JPH08173169A - ニトリラーゼ遺伝子発現のための調節因子およびその遺伝子 - Google Patents
ニトリラーゼ遺伝子発現のための調節因子およびその遺伝子Info
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- JPH08173169A JPH08173169A JP6337652A JP33765294A JPH08173169A JP H08173169 A JPH08173169 A JP H08173169A JP 6337652 A JP6337652 A JP 6337652A JP 33765294 A JP33765294 A JP 33765294A JP H08173169 A JPH08173169 A JP H08173169A
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Abstract
作用を有し配列番号1のアミノ酸配列を有するポリペプ
チドおよび配列番号2のアミノ酸配列を有するポリペプ
チドの2成分より構成される調節因子およびそれらをコ
ードする遺伝子DNA。 【効果】本調節因子をコードする遺伝子をプロモーター
領域を含むニトリラーゼ遺伝子とロドコッカス属菌体内
に共存させることにより、ニトリラーゼの生産が可能と
なる。
Description
発現に関わる調節因子およびそれらをコードする遺伝子
DNAに関する。詳しくは、ロドコッカス エリスロポ
リス(Rhodococcus erythropolis)SK92株に由来
し、ニトリラーゼ遺伝子プロモーターを活性化する作用
を有する調節因子およびそれらをコードする遺伝子DN
Aとこれらの遺伝子DNAを含む組換え体プラスミドお
よび該組換え体プラスミドにより形質転換させた形質転
換体に関する。
リル化合物から対応する有機酸を製造する方法として
は、化学合成的手法と生物学的手法が知られている。生
物学的手法では、微生物あるいは微生物由来の酵素をニ
トリル化合物の加水分解触媒とするため、温和な条件で
有機酸を生成させることができるという利点がある。ロ
ドコッカス属に属する微生物は、ニトリル類を水和また
は加水分解して対応するアミドまたは有機酸を生産する
ための微生物触媒として知られている(特開平3-251192
号、特開昭62-91189号、特開平2-470 号および同2-8419
8 号各公報参照)。
トリラーゼ遺伝子によるニトリルの加水分解では、菌体
内に同遺伝子を多コピー存在させることができるため、
微生物の触媒能力を従来の方法と比べ飛躍的に増大させ
ることが期待できる。本発明者らはより高い触媒活性を
持つ微生物触媒を調製する目的で、ロドコッカス エリ
スロポリス SK92株のニトリラーゼ遺伝子をクロー
ニングし、大腸菌ラクトースプロモーターの下流に本遺
伝子を挿入したプラスミドを作製した。本プラスミドを
導入した大腸菌はIPTG(イソプロピル−β−D−チ
オガラクトシド)存在下で培養することにより高いニト
リラーゼ活性を示した。さらに、微生物触媒として利用
する場合に、より機能性のよいロドコッカス属細菌組換
え体を作製した。すなわち、ニトリラーゼ遺伝子をロド
コッカス属−大腸菌複合プラスミドベクター(特開平5-
64589 号および同5-68566 号公報参照)に組み込み、ロ
ドコッカス属細菌に導入した。しかしながら、ニトリラ
ーゼ活性は発現せず、ロドコッカス属細菌組換え体にお
いて発現させるための方法が望まれていた。
カス属において発現が認められないのはニトリラーゼ遺
伝子のプロモーターが機能しておらず、プロモーターが
機能するために必要な調節因子をコードする遺伝子がS
K92株染色体DNA上のどこかに存在するのではない
かと考えた。探索の結果、ニトリラーゼ構造遺伝子の上
流にその存在を見い出し、ロドコカッス属細菌組換え体
においてニトリラーゼ活性を発現させ、本発明を完成す
るに至った。
プロモーターを活性化する作用を有し、配列番号1のア
ミノ酸配列を有するポリペプチドおよび配列番号2のア
ミノ酸配列を有するポリペプチドの2成分より構成され
る調節因子およびそれらをコードする遺伝子DNA、で
ある。
は、下記の工程により実施されるものである。 (1) SK92株染色体DNAの調製 ロドコッカス エリスロポリス SK92株より染色体
DNAを分離、調製する。
ゼーション法により目的遺伝子を含有するDNA断片画
分をSK92株ニトリラーゼ遺伝子をプローブとして用
いて検出する。この画分を大腸菌およびロドコッカス属
細菌の細胞内で複製増殖可能な複合プラスミドベクター
に挿入しライブラリーとする。
体DNAの選別 工程(2) で作製された組換え体ライブラリーによる大腸
菌形質転換体を作製し、その中から工程(2) で作製した
プローブを用いてコロニーハイブリダイゼーション法に
より目的の組換え体DNAを含む形質転換体を選別す
る。
る。
形質転換体のニトリラーゼ活性 得られたプラスミドによりロドコッカス属細菌を形質転
換し、ニトリラーゼ活性を測定する。
プラスミドを作製し、ニトリラーゼ構造遺伝子領域以外
の部分で発現に必須な領域を特定する。ここで作製する
プラスミドは必ずしも大腸菌細胞内で複製増殖可能であ
る必要はなく、ロドコッカス属に属する細菌細胞内で複
製増殖可能なDNA領域を含んでいればよい。
る。
pK1、pK2、pK3およびpK4が挙げられる。こ
れらのプラスミドはロドコッカス ロドクロウス AT
CC12674に導入され、R. rhodochrous ATCC 1267
