JPH10276782A - セルロース合成酵素遺伝子 - Google Patents

セルロース合成酵素遺伝子

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JPH10276782A
JPH10276782A JP9083133A JP8313397A JPH10276782A JP H10276782 A JPH10276782 A JP H10276782A JP 9083133 A JP9083133 A JP 9083133A JP 8313397 A JP8313397 A JP 8313397A JP H10276782 A JPH10276782 A JP H10276782A
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gly
val
lys
glu
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JP9083133A
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Osamu Hasegawa
修 長谷川
Satoshi Aozuka
聡 青塚
Takahisa Hayashi
隆久 林
Yuri Ihara
由理 井原
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Nisshinbo Holdings Inc
Original Assignee
Nisshinbo Industries Inc
Nisshin Spinning Co Ltd
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    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N9/00Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
    • C12N9/10Transferases (2.)
    • C12N9/1048Glycosyltransferases (2.4)
    • C12N9/1051Hexosyltransferases (2.4.1)
    • C12N9/1059Cellulose synthases (2.4.1.12; 2.4.1.29)

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Abstract

(57)【要約】 【課題】 原核細胞及び真核細胞へ組み込んで、セルロ
ースの生産を制御するために用いられるセルロース合成
酵素遺伝子を提供する。 【解決手段】 以下の(A)〜(C)のいずれかのタン
パク質をコードするDNA。(A)配列番号2に示すア
ミノ酸配列、又は配列番号2において1若しくは数個の
アミノ酸が欠失、置換、挿入若しくは付加されたアミノ
酸配列からなり、かつ、セルロース合成酵素活性を有す
るタンパク質。(B)配列番号4に示すアミノ酸配列、
又は配列番号4において1若しくは数個のアミノ酸が欠
失、置換、挿入若しくは付加されたアミノ酸配列からな
り、かつ、セルロース合成酵素活性を有するタンパク
質。(C)配列番号8に示すアミノ酸配列、又は配列番
号8において1若しくは数個のアミノ酸が欠失、置換、
挿入若しくは付加されたアミノ配列、及び、配列番号1
1に示すアミノ酸配列、又は配列番号11において1若
しくは数個のアミノ酸が欠失、置換、挿入若しくは付加
されたアミノ酸配列、を含み、かつ、セルロース合成酵
素活性を有するタンパク質。

Description

【発明の詳細な説明】
【0001】
【発明の属する技術分野】本発明は、ワタ(Gossypium
hirsutum)由来のセルロース合成酵素をコードするDN
A、これを含む組換えDNA、前記DNAで形質転換さ
れた形質転換細胞、及び細胞のセルロース合成を制御す
る方法に関する。
【0002】
【従来の技術】セルロースは、紙、木質構造物、繊維、
衣類、食品、化粧品、医療品としての用途の他、エネル
ギーとしても利用されており、産業上利用価値がある。
セルロースは、またさまざまな結晶構造を取り得るた
め、その生合成酵素を制御することにより新素材の開発
が期待される。これまでのセルロースに関する産業は、
既に造られたセルロース産物だけを対象にしてきてお
り、生合成の側面から新素材を開発しようとする試みは
なかった。また植物に対する病原菌の病害作用機作が、
イモチ菌(P. oryzae)のように、セルロース生合成の
阻害に起因するものが多く、セルロース生合成機構の病
害抵抗性付加は農業上応用価値がある。さらにセルロー
スは、地球上で最も豊富な有機化合物であるとともに、
大気中のCO2が最も多量に固定されているシンクでも
ある。セルロース生合成酵素の遺伝的改良は、セルロー
スをシンクとする大気中のCO2の調節につながる産業
へも応用できる。近年、ワタ繊維細胞由来のcDNAsのラ
ンダムシーケンスを行い、微生物セルロース合成酵素遺
伝子(bacterial BcsA)との相同性から、完全鎖長CelA1
と不完全鎖長CelA2がワタセルロース合成酵素cDNA
である可能性が報告された(Pearet al., Proceeding o
f National Academy of Science, USA (1996) 93, 1263
7-12642)。CelA1については、UDP-glucoseとの結合能が
示されたが、CelA2については単にC末端アミノ酸配列
が相同性を示すのみにとどまっている。
【0003】
【発明が解決しようとする課題】本発明は、原核細胞又
は真核細胞のセルロースの生産を制御する新たな方法を
提供するために、セルロース合成酵素をコードするDN
A、これを含む組換えDNA、前記DNAで形質転換さ
れた形質転換細胞、及び細胞のセルロース合成を制御す
る方法を提供することを課題とする。
【0004】
【課題を解決するための手段】本発明者らは、まずワタ
繊維細胞がセルロースを蓄積する時期のmRNAを抽出
し、それと相補的なcDNAを合成し、cDNAライブ
ラリーを構築した。ライブラリーより任意に選択した7
50のクローンをランダムにシーケンスした。得られた
各クローンの塩基配列ひとつに対して6つのアミノ酸配
列を導き、酢酸菌セルロース合成酵素オペロンのセルロ
ース 4−β−グルコシルトランスフェラーゼ(bcs
A)遺伝子をアミノ酸配列に置き換えたものと、相同性
のあるものを選抜した。その結果、3つの種類あるいは
グループに分類される遺伝子を見い出し、それぞれPc
sA1、PcsA2、及びPcsA3と命名した(PcsA
は、Plant Cellulose Synthase Aの略である)。
【0005】すなわち本発明は、以下の(A)〜(C)
のいずれかのタンパク質をコードするDNAである。 (A)配列番号2に示すアミノ酸配列、又は配列番号2
において1若しくは数個のアミノ酸が欠失、置換、挿入
若しくは付加されたアミノ酸配列からなり、かつ、セル
ロース合成酵素活性を有するタンパク質。 (B)配列番号4に示すアミノ酸配列、又は配列番号4
において1若しくは数個のアミノ酸が欠失、置換、挿入
若しくは付加されたアミノ酸配列からなり、かつ、セル
ロース合成酵素活性を有するタンパク質。 (C)配列番号8に示すアミノ酸配列、又は配列番号8
において1若しくは数個のアミノ酸が欠失、置換、挿入
若しくは付加されたアミノ配列、及び、配列番号11に
示すアミノ酸配列、又は配列番号11において1若しく
は数個のアミノ酸が欠失、置換、挿入若しくは付加され
たアミノ酸配列、を含み、かつ、セルロース合成酵素活
性を有するタンパク質。
【0006】また本発明は、上記DNAの全部又は一部
を含む組換えベクター、及び上記DNAで形質転換され
た形質転換細胞を提供する。
【0007】本発明はさらに、前記DNAを細胞に導入
し、前記DNAと相同な塩基配列又は相補的な塩基配列
を有するRNAを発現させることにより、前記細胞のセ
ルロース合成を制御する方法を提供する。
【0008】尚、配列番号1はPcsA1の、配列番号
3はPcsA2の配列に相当する。また、配列番号5は
PcsA3の3’側領域、配列番号7はPcsA3の
5’側領域、配列番号9はPcsA3の内部領域の配列
にそれぞれ相当する。
【0009】上記DNAのうち、PcsA1及びPcs
A2は、ワタセルロース合成酵素をコードするDNAで
あることが、真核細胞(動物細胞及び酵母)における発
現によって証明された。また、それらに対する抗体は、
無細胞系におけるワタセルロース合成酵素活性をも阻害
することが示された。さらに、PcsA1及びPcsA
2と異なるPcsA3がさらに見い出された。これら
は、ランダムシーケンスで得られたクローンの段階では
いずれも不完全長であり、コード領域の5’部分を含ん
でいなかったため、PCRを用いた5’RACE法によ
り完全長の5’部分の配列を単離しそのシーケンスを決
定した。この操作でPcsA1及びPcsA2に関して
は、不完全長クローンに対応する5’部分の配列が得ら
れた。
【0010】一方、PcsA3に関しては、同じPcs
A3のグループに属すると思われる別のクローンの5’
部分の配列が得られた。両者は相同性が非常に高く、進
化の過程で、比較的最近、同じ遺伝子から重複によりマ
ルチジーン化したものと思われる。よって両者を対応す
る部分で結合し、融合遺伝子を構築した後発現させたと
しても、生産された酵素の活性機能には影響はないと考
えられる。
【0011】PcsA1、PcsA2ではさらに完全長
クローンを得るために、5’部分の配列と不完全長クロ
ーンの3’部分の配列よりプライマーを設計しPCRを
行ない、ORFを含むクローンを得た。RACE法を行
なう際に用いる鋳型は、mRNAより合成したcDN
A、ファージライブラリーのいずれでもよく、ファージ
ライブラリーを用いる場合にはベクター中の配列を5’
側プライマーとして用いることができる。
【0012】またランダムシーケンスの結果、セルロー
ス合成酵素と思われる15個のクローンの内で、最も多
量に存在したのはPcsA2の7クローンであった。こ
れらセルロース合成酵素遺伝子で形質転換された真核細
胞(動物細胞及び酵母)における発現を見たところ、セ
ルロース合成酵素活性を示した。
【0013】
【発明の実施の形態】以下、本発明を詳細に説明する。
【0014】<1>ワタcDNAライブラリーの作製 ワタcDNAライブラリーを作成するためのmRNAを
抽出する材料としては、セルロースを蓄積する時期のワ
タ繊維細胞が好ましい。mRNAの抽出法は特に制限は
なく、通常の植物からのmRNAの抽出法を採用するこ
とができる。cDNAの合成は、例えば、mRNA末端
に存在するポリAヌクレオチドに相補的なポリT配列を
プライマーとして、逆転写酵素により相補DNAを合成
し、DNAポリメラーゼによって二本鎖にすることによ
って成し得る。その方法は、例えばMolecular Cloning
(Maniatisら、Cold Spring Harbour Laboratory)に記載
されているが、各社からcDNA合成キットが多数市販
されているのでそれらを使用しても良い。ライブラリー
は一般的にファージベクターによって構築され、市販さ
れている多数のベクターが使用可能であるが、ベクター
からのリクローニングの必要が無く、すぐにシーケンス
用プラスミドの調製ができるベクター、例えばλZAPベ
クター等を使用することが好ましい。
【0015】<2>cDNAの塩基配列の決定 得られたcDNAライブラリーからランダムにクローン
を選択し、クローン中のインサートの塩基配列を決定す
る。塩基配列の決定は、Maxam-Gilbert 法あるいはダイ
デオキシ法によって行うことができるが、これらのうち
ではダイデオキシ法がより簡便であり好ましい。
【0016】ダイデオキシ法による塩基配列の決定を行
うには、市販されているシーケンス決定キットを用いて
行うことができ、更にオートシーケンサーを使うことに
よって短時間に大量のクローンの配列を決定することが
できる。配列の決定はインサート全長について行う必要
はなく、ホモロジー検索をするのに足ると思われる長さ
を決定できればよい。例えば、後記実施例では、60塩基
以上の配列を決定できた場合に、次に示すホモロジーの
検索を行った。
【0017】<3>遺伝子データベースとのホモロジー
検索 決定された各cDNAクローンの塩基配列を、遺伝子デ
ータベースに登録されている既知のセルロース合成酵素
のアミノ酸配列又はこれをコードする遺伝子の塩基配列
との間で、ホモロジー検索を行う。セルロース合成酵素
としては、酢酸菌セルロース合成酵素オペロンのセルロ
ース 4−β−グルコシルトランスフェラーゼ(BcsA)
遺伝子がコードする酵素が挙げられる(Wong,H.C. et a
l.,Proc.Natl. Acad. Sci. U.S.A. 87, 8130-8134 (199
0),ACCESSION No. M37202)。
【0018】データベースとしては、米国ロスアラモス
国立研究所、欧州分子生物学研究所、国立遺伝学研究所
などから公表されているGenBank、EMBL、DDBJなどを利
用することができ、ホモロジー検索用のプログラムとし
ては、市販のDNA解析ソフト、DNASIS(日立ソフトウ
エアエンジニアリング)、GENETYX(SDCソフトウェア開
発(株))などを購入して使用することができる。ま
た、国立遺伝学研究所の大型計算機と端末とを接続して
の解析や、インターネット上で、NCBI(NationalCenter
for Biotechnology Information)へ接続して(http://w
ww.ncbi.nlm.nih.gov/BLAST/)BLAST(Basic Local Alig
nment Search Tool)などを利用した高速なホモロジー検
索を行う等の方法もある。ホモロジー検索は、例えば次
のようなアルゴリズムによって行う。塩基配列について
行う場合は、調べようとする塩基配列をデータベース中
の個々の遺伝子配列に対して1塩基ずつずらしながらホ
モロジーを比較していき、6塩基以上連続して塩基が一
致している場合にホモロジースコアテーブル(例えばM.
