JP6797017B2 - 膵臓がんの検出キット又はデバイス及び検出方法 - Google Patents
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Description
すなわち、本発明は、以下の特徴を有する。
(a)配列番号1〜104、464〜473、及び492〜494のいずれかで表される塩基配列もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列からなるポリヌクレオチド、その変異体、その誘導体、又は15以上の連続した塩基を含むその断片、
(b)配列番号1〜104、464〜473、及び492〜494のいずれかで表される塩基配列を含むポリヌクレオチド、
(c)配列番号1〜104、464〜473、及び492〜494のいずれかで表される塩基配列もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列に相補的な塩基配列からなるポリヌクレオチド、その変異体、その誘導体、又は15以上の連続した塩基を含むその断片、
(d)配列番号1〜104、464〜473、及び492〜494のいずれかで表される塩基配列もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列に相補的な塩基配列を含むポリヌクレオチド、及び
(e)前記(a)〜(d)のいずれかのポリヌクレオチドとストリンジェントな条件でハイブリダイズするポリヌクレオチド、
からなる群から選択されるポリヌクレオチドである、(1)又は(2)に記載のキット。
(f)配列番号105〜122のいずれかで表される塩基配列もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列からなるポリヌクレオチド、その変異体、その誘導体、又は15以上の連続した塩基を含むその断片、
(g)配列番号105〜122のいずれかで表される塩基配列を含むポリヌクレオチド、
(h)配列番号105〜122のいずれかで表される塩基配列もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列に相補的な塩基配列からなるポリヌクレオチド、その変異体、その誘導体、又は15以上の連続した塩基を含むその断片、
(i)配列番号105〜122のいずれかで表される塩基配列もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列に相補的な塩基配列を含むポリヌクレオチド、及び
(j)前記(f)〜(i)のいずれかのポリヌクレオチドとストリンジェントな条件でハイブリダイズするポリヌクレオチド、
からなる群から選択されるポリヌクレオチドをさらに含む、(4)又は(5)に記載のキット。
(k)配列番号349〜383のいずれかで表される塩基配列もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列からなるポリヌクレオチド、その変異体、その誘導体、又は15以上の連続した塩基を含むその断片、
(l)配列番号349〜383のいずれかで表される塩基配列を含むポリヌクレオチド、
(m)配列番号349〜383のいずれかで表される塩基配列もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列に相補的な塩基配列からなるポリヌクレオチド、その変異体、その誘導体、又は15以上の連続した塩基を含むその断片、
(n)配列番号349〜383のいずれかで表される塩基配列もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列に相補的な塩基配列を含むポリヌクレオチド、及び
(o)前記(k)〜(n)のいずれかのポリヌクレオチドとストリンジェントな条件でハイブリダイズするポリヌクレオチド、
からなる群から選択されるポリヌクレオチドをさらに含む、(7)又は(8)に記載のキット。
(a)配列番号1〜104、464〜473、及び492〜494のいずれかで表される塩基配列もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列からなるポリヌクレオチド、その変異体、その誘導体、又は15以上の連続した塩基を含むその断片、
(b)配列番号1〜104、464〜473、及び492〜494のいずれかで表される塩基配列を含むポリヌクレオチド、
(c)配列番号1〜104、464〜473、及び492〜494のいずれかで表される塩基配列もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列に相補的な塩基配列からなるポリヌクレオチド、その変異体、その誘導体、又は15以上の連続した塩基を含むその断片、
(d)配列番号1〜104、464〜473、及び492〜494のいずれかで表される塩基配列もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列に相補的な塩基配列を含むポリヌクレオチド、及び
(e)前記(a)〜(d)のいずれかのポリヌクレオチドとストリンジェントな条件でハイブリダイズするポリヌクレオチド、
からなる群から選択されるポリヌクレオチドである、(11)又は(12)に記載のデバイス。
(f)配列番号105〜122のいずれかで表される塩基配列もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列からなるポリヌクレオチド、その変異体、その誘導体、又は15以上の連続した塩基を含むその断片、
(g)配列番号105〜122のいずれかで表される塩基配列を含むポリヌクレオチド、
(h)配列番号105〜122のいずれかで表される塩基配列もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列に相補的な塩基配列からなるポリヌクレオチド、その変異体、その誘導体、又は15以上の連続した塩基を含むその断片、
(i)配列番号105〜122のいずれかで表される塩基配列もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列に相補的な塩基配列を含むポリヌクレオチド、及び
(j)前記(f)〜(i)のいずれかのポリヌクレオチドとストリンジェントな条件でハイブリダイズするポリヌクレオチド、
からなる群から選択されるポリヌクレオチドである、(14)又は(15)に記載のデバイス。
(k)配列番号349〜383のいずれかで表される塩基配列もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列からなるポリヌクレオチド、その変異体、その誘導体、又は15以上の連続した塩基を含むその断片、
(l)配列番号349〜383のいずれかで表される塩基配列を含むポリヌクレオチド、
(m)配列番号349〜383のいずれかで表される塩基配列もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列に相補的な塩基配列からなるポリヌクレオチド、その変異体、その誘導体、又は15以上の連続した塩基を含むその断片、
(n)配列番号349〜383のいずれかで表される塩基配列もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列に相補的な塩基配列を含むポリヌクレオチド、及び
(o)前記(k)〜(n)のいずれかのポリヌクレオチドとストリンジェントな条件でハイブリダイズするポリヌクレオチド、
からなる群から選択されるポリヌクレオチドである、(17)又は(18)に記載のデバイス。
本明細書中で使用する用語は、以下の定義を有する。
−miR−6880−5p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa−mir−6880」(miRBase Accession No.MI0022727、配列番号148)が知られている。
る方法によって得ることができる。また、「hsa−miR−1202」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa−mir−1202」(miRBase Accession No.MI0006334、配列番号205)が知られている。
巻、p1634−1645に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa−miR−6777−5p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa−mir−6777」(miRBase Accession No.MI0022622、配列番号390)が知られている。
1.膵臓がんの標的核酸
本発明の上記定義の膵臓がん検出用の核酸プローブ又はプライマーを使用して、膵臓がん又は膵臓がん細胞の存在及び/又は不存在を検出するための、膵臓がんマーカーとしての主要な標的核酸には、hsa−miR−6893−5p、hsa−miR−6075、hsa−miR−6820−5p、hsa−miR−4294、hsa−miR−6729−5p、hsa−miR−4476、hsa−miR−6836−3p、hsa−miR−6765−3p、hsa−miR−6799−5p、hsa−miR−4530、hsa−miR−7641、hsa−miR−4454、hsa−miR−615−5p、hsa−miR−8073、hsa−miR−663a、hsa−miR−4634、hsa−miR−4450、hsa−miR−4792、hsa−miR−665、hsa−miR−7975、hsa−miR−7109−5p、hsa−miR−6789−5p、hsa−miR−4497、hsa−miR−6877−5p、hsa−miR−6880−5p、hsa−miR−7977、hsa−miR−4734、hsa−miR−6821−5p、hsa−miR−8089、hsa−miR−5585−3p、hsa−miR−6085、hsa−miR−6845−5p、hsa−miR−4651、hsa−miR−4433−3p、hsa−miR−1231、hsa−miR−4665−5p、hsa−miR−7114−5p、hsa−miR−1238−5p、hsa−miR−8069、hsa−miR−4732−5p、hsa−miR−619−5p、hsa−miR−3622a−5p、hsa−miR−1260a、hsa−miR−6741−5p、hsa−miR−6781−5p、hsa−miR−6125、hsa−miR−6805−5p、hsa−miR−6132、hsa−miR−6872−3p、hsa−miR−6875−5p、hsa−miR−1908−3p、hsa−miR−4433b−3p、hsa−miR−4736、hsa−miR−5100、hsa−miR−6724−5p、hsa−miR−7107−5p、hsa−miR−6726−5p、hsa−miR−3185、hsa−miR−4638−5p、hsa−miR−1273g−3p、hsa−miR−6778−5p、hsa−miR−328−5p、hsa−miR−3679−3p、hsa−miR−1228−3p、hsa−miR−6779−5p、hsa−miR−4723−5p、hsa−miR−6850−5p、hsa−miR−760、hsa−miR−7704、hsa−miR−8072、hsa−miR−4486、hsa−miR−1913、hsa−miR−4656、hsa−miR−1260b、hsa−miR−7106−5p、hsa−miR−6889−5p、hsa−miR−6780b−5p、hsa−miR−6090、hsa−miR−4534、hsa−miR−4449、hsa−miR−5195−3p、hsa−miR−1202、hsa−miR−4467、hsa−miR−6515−3p、hsa−miR−4281、hsa−miR−4505、hsa−miR−4484、hsa−miR−6805−3p、hsa−miR−3135b、hsa−miR−3162−5p、hsa−miR−6768−5p、hsa−miR−6721−5p、hsa−miR−1227−5p、hsa−miR−6722−3p、hsa−miR−4286、hsa−miR−4746−3p、hsa−miR−6727−5p、hsa−miR−6816−5p、hsa−miR−4741、hsa−miR−4508、hsa−miR−940、hsa−miR−4327、hsa−miR−4665−3p、hsa−miR−718、hsa−miR−1203、hsa−miR−663b、hsa−miR−4258、hsa−miR−4649−5p、hsa−miR−4516、hsa−miR−3619−3p、hsa−miR−6826−5p、hsa−miR−6757−5p、hsa−miR−3131、hsa−miR−1343−3p、hsa−miR−6775−5p、hsa−miR−6813−5p及びhsa−miR−3940−5pからなる群から選択される少なくとも1つ以上のmiRNAが含まれる。さらにこれらのmiRNAと組み合わせることができる他の膵臓がんマーカー、すなわち、hsa−miR−125a−3p、hsa−miR−204−3p、hsa−miR−1469、hsa−miR−575、hsa−miR−150−3p、hsa−miR−423−5p、hsa−miR−564、hsa−miR−3188、hsa−miR−1246、hsa−miR−602、hsa−miR−1290、hsa−miR−16−5p、hsa−miR−451a、hsa−miR−24−3p、hsa−miR−187−5p、hsa−miR−1908−5p、hsa−miR−371a−5p及びhsa−miR−550a−5pからなる群から選択される少なくとも1つ以上のmiRNAも標的核酸として好ましく用いることができる。さらにこれらのmiRNAと組み合わせることができる他の膵臓がんマーカー、すなわち、hsa−miR−4417、hsa−miR−4707−5p、hsa−miR−7847−3p、hsa−miR−2861、hsa−miR−4513、hsa−miR−7111−5p、hsa−miR−6777−5p、hsa−miR−7113−3p、hsa−miR−4648、hsa−miR−3184−5p、hsa−miR−4271、hsa−miR−6791−5p、hsa−miR−642a−3p、hsa−miR−7108−5p、hsa−miR−128−1−5p、hsa−miR−5196−5p、hsa−miR−3178、hsa−miR−3656、hsa−miR−92a−2−5p、hsa−miR−6769b−5p、hsa−miR−4689、hsa−miR−6076、hsa−miR−92b−5p、hsa−miR−6774−5p、hsa−miR−486−3p、hsa−miR−6806−5p、hsa−miR−6842−5p、hsa−miR−6716−5p、hsa−miR−557、hsa−miR−4673、hsa−miR−4674、hsa−miR−4442、hsa−miR−1915−3p、hsa−miR−4687−3p及びhsa−miR−92b−3pからなる群から選択される少なくとも1つ以上のmiRNAも標的核酸として好ましく用いることができる。
