JPH0616709B2 - セロビオヒドロラーゼiをコードする遺伝子 - Google Patents
セロビオヒドロラーゼiをコードする遺伝子Info
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- JPH0616709B2 JPH0616709B2 JP59180893A JP18089384A JPH0616709B2 JP H0616709 B2 JPH0616709 B2 JP H0616709B2 JP 59180893 A JP59180893 A JP 59180893A JP 18089384 A JP18089384 A JP 18089384A JP H0616709 B2 JPH0616709 B2 JP H0616709B2
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Description
【発明の詳細な説明】 (産業上の利用分野) この発明はセルロースの分解及び変性に関し、特にこの
ために有用な酵素に関する。さらに詳しくは、この発明
は、セロビオヒドロラーゼIをコードする遺伝子、並び
にそれを含有する発現ベクター及び宿主に関する。
ために有用な酵素に関する。さらに詳しくは、この発明
は、セロビオヒドロラーゼIをコードする遺伝子、並び
にそれを含有する発現ベクター及び宿主に関する。
(従来の技術) 世界の最も豊富な再生産可能な資源は、木材料及び草材
料の主要な構造成分であるセルロース、すなわちグルコ
ースの重合体である。このため、セルロースは、いわゆ
る廃棄物、例えば都市固形廃棄物、使用済紙製品、及び
農作物の副産物の大きな部分を成す。食料として直接使
用するために、又はエタノールのごとき有用な他の物質
の出発材料として使用するために、これらの廃棄物から
グルコースを得ることは有利であろう。セルロース出発
材料をグルコース最終生成物に転換するために、限られ
た技法が使用可能である。酸加水分解のごとき種々の非
酵素的方法が試みられているが、これらの方法は商業的
に競争できるだけの十分な特異性と生成物の純度に欠け
ている。
料の主要な構造成分であるセルロース、すなわちグルコ
ースの重合体である。このため、セルロースは、いわゆ
る廃棄物、例えば都市固形廃棄物、使用済紙製品、及び
農作物の副産物の大きな部分を成す。食料として直接使
用するために、又はエタノールのごとき有用な他の物質
の出発材料として使用するために、これらの廃棄物から
グルコースを得ることは有利であろう。セルロース出発
材料をグルコース最終生成物に転換するために、限られ
た技法が使用可能である。酸加水分解のごとき種々の非
酵素的方法が試みられているが、これらの方法は商業的
に競争できるだけの十分な特異性と生成物の純度に欠け
ている。
他の重要な方法は、天然由来のセルロース分解性酵素の
使用、又はこれらの酵素を有する微生物の直接的使用で
ある。利用し得る酵素活性レベルが容易に操作できない
因子によって制御されるため、これらの方法もまた経済
的欠点を有していた。
使用、又はこれらの酵素を有する微生物の直接的使用で
ある。利用し得る酵素活性レベルが容易に操作できない
因子によって制御されるため、これらの方法もまた経済
的欠点を有していた。
従って、セルロース生産性微生物の改良された菌株を開
発し、そして組換型のセルラーゼ遺伝子を、炭素源とし
てセルロースを利用することができない微生物に導入す
ることに興味が持たれる。特に、セルロース分解酵素遺
伝子を発酵微生物、例えばセルロースを加水分解してグ
ルコースのごとき基質を利用する能力を有しないが、卓
越した増殖及び生産性を有する発酵酵母に導入すること
が経済的に望ましいであろう。
発し、そして組換型のセルラーゼ遺伝子を、炭素源とし
てセルロースを利用することができない微生物に導入す
ることに興味が持たれる。特に、セルロース分解酵素遺
伝子を発酵微生物、例えばセルロースを加水分解してグ
ルコースのごとき基質を利用する能力を有しないが、卓
越した増殖及び生産性を有する発酵酵母に導入すること
が経済的に望ましいであろう。
典型的なセルラーゼ系は、セルロースの分解において協
働的に作用する3種類の主要なタイプの酵素を含む〔Gr
itzal,M.等,セルロースの加水分解:酵素的及び酸触媒
の機構(Hydrolysis of Cellulose:Mech.of Enzymatic
and Acid Catalysis),Brown,R.D.等編(1979),Am.C
hem.Soc.,ワシントンD.C.,237頁;Mandels M.等,プロ
セス・ビオケミストリー(Process Biochem.)(1978年
5月,7頁)〕。これらの酵素タイプはセロビオヒドォ
ラーゼ、エンドグルカナーゼ、及びβ−グルコシダーゼ
である。
働的に作用する3種類の主要なタイプの酵素を含む〔Gr
itzal,M.等,セルロースの加水分解:酵素的及び酸触媒
の機構(Hydrolysis of Cellulose:Mech.of Enzymatic
and Acid Catalysis),Brown,R.D.等編(1979),Am.C
hem.Soc.,ワシントンD.C.,237頁;Mandels M.等,プロ
セス・ビオケミストリー(Process Biochem.)(1978年
5月,7頁)〕。これらの酵素タイプはセロビオヒドォ
ラーゼ、エンドグルカナーゼ、及びβ−グルコシダーゼ
である。
セロビオヒドロラーゼ(CBH)はセルロース重合体の非
還元末端からセルロースを攻撃し、そして主生成物とし
てセロビオース(グルコースの二量体))を生成せしめ
る。2つのタイプのCBH酵素、すなわち、セロビオース
のみを生成せしめるセロビオヒドロラーゼ−I(CBH
I)、及びセロビオースとグルコースとの混合物を生成
せしるセロビオヒドロラーゼ−II(CBHII)が知られて
いる。CBH酵素はセルロース分解性非糸状細菌(nonfila
mentous bacteria)中には見出されておらず、従って菌
類(fungi)及び糸状細菌(filamentous bacheria)に
限られているようである。これらは高い基質特異性を有
し、そして高い基質親和性を有する。(誘導体にされた
形のセルロースはCBHによって広範囲には切断されな
い。) エンドグルカナーゼ(EG)はセルロース鎖中の内部グル
コシド結合を加水分解する。これらは菌類及び細菌に見
出され、そしてCBH酵素より広い基質特異性を有する。
これらは半無作為的にβ−グルコシド結合を攻撃し、そ
して誘導体にされたセルロース(例えば、カルボキシメ
チルセルロース)を基質として利用し、そして1,3−
β,D−結合及び1,6−β,D−結合を1,4−β,
D−結合と同様に加水分解するであろう。細菌及び菌類
から得られた若干の公知の形のEG酵素が存在する。エ
ンドグルカナーゼ−I(EGI)は菌類トリコデルマ・リ
ーゼイ(Trichoderma reesei)において比較的高レベル
(細胞外蛋白質の5〜10%)で生産され、この菌類に
おける第2のEG活性を有するエンドグルカナーゼ−II
(EGII)は線状1,4−β,D−マンナンを攻撃して主
としてマンノビオースを生成せしることが示されてい
る。
還元末端からセルロースを攻撃し、そして主生成物とし
てセロビオース(グルコースの二量体))を生成せしめ
る。2つのタイプのCBH酵素、すなわち、セロビオース
のみを生成せしめるセロビオヒドロラーゼ−I(CBH
I)、及びセロビオースとグルコースとの混合物を生成
せしるセロビオヒドロラーゼ−II(CBHII)が知られて
いる。CBH酵素はセルロース分解性非糸状細菌(nonfila
mentous bacteria)中には見出されておらず、従って菌
類(fungi)及び糸状細菌(filamentous bacheria)に
限られているようである。これらは高い基質特異性を有
し、そして高い基質親和性を有する。(誘導体にされた
形のセルロースはCBHによって広範囲には切断されな
い。) エンドグルカナーゼ(EG)はセルロース鎖中の内部グル
コシド結合を加水分解する。これらは菌類及び細菌に見
出され、そしてCBH酵素より広い基質特異性を有する。
これらは半無作為的にβ−グルコシド結合を攻撃し、そ
して誘導体にされたセルロース(例えば、カルボキシメ
チルセルロース)を基質として利用し、そして1,3−
β,D−結合及び1,6−β,D−結合を1,4−β,
D−結合と同様に加水分解するであろう。細菌及び菌類
から得られた若干の公知の形のEG酵素が存在する。エ
ンドグルカナーゼ−I(EGI)は菌類トリコデルマ・リ
ーゼイ(Trichoderma reesei)において比較的高レベル
(細胞外蛋白質の5〜10%)で生産され、この菌類に
おける第2のEG活性を有するエンドグルカナーゼ−II
(EGII)は線状1,4−β,D−マンナンを攻撃して主
としてマンノビオースを生成せしることが示されてい
る。
β−グルコシダーゼは、CBHと同様に、グリコシドの非
還元末端を攻撃するが、可溶化されたセロ−オリゴサッ
カライド(鎖長6未満)にのみ作用してグルコース単位
を生成せしめる。従って、β−グルコシダーゼはCBH及
びEGのセロビオース生成物をグルコースに分解する。
全セルラーゼ系におけるβ−グルコシダーゼの存在は、
この酵素が最終生成物を供するためのみならず、ある種
のCBH及びEGはセロビオースによって阻害されるため
に、有意義である。従って、この生成物を涸渇させるた
めに追加の酵素を供することは、セルロースからグルコ
ースへの転換を助長する。
還元末端を攻撃するが、可溶化されたセロ−オリゴサッ
カライド(鎖長6未満)にのみ作用してグルコース単位
を生成せしめる。従って、β−グルコシダーゼはCBH及
びEGのセロビオース生成物をグルコースに分解する。
全セルラーゼ系におけるβ−グルコシダーゼの存在は、
この酵素が最終生成物を供するためのみならず、ある種
のCBH及びEGはセロビオースによって阻害されるため
に、有意義である。従って、この生成物を涸渇させるた
めに追加の酵素を供することは、セルロースからグルコ
ースへの転換を助長する。
セルラーゼ系構成成分の上記の明確な反応特異性は、セ
ルロース性材料の制限された、そして限定された加水分
解を達成するために、複数の酵素を個別的に、又は選択
された組合わせにおいて使用することができることを示
唆している。限定された加水分解の目的は、セルロース
性材料の構造及び/又は機能的特性を所望のように変化
せしめることである。構造的変化の例には、鎖長、粘度
及びセルロース結合に影響を与える変化が含まれる。機
能的変化の例には、手ざわり、香り、及び材料に結合す
る水に影響を与える変化が含まれる。さらに、エンドグ
ルカナーゼは、その広い基質特異性の故に、他のβ−結
合重合体に作用する。この1つの例は、キシランに対す
るEGIの作用である。この発明を援護して行われた実験
において、EGIIはβ−マンナンを転換して主としてマ
ンノビオースを生成せしめることが示された。このこと
はコーヒー工業において有意義である。なぜなら、β−
マンナンはコーヒー豆の外側を被覆する主たるポリサッ
カライドであり、そしてコーヒーの製造、特に凍結乾燥
コーヒーの製造において香味成分の抽出を妨害し、そし
て苦味を付与するからである。
ルロース性材料の制限された、そして限定された加水分
解を達成するために、複数の酵素を個別的に、又は選択
された組合わせにおいて使用することができることを示
唆している。限定された加水分解の目的は、セルロース
性材料の構造及び/又は機能的特性を所望のように変化
せしめることである。構造的変化の例には、鎖長、粘度
及びセルロース結合に影響を与える変化が含まれる。機
能的変化の例には、手ざわり、香り、及び材料に結合す
る水に影響を与える変化が含まれる。さらに、エンドグ
ルカナーゼは、その広い基質特異性の故に、他のβ−結
合重合体に作用する。この1つの例は、キシランに対す
るEGIの作用である。この発明を援護して行われた実験
において、EGIIはβ−マンナンを転換して主としてマ
ンノビオースを生成せしめることが示された。このこと
はコーヒー工業において有意義である。なぜなら、β−
マンナンはコーヒー豆の外側を被覆する主たるポリサッ
カライドであり、そしてコーヒーの製造、特に凍結乾燥
コーヒーの製造において香味成分の抽出を妨害し、そし
て苦味を付与するからである。
セルラーゼ系の酵素は広く研究されており、そして確か
に、コード配列のクローニング及び発現を行うための試
みが行われている。例えば、Whitte,D.J等,ジーン「Ge
ne」(1982)17:139;Cornet,P.等,FEBSミ
クロ.ビオレ.レターズ(FEBS Micro.Biol.Letters)
(1983)16:137;Tuse,D.等,ゼネティック
・テクノロ・ニュース(Genetic Technol.News)(19
81)11月,6頁;Abstract No. H19ASM Annual M
eeting,1981年3月;Symposium ASM Annual Meeti
ng,1983年3月;Wilson,D.B.等,ビオ/テクノロ
ジー(BioTechnology)(1983)1:594;Teer
i,T.等,ビオ/テクノロジー(Bio/Technology)(1
983)1:696;及びCollmer,A.等,ビオ/テクノ
ロジー(Bio/Technology)(1983)1:594−
601を参照のこと。
に、コード配列のクローニング及び発現を行うための試
みが行われている。例えば、Whitte,D.J等,ジーン「Ge
ne」(1982)17:139;Cornet,P.等,FEBSミ
クロ.ビオレ.レターズ(FEBS Micro.Biol.Letters)
(1983)16:137;Tuse,D.等,ゼネティック
・テクノロ・ニュース(Genetic Technol.News)(19
81)11月,6頁;Abstract No. H19ASM Annual M
eeting,1981年3月;Symposium ASM Annual Meeti
ng,1983年3月;Wilson,D.B.等,ビオ/テクノロ
ジー(BioTechnology)(1983)1:594;Teer
i,T.等,ビオ/テクノロジー(Bio/Technology)(1
983)1:696;及びCollmer,A.等,ビオ/テクノ
ロジー(Bio/Technology)(1983)1:594−
601を参照のこと。
先行する試みは、コード配列の入手源としてT.リーゼ
イを含む種々の細菌性及び菌類性入手源を用いている
が、分泌され、グリコシル化されており、そして生物学
的に活性な菌類性セルラーゼの酵母における発見を報告
したものはない。
イを含む種々の細菌性及び菌類性入手源を用いている
が、分泌され、グリコシル化されており、そして生物学
的に活性な菌類性セルラーゼの酵母における発見を報告
したものはない。
(発明の概要) セロビオヒドロラーゼIのコード配列が、この明細書に
開示する一般的方法により、中断されていない形で再構
成される。このような配列を適当な組換発現ベクターに
導入することによって、大量の又は増加した量のこれら
の酵素を、個別的に、又は組合わせて製造することがで
きる。これらの酵素の大量生産は、これらの酵素を溶解
された形で又は固定化された形で生体外において用いな
がら反応を行うことによてセルロースを加水分解するた
めにその活性を工業的に利用することを可能にする。こ
の方法に代えて、組換ベクターを適切な宿主生物に形質
転換し、この宿主生物を用いて所望の加水分解を行うこ
ともできる。生産された酵素は培地中に分泌されるのが
好ましい。
開示する一般的方法により、中断されていない形で再構
成される。このような配列を適当な組換発現ベクターに
導入することによって、大量の又は増加した量のこれら
の酵素を、個別的に、又は組合わせて製造することがで
きる。これらの酵素の大量生産は、これらの酵素を溶解
された形で又は固定化された形で生体外において用いな
がら反応を行うことによてセルロースを加水分解するた
めにその活性を工業的に利用することを可能にする。こ
の方法に代えて、組換ベクターを適切な宿主生物に形質
転換し、この宿主生物を用いて所望の加水分解を行うこ
ともできる。生産された酵素は培地中に分泌されるのが
好ましい。
この発明の1つの観点に従えば、適当な菌類入手源、例
えT.リ-ゼイからセルラーゼ遺伝子が分離され、そしてそ
の配列が決定される。これらの配列及びこれらがもたら
す情報を用いて、成熟酵素に限定してコードするイント
ロン不含コード配列、又は所望により天然宿主からの分
泌のために機能するリーダー配列とリーディングフレー
ムが整合する成熟コード配列を構成することが可能であ
る。コード配列は、酵母のごとき異宿主において外来配
列の遺伝子発現を可能にする新規な発現ベクター中に置
かれる。この発現ベクターにより形質転換された宿主
は、セルラーゼを成熟した、グリコシル化された、機能
的に活性な形で生産し、そして分泌することができる。
えT.リ-ゼイからセルラーゼ遺伝子が分離され、そしてそ
の配列が決定される。これらの配列及びこれらがもたら
す情報を用いて、成熟酵素に限定してコードするイント
ロン不含コード配列、又は所望により天然宿主からの分
泌のために機能するリーダー配列とリーディングフレー
ムが整合する成熟コード配列を構成することが可能であ
る。コード配列は、酵母のごとき異宿主において外来配
列の遺伝子発現を可能にする新規な発現ベクター中に置
かれる。この発現ベクターにより形質転換された宿主
は、セルラーゼを成熟した、グリコシル化された、機能
的に活性な形で生産し、そして分泌することができる。
この発明の他の特徴に従えば、宿主生物を形質転換する
ために使用される組換ベクターは、効率的なプロセシン
グのため及び酵母からのセルラーゼの分泌のために酵母
において機能することが示されるセルラーゼシグナル配
列を含有する。これらの配列はまた、酵母からの他の蛋
白質の分泌のために、好ましくはその天然宿主により通
常に分泌される蛋白質の分泌のためにも使用することが
できる。このような蛋白質の例にはアミラーゼ、プロテ
アーゼ、インターフェロン、リンポカイン、インシュリ
ン、及びホルモン類が含まれる。
ために使用される組換ベクターは、効率的なプロセシン
グのため及び酵母からのセルラーゼの分泌のために酵母
において機能することが示されるセルラーゼシグナル配
列を含有する。これらの配列はまた、酵母からの他の蛋
白質の分泌のために、好ましくはその天然宿主により通
常に分泌される蛋白質の分泌のためにも使用することが
できる。このような蛋白質の例にはアミラーゼ、プロテ
アーゼ、インターフェロン、リンポカイン、インシュリ
ン、及びホルモン類が含まれる。
この発明の他の観点においては、異る複数のセルラーゼ
酵素を所定の比率で生産する生物が、セルラーゼ酵素の
1又は複数を不活性化し又は変形して該酵素を所望の通
りに強化し、又は酵素の生産を防止するために操作され
る。例えば、CBHI酵素及びCBHII酵素の両者を生産する
菌類において、CBHII遺伝子を不活性化してCBHIセロビ
オヒドロラーゼのみを生産する生物を得ることができ
る。選択されたセルラーゼを不活性化する方法は、一般
に、この発明に従って構成された組換セルラーゼ遺伝子
を不活性化し(例えば大セグメントの欠失により)、そ
してこの不活性化された遺伝子によりセルラーゼ生産生
物を形質転換することが含まれる。不活性化された遺伝
子とゲノム遺伝子との間の組換は選択されたゲノム遺伝
子の不活性化をもたらす。糸状菌類(filamentous fung
ul organism)に適用されるこの方法の実施可能性は、Y
elton,M.M.等,プロシーディングス・オブ・ナショナル
・アカデミー・オブサイエンス,米国(Proc.Nat.Acad.
Sci.,USA),(1984)80:1470に示されてい
る。
酵素を所定の比率で生産する生物が、セルラーゼ酵素の
1又は複数を不活性化し又は変形して該酵素を所望の通
りに強化し、又は酵素の生産を防止するために操作され
る。例えば、CBHI酵素及びCBHII酵素の両者を生産する
菌類において、CBHII遺伝子を不活性化してCBHIセロビ
オヒドロラーゼのみを生産する生物を得ることができ
る。選択されたセルラーゼを不活性化する方法は、一般
に、この発明に従って構成された組換セルラーゼ遺伝子
を不活性化し(例えば大セグメントの欠失により)、そ
してこの不活性化された遺伝子によりセルラーゼ生産生
物を形質転換することが含まれる。不活性化された遺伝
子とゲノム遺伝子との間の組換は選択されたゲノム遺伝
子の不活性化をもたらす。糸状菌類(filamentous fung
ul organism)に適用されるこの方法の実施可能性は、Y
elton,M.M.等,プロシーディングス・オブ・ナショナル
・アカデミー・オブサイエンス,米国(Proc.Nat.Acad.
Sci.,USA),(1984)80:1470に示されてい
る。
この発明のこれらの及び他の目的及び観点は、添付され
た図面と共に以下の詳細な記載により明らかになるであ
ろう。
た図面と共に以下の詳細な記載により明らかになるであ
ろう。
(具体的な態様) A.定義 「セロビオヒドロラーゼ」、又は「エキソ−セロビオヒ
ドロラーゼ」又は「CBH」なる語は、この明細書におい
て使用される場合、セルロースをセルロース重合体鎖の
の非還元末端からセロビオース単位に切断することがで
きる蛋白質について用いる。CBH酵素は糸状細菌及び菌
類に存在することが知られているが、非糸状細菌におい
てはまだ証明されていない。少なくとも2つの形のCB
H、すなわちセロビオースのみを生成せしめるCBHI、及
びセロビオースとグルコースの混合物を生成せしめるCB
HIIがトリコデルマにおいて知られている。
ドロラーゼ」又は「CBH」なる語は、この明細書におい
て使用される場合、セルロースをセルロース重合体鎖の
の非還元末端からセロビオース単位に切断することがで
きる蛋白質について用いる。CBH酵素は糸状細菌及び菌
類に存在することが知られているが、非糸状細菌におい
てはまだ証明されていない。少なくとも2つの形のCB
H、すなわちセロビオースのみを生成せしめるCBHI、及
びセロビオースとグルコースの混合物を生成せしめるCB
HIIがトリコデルマにおいて知られている。
この明細書において示すCBHI蛋白質は496アミノ酸
の配列を有し、そして17アミノ酸のリーダー配列によ
り先行されている。このリーダー配列の除去によって生
成する成熟CBHIは、約66,000ドルトンの分子量を有す
る。天然形において生産された場合、この蛋白質は主と
してセリン及び/又はスレオニンのOHへの結合を介して
のある程度のグリコシル化を示す(Gum,E.K.等,ビオケ
ミカ・ビオフィジカ・アクタ(Biochem.Biopheys.Act
a)(1976)446:371)。
の配列を有し、そして17アミノ酸のリーダー配列によ
り先行されている。このリーダー配列の除去によって生
成する成熟CBHIは、約66,000ドルトンの分子量を有す
る。天然形において生産された場合、この蛋白質は主と
してセリン及び/又はスレオニンのOHへの結合を介して
のある程度のグリコシル化を示す(Gum,E.K.等,ビオケ
ミカ・ビオフィジカ・アクタ(Biochem.Biopheys.Act
a)(1976)446:371)。
「エンドグルカナーゼ」なる語は、セルロースを内部グ
リコシル部位において切断することができる酵素につい
て用いる。菌類、例えばT.リーゼイ、及び他の適当な
菌類に由来するEGI及びEGIIの両者を含む多くの形
のエンドグルカナーゼが知られている。
リコシル部位において切断することができる酵素につい
て用いる。菌類、例えばT.リーゼイ、及び他の適当な
菌類に由来するEGI及びEGIIの両者を含む多くの形
のエンドグルカナーゼが知られている。
この明細書において例示されるEGIは、成熟蛋白質で
あると考えられる437アミノ酸の配列を有し、そして
22アミノ酸のリーダー配列に先行されている。この4
37アミノ酸組成に基礎を置く分泌される形のアミノ酸
は約46,000ドルトンの分子量を有する。天然蛋白質は、
天然宿主により生産れた場合、ある程度のグリコシル化
を含むことが知られている〔Shoemaker,S.P.等,ビオケ
ミカ・ビオフィジカ・アクタ(Biochem.Biopheys.Act
a)(1978)523:147〕。
あると考えられる437アミノ酸の配列を有し、そして
22アミノ酸のリーダー配列に先行されている。この4
37アミノ酸組成に基礎を置く分泌される形のアミノ酸
は約46,000ドルトンの分子量を有する。天然蛋白質は、
天然宿主により生産れた場合、ある程度のグリコシル化
を含むことが知られている〔Shoemaker,S.P.等,ビオケ
ミカ・ビオフィジカ・アクタ(Biochem.Biopheys.Act
a)(1978)523:147〕。
「β−グルコシダーゼ」は同様に定義される。これらの
酵素は、菌類のセルラーゼ系、及び細菌の系の部分を構
成する。これらは、T.リーゼイにおいては、少なくと
も2つの物質的形体、すなわちβ−グルコシダーゼ−
I、及びβ−グルコシダーゼ−IIとして存在することが
知られている。これらの酵素は、可溶性オゴサッカライ
ドからグルコースを生成せしめることによってセルロー
ス消化を完結する。この発明の組換β−グルコシダーゼ
は、この活性及び特異性を有しそしてアミノ酸配列が菌
類性β−グルコシダーゼのそれと絶対に同一であるか否
かは別にして実質上同等である蛋白質を包含する。
酵素は、菌類のセルラーゼ系、及び細菌の系の部分を構
成する。これらは、T.リーゼイにおいては、少なくと
も2つの物質的形体、すなわちβ−グルコシダーゼ−
I、及びβ−グルコシダーゼ−IIとして存在することが
知られている。これらの酵素は、可溶性オゴサッカライ
ドからグルコースを生成せしめることによってセルロー
ス消化を完結する。この発明の組換β−グルコシダーゼ
は、この活性及び特異性を有しそしてアミノ酸配列が菌
類性β−グルコシダーゼのそれと絶対に同一であるか否
かは別にして実質上同等である蛋白質を包含する。
次のことは、上に定義した3タイプすべてに適用され
る。
る。
すべての蛋白質は、それが調製される際のpHに依存して
潜在的に酸性塩又は塩基性塩である。蛋白質のすべての
イオン化形が定義内に含まれる。さらに、宿主系の性質
に依存してグリコシル化、燐酸化、アセチル化等の翻訳
後プロセシングにより分子にある種の変更が加えられる
ことが理解される。ポリペプチドのプロセス形及び非プ
ロセス系の両者がセルラーゼの定義に含まれる。同様
に、例えばスルフィドリル基の酸化のごときアミノ酸側
鎖の偶然的な又は意図しない化学的変形により構造変化
が生ずるであろう。このように変形された蛋白質もな
お、その変形が酵素活性を破壊しない限り定義内に含ま
れる。最後に、正確なアミノ酸配列内の小さな変更が、
酵素活性を破壊することなく行われることが期待され
る。このような変更には、配列内のアミノ酸の置き換
え、及び1又は複数のアミノ酸の付加と又は欠失が含ま
れ、そして酵素活性が維持される限り、これらの変形も
また定義に含まれる。ここで、アミノ酸の付加、欠失又
は置換は出願前周知技術である部位特定変異誘発(例え
ば、Nucleic Acid Research,Vol.10,No.20, p6487〜650
0,1982を参照のこと)により実施することができ、アミ
ノ酸の付加、欠失又は置換に関し、1又は複数のアミノ
酸とは、部位特定変異誘発法により付加、欠失又は置換
できる程度の数のアミノ酸を意味する。なお、部位特定
変異誘発の具体的な方法はこの明細書中B.l.e.項(第41
頁〜第42頁)に記載されている。
潜在的に酸性塩又は塩基性塩である。蛋白質のすべての
イオン化形が定義内に含まれる。さらに、宿主系の性質
に依存してグリコシル化、燐酸化、アセチル化等の翻訳
後プロセシングにより分子にある種の変更が加えられる
ことが理解される。ポリペプチドのプロセス形及び非プ
ロセス系の両者がセルラーゼの定義に含まれる。同様
に、例えばスルフィドリル基の酸化のごときアミノ酸側
鎖の偶然的な又は意図しない化学的変形により構造変化
が生ずるであろう。このように変形された蛋白質もな
お、その変形が酵素活性を破壊しない限り定義内に含ま
れる。最後に、正確なアミノ酸配列内の小さな変更が、
酵素活性を破壊することなく行われることが期待され
る。このような変更には、配列内のアミノ酸の置き換
え、及び1又は複数のアミノ酸の付加と又は欠失が含ま
れ、そして酵素活性が維持される限り、これらの変形も
また定義に含まれる。ここで、アミノ酸の付加、欠失又
は置換は出願前周知技術である部位特定変異誘発(例え
ば、Nucleic Acid Research,Vol.10,No.20, p6487〜650
0,1982を参照のこと)により実施することができ、アミ
ノ酸の付加、欠失又は置換に関し、1又は複数のアミノ
酸とは、部位特定変異誘発法により付加、欠失又は置換
できる程度の数のアミノ酸を意味する。なお、部位特定
変異誘発の具体的な方法はこの明細書中B.l.e.項(第41
頁〜第42頁)に記載されている。
特に、2種類のセルラーゼ酵素は、配列間の1:1の対
応がおよそ存在する場合、「実質上同等」のアミノ酸配
列を有する。しかしながら、CBH、EG又はβ−グルコ
シダーゼ機能の喪失をもたらない、1又は複数のアミノ
酸における小さな変更はこの定義内にとどまるペプチド
を生じさせると考えられる。
応がおよそ存在する場合、「実質上同等」のアミノ酸配
列を有する。しかしながら、CBH、EG又はβ−グルコ
シダーゼ機能の喪失をもたらない、1又は複数のアミノ
酸における小さな変更はこの定義内にとどまるペプチド
を生じさせると考えられる。
特定の入手源に「由来する」特定のセルラーゼは、その
入手源により天然に生産されるアミノ酸配列に向けられ
る。
入手源により天然に生産されるアミノ酸配列に向けられ
る。
以下の説明において、T.リーゼイL27由来のEGI
又はCBHIに関連する完全ゲノム配列が「コード配列」
として使用される。これらのコード配列は、リーダーペ
プチドをコードする前配列(pre-sequence)を含有す
る。これらの説明において、生産された蛋白質の分泌を
得るのが有利であろうから、前配列が維持される。しか
しながら、他の場合には、細胞から分泌されない成熟蛋
白質を生産するのが好ましい。このリーダー又はその部
分を除去するためにコード配列を変更するための手段、
従って非分泌形の成熟蛋白質の生産を行うための手段
は、技術の範囲内である。このような成熟蛋白質のほか
に、この発明はさらに、分泌され又は分泌されない融合
形のセロビオヒドラーゼ、エンドグルカナーゼ又はβ−
グルコシダーゼ、並びに関連する製造手段及び料に関す
る。
又はCBHIに関連する完全ゲノム配列が「コード配列」
として使用される。これらのコード配列は、リーダーペ
プチドをコードする前配列(pre-sequence)を含有す
る。これらの説明において、生産された蛋白質の分泌を
得るのが有利であろうから、前配列が維持される。しか
しながら、他の場合には、細胞から分泌されない成熟蛋
白質を生産するのが好ましい。このリーダー又はその部
分を除去するためにコード配列を変更するための手段、
従って非分泌形の成熟蛋白質の生産を行うための手段
は、技術の範囲内である。このような成熟蛋白質のほか
に、この発明はさらに、分泌され又は分泌されない融合
形のセロビオヒドラーゼ、エンドグルカナーゼ又はβ−
グルコシダーゼ、並びに関連する製造手段及び料に関す
る。
下の説明において、「標的遺伝子」なる語はEGI蛋白
質又はCBHI遺伝子について用いる。これに関連して、
この遺伝子の正確な性質がどうであるか、すなわちこれ
が成熟蛋白質、融合蛋白質又はリーダー配列含有蛋白質
のいずれをコードするかは明らかであり、そしてこれが
前配列を含有するか否か、成熟蛋白質又は融合蛋白質と
してのその形に関係なく、そのように称されるであろ
う。
質又はCBHI遺伝子について用いる。これに関連して、
この遺伝子の正確な性質がどうであるか、すなわちこれ
が成熟蛋白質、融合蛋白質又はリーダー配列含有蛋白質
のいずれをコードするかは明らかであり、そしてこれが
前配列を含有するか否か、成熟蛋白質又は融合蛋白質と
してのその形に関係なく、そのように称されるであろ
う。
適当なセルラーゼ基質、例えばセルロースの「処理」
は、選択された基質の変形を生じさせるため、又は基質
の加水分解(セルロースからグルコースへの完全加水分
解、もしくは限定され制御された加水分解/変形を含
む)を行うために設計された加水分解的酵素反応を含
む。
は、選択された基質の変形を生じさせるため、又は基質
の加水分解(セルロースからグルコースへの完全加水分
解、もしくは限定され制御された加水分解/変形を含
む)を行うために設計された加水分解的酵素反応を含
む。
「制御配列」なる語は、特定の宿主において特定のコー
ド配列の発現を制御するDNA配列について用いる。宿主
の種類に応じて、これらには、プロモーター、オペレー
ター、リボゾーム結合部位、ターミネーター、エンハン
サー、及びあるレベルの発現を行うのに必要な他の配列
が含まれる。「適切な」制御配列なる語は、関連する特
定の宿主に適合性の制御配列について用いる。
ド配列の発現を制御するDNA配列について用いる。宿主
の種類に応じて、これらには、プロモーター、オペレー
ター、リボゾーム結合部位、ターミネーター、エンハン
サー、及びあるレベルの発現を行うのに必要な他の配列
が含まれる。「適切な」制御配列なる語は、関連する特
定の宿主に適合性の制御配列について用いる。
「シグナル配列」と称する制御配列の1つは、この明細
書においては、蛋白質鎖の放出(export)を開始するた
めに機能するアミノ酸の配列と定義される。シグナル配
列は、生長しつつある蛋白質鎖の放出(export)が開始
された後、特定の部位において成熟蛋白質から切断され
る。この用語はさらにリーダー配列又はリーダーペプチ
ドを含む。ここでで、好ましい1つのシグナル配列は、
第1表に示されているT.リーゼイ由来のCBHIのため
の推定された配列である。他の1つは第3表に示される
T.リーゼイ由来のEGIのたのそれである。
書においては、蛋白質鎖の放出(export)を開始するた
めに機能するアミノ酸の配列と定義される。シグナル配
列は、生長しつつある蛋白質鎖の放出(export)が開始
された後、特定の部位において成熟蛋白質から切断され
る。この用語はさらにリーダー配列又はリーダーペプチ
ドを含む。ここでで、好ましい1つのシグナル配列は、
第1表に示されているT.リーゼイ由来のCBHIのため
の推定された配列である。他の1つは第3表に示される
T.リーゼイ由来のEGIのたのそれである。
「機能的に連結された(operably linked)」なる語
は、系の構成成分の活性が維持される態様における遺伝
子要素の、及び制御配列についての並置(juxtapositio
n)について用いる。特に、「制御配列に機能的に連結
されたコード配列」なる語は、コード配列が適当な宿主
中で発現されるような配置を意味する。与えられた制御
配列は、その効率に関して極大化され得るであろうが、
「適切な制御配列に機能的に連結された」なる語は、単
に、ある有用なレベルの発現をもたらすために十分な制
御配列効率が用いられ得ることを意味する。
は、系の構成成分の活性が維持される態様における遺伝
子要素の、及び制御配列についての並置(juxtapositio
n)について用いる。特に、「制御配列に機能的に連結
されたコード配列」なる語は、コード配列が適当な宿主
中で発現されるような配置を意味する。与えられた制御
配列は、その効率に関して極大化され得るであろうが、
「適切な制御配列に機能的に連結された」なる語は、単
に、ある有用なレベルの発現をもたらすために十分な制
御配列効率が用いられ得ることを意味する。
「細胞」、「細胞系」、「細胞培養物」、及び「宿主細
胞」なる語は相互交換可能に使用され、そして文脈から
そうでないことが明らかでない限り、最の一般的な場合
を意味する。
胞」なる語は相互交換可能に使用され、そして文脈から
