JP7404241B2 - EphA2に特異的な二環ペプチドリガンド - Google Patents

EphA2に特異的な二環ペプチドリガンド Download PDF

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Description

本発明は、2つ以上のペプチドループがスキャフォールドへの結合点の間に張られるように非芳香族分子スキャフォールドに共有結合的に結合したポリペプチドに関する。特に、本発明は、Eph受容体チロシンキナーゼA2(EphA2)の高親和性バインダーであるペプチドを記載する。本発明はまた、1つまたは複数のエフェクターおよび/または官能基にコンジュゲートされている、前記ペプチドを含む薬物コンジュゲート、前記ペプチドリガンドおよび薬物コンジュゲートを含む医薬組成物ならびに疾患組織(例えば、腫瘍)におけるEphA2の過剰発現により特徴付けられる疾患または障害の予防、抑制または治療における前記ペプチドリガンドおよび薬物コンジュゲートの使用を含む。
環状ペプチドは、高い親和性および標的特異性でタンパク質標的に結合することができ、それゆえ、治療剤の開発のための魅力的な分子クラスである。実際、例えば、抗菌性ペプチドバンコマイシン、免疫抑制薬シクロスポリンまたは抗がん薬物オクトレオチドのようないくつかの環状ペプチドは、診療所において既に成功裡に使用されている(Driggers et al. (2008), Nat Rev Drug Discov 7 (7), 608-24)。良好な結合特性は、ペプチドと標的との間に形成される比較的大きい相互作用表面の他に、環状構造の低減したコンホメーション柔軟性の結果としてもたらされる。典型的には、例えば、環状ペプチドCXCR4アンタゴニストCVX15(400Å;Wu et al. (2007), Science 330, 1066-71)、インテグリンαVb3に結合するArg-Gly-Aspモチーフを有する環状ペプチド(355Å)(Xiong et al. (2002), Science 296 (55565), 151-5)またはウロキナーゼ型プラスミノーゲン活性化因子に結合する環状ペプチド阻害剤upain-1(603Å;Zhao et al. (2007), J Struct Biol 160 (1), 1-10)のように、大環状分子は数百平方オングストロームの表面に結合する。
環状の構成に起因して、ペプチド大環状分子は直鎖状ペプチドより柔軟性が低く、標的への結合時にエントロピーのより小さい損失に繋がり、結果としてより高い結合親和性をもたらす。低減した柔軟性はまた、標的特異的なコンホメーションのロッキングに繋がり、直鎖状ペプチドと比較して結合特異性を増加させる。この効果は、その環が開いた時に他のMMPに対するその選択性を喪失するマトリックスメタロプロテイナーゼ8(MMP-8)の強力かつ選択的な阻害剤により例示されている(Cherney et al. (1998), J Med Chem 41 (11), 1749-51)。大環状化を通じて達成される好都合な結合特性は、例えば、バンコマイシン、ナイシンおよびアクチノマイシンにおけるように1つより多くのペプチド環を有する多環ペプチドにおいてよりいっそう顕著になる。
異なる研究チームはこれまでに、システイン残基を有するポリペプチドを合成分子構造にテザー連結してきた(Kemp and McNamara (1985), J. Org. Chem;Timmerman et al. (2005), ChemBioChem)。Meloenおよび共同研究者らは、タンパク質表面の構造的模倣のために合成スキャフォールド上への複数のペプチドループの迅速かつ定量的な環化のためにトリス(ブロモメチル)ベンゼンおよび関連分子を使用した(Timmerman et al. (2005), ChemBioChem)。候補薬物化合物がシステイン含有ポリペプチドを、例えばTATA(1,1’,1’’-(1,3,5-トリアジナン-1,3,5-トリイル)トリプロパ-2-エン-1-オン、Heinis et al. Angew Chem, Int Ed. 2014; 53:1602-1606)のような分子スキャフォールドに連結することにより生成される、前記化合物の生成のための方法。
目的の標的に対する二環ペプチドの大きいライブラリーを生成およびスクリーニングするためのファージディスプレイに基づいたコンビナトリアルアプローチが開発されている(Heinis et al. (2009), Nat Chem Biol 5 (7), 502-7およびWO2009/098450)。簡潔に述べれば、3つのシステイン残基および6つのランダムなアミノ酸(Cys-(Xaa)-Cys-(Xaa)-Cys)の2つの領域を含有する直鎖状ペプチドのコンビナトリアルライブラリーがファージ上に提示され、システイン側鎖を小分子スキャフォールドに共有結合的に連結することにより環化される。
本発明の第1の態様によれば、少なくとも2つのループ配列により分離された少なくとも3つのシステイン残基を含むポリペプチド、および少なくとも2つのポリペプチドループが非芳香族分子スキャフォールド上に形成されるように前記ポリペプチドの前記システイン残基と共有結合を形成する前記分子スキャフォールドを含む、EphA2に特異的なペプチドリガンドが提供される。
本発明のさらなる態様によれば、1つまたは複数のエフェクターおよび/または官能基にコンジュゲートされている本明細書において定義されるようなペプチドリガンドを含む薬物コンジュゲートが提供される。
本発明のさらなる態様によれば、1つまたは複数の薬学的に許容される賦形剤と組み合わせて本明細書において定義されるようなペプチドリガンドまたは薬物コンジュゲートを含む医薬組成物が提供される。
本発明のさらなる態様によれば、疾患組織(例えば、腫瘍)におけるEphA2の過剰発現により特徴付けられる疾患または障害の予防、抑制または治療において使用するための本明細書において定義されるようなペプチドリガンドまたは薬物コンジュゲートが提供される。
LU-01-0046腫瘍を有する雌Balb/CヌードマウスへのBCY6031の投与後の体重変化である。データ点は群平均体重を表す。 LU-01-0046腫瘍を有する雌Balb/CヌードマウスへのBCY6031の投与後の腫瘍体積の追跡である。データ点は群平均を表す。処置を28日目から中止した。 二環薬物コンジュゲート(BDC)の調製の概念を実証する一般的な概略図である。 HT1080異種移植マウスにおけるBCY6136についての平均腫瘍体積対時間のプロットである。用量(2、3および5mg/kg)を0および7日目に投与した。腫瘍負荷の指標となる処置の間の体重変化、薬物関連毒物学および全般的な動物の健康を右上の挿入図に示す。 NCI-H1975異種移植マウスにおけるBCY6136についての平均腫瘍体積対時間のプロットである。用量(1、2および3mg/kg)を0、7、14、21、28および35日目に投与した。腫瘍負荷の指標となる処置の間の体重変化、薬物関連毒物学および全般的な動物の健康を右上の挿入図に示す。 MDA-MB-231異種移植マウスにおけるBCY6136についての平均腫瘍体積対時間のプロットである。用量(1、2および3mg/kg)を0、7、14、21、28、35および45日目に投与した。腫瘍負荷の指標となる処置の間の体重変化、薬物関連毒物学および全般的な動物の健康を右上の挿入図に示す。 PC-3異種移植片を有する雌BALB/cヌードマウスへのBCY6136の投与後の体重変化および腫瘍体積の追跡である。データ点は群平均体重を表す。 PC-3異種移植片を有する雌BALB/cヌードマウスへのADCの投与後の体重変化および腫瘍体積の追跡である。データ点は群平均体重を表す。 PC-3異種移植片を有する雌BALB/cヌードマウスへのBCY6033の投与後の体重変化および腫瘍体積の追跡である。データ点は群平均体重を表す。 PC-3異種移植片を有する雄Balb/cヌードマウスへのBCY6136、EphA2-ADCまたはドセタキセルの投与後の体重変化および腫瘍体積の追跡である。データ点は群平均体重を表す。 NCI-H1975異種移植片を有する雌Balb/cヌードマウスへのBCY6033の投与後の体重変化および腫瘍体積の追跡である。データ点は群平均腫瘍体積および体重を表す。 NCI-H1975異種移植片を有する雌Balb/cヌードマウスへのBCY6136の投与後の体重変化および腫瘍体積の追跡である。データ点は群平均腫瘍体積および体重を表す。 NCI-H1975異種移植片を有する雌Balb/cヌードマウスへのBCY6082の投与後の体重変化および腫瘍体積の追跡である。データ点は群平均腫瘍体積および体重を表す。 LU-01-0251異種移植片を有する雌Balb/cヌードマウスへのBCY6136およびADCの投与後の体重変化および腫瘍体積の追跡である。データ点は群平均体重を表す。 LU-01-0251異種移植片を有する雌Balb/cヌードマウスへのBCY6136およびADCの投与後の体重変化および腫瘍体積の追跡である。データ点は群平均体重を表す。 LU-01-0046を有する雌Balb/cヌードマウスへのBCY6033、BCY6136、BCY6082およびBCY6031の投与後の体重変化および腫瘍体積の追跡である。データ点は群平均体重を表す。 LU-01-0046 NSCLC PDXモデルを有する雌Balb/cヌードマウスへのBCY6136またはADCの投与後の体重変化および腫瘍体積の追跡である。データ点は群平均体重を表す。 LU-01-0046を有する雌Balb/cヌードマウスへのBCY6033の投与後の体重変化および腫瘍体積の追跡である。データ点は群平均体重を表す。 LU-01-0046を有する雌Balb/cヌードマウスへのBCY6136の投与後の体重変化および腫瘍体積の追跡である。データ点は群平均体重を表す。 LU-01-0046を有する雌Balb/cヌードマウスへのBCY6082の投与後の体重変化および腫瘍体積の追跡である。データ点は群平均体重を表す。 LU-01-0046を有する雌Balb/cヌードマウスへのBCY6173の投与後の体重変化および腫瘍体積の追跡である。データ点は群平均体重を表す。 LU-01-0046を有する雌Balb/cヌードマウスへのBCY6175および6031の投与後の体重変化および腫瘍体積の追跡である。データ点は群平均体重を表す。 LU-01-0412異種移植片を有する雌BALB/cヌードマウスへのBCY6136(図23においてBT5528と称される)、BCY8245またはBCY8781の投与後の体重変化および腫瘍体積の追跡である。データ点は群平均腫瘍体積(左パネル)および体重(右パネル)を表す。 LU-01-0486異種移植片を有する雌Balb/cヌードマウスへのBCY6136の投与後の体重変化および腫瘍体積の追跡である。データ点は群平均体重を表す。 MDA-MB-231-luc異種移植片を有する雌Balb/cヌードマウスへのBCY6033の投与後の体重変化および腫瘍体積の追跡である。データ点は群平均腫瘍体積および体重を表す。 MDA-MB-231-luc異種移植片を有する雌Balb/cヌードマウスへのBCY6136の投与後の体重変化および腫瘍体積の追跡である。データ点は群平均腫瘍体積および体重を表す。 MDA-MB-231-luc異種移植片を有する雌Balb/cヌードマウスへのおよびBCY6082の投与後の体重変化および腫瘍体積の追跡である。データ点は群平均腫瘍体積および体重を表す。 EMT-6同系移植片(EMT-6 syngeneic)を有する雌BALB/cマウスへのBCY6136の投与後の体重変化および腫瘍体積の追跡である。データ点は群平均体重を表す。群3および群4の投与量を14日目から5mpkおよび3mpkに変化させた。 NCI-N87異種移植片を有する雌Balb/cヌードマウスへのBCY6136の投与後の体重変化および腫瘍体積の追跡である。データ点は群平均体重を表す。 SK-OV-3異種移植片を有する雌Balb/cヌードマウスへのBCY6136の投与後の体重変化および腫瘍体積の追跡である。データ点は群平均体重を表す。 OE21異種移植片を有する雌Balb/cヌードマウスへのBCY6136の投与後の体重変化および腫瘍体積の追跡である。データ点は群平均体重を表す。 MOLP-8異種移植片を有する雌CB17-SCIDマウスへのBCY6136の投与後の体重変化および腫瘍体積の追跡である。データ点は群平均体重を表す。 MOLP-8異種移植片を有する雌CB17-SCIDマウスへのBCY6082の投与後の体重変化および腫瘍体積の追跡である。データ点は群平均体重を表す。 HT1080異種移植片を有する雌BALB/cヌードマウスへのBCY6082の投与後の体重変化および腫瘍体積の追跡である。データ点は群平均体重を表す。 HT1080異種移植片を有する雌BALB/cヌードマウスへのBCY6031の投与後の体重変化および腫瘍体積の追跡である。データ点は群平均体重を表す。 HT1080異種移植片を有する雌BALB/cヌードマウスへのBCY6173の投与後の体重変化および腫瘍体積の追跡である。データ点は群平均体重を表す。 HT1080異種移植片を有する雌BALB/cヌードマウスへのBCY6135の投与後の体重変化および腫瘍体積の追跡である。データ点は群平均体重を表す。 HT1080異種移植片を有する雌BALB/cヌードマウスへのBCY6033の投与後の体重変化および腫瘍体積の追跡である。データ点は群平均体重を表す。 HT1080異種移植片を有する雌BALB/cヌードマウスへのBCY6136の投与後の体重変化および腫瘍体積の追跡である。データ点は群平均体重を表す。 HT1080異種移植片を有する雌BALB/cヌードマウスへのBCY6174の投与後の体重変化および腫瘍体積の追跡である。データ点は群平均体重を表す。 HT1080異種移植片を有する雌BALB/cヌードマウスへのBCY6175の投与後の体重変化および腫瘍体積の追跡である。データ点は群平均体重を表す。 HT1080異種移植片を有する雌BALB/cヌードマウスへのADCの投与後の体重変化および腫瘍体積の追跡である。データ点は群平均体重を表す。エラーバーが上記の図中に存在する場合、これらは平均の標準誤差(SEM)を表す。
一実施形態では、前記ループ配列は、2、3、5、6または7つのアミノ酸酸を含む。
さらなる実施形態では、前記ループ配列が、2つのループ配列により分離された3つのシステイン残基を含み、当該2つのループ配列の一方が2つのアミノ酸からなりかつ他方が7つのアミノ酸からなる(例えば、表4に列記されるもの)。
さらなる実施形態では、前記ループ配列が、2つのループ配列により分離された3つのシステイン残基を含み、当該2つのループ配列の両方が5つのアミノ酸からなる(例えば、表3および表4に列記されるもの)。
さらなる実施形態では、前記ループ配列が、2つのループ配列により分離された3つのシステイン残基を含み、当該2つのループ配列の両方が6つのアミノ酸からなる(例えば、表3~5に列記されるもの)。
さらなる実施形態では、前記ループ配列が、2つのループ配列により分離された3つのシステイン残基を含み、当該2つのループ配列の両方が6つのアミノ酸からなる(例えば、表10に列記されるもの)。
さらなる実施形態では、前記ループ配列が、2つのループ配列により分離された3つのシステイン残基を含み、当該2つのループ配列の一方が7つのアミノ酸からなりかつ他方が3つのアミノ酸からなる(例えば、表4に列記されるもの)。
さらなる実施形態では、前記ループ配列が、2つのループ配列により分離された3つのシステイン残基を含み、当該2つのループ配列の一方が6つのアミノ酸からなりかつ他方が7つのアミノ酸からなる(例えば、表5に列記されるもの)。
一実施形態では、ペプチドリガンドは、
-X-Cii-X-Ciii
(XおよびXは、表3~5において列記されるシステイン残基の間のアミノ酸残基を表し、かつ、C、CiiおよびCiiiは、それぞれ第1、第2および第3のシステイン残基、または薬学的に許容されるその塩を表す)から選択されるアミノ酸配列を含む。
さらなる実施形態では、ペプチドリガンドは、1つまたは複数の表3~5において列記されるペプチドリガンドのうちの1つまたは複数から選択されるアミノ酸配列を含む。
さらなる実施形態では、ペプチドリガンドは、
-X-Cii-X-Ciii
(XおよびXは、表10において列記されるシステイン残基の間のアミノ酸残基を表し、かつ、C、CiiおよびCiiiは、それぞれ第1、第2および第3のシステイン残基、または薬学的に許容されるその塩を表す)から選択されるアミノ酸配列を含む。
さらなる実施形態では、ペプチドリガンドは、表10において列記されるペプチドリガンドのうちの1つまたは複数から選択されるアミノ酸配列を含む。
一実施形態では、前記ループ配列は、その両方が6つのアミノ酸からなる2つのループ配列により分離された3つのシステイン残基を含み、かつ、ペプチドリガンドは、
(HyP)LVNPLCiiLHP(D-Asp)W(HArg)Ciii(配列番号1);および
PLVNPLCiiLHPGWTCiii(配列番号97)
(HyPはヒドロキシプロリンであり、HArgはホモアルギニンであり、かつ、C、CiiおよびCiiiは、それぞれ第1、第2および第3のシステイン残基、または薬学的に許容されるその塩を表す)から選択されるアミノ酸配列を有する。
さらなる実施形態では、前記ループ配列は、その両方が6つのアミノ酸からなる2つのループ配列により分離された3つのシステイン残基を含み、かつ、ペプチドリガンドは、以下のアミノ酸配列:
(HyP)LVNPLCiiLHP(D-Asp)W(HArg)Ciii(配列番号1)
(HyPはヒドロキシプロリンであり、HArgはホモアルギニンであり、かつ、C、CiiおよびCiiiは、それぞれ第1、第2および第3のシステイン残基、または薬学的に許容されるその塩を表す)を有する。
一実施形態では、本発明のペプチドリガンドは、アミノ酸配列:
(HyP)LVNPLCiiLHP(D-Asp)W(HArg)Ciii(配列番号1)
以外のペプチドリガンドである。
一実施形態では、前記ループ配列は、その両方が6つのアミノ酸からなる2つのループ配列により分離された3つのシステイン残基を含み、かつ、ペプチドリガンドは、
(β-Ala)-Sar10-A(HArg)D-C(HyP)LVNPLCiiLHP(D-Asp)W(HArg)Ciii(配列番号2)(BCY6099;化合物66);および
(β-Ala)-Sar10-A(HArg)D-CPLVNPLCiiLHPGWTCiii((β-Ala)-Sar10-(配列番号11))(BCY6014;化合物67)
(Sarはサルコシンであり、HArgはホモアルギニンであり、かつ、HyPはヒドロキシプロリンである)から選択されるアミノ酸配列を有する。
さらなる実施形態では、前記ループ配列は、その両方が6つのアミノ酸からなる2つのループ配列により分離された3つのシステイン残基を含み、かつ、ペプチドリガンドは、以下のアミノ酸配列:
(β-Ala)-Sar10-A(HArg)D-C(HyP)LVNPLCiiLHP(D-Asp)W(HArg)Ciii(配列番号2)(BCY6099;化合物66)
(Sarはサルコシンであり、HArgはホモアルギニンであり、かつ、HyPはヒドロキシプロリンである)を有する。
一実施形態では、本発明のペプチドリガンドは、アミノ酸配列:
(β-Ala)-Sar10-A(HArg)D-C(HyP)LVNPLCiiLHP(D-Asp)W(HArg)Ciii(配列番号2)(BCY6099;化合物66)
以外のペプチドリガンドである。
一実施形態では、分子スキャフォールドは、1,1’,1’’-(1,3,5-トリアジナン-1,3,5-トリイル)トリプロパ-2-エン-1-オン(TATA)から選択され、かつ、ペプチドリガンドは、表3~5において列記されるペプチドリガンドのいずれか1つから選択される。
代替的な実施形態では、分子スキャフォールドは、1,1’,1’’-(1,3,5-トリアジナン-1,3,5-トリイル)トリプロパ-2-エン-1-オン(TATA)から選択され、かつ、ペプチドリガンドは、表10において列記されるペプチドリガンドのいずれか1つから選択される。
一実施形態では、分子スキャフォールドは、1,1’,1’’-(1,3,5-トリアジナン-1,3,5-トリイル)トリプロパ-2-エン-1-オン(TATA)から選択され、かつ、ペプチドリガンドは、
(β-Ala)-Sar10-A(HArg)D-C(HyP)LVNPLCiiLHP(D-Asp)W(HArg)Ciii(配列番号2)(BCY6099;化合物66);および
(β-Ala)-Sar10-A(HArg)D-CPLVNPLCiiLHPGWTCiii((β-Ala)-Sar10-(配列番号11))(BCY6014;化合物67)
(Sarはサルコシンであり、HArgはホモアルギニンであり、かつ、HyPはヒドロキシプロリンである)から選択される。
さらなる実施形態では、分子スキャフォールドは、1,1’,1’’-(1,3,5-トリアジナン-1,3,5-トリイル)トリプロパ-2-エン-1-オン(TATA)から選択され、かつ、ペプチドリガンドは、
(β-Ala)-Sar10-A(HArg)D-C(HyP)LVNPLCiiLHP(D-Asp)W(HArg)Ciii(配列番号2)
(Sarはサルコシンであり、HArgはホモアルギニンであり、かつ、HyPはヒドロキシプロリンである)である。
一実施形態では、ペプチドリガンドは、化合物1~113のいずれか1つまたは薬学的に許容されるその塩から選択される。
さらなる実施形態では、ペプチドリガンドは、化合物66(BCY6099)または化合物67(BCY6014)または薬学的に許容されるその塩である。
いっそうさらなる実施形態では、ペプチドリガンドは、化合物66(BCY6099)または薬学的に許容されるその塩である。
他に定義されなければ、本明細書において使用される全ての科学技術用語は、ペプチド化学、細胞培養およびファージディスプレイ、核酸化学および生化学などの技術分野における当業者により一般的に理解されるものと同じ意味を有する。標準技術が、分子生物学、遺伝学および生化学的方法のために使用され、(Sambrook et al., Molecular Cloning: A Laboratory Manual, 3rd ed., 2001, Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor, NY; Ausubel et al., Short Protocols in Molecular Biology (1999) 4th ed., John Wiley & Sons, Inc.を参照)参照により本明細書に組み込まれる。
命名法
ナンバリング
本発明のペプチド内のアミノ酸残基位置を指す場合、システイン残基(C、CiiおよびCiii)は不変であるのでナンバリングから省略し、したがって、本発明のペプチド内のアミノ酸残基のナンバリングは、以下:
-C-HyP-L-V-N-P-L-Cii-L-H-P-(D-Asp)10-W11-(HArg)12-Ciii-(配列番号1)
のように称される。
この記載の目的のために、全ての二環ペプチドは、1,1’,1’’-(1,3,5-トリアジナン-1,3,5-トリイル)トリプロパ-2-エン-1-オン(TATA)と共に環化されて三置換1,1’,1’’-(1,3,5-トリアジナン-1,3,5-トリイル)トリプロパン-1-オン構造をもたらすものと仮定される。TATAとの環化は、C、Cii、およびCiiiにおいて起こる。
分子フォーマット
二環コア配列へのNまたはC末端伸長は、ハイフンにより分離されて、配列の左または右側に付加される。例えば、N末端(β-Ala)-Sar10-Alaテイルは、
(β-Ala)-Sar10-A-(配列番号X)
として表される。
反転ペプチド配列
Nair et al (2003) J Immunol 170(3), 1362-1373の開示に照らして、本明細書に開示されるペプチド配列はまた、レトロインベルソ形態において有用性を有することが想定される。例えば、配列が逆転され(すなわち、N末端はC末端となり、逆もまた成り立つ)、立体化学もまた同様に逆転する(すなわち、D-アミノ酸はL-アミノ酸となり、逆もまた成り立つ)。
ペプチドリガンド
ペプチドリガンドは、本明細書において称されるように、分子スキャフォールドに共有結合的に結合したペプチド、ペプチド性化合物(peptidic)またはペプチド模倣物を指す。典型的には、そのようなペプチド、ペプチド性化合物またはペプチド模倣物は、天然または非天然アミノ酸、スキャフォールドへの共有結合を形成できる2つ以上の反応性基(すなわち、システイン残基)、および前記反応性基の間に張られる配列を有するペプチドを含み、前記反応性基の間に張られる配列は、ペプチド、ペプチド性化合物またはペプチド模倣物がスキャフォールドに結合した場合にループを形成するので、ループ配列と称される。本発明の場合において、ペプチド、ペプチド性化合物またはペプチド模倣物は、少なくとも3つのシステイン残基(本明細書においてC、CiiおよびCiiiのように称される)を含み、かつスキャフォールド上に少なくとも2つのループを形成する。
ペプチドリガンドの利点
本発明のある特定の二環ペプチドは、注射、吸入、経鼻、眼、経口または局所投与のために好適な薬物様分子として該二環ペプチドを考えることを可能とする多数の有利な特性を有する。そのような有利な特性としては以下が挙げられる。
- 種交差反応性。これは、前臨床の薬力学および薬物動態評価のための典型的な要件である;
- プロテアーゼ安定性。二環ペプチドリガンドは、ほとんどの状況において、血漿プロテアーゼ、上皮(「膜アンカー」)プロテアーゼ、胃および腸プロテアーゼ、肺表面プロテアーゼ、ならびに細胞内プロテアーゼなどに対して安定性を実証するべきである。二環ペプチドリード候補を動物モデルにおいて開発できることの他に、ヒトに対して信頼性と共に投与できるように、プロテアーゼ安定性は異なる種間で維持されるべきである;
- 望ましい溶解性プロファイル。これは、疎水性残基に対する荷電性および親水性残基の割合ならびに分子内/分子間H結合の関数であり、配合および吸収目的のために重要である;
- 循環中での最適な血漿中半減期。臨床的適応および治療レジメンに依存して、慢性または急性のいずれかの病態の管理のために短いまたは長いin vivo曝露時間を有する二環ペプチドの開発が必要とされることがある。最適な曝露時間は、薬剤への持続的な曝露から生じる毒物学的効果を最小化するための短い曝露時間の要件に対する持続的な曝露(最大の治療効率のため)の要件により支配される;
- 選択性。本発明のある特定のペプチドリガンドは、EphA1、EphA3、EphA4、EphA5、EphA6、EphA7およびEphB1などの他のEph受容体チロシンキナーゼならびにXIIA因子、炭酸脱水酵素9およびCD38に対して良好な選択性を実証する(本発明の選択されるペプチドリガンドについての選択性データを表7および表14に見出すことができる)。本発明の選択されるペプチドリガンドは他の種(例えば、マウスおよびラット)との交差反応性を呈して、動物モデルにおける試験を可能とすることもまた留意されるべきである(表3~6および表15);ならびに
- 安全性。出血事象が、EphA2抗体薬物コンジュゲートを用いた前臨床in vivoモデルおよび臨床試験において報告されている。例えば、MEDI-547を用いた第1相オープンラベル研究は、6人の患者のうち5人において起こった出血および凝固事象に起因して中止された(Annunziata et al, Invest New Drugs (2013) 31:77-84)。患者において観察された出血事象は、ラットおよびサルの前臨床研究において観察された凝固システムへの効果、すなわち、活性化部分トロンボプラスチン時間の増加およびフィブリノーゲン/フィブリン分解生成物の増加に合致した(Annunziata et al、同書)。明白な出血事象がサルにおける毒物学研究において見られたことが報告されている(Annunziata et al、同書)。これらの結果を合わせると、MEDI-547は前臨床種および患者の両方において播種性血管内凝固(DIC)を引き起こすことが暗示される。本明細書において報告するBDCは、短いin vivo半減期(<30分)を有し、したがって、患者においてDICを生じさせる可能性が本来的により低い。本明細書において示す結果(生物学的データのセクション5および6ならびに表20を参照)は、本発明の選択される二環薬物コンジュゲートは、凝固パラメーターに対して効果を有さず、かつ前臨床研究において出血事象を生じさせなかったことを実証する。
薬学的に許容される塩
塩形態は本発明の範囲内にあり、ペプチドリガンドへの言及は前記リガンドの塩形態を含むことが理解されるであろう。
本発明の塩は、Pharmaceutical Salts: Properties, Selection, and Use, P. Heinrich Stahl (Editor), Camille G. Wermuth (Editor), ISBN: 3-90639-026-8, Hardcover, 388 pages, August 2002に記載される方法などの従来の化学的方法により塩基性または酸性部分を含有する親化合物から合成され得る。一般的に、そのような塩は、これらの化合物の遊離酸または塩基形態を、水中または有機溶媒中、または2つの混合物中で適切な塩基または酸と反応させることにより調製され得る。
酸付加塩(一塩または二塩)は、無機および有機の両方の、多様な酸と共に形成されてもよい。酸付加塩の例としては、酢酸、2,2-ジクロロ酢酸、アジピン酸、アルギン酸、アスコルビン酸(例えば、L-アスコルビン酸)、L-アスパラギン酸、ベンゼンスルホン酸、安息香酸、4-アセトアミド安息香酸、ブタン酸、(+)樟脳酸、カンファースルホン酸、(+)-(1S)-カンファー-10-スルホン酸、カプリン酸、カプロン酸、カプリル酸、ケイ皮酸、クエン酸、シクラミン酸、ドデシル硫酸、エタン-1,2-二スルホン酸、エタンスルホン酸、2-ヒドロキシエタンスルホン酸、ギ酸、フマル酸、ガラクタル酸、ゲンチジン酸、グルコヘプトン酸、D-グルコン酸、グルクロン酸(例えば、D-グルクロン酸)、グルタミン酸(例えば、L-グルタミン酸)、α-オキソグルタル酸、グリコール酸、馬尿酸、ハロゲン化水素酸(例えば、臭化水素酸、塩化水素酸、ヨウ化水素酸)、イセチオン酸、乳酸(例えば、(+)-L-乳酸、(±)-DL-乳酸)、ラクトビオン酸、マレイン酸、リンゴ酸、(-)-L-リンゴ酸、マロン酸、(±)-DL-マンデル酸、メタンスルホン酸、ナフタレン-2-スルホン酸、ナフタレン-1,5-二スルホン酸、1-ヒドロキシ-2-ナフトエ酸、ニコチン酸、硝酸、オレイン酸、オロチン酸、シュウ酸、パルミチン酸、パモン酸、リン酸、プロピオン酸、ピルビン酸、L-ピログルタミン酸、サリチル酸、4-アミノ-サリチル酸、セバシン酸、ステアリン酸、コハク酸、硫酸、タンニン酸、(+)-L-酒石酸、チオシアン酸、p-トルエンスルホン酸、ウンデシレン酸および吉草酸の他に、アシル化されたアミノ酸およびカチオン交換樹脂からなる群から選択される酸と共に形成される一塩または二塩が挙げられる。
塩の1つの特定の群は、酢酸、塩化水素酸、ヨウ化水素酸、リン酸、硝酸、硫酸、クエン酸、乳酸、コハク酸、マレイン酸、リンゴ酸、イセチオン酸、フマル酸、ベンゼンスルホン酸、トルエンスルホン酸、硫酸、メタンスルホン酸(メシル酸)、エタンスルホン酸、ナフタレンスルホン酸、吉草酸、プロパン酸、ブタン酸、マロン酸、グルクロン酸およびラクトビオン酸から形成される塩からなる。1つの特定の塩は塩酸塩である。別の特定の塩は酢酸塩である。
化合物がアニオン性であるか、またはアニオン性であり得る(例えば、-COOHは-COOであり得る)官能基を有する場合、塩は、有機または無機塩基と共に形成されて、好適な陽イオンを生成してもよい。好適な無機カチオンの例としては、Li、NaおよびKなどのアルカリ金属イオン、Ca2+およびMg2+などのアルカリ土類金属カチオン、ならびにAl3+またはZnなどの他のカチオンが挙げられるがそれに限定されない。好適な有機カチオンの例としては、アンモニウムイオン(すなわち、NH )および置換アンモニウムイオン(例えば、NH、NH 、NHR 、NR )が挙げられるがそれに限定されない。一部の好適な置換アンモニウムイオンの例は、メチルアミン、エチルアミン、ジエチルアミン、プロピルアミン、ジシクロヘキシルアミン、トリエチルアミン、ブチルアミン、エチレンジアミン、エタノールアミン、ジエタノールアミン、ピペラジン、ベンジルアミン、フェニルベンジルアミン、コリン、メグルミン、およびトロメタミンの他に、リジンおよびアルギニンなどのアミノ酸に由来するものである。一般的な第四級アンモニウムイオンの例は、N(CH である。
本発明のペプチドがアミン官能基を含有する場合、これらは、例えば、当業者に周知の方法によるアルキル化剤との反応により、第四級アンモニウム塩を形成してもよい。そのような第四級アンモニウム化合物は本発明のペプチドの範囲内である。
修飾誘導体
本明細書において定義されるようなペプチドリガンドの修飾誘導体は本発明の範囲内であることが理解されるであろう。そのような好適な修飾誘導体の例としては、N末端および/またはC末端修飾;1つまたは複数のアミノ酸残基の1つまたは複数の非天然アミノ酸残基による置換(例えば、1つまたは複数の極性アミノ酸残基の1つまたは複数の等配電子または等電子アミノ酸による置換;1つまたは複数の非極性アミノ酸残基の他の非天然の等配電子または等電子アミノ酸による置換);スペーサー基の付加;1つまたは複数の酸化感受性アミノ酸残基の1つまたは複数の酸化抵抗性アミノ酸残基による置換;1つまたは複数のアミノ酸残基の1つまたは複数の置換アミノ酸、例えば、アラニンによる置換、1つまたは複数のL-アミノ酸残基の1つまたは複数のD-アミノ酸残基による置換;二環ペプチドリガンド内の1つまたは複数のアミド結合のN-アルキル化;1つまたは複数のペプチド結合のサロゲート結合による置換;ペプチド骨格長さの修飾;1つまたは複数のアミノ酸残基のアルファ炭素上の水素の別の化学基による置換、システイン、リジン、グルタミン酸/アスパラギン酸およびチロシンなどのアミノ酸を官能基化するような、前記アミノ酸の好適なアミン、チオール、カルボン酸およびフェノール反応性試薬を用いた修飾、ならびに、例えば、アルキンまたはアジド含有部分を用いた官能基化を可能とするそれぞれアジドまたはアルキン基含有アミノ酸といった、官能基化のために好適な直交反応性を導入するアミノ酸の導入または置換から選択される1つまたは複数の修飾が挙げられる。