Dayhoff,Atlas of Protein Sequence and Structure,
vol.5 (1978)等参照)に従ってホモロジースコアを計算
していく。スコアが一定値以上のものをホモロジーを有
する候補として取り上げるように設定し、さらに、調べ
ようとする配列またはデータベース中の遺伝子配列にギ
ャップを入れ、スコアが最大となるように最適化すると
よい。
【0019】また、アミノ酸配列についてホモロジー検
索を行う場合は、調べようとする塩基配列を、相補鎖を
含めた6フレームすべてにおいてアミノ酸に変換し、塩
基の場合と同様に調べることができる。具体的には前記
のBLASTのうちblastxを使用することができる。検索の
詳細な手法や条件は、DDBJ News Letter No.15 (Februa
ry 1995)を参照すればよい。
【0020】<4>ワタセルロース合成酵素cDNAク
ローンの単離 上記のようにして得られるクローンは、必ずしもその遺
伝子の全ヌクレオチド配列を含んでいるとは限らない。
その場合には、そのクローンをプローブとして用い、プ
ラークハイブリダイゼーションによるスクーリニングを
行うことにより、ライブラリーから完全長遺伝子を含む
クローンを得ることができる。具体的な方法は、Molecu
lar Cloning 第2版 (Maniatisら、Cold Spring Harbour
Laboratory)12.30〜12.40を参照して行えばよい。ま
た、得られたcDNAが5’側を欠いている場合には、
そのcDNA配列を5’末端側へ伸長できるようにプラ
イマーを合成し、mRNAを鋳型にRT−PCRを行う
ことによって5’部分を取得することもできる。
【0021】本発明のDNAは、後記実施例に示すよう
に、既知のバクテリアのセルロース合成酵素遺伝子とホ
モロジーを有する物として得られたものである。さらに
UDP-glucose結合ドメインと考えられているアミノ酸配
列GlnXXXXXXArgTrp(配列番号12)をコードしてお
り、その近辺に高い相同性を有するものである。上記の
ようにして得られた本発明のDNAのヌクレオチド配列
及びこの配列から予想されるアミノ酸配列を配列表配列
番号1〜10に示す。配列番号1、3はPcsA1及び
PcsA2の塩基配列を各々示し、配列番号2、4はP
csA1及びPcsA2の塩基配列から予想されるアミ
ノ酸配列を各々示す。
【0022】また、配列番号5及び配列番号6は、Pc
sA3の3’側領域を含むクローン(PcsA3-682)の塩
基配列及びこの塩基配列から予想されるアミノ酸配列を
示す。配列番号7及び配列番号8は、PcsA3の5’
側領域を含む別のクローンの5’部分(PcsA3-5')の塩
基配列及びこの塩基配列から予想されるアミノ酸配列
を、配列番号9及び配列番号10は、このクローンの
3’部分(PcsA3-3')の塩基配列及びこの塩基配列から
予想されるアミノ酸配列を、各々示す(図1参照)。す
なわち、配列番号5はPcsA3の3’側領域、配列番
号7はPcsA3の5’側領域、配列番号9はPcsA
3の内部領域に相当する。PcsA3-682とPcsA3-3'のオー
バーラップしている部分は、塩基配列で9塩基、アミノ
酸配列で1アミノ酸異なっている。PcsA3-682とPcsA3-
3'の塩基配列の比較を、図3及び4に示す。また、PcsA
3-682とPcsA3-3'がコードするアミノ酸配列を統合した
ものを、配列番号11に示す。ちなみにGlnXXXXXXArgTr
p(配列番号12)の配列は、PcsA1に関しては、配列番
号2におけるアミノ酸番号710から714であり、PcsA2に
関しては、配列番号4におけるアミノ酸番号778から782
であり、PcsA3に関しては、配列番号6におけるアミノ
酸番号356から360である。
【0023】PcsA1は、Pear et al.(Proceeding o
f National Academy of Science, USA (1996) 93, 1263
7-12642)らが報告したCelA1と、塩基配列が28塩基異な
り、その結果コードされるアミノ酸配列も10アミノ酸残
基異なる。一般に糖鎖転移酵素は、DNA塩基のポイント
ミューテーションで、糖鎖特異性や基質特異性が極端に
変化するため(Yamamoto and Hakomori, The Journal o
f Biological Chemistry (1990) 265, 19257-19262)、
CelA1がセルロース合成酵素活性を有するタンパク質を
コードするか否かは不明である。尚、CelA1のコードす
るアミノ酸配列において48番目のArg、56番目のSer、81
番目のAsn、104番目のAla、110番目のSer、247番目のAs
p、376番目のAsp、386番目のSer、409番目のArg、649番
目のSerは、PcsA1ではそれぞれGln、Ile、Ser、Th
r、Pro、Asn、Glu、Pro、His、Glyである。
【0024】また、本発明のPcsA2は、Pear et a
l.が報告したCelA2と同一の配列を含んでいるが、CelA2
は不完全長であり、コード領域全体を含んでいない。Ce
lA2は、配列番号3に示すPcsA2の塩基配列におい
て、塩基番号1083〜3311に相当する。配列番号2、4、
6、8、10及び11に示すアミノ酸配列はいずれも新
規な配列であり、このアミノ酸配列をコードする塩基配
列を有する遺伝子はすべて本発明に含まれる。
【0025】また、上記アミノ酸配列のうち、本発明の
遺伝子の特性に実質的に影響を与えない限り、アミノ酸
残基の欠失、置換、挿入あるいは付加を含んでいてもよ
い。そのようなアミノ酸残基の欠失、置換、挿入あるい
は付加は、配列番号2、4、6、8、10及び11に示
すアミノ酸配列をコードするDNAに対して、通常の変
異処理によりランダムに、あるいは部位特異的変異法に
より計画的に改変することによって得られる。上述した
ように、一般に糖鎖転移酵素は、DNA塩基のポイントミ
ューテーションで、糖鎖特異性や基質特異性が極端に変
化するため、改変されたDNAのうち、セルロース合成
酵素活性を有するタンパク質をコードするDNAを選択
する。セルロース合成酵素活性は、例えば、T. Hayash
i: Measuring-β-glucan deposition in plant cell wa
lls, In Modern Methods of PlantAnalysis: Plant Fib
ers, eds. HF. Linskens and JF. Jackson, Springer-V
erlag, 10: 138-160 (1989)に記載されている方法によ
って測定することができる。
【0026】また、ワタの品種によって、あるいは自然
突然変異等によって、配列表に示す配列と一部異なる配
列を有するタンパクあるいは遺伝子を保持するものも存
在する可能性があるが、そのような遺伝子も本発明の遺
伝子に含まれる。このような遺伝子は、配列番号1、
3、5、7又は9に示す塩基配列のうち、コード領域の
全部又は一部とストリンジェントな条件下でハイブリダ
イズするDNAとして取得され得る。ここでいう「スト
リンジェントな条件」とは、いわゆる特異的なハイブリ
ッドが形成され、非特異的なハイブリッドが形成されな
い条件をいう。この条件を明確に数値化することは困難
であるが、一例を示せば、相同性が高い核酸同士、例え
ば80%以上の相同性を有するDNA同士がハイブリダ
イズし、それより相同性が低い核酸同士がハイブリダイ
ズしない条件が挙げられる。
【0027】<5>本発明の遺伝子の利用 本発明のDNAにより、酢酸菌等の前核細胞、サッカロ
ミセス(Saccharomyces)属等に属する酵母、ワタ等の植
物細胞やほ乳類の培養細胞等の真核細胞におけるセルロ
ース合成を制御することが可能となる。具体的には、例
えば、本発明のDNAの上流域にプロモーターを連結
し、適当なベクターに挿入して組換えベクターを構築
し、この組換えベクターを細胞に導入することによっ
て、前記細胞のセルロース合成を促進することができ
る。また、本発明のDNAのアンチセンス遺伝子を細胞
に導入することによって、前記細胞のセルロース合成を
抑制することができる。プロモーター及びベクターの選
択、形質転換方法は、通常の異種遺伝子の発現に利用さ
れているもの及び方法を用いればよい。具体的には、酵
母では、Invitrogen社製のタンパク発現用キットPichia
Expression Kit及びこのキットに含まれているベクタ
ーpPIC9を用いることができる。また、ほ乳類の培養細
胞としては、COS7細胞及びベクターCDM8等を用いること
ができる。
【0028】
【実施例】以下に、本発明の実施例を説明する。
【0029】<1>ワタからの全RNAの調製 材料としてワタ(Gossypium hirsutum L.) Coker312を使
用し、開花後16〜18日目の繊維細胞を液体窒素中で採取
した。ワタ繊維細胞75gを、液体窒素で凍結しながら乳
鉢中で十分磨砕した。粉末になったファイバーを蓋付き
の遠心管に移し、375mgのDTTを粉末のまま加えた後、90
〜95℃に加熱したXT緩衝液(30mM EDTA及び 1%SDSを
含む0.2Mホウ酸ナトリウムをpH9.0に合わせた後、ジエ
チルピロカーボネート処理をし、オートクレーブする。
この溶液にバナジルリボヌクレオシドを10mMになるよう
に加える)を200ml加えよく撹拌した。
【0030】これにプロテアーゼKを100mg加え再び撹拌
し、40℃で2時間インキュベートした後16mlの2M KCl
を加えた。再びよく撹拌した後、氷中に1時間静置し、
高速冷却遠心機で20分間(4℃)12,000 gで遠心分離し
た。上清を濾過して浮遊物を除去し、メスシリンダーに
移して容量を計り、これを別の遠心管に移し、抽出液量
1ml当たり85mgの塩化リチウムを加えて最終濃度2Mに
した。この溶液を4℃で一晩静置した後、沈殿したRN
Aを20分 12,000 gで遠心分離した。得られたRNAの
沈殿は、冷やした2M塩化リチウムで2回洗浄沈殿させ
た。
【0031】得られたRNAを、10mMトリス緩衝液(pH
7.5)で約2mg/mlになるように溶解し、5M酢酸カリウム
を200mMになるよう加えた後、エタノールを70%になるよ
うに加え-80℃で10分冷やした。4℃ 15,000 rpmで、10
分間遠心分離後、沈殿を適当量の滅菌水に懸濁してRN
A試料とした。このRNA試料を定量した結果、2mgの
全RNAが得られた。
【0032】<2>mRNAの精製 上記で得られた全RNAからmRNAをポリ(A)+ RN
A画分として精製した。精製には、ポリ(A)+ RNA精
製用オリゴ(dT)固定化ラテックスであるOligotex-dT3
0<Super>(東洋紡(株)より購入)を用いた。全RNA
1mgの溶液にElution buffer(溶出バッファー:10mM T
ris-HCl(pH7.5), 1mM EDTA, 0.1% SDS)を加えて全量で
1mlとし、それにOligotex-dT30<Super>1mlを加え、65
℃で5分間加熱し、氷上で3分間急冷した。これに5M
NaCl 0.2mlを加え、37で10分間インキュベートした後1
5,000 rpmで、3分間遠心分離後、上清を注意深く除去
した。
【0033】ペレットをWashing Buffer(洗浄バッファ
ー:10mM Tris-HCl(pH7.5), 1mM EDTA, 0.5M NaCl, 0.1
% SDS) 2.5mlに懸濁し、15,000 rpmで、3分間遠心分
離後、上清を注意深く除去した。ペレットをTE Buffer
1mlに懸濁して、その後65℃で5分間加熱した。これを
氷上で3分間急冷したのち、15,000 rpmで3分間遠心分
離し、上清中のポリ(A)+ mRNAを回収した。上記の
ようにして、1mgの全RNAから約10μgのポリ(A)+
RNAが得られた。そのうちの5μgをcDNAライブ
ラリーの作製に使用した。
【0034】<3>cDNAライブラリーの作製 (1)cDNAの合成 上記で得られたmRNAを鋳型に用い、Stratagene社製
λZAP cDNA合成キットを用いてcDNA合成を行っ
た。以下の溶液をチューブ中に混合した。 5.0μl 10× 1st Strand Buffer(逆転写反応用バッフ
ァー) 3.0μl 10mM 1st Strand Methyl Nucleotide Mix(5-m
ethyl dCTP,dATP,dGTP,dTTP 混合物) 2.0μl Linker-Primer(リンカー兼プライマー) H2O (全体を50μlになるように調節する。) 1.0μl RNase Block II(RNAse阻害剤)
【0035】上記の各成分はキットの内容物であり、Li
nker-Primerの配列は、配列番号13に示したとおりで
ある。尚、メチル化されたヌクレオチドを用いるのは、
後の制限酵素反応でcDNAが切断されないようにする
ためである。上記反応液をよく撹拌した後、ポリ(A)+
mRNA 5.0μgを加え、室温で10分放置した。さらに
2.5μl M-MuLV RTase(逆転写酵素)を加え(この時に
全体が50μlになる)、緩やかに混合した後、軽く遠心
して反応液をチューブの底部に落とし、37℃で60分反応
させた。
【0036】次に、以下の溶液を順序に従ってチューブ
中に混合した。 45.0μl cDNA一次鎖を含む反応液 40.0μl 10×2nd Strand Buffer(ポリメラーゼ反応
用バッファー) 6.0μl 2nd Strand Nucleotide Mixture(A,G,C,T混
合物) 302.0μl H2O
【0037】更に以下の溶液を添加したが、RNaseとDNA
ポリメラーゼが同時に働き出すようにチューブの壁に酵
素液を付着させ、その後手早くボルテックスし、遠心し
て反応液をチューブの底部に落とし、16℃で150分、c
DNA二次鎖の合成反応を行った。 0.8μl RNase H(RNA分解酵素) 7.5μl DNAポリメラーゼI(10.0 u /μl)
【0038】これに400μlのフェノール:クロロホルム
(1:1)混液を加え、よく撹拌した後室温で2分遠心し
た。上清に再度400μlのフェノール:クロロホルムを加
え、ボルテックスして室温で2分遠心し、その上清に以
下の溶液を加えてcDNAを沈殿させた。
【0039】 33.3μl 3M 酢酸ナトリウム溶液 867.0μl 100% エタノール
【0040】これを-20℃で一晩放置し、室温で60分遠
心した後、80% エタノールで緩やかに洗浄し、2分遠心
した。上清を除き、ペレットを乾燥させ、43.5μlの滅
菌水に溶解した。そのうち39.0μl に以下の溶液を添加
し、cDNA末端を平滑化させた。
【0041】 5.0μl 10×T4 DNA Polymerase Buffer(T4ポリメラ
ーゼ反応用バッファー) 2.5μl 2.5mM dNTP Mix(A,G,C,T混合物) 3.5μl T4 DNAポリメラーゼ(2.9 u /μl)
【0042】37℃で30分反応させ、50μlの滅菌水を加
えた後100μlのフェノール:クロロホルムを加え、ボル
テックスして2分遠心した。上清に100μlのクロロホル
ムを加え、ボルテックスして2分遠心し、上清に以下の
溶液を加えてcDNAを沈殿させた。 7.0μl 3M 酢酸ナトリウム溶液 226μl 100% エタノール
【0043】この溶液を氷上に30分以上放置し、4℃で
60分遠心した。沈殿を150μlの80%エタノールで洗浄
し、2分遠心した後乾燥させた。このcDNAのペレッ
トを7.0μlのEcoRI Adaptor(EcoRIアダプター)溶液に
溶解し、更に、以下の溶液を添加してcDNAの両末端
にEcoRIアダプターを連結した。EcoRIアダプターの各々
のストランドの配列を配列番号14及び図2に示す。 1.0μl 10×Ligation Buffer(リガーゼ反応用バッ
ファー) 1.0μl 10mM ATP 1.0μl T4 DNAリガーゼ
【0044】この反応液を軽く遠心し4℃に一晩以上放
置した。この溶液を70℃で30分処理した後軽く遠心し、
5分室温に放置し、以下の溶液を加えて、EcoRIアダプ
ターの5’末端をリン酸化した。 1.0μl 10×Ligation Buffer(リガーゼ反応用バッ
ファー) 2.0μl 10mM ATP 6.0μl H2O 1.0μl T4ポリヌクレオチドキナーゼ(10.0 u /μ
l)
【0045】37℃で30分反応させ、70℃で30分処理した
後、軽く遠心し室温に5分放置した。さらに以下の溶液
を加え、37℃で90分反応させてXhoIでLinker-Primerに
よって導入されたXhoIサイトを切断したのち室温に放置
し冷却させた。 28.0μl XhoI Buffer 3.0μl XhoI (45 u /μl)
【0046】この反応液に5.0μlの10×STE(10mM Tris
-HCl(pH8.0), 100mM NaCl, 1mM EDTA)を加え、ショー
トフラグメント除去用遠心カラム(Sephacryl Spin Col
umn)に添加し、600 gで2分遠心した溶出液を、フラク
ション1とした。さらにこの操作を3回繰り返し、それ
ぞれフラクション2、3及び4とした。フラクション
3、4を合わせ、フェノール:クロロホルム(1:1)を加
えよく撹拌し、室温で2分遠心した。上清に等量のクロ
ロホルムを加えよく撹拌し、室温で2分遠心しさらにそ
の上清に2倍の100%エタノールを加え-20℃に一晩放置
した。これを4℃で60分遠心した後等量の80%エタノー
ルで洗浄した。さらに4℃で60分遠心し、得られたcD
NAのペレットを10μlの滅菌水に懸濁した。
【0047】(2)cDNAライブラリーの作製 上記で得られた二本鎖cDNAをλファージ発現ベクタ
ーに連結し、組換えベクターを調製した。チューブに以
下の溶液を混合し、12℃で一晩、反応させ、2時間室
温で放置し、cDNAをベクターに連結させた。
【0048】 2.5μl cDNA溶液 0.5μl 10×Ligation Buffer 0.5μl 10mM ATP 1.0μl λZAPベクターDNA(1μg/μl) 0.5μl T4 DNAリガーゼ(4 Weiss u/μl)
【0049】(3)ファージDNAのファージ粒子への
パッケージング cDNAを挿入したファージベクターを、インビトロ・
パッケージングキット(GigapackII Gold packaging ex
tract;Stratagene社製)を用いてファージ粒子にパッ
ケージングした。溶解した直後の凍結−融解エキス(Fr
eeze / Thaw extract)に組換えファージ溶液を加え、
氷上に置き、すぐに15μlの超音波処理エキス(Sonic e
