JP6667856B2 - 糖タンパク質の糖鎖遊離法 - Google Patents
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[1]糖タンパク質から糖鎖を遊離させる方法であって、前記糖タンパク質に、(a)ヒドロキシルアミン類と、(b)塩基性試薬とを含む反応液を接触させて、前記糖タンパク質から遊離した糖鎖と前記反応液との混合液を得る工程を含み、前記(a)ヒドロキシルアミン類は、ヒドロキシルアミン、ヒドロキシルアミンの塩、O置換ヒドロキシルアミン及びO置換ヒドロキシルアミンの塩からなる群より選択される少なくとも一つの化合物であり、前記(b)塩基性試薬は、アルカリ金属の水酸化物、アルカリ金属の弱酸塩、アルカリ土類金属の水酸化物、アンモニア水溶液に溶解したアルカリ土類金属の塩及び有機塩基からなる群より選択される少なくとも一つである方法。
[2]前記反応液が前記(a)ヒドロキシルアミン類を2〜70%(w/w)含む、[1]に記載の方法。
[3]前記反応液が(c)アミン類を更に含み、前記(c)アミン類は、アンモニア水、メチルアミン水溶液、ジメチルアミン水溶液、エチルアミン、ジエチルアミン、エタノールアミン、エチレンジアミン、ブチルアミン、モルホリン、DABCO、アントラニル酸からなる群より選択される少なくとも一つの化合物である、[1]又は[2]に記載の方法。
[4]前記糖タンパク質から遊離した糖鎖が糖鎖オキシムを含む、[1]〜[3]のいずれかに記載の方法。
[5]前記糖タンパク質に前記反応液を接触させる工程において、前記反応液のpHが、8〜14の範囲内である、[1]〜[4]のいずれかに記載の方法。
[6]前記アルカリ金属の水酸化物が、水酸化リチウム、水酸化ナトリウム又は水酸化カリウムであり、前記アルカリ金属の弱酸塩が、重炭酸ナトリウム又は炭酸ナトリウムであり、前記アルカリ土類金属の水酸化物が、水酸化カルシウム、水酸化バリウム又は水酸化ストロンチウムであり、前記アルカリ土類金属の塩が、酢酸カルシウム、塩化カルシウム、酢酸バリウム又は酢酸マグネシウムであり、前記有機塩基が、1,8−ジアザビシクロ[5.4.0]ウンデカ−7−エン、1,5,7−トリアザビシクロ[4.4.0]デカ−5−エン、7−メチル−1,5,7−トリアザビシクロ[4.4.0]デカ−5−エン、1,1,3,3−テトラメチルグアニジン、2−tert−ブチル−1,1,3,3−テトラメチルグアニジン又はセチルトリメチルアンモニウムヒドロキシドである、[1]〜[5]のいずれかに記載の方法。
[7]前記混合液にケトン、アルデヒド又は酸無水物を添加し、前記混合液中に残存する(a)ヒドロキシルアミン類をケトキシム、アルドキシム又はアミドに変換する工程と、前記混合液を、糖鎖に親和性を有する固相と接触させて、前記固相に前記糖タンパク質から遊離した糖鎖を吸着させる工程と、前記固相から前記糖鎖を溶出させる工程と、を更に含む、[1]〜[6]のいずれかに記載の方法。
[8]糖タンパク質が有する糖鎖の分析方法であって、[1]〜[7]のいずれかに記載の方法により糖タンパク質から糖鎖を遊離する工程と、遊離した糖鎖を標識する工程であって、糖鎖オキシムの標識を含む工程と、を含む、糖鎖の分析方法。
[9]糖タンパク質から糖鎖を遊離するためのキットであって、(a)ヒドロキシルアミン類と(b)塩基性試薬とを含み、前記(a)ヒドロキシルアミン類は、ヒドロキシルアミン、ヒドロキシルアミンの塩、O置換ヒドロキシルアミン及びO置換ヒドロキシルアミンの塩からなる群より選択される少なくとも一つの化合物であり、前記(b)塩基性試薬は、アルカリ金属の水酸化物、アルカリ金属の弱酸塩、アルカリ土類金属の水酸化物、アンモニア水溶液に溶解したアルカリ土類金属の塩及び有機塩基からなる群より選択される少なくとも一つであり、[1]〜[7]のいずれかに記載の方法を行うための説明書を更に含む、キット。
[10](c)アミン類を更に含み、前記(c)アミン類は、アンモニア水、メチルアミン水溶液、ジメチルアミン水溶液、エチルアミン、ジエチルアミン、エタノールアミン、エチレンジアミン、ブチルアミン、モルホリン、DABCO及びアントラニル酸からなる群より選択される少なくとも一つの化合物である、[9]に記載のキット。
[11]ケトン、アルデヒド又は酸無水物と、糖鎖に親和性を有する固相とを更に含む、[9]又は[10]に記載のキット。
[12]糖タンパク質から糖鎖を遊離するためのキットであって、(a)ヒドロキシルアミン類と併用して使用するための(b)塩基性試薬と(c)アミン類とを含み、前記(a)ヒドロキシルアミン類は、ヒドロキシルアミン、ヒドロキシルアミンの塩、O置換ヒドロキシルアミン及びO置換ヒドロキシルアミンの塩からなる群より選択される少なくとも一つの化合物であり、前記(b)塩基性試薬は、アルカリ金属の水酸化物、アルカリ金属の弱酸塩、アルカリ土類金属の水酸化物、アンモニア水溶液に溶解したアルカリ土類金属の塩及び有機塩基からなる群より選択される少なくとも一つであり、前記(c)アミン類は、アンモニア水、メチルアミン水溶液、ジメチルアミン水溶液、エチルアミン、ジエチルアミン、エタノールアミン、エチレンジアミン、ブチルアミン、モルホリン、DABCO及びアントラニル酸からなる群より選択される少なくとも一つの化合物であるキット。
