JP4112582B2 - 非常に大きい規模の固定化されたポリマーの合成 - Google Patents
非常に大きい規模の固定化されたポリマーの合成 Download PDFInfo
- Publication number
- JP4112582B2 JP4112582B2 JP2005351375A JP2005351375A JP4112582B2 JP 4112582 B2 JP4112582 B2 JP 4112582B2 JP 2005351375 A JP2005351375 A JP 2005351375A JP 2005351375 A JP2005351375 A JP 2005351375A JP 4112582 B2 JP4112582 B2 JP 4112582B2
- Authority
- JP
- Japan
- Prior art keywords
- synthesis
- support
- group
- mask
- seq
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Expired - Lifetime
Links
Classifications
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N21/00—Investigating or analysing materials by the use of optical means, i.e. using sub-millimetre waves, infrared, visible or ultraviolet light
- G01N21/62—Systems in which the material investigated is excited whereby it emits light or causes a change in wavelength of the incident light
- G01N21/63—Systems in which the material investigated is excited whereby it emits light or causes a change in wavelength of the incident light optically excited
- G01N21/64—Fluorescence; Phosphorescence
- G01N21/645—Specially adapted constructive features of fluorimeters
- G01N21/6452—Individual samples arranged in a regular 2D-array, e.g. multiwell plates
-
- B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
- B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
- B01J—CHEMICAL OR PHYSICAL PROCESSES, e.g. CATALYSIS OR COLLOID CHEMISTRY; THEIR RELEVANT APPARATUS
- B01J19/00—Chemical, physical or physico-chemical processes in general; Their relevant apparatus
- B01J19/0046—Sequential or parallel reactions, e.g. for the synthesis of polypeptides or polynucleotides; Apparatus and devices for combinatorial chemistry or for making molecular arrays
-
- B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
- B82—NANOTECHNOLOGY
- B82Y—SPECIFIC USES OR APPLICATIONS OF NANOSTRUCTURES; MEASUREMENT OR ANALYSIS OF NANOSTRUCTURES; MANUFACTURE OR TREATMENT OF NANOSTRUCTURES
- B82Y30/00—Nanotechnology for materials or surface science, e.g. nanocomposites
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07C—ACYCLIC OR CARBOCYCLIC COMPOUNDS
- C07C229/00—Compounds containing amino and carboxyl groups bound to the same carbon skeleton
- C07C229/02—Compounds containing amino and carboxyl groups bound to the same carbon skeleton having amino and carboxyl groups bound to acyclic carbon atoms of the same carbon skeleton
- C07C229/04—Compounds containing amino and carboxyl groups bound to the same carbon skeleton having amino and carboxyl groups bound to acyclic carbon atoms of the same carbon skeleton the carbon skeleton being acyclic and saturated
- C07C229/06—Compounds containing amino and carboxyl groups bound to the same carbon skeleton having amino and carboxyl groups bound to acyclic carbon atoms of the same carbon skeleton the carbon skeleton being acyclic and saturated having only one amino and one carboxyl group bound to the carbon skeleton
- C07C229/10—Compounds containing amino and carboxyl groups bound to the same carbon skeleton having amino and carboxyl groups bound to acyclic carbon atoms of the same carbon skeleton the carbon skeleton being acyclic and saturated having only one amino and one carboxyl group bound to the carbon skeleton the nitrogen atom of the amino group being further bound to acyclic carbon atoms or to carbon atoms of rings other than six-membered aromatic rings
- C07C229/14—Compounds containing amino and carboxyl groups bound to the same carbon skeleton having amino and carboxyl groups bound to acyclic carbon atoms of the same carbon skeleton the carbon skeleton being acyclic and saturated having only one amino and one carboxyl group bound to the carbon skeleton the nitrogen atom of the amino group being further bound to acyclic carbon atoms or to carbon atoms of rings other than six-membered aromatic rings to carbon atoms of carbon skeletons containing rings
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07C—ACYCLIC OR CARBOCYCLIC COMPOUNDS
- C07C229/00—Compounds containing amino and carboxyl groups bound to the same carbon skeleton
- C07C229/02—Compounds containing amino and carboxyl groups bound to the same carbon skeleton having amino and carboxyl groups bound to acyclic carbon atoms of the same carbon skeleton
- C07C229/04—Compounds containing amino and carboxyl groups bound to the same carbon skeleton having amino and carboxyl groups bound to acyclic carbon atoms of the same carbon skeleton the carbon skeleton being acyclic and saturated
- C07C229/06—Compounds containing amino and carboxyl groups bound to the same carbon skeleton having amino and carboxyl groups bound to acyclic carbon atoms of the same carbon skeleton the carbon skeleton being acyclic and saturated having only one amino and one carboxyl group bound to the carbon skeleton
- C07C229/10—Compounds containing amino and carboxyl groups bound to the same carbon skeleton having amino and carboxyl groups bound to acyclic carbon atoms of the same carbon skeleton the carbon skeleton being acyclic and saturated having only one amino and one carboxyl group bound to the carbon skeleton the nitrogen atom of the amino group being further bound to acyclic carbon atoms or to carbon atoms of rings other than six-membered aromatic rings
- C07C229/16—Compounds containing amino and carboxyl groups bound to the same carbon skeleton having amino and carboxyl groups bound to acyclic carbon atoms of the same carbon skeleton the carbon skeleton being acyclic and saturated having only one amino and one carboxyl group bound to the carbon skeleton the nitrogen atom of the amino group being further bound to acyclic carbon atoms or to carbon atoms of rings other than six-membered aromatic rings to carbon atoms of hydrocarbon radicals substituted by amino or carboxyl groups, e.g. ethylenediamine-tetra-acetic acid, iminodiacetic acids
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07D—HETEROCYCLIC COMPOUNDS
- C07D263/00—Heterocyclic compounds containing 1,3-oxazole or hydrogenated 1,3-oxazole rings
- C07D263/02—Heterocyclic compounds containing 1,3-oxazole or hydrogenated 1,3-oxazole rings not condensed with other rings
- C07D263/30—Heterocyclic compounds containing 1,3-oxazole or hydrogenated 1,3-oxazole rings not condensed with other rings having two or three double bonds between ring members or between ring members and non-ring members
- C07D263/34—Heterocyclic compounds containing 1,3-oxazole or hydrogenated 1,3-oxazole rings not condensed with other rings having two or three double bonds between ring members or between ring members and non-ring members with hetero atoms or with carbon atoms having three bonds to hetero atoms with at the most one bond to halogen, e.g. ester or nitrile radicals, directly attached to ring carbon atoms
- C07D263/44—Two oxygen atoms
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07D—HETEROCYCLIC COMPOUNDS
- C07D317/00—Heterocyclic compounds containing five-membered rings having two oxygen atoms as the only ring hetero atoms
- C07D317/08—Heterocyclic compounds containing five-membered rings having two oxygen atoms as the only ring hetero atoms having the hetero atoms in positions 1 and 3
- C07D317/44—Heterocyclic compounds containing five-membered rings having two oxygen atoms as the only ring hetero atoms having the hetero atoms in positions 1 and 3 ortho- or peri-condensed with carbocyclic rings or ring systems
- C07D317/46—Heterocyclic compounds containing five-membered rings having two oxygen atoms as the only ring hetero atoms having the hetero atoms in positions 1 and 3 ortho- or peri-condensed with carbocyclic rings or ring systems condensed with one six-membered ring
- C07D317/48—Methylenedioxybenzenes or hydrogenated methylenedioxybenzenes, unsubstituted on the hetero ring
- C07D317/62—Methylenedioxybenzenes or hydrogenated methylenedioxybenzenes, unsubstituted on the hetero ring with hetero atoms or with carbon atoms having three bonds to hetero atoms with at the most one bond to halogen, e.g. ester or nitrile radicals, directly attached to atoms of the carbocyclic ring
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07H—SUGARS; DERIVATIVES THEREOF; NUCLEOSIDES; NUCLEOTIDES; NUCLEIC ACIDS
- C07H19/00—Compounds containing a hetero ring sharing one ring hetero atom with a saccharide radical; Nucleosides; Mononucleotides; Anhydro-derivatives thereof
- C07H19/02—Compounds containing a hetero ring sharing one ring hetero atom with a saccharide radical; Nucleosides; Mononucleotides; Anhydro-derivatives thereof sharing nitrogen
- C07H19/04—Heterocyclic radicals containing only nitrogen atoms as ring hetero atom
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07H—SUGARS; DERIVATIVES THEREOF; NUCLEOSIDES; NUCLEOTIDES; NUCLEIC ACIDS
- C07H21/00—Compounds containing two or more mononucleotide units having separate phosphate or polyphosphate groups linked by saccharide radicals of nucleoside groups, e.g. nucleic acids
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K1/00—General methods for the preparation of peptides, i.e. processes for the organic chemical preparation of peptides or proteins of any length
- C07K1/04—General methods for the preparation of peptides, i.e. processes for the organic chemical preparation of peptides or proteins of any length on carriers
- C07K1/042—General methods for the preparation of peptides, i.e. processes for the organic chemical preparation of peptides or proteins of any length on carriers characterised by the nature of the carrier
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K1/00—General methods for the preparation of peptides, i.e. processes for the organic chemical preparation of peptides or proteins of any length
- C07K1/04—General methods for the preparation of peptides, i.e. processes for the organic chemical preparation of peptides or proteins of any length on carriers