4/pK1 (FERM BP−3728)、R. rhodochrous
ATCC 12674/pK2 (FERM BP−3729)、R. r
hodochrous ATCC 12674/pK3 (FERM BP−373
0)およびR. rhodochrous ATCC 12674/pK4 (FERM
BP−3731)として工業技術院生命工学工業技術
研究所に寄託されている(特開平5-68556 号公報参
照)。
で複製増殖可能なDNA領域としては、プラスミドpR
C001、pRC002、pRC003およびpRC0
04から選ばれるプラスミド由来のものが用いられ、こ
れらはプラスミド全体であってもよく、或いは一断片で
もよい。上記プラスミドはそれぞれロドコッカス ロド
クロウス ATCC 4276、ATCC 1434
9、ATCC 14348およびIFO 3338株由
来である(特開平5-68556 号公報参照)。
株はFERM BP−3324として、また、ニトリラ
ーゼ遺伝子および調節遺伝子を含むプラスミドpSK1
08は、これを含有する形質転換体 JM109/pS
K108(FERM P−14569)として工業技術
院生命工学工業技術研究所に寄託されている。SK92
株はその菌学的性質よりロドコッカス属と同定されてい
たが(特開平3-280889号公報参照)、さらに、以下の詳
細な菌学的な性質より、ロドコッカス エリスロポリス
と同定された。
し、本発明はこれらの実施例により限定されるものでは
ない。なお、参考例として、SK92株ニトリラーゼ遺
伝子のクローニングと大腸菌およびロドコッカス細菌に
おける発現についても明記する。
トン、0.3%バクトイーストエキス、0.3%バクト
モルトエキス)中、30℃にて72時間振盪培養した後
集菌し、この菌体をSaline−EDTA溶液(0.
1MEDTA、0.15MNaCl(pH8.0)4m
lに懸濁しリゾチーム8mgを加えて37℃で1〜2時
間振盪した後凍結した。次に、10mlのTris−S
DS液(1%SDS、0.1MNaCl、0.1MTr
is(pH9.0)を穏やかに振盪しながら加え、さら
にプロテイナーゼK(メルク社)(終濃度0.1mg)
を加え37℃で1時間振盪後、さらに60℃で振盪し
た。次に、等量のTE飽和フェノールを加え撹拌後(T
E:10mMTris、1mMEDTA(pH8.
0))遠心し、上層をとり2倍量のエタノールを加えた
後、ガラス棒でDNAを巻きとり、90%、80%、7
0%のエタノールで順次フェノールを取り除いた。次
に、DNAを3mlのTE緩衝液に溶解させ、リボヌク
レアーゼA溶液(100℃、15分間の加熱処理済)を
10μg/mlになるよう加え37℃で30分間振盪し
た。さらにプロテイナーゼKを加え37℃で30分間振
盪した後、等量のTE飽和フェノールを加え遠心し上層
と下層に分離させた。上層についてこの操作を2回繰り
返した後、同量のクロロホルム(4%イソアミルアルコ
ール含有)を加え同様の抽出操作を繰り返した(以後、
この操作をフェノール処理と呼ぶ)。その後、上層に2
倍量のエタノールを加えガラス棒でDNAを巻きとり回
収し、染色体DNA標品を得た。
C118ベクターに組み込まれたプラスミドpSK00
2(参考例参照)を制限酵素SalIで切断後、1.1
kbのSalI断片を0.7%アガロース電気泳動によ
り分離し、ゲルより切り出し回収した。制限酵素による
切断は以下のように行った。pSK00210μlに対
し10倍濃度制限酵素緩衝液10μl、滅菌水78μ
l、制限酵素SalI2μlを加え37℃にて2時間反
応させた。SK92株染色体DNAをEcoRIにより
切断した標品についてアガロース電気泳動を行った。
1.1kbSalI断片をDIG DNA Labeling Kit(ベー
リンガー・マンハイム株式会社)を用いて標識し、これ
をプローブとしてサザンハイブリダイゼーション法(So
uthern E.M.,Mol.Bionl.98 503(1975))により約14k
bのDNA断片を検出した。プローブとハイブリダイズ
した14kb断片を含むDNA断片分画分をアガロース
ゲルより切り出し、EcoRIで切断した複合プラスミ
ドベクターpK4〔FERM BP−3731:ロドコ
ッカス属プラスミドpRC004と大腸菌ベクターpH
SG299を連結させたもの(特開平5-64589 号および
同5-68566 号公報参照)〕へ挿入した。ベクターに用い
たpK4断片は次のように作製した。pK410μlに
対し10倍濃度制限酵素緩衝液10μl、滅菌水77μ
l、制限酵素EcoRI2μlを加え37℃で2時間反
応後、フェノール処理、エタノール沈澱させた後乾燥し
て50μlの滅菌水に溶解した。さらにアルカリフォス
タファーゼ(宝酒造株式会社)1μl、10倍濃度緩衝
液10μl、滅菌水39μlを加え65℃で反応後、フ
ェノール処理、エタノール沈澱を行い乾燥して滅菌水に
溶解した。14kb断片を含むDNA断片画分1μl
を、上記のように調製したEcoRI切断pK4とライ
ゲーションキット(宝酒造株式会社)を用いて4℃で一
晩反応させることによりpK4への挿入を行い、DNA
ライブラリーとした。
Aの選別 大腸菌JM109株をLB培地(1%バクトトリプト
ン、0.5%バクトイーストエキス、0.5%NaC
l)1mlに接種し37℃、5時間前培養し、この培養
物100μlをSOB培地(2%バクトトリプトン、
0.5%バクトイーストエキス、10mMNaCl、
2.5mMKCl、1mMMgSO4 、1mMMgCl
2 )50mlに加え、18℃で20時間培養した。遠心
