JP4904444B2 - シャトルベクター - Google Patents
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(1)ロドコッカス属に属する微生物内およびエシェリキア属に属する微生物内において複製可能なベクターであって、ロドコッカス属に属する微生物内で目的タンパク質を誘導発現可能なベクター。
(2)以下の(a)、(b)および(c)の領域を含むことを特徴とするベクター。
(b) エシェリキア属に属する微生物内で複製可能なDNA領域
(c) ニトリラーゼ系誘導型発現プロモーター領域
ここで、上記(a) ロドコッカス属に属する微生物内で複製可能なDNA領域が、ロドコッカス・エリスロポリスPR4株の環状プラスミド(例えばpREC2)由来のプラスミド複製領域であってもよい。このプラスミド複製領域は、例えば、複製タンパク質およびDNA結合複製タンパク質をコードするDNA領域である。
(3)受領番号がFERM AP-20328であるベクター。
(4)配列番号7で表される塩基配列を含むベクター。
(5)上記(1)〜(4)記載のベクターに目的タンパク質をコードするDNAを挿入した組換えベクター。
(6)上記(1)〜(4)記載のベクターまたは上記(5)記載の組換えベクターにより、宿主を形質転換した形質転換体。
(7)上記(6)記載の形質転換体を培養し、得られる培養物から目的タンパク質を採取することを特徴とする、目的タンパク質の製造方法。
本発明のベクターは、ロドコッカス(Rhodococcus)属に属する微生物(以下、「ロドコッカス属微生物」ともいう)内で複製可能なDNA領域、エシェリキア(Escherichia)属に属する微生物(以下、「エシェリキア属微生物」ともいう)内で複製可能なDNA領域およびロドコッカス属微生物由来のニトリラーゼ系誘導型発現プロモーター領域を有する。すなわち、本発明のベクターは、ロドコッカス属微生物内およびエシェリキア属微生物内のいずれにおいても複製可能なシャトルベクタープラスミドであり、目的タンパク質をロドコッカス属微生物内で発現させるのに有効なベクターである。
2.ロドコッカス属に属する微生物内で複製可能なDNA領域
(1)PR4株由来環状プラスミド
本発明のシャトルベクターは、ロドコッカス・エリスロポリスPR4 (Rhodococcus erythropolis PR4)株(MBIC社)から得られる環状プラスミドである、pREC2をもとにして作製することができる。ロドコッカス・エリスロポリスPR4株の全ゲノム配列は、すでに独立行政法人 製品評価技術基盤機構(National Institute of Technology and Evaluation; NITE)によって決定されている。それによると、ロドコッカス・エリスロポリスPR4株は、約270 kbpの線状プラスミド(pREL1;GC含量61.9%)一つと、約100 kbpと約3.6kbpの環状プラスミド二つ(pREC1;GC含量63.0%、pREC2;GC含量62.2%)とを有していることが明らかにされている(図1)。pREC2の塩基配列を配列番号1に示す。この環状プラスミド(pREC1、pREC2)は、上記PR4株の潜在性プラスミドであるため、PR4株で確実に複製されるものである。すなわち、pREC1またはpREC2上に存在するpREC1またはpREC2の複製に関与するDNA領域を明らかにし、当該DNA領域を含有させたプラスミドを作製すると、このようなプラスミドは、ロドコッカス属微生物内で複製することが可能となる。本発明のベクターは、pREC1またはpREC2のプラスミド複製領域を含むものであるため、ロドコッカス属微生物内で複製することが可能である。
(2)ロドコッカス属微生物内で複製可能なDNA領域
本発明において、ロドコッカス属微生物内で複製可能なDNA領域としては、ロドコッカス属微生物内で複製が可能であれば、pREC1またはpREC2の全体であってもよく、一部であってもよい。ここで、本発明のシャトルベクターがロドコッカス属微生物内で複製が可能となるには、pREC1またはpREC2の複製に関与する部位、すなわちプラスミド複製領域を少なくとも含む必要がある。上記のpREC1またはpREC2のプラスミド複製領域のプラスミド中での存在位置は、例えば、pREC1またはpREC2を各種制限酵素で処理して、種々の長さを有するDNA断片を調製し、得られたDNA断片でロドコッカス属微生物を形質転換し、いずれの長さのDNA断片を有する形質転換体が複製できるかを調べることにより、明らかにすることができる。あるいは、以下の方法により、プラスミド複製領域の存在位置を明らかにすることができる。
(3)制限酵素認識部位