[13]ケトン、アルデヒド又は酸無水物と、糖鎖に親和性を有する固相とを更に含む、[12]に記載のキット。
[14][1]〜[7]のいずれか一項に記載の方法を行うための説明書を更に含む、[12]又は[13]に記載のキット。
[15]糖タンパク質を含む試料が収容される容器を保持する容器保持部と、前記容器に試薬を導入する試薬導入部と、を備え、前記試薬導入部が、前記容器に(a)ヒドロキシルアミン類と、(b)塩基性試薬とを含む反応液を導入する反応液導入部を含む、糖タンパク質から糖鎖を遊離させる装置であって、前記(a)ヒドロキシルアミン類は、ヒドロキシルアミン、ヒドロキシルアミンの塩、O置換ヒドロキシルアミン及びO置換ヒドロキシルアミンの塩からなる群より選択される少なくとも一つの化合物であり、前記(b)塩基性試薬は、アルカリ金属の水酸化物、アルカリ金属の弱酸塩、アルカリ土類金属の水酸化物、アンモニア水溶液に溶解したアルカリ土類金属の塩及び有機塩基からなる群より選択される少なくとも一つである装置。
[16]前記試薬導入部が、前記容器にケトンを導入するケトン導入部、アルデヒドを導入するアルデヒド導入部又は酸無水物を導入する酸無水物導入部を更に含む、[15]に記載の装置。
[17]糖鎖に親和性を有する固相を含む容器を保持する固相保持部を更に備える、[15]又は[16]に記載の装置。
〔1〕糖タンパク質から糖鎖を遊離させる方法であって、
前記糖タンパク質に、(a)ヒドロキシルアミン類と、(b)塩基性試薬とを含む反応液を接触させる工程であって、前記(a)ヒドロキシルアミン類が、2〜50%(w/w)で反応液中に含まれる工程、を含む方法に関する。
ここで、本発明の糖タンパク質から糖鎖を遊離させる方法は、一実施の形態において、〔2〕上記〔1〕に記載の方法であって、
前記反応液がさらに(c)アミン類を含むことを特徴とする。
また、本発明の糖タンパク質から糖鎖を遊離させる方法は、一実施の形態において、〔3〕上記〔1〕または〔2〕に記載の方法であって、
前記糖タンパク質から遊離した糖鎖が糖鎖オキシムを含むことを特徴とする。
また、本発明の糖タンパク質から糖鎖を遊離させる方法は、一実施の形態において、〔4〕上記〔1〕〜〔3〕のいずれかに記載の方法であって、
前記糖タンパク質に前記反応液を接触させる工程において、前記反応液のpHが、8〜14の範囲内であることを特徴とする。
また、本発明の糖タンパク質から糖鎖を遊離させる方法は、一実施の形態において、
〔5〕上記〔1〕〜〔4〕のいずれかに記載の方法であって、
前記(a)ヒドロキシルアミン類が、ヒドロキシルアミンおよびその塩類、ならびに、O置換ヒドロキシルアミンおよびその塩類からなる群より選択される少なくとも一つの化合物であることを特徴とする。
また、本発明の糖タンパク質から糖鎖を遊離させる方法は、一実施の形態において、
〔6〕上記〔1〕〜〔5〕のいずれかに記載の方法であって、
前記(b)塩基性試薬が、アルカリ金属水酸化物、アルカリ金属弱酸塩、アルカリ土類水酸化物、アンモニア水溶液に溶解したアルカリ土類の塩、および、有機塩基からなる群より選択される少なくとも一つであることを特徴とする。
また、本発明の糖タンパク質から糖鎖を遊離させる方法は、一実施の形態において、〔7〕上記〔6〕に記載の方法であって、
前記アルカリ金属水酸化物、アルカリ金属弱酸塩、または、アルカリ土類水酸化物が、水酸化リチウム、水酸化ナトリウム、水酸化カリウム、重炭酸ナトリウム、炭酸ナトリウム、水酸化カルシウム、水酸化バリウム、水酸化ストロンチウム、からなる群より選択される少なくとも一つであり、
前記アンモニア水溶液に溶解したアルカリ土類の塩が、酢酸カルシウム、塩化カルシウム、酢酸バリウム、酢酸マグネシウムからなる群より選択される少なくとも一つであることを特徴とする。
また、本発明の糖タンパク質から糖鎖を遊離させる方法は、一実施の形態において、〔8〕上記〔6〕に記載の方法であって、
前記有機塩基が、1,8−ジアザビシクロ[5.4.0]ウンデカ−7−エン、1,5,7−トリアザビシクロ[4.4.0]デカ−5−エン、7−メチル−1,5,7−トリアザビシクロ[4.4.0]デカ−5−エン、1,1,3,3−テトラメチルグアニジン、2−tert−ブチル−1,1,3,3−テトラメチルグアニジン、セチルトリメチルアンモニウムヒドロキシドからなる群より選択される少なくとも一つであることを特徴とする。