本発明においては、上記の膵臓がんマーカーとしての標的核酸に特異的に結合可能な核酸を、膵臓がんを検出又は診断するための核酸、例えば核酸プローブ又はプライマーとして用いることができる。
(a)配列番号1〜104、464〜473、及び492〜494のいずれかで表される塩基配列、もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列、からなるポリヌクレオチド、その変異体、その誘導体、又は15以上の連続した塩基を含むその断片、
(b)配列番号1〜104、464〜473、及び492〜494のいずれかで表される塩基配列を含むポリヌクレオチド、
(c)配列番号1〜104、464〜473、及び492〜494のいずれかで表される塩基配列、もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列、に相補的な塩基配列からなるポリヌクレオチド、その変異体、その誘導体、又は15以上の連続した塩基を含むその断片、
(d)配列番号1〜104、464〜473、及び492〜494のいずれかで表される塩基配列、もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列、に相補的な塩基配列を含むポリヌクレオチド、並びに、
(e)前記(a)〜(d)のいずれかのポリヌクレオチドとストリンジェントな条件でハイブリダイズするポリヌクレオチド。
(f)配列番号105〜122のいずれかで表される塩基配列もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列からなるポリヌクレオチド、その変異体、その誘導体、又は15以上の連続した塩基を含むその断片、
(g)配列番号105〜122のいずれかで表される塩基配列を含むポリヌクレオチド、
(h)配列番号105〜122のいずれかで表される塩基配列、もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列、に相補的な塩基配列からなるポリヌクレオチド、その変異体、その誘導体、又は15以上の連続した塩基を含むその断片、
(i)配列番号105〜122のいずれかで表される塩基配列、もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列、に相補的な塩基配列を含むポリヌクレオチド、並びに、
(j)前記(f)〜(i)のいずれかのポリヌクレオチドとストリンジェントな条件でハイブリダイズするポリヌクレオチド。
(k)配列番号349〜383のいずれかで表される塩基配列もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列からなるポリヌクレオチド、その変異体、その誘導体、又は15以上の連続した塩基を含むその断片、
(l)配列番号349〜383のいずれかで表される塩基配列を含むポリヌクレオチド、
(m)配列番号349〜383のいずれかで表される塩基配列、もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列、に相補的な塩基配列からなるポリヌクレオチド、その変異体、その誘導体、又は15以上の連続した塩基を含むその断片、
(n)配列番号349〜383のいずれかで表される塩基配列、もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列、に相補的な塩基配列を含むポリヌクレオチド、並びに、
(o)前記(k)〜(n)のいずれかのポリヌクレオチドとストリンジェントな条件でハイブリダイズするポリヌクレオチド。
本発明はまた、膵臓がんマーカーである標的核酸を測定するための、本発明において核酸プローブ又はプライマーとして使用可能なポリヌクレオチド(これには、変異体、断片、又は誘導体を含みうる。)の1つ又は複数を含む膵臓がん検出用のキット又はデバイスを提供する。
miR−6893−5p、miR−6075、miR−6820−5p、miR−4294、miR−6729−5p、miR−4476、miR−6836−3p、miR−6765−3p、miR−6799−5p、miR−4530、miR−7641、miR−4454、miR−615−5p、miR−8073、miR−663a、miR−4634、miR−4450、miR−4792、miR−665、miR−7975、miR−7109−5p、miR−6789−5p、miR−4497、miR−6877−5p、miR−6880−5p、miR−7977、miR−4734、miR−6821−5p、miR−8089、miR−5585−3p、miR−6085、miR−6845−5p、miR−4651、miR−4433−3p、miR−1231、miR−4665−5p、miR−7114−5p、miR−1238−5p、miR−8069、miR−4732−5p、miR−619−5p、miR−3622a−5p、miR−1260a、miR−6741−5p、miR−6781−5p、miR−6125、miR−6805−5p、miR−6132、miR−6872−3p、miR−6875−5p、miR−1908−3p、miR−4433b−3p、miR−4736、miR−5100、miR−6724−5p、miR−7107−5p、miR−6726−5p、miR−3185、miR−4638−5p、miR−1273g−3p、miR−6778−5p、miR−328−5p、miR−3679−3p、miR−1228−3p、miR−6779−5p、miR−4723−5p、miR−6850−5p、miR−760、miR−7704、miR−8072、miR−4486、miR−1913、miR−4656、miR−1260b、miR−7106−5p、miR−6889−5p、miR−6780b−5p、miR−6090、miR−4534、miR−4449、miR−5195−3p、miR−1202、miR−4467、miR−6515−3p、miR−4281、miR−4505、miR−4484、miR−6805−3p、miR−3135b、miR−3162−5p、miR−6768−5p、miR−6721−5p、miR−1227−5p、miR−6722−3p、miR−4286、miR−4746−3p、miR−6727−5p、miR−6816−5p、miR−4741、miR−4508、miR−940、miR−4327、miR−4665−3p、miR−718、miR−1203、miR−663b、miR−4258、miR−4649−5p、miR−4516、miR−3619−3p、miR−6826−5p、miR−6757−5p、miR−3131、miR−1343−3p、miR−6775−5p、miR−6813−5p及びmiR−3940−5p。
miR−125a−3p、miR−204−3p、miR−1469、miR−575、miR−150−3p、miR−423−5p、miR−564、miR−3188、miR−1246、miR−602、miR−1290、miR−16−5p、miR−451a、miR−24−3p、miR−187−5p、miR−1908−5p、miR−371a−5p及びmiR−550a−5p。
miR−4417、miR−4707−5p、miR−7847−3p、miR−2861、miR−4513、miR−7111−5p、miR−6777−5p、miR−7113−3p、miR−4648、miR−3184−5p、miR−4271、miR−6791−5p、miR−642a−3p、miR−7108−5p、miR−128−1−5p、miR−5196−5p、miR−3178、miR−3656、miR−92a−2−5p、miR−6769b−5p、miR−4689、miR−6076、miR−92b−5p、miR−6774−5p、miR−486−3p、miR−6806−5p、miR−6842−5p、miR−6716−5p、miR−557、miR−4673、miR−4674、miR−4442、miR−1915−3p、miR−4687−3p及びmiR−92b−3p。
(1)配列番号1〜104、464〜473、及び492〜494のいずれかで表される塩基配列においてuがtである塩基配列又はその相補的配列において、15以上の連続した塩基を含むポリヌクレオチド。
(2)配列番号105〜122のいずれかで表される塩基配列においてuがtである塩基配列又はその相補的配列において、15以上の連続した塩基を含むポリヌクレオチド。
(3)配列番号349〜383のいずれかで表される塩基配列においてuがtである塩基配列又はその相補的配列において、15以上の連続した塩基を含むポリヌクレオチド。
(2)配列番号1と119(マーカー:hsa−miR−6893−5pとhsa−miR−187−5p)の組み合わせ
(3)配列番号1と20(マーカー:hsa−miR−6893−5pとhsa−miR−7975)の組み合わせ
更に、非限定的に、膵臓がんと健常体を判別するための、配列番号1〜122、349〜383、464〜473、及び492〜494によって表される塩基配列からなる上記のポリヌクレオチドで構成される2個の組み合わせのうち、配列番号2で表される塩基配列もしくはその相補的配列からなるポリヌクレオチドを含む組み合わせを以下に例示する。
(2)配列番号2と16(マーカー:hsa−miR−6075とhsa−miR−4634)の組み合わせ
(3)配列番号2と10(マーカー:hsa−miR−6075とhsa−miR−4530)の組み合わせ
更に、非限定的に、膵臓がんと健常体を判別するための、配列番号1〜122、349〜383、464〜473、及び492〜494によって表される塩基配列からなる上記のポリヌクレオチドで構成される2個の組み合わせのうち、配列番号4で表される塩基配列もしくはその相補的配列からなるポリヌクレオチドを含む組み合わせを以下に例示する。
(2)配列番号4と119(マーカー:hsa−miR−4294とhsa−miR−187−5p)の組み合わせ
(3)配列番号4と45(マーカー:hsa−miR−4294とhsa−miR−6781−5p)の組み合わせ
更に、非限定的に、膵臓がんと健常体を判別するための、配列番号1〜122、349〜383、464〜473、及び492〜494によって表される塩基配列からなる上記のポリヌクレオチドで構成される2個の組み合わせのうち、配列番号7で表される塩基配列もしくはその相補的配列からなるポリヌクレオチドを含む組み合わせを以下に例示する。
(2)配列番号7と34(マーカー:hsa−miR−6836−3pとhsa−miR−4433−3p)の組み合わせ
(3)配列番号7と12(マーカー:hsa−miR−6836−3pとhsa−miR−4454)の組み合わせ
更に、非限定的に、膵臓がんと健常体を判別するための、配列番号1〜122、349〜383、464〜473、及び492〜494によって表される塩基配列からなる上記のポリヌクレオチドで構成される2個の組み合わせのうち、配列番号105で表される塩基配列もしくはその相補的配列からなるポリヌクレオチドを含む組み合わせを以下に例示する。
(2)配列番号46と105(マーカー:hsa−miR−6125とhsa−miR−125a−3p)の組み合わせ
(3)配列番号105と494(マーカー:hsa−miR−125a−3pとhsa−miR−3940−5p)の組み合わせ
また、膵臓がんを健常体だけではなく他のがんとも判別できるがん種特異性のあるポリヌクレオチドの組み合わせとして、例えば配列番号2、4、6、7、9、10、25、28、30、31、38、48、82、103、105、108及び464によって表される塩基配列またはその相補的配列からなるポリヌクレオチドからなる群(以降、本群を「がん種特異性ポリヌクレオチド群1」とする)から選択される少なくとも1つのポリヌクレオチドと、その他の配列番号のポリヌクレオチドとの複数個の組み合わせが好ましい。
(2)配列番号2、7、108、464(マーカー:hsa−miR−6075, hsa−miR−6836−3p, hsa−miR−575, hsa−miR−1203)の組み合わせ