xtract)を加え、ピペッティングしてよく混合した。こ
れを軽く遠心して室温(22℃)に2時間放置した。上記
反応液に500μlのファージ希釈バッファー(Phage Dilu
tion Buffer)を加えさらに20μlのクロロホルムを加
え、混合した。ライブラリーのタイターを測定するため
に、500μlの水相の内2μlを18μlのSM buffer(1L
中、NaCl 5.8g, MgSO4・7H2O 2g, 1M Tris-HCl(pH7.5)
50ml, 2% ゼラチン 5ml)で1:10に希釈した。1μlの希
釈液と1μlのファージ原液をそれぞれ、OD600が0.5に
なるまで培養した大腸菌 PLK-F'株の培養液200μlと共
にプレーティングした。すなわち、大腸菌 PLK-F'株と
ファージ溶液を混合し、37℃で15分培養し、これを2〜
3mlのトップアガー(48℃)に加え、直ちに37℃に温め
たNZY アガープレートへ重層した。37℃で一晩培養し、
出現したプラークを数えてタイターを算出した。その結
果、タイターは1.2×106 pfu/mlであった。
【0050】(4)ライブラリーの増幅 遠心チューブに約50,000の組み換えバクテリオファージ
を含むパッケージング溶液と、OD600が0.5になるま
で培養した大腸菌 PLK-F'株の培養液600μlを加え、37
℃で15分培養した。この培養液に、溶解後48℃に保って
おいた6.5mlのトップアガーを加え、約37℃に温めてお
いた150mm NZY プレートに重層し、37℃で5〜8時間培
養した。各プレートに10mlのSM Bufferを加え、4℃で
一晩ゆっくり振とうさせながら培養した。各プレート中
のSM Bufferを滅菌したポリプロピレンチューブに集
め、更に各プレートを2mlのSM bufferでリンスし、こ
れも同チューブに集めた。全量の5%にあたるクロロホ
ルムを加えて混合し、室温で15分放置し、4,000 gで5
分遠心して菌体を除いた。この上清に、全量の0.3%にあ
たるクロロホルムを加え、4℃で保存した。こうして増
幅したライブラリーのタイターを前記と同様にして測定
した結果、2.3×109 pfu/mlであった。
【0051】(5)ファージDNAからのプラスミドの
切り出し組換えファージDNAから、プラスミド部分の
インビボ切りだし(In vivo Excision)を行った。50ml
のコニカルチューブ中に以下のものを混合し、37℃で15
分感染させた。 大腸菌XL1-Blue培養液(OD600=0.1) 200μl 増幅後のファージ溶液 200μl (>1×105 ファージ粒子) ヘルパーファージR408 1μl (>1×106 pfu/ml)
【0052】上記混合液に5mlの2×YT培地を加え、37
℃で3時間振とう培養して、70℃で20分熱処理した後40
00 gで5分遠心した。上清をデカントし、滅菌チューブ
へ移した。これを遠心し、上清を100倍希釈した溶液20
μlとOD600が1.0になるまで培養した大腸菌XL1-Blue の
培養液200μlを混合し、37℃で15分感染させた。1〜100
μlの培養液を、アンピシリンを含むLBプレートにプレ
ーティングした後、37℃で一晩培養した。出現したコロ
ニーをランダムに選択して、グリセロールを加えて-80
℃で保存した。
【0053】(6)プラスミドの調製 プラスミドの調製は、Promega社製のMagic mini-prepキ
ットを用いて行った。-80℃で保存しておいたプラスミ
ドを保持する大腸菌の培養液を、5mlの2×YT培地に植
菌し、37℃で一晩培養した。5分間遠心(4,000 rpm,
4℃)して上清をデカントにより除去し、菌体ペレット
にTEバッファーを1ml加えボルテックスした。菌体懸濁
液をエッペンドルフチューブに移し、5分間遠心(5,00
0 rpm,4℃)して上清をデカントにより除去した。
【0054】菌体ペレットに300μlのCell Resuspensio
n Solution(細胞懸濁用溶液)を加えよく懸濁し、エッ
ペンドルフチューブに移した。これを2分間ミキサーで
撹拌し、300μlのCell Lysis Solution(細胞溶解用溶
液)を加え透明になるまで撹拌した。さらに300μlのNe
utralization Solution(中和用溶液)を加え、手で振
って撹拌した後、10分間遠心(15,000 rpm)した。
【0055】上清のみを新しいエッペンドルフチューブ
(1.5ml)に移した。吸引管にコック、ミニカラム、シ
リンジ(注射器)の順で接続し、シリンジにレジンを1
ml入れた。上記上清をこのシリンジの中へ注入し良く撹
拌した後、吸引した。Column WashSolution(カラム洗
浄用溶液)を2ml加え吸引して洗浄し、乾燥のため1〜
2分そのまま吸引しておいた。ミニカラムを取り外し、
新しいエッペンドルフチューブ(1.5ml)内にセットし
た。65〜70℃に温めた滅菌水100μlをミニカラムに注入
し、1分間エッペンドルフチューブごと遠心(5,000 rp
m)した。溶出液をエッペンドルフチューブに移し、3M
酢酸ナトリウム水溶液を5μl加え、冷エタノールを25
0μl加えた。これを遠心し(15000 rpm,25分)、上清
を捨て、沈殿に70%エタノールを1ml加え、再び遠心し
た(15000 rpm,3分)。エタノールを完全に取り除
き、チューブをデシケーター中でバキュームドライし
た。沈澱を20μlの滅菌水に良く溶かし、-20℃で保存し
た。この溶液1μlを取って、ボリュームマーカーと一
緒に電気泳動してプラスミドDNAを定量した。
【0056】<4>cDNAの塩基配列の決定及び遺伝
子データベースとのホモロジー検索 (1)cDNAの塩基配列の決定 cDNAの塩基配列解析は、アプライドバイオシステム
ズ社(ABI)製DNAオートシーケンサー373Aを用いて
行った。シーケンス反応は同社製Dye Primer Cycle Seq
uencingキットによりT3プライマーを用いて付属の説
明書に従って行った。ランダムに選択した約750個のク
ローンについて、塩基配列の決定を行った。
【0057】(2)ホモロジー検索 約750個のクローンの部分配列を、BlastX により、コン
ピューター検索した。その結果、3個のクローンがバク
テリアセルロース合成酵素サブユニットのホモログであ
ったので、その完全長クローンの単離を試みた。
【0058】<5>完全長クローンの単離 (1) 5’RACE ホモロジー検索の結果、得られたホモログクローンは不
完全長だったため、5’末端側へ伸長できるように、プ
ライマーを合成し、mRNAを鋳型にRT-PCRを行なった。
【0059】(1-a) first-strand DNAの合成 以下の溶液をチューブ中に混合した。 0.5μl 10μmol gene-specific primer1 1μg total RNA DEPC-treated H2O (全体を9μl になるように調節す
る )
【0060】gene-specific primer1として、PcsA1用に
は配列番号15記載の塩基配列を有するオリゴヌクレオ
チドを、PcsA2用には配列番号16記載の塩基配列を有
するオリゴヌクレオチドを、PcsA3用には配列番号17
記載の塩基配列を有するオリゴヌクレオチドを用いた。
【0061】上記反応液を緩やかに混合した後、軽く遠
心して反応液をチューブの底部に落とし、70℃で10分放
置しすぐに氷冷した。次に、以下の溶液をチューブ中に
混合した。 5×RT Buffer 5μl 25mM MgCl2 2.5μl 2mM dNTP mix 5μl 0.1M DTT 2.5μl H2O (全体が24μlになるように加える)
【0062】緩やかに撹拌した後、軽く遠心して反応液
をチューブの底部に落とし、42℃で1分置いた。そこに1
μl SuperScriptII RT (逆転写酵素 GIBCO BRL)を加
え、緩やかに混合した後、42℃で50分反応させた。その
後70℃で15分置き、反応を停止させた。軽く遠心して反
応液をチューブの底部に落とした後、37℃に置いた。そ
こに1μl RNase H (東洋紡)を加え、37℃で30分反応さ
せた。
【0063】続いて、反応液中に含まれる、過剰のプラ
イマーやヌクレオチドを除くために、ベーリンガー社製
の精製カラム、Quick Spin Columns を用いてゲルろ過
を行なった。まず、カラムのtip を取り、1100×gで2分
間遠心してbufferを捨てた。カラムの中央に上記反応液
を入れ、1100×gで4分間遠心し、溶液を回収した。
【0064】(1-b) Poly(dC) tailing 得られた溶液から5μl 取り、以下の溶液を加えた。 5μl 5×CoCl2 Buffer 2.5μl 2mM dCTP H2O (全体を24μl になるように調節する)
【0065】上記反応液を良く混合し、94℃で3分間置
いた。軽く遠心してチューブの底部に落として、氷上に
置いた。そこにターミナルトランスフェラーゼTdT (東
洋紡)を1μl 加えて軽く混合し、37℃で10分間反応させ
た。引き続き65℃で10分間置いて反応を停止させた。
【0066】(1-c)PCR反応 上記反応液から、2.5μl 取り、以下の溶液を加えた。 2.5μl 10×PCR Buffer 2.5μl 2mM dNTP mix 0.5μl Gene-specific primer2 0.5μl Abridged Anchor Primer (GIBCO BRL) 0.5μl Advantage Klentaq Polymerase Mix (Clontec
h) H2O (全体を25μlになるように調節する)
【0067】Gene-specific primer2としては、PcsA1用
には配列番号18記載の塩基配列を有するオリゴヌクレ
オチドを、PcsA2用には配列番号19記載の塩基配列を
有するオリゴヌクレオチドを、PcsA3用には配列番号2
0記載の塩基配列を有するオリゴヌクレオチドを用い
た。
【0068】0.2mlチューブに入れ、以下の条件でPCR反
応を行なった。
【0069】反応液のアガロースゲル電気泳動を行な
い、最も大きいサイズ(PcsA1で約1.8K,PcsA2で約2K,Pc
sA3で約2.2K)の部分のDNAをゲルから抽出した。抽出に
は CLONTECH 社のGENO-BIND を用い、そのプロトコール
に従った。こうして得られたDNAに Poly(dC)tailing を
行ない、これをテンプレートとしてPCR反応を行なっ
た。条件および反応液組成は上記と同じである。
【0070】(2)クローニング (2-a)5’RACEのTAクローニング 得られたPCR反応液から、Invitrogen社の TA Cloning K
it を用いて、そのプロトコールに従い、クローニング
を行なった。上記で得られたPCR反応液中1.5μl に以下
の溶液を加えた。 0.5μl 10×Ligation Buffer 1μ l pCRII vector 0.5μl T4 DNA Ligase 1.5μl dH2O
【0071】14℃で一晩反応させた。その反応液から2
μlを大腸菌コンピテントセル(JM109)25μlに加え、30
分間氷上においた後、42℃で30秒間ヒートショックを与
えた。氷上で2分間静置した後、SOB培地を450μl加えて
200rpm37℃で1時間振とう培養した。これを、Amp/Xgal/
IPTG プレートにまき、37℃で一晩静置培養した。得ら
れたコロニーから前記の方法によりプラスミドを抽出し
た。
【0072】(2-b) 完全長 cDNA のクローニング ABI 社製の DNA Sequencer 377 を用いてプロトコール
に従って行なった。シーケンス反応は同社製 Dye Termi
nater Cycle Sequencing キットにより M13 プライマー
及び合成オリゴマーをプライマーとして用いて行なっ
た。シーケンスの結果PcsA3に関しては、同じPcsA3の仲
間ではあるが配列のわずかに異なる(アミノ酸で1箇
所)別のクローンが単離されてきたことがわかった(図
3、4参照)。PcsA3の3’側領域を含むクローン(Pcs
A3-682)の塩基配列及びこの塩基配列から予想されるア
ミノ酸配列を、配列番号5、6に示す。PcsA3の5’側
領域を含む別のクローンの5’部分(PcsA3-5')の塩基
配列及びこの塩基配列から予想されるアミノ酸配列を、
配列番号7、8に示す。また、このクローンの3’部分
(PcsA3-3')の塩基配列及びこの塩基配列から予想され
るアミノ酸配列を、配列番号9、10に示す。PcsA1,Pc
sA2に関しては、得られた配列よりORFを含む領域の5’
末端および3’末端のプライマーを合成し、PCR 反応を
行ない、TAクローニングにより完全長クローンを単離し
た。条件および反応液組成は上記と同じである。プライ
マーは、PcsA1用には配列番号21(5’末端)及び配列
番号22(3’末端)に示すオリゴヌクレオチドを、Pcs
A2用には配列番号23(5’末端)及び配列番号24
(3’末端)に示すオリゴヌクレオチドを、用いた。結
果を、配列番号1〜4に示す。
【0073】
【発明の効果】本発明によって、セルコース合成酵素を
コードするDNAが提供される。これらのDNAは、原
核細胞及び真核細胞へ組み込んで、セルロースの生産を
制御する新たな方法を提供する。
【0074】
【配列表】
配列番号:1 配列の長さ:3207 配列の型:核酸 鎖の数:二本鎖 トポロジー:直鎖状 配列の種類:cDNA to mRNA 起源 生物名:ワタ(Gossypium hirsutum L.) 株名:Coker312 配列の特徴 特徴を表す記号:CDS 存在位置:77..3001 特徴を決定した方法:S 配列 GGTTAGCATA TTGTTTGTAG CATTGGGTTT TTTTCTCAAG GAAGAAGAAG GAGAAAGATA 60 AGTAATGTTT TTGAGA ATG ATG GAA TCT GGG GTT CCT GTT TGC CAC ACT 109 Met Met Glu Ser Gly Val Pro Val Cys His Thr 1 5 10 TGT GGT GAA CAT GTT GGG TTG AAT GTT AAT GGT GAA CCC TTT GTG GCT 157 Cys Gly Glu His Val Gly Leu Asn Val Asn Gly Glu Pro Phe Val Ala 15 20 25 TGC CAT GAA TGT AAT TTC CCT ATT TGT AAG AGT TGT TTT GAG TAT GAT 205 Cys His Glu Cys Asn Phe Pro Ile Cys Lys Ser Cys Phe Glu Tyr Asp 30 35 40 CTT AAG GAA GGA CAA AAA GCT TGC TTG CGT TGT GGT ATT CCG TAT GAT 253 Leu Lys Glu Gly Gln Lys Ala Cys Leu Arg Cys Gly Ile Pro Tyr Asp 45 50 55 GAA AAC CTG TTG GAC GAT GTC GAG AAG GCC ACC GGC GAT CAA TCG ACA 301 Glu Asn Leu Leu Asp Asp Val Glu Lys Ala Thr Gly Asp Gln Ser Thr 60 65 70 75 ATG GCT GCA CAT TTG AGC AAG TCT CAG GAT GTT GGA ATT CAT GCA AGA 349 Met Ala Ala His Leu Ser Lys Ser Gln Asp Val Gly Ile His Ala Arg 80 85 90 CAT ATC AGC AGT GTG TCT ACA TTG GAT AGT GAA ATG ACT GAA GAC AAT 397 His Ile Ser Ser Val Ser Thr Leu Asp Ser Glu Met Thr Glu Asp Asn 95 100 105 GGG AAT CCG ATT TGG AAG AAC AGG GTG GAA AGT TGG AAA GAA AAG AAG 445 Gly Asn Pro Ile Trp Lys Asn Arg Val Glu Ser Trp Lys Glu Lys Lys 110 115 120 AAC AAG AAG AAG AAG CCT GCA ACA ACT AAG GTT GAA AGA GAG GCT GAA 493 Asn Lys Lys Lys Lys Pro Ala Thr Thr Lys Val Glu Arg Glu Ala Glu 125 130 135 ATC CCA CCT GAG CAA CAA ATG GAA GAT AAA CCG GCA CCG GAT GCT TCC 541 Ile Pro Pro Glu Gln Gln Met Glu Asp Lys Pro Ala Pro Asp Ala Ser 140 145 150 155 CAG CCC CTC TCG ACT ATA ATT CCA ATC CCG AAA AGC AGA CTT GCA CCA 589 Gln Pro Leu Ser Thr Ile Ile Pro Ile Pro Lys Ser Arg Leu Ala Pro 160 165 170 TAC CGA ACC GTG ATC ATT ATG CGA TTG ATC ATT CTC GGT CTT TTC TTC 637 Tyr Arg Thr Val Ile Ile Met Arg Leu Ile Ile Leu Gly Leu Phe Phe 175 180 185 CAT TAT CGA GTA ACA AAC CCC GTT GAC AGT GCT TTT GGA CTG TGG CTC 685 His Tyr Arg Val Thr Asn Pro Val Asp Ser Ala Phe Gly Leu Trp Leu 190 195 200 ACT TCA GTC ATA TGT GAA ATC TGG TTT GCT TTT TCC TGG GTG TTG GAT 733 Thr Ser Val Ile Cys Glu Ile Trp Phe Ala Phe Ser Trp Val Leu Asp 205 210 215 CAG TTC CCT AAG TGG TAT CCT GTT AAC AGG GAA ACA TAC ATT GAC AGA 781 Gln Phe Pro Lys Trp Tyr Pro Val Asn Arg Glu Thr Tyr Ile Asp Arg 220 225 230 235 CTG TCT GCA AGA TAT GAA AGA GAA GGT GAA CCT AAT GAA CTT GCT GCA 