JP7301924B2 - アミロイドβに対する抗体 - Google Patents
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Description
- 可溶性単量体ヒトAβ1-42および/またはオリゴマーAβ1-42への結合;
- Aβ1-40よりもAβ1-42との結合に対する選択性。それらはAβ1-40との結合を示さなくてもよく、または結合は微々たるものであってもよい。例えば本発明による抗体分子は、500pM以下の解離定数(KD)で、単量体Aβ1-42と結合してもよい。それらはAβ1-40と結合しなくてもよく、または1mMを超えるKDでAβ1-40と結合してもよい;
- ヒトAβ17-42への結合。したがって抗体分子は、Aβ1-42ペプチドのアミノ酸17~42間のエピトープを認識してもよく、より具体的には、抗体分子は、Aβ1-42ペプチドのアミノ酸29~42間のエピトープを認識してもよい;
- 可溶性単量体ヒト3ピロ-42(ピログルタミン酸3)および11ピロ-42(ピログルタミン酸11)への結合;
- ヒトAβ1-43への結合;および
- マウスAβ1-42との交差反応性。
(i)HCDRセットのアミノ酸配列が、抗体Abet0380、Abet0007、Abet0144、Abet0319、Abet0321b、Abet0322b、Abet0323b、Abet0328、Abet0329、Abet0332、Abet0342、Abet0343、Abet0344、Abet0368、Abet0369、Abet0370、Abet0371、Abet0372、Abet0373、Abet0374、Abet0377、Abet0378、Abet0379、Abet0381、Abet0382、およびAbet0383、またはそのGLバージョンのいずれかについて表16に示される通りである、フレームワーク領域が散在するHCDR1、HCDR2、およびHCDR3のHCDRセットを含んでなり、または1つまたは2つのアミノ酸変異があるそのHCDRセットを含んでなってもよい、VH領域、および
(ii)LCDRセットのアミノ酸配列が、抗体Abet0380、Abet0007、Abet0144、Abet0319、Abet0321b、Abet0322b、Abet0323b、Abet0328、Abet0329、Abet0332、Abet0342、Abet0343、Abet0344、Abet0368、Abet0369、Abet0370、Abet0371、Abet0372、Abet0373、Abet0374、Abet0377、Abet0378、Abet0379、Abet0381、Abet0382、およびAbet0383、またはそのGLバージョンのいずれかについて、表16に示される通りである、フレームワーク領域が散在するLCDR1、LCDR2、およびLCDR3のLCDRセットを含んでなり、または1つまたは2つのアミノ酸変異があるそのLCDRセットを含んでなってもよい、VL領域
を含んでなってもよい。
(i)Abet0380のHCDRのアミノ酸配列が、
HCDR1配列番号525、
HCDR2配列番号526、および
HCDR3配列番号527である、Abet0380またはAbet0380 GLのHCDRセットを含んでなり、
または1つまたは2つのアミノ酸変異があるAbet0380またはAbet0380 GLのHCDセットを含んでなってもよい、VH領域、および
(ii)Abet0380のLCDRのアミノ酸配列が、
LCDR1配列番号534
LCDR2配列番号535、および
LCDR3配列番号536である、Abet0380またはAbet0380 GLのLCDRセットを含んでなり、
または1つまたは2つのアミノ酸変異があるAbet0380またはAbet0380 GLのLCDRセットを含んでなってもよい、VL領域
を含んでなってもよい。
(i)HCDRのアミノ酸配列が、
HCDR1配列番号525、
HCDR2配列番号526、および
HCDR3配列番号527であり、フレームワーク領域が散在する、HCDR1、HCDR2、およびHCDR3のHCDRセットを含んでなり、
または1つまたは複数のアミノ酸置換があるHCDRセットを含んでなり、前記1つまたは複数の置換が表12または表14に示されるものから選択されるHCDRセットを含んでなってもよい、VH領域、および
(ii)LCDRのアミノ酸配列が、
LCDR1配列番号534、
LCDR2配列番号535、および
LCDR3配列番号536であり、フレームワーク領域が散在する、LCDR1、LCDR2、およびLCDR3のLCDRセットを含んでなり、
または1つまたは複数のアミノ酸置換があるLCDRセットを含んでなり、前記1つまたは複数の置換が表13または表15に示されるものから選択されるLCDRセットを含んでなってもよい、VL領域
を含んでなってもよい。
FW1配列番号528、
FW2配列番号529、
FW3配列番号530、および
FW4配列番号531であり、
またはFW1は、表12または表14に示されるものから選択される1つまたは複数のアミノ酸置換がある、配列番号528を含んでなる。
FW1配列番号537
FW2配列番号538
FW3配列番号539、および
FW4配列番号540である。
(i)Abet0380、Abet0343、Abet0369、Abet0377、およびAbet0382、またはそのGLバージョンのいずれかについて、表16に示される通りであり、
または1つまたは2つのアミノ酸変異があるそのアミノ酸配列を含んでなってもよい、VH領域アミノ酸配列、および
(ii)Abet0380、Abet0343、Abet0369、Abet0377、およびAbet0382、またはそのGLバージョンのいずれかについて、表16に示される通りであり、
または1つまたは2つのアミノ酸変異があるそのアミノ酸配列を含んでなってもよい、VL領域アミノ酸配列
を含んでなってもよい。
アミノ酸26はM、GまたはSであり;
アミノ酸27はG、FまたはDであり;
アミノ酸28はN、T、DまたはHであり;
アミノ酸29はFであり;
アミノ酸30はN、S、K、またはPであり;
アミノ酸31はY、V、R、E、またはTであり;
アミノ酸32はQ、Y、D、S、またはEであり;
アミノ酸33はT、P、I、またはVであり;
アミノ酸34はMであり;
アミノ酸35はWであり;
アミノ酸50はVであり;
アミノ酸51はIであり;
アミノ酸52はGであり;
アミノ酸52aはK、S、またはAであり;
アミノ酸53はT、S、N、D、G、またはQであり;
アミノ酸54はN、G、T、またはPであり;
アミノ酸55はE、G、N、K、またはTであり;
アミノ酸56はN、T、R、またはKであり;
アミノ酸57はI、T、K、またはVであり;
アミノ酸58はA、V、またはTであり;
アミノ酸59はYであり;
アミノ酸60はAであり;
アミノ酸61はDであり;
アミノ酸62はSであり;
アミノ酸63はVであり;
アミノ酸64はKであり;
アミノ酸65はGであり;
アミノ酸95はEであり;
アミノ酸96はWであり;
アミノ酸97はMであり;
アミノ酸98はDであり;
アミノ酸99はHであり;
アミノ酸100はSであり;
アミノ酸100aはRであり;
アミノ酸100bはPであり;
アミノ酸100cはYであり;
アミノ酸100dはYであり;
アミノ酸100eはYであり;
アミノ酸100fはYであり;
アミノ酸100gはGであり;
アミノ酸100hはMであり;
アミノ酸101はDであり;
アミノ酸102はVであり;
および式中、VL領域内では:
アミノ酸24はSであり;
アミノ酸25はGであり;
アミノ酸26はHであり;
アミノ酸27はNであり;
アミノ酸28はL、またはIであり;
アミノ酸29はE、またはGであり;
アミノ酸30はDであり;
アミノ酸31はKであり;
アミノ酸32はF、またはWであり;
アミノ酸33はA、またはVであり;
アミノ酸34はSであり;
アミノ酸50はRであり;
アミノ酸51はDであり;
アミノ酸52はDであり;
アミノ酸53はKであり;
アミノ酸54はRであり;
アミノ酸55はPであり;
アミノ酸56はSであり;
アミノ酸89はS、またはQであり;
アミノ酸90はS、またはAであり;
アミノ酸91はQであり;
アミノ酸92はDであり;
アミノ酸93はT、またはSであり;
アミノ酸94はV、またはTであり;
アミノ酸95はTであり;
アミノ酸96はRであり;
アミノ酸97はVである。
アミノ酸26はM、G、S、V、A、N、T、またはHであり;
アミノ酸27はG、F、S、Y、E、D、またはPであり;
アミノ酸28はN、Q、H、V、E、T、A、S、D、M、またはPであり;
アミノ酸29はF、I、Y、S、L、またはWであり;
アミノ酸30はN、S、T、Q、K、H、R、G、P、E、K、A、またはDであり;
アミノ酸31はY、H、K、E、N、T、R、V、P、M、F、I、D、またはWであり;
アミノ酸32はQ、Y、D、N、S、E、またはTであり;
アミノ酸33はT、P、I、またはVであり;
アミノ酸34はM、またはLであり;
アミノ酸35はWであり;
アミノ酸50はVであり;
アミノ酸51はIであり;
アミノ酸52はGであり;
アミノ酸52aはK、S、P、A、N、G、E、D、V、またはTであり;
アミノ酸53はT、S、N、H、Q、D、G、またはEであり;
アミノ酸54はN、G、P、T、Q、E、M、K、またはAであり;
アミノ酸55はE、G、K、N、Q、T、H、D、またはAであり;
アミノ酸56はN、T、A、R、またはKであり;
アミノ酸57はI、T、N、S、K、F、Q、V、またはLであり;
アミノ酸58はA、V、S、T、またはNであり;
アミノ酸59はYであり;