- C07K1/045—General methods for the preparation of peptides, i.e. processes for the organic chemical preparation of peptides or proteins of any length on carriers using devices to improve synthesis, e.g. reactors, special vessels
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K1/00—General methods for the preparation of peptides, i.e. processes for the organic chemical preparation of peptides or proteins of any length
- C07K1/04—General methods for the preparation of peptides, i.e. processes for the organic chemical preparation of peptides or proteins of any length on carriers
- C07K1/047—Simultaneous synthesis of different peptide species; Peptide libraries
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K7/00—Peptides having 5 to 20 amino acids in a fully defined sequence; Derivatives thereof
- C07K7/04—Linear peptides containing only normal peptide links
- C07K7/06—Linear peptides containing only normal peptide links having 5 to 11 amino acids
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N21/00—Investigating or analysing materials by the use of optical means, i.e. using sub-millimetre waves, infrared, visible or ultraviolet light
- G01N21/62—Systems in which the material investigated is excited whereby it emits light or causes a change in wavelength of the incident light
- G01N21/63—Systems in which the material investigated is excited whereby it emits light or causes a change in wavelength of the incident light optically excited
- G01N21/64—Fluorescence; Phosphorescence
- G01N21/6428—Measuring fluorescence of fluorescent products of reactions or of fluorochrome labelled reactive substances, e.g. measuring quenching effects, using measuring "optrodes"
-
- G—PHYSICS
- G03—PHOTOGRAPHY; CINEMATOGRAPHY; ANALOGOUS TECHNIQUES USING WAVES OTHER THAN OPTICAL WAVES; ELECTROGRAPHY; HOLOGRAPHY
- G03F—PHOTOMECHANICAL PRODUCTION OF TEXTURED OR PATTERNED SURFACES, e.g. FOR PRINTING, FOR PROCESSING OF SEMICONDUCTOR DEVICES; MATERIALS THEREFOR; ORIGINALS THEREFOR; APPARATUS SPECIALLY ADAPTED THEREFOR
- G03F7/00—Photomechanical, e.g. photolithographic, production of textured or patterned surfaces, e.g. printing surfaces; Materials therefor, e.g. comprising photoresists; Apparatus specially adapted therefor
-
- G—PHYSICS
- G03—PHOTOGRAPHY; CINEMATOGRAPHY; ANALOGOUS TECHNIQUES USING WAVES OTHER THAN OPTICAL WAVES; ELECTROGRAPHY; HOLOGRAPHY
- G03F—PHOTOMECHANICAL PRODUCTION OF TEXTURED OR PATTERNED SURFACES, e.g. FOR PRINTING, FOR PROCESSING OF SEMICONDUCTOR DEVICES; MATERIALS THEREFOR; ORIGINALS THEREFOR; APPARATUS SPECIALLY ADAPTED THEREFOR
- G03F7/00—Photomechanical, e.g. photolithographic, production of textured or patterned surfaces, e.g. printing surfaces; Materials therefor, e.g. comprising photoresists; Apparatus specially adapted therefor
- G03F7/26—Processing photosensitive materials; Apparatus therefor
- G03F7/265—Selective reaction with inorganic or organometallic reagents after image-wise exposure, e.g. silylation
-
- B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
- B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
- B01J—CHEMICAL OR PHYSICAL PROCESSES, e.g. CATALYSIS OR COLLOID CHEMISTRY; THEIR RELEVANT APPARATUS
- B01J2219/00—Chemical, physical or physico-chemical processes in general; Their relevant apparatus
- B01J2219/00274—Sequential or parallel reactions; Apparatus and devices for combinatorial chemistry or for making arrays; Chemical library technology
- B01J2219/00277—Apparatus
- B01J2219/00351—Means for dispensing and evacuation of reagents
- B01J2219/00427—Means for dispensing and evacuation of reagents using masks
- B01J2219/00432—Photolithographic masks
-
- B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
- B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
- B01J—CHEMICAL OR PHYSICAL PROCESSES, e.g. CATALYSIS OR COLLOID CHEMISTRY; THEIR RELEVANT APPARATUS
- B01J2219/00—Chemical, physical or physico-chemical processes in general; Their relevant apparatus
- B01J2219/00274—Sequential or parallel reactions; Apparatus and devices for combinatorial chemistry or for making arrays; Chemical library technology
- B01J2219/00277—Apparatus
- B01J2219/00497—Features relating to the solid phase supports
- B01J2219/00527—Sheets
-
- B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
- B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
- B01J—CHEMICAL OR PHYSICAL PROCESSES, e.g. CATALYSIS OR COLLOID CHEMISTRY; THEIR RELEVANT APPARATUS
- B01J2219/00—Chemical, physical or physico-chemical processes in general; Their relevant apparatus
- B01J2219/00274—Sequential or parallel reactions; Apparatus and devices for combinatorial chemistry or for making arrays; Chemical library technology
- B01J2219/00277—Apparatus
- B01J2219/00497—Features relating to the solid phase supports
- B01J2219/00527—Sheets
- B01J2219/00529—DNA chips
-
- B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
- B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
- B01J—CHEMICAL OR PHYSICAL PROCESSES, e.g. CATALYSIS OR COLLOID CHEMISTRY; THEIR RELEVANT APPARATUS
- B01J2219/00—Chemical, physical or physico-chemical processes in general; Their relevant apparatus
- B01J2219/00274—Sequential or parallel reactions; Apparatus and devices for combinatorial chemistry or for making arrays; Chemical library technology
- B01J2219/00277—Apparatus
- B01J2219/00497—Features relating to the solid phase supports
- B01J2219/00527—Sheets
- B01J2219/00531—Sheets essentially square
-
- B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
- B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
- B01J—CHEMICAL OR PHYSICAL PROCESSES, e.g. CATALYSIS OR COLLOID CHEMISTRY; THEIR RELEVANT APPARATUS
- B01J2219/00—Chemical, physical or physico-chemical processes in general; Their relevant apparatus
- B01J2219/00274—Sequential or parallel reactions; Apparatus and devices for combinatorial chemistry or for making arrays; Chemical library technology
- B01J2219/00583—Features relative to the processes being carried out
- B01J2219/00585—Parallel processes
-
- B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
- B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
- B01J—CHEMICAL OR PHYSICAL PROCESSES, e.g. CATALYSIS OR COLLOID CHEMISTRY; THEIR RELEVANT APPARATUS
- B01J2219/00—Chemical, physical or physico-chemical processes in general; Their relevant apparatus
- B01J2219/00274—Sequential or parallel reactions; Apparatus and devices for combinatorial chemistry or for making arrays; Chemical library technology
- B01J2219/00583—Features relative to the processes being carried out
- B01J2219/0059—Sequential processes
-
- B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
- B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
- B01J—CHEMICAL OR PHYSICAL PROCESSES, e.g. CATALYSIS OR COLLOID CHEMISTRY; THEIR RELEVANT APPARATUS
- B01J2219/00—Chemical, physical or physico-chemical processes in general; Their relevant apparatus
- B01J2219/00274—Sequential or parallel reactions; Apparatus and devices for combinatorial chemistry or for making arrays; Chemical library technology
- B01J2219/00583—Features relative to the processes being carried out
- B01J2219/00596—Solid-phase processes
-
- B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
- B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
- B01J—CHEMICAL OR PHYSICAL PROCESSES, e.g. CATALYSIS OR COLLOID CHEMISTRY; THEIR RELEVANT APPARATUS
- B01J2219/00—Chemical, physical or physico-chemical processes in general; Their relevant apparatus
- B01J2219/00274—Sequential or parallel reactions; Apparatus and devices for combinatorial chemistry or for making arrays; Chemical library technology
- B01J2219/00583—Features relative to the processes being carried out
- B01J2219/00603—Making arrays on substantially continuous surfaces
- B01J2219/00605—Making arrays on substantially continuous surfaces the compounds being directly bound or immobilised to solid supports
-
- B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
- B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
- B01J—CHEMICAL OR PHYSICAL PROCESSES, e.g. CATALYSIS OR COLLOID CHEMISTRY; THEIR RELEVANT APPARATUS
- B01J2219/00—Chemical, physical or physico-chemical processes in general; Their relevant apparatus
- B01J2219/00274—Sequential or parallel reactions; Apparatus and devices for combinatorial chemistry or for making arrays; Chemical library technology
- B01J2219/00583—Features relative to the processes being carried out
- B01J2219/00603—Making arrays on substantially continuous surfaces
- B01J2219/00605—Making arrays on substantially continuous surfaces the compounds being directly bound or immobilised to solid supports
- B01J2219/00608—DNA chips
-
- B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
- B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
- B01J—CHEMICAL OR PHYSICAL PROCESSES, e.g. CATALYSIS OR COLLOID CHEMISTRY; THEIR RELEVANT APPARATUS
- B01J2219/00—Chemical, physical or physico-chemical processes in general; Their relevant apparatus
- B01J2219/00274—Sequential or parallel reactions; Apparatus and devices for combinatorial chemistry or for making arrays; Chemical library technology
- B01J2219/00583—Features relative to the processes being carried out
- B01J2219/00603—Making arrays on substantially continuous surfaces
- B01J2219/00605—Making arrays on substantially continuous surfaces the compounds being directly bound or immobilised to solid supports
- B01J2219/0061—The surface being organic
-
- B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
- B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
- B01J—CHEMICAL OR PHYSICAL PROCESSES, e.g. CATALYSIS OR COLLOID CHEMISTRY; THEIR RELEVANT APPARATUS
- B01J2219/00—Chemical, physical or physico-chemical processes in general; Their relevant apparatus