そうでないことが明らかでない限り、最の一般的な場合
を意味する。
他のベクターの「誘導体」であるベクターは、「誘導
体」ベクターの合成に導く一連の段階において親ベクタ
ーが用いられたことを意味する。
体」ベクターの合成に導く一連の段階において親ベクタ
ーが用いられたことを意味する。
B.一般的記載 B.1. 組換セルラーゼの製造 一般に、以下に説明する方法において、組換形セルラー
ゼ酵素の製造は次の段階を含む。
ゼ酵素の製造は次の段階を含む。
(1) 成熟セルラーゼ蛋白質、融合形の蛋白質、又は切
除され得る形もしくは回収され得る形のリーダー配列に
より先行されている蛋白質のための、イントロンによっ
て中断されていないコード配列を得; (2) セルラーゼコード配列を、段階(1)に従ってイント
ロを除去する前又は除去した後に、複製可能な発現ベク
ターの適切な制御配列と機能的に連結し; (3) こうして形成した発現ベクターを適切な宿主に形
質転換し; (4) 形質転換された宿主を、組換セルラーゼ酵素の生
産を行うために好都合な条件下で培養し;そして、 (5) 場合によっては、培地又は細胞からセルラーゼを
回収する。セルロースの分解のためにセルラーゼ活性を
用いるためには、酵素の回収は実際に必要ないであろ
う。確かに、セルロースの分解のために組換セルラーゼ
を用いることに関するこの発明の方法の1つの態様にお
いては、セルロースが培養細胞にその場で加えられ、そ
してセルロースの分解のために増殖中の細胞培養物又は
休止細胞培養物が用いられるであろう。
除され得る形もしくは回収され得る形のリーダー配列に
より先行されている蛋白質のための、イントロンによっ
て中断されていないコード配列を得; (2) セルラーゼコード配列を、段階(1)に従ってイント
ロを除去する前又は除去した後に、複製可能な発現ベク
ターの適切な制御配列と機能的に連結し; (3) こうして形成した発現ベクターを適切な宿主に形
質転換し; (4) 形質転換された宿主を、組換セルラーゼ酵素の生
産を行うために好都合な条件下で培養し;そして、 (5) 場合によっては、培地又は細胞からセルラーゼを
回収する。セルロースの分解のためにセルラーゼ活性を
用いるためには、酵素の回収は実際に必要ないであろ
う。確かに、セルロースの分解のために組換セルラーゼ
を用いることに関するこの発明の方法の1つの態様にお
いては、セルロースが培養細胞にその場で加えられ、そ
してセルロースの分解のために増殖中の細胞培養物又は
休止細胞培養物が用いられるであろう。
前記の各段階は種々の方法で行うことができる。例え
ば、目的とするコード配列は、細胞メッセンジャーRNA
(mRNA)から適切なcDNAを調製し、そして該cDNAを操作
して完全配列を得ることによって得られる。この方法に
代えて、後に記載するような種々の方法に従ってゲノム
断片を操作して同定されたイントロン領域を除去するこ
とができよう。配列の部分が、公知の化学的合成技法の
範囲に入る程十分に短い場合には、このような配列は個
々のヌクレオチド出発材料から化学合成により調製する
ことができる。確かに、この方法によって得られる配列
の長さは、オリゴヌクレオチド合成技術の今日の状況に
全く依存する。
ば、目的とするコード配列は、細胞メッセンジャーRNA
(mRNA)から適切なcDNAを調製し、そして該cDNAを操作
して完全配列を得ることによって得られる。この方法に
代えて、後に記載するような種々の方法に従ってゲノム
断片を操作して同定されたイントロン領域を除去するこ
とができよう。配列の部分が、公知の化学的合成技法の
範囲に入る程十分に短い場合には、このような配列は個
々のヌクレオチド出発材料から化学合成により調製する
ことができる。確かに、この方法によって得られる配列
の長さは、オリゴヌクレオチド合成技術の今日の状況に
全く依存する。
セルラーゼ酵素に対応するコード配列をゲノムライブラ
リーから再構成するために特に有用な方法をこの明細書
において説明する。セルラーゼ複合体の高生産体、例え
ば誘導されたT.リーゼイL27の核DNAからファージ
中に調製されたゲノムライブラリーは、目的酵素すべて
のコード配列を含有する。目的とする各酵素について、
精製された天然形を用いて抗体を得る。この抗体を用い
て、適切に免疫沈澱する蛋白質を試験管内翻訳系におい
て合成し得る濃縮されたmRNA画分を同定する。同定され
たmRNAを用いてcDNAプローブを生成せしめ、こんどはこ
のプローブを用いてライブラリーから目的とする遺伝子
又は遺伝子部分を同定する。プローブで同定された遺伝
子において、さらに変形を行うことがでできる。便利に
は、適当な制限部位が天然に存在しない場合には、これ
をコード配列の末端に付加して切出し可能な遺伝子セグ
メントを得、次にこれを適切な制御配列に隣接して発現
ベクター中に導入することができる。この方法に代え
て、遺伝子又はその部分をすでに含有するベクターに制
御配列を導入することもできる。制御配列、発現ベクタ
ー、及び形質転換方法は、遺伝子の発現に使用される宿
主細胞のタイプに依存する。一般に、現在のところ宿主
として、原核生物細胞、酵母細胞、又は哺乳動物細胞が
有用である。適当な制御配列及び技法は、下記に概略を
記載するように、宿主の選択に依存するであろう。
リーから再構成するために特に有用な方法をこの明細書
において説明する。セルラーゼ複合体の高生産体、例え
ば誘導されたT.リーゼイL27の核DNAからファージ
中に調製されたゲノムライブラリーは、目的酵素すべて
のコード配列を含有する。目的とする各酵素について、
精製された天然形を用いて抗体を得る。この抗体を用い
て、適切に免疫沈澱する蛋白質を試験管内翻訳系におい
て合成し得る濃縮されたmRNA画分を同定する。同定され
たmRNAを用いてcDNAプローブを生成せしめ、こんどはこ
のプローブを用いてライブラリーから目的とする遺伝子
又は遺伝子部分を同定する。プローブで同定された遺伝
子において、さらに変形を行うことがでできる。便利に
は、適当な制限部位が天然に存在しない場合には、これ
をコード配列の末端に付加して切出し可能な遺伝子セグ
メントを得、次にこれを適切な制御配列に隣接して発現
ベクター中に導入することができる。この方法に代え
て、遺伝子又はその部分をすでに含有するベクターに制
御配列を導入することもできる。制御配列、発現ベクタ
ー、及び形質転換方法は、遺伝子の発現に使用される宿
主細胞のタイプに依存する。一般に、現在のところ宿主
として、原核生物細胞、酵母細胞、又は哺乳動物細胞が
有用である。適当な制御配列及び技法は、下記に概略を
記載するように、宿主の選択に依存するであろう。
B.1.a. 制御配列 原核生物は、最もしばしばE.コリ((E.coli)の種々の
菌株によって代表される。しかしながら、他の微生物菌
株、例えばバシルス、例えばバシルス・ズブチリス(Ba
cillus subtilis)、シュードモナス(Pseudomonas)の
色々な種、又は他の細菌株を使用することもできる。こ
れらの原核生物系において、宿主と適合する菌株に由来
する複製部位及び制御配列を含有するプラスミドベクタ
ーが使用される。例えば、E.コリは、Bolivar等,ジー
ン「Gene」(1977)2:95によってE.コリ種から
得られたプラスミドpBR322の誘導体を用いて、典型的に
形質転換される。pBR322は、アンピシリン及びテトラサ
イクリン耐性遺伝子を含有し、そしてこれらのマーカー
は所望のベクターの造成において維持され、又は破壊さ
れる。リボゾーム結合部位配列と共に、場合によっては
オペレーターを伴う、転写開始のためのプロモーターを
含有するものとしてこの明細書において定義される一般
に使用される原核生物制御配列は、β−ラクタマーゼ
(ペニシリナーゼ)プロモーター系及びラクトース(la
c)プロモーター系〔Chang等,ネイチャー(Nature)
(1977)198:1056〕、並びにトリプトファ
ン(trp)プロモーター系〔Goeddel等,ニュークレイッ
ク・アシド・リサーチ(Nucleic Acids Res・).(19
80)8:4057〕のごとき一般に使用されるプロモ
ーターを含有する。1984年2月8日に出願された米
国特許出願第578,133号に記載されているような、ポー
タブル制御カセットとして有用にされている、λ−由来
PLプロモーター及びN−遺伝子リボゾーム結合部位
〔シマタケ等,ネイチヤー(Nature)(1981)29
2:128〕が他の1例である。しかしながら、原核生
物に適合性の任意の手入し得るプロモーター系を使用す
ることができる。
菌株によって代表される。しかしながら、他の微生物菌
株、例えばバシルス、例えばバシルス・ズブチリス(Ba
cillus subtilis)、シュードモナス(Pseudomonas)の
色々な種、又は他の細菌株を使用することもできる。こ
れらの原核生物系において、宿主と適合する菌株に由来
する複製部位及び制御配列を含有するプラスミドベクタ
ーが使用される。例えば、E.コリは、Bolivar等,ジー
ン「Gene」(1977)2:95によってE.コリ種から
得られたプラスミドpBR322の誘導体を用いて、典型的に
形質転換される。pBR322は、アンピシリン及びテトラサ
イクリン耐性遺伝子を含有し、そしてこれらのマーカー
は所望のベクターの造成において維持され、又は破壊さ
れる。リボゾーム結合部位配列と共に、場合によっては
オペレーターを伴う、転写開始のためのプロモーターを
含有するものとしてこの明細書において定義される一般
に使用される原核生物制御配列は、β−ラクタマーゼ
(ペニシリナーゼ)プロモーター系及びラクトース(la
c)プロモーター系〔Chang等,ネイチャー(Nature)
(1977)198:1056〕、並びにトリプトファ
ン(trp)プロモーター系〔Goeddel等,ニュークレイッ
ク・アシド・リサーチ(Nucleic Acids Res・).(19
80)8:4057〕のごとき一般に使用されるプロモ
ーターを含有する。1984年2月8日に出願された米
国特許出願第578,133号に記載されているような、ポー
タブル制御カセットとして有用にされている、λ−由来
PLプロモーター及びN−遺伝子リボゾーム結合部位
〔シマタケ等,ネイチヤー(Nature)(1981)29
2:128〕が他の1例である。しかしながら、原核生
物に適合性の任意の手入し得るプロモーター系を使用す
ることができる。
細菌のほかに、真核生微生物、例えば酵母も宿主として
使用することができる。パン酵母であるサッカロミセス
・セレビシエー(Sacharomyces cerevisiae)の実験室
株が最も頻繁に使用されるが、他の多くの菌株も一般に
使用し得る。2ミクロン複製開始点を用いるベクターが
記載されている〔Broach,J.R.,メソド・イン・エンチモ
ロジー(Meth.Enz.)(1983)101:307〕
が、酵母での発現のために適当な他のプラスミドベクタ
ー〔例えば、Stinchcomb等,ネイチヤー(Nature)
((1979)282:39; Tschempe等,ジーン「Gene」(1980)10:15
7;及びClarke,L.等,メソド・イン・エンチモロジー
(Meth.Enz.)(1983)101:300を参照のこ
と〕が知られている。酵母ベクターのための制御配列
は、解糖系酵母の合成のためのプロモーター〔Hess等,
J.アドバ.エンチム.レグ(J.Adv.Enzyme Reg.)
(1968)7:149;Holland等,ビオケミストリ
ー(Biochemistry)(1978)17:4900〕を含
む。当業界において知られている他のプロモーターは3
−ホスホグリセレートキナーゼのためのプロモーター
〔Hitzeman等,ジャーナル・オブ・ビオロジカル・ケミ
ストリー(J.Biol.Chem.)(1980)255:207
3〕、並びに他の解糖系酵素、例えばグリセロアルデヒ
ド−3−ホスフェートデヒドロゲナーゼ、ヘキソキナー
ゼ、ピルベートデカルボキシダーゼ、ホスホフラクトキ
ナーゼ、グルコース−6−ホスフェートイソメラーゼ、
3−ホスホグリセレートムターゼ、ピルベートキナー
ゼ、トリオースホスフェートイソメラーゼ、ホスホグル
コースイソメラーゼ、及びグルコキナーゼのそれを包含
する。増殖条件により制御される転写の追加の利点を有
する他のプロモーターは、アルコールデヒドロゲナーゼ
2、イソチトクロームC、酸性ホスファターゼ、窒素代
謝に関連する分解酵素、並びにマルトース及びガラクト
ース利用のために必要な酵素のためのプロモーター領域
である(Holland,前掲)。
使用することができる。パン酵母であるサッカロミセス
・セレビシエー(Sacharomyces cerevisiae)の実験室
株が最も頻繁に使用されるが、他の多くの菌株も一般に
使用し得る。2ミクロン複製開始点を用いるベクターが
記載されている〔Broach,J.R.,メソド・イン・エンチモ
ロジー(Meth.Enz.)(1983)101:307〕
が、酵母での発現のために適当な他のプラスミドベクタ
ー〔例えば、Stinchcomb等,ネイチヤー(Nature)
((1979)282:39; Tschempe等,ジーン「Gene」(1980)10:15
7;及びClarke,L.等,メソド・イン・エンチモロジー
(Meth.Enz.)(1983)101:300を参照のこ
と〕が知られている。酵母ベクターのための制御配列
は、解糖系酵母の合成のためのプロモーター〔Hess等,
J.アドバ.エンチム.レグ(J.Adv.Enzyme Reg.)
(1968)7:149;Holland等,ビオケミストリ
ー(Biochemistry)(1978)17:4900〕を含
む。当業界において知られている他のプロモーターは3
−ホスホグリセレートキナーゼのためのプロモーター
〔Hitzeman等,ジャーナル・オブ・ビオロジカル・ケミ
ストリー(J.Biol.Chem.)(1980)255:207
3〕、並びに他の解糖系酵素、例えばグリセロアルデヒ
ド−3−ホスフェートデヒドロゲナーゼ、ヘキソキナー
ゼ、ピルベートデカルボキシダーゼ、ホスホフラクトキ
ナーゼ、グルコース−6−ホスフェートイソメラーゼ、
3−ホスホグリセレートムターゼ、ピルベートキナー
ゼ、トリオースホスフェートイソメラーゼ、ホスホグル
コースイソメラーゼ、及びグルコキナーゼのそれを包含
する。増殖条件により制御される転写の追加の利点を有
する他のプロモーターは、アルコールデヒドロゲナーゼ
2、イソチトクロームC、酸性ホスファターゼ、窒素代
謝に関連する分解酵素、並びにマルトース及びガラクト
ース利用のために必要な酵素のためのプロモーター領域
である(Holland,前掲)。
ターミネーター配列がコード配列の3′末端において望
ましいことが示唆されている。このようなターミネータ
ーは、酵母由来遺伝子においてコード配列に続く3′非
翻訳領域中に見出される。記載されているベクターの多
くは、エノラーゼ−I遺伝子含有プラスミミドpeno46
〔Holland,M.J.等,ジャーナル・オブ・ビオロジカル・
ケミストリー(J.Biol.Chem.)(1981)256:1
358〕由来の制御配列、又はYEp13から得られるLEU2
遺伝子〔Broach,J.等,ジーン「Gene」(1979)
8:121〕由来の制御配列を含有するが、しかしなが
ら、酵母適合性のプロモーター、複製開始点及び他の制
御配列を含有する任意のベクターを使用することができ
る。
ましいことが示唆されている。このようなターミネータ
ーは、酵母由来遺伝子においてコード配列に続く3′非
翻訳領域中に見出される。記載されているベクターの多
くは、エノラーゼ−I遺伝子含有プラスミミドpeno46
〔Holland,M.J.等,ジャーナル・オブ・ビオロジカル・
ケミストリー(J.Biol.Chem.)(1981)256:1
358〕由来の制御配列、又はYEp13から得られるLEU2
遺伝子〔Broach,J.等,ジーン「Gene」(1979)
8:121〕由来の制御配列を含有するが、しかしなが
ら、酵母適合性のプロモーター、複製開始点及び他の制
御配列を含有する任意のベクターを使用することができ
る。
多細胞生物由来の真核性宿主細胞培養物において、ポリ
ペプチドをコードする遺伝子を発現せしめることが可能
なことも言うまでもない。例えば、ティシュカルチュア
ーズ(Tissue Cultures),アカデックプレス、Cruz及
びPatterson編(1973)を参照のこと。有用な宿主
細胞系にはVERO及びHeLa細胞、並びにチャイニーズハム
スター卵巣(CHO)細胞が含まれる。これらの細胞のた
めの発現ベクターには一般に、哺乳動物細胞との適合性
を有するプロモーター及び制御配列、例えばシミアンウ
イルス(Simian Virus)40(SV40)〔Fiers等,
ネイチヤー(Nature)(1978)273:113〕由
来の一般に使用される初期及び後期プロモーター、又は
他のウイルス性プロモーター、例えばポリオーマウイル
ス、アデノウイルス2、牛乳頭腫ウイルス、もしくは鳥
類肉腫ウイルス由来のプロモーターが含まれる。哺乳動
物細胞宿主系形質転換の一般的観点は、1983年8月
16日に与えられたたAxelの米国特許第4,399,216号に
記載されている。「エンハンサー(enhancer)」領域が
発現の最適化において重要なことが、今や明らかであ
り、この領域は一般に、プロモーター領域の上流に見出
される配列である。必要であれば、複製開始点がウイル
スから得られるであろう。しかしながら、染色体への遺
伝子組込みは、真核生物におけるDNA複製の共通の機作
であり、従って独立して複製するベクターは必要でな
い。今や、植物細胞も宿主として用いることが出来、そ
して植物細胞に適合性の制御配列、例えばノパリン(no
paline)合成プロモーター、及びポリアデニル化シグナ
ル配列〔Depicker,A.等,ジャーナル・オブ・モレキュ
ラー・アンド・アプライド・ゼネティクス((J.Mol.Ap
pl.Gen.)(1982)1:561〕が使用可能であ
る。
ペプチドをコードする遺伝子を発現せしめることが可能
なことも言うまでもない。例えば、ティシュカルチュア
ーズ(Tissue Cultures),アカデックプレス、Cruz及
びPatterson編(1973)を参照のこと。有用な宿主
細胞系にはVERO及びHeLa細胞、並びにチャイニーズハム
スター卵巣(CHO)細胞が含まれる。これらの細胞のた
めの発現ベクターには一般に、哺乳動物細胞との適合性
を有するプロモーター及び制御配列、例えばシミアンウ
イルス(Simian Virus)40(SV40)〔Fiers等,
ネイチヤー(Nature)(1978)273:113〕由
来の一般に使用される初期及び後期プロモーター、又は
他のウイルス性プロモーター、例えばポリオーマウイル
ス、アデノウイルス2、牛乳頭腫ウイルス、もしくは鳥
類肉腫ウイルス由来のプロモーターが含まれる。哺乳動
物細胞宿主系形質転換の一般的観点は、1983年8月
16日に与えられたたAxelの米国特許第4,399,216号に
記載されている。「エンハンサー(enhancer)」領域が
発現の最適化において重要なことが、今や明らかであ
り、この領域は一般に、プロモーター領域の上流に見出
される配列である。必要であれば、複製開始点がウイル
スから得られるであろう。しかしながら、染色体への遺
伝子組込みは、真核生物におけるDNA複製の共通の機作
であり、従って独立して複製するベクターは必要でな
い。今や、植物細胞も宿主として用いることが出来、そ
して植物細胞に適合性の制御配列、例えばノパリン(no
paline)合成プロモーター、及びポリアデニル化シグナ
ル配列〔Depicker,A.等,ジャーナル・オブ・モレキュ
ラー・アンド・アプライド・ゼネティクス((J.Mol.Ap
pl.Gen.)(1982)1:561〕が使用可能であ
る。
B.1.b. 形質転換 使用する宿主細胞に依存して、形質転換は、その細胞に
適する標準的技法を用いて行う。Cohen,S.N.,プロシー
ディングス・オブ・ナショナル・アカデミー・オブ・サ
イエンシス(米国)(Proc.Natl.Acad.Sci.USA)(19
72)69:2110により記載された、塩化カルシウ
ムを用いるカルシウム処理法が、原核生物細胞、又は実
質的な細胞壁障壁を有する他の細胞のために用いられ
る。ある種の植物細胞については、アグロバクテリウム
・チュメファシエンス(Agrobacterium tumefaciens)
を用いる感染〔Shaw,C.H.等,ジーン「Gene」(198
3)23:315〕が用いられる。細胞壁を有しない哺
乳動物細胞については、Graham及びvan der Eb,Virolog
y(1978)52:546の燐酸カルシウム沈澱法が
好ましい。酵母への形質転換はVan Solingen,P.等,ジ
ャーナル・オブ・バクテリオロジー(J.Bact.)(19
77)130:946;及びHsiao,C.L.等,プロシーデ
ィングス・オブ・ナショナル・アカデミー・オブ・サイ
エンシス(米国)(Proc.Natl.Acad.Sci.(USA)(197
9)76:3829の方法に従って行われる。要約すれ
ば、YEPD富化培地(酵母エキストラクト、ペプトン、及
び4%グルコース)中に対数中期まで増殖した酵母培養
物を洗浄し、そしてソルビトール燐酸緩衝液中リゾチー
ム5000(マイルスラボラトリーズ)を用いてプロト
プラスト化する。プロトプラストを洗浄し、1Mソルビ
トール含有67%YEPD中に室温にて1時間放置し、そし
てペレット化し、そしてトリス−ソルビトール−塩化カ
ルシウム緩衝液中に2×109プロトプラスト/mlに懸
濁する。プロトプラストを、100μの反応混合物
中、形質転換用DNA5〜10μgと混合し、次に1mlの4
4%PEGを加え、そしてこの混合物を室温にて40分間
放置する。この方法の代りに、Klebe等〔〔ジーン「Gen
e」(1983)25:333〕の方法を使用すること
もできる。
適する標準的技法を用いて行う。Cohen,S.N.,プロシー
ディングス・オブ・ナショナル・アカデミー・オブ・サ
イエンシス(米国)(Proc.Natl.Acad.Sci.USA)(19
72)69:2110により記載された、塩化カルシウ
ムを用いるカルシウム処理法が、原核生物細胞、又は実
質的な細胞壁障壁を有する他の細胞のために用いられ
る。ある種の植物細胞については、アグロバクテリウム
・チュメファシエンス(Agrobacterium tumefaciens)
を用いる感染〔Shaw,C.H.等,ジーン「Gene」(198
3)23:315〕が用いられる。細胞壁を有しない哺
乳動物細胞については、Graham及びvan der Eb,Virolog
y(1978)52:546の燐酸カルシウム沈澱法が
好ましい。酵母への形質転換はVan Solingen,P.等,ジ
ャーナル・オブ・バクテリオロジー(J.Bact.)(19
77)130:946;及びHsiao,C.L.等,プロシーデ
ィングス・オブ・ナショナル・アカデミー・オブ・サイ
エンシス(米国)(Proc.Natl.Acad.Sci.(USA)(197
9)76:3829の方法に従って行われる。要約すれ
ば、YEPD富化培地(酵母エキストラクト、ペプトン、及
び4%グルコース)中に対数中期まで増殖した酵母培養
物を洗浄し、そしてソルビトール燐酸緩衝液中リゾチー
ム5000(マイルスラボラトリーズ)を用いてプロト
プラスト化する。プロトプラストを洗浄し、1Mソルビ
トール含有67%YEPD中に室温にて1時間放置し、そし
てペレット化し、そしてトリス−ソルビトール−塩化カ
ルシウム緩衝液中に2×109プロトプラスト/mlに懸
濁する。プロトプラストを、100μの反応混合物
中、形質転換用DNA5〜10μgと混合し、次に1mlの4
4%PEGを加え、そしてこの混合物を室温にて40分間
放置する。この方法の代りに、Klebe等〔〔ジーン「Gen
e」(1983)25:333〕の方法を使用すること
もできる。
B.1.c. ベクターの構成 所望のコード配列及び制御配列を含有する適当なベクタ
ーの構成においては、当業界においてよく理解される標
準的連結(ligation)技法及び制限(restriction)技
法が用いられる。分離されたプラスド、DNA配列、又は
合成されたオリゴデオキシリボヌクレオチドを切断(cl
eave)し、接続(tailor)され、そして所望の形に再連
結(religate)する。
ーの構成においては、当業界においてよく理解される標
準的連結(ligation)技法及び制限(restriction)技
法が用いられる。分離されたプラスド、DNA配列、又は
合成されたオリゴデオキシリボヌクレオチドを切断(cl
eave)し、接続(tailor)され、そして所望の形に再連
結(religate)する。
部位特異的DNA切断は、当業界において一般に理解され
る条件のもとで適切な制限酵素(1種又は複数種)を用
いる処理によって行われ、この方法の詳細は、これらの
市販制限酵素の製造者により特定されている。例えば、
ニューイングランド ビオラブス(New England Biolab
s)の商品カタログを参照のこと。一般に、約1μgの
プラスミド又はDNA配列を約20μの緩衝液中で1ユ
ニットの酵素により切断する。この明細書に記載する例
においては、DNA基質の完全な消化を保証するために過
剰の制限酵素を使用する。約37℃における約1〜2時
間のインキュベーション時間が有効でであるが、変法を
用いることもできる。各インキュベーションの後、フェ
ノール/クロロホルムによる出によって蛋白質を除去
し、そしてさらにエーテル抽出することもでき、そして
エタノール沈澱により核酸を水相から取り出し、次にセ
ファデックスG−50スピンカラムに通す。所望によ
り、標準的方法を用いながら、ポリアクリルアミドゲル
又はアガロースゲルにより切断された断片のサイズ分離
を行う。サイズ分離の一般的記載はメソド・イン・エン
チモロジー(Methods in Enzymology)(1980)6
5:499−560に見られる。
る条件のもとで適切な制限酵素(1種又は複数種)を用
いる処理によって行われ、この方法の詳細は、これらの
市販制限酵素の製造者により特定されている。例えば、
ニューイングランド ビオラブス(New England Biolab
s)の商品カタログを参照のこと。一般に、約1μgの
プラスミド又はDNA配列を約20μの緩衝液中で1ユ
ニットの酵素により切断する。この明細書に記載する例
においては、DNA基質の完全な消化を保証するために過
剰の制限酵素を使用する。約37℃における約1〜2時
間のインキュベーション時間が有効でであるが、変法を
用いることもできる。各インキュベーションの後、フェ
ノール/クロロホルムによる出によって蛋白質を除去
し、そしてさらにエーテル抽出することもでき、そして
エタノール沈澱により核酸を水相から取り出し、次にセ
ファデックスG−50スピンカラムに通す。所望によ
り、標準的方法を用いながら、ポリアクリルアミドゲル
又はアガロースゲルにより切断された断片のサイズ分離
を行う。サイズ分離の一般的記載はメソド・イン・エン
チモロジー(Methods in Enzymology)(1980)6
5:499−560に見られる。
制限切断された断片は、E.コリDNAポリメラーゼIの大
断片(Klenow断片)による処理によって、4種類のデオ
キシヌクレオチドトリホスフェート(dNTP)の存在下
で、約15〜25分間のインキュベーション時間、20
〜25℃にて、50mM Tris-Cl((pH7.6,50mM NaC
l,6mM MgCl2,6mM DTT,及び5〜10μM dNTP)
中で、平滑末端化することができる。Klenow断片は、
5′接着末端を満たす(fill inする)が、4種類のdNT
Pが存在しても3′単鎖を切り取る(chew backする)。
所望により、接着末端の種類により指令される限界内で
選択された1種又は複数種のdNTPのみを供給することに
より、選択的補修(selective repair)を行うことがで
きる。Klenow断片で処理した後、混合物をフェノール/
クロロホルムで抽出し、エタノール沈澱を行い、次にセ
ファデックスG−50スピンカラムに通す。適当な条件
下でS1ヌクレアーゼにより処理することによって、任
意の単鎖部分の加水分解を行う。
断片(Klenow断片)による処理によって、4種類のデオ
キシヌクレオチドトリホスフェート(dNTP)の存在下
で、約15〜25分間のインキュベーション時間、20
〜25℃にて、50mM Tris-Cl((pH7.6,50mM NaC
l,6mM MgCl2,6mM DTT,及び5〜10μM dNTP)
中で、平滑末端化することができる。Klenow断片は、
5′接着末端を満たす(fill inする)が、4種類のdNT
Pが存在しても3′単鎖を切り取る(chew backする)。
所望により、接着末端の種類により指令される限界内で
選択された1種又は複数種のdNTPのみを供給することに
より、選択的補修(selective repair)を行うことがで
きる。Klenow断片で処理した後、混合物をフェノール/
クロロホルムで抽出し、エタノール沈澱を行い、次にセ
ファデックスG−50スピンカラムに通す。適当な条件
下でS1ヌクレアーゼにより処理することによって、任
意の単鎖部分の加水分解を行う。
合成オリゴヌクレオチドは、Matteucciのトリエステル
法〔ジャーナル・オブ・アメリカン・ケミカル・ソシシ
エティー(J.Am.Chem.Soc.)(1981)103:31
85−3191〕、又はCaruthersのジメチルホスホラ
ミド法(1983年11月15日に与えられた米国特許
第4,415,732号に記載されている)により調製すること
ができる。
法〔ジャーナル・オブ・アメリカン・ケミカル・ソシシ
エティー(J.Am.Chem.Soc.)(1981)103:31
85−3191〕、又はCaruthersのジメチルホスホラ
ミド法(1983年11月15日に与えられた米国特許
第4,415,732号に記載されている)により調製すること
ができる。
アニーリングに先立つ、又は放射性標識付与(radio-la
beling)のための、単鎖のキナーゼ処理は、過剰のポリ
ヌクレオチドキナーゼ、例えば50mM Tris〔pH7.6 1
0mM MgCl2、5mMジチオスレイトール、1〜2mM ATP、
1.7pモルγ32P−ATP(2.9mCi/mモル)、0.1mMスペル
ミジン、及び0.1mM EDTA〕中1nモルの基質に対して約
10ユニットのキナーゼを用いて達成される。
beling)のための、単鎖のキナーゼ処理は、過剰のポリ
ヌクレオチドキナーゼ、例えば50mM Tris〔pH7.6 1
0mM MgCl2、5mMジチオスレイトール、1〜2mM ATP、
1.7pモルγ32P−ATP(2.9mCi/mモル)、0.1mMスペル
ミジン、及び0.1mM EDTA〕中1nモルの基質に対して約
10ユニットのキナーゼを用いて達成される。
連結(ligation)は典型的には、10〜30μの体積
中で、次の条件及び温度のもとで行われる。20mM Tri
s-Cl、pH7.5、10mM MgCl2、10mM DTT、33μg/m
BSA、10mM〜50mM NaCl、及び40μM ATP、0.01
〜0.02(Weiss)ユニットT4 DNAリガーゼ、0℃(接
着末端の連結のため)、又は1mM ATP、0.3〜0.6(Weis
s)ユニットT4DNAリガーゼ、14℃(平滑末端の連結
のため)のいずれか。分子間「接着末端」連結は通常3
3〜100μg/mlの全DNA濃度(5〜100nM全最終
濃度)において行われる。分子間平滑末端連結(通常、
10〜30モル倍の過剰のリンカーを用いる)は典型的
には約1μMの全最終濃度において行われる。
中で、次の条件及び温度のもとで行われる。20mM Tri
s-Cl、pH7.5、10mM MgCl2、10mM DTT、33μg/m
BSA、10mM〜50mM NaCl、及び40μM ATP、0.01
〜0.02(Weiss)ユニットT4 DNAリガーゼ、0℃(接
着末端の連結のため)、又は1mM ATP、0.3〜0.6(Weis
s)ユニットT4DNAリガーゼ、14℃(平滑末端の連結
のため)のいずれか。分子間「接着末端」連結は通常3
3〜100μg/mlの全DNA濃度(5〜100nM全最終
濃度)において行われる。分子間平滑末端連結(通常、
10〜30モル倍の過剰のリンカーを用いる)は典型的
には約1μMの全最終濃度において行われる。
「ベクター断片」を用いるベクターの造成において、ベ
クター断片は一般に、5′燐酸を除去するため、及びベ
クターの再連結を防止するために、細菌アルカリホスフ
ァターゼ(BAP)で処理する。BAP消化は、典型的には、
約8のpHにおいて、約150mM Tris中で、Na+及びMg++
の存在下で、ベクターμg当り約1ユニットのBAPを用
いて、60℃にて1時間行う。核酸断片を回収するため
に、調製物をフェノール/クロロホルムで抽出し、そし
てエタノール沈澱を行い、そしてセファデックスG−5
0スピンカラムに適用することによって脱塩する。この
方法に代えて、不所望の断片の追加の制限酵素消化によ
り、二重消化されたベクターにおいて、再連結を防止す
ることができる。
クター断片は一般に、5′燐酸を除去するため、及びベ
クターの再連結を防止するために、細菌アルカリホスフ
ァターゼ(BAP)で処理する。BAP消化は、典型的には、
約8のpHにおいて、約150mM Tris中で、Na+及びMg++
の存在下で、ベクターμg当り約1ユニットのBAPを用
いて、60℃にて1時間行う。核酸断片を回収するため
に、調製物をフェノール/クロロホルムで抽出し、そし
てエタノール沈澱を行い、そしてセファデックスG−5
0スピンカラムに適用することによって脱塩する。この
方法に代えて、不所望の断片の追加の制限酵素消化によ
り、二重消化されたベクターにおいて、再連結を防止す
ることができる。
B.1.d. 構成の確認 下記の構成において、プラスミド造成のための正しい連
結はまず、E.コリGenetic Stock Center,CGSC#613
5から得られるE.コリMM294株、又は他の適当な宿主を
連結混合物により形質転換することにより確認される。
形質転換に成功した細胞はアンピシリン、テトラサイク
リン又は他の抗生物質耐性により、又は当業界において
理解されるように、プラスムドの造成方法に依存して他
のマーカーを用いて選択する。次に、形質転換体からの
プラスドは、Clewell,D.B.等,プロシーディングス.
オブ.ナショナルアカデミー・オブ・サイエンシス(米
国)(Proc.Nac.Acad.Sci.USA)(1969)62:1
159の方法に従って、そして場合によっては次にクロ
ラムフェニコール増幅〔Clewell,D.B.,ジャーナル・オ
ブ・バクテリオロジー(J.Bacteriol.)(1972)1
10:667〕することにより調製する。分離されたDN
Aは、制限処理し、そして/又はSanger,F.等,プロシー
ディングス・オブ・ナショナル・アカデミー・オブ・サ
イエンシス(米国)(Proc.Natl.Acad.Sci.(USA)(19
77)74:5463のジデオキシ法〔さらに、Messin
g等,ニュークレイック・アシド・リサーチ(Nucleic A
cids Res.)(1981)9:309に記載されてい
る〕、もしくはMaxam等,メソド・イン・エンチモロジ
ー(Methods in Enzymology)(1980)65:49
9の方法により配列決定する。
結はまず、E.コリGenetic Stock Center,CGSC#613
5から得られるE.コリMM294株、又は他の適当な宿主を
連結混合物により形質転換することにより確認される。
形質転換に成功した細胞はアンピシリン、テトラサイク
リン又は他の抗生物質耐性により、又は当業界において
理解されるように、プラスムドの造成方法に依存して他
のマーカーを用いて選択する。次に、形質転換体からの
プラスドは、Clewell,D.B.等,プロシーディングス.