アミノ酸60はAであり;
アミノ酸61はDであり;
アミノ酸62はS、A、またはTであり;
アミノ酸63はVであり;
アミノ酸64はKであり;
アミノ酸65はGであり;
アミノ酸95はEであり;
アミノ酸96はWであり;
アミノ酸97はMであり;
アミノ酸98はD、またはGであり;
アミノ酸99はH、またはRであり;
アミノ酸100はSであり;
アミノ酸100aはRであり;
アミノ酸100bはPであり;
アミノ酸100cはYであり;
アミノ酸100dはYであり;
アミノ酸100eはYであり;
アミノ酸100fはYであり;
アミノ酸100gはGであり;
アミノ酸100hはM、またはIであり;
アミノ酸101はDであり;
アミノ酸102はV、またはAであり;
および式中、VL領域内では:
アミノ酸24はS、またはTであり;
アミノ酸25はG、またはTであり;
アミノ酸26はH、R、またはPであり;
アミノ酸27はN、またはHであり;
アミノ酸28はL、I、V、F、またはTであり;
アミノ酸29はE、M、G、S、またはNであり;
アミノ酸30はD、A、S、G、またはHであり;
アミノ酸31はK、またはSであり;
アミノ酸32はF、またはWであり;
アミノ酸33はA、V、M、T、またはIであり;
アミノ酸34はS、T、またはAであり;
アミノ酸50はRであり;
アミノ酸51はDであり;
アミノ酸52はDであり;
アミノ酸53はKであり;
アミノ酸54はRであり;
アミノ酸55はPであり;
アミノ酸56はSであり;
アミノ酸89はS、Q、またはAであり;
アミノ酸90はS、A、またはTであり;
アミノ酸91はQであり;
アミノ酸92はD、またはGであり;
アミノ酸93はT、Q、S、N、またはKであり;
アミノ酸94はV、T、またはFであり;
アミノ酸95はTであり;
アミノ酸96はRであり;
アミノ酸97はV、S、またはAである。
(i)Abet0380、Abet0343、Abet0369、Abet0377、およびAbet0382、またはそのGLバージョンのいずれかについて表16に示されるVH領域アミノ酸配列と、少なくとも90%同一であるアミノ酸配列を有するVH領域;および
(ii)Abet0380、Abet0343、Abet0369、Abet0377、およびAbet0382、またはそのGLバージョンのいずれかについて、表16に示されるVL領域アミノ酸配列と、少なくとも90%同一であるアミノ酸配列を有するVL領域
を含んでなってもよい。
(i)VH領域アミノ酸配列番号524およびVL領域アミノ酸配列番号533を含んでなる抗体分子、
(ii)NCIMB 41890、41891または41892の受入番号の下に寄託された核酸によってコードされる抗体分子
と競合するものであってもよい。
(i)受入番号41890の下に寄託されたAbet0380-GL核酸配列;
(ii)受入番号41891の下に寄託されたAbet0144-GL核酸配列;または(ii)受入番号41892の下に寄託されたAbet0377-GL核酸配列
によってコードされる、VH領域およびVL領域を含んでなってもよい。
HCDR1は、Kabat残基31~35からなる5アミノ酸長であってもよく;
HCDR2は、Kabat残基50~65からなる17アミノ酸長であってもよく;
HCDR3は、Kabat残基95~102からなる16アミノ酸長であってもよく;
LCDR1は、Kabat残基24~34からなる11アミノ酸長であってもよく;
LCDR2は、Kabat残基50~56からなる7アミノ酸長であってもよく;および/または
LCDR3は、Kabat残基89~97からなる9アミノ酸長であってもよい。
Abet0380またはAbet0380GLのHCDRのアミノ酸配列が、
HCDR1配列番号525、
HCDR2配列番号526、および
HCDR3配列番号527である、
Abet0380またはAbet0380GLのHCDRセットを含んでなり、
または1つまたは2つのアミノ酸変異があるAbet0380のHCDRセットを含んでなる、VH領域、および
(ii)Abet0380またはAbet0380GLのLCDRのアミノ酸配列が、
LCDR1配列番号534、
LCDR2配列番号535、および
LCDR3配列番号536である、
Abet0380またはAbet0380GLのLCDRセットを含んでなり、
または1つまたは2つのアミノ酸変異がある、Abet0380またはAbet0380GLのLCDRセットを含んでなる、VL領域
を含んでなってもよい。
VH FW1中の26、27、28、29または30;
VH CDR1中の31、32、33、34または35;
VH CDR2中の52a、53、54、55、56、57、58または62;
VH CDR3中の98、99、100hまたは102;
VL CDR1中の24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34;
VL CDR3中の89、90、92、93、94または97
のKabat残基の1つまたは複数であってもよい。
FW1配列番号528;
FW2配列番号529;
FW3配列番号530;
FW4配列番号531
の重鎖フレームワーク領域セットを含んでなってもよく、
または例えば置換である、1、2、3、4、5、6または7個のアミノ酸変異がある、重鎖フレームワーク領域の前記セットを含んでなってもよい。
FW1配列番号537;
FW2配列番号538;
FW3配列番号539;
FW4配列番号540
の軽鎖フレームワーク領域セットを含んでなってもよく、
または例えば置換である、1、2、3、4、5、または6個のアミノ酸変異がある、前記セット軽鎖フレームワーク領域を含んでなってもよい。
(i)Abet0380、Abet0343、Abet0369、Abet0377、およびAbet0382、またはその生殖系列化バージョンのいずれかについて、表16または添付の配列表に示される通りであり、または1つまたは2つのアミノ酸変異があるそのアミノ酸配列を含んでなる、VH領域アミノ酸配列、および
(ii)Abet0380、Abet0343、Abet0369、Abet0377、およびAbet0382、またはその生殖系列化バージョンのいずれかについて、表16または添付の配列表に示される通りであり、または1つまたは2つのアミノ酸変異があるそのアミノ酸配列を含んでなる、VL領域アミノ酸配列
を含んでなってもよい。
(i)Abet0380、Abet0343、Abet0369、Abet0377、およびAbet0382、またはその生殖系列化バージョンのいずれかについて、表16に示されるVH領域アミノ酸配列と、少なくとも90%、95%または98%同一であるアミノ酸配列を有するVH領域;および
(ii)Abet0380、Abet0343、Abet0369、Abet0377、およびAbet0382、またはその生殖系列化バージョンのいずれかについて、表16に示されるVL領域アミノ酸配列と、少なくとも90%、95%または98%同一であるアミノ酸配列を有するVL領域
を含んでなってもよい。
(i)VH領域アミノ酸配列は配列番号524で示され、VL領域アミノ酸配列は配列番号533で示され;
(ii)VH領域アミノ酸配列は、配列番号524と比較して、1、2、3、4、5、6、7、8、9または10個のアミノ酸置換を有し、VL領域アミノ酸配列は、配列番号533と比較して、1、2、3、4、5、6、7、8、9または10個のアミノ酸置換を有し;または
(iii)VH領域アミノ酸配列は、配列番号524と、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%または少なくとも95%の配列同一性を有し、VL領域アミノ酸配列は、配列番号533と、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%または少なくとも95%の配列同一性を有する。
(i)寄託受入番号NCIMB 41889(Abet0007);
(ii)寄託受入番号NCIMB 41890(Abet0380-GL);
(iii)寄託受入番号NCIMB 41891(Abet0144-GL);
(iv)寄託受入番号NCIMB 41892(Abet0377-GL)
のいずれかの核酸配列および/またはベクターによってコードされる、CDR、VH領域、VL領域、抗体-抗原結合部位または抗体分子を含んでなってもよい。
結合メンバーという用語は、互いに結合する一対の分子の一方のメンバーを表現する。結合対のメンバーは、天然由来であっても、または完全にまたは部分的に合成的に生成されてもよい。対の分子の一方のメンバーは、その表面に領域または窩洞を有し、それは対の分子の他方のメンバーの特定の空間的および極性機構と結合し、したがってそれと相補的である。結合対のタイプの例は、抗原-抗体、ビオチン-アビジン、ホルモン-ホルモン受容体、受容体-リガンド、酵素-基質である。本発明は、抗原-抗体タイプの反応に関する。
これは、天然であるか、または部分的にまたは完全に合成的に製造されたかどうかに関わりなく、免疫グロブリンを表現する。用語はまた、抗体抗原結合部位を含んでなる、あらゆるポリペプチドまたはタンパク質を包含する。本明細書中では、本発明は、天然形態の抗体に関するものでないことが、理解されるべきであり、すなわちそれらはそれらの天然環境中にないが、それらは天然原料からの精製によって単離または入手され得て、さもなければ遺伝子組換えによって、または化学合成によって入手され得て、次にそれらは、後述するように非天然アミノ酸を含有し得る。抗体抗原結合部位を含んでなる抗体断片としては、Fab、Fab’、Fab’-SH、scFv、Fv、dAb、およびFdなどの分子が挙げられるが、これに限定されるものではない。例えばFab2、Fab3、二特異性抗体、三特異性抗体、四特異性抗体、およびミニ抗体をはじめとする、1つまたは複数の抗体抗原結合部位を含む、様々なその他の抗体分子が、改変されている。抗体分子とそれらの構築および利用方法は、Holliger & Hudson,Nature Biotechnology 23(9):1126-1136 2005に記載される。