一実施形態では、修飾誘導体はN末端および/またはC末端修飾を含む。さらなる実施形態では、修飾誘導体は、好適なアミノ反応化学を使用するN末端修飾、および/または好適なカルボキシ反応化学を使用するC末端修飾を含む。さらなる実施形態では、前記N末端またはC末端修飾は、細胞傷害剤、ラジオキレーター(radiochelator)または発色団が挙げられるがそれに限定されないエフェクター基の付加を含む。
さらなる実施形態では、修飾誘導体はN末端修飾を含む。さらなる実施形態では、N末端修飾はN末端アセチル基を含む。この実施形態では、N末端残基は、ペプチド合成の間に無水酢酸または他の適切な試薬を用いてキャップ付加されて、N末端がアセチル化された分子をもたらす。この実施形態は、アミノペプチダーゼの潜在的な認識点を除去する利点を提供し、二環ペプチドの分解の可能性を回避する。
代替的な実施形態では、N末端修飾は分子スペーサー基の付加を含み、分子スペーサー基は、エフェクター基のコンジュゲーションおよびその標的への二環ペプチドの効力の保持を促進する。
さらなる実施形態では、修飾誘導体はC末端修飾を含む。さらなる実施形態では、C末端修飾はアミド基を含む。この実施形態では、C末端残基は、ペプチド合成の間にアミドとして合成されて、C末端がアミド化された分子をもたらす。この実施形態は、カルボキシペプチダーゼの潜在的な認識点を除去する利点を提供し、二環ペプチドのタンパク質分解の可能性を低減する。
一実施形態では、修飾誘導体は、1つまたは複数のアミノ酸残基の1つまたは複数の非天然アミノ酸残基による置換を含む。この実施形態では、分解性プロテアーゼにより認識されず、かつ標的効力に対する何らの有害効果も有しない等配電子/等電子の側鎖を有する非天然アミノ酸が選択されてもよい。
あるいは、近くのペプチド結合のタンパク質加水分解が配座によりおよび立体的に妨害されるように、束縛されたアミノ酸側鎖を有する非天然アミノ酸が使用されてもよい。特に、これらは、プロリンアナログ、バルキーな側鎖、C□二置換誘導体(例えば、アミノイソ酪酸、Aib)、およびシクロアミノ酸に関し、単純な誘導体はアミノ-シクロプロピルカルボン酸である。
一実施形態では、修飾誘導体はスペーサー基の付加を含む。さらなる実施形態では、修飾誘導体は、N末端システイン(C)および/またはC末端システイン(Ciii)へのスペーサー基の付加を含む。
一実施形態では、修飾誘導体は、1つまたは複数の酸化感受性アミノ酸残基の1つまたは複数の酸化抵抗性アミノ酸残基による置換を含む。さらなる実施形態では、修飾誘導体は、トリプトファン残基のナフチルアラニンまたはアラニン残基による置換を含む。この実施形態は、結果として生じる二環ペプチドリガンドの薬学的安定性プロファイルを向上させる利点を提供する。
一実施形態では、修飾誘導体は、1つまたは複数の荷電性アミノ酸残基の1つまたは複数の疎水性アミノ酸残基による置換を含む。代替的な実施形態では、修飾誘導体は、1つまたは複数の疎水性アミノ酸残基の1つまたは複数の荷電性アミノ酸残基による置換を含む。疎水性アミノ酸残基に対する荷電性アミノ酸残基の正しい均衡は、二環ペプチドリガンドの重要な特徴である。例えば、疎水性アミノ酸残基は、血漿タンパク質の結合の程度およびしたがって血漿中の遊離の利用可能な画分の濃度に影響を及ぼし、荷電性アミノ酸残基(特に、アルギニン)は、細胞表面上のリン脂質膜とのペプチドの相互作用に影響を及ぼすことがある。2つの組合せは、ペプチド薬物の半減期、分布の体積および曝露に影響を及ぼすことがあり、臨床的なエンドポイントにしたがって調整することができる。加えて、疎水性アミノ酸残基に対する荷電性アミノ酸残基の正しい組合せおよび数は、注射部位(ペプチド薬物が皮下に投与された場合)において刺激を低減し得る。
一実施形態では、修飾誘導体は、1つまたは複数のL-アミノ酸残基の1つまたは複数のD-アミノ酸残基による置換を含む。この実施形態は、立体障害によりおよび□-ターンコンホメーションを安定化させるD-アミノ酸の傾向によりタンパク質分解の安定性を増加させると考えられる(Tugyi et al (2005) PNAS, 102(2), 413-418)。
一実施形態では、修飾誘導体は、任意のアミノ酸残基の除去およびD-アラニンなどのアラニンによる置換を含む。この実施形態は、鍵となる結合性残基を同定し、かつ潜在的なタンパク質分解攻撃部位を除去する利点を提供する。
上記の各修飾は、ペプチドの効力または安定性を意図的に向上させるように働くことが留意されるべきである。修飾に基づくさらなる効力向上は、以下の機序を通じて達成されてもよい。
- より高い親和性が達成されるように、疎水性効果を活用し、より低い解離速度に繋がる疎水性部分を組み込むこと;
- ロングレンジのイオン相互作用を活用して、より速い会合速度およびより高い親和性をもたらす荷電性基を組み込むこと(例えば、Schreiber et al, Rapid, electrostatically assisted association of proteins (1996), Nature Struct. Biol. 3, 427-31を参照);ならびに
- 例えば、エントロピーの損失が標的結合時に最小となるように正しくアミノ酸の側鎖を束縛すること、エントロピーの損失が標的結合時に最小となるように骨格のねじり角度を束縛することおよび同一の理由から分子中に追加の環化を導入することにより、ペプチドに追加の束縛を組み込むこと。
(総説について、Gentilucci et al, Curr. Pharmaceutical Design, (2010), 16, 3185-203、およびNestor et al, Curr. Medicinal Chem (2009), 16, 4399-418を参照)。
同位体バリエーション
本発明は、1つまたは複数の原子が、同じ原子数を有するが天然に通常見出される原子質量または質量数とは異なる原子質量または質量数を有する原子により置き換えられた、本発明の全ての薬学的に許容される(放射性)同位体標識されたペプチドリガンド、および、関連する(放射性)同位体を保持することができる金属キレーティング基(「エフェクター」と称される)が取り付けられた本発明のペプチドリガンド、および、ある特定の官能基が、関連する(放射性)同位体または同位体標識された官能基により共有結合的に置き換えられた本発明のペプチドリガンドを含む。
本発明のペプチドリガンドに含めるために好適な同位体の例は、H(D)およびH(T)などの水素、11C、13Cおよび14Cなどの炭素、36Clなどの塩素、18Fなどのフッ素、123I、125Iおよび131Iなどのヨウ素、13Nおよび15Nなどの窒素、15O、17Oおよび18Oなどの酸素、32Pなどのリン、35Sなどの硫黄、64Cuなどの銅、67Gaまたは68Gaなどのガリウム、90Yなどのイットリウム、177Luなどのルテチウム、ならびに213Biなどのビスマスの同位体を含む。
本発明のある特定の同位体標識されたペプチドリガンド、例えば、放射活性同位体を組み込んだものは、薬物および/または基質の組織分布研究において、ならびに疾患組織におけるEphA2標的の存在および/または非存在を臨床的に評価するために有用である。本発明のペプチドリガンドは、標識された化合物と他の分子、ペプチド、タンパク質、酵素または受容体との間の複合体の形成を検出または同定するために使用され得るという点で価値のある診断特性をさらに有し得る。検出または同定方法は、放射性同位体、酵素、蛍光物質、発光物質(例えば、ルミノール、ルミノール誘導体、ルシフェリン、エクオリンおよびルシフェラーゼ)などの標識化剤を用いて標識された化合物を使用し得る。放射活性同位体トリチウム、すなわち、H(T)、および炭素-14、すなわち、14Cは、組込みの容易さおよび検出の手段が用意されていることを考慮してこの目的のために特に有用である。
重水素、すなわち、H(D)などのより重い同位体による置換は、より大きい代謝安定性、例えば、増加したin vivoでの半減期または低減した投与量の必要性の結果としてもたらされるある特定の治療的な利点が得られることがあり、それゆえ、一部の状況において好ましいことがある。
11C、18F、15Oおよび13Nなどのポジトロン放出同位体による置換は、標的占有を調べるためのポジトロン断層法(Positron Emission Topography)(PET)研究において有用であり得る。
本発明のペプチドリガンドの同位体標識された化合物は、一般的に、当業者に公知の従来技術によりまたは以前に用いられた非標識化試薬の代わりに適切な同位体標識された試薬を使用する本明細書中の実施例において記載されるものに類似の方法により調製され得る。
非芳香族分子スキャフォールド
「非芳香族分子スキャフォールド」という用語への本明細書における言及は、芳香族(すなわち、不飽和)炭素環式または複素環式環系を含有しない本明細書において定義されるような任意の分子スキャフォールドを指す。
非芳香族分子スキャフォールドの好適な例は、Heinis et al (2014) Angewandte Chemie, International Edition 53(6) 1602-1606に記載されている。
以上の文献において記載されているように、分子スキャフォールドは、小有機分子などの小分子であってもよい。
一実施形態では、分子スキャフォールドは高分子であってもよい。一実施形態では、分子スキャフォールドは、アミノ酸、ヌクレオチドまたは炭水化物から構成される高分子である。
一実施形態では、分子スキャフォールドは、ポリペプチドの官能基と反応して共有結合を形成できる反応性基を含む。
分子スキャフォールドは、アミン、チオール、アルコール、ケトン、アルデヒド、ニトリル、カルボン酸、エステル、アルケン、アルキン、アジド、無水物、スクシンイミド、マレイミド、ハロゲン化アルキルおよびハロゲン化アシルなどの、ペプチドと連結を形成する化学基を含んでもよい。
α不飽和カルボニル含有化合物の例は、1,1’,1’’-(1,3,5-トリアジナン-1,3,5-トリイル)トリプロパ-2-エン-1-オン(TATA)である(Angewandte Chemie, International Edition (2014), 53(6), 1602-1606)。
エフェクターおよび官能基
本発明のさらなる態様によれば、1つまたは複数のエフェクターおよび/または官能基にコンジュゲートされている本明細書において定義されるようなペプチドリガンドを含む薬物コンジュゲートが提供される。
エフェクターおよび/または官能基は、例えば、ポリペプチドのNおよび/もしくはC末端、ポリペプチド内のアミノ酸、または分子スキャフォールドに取り付けられ得る。
適切なエフェクター基としては、抗体およびその部分または断片が挙げられる。例えば、エフェクター基は、1つまたは複数の定常領域ドメインに加えて、抗体軽鎖定常領域(CL)、抗体CH1重鎖ドメイン、抗体CH2重鎖ドメイン、抗体CH3重鎖ドメイン、または任意のその組合せを含み得る。エフェクター基はまた、抗体のヒンジ領域を含んでもよい(そのような領域は通常、IgG分子のCH1ドメインとCH2ドメインとの間に見出される)。
本発明のこの態様のさらなる実施形態では、本発明によるエフェクター基はIgG分子のFc領域である。有利には、本発明によるペプチドリガンド-エフェクター基は、1日以上、2日以上、3日以上、4日以上、5日以上、6日以上または7日以上のtβ半減期を有するペプチドリガンドFc融合物を含むまたはからなる。より有利には、本発明によるペプチドリガンドは、1日以上のtβ半減期を有するペプチドリガンドFc融合物を含むまたはからなる。
官能基としては、一般に、結合性基、薬物、他の実体の取付けのための反応性基、および細胞への大環状ペプチドの取込みを補助する官能基などが挙げられる。
細胞中に透過するペプチドの能力は、細胞内標的に対してペプチドが効果的となることを可能とする。細胞中に透過する能力を有するペプチドによりアクセスされ得る標的としては、転写因子、チロシンキナーゼおよびアポトーシス経路に関与する分子などの細胞内シグナル伝達分子が挙げられる。細胞の透過を可能とする官能基としては、ペプチドまたは分子スキャフォールドのいずれかに付加されたペプチドまたは化学基が挙げられる。例えば、Chen and Harrison, Biochemical Society Transactions (2007) Volume 35, part 4, p821; Gupta et al. in Advanced Drug Discovery Reviews (2004) Volume 57 9637に記載されるような、VP22、HIV-Tat、ショウジョウバエのホメオボックスタンパク質(アンテナペディア)などに由来するものなどのペプチド。細胞膜を通る移行において効率的であることが示されている短いペプチドの例としては、ショウジョウバエアンテナペディアタンパク質からの16アミノ酸ペネトラチンペプチド(Derossi et al (1994) J Biol. Chem. Volume 269 p10444)、18アミノ酸「モデル両親媒性ペプチド」(Oehlke et al (1998) Biochim Biophys Acts Volume 1414 p127)およびHIV TATタンパク質のアルギニンリッチ領域が挙げられる。非ペプチド性アプローチとしては、生体分子に容易に取り付けることができる小分子模倣体またはSMOCの使用が挙げられる(Okuyama et al (2007) Nature Methods Volume 4 p153)。分子にグアニジニウム基を付加する他の化学的戦略はまた、細胞透過を増進する(Elson-Scwab et al (2007) J Biol Chem Volume 282 p13585)。ステロイドなどの低分子量分子は、細胞への取込みを増進するために分子スキャフォールドに付加されてもよい。
ペプチドリガンドに取り付けられ得る官能基の1つのクラスとしては、抗体およびFab、Fvまたは単一ドメイン断片などのその結合断片が挙げられる。特に、in vivoにおいてペプチドリガンドの半減期を増加させることができるタンパク質に結合する抗体が使用されてもよい。
一実施形態では、本発明によるペプチドリガンド-エフェクター基は、12時間以上、24時間以上、2日以上、3日以上、4日以上、5日以上、6日以上、7日以上、8日以上、9日以上、10日以上、11日以上、12日以上、13日以上、14日以上、15日以上または20日以上からなる群から選択されるtβ半減期を有する。有利には、本発明によるペプチドリガンド-エフェクター基または組成物は、12~60時間のtβ範囲を有する。さらなる実施形態では、それは1日以上のtβ半減期を有する。いっそうさらなる実施形態では、それは12~26時間の範囲内である。
本発明の1つの特定の実施形態では、官能基は、医薬的関連性のある金属放射性同位体を錯化させるために好適な金属キレーターから選択される。
可能なエフェクター基としては酵素もまた挙げられ、酵素は、例えば、ペプチドリガンドがADEPTにおいて抗体を置き換える酵素/プロドラッグ療法において使用するためのカルボキシペプチダーゼG2などである。
本発明の1つの特定の実施形態では、官能基は、がん療法用の細胞傷害剤などの薬物から選択される。好適な例としては、シスプラチンおよびカルボプラチンの他に、オキサリプラチン、メクロレタミン、シクロホスファミド、クロラムブシル、イホスファミドなどのアルキル化剤;プリンアナログであるアザチオプリンおよびメルカプトプリンまたはピリミジンアナログを含む抗代謝物;ビンクリスチン、ビンブラスチン、ビノレルビンおよびビンデシンなどのビンカアルカロイドを含む植物アルカロイドおよびテルペノイド;ポドフィロトキシンおよびその誘導体エトポシドおよびテニポシド;元々はタキソールとして公知のパクリタキセルを含むタキサン;イリノテカンおよびトポテカンといったカンプトテシン類を含むトポイソメラーゼ阻害剤;ならびにアムサクリン、エトポシド、エトポシドリン酸塩、およびテニポシドを含むII型阻害剤が挙げられる。さらなる薬剤としては、免疫抑制剤ダクチノマイシン(腎臓移植において使用される)、ドキソルビシン、エピルビシン、ブレオマイシン、カリケアマイシン(calicheamycins)、およびその他を含む抗腫瘍性抗生物質を挙げることができる。
本発明の1つのさらなる特定の実施形態では、細胞傷害剤は、メイタンシノイド(例えば、DM1)またはモノメチルアウリスタチン(例えば、MMAE)から選択される。
DM1は、メイタンシンのチオール含有誘導体である細胞傷害剤であり、以下の構造を有する。
モノメチルアウリスタチンE(MMAE)は合成の抗新生物剤であり、以下の構造を有する。
本発明の1つのまたさらなる特定の実施形態では、細胞傷害剤はメイタンシノイド(例えば、DM1)から選択される。DM1を含有する毒素にコンジュゲートされているペプチドリガンドの効果を実証するデータが本明細書の表6に提示される。
一実施形態では、細胞傷害剤は、ジスルフィド結合またはプロテアーゼ感受性結合などの切断可能な結合により二環ペプチドに連結される。さらなる実施形態では、ジスルフィド結合に隣接する基は、ジスルフィド結合の障害、ならびにこれにより切断および細胞傷害剤の付随的な放出の速度を制御するように修飾される。
公開された研究は、ジスルフィド結合のいずれかの側に立体障害を導入することにより還元に対するジスルフィド結合の感受性を修飾する可能性を確立した(Kellogg et al (2011) Bioconjugate Chemistry, 22, 717)。より大きい程度の立体障害は、細胞内グルタチオン、そしてまた細胞外(全身性)の還元剤による還元の速度を低減し、結果的に、細胞の内部および外部の両方において、毒素が放出される容易さを低減する。したがって、細胞内環境における効率的な放出(これは治療効果を最大化する)と対比した循環中のジスルフィド安定性(これは毒素の望ましくない副作用を最小化する)における最適条件の選択は、ジスルフィド結合のいずれかの側における障害の程度の注意深い選択により達成され得る。
ジスルフィド結合のいずれかの側における障害は、標的化実体(ここでは、二環ペプチド)または分子構築物の毒素側のいずれか上に1つまたは複数のメチル基を導入することを通じてモジュレートされる。
一実施形態では、薬物コンジュゲートは、前記ペプチドリガンドと前記細胞傷害剤との間のリンカーを追加的に含む。
一実施形態では、細胞傷害剤およびリンカーは、WO2016/067035(その細胞傷害剤およびリンカーは参照により本明細書に組み込まれる)に記載のものの任意の組合せから選択される。
一実施形態では、細胞傷害剤はDM1またはMMAEから選択される。
一実施形態では、前記細胞傷害剤と前記二環ペプチドとの間のリンカーは1つまたは複数のアミノ酸残基を含む。したがって、一実施形態では、細胞傷害剤はMMAEであり、かつ、リンカーは、-Val-Cit-、-Trp-Cit-、-Val-Lys-、-D-Trp-Cit-、-Ala-Ala-Asn-、D-Ala-Phe-Lys-または-Glu-Pro-Cit-Gly-hPhe-Tyr-Leu-(配列番号98)から選択される。さらなる実施形態では、細胞傷害剤はMMAEであり、かつ、リンカーは、-Val-Cit-、-Trp-Cit-、-Val-Lys-または-D-Trp-Cit-から選択される。いっそうさらなる実施形態では、細胞傷害剤はMMAEであり、かつ、リンカーは-Val-Cit-または-Val-Lys-である。よりいっそうさらなる実施形態では、細胞傷害剤はMMAEであり、かつ、リンカーは-Val-Cit-である。
代替的な実施形態では、前記細胞傷害剤(cytoxic agent)の間のリンカーは、切断性ジスルフィド結合などのジスルフィド結合を含む。したがって、さらなる実施形態では、細胞傷害剤はDM1であり、かつ、リンカーは、-S-S-、-SS(SOH)-、-SS-(Me)-、-(Me)-SS-(Me)-、-SS-(Me)-または-SS-(Me)-SOH-から選択される。さらなる実施形態では、細胞傷害剤はDM1であり、かつ、リンカーは、(N-スクシンイミジル3-(2-ピリジルジチオ)プロピオネート(SPDB)などの-S-S-部分、またはSOH-SPDBなどの-SS(SOH)-部分を含む。
代替的な実施形態では、細胞傷害剤は切断可能でない細胞傷害剤を含む。したがって、一実施形態では、細胞傷害剤は、切断可能でないMMAE(例えば、BCY6063内の細胞傷害剤)または切断可能でないDM1(例えば、BCY6064内の細胞傷害剤)である。
一実施形態では、細胞傷害剤はDM1であり、かつ、薬物コンジュゲートは、式(A):
の化合物を含み、前記二環は、本明細書において定義されるようなBCY6099およびBCY6014のいずれか1つから選択される。
代替的な実施形態では、細胞傷害剤はDM1であり、かつ、薬物コンジュゲートは、式(B):
の化合物を含み、前記二環は、本明細書において定義されるようなBCY6099およびBCY6014のいずれか1つから選択される。
代替的な実施形態では、細胞傷害剤はDM1であり、かつ、薬物コンジュゲートは式(A)の化合物を含み、前記二環は、本明細書において定義されるようなBCY6099から選択される。このBDCは本明細書においてBCY6027として知られる。表6に示すように、EphA2競合結合アッセイにおいてBCY6027について優れた競合結合を実証するデータが本明細書において提示される。
代替的な実施形態では、細胞傷害剤はDM1であり、かつ、薬物コンジュゲートは式(B)の化合物を含み、前記二環は、本明細書において定義されるようなBCY6099から選択される。このBDCは本明細書においてBCY6028として知られる。表6に示すように、EphA2競合結合アッセイにおいてBCY6028について優れた競合結合を実証するデータが本明細書において提示される。
代替的な実施形態では、細胞傷害剤はDM1であり、かつ、薬物コンジュゲートは式(A)の化合物を含み、前記二環は、本明細書において定義されるようなBCY6014から選択される。このBDCは本明細書においてBCY6031として知られる。表6に示すように、EphA2競合結合アッセイにおいてBCY6031について優れた競合結合を実証するデータが本明細書において提示される。BCY6031処理は32日目から非小細胞肺癌を完全に根絶し、28日目における懸濁液の投与後に腫瘍再成長は起こらなかったことを実証するデータもまた本明細書の表11ならびに図1および図2において提示される。
代替的な実施形態では、細胞傷害剤はDM1であり、かつ、薬物コンジュゲートは式(B)の化合物を含み、前記二環は、本明細書において定義されるようなBCY6014から選択される。このBDCは本明細書においてBCY6032として知られる。表6に示すように、EphA2競合結合アッセイにおいてBCY6032について優れた競合結合を実証するデータが本明細書において提示される。
代替的な実施形態では、細胞傷害剤はMMAEまたはDM1であり、かつ、薬物コンジュゲートは、表11に列記される任意のBDCから選択される。表11に示すように、これらのBDCは、ヒト、マウスおよび齧歯動物EphA2の間で優れた交差反応性を呈したことを示すデータが本明細書において提示される。
さらなる実施形態では、細胞傷害剤はMMAEまたはDM1であり、かつ、薬物コンジュゲートは、表13に列記される任意のBDCから選択される。
さらなる実施形態では、細胞傷害剤はMMAEまたはDM1であり、かつ、薬物コンジュゲートは、BCY6033、BCY6082、BCY6136およびBCY6173から選択される。表14および表15に示すように、これらの4つの二環薬物コンジュゲートは、密接に関連するヒトホモログEphA1、EphA3、EphA4、EphA5、EphA6、EphA7およびEphB4;マウスEphA3およびEphA4;ならびにラットEphA3およびEphB1への有意な結合を呈しなかったことを示すデータが本明細書において提示される。
いっそうさらなる実施形態では、薬物コンジュゲートは、BCY6031、BCY6033、BCY6082、BCY6135、BCY6136、BCY6173、BCY6174およびBCY6175のいずれか1つから選択される。
一実施形態では、薬物コンジュゲートは、BCY6027、BCY6028、BCY6135、BCY6136、BCY6173、BCY6174およびBCY6175以外のものである。
よりいっそうさらなる実施形態では、薬物コンジュゲートはBCY6136である。BCY6136はPC-3異種移植前立腺がんモデルにおいて有意かつ強力な抗腫瘍活性を示したことを示すデータが本明細書の研究7および8において提示される(図7~10および表21~24を参照)。BCY6136はNCI-H1975異種移植肺がん(NSCLC)モデルにおいて強力な抗腫瘍活性を実証したことを示すデータもまた本明細書において提供される(図11~13および表25~30を参照)。BCY6136は大腫瘍サイズおよび小腫瘍サイズの両方のLU-01-0251 PDX肺がん(NSCLC)モデルにおいて強力な抗腫瘍効果を実証し(図14および図15および表31~34を参照)、完全な腫瘍退縮が観察されたことを示すデータもまた本明細書の研究10および11において提示される。BCY6136はLU-01-0046 PDX肺がん(NSCLC)モデルにおいて有意な抗腫瘍効果を実証し(図16ならびに表35および表36を参照)、完全な腫瘍退縮がBCY6136について観察されたことを示すデータもまた本明細書の研究12において提示される。BCY6136はLU-01-0046 PDX肺がん(NSCLC)モデルにおいて用量依存的な抗腫瘍活性を実証したことを示すデータもまた本明細書の研究13において提示される(図17ならびに表37および表38を参照)。BCY6136はLU-01-0046 PDX肺がん(NSCLC)モデルにおいて腫瘍を根絶したことを示すデータもまた本明細書の研究14において提示される(図18~22および表39~42を参照)。低い/ごくわずかなEphA2発現を有する細胞株(すなわち、Lu-01-0412およびLu-01-0486)を利用する2つのモデルにおいてBCY6136の効果を実証するデータもまた本明細書の研究15および16において提示される。このデータは図23および図24ならびに表43~46において示され、BCY6136はいずれの細胞株においても腫瘍退縮に対して効果を有しなかったが、Lu-01-0412細胞株において高発現される標的に結合するBCYであるBCY8245およびBCY8781は、腫瘍を完全に根絶したことを実証する。BCY6136はMDA-MB-231異種移植乳がんモデルにおいて強力な抗腫瘍活性を実証したことを示すデータが本明細書の研究17において提示される(図25~27および表47~50を参照)。低い/ごくわずかなEphA2発現を有する細胞株(すなわち、EMT6)を利用する乳がんモデルにおいてBCY6136の効果を実証するデータもまた本明細書の研究18において提示される。このデータは図28ならびに表51および表52において示され、BCY6136はこの細胞株において腫瘍退縮に対して効果を有しなかったことを実証する。BCY6136はNCI-N87異種移植胃がんモデルにおいて有意な抗腫瘍活性を実証したことを示すデータもまた本明細書の研究19において提示される(図29ならびに表53および表54を参照)。BCY6136は、中等度の抗腫瘍活性を実証したADC MEDI-547と比較して、SK-OV-3異種移植卵巣がんモデルにおいて有意な抗腫瘍活性を実証したことを示すデータもまた本明細書の研究20において提示される(図30ならびに表55および表56を参照)。BCY6136はOE-21異種移植食道がんモデルにおいて有意な抗腫瘍活性を実証したことを示すデータもまた本明細書の研究21において提示される(図31ならびに表57および表58を参照)。BCY6136はMOLP-8異種移植多発性骨髄腫モデルにおいて用量依存的な抗腫瘍活性を実証し、BCY6082は有意な抗腫瘍活性を実証したことを示すデータもまた本明細書の研究22において提示される(図32および図33ならびに表59および表60を参照)。BCY6136はHT-1080異種移植線維肉腫モデルにおいて強力な抗腫瘍活性を実証したことを示すデータもまた本明細書の研究23において提示される(図34~41ならびに表61および表62を参照)。
合成
本発明のペプチドは、標準技術による合成の後に、in vitroでの分子スキャフォールドとの反応により製造されてもよい。これが行われる場合、標準的な化学が使用されてもよい。これは、さらなる下流の実験または検証のために可溶性の材料の迅速な大規模の調製を可能とする。そのような方法は、Timmerman et al(上掲)に開示されるものなどの従来の化学を使用して達成され得る。
したがって、本発明はまた、本明細書において示されるような選択されるポリペプチドまたはコンジュゲートの製造であって、以下において説明するような任意選択のさらなるステップを含む製造に関する。一実施形態では、これらのステップは、化学合成により作製された最終生成物のポリペプチド/コンジュゲートに対して実行される。
任意選択で、目的のポリペプチド中のアミノ酸残基は、コンジュゲートまたは複合体を製造する時に置換されてもよい。
ペプチドはまた、例えば、別のループを組み込み、したがって複数の特異性を導入するために伸長され得る。
ペプチドを伸長するために、それは単純に、標準的な固相または溶液相化学を使用して直交的に保護されたリジン(およびアナログ)を使用してそのN末端もしくはC末端においてまたはループ内において化学的に伸長されてもよい。標準的な(生物)コンジュゲーション技術を使用して、活性化されたまたは活性化可能なNまたはC末端を導入してもよい。あるいは、付加は、例えば(Dawson et al. 1994. Synthesis of Proteins by Native Chemical Ligation. Science 266:776-779)に記載されるような断片凝縮もしくは天然の化学的ライゲーションにより、または、例えば(Chang et al Proc Natl Acad Sci U S A. 1994 Dec 20; 91(26):12544-8もしくはHikari et al Bioorganic & Medicinal Chemistry Letters Volume 18, Issue 22, 15 November 2008, Pages 6000-6003)に記載されるようなサブチリガーゼを使用して、酵素により為されてもよい。
あるいは、ペプチドは、ジスルフィド結合を通じたさらなるコンジュゲーションにより伸長または修飾されてもよい。これは、第1および第2のペプチドが、細胞の還元性環境内に入ると互いに解離することを可能とするという追加の利点を有する。この場合、分子スキャフォールドは、3つのシステイン基と反応するように第1のペプチドの化学合成の間に付加されてもよく、さらなるシステインまたはチオールは次に、第1のペプチドのNまたはC末端に付加されてもよく、それにより、このシステインまたはチオールは第2のペプチドの遊離のシステインまたはチオールとのみ反応して、ジスルフィド連結した二環ペプチド-ペプチドコンジュゲートを形成する。
類似の技術は、2つの二環および二重特異性大環状分子の合成/連結に等しく適用され、四重特異性分子を潜在的に作製する。
さらには、他の官能基またはエフェクター基の付加は、適切な化学を使用して、NもしくはC末端においてまたは側鎖を介して連結させて、同様に達成されてもよい。一実施形態では、連結は、いずれの実体の活性も遮断しないような方式において実行される。
医薬組成物
本発明のさらなる態様によれば、1つまたは複数の薬学的に許容される賦形剤と組み合わせて本明細書において定義されるようなペプチドリガンドまたは薬物コンジュゲートを含む医薬組成物が提供される。
一般的に、本発明のペプチドリガンドは、薬理学的に適切な賦形剤または担体と共に精製された形態において利用される。典型的には、これらの賦形剤または担体は、生理食塩水および/または緩衝化媒体を含む、水性またはアルコール/水性溶液、エマルションまたは懸濁液を含む。非経口ビヒクルとしては、塩化ナトリウム溶液、リンゲルのデキストロース、デキストロースおよび塩化ナトリウムならびに乳酸リンゲル液が挙げられる。好適な生理的に許容される佐剤は、ポリペプチド複合体を懸濁状態に保つために必要な場合、カルボキシメチルセルロース、ポリビニルピロリドン、ゼラチンおよびアルギネートなどの増粘剤から選択されてもよい。
静脈内ビヒクルとしては、流体および栄養補充液および電解質補充液、例えば、リンゲルのデキストロースに基づくものが挙げられる。防腐剤ならびに他の添加物、例えば、抗菌物質、酸化防止剤、キレート剤および不活性ガスもまた存在してもよい(Mack (1982) Remington’s Pharmaceutical Sciences, 16th Edition)。
本発明のペプチドリガンドは、別々に投与される組成物としてまたは他の薬剤と組み合わせて使用されてもよい。これらとしては、抗体、抗体断片および様々な免疫療法薬物、例えば、シクロスポリン(cylcosporine)、メトトレキサート、アドリアマイシンまたはシスプラチナムおよび免疫毒素を挙げることができる。医薬組成物は、本発明のタンパク質リガンドと組み合わせて様々な細胞傷害剤もしくは他の薬剤の「カクテル」、または、投与前にプールされるか否かによらず、異なる標的リガンドを使用して選択されるポリペプチドなどの、異なる特異性を有する本発明による選択されるポリペプチドの組合せさえも含み得る。
本発明による医薬組成物の投与の経路は、当業者に一般的に公知の任意のものであってもよい。療法のために、本発明のペプチドリガンドは、標準技術にしたがって任意の患者に投与され得る。投与は、任意の適切な様式によるものであり得、該様式としては、非経口的、静脈内、筋肉内、腹腔内、経皮的、肺経路を介して、または適宜、カテーテルを用いる直接注入によるものが挙げられる。好ましくは、本発明による医薬組成物は吸入により投与される。投与の量および頻度は、患者の年齢、性別および状態、他の薬物の同時的な投与、禁忌および臨床医により考慮される他のパラメーターに依存する。
