JP7034066B2 - 共刺激tnf受容体に対する二重特異性抗体 - Google Patents
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Description
本発明は、(a)共刺激TNF受容体ファミリーメンバーに特異的に結合することができる少なくとも1つの部分、(b)標的細胞抗原に特異的に結合することができる少なくとも1つの部分、及び(c)安定な会合が可能な第1及び第2のサブユニットからなるFcドメインを含む、新規な二重特異性抗原結合分子に関する。本発明は更に、これらの分子を産生する方法及びその使用方法に関する。
(a)共刺激TNF受容体ファミリーメンバーに特異的に結合することができる少なくとも1つの部分、
(b)標的細胞抗原に特異的に結合することができる少なくとも1つの部分、及び
(c)安定な会合が可能な第1及び第2のサブユニットからなるFcドメイン
を含む、二重特異性抗原結合分子を提供する。
(i)配列番号2及び配列番号3からなる群から選択されるアミノ酸配列を含むCDR-H1、
(ii)配列番号4及び配列番号5からなる群から選択されるアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び
(iii)配列番号6、配列番号7、配列番号8、配列番号9、配列番号10、配列番号11、及び配列番号12からなる群から選択されるアミノ酸配列を含むCDR-H3
を含むVHドメイン、
及び、
(iv)配列番号13、配列番号14、及び配列番号15からなる群から選択されるアミノ酸配列を含むCDR-L1、
(v)配列番号16、配列番号17、及び配列番号18からなる群から選択されるアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び
(vi)配列番号19、配列番号20、配列番号21、配列番号22、配列番号23、及び配列番号24からなる群から選択されるアミノ酸配列を含むCDR-L3
を含むVLドメイン
を含む。
(i)配列番号25のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域VH及び配列番号26のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域VL、
(ii)配列番号27のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域VH及び配列番号28のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域VL、
(iii)配列番号29のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域VH及び配列番号30のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域VL、
(iv)配列番号31のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域VH及び配列番号32のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域VL、
(v)配列番号33のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域VH及び配列番号34のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域VL、
(vi)配列番号35のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域VH及び配列番号36のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域VL、又は
(vii)配列番号37のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域VH及び配列番号38のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域VL
を含む。
(i)配列番号40及び配列番号41からなる群から選択されるアミノ酸配列を含むCDR-H1、
(ii)配列番号42及び配列番号43からなる群から選択されるアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び
(iii)配列番号44、配列番号45、配列番号46、配列番号47、及び配列番号48からなる群から選択されるアミノ酸配列を含むCDR-H3
を含むVHドメイン、
並びに
(iv)配列番号49及び配列番号50からなる群から選択されるアミノ酸配列を含むCDR-L1、
(v)配列番号51及び配列番号52からなる群から選択されるアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び
(vi)配列番号53、配列番号54、配列番号55、配列番号56、及び配列番号57からなる群から選択されるアミノ酸配列を含むCDR-L3
を含むVLドメイン
を含む。
(i)配列番号58のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域VH及び配列番号59のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域VL、
(ii)配列番号60のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域VH及び配列番号61のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域VL、
(iii)配列番号62のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域VH及び配列番号63のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域VL、
(iv)配列番号64のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域VH及び配列番号65のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域VL、又は
(v)配列番号66のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域VH及び配列番号67のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域VL
を含む。
(a)共刺激TNF受容体ファミリーメンバーに特異的に結合することができる少なくとも1つの部分、
(b)標的細胞抗原に特異的に結合することができる少なくとも1つの部分、及び
(c)安定な会合が可能な第1及び第2のサブユニットからなるFcドメイン
を含む、二重特異性抗原結合分子を提供し、ここで、共刺激TNF受容体ファミリーメンバーに特異的に結合することができる部分はFab断片である。一態様では、二重特異性抗原結合分子が、共刺激TNF受容体ファミリーメンバーに特異的に結合することができる2つ以上の部分を含む場合、共刺激TNF受容体ファミリーメンバーに特異的に結合することができる全ての部分はFab断片である。
(i)配列番号68及び配列番号69からなる群から選択されるアミノ酸配列を含むCDR-H1、
(ii)配列番号70及び配列番号71からなる群から選択されるアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び
(iii)配列番号72及び配列番号73からなる群から選択されるアミノ酸配列を含むCDR-H3
を含むVHドメイン、
並びに
(iv)配列番号74及び配列番号75からなる群から選択されるアミノ酸配列を含むCDR-L1、
(v)配列番号76及び配列番号77からなる群から選択されるアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び
(vi)配列番号78及び配列番号79からなる群から選択されるアミノ酸配列を含むCDR-L3
を含むVLドメインを含む。
(i)OX40に特異的に結合することができる部分は、配列番号25、配列番号27、配列番号29、配列番号31、配列番号33、配列番号35又は配列番号37のアミノ酸配列と少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%又は100%同一であるアミノ酸配列を含む重鎖可変領域VHと、配列番号26、配列番号28、配列番号30、配列番号32、配列番号34、配列番号36又は配列番号38のアミノ酸配列と少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%又は100%同一であるアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域とを含み、かつ、
(ii)FAPに特異的に結合することができる部分は、配列番号80又は配列番号82のアミノ酸配列と少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%又は100%同一であるアミノ酸配列を含む重鎖可変領域VHと、配列番号81又は配列番号83のアミノ酸配列と少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%又は100%同一であるアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域とを含む。
(i)OX40に特異的に結合することができる部分は、配列番号27のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域VH及び配列番号28のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域を含み、かつ、
(ii)FAPに特異的に結合することができる部分は、配列番号82のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域VH及び配列番号83のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域を含む。別の態様では、本発明は二重特異性抗原結合分子を提供し、ここで、
(i)4-1BBに特異的に結合することができる部分は、配列番号58、配列番号60、配列番号62、配列番号64又は配列番号66のアミノ酸配列と少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%又は100%同一であるアミノ酸配列を含む重鎖可変領域VHと、配列番号59、配列番号61、配列番号63、配列番号65又は配列番号67のアミノ酸配列と少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%又は100%同一であるアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域とを含み、かつ、
(ii)FAPに特異的に結合することができる部分は、配列番号80又は配列番号82のアミノ酸配列と少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%又は100%同一であるアミノ酸配列を含む重鎖可変領域VHと、配列番号81又は配列番号83のアミノ酸配列と少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%又は100%同一であるアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域とを含む。
(a)共刺激TNF受容体ファミリーメンバーに特異的に結合することができる第1のFab断片、
(b)標的細胞抗原に特異的に結合することができる第2のFab断片、及び
(c)安定な会合が可能な第1及び第2のサブユニットからなるFcドメイン
を含む。
(a)共刺激TNF受容体ファミリーメンバーに特異的に結合することができる2つの部分、
(b)標的細胞抗原に特異的に結合することができる2つの部分、及び
(c)安定な会合が可能な第1及び第2のサブユニットからなるFcドメイン
を含む、二重特異性抗原結合分子を提供する。
(a)共刺激TNF受容体ファミリーメンバーに特異的に結合することができる2つのFab断片とFcドメインとを含む抗体の2つの軽鎖及び2つの重鎖、及び
(b)標的細胞抗原に特異的に結合することができる2つの追加のFab断片であって、前記追加のFab断片はそれぞれペプチドリンカーを介して(a)の重鎖のC末端に連結されている、2つの追加のFab断片を含む。より具体的には、標的細胞抗原に特異的に結合することができる2つの追加のFab断片は、可変ドメインVL及びVHが互いに置換されたクロスFab断片であり、かつ、VL-CH鎖はそれぞれペプチドリンカーを介して(a)の重鎖のC末端に連結されている。
(a)共刺激TNF受容体ファミリーメンバーに特異的に結合することができる2つの部分、
(b)標的細胞抗原に特異的に結合することができる1つの部分、及び
(c)安定な会合が可能な第1及び第2のサブユニットからなるFcドメイン
を含む、二重特異性抗原結合分子を提供する。
(a)共刺激TNF受容体ファミリーメンバーに特異的に結合することができる2つのFab断片とFcドメインとを含む抗体の2つの軽鎖及び2つの重鎖、及び
(b)標的細胞抗原に特異的に結合することができるVH及びVLドメインであって、ここで、VHドメインはペプチドリンカーを介して重鎖の1つのC末端に連結され、かつ、VLドメインはペプチドリンカーを介して第2の重鎖のC末端に連結される、VH及びVLドメイン
を含む。
(i)配列番号25のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域VH及び配列番号26のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域VL、
(ii)配列番号27のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域VH及び配列番号28のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域VL、
(iii)配列番号29のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域VH及び配列番号30のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域VL、
(iv)配列番号31のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域VH及び配列番号32のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域VL、
(v)配列番号33のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域VH及び配列番号34のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域VL、
(vi)配列番号35のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域VH及び配列番号36のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域VL、又は
(vii)配列番号37のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域VH及び配列番号38のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域VL
を含む。
(i)配列番号58のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域VH及び配列番号59のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域VL、
(ii)配列番号60のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域VH及び配列番号61のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域VL、
(iii)配列番号62のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域VH及び配列番号63のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域VL、
(iv)配列番号64のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域VH及び配列番号65のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域VL、又は
(v)配列番号66のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域VH及び配列番号67のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域VL
を含む。
(i)T細胞応答を刺激することにおける、
(ii)活性化T細胞の生存を支持することにおける、
(iii)感染症の治療における、
(iv)がんの治療における、
(v)がんの進行を遅延させることにおける、又は
(vi)がんに罹患している患者の生存を延長することにおける
使用のための、本明細書で前に記載される二重特異性抗原結合分子、又は本明細書で前に記載されるOX40に特異的に結合する抗体、又は本明細書で前に記載される4-1BBに特異的に結合する抗体、又は本発明の薬学的組成物が提供される。
定義
特に定義されない限り、本明細書中で使用される技術用語及び科学用語は、本発明が属する分野において一般的に使用されるのと同じ意味を有する。本明細書を解釈する目的で、以下の定義が適用され、適切な場合はいつでも、単数形で使用される用語は複数形を含み、その逆もまた同様である。
-FcγRI(CD64)は単量体IgGと高親和性で結合し、マクロファージ、単球、好中球、及び好酸球上に発現する。アミノ酸残基E233-G236、P238、D265、N297、A327及びP329(KabatのEUインデックスによる番号付け)の少なくとも1つにおける、IgGのFc領域における改変は、FcγRIへの結合を減少させる。IgG1及びIgG4に置換された位置233-236のIgG2残基は、FcγRIとの結合を千分の一に減少させ、抗体感作赤血球に対するヒト単球応答を排除した(Armour, K.L., et al., Eur. J. Immunol. 29 (1999) 2613-2624)。
-FcγRII(CD32)は、中程度から低い親和性で複合体化したIgGに結合し、広く発現される。この受容体は、2つのサブタイプ、FcγRIIA及びFcγRIIBに分けることができる。FcγRIIAは、死滅に関与する多くの細胞(例えば、マクロファージ、単球、好中球)に見られ、死滅プロセスを活性化するようである。FcγRIIBは、阻害プロセスにおいて役割を果たすようであり、B細胞、マクロファージ、並びに肥満細胞及び好酸球に見られる。B細胞では、更なる免疫グロブリン産生及び例えばIgEクラスへのアイソタイプスイッチングを抑制するように機能するようである。マクロファージでは、FcγRIIBは、FcγRIIAを介して媒介される食作用を阻害するように作用する。好酸球及び肥満細胞において、B型は、その別個の受容体へのIgE結合を介してこれらの細胞の活性化を抑制するのに役立ち得る。FcγRIIAに対する結合の減少は、例えば、アミノ酸残基E233-G236、P238、D265、N297、A327、P329、D270、Q295、A327、R292、及びK414の少なくとも1つに突然変異を有するIgG Fc領域を含む抗体について見出される(KabatのEUインデックスによる番号付け)。
-FcγRIII(CD16)は、中程度から低い親和性でIgGに結合し、2つのタイプとして存在する。FcγRIIIAは、NK細胞、マクロファージ、好酸球、及び幾つかの単球及びT細胞上に見出され、ADCCを媒介する。FcγRIIIBは好中球上で高度に発現される。FcγRIIAへの結合の減少は、例えば、アミノ酸残基E233-G236、P238、D265、N297、A327、P329、D270、Q295、A327、S239、E269、E293、Y296、V303、A327、K338、及びD376の少なくとも1つに突然変異を有するIgG Fc領域を含む抗体について見出される(KabatのEUインデックスによる番号付け)。
100×分率X/Y
ここで、Xは、配列アラインメントプログラムALIGN-2により、そのプログラムのAとBとの配列比較において、完全一致を記録したアミノ酸残基の数であり、YはBの全アミノ酸残基数である。アミノ酸配列Aの長さがアミノ酸配列Bの長さと異なる場合、AのBに対する%アミノ酸配列同一性は、BのAに対する%アミノ酸配列同一性とは異なることは理解されるであろう。特に断らない限り、本明細書で使用される全ての%アミノ酸配列同一性値は、ALIGN-2コンピュータプログラムを使用し、直前の段落で説明したようにして得られる。
(1)疎水性:ノルロイシン、Met、Ala、Val、Leu、Ile;
(2)中性の親水性:Cys、Ser、Thr、Asn、Gln;
(3)酸性:Asp、Glu;
(4)塩基性:His、Lys、Arg;
(5)鎖配向に影響する残基:Gly、Pro;
(6)芳香族:Trp、Tyr、Phe.
