JP4495429B2 - ロドコッカス属細菌の形質転換方法 - Google Patents
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(a)プラスミドDNAを含む、形質転換の対象となるロドコッカス属細菌とは異なるロドコッカス属細菌またはその類縁菌を調製する工程、
(b)工程(a)で調製した細菌からプラスミドDNAを調製する工程、
(c)工程(b)により調製したプラスミドDNAを用いて形質転換対象ロドコッカス属細菌株を形質転換する工程。
本発明に係るロドコッカス属細菌の形質転換方法は、形質転換しようとするロドコッカス属細菌とは異なるロドコッカス属細菌またはその類縁株からプラスミドDNAを調製し、そのプラスミドDNAを用いて形質転換対象ロドコッカス属細菌を形質転換することによって、ロドコッカス属細菌における形質転換効率を高めるものである。
本発明に係る形質転換方法の形質転換の対象となるロドコッカス属細菌(本明細書中、「形質転換対象ロドコッカス属細菌」ともいう)は、特に限定されるものではなく、例えば、ロドコッカス・ロドクロウス(Rhodococcus rhodocrous)、ロドコッカス・エリスロポリス(Rhodococcus erythropolis)、ロドコッカス・エクイ(Rhodococcus equi)、ロドコッカス・ロドニ(Rhodococcus rhodnii)、 ロドコッカス・コラリヌス(Rhodococcus corallinus)、ロドコッカス・ルブロペルチンクタス(Rhodococcus rubropertinctus)、ロドコッカス・コプロフィラス(Rhodococcus coprophilus)、ロドコッカス・グロベルルス(Rhodococcus globerulus)、ロドコッカス・クロロフェノリカス(Rhodococcus chlorophenolicus)、ロドコッカス・ルテウス(Rhodococcus luteus)、ロドコッカス・アイシェンシス(Rhodococcus aichiensis)、ロドコッカス・チュブエンシス(Rhodococcus chubuensis)、ロドコッカス・マリス(Rhodococcus maris)、ロドコッカス・ファシエンス(Rhodococcus fascines)等が挙げられる。特に、本発明に係る形質転換方法は、現在までに形質転換体が得られていないロドコッカス属細菌にも適用可能であり、有効である。そのようなロドコッカス属細菌の例としては、ロドコッカス・ロドクロウスJ−1株、ロドコッカス・ロドクロウスATCC4273株、ATCC15905株、ATCC21197株、ATCC14894株などが挙げられる。ロドコッカス・ロドクロウスJ−1株は、Rhodococcus rhodocrouse J−1(FERM BP−1478)として独立行政法人産業技術総合研究所 特許生物寄託センター(茨城県つくば市東1丁目1番地1 中央第6)に、昭和62年9月18日に寄託されている。形質転換対象ロドコッカス属細菌には、上述したような菌株(例えばロドコッカス・ロドクロウスJ−1株)に変異剤処理や紫外線照射等によって変異を導入した変異株なども含まれる。ロドコッカス・ロドクロウスATCC4273株、ATCC15905株、ATCC21197株およびATCC14894株は、アメリカンタイプカルチャーコレクションから容易に入手可能である。
本発明の形質転換方法においては、形質転換対象ロドコッカス属細菌とは異なるロドコッカス属細菌またはその類縁菌(本明細書中、「異なるロドコッカス属細菌またはその類縁菌」ともいう)からプラスミドDNAを調製する。当該異なるロドコッカス属細菌またはその類縁菌は、形質転換対象ロドコッカス属細菌と菌株の種類が異なる限り特に限定されるものではない。例えば、ロドコッカス・ロドクロウス、ロドコッカス・エリスロポリス、ロドコッカス・エクイ、ロドコッカス・ロドニ、ロドコッカス・コラリヌス、ロドコッカス・ルブロペルチンクタス、ロドコッカス・コプロフィラス、ロドコッカス・グロベルルス、ロドコッカス・クロロフェノリカス、ロドコッカス・ルテウス、ロドコッカス・アイシェンシス、ロドコッカス・チュブエンシス、ロドコッカス・マリス、ロドコッカス・ファシエンス等が挙げられる。