オブ.ナショナルアカデミー・オブ・サイエンシス(米
国)(Proc.Nac.Acad.Sci.USA)(1969)62:1
159の方法に従って、そして場合によっては次にクロ
ラムフェニコール増幅〔Clewell,D.B.,ジャーナル・オ
ブ・バクテリオロジー(J.Bacteriol.)(1972)1
10:667〕することにより調製する。分離されたDN
Aは、制限処理し、そして/又はSanger,F.等,プロシー
ディングス・オブ・ナショナル・アカデミー・オブ・サ
イエンシス(米国)(Proc.Natl.Acad.Sci.(USA)(19
77)74:5463のジデオキシ法〔さらに、Messin
g等,ニュークレイック・アシド・リサーチ(Nucleic A
cids Res.)(1981)9:309に記載されてい
る〕、もしくはMaxam等,メソド・イン・エンチモロジ
ー(Methods in Enzymology)(1980)65:49
9の方法により配列決定する。
B.1.e. 部位特定変異誘発(Site Specific Mutagenesi
s) オリゴヌクレオチド誘導変異は、所望の変異を代表する
限定された不一致(mismaching)のほかは変異を受ける
べき1本鎖ファージDNAに相補的なプライマー合成オリ
ゴヌクレオチドを用いて行う。簡単に記載すれば、プラ
イマーとして合成オリゴヌクレオチドを用いてファージ
に相補的な鎖の合成を指令し、そして得られた二重鎖DN
Aをファージ担持性宿主細菌に形質転換する。形質転換
された細菌の培養物を寒天にプレートし、ファージを含
有する単一細胞からプラークを形成せしめる。
s) オリゴヌクレオチド誘導変異は、所望の変異を代表する
限定された不一致(mismaching)のほかは変異を受ける
べき1本鎖ファージDNAに相補的なプライマー合成オリ
ゴヌクレオチドを用いて行う。簡単に記載すれば、プラ
イマーとして合成オリゴヌクレオチドを用いてファージ
に相補的な鎖の合成を指令し、そして得られた二重鎖DN
Aをファージ担持性宿主細菌に形質転換する。形質転換
された細菌の培養物を寒天にプレートし、ファージを含
有する単一細胞からプラークを形成せしめる。
理論的には、50%の新コロニーが単鎖として変異形を
有するファージを含有し、50%がもとの配列を有する
であろう。得られたプラークを、完全に一致するものと
はハイブリド形成するが、もとの鎖を伴う不一致のもの
とはハイブリド形成しない温度において、キナーゼ処理
された合成プリイマーとハイブリド形成せしめる。次に
プローブとハイブリド形成するプラークを拾いげ、培養
し、そしてDNAを回収する。部位特定変異法の詳細は、
後の具体的な例に記載する。
有するファージを含有し、50%がもとの配列を有する
であろう。得られたプラークを、完全に一致するものと
はハイブリド形成するが、もとの鎖を伴う不一致のもの
とはハイブリド形成しない温度において、キナーゼ処理
された合成プリイマーとハイブリド形成せしめる。次に
プローブとハイブリド形成するプラークを拾いげ、培養
し、そしてDNAを回収する。部位特定変異法の詳細は、
後の具体的な例に記載する。
B.1.f. 宿主の例 この発明において、クローニング及び発現のために使用
する宿主菌株は次の通りである。
する宿主菌株は次の通りである。
クローニング及び配列決定のため、並びにほとんどの細
菌プロモーターの制御のもとでの造成物の発現のため
に、E.コリMM294株(前掲)、Talmadge,K.等,ジーン
「Gene」(1980)12:235;Meshlson,M.等,
ネイチャー(Nature)(1968)217:1100を
宿主として使用した。
菌プロモーターの制御のもとでの造成物の発現のため
に、E.コリMM294株(前掲)、Talmadge,K.等,ジーン
「Gene」(1980)12:235;Meshlson,M.等,
ネイチャー(Nature)(1968)217:1100を
宿主として使用した。
M13ファージ組換体のために、ファージ感染に感受性
のE.コリ株、例えばE.コリK/12/DG98株を使用す
る。DG98株はATCCに寄託されており、寄託番号3976
8を有する。
のE.コリ株、例えばE.コリK/12/DG98株を使用す
る。DG98株はATCCに寄託されており、寄託番号3976
8を有する。
酵母での発現のために、S.セレビシエーの実験室株:
ATCCから得られるC468(α,his4-,leu2-,mal-)株
(寄託番号20,690)、及びニューヨーク、ロチェスター
大学、Hred Sherman教授から入手できるS173−6B
(trp1-,leu2-,ura3-,his4-)株を用いる。
ATCCから得られるC468(α,his4-,leu2-,mal-)株
(寄託番号20,690)、及びニューヨーク、ロチェスター
大学、Hred Sherman教授から入手できるS173−6B
(trp1-,leu2-,ura3-,his4-)株を用いる。
B.2. 組換酵素の用途 組換セロビオヒドラーゼ、エンドグルカナーゼ、及びβ
−グルコシダーゼは、むろん、対応する酵素の天然形と
同じ用途に、そして同じ条件下で使用することができ
る。組換形は、単独で、又は制御された組合わせにおい
ては比較的多量に得られ、そしてそれらの性質を強化す
るために、コード配列の遺伝的操作により、又は最適の
翻訳後プロセシング特性を有する宿主を選択することに
より適当な変形が加えられるという利点を有する。組換
酵素は、新規な宿主において生産される場合、該宿にお
いて新な基質を利用し及び/又は変形する能力を付与す
る。
−グルコシダーゼは、むろん、対応する酵素の天然形と
同じ用途に、そして同じ条件下で使用することができ
る。組換形は、単独で、又は制御された組合わせにおい
ては比較的多量に得られ、そしてそれらの性質を強化す
るために、コード配列の遺伝的操作により、又は最適の
翻訳後プロセシング特性を有する宿主を選択することに
より適当な変形が加えられるという利点を有する。組換
酵素は、新規な宿主において生産される場合、該宿にお
いて新な基質を利用し及び/又は変形する能力を付与す
る。
組換セルラーゼ酵素の各々は、生体外において、溶液と
して又は固定化された形で、セルロース、又は問題の酵
素にとって望ましいように又はそれと適合するように変
形された他の基質の完全加水分解又は制御された加水分
解においてその役割を演ずるように用いることができ
る。
して又は固定化された形で、セルロース、又は問題の酵
素にとって望ましいように又はそれと適合するように変
形された他の基質の完全加水分解又は制御された加水分
解においてその役割を演ずるように用いることができ
る。
この発明の酵素は、単独で、又は相互に組合わせて、も
しくは他の適当な触媒と組合わせて使用することができ
る。不溶性のセルロース基質の効率的な加水分解のため
には、少なくとも1種類のエンドグルカナーゼ、セロビ
オヒドラーゼ、及びβ−グルコシダーゼの組合せを用い
るのが好ましい。再び、これらは溶解した形又は固定化
された形で用いることができ、あるいは同一の又は異る
形質転換宿主により得ることができる。例えば、セルロ
ース複合体の各酵素の遺伝子を含有する複数の発現プラ
スミドにより、又はこれらの酵素の各々のための複数の
発現モジュールを含有する1種類の発現プラスミドによ
り酵素宿主を形質転換することは、この発明の範囲であ
る。最近、酵母の若干の種が本来的にβ−グルコシダー
ゼを生産することが知られており、そしてセルラーゼ複
合体の他の酵素を本来的に生産する他の種を見出すこと
が出来よう。このような宿主菌株については、セルラー
ゼ複合体の欠けている構成員を適当な発現ベクターの形
で供給することだけが必要であろう。
しくは他の適当な触媒と組合わせて使用することができ
る。不溶性のセルロース基質の効率的な加水分解のため
には、少なくとも1種類のエンドグルカナーゼ、セロビ
オヒドラーゼ、及びβ−グルコシダーゼの組合せを用い
るのが好ましい。再び、これらは溶解した形又は固定化
された形で用いることができ、あるいは同一の又は異る
形質転換宿主により得ることができる。例えば、セルロ
ース複合体の各酵素の遺伝子を含有する複数の発現プラ
スミドにより、又はこれらの酵素の各々のための複数の
発現モジュールを含有する1種類の発現プラスミドによ
り酵素宿主を形質転換することは、この発明の範囲であ
る。最近、酵母の若干の種が本来的にβ−グルコシダー
ゼを生産することが知られており、そしてセルラーゼ複
合体の他の酵素を本来的に生産する他の種を見出すこと
が出来よう。このような宿主菌株については、セルラー
ゼ複合体の欠けている構成員を適当な発現ベクターの形
で供給することだけが必要であろう。
さらに、この発明の組換酵素の用途は、セルロースから
のグルコースの製造に限定されない。コーヒー豆の障害
ポリサッカライドを加水分解することにより凍結乾燥コ
ーヒーの製造を促進するためにEGIIの特異性が有利に
使用されることはすでに述べた。CBHは、1,4−β,
D−グルカン結合に対する高い特異性を有するために、
価値ある研究の道具であり、従って、ポリサッカライド
標品中のこの結合の存否を確認するための手段を提供す
る。確かに、ある状況においては、セロビオースの純粋
な標品を特異的に得ることが望ましく、そしてこのため
にはCBHIが単独で有用であろう。CBHIセロビオヒドラー
ゼのみを生産するためにセルラーゼ生産菌を操作する方
法は、前に概略記載した。最後に、工業的酵母菌株が、
適当な優性選択マーカーを有するベクターを与えること
によって簡単にセルラーゼ複合体の1又は複数の構成成
分について形質転換されるであろう。ザ・モレキュラー
・バイオロン・オブ・イースト(The Molecular Biolog
y of Yeast),Cold Spring Harbor Meeting,1983
年8月16〜21日を参照のこと。
のグルコースの製造に限定されない。コーヒー豆の障害
ポリサッカライドを加水分解することにより凍結乾燥コ
ーヒーの製造を促進するためにEGIIの特異性が有利に
使用されることはすでに述べた。CBHは、1,4−β,
D−グルカン結合に対する高い特異性を有するために、
価値ある研究の道具であり、従って、ポリサッカライド
標品中のこの結合の存否を確認するための手段を提供す
る。確かに、ある状況においては、セロビオースの純粋
な標品を特異的に得ることが望ましく、そしてこのため
にはCBHIが単独で有用であろう。CBHIセロビオヒドラー
ゼのみを生産するためにセルラーゼ生産菌を操作する方
法は、前に概略記載した。最後に、工業的酵母菌株が、
適当な優性選択マーカーを有するベクターを与えること
によって簡単にセルラーゼ複合体の1又は複数の構成成
分について形質転換されるであろう。ザ・モレキュラー
・バイオロン・オブ・イースト(The Molecular Biolog
y of Yeast),Cold Spring Harbor Meeting,1983
年8月16〜21日を参照のこと。
B.3. 組換遺伝子酵母ベクター 下に記載するように、この発明に従って造成された組換
ベクターは、分泌される、グリコシル化された、生物学
的に活性なセルラーゼの酵母中での効率的な生産をもた
らす。酵母における外来性組換セルラーゼの生産のため
に重要なベクターの構造的特徴は、(1)酵母プロモータ
ー配列;(2)該プロモーターにリンクされたセルラーゼ
酵素シグナル配列;及び(3)生産されるべき成熟セルラ
ーゼのコード領域を含む。さらに、例示する組換ベクタ
ーはセルラーゼコー領域の3′末端に酵母ターミネータ
ーを含有する。
ベクターは、分泌される、グリコシル化された、生物学
的に活性なセルラーゼの酵母中での効率的な生産をもた
らす。酵母における外来性組換セルラーゼの生産のため
に重要なベクターの構造的特徴は、(1)酵母プロモータ
ー配列;(2)該プロモーターにリンクされたセルラーゼ
酵素シグナル配列;及び(3)生産されるべき成熟セルラ
ーゼのコード領域を含む。さらに、例示する組換ベクタ
ーはセルラーゼコー領域の3′末端に酵母ターミネータ
ーを含有する。
この発明の観点に従えば、セルラーゼ遺伝子を含有する
酵母ベクターは、常用の組換技法により、(1)上記の酵
母プロモーター;(2)セルラーゼ酵素シグナル配列;及
び(3)該シグナル配列の3′末端又は隣接するセルラー
ゼコード領域中に、外来性遺伝子を導入することができ
るための適当な制限部位;を含有するように変形するこ
とができる。この外来性遺伝子は他のセルラーゼ、又は
関連性のない蛋白質、例えばアミラーゼ、プロテアー
ゼ、ペプチドホルモン、又は外来性遺伝子を好ましくは
非中断形として得ることができる他の多くのペプチドの
いずれかをコードするであろう。
酵母ベクターは、常用の組換技法により、(1)上記の酵
母プロモーター;(2)セルラーゼ酵素シグナル配列;及
び(3)該シグナル配列の3′末端又は隣接するセルラー
ゼコード領域中に、外来性遺伝子を導入することができ
るための適当な制限部位;を含有するように変形するこ
とができる。この外来性遺伝子は他のセルラーゼ、又は
関連性のない蛋白質、例えばアミラーゼ、プロテアー
ゼ、ペプチドホルモン、又は外来性遺伝子を好ましくは
非中断形として得ることができる他の多くのペプチドの
いずれかをコードするであろう。
下のD項は、酵母エノラーゼプロモーター、CBHIシグ
ナル配列、T.リーゼイ由来成熟CBHIのコード配列及び
酵母エノラーゼターミネーターを含有するpenoCBH500.2
02と称する例示的な酵母ベクターを説明する。このベク
ターは、公知の方法に従って変形して、CBHIコード配列
の全部又は一部分を外来性蛋白質コード配列で置き換え
ることができる。得られたベクターは、酵母における外
来性蛋白質の効率的なプロセシング及び分泌を可能にす
る。
ナル配列、T.リーゼイ由来成熟CBHIのコード配列及び
酵母エノラーゼターミネーターを含有するpenoCBH500.2
02と称する例示的な酵母ベクターを説明する。このベク
ターは、公知の方法に従って変形して、CBHIコード配列
の全部又は一部分を外来性蛋白質コード配列で置き換え
ることができる。得られたベクターは、酵母における外
来性蛋白質の効率的なプロセシング及び分泌を可能にす
る。
下記のE項は、酵母エノラーゼプロモーター、EGIシグ
ナル配列、T.リーゼイ由来成熟EGIのコード配列、及び
上記のエノラーゼターネーター配列を含有するpJV160と
称する例示的な酵母ベクターを説明する。類似の技法を
用いることにより、このベクターを、酵母における外来
性遺伝子生成物の効率的なプロセシング及び分泌をもた
らすために変形することができる。
ナル配列、T.リーゼイ由来成熟EGIのコード配列、及び
上記のエノラーゼターネーター配列を含有するpJV160と
称する例示的な酵母ベクターを説明する。類似の技法を
用いることにより、このベクターを、酵母における外来
性遺伝子生成物の効率的なプロセシング及び分泌をもた
らすために変形することができる。
C.T.リ-ゼイL27株由来EGI及びCBHIのクローニング及び発
現 後のD項及びE項において、この発明の具体例を記載す
る。この具体例においては、T.リーゼイL27株から分
泌されるCBHI及びEGIをコードするそれぞれのDNA配
列がクローニングされ、そして発現される。これらの例
示的具体例は、この発明を限定するものではなく、むし
ろ一般的に、組換セルラーゼ酵素、及び酵素のごとき異
宿主中でのグリコシル化された、成熟した、酵素的に活
性な菌類性セルラーゼ酵素の生産を可能にする発現ベク
ターを得るための例示的で実施可能な方法を記載するも
のである。
現 後のD項及びE項において、この発明の具体例を記載す
る。この具体例においては、T.リーゼイL27株から分
泌されるCBHI及びEGIをコードするそれぞれのDNA配
列がクローニングされ、そして発現される。これらの例
示的具体例は、この発明を限定するものではなく、むし
ろ一般的に、組換セルラーゼ酵素、及び酵素のごとき異
宿主中でのグリコシル化された、成熟した、酵素的に活
性な菌類性セルラーゼ酵素の生産を可能にする発現ベク
ターを得るための例示的で実施可能な方法を記載するも
のである。
簡単に、且つ要約して記載すれば、2つのコード配列の
好ましい分離源は、T.リーゼイL27株である。この
菌株は、セルラーゼ複合体の高生産菌として、そして
T.リーゼイ由来のEGI及びCBHI配列の部分がすでに
公表されている(後で言及する)ために選択した。
好ましい分離源は、T.リーゼイL27株である。この
菌株は、セルラーゼ複合体の高生産菌として、そして
T.リーゼイ由来のEGI及びCBHI配列の部分がすでに
公表されている(後で言及する)ために選択した。
イントロン不含コード配列を得るためのストラテジーは
次の通りである。選択された菌類からセルロース誘導後
にポリ−A RNA(mRNA)を分離し、そしてアガローズ
ゲル電気泳動を用いてサイズ分画した。誘導された細胞
からのmRNA画分を含有するゲル(このものは、誘導され
ていない細胞において比較的少量のみ存在する、又は存
在しない多数のバンドを示した)をサイズに従ってスラ
イスし、各スライスを目的とするmRNAの存在について試
験した。試験は、溶出されたmRNAを試験管内蛋白質合成
(翻訳)系に加え、そして全蛋白質、及び抗−EGI抗体
又は抗−CBHI抗体の存在下で免疫沈澱するポリペプチ
ドの両者をSDS−PAGEを用いて電気泳動することによっ
て合成された蛋白質を分析することにより実施した。こ
の方法により、各場合において所望のメッセージが濃縮
されているmRNA画分を同定することが可能であった。
次の通りである。選択された菌類からセルロース誘導後
にポリ−A RNA(mRNA)を分離し、そしてアガローズ
ゲル電気泳動を用いてサイズ分画した。誘導された細胞
からのmRNA画分を含有するゲル(このものは、誘導され
ていない細胞において比較的少量のみ存在する、又は存
在しない多数のバンドを示した)をサイズに従ってスラ
イスし、各スライスを目的とするmRNAの存在について試
験した。試験は、溶出されたmRNAを試験管内蛋白質合成
(翻訳)系に加え、そして全蛋白質、及び抗−EGI抗体
又は抗−CBHI抗体の存在下で免疫沈澱するポリペプチ
ドの両者をSDS−PAGEを用いて電気泳動することによっ
て合成された蛋白質を分析することにより実施した。こ
の方法により、各場合において所望のメッセージが濃縮
されているmRNA画分を同定することが可能であった。
次に、同定されたmRNAを用いて単鎖コピーDNA(cDNA)を
得、これを放射性ラベルしてゲノムライブラリーのプロ
ーブとして使用した。このcDNAはまた、EGI遺伝子又は
CBHI遺伝子のコード配列を含有する断片を含む。cDNA
ライブラリーを得るためにも用いた。
得、これを放射性ラベルしてゲノムライブラリーのプロ
ーブとして使用した。このcDNAはまた、EGI遺伝子又は
CBHI遺伝子のコード配列を含有する断片を含む。cDNA
ライブラリーを得るためにも用いた。
選択された菌類株からのゲノムDNAライブラリーはλ−
ファージ中に調製した。菌類からの全核DNAを、1又は
複数の選択された制限酵素を用いて部分消化し、そして
ファージベクターに挿入した。このファージライブリー
はこの菌類セルロース複合体のすべての酵素をコードす
るコード配列を含有する。クローニングされた断片は適
切な濃縮されたmRNA画分から誘導されたcDNAを用いて検
出した。CBHI又はEGIに特異的なプローブに相同のフ
ァージを同定し、そしてコード配列に対応するT.リー
ゼイDNA断片を適当なプラスミドベクターにサブクロー
ニングした。完全EGI配列を含有する4kbHind IIIゲノ
ム断片、並びに一緒になって完全CBHI配列をコードす
る1.16kb及び2.3kbの隣接する2個のHind IIIゲノム断
片をこの方法により得た。
ファージ中に調製した。菌類からの全核DNAを、1又は
複数の選択された制限酵素を用いて部分消化し、そして
ファージベクターに挿入した。このファージライブリー
はこの菌類セルロース複合体のすべての酵素をコードす
るコード配列を含有する。クローニングされた断片は適
切な濃縮されたmRNA画分から誘導されたcDNAを用いて検
出した。CBHI又はEGIに特異的なプローブに相同のフ
ァージを同定し、そしてコード配列に対応するT.リー
ゼイDNA断片を適当なプラスミドベクターにサブクロー
ニングした。完全EGI配列を含有する4kbHind IIIゲノ
ム断片、並びに一緒になって完全CBHI配列をコードす
る1.16kb及び2.3kbの隣接する2個のHind IIIゲノム断
片をこの方法により得た。
さらに制限分析及び配列決定を行うことにより、選択さ
れた断片のコード部分の配列を決定した。遺伝子の配列
により、CBHI遺伝子及びEGI遺伝子の両方に2個ずつ
のイントロンを同定した。好ましくは遺伝子をその発現
ベクターに入れる前に、セルラーゼ遺伝子イントロンを
除去する。
れた断片のコード部分の配列を決定した。遺伝子の配列
により、CBHI遺伝子及びEGI遺伝子の両方に2個ずつ
のイントロンを同定した。好ましくは遺伝子をその発現
ベクターに入れる前に、セルラーゼ遺伝子イントロンを
除去する。
CBHIについては、cDNA断片置換により2個のイントロ
ンを除去した。EGIについては、1つのイントロンを、
ゲノムDNAの部分をcDNAライブラリーから得られたcDNA
クローンの対応する配列で置換することにより除去し、
他方のイントロンは、化学合成プライマーを用いる部位
特定変異誘発により除去した。
ンを除去した。EGIについては、1つのイントロンを、
ゲノムDNAの部分をcDNAライブラリーから得られたcDNA
クローンの対応する配列で置換することにより除去し、
他方のイントロンは、化学合成プライマーを用いる部位
特定変異誘発により除去した。
イントロン不含CBHIコード断片を用いて、酵母を形質
転換して機能的に活性なCBHIを分泌せしめることがで
きる発現ベクターの造成を行った。EGIについては、コ
ード配列の末端を部位特定変異誘発によって変形して所
望の制限部位を挿入してHind IIIカセットとして使用し
得る完全コード配列を作った。このカセットを酵母中で
機能し得る発現ベクターにクローニングし、そしてこれ
を用いて適当な酵母宿主を形質転換し、EGIを生産する
ことができる細換細胞を得た。
転換して機能的に活性なCBHIを分泌せしめることがで
きる発現ベクターの造成を行った。EGIについては、コ
ード配列の末端を部位特定変異誘発によって変形して所
望の制限部位を挿入してHind IIIカセットとして使用し
得る完全コード配列を作った。このカセットを酵母中で
機能し得る発現ベクターにクローニングし、そしてこれ
を用いて適当な酵母宿主を形質転換し、EGIを生産する
ことができる細換細胞を得た。
同様にして、EG II、CBH II、並びにβ−グルコシダー
ゼ−I及びβ−グルコシダーゼ−IIのためのイントロン
不含コード配列を得、適当な宿主ベクターに導入し、そ
して所望の宿主、例えば酵母を形質転換する。確かに、
下に記載するのと同様にしてβ−グルコシダーゼIIに対
する抗体標品を調製し、正しいmRNA画分を同定し、そし
てこの酵素のためのcDNAプロブ(単鎖)及びクローニン
グベクターcDNAライブラリー(二重鎖)を調製した。
ゼ−I及びβ−グルコシダーゼ−IIのためのイントロン
不含コード配列を得、適当な宿主ベクターに導入し、そ
して所望の宿主、例えば酵母を形質転換する。確かに、
下に記載するのと同様にしてβ−グルコシダーゼIIに対
する抗体標品を調製し、正しいmRNA画分を同定し、そし
てこの酵素のためのcDNAプロブ(単鎖)及びクローニン
グベクターcDNAライブラリー(二重鎖)を調製した。
D.組換CBHIの調製 この項は、イントロン不含セロビオヒドロラーゼ−I
(CBHI)遺伝子、該遺伝子が組換DNA枝法によって導入
された発現ベクター、これらのベクターにより形質転換
された宿主、及びこうして調製さたCBHIについて記載
する。CBHI遺伝子を選択されれた菌類から得る。この
菌類は好ましくは、セルロースのごとき誘導性炭素源に
増殖した場合に誘導されたレベルの細胞外セルラーゼ
(CBHIを含む)を生産することができるものである。
(CBHI)遺伝子、該遺伝子が組換DNA枝法によって導入
された発現ベクター、これらのベクターにより形質転換
された宿主、及びこうして調製さたCBHIについて記載
する。CBHI遺伝子を選択されれた菌類から得る。この
菌類は好ましくは、セルロースのごとき誘導性炭素源に
増殖した場合に誘導されたレベルの細胞外セルラーゼ
(CBHIを含む)を生産することができるものである。
D.1.CBHIの菌類入手源の選択 この発明において使用するためのCBHIの菌類入手源の
選択に当っては、CBHI及び対応するmRNAが、非誘導性
炭素源に増殖した場合の実質上検出不可能な活性レベル
から、セルロースのごとき誘導性炭素源に増殖した場合
の容易に測定し得るレベルに誘導され得るような生物を
選択するのが有利である。好ましい菌類にはトリコデル
マ属の種が含まれ、そしてセルロースの存在下に増殖し
た場合に誘導される全細胞外セルラーゼの約60%まで
も占める誘導性CBHI酵素を有するT.リーゼイが最も
好ましい。T.リーゼイの追加の利点は、誘導性セルラ
ーゼ系を構成する酵素が比較的よく研究されていること
である。特に、T.リーゼイCBHI酵素のアミノ酸配列
の実質的な部分が報告されている〔Fagerstam,L等,F
EBSレター(FEBS LETT.)(1980)119:97;
及びFagerstam,L.G.,ドクトラル・セシス(Docto
ral Thesis),スゥエーデン,アプサラ大学(198
1)〕。
選択に当っては、CBHI及び対応するmRNAが、非誘導性
炭素源に増殖した場合の実質上検出不可能な活性レベル
から、セルロースのごとき誘導性炭素源に増殖した場合
の容易に測定し得るレベルに誘導され得るような生物を
選択するのが有利である。好ましい菌類にはトリコデル
マ属の種が含まれ、そしてセルロースの存在下に増殖し
た場合に誘導される全細胞外セルラーゼの約60%まで
も占める誘導性CBHI酵素を有するT.リーゼイが最も
好ましい。T.リーゼイの追加の利点は、誘導性セルラ
ーゼ系を構成する酵素が比較的よく研究されていること
である。特に、T.リーゼイCBHI酵素のアミノ酸配列
の実質的な部分が報告されている〔Fagerstam,L等,F
EBSレター(FEBS LETT.)(1980)119:97;
及びFagerstam,L.G.,ドクトラル・セシス(Docto
ral Thesis),スゥエーデン,アプサラ大学(198
1)〕。
効率的、且つ大量にCBHIのmRNAを生産する微生物の能
力は、コロニー選択枝法により、好ましくは微生物を変
異源に暴露した後に、上昇したレベルの1又は複数のセ
ルラーゼを生産することができ、そして/又は最大に誘
導されたレベルのセルラーゼを短縮された発酵期間に生
産することができる菌株を同定することにより、さらに
強化される。本発明の発明者の1人(Shoemaker)はす
でに、商業的に入手できる親株の場合よりも高い誘導さ
れたレベルのセルラーゼ酵素を生産することができる一
群のT.リーゼイ変異株を記載している。さらに、後に
記載するように、親株の場合よりも短い酵素誘導期間の
後に細胞外セルラーゼの最も大きな増加が観察された。
このタイプのT.リーゼイ変異株を得るための方法の詳
細な検討については、Shoemaker,S.P.等,トレン
ド・イン・ザ・バイオロジー・オブ・ファーメンテーシ
ョン・フォア・フュールス・アンド・ケミカルス(Tren
ds in the Biology of Fermentation for Fuels and Ch
emicalg),Hollaender等編,Plenum Publishing Corp
・,ニューヨーク,ニューヨーク州(1981)89頁
を参照のこと。ここで記載しようとすることは、L27
株と命名された変異株と、この発明において使用するた
めの好ましい候補としてのL27株が選択された親株Qu
artermasterNo.9414(QM9414)との比較特性
である。
力は、コロニー選択枝法により、好ましくは微生物を変
異源に暴露した後に、上昇したレベルの1又は複数のセ
ルラーゼを生産することができ、そして/又は最大に誘
導されたレベルのセルラーゼを短縮された発酵期間に生
産することができる菌株を同定することにより、さらに
強化される。本発明の発明者の1人(Shoemaker)はす
でに、商業的に入手できる親株の場合よりも高い誘導さ
れたレベルのセルラーゼ酵素を生産することができる一
群のT.リーゼイ変異株を記載している。さらに、後に
記載するように、親株の場合よりも短い酵素誘導期間の
後に細胞外セルラーゼの最も大きな増加が観察された。
このタイプのT.リーゼイ変異株を得るための方法の詳
細な検討については、Shoemaker,S.P.等,トレン
ド・イン・ザ・バイオロジー・オブ・ファーメンテーシ
ョン・フォア・フュールス・アンド・ケミカルス(Tren
ds in the Biology of Fermentation for Fuels and Ch
emicalg),Hollaender等編,Plenum Publishing Corp
・,ニューヨーク,ニューヨーク州(1981)89頁
を参照のこと。ここで記載しようとすることは、L27
株と命名された変異株と、この発明において使用するた
めの好ましい候補としてのL27株が選択された親株Qu
artermasterNo.9414(QM9414)との比較特性
である。
L27株によって一層高いレベルの細胞外セルラーゼが
生産されることにより、この菌株がQM9414株より
も高レベルのセルラーゼmRNAを生産することが示唆され
る。この2つの菌株における相対的なセルラーゼmRNAレ
ベルを決定するために、セルラーゼ誘導条件下で増殖し
たこれら2菌株のそれぞれに由来する全ポリA RNAを
分離し、そして無細胞蛋白質合成系に加えてセルラーゼ
ポリペプチドの合成を指令した。無細胞蛋白質合成を行
うのに使用される一般的方法は、後のD.3項において
記載する。各無細胞合成実験において合成されたポリペ
プチドを、CBHI、EGI、又はβ−グルコシダーゼのい
ずれかに対する抗体と免疫沈澱せしめた。免疫沈澱は、
C.3.項に言及したドデシル硫酸ナトリウム−ポリアクリ
ルアミドゲル電気泳動(SDS−PAGE)により常法通りに
行った。ゲルの特異的蛋白質バンド領域(示してない)
における放射能の相対量により判定した場合、L27株
は、3種類の酵素すべてについて高い試験管内翻管訳活
性を示し、この菌株は検討された各セルラーゼ成分につ
いて高い生体内レベルのmRNAを生産することが示唆され
た。
生産されることにより、この菌株がQM9414株より
も高レベルのセルラーゼmRNAを生産することが示唆され
る。この2つの菌株における相対的なセルラーゼmRNAレ
ベルを決定するために、セルラーゼ誘導条件下で増殖し
たこれら2菌株のそれぞれに由来する全ポリA RNAを
分離し、そして無細胞蛋白質合成系に加えてセルラーゼ
ポリペプチドの合成を指令した。無細胞蛋白質合成を行
うのに使用される一般的方法は、後のD.3項において
記載する。各無細胞合成実験において合成されたポリペ
プチドを、CBHI、EGI、又はβ−グルコシダーゼのい
ずれかに対する抗体と免疫沈澱せしめた。免疫沈澱は、
C.3.項に言及したドデシル硫酸ナトリウム−ポリアクリ
ルアミドゲル電気泳動(SDS−PAGE)により常法通りに
行った。ゲルの特異的蛋白質バンド領域(示してない)
における放射能の相対量により判定した場合、L27株
は、3種類の酵素すべてについて高い試験管内翻管訳活
性を示し、この菌株は検討された各セルラーゼ成分につ
いて高い生体内レベルのmRNAを生産することが示唆され
た。
上記の実験において、細胞外セルラーゼの最も大きな増
加が観察された時点において、誘導された増養物から全
ポリA RBAを分離した。この誘導時間はL27株につい
ては約18〜20時間の間であり、QM9414株につ
いては約26〜28時間の間であった。従って、L27
株は、誘導されたセルラーゼmRNAの生産のために相対的
に短い時間でよいという追加の利点をもたらす。ここ
で、セルラーゼの合成がグルコースにより制御される親
株QM9414と異り、L27株はセルロース又はグル
コースのいずれかに増殖した場合に誘導されたセルロー
スレベルを示すことが注目される。
加が観察された時点において、誘導された増養物から全
ポリA RBAを分離した。この誘導時間はL27株につい
ては約18〜20時間の間であり、QM9414株につ
いては約26〜28時間の間であった。従って、L27
株は、誘導されたセルラーゼmRNAの生産のために相対的
に短い時間でよいという追加の利点をもたらす。ここ
で、セルラーゼの合成がグルコースにより制御される親
株QM9414と異り、L27株はセルロース又はグル
コースのいずれかに増殖した場合に誘導されたセルロー
スレベルを示すことが注目される。
D.2. CBHI蛋白質の精製及び抗CBHI抗体の製造 この発明の特徴に従えば、CBHIは、抗CBHI抗体と免疫
反応を行うポポリペプチドの無細胞蛋白質合成系におけ
る合成を指令するその能力によって同定される。抗体は
好ましくは、CBH I mRNAの選択された菌類性分離源から
得られた精製されたCBHI酵素に対して生成せしめる。
反応を行うポポリペプチドの無細胞蛋白質合成系におけ
る合成を指令するその能力によって同定される。抗体は
好ましくは、CBH I mRNAの選択された菌類性分離源から
得られた精製されたCBHI酵素に対して生成せしめる。
精製されたCBHIは、細胞外培養液から蛋白質を精製す
るための標準的方法に従って得られる。
るための標準的方法に従って得られる。
典型的には、純粋な酵素が得られるまで、ブロス又は
液を1回又は複数回のイオン交換クロマトグラフ段階に
よって画分し、必要であれば分子篩クロマトグラフ段階
により画分する。酵素は精製段階中において、後に記載
するような常用のセルラーゼ測定法、及びSDS−PAGEに
より測定することができる。
液を1回又は複数回のイオン交換クロマトグラフ段階に
よって画分し、必要であれば分子篩クロマトグラフ段階
により画分する。酵素は精製段階中において、後に記載
するような常用のセルラーゼ測定法、及びSDS−PAGEに
より測定することができる。
例えば、T.リーゼイL27株からのCBHIを、FMC Cor
p.(ロックフイールド,メリーランド)から得られる
8%のアビセル(Avicel)(微細晶セルロース)に増殖
した菌殖した菌株の8日間培養物から精製した。発酵液
を0.45ミクロンのマイクロポアフィルターに通すこと
によって細胞性物質を除去し、次に透析し、そしてアミ
コン限外過セル(レキシントン,マサチューセッツ)
を用いて50mM酢酸ナトリウム緩衝液(pH5.5)中で
濃縮した。濃縮された細胞外液を、フアルマシアファ
インケミカルス(スウェーデン,ウプラス)製DEAE−セ
ファロースを用いる陰イオン交換クロマトグラフィーに
より画分した。カラムを、50mM酢酸ナトリウム緩衝
液(pH5.0)中0〜300mM塩化ナトリウムのグラジェン
トにより溶出した。CBHI約200mMNaClにおいてカ
ラムから溶出した。
p.(ロックフイールド,メリーランド)から得られる
8%のアビセル(Avicel)(微細晶セルロース)に増殖
した菌殖した菌株の8日間培養物から精製した。発酵液
を0.45ミクロンのマイクロポアフィルターに通すこと
によって細胞性物質を除去し、次に透析し、そしてアミ
コン限外過セル(レキシントン,マサチューセッツ)
を用いて50mM酢酸ナトリウム緩衝液(pH5.5)中で
濃縮した。濃縮された細胞外液を、フアルマシアファ
インケミカルス(スウェーデン,ウプラス)製DEAE−セ
ファロースを用いる陰イオン交換クロマトグラフィーに
より画分した。カラムを、50mM酢酸ナトリウム緩衝
液(pH5.0)中0〜300mM塩化ナトリウムのグラジェン
トにより溶出した。CBHI約200mMNaClにおいてカ
ラムから溶出した。
酵素を、50mM酢酸ナトリウム緩衝液(pH6.0)中DEA
E−セファロースを用いるイオン交換グロマトグラフィ
ーによりさらに精製した。
E−セファロースを用いるイオン交換グロマトグラフィ
ーによりさらに精製した。
CBHIはまた、0〜300mM塩化ナトリウムグラジェ
ント中約200mMNaClにおいてカラムから溶出した。
カラム溶出画分中のCBHIの存在は、50mM酢酸ナト
リウム緩衝液(pH4.5)中に1%燐酸膨潤セルロース(P
SC)を含有する溶液中で前記画分を45℃にて30分間
インキュベートした後における還元糖の存在により同定
した。還元糖の同定は、セロビオースと同様、高速液体
クロマトグラフィー(HPLC)により確認した。エキソ−
セロビオヒドロラーゼ測定の詳細については、Shoemake
r,S.P.等,ビオケミカ・ビオフィジカ・アクタ(B
iochem.Biopheys.Acta)(1978)523:147を
参照のこと。
ント中約200mMNaClにおいてカラムから溶出した。
カラム溶出画分中のCBHIの存在は、50mM酢酸ナト
リウム緩衝液(pH4.5)中に1%燐酸膨潤セルロース(P
SC)を含有する溶液中で前記画分を45℃にて30分間
インキュベートした後における還元糖の存在により同定
した。還元糖の同定は、セロビオースと同様、高速液体
クロマトグラフィー(HPLC)により確認した。エキソ−
セロビオヒドロラーゼ測定の詳細については、Shoemake
r,S.P.等,ビオケミカ・ビオフィジカ・アクタ(B
iochem.Biopheys.Acta)(1978)523:147を
参照のこと。
2回クロマトグラフ処理したCBHIの純度は、垂直スラ
ブ装置中で不連続緩衝系の変法〔Laemmli,U.K.