- B01J2219/00274—Sequential or parallel reactions; Apparatus and devices for combinatorial chemistry or for making arrays; Chemical library technology
- B01J2219/00583—Features relative to the processes being carried out
- B01J2219/00603—Making arrays on substantially continuous surfaces
- B01J2219/00605—Making arrays on substantially continuous surfaces the compounds being directly bound or immobilised to solid supports
- B01J2219/00612—Making arrays on substantially continuous surfaces the compounds being directly bound or immobilised to solid supports the surface being inorganic
-
- B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
- B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
- B01J—CHEMICAL OR PHYSICAL PROCESSES, e.g. CATALYSIS OR COLLOID CHEMISTRY; THEIR RELEVANT APPARATUS
- B01J2219/00—Chemical, physical or physico-chemical processes in general; Their relevant apparatus
- B01J2219/00274—Sequential or parallel reactions; Apparatus and devices for combinatorial chemistry or for making arrays; Chemical library technology
- B01J2219/00583—Features relative to the processes being carried out
- B01J2219/00603—Making arrays on substantially continuous surfaces
- B01J2219/00605—Making arrays on substantially continuous surfaces the compounds being directly bound or immobilised to solid supports
- B01J2219/00623—Immobilisation or binding
- B01J2219/00626—Covalent
-
- B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
- B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
- B01J—CHEMICAL OR PHYSICAL PROCESSES, e.g. CATALYSIS OR COLLOID CHEMISTRY; THEIR RELEVANT APPARATUS
- B01J2219/00—Chemical, physical or physico-chemical processes in general; Their relevant apparatus
- B01J2219/00274—Sequential or parallel reactions; Apparatus and devices for combinatorial chemistry or for making arrays; Chemical library technology
- B01J2219/00583—Features relative to the processes being carried out
- B01J2219/00603—Making arrays on substantially continuous surfaces
- B01J2219/00659—Two-dimensional arrays
-
- B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
- B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
- B01J—CHEMICAL OR PHYSICAL PROCESSES, e.g. CATALYSIS OR COLLOID CHEMISTRY; THEIR RELEVANT APPARATUS
- B01J2219/00—Chemical, physical or physico-chemical processes in general; Their relevant apparatus
- B01J2219/00274—Sequential or parallel reactions; Apparatus and devices for combinatorial chemistry or for making arrays; Chemical library technology
- B01J2219/0068—Means for controlling the apparatus of the process
- B01J2219/00686—Automatic
- B01J2219/00689—Automatic using computers
-
- B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
- B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
- B01J—CHEMICAL OR PHYSICAL PROCESSES, e.g. CATALYSIS OR COLLOID CHEMISTRY; THEIR RELEVANT APPARATUS
- B01J2219/00—Chemical, physical or physico-chemical processes in general; Their relevant apparatus
- B01J2219/00274—Sequential or parallel reactions; Apparatus and devices for combinatorial chemistry or for making arrays; Chemical library technology
- B01J2219/0068—Means for controlling the apparatus of the process
- B01J2219/00695—Synthesis control routines, e.g. using computer programs
-
- B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
- B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
- B01J—CHEMICAL OR PHYSICAL PROCESSES, e.g. CATALYSIS OR COLLOID CHEMISTRY; THEIR RELEVANT APPARATUS
- B01J2219/00—Chemical, physical or physico-chemical processes in general; Their relevant apparatus
- B01J2219/00274—Sequential or parallel reactions; Apparatus and devices for combinatorial chemistry or for making arrays; Chemical library technology
- B01J2219/00709—Type of synthesis
- B01J2219/00711—Light-directed synthesis
-
- B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
- B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
- B01J—CHEMICAL OR PHYSICAL PROCESSES, e.g. CATALYSIS OR COLLOID CHEMISTRY; THEIR RELEVANT APPARATUS
- B01J2219/00—Chemical, physical or physico-chemical processes in general; Their relevant apparatus
- B01J2219/00274—Sequential or parallel reactions; Apparatus and devices for combinatorial chemistry or for making arrays; Chemical library technology
- B01J2219/00718—Type of compounds synthesised
- B01J2219/0072—Organic compounds
- B01J2219/00722—Nucleotides
-
- B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
- B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
- B01J—CHEMICAL OR PHYSICAL PROCESSES, e.g. CATALYSIS OR COLLOID CHEMISTRY; THEIR RELEVANT APPARATUS
- B01J2219/00—Chemical, physical or physico-chemical processes in general; Their relevant apparatus
- B01J2219/00274—Sequential or parallel reactions; Apparatus and devices for combinatorial chemistry or for making arrays; Chemical library technology
- B01J2219/00718—Type of compounds synthesised
- B01J2219/0072—Organic compounds
- B01J2219/00725—Peptides
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07B—GENERAL METHODS OF ORGANIC CHEMISTRY; APPARATUS THEREFOR
- C07B2200/00—Indexing scheme relating to specific properties of organic compounds
- C07B2200/11—Compounds covalently bound to a solid support
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C40—COMBINATORIAL TECHNOLOGY
- C40B—COMBINATORIAL CHEMISTRY; LIBRARIES, e.g. CHEMICAL LIBRARIES
- C40B40/00—Libraries per se, e.g. arrays, mixtures
- C40B40/04—Libraries containing only organic compounds
- C40B40/06—Libraries containing nucleotides or polynucleotides, or derivatives thereof
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C40—COMBINATORIAL TECHNOLOGY
- C40B—COMBINATORIAL CHEMISTRY; LIBRARIES, e.g. CHEMICAL LIBRARIES
- C40B40/00—Libraries per se, e.g. arrays, mixtures
- C40B40/04—Libraries containing only organic compounds
- C40B40/10—Libraries containing peptides or polypeptides, or derivatives thereof
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C40—COMBINATORIAL TECHNOLOGY
- C40B—COMBINATORIAL CHEMISTRY; LIBRARIES, e.g. CHEMICAL LIBRARIES
- C40B60/00—Apparatus specially adapted for use in combinatorial chemistry or with libraries
- C40B60/14—Apparatus specially adapted for use in combinatorial chemistry or with libraries for creating libraries
-
- Y—GENERAL TAGGING OF NEW TECHNOLOGICAL DEVELOPMENTS; GENERAL TAGGING OF CROSS-SECTIONAL TECHNOLOGIES SPANNING OVER SEVERAL SECTIONS OF THE IPC; TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC CROSS-REFERENCE ART COLLECTIONS [XRACs] AND DIGESTS
- Y02—TECHNOLOGIES OR APPLICATIONS FOR MITIGATION OR ADAPTATION AGAINST CLIMATE CHANGE
- Y02P—CLIMATE CHANGE MITIGATION TECHNOLOGIES IN THE PRODUCTION OR PROCESSING OF GOODS
- Y02P20/00—Technologies relating to chemical industry
- Y02P20/50—Improvements relating to the production of bulk chemicals
- Y02P20/55—Design of synthesis routes, e.g. reducing the use of auxiliary or protecting groups
Landscapes
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Analytical Chemistry (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- General Physics & Mathematics (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
- Immunology (AREA)
- Nanotechnology (AREA)
- Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Pathology (AREA)
- Materials Engineering (AREA)
- Crystallography & Structural Chemistry (AREA)
- Condensed Matter Physics & Semiconductors (AREA)
- Composite Materials (AREA)
- Optics & Photonics (AREA)
- Inorganic Chemistry (AREA)
- Peptides Or Proteins (AREA)
- Organic Low-Molecular-Weight Compounds And Preparation Thereof (AREA)
- Addition Polymer Or Copolymer, Post-Treatments, Or Chemical Modifications (AREA)
- Saccharide Compounds (AREA)
- Physical Or Chemical Processes And Apparatus (AREA)
- Heterocyclic Carbon Compounds Containing A Hetero Ring Having Nitrogen And Oxygen As The Only Ring Hetero Atoms (AREA)
Description
本発明はポリマーの合成の分野に関する。さらに詳しくは、本発明は反応器システム、マスキング法、光除去可能な保護基、データの収集およびプロセシング技術、および支持体上の多様なポリマー一配列の光統制(1ight directed)合成のための応用を提供する。
a)前記支持体に反応流体を接触するための反応器;
b)前記反応器に選択された反応流体を送るためのシステム;
c)少なくとも第1相対位置から第2相対位置に対してマスク又は支持体を移動するための並進段階;
d)マスクを通して前記支持体を選択された時間で照射するための光;
e)前記反応器システムからの流体の流れを選択的に方向付けし、前記並進段階を選択的に活性化し、そして前記支持体上で多くの多様なポリマー配列を予定された位置で形成するために前記支持体を選択的に照射するための適切にプログラムされたディジタル型コン
ピューターを含んで成る反応器システム。
(項目2) ポリマー配列の初期スクリーニングのために使用される前記支持体に反応流体における多くのモノマーを供給するように適合される第1項記載の反応器システム。
(項目3) 試薬の連続的な添加により多くのポリマー配列を形成するための規則方法であって、二段階合成手段を用いて前記多くのポリマー配列の一部を前記ポリマー配列の他の一部の添加のために連続的に保護し、そして保護解除する段階を含んで成る方法。
(項目4) 前記二段階合成手段が二段階マスキング手段である第3項記載の方法。
(項目5) 前記マスキング手段が、マスクが、前もって照射された部分の一部を光から保護し、そして前もって保護された部分の一部を光に照射することによって、前のマスクの代理をする、少なくとも2つの連続的段階を提供する第4項記載の方法。
(項目6) 前記マスキング手段における少なくとも2つの連続的段階が前記支持体上の対象の領域の約半分を照射することを含んで成る第4項記載の方法。
(項目7) 前記マスキング手段が単一の支持体上に多くのポリマー配列を形成することを含んで成る第4項記載の方法。
(項目8) 前記マスクが、多くの合成部位の個々上に1つの端面照射を有するグレイコードマスキング手段により配置される第4項記載の方法。
(項目9) 前記マスキング手段が、多くの合成されるポリマーのために最少数のマスキング段階に起因する第4項記載の方法。
(項目10) 長さ1のすべての可能なポリマーが与えられた基本組のモノマーにより形成される第4項記載の方法。
(項目11) 前記マスキング手段が、ポリマーの少なくとも所望する基本組及び長さを入力する適切にプログラムされたディジタル型コンピューターで開発される第4項記載の方法。
(項目12) 1よりも短い又は1に等しい長さのすべての可能なポリマーが与えられた基本組のモノマーにより形成される第4項記載の方法。
(項目13) 非二段階マスキング手段により前記ポリマーの一部を形成する段階をさらに含んで成る第4項記載の方法。
(項目14) マスキング手段を出力する段階をさらに含んで成る第10項記載の方法。
(項目15) 前記支持体上に合成されたポリマーの地図を出力する段階をさらに含んで成る第10項記載の方法。
(項目16) 前記地図が図9の形で存在する第15項記載の方法。
(項目17) 結合親和性研究への使用のために多くのリンカーポリマーをスクリーニングするための方法であって:
a)選択された領域における支持体上に多くのリンカーポリマーを形成し、ここで前記ポリマーが:
i)支持体の表面上で、保護基を除去するために前記選択された領域の一部を照射し;そして
ii)前記表面とモノマーとを接触せしめる回帰的段階により形成され;
b)前記多くのリンカーポリマーとリガンドとを接触せしめ;そして
c)前記リガンドとラベルされたレセプターとを接触せしめる段階を含んで成る方法。
(項目18) 前記リガンドがポリペプチドである第17項記載の方法。
(項目19) 前記レセプターが抗体である第17項記載の方法。
(項目20) 前記段階ii)で添加されるモノマーが前記回帰的段階の個々において同じであり、前記選択された領域が異なった長さのリンカー分子を含んで成る第17項記載の方法。
(項目21) 前記ラベルされたレセプターがフルオレセイン化されたレセプターである第17項記載の方法。
(項目22) リガンドに対するレセプターの親和性を決定するためのシステムであって:
a)予定された位置で多くのリガンドを含んで成る支持体の表面に光を適用するための手段、ここで前記直接光を適用するための手段が前記多くの予定された位置で同時照射を提供し;及び