これは、標的抗原の全部または一部と結合する相補的な分子の部分を表現する。抗体分子中では、それは抗体抗原結合部位と称され、標的抗原の全部または一部と結合する相補的な抗体の一部を含んでなる。抗原が大型である場合、抗体は抗原の特定部分のみと結合してもよく、その部分はエピトープと称される。抗体抗原結合部位は、1つまたは複数の抗体可変ドメインによって提供されてもよい。抗体抗原結合部位は、抗体軽鎖可変領域(VL)および抗体重鎖可変領域(VH)を含んでなってもよい。
これは、その中で本発明の結合メンバー、またはこのような結合メンバーをコードする核酸が、一般的に、本発明に従っている状態を指す。したがって本発明による結合メンバー、VHおよび/またはVL領域、およびコード核酸分子およびベクターは、例えばそれらの天然環境から単離および/または精製されて、実質的に純粋または均質形態で提供されてもよく、または核酸の場合は、必要な機能があるポリペプチドをコードする配列以外の起源の核酸または遺伝子を含まず、または実質的に含まずに提供されてもよい。単離メンバーおよび単離核酸は、天然環境内で、またはこのような調製品が生体外または生体内で実施される組換えDNA技術による場合は、その中でそれらが調製される環境(例えば細胞培養物)内で、それらと共に見られる、その他のポリペプチドまたは核酸などの、それらが天然に結合している物質を含まず、または実質的に含まないであろう。メンバーおよび核酸は、希釈剤またはアジュバントと配合され、なおも実用的目的のために単離されてもよく、例えば、免疫測定法で使用されるマイクロタイタープレートの被覆に使用される場合、常態ではメンバーはゼラチンまたはその他の担体と混合され、または診断または治療で使用される場合は、薬学的に許容可能な担体または希釈剤と混合されるであろう。結合メンバーは、自然に、あるいは異種真核生物細胞系(例えばCHOまたはNS0(ECACC 85110503))細胞によって、グリコシル化されていてもよく、または(例えば原核細胞中の発現によって生成される場合)それらはグリコシル化されていなくてもよい。
(a)置換されるCDR3を含みまたはCDR3コード領域を欠く、VH領域をコードする核酸の出発レパートリーを提供するステップと;
(b)VH領域をコードする核酸の生成物レパートリーを提供するように、ドナー核酸がレパートリー中のCDR3領域内に挿入されるように、前記レパートリーと、例えば表11に示されるVH CDR3などのVH CDR3について実質的に本明細書で示される通りのアミノ酸配列をコードする前記ドナー核酸とを組み合わせるステップと;
(c)前記生成物レパートリーの核酸を発現するステップと;
(d)ヒトAβ1-42の結合メンバーを選択するステップと;
(e)前記結合メンバーまたはそれをコードする核酸を回収するステップと
を含んでなる。
- アルカリホスファターゼ、グルコース-6-リン酸デヒドロゲナーゼ(「G6PDH」)、α-D-ガラクトシダーゼ、グルコースオキシダーゼ、グルコースアミラーゼ、炭酸脱水酵素、アセチルコリンエステラーゼ、リゾチーム、リンゴ酸デヒドロゲナーゼ、および例えば西洋ワサビペルオキシダーゼのようなペルオキシダーゼなどの酵素;
- 染料;
- フルオレセインおよびその誘導体、蛍光色素、ローダミン化合物および誘導体、GFP(GFPは「緑色蛍光タンパク質(Green Fluorescent Protein)を指す)、ダンシル、ウンベリフェロン、フィコエリトリン、フィコシアニン、アロフィコシアニン、o-フタルアルデヒド、およびフルオレスカミンなどの蛍光性標識または蛍光物質;例えばユウロピウム(Perkin Elmer and Cis Biointernational)などのランタニドクリプテートおよびキレートなどのフルオロフォア;
- イソルミノール、ルミノール、およびジオキセタンなどの化学発光標識または化学発光物質;
- ルシフェラーゼおよびルシフェリンなどの生物ルミネセンス標識;
- 増感剤;
- 補酵素;
- 酵素基質;
- 臭素77、炭素14、コバルト57、フッ素8、ガリウム67、ガリウム68、水素3(トリチウム)、インジウム111、インジウム113m、ヨウ素123m、ヨウ素125、ヨウ素126、ヨウ素131、ヨウ素133、水銀107、水銀203、亜リン酸32、レニウム99m、レニウム101、レニウム105、ルテニウム95、ルテニウム97、ルテニウム103、ルテニウム105、スカンジウム47、セレン75、イオウ35、テクネチウム99、テクネチウム99m、テルル121m、テルル122m、テルル125m、ツリウム165、ツリウム167、ツリウム168、イットリウム199、および本明細書で言及されるその他の放射性標識をはじめとするが、これに限定されるものではない放射性標識;
- 染料、触媒またはその他の検出可能な基で、さらに標識されてもよい、ラテックスまたは炭素粒子などの粒子;金属ゾル;微結晶;リポソーム;細胞など;
- ビオチン、ジゴキシゲニンまたは5-ブロモデオキシウリジンなどの分子;
- 例えば、シュードモナス属(Pseudomonas)菌体外毒素(PEまたはその細胞毒性断片また変異体)、ジフテリア毒素またはその細胞毒性断片または変異体、ボツリヌス毒素A、B、C、D、EまたはF、リシンまたは例えばリシンAなどのその細胞毒性断片、アブリンまたはその細胞毒性断片、サポリンまたはその細胞毒性断片、アメリカヤマゴボウ抗ウイルス毒素またはその細胞毒性断片、およびブリオジン1またはその細胞毒性断片の群から選択される、毒素部分などの毒素部分
が挙げられる。
1.ヒトアミロイドβ1-40ペプチド(Aβ1-40)に比べて、ヒトアミロイドβ1-42ペプチド(Aβ1-42)との結合について選択的であり、可溶性単量体ヒトAβ1-42および低nオリゴマー(五量体以下)ヒトAβ1-42と結合できる、単離抗体分子。
2.前記抗体分子が、500pM以下の解離定数(KD)で単量体Aβ1-42と結合し、Aβ1-40と結合せず、または1mMを超えるKDでAβ1-40と結合する、上記1に記載の抗体分子。
3.前記抗体分子が、アミロイドβ17-42ペプチド(Aβ17-42)およびアミロイドβ29-42ペプチド(Aβ29-42)と結合する、上記1または上記2に記載の抗体分子。
4.前記抗体分子が、3-ピロ-42アミロイドβペプチドおよび11-ピロ-42アミロイドβペプチドと結合する、上記1~3のいずれかに記載の抗体分子。
5.前記抗体分子が、アミロイドβ1-43ペプチド(Aβ1-43)と結合する、上記1~4のいずれかに記載の抗体分子。
6.(i)HCDRセットのアミノ酸配列が、抗体Abet0380、Abet0319、Abet0321b、Abet0322b、Abet0323b、Abet0328、Abet0329、Abet0332、Abet0342、Abet0343、Abet0369、Abet0370、Abet0371、Abet0372、Abet0373、Abet0374、Abet0377、Abet0378、Abet0379、Abet0381、Abet0382、およびAbet0383、またはその生殖系列化バージョンのいずれかについて表16に示される通りである、フレームワーク領域が散在する、HCDR1、HCDR2、およびHCDR3のHCDRセットを含んでなり、
または1つまたは2つのアミノ酸変異がある前記HCDRセットを含んでなる、VH領域、ならびに
(ii)LCDRセットのアミノ酸配列が、抗体Abet0380、Abet0319、Abet0321b、Abet0322b、Abet0323b、Abet0328、Abet0329、Abet0332、Abet0342、Abet0343、Abet0369、Abet0370、Abet0371、Abet0372、Abet0373、Abet0374、Abet0377、Abet0378、Abet0379、Abet0381、Abet0382、およびAbet0383、またはその生殖系列化バージョンのいずれかについて、表16に示される通りである、フレームワーク領域が散在する、LCDR1、LCDR2およびLCDR3のLCDRのセットを含んでなり、
または1つまたは2つのアミノ酸変異がある前記LCDRセットを含んでなる、VL領域を含んでなる、ヒトAβ1-42に対する単離抗体分子。
7.(i)Abet0380のHCDRのアミノ酸配列が、
HCDR1配列番号525、
HCDR2配列番号526、および
HCDR3配列番号527である、
前記Abet0380のHCDRセットを含んでなり、
または1つまたは2つのアミノ酸変異がある前記Abet0380のHCDRセットを含んでなる、VH領域、ならびに
(ii)Abet0380のLCDRのアミノ酸配列が、
LCDR1配列番号534、
LCDR2配列番号535、および
LCDR3配列番号536である、
前記Abet0380のLCDRセットを含んでなり、
または1つまたは2つのアミノ酸変異がある前記Abet0380のLCDRセットを含んでなる、VL領域
を含んでなる、上記1~6のいずれかに記載の抗体分子。
8.(i)HCDRのアミノ酸配列が、
HCDR1配列番号525、
HCDR2配列番号526、および
HCDR3配列番号527である、
フレームワーク領域が散在するHCDR1、HCDR2、およびHCDR3のHCDRセットを含んでなり、