本発明のペプチドリガンドは、貯蔵および使用前に好適な担体中に復元するために凍結乾燥され得る。この技術は効果的であることが示されており、当該技術分野において公知の凍結乾燥および復元技術が用いられ得る。凍結乾燥および復元は様々な程度の活性損失に繋がることがあり、補償のためにレベルを上方に調整する必要があり得ることが当業者により理解されるであろう。
本発明のペプチドリガンドまたはそのカクテルを含有する組成物は、予防および/または治療処置のために投与され得る。ある特定の治療応用では、選択される細胞の集団の少なくとも部分的な阻害、抑制、モジュレーション、殺傷、または何らかの他の測定可能なパラメーターを達成するために充分な量は、「治療有効量」として定義される。この投与量を達成するために必要とされる量は、疾患の重篤度および患者自身の免疫系の全般的状態に依存するが、概ね体重1キログラム当たり0.005~5.0mgの選択されるペプチドリガンドの範囲内であり、0.05~2.0mg/kg/用量の用量がより一般的に使用される。予防応用のために、本発明のペプチドリガンドまたはそのカクテルを含有する組成物はまた、類似のまたはわずかにより低い投与量において投与されてもよい。
本発明によるペプチドリガンドを含有する組成物は、哺乳動物における選択標的細胞集団の変化、不活性化、殺傷または除去を補助するために予防的および治療的な設定において利用されてもよい。加えて、本明細書に記載のペプチドリガンドは、細胞の異成分集合物から標的細胞集団を選択的に殺傷し、枯渇させまたは他に効果的に除去するために生体外またはin vitroにおいて使用されてもよい。哺乳動物からの血液を選択されるペプチドリガンドと生体外において合わせることにより、望まない細胞を殺傷し、またはそれ以外に標準技術にしたがって哺乳動物に戻すために血液から除去してもよい。
治療的使用
本発明の二環ペプチドは、EphA2結合剤として特定の有用性を有する。
Eph受容体チロシンキナーゼ(Eph)は、チロシン残基においてタンパク質をリン酸化するキナーゼである受容体チロシンキナーゼ(RTK)の大きい群に属する。Ephおよびその膜結合型エフリンリガンド(エフリン)は、細胞の位置決めおよび組織編成を制御する(Poliakov et al. (2004) Dev Cell 7, 465-80)。機能的および生化学的なEph応答は、より高いリガンドオリゴマー化状態において起こる(Stein et al. (1998) Genes Dev 12, 667-678)。
他のパターニング機能の中で、様々なEphおよびエフリンは血管発生において役割を果たすことが示されている。EphB4およびエフリン-B2のノックアウトは、毛細血管床を血管に再モデル化する能力の欠如(Poliakov et al.、上掲)および胚致死性を結果としてもたらす。一部のEph受容体およびエフリンの持続性の発現もまた、新たに形成された成体微小血管において観察されている(Brantley-Sieders et al. (2004) Curr Pharm Des 10, 3431-42; Adams (2003) J Anat 202, 105-12)。
成体における一部のエフリンおよびその受容体の脱調節された再出現はまた、腫瘍浸潤、転移および血管新生に寄与することが観察されている(Nakamoto et al. (2002) Microsc Res Tech 59, 58-67;Brantley-Sieders et al.、上掲)。さらには、一部のEphファミリーメンバーは、様々なヒト腫瘍からの腫瘍細胞上に過剰発現されることが見出されている(Brantley-Sieders et al.、上掲);Marme (2002) Ann Hematol 81 Suppl 2, S66; Booth et al. (2002) Nat Med 8, 1360-1)。
EPH受容体A2(エフリンA型受容体2)は、ヒトにおいてEPHA2遺伝子によりコードされるタンパク質である。
EphA2は、ヒトにおける複数のがんにおいて上方調節されており、多くの場合に、疾患進行、転移および予後不良と相関する。例えば、乳房(Zelinski et al (2001) Cancer Res. 61, 2301-2306; Zhuang et al (2010) Cancer Res. 70, 299-308; Brantley-Sieders et al (2011) PLoS One 6, e24426)、肺(Brannan et al (2009) Cancer Prev Res (Phila) 2, 1039-1049; Kinch et al (2003) Clin Cancer Res. 9, 613-618; Guo et al (2013) J Thorac Oncol. 8, 301-308)、胃(Nakamura et al (2005) Cancer Sci. 96, 42-47; Yuan et al (2009) Dig Dis Sci 54, 2410-2417)、膵臓(Mudali et al (2006) Clin Exp Metastasis 23, 357-365)、前立腺(Walker-Daniels et al (1999) Prostate 41, 275-280)、肝臓(Yang et al (2009) Hepatol Res. 39, 1169-1177)および膠芽腫(Wykosky et al (2005) Mol Cancer Res. 3, 541-551; Li et al (2010) Tumour Biol. 31, 477-488)。
がんの進行におけるEphA2の全体的役割は依然として定義されていないが、腫瘍細胞の増殖、生存、浸潤および血管新生を含むがんの進行の多数のステージにおける相互作用について証拠が存在する。EphA2発現の下方調節は腫瘍のがん細胞繁殖を抑制し(Binda et al (2012) Cancer Cell 22, 765-780)、EphA2の遮断は、VEGF誘導性の細胞遊走(Hess et al (2001) Cancer Res. 61, 3250-3255)、出芽および血管新生(Cheng et al (2002) Mol Cancer Res. 1, 2-11; Lin et al (2007) Cancer 109, 332-40)ならびに転移の進行(Brantley-Sieders et al (2005) FASEB J. 19, 1884-1886)を阻害する。
EphA2への抗体薬物コンジュゲートは、ラットおよびマウス異種移植モデルにおいて腫瘍成長を有意に減少させることが示されており(Jackson et al (2008) Cancer Research 68, 9367-9374)、類似のアプローチが男性において試みられたが、治療関連有害事象のために治療は中止されなければならなかった(Annunziata et al (2013) Invest New drugs 31, 77-84)。
本発明の方法により選択されるポリペプチドリガンドは、in vivoでの治療および予防応用、in vitroおよびin vivoでの診断応用、in vitroアッセイならびに試薬応用などにおいて用いられてもよい。選択されるレベルの特異性を有するリガンドは、交差反応性が望まれる非ヒト動物における試験を伴う応用、または、ホモログもしくはパラログとの交差反応性が慎重に制御される必要がある診断応用において有用である。ワクチン応用などの一部の応用では、予め決定された範囲の抗原に対し免疫応答を誘発する能力を活用して、特定の疾患および病原体に対するワクチンを調整することができる。
少なくとも90~95%の均質性の実質的に純粋なペプチドリガンドは哺乳動物への投与のために好ましく、98~99%またはより高い均質性は、特に哺乳動物がヒトである場合に、医薬的使用のために最も好ましい。所望に応じて部分的にまたは均質になるまで精製されると、選択されるポリペプチドは、診断的もしくは治療的(生体外を含む)にまたはアッセイ手順および免疫蛍光染色などの開発および実行において使用され得る(Lefkovite and Pernis, (1979 and 1981) Immunological Methods, Volumes I and II, Academic Press, NY)。
本発明のさらなる態様によれば、疾患組織(例えば、腫瘍)におけるEphA2の過剰発現により特徴付けられる疾患または障害の予防、抑制または治療において使用するための、本明細書において定義されるようなペプチドリガンドまたは薬物コンジュゲートが提供される。
本発明のさらなる態様によれば、疾患組織(例えば、腫瘍)におけるEphA2の過剰発現により特徴付けられる疾患または障害を予防、抑制または治療する方法であって、それを必要とする患者に本明細書において定義されるようなペプチドリガンドのエフェクター基および薬物コンジュゲートを投与することを含む方法が提供される。
一実施形態では、EphA2は哺乳動物EphA2である。さらなる実施形態では、哺乳動物EphA2はヒトEphA2である。
一実施形態では、疾患組織におけるEphA2の過剰発現により特徴付けられる疾患または障害はがんから選択される。
治療(または阻害)され得るがん(およびその良性の対応物)の例としては、上皮起源の腫瘍(腺癌、扁平癌、移行細胞癌および他の癌腫を含む様々な種類の腺腫および癌腫)、例えば、膀胱および尿路、乳房、胃腸管(食道、胃、小腸、結腸、直腸および肛門を含む)、肝臓(肝細胞癌)、胆嚢および胆汁系、外分泌膵臓、腎臓、肺(例えば、腺癌、小細胞肺癌、非小細胞肺癌、気管支肺胞上皮癌および中皮腫)、頭頸部(例えば、舌、頬腔、喉頭、咽頭、鼻咽頭、扁桃、唾液腺、鼻腔および副鼻腔のがん)、卵巣、卵管、腹膜、膣、外陰部、陰茎、子宮頸部、子宮筋層、子宮内膜、甲状腺(例えば、甲状腺濾胞癌)、副腎、前立腺、皮膚および付属器(例えば、黒色腫、基底細胞癌、扁平細胞癌、ケラトアカントーマ、形成異常母斑)の癌腫;血液学的悪性腫瘍(すなわち、白血病、リンパ腫)および前悪性血液学的障害およびリンパ系列の血液学的悪性腫瘍および関連する状態を含む境界型悪性腫瘍の障害(例えば、急性リンパ性白血病[ALL]、慢性リンパ性白血病[CLL]、B細胞リンパ腫、例えば、びまん性大B細胞リンパ腫[DLBCL]、濾胞性リンパ腫、バーキットリンパ腫、マントル細胞リンパ腫、T細胞リンパ腫および白血病、ナチュラルキラー[NK]細胞リンパ腫、ホジキンリンパ腫、有毛細胞白血病、意義不明のモノクローナルガンマグロブリン血症、形質細胞腫、多発性骨髄腫、および移植後リンパ増殖性障害)、および骨髄系列の血液学的悪性腫瘍および関連する状態(例えば、急性骨髄性白血病[AML]、慢性骨髄性白血病[CML]、慢性骨髄単球性白血病[CMML]、好酸球増多症候群、骨髄増殖性障害、例えば、真性赤血球増加症、本態性血小板血症および原発性骨髄線維症、骨髄増殖性症候群、骨髄異形成症候群、および前骨髄球性白血病);間葉起源の腫瘍、例えば軟組織肉腫、骨または軟骨の腫瘍、例えば、骨肉腫、線維肉腫、軟骨肉腫、横紋筋肉腫、平滑筋肉腫、脂肪肉腫、血管肉腫、カポジ肉腫、ユーイング肉腫、滑膜肉腫、類上皮肉腫、消化管間質腫瘍、良性および悪性組織球腫、および隆起性皮膚線維肉腫;中枢または末梢神経系の腫瘍(例えば、星状細胞腫、神経膠腫および膠芽腫、髄膜腫、上衣腫、松果体腫瘍および神経鞘腫);内分泌腫瘍(例えば、下垂体腫瘍、副腎腫瘍、膵島細胞腫瘍、副甲状腺腫瘍、カルチノイド腫瘍および甲状腺の髄様癌);目および付属器の腫瘍(例えば、網膜芽腫);生殖細胞および栄養膜腫瘍(例えば、奇形腫、精上皮腫、未分化胚細胞腫、胞状奇胎および絨毛癌);ならびに小児性および胎児性腫瘍(例えば、髄芽腫、神経芽腫、ウィルムス腫瘍、および未分化神経外胚葉性腫瘍);または患者を悪性腫瘍にかかりやすくする症候群、先天性もしくはその他(例えば、色素性乾皮症)が挙げられるがそれに限定されない。
さらなる実施形態では、がんは、乳がん、肺がん、胃がん、膵臓がん、前立腺がん、肝臓がん、膠芽腫および血管新生から選択される。
さらなる実施形態では、がんは、前立腺がん、肺がん(例えば、非小細胞肺癌(NSCLC))、乳がん(例えば、トリプルネガティブ乳がん)、胃がん、卵巣がん、食道がん、多発性骨髄腫および線維肉腫から選択される。
いっそうさらなる実施形態では、がんは前立腺がんである。BCY6033およびBCY6136はPC-3異種移植前立腺がんモデルにおいて有意かつ強力な抗腫瘍活性を示したことを示すデータが本明細書の研究7および8において提示される(図7~10および表21~24を参照)。
いっそうさらなる実施形態では、薬物コンジュゲートは、線維肉腫および乳房、および非小細胞肺癌などの固形腫瘍を予防、抑制または治療するために有用なものである。
いっそうさらなる実施形態では、がんは、非小細胞肺癌(NSCLC)などの肺がんから選択される。本発明のBDC(BCY6031)は、32日目から非小細胞肺癌を完全に根絶し、28日目における懸濁液の投与後に腫瘍再成長は起こらなかったことを実証するデータが本明細書において提示される。このデータは、肺がん、特に非小細胞肺癌などのがんにおける本発明のBDCの臨床的有用性を明確に実証する。NCI-H1975異種移植肺がん(NSCLC)モデルにおいてBCY6033は用量依存的な抗腫瘍活性を実証し、BCY6082は有意な抗腫瘍活性を実証し、BCY6136は強力な抗腫瘍活性を実証したことを示すデータもまた本明細書の研究9において提示される(図11~13および表25~30を参照)。BCY6136は大腫瘍サイズおよび小腫瘍サイズの両方のLU-01-0251 PDX肺がん(NSCLC)モデルにおいて強力な抗腫瘍効果を実証し(図14および図15ならびに表31~34を参照)、完全な腫瘍退縮が観察されたことを示すデータもまた本明細書の研究10および11において提示される。BCY6033、BCY6136、BCY6082およびBCY6031はLU-01-0046 PDX肺がん(NSCLC)モデルにおいて有意な抗腫瘍効果を実証し(図16ならびに表35および表36を参照)、BCY6033およびBCY6136について完全な腫瘍退縮が観察されたことを示すデータもまた本明細書の研究12において提示される。BCY6136はLU-01-0046 PDX肺がん(NSCLC)モデルにおいて用量依存的な抗腫瘍活性を実証したことを示すデータもまた本明細書の研究13において提示される(図17ならびに表37および表38を参照)。LU-01-0046 PDX肺がん(NSCLC)モデルにおいてBCY6082は用量依存的な抗腫瘍活性を実証し、BCY6031およびBCY6173は抗腫瘍活性を実証し、BCY6033、BCY6136およびBCY6175は腫瘍を根絶したことを示すデータもまた本明細書の研究14において提示される(図18~22および表39~42を参照)。低い/ごくわずかなEphA2発現を有する細胞株(すなわち、Lu-01-0412およびLu-01-0486)を利用する2つのモデルにおいてBCY6136の効果を実証するデータもまた本明細書の研究15および16において提示される。このデータは図23および図24ならびに表43~46において示され、BCY6136はいずれの細胞株においても腫瘍退縮に対して効果を有しなかったが、Lu-01-0412細胞株において高発現される標的に結合するBCYであるBCY8245およびBCY8781は、腫瘍を完全に根絶したことを実証する。さらなる実施形態では、がんは乳がんである。いっそうさらなる実施形態では、乳がんはトリプルネガティブ乳がんである。MDA-MB-231異種移植乳がんモデルにおいてBCY6082は抗腫瘍活性を実証し、BCY6033は用量依存的な抗腫瘍活性を実証し、BCY6136は強力な抗腫瘍活性を実証したことを示すデータが本明細書の研究17において提示される(図25~27および表47~50を参照)。低い/ごくわずかなEphA2発現を有する細胞株(すなわち、EMT6)を利用する乳がんモデルにおいてBCY6136の効果を実証するデータもまた本明細書の研究18において提示される。このデータは図28ならびに表51および表52において示され、BCY6136はこの細胞株において腫瘍退縮に対して効果を有しなかったことを実証する。代替的な実施形態では、乳がんはハーセプチン抵抗性乳がんである。理論により縛られるものではないが、EphA2は、ハーセプチンへの抵抗性に関係があると考えられ、したがって、EphA2標的化実体は、ハーセプチンに応答しなかった患者において潜在的な有用性を有する。
さらなる実施形態では、がんは胃がんである。BCY6136はNCI-N87異種移植胃がんモデルにおいて有意な抗腫瘍活性を実証したことを示すデータが本明細書の研究19において提示される(図29ならびに表53および表54を参照)。
さらなる実施形態では、がんは卵巣がんである。BCY6136は、中等度の抗腫瘍活性を実証したADC MEDI-547と比較して、SK-OV-3異種移植卵巣がんモデルにおいて有意な抗腫瘍活性を実証したことを示すデータが本明細書の研究20において提示される(図30ならびに表55および表56を参照)。
さらなる実施形態では、がんは食道がんである。BCY6136はOE-21異種移植食道がんモデルにおいて有意な抗腫瘍活性を実証したことを示すデータが本明細書の研究21において提示される(図31ならびに表57および表58を参照)。
さらなる実施形態では、がんは多発性骨髄腫である。BCY6136はMOLP-8異種移植多発性骨髄腫モデルにおいて用量依存的な抗腫瘍活性を実証し、BCY6082は有意な抗腫瘍活性を実証したことを示すデータが本明細書の研究22において提示される(図32および図33ならびに表59および表60を参照)。
さらなる実施形態では、がんは線維肉腫である。HT-1080異種移植線維肉腫モデルにおいてBCY6173、BCY6135、BCY6174およびBCY6175は用量依存的な抗腫瘍活性を実証し、BCY6082、BCY6031、BCY6033およびBCY6136は強力な抗腫瘍活性を実証したことを示すデータが本明細書の研究23において提示される(図34~41ならびに表61および表62を参照)。
「予防」という用語への本明細書における言及は、疾患の誘導前の保護的な組成物の投与を伴う。「抑制」は、誘導性の事象の後であるが疾患の臨床的出現の前の組成物の投与を指す。「治療」は、疾患症状が現れた後の保護的な組成物の投与を伴う。
疾患からの保護または疾患の治療におけるペプチドリガンドの有効性をスクリーニングするために使用され得る動物モデル系が利用可能である。動物モデル系の使用は本発明により促進され、本発明は、ヒトおよび動物標的と交差反応して、動物モデルの使用を可能とし得るポリペプチドリガンドの開発を可能とする。
さらには、複数の腫瘍種からのEphA2についてのコピー数多型(CNV)と遺伝子発現との関連性を実証するデータが本明細書において提示される。したがって、本発明のさらなる態様によれば、がんを予防、抑制または治療する方法であって、それを必要とする患者に本明細書において定義されるようなペプチドリガンドのエフェクター基および薬物コンジュゲートを投与することを含み、前記患者が、EphA2の増加したコピー数多型(CNV)を有するとして同定される、方法が提供される。
一実施形態では、がんは、EphA2の増加したCNVを有するとして本明細書において同定されるものから選択される。さらなる実施形態では、がんは乳がんである。
以下の実施例を参照して本発明を以下においてさらに記載する。
材料および方法
ペプチド合成
ペプチドを固相合成により合成した。Rink Amide MBHA Resinを使用した。Rink Amide MBHA(0.4~0.45mmol/g)およびFmoc-Cys(Trt)-OH(3.0当量)を含有する混合物にDMFを加えた後、DIC(3当量)およびHOAt(3当量)を加え、1時間混合した。DMF中の20%のピペリジンをデブロッキングのために使用した。その後の各アミノ酸をDMF中の活性化試薬、DIC(3.0当量)およびHOAT(3.0当量)を使用して3当量を用いて連結させた。反応をニンヒドリン呈色反応またはテトラクロル呈色反応によりモニターした。合成完了後に、DMF×3、MeOH×3を用いてペプチド樹脂を洗浄した後、Nバブリング下で終夜乾燥した。次に、92.5%のTFA/2.5%のTIS/2.5%のEDT/2.5%のHOを用いてペプチド樹脂を3時間処理した。冷イソプロピルエーテルを用いてペプチドを沈殿させ、遠心分離した(3000rpmで3分)。イソプロピルエーテルを用いてペレットを2回洗浄し、粗ペプチドを真空下で2時間乾燥した後に凍結乾燥した。凍結乾燥粉末をACN/HO(50:50)中に溶解し、ACN中の100mMのTATAの溶液の後にHO中の重炭酸アンモニウム(1M)を加え、溶液を1時間混合した。環化が完了したら、1Mの水性塩酸システイン(TATAに対して10当量)を用いて反応を停止させた後に混合し、1時間静置した。溶液を凍結乾燥して粗生成物を得た。粗ペプチドを分取HPLCにより精製し、凍結乾燥して生成物を得た。
他に記載しなければ、全てのアミノ酸はLコンフィギュレーションにて使用した。
BCY6099(化合物66)
配列:(β-Ala)-Sar10-(配列番号2)-CONH
8.0gの樹脂を使用して2.1gのBCY6099(99.2%の純度;16.3%の収率)を白色固体として生成した。
BCY6014(化合物67)
配列:(β-Ala)-Sar10-(配列番号11)-CONH
4.79gの樹脂を使用して1.07gのBCY6014(Q1:131.9mg、97.99%の純度;Q2:141.7mg、99.04%の純度;Q3:800.7mg、92.35%の純度;16.9%の収率)を白色固体として生成した。
BCY6104(化合物99)
配列:(β-Ala)-Sar10-A(HArg)DC(HyP)(Hse(Me))VNPLCLHP(D-Asp)W(HArg)C((β-Ala)-Sar10-(配列番号85))
4.44gの樹脂を使用して700mgのBCY6104(95.87%の純度、10.5%の収率)を白色固体として生成した。
BCY6103(化合物100)
配列:(β-Ala)-Sar10-A(HArg)DC(HyP)(Hse(Me))VNPLCLHP(D-Asp)WTC((β-Ala)-Sar10-(配列番号86))
4.44gの樹脂を使用して700mgのBCY6103(98.9%の純度、11.1%の収率)を白色固体として生成した。
BCY6101(化合物101)
配列:(β-Ala)-Sar10-A(HArg)DC(HyP)LVNPLCLHP(D-Ala)WTC((β-Ala)-Sar10-(配列番号87))
4.44gの樹脂を使用して700mgのBCY6101(95.9%の純度、10.9%の収率)を白色固体として生成した。
BCY6102(化合物102)
配列:(β-Ala)-Sar10-A(HArg)DCPLVNPLCLHP(D-Ala)WTC((β-Ala)-Sar10-(配列番号88))
4.44gの樹脂を使用して900mgのBCY6102(95.9%の純度、14.1%の収率)を白色固体として生成した。
BCY6139(化合物103)
配列:(β-Ala)-Sar10-ARDC(HyP)LVNPLCLHPGWTC((β-Ala)-Sar10-(配列番号89))
4.44gの樹脂を使用して900mgのBCY6139(97.4%の純度、11.2%の収率)を白色固体として生成した。
BCY6138(化合物104)
配列:(β-Ala)-Sar10-ARDCPLVNPLCL(D-3,3-DPA)PGWTC((β-Ala)-Sar10-(配列番号90))
1.11gの樹脂を使用して200mgのBCY6138(95.2%の純度、12.2%の収率)を白色固体として生成した。
BCY6137(化合物105)
配列:(β-Ala)-Sar10-ARDCPLVNPLCLHPGWTCLH((β-Ala)-Sar10-(配列番号91))
4.44gの樹脂を使用して600mgのBCY6137(98.9%の純度、9.06%の収率)を白色固体として生成した。
BCY6042(化合物91)
配列:Ac-(配列番号14)-Sar-(D-K)
1.11gの樹脂を使用して99.2mgのBCY6042(99.2%の純度、7.0%の収率)を白色固体として生成した。
BCY6019(化合物77)
配列:Ac-(配列番号12)-Sar-(D-K)
4.79gの樹脂を使用して732.0mgのBCY6019(92.82%の純度、12.2%の収率)を白色固体として生成した。
BCY6059(化合物106)
配列:Ac-(配列番号12)-Sar-(D-K[Ac])
O(3mL)中のBCY6019(0.05g、17.82μmol、1.00当量)の溶液をNaCO(水性)によりPH=11に調整し、アセチルアセテート(5.46mg、53.46μmol、5.01μL、3.00当量)を加えた。混合物を15℃で1時間撹拌した。LC-MSは、BCY6019は完全に消費され、所望のMSを有する1つの主なピークが検出されたことを示した。反応液を1NのHClによりPH=7に調整し、分取HPLC(TFA条件)により直接的に精製した。化合物BCY6059(18.1mg、6.36μmol、35.67%の収率)を白色固体として得た。
BCY6160(化合物107)
配列:(β-AlaSOH)-Sar-(Cya)-Sar-(Cya)-A(HArg)DCPLVNPLCLHP(D-Cya)WTC((β-AlaSOH)-Sar-(Cya)-Sar-(Cya)-(配列番号92))
1.11gの樹脂を使用して45.2mgのBCY6160(95.5%の純度、2.5%の収率)を白色固体として生成した。
BCY6009(化合物108)
配列:(β-Ala)-Sar10-ARDCPLVNPLCLHPGWTC((β-Ala)-Sar10-(配列番号10))
4.79gの樹脂を使用して2.42gのBCY6009(>88.92%の純度、36.0%の収率)を白色固体として生成した。
BCY6017(化合物109)
配列:A(HArg)DCPLVNPLCLHPGWTC(配列番号11)
1.19gの樹脂を使用して189.9mgのBCY6017(95.05%の純度、16.8%の収率)を白色固体として生成した。
BCY6018(化合物110)
配列:(β-Ala)-Sar-(配列番号11)
1.19gの樹脂を使用して289.1mgのBCY6018(97.92%の純度、21.0%の収率)を白色固体として生成した。
BCY6152(化合物111)
配列:(β-AlaSOH)-Sar10-(配列番号11)
1.11gの樹脂を使用して150.0mgのBCY6152(98.75%の純度;9.5%の収率)を白色固体として生成した。
BCY6141(化合物112)
配列:(β-Ala)-Sar10-A(D-Arg)DC(HyP)LVNPLCL(D-3,3-DPA)P(D-Asp)W(HArg)C((β-Ala)-Sar10-(配列番号93))
1.11gの樹脂を使用して120.0mgのBCY6141(97.91%の純度;7.3%の収率)を白色固体として生成した。
BCY6026(化合物87)
配列:ACPLVNPLCLHPGWSCRGQ(配列番号77)
1.11gの樹脂を使用して285.0mgのBCY6026(97.7%の純度;24.2%の収率)を白色固体として生成した。
BCY6153(化合物113)
配列:(β-AlaSOH)-Sar-(配列番号11)
1.11gの樹脂を使用して140.0mgのBCY6153(98.59%の純度;9.9%の収率)を白色固体として生成した。
二環ペプチド薬物コンジュゲートの調製
二環薬物コンジュゲート(BDC)を調製するための概略図を図3に示し、表Aは、各BDC内の成分標的化二環およびリンカー/毒素を記載する。
表6に列記する二環ペプチド薬物コンジュゲートBCY6027、BCY6028、BCY6031およびBCY6032の合成をWO2016/067035に開示されるプロトコールを使用して行った。
式(C)および(D):
を有する活性化二環ペプチドを、二環前駆体の遊離アミノ基をDMSO中のそれぞれSPP(N-スクシンイミジル4-(2-ピリジルジチオ)ペンタノエート、Annova Chem)およびSPDB(N-スクシンイミジル3-(2-ピリジルジチオ)プロピオネート、Annova Chem)と反応させることにより合成した。二環前駆体の濃度は10mM以上、室温において1.3倍過剰のSPPまたはSPDB、および20倍過剰のジイソプロピルエチルアミンであった。LCMSによる判断により、1時間後に反応は完了したと判断した。上記のように逆相により精製を行った。適切な画分を凍結乾燥した。
式(C)および(D)を有する活性化二環ペプチドを、窒素ガスブランケット下の室温で21時間、半水性条件(2mMのEDTAを添加したpH5.0の50%のジメチルアセトアミドおよび50%の100mMの酢酸ナトリウム)中で1.15当量のDM1(遊離チオールとして)を用いてジスルフィド交換した。反応液中の構造CおよびDを有する活性化二環ペプチドの濃度は10mM以上であった。
この後に、C18カラムを使用する標準的な逆相精製を行った。95%より高い純度の画分を単離し、凍結乾燥した。材料は、測定可能な量の遊離の毒素を含有しなかった。
MMAE系列
Val-Cit-MMAE系列
Val-Cit-MMAEリンカー
化合物2
ペプチドを固相合成により合成した。50gのCTC樹脂(サブ:1.0mmol/g)を使用した。CTC樹脂(50mmol、50g、1.0mmol/g)およびFmoc-Cit-OH(19.8g、50mmol、1.0当量)を含有する混合物にDCM(400mL)を加えた後、DIEA(6.00当量)を加え、3時間混合した。次にMeOH(50mL)を加え、キャップ付加のために30分間混合した。DMF中の20%のピペリジンをデブロッキングのために使用した。Boc-Val-OH(32.5g、150mmol、3当量)を、DMF(400mL)中のHBTU(2.85当量)およびDIPEA(6.0当量)を使用して3当量を用いて連結させた。ニンヒドリン呈色反応試験により反応をモニターした。合成完了後に、ペプチド樹脂をDMF×3、MeOH×3を用いて洗浄した後、Nバブリング下で終夜乾燥した。その後、20%のHFIP/DCMを用いて30分間、ペプチド樹脂を2回処理した。溶液をロータリーエバポレーターで除去して粗生成物を得た。粗ペプチドをACN/H2O中に溶解した後、2回凍結乾燥(llyophilized)してペプチド生成物(17.3gの粗生成物)を得た。
化合物3
DCM(40.00mL)およびMeOH(20.00mL)中の化合物2(4.00g、10.68mmol、1.00当量)の溶液を室温で撹拌した後、(4-アミノフェニル)メタノール(1.58g、12.82mmol、1.20当量)およびEEDQ(5.28g、21.37mmol、2.00当量)を加え、混合物を暗所で9時間撹拌した。TLC(ジクロロメタン/メタノール=5/1、Rf=0.56)は、1つの新たなスポットが形成されたことを指し示した。反応混合物を減圧下で濃縮して溶媒を除去した。結果として得られた残留物をフラッシュシリカゲルクロマトグラフィー(ISCO(登録商標);120gのSepaFlash(登録商標) Silica Flash Column、0~20%のMeOH/DCMの溶出液、80mL/分)により精製した。化合物3(3.00g、6.26mmol、58.57%の収率)を白色固体として得た。
化合物4
無水THF(35.00mL)および無水DCM(15.00mL)中の化合物3(3.00g、6.26mmol、1.00当量)の溶液に(4-ニトロフェニル)クロロホルメート(6.31g、31.30mmol、5.00当量)およびピリジン(2.48g、31.30mmol、2.53mL、5.00当量)を加え、混合物を25℃で5時間撹拌した。TLC(ジクロロメタン/メタノール=10/1、Rf=0.55)は、新たなスポットが形成されたことを指し示した。反応混合物を濾過し、濾液を減圧下で濃縮して残留物を得た。残留物をフラッシュシリカゲルクロマトグラフィー(ISCO(登録商標);120gのSepaFlash(登録商標) Silica Flash Column、0~10%のDCM/MeOHの溶出液、80mL/分)により精製した。化合物4(2.00g、3.10mmol、49.56%の収率)を白色固体として得た。
化合物5
DMF(5.00mL)中の化合物4(278.43mg、387.80μmol、1.00当量)およびDIEA(501.19mg、3.88mmol、677.29μL、10.00当量)の混合物を窒素下で10分間撹拌した。MMAE(250.00mg、387.80μmol、1.00当量)およびHOBt(52.40mg、387.80μmol、1.00当量)を加え、混合物を窒素下0℃で20分間撹拌し、30℃でさらに18時間撹拌した。LC-MSは、所望の質量を有する1つの主なピークが検出されたことを示した。結果として得られた混合物をフラッシュC18ゲルクロマトグラフィー(ISCO(登録商標);130gのSepaFlash(登録商標) C18 Flash Column、0~50%のMeCN/HOの溶出液、75mL/分)により精製した。化合物5(190.00mg、155.29μmol、40.04%の収率)を白色固体として得た。
化合物6
DCM(2.70mL)中の化合物5(170.00mg、138.94μmol、1.00当量)の溶液に2,2,2-トリフルオロ酢酸(413.32mg、3.62mmol、268.39μL、26.09当量)を加え、混合物を25℃で1時間撹拌した。LC-MSは、化合物5は完全に消費されたことを示した。混合物を減圧下で濃縮して残留物を得た。残留物をTHF(10.00mL)中に溶解し、KCO(192.03mg、1.39mmol、10.00当量)を加え、混合物を室温でさらに3時間撹拌した。LC-MSは、所望の質量を有する1つの主なピークが検出されたことを示した。結果として得られた反応混合物を減圧下で濃縮して溶媒を除去して残留物を得た。残留物をフラッシュC18ゲルクロマトグラフィー(ISCO(登録商標);130gのSepaFlash(登録商標) C18 Flash Column、0~50%のMeCN/HOの溶出液、75mL/分)により精製した。化合物6(110.00mg、97.92μmol、70.48%の収率)を白色固体として得た。