b)前記多くの予定された位置で螢光を検出するためのずらりと並んだ検出器を含んで成るシステム。
(項目23) 前記光を適用するための手段が点光源及び実質的に直線路にそって前記点光源の焦点を合わすための円柱状レンズを含んで成る第22項記載のシステム。
(項目24) 前記ずらりと並んだ検出器が直線状アレイを含んで成る第22項記載のシステム。
(項目25) 前記ずらりと並んだ検出器が直線状CCDアレイを含んで成る第22項記載のシステム。
(項目26) ディジタルコンピューターにおいて、リガンドに対して結合レセプターの傾向を検出するための方法であって:
a)既知位置での領域において多くのリガンドを含んで成る支持体に螢光ラベルされたレセプターを暴露し;
b)前記個々の領域内の多くのデータ収集点で、前記データ収集点から螢光の量を決定し;
c)予定された統計学的分布から設定量からずれる前記データ収集点を除去し;そして
d)残存するデータ収集点に対する前記レセプターの相対的結合親和性を決定することを含んで成る方法。
(項目27) 前記予定された統計学的分布が正規分布である第26項記載の方法。
(項目28) 下記式:
(項目29) 前記Yが天然又は非天然のデオキシリボ核酸又はリボ核酸のC−5’酸素基である第28項記載の化合物。
(項目30) 前記nがゼロである第29項記載の化合物。
(項目31) 前記R1及びR2がそれぞれ水素原子である第29項記載の化合物。
(項目32) 前記R3が水素原子である第31項記載の化合物。
(項目33) 前記R3がメチル基である第31項記載の化合物。
(項目34) 前記Yがアミノ酸のカルボキシル基の酸素原子であり、そしてn−0である第28項記載の化合物。
(項目35) 前記R1及びR2がそれぞれ水素原子である第34項記載の化合物。
(項目36) 前記R3が水素原子である第35項記載の化合物。
(項目37) 前記R3がメチル基である第35項記載の化合物。
(項目38)下記式:
ドロキシル、アルコキシル、チオール、チオエーテル、アミノ、ニトロ、カルボキシル、ホルメート、ホルムアミド、スルフィド又はホスフィド基であり;R4及びR5は独立して、アルコキシ、アルキル、水素原子、ハロ、アリール又はアルケニル基である]で表わされる化合物。
(項目39) 前記R1〜R3がそれぞれ水素原子である第38項記載の化合物。
(項目40) 前記R4及びR5がそれぞれ水素原子である第39項記載の化合物。
(項目41) 前記R4及びR5がそれぞれメチル基である第39項記載の化合物。
(項目42) 下記式:
(項目43) 前記R2及びR3がそれぞれメトキシ基である第42項記載の化合物。
(項目44) 前記R1及びR4がそれぞれ水素原子である第43項記載の化合物。
(項目45) 前記R5がメチル基である第44項記載の化合物。
(項目46) 下記式:
(項目47) 前記Yが天然又は非天然のアミノ酸のカルボキシル基の酸素原子又は天然又は非天然のデオキシリボ核酸又はリボ核酸のC−5’酸素基、又は天然又は非天然のアミノ酸のアミノ基から成る群から選択される第46項記載の化合物。
(項目48) 前記R1及びR2が水素原子である第47項記載の化合物。
(項目49) 前記R3がメチル基である第48項記載の化合物。
(項目50) 下記式:
(項目51) 前記Xが下記式:
(項目52) 前記R1及びR4がそれぞれ水素原子であり、そしてR2及びR3がそれぞれメトキシ基である第51項記載の化合物。
(項目53) 前記R5がメチル基である第52項記載の化合物。
(項目54) 前記R2及びR3が環状アセタールを一緒に形成する置換された酸素基である第51項記載の化合物。
(項目55) 前記R1及びR4がそれぞれ水素原子である第54項記載の化合物。
(項目56) 前記R5がメチル基である第55項記載の化合物。
発明の要約
支持体上の多様なポリマーの配列の合成の方法、装置および組成物、および技術の使用、ならびにそれらの応用を開示する。
を有する化合物が提供される。
内容
I.定義
II.一般
A.脱保護および添加
1.実施例
2.実施例
III.合成
A.反応器システム
B.バイナリー合成法
1.実施例
2.実施例
3.実施例
4.実施例
5.実施例
6.実施例
C.リンカーの選択
D.保護基
1.ペプチドの固相合成の問の光除去可能な保護基の使用
2.オリゴヌクレオチドの固相合成の間の光除去可能な保護基の使用
E.光除去可能な基で保護されたアミノ酸N一カルボキシ無水物
IV.データ収集
A.データ収集システム
B.データの分析
V.他の代表的な応用
A.オリゴヌクレオチドの合成
1.実施例
VI.結論
1.定義
ここにおいて使用するある種の用語は次の一般的定義を有することを意図する:
1.相補性:リガンド分子およびそのレセプターの相互作用する表面のトポロジー的相補性または一緒に合致することを意味する。こうして、レセプターおよびそのリガンドは相補性として記載することができ、そしてさらに、接触表面の特性は互いに相補的である。
a)微生物のレセプター:レセプターに結合するリガンド、例えば、微生物の生き残りに対して必須の特定の輸送タンパク質または酵素の決定は抗体の新しいクラスのために有用である。日和見性の菌類、原生動物、および現在の使用における抗体に対して耐性のバクテリアに対する抗体はとくに価値があるであろう。
b)酸素:例えば、酵素、例えば、神経伝達物質を切断することに関係する酵素の結合部位の決定は有用情報を提供する。ある種のレセプターに結合して、異なる神経伝達物質を切断する酵素の作用を変調するリガンドの決定は、神経伝達物質の障害の処置において使用できる薬物の開発において有用である。
c)抗体:例えば、本発明は問題の抗原のエピトープと結合する抗体分子上のリガンド結合部位の研究において有用である;抗原のエピトープをまねる配列を決定することは、免疫原が1種または2種以上のこのような物質に基づくワクチンの開発に導くことができるか、あるいは治療的処置、例えば、自己免疫病において有用である(例えば、「自己」抗体の結合をブロックすることによって)関係する診断剤または化合物の開発に導くことができる。
d).核酸:核酸の配列を合成して、DNAまたはRNAの結合性配列を確立することができる。
e)触媒のポリペプチド:1種または2種以上の反応成分を1種または2種以上の生成物に変換することを包含する化学的反応を促進することができるポリマー、好ましくはポリペプチド。このようなポリペプチドは、一般に、少なくとも1つの反応成分または反応の中間体に対して特異的な結合部位および、官能性が結合した反応成分を化学的修飾することができる、結合部位に近接した活性な官能性を含む。触媒のポリペプチドは、例えば、米国特許第404,920号(これをすべての目的のためにここに引用によって加える)に記載されている。
f)ホルモンのレセプター:例えば、インスリンおよび成長ホルモンのためのレセプター。高い親和性をもってレセプターに結合するリガンドの決定は、例えば、糖尿病患者が糖尿病の症状を解放しなくてはならない毎日の注射の経口的代替物、および他の場合において、死体からか、あるいは組み換えDNA技術によってのみ得ることができる、稀なホモ成長ホルモンの代替物の開発において有用である。他の例は脈管収縮性ホルモンのレセプターである;レセプターに結合するそれらのリガンドの決定は、血圧をコントロールする薬物の開発に導くことができる。
g)オピエートレセプター:脳の中のオピエートのレセプターに結合するリガンドの決定は、モルフィンおよび関係する薬物のための嗜癖性が低い代替物の開発において有用である。
II.一般
本発明は、大規模の化学的多様性をつくる合成法および装置を提供する。固相の化学、光不安定性保護基、および写真平版を一緒にして、光統制された空間的にアドレス可能な平行の化学的合成を好ましい態様において達成する。
本発明は、マスクした抗原または他のアクチベーターを使用して、多数の異なる化学的化合物の同時の合成を統制する。第1図は、本発明の1つの態様に従う化学的化合物を形成する方法を示すフローチャートである。合成は固体の支持体2上で起こる。光源6を使用してマスク4aを通る照明のパターンは、支持体のどの領域が化学的カップリングのために活性化されるかを決定する。1つの好ましい態様において、活性化は光を使用して、支持体の選択した区域から光不安定性保護基を除去することによって達成される。
第2図は、本発明の他の実施例を例示するフローチャートである,カルボキシ活性化されたNVOC一ロイシンをアミン化された支持体と反応させた。この合成において使用したロイシンおよび他のアミノ酸のカルボキシ活性化されたHOBTエステルは、2.5mlの脳F中で0.25ミリモルのNVOCアミノ保護されたアミノ酸を37mgのHOBT(1一ヒドロキシベンゾトリアゾール)、111mgのBop(ベンゾトリアゾリル−n−オキシ−トリス(ジメチルアミノ)−ホスホニウムヘキサ−フルオロホスフェート)および86μ1のDIEA(ジイソプロピルエチルアミン)と混合することによって形成した。NVOC保護基は均一な照明により除去した。カルボキシ活性化されたNVOC−フェニルアラニンを暴露されたアミノ基に室温において2時間の間カップリングさせ、次いでDMFおよび塩化メチレンで洗浄した。光脱保護のマスク除去のサイクルおよびカルボキシ活性化されたNVOC一グリシンとのカップリングを実施した。次いで表面をガラスの50μmのチェッカー盤状のパターンのマスク上のクロムを通して照明した。次いでカルボキシ活性化されたNα−tBOC−o−t一ブチル−L−チロシンを添加した。全体の表面を均一に照明して、残りのNVOC基を光分解した。最後に、カルボキシ活性化されたNVOC−L一プロリンを添加し、NVOC基を照明により除去し、そしてt−BOCおよびt一ブチル保護基をTFAで除去した。保護基の除去後、表面はTyr−Gly−Gly−Phe−Leu(YGGFL)およびPro−Gly−Gly−Phe−Leu(PGGFL)の50μmのチェッカー盤状の配列から成っていた。参照、また、配列識別番号:1および配列識別番号:2。
1つの好ましい態様において、支持体を使用して、複数のアミノ酸配列のどれが問題の抗体により認識されるかを決定する。
1つの実施例において、第2図に示す実雄例におけるペンタペプチドの配列をβ一エンドルフィンに対して向けられたマウスモノクローナル抗体でプロービングした。この抗体(3E7と呼ぶ)はナノモルの親和性でYGGFLおよびYGGFM(参照、また、配列識別番号:1および配列識別番号321)に結合することが知られており、そしてMeoら、Proc.Nat1.Acad.Sci.USA(1983)80:4084、これをすべての目的のためにここに引用によって加える、の中で論じられでいる。この抗体は高い親和性の結合のためにアミノ末端のチロシンを必要とする。第2図に記載するように形成したペプチドの配列を、YGGFLを認識することが知られている2μg/mlのマウスモノクローナル抗体(3E7)とインキュベーションした。参照、また、配列識別番号:1。3E7はPGGFLと結合しなかった。参照、また、配列識別番号2。蛍光化ヤギ抗マウス抗体との第2インキュベーションは3E7と結合した領域を標識した。表面をepi−蛍光顕微鏡で走査した。結果は交互する輝いたおよび暗い50μmの正方形を示し、YGGFL(配列識別番号:1)およびPGGFL(配列識別番号:2)がマスクにより決定された幾何学的配列で合成されたことが示された。高いコントラスト(>12:1の強度の比)の蛍光性チェッカー盤状の画像が示すように、(a)YGGFL(配列識別番号:1)およびPGGFL(配列識別番号:2)は交互する50μmの正方形で合成され、(b)表面に取り付けられたYGGFL(配列識別番号:1)は抗体3E7への結合のためにアクセス可能であり、そして(c)抗体3E7はPGGFL(配列識別番号:2)に結合しない。
A.反応器システム
第3図は、支持体上で多様なポリマーの配列を合成するために使用する装置を概略的に示す。この装置は自動化されたペプチド合成装置401を含む。自動化されたペプチド合成装置は、コンピューター401の指令下にフローセル402を通して選択した反応流体を流す。好ましい態様において、合成装置はABIペプチド合成装置、型No.431Aである。コンピューターは広範な種類のコンピューターまたは離散的ロジック、例えば、ペプチド合成装置における適当な内部のコントロールシステムと連係した1聞PC−ATまたは同様なコンピューターから選択することができる。PCは、例えばカップリングサイクルの終わりを示すボードコンピューターからのシグナルを供給される。
光統制された化学的合成において、形成する生成物はマスクのパターンおよび順序、および反応成分の順序に依存する。1組の生成物をつくるために、一般に有限の数可能な方法が存在するであろう。本発明の好ましい態様において、二段階合成法を利用する。二段階合成法はここにおいて主としてマスキング法に関して例示するが、それは他のポリマーの合成、例えば、ピン法などに適用することができるであろう。
この合成手順は完成した生成物をマッピングする容易な方法を提供する。支持体上の種々の位置における生成物は、スイッチのマトリックスの列により簡単に規定される(第1列は、例えば、生成物ABCDが支持体の上左の位置に存在するであろうことを示す)。さらに、選択した所望の生成物のみをつくる場合、マスクの配列は列を所望の配列で抽出することによって誘導することができる。例えば、生成物の組ABCD,ABD,ACD,AD,BCD,BD,CD、およびDを形成するために、第1、第3、第5、第7、第9、第11、第13、および第15の列がスイッチのマトリックスに配置されたスイッチのマトリックスを使用することによって、マスクを形成する:
P=(A+B)(C+D)
反応の多項式は、それが代数学の表現であるように、展開することができるが、ただし反応成分X1、およびX2を接合する順序は保存される(X1、X2、≠X2、X1)、すなわち、生成物は交換可能ではないことを条件とする。次いで生成物はAC+AD+BC+BDである。多項式は反応成分を明瞭に特定し、そして各工程のためのマスクを暗示的に特定する。括弧の各対は合成のラウンドを証明する。あるラウンドの化学的反応成分(例えば、AおよびB)はオーバーラッピングしない部位において反応し、それゆえ互いに組み合わせることができない。合成区域はラウンドの要素の間で等しく分画される(例えば、Aはその区域の1つの半分に向けられ、そしてBは他方の半分に向けられる)。それゆえ、あるラウンドにためのマスク(例えば、マスクmAおよびmB)は直交し、そして正規直交の組を形成する。多項式の表示は、また、あるラウンドにおける各要素が次のラウンドの各要素に対して接合すべきであることを意味する(例えば、AとC、AとD、BとC、およびBとD)。これはmCをmAおよびmBと等しくオーバーラッピングし、そしてmDについて同様にオーバーラッピングすることによって達成される。CおよびDはあるラウンドの要素であるので、mCおよびmDは互いに対して直交し、そして正規直交の組を形成する。
K:=Σ(bi+Zi)
であり、そして化学的工程nの数は
n=Ebi
である。すべてのラウンドにおいてb=a(化学的構成ブロックの数)およびz=0であるとき合成される化合物の数はan/aであり、これに対して二段階合成については2nである。n−20かつa=5について、625の化合物(すべてテトラマー)が形成し、これに対して同一の数の化学的工程をもつ二段階合成において1,049×106の化合物が形成するであろう。また、多項式におけるラウンドは、
第5図は、二段階マスキング法を使用する合成を示す。二段階マスキング法は、所定数のサイクルについて最大数の配列を提供する。この態様によれば、マズクm1は支持体の半分の照明を可能とする。次いで支持体を構成ブロックに対して露出し、これは照明された領域において結合する。
第6図は、ここにおいてグレイコードのマスキング法と呼ぶ他の好ましい二段階マスキング法を例示する。この態様によれば、任意の所定の合成領域の側面が1つだけのマスクのへりにより規定されたように、マスクm1〜m5を選択する。例えば、配列BCDEが形成される部位は、m5により規定されたその右へりおよびマスクm4により形成されたその左側を有する(そして他のマスクはこの部位の側面で整列されていない)。したがって、非整列、マスクの下の光の拡散などにより発生する問題は最小とされるであろう。
第7図は、他の二段階マスキング法を例示する。ここにおいて変更されたグレイコードの二段階マスキング法と呼ぶ、このスキームによれば、必要なマスクの数は最小とされる。例えば、マスクm2はm1と同一のマスクであり、そして単に横方向に並進させることができる。同様に、マスクm4はm3と同一のマスクであり、そして単に横方向に並進させることができる。
4工程の合成は第8a図に示されている。反応成分は順序づけられた組である{A,B,C,D}。第1サイクルにおいて、m1を通した照明は合成区域の上半分を活性化する。次いで構成ブロックAを添加して分布602を与える。マスクm2を通して照明し(これは下半分を活性化する)、次いでBを添加すると、次の照明分布604が生ずる。m3を通して照明し(これは左半分を活性化する)次いでCを添加すると、分布604が得られ、そしてm4を通して照明し(これは右半分を活性化する)次いでDを添加すると、最終の生成物のパターン608が得られる{AC,AD,BC,BD}。
合成の上のマスキング法を、第8b図に示すように、20の天然に見いだされるアミノ酸からのすべての400ジペプチドのために拡張することができる。この合成は2ラウンドから成り、20の光分解および化学的カップリング/ラウンドを使用する。ラウンド1の第1サイクルにおいて、マスク1は20のアミノ酸の第1とのカップリングのために支持体の1/20を活性化する。ラウンド1において19の引き続く照明/カップリングのサイクルは、各々が20アミノ酸の離散した構成員を有する、20の長方形のストライプから成る支持体を生ずる。ラウンド2のマスクはラウンド1のマスクに対して垂直であり、したがって、ラウンド2における単一の照明/カップリングのサイクルは20のジペプチドを生ずる。ラウンド2の20の照明/カップリングのサイクルは400のジペプチドの合成を完結する。
2段階マスキング法の力は、1,024ペプチドを生成した10工程の合成の結果から理解することができる。この10工程の二段階合成のための多項式の表現は、次の通りであった:
A11110000
B00001111
C11001100
D00110011
E10101010
F01010101
G11110000
H00001111
であると仮定する。
好ましい態様によれば、合成されたポリマーと支持体との間の中間体として使用するリンカー分子は、レセプターとの改良された結合相互作用のために最適な長さまたは型について選択される。本発明のこの面に従い、変化する長さおよび/または型の種々のリンカーの長さおよび型の変動により、固定化されたリガンドおよびそのレセプターとの間の結合相互作用を最適化することが可能となる。
前述したように、選択的に除去可能な保護基は異なる反応性を有する支持体表面のよく規定された区域の発生を可能とする。好ましくは、保護基は特定のアクチベーター、例えば、特定の波長および強度の電磁輻射線を適用することによって表面から選択的に除去する。さらに詳しくは、特定のアクチベーターは表面の選択した区域を暴露して、暴露された区域における保護基を除去する。
NVOC−AA→3,4−ジメトキシ−6−ニトロソベンズアルデヒド+CO2+AA
MeNVOC−AA→3,4−ジメトキシ−6−ニトロソアセトフェノン+CO2+AAここでAAはアミノ酸オリゴマーのN末端を表す。
固相支持体上のペプチドの形成は、支持体に結合した成長する鎖にアミノ酸を段階的に取り付けることを必要とする。反応条件下のモノマーのアミノ酸の不都合な重合を防止するために、アミノ酸のアミノ末端の保護を必要とする。モノマーをペプチドの末端にカップリングさせた後、N末端の保護基を除去し、そして他のアミノ酸をこの鎖にカップリングさせた。カップリングおよび脱保護のこのサイクルはペプチド配列の中の各アミノ酸について続けられる。参照、Merrifield,J.Am.Chem.Soc.(1963)85:2149、およびAthertonら、「固相ペプチド合成(Solid Phase Peptide Synthesis)」、1989,IRL Press,ロンドン、それらの両者をすべての目的のためにここに引用によって加える。前述したように、光除去可能な保護基の使用は、固相合成の脱保護サイクルの聞に、パターン化された照射により、支持体表面の選択した部分の除去を可能とする。これは合成の窒間的コントロールを選択的に可能とする−一次のアミノ酸を照射された区域にのみカップリングされる。
固相支持体上のヌクレオチドの形成は、支持体に結合した成長するオリゴマーへのヌクレオチドの段階的取り付けを必要とする。反応条件下のモノマーのヌクレオチドの不都合な重合を防止するために、ヌクレオチドの5’−ヒドロキシル基の保護を必要とする。モノマーをオリゴマーの末端にカップリングした後、5’−ヒドロキシル保護基を除去し、そして他のヌクレオチドをこの鎖にカップリングする。カップリングおよび脱保護のこのサイクルはオリゴマー配列の中の各ヌクレオチドについて統ける。参照、Gait,「オリゴヌクレオチドの合成:実際のアプローチ(Oligonucleotide Synthesis:A Practical Approach)」、1984,IRL Press,ロンドン、これをすべての目的のためにここに引用によって加える。前述したように、光除去可能な保護基の使用は、固相合成の脱保護サイクルの間に、支持体表面の選択した部分の、パターン化された照射により、除去を可能とする。これは選択的に合成の空間的コントロールを可能とする−一次のヌクレオチドは照射された区域にのみカップリングされる。
Merrifieldのペプチド合成の間に、アミノ酸の活性化エステルを支持体に結合したオリゴマーの遊離アミノ末端とカップリングさせる。固相合成に適当なアミノ酸の活性化エステルは、ハロ−ホルメート、混合無水物、イミダゾイルホルメート、アシル化ハライドを包含し、そしてまた活性化エステルの’その場の形成および普通の試薬、例えば、DCCなどの使用を包含する(参照、Athertonら)。好ましい保護されかつ活性化されたアミノ酸は、次の一般式を有する:
A.データ収集システム
