JP4884899B2 - イリノテカンの副作用の発生危険度を判定する方法およびそのためのキット - Google Patents
イリノテカンの副作用の発生危険度を判定する方法およびそのためのキット Download PDFInfo
- Publication number
- JP4884899B2 JP4884899B2 JP2006253066A JP2006253066A JP4884899B2 JP 4884899 B2 JP4884899 B2 JP 4884899B2 JP 2006253066 A JP2006253066 A JP 2006253066A JP 2006253066 A JP2006253066 A JP 2006253066A JP 4884899 B2 JP4884899 B2 JP 4884899B2
- Authority
- JP
- Japan
- Prior art keywords
- nucleic acid
- base sequence
- acid probe
- bases
- seq
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Active
Links
- 230000000694 effects Effects 0.000 title claims abstract description 49
- UWKQSNNFCGGAFS-XIFFEERXSA-N irinotecan Chemical compound C1=C2C(CC)=C3CN(C(C4=C([C@@](C(=O)OC4)(O)CC)C=4)=O)C=4C3=NC2=CC=C1OC(=O)N(CC1)CCC1N1CCCCC1 UWKQSNNFCGGAFS-XIFFEERXSA-N 0.000 title claims abstract description 47
- 238000000034 method Methods 0.000 title claims abstract description 44
- 229960004768 irinotecan Drugs 0.000 title claims abstract description 41
- 108020004711 Nucleic Acid Probes Proteins 0.000 claims abstract description 327
- 239000002853 nucleic acid probe Substances 0.000 claims abstract description 327
- 108700026226 TATA Box Proteins 0.000 claims abstract description 31
- 108700039691 Genetic Promoter Regions Proteins 0.000 claims abstract description 25
- 108020004707 nucleic acids Proteins 0.000 claims description 114
- 102000039446 nucleic acids Human genes 0.000 claims description 114
- 150000007523 nucleic acids Chemical class 0.000 claims description 114
- 101710205316 UDP-glucuronosyltransferase 1A1 Proteins 0.000 claims description 32
- 108010060309 Glucuronidase Proteins 0.000 claims description 30
- 238000006243 chemical reaction Methods 0.000 claims description 28
- 239000002773 nucleotide Substances 0.000 claims description 23
- 125000003729 nucleotide group Chemical group 0.000 claims description 23
- 230000003321 amplification Effects 0.000 claims description 14
- 238000003199 nucleic acid amplification method Methods 0.000 claims description 14
- 239000012472 biological sample Substances 0.000 claims description 12
- 108010092364 Glucuronosyltransferase Proteins 0.000 abstract description 4
- 239000002246 antineoplastic agent Substances 0.000 abstract description 4
- 102000054765 polymorphisms of proteins Human genes 0.000 abstract description 3
- 230000002411 adverse Effects 0.000 abstract 2
- 229940041181 antineoplastic drug Drugs 0.000 abstract 1
- 239000000523 sample Substances 0.000 description 104
- 108020004414 DNA Proteins 0.000 description 69
- OKTJSMMVPCPJKN-UHFFFAOYSA-N Carbon Chemical compound [C] OKTJSMMVPCPJKN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 33
- 229910052799 carbon Inorganic materials 0.000 description 31
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 description 25
- 238000002493 microarray Methods 0.000 description 23
- 239000000758 substrate Substances 0.000 description 21
- FWMNVWWHGCHHJJ-SKKKGAJSSA-N 4-amino-1-[(2r)-6-amino-2-[[(2r)-2-[[(2r)-2-[[(2r)-2-amino-3-phenylpropanoyl]amino]-3-phenylpropanoyl]amino]-4-methylpentanoyl]amino]hexanoyl]piperidine-4-carboxylic acid Chemical compound C([C@H](C(=O)N[C@H](CC(C)C)C(=O)N[C@H](CCCCN)C(=O)N1CCC(N)(CC1)C(O)=O)NC(=O)[C@H](N)CC=1C=CC=CC=1)C1=CC=CC=C1 FWMNVWWHGCHHJJ-SKKKGAJSSA-N 0.000 description 12
- 102100029152 UDP-glucuronosyltransferase 1A1 Human genes 0.000 description 12
- 230000000295 complement effect Effects 0.000 description 12
- 125000004185 ester group Chemical group 0.000 description 12
- 238000007385 chemical modification Methods 0.000 description 11
- 238000001514 detection method Methods 0.000 description 11
- 238000009396 hybridization Methods 0.000 description 11
- -1 etc.) Substances 0.000 description 10
- 125000003178 carboxy group Chemical group [H]OC(*)=O 0.000 description 9
- 238000002073 fluorescence micrograph Methods 0.000 description 9
- 102000053187 Glucuronidase Human genes 0.000 description 8
- NQTADLQHYWFPDB-UHFFFAOYSA-N N-Hydroxysuccinimide Chemical group ON1C(=O)CCC1=O NQTADLQHYWFPDB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 8
- 238000007740 vapor deposition Methods 0.000 description 8
- XUIMIQQOPSSXEZ-UHFFFAOYSA-N Silicon Chemical compound [Si] XUIMIQQOPSSXEZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 7
- 125000004432 carbon atom Chemical group C* 0.000 description 7
- 150000001875 compounds Chemical class 0.000 description 7
- 230000007423 decrease Effects 0.000 description 7
- 229910003460 diamond Inorganic materials 0.000 description 7
- 239000010432 diamond Substances 0.000 description 7
- 229910052710 silicon Inorganic materials 0.000 description 7
- 239000010703 silicon Substances 0.000 description 7
- 239000000126 substance Substances 0.000 description 7
- MUBZPKHOEPUJKR-UHFFFAOYSA-N Oxalic acid Chemical compound OC(=O)C(O)=O MUBZPKHOEPUJKR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- 210000004369 blood Anatomy 0.000 description 6
- 239000008280 blood Substances 0.000 description 6
- 150000003839 salts Chemical class 0.000 description 6
- 108090000790 Enzymes Proteins 0.000 description 5
- 238000009739 binding Methods 0.000 description 5
- 239000007789 gas Substances 0.000 description 5
- 150000002430 hydrocarbons Chemical group 0.000 description 5
- 239000000463 material Substances 0.000 description 5
- VNWKTOKETHGBQD-UHFFFAOYSA-N methane Chemical compound C VNWKTOKETHGBQD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 5
- 210000002381 plasma Anatomy 0.000 description 5
- 238000003752 polymerase chain reaction Methods 0.000 description 5
- 230000002829 reductive effect Effects 0.000 description 5
- 239000001226 triphosphate Substances 0.000 description 5
- 235000011178 triphosphate Nutrition 0.000 description 5
- UNXRWKVEANCORM-UHFFFAOYSA-N triphosphoric acid Chemical compound OP(O)(=O)OP(O)(=O)OP(O)(O)=O UNXRWKVEANCORM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 5
- 238000005406 washing Methods 0.000 description 5
- QGZKDVFQNNGYKY-UHFFFAOYSA-N Ammonia Chemical compound N QGZKDVFQNNGYKY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- VZCYOOQTPOCHFL-OWOJBTEDSA-N Fumaric acid Chemical compound OC(=O)\C=C\C(O)=O VZCYOOQTPOCHFL-OWOJBTEDSA-N 0.000 description 4
- TWRXJAOTZQYOKJ-UHFFFAOYSA-L Magnesium chloride Chemical compound [Mg+2].[Cl-].[Cl-] TWRXJAOTZQYOKJ-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 4
- NBIIXXVUZAFLBC-UHFFFAOYSA-N Phosphoric acid Chemical compound OP(O)(O)=O NBIIXXVUZAFLBC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- OFOBLEOULBTSOW-UHFFFAOYSA-N Propanedioic acid Natural products OC(=O)CC(O)=O OFOBLEOULBTSOW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 239000002253 acid Substances 0.000 description 4
- 125000003277 amino group Chemical group 0.000 description 4
- 238000011088 calibration curve Methods 0.000 description 4
- 239000007850 fluorescent dye Substances 0.000 description 4
- 238000011534 incubation Methods 0.000 description 4
- 238000002372 labelling Methods 0.000 description 4
- 230000036961 partial effect Effects 0.000 description 4