化合物7
DMA(5mL)中の化合物6(110.00mg、97.92μmol、1.00当量)の溶液にDIEA(25.31mg、195.83μmol、34.20μL、2.00当量)およびテトラヒドロピラン-2,6-ジオン(22.34mg、195.83μmol、2.00当量)。混合物を室温で18時間撹拌した。LC-MSは、化合物6は完全に消費され、所望の質量を有する1つの主なピークが検出されたことを示した。反応混合物をフラッシュC18ゲルクロマトグラフィー(ISCO(登録商標);130gのSepaFlash(登録商標) C18 Flash Column、0~50%のMeCN/HOの溶出液、75mL/分)により精製した。化合物7(100.00mg、80.81μmol、82.53%の収率)を白色固体として得た。
化合物8(MMAE-PABC-Cit-Val-グルタレート-NHS)
DMA(4.5mL)およびDCM(1.5mL)中の化合物7(100.00mg、80.81μmol、1.00当量)の溶液にN下で1-ヒドロキシピロリジン-2,5-ジオン(27.90mg、242.42μmol、3.00当量)を加え、混合物を0℃で30分間撹拌した。EDCI(46.47mg、242.43μmol、3.00当量)を混合物に加え、混合物を25℃でさらに16時間撹拌した。LC-MSは、化合物7は完全に消費され、所望の質量を有する1つの主なピークが検出されたことを示した。反応混合物をフラッシュC18ゲルクロマトグラフィー(ISCO(登録商標);130gのSepaFlash(登録商標) C18 Flash Column、0~50%のMeCN/HOの溶出液、75mL/分)により精製した。化合物8(90.00mg、60.69μmol、75.11%の収率)を白色固体として得た。
標的化二環とMMAE-PABC-Cit-Val-グルタレート-NHSを連結するための一般的手順
DMA中の二環(1.0~1.3当量)の溶液にDIEA(3当量)およびMMAE-PABC-Cit-Val-グルタレート-NHS(1当量)を加えた。混合物を25℃で18時間撹拌した。反応をLC-MSによりモニターし、完了したら分取HPLCにより直接的に精製した。
BCY6136
BCY6099(71.5mg、22.48μmol)を二環試薬として使用した。化合物BCY6136(40.9mg、9.05μmol、40.27%の収率、97.42%の純度)を白色固体として得た。
BCY6033
BCY6014(70.00mg、22.47μmol、1.00当量)を二環試薬として使用した。化合物BCY6033(33.90mg、7.96μmol、34.57%の収率)を白色固体として得た。
BCY6029
BCY6009(70.0mg、22.47μmol、1当量)を二環試薬として使用した。化合物BCY6029(32.9mg、7.75μmol、33.49%の収率)を白色固体として得た。
BCY6122
BCY6104(71.59mg、22.48μmol、1.00当量)を二環試薬として使用した。化合物BCY6122(38.30mg、8.57μmol、38.14%の収率、98.58%の純度)を白色固体として得た。
BCY6053
BCY6018(72.40mg、26.97μmol、1.2当量)を二環試薬として使用した。化合物BCY6053(38.3mg、9.81μmol、43.65%の収率)を白色固体として得た。
BCY6049
BCY6017(50.75mg、22.48μmol、1.2当量)を二環試薬として使用した。化合物BCY6049(22.5mg、6.47μmol、34.54%の収率)を白色固体として得た。
BCY6037
BCY6019(65.00mg、22.47μmol、1.00当量)を二環試薬として使用した。化合物BCY6037(26.80mg、6.66μmol、28.74%の収率)を白色固体として得た。
Trp-Cit-MMAE系列
Trp-Cit-MMAEリンカー
3の調製のための一般的手順
DMF(30.00mL)中の化合物2(4.00g、8.67mmol、1.00当量)、DIC(1.61g、12.78mmol、1.97mL、9.00当量)およびHOBt(10.54g、78.00mmol、9.00当量)の溶液に(4-アミノフェニル)メタノール(9.61g、78.00mmol、9.00当量)を加えた。混合物を15℃で1時間撹拌した。LC-MSは、化合物2は完全に消費され、所望のMSを有する1つの主なピークが検出されたことを示した。混合物を分取HPLCにより精製した。化合物3(4.20g、7.41mmol、85.49%の収率)を白色固体として得た。
4の調製のための一般的手順
DMF(30.00mL)中の化合物3(4.20g、6.30mmol、1.00当量)、DIPEA(1.09g、8.40mmol、1.47mL、7.00当量)の溶液にビス(4-ニトロフェニル)炭酸塩(11.50g、37.79mmol、6.00当量)を一度に加えた。混合物を0~15℃で1.5時間撹拌した。LC-MSは、化合物3は完全に消費され、所望のMSを有する1つの主なピークが検出されたことを示した。分取HPLC(TFA条件)により直接的に精製した。化合物4(2.00g、2.40mmol、38.16%の収率)を白色固体として得た。
5の調製のための一般的手順
DMF(10.00mL)中の化合物4(300.00mg、360.63μmol、1.00当量)、DIEA(93.22mg、721.27μmol、125.97μL、3.00当量)の溶液にMMAE(233.03mg、324.57μmol、0.90当量)およびHOBt(48.73mg、360.63μmol、1.00当量)を0℃で加えた。混合物を30℃で18時間撹拌した。LC-MSは、化合物4は完全に消費され、所望のMSを有する1つの主なピークが検出されたことを示した。分取HPLC(中性条件)により直接的に精製した。化合物5(250.00mg、190.75μmol、52.89%の収率)を黄色固体として得た。
6の調製のための一般的手順
DCM(10.00mL)中の化合物5(240.00mg、183.12μmol、1.00当量)の溶液にTFA(1.54g、13.51mmol、1.00mL、73.76当量)を加えた。混合物を15℃で2時間撹拌した。混合物を減圧下で濃縮して溶媒を除去することにより残留物を得、残留物をTHF中に溶解し、KCOを加え、15℃で2時間撹拌した。LC-MSは、化合物5は完全に消費され、所望のMSを有する1つの主なピークが検出されたことを示した。反応混合物を減圧下で濃縮して溶媒を除去して残留物を得た。残留物を分取HPLC(中性条件)により精製した。粗生成物6(125.00mg、94.37μmol、51.53%の収率、TFA)をさらなる精製なしで次の工程において使用した。
7の調製のための一般的手順
DMA(5.00mL)中の化合物6(125.00mg、94.37μmol、1.00当量、TFA)の溶液にDIEA(24.39mg、188.75μmol、32.96μL、2.00当量)、テトラヒドロピラン-2,6-ジオン(21.54mg、188.75μmol、2.00当量)を加えた。混合物を15℃で2時間撹拌した。LC-MSは、化合物6は完全に消費され、所望のMSを有する1つの主なピークが検出されたことを示した。分取HPLC(中性条件)により直接的に精製した。化合物7(100.00mg、75.49μmol、80.00%の収率)を白色固体として得た。
8(MMAE-PABC-Cit-Trp-グルタレート-NHS)の調製のための一般的手順
DMA(3.00mL)およびDCM(1.00mL)中の化合物7(100.00mg、75.49μmol、1.00当量)、1-ヒドロキシピロリジン-2,5-ジオン(26.07mg、226.48μmol、3.00当量)の溶液にEDCI(43.42mg、226.48μmol、3.00当量)を加えた。混合物を15℃で4時間撹拌した。LC-MSは、化合物7は完全に消費され、所望のMSを有する1つの主なピークが検出されたことを示した。DCMを除去した。分取HPLC(中性条件)により直接的に精製した。化合物8(60.00mg、42.20μmol、55.91%の収率)を白色固体として得た。
標的化二環とMMAE-PABC-Cit-Trp-グルタレート-NHSを連結するための一般的手順
DMA中の二環(1.0~1.3当量)の溶液にDIEA(3当量)およびMMAE-PABC-Cit-Trp-グルタレート-NHS(1当量)を加えた。混合物を25℃で18時間撹拌した。反応をLC-MSによりモニターし、完了したら分取HPLCにより直接的に精製した。
BCY6030
BCY6009(47.29mg、14.07μmol、1.00当量)を二環試薬として使用した。化合物BCY6030(0.0156g、3.51μmol、24.93%の収率、97.41%の純度)を白色固体として得た。
BCY6034
BCY6014(88.21mg、23.21μmol、1.10当量)を二環試薬として使用した。化合物BCY6034(27.70mg、6.05μmol、28.70%の収率、95.02%の純度)を白色固体として得た。
BCY6050
BCY6017(57.17mg、25.32μmol、1.2当量)を二環試薬として使用した。化合物BCY6050(0.0519g、14.56μmol、69.01%の収率)を白色固体として得た。
BCY6054
BCY6018(67.97mg、25.32μmol、1.2当量)を二環試薬として使用した。化合物BCY6054(40.10mg、10.05μmol、47.62%の収率)を白色固体として得た。
BCY6038
BCY6019(81.39mg、23.21μmol、1.10当量)を二環試薬として使用した。化合物BCY6038(34.10mg、8.02μmol、38.00%の収率、96.68%の純度)を白色固体として得た。
Val-Lys-MMAE系列
Val-Lys-MMAEリンカー
化合物2の調製のための一般的手順
DCM(35mL)およびMeOH(18mL)中の化合物1(3.00g、5.89mmol、1当量)および(4-アミノフェニル)メタノール(869.93mg、7.06mmol、1.2当量)の混合物に窒素下において暗所でEEDQ(2.91g、11.77mmol、2当量)を加え、混合物を25℃で5時間撹拌した。LC-MSは、化合物1は完全に消費され、所望のMSを有する1つの主なピークが検出されたことを示した。結果として得られた反応混合物を減圧下で濃縮して残留物を得た。残留物をフラッシュシリカゲルクロマトグラフィー(ISCO(登録商標);120gのSepaFlash(登録商標) Silica Flash Column、0~20%のMeOH/DCMの溶出液、80mL/分)により精製した。化合物2(2.2g、3.58mmol、60.79%の収率)を白色固体として得た。
化合物3の調製のための一般的手順
THF(10mL)中の化合物2(500mg、813.31μmol、1当量)の溶液に0℃において窒素下でDIEA(630.69mg、4.88mmol、849.98μL、6当量)を加え、30分間攪拌した。次にビス(4-ニトロフェニル)炭酸塩(1.48g、4.88mmol、6当量)をそこに加え、混合物を窒素下25℃でさらに21時間撹拌した。LC-MSは、所望のMSを有する1つの主なピークが検出されたことを示した。結果として得られた反応混合物を減圧下で濃縮して残留物を得た。残留物をフラッシュシリカゲルクロマトグラフィー(ISCO(登録商標);40gのSepaFlash(登録商標) Silica Flash Column、0~20%のMeOH/DCMの溶出液、40mL/分)により精製した。化合物3(500mg、641.13μmol、78.83%の収率)を黄色固体として得た。
化合物4の調製のための一般的手順
DMF(8mL)中の化合物3(500mg、512.90μmol、1.23当量)の混合物に0℃でDIEA(135.01mg、1.04mmol、181.95μL、2.5当量)を加え、30分間撹拌した。次にMMAE(300mg、417.84μmol、1当量)およびHOBt(84.69mg、626.76μmol、1.5当量)をそこに加え、混合物を40℃で15時間撹拌した。LC-MSは、化合物3は完全に消費され、所望のMSを有する1つの主なピークが検出されたことを示した。残留物をフラッシュC18ゲルクロマトグラフィー(ISCO(登録商標);130gのSepaFlash(登録商標) C18 Flash Column、0~60%のMeCN/H2Oの溶出液、75mL/分)により精製した。化合物4(330mg、242.87μmol、58.13%の収率)を白色固体として得た。
化合物5の調製のための一般的手順
DCM(18mL)中の化合物4(325mg、239.19μmol、1当量)の溶液にTFA(3.03g、26.60mmol、1.97mL、111.22当量)を0℃で加え、混合物を25℃で2時間撹拌した。LC-MSは、化合物4は完全に消費されたことを示した。次に反応混合物を減圧下で濃縮して残留物を得、残留物をTHF(10mL)中に溶解し、KCO(661.16mg、4.78mmol、20当量)をそこに加えた。混合物を25℃で15時間撹拌した。LC-MSは、所望のMSを有する1つの主なピークが検出されたことを示した。結果として得られた反応混合物を濾過し、濾液を減圧下で濃縮して残留物(resiude)を得た。残留物をフラッシュC18ゲルクロマトグラフィー(ISCO(登録商標);130gのSepaFlash(登録商標) C18 Flash Column、0~60%のMeCN/H2Oの溶出液、75mL/分)により精製した。化合物5(170mg、135.07μmol、56.47%の収率)を白色固体として得た。
化合物6の調製のための一般的手順
DMA(5mL)中の化合物5(140mg、111.23μmol、1当量)の溶液を含有するラウンドボトルを窒素バルーンを使用してパージし、0℃でDIEA(28.75mg、222.46μmol、38.75μL、2当量)を加えて10分間撹拌し、テトラヒドロピラン-2,6-ジオン(25.38mg、222.46μmol、2当量)をDMA中の溶液として加えた(addded)。混合物を25℃で12時間撹拌した。LC-MSは、化合物5は完全に消費され、所望のMSを有する1つの主なピークが検出されたことを示した。結果として得られた反応混合物をフラッシュC18ゲルクロマトグラフィー(ISCO(登録商標);43gのSepaFlash(登録商標) C18 Flash Column、0~60%のMeCN/H2Oの溶出液、40mL/分)により精製した。化合物6(120mg、87.42μmol、78.59%の収率)を白色固体として得た。
化合物7(MMAE-PABC-Lys(Dde)-Val-グルタレート-NHS)の調製のための一般的手順
DMA(9mL)およびDCM(3mL)中の化合物6(120mg、87.42μmol、1当量)の溶液に1-ヒドロキシピロリジン-2,5-ジオン(30.18mg、262.25μmol、3当量)を加えて撹拌し、EDCI(50.27mg、262.25μmol、3当量)をそこに加え、混合物を0℃で30分間、および25℃でさらに19時間撹拌した。LC-MSは、化合物6は完全に消費され、所望のMSを有する1つの主なピークが検出されたことを示した。結果として得られた反応混合物を減圧下で濃縮してDCMを除去した。混合物をフラッシュC18ゲルクロマトグラフィー(ISCO(登録商標);43gのSepaFlash(登録商標) C18 Flash Column、0~60%のMeCN/H2Oの溶出液、40mL/分)により精製した。化合物7(60mg、40.82μmol、46.70%の収率)を白色固体として得た。
標的化二環とMMAE-PABC-Lys(Dde)-Val-グルタレート-NHSを連結するための一般的手順
DMA中の二環(1.0~1.3当量)の溶液にDIEA(3当量)およびMMAE-PABC-Lys(Dde)-Val-グルタレート-NHS(1当量)を加えた。混合物を25℃で18時間撹拌した。反応をLC-MSによりモニターし、完了したら分取HPLCにより直接的に精製した。
Ddeの脱保護のための一般的手順
DMF中のDde保護ペプチド(1当量)の溶液にヒドラジン水和物(6500当量)を加え、混合物を25℃で1時間撹拌した。LC-MSを使用して反応をモニターし、完了したら、混合物を分取HPLCにより精製し、清浄な画分を凍結乾燥した。
BCY6061
BCY6014(124.12mg、40.82μmol、1.2当量)を二環試薬として使用した。Dde-BCY6038(80mg、18.20μmol、53.51%の収率)を白色固体として得た。
一般的手順にしたがってヒドラジンを使用してDde-BCY6061(78mg、17.75μmol)を脱保護してBCY6061(47.1mg、11.13μmol、62.73%の収率)を白色固体として得た。
BCY6174
BCY6099(389.77mg、122.47μmol、1.2当量)を二環試薬として使用した。Dde-BCY6174(0.250g、55.10μmol、53.99%の収率)を白色固体として得た。
一般的手順にしたがってヒドラジンを使用してDde-BCY6174(0.250g、55.10μmol、1.0当量)を脱保護してBCY6174(0.1206g、27.45μmol、49.82%の収率)を白色固体として得た。
D-Trp-Cit-MMAE系列
D-Trp-Cit-MMAEリンカー
化合物3の調製のための一般的手順
DMF(30.00mL)中の化合物1(2g、4.33mmol、1.00当量)、DIC(4.92g、39.00mmol、6.00mL、9.00当量)、HOBt(5.27g、39.00mmol、9.00当量)の溶液に(4-アミノフェニル)メタノール(4.80g、39.00mmol、9.00当量)を加えた。混合物を15℃で1時間撹拌した。LC-MSは、化合物1は完全に消費され、所望のMSを有する1つの主なピークが検出されたことを示した。分取HPLC(中性条件)により直接的に精製した。化合物2(2g、3.53mmol、81.45%の収率)を白色固体として得た。
化合物4の調製のための一般的手順
DMF(20mL)中の化合物2(2g、3.00mmol、1当量)、DIEA(2.71g、21.00mmol、3.66mL、7当量)の溶液にビス(4-ニトロフェニル)炭酸塩(5.48g、18.00mmol、6当量)を一度に0℃で加えた。混合物を0~15℃で2時間撹拌した。LC-MSは、化合物2は完全に消費され、所望のMSを有する1つの主なピークが検出されたことを示した。分取HPLC(中性条件)により直接的に精製した。化合物3(0.9g、1.08mmol、36.07%の収率)を黄色固体として得た。
化合物5の調製のための一般的手順
DMF(10mL)中の化合物3(350mg、420.74μmol、1.00当量)、HOBt(56.85mg、420.74μmol、1当量)およびDIEA(163.13mg、1.26mmol、219.86μL、3当量)の溶液にMMAE(302.08mg、420.74μmol、1当量)を0℃で加えた。混合物を40℃で18時間撹拌した。LC-MSは、化合物4は完全に消費され、所望のMSを有する1つの主なピークが検出されたことを示した。分取HPLC(中性条件)により直接的に精製した。化合物4(0.22g、155.95μmol、37.06%の収率)を黄色固体として得た。
化合物6の調製のための一般的手順
DCM(9mL)中の化合物4(0.21g、148.86μmol、1当量)の溶液にTFA(1.54g、13.51mmol、1mL、90.73当量)を加えた。混合物を15℃で4h撹拌し、減圧下で濃縮して残留物を得、THF中に溶解した(dissloved)後、KCOを加え(addded)、15℃で16時間撹拌した。LC-MSは、化合物4は完全に消費され、所望のMSを有する1つの主なピークが検出されたことを示した。反応混合物を濾過し、減圧下で濃縮して残留物を得た。残留物を分取HPLC(中性条件)により精製した。化合物5(0.13g、102.02μmol、68.54%の収率、95%の純度)を白色固体として得た。
化合物7の調製のための一般的手順
DMA(5mL)中の化合物5(0.12g、99.13μmol、1当量)の溶液にDIEA(38.44mg、297.40μmol、51.80μL、3当量)およびテトラヒドロピラン-2,6-ジオン(22.62mg、198.26μmol、2当量)を加えた。混合物を15℃で16時間撹拌した。LC-MSは、化合物5は完全に消費され、所望のMSを有する1つの主なピークが検出されたことを示した。分取HPLC(中性条件)により直接的に精製した。化合物6(0.09g、67.94μmol、68.54%の収率)を白色固体として得た。
化合物8の調製のための一般的手順
DMA(6mL)およびDCM(2mL)中の化合物6(0.09g、67.95μmol、1当量)、HOSu(23.46mg、203.84μmol、3当量)の溶液にEDCI(39.08mg、203.84μmol、3当量)を加えた。混合物を15℃で16h撹拌した。LC-MSは、化合物6は完全に消費され、所望のMSを有する1つの主なピークが検出されたことを示した。DCMを除去し、分取HPLC(中性条件)により直接的に精製した。化合物7(0.06g、40.09μmol、59.01%の収率、95%の純度)を白色固体として得た。
BCY6062
DMA(5mL)中のBCY6014(76.99mg、25.32μmol、1.2当量)の溶液にDIEA(8.18mg、63.31μmol、11.03μL、3当量)、化合物7(0.03g、21.10μmol、1当量)を加えた。混合物を15℃で16時間撹拌した。反応をLC-MSによりモニターし、完了したら、混合物を分取HPLCにより精製した。BCY6062(0.0255g、5.70μmol、27.01%の収率、97.15%の純度)を白色固体として得た。
DM1系列
DM1-SS系列
DM1-SPDP-TFPリンカー
SPDB
EtOH(100.00mL)中の2-(2-ピリジルジスルファニル)ピリジン(12.37g、56.18mmol、1.50当量)の溶液に4-スルファニルブタン酸(4.50g、37.45mmol、1.00当量)を加えた。混合物を15℃でN下で18時間撹拌した。LC-MSは、化合物1は完全に消費され、所望の質量を有する1つの主なピークが検出されたことを示した。反応混合物を減圧下で濃縮して溶媒を除去して残留物を得た。残留物を分取HPLC(C18 360g、中性条件)により精製した。化合物SPDB(1.9g、8.29mmol、22.12%の収率)を黄色固体として得た。
1H NMR: ES6446-8-P1A 400 MHz CDCl3
δ ppm 1.98 (q, J=7.09 Hz, 2 H), 2.45 (t, J=7.15 Hz, 2 H), 2.79 (t, J=7.03 Hz, 2 H), 7.03 (dd, J=7.15, 4.89 Hz, 1 H), 7.19 (s, 1 H), 7.56 - 7.65 (m, 2 H), 8.41 (d, J=4.52 Hz, 1 H).
DM1-SPDB
DM1(250.00mg、338.62μmol、1.00当量)および4-(2-ピリジルジスルファニル)ブタン酸(100.95mg、440.21μmol、1.30当量)の混合物を窒素下でNを用いて30分間パージしたDMF(10.00mL)を含む50mLのフラスコ中に加えた。混合物を室温で1時間撹拌した。LC-MSは、DM1は完全に消費され、所望の質量を有する1つの主なピークが検出されたことを示した。残留物をフラッシュC18ゲルクロマトグラフィー(ISCO(登録商標);120gのSepaFlash(登録商標) C18 Flash Column、0~60%のMeCN/HOの溶出液、85mL/分)により精製した。DM1-SPDB(120.00mg、140.11μmol、41.38%の収率)を白色固体として得た。
DM1-SPDB-TFP
DCM(1.00mL)およびDMA(3.00mL)中のDM1-SPDB(120.00mg、140.11μmol、1.00当量)および2,3,5,6-テトラフルオロフェノール(69.81mg、420.34μmol、3.00当量)の溶液にEDCI(80.58mg、420.34μmol、3.00当量)を加えた。混合物を15℃で4時間撹拌した。LC-MSは、DM1-SPDBは完全に消費され、所望の質量を有する1つの主なピークが検出されたことを示した。DCMを除去し、残留混合物を分取HPLC(中性条件)により直接的に精製した。化合物DM1-SPDB-TFP(60.00mg、59.73μmol、42.63%の収率)を白色固体として得た。
標的化二環とDM1-SPDB-TFPを連結するための一般的手順
DMA中の標的化二環(1.1~1.3当量)の溶液にDIEA(3当量)およびDM1-SPDB-TFP(1当量)を加えた。混合物を25℃で18時間撹拌した。反応をLC-MSによりモニターし、完了したら、混合物を分取HPLCにより直接的に精製した。
BCY6135
BCY6099(114.1mg、35.84μmol)を二環試薬として使用した。22.4mgの化合物BCY6135(5.30μmol、17.74%の収率、95.14%の純度)を白色固体として得た。
BCY6031
BCY6014(121.07mg、39.82μmol)を二環試薬として使用した。59.90mgの化合物BCY6031(14.67μmol、36.85%の収率、95.02%の純度)を白色固体として得た。
BCY6134
BCY6104(95.11mg、29.87μmol、1当量)を二環試薬として使用した。BCY6134(0.0232g、5.64μmol、18.89%の収率、97.82%の純度)を白色固体として得た。
BCY6027
BCY6009(60.24mg、19.91μmol、1.00当量)を二環試薬として使用した。BCY6027(20.40mg、5.11μmol、25.69%の収率、96.88%の純度)を白色固体として得た。
BCY6047
BCY6017(61.81mg、27.38μmol、1.1当量)を二環試薬として使用した。BCY6047(0.032g、10.34μmol、41.53%の収率)を白色固体として得た。
BCY6035
BCY6019(115.22mg、32.86μmol、1.10当量)を二環試薬として使用した。BCY6035(37.80mg、10.37μmol、34.73%の収率)を白色固体として得た。
BCY6051
BCY6018(73.48mg、27.38μmol、1.1当量)を二環試薬として使用した。BCY6051(0.0582g、16.52μmol、66.39%の収率)を白色固体として得た。
BCY6154
BCY6152(93.17mg、29.87μmol、1当量)を二環試薬として使用した。BCY6154(40.10mg、9.93μmol、33.27%の収率、98.06%の純度)を白色固体として得た。
BCY6155
BCY6153(82.55mg、29.87μmol、1当量)を二環試薬として使用した。BCY6155(0.0312g、8.55μmol、28.62%の収率、98.69%の純度)を白色固体として得た。
DM1-SS(SO3H)系列
DM1-SPDP(SO3H)-NHSリンカー
化合物2
EtOH(50mL)中の4-スルファニルブタン酸(2.0g、16.64mmol、1当量)および2-(2-ピリジルジスルファニル)ピリジン(11.0g、49.93mmol、3当量)の溶液にAcOH(1.05g、17.48mmol、1mL、1.05当量)を加えた。混合物を40℃でN下で16時間撹拌した。LC-MSは、所望の質量を有する1つの主なピークが検出されたことを示し、TLCは、4-スルファニルブタン酸は完全に消費されたことを指し示した。反応混合物を減圧下で濃縮して溶媒を除去して残留物を得た。残留物を分取HPLC(中性条件)により精製した。化合物2(2.0g、8.72mmol、52.4%の収率)を黄色固体として得た。
1H NMR: 400 MHz CDCl3
δ ppm 2.03-2.11 (m, 2 H), 2.54 (t, J=7.20 Hz, 2 H), 2.88 (t, J=7.20 Hz, 2 H), 7.11-7.14 (m, 1 H), 7.67-7.74 (m, 2 H), 8.50 (d, J=4.80 Hz, 1 H).
化合物3
DCE(5mL)中の化合物2(0.5g、2.18mmol、1当量)の溶液に3度に分けてクロロスルホン酸(1.5g、13.08mmol、0.89mL、6当量)および2度に分けてDIEA(1.13g、8.72mmol、1.52mL、4当量)を加えた。混合物を75℃で2時間撹拌した。LC-MSは、化合物2は完全に消費され、所望の質量を有する1つの主なピークが検出されたことを示した。反応混合物を3mLのHOの添加によりクエンチし、DCEを除去した。残留混合物を分取HPLC(中性条件)により直接的に精製した。化合物3(0.68g、1.76mmol、80.6%の収率、80%の純度)を淡黄色油として得た。
1H NMR: 400 MHz CDCl3
δ ppm 2.49-2.54 (m, 2 H), 3.63-3.67 (m, 2 H), 3.90 (t, J=6.60 Hz, 2 H), 7.09-7.12 (m, 1 H), 7.66-7.76 (m, 2 H), 8.47 (dd, J=4.80 Hz, 0.80 Hz, 1 H), 8.56 (s, 1 H).
DM1-SOH-SPDB
DMF(10mL)中のDM1(1.0g、1.35mmol、1当量)および化合物3(502.9mg、1.63mmol、1.2当量)の溶液にpHが8に達するまでNaHCO(水性)を加えた。混合物を25℃で1時間撹拌した。LC-MSは、DM1は完全に消費され、所望の質量を有する1つの主なピークが検出されたことを示した。残基混合物を分取HPLC(中性条件)により直接的に精製した。化合物DM1-SOH-SPDB(0.28g、299.0μmol、22.1%の収率)を白色固体として得た。
DM1-SOH-SPDB-NHS
DMA(6mL)およびDCM(2mL)中のDM1-SOH-SPDB(103.2mg、896.95μmol、3当量)、1-ヒドロキシピロリジン-2,5-ジオン(103.2mg、896.95μmol、3当量)の溶液にEDCI(171.9mg、896.95μmol、3当量)を加えた。混合物を25℃で16時間撹拌した。LC-MSは、DM1-SO3H-SPDBは完全に消費され、所望の質量を有する1つの主なピークが検出されたことを示した。DCMを除去した。残留混合物を分取HPLC(中性条件)により直接的に精製した。化合物DM1-SOH-SPDB-NHS(0.22g、212.85μmol、71.2%の収率)を白色固体として得た。
標的化二環とDM1-SO3H-SPDB-NHSを連結するための一般的手順
DMA中の標的化二環(1.1~1.3当量)の溶液にDIEA(3当量)およびDM1-SO3H-SPDB-NHS(1当量)を加えた。混合物を25℃で16時間撹拌した。反応をLC-MSによりモニターし、完了したら、混合物を分取HPLCにより直接的に精製した。
BCY6173
BCY6099(200.15mg、62.89μmol)を二環試薬として使用した。57.1mgの化合物BCY6173(3.40μmol、22.79%の収率、95.80%の純度)を白色固体として得た。
BCY6082
BCY6014(711.9mg、234.14μmol)を二環試薬として使用した。308mgの化合物BCY6082(74.97μmol、35.2%の収率、96.36%の純度)を白色固体として得た。
BCY6150
BCY6018(77.91mg、29.03μmol、1当量)を二環試薬として使用した。BCY6150(0.0249g、6.61μmol、22.78%の収率)を白色固体として得た。
BCY6151
BCY6104(120.17mg、37.73μmol、1.3当量)を二環試薬として使用した。BCY6151(0.0256g、6.16μmol、21.22%の収率)を白色固体として得た。
BCY6162
BCY6138(82.80mg、26.61μmol、1.1当量)を二環試薬として使用した。BCY6162(0.0362g、8.98μmol、37.13%の収率)を白色固体として得た。
BCY6161
BCY6137(79.67mg、24.48μmol、1.1当量)を二環試薬として使用した。BCY6161(0.0232g、5.26μmol、21.76%の収率)を白色固体として得た。
DM1-SS-Me系列
DM1-SS-Meリンカー
SPP
EtOH(50.00mL)中の2-(2-ピリジルジスルファニル)ピリジン(2.46g、11.18mmol、1.50当量)およびAcOH(1.05g、17.49mmol、1.00mL、2.35当量)の溶液に4-スルファニルペンタン酸(1.00g、7.45mmol、1.00当量)を加えた。混合物を40℃でN下で18時間撹拌した。LC-MSは、化合物1は完全に消費され、所望の質量を有する1つの主なピークが検出されたことを示した。反応混合物を減圧下で濃縮して溶媒を除去して残留物を得た。残留物を分取HPLC(中性条件)により精製した。化合物SPP(1.61g、6.62mmol、88.81%の収率)を黄色固体として得た。
1H NMR: 400 MHz DMSO-d6
δ ppm 1.36 (d, J=6.78 Hz, 3 H), 1.88 - 2.07 (m, 2 H), 2.56 (td, J=7.53, 1.76 Hz, 2 H), 3.00 - 3.09 (m, 1 H), 7.11 (ddd, J=7.34, 4.96, 1.00 Hz, 1 H), 7.66 (td, J=7.78, 1.76 Hz, 1 H), 7.73 - 7.77 (m, 1 H), 8.48 (dt, J=4.02, 0.88 Hz, 1 H).