前述したように調製された支持体を1つの態様において使用して、支持体上の複数の配列のどれが問題のレセプターに結合するかを決定する。第10図は、蛍光性マスクを含有する支持体の領域を検出するために使用する装置の1つの態様を例示する。この装置は、例えば、蛍光標識したレセプター、例えば、支持体上の合成されたポリマーに結合している抗体の存在または不存在を検出するために使用されるであろう。
データ収集システムからの出力は、蛍光強度/支持体上の位置を示すデータの配列である。データは、典型的には、所定のポリマーの合成が起こった区域より実質的に小さい領域にわたって採取される。単に例として、ポリマーが500ミクロン×500ミクロンの寸法を有する支持体上の正方形で合成された場合、データは5ミクロン×5ミクロンの寸法を有する領域にわたって採取することができる。最も好ましい態様において、支持体を横切って蛍光のデータを取る領域は、個々のポリマーが合成される領域の区域の約1/2より小さく、妊ましくは単一のポリマーが合成される領域の区域の約1/10より小さく、最も好ましくは単一のポリマーが合成される領域の区域の約1/100より小さい。それゆえ、所定のポリマーが合成された任意の区域内で、多数の蛍光のデータ点が集められる。
A.オリゴヌクレオチドの合成
光統制された空間的にアドレス可能な平行の化学的合成の一般性を、核酸の合成への応用により証明する。
チミジン−シチジンの2量体の光活性化された形成を実施した。ジヌクレオチドの光統制された合成により発生された7つの正方形×4つの正方形のチェッカー盤状のパターンを示す蛍光の走査の3次元の表示を生成した。5’−ニトロベラトリルチミジンを合成支持体に3’ヒドロキシ基を通して取り付けた。ニトロベラトリル保護基を500μmのチェッカー盤状のマスクを通す照明により除去した。次いで、支持体をホスホルアミダイト活性化2’−デオキシシチジンで処理した。反応を蛍光測定的に追跡するために、デオキシシチジンはエキソサイクリックアミンに取り付けられたFMOC保護されたアミノヒドロキシルリンカーで修飾されていた(5’−〇−ジメトキシトリチル−4−N−(6−N−フルオレニルメチルカルバモイル−ヒドロキシルカルボキシ)−2’−デオキシシチジン)。FMOC保護基を塩基で除去した後、支持体をDMF中の1mMのFITCで1時間の間処理することによって、ジヌクレオチドを含有する領域を蛍光標識した。
ここにおける本発明は、多数の化合物を同時に合成する新規なアプローチを提供する。この方法は、固相のフォーマットでカップリングすることができる化学的構成ブロックを有するとき、および光を使用して反応性基を発生させることができるとき、いつでも応用することができる。
(2)配列番号1についての情報:
(i)配列特徴
(A)長さ:5個のアミノ酸
(B)型:アミノ酸
(C)鎖の数:一本鎖
(D)トポロジー:直鎖状
(ii)配列の種類:ペプチド
(xi)配列:配列番号1:
Tyr Gly Gly Phe Leu
1 5
(2)配列番号2についての情報:
(i)配列特徴
(A)長さ:5個のアミノ酸
(B)型:アミノ酸
(C)鎖の数:一本鎖
(D)トポロジー:直鎖状
(il)配列の種類:ペプチド
(xi)配列:配列番号2:
Pro Gly Gly Phe Leu
1 5
(2)配列番号3についての情報:
(i)配列特徴
(A)長さ:5個のアミノ酸
(B)型:アミノ酸
(C)鎖の数:一本鎖
(D)トポロジー:直鎖状
(ii)配列の種類:ペプチド
(xi)配列:配列番号3:
Tyr Gly Ala Gly Phe
1 5
(2)配列番号4についての情報:
(i)配列特徴
(A)長さ:6個のアミノ酸
(B)型:アミノ酸
(C)鎖の数:一本鎖
(D)トポロジー:直鎖状
(ii)配列の種類:ペプチド
(xi)配列:配列番号4:
Tyr Gly Ala Phe Leu Ser
1 5
(2)配列番号5についての情報:
(i)配列特徴
(A)長さ:5個のアミノ酸
(B)型:アミノ酸
(C)鎖の数:一本鎖
(D)トポロジー:直鎖状
(ii)配列の種類:ペプチド
(xi)配列:配列番号5:
Tyr Gly Ala Phe Ser
1 5
(2)配列番号6についての情報:
(i)配列特徴
(A)長さ:5個のアミノ酸
(B)型:アミノ酸
(C)鎖の数:一本鎖
(D)トポロジー:直鎖状
(ii)配列の種類:ペプチド
(xi)配列:配列番号6:
Tyr Gly Ala Phe Leu
1 5
(2)配列番号7についての情報:
(i)配列特徴
(A)長さ:6個のアミノ酸
(B)型:アミノ酸
(C)鎖の数:一本鎖
(D)トポロジー:直鎖状
(ii)配列の種類:ペプチド
(xi)配列:配列番号7:
Tyr Gly Gly Phe Leu Ser
1 5
(2)配列番号8についての情報:
(i)配列特徴
(A)長さ:4個のアミノ酸
(B)型:アミノ酸
(C)鎖の数:一本鎖
(D)トポロジー:直鎖状
(ii)配列の種類:ペプチド
(xi)配列:配列番号8:
Tyr Gly Ala Phe
1
(2)配列番号9についての情報:
(i)配列特徴
(A)長さ5個のアミノ酸
(B)型:アミノ酸
(C)鎖の数:一本鎖
(D)トポロジー:直鎖状
(ii)配列の種類:ペプチド
(xi)配列:配列番号9:
Tyr Gly Ala Leu Ser
1 5
(2)配列番号10についての情報;
(i)配列特徴
(A)長さ:5個のアミノ酸
(B)型:アミノ酸
(C)鎖の数:一本鎖
(D)トポロジー:直鎖状
(ii)配列の種類:ペプチド
(xi)配列:配列番号10:
Tyr Gly Gly Phe Ser
1 5
(2)配列番号11についての情報:
(i)配列特徴
(A)長さ:4個のアミノ酸
(B)型:アミノ酸
(C)鎖の数:一本鎖
(D)トポロジー:直鎖状
(ii)配列の種類:ペプチド
(xi)配列:配列番号11:
Tyr Gly Ala Leu
1
(2)配列番号12についての情報:
(i)配列特徴
(A)長さ:6個のアミノ酸
(B)型:アミノ酸
(C)鎖の数:一本鎖
(D)トポロジー:直鎖状
(ii)配列の種類:ペプチド
(xi)配列:配列番号12:
Tyr Gly Ala Phe Leu Phe
1 5
(2)配列番号13についての情報:
(i)配列特徴
(A)長さ5個のアミノ酸
(B)型:アミノ酸
(C)鎖の数:一本鎖
(D)トポロジー:直鎖状
(ii)配列の種類:ペプチド
(xi)配列:配列番号13;
Tyr Gly Ala Phe Phe
1 5
(2)配列番号14についての情報:
(i)配列特徴
(A)長さ:5個のアミノ酸
(B)型:アミノ酸
(C)鎖の数:一本鎖
(D)トポロジー:直鎖状
(il)配列の種類:ペプチド
(xi)配列:配列番号14:
Tyr Gly Gly Leu Ser
1 5
(2)配列番号15についての情報:
(i)配列特徴
(A)長さ:5個のアミノ酸
(B)型:アミノ酸
(C)鎖の数:一本鎖
(D)トポロジー:直鎖状
(ii)配列の種類:ペプチド
(xi)配列:配列番号15:
Tyr Gly Gly Phe Leu
1 5
(2)配列番号16についての情報:
(i)配列特徴
(A)長さ:6個のアミノ酸
(B)型:アミノ酸
(C)鎖の数:一本鎖
(D)トポロジー:直鎖状
(ii)配列の種類:ペプチド
(xi)配列:配列番号16:
Tyr Gly Ala Phe Ser Phe
1 5
(2)配列番号17についての情報:
(i)配列特徴
(A)長さ:7個のアミノ酸
(B)型:アミノ酸
(C)鎖の数:一本鎖
(D)トポロジー:直鎖状
(ii)配列の種類:ペプチド
(xi)配列=配列番号17:
Tyr Gly Ala Phe Leu Ser Phe
1 5
(2)配列番号18についての情報:
(i)配列特徴
(A)長さ;6個のアミノ酸
(B)型:アミノ酸
(C)鎖の数::一本鎖
(D)トポロジー:直鎖状
(ii)配列の種類:ペプチド
(xi)配列:配列番号18:
Tyr Gly Ala Phe Met Gln
1 5
(2)配列番号19についての情報:
(i)配列特徴
(A)長さ:5個のアミノ酸
(B)型:アミノ酸
(C)鎖の数:一本鎖
(D)トポロジー:直鎖状
(ii)配列の種類:ペプチド
(xi)配列:配列番号19:
Tyr Gly Ala Phe Met
1 5
(2)配列番号20についての情報:
(i)配列特致
(A)長さ:5個のアミノ酸
(B)型:アミノ酸
(C)鎖の数:一本鎖
(D)トポロジー:直鎖状
(ii)配列の種類:ペプチド
(xi)配列:配列番号20:
Tyr Gly Ala Phe Gln
1 5
(2)配列番号21についての情報:
(i)配列特徴
(A)長さ:5個のアミノ酸
(B)型:アミノ酸
(C)鎖の数:一本鎖
(D)トポロジー:直鎖状
(ii)配列の種類:ペプチド
(xi)配列:配列番号21:
Tyr Gly Gly Phe Met
1 5
Claims (1)
- 支持体上で、ポリマーの配列を複数合成するための反応器システムであって:
a)前記支持体に反応流体を接触するための反応器;
b)マスク;
c)前記反応器に選択された反応流体を送るためのシステム;
d)少なくとも第1相対位置から第2相対位置に対してマスク又は支持体を移動するための並進ステージ;
e)マスクを通して前記支持体を選択された時間で照射するための光源;
f)前記システム(c)からの流体の流れを選択的に制御し、前記並進ステージを選択的に移動させ、そして前記支持体上で複数の多様なポリマー配列を予定された位置で形成するために前記支持体を選択的に照射するための適切にプログラムされたディジタル型コンピューターを含んで成る反応器システム。
Applications Claiming Priority (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
US62412090A | 1990-12-06 | 1990-12-06 |
Related Parent Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
JP4503660A Division JPH06504997A (ja) | 1990-12-06 | 1991-11-20 | 非常に大きい規模の固定化されたポリマーの合成 |
Publications (2)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
JP2006188495A JP2006188495A (ja) | 2006-07-20 |
JP4112582B2 true JP4112582B2 (ja) | 2008-07-02 |
Family
ID=24500735
Family Applications (3)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
JP4503660A Withdrawn JPH06504997A (ja) | 1990-12-06 | 1991-11-20 | 非常に大きい規模の固定化されたポリマーの合成 |
JP2005049797A Withdrawn JP2005194285A (ja) | 1990-12-06 | 2005-02-24 | 非常に大きい規模の固定化されたポリマーの合成 |
JP2005351375A Expired - Lifetime JP4112582B2 (ja) | 1990-12-06 | 2005-12-05 | 非常に大きい規模の固定化されたポリマーの合成 |
Family Applications Before (2)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
JP4503660A Withdrawn JPH06504997A (ja) | 1990-12-06 | 1991-11-20 | 非常に大きい規模の固定化されたポリマーの合成 |
JP2005049797A Withdrawn JP2005194285A (ja) | 1990-12-06 | 2005-02-24 | 非常に大きい規模の固定化されたポリマーの合成 |
Country Status (14)
Country | Link |
---|---|
EP (2) | EP0562025B1 (ja) |
JP (3) | JPH06504997A (ja) |
AT (2) | ATE244065T1 (ja) |
AU (1) | AU663300B2 (ja) |
CA (1) | CA2097708A1 (ja) |
DE (2) | DE69132531T2 (ja) |
DK (1) | DK0562025T3 (ja) |
ES (1) | ES2155822T3 (ja) |
GR (1) | GR3035773T3 (ja) |
IL (1) | IL100193A (ja) |
MX (1) | MX9102400A (ja) |
NZ (1) | NZ240744A (ja) |
WO (1) | WO1992010092A1 (ja) |
ZA (1) | ZA919650B (ja) |
Families Citing this family (409)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
GB8810400D0 (en) | 1988-05-03 | 1988-06-08 | Southern E | Analysing polynucleotide sequences |
US7811751B2 (en) | 1988-05-03 | 2010-10-12 | Oxford Gene Technology Limited | Analysing polynucleotide sequences |
US5242974A (en) * | 1991-11-22 | 1993-09-07 | Affymax Technologies N.V. | Polymer reversal on solid surfaces |
US5871928A (en) * | 1989-06-07 | 1999-02-16 | Fodor; Stephen P. A. | Methods for nucleic acid analysis |
US5143854A (en) | 1989-06-07 | 1992-09-01 | Affymax Technologies N.V. | Large scale photolithographic solid phase synthesis of polypeptides and receptor binding screening thereof |
US5800992A (en) * | 1989-06-07 | 1998-09-01 | Fodor; Stephen P.A. | Method of detecting nucleic acids |
US6040138A (en) * | 1995-09-15 | 2000-03-21 | Affymetrix, Inc. | Expression monitoring by hybridization to high density oligonucleotide arrays |
US5925525A (en) * | 1989-06-07 | 1999-07-20 | Affymetrix, Inc. | Method of identifying nucleotide differences |
EP0773227A1 (en) * | 1991-09-18 | 1997-05-14 | Affymax Technologies N.V. | Diverse collections of oligomers in use to prepare drugs, diagnostic reagents, pesticides or herbicides |
US5639603A (en) * | 1991-09-18 | 1997-06-17 | Affymax Technologies N.V. | Synthesizing and screening molecular diversity |
US5846708A (en) * | 1991-11-19 | 1998-12-08 | Massachusetts Institiute Of Technology | Optical and electrical methods and apparatus for molecule detection |
US5550215A (en) * | 1991-11-22 | 1996-08-27 | Holmes; Christopher P. | Polymer reversal on solid surfaces |
US5324633A (en) * | 1991-11-22 | 1994-06-28 | Affymax Technologies N.V. | Method and apparatus for measuring binding affinity |
US6943034B1 (en) | 1991-11-22 | 2005-09-13 | Affymetrix, Inc. | Combinatorial strategies for polymer synthesis |
US5420328A (en) * | 1992-09-11 | 1995-05-30 | Affymax Technologies, N.V. | Methods for the synthesis of phosphonate esters |
US5288514A (en) * | 1992-09-14 | 1994-02-22 | The Regents Of The University Of California | Solid phase and combinatorial synthesis of benzodiazepine compounds on a solid support |
US5324483B1 (en) * | 1992-10-08 | 1996-09-24 | Warner Lambert Co | Apparatus for multiple simultaneous synthesis |
US5702672A (en) * | 1992-10-08 | 1997-12-30 | Warner-Lambert Company | Apparatus and method for multiple simultaneous synthesis |
US5714127A (en) * | 1992-10-08 | 1998-02-03 | Warner-Lambert Company | System for multiple simultaneous synthesis |
US5565173A (en) * | 1992-10-08 | 1996-10-15 | Warner-Lambert Company | Apparatus and method for multiple simultaneous synthesis |
US5858659A (en) * | 1995-11-29 | 1999-01-12 | Affymetrix, Inc. | Polymorphism detection |
WO1995000530A1 (en) | 1993-06-25 | 1995-01-05 | Affymax Technologies N.V. | Hybridization and sequencing of nucleic acids |
US5837832A (en) * | 1993-06-25 | 1998-11-17 | Affymetrix, Inc. | Arrays of nucleic acid probes on biological chips |
US5861242A (en) * | 1993-06-25 | 1999-01-19 | Affymetrix, Inc. | Array of nucleic acid probes on biological chips for diagnosis of HIV and methods of using the same |
US6027880A (en) * | 1995-08-02 | 2000-02-22 | Affymetrix, Inc. | Arrays of nucleic acid probes and methods of using the same for detecting cystic fibrosis |
US7115364B1 (en) | 1993-10-26 | 2006-10-03 | Affymetrix, Inc. | Arrays of nucleic acid probes on biological chips |
US20060229824A1 (en) | 1993-10-26 | 2006-10-12 | Affymetrix, Inc. | Arrays of nucleic acid probes for analyzing biotransformation genes |
US6156501A (en) * | 1993-10-26 | 2000-12-05 | Affymetrix, Inc. | Arrays of modified nucleic acid probes and methods of use |
US7375198B2 (en) | 1993-10-26 | 2008-05-20 | Affymetrix, Inc. | Modified nucleic acid probes |
US6309823B1 (en) | 1993-10-26 | 2001-10-30 | Affymetrix, Inc. | Arrays of nucleic acid probes for analyzing biotransformation genes and methods of using the same |
US6045996A (en) * | 1993-10-26 | 2000-04-04 | Affymetrix, Inc. | Hybridization assays on oligonucleotide arrays |
US5922545A (en) * | 1993-10-29 | 1999-07-13 | Affymax Technologies N.V. | In vitro peptide and antibody display libraries |