等,ジヤーナル・オブ・モレキュラー・バイオロジー
(J.Mol.Biol.)(1973)80:575〕を用い
て、SDS−PAGEにより分析した。電気泳動的に分離され
た蛋白質はクマーシーブルー(Coomassie Blue)R25
0で染色することにより検出した。ゲルは単一の染色バ
ンドを示し、酵素が実質純粋であることが示された。こ
の蛋白質の見かけ分子量を、その移動速度を分子量既知
のそと比較することにより、約66,000ドルトンであ
ると算定した。
ブ装置中で不連続緩衝系の変法〔Laemmli,U.K.
等,ジヤーナル・オブ・モレキュラー・バイオロジー
(J.Mol.Biol.)(1973)80:575〕を用い
て、SDS−PAGEにより分析した。電気泳動的に分離され
た蛋白質はクマーシーブルー(Coomassie Blue)R25
0で染色することにより検出した。ゲルは単一の染色バ
ンドを示し、酵素が実質純粋であることが示された。こ
の蛋白質の見かけ分子量を、その移動速度を分子量既知
のそと比較することにより、約66,000ドルトンであ
ると算定した。
精製されたL27CBHIのアミノ酸組成及び配列と、T.
リーゼイQM9414から得られたCBHI酵素のアミノ
酸組成及び配列(Fagerstam,L.等,前掲;及びFagers
tam,L.G.,前掲に開示される)とを比較した。
リーゼイQM9414から得られたCBHI酵素のアミノ
酸組成及び配列(Fagerstam,L.等,前掲;及びFagers
tam,L.G.,前掲に開示される)とを比較した。
2つの酵素のアミノ酸組成を次のようにして比較した。
L27株由来の精製されたCBHIを、Watt,K.W.
等,プロシーディングス・オブ・ナショナル・アカデミ
ー・オブサイエンス,米国(Proc.Nat.Acad.Sci.,USA)
(1978)75:1731に記載されているように、
6mMグアニジン中ジチオスレイトール(0.02mM)
により還元し、そしてヨウド〔14C〕酢酸でカルボキシ
メチル化した。還元されそしてカルボキシメチル化され
たCBHIのアミノ酸分析は、40μgの蛋白質を5.7NH
Cl中0.1フェノールにより、108℃にて24,48及
び72時間、真空中で加水分解することにより行った。
加水分解物中のアミノ酸を、Spinco model121MB Ami
no Acid Analyzer(Beckman Instruments,Inc.パロア
ルト,カリホルニア)を用いて定量した。トリプトファ
ンは、5.7NHCl中10%メルカプト酢酸を用いる別の
酸分解物から測定した。L27株CBHIについて得られ
たアミノ酸組成は、T.リーゼイQM9414由来のCBHI
の公表されているアミノ酸組成とほとんど同一であっ
た。
L27株由来の精製されたCBHIを、Watt,K.W.
等,プロシーディングス・オブ・ナショナル・アカデミ
ー・オブサイエンス,米国(Proc.Nat.Acad.Sci.,USA)
(1978)75:1731に記載されているように、
6mMグアニジン中ジチオスレイトール(0.02mM)
により還元し、そしてヨウド〔14C〕酢酸でカルボキシ
メチル化した。還元されそしてカルボキシメチル化され
たCBHIのアミノ酸分析は、40μgの蛋白質を5.7NH
Cl中0.1フェノールにより、108℃にて24,48及
び72時間、真空中で加水分解することにより行った。
加水分解物中のアミノ酸を、Spinco model121MB Ami
no Acid Analyzer(Beckman Instruments,Inc.パロア
ルト,カリホルニア)を用いて定量した。トリプトファ
ンは、5.7NHCl中10%メルカプト酢酸を用いる別の
酸分解物から測定した。L27株CBHIについて得られ
たアミノ酸組成は、T.リーゼイQM9414由来のCBHI
の公表されているアミノ酸組成とほとんど同一であっ
た。
成熟CBHI酵素の最初の37N−端アミノ酸を含む、L
27株酵素のN−端部分を配列決定し、そしてT.リーゼ
イQM9414由来のすでに配列決定されたCBHI蛋白
質の対応する部分と比較した。精製されたL27株CBH
I40〜50nモルを用いる自動アミノ酸配列決定を、
スピンニング・カップ・シーケンサー(コールドトラッ
プを用いて変形したモデル890c,Beckman Instru-m
ents,Inc.,パロアルト,カリホルニア)を用いて実施
した。T.リーゼイL27株CBHIは、ピログルタミル残
基によりアミノ末端においてブロックされている。Pode
ll,D.N.等,ビオケミカル・アンド・ビオフィジカ
ル・リサーチ・コミュニケーションズ(Biochem.Biophy
s.Res.Commun.)(1978)81:176に記載され
ているように、牛肝臓ピログルタメートペプチダーゼ
(Boehringer Bioche-micals)を用いて蛋白質を処理す
ることにより前記の残基を除去す。ペプチダーゼ処理の
後、酵素を過し、凍結乾燥し、ジチオスレイトールで
還元し、そしてヨウド〔14C〕酢酸を用いてカルボキシ
メチル化し、そして配列分析に直接使用した。ブローリ
ン残基がアミノ末端であると決定された場合、すべての
新しく生成したアミノ末端をブロックすることにより配
列分析中のバックグラウンドの一時的還元を達成した。
シーケンサーからの分解生成物の同定は完全に自動化さ
れたHPLC系のアミノ酸アナライザー(Waters Associate
s)により行った。
27株酵素のN−端部分を配列決定し、そしてT.リーゼ
イQM9414由来のすでに配列決定されたCBHI蛋白
質の対応する部分と比較した。精製されたL27株CBH
I40〜50nモルを用いる自動アミノ酸配列決定を、
スピンニング・カップ・シーケンサー(コールドトラッ
プを用いて変形したモデル890c,Beckman Instru-m
ents,Inc.,パロアルト,カリホルニア)を用いて実施
した。T.リーゼイL27株CBHIは、ピログルタミル残
基によりアミノ末端においてブロックされている。Pode
ll,D.N.等,ビオケミカル・アンド・ビオフィジカ
ル・リサーチ・コミュニケーションズ(Biochem.Biophy
s.Res.Commun.)(1978)81:176に記載され
ているように、牛肝臓ピログルタメートペプチダーゼ
(Boehringer Bioche-micals)を用いて蛋白質を処理す
ることにより前記の残基を除去す。ペプチダーゼ処理の
後、酵素を過し、凍結乾燥し、ジチオスレイトールで
還元し、そしてヨウド〔14C〕酢酸を用いてカルボキシ
メチル化し、そして配列分析に直接使用した。ブローリ
ン残基がアミノ末端であると決定された場合、すべての
新しく生成したアミノ末端をブロックすることにより配
列分析中のバックグラウンドの一時的還元を達成した。
シーケンサーからの分解生成物の同定は完全に自動化さ
れたHPLC系のアミノ酸アナライザー(Waters Associate
s)により行った。
この方法により決定された部分配分配列は、37アミノ
酸中36アミノ酸において、T.リーゼイQM9414由
来の成熟CBHIの最初の37アミノ酸の公表されている
配列と同一であり、アミノ酸組成データと相俟って、L
27株CBHIはQM9414CBHIと同一であるか、又はほ
とんど同一であることが確認された。
酸中36アミノ酸において、T.リーゼイQM9414由
来の成熟CBHIの最初の37アミノ酸の公表されている
配列と同一であり、アミノ酸組成データと相俟って、L
27株CBHIはQM9414CBHIと同一であるか、又はほ
とんど同一であることが確認された。
精製された蛋白質を、常法により抗CBHI抗体を生成せ
しめるために用いる。得られた抗体を、エキソーセロビ
オヒドロラーゼ酵素活性を中和する能力、及び誘導され
たセルラーゼ酵素の混合物からCBHIを特異的に免疫沈
澱せしめる能力について試験する。
しめるために用いる。得られた抗体を、エキソーセロビ
オヒドロラーゼ酵素活性を中和する能力、及び誘導され
たセルラーゼ酵素の混合物からCBHIを特異的に免疫沈
澱せしめる能力について試験する。
T.リーゼイL27株由来の精製されたCBHIに対する抗
体を調製するために、該精製された酵素をフロインドの
アジュバントと混合し、そして0.2〜0.4mの混合物
をニュージーランドホワイトラビットに筋肉内注射し
た。注射は、10日毎に、抗体価がOuchterlony,O.
アーキブ・ケミ(Arkiv Kemi.)(1949)1:43
の二重免疫拡散法により検出されるまで反復した。
体を調製するために、該精製された酵素をフロインドの
アジュバントと混合し、そして0.2〜0.4mの混合物
をニュージーランドホワイトラビットに筋肉内注射し
た。注射は、10日毎に、抗体価がOuchterlony,O.
アーキブ・ケミ(Arkiv Kemi.)(1949)1:43
の二重免疫拡散法により検出されるまで反復した。
製造された抗−CBHI抗体は精製されたCBHIのエキソ−
セロビオヒドロラーゼ酵素活性を中和することができ
た。Ouchterlony免疫拡散分析は、上記のCBHI標品に対
して調製された抗体がCBHI酵素及びEGI酵素の両者に
対して免疫反応性であることを示した。
セロビオヒドロラーゼ酵素活性を中和することができ
た。Ouchterlony免疫拡散分析は、上記のCBHI標品に対
して調製された抗体がCBHI酵素及びEGI酵素の両者に
対して免疫反応性であることを示した。
D.3.CBHImRNAについて濃縮されたmRNAの調製 CBHIの好ましい分離源、例えばT.リーゼイL27株
は、セルラーゼ誘導条件下で増殖した場合、非誘導培養
において実質上検出することができないCBHImRNAを含
有する。このmRNAは、無細胞蛋白質合成系において、同
じ微生物源から精製されたCBHI蛋白質に対して調製さ
れた抗体と免疫反応するポリペプチドの合成を指令する
ことができる。CBHImRNAについて濃縮されたRNA画分を
得るために、誘導培養から分離された全ポリARNAを、
例えばゲル電気泳動によりサイズ画分する。誘導された
微生物源及び非誘導微生物源からのポリARNAを並行し
て画分し、これら2つのポリARNA標品のゲル電気泳動
パターンを比較することができる。
は、セルラーゼ誘導条件下で増殖した場合、非誘導培養
において実質上検出することができないCBHImRNAを含
有する。このmRNAは、無細胞蛋白質合成系において、同
じ微生物源から精製されたCBHI蛋白質に対して調製さ
れた抗体と免疫反応するポリペプチドの合成を指令する
ことができる。CBHImRNAについて濃縮されたRNA画分を
得るために、誘導培養から分離された全ポリARNAを、
例えばゲル電気泳動によりサイズ画分する。誘導された
微生物源及び非誘導微生物源からのポリARNAを並行し
て画分し、これら2つのポリARNA標品のゲル電気泳動
パターンを比較することができる。
CBHImRNAが最も濃縮されたmRNA画分を同定するため
に、画分されたARNAの種々のサイズ画分を、無細胞合
成系において、抗−CBHI抗血清と共に免疫沈澱し得る
ポリペプチドの合成を指令するそれらの能力について試
験する。説明により、T.リーゼイL27株由来のCBHIm
RNAが濃縮されたmRNA画分を調製する方法を、ここに記
載する。
に、画分されたARNAの種々のサイズ画分を、無細胞合
成系において、抗−CBHI抗血清と共に免疫沈澱し得る
ポリペプチドの合成を指令するそれらの能力について試
験する。説明により、T.リーゼイL27株由来のCBHIm
RNAが濃縮されたmRNA画分を調製する方法を、ここに記
載する。
アビセル(Avicel)(18時間)又はグリセリン(48
時間)に増殖した対数中期のT.リーゼイL27株を収得
し、そして液体窒素中で凍結した。グリセリンに増殖し
た培養物は48時間の増殖期間中に測定し得る細胞外CB
HI活性を示さなかった。これらの培養物から、Chirgwi
n,J.M.等,ビオケミストリー(Biochem.)(1979)
18:5294に記載されている方法の変法を用いて、
全細胞RNAを分離した。簡単に記載すれば、凍結した細
胞を、4.7Mグアニジンチオシアナート及び12mMア
デノシン:VOSO4複合体(RNアーゼ阻害剤)中でホモジ
ナイズした。RNAを超遠心分離によりCsClクッションを
通してペレット化し、そしてオリゴdTクロマトグラフィ
ーによりポリARNAを分離した。誘導された培養物及び
非誘導培養物からのポリARNAを、Marine Colloids(ニ
ューヨーク)から得られる標準Sea Kemアガロースを用
いて公知の方法に従って、メチル水銀アガロースゲル上
で画分した。第1図は、アビセル(レーン1)又はグリ
セリン(レーン2)に増殖したT.リーゼイL27株由来
のポリARNAの電気泳動パターンを示す。2つのゲルパ
ターンの比較により、誘導された培養物に特異的である
か、又はこれに高濃度で存在する複数のRNAバンドが示
される。23SRNAに対応するRNAサイズ領域をこの図の
左側に示す。
時間)に増殖した対数中期のT.リーゼイL27株を収得
し、そして液体窒素中で凍結した。グリセリンに増殖し
た培養物は48時間の増殖期間中に測定し得る細胞外CB
HI活性を示さなかった。これらの培養物から、Chirgwi
n,J.M.等,ビオケミストリー(Biochem.)(1979)
18:5294に記載されている方法の変法を用いて、
全細胞RNAを分離した。簡単に記載すれば、凍結した細
胞を、4.7Mグアニジンチオシアナート及び12mMア
デノシン:VOSO4複合体(RNアーゼ阻害剤)中でホモジ
ナイズした。RNAを超遠心分離によりCsClクッションを
通してペレット化し、そしてオリゴdTクロマトグラフィ
ーによりポリARNAを分離した。誘導された培養物及び
非誘導培養物からのポリARNAを、Marine Colloids(ニ
ューヨーク)から得られる標準Sea Kemアガロースを用
いて公知の方法に従って、メチル水銀アガロースゲル上
で画分した。第1図は、アビセル(レーン1)又はグリ
セリン(レーン2)に増殖したT.リーゼイL27株由来
のポリARNAの電気泳動パターンを示す。2つのゲルパ
ターンの比較により、誘導された培養物に特異的である
か、又はこれに高濃度で存在する複数のRNAバンドが示
される。23SRNAに対応するRNAサイズ領域をこの図の
左側に示す。
誘導されたRNAを含有するゲルを、ゲルの23SRNA領域
から出発して低分子量RNAの方向に向って(図における
ゲルの下方に向って)2mm間隔で細断した。ゲルスライ
スからRNAを遊離せしめるために、各スライスを、0.1
MNaCl,0.01MEDTA及び0.2%SDSを含有する0.01
MTris−HCl緩衝液(pH7.5)中で95℃にて5分間溶融
した。アガロースを遠心分離によりペレット化した。上
清液をフェノール/クロロホルム抽出した後、エタノー
ルによりRNAを沈澱せしめ、そして水に溶解した。
から出発して低分子量RNAの方向に向って(図における
ゲルの下方に向って)2mm間隔で細断した。ゲルスライ
スからRNAを遊離せしめるために、各スライスを、0.1
MNaCl,0.01MEDTA及び0.2%SDSを含有する0.01
MTris−HCl緩衝液(pH7.5)中で95℃にて5分間溶融
した。アガロースを遠心分離によりペレット化した。上
清液をフェノール/クロロホルム抽出した後、エタノー
ルによりRNAを沈澱せしめ、そして水に溶解した。
ゲルスライスから得られた各RNA画分の少量を無細胞蛋
白質合成系、詳しくはNew England Nuclear Company
(ボストン,マサチューセッツ)から入手した、網状赤
血球溶解物/メチオニンL−〔35S〕−翻訳系として販
売された網状赤血球溶解物(reticulocyte lysate)キ
ットに加えた。Pelham,R.B.等,ヨーロピアン・ジ
ャーナル・オブ・バイオケミストリー(Europ.J.Bioche
m.)(1979)67:247は典型的な網状赤血球溶
解物系を記載している。規定された反応時間の後、溶解
物(lysate)のアリコートを取り出し、そしてSDS−PAG
Eにより分析した。全溶解物、又は溶解物に抗−CBHI抗
体を加えることにより生成した免疫沈澱物を分析した。
免疫反応生成物は本質上常法に従って沈澱せしめた。
白質合成系、詳しくはNew England Nuclear Company
(ボストン,マサチューセッツ)から入手した、網状赤
血球溶解物/メチオニンL−〔35S〕−翻訳系として販
売された網状赤血球溶解物(reticulocyte lysate)キ
ットに加えた。Pelham,R.B.等,ヨーロピアン・ジ
ャーナル・オブ・バイオケミストリー(Europ.J.Bioche
m.)(1979)67:247は典型的な網状赤血球溶
解物系を記載している。規定された反応時間の後、溶解
物(lysate)のアリコートを取り出し、そしてSDS−PAG
Eにより分析した。全溶解物、又は溶解物に抗−CBHI抗
体を加えることにより生成した免疫沈澱物を分析した。
免疫反応生成物は本質上常法に従って沈澱せしめた。
得られたゲル電気泳動パターンを選択して第2図に示
す。この図に示される1000ドルトン単位の分子量
を、図中左のレーンのマーカー蛋白質の位置により示
す。誘導された全ポリARNAを翻訳系に供給することに
よって生成した全リゼート(lysate)蛋白質の電気泳動
パターンをレーン1に示す。レーン2は、これらのペプ
チドと抗−CBHIの免疫沈澱物の加水分解物を用いた同
様のパターンを示す。図から明らかな通り、レーン2の
パターンは、CBHIの予想される見かけ分子量である約6
6,000ドルトンの分子量範囲における単一の比較的広
いバンドから成る。
す。この図に示される1000ドルトン単位の分子量
を、図中左のレーンのマーカー蛋白質の位置により示
す。誘導された全ポリARNAを翻訳系に供給することに
よって生成した全リゼート(lysate)蛋白質の電気泳動
パターンをレーン1に示す。レーン2は、これらのペプ
チドと抗−CBHIの免疫沈澱物の加水分解物を用いた同
様のパターンを示す。図から明らかな通り、レーン2の
パターンは、CBHIの予想される見かけ分子量である約6
6,000ドルトンの分子量範囲における単一の比較的広
いバンドから成る。
前に記載したように、T.リーゼイCBHIに対して調製さ
れた抗体はT.リーゼイEGIと交差反応を行うから、レー
ン2中の広い66,000分子量バンドの少なくとも一部
分はエンドグルカナーゼポリペプチドの合成によるもの
である可能性が生ずる。精製されたEGIは、SDS−PAGE
により分析した場合、CBHIから区別され、そして低い
分子量を示す蛋白質バンドを与えるという事実は、この
可能性に反対する。また、CBHI酵素は、ポリARNAが分
離された時点において菌類培養物中で誘導される全セル
ラーゼの約60%を占めるから、CBHIポリペプチド合
成は、翻訳系において生ずる全ペプチド合成の大部分を
占めることが期待される。これに対して、EGIは全セル
ラーゼの約5%を占めるに過ぎない。
れた抗体はT.リーゼイEGIと交差反応を行うから、レー
ン2中の広い66,000分子量バンドの少なくとも一部
分はエンドグルカナーゼポリペプチドの合成によるもの
である可能性が生ずる。精製されたEGIは、SDS−PAGE
により分析した場合、CBHIから区別され、そして低い
分子量を示す蛋白質バンドを与えるという事実は、この
可能性に反対する。また、CBHI酵素は、ポリARNAが分
離された時点において菌類培養物中で誘導される全セル
ラーゼの約60%を占めるから、CBHIポリペプチド合
成は、翻訳系において生ずる全ペプチド合成の大部分を
占めることが期待される。これに対して、EGIは全セル
ラーゼの約5%を占めるに過ぎない。
逐次的ゲルライスから得られたサイズ画分されたRNAを
用いて、翻訳系において放射性ポリペプチドの合成を指
令した。ゲルスライス#9(23SRNAバンドにおける
最初のゲル切断点から約18mmに位置するスライス)
は、レーン3に見られる全翻訳系生成ポリペプチドパタ
ーンを与えた。このパターンは46,000〜67,000ド
ルトンの分子量範囲に複数の蛋白質の集中を有する。抗
−CBHI抗体を加えることによって生成した免疫沈澱物
により生ずる同様のパターンをレーン4に示す。このレ
ーンはCBHIの分子量範囲に単一の広い蛋白質バンドを
示す。
用いて、翻訳系において放射性ポリペプチドの合成を指
令した。ゲルスライス#9(23SRNAバンドにおける
最初のゲル切断点から約18mmに位置するスライス)
は、レーン3に見られる全翻訳系生成ポリペプチドパタ
ーンを与えた。このパターンは46,000〜67,000ド
ルトンの分子量範囲に複数の蛋白質の集中を有する。抗
−CBHI抗体を加えることによって生成した免疫沈澱物
により生ずる同様のパターンをレーン4に示す。このレ
ーンはCBHIの分子量範囲に単一の広い蛋白質バンドを
示す。
ゲルスライス#10からのRNAは、次に小さいサイズ範
囲の画分されたポリARNAを含有し、翻訳系において、
レーン5に見られるポリペプチドの合成を指令する。免
疫沈澱物の加水分解物の同様の分析をレーン6に示す。
CBHIの分子量範囲における免疫沈澱物の濃度が相対的
に高いことから、ゲルスライス#10は、ゲルスライス
#9に比べて、CBHImRNAに関してより高度に濃縮され
ていることが示される。
囲の画分されたポリARNAを含有し、翻訳系において、
レーン5に見られるポリペプチドの合成を指令する。免
疫沈澱物の加水分解物の同様の分析をレーン6に示す。
CBHIの分子量範囲における免疫沈澱物の濃度が相対的
に高いことから、ゲルスライス#10は、ゲルスライス
#9に比べて、CBHImRNAに関してより高度に濃縮され
ていることが示される。
ゲルスライス#11からのRNAにより生成された同様の
ポリペプチドパターンをレーン7及び8に示す。レーン
7は全リゼートポリペプチドを示し、レーン8は抗−CB
HI抗体の存在下で免疫沈澱するポリペプチドを示す。
これから明らかなように、レーン8における66,000
ドルトンの分子量バンドの濃度はレーン4におけるそれ
に匹敵し、そしてレーン6に見られるそれよりも明らか
に低い。この比較から、ゲルスライス#10をCBHImRN
Aが最も濃縮されているゲルスライスであると同定し、
そしてそ故に、CBHIプローブ及びCBHIcDNAの調製のた
めに後に記載する方法においてCBHImRNA源として使用
した。
ポリペプチドパターンをレーン7及び8に示す。レーン
7は全リゼートポリペプチドを示し、レーン8は抗−CB
HI抗体の存在下で免疫沈澱するポリペプチドを示す。
これから明らかなように、レーン8における66,000
ドルトンの分子量バンドの濃度はレーン4におけるそれ
に匹敵し、そしてレーン6に見られるそれよりも明らか
に低い。この比較から、ゲルスライス#10をCBHImRN
Aが最も濃縮されているゲルスライスであると同定し、
そしてそ故に、CBHIプローブ及びCBHIcDNAの調製のた
めに後に記載する方法においてCBHImRNA源として使用
した。
レーン6に見られる66,000ドルトンの分子量範囲に
おける比較的広いバンドが誘導されたCBHImRNAの生成
物を示すことを確認するために、翻訳系に、非誘導T.リ
ーゼイ培養物(グリセリンの存在下で増殖したもの)由
来のポリARNAの匹敵するサイズのmRNA画分を加えた。
非誘導ポリARNAをゲル電気泳動により画分した後、ゲ
ルの23S領域から下10番目のゲルスライスから溶出
されたRNAを翻訳系に加えた。翻訳系からの全翻訳ポリ
ペプチド及び免疫沈澱したペプチドを、それぞれレーン
9及び10に示す。明らかな通り、レーン9は66,00
0分子量範囲に非常に少量の新たに合成された蛋白質を
含有し、そしてレーン10は抗−CBHI抗体の存在下で
免疫沈澱する新たに合成された蛋白質を実質上示さな
い。このことは、抗−CBHIと免疫的に反応する新たに
合成されたポリペプチドのすべてではないにしてもほと
んどが、誘導されたCBHImRNAの指令のもとに生産され
ることを確認するものである。
おける比較的広いバンドが誘導されたCBHImRNAの生成
物を示すことを確認するために、翻訳系に、非誘導T.リ
ーゼイ培養物(グリセリンの存在下で増殖したもの)由
来のポリARNAの匹敵するサイズのmRNA画分を加えた。
非誘導ポリARNAをゲル電気泳動により画分した後、ゲ
ルの23S領域から下10番目のゲルスライスから溶出
されたRNAを翻訳系に加えた。翻訳系からの全翻訳ポリ
ペプチド及び免疫沈澱したペプチドを、それぞれレーン
9及び10に示す。明らかな通り、レーン9は66,00
0分子量範囲に非常に少量の新たに合成された蛋白質を
含有し、そしてレーン10は抗−CBHI抗体の存在下で
免疫沈澱する新たに合成された蛋白質を実質上示さな
い。このことは、抗−CBHIと免疫的に反応する新たに
合成されたポリペプチドのすべてではないにしてもほと
んどが、誘導されたCBHImRNAの指令のもとに生産され
ることを確認するものである。
D.4.CBHIcDNAプローブの調製 上記のようにして得られた濃縮されたCBHImRNA画分
は、選択された微生物の、CBHI遺伝子の領域を含有す
るゲノム消化断片の同定においてプローブとして使用す
るための放射性ラベルされた単鎖CBHIcDNAを合成する
ための鋳型(template)を提供する。
は、選択された微生物の、CBHI遺伝子の領域を含有す
るゲノム消化断片の同定においてプローブとして使用す
るための放射性ラベルされた単鎖CBHIcDNAを合成する
ための鋳型(template)を提供する。
mRNAから放射性ラベルされた単鎖cDNAを調製する方法は
よく知られている。Payvar,F.等,ジャーナル・オブ
・ビオロジカル・ケミストリー(J.Biol.Chem.)(19
79)254:7636に記載されている一般的方法を
用いて、T.リーゼイL27株CBHI濃縮mRNAからcDNAを
調製した。簡単に記載すれば、濃縮されたmRNAを10m
M水酸化メチル水銀で前処理してRNAを変性し、そして
放射性ラベルしたヌクレオチド類、プライマーとしての
オリゴdT、及びRNAアーゼ阻害剤としての2mMアデ
ノシン:VOSO4を含有する反応混合物に導入した。cDNA
合成に続き、ポリARNAをNaOHで処理することにより破
壊し、そしてcDNAをゲル電気泳動によりサイズ分析して
完全な長さのcDNAが合成されていることを確認した。cD
NA画分の典型的なゲル電気泳動パターンは、cDNAの調製
に使用した濃縮されたmRNA画分のサイズ範囲におよそ対
応して、1.6〜1.8キロベース(kb)領域に顕著な要
主バンドを示した。
よく知られている。Payvar,F.等,ジャーナル・オブ
・ビオロジカル・ケミストリー(J.Biol.Chem.)(19
79)254:7636に記載されている一般的方法を
用いて、T.リーゼイL27株CBHI濃縮mRNAからcDNAを
調製した。簡単に記載すれば、濃縮されたmRNAを10m
M水酸化メチル水銀で前処理してRNAを変性し、そして
放射性ラベルしたヌクレオチド類、プライマーとしての
オリゴdT、及びRNAアーゼ阻害剤としての2mMアデ
ノシン:VOSO4を含有する反応混合物に導入した。cDNA
合成に続き、ポリARNAをNaOHで処理することにより破
壊し、そしてcDNAをゲル電気泳動によりサイズ分析して
完全な長さのcDNAが合成されていることを確認した。cD
NA画分の典型的なゲル電気泳動パターンは、cDNAの調製
に使用した濃縮されたmRNA画分のサイズ範囲におよそ対
応して、1.6〜1.8キロベース(kb)領域に顕著な要
主バンドを示した。
CBHIプローブも公知の方法に従って、CBHImRNA断片を
放射性ラベルすることにより調製することができる。こ
の方法に代えて、成熟CBHI蛋白質の短セグメントの公
知のアミノ酸配列に対応するコード配列を有するように
造成された合成ポリヌクレオチドもまた、この発明にお
いて使用するための適当なCBHIプローブを提供する。
放射性ラベルすることにより調製することができる。こ
の方法に代えて、成熟CBHI蛋白質の短セグメントの公
知のアミノ酸配列に対応するコード配列を有するように
造成された合成ポリヌクレオチドもまた、この発明にお
いて使用するための適当なCBHIプローブを提供する。
D.5.CBHI遺伝子領域を含有するゲノムDNAクローンの調
製 選択された微生物から分離された全ゲノムDNAを1種又
は複数種のエンドヌクレアーゼで処理して、クローニン
グすることができるゲノム断片を生成せしめ、そして上
記のcDNA CBHIプローブとハイブリド形成する能力によ
りCBHI遺伝子領域を含有するものとして同定する。CBH
I遺伝子領域を含有するとして同定されたクローンはゲ
ノムDNAのヌクレオチド配列の決定に使用される遺伝
子材料を提供し、そして遺伝子の選択された領域を含有
するクローンは下記の方法に従ってイントロン不含CBH
I遺伝子を造成する場合に使用することができる。
製 選択された微生物から分離された全ゲノムDNAを1種又
は複数種のエンドヌクレアーゼで処理して、クローニン
グすることができるゲノム断片を生成せしめ、そして上
記のcDNA CBHIプローブとハイブリド形成する能力によ
りCBHI遺伝子領域を含有するものとして同定する。CBH
I遺伝子領域を含有するとして同定されたクローンはゲ
ノムDNAのヌクレオチド配列の決定に使用される遺伝
子材料を提供し、そして遺伝子の選択された領域を含有
するクローンは下記の方法に従ってイントロン不含CBH
I遺伝子を造成する場合に使用することができる。
T.リーゼイL27DNAの完全ライブラリーをλL47.1中
に造成した。ファージDNAを分離し、そして次のように
してスタファー断片(stufferfragment)からクローニ
ングアームを精製することによりλファージベクターを
調製した。全ファージDNAから出発し、「接着末端」条
件下でcos部位を一緒に連結した。連結の効率はアガロ
ースゲル分析により約80〜90%であると決定され
た。連結されたファージDNAをBamHI及びSalIで切断し
た。BamHI消化により連結されたアームからスタファー
断片が放出され、他方SalIはスタファー断片を2回以
上切断し、BamHI消化アームからの一層容易な分離を保
証する。
に造成した。ファージDNAを分離し、そして次のように
してスタファー断片(stufferfragment)からクローニ
ングアームを精製することによりλファージベクターを
調製した。全ファージDNAから出発し、「接着末端」条
件下でcos部位を一緒に連結した。連結の効率はアガロ
ースゲル分析により約80〜90%であると決定され
た。連結されたファージDNAをBamHI及びSalIで切断し
た。BamHI消化により連結されたアームからスタファー
断片が放出され、他方SalIはスタファー断片を2回以
上切断し、BamHI消化アームからの一層容易な分離を保
証する。
BamHI消化アームをCsCl速度沈降勾配法によりスタファ
ー断片から精製した。
ー断片から精製した。
T.リーゼイゲノムDNAをSau3Aにより部分消化し、そし
てNaCl速度勾配によりサイズ画分し、そして15〜20
kbの範囲の分子を含有する画分を選択した。この画分
の断片をベクターのBamHIアームと1:1のモル比、2
00μg/mの全DNA濃度において混合し、そして4
0℃にて一夜、20μの体積中0.2Weissユニットの
T4DNAリガーゼを用いて連結した。連結混合物の0.5
μgを、Hohn,B.メソド・イン・エンチモロジー(Me
thods in Enzymology)(1979)68:299−3
09に記載されているように凍結したパッケージ成分を
用いて、試験管内においてλヘッドにパッケージし、そ
して得られたファージをE.コリMM294株上にプレー
トした。この方法により約1.7×104ファージのライ
ブラリーが得られ、こはすべてのシングルコピー遺伝子
が代表される0.99+の可能性を与えた。
てNaCl速度勾配によりサイズ画分し、そして15〜20
kbの範囲の分子を含有する画分を選択した。この画分
の断片をベクターのBamHIアームと1:1のモル比、2
00μg/mの全DNA濃度において混合し、そして4
0℃にて一夜、20μの体積中0.2Weissユニットの
T4DNAリガーゼを用いて連結した。連結混合物の0.5
μgを、Hohn,B.メソド・イン・エンチモロジー(Me
thods in Enzymology)(1979)68:299−3
09に記載されているように凍結したパッケージ成分を
用いて、試験管内においてλヘッドにパッケージし、そ
して得られたファージをE.コリMM294株上にプレー
トした。この方法により約1.7×104ファージのライ
ブラリーが得られ、こはすべてのシングルコピー遺伝子
が代表される0.99+の可能性を与えた。
こうして得られたT.リーゼイゲノムライブラリーを、前
記のようにして調製した放射性ラベルされたCBHIcDNA
を用いて検出した。試験した約60,000ファージの内
54ファージがcDNAプローブとハイブリド形成した。間
違った陽性反応物を除去するため、cDNAと最も強力にハ
イブリド形成する23クローンをさらに精製し、そして
2種類の異るプローブにより検出した。一方のブローブ
は「誘導された」培養物由来のmRNAから調製したもので
あり、そして他方のプローブはCBHImRNAを欠く「非誘
導」培養物由来のmRNAから調製したものである。選択さ
れた23ゲノムライブラリークローンの内22クローン
が「誘導さた」cDNAプローブとハイブリド形成するが、
「非誘導」cDNAとはハイプリド形成しなかった。選択さ
た22クローン中の15クローンの制限分析により幾つ
かの重複が示され、CBHI遺伝子ライブラリーは6個の
特異クローンに減少した。
記のようにして調製した放射性ラベルされたCBHIcDNA
を用いて検出した。試験した約60,000ファージの内
54ファージがcDNAプローブとハイブリド形成した。間
違った陽性反応物を除去するため、cDNAと最も強力にハ
イブリド形成する23クローンをさらに精製し、そして
2種類の異るプローブにより検出した。一方のブローブ
は「誘導された」培養物由来のmRNAから調製したもので
あり、そして他方のプローブはCBHImRNAを欠く「非誘
導」培養物由来のmRNAから調製したものである。選択さ
れた23ゲノムライブラリークローンの内22クローン
が「誘導さた」cDNAプローブとハイブリド形成するが、
「非誘導」cDNAとはハイプリド形成しなかった。選択さ
た22クローン中の15クローンの制限分析により幾つ
かの重複が示され、CBHI遺伝子ライブラリーは6個の
特異クローンに減少した。
6クローン中、λ−CBH−4と命名された1クローンはC
BHIゲノムコード配列のすべてを含有すると推定され、
これを用いて遺伝子サブフラグメントクローンを生成せ
しめた。実験的には、λ−CBH−4をHind IIIにより完
全消化し、そして生成した消化断片をHind III消化した
E.コリプラスミドpBR322中に連結した。組換形で消
化CBHI断片を含有するプラスミドをアンピシリン耐性
(pBR322ベクター上に担持されている)により選択
し、そしてテトラサイクリン耐性遺伝子の不活性化を導
く外来性DNAの挿入によりもたらされるテトラサイクリ
ン感受性についてスクリーニングした。CBHI遺伝子の
5′領域を含む1.16kb断片、又は遺伝子の3′領域を
含む2.3kb断片のいずれかを含有するサブクローンを選
択した。これら2つのクローンをそれぞれpCBH157、
及びpCBH164と命名し、そしてそれぞれ第3A図及び
第3B図に示す。
BHIゲノムコード配列のすべてを含有すると推定され、
これを用いて遺伝子サブフラグメントクローンを生成せ
しめた。実験的には、λ−CBH−4をHind IIIにより完
全消化し、そして生成した消化断片をHind III消化した
E.コリプラスミドpBR322中に連結した。組換形で消
化CBHI断片を含有するプラスミドをアンピシリン耐性
(pBR322ベクター上に担持されている)により選択
し、そしてテトラサイクリン耐性遺伝子の不活性化を導
く外来性DNAの挿入によりもたらされるテトラサイクリ
ン感受性についてスクリーニングした。CBHI遺伝子の
5′領域を含む1.16kb断片、又は遺伝子の3′領域を
含む2.3kb断片のいずれかを含有するサブクローンを選
択した。これら2つのクローンをそれぞれpCBH157、
及びpCBH164と命名し、そしてそれぞれ第3A図及び
第3B図に示す。
pCBH157はT.リーゼイL27株由来の成熟CBHI蛋白
質の最初の278アミノ酸のためのコード領域を含有す
る。第3A図に示すpCBH157の太線部分は完全1.16
kb DNA断片を示し、該断片の一部分にそって内側を伸び
る線分は5′側CBHI遺伝子領域を示す。
質の最初の278アミノ酸のためのコード領域を含有す
る。第3A図に示すpCBH157の太線部分は完全1.16
kb DNA断片を示し、該断片の一部分にそって内側を伸び
る線分は5′側CBHI遺伝子領域を示す。
λ−CBH−4由来の2.3kb Hind III断片を含有するpCB
H164は、成熟CBHI蛋白質のアミノ酸279〜496
の最後の218アミノ酸をコードするCBHIゲノム遺伝
子の領域を含む。第3B図の太線部分は2.3kb DNA断片
を示し、そして内側の線分はCBHIゲノム遺伝子のコー
ド領域を示す。
H164は、成熟CBHI蛋白質のアミノ酸279〜496
の最後の218アミノ酸をコードするCBHIゲノム遺伝
子の領域を含む。第3B図の太線部分は2.3kb DNA断片
を示し、そして内側の線分はCBHIゲノム遺伝子のコー
ド領域を示す。
第3A図及び第3B図はまた、CBHI遺伝子領域内の幾
つかの制限酵素部位を示す。これは常用の制限酵素部位
分析によって決定したものである。
つかの制限酵素部位を示す。これは常用の制限酵素部位
分析によって決定したものである。
pCBH157及びpCBH164を、セルロース誘導T.リーゼ
イL27培養物から得られた全ポリARNA標品からCBHIm
RNAを「釣り上げる(fish out)」能力について試験し
た。発表されている方法〔Harpold.M.H.等,ニュー
クレイック・アンド・リサーチ(Nucleic Acids Res.)