また、ロドコッカス属細菌の類縁菌としては、ゴルドナ・テラエ(Gordonia terrae)、ゴルドナ・スプチ(Gordonia sputi)、ゴルドナ・ルブロペルチンクタス(Gordonia rubropertinctus)等が挙げられる。本発明に係る形質転換方法においては、ロドコッカス・ロドクロウスATCC12674株、ロドコッカス・ロドクロウスATCC17894株、ロドコッカス・ロドクロウスATCC19140株、ロドコッカス・ロドクロウスATCC33258株、ロドコッカス sp N774株、ロドコッカス・エリスロポリスSK92株が好ましい。ロドコッカス・ロドクロウスATCC12764株、ATCC17895株、およびATCC19140株は、アメリカンタイプカルチャーコレクションから容易に入手可能であり、ロドコッカス sp N774株は受託番号FEPM P−1936として、ロドコッカス・エリスロポリスSK92株は受託番号FEPM BP−3324として独立行政法人産業技術総合研究所 特許生物寄託センター(茨城県つくば市東1丁目1番地1 中央第6)に寄託されており、容易に入手可能である。
上述のように異なるロドコッカス属細菌またはその類縁菌から調製したプラスミドDNAを用いて、形質転換対象ロドコッカス属細菌を形質転換する。形質転換は、前項「2.プラスミドDNAの調製」に記載のようにして、任意の手法により行うことができる。また、形質転換を行う際には、プラスミドDNAの導入効率を高めるために細胞壁の構造を変化させたり、形質転換体の効率的な選抜のためにマーカー薬剤遺伝子と選択培地を使用してもよい。これらの手順は、前項「2.プラスミドDNAの調製」に記載のように実施することができる。
(1)プラスミドDNAの調製
本実施例に使用するDNA pK4は、ロドコッカス・ロドクロウスATCC12674/pK4株に導入されて、受託番号FERM BP−3731号として、独立行政法人 産業技術総合研究所特許生物寄託センター(茨城県つくば市東1丁目1番地1 中央第6)に寄託されている。
10mlのMYKG培地(ポリペプトン0.5%、バクトイーストエキス0.3%、マルツエキス0.3%、KH2PO40.2%、K2HPO40.2%、グルコース1%)にロドコッカス・ロドクロウスJ−1株を植菌し、30℃で培養した。15〜17時間後、終濃度2%となるように滅菌した20%グリシン溶液を添加し、さらに24時間培養した。この培養液を1%グリシンを含んだ10mlのMYKG培地に2%植菌し、さらに30℃で48時間培養を行った。この培養液を滅菌水で3回洗浄し、最後に滅菌水500μlに再懸濁した。これをコンピテントセルとして用いた。
前項(1)で調製したDNA(pK4)1μlと前項(2)で調製したJ−1株コンピテントセル10μlを混合し、30分間氷冷した。キュベットにDNAと菌体の懸濁液を入れ、遺伝子導入装置GenePulser(BIO RAD)により20KV/cm、100Ωで電気パルス処理を行った。電気パルス処理液を氷冷下10分静置し、37℃で10分間ヒートショックを行い、MYK培地(0.5%ポリペプトン、0.3%バクトイーストエキス、0.3%バクトモルトエキス、0.2%K2HPO4、0.2%KH2PO4)500μlを加え、30℃にて24時間静置した後、10μg/mlカナマイシン入りMYK寒天培地に塗布し、30℃にて3日間培養した。コロニー数はプレート上に生育したコロニー数を示す。
このように、JM109株由来のDNAでは形質転換体が得られなかったのに対し、ATCC12674形質転換体から調製したDNAを用いることにより、ロドコッカス・ロドクロウスJ−1株の形質転換体が得られた。
(1)プラスミドDNAの調製
実施例1で調製したプラスミドDNAを用いて種々の宿主細菌を形質転換した。