また、本発明の糖タンパク質から糖鎖を遊離させる方法は、一実施の形態において、
〔9〕上記〔1〕〜〔6〕のいずれかに記載の方法であって、
前記(c)アミン類が、アンモニア、メチルアミン、ジメチルアミン、エチルアミン、ジエチルアミン、エタノールアミン、エチレンジアミン、ブチルアミン、モルホリン、DABCO、アントラニル酸からなる群より選択される少なくとも一つの化合物であることを特徴とする。
また、本発明は、別の態様において、
〔10〕糖タンパク質が有する糖鎖の分析方法であって、
請求項1〜9のいずれか一項に記載の方法により糖タンパク質から糖鎖を遊離する工程と、
遊離した糖鎖を標識する工程であって、糖鎖オキシムの標識を含む工程と
を含む、糖鎖の分析方法に関する。
また、本発明は、別の態様において、
〔11〕糖タンパク質から糖鎖を遊離するためのキットであって、
(a)ヒドロキシルアミン類と(b)塩基性試薬とを含むキット。
また、本発明の糖タンパク質から糖鎖を遊離するためのキットは、一実施の形態において、
〔12〕上記〔11〕に記載のキットであって、
(a)アミン類をさらに含むことを特徴とする。
また、本発明の糖タンパク質から糖鎖を遊離するためのキットは、一実施の形態において、
〔13〕糖タンパク質から糖鎖を遊離するためのキットであって、
(a)ヒドロキシルアミン類と併用して使用するための(b)塩基性試薬と(c)アミン類とを含むキットであることを特徴とする。
一実施形態において、本発明は、糖タンパク質から糖鎖を遊離させる方法であって、前記糖タンパク質に、(a)ヒドロキシルアミン類と、(b)塩基性試薬とを含む反応液を接触させて、前記糖タンパク質から遊離した糖鎖と前記反応液との混合液を得る工程を含む方法を提供する。糖タンパク質を、(a)ヒドロキシルアミン類と、(b)塩基性試薬とを含む反応液と接触させることにより、当該糖タンパク質から糖鎖を遊離することができる。
一実施形態において、本発明は、糖タンパク質が有する糖鎖の分析方法であって、上述した方法により糖タンパク質から糖鎖を遊離する工程と、遊離した糖鎖を標識する工程と、を含む、糖鎖の分析方法を提供する。
一実施形態において、本発明は、糖タンパク質から糖鎖を遊離するためのキットであって、(a)ヒドロキシルアミン類と(b)塩基性試薬とを含むキットを提供する。また、本実施形態のキットは、一形態の形態において、(a)ヒドロキシルアミン類と(b)塩基性試薬とに加えて、さらに(c)アミン類を含むキットである。また、本実施形態の糖タンパク質から糖鎖を遊離するためのキットは、別の一実施形態において、(a)ヒドロキシルアミン類と併用して使用するための(b)塩基性試薬と(c)アミン類とを含むキットである。
一実施形態において本発明は、糖タンパク質を含む試料が収容される容器を保持する容器保持部と、前記容器に試薬を導入する試薬導入部と、を備え、前記試薬導入部が、前記容器に(a)ヒドロキシルアミン類と、(b)塩基性試薬とを含む反応液を導入する反応液導入部を含む、糖タンパク質から糖鎖を遊離させる装置を提供する。なお、以下に説明する装置の構成はあくまで一例であり、本実施形態の装置はこの構成に拘束されるものではない。
<モノクローナル抗体(IgG1)の糖鎖分析>
(N結合型糖鎖遊離反応)
モノクローナル抗体(IgG1、40μg)を酢酸カルシウムで飽和させた25%アンモニア水溶液30μLに溶解し、50%ヒドロキシルアミン水溶液を20μLを添加して混合した後、ドラフト中、ヒートブロックを用いて80℃にて1時間加熱した。その後、直ちに氷浴中で冷却し1N塩酸で反応液を中和した。
グラファイトカーボンを充填した固相抽出カートリッジ(HyperSep Hypercarb 25mg、サーモサイエンティフィック社製)を用いて中和した反応液を脱塩し、続いてピコリンボランと2−アミノベンズアミドを用いて糖鎖を蛍光標識した。蛍光標識糖鎖はSephadex G−15(GEヘルスケア社製)で精製した後、HPLCにて分析した。図1にそのクロマトグラムを示した。図1中、横軸は溶出時間を示し、縦軸は蛍光強度(相対値)を示す。
従来の方法と比較するため酵素(PNGaseF)を用いて糖鎖遊離反応を行った。モノクローナル抗体(IgG1、40μg)を100mMジチオスレイトールと0.5%SDSを含む500mMトリス塩酸緩衝液(pH8.6)40μLに溶解し、80℃で10分間加熱した。その後、室温まで冷却した後、5%Nonidet P−40(40μL)と蒸留水15μLを加え、さらにPNGaseFを5μL(16mU、Takara bio Inc.)添加し37℃にて16時間インキュベートした。その後、直ちに氷浴中で冷却し1N塩酸で反応液を中和した。その後、固相抽出カートリッジSepPak C18(50mg、Waters Corp.)に供し、蒸留水で洗浄した。濾液と洗浄液を合わせて、実施例1に記載した方法により固相抽出カートリッジ(HyperSep Hypercarb 25mg)にて脱塩処理、2−アミノベンズアミドによる蛍光標識、Sephadex G−15(GEヘルスケア社製)による精製を経てHPLCに供した。図2にそのクロマトグラムを示した。図2中、横軸は溶出時間を示し、縦軸は蛍光強度(相対値)を示す。図1および図2に示すように、本実施例の方法により、従来法と同様のクロマトグラムが得られることが明らかとなった。