(1978)5:2039〕に従って各クローンをニト
ロセルロースフイルターに結合せしめ、そして誘導され
たT.リーゼイL27由来の全ポリARNAを、相補配列の
ハイブリド形成を許容する条件下でフイルターに加え
た。強く洗浄することによって非結合(非特異的)mRNA
を除去し、フイルターに結合したプラスミドと特異的に
ハイブリド形成するmRNAを溶出した。
イL27培養物から得られた全ポリARNA標品からCBHIm
RNAを「釣り上げる(fish out)」能力について試験し
た。発表されている方法〔Harpold.M.H.等,ニュー
クレイック・アンド・リサーチ(Nucleic Acids Res.)
(1978)5:2039〕に従って各クローンをニト
ロセルロースフイルターに結合せしめ、そして誘導され
たT.リーゼイL27由来の全ポリARNAを、相補配列の
ハイブリド形成を許容する条件下でフイルターに加え
た。強く洗浄することによって非結合(非特異的)mRNA
を除去し、フイルターに結合したプラスミドと特異的に
ハイブリド形成するmRNAを溶出した。
各フイルターについて、結合RNA画分及び非結合RNA画分
を前記の無細胞蛋白質合成系において翻訳した。2つの
サンプルから翻訳された全蛋白質を、抗−CBHI抗体と
スタフィロコッカス・アウレウス(Staphylococcus aur
eus)の細胞との混合物により沈澱せしめた。翻訳され
た全蛋白質を、SDS−PAGE上で、そして前記の免疫沈澱
物の分析により分析した。プラスミドpCBH164及びpC
BH157の両者は、抗−CBHI抗体と免疫的に反応する
蛋白質の合成を指令することができるRNAと結合した。
を前記の無細胞蛋白質合成系において翻訳した。2つの
サンプルから翻訳された全蛋白質を、抗−CBHI抗体と
スタフィロコッカス・アウレウス(Staphylococcus aur
eus)の細胞との混合物により沈澱せしめた。翻訳され
た全蛋白質を、SDS−PAGE上で、そして前記の免疫沈澱
物の分析により分析した。プラスミドpCBH164及びpC
BH157の両者は、抗−CBHI抗体と免疫的に反応する
蛋白質の合成を指令することができるRNAと結合した。
D.6.ゲノム配列の決定 配列情報を得るために、上記の方法により得られたゲノ
ムCBHI遺伝子のサブクローンを、1種又は複数種のエ
ンドヌクレアーゼ消化することによりさらに細断し、ヌ
クレオチドの配列決定に適する長さのサブクローン断片
を生成せしめた。
ムCBHI遺伝子のサブクローンを、1種又は複数種のエ
ンドヌクレアーゼ消化することによりさらに細断し、ヌ
クレオチドの配列決定に適する長さのサブクローン断片
を生成せしめた。
遺伝子の5′側部分を含有するサブクローンpCBH157
をHind III及びEcoRIの両者を用いて実質上完全に消化
し、第3A図から予想できるように、約600ベースペ
ア(bp)及び約500bpの2つの遺伝子領域断片を得
た。この2断片をM13バクテリオファージベクターM
13mp8及びM13mp9にそれぞれサブクローニングし
た。
をHind III及びEcoRIの両者を用いて実質上完全に消化
し、第3A図から予想できるように、約600ベースペ
ア(bp)及び約500bpの2つの遺伝子領域断片を得
た。この2断片をM13バクテリオファージベクターM
13mp8及びM13mp9にそれぞれサブクローニングし
た。
他のHind III断片サブクローンpCBH164をBamh I,Hin
d III、及びHinc IIにより消化した。生成した断片をベ
クターM13mp8にサブクローニングした。
d III、及びHinc IIにより消化した。生成した断片をベ
クターM13mp8にサブクローニングした。
ベクターM13mp8及びM13mp9にサブクローニング
したCBHIゲノム領域断片を、SangerF,等,ナショナ
ル・アカデミック・サイエンス・米国(Nat.Acad.Sci.U
SA)(1977)74:5463、及びMessing,J.等,
ニュークレイック・アシド・リサーチ(Nucleic Acids
Res.)(1981)9:309に記載されているジデオ
キシ鎖ターミネーション法により配列決定した。配列の
部分はMaxam−Gilbert配列決定法〔Maxam,A.M.
等,プロシーディングス・オブ・ナショナル・アカデミ
ー・オブサイエンス,米国(Proc.Nat.Acad.Sci.,USA)
(1977)74:560〕により確認した。T.リーゼ
イL27株由来の1.16kb Hind III断片中の5′Hind
III部位から2.3kb断片中のCBHI遺伝子の3′末端に
おけるストップコドンの後約306ヌクレオチドまで伸
びる完全遺伝子配列を第1表に示す。
したCBHIゲノム領域断片を、SangerF,等,ナショナ
ル・アカデミック・サイエンス・米国(Nat.Acad.Sci.U
SA)(1977)74:5463、及びMessing,J.等,
ニュークレイック・アシド・リサーチ(Nucleic Acids
Res.)(1981)9:309に記載されているジデオ
キシ鎖ターミネーション法により配列決定した。配列の
部分はMaxam−Gilbert配列決定法〔Maxam,A.M.
等,プロシーディングス・オブ・ナショナル・アカデミ
ー・オブサイエンス,米国(Proc.Nat.Acad.Sci.,USA)
(1977)74:560〕により確認した。T.リーゼ
イL27株由来の1.16kb Hind III断片中の5′Hind
III部位から2.3kb断片中のCBHI遺伝子の3′末端に
おけるストップコドンの後約306ヌクレオチドまで伸
びる完全遺伝子配列を第1表に示す。
得られたヌクレオチド配列を、コンピユーターにプログ
ラムされたマッチング操作により、Fagerstam,L.
等,前掲、及びFagerstam,L.G.,前掲によるT.リ
ーゼイCBHIの公知のアミノ酸配列と比較した。マチン
グ操作により、所与のアミノ酸配列に対応するコドンに
ついての3種類の可能なリーデイングフレームのそれぞ
れにおいてヌクレオチド配列を試験した。マッチング操
作は、CBHI遺伝子のコード領域とT.リーゼイQM94
14由来のCBHIの公知のアミノ酸配列の領域との間に
ほぼ完全な対応をもたらした。このマッチングは、後で
検討するように、正しいリーデイングフレーム、開始コ
ドン及び終止コドン、並びに遺伝子中の2個のイントロ
ンの同定を可能にした。第1表はさらに、遺伝子の部分
をコードするリーダー配列に対応するアミノ酸を示す。
(リーダー配列アミノ酸はアンダーラインが付してあ
る。)この発明書において言及する選択された制限エン
ドヌクレアーゼの認識配列を表中にアンダーラインを付
して示す。非翻訳イントロンのオーバラインを付した部
分は、他の遺伝子において報告されているイントロンの
配列に類似すると認識される部分を示す。
ラムされたマッチング操作により、Fagerstam,L.
等,前掲、及びFagerstam,L.G.,前掲によるT.リ
ーゼイCBHIの公知のアミノ酸配列と比較した。マチン
グ操作により、所与のアミノ酸配列に対応するコドンに
ついての3種類の可能なリーデイングフレームのそれぞ
れにおいてヌクレオチド配列を試験した。マッチング操
作は、CBHI遺伝子のコード領域とT.リーゼイQM94
14由来のCBHIの公知のアミノ酸配列の領域との間に
ほぼ完全な対応をもたらした。このマッチングは、後で
検討するように、正しいリーデイングフレーム、開始コ
ドン及び終止コドン、並びに遺伝子中の2個のイントロ
ンの同定を可能にした。第1表はさらに、遺伝子の部分
をコードするリーダー配列に対応するアミノ酸を示す。
(リーダー配列アミノ酸はアンダーラインが付してあ
る。)この発明書において言及する選択された制限エン
ドヌクレアーゼの認識配列を表中にアンダーラインを付
して示す。非翻訳イントロンのオーバラインを付した部
分は、他の遺伝子において報告されているイントロンの
配列に類似すると認識される部分を示す。
上記の表において、ATG開始コドンはpCBH157中の挿
入された配列の5′末端から数えてヌクレオチド210
−212に位置する。ヌクレオチド261−263のコ
ドンは成熟CBHI蛋白質中のN−末端グルタミン(ピロ
グルタミン)アミノ酸に対応する。ヌクレオチド210
と260の間のコドンはおそらく、17アミノ酸から成
る疎水性ペプチドリーダー配列をコードし、このアミノ
酸配列は対応するコード配列により決定され、表中にア
ンダーラインを付して示す。ヌクレオチド261〜67
1のコドンは成熟CBHI酵素の最初の137アミノ酸を
コードする。
入された配列の5′末端から数えてヌクレオチド210
−212に位置する。ヌクレオチド261−263のコ
ドンは成熟CBHI蛋白質中のN−末端グルタミン(ピロ
グルタミン)アミノ酸に対応する。ヌクレオチド210
と260の間のコドンはおそらく、17アミノ酸から成
る疎水性ペプチドリーダー配列をコードし、このアミノ
酸配列は対応するコード配列により決定され、表中にア
ンダーラインを付して示す。ヌクレオチド261〜67
1のコドンは成熟CBHI酵素の最初の137アミノ酸を
コードする。
成熟CBHI蛋白質のアミノ酸137及び138をコード
するコード領域間に、この明細書においてCBHI遺伝子
中の第1イントロン又は上流イントロンとして同定され
る67bp領域が存在する。このイントロンは7bp AGCTG
AC配列(第1表中オーバーラインで示されている)を含
有し、この配列は酵母からのアクチン遺伝子のイントロ
ン配列〔Langford,C.J.等、セル(Cell)(198
3)33:519〕中、及びアスペルギルス・アワモリ
(Aspergillus awamori)由来のグルコアミラーゼ遺伝
子中の3個のイントロン中の7−merと類似し、そして
ニューロスポーラ・クラッサ(Neurospora crassa)由
来のグルタメートデヒドロゲナーゼ遺伝子中のイントロ
ン配列〔Kinnaird,J.等、ジーン「Gene」(198
2)20:387〕、及びA.アワモリグルコアミラーゼ
遺伝子中のイントロンの1つと同一である。この配列
は、mRNA転写物からイントロンをスプライシングするた
めに必要なシグナルを提供するようである。さらに、こ
のイントロンは、ドナー共通配列TAAGTG、及びアクセプ
ター共通配列TTTAAGG(表中オーバーラインで示してあ
る)を含有し、これらはMount,S.M.,ニュークレ
イック・アンド・リサーチ(Nucleic Acids Res.)(1
982)10:459により揚げられたドナー部位共通
配列及びアクセプター部位共通配列と同一である。
するコード領域間に、この明細書においてCBHI遺伝子
中の第1イントロン又は上流イントロンとして同定され
る67bp領域が存在する。このイントロンは7bp AGCTG
AC配列(第1表中オーバーラインで示されている)を含
有し、この配列は酵母からのアクチン遺伝子のイントロ
ン配列〔Langford,C.J.等、セル(Cell)(198
3)33:519〕中、及びアスペルギルス・アワモリ
(Aspergillus awamori)由来のグルコアミラーゼ遺伝
子中の3個のイントロン中の7−merと類似し、そして
ニューロスポーラ・クラッサ(Neurospora crassa)由
来のグルタメートデヒドロゲナーゼ遺伝子中のイントロ
ン配列〔Kinnaird,J.等、ジーン「Gene」(198
2)20:387〕、及びA.アワモリグルコアミラーゼ
遺伝子中のイントロンの1つと同一である。この配列
は、mRNA転写物からイントロンをスプライシングするた
めに必要なシグナルを提供するようである。さらに、こ
のイントロンは、ドナー共通配列TAAGTG、及びアクセプ
ター共通配列TTTAAGG(表中オーバーラインで示してあ
る)を含有し、これらはMount,S.M.,ニュークレ
イック・アンド・リサーチ(Nucleic Acids Res.)(1
982)10:459により揚げられたドナー部位共通
配列及びアクセプター部位共通配列と同一である。
アミノ酸138(システイン)からアミノ酸369(ア
スパラギン酸)までは、ヌクレオチド739−1434
の間にわたる非中断蛋白質コード領域によりコードされ
る。アミノ酸369及び370をコードするコドン間の
遺伝子領域は63非コードヌクレオチドを含有し、これ
はゲノムCBHI遺伝子中で第2イントロンすなわち下流
イントロンを構成する。この第2イントロンもまた、酵
母イントロンに特異的な7bp配列AGCTGAC、並びにドナ
ー共通配列GTGAGT及びアクセプター共通配列TTACAGを含
有し、これらは酵母遺伝子(Mount,S.M.,前掲)
におけるイントロン−エクソン接続部における公知のド
ナー部位配列及びアクセプター部位配列と同一である。
スパラギン酸)までは、ヌクレオチド739−1434
の間にわたる非中断蛋白質コード領域によりコードされ
る。アミノ酸369及び370をコードするコドン間の
遺伝子領域は63非コードヌクレオチドを含有し、これ
はゲノムCBHI遺伝子中で第2イントロンすなわち下流
イントロンを構成する。この第2イントロンもまた、酵
母イントロンに特異的な7bp配列AGCTGAC、並びにドナ
ー共通配列GTGAGT及びアクセプター共通配列TTACAGを含
有し、これらは酵母遺伝子(Mount,S.M.,前掲)
におけるイントロン−エクソン接続部における公知のド
ナー部位配列及びアクセプター部位配列と同一である。
第2イントロンの後に、成熟CBHI蛋白質のアミノ酸3
70−496をコードする非中断127コドン領域が続
く。このC−末端アミノ酸はロイシン(ヌクレオチド1
876−1878によりコードされる)である。遺伝子
の3′コード領域における終止コドンの下流にあるヌク
レオチド1879−2221は、表示されているように
SmaI部位及びHinc II部位を含有する。
70−496をコードする非中断127コドン領域が続
く。このC−末端アミノ酸はロイシン(ヌクレオチド1
876−1878によりコードされる)である。遺伝子
の3′コード領域における終止コドンの下流にあるヌク
レオチド1879−2221は、表示されているように
SmaI部位及びHinc II部位を含有する。
第1表中の遺伝子の蛋白質コード部分中のヌクレオチド
の配列は、示されたアミノ酸の配列をコードする1つの
コドン配列を構成する。コドンの多くは、そのコドンに
より特定されるアミノ酸を変えることなく、一般に第3
ヌクレオチド部分においてヌクレオチド配列を変えられ
得る。遺伝子中に単一ヌクレオチド変異すなわち点変異
(point mutation)を生じさせる方法は当業者に知られ
ている。この明細書において定義する「コドン配列」な
る語は、特定のアミノ酸配列をコードするすべてのヌク
レオチド配列を包含し、第1表に示されるヌクレオチド
配列はそこに示されたアミノ酸配列をコードする多くの
コドン配列の1つである。
の配列は、示されたアミノ酸の配列をコードする1つの
コドン配列を構成する。コドンの多くは、そのコドンに
より特定されるアミノ酸を変えることなく、一般に第3
ヌクレオチド部分においてヌクレオチド配列を変えられ
得る。遺伝子中に単一ヌクレオチド変異すなわち点変異
(point mutation)を生じさせる方法は当業者に知られ
ている。この明細書において定義する「コドン配列」な
る語は、特定のアミノ酸配列をコードするすべてのヌク
レオチド配列を包含し、第1表に示されるヌクレオチド
配列はそこに示されたアミノ酸配列をコードする多くの
コドン配列の1つである。
遺伝子のコドン配列を保存するヌクレオチド置換に加え
て、この発明は、上に検討したように、コードされたCB
HI酵素中の「中立的な」又は非臨界的なアミノ酸変化
を導く、遺伝子中のヌクレオチドの変化を予想する。特
に蛋白質アミノ酸配列中の進化的変化についての研究か
ら、蛋白質の機能的特性を有意に変化せしめることな
く、蛋白質中に中立的なアミノ酸変化が生じうることが
知られている。小さなコドン変化を実験的に生じさせる
ために多くの方法を用いることができ、この方法には、
点変異又は欠失変異を生じさせるために遺伝子を変異源
処理する方法;遺伝子を選択的に開裂し、次に選択され
たヌクレオチドを除去又は付加し、そして次に遺伝子を
連結する方法;及び常用のオリゴヌクレオチド変異誘発
法が含まれる。このようにして変異を受けたCBHI遺伝
子は酵素的に活性なCBHI酵素をコードし、そしてしば
しば、その比活性が、変異を受けていないCBHI酵素と
比べて実質上変化しない酵素をコードするであろう。こ
の発明は、そのコドン配列がCBHI酵素中のこのような
中立的なアミノ酸変化をコードする遺伝子、及びそのコ
ドン配列が変異を受けていない成熟CBHIのアミノ酸配
列と厳格な1:1コドン対応を有する遺伝子を包含す
る。この明細書における定義において、そのコドン配列
が成熟CBHIと「実質的な」1:1対応を有する遺伝子
には、厳格な対応を有する遺伝子、及び中立的な又は小
さコドン変化を有し、CBHI(エキソ−セロビオヒドロ
ラーゼ)酵素活性を有するポリペプチドをコードする遺
伝子の両者が包含される〔Shoeker,S.P.等、ビオ
ケミカ・ビオフィジカ・アクタ(Biochem.Biopheys.Act
a)(1973)523:147参照のこと〕。
て、この発明は、上に検討したように、コードされたCB
HI酵素中の「中立的な」又は非臨界的なアミノ酸変化
を導く、遺伝子中のヌクレオチドの変化を予想する。特
に蛋白質アミノ酸配列中の進化的変化についての研究か
ら、蛋白質の機能的特性を有意に変化せしめることな
く、蛋白質中に中立的なアミノ酸変化が生じうることが
知られている。小さなコドン変化を実験的に生じさせる
ために多くの方法を用いることができ、この方法には、
点変異又は欠失変異を生じさせるために遺伝子を変異源
処理する方法;遺伝子を選択的に開裂し、次に選択され
たヌクレオチドを除去又は付加し、そして次に遺伝子を
連結する方法;及び常用のオリゴヌクレオチド変異誘発
法が含まれる。このようにして変異を受けたCBHI遺伝
子は酵素的に活性なCBHI酵素をコードし、そしてしば
しば、その比活性が、変異を受けていないCBHI酵素と
比べて実質上変化しない酵素をコードするであろう。こ
の発明は、そのコドン配列がCBHI酵素中のこのような
中立的なアミノ酸変化をコードする遺伝子、及びそのコ
ドン配列が変異を受けていない成熟CBHIのアミノ酸配
列と厳格な1:1コドン対応を有する遺伝子を包含す
る。この明細書における定義において、そのコドン配列
が成熟CBHIと「実質的な」1:1対応を有する遺伝子
には、厳格な対応を有する遺伝子、及び中立的な又は小
さコドン変化を有し、CBHI(エキソ−セロビオヒドロ
ラーゼ)酵素活性を有するポリペプチドをコードする遺
伝子の両者が包含される〔Shoeker,S.P.等、ビオ
ケミカ・ビオフィジカ・アクタ(Biochem.Biopheys.Act
a)(1973)523:147参照のこと〕。
第4図は、前記の配列データから構成された、T.リーゼ
イL27株からのゲノムCBHI遺伝子の地図を示す。こ
の地図は、幾つかの制限エンドヌクレアーゼ部位と関連
させて、特に前記の1.16kb及び2.3kb Hind III遺伝子
断片を規定するHind III部位と関連させて、遺伝子の蛋
白質コード領域を示す。この地図からわかるように、遺
伝子中の上流イントロンは1.16kb Hind III断片の中
央領域に位置し、そして下流イントロンは2.3kb断片の
中央の蛋白質コード領域に位置する。
イL27株からのゲノムCBHI遺伝子の地図を示す。こ
の地図は、幾つかの制限エンドヌクレアーゼ部位と関連
させて、特に前記の1.16kb及び2.3kb Hind III遺伝子
断片を規定するHind III部位と関連させて、遺伝子の蛋
白質コード領域を示す。この地図からわかるように、遺
伝子中の上流イントロンは1.16kb Hind III断片の中
央領域に位置し、そして下流イントロンは2.3kb断片の
中央の蛋白質コード領域に位置する。
ここに記載した例において、T.リーゼイL27株CBHI
遺伝子の上流イントロン及び下流イントロンの存在及び
位置を、配列決定されたゲノム遺伝子とコードされた蛋
白質のアミノ酸配列とを比較することによって決定し
た。この方法は高い精度をもってイントロンを規定する
ために使用することができる方法の1つである。この方
法に代えて、遺伝子イントロンの長さ位置を、ゲノムCB
HI遺伝子のヌクレオチド配列と、この明細書に記載し
た一般的方法に従って調製されそして配列決定された完
全な長さのCBH I cDNAのヌクレオチド配列を比較するこ
とによっても決定することができる。また、ヌクレオチ
ド配列のみからゲノム遺伝子イントロンの存在及び位置
を同定することもできる。前に検討したように、T.リー
ゼイL27株CBHI遺伝子中の両イントロンは、酵母イ
ントロンに特徴的な7bp配列を含有し、従ってイントロ
ンを予備的に同定するための手段を提供している。同様
に、イントロンのドナー領域及びアクセプターエンド領
域は、すでに掲げられている幾つかの共通配列の1つと
一致する特徴的な共通配列によって同定することができ
よう。この発明は、イントロンの同定をアミノ酸−コド
ンマッチング法に関連して説明したが、ヌクレオチド配
列から遺伝子イントロンの存在及び位置を決定するため
のここに記載した他の2つの方法もこの発明の方法に含
まれる。
遺伝子の上流イントロン及び下流イントロンの存在及び
位置を、配列決定されたゲノム遺伝子とコードされた蛋
白質のアミノ酸配列とを比較することによって決定し
た。この方法は高い精度をもってイントロンを規定する
ために使用することができる方法の1つである。この方
法に代えて、遺伝子イントロンの長さ位置を、ゲノムCB
HI遺伝子のヌクレオチド配列と、この明細書に記載し
た一般的方法に従って調製されそして配列決定された完
全な長さのCBH I cDNAのヌクレオチド配列を比較するこ
とによっても決定することができる。また、ヌクレオチ
ド配列のみからゲノム遺伝子イントロンの存在及び位置
を同定することもできる。前に検討したように、T.リー
ゼイL27株CBHI遺伝子中の両イントロンは、酵母イ
ントロンに特徴的な7bp配列を含有し、従ってイントロ
ンを予備的に同定するための手段を提供している。同様
に、イントロンのドナー領域及びアクセプターエンド領
域は、すでに掲げられている幾つかの共通配列の1つと
一致する特徴的な共通配列によって同定することができ
よう。この発明は、イントロンの同定をアミノ酸−コド
ンマッチング法に関連して説明したが、ヌクレオチド配
列から遺伝子イントロンの存在及び位置を決定するため
のここに記載した他の2つの方法もこの発明の方法に含
まれる。
D.7.遺伝子からのイントロン配列の除去 この項は、イントロン不含CBHI遺伝子を造成する方法
を記載する。この方法はまず、適当なクローニングベク
ターに、5′遺伝子末端からゲノムCBHI遺伝子中の
5′末端イントロンの下流の選択された制限エンドヌク
レアーゼ部位に伸びる5′ゲノムCBHI遺伝子断片を得
ることを含む。一般に、CBHI遺伝子領域を含有するゲ
ノムDNA消化クローンを調製するためにD.5項に前記し
た方法が、この5′ゲノム遺伝子断片を調製するために
適用され得る。
を記載する。この方法はまず、適当なクローニングベク
ターに、5′遺伝子末端からゲノムCBHI遺伝子中の
5′末端イントロンの下流の選択された制限エンドヌク
レアーゼ部位に伸びる5′ゲノムCBHI遺伝子断片を得
ることを含む。一般に、CBHI遺伝子領域を含有するゲ
ノムDNA消化クローンを調製するためにD.5項に前記し
た方法が、この5′ゲノム遺伝子断片を調製するために
適用され得る。
特に、この明細書に説明する有利な方法は、完全なCBH
I遺伝子を含有する1又は複数の断片を生成せしめる条
件下で、選択された制限エンドヌクレアーゼによりゲノ
ムDNAを処理する第1段階を含む。次に、この完全遺伝
子断片をさらに消化して、2又はそれより多くの遺伝子
サブフラグメントを生成せしめる。このサブフラグメン
トには、例えば前記のT.リーゼイL27株からの1.16
kb5′CBHI遺伝子断片が包含される。
I遺伝子を含有する1又は複数の断片を生成せしめる条
件下で、選択された制限エンドヌクレアーゼによりゲノ
ムDNAを処理する第1段階を含む。次に、この完全遺伝
子断片をさらに消化して、2又はそれより多くの遺伝子
サブフラグメントを生成せしめる。このサブフラグメン
トには、例えば前記のT.リーゼイL27株からの1.16
kb5′CBHI遺伝子断片が包含される。
第2段階は、1又は複数のCBH I cDNAコード配列断片を
組換形として得ることを含み、このcDNAコード配列は、
非中断蛋白質コード遺伝子領域を得るために、ゲノム遺
伝子断片の対応するイントロン含有領域と共にスプライ
ングすることができ又はそれと置き換えることができる
ものである。cDNA遺伝子片は常法に従って、好ましくは
濃縮されたCBH I mRNAから単鎖cDNAを生成せしめ、そし
てこの単鎖cDNAから二本鎖cDNAを形成することによって
造成される。
組換形として得ることを含み、このcDNAコード配列は、
非中断蛋白質コード遺伝子領域を得るために、ゲノム遺
伝子断片の対応するイントロン含有領域と共にスプライ
ングすることができ又はそれと置き換えることができる
ものである。cDNA遺伝子片は常法に従って、好ましくは
濃縮されたCBH I mRNAから単鎖cDNAを生成せしめ、そし
てこの単鎖cDNAから二本鎖cDNAを形成することによって
造成される。
濃縮されたCBH I mRNAを得るための一般的方法はD.3項
に前記した方法に従う。濃縮されたmRNAは、逆転写酵素
の存在下でオリゴdTと反応した場合、やはり前記の方法
に従って、cDNA鎖を合成するための鋳型として機能す
る。mRNA/cDNAハイブリド中のmRNAをNaOHで処理するこ
とによって加水分解し、単鎖cDNAは保存する。このcDNA
は、Maniatis等、モレキュラー・クローニング−A・ラ
ボラトリー・マニュアル(Molecular Cloning-A Labora
tory Manual),Cold Spring Harbor Laboratory,Cold
Spring Harbor,ニューヨーク(1982)235−2
38頁に記載されている方法に従ってE.コリDNAポリメ
ラーゼIにより第2のcDNAを合成する反応を開始し、そ
してこの合成のための鋳型として機能し、「ヘアーピ
ン」二重鎖DNAをもたらす。第2のcDNA鎖の合成の後、
ヌクレアーゼSIで処理することによりヘアーピンルー
プを除去し、そして種々のデュプレックスcDNAを選択す
ることができる。
に前記した方法に従う。濃縮されたmRNAは、逆転写酵素
の存在下でオリゴdTと反応した場合、やはり前記の方法
に従って、cDNA鎖を合成するための鋳型として機能す
る。mRNA/cDNAハイブリド中のmRNAをNaOHで処理するこ
とによって加水分解し、単鎖cDNAは保存する。このcDNA
は、Maniatis等、モレキュラー・クローニング−A・ラ
ボラトリー・マニュアル(Molecular Cloning-A Labora
tory Manual),Cold Spring Harbor Laboratory,Cold
Spring Harbor,ニューヨーク(1982)235−2
38頁に記載されている方法に従ってE.コリDNAポリメ
ラーゼIにより第2のcDNAを合成する反応を開始し、そ
してこの合成のための鋳型として機能し、「ヘアーピ
ン」二重鎖DNAをもたらす。第2のcDNA鎖の合成の後、
ヌクレアーゼSIで処理することによりヘアーピンルー
プを除去し、そして種々のデュプレックスcDNAを選択す
ることができる。
T.リーゼイL27株CBH I mRNAをコピーすることにより
得られる二重鎖cDNAを上記の方法によって得、そして標
準的方法に従ってpUC8ベクターにクローニングした。ク
ローンを、CBHIゲノムDNAの領域を含有する前記のpCBH
157クローン又はpCBH164クローンの1つとハイブ
リド形成する能力により同定した。選択されたcDNA断片
クローンの1つをp805と命名し、第6図に示す。図
中に太線で示されている、p805中のcDNA断片は、遺
伝子の5′末端からNcoI部位を越えて下流に伸びる。
このNcoI部位は図示されているように、ゲノム遺伝子
中第1イントロンすなわち上流イントロンの下流側に位
置する。
得られる二重鎖cDNAを上記の方法によって得、そして標
準的方法に従ってpUC8ベクターにクローニングした。ク
ローンを、CBHIゲノムDNAの領域を含有する前記のpCBH
157クローン又はpCBH164クローンの1つとハイブ
リド形成する能力により同定した。選択されたcDNA断片
クローンの1つをp805と命名し、第6図に示す。図
中に太線で示されている、p805中のcDNA断片は、遺
伝子の5′末端からNcoI部位を越えて下流に伸びる。
このNcoI部位は図示されているように、ゲノム遺伝子
中第1イントロンすなわち上流イントロンの下流側に位
置する。
p417及びp247と同定された2つの他のcDNAクロ
ーンを第7図に示す。図から明らかなように、p247
中のcDNA断片はcDNAの3′末端からBstE II部位を越え
て上流に伸びる。
ーンを第7図に示す。図から明らかなように、p247
中のcDNA断片はcDNAの3′末端からBstE II部位を越え
て上流に伸びる。
p417中のcDNA断片は、上記のBstE II部位において
断片247と重なり、そしてCBHI遺伝子中の内部Hind
III部位を越えてそれから上流に伸びる。上記の3種類
のcDNA断片の長さ及び相対的位置を、常用の制限エンド
ヌクレアーゼ地図の作成によって決定した。
断片247と重なり、そしてCBHI遺伝子中の内部Hind
III部位を越えてそれから上流に伸びる。上記の3種類
のcDNA断片の長さ及び相対的位置を、常用の制限エンド
ヌクレアーゼ地図の作成によって決定した。
イントロン不含CBHI遺伝子を造成するために、上流イ
ントロンを含有するゲノムDNAの部分を5′ゲノム断片
から切り取り、そして切り取られたイントロン含有領域
に対応するcDNA領域を挿入した。次に、このイントロン
不含5′遺伝子断片を、選択された制限エンドヌクレア
ーゼ部位において、この部位から遺伝子の3′末端に伸
びる3′末端cDNA断片に連結した。後の説明において、
イントロン不含5′遺伝子断は、ベクターが適当な宿主
に導入された場合にこの断片の発現を可能にする制御配
列に隣接して適当な発現ベクターにクローニングした。
次に、遺伝子の残りの3′cDNA部分を発現ベクターに導
入し、遺伝子発現のためのベクター中に配置されそして
方向付けられた完全な長さのイントロン不含CBHI遺伝
子を生成せしめた。
ントロンを含有するゲノムDNAの部分を5′ゲノム断片
から切り取り、そして切り取られたイントロン含有領域
に対応するcDNA領域を挿入した。次に、このイントロン
不含5′遺伝子断片を、選択された制限エンドヌクレア
ーゼ部位において、この部位から遺伝子の3′末端に伸
びる3′末端cDNA断片に連結した。後の説明において、
イントロン不含5′遺伝子断は、ベクターが適当な宿主
に導入された場合にこの断片の発現を可能にする制御配
列に隣接して適当な発現ベクターにクローニングした。
次に、遺伝子の残りの3′cDNA部分を発現ベクターに導
入し、遺伝子発現のためのベクター中に配置されそして
方向付けられた完全な長さのイントロン不含CBHI遺伝
子を生成せしめた。