DM1-SPP
O(5.00mL)中のDM1(200mg、270.90μmol、1.00当量)、4-(2-ピリジルジスルファニル)ペンタン酸(98.89mg、406.35μmol、1.50当量)の溶液をNaHCO(水性)を使用してPH=8に調整した。混合物を15℃で1時間撹拌した。LC-MSは、DM1は完全に消費され、所望の質量を有する1つの主なピークが検出されたことを示した(主なMSはM+1~18)。混合物を分取HPLC(中性条件)により直接的に精製した。化合物DM1-SPP(120mg、137.86μmol、50.89%の収率)を白色固体として得た。
DM1-SPP-TFP
DCM(1.0mL)およびDMA(3.0mL)中のDM1-SPP(0.175g、201.04μmol、1.0当量)、2,3,5,6-テトラフルオロフェノール(100.16mg、603.13μmol、3.0当量)の溶液にEDCI(115.62mg、603.13μmol、3.0当量)を加えた。混合物を15℃で12時間撹拌した。LC-MSは、DM1-SPPは完全に消費され、所望のMSを有する1つの主なピークが検出されたことを示した。DCMを除去し、残留物を分取HPLC(中性条件)により精製した。化合物DM1-SPP-TFP(0.123g、120.76μmol、60.07%の収率)を白色固体として得た。
標的化二環とDM1-SPP-TFPを連結するための一般的手順
DMA中の標的化二環(1.1~1.3当量)の溶液にDIEA(3当量)およびDM1-SPP-TFP(1当量)を加えた。混合物を25℃で16時間撹拌した。反応をLC-MSによりモニターし、完了したら、混合物を分取HPLCにより直接的に精製した。
BCY6032
DMF(5.00mL)中のDM1-SPP(30.00mg、34.46μmol、1.00当量)の溶液にDIEA(13.36mg、103.38μmol、18.05μL、3.00当量)およびHATU(13.10mg、34.46μmol、1.00当量)を加えた。1時間後、BCY6014(104.79mg、34.46μmol、1.00当量)を加え、混合物を15℃で2時間撹拌した。LC-MSは、40%のDM1-SPPが残留していたことを示した。いくつかの新たなピークがLC-MSにおいて観察され、20%の所望の化合物が検出された。混合物を分取HPLC(TFA条件)により直接的に精製した。化合物BCY6032(10.00mg、2.57μmol、7.45%の収率)を白色固体として得た。
BCY6052
BCY6018(86.96mg、32.40μmol、1.1当量)を二環試薬として使用した。BCY6052(32.30mg、9.13μmol、31.01%の収率)を白色固体として得た。
BCY6048
BCY6017(66.50mg、29.45μmol、1.2当量)を二環試薬として使用した。BCY6048(40.80mg、13.12μmol、53.45%の収率)を白色固体として得た。
BCY6036
BCY6019(113.60mg、32.40μmol、1.10当量)を二環試薬として使用した。BCY6036(53.20mg、14.00μmol、47.54%の収率、96.26%の純度)を白色固体として得た。
BCY6028
BCY6009(99.00mg、29.45μmol、1.00当量)を二環試薬として使用した。BCY6028(24.30mg、6.05μmol、20.56%の収率、96.61%の純度)を白色固体として得た。
ジスルフィドリンカー(様々な障害)
BCY6039(DM1-Me-SS-Me-二環)
化合物2A
EtOH(50.00mL)中の2-(2-ピリジルジスルファニル)ピリジン(2.46g、11.18mmol、1.50当量)およびAcOH(1.05g、17.49mmol、1.00mL、2.35当量)の溶液に4-スルファニルペンタン酸(1A)(1.00g、7.45mmol、1.00当量)を加えた。混合物を40℃でN下で18時間撹拌した。LC-MSは、1Aは完全に消費され、所望の質量を有する1つの主なピークが検出されたことを示した。反応混合物を減圧下で濃縮して残留物を得、これを分取HPLC(中性条件)により精製した。化合物2A(1.61g、6.62mmol、88.81%の収率)を淡黄色固体として得た。
化合物3A
DMA(1mL)中の2A(0.01g、41.09μmol、1.00当量)、1-ヒドロキシピロリジン-2,5-ジオン(14.19mg、123.28μmol、3.00当量)の溶液にEDCI(23.63mg、123.28μmol、3.00当量)を加えた。混合物を15℃で16時間撹拌した。LC-MSは、2Aは完全に消費され、所望の質量を有する1つの主なピークが検出されたことを示した。残留物を分取HPLC(中性条件)により精製した。化合物3A(0.011g、32.31μmol、78.63%の収率)を白色固体として得た。
化合物4A
DMA(3mL)中のBCY6014(98.25mg、32.31μmol、1.00当量)の溶液にDIEA(8.26mg、64.62μmol、11.26μL、2.00当量)および3A(0.011g、32.31μmol、1.00当量)を加えた。混合物を15℃で18時間撹拌した。LC-MSは、3Aは完全に消費され、所望の質量を有する1つの主なピークが検出されたことを示した。混合物を分取HPLC(中性条件)により直接的に精製した。化合物4A(0.04g、12.25μmol、37.90%の収率)を白色固体として得た。
化合物5A
MeCN(4mL)およびHO(2mL)中の4A(0.04g、12.25μmol、1.00当量)の溶液にTCEP(4.21mg、14.70μmol、4.05μL、1.20当量)を加えた。混合物を15℃で1時間撹拌した。LC-MSは、4Aは完全に消費され、所望の質量を有する1つの主なピークが検出されたことを示した。残留物を分取HPLC(中性条件)により精製した。化合物5A(0.035g、11.09μmol、90.53%の収率)を白色固体として得た。
DM3-SPy
DMF(5mL)中の4-(2-ピリジルジスルファニル)ペンタン酸(2A)(22.46mg、92.29μmol、1.20当量)、HATU(35.09mg、92.29μmol、1.20当量)、DIEA(29.82mg、230.71μmol、40.19μL、3.00当量)の溶液に1B(0.05g、76.90μmol、1.00当量)を加えた。混合物を15℃で1時間撹拌した。LC-MSは、1Bは完全に消費され、所望の質量を有する1つの主なピークが検出されたことを示した。残留物を分取HPLC(中性条件)により精製した。化合物DM3-SPy(0.025g、28.56μmol、37.13%の収率)を白色固体として得た。
BCY6039
DMF(3mL)中のDM3-SPy(0.015g、17.13μmol、1.00当量)および5A(54.08mg、17.13μmol、1.00当量)の溶液をNaHCO(水性)を使用してpH=8に調整した。混合物を15℃で1時間撹拌した。LC-MSは、DM3-SPyは完全に消費され、所望の質量を有する1つの主なピークが検出されたことを示した。混合物を分取HPLC(TFA条件)により直接的に精製した。化合物BCY6039(0.0263g、6.58μmol、38.39%の収率)を白色固体として得た。
BCY6055(DM1-SS-Me-二環)
化合物2
O(1mL)中の化合物1(0.045g、126.96μmol、1当量)の溶液を1NのNaOH溶液を使用してpH=13に調整した。混合物を15℃で16時間撹拌した。LC-MSは、化合物1は完全に消費され、所望の質量を有する1つの主なピークが検出されたことを示した。残留物を分取HPLC(中性条件)により精製した。化合物2(0.03g、116.56μmol、91.81%の収率)を黄色固体として得た。
化合物3
DMF(5mL)中の化合物2(0.03、116.56μmol、1.0当量)およびDM1(111.87mg、151.53μmol、1.3当量)の溶液を15℃で2時間撹拌した。LC-MSは、DM1は完全に消費され、所望の質量を有する1つの主なピークが検出されたことを示した。混合物を分取HPLC(NHHCO条件)により直接的に精製した。化合物3(0.05g、56.53μmol、48.50%の収率)を白色固体として得た。
化合物4
DMA(3mL)およびDCM(1mL)中の化合物3(0.05g、56.53μmol、1.0当量)および2,3,5,6-テトラフルオロフェノール(28.16mg、169.59μmol、3.0当量)の溶液にEDCI(32.51mg、169.59μmol、3当量)を加えた。混合物を15℃で16時間撹拌した。LC-MSは、化合物3は完全に消費され、所望の質量を有する1つの主なピークが検出されたことを示した。DCMを除去し、混合物を分取HPLC(中性条件)により直接的に精製した。化合物4(0.03g、29.05μmol、51.40%の収率)を白色固体として得た。
BCY6055
DMA(3mL)中のBCY6014(106.01mg、34.87μmol、1.2当量)の溶液にDIEA(11.27mg、87.16μmol、15.18μL、3.0当量)および化合物4(0.03g、29.05μmol、1.0当量)を加えた。混合物を15℃で16時間撹拌した。LC-MSは、化合物4は完全に消費され、所望の質量を有する1つの主なピークが検出されたことを示した。混合物を分取HPLC(TFA条件)により直接的に精製した。化合物BCY6055(0.0352g、9.01μmol、31.01%の収率)を白色固体として得た。
BCY6077(DM1-SS-Me-(SO3H)-二環)
化合物2の調製のための一般的手順
1,2-ジクロロエタン(3mL)中の化合物1(0.1g、410.94μmol、1当量)の溶液に3度に分けてクロロスルホン酸(0.86g、7.38mmol、491.43μL、17.96当量)を加え、2度に分けてDIEA(318.67mg、2.47mmol、429.47μL、6当量)を加えた。混合物を75℃で16時間撹拌した。LC-MSは、化合物1は完全に消費され、所望のMSを有する1つの主なピークはMS324と検出され、副生成物MS221の1つの主なピークはPySSPyであったことを示した。溶媒を除去し、H2O/MeCN=15/1中に溶解した。分取HPLC(中性条件:MeCN/HO)により直接的に精製した。化合物2(0.055g、170.06μmol、41.38%の収率)を黄色油として得た。
DM1-SO3H-SPPの調製のための一般的手順
DMF(2mL)中のDM1(113.00mg、153.06μmol、1.1当量)、化合物2(0.045g、139.14μmol、1当量)の溶液をNaHCO(水性)のために使用されるPH=8に調整した。混合物を15℃で1時間撹拌した。LC-MSは、DM1は完全に消費され、所望のMSを有する1つの主なピークが検出されたことを示した。分取HPLC(中性条件)により直接的に精製した。化合物DM1-SO3H-SPP(0.075g、78.90μmol、56.71%の収率)を白色固体として得た。
DM1-SO3H-SPP-NHSの調製のための一般的手順
DMA(1.5mL)およびDCM(0.5mL)中のDM1-SO3H-SPP(0.06g、63.12μmol、1当量)、1-ヒドロキシピロリジン-2,5-ジオン(7.99mg、69.43μmol、1.1当量)の溶液にEDCI(13.31mg、69.43μmol、1.1当量)を加えた。混合物を15℃で18時間撹拌した。LC-MSは、DM1-SO3H-SPPは完全に消費され、所望のMSを有する1つの主なピークが検出されたことを示した。分取HPLC(中性条件:MeCN/HO)により直接的に精製した。化合物DM1-SO3H-SPP-NHS(0.045g、42.96μmol、68.05%の収率)を白色固体として得た。
BCY6077の調製のための一般的手順
DMA(1mL)中のBCY6014(101.58mg、33.41μmol、1当量)の溶液にDIEA(12.95mg、100.23μmol、17.46μL、3当量)およびDM1-SO3H-SPP-TFP(0.035g、33.41μmol、1当量)を加えた。混合物を15℃で16時間撹拌した。LC-MSは、DM1-SO3H-SPP-TFPは完全に消費され、所望のMSを有する1つの主なピークが検出されたことを示した。分取HPLC(TFA条件)により直接的に精製した。化合物BCY6077(41.30mg、10.03μmol、30.01%の収率、96.44%の純度)を白色固体として得た。
切断可能でない系列
BCY6063(MMAE)
グルタレート-MMAE
DMA(3mL)中のMMAE(0.2g、278.56μmol、1.0当量)の溶液にDIEA(108.01mg、835.68μmol、145.56μL、3.0当量)およびテトラヒドロピラン-2,6-ジオン(63.57mg、557.12μmol、2.0当量)を加えた。混合物を15℃で16時間撹拌した。LC-MSは、MMAEは完全に消費され、所望の質量を有する1つの主なピークが検出されたことを示した。混合物を混合物を分取HPLC(中性条件)により直接的に精製した。化合物グルタレート-MMAE(0.12g、144.22μmol、51.77%の収率)を白色固体として得た。
グルタレート-MMAE-NHS
DMA(3mL)およびDCM(1mL)中のグルタレート-MMAE(0.12g、144.22μmol、1.0当量)、1-ヒドロキシピロリジン-2,5-ジオン(49.79mg、432.65μmol、3.0当量)の溶液にEDCI(82.94mg、432.65μmol、3.0当量)を加えた。混合物を15℃で16時間撹拌した。LC-MSは、グルタレート-MMAEは完全に消費され、所望の質量を有する1つの主なピークが検出されたことを示した。混合物を混合物を分取HPLC(TFA条件)により直接的に精製した。化合物グルタレート-MMAE-NHS(0.055g、59.19μmol、41.04%の収率)を白色固体として得た。
BCY6063
DMA(2mL)中のBCY6014(98.17mg、32.29μmol、1.2当量)の溶液にDIEA(10.43mg、80.72μmol、14.06μL、3当量)およびグルタレート-MMAE-NHS(0.025g、26.91μmol、1当量)を加えた。混合物を15℃で16時間撹拌した。LC-MSは、グルタレート-MMAE-NHSは完全に消費され、所望の質量を有する1つの主なピークが検出されたことを示した。混合物を分取HPLC(TFA条件)により直接的に精製した。化合物BCY6063(32.10mg、8.33μmol、30.95%の収率)を白色固体として得た。
BCY6064(DM1)
化合物1
DMF(5mL)中のDM1(0.1g、135.45μmol、1当量)、3-[(2-ブロモアセチル)アミノ]プロパン酸(34.14mg、162.54μmol、1.2当量)の溶液にTEA(41.12mg、406.35μmol、56.56μL、3当量)を加えた。混合物を15℃で1時間撹拌した。LC-MSは、DM1は完全に消費され、所望の質量を有する1つの主なピークが検出されたことを示した。混合物を分取HPLC(中性条件)により直接的に精製した。化合物1(0.08g、92.23μmol、68.09%の収率)を白色固体として得た。
化合物2
DMA(3mL)およびDCM(1mL)中の化合物1(0.08g、92.23μmol、1当量)、2,3,5,6-テトラフルオロフェノール(45.95mg、276.69μmol、3当量)の溶液にEDCI(53.04mg、276.69μmol、3当量)を加えた。混合物を15℃で4時間撹拌した。LC-MSは、化合物1は完全に消費され、所望の質量を有する1つの主なピークが検出されたことを示した。混合物を分取HPLC(中性条件)により直接的に精製した。化合物2(0.06g、59.09μmol、64.06%の収率)を白色固体として得た。
BCY6064
DMA(3mL)中のBCY6014(107.79mg、35.45μmol、1.2当量)の溶液にDIEA(11.45mg、88.63μmol、15.44μL、3.0当量)および化合物2(0.030g、29.54μmol、1当量)を加えた。混合物を15℃で16時間撹拌した。LC-MSは、化合物2は完全に消費され、所望の質量を有する1つの主なピークが検出されたことを示した。混合物を分取HPLC(TFA条件)により直接的に精製した。化合物BCY6064(28.40mg、7.30μmol、24.71%の収率)を白色固体として得た。
BCY6105
化合物2の調製のための一般的手順
DCM(20mL)およびMeOH(10mL)中の化合物1(3.5g、5.68mmol、1.0当量)の溶液に(4-アミノフェニル)メタノール(978.5mg、7.95mmol、1.4当量)およびEEDQ(2.81g、11.35mmol、2.0当量)を暗所で加え、混合物を25℃で18時間撹拌した。LC-MSは、化合物1は完全に消費され、所望のMSを有する1つの主なピークが検出されたことを示した([M+H]=722.0)。結果として得られた反応混合物を減圧下で濃縮して残留物を得た。残留物をフラッシュシリカゲルクロマトグラフィー(ISCO(登録商標);220gのSepaFlash(登録商標) Silica Flash Column、0~10%のメタノール/ジクロロメタンの溶出液、80mL/分)により精製した。化合物2(3.0g、4.16mmol、73.2%の収率)を黄色固体として得た。
化合物3の調製のための一般的手順
THF(30mL)中の化合物2(2.5g、3.46mmol、1.0当量)の溶液にDIEA(2.69g、20.78mmol、3.62mL、6.0当量)およびビス(4-ニトロフェニル)炭酸塩(6.32g、20.78mmol、6.0当量)を加え、混合物を25℃で16時間撹拌した。TLCは、化合物2は完全に消費され、1つの新たなスポットが形成されたことを指し示した。反応液はTLCによれば清浄であった。反応混合物を減圧下で濃縮して残留物を得た。残留物をフラッシュシリカゲルクロマトグラフィー(ISCO(登録商標);220gのSepaFlash(登録商標) Silica Flash Column、0~5%のメタノール/ジクロロメタンの溶出液、100mL/分)により精製した。化合物3(2.2g、2.48mmol、71.6%の収率)を黄色固体として得た。
化合物4の調製のための一般的手順
DMF(5mL)中の化合物3(0.3g、338.24umol、1.0当量)の溶液に、HOBt(50.3mg、372.06umol、1.1当量)、DIEA(131.1mg、1.01mmol、176.7μL、3.0当量)、およびMMAE(218.6mg、304.42umol、0.9当量)を加えた。混合物を40℃で16時間撹拌した。LC-MSは、所望のMSを有する1つのピークを示した([M+H]=1466.4、[M+2H]/2=733.2)。反応混合物を次に分取HPLC(中性条件)により直接的に精製し、化合物4(0.2g、136.44umol、40.3%の収率)を白色固体として得た。
化合物5の調製のための一般的手順
化合物4(0.175g、119.39umol、1.0当量)を最初にTFA(1.8mL)中に溶解し、次にトリイソプロピルシラン(13.5g、85.20mmol、17.5mL、713.7当量)を加えた。混合物を0℃で30分間撹拌した。LC-MSは、所望のMSを有する1つのピークを示した([M+H]=1123.4、[M+2H]/2=562.2)。反応混合物を減圧下で濃縮して溶媒を除去して残留物を得た。残留物を分取HPLC(中性条件)により精製した。化合物5(0.1g、89.02umol、74.6%の収率)を黄色固体として得た。
化合物6の調製のための一般的手順
DMA(1.0mL)中の化合物5(0.07g、62.31umol、1.0当量)の溶液にDIEA(24.2mg、186.94umol、32.6μL、3.0当量)およびテトラヒドロピラン-2,6-ジオン(14.2mg、124.62umol、2.0当量)を加えた。混合物を25℃で2時間撹拌した。LC-MSは、化合物5は完全に消費され、所望のMSを有する1つの主なピークが検出されたことを示した([M+H]=1237.4、[M+2H]/2=619.3)。反応混合物を次に分取HPLC(中性条件)により直接的に精製し、化合物6(0.04g、32.32umol、51.8%の収率)を淡黄色固体として得た。
化合物7の調製のための一般的手順
DMA(3.0mL)およびDCM(1.0mL)中の化合物6(0.04g、32.32umol、1.0当量)、1-ヒドロキシピロリジン-2,5-ジオン(11.2mg、96.97umol、3.0当量)の溶液にEDCI(18.6mg、96.97umol、3.0当量)を加えた。混合物を25℃で18時間撹拌した。LC-MSは、化合物6は完全に消費され、所望のMSを有する1つの主なピークが検出されたことを示した([M+H]=1334.5、[M+2H]/2=667.7)。反応混合物を次に分取HPLC(TFA条件)により直接的に精製し、化合物7(0.025g、18.73umol、57.9%の収率)を白色固体として得た。
BCY6105の調製のための一般的手順
DMA(4mL)中のBCY6014(82.0mg、26.98umol、1.2当量)の溶液にDIEA(8.7mg、67.44umol、11.7μL、3.0当量)および化合物7(0.03g、22.48umol、1.0当量)を加えた。混合物を25℃で18時間撹拌した。LC-MSは、化合物7は完全に消費され、所望のMSを有する1つの主なピークが検出されたことを示した([M+4H]/4=1065.2)。反応混合物を次に分取HPLC(TFA条件)により直接的に精製した。化合物BCY6105(0.024g、5.41umol、24.1%の収率、96.06%の純度)を白色固体として得た。
BCY6106
化合物2の調製のための一般的手順
DCM(30mL)およびMeOH(10mL)中の化合物1(5.0g、10.67mmol、1.0当量)の溶液にEEDQ(5.28g、21.34mmol、2.0当量)および(4-アミノフェニル)メタノール(2.63g、21.34mmol、2.0当量)を加えた。混合物を20℃で18時間撹拌した。LC-MSは、化合物1は完全に消費され、所望のMSを有する1つの主なピークが検出されたことを示した(所望のm/z=574;脱落および部分的に脱落したBoc基はそれぞれm/z=474および518に対応した)。反応混合物を減圧下で濃縮して溶媒を除去して残留物を得た。残留物を分取HPLC(中性条件)により精製した。化合物2(3.7g、6.45mmol、60.4%の収率)を黄色固体として得た。
化合物3の調製のための一般的手順
DMF(20mL)中の化合物2(3.4g、5.93mmol、1.0当量)の溶液にDIEA(5.36g、41.49mmol、7.23mL、7.0当量)およびビス(4-ニトロフェニル)炭酸塩(10.82g、35.56mmol、6.0当量)を一度に加えた。混合物を25℃で2時間撹拌した。LC-MSは、所望のMSを有する1つのピークを示した(m/z=639は、ESIの間にBoc基が脱落する質量に対応した)。反応混合物を分取HPLC(中性条件)により直接的に精製した。化合物3(3.0g、4.06mmol、68.5%の収率)を黄色固体として得た。
化合物4の調製のための一般的手順
DMF(15mL)中の化合物3(707.4mg、957.55umol、1.0当量)の溶液に、HOBt(155.3mg、1.15mmol、1.2当量)、DIEA(371.3mg、2.87mmol、500.4μL、3.0当量)、およびMMAE(0.55g、766.04umol、0.8当量)を加えた。混合物を30℃で16時間撹拌した。LC-MSは、所望のMSを有する1つのピークを示した(所望のm/z=1317、およびm/z=609は、ESIの間に2つのプロトンおよびBoc基が脱落する質量に対応した)。反応混合物を次に分取HPLC(中性条件)により直接的に精製した。化合物4(0.53g、402.23umol、42.0%の収率)を黄色固体として得た。
化合物5の調製のための一般的手順
DMF(4mL)中の化合物4(0.526g、399.20umol、1.0当量)の溶液にピペリジン(862.2mg、10.13mmol、1.0mL、25.4当量)を加えた。混合物を25℃で30分間撹拌した。LC-MSは、化合物4は完全に消費され、所望のMSを有する1つの主なピークが検出されたことを示した(所望のm/z=1095、およびm/z=265はFmoc-ピペリジン付加体に対応した)。反応混合物を次に分取HPLC(中性条件)により直接的に精製した。化合物5(0.230g、209.97umol、52.6%の収率)を白色固体として得た。
化合物6の調製のための一般的手順
DMF(10mL)中のFmoc-(D-Ala)-Phe-OH(125.6mg、273.87umol、1.2当量)の溶液に、EDCI(52.5mg、273.87umol、1.2当量)、HOBt(37.0mg、273.87umol、1.2当量)、および化合物5(0.25g、228.23umol、1当量)を加えた。混合物を25℃で3時間撹拌した。LC-MSは、化合物5は完全に消費され、所望のMSを有する1つのピークが検出されたことを示した(m/z=718は、ESIの間に2つのプロトンおよびBoc基が脱落する質量に対応した)。反応混合物を次に分取HPLC(中性条件)により直接的に精製した。化合物6(0.18g、117.20umol、51.3%の収率)を白色固体として得た。
化合物7の調製のための一般的手順
DMF(8mL)中の化合物6(0.18g、117.20umol、1.0当量)の溶液にピペリジン(1.72g、20.25mmol、2.0mL、172.8当量)を加えた。混合物を25℃で1時間撹拌した。LC-MSは、化合物7は完全に消費され、所望のMSを有する1つの主なピークが検出されたことを示した(m/z=1314および657は所望の質量に対応し、m/z=265はFmoc-ピペリジン付加体に対応した)。反応混合物を次に分取HPLC(中性条件)により直接的に精製した。化合物7(0.13g、98.96umol、84.4%の収率)を白色固体として得た。
化合物8の調製のための一般的手順
DMA(4mL)中の化合物7(0.105g、79.93umol、1.0当量)の溶液にDIEA(31.0mg、239.79umol、41.8μL、3.0当量)およびテトラヒドロピラン-2,6-ジオン(27.4mg、239.79umol、3.0当量)を加えた。混合物を25℃で2時間撹拌した。LC-MSは、化合物7は完全に消費され、所望のMSを有する1つの主なピークが検出されたことを示した(m/z 664.5は、ESIの間に2つのプロトンおよびBoc基が脱落する質量に対応した)。反応混合物を次に分取HPLC(中性条件)により直接的に精製し、化合物8(0.09g、63.04umol、78.8%の収率)を白色固体として得た。
化合物9の調製のための一般的手順
DMA(3mL)およびDCM(1mL)中の化合物8(0.09g、63.04umol、1.0当量)、1-ヒドロキシピロリジン-2,5-ジオン(21.7mg、189.11umol、3.0当量)の溶液に、1mLのDCM中に溶解したEDCI(36.2mg、189.11umol、3.0当量)を加えた。混合物を25℃で18時間撹拌した。LC-MSは、化合物8は完全に消費され、所望のMSを有する1つの主なピークが検出されたことを示した(所望のm/z=1524(1つのプロトン)および763(2つのプロトン)であり、m/z=713はESIの間にBoc基が脱落する質量に対応した)。反応混合物を分取HPLC(中性条件)により直接的に精製した。化合物9(0.07g、45.91umol、72.8%の収率)を白色固体として得た。
化合物10の調製のための一般的手順
DMF(3mL)中のBCY6014(167.5mg、55.09umol、1.2当量)の溶液にDIEA(11.8mg、91.81umol、16.0μL、2.0当量)および化合物9(0.07g、45.91umol、1.0当量)を加えた。混合物を25℃で16時間撹拌した。LC-MSは、化合物9は完全に消費され、所望のMSを有する1つの主なピークが検出されたことを示した([M+4H+]/4=1112.9、[M+5H+]/5=890.5)。反応混合物を減圧下で濃縮して溶媒を除去して残留物を得た。粗生成物10(0.220g、粗)をさらなる精製なしで次の工程において使用した。
BCY6106の調製のための一般的手順
DCM(4mL)中の化合物10(0.200g、44.95umol、1.0当量)の溶液に1mLのTFAを加えた。混合物を25℃で1時間撹拌した。LC-MSは、所望のMSを有する1つの主なピークを示した([M+4H]/4=1088.0、[M+5H]/5=870.8)。反応混合物を減圧下で濃縮して残留物を得、それを次に分取HPLC(TFA条件)により直接的に精製した。化合物BCY6106(0.0297g、20.06umol、14.5%の収率、95.46%の純度)を白色固体として得た。
BCY6175
化合物9の調製のための一般的手順
化合物9の合成は、BCY6106において記載したものと類似の様式で行った。
化合物10Aの調製のための一般的手順
DMA(3mL)中のBCY6099(195.15mg、61.32μmol、1.1当量)の溶液にDIEA(21.61mg、167.23μmol、29.13μL、3当量)および化合物9(0.085g、55.74μmol、1.0当量)を加えた。混合物を25℃で16時間撹拌した。LC-MSは、化合物9は完全に消費され、所望のm/zを有する1つの主なピークが検出されたことを示した。反応混合物を減圧下で濃縮して溶媒を除去することにより残留物(淡黄色油)を得た。反応液を分取HPLC(中性条件)により直接的に精製した。化合物10A(0.160g、34.84μmol、62.50%の収率)を白色固体として得た。
BCY6175の調製のための一般的手順
DCM(4.5mL)中の化合物10Aの溶液にTFA(4.5mL)を加えた。混合物を0℃で30分間撹拌した。LC-MSは、化合物10Aは完全に消費され、所望のm/zを有する1つの主なピークが検出されたことを示した。反応混合物を減圧下で濃縮して溶媒を除去することにより残留物を得、それを分取HPLC(TFA条件)により精製した。化合物BCY6175(61.40mg、13.56μmol、31.13%の収率)を白色固体として得た。
BCY6107
化合物2の調製のための一般的手順
DCM(30mL)およびMeOH(10mL)中の化合物1(3.0g、8.49mmol、1.0当量)の溶液にEEDQ(2.52g、10.19mmol、1.2当量)および(4-アミノフェニル)メタノール(1.25g、10.19mmol、1.2当量)を加えた。混合物を25℃で16時間撹拌した。LC-MSは、化合物1は完全に消費され、所望のMSを有する1つの主なピークが検出されたことを示した([M+H] 459.5)。加えて、TLCは、化合物1は完全に消費され、新たなスポットが形成されたことを指し示した。反応混合物を減圧下で濃縮して溶媒を除去して残留物を得た。残留物をフラッシュシリカゲルクロマトグラフィー(ISCO(登録商標);120gのSepaFlash(登録商標) Silica Flash Column、0~60%のエチルアセテート/石油エーテル勾配の溶出液、80mL/分)により精製した。化合物2(3.5g、7.63mmol、89.9%の収率)を黄色固体として得た。
化合物3の調製のための一般的手順
THF(100mL)中の化合物2(3.3g、7.20mmol、1.0当量)の溶液にDIEA(4.65g、35.98mmol、6.27mL、5.0当量)およびビス(4-ニトロフェニル)炭酸塩(8.76g、28.79mmol、4.0当量)を加えた。混合物を25℃で16時間撹拌した。LC-MSは、化合物2は完全に消費され、所望のMSを有する1つの主なピークが検出されたことを示した([M+H] 624.0)。加えて、TLCは、化合物2は完全に消費され、新たなスポットが形成されたことを指し示した。反応混合物を減圧下で濃縮して溶媒を除去して残留物を得た。残留物をフラッシュシリカゲルクロマトグラフィー(ISCO(登録商標);120gのSepaFlash(登録商標) Silica Flash Column、0~15%のエチルアセテート/石油エーテル勾配の溶出液、80mL/分)により精製した。化合物3(3.0g、4.81mmol、66.8%の収率)を黄色固体として得た。
化合物4の調製のための一般的手順
DMF(5mL)中の化合物3(124.09mg、198.97umol、1.0当量)の溶液に、HOBt(32.3mg、238.77umol、1.2当量)、DIEA(77.1mg、596.92μmol、103.9μL、3.0当量)、およびMMAE(0.1g、139.28umol、0.7当量)を加えた。混合物を25℃で1時間撹拌した。LC-MSは、化合物3は完全に消費され、所望のMSを有する1つの主なピークが検出されたことを示した([M+H] 1202.5、[M+Na] 1224.5)。反応混合物を次に分取HPLC(中性条件)により直接的に精製した。凍結乾燥後、化合物4(0.08g、66.53umol、33.4%の収率)を白色固体として得た。
化合物5の調製のための一般的手順
DMF(4mL)中の化合物4(0.08g、66.53umol、1.0当量)の溶液にピペリジン(862.2mg、10.13mmol、1mL、152.2当量)を加えた。混合物を25℃で1時間撹拌した。LC-MSは、化合物4は完全に消費され、所望のMSを有する1つの主なピークが検出されたことを示した([M+H] 981.5、[M+Na] 1003.5、m/z=264.0はFmoc-ピペリジン付加体に対応した)。反応混合物を分取HPLC(中性条件)により直接的に精製した。化合物5(0.055g、56.11umol、84.3%の収率)を白色固体として得た。
化合物6の調製のための一般的手順
DMF(4mL)中のFmoc-Glu(t-Bu)-Pro-Cit-Gly-HPhe-Tyr(t-Bu)-OH(74.1mg、66.31umol、1.3当量)の溶液に、EDCI(12.7mg、66.31umol、1.3当量)、HOBt(8.9mg、66.31umol、1.3当量)、および化合物5(0.05g、51.01umol、1.0当量)を加えた。混合物を25℃で30分間撹拌した。LC-MSは、20%の化合物5が残留し、いくつかの新たなピークが形成され、60%の反応混合物が所望の生成物([M+2H]/2=1040.4)であったことを指し示した。反応混合物を分取HPLC(中性条件)により直接的に精製した。化合物6(0.07g、33.66umol、66.0%の収率)を白色固体として得た。
化合物7の調製のための一般的手順
DMF(4mL)中の化合物6(0.07g、33.66umol、1.0当量)の溶液にピペリジン(2.9mg、33.66umol、3.3μL、1.0当量)を加えた。混合物を25℃で15分間撹拌した。LC-MSは、化合物6は完全に消費され、所望のMSを有する1つの主なピークが検出されたことを示した([M+2H]/2=929.1、m/z=264.2はFmoc-ピペリジン付加体に対応した)。反応混合物を分取HPLC(中性条件)により直接的に精製した。化合物7(0.045g、24.23umol、72.0%の収率)を白色固体として得た。