本発明は、生産性、安定性、結合親和性、生物学的活性、標的化効率、及び低減された毒性などの特に有利な特性を有する新規な二重特異性抗原結合分子を提供する。
一態様では、本発明は二重特異性抗原結合分子を提供し、該分子は
(a)共刺激TNF受容体ファミリーメンバーに特異的に結合することができる少なくとも1つの部分、
(b)標的細胞抗原に特異的に結合することができる少なくとも1つの部分、及び
(c)安定な会合が可能な第1及び第2のサブユニットからなるFcドメイン
を含む。
一態様では、共刺激TNF受容体ファミリーメンバーはOX40である。特に、本発明は、二重特異性抗原結合分子を提供し、ここで、共刺激TNF受容体ファミリーメンバーに特異的に結合することができる部分は、配列番号1のアミノ酸配列を含むポリペプチドに結合する。
(i)配列番号2及び配列番号3からなる群から選択されるアミノ酸配列を含むCDR-H1、
(ii)配列番号4及び配列番号5からなる群から選択されるアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び
(iii)配列番号6、配列番号7、配列番号8、配列番号9、配列番号10、配列番号11、及び配列番号12からなる群から選択されるアミノ酸配列を含むCDR-H3
を含むVHドメイン、
及び、
(iv)配列番号13、配列番号14、及び配列番号15からなる群から選択されるアミノ酸配列を含むCDR-L1、
(v)配列番号16、配列番号17、及び配列番号18からなる群から選択されるアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び
(vi)配列番号19、配列番号20、配列番号21、配列番号22、配列番号23、及び配列番号24からなる群から選択されるアミノ酸配列を含むCDR-L3
を含むVLドメイン
を含む。
(a)配列番号2のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号4のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号6のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含むVHドメイン、並びに配列番号13のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号16のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号19のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含むVLドメイン、
(b)配列番号2のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号4のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号7のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含むVHドメイン、並びに配列番号13のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号16のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号20のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含むVLドメイン、
(c)配列番号2のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号4のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号8から選択されるアミノ酸配列を含むCDR-H3を含むVHドメイン、並びに配列番号13のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号16のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号21のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含むVLドメイン、
(d)配列番号2のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号4のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号9のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含むVHドメイン;並びに配列番号13のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号16のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号22のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含むVLドメイン、
(e)配列番号3のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号5のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号10のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含むVHドメイン、並びに配列番号14のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号17のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号23のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含むVLドメイン、
(f)配列番号3のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号5のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号11から選択されるアミノ酸配列を含むCDR-H3を含むVHドメイン、並びに配列番号14のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号17のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号23のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含むVLドメイン、又は
(g)配列番号3のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号5のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号12のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含むVHドメイン、並びに配列番号15のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号18のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号24のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含むVLドメイン
を含む。
(i)配列番号25のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域VH及び配列番号26のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域VL、
(ii)配列番号27のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域VH及び配列番号28のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域VL、
(iii)配列番号29のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域VH及び配列番号30のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域VL、
(iv)配列番号31のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域VH及び配列番号32のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域VL、
(v)配列番号33のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域VH及び配列番号34のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域VL、
(vi)配列番号35のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域VH及び配列番号36のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域VL、又は
(vii)配列番号37のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域VH及び配列番号38のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域VL
を含む。
別の態様では、共刺激TNF受容体ファミリーメンバーは4-1BBである。特に、本発明は、二重特異性抗原結合分子を提供し、ここで、共刺激TNF受容体ファミリーメンバーに特異的に結合することができる部分は、配列番号39のアミノ酸配列を含むポリペプチドに結合する。
(i)配列番号40及び配列番号41からなる群から選択されるアミノ酸配列を含むCDR-H1、
(ii)配列番号42及び配列番号43からなる群から選択されるアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び
(iii)配列番号44、配列番号45、配列番号46、配列番号47、及び配列番号48からなる群から選択されるアミノ酸配列を含むCDR-H3
を含むVHドメイン、
並びに
(iv)配列番号49及び配列番号50からなる群から選択されるアミノ酸配列を含むCDR-L1、
(v)配列番号51及び配列番号52からなる群から選択されるアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び
(vi)配列番号53、配列番号54、配列番号55、配列番号56、及び配列番号57からなる群から選択されるアミノ酸配列を含むCDR-L3
を含むVLドメイン
を含む。
(a)配列番号40のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号42のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号44のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含むVHドメイン、並びに配列番号49のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号51のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号53のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含むVLドメイン、
(b)配列番号41のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号43のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号45のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含むVHドメイン、並びに配列番号50のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号52のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号54のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含むVLドメイン、
(c)配列番号40のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号42のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号46から選択されるアミノ酸配列を含むCDR-H3を含むVHドメイン、並びに配列番号49のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号51のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号55のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含むVLドメイン、
(d)配列番号40のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号42のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号47のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含むVHドメイン、並びに配列番号49のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号51のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号56のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含むVLドメイン、又は
(e)配列番号40のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号42のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号48のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含むVHドメイン、並びに配列番号49のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号51のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号57のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含むVLドメイン
を含む。
(i)配列番号58のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域VH及び配列番号59のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域VL、
(ii)配列番号60のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域VH及び配列番号61のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域VL、
(iii)配列番号62のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域VH及び配列番号63のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域VL、
(iv)配列番号64のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域VH及び配列番号65のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域VL、又は
(v)配列番号66のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域VH及び配列番号67のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域VL
を含む。
特定の態様では、標的細胞抗原は線維芽細胞活性化タンパク質(FAP)である。FAP結合部分は、国際公開第2012/02006号に記載されており、その全体が参照により本明細書に組み込まれる。特に興味のあるFAP結合部分を以下に記載する。
(i)配列番号68及び配列番号69からなる群から選択されるアミノ酸配列を含むCDR-H1、
(ii)配列番号70及び配列番号71からなる群から選択されるアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び
(iii)配列番号72及び配列番号73からなる群から選択されるアミノ酸配列を含むCDR-H3
を含むVHドメイン、
並びに
(iv)配列番号74及び配列番号75からなる群から選択されるアミノ酸配列を含むCDR-L1、
(v)配列番号76及び配列番号77からなる群から選択されるアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び
(vi)配列番号78及び配列番号79からなる群から選択されるアミノ酸配列を含むCDR-L3
を含むVLドメインを含む。
(a)配列番号68のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号70のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号72のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含むVHドメイン、並びに配列番号74のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号76のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号78のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含むVLドメイン、又は
(b)配列番号69のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号71のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号73のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含むVHドメイン、並びに配列番号75のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号77のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号79のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含むVLドメイン
を含む。
(i)配列番号80のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域VH及び配列番号81のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域VL、又は
(ii)配列番号82のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域VH及び配列番号83のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域VL
を含む。
更なる態様にて、二重特異性抗原結合分子が提供され、ここで、
(i)OX40に特異的に結合することができる部分は、配列番号25、配列番号27、配列番号29、配列番号31、配列番号33、配列番号35又は配列番号37のアミノ酸配列と少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%又は100%同一であるアミノ酸配列を含む重鎖可変領域VHと、配列番号26、配列番号28、配列番号30、配列番号32、配列番号34、配列番号36又は配列番号38のアミノ酸配列と少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%又は100%同一であるアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域とを含み、かつ、
(ii)FAPに特異的に結合することができる部分は、配列番号80又は配列番号82のアミノ酸配列と少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%又は100%同一であるアミノ酸配列を含む重鎖可変領域VHと、配列番号81又は配列番号83のアミノ酸配列と少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%又は100%同一であるアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域とを含む。
(a)OX40に特異的に結合することができる部分は、配列番号25のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域VHと、配列番号26のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域とを含み、かつ、FAPに特異的に結合することができる部分は、配列番号80のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域VHと、配列番号81のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域とを含み、
(b)OX40に特異的に結合することができる部分は、配列番号25のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域VHと、配列番号26のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域とを含み、かつ、FAPに特異的に結合することができる部分は、配列番号82のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域VHと、配列番号83のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域とを含み、
(c)OX40に特異的に結合することができる部分は、配列番号27のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域VHと、配列番号28のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域とを含み、かつ、FAPに特異的に結合することができる部分は、配列番号80のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域VHと、配列番号81のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域とを含み、
(d)OX40に特異的に結合することができる部分は、配列番号27のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域VHと、配列番号28のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域とを含み、かつ、FAPに特異的に結合することができる部分は、配列番号82のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域VHと、配列番号83のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域とを含み、
(e)OX40に特異的に結合することができる部分は、配列番号29のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域VHと、配列番号30のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域とを含み、かつ、FAPに特異的に結合することができる部分は、配列番号80のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域VHと、配列番号81のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域とを含み、
(f)OX40に特異的に結合することができる部分は、配列番号29のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域VHと、配列番号30のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域とを含み、かつ、FAPに特異的に結合することができる部分は、配列番号82のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域VHと、配列番号83のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域とを含み、