により集菌した後、冷13mlTF溶液(20mMPI
PES−KOH(pH6.0)、200mMKCl、1
0mMCaCl2 、40mMMnCl2 )を13ml加
え、0℃で10分放置後、再度遠心した。上澄を除いた
後、沈澱した大腸菌に冷TF溶液3.2mlに懸濁し
0.22mlのジメチルスルホキシドを加え0℃で10
分間放置した。こうして作製したコンピテントセル20
0μlに工程(2) で作製した組換え体プラスミドを含有
する溶液(DNAライブラリー)を10μl加え、0℃
で30分放置後、42℃で30秒間ヒートショックを与
え0℃で2分間冷却後、SOC培地(2%バクトトリプ
トン、0.5%バクトイーストエキス、20mMグルコ
ース、10mMNaCl、2.5mMKCl、1mMM
gSO4 、1mMMgCl2 )を0.8ml加え37℃
にて60分間振盪培養した。これを200μlずつアン
ピシリン100μg/ml含有のLB寒天培地にまき、
37℃で培養した。寒天培地上に生育した形質転換体コ
ロニーについてコロニーハイブリダイゼーション法にて
ニトリラーゼ遺伝子をもつ形質転換体を選別した。すな
わち、寒天培地上に生育した形質転換体をナイロンメン
ブレン(バイオダインA:日本ポール株式会社)上に移
し、菌体を溶かしてDNAを固定した後、これを工程
(2) で作製したプローブ(1.1kb断片)で処理し、
DIG Luminescent Detection Kit (ベーリンガー・マン
ハイム株式会社)を用い、目的の組換え体DNAを含む
コロニーを選択した。
にて37℃で一晩培養し、集菌後、滅菌水により洗浄
し、溶液I (2mMグルコース、10mMEDTA、2
5mMTris・HCl(pH8.0)を5ml、リゾ
チームを25mg加え、0℃で30分間放置した。溶液
II(1NNaOH、5%SDS)を10ml加え0℃で
5分間放置し、溶液III (3M酢酸ナトリウム(pH
4.8)を7.5ml加え0℃で30分間放置した。こ
れを遠心し、その上澄みに50mlのエタノールを加
え、さらに遠心し上清を取り除き5mlの溶液IV(10
mM酢酸ナトリウム、50mMTris・HCl(pH
8.0)とリボヌクレアーゼA溶液(10mg/ml)
を2.5μl加え室温で20分間放置した。これに12
mlのエタノールを加え遠心後乾燥し滅菌水で溶解し
た。
形質転換体のニトリラーゼ活性 ロドコッカス ロドクロウス ATCC 12674株
の対数増殖期の細胞を遠心分離により集菌し、氷冷した
滅菌水にて3回洗浄し、滅菌水に懸濁した。工程(4) の
プラスミドpSK1041μlと菌体懸濁液10μlを
混合し、氷冷した。チャンバーにDNAと菌体の混合液
を入れ、遺伝子導入装置CET−200型(日本分光)
により電場強度3.8kV/cm、パルス幅1ms、パ
ルス回数20回で電気パルス処理を行った。電気パルス
処理液を氷冷下10分間静置し、37℃で10分間ヒー
トショックを行い、MYK培地(0.5%ポリペプト
ン、0.3%バクトモルトエキス、0.3%バクトイー
ストエキス、0.2%KH2PO4 、0.2%K2 HP
O4 (pH7.0))500μlを加え、26℃、3時
間振盪培養した後、75μg/mlカナマイシン入りM
YK寒天培地に塗布し26℃、3日間培養した。こうし
て作製したロドコッカス属細菌組換え体をMYK培地
(50μg/mlカナマイシン含有)10mlに接種し、3
0℃で24時間前培養した。この培養物1mlをGGP
培地(1.5%グルコース、0.1%バクトイーストエ
キス、1.0%グルタミン酸ナトリウム、0.05%K
H2 PO4 、0.05%K2 HPO4 、0.05%Mg
SO4 ・7H2 O(pH7.2))100ml(75μ
g/mlカナマイシン含有)に加え、誘導物質としてエチレ
ンシアンヒドリン(ECH)1.5%を添加し、30℃
で48時間培養した。集菌後、この菌体を50mMリン
酸緩衝液(pH7.7)に懸濁し、その一部を100m
Mアクリロニトリルを含有する同緩衝液中で30℃、2
0分反応させた。1N塩酸の添加により反応を止め、反
応液中の生成アクリル酸を高速液体クロマトグラフィー
を用いて測定した。その結果、ロドコッカス属細菌組換
え体ATCC 12674/pSK104において、8
mMのアクリル酸生成が認められた。このことにより、
ニトリラーゼ発現に必要な調節因子をコードする遺伝子
がニトリラーゼ構造遺伝子の上流あるいは下流域に存在
することが明かになった。
まだ多く残っていると考えられたため、様々な欠失プラ
スミドを作製しニトリラーゼ活性を測定した。(表1、
図1)
08(6.2kb HindIII-EcoRV断片)(図2)におい
て高いニトリラーゼ活性が認められた。さらに、欠失プ
ラスミドを作製し位置を探索した結果、調節因子をコー
ドする遺伝子はニトリラーゼ構造遺伝子のかなり上流域
(約3kb BamHI-EcoRV断片)内に存在することがわか
った。
調節因子をコードする遺伝子の塩基配列をファルマシア
社蛍光シーケンサーALFI I を用いて決定した。その
結果、配列番号5に示される塩基配列が得られ、配列番
号1および2に示されるアミノ酸配列を持つ2つのオー
プンリーディングフレームが見い出された。アミノ酸配
列データーベースNBRF(National Biomedical Rese
arch Fo-undation)との比較より調節因子は二成分系調
節系のファミリーに属することが推定された。また、こ
れらのオープンリーディングフレームの塩基配列を配列
番号3および4に示した。
行い、染色体DNA標品を得た。