(3)配列番号2、31、48、38(マーカー:hsa−miR−6075, hsa−miR−6085, hsa−miR−6132, hsa−miR−1238−5p)の組み合わせ
(4)配列番号2、31、28、48(マーカー:hsa−miR−6075, hsa−miR−6085, hsa−miR−6821−5p, hsa−miR−6132)の組み合わせ
(5)配列番号2、25、105、10(マーカー:hsa−miR−6075, hsa−miR−6880−5p, hsa−miR−125a−3p, hsa−miR−4530)の組み合わせ
更に、非限定的に、配列番号4で表される塩基配列もしくはその相補的配列からなるポリヌクレオチドとがん種特異性ポリヌクレオチド群1から選択される3つのポリヌクレオチドの配列番号で表される塩基配列もしくはその相補的配列からなるポリヌクレオチドとの組み合わせを以下に例示する。
(2)配列番号4、31、28、82(マーカー:hsa−miR−4294, hsa−miR−6085, hsa−miR−6821−5p, hsa−miR−1202)の組み合わせ
(3)配列番号4、10、7、82(マーカー:hsa−miR−4294, hsa−miR−4530, hsa−miR−6836−3p, hsa−miR−1202)の組み合わせ
(4)配列番号4、7、82、103(マーカー:hsa−miR−4294, hsa−miR−6836−3p, hsa−miR−1202, hsa−miR−4665−3p)の組み合わせ
(5)配列番号4、105、10、6(マーカー:hsa−miR−4294, hsa−miR−125a−3p, hsa−miR−4530, hsa−miR−4476)の組み合わせ
更に、非限定的に、配列番号7で表される塩基配列もしくはその相補的配列からなるポリヌクレオチドとがん種特異性ポリヌクレオチド群1から選択される3つのポリヌクレオチドの配列番号で表される塩基配列もしくはその相補的配列からなるポリヌクレオチドとの組み合わせを以下に例示する。
(2)配列番号4、7、38、82(マーカー:hsa−miR−4294、hsa−miR−6836−3p、hsa−miR−1238−5p、hsa−miR−1202)の組み合わせ
(3)配列番号6、7、61、68(マーカー:hsa−miR−4476、hsa−miR−6836−3p、hsa−miR−6778−5p、hsa−miR−760)の組み合わせ
(4)配列番号4、7、47、82(マーカー:hsa−miR−4294、hsa−miR−6836−3p、hsa−miR−6805−5p、hsa−miR−1202)の組み合わせ
(5)配列番号4、7、82、103(マーカー:hsa−miR−4294、hsa−miR−6836−3p、hsa−miR−1202、hsa−miR−4665−3p)の組み合わせ
更に、非限定的に、配列番号10で表される塩基配列もしくはその相補的配列からなるポリヌクレオチドとがん種特異性ポリヌクレオチド群1から選択される3つのポリヌクレオチドの配列番号で表される塩基配列もしくはその相補的配列からなるポリヌクレオチドとの組み合わせを以下に例示する。
(2)配列番号10、30、103、365(マーカー:hsa−miR−4530、hsa−miR−5585−3p、hsa−miR−4665−3p、phsa−miR−3178)の組み合わせ
(3)配列番号9、10、61、68(マーカー:hsa−miR−6799−5p、hsa−miR−4530、hsa−miR−6778−5p、hsa−miR−760)の組み合わせ
(4)配列番号10、48、68、90(マーカー:hsa−miR−4530、hsa−miR−6132、hsa−miR−760、hsa−miR−3162−5p)の組み合わせ
(5)配列番号10、30、68、365(マーカー:hsa−miR−4530、hsa−miR−5585−3p、hsa−miR−760、hsa−miR−3178)の組み合わせ
更に、非限定的に、配列番号25で表される塩基配列もしくはその相補的配列からなるポリヌクレオチドとがん種特異性ポリヌクレオチド群1から選択される3つのポリヌクレオチドの配列番号で表される塩基配列もしくはその相補的配列からなるポリヌクレオチドとの組み合わせを以下に例示する。
(2)配列番号7、25、48、466(マーカー:hsa−miR−6836−3p、hsa−miR−6880−5p、hsa−miR−6132、hsa−miR−4258)の組み合わせ
(3)配列番号7、25、28、466(マーカー:hsa−miR−6836−3p、hsa−miR−6880−5p、hsa−miR−6821−5p、hsa−miR−4258)の組み合わせ
(4)配列番号7、25、30、466(マーカー:hsa−miR−6836−3p、hsa−miR−6880−5p、hsa−miR−5585−3p、hsa−miR−4258)の組み合わせ
(5)配列番号7、25、31、47(マーカー:hsa−miR−6836−3p、hsa−miR−6880−5p、hsa−miR−6085、hsa−miR−6805−5p)の組み合わせ
本発明のキット又はデバイスには、上で説明した本発明におけるポリヌクレオチド(これには、変異体、断片又は誘導体を包含しうる。)に加えて、膵臓がん検出を可能とする既知のポリヌクレオチド又は将来見出されるであろうポリヌクレオチドも包含させることができる。
本発明はさらに、上記3.で説明した本発明のキット又はデバイス(本発明で使用可能な上記の核酸を含む。)を用いて、検体中の、以下の群から選択される、miR−6893−5p、miR−6075、miR−6820−5p、miR−4294、miR−6729−5p、miR−4476、miR−6836−3p、miR−6765−3p、miR−6799−5p、miR−4530、miR−7641、miR−4454、miR−615−5p、miR−8073、miR−663a、miR−4634、miR−4450、miR−4792、miR−665、miR−7975、miR−7109−5p、miR−6789−5p、miR−4497、miR−6877−5p、miR−6880−5p、miR−7977、miR−4734、miR−6821−5p、miR−8089、miR−5585−3p、miR−6085、miR−6845−5p、miR−4651、miR−4433−3p、miR−1231、miR−4665−5p、miR−7114−5p、miR−1238−5p、miR−8069、miR−4732−5p、miR−619−5p、miR−3622a−5p、miR−1260a、miR−6741−5p、miR−6781−5p、miR−6125、miR−6805−5p、miR−6132、miR−6872−3p、miR−6875−5p、miR−1908−3p、miR−4433b−3p、miR−4736、miR−5100、miR−6724−5p、miR−7107−5p、miR−6726−5p、miR−3185、miR−4638−5p、miR−1273g−3p、miR−6778−5p、miR−328−5p、miR−3679−3p、miR−1228−3p、miR−6779−5p、miR−4723−5p、miR−6850−5p、miR−760、miR−7704、miR−8072、miR−4486、miR−1913、miR−4656、miR−1260b、miR−7106−5p、miR−6889−5p、miR−6780b−5p、miR−6090、miR−4534、miR−4449、miR−5195−3p、miR−1202、miR−4467、miR−6515−3p、miR−4281、miR−4505、miR−4484、miR−6805−3p、miR−3135b、miR−3162−5p、miR−6768−5p、miR−6721−5p、miR−1227−5p、miR−6722−3p、miR−4286、miR−4746−3p、miR−6727−5p、miR−6816−5p、miR−4741、miR−4508、miR−940、miR−4327、miR−4665−3p及びmiR−718、miR−1203、miR−663b、miR−4258、miR−4649−5p、miR−4516、miR−3619−3p、miR−6826−5p、miR−6757−5p、miR−3131、miR−1343−3p、miR−6775−5p、miR−6813−5p及びmiR−3940−5pで表される膵臓がん由来の遺伝子の発現量、並びに場合により、以下の群から選択される、miR−125a−3p、miR−204−3p、miR−1469、miR−575、miR−150−3p、miR−423−5p、miR−564、miR−3188、miR−1246、miR−602、miR−1290、miR−16−5p、miR−451a、miR−24−3p、miR−187−5p、miR−1908−5p、miR−371a−5p及びmiR−550a−5pで表される膵臓がん由来の遺伝子の発現量、並びに場合により、以下の群から選択される、miR−4417、miR−4707−5p、miR−7847−3p、miR−2861、miR−4513、miR−7111−5p、miR−6777−5p、miR−7113−3p、miR−4648、miR−3184−5p、miR−4271、miR−6791−5p、miR−642a−3p、miR−7108−5p、miR−128−1−5p、miR−5196−5p、miR−3178、miR−3656、miR−92a−2−5p、miR−6769b−5p、miR−4689、miR−6076、miR−92b−5p、miR−6774−5p、miR−486−3p、miR−6806−5p、miR−6842−5p、miR−6716−5p、miR−557、miR−4673、miR−4674、miR−4442、miR−1915−3p、miR−4687−3p及びmiR−92b−3pで表される膵臓がん由来の遺伝子の発現量、の1つ以上で表される膵臓がん由来の遺伝子の発現量、をin vitroで測定し、さらに、膵臓がんの罹患が疑われる被験体と、健常体(非膵臓がん患者を含む)とから採取した血液、血清、血漿等の検体について、検体中の上記遺伝子の発現量と、健常体の対照発現量とを用いて、たとえば両発現量を比較して、当該検体中の標的核酸の発現量に統計学的に有意に差がある場合、被験体が、膵臓がんに罹患していると評価することを含む、膵臓がんの検出方法を提供する。
(a)被験体由来の検体を、in vitroで、本発明のキット又はデバイス中のポリヌクレオチドと接触させるステップ、
(b)検体中の標的核酸の発現量を、上記ポリヌクレオチドを核酸プローブ又はプライマーとして用いて測定するステップ、
(c)(b)の結果をもとに、当該被験体中の膵臓がん(細胞)の存在又は不存在を評価するステップ、
を含むことができる。
(a)配列番号1〜104、464〜473、及び492〜494のいずれかで表される塩基配列、もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列、からなるポリヌクレオチド、その変異体、その誘導体、又は15以上の連続した塩基を含むその断片、
(b)配列番号1〜104、464〜473、及び492〜494のいずれかで表される塩基配列を含むポリヌクレオチド、
(c)配列番号1〜104、464〜473、及び492〜494のいずれかで表される塩基配列、もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列、に相補的な塩基配列からなるポリヌクレオチド、その変異体、その誘導体、又は15以上の連続した塩基を含むその断片、
(d)配列番号1〜104、464〜473、及び492〜494のいずれかで表される塩基配列、もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列、に相補的な塩基配列を含むポリヌクレオチド、及び
(e)前記(a)〜(d)のいずれかのポリヌクレオチドとストリンジェントな条件でハイブリダイズするポリヌクレオチド、
からなる群から選択される。
(f)配列番号105〜122のいずれかで表される塩基配列、もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列、からなるポリヌクレオチド、その変異体、その誘導体、又は15以上の連続した塩基を含むその断片、
(g)配列番号105〜122のいずれかで表される塩基配列を含むポリヌクレオチド、
(h)配列番号105〜122のいずれかで表される塩基配列、もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列、に相補的な塩基配列からなるポリヌクレオチド、その変異体、その誘導体、又は15以上の連続した塩基を含むその断片、
(i)配列番号105〜122のいずれかで表される塩基配列、もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列、に相補的な塩基配列を含むポリヌクレオチド、及び
(j)前記(f)〜(i)のいずれかのポリヌクレオチドとストリンジェントな条件でハイブリダイズするポリヌクレオチド、
からなる群から選択される。
(k)配列番号349〜383のいずれかで表される塩基配列、もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列、からなるポリヌクレオチド、その変異体、その誘導体、又は15以上の連続した塩基を含むその断片、
(l)配列番号349〜383のいずれかで表される塩基配列を含むポリヌクレオチド、