または1つまたは複数のアミノ酸置換があるHCDRセットを含んでなり、前記1つまたは複数の置換が表12または表14に示されるものから選択されるVH領域、ならびに
(ii)LCDRのアミノ酸配列が、
LCDR1配列番号534
LCDR2配列番号535、および
LCDR3配列番号536である、フレームワーク領域が散在するLCDR1、LCDR2、およびLCDR3のLCDRセットを含んでなり、
または1つまたは複数のアミノ酸置換があるLCDRセットを含んでなり、前記1つまたは複数の置換が表13または表15に示されるものから選択されるVL領域
を含んでなる、上記1~7のいずれかに記載の抗体分子。
9.前記VH領域が、重鎖フレームワーク領域FW1、FW2、FW3、およびFW4を含んでなり、前記重鎖フレームワーク領域のアミノ酸配列が、
FW1配列番号528
FW2配列番号529
FW3配列番号530、および
FW4配列番号531であり、
またはFW1が、1つまたは複数のアミノ酸置換のある配列番号528を含んでなり、前記FW1中の前記1つまたは複数の置換が、表12または表14に示されるものから選択される、上記6~8のいずれかに記載の抗体分子。
10.前記VL領域が、軽鎖フレームワーク領域FW1、FW2、FW3、およびFW4を含んでなり、前記軽鎖フレームワーク領域のアミノ酸配列が、
FW1配列番号537
FW2配列番号538
FW3配列番号539、および
FW4配列番号540である、上記6~9のいずれかに記載の抗体分子。
11.(i)Abet0380、Abet0343、Abet0369、Abet0377、およびAbet0382、またはその生殖系列化バージョンのいずれかについて、表16に示される通りであり、
または1つまたは2つのアミノ酸変異がある前記アミノ酸配列を含んでなる、VH領域アミノ酸配列、および
(ii)Abet0380、Abet0343、Abet0369、Abet0377、およびAbet0382、またはその生殖系列化バージョンのいずれかについて、表16に示される通りであり、
または1つまたは2つのアミノ酸変異がある前記アミノ酸配列を含んでなる、VL領域アミノ酸配列を含んでなる、上記1~6のいずれかに記載の抗体分子。
12.(i)Abet0380、Abet0343、Abet0369、Abet0377、およびAbet0382、またはその生殖系列化バージョンのいずれかについて、表16に示されるVH領域アミノ酸配列と、少なくとも90%同一であるアミノ酸配列を有するVH領域;および
(ii)Abet0380、Abet0343、Abet0369、Abet0377、およびAbet0382、またはその生殖系列化バージョンのいずれかについて、表16に示されるVL領域アミノ酸配列と、少なくとも90%同一であるアミノ酸配列を有するVL領域
を含んでなる、上記1~6のいずれかに記載の抗体分子。
13.Abet0380、Abet0343、Abet0369、Abet0377、およびAbet0382、またはその生殖系列化バージョンのいずれかのVH領域およびVL領域と、それぞれ少なくとも90%同一であるVH領域およびVL領域を含んでなる、上記12に記載の抗体分子。
14.Abet0380、Abet0343、Abet0369、Abet0377、およびAbet0382、またはその生殖系列化バージョンのいずれかのVH領域およびVL領域を含んでなる、上記11~13のいずれかに記載の抗体分子。
15.Abet0380-GLのVH領域アミノ酸配列番号524およびAbet0380-GLのVL領域アミノ酸配列番号533を含んでなる、上記14に記載の抗体分子。16.VH領域アミノ酸配列番号524およびVL領域アミノ酸配列番号533を含んでなる抗体分子と、Aβ1-42との結合について競合する、抗体分子。
17.(i)受入番号41890の下に寄託されたAbet0380-GL核酸配列;または (ii)受入番号41892の下に寄託されたAbet0377-GL核酸配列
によってコードされるVH領域およびVL領域を含んでなる抗体分子。
18.ヒトIgGである、上記1~17のいずれかに記載の抗体分子。
19.ヒトIgG1またはヒトIgG2である、上記18に記載の抗体分子。
20.ヒトIgG1-TM、IgG1-YTEまたはIgG1-TM-YTEである、上記19に記載の抗体分子。
21.上記1~20のいずれかに記載の抗体分子と、薬学的に許容可能な賦形剤とを含んでなる組成物。
22.人体または動物体の治療法で使用するための、上記1~20のいずれかに記載の抗体分子を含んでなる組成物。
23.アミロイドーシスの低下、アルツハイマー病の治療、アルツハイマー病またはダウン症候群患者における認知力の改善または認知低下の低減、および/または黄斑変性の治療で使用するための、上記22に記載の組成物。
24.上記1~20のいずれかに記載の抗体分子を個体に投与するステップを含んでなる、個体において、アミロイドーシスを低下させ、アルツハイマー病を治療し、アルツハイマー病またはダウン症候群患者の認知力を改善しまたは認知低下を低減し、および/または黄斑変性を治療する方法。
25.上記1~20のいずれかに記載の抗体分子をコードする、単離核酸。
26.上記25に記載の核酸で試験管内で形質転換された、宿主細胞。
27.前記抗体分子を生成する条件下で、上記26に記載の宿主細胞を培養するステップを含んでなる、上記1~20のいずれかに記載の抗体分子を生成する方法。
28.前記抗体分子を単離および/または精製するステップをさらに含んでなる、上記27に記載の方法。
29.前記抗体分子を少なくとも1つの追加的な成分を含んでなる組成物に調合するステップをさらに含んでなる、上記28に記載の方法。
30.親VH領域HCDR1、HCDR2、およびHCDR3が、表5に示される通りのHCDRのセットである、HCDR1、HCDR2、およびHCDR3を含んでなる親VH領域のアミノ酸配列中の1つまたは複数のアミノ酸の付加、欠失、置換または挿入の手段によって、前記親VH領域のアミノ酸配列変種であるVH領域を提供するステップと、 任意選択的に、このようにして提供された前記VH領域を1つまたは複数のVL領域と組み合わせ、1つまたは複数のVH/VLの組み合わせを提供するステップと;
前記親VH領域のアミノ酸配列変種である前記VH領域または前記VH/VLの組み合わせを検査して、ヒトAβの抗体抗原結合領域を同定するステップと
を含んでなる、ヒトAβ1-42に対する抗体抗原結合領域を生成する方法。
31.前記親VH領域が、表16に示される通りのAbet0380、Abet0343、Abet0369、Abet0377、およびAbet0382、またはその生殖系列化バージョンのいずれかのVH領域である、上記30に記載の方法。
32.前記1つまたは複数のVL領域が、LCDR1、LCDR2、およびLCDR3を含んでなる親VL領域のアミノ酸配列中の1つまたは複数のアミノ酸の付加、欠失、置換または挿入の手段によって提供され、前記親VL領域LCDR1、LCDR2、およびLCDR3が、表6に示される通りのVL CDRセットであり、それぞれが前記親VL領域のアミノ酸配列変種である、1つまたは複数のVL領域を生成する、上記30または31に記載の方法。
33.前記親VL領域が、表16に示される通りのAbet0380、Abet0343、Abet0369、Abet0377、およびAbet0382、またはその生殖系列化バージョンのいずれかのVL領域である、上記32に記載の方法。
34.IgG、scFvまたはFab抗体分子の成分として、前記抗体抗原結合領域を生成するステップをさらに含んでなる、上記30~33のいずれかに記載の方法。
35.VH領域をコードする出発核酸、またはそれぞれVH領域をコードする核酸の出発レパートリーを提供するステップであって、前記VH領域またはVH領域が、置換されるHCDR1、HCDR2および/またはHCDR3を含んでなるか、またはHCDR1、HCDR2および/またはHCDR3をコードする領域を欠失しているかのいずれかである前記ステップと;
ドナー核酸またはドナー核酸群が、前記出発核酸または出発レパートリーのCDR1、CDR2および/またはCDR3領域中に挿入されて、VH領域をコードする核酸の生成物レパートリーを提供するように、前記出発核酸または出発レパートリーと、表5に示されるHCDR1、HCDR2、および/またはHCDR3、またはその変異によって生成されるアミノ酸配列をコードする前記ドナー核酸またはドナー核酸群とを組み合わせるステップと;
前記生成物レパートリーの核酸を発現して生成物VH領域を生成するステップと;
任意選択的に、前記生成物VH領域を1つまたは複数のVL領域と組み合わせるステップと;
生成物VH領域および任意選択的にVL領域を含んでなる、Aβ1-42の結合メンバー選択するステップと;
前記結合メンバーまたはそれをコードする核酸を回収するステップ
とを含んでなる、ヒトAβ1-42と結合する結合メンバーを生成する方法。
36.前記ドナー核酸が、前記HCDR1および/またはHCDR2の変異によって生成される、上記35に記載の方法。
37.前記ドナー核酸が、HCDR3の変異によって生成される、上記35に記載の方法。
38.核酸のランダム変異によって前記ドナー核酸を提供するステップを含んでなる、上記35に記載の方法。
39.前記回収された結合メンバー内に含まれる生成物VH領域を、抗体定常領域に付着させるステップをさらに含んでなる、上記35~38のいずれかに記載の方法。
40.前記生成物VH領域およびVL領域を含んでなる、IgG、scFvまたはFab抗体分子を提供するステップを含んでなる、上記35~39のいずれかに記載の方法。
大腸菌(E.coli)TOP10細胞Abet0007=NCIMB 41889