- VZCYOOQTPOCHFL-UHFFFAOYSA-N trans-butenedioic acid Natural products OC(=O)C=CC(O)=O VZCYOOQTPOCHFL-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- QTBSBXVTEAMEQO-UHFFFAOYSA-N Acetic acid Chemical compound CC(O)=O QTBSBXVTEAMEQO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- UHOVQNZJYSORNB-UHFFFAOYSA-N Benzene Chemical compound C1=CC=CC=C1 UHOVQNZJYSORNB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 102000004190 Enzymes Human genes 0.000 description 3
- 102000016354 Glucuronosyltransferase Human genes 0.000 description 3
- VEXZGXHMUGYJMC-UHFFFAOYSA-N Hydrochloric acid Chemical compound Cl VEXZGXHMUGYJMC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 235000010724 Wisteria floribunda Nutrition 0.000 description 3
- 239000012491 analyte Substances 0.000 description 3
- 210000003050 axon Anatomy 0.000 description 3
- 239000000872 buffer Substances 0.000 description 3
- KRKNYBCHXYNGOX-UHFFFAOYSA-N citric acid Chemical compound OC(=O)CC(O)(C(O)=O)CC(O)=O KRKNYBCHXYNGOX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 238000001784 detoxification Methods 0.000 description 3
- 238000001704 evaporation Methods 0.000 description 3
- 230000023611 glucuronidation Effects 0.000 description 3
- 229910002804 graphite Inorganic materials 0.000 description 3
- 239000010439 graphite Substances 0.000 description 3
- 125000002887 hydroxy group Chemical group [H]O* 0.000 description 3
- 201000002364 leukopenia Diseases 0.000 description 3
- 238000004519 manufacturing process Methods 0.000 description 3
- 229910021421 monocrystalline silicon Inorganic materials 0.000 description 3
- 238000007899 nucleic acid hybridization Methods 0.000 description 3
- BASFCYQUMIYNBI-UHFFFAOYSA-N platinum Chemical compound [Pt] BASFCYQUMIYNBI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 239000002210 silicon-based material Substances 0.000 description 3
- YBJHBAHKTGYVGT-ZKWXMUAHSA-N (+)-Biotin Chemical compound N1C(=O)N[C@@H]2[C@H](CCCCC(=O)O)SC[C@@H]21 YBJHBAHKTGYVGT-ZKWXMUAHSA-N 0.000 description 2
- LMDZBCPBFSXMTL-UHFFFAOYSA-N 1-ethyl-3-(3-dimethylaminopropyl)carbodiimide Chemical compound CCN=C=NCCCN(C)C LMDZBCPBFSXMTL-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- VZSRBBMJRBPUNF-UHFFFAOYSA-N 2-(2,3-dihydro-1H-inden-2-ylamino)-N-[3-oxo-3-(2,4,6,7-tetrahydrotriazolo[4,5-c]pyridin-5-yl)propyl]pyrimidine-5-carboxamide Chemical compound C1C(CC2=CC=CC=C12)NC1=NC=C(C=N1)C(=O)NCCC(N1CC2=C(CC1)NN=N2)=O VZSRBBMJRBPUNF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- FALRKNHUBBKYCC-UHFFFAOYSA-N 2-(chloromethyl)pyridine-3-carbonitrile Chemical compound ClCC1=NC=CC=C1C#N FALRKNHUBBKYCC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- BPYKTIZUTYGOLE-IFADSCNNSA-N Bilirubin Chemical compound N1C(=O)C(C)=C(C=C)\C1=C\C1=C(C)C(CCC(O)=O)=C(CC2=C(C(C)=C(\C=C/3C(=C(C=C)C(=O)N\3)C)N2)CCC(O)=O)N1 BPYKTIZUTYGOLE-IFADSCNNSA-N 0.000 description 2
- KLWPJMFMVPTNCC-UHFFFAOYSA-N Camptothecin Natural products CCC1(O)C(=O)OCC2=C1C=C3C4Nc5ccccc5C=C4CN3C2=O KLWPJMFMVPTNCC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- AEMOLEFTQBMNLQ-AQKNRBDQSA-N D-glucopyranuronic acid Chemical compound OC1O[C@H](C(O)=O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@H]1O AEMOLEFTQBMNLQ-AQKNRBDQSA-N 0.000 description 2
- 102000053602 DNA Human genes 0.000 description 2
- 102000016928 DNA-directed DNA polymerase Human genes 0.000 description 2
- 108010014303 DNA-directed DNA polymerase Proteins 0.000 description 2
- 206010012735 Diarrhoea Diseases 0.000 description 2
- SHIBSTMRCDJXLN-UHFFFAOYSA-N Digoxigenin Natural products C1CC(C2C(C3(C)CCC(O)CC3CC2)CC2O)(O)C2(C)C1C1=CC(=O)OC1 SHIBSTMRCDJXLN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- LFQSCWFLJHTTHZ-UHFFFAOYSA-N Ethanol Chemical compound CCO LFQSCWFLJHTTHZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- IAJILQKETJEXLJ-UHFFFAOYSA-N Galacturonsaeure Natural products O=CC(O)C(O)C(O)C(O)C(O)=O IAJILQKETJEXLJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- AFVFQIVMOAPDHO-UHFFFAOYSA-N Methanesulfonic acid Chemical compound CS(O)(=O)=O AFVFQIVMOAPDHO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- NIPNSKYNPDTRPC-UHFFFAOYSA-N N-[2-oxo-2-(2,4,6,7-tetrahydrotriazolo[4,5-c]pyridin-5-yl)ethyl]-2-[[3-(trifluoromethoxy)phenyl]methylamino]pyrimidine-5-carboxamide Chemical compound O=C(CNC(=O)C=1C=NC(=NC=1)NCC1=CC(=CC=C1)OC(F)(F)F)N1CC2=C(CC1)NN=N2 NIPNSKYNPDTRPC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- KDLHZDBZIXYQEI-UHFFFAOYSA-N Palladium Chemical compound [Pd] KDLHZDBZIXYQEI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- KFSLWBXXFJQRDL-UHFFFAOYSA-N Peracetic acid Chemical compound CC(=O)OO KFSLWBXXFJQRDL-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- VYPSYNLAJGMNEJ-UHFFFAOYSA-N Silicium dioxide Chemical compound O=[Si]=O VYPSYNLAJGMNEJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- PPBRXRYQALVLMV-UHFFFAOYSA-N Styrene Chemical compound C=CC1=CC=CC=C1 PPBRXRYQALVLMV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- QAOWNCQODCNURD-UHFFFAOYSA-N Sulfuric acid Chemical compound OS(O)(=O)=O QAOWNCQODCNURD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- DHKHKXVYLBGOIT-UHFFFAOYSA-N acetaldehyde Diethyl Acetal Natural products CCOC(C)OCC DHKHKXVYLBGOIT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 125000005907 alkyl ester group Chemical group 0.000 description 2
- 229910000147 aluminium phosphate Inorganic materials 0.000 description 2
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 description 2
- 239000003976 antineoplastic alkaloid Substances 0.000 description 2
- WPYMKLBDIGXBTP-UHFFFAOYSA-N benzoic acid Chemical compound OC(=O)C1=CC=CC=C1 WPYMKLBDIGXBTP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 229940127093 camptothecin Drugs 0.000 description 2
- VSJKWCGYPAHWDS-FQEVSTJZSA-N camptothecin Chemical compound C1=CC=C2C=C(CN3C4=CC5=C(C3=O)COC(=O)[C@]5(O)CC)C4=NC2=C1 VSJKWCGYPAHWDS-FQEVSTJZSA-N 0.000 description 2
- 239000000969 carrier Substances 0.000 description 2
- 229920001577 copolymer Polymers 0.000 description 2
- 239000013078 crystal Substances 0.000 description 2
- 230000003247 decreasing effect Effects 0.000 description 2
- 238000000151 deposition Methods 0.000 description 2
- 238000013461 design Methods 0.000 description 2
- QONQRTHLHBTMGP-UHFFFAOYSA-N digitoxigenin Natural products CC12CCC(C3(CCC(O)CC3CC3)C)C3C11OC1CC2C1=CC(=O)OC1 QONQRTHLHBTMGP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- SHIBSTMRCDJXLN-KCZCNTNESA-N digoxigenin Chemical compound C1([C@@H]2[C@@]3([C@@](CC2)(O)[C@H]2[C@@H]([C@@]4(C)CC[C@H](O)C[C@H]4CC2)C[C@H]3O)C)=CC(=O)OC1 SHIBSTMRCDJXLN-KCZCNTNESA-N 0.000 description 2
- VSJKWCGYPAHWDS-UHFFFAOYSA-N dl-camptothecin Natural products C1=CC=C2C=C(CN3C4=CC5=C(C3=O)COC(=O)C5(O)CC)C4=NC2=C1 VSJKWCGYPAHWDS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 229940079593 drug Drugs 0.000 description 2
- 239000003814 drug Substances 0.000 description 2
- 238000010894 electron beam technology Methods 0.000 description 2
- 125000006575 electron-withdrawing group Chemical group 0.000 description 2
- 125000003700 epoxy group Chemical group 0.000 description 2
- 230000008020 evaporation Effects 0.000 description 2
- QEWYKACRFQMRMB-UHFFFAOYSA-N fluoroacetic acid Chemical compound OC(=O)CF QEWYKACRFQMRMB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 125000002485 formyl group Chemical group [H]C(*)=O 0.000 description 2
- 239000001530 fumaric acid Substances 0.000 description 2