上記(2)のロドコッカス属微生物内で複製可能なDNA領域は、本発明のベクターが当該微生物内において複製するのに必要なプラスミド複製領域であるため、本発明のベクターを構築する上で、これらの領域を破壊しないような制限酵素を選択しておく必要がある。前述のpREC2の場合も、二つのORFを破壊しないような制限酵素を選択する必要がある。
3.エシェリキア属に属する微生物内で複製可能なDNA領域
本発明のベクターは、エシェリキア属微生物内において複製可能なDNA領域を含むため、エシェリキア属に属する微生物内で複製することができる。プラスミドがエシェリキア属微生物内において複製可能であるためには、エシェリキア属微生物のプラスミド由来の複製領域(ori)を含有すればよい。エシェリキア属微生物内において複製可能なDNAとしては、pHSG299、pHSG298(以上、タカラバイオ社)、pUC19、pUC18などのプラスミドを用いることが可能であり、複製領域を有する限り、プラスミド全体であってもよく、あるいは一部分であってもよい。pHSG298の塩基配列を配列番号6に示す。
4.シャトルベクターの構築
本発明のベクターは、ロドコッカス属微生物内およびエシェリキア属微生物内で複製可能なシャトルベクターである。上記2および3のDNA領域を含有したベクターは、ロドコッカス属微生物内およびエシェリキア属由来微生物内で複製することが可能である。
5.ニトリラーゼ系誘導型発現プロモーター領域
ロドコッカス・ロドクロスJ1(Rhodococcus rhodochrous J1)株は、アクリルアミドやニコチンアミドの工業的生産に用いられている菌である。J1株からは、ニトリル(RCN)の加水分解を触媒するニトリラーゼが発現しており、ε−カプロラクタム(caprolactam)またはイソバレロニトリルの添加によって、J1株の可溶性タンパク質全体の35%にも相当する量のニトリラーゼが産生されることが知られている(図5)。
6.ロドコッカス属微生物用の誘導型発現シャトルベクターの構築
本発明のロドコッカス属微生物用の誘導型発現シャトルベクターは、pREC2由来のロドコッカス属微生物内で複製可能なDNA領域(上記2参照)と、エシェリキア属微生物内で複製可能なDNA領域(上記3参照)と、ニトリラーゼ系誘導型発現プロモーター領域(上記5参照)とを含むものである。上記の各DNA領域を単離し、連結することは、当業者であれば、適宜公知の技術を用いて容易に行うことができる。
7.ロドコッカス属微生物における目的タンパク質の発現
(1)組換えベクター
本発明のロドコッカス属微生物用誘導発現シャトルベクターを用いて目的のタンパク質をロドコッカス属微生物において発現させるためには、本発明のベクターに目的タンパク質をコードするDNAを挿入した組換えベクターを作製する必要がある。
(2)形質転換体
本発明の形質転換体は、宿主を本発明のベクターまたは本発明の組換えベクターで形質転換することで作製できる。形質転換の方法は、例えばエレクトロポレーション法、リン酸カルシウム法、DEAEデキストラン法を用いることができる。エレクトロポレーション法は、上記4を参照することができる。本発明において用いる宿主は、ロドコッカス属微生物、エシェリキア属微生物である。目的タンパク質を発現させるために用いる宿主は、好ましくはロドコッカス属微生物である。ベクタープラスミドの増殖、回収に用いる宿主は、ロドコッカス属微生物またはエシェリキア属微生物を用いることができるが、好ましくはエシェリキア属微生物である。
(3)タンパク質の産生
本発明は、目的タンパク質の製造方法も提供することができる。すなわち、(2)の形質転換体を培養し、得られる培養物から目的タンパク質を採取することにより、目的タンパク質を製造することができる。
以下、実施例により本発明を具体的に説明するが、本発明は実施例によって限定されるものではない。
(1)ロドコッカス属微生物からのプラスミドの抽出
ロドコッカス属微生物からのプラスミドの大量調製は、Sambrook and Russellの方法を参考にした。培養液には2YT +Km(カナマイシン)を用いた。
(2)大腸菌からのプラスミド抽出
大腸菌の培養液は、5 ml 2YT +50μg/ml Km(カナマイシン)を用いた。
(3)アガロースゲルからのDNA断片抽出
MagExtractor-PCR & Gel clean up-キット(東洋紡社)を用いて、アガロースゲルから説明書に従いDNA断片を抽出した。
(1)PCR組成、PCR反応条件
L-NHaseは、αサブユニットとβサブユニットとが会合した高次構造をとっている。L-NHaseを構成するαサブユニットとβサブユニットをコードするそれぞれの遺伝子(nhlA、nhlB)をKOD-PLUS DNA Polymerase (東洋紡社)で増幅した。鋳型には、pLJK60を用いた。PCRに用いたプライマーは、以下のとおりである。