リーの作製 基質DNA10μl(1/20希釈)、10倍濃度の反
応緩衝液10μl、5mMdNTP4μl、プライマー
#1として、5’-AACTGCTGGGA(AG)CACTTCCA-3’(2
0ヌクレオチド、対応するアミノ酸配列NCWEHF
Q)、プライマー#2として、5’-GA(AG)TA(AG)TG(A
G)CC(CG)AC(ACTG)GG(AG)TC-3’(20ヌクレオチド、
対応するアミノ酸配列DPVGHYS)各5μl(50
0pmol濃度相当)、TthDNAポリメラーゼ(東
洋紡績株式会社)1μlを加えて100μlとした。プ
ライマーはいずれもすでに公知されている各種ニトリラ
ーゼのホモロジーの高いアミノ酸配列をもとに作成し
た。反応は93℃、30秒間(変性ステップ)、45
℃、30秒間(アニーリングステップ)、72℃、2分
間(伸長ステップ)のインキュベーションを50サイク
ル行い反応を終了した。得られた反応液からSK92株
ニトリラーゼ遺伝子をコードする410bpDNA断片
を得た。こうして得られたDNA断片をDIG DNA Labeli
ng Kit(ベーリンガー・マンハイム株式会社)を用いて
標識し、プローブとした。SK92株染色体DNA50
μlに10倍濃度制限酵素緩衝液10μl、滅菌水37
μl、制限酵素SalI3μlを加え37℃にて2時間
反応させた後、エタノール沈澱を行い、アガロース電気
泳動を行い分離した。そして、1.1kb付近のDNA
断片をDNAPREP(株式会社ダイアヤトロン)を用
いて回収した。このDNA断片をライゲーションキット
(宝酒造株式会社)を用いて大腸菌ベクターpUC11
8のSalI部位に挿入し、組換え体DNAライブラリ
ーを作製した。ライゲーションに用いたpUC118断
片は次のように作製した。pUC11810μlに対し
10倍濃度制限酵素緩衝液10μl、滅菌水77μl、
制限酵素SalI2μlを加え37℃で2時間反応後、
フェノール処理、エタノール沈澱させた後乾燥して50
μlの滅菌水に溶解した。さらに、アルカリフォスタフ
ァーゼ(宝酒造株式会社)1μl、10倍濃度緩衝液1
0μl、滅菌水39μlを加え65℃で反応後フェノー
ル処理、エタノール沈澱を行い乾燥して滅菌水に溶解し
た。
の選別 実施例工程(3) 同様、大腸菌JM109株のコンピテン
トセルを作製した。このコンピテントセル200μlに
工程(2) で作製した組換え体プラスミドを含有する溶液
(DNAライブラリー)を10μl加え、0℃で30分
放置後、42℃で30秒間ヒートショックを与え0℃で
2分間冷却後、SOC培地を0.8ml加え37℃にて
60分間振盪培養した。これを200μlずつアンピシ
リン100μg/ml含有のLB寒天培地にまき、37
℃で培養した。寒天培地上に生育した形質転換体コロニ
ーについてコロニーハイブリダイゼーション法にてニト
リラーゼ遺伝子を持つ形質転換体を選別した。すなわ
ち、寒天培地上に生育した形質転換体をナイロンメンブ
レン(バイオダインA:ポール社)上に移し、菌体を溶
かしてDNAを固定した後、これを工程(2) で作製した
プローブ(410bp断片)で処理し、DIG Luminescen
t Detection Kit (ベーリンガー・マンハイム株式会
社)を用い、目的の組換え体DNAを含むコロニーを選
択した。
地図の作製 工程(3) で選択した形質転換体を実施例工程(4) 同様、
調製を行った。こうして得られた組換え体プラスミドp
SK002を数種の制限酵素を用いて切断し制限酵素地
図を作製した。
生産とニトリル類の酸類への変換 JM109/pSK002株を2×YT培地(1.6%
バクトトリプトン、1.0%バクトイーストエキス、
0.5%NaCl)(50μg/mlアンピシリン含有)1
mlに接種し37℃で8時間前培養し、この培養物1m
lを2×YT培地100ml(50μg/mlアンピシリ
ン、1mMIPTG含有)に加え、37℃で14時間培
養した。集菌後、この菌体を50mMリン酸緩衝液(p
H7.7)に懸濁し、その一部を100mMアクリロニ
トリルを含有する同緩衝液中で30℃、20分間反応さ
せた。1N塩酸の添加により反応を止め、反応液中の生
成アクリル酸を高速液体クロマトグラフィーを用いて測
定した。なお、対照試験としJM109株のみを用いて
行った。その結果、宿主JM109株ではアクリル酸が
検出されなかったが、形質転換体JM109/pSK0
02では18mMのアクリル酸生成が認められた。
の複合プラスミドベクターへの挿入 工程(4) で得られたSK92株ニトリラーゼ遺伝子およ
び、そのプロモーターと考えられる領域を含むDNA断
片(5.8kb BglII-HindIII断片)を染色体DNAよ
り切り出し、複合プラスミドベクターpK4に挿入しプ
ラスミドpSK120を作製した。
形質転換体のニトリラーゼ活性 ロドコッカス ロドクロウス ATCC 12674株
の対数増殖期の細胞を遠心分離により集菌し、氷冷した
滅菌水にて3回洗浄し、滅菌水に懸濁した。工程(6) の
プラスミドpSK1201μlと菌体懸濁液10μlを
混合し、氷冷した。チャンバーにDNAと菌体の混合液
を入れ、遺伝子導入装置CET−200型(日本分光)
により電場強度3.8kV/cm、パルス幅1ms、パ
ルス回数20回で電気パルス処理を行った。電気パルス
処理液を氷冷下10分間静置し、37℃で、10分間ヒ
ートショックを行い、MYK培地500μlを加え、2
6℃、3時間振盪した。75μg/mlカナマイシン入
りMYK寒天培地に塗布し26℃、3日間培養した。こ
うして作製したロドコッカス属細菌組換え体をMYK培