- 239000011521 glass Substances 0.000 description 2
- 229940097043 glucuronic acid Drugs 0.000 description 2
- 125000005843 halogen group Chemical group 0.000 description 2
- 238000003780 insertion Methods 0.000 description 2
- 230000037431 insertion Effects 0.000 description 2
- KLEAIHJJLUAXIQ-JDRGBKBRSA-N irinotecan hydrochloride hydrate Chemical compound O.O.O.Cl.C1=C2C(CC)=C3CN(C(C4=C([C@@](C(=O)OC4)(O)CC)C=4)=O)C=4C3=NC2=CC=C1OC(=O)N(CC1)CCC1N1CCCCC1 KLEAIHJJLUAXIQ-JDRGBKBRSA-N 0.000 description 2
- 230000001678 irradiating effect Effects 0.000 description 2
- 210000004185 liver Anatomy 0.000 description 2
- 229910001629 magnesium chloride Inorganic materials 0.000 description 2
- VZCYOOQTPOCHFL-UPHRSURJSA-N maleic acid Chemical compound OC(=O)\C=C/C(O)=O VZCYOOQTPOCHFL-UPHRSURJSA-N 0.000 description 2
- 239000011976 maleic acid Substances 0.000 description 2
- 239000000203 mixture Substances 0.000 description 2
- 150000004967 organic peroxy acids Chemical class 0.000 description 2
- 235000006408 oxalic acid Nutrition 0.000 description 2
- XNGIFLGASWRNHJ-UHFFFAOYSA-N phthalic acid Chemical compound OC(=O)C1=CC=CC=C1C(O)=O XNGIFLGASWRNHJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 238000005268 plasma chemical vapour deposition Methods 0.000 description 2
- 229920005989 resin Polymers 0.000 description 2
- 239000011347 resin Substances 0.000 description 2
- 238000004544 sputter deposition Methods 0.000 description 2
- 229940014800 succinic anhydride Drugs 0.000 description 2
- JOXIMZWYDAKGHI-UHFFFAOYSA-N toluene-4-sulfonic acid Chemical compound CC1=CC=C(S(O)(=O)=O)C=C1 JOXIMZWYDAKGHI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- ARCGXLSVLAOJQL-UHFFFAOYSA-N trimellitic acid Chemical compound OC(=O)C1=CC=C(C(O)=O)C(C(O)=O)=C1 ARCGXLSVLAOJQL-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- WFKWXMTUELFFGS-UHFFFAOYSA-N tungsten Chemical compound [W] WFKWXMTUELFFGS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 229910052721 tungsten Inorganic materials 0.000 description 2
- 239000010937 tungsten Substances 0.000 description 2
- GGAUUQHSCNMCAU-ZXZARUISSA-N (2s,3r)-butane-1,2,3,4-tetracarboxylic acid Chemical compound OC(=O)C[C@H](C(O)=O)[C@H](C(O)=O)CC(O)=O GGAUUQHSCNMCAU-ZXZARUISSA-N 0.000 description 1
- BJEPYKJPYRNKOW-REOHCLBHSA-N (S)-malic acid Chemical compound OC(=O)[C@@H](O)CC(O)=O BJEPYKJPYRNKOW-REOHCLBHSA-N 0.000 description 1
- INZDTEICWPZYJM-UHFFFAOYSA-N 1-(chloromethyl)-4-[4-(chloromethyl)phenyl]benzene Chemical compound C1=CC(CCl)=CC=C1C1=CC=C(CCl)C=C1 INZDTEICWPZYJM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- QIJNJJZPYXGIQM-UHFFFAOYSA-N 1lambda4,2lambda4-dimolybdacyclopropa-1,2,3-triene Chemical compound [Mo]=C=[Mo] QIJNJJZPYXGIQM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- XYPISWUKQGWYGX-UHFFFAOYSA-N 2,2,2-trifluoroethaneperoxoic acid Chemical compound OOC(=O)C(F)(F)F XYPISWUKQGWYGX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- GAWAYYRQGQZKCR-UHFFFAOYSA-N 2-chloropropionic acid Chemical compound CC(Cl)C(O)=O GAWAYYRQGQZKCR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- LJGHYPLBDBRCRZ-UHFFFAOYSA-N 3-(3-aminophenyl)sulfonylaniline Chemical compound NC1=CC=CC(S(=O)(=O)C=2C=C(N)C=CC=2)=C1 LJGHYPLBDBRCRZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- YNJSNEKCXVFDKW-UHFFFAOYSA-N 3-(5-amino-1h-indol-3-yl)-2-azaniumylpropanoate Chemical compound C1=C(N)C=C2C(CC(N)C(O)=O)=CNC2=C1 YNJSNEKCXVFDKW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- BMYNFMYTOJXKLE-UHFFFAOYSA-N 3-azaniumyl-2-hydroxypropanoate Chemical compound NCC(O)C(O)=O BMYNFMYTOJXKLE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- UUOFSRVHZJTWDE-UHFFFAOYSA-N 3-chloro-3-oxopropanoic acid Chemical compound OC(=O)CC(Cl)=O UUOFSRVHZJTWDE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- QEYMMOKECZBKAC-UHFFFAOYSA-N 3-chloropropanoic acid Chemical compound OC(=O)CCCl QEYMMOKECZBKAC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- GPIUUMROPXDNRH-UHFFFAOYSA-N 3647-74-3 Chemical group C1C2C3C(=O)NC(=O)C3C1C=C2 GPIUUMROPXDNRH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- MMZMROHDQCJAJT-UHFFFAOYSA-N 4-chloro-4-oxobutanoic acid Chemical compound OC(=O)CCC(Cl)=O MMZMROHDQCJAJT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- XRHGYUZYPHTUJZ-UHFFFAOYSA-N 4-chlorobenzoic acid Chemical compound OC(=O)C1=CC=C(Cl)C=C1 XRHGYUZYPHTUJZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229920000178 Acrylic resin Polymers 0.000 description 1
- 239000004925 Acrylic resin Substances 0.000 description 1
- NLHHRLWOUZZQLW-UHFFFAOYSA-N Acrylonitrile Chemical compound C=CC#N NLHHRLWOUZZQLW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 201000004384 Alopecia Diseases 0.000 description 1
- 206010003445 Ascites Diseases 0.000 description 1
- 239000005711 Benzoic acid Substances 0.000 description 1
- 206010051779 Bone marrow toxicity Diseases 0.000 description 1
- XMWRBQBLMFGWIX-UHFFFAOYSA-N C60 fullerene Chemical compound C12=C3C(C4=C56)=C7C8=C5C5=C9C%10=C6C6=C4C1=C1C4=C6C6=C%10C%10=C9C9=C%11C5=C8C5=C8C7=C3C3=C7C2=C1C1=C2C4=C6C4=C%10C6=C9C9=C%11C5=C5C8=C3C3=C7C1=C1C2=C4C6=C2C9=C5C3=C12 XMWRBQBLMFGWIX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229920000049 Carbon (fiber) Polymers 0.000 description 1
- 102000013392 Carboxylesterase Human genes 0.000 description 1
- 108010051152 Carboxylesterase Proteins 0.000 description 1
- KZBUYRJDOAKODT-UHFFFAOYSA-N Chlorine Chemical compound ClCl KZBUYRJDOAKODT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 206010052358 Colorectal cancer metastatic Diseases 0.000 description 1
- XZMCDFZZKTWFGF-UHFFFAOYSA-N Cyanamide Chemical compound NC#N XZMCDFZZKTWFGF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000004543 DNA replication Effects 0.000 description 1
- FEWJPZIEWOKRBE-JCYAYHJZSA-N Dextrotartaric acid Chemical compound OC(=O)[C@H](O)[C@@H](O)C(O)=O FEWJPZIEWOKRBE-JCYAYHJZSA-N 0.000 description 1
- 238000009007 Diagnostic Kit Methods 0.000 description 1
- 239000004593 Epoxy Substances 0.000 description 1
- PIICEJLVQHRZGT-UHFFFAOYSA-N Ethylenediamine Chemical compound NCCN PIICEJLVQHRZGT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- YCKRFDGAMUMZLT-UHFFFAOYSA-N Fluorine atom Chemical compound [F] YCKRFDGAMUMZLT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 206010071602 Genetic polymorphism Diseases 0.000 description 1
- SXRSQZLOMIGNAQ-UHFFFAOYSA-N Glutaraldehyde Chemical compound O=CCCCC=O SXRSQZLOMIGNAQ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- UFHFLCQGNIYNRP-UHFFFAOYSA-N Hydrogen Chemical compound [H][H] UFHFLCQGNIYNRP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- AVXURJPOCDRRFD-UHFFFAOYSA-N Hydroxylamine Chemical class ON AVXURJPOCDRRFD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000007397 LAMP assay Methods 0.000 description 1
- 206010058467 Lung neoplasm malignant Diseases 0.000 description 1
- 239000004640 Melamine resin Substances 0.000 description 1
- 229920000877 Melamine resin Polymers 0.000 description 1
- 229910039444 MoC Inorganic materials 0.000 description 1
- SECXISVLQFMRJM-UHFFFAOYSA-N N-Methylpyrrolidone Chemical compound CN1CCCC1=O SECXISVLQFMRJM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 206010028980 Neoplasm Diseases 0.000 description 1