(g)OX40に特異的に結合することができる部分は、配列番号31のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域VHと、配列番号32のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域とを含み、かつ、FAPに特異的に結合することができる部分は、配列番号80のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域VHと、配列番号81のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域とを含み、
(h)OX40に特異的に結合することができる部分は、配列番号31のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域VHと、配列番号32のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域とを含み、かつ、FAPに特異的に結合することができる部分は、配列番号82のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域VHと、配列番号83のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域とを含み、
(i)OX40に特異的に結合することができる部分は、配列番号33のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域VHと、配列番号34のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域とを含み、かつ、FAPに特異的に結合することができる部分は、配列番号80のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域VHと、配列番号81のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域とを含み、
(j)OX40に特異的に結合することができる部分は、配列番号33のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域VHと、配列番号34のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域とを含み、かつ、FAPに特異的に結合することができる部分は、配列番号82のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域VHと、配列番号83のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域とを含み、
(k)OX40に特異的に結合することができる部分は、配列番号35のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域VHと、配列番号36のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域とを含み、かつ、FAPに特異的に結合することができる部分は、配列番号80のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域VHと、配列番号81のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域とを含み、
(l)OX40に特異的に結合することができる部分は、配列番号35のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域VHと、配列番号36のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域とを含み、かつ、FAPに特異的に結合することができる部分は、配列番号82のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域VHと、配列番号83のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域とを含み、
(m)OX40に特異的に結合することができる部分は、配列番号37のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域VHと、配列番号38のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域とを含み、かつ、FAPに特異的に結合することができる部分は、配列番号80のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域VHと、配列番号81のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域とを含み、又は
(n)OX40に特異的に結合することができる部分は、配列番号37のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域VHと、配列番号38のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域とを含み、かつ、FAPに特異的に結合することができる部分は、配列番号82のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域VHと、配列番号83のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域とを含む。
別の態様では、二重特異性抗原結合分子が提供され、ここで、
(i)4-1BBに特異的に結合することができる部分は、配列番号58、配列番号60、配列番号62、配列番号64又は配列番号66のアミノ酸配列と少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%又は100%同一であるアミノ酸配列を含む重鎖可変領域VHと、配列番号59、配列番号61、配列番号63、配列番号65又は配列番号67のアミノ酸配列と少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%又は100%同一であるアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域とを含み、かつ、
(ii)FAPに特異的に結合することができる部分は、配列番号80又は配列番号82のアミノ酸配列と少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%又は100%同一であるアミノ酸配列を含む重鎖可変領域VHと、配列番号81又は配列番号83のアミノ酸配列と少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%又は100%同一であるアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域とを含む。
(a)4-1BBに特異的に結合することができる部分は、配列番号58のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域VHと、配列番号59のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域とを含み、かつ、FAPに特異的に結合することができる部分は、配列番号80のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域VHと、配列番号81のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域とを含み、
(b)4-1BBに特異的に結合することができる部分は、配列番号58のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域VHと、配列番号95のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域とを含み、かつ、FAPに特異的に結合することができる部分は、配列番号82のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域VHと、配列番号83のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域とを含み、
(c)4-1BBに特異的に結合することができる部分は、配列番号60のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域VHと、配列番号61のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域とを含み、かつ、FAPに特異的に結合することができる部分は、配列番号80のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域VHと、配列番号81のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域とを含み、
(d)4-1BBに特異的に結合することができる部分は、配列番号60のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域VHと、配列番号61のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域とを含み、かつ、FAPに特異的に結合することができる部分は、配列番号82のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域VHと、配列番号83のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域とを含み、
(e)4-1BBに特異的に結合することができる部分は、配列番号62のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域VHと、配列番号63のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域とを含み、かつ、FAPに特異的に結合することができる部分は、配列番号80のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域VHと、配列番号81のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域とを含み、
(f)4-1BBに特異的に結合することができる部分は、配列番号62のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域VHと、配列番号63のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域とを含み、かつ、FAPに特異的に結合することができる部分は、配列番号82のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域VHと、配列番号83のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域とを含み、
(g)4-1BBに特異的に結合することができる部分は、配列番号64のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域VHと、配列番号65のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域とを含み、かつ、FAPに特異的に結合することができる部分は、配列番号80のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域VHと、配列番号81のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域とを含み、
(h)4-1BBに特異的に結合することができる部分は、配列番号64のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域VHと、配列番号65のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域とを含み、かつ、FAPに特異的に結合することができる部分は、配列番号82のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域VHと、配列番号83のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域とを含み、
(i)4-1BBに特異的に結合することができる部分は、配列番号66のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域VHと、配列番号67のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域とを含み、かつ、FAPに特異的に結合することができる部分は、配列番号80のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域VHと、配列番号81のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域とを含み、又は
(j)4-1BBに特異的に結合することができる部分は、配列番号66のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域VHと、配列番号67のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域とを含み、かつ、FAPに特異的に結合することができる部分は、配列番号82のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域VHと、配列番号83のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域とを含む。
一態様では、本発明は、
(a)共刺激TNF受容体ファミリーメンバーに特異的に結合することができる1つの部分、
(b)標的細胞抗原に特異的に結合することができる1つの部分、及び
(c)安定な会合が可能な第1及び第2のサブユニットからなるFcドメイン
を含む、二重特異性抗原結合分子に関する。
(a)共刺激TNF受容体ファミリーメンバーに特異的に結合することができる第1のFab断片、
(b)標的細胞抗原に特異的に結合することができる第2のFab断片、及び
(c)安定な会合が可能な第1及び第2のサブユニットからなるFcドメイン
を含む。
(a)OX40に特異的に結合することができる第1のFab断片、
(b)標的細胞抗原に特異的に結合することができる第2のFab断片、及び
(c)安定な会合が可能な第1及び第2のサブユニットからなるFcドメイン
を含む。
(a)OX40に特異的に結合することができる第1のFab断片、
(b)FAPに特異的に結合することができる第2のFab断片、及び
(c)安定な会合が可能な第1及び第2のサブユニットからなるFcドメイン
を含む。
(a)配列番号303のアミノ酸配列を含む第1の重鎖、配列番号182のアミノ酸配列を含む第1の軽鎖、配列番号229のアミノ酸配列を含む第2の重鎖、及び配列番号217のアミノ酸配列を含む第2の軽鎖、又は
(b)配列番号231のアミノ酸配列を含む第1の重鎖、配列番号186のアミノ酸配列を含む第1の軽鎖、配列番号229のアミノ酸配列を含む第2の重鎖、及び配列番号217のアミノ酸配列を含む第2の軽鎖、又は
(c)配列番号233のアミノ酸配列を含む第1の重鎖、配列番号190のアミノ酸配列を含む第1の軽鎖、配列番号229のアミノ酸配列を含む第2の重鎖、及び配列番号217のアミノ酸配列を含む第2の軽鎖、又は
(d)配列番号235のアミノ酸配列を含む第1の重鎖、配列番号194のアミノ酸配列を含む第1の軽鎖、配列番号229のアミノ酸配列を含む第2の重鎖、及び配列番号217のアミノ酸配列を含む第2の軽鎖、又は
(e)配列番号237のアミノ酸配列を含む第1の重鎖、配列番号198のアミノ酸配列を含む第1の軽鎖、配列番号229のアミノ酸配列を含む第2の重鎖、及び配列番号217のアミノ酸配列を含む第2の軽鎖、又は
(f)配列番号239のアミノ酸配列を含む第1の重鎖、配列番号202のアミノ酸配列を含む第1の軽鎖、配列番号229のアミノ酸配列を含む第2の重鎖、及び配列番号217のアミノ酸配列を含む第2の軽鎖
を含む。
(a)4-1BBに特異的に結合することができる第1のFab断片、
(b)標的細胞抗原に特異的に結合することができる第2のFab断片、及び
(c)安定な会合が可能な第1及び第2のサブユニットからなるFcドメイン
を含む。
(a)4-1BBに特異的に結合することができる第1のFab断片、
(b)FAPに特異的に結合することができる第2のFab断片、及び
(c)安定な会合が可能な第1及び第2のサブユニットからなるFcドメイン
を含む。
(a)配列番号295のアミノ酸配列を含む第1の重鎖、配列番号261のアミノ酸配列を含む第1の軽鎖、配列番号229のアミノ酸配列を含む第2の重鎖、及び配列番号217のアミノ酸配列を含む第2の軽鎖、又は
(b)配列番号297のアミノ酸配列を含む第1の重鎖、配列番号265のアミノ酸配列を含む第1の軽鎖、配列番号229のアミノ酸配列を含む第2の重鎖、及び配列番号217のアミノ酸配列を含む第2の軽鎖、又は
(c)配列番号299のアミノ酸配列を含む第1の重鎖、配列番号269のアミノ酸配列を含む第1の軽鎖、配列番号229のアミノ酸配列を含む第2の重鎖、及び配列番号217のアミノ酸配列を含む第2の軽鎖、又は
(d)配列番号301のアミノ酸配列を含む第1の重鎖、配列番号273のアミノ酸配列を含む第1の軽鎖、配列番号229のアミノ酸配列を含む第2の重鎖、及び配列番号217のアミノ酸配列を含む第2の軽鎖
を含む。
別の態様では、本発明は、
(a)共刺激TNF受容体ファミリーメンバーに特異的に結合することができる2つの部分、
(b)標的細胞抗原に特異的に結合することができる2つの部分、及び
(c)安定な会合が可能な第1及び第2のサブユニットからなるFcドメイン
を含む、二重特異性抗原結合分子に関する。
(a)共刺激TNF受容体ファミリーメンバーに特異的に結合することができる2つのFab断片とFcドメインとを含む抗体の2つの軽鎖及び2つの重鎖、及び
(b)標的細胞抗原に特異的に結合することができる2つの追加のFab断片であって、前記追加のFab断片はそれぞれペプチドリンカーを介して(a)の重鎖のC末端に連結されている2つの追加のFab断片
を含む。
(a)OX40に特異的に結合することができる2つの部分、(b)FAPに特異的に結合することができる2つの部分、及び(c)安定な会合が可能な第1及び第2のサブユニットからなるFcドメイン
を含む、二重特異性抗原結合分子に関する。
(a)それぞれが配列番号216のアミノ酸配列を含む2つの重鎖、配列番号182のアミノ酸配列を含む第1の軽鎖、及び配列番号217のアミノ酸配列を含む第2の軽鎖、又は
(b)それぞれが配列番号219のアミノ酸配列を含む2つの重鎖、配列番号186のアミノ酸配列を含む第1の軽鎖、及び配列番号217のアミノ酸配列を含む第2の軽鎖、又は
(c)それぞれが配列番号221のアミノ酸配列を含む2つの重鎖、配列番号190のアミノ酸配列を含む第1の軽鎖、及び配列番号217のアミノ酸配列を含む第2の軽鎖、又は
(d)それぞれが配列番号223のアミノ酸配列を含む2つの重鎖、配列番号194のアミノ酸配列を含む第1の軽鎖、及び配列番号217のアミノ酸配列を含む第2の軽鎖、又は
(e)それぞれが配列番号225のアミノ酸配列を含む2つの重鎖、配列番号198のアミノ酸配列を含む第1の軽鎖、及び配列番号217のアミノ酸配列を含む第2の軽鎖、又は
(f)それぞれが配列番号227のアミノ酸配列を含む2つの重鎖、配列番号202のアミノ酸配列を含む第1の軽鎖、及び配列番号217のアミノ酸配列を含む第2の軽鎖
を含む。
(a)4-1BBに特異的に結合することができる2つの部分、(b)FAPに特異的に結合することができる2つの部分、及び(c)安定な会合が可能な第1及び第2のサブユニットからなるFcドメイン
を含む、二重特異性抗原結合分子に関する。
(a)それぞれが配列番号287のアミノ酸配列を含む2つの重鎖、配列番号261のアミノ酸配列を含む第1の軽鎖、及び配列番号217のアミノ酸配列を含む第2の軽鎖、又は
(b)それぞれが配列番号289のアミノ酸配列を含む2つの重鎖、配列番号265のアミノ酸配列を含む第1の軽鎖、及び配列番号217のアミノ酸配列を含む第2の軽鎖、又は
(c)それぞれが配列番号291のアミノ酸配列を含む2つの重鎖、配列番号269のアミノ酸配列を含む第1の軽鎖、及び配列番号217のアミノ酸配列を含む第2の軽鎖、又は
(d)それぞれが配列番号293のアミノ酸配列を含む2つの重鎖、配列番号273のアミノ酸配列を含む第1の軽鎖、及び配列番号217のアミノ酸配列を含む第2の軽鎖
を含む。
別の態様では、本発明は、
(a)共刺激TNF受容体ファミリーメンバーに特異的に結合することができる2つの部分、
(b)標的細胞抗原に特異的に結合することができる1つの部分、及び
(c)安定な会合が可能な第1及び第2のサブユニットからなるFcドメイン
を含む、二重特異性抗原結合分子を提供する。
(a)共刺激TNF受容体ファミリーメンバーに特異的に結合することができる2つのFab断片とFcドメインとを含む抗体の2つの軽鎖及び2つの重鎖、及び
(b)標的細胞抗原に特異的に結合することができるVH及びVLドメインであって、ここで、VHドメインはペプチドリンカーを介して重鎖の1つのC末端に連結され、かつ、VLドメインはペプチドリンカーを介して第2の重鎖のC末端に連結される、VH及びVLドメイン
を含む。
(a)共刺激TNF受容体ファミリーメンバーに特異的に結合することができる2つのFab断片とFcドメインとを含む抗体の2つの軽鎖及び2つの重鎖、及び
(b)標的細胞抗原に特異的に結合することができるVH及びVLドメインであって、ここで、VHドメインはペプチドリンカーを介してFcノブ重鎖のC末端に連結され、VLドメインはペプチドリンカーを介してFcホール重鎖のC末端に連結される、VH及びVLドメイン
を含む。
(a)共刺激TNF受容体ファミリーメンバーに特異的に結合することができる2つのFab断片とFcドメインとを含む抗体の2つの軽鎖及び2つの重鎖、及び
(b)標的細胞抗原に特異的に結合することができるVH及びVLドメインであって、ここで、VHドメインはペプチドリンカーを介してFcホール重鎖のC末端に連結され、VLドメインはペプチドリンカーを介してFcノブ重鎖のC末端に連結される、VH及びVLドメインを含む。特に、本発明は、二重特異性抗原結合分子に関し、ここで、共刺激TNF受容体ファミリーメンバーに特異的に結合することができる2つのFab断片は、OX40又は4-1BBに特異的に結合することができる2つのFab断片であり、かつ、標的細胞抗原に特異的に結合することができるVH及びVLドメインは、FAPに特異的に結合することができる。
を含む、二重特異性抗原結合分子に関する。
(a)それぞれが配列番号186のアミノ酸配列を含む2つの軽鎖、配列番号306のアミノ酸配列を含む第1の重鎖、及び配列番号307のアミノ酸配列を含む第2の重鎖、又は
(b)それぞれが配列番号186のアミノ酸配列を含む2つの軽鎖、配列番号310のアミノ酸配列を含む第1の重鎖、及び配列番号311のアミノ酸配列を含む第2の重鎖
を含む。
(a)4-1BBに特異的に結合することができる2つのFab断片、(b)FAPに特異的に結合することができるVH及びVLドメイン、及び(c)安定な会合が可能な第1及び第2のサブユニットからなるFcドメイン
を含む、二重特異性抗原結合分子に関する。
(a)それぞれが配列番号261のアミノ酸配列を含む2つの軽鎖、配列番号318のアミノ酸配列を含む第1の重鎖、及び配列番号319のアミノ酸配列を含む第2の重鎖、又は
(b)それぞれが配列番号265のアミノ酸配列を含む2つの軽鎖、配列番号322のアミノ酸配列を含む第1の重鎖、及び配列番号323のアミノ酸配列を含む第2の重鎖、又は
(c)それぞれが配列番号269のアミノ酸配列を含む2つの軽鎖、配列番号326のアミノ酸配列を含む第1の重鎖、及び配列番号327のアミノ酸配列を含む第2の重鎖、又は
(d)それぞれが配列番号273のアミノ酸配列を含む2つの軽鎖、配列番号330のアミノ酸配列を含む第1の重鎖、及び配列番号331のアミノ酸配列を含む第2の重鎖、又は
(e)それぞれが配列番号261のアミノ酸配列を含む2つの軽鎖、配列番号334のアミノ酸配列を含む第1の重鎖、及び配列番号335のアミノ酸配列を含む第2の重鎖、又は
(f)それぞれが配列番号265のアミノ酸配列を含む2つの軽鎖、配列番号338のアミノ酸配列を含む第1の重鎖、及び配列番号339のアミノ酸配列を含む第2の重鎖、又は
(g)それぞれが配列番号269のアミノ酸配列を含む2つの軽鎖、配列番号342のアミノ酸配列を含む第1の重鎖、及び配列番号343のアミノ酸配列を含む第2の重鎖、又は
(h)それぞれが配列番号273のアミノ酸配列を含む2つの軽鎖、配列番号346のアミノ酸配列を含む第1の重鎖、及び配列番号347のアミノ酸配列を含む第2の重鎖
を含む。
本発明の二重特異性抗原結合分子は、安定した会合が可能な第1及び第2のサブユニットからなるFcドメインを更に含む。
本発明の二重特異性抗原結合分子は、Fcドメインの2つのサブユニットの一方又は他方に融合された異なる抗原結合部位を含み、従ってFcドメインの2つのサブユニットは2つの非同一ポリペプチド鎖に含まれ得る。これらのポリペプチドの組換え同時発現及びその後の二量体形成は、2つのポリペプチドの複数の可能な組み合わせをもたらす。組換え産生における本発明の二重特異性抗体の収率及び純度を改善するためには、所望のポリペプチドの会合を促進する修飾を本発明の二重特異性抗体のFcドメインに導入することが有利であろう。