(m)配列番号349〜383のいずれかで表される塩基配列、もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列、に相補的な塩基配列からなるポリヌクレオチド、その変異体、その誘導体、又は15以上の連続した塩基を含むその断片、
(n)配列番号349〜383のいずれかで表される塩基配列、もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列、に相補的な塩基配列を含むポリヌクレオチド、及び
(o)前記(k)〜(n)のいずれかのポリヌクレオチドとストリンジェントな条件でハイブリダイズするポリヌクレオチド、
からなる群から選択されるポリヌクレオチドである。
(a)被験体の検体から調製されたRNA又はそれから転写された相補的ポリヌクレオチド(cDNA)を、本発明のキット又はデバイス中のポリヌクレオチドと結合させるステップ、
(b)当該ポリヌクレオチドに結合した検体由来のRNA又は当該RNAから合成されたcDNAを、上記ポリヌクレオチドを核酸プローブとして用いるハイブリダイゼーションによって、あるいは、上記ポリヌクレオチドをプライマーとして用いる定量RT−PCRによって測定するステップ、
(c)上記(b)の測定結果に基づいて、膵臓がん(由来の遺伝子の発現)の存在又は不存在を評価するステップ、
を含むことができる。
(a)膵臓がん患者由来の膵臓がん由来遺伝子を含む組織及び/又は健常体由来の膵臓がん由来遺伝子を含まない組織であることが既に知られている検体中の標的遺伝子の発現量を、本発明による検出用ポリヌクレオチド、キット又はデバイス(例えばDNAチップ)を用いて測定するステップ、
(b)(a)で測定された発現量の測定値から、上記の式1〜3、5及び6の判別式を作成するステップ、
(c)被験体由来の検体中の当該標的遺伝子の発現量を、本発明による診断(検出)用ポリヌクレオチド、キット又はデバイス(例えばDNAチップ)を用いて測定し、(b)で作成した判別式にそれらを代入して、得られた結果に基づいて検体が膵臓がん由来の標的遺伝子の発現を含むこと及び/又は含まないことを決定又は評価する、あるいはその発現量を健常体由来の対照と比較し評価する、ステップ、
を含むことができる。
<膵臓がん患者と健常体の検体の採取>
インフォームドコンセントを得た健常体100人と膵臓以外の臓器にがんが認められていない膵臓がん患者67人(stage IBが1例、stage IIBが10例、stage IIIが17例、stage IVが39例)からベノジェクトII真空採血管VP−AS109K60(テルモ株式会社、日本国)を用いてそれぞれ血清を採取し、学習検体群とした。同様に、インフォームドコンセントを得た健常体50人と膵臓以外の臓器にがんが認められていない膵臓がん患者33人(stage IBが1例、stage IIAが2例、stage IIBが4例、stage IIIが11例、stage IVが15例)からベノジェクトII真空採血管VP−AS109K60(テルモ株式会社)を用いてそれぞれ血清を採取し、テスト検体群とした。
検体として上記学習検体群、テスト検体群合わせて健常体150人と膵臓がん患者100人の合計250人からそれぞれ得られた血清300μLから、3D−Gene(登録商標)RNA extraction reagent from liquid sample kit(東レ株式会社、日本国)中のRNA抽出用試薬を用いて、同社の定めるプロトコールに従ってtotal RNAを得た。
検体として上記学習検体群、テスト検体群合わせて健常体150人と膵臓がん患者100人の合計250人の血清から得たtotal RNAに対して、3D−Gene(登録商標) miRNA Labeling kit(東レ株式会社)を用いて同社が定めるプロトコール(ver2.20)に基づいてmiRNAを蛍光標識した。オリゴDNAチップとして、miRBase release 20に登録されているmiRNAの中で、2,555種のmiRNAと相補的な配列を有するプローブを搭載した3D−Gene(登録商標) Human miRNA Oligo chip(東レ株式会社)を用い、同社が定めるプロトコールに基づいてストリンジェントな条件でハイブリダイゼーション及びハイブリダイゼーション後の洗浄を行った。DNAチップを3D−Gene(登録商標)スキャナー(東レ株式会社)を用いてスキャンし、画像を取得して3D−Gene(登録商標)Extraction(東レ株式会社)にて蛍光強度を数値化した。数値化された蛍光強度を、底が2の対数値に変換して遺伝子発現量とし、ブランク値の減算を行い、欠損値は各DNAチップにおける遺伝子発現量の最小値の対数値から0.1を減算した値で置換した。その結果、膵臓がん患者100人の血清及び健常体150人の血清に対する、網羅的なmiRNAの遺伝子発現量を得た。数値化されたmiRNAの遺伝子発現量を用いた計算及び統計解析は、R言語3.0.2(R Development Core Team (2013). R: A language and environment for statistical computing. R Foundation for Statistical Computing, URL http://www.R−project.org/.)及びMASSパッケージ7.3−30(Venables, W. N. & Ripley, B. D. (2002) Modern Applied Statistics with S. Fourth Edition. Springer, New York. ISBN 0−387−95457−0)を用いて実施した。
<他のがんと良性疾患の検体の採取>
インフォームドコンセントを得た他の臓器にがんが認められていない、大腸がん患者35人、胃がん患者37人、食道がん患者32人、肝がん患者38人及び膵胆道良性疾患患者13人からベノジェクトII真空採血管VP−AS109K60(テルモ株式会社)を用いてそれぞれ血清を採取し、参考例1の膵臓がん患者67人(stage IIAが1例、stage IIBが11例、stage IIIが17例、stage IVが38例)と健常体93人と合わせて学習検体群とした。同様に、インフォームドコンセントを得た他の臓器にがんが認められていない大腸がん患者15人、胃がん患者13人、食道がん患者18人、肝がん患者12人及び膵胆道良性疾患患者8人からベノジェクトII真空採血管VP−AS109K60(テルモ株式会社)を用いてそれぞれ血清を採取し、参考例1の膵臓がん患者33人(stage IBが2例、stage IIAが1例、stage IIBが3例、stage IIIが11例、stage IVが16例)、健常体57人と合わせてテスト検体群とした。以降のtotal RNAの抽出並びに遺伝子発現量の測定及び解析は参考例1と同様に行った。
<学習検体群の検体を用いた遺伝子マーカーの選定とテスト検体群の検体を用いた単独の遺伝子マーカーの膵臓がん判別性能の評価方法>
本実施例では、学習検体群から膵臓がんを健常体と判別するための遺伝子マーカーを選定し、学習検体群とは独立したテスト検体群の検体において検討した。
<テスト検体群検体を用いた複数の遺伝子マーカーの組合せによる膵臓がん判別性能の評価方法A>
本実施例では、実施例1で選定された遺伝子マーカーを組合せて膵臓がん判別性能を評価する方法を検討した。
<全検体を用いた場合の遺伝子マーカーの選定と獲られた遺伝子マーカーの膵臓がん判別性能の評価方法>
本実施例では、上記実施例1及び2で用いた学習検体群及びテスト検体群の検体を統合し全検体を用いて、遺伝子マーカーの選定及びその膵臓がん判別性能評価を行った。
<テスト検体群検体を用いた複数の遺伝子マーカーの組合せによる膵臓がん特異的な判別性能の評価方法>
本実施例では、参考例2に記載した検体群の学習検体群を対象として、実施例1に記載の方法と同様の方法で、膵臓がん患者と健康人、大腸がん患者、胃がん患者、食道がん患者、肝がん患者及び膵胆道良性疾患患者からなる対照群との血清中のmiRNAの遺伝子発現量の比較を行い、追加の診断用遺伝子マーカーを選択した。その結果選択された、追加の診断用遺伝子マーカー(配列番号464〜473及び492〜494の少なくとも1つ)と実施例1で選定された遺伝子マーカーを組合せて膵臓がん特異的な判別性能を評価する方法を検討した。
<テスト検体群検体を用いた複数の遺伝子マーカーの組合せによる膵臓がん判別性能の評価方法B>
実施例2では、実施例1で選定された遺伝子マーカーを複数組み合わせることで、1個の遺伝子マーカーを用いた場合よりも判別性能が向上したことを示した。そこで、本実施例では、実施例1で選定されなかった遺伝子マーカーも実施例1で選定された遺伝子マーカーと組み合わせることで膵臓がんを判別する高い性能が得られるか検討した。
レオチドも、優れた診断マーカーであるといえる。
<既存血中腫瘍マーカーの膵臓がん判別性能>
上記の参考例で得た学習検体群とテスト検体群について、既存の腫瘍マーカーCEA及びCA19−9の血中濃度を測定した。これらの腫瘍マーカーは、原則、非特許文献3に記載される基準値(CEAは5ng/mL、CA19−9は37U/mL)よりも血中濃度が高いとがんの疑いがあるとされる。従って、各検体毎にCEA及びCA19−9の血中濃度が基準値を超えているか否かを確認し、膵臓がん患者をがんと判定しているか見定め、学習検体群及びテスト検体群における各既存マーカーの感度を算出した。この結果を表5に示した。学習検体群においてはCEAの感度は55.2%、CA19−9の感度は77.6%、テスト検体群においてはCEAの感度は45.5%、CA19−9の感度は75.8%しかなく、いずれのマーカーも膵臓がんの検出には有用でないことが分かった(表5)。
Claims (31)
- 膵臓がんマーカーであるmiR−6836−3p又はその前駆体のポリヌクレオチドと特異的に結合可能な核酸を含む、膵臓がんの検出用キット。
- miR−6836−3pがhsa−miR−6836−3pである、請求項1に記載のキット。
- 前記核酸が、下記の(a)〜(e)に示すポリヌクレオチド又はその断片からなる群から選択される少なくとも1つのポリヌクレオチド又はその断片である、請求項1又は2に記載のキット:
(a)(1)配列番号7で表される塩基配列もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列からなるポリヌクレオチド、又は15以上の連続した塩基を含むその断片、
(2)(1)の前記ポリヌクレオチド又は前記断片の塩基配列において1又は2の塩基の欠失、置換、付加又は挿入を含む、ポリヌクレオチド又はその断片、
(3)(1)の前記ポリヌクレオチド又は前記断片の塩基配列と90%以上の%同一性を示すポリヌクレオチド又はその断片、又は
(4)修飾核酸及び/又は修飾ヌクレオチドを含む、(1)〜(3)のいずれかのポリヌクレオチド又はその断片、
(b)配列番号7で表される塩基配列を含むポリヌクレオチド、又は15以上の連続した塩基を含むその断片、
(c)(5)配列番号7で表される塩基配列もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列に相補的な塩基配列からなるポリヌクレオチド、又は15以上の連続した塩基を含むその断片、
(6)(5)の前記ポリヌクレオチド又は前記断片の塩基配列において1又は2の塩基の欠失、置換、付加又は挿入を含む、ポリヌクレオチド又はその断片、
(7)(5)の前記ポリヌクレオチド又は前記断片の塩基配列と90%以上の%同一性を示すポリヌクレオチド又はその断片、又は
(8)修飾核酸及び/又は修飾ヌクレオチドを含む、(5)〜(7)のいずれかのポリヌクレオチド又はその断片、
(d)配列番号7で表される塩基配列もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列に相補的な塩基配列を含むポリヌクレオチド、又は15以上の連続した塩基を含むその断片、及び
(e)前記(a)〜(d)のいずれかのポリヌクレオチド又はその断片と高ストリンジェントな条件でハイブリダイズするポリヌクレオチド。 - 前記キットが、別の膵臓がんマーカーである、miR−6893−5p、miR−6075、miR−6820−5p、miR−4294、miR−6729−5p、miR−4476、miR−6765−3p、miR−6799−5p、miR−4530、miR−7641、miR−4454、miR−615−5p、miR−8073、miR−663a、miR−4634、miR−4450、miR−4792、miR−665、miR−7975、miR−7109−5p、miR−6789−5p、miR−4497、miR−6877−5p、miR−6880−5p、miR−7977、miR−4734、miR−6821−5p、miR−8089、miR−5585−3p、miR−6085、miR−6845−5p、miR−4651、miR−4433−3p、miR−1231、miR−4665−5p、miR−7114−5p、miR−1238−5p、miR−8069、miR−4732−5p、miR−619−5p、miR−3622a−5p、miR−1260a、miR−6741−5p、miR−6781−5p、miR−6125、miR−6805−5p、miR−6132、miR−6872−3p、miR−6875−5p、miR−1908−3p、miR−4433b−3p、miR−4736、miR−5100、miR−6724−5p、miR−7107−5p、miR−6726−5p、miR−3185、miR−4638−5p、miR−1273g−3p、miR−6778−5p、miR−328−5p、miR−3679−3p、miR−1228−3p、miR−6779−5p、miR−4723−5p、miR−6850−5p、miR−760、miR−7704、miR−8072、miR−4486、miR−1913、miR−4656、miR−1260b、miR−7106−5p、miR−6889−5p、miR−6780b−5p、miR−6090、miR−4534、miR−4449、miR−5195−3p、miR−1202、miR−4467、miR−6515−3p、miR−4281、miR−4505、miR−4484、miR−6805−3p、miR−3135b、miR−3162−5p、miR−6768−5p、miR−6721−5p、miR−1227−5p、miR−6722−3p、miR−4286、miR−4746−3p、miR−6727−5p、miR−6816−5p、miR−4741、miR−4508、miR−940、miR−4327、miR−4665−3p、miR−718、miR−1203、miR−663b、miR−4258、miR−4649−5p、miR−4516、miR−3619−3p、miR−6826−5p、miR−6757−5p、miR−3131、miR−1343−3p、miR−6775−5p、miR−6813−5p及びmiR−3940−5p、並びに/又は、miR−125a−3p、miR−204−3p、miR−1469、miR−575、miR−150−3p、miR−423−5p、miR−564、miR−3188、miR−1246、miR−602、miR−1290、miR−16−5p、miR−451a、miR−24−3p、miR−187−5p、miR−1908−5p、miR−371a−5p及びmiR−550a−5p、或いはそれらの前駆体からなる群から選択される少なくとも1つ以上のポリヌクレオチドと特異的に結合可能な核酸をさらに含む、請求項1〜3のいずれか1項に記載のキット。