- LGRFSURHDFAFJT-UHFFFAOYSA-N Phthalic anhydride Natural products C1=CC=C2C(=O)OC(=O)C2=C1 LGRFSURHDFAFJT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229920002845 Poly(methacrylic acid) Polymers 0.000 description 1
- 239000004952 Polyamide Substances 0.000 description 1
- 229920002367 Polyisobutene Polymers 0.000 description 1
- 239000004721 Polyphenylene oxide Substances 0.000 description 1
- 239000004743 Polypropylene Substances 0.000 description 1
- 229920001213 Polysorbate 20 Polymers 0.000 description 1
- 239000004793 Polystyrene Substances 0.000 description 1
- 239000004372 Polyvinyl alcohol Substances 0.000 description 1
- 229920001328 Polyvinylidene chloride Polymers 0.000 description 1
- 108091081062 Repeated sequence (DNA) Proteins 0.000 description 1
- 229910052581 Si3N4 Inorganic materials 0.000 description 1
- BQCADISMDOOEFD-UHFFFAOYSA-N Silver Chemical compound [Ag] BQCADISMDOOEFD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108020004682 Single-Stranded DNA Proteins 0.000 description 1
- 229920002125 Sokalan® Polymers 0.000 description 1
- KDYFGRWQOYBRFD-UHFFFAOYSA-N Succinic acid Natural products OC(=O)CCC(O)=O KDYFGRWQOYBRFD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- FEWJPZIEWOKRBE-UHFFFAOYSA-N Tartaric acid Natural products [H+].[H+].[O-]C(=O)C(O)C(O)C([O-])=O FEWJPZIEWOKRBE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 101710183280 Topoisomerase Proteins 0.000 description 1
- 229910052770 Uranium Inorganic materials 0.000 description 1
- 229920001807 Urea-formaldehyde Polymers 0.000 description 1
- 206010047700 Vomiting Diseases 0.000 description 1
- 229910026551 ZrC Inorganic materials 0.000 description 1
- OTCHGXYCWNXDOA-UHFFFAOYSA-N [C].[Zr] Chemical compound [C].[Zr] OTCHGXYCWNXDOA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000010521 absorption reaction Methods 0.000 description 1
- 239000011354 acetal resin Substances 0.000 description 1
- 150000001241 acetals Chemical class 0.000 description 1
- 235000011054 acetic acid Nutrition 0.000 description 1
- 150000008065 acid anhydrides Chemical class 0.000 description 1
- 230000003213 activating effect Effects 0.000 description 1
- BJEPYKJPYRNKOW-UHFFFAOYSA-N alpha-hydroxysuccinic acid Natural products OC(=O)C(O)CC(O)=O BJEPYKJPYRNKOW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- PNEYBMLMFCGWSK-UHFFFAOYSA-N aluminium oxide Inorganic materials [O-2].[O-2].[O-2].[Al+3].[Al+3] PNEYBMLMFCGWSK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 150000001412 amines Chemical class 0.000 description 1
- 150000001413 amino acids Chemical group 0.000 description 1
- 229910021529 ammonia Inorganic materials 0.000 description 1
- 229910003481 amorphous carbon Inorganic materials 0.000 description 1
- 229910021417 amorphous silicon Inorganic materials 0.000 description 1
- 230000001093 anti-cancer Effects 0.000 description 1
- 230000004596 appetite loss Effects 0.000 description 1
- 239000012298 atmosphere Substances 0.000 description 1
- DRZOELSSQWENBA-UHFFFAOYSA-N benzene-1,2-dicarboperoxoic acid Chemical compound OOC(=O)C1=CC=CC=C1C(=O)OO DRZOELSSQWENBA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 235000010233 benzoic acid Nutrition 0.000 description 1
- 239000003613 bile acid Substances 0.000 description 1
- 230000015572 biosynthetic process Effects 0.000 description 1
- 229960002685 biotin Drugs 0.000 description 1
- 235000020958 biotin Nutrition 0.000 description 1
- 239000011616 biotin Substances 0.000 description 1
- 210000001124 body fluid Anatomy 0.000 description 1
- 239000010839 body fluid Substances 0.000 description 1
- 231100000366 bone marrow toxicity Toxicity 0.000 description 1
- 229910021538 borax Inorganic materials 0.000 description 1
- KDYFGRWQOYBRFD-NUQCWPJISA-N butanedioic acid Chemical compound O[14C](=O)CC[14C](O)=O KDYFGRWQOYBRFD-NUQCWPJISA-N 0.000 description 1
- JHIWVOJDXOSYLW-UHFFFAOYSA-N butyl 2,2-difluorocyclopropane-1-carboxylate Chemical compound CCCCOC(=O)C1CC1(F)F JHIWVOJDXOSYLW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 150000001718 carbodiimides Chemical class 0.000 description 1
- 150000001721 carbon Chemical class 0.000 description 1
- 239000004917 carbon fiber Substances 0.000 description 1
- 239000002041 carbon nanotube Substances 0.000 description 1
- 229910021393 carbon nanotube Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000003575 carbonaceous material Substances 0.000 description 1
- 150000001735 carboxylic acids Chemical class 0.000 description 1
- 210000004027 cell Anatomy 0.000 description 1
- 239000000919 ceramic Substances 0.000 description 1
- 210000001175 cerebrospinal fluid Anatomy 0.000 description 1
- 239000003795 chemical substances by application Substances 0.000 description 1
- FOCAUTSVDIKZOP-UHFFFAOYSA-N chloroacetic acid Chemical compound OC(=O)CCl FOCAUTSVDIKZOP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229940106681 chloroacetic acid Drugs 0.000 description 1
- GVEHJMMRQRRJPM-UHFFFAOYSA-N chromium(2+);methanidylidynechromium Chemical compound [Cr+2].[Cr]#[C-].[Cr]#[C-] GVEHJMMRQRRJPM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 235000015165 citric acid Nutrition 0.000 description 1
- 239000002131 composite material Substances 0.000 description 1
- 239000004020 conductor Substances 0.000 description 1
- 230000021615 conjugation Effects 0.000 description 1
- 125000004122 cyclic group Chemical group 0.000 description 1
- 230000007547 defect Effects 0.000 description 1
- 230000003111 delayed effect Effects 0.000 description 1
- 229940039227 diagnostic agent Drugs 0.000 description 1
- 239000000032 diagnostic agent Substances 0.000 description 1
- 238000010891 electric arc Methods 0.000 description 1
- 210000002472 endoplasmic reticulum Anatomy 0.000 description 1
- 239000003344 environmental pollutant Substances 0.000 description 1
- 239000003822 epoxy resin Substances 0.000 description 1
- 230000032050 esterification Effects 0.000 description 1
- 238000005886 esterification reaction Methods 0.000 description 1
- 150000002148 esters Chemical class 0.000 description 1
- WBJINCZRORDGAQ-UHFFFAOYSA-N ethyl formate Chemical compound CCOC=O WBJINCZRORDGAQ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- YZUCHPMXUOSLOJ-UHFFFAOYSA-N ethyne;thorium Chemical compound [Th].[C-]#[C] YZUCHPMXUOSLOJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000011156 evaluation Methods 0.000 description 1
- 239000000284 extract Substances 0.000 description 1
- 238000000605 extraction Methods 0.000 description 1
- 210000003608 fece Anatomy 0.000 description 1
- 238000001215 fluorescent labelling Methods 0.000 description 1
- 229910052731 fluorine Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000011737 fluorine Substances 0.000 description 1
- 235000013373 food additive Nutrition 0.000 description 1
- 239000002778 food additive Substances 0.000 description 1
- 229910052839 forsterite Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000012634 fragment Substances 0.000 description 1
- 229910003472 fullerene Inorganic materials 0.000 description 1
- 235000011087 fumaric acid Nutrition 0.000 description 1
- PCHJSUWPFVWCPO-UHFFFAOYSA-N gold Chemical compound [Au] PCHJSUWPFVWCPO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229910052737 gold Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000010931 gold Substances 0.000 description 1