地(50μg/mlカナマイシン含有)10mlに接種し3
0℃で24時間前培養し、この培養物1mlをGGP培
地100ml(75μg/mlカナマイシン含有)に加え、
誘導物質としてECH1.5%を添加し、30℃で48
時間培養した。集菌後、この菌体を50mMリン酸緩衝
液(pH7.7)に懸濁し、工程(5) に記したようにニ
トリラーゼ活性を調べたところ、活性は認められなかっ
た。
ー領域を含むニトリラーゼ遺伝子とロドコッカス属菌体
内に共存させることにより、ニトリラーゼの生産が可能
となる。
erythropolis) 株名:SK92 配列: 15 MetAlaGlyAlaAspValHisAlaGlnGlyGlyThrAsnArgArg 30 AlaArgIleLeuValValAspAspGluLysHisValArgThrMet 45 ValThrTrpGlnLeuGluSerGluAsnPheAspValValAlaAla 60 AlaAspGlyAspAlaAlaLeuArgGlnValThrGluSerAlaPro 75 AspLeuMetValLeuAspLeuSerLeuProGlyLysGlyGlyLeu 90 GluValLeuAlaThrValArgArgThrAspAlaLeuProIleVal 105 ValLeuThrAlaArgArgAspGluThrGluArgIleValAlaLeu 120 AspLeuGlyAlaAspAspTyrValIleLysProPheSerProArg 135 GluLeuAlaAlaArgIleArgAlaValLeuArgArgThrThrAla 150 GluProProHisGluAlaAlaValGlnArgPheGlyAspLeuGlu 165 IleAspThrAlaAlaArgGluValArgLeuHisGlyIleProLeu 180 GluPheThrThrLysGluPheAspLeuLeuAlaTyrMetAlaAla 195 SerProMetGlnValPheSerArgArgArgLeuLeuLeuGluVal 210 TrpArgSerSerProAspTrpGlnGlnAspAlaThrValThrGlu 225 HisValHisArgIleArgArgLysIleGluGluAspProThrLys 240 ProThrIleLeuGlnThrValArgGlyAlaGlyTyrArgPheAsp 244 GlyGluArgAla
erythropolis) 株名:SK92 配列: 15 MetMetThrAspThrLeuProSerSerSerArgTrpThrLeuGlu 30 GlyProHisLeuGlnProLeuGlnGlyGluAlaLeuAlaAspLeu 45 HisAlaArgThrLeuGluMetIleThrSerGlyArgGluLeuHis 60 GluThrLeuGluValValAlaArgGlyIleGluGluLeuMetPro 75 GlyLysArgCysAlaIleLeuLeuLeuAspAsnThrGlyProVal 90 LeuArgCysGlyAlaAlaProThrMetSerAlaProTrpArgArg 105 TrpIleAspSerLeuValProGlyProMetSerGlyGlyCysGly 120 ThrAlaValHisLeuGlyGluProValIleSerTyrAspValAla 135 AspAspProLysPheArgGlyProPheArgAlaAlaAlaLeuHis 150 GluGlyIleArgAlaCysTrpSerThrProValThrSerGlyAsp 165 GlyThrIleLeuGlyThrPheAlaIleTyrGlySerValProAla 180 PheProAlaGlnGlnAspValAlaLeuValThrGlnCysThrAsp 195 LeuThrAlaAlaValIleThrThrHisLysLeuHisGlnAspLeu 210 SerMetSerGluGluArgPheArgArgAlaPheAspSerAsnVal 225 ValGlyMetAlaLeuLeuAspGluSerGlySerSerIleArgVal 240 AsnAspThrLeuCysAlaLeuThrAlaAlaProProArgArgLeu 255 LeuGlyHisProMetGlnGluIleLeuThrAlaAspSerArgGlu 270 ProPheAlaAsnGlnLeuSerSerIleArgGluGlyLeuThrAsp 285 GlyGlyGlnLeuAspGlyArgIleGlnThrThrGlyGlyArgTrp 300 IleProValHisLeuSerIleSerGlyMetTrpThrThrGluArg 315 GluPheMetGlyPheSerValHisValLeuAspIleSerGluArg 330 LeuAlaAlaGluArgAlaArgGluGluGlnLeuGluAlaGluVal 345 AlaArgHisThrAlaGluGluAlaSerArgAlaLysSerThrPhe 360 LeuSerGlyMetThrHisGluValGlnThrProMetAlaValIle 375 ValGlyPheSerGluLeuLeuGluThrLeuAspLeuAspGluGlu 390 ArgArgGlnCysAlaTyrArgLysIleGlyGluAlaAlaLysHis 405 ValIleSerLeuValAspAspValLeuAspIleAlaLysIleGlu 