- miR−6893−5pがhsa−miR−6893−5pであり、miR−6075がhsa−miR−6075であり、miR−6820−5pがhsa−miR−6820−5pであり、miR−4294がhsa−miR−4294であり、miR−6729−5pがhsa−miR−6729−5pであり、miR−4476がhsa−miR−4476であり、miR−6765−3pがhsa−miR−6765−3pであり、miR−6799−5pがhsa−miR−6799−5pであり、miR−4530がhsa−miR−4530であり、miR−7641がhsa−miR−7641であり、miR−4454がhsa−miR−4454であり、miR−615−5pがhsa−miR−615−5pであり、miR−8073がhsa−miR−8073であり、miR−663aがhsa−miR−663aであり、miR−4634がhsa−miR−4634であり、miR−4450がhsa−miR−4450であり、miR−4792がhsa−miR−4792であり、miR−665がhsa−miR−665であり、miR−7975がhsa−miR−7975であり、miR−7109−5pがhsa−miR−7109−5pであり、miR−6789−5pがhsa−miR−6789−5pであり、miR−4497がhsa−miR−4497であり、miR−6877−5pがhsa−miR−6877−5pであり、miR−6880−5pがhsa−miR−6880−5pであり、miR−7977がhsa−miR−7977であり、miR−4734がhsa−miR−4734であり、miR−6821−5pがhsa−miR−6821−5pであり、miR−8089がhsa−miR−8089であり、miR−5585−3pがhsa−miR−5585−3pであり、miR−6085がhsa−miR−6085であり、miR−6845−5pがhsa−miR−6845−5pであり、miR−4651がhsa−miR−4651であり、miR−4433−3pがhsa−miR−4433−3pであり、miR−1231がhsa−miR−1231であり、miR−4665−5pがhsa−miR−4665−5pであり、miR−7114−5pがhsa−miR−7114−5pであり、miR−1238−5pがhsa−miR−1238−5pであり、miR−8069がhsa−miR−8069であり、miR−4732−5pがhsa−miR−4732−5pであり、miR−619−5pがhsa−miR−619−5pであり、miR−3622a−5pがhsa−miR−3622a−5pであり、miR−1260aがhsa−miR−1260aであり、miR−6741−5pがhsa−miR−6741−5pであり、miR−6781−5pがhsa−miR−6781−5pであり、miR−6125がhsa−miR−6125であり、miR−6805−5pがhsa−miR−6805−5pであり、miR−6132がhsa−miR−6132であり、miR−6872−3pがhsa−miR−6872−3pであり、miR−6875−5pがhsa−miR−6875−5pであり、miR−1908−3pがhsa−miR−1908−3pであり、miR−4433b−3pがhsa−miR−4433b−3pであり、miR−4736がhsa−miR−4736であり、miR−5100がhsa−miR−5100であり、miR−6724−5pがhsa−miR−6724−5pであり、miR−7107−5pがhsa−miR−7107−5pであり、miR−6726−5pがhsa−miR−6726−5pであり、miR−3185がhsa−miR−3185であり、miR−4638−5pがhsa−miR−4638−5pであり、miR−1273g−3pがhsa−miR−1273g−3pであり、miR−6778−5pがhsa−miR−6778−5pであり、miR−328−5pがhsa−miR−328−5pであり、miR−3679−3pがhsa−miR−3679−3pであり、miR−1228−3pがhsa−miR−1228−3pであり、miR−6779−5pがhsa−miR−6779−5pであり、miR−4723−5pがhsa−miR−4723−5pであり、miR−6850−5pがhsa−miR−6850−5pであり、miR−760がhsa−miR−760であり、miR−7704がhsa−miR−7704であり、miR−8072がhsa−miR−8072であり、miR−4486がhsa−miR−4486であり、miR−1913がhsa−miR−1913であり、miR−4656がhsa−miR−4656であり、miR−1260bがhsa−miR−1260bであり、miR−7106−5pがhsa−miR−7106−5pであり、miR−6889−5pがhsa−miR−6889−5pであり、miR−6780b−5pがhsa−miR−6780b−5pであり、miR−6090がhsa−miR−6090であり、miR−4534がhsa−miR−4534であり、miR−4449がhsa−miR−4449であり、miR−5195−3pがhsa−miR−5195−3pであり、miR−1202がhsa−miR−1202であり、miR−4467がhsa−miR−4467であり、miR−6515−3pがhsa−miR−6515−3pであり、miR−4281がhsa−miR−4281であり、miR−4505がhsa−miR−4505であり、miR−4484がhsa−miR−4484であり、miR−6805−3pがhsa−miR−6805−3pであり、miR−3135bがhsa−miR−3135bであり、miR−3162−5pがhsa−miR−3162−5pであり、miR−6768−5pがhsa−miR−6768−5pであり、miR−6721−5pがhsa−miR−6721−5pであり、miR−1227−5pがhsa−miR−1227−5pであり、miR−6722−3pがhsa−miR−6722−3pであり、miR−4286がhsa−miR−4286であり、miR−4746−3pがhsa−miR−4746−3pであり、miR−6727−5pがhsa−miR−6727−5pであり、miR−6816−5pがhsa−miR−6816−5pであり、miR−4741がhsa−miR−4741であり、miR−4508がhsa−miR−4508であり、miR−940がhsa−miR−940であり、miR−4327がhsa−miR−4327であり、miR−4665−3pがhsa−miR−4665−3pであり、及び、miR−718がhsa−miR−718であり、miR−1203がhsa−miR−1203であり、miR−663bがhsa−miR−663bであり、miR−4258がhsa−miR−4258であり、miR−4649−5pがhsa−miR−4649−5pであり、miR−4516がhsa−miR−4516であり、miR−3619−3pがhsa−miR−3619−3pであり、miR−6826−5pがhsa−miR−6826−5pであり、miR−6757−5pがhsa−miR−6757−5pであり、miR−3131がhsa−miR−3131であり、miR−1343−3pがhsa−miR−1343−3pであり、miR−6775−5pがhsa−miR−6775−5pであり、miR−6813−5pがhsa−miR−6813−5pであり、及び、miR−3940−5pがhsa−miR−3940−5pであり、miR−125a−3pがhsa−miR−125a−3pであり、miR−204−3pがhsa−miR−204−3pであり、miR−1469がhsa−miR−1469であり、miR−575がhsa−miR−575であり、miR−150−3pがhsa−miR−150−3pであり、miR−423−5pがhsa−miR−423−5pであり、miR−564がhsa−miR−564であり、miR−3188がhsa−miR−3188であり、miR−1246がhsa−miR−1246であり、miR−602がhsa−miR−602であり、miR−1290がhsa−miR−1290であり、miR−16−5pがhsa−miR−16−5pであり、miR−451aがhsa−miR−451aであり、miR−24−3pがhsa−miR−24−3pであり、miR−187−5pがhsa−miR−187−5pであり、miR−1908−5pがhsa−miR−1908−5pであり、miR−371a−5pがhsa−miR−371a−5pであり、及び、miR−550a−5pがhsa−miR−550a−5pである、請求項4に記載のキット。
- 前記核酸が、下記の(f)〜(j)に示すポリヌクレオチド又はその断片からなる群から選択される少なくとも1つのポリヌクレオチド又はその断片である、請求項4又は5に記載のキット:
(f)(9)配列番号1〜6、8〜104、105〜122、464〜473、及び492〜494のいずれかで表される塩基配列もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列からなるポリヌクレオチド、又は15以上の連続した塩基を含むその断片、
(10)(9)の前記ポリヌクレオチド又は前記断片の塩基配列において1又は2の塩基の欠失、置換、付加又は挿入を含む、ポリヌクレオチド又はその断片、
(11)(9)の前記ポリヌクレオチド又は前記断片の塩基配列と90%以上の%同一性を示すポリヌクレオチド又はその断片、又は
(12)修飾核酸及び/又は修飾ヌクレオチドを含む、(9)〜(11)のいずれかのポリヌクレオチド又はその断片、
(g)配列番号1〜6、8〜104、105〜122、464〜473、及び492〜494のいずれかで表される塩基配列を含むポリヌクレオチド、又は15以上の連続した塩基を含むその断片、
(h)(13)配列番号1〜6、8〜104、105〜122、464〜473、及び492〜494のいずれかで表される塩基配列もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列に相補的な塩基配列からなるポリヌクレオチド、又は15以上の連続した塩基を含むその断片、
(14)(13)の前記ポリヌクレオチド又は前記断片の塩基配列において1又は2の塩基の欠失、置換、付加又は挿入を含む、ポリヌクレオチド又はその断片、
(15)(13)の前記ポリヌクレオチド又は前記断片の塩基配列と90%以上の%同一性を示すポリヌクレオチド又はその断片、又は
(16)修飾核酸及び/又は修飾ヌクレオチドを含む、(13)〜(15)のいずれかのポリヌクレオチド又はその断片、
(i)配列番号1〜6、8〜104、105〜122、464〜473、及び492〜494のいずれかで表される塩基配列もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列に相補的な塩基配列を含むポリヌクレオチド、又は15以上の連続した塩基を含むその断片、及び
(j)前記(f)〜(i)のいずれかのポリヌクレオチド又はその断片と高ストリンジェントな条件でハイブリダイズするポリヌクレオチド。 - 前記キットが、別の膵臓がんマーカーである、miR−4417、miR−4707−5p、miR−7847−3p、miR−2861、miR−4513、miR−7111−5p、miR−6777−5p、miR−7113−3p、miR−4648、miR−3184−5p、miR−4271、miR−6791−5p、miR−642a−3p、miR−7108−5p、miR−128−1−5p、miR−5196−5p、miR−3178、miR−3656、miR−92a−2−5p、miR−6769b−5p、miR−4689、miR−6076、miR−92b−5p、miR−6774−5p、miR−486−3p、miR−6806−5p、miR−6842−5p、miR−6716−5p、miR−557、miR−4673、miR−4674、miR−4442、miR−1915−3p、miR−4687−3p及びmiR−92b−3p、或いはそれらの前駆体からなる群から選択される少なくとも1つ以上のポリヌクレオチドと特異的に結合可能な核酸をさらに含む、請求項1〜6のいずれか1項に記載のキット。