- 239000007770 graphite material Substances 0.000 description 1
- WHJFNYXPKGDKBB-UHFFFAOYSA-N hafnium;methane Chemical compound C.[Hf] WHJFNYXPKGDKBB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000003676 hair loss Effects 0.000 description 1
- 208000024963 hair loss Diseases 0.000 description 1
- 150000003977 halocarboxylic acids Chemical class 0.000 description 1
- 238000010438 heat treatment Methods 0.000 description 1
- 150000004677 hydrates Chemical class 0.000 description 1
- 125000004435 hydrogen atom Chemical group [H]* 0.000 description 1
- 238000001727 in vivo Methods 0.000 description 1
- 230000001939 inductive effect Effects 0.000 description 1
- 230000002401 inhibitory effect Effects 0.000 description 1
- 229910010272 inorganic material Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000011147 inorganic material Substances 0.000 description 1
- 239000012212 insulator Substances 0.000 description 1
- 210000000936 intestine Anatomy 0.000 description 1
- JDNTWHVOXJZDSN-UHFFFAOYSA-N iodoacetic acid Chemical compound OC(=O)CI JDNTWHVOXJZDSN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229960000779 irinotecan hydrochloride Drugs 0.000 description 1
- GURKHSYORGJETM-WAQYZQTGSA-N irinotecan hydrochloride (anhydrous) Chemical compound Cl.C1=C2C(CC)=C3CN(C(C4=C([C@@](C(=O)OC4)(O)CC)C=4)=O)C=4C3=NC2=CC=C1OC(=O)N(CC1)CCC1N1CCCCC1 GURKHSYORGJETM-WAQYZQTGSA-N 0.000 description 1
- 150000004715 keto acids Chemical class 0.000 description 1
- 231100001022 leukopenia Toxicity 0.000 description 1
- 235000021266 loss of appetite Nutrition 0.000 description 1
- 208000019017 loss of appetite Diseases 0.000 description 1
- 201000005202 lung cancer Diseases 0.000 description 1
- 208000020816 lung neoplasm Diseases 0.000 description 1
- 210000002751 lymph Anatomy 0.000 description 1
- HCWCAKKEBCNQJP-UHFFFAOYSA-N magnesium orthosilicate Chemical compound [Mg+2].[Mg+2].[O-][Si]([O-])([O-])[O-] HCWCAKKEBCNQJP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 206010025482 malaise Diseases 0.000 description 1
- FPYJFEHAWHCUMM-UHFFFAOYSA-N maleic anhydride Chemical compound O=C1OC(=O)C=C1 FPYJFEHAWHCUMM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000001630 malic acid Substances 0.000 description 1
- 235000011090 malic acid Nutrition 0.000 description 1
- 238000005259 measurement Methods 0.000 description 1
- 230000008018 melting Effects 0.000 description 1
- 238000002844 melting Methods 0.000 description 1
- 239000012528 membrane Substances 0.000 description 1
- QSHDDOUJBYECFT-UHFFFAOYSA-N mercury Chemical compound [Hg] QSHDDOUJBYECFT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229910052753 mercury Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000002207 metabolite Substances 0.000 description 1
- 150000001247 metal acetylides Chemical class 0.000 description 1
- RTWNYYOXLSILQN-UHFFFAOYSA-N methanediamine Chemical compound NCN RTWNYYOXLSILQN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229940098779 methanesulfonic acid Drugs 0.000 description 1
- UNASZPQZIFZUSI-UHFFFAOYSA-N methylidyneniobium Chemical compound [Nb]#C UNASZPQZIFZUSI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- NFFIWVVINABMKP-UHFFFAOYSA-N methylidynetantalum Chemical compound [Ta]#C NFFIWVVINABMKP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 150000007522 mineralic acids Chemical class 0.000 description 1
- 238000002156 mixing Methods 0.000 description 1
- 150000002762 monocarboxylic acid derivatives Chemical class 0.000 description 1
- 230000035772 mutation Effects 0.000 description 1
- 229910000510 noble metal Inorganic materials 0.000 description 1
- 238000007344 nucleophilic reaction Methods 0.000 description 1
- 210000000056 organ Anatomy 0.000 description 1
- 150000007524 organic acids Chemical class 0.000 description 1
- 235000005985 organic acids Nutrition 0.000 description 1
- 150000002894 organic compounds Chemical class 0.000 description 1
- 239000011368 organic material Substances 0.000 description 1
- 230000010355 oscillation Effects 0.000 description 1
- PFPYHYZFFJJQFD-UHFFFAOYSA-N oxalic anhydride Chemical compound O=C1OC1=O PFPYHYZFFJJQFD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 125000000636 p-nitrophenyl group Chemical group [H]C1=C([H])C(=C([H])C([H])=C1*)[N+]([O-])=O 0.000 description 1
- 229910052763 palladium Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000005011 phenolic resin Substances 0.000 description 1
- 150000002989 phenols Chemical class 0.000 description 1
- 125000005543 phthalimide group Chemical group 0.000 description 1
- 238000009832 plasma treatment Methods 0.000 description 1
- 229920003023 plastic Polymers 0.000 description 1
- 239000004033 plastic Substances 0.000 description 1
- 229910052697 platinum Inorganic materials 0.000 description 1
- 229920002492 poly(sulfone) Polymers 0.000 description 1
- 239000004584 polyacrylic acid Substances 0.000 description 1
- 229920002239 polyacrylonitrile Polymers 0.000 description 1
- 229920002647 polyamide Polymers 0.000 description 1
- 239000004417 polycarbonate Substances 0.000 description 1
- 229920000515 polycarbonate Polymers 0.000 description 1
- 229920000647 polyepoxide Polymers 0.000 description 1
- 229920000139 polyethylene terephthalate Polymers 0.000 description 1
- 239000005020 polyethylene terephthalate Substances 0.000 description 1
- 229920000098 polyolefin Polymers 0.000 description 1
- 239000000256 polyoxyethylene sorbitan monolaurate Substances 0.000 description 1
- 235000010486 polyoxyethylene sorbitan monolaurate Nutrition 0.000 description 1
- 229920006324 polyoxymethylene Polymers 0.000 description 1
- 229920006380 polyphenylene oxide Polymers 0.000 description 1
- 229920001155 polypropylene Polymers 0.000 description 1
- 229920002223 polystyrene Polymers 0.000 description 1
- 229920002689 polyvinyl acetate Polymers 0.000 description 1
- 239000011118 polyvinyl acetate Substances 0.000 description 1
- 229920002451 polyvinyl alcohol Polymers 0.000 description 1
- 239000004800 polyvinyl chloride Substances 0.000 description 1
- 229920000915 polyvinyl chloride Polymers 0.000 description 1
- 239000005033 polyvinylidene chloride Substances 0.000 description 1
- 239000005373 porous glass Substances 0.000 description 1
- 239000008057 potassium phosphate buffer Substances 0.000 description 1
- 238000002360 preparation method Methods 0.000 description 1
- 238000012545 processing Methods 0.000 description 1
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 description 1
- 230000009257 reactivity Effects 0.000 description 1
- 230000002441 reversible effect Effects 0.000 description 1
- 229910052703 rhodium Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000010948 rhodium Substances 0.000 description 1
- MHOVAHRLVXNVSD-UHFFFAOYSA-N rhodium atom Chemical compound [Rh] MHOVAHRLVXNVSD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 210000003296 saliva Anatomy 0.000 description 1
- 229910052594 sapphire Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000010980 sapphire Substances 0.000 description 1
- 210000002966 serum Anatomy 0.000 description 1
- 208000026775 severe diarrhea Diseases 0.000 description 1