大腸菌(E.coli)TOP10細胞Abet0380-GL=NCIMB 41890
大腸菌(E.coli)TOP10細胞Abet0144-GL=NCIMB 41891
大腸菌(E.coli)TOP10細胞Abet0377-GL=NCIMB 41892
寄託日=2011年11月2日
1.1 アミロイドβペプチドの調合
ビオチン化ヒトアミロイドβ1-42ペプチド(rPeptide,USA;カタログ番号A1117またはBachem AG,Switzerland;カタログ番号H-5642)を1%水酸化アンモニウム溶液(v/v)中で1mg/mlに再懸濁して、必要になるまで、アリコートで-80℃で保存した。未標識ヒトアミロイドβ1-42ペプチド(Anaspec,USA;カタログ番号64129)、未標識ヒトアミロイドβ1-40ペプチド(rPeptide,USA;カタログ番号A1155)、ビオチン化ヒトアミロイドβ1-40ペプチド(rPeptide,USA;カタログ番号A111またはBachem AG,Switzerland;カタログ番号H-5914)、ビオチン化マウスアミロイドβ1-42ペプチド(Anaspec,USA;カタログ番号61718-01)、およびビオチン化マウスアミロイドβ1-40ペプチド(Anaspec,USA;カタログ番号61717)についても、同一手順に従った。
繊維状ファージM13ベースのファージミドベクターにクローン化されたFab310-λファージディスプレイライブラリー(Dyax,USA)を、選択のために使用した(Hoet et al.,2005)。基本的に、以前記載されているようにして、合成ヒトビオチン化アミロイドβ1-42(rPeptide,USA)上で一連の選択サイクルを使用して、ファージディスプレイライブラリーから抗アミロイドβ1-42特異的Fab抗体を単離した(Hawkins et al.,1992;Vaughan et al.,1996)。手短に述べると、溶液相選択の第1ラウンドでは、100倍過剰の未標識ヒトアミロイドβ1-40ペプチド(Anaspec,USA)を含有するMarvel-PBS(3%w/v)中で1時間プレインキュベートした精製ファージ粒子に、ダルベッコのリン酸緩衝食塩水(DPBS、pH7.4)中のビオチン化アミロイドβ1-42を添加した。ストレプトアビジン共役常磁性ビーズ(Invitrogen Life Technologies,UK)を使用して、ビオチン化アミロイドβ1-42ペプチドと結合したファージ粒子を捕捉し、PBS-ツイーン(0.1%v/v)を使用した一連の洗浄サイクルによって、弱く結合したファージを除去した。ビーズから結合ファージ粒子を溶出し、大腸菌(E.coli)TG1細菌に感染させて、次の選択ラウンドでレスキューした(Vaughan et al.,1996)。前述の通りであるが、ビオチン化アミロイドβ1-42抗原の濃度を低下させて、引き続く2回の選択ラウンドを実施した。
可溶性一本鎖Fab断片(sFab)を生成するために、標準切断およびライゲーション技術を使用して、Fab310-λディスプレイカセットから遺伝子IIIテザーを除去した。簡単に述べると、標準DNA精製キット(QIAgen,UK)を使用して、ラウンド3の結果からファージミドベクターを単離し、MluI制限消化を使用して、ベクターから遺伝子IIIテザー配列を除去した(Hoet et al.,2005)。再ライゲートしたベクターをTG1細胞に形質転換して戻し、分析のために個々のコロニーを選択した。
HTRF(商標)アッセイでヒトアミロイドβ1-42ペプチドに対する特異的結合を示した未精製sFabぺリプラズム抽出物に、DNA配列決定を実施した(Osbourn et al.,1996;Vaughan et al.,1996)。(基本的に、(Bannister et al.,2006)に記載されるようにして)独自のタンパク質配列があるsFabを大腸菌(E.coli)中で発現させ、アフィニティクロマトグラフィーによって精製した。各精製sFabのアミロイドβ結合プロファイルは、セクション1.3に記載されるHTRF(商標)アッセイ中で、未精製sFabペリプラズム調製物を精製sFabで置き換えて、精製sFabの希釈系列を試験することで判定された。精製sFabは、ビオチン化ヒトアミロイドβ1-42ペプチド、ビオチン化マウスアミロイドβ1-42ペプチド、およびビオチン化ヒトアミロイドβ1-40ペプチドへの結合について、同時に試験した。さらにsFabは、あらゆる非特異的ペプチド結合について調節するために、別のHTRF(商標)実験で、スクランブルされたヒトアミロイドβ1-42ペプチド(Anaspec、カスタム合成)に対する結合について試験した。セクション1.3に記載されるように%ΔF値を計算することで、データを解析した。
ヒト抗体重鎖および軽鎖全体をそれぞれ発現するベクターに、可変重鎖(VH)および可変軽鎖(VL)領域をサブクローニングすることで、13個のアミロイドβ1-42特異的クローンをFabからIgG2に変換した。Dyax FAB310ライブラリーVH領域は半合成であり、本明細書に記載される哺乳類細胞内では十分な量を発現できなかったので、サブクローニング前に、VH領域を社内でコドン最適化した。哺乳類細胞内で完全長ヒトIgGとして良好に発現することが分かっている、社内で生殖細胞系適合させたVHをテンプレートとして使用して、元のアミノ酸配列を保ちながら、Dyax VH領域のDNAコドン使用頻度を変化させた。ヒト重鎖定常領域および調節因子を含有する哺乳類発現ベクター(pEU9.2)に、コドン最適化可変重鎖をクローン化して、哺乳類細胞内でIgG2重鎖全体を発現させた。同様に、ヒトλ軽鎖定常領域および調節因子の発現のための哺乳類発現ベクター(pEU4.4)に、可変軽鎖領域をクローン化して、哺乳類細胞内でIgG軽鎖全体を発現させた。重鎖および軽鎖の発現のためのベクターは、最初にPersic et al.(Persic et al.,1997)に記載された。IgG2としてクローンを得るために、HEK293-EBNA(Invitrogen,UK;カタログ番号R620-07)またはCEP6-CHO(社内で生成された)哺乳類細胞内に、重鎖および軽鎖IgG発現ベクターを一過性に形質移入して、抗体を発現させて培地内に分泌させた。収集した培地は、精製前に濾過した。プロテインAクロマトグラフィー(Biosepra(商標)、Pall,USA;またはMabSelect SuRe、GE Healthcare,UK)を使用して、IgGを精製した。50mMのトリス、pH8.0、250mMのNaCl中で前もって平衡化した適切なプロテインAカラムに、培養上清を装填した。0.1Mのクエン酸ナトリウム、pH3.0を使用して、結合IgGをカラムから溶出し、溶出液を1Mのトリス緩衝液(pH10.0)の添加によって中和した。NAP-10緩衝液交換カラム(GE Healthcare,UK;カタログ番号17-0854-02)を使用して、IgGをダルベッコのPBSで緩衝液交換した。精製IgGを0.2マイクロメートルフィルターに通過させ、IgGのアミノ酸配列に基づく吸光係数を使用して、280nmにおける吸光度によってIgGの濃度を判定した。SEC-HPLCおよびSDS-PAGE技術を使用して、精製IgGを凝集または分解について分析した。
上述したように、アミロイドβ1-42ペプチドに特異的に結合する精製sFab断片を組換えIgGに変換した。その他のヒトアミロイドβペプチドとの結合に対するこれらのIgGの特異性を試験するために、競合アッセイを開発した。このアッセイでは、リードIgGおよびビオチン化ヒトアミロイドβペプチド1-42(rPeptide,USA;カタログ番号A1117)と共に、未標識ヒトアミロイドβペプチド1-42(rPeptide,USA;カタログ番号A1165)、1-40(rPeptide,USA;カタログ番号A1155)、11-42(rPeptide,USA;カタログ番号A1063)、17-42(rPeptide,USA;カタログ番号A1058)、および1-43(Anaspec,USA;カタログ番号25356)をインキュベートした。簡単に述べると、各試験ペプチドの希釈系列と、0.3nMの試験IgGおよび5nMのビオチン化ヒトアミロイドβ1-42ペプチドとを合わせた。ストレプトアビジンクリプテート(CisBio International,フランス;カタログ番号610SAKLB)および抗ヒトFc IgG XL665(CisBio International,フランス;カタログ番号61HFCXLB)検出試薬を使用して、IgGとビオチン化1-42アミロイドβ間の蛍光共鳴エネルギー転移(FRET)を測定することで、ビオチン化1-42ペプチドへのリードIgG結合の損失を検出することで、各ペプチドの競合を評価した。
BIAcore T-100(GE Healthcare,UK)バイオセンサー装置を使用して、各リード抗体と、合成的に生成されたヒトアミロイドβ1-42ペプチドとの間の相互作用の動態学パラメータを評価した。これらの実験は、基本的に、Karlsson et al.(Karlsson et al.,1991)に記載されるようにして実施した。
血漿枯渇アッセイでリード抗体を試験して、ヒト血漿からヒトアミロイドβ1-42ペプチドを免疫沈降させる、それらの能力を調べた。このアッセイを使用して、各抗体の機能的効力の証拠を提供した。簡単に述べると、ヒト血漿サンプルを各試験IgGと共に3時間インキュベートし、その後、抗体およびあらゆる結合リガンドを除去した。免疫沈降法の前後に、標準的な技術を使用してヒト血漿サンプルのアミロイドβ1-42ペプチド含有量をアッセイし、これらの値を使用して抗体の効力を判定した。血漿サンプルはまた、アミロイドβ1-40ペプチドのあらゆる枯渇についてもアッセイし、リード抗体の特異性を評価した。