- miR−4417がhsa−miR−4417であり、miR−4707−5pがhsa−miR−4707−5pであり、miR−7847−3pがhsa−miR−7847−3pであり、miR−2861がhsa−miR−2861であり、miR−4513がhsa−miR−4513であり、miR−7111−5pがhsa−miR−7111−5pであり、miR−6777−5pがhsa−miR−6777−5pであり、miR−7113−3pがhsa−miR−7113−3pであり、miR−4648がhsa−miR−4648であり、miR−3184−5pがhsa−miR−3184−5pであり、miR−4271がhsa−miR−4271であり、miR−6791−5pがhsa−miR−6791−5pであり、miR−642a−3pがhsa−miR−642a−3pであり、miR−7108−5pがhsa−miR−7108−5pであり、miR−128−1−5pがhsa−miR−128−1−5pであり、miR−5196−5pがhsa−miR−5196−5pであり、miR−3178がhsa−miR−3178であり、miR−3656がhsa−miR−3656であり、miR−92a−2−5pがhsa−miR−92a−2−5pであり、miR−6769b−5pがhsa−miR−6769b−5pであり、miR−4689がhsa−miR−4689であり、miR−6076がhsa−miR−6076であり、miR−92b−5pがhsa−miR−92b−5pであり、miR−6774−5pがhsa−miR−6774−5pであり、miR−486−3pがhsa−miR−486−3pであり、miR−6806−5pがhsa−miR−6806−5pであり、miR−6842−5pがhsa−miR−6842−5pであり、miR−6716−5pがhsa−miR−6716−5pであり、miR−557がhsa−miR−557であり、miR−4673がhsa−miR−4673であり、miR−4674がhsa−miR−4674であり、miR−4442がhsa−miR−4442であり、miR−1915−3pがhsa−miR−1915−3pであり、miR−4687−3pがhsa−miR−4687−3pであり、及び、miR−92b−3pがhsa−miR−92b−3pである、請求項7に記載のキット。
- 前記核酸が、下記の(k)〜(o)に示すポリヌクレオチド又はその断片からなる群から選択される少なくとも1つのポリヌクレオチド又はその断片である、請求項7又は8に記載のキット:
(k)(17)配列番号349〜383のいずれかで表される塩基配列もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列からなるポリヌクレオチド、又は15以上の連続した塩基を含むその断片、
(18)(17)の前記ポリヌクレオチド又は前記断片の塩基配列において1又は2の塩基の欠失、置換、付加又は挿入を含む、ポリヌクレオチド又はその断片、
(19)(17)の前記ポリヌクレオチド又は前記断片の塩基配列と90%以上の%同一性を示すポリヌクレオチド又はその断片、又は
(20)修飾核酸及び/又は修飾ヌクレオチドを含む、(17)〜(19)のいずれかのポリヌクレオチド又はその断片、
(l)配列番号349〜383のいずれかで表される塩基配列を含むポリヌクレオチド、又は15以上の連続した塩基を含むその断片、
(m)(21)配列番号349〜383のいずれかで表される塩基配列もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列に相補的な塩基配列からなるポリヌクレオチド、又は15以上の連続した塩基を含むその断片、
(22)(21)の前記ポリヌクレオチド又は前記断片の塩基配列において1又は2の塩基の欠失、置換、付加又は挿入を含む、ポリヌクレオチド又はその断片、
(23)(21)の前記ポリヌクレオチド又は前記断片の塩基配列と90%以上の%同一性を示すポリヌクレオチド又はその断片、又は
(24)修飾核酸及び/又は修飾ヌクレオチドを含む、(21)〜(23)のいずれかのポリヌクレオチド又はその断片、
(n)配列番号349〜383のいずれかで表される塩基配列もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列に相補的な塩基配列を含むポリヌクレオチド、又は15以上の連続した塩基を含むその断片、及び
(o)前記(k)〜(n)のいずれかのポリヌクレオチド又はその断片と高ストリンジェントな条件でハイブリダイズするポリヌクレオチド。 - 前記キットが、膵臓がんマーカーである、miR−6893−5p、miR−6075、miR−6820−5p、miR−4294、miR−6729−5p、miR−4476、miR−6765−3p、miR−6799−5p、miR−4530、miR−7641、miR−4454、miR−615−5p、miR−8073、miR−663a、miR−4634、miR−4450、miR−4792、miR−665、miR−7975、miR−7109−5p、miR−6789−5p、miR−4497、miR−6877−5p、miR−6880−5p、miR−7977、miR−4734、miR−6821−5p、miR−8089、miR−5585−3p、miR−6085、miR−6845−5p、miR−4651、miR−4433−3p、miR−1231、miR−4665−5p、miR−7114−5p、miR−1238−5p、miR−8069、miR−4732−5p、miR−619−5p、miR−3622a−5p、miR−1260a、miR−6741−5p、miR−6781−5p、miR−6125、miR−6805−5p、miR−6132、miR−6872−3p、miR−6875−5p、miR−1908−3p、miR−4433b−3p、miR−4736、miR−5100、miR−6724−5p、miR−7107−5p、miR−6726−5p、miR−3185、miR−4638−5p、miR−1273g−3p、miR−6778−5p、miR−328−5p、miR−3679−3p、miR−1228−3p、miR−6779−5p、miR−4723−5p、miR−6850−5p、miR−760、miR−7704、miR−8072、miR−4486、miR−1913、miR−4656、miR−1260b、miR−7106−5p、miR−6889−5p、miR−6780b−5p、miR−6090、miR−4534、miR−4449、miR−5195−3p、miR−1202、miR−4467、miR−6515−3p、miR−4281、miR−4505、miR−4484、miR−6805−3p、miR−3135b、miR−3162−5p、miR−6768−5p、miR−6721−5p、miR−1227−5p、miR−6722−3p、miR−4286、miR−4746−3p、miR−6727−5p、miR−6816−5p、miR−4741、miR−4508、miR−940、miR−4327、miR−4665−3p、miR−718、miR−1203、miR−663b、miR−4258、miR−4649−5p、miR−4516、miR−3619−3p、miR−6826−5p、miR−6757−5p、miR−3131、miR−1343−3p、miR−6775−5p、miR−6813−5p及びmiR−3940−5p、或いはそれらの前駆体から選択される少なくとも1つ以上のポリヌクレオチド、並びにmiR−6836−3pのポリヌクレオチド又はその前駆体のそれぞれと特異的に結合可能な少なくとも2つ以上の核酸を含む、請求項1〜9のいずれか1項に記載のキット。
- 膵臓がんマーカーである、miR−6836−3p又はその前駆体のポリヌクレオチドと特異的に結合可能な核酸を含む、膵臓がんの検出用デバイス。
- miR−6836−3pがhsa−miR−6836−3pである、請求項11に記載のデバイス。
- 前記核酸が、下記の(a)〜(e)に示すポリヌクレオチド又はその断片からなる群から選択される少なくとも1つのポリヌクレオチド又はその断片である、請求項11又は12に記載のデバイス:
(a)(25)配列番号7で表される塩基配列もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列からなるポリヌクレオチド、又は15以上の連続した塩基を含むその断片、
(26)(25)の前記ポリヌクレオチド又は前記断片の塩基配列において1又は2の塩基の欠失、置換、付加又は挿入を含む、ポリヌクレオチド又はその断片、
(27)(25)の前記ポリヌクレオチド又は前記断片の塩基配列と90%以上の%同一性を示すポリヌクレオチド又はその断片、又は
(28)修飾核酸及び/又は修飾ヌクレオチドを含む、(25)〜(27)のいずれかのポリヌクレオチド又はその断片、
(b)配列番号7で表される塩基配列を含むポリヌクレオチド、又は15以上の連続した塩基を含むその断片、
(c)(29)配列番号7で表される塩基配列もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列に相補的な塩基配列からなるポリヌクレオチド、又は15以上の連続した塩基を含むその断片、
(30)(29)の前記ポリヌクレオチド又は前記断片の塩基配列において1又は2の塩基の欠失、置換、付加又は挿入を含む、ポリヌクレオチド又はその断片、
(31)(29)の前記ポリヌクレオチド又は前記断片の塩基配列と90%以上の%同一性を示すポリヌクレオチド又はその断片、又は
(32)修飾核酸及び/又は修飾ヌクレオチドを含む、(29)〜(31)のいずれかのポリヌクレオチド又はその断片、
(d)配列番号7で表される塩基配列もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列に相補的な塩基配列を含むポリヌクレオチド、又は15以上の連続した塩基を含むその断片、及び
(e)前記(a)〜(d)のいずれかのポリヌクレオチド又はその断片と高ストリンジェントな条件でハイブリダイズするポリヌクレオチド。 - 前記デバイスが、膵臓がんマーカーである、miR−6893−5p、miR−6075、miR−6820−5p、miR−4294、miR−6729−5p、miR−4476、miR−6765−3p、miR−6799−5p、miR−4530、miR−7641、miR−4454、miR−615−5p、miR−8073、miR−663a、miR−4634、miR−4450、miR−4792、miR−665、miR−7975、miR−7109−5p、miR−6789−5p、miR−4497、miR−6877−5p、miR−6880−5p、miR−7977、miR−4734、miR−6821−5p、miR−8089、miR−5585−3p、miR−6085、miR−6845−5p、miR−4651、miR−4433−3p、miR−1231、miR−4665−5p、miR−7114−5p、miR−1238−5p、miR−8069、miR−4732−5p、miR−619−5p、miR−3622a−5p、miR−1260a、miR−6741−5p、miR−6781−5p、miR−6125、miR−6805−5p、miR−6132、miR−6872−3p、miR−6875−5p、miR−1908−3p、miR−4433b−3p、miR−4736、miR−5100、miR−6724−5p、miR−7107−5p、miR−6726−5p、miR−3185、miR−4638−5p、miR−1273g−3p、miR−6778−5p、miR−328−5p、miR−3679−3p、miR−1228−3p、miR−6779−5p、miR−4723−5p、miR−6850−5p、miR−760、miR−7704、miR−8072、miR−4486、miR−1913、miR−4656、miR−1260b、miR−7106−5p、miR−6889−5p、miR−6780b−5p、miR−6090、miR−4534、miR−4449、miR−5195−3p、miR−1202、miR−4467、miR−6515−3p、miR−4281、miR−4505、miR−4484、miR−6805−3p、miR−3135b、miR−3162−5p、miR−6768−5p、miR−6721−5p、miR−1227−5p、miR−6722−3p、miR−4286、miR−4746−3p、miR−6727−5p、miR−6816−5p、miR−4741、miR−4508、miR−940、miR−4327、miR−4665−3p、miR−718、miR−1203、miR−663b、miR−4258、miR−4649−5p、miR−4516、miR−3619−3p、miR−6826−5p、miR−6757−5p、miR−3131、miR−1343−3p、miR−6775−5p、miR−6813−5p及びmiR−3940−5p、並びに/又は、miR−125a−3p、miR−204−3p、miR−1469、miR−575、miR−150−3p、miR−423−5p、miR−564、miR−3188、miR−1246、miR−602、miR−1290、miR−16−5p、miR−451a、miR−24−3p、miR−187−5p、miR−1908−5p、miR−371a−5p及びmiR−550a−5p、或いはそれらの前駆体からなる群から選択される少なくとも1つ以上のポリヌクレオチドと特異的に結合可能な核酸をさらに含む、請求項11〜13のいずれか1項に記載のデバイス。