D.7.apCBH5の造成/上流イントロンの除去 第6図はT.リーゼイL27株ゲノムDNA由来の1.16kb
Hind III断片を含有するプラスミドpCBH157を示す。
この断片は第3A図にも示されている。前記の遺伝子ヌ
クレオチド配列データから、1.16kb断片が遺伝子中の
第1ATG開始シグナルにおける翻訳の開始点への11bp
5′側にユニークSac II認識部位を、そして遺伝子断片
中上流イントロンへの32bp3′側にユニークNcoI切
断部位を含有することが知られている。これは図示され
ている通りである。
Hind III断片を含有するプラスミドpCBH157を示す。
この断片は第3A図にも示されている。前記の遺伝子ヌ
クレオチド配列データから、1.16kb断片が遺伝子中の
第1ATG開始シグナルにおける翻訳の開始点への11bp
5′側にユニークSac II認識部位を、そして遺伝子断片
中上流イントロンへの32bp3′側にユニークNcoI切
断部位を含有することが知られている。これは図示され
ている通りである。
約800bpの5′端cDNA断片を含有するプラスミドp8
05もまた、第6図に示すように、上記のユニークSac
II部位及びNcoI部位を含有する。プラスミドpCBH15
7及びp805のそれぞれをSac II及びNCoIにより処
理し、プラスミドpCBH157から上流イントロンを含有
する573bp断片を放出せしめ、そしてプラスミドp8
05から対応するイントロン不含506bp断片を放出
せしめた。p805からのイントロン不含Sac II/Nco
I断片を消化されたpCBH157プラスミド中に連結し、
pCBH5と称する新しいプラスミドを形成した。このプラ
スミドは、上流イントロンが除去された1.16kb Hind
III断片から成るキメラ性ゲノム/cDNA遺伝子断片を含
有する。
05もまた、第6図に示すように、上記のユニークSac
II部位及びNcoI部位を含有する。プラスミドpCBH15
7及びp805のそれぞれをSac II及びNCoIにより処
理し、プラスミドpCBH157から上流イントロンを含有
する573bp断片を放出せしめ、そしてプラスミドp8
05から対応するイントロン不含506bp断片を放出
せしめた。p805からのイントロン不含Sac II/Nco
I断片を消化されたpCBH157プラスミド中に連結し、
pCBH5と称する新しいプラスミドを形成した。このプラ
スミドは、上流イントロンが除去された1.16kb Hind
III断片から成るキメラ性ゲノム/cDNA遺伝子断片を含
有する。
D.7.b.pCBH3の造成/下流イントロンの除去 3′イントロン不含遺伝子断片の造成を検討しよう。第
7図に関して、プラスミドp247は、遺伝子のTAA終
止コドン77bp離れた位置にSmaI部位、ゲノム遺伝子
中の下流イントロンへ約138ヌクレオチドだけ3′の
位置にユニークBstE II部位、及びcDNAコード配列に関
して5′側であるプラスミドのポリリンカー領域にユニ
ークSalI部位を含有する。
7図に関して、プラスミドp247は、遺伝子のTAA終
止コドン77bp離れた位置にSmaI部位、ゲノム遺伝子
中の下流イントロンへ約138ヌクレオチドだけ3′の
位置にユニークBstE II部位、及びcDNAコード配列に関
して5′側であるプラスミドのポリリンカー領域にユニ
ークSalI部位を含有する。
プラスミドp417はやはり第7図に示されており、p
247と同様であるがCBHコード配列中にBstE II部位を
含有し、そしてCBHIコード配列内でHibd III認識部位
を越えてさらに5′方向に伸び、そしてBst II部位の上
流約600bpにユニークSalI部位を含む。
247と同様であるがCBHコード配列中にBstE II部位を
含有し、そしてCBHIコード配列内でHibd III認識部位
を越えてさらに5′方向に伸び、そしてBst II部位の上
流約600bpにユニークSalI部位を含む。
遺伝子の終止コドンの下流末端から中間Hind III部位を
越して上流に伸びる3′cDNA遺伝子クローンを造成する
ために、プラスミドp247及びp417のそれぞれを
BstE II、そして次にSal Iにより完全消化した。p41
7からの小さい方の600bp BstE II/Sal I DNA断片
を精製し、そしてBstE II/Sal I p247ベクター断
片と連結した。図に示すプラスミドpCBH3は、cDNAの
3′末端から遺伝子中の中間Hind III部位に伸びるcDNA
断片を有する目的とする組換体であると同定された。
越して上流に伸びる3′cDNA遺伝子クローンを造成する
ために、プラスミドp247及びp417のそれぞれを
BstE II、そして次にSal Iにより完全消化した。p41
7からの小さい方の600bp BstE II/Sal I DNA断片
を精製し、そしてBstE II/Sal I p247ベクター断
片と連結した。図に示すプラスミドpCBH3は、cDNAの
3′末端から遺伝子中の中間Hind III部位に伸びるcDNA
断片を有する目的とする組換体であると同定された。
D.8 細菌宿主のための発現ベクターの造成 pCBH5及びpCBH3からのCBH I遺伝子断片を、選択され
たE.コリ/S.セレビシエーシャトルベクター中に、
trpプロモーターの制御下にCBH I遺伝子の発現を許容す
るように調整された位置及び方向にクローニングした。
宿主ベクターは、第5図に示す通りのpDG151と命名
された11.12kbシャトルベクターであり、1984年
5月11日にATCCに寄託され、寄託番号39686が与
えられた。このプラスミドは、カナマイシン、ネオマイ
シン、G418、及び他の抗生物質に対する抗生物質耐
性を付与する酵素をコードする変形されたアミノグリコ
シドホスホトランスフェラーゼAPH-I遺伝子を含有す
る。
たE.コリ/S.セレビシエーシャトルベクター中に、
trpプロモーターの制御下にCBH I遺伝子の発現を許容す
るように調整された位置及び方向にクローニングした。
宿主ベクターは、第5図に示す通りのpDG151と命名
された11.12kbシャトルベクターであり、1984年
5月11日にATCCに寄託され、寄託番号39686が与
えられた。このプラスミドは、カナマイシン、ネオマイ
シン、G418、及び他の抗生物質に対する抗生物質耐
性を付与する酵素をコードする変形されたアミノグリコ
シドホスホトランスフェラーゼAPH-I遺伝子を含有す
る。
このプラスミドの配列は次の通りである。
1. コーディネート0−1.54は、peno46から誘導さ
れたENO1遺伝子の1.54kb Hind III/EcoR I3′非翻
ターミネーター配列である〔Holland,M.J.等,ジャーナ
ル・オブ・ビオロジカル・ケミストリー(J.Biol.Che
m.)(1981)256:1385〕。
れたENO1遺伝子の1.54kb Hind III/EcoR I3′非翻
ターミネーター配列である〔Holland,M.J.等,ジャーナ
ル・オブ・ビオロジカル・ケミストリー(J.Biol.Che
m.)(1981)256:1385〕。
2. コーディネート1.54−2.75は、変形されたAPH-
I遺伝子を含有する(これは、ザ・モレキュラー・バイ
オロン・オブ・イースト(The Molecular Biology of Y
east)Cold Spring Harbor Meeting,1983年8月1
6〜21日に詳細に記載されている)。
I遺伝子を含有する(これは、ザ・モレキュラー・バイ
オロン・オブ・イースト(The Molecular Biology of Y
east)Cold Spring Harbor Meeting,1983年8月1
6〜21日に詳細に記載されている)。
3. コーディネート2.75−2.85は、逆向きのポリリ
ンカーの反復に挾まれた重複lacオペレーター配列を含
んで成る配列を含有する。変形されたAPH-IのATG開始コ
ドン(2.75における)に直接先行するこの配列は次の
通りである。
ンカーの反復に挾まれた重複lacオペレーター配列を含
んで成る配列を含有する。変形されたAPH-IのATG開始コ
ドン(2.75における)に直接先行するこの配列は次の
通りである。
4. コーディネート2.85−2.95は、trpプロモータ
ー−オペレーターを含有する107bpの5′−EcoR I
(修復された)/BamH I−3′断片である。
ー−オペレーターを含有する107bpの5′−EcoR I
(修復された)/BamH I−3′断片である。
5. コーディネート2.95−3.04は、Sph I(修復)
部位及びSal I部位間に90bp pBR322断片を含有す
る。
部位及びSal I部位間に90bp pBR322断片を含有す
る。
6. コーディネート3.04−5.25は酵母由来LEU2遺
伝子のコピーである。これは、Xho I/Sal I消化物とし
てYEp13から得られた〔Broach,J等、ジーン「Gene」
(1979)8:121〕。
伝子のコピーである。これは、Xho I/Sal I消化物とし
てYEp13から得られた〔Broach,J等、ジーン「Gene」
(1979)8:121〕。
7. コーディネート5.25−8.97中の2ミクロンプラ
スミドレプリコンは、pDB248〔Beach,D.等、ネイチ
ャー(Nature)(1981)290:140〕をEcoR I
(修復)及びSal Iで消化し、そしてレプリコンを含む
2.7kb DNA断片を分離することにより得られる。適切
なSal I部位の存在はBeachの開示からは推定できなかっ
た。しかしながら、pDB248は、前記のBeachの文献に
示されたLEU2領域12μPst Iティリング部位から約5
0bp下流にSal I部位を含有することが示された。
スミドレプリコンは、pDB248〔Beach,D.等、ネイチ
ャー(Nature)(1981)290:140〕をEcoR I
(修復)及びSal Iで消化し、そしてレプリコンを含む
2.7kb DNA断片を分離することにより得られる。適切
なSal I部位の存在はBeachの開示からは推定できなかっ
た。しかしながら、pDB248は、前記のBeachの文献に
示されたLEU2領域12μPst Iティリング部位から約5
0bp下流にSal I部位を含有することが示された。
8. コーディネート8.97−11.12は、AmpR及びE.
コリ複製開始点を提供するpBR322のTthlll I(修復)/
EcoR I消化断片を含有する。
コリ複製開始点を提供するpBR322のTthlll I(修復)/
EcoR I消化断片を含有する。
第8図は、pCBH5由来のイントロン不含5′端遺伝子断
片をpDG151に挿入する方法を示す。プラスミドpCBH
5をSac IIで完全消化し、そして3′突出2塩基接着末
端をdCTPの存在下でE.コリDNAポリメラーゼI(Pol
I)(Klenow)により修復した。Pol Iを不活性化した
後、DNA基質をHind IIIで完全消化し、そして895bp
Sac II(修復)/Hind III断片を精製した。第5図に示
す拡大した遺伝子領域に間し、プラスミドpDG151をX
ma Iにより完全消化し、2つの隣接するXma I部位間に
重複する合成lacオペレーター断片を含有する62bp DN
A断片を放出せしめた。5′突出4塩基接着末端をdCTP
及びdGTPの存在下でPol Iにより修復した。Pol Iを不活
性化した後、平滑末端DNAをHind IIIにより完全消化し
た。11.12kbベクターDNA断片中の修復されたXma I部
位は、E.コリtrpプロモーター及びリーダーペプチド
リボゾーム結合部位の18ヌクレオチド3′側にあり、
そして接着Hind III部位は変形されたPPH-I遺伝子の開
始コドンに直接先行する。
片をpDG151に挿入する方法を示す。プラスミドpCBH
5をSac IIで完全消化し、そして3′突出2塩基接着末
端をdCTPの存在下でE.コリDNAポリメラーゼI(Pol
I)(Klenow)により修復した。Pol Iを不活性化した
後、DNA基質をHind IIIで完全消化し、そして895bp
Sac II(修復)/Hind III断片を精製した。第5図に示
す拡大した遺伝子領域に間し、プラスミドpDG151をX
ma Iにより完全消化し、2つの隣接するXma I部位間に
重複する合成lacオペレーター断片を含有する62bp DN
A断片を放出せしめた。5′突出4塩基接着末端をdCTP
及びdGTPの存在下でPol Iにより修復した。Pol Iを不活
性化した後、平滑末端DNAをHind IIIにより完全消化し
た。11.12kbベクターDNA断片中の修復されたXma I部
位は、E.コリtrpプロモーター及びリーダーペプチド
リボゾーム結合部位の18ヌクレオチド3′側にあり、
そして接着Hind III部位は変形されたPPH-I遺伝子の開
始コドンに直接先行する。
pDG151DNA部位(1.5μg)及び精製されたpCBH5
DNA断片(0.24μg)を、ml当り約60μgの全DNA濃
度において、接着末端条件のもとで連結した。連結され
たDNA断片を20μg/mlに稀釈し、そして分子内環化
に好都合な平滑末端条件下で連結を継続した。E.コリ
K12/GM119株を、連結されたDNA150ngを用い
てアンピシリン耐性に形質転換し、そして非−構成的
(nom-comstitutive)Lac+コロニーを、目的とする11.
94kbプラスミドptrpCBH5の存在についてスクリーニ
ングした。第8図に示すプラスミドptrpCBH5は、修復
されたpDG151Xma I部位に新しいユニークXma I認識
部位を有する目的とする挿入部を含有する。第8図に示
されるプラスミド構成は制限酵素地図の作成により確認
した。E.コリK12/GM119中のプラスミドptrpCB
H5はシタス・マスター・カルチュアー・コレクション
(Cetus Master Culture Collection;CMCC)に寄託さ
れ、CMCC寄託#1842の番号を有する。このプラスミ
ドはNorthern Regional Research Labaratory(NRRL)、
ペオリア,イリノイに寄託され、そして番号NRRL#B15
574を有する。
DNA断片(0.24μg)を、ml当り約60μgの全DNA濃
度において、接着末端条件のもとで連結した。連結され
たDNA断片を20μg/mlに稀釈し、そして分子内環化
に好都合な平滑末端条件下で連結を継続した。E.コリ
K12/GM119株を、連結されたDNA150ngを用い
てアンピシリン耐性に形質転換し、そして非−構成的
(nom-comstitutive)Lac+コロニーを、目的とする11.
94kbプラスミドptrpCBH5の存在についてスクリーニ
ングした。第8図に示すプラスミドptrpCBH5は、修復
されたpDG151Xma I部位に新しいユニークXma I認識
部位を有する目的とする挿入部を含有する。第8図に示
されるプラスミド構成は制限酵素地図の作成により確認
した。E.コリK12/GM119中のプラスミドptrpCB
H5はシタス・マスター・カルチュアー・コレクション
(Cetus Master Culture Collection;CMCC)に寄託さ
れ、CMCC寄託#1842の番号を有する。このプラスミ
ドはNorthern Regional Research Labaratory(NRRL)、
ペオリア,イリノイに寄託され、そして番号NRRL#B15
574を有する。
D.8.a ptrpCBH8の造成 pCBH3からの3′cDNA遺伝子断片をptrpCBH5中にサブ
クローニングする方法を第9図に示す。プラスミドpCBH
3をHind IIIにより完全消化し、CBH I遺伝子の中間Hin
d III部位からSma I部位に隣接する遺伝子の3′末端を
越えて伸び3′Hind IIIに至るpUC8からの配列を含
む、約800bpの3′CBH Iコード断片を放出せしめ
た。プラスミドptrpCBH5もHind IIIで消化し、APH-I遺
伝子における開始コドンに直接先行するHind III部位に
おいてベクターを線状にした。精製されたpCBH3/Hind
III断片(0.2μg)を接着末端条件下でptrpCBH5
/Hind III断片(1.6μg)と連結した。E.コリK
12/MM294株をアンピシリン耐性に形質転換し、そ
してコロニーを目的とするプラスミドの存在についてス
クリーニングした。ptrpCBH8と称する新プラスミドの
造成を第9図に示す。Hind III、BamH I及びEcoR Iによ
る制限地図の作成により表示された構成が確認された。
プラスミドptrpCBH8は、CBH Iコード配列を挾んで2個
のXma I/Sma I部位を含有する。いずれかの酵素でptrp
CBH8を消化することにより1.63kbのDNA CBH I遺伝子
断片を生成し、この断片は、コード領域の5′末端に約
12bp及びコード領域の3′末端に約80bpを伴う完全
CBH Iコード領域を含有する。E.コリK12/MM29
4中のプラスミドptrpCBH8はCMCC#1841と称さ
れ、そしてNRRLに寄託され、番号NRRL#B15573を有す
る。
クローニングする方法を第9図に示す。プラスミドpCBH
3をHind IIIにより完全消化し、CBH I遺伝子の中間Hin
d III部位からSma I部位に隣接する遺伝子の3′末端を
越えて伸び3′Hind IIIに至るpUC8からの配列を含
む、約800bpの3′CBH Iコード断片を放出せしめ
た。プラスミドptrpCBH5もHind IIIで消化し、APH-I遺
伝子における開始コドンに直接先行するHind III部位に
おいてベクターを線状にした。精製されたpCBH3/Hind
III断片(0.2μg)を接着末端条件下でptrpCBH5
/Hind III断片(1.6μg)と連結した。E.コリK
12/MM294株をアンピシリン耐性に形質転換し、そ
してコロニーを目的とするプラスミドの存在についてス
クリーニングした。ptrpCBH8と称する新プラスミドの
造成を第9図に示す。Hind III、BamH I及びEcoR Iによ
る制限地図の作成により表示された構成が確認された。
プラスミドptrpCBH8は、CBH Iコード配列を挾んで2個
のXma I/Sma I部位を含有する。いずれかの酵素でptrp
CBH8を消化することにより1.63kbのDNA CBH I遺伝子
断片を生成し、この断片は、コード領域の5′末端に約
12bp及びコード領域の3′末端に約80bpを伴う完全
CBH Iコード領域を含有する。E.コリK12/MM29
4中のプラスミドptrpCBH8はCMCC#1841と称さ
れ、そしてNRRLに寄託され、番号NRRL#B15573を有す
る。
D.8.b. ptrp81の造成 pCBH3からの3′CBH I cDNA断片をptrpCBH5に挿入す
る方法は次の通りである。pCBH3をSma I及びHind III
で処理し、中間Hind III部位から下流のCBH I遺伝子の
完全コード配列を含有する734bp断片を放出せしめ
た。シャトルベクターptrpCBH5(E.コリK12dam-1
宿主であるGM119中に調製)をエンドヌクレアーゼ
Stu I及びHind IIIにより次々に処理し、Hind III/Stu
Iベクター断片を放出せしめた。pCH3からの精製したC
BH3 Sm I/Hind III断片を、ptrpCBH5 Stu I/Hind
III断片と、接着末端条件下で、そして次に平滑末端条
件下で連結した。E.コリK12/MM294をアンピ
シリン耐性に形質転換し、そして目的とするプラスミド
の存在についてコロニーをスクリーニングした。ptrpCB
H81と称する新プラスミドの構成を第10図に示す。
E.コリK12/MM294中のプラスミドptrpCBH8
1はCMCC#1843として同定され、そしてNRRLに寄託
され番号NRRL#B15575を有する。
る方法は次の通りである。pCBH3をSma I及びHind III
で処理し、中間Hind III部位から下流のCBH I遺伝子の
完全コード配列を含有する734bp断片を放出せしめ
た。シャトルベクターptrpCBH5(E.コリK12dam-1
宿主であるGM119中に調製)をエンドヌクレアーゼ
Stu I及びHind IIIにより次々に処理し、Hind III/Stu
Iベクター断片を放出せしめた。pCH3からの精製したC
BH3 Sm I/Hind III断片を、ptrpCBH5 Stu I/Hind
III断片と、接着末端条件下で、そして次に平滑末端条
件下で連結した。E.コリK12/MM294をアンピ
シリン耐性に形質転換し、そして目的とするプラスミド
の存在についてコロニーをスクリーニングした。ptrpCB
H81と称する新プラスミドの構成を第10図に示す。
E.コリK12/MM294中のプラスミドptrpCBH8
1はCMCC#1843として同定され、そしてNRRLに寄託
され番号NRRL#B15575を有する。
第10図に示すように、Sma I/Stu I融合は新ベクター
中にSma I部位を再生しない。従ってptrpCBH81プラス
ミドは、CBH Iイントロン不含遺伝子の開始(メチオニ
ン)コドンに12bp先行し、そしてtrpリーダーリボゾ
ーム結合部位の16bp後にユニークSma I/Xma I部位を
有する。
中にSma I部位を再生しない。従ってptrpCBH81プラス
ミドは、CBH Iイントロン不含遺伝子の開始(メチオニ
ン)コドンに12bp先行し、そしてtrpリーダーリボゾ
ーム結合部位の16bp後にユニークSma I/Xma I部位を
有する。
D.8.c. ptrpCBH82の造成 D.8.a.及びD.8.b.項に前記したプラスミドptrpCBH8、
及びptrpCBH81をさらに変形して、trpリボゾーム結合
(RBS)と目的とするCBH Iコード配列のATG開始コドン
との間の間隔を短縮した。後で詳細に記載するように、
ptrpCBH8中のRBSとATC開始コドンとの間の介在配列の
23ヌクレオチドを7ヌクレオチド断片によって置き換
え、そして得られた変形された断片をptrpCBH81の対
応部分と置換した。変形された配列はさらに、この領域
に最初に含まれていたBma I部位及びXma I部位に代る重
複するCla I認識部位及びAha III認識部位を含有する。
置換方法は第11図と関連させて下に記載する。
及びptrpCBH81をさらに変形して、trpリボゾーム結合
(RBS)と目的とするCBH Iコード配列のATG開始コドン
との間の間隔を短縮した。後で詳細に記載するように、
ptrpCBH8中のRBSとATC開始コドンとの間の介在配列の
23ヌクレオチドを7ヌクレオチド断片によって置き換
え、そして得られた変形された断片をptrpCBH81の対
応部分と置換した。変形された配列はさらに、この領域
に最初に含まれていたBma I部位及びXma I部位に代る重
複するCla I認識部位及びAha III認識部位を含有する。
置換方法は第11図と関連させて下に記載する。
D.8.c.1. プレーATG配列の変形 Sal I/Pst I DNA断片をptrpCBH8から、これらの酵素
を用いる二重消化により切り出した。この断片は、pDG
151trpプロモーター(第5図)の5′側のSal I部位
からCBH遺伝子(第7図)の3′側に隣接するPst I部位
まで伸びる。この断片をアガロースゲル電気泳動により
分離し、そして電気溶出により分離した。
を用いる二重消化により切り出した。この断片は、pDG
151trpプロモーター(第5図)の5′側のSal I部位
からCBH遺伝子(第7図)の3′側に隣接するPst I部位
まで伸びる。この断片をアガロースゲル電気泳動により
分離し、そして電気溶出により分離した。
バクテリオファージM13mp10w DNAをSal Iで処理し、
次にPst Iで消化してSal I/Pst Iファージ断片を放出
せしめた。バクテリオファージM13mp 10wは部位変異
誘発に使用されるタイプの常用のファージであり、匹敵
するタイプのファージがNew England Biolabs(ベバリ
ンマサチューセッツ)から入手可能である。Sal I/Pst
I断片をアガロースゲル電気泳動により分離し、そして
電気溶出により回収した。
次にPst Iで消化してSal I/Pst Iファージ断片を放出
せしめた。バクテリオファージM13mp 10wは部位変異
誘発に使用されるタイプの常用のファージであり、匹敵
するタイプのファージがNew England Biolabs(ベバリ
ンマサチューセッツ)から入手可能である。Sal I/Pst
I断片をアガロースゲル電気泳動により分離し、そして
電気溶出により回収した。
上記のようにして調製したptrpCBH8及びM13mp 10w
のSal I/Pst I断片を標準的条件下で連結し、そして凍
結したコンピテントE.コリK12/DG98株に形質
転換した。細胞を、5×10-4Mイソプロピルチオガラ
クトシド(IPTG)(Sigma Chem.;セントルイス,ミズ
リーから入手される)及び40μg/mlのX-galを含有
する培地上にプレートした。非α−補完白色プラーク
(16/405,4%)を新鮮な培地に拾い上げた。ミ
ニカルチュアーを期待されるサイズ(9kb)の組換単鎖
ファージDNAについてスクリーニングした。A6と称す
る目的とする組換ファージの構造を制限分析を用いて確
認した。
のSal I/Pst I断片を標準的条件下で連結し、そして凍
結したコンピテントE.コリK12/DG98株に形質
転換した。細胞を、5×10-4Mイソプロピルチオガラ
クトシド(IPTG)(Sigma Chem.;セントルイス,ミズ
リーから入手される)及び40μg/mlのX-galを含有
する培地上にプレートした。非α−補完白色プラーク
(16/405,4%)を新鮮な培地に拾い上げた。ミ
ニカルチュアーを期待されるサイズ(9kb)の組換単鎖
ファージDNAについてスクリーニングした。A6と称す
る目的とする組換ファージの構造を制限分析を用いて確
認した。
次の配列、 5′−CAACCTCCGATACATTTTAAATCGATACCCTTTTTAC-3′を
有する化学合成した純粋なオリゴデオキシヌクレオチド
を、Maxam及びGilbert〔Maxam,A.等、メソド・イン・エ
ンチモロジー(Methods in Enzymology)(1980)
68:521,Academic Press〕の方法の変法に従って
放射性ラベルした。簡単に記載すれば、New England Nu
clearから得た32P-ATP87pモル(2900Ci/mモル)
を乾燥し、そして40mM Tris-Cl,pH7.6,10mM MgCl2,
5mMDTT,0.1mMスペルミジン、及び0.1mM EDTAを含有
する溶液全容30μ中で50pモルのオリゴマー及び
12UのT4ポリヌクレオチドキナーゼと混合した。こ
の混合物を37℃にて1時間インキュベートし、さらに
12Uのキナーゼを加え、そしてさらに1時間反応を継
続した。粗生成物を、1mmの16%アクリルアミドゲル
を用いて、冷却しながら500Vにて30分間電気泳動
を行うPAGEにより精製した。最も遅く泳動するバンドを
切り取り、破砕し、そして100℃にて10分間加熱し
た後に0.5mlずつのハイブリド形成緩衝液を用いて2
回溶出した。溶液の比活性は5.3×106dpm/pm(7
5%導入)であった。
有する化学合成した純粋なオリゴデオキシヌクレオチド
を、Maxam及びGilbert〔Maxam,A.等、メソド・イン・エ
ンチモロジー(Methods in Enzymology)(1980)
68:521,Academic Press〕の方法の変法に従って
放射性ラベルした。簡単に記載すれば、New England Nu
clearから得た32P-ATP87pモル(2900Ci/mモル)
を乾燥し、そして40mM Tris-Cl,pH7.6,10mM MgCl2,
5mMDTT,0.1mMスペルミジン、及び0.1mM EDTAを含有
する溶液全容30μ中で50pモルのオリゴマー及び
12UのT4ポリヌクレオチドキナーゼと混合した。こ
の混合物を37℃にて1時間インキュベートし、さらに
12Uのキナーゼを加え、そしてさらに1時間反応を継
続した。粗生成物を、1mmの16%アクリルアミドゲル
を用いて、冷却しながら500Vにて30分間電気泳動
を行うPAGEにより精製した。最も遅く泳動するバンドを
切り取り、破砕し、そして100℃にて10分間加熱し
た後に0.5mlずつのハイブリド形成緩衝液を用いて2
回溶出した。溶液の比活性は5.3×106dpm/pm(7
5%導入)であった。
組換M13mp10wバクテリオファージA6をE.コリ
K12/DG98株中に調製し、そして単鎖ファージDN
Aを精製した。1pモルの単鎖ファージDNA及び10pモ
ルの合成ヌクレオチドプライマー(キナーゼ処理してな
い)を、20mM Tris-Cl、pH8、20mM MgCl2、100mM
NaCl、20mM 2−メルカプトエタノールから成る液1
5μ中で、67℃にて1分間、そして次に37℃にて
30分間加熱することによりアニーリングした。次にア
ニーリングしたDNAをDNAポリメラーゼI(Klenow)及び
500μMdNTPと共に0℃にて30分間インキュベート
し、そして次に37℃にした。アリコート(0.05又は
0.25pモル)を、5分、20分、及び45分後に取り
出し、E.コリK12/MM294に形質転換し、そし
てE.コリK12/DG98株と共にプレートした。
K12/DG98株中に調製し、そして単鎖ファージDN
Aを精製した。1pモルの単鎖ファージDNA及び10pモ
ルの合成ヌクレオチドプライマー(キナーゼ処理してな
い)を、20mM Tris-Cl、pH8、20mM MgCl2、100mM
NaCl、20mM 2−メルカプトエタノールから成る液1
5μ中で、67℃にて1分間、そして次に37℃にて
30分間加熱することによりアニーリングした。次にア
ニーリングしたDNAをDNAポリメラーゼI(Klenow)及び
500μMdNTPと共に0℃にて30分間インキュベート
し、そして次に37℃にした。アリコート(0.05又は
0.25pモル)を、5分、20分、及び45分後に取り
出し、E.コリK12/MM294に形質転換し、そし
てE.コリK12/DG98株と共にプレートした。
このプレートを4℃に冷却し、そしてBiodyneから得ら
れるPal I膜を用いてプラークを取り上げた(第1の
紙においては1〜2分間、第2の紙については10分
間以上)。紙を2.5M NaCl,0.5M NaOH中で
変性した(5分間)。変性媒体を3M酢酸ナトリウムに
よりpH5.5に中和し、紙を真空中で1時間80℃に
て加熱し、そして次に6×SSC、5×Denhart溶液、0.
1%SDS、50μg/ml酵母t-RNA中で54.4℃にて2時
間前ハイブリド形成した。次に紙を、6.5×106c
pm/1.25pモルのキナーゼ処理した合成オリゴヌクレ
オチド(2.5ml/紙)を用いて50.5℃にて一夜プ
ローブ処理し、6×SSC中で40℃にて5分間ずつ2回
洗浄し、そして6×SSC中で50.5℃で5分間洗浄し、
そして−80℃にて一夜オートラジオグラフ処理した。
れるPal I膜を用いてプラークを取り上げた(第1の
紙においては1〜2分間、第2の紙については10分
間以上)。紙を2.5M NaCl,0.5M NaOH中で
変性した(5分間)。変性媒体を3M酢酸ナトリウムに
よりpH5.5に中和し、紙を真空中で1時間80℃に
て加熱し、そして次に6×SSC、5×Denhart溶液、0.