<ヒト血清由来IgGの糖鎖分析>
(N結合型糖鎖遊離反応)
ヒト血清由来IgG(200μg)の水溶液20μLをサンプルチューブに入れ、そのチューブに50%ヒドロキシルアミン水溶液を10μL添加し、次いで25%アンモニア水溶液の25μLと5μLの1.2M水酸化リチウムとを加えて混合した後、ドラフト中、ヒートブロックを用いて50℃、1時間加熱した。その後、直ちに氷浴中で冷却し1N塩酸で反応液を中和した。
実施例1と同様の方法により、反応液を脱塩後、糖鎖を蛍光標識してHPLCにて分析した。図3にそのクロマトグラムを示した。図3中、横軸は溶出時間を示し、縦軸は蛍光強度(相対値)を示す。その結果、これまでに報告されている、ヒト血清由来IgGから遊離させた糖鎖の分析結果と同様の結果が得られた。
<ウシフェツインの糖鎖分析>
(O結合型糖鎖遊離反応)
ウシフェツイン(20μg)を蒸留水38.5μLに溶解し、50%ヒドロキシルアミン10μLとジアザビシクロウンデセン1.5μLを添加し混合した後、ドラフト中、ヒートブロックを用いて60℃にて5分間加熱した。その後、直ちに氷浴中で冷却し1N塩酸で反応液を中和した。
実施例1と同様の方法により、反応液を脱塩後、糖鎖を蛍光標識してHPLCにて分析した。図4にそのクロマトグラムを示した。図4中、横軸は溶出時間を示し、縦軸は蛍光強度(相対値)を示す。その結果、これまでに報告されている、ウシフェツインから遊離させた糖鎖の分析結果と同様の結果が得られた。
<ウシアポトランスフェリンの糖鎖分析>
(N結合型糖鎖遊離反応)
ウシアポトランスフェリン(200μg)の水溶液20μLをサンプルチューブに入れ、そのチューブに50%ヒドロキシルアミン水溶液を20μL添加し、次いで1.0M 水酸化リチウムを10μL加えて混合した後、ドラフト中、ヒートブロックを用いて50℃、1時間加熱した。その後、直ちに氷浴中で冷却し1N塩酸で反応液を中和した。
実施例1と同様の方法により、反応液を脱塩後、糖鎖を蛍光標識してHPLCにて分析した。図5にそのクロマトグラムを示した。図5中、横軸は溶出時間を示し、縦軸は蛍光強度(相対値)を示す。その結果、Nグリコリルノイラミン酸を含有する糖鎖も分析できることが明らかとなった。
<セイヨウワサビペルオキシダーゼの糖鎖分析>
(N結合型糖鎖遊離反応)
セイヨウワサビペルオキシダーゼ(200μg)を含む水溶液20μLをサンプルチューブに入れ、そのチューブに50%ヒドロキシルアミン水溶液を20μL添加し、次いで1.0M 水酸化リチウムを10μL加えて混合した後、ドラフト中、ヒートブロックを用いて50℃、1時間加熱した。その後、直ちに氷浴中で冷却し1N塩酸で反応液を中和した。
実施例1と同様の方法により、反応液を脱塩後、糖鎖を蛍光標識してHPLCにて分析した。図6にそのクロマトグラムを示した。図6中、横軸は溶出時間を示し、縦軸は蛍光強度(相対値)を示す。その結果、還元末端のNアセチルグルコサミンの3位にフコースを有するN結合型糖鎖の分析も可能であることが明らかとなった。
<ウシ顎下腺ムチンの糖鎖分析>
(O結合型糖鎖遊離反応)
ウシ顎下腺ムチン(50μg)の水溶液20μLと50%ヒドロキシルアミン20μLとジアザビシクロウンデセン10μLを混合した後、ドラフト中、ヒートブロックを用いて60℃にて5分間加熱した。その後、直ちに氷浴中で冷却し1N塩酸で反応液を中和した。
実施例1と同様の方法により、反応液を脱塩後、糖鎖を蛍光標識してHPLCにて分析した。図7にそのクロマトグラムを示した。図7中、横軸は溶出時間を示し、縦軸は蛍光強度(相対値)を示す。その結果、これまでに報告されているものと同様の結果が得られた。
<各種条件下におけるN結合型糖鎖遊離反応>
(a)ヒドロキシルアミン類、(b)塩基性試薬、および/または、(c)アミン類を含む反応液について、試薬の種類や濃度、温度条件、反応時間などの各種条件を変更した各種試験を行った。各試験例の条件および収量を表1A及び表1Bに示す。なお、試験例1〜6において、糖タンパク質はhuman serum IgG 200μgを用い、試験例7〜80においては、モノクローナル抗体M−L001 40μgを用いた。また、各試薬の濃度は終濃度を示し、収量は、HPLCにおける全糖鎖ピークの面積値の合計を表す。また、結果の「A」はPNGaseFを用いた従来法とほぼ同等の結果が得られたことを示し、「B」はPNGaseFを用いた従来法に比べて収量が半分以下の結果が得られたことを示し、「C」は本来の糖鎖に加えて分解した糖鎖のピークが検出された結果を示し、「D」は糖鎖がほとんど分析できなかったことを示す。