- HBMJWWWQQXIZIP-UHFFFAOYSA-N silicon carbide Chemical compound [Si+]#[C-] HBMJWWWQQXIZIP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229910010271 silicon carbide Inorganic materials 0.000 description 1
- HQVNEWCFYHHQES-UHFFFAOYSA-N silicon nitride Chemical compound N12[Si]34N5[Si]62N3[Si]51N64 HQVNEWCFYHHQES-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229910052814 silicon oxide Inorganic materials 0.000 description 1
- 229910052709 silver Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000004332 silver Substances 0.000 description 1
- 235000010339 sodium tetraborate Nutrition 0.000 description 1
- 239000007787 solid Substances 0.000 description 1
- 239000012453 solvate Substances 0.000 description 1
- 238000001179 sorption measurement Methods 0.000 description 1
- 239000003270 steroid hormone Substances 0.000 description 1
- KZNICNPSHKQLFF-UHFFFAOYSA-N succinimide Chemical group O=C1CCC(=O)N1 KZNICNPSHKQLFF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 210000004243 sweat Anatomy 0.000 description 1
- 238000003786 synthesis reaction Methods 0.000 description 1
- 230000002194 synthesizing effect Effects 0.000 description 1
- 229910003468 tantalcarbide Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000011975 tartaric acid Substances 0.000 description 1
- 235000002906 tartaric acid Nutrition 0.000 description 1
- 210000001138 tear Anatomy 0.000 description 1
- 125000003396 thiol group Chemical group [H]S* 0.000 description 1
- RMVRSNDYEFQCLF-UHFFFAOYSA-N thiophenol Chemical class SC1=CC=CC=C1 RMVRSNDYEFQCLF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 210000001519 tissue Anatomy 0.000 description 1
- 229910003470 tongbaite Inorganic materials 0.000 description 1
- 231100000419 toxicity Toxicity 0.000 description 1
- 230000001988 toxicity Effects 0.000 description 1
- MHMUCYJKZUZMNJ-OWOJBTEDSA-N trans-3-chloroacrylic acid Chemical compound OC(=O)\C=C\Cl MHMUCYJKZUZMNJ-OWOJBTEDSA-N 0.000 description 1
- MTPVUVINMAGMJL-UHFFFAOYSA-N trimethyl(1,1,2,2,2-pentafluoroethyl)silane Chemical compound C[Si](C)(C)C(F)(F)C(F)(F)F MTPVUVINMAGMJL-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- BSVBQGMMJUBVOD-UHFFFAOYSA-N trisodium borate Chemical compound [Na+].[Na+].[Na+].[O-]B([O-])[O-] BSVBQGMMJUBVOD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- UONOETXJSWQNOL-UHFFFAOYSA-N tungsten carbide Chemical compound [W+]#[C-] UONOETXJSWQNOL-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229920006305 unsaturated polyester Polymers 0.000 description 1
- JFALSRSLKYAFGM-UHFFFAOYSA-N uranium(0) Chemical compound [U] JFALSRSLKYAFGM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 210000002700 urine Anatomy 0.000 description 1
- 229920002554 vinyl polymer Polymers 0.000 description 1
- 230000008673 vomiting Effects 0.000 description 1
- XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N water Substances O XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
Images
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6876—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
- C12Q1/6883—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for diseases caused by alterations of genetic material
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
- C12Q2600/142—Toxicological screening, e.g. expression profiles which identify toxicity
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
- C12Q2600/156—Polymorphic or mutational markers
Landscapes
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Analytical Chemistry (AREA)
- Zoology (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Pathology (AREA)
- Immunology (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
Description
(1)グルクロン酸抱合酵素遺伝子のプロモーター領域におけるTATAボックスの遺伝子多型を検出することにより、イリノテカンによる副作用の発生危険度を判定する方法であって、
以下のaおよびbの核酸プローブ、cおよびdの核酸プローブ、eおよびfの核酸プローブ、aおよびfの核酸プローブ、ならびにeおよびbの核酸プローブ:
a)配列番号1における439〜452番目の14塩基を含む連続した25〜35塩基の塩基配列からなる核酸プローブ、
b)配列番号2における439〜450番目の12塩基を含む連続した25〜35塩基の塩基配列からなる核酸プローブ、
c)配列番号1における439〜452番目の14塩基を含む連続した25〜35塩基の塩基配列に相補的な塩基配列からなる核酸プローブ、
d)配列番号2における439〜450番目の12塩基を含む連続した25〜35塩基の塩基配列に相補的な塩基配列からなる核酸プローブ、
e)配列番号1における439〜452番目の14塩基がTA×8の16塩基(TATATATATATATATA)に置換された塩基配列における該16塩基を含む連続した25〜35塩基の塩基配列からなる核酸プローブ、
f)配列番号2における439〜450番目の12塩基がTA×5の10塩基(TATATATATA)に置換された塩基配列における該10塩基を含む連続した25〜35塩基の塩基配列からなる核酸プローブ、
からなる群から選択される少なくとも1の核酸プローブの組と、被検者の生体試料由来のゲノムDNAを鋳型とする増幅反応によって得られた増幅核酸とを用いる核酸ハイブリダイゼーション法において、aの核酸プローブにハイブリダイズした核酸とbの核酸プローブにハイブリダイズした核酸との比、cの核酸プローブにハイブリダイズした核酸とdの核酸プローブにハイブリダイズした核酸との比、eの核酸プローブにハイブリダイズした核酸とfの核酸プローブにハイブリダイズした核酸との比、aの核酸プローブにハイブリダイズした核酸とfの核酸プローブにハイブリダイズした核酸との比、および/またはeの核酸プローブにハイブリダイズした核酸とbの核酸プローブにハイブリダイズした核酸との比を測定することを特徴とする前記方法。
(2)被検者におけるイリノテカンによる副作用の発生危険度を判定する方法であって、
1)被検者の生体試料由来のゲノムDNAを鋳型として、グルクロン酸抱合酵素遺伝子のプロモーター領域におけるTATAボックスを含む領域を増幅する工程、
2)1の工程で得られた増幅核酸を、以下のaおよびbの核酸プローブ、cおよびdの核酸プローブ、eおよびfの核酸プローブ、aおよびfの核酸プローブ、ならびにeおよびbの核酸プローブ:
a)配列番号1における439〜452番目の14塩基を含む連続した25〜35塩基の塩基配列からなる核酸プローブ、
b)配列番号2における439〜450番目の12塩基を含む連続した25〜35塩基の塩基配列からなる核酸プローブ、
c)配列番号1における439〜452番目の14塩基を含む連続した25〜35塩基の塩基配列に相補的な塩基配列からなる核酸プローブ、
d)配列番号2における439〜450番目の12塩基を含む連続した25〜35塩基の塩基配列に相補的な塩基配列からなる核酸プローブ、
e)配列番号1における439〜452番目の14塩基がTA×8の16塩基(TATATATATATATATA)に置換された塩基配列における該16塩基を含む連続した25〜35塩基の塩基配列からなる核酸プローブ、
f)配列番号2における439〜450番目の12塩基がTA×5の10塩基(TATATATATA)に置換された塩基配列における該10塩基を含む連続した25〜35塩基の塩基配列からなる核酸プローブ、
からなる群から選択される少なくとも1の核酸プローブの組にハイブリダイズさせる工程、
3)aの核酸プローブにハイブリダイズした核酸とbの核酸プローブにハイブリダイズした核酸との比、cの核酸プローブにハイブリダイズした核酸とdの核酸プローブにハイブリダイズした核酸との比、eの核酸プローブにハイブリダイズした核酸とfの核酸プローブにハイブリダイズした核酸との比、aの核酸プローブにハイブリダイズした核酸とfの核酸プローブにハイブリダイズした核酸との比、および/またはeの核酸プローブにハイブリダイズした核酸とbの核酸プローブにハイブリダイズした核酸との比を測定する工程
を含む、前記方法。
(3)aの核酸プローブが配列番号3で表される塩基配列を含み、かつbの核酸プローブが配列番号4もしくは17で表される塩基配列を含むか、または
aの核酸プローブが配列番号5で表される塩基配列を含み、かつbの核酸プローブが配列番号6で表される塩基配列を含む、
(1)または(2)記載の方法。
(4)cの核酸プローブが配列番号7で表される塩基配列を含み、かつdの核酸プローブが配列番号8で表される塩基配列を含むか、または
cの核酸プローブが配列番号9で表される塩基配列を含み、かつdの核酸プローブが配列番号10で表される塩基配列を含む、
(1)または(2)記載の方法。
(5)eの核酸プローブが配列番号18で表される塩基配列を含み、かつfの核酸プローブが配列番号19で表される塩基配列を含む、
(1)または(2)記載の方法。
(6)aの核酸プローブが配列番号3において3'末端および/または5'末端の1〜2塩基が欠失した塩基配列からなり、かつbの核酸プローブが配列番号4もしくは17において3'末端および/または5'末端の1〜2塩基が欠失した塩基配列からなるか、または
aの核酸プローブが配列番号5において3'末端および/または5'末端の1〜2塩基が欠失した塩基配列からなり、かつbの核酸プローブが配列番号6において3'末端および/または5'末端の1〜2塩基が欠失した塩基配列からなる、
(1)または(2)記載の方法。
(7)cの核酸プローブが配列番号7において3'末端および/または5'末端の1〜2塩基が欠失した塩基配列からなり、かつdの核酸プローブが配列番号8において3'末端および/または5'末端の1〜2塩基が欠失した塩基配列からなるか、または
cの核酸プローブが配列番号9において3'末端および/または5'末端の1〜2塩基が欠失した塩基配列からなり、かつdの核酸プローブが配列番号10において3'末端および/または5'末端の1〜2塩基が欠失した塩基配列からなる、
(1)または(2)記載の方法。
(8)eの核酸プローブが配列番号18において3'末端および/または5'末端の1〜2塩基が欠失した塩基配列からなり、かつfの核酸プローブが配列番号19において3'末端および/または5'末端の1〜2塩基が欠失した塩基配列からなる、
(1)または(2)記載の方法。
(9)イリノテカンによる副作用を検出するためのキットであって、以下のaおよびbの核酸プローブ、cおよびdの核酸プローブ、eおよびfの核酸プローブ、aおよびfの核酸プローブ、ならびにeおよびbの核酸プローブ:
a)配列番号1における439〜452番目の14塩基を含む連続した25〜35塩基の塩基配列からなる核酸プローブ、
b)配列番号2における439〜450番目の12塩基を含む連続した25〜35塩基の塩基配列からなる核酸プローブ、
c)配列番号1における439〜452番目の14塩基を含む連続した25〜35塩基の塩基配列に相補的な塩基配列からなる核酸プローブ、
d)配列番号2における439〜450番目の12塩基を含む連続した25〜35塩基の塩基配列に相補的な塩基配列からなる核酸プローブ、
e)配列番号1における439〜452番目の14塩基がTA×8の16塩基(TATATATATATATATA)に置換された塩基配列における該16塩基を含む連続した25〜35塩基の塩基配列からなる核酸プローブ、
f)配列番号2における439〜450番目の12塩基がTA×5の10塩基(TATATATATA)に置換された塩基配列における該10塩基を含む連続した25〜35塩基の塩基配列からなる核酸プローブ、
からなる群から選択される少なくとも1の核酸プローブの組を含む、前記キット。
(10)核酸プローブが担体上に固定化されたマイクロアレイを含む、(9)記載のキット。
(11)aの核酸プローブが配列番号3で表される塩基配列を含み、かつbの核酸プローブが配列番号4もしくは17で表される塩基配列を含むか、または