1%SDS、50μg/ml酵母t-RNA中で54.4℃にて2時
間前ハイブリド形成した。次に紙を、6.5×106c
pm/1.25pモルのキナーゼ処理した合成オリゴヌクレ
オチド(2.5ml/紙)を用いて50.5℃にて一夜プ
ローブ処理し、6×SSC中で40℃にて5分間ずつ2回
洗浄し、そして6×SSC中で50.5℃で5分間洗浄し、
そして−80℃にて一夜オートラジオグラフ処理した。
前記合成オリゴヌクレオチドのヌクレオチド1−15は
CBH I遺伝子の5′末端に相補的であり、そしてヌクレ
オチド23−37はptrpCBH8中のS/D配列と隣接す
るBamH I部位との間のコントロール領域に相補的であ
る。第11図の拡大された部分からわかる通り、目的と
する組換ファージ〔ptrpCBH81の末端相同(end-homol
ogous)部分がオリゴヌクレオチドプライマーで置換さ
れている〕はBamH I部位及びXma I部位を喪失し、そし
てオリゴヌクレオチドの中央部分に由来するCla I部位
及びAha III部位を獲得している。さらに詳しくは、図
の下部拡大部分に示されているように、変形されたファ
ージはCBH遺伝子のATG開始コドンに直接隣接してTTTAAA
からなるAha III認識部位を含有する。
CBH I遺伝子の5′末端に相補的であり、そしてヌクレ
オチド23−37はptrpCBH8中のS/D配列と隣接す
るBamH I部位との間のコントロール領域に相補的であ
る。第11図の拡大された部分からわかる通り、目的と
する組換ファージ〔ptrpCBH81の末端相同(end-homol
ogous)部分がオリゴヌクレオチドプライマーで置換さ
れている〕はBamH I部位及びXma I部位を喪失し、そし
てオリゴヌクレオチドの中央部分に由来するCla I部位
及びAha III部位を獲得している。さらに詳しくは、図
の下部拡大部分に示されているように、変形されたファ
ージはCBH遺伝子のATG開始コドンに直接隣接してTTTAAA
からなるAha III認識部位を含有する。
候補プラークを取り上げ、E.コリK12/DG98株
に感染せしめた後、複製形(RF)DNAを、新しいCla I及
びAha III認識部位の獲得、並びにXma I認識部位の喪失
について試験する。適切な分析結果を示す1つの候補を
mp10w5Aと命名した。
に感染せしめた後、複製形(RF)DNAを、新しいCla I及
びAha III認識部位の獲得、並びにXma I認識部位の喪失
について試験する。適切な分析結果を示す1つの候補を
mp10w5Aと命名した。
D.8.c.2. ptrpCBH81への置き換え プラスミドptrpCBH81、及びmp10w5ARF-DNAのそ
れぞれを、Sal I及びBamH Iを用いて完全消化し、そし
て消化物を標準的条件下で連結した。連結混合物をXma
Iにより消化することにより不所望の連結混合物を不活
性化し、そしてこれを用いてE.コリK12/MM29
4をAmpRに形質転換した。
れぞれを、Sal I及びBamH Iを用いて完全消化し、そし
て消化物を標準的条件下で連結した。連結混合物をXma
Iにより消化することにより不所望の連結混合物を不活
性化し、そしてこれを用いてE.コリK12/MM29
4をAmpRに形質転換した。
候補プラスミドを制限分析により分析した。これは、Sa
l I/Bam I消化により1.26kb DNA断片を;Cla I/Bam
H I消化により1.07kb DNA断片を;そしてBamH I/Aha
III消化により1.07kb DNAを放出するものである。第
11図においてptrpCBH82として示す正しい構成が配
列決定により確認された。
l I/Bam I消化により1.26kb DNA断片を;Cla I/Bam
H I消化により1.07kb DNA断片を;そしてBamH I/Aha
III消化により1.07kb DNAを放出するものである。第
11図においてptrpCBH82として示す正しい構成が配
列決定により確認された。
9. CBH Iをコードする酵母発現プラスミドの造成 pDG151から誘導されたD.8項の細菌/酵母複製プラス
ミドのベクター骨格の特徴を維持しながらENO1プロモ
ーターの制御のもとにCBH Iコード配列を配置して幾つ
かのプラスミドを造成した。penoCBH500・202と
称する、これらのベクターの内の1つの造成を第12図
に示す。
ミドのベクター骨格の特徴を維持しながらENO1プロモ
ーターの制御のもとにCBH Iコード配列を配置して幾つ
かのプラスミドを造成した。penoCBH500・202と
称する、これらのベクターの内の1つの造成を第12図
に示す。
プラスミドpPM14をENO1プロモーターの分離源として
使用した。pPM14は、エノラーゼ−I翻訳開始部位に先
行する723bpからエノラーゼATG開始コドンのヌクレ
オチド−2にわたる断片を含有するpeno46〔Holland,
M.J.等、ジャーナル・オブ・ビオロジカル・ケミストリ
ー(J.Biol.Chem.)(1981)256:1385〕か
らの722bp EcoR I/Hind III断片を含有するpBR32
2の誘導体である。pPM14をEcoR Iで消化し、dATP及
びdTTPの存在下でKlenowで処理し、そして次にHind III
で処理してEcoR I(平滑)/Hind III ENO1プロモータ
ー含有断片を得た。
使用した。pPM14は、エノラーゼ−I翻訳開始部位に先
行する723bpからエノラーゼATG開始コドンのヌクレ
オチド−2にわたる断片を含有するpeno46〔Holland,
M.J.等、ジャーナル・オブ・ビオロジカル・ケミストリ
ー(J.Biol.Chem.)(1981)256:1385〕か
らの722bp EcoR I/Hind III断片を含有するpBR32
2の誘導体である。pPM14をEcoR Iで消化し、dATP及
びdTTPの存在下でKlenowで処理し、そして次にHind III
で処理してEcoR I(平滑)/Hind III ENO1プロモータ
ー含有断片を得た。
プラスミドptrpCBH81をSal Iで消化し、4種数すべて
のdNTPの存在下でKlenowで処理し、そして次にHind III
で完全消化した。
のdNTPの存在下でKlenowで処理し、そして次にHind III
で完全消化した。
前記において調製した断片を等モル比において接着末端
条件下で連結し、次に平滑末端連結し、そして連結生成
物をNru I及びSma Iで処理して不所望の連結生成物を不
活性化した。連結混合物を用いてE.コリK12/MM
294をAmpRに形質転換し、そして形質転換体を、peno
CBH24と称する目的の11.32kbプラスミドの存在に
ついてスクリーニングした。制限分析により正しい構成
を確認した。
条件下で連結し、次に平滑末端連結し、そして連結生成
物をNru I及びSma Iで処理して不所望の連結生成物を不
活性化した。連結混合物を用いてE.コリK12/MM
294をAmpRに形質転換し、そして形質転換体を、peno
CBH24と称する目的の11.32kbプラスミドの存在に
ついてスクリーニングした。制限分析により正しい構成
を確認した。
第12図に関し、ptrpCBH82をAha IIIで消化し、そし
てCBH Iをコードする2.2kb DNA断片をアガロースゲ
ル電気泳動により精製した。
てCBH Iをコードする2.2kb DNA断片をアガロースゲ
ル電気泳動により精製した。
この操作により切断される2つのAha III部位は、(1)す
ぐ前に記載したように、CBH I遺伝子の5′末端に隣接
して導入したAha III部位、及び(2)ptrpCBH81及びptr
pCBH82中のCBH I遺伝子の3′末端に接するpDG151
ベクター領域に含まれるAha III部位である。次にこの
断片をBamH Iで消化して2つのサブフラグメント、すな
わち5′CBH I配列をコードする1068bp Aha III/B
amH I断片、及び3′CBH I配列をコードし、さらに細菌
DNA及び3′非翻ENO1配列の広がりを含有する1.13kb
BamH I/Aha III断片を得る。
ぐ前に記載したように、CBH I遺伝子の5′末端に隣接
して導入したAha III部位、及び(2)ptrpCBH81及びptr
pCBH82中のCBH I遺伝子の3′末端に接するpDG151
ベクター領域に含まれるAha III部位である。次にこの
断片をBamH Iで消化して2つのサブフラグメント、すな
わち5′CBH I配列をコードする1068bp Aha III/B
amH I断片、及び3′CBH I配列をコードし、さらに細菌
DNA及び3′非翻ENO1配列の広がりを含有する1.13kb
BamH I/Aha III断片を得る。
プラスミドponoCBH24をHind IIIで消化し、S1ヌク
レアーゼで処理し、そして次にBamH Iで消化した。前記
の断片及びpenoCBH24からのベクターDNA断片を2:1
のモル比で接着末端条件下で連結し、そして次に平滑末
端条件下で連結した。この連結混合物を用いてE.コリ
K12/MM294株をAmpRに形質転換し、そして好結
果の形質転換体を、5′CBH I配列を含有する目的の1
2.2kbプラスミドについてスクリーニングした。EcoR I
消化において2.05kb断片を放出し、そしてHae III消
化において200bp断片を放出することにより同定され
た好結果の候補をpenoCBH500Xと命名した。ここで
Xは後で特定する標識番号である。プラスミドを、成熟
CBH Iコード配列のヌクレオチド31−48に相補的な
内部オクタマープライマーを用いて、ジデオキシDNA配
列分析によりさらに分析した。
レアーゼで処理し、そして次にBamH Iで消化した。前記
の断片及びpenoCBH24からのベクターDNA断片を2:1
のモル比で接着末端条件下で連結し、そして次に平滑末
端条件下で連結した。この連結混合物を用いてE.コリ
K12/MM294株をAmpRに形質転換し、そして好結
果の形質転換体を、5′CBH I配列を含有する目的の1
2.2kbプラスミドについてスクリーニングした。EcoR I
消化において2.05kb断片を放出し、そしてHae III消
化において200bp断片を放出することにより同定され
た好結果の候補をpenoCBH500Xと命名した。ここで
Xは後で特定する標識番号である。プラスミドを、成熟
CBH Iコード配列のヌクレオチド31−48に相補的な
内部オクタマープライマーを用いて、ジデオキシDNA配
列分析によりさらに分析した。
プラスミドpenoCBH500.202は次の配列、 をコードし、Hind III接着末端の正確な除去及びAha II
I/CBH I DNA断片への融合が示された。
I/CBH I DNA断片への融合が示された。
プラスミドpenoCBH500.108、及びpenoCBH50
0.150は次の同じDNA配列、 をコードし、1個のA/T塩基対がS1ヌクレアーゼ処
理中に除去されたことが示された。
0.150は次の同じDNA配列、 をコードし、1個のA/T塩基対がS1ヌクレアーゼ処
理中に除去されたことが示された。
プラスミドpenoCBH500.212は次の配列、 をコードし、2個のA/T塩基対、及び1個のC/G塩
基対がENO1プロモーター断片から除去されたことが示
された。
基対がENO1プロモーター断片から除去されたことが示
された。
D.10. 酵母におけるクローニングされたCBH I遺伝子の
発現 酵母S.セレビシエーS173−6B株をpenoCBH50
0.202により形質転換し、そしてLEU+形質転換体に
ついて選択した。好結果の形質転換体コロニーを培養
し、そして最少培地に炭素源としてグルコースを用いて
10の発酵槽中で増殖せしめた。培養物は光学濃度
(OD680)10まで増殖した。発酵槽の内容物を過
し、液体画分を濃縮し、そして水に対して透析した。
発現 酵母S.セレビシエーS173−6B株をpenoCBH50
0.202により形質転換し、そしてLEU+形質転換体に
ついて選択した。好結果の形質転換体コロニーを培養
し、そして最少培地に炭素源としてグルコースを用いて
10の発酵槽中で増殖せしめた。培養物は光学濃度
(OD680)10まで増殖した。発酵槽の内容物を過
し、液体画分を濃縮し、そして水に対して透析した。
得られた約10の培地を500mlに減少せしめ、そし
てD.2に前記した方法に従って、DEAEセファロースカラ
ムに適用することによりさらに精製した。500mgの蛋
白質をカラムに適用し、約437mgを非吸着画分中に回
収し、そして約100mg、すなわち18%をCBH Iに対
応する単一ピークとして溶出した。
てD.2に前記した方法に従って、DEAEセファロースカラ
ムに適用することによりさらに精製した。500mgの蛋
白質をカラムに適用し、約437mgを非吸着画分中に回
収し、そして約100mg、すなわち18%をCBH Iに対
応する単一ピークとして溶出した。
10.c 酵母における組換法により生産されたCBH Iの特
徴付け 分泌され精製されたCBH I(組換CBH I)を特徴付け、そ
してD.2項に前記した方法に従って分離された天然T.
リーゼイCBH Iと比較した。結果を後記の第2表に要約
する。
徴付け 分泌され精製されたCBH I(組換CBH I)を特徴付け、そ
してD.2項に前記した方法に従って分離された天然T.
リーゼイCBH Iと比較した。結果を後記の第2表に要約
する。
組換CBH I及び天然CBH Iのウエスタンブロット分析を標
準的方法に従って行った。第13図中のレーン1及び3
は、それぞれ天然CBH I及び組換CBH Iのゲルパターンを
示す。第2表に示すように、ブロット分析により、天然
CBH Iの見かけ分子量は約60kドルトンであり、そし
て組換CBH Iのこれは約100kドルトン〜200kド
ルトンの間であることが示された。
準的方法に従って行った。第13図中のレーン1及び3
は、それぞれ天然CBH I及び組換CBH Iのゲルパターンを
示す。第2表に示すように、ブロット分析により、天然
CBH Iの見かけ分子量は約60kドルトンであり、そし
て組換CBH Iのこれは約100kドルトン〜200kド
ルトンの間であることが示された。
2種類の酵素をグリコシダーゼエンド−Hで処理した。
このグリコシダーゼは、蛋白質のN−結合グリコシル残
基を脱グリコシル化する。脱グリコシル化処理した天然
蛋白質及び組換蛋白質を上記のようにウエスタンブロッ
ト分析により試験した。結果をそれぞれ第13図中のレ
ーン2及びレーン4に示す。この図から明らかなよう
に、脱グリコシル化された両蛋白質はおよそ同じ分子量
を有し、組換CBH Iは、天然CBH Iと異り、大きなN−結
合残基によって高度にグリコシル化されていることが示
された。これに対して天然CBH Iは、第2表に示すよう
に主としてO−結合残基を含有することが知られる。グ
リコシル化された組換CBH Iの見かけ分子量が非常に大
きいのは、N−結合糖残基が、天然酵素中のO−結合グ
リコシル化における部位当り1〜2糖残基と比べて長い
ためである。
このグリコシダーゼは、蛋白質のN−結合グリコシル残
基を脱グリコシル化する。脱グリコシル化処理した天然
蛋白質及び組換蛋白質を上記のようにウエスタンブロッ
ト分析により試験した。結果をそれぞれ第13図中のレ
ーン2及びレーン4に示す。この図から明らかなよう
に、脱グリコシル化された両蛋白質はおよそ同じ分子量
を有し、組換CBH Iは、天然CBH Iと異り、大きなN−結
合残基によって高度にグリコシル化されていることが示
された。これに対して天然CBH Iは、第2表に示すよう
に主としてO−結合残基を含有することが知られる。グ
リコシル化された組換CBH Iの見かけ分子量が非常に大
きいのは、N−結合糖残基が、天然酵素中のO−結合グ
リコシル化における部位当り1〜2糖残基と比べて長い
ためである。
精製された天然酵素及び組換酵素のCBH I活性を常法に
従って、燐酸膨潤セルロースからのセロビオースの生成
について測定した。第2表からわかるように、Lowryの
蛋白質測定に基いて、天然CBH Iは約0.57ユニット/m
gの比活性を有し、組換CBH Iのそれは0.34ユニット/
mgであった。蛋白質のアミノ酸組成に基いて、組換CBH
Iについての一層高い比活性値(0.46ユニット/mg)
が算出された。明らかなように、この発明の組換CBH I
は、T.リーゼイ由来の天然CBH Iとほとんど同じ比活
性を有する。
従って、燐酸膨潤セルロースからのセロビオースの生成
について測定した。第2表からわかるように、Lowryの
蛋白質測定に基いて、天然CBH Iは約0.57ユニット/m
gの比活性を有し、組換CBH Iのそれは0.34ユニット/
mgであった。蛋白質のアミノ酸組成に基いて、組換CBH
Iについての一層高い比活性値(0.46ユニット/mg)
が算出された。明らかなように、この発明の組換CBH I
は、T.リーゼイ由来の天然CBH Iとほとんど同じ比活
性を有する。
組換CBH Iの同一性を確認するために、D.2項に前記した
方法を用いて、アミノ末端断片(残基1〜37)及び中
間断片(残基225〜251)のアミノ酸配列を決定し
た。2つの配列はそれぞれ、アミノ酸組成において天然
CBH Iの対応断片と同一であった。興味あることに、組
換蛋白質は成熟天然CBH Iと同じアミノ末端ピログルタ
ミンを含有し、(1)リーダーポリペプチドの除去、及び
(2)アミノ末端グルタミン残基を含む同じプロセシンが
組換酵素において生ずることが示された。
方法を用いて、アミノ末端断片(残基1〜37)及び中
間断片(残基225〜251)のアミノ酸配列を決定し
た。2つの配列はそれぞれ、アミノ酸組成において天然
CBH Iの対応断片と同一であった。興味あることに、組
換蛋白質は成熟天然CBH Iと同じアミノ末端ピログルタ
ミンを含有し、(1)リーダーポリペプチドの除去、及び
(2)アミノ末端グルタミン残基を含む同じプロセシンが
組換酵素において生ずることが示された。
要約すれば、CBHセルラーゼをコードする遺伝子がクロ
ーニングされ、そして酵母において発現された。そし
て、適当な制御配列を用いることにより種々の宿主にお
いて発現するために改造することができる。組換CBHが
入手できることは、セルロース廃棄物の一層効率的な利
用、及び最終的にはグルコース及びエタノールを包含す
る有用な誘導体への該廃棄物の転換及びセルロース材料
の特定の変性のための転換の可能性を提供する。
ーニングされ、そして酵母において発現された。そし
て、適当な制御配列を用いることにより種々の宿主にお
いて発現するために改造することができる。組換CBHが
入手できることは、セルロース廃棄物の一層効率的な利
用、及び最終的にはグルコース及びエタノールを包含す
る有用な誘導体への該廃棄物の転換及びセルロース材料
の特定の変性のための転換の可能性を提供する。
CBH遺伝子の造成及び発現を酵母において発現されるT.
リーゼイ遺伝子に関連させて説明したが、この明細書に
記載した技法は他のCBH遺伝子、例えば種々の菌類由来
のCBH I遺伝子の造成に適用し得ることが理解される。
この明細書に説明した発現ベクターの、他の蛋白質の発
現への一般的適用は前記のB.3項に検討されている。
リーゼイ遺伝子に関連させて説明したが、この明細書に
記載した技法は他のCBH遺伝子、例えば種々の菌類由来
のCBH I遺伝子の造成に適用し得ることが理解される。
この明細書に説明した発現ベクターの、他の蛋白質の発
現への一般的適用は前記のB.3項に検討されている。
E. 組換EG Iの製造 この項は組換EG I遺伝子、及び酵母におけるその発現を
説明する。例として、EG Iコード配列をHind IIIカセッ
トとして造成し、そして酵母エノラーゼ制限配列に機能
的に結合するように酵母発現ベクターに連結した。
説明する。例として、EG Iコード配列をHind IIIカセッ
トとして造成し、そして酵母エノラーゼ制限配列に機能
的に結合するように酵母発現ベクターに連結した。
E.1. EGIについて濃縮されたmRNAの調製及びcDNAの
合成 セルロース誘導T.リーゼイL27株からポリ−A RNAを
得、そしてD.3に前記したのと実質上同様にしてアガロ
ース電気泳動により画分した。
合成 セルロース誘導T.リーゼイL27株からポリ−A RNAを
得、そしてD.3に前記したのと実質上同様にしてアガロ
ース電気泳動により画分した。
標準的方法に従って精製EGIを用いてEGIに対して
特異的な抗体を調製した。簡単に記載すれば、Shoemake
r,S.等、バイオ・テクノロジ(Bio Technology)(19
83年10月)687に記載されている方法によって得
た精製EGIをフロインドのアジュバントと混合し、そ
して0.2〜0.4mlの混合物をニュージランドホウイ
トラビットに筋肉内注射した。抗体価がOuchterlony,
O.,Arkiv Kemi(1949)1:43の二重免疫拡散法
により検出できるようになるまで10日121回注射を
反復した。
特異的な抗体を調製した。簡単に記載すれば、Shoemake
r,S.等、バイオ・テクノロジ(Bio Technology)(19
83年10月)687に記載されている方法によって得
た精製EGIをフロインドのアジュバントと混合し、そ
して0.2〜0.4mlの混合物をニュージランドホウイ
トラビットに筋肉内注射した。抗体価がOuchterlony,
O.,Arkiv Kemi(1949)1:43の二重免疫拡散法
により検出できるようになるまで10日121回注射を
反復した。
正しいmRNA画分を証明するため、少量ずつの各RNA画分
を、New England Nuclear Company、ボストン,マサチ
ューセッツから網状赤血球溶解物/メチオニンL−(3
5S)−翻訳系として販売されている無細胞蛋白質合成
系に加えた。この系により合成されたEGIの存否を、
合成された全蛋白質のSDS-PAGE及び抗−EGI抗体と免
疫沈殿しそして次に解離された翻訳系由来蛋白質のSDS-
PAGEにより確認した。
を、New England Nuclear Company、ボストン,マサチ
ューセッツから網状赤血球溶解物/メチオニンL−(3
5S)−翻訳系として販売されている無細胞蛋白質合成
系に加えた。この系により合成されたEGIの存否を、
合成された全蛋白質のSDS-PAGE及び抗−EGI抗体と免
疫沈殿しそして次に解離された翻訳系由来蛋白質のSDS-
PAGEにより確認した。
E.2. cDNAプローブの調製 無細胞合成系において高レベルのEGIを含成したmRNA
画分を選択し、そしてこれを用いてD.4項に前記したの
と実質上同様にして単鎖コピーDNAを生成せしめた。単
鎖DNAをゲル電気泳動によりサイズ分析し、期待されるc
DNAサイズに対応する主要バンドを観察した。
画分を選択し、そしてこれを用いてD.4項に前記したの
と実質上同様にして単鎖コピーDNAを生成せしめた。単
鎖DNAをゲル電気泳動によりサイズ分析し、期待されるc
DNAサイズに対応する主要バンドを観察した。
E.3 二重鎖cDNAライブラリーの調製 E.1項で調製したmRNA画分を用いて、Maniatis等、モレ
キュラー・クローニング−A・ラボラトリー・マニュア
ル(Molecular Cloning-A Laboratory Manual)(19
82)Cold Spring Harbor Laboratory,コールドスプ
リングハーバー,ニューヨーク、235−238頁の方
法に従ってcDNAライブラリーを作成した。こうして得た
二重鎖cDNAを次に、標準的方法に従ってpUC-8クローニ
ングベクター中にクローニングし、そしてEGIをコー
ドすることが知られている4kb Hing IIIゲノム断片
(前記)を用いて検出した。
キュラー・クローニング−A・ラボラトリー・マニュア
ル(Molecular Cloning-A Laboratory Manual)(19
82)Cold Spring Harbor Laboratory,コールドスプ
リングハーバー,ニューヨーク、235−238頁の方
法に従ってcDNAライブラリーを作成した。こうして得た
二重鎖cDNAを次に、標準的方法に従ってpUC-8クローニ
ングベクター中にクローニングし、そしてEGIをコー
ドすることが知られている4kb Hing IIIゲノム断片
(前記)を用いて検出した。
プローブとハイブリド形成する3つのcDNAクローン、す
なわちpcEG10,pcEG9,及びpcEG1を選択してさらに
検討した。これらを、制限分析及びジデオキシ法を用い
るcDNA領域の配列決定により分析した。pcEG10は配列
の3′領域をコードし、そしてpcEG1は5′部分をコー
ドすることが見出された。
なわちpcEG10,pcEG9,及びpcEG1を選択してさらに
検討した。これらを、制限分析及びジデオキシ法を用い
るcDNA領域の配列決定により分析した。pcEG10は配列
の3′領域をコードし、そしてpcEG1は5′部分をコー
ドすることが見出された。
E.4. EGI遺伝子の調製及び配列決定 T.リーゼイL27株からのλ−ファージ中のゲノムライ
ブラリーを、Shoemaker,S.等、バイオ・テクノロジー
(Bio Technology)(1983年10月)691−696
頁に記載されている方法(この記載を引用によりこの明
細書に組み入れる)、及びさらにD.5項に前記した方法
により調製した。このλ−ゲノムライブラリーを、Shoe
maker,S.等(前掲)に記載されているようにして、但し
プローブとしてE.2項において調製した単鎖cDNAを使用
してスクリーニングした。陽性反応を示すファージから
の1つの断片をpUC8にサブクローニングし、pUC8-hを得
た。このベクターは、全EGI遺伝子にわたる4kb Hin
d III断片を含有する。
ブラリーを、Shoemaker,S.等、バイオ・テクノロジー
(Bio Technology)(1983年10月)691−696
頁に記載されている方法(この記載を引用によりこの明
細書に組み入れる)、及びさらにD.5項に前記した方法
により調製した。このλ−ゲノムライブラリーを、Shoe
maker,S.等(前掲)に記載されているようにして、但し
プローブとしてE.2項において調製した単鎖cDNAを使用
してスクリーニングした。陽性反応を示すファージから
の1つの断片をpUC8にサブクローニングし、pUC8-hを得
た。このベクターは、全EGI遺伝子にわたる4kb Hin
d III断片を含有する。
この断片中のコード配列の位置を、制限分析、並びに
5′末端合成オリゴヌクレオチド及び3′末端cDNAプロ
ーブへのハイブリド形成により決定した。DNAを、EcoR
Iと共にKpn I,Sst I,Xba I及びSph Iを用いて消化
し、そしてプローブとして成熟EGI配列のアミノ酸残
基16−20に対応し、4ヌクレオチドのあいまいさ
(ambiguity)を有する16merを用いて、サザンブロッ
ト分析〔Southern,ジャーナル・オブ・モレキュラー・
バイオロジー(J.Mol.Biol.)(1975)98:50
3〕に付した。その結果、遺伝子の主要部分がKpn I部
位及びSst I部位の間に位置することが示された。pUC8
−hゲノムDNAの制限地図を第14図Aに示す。
5′末端合成オリゴヌクレオチド及び3′末端cDNAプロ
ーブへのハイブリド形成により決定した。DNAを、EcoR
Iと共にKpn I,Sst I,Xba I及びSph Iを用いて消化
し、そしてプローブとして成熟EGI配列のアミノ酸残
基16−20に対応し、4ヌクレオチドのあいまいさ
(ambiguity)を有する16merを用いて、サザンブロッ
ト分析〔Southern,ジャーナル・オブ・モレキュラー・
バイオロジー(J.Mol.Biol.)(1975)98:50
3〕に付した。その結果、遺伝子の主要部分がKpn I部
位及びSst I部位の間に位置することが示された。pUC8
−hゲノムDNAの制限地図を第14図Aに示す。
さらに、4kb Hind III配列の部分とEGIコード配列との
同一性を制限/選択実験によって確認した。4kb断片
を、Harpold,M.H.等、ニュークレイック・アシド・リサ
ーチ(Nucleic Acids Res.)(1978)5:2039
の方法に従ってニトロセルロース紙に結合せしめた。
誘導された培養物由来の全mRNAを紙に加え、そして結
合したmRNAを強力な条件下で洗浄することにより非結合
mRNAから分離した。次に紙に結合したmRNAを溶出し
た。各紙について、結合mRNA画分及び非結合mRNA画分
を無細胞蛋白質合成系において翻訳し、そして合成され
た蛋白質を抗−EGI抗体及びスタフィロコッカス・ア
ウレス細胞の混合物を用いて沈殿せしめた。免疫沈殿物
からの蛋白質をSDS-PAGEに付した。実験結果を第15図
に示す。図中のレーン1は並行して泳動した幾つかの分
子量マーカーを示す。レーン2は無細胞合成系中で生産
された全ポリA-RNR翻訳生成物のゲルである。全翻訳生
成物の抗−EGI免疫沈殿をレーン3に示す。分子量に
おいてEGIに対応する単一バンドを示す。プローブとハ
イブリド形成するポリA-RNAの翻訳生成物のゲルパター
ンをレーン4に示す。このレーンはEGIの分子量に相
当する主たるバンドを示す。レーン4の材料は、抗−E
GI抗体により免疫沈殿した後、レーン5に示されるE
GIについて期待される分子量を有する単一バンドをも
たらす。レーン6及び7はそれぞれ、4kb Hind III断
片とハイブリド形成しなかったポリA-RNAにより指令さ
れた翻訳生成物のすべて、及び抗−EGI免疫沈殿物を
示す。図から明らかな通り、4kb Hind III断片を含有
する紙に結合したmRNAのみが、抗−EGIにより免疫
沈殿する蛋白質の合成を指令することができた。
同一性を制限/選択実験によって確認した。4kb断片
を、Harpold,M.H.等、ニュークレイック・アシド・リサ
ーチ(Nucleic Acids Res.)(1978)5:2039
の方法に従ってニトロセルロース紙に結合せしめた。
誘導された培養物由来の全mRNAを紙に加え、そして結
合したmRNAを強力な条件下で洗浄することにより非結合
mRNAから分離した。次に紙に結合したmRNAを溶出し
た。各紙について、結合mRNA画分及び非結合mRNA画分
を無細胞蛋白質合成系において翻訳し、そして合成され
た蛋白質を抗−EGI抗体及びスタフィロコッカス・ア
ウレス細胞の混合物を用いて沈殿せしめた。免疫沈殿物
からの蛋白質をSDS-PAGEに付した。実験結果を第15図
に示す。図中のレーン1は並行して泳動した幾つかの分
子量マーカーを示す。レーン2は無細胞合成系中で生産
された全ポリA-RNR翻訳生成物のゲルである。全翻訳生
成物の抗−EGI免疫沈殿をレーン3に示す。分子量に
おいてEGIに対応する単一バンドを示す。プローブとハ
イブリド形成するポリA-RNAの翻訳生成物のゲルパター
ンをレーン4に示す。このレーンはEGIの分子量に相
当する主たるバンドを示す。レーン4の材料は、抗−E
GI抗体により免疫沈殿した後、レーン5に示されるE
GIについて期待される分子量を有する単一バンドをも
たらす。レーン6及び7はそれぞれ、4kb Hind III断
片とハイブリド形成しなかったポリA-RNAにより指令さ
れた翻訳生成物のすべて、及び抗−EGI免疫沈殿物を
示す。図から明らかな通り、4kb Hind III断片を含有
する紙に結合したmRNAのみが、抗−EGIにより免疫
沈殿する蛋白質の合成を指令することができた。
次に、EGI遺伝子の完全コード配列を標準的制限法及
び配列決定法を用いて得た。結果を後の第3表に示す。
配列決定された断片は1697ヌクレオチドを含有し、
この配列は成熟蛋白質の437アミノ酸残基のコード配
列に先行する22アミノ酸リーダー配列のための66ヌ
クレオチドを包含する。DNA配列はさらに、ヌクレオチ
ド位置893〜962、及び1553〜1609に2個
のイントロンを含有する。イントロンの位置は、このコ
ード配列をcDNApcEG10及びpcEG1の同様の配列決定に
より得られた配列と比較することにより、そして公知の
アミノ酸配列(表に示してある)と比較することにより
推定した。リーダーペプチド(アミノ酸1−22)に対
応するコード配列はEGIの分泌を開始するためのシグ
ナル配列を提供し、そしてこの明細書においてEGIシ
グナル配列と称する。第3表のアミノ酸配列は、連続し
た形でEGIのポリペプチド配列である。
び配列決定法を用いて得た。結果を後の第3表に示す。
配列決定された断片は1697ヌクレオチドを含有し、
この配列は成熟蛋白質の437アミノ酸残基のコード配
列に先行する22アミノ酸リーダー配列のための66ヌ
クレオチドを包含する。DNA配列はさらに、ヌクレオチ
ド位置893〜962、及び1553〜1609に2個
のイントロンを含有する。イントロンの位置は、このコ
ード配列をcDNApcEG10及びpcEG1の同様の配列決定に
より得られた配列と比較することにより、そして公知の
アミノ酸配列(表に示してある)と比較することにより
推定した。リーダーペプチド(アミノ酸1−22)に対
応するコード配列はEGIの分泌を開始するためのシグ
ナル配列を提供し、そしてこの明細書においてEGIシ
グナル配列と称する。第3表のアミノ酸配列は、連続し
た形でEGIのポリペプチド配列である。
E.5 イントロン不含EGIコード配列の造成 E.4項からのプラスミドpUC8-hをSph Iで消化し、そして
Sph I断片をアガロースゲル上で精製した。分離された
断片を、標準的方法に従ってSph I消化M18mp8にク
ローニングした。連結されたファージをコンピテント
E.コリDG98株に形質転換し、そして細胞を、IPTG
(5×10-4M)の存在下X-gal(40mg/ml)を含有するプレ
ート上にプレートした。非α−補完白色プラークを、期
待される10.3kbサイズの組換単鎖ファージDNAにつ
いてスクリーニングした。JV82.2と称する目的と
する組換ファージの構造を制限分析を用いて確認した。
この構成を第14図フレームBに示す。このベクターを
Φ82.2と命名する。
Sph I断片をアガロースゲル上で精製した。分離された
断片を、標準的方法に従ってSph I消化M18mp8にク
ローニングした。連結されたファージをコンピテント
E.コリDG98株に形質転換し、そして細胞を、IPTG
(5×10-4M)の存在下X-gal(40mg/ml)を含有するプレ
ート上にプレートした。非α−補完白色プラークを、期
待される10.3kbサイズの組換単鎖ファージDNAにつ
いてスクリーニングした。JV82.2と称する目的と
する組換ファージの構造を制限分析を用いて確認した。
この構成を第14図フレームBに示す。このベクターを
Φ82.2と命名する。
下流イントロンの除去はゲノムクローンの3′部分を、
濃縮されたmRNAから調製されたcDNAクローンの対応部分
で置き換えることにより行い、そして制限分析により特
徴付けた。具体的には、JV82.2をPst Iで完全消
化し、そしてこの消化物をpcEG10からのpst I消化断
片と連結し、第14図のコードフレーム中に示されるJ
V104.34(Φ104.34)を得る。pcEG10からの
Pst I断片は、下流イントロンを含有する部分を含むゲ
ノムクローン中のコード領域に対応するコード領域を含
む。すなわちJV104.34は下流イントロンが除去さ
れたEGI遺伝子の完全コード配列を含む。
濃縮されたmRNAから調製されたcDNAクローンの対応部分
で置き換えることにより行い、そして制限分析により特
徴付けた。具体的には、JV82.2をPst Iで完全消
化し、そしてこの消化物をpcEG10からのpst I消化断
片と連結し、第14図のコードフレーム中に示されるJ
V104.34(Φ104.34)を得る。pcEG10からの
Pst I断片は、下流イントロンを含有する部分を含むゲ
ノムクローン中のコード領域に対応するコード領域を含
む。すなわちJV104.34は下流イントロンが除去さ
れたEGI遺伝子の完全コード配列を含む。
上流イントロンを除去するために、部位特定変異誘発を
用いた。第1上流イントロンを含む配列に相補的である
がイントロン配列を欠いているオリゴヌクレオチドプラ
イマーを合成した。このプライマー配列: 5′−GGCAGCGGCTACCAAAAGGTACTACGGCCCCGGAGA−3′ を有する。組換M13mp19バクテリオファージJV1
04.34をE.コリK12/DG98株中に調製し、そ
して常法に従って単鎖ファージを精製した。単鎖ファー
ジをDNA合成のためのプライマーとして用いて、標準的
方法に従ってプライマーとして合成オリゴマーを用いる
部位特定変異誘発を行った。プローブとして放射ラベル
したオリゴマーを用いるスクリーニングにより得られた
好結果のバクテリオファージ候補JV129.3(Φ12
9.3)を第14図のフレームDに示す。JV129.3は
適切なリーディングフレーム中に完全な非中断EGIコ
ード配列を含有する。
用いた。第1上流イントロンを含む配列に相補的である
がイントロン配列を欠いているオリゴヌクレオチドプラ
イマーを合成した。このプライマー配列: 5′−GGCAGCGGCTACCAAAAGGTACTACGGCCCCGGAGA−3′ を有する。組換M13mp19バクテリオファージJV1
04.34をE.コリK12/DG98株中に調製し、そ
して常法に従って単鎖ファージを精製した。単鎖ファー
ジをDNA合成のためのプライマーとして用いて、標準的
方法に従ってプライマーとして合成オリゴマーを用いる
部位特定変異誘発を行った。プローブとして放射ラベル
したオリゴマーを用いるスクリーニングにより得られた
好結果のバクテリオファージ候補JV129.3(Φ12
9.3)を第14図のフレームDに示す。JV129.3は
適切なリーディングフレーム中に完全な非中断EGIコ
ード配列を含有する。
イントロン不含遺伝子をさらに精巧にし、第14図フレ
ームE及びFに示すように、コード配列の直接上流及び
下流にHind III部位を設けてHind IIIカセットとして操
作できるようにした。上流Hind III部位を設けるため
に、コード配列の直接上流の配列に相補的であるが、AT
G翻訳開始コドンの5′に隣接してHind III部位を形成
するために6個のミスマッチを有する合成オリゴヌクレ
オチド: 5′−CTTAGTCCTTCTTGAAGCTTTAAAATGGCGCCCT-3′ を使用して、上記の部位特定変異誘発により天然上流配
列を置き換えた。得られたファージをHind IIIを用いて
さらに処理し、そして再連結して新しい5′近くのHind
IIIと第14図フレームA〜Dに示す上流部位との間の
DNA部分を除去し、JV134.1(第14図中フレーム
EのΦ134.1)を得た。
ームE及びFに示すように、コード配列の直接上流及び
下流にHind III部位を設けてHind IIIカセットとして操
作できるようにした。上流Hind III部位を設けるため
に、コード配列の直接上流の配列に相補的であるが、AT
G翻訳開始コドンの5′に隣接してHind III部位を形成
するために6個のミスマッチを有する合成オリゴヌクレ
オチド: 5′−CTTAGTCCTTCTTGAAGCTTTAAAATGGCGCCCT-3′ を使用して、上記の部位特定変異誘発により天然上流配
列を置き換えた。得られたファージをHind IIIを用いて
さらに処理し、そして再連結して新しい5′近くのHind
IIIと第14図フレームA〜Dに示す上流部位との間の
DNA部分を除去し、JV134.1(第14図中フレーム
EのΦ134.1)を得た。
同様にして、部位特定変異誘発法において合成ヌクレオ
チド: 5′−AATGCCTTTAGAAGCTTGACTTGCCT-3′ を使用してEGI遺伝子を含有するM13ベクターを、
Hind IIIカセットJV139.2(第14図中フレーム
F、Φ139.2)として造成した。
チド: 5′−AATGCCTTTAGAAGCTTGACTTGCCT-3′ を使用してEGI遺伝子を含有するM13ベクターを、
Hind IIIカセットJV139.2(第14図中フレーム
F、Φ139.2)として造成した。
E.6. EGIコード配列を含有する発現ベクターの造成 エノラーゼ−1プロモーター及びエノラーゼ−1ターミ
ネーターの制御のもとにEGI配列を含有する酵母にお
いて有用な発現ベクターを、酵母宿主ベクターpMAC 101
のHind III部位にHind IIIカセットを連結することによ
り造成した。
ネーターの制御のもとにEGI配列を含有する酵母にお