- miR−6893−5pがhsa−miR−6893−5pであり、miR−6075がhsa−miR−6075であり、miR−6820−5pがhsa−miR−6820−5pであり、miR−4294がhsa−miR−4294であり、miR−6729−5pがhsa−miR−6729−5pであり、miR−4476がhsa−miR−4476であり、miR−6765−3pがhsa−miR−6765−3pであり、miR−6799−5pがhsa−miR−6799−5pであり、miR−4530がhsa−miR−4530であり、miR−7641がhsa−miR−7641であり、miR−4454がhsa−miR−4454であり、miR−615−5pがhsa−miR−615−5pであり、miR−8073がhsa−miR−8073であり、miR−663aがhsa−miR−663aであり、miR−4634がhsa−miR−4634であり、miR−4450がhsa−miR−4450であり、miR−4792がhsa−miR−4792であり、miR−665がhsa−miR−665であり、miR−7975がhsa−miR−7975であり、miR−7109−5pがhsa−miR−7109−5pであり、miR−6789−5pがhsa−miR−6789−5pであり、miR−4497がhsa−miR−4497であり、miR−6877−5pがhsa−miR−6877−5pであり、miR−6880−5pがhsa−miR−6880−5pであり、miR−7977がhsa−miR−7977であり、miR−4734がhsa−miR−4734であり、miR−6821−5pがhsa−miR−6821−5pであり、miR−8089がhsa−miR−8089であり、miR−5585−3pがhsa−miR−5585−3pであり、miR−6085がhsa−miR−6085であり、miR−6845−5pがhsa−miR−6845−5pであり、miR−4651がhsa−miR−4651であり、miR−4433−3pがhsa−miR−4433−3pであり、miR−1231がhsa−miR−1231であり、miR−4665−5pがhsa−miR−4665−5pであり、miR−7114−5pがhsa−miR−7114−5pであり、miR−1238−5pがhsa−miR−1238−5pであり、miR−8069がhsa−miR−8069であり、miR−4732−5pがhsa−miR−4732−5pであり、miR−619−5pがhsa−miR−619−5pであり、miR−3622a−5pがhsa−miR−3622a−5pであり、miR−1260aがhsa−miR−1260aであり、miR−6741−5pがhsa−miR−6741−5pであり、miR−6781−5pがhsa−miR−6781−5pであり、miR−6125がhsa−miR−6125であり、miR−6805−5pがhsa−miR−6805−5pであり、miR−6132がhsa−miR−6132であり、miR−6872−3pがhsa−miR−6872−3pであり、miR−6875−5pがhsa−miR−6875−5pであり、miR−1908−3pがhsa−miR−1908−3pであり、miR−4433b−3pがhsa−miR−4433b−3pであり、miR−4736がhsa−miR−4736であり、miR−5100がhsa−miR−5100であり、miR−6724−5pがhsa−miR−6724−5pであり、miR−7107−5pがhsa−miR−7107−5pであり、miR−6726−5pがhsa−miR−6726−5pであり、miR−3185がhsa−miR−3185であり、miR−4638−5pがhsa−miR−4638−5pであり、miR−1273g−3pがhsa−miR−1273g−3pであり、miR−6778−5pがhsa−miR−6778−5pであり、miR−328−5pがhsa−miR−328−5pであり、miR−3679−3pがhsa−miR−3679−3pであり、miR−1228−3pがhsa−miR−1228−3pであり、miR−6779−5pがhsa−miR−6779−5pであり、miR−4723−5pがhsa−miR−4723−5pであり、miR−6850−5pがhsa−miR−6850−5pであり、miR−760がhsa−miR−760であり、miR−7704がhsa−miR−7704であり、miR−8072がhsa−miR−8072であり、miR−4486がhsa−miR−4486であり、miR−1913がhsa−miR−1913であり、miR−4656がhsa−miR−4656であり、miR−1260bがhsa−miR−1260bであり、miR−7106−5pがhsa−miR−7106−5pであり、miR−6889−5pがhsa−miR−6889−5pであり、miR−6780b−5pがhsa−miR−6780b−5pであり、miR−6090がhsa−miR−6090であり、miR−4534がhsa−miR−4534であり、miR−4449がhsa−miR−4449であり、miR−5195−3pがhsa−miR−5195−3pであり、miR−1202がhsa−miR−1202であり、miR−4467がhsa−miR−4467であり、miR−6515−3pがhsa−miR−6515−3pであり、miR−4281がhsa−miR−4281であり、miR−4505がhsa−miR−4505であり、miR−4484がhsa−miR−4484であり、miR−6805−3pがhsa−miR−6805−3pであり、miR−3135bがhsa−miR−3135bであり、miR−3162−5pがhsa−miR−3162−5pであり、miR−6768−5pがhsa−miR−6768−5pであり、miR−6721−5pがhsa−miR−6721−5pであり、miR−1227−5pがhsa−miR−1227−5pであり、miR−6722−3pがhsa−miR−6722−3pであり、miR−4286がhsa−miR−4286であり、miR−4746−3pがhsa−miR−4746−3pであり、miR−6727−5pがhsa−miR−6727−5pであり、miR−6816−5pがhsa−miR−6816−5pであり、miR−4741がhsa−miR−4741であり、miR−4508がhsa−miR−4508であり、miR−940がhsa−miR−940であり、miR−4327がhsa−miR−4327であり、miR−4665−3pがhsa−miR−4665−3pであり、及び、miR−718がhsa−miR−718であり、miR−1203がhsa−miR−1203であり、miR−663bがhsa−miR−663bであり、miR−4258がhsa−miR−4258であり、miR−4649−5pがhsa−miR−4649−5pであり、miR−4516がhsa−miR−4516であり、miR−3619−3pがhsa−miR−3619−3pであり、miR−6826−5pがhsa−miR−6826−5pであり、miR−6757−5pがhsa−miR−6757−5pであり、miR−3131がhsa−miR−3131であり、miR−1343−3pがhsa−miR−1343−3pであり、miR−6775−5pがhsa−miR−6775−5pであり、miR−6813−5pがhsa−miR−6813−5pであり、及び、miR−3940−5pがhsa−miR−3940−5pであり、miR−125a−3pがhsa−miR−125a−3pであり、miR−204−3pがhsa−miR−204−3pであり、miR−1469がhsa−miR−1469であり、miR−575がhsa−miR−575であり、miR−150−3pがhsa−miR−150−3pであり、miR−423−5pがhsa−miR−423−5pであり、miR−564がhsa−miR−564であり、miR−3188がhsa−miR−3188であり、miR−1246がhsa−miR−1246であり、miR−602がhsa−miR−602であり、miR−1290がhsa−miR−1290であり、miR−16−5pがhsa−miR−16−5pであり、miR−451aがhsa−miR−451aであり、miR−24−3pがhsa−miR−24−3pであり、miR−187−5pがhsa−miR−187−5pであり、miR−1908−5pがhsa−miR−1908−5pであり、miR−371a−5pがhsa−miR−371a−5pであり、及び、miR−550a−5pがhsa−miR−550a−5pである、請求項14に記載のデバイス。
- 前記核酸が、下記の(f)〜(j)に示すポリヌクレオチド又はその断片からなる群から選択される少なくとも1つのポリヌクレオチド又はその断片である、請求項14又は15に記載のデバイス:
(f)(33)配列番号1〜6、8〜104、105〜122、464〜473、及び492〜494のいずれかで表される塩基配列もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列からなるポリヌクレオチド、又は15以上の連続した塩基を含むその断片、
(34)(33)の前記ポリヌクレオチド又は前記断片の塩基配列において1又は2の塩基の欠失、置換、付加又は挿入を含む、ポリヌクレオチド又はその断片、
(35)(33)の前記ポリヌクレオチド又は前記断片の塩基配列と90%以上の%同一性を示すポリヌクレオチド又はその断片、又は
(36)修飾核酸及び/又は修飾ヌクレオチドを含む、(33)〜(35)のいずれかのポリヌクレオチド又はその断片、
(g)配列番号1〜6、8〜104、105〜122、464〜473、及び492〜494のいずれかで表される塩基配列を含むポリヌクレオチド、又は15以上の連続した塩基を含むその断片、
(h)(37)配列番号1〜6、8〜104、105〜122、464〜473、及び492〜494のいずれかで表される塩基配列もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列に相補的な塩基配列からなるポリヌクレオチド、又は15以上の連続した塩基を含むその断片、
(38)(37)の前記ポリヌクレオチド又は前記断片の塩基配列において1又は2の塩基の欠失、置換、付加又は挿入を含む、ポリヌクレオチド又はその断片、
(39)(37)の前記ポリヌクレオチド又は前記断片の塩基配列と90%以上の%同一性を示すポリヌクレオチド又はその断片、又は
(40)修飾核酸及び/又は修飾ヌクレオチドを含む、(37)〜(39)のいずれかのポリヌクレオチド又はその断片、
(i)配列番号1〜6、8〜104、105〜122、464〜473、及び492〜494のいずれかで表される塩基配列もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列に相補的な塩基配列を含むポリヌクレオチド、又は15以上の連続した塩基を含むその断片、及び
(j)前記(f)〜(i)のいずれかのポリヌクレオチド又はその断片と高ストリンジェントな条件でハイブリダイズするポリヌクレオチド。 - 前記デバイスが、別の膵臓がんマーカーである、miR−4417、miR−4707−5p、miR−7847−3p、miR−2861、miR−4513、miR−7111−5p、miR−6777−5p、miR−7113−3p、miR−4648、miR−3184−5p、miR−4271、miR−6791−5p、miR−642a−3p、miR−7108−5p、miR−128−1−5p、miR−5196−5p、miR−3178、miR−3656、miR−92a−2−5p、miR−6769b−5p、miR−4689、miR−6076、miR−92b−5p、miR−6774−5p、miR−486−3p、miR−6806−5p、miR−6842−5p、miR−6716−5p、miR−557、miR−4673、miR−4674、miR−4442、miR−1915−3p、miR−4687−3p及びmiR−92b−3p、或いはそれらの前駆体からなる群から選択される少なくとも1つ以上のポリヌクレオチドと特異的に結合可能な核酸をさらに含む、請求項11〜16のいずれか1項に記載のデバイス。