829 Leu Ser Ala Arg Tyr Glu Arg Glu Gly Glu Pro Asn Glu Leu Ala Ala 240 245 250 GTT GAC TTC TTT GTG AGT ACA GTG GAT CCA TTG AAA GAG CCT CCA TTG 877 Val Asp Phe Phe Val Ser Thr Val Asp Pro Leu Lys Glu Pro Pro Leu 255 260 265 ATT ACT GCC AAT ACT GTG CTT TCC ATC CTT GCC TTG GAC TAC CCG GTA 925 Ile Thr Ala Asn Thr Val Leu Ser Ile Leu Ala Leu Asp Tyr Pro Val 270 275 280 GAT AAG GTC TCT TGT TAT ATA TCT GAT GAT GGT GCG GCC ATG CTG ACA 973 Asp Lys Val Ser Cys Tyr Ile Ser Asp Asp Gly Ala Ala Met Leu Thr 285 290 295 TTT GAA TCT CTA GTA GAA ACA GCC GAC TTT GCA AGA AAG TGG GTT CCA 1021 Phe Glu Ser Leu Val Glu Thr Ala Asp Phe Ala Arg Lys Trp Val Pro 300 305 310 315 TTC TGC AAA AAA TTT TCC ATT GAA CCA CGG GCA CCT GAG TTT TAC TTC 1069 Phe Cys Lys Lys Phe Ser Ile Glu Pro Arg Ala Pro Glu Phe Tyr Phe 320 325 330 TCA CAG AAG ATT GAT TAC TTG AAA GAT AAA GTG CAG CCC TCT TTT GTA 1117 Ser Gln Lys Ile Asp Tyr Leu Lys Asp Lys Val Gln Pro Ser Phe Val 335 340 345 AAA GAA CGT AGA GCT ATG AAA AGA GAT TAC GAA GAG TAC AAA ATT CGA 1165 Lys Glu Arg Arg Ala Met Lys Arg Asp Tyr Glu Glu Tyr Lys Ile Arg 350 355 360 ATC AAT GCT TTA GTT GCA AAG GCT CAG AAA ACA CCT GAA GAA GGA TGG 1213 Ile Asn Ala Leu Val Ala Lys Ala Gln Lys Thr Pro Glu Glu Gly Trp 365 370 375 ACA ATG CAA GAT GGA ACT CCT TGG CCG GGA AAT AAC CCG CGT GAT CAC 1261 Thr Met Gln Asp Gly Thr Pro Trp Pro Gly Asn Asn Pro Arg Asp His 380 385 390 395 CCT GGC ATG ATT CAG GTT TTC CTT GGA TAT AGC GGT GCT CAT GAC ATC 1309 Pro Gly Met Ile Gln Val Phe Leu Gly Tyr Ser Gly Ala His Asp Ile 400 405 410 GAA GGA AAT GAA CTT CCC CGA CTG GTT TAC GTC TCT 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【0075】配列番号:2 配列の長さ:974 配列の型:アミノ酸 トポロジー:直鎖状 配列の種類:タンパク質 配列 Met Met Glu Ser Gly Val Pro Val Cys His Thr Cys Gly Glu His Val 1 5 10 15 Gly Leu Asn Val Asn Gly Glu Pro Phe Val Ala Cys His Glu Cys Asn 20 25 30 Phe Pro Ile Cys Lys Ser Cys Phe Glu Tyr Asp Leu Lys Glu Gly Gln 35 40 45 Lys Ala Cys Leu Arg Cys Gly Ile Pro Tyr Asp Glu Asn Leu Leu Asp 50 55 60 Asp Val Glu Lys Ala Thr Gly Asp Gln Ser Thr Met Ala Ala His Leu 65 70 75 80 Ser Lys Ser Gln Asp Val Gly Ile His Ala Arg His Ile Ser Ser Val 85 90 95 Ser Thr Leu Asp Ser Glu Met Thr Glu Asp Asn Gly Asn Pro Ile Trp 100 105 110 Lys Asn Arg Val Glu Ser Trp Lys Glu Lys Lys Asn Lys Lys Lys Lys 115 120 125 Pro Ala Thr Thr Lys Val Glu Arg Glu Ala Glu Ile Pro Pro Glu Gln 130 135 140 Gln Met Glu Asp Lys Pro Ala Pro Asp Ala Ser Gln Pro Leu Ser Thr 145 150 155 160 Ile Ile Pro Ile Pro Lys Ser Arg Leu Ala Pro Tyr Arg Thr Val Ile 165 170 175 Ile Met Arg Leu Ile Ile Leu Gly Leu Phe Phe His Tyr Arg Val Thr 180 185 190 Asn Pro Val Asp Ser Ala Phe Gly Leu Trp Leu Thr Ser Val Ile Cys 195 200 205 Glu Ile Trp Phe Ala Phe Ser Trp Val Leu Asp Gln Phe Pro Lys Trp 210 215 220 Tyr Pro Val Asn Arg Glu Thr Tyr Ile Asp Arg Leu Ser Ala Arg Tyr 225 230 235 240 Glu Arg Glu Gly Glu Pro Asn Glu Leu Ala Ala Val Asp Phe Phe Val 245 250 255 Ser Thr Val Asp Pro Leu Lys Glu Pro Pro Leu Ile Thr Ala Asn Thr 260 265 270 Val Leu Ser Ile Leu Ala Leu Asp Tyr Pro Val Asp Lys Val Ser Cys 275 280 285 Tyr Ile Ser Asp Asp Gly Ala Ala Met Leu Thr Phe Glu Ser Leu Val 290 295 300 Glu Thr Ala Asp Phe Ala Arg Lys Trp Val Pro Phe Cys Lys Lys Phe 305 310 315 320 Ser Ile Glu Pro Arg Ala Pro Glu Phe Tyr Phe Ser Gln Lys Ile Asp 325 330 335 Tyr Leu Lys Asp Lys Val Gln Pro Ser Phe Val Lys Glu Arg Arg Ala 340 345 350 Met Lys Arg Asp Tyr Glu Glu Tyr Lys Ile Arg Ile Asn Ala Leu Val 355 360 365 Ala Lys Ala Gln Lys Thr Pro Glu Glu Gly Trp Thr Met Gln Asp Gly 370 375 380 Thr Pro Trp Pro Gly Asn Asn Pro Arg Asp His Pro Gly Met Ile Gln 385 390 395 400 Val Phe Leu Gly Tyr Ser Gly Ala His Asp Ile Glu Gly Asn Glu Leu 405 410 415 Pro Arg Leu Val Tyr Val Ser Arg Glu Lys Arg Pro Gly Tyr Gln His 420 425 430 His Lys Lys Ala Gly Ala Glu Asn Ala Leu Val Arg Val Ser Ala Val 435 440 445 Leu Thr Asn Ala Pro Phe Ile Leu Asn Leu Asp Cys Asp His Tyr Val 450 455 460 Asn Asn Ser Lys Ala Val Arg Glu Ala Met Cys Phe Leu Met Asp Pro 465 470 475 480 Gln Val Gly Arg Asp Val Cys Tyr Val Gln Phe Pro Gln Arg Phe Asp 485 490 495 Gly Ile Asp Arg Ser Asp Arg Tyr Ala Asn Arg Asn Thr Val Phe Phe 500 505 510 Asp Val Asn Met Lys Gly Leu Asp Gly Ile Gln Gly Pro Val Tyr Val 515 520 525 Gly Thr Gly Cys Val Phe Asn Arg Gln Ala Leu Tyr Gly Tyr Gly Pro 530 535 540 Pro Ser Met Pro Ser Phe Pro Lys Ser Ser Ser Ser Ser Cys Ser Cys 545 550 555 560 Cys Cys Pro Gly Lys Lys Glu Pro Lys Asp Pro Ser Glu Leu Tyr Arg 565 570 575 Asp Ala Lys Arg Glu Glu Leu Asp Ala Ala Ile Phe Asn Leu Arg Glu 580 585 590 Ile Asp Asn Tyr Asp Glu Tyr Glu Arg Ser Met Leu Ile Ser Gln Thr 595 600 605 Ser Phe Glu Lys Thr Phe Gly Leu Ser Ser Val Phe Ile Glu Ser Thr 610 615 620 Leu Met Glu Asn Gly Gly Val Ala Glu Ser Ala Asn Pro Ser Thr Leu 625 630 635 640 Ile Lys Glu Ala Ile His Val Ile Gly Cys Gly Tyr Glu Glu Lys Thr 645 650 655 Ala Trp Gly Lys Glu Ile Gly Trp Ile Tyr Gly Ser Val Thr Glu Asp 660 665 670 Ile Leu Thr Gly Phe Lys Met His Cys Arg Gly Trp Arg Ser Ile Tyr 675 680 685 Cys Met Pro Leu Arg Pro Ala Phe Lys Gly Ser Ala Pro Ile Asn Leu 690 695 700 Ser Asp Arg Leu His Gln Val Leu Arg Trp Ala Leu Gly Ser Val Glu 705 710 715 720 Ile Phe Leu Ser Arg His Cys Pro Leu Trp Tyr Gly Phe Gly Gly Gly 725 730 735 Arg Leu Lys Trp Leu Gln Arg Leu Ala Tyr Ile Asn Thr Ile Val Tyr 740 745 750 Pro Phe Thr Ser Leu Pro Leu Ile Ala Tyr Cys Ser Leu Pro Ala Ile 755 760 765 Cys Leu Leu Thr Gly Lys Phe Ile Ile Pro Thr Leu Ser Asn Leu Ala 770 775 780 Ser Val Leu Phe Leu Gly Leu Phe Leu Ser Ile Ile Val Thr Ala Val 785 790 795 800 Leu Glu Leu Arg Trp Ser Gly Val Ser Ile Glu Asp Leu Trp Arg Asn 805 810 815 Glu Gln Phe Trp Val Ile Gly Gly Val Ser Ala His Leu Phe Ala Val 820 825 830 Phe Gln Gly Phe Leu Lys Met Leu Ala Gly Ile Asp Thr Asn Phe Thr 835 840 845 Val Thr Ala Lys Ala Ala Asp Asp Ala Asp Phe Gly Glu Leu Tyr Ile 850 855 860 Val Lys Trp Thr Thr Leu Leu Ile Pro Pro Thr Thr Leu Leu Ile Val 865 870 875 880 Asn Met Val Gly Val Val Ala Gly Phe Ser Asp Ala Leu Asn Lys Gly 885 890 895 Tyr Glu Ala Trp Gly Pro Leu Phe Gly Lys Val Phe Phe Ser Phe Trp 900 905 910 Val Ile Leu His Leu Tyr Pro Phe Leu Lys Gly Leu Met Gly Arg Gln 915 920 925 Asn Arg Thr Pro Thr Ile Val Val Leu Trp Ser Val Leu Leu Ala Ser 930 935 940 Val Phe Ser Leu Val Trp Val Arg Ile Asn Pro Phe Val Ser Thr Ala 945 950 955 960 Asp Ser Thr Thr Val Ser Gln Ser Cys Ile Ser Ile Asp Cys 965 970
【0076】配列番号:3 配列の長さ:3311 配列の型:核酸 鎖の数:二本鎖 トポロジー:直鎖状 配列の種類:cDNA to mRNA 起源 生物名:ワタ(Gossypium hirsutum L.) 株名:Coker312 配列の特徴 特徴を表す記号:CDS 存在位置:23..3142 特徴を決定した方法:S 配列 CTTTCGTTCT TTTGGTTTTG CC ATG GCT TCA ACC ACC ATG GCC GCT GGC TTT 52 Met Ala Ser Thr Thr Met Ala Ala Gly Phe 1 5 10 GGT TCA CTT GCT GTT GAC GAG AAT CGG GGA TCA TCG ACA CAT CAA TCA 100 Gly Ser Leu Ala Val Asp Glu Asn Arg Gly Ser Ser Thr His Gln Ser 15 20 25 TCA ACG AAA ATA TGC AGG GTG TGT GGG GAT AAG ATC GGG CAA AAG GAA 148 Ser Thr Lys Ile Cys Arg Val Cys Gly Asp Lys Ile Gly Gln Lys Glu 30 35 40 AAC GGA CAA CCG TTC GTG GCT TGT CAT GTC TGT GCT TTC CCG GTT TGC 196 Asn Gly Gln Pro Phe Val Ala Cys His Val Cys Ala Phe Pro Val Cys 45 50 55 CGT CCT TGT TAT GAA TAT GAA AGG AGT GAA GGA AAC CAG TGC TGT CCT 244 Arg Pro Cys Tyr Glu Tyr Glu Arg Ser Glu Gly Asn Gln Cys Cys Pro 60 65 70 CAG TGC AAT ACT CGC TAT AAG CGT CAC AAA GGT AGT CCA AGA ATT TCA 292 Gln Cys Asn Thr Arg Tyr Lys Arg His Lys Gly Ser Pro Arg Ile Ser 75 80 85 90 GGA GAT GAA GAA 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CCG AAA AGA CCG 2308 Met His Cys Arg Gly Trp Lys Ser Val Tyr Cys Val Pro Lys Arg Pro 750 755 760 GCA TTC AAA GGG TCC GCT CCA ATC AAT CTC TCG GAT CGG TTG CAC CAA 2356 Ala Phe Lys Gly Ser Ala Pro Ile Asn Leu Ser Asp Arg Leu His Gln 765 770 775 GTT TTG AGA TGG GCA CTT GGT TCT GTA GAA ATT TTC CTT AGT CGT CAC 2404 Val Leu Arg Trp Ala Leu Gly Ser Val Glu Ile Phe Leu Ser Arg His 780 785 790 TGT CCA CTT TGG TAT GGT TAT GGT GGA AAA CTG AAA TGG CTC GAG AGG 2452 Cys Pro Leu Trp Tyr Gly Tyr Gly Gly Lys Leu Lys Trp Leu Glu Arg 795 800 805 810 CTT GCT TAT ATC AAC ACC ATT GTT TAC CCT TTC ACC TCG ATC CCT TTA 2500 Leu Ala Tyr Ile Asn Thr Ile Val Tyr Pro Phe Thr Ser Ile Pro Leu 815 820 825 CTC GCC TAT TGT ACT ATT CCA GCT GTT TGT CTT CTC ACC GGC AAA TTC 2548 Leu Ala Tyr Cys Thr Ile Pro Ala Val Cys Leu Leu Thr Gly Lys Phe 830 835 840 ATC ATT CCA ACT CTA AGC AAC CTT ACA AGT GTG TGG TTC TTG GCA CTT 2596 Ile Ile Pro Thr Leu