US5503805A (en) * | 1993-11-02 | 1996-04-02 | Affymax Technologies N.V. | Apparatus and method for parallel coupling reactions |
US6165778A (en) * | 1993-11-02 | 2000-12-26 | Affymax Technologies N.V. | Reaction vessel agitation apparatus |
US6741344B1 (en) | 1994-02-10 | 2004-05-25 | Affymetrix, Inc. | Method and apparatus for detection of fluorescently labeled materials |
US5631734A (en) * | 1994-02-10 | 1997-05-20 | Affymetrix, Inc. | Method and apparatus for detection of fluorescently labeled materials |
US5571639A (en) * | 1994-05-24 | 1996-11-05 | Affymax Technologies N.V. | Computer-aided engineering system for design of sequence arrays and lithographic masks |
DE69527585T2 (de) * | 1994-06-08 | 2003-04-03 | Affymetrix Inc | Verfahren und Vorrichtung zum Verpacken von Chips |
US6287850B1 (en) | 1995-06-07 | 2001-09-11 | Affymetrix, Inc. | Bioarray chip reaction apparatus and its manufacture |
US5679773A (en) * | 1995-01-17 | 1997-10-21 | Affymax Technologies N.V | Reagants and methods for immobilized polymer synthesis and display |
JPH10507160A (ja) * | 1994-06-23 | 1998-07-14 | アフィマックス テクノロジーズ エヌ.ブイ. | 光活性化合物およびその使用方法 |
US5710000A (en) | 1994-09-16 | 1998-01-20 | Affymetrix, Inc. | Capturing sequences adjacent to Type-IIs restriction sites for genomic library mapping |
US5599668A (en) * | 1994-09-22 | 1997-02-04 | Abbott Laboratories | Light scattering optical waveguide method for detecting specific binding events |
US7767627B1 (en) | 1994-10-18 | 2010-08-03 | Symyx Solutions, Inc. | Combinatorial synthesis of inorganic or composite materials |
US6004617A (en) * | 1994-10-18 | 1999-12-21 | The Regents Of The University Of California | Combinatorial synthesis of novel materials |
US5985356A (en) | 1994-10-18 | 1999-11-16 | The Regents Of The University Of California | Combinatorial synthesis of novel materials |
US6121048A (en) * | 1994-10-18 | 2000-09-19 | Zaffaroni; Alejandro C. | Method of conducting a plurality of reactions |
US6974666B1 (en) | 1994-10-21 | 2005-12-13 | Appymetric, Inc. | Methods of enzymatic discrimination enhancement and surface-bound double-stranded DNA |
US6600996B2 (en) | 1994-10-21 | 2003-07-29 | Affymetrix, Inc. | Computer-aided techniques for analyzing biological sequences |
US5556752A (en) | 1994-10-24 | 1996-09-17 | Affymetrix, Inc. | Surface-bound, unimolecular, double-stranded DNA |
US5795716A (en) | 1994-10-21 | 1998-08-18 | Chee; Mark S. | Computer-aided visualization and analysis system for sequence evaluation |
DE69533554T2 (de) * | 1994-11-10 | 2005-01-27 | Orchid Biosciences, Inc. | Flüssigkeitsverteilungssystem |
US5585069A (en) * | 1994-11-10 | 1996-12-17 | David Sarnoff Research Center, Inc. | Partitioned microelectronic and fluidic device array for clinical diagnostics and chemical synthesis |
US5603351A (en) | 1995-06-07 | 1997-02-18 | David Sarnoff Research Center, Inc. | Method and system for inhibiting cross-contamination in fluids of combinatorial chemistry device |
GB2295152A (en) * | 1994-11-18 | 1996-05-22 | Pfizer Ltd | Preparation of a library of compounds by solid-phase synthesis |
US6239273B1 (en) | 1995-02-27 | 2001-05-29 | Affymetrix, Inc. | Printing molecular library arrays |
US5599695A (en) * | 1995-02-27 | 1997-02-04 | Affymetrix, Inc. | Printing molecular library arrays using deprotection agents solely in the vapor phase |
US5959098A (en) * | 1996-04-17 | 1999-09-28 | Affymetrix, Inc. | Substrate preparation process |
US5908926A (en) * | 1995-03-16 | 1999-06-01 | Duke University | 5'to 3' nucleic acid synthesis using 3'-photoremovable protecting group |
US5961923A (en) * | 1995-04-25 | 1999-10-05 | Irori | Matrices with memories and uses thereof |
US6100026A (en) * | 1995-04-25 | 2000-08-08 | Irori | Matrices with memories and uses thereof |
US5925562A (en) * | 1995-04-25 | 1999-07-20 | Irori | Remotely programmable matrices with memories |
US6284459B1 (en) | 1995-04-25 | 2001-09-04 | Discovery Partners International | Solid support matrices with memories and combinatorial libraries therefrom |
US5624711A (en) * | 1995-04-27 | 1997-04-29 | Affymax Technologies, N.V. | Derivatization of solid supports and methods for oligomer synthesis |
US6720149B1 (en) | 1995-06-07 | 2004-04-13 | Affymetrix, Inc. | Methods for concurrently processing multiple biological chip assays |
US5545531A (en) * | 1995-06-07 | 1996-08-13 | Affymax Technologies N.V. | Methods for making a device for concurrently processing multiple biological chip assays |
US5856174A (en) | 1995-06-29 | 1999-01-05 | Affymetrix, Inc. | Integrated nucleic acid diagnostic device |
US6168948B1 (en) | 1995-06-29 | 2001-01-02 | Affymetrix, Inc. | Miniaturized genetic analysis systems and methods |
US5968740A (en) * | 1995-07-24 | 1999-10-19 | Affymetrix, Inc. | Method of Identifying a Base in a Nucleic Acid |
US5733729A (en) * | 1995-09-14 | 1998-03-31 | Affymetrix, Inc. | Computer-aided probability base calling for arrays of nucleic acid probes on chips |
US5843655A (en) | 1995-09-18 | 1998-12-01 | Affymetrix, Inc. | Methods for testing oligonucleotide arrays |
US6132580A (en) * | 1995-09-28 | 2000-10-17 | The Regents Of The University Of California | Miniature reaction chamber and devices incorporating same |
US6953663B1 (en) | 1995-11-29 | 2005-10-11 | Affymetrix, Inc. | Polymorphism detection |
US6300063B1 (en) | 1995-11-29 | 2001-10-09 | Affymetrix, Inc. | Polymorphism detection |
US6022963A (en) * | 1995-12-15 | 2000-02-08 | Affymetrix, Inc. | Synthesis of oligonucleotide arrays using photocleavable protecting groups |
US6147205A (en) * | 1995-12-15 | 2000-11-14 | Affymetrix, Inc. | Photocleavable protecting groups and methods for their use |
US6660233B1 (en) | 1996-01-16 | 2003-12-09 | Beckman Coulter, Inc. | Analytical biochemistry system with robotically carried bioarray |
US6864059B2 (en) | 1996-01-23 | 2005-03-08 | Affymetrix, Inc. | Biotin containing C-glycoside nucleic acid labeling compounds |
US7468243B2 (en) | 2001-03-12 | 2008-12-23 | Affymetrix, Inc. | 2-aminopyrimidin-4-one nucleic acid labeling compounds |
US6965020B2 (en) | 1996-01-23 | 2005-11-15 | Affymetrix, Inc. | Nucleic acid labeling compounds |
US7423143B2 (en) | 1996-01-23 | 2008-09-09 | Affymetrix. Inc. | Nucleic acid labeling compounds |
US7291463B2 (en) | 1996-01-23 | 2007-11-06 | Affymetrix, Inc. | Nucleic acid labeling compounds |
US7282327B2 (en) | 1996-01-23 | 2007-10-16 | Affymetrix, Inc. | Nucleic acid labeling compounds |
US20010018514A1 (en) | 1998-07-31 | 2001-08-30 | Mcgall Glenn H. | Nucleic acid labeling compounds |
JP2000504575A (ja) | 1996-02-08 | 2000-04-18 | アフィメトリックス,インコーポレイテッド | 微生物のチップベースの種分化および表現型特徴付け |
EP1728875A3 (en) | 1996-02-08 | 2007-05-09 | Affymetrix, Inc. | Chip-based speciation and phenotypic characterization of microorganisms |
US6924094B1 (en) | 1996-02-08 | 2005-08-02 | Affymetrix, Inc. | Chip-based species identification and phenotypic characterization of microorganisms |
DE19609272C2 (de) * | 1996-02-27 | 2000-05-25 | Schering Ag | Verfahren zur Parallelsynthese großer Zahlen von 2,6-disubstituierten Chinolinderivaten |
US6063633A (en) | 1996-02-28 | 2000-05-16 | The University Of Houston | Catalyst testing process and apparatus |
US6361937B1 (en) | 1996-03-19 | 2002-03-26 | Affymetrix, Incorporated | Computer-aided nucleic acid sequencing |
US6777217B1 (en) | 1996-03-26 | 2004-08-17 | President And Fellows Of Harvard College | Histone deacetylases, and uses related thereto |
US6114122A (en) * | 1996-03-26 | 2000-09-05 | Affymetrix, Inc. | Fluidics station with a mounting system and method of using |
US6458530B1 (en) | 1996-04-04 | 2002-10-01 | Affymetrix Inc. | Selecting tag nucleic acids |
US6706875B1 (en) | 1996-04-17 | 2004-03-16 | Affyemtrix, Inc. | Substrate preparation process |
WO1997040385A1 (en) | 1996-04-25 | 1997-10-30 | Bioarray Solutions, Llc | Light-controlled electrokinetic assembly of particles near surfaces |
EP0902885A4 (en) | 1996-05-16 | 2006-09-27 | Affymetrix Inc | SYSTEMS AND METHODS FOR DETECTION OF BRANDED PRODUCTS |
US5912124A (en) * | 1996-06-14 | 1999-06-15 | Sarnoff Corporation | Padlock probe detection |
EP0912752A1 (en) * | 1996-06-14 | 1999-05-06 | Sarnoff Corporation | Method for polynucleotide sequencing |
US5914229A (en) * | 1996-06-14 | 1999-06-22 | Sarnoff Corporation | Method for amplifying a polynucleotide |
US5770370A (en) * | 1996-06-14 | 1998-06-23 | David Sarnoff Research Center, Inc. | Nuclease protection assays |
US6391550B1 (en) | 1996-09-19 | 2002-05-21 | Affymetrix, Inc. | Identification of molecular sequence signatures and methods involving the same |
WO1998014641A1 (en) | 1996-10-02 | 1998-04-09 | Symyx Technologies | Potential masking systems and methods for combinatorial library synthesis |
US5932546A (en) * | 1996-10-04 | 1999-08-03 | Glaxo Wellcome Inc. | Peptides and compounds that bind to the thrombopoietin receptor |
US6133436A (en) * | 1996-11-06 | 2000-10-17 | Sequenom, Inc. | Beads bound to a solid support and to nucleic acids |
EP0946286B1 (en) * | 1996-11-14 | 2003-03-19 | Affymetrix, Inc. | Chemical amplification for the synthesis of patterned arrays |
PT971946E (pt) | 1997-01-21 | 2006-11-30 | Gen Hospital Corp | Selecção de proteínas utilizando fusões arn-proteína |
EP0972082A4 (en) | 1997-04-04 | 2007-04-25 | Caliper Life Sciences Inc | BIOCHEMICAL ANALYZERS OPERATING IN CLOSED LOOP |
US6151123A (en) * | 1997-07-14 | 2000-11-21 | Symyx Technologies, Inc. | Systems and methods for employing optical probes to characterize material properties |
US6420108B2 (en) | 1998-02-09 | 2002-07-16 | Affymetrix, Inc. | Computer-aided display for comparative gene expression |
DE69823206T2 (de) | 1997-07-25 | 2004-08-19 | Affymetrix, Inc. (a Delaware Corp.), Santa Clara | Verfahren zur herstellung einer bio-informatik-datenbank |