いて有用な発現ベクターを、酵母宿主ベクターpMAC 101
のHind III部位にHind IIIカセットを連結することによ
り造成した。
pMAC 101は、変形された酵母エノラーゼ−1(ENO1)プ
ロモーター配列及び酵母エノラーゼ−1(ENO1)ターミ
ネーター配列の間に設けられたHind切断部位を含有する
10.2kbベクターである。このベクターはさらに、酵母
LEI2遺伝子、酵母2μ複製開始点、並びにpBR322の
複製開始点及びAmpR部分を有する。pMAC101は、下に記
載するように、ベクターpJV160から、該ベクター中
のHind III遺伝子カセットを除去することにより容易に
得られる。
ロモーター配列及び酵母エノラーゼ−1(ENO1)ターミ
ネーター配列の間に設けられたHind切断部位を含有する
10.2kbベクターである。このベクターはさらに、酵母
LEI2遺伝子、酵母2μ複製開始点、並びにpBR322の
複製開始点及びAmpR部分を有する。pMAC101は、下に記
載するように、ベクターpJV160から、該ベクター中
のHind III遺伝子カセットを除去することにより容易に
得られる。
酵母におけるEGIのための発現ベクターpJV160を
造成するために、pMAC101をHind IIIにより完全消化
し、そして複製形(RF)のJV139.2から切り出され
たHind IIIカセットに連結した。連結混合物を使用して
酵母C 468株を形質転換した。好結果の形質転換体
をLEU+について選択し、そして陽性の候補を、下記のよ
うにカルボキシメチルセルロース(CMC)の上層を透明
にする能力により測定した。(セルラーゼ複合体酵素の
内エンドグルカナーゼのみがカルボキシメチルセルロー
スを加水分解するために適当な特異性を有する。セロビ
オヒドロラーゼはセルラーゼ自体に特異的であり、CMC
を加水分解しない。) E.7. 酵母におけるEGIの発現の確認 LEU2+について選択した後、3種類の好結果の形質転換
体を、Teather,R.等、アブライド・エンビロンメンタル
・ミクロ(Aplld.Envir.Micro.)(1982)43:77
7の方法に実質上従って、EGIの生成について測定し
た。コロニーの最少培地上に30℃にて増殖せしめ、そ
して0.5%CMC、15mM NaOAc,pH4.5、及び10mM
ナトリウムアジドを含有する上層寒天(0.8%)で覆
った。次にプレートを37℃にて4時間インキュベート
した。CMCの透明化を可視化するために、プレートを1m
g/mlのコンゴーレッドにより15分間処理し、そして1
M NaClで5分間処理し、次に1M HClで5分間処理し
た。分泌される機能的に活性なEGIを生産する3種類
の酵素形質転換体の能力を試験するために、3種類の形
質転換体のそれぞれ、及びpMAC101で形質転換された
酵母(対照)の培養上清液を調製した。上清サンプル
(1倍、又は20倍に濃縮したもの)をCMCプレート上
にスポットし、そして上記のようにしてEGI活性につ
いて測定した。結果を第16図に示す。スポット1〜4
は、3種類のEGI(1−3)及び対照(4)の1倍濃度の結
果であり、スポット5〜8は対応する20倍濃度の結果
である。図から明らかなように、すべてのEGI形質転
換体は活性なEGIを分泌したが対照形質転換体は分泌
しなかった。スポット9はT.リーゼイ由来の天然EGI
により形成されたものである。
造成するために、pMAC101をHind IIIにより完全消化
し、そして複製形(RF)のJV139.2から切り出され
たHind IIIカセットに連結した。連結混合物を使用して
酵母C 468株を形質転換した。好結果の形質転換体
をLEU+について選択し、そして陽性の候補を、下記のよ
うにカルボキシメチルセルロース(CMC)の上層を透明
にする能力により測定した。(セルラーゼ複合体酵素の
内エンドグルカナーゼのみがカルボキシメチルセルロー
スを加水分解するために適当な特異性を有する。セロビ
オヒドロラーゼはセルラーゼ自体に特異的であり、CMC
を加水分解しない。) E.7. 酵母におけるEGIの発現の確認 LEU2+について選択した後、3種類の好結果の形質転換
体を、Teather,R.等、アブライド・エンビロンメンタル
・ミクロ(Aplld.Envir.Micro.)(1982)43:77
7の方法に実質上従って、EGIの生成について測定し
た。コロニーの最少培地上に30℃にて増殖せしめ、そ
して0.5%CMC、15mM NaOAc,pH4.5、及び10mM
ナトリウムアジドを含有する上層寒天(0.8%)で覆
った。次にプレートを37℃にて4時間インキュベート
した。CMCの透明化を可視化するために、プレートを1m
g/mlのコンゴーレッドにより15分間処理し、そして1
M NaClで5分間処理し、次に1M HClで5分間処理し
た。分泌される機能的に活性なEGIを生産する3種類
の酵素形質転換体の能力を試験するために、3種類の形
質転換体のそれぞれ、及びpMAC101で形質転換された
酵母(対照)の培養上清液を調製した。上清サンプル
(1倍、又は20倍に濃縮したもの)をCMCプレート上
にスポットし、そして上記のようにしてEGI活性につ
いて測定した。結果を第16図に示す。スポット1〜4
は、3種類のEGI(1−3)及び対照(4)の1倍濃度の結
果であり、スポット5〜8は対応する20倍濃度の結果
である。図から明らかなように、すべてのEGI形質転
換体は活性なEGIを分泌したが対照形質転換体は分泌
しなかった。スポット9はT.リーゼイ由来の天然EGI
により形成されたものである。
EGIの発現の証明はまた、ウエスタンブロット法によ
っても行った。3種類の酵母培養物からの前記の測定に
よってEGI活性を示す濃縮された培養上清をSDS-PAGE
上で泳動し、ニトロセルロースに移し、そして抗−EG
I抗体を用いて検出し、次に125Iで放射性ラベルしたst
aph A蛋白質で処理した。
っても行った。3種類の酵母培養物からの前記の測定に
よってEGI活性を示す濃縮された培養上清をSDS-PAGE
上で泳動し、ニトロセルロースに移し、そして抗−EG
I抗体を用いて検出し、次に125Iで放射性ラベルしたst
aph A蛋白質で処理した。
第17図中レーン1はT.リーゼイ由来の天然の精製され
たEGIを示す。レーン2,3,4は3種類のEGI酵
母形質転換体のそれぞれの上清液のゲルパターンであ
る。図から明らかな通り、EGI形質転換体のそれぞれ
は天然EGIの分子量よりは幾分高い分子量を有するポ
リペプチドを分泌する。このバンドは、pMAC101を用い
て形質転換した酵母からの上清液中には見出されなかっ
た。EGIの分子量が高いのはおそらく、CBH Iについ
てすでに記載したのと同様に、翻訳後プロセシングにお
いて天然EGIと異るためであろう。
たEGIを示す。レーン2,3,4は3種類のEGI酵
母形質転換体のそれぞれの上清液のゲルパターンであ
る。図から明らかな通り、EGI形質転換体のそれぞれ
は天然EGIの分子量よりは幾分高い分子量を有するポ
リペプチドを分泌する。このバンドは、pMAC101を用い
て形質転換した酵母からの上清液中には見出されなかっ
た。EGIの分子量が高いのはおそらく、CBH Iについ
てすでに記載したのと同様に、翻訳後プロセシングにお
いて天然EGIと異るためであろう。
酵母におけるEGIの好結果の発現のために使用される
方法は、ベクター制御配列における適当な変形により、
細菌宿主及び酵母宿主を含む種々の宿主において発現を
達成するために適用することができる。CBH Iの場合と
同様に、この発明の方法は、T.リーゼイ由来のEGIIを
含む他の種々のエンドグルカナーゼの遺伝のクローニン
グ、及び発現を得るために使用することができる。
方法は、ベクター制御配列における適当な変形により、
細菌宿主及び酵母宿主を含む種々の宿主において発現を
達成するために適用することができる。CBH Iの場合と
同様に、この発明の方法は、T.リーゼイ由来のEGIIを
含む他の種々のエンドグルカナーゼの遺伝のクローニン
グ、及び発現を得るために使用することができる。
特に組換CBH Iと相俟って、組換EGIが入手可能であ
ることは、セルロース生成物の一層効率的な使用、セル
ロースの有用な誘導体への転換、及び/又はセルロース
材料の選択的変性の可能性を提供する。CBH I,EG
I、及び場合によってはβ−グルコシダーゼを含むセル
ロース分解系は、個々の分離された組換酵素から、又は
セルラーゼの組合せを含有する多宿主系を使用すること
により構成することができる。
ることは、セルロース生成物の一層効率的な使用、セル
ロースの有用な誘導体への転換、及び/又はセルロース
材料の選択的変性の可能性を提供する。CBH I,EG
I、及び場合によってはβ−グルコシダーゼを含むセル
ロース分解系は、個々の分離された組換酵素から、又は
セルラーゼの組合せを含有する多宿主系を使用すること
により構成することができる。
前記のATCC及びNRRLへの寄託に加えて、下記の微生物
が、特許手続上の微生物の寄託の国際的承認に関するブ
タペスト条約に基いてアメリカン・タイプ・カルチュア
・コレクション、12301パークラウンドライブ、ロック
ベレ、メリーランド、米国(ATCC)に寄託され、維持さ
れており、そしてブタペスト条約に基いて入手可能であ
る。これらの菌株の入手可能性を、いずれかの国の特許
法に基いてその政府の権威の下に認められた権利に反し
てこの発明を実施することの承諾であると解してはなら
ない。
が、特許手続上の微生物の寄託の国際的承認に関するブ
タペスト条約に基いてアメリカン・タイプ・カルチュア
・コレクション、12301パークラウンドライブ、ロック
ベレ、メリーランド、米国(ATCC)に寄託され、維持さ
れており、そしてブタペスト条約に基いて入手可能であ
る。これらの菌株の入手可能性を、いずれかの国の特許
法に基いてその政府の権威の下に認められた権利に反し
てこの発明を実施することの承諾であると解してはなら
ない。
寄託には下記のATCC寄託番号、及びMaster Culture Col
lection of Cetus Corprationの番号が与えられた。
lection of Cetus Corprationの番号が与えられた。
第1図はセルラーゼ誘導体炭素源の存在下(レーン1)
又は非存在下(レーン2)で増殖したT.リーゼイから分
離されたポリA RNAのゲル電気泳動パターンを示し; 第2図は、無細胞合成系で生産されたポリペプチドのゲ
ル電気泳動パターンを示し、この系には(a)セルラーゼ
誘導条件下で増殖したT.リーゼイから得られた全ポリA
RNA(レーン1及び2)、(b)全誘導ポリA RNAの3つの
異るサイズの画分(レーン3〜8)、又は(c)セルラー
ゼ非誘導条件下で増殖したT.リーゼイの細胞から得られ
たポリA RNAのサイズ画分(レーン9及び10)が加え
られ、この図において奇数番号のゲルパターンは種種の
RNAサンプルの指令のもとに合成された全ポリペプチド
を示し、そして偶数番号のゲルパターンは抗−CBH I抗
体の存在下で免疫沈殿する対応するペプチドを示し; 第3A図は、T.リーゼイL27株ゲノムDNAからの1.1
6kb Hind III断片を含有するpCBH 157と称するベクタ
ーの地図であり; 第3B図は、同じゲノムDNAからの上記1.16kb断片に
隣接する2.3kb Hind III断片を含有するpCBH164
と称するベクターの地図であり; 第4図は、T.リーゼイL27株からの隣接する2個のHi
nd IIIゲノム消化断片であって一緒になってCBH I遺伝
子を含有するものの地図であり; 第5図は、この発明の1つの態様において使用するE.コ
リ/S.セレビシエーシャトルベクターの地図であり; 第6図は、この発明の1つの態様に従ってCBH I遺伝子
のイントロン不含5′端部分を造成する段階を示し; 第7図は、この発明の態様に従ってイントロン不含CBH
I遺伝子の3′端部分を造成する段階を示し; 第8図は、pDG151(第5図)及びpCBH5(第6図)
からのptrpCBH5と称するベクターの造成を示し; 第9図は、ptrpCBH5(第8図)及びpCBH3(第7図)
からの、完全な長さのイントロン不含CBH I遺伝子を含
有するptrpCBH8と称するベクターの造成を示し; 第10図は、ptrpCBH5及びpCBH5からの、完全な長さ
を有するイントロン不含CBH I遺伝子を含有するptrpCBH
81と称するベクターの造成を示し; 第11図は、E.コリ中でのCBH Iの発現に適するベクタ
ーのptrpCBH82の構成を示し; 第12図は、酵母中でのCBH Iの発現に適するベクターp
eno500.202の造成を示し; 第13図は、天然CBH I及び組換CBH Iのウエスタンブロ
ット分析の結果を示し; 第14図は、フレームAにおいてpUC8-hのEGIコード
部分の制限地図を、フレームB〜DにEGIのイントロ
ン不含コード配列を造成するまでの一連の段階を、そし
てフレームE及びFにEGIコード配列の直接上流及び
下流にHind III部位を設けるための段階を示し; 第15図は、T.リーゼイからの4kb Hind III断片の、
EGI合成を指令することができるmRNAを分離する能力
を試験するハイブリド形成実験の結果を示し; 第16図は、pJV160により形質転換されたコロニー
の、CMCを加水分解する能力を示し; そして、 第17図は、pJV160で形質転換された酵母及び対照
ベクターで形質転換された酵母の培養上清液において行
われたウエスタンブロットのラジオオートグラムであ
る。
又は非存在下(レーン2)で増殖したT.リーゼイから分
離されたポリA RNAのゲル電気泳動パターンを示し; 第2図は、無細胞合成系で生産されたポリペプチドのゲ
ル電気泳動パターンを示し、この系には(a)セルラーゼ
誘導条件下で増殖したT.リーゼイから得られた全ポリA
RNA(レーン1及び2)、(b)全誘導ポリA RNAの3つの
異るサイズの画分(レーン3〜8)、又は(c)セルラー
ゼ非誘導条件下で増殖したT.リーゼイの細胞から得られ
たポリA RNAのサイズ画分(レーン9及び10)が加え
られ、この図において奇数番号のゲルパターンは種種の
RNAサンプルの指令のもとに合成された全ポリペプチド
を示し、そして偶数番号のゲルパターンは抗−CBH I抗
体の存在下で免疫沈殿する対応するペプチドを示し; 第3A図は、T.リーゼイL27株ゲノムDNAからの1.1
6kb Hind III断片を含有するpCBH 157と称するベクタ
ーの地図であり; 第3B図は、同じゲノムDNAからの上記1.16kb断片に
隣接する2.3kb Hind III断片を含有するpCBH164
と称するベクターの地図であり; 第4図は、T.リーゼイL27株からの隣接する2個のHi
nd IIIゲノム消化断片であって一緒になってCBH I遺伝
子を含有するものの地図であり; 第5図は、この発明の1つの態様において使用するE.コ
リ/S.セレビシエーシャトルベクターの地図であり; 第6図は、この発明の1つの態様に従ってCBH I遺伝子
のイントロン不含5′端部分を造成する段階を示し; 第7図は、この発明の態様に従ってイントロン不含CBH
I遺伝子の3′端部分を造成する段階を示し; 第8図は、pDG151(第5図)及びpCBH5(第6図)
からのptrpCBH5と称するベクターの造成を示し; 第9図は、ptrpCBH5(第8図)及びpCBH3(第7図)
からの、完全な長さのイントロン不含CBH I遺伝子を含
有するptrpCBH8と称するベクターの造成を示し; 第10図は、ptrpCBH5及びpCBH5からの、完全な長さ
を有するイントロン不含CBH I遺伝子を含有するptrpCBH
81と称するベクターの造成を示し; 第11図は、E.コリ中でのCBH Iの発現に適するベクタ
ーのptrpCBH82の構成を示し; 第12図は、酵母中でのCBH Iの発現に適するベクターp
eno500.202の造成を示し; 第13図は、天然CBH I及び組換CBH Iのウエスタンブロ
ット分析の結果を示し; 第14図は、フレームAにおいてpUC8-hのEGIコード
部分の制限地図を、フレームB〜DにEGIのイントロ
ン不含コード配列を造成するまでの一連の段階を、そし
てフレームE及びFにEGIコード配列の直接上流及び
下流にHind III部位を設けるための段階を示し; 第15図は、T.リーゼイからの4kb Hind III断片の、
EGI合成を指令することができるmRNAを分離する能力
を試験するハイブリド形成実験の結果を示し; 第16図は、pJV160により形質転換されたコロニー
の、CMCを加水分解する能力を示し; そして、 第17図は、pJV160で形質転換された酵母及び対照
ベクターで形質転換された酵母の培養上清液において行
われたウエスタンブロットのラジオオートグラムであ
る。
フロントページの続き (51)Int.Cl.5 識別記号 庁内整理番号 FI 技術表示箇所 C12R 1:885) (C12N 1/19 C12R 1:865) (72)発明者 マイケル アラン イニス アメリカ合衆国,カリフオルニア 94602, オークランド,カールセン ストリート 3133 (72)発明者 ジヤネル バン アースデル アメリカ合衆国,カリフオルニア 94803, エル ソブランテ,サン パブロ ダム ロード 4172エー (72)発明者 シヤーリー イー ウオク アメリカ合衆国,カリフオルニア 94583, サン ラモン,ロモンド サークル 611 (72)発明者 マーサ ベイリー ラドナー アメリカ合衆国,カリフオルニア 94804, リツチモンド,バレツト アベニユ 2800 (72)発明者 ビツキー シユウエイカート アメリカ合衆国,カリフオルニア 94707, ケンシングトン,バリイ ロード 1513
Claims (5)
- 【請求項1】セロビオヒドロラーゼIをもたらす次のア
ミノ酸配列: X-Gln Ser Ala Cys Thr Leu Gln Ser Glu Thr His Pro
Pro Leu Thr Trp Gln Lys Cys Ser Ser Gly Gly Thr
Cys Thr Gln Gln Thr Gly Ser Val Val Ile Asp Ala
Asn Trp Arg Trp Thr His Ala Thr Asn Ser Ser Thr
Asn Cys Tyr Asp Gly Asn Thr Trp Ser Ser Thr Leu Cy
s Pro Asp Asn Glu Thr Cys Ala Lys Asn Cys Cys Leu
Asp Gly Ala Ala Tyr Ala Ser Thr Tyr Gly Val Thr
Thr Ser Gly Asn Ser Leu Ser Ile Gly Phe Val Thr G
ln Ser Ala Gln Lys Asn Val Gly Ala Arg Leu Tyr Le
u Met Ala Ser Asp Thr Thr Tyr Gln Glu Phe Thr Leu
Leu Gly Asn Glu Phe Ser Phe Asp Val Asp Val Ser
Gln Leu Pro Cys Gly Leu Asn Gly Ala Leu Tyr Phe V
al Ser Met Asp Ala Asp Gly Gly Val Ser Lys Tyr Pr
o Thr Asn Thr Ala Gly Ala Lys Tyr Gly Thr Gly Tyr
Cys Asp Ser Gln Cys Pro Arg Asp Leu Lys Phe Ile
Asn Gly Gln Ala Asn Val Glu Gly Trp Glu Pro Ser S
er Asn Asn Ala Asn Thr Gly Ile Gly Gly His Gly Se
r Cys Cys Ser Glu Met Asp Ile Trp Glu Ala Asn Ser
Ile Ser Glu Ala Leu Thr Pro His Pro Cys Thr Thr
Val Gly Gln Glu Ile Cys Glu Gly Asp Gly Cys Gly G
ly Thr Tyr Ser Asp Asn Arg Tyr Gly Gly Thr Cys As
p Pro Asp Gly Cys Asp Trp Asn Pro Tyr Arg Leu Gly
Asn Thr Ser Phe Tyr Gly Pro Gly Ser Ser Phe Thr
Leu Asp Thr Thr Lys Lys Leu Thr Val Val Thr Gln P
he Glu Thr Ser Gly Ala Ile Asn Arg Tyr Tyr Val Gl
n Asn Gly Val Thr Phe Gln Gln Pro Asn Ala Glu Leu
Gly Ser Tyr Ser Gly Asn Glu Leu Asn Asp Asp Tyr
Cys Thr Ala Glu Glu Ala Glu Phe Gly Gly Ser Ser P
he Ser Asp Lys Gly Gly Leu Thr Gln Phe Lys Lys Al
a Thr Ser Gly Gly Met Val Leu Val Met Ser Leu Trp
Asp Asp Tyr Tyr Ala Asn Met Leu Trp Leu Asp Ser
Thr Tyr Pro Thr Asn Glu Thr Ser Ser Thr Pro Gly A
la Val Arg Gly Ser Cys Ser Thr Ser Ser Gly Val Pr
o Ala Gln Val Glu Ser Gln Ser Pro Asn Ala Lys Val
Thr Phe Ser Asn Ile Lys Phe Gly Pro Ile Gly Ser
Thr Gly Asn Pro Ser Gly Gly Asn Pro Pro Gly Gly A
sn Arg Gly Thr Thr Thr Thr Arg Arg Pro Ala Thr Th
r Thr Gly Ser Ser Pro Gly Pro Thr Gln Ser His Tyr
Gly Gln Cys Gly Gly Ile Gly Tyr Ser Gly Pro Thr
Val Cys Ala Ser Gly Thr Thr Cys Gln Val Leu Asn P
ro Tyr Tyr Ser Gln Cys Leu(配列中、Xは存在しない
か、又は次のアミノ酸配列:Met Tyr Arg Lys Leu Ala
Val Ile Ser Ala Phe Leu Ala Thr Ala Arg Alaを有す
るリーダー配列を示す)、 又は該アミノ酸配列において1もしくは複数のアミノ酸
が付加、欠失もしくは置換されており且つセロビオヒド
ロラーゼIの酵素活性をもたらすアミノ酸配列、 をコードしている塩基配列を含んで成るDNA。 - 【請求項2】イントロンを含有している特許請求の範囲
第1項に記載のDNA。 - 【請求項3】イントロンを含有することなく前記アミノ
酸配列をコードしている特許請求の範囲第1項に記載の
DNA。 - 【請求項4】セロビオヒドロラーゼIをもたらす次のア
ミノ酸配列: X-Gln Ser Ala Cys Thr Leu Gln Ser Glu Thr His Pro
Pro Leu Thr Trp Gln Lys Cys Ser Ser Gly Gly Thr
Cys Thr Gln Gln Thr Gly Ser Val Val Ile Asp Ala A
sn Trp Arg Trp Thr His Ala Thr Asn Ser Ser Thr As
n Cys Tyr Asp Gly Asn Thr Trp Ser Ser Thr Leu Cys
Pro Asp Asn Glu Thr Cys Ala Lys Asn Cys Cys Leu
Asp Gly Ala Ala Tyr Ala Ser Thr Tyr Gly Val Thr T
hr Ser Gly Asn Ser Leu Ser Ile Gly Phe Val Thr Gl
n Ser Ala Gln Lys Asn Val Gly Ala Arg Leu Tyr Leu
Met Ala Ser Asp Thr Thr Tyr Gln Glu Phe Thr Leu
Leu Gly Asn Glu Phe Ser Phe Asp Val Asp Val Ser G
ln Leu Pro Cys Gly Leu Asn Gly Ala Leu Tyr Phe Va
l Ser Met Asp Ala Asp Gly Gly Val Ser Lys Tyr Pro
Thr Asn Thr Ala Gly Ala Lys Tyr Gly Thr Gly Tyr
Cys Asp Ser Gln Cys Pro Arg Asp Leu Lys Phe Ile A
sn Gly Gln Ala Asn Val Glu Gly Trp Glu Pro Ser Se
r Asn Asn Ala Asn Thr Gly Ile Gly Gly His Gly Ser
Cys Cys Ser Glu Met Asp Ile Trp Glu Ala Asn Ser
Ile Ser Glu Ala Leu Thr Pro His Pro Cys Thr Thr V
al Gly Gln Glu Ile Cys Glu Gly Asp Gly Cys Gly Gl
y Thr Tyr Ser Asp Asn Arg Tyr Gly Gly Thr Cys Asp
Pro Asp Gly Cys Asp Trp Asn Pro Tyr Arg Leu Gly
Asn Thr Ser Phe Tyr Gly Pro Gly Ser Ser Phe Thr L
eu Asp Thr Thr Lss Lys Leu Thr Val Val Thr Gln Ph
e Glu Thr Ser Gly Ala Ile Asn Arg Tyr Tyr Val Gln
Asn Gly Val Thr Phe Gln Gln Pro Asn Ala Glu Leu
Gly Ser Tyr Ser Gly Asn Glu Leu Asn Asp Asp Tyr C
ys Thr Ala Glu Glu Ala Glu Phe Gly Gly Ser Ser Ph
e Ser Asp Lys Gly Gly Leu Thr Gln Phe Lys Lys Ala
Thr Ser Gly Gly Met Val Leu Val Met Ser Leu Trp
Asp Asp Tyr Tyr Ala Asn Met Leu Trp Leu Asp Ser T
hr Tyr Pro Thr Asn Glu Thr Ser Ser Thr Pro Gly Al
a Val Arg Gly Ser Cys Ser Thr Ser Ser Gly Val Pro
Ala Gln Val Glu Ser Gln Ser Pro Asn Ala Lys Val
Thr Phe Ser Asn Ile Lys Phe Gly Pro Ile Gly Ser T
hr Gly Asn Pro Ser Gly Gly Asn Pro Pro Gly Gly As
n Arg Gly Thr Thr Thr Thr Arg Arg Pro Ala Thr Thr
Thr Gly Ser Ser Pro Gly Pro Thr Gln Ser His Tyr
Gly Gln Cys Gly Gly Ile Gly Tyr Ser Gly Pro Thr V
al Cys Ala Ser Gly Thr Thr Cys Gln Val Leu Asn Pr
o Tyr Tyr Ser Gln Cys Leu(配列中、Xは存在しない
か、又は次のアミノ酸配列:Met Tyr Arg Lys Leu Ala
Val Ile Ser Ala Phe Leu Ala Thr Ala Arg Alaを有す
るリーダー配列を示す)、 又は該アミノ酸配列において1もしくは複数のアミノ酸
が付加、欠失もしくは置換されており且つセロビオヒド
ロラーゼIの酵素活性をもたらすアミノ酸配列、 をコードしている塩基配列を含んで成る発現ベクター。 - 【請求項5】セロビオヒドロラーゼIをもたらす次のア
ミノ酸配列: X-Gln Ser Ala Cys Thr Leu Gln Ser Glu Thr His Pro
Pro Leu Thr Trp Gln Lys Cys Ser Ser Gly Gly Thr
Cys Thr Gln Gln Thr Gly Ser Val Val Ile Asp Ala A
sn Trp Arg Trp Thr His Ala Thr Asn Ser Ser Thr As
n Cys Tyr Asp Gly Asn Thr Trp Ser Ser Thr Leu Cys
Pro Asp Asn Glu Thr Cys Ala Lys Asn Cys Cys Leu
Asp Gly Ala Ala Tyr Ala Ser Thr Tyr Gly Val Thr T
hr Ser Gly Asn Ser Leu Ser Ile Gly Phe Val Thr Gl
n Ser Ala Gln Lys Asn Val Gly Ala Arg Leu Tyr Leu
Met Ala Ser Asp Thr Thr Tyr Gln Glu Phe Thr Leu
Leu Gly Asn Glu Phe Ser Phe Asp Val Asp Val Ser G
ln Leu Pro Cys Gly Leu Asn Gly Ala Leu Tyr Phe Va
l Ser Met Asp Ala Asp Gly Gly Val Ser Lys Tyr Pro
Thr Asn Thr Ala Gly Ala Lys Tyr Gly Thr Gly Tyr
Cys Asp Ser Gln Cys Pro Arg Asp Leu Lys Phe Ile A
sn Gly Gln Ala Asn Val Glu Gly Trp Glu Pro Ser Se
r Asn Asn Ala Asn Thr Gly Ile Gly Gly His Gly Ser
Cys Cys Ser Glu Met Asp Ile Trp Glu Ala Asn Ser
Ile Ser Glu Ala Leu Thr Pro His Pro Cys Thr Thr V
al Gly Gln Glu Ile Cys Glu Gly Asp Gly Cys Gly Gl
y Thr Tyr Ser Asp Asn Arg Tyr Gly Gly Thr Cys Asp
Pro Asp Gly Cys Asp Trp Asn Pro Tyr Arg Leu Gly
Asn Thr Ser Phe Tyr Gly Pro Gly Ser Ser Phe Thr L
eu Asp Thr Thr Lys Lys Leu Thr Val Val Thr Gln Ph
e Glu Thr Ser Gly Ala Ile Asn Arg Tyr Tyr Val Gln
Asn Gly Val Thr Phe Gln Gln Pro Asn Ala Glu Leu
Gly Ser Tyr Ser Gly Asn Glu Leu Asn Asp Asp Tyr C
ys Thr Ala Glu Glu Ala Glu Phe Gly Gly Ser Ser Ph
e Ser Asp Lys Gly Gly Leu Thr Gln Phe Lys Lys Ala
Thr Ser Gly Gly Met Val Leu Val Met Ser Leu Trp
Asp Asp Tyr Tyr Ala Asn Met Leu Trp Leu Asp Ser T
hr Tyr Pro Thr Asn Glu Thr Ser Ser Thr Pro Gly Al
a Val Arg Gly Ser Cys Ser Thr Ser Ser Gly Val Pro
Ala Gln Val Glu Ser Gln Ser Pro Asn Ala Lys Val
Thr Phe Ser Asn Ile Lys Phe Gly Pro Ile Gly Ser T
hr Gly Asn Pro Ser Gly Gly Asn Pro Pro Gly Gly As
n Arg Gly Thr Thr Thr Thr Arg Arg Pro Ala Thr Thr
Thr Gly Ser Ser Pro Gly Pro Thr Gln Ser His Tyr
Gly Gln Cys Gly Gly Ile Gly Tyr Ser Gly Pro Thr V
al Cys Ala Ser Gly Thr Thr Cys Gln Val Leu Asn Pr
o Tyr Tyr Ser Gln Cys Leu(配列中、Xは存在しない
か、又は次のアミノ酸配列:Met Tyr Arg Lys Leu Ala
Val Ile Ser Ala Phe Leu Ala Thr Ala Arg Alaを有す
るリーダー配列を示す)、 又は該アミノ酸配列において1もしくは複数のアミノ酸
が付加、欠失もしくは置換されており且つセロビオヒド
ロラーゼIの酵素活性をもたらすアミノ酸配列、 をコードしている塩基配列を含んで成る発現ベクターに
より形質転換された酵母。
Applications Claiming Priority (4)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
US52821683A | 1983-08-31 | 1983-08-31 | |
US528216 | 1983-08-31 | ||
US63097484A | 1984-07-16 | 1984-07-16 | |
US630974 | 1984-07-16 |
Related Child Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
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Publication Number | Publication Date |
---|---|
JPS60149387A JPS60149387A (ja) | 1985-08-06 |
JPH0616709B2 true JPH0616709B2 (ja) | 1994-03-09 |
Family
ID=27062651
Family Applications (2)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
JP59180893A Expired - Fee Related JPH0616709B2 (ja) | 1983-08-31 | 1984-08-31 | セロビオヒドロラーゼiをコードする遺伝子 |
JP5251285A Expired - Lifetime JP2584186B2 (ja) | 1983-08-31 | 1993-10-07 | エンドグルカナーゼをコードする遺伝子 |
Family Applications After (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
JP5251285A Expired - Lifetime JP2584186B2 (ja) | 1983-08-31 | 1993-10-07 | エンドグルカナーゼをコードする遺伝子 |
Country Status (8)
Country | Link |
---|---|
EP (1) | EP0137280B1 (ja) |
JP (2) | JPH0616709B2 (ja) |
AU (1) | AU589112B2 (ja) |
BR (1) | BR8404346A (ja) |
CA (1) | CA1338400C (ja) |
DE (2) | DE137280T1 (ja) |
DK (1) | DK419584A (ja) |
ES (3) | ES8602139A1 (ja) |
Families Citing this family (107)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
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US5320960A (en) * | 1992-04-03 | 1994-06-14 | Genencor International, Inc. | Method of preparing solution enriched in xylanase using low molecular weight alcohol, organic salt and inorganic salt |
US5989870A (en) * | 1986-04-30 | 1999-11-23 | Rohm Enzyme Finland Oy | Method for cloning active promoters |
GB8610600D0 (en) * | 1986-04-30 | 1986-06-04 | Novo Industri As | Transformation of trichoderma |
US5298405A (en) * | 1986-04-30 | 1994-03-29 | Alko Limited | Enzyme preparations with recombinantly-altered cellulose profiles and methods for their production |
GB8621626D0 (en) * | 1986-09-08 | 1986-10-15 | Health Lab Service Board | Phenylalanine ammonia lyase |
JP2507345B2 (ja) * | 1986-09-16 | 1996-06-12 | 三井東圧化学株式会社 | L―フェニルアラニン―アンモニアリ・ア―ゼ構造遺伝子 |
US5610034A (en) * | 1987-04-29 | 1997-03-11 | Alko Group Ltd. | Immunoglobulin production by trichoderma |
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CA2069962A1 (en) * | 1990-08-17 | 1992-02-18 | Shi-Hsiang Shen | Recombinant dna production of beta-1, 3-glucanase |
WO1992006221A1 (en) * | 1990-10-05 | 1992-04-16 | Genencor International, Inc. | Methods for treating cotton-containing fabrics with cellulase |
CA2093422C (en) * | 1990-10-05 | 2001-04-03 | DETERGENT COMPOSITIONS CONTAINING LOW CBH I CONTENT CELLULASE COMPOSITIONS | |
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US5997913A (en) * | 1990-12-10 | 1999-12-07 | Genencor International, Inc. | Method enhancing flavor and aroma in foods by overexpression of β-glucosidase |
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US5861271A (en) * | 1993-12-17 | 1999-01-19 | Fowler; Timothy | Cellulase enzymes and systems for their expressions |
GB9400623D0 (en) * | 1994-01-14 | 1994-03-09 | Univ Leeds | Exploitation of the cellulase enzyme complex of neurospora |
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