Ser Asn Leu Thr Ser Val Trp Phe Leu Ala Leu 845 850 855 TTC CTC TCC ATC ATT GCA ACT GGA GTG CTT GAA CTT CGA TGG AGC GGG 2644 Phe Leu Ser Ile Ile Ala Thr Gly Val Leu Glu Leu Arg Trp Ser Gly 860 865 870 GTT AGC ATC CAA GAC TGG TGG CGC AAT GAA CAA TTC TGG GTG ATC GGA 2692 Val Ser Ile Gln Asp Trp Trp Arg Asn Glu Gln Phe Trp Val Ile Gly 875 880 885 890 GGT GTC TCC GCC CAT CTT TTT GCT GTC TTC CAG GGC CTC CTC AAA GTC 2740 Gly Val Ser Ala His Leu Phe Ala Val Phe Gln Gly Leu Leu Lys Val 895 900 905 CTA GCT GGA GTA GAC ACC AAC TTC ACC GTA ACA GCA AAA GCA GCA GAC 2788 Leu Ala Gly Val Asp Thr Asn Phe Thr Val Thr Ala Lys Ala Ala Asp 910 915 920 GAT ACA GAA TTC GGT GAA CTT TAT CTC TTC AAA TGG ACA ACT CTC TTA 2836 Asp Thr Glu Phe Gly Glu Leu Tyr Leu Phe Lys Trp Thr Thr Leu Leu 925 930 935 ATC CCT CCC ACA ACT CTG ATA ATA CTG AAC ATG GTC GGA GTC GTG GCC 2884 Ile Pro Pro Thr Thr Leu Ile Ile Leu Asn Met Val Gly Val Val Ala 940 945 950 GGA GTT TCA GAC GCA ATC AAC AAC GGC TAT GGT TCA TGG GGT CCA TTG 2932 Gly Val Ser Asp Ala Ile Asn Asn Gly Tyr Gly Ser Trp Gly Pro Leu 955 960 965 970 TTC GGC AAA CTG TTC TTC GCA TTC TGG GTC ATT CTT CAT CTT TAC CCA 2980 Phe Gly Lys Leu Phe Phe Ala Phe Trp Val Ile Leu His Leu Tyr Pro 975 980 985 TTC CTC AAA GGT TTG ATG GGG AGA CAA AAC AGG ACG CCC ACC ATT GTT 3028 Phe Leu Lys Gly Leu Met Gly Arg Gln Asn Arg Thr Pro Thr Ile Val 990 995 1000 GTG CTT TGG TCC ATA CTT TTG GCA TCG ATT TTC TCA CTG GTT TGG GTA 3076 Val Leu Trp Ser Ile Leu Leu Ala Ser Ile Phe Ser Leu Val Trp Val 1005 1010 1015 CGG ATC GAT CCC TTC TTG CCC AAA CAA ACA GGT CCA GTT CTT AAA CAA 3124 Arg Ile Asp Pro Phe Leu Pro Lys Gln Thr Gly Pro Val Leu Lys Gln 1020 1025 1030 TGT GGC GTG GAG TGC TAAATGGTGT TTTACAAACC TTTCTTATTA TTTTATTTTC 3179 Cys Gly Val Glu Cys 1035 CCTTTTTGCC ACTACTGTTG ATTTGCTGTG ATTCTAAAAG GGATTTATCT TGTTTGTAAA 3239 AAGTCTCCTA TGATTTTGTT GGTTCAATTT AATTTCTATA TGGTAAAAAA ATATTTCTTT 3299 AAATTAACTA TA 3311
【0077】配列番号:4 配列の長さ:1039 配列の型:アミノ酸 トポロジー:直鎖状 配列の種類:タンパク質 配列 Met Ala Ser Thr Thr Met Ala Ala Gly Phe Gly Ser Leu Ala Val Asp 1 5 10 15 Glu Asn Arg Gly Ser Ser Thr His Gln Ser Ser Thr Lys Ile Cys Arg 20 25 30 Val Cys Gly Asp Lys Ile Gly Gln Lys Glu Asn Gly Gln Pro Phe Val 35 40 45 Ala Cys His Val Cys Ala Phe Pro Val Cys Arg Pro Cys Tyr Glu Tyr 50 55 60 Glu Arg Ser Glu Gly Asn Gln Cys Cys Pro Gln Cys Asn Thr Arg Tyr 65 70 75 80 Lys Arg His Lys Gly Ser Pro Arg Ile Ser Gly Asp Glu Glu Asp Asp 85 90 95 Ser Asp Gln Asp Asp Phe Asp Asp Glu Phe Gln Ile Lys Asn Arg Lys 100 105 110 Asp Asp Ser His Pro Gln His Glu Asn Glu Glu Tyr Asn Asn Asn Asn 115 120 125 His Gln Trp His Pro Asn Gly Gln Ala Phe Ser Val Ala Gly Ser Thr 130 135 140 Ala Gly Lys Asp Leu Glu Gly Asp Lys Glu Ile Tyr Gly Ser Glu Glu 145 150 155 160 Trp Lys Glu Arg Val Glu Lys Trp Lys Val Arg Gln Glu Lys Arg Gly 165 170 175 Leu Val Ser Asn Asp Asn Gly Gly Asn Asp Pro Pro Glu Glu Asp Asp 180 185 190 Tyr Leu Leu Ala Glu Ala Arg Gln Pro Leu Trp Arg Lys Val Pro Ile 195 200 205 Ser Ser Ser Leu Ile Ser Pro Tyr Arg Ile Val Ile Val Leu Arg Phe 210 215 220 Phe Ile Leu Ala Phe Phe Leu Arg Phe Arg Ile Leu Thr Pro Ala Tyr 225 230 235 240 Asp Ala Tyr Pro Leu Trp Leu Ile Ser Val Ile Cys Glu Val Trp Phe 245 250 255 Ala Phe Ser Trp Ile Leu Asp Gln Phe Pro Lys Trp Phe Pro Ile Thr 260 265 270 Arg Glu Thr Tyr Leu Asp Arg Leu Ser Leu Arg Phe Glu Arg Glu Gly 275 280 285 Glu Pro Asn Gln Leu Gly Pro Val Asp Val Phe Val Ser Thr Val Asp 290 295 300 Leu Leu Lys Glu Pro Pro Ile Ile Thr Ala Asn Ala Val Leu Ser Ile 305 310 315 320 Leu Ala Val Asp Tyr Pro Val Glu Lys Val Cys Cys Tyr Val Ser Asp 325 330 335 Asp Gly Ala Ser Met Leu Leu Phe Asp Ser Leu Ser Glu Thr Ala Glu 340 345 350 Phe Ala Arg Arg Trp Val Pro Phe Cys Lys Lys His Asn Val Glu Pro 355 360 365 Arg Ala Pro Glu Phe Tyr Phe Asn Glu Lys Ile Asp Tyr Leu Lys Asp 370 375 380 Lys Val His Pro Ser Phe Val Lys Glu Arg Arg Ala Met Lys Arg Glu 385 390 395 400 Tyr Glu Glu Phe Lys Val Arg Ile Asn Ala Leu Val Ala Lys Ala Gln 405 410 415 Lys Lys Pro Glu Glu Gly Trp Val Met Gln Asp Gly Thr Pro Trp Pro 420 425 430 Gly Asn Asn Thr Arg Asp His Pro Gly Met Ile Gln Val Tyr Leu Gly 435 440 445 Ser Ala Gly Ala Leu Asp Val Asp Gly Lys Glu Leu Pro Arg Leu Val 450 455 460 Tyr Val Ser Arg Glu Lys Arg Pro Gly Tyr Gln His His Lys Lys Ala 465 470 475 480 Gly Ala Glu Asn Ala Leu Val Arg Val Ser Ala Val Leu Thr Asn Ala 485 490 495 Pro Phe Ile Leu Asn Leu Asp Cys Asp His Tyr Ile Asn Asn Ser Lys 500 505 510 Ala Met Arg Glu Ala Met Cys Phe Leu Met Asp Pro Gln Phe Gly Lys 515 520 525 Lys Leu Cys Tyr Val Gln Phe Pro Gln Arg Phe Asp Gly Ile Asp Arg 530 535 540 His Asp Arg Tyr Ala Asn Arg Asn Val Val Phe Phe Asp Ile Asn Met 545 550 555 560 Leu Gly Leu Asp Gly Leu Gln Gly Pro Val Tyr Val Gly Thr Gly Cys 565 570 575 Val Phe Asn Arg Gln Ala Leu Tyr Gly Tyr Asp Pro Pro Val Ser Glu 580 585 590 Lys Arg Pro Lys Met Thr Cys Asp Cys Trp Pro Ser Trp Cys Cys Cys 595 600 605 Cys Cys Gly Gly Ser Arg Lys Lys Ser Lys Lys Lys Gly Glu Lys Lys 610 615 620 Gly Leu Leu Gly Gly Leu Leu Tyr Gly Lys Lys Lys Lys Met Met Gly 625 630 635 640 Lys Asn Tyr Val Lys Lys Gly Ser Ala Pro Val Phe Asp Leu Glu Glu 645 650 655 Ile Glu Glu Gly Leu Glu Gly Tyr Glu Glu Leu Glu Lys Ser Thr Leu 660 665 670 Met Ser Gln Lys Asn Phe Glu Lys Arg Phe Gly Gln Ser Pro Val Phe 675 680 685 Ile Ala Ser Thr Leu Met Glu Asn Gly Gly Leu Pro Glu Gly Thr Asn 690 695 700 Ser Thr Ser Leu Ile Lys Glu Ala Ile His Val Ile Ser Cys Gly Tyr 705 710 715 720 Glu Glu Lys Thr Glu Trp Gly Lys Glu Ile Gly Trp Ile Tyr Gly Ser 725 730 735 Val Thr Glu Asp Ile Leu Thr Gly Phe Lys Met His Cys Arg Gly Trp 740 745 750 Lys Ser Val Tyr Cys Val Pro Lys Arg Pro Ala Phe Lys Gly Ser Ala 755 760 765 Pro Ile Asn Leu Ser Asp Arg Leu His Gln Val Leu Arg Trp Ala Leu 770 775 780 Gly Ser Val Glu Ile Phe Leu Ser Arg His Cys Pro Leu Trp Tyr Gly 785 790 795 800 Tyr Gly Gly Lys Leu Lys Trp Leu Glu Arg Leu Ala Tyr Ile Asn Thr 805 810 815 Ile Val Tyr Pro Phe Thr Ser Ile Pro Leu Leu Ala Tyr Cys Thr Ile 820 825 830 Pro Ala Val Cys Leu Leu Thr Gly Lys Phe Ile Ile Pro Thr Leu Ser 835 840 845 Asn Leu Thr Ser Val Trp Phe Leu Ala Leu Phe Leu Ser Ile Ile Ala 850 855 860 Thr Gly Val Leu Glu Leu Arg Trp Ser Gly Val Ser Ile Gln Asp Trp 865 870 875 880 Trp Arg Asn Glu Gln Phe Trp Val Ile Gly Gly Val Ser Ala His Leu 885 890 895 Phe Ala Val Phe Gln Gly Leu Leu Lys Val Leu Ala Gly Val Asp Thr 900 905 910 Asn Phe Thr Val Thr Ala Lys Ala Ala Asp Asp Thr Glu Phe Gly Glu 915 920 925 Leu Tyr Leu Phe Lys Trp Thr Thr Leu Leu Ile Pro Pro Thr Thr Leu 930 935 940 Ile Ile Leu Asn Met Val Gly Val Val Ala Gly Val Ser Asp Ala Ile 945 950 955 960 Asn Asn Gly Tyr Gly Ser Trp Gly Pro Leu Phe Gly Lys Leu Phe Phe 965 970 975 Ala Phe Trp Val Ile Leu His Leu Tyr Pro Phe Leu Lys Gly Leu Met 980 985 990 Gly Arg Gln Asn Arg Thr Pro Thr Ile Val Val Leu Trp Ser Ile Leu 995 1000 1005 Leu Ala Ser Ile Phe Ser Leu Val Trp Val Arg Ile Asp Pro Phe Leu 1010 1015 1020 Pro Lys Gln Thr Gly Pro Val Leu Lys Gln Cys 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【0078】配列番号:5 配列の長さ:2033 配列の型:核酸 鎖の数:二本鎖 トポロジー:直鎖状 配列の種類:cDNA to mRNA 起源 生物名:ワタ(Gossypium hirsutum L.) 