、Ｔ７遺伝子１０タンパク質に対するＴ７ポリメラーゼプロモーターφ１０ および翻訳開始部位を含むｐＢＲ３２２の誘導体である（Tabor S.およびRicher dson C．C．(1985),特異的遺伝子の制御された独占的発現のためのバクテリオフ ァージＴ７ＲＮＡポリメラーゼ／プロモーター系(A bacteriophage T7 RNA poly merase/promoter system for controlled exclusive expression of Specific g enes)，Proc．Natl．Acad．Sci．USA 82，1074-1078)。 ｐＴ７−７（ＮＳ５Ｂ）は、ヌクレオチド７５９０からヌクレオチド９３６６ までのＨＣＶ配列を含み、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１に記載のＮＳ５Ｂタンパク質 をコードする。 このプラスミドを得るため、ｃＤＮＡ断片を、それぞれ配列５′−ＴＣＡＡＴ ＧＴＣＣＴＡＣＡＣＡＴＧＧＡＣ−３′（ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１０）および５ ′−ＧＡＴＣＴＣＴＡＧＡＴＣＡＴＣＧＧＴＴＧＧＧＧＧＡＧＧＡＧＧＴＡＧＡ ＴＧＣＣ−３′（ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１１）を有する合成オリゴヌクレオチド を用いるＰＣＲによって生成した。次に、ＰＣＲ生成物をクレノウＤＮＡポリメ ラーゼで処理した後、これをＥｃｏＲＩで線形化して、クレノウＤＮＡポリメラ ーゼでその両端を平滑化した後、E．coli 発現ベクターｐＴ７−７に連結した。 あるいは、ｃＤＮＡ断片を、それぞれ配列５′−ＴＧＴＣＡＡＴＧＴＣＣＴＡＣ ＡＣＡＴＧＧ−３′（ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１３）および５′−ＡＡＴＡＴＴＣ ＧＡＡＴＴＣＡＴＣＧＧＴＴＧＧＧＧＡＧＣＡＧＧＴＡＧＡＴＧ−３′（ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１４）を有する合成オリゴヌクレオチドを用いるＰＣＲによって 生成した。次に、ＰＣＲ生成物をクレノウＤＮＡポリメラーゼで処理した後、こ れをＮｄｅＩで線形化し、クレノウＤＮＡポリメラーゼでその両端を平滑化した 後、E．coli 発現ベクターｐＴ７−７に連結した。

【手続補正書】特許法第１８４条の８第１項 【提出日】１９９７年４月２４日 【補正内容】 請求の範囲 １． Ｃ型肝炎ウイルスによってコードされるＲＮＡ依存性ＲＮＡポリメラー ゼ活性および末端ヌクレオチジルトランスフェラーゼ活性のイン・ビトロでの再 生法であって、ＮＳ５Ｂ（配列番号１）を含む配列を反応混合物に用いることを 特徴とする、方法。 ２． ＮＳ５ＢをＮＳ２−ＮＳ５Ｂ前駆体として反応混合物に取り込み、前記 前駆体が、過剰産生生物で起こる多重タンパク質分解的現象によって、ＮＳ５Ｂ の酵素的に活性な形態を生じる、請求項１に記載のＨＣＶによってコードされる ＲＮＡ依存性のＲＮＡポリメラーゼ活性のイン・ビトロでの再生法。 ３． ＮＳ５ＢをＮＳ２−ＮＳ５Ｂ前駆体として反応混合物に取り込み、前記 前駆体が、過剰産生生物で起こる多重タンパク質分解的現象によって、ＮＳ５Ｂ の酵素的に活性な形態を生じる、請求項１に記載のＨＣＶによってコードされる 末端ヌクレオチジルトランスフェラーゼ活性のイン・ビトロでの再生法。 ４． 請求項１〜３のいずれか１項に記載の方法によって得ることができるＮ Ｓ５Ｂ配列を含む、組成物。 ５． 配列が、配列番号１、そこに含まれているまたはそれから誘導される配 列に記載されているタンパク質を含んでいる、請求項４に記載の組成物。 ６． 治療目的で、ＮＳ５Ｂと会合した酵素活性を阻害する化合物を選択する ことができる酵素試験を準備するための、請求項４または５に記載の組成物の使 用。

───────────────────────────────────────────────────── フロントページの続き (51)Int.Cl.⁶ 識別記号 ＦＩ Ｃ１２Ｑ 1/48 Ａ６１Ｋ 37/64 ＡＣＳ (72)発明者 ベーレンス，スベン − エリク ドイツ連邦共和国 ディー − 35096 ヴァイマール，シュタインベク ２

Claims (1)

1. 【特許請求の範囲】 １． Ｃ型肝炎ウイルスによってコードされるＲＮＡ依存性ＲＮＡポリメラー ゼ活性および末端ヌクレオチジルトランスフェラーゼ活性のイン・ビトロでの再 生法であって、ＮＳ５Ｂ（配列番号１）を含む配列を反応混合物に用いることを 特徴とする、方法。 ２． ＮＳ５ＢをＮＳ２−ＮＳ５Ｂ前駆体として反応混合物に取り込み、前記 前駆体が、過剰産生生物で起こる多重タンパク質分解的現象によって、ＮＳ５Ｂ の酵素的に活性な形態を生じる、請求項１に記載のＨＣＶによってコードされる ＲＮＡ依存性のＲＮＡポリメラーゼ活性のイン・ビトロでの再生法。 ３． ＮＳ５ＢをＮＳ２−ＮＳ５Ｂ前駆体として反応混合物に取り込み、前記 前駆体が、過剰産生生物で起こる多重タンパク質分解的現象によって、ＮＳ５Ｂ の酵素的に活性な形態を生じる、請求項１に記載のＨＣＶによってコードされる 末端ヌクレオチジルトランスフェラーゼ活性のイン・ビトロでの再生法。 ４． 請求項１〜３のいずれか１項に記載のＮＳ５Ｂ配列を含むことを特徴と する、組成物。 ５． 配列が、配列番号１、そこに含まれているまたはそれから誘導される配 列に記載されているタンパク質を含んでいる、請求項４に記載の組成物。 ６． 治療目的で、ＮＳ５Ｂと会合した酵素活性を阻害する化合物を選択する ことができる酵素試験を準備するための、請求項４または５に記載の組成物の使 用。 ７． 上記説明、例および請求項に記載の、ＮＳ５ＢのＲＮＡ依存性のＲＮＡ ポリメラーゼおよび末端ヌクレオチジルトランスフェラーゼ活性をイン・ビトロ で再生する方法、組成物、治療目的で、ＮＳ５Ｂと会合した酵素活性を阻害する 化合物を選択することができる酵素試験を準備するための上記組成物の使用。