420 AlaGlyAlaIleThrLeuGlnAspGluAspIleAspLeuSerGlu 435 GluValAlaThrIleValGluMetLeuGluProIleAlaArgAsp 450 ArgAspArgAspValCysLeuArgTyrValProProGlnThrPro 465 ValHisValCysSerAspArgArgArgValArgGluValLeuLeu 480 AsnIleValSerAsnGlyIleLysTyrAsnArgLeuGlyGlyVal 495 ValAspProProThrGlySerGlyAlaAlaArgProArgGlnThr 510 ArgAlaProAspTyrProAlaThrProThrThrAsnSerSerSer 525 ProSerThrGlyTrpGluSerArgProArgGlyCysLysGlyArg 534 GlySerValLeuArgSerProAlaArg
erythropolis) 株名:SK92 配列: ATG GCC GGA GCG GAC GTC CAC GCC CAG GGT GGC ACG AAT CGA CGT 45 GCA CGC ATC CTC GTC GTC GAC GAC GAA AAA CAC GTG CGC ACG ATG 90 GTG ACG TGG CAA CTC GAA TCG GAG AAT TTC GAT GTT GTC GCT GCG 135 GCA GAC GGA GAT GCG GCA CTG CGT CAG GTC ACT GAG AGC GCA CCC 180 GAT TTG ATG GTG CTC GAT CTG TCG CTC CCG GGG AAA GGT GGG TTG 225 GAA GTG CTC GCT ACG GTC CGC AGA ACC GAT GCA CTG CCT ATC GTC 270 GTG CTC ACA GCA CGC CGC GAT GAA ACC GAA CGG ATC GTC GCG CTG 315 GAT CTC GGC GCC GAT GAC TAC GTC ATC AAA CCG TTC TCC CCG CGG 360 GAA TTG GCC GCC CGT ATC CGG GCA GTG CTT CGT CGA ACC ACA GCT 405 GAA CCC CCA CAC GAG GCG GCG GTT CAG CGA TTC GGT GAC CTA GAG 450 ATC GAC ACC GCT GCG CGC GAG GTT CGG CTC CAC GGG ATA CCG CTC 495 GAG TTC ACC ACC AAG GAG TTC GAT CTG CTG GCC TAT ATG GCC GCA 540 TCA CCG ATG CAG GTC TTC AGC CGA CGC AGA TTG TTG CTC GAG GTG 585 TGG CGA TCG TCG CCC GAC TGG CAG CAG GAC GCC ACC GTG ACC GAG 630 CAC GTG CAC CGC ATT CGC CGC AAG ATC GAA GAA GAT CCC ACC AAA 675 CCG ACG ATC CTG CAG ACA GTG CGG GGA GCC GGT TAC CGT TTC GAC 720 GGA GAG CGT GCA TGA 735
erythropolis) 株名:SK92 配列: ATG ATG ACC GAC ACA CTG CCC TCC TCG TCC CGT TGG ACC CTT GAA 45 GGC CCG CAT CTC CAG CCG CTG CAG GGT GAG GCC CTG GCG GAT CTC 90 CAC GCC CGT ACG CTC GAG ATG ATC ACT TCC GGG AGA GAA TTG CAC 135 GAG ACA CTC GAG GTG GTC GCC CGC GGC ATC GAG GAA CTG ATG CCG 180 GGC AAA CGT TGC GCA ATT CTG TTG CTC GAC AAC ACC GGA CCG GTA 225 TTG CGC TGC GGC GCG GCC CCA ACA ATG AGC GCG CCG TGG CGC CGG 270 TGG ATC GAC AGC CTC GTC CCT GGT CCG ATG TCG GGT GGC TGC GGC 315 ACA GCG GTT CAC CTC GGC GAG CCG GTT ATT TCC TAT GAC GTG GCC 360 GAT GAC CCG AAA TTC CGC GGC CCC TTC CGC GCC GCA GCC CTC CAC 405 GAG GGC ATA CGT GCC TGC TGG TCC ACC CCC GTC ACA AGC GGA GAC 450 GGC ACG ATC CTC GGC ACT TTC GCG ATC TAC GGA TCC GTG CCG GCG 495 TTC CCC GCA CAA CAG GAC GTT GCC CTG GTC ACC CAA TGC ACC GAC 540 CTG ACC GCT GCC GTC ATC ACC ACC CAC AAA CTT CAT CAA GAT CTG 585 AGC ATG AGC GAG GAG CGG TTC CGA CGC GCC TTC GAT TCC AAT GTC 630 