KR100664331B1 (ko) | 1997-07-28 | 2007-01-02 | 메디칼 바이오시스템스 리미티드 | 핵산 서열 분석 |
US6506895B2 (en) | 1997-08-15 | 2003-01-14 | Surmodics, Inc. | Photoactivatable nucleic acids |
US6207370B1 (en) | 1997-09-02 | 2001-03-27 | Sequenom, Inc. | Diagnostics based on mass spectrometric detection of translated target polypeptides |
US7252950B1 (en) | 1997-09-04 | 2007-08-07 | The Regents Of The University Of California | Assays for detecting modulators of cytoskeletal function |
GB9722131D0 (en) | 1997-10-20 | 1997-12-17 | Medical Res Council | Method |
US6465054B2 (en) | 1997-10-21 | 2002-10-15 | Roche Diagnostics Gmbh | Process for coating surfaces |
US6235871B1 (en) | 1997-12-03 | 2001-05-22 | Massachusetts Institute Of Technology | Synthesis of oligoarylamines, and uses and reagents related thereto |
US6794133B1 (en) | 1997-12-11 | 2004-09-21 | The General Hospital Corporation | Broad range PCR amplification techniques |
US20030096232A1 (en) | 1997-12-19 | 2003-05-22 | Kris Richard M. | High throughput assay system |
WO1999041007A2 (en) * | 1998-02-11 | 1999-08-19 | University Of Houston | Method and apparatus for chemical and biochemical reactions using photo-generated reagents |
WO1999051773A1 (en) * | 1998-04-03 | 1999-10-14 | Phylos, Inc. | Addressable protein arrays |
US7108968B2 (en) | 1998-04-03 | 2006-09-19 | Affymetrix, Inc. | Mycobacterial rpoB sequences |
US7094943B2 (en) | 1998-04-27 | 2006-08-22 | Hubert Köster | Solution phase biopolymer synthesis |
US7875440B2 (en) | 1998-05-01 | 2011-01-25 | Arizona Board Of Regents | Method of determining the nucleotide sequence of oligonucleotides and DNA molecules |
US6780591B2 (en) | 1998-05-01 | 2004-08-24 | Arizona Board Of Regents | Method of determining the nucleotide sequence of oligonucleotides and DNA molecules |
DE19940749A1 (de) * | 1998-08-28 | 2000-05-18 | Febit Ferrarius Biotech Gmbh | Verfahren und Vorrichtung zur integrierten Synthese und Analyse von Polymeren |
US6185561B1 (en) | 1998-09-17 | 2001-02-06 | Affymetrix, Inc. | Method and apparatus for providing and expression data mining database |
US6203989B1 (en) | 1998-09-30 | 2001-03-20 | Affymetrix, Inc. | Methods and compositions for amplifying detectable signals in specific binding assays |
US6262216B1 (en) | 1998-10-13 | 2001-07-17 | Affymetrix, Inc. | Functionalized silicon compounds and methods for their synthesis and use |
US7071324B2 (en) | 1998-10-13 | 2006-07-04 | Brown University Research Foundation | Systems and methods for sequencing by hybridization |
US7034143B1 (en) | 1998-10-13 | 2006-04-25 | Brown University Research Foundation | Systems and methods for sequencing by hybridization |
US6489096B1 (en) | 1998-10-15 | 2002-12-03 | Princeton University | Quantitative analysis of hybridization patterns and intensities in oligonucleotide arrays |
FR2784751B1 (fr) | 1998-10-20 | 2001-02-02 | Mesatronic | Boitier de logement d'une puce electronique a sondes biologiques |
US6261431B1 (en) | 1998-12-28 | 2001-07-17 | Affymetrix, Inc. | Process for microfabrication of an integrated PCR-CE device and products produced by the same |
US6291516B1 (en) | 1999-01-13 | 2001-09-18 | Curis, Inc. | Regulators of the hedgehog pathway, compositions and uses related thereto |
US6514768B1 (en) | 1999-01-29 | 2003-02-04 | Surmodics, Inc. | Replicable probe array |
US7005256B1 (en) | 1999-03-10 | 2006-02-28 | Cold Spring Harbor Laboratory | Gene chip technology for determining memory genes |
US6824866B1 (en) | 1999-04-08 | 2004-11-30 | Affymetrix, Inc. | Porous silica substrates for polymer synthesis and assays |
DE19918956A1 (de) * | 1999-04-27 | 2000-11-02 | Studiengesellschaft Kohle Mbh | Verfahren zur automatisierten Untersuchung katalytischer und spektroskopischer Eigenschaften der Komponenten kombinatorischer Bibliotheken |
AU4808200A (en) * | 1999-04-30 | 2000-11-17 | Ball Semiconductor Inc. | Dna balls |
US7396905B1 (en) | 1999-05-21 | 2008-07-08 | Mckeon Frank | Calcipressins: endogenous inhibitors of calcineurin, uses and reagents related thereto |
US6716579B1 (en) | 1999-06-11 | 2004-04-06 | Narayan Baidya | Gene specific arrays, preparation and use |
US7501245B2 (en) | 1999-06-28 | 2009-03-10 | Helicos Biosciences Corp. | Methods and apparatuses for analyzing polynucleotide sequences |
US6771376B2 (en) | 1999-07-05 | 2004-08-03 | Novartis Ag | Sensor platform, apparatus incorporating the platform, and process using the platform |
CN100397068C (zh) | 1999-07-05 | 2008-06-25 | 诺瓦提斯公司 | 传感器平台、装有该平台的装置以及使用该平台的方法 |
WO2001020593A1 (en) | 1999-09-17 | 2001-03-22 | Bioarray Solutions, Llc | System and method for programmable illumination pattern generation |
GB9928789D0 (en) * | 1999-12-03 | 2000-02-02 | Medical Res Council | Naive screening method |
GB9928787D0 (en) | 1999-12-03 | 2000-02-02 | Medical Res Council | Direct screening method |
US6800439B1 (en) | 2000-01-06 | 2004-10-05 | Affymetrix, Inc. | Methods for improved array preparation |
GB0002389D0 (en) * | 2000-02-02 | 2000-03-22 | Solexa Ltd | Molecular arrays |
US6515131B2 (en) | 2000-02-22 | 2003-02-04 | Biostream Therapeutics, Inc. | Imagining agents for diagnosis of Parkinson's disease |
US6627571B1 (en) | 2000-03-01 | 2003-09-30 | Symyx Technologies, Inc. | Method and system for the situ synthesis of a combinatorial library of supported catalyst materials |
US20030129724A1 (en) | 2000-03-03 | 2003-07-10 | Grozinger Christina M. | Class II human histone deacetylases, and uses related thereto |
US6833450B1 (en) | 2000-03-17 | 2004-12-21 | Affymetrix, Inc. | Phosphite ester oxidation in nucleic acid array preparation |
US6806361B1 (en) | 2000-03-17 | 2004-10-19 | Affymetrix, Inc. | Methods of enhancing functional performance of nucleic acid arrays |
US6653080B2 (en) | 2000-03-22 | 2003-11-25 | Quantum Dot Corporation | Loop probe hybridization assay for polynucleotide analysis |
US7115653B2 (en) | 2000-03-30 | 2006-10-03 | Curis, Inc. | Small organic molecule regulators of cell proliferation |
US6683108B1 (en) | 2000-03-30 | 2004-01-27 | Curis, Inc. | Agonists of hedgehog signaling pathways and uses related thereto |
US8852937B2 (en) | 2000-03-30 | 2014-10-07 | Curis, Inc. | Small organic molecule regulators of cell proliferation |
US6613798B1 (en) | 2000-03-30 | 2003-09-02 | Curis, Inc. | Small organic molecule regulators of cell proliferation |
EP1285092A4 (en) | 2000-04-14 | 2003-07-16 | Metabolon Inc | METHOD FOR DISCOVERY OF MEDICINES, DISEASE TREATMENT AND DIAGNOSIS USE THE METABOLOMICS |
US7005259B1 (en) | 2000-06-01 | 2006-02-28 | Affymetrix, Inc. | Methods for array preparation using substrate rotation |
WO2001093892A1 (en) | 2000-06-08 | 2001-12-13 | The Center For Blood Research, Inc. | Methods and compositions for inhibiting immunoglobulin-mediated__reperfusion injury |
US9709559B2 (en) | 2000-06-21 | 2017-07-18 | Bioarray Solutions, Ltd. | Multianalyte molecular analysis using application-specific random particle arrays |
US6697454B1 (en) | 2000-06-29 | 2004-02-24 | X-Ray Optical Systems, Inc. | X-ray analytical techniques applied to combinatorial library screening |
US6511277B1 (en) | 2000-07-10 | 2003-01-28 | Affymetrix, Inc. | Cartridge loader and methods |
US7091033B2 (en) | 2000-07-21 | 2006-08-15 | Phase-1 Molecular Toxicology, Inc. | Array of toxicologically relevant canine genes and uses thereof |
DE10036174B4 (de) | 2000-07-25 | 2006-12-07 | Axaron Bioscience Ag | Verfahren und Vorrichtung zum Analysieren von chemischen oder biologischen Proben |
US7135565B2 (en) | 2000-07-28 | 2006-11-14 | Agilent Technologies, Inc. | Synthesis of polynucleotides using combined oxidation/deprotection chemistry |
US6984522B2 (en) | 2000-08-03 | 2006-01-10 | Regents Of The University Of Michigan | Isolation and use of solid tumor stem cells |
CA2416631C (en) | 2000-08-03 | 2011-11-22 | F. Hoffmann-La Roche Ag | Nucleic acid binding compounds containing pyrazolo[3,4-d]pyrimidine analogues of purin-2,6-diamine and their uses |
US6422249B1 (en) | 2000-08-10 | 2002-07-23 | Affymetrix Inc. | Cartridge washing system and methods |
RU2286172C2 (ru) | 2000-08-17 | 2006-10-27 | Трипеп Аб | Вакцины, содержащие рибавирин, и способы их использования |
US6680059B2 (en) | 2000-08-29 | 2004-01-20 | Tripep Ab | Vaccines containing ribavirin and methods of use thereof |
WO2002013855A2 (en) | 2000-08-17 | 2002-02-21 | Tripep Ab | Vaccines containing ribavirin and methods of use thereof |
AU2002224336B2 (en) | 2000-09-25 | 2007-01-04 | Picoliter Inc. | Acoustic ejection of fluids from a plurality of reservoirs |
US6496250B1 (en) | 2000-09-29 | 2002-12-17 | General Electric Company | Combinatorial method foe development of optical ceramics |
US6908732B2 (en) | 2000-10-13 | 2005-06-21 | President & Fellows Of Harvard College | Compounds and methods for regulating cell differentiation |
DE10051396A1 (de) | 2000-10-17 | 2002-04-18 | Febit Ferrarius Biotech Gmbh | Verfahren und Vorrichtung zur integrierten Synthese und Analytbestimmung an einem Träger |
US20030138782A1 (en) | 2001-01-19 | 2003-07-24 | Evans Glen A. | Computer-directed assembly of a polynucleotide encoding a target polypeptide |
US6832163B2 (en) | 2001-02-09 | 2004-12-14 | Agilent Technologies, Inc. | Methods of identifying heterogeneous features in an image of an array |
EP2295475A1 (en) | 2001-03-02 | 2011-03-16 | University of Western Ontario | Polymer precursors of radiolabeled compounds, and methods of making and using the same |
EP1370690B1 (en) | 2001-03-16 | 2012-03-14 | Kalim Mir | Arrays and methods of use |
FR2822476B1 (fr) | 2001-03-23 | 2004-04-02 | Aventis Pharma Sa | Procedes de purification et de detection de sequences cibles d'adn double brin par interaction triple helice |
AU785425B2 (en) | 2001-03-30 | 2007-05-17 | Genetic Technologies Limited | Methods of genomic analysis |
EP1390340B1 (en) | 2001-04-24 | 2017-03-01 | Massachusetts Institute Of Technology | Copper-catalyzed formation of carbon-heteroatom and carbon-carbon bonds |