一態様では、本発明は、(a)共刺激TNF受容体ファミリーメンバーに特異的に結合することができる第1のFab断片、(b)標的細胞抗原に特異的に結合することができる第2のFab断片、及び(c)安定な会合が可能な第1及び第2のサブユニットからなるFcドメインを含む二重特異性抗原結合分子であって、ここで、Fab断片の1つにおいて、可変ドメインVH及びVL又は定常ドメインCH1及びCLの何れかが交換されている二重特異性抗原結合分子に関する。二重特異性抗体は、Crossmab技術に従って調製される。
(a)共刺激TNF受容体ファミリーメンバーに特異的に結合することができる2つのFab断片とFcドメインとを含む抗体の2つの軽鎖及び2つの重鎖、及び
(b)標的細胞抗原に特異的に結合することができる2つの追加のFab断片であって、前記追加のFab断片はそれぞれペプチドリンカーを介して(a)の重鎖のC末端に連結されている、2つの追加のFab断片を含む。特定の態様では、追加のFab断片は、可変ドメインVL及びVHが、VHドメインが軽鎖の一部であり、かつ、VLドメインが重鎖の一部であるように、互いに置換されているFab断片である。
一態様では、本発明は、OX40に特異的に結合する新規抗体及び抗体断片を提供する。これらの抗体は、既知のOX40抗体と比較して、標的細胞抗原に特異的に結合することができる別の抗原結合部分を含む二重特異性抗原結合分子への取り込みに特に適したものにする優れた特性を有する。
(a)配列番号2のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号4のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号6のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含むVHドメイン、並びに配列番号13のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号16のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号19のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含むVLドメイン、
(b)配列番号2のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号4のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号7のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含むVHドメイン、並びに配列番号13のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号16のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号20のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含むVLドメイン、
(c)配列番号2のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号4のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号8から選択されるアミノ酸配列を含むCDR-H3を含むVHドメイン、並びに配列番号13のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号16のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号21のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含むVLドメイン、
(d)配列番号2のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号4のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号9のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含むVHドメイン;並びに配列番号13のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号16のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号22のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含むVLドメイン、
(e)配列番号3のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号5のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号10のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含むVHドメイン、並びに配列番号14のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号17のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号23のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含むVLドメイン、
(f)配列番号3のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号5のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号11から選択されるアミノ酸配列を含むCDR-H3を含むVHドメイン、並びに配列番号14のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号17のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号23のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含むVLドメイン、又は
(g)配列番号3のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号5のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号12のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含むVHドメイン、並びに配列番号15のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号18のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号24のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含むVLドメイン
を含む。
(i)配列番号25のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域VH及び配列番号26のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域VL、
(ii)配列番号27のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域VH及び配列番号28のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域VL、
(iii)配列番号29のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域VH及び配列番号30のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域VL、
(iv)配列番号31のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域VH及び配列番号32のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域VL、
(v)配列番号33のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域VH及び配列番号34のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域VL、
(vi)配列番号35のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域VH及び配列番号36のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域VL、又は
(vii)配列番号37のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域VH及び配列番号38のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域VL
を含む。
(i)配列番号25のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域VH及び配列番号26のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域VL、
(ii)配列番号27のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域VH及び配列番号28のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域VL、
(iii)配列番号29のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域VH及び配列番号30のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域VL、
(iv)配列番号31のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域VH及び配列番号32のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域VL、
(v)配列番号33のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域VH及び配列番号34のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域VL、
(vi)配列番号35のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域VH及び配列番号36のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域VL、又は
(vii)配列番号37のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域VH及び配列番号38のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域VL
を含む。
(a)配列番号40のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号42のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号44のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含むVHドメイン、並びに配列番号49のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号51のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号53のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含むVLドメイン、
(b)配列番号41のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号43のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号45のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含むVHドメイン、並びに配列番号50のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号52のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号54のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含むVLドメイン、
(c)配列番号40のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号42のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号46から選択されるアミノ酸配列を含むCDR-H3を含むVHドメイン、並びに配列番号49のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号51のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号55のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含むVLドメイン、
(d)配列番号40のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号42のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号47のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含むVHドメイン、並びに配列番号49のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号51のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号56のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含むVLドメイン、又は
(e)配列番号40のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号42のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号48のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含むVHドメイン、並びに配列番号49のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号51のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号57のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含むVLドメイン
を含む。
(i)配列番号58のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域VH及び配列番号59のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域VL、
(ii)配列番号60のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域VH及び配列番号61のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域VL、
(iii)配列番号62のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域VH及び配列番号63のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域VL、
(iv)配列番号64のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域VH及び配列番号65のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域VL、又は
(v)配列番号66のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域VH及び配列番号67のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域VL
を含む。
(i)配列番号58のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域VH及び配列番号59のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域VL、
(ii)配列番号60のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域VH及び配列番号61のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域VL、
(iii)配列番号62のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域VH及び配列番号63のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域VL、
(iv)配列番号64のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域VH及び配列番号65のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域VL、又は
(v)配列番号66のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域VH及び配列番号67のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域VL
を含む。
本発明は更に、本明細書に記載の二重特異性抗原結合分子又はその断片をコードする単離されたポリヌクレオチドを提供する。
本発明の二重特異性抗体は、例えば、固相ペプチド合成(例えば、メリフィールド固相合成)又は組換え産生によって得ることができる。組換え産生のために、二重特異性抗原結合分子又はそのポリペプチド断片をコードする一又は複数のポリヌクレオチドを、例えば上記のように単離し、宿主細胞における更なるクローニング及び/又は発現のために一又は複数のベクターに挿入する。このようなポリヌクレオチドは、一般的な手順を使用して容易に単離され配列決定され得る。本発明の一態様では、本発明のポリヌクレオチドの一又は複数を含むベクタ-、好ましくは発現ベクターが提供される。当業者に周知の方法を用いて、適切な転写/翻訳制御シグナルとともに二重特異性抗原結合分子(断片)のコード配列を含む発現ベクターを構築することができる。これらの方法は、in vitroでの組換えDNA技術、合成技術及びin vivoでの組換え/遺伝子組換えを含む。例えば、Maniatis et al., MOLECULAR CLONING: A LABORATORY MANUAL, Cold Spring Harbor Laboratory, N.Y. (1989);及びAusubel et al., CURRENT PROTOCOLS IN MOLECULAR BIOLOGY, Greene Publishing Associates and Wiley Interscience, N.Y. (1989)に記載される技術を参照。発現ベクターはプラスミド、又はウイルスの一部とすることができるか、又は核酸断片でよい。発現ベクターは、二重特異性抗原結合分子又はそのポリペプチド断片(すなわちコード領域)をコードするポリヌクレオチドが、プロモーター及び/又は他の転写若しくは翻訳制御エレメントと作動可能に結合してクローニングされる発現カセットを含む。本発明で使用される場合、「コード領域」は、アミノ酸に翻訳されるコドンからなる核酸の一部である。「終止コドン」(TAG、TGA、又はTAA)はアミノ酸に翻訳されないが、存在する場合にはコード領域の一部と考えられ、しかし、任意の隣接配列、例えばプロモーター、リボソーム結合部位、転写ターミネーター、イントロン、5’及び3’非翻訳領域などはコード領域の一部ではない。2つ以上のコード領域が、単一のポリヌクレオチド構築物中に、例えば単一のベクター上に、又は別々のポリヌクレオチド構築物中に、例えば別の(異なる)ベクター上に存在することができる。更に、任意のベクターは、単一のコード領域を含んでいてもよいし、2つ以上のコード領域を含んでいてもよく、例えば本発明のベクターは、タンパク質分解性切断を介して、翻訳後又は翻訳と同時に最終タンパク質中に分離された一又は複数のポリペプチドをコードしてもよい。加えて、本発明のベクター、ポリヌクレオチド、又は核酸は、本発明の二重特異性抗原結合分子若しくはそのポリペプチド断片、又はその変異体若しくは誘導体をコードするポリヌクレオチドに融合又は非融合された異種コード領域をコードし得る。異種コード領域は、限定しないが、特殊化要素又はモチーフ、例えば分泌シグナルペプチド又は異種機能ドメインを含む。作動可能に結合とは、ポリペプチドなどの遺伝子産物のコード領域が、制御配列の影響下又は制御下において遺伝子産物の発現を配置するように、一又は複数の制御配列と結合するときである。(ポリペプチドコード領域及びそれに結合するプロモーターのような)2つのDNA断片は、プロモーター機能の誘導が所望の遺伝子産物をコードするmRNAの転写をもたらす場合、及び2つのDNA断片間の連結の性質が、遺伝子産物の発現を導く発現制御配列の能力を妨げないか又は転写されるべきDNAテンプレートの能力を妨げない場合、「作動可能に結合している」。従って、プロモーター領域は、プロモーターがその核酸の転写をもたらすことができる場合に、ポリペプチドをコードする核酸に作動可能に結合されるであろう。プロモーターは所定の細胞においてのみDNAの実質的な転写を導く細胞特異的プロモーターであってもよい。プロモーターの他に他の転写制御エレメント、例えばエンハンサー、オペレーター、リプレッサー、及び転写終結シグナルが、細胞特異的転写を導くポリヌクレオチドと作動可能に結合することができる。
本明細書で提供される抗原結合分子が、同定され、当該技術分野で周知の様々なアッセイによってその物理的/化学的性質及び/又は生物学的活性についてスクリーニングされ、又は特徴づけられる。
本明細書で提供される二重特異性抗原結合分子、抗体及び抗体断片の、その対応するTNF受容体に対する親和性を、実施例に説明される方法に従い、BIAcore機器(GE Healthcare)ような標準的器具類と、組換え発現により得られるような受容体又は標的タンパク質とを用いて、プラズモン共鳴アッセイ(SPR)により決定することができる。二重特異性抗原結合分子の、その標的細胞抗原に対する親和性も、実施例に説明される方法に従い、BIAcore機器(GE Healthcare)のような標準的器具類と、組換え発現により得られるような受容体又は標的タンパク質とを用いて、表面プラズモン共鳴アッセイ(SPR)により決定することができる。結合親和性を測定するための具体的な例示であって例示的な実施態様は、実施例2で説明される。一態様によれば、KDは、25℃でBIACORE(登録商標)T100装置(GE Healthcare)を用いる表面プラズモン共鳴により測定される。
本明細書で提供される二重特異性抗原結合分子の、その対応する受容体発現細胞への結合は、特定の受容体又は標的抗原を発現する細胞株を用いて、例えばフローサイトメトリー(FACS)により評価することができる。一態様では、TNF受容体を発現する末梢血単核細胞(PBMC)が結合アッセイに使用される。これらの細胞は、単離直後(ナイーブPMBC)又は刺激後(活性化PMBC)に使用される。別の態様では、活性化マウス脾細胞(TNF受容体分子を発現する)を使用して、本発明の二重特異性抗原結合分子又は抗体の、その対応するTNF受容体発現細胞への結合を実証した。更なる態様では、健常なMacaca fascicularisのヘパリン処置血液から単離したPBMCを使用して、対応するカニクイザルTNF受容体発現細胞に対する二重特異性抗原結合分子又は抗体を示した。
一態様では、特定の標的細胞抗原及び生物学的活性を有する特定のTNF受容体に結合する二重特異性抗原結合分子を同定するためのアッセイが提供される。生物学的活性は、例えば、標的細胞抗原を発現する細胞上のTNF受容体を介したアゴニストシグナル伝達を含み得る。in vitroでこのような生物学的活性を有するものとして本アッセイによって同定されたTNFファミリーリガンド三量体含有抗原結合分子も提供される。
更なる態様において、本発明は、例えば下記の治療法の何れかに使用される、本明細書で提供される二重特異性抗原結合分子又は抗体の何れかを含む薬学的組成物を提供する。一実施態様では、本明細書で提供される二重特異性抗原結合分子の何れかと、少なくとも1つの薬学的に許容される賦形剤とを含む薬学的組成物を提供する。別の他の実施態様において、薬学的組成物は、本明細書で提供される二重特異性抗原結合分子の何れかと、少なくとも1つの追加的な治療剤とを、例えば後述するように含む。