(2)試験例4〜6では、塩基性試薬としてアルカリ土類金属のカルシウム塩または水酸化カルシウムの使用を比較した。その結果、いずれのカルシウム化合物も良好な結果を得ることができ、特に、水酸化カルシウムが最も収量が高かった。なお、水酸化リチウムと比較すると、収量自体は下がっていたが、分解反応の一種である異性化(エピメリゼーション)を抑制することができていた。
(3)試験例8〜14では、ヒドロキシルアミン類の濃度条件を変更して比較を行った。その結果、ヒドロキシルアミンは、0.5%、150mMでは効果を得ることができなかった。一方で、2%、600mMから遊離された糖鎖の安定化の効果を得ることができた。
(4)試験例15〜20では、反応時間の条件を変更して比較を行った。その結果、アンモニアと酢酸カルシウムを用いた80℃の条件下においては、反応時間が2時間程度において、最も好ましい結果が得られたが、2時間を超えると遊離した糖鎖の分解が進行することがわかった。
(5)試験例21〜26では、塩基性試薬(アルカリ触媒)を変更して比較を行った。その結果、弱アルカリでも糖鎖の遊離を行うことができ、各塩基性試薬において好ましい収量および結果を得ることができた。
(6)試験例27〜32では、塩基性試薬のうち各種のアンモニア水に溶解したアルカリ土類金属の塩または水酸化物を用い、比較を行った。その結果、酢酸マグネシウム以外は良好な結果を得ることができた。
(7)試験例33〜38では、アミンを変更して比較を行った。その結果、メチルアミン、ジメチルアミンは、収量が増加する一方で、異性化やアミドの分解(デアミデーション)が促進した。エチレンジアミン、および、エタノールアミンの使用は、異性化を抑制しつつ、収量を増加させることができた。
(8)試験例39〜42では、低pKaを有する各種アミンを用い、比較を行った。その結果、DABCOおよびモルホリンにおいては、良好な収量および結果をえることができた。特に、DABCOは、デアミデーションが全く見られなかった。
(9)試験例43〜48では、KOHの濃度を変更(2mM〜2M)して比較を行った。その結果、KOHの濃度が高い方が好ましい結果を得ることができた。
(10)試験例49、50では、塩基性試薬としてのDBUを用い、水酸化リチウムと比較した。その結果、DBUを用いた方が、水酸化リチウムよりも好ましい収量を得ることができた。
(11)試験例51〜54では、DBU存在下におけるヒドロキシルアミン類の濃度を変更して比較を行った。その結果、ヒドロキシルアミンの濃度が少なくとも10%となるまでは濃度依存的に好ましい収量および結果を得ることができた。
(12)試験例55〜57では、DBU存在下、50℃における反応時間(60分〜240分)の変更について比較した。その結果、1時間が最も好ましく、1時間以上の反応時間では、反応時間が伸びるほど、収量および結果が悪くなった。
(13)試験例58〜61では、室温における反応時間について比較した。その結果、室温では反応速度が低く、酵素を用いた反応の半量程度の収量をえるのに16時間を要した。
(14)試験例62、63では、ヒドロキシルアミン類として、ヒドロキシルアミン塩酸塩の使用についてDMSO中で比較、検討した(表中には、DMSOの表示なし)。その結果、DMSOを溶媒とした場合にはほとんど反応が進行しないことが判明した。
(15)試験例64〜67では、DBU以外の各種有機塩基の使用について比較した。その結果、DBUとアンモニアとの組み合わせ以外は、いずれも非常に良好な収量および結果を得られた。
(16)試験例68〜71では、DBUの濃度の変更について比較した。その結果、DBUは、濃度が高い方が好ましい収量および結果を得ることができた。具体的には、100mM以上のDBUを用いることで優れた効果を得ることができた。
(17)試験例72〜75では、DBU以外の各種有機塩基の使用について比較した。その結果、Proton spongeでは、好ましい収量を得ることができなかった。Proton sponge以外の有機塩基では、好ましい収量および結果を得ることができた。
(18)試験例76〜79では、アミン類非存在下におけるDBUの濃度の変更について比較した。その結果、100mM以上のDBUを用いることで優れた効果を得ることができた。
(19)試験例80では、4%セチルトリメチルアンモニウム水酸化物を検討した。その結果、良好な収量および結果を得ることができた。
<各種条件下におけるO結合型糖鎖遊離反応>