株名:Coker312 配列の特徴 特徴を表す記号:CDS 存在位置:1..1857 特徴を決定した方法:S 配列 CCG ACA TTC GTG AAG GAG CGT CGA GCT ATG AAG AGA GAA TAT GAA GAA 48 Pro Thr Phe Val Lys Glu Arg Arg Ala Met Lys Arg Glu Tyr Glu Glu 1 5 10 15 TTC AAG GTT AGG ATA AAT GCA CTT GTA GCC AAA GCC CAA AAG GTT CCT 96 Phe Lys Val Arg Ile Asn Ala Leu Val Ala Lys Ala Gln Lys Val Pro 20 25 30 CCA GAA GGG TGG ATC ATG CAA GAT GGG ACA CCA TGG CCA GGA AAC AAT 144 Pro Glu Gly Trp Ile Met Gln Asp Gly Thr Pro Trp Pro Gly Asn Asn 35 40 45 ACT AAA GAT CAC CCT GGT ATG ATT CAA GTA TTT CTC GGT CAA AGT GGA 192 Thr Lys Asp His Pro Gly Met Ile Gln Val Phe Leu Gly Gln Ser Gly 50 55 60 GGC CAT GAT ACC GAA GGA AAT GAG CTT CCT CGT CTC GTC TAT GTA TCT 240 Gly His Asp Thr Glu Gly Asn Glu Leu Pro Arg Leu Val Tyr Val Ser 65 70 75 80 CGA GAG AAA AGG CCT GGT TTC TTG CAT CAC AAG AAA GCT GGT GCC ATG 288 Arg Glu Lys Arg Pro Gly Phe Leu His His Lys Lys Ala Gly Ala Met 85 90 95 AAC GCC CTT GTT CGG GTC TCG GGG GTG CTC ACA AAT GCT CCT TTT ATG 336 Asn Ala Leu Val Arg Val Ser Gly Val Leu Thr Asn Ala Pro Phe Met 100 105 110 TTG AAC TTG GAT TGT GAC CAT TAT TTA AAT AAC AGC AAG GCT GTA AGA 384 Leu Asn Leu Asp Cys Asp His Tyr Leu Asn Asn Ser Lys Ala Val Arg 115 120 125 GAG GCT ATG TGT TTC TTG ATG GAC CCT CAA ATT GGA AGA AAG GTT TGC 432 Glu Ala Met Cys Phe Leu Met Asp Pro Gln Ile Gly Arg Lys Val Cys 130 135 140 TAT GTC CAA TTC CCT CAA CGT TTC GAT GGT ATT GAT AGA CAT GAT CGA 480 Tyr Val Gln Phe Pro Gln Arg Phe Asp Gly Ile Asp Arg His Asp Arg 145 150 155 160 TAT GCC AAT CGG AAC ACA GTT TTC TTT GAT ATT AAC ATG AAA GGT CTA 528 Tyr Ala Asn Arg Asn Thr Val Phe Phe Asp Ile Asn Met Lys Gly Leu 165 170 175 GAT GGT ATA CAA GGC CCT GTA TAT GTC GGC ACG GGG TGT GTT TTC AGA 576 Asp Gly Ile Gln Gly Pro Val Tyr Val Gly Thr Gly Cys Val Phe Arg 180 185 190 AGG CAA GCT CTT TAT GGT TAT GAA CCT CCA AAG GGA CCT AAG CGC CCG 624 Arg Gln Ala Leu Tyr Gly Tyr Glu Pro Pro Lys Gly Pro Lys 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Thr Glu Asp Ile Leu 305 310 315 320 ACA GGA TTC AAG ATG CAT TGC CGT GGA TGG AGA TCA ATA TAC TGC ATG 1008 Thr Gly Phe Lys Met His Cys Arg Gly Trp Arg Ser Ile Tyr Cys Met 325 330 335 CCA AAG TTG CCT GCA TTC AAG GGT TCA GCT CCC ATC AAT CTA TCG GAT 1056 Pro Lys Leu Pro Ala Phe Lys Gly Ser Ala Pro Ile Asn Leu Ser Asp 340 345 350 CGT CTA AAC CAA GTC CTT CGA TGG GCA CTC GGT TCT GTT GAA ATT TTC 1104 Arg Leu Asn Gln Val Leu Arg Trp Ala Leu Gly Ser Val Glu Ile Phe 355 360 365 TTT AGT CAT CAT TGC CCA GCA TGG TAT GGT TTC AAG GGA GGA AAG CTA 1152 Phe Ser His His Cys Pro Ala Trp Tyr Gly Phe Lys Gly Gly Lys Leu 370 375 380 AAA TGG CTT GAA CGA TTC GCA TAT GTC AAC ACA ACC ATC TAC CCC TTC 1200 Lys Trp Leu Glu Arg Phe Ala Tyr Val Asn Thr Thr Ile Tyr Pro Phe 385 390 395 400 ACA TCT TTA CCA CTT CTC GCC TAT TGT ACC CTA CCG GCA ATC TGT TTA 1248 Thr Ser Leu Pro Leu Leu Ala Tyr Cys Thr Leu Pro Ala Ile Cys Leu 405 410 415 CTT ACC GAT AAA TTT ATC ATG CCA CCG ATA AGC ACC TTT GCA AGT CTA 1296 Leu Thr Asp Lys Phe Ile Met Pro Pro Ile Ser Thr Phe Ala Ser Leu 420 425 430 TTC TTC ATT GCC TTG TTT CTT TCA ATC TTT GCA ACT GGT ATT CTC GAG 1344 Phe Phe Ile Ala Leu Phe Leu Ser Ile Phe Ala Thr Gly Ile Leu Glu 435 440 445 CTA AGG TGG AGT GGA GTA AGC ATT GAA GAA TGG TGG AGG AAT GAG CAA 1392 Leu Arg Trp Ser Gly Val Ser Ile Glu Glu Trp Trp Arg Asn Glu Gln 450 455 460 TTT TGG GTC ATC GGT GGC ATT TCG GCA CAT TTG TTC GCT GTT ATC CAA 1440 Phe Trp Val Ile Gly Gly Ile Ser Ala His Leu Phe Ala Val Ile Gln 465 470 475 480 GGC TTG TTG AAA GTT CTA GCT GGT ATT GAC ACT AAT TTC ACT GTC ACA 1488 Gly Leu Leu Lys Val Leu Ala Gly Ile Asp Thr Asn Phe Thr Val Thr 485 490 495 TCC AAG GCA ACT GAT GAC GAG GAG TTC GGG GAA TTG TAT ACT TTC AAA 1536 Ser Lys Ala Thr Asp Asp Glu Glu Phe Gly Glu Leu Tyr Thr Phe Lys 500 505 510 TGG ACA ACC CTT CTA ATT CCT CCT ACT ACC GTC TTA ATC ATC AAT TTA 1584 Trp Thr Thr Leu Leu Ile Pro Pro Thr Thr Val Leu Ile Ile Asn Leu 515 520 525 GTC GGT GTC GTT GCA GGC ATC TCG GAT GCC ATA AAC AAT GGA TAC CAA 1632 Val Gly Val Val Ala Gly Ile Ser Asp Ala Ile Asn Asn Gly Tyr Gln 530 535 540 TCA TGG GGA CCT CTT TTT GGG AAG CTC TTC TTC TCT TTC TGG GTG ATT 1680 Ser Trp Gly Pro Leu Phe Gly Lys Leu Phe Phe Ser Phe Trp Val Ile 545 550 555 560 GTC CAT CTC TAT CCA TTC CTC AAA GGT TTA ATG GGG AGA CAA AAC CGG 1728 Val His Leu Tyr Pro Phe Leu Lys Gly Leu Met Gly Arg Gln Asn Arg 565 570 575 ACA CCA ACC ATT GTT GTT ATA TGG TCA GTG CTA TTG GCT TCA ATC TTC 1776 Thr Pro Thr Ile Val Val Ile Trp Ser Val Leu Leu Ala Ser Ile Phe 580 585 590 TCC TTG CTT TGG GTC CGA ATT GAT CCA TTT GTG ATG AAA ACC AAA GGA 1824 Ser Leu Leu Trp Val Arg Ile Asp Pro Phe Val Met Lys Thr Lys Gly 595 600 605 CCA GAC ACT ACA ATG TGT GGC ATT AAC TGT TGAAAAAAAA TCATCTTGCG 1874 Pro Asp Thr Thr Met Cys Gly Ile Asn Cys 610 615 TGGTTCTTTT AGATTATGGT ATGTGATGTA TGAACAAACA AGAATGGAGA TGCACAAGAC 1934 AGAATAAAAT TAGAGTGAAA GTTTTGTGTA GTTATATATT CATTCTACCA ACTATAAGTT 1994 TTGTCATTCA ATTGAAAATA GCTCAACTTT GTGATCAAA 2033
【0079】配列番号:6 配列の長さ:618 配列の型:アミノ酸 トポロジー:直鎖状 配列の種類:ペプチド フラグメント型:C-terminal 配列 Pro Thr Phe Val Lys Glu Arg Arg Ala Met Lys Arg Glu Tyr Glu Glu 1 5 10 15 Phe Lys Val Arg Ile Asn Ala Leu Val Ala Lys Ala Gln Lys Val Pro 20 25 30 Pro Glu Gly Trp Ile Met Gln Asp Gly Thr Pro Trp Pro Gly Asn Asn 35 40 45 Thr Lys Asp His Pro Gly Met Ile Gln Val Phe Leu Gly Gln Ser Gly 50 55 60 Gly His Asp Thr Glu Gly Asn Glu Leu Pro Arg Leu Val Tyr Val Ser 65 70 75 80 Arg Glu Lys Arg Pro Gly Phe Leu His His Lys Lys Ala Gly Ala Met 85 90 95 Asn Ala Leu Val Arg Val Ser Gly Val Leu Thr Asn Ala Pro Phe Met 100 105 110 Leu Asn Leu Asp Cys Asp His Tyr Leu Asn Asn Ser Lys Ala Val Arg 115 120 125 Glu Ala Met Cys Phe Leu Met Asp Pro Gln Ile Gly Arg Lys Val Cys 130 135 140 Tyr Val Gln Phe Pro Gln Arg Phe Asp Gly Ile Asp Arg His Asp Arg 145 150 155 160 Tyr Ala Asn Arg Asn Thr Val Phe Phe Asp Ile Asn Met Lys Gly Leu 165 170 175 Asp Gly Ile Gln Gly Pro Val Tyr Val Gly Thr Gly Cys Val Phe Arg 180 185 190 Arg Gln Ala Leu Tyr Gly Tyr Glu Pro Pro Lys Gly Pro Lys Arg Pro 195 200 205 Lys Met Val Thr Cys Gly Cys Cys Pro Cys Phe Gly Arg Arg Arg Lys 210 215 220 Asp Lys Lys His Ser Lys Asp Gly Gly Asn Ala Asn Gly Leu Ser Leu 225 230 235 240 Glu Ala Ala Lys Asp Asp Lys Glu Leu Leu Met Ser His Met Asn Phe 245 250 255 Glu Lys Lys Phe Gly Gln Ser Ala Ile Phe Val Thr Ser Thr Leu Met 260 265 270 Glu Gln Gly Gly Val Pro Pro Ser Ser Ser Pro Ala Ala Leu Leu Lys 275 280 285 Glu Ala Ile His Val Ile Ser Cys Gly Tyr Glu Asp Lys Thr Glu Trp 290 295 300 Gly Ser Glu Leu Gly Trp Ile Tyr Gly Ser Ile Thr Glu Asp Ile Leu 305 310 315 320 Thr Gly Phe Lys Met His Cys Arg Gly Trp Arg Ser Ile Tyr Cys Met 325 330 335 Pro Lys Leu Pro Ala Phe Lys Gly Ser Ala Pro Ile Asn Leu Ser Asp 340 345 350 Arg Leu Asn Gln Val Leu Arg Trp Ala Leu Gly Ser Val Glu Ile Phe 355 360 365 Phe Ser His His Cys Pro Ala Trp Tyr Gly Phe Lys Gly Gly Lys Leu 370 375 380 Lys Trp Leu Glu Arg Phe Ala Tyr Val Asn Thr Thr Ile Tyr Pro Phe 385 390 395 400 Thr Ser Leu Pro Leu Leu Ala Tyr Cys Thr Leu Pro Ala Ile Cys Leu 405 410 415 Leu Thr Asp Lys Phe Ile Met Pro Pro Ile Ser Thr Phe Ala Ser Leu 420 425 430 Phe Phe Ile Ala Leu Phe Leu Ser Ile Phe Ala Thr Gly Ile Leu Glu 435 440 445 Leu Arg Trp Ser Gly Val Ser Ile Glu Glu Trp Trp Arg Asn Glu Gln 450 455 460 Phe Trp Val Ile Gly Gly Ile Ser Ala His Leu Phe Ala Val Ile Gln 465 470 475 480 Gly Leu Leu Lys Val Leu Ala Gly Ile Asp Thr Asn Phe Thr Val Thr 485 490 495 Ser Lys Ala Thr Asp Asp Glu Glu Phe Gly Glu Leu Tyr Thr Phe Lys 500 505 510 Trp Thr Thr Leu Leu Ile Pro Pro Thr Thr Val Leu Ile Ile Asn Leu 515 520 525 Val Gly Val Val Ala Gly Ile Ser Asp Ala Ile Asn Asn Gly Tyr Gln 530 535 540 Ser Trp Gly Pro Leu Phe Gly Lys Leu Phe Phe Ser Phe Trp Val Ile 545 550 555 560 Val His Leu Tyr Pro Phe Leu Lys Gly Leu Met Gly Arg Gln Asn Arg 565 570 575 Thr Pro Thr Ile Val Val Ile Trp Ser Val Leu Leu Ala Ser Ile Phe 580 585 590 Ser Leu Leu Trp Val Arg Ile Asp Pro Phe Val Met Lys Thr Lys Gly 595 600 605 Pro Asp Thr Thr Met Cys Gly Ile Asn Cys 610 615
【0080】配列番号:7 配列の長さ:1086 配列の型:核酸 鎖の数:二本鎖 トポロジー:直鎖状 配列の種類:cDNA to mRNA 起源 生物名:ワタ(Gossypium hirsutum L.) 株名:Coker312 配列の特徴 特徴を表す記号:CDS 存在位置:24..1086 特徴を決定した方法:S 配列 GGCACGAGCT TTCATATCCT CCA ATG GAA GCC AGC GCC GGA CTC GTT GCG 50 Met Glu Ala Ser Ala Gly Leu Val Ala 1 5 GGC TCT CAC AAC CGC AAT GAA CTT GTT GTC ATT CAT GGC CAT GAA GAG 98 Gly Ser His Asn Arg Asn Glu Leu Val Val Ile His Gly His Glu Glu 10 15 20 25 CCT AAA CCT CTG AAG AAC TTG GAT GGT CAA GTT TGT GAG ATT TGT GGT 146 Pro Lys Pro Leu Lys Asn Leu Asp Gly Gln Val Cys Glu Ile Cys Gly 30 35 40 GAT GAA ATT GGG TTG ACG GTC GAT GGA GAT CTT TTC GTG GCC TGC AAC 194 Asp Glu Ile Gly Leu Thr Val Asp Gly Asp Leu Phe Val Ala Cys Asn 45 50 55 GAG TGT GGT TTT CCA GTT TGT AGG CCT TGT TAT GAG TAT GAA AGG AGA 242 Glu Cys Gly Phe Pro Val Cys Arg Pro Cys Tyr Glu Tyr Glu Arg Arg 60 65 70 GAA GGG AGT CAA CAA TGT CCT CAA TGC AAA ACT AGA TAC AAG CGT CTC 290 Glu Gly Ser Gln Gln Cys Pro Gln Cys Lys Thr Arg Tyr Lys Arg Leu 75 80 85 AAG GGG AGT CCG AGG GTG GAG GGA GAT GAA GAT GAA GAG GAT GTG GAT 338 Lys Gly Ser Pro Arg Val Glu Gly Asp Glu Asp Glu Glu Asp Val Asp 90 95 100 105 GAT ATC GAA CAT GAA TTC AAC ATT GAT GAT GAA CAA AAC AAG TAT AGA 386 Asp Ile Glu His Glu Phe Asn Ile Asp Asp Glu Gln Asn Lys Tyr Arg 110 115 120 AAT ATC GCT GAA TCG ATG CTT CAT GGA AAG ATG AGC TAC GGG AGA GGC 434 Asn Ile Ala Glu Ser Met Leu His Gly Lys Met Ser Tyr Gly Arg Gly 125 130 135 CCT GAA GAC GAT GAA GGT TTG CAA ATC CCA CCC GGT TTA GCT GGT GTT 482 Pro Glu Asp Asp Glu Gly Leu Gln Ile Pro Pro Gly Leu Ala Gly Val 140 145 150 CGA TCT CGG CCG GTG AGC GGG GAG TTC CCA ATA GGA AGC TCT CTT