本明細書で提供される二重特異性抗原結合分子又は抗体の何れかが、治療方法において使用され得る。
本発明の二重特異性抗原結合分子又は抗体は、治療法において、一又は複数の他の薬剤との組み合わせで投与され得る。例えば、本発明の二重特異性抗原結合分子又は抗体は、少なくとも1つの追加的治療剤と同時投与され得る。用語「治療剤」は、症状又は疾患を治療するために、そのような治療を必要とする個体に投与することができる任意の薬剤を包含する。このような追加的治療剤は、治療される特定の徴候に適した任意の活性成分、好ましくは互いに悪影響を及ぼさない相補的活性を有するものを含み得る。特定の実施態様では、追加的治療剤は、別の抗がん剤、例えば微小管破壊因子、抗代謝剤、トポイソメラーゼ阻害剤、DNAインターカレーター、アルキル化剤、ホルモン療法、キナーゼ阻害剤、受容体アンタゴニスト、腫瘍細胞アポトーシスの活性化因子、又は抗血管新生剤である。特定の態様では、追加的治療剤は、免疫調節剤、細胞増殖抑制剤、細胞接着の阻害剤、細胞傷害性剤又は細胞増殖抑制剤、細胞アポトーシスの活性化剤、又はアポトーシス誘導因子に対する細胞の感受性を増大させる薬剤である。
本発明の他の態様では、上述した疾患の治療、予防、及び/又は診断に有用な物質を含む製造品が提供される。製造品は、容器、及び容器上又は容器に付属するラベル又は添付文書を含む。好適な容器は、例としてボトル、バイアル、シリンジ、IV輸液バッグなどを含む。容器はガラス又はプラスチックなどの様々な材料から形成され得る。容器は、症状の治療、予防、及び/又は診断に有効な、単独の又はその他の組成物と併用される化合物を収容し、無菌のアクセスポートを有することができる(例えば、容器は皮下注射針により穿孔可能なストッパーを有する静脈注射用の溶液のバッグ又はバイアルであってよい)。組成物中の少なくとも1つの活性剤は、本発明の二重特異性抗原結合分子又は抗体である。
1.(a)共刺激TNF受容体ファミリーメンバーに特異的に結合することができる少なくとも1つの部分、
(b)標的細胞抗原に特異的に結合することができる少なくとも1つの部分、及び
(c)安定な会合が可能な第1及び第2のサブユニットからなるFcドメイン
を含む、二重特異性抗原結合分子。
2.共刺激TNF受容体ファミリーメンバーが、OX40及び4-1BBからなる群から選択される、請求項1に記載の二重特異性抗原結合分子。
3.共刺激TNF受容体ファミリーメンバーがOX40である、請求項1又は2に記載の二重特異性抗原結合分子。
4.共刺激TNF受容体ファミリーメンバーに特異的に結合することができる部分が、配列番号1のアミノ酸配列を含むポリペプチドに結合する、請求項1から3の何れか一項に記載の二重特異性抗原結合分子。
5.OX40に特異的に結合することができる少なくとも1つの部分が、
(i)配列番号2及び配列番号3からなる群から選択されるアミノ酸配列を含むCDR-H1、
(ii)配列番号4及び配列番号5からなる群から選択されるアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び
(iii)配列番号6、配列番号7、配列番号8、配列番号9、配列番号10、配列番号11、及び配列番号12からなる群から選択されるアミノ酸配列を含むCDR-H3
を含むVHドメイン、
並びに
(iv)配列番号13、配列番号14、及び配列番号15からなる群から選択されるアミノ酸配列を含むCDR-L1、
(v)配列番号16、配列番号17、及び配列番号18からなる群から選択されるアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び
(vi)配列番号19、配列番号20、配列番号21、配列番号22、配列番号23、及び配列番号24からなる群から選択されるアミノ酸配列を含むCDR-L3
を含むVLドメイン
を含む、請求項1から4の何れか一項に記載の二重特異性抗原結合分子。
6.OX40に特異的に結合することができる部分が、配列番号25、配列番号27、配列番号29、配列番号31、配列番号33、配列番号35、及び配列番号37からなる群から選択されるアミノ酸配列と少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%又は100%同一であるアミノ酸配列を含む重鎖可変領域VHと、配列番号26、配列番号28、配列番号30、配列番号30、配列番号32、配列番号34、配列番号36、及び配列番号38のアミノ酸配列と少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%又は100%同一であるアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域VLとを含む、請求項1から5の何れか一項に記載の二重特異性抗原結合分子。
7.OX40に特異的に結合することができる部分が、
(i)配列番号25のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域VH及び配列番号26のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域VL、
(ii)配列番号27のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域VH及び配列番号28のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域VL、
(iii)配列番号29のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域VH及び配列番号30のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域VL、
(iv)配列番号31のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域VH及び配列番号32のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域VL、
(v)配列番号33のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域VH及び配列番号34のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域VL、
(vi)配列番号35のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域VH及び配列番号36のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域VL、又は
(vii)配列番号37のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域VH及び配列番号38のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域VL
を含む、請求項1から5の何れか一項に記載の二重特異性抗原結合分子。
8.共刺激TNF受容体ファミリーメンバーが4-1BBである、請求項1又は2に記載の二重特異性抗原結合分子。
9.共刺激TNF受容体ファミリーメンバーに特異的に結合することができる部分が、配列番号39のアミノ酸配列を含むポリペプチドに結合する、請求項1、2又は8の何れか一項に記載の二重特異性抗原結合分子。
10.4-1BBに特異的に結合することができる少なくとも1つの部分が、
(i)配列番号40及び配列番号41からなる群から選択されるアミノ酸配列を含むCDR-H1、
(ii)配列番号42及び配列番号43からなる群から選択されるアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び
(iii)配列番号44、配列番号45、配列番号46、配列番号47、及び配列番号48からなる群から選択されるアミノ酸配列を含むCDR-H3
を含むVHドメイン、
並びに
(iv)配列番号49及び配列番号50からなる群から選択されるアミノ酸配列を含むCDR-L1、
(v)配列番号51及び配列番号52からなる群から選択されるアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び
(vi)配列番号53、配列番号54、配列番号55、配列番号56、及び配列番号57からなる群から選択されるアミノ酸配列を含むCDR-L3
を含むVLドメイン
を含む、請求項1、2、8又は9の何れか一項に記載の二重特異性抗原結合分子。
11.4-1BBに特異的に結合することができる部分が、配列番号58、配列番号60、配列番号62、配列番号64、及び配列番号66からなる群から選択されるアミノ酸配列と少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%又は100%同一であるアミノ酸配列を含む重鎖可変領域VHと、配列番号59、配列番号61、配列番号63、配列番号65、及び配列番号67からなる群から選択されるアミノ酸配列と少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%又は100%同一であるアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域とを含む、請求項1、2、8、9又は10の何れか一項に記載の二重特異性抗原結合分子。
12.4-1BBに特異的に結合することができる部分が、
(i)配列番号58のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域VH及び配列番号59のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域VL、
(ii)配列番号60のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域VH及び配列番号61のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域VL、
(iii)配列番号62のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域VH及び配列番号63のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域VL、
(iv)配列番号64のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域VH及び配列番号65のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域VL、又は
(v)配列番号66のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域VH及び配列番号67のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域VL
を含む、請求項1、2、及び8から11の何れか一項に記載の二重特異性抗原結合分子。
13.標的細胞抗原が、線維芽細胞活性化タンパク質(FAP)、メラノーマ関連コンドロイチン硫酸プロテオグリカン(MCSP)、上皮増殖因子受容体(EGFR)、がん胎児性抗原(CEA)、CD19、CD20、及びCD33からなる群から選択される、請求項1から12の何れか一項に記載の二重特異性抗原結合分子。
14.標的細胞抗原が線維芽細胞活性化タンパク質(FAP)である、請求項1から13の何れか一項に記載の二重特異性抗原結合分子。
15.FAPに特異的に結合することができる部分が、
(i)配列番号68及び配列番号69からなる群から選択されるアミノ酸配列を含むCDR-H1、
(ii)配列番号70及び配列番号71からなる群から選択されるアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び
(iii)配列番号72及び配列番号73からなる群から選択されるアミノ酸配列を含むCDR-H3
を含むVHドメイン、
並びに
(iv)配列番号74及び配列番号75からなる群から選択されるアミノ酸配列を含むCDR-L1、
(v)配列番号76及び配列番号77からなる群から選択されるアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び
(vi)配列番号78及び配列番号79からなる群から選択されるアミノ酸配列を含むCDR-L3
を含むVLドメインを含む、請求項1から13の何れか一項に記載の二重特異性抗原結合分子。
16.(i)OX40に特異的に結合することができる部分が、配列番号25、配列番号27、配列番号29、配列番号31、配列番号33、配列番号35又は配列番号37のアミノ酸配列と少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%又は100%同一であるアミノ酸配列を含む重鎖可変領域VHと、配列番号26、配列番号28、配列番号30、配列番号32、配列番号34、配列番号36又は配列番号38のアミノ酸配列と少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%又は100%同一であるアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域とを含み、かつ、
(ii)FAPに特異的に結合することができる部分が、配列番号80又は配列番号82のアミノ酸配列と少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%又は100%同一であるアミノ酸配列を含む重鎖可変領域VHと、配列番号81又は配列番号83のアミノ酸配列と少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%又は100%同一であるアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域とを含む、請求項1から7の何れか一項に記載の二重特異性抗原結合分子。
17.(i)4-1BBに特異的に結合することができる部分が、配列番号58、配列番号60、配列番号62、配列番号64又は配列番号66のアミノ酸配列と少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%又は100%同一であるアミノ酸配列を含む重鎖可変領域VHと、配列番号59、配列番号61、配列番号63、配列番号65又は配列番号67のアミノ酸配列と少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%又は100%同一であるアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域とを含み、かつ、
(ii)FAPに特異的に結合することができる部分が、配列番号80又は配列番号82のアミノ酸配列と少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%又は100%同一であるアミノ酸配列を含む重鎖可変領域VHと、配列番号81又は配列番号83のアミノ酸配列と少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%又は100%同一であるアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域とを含む、請求項1、2、又は8から12の何れか一項に記載の二重特異性抗原結合分子。
18.前記分子が、
(a)共刺激TNF受容体ファミリーメンバーに特異的に結合することができる第1のFab断片、
(b)標的細胞抗原に特異的に結合することができる第2のFab断片、及び
(c)安定な会合が可能な第1及び第2のサブユニットからなるFcドメイン
を含む、請求項1から17の何れか一項に記載の二重特異性抗原結合分子。
19.FcドメインがIgG、特にIgG1 Fcドメイン又はIgG4 Fcドメインである、請求項1から18の何れか一項に記載の二重特異性抗原結合分子。
20.Fcドメインが、Fc受容体への抗体の結合親和性及び/又はエフェクター機能を低減させる1つ以上のアミノ酸置換を含む、請求項1から19の何れか一項に記載の二重特異性抗原結合分子。
21.Fcドメインが、アミノ酸変異L234A、L235A及びP329Gを有するヒトIgG1サブクラスである(Kabat EUインデックスによる番号付け)、請求項1から20の何れか一項に記載の二重特異性抗原結合分子。
22.Fcドメインが、Fcドメインの第1及び第2のサブユニットの会合を促進する修飾を含む、請求項1から21の何れか一項に記載の二重特異性抗原結合分子。
23.ノブ・イントゥー・ホール法に従って、Fcドメインの第1のサブユニットがノブを含み、かつ、Fcドメインの第2のサブユニットがホールを含む、請求項1から22の何れか一項に記載の二重特異性抗原結合分子。
24.Fcドメインの第1のサブユニットが、アミノ酸置換S354C及びT366W(Kabat EUインデックスによる番号付け)を含み、かつ、Fcドメインの第2のサブユニットが、アミノ酸置換Y349C、T366S及びY407V(Kabat EUインデックスによる番号付け)を含む、請求項1から23の何れか一項に記載の二重特異性抗体。
25.(a)共刺激TNF受容体ファミリーメンバーに特異的に結合することができる2つの部分、
(b)標的細胞抗原に特異的に結合することができる2つの部分、及び
(c)安定な会合が可能な第1及び第2のサブユニットからなるFcドメイン
を含む、請求項1から24の何れか一項に記載の二重特異性抗原結合分子。
26.二重特異性抗原結合分子が、共刺激TNF受容体ファミリーメンバー及び標的細胞抗原の両方に対して二価である、請求項25に記載の二重特異性抗原結合分子。
27.(a)共刺激TNF受容体ファミリーメンバーに特異的に結合することができる2つのFab断片とFcドメインとを含む抗体の2つの軽鎖及び2つの重鎖、及び
(b)標的細胞抗原に特異的に結合することができる2つの追加のFab断片であって、前記追加のFab断片がそれぞれペプチドリンカーを介して(a)の重鎖のC末端に連結されている2つの追加のFab断片
を含む、請求項1から24の何れか一項に記載の二重特異性抗原結合分子。
28.標的細胞抗原に特異的に結合することができる2つの追加のFab断片が、可変ドメインVL及びVHが互いに置換されたクロスオーバーFab断片であり、かつ、VL-CH鎖がそれぞれペプチドリンカーを介して(a)の重鎖のC末端に連結されている、請求項27に記載の二重特異性抗原結合分子。
29.共刺激TNF受容体ファミリーメンバーに特異的に結合することができる2つのFab断片が、OX40又は4-1BBに特異的に結合することができる2つのFab断片であり、かつ、標的細胞抗原に特異的に結合することができる2つの追加のFab断片が、FAPに特異的に結合することができるクロスオーバーFab断片である、請求項27又は28に記載の二重特異性抗原結合分子。
30.(a)共刺激TNF受容体ファミリーメンバーに特異的に結合することができる2つの部分、
(b)標的細胞抗原に特異的に結合することができる1つの部分、及び
(c)安定な会合が可能な第1及び第2のサブユニットからなるFcドメイン
を含む、請求項1から29の何れか一項に記載の二重特異性抗原結合分子。
31.二重特異性抗原結合分子が、共刺激TNF受容体ファミリーメンバーに対して二価であり、かつ、標的細胞抗原に対して一価である、請求項30に記載の二重特異性抗原結合分子。
32.(a)共刺激TNF受容体ファミリーメンバーに特異的に結合することができる2つのFab断片とFcドメインとを含む抗体の2つの軽鎖及び2つの重鎖、及び
(b)標的細胞抗原に特異的に結合することができるVH及びVLドメインであって、ここで、VHドメインがペプチドリンカーを介して重鎖の1つのC末端に連結され、かつ、VLドメインがペプチドリンカーを介して第2の重鎖のC末端に連結される、VH及びVLドメイン
を含む、請求項1から31の何れか一項に記載の二重特異性抗原結合分子。
33.請求項1から32の何れか一項に記載の二重特異性抗原結合分子をコードするポリヌクレオチド。
34.(i)配列番号25のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域VH及び配列番号26のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域VL、
(ii)配列番号27のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域VH及び配列番号28のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域VL、
(iii)配列番号29のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域VH及び配列番号30のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域VL、
(iv)配列番号31のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域VH及び配列番号32のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域VL、
(v)配列番号33のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域VH及び配列番号34のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域VL、
(vi)配列番号35のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域VH及び配列番号36のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域VL、又は
(vii)配列番号37のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域VH及び配列番号38のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域VL
を含む、OX40に特異的に結合する抗体。
35.(i)配列番号58のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域VH及び配列番号59のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域VL、
(ii)配列番号60のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域VH及び配列番号61のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域VL、
(iii)配列番号62のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域VH及び配列番号63のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域VL、
(iv)配列番号64のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域VH及び配列番号65のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域VL、又は
(v)配列番号66のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域VH及び配列番号67のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域VL
を含む、4-1BBに特異的に結合する抗体。
36.請求項34又は35に記載の抗体をコードするポリヌクレオチド。
37.請求項1から32の何れか一項に記載の二重特異性抗原結合分子又は請求項34若しくは35に記載の抗体と、少なくとも1つの薬学的に許容される賦形剤とを含む薬学的組成物。
38.医薬としての使用のための、請求項1から32の何れか一項に記載の二重特異性抗原結合分子、又は請求項34若しくは35に記載の抗体、又は請求項37に記載の薬学的組成物。
39.(i)T細胞応答を刺激することにおける、
(ii)活性化T細胞の生存を支持することにおける、
(iii)感染症の治療における、
(iv)がんの治療における、
(v)がんの進行を遅延させることにおける、又は
(vi)がんに罹患している患者の生存を延長することにおける
使用のための、請求項1から32の何れか一項に記載の二重特異性抗原結合分子、又は請求項34若しくは35に記載の抗体、又は請求項37に記載の薬学的組成物。
40.がんの治療における使用のための、請求項1から32の何れか一項に記載の二重特異性抗原結合分子、又は請求項34若しくは35に記載の抗体、又は請求項37に記載の薬学的組成物。
41.二重特異性抗原結合分子が、化学療法剤、放射線及び/又はがん免疫療法における使用のための他の薬剤と組み合わせて投与される、がんの治療における使用のための、請求項1から32の何れか一項に記載の二重特異性抗原結合分子、又は請求項34若しくは35に記載の抗体、又は請求項37に記載の薬学的組成物。
42.腫瘍細胞の増殖を阻害するために、請求項1から32の何れか一項に記載の二重特異性抗原結合分子又は請求項34若しくは35に記載の抗体又は請求項37に記載の薬学的組成物の有効量を個体に投与することを含む、個体における腫瘍細胞の増殖を阻害する方法。