(a)ヒドロキシルアミン類、(b)塩基性試薬、および/または、(c)アミン類を含む反応液について、試薬の種類や濃度、温度条件、反応時間などの各種条件を変更した各種試験を行った。各試験例の条件および収量を表2A及び表2Bに示す。なお、試験例1〜52においては、糖タンパク質としてウシフェツイン20μgを用いた。また、各試薬の濃度は終濃度を示し、収量は、HPLCにおける全糖鎖ピークの面積値の合計を表す。また、結果の「A」は糖鎖収量が2000以上で、かつピーリング産物が20%以下であったことを示し、「B」はピーリング産物が20%以上または糖鎖収量が1000以上2000以下であったことを示し、「C」は糖鎖収量が200以上1000以下であったことを示し、「D」は糖鎖収量が200以下であったことを示す。
(2)試験例5、6は、塩基なしまたはアンモニアよりも弱い塩基を用いて比較を行った。その結果、アンモニアよりも強い塩基性が糖鎖の遊離には必要不可欠であることがわかった。
(3)試験例7〜10は、アルカリの強度の違いによる比較を行った。その結果、いずれの試験例でも好ましい結果を得られた。また、強アルカリ条件下とすることで、収量が増加した。
(4)試験例11〜14では、強アルカリ条件下での温度の変化について比較した。その結果、60〜75℃までは、温度の上昇に伴い、収量が増加し、非常に好ましい結果が得られた。一方、90℃でも好ましい結果は得られたが、収量が若干低下し、ピーリングが増加し始めた。
(5)試験例15〜18では、強アルカリ条件下でのアンモニア濃度の変化について比較した。その結果、強アルカリ条件下においては、O結合型糖鎖の遊離にアンモニアの存在は不要であった。
(6)試験例19では、ヒドロキシルアミンの有無の影響について比較した。その結果、ヒドロキシルアミン不存在の条件では、糖鎖のほとんどがピーリングを引き起こしていた。
(7)試験例20〜26では、アントラニル酸存在下で反応時間を変更した際の影響について比較した。また、21〜26では反応液にDMSOを添加している。その結果、アントラニル酸を添加する場合にはDMSOが必要で、試験例の条件において反応時間30分までは、ピーリングを抑えたO結合型糖鎖の遊離を行うことができた。一方、30分以上ではピーリングが生じ、1時間以上では、ピーリングとは異なる分解物が生じていた。
(8)試験例27、28では、LiOHの代わりに、高濃度KOHの使用を検討した。その結果は、高濃度のKOHでは全くO結合型糖鎖を遊離させることができなかった。
(9)試験例29、30では、アルカリ(KOH、NaOH)の検討を行った。その結果、いずれのアルカリも、遊離したO結合型糖鎖としてジシアリル糖鎖が少なく、LiOHの方が好ましい結果を示した。
(10)試験例31、32では、DABCOの効果の検討を行った。その結果、DABCOの添加により収量は減少するものの、ピーリングを抑制することができた。
(11)試験例33、34では、塩基性試薬としてのDBUとLiOHとの比較を行った。その結果、DBUを使用した試験の方が、収量が良く、また、ジシアリル糖鎖の量も相対的に多い結果となった。
(12)試験例35〜38は、200mMDBU、10%ヒドロキシルアミンを用いた際の反応時間の長さについて比較した。その結果、室温でもO結合型糖鎖の遊離反応は時間の経過ごとに進行した。また、4時間の反応後であっても、ピーリングした糖鎖はほとんどなかった。
(13)試験例40〜44では、他の有機塩基の使用を検討した。その結果、TMG、t−ブチルTMG、TBD、MTBDのいずれもO結合型糖鎖の遊離を行うことができ、特に、TMD、TBD、MTBDの方がより好ましい収量および結果を得ることができた。
(14)試験例45〜47では、DBUの濃度について検討した。その結果、DBUの濃度が高い方が、収量が増加した。
(15)試験例48〜51では、ヒドロキシルアミンの濃度の検討を行った。その結果、ヒドロキシルアミンの量はDBUよりも相対的に多くすることでピーリングを抑えることが可能であった。
(16)試験例52は、塩基性試薬として、4%セチルトリメチルアンモニウム水酸化物を用いた試験結果を示す。良好な収量および結果を得ることができた。
<モノリスシリカによる試薬除去を組みあわせたウシフェツインのO結合型糖鎖分析>
(50%ヒドロキシルアミンを用いたO型糖鎖遊離反応)
ウシフェツイン(20μg)を50%ヒドロキシルアミン50μLに溶解し、1,8−ジアザビシクロ[5.4.0]ウンデカ−7−エン(DBU)10μLを添加して混合した後、ドラフト中、ヒートブロックを用いて60℃で20分間加熱した。その後、直ちに氷浴中で冷却し1N塩酸で反応液を中和した。
中和した反応液にアセトン200μL又はサリチルアルデヒド200μLをそれぞれ添加し攪拌した。さらに、上記の反応液にアセトニトリル16mLを添加し、あらかじめアセトニトリルで平衡化したモノリスシリカ(シリカモノリススピンカラム、Cleanup column、住友ベークライト社製)に全量アプライし、続いてアセトニトリル1.2mLで洗浄した。続いて、10%酢酸100μLを用いてモノリスシリカから糖鎖を溶出し、900μLの純水と混合した後、実施例1と同様にしてグラファイトカーボンカートリッジによる脱塩処理を行い、0.1%トリフルオロ酢酸(TFA)を含む50%アセトニトリル1mLで糖鎖を溶出し、減圧乾固した。