GCT 530 Arg Ser Arg Pro Val Ser Gly Glu Phe Pro Ile Gly Ser Ser Leu Ala 155 160 165 TAT GGG GAA CAC ATG TCA AAT AAA CGA GTT CAT CCA TAT CCT ATG TCT 578 Tyr Gly Glu His Met Ser Asn Lys Arg Val His Pro Tyr Pro Met Ser 170 175 180 185 GAA CCT GGA AGT GCA AGA TGG GAT GAA AAG AAA GAG GGA GGA TGG AGA 626 Glu Pro Gly Ser Ala Arg Trp Asp Glu Lys Lys Glu Gly Gly Trp Arg 190 195 200 GAA AGG ATG GAT GAT TGG AAA ATG CAG CAA GGG AAT TTG GGT CCT GAA 674 Glu Arg Met Asp Asp Trp Lys Met Gln Gln Gly Asn Leu Gly Pro Glu 205 210 215 CCT GAT GAT GCC TAT GAT GCT GAC ATG GCT ATG CTT GAT GAA GCT AGG 722 Pro Asp Asp Ala Tyr Asp Ala Asp Met Ala Met Leu Asp Glu Ala Arg 220 225 230 CAG CCA TTG TCA AGG AAA GTG CCA ATT GCA TCG AGC AAA ATC AAT CCT 770 Gln Pro Leu Ser Arg Lys Val Pro Ile Ala Ser Ser Lys Ile Asn Pro 235 240 245 TAT CGT ATG GTG ATT GTG GCT CGT CTA GTT ATC CTT GCT TTC TTT CTT 818 Tyr Arg Met Val Ile Val Ala Arg Leu Val Ile Leu Ala Phe Phe Leu 250 255 260 265 CGC TAT CGG ATT TTG AAC CCG GTA CAT GAT GCA ATT GGG CTT TGG CTA 866 Arg Tyr Arg Ile Leu Asn Pro Val His Asp Ala Ile Gly Leu Trp Leu 270 275 280 ACT TCT GTG ATC TGT GAA ATC TGG TTT GCC TTT TCA TGG ATC CTT GAT 914 Thr Ser Val Ile Cys Glu Ile Trp Phe Ala Phe Ser Trp Ile Leu Asp 285 290 295 CAG TTC CCT AAA TGG TTC CCT ATT GAC CGC GAG ACG TAT CTC GAT CGC 962 Gln Phe Pro Lys Trp Phe Pro Ile Asp Arg Glu Thr Tyr Leu Asp Arg 300 305 310 CTT TCC CTC AGG TAT GAG AGG GAA GGT GAG CCC AAC ATG CTT GCT TCT 1010 Leu Ser Leu Arg Tyr Glu Arg Glu Gly Glu Pro Asn Met Leu Ala Ser 315 320 325 GTT GAT ATT TTT GTC AGT ACA GTG GAT CCA TTG AAG GGA CCT CCT CTA 1058 Val Asp Ile Phe Val Ser Thr Val Asp Pro Leu Lys Gly Pro Pro Leu 330 335 340 345 GTA ACA GCG AAT ACA GTT CTA TCG ATC T 1086 Val Thr Ala Asn Thr Val Leu Ser Ile 350
【0081】配列番号:8 配列の長さ:354 配列の型:アミノ酸 トポロジー:直鎖状 配列の種類:ペプチド フラグメント型:N-terminal 配列 Met Glu Ala Ser Ala Gly Leu Val Ala Gly Ser His Asn Arg Asn Glu 1 5 10 15 Leu Val Val Ile His Gly His Glu Glu Pro Lys Pro Leu Lys Asn Leu 20 25 30 Asp Gly Gln Val Cys Glu Ile Cys Gly Asp Glu Ile Gly Leu Thr Val 35 40 45 Asp Gly Asp Leu Phe Val Ala Cys Asn Glu Cys Gly Phe Pro Val Cys 50 55 60 Arg Pro Cys Tyr Glu Tyr Glu Arg Arg Glu Gly Ser Gln Gln Cys Pro 65 70 75 80 Gln Cys Lys Thr Arg Tyr Lys Arg Leu Lys Gly Ser Pro Arg Val Glu 85 90 95 Gly Asp Glu Asp Glu Glu Asp Val Asp Asp Ile Glu His Glu Phe Asn 100 105 110 Ile Asp Asp Glu Gln Asn Lys Tyr Arg Asn Ile Ala Glu Ser Met Leu 115 120 125 His Gly Lys Met Ser Tyr Gly Arg Gly Pro Glu Asp Asp Glu Gly Leu 130 135 140 Gln Ile Pro Pro Gly Leu Ala Gly Val Arg Ser Arg Pro Val Ser Gly 145 150 155 160 Glu Phe Pro Ile Gly Ser Ser Leu Ala Tyr Gly Glu His Met Ser Asn 165 170 175 Lys Arg Val His Pro Tyr Pro Met Ser Glu Pro Gly Ser Ala Arg Trp 180 185 190 Asp Glu Lys Lys Glu Gly Gly Trp Arg Glu Arg Met Asp Asp Trp Lys 195 200 205 Met Gln Gln Gly Asn Leu Gly Pro Glu Pro Asp Asp Ala Tyr Asp Ala 210 215 220 Asp Met Ala Met Leu Asp Glu Ala Arg Gln Pro Leu Ser Arg Lys Val 225 230 235 240 Pro Ile Ala Ser Ser Lys Ile Asn Pro Tyr Arg Met Val Ile Val Ala 245 250 255 Arg Leu Val Ile Leu Ala Phe Phe Leu Arg Tyr Arg Ile Leu Asn Pro 260 265 270 Val His Asp Ala Ile Gly Leu Trp Leu Thr Ser Val Ile Cys Glu Ile 275 280 285 Trp Phe Ala Phe Ser Trp Ile Leu Asp Gln Phe Pro Lys Trp Phe Pro 290 295 300 Ile Asp Arg Glu Thr Tyr Leu Asp Arg Leu Ser Leu Arg Tyr Glu Arg 305 310 315 320 Glu Gly Glu Pro Asn Met Leu Ala Ser Val Asp Ile Phe Val Ser Thr 325 330 335 Val Asp Pro Leu Lys Gly Pro Pro Leu Val Thr Ala Asn Thr Val Leu 340 345 350 Ser Ile
【0082】配列番号:9 配列の長さ:1000 配列の型:核酸 鎖の数:二本鎖 トポロジー:直鎖状 配列の種類:cDNA to mRNA 起源 生物名:ワタ(Gossypium hirsutum L.) 株名:Coker312 配列の特徴 特徴を表す記号:CDS 存在位置:1..1000 特徴を決定した方法:S 配列 GAC AAA GTC CGG CCG ACA TTC GTG AAG GAG CGT CGA GCT ATG AAG AGA 48 Asp Lys Val Arg Pro Thr Phe Val Lys Glu Arg Arg Ala Met Lys Arg 1 5 10 15 GAA TAT GAA GAA TTC AAG GTT AGG ATA AAT GCA CTT GTA GCC AAA GCC 96 Glu Tyr Glu Glu Phe Lys Val Arg Ile Asn Ala Leu Val Ala Lys Ala 20 25 30 CAA AAG GTT CCT CCA GAA GGG TGG ATC ATG CAA GAT GGG ACA CCA TGG 144 Gln Lys Val Pro Pro Glu Gly Trp Ile Met Gln Asp Gly Thr Pro Trp 35 40 45 CCA GGA AAC AAT ACT AAA GAT CAC CCT GGT ATG ATT CAA GTA TTT CTC 192 Pro Gly Asn Asn Thr Lys Asp His Pro Gly Met Ile Gln Val Phe Leu 50 55 60 GGT CAA AGT GGA GGC CAT GAT ACC GAA GGA AAT GAG CTT CCT CGT CTC 240 Gly Gln Ser Gly Gly His Asp Thr Glu Gly Asn Glu Leu Pro Arg Leu 65 70 75 80 GTC TAT GTA TCT CGA GAG AAA AGG CCA GGT TTC TTG CAT CAC AAG AAA 288 Val Tyr Val Ser Arg Glu Lys Arg Pro Gly Phe Leu His His Lys Lys 85 90 95 GCT GGT GCC ATG AAC GCC CTT GTT CGT GTC TCG GGG GTG CTT ACA AAT 336 Ala Gly Ala Met Asn Ala Leu Val Arg Val Ser Gly Val Leu Thr Asn 100 105 110 GCT CCT TTT ATG TTG AAC TTG GAT TGT GAC CAC TAT TTA AAT AAC AGC 384 Ala Pro Phe Met Leu Asn Leu Asp Cys Asp His Tyr Leu Asn Asn Ser 115 120 125 AAG GCT GTA AGA GAG GCT ATG TGT TTC TTG ATG GAC CCT CAA ATT GGA 432 Lys Ala Val Arg Glu Ala Met Cys Phe Leu Met Asp Pro Gln Ile Gly 130 135 140 AGA AAG GTT TGC TAT GTC CAA TTC CCT CAA CGT TTC GAT GGT ATT GAT 480 Arg Lys Val Cys Tyr Val Gln Phe Pro Gln Arg Phe Asp Gly Ile Asp 145 150 155 160 AGA CAT GAT CGA TAT GCC AAT CGG AAC ACA GTT TTC TTT GAT ATT AAC 528 Arg His Asp Arg Tyr Ala Asn Arg Asn Thr Val Phe Phe Asp Ile Asn 165 170 175 ATG AAA GGT CTA GAT GGT ATA CAA GGC CCT GTA TAT GTC GGC ACG GGG 576 Met Lys Gly Leu Asp Gly Ile Gln Gly Pro Val Tyr Val Gly Thr Gly 180 185 190 TGT GTT TTC AGA AGG CAA GCT CTT TAT GGT TAT GAA CCT CCA AAG GGA 624 Cys Val Phe Arg Arg Gln Ala Leu Tyr Gly Tyr Glu Pro Pro Lys Gly 195 200 205 CCT AAG CGC CCG AAA ATG GTA ACC TGT GGT TGC TGC CCT TGC TTT GGA 672 Pro Lys Arg Pro Lys Met Val Thr Cys Gly Cys Cys Pro Cys Phe Gly 210 215 220 CGC CGC AGA AAG GAC AAA AAG CAC TCT AAG GAT GGT GGA AAT GCA AAT 720 Arg Arg Arg Lys Asp Lys Lys His Ser Lys Asp Gly Gly Asn Ala Asn 225 230 235 240 GGT CTA AGC CTA GAA GCA GCC GAA GAT GAC AAG GAG TTA TTG ATG TCC 768 Gly Leu Ser Leu Glu Ala Ala Glu Asp Asp Lys Glu Leu Leu Met Ser 245 250 255 CAC ATG AAC TTT GAA AAG AAA TTT GGA CAA TCA GCC ATT TTT GTA ACT 816 His Met Asn Phe Glu Lys Lys Phe Gly Gln Ser Ala Ile Phe Val Thr 260 265 270 TCA ACA CTG ATG GAA CAA GGT GGT GTC CCT CCT TCT TCA AGC CCT GCA 864 Ser Thr Leu Met Glu Gln Gly Gly Val Pro Pro Ser Ser Ser Pro Ala 275 280 285 GCT TTG CTC AAA GAA GCC ATT CAT GTA ATT AGT TGT GGT TAT GAA GAC 912 Ala Leu Leu Lys Glu Ala Ile His Val Ile Ser Cys Gly Tyr Glu Asp 290 295 300 AAA ACC GAA TGG GGA AGC GAG CTT GGC TGG ATT TAC GGC TCG ATT ACA 960 Lys Thr Glu Trp Gly Ser Glu Leu Gly Trp Ile Tyr Gly Ser Ile Thr 305 310 315 320 GAA GAT ATC TTA ACA GGT TTC AAG ATG CAT TGC CGT GGA T 1000 Glu Asp Ile Leu Thr Gly Phe Lys Met His Cys Arg Gly 325 330
【0083】配列番号:10 配列の長さ:333 配列の型:アミノ酸 トポロジー:直鎖状 配列の種類:ペプチド フラグメント型:internal Asp Lys Val Arg Pro Thr Phe Val Lys Glu Arg Arg Ala Met Lys Arg 1 5 10 15 Glu Tyr Glu Glu Phe Lys Val Arg Ile Asn Ala Leu Val Ala Lys Ala 20 25 30 Gln Lys Val Pro Pro Glu Gly Trp Ile Met Gln Asp Gly Thr Pro Trp 35 40 45 Pro Gly Asn Asn Thr Lys Asp His Pro Gly Met Ile Gln Val Phe Leu 50 55 60 Gly Gln Ser Gly Gly His Asp Thr Glu Gly Asn Glu Leu Pro Arg Leu 65 70 75 80 Val Tyr Val Ser Arg Glu Lys Arg Pro Gly Phe Leu His His Lys Lys 85 90 95 Ala Gly Ala Met Asn Ala Leu Val Arg Val Ser Gly Val Leu Thr Asn 100 105 110 Ala Pro Phe Met Leu Asn Leu Asp Cys Asp His Tyr Leu Asn Asn Ser 115 120 125 Lys Ala Val Arg Glu Ala Met Cys Phe Leu Met Asp Pro Gln Ile Gly 130 135 140 Arg Lys Val Cys Tyr Val Gln Phe Pro Gln Arg Phe Asp Gly Ile Asp 145 150 155 160 Arg His Asp Arg Tyr Ala Asn Arg Asn Thr Val Phe Phe Asp Ile Asn 165 170 175 Met Lys Gly Leu Asp Gly Ile Gln Gly Pro Val Tyr Val Gly Thr Gly 180 185 190 Cys Val Phe Arg Arg Gln Ala Leu Tyr Gly Tyr Glu Pro Pro Lys Gly 195 200 205 Pro Lys Arg Pro Lys Met Val Thr Cys Gly Cys Cys Pro Cys Phe Gly 210 215 220 Arg Arg Arg Lys Asp Lys Lys His Ser Lys Asp Gly Gly Asn Ala Asn 225 230 235 240 Gly Leu Ser Leu Glu Ala Ala Glu Asp Asp Lys Glu Leu Leu Met Ser 245 250 255 His Met Asn Phe Glu Lys Lys Phe Gly Gln Ser Ala Ile Phe Val Thr 260 265 270 Ser Thr Leu Met Glu Gln Gly Gly Val Pro Pro Ser Ser Ser Pro Ala 275 280 285 Ala Leu Leu Lys Glu Ala Ile His Val Ile Ser Cys Gly Tyr Glu Asp 290 295 300 Lys Thr Glu Trp Gly Ser Glu Leu Gly Trp Ile Tyr Gly Ser Ile Thr 305 310 315 320 Glu Asp Ile Leu Thr Gly Phe Lys Met His Cys Arg Gly 325 330