標準的な方法を使用して、Molecular cloning: A laboratory manual; Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor, New York, 1989に記載されているようにDNAを操作した。分子生物学的試薬を、製造者の指示に従って使用した。ヒト免疫グロブリン軽鎖及び重鎖のヌクレオチド配列に関する一般的な情報は、Kabat, E.A. et al., (1991) Sequences of Proteins of Immunological Interest, Fifth Ed., NIH Publication No 91-3242に与えられている。
DNA配列は、二本鎖配列決定により決定された。
所望の遺伝子セグメントは、適切なテンプレートを用いたPCRによって生成されるか、Geneart AG(Regensburg,Germany)によって合成オリゴヌクレオチド及びPCR産物から自動遺伝子合成によって合成された。正確な遺伝子配列が入手可能でない場合、最も近いホモログ由来の配列に基づいてオリゴヌクレオチドプライマーを設計し、適切な組織を起源とするRNAからRT-PCRによって遺伝子を単離した。特異的な制限エンドヌクレアーゼ切断部位に隣接する遺伝子セグメントを、標準のクローニング/シーケンシングベクター中にクローニングした。形質転換した細菌からプラスミドDNAを精製し、UV分光法により濃度を決定した。サブクローニングされた遺伝子断片のDNA配列を、DNA配列決定によって確認した。遺伝子セグメントは、それぞれの発現ベクター中へのサブクローニングを可能にする適切な制限部位を用いて設計された。全てのコンストラクトは、真核細胞内の分泌のためにタンパク質を標的とするリーダーペプチドをコードする5’末端DNA配列を含むように設計された。
標準プロトコールを参照して、濾過した細胞培養上清からタンパク質を精製した。簡潔には、抗体をプロテインAセファロースカラム(GE healthcare)に適用し、PBSで洗浄した。抗体の溶出は、pH2.8で達成され、続いて試料を直ちに中和した。凝集したタンパク質をPBS又は20mMヒスチジン、150mMのNaCl、pH6.0中のサイズ排除クロマトグラフィー(Superdex 200、GE Healthcare)により単量体抗体から分離した。単量体抗体画分をプールし、例えばMILLIPORE Amicon Ultra(30 MWCO)遠心濃縮器を用いて濃縮し(必要に応じて)、-20℃又は-80℃で凍結保存した。試料の一部が、例えばSDS-PAGE、サイズ排除クロマトグラフィー(SEC)又は質量分析法によるその後のタンパク質分析及び分析的特徴づけのために提供された。
NuPAGE(登録商標)Pre-Castゲルシステム(Invitrogen)を製造者の指示に従って使用した。特に、10%又は4~12%のNuPAGE(登録商標)Novex(登録商標)Bis-TRIS Pre-Castゲル(pH6.4)及びNuPAGE(登録商標)MES(還元ゲル、NuPAGE(登録商標)酸化防止剤ランニングバッファー添加剤を含む)又はMOPS(非還元ゲル)ランニングバッファーを使用した。
抗体の凝集及びオリゴマー状態の測定のためのサイズ排除クロマトグラフィー(SEC)は、HPLCクロマトグラフィーによって行った。簡潔には、プロテインA精製抗体を、Agilent HPLC 1100システム上の300mMのNaCl、50mMのKH2PO4/K2HPO4、pH7.5中のTosoh TSKgel G3000SWカラムに又はDionex HPLCシステム上の2xPBS中のSuperdex 200カラム(GE Healthcare)に適用した。溶出したタンパク質を、UV吸光度及びピーク面積の積分によって定量した。BioRadゲルろ過スタンダード151-1901が標準の役割を果たした。
このセクションでは、VH/VL又はCH/CL交換を有する多重特異性抗体(CrossMab)の特徴づけについて、それらの正確な組み立てに重点を置いて記載する。期待される一次構造は、脱グリコシル化されたインタクトなCrossMab、及び脱グリコシル化/プラスミン消化CrossMab又は代わりに脱グリコシル化/限定LysC消化CrossMabのエレクトロスプレーイオン化質量分析(ESI-MS)によって分析された。
OX40抗体及びツールのバインダーの生成
1.1 抗原の調製、精製及び特徴づけ、並びにファージディスプレイによる新規OX40バインダーの生成のためのスクリーニングツール
ヒト、マウス又はカニクイザルOX40のエクトドメインをコードするDNA配列(表1)を、ノブについてのヒトIgG1重鎖CH2及びCH3ドメインとともにフレーム内にサブクローニングした(Merchant et al., 1998)。AcTEVプロテアーゼ切断部位を、抗原エクトドメインとヒトIgG1のFcとの間に導入した。指示されたビオチン化のためのAviタグを抗原-FcノブのC末端に導入した。S354C/T366W変異を含む抗原-Fcノブ鎖と、Y349C/T366S/L368A/Y407V変異を含むFcホール鎖との組み合わせは、OX40エクトドメイン含有鎖の単一コピーを含むヘテロ二量体の生成を可能にし、従ってFc結合抗原の単量体型を作り出す(図1A)。表1は、様々なOX40エクトドメインのアミノ酸配列を示す。表2は、図1に示される単量体抗原Fc(kih)融合分子のcDNA及びアミノ酸配列を示す。
抗OX40抗体を、3つの異なる一般的なファージディスプレイライブラリー:DP88-4(クローン20B7、8H9 1G4及び49B4)、共通軽鎖ライブラリーVk3_20/VH3_23(クローンCLC-563及びCLC-564)及びラムダ-DP47(クローン17A9)から選択した。
1. 抗原のFc部分を認識する抗体のライブラリーを枯渇させるために、10ug/mlの無関係のヒトIgGでコーティングされたmaxisorpプレート上において約1012個のファージミド粒子を事前清澄化する。
2. 全容量1ml中のFcバインダーの更なる枯渇のために、非結合ファージミド粒子を、100nMの無関係な非ビオチン化Fcノブ・イントゥー・ホール構築物の存在下で、100nMのビオチン化ヒトOX40と0.5時間インキュベートする。
3. ビオチン化hu OX40及び付着した特異的に結合するファージをニュートラアビジンプレコートマイクロタイタープレートの4つのウェルに10分間(ラウンド1及びラウンド3で)移すことによって捕捉する。
4. 5×PBS/Tween20及び5×PBSを用いてそれぞれのウェルを洗浄する。
5. 1ウェルあたり100mMのTEA(トリエチルアミン)250ulを10分間添加することによりファージ粒子を溶出し、1MのTris/HCl(pH7.4)500ulを4つのウェルからのプールされた溶出液に添加することによって中和する。
6. Fcバインダーを最終的に除去するために、100nMのビオチン捕捉したFcノブ・イントゥー・ホール構築物を有するニュートラアビジンプレコートマイクロタイタープレート上でのインキュベーションにより中和溶出液を事後清澄化する。
7. 溶出されたファージ粒子の上清により対数期大腸菌TG1細胞を再感染させ、ヘルパーファージVCSM13により感染させ、振盪機で30℃で一晩インキュベートし、続いて次の選択ラウンドで使用されるファージミド粒子をPEG/NaCl沈殿させる。
表3は、一般的なファージディスプレイ抗体ライブラリー(DP88-4)の配列を示し、表4は、ライブラリーDP88-4生殖細胞系列テンプレートのcDNA及びアミノ酸配列を提供し、表5は、DP88-4生殖細胞系列テンプレートの生成に使用されるプライマー配列を示す。
選択された抗Ox40バインダーの重鎖及び軽鎖DNA配列の可変領域を、ヒトIgG1の定常重鎖又は定常軽鎖の何れかとフレーム内にサブクローニングした。国際特許出願番号WO2012/130831(A1)に記載される方法に従って、Fcガンマ受容体への結合を抑止するために、Pro329Gly、Leu234Ala及びLeu235Ala変異がノブ及びホール重鎖の定常領域に導入されている。
表14は、抗Ox40 P329G LALA IgG1抗体の収率及び最終含有量をまとめたものである。
抗OX40抗体の特徴づけ
2.1 ヒトOX40への結合
2.1.1 表面プラズモン共鳴(アビディティー+親和性)
ファージ由来OX40特異的抗体の組換えOX40 Fc(kih)への結合を、表面プラズモン共鳴(SPR)によって評価した。全てのSPR実験をBiacore T200において、ランニングバッファーとしてHBS-EP(0.01MのHEPES pH7.4、0.15MのNaCl、3mMのEDTA、0.005%の界面活性剤P20、Biacore、Freiburg/Germany)を用いて25℃で行った。
設定1)抗ヒトFab抗体(Biacore,Freiburg/Germany)を、標準的アミンカップリングキット(Biacore,Freiburg/Germany)を用いてpH5.0でCM5チップ上に直接連結させた。固定化レベルは約9000RUであった。OX40に対するファージディスプレイ由来抗体を25~50nMの濃度で60秒間捕捉した。組換えヒトOX40 Fc(kih)を4~1000nMの濃度範囲で30μL/分の流速で120秒間フローセルを通過させた。解離を120秒間モニターした。バルク屈折率の差異は、基準フローセルで取得される応答を差し引くことにより補正された。ここでは、抗原を固定化抗ヒトFab抗体を有する表面上に流したが、その上には抗体でなくHBS-EPが注入された。
バフィーコートはチューリッヒ献血センターから入手した。新鮮な末梢血単核細胞(PBMC)を単離するために、バフィーコートを同じ容量のDPBS(Gibco by Life Technologies、カタログ番号14190 326)で希釈した。50mLのポリプロピレン遠心分離管(TPP、カタログ番号91050)に、15mLのHistopaque 1077(SIGMA Life Science、カタログ番号10771、カタログ番号10771、ポリスクロース及びジアトリゾ酸ナトリウム、1.077g/mLの密度に調整)が供給され、バフィコート溶液をそのHistopaque 1077の上に重ねた。試験管を400×g、室温で、低加速度でブレーキ無しで30分間遠心分離した。その後、PBMCを界面から採取し、DPBSで3回洗浄し、10%ウシ胎仔血清(FBS、Gibco by Life Technology、カタログ番号16000-044、Lot941273、ガンマ線照射、マイコプラズマフリー、及び56℃で35分間の熱不活性化)を供給されたRPMI 1640培地(Gibco by Life Technology、カタログ番号42401-042)、1%(v/v)GlutaMAX I(GIBCO by Life Technologies、カタログ番号35050 038)、1mMのピルビン酸ナトリウム(SIGMA、カタログ番号S8636)、1%(v/v)のMEM非必須アミノ酸(SIGMA、カタログ番号M7145)及び50μMのβメルカプトエタノール(SIGMA、M3148)からなるT細胞培地に再懸濁した。
2.2.1 表面プラズモン共鳴(アビディティー+親和性)
ファージ由来OX40特異的抗体20B7の組換えマウスOX40 Fc(kih)への結合を、ヒトOX40 Fc(kih)について上記したように表面プラズモン共鳴によって評価した(実施例2.1.1を参照)。速度定数を、Biacore T200 Evaluation Software(vAA、Biacore AB、Uppsala/Sweden)を用いて導出し、数値積分法により1:1ラングミュア結合の反応速度式に当てはめ、定性的にアビディティーを推定するために使用した(表18)。
マウス脾臓を3mLのPBSに集め、gentle MACSチューブ(Miltenyi Biotec カタログ番号130-096-334)及びgentleMACS Octo Dissociator(Miltenyi Biotec)を用いて単一細胞懸濁液を生成した。その後、脾細胞を30μmの前分離(pre-separation)フィルター(Miltenyi Biotec カタログ番号130-041-407)に通して濾過し、4℃、350xgで7分間遠心分離した。上清を吸引し、細胞を10%(v/v)FBS、1%(v/v)GlutaMAX I、1mMピルビン酸ナトリウム、1%(v/v)MEM非必須アミノ酸、50μMのβ-メルカプトエタノール及び10%ペニシリン-ストレプトマイシン(SIGMA、カタログ番号P4333)を供給したRPMI1640培地に再懸濁した。106細胞/mLを、10μg/mLの抗マウスCD3εアルメニアハムスターIgG(クローン145-2C11、BioLegend、カタログ番号100331)及び2μg/mLの抗マウスCD28シリアンハムスターIgG(クローン37.51、BioLegend、カタログ番号102102)をコーティングした6ウェル組織培養プレート中で3日間培養した。活性化又は新鮮なマウス脾細胞を収集し、DPBSで洗浄し、計数し、0.1×106個の細胞を96個のU底非組織培養処理ウェルプレートの各ウェルに移した。細胞をDPBSで洗浄し、異なる濃度の抗OX40ヒトIgG1 P329GLALA抗体(選択されたバインダーのみ)を含有する50μLのFACS緩衝液中で染色した。細胞を4℃で120分間インキュベートした。その後、細胞をFACS緩衝液で2回洗浄し、抗マウスCD8bラットIgG2bκ-APC-Cy7(BioLegend、カタログ番号100714、クローン53-6.7)、抗マウスCD4ラットIgG2bκ-PE-Cy7(BioLegend、カタログ番号100422、クローンGK1.5)及びFITC結合AffiniPure抗ヒトIgG Fcγ断片特異的ヤギIgG F(ab’)2断片(Jackson ImmunoResearch、カタログ番号109-096-098)を含有するFACS緩衝液25μL/ウェル中で4℃で30分間染色した。プレートを200μL/ウェルの4℃のFACS緩衝液で2回洗浄し、最終的に0.2μg/mLのDAPI(Santa Cruz Biotec、カタログ番号Sc-3598)を含む80μL/ウェルのFACS緩衝液に再懸濁し、5レーザーLSR-Fortessa(BD Bioscience、DIVAソフトウェアを備える)を使用して同日に取得した。
選択された抗OX40バインダーのカニクイザル細胞との反応性を試験するために、健常なMacaca fascicularisのPBMCを、ヒト細胞について記載したような密度勾配遠心分離を軽微な修正を加えて用いてヘパリン処置血液から単離した。DPBSで希釈したリンパ球プレパラート培地(90%v/v、Axon Lab、カタログ番号1114545)を用いて、ヘパリン処理した新鮮な血液から密度勾配遠心分離を用いてカニクイザルPBMCを単離した。遠心分離は、520xgで、室温で30分間ブレーキ無しで行った。血小板数を減少させるために、150xgで室温で15分間の隣接した遠心分離を行った後、無菌DPBSでPBMCを洗浄するために室温で10分間400xgで数回遠心分離を行った。PBMCは、T細胞の細胞表面上で強いOx40発現を受けるように刺激された(活性化されたカニクイザルPBMCへの結合)。従って、ナイーブPBMCを、プレコートした12ウェル組織培養プレート[10μg/mLのカニクイザル交差反応性抗ヒトCD3(クローンSP34)及び2μg/mLのカニクイザル交差反応性抗ヒトCD28(クローンCD28.2)]上で、37℃、5%CO2で200U/mLのProleukinを供給したT細胞培地中で72時間培養した。
ファージ由来OX40特異的抗体(全てヒトIgG1 P329GLALA)の組換えカニクイザルOX40 Fc(kih)への結合を、表面プラズモン共鳴(SPR)によって評価した。全てのSPR実験をBiacore T200において、ランニングバッファーとしてHBS-EP(0.01MのHEPES pH7.4、0.15MのNaCl、3mMのEDTA、0.005%の界面活性剤P20、Biacore、Freiburg/Germany)を用いて25℃で行った。
OX40陰性腫瘍細胞への結合
OX40陰性腫瘍細胞への結合の欠如は、WM266-4細胞(ATCC CRL-1676)及びU-87 MG(ATCC HTB-14)腫瘍細胞を用いて試験した。両方の腫瘍細胞の分離を可能にするために、WM266-4細胞をPKH-26赤色蛍光細胞リンカーキット(Sigma、カタログ番号PKH26GL)で予め標識した。細胞を収集し、RPMI 1640培地で3回洗浄した。ペレットを、新たに調製したPKH26-赤色染色溶液(提供された希釈液C中で最終濃度[1nM])中、1×107個の細胞の最終細胞密度で、暗所で室温で5分間染色した。過剰のFBSを添加して標識反応を停止させ、細胞を10%(v/v)FBS、1%(v/v)GlutaMAX-Iを補充したRPMI 1640培地で4回洗浄して過剰の色素を除去した。
OX40/OX40-リガンド相互作用を妨げるOX40特異的ヒトIgG1 P329GLALA抗体分子の能力を決定するために、ヒトOX40リガンド(R&D systems)を使用した。OX40とOX40リガンドとの間の相互作用の親和性が低いため、C末端のHaタグを有する二量体ヒトOX40 Fc融合体を調製した(図1B)。この二量体ヒトOx40 Fc融合分子のヌクレオチド配列及びアミノ酸配列を表21に示す。産生及び精製を、実施例1.1の単量体OX40 Fc(kih)について記載したように実施した。
図1Cは実験の設計を示す。
抗ヒトOX40結合クローンの機能特性
3.1 ヒトOX40及びレポーター遺伝子NF-κB-ルシフェラーゼを発現するHeLa細胞
OX40のそのリガンドへのアゴニスト結合は、核因子カッパB(NFκB)の活性化を介した下流シグナル伝達を誘導する(A. D. Weinberg et al., J. Leukoc. Biol. 2004, 75(6), 962-972)。組換えレポーター細胞株HeLa_hOx40_NFkB_Luc1を作成し、その表面にヒトOx40を発現させた。更に、それはNFκB感受性エンハンサーセグメントの制御下にルシフェラーゼ遺伝子を含むレポータープラスミドを保持している。Ox40トリガーは、NFκBの用量依存的活性化を誘導し、これは核内に移行し、レポータープラスミドのNFκB感受性エンハンサーに結合して、ルシフェラーゼタンパク質の発現を増加させるルシフェラーゼはルシフェリン酸化を触媒し、光を放出するオキシルシフェリンを生じる。これは、ルミノメーターで定量することができる。1つの実験の範囲は、HeLa_hOx40_NFκB_Luc1レポーター細胞においてNFκB活性化を誘導するためのP329GLALA huIgG1フォーマットにおける様々な抗Ox40バインダーの能力を試験することであった。
OX40のライゲーションは、最適以下のT細胞受容体(TCR)刺激後にT細胞の分裂及び生存を促進する相乗的な共刺激シグナルを提供する(M. Croft et al., Immunol. Rev. 2009, 229(1), 173-191)。更に、幾つかのサイトカインの産生及びT細胞活性化マーカーの表面発現が増加する(I. Gramaglia et al., J. Immunol. 1998, 161(12), 6510-6517; S. M. Jensen et al., Seminars in Oncology 2010, 37(5), 524-532)。
Ox40及び線維芽細胞活性化タンパク質(FAP)を標的とする二重特異性構築物の生成
4.1 Ox40及び線維芽細胞活性化タンパク質(FAP)を標的とする二重特異性二価抗原結合分子の生成(2+2フォーマット)
Ox40及びFAPに対する二価結合を有する二重特異性アゴニストOx40抗体を調製した。誤って対形成された軽鎖の形成を減少させるために、国際特許出願第WO2010/145792(A1)号によるクロスマブ(crossmab)技術が適用された。
Ox40及びFAPに対する一価結合を有する二重特異性アゴニストOx40抗体は、誤って対形成された軽鎖の形成を減少させるために、国際特許出願WO2010145792(A1)号によるクロスマブ技術を適用することによって調製された。
表28は、二価特異的一価抗Ox40/抗FAP IgG1 P329G LALA kih抗原結合分子の生化学分析をまとめたものである。
4.3.1 表面プラズモン共鳴(同時結合)
ヒトOx40 Fc(kih)及びヒトFAPを同時に結合させる能力を、表面プラズモン共鳴(SPR)によって評価した。全てのSPR実験をBiacore T200において、ランニングバッファーとしてHBS-EP(0.01MのHEPES pH7.4、0.15MのNaCl、3mMのEDTA、0.005%の界面活性剤P20、Biacore、Freiburg/Germany)を用いて25℃で行った。ビオチン化ヒトOx40 Fc(kih)をストレプトアビジン(SA)センサーチップの異なるフローセルに直接結合させた。最大1000の共鳴単位(RU)までの固定化レベルを使用した。
4.3.2.1 FAP標的化抗ヒトOx40抗体のヒトPBMCへの結合;ナイーブ対活性化ヒトPBMC
ヒトPBMCを、実施例2.1.2に記載のフィコール密度勾配遠心分離によって単離した。PBMCは単離直後に使用され(休止ヒトPBMCへの結合)、又はそれらは、T細胞の細胞表面上の強いヒトOx40発現を受けるように刺激された(活性化ヒトPBMCへの結合)。従って、ナイーブPBMCを、6ウェル組織培養プレート中に200U/mLのProleukin及び2ug/mLのPHA-Lを供給したT細胞培地で4~7日間培養し、次いで、プレコートした6ウェル組織培養プレート[10ug/mLの抗ヒトCD3(クローンOKT3)及び2ug/mLの抗ヒトCD28(クローンCD28.2)]上で、37℃、5%CO2で、200U/mLのProleukinを供給したT細胞培地中で1日間培養した。
細胞表面FAPへの結合を、ヒト線維芽細胞活性化タンパク質(huFAP)発現細胞NIH/3T3-huFAPクローン39又はWM266-4細胞(ATCC、CRL-1676)を使用して試験した。NIH/3T3-huFAPクローン39は、マウス胎仔線維芽細胞NIH/3T3細胞株(ATCC、CRL-1658)を、1.5μg/mLのピューロマイシン選択下で、huFAPを発現する発現ベクターpETR4921でトランスフェクションすることによって生成された。幾つかのアッセイでは、実施例2.3.2に記載のように、WM266-4細胞をPKH-26赤色蛍光細胞リンカーキット(Sigma、カタログ番号PKH26GL)で予め標識し、これらの腫瘍細胞を、存在する他の細胞(例えば、ヒトPBMC)からの分離を可能にした。
2つの異なる重鎖の組み立てを可能にするノブ・イントゥー・ホール技術を適用することによって、Ox40に対する二価結合及びFAPに対する一価結合を有する二重特異性アゴニストOx40抗体を調製した。
4.5.1 FAPへの結合(表面プラズモン共鳴)
ヒト、マウス及びカニクイザルFAPに結合する二重特異性構築物の能力を表面プラズモン共鳴(SPR)によって評価した。全てのSPR実験をBiacore T200 (Biacore)において、ランニングバッファーとしてHBS-EP(0.01MのHEPES pH7.4、0.15MのNaCl、3mMのEDTA、0.005%の界面活性剤P20(Biacore)を用いて25℃で行った。
2つの抗OX40のFabドメインの全ての、IgGに匹敵する、huOX40に結合する能力を確認するために、細胞ベースのFRETアッセイ(TagLite)を適用した。従って、huOX40-SNAP融合体でトランスフェクトされ、FRETドナーであるテルビウム(Cisbio)で標識した10000 Hek293 EBNA細胞/ウェルを、FRETアクセプターd2(Cisbio)で標識した0.2nM(49B4)のIgGと混合した。更に、(49B4)IgG又は二重特異性構築物49B4/28H1(2+1)の何れかからの0.004-750nMの範囲の濃度希釈液を加えて、室温で2-4時間インキュベートした。蛍光シグナルは、蛍光ドナー(Terbium)については620nmで、蛍光アクセプター色素(M100 Pro、Tecan)については665nmで測定した。665/620*1000の比を計算し、基準(細胞のみ)を差し引いた(図13M)。EC50の決定のために、結果をGraphpad Prism 5で分析した。観察されたEC50値を表33に示す。全ての2+1構築物は、これらの実験条件下で二価IgGよりも同様のEC50を示した。
ヒトOX40 Fc(kih)及びヒトFAPを同時に結合させる能力を、表面プラズモン共鳴(SPR)によって評価した。全てのSPR実験をBiacore T200 (Biacore)において、ランニングバッファーとしてHBS-EP(0.01MのHEPES pH7.4、0.15MのNaCl、3mMのEDTA、0.005%の界面活性剤P20(Biacore)を用いて25℃で行った。
4.5.4.1 OX40及びFAPを標的とする二重特異性抗体のヒトPBMCへの結合;ナイーブ対活性化ヒトPBMC
ヒトPBMCを、実施例2.1.2に記載のフィコール密度勾配遠心分離によって単離した。PBMCは単離直後に使用され(休止ヒトPBMCへの結合)、又はそれらは、T細胞の細胞表面上の強いヒトOx40発現を受けるように刺激された(活性化ヒトPBMCへの結合)。従って、ナイーブPBMCを、6ウェル組織培養プレート中に200U/mLのProleukin及び2μg/mLのPHA-Lを供給したT細胞培地で4日間培養し、次いで、プレコートした6ウェル組織培養プレート[4μg/mLの抗ヒトCD3(クローンOKT3)及び2μg/mLの抗ヒトCD28(クローンCD28.2)]上で、37℃、5%CO2で、200U/mLのProleukinを供給したT細胞培地中で1日間培養した。