乾固した糖鎖を10%酢酸25μLに溶解し、ピコリンボランと2−アミノ安息香酸を用いて糖鎖を蛍光標識した。蛍光標識糖鎖は、モノリスシリカ(シリカモノリススピンカラム、Cleanup column、住友ベークライト社製)で過剰の試薬を除去した後、HPLCで分析した。
<10%ヒドロキシルアミンを用いたO結合型糖鎖遊離反応>
ウシフェツイン(20μg)を10%ヒドロキシルアミン50μLに溶解し、DBU 10μLを添加して混合した後、ドラフト中、ヒートブロックを用いて60℃で20分間加熱した。その後、直ちに氷浴中で冷却し1N塩酸で反応液を中和した。
実施例1と同様にして、グラファイトカーボンを充填した固相抽出カートリッジ(HyperSep Hypercarb 25mg、サーモサイエンティフィック社製)を用いて中和した反応液を脱塩処理し、0.1%TFAを含む50%アセトニトリル1mLで糖鎖を溶出し、減圧乾固した。
実施例9と同様にして糖鎖を蛍光標識し、HPLCで分析した。
<50%ヒドロキシルアミンを用いたO結合型糖鎖遊離反応>
ウシフェツイン(20μg)を50%ヒドロキシルアミン50μLに溶解し、DBU 10μLを添加して混合した後、ドラフト中、ヒートブロックを用いて60℃で20分間加熱した。その後、直ちに氷浴中で冷却し1N塩酸で反応液を中和した。
実施例1と同様にして、グラファイトカーボンを充填した固相抽出カートリッジ(HyperSep Hypercarb 25mg、サーモサイエンティフィック社製)を用いて中和した反応液を脱塩処理し、0.1%TFAを含む50%アセトニトリル1mLで糖鎖を溶出し、減圧乾固した。
実施例9と同様にして糖鎖を蛍光標識し、HPLCで分析した。
<モノリスシリカからの糖鎖回収法の検討>
(50%ヒドロキシルアミンを用いたO結合型糖鎖遊離反応)
ウシフェツイン(20μg)を50%ヒドロキシルアミン50 μLに溶解し、DBU 10μLを添加して混合した後、ドラフト中、ヒートブロックを用いて60℃で20分間加熱した。その後、直ちに氷浴中で冷却し1N塩酸で反応液を中和した。
中和した反応液にアセトン200μLを添加し攪拌した。さらに、上記の反応液にアセトニトリル20mLを添加し、あらかじめアセトニトリルで平衡化したモノリスシリカ(シリカモノリススピンカラム、Cleanup column、住友ベークライト社製)に全量アプライし、続いてアセトニトリル1.2mLで洗浄した。
続いて、10%酢酸25μLをモノリスシリカに添加し、溶液を回収した。さらに、ピコリンボランと2−アミノ安息香酸の混合液25μLをモノリスシリカに添加後、溶液を回収し、先の溶液と混合して50℃で3時間反応させ、糖鎖を蛍光標識した。蛍光標識糖鎖は、モノリスシリカ(シリカモノリススピンカラム、Cleanup column、住友ベークライト社製)で過剰の試薬を除去した後、HPLCで分析した。
Claims (17)
- 糖タンパク質から糖鎖を遊離させる方法であって、前記糖タンパク質に、(a)ヒドロキシルアミン類と、(b)塩基性試薬とを含む反応液を接触させて、前記糖タンパク質から遊離した糖鎖と前記反応液との混合液を得る工程を含み、
前記(a)ヒドロキシルアミン類は、ヒドロキシルアミン、ヒドロキシルアミンの塩、O置換ヒドロキシルアミン及びO置換ヒドロキシルアミンの塩からなる群より選択される少なくとも一つの化合物であり、
前記(b)塩基性試薬は、アルカリ金属の水酸化物、アルカリ金属の弱酸塩、アルカリ土類金属の水酸化物、アンモニア水溶液に溶解したアルカリ土類金属の塩及び有機塩基からなる群より選択される少なくとも一つである方法。 - 前記反応液が前記(a)ヒドロキシルアミン類を2〜70%(w/w)含む、請求項1に記載の方法。
- 前記反応液が(c)アミン類を更に含み、
前記(c)アミン類は、アンモニア水、メチルアミン水溶液、ジメチルアミン水溶液、エチルアミン、ジエチルアミン、エタノールアミン、エチレンジアミン、ブチルアミン、モルホリン、DABCO、アントラニル酸からなる群より選択される少なくとも一つの化合物である、請求項1又は2に記載の方法。 - 前記糖タンパク質から遊離した糖鎖が糖鎖オキシムを含む、請求項1〜3のいずれか一項に記載の方法。
- 前記糖タンパク質に前記反応液を接触させる工程において、前記反応液のpHが、8〜14の範囲内である、請求項1〜4のいずれか一項に記載の方法。
- 前記アルカリ金属の水酸化物が、水酸化リチウム、水酸化ナトリウム又は水酸化カリウムであり、
前記アルカリ金属の弱酸塩が、重炭酸ナトリウム又は炭酸ナトリウムであり、