- miR−4417がhsa−miR−4417であり、miR−4707−5pがhsa−miR−4707−5pであり、miR−7847−3pがhsa−miR−7847−3pであり、miR−2861がhsa−miR−2861であり、miR−4513がhsa−miR−4513であり、miR−7111−5pがhsa−miR−7111−5pであり、miR−6777−5pがhsa−miR−6777−5pであり、miR−7113−3pがhsa−miR−7113−3pであり、miR−4648がhsa−miR−4648であり、miR−3184−5pがhsa−miR−3184−5pであり、miR−4271がhsa−miR−4271であり、miR−6791−5pがhsa−miR−6791−5pであり、miR−642a−3pがhsa−miR−642a−3pであり、miR−7108−5pがhsa−miR−7108−5pであり、miR−128−1−5pがhsa−miR−128−1−5pであり、miR−5196−5pがhsa−miR−5196−5pであり、miR−3178がhsa−miR−3178であり、miR−3656がhsa−miR−3656であり、miR−92a−2−5pがhsa−miR−92a−2−5pであり、miR−6769b−5pがhsa−miR−6769b−5pであり、miR−4689がhsa−miR−4689であり、miR−6076がhsa−miR−6076であり、miR−92b−5pがhsa−miR−92b−5pであり、miR−6774−5pがhsa−miR−6774−5pであり、miR−486−3pがhsa−miR−486−3pであり、miR−6806−5pがhsa−miR−6806−5pであり、miR−6842−5pがhsa−miR−6842−5pであり、miR−6716−5pがhsa−miR−6716−5pであり、miR−557がhsa−miR−557であり、miR−4673がhsa−miR−4673であり、miR−4674がhsa−miR−4674であり、miR−4442がhsa−miR−4442であり、miR−1915−3pがhsa−miR−1915−3pであり、miR−4687−3pがhsa−miR−4687−3pであり、及び、miR−92b−3pがhsa−miR−92b−3pである、請求項17に記載のデバイス。
- 前記核酸が、下記の(k)〜(o)に示すポリヌクレオチド又はその断片からなる群から選択される少なくとも1つのポリヌクレオチド又はその断片である、請求項17又は18に記載のデバイス:
(k)(41)配列番号349〜383のいずれかで表される塩基配列もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列からなるポリヌクレオチド、又は15以上の連続した塩基を含むその断片、
(42)(41)の前記ポリヌクレオチド又は前記断片の塩基配列において1又は2の塩基の欠失、置換、付加又は挿入を含む、ポリヌクレオチド又はその断片、
(43)(41)の前記ポリヌクレオチド又は前記断片の塩基配列と90%以上の%同一性を示すポリヌクレオチド又はその断片、又は
(44)修飾核酸及び/又は修飾ヌクレオチドを含む、(41)〜(43)のいずれかのポリヌクレオチド又はその断片、
(l)配列番号349〜383のいずれかで表される塩基配列を含むポリヌクレオチド、又は15以上の連続した塩基を含むその断片、
(m)(45)配列番号349〜383のいずれかで表される塩基配列もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列に相補的な塩基配列からなるポリヌクレオチド、又は15以上の連続した塩基を含むその断片、
(46)(45)の前記ポリヌクレオチド又は前記断片の塩基配列において1又は2の塩基の欠失、置換、付加又は挿入を含む、ポリヌクレオチド又はその断片、
(47)(45)の前記ポリヌクレオチド又は前記断片の塩基配列と90%以上の%同一性を示すポリヌクレオチド又はその断片、又は
(48)修飾核酸及び/又は修飾ヌクレオチドを含む、(45)〜(47)のいずれかのポリヌクレオチド又はその断片、
(n)配列番号349〜383のいずれかで表される塩基配列もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列に相補的な塩基配列を含むポリヌクレオチド、又は15以上の連続した塩基を含むその断片、及び
(o)前記(k)〜(n)のいずれかのポリヌクレオチド又はその断片と高ストリンジェントな条件でハイブリダイズするポリヌクレオチド。 - 前記デバイスが、ハイブリダイゼーション技術による測定のためのデバイスである、請求項11〜19のいずれか1項に記載のデバイス。
- 前記ハイブリダイゼーション技術が、核酸アレイ技術である、請求項20に記載のデバイス。
- 前記デバイスが、膵臓がんマーカーである、miR−6893−5p、miR−6075、miR−6820−5p、miR−4294、miR−6729−5p、miR−4476、miR−6765−3p、miR−6799−5p、miR−4530、miR−7641、miR−4454、miR−615−5p、miR−8073、miR−663a、miR−4634、miR−4450、miR−4792、miR−665、miR−7975、miR−7109−5p、miR−6789−5p、miR−4497、miR−6877−5p、miR−6880−5p、miR−7977、miR−4734、miR−6821−5p、miR−8089、miR−5585−3p、miR−6085、miR−6845−5p、miR−4651、miR−4433−3p、miR−1231、miR−4665−5p、miR−7114−5p、miR−1238−5p、miR−8069、miR−4732−5p、miR−619−5p、miR−3622a−5p、miR−1260a、miR−6741−5p、miR−6781−5p、miR−6125、miR−6805−5p、miR−6132、miR−6872−3p、miR−6875−5p、miR−1908−3p、miR−4433b−3p、miR−4736、miR−5100、miR−6724−5p、miR−7107−5p、miR−6726−5p、miR−3185、miR−4638−5p、miR−1273g−3p、miR−6778−5p、miR−328−5p、miR−3679−3p、miR−1228−3p、miR−6779−5p、miR−4723−5p、miR−6850−5p、miR−760、miR−7704、miR−8072、miR−4486、miR−1913、miR−4656、miR−1260b、miR−7106−5p、miR−6889−5p、miR−6780b−5p、miR−6090、miR−4534、miR−4449、miR−5195−3p、miR−1202、miR−4467、miR−6515−3p、miR−4281、miR−4505、miR−4484、miR−6805−3p、miR−3135b、miR−3162−5p、miR−6768−5p、miR−6721−5p、miR−1227−5p、miR−6722−3p、miR−4286、miR−4746−3p、miR−6727−5p、miR−6816−5p、miR−4741、miR−4508、miR−940、miR−4327、miR−4665−3p、miR−718、miR−1203、miR−663b、miR−4258、miR−4649−5p、miR−4516、miR−3619−3p、miR−6826−5p、miR−6757−5p、miR−3131、miR−1343−3p、miR−6775−5p、miR−6813−5p及びmiR−3940−5p、或いはそれらの前駆体から選択される少なくとも1つ以上のポリヌクレオチド、並びにmiR−6836−3pのポリヌクレオチド又はその前駆体のそれぞれと特異的に結合可能な少なくとも2つ以上の核酸を含む、請求項11〜21のいずれか1項に記載のデバイス。
- 請求項1〜10のいずれか1項に記載のキット又は請求項11〜22のいずれか1項に記載のデバイスを用いて、被験体の検体における標的核酸の発現量を測定し、該測定された発現量と、同様に測定された健常体の対照発現量とを用いて、被験体が膵臓がんに罹患していること、又は膵臓がんに罹患していないことをin vitroで評価することを含む、膵臓がんの検出を補助する方法。
- 前記被験体が、ヒトである、請求項23に記載の方法。
- 前記検体が、血液、血清又は血漿である、請求項23又は24に記載の方法。
- miR−6836−3pのポリヌクレオチドの、膵臓がん検出のための膵臓がんマーカーとしての使用。
- 前記miR−6836−3pのポリヌクレオチドが、以下の(a)及び(b)のいずれかに示すポリヌクレオチドからなる群から選択される少なくとも1つである、請求項26に記載の使用:
(a)配列番号7で表される塩基配列又は当該塩基配列においてuがtである塩基配列からなるポリヌクレオチド、
(b)配列番号7で表される塩基配列又は当該塩基配列においてuがtである塩基配列を含むポリヌクレオチド。 - miR−6893−5p、miR−6075、miR−6820−5p、miR−4294、miR−6729−5p、miR−4476、miR−6765−3p、miR−6799−5p、miR−4530、miR−7641、miR−4454、miR−615−5p、miR−8073、miR−663a、miR−4634、miR−4450、miR−4792、miR−665、miR−7975、miR−7109−5p、miR−6789−5p、miR−4497、miR−6877−5p、miR−6880−5p、miR−7977、miR−4734、miR−6821−5p、miR−8089、miR−5585−3p、miR−6085、miR−6845−5p、miR−4651、miR−4433−3p、miR−1231、miR−4665−5p、miR−7114−5p、miR−1238−5p、miR−8069、miR−4732−5p、miR−619−5p、miR−3622a−5p、miR−1260a、miR−6741−5p、miR−6781−5p、miR−6125、miR−6805−5p、miR−6132、miR−6872−3p、miR−6875−5p、miR−1908−3p、miR−4433b−3p、miR−4736、miR−5100、miR−6724−5p、miR−7107−5p、miR−6726−5p、miR−3185、miR−4638−5p、miR−1273g−3p、miR−6778−5p、miR−328−5p、miR−3679−3p、miR−1228−3p、miR−6779−5p、miR−4723−5p、miR−6850−5p、miR−760、miR−7704、miR−8072、miR−4486、miR−1913、miR−4656、miR−1260b、miR−7106−5p、miR−6889−5p、miR−6780b−5p、miR−6090、miR−4534、miR−4449、miR−5195−3p、miR−1202、miR−4467、miR−6515−3p、miR−4281、miR−4505、miR−4484、miR−6805−3p、miR−3135b、miR−3162−5p、miR−6768−5p、miR−6721−5p、miR−1227−5p、miR−6722−3p、miR−4286、miR−4746−3p、miR−6727−5p、miR−6816−5p、miR−4741、miR−4508、miR−940、miR−4327、miR−4665−3p、miR−718、miR−1203、miR−663b、miR−4258、miR−4649−5p、miR−4516、miR−3619−3p、miR−6826−5p、miR−6757−5p、miR−3131、miR−1343−3p、miR−6775−5p、miR−6813−5p及びmiR−3940−5p、並びに/又は、miR−125a−3p、miR−204−3p、miR−1469、miR−575、miR−150−3p、miR−423−5p、miR−564、miR−3188、miR−1246、miR−602、miR−1290、miR−16−5p、miR−451a、miR−24−3p、miR−187−5p、miR−1908−5p、miR−371a−5p及びmiR−550a−5pからなる群から選択される少なくとも1つのポリヌクレオチドが、前記miR−6836−3pのポリヌクレオチドと組み合わせて、膵臓がん検出のための膵臓がんマーカーとして使用される、請求項26又は27に記載の使用。
- 前記の少なくとも1つのポリヌクレオチドが、以下の(f)及び(g):
(f)配列番号1〜6、8〜104、105〜122、464〜473、及び492〜494のいずれかで表される塩基配列又は当該塩基配列においてuがtである塩基配列からなるポリヌクレオチド、
(g)配列番号1〜6、8〜104、105〜122、464〜473、及び492〜494のいずれかで表される塩基配列又は当該塩基配列においてuがtである塩基配列を含むポリヌクレオチド、
のポリヌクレオチドからなる群から選択される少なくとも1つのポリヌクレオチドである、請求項28に記載の使用。 - miR−4417、miR−4707−5p、miR−7847−3p、miR−2861、miR−4513、miR−7111−5p、miR−6777−5p、miR−7113−3p、miR−4648、miR−3184−5p、miR−4271、miR−6791−5p、miR−642a−3p、miR−7108−5p、miR−128−1−5p、miR−5196−5p、miR−3178、miR−3656、miR−92a−2−5p、miR−6769b−5p、miR−4689、miR−6076、miR−92b−5p、miR−6774−5p、miR−486−3p、miR−6806−5p、miR−6842−5p、miR−6716−5p、miR−557、miR−4673、miR−4674、miR−4442、miR−1915−3p、miR−4687−3p及びmiR−92b−3pからなる群から選択される少なくとも1つのポリヌクレオチドがさらに膵臓がん検出のための膵臓がんマーカーとして使用される、請求項26〜29のいずれか1項に記載の使用。
- 前記ポリヌクレオチドが、以下の(k)及び(l):
(k)配列番号349〜383のいずれかで表される塩基配列又は当該塩基配列においてuがtである塩基配列からなるポリヌクレオチド、
(l)配列番号349〜383のいずれかで表される塩基配列又は当該塩基配列においてuがtである塩基配列を含むポリヌクレオチド、
のポリヌクレオチドからなる群から選択される少なくとも1つのポリヌクレオチドである、請求項30に記載の使用。
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