細胞表面FAPへの結合を、ヒト線維芽細胞活性化タンパク質(huFAP)発現WM266-4細胞(ATCC、CRL-1676)を使用して試験した。OX40陰性FAP陰性腫瘍細胞への結合の欠如は、標識されていないヒトFAP陽性WM266-4細胞からの分離を可能にするために、核に限定されたNucLight Red蛍光タンパク質を発現するA549 NucLightTM Red Cells(Essenbioscience、カタログ番号4491)を用いて試験した。親のA549(ATCC CCL-185)は、標準的なEssenプロトコルに従って、8μg/mlポリブレンの存在下で、MOIを3(TU/細胞)で、Essen CellPlayer NucLight Red Lentivirus(Essenbioscience、カタログ番号4476;EF1α、ピューロマイシン)を形質導入した。これは、≧70%の形質導入効率をもたらした。
二重特異性抗ヒトOX40結合分子の機能特性
5.1 ヒトOX40及びレポーター遺伝子NF-κB-ルシフェラーゼを発現するHeLa細胞
実施例3.1に示されるように、限定された用量依存性のNFκB活性化は、抗OX40 P329GLALA huIgG1抗体をHeLa_hOX40_NFkB_Luc1レポーター細胞株に添加することによって誘導された。抗ヒトIgG特異的二次抗体による抗OX40抗体の過架橋は、濃度依存的にNFκB媒介性ルシフェラーゼ活性化の誘導を強く増加させた。結果的に、発明者らは、一価及び二価のFAP標的フォーマットの選択された抗OX40バインダー(8H9、1G4、49B9)のNFκB活性化能力を、単独で、及び二次抗体又はFAP+腫瘍細胞株の何れかによる構築物の過架橋を伴うもので試験した。
FAP標的化一価又は二価フォーマットの選択されたバインダー(クローン8H9及び1G4)もまた、それらが表面固定化されたときにT細胞を共活性化する能力について試験された。
実施例5.1において、FAP+腫瘍細胞の添加は、OX40受容体の強力なオリゴマー化を提供することによって、ヒトOX40陽性レポーター細胞株におけるFAP標的化一価及び二価抗OX40構築物によって誘導されるNFκB活性を強く増加させることができると示された。同様に、発明者らは、NIH/3T3-huFAPクローン39細胞の存在下において、FAP標的化一価(1+1)及び二価(2+1、2+2)抗OX40構築物を、休止ヒトPBMC細胞の最適以下のTCR刺激をレスキューする能力について試験した。
ヒトIgG1クラスの抗体は、ADCCコンピテント細胞、例えばNK細胞上のFcγ受容体(FcγR)に結合することにより、抗原陽性標的細胞の抗体依存性細胞死(ADCC)を誘導することができる。従って、ADCCコンピテントOx40抗体は、直近に活性化されたOx40+ T細胞の溶解を媒介し、腫瘍反応性T細胞のプールを減少させることができた。抗体のFc部分へのIgG1P329GLALA突然変異の導入は、FcγR(国際特許出願公開番号WO2001/130831A1)への結合を妨げ、従ってNK細胞の存在下でのADCCを妨げる。しかしながら、FcN受容体への結合は変化せず、抗体のIgG様の薬物動態を確実にする。
4-1BB抗体及びツールのバインダーの生成
6.1 抗原の調製、精製及び特徴づけ、並びにファージディスプレイによる新規4-1BBバインダーの生成のためのスクリーニングツール
ヒト、マウス又はカニクイザル4-1BBのエクトドメインをコードするDNA配列(表36)を、ノブについてのヒトIgG1重鎖CH2及びCH3ドメインとともにフレーム内にサブクローニングした(Merchant et al., 1998)。AcTEVプロテアーゼ切断部位を、抗原エクトドメインとヒトIgG1のFcとの間に導入した。指示されたビオチン化のためのAviタグを抗原-FcノブのC末端に導入した。S354C/T366W変異を含む抗原-Fcノブ鎖と、Y349C/T366S/L368A/Y407V変異を含むFcホール鎖との組み合わせは、4-1BBエクトドメイン含有鎖の単一コピーを含むヘテロ二量体の生成を可能にし、従ってFc結合抗原の単量体型を作り出す(図1A)。表37は、抗原Fc融合構築物のcDNA及びアミノ酸配列を示す。
ヒト及びカニクイザル4-1BBに対して特異性を有する抗体11D5、9B11、及び12B3は、Fabフォーマットの一般的なファージディスプレイ抗体ライブラリー(DP88-4)から選択された。同じライブラリーから、マウス4-1BBに対する反応性を有する付加的な抗体、クローン20G2も同様に選択した。このライブラリーは、軽鎖のCDR3(L3、3つの異なる長さ)及び重鎖のCDR3(H3、3つの異なる長さ)に無作為化配列空間を含む、Vドメイン対合Vk1_5(カッパ軽鎖)及びVH1_69(重鎖)を用いて、ヒト生殖細胞系列遺伝子に基づいて構築した。ライブラリー生成は、オーバーラップ伸長によるスプライシング(SOE)PCRを適用する3つのPCR増幅断片のアセンブリによって実施した。断片1は無作為化されたL3を含む抗体遺伝子の5’末端を含み、断片2はL3からH3にわたる中央の定常断片であり、一方、断片3は抗体遺伝子の無作為化されたH3及び3’部分を含む。以下のプライマーの組み合わせを使用して、DP88-4ライブラリーのこれらのライブラリー断片を生成した:断片1(リバースプライマーVk1_5_L3r_S又はVk1_5_L3r_SY又はVk1_5_L3r_SPYと組み合わせたフォワードプライマーLMB3)、断片2(リバースプライマーRJH32と組み合わせたフォワードプライマーRJH31)及び断片3(フォワードプライマーDP88-v4-4又はDP88-v4-6又はDP88-v4-8とリバースプライマーfdseqlongを組み合わせたもの)。ライブラリー断片の作製のためのPCRパラメーターは、94℃で5分間の初期変性、94℃で1分、58℃で1分、72℃で1分、72℃で10分間の末端伸長の25サイクルであった。テンプレートとして等モル比のゲル精製単一断片を使用するアセンブリPCRのために、パラメーターは、94℃で3分間の初期変性及び94℃で30秒、58℃で1分、72℃で2分の5サイクルであった。この段階で、外側プライマー(LMB3及びfdseqlong)を添加し、72℃で10分間の末端伸長の前に更に20サイクルを行った。十分な量の全長無作為化Fab構築物を集めた後、それらをNcoI/NheIで消化し、同様に処理したアクセプターファージミドベクターに連結した。精製されたライゲーションを、エレクトロコンピテント大腸菌TG1への約60の形質転換のために使用した。Fabライブラリーを表示するファージミド粒子をレスキューし、PEG/NaCl精製によって精製し、選択のために使用した。これらのライブラリー構築工程を3回繰り返して、4.4×109の最終ライブラリーサイズを得た。ドットブロットにおけるC末端タグ検出によって決定されるように、機能的クローンの割合は、軽鎖については92.6%、重鎖については93.7%であった。
選択された抗4-1BBバインダーの重鎖及び軽鎖DNA配列の可変領域を、ヒトIgG1の定常重鎖又は定常軽鎖の何れかとフレーム内にサブクローニングした。国際特許出願番号WO2012/130831(A1)号に記載される方法に従って、Fcガンマ受容体への結合を抑止するために、Pro329Gly、Leu234Ala及びLeu235Ala変異がノブ及びホール重鎖の定常領域に導入されている。
抗4-BB抗体の特徴づけ
7.1 ヒト4-1BBへの結合
7.1.1 表面プラズモン共鳴(アビディティー+親和性)
ファージ由来4-1BB特異的抗体の組換え4-1BB Fc(kih)への結合を、表面プラズモン共鳴(SPR)によって評価した。全てのSPR実験をBiacore T200において、ランニングバッファーとしてHBS-EP(0.01MのHEPES pH7.4、0.15MのNaCl、3mMのEDTA、0.005%の界面活性剤P20、Biacore、Freiburg/Germany)を用いて25°Cで行った。
ヒト4-1BBの発現は、休止及びナイーブヒトT細胞には存在しない(Kienzle G. and von Kempis J (2000), Int. Immunol. 12(1):, 73-82, Wen T. et al. (2002), J. Immunol. 168, 4897-4906)。固定化抗ヒトCD3アゴニスト抗体による活性化後、4-1BBはCD4+及びCD8+ T細胞上でアップレギュレートされる。4-1BBの発現は、活性化ヒトNK細胞(Baessler T. et. al. (2010) Blood 115(15), 3058-3069)、活性化ヒトNKT細胞(Cole S.L. et al. (2014) J. Immunol. 192(8), 3898-3907)、活性化ヒトB細胞(Zhang et al. (2010) J. Immunol. 184(2), 787-795)、活性化ヒト好酸球(Heinisch et al. 2001)、恒常的にヒト好中球(Heinisch I.V. (2000) J Allergy Clin Immunol. 108(1), 21-28)、活性化ヒト単球(Langstein J.et al. (1998) J Immunol. 160(5), 2488-2494, Kwajah M. and Schwarz H. (2010) Eur J Immunol. 40(7), 1938-1949)、恒常的にヒト制御性T細胞(Bacher P. et al. (2014) Mucosal Immunol. 7(4), 916-928)、ヒト濾胞性樹状細胞(Pauly S. et al. (2002) J Leukoc Biol. 72(1), 35-42)、活性化ヒト樹状細胞(Zhang L. et al. (2004) Cell Mol Immunol. 1(1), 71-76)及び悪性ヒト腫瘍の血管(Broll K. et al. (2001) Am J Clin Pathol. 115(4), 543-549)についても報告されている。
7.2.1 表面プラズモン共鳴(アビディティー+親和性)
ファージ由来4-1BB特異的抗体20G2の組換えマウス4-1BB Fc(kih)への結合を、ヒト4-1BB Fc(kih)について上記したように表面プラズモン共鳴によって評価した(実施例7.1.1を参照)。速度定数を、Biacore T200 Evaluation Software(vAA、Biacore AB、Uppsala/Sweden)を用いて導出し、数値積分法により1:1ラングミュア結合の反応速度式に当てはめ、定性的にアビディティーを推定するために使用した(表44)。
ヒトと同様に、新たに単離された休止マウスT細胞は4-1BBを発現しないが、ペプチドパルスAPC(Cannons J.et al. (2001) J. Immunol. 167(3): 1313-1324)又は固定化抗マウスCD3又は抗マウスCD3と抗マウスCD28抗体との組み合わせ(Pollok K. et al. (1995), European J. Immunol. 25(2), 488-494)を介したTCR活性化によって発現を誘導することができる。表面固定化抗CD3抗体による活性化の後、4-1BB発現はCD8+ T細胞上でより高いと報告されているが(Shuford W, et al. (1997) J. of Experimental Med. 186(1), 47-55)、これは活性化プロトコールに依存し得る。更なる4-1BB発現は、活性化マウスNK細胞(Melero et al. (1998) Cell Immunol. 190(2), 167-172)、活性化マウスNKT細胞(Vinay D, et al. (2004) J Immunol. 173(6), 4218-4229)、活性化マウスB細胞(Vinay, Kwon (2011) Cell Mol Immunol. 8(4), 281-284)、恒常的にマウス好中球に(Lee S. et al. (2005) Infect Immun. 73(8), 5144-5151)、並びにマウス調節性T細胞(Gavin et al. (2002) Nat Immunol. 3(1), 33-41)、マウスIgE刺激肥満細胞(Nishimoto et al. (2005) Blood 106(13): 4241-4248)、マウス骨髄系統細胞(Lee et al. (2008) Nat Immunol. 9(8), 917-926)、マウス濾胞性樹状細胞(Middendorp et al. (2009) Blood 114(11), 2280-2289)及び活性化マウス樹状細胞(Wilcox, Chapoval et al. (2002) J Immunol. 168(9),4262-4267)についても報告されている。
7.3.1 表面プラズモン共鳴(アビディティー+親和性)
ファージ由来4-1BB特異的抗体12B3、25G7、11D5及び9B11の組換えカニクイザル4-1BB Fc(kih)への結合を、ヒト4-1BB Fc(kih)について上記したように表面プラズモン共鳴(SPR)によって評価した(実施例7.1.1を参照)。全てのSPR実験をBiacore T200において、ランニングバッファーとしてHBS-EP(0.01MのHEPES pH7.4、0.15MのNaCl、3mMのEDTA、0.005%の界面活性剤P20、Biacore、Freiburg/Germany)を用いて25℃で行った。速度定数を、Biacore T200 Evaluation Software(vAA、Biacore AB、Uppsala/Sweden)を用いて導出し、数値積分法により1:1ラングミュア結合の反応速度式に当てはめ、定性的にアビディティーを推定するために使用した(表52)。
抗ヒト4-1BB結合クローンのカニクイザル細胞への交差反応性を試験するために、健常なカニクイザル(cynomolgus fascicularis)のPBMCをヒトPBMC(7.1.2)について記載したような密度勾配遠心分離(軽微な違いを含む)を用いてヘパリン処置血液から単離した。単離したPBMCを、10μg/mLの抗カニクイザル交差反応性CD3(抗IgG3λ、抗ヒトCD3、クローンSP34、BD Pharmingen、カタログ番号556610)及び2μg/mLの抗カニクイザル交差反応性CD28(moIgG1κ、抗ヒトCD28、クローンCD28.2、BioLegend、カタログ番号140786)抗体をコーティングした6ウェル細胞培養プレート上で、10%FBS、1%(v/v)GlutaMAX-1、1mMピルビン酸ナトリウム、1%(v/v)MEM非必須アミノ酸及び50μMのβメルカプトエタノール(Greiner Bio-One、Germany)を供給されたRPMI 1640培地からなるT細胞培地中で、1.5×106細胞/mLの細胞密度で72時間培養した。72時間の刺激の後、細胞を収集し、0.1×106細胞/ウェルの濃度で丸底懸濁細胞96ウェルプレート(Greiner bio-one、cellstar、カタログ番号650185)に播種した。細胞を、異なる濃度の一次抗ヒト4-1BB特異的huIgG P32G LALA抗体を含む50μL/ウェルのFACS緩衝液中で4℃で2時間インキュベートした。その後、細胞を200μL/ウェルのFACS緩衝液で4回洗浄し、2μLのPE結合抗カニクイザル交差反応性CD4(moIgG2aκ、抗ヒトCD4、クローンM-T477、BD Pharmingen、カタログ番号556616)、1μg/mLのPerCP/Cy5.5結合抗カニクイザル反応性CD8(moIgG1κ、抗ヒトCD8、クローンRPA-T8、BioLegend、カタログ番号301032)及び30μg/mLのFITC結合AffiniPure抗ヒトIgG Fcγ断片特異的ヤギF(ab’)2断片(Jackson ImmunoResearch、カタログ番号109 096 098)を含む50μL/ウェルのFACS緩衝液で4℃で30分間更にインキュベートした。細胞をFACS緩衝液で2回洗浄し、0.2μg/mLのDAPIを供給した100μL/ウェルのFACS緩衝液に再懸濁して、生存細胞から死滅したことを識別した。細胞は、5レーザーFortessa(BD Bioscience、DIVAソフトウェアを備える)を用いて直ちに取得した。ゲートをCD8+及びCD4+ T細胞にセットし、二次検出抗体の蛍光強度中央値(MFI)を用いて、一次抗体の結合を分析した。Graph Pad Prism(Graph Pad Software Inc.)を使用して、ブランク値を差し引いて(一次抗体を添加しない)データをベースライン化し、EC50値を非線形回帰曲線適合(ロバストフィット)を用いて計算した。
4-1BB/4-1BB-リガンド相互作用を妨げる4-1BB特異的ヒトIgG1 P329GLALA抗体分子の能力を決定するために、ヒト4-1BBリガンド(R&D systems)を使用した。同様に、マウス4-1BBリガンド(R&D systems)を用いて、抗マウス4-1BB特異的IgG1 P329GLALA抗体20G2のリガンドブロッキング特性を評価した。
ファージ由来抗4-1BB抗体によって認識されるエピトープは、表面プラズモン共鳴によって特徴づけられた。最初に、ヒト4-1BBへの結合を競合する抗体の能力を表面プラズモン共鳴によって評価した。第2に、抗4-1BB抗体のヒト4-1BBとマウス4-1BBの2つの異なるドメインへの結合を、以前に本明細書に記載したようにSPRによって評価した。この目的のために、ハイブリッド4-1BB Fc(kih)融合タンパク質が設計されている。それらは、ヒトドメイン又はマウスドメインの何れかの4-1BBのエクトドメインを含む。ファージディスプレイ選択のために使用された、上記の抗原Fc融合体と同様に、ハイブリッド4-1BB変異体をFc(kih)のノブ鎖に融合させた。これらの実験の目的は、「エピトープビン(epitope bin)」を定義することであった。類似又は重複エピトープについて競合する抗体は、4-1BBに同時に結合することができず、「エピトープビン」に属する。4-1BBに同時に結合することができる抗4-1BB抗体は、エピトープ又はその一部を共有しないので、異なるエピトープビンに分類される。
抗4-1BBヒトIgG1 P329GLALA(図28A-28F)のヒト又はマウス受容体に対する競合的結合を分析するために、標準的なアミンカップリングキット(Biacore、Freiburg/Germany)を用いて、ファージ由来抗4-1BBクローン9B11及び11D5をそれぞれCM5チップに1400及び2200RUでpH5.5で直接連結させた。組換えヒト4-1BB Fc(kih)を、200nMの濃度で30μL/分の流速で180秒間注入させた。解離を省略し、第2の抗4-1BBヒトIgG1 P329GLALA抗体を100nMの濃度で30μL/分の流速で90秒間通過させた。バルク屈折率の差異は、基準フローセルで取得される応答を差し引くことにより補正された。
ファージ由来の抗4-1BBクローン12B3、25G7、11D5、9B11及び20G2によって認識されるエピトープは、ヒト及びマウスドメインの組み合わせ、又は単一ドメインを含む4-1BB Fc(kih)融合分子のハイブリッド変異体を用いて特徴づけられている(表56)。ハイブリッド4-1BBを4-1BB Fc(kih)抗原について実施例6.1に記載のようにFc(kih)に融合させた。表52は、ハイブリッド4-1BB変異体の調製に使用される4-1BBドメインの配列を含む。
抗4-1BB結合クローンの機能特性
8.1 抗ヒト4-1BB結合クローンの機能特性
4-1BBは共刺激受容体として働き、TCR依存的にT細胞の増殖、サイトカイン産生及び機能的特性を改善する。表面固定化抗CD3抗体又はペプチドパルス化抗原提示細胞によるTCR活性化は、T細胞上の4-1BBのアップレギュレーションを誘導し(Pollok et al. (1993) J. Immunol. 150(3): 771-781)、結合後に増殖及びサイトカイン放出を促進することにより免疫応答を支持する(Hurtado et al. (1995) J Immunology 155(7), 3360-3367)。生成した抗ヒト4-1BB抗体のブースティング(boosting)能力を試験するために、丸底懸濁96ウェルプレート(Greiner bio-one、cellstar、カタログ番号650185)を、2μg/mLのAffiniPure F(ab’)2断片ヤギ抗ヒトIgG、Fcγ断片特異的(Jackson Immunoresearch、カタログ番号109-006-008)及び2μg/mLのAffiniPureヤギ抗マウスIgG、Fcγ断片特異的(Jackson Immunoresearch、カタログ番号115-005-008)を含むDPBSで一晩にわたってコーティングした。プレートをDPBSで洗浄して余分な分子を除去し、1%(w/v)BSAを含むDPBS(SIGMA-Aldrich、カタログ番号A3059-100G)で37℃で90分間ブロックした。上清を除去し、プレートを1%(w/v)BSAを含み、10ng/mLの抗ヒトCD3抗体(BioLegend、カタログ番号317315、クローンOKT3)を含むか又は含まないDPBSと共に37℃で90分間インキュベートした。プレートをDPBSで洗浄し、1%(w/v)BSA及び異なる濃度の滴定抗ヒト4-1BB IgG1 P329 G LALA抗体を供給したDPBSと共にインキュベートした。プレートをDPBSで洗浄し、上清を吸引した。
Fc受容体によるアゴニスト抗4-1BB抗体の架橋を防止するために、抗体のFc部分に変異を導入した.ヒトIgG1抗体のP329G LALA突然変異と同様に、DAPG突然変異をマウスIgG1分子のFc部分に導入した。これがFcR架橋及びそれによる活性化能力を妨げるかどうかを試験するために、マウス脾細胞を、最適以下の濃度の抗マウスCD3抗体と、マウスIgG1及びマウスIgG1 DAPGとしての異なる濃度のクローン20G2とで活性化した。
アゴニスト抗マウス4-1BBラットIgG2aでマウスを処理すると、無腫瘍マウス(Dubrot et al. (2010) Cancer Immunol Immunother. 59(8), 1223-33; Niu et al. (2007) J Immunol. 178(7):4194-213)及び担がんマウス(Wang et al. (2010) J Immunol. 185(12):7654-62; Kocak et al. (2006) Cancer Res. 66(14):7276-84)において肝臓に活性化T細胞が蓄積し、肝臓の炎症を誘発する。ステージIVのメラノーマ患者における抗4-1BB抗体ウレルマブ(huIgG4)を用いた同様の臨床第II相試験は、異常に高いグレード4の肝炎の発生率のために終了しなければならなかった(Ascierto P.et al. (2010) Semin Oncol. 37(5), 508-16)。試験するために、抗マウス4-1BBマウスIgG1が、報告されたアゴニスト抗マウス4-1BBラットIgG2a抗体と同様のT細胞蓄積を肝臓に誘導することができ、更にDAPG突然変異がこれを防ぐことができれば、ナイーブな健常メスC57BL/6マウス(7-9週齢、Charles River、France)を、抗マウス4-1BB IgG1及びIgG DAPGクローン20G2で処置した。マウスは、以前に本明細書に記載されているように室内に保管された。150μgの抗体を3週間週1回尾静脈に静脈注射した。2回目の注射の1日後及び3回目の注射の1日後及び8日後に、マウスを頸部脱臼によって屠殺した。脾臓と肝臓を解剖し、10%(v/v)熱不活性化FBS及び1%(v/v)GlutaMAX-Iを添加したRPMI 1640中で氷上で保存した。脾細胞は、以前に記載されたように(8.2)単離された。肝臓からの白血球を以下のように単離した:各肝臓を、0.3mg/mLのDispase II(Roche Applied Science、カタログ番号04942078001)、1μg/mLのDnase I(Roche Applied Science、カタログ番号11284932001)及び2mg/mLのコラゲナーゼD(Roche Applied Science、カタログ番号11088882001)を供給した5mLのRPMI1640を含むCチューブ(Miltenyi Biotec、カタログ番号130-096-334)に移し、プログラム「m_liver_01」(Miltenyi Biotec、カタログ番号130-095-937)を用いてgentle MACS Octo Dissociatorを用いて組織を破壊し、肝臓を37℃で30分間インキュベートした。消化された肝臓は、プログラム「m_liver_02」を用いてMACS Octo Dissociatorを用いて2回目に破壊された。遠心分離(400×g、8分、RT)後、細胞ペレットを7mlのACK溶解緩衝液に再懸濁し、赤血球溶解を37℃で10分間行った。10%FBS及び1%(v/v)GlutaMAX-Iを供給したRPMI 1640培地を添加することにより、赤血球溶解を停止させた。肝臓からの106細胞/ウェルの脾細胞又は白血球を、丸底96ウェル懸濁細胞プレート(Greiner bio-one、cellstar、カタログ番号650185)に移し、DPBSで1回洗浄した。細胞を、1:5000希釈LIVE/DEADFixable Green Dead Cell Stain Kit(Live Technologies、カタログ番号L-23101)を含む100μL/ウェルに再懸濁し、4℃で30分間インキュベートした。その後、細胞を洗浄し、6μg/mLのPE結合抗マウスCD137シリアンハムスターIgG(クローン17B5、BioLegend、カタログ番号106106)又はシリアンハムスターアイソタイプコントロール(クローンSHG-1、BioLegend、カタログ番号402008)、2μg/mLのPerCP/Cy5.5結合抗マウスTCR-βアルメニアハムスターIgG(クローンH57-597、BioLegend、カタログ番号109228)、5μg/mLのPE/Cy7結合抗マウスCD25ラットIgG1(クローンPC61、BD Bioscience、カタログ番号552880)又はラットIgG1アイソタイプコントロール(クローンA110-1、BD Bioscience、カタログ番号552869)、2μg/mLのAlexa Fluor700標識抗マウスCD8aラットIgG2a(クローン53-6.7、BD Bioscience、カタログ番号557959)、0.25μg/mLのBV421結合抗マウスCD4ラットigG2b(クローンGK1.5、BioLegend、カタログ番号100438)、4μg/mLのBV605結合抗マウスCD11cアルメニアハムスターIgG(クローンN418、BioLegend、カタログ番号117333)又はアルメニアハムスターアイソタイプコントロール(クローンHTK888、BioLegend、カタログ番号400943)を含む50μL/ウェルのFACS緩衝液に再懸濁し、4℃で30分間インキュベートした。細胞を洗浄し、新たに調製した固定/透過化溶液(eBioscience、カタログ番号00-5523-00)100μL/ウェルに再懸濁した。4℃で30分間インキュベートした後、細胞を新たに調製した透過化緩衝液(eBioscience、カタログ番号00-5523-00)で洗浄し、0.2μg/mLのeF660結合抗マウスKi67ラットIgG2aκ(クローンSolA15、eBioscience、カタログ番号50-5698-82)を含む50μL/ウェルの透過性緩衝液に再懸濁した。細胞を4℃で30分間インキュベートし、透過性緩衝液で2回洗浄し、1%ホルムアルデヒドを含む50μL/ウェルのDPBSで固定した。翌日、5レーザーFortessa(BD Bioscience、DIVAソフトウェア)を用いて細胞を取得した。FlowJo(FlowJo、LLC)を用いてデータを分析し、ゲートをCD8+又はCD4+ T細胞にセットし、CD137+、CD25+、CD11c+及びKi67+ T細胞の頻度を決定した。Graph Pad Prism(Graph Pad Software Inc.)を使用してデータをブロットした。