前記アルカリ土類金属の水酸化物が、水酸化カルシウム、水酸化バリウム又は水酸化ストロンチウムであり、
前記アルカリ土類金属の塩が、酢酸カルシウム、塩化カルシウム、酢酸バリウム又は酢酸マグネシウムであり、
前記有機塩基が、1,8−ジアザビシクロ[5.4.0]ウンデカ−7−エン、1,5,7−トリアザビシクロ[4.4.0]デカ−5−エン、7−メチル−1,5,7−トリアザビシクロ[4.4.0]デカ−5−エン、1,1,3,3−テトラメチルグアニジン、2−tert−ブチル−1,1,3,3−テトラメチルグアニジン又はセチルトリメチルアンモニウムヒドロキシドである、請求項1〜5のいずれか一項に記載の方法。 - 前記混合液にケトン、アルデヒド又は酸無水物を添加し、前記混合液中に残存する(a)ヒドロキシルアミン類をケトキシム、アルドキシム又はアミドに変換する工程と、
前記混合液を、糖鎖に親和性を有する固相と接触させて、前記固相に前記糖タンパク質から遊離した糖鎖を吸着させる工程と、
前記固相から前記糖鎖を溶出させる工程と、
を更に含む、請求項1〜6のいずれか一項に記載の方法。 - 糖タンパク質が有する糖鎖の分析方法であって、
請求項1〜7のいずれか一項に記載の方法により糖タンパク質から糖鎖を遊離する工程と、
遊離した糖鎖を標識する工程であって、糖鎖オキシムの標識を含む工程と、
を含む、糖鎖の分析方法。 - 糖タンパク質から糖鎖を遊離するためのキットであって、(a)ヒドロキシルアミン類と(b)塩基性試薬とを含み、
前記(a)ヒドロキシルアミン類は、ヒドロキシルアミン、ヒドロキシルアミンの塩、O置換ヒドロキシルアミン及びO置換ヒドロキシルアミンの塩からなる群より選択される少なくとも一つの化合物であり、
前記(b)塩基性試薬は、アルカリ金属の水酸化物、アルカリ金属の弱酸塩、アルカリ土類金属の水酸化物、アンモニア水溶液に溶解したアルカリ土類金属の塩及び有機塩基からなる群より選択される少なくとも一つであり、
請求項1〜7のいずれか一項に記載の方法を行うための説明書を更に含む、キット。 - (c)アミン類を更に含み、
前記(c)アミン類は、アンモニア水、メチルアミン水溶液、ジメチルアミン水溶液、エチルアミン、ジエチルアミン、エタノールアミン、エチレンジアミン、ブチルアミン、モルホリン、DABCO及びアントラニル酸からなる群より選択される少なくとも一つの化合物である、請求項9に記載のキット。 - ケトン、アルデヒド又は酸無水物と、糖鎖に親和性を有する固相とを更に含む、請求項9又は10に記載のキット。
- 糖タンパク質から糖鎖を遊離するためのキットであって、(a)ヒドロキシルアミン類と併用して使用するための(b)塩基性試薬と(c)アミン類とを含み、
前記(a)ヒドロキシルアミン類は、ヒドロキシルアミン、ヒドロキシルアミンの塩、O置換ヒドロキシルアミン及びO置換ヒドロキシルアミンの塩からなる群より選択される少なくとも一つの化合物であり、
前記(b)塩基性試薬は、アルカリ金属の水酸化物、アルカリ金属の弱酸塩、アルカリ土類金属の水酸化物、アンモニア水溶液に溶解したアルカリ土類金属の塩及び有機塩基からなる群より選択される少なくとも一つであり、
前記(c)アミン類は、アンモニア水、メチルアミン水溶液、ジメチルアミン水溶液、エチルアミン、ジエチルアミン、エタノールアミン、エチレンジアミン、ブチルアミン、モルホリン、DABCO及びアントラニル酸からなる群より選択される少なくとも一つの化合物であるキット。 - ケトン、アルデヒド又は酸無水物と、糖鎖に親和性を有する固相とを更に含む、請求項12に記載のキット。
- 請求項1〜7のいずれか一項に記載の方法を行うための説明書を更に含む、請求項12又は13に記載のキット。
- 糖タンパク質を含む試料が収容される容器を保持する容器保持部と、前記容器に試薬を導入する試薬導入部と、を備え、
前記試薬導入部が、前記容器に(a)ヒドロキシルアミン類と、(b)塩基性試薬とを含む反応液を導入する反応液導入部を含む、糖タンパク質から糖鎖を遊離させる装置であって、
前記(a)ヒドロキシルアミン類は、ヒドロキシルアミン、ヒドロキシルアミンの塩、O置換ヒドロキシルアミン及びO置換ヒドロキシルアミンの塩からなる群より選択される少なくとも一つの化合物であり、
前記(b)塩基性試薬は、アルカリ金属の水酸化物、アルカリ金属の弱酸塩、アルカリ土類金属の水酸化物、アンモニア水溶液に溶解したアルカリ土類金属の塩及び有機塩基からなる群より選択される少なくとも一つである装置。 - 前記試薬導入部が、前記容器にケトンを導入するケトン導入部、アルデヒドを導入するアルデヒド導入部又は酸無水物を導入する酸無水物導入部を更に含む、請求項15に記載の装置。
- 糖鎖に親和性を有する固相を含む容器を保持する固相保持部を更に備える、請求項15又は16に記載の装置。
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