アミロイドβペプチドの天然形態に対する親和性が低いリードクローンを同定する目的で、アミロイドβと結合するそれらの能力について、リード抗体を試験した。簡単に述べると、ヒトアルツハイマー病脳切片およびTg2576マウス脳切片上で、リード抗体をスクリーニングして、試験管内で天然アミロイドと結合する抗アミロイドβ1-42抗体を同定した。
2.1 Abet0007親クローンのscFv形態への変換
親和性最適化のための調製において、親クローンをIgG2形態から一本鎖可変断片(scFv)形態に変換した。それらのそれぞれのIgGベクターから、コドン最適化可変重鎖(VH)および可変軽鎖(VL)領域を別々に増幅し、特異的クローニング部位および可撓性リンカー領域を付加した。次に再コンビナトリアルPCRを実施して、完全なscFvコンストラクトを生成し、基本的に、Vaughan et al.(Vaughan et al.,1996)に記載されるようにして、それをpCantab10.5ファージミドベクターにクローン化した。pCantab10.5ベクターは、pCantab6ベクターの修正バージョンであり、それは追加的な制限酵素認識部位を含有して、標準Hisおよびmycタグ以外のタグの付加を容易にする。
親和性ベースのファージディスプレイ選択による標的変異誘発アプローチを使用して、ヒトアミロイドβ1-42ペプチドに対する改善された親和性のために、リード抗体(Abet0007)を最適化した。Clackson and Lowman((2004)A Practical Approach,Oxford University Press)によって記載されるような標準分子生物学的技術を使用して、可変重鎖(VH)および可変軽鎖(VL)相補性決定領域3(CDR3)のオリゴヌクレオチド指定変異誘発によって、Abet0007に由来する大型scFv-ファージライブラリーを作成した。
セクション2.2.に記載される標的変異誘発アプローチからの選択ラウンド2および3から、1760個のscFvを無作為に選択した。基本的に、セクション1.3に記載されるように、直接結合アッセイを使用して、これらのクローンをスクリーニングした。簡単に述べると、ビオチン化ヒトアミロイドβ1-42ペプチドの結合増大について、ペリプラズム調製物からの未精製scFvを試験して、ストレプトアビジンクリプテートおよび抗6his-XL665検出試薬と共に、HTRF(商標)技術を使用して検出した。
ヒトアミロイドβ1-42ペプチドに対して、Abet0007親クローンよりも高い結合を示したクローンに、DNA配列決定を実施した(Osbourn et al.,1996;Vaughan et al.,1996)。独自のタンパク質配列があるscFvを大腸菌(E.coli)中で発現させて、アフィニティクロマトグラフィーと、それに続く緩衝液交換によって精製した。次に、ヒトアミロイドβ1-42ペプチドに対してAbet0007と同様の親和性を有する、Abet0042と称されるベンチマーク抗体に対するエピトープ競合アッセイ中で、これらのscFvの結合親和性を試験した。この競合アッセイでは、ビオチン化ヒトアミロイドβ1-42ペプチドに対するAbet0042 IgGの結合が、試験scFvサンプルに対して競合した。ビオチン化ヒトアミロイドβ1-42ペプチドに対するAbet0042 IgGの結合は、先に記載されるようにして(セクション1.6)、HTRF(商標)技術を使用して検出される。簡単に述べると、Abet0042 IgG、ビオチン化アミロイドβ1-42ペプチド、ストレプトアビジンクリプテート、および抗ヒトFc IgG XL665の混合物に、精製scFvの希釈系列を添加した。室温における2時間のインキュベーション後、時間分解蛍光を読み取った。
HTRF(商標)エピトープ競合アッセイ(セクション2.4)において、表面プラズモン共鳴を使用して、親配列であるAbet0007と比較して、ヒトアミロイドβ1-42ペプチドへの結合親和性に有意な改善を示した精製scFvクローンを分析した。簡単に述べると、BIAcore T-100(GE Healthcare,UK)バイオセンサー装置を使用して、各精製scFvと、合成的に生成されたヒトアミロイドβ1-42ペプチドとの間の相互作用の動態学パラメータを評価した。これらの実験は、基本的に、Karlsson et al.(Karlsson et al.,1991)に記載されるようにして実施した。さらなる詳細は、セクション1.7を参照されたい。
IgG1-TM抗体形態は、下側ヒンジおよびCH2定常領域内に3つの単一アミノ酸置換(三重変異:TM)を含有するヒトIgG1アイソタイプである(Oganesyan et al.,2008)。ヒトIgG1分子の下側ヒンジおよびCH2領域に導入すると、三重変異L234F/L235E/P331S(「TM」)は、ヒトCD64、CD32A、CD16、およびC1qに対するそれらの結合に、著明な低下を引き起こす。これらのTM変異を使用して、エフェクター機能が非常に低いヒトアイソタイプを作成した。それぞれヒト抗体重鎖および軽鎖全体を発現する、可変重鎖(VH)および可変軽鎖(VL)領域をベクターにサブクローニングすることで、ScFvをIgG1-TMに再構成した。ヒト重鎖定常領域と調節因子を含有する哺乳類発現ベクター(pEU1.4)に、可変重鎖をクローン化して、哺乳類細胞内でIgG1-TM重鎖全体を発現させた。同様に、ヒトλ軽鎖定常領域および調節因子の発現のための哺乳類発現ベクター(pEU4.4)に、可変軽鎖領域をクローン化して、哺乳類細胞内でIgG軽鎖全体を発現させた。基本的に、セクション1.5に記載されるようにして、IgG抗体を発現させて精製した。
親和性最適化アミロイドβ1-42ペプチド特異的抗体のVHおよびVL領域のアミノ酸配列と、VBASEデータベース(Tomlinson et al.,1992)中の既知のヒト生殖細胞系配列を配列比較して、配列類似性によって最も近い生殖細胞系を同定した。最適化抗体系統のVH領域では、これはVh3-23(DP-47)であり、VL領域では、これはVλ3-3r(DPL-23)であった。
表面プラズモン共鳴を使用して、親和性最適化IgG(セクション2.6)およびそれらの生殖系列化相当物(セクション2.7)の結合動態を解析した。簡単に述べると、BIAcore T-100(GE Healthcare,UK)バイオセンサー装置を使用して、各試験IgGと、合成的に生成されたヒトアミロイドβ1-42ペプチドとの間の相互作用の動態学パラメータを評価した。これらの実験は、基本的に、Karlsson et al.(Karlsson et al.,1991)に記載されるようにして実施した。さらなる詳細は、セクション1.7を参照されたい。
表面プラズモン共鳴を使用して、ヒトアミロイドβ1-42ペプチドの親和性最適化IgGの特異性を確認した。簡単に述べると、BIAcore T-100(GE Healthcare,UK)バイオセンサー装置を使用して、各試験IgGと、合成的に生成されたヒトアミロイドβ1-42およびヒトアミロイドβ1-40をはじめとする一連の小型ペプチドとの間の相互作用の動態学パラメータを評価した。これらの実験は、基本的に、Karlsson et al.(Karlsson et al.,1991)に記載されるようにして実施した。さらなる詳細は、セクション1.7を参照されたい。
その他のヒトアミロイドβペプチドへの結合に対するAbet0144-GLのIgG1-TMの特異性を試験するために、競合アッセイを開発した。このアッセイでは、固定濃度(0.28nM)のAbet0144-GLのIgG1-TMの存在下で、異なる濃度範囲の1-42、1-40、1-16、12-28、ピロ3-42、ピロ11-42、およびスクランブルされた1-42(それぞれAnaspecカタログ番号20276、24236、24226、24230、29907、29903、および25383)をはじめとする、未標識ヒトアミロイドβペプチドと共に、固定濃度(1.5nM)のビオチン化ヒトアミロイドβ1-42ペプチド(rPeptide,USA;カタログ番号A1117)をインキュベートした。ペプチド競合は、時間分解蛍光共鳴エネルギー転移(TR-FRET)を使用して、ビオチン化ヒトアミロイドβ1-42ペプチドへのAbet0144-GLのIgG1-TMの結合阻害の検出によって評価した。これは、ユウロピウムクリプテート標識ヒトFc IgG(CisBio International,フランス;カタログ番号61HFCKLB)、およびXL665標識ストレプトアビジン(CisBio International,フランス;カタログ番号611SAXLB)TR-FRET検出試薬の使用を伴った。
血漿枯渇アッセイでリード抗体を試験して、ヒト血漿からヒトアミロイドβ1-42ペプチドを免疫沈降させるそれらの能力を調べた。このアッセイを使用して、各抗体の機能的効力の証拠を提供した。アッセイは、正確にセクション1.8に記載されるようにして、実施した。
天然アミロイドβペプチドを認識するリードクローンを同定する目的で、アミロイドβと結合する能力について、親和性最適化IgGを試験した。簡単に述べると、ヒトアルツハイマー病脳切片およびTg2576マウス脳切片上で、リード抗体をスクリーニングして、試験管内で天然アミロイドと結合する抗アミロイドβ1-42抗体を同定した。実験は、基本的に、セクション1.9に記載されるようにして実施した。
3.1 リボソームディスプレイと適合性のscFv形態へのAbet0144-GL親クローンの変換