GTC GGC ATG GCA CTT CTC GAC GAA TCC GGC TCC AGC ATC CGC GTC 675 AAC GAC ACC CTG TGC GCG TTG ACC GCA GCT CCG CCA CGG CGC CTC 720 CTC GGC CAC CCC ATG CAG GAG ATA CTC ACC GCC GAC TCC CGG GAA 765 CCG TTC GCC AAT CAG TTG TCC TCC ATC CGT GAG GGA TTG ACC GAC 810 GGC GGA CAG CTC GAC GGA CGA ATC CAA ACC ACC GGA GGT CGG TGG 855 ATT CCG GTG CAC CTG TCC ATC AGC GGT ATG TGG ACC ACG GAG CGG 900 GAG TTC ATG GGA TTC AGC GTC CAT GTC CTG GAC ATC TCC GAG CGC 945 CTG GCC GCC GAA CGC GCC CGC GAG GAA CAA CTC GAG GCC GAG GTT 990 GCC CGC CAT ACC GCG GAG GAA GCC AGT CGC GCC AAG TCC ACG TTC 1035 CTG TCC GGC ATG ACG CAC GAG GTC CAA ACG CCC ATG GCC GTT ATC 1080 GTC GGA TTC AGT GAG CTA CTC GAG ACG CTG GAC CTG GAT GAA GAA 1125 CGT CGT CAG TGC GCC TAC CGC AAG ATC GGC GAA GCC GCG AAA CAC 1170 GTG ATC TCC CTG GTC GAC GAC GTT CTC GAT ATA GCC AAG ATC GAA 1215 GCC GGC GCT ATC ACT CTG CAG GAC GAA GAC ATC GAC CTG TCC GAA 1260 GAA GTT GCC ACC ATC GTG GAG ATG CTC GAG CCC ATC GCC CGT GAC 1305 CGT GAC CGT GAC GTC TGC CTG CGG TAC GTC CCG CCG CAG ACA CCG 1350 GTG CAC GTG TGC TCG GAC CGG CGG CGG GTG CGG GAA GTG CTG CTC 1395 AAC ATC GTC TCC AAC GGG ATC AAG TAC AAT CGG CTC GGT GGT GTC 1440 GTC GAC CCC CCA ACA GGA TCA GGG GCT GCT CGT CCG CGT CAG ACG 1485 AGG GCC CCG GAC TAC CCA GCG ACG CCG ACG ACG AAC TCT TCG AGC 1530 CCT TCA ACC GGC TGG GAG TCG AGG CCA CGG GGG TGC AAG GGT CGG 1575 GGC TCG GTC TTG CGC TCT CCC GCG CGC TGA 1605
erythropolis) 株名:SK92 配列: ATGGCCGGAG CGGACGTCCA CGCCCAGGGT GGCACGAATC GACGTGCACG 50 CATCCTCGTC GTCGACGACG AAAAACACGT GCGCACGATG GTGACGTGGC 100 AACTCGAATC GGAGAATTTC GATGTTGTCG CTGCGGCAGA CGGAGATGCG 150 GCACTGCGTC AGGTCACTGA GAGCGCACCC GATTTGATGG TGCTCGATCT 200 GTCGCTCCCG GGGAAAGGTG GGTTGGAAGT GCTCGCTACG GTCCGCAGAA 250 CCGATGCACT GCCTATCGTC GTGCTCACAG CACGCCGCGA TGAAACCGAA 300 CGGATCGTCG CGCTGGATCT CGGCGCCGAT GACTACGTCA TCAAACCGTT 350 CTCCCCGCGG GAATTGGCCG CCCGTATCCG GGCAGTGCTT CGTCGAACCA 400 CAGCTGAACC CCCACACGAG GCGGCGGTTC AGCGATTCGG TGACCTAGAG 450 ATCGACACCG CTGCGCGCGA GGTTCGGCTC CACGGGATAC CGCTCGAGTT 500 CACCACCAAG GAGTTCGATC TGCTGGCCTA TATGGCCGCA TCACCGATGC 550 AGGTCTTCAG CCGACGCAGA TTGTTGCTCG AGGTGTGGCG ATCGTCGCCC 600 GACTGGCAGC AGGACGCCAC CGTGACCGAG CACGTGCACC GCATTCGCCG 650 CAAGATCGAA GAAGATCCCA CCAAACCGAC GATCCTGCAG ACAGTGCGGG 700 GAGCCGGTTA CCGTTTCGAC GGAGAGCGTG CATGATGACC GACACACTGC 750 CCTCCTCGTC CCGTTGGACC CTTGAAGGCC CGCATCTCCA GCCGCTGCAG 800 GGTGAGGCCC TGGCGGATCT CCACGCCCGT ACGCTCGAGA TGATCACTTC 850 CGGGAGAGAA