【0084】配列番号:11 配列の長さ:333 配列の型:アミノ酸 トポロジー:直鎖状 配列の種類:ペプチド フラグメント型:C-terminal 配列の特徴 特徴を表す記号: 存在位置: 特徴を決定した方法:S 他の情報:XaaはGlu又はLysを表す 配列 Asp Lys Val Arg Pro Thr Phe Val Lys Glu Arg Arg Ala Met Lys Arg 1 5 10 15 Glu Tyr Glu Glu Phe Lys Val Arg Ile Asn Ala Leu Val Ala Lys Ala 20 25 30 Gln Lys Val Pro Pro Glu Gly Trp Ile Met Gln Asp Gly Thr Pro Trp 35 40 45 Pro Gly Asn Asn Thr Lys Asp His Pro Gly Met Ile Gln Val Phe Leu 50 55 60 Gly Gln Ser Gly Gly His Asp Thr Glu Gly Asn Glu Leu Pro Arg Leu 65 70 75 80 Val Tyr Val Ser Arg Glu Lys Arg Pro Gly Phe Leu His His Lys Lys 85 90 95 Ala Gly Ala Met Asn Ala Leu Val Arg Val Ser Gly Val Leu Thr Asn 100 105 110 Ala Pro Phe Met Leu Asn Leu Asp Cys Asp His Tyr Leu Asn Asn Ser 115 120 125 Lys Ala Val Arg Glu Ala Met Cys Phe Leu Met Asp Pro Gln Ile Gly 130 135 140 Arg Lys Val Cys Tyr Val Gln Phe Pro Gln Arg Phe Asp Gly Ile Asp 145 150 155 160 Arg His Asp Arg Tyr Ala Asn Arg Asn Thr Val Phe Phe Asp Ile Asn 165 170 175 Met Lys Gly Leu Asp Gly Ile Gln Gly Pro Val Tyr Val Gly Thr Gly 180 185 190 Cys Val Phe Arg Arg Gln Ala Leu Tyr Gly Tyr Glu Pro Pro Lys Gly 195 200 205 Pro Lys Arg Pro Lys Met Val Thr Cys Gly Cys Cys Pro Cys Phe Gly 210 215 220 Arg Arg Arg Lys Asp Lys Lys His Ser Lys Asp Gly Gly Asn Ala Asn 225 230 235 240 Gly Leu Ser Leu Glu Ala Ala Xaa Asp Asp Lys Glu Leu Leu Met Ser 245 250 255 His Met Asn Phe Glu Lys Lys Phe Gly Gln Ser Ala Ile Phe Val Thr 260 265 270 Ser Thr Leu Met Glu Gln Gly Gly Val Pro Pro Ser Ser Ser Pro Ala 275 280 285 Ala Leu Leu Lys Glu Ala Ile His Val Ile Ser Cys Gly Tyr Glu Asp 290 295 300 Lys Thr Glu Trp Gly Ser Glu Leu Gly Trp Ile Tyr Gly Ser Ile Thr 305 310 315 320 Glu Asp Ile Leu Thr Gly Phe Lys Met His Cys Arg Gly Trp Arg Ser 325 330 335 Ile Tyr Cys Met Pro Lys Leu Pro Ala Phe Lys Gly Ser Ala Pro Ile 340 345 350 Asn Leu Ser Asp Arg Leu Asn Gln Val Leu Arg Trp Ala Leu Gly Ser 355 360 365 Val Glu Ile Phe Phe Ser His His Cys Pro Ala Trp Tyr Gly Phe Lys 370 375 380 Gly Gly Lys Leu Lys Trp Leu Glu Arg Phe Ala Tyr Val Asn Thr Thr 385 390 395 400 Ile Tyr Pro Phe Thr Ser Leu Pro Leu Leu Ala Tyr Cys Thr Leu Pro 405 410 415 Ala Ile Cys Leu Leu Thr Asp Lys Phe Ile Met Pro Pro Ile Ser Thr 420 425 430 Phe Ala Ser Leu Phe Phe Ile Ala Leu Phe Leu Ser Ile Phe Ala Thr 435 440 445 Gly Ile Leu Glu Leu Arg Trp Ser Gly Val Ser Ile Glu Glu Trp Trp 450 455 460 Arg Asn Glu Gln Phe Trp Val Ile Gly Gly Ile Ser Ala His Leu Phe 465 470 475 480 Ala Val Ile Gln Gly Leu Leu Lys Val Leu Ala Gly Ile Asp Thr Asn 485 490 495 Phe Thr Val Thr Ser Lys Ala Thr Asp Asp Glu Glu Phe Gly Glu Leu 500 505 510 Tyr Thr Phe Lys Trp Thr Thr Leu Leu Ile Pro Pro Thr Thr Val Leu 515 520 525 Ile Ile Asn Leu Val Gly Val Val Ala Gly Ile Ser Asp Ala Ile Asn 530 535 540 Asn Gly Tyr Gln Ser Trp Gly Pro Leu Phe Gly Lys Leu Phe Phe Ser 545 550 555 560 Phe Trp Val Ile Val His Leu Tyr Pro Phe Leu Lys Gly Leu Met Gly 565 570 575 Arg Gln Asn Arg Thr Pro Thr Ile Val Val Ile Trp Ser Val Leu Leu 580 585 590 Ala Ser Ile Phe Ser Leu Leu Trp Val Arg Ile Asp Pro Phe Val Met 595 600 605 Lys Thr Lys Gly Pro Asp Thr Thr Met Cys Gly Ile Asn Cys 610 615 620
【0085】配列番号:12 配列の長さ:9 配列の型:アミノ酸 トポロジー:直鎖状 配列の種類:ペプチド フラグメント型:internal 配列 Gln Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Arg Trp 1 5
【0086】配列番号:13 配列の長さ:54 配列の型:核酸 鎖の数:一本鎖 トポロジー:直鎖状 配列の種類:他の核酸..合成DNA 配列 GAGAGAGAGA GAGAGAGAGA ACTAGTCTCG AGTTTTTTTT TTTTTTTTTT 54
【0087】配列番号:14 配列の長さ:13 配列の型:核酸 鎖の数:二本鎖 トポロジー:直鎖状 配列の種類:他の核酸..合成DNA 配列の特徴 特徴を表す記号: 存在位置:1..4 特徴を決定した方法:S 他の情報:一本鎖 配列 AATTCGGCAC GAG 13
【0088】配列番号:15 配列の長さ:20 配列の型:核酸 鎖の数:一本鎖 トポロジー:直鎖状 配列の種類:他の核酸..合成DNA 配列 GACTGAAGAT AAGCCAAAAG 20
【0089】配列番号:16 配列の長さ:19 配列の型:核酸 鎖の数:一本鎖 トポロジー:直鎖状 配列の種類:他の核酸..合成DNA 配列 GGAATGATGA ATTTGCCGG 19
【0090】配列番号:17 配列の長さ:20 配列の型:核酸 鎖の数:一本鎖 トポロジー:直鎖状 配列の種類:他の核酸..合成DNA 配列 TGCAGGCAAC TTTGGCATGC 20
【0091】配列番号:18 配列の長さ:30 配列の型:核酸 鎖の数:一本鎖 トポロジー:直鎖状 配列の種類:他の核酸..合成DNA 配列 AGCAACACGA GCAAGATGAG GAGGATGACT 30
【0092】配列番号:19 配列の長さ:28 配列の型:核酸 鎖の数:一本鎖 トポロジー:直鎖状 配列の種類:他の核酸..合成DNA 配列 CCGGATCCTT CAACCCTTCT TCGATTTC 28
【0093】配列番号:20 配列の長さ:29 配列の型:核酸 鎖の数:一本鎖 トポロジー:直鎖状 配列の種類:他の核酸..合成DNA 配列 CCGGATCCAC GGCAATGCAT CTTGAAACC 29
【0094】配列番号:21 配列の長さ:17 配列の型:核酸 鎖の数:一本鎖 トポロジー:直鎖状 配列の種類:他の核酸..合成DNA 配列 GGTTAGCATA TTGTTTGTAG CATTGGG 17
【0095】配列番号:22 配列の長さ:17 配列の型:核酸 鎖の数:一本鎖 トポロジー:直鎖状 配列の種類:他の核酸..合成DNA 配列 ATCAATGAAA TATGTATAGT TCATAGC 17
【0096】配列番号:23 配列の長さ:17 配列の型:核酸 鎖の数:一本鎖 トポロジー:直鎖状 配列の種類:他の核酸..合成DNA 配列 CTTTCGTTCT TTTGGTTTTG CCATGGC 17
【0097】配列番号:24 配列の長さ:17 配列の型:核酸 鎖の数:一本鎖 トポロジー:直鎖状 配列の種類:他の核酸..合成DNA 配列 AGACTTTTTA CAAACAAGAT AAATCCC 17
【図面の簡単な説明】
【図1】 本発明のDNAの一形態であるPcsA3の
2つのクローンの関係を示す図。矢印で挟まれた領域は
塩基配列を決定した領域を、点線は塩基配列未決定の領
域を表す。
【図2】 EcoRIアダプターの構造を示す図。
【図3】 PcsA3−682とPcsA3−3’の配
列を比較した図(前半)。
【図4】 PcsA3−682とPcsA3−3’の配
列を比較した図(後半)。「:」は一致する塩基を、
「*」は一致しない塩基を表す。
───────────────────────────────────────────────────── フロントページの続き (51)Int.Cl.6 識別記号 FI C12N 9/10 C12N 5/00 B //(C12N 15/09 ZNA C12R 1:91) (72)発明者 青塚 聡 東京都足立区西新井栄町1−18−1 日清 紡績株式会社東京研究センター内 (72)発明者 林 隆久 京都府宇治市五ヶ庄官有地京都大学宿舎 544号 (72)発明者 井原 由理 大阪府高石市東羽衣1丁目5−33

Claims (4)

    【特許請求の範囲】
  1. 【請求項1】 以下の(A)〜(C)のいずれかのタン
    パク質をコードするDNA。 (A)配列番号2に示すアミノ酸配列、又は配列番号2
    において1若しくは数個のアミノ酸が欠失、置換、挿入
    若しくは付加されたアミノ酸配列からなり、かつ、セル
    ロース合成酵素活性を有するタンパク質。 (B)配列番号4に示すアミノ酸配列、又は配列番号4
    において1若しくは数個のアミノ酸が欠失、置換、挿入
    若しくは付加されたアミノ酸配列からなり、かつ、セル
    ロース合成酵素活性を有するタンパク質。 (C)配列番号8に示すアミノ酸配列、又は配列番号8
    において1若しくは数個のアミノ酸が欠失、置換、挿入
    若しくは付加されたアミノ配列、及び、 配列番号11に示すアミノ酸配列、又は配列番号11に
    おいて1若しくは数個のアミノ酸が欠失、置換、挿入若
    しくは付加されたアミノ酸配列、 を含み、かつ、セルロース合成酵素活性を有するタンパ
    ク質。
  2. 【請求項2】 請求項1記載のDNAの全部又は一部を
    含む組換えベクター。
  3. 【請求項3】 請求項1記載のDNAで形質転換された
    形質転換細胞。
  4. 【請求項4】 請求項1記載のDNAを細胞に導入し、
    請求項1記載のDNAと相同な塩基配列又は相補的な塩
    基配列を有するRNAを発現させることにより、前記細
    胞のセルロース合成を制御する方法。
JP9083133A 1997-04-01 1997-04-01 セルロース合成酵素遺伝子 Pending JPH10276782A (ja)

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Cited By (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO2005062034A1 (ja) * 2003-12-19 2005-07-07 Nec Corporation 質量分析法を利用するタンパク質の同定方法
JP2006526990A (ja) * 2003-06-06 2006-11-30 アーバージェン リミテッド ライアビリティ カンパニー 植物細胞多糖体を調節するための組成物および方法

Families Citing this family (8)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
AUPO069996A0 (en) 1996-06-27 1996-07-18 Australian National University, The Manipulation of plant cellulose
WO2000004166A2 (en) * 1998-07-14 2000-01-27 E.I. Du Pont De Nemours And Company Plant cellulose synthases
US6867352B2 (en) 1998-07-14 2005-03-15 E. I. Du Pont De Nemours And Company Plant cellulose synthases
GB9911379D0 (en) * 1999-05-18 1999-07-14 Univ Manchester Plant cellulose synthase genes
BR0010798A (pt) * 1999-05-21 2003-07-01 Univ Michigan Tech Método para aumentar a celulose e modificar a biossìntese de lignina em plantas
US7049481B1 (en) 1999-05-21 2006-05-23 Board Of Control Of Michigan Technological University Cellulose synthase encoding polynucleotides and uses thereof
US7674951B1 (en) 1999-05-21 2010-03-09 Michigan Technological University Isolated cellulose synthase promoter regions
US8129585B2 (en) 2005-08-03 2012-03-06 Michigan Technological University Methods for enhancing expression of secondary cell wall cellulose synthases in plants

Family Cites Families (4)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US5268274A (en) * 1989-04-12 1993-12-07 Cetus Corporation Methods and nucleic acid sequences for the expression of the cellulose synthase operon
WO1991013988A1 (en) * 1990-03-15 1991-09-19 The Board Of Regents, The University Of Texas System RECOMBINANT β-1,4 GLUCAN SYNTHASE PROTEINS
AUPO069996A0 (en) * 1996-06-27 1996-07-18 Australian National University, The Manipulation of plant cellulose
AU741197B2 (en) * 1996-10-29 2001-11-22 Monsanto Company Plant cellulose synthase and promoter sequences

Cited By (5)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
JP2006526990A (ja) * 2003-06-06 2006-11-30 アーバージェン リミテッド ライアビリティ カンパニー 植物細胞多糖体を調節するための組成物および方法
US8110726B2 (en) 2003-06-06 2012-02-07 Arborgen Inc. Polynucleotides encoding cellulose synthase from pinus radiata and methods of use for regulating polysaccharides of a plant
WO2005062034A1 (ja) * 2003-12-19 2005-07-07 Nec Corporation 質量分析法を利用するタンパク質の同定方法
JPWO2005062034A1 (ja) * 2003-12-19 2007-07-12 日本電気株式会社 質量分析法を利用するタンパク質の同定方法
JP4586989B2 (ja) * 2003-12-19 2010-11-24 日本電気株式会社 質量分析法を利用するタンパク質の同定方法

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