aの核酸プローブが配列番号5で表される塩基配列を含み、かつbの核酸プローブが配列番号6で表される塩基配列を含む、
(9)または(10)記載のキット。
(12)cの核酸プローブが配列番号7で表される塩基配列を含み、かつdの核酸プローブが配列番号8で表される塩基配列を含むか、または
cの核酸プローブが配列番号9で表される塩基配列を含み、かつdの核酸プローブが配列番号10で表される塩基配列を含む、
(9)または(10)記載のキット。
(13)eの核酸プローブが配列番号18で表される塩基配列を含み、かつfの核酸プローブが配列番号19で表される塩基配列を含む、
(9)または(10)記載のキット。
(14)aの核酸プローブが配列番号3において3'末端および/または5'末端の1〜2塩基が欠失した塩基配列からなり、かつbの核酸プローブが配列番号4もしくは17において3'末端および/または5'末端の1〜2塩基が欠失した塩基配列からなるか、または
aの核酸プローブが配列番号5において3'末端および/または5'末端の1〜2塩基が欠失した塩基配列からなり、かつbの核酸プローブが配列番号6において3'末端および/または5'末端の1〜2塩基が欠失した塩基配列からなる、
(9)または(10)記載のキット。
(15)cの核酸プローブが配列番号7において3'末端および/または5'末端の1〜2塩基が欠失した塩基配列からなり、かつdの核酸プローブが配列番号8において3'末端および/または5'末端の1〜2塩基が欠失した塩基配列からなるか、または
cの核酸プローブが配列番号9において3'末端および/または5'末端の1〜2塩基が欠失した塩基配列からなり、かつdの核酸プローブが配列番号10において3'末端および/または5'末端の1〜2塩基が欠失した塩基配列からなる、
(9)または(10)記載のキット。
(16)eの核酸プローブが配列番号18において3'末端および/または5'末端の1〜2塩基が欠失した塩基配列からなり、かつfの核酸プローブが配列番号19において3'末端および/または5'末端の1〜2塩基が欠失した塩基配列からなる、
(9)または(10)記載のキット。
a)配列番号1における439〜452番目の14塩基を含む連続した25〜35塩基、好ましくは27〜33塩基、さらに好ましくは29〜31塩基の塩基配列からなる核酸プローブ、
b)配列番号2における439〜450番目の12塩基を含む連続した25〜35塩基、好ましくは27〜33塩基、さらに好ましくは29〜31塩基の塩基配列からなる核酸プローブ、
c)配列番号1における439〜452番目の14塩基を含む連続した25〜35塩基、好ましくは27〜33塩基、さらに好ましくは29〜31塩基の塩基配列に相補的な塩基配列からなる核酸プローブ、
d)配列番号2における439〜450番目の12塩基を含む連続した25〜35塩基、好ましくは27〜33塩基、さらに好ましくは29〜31塩基の塩基配列に相補的な塩基配列からなる核酸プローブ、
e)配列番号1における439〜452番目の14塩基がTA×8の16塩基(TATATATATATATATA)に置換された塩基配列における該16塩基を含む連続した25〜35塩基の塩基配列からなる核酸プローブ、
f)配列番号2における439〜450番目の12塩基がTA×5の10塩基(TATATATATA)に置換された塩基配列における該10塩基を含む連続した25〜35塩基の塩基配列からなる核酸プローブ、
と、被検者(通常、ヒト被検者をさす)の生体試料由来のゲノムDNAを鋳型とする増幅反応によって得られた増幅核酸とを用いる核酸ハイブリダイゼーション法において、aの核酸プローブにハイブリダイズした核酸とbの核酸プローブにハイブリダイズした核酸との比、cの核酸プローブにハイブリダイズした核酸とdの核酸プローブにハイブリダイズした核酸との比、eの核酸プローブにハイブリダイズした核酸とfの核酸プローブにハイブリダイズした核酸との比、aの核酸プローブにハイブリダイズした核酸とfの核酸プローブにハイブリダイズした核酸との比、および/またはeの核酸プローブにハイブリダイズした核酸とbの核酸プローブにハイブリダイズした核酸との比を測定することを特徴とする。以下、核酸プローブを単にプローブと称する場合もある。
1)被検者の生体試料由来のゲノムDNAを鋳型として、グルクロン酸抱合酵素遺伝子のプロモーター領域におけるTATAボックスを含む領域を増幅する工程、
2)1の工程で得られた増幅核酸を、上記のaおよびbの核酸プローブ、cおよびdの核酸プローブ、eおよびfの核酸プローブ、aおよびfの核酸プローブ、ならびに/またはeおよびbの核酸プローブにハイブリダイズさせる工程、および
3)aの核酸プローブにハイブリダイズした核酸とbの核酸プローブにハイブリダイズした核酸との比、cの核酸プローブにハイブリダイズした核酸とdの核酸プローブにハイブリダイズした核酸との比、eの核酸プローブにハイブリダイズした核酸とfの核酸プローブにハイブリダイズした核酸との比、aの核酸プローブにハイブリダイズした核酸とfの核酸プローブにハイブリダイズした核酸との比、および/またはeの核酸プローブにハイブリダイズした核酸とbの核酸プローブにハイブリダイズした核酸との比を測定する工程
を含む。
1-1. 担体の作製
3mm角のシリコン基板にイオン化蒸着法を用いて、下記の条件で2層のダイヤモンドライクカーボン(DLC)層の製膜を行った。
グルクロン酸抱合酵素遺伝子(UGT1A1)のプロモーター領域の少なくともTATAボックスを含む部分配列であって、TATAボックスにおけるTAの繰り返し配列が6回または7回であり、その塩基長が20mer、30merまたは50merである塩基配列からなる核酸プローブをそれぞれ合成した。
50mer
プローブ1(TA×7): 5'-GTATCGATTGGTTTTTGCCATATATATATATATATAAGTAGGAGAGGGCG-3'(配列番号11)
プローブ2(TA×6): 5'-TGTATCGATTGGTTTTTGCCATATATATATATATAAGTAGGAGAGGGCGA-3'(配列番号12)
30mer
プローブ3(TA×7): 5'-TTTTGCCATATATATATATATATAAGTAGG-3'(配列番号3)
プローブ4(TA×6): 5'-TTTTGCCATATATATATATATAAGTAGGAG-3'(配列番号4)
20mer
プローブ5(TA×7): 5'-GCCATATATATATATATATA-3'(配列番号13)
プローブ6(TA×6): 5'-TTGCCATATATATATATATA-3'(配列番号14)
1-2で合成した各核酸プローブの溶液(10μM)を1-1で作製した担体上にスポッティングした。スポッティングした担体を80℃で1時間加熱後、2xSSC/0.2%SDS溶液で洗浄し、乾燥させることによりマイクロアレイを作製した。
それぞれ異なる遺伝子型を有する被検者の血液(サンプル1〜3)から採取したゲノムDNAを鋳型として、蛍光標識ヌクレオチドを用いたPCR反応を行うことにより、蛍光標識されたターゲットDNA(増幅核酸)を調製した。PCR反応に用いたプライマーは以下の通りである。
フォワードプライマー:5'-CCTTCTTCCTCTCTGGTAACAC-3'(配列番号15)
リバースプライマー:5'-CGTCAGGTGCTAGGACAACTAT-3'(配列番号16)
PCR反応条件を以下の表に示す。
ターゲットDNAを含むハイブリダイズ溶液(4xSSC溶液)を調製し、この溶液25μlに実施例1で作製したマイクロアレイを浸漬し、50℃で2時間ハイブリダイゼーション反応を実施した。マイクロアレイを洗浄後、蛍光スキャナー(FLA8000/富士写真フィルム)で蛍光画像を撮影した(図1)。
GenepixPro(アクソン)を用いて蛍光画像を解析し、各プローブが固定化されたスポットにおける蛍光強度を測定した。DNA量と蛍光強度の検量線を作成し、蛍光強度をDNA量(μM)に換算した。結果を図2に示す。各サンプルについて、TAの繰り返し配列が6回のプローブにハイブリダイズしたDNA量(TA6)とTAの繰り返し配列が7回のプローブにハイブリダイズしたDNA量(TA7)を棒グラフで示す。また、TAの繰り返し配列が6回のプローブにハイブリダイズしたDNA量(TA6)とTAの繰り返し配列が7回のプローブにハイブリダイズしたDNA量(TA7)との比(TA6/T7)を折れ線で示す。
2-1. マイクロアレイの作製
実施例1の1-1と同様にしてシリコン基板表面にDLC層および化学修飾基としてのN-ヒドロキシスクシイミド基を有する担体を作製した。
30merの別の部分配列
プローブ7(TA×7): 5'-ATTGGTTTTTGCCATATATATATATATATA-3'(配列番号5)
プローブ8(TA×6): 5'-CGATTGGTTTTTGCCATATATATATATATA-3'(配列番号6)
相補配列
プローブ9(TA×7): 5'-CCTACTTATATATATATATATATGGCAAAA-3'(配列番号7)
プローブ10(TA×7): 5'-CTCCTACTTATATATATATATATGGCAAAA-3'(配列番号8)
合成した各核酸プローブの溶液(10μM)を実施例1の1-3と同様に担体上にスポッティングすることによりマイクロアレイを作製した。
実施例1の1-4で調製したターゲットDNAを含むハイブリダイズ溶液(4xSSC溶液)を調製し、この溶液25μlに上記2-1で作製したマイクロアレイを浸漬し、50℃で2時間ハイブリダイゼーション反応を実施した。マイクロアレイを洗浄後、蛍光スキャナー(FLA8000/富士写真フィルム)で蛍光画像を撮影した(図3)。
GenepixPro(アクソン)を用いて蛍光画像を解析し、各プローブが固定化されたスポットにおける蛍光強度を測定した。DNA量と蛍光強度の検量線を作成し、蛍光強度をDNA量(μM)に換算した。結果を図4に示す。
3-1. マイクロアレイの作製
実施例1の1-1と同様にしてシリコン基板表面にDLC層および化学修飾基としてのN-ヒドロキシスクシイミド基を有する担体を作製した。
TAの繰り返し配列が6回または7回の塩基配列
プローブ3 (TA×7): 5'-TTTTGCCATATATATATATATATAAGTAGG-3'(配列番号3)
プローブ11(TA×6): 5'-GTTTTTGCCATATATATATATATAAGTAGG-3'(配列番号17)
TAの繰り返し配列が5回または8回の塩基配列
プローブ12(TA×8): 5'-TTGCCATATATATATATATATATAAGTAGG-3'(配列番号18)
プローブ13(TA×5): 5'-TGGTTTTTGCCATATATATATATAAGTAGG-3'(配列番号19)
合成した各核酸プローブの溶液(10μM)を実施例1の1-3と同様に担体上にスポッティングすることによりマイクロアレイを作製した。
実施例1の1-4で調製したターゲットDNAを含むハイブリダイズ溶液(4xSSC溶液)を調製し、この溶液25μlに上記3-1で作製したマイクロアレイを浸漬し、50℃で2時間ハイブリダイゼーション反応を実施した。マイクロアレイを洗浄後、蛍光スキャナー(FLA8000/富士写真フィルム)で蛍光画像を撮影した(図5)。
Claims (6)
- グルクロン酸抱合酵素遺伝子(UGT1A1遺伝子)のプロモーター領域におけるTATAボックスの遺伝子多型を検出することにより、イリノテカンによる副作用の発生危険度を判定するためのデータを取得する方法であって、
以下のaおよびbの核酸プローブの組と、被検者の生体試料由来のゲノムDNAを鋳型とする増幅反応によって得られた増幅核酸とをハイブリダイズさせ、aの核酸プローブにハイブリダイズした核酸とbの核酸プローブにハイブリダイズした核酸との比を測定する工程を含み、
aの核酸プローブとbの核酸プローブの組が:aの核酸プローブが配列番号3で表される塩基配列若しくは当該塩基配列において3'末端および/または5'末端の1〜2塩基が欠失した塩基配列を含む25〜35塩基の核酸プローブ、かつbの核酸プローブが配列番号4若しくは17で表される塩基配列若しくは当該塩基配列において3'末端および/または5'末端の1〜2塩基が欠失した塩基配列を含む25〜35塩基の核酸プローブの組;または、aの核酸プローブが配列番号5で表される塩基配列若しくは当該塩基配列において3'末端および/または5'末端の1〜2塩基が欠失した塩基配列を含む25〜35塩基の核酸プローブ、かつbの核酸プローブが配列番号6で表される塩基配列若しくは当該塩基配列において3'末端および/または5'末端の1〜2塩基が欠失した塩基配列を含む25〜35塩基の核酸プローブの組であることを特徴とする、前記方法。 - グルクロン酸抱合酵素遺伝子(UGT1A1遺伝子)のプロモーター領域におけるTATAボックスの遺伝子多型を検出することにより、イリノテカンによる副作用の発生危険度を判定するためのデータを取得する方法であって、
以下のcおよびdの核酸プローブの組と、被検者の生体試料由来のゲノムDNAを鋳型とする増幅反応によって得られた増幅核酸とをハイブリダイズさせ、cの核酸プローブにハイブリダイズした核酸とdの核酸プローブにハイブリダイズした核酸との比を測定する工程を含み、
cの核酸プローブとdの核酸プローブの組が:cの核酸プローブが配列番号7で表される塩基配列若しくは当該塩基配列において3'末端および/または5'末端の1〜2塩基が欠失した塩基配列を含む25〜35塩基の核酸プローブ、かつdの核酸プローブが配列番号8で表される塩基配列若しくは当該塩基配列において3'末端および/または5'末端の1〜2塩基が欠失した塩基配列を含む25〜35塩基の核酸プローブの組;または、cの核酸プローブが配列番号9で表される塩基配列若しくは当該塩基配列において3'末端および/または5'末端の1〜2塩基が欠失した塩基配列を含む25〜35塩基の核酸プローブ、かつdの核酸プローブが配列番号10で表される塩基配列若しくは当該塩基配列において3'末端および/または5'末端の1〜2塩基が欠失した塩基配列を含む25〜35塩基の核酸プローブの組であることを特徴とする、前記方法。 - グルクロン酸抱合酵素遺伝子(UGT1A1遺伝子)のプロモーター領域におけるTATAボックスの遺伝子多型を検出することにより、イリノテカンによる副作用の発生危険度を判定するためのデータを取得する方法であって、
以下のeおよびfの核酸プローブの組と、被検者の生体試料由来のゲノムDNAを鋳型とする増幅反応によって得られた増幅核酸とをハイブリダイズさせ、eの核酸プローブにハイブリダイズした核酸とfの核酸プローブにハイブリダイズした核酸との比を測定する工程を含み、
eの核酸プローブとfの核酸プローブの組が、eの核酸プローブが配列番号18で表される塩基配列若しくは当該塩基配列において3'末端および/または5'末端の1〜2塩基が欠失した塩基配列を含む25〜35塩基の核酸プローブ、かつfの核酸プローブが配列番号19で表される塩基配列若しくは当該塩基配列において3'末端および/または5'末端の1〜2塩基が欠失した塩基配列を含む25〜35塩基の核酸プローブの組であることを特徴とする、前記方法。 - イリノテカンによる副作用を検出するための、以下のaおよびbの核酸プローブの組を含むキットであって、
aの核酸プローブとbの核酸プローブの組が:aの核酸プローブが配列番号3で表される塩基配列若しくは当該塩基配列において3'末端および/または5'末端の1〜2塩基が欠失した塩基配列を含む25〜35塩基の核酸プローブ、かつbの核酸プローブが配列番号4若しくは17で表される塩基配列若しくは当該塩基配列において3'末端および/または5'末端の1〜2塩基が欠失した塩基配列を含む25〜35塩基の核酸プローブの組;または、aの核酸プローブが配列番号5で表される塩基配列若しくは当該塩基配列において3'末端および/または5'末端の1〜2塩基が欠失した塩基配列を含む25〜35塩基の核酸プローブ、かつbの核酸プローブが配列番号6で表される塩基配列若しくは当該塩基配列において3'末端および/または5'末端の1〜2塩基が欠失した塩基配列を含む25〜35塩基の核酸プローブの組であることを特徴とする、前記キット。 - イリノテカンによる副作用を検出するための、以下のcおよびdの核酸プローブの組を含むキットであって、