化合物8の調製のための一般的手順
DMA(1mL)中の化合物7(0.04g、21.54umol、1.0当量)の溶液にDIEA(8.3mg、64.61umol、11.2μL、3.0当量)およびテトラヒドロピラン-2,6-ジオン(7.4mg、64.61umol、3.0当量)を加えた。混合物を25℃で1時間撹拌した。LC-MSは、化合物7は完全に消費され、所望のMSを有する1つの主なピークが検出されたことを示した([M+2H]/2=986.4)。反応混合物を次に分取HPLC(中性条件)により直接的に精製した。化合物8(0.035g、17.75umol、82.4%の収率)を白色固体として得た。
化合物9の調製のための一般的手順
DMA(3mL)およびDCM(1mL)中の化合物8(0.035g、17.75umol、1.0当量)、1-ヒドロキシピロリジン-2,5-ジオン(6.1mg、53.26umol、3.0当量)の溶液にEDCI(10.2mg、53.26umol、3.0当量)を加えた。混合物を25℃で16時間撹拌した。LC-MSは、化合物8が部分的に残留し、所望のMS([M+2H+]/2=1034.7)を有する1つのピークが検出されたことを示した。DCMを次に除去した後、混合物を分取HPLC(中性条件)により精製した。化合物9(0.03g、14.50umol、81.7%の収率)を白色固体として得た。
化合物10の調製のための一般的手順
DMF(2mL)中のBCY6014(52.9mg、17.40umol、1.59μL、1.2当量)の溶液にDIEA(5.6mg、43.51umol、7.6μL、3.0当量)および化合物9(0.03g、14.50umol、1.0当量)を加えた。混合物を25℃で16時間撹拌した。LC-MSは、所望のMSを有する1つの主なピークを示した([M+4H+]/4=1249.2、[M+5H+]/5=999.3)。溶媒を次に除去し、結果として得られた粗生成物10(0.06g、粗)をさらなる精製なしで次の工程において使用した。
BCY6107の調製のための一般的手順
DCM(1mL)中の化合物10(0.055g、11.01umol、1.0当量)の溶液に1mLのTFAを加えた。混合物を0℃で15分間撹拌した。LC-MSは、化合物10は完全に消費され、所望のMSを有する1つの主なピークが検出されたことを示した([M+4H+]/4=1221.0、[M+5H+]/5=977.0)。反応混合物を減圧下で濃縮して溶媒を除去して残留物を得、それを次に分取HPLC(TFA条件)により直接的に精製した。化合物BCY6107(20.4mg、4.03umol、36.6%の収率、96.36%の純度)を白色固体として得た。
生物学的データ
研究1:蛍光偏光測定
(a)直接結合アッセイ
蛍光タグ(フルオレセイン、SIGMAまたはAlexa Fluor488(商標)、Fisher Scientificのいずれか)を有するペプチドを、0.01%のtween 20を含むPBSまたは100mMのNaClおよび0.01%のtweenを含む50mMのHEPES(pH7.4)(共にアッセイ緩衝液と称する)を用いて2.5nMに希釈した。これをペプチドと同じアッセイ緩衝液中のタンパク質の滴定と合わせて、黒壁および黒底の低結合低体積384ウェルプレート中の25μLの総体積の1nMのペプチド、典型的には、5μLのアッセイ緩衝液、10μLのタンパク質(表1)、そして10μLの蛍光ペプチドを得た。2倍の段階希釈を使用して、既知の高親和性結合剤のための500nMから低親和性結合剤および選択性アッセイのための10μMまでの範囲内の最高濃度を有する12の異なる濃度を得た。測定は、485nmにおいて励起されて520nmにおいて平行および垂直な放射を検出する「FP 485 520 520」の光学モジュールを備えたBMG PHERAstar FSにより実行した。PHERAstar FSを25℃においてウェル当たり200のフラッシュおよび0.1秒の配置遅延で設定し、各ウェルを5~10分間隔で60分間測定した。ウェル中にタンパク質が存在しない60分の終わりに各トレーサーについて解析のために使用される増加を決定した。Systat Sigmaplotバージョン12.0を使用してデータを解析した。mP値をユーザー定義の二次式にフィッティングしてKd値を生成した:f=ymin+(ymax-ymin)/Lig*((x+Lig+Kd)/2-sqrt((((x+Lig+Kd)/2)^2)-(Lig*x)))。「Lig」は、使用したトレーサーの濃度の定義された値であった。
(b)競合結合アッセイ
蛍光タグを有しないペプチドを蛍光タグおよび既知のKdを有するペプチドとの競合において試験した(表2)。参照化合物Aは配列Fl-G-Sar-ACPWGPAWCPVNRPGCA(Fl-G-Sar-(配列番号94))を有する。参照化合物Bは配列Fl-G-Sar-ACPWGPFWCPVNRPGCA(Fl-G-Sar-(配列番号95))を有する。参照化合物Cは配列Fl-G-Sar-ADVTCPWGPFWCPVNRPGCA(Fl-G-Sar-(配列番号96)を有する。参照化合物A、BおよびCのそれぞれはTBMB分子スキャフォールドを含有する。最大5%のDMSOを用いて直接結合アッセイにおいて記載したようなアッセイ緩衝液中に適切な濃度までペプチドを希釈した後、2倍に段階希釈した。5μLの希釈したペプチドをプレートに加えた後に使用する蛍光ペプチドに依存する固定濃度(表2)の10μLのヒトまたはマウスEphA2(表1)、次に10μLの蛍光ペプチドを加えた。直接結合アッセイと同様に測定を実行したが、最初の測定の前に増加を決定した。データ解析をSystat Sigmaplotバージョン12.0において行い、mP値をユーザー定義の三次式にフィッティングしてKi値を生成した:
f=ymin+(ymax-ymin)/Lig*((Lig*((2*((Klig+Kcomp+Lig+Comp-Prot*c)^2-3*(Kcomp*(Lig-Prot*c)+Klig*(Comp-Prot*c)+Klig*Kcomp))^0.5*COS(ARCCOS((-2*(Klig+Kcomp+Lig+Comp-Prot*c)^3+9*(Klig+Kcomp+Lig+Comp-Prot*c)*(Kcomp*(Lig-Prot*c)+Klig*(Comp-Prot*c)+Klig*Kcomp)-27*(-1*Klig*Kcomp*Prot*c))/(2*((((Klig+Kcomp+Lig+Comp-Prot*c)^2-3*(Kcomp*(Lig-Prot*c)+Klig*(Comp-Prot*c)+Klig*Kcomp))^3)^0.5)))/3))-(Klig+Kcomp+Lig+Comp-Prot*c)))/((3*Klig)+((2*((Klig+Kcomp+Lig+Comp-Prot*c)^2-3*(Kcomp*(Lig-Prot*c)+Klig*(Comp-Prot*c)+Klig*Kcomp))^0.5*COS(ARCCOS((-2*(Klig+Kcomp+Lig+Comp-Prot*c)^3+9*(Klig+Kcomp+Lig+Comp-Prot*c)*(Kcomp*(Lig-Prot*c)+Klig*(Comp-Prot*c)+Klig*Kcomp)-27*(-1*Klig*Kcomp*Prot*c))/(2*((((Klig+Kcomp+Lig+Comp-Prot*c)^2-3*(Kcomp*(Lig-Prot*c)+Klig*(Comp-Prot*c)+Klig*Kcomp))^3)^0.5)))/3))-(Klig+Kcomp+Lig+Comp-Prot*c))))。
「Lig」、「KLig」および「Prot」はいずれも、それぞれ蛍光ペプチド濃度、蛍光ペプチドのKdおよびEphA2濃度に関する定義された値であった。
本発明のある特定のペプチドリガンドを上記のアッセイにおいて試験し、結果を表3~7に示す。
研究2:蛍光偏光測定(代替的なプロトコール)
(a)競合結合
蛍光タグを有しないペプチドを蛍光タグおよび既知のKdを有するペプチドとの競合において試験した(表9)。5μLの増加(2倍)濃度の試験化合物をプレートに加えた後に使用する蛍光ペプチドに依存する固定濃度(表9)の10μLのEphA2タンパク質(表8)、次に10μLの蛍光ペプチドを加えた。緩衝液は、DMSO<1%の上記のようなアッセイ緩衝液であった。測定は、485nmにおいて励起されて520nmにおいて平行および垂直な放射を検出する「FP 485 520 520」の光学モジュールを備えたBMG PHERAstar FSにより実行した。PHERAstar FSを25℃においてウェル当たり200回のフラッシュおよび0.1秒の配置遅延で設定し、各ウェルを5~10分間隔で60分間測定した。代替的に、測定は、30回のフラッシュおよび1.2のG係数を有するFITC FP Dual Mirror、FITC FP 480励起フィルターならびにFITC FP P-pol 535およびFITC FP S-pol発光フィルターを備えたPerkin Elmer Envisionにおいて類似の時間間隔で行った。データ解析をSystat Sigmaplotバージョン12.0または13.0において行い、60分におけるmP値をユーザー定義の三次式にフィッティングしてKi値を生成した:
f=ymin+(ymax-ymin)/Lig*((Lig*((2*((Klig+Kcomp+Lig+Comp-Prot*c)^2-3*(Kcomp*(Lig-Prot*c)+Klig*(Comp-Prot*c)+Klig*Kcomp))^0.5*COS(ARCCOS((-2*(Klig+Kcomp+Lig+Comp-Prot*c)^3+9*(Klig+Kcomp+Lig+Comp-Prot*c)*(Kcomp*(Lig-Prot*c)+Klig*(Comp-Prot*c)+Klig*Kcomp)-27*(-1*Klig*Kcomp*Prot*c))/(2*((((Klig+Kcomp+Lig+Comp-Prot*c)^2-3*(Kcomp*(Lig-Prot*c)+Klig*(Comp-Prot*c)+Klig*Kcomp))^3)^0.5)))/3))-(Klig+Kcomp+Lig+Comp-Prot*c)))/((3*Klig)+((2*((Klig+Kcomp+Lig+Comp-Prot*c)^2-3*(Kcomp*(Lig-Prot*c)+Klig*(Comp-Prot*c)+Klig*Kcomp))^0.5*COS(ARCCOS((-2*(Klig+Kcomp+Lig+Comp-Prot*c)^3+9*(Klig+Kcomp+Lig+Comp-Prot*c)*(Kcomp*(Lig-Prot*c)+Klig*(Comp-Prot*c)+Klig*Kcomp)-27*(-1*Klig*Kcomp*Prot*c))/(2*((((Klig+Kcomp+Lig+Comp-Prot*c)^2-3*(Kcomp*(Lig-Prot*c)+Klig*(Comp-Prot*c)+Klig*Kcomp))^3)^0.5)))/3))-(Klig+Kcomp+Lig+Comp-Prot*c))))。
「Lig」、「KLig」および「Prot」はいずれも、それぞれ蛍光ペプチド濃度、蛍光ペプチドのKdおよびEphA2濃度に関する定義された値であった。
本発明のある特定のペプチドリガンドおよび二環薬物コンジュゲートを上記の競合結合アッセイにおいて試験し、結果を表10~11に示す。
表10における競合結合アッセイの結果は、ヒトEphA2標的化二環ペプチド(BCY6014およびBCY6099)は、マウスおよびラットEphA2に高い親和性で結合することを示す。同様に、BCY6019はヒトEphA2およびマウスEphA2の両方に結合する。これらの結果は、本発明のある特定のペプチドをin vivoでのマウスおよびラット有効性および毒物学モデルにおいて使用できることを示す。
表11は、本発明のある特定の二環薬物コンジュゲートは、ヒト、マウスおよび齧歯動物EphA2の間で優れた交差反応性を呈することを示す。本発明のペプチドは、したがって、マウスおよびラット有効性および毒物学in vivoモデルにおいて使用することができる。
(b)SPR測定
タンパク質に対して3xモル過剰のビオチンを用いてpH5.4の4mMの酢酸ナトリウム、100mMのNaCl中で1時間、EZ-Link(商標) Sulfo-NHS-LC-Biotinを用いて非Fc融合タンパク質をビオチン化した。反応混合物のPBSへの透析後にFluorescence Biotin Quantification Kit(Thermo)を使用して標識化の程度を決定した。ペプチド結合の解析のために、XanTec CMD500Dチップを利用してBiacore T200機器を使用した。ランニングバッファーとしてHBS-N(10mMのHEPES、0.15MのNaCl、pH7.4)を用いて25℃において標準的なアミン連結化学を使用してストレプトアビジンをチップ上に固定化した。簡潔に述べれば、10μl/分の流速において1:1の比の0.4Mの1-エチル-3-(3-ジメチルアミノプロピル)カルボジイミド塩酸塩(EDC)/0.1MのN-ヒドロキシスクシンイミド(NHS)の7分の注入を用いてカルボキシメチルデキストラン表面を活性化させた。ストレプトアビジンの捕捉のために、タンパク質を10mMの酢酸ナトリウム(pH4.5)中に0.2mg/mlまで希釈し、活性化させたチップ表面上に120μlを注入することにより捕捉した。残留の活性化した基を1Mのエタノールアミン(pH8.5):HBS-N(1:1)の7分の注入を用いて遮断した。緩衝液をPBS/0.05%のTween 20に変更し、緩衝液中への0.2μMまでのタンパク質の希釈を使用してビオチン化EphA2を500~1500RUのレベルまで捕捉した。0.5%の最終のDMSO濃度を用い、50または100nMの最高ペプチド濃度および6つのさらなる2倍希釈を用いてこの緩衝液中のペプチドの希釈系列を調製した。60秒の会合および900~1200秒の解離を用いて90μl/分の流速において25℃でSPR分析を実行した。データをDMSO除外体積効果について補正した。標準的な処理手順およびデータ処理を使用して全てのデータをブランク注入および参照表面について二重参照化し、Scrubberソフトウェア、バージョン2.0c(BioLogic Software)を使用して速度論的フィッティングを行った。単純な1:1の結合モデルを使用してデータをフィッティングして、適切な場合に物質輸送効果を可能とした。
二環薬物コンジュゲートの結合についてBiacore 3000機器を使用した。ビオチン化タンパク質について固定化レベルは1500RUであり、最高濃度は100nMであった。それ以外に、方法は、CMD500DまたはCM5チップ(GE Healthcare)のいずれかを使用する上記したものと同じであった。Fcタグ化タンパク質について、CM5チップを上記のように活性化させた後、ヤギ抗ヒトIgG抗体(Thermo-Fisher H10500)をpH5.0の10mMの酢酸ナトリウム中に20μg/mlまで希釈し、約3000RUまで捕捉した。表面を次に上記のように遮断した。その後にFcタグ化タンパク質の捕捉を実行して約200~400RUの標的タンパク質を得た。使用したタンパク質を以下に記載する。製造者の示唆する緩衝液および濃度にしたがって全てのタンパク質を復元し、PBS/0.05%のTween 20中の5~10μg/mlのタンパク質を使用して捕捉した。
本発明のある特定のペプチドリガンドおよび二環薬物コンジュゲートを上記の競合結合アッセイにおいて試験し、結果を表13~15に示す。
表13は、SPRアッセイを使用して決定したヒトEphA2への選択された二環薬物コンジュゲートの結合についての結合親和性および速度論的パラメーター(KoffおよびKon)を詳述する。
表14は、密接に関連するヒトエフリンホモログを用いたSPRアッセイにおいて4つの二環薬物コンジュゲート(BCY6033、BCY6082、BCY6136およびBCY6173)を用いた結合性の結果を示す。結果は、本発明の化合物は、密接に関連するヒトホモログであるEphA1、EphA3、EphA4、EphA5、EphA6、EphA7およびEphB4への有意な結合を呈しないことを示す。
表15の結果は、本発明のある特定の二環薬物コンジュゲート(BCY6033、BCY6082、BCY6136およびBCY6173)はまたマウスおよびラットEphA2に選択的であり、密接に関連するホモログであるマウスEphA3およびEphA4、ならびにラットEphA3およびEphB1への有意な結合を呈しないことを示す。
研究3および7~23
研究3および7~23のそれぞれにおいて、以下の方法論を各研究のために採用した:
(a)材料
(i)動物および飼育条件
動物
種:ハツカネズミ(Mus Musculus)
株:Balb/cヌードまたはCB17-SCID
齢:6~8週
体重:18~22g
動物の数:9~90匹のマウス
動物供給業者:Shanghai Lingchang Biotechnology Experimental Animal Co.Limited
飼育条件
マウスを各ケージ中に3~5匹の動物で一定の温度および湿度において個々の換気ケージ中に留めた。
・温度:20~26℃
・湿度 40~70%
ケージ:ポリカーボネート製。サイズは300mm×180mm×150mmである。ベッド材料はトウモロコシの穂軸であり、週に2回交換する。
食餌:動物は、全研究期間の間に照射滅菌した乾燥顆粒食品に自由にアクセスできた。
水:動物は、無菌の飲料水に自由にアクセスできた。
ケージの同定:各ケージの同定ラベルは以下の情報:動物の番号、性別、系統、受入日、処置、研究番号、群番号および処置の開始日を含有した。
動物の同定:動物は耳の符号化により印をした。
(ii)試験および陽性(Postitive)対照物品
(b)実験の方法および手順
(i)観察
本研究における動物の取扱い、世話および処置に関する全ての手順は、Association for Assessment and Accreditation of Laboratory Animal Care(AAALAC)のガイダンスにしたがって、WuXi AppTecのInstitutional Animal Care and Use Committee(IACUC)により承認されたガイドラインにしたがって行った。ルーチンのモニタリングの時点において、可動性などの正常な挙動、食料および水の消費(視認によってのみ)、体重の増加/減少、目/毛のマッティングおよびプロトコールにおいて述べられるような任意の他の異常な効果に関する腫瘍成長および処置の任意の効果について動物を連日チェックした。死亡および観察された臨床徴候を各サブセット内の動物の番号に基づいて記録した。
(ii)腫瘍の測定およびエンドポイント
主要なエンドポイントは、腫瘍成長が遅延され得るかまたはマウスが治癒され得るかを見ることであった。キャリパーを使用して2つの次元において腫瘍体積を週に3回測定し、式V=0.5a×b(aおよびbはそれぞれ腫瘍の長径および短径である)を使用してmmにおいて表した。腫瘍サイズを次にT/C値の算出のために使用した。T/C値(パーセント)は、抗腫瘍有効性の指標であり、TおよびCは、所与の日における、それぞれ治療群および対照群の平均体積である。TGIを式:TGI(%)=[1-(T-T)/(V-V)]×100(Tは所与の日における治療群の平均腫瘍体積であり、Tは処置開始日における治療群の平均腫瘍体積であり、VはTと同日におけるビヒクル対照群の平均腫瘍体積であり、Vは処置開始日におけるビヒクル群の平均腫瘍体積である)を使用して各群について算出した。
(iii)試料収集
研究の終了時に全ての群の腫瘍をFFPEのために収集した。
(iv)統計解析
平均および平均の標準誤差(SEM)を含む要約統計量を各時点における各群の腫瘍体積について提供する。
群間の腫瘍体積の差異の統計解析を最終投与後の最良の治療的時点において得られたデータに対して実行した。
一元配置分散分析を行って群間で腫瘍体積を比較し、有意なF統計量(誤差分散に対する治療分散の比)が得られた場合、Games-Howell検定を用いて群間の比較を実行した。全てのデータをGraphPad Prism 5.0を使用して解析した。P<0.05を統計的に有意と考えた。
研究3:LU-01-0046 PDXモデルにおけるin vivoでの有効性
がん細胞株(CCL)は元々は患者腫瘍に由来したが、in vitro細胞培養物内で増殖する能力を獲得する。in vitroマニピュレーションの結果として、がん研究において伝統的に使用されてきたCCLは、細胞がin vivoにおいて生育される場合に回復されない遺伝的形質転換を起こす。細胞培養プロセスのため、培養において生存するようにより良好に適合する細胞を選択し、がん細胞と相互作用する腫瘍内在性の細胞およびタンパク質を除去し、培養物は表現型が均質となる。研究者らは、5%の抗がん剤のみが前臨床試験後に食品医薬品局により承認される理由を腫瘍不均質性の欠如およびヒト間質性微環境の非存在に帰せ始めている。詳細には、CCL異種移植片は、多くの場合に、原発性腫瘍における薬物応答を予測せず、その理由は、CCLは、薬物抵抗性の経路およびヒト原発性腫瘍において見出される薬物応答に対する微環境の効果に従わないからである。これらの問題を克服するために、本発明者らは、PDXモデルを使用して、前臨床モデルの予測能力を向上させた。
患者の原発性腫瘍からのがん性組織が免疫不全マウスに直接的に移植される場合にPDXは生じる。PDXは、非腫瘍細胞(例えば、間質細胞)の存在を含む患者組織構造を維持することができ、したがって腫瘍微環境をより良好に模倣することができる。一般に、PDXは、したがって、CCL異種移植片よりも原発性腫瘍の不均質性および組織構造をより反映する。
非小細胞肺癌(NSCLC)を有する患者に由来する原発性腺癌PDX異種移植片(LU-01-0046)においてBCY6031をスクリーニングした。LU-01-0046は、RNAシークエンシングを使用して高レベルのEphA2を発現することが示されている。BCY6031は、LU-01-0046モデルにおいて優れた有効性を呈し、したがって、非小細胞肺がんの治療のための有望な新規の療法である。
(a)処置アーム
ビヒクル処置動物および5mg/kg qwにおいて4週間BCY6031を用いて処置された動物において腫瘍成長を比較するための実験を設計した。
(b)実験方法
(i)PDXの情報
(ii)腫瘍接種
各マウスの右脇腹の皮下に約30mmのLU-01-0046腫瘍断片を接種した。平均腫瘍体積が943mmに達した時に薬物処置を開始した。試験品、投与の経路、投与頻度および各群中の動物数を上記している。
(iii)試験品配合物の調製
(c)結果
(i)死亡率、罹病率、および体重の増加または減少
動物の体重を毒性の間接的な尺度として定期的にモニターした。BCY6031を投与したLU-01-0046腫瘍を有する雌Balb/Cヌードマウスにおける体重変化を図1に示す。
(ii)腫瘍成長曲線
腫瘍成長曲線を図2に示す。
(iii)腫瘍成長阻害解析
PDXモデルLU-01-0046におけるBCY6031についての腫瘍成長阻害率を処置の開始後7日目の腫瘍体積測定値に基づいて算出した。
(e)考察
本研究では、LU-01-0046 PDXモデルにおいてBCY6031の治療効果を評価した。測定された体重を図1に示す。様々な時点における処置群の腫瘍体積を表19および図2に示す。
ビヒクル処置マウスの平均腫瘍サイズは7日目に2191mmに達した。5mg/kgのBCY6031は強力な抗腫瘍活性を生じさせ、腫瘍は7日目までに463mm(TGI=138.6%、p<0.05)と測定された。さらには、BCY6031処置は32日目から腫瘍を完全に根絶し、28日目における懸濁液の投与後に腫瘍再成長は起こらなかった。BCY6031は有意な体重損失を生じさせず(図1)、研究の全体を通じて薬物処置マウスにおいて有害な臨床的所見はなかった。
研究4:CDX異種移植モデルにおけるBCY6136のin vivoでの有効性
本研究では、HT1080線維肉腫株、MDA-MB-231トリプルネガティブ乳がん株およびNCI-H1975非小細胞肺がん(NSCLC)株の3つのがん細胞株由来(CDX)モデルにおいてBCY6136の治療効果を評価した。
(a)実験方法
Balb/cマウスの右脇腹の皮下に腫瘍細胞を接種し、平均平均腫瘍体積が150~200mmに達した時に薬物処置を開始した。腫瘍測定および統計解析は上記のように行った。腫瘍を有する動物をBCY6136またはビヒクルを用いて週に1回処置した。
(b)考察
図4~6は、BCY6136は週に1回の投与後に乳房、肺および線維肉腫異種移植モデルにおいて効果的であることを示す。
HT1080線維肉腫モデル:
HT1080モデルにおいて、0および7日目における3および5mg/kgでのBCY6136の週に1回の投与後14日目までに腫瘍成長の完全な退縮が達成された(図4)。0および7日目における2mg/kgでのBCY6136の週に1回の投与は腫瘍静止(部分的な退縮)を生じさせた(図4)。BCY6136処置は有意な体重損失を生じさせず(図4の挿入図)、研究の全体を通じて薬物処置マウスにおいて有害な臨床的所見はなかった。
NCI-H1975 NSCLCモデル:
2および3mg/kgの週に1回のBCY6136の投与後約28日目までにNCI-H1975モデルにおいて腫瘍成長の完全な退縮が観察された(図5)。35日目における投与中止後、35日目から3mg/kgアームの測定が終了した72日目までに3mg/kg処置動物において腫瘍再成長は観察されなかった(図5)。2mg/kgでのBCY6136の投与は、このモデルにおいて約28日目からの完全な退縮を生じさせた。35日目における投与中止後に2mg/kgの用量での約51日目まで腫瘍再成長はなかった。この用量レベルにおいて中等度の腫瘍再成長が約51日目から77日目の研究終了まで観察された。1mg/kgのBCY6136での処置は腫瘍静止(部分的な退縮)を生じさせた(図5)。BCY6136処置は有意な体重損失を生じさせず(図5の挿入図)、研究の全体を通じて薬物処置マウスにおいて有害な臨床的所見はなかった。
MDA-MB-231乳房モデル:
0~45日目の2および3mg/kgでの週に1回の投与後にMDA-MB231モデルにおいて腫瘍静止(部分的な退縮)が観察された(図6)。2mg/kg処置動物においてある程度の体重損失(腫瘍負荷に帰せられる)が観察された(図6の挿入図)。
これらの結果は、BCY6136は、線維肉腫、乳房および肺CDX異種移植片を移植されたマウスにおいて1日1回の投与後に甚大な腫瘍成長阻害を生じさせることを実証する。
研究5:ラットにおける安全性研究
6匹の雌ラットを2ラット/群の3群に無作為に割り当てて、1および8日目における5、7.5および10mg/kgでのIVボーラス注射による投与後にBCY6136の毒性を決定した。研究を15日目に終了した。
凝固パラメーター(プロトロンビン時間(秒)、活性化部分トロンボプラスチン時間(秒)またはフィブロギノゲン(fibroginogen)レベル(g/L)に対する有意な効果は2、12および15日目に観察されなかった(データ示さず)。生存中の出血事象は報告されず、病理学的検査後に内出血の証拠は検出されなかった。
研究6:カニクイザル(cynomologous monkeys)における安全性研究
BCY6136を用いた28日の毒物学研究をカニクイザルにおいて実行した。BCY6136を1、8、15および22日目に1.0および2.0mg/kgで投与した。29日目(最終用量の7日後)に動物を安楽死させ、検死した。
ベースラインと比べて凝固パラメーターに対する有意な効果は18、22および25(データ示さず)および29日目(表20)に観察されなかった。生存中の出血事象は報告されず、病理学的検査後に内出血の証拠は検出されなかった。
研究7:Balb/cヌードマウスにおけるPC-3異種移植片の処置におけるBCY6033およびBCY6136およびADCのin vivo有効性試験
(a)研究目的
研究の目的は、PC-3異種移植片の処置におけるBCY6033およびBCY6136のin vivo抗腫瘍有効性を評価することである。
(b)実験の設計
(c)実験の方法および手順
(i)細胞培養
37℃の空気中の5%のCOの雰囲気において10%の熱不活性化ウシ胎仔血清を添加したF12K培地中でPC-3腫瘍細胞を維持する。腫瘍細胞を週に2回通常通りに継代培養する。指数増殖期の増殖する細胞を回収し、腫瘍接種のために計数する。
(ii)腫瘍接種
各マウスの右脇腹の皮下に腫瘍発生のためにPC-3(1010)腫瘍細胞を接種する。動物を無作為化し、平均腫瘍体積が約150mmに達した時に処置を開始する。試験品投与および各群中の動物数を以下の実験設計の表に示す。
(iii)試験品配合物の調製
(d)結果
(i)体重変化および腫瘍成長曲線
体重および腫瘍成長曲線を図7~9に示す。
(ii)腫瘍体積の追跡
PC-3異種移植片を有する雌Balb/cヌードマウスにおける経時的な平均腫瘍体積を表21に示す。
(iii)腫瘍成長阻害解析
PC-3異種移植モデルにおける試験品の腫瘍成長阻害率を処置の開始後16日目における腫瘍体積測定値に基づいて算出した。
(e)結果の要約および考察
この研究では、PC-3異種移植モデルにおける試験品の治療効果を評価した。様々な時点における全ての処置群の測定された体重および腫瘍体積を図7~9ならびに表21および表22に示す。
ビヒクル処置マウスの平均腫瘍サイズは16日目に2070mmに達した。1mg/kg、qwでのBCY6136(TV=107mm、TGI=102.2%、p<0.001)、2mg/kg、qwでのBCY6136(TV=79mm、TGI=103.6%、p<0.001)および3mg/kg、qwでのBCY6136(TV=70mm、TGI=104.1%、p<0.001)は強力な抗腫瘍効果を示した。
3mg/kg、qwでのBCY6033(TV=116mm、TGI=101.8%、p<0.001)および3mg/kg、qwでのADC(TV=124mm、TGI=101.4%、p<0.001)は同等の抗腫瘍効果を示した。
この研究では、動物の体重を定期的にモニターした。全てのマウスは体重を良好に維持した。
研究8.Balb/cヌードマウスにおけるPC-3異種移植片の処置におけるBCY6136のin vivo有効性試験
(a)研究目的
研究の目的は、Balb/cヌードマウスにおけるPC-3異種移植片の処置におけるBCY6136のin vivo抗腫瘍有効性を評価することである。
(b)実験の設計
(c)実験の方法および手順
(i)細胞培養
37℃の空気中の5%のCOの雰囲気において10%の熱不活性化ウシ胎仔血清を添加したF-12K培地中で腫瘍細胞を維持した。腫瘍細胞を週に2回通常通りに継代培養した。指数増殖期の増殖する細胞を回収し、腫瘍接種のために計数した。
(ii)腫瘍接種
各マウスの右脇腹の皮下に腫瘍発生のために0.2mlのPBS中のPC-3腫瘍細胞(10×10)を接種した。52匹の動物を平均腫瘍体積が454mmに達した時に無作為化した。試験品投与および各群中の動物数を実験設計の表に示した。
(iii)試験品配合物の調製
(c)結果
(i)体重変化および腫瘍成長曲線
体重および腫瘍成長曲線を図10に示す。
(ii)腫瘍体積の追跡
PC-3異種移植片を有する雄Balb/cヌードマウスにおける経時的な平均腫瘍体積を表23に示す。
(iii)腫瘍成長阻害解析
PC-3異種移植モデルにおける試験品の腫瘍成長阻害率を処置の開始後20日目における腫瘍体積測定値に基づいて算出した。
(d)結果の要約および考察
この研究では、PC-3異種移植モデルにおける試験品の治療効果を評価した。様々な時点における全ての処置群の測定された体重および腫瘍体積を図10ならびに表23および表24に示す。
ビヒクル処置マウスの平均腫瘍サイズは20日目に2364mmに達した。0.167mg/kg、qw(TV=1188mm、TGI=61.4%、p<0.001)、0.5mg/kg、q2w(TV=530mm、TGI=96.0%、p<0.001)、0.5mg/kg、qw(TV=234mm、TGI=111.4%、p<0.001)および1.5mg/kg、qw(TV=131mm、TGI=117.2%、p<0.001)でのBCY6136は、20日目に用量または投与頻度依存的な方式で有意な抗腫瘍活性を生じた。1.5mg/kg、q2wでのBCY6136(TV=128mm、TGI=117.0%、p<0.001)は、1.5mg/kg qwのBCY6136と同等の抗腫瘍活性を生じた。それらの中で、0.5mg/kg qwのBCY6136、または0.5mg/kg q2wのBCY6136を用いて処置したマウスは処置の中止後に明らかな腫瘍再発を示し、52日目からの1.5mg/kg qwのBCY6136を用いたさらなる処置は腫瘍退縮に良好に働いた。1.5mg/kg q2wのBCY6136を用いて処置したマウスもまた処置の中止後に腫瘍再発を示したが、さらなる投与は完全な腫瘍退縮に働かなかった。1.5mpk qwのBCY6136を用いて処置したマウスは48日目までいかなる腫瘍再発も示さなかった。
0.33mg/kg、qw(TV=1637mm、TGI=38.1%、p<0.001)、1mg/kg、qw(TV=981mm、TGI=72.2%、p<0.001)および3mg/kg、qw(TV=184mm、TGI=114.0%、p<0.001)でのEphA2-ADCは、20日目に用量依存的な方式で有意な抗腫瘍活性を生じた。3mg/kg qwのEphA2-ADCを用いて処置したマウスは59日目までいかなる腫瘍再発も示さなかった。
15mg/kg、qwでのドセタキセル(TV=419mm、TGI=101.8%、p<0.001)は有意な抗腫瘍活性を生じたが、重篤な動物の体重損失を引き起こした。処置の中止後に、マウスは明らかな腫瘍再発を示した。42日目からの1.5mg/kg qwのBCY6136を用いた処置はこれらのマウスの腫瘍退縮に良好に働いた。
研究9.Balb/cヌードマウスにおけるNCI-H1975異種移植片の処置におけるBCY6033、BCY6136およびBCY6082のin vivo有効性試験
(a)研究目的
研究の目的は、Balb/cヌードマウスにおけるNCI-H1975異種移植モデルの処置におけるBCY6033、BCY6136およびBCY6082のin vivo抗腫瘍有効性を評価することであった。
(b)実験の設計
(c)実験の方法および手順
(i)細胞培養
指数増殖期の増殖する細胞を回収し、腫瘍接種のために計数した。
(ii)腫瘍接種
各マウスの右脇腹の皮下に腫瘍発生のために0.2mlのPBS中のNCI-H1975腫瘍細胞(10×10^6)を接種した。36匹の動物を平均腫瘍体積が149mmに達した時に無作為化した。試験品投与および各群中の動物数を実験設計の表に示した。
(iii)試験品配合物の調製
(iv)試料収集
PG-D23において、FFPEのために群1の腫瘍を固定した。
PG-D44において、FFPEのために群2および群5の腫瘍を固定した。
研究の終了時に、FFPEのために群6の腫瘍をした。
(d)結果
(i)体重変化および腫瘍成長曲線
体重および腫瘍成長を図11~13に示す。
(ii)腫瘍体積の追跡
NCI-H1975異種移植片を有する雌Balb/cヌードマウスにおける経時的な平均腫瘍体積を表25~29に示す。