L-NHase-S; 5'-CATCTAgAAgCAACggAggTACggACATggATggAATCCACgACCTCggTggCCgC-3'(配列番号11)(5'末端側にXbaIサイトを付加してある)、および、
L-NHase-AS; 5'-CAgAgCTCTCAggCCTTgCTgggTgTgg-3'(配列番号12)(5'末端側にSacIサイトを付加してある)
反応液組成は、KOD-PLUS DNA Polymeraseの説明書に従った。
(3)形質転換方法
2YT培地(100mL/500mL坂口フラスコ)に前述のPR4株またはRhodococcus fascians JCM6163菌を植菌し、28℃でOD660=0.9-1.2まで培養した後、集菌(3,000rpm, 10min, 4℃)した。菌体を、氷冷した滅菌milliQで1回、同じく氷冷した10%グリセロールで2回リンスした後、10%グリセロール 2.5mLに懸濁し(40倍濃縮)、分注してコンピテントセルとした。コンピテントセルを-80℃で保存し、使用する直前に氷中にて融解させて使用した。
(4)コロニーの確認
プラスミド導入から3-5日でロドコッカス属にてコロニーの形成を確認した。大腸菌から抽出したプラスミドを導入した場合の形質転換効率は、PR4株を宿主とした場合は、101 cfu/μgプラスミド、JCM6163株を宿主とした場合は103 cfu/μgプラスミドであった。ロドコッカス属から抽出したプラスミドを導入した場合の形質転換効率は、JCM6163株を宿主とした場合は105 cfu/μgプラスミドであった。
(5)プラスミド抽出
実施例1記載の方法と同様の方法で、大腸菌及びロドコッカス属のコロニーからプラスミドの抽出を行った。
(6)SDS-PAGE
Sambrook and Russellの方法に従い、12%のポリアクリルアミドゲルを作製し、SDS-PAGEを行った。
(7)発現の比較
pREIT19にL-NHaseを連結したプラスミドを導入したRhodococcus fascians(JCM6163)株を、50μg/ml Kmと0.01% CoCl2を添加した10 mlの2YT培地に植菌し、培養開始時から誘導剤としてイソバレロニトリルを0.1%添加した。比較実験としてイソバレロニトリルを添加していない培地を用いた。28℃で3日間培養し、L-NHaseの発現の検討を行った。12,000rpm, 5min, 4℃で集菌し、リン酸ナトリウム緩衝液を加え、菌体を破砕した後、遠心(15,000rpm, 10min, 4℃)し、回収した上清を無細胞抽出液とした。無細胞抽出液を等量のSDS-PAGE用のサンプル溶液と混合し、湯浴上で5min加熱処理し、SDS-PAGEに用いるサンプルとした。
配列番号7;ベクター
配列番号8;ベクター
配列番号11;プライマー
配列番号12;プライマー
Claims (7)
- ロドコッカス属に属する微生物内およびエシェリキア属に属する微生物内において複製可能なベクターであって、(i)配列番号3で表されるアミノ酸配列からなるポリペプチドをコードするDNA及び配列番号5で表されるアミノ酸配列からなるポリペプチドをコードするDNA、又は(ii)配列番号2で表される塩基配列からなるDNA及び配列番号4で表される塩基配列からなるDNAを含むプラスミド複製領域を含み、ロドコッカス属に属する微生物内で目的タンパク質を誘導発現可能なベクター。
- 以下の(a)、(b)および(c)の領域を含むことを特徴とするベクター。
(a) (i)配列番号3で表されるアミノ酸配列からなるポリペプチドをコードするDNA及び配列番号5で表されるアミノ酸配列からなるポリペプチドをコードするDNA、又は(ii)配列番号2で表される塩基配列からなるDNA及び配列番号4で表される塩基配列からなるDNAを含むプラスミド複製領域
(b) エシェリキア属に属する微生物内で複製可能なDNA領域
(c) ニトリラーゼ系誘導型発現プロモーター領域 - 受託番号がFERM P-20328であるベクター。
- 配列番号7で表される塩基配列を含むベクター。
- 請求項1〜4記載のベクターに目的タンパク質をコードするDNAを挿入した組換えベクター。
- 請求項1〜4記載のベクターまたは請求項5記載の組換えベクターにより、宿主を形質転換した形質転換体。
- 請求項6記載の形質転換体を培養し、得られる培養物から目的タンパク質を採取することを特徴とする、目的タンパク質の製造方法。
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