4-1BB及び腫瘍関連抗原(TAA)を標的とする二重特異性二価抗体の調製、精製及び特徴づけ
9.1 4-1BB及び線維芽細胞活性化タンパク質(FAP)を標的とする二重特異性二価抗体の生成(2+2フォーマット)
4-1BB及びFAPに対する二価結合を有する二重特異性アゴニスト4-1BB抗体を調製した。クロスマブ技術は、国際特許出願番号WO200/145792A1に記載されているように、誤って対になった軽鎖の形成を減少させるために適用された。
9.2.1 表面プラズモン共鳴(同時結合)
ヒト4-1BB Fc(kih)及びヒトFAPを同時に結合させる能力を、表面プラズモン共鳴(SPR)によって評価した。全てのSPR実験をBiacore T200において、ランニングバッファーとしてHBS-EP(0.01MのHEPES pH7.4、0.15MのNaCl、3mMのEDTA、0.005%の界面活性剤P20、Biacore、Freiburg/Germany)を用いて25℃で行った。
9.2.2.1 ヒト4-1BB発現細胞への結合:休止及び活性化ヒト末梢単核血液白血球(PBMC)
ヒトPBMCを単離し、活性化して4-1BBを誘導し、実施例7.1.2で既に記載したように、ヒト4-1BBに対する抗体の結合特性を試験するために使用した。
細胞表面発現線維芽細胞活性化タンパク質(FAP)に対する結合アッセイのために、NIH/3T3-huFAPクローン19細胞株又はヒトメラノーマ細胞株WM-266-4(ATCC CRL-1676)を使用した。NIH/3T3-huFAPクローン19は、マウス胚線維芽細胞NIH/3T3細胞(ATCC CRL-1658)を、CMVプロモーター下でヒトFAPをコードする発現pETR4921プラスミドでトランスフェクションすることによって生成した。1.5μg/mLピューロマイシン(InvivoGen、カタログ番号:ant-pr-5)の存在下で細胞を維持した。丸底懸濁細胞96ウェルプレート(Greiner bio-one、cellstar、カタログ番号650185)の各ウェルに2×105個のFAP発現腫瘍細胞を添加した。細胞を200μLのDPBSで1回洗浄し、1:5000希釈のFixable Viability Dye eFluor 450(eBioscience、カタログ番号65 0863 18)又はFixable Viability Dye eFluor 660(eBioscience、カタログ番号65-0864-18)を含む100μL/ウェルの4℃の冷DPBS緩衝液に再懸濁し、4℃で30分間インキュベートした。細胞を200μLの4℃の冷DPBS緩衝液で1回洗浄し、4-1BB特異的FAP標的化抗体及び非標的化抗体の異なる滴定濃度を含む50μL/ウェルの4℃の冷FACS緩衝液に再懸濁し、続いて4℃で1時間インキュベートした。200μL/ウェルで4回洗浄した後、細胞を、2.5μg/mLのPE結合AffiniPure抗ヒトIgG Fcγ断片特異的ヤギF(ab’)2断片(Jackson ImmunoResearch、カタログ番号109-116-098)又は30μg/mLのFITC結合AffiniPure抗ヒトIgG Fcγ断片特異的ヤギF(ab’)2断片(Jackson ImmunoResearch、カタログ番号109 096 098)を含む50μL/ウェルの4℃冷FACS緩衝液で4℃で30分間染色した。細胞を200μLの4℃のFACS緩衝液で2回洗浄し、細胞を固定のために1%ホルムアルデヒドを含む50μL/ウェルのDPBSに再懸濁した。同日又は翌日、細胞を100μLのFACS緩衝液に再懸濁し、5レーザーLSR-Fortessa(BD Bioscience、DIVAソフトウェアを備える)又はMACSQuant Analyzer 10(Miltenyi Biotec)を用いて取得した。
9.2.3.1 ヒト4-1BB及びNF-κB-ルシフェラーゼを発現するHeLa細胞の生成
子宮頸部癌細胞株HeLa(ATCC CCL-2)に、CMV-プロモーター及びピューロマイシン耐性遺伝子の制御下にあるヒト4-1BB(Uniprotアクセッション番号Q07011)の配列を含む発現ベクターpETR10829に基づくプラスミドを形質導入した。細胞を、10%(v/v)FBS、1%(v/v)GlutaMAX-1及び3μg/mLのピューロマイシンを補充したDMEM培地中で培養した。
HeLa-hu4-1BB-NF-κB-lucクローン26細胞を収集し、10%(v/v)FBS及び1%(v/v)GlutaMAX-Iを供給したDMEM培地に0.2×106細胞/mlの濃度に再懸濁した。この細胞懸濁液100μL(2×104細胞)を蓋付きの滅菌白色96ウェル平底組織培養プレート(greiner bio one、カタログ番号655083)の各ウェルに移し、プレートを37℃及び5%CO2で一晩インキュベートした。翌日、滴定したFAP標的化抗ヒト4-1BB構築物又はそれらの親huIgG1 P329G LALA抗体を含む培地50μLを添加した。FAPを発現するNIH/3T3-huFAPクローン19又はWM-266-4を、10%(v/v)FBS及び1%(v/v)GlutaMAX-Iを供給したDMEM培地に2×106細胞/mlの濃度に再懸濁した。
4-1BB及び腫瘍関連抗原(TAA)を標的とする二重特異性一価抗体の調製、精製及び特徴づけ
10.1 一価フォーマットの4-1BB及び線維芽細胞活性化タンパク質(FAP)を標的とする二重特異性抗体の生成(1+1フォーマット)
4-1BB及びFAPに対する一価結合を有する二重特異性アゴニスト4-1BB抗体を調製した。クロスマブ技術は、国際特許出願番号WO200/145792(A1)号に記載されているように、誤って対になった軽鎖の形成を減少させるために適用された。
FAPへの結合を試験するために、C末端Hisタグに融合したヒト、マウス又はカニクイザルFAPのエクトドメインをコードするDNA配列を、CMVプロモーターエンハンサー断片と組み合わせたMPSVコアプロモーターからなるキメラMPSVプロモーターを含む発現ベクターにクローニングした。発現ベクターはまた、宿主細胞を含有するEBNA(エプスタイン・バーウイルス・核抗原)におけるエピソーム複製のためのoriP領域を含む。Hisタグ付きヒトFAP ECDのアミノ酸配列及びヌクレオチド配列をそれぞれ配列番号85及び86に示す。配列番号88及び89は、それぞれHisタグ付きマウスFAP ECDのアミノ酸配列及びヌクレオチド配列を示す。配列番号90及び91は、それぞれHisタグ付きカニクイザルFAP ECDのアミノ酸配列及びヌクレオチド配列を示す。
10.3.1 表面プラズモン共鳴(同時結合)
ヒト4-1BB Fc(kih)及びヒトFAPを同時に結合させる能力を、表面プラズモン共鳴(SPR)によって評価した。全てのSPR実験をBiacore T200において、ランニングバッファーとしてHBS-EP(0.01MのHEPES pH7.4、0.15MのNaCl、3mMのEDTA、0.005%の界面活性剤P20、Biacore、Freiburg/Germany)を用いて25℃で行った。
10.3.2.1 ヒト4-1BB発現細胞への結合:休止及び活性化ヒト末梢単核血液白血球(PBMC)
ヒトPBMCを単離し、新たに使用し(例えば休止T細胞)、又は活性化して4-1BBを誘導し、実施例7.1.2で既に記載したように、ヒト4-1BBに対する抗体の結合特性を試験するために使用した。
FAP発現腫瘍細胞への結合は、既に9.2.2.2に記載されている。
図41に示すように、クローン25G7及び12B3のDP47標的化1+1抗体又は親huIgG1 P293G LALA抗体ではなく、FAP標的化1+1分子は、ヒトFAP発現細胞に効率的に結合する(図41B/D 41E/F)。従って、1+1構築物もFAP発現細胞に特異的に結合することができるが、一価FAP標的化に起因して、FAP標的化2+2フォーマットよりもわずかに高いEC50を有する(表68及び図41B/D及び41E/F)。しかしながら、これは、結合曲線のAUCにごく僅かな影響しか与えない(図42)。
ヒト4-1BB発現レポーター細胞株HeLa-hu4-1BB-NFκB-lucを用いた機能的能力を分析するためのプロトコルは、実施例9.2.3.2に既に記載されている。
4-1BBへの二価結合及び腫瘍関連抗原(TAA)への一価結合を有する二重特異性抗体の調製、精製及び特徴づけ
11.1.4-1BBへの二価結合及び腫瘍関連抗原(TAA)への一価結合を有する二重特異性抗体の生成(2+1フォーマット)
4-1BBに対する二価結合及びFAPに対する一価結合(2+1とも呼ばれる)を有する二重特異性アゴニスト4-1BB抗体は、図36に示すように調製されている。
11.2.1.表面プラズモン共鳴(同時結合)
ヒト4-1BB Fc(kih)及びヒトFAPへ同時に結合する能力を、表面プラズモン共鳴(SPR)によって評価した。全てのSPR実験をBiacore T200において、ランニングバッファーとしてHBS-EP(0.01MのHEPES pH7.4、0.15MのNaCl、3mMのEDTA、0.005%の界面活性剤P20、Biacore、Freiburg/Germany)を用いて25℃で行った。
NFκB-レポーター細胞株HeLa-huCD137-NFκB-lucクローン26の生成並びに活性化アッセイの設定は、9.2.3に記載されている。
Claims (29)
- (a)OX40に特異的に結合することができる少なくとも1つの部分、
(b)線維芽細胞活性化タンパク質(FAP)に特異的に結合することができる少なくとも1つの部分、及び
(c)安定な会合が可能な第1及び第2のサブユニットからなるFcドメイン
を含む、二重特異性抗原結合分子であって、
OX40に特異的に結合することができる少なくとも1つの部分が、
(i)配列番号2のアミノ酸配列からなるCDR-H1、配列番号4のアミノ酸配列からなるCDR-H2、及び配列番号6のアミノ酸配列からなるCDR-H3を含むVHドメイン、並びに配列番号13のアミノ酸配列からなるCDR-L1、配列番号16のアミノ酸配列からなるCDR-L2、及び配列番号19のアミノ酸配列からなるCDR-L3を含むVLドメイン;
(ii)配列番号2のアミノ酸配列からなるCDR-H1、配列番号4のアミノ酸配列からなるCDR-H2、及び配列番号7のアミノ酸配列からなるCDR-H3を含むVHドメイン、並びに配列番号13のアミノ酸配列からなるCDR-L1、配列番号16のアミノ酸配列からなるCDR-L2、及び配列番号20のアミノ酸配列からなるCDR-L3を含むVLドメイン;
(iii)配列番号2のアミノ酸配列からなるCDR-H1、配列番号4のアミノ酸配列からなるCDR-H2、及び配列番号8のアミノ酸配列からなるCDR-H3を含むVHドメイン、並びに配列番号13のアミノ酸配列からなるCDR-L1、配列番号16のアミノ酸配列からなるCDR-L2、及び配列番号21のアミノ酸配列からなるCDR-L3を含むVLドメイン;
(iv)配列番号2のアミノ酸配列からなるCDR-H1、配列番号4のアミノ酸配列からなるCDR-H2、及び配列番号9のアミノ酸配列からなるCDR-H3を含むVHドメイン、並びに配列番号13のアミノ酸配列からなるCDR-L1、配列番号16のアミノ酸配列からなるCDR-L2、及び配列番号22のアミノ酸配列からなるCDR-L3を含むVLドメイン;
(v)配列番号3のアミノ酸配列からなるCDR-H1、配列番号5のアミノ酸配列からなるCDR-H2、及び配列番号10のアミノ酸配列からなるCDR-H3を含むVHドメイン、並びに配列番号14のアミノ酸配列からなるCDR-L1、配列番号17のアミノ酸配列からなるCDR-L2、及び配列番号23のアミノ酸配列からなるCDR-L3を含むVLドメイン;
(vi)配列番号3のアミノ酸配列からなるCDR-H1、配列番号5のアミノ酸配列からなるCDR-H2、及び配列番号11のアミノ酸配列からなるCDR-H3を含むVHドメイン、並びに配列番号14のアミノ酸配列からなるCDR-L1、配列番号17のアミノ酸配列からなるCDR-L2、及び配列番号23のアミノ酸配列からなるCDR-L3を含むVLドメイン;又は
(vii)配列番号3のアミノ酸配列からなるCDR-H1、配列番号5のアミノ酸配列からなるCDR-H2、及び配列番号12のアミノ酸配列からなるCDR-H3を含むVHドメイン、並びに配列番号15のアミノ酸配列からなるCDR-L1、配列番号18のアミノ酸配列からなるCDR-L2、及び配列番号24のアミノ酸配列からなるCDR-L3を含むVLドメイン
を含む、二重特異性抗原結合分子。 - OX40に特異的に結合することができる部分が、配列番号25、配列番号27、配列番号29、配列番号31、配列番号33、配列番号35、及び配列番号37からなる群から選択されるアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含む重鎖可変領域VHと、配列番号26、配列番号28、配列番号30、配列番号32、配列番号34、配列番号36、及び配列番号38のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域VLとを含む、請求項1に記載の二重特異性抗原結合分子。
- OX40に特異的に結合することができる部分が、
(i)配列番号25のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域VH及び配列番号26のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域VL、
(ii)配列番号27のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域VH及び配列番号28のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域VL、
(iii)配列番号29のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域VH及び配列番号30のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域VL、
(iv)配列番号31のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域VH及び配列番号32のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域VL、
(v)配列番号33のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域VH及び配列番号34のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域VL、
(vi)配列番号35のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域VH及び配列番号36のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域VL、又は
(vii)配列番号37のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域VH及び配列番号38のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域VL
を含む、請求項1又は2に記載の二重特異性抗原結合分子。 - OX40に特異的に結合することができる部分がFab断片である、請求項1から3の何れか一項に記載の二重特異性抗原結合分子。
- FAPに特異的に結合することができる部分が、
(i)配列番号68のアミノ酸配列からなるCDR-H1、配列番号70のアミノ酸配列からなるCDR-H2、及び配列番号72のアミノ酸配列からなるCDR-H3を含むVHドメイン、並びに配列番号74のアミノ酸配列からなるCDR-L1、配列番号76のアミノ酸配列からなるCDR-L2、及び配列番号78のアミノ酸配列からなるCDR-L3を含むVLドメイン;又は
(ii)配列番号69のアミノ酸配列からなるCDR-H1、配列番号71のアミノ酸配列からなるCDR-H2、及び配列番号73のアミノ酸配列からなるCDR-H3を含むVHドメイン、並びに配列番号75のアミノ酸配列からなるCDR-L1、配列番号77のアミノ酸配列からなるCDR-L2、及び配列番号79のアミノ酸配列からなるCDR-L3を含むVLドメイン
を含む、請求項1から4の何れか一項に記載の二重特異性抗原結合分子。 - (i)OX40に特異的に結合することができる部分が、配列番号25、配列番号27、配列番号29、配列番号31、配列番号33、配列番号35又は配列番号37のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含む重鎖可変領域VHと、配列番号26、配列番号28、配列番号30、配列番号32、配列番号34、配列番号36又は配列番号38のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域VLとを含み、かつ、
(ii)FAPに特異的に結合することができる部分が、配列番号80又は配列番号82のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含む重鎖可変領域VHと、配列番号81又は配列番号83のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域VLとを含む、請求項1から5の何れか一項に記載の二重特異性抗原結合分子。 - (i)OX40に特異的に結合することができる部分が、配列番号27のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域VH及び配列番号28のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域を含み、かつ、
(ii)FAPに特異的に結合することができる部分が、配列番号82のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域VH及び配列番号83のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域を含む、請求項1から6の何れか一項に記載の二重特異性抗原結合分子。 - (a)OX40に特異的に結合することができる第1のFab断片、
(b)FAPに特異的に結合することができる第2のFab断片、及び
(c)安定な会合が可能な第1及び第2のサブユニットからなるFcドメイン
を含む、請求項1から7の何れか一項に記載の二重特異性抗原結合分子。 - FcドメインがIgG、特にIgG1 Fcドメイン又はIgG4 Fcドメインである、請求項1から8の何れか一項に記載の二重特異性抗原結合分子。
- Fcドメインが、Fc受容体への抗体の結合親和性及び/又はエフェクター機能を低減させる1つ以上のアミノ酸置換を含む、請求項1から9の何れか一項に記載の二重特異性抗原結合分子。
- Fcドメインが、アミノ酸変異L234A、L235A及びP329Gを有するヒトIgG1サブクラスである(Kabat EUインデックスによる番号付け)、請求項1から10の何れか一項に記載の二重特異性抗原結合分子。
- Fcドメインが、Fcドメインの第1及び第2のサブユニットの会合を促進する修飾を含む、請求項1から11の何れか一項に記載の二重特異性抗原結合分子。
- ノブ・イントゥー・ホール法に従って、Fcドメインの第1のサブユニットがノブを含み、かつ、Fcドメインの第2のサブユニットがホールを含む、請求項1から12の何れか一項に記載の二重特異性抗原結合分子。
- Fcドメインの第1のサブユニットが、アミノ酸置換S354C及びT366W(Kabat EUインデックスによる番号付け)を含み、かつ、Fcドメインの第2のサブユニットが、アミノ酸置換Y349C、T366S及びY407V(Kabat EUインデックスによる番号付け)を含む、請求項1から13の何れか一項に記載の二重特異性抗原結合分子。
- (a)OX40に特異的に結合することができる2つの部分、
(b)FAPに特異的に結合することができる2つの部分、及び
(c)安定な会合が可能な第1及び第2のサブユニットからなるFcドメイン
を含む、請求項1から14の何れか一項に記載の二重特異性抗原結合分子。 - 二重特異性抗原結合分子が、OX40及びFAPの両方に対して二価である、請求項15に記載の二重特異性抗原結合分子。
- (a)OX40に特異的に結合することができる2つのFab断片とFcドメインとを含む抗体の2つの軽鎖及び2つの重鎖、及び
(b)FAPに特異的に結合することができる2つの追加のFab断片であって、前記追加のFab断片がそれぞれペプチドリンカーを介して(a)の重鎖のC末端に連結されている2つの追加のFab断片
を含む、請求項1から14の何れか一項に記載の二重特異性抗原結合分子。 - FAPに特異的に結合することができる2つの追加のFab断片が、可変ドメインVL及びVHが互いに置換されたクロスオーバーFab断片であり、かつ、VL-CH鎖がそれぞれペプチドリンカーを介して(a)の重鎖のC末端に連結されている、請求項17に記載の二重特異性抗原結合分子。
- OX40に特異的に結合することができる2つのFab断片が、OX40に特異的に結合することができる2つのFab断片であり、かつ、FAPに特異的に結合することができる2つの追加のFab断片が、FAPに特異的に結合することができるクロスオーバーFab断片である、請求項17又は18に記載の二重特異性抗原結合分子。
- (a)OX40に特異的に結合することができる2つの部分、
(b)FAPに特異的に結合することができる1つの部分、及び
(c)安定な会合が可能な第1及び第2のサブユニットからなるFcドメイン
を含む、請求項1から14の何れか一項に記載の二重特異性抗原結合分子。 - 二重特異性抗原結合分子が、OX40に対して二価であり、かつ、FAPに対して一価である、請求項20に記載の二重特異性抗原結合分子。
- (a)OX40に特異的に結合することができる2つのFab断片とFcドメインとを含む抗体の2つの軽鎖及び2つの重鎖、及び
(b)FAPに特異的に結合することができるVH及びVLドメインであって、ここで、VHドメインがペプチドリンカーを介して重鎖の1つのC末端に連結され、かつ、VLドメインがペプチドリンカーを介して第2の重鎖のC末端に連結される、VH及びVLドメイン
を含む、請求項1から14、又は20又は21の何れか一項に記載の二重特異性抗原結合分子。 - 請求項1から22の何れか一項に記載の二重特異性抗原結合分子をコードするポリヌクレオチド。
- 請求項1から22の何れか一項に記載の二重特異性抗原結合分子と、少なくとも1つの薬学的に許容される賦形剤とを含む、薬学的組成物。
- 医薬としての使用のための、請求項1から22の何れか一項に記載の二重特異性抗原結合分子、又は請求項24に記載の薬学的組成物。
- (i)T細胞応答を刺激することにおける、
(ii)活性化T細胞の生存を支持することにおける、
(iii)感染症の治療における、
(iv)がんの治療における、
(v)がんの進行を遅延させることにおける、又は
(vi)がんに罹患している患者の生存を延長することにおける
使用のための医薬であって、請求項1から22の何れか一項に記載の二重特異性抗原結合分子、又は請求項24に記載の薬学的組成物を含む、医薬。 - がんの治療における使用のための医薬であって、請求項1から22の何れか一項に記載の二重特異性抗原結合分子、又は請求項24に記載の薬学的組成物を含む、医薬。
- 化学療法剤、放射線及び/又はがん免疫療法における使用のための他の薬剤と組み合わせて投与される、がんの治療における使用のための医薬であって、請求項1から22の何れか一項に記載の二重特異性抗原結合分子、又は請求項24に記載の薬学的組成物を含む、医薬。
- 個体における腫瘍細胞の増殖を阻害するための医薬であって、請求項1から22の何れか一項に記載の二重特異性抗原結合分子、又は請求項24に記載の薬学的組成物の有効量を含む、医薬。
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