cの核酸プローブとdの核酸プローブの組が:cの核酸プローブが配列番号7で表される塩基配列若しくは当該塩基配列において3'末端および/または5'末端の1〜2塩基が欠失した塩基配列を含む25〜35塩基の核酸プローブ、かつdの核酸プローブが配列番号8で表される塩基配列若しくは当該塩基配列において3'末端および/または5'末端の1〜2塩基が欠失した塩基配列を含む25〜35塩基の核酸プローブの組;または、cの核酸プローブが配列番号9で表される塩基配列若しくは当該塩基配列において3'末端および/または5'末端の1〜2塩基が欠失した塩基配列を含む25〜35塩基の核酸プローブ、かつdの核酸プローブが配列番号10で表される塩基配列若しくは当該塩基配列において3'末端および/または5'末端の1〜2塩基が欠失した塩基配列を含む25〜35塩基の核酸プローブの組であることを特徴とする、前記キット。 - イリノテカンによる副作用を検出するための、以下のeおよびfの核酸プローブの組を含むキットであって、
eの核酸プローブとfの核酸プローブの組が、eの核酸プローブが配列番号18で表される塩基配列若しくは当該塩基配列において3'末端および/または5'末端の1〜2塩基が欠失した塩基配列を含む25〜35塩基の核酸プローブ、かつfの核酸プローブが配列番号19で表される塩基配列若しくは当該塩基配列において3'末端および/または5'末端の1〜2塩基が欠失した塩基配列を含む25〜35塩基の核酸プローブの組であることを特徴とする、前記キット。
Priority Applications (2)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
JP2006253066A JP4884899B2 (ja) | 2006-09-19 | 2006-09-19 | イリノテカンの副作用の発生危険度を判定する方法およびそのためのキット |
US11/857,064 US7943311B2 (en) | 2006-09-19 | 2007-09-18 | Kits and method for determining the risk of adverse effects of irinotecan comprising hybridizing pairs of nucleic acid probes |
Applications Claiming Priority (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
JP2006253066A JP4884899B2 (ja) | 2006-09-19 | 2006-09-19 | イリノテカンの副作用の発生危険度を判定する方法およびそのためのキット |
Publications (2)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
JP2008072913A JP2008072913A (ja) | 2008-04-03 |
JP4884899B2 true JP4884899B2 (ja) | 2012-02-29 |
Family
ID=39345641
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
JP2006253066A Active JP4884899B2 (ja) | 2006-09-19 | 2006-09-19 | イリノテカンの副作用の発生危険度を判定する方法およびそのためのキット |
Country Status (2)
Country | Link |
---|---|
US (1) | US7943311B2 (ja) |
JP (1) | JP4884899B2 (ja) |
Families Citing this family (7)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
WO2008066136A1 (en) | 2006-11-30 | 2008-06-05 | Arkray, Inc. | Primer set for amplification of ugt1a1 gene, reagent for amplification of ugt1a1 gene comprising the same, and use of the same |
JP5376841B2 (ja) * | 2008-06-19 | 2013-12-25 | ソニー株式会社 | イリノテカンの副作用の発生危険度を判定する方法、及びこれに用いられるdnaチップとキット |
WO2010025952A1 (en) * | 2008-09-05 | 2010-03-11 | Medizinische Hochschule Hannover | Method for genotyping ugt1a1*28 promoter region variant and systems useful therefor |
JP2011250726A (ja) * | 2010-06-01 | 2011-12-15 | Toyo Kohan Co Ltd | イリノテカンの副作用の発生危険度を判定する方法及びそのためのキット |
CN107208163B (zh) | 2015-02-17 | 2021-01-08 | 国立大学法人山口大学 | 辅助对伊立替康副作用的发生风险的预测的方法 |
JP6915804B2 (ja) | 2017-06-22 | 2021-08-04 | 国立大学法人山口大学 | イリノテカンの治療効果予測方法及びそのためのキット |
JP7123593B2 (ja) * | 2018-03-23 | 2022-08-23 | 東洋鋼鈑株式会社 | マイクロサテライト検出マイクロアレイ及びこれを用いたマイクロサテライト検出方法 |
Family Cites Families (5)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US6274310B1 (en) * | 1997-06-24 | 2001-08-14 | The General Hospital Corporation | Compositions and methods for detecting pancreatic disease |
ES2346848T3 (es) * | 2000-12-12 | 2010-10-21 | Nagoya Industrial Science Research Institute | Procedimiento de estimacion del riesgo de expresion de una reaccion farmacologica adversa causada por la administracion de un compuesto que se metaboliza per se mediante la enzima ugt1a1 o cuyo intermedio se metaboliza mediante la enzima. |
US20060160074A1 (en) * | 2001-12-27 | 2006-07-20 | Third Wave Technologies, Inc. | Pharmacogenetic DME detection assay methods and kits |
JP4096037B2 (ja) * | 2002-08-12 | 2008-06-04 | 国立大学法人滋賀医科大学 | グルクロン酸転移酵素遺伝子の変異解析による薬剤代謝活性の予測方法 |
US20040203034A1 (en) * | 2003-01-03 | 2004-10-14 | The University Of Chicago | Optimization of cancer treatment with irinotecan |
-
2006
- 2006-09-19 JP JP2006253066A patent/JP4884899B2/ja active Active
-
2007
- 2007-09-18 US US11/857,064 patent/US7943311B2/en active Active
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
JP2008072913A (ja) | 2008-04-03 |
US20080153093A1 (en) | 2008-06-26 |
US7943311B2 (en) | 2011-05-17 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
JP4884899B2 (ja) | イリノテカンの副作用の発生危険度を判定する方法およびそのためのキット | |
US20200190595A1 (en) | Kit for evaluating gene mutation related to myeloproliferative tumor | |
JP5376841B2 (ja) | イリノテカンの副作用の発生危険度を判定する方法、及びこれに用いられるdnaチップとキット | |
WO2011152272A1 (ja) | イリノテカンの副作用の発生危険度を判定する方法及びそのためのキット | |
JP2016192939A (ja) | Cyp2c19*2検出用プローブ及びcyp2c19*3検出用プローブ | |
WO2019182103A1 (ja) | マイクロサテライト検出マイクロアレイ及びこれを用いたマイクロサテライト検出方法 | |
JP7248982B2 (ja) | 遺伝子変異評価方法、遺伝子変異評価用キット | |
JP2016192940A (ja) | CYP3A4*1b検出用プローブ及びCYP3A5*3検出用プローブ | |
WO2022149575A1 (ja) | Mlh1メチル化修飾及びbraf変異を検出するためのキット | |
WO2021039958A1 (ja) | 骨髄増殖性腫瘍に関連する遺伝子変異評価用キット | |
JP5607373B2 (ja) | マイクロアレイの検出方法 | |
JPWO2009130797A1 (ja) | Abo式血液型を判定するためのプローブセット | |
WO2020067388A1 (ja) | 甲状腺乳頭癌の予後予測に関連する遺伝子変異評価用キット | |
JP6995604B2 (ja) | 一塩基多型検出用プローブの設計方法及びプローブセット | |
JP7487040B2 (ja) | 骨髄増殖性腫瘍に関連する遺伝子変異評価用キット | |
JP6028299B2 (ja) | 人獣判定するためのプライマーセット及びプローブ | |
JP6028300B2 (ja) | Abo式血液型を判定するためのプライマーセット及びプローブ | |
JP2020162503A (ja) | CpGアイランドにおけるメチル化判別方法及びメチル化判別キット | |
JP7456739B2 (ja) | 骨髄増殖性腫瘍に関連する遺伝子変異評価用キット | |
JP2024102248A (ja) | 骨髄増殖性腫瘍に関連する遺伝子変異評価用キット | |
JP6735105B2 (ja) | ゲムシタビンによる副作用を予測する方法及びdnaチップ | |
JP2014103904A (ja) | K−rasにおける変異検出用オリゴヌクレオチドプローブ | |
JP2016192941A (ja) | Cyp2c9*3検出用プローブ | |
JP2015198581A (ja) | Il28b遺伝子における多型検出用プローブ、当該多型検出用プローブを有するdnaチップ、当該多型検出用プローブを用いたc型慢性肝炎の治療効果を予測するためのデータ取得方法 | |
WO2009128399A1 (ja) | Bkウイルスのゲノム型を判定するためのオリゴヌクレオチドプローブ及びマイクロアレイ |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
A621 | Written request for application examination |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A621 Effective date: 20090401 |
|
A131 | Notification of reasons for refusal |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A131 Effective date: 20110823 |
|
A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523 Effective date: 20111021 |
|
TRDD | Decision of grant or rejection written | ||
A01 | Written decision to grant a patent or to grant a registration (utility model) |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A01 Effective date: 20111129 |
|
A01 | Written decision to grant a patent or to grant a registration (utility model) |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A01 |
|
A61 | First payment of annual fees (during grant procedure) |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A61 Effective date: 20111207 |
|
FPAY | Renewal fee payment (event date is renewal date of database) |
Free format text: PAYMENT UNTIL: 20141216 Year of fee payment: 3 |
|
R150 | Certificate of patent or registration of utility model |
Ref document number: 4884899 Country of ref document: JP Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R150 |
|
R250 | Receipt of annual fees |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250 |
|
R250 | Receipt of annual fees |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250 |
|
R250 | Receipt of annual fees |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250 |
|
R250 | Receipt of annual fees |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250 |
|
R250 | Receipt of annual fees |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250 |
|
R250 | Receipt of annual fees |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250 |
|
R250 | Receipt of annual fees |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250 |
|
R250 | Receipt of annual fees |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250 |
|
R250 | Receipt of annual fees |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250 |
|
R250 | Receipt of annual fees |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250 |