(iii)腫瘍成長阻害解析
NCI-H1975異種移植モデルにおけるBCY6033、BCY6136およびBCY6082についての腫瘍成長阻害率を処置の開始後21日目における腫瘍体積測定値に基づいて算出した。
(e)結果の要約および考察
この研究では、NCI-H1975異種移植モデルにおけるBCY6033、BCY6136およびBCY6082の治療効果を評価した。様々な時点における全ての処置群の測定された体重および腫瘍体積を図11~13および表25~30に示す。
ビヒクル処置マウスの平均腫瘍サイズは21日目に2371mmに達した。1mg/kg(TV=306mm、TGI=92.9%、p<0.001)、2mg/kg(TV=95mm、TGI=102.5%、p<0.001)および3mg/kg(TV=29mm、TGI=105.4%、p<0.001)でのBCY6033は用量依存的な抗腫瘍活性を生じた。2mg/kgおよび3mg/kgでのBCY6033は腫瘍を根絶し、または小さいサイズまで腫瘍を退縮させ、処置を35日目から中止したところ、腫瘍はその後の5~6週のモニタリング中に明らかな再成長を示さなかった。
1mg/kg(TV=205mm、TGI=97.5%、p<0.001)、2mg/kg(TV=99mm、TGI=102.3%、p<0.001)および3mg/kg(TV=94mm、TGI=102.4%、p<0.001)でのBCY6136は強力な抗腫瘍活性を生じた。2mg/kgおよび3mg/kgでのBCY6136は腫瘍を根絶し、または小さいサイズまで腫瘍を退縮させた。処置を35日目から中止したところ、3mg/kg群における腫瘍はその後の5~6週のモニタリング中に明らかな再成長を示さなかったが、2mg/kg群における腫瘍は明らかな再成長を示し、投与を再開した時に有意な腫瘍阻害を示さなかった。
2mg/kgでのBCY6082(TV=1528mm3、TGI=37.9%、p>0.05)は明らかな抗腫瘍活性を示さず、5mg/kgでのBCY6082(TV=390mm3、TGI=89.1%、p<0.001)は有意な抗腫瘍活性を生じた。
この研究では、3mg/kgのBCY6033を用いて処置した1匹のマウスはモニタリングの間に15%より多く体重を損失し、他のマウスは体重を良好に維持した。
研究10.Balb/cヌードマウスにおけるLU-01-0251 PDXモデルにおけるBCY6136のin vivo有効性試験
(a)研究目的
研究の目的は、Balb/cヌードマウスにおけるLU-01-0251 PDXモデルにおいてBCY6136のin vivo抗腫瘍有効性を評価することである。
(b)実験の設計
(c)実験の方法および手順
(i)腫瘍接種
各マウスの右脇腹の皮下に腫瘍発生のためにLU-01-0251の腫瘍断片(約30mm)を接種した。有効性試験のために平均腫瘍体積が174mmに達した時に処置を開始した。試験品投与および各群中の動物数を実験設計の表に示す。
(ii)試験品配合物の調製
(d)結果
(i)体重変化および腫瘍成長曲線
体重および腫瘍成長曲線を図14に示す。
(ii)腫瘍体積の追跡
LU-01-0251異種移植片を有する雌Balb/cヌードマウスにおける処置の開始後28日目の平均腫瘍体積を表31に示す。
(iii)腫瘍成長阻害解析
LU-01-0251 PDXモデルにおけるBCY6136およびADCについての腫瘍成長阻害率を処置の開始後28日目における腫瘍体積測定値に基づいて算出した。
(e)結果の要約および考察
この研究では、LU-01-0251 PDXモデルにおけるBCY6136およびADCの治療効果を評価した。様々な時点における全ての処置群の測定された体重および腫瘍体積を図14ならびに表31および表32に示す。
この研究では、ビヒクル処置マウスの平均腫瘍体積は処置の開始後28日目に2208mmに達した。1mg/kg、qw(TV=499mm、TGI=84.0%、p<0.001)、2mg/kg、qw(TV=32mm、TGI=107.0%、p<0.001)および3mg/kg、qw(TV=0mm、TGI=108.6%、p<0.001)でのBCY6136は用量依存的な抗腫瘍活性を生じた。3mg/kg、qwでのADC(TV=39mm、TGI=106.6%、p<0.001)は有意な抗腫瘍活性を示した。
研究11:Balb/cヌードマウスにおけるLU-01-0251 PDXモデルにおけるBCY6136のin vivo有効性試験
(a)研究目的
研究の目的は、Balb/cヌードマウスにおけるLU-01-0251 PDXモデルにおいてBCY6136のin vivo抗腫瘍有効性を評価することである。
(b)実験の設計
(c)実験の方法および手順
(i)腫瘍接種
各マウスの右脇腹の皮下に腫瘍発生のためにLU-01-0251の腫瘍断片(約30mm)を接種した。有効性試験のために平均腫瘍体積が960mmに達した時に処置を開始した。試験品投与および各群中の動物数を実験設計の表に示す。
(ii)試験品配合物の調製
(iii)試料収集
マウス#3-2の腫瘍をFFPEのために94日目に収集した。マウス#5-2および5-3の腫瘍を収集し、140日目に1つのFFPEブロックに埋め込んだ。
(d)結果
(i)体重変化および腫瘍成長曲線
体重および腫瘍成長曲線を図15に示す。
(ii)腫瘍体積の追跡
LU-01-0251異種移植片を有する雌Balb/cヌードマウスにおける処置の開始後0日目から28日目の平均腫瘍体積を表33に示す。
(iii)腫瘍成長阻害解析
LU-01-0251 PDXモデルにおけるBCY6136およびADCについての腫瘍成長阻害率を処置の開始後17日目における腫瘍体積測定値に基づいて算出した。
(e)結果の要約および考察
この研究では、LU-01-0251 PDXモデルにおけるBCY6136およびADCの治療効果を評価した。様々な時点における全ての処置群の測定された体重および腫瘍体積を図15ならびに表33および表34に示す。
この研究では、平均腫瘍体積が960mmに達した時に処置を開始した。処置の開始後17日目に、ビヒクル処置マウスの平均腫瘍体積は2301mmに達した。1mg/kg qwでのBCY6136(TV=1672mm、TGI=47.0%、p>0.05)は明らかな抗腫瘍活性を示さず、2mg/kg qw(TV=398mm、TGI=142.1%、p<0.001)および3mg/kg qw(TV=216mm、TGI=155.6%、p<0.001)でのBCY6136は17日目に用量依存的な抗腫瘍活性を生じた。
2mg/kg qwでのBCY6136を用いた70日の処置後に、これらの5匹のマウスのうちの3匹は完全な腫瘍退縮を示し、他の2匹のマウスは42日目から77日目まで明らかな腫瘍再発を示した。次に3mg/kg qwのBCY6136を用いたさらなる処置を2つの再発腫瘍に7日目から行ったところ、腫瘍の1つは明らかな腫瘍退縮を示し、別の1つは処置への抵抗性を示した。
3mg/kg qwでのBCY6136を用いた56日の処置後に、この群の全てのマウスは完全な腫瘍退縮を示した。
3mg/kg qwでのADC(TV=1143mm、TGI=86.3%、p<0.01)は17日目に明らかな抗腫瘍活性を示し、さらなる53日の処置後に、これらのマウスは完全ではないがさらなる腫瘍退縮を示した。
この研究では、一部のマウスは突然の体重損失を示し、これは免疫不全マウスの長期飼養と関係性を有し得る。
研究12:Balb/cヌードマウスにおけるLU-01-0046 NSCLC PDXモデルにおけるBCY6033、BCY6136、BCY6082およびBCY6031のin vivo有効性試験
(a)研究目的
研究の目的は、Balb/cヌードマウスにおける大きいLU-01-0046 PDX腫瘍においてBCY6033、BCY6136、BCY6082およびBCY6031のin vivo抗腫瘍有効性を評価することである。
(b)実験の設計
(c)実験の方法および手順
(i)腫瘍接種
各マウスの右脇腹の皮下に腫瘍発生のためにLU-01-0046の腫瘍断片(約30mm)を接種した。平均腫瘍体積がBT17BDC研究について955mm、BCY研究について1039mmに達した時に処置を開始した。試験品投与および各群中の動物数を実験設計の表に示す。
(ii)試験品配合物の調製
(d)結果
(i)体重変化および腫瘍成長曲線
体重および腫瘍成長曲線を図16に示す。
(ii)腫瘍体積の追跡
LU-01-0046を有する雌Balb/cヌードマウスにおける経時的な平均腫瘍体積を表35に示す。
(iii)腫瘍成長阻害解析
LU-01-0046 PDXモデルにおける試験品の腫瘍成長阻害率を2セクション研究のそれぞれについて処置の開始後それぞれ22日目および28日目における腫瘍体積測定値に基づいて算出した。
(e)結果の要約および考察
この研究では、大きいLU-01-0046腫瘍における試験品の治療効果を評価した。様々な時点における全ての処置群の測定された体重および腫瘍体積を図16ならびに表35および表36に示す。
BCY研究において、ビヒクル処置マウスの平均腫瘍サイズは22日目に6186mmと算出された。1mg/kgでのBCY6082、BCY6033、BCY6136および3mg/kgでのADCは、1000mmの腫瘍サイズから処置を開始した場合に明らかな抗腫瘍活性を示さなかった。
3mg/kgでのBCY6082(TV=1999mm、TGI=81.2%、p<0.01)、BCY6033(TV=88mm、TGI=118.6%、p<0.001)、BCY6136(TV=233mm、TGI=115.6%、p<0.001)およびBCY6031(TV=115mm、TGI=110.2%、p<0.001)は有意な抗腫瘍抗腫瘍活性を生じた。それらの中で、BCY6033およびBCY6136は2/5および4/5の腫瘍を完全に根絶した。
研究13:LU-01-0046 NSCLC PDXモデルを有するBalb/cヌードマウスにおけるBCY6136のin vivo有効性
(a)研究目的
研究の目的は、LU-01-0046 NSCLC PDXモデルを有するBalb/cヌードマウスにおいてBCY6136のin vivo治療効果を評価することであった。
(b)実験の設計
(c)実験の方法および手順
(i)腫瘍接種
各マウスの右脇腹の皮下に腫瘍発生のためにある特定の種類の腫瘍断片(約30mm)を接種した。平均腫瘍体積が約198mmに達した時に処置を開始した。試験品投与および各群中の動物数を実験設計の表に示す。
(ii)試験品配合物の調製
(iii)試料収集
群は、平均腫瘍体積が2000mmを超えた時に終了させ、群1はPG-D14、群5はPG-D18、群2&6はPG-D21、群3&4はPG-D31において最後の測定の後に腫瘍をFFPEのために回収した。
(d)結果
(i)体重変化および腫瘍成長曲線
体重および腫瘍成長曲線を図17に示す。
(ii)腫瘍体積の追跡
LU-01-0046 NSCLC PDXモデルを有する雌Balb/cヌードマウスにおける経時的な平均腫瘍体積を表37に示す。
(iii)腫瘍成長阻害解析
LU-01-0046 PDXモデルを有するBalb/cヌードマウスにおける試験品の腫瘍成長阻害率をPG-D14において測定された腫瘍体積に基づいて算出した。
(e)結果の要約および考察
本研究では、LU-01-0046 PDXモデルにおける試験品の治療効果を評価した。様々な時点における全ての処置群の測定された体重および腫瘍体積を図17ならびに表37および表38に示す。
ビヒクル処置マウスの平均腫瘍サイズはPG-D14において2307mmに達した。1mg/kg(TV=1058mm、TGI=59.1%、p<0.05)、2mg/kg(TV=264mm、TGI=97.0%、p<0.001)および3mg/kg(TV=26mm、TGI=108.3%、p<0.001)でのBCY6136は用量依存的な抗腫瘍活性を生じた。3mg/kgおよび5mg/kgでのADCは明らかな抗腫瘍活性を示さなかった(p>0.05)。
この研究では、全ての群の動物は体重を良好に維持した。
研究14:Balb/cヌードマウスにおけるLU-01-0046 NSCLC PDXモデルにおけるBCY6033、BCY6136、BCY6082、BCY6173、BCY6175およびBCY6031のin vivo有効性試験
(a)研究目的
研究の目的は、Balb/cヌードマウスにおけるLU-01-0046 NSCLC PDXモデルにおいて試験品のin vivo抗腫瘍有効性を評価することである。
(b)実験の設計
(c)実験の方法および手順
(i)腫瘍接種
各マウスの右脇腹の皮下に腫瘍発生のためにLU-01-0046の腫瘍断片(約30mm)を接種した。平均腫瘍体積がパート1の研究について200mm、パート2の研究について192mmに達した時に処置を開始した。試験品投与および各群中の動物数を実験設計の表に示す。
(ii)試験品配合物の調製
(d)結果
(i)体重変化および腫瘍成長曲線
体重および腫瘍成長曲線を図18~22に示す。
(ii)腫瘍体積の追跡
LU-01-0046を有する雌Balb/cヌードマウスにおける処置の開始後21日目の平均腫瘍体積を表39および表40に示す。
(iii)腫瘍成長阻害解析
LU-01-0046 PDXモデルにおける試験品の腫瘍成長阻害率を処置の開始後21日目における腫瘍体積測定値に基づいて算出した。
(e)結果の要約および考察
この研究では、LU-01-0046 PDXモデルにおける試験品の治療効果を評価した。様々な時点における全ての処置群の測定された体重および腫瘍体積を図18~22および表39~42に示す。
パート1の研究では、ビヒクル処置マウスの平均腫瘍サイズは処置の開始後21日目に2551mmに達した。
1/2mg/kg、qwでのBCY6033(TV=1285mm、TGI=53.9%、p<0.001)および1/2mg/kg、qwでのBCY6136(TV=1285mm、TGI=53.9%、p<0.001)は有意な抗腫瘍活性を生じたが、いかなる腫瘍退縮も呈しなかった。3mg/kg、qwでのBCY6033(TV=0mm、TGI=108.6%、p<0.001)および3mg/kg、qwでのBCY6136(TV=0mm、TGI=108.5%、p<0.001)は腫瘍を完全に根絶し、BCY6033およびBCY6136 3mg/kg群におけるそれぞれ5個の腫瘍のうちの1つは投与停止後に再成長を示し、投与を再開した時に腫瘍はBCY6033またはBICY6136処置に抵抗性であった。BCY6033およびBCY6136群における残存腫瘍(各群について4/5)は、投与停止の80日後に再成長を示さなかった。
1mg/kg、qw(TV=1826mm、TGI=30.8%、p<0.05)および3mg/kg、qw(TV=1042mm、TGI=64.2%、p<0.001)でのBCY6082は用量依存的な抗腫瘍活性を生じたが、腫瘍退縮を示さなかった。
パート2の研究では、ビヒクル処置マウスの平均腫瘍サイズは処置の開始後21日目に2342mmに達した。1mg/kg、qwでのBCY6173(TV=2151mm、TGI=8.9%,p>0.05)は抗腫瘍抗腫瘍活性を示さなかった。3mg/kg、qwでのBCY6173(TV=890mm、TGI=67.5%、p<0.05)は明らかな抗腫瘍活性を生じた。
3mg/kg、qwでのBCY6175(TV=0mm、TGI=108.9%、p<0.001)は14日目に4/5の腫瘍を完全に根絶した。3mg/kg、qwでのBCY6031(TV=874mm、TGI=68.2%、p<0.05)は明らかな抗腫瘍活性を生じたが、いかなる腫瘍退縮も示さなかった。
研究15:Balb/cヌードマウスにおけるLU-01-0412 NSCLC PDXモデルにおけるBCY6136のin vivo有効性試験
(a)研究目的
プロジェクトの目的は、BALB/cヌードマウスにおけるLU-01-0412 NSCLC PDXモデルにおいてBCY6136のin vivo治療効果を評価することである。
(b)実験の設計
(c)実験の方法および手順
(i)腫瘍接種
各マウスの右脇腹の皮下に腫瘍発生のためにLU-01-0412腫瘍断片(約30mm)を接種した。平均腫瘍体積が159mmに達した時に動物を無作為化した。試験品投与および各群中の動物数を実験設計の表に示した。
(ii)試験品配合物の調製
(iii)試料収集
ビヒクルならびにBCY6136、BCY8245およびBCY8781を用いて処置した3匹の追加のマウスからの血漿を投与後30分および24時間に収集した。ビヒクルならびにBCY6136、BCY8245およびBCY8781を用いて処置した3匹の追加のマウスからの腫瘍を投与後24時間に収集した。
(d)結果
(i)体重変化および腫瘍成長曲線
体重および腫瘍成長曲線を図23に示す。
(ii)腫瘍体積の追跡
LU-01-0412異種移植片を有する雌BALB/cヌードマウスにおける経時的な平均腫瘍体積を表43に示す。
(iii)腫瘍成長阻害解析
LU-01-0412異種移植モデルにおけるBCY6136、BCY8245およびBCY8781についての腫瘍成長阻害率を処置の開始後32日目の腫瘍体積測定値に基づいて算出した。
(e)結果の要約および考察
この研究では、LU-01-0412異種移植モデルにおけるBCY6136、BCY8245およびBCY8781の治療効果を評価した。様々な時点における全ての処置群の測定された体重および腫瘍体積を図23ならびに表43および表44に示す。
ビヒクル処置マウスの平均腫瘍体積は処置の開始後32日目に1104mmに達した。1mg/kg、qw×4(TV=758mm、TGI=36.7%、p<0.05)および3mg/kg、qw×4(TV=416mm、TGI=72.9%、p<0.001)でのBCY6136は用量依存的な抗腫瘍活性を生じたが、いかなる腫瘍退縮も示さなかった。3mg/kg、qw×4でのBCY8245(TV=1mm、TGI=116.8%、p<0.001)および3mg/kg、qw×4でのBCY8781(TV=12mm、TGI=115.6%、p<0.001)は腫瘍を明らかに退縮させた。それらの中で、3mg/kgのBCY8245を用いて処置された6つの腫瘍の内の5つおよび3mg/kgのBCY8781を用いて処置された6つの腫瘍の内の2つは32日目に完全に根絶された。
この研究では、全ての群の動物は体重を良好に維持した。
研究16:Balb/cヌードマウスにおけるLU-01-0486 PDXモデルの処置におけるBCY6136のin vivo有効性試験
(a)研究目的
研究の目的は、Balb/cヌードマウスにおけるLU-01-0486 PDXモデルにおいてBCY6136のin vivo抗腫瘍有効性を評価することである。
(b)実験の設計
(c)実験の方法および手順
(i)腫瘍接種
各マウスの右脇腹の皮下に腫瘍発生のためにLU-01-0486の腫瘍断片(約30mm)を接種した。有効性試験のために平均腫瘍体積が180mmに達した時に処置を開始した。試験品投与および各群中の動物数を実験設計の表に示す。
(ii)試験品配合物の調製
(d)結果
(i)体重変化および腫瘍成長曲線
体重および腫瘍成長曲線を図24に示す。
(ii)腫瘍体積の追跡
LU-01-0486異種移植片を有する雌Balb/cヌードマウスにおける処置の開始後14日目の平均腫瘍体積を表45に示す。
(iii)腫瘍成長阻害解析
LU-01-0486 PDXモデルにおけるBCY6136についての腫瘍成長阻害率を処置の開始後14日目における腫瘍体積測定値に基づいて算出した。
(e)結果の要約および考察
この研究では、LU-01-0486 PDXモデルにおけるBCY6136の治療効果を評価した。様々な時点における全ての処置群の測定された体重および腫瘍体積を図24ならびに表45および表46に示す。
この研究では、ビヒクル処置マウスの平均腫瘍体積は処置の開始後14日目に651mmに達した。1mg/kg、qw(TV=638mm、TGI=3.0%、p>0.05)および2mg/kg、qw(TV=645mm、TGI=1.2%、p>0.05)でのBCY6136はいかなる抗腫瘍活性も示さなかった。3mg/kg、qwでのBCY6136(TV=449mm、TGI=43.1%、p>0.05)は統計的有意性を伴わずにわずかな抗腫瘍活性を生じた。
研究17:Balb/cヌードマウスにおけるMDA-MB-231-luc異種移植片の処置におけるBCY6033、BCY6136およびBCY6082のin vivo有効性試験
(a)研究目的
研究の目的は、Balb/cヌードマウスにおけるMDA-MB-231-luc異種移植モデルの処置においてBCY6033、BCY6136およびBCY6082のin vivo抗腫瘍有効性を評価することであった。
(b)実験の設計
(c)実験の方法および手順
(i)細胞培養
指数増殖期の増殖する細胞を回収し、腫瘍接種のために計数した。
(ii)腫瘍接種
各マウスの右脇腹の皮下に腫瘍発生のために0.1mlのマトリゲルと共に0.1mlのPBS中のMDA-MB-231-luc腫瘍細胞(10×10^6)を接種した。36匹の動物を平均腫瘍体積が159mmに達した時に無作為化した。試験品投与および各群中の動物数を実験設計の表に示した。
(iii)試験品配合物の調製
(iv)試料収集
PG-D24において、群1、8および9の腫瘍を収集し、それをFFPEのために固定した。
PG-D33において、群2および5の腫瘍を収集し、それをFFPEのために固定した。
研究の終了時に、群3、4、6および7の腫瘍を収集し、それをFFPEのために固定した。
(d)結果
(i)体重変化および腫瘍成長曲線
体重および腫瘍成長を図25~27に示す。
(ii)腫瘍体積の追跡
MDA-MB-231-luc異種移植片を有する雌Balb/cヌードマウスにおける経時的な平均腫瘍体積を表47~49に示す。
(iii)腫瘍成長阻害解析
MDA-MB-231-luc異種移植モデルにおけるBCY6033、BCY6136およびBCY6082についての腫瘍成長阻害率を処置の開始後21日目における腫瘍体積測定値に基づいて算出した。
(e)結果の要約および考察
この研究では、MDA-MB-231-luc異種移植モデルにおけるBCY6033、BCY6136およびBCY6082の治療効果を評価した。様々な時点における全ての処置群の測定された体重および腫瘍体積を図25~27および表47~50に示す。
ビヒクル処置マウスの平均腫瘍サイズは21日目に1661mmに達した。1mg/kg(TV=880mm、TGI=52.0%、p<0.001)、2mg/kg(TV=67mm、TGI=106.1%、p<0.001)および3mg/kg(TV=22mm、TGI=109.1%、p<0.001)でのBCY6033は用量依存的な抗腫瘍活性を生じた。2mg/kgおよび3mg/kgでのBCY6033は腫瘍を強力に退縮させたが、腫瘍は21日目から明らかな再成長を示した。
1mg/kgでのBCY6136(TV=994mm、TGI=44.4%、p<0.01)は中等度の抗腫瘍活性を示し、2mg/kg(TV=33mm、TGI=108.4%、p<0.001)および3mg/kg(TV=132mm、TGI=101.1%、p<0.001)でのBCY6136は強力な抗腫瘍活性を生じたが、腫瘍は28日目から明らかな再成長を示した。
2mg/kgでのBCY6082(TV=1287mm3、TGI=24.9%、p>0.05)は明らかな抗腫瘍活性を示さず、5mg/kgでのBCY6082(TV=218mm3、TGI=96.1%、p<0.001)は有意な抗腫瘍活性を生じた。
この研究では、2mg/kgのBCY6136を用いて処置した1匹のマウスは処置スケジュールの間に15%を超える体重を損失したが、他のマウスは体重を良好に維持した。
研究18:BALB/cマウスにおけるEMT-6同系モデルの処置におけるBCY6136のin vivo有効性試験
(a)研究目的
研究の目的は、BALB/cマウスにおけるEMT-6同系モデルの処置においてBCY6136のin vivo抗腫瘍有効性を評価することであった。
(b)実験の設計
(c)実験の方法および手順
(i)細胞培養
37℃の空気中の5%のCOの雰囲気において10%の熱不活性化ウシ胎仔血清を添加したEMEM培地中の単層培養物としてEMT-6腫瘍細胞をin vitroで維持した。腫瘍細胞を週に2回トリプシン-EDTA処理により通常通りに継代培養した。指数増殖期の増殖する細胞を回収し、腫瘍接種のために計数した。
(ii)腫瘍接種
各マウスの右脇腹の皮下に腫瘍発生のために0.1mlのPBS中のEMT-6腫瘍細胞(5×10)を接種した。44匹の動物を平均腫瘍体積が75mmに達した時に無作為化した。試験品投与および各群中の動物数を実験設計の表に示した。
(iii)試験品配合物の調製
(iv)試料収集
11日目に予備のマウスから3つの腫瘍をFACSのために収集した。データは生物学チームにより供給された。
(d)結果
(i)体重変化および腫瘍成長曲線
体重および腫瘍成長曲線を図28に示す。
(ii)腫瘍体積の追跡
EMT-6同系移植片を有する雌BALB/cマウスにおける経時的な平均腫瘍体積を表51に示す。
(iii)腫瘍成長阻害解析
EMT-6同系モデルにおけるBCY6136についての腫瘍成長阻害率を処置の開始後21日目の腫瘍体積測定値に基づいて算出した。
(e)結果の要約および考察
この研究では、EMT-6同系モデルにおけるBCY6136の治療効果を評価した。様々な時点における全ての処置群の測定された体重および腫瘍体積を図28ならびに表51および表52に示す。
ビヒクル処置マウスの平均腫瘍サイズは21日目に1499mmに達した。3mg/kg、qwでのBCY6136(TV=561mm、TGI=66.2%、p<0.05)は明らかな抗腫瘍活性を示した。1/5mg/kg、qwでのBCY6136(TV=1272mm、TGI=16.1%、p>0.05)および0.3/3mg/kg、qwでのBCY6136(TV=1394mm、TGI=7.4%、p>0.05)はいかなる抗腫瘍活性も示さなかった。
群3および群4の投与量を14日目から5mpkおよび3mpkに変更した。腫瘍性潰瘍形成が14日目にマウス3~5において見出され、抗生物質クリームを用いてマウスを処置した。この研究では、全てのマウスは体重を良好に維持した。
研究19:Balb/cヌードマウスにおけるNCI-N87異種移植片の処置におけるBCY6136のin vivo有効性試験
(a)研究目的
研究の目的は、Balb/cヌードマウスにおけるNCI-N87異種移植片の処置におけるBCY6136のin vivo抗腫瘍有効性を評価することである。
(b)実験の設計
(c)実験の方法および手順
(i)細胞培養
37℃の空気中の5%のCOの雰囲気において10%の熱不活性化ウシ胎仔血清を添加したRPMI-1640培地中でNCI-N87腫瘍細胞を維持した。腫瘍細胞を週に2回通常通りに継代培養した。指数増殖期の増殖する細胞を回収し、腫瘍接種のために計数した。
(ii)腫瘍接種
各マウスの右脇腹の皮下に腫瘍発生のために0.2mlのPBS中でマトリゲル(1:1)と共にNCI-N87腫瘍細胞(10×10)を接種した。動物を無作為化し、平均腫瘍体積が約176mmに達した時に処置を開始した。試験品投与および各群中の動物数を実験設計の表に示す。
(iii)試験品配合物の調製
(d)結果
(i)体重変化および腫瘍成長曲線
体重および腫瘍成長曲線を図29に示す。
(ii)腫瘍体積の追跡
NCI-N87異種移植片を有する雌Balb/cヌードマウスにおける経時的な平均腫瘍体積を表53に示す。
(iii)腫瘍成長阻害解析
NCI-N87異種移植片におけるBCY6136についての腫瘍成長阻害率を処置の開始後30日目における腫瘍体積測定値に基づいて算出した。
(e)結果の要約および考察
この研究では、NCI-N87モデルにおけるBCY6136の治療効果を評価した。様々な時点における全ての処置群の測定された体重および腫瘍体積を図29ならびに表53および表54に示す。
ビヒクル処置マウスの平均腫瘍サイズは30日目に1465mmに達した。1mg/kg、qw(TV=425mm、TGI=80.7%、p<0.001)および2mg/kg、qw(TV=210mm、TGI=97.4%、p<0.001)でのBCY6136は用量依存的な方式で有意な抗腫瘍活性を生じ、3mg/kg、qwでのBCY6136(TV=201mm、TGI=98.1%、p<0.001)は2mpkでのBCY6136と同等の抗腫瘍活性を示した。
この研究では、処置スケジュールの間に全ての群において明らかな体重損失は見出されなかった。
研究20:Balb/cヌードマウスにおけるSK-OV-3異種移植片の処置におけるBCY6136のin vivo有効性試験
(a)研究目的
研究の目的は、Balb/cヌードマウスにおけるSK-OV-3異種移植片の処置においてBCY6136のin vivo抗腫瘍有効性を評価することである。
(b)実験の設計
(c)実験の方法および手順
(i)細胞培養
37℃の空気中の5%のCOの雰囲気において10%の熱不活性化ウシ胎仔血清を添加したMcCoy 5a培地中にSK-OV-3腫瘍細胞を維持した。腫瘍細胞を週に2回通常通りに継代培養した。指数増殖期の増殖する細胞を回収し、腫瘍接種のために計数した。
(ii)腫瘍接種
各マウスの右脇腹の皮下に腫瘍発生のために0.2mlのPBS中でマトリゲル(1:1)と共にSK-OV-3腫瘍細胞(10×10)を接種した。動物を無作為化し、平均腫瘍体積が約186mmに達した時に処置を開始した。試験品投与および各群中の動物数を実験設計の表に示す。
(iii)試験品配合物の調製
(d)結果
(i)体重変化および腫瘍成長曲線
体重および腫瘍成長曲線を図30に示す。
(ii)腫瘍体積の追跡
SK-OV-3異種移植片を有する雌Balb/cヌードマウスにおける経時的な平均腫瘍体積を表55に示す。
(iii)腫瘍成長阻害解析
SK-OV-3異種移植片におけるBCY6136についての腫瘍成長阻害率を処置の開始後28日目における腫瘍体積測定値に基づいて算出した。
(e)結果の要約および考察
この研究では、SK-OV-3モデルにおけるBCY6136の治療効果を評価した。様々な時点における全ての処置群の測定された体重および腫瘍体積を図30ならびに表55および表56に示す。
ビヒクル処置マウスの平均腫瘍サイズは28日目に1560mmに達した。3mg/kg、qwでのADC(TV=684mm、TGI=63.8%、p<0.01)は中等度の抗腫瘍有効性を示した。1mg/kg、qwでのBCY6136(TV=1035mm、TGI=38.1%、p>0.05)は明らかな抗腫瘍活性を示さなかった。2mg/kg、qw(TV=277mm、TGI=93.3%、p<0.001)および3mg/kg、qw(TV=254mm、TGI=95.0%、p<0.001)でのBCY6136は有意な抗腫瘍活性を生じた。
この研究では、処置スケジュールの間に全ての群において明らかな体重損失は見出されなかった。
研究21:Balb/cヌードマウスにおけるOE21異種移植片の処置におけるBCY6136のin vivo有効性試験
(a)研究目的
研究の目的は、Balb/cヌードマウスにおけるOE21異種移植片の処置においてBCY6136のin vivo抗腫瘍有効性を評価することである。
(b)実験の設計
(c)実験の方法および手順
(i)細胞培養
37℃の空気中の5%のCOの雰囲気において10%の熱不活性化ウシ胎仔血清を添加したRPMI-1640培地中にOE21腫瘍細胞を維持した。腫瘍細胞を週に2回通常通りに継代培養した。指数増殖期の増殖する細胞を回収し、腫瘍接種のために計数した。
(ii)腫瘍接種
各マウスの右脇腹の皮下に腫瘍発生のために0.2mlのPBS中でマトリゲル(1:1)と共にOE21腫瘍細胞(5×10)を接種した。動物を無作為化し、平均腫瘍体積が約157mmに達した時に処置を開始した。試験品投与および各群中の動物数を実験設計の表に示す。
(iii)試験品配合物の調製
(d)結果
(i)体重変化および腫瘍成長曲線
体重および腫瘍成長曲線を図31に示す。
(ii)腫瘍体積の追跡
OE21異種移植片を有する雌Balb/cヌードマウスにおける経時的な平均腫瘍体積を表57に示す。
(iii)腫瘍成長阻害解析
OE21異種移植片におけるBCY6136についての腫瘍成長阻害率を処置の開始後23日目における腫瘍体積測定値に基づいて算出した。
(e)結果の要約および考察
この研究では、OE21モデルにおけるBCY6136の治療効果を評価した。様々な時点における全ての処置群の測定された体重および腫瘍体積を図31ならびに表57および表58に示す。
ビヒクル処置マウスの平均腫瘍サイズは23日目に1586mmに達した。1mg/kg、qwでのBCY6136(TV=1155mm、TGI=30.4% p<0.05)はわずかな抗腫瘍活性を示した。2mg/kg、qw(TV=537mm、TGI=73.4%、p<0.001)および3mg/kg、qw(TV=489mm、TGI=76.7%、p<0.001)でのBCY6136は有意な抗腫瘍活性を生じた。
この研究では、処置スケジュールの間に全ての群において明らかな体重損失は見出されなかった。
研究22:CB17-SCIDマウスにおけるMOLP-8異種移植片の処置におけるBCY6136およびBCY6082のin vivo有効性試験
(a)研究目的
研究の目的は、CB17-SCIDマウスにおけるMOLP-8異種移植片の処置におけるBCY6136およびBCY6082のin vivo抗腫瘍有効性を評価することである。
(b)実験の設計
(c)実験の方法および手順
(i)細胞培養
37℃の空気中の5%のCOの雰囲気において20%の熱不活性化ウシ胎仔血清を添加したRMPI-1640中の単層培養物としてMOLP-8腫瘍細胞を維持した。腫瘍細胞をトリプシン-EDTA処理により通常通りに継代培養した。指数増殖期の増殖する細胞を回収し、腫瘍接種のために計数した。
(ii)腫瘍接種
各マウスの右脇腹の皮下に腫瘍発生のために50%のマトリゲルと共に0.2mlのPBS中のMOLP-8腫瘍細胞(10×10)を接種した。36匹の動物を平均腫瘍体積が141mmに達した時に無作為化した。試験品投与および各群中の動物数を実験設計の表に示した。
(iii)試験品配合物の調製
(d)結果
(i)体重変化および腫瘍成長曲線
体重および腫瘍成長曲線を図32および図33に示す。
(ii)腫瘍体積の追跡
MOLP-8異種移植片を有する雌CB17-SCIDマウスにおける経時的な平均腫瘍体積を表59に示す。
(iii)腫瘍成長阻害解析
MOLP-8異種移植モデルにおけるBCY6136およびBCY6082についての腫瘍成長阻害率を処置の開始後14日目における腫瘍体積測定値に基づいて算出した。
(e)結果の要約および考察
この研究では、MOLP-8異種移植モデルにおけるBCY6136およびBCY6082の治療効果を評価した。様々な時点における全ての処置群の測定された体重および腫瘍体積を図32および図33ならびに表59および表60に示す。
ビヒクル処置マウスの平均腫瘍サイズは14日目に2528mmに達した。1mg/kg(TV=1146mm、TGI=45.5%、p>0.05)、2mg/kg(TV=1218mm、TGI=54.9%、p<0.05)および3mg/kg(TV=938mm、TGI=66.7%、p<0.01)でのBCY6136は用量依存的な抗腫瘍活性を生じたが、全ての投与量はMOLP-8異種移植片において腫瘍を退縮させなかった。