ロドコッカス・ロドクロウスATCC17895株の対数増殖期の細胞を遠心分離器により集菌し、氷冷した滅菌水にて3回洗浄し、滅菌水に懸濁した。DNA(pK4)1μlと菌体懸濁液10μlを混合し、氷冷した。キュベットにDNAと菌体の懸濁液を入れ、遺伝子導入装置GenePulser(BIO RAD)により20KV/cm、200Ωで電気パルス処理を行った。電気パルス処理液を氷冷下10分静置し、37℃で10分間ヒートショックを行い、MYK培地(0.5%ポリペプトン、0.3%バクトイーストエキス、0.3%バクトモルトエキス、0.2%K2HPO4、0.2 KH2PO4)500μlを加え、30℃にて5時間静置した後、50μg/mlカナマイシン入りMYK寒天培地に塗布し、30℃にて3日間培養した。このようにして得られたコロニーをATCC17895/pK4として用いた。
次に得られた形質転換体から実施例1(1)の方法に従いDNAの調製を行った。
前項(1)で調製したDNAを使用し、実施例1の(3)と同様の操作を行ってロドコッカス・ロドクロウスJ−1株に形質転換した。選択プレートのカナマイシン濃度は10μg/mlを使用し、比較対照として大腸菌JM109株から調製したDNAを用いてロドコッカス・ロドクロウスJ−1株を形質転換した。表2に結果を示した。
このように、大腸菌JM109株由来のDNAではロドコッカス・ロドクロウスJ−1株の形質転換体が得られなかったのに対し、ATCC12674形質転換体から調製したDNAを用いることにより、ロドコッカス・ロドクロウスJ−1株の形質転換体が得られた。
(1)プラスミドDNA pSJ023の調製
本実施例で使用するpSJ023は、ロドコッカス・ロドクロウスATCC12674/pSJ023に導入されて、受託番号FERM P−16108として独立行政法人 産業技術総合研究所特許生物寄託センター(茨城県つくば市東1丁目1番地1 中央第6)に寄託されている。
10mlのMYKG培地(ポリペプトン0.5%、バクトイーストエキス0.3%、マルツエキス0.3%、KH2PO40.2%、K2HPO40.2%、グルコース1%)にロドコッカス・ロドクロウスJ−1株を植菌し、30℃で24時間培養した。
前項(1)で調製したDNA(pSJ023)と前項(2)で作製したコンピテントセルを用い、その他は実施例1と同様の操作を行った。選択プレートのカナマイシン濃度は10μg/mlを使用し、比較対照として大腸菌JM109株から調製したDNAを用いた。表3に結果を示した。
Claims (7)
- 下記の工程:
(a)プラスミドDNAを含む、形質転換の対象となるロドコッカス・ロドクロウスJ−1株(FERM BP−1478)またはその変異株とは異なるロドコッカス属細菌を調製する工程、
(b)工程(a)で調製した細菌からプラスミドDNAを調製する工程、
(c)工程(b)により調製したプラスミドDNAを用いて形質転換対象のロドコッカス・ロドクロウスJ−1株又はその変異株を形質転換する工程
を含む、ロドコッカス属細菌の形質転換方法。 - 工程(a)が、プラスミドDNAを用いて異なるロドコッカス属細菌を形質転換することにより行われる、請求項1記載の形質転換方法。
- 異なるロドコッカス属細菌が、ロドコッカス・ロドクロウスATCC12674、ロドコッカス・ロドクロウスATCC17895、ロドコッカス・ロドクロウスATCC19140、ロドコッカス・ロドクロウスATCC33258、ロドコッカス sp N774、またはロドコッカス・エリスロポリスSK92である、請求項1又は2記載の形質転換方法。
- 形質転換対象の細菌が、グリシン、ペニシリンGまたはイソニコチン酸ヒドラジドで処理されているものである、請求項1〜3のいずれか1項に記載の形質転換方法。
- 形質転換が電気パルス法を用いて行われる、請求項1〜4のいずれか1項に記載の形質転換方法。
- 形質転換が、ロドコッカス属細菌内で自律複製可能で、かつ薬剤耐性遺伝子を含むプラスミドDNAを用い、該薬剤の存在下で宿主細菌を培養し、形質転換体を選択することを含む、請求項1〜5のいずれか1項に記載の形質転換方法。
- 薬剤がカナマイシンである、請求項6記載の形質転換方法。
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