親和性最適化のための調製において、親クローンをIgG1-TM形態から一本鎖可変断片(scFv)形態に変換した。それらのそれぞれのIgGベクターから、コドン最適化可変重鎖(VH)および可変軽鎖(VL)領域を別々に増幅して、特異的クローニング部位および可撓性リンカー領域を付加した。次に再コンビナトリアルPCRを実施して、完全なscFvコンストラクトを生成し、それをリボソームディスプレイに必要な構造的特徴を含有する修飾pUCベクター(pUC-RD)にクローン化した。これらの特徴としては、エキソヌクレアーゼによるmRNA転写物の分解を防止する5’および3’ステムループ、mRNA転写物へのリボソーム結合を促進するシャイン・ダルガノ配列、および翻訳scFv分子がリボソームに付着したままで折り畳みできるようにする遺伝子IIIスペーサーが挙げられる(Grovesetal.,2005)。
親和性ベースのリボソームディスプレイ選択による標的変異誘発アプローチを使用して、ヒトアミロイドβ1-42ペプチドに対する改善された親和性のために、リード抗体(Abet0144-GL)をさらに最適化した。Clackson and Lowman(Clackson et al.,2004)によって記載されるような標準分子生物学的技術を使用して、全ての6個の可変重鎖(VH)および可変軽鎖(VL)相補性決定領域(CDR)のオリゴヌクレオチド指定変異誘発によって、Abet0144-GLに由来する大型scFv-リボソームライブラリーを作成した。各CDRからの変異配列は、別個のライブラリーとして親和性最適化した。VHCDR1(Kabat残基26-30)に先行する5個のベルニエ残基もまた、標的変異誘発を使用して無作為化し、これらの配列を残りのVHCDR1ライブラリーと組み合わせて成熟させた。ヒトアミロイドβ1-42ペプチドに対するより高い親和性がある変種を濃縮するために、親和性ベースのリボソームディスプレイ選択を全てのライブラリーに実施した。選択は、基本的に、以前記載されるようにして実施した(Hanes et al.,2000)。
セクション3.2に記載される標的変異誘発アプローチの選択ラウンド3および4から無作為に選択された2024個のscFvを細菌中で発現させ、未精製ペリプラズムscFvを生成した。HTRF(商標)プラットフォームを使用して、Abet0144-GLのIgG1-TMと同じエピトープを介して合成ヒトアミロイドβ1-42ペプチドと結合できるscFvを、競合形式アッセイで解明した。具体的には、単一濃度の各未精製ペリプラズム試験scFvの存在下で、ストレプトアビジンクリプテート(ビオチン化アミロイドβ1-42ペプチドと結合する)および抗ヒトFcXL665(Abet0144-GLのIgG1-TMと結合する)の間で、蛍光共鳴エネルギー転移(FRET)を測定した。scFvによる、Abet0144-GLのIgG1-TMエピトープのペプチド上の成功裏の占有は、蛍光プレートリーダー上の評価でFRETの低下をもたらした。
式6:
%阻害=100-%全結合量
セクション3.3に記載されるエピトープ競合アッセイを使用して、最初の4ラウンドの選択中に、特定のscFv-リボソームライブラリーが親和性成熟しているかどうかを判定した。VHCDR3およびVLCDR2標的変異誘発ライブラリーの2つのライブラリーは、親Abet0144-GLクローンと比べて改善を示さず、さらに開発されなかった。
セクション3.3に記載されるエピトープ競合アッセイを使用して、各二成分ライブラリーが、先の2ラウンドの選択(5および6)よりも親和性成熟しているかどうかを判定した。全てのライブラリーは親和性改善を示し、したがってさらに親和性成熟していると見なされた。
セクション3.3に記載されるエピトープ競合アッセイを使用して、各三成分ライブラリーが、先の2ラウンドの選択(7および8)よりも親和性成熟しているかどうかを判定した。全てのライブラリーは、親和性改善を示し、したがってさらに親和性成熟していると見なされた。
HTRF(商標)エピトープ競合アッセイ(セクション3.3~3.6)において、表面プラズモン共鳴を使用して、親配列であるAbet0144-GLと比較して、ヒトアミロイドβ1-42ペプチドへの結合親和性に有意な改善を示した精製scFvクローンを分析した。簡単に述べると、ProteOnタンパク質相互作用アレイシステム(BioRad,USA)を使用して、各精製scFvと、合成的に生成されたヒトアミロイドβ1-42ペプチドの間の相互作用の動態学パラメータを評価した。これらの実験は、基本的に、Karlsson et al.(Karlsson et al.,1991)に記載されるようにして実施した。さらなる詳細は、セクション1.7を参照されたい。
IgG1-TM抗体形態は、セクション2.6で考察される。それぞれヒト抗体重鎖および軽鎖全体を発現する、可変重鎖(VH)および可変軽鎖(VL)領域をベクターにサブクローニングすることで、ScFvをIgG1-TMに再構成した。ヒト重鎖定常領域と調節因子を含有する哺乳類発現ベクター(pEU1.4)に、可変重鎖をクローン化して、哺乳類細胞内でIgG1-TM重鎖全体を発現した。同様に、ヒトλ軽鎖定常領域および調節因子の発現のための哺乳類発現ベクター(pEU4.4)に、可変軽鎖領域をクローン化して、哺乳類細胞内でIgG軽鎖全体を発現した。
それらの対応するscFvの実験的特性評価に基づいて、生殖系列化のために、最も強力なIgGの内5つを選択した。クローンAbet0343、Abet0369、Abet0377、Abet0380、およびAbet0382の精製scFvは全て、エピトープ競合アッセイによる測定で、750pM未満のIC50値を示し(表4)、全て、表面プラズモン共鳴による測定で250pM未満の実験的解離定数を有した、表7。
表面プラズモン共鳴を使用して、親和性最適化IgG(セクション3.8)およびそれらの生殖系列化相当物(セクション3.9)の結合動態を解析した。簡単に述べると、BIAcore T-100(GE Healthcare,UK)バイオセンサー装置を使用して、各試験IgGと、合成的に生成されたヒトアミロイドβ1-42ペプチドの間の相互作用の動態学パラメータを評価した。これらの実験は、基本的に、Karlsson et al.(Karlsson et al.,1991)に記載されるようにして実施した。さらなる詳細は、セクション1.7を参照されたい。
アミロイドβペプチドの天然形態に対するこれらのクローンの親和性を推定する目的で、最も強力なIgGをアミロイドβと結合するそれらの能力について試験した。簡単に述べると、ヒトアルツハイマー病脳切片およびTg2576マウス脳切片上で、リード抗体をスクリーニングして、試験管内でアミロイドプラークと結合する抗アミロイドβ1-42抗体を同定した。実験は、基本的に、セクション1.9に記載されるようにして実施した。
SDS-PAGE前にAβ42オリゴマーを架橋させるために、PICUP(ペプチドの光誘起架橋)を以下のように実施した。2μlの原液(10mM濃度)を18μlの1×PBSに添加して、1mMのRu(Bpy)溶液を作成した。さらに、2μlの原液(at200mM)を18μlの1×PBSに添加して、20mMの過硫酸アンモニウム(APS)溶液を作成した。未使用原液は、ドライアイス上で即座にスナップ凍結し、-80℃の冷凍庫に戻した。暗室で、5μlのRu(Bpy)を80μlの凝集体(無希釈の10μMサンプル)に添加し、5μlのAPSがそれに続いた。暗室内で、サンプルをランプで10秒間照射した。30μlの(4×)LDSサンプル緩衝液を即座に添加した。
4.1 生体内遊離アミロイドβ1-42ペプチドの低下によるAbet0380-GLのIgG1-TMの機能特性評価
25mMのヒスチジン、7%のスクロース、0.02%のp80界面活性剤、pH6.0の投薬ビヒクルを用いた静脈注射によって、8週齢オスアルビノハーランスプラーグドーリー系ラット(n=8~12)に、Abet0380-GLのIgG1-TM抗体を5ml/kgで単回投与した。投与液は、投薬直前に作成した。示される時点で動物を麻酔して、大槽から脳脊髄液(CSF)を吸引した。試料採取の20分間以内に、CSFサンプルを4℃でおよそ3000×gで10分間遠心分離して、細胞または壊死組織片を除去した。次に引き続く分析のために、サンプルをドライアイス上で凍結し、-70℃で保存した。
20mg/kgでのAbet0380-GLのIgG1-TM抗体の単回投与は、セクション4.1に記載されるアッセイにおける投与の72または168時間後に、ラット中で、定量化限界まで、CSFの遊離アミロイドβ1-42ペプチドレベルを低下させた(データ示さず)。生体内におけるAbet0380-GLのIgG1-TM抗体の効果をさらに調べるために、0.25、0.5、1、5または10mg/kgの週間用量で、ラットに14日間にわたり投与した。2回目の投与168時間後に、動物を安楽死させて、CSF中の遊離アミロイドβ1-42ペプチド、ならびに脳組織内の全アミロイドβ1-42または1-40ペプチドのレベルを測定した。
単回末梢投与後に、老化Tg2576マウス中でアミロイドβプラークと結合する能力について、Abet0380-GLのIgG1-TMを試験した。動物実験は、スウェーデン農業庁によって提供される、該当するガイドラインおよび規制に従って実施された。倫理的認可は、動物実験専門の倫理委員会である、ストックホルム・セドラ動物実験倫理委員会によって提供された。
例証的抗体VH領域、VL領域、個々のCDR配列、HCDRセット、LCDRセット、およびフレームワーク領域をはじめとする抗体分子の例配列は、添付の配列表に列挙される。