1mg/kg(TV=2296mm、TGI=9.8%、p>0.05)および2mg/kg(TV=1554mm、TGI=40.8%、p>0.05)でのBCY6082は明らかな抗腫瘍活性を示さなかった。3mg/kgでのBCY6082は腫瘍成長を有意に阻害したが(TV=1321mm、TGI=50.6%、p<0.05)、MOLP-8異種移植片において腫瘍を退縮させなかった。
この研究では、全てのマウスは体重を良好に維持した。
研究23:BALB/cヌードマウスにおけるHT1080異種移植片の処置におけるBCYのin vivo有効性試験
(a)研究目的
研究の目的は、BALB/cヌードマウスにおけるHT1080異種移植モデルの処置においてBCYのin vivo抗腫瘍有効性を評価することであった。
(b)実験の設計
(c)実験の方法および手順
(i)細胞培養
37℃の空気中の5%のCOの雰囲気において10%の熱不活性化ウシ胎仔血清を添加した培地中でHT1080腫瘍細胞を維持する。腫瘍細胞を週に2回通常通りに継代培養する。指数増殖期の増殖する細胞を回収し、腫瘍接種のために計数する。
(ii)腫瘍接種
各マウスの右脇腹の皮下に腫瘍発生のためにHT1080腫瘍細胞(5×10)を接種する。動物を無作為化し、平均腫瘍体積が約150~200mmに達した時に処置を開始する。試験品投与および各群中の動物数を以下の実験設計の表に示す。
(iii)試験品配合物の調製
(d)結果
(i)体重変化および腫瘍成長曲線
体重および腫瘍成長曲線を図34~42に示す。
(ii)腫瘍体積の追跡
HT1080異種移植片を有する雌Balb/cヌードマウスにおける経時的な平均腫瘍体積を表61に示す。
(iii)腫瘍成長阻害解析
HT1080異種移植モデルにおけるBCYについての腫瘍成長阻害率を処置の開始後14日目における腫瘍体積測定値に基づいて算出した。
(e)結果の要約および考察
この研究では、HT1080異種移植モデルにおけるBCYの治療効果を評価した。様々な時点における全ての処置群の測定された体重および腫瘍体積を図34~42ならびに表61および表62に示す。
ビヒクル処置マウスの平均腫瘍サイズは14日目に1737mmに達した。
2mg/kg、qwでのBCY6082(TV=5mm、TGI=111.1%、p<0.01)および2mg/kg qwでのBCY6031(TV=7mm、TGI=106.8%、p<0.01)は強力な抗腫瘍活性を示した。
1mg/kg、qw(TV=1074mm、TGI=42.5%、p>0.05)、2mg/kg、qw(TV=480mm、TGI=80.6%、p<0.05)および3mg/kg、qw(TV=7mm、TGI=108.4%、p<0.01)でのBCY6173は用量依存的な抗腫瘍活性を生じた。
1mg/kg、qw(TV=871mm、TGI=55.5%、p<0.01)、2mg/kg、qw(TV=62mm、TGI=107.5%、p<0.001)および3mg/kg、qw(TV=44mm、TGI=108.6%、p<0.001)でのBCY6135は用量依存的な抗腫瘍活性を生じた。
3mg/kg、qw(TV=9mm、TGI=110.8%、p<0.001)および5mg/kg、qw(TV=0mm、TGI=111.4%、p<0.001)でのBCY6033は強力な抗腫瘍活性を示し、5mg/kgにおいて14日目までに腫瘍を完全に根絶した。
2mg/kg、qw(TV=345mm、TGI=95.7%、p<0.001)、3mg/kg、qw(TV=3mm、TGI=111.2%、p<0.001)および5mg/kg、qw(TV=2mm、TGI=111.3%、p<0.001)でのBCY6136は強力な抗腫瘍活性を示した。
1mg/kg、qw(TV=1066mm、TGI=43.1%、p<0.05)、2mg/kg、qw(TV=532mm、TGI=77.3%、p<0.01)および3mg/kg、qw(TV=11mm、TGI=110.7%、p<0.001)でのBCY6174は用量依存的な抗腫瘍活性を生じた。
1mg/kg、qw(TV=769mm、TGI=62.1%、p<0.01)、2mg/kg、qw(TV=295mm、TGI=92.5%、p<0.001)および3mg/kg、qw(TV=11mm、TGI=110.8%、p<0.001)でのBCY6175は用量依存的な抗腫瘍活性を生じた。
3mg/kg、qwでのADC(TV=0mm、TGI=111.5%)は14日目までに腫瘍を完全に根絶した。
研究24:複数の腫瘍の種類からのEphA2についてのコピー数多型(CNV)と遺伝子発現との関連性の研究
1.cBioPortal(http://www.cbioportal.org/)において全ての研究を選択し、EPHA2について検索する。
(a)暫定的な研究を除去する。
(b)重なり合う試料を用いた研究を選択しないようにして試料バイアスを防止する(cBioPortalにおける警告に基づく)。このオプションの場合、PanCancerの研究を常に残す。
(c)解析のために選択した研究(表63)。
2.cBioPortalからのCNVおよびRNA発現データをエクスポートする。
3.CNVがEphA2についてのmRNA発現の変化と統計的に有意に関連付けられるかどうかを試験する(log2は適用しない)。
(a)GraphPad Prism(7.04)およびR/R studioにおいてノンパラメトリックなクラスカル・ウォリス検定を実行する(有意性の閾値:p<0.01)。
(i)GraphPad Prism:カラムテーブルを設定し、マッチングおよびペアリングのいずれもなしでノンパラメトリック検定を実行し、ガウス分布は仮定しない。
(ii)Rにおいて使用されるパッケージ:
1.XLConnect
2.dplyr
3.Kruskal-Wallis Rank Sum Test: Kruskal.test。
4.Dunn検定を使用してR/Rstudioにおいて多重比較(群内でn=1であったとしても全ての可能な比較を含む)のために調整する(有意性のための閾値:p<0.025)。
(a)多重比較方法=「bonferonni」を用いるdunn.test。
結果
結果を以下の表64に示す。EphA2についてコピー数多型(CNV)およびmRNA遺伝子発現の両方を報告するcBioPortalにおいて編纂された41の公開されているデータセットにわたり、EphA2浅欠失(shallow-deletions)(<2コピー)を有する症例が報告されている多数のがん種がある。より頻度が低いが、これらの同じがん種において腫瘍のサブセットはEphA2深欠失(deep deletions)(>1コピーの喪失もしくは両アレルの喪失)、EphA2増加(2~3コピー)またはEphA2増幅(>3コピー)を宿した。>33%の腫瘍がEphA2において浅欠失または深欠失のいずれかを有した適応症は、色素嫌性腎臓、胆管癌、褐色細胞腫および傍神経節腫、肺扁平がん、乳房、直腸、脳の低グレード神経膠腫、肝臓、副腎皮質癌、中皮腫、食道腺癌および結腸がんを含んだ。対照的に、>33%の試料がEphA2において増加または増幅のいずれかを有した研究はなかった。合わせると、これらの結果は、EphA2 DNAにおける欠失は様々な適応症にわたり見出されることを実証する。
41の研究において解析した全ての試料の約3分の1はEphA2 CNVを宿した。研究にわたるこの高いパーセンテージのCNV、および特定の腫瘍種内の浅欠失の高いパーセンテージに基づいて、統計的検定を行って、コピー数変化とRNA発現とのあり得る関連性を同定した。適応症当たりの腫瘍を5つのクラスのうちの1つに割り当てた:
a)深欠失、
b)浅欠失、
c)二倍体、
d)増加、
e)増幅。
クラスカル-ウォリス検定を次に行って、クラス当たりのmRNA発現値の分布がクラス間で異なるかどうかを検出した(P<0.01)。P<0.01のTCGAデータセットのためおよびいずれのクラスが互いに異なるかを同定するために、算出された調整P値(ボンフェローニ)を用いてZ統計量を算出することにより事後検定を行った。解釈の簡便性のために、適応症当たりの二倍体に対するペアワイズ比較を検討した(但し、全てのペアワイズP値を算出した)。これらの41の研究のうちの19は、<0.01のクラスカル-ウォリスのp値を有し、コピー数はRNA発現と統計的に有意に関連付けられることを実証した。これらの19の研究のうちの17は、二倍体対浅欠失について<0.025のボンフェローニ調整Pを有し、EphA2コピー数の減少とのEphA2 mRNA発現の減少の関連性を指し示した。これらの19の研究のうちの2つのみが、二倍体対増加について<0.025のボンフェローニ調整Pを有し、これらは共に乳がん研究であった。さらには、これらの乳がん研究のうちの1つ(Breast Invasive Carcinoma(TCGA、PanCancer Atlas))は、二倍体対浅欠失および二倍体対増加の両方について<0.025のボンフェローニ調整Pを有し、コピー数変化は乳がんにおけるEphA2 RNA発現に強い影響力を有し得ることを示唆した。
遺伝学のセントラルドグマは、EphA2のコピー数の低減はRNAおよびタンパク質発現の低減に繋がることを示唆する。したがって、様々な腫瘍種におけるEphA2のコピー数喪失とmRNA発現の低減との観察された関連性は、EphA2タンパク質発現もまた低減し得ることを示唆する。同様に、mRNA発現の増加と関連付けられた乳がんにおけるEphA2のコピー数増加はまた、EphA2タンパク質発現の増加を示唆し得る。さらに、より高いEphA2タンパク質発現(FACSにより測定される)は、前臨床in vivoモデルにおける本発明のある特定のEphA2二環薬物コンジュゲートの有効性(腫瘍体積により測定される)の増加と関連付けられる。合わせると、mRNA発現変化と関連付けられるコピー数変化がタンパク質発現レベルを予測する場合、EphA2のコピー数欠失を含有する腫瘍を有する患者は本発明のEphA2二環薬物コンジュゲートに応答する可能性がより低い可能性がある。同様に、EphA2において腫瘍コピー数増加を有する(例えば、乳がん)患者は、本発明のEphA2二環薬物コンジュゲートに応答する可能性がより高い可能性がある。したがって、患者をEphA2コピー数状態により層化した場合、この情報は、有効性を増加させるために、本発明のEphA2二環薬物コンジュゲートを用いる治療のための患者の除外および選択の両方のために使用され得る。

Claims (18)

  1. 少なくとも2つのループ配列により分離された少なくとも3つのシステイン残基を含むポリペプチド、および少なくとも2つのポリペプチドループが非芳香族分子スキャフォールド上に形成されるように前記ポリペプチドの前記システイン残基と共有結合を形成する前記分子スキャフォールドを含む、EphA2に特異的なペプチドリガンドであって、前記分子スキャフォールドが、1,1’,1’’-(1,3,5-トリアジナン-1,3,5-トリイル)トリプロパ-2-エン-1-オン(TATA)であり、
    前記ポリペプチドが、
    ACMNDWWCAMGWKCA(配列番号3)、
    ACVPDRRCAYMNVCA(配列番号4)、
    ACVVDGRCAYMNVCA(配列番号5)、
    ACVVDSRCAYMNVCA(配列番号6)、
    ACVPDSRCAYMNVCA(配列番号7)、
    ACYVGKECAIRNVCA(配列番号8)、
    ACYVGKECAYMNVCA(配列番号9)、
    ARDCPLVNPLCLHPGWTC(配列番号10)、
    A(HArg)DCPLVNPLCLHPGWTC(配列番号11)、
    CPLVNPLCLHPGWTCLHG(配列番号12)、
    CPLVNPLCLHPGWTCL(D-His)G(配列番号13)、
    CPLVNPLCLHPGWSCRGQ(配列番号14)、
    CPLVNPLCLHPGWSC(HArg)GQ(配列番号15)、
    ACVPDRRCAYMNVC(配列番号16)、
    DLRCGGDPRCAYMNVCA(配列番号17)、
    SRPCVIDSRCAYMNVCA(配列番号18)、
    ESRCSPDARCAYMNVCA(配列番号19)、
    HSGCRPDPRCAYMNVCA(配列番号20)、
    GSGCKPDSRCAYMNVCA(配列番号21)、
    ETVCLPDSRCAYMNVCA(配列番号22)、
    GQVCIVDARCAYMNVCA(配列番号23)、
    ACVPDRRCAFENVCVDH(配列番号24)、
    ACVPDRRCAFMNVCEDR(配列番号25)、
    ACVPDRRCAFQDVCDHE(配列番号26)、
    ACVPDRRCAFRDVCLTG(配列番号27)、
    ACQPSNHCAFMNYCA(配列番号28)、
    ACSPTPACAVQNLCA(配列番号29)、
    ACTSCWAYPDSFCA(配列番号30)、
    ACTKPTGFCAYPDTICA(配列番号31)、
    ACRGEWGYCAYPDTICA(配列番号32)、
    ACRNWGMYCAYPDTICA(配列番号33)、
    ACPDWGKYCAYPDTICA(配列番号34)、
    ACRVYGPYCAYPDTICA(配列番号35)、
    ACSSCWAYPDSVCA(配列番号36)、
    ACQSCWAYPDTYCA(配列番号37)、
    ACGFMGLEPCETFCA(配列番号38)、
    ACGFMGLVPCEVHCA(配列番号39)、
    ACGFMGLEPCEMVCA(配列番号40)、
    ACGFMGLEPCVTYCA(配列番号41)、
    ACGFMGLEPCELVCA(配列番号42)、
    ACGFMGLVPCNVFCA(配列番号43)、
    ACGFMGLEPCELFCA(配列番号44)、
    ACGFMGLEPCELFCMPK(配列番号45)、
    ACGFMGLEPCELYCA(配列番号46)、
    ACGFMGLEPCELYCAHT(配列番号47)、
    ACGFMGLEPCEMYCA(配列番号48)、
    ACGFMGLVPCELYCADN(配列番号49)、
    ACPLVNPLCLTSGWKCA(配列番号50)、
    ACPMVNPLCLHPGWICA(配列番号51)、
    ACPLVNPLCLHPGWICA(配列番号52)、
    ACPLVNPLCLHPGWRCA(配列番号53)、
    ACPLVNPLCNLPGWTCA(配列番号54)、
    ACPLVNPLCLVPGWSCA(配列番号55)、
    ACPLVNPLCLLDGWTCA(配列番号56)、
    ACPLVNPLCLMPGWGCA(配列番号57)、
    ACPLVNPLCMIGNWTCA(配列番号58)、
    ACPLVNPLCLMTGWSCA(配列番号59)、
    ACPLVNPLCMMGGWKCA(配列番号60)、
    ACPLVNPLCLYGSWKCA(配列番号61)、
    ACPLVNPLCLHPGWTCA(配列番号62)、
    ARDCPLVNPLCLHPGWTCA(配列番号63)、
    RPACPLVNPLCLHPGWTCA(配列番号64)、
    RPPCPLVNPLCLHPGWTCA(配列番号65)、
    KHSCPLVNPLCLHPGWTCA(配列番号66)、
    ACPLVNPLCLHPGWTCLHG(配列番号67)、
    ACPLVNPLCLHPGWTCL(D-His)G(配列番号68)、
    ACPLVNPLCLHPG(2Nal)TCLHG(配列番号69)、
    RHDCPLVNPLCLLPGWTCA(配列番号70)、
    TPRCPLVNPLCLMPGWTCA(配列番号71)、
    ACPLVNPLCLAPGWTCA(配列番号72)、
    ACPLVNPLCLAPGWTCSRS(配列番号73)、
    ACPLVNPLCLEPGWTCA(配列番号74)、
    ACPLVNPLCLEPGWTCAKR(配列番号75)、
    ACPLVNPLCLHPGWSCA(配列番号76)、
    ACPLVNPLCLHPGWSCRGQ(配列番号77)、
    ACPLVNPLCLHPGWSC(HArg)GQ(配列番号78)、
    ACPLVNPLCLHPG(2Nal)SCRGQ(配列番号79)、
    ACPLVNPLCLTPGWTCTNT(配列番号80)、
    ACPMVNPLCLHPGWKCA(配列番号81)、
    ACPMVNPLCLTPGWICA(配列番号82)、
    ACPMVNPLCLHPGWTCA(配列番号83)、
    H(D-Asp)VT-C(Aib)(1Nal)G(Aib)F(1Nal)CP(tBuGly)N(HArg)P(D-Asp)C(配列番号84)、
    A(HArg)DC(HyP)(Hse(Me))VNPLCLHP(D-Asp)W(HArg)C(配列番号85)、
    A(HArg)DC(HyP)(Hse(Me))VNPLCLHP(D-Asp)WTC(配列番号86)、
    A(HArg)DC(HyP)LVNPLCLHP(D-Ala)WTC(配列番号87)、
    A(HArg)DCPLVNPLCLHP(D-Ala)WTC(配列番号88)、
    ARDC(HyP)LVNPLCLHPGWTC(配列番号89)、
    ARDCPLVNPLCL(D-3,3-DPA)PGWTC(配列番号90)、
    ARDCPLVNPLCLHPGWTCLH(配列番号91)、
    A(HArg)DCPLVNPLCLHP(D-Cya)WTC(配列番号92)、
    A(D-Arg)DC(HyP)LVNPLCL(D-3,3-DPA)P(D-Asp)W(HArg)C(配列番号93)、および
    CPLVNPLCLHPGWTC(配列番号97)、
    (HyPはヒドロキシプロリンであり、HArgはホモアルギニンであり、Sarはサルコシンであり、D-AspはD-アスパラギン酸であり、2Nalは2-ナフチルアラニンであり、1Nalは1-ナフチルアラニンであり、Aibは2-アミノイソ酪酸であり、tBuGlyはtert-ロイシンであり、hSerMeはホモセリン(メチル)であり、D-AlaはD-アラニンであり、D-3,3-DPAは3,3-ジフェニル-D-アラニンであり、D-CyaはD-システイン酸であり、D-ArgはD-アルギニンであり、HPheはホモフェニルアラニンであり、かつD-HisはD-ヒスチジンである)
    から選択されるアミノ酸配列を含む、ペプチドリガンドまたは薬学的に許容されるその塩
  2. 以下の化合物:
    ACMNDWWCAMGWKCA-Sar-K(Fl) ((配列番号3)-Sar-K(Fl))、
    ACVPDRRCAYMNVCA-Sar-K(Fl) ((配列番号4)-Sar-K(Fl))、
    ACVVDGRCAYMNVCA-Sar-K(Fl) ((配列番号5)-Sar-K(Fl))、
    ACVVDSRCAYMNVCA-Sar-K(Fl) ((配列番号6)-Sar-K(Fl))、
    ACVPDSRCAYMNVCA-Sar-K(Fl) ((配列番号7)-Sar-K(Fl))、
    ACYVGKECAIRNVCA-Sar-K(Fl) ((配列番号8)-Sar-K(Fl))、
    ACYVGKECAYMNVCA-Sar-K(Fl) ((配列番号9)-Sar-K(Fl))、
    Fl-G-Sar-ACYVGKECAYMNVCA (Fl-G-Sar-(配列番号9))、
    Fl-(β-Ala)-Sar10-ARDCPLVNPLCLHPGWTC (Fl-(β-Ala)-Sar10-(配列番号10))、
    Fl-(β-Ala)-Sar10-A(HArg)DCPLVNPLCLHPGWTC (Fl-(β-Ala)-Sar10-(配列番号11))、
    Ac-CPLVNPLCLHPGWTCLHG-Sar-(D-K[Fl]) (Ac-(配列番号12)-Sar-(D-K[Fl]))、
    Ac-CPLVNPLCLHPGWTCL(D-His)G-Sar-(D-K[Fl]) (Ac-(配列番号13)-Sar-(D-K[Fl]))、
    Ac-CPLVNPLCLHPGWSCRGQ-Sar-(D-K[Fl]) (Ac-(配列番号14)- Sar-(D-K[Fl]))、
    Ac-CPLVNPLCLHPGWSC(HArg)GQ-Sar-(D-K[Fl]) (Ac-(配列番号15)- Sar-(D-K[Fl]))、
    (Flは5(6)-カルボキシフルオレセインである)
    ACMNDWWCAMGWKCA (配列番号3)、
    ACVPDRRCAYMNVCA (配列番号4)、
    (β-Ala)-Sar10-ACVPDRRCAYMNVC ((β-Ala)-Sar10-(配列番号16))、
    DLRCGGDPRCAYMNVCA (配列番号17)、
    SRPCVIDSRCAYMNVCA (配列番号18)、
    ESRCSPDARCAYMNVCA (配列番号19)、
    HSGCRPDPRCAYMNVCA (配列番号20)、
    GSGCKPDSRCAYMNVCA (配列番号21)、
    ETVCLPDSRCAYMNVCA (配列番号22)、
    GQVCIVDARCAYMNVCA (配列番号23)、
    ACVPDRRCAFENVCVDH (配列番号24)、
    ACVPDRRCAFMNVCEDR (配列番号25)、
    ACVPDRRCAFQDVCDHE (配列番号26)、
    ACVPDRRCAFRDVCLTG (配列番号27)、
    ACYVGKECAYMNVCA (配列番号9)、
    ACQPSNHCAFMNYCA (配列番号28)、
    ACSPTPACAVQNLCA (配列番号29)、
    ACTSCWAYPDSFCA (配列番号30)、
    ACTKPTGFCAYPDTICA (配列番号31)、
    ACRGEWGYCAYPDTICA (配列番号32)、
    ACRNWGMYCAYPDTICA (配列番号33)、
    ACPDWGKYCAYPDTICA (配列番号34)、
    ACRVYGPYCAYPDTICA (配列番号35)、
    ACSSCWAYPDSVCA (配列番号36)、
    ACQSCWAYPDTYCA (配列番号37)、
    ACGFMGLEPCETFCA (配列番号38)、
    ACGFMGLVPCEVHCA (配列番号39)、
    ACGFMGLEPCEMVCA (配列番号40)、
    ACGFMGLEPCVTYCA (配列番号41)、
    ACGFMGLEPCELVCA (配列番号42)、
    ACGFMGLVPCNVFCA (配列番号43)、
    ACGFMGLEPCELFCA (配列番号44)、
    ACGFMGLEPCELFCMPK (配列番号45)、
    ACGFMGLEPCELYCA (配列番号46)、
    ACGFMGLEPCELYCAHT (配列番号47)、
    ACGFMGLEPCEMYCA (配列番号48)、
    ACGFMGLVPCELYCADN (配列番号49)、
    ACPLVNPLCLTSGWKCA (配列番号50)、
    ACPMVNPLCLHPGWICA (配列番号51)、
    ACPLVNPLCLHPGWICA (配列番号52)、
    ACPLVNPLCLHPGWRCA (配列番号53)、
    ACPLVNPLCNLPGWTCA (配列番号54)、
    ACPLVNPLCLVPGWSCA (配列番号55)、
    ACPLVNPLCLLDGWTCA (配列番号56)、
    ACPLVNPLCLMPGWGCA (配列番号57)、
    ACPLVNPLCMIGNWTCA (配列番号58)、
    ACPLVNPLCLMTGWSCA (配列番号59)、
    ACPLVNPLCMMGGWKCA (配列番号60)、
    ACPLVNPLCLYGSWKCA (配列番号61)、
    ACPLVNPLCLHPGWTCA (配列番号62)、
    ARDCPLVNPLCLHPGWTCA (配列番号63)、
    (β-Ala)-Sar10-A(HArg)DCPLVNPLCLHPGWTC ((β-Ala)-Sar10-(配列番号11))、
    Ac-ARDCPLVNPLCLHPGWTCA-Sar-(D-K) (Ac-(配列番号63)-Sar-(D-K))、
    Ac-A(HArg)DCPLVNPLCLHPGWTCA- Sar-(D-K) (Ac-(配列番号11)-A-Sar-(D-K))、
    RPACPLVNPLCLHPGWTCA (配列番号64)、
    RPPCPLVNPLCLHPGWTCA (配列番号65)、
    KHSCPLVNPLCLHPGWTCA (配列番号66)、
    ACPLVNPLCLHPGWTCLHG (配列番号67)、
    Ac-CPLVNPLCLHPGWTCLHG (Ac-(配列番号12))、
    (β-Ala)-Sar10-ACPLVNPLCLHPGWTCLHG ((β-Ala)-Sar10-(配列番号67))、
    (β-Ala)-Sar10-ACPLVNPLCLHPGWTCL(D-His)G ((β-Ala)-Sar10-(配列番号68))、
    Ac-CPLVNPLCLHPGWTCLHG-Sar-(D-K) (Ac-(配列番号12)-Sar-(D-K))、
    Ac-CPLVNPLCLHPGWTCL(D-His)G-Sar-(D-K) (Ac-(配列番号13)- Sar-(D-K))、
    ACPLVNPLCLHPG(2Nal)TCLHG (配列番号69)、
    RHDCPLVNPLCLLPGWTCA (配列番号70)、
    TPRCPLVNPLCLMPGWTCA (配列番号71)、
    ACPLVNPLCLAPGWTCA (配列番号72)、
    ACPLVNPLCLAPGWTCSRS (配列番号73)、
    ACPLVNPLCLEPGWTCA (配列番号74)、
    ACPLVNPLCLEPGWTCAKR (配列番号75)、
    ACPLVNPLCLHPGWSCA (配列番号76)、
    ACPLVNPLCLHPGWSCRGQ (配列番号77)、
    Ac-CPLVNPLCLHPGWSCRGQ (Ac-(配列番号14))、
    (β-Ala)-Sar10-ACPLVNPLCLHPGWSCRGQ ((β-Ala)-Sar10-(配列番号77))、
    (β-Ala)-Sar10-ACPLVNPLCLHPGWSC(HArg)GQ ((β-Ala)-Sar10-(配列番号78))、
    Ac-CPLVNPLCLHPGWSCRGQ-Sar-(D-K) (Ac-(配列番号14)-Sar-(D-K))、
    Ac-CPLVNPLCLHPGWSC(HArg)GQ-Sar-(D-K) (Ac-(配列番号15) -Sar-(D-K))、
    ACPLVNPLCLHPG(2Nal)SCRGQ (配列番号79)、
    ACPLVNPLCLTPGWTCTNT (配列番号80)、
    ACPMVNPLCLHPGWKCA (配列番号81)、
    ACPMVNPLCLTPGWICA (配列番号82)、
    ACPMVNPLCLHPGWTCA (配列番号83)、
    (β-Ala)-Sar10-H(D-Asp)VT-C(Aib)(1Nal)G(Aib)F(1Nal)CP(tBuGly)N(HArg)P(D-Asp)C ((β-Ala)-Sar10-(配列番号84))、
    (β-Ala)-Sar10-A(HArg)DC(HyP)(Hse(Me))VNPLCLHP(D-Asp)W(HArg)C ((β-Ala)-Sar10-(配列番号85))、
    (β-Ala)-Sar10-A(HArg)DC(HyP)(Hse(Me))VNPLCLHP(D-Asp)WTC ((β-Ala)-Sar10-(配列番号86))、
    (β-Ala)-Sar10-A(HArg)DC(HyP)LVNPLCLHP(D-Ala)WTC ((β-Ala)-Sar10-(配列番号87))、
    (β-Ala)-Sar10-A(HArg)DCPLVNPLCLHP(D-Ala)WTC ((β-Ala)-Sar10-(配列番号88))、
    (β-Ala)-Sar10-ARDC(HyP)LVNPLCLHPGWTC ((β-Ala)-Sar10-(配列番号89))、
    (β-Ala)-Sar10-ARDCPLVNPLCL(D-3,3-DPA)PGWTC ((β-Ala)-Sar10-(配列番号90))、
    (β-Ala)-Sar10-ARDCPLVNPLCLHPGWTCLH ((β-Ala)-Sar10-(配列番号91))、
    Ac-(配列番号12)-Sar-(D-K[Ac])、
    (β-AlaSOH)-Sar-(Cya)-Sar-(Cya)-A(HArg)DCPLVNPLCLHP(D-Cya)WTC ((β-AlaSOH)-Sar-(Cya)-Sar-(Cya)-(配列番号92))、
    (β-Ala)-Sar10-ARDCPLVNPLCLHPGWTC ((β-Ala)-Sar10-(配列番号10))、
    A(HArg)DCPLVNPLCLHPGWTC (配列番号11)、
    (β-Ala)-Sar-(配列番号11)、
    (β-AlaSOH)-Sar10-(配列番号11)、
    (β-Ala)-Sar10-A(D-Arg)DC(HyP)LVNPLCL(D-3,3-DPA)P(D-Asp)W(HArg)C ((β-Ala)-Sar10-(配列番号93))、および
    (β-AlaSOH)-Sar-(配列番号11)
    のいずれか1つから選択される、請求項1に記載のペプチドリガンドまたは薬学的に許容されるその塩
  3. ((β-Ala)-Sar10-A(HArg)D-CPLVNPLCiiLHPGWTCiii((β-Ala)-Sar10-(配列番号11))(BCY6014、化合物67)である、請求項1または2に記載のペプチドリガンドまたは薬学的に許容されるその塩
  4. 前記薬学的に許容される塩が、遊離酸またはナトリウム、カリウム、カルシウム、アンモニウム塩から選択される、請求項1から3のいずれか1項に記載のペプチドリガンドまたは薬学的に許容されるその塩
  5. 前記EphA2がヒトEphA2である、請求項1から4のいずれか1項に記載のペプチドリガンドまたは薬学的に許容されるその塩
  6. 1つまたは複数のエフェクターおよび/または官能基にコンジュゲートされている、請求項1から5のいずれか1項に記載のペプチドリガンドを含む薬物コンジュゲート。
  7. 前記官能基がDM1またはMMAEから選択される細胞傷害剤である、請求項6に記載の薬物コンジュゲート。
  8. 前記ペプチドリガンドと前記細胞傷害剤との間のリンカーを追加的に含む、請求項7に記載の薬物コンジュゲート。
  9. 前記細胞傷害剤がMMAEであり、かつ、前記リンカーが、-Val-Cit-、-Trp-Cit-、-Val-Lys-、-D-Trp-Cit-、-Ala-Ala-Asn-、D-Ala-Phe-Lys-または-Glu-Pro-Cit-Gly-hPhe-Tyr-Leu-(配列番号98)から選択される、請求項8に記載の薬物コンジュゲート。
  10. 前記細胞傷害剤がMMAEであり、かつ、前記リンカーが-Val-Cit-である、請求項9に記載の薬物コンジュゲート。
  11. 前記細胞傷害剤がDM1であり、かつ、前記リンカーが、-S-S-、-SS(SOH)-、-SS-(Me)-、-(Me)-SS-(Me)-、-SS-(Me)-または-SS-(Me)-SOH-から選択される、請求項8に記載の薬物コンジュゲート。
  12. BCY6031:
    BCY6032:
    BCY6061:
    BCY6037:
    BCY6049:
    BCY6053:
    BCY6122:
    BCY6030:
    BCY6034:
    BCY6038:
    BCY6050:
    BCY6054:
    BCY6035:
    BCY6047:
    BCY6051:
    BCY6134:
    BCY6154:
    BCY6155:
    BCY6063:
    BCY6036:
    BCY6048:
    BCY6052:
    BCY6064:
    BCY6162:
    BCY6150:
    BCY6151:
    BCY6161:
    BCY6077:
    BCY6055:
    BCY6026:
    BCY6033:
    および
    BCY6082:
    (式中、
    BCY6014が(β-Ala)-Sar10-A(HArg)DCPLVNPLCLHPGWTC ((β-Ala)-Sar10-(配列番号11)であり、
    BCY6017がA(HArg)DCPLVNPLCLHPGWTC (配列番号11)であり、
    BCY6018が(β-Ala)-Sar-(配列番号11)であり、
    BCY6019がAc-(配列番号12)-Sar-(D-K)であり、
    BCY6137が(β-Ala)-Sar10-ARDCPLVNPLCLHPGWTCLH ((β-Ala)-Sar10-(配列番号91))であり、
    BCY3138が(β-Ala)-Sar10-ARDCPLVNPLCL(D-3,3-DPA)PGWTC ((β-Ala)-Sar10-(配列番号90))であり、
    BCY6152が(β-AlaSOH)-Sar10-(配列番号11)であり、および
    BCY6153が(β-AlaSOH)-Sar-(配列番号11)である)
    のいずれか1つから選択される、請求項6から11のいずれか1項に記載の薬物コンジュゲート。
  13. BCY6031、BCY6033およびBCY6082のいずれか1つから選択される、請求項12に記載の薬物コンジュゲート。
  14. 1つまたは複数の薬学的に許容される賦形剤と組み合わせて請求項1から5のいずれか1項に記載のペプチドリガンドまたは請求項6から13のいずれか1項に記載の薬物コンジュゲートを含む医薬組成物。
  15. 疾患組織におけるEphA2の過剰発現により特徴付けられる疾患または障害の予防、抑制または治療において使用するための、請求項6から13のいずれか1項に記載の薬物コンジュゲート。
  16. がんの予防、抑制または治療において使用するための、請求項6から13のいずれか1項に記載の薬物コンジュゲート。
  17. 前記がんが、前立腺がん、肺がん(例えば、非小細胞肺癌(NSCLC))、乳がん(例えば、トリプルネガティブ乳がん)、胃がん、卵巣がん、食道がん、多発性骨髄腫および線維肉腫から選択される、請求項16に記載の使用のための薬物コンジュゲート。
  18. がんを予防、抑制または治療する方法において、それを必要とする患者に使用するための請求項6から13のいずれか1項に記載の薬物コンジュゲートであって、前記患者が、EphA2の増加したコピー数多型(CNV)を有するとして同定される、薬物コンジュゲート。
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