TTGCACGAGA CACTCGAGGT GGTCGCCCGC GGCATCGAGG 900 AACTGATGCC GGGCAAACGT TGCGCAATTC TGTTGCTCGA CAACACCGGA 950 CCGGTATTGC GCTGCGGCGC GGCCCCAACA ATGAGCGCGC CGTGGCGCCG 1000 GTGGATCGAC AGCCTCGTCC CTGGTCCGAT GTCGGGTGGC TGCGGCACAG 1050 CGGTTCACCT CGGCGAGCCG GTTATTTCCT ATGACGTGGC CGATGACCCG 1100 AAATTCCGCG GCCCCTTCCG CGCCGCAGCC CTCCACGAGG GCATACGTGC 1150 CTGCTGGTCC ACCCCCGTCA CAAGCGGAGA CGGCACGATC CTCGGCACTT 1200 TCGCGATCTA CGGATCCGTG CCGGCGTTCC CCGCACAACA GGACGTTGCC 1250 CTGGTCACCC AATGCACCGA CCTGACCGCT GCCGTCATCA CCACCCACAA 1300 ACTTCATCAA GATCTGAGCA TGAGCGAGGA GCGGTTCCGA CGCGCCTTCG 1350 ATTCCAATGT CGTCGGCATG GCACTTCTCG ACGAATCCGG CTCCAGCATC 1400 CGCGTCAACG ACACCCTGTG CGCGTTGACC GCAGCTCCGC CACGGCGCCT 1450 CCTCGGCCAC CCCATGCAGG AGATACTCAC CGCCGACTCC CGGGAACCGT 1500 TCGCCAATCA GTTGTCCTCC ATCCGTGAGG GATTGACCGA CGGCGGACAG 1550 CTCGACGGAC GAATCCAAAC CACCGGAGGT CGGTGGATTC CGGTGCACCT 1600 GTCCATCAGC GGTATGTGGA CCACGGAGCG GGAGTTCATG GGATTCAGCG 1650 TCCATGTCCT GGACATCTCC GAGCGCCTGG CCGCCGAACG CGCCCGCGAG 1700 GAACAACTCG AGGCCGAGGT TGCCCGCCAT ACCGCGGAGG AAGCCAGTCG 1750 CGCCAAGTCC ACGTTCCTGT CCGGCATGAC GCACGAGGTC CAAACGCCCA 1800 TGGCCGTTAT CGTCGGATTC AGTGAGCTAC TCGAGACGCT GGACCTGGAT 1850 GAAGAACGTC GTCAGTGCGC CTACCGCAAG ATCGGCGAAG CCGCGAAACA 1900 CGTGATCTCC CTGGTCGACG ACGTTCTCGA TATAGCCAAG ATCGAAGCCG 1950 GCGCTATCAC TCTGCAGGAC GAAGACATCG ACCTGTCCGA AGAAGTTGCC 2000 ACCATCGTGG AGATGCTCGA GCCCATCGCC CGTGACCGTG ACCGTGACGT 2050 CTGCCTGCGG TACGTCCCGC CGCAGACACC GGTGCACGTG TGCTCGGACC 2100 GGCGGCGGGT GCGGGAAGTG CTGCTCAACA TCGTCTCCAA CGGGATCAAG 2150 TACAATCGGC TCGGTGGTGT CGTCGACCCC CCAACAGGAT CAGGGGCTGC 2200 TCGTCCGCGT CAGACGAGGG CCCCGGACTA CCCAGCGACG CCGACGACGA 2250 ACTCTTCGAG CCCTTCAACC GGCTGGGAGT CGAGGCCACG GGGGTGCAAG 2300 GGTCGGGGCT CGGTCTTGCG CTCTCCCGCG CGCTGA 2336
上における矢印は、本発明において見いだされた調節因
子をコードする遺伝子およびニトリラーゼ遺伝子の位置
と方向を示した。
図
Claims (6)
- 【請求項1】 ニトリラーゼ遺伝子プロモーターを活性
化する作用を有し、配列番号1のアミノ酸配列を有する
ポリペプチドおよび配列番号2のアミノ酸配列を有する
ポリペプチドの2成分より構成される調節因子およびそ
れらをコードする遺伝子DNA。 - 【請求項2】 ポリペプチドをコードする遺伝子が配列
番号3および配列番号4の塩基配列を有する請求項1記
載の調節因子および遺伝子DNA。 - 【請求項3】 ニトリル類の存在により、ニトリラーゼ
遺伝子プロモーターを活性化する作用が増強される請求
項1または請求項2記載の調節因子および遺伝子DN
A。 - 【請求項4】 請求項1、2または3記載の調節因子を
コードするDNA、プロモーター領域を含むニトリラー
ゼ遺伝子およびロドコッカス属に属する細菌細胞内で複
製増殖可能なDNA領域を含む組換え体プラスミド。 - 【請求項5】 ロドコッカス属に属する細菌細胞内で増
殖可能なDNA領域がプラスミドpRC001、pRC
002、pRC003またはpRC004から選ばれた
ものであることを特徴とする請求項4記載の組換え体プ
ラスミド。 - 【請求項6】 請求項4または5記載の組換え体プラス
ミドにより形質転換されたロドコッカス属に属する微生
物。
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