Abet0380-GLのIgG1-TMの特異性を競合結合実験で検査した。手短に述べると、異なる濃度範囲(10μM~0.17nM)の完全長、切断型、およびピロヒトAβペプチド(Aβ1-42、Aβ1-43、Aβ1-16、Aβ12-28、Aβ17-42、Aβピロ-3-42、またはAβピロ-11-42)のパネルを用いて、Abet0380-GLのIgG1-TM(0.5nM)を(室温で1時間)インキュベートした。
正常ラット中のPK-PD研究において、アミロイドβ1-42を隔離する抗体Abet0144-GLの能力を調べた。ラットに、Abet0144-GL(10または40mg/kg)またはビヒクルを2週間にわたり毎週(0および7日目に)静脈内投与して、2回目の投与後に殺処分した。遊離および全アミロイドβ1-42測定のためにCSFを採取し、全アミロイドβ1-42測定のために脳を採取した。上述のアッセイを使用して、遊離および全アミロイドβ1-42レベルを評価した。
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Claims (19)
- ヒトアミロイドβ1-40ペプチド(Aβ1-40)に比べて、ヒトアミロイドβ1-42ペプチド(Aβ1-42)との結合について選択的である単離抗体分子であって、
(i)以下のHCDR:
HCDR1配列番号525、
HCDR2配列番号526、および
HCDR3配列番号527
を含むVH領域であって、
HCDRのセットは、リスト:
a)配列番号524のアミノ酸31は、ヒスチジン、リジン、グルタミン酸、アスパラギン、スレオニン、アルギニン、バリン、プロリン、メチオニン、フェニルアラニン、イソロイシン、アスパラギン酸、又はトリプトファンで置換されている;
b)配列番号524のアミノ酸32は、チロシン、アスパラギン酸、アスパラギン、セリン、グルタミン酸、又はスレオニンで置換されている;
c)配列番号524のアミノ酸33は、プロリン、イソロイシン、バリン、またはアラニンで置換されている;
d)配列番号524のアミノ酸34は、ロイシンで置換されている;
e)配列番号524のアミノ酸52aは、セリン、プロリン、アラニン、アスパラギン、グリシン、グルタミン酸、アスパラギン酸、バリン、またはスレオニンで置換されている;
f)配列番号524のアミノ酸53は、セリン、アスパラギン、ヒスチジン、グルタミン、アスパラギン酸、グリシン、またはグルタミン酸で置換されている;
g)配列番号524のアミノ酸54は、グリシン、プロリン、スレオニン、グルタミン、グルタミン酸、メチオニン、リジン、又はアラニンで置換されている;
h)配列番号524のアミノ酸55は、グリシン、リジン、アスパラギン、グルタミン、スレオニン、ヒスチジン、アスパラギン酸、またはアラニンで置換されている;
i)配列番号524のアミノ酸56は、スレオニン、アラニン、アルギニン、またはリジンで置換されている;
j)配列番号524のアミノ酸57は、スレオニン、アスパラギン、セリン、リジン、フェニルアラニン、グルタミン、バリン、またはロイシンで置換されている;
k)配列番号524のアミノ酸58は、バリン、セリン、スレオニン、またはアスパラギンで置換されている;
l)配列番号524のアミノ酸62は、アラニンまたはスレオニンで置換されている;
m)配列番号524のアミノ酸98は、グリシンで置換されている;
n)配列番号524のアミノ酸99は、アルギニンで置換されている;
o)配列番号524のアミノ酸100hは、イソロイシンで置換されている;および
p)配列番号524のアミノ酸102は、アラニンで置換されている;または
その組み合わせ
から選択される1つまたは2つのアミノ酸置換を含む、前記VH領域、および
(ii)以下のLCDR:
LCDR1配列番号534、
LCDR2配列番号535、および
LCDR3配列番号536
を含むVL領域であって、
LCDRのセットは、リスト:
a)配列番号533のアミノ酸24は、スレオニンで置換されている;
b)配列番号533のアミノ酸25は、スレオニンで置換されている;
c)配列番号533のアミノ酸26は、アルギニンまたはプロリンで置換されている;
d)配列番号533のアミノ酸27は、ヒスチジンで置換されている;
e)配列番号533のアミノ酸28は、イソロイシン、バリン、フェニルアラニン、またはスレオニンで置換されている;
f)配列番号533のアミノ酸29は、メチオニン、グリシン、セリン、またはアスパラギンで置換されている;
g)配列番号533のアミノ酸30は、アラニン、セリン、グリシン、またはヒスチジンで置換されている;
h)配列番号533のアミノ酸31は、セリンで置換されている;
i)配列番号533のアミノ酸32は、トリプトファンで置換されている;
j)配列番号533のアミノ酸33は、バリン、メチオニン、スレオニン、またはイソロイシンで置換されている;
k)配列番号533のアミノ酸34は、スレオニンまたはアラニンで置換されている;
l)配列番号533のアミノ酸89は、グルタミンまたはアラニンで置換されている;
m)配列番号533のアミノ酸90は、アラニンまたはスレオニンで置換されている;
n)配列番号533のアミノ酸92は、グリシンで置換されている;
o)配列番号533のアミノ酸93は、グルタミン、セリン、アスパラギン、またはリジンで置換されている;
p)配列番号533のアミノ酸94は、スレオニンまたはフェニルアラニンで置換されている;および
q)配列番号533のアミノ酸97は、セリンまたはアラニンで置換されている;または
その組み合わせ
から選択される1つまたは2つのアミノ酸置換を含む、前記VL領域
を含む、前記単離抗体分子。 - 前記抗体分子が、500pM以下の解離定数(KD)で単量体Aβ1-42と結合し、Aβ1-40と結合せず、または1mMを超えるKDでAβ1-40と結合する、請求項1に記載の抗体分子。
- 前記抗体分子が、アミロイドβ17-42ペプチド(Aβ17-42)およびアミロイドβ29-42ペプチド(Aβ29-42)と結合する、請求項1または請求項2に記載の抗体分子。
- 前記抗体分子が、3-ピロ-42アミロイドβペプチドおよび11-ピロ-42アミロイドβペプチドと結合する、請求項1~3のいずれか一項に記載の抗体分子。
- 前記抗体分子が、アミロイドβ1-43ペプチド(Aβ1-43)と結合する、請求項1~4のいずれか一項に記載の抗体分子。
- 前記VH領域が、重鎖フレームワーク領域FW1、FW2、FW3、およびFW4を含んでなり、前記重鎖フレームワーク領域のアミノ酸配列が、
FW1配列番号528
FW2配列番号529
FW3配列番号530、および
FW4配列番号531であり、
またはFW1が、1つまたは複数のアミノ酸置換のある配列番号528を含んでなり、前記FW1中の前記1つまたは複数の置換が、
a)配列番号524のアミノ酸26は、グリシン、セリン、バリン、アラニン、アスパラギン、スレオニン、またはヒスチジンで置換されている;
b)配列番号524のアミノ酸27は、フェニルアラニン、セリン、チロシン、グルタミン酸、アスパラギン酸、またはプロリンで置換されている;
c)配列番号524のアミノ酸28は、グルタミン、ヒスチジン、バリン、グルタミン酸、スレオニン、アラニン、セリン、アスパラギン酸、メチオニン、またはプロリンで置換されている;
d)配列番号524のアミノ酸29は、イソロイシン、チロシン、セリン、ロイシン、またはトリプトファンで置換されている;および
e)配列番号524のアミノ酸30は、セリン、スレオニン、グルタミン、リジン、ヒスチジン、アルギニン、グリシン、プロリン、グルタミン酸、アラニン、またはアスパラギン酸で置換されている;または
その組合わせ
から選択される、請求項1~5のいずれか一項に記載の抗体分子。 - 前記VL領域が、軽鎖フレームワーク領域FW1、FW2、FW3、およびFW4を含んでなり、前記軽鎖フレームワーク領域のアミノ酸配列が、
FW1配列番号537
FW2配列番号538
FW3配列番号539、および
FW4配列番号540
である、請求項1~6のいずれか一項に記載の抗体分子。 - ヒトIgGである、請求項1~7のいずれか一項に記載の抗体分子。
- ヒトIgG1またはヒトIgG2である、請求項8に記載の抗体分子。
- ヒトIgG1-TM、IgG1-YTEまたはIgG1-TM-YTEである、請求項9に記載の抗体分子。
- 請求項1~10のいずれか一項に記載の抗体分子と、薬学的に許容可能な賦形剤とを含んでなる組成物。
- 人体または動物体の治療法で使用するための、請求項1~10のいずれか一項に記載の抗体分子を含んでなる組成物。
- アミロイドーシスの低下、アルツハイマー病の治療、アルツハイマー病またはダウン症候群患者における認知力の改善または認知低下の低減、および/または黄斑変性の治療で使用するための、請求項12に記載の組成物。
- 請求項1~10のいずれか一項に記載の抗体分子を含む、個体において、アミロイドーシスを低下させ、アルツハイマー病を治療し、アルツハイマー病またはダウン症候群患者の認知力を改善しまたは認知低下を低減し、および/または黄斑変性を治療するための組成物。
- 請求項1~10のいずれか一項に記載の抗体分子をコードする、単離核酸。
- 請求項15に記載の核酸で試験管内で形質転換された、宿主細胞。
- 前記抗体分子を生成する条件下で、請求項16に記載の宿主細胞を培養するステップを含んでなる、請求項1~10のいずれか一項に記載の抗体分子を生成する方法。
- 前記抗体分子を単離および/または精製するステップをさらに含んでなる、請求項17に記載の方法。
- 前記抗体分子を少なくとも1つの追加的な成分を含んでなる組成物に調合するステップをさらに含んでなる、請求項18に記載の方法。
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