WO2002088396A2 (en) | 2001-04-30 | 2002-11-07 | Ventana Medical Systems, Inc. | Reagents and methods for automated in situ or microarray hybridization |
US7244853B2 (en) | 2001-05-09 | 2007-07-17 | President And Fellows Of Harvard College | Dioxanes and uses thereof |
US7262063B2 (en) | 2001-06-21 | 2007-08-28 | Bio Array Solutions, Ltd. | Directed assembly of functional heterostructures |
EP1925672A1 (en) | 2001-06-22 | 2008-05-28 | Syngeta Participations AG | Abiotic stress responsive polynucleotides and polypeptides |
US7348140B1 (en) | 2001-07-25 | 2008-03-25 | Acadia Pharmaceuticals, Inc. | Clinical indications for genotyping polymorphic variants of G-protein coupled receptors |
US7285631B2 (en) | 2001-08-10 | 2007-10-23 | Serono Genetics Institute S.A. | Human cDNAs and proteins and uses thereof |
JP4377689B2 (ja) | 2001-10-15 | 2009-12-02 | バイオアレイ ソリューションズ リミテッド | 同時尋問及び酵素仲介検出による多型遺伝子座の複合分析 |
DK1440083T3 (da) | 2001-10-25 | 2013-03-25 | Medical Res Council | Molekyler |
WO2003048295A1 (en) | 2001-11-30 | 2003-06-12 | Fluidigm Corporation | Microfluidic device and methods of using same |
US7858297B2 (en) | 2001-12-18 | 2010-12-28 | Centre National De La Recherche Scientifique Cnrs | Chemokine-binding protein and methods of use |
DE60234713D1 (de) | 2001-12-18 | 2010-01-21 | Endocube Sas | Neue mit dem zelltod assoziierte proteine aus der thap familie und par4 verwandte signalwege, die bei der kontrolle von apoptosis involviert sind |
DE10209203A1 (de) | 2002-03-04 | 2003-09-25 | Ulrich Steiner | Verfahren zur Abspaltung von labilen funktionellen Gruppen aus chemischen Verbindungen |
US20050065205A1 (en) | 2002-03-07 | 2005-03-24 | Daniel Alkon | Methods for Alzheimer's disease treatment and cognitive enhance |
US6825229B2 (en) | 2002-03-07 | 2004-11-30 | Blanchette Rockefeller Neurosciences Institute | Methods for Alzheimer's Disease treatment and cognitive enhancement |
EP2963017A1 (en) | 2002-03-11 | 2016-01-06 | Molecular Insight Pharmaceuticals, Inc. | Technetium-dipyridine complexes, and methods of use thereof |
EP1485408A2 (en) | 2002-03-13 | 2004-12-15 | Bayer CropScience S.A. | Mutagenesis of aspergillus fungi and genes essential for growth |
JP2004003989A (ja) | 2002-03-15 | 2004-01-08 | Affymetrix Inc | 生物学的物質の走査のためのシステム、方法、および製品 |
US7935500B2 (en) | 2002-03-26 | 2011-05-03 | Massachusetts Institute Of Technology | Identifying calcineurin activators for treatment of schizophrenia |
ATE459880T1 (de) | 2002-04-17 | 2010-03-15 | Deutsches Krebsforsch | Verfahren zum screening einer substanz zur modulierung der wnt -signalkaskade. |
ATE404200T1 (de) | 2002-04-22 | 2008-08-15 | Univ Johns Hopkins Med | Modulatoren von hedgehog signalpfaden, zusammensetzungen und verwandte verwendungen |
AU2003228793B2 (en) | 2002-04-30 | 2008-01-03 | Trustees Of Tufts College | Smart Pro-Drugs of Serine Protease Inhibitors |
US7332273B2 (en) | 2002-06-20 | 2008-02-19 | Affymetrix, Inc. | Antireflective coatings for high-resolution photolithographic synthesis of DNA arrays |
US7144950B2 (en) | 2003-09-17 | 2006-12-05 | The Regents Of The University Of California | Conformationally flexible cationic conjugated polymers |
EP2278027A3 (en) | 2002-06-20 | 2011-02-16 | The Regents of the University of California | Methods and compositions for detection and analysis of polynucleotides using light harvesting multichromophores |
DE10227814A1 (de) * | 2002-06-21 | 2004-01-08 | Chemogenix Gmbh | Verfahren zur Abspaltung von labilen funtionellen Gruppen aus chemischen Verbindungen |
CN1694967B (zh) | 2002-08-26 | 2010-12-15 | 加州大学评议会 | 利用集光多发色团的多核苷酸的检测和分析的方法以及组合物 |
EP1534340B1 (en) | 2002-09-06 | 2011-11-16 | Cerulean Pharma Inc. | Cyclodextrin-based polymers for delivering the therapeutic agents covalently bound thereto |
JP2006512923A (ja) | 2002-10-18 | 2006-04-20 | エルジー ライフサイエンス リミテッド | 癌関連遺伝子ファミリー |
WO2004047007A1 (en) | 2002-11-15 | 2004-06-03 | Bioarray Solutions, Ltd. | Analysis, secure access to, and transmission of array images |
US7314750B2 (en) | 2002-11-20 | 2008-01-01 | Affymetrix, Inc. | Addressable oligonucleotide array of the rat genome |
US7250289B2 (en) | 2002-11-20 | 2007-07-31 | Affymetrix, Inc. | Methods of genetic analysis of mouse |
CA2509522C (en) | 2002-12-09 | 2013-05-07 | Massachusetts Institute Of Technology | Ligands for metals and improved metal-catalyzed processes based thereon |
WO2004058946A2 (en) | 2002-12-22 | 2004-07-15 | The Scripps Research Institute | Protein arrays |
US20040157220A1 (en) | 2003-02-10 | 2004-08-12 | Purnima Kurnool | Methods and apparatus for sample tracking |
JP4740111B2 (ja) | 2003-02-13 | 2011-08-03 | ザ リージェンツ オブ ザ ユニバーシティ オブ カリフォルニア | 集光性多発色団を用いてポリヌクレオチド結合タンパク質相互作用を検出及び分析するための方法並びに組成物 |
CA2521171C (en) | 2003-04-03 | 2013-05-28 | Fluidigm Corp. | Microfluidic devices and methods of using same |
CA2463719A1 (en) | 2003-04-05 | 2004-10-05 | F. Hoffmann-La Roche Ag | Nucleotide analogs with six membered rings |
WO2005019819A1 (en) | 2003-08-20 | 2005-03-03 | Biosite, Inc. | Methods and compositions for measuring biologically active natriuretic peptides and for improving their therapeutic potential |
AU2004237155B2 (en) | 2003-05-02 | 2008-02-28 | The University Of Western Ontario | Prosthetic groups attached to stannyl polymer in the synthesis of radiopharmaceuticals |
EP1627062A1 (en) | 2003-05-14 | 2006-02-22 | Domantis Limited | A process for recovering polypeptides that unfold reversibly from a polypeptide repertoire |
US8133670B2 (en) | 2003-06-13 | 2012-03-13 | Cold Spring Harbor Laboratory | Method for making populations of defined nucleic acid molecules |
ATE437369T1 (de) | 2003-06-24 | 2009-08-15 | Ventana Med Syst Inc | Enzymkatalysierte metalldeposition zum verstärkten in-situ-nachweis von immunhistologischen epitopen und nukleinsäuresequenzen |
US7642064B2 (en) | 2003-06-24 | 2010-01-05 | Ventana Medical Systems, Inc. | Enzyme-catalyzed metal deposition for the enhanced detection of analytes of interest |
US7427679B2 (en) * | 2003-08-30 | 2008-09-23 | Agilent Technologies, Inc. | Precursors for two-step polynucleotide synthesis |
US7385050B2 (en) | 2003-08-30 | 2008-06-10 | Agilent Technologies, Inc. | Cleavable linker for polynucleotide synthesis |
US7193077B2 (en) | 2003-08-30 | 2007-03-20 | Agilent Technologies, Inc. | Exocyclic amine triaryl methyl protecting groups in two-step polynucleotide synthesis |
US7417139B2 (en) | 2003-08-30 | 2008-08-26 | Agilent Technologies, Inc. | Method for polynucleotide synthesis |
JP4564959B2 (ja) | 2003-09-22 | 2010-10-20 | バイオアレイ ソリューションズ リミテッド | 生体分子に共有結合できる、複数の官能基を持つ表面固定化高分子電解質 |
EP2093298A3 (en) | 2003-10-10 | 2009-09-23 | Deutsches Krebsforschungszentrum | Compositions for diagnosis and therapy of diseases associated with aberrant expression of Futrins (R-Spondins) |
CA2899287A1 (en) | 2003-10-28 | 2005-05-12 | Bioarray Solutions Ltd. | Optimization of gene expression analysis using immobilized capture probes |
CA2586515A1 (en) | 2003-11-05 | 2005-05-26 | Exact Sciences Corporation | Repetitive reversed-field affinity electrophoresis and uses therefor |
US7169560B2 (en) | 2003-11-12 | 2007-01-30 | Helicos Biosciences Corporation | Short cycle methods for sequencing polynucleotides |
WO2005080605A2 (en) | 2004-02-19 | 2005-09-01 | Helicos Biosciences Corporation | Methods and kits for analyzing polynucleotide sequences |
AU2005216949B2 (en) | 2004-02-24 | 2011-09-22 | The General Hospital Corporation | Catalytic radiofluorination |
ATE498010T1 (de) | 2004-03-01 | 2011-02-15 | Immune Disease Inst Inc | Natürliche igm-antikörper und inhibitoren davon |
TW200538181A (en) | 2004-05-18 | 2005-12-01 | Brni Neurosciences Inst | Treatment of depressive disorders |
US8034553B2 (en) | 2004-06-24 | 2011-10-11 | Kimberly-Clark Worldwide, Inc. | Biomarkers for wound healing |
US7342093B2 (en) | 2004-07-23 | 2008-03-11 | University Of Massachusetts | Compounds that inhibit Hsp90 protein-protein interactions with IAP proteins |
US7848889B2 (en) | 2004-08-02 | 2010-12-07 | Bioarray Solutions, Ltd. | Automated analysis of multiplexed probe-target interaction patterns: pattern matching and allele identification |
FI20041204A0 (fi) | 2004-09-16 | 2004-09-16 | Riikka Lund | Menetelmät immuunivälitteisiin sairauksiin liittyvien uusien kohdegeenien hyödyntämiseksi |
EP2280085A3 (en) | 2004-11-01 | 2011-02-23 | George Mason University | Compositions and methods for diagnosing colon disorders |
US8338093B2 (en) | 2004-12-31 | 2012-12-25 | Affymetrix, Inc. | Primer array synthesis and validation |
US7547775B2 (en) | 2004-12-31 | 2009-06-16 | Affymetrix, Inc. | Parallel preparation of high fidelity probes in an array format |
WO2006074471A2 (en) | 2005-01-10 | 2006-07-13 | The Regents Of The University Of California | Cationic conjugated polymers suitable for strand-specific polynucleotide detection in homogeneous and solid state assays |
EP1861512A4 (en) | 2005-03-18 | 2009-12-09 | Fluidigm Corp | THERMAL REACTION DEVICE AND USE METHOD THEREFOR |
JP2008532559A (ja) | 2005-03-19 | 2008-08-21 | メディカル リサーチ カウンシル | ウイルス感染の治療及び予防又は治療及び予防の改善 |
WO2006102557A2 (en) | 2005-03-22 | 2006-09-28 | The President And Fellows Of Harvard College | Treatment of protein degradation disorders |
EP1888575A2 (en) | 2005-05-09 | 2008-02-20 | Hydra Biosciences, Inc. | Compounds for modulating trpv3 function |
US20090317799A1 (en) | 2005-05-18 | 2009-12-24 | Decode Genetics Ehf. | Variants at chr8q24.21 confer risk of cancer |
EP1888751A2 (en) | 2005-05-25 | 2008-02-20 | Tripep Ab | A hepatitis c virus non-structural ns3/4a fusion gene |
US20070054890A1 (en) | 2005-07-29 | 2007-03-08 | Alkon Daniel L | Protein synthesis required for long-term memory is induced by PKC activation on days preceding associative learning |
US7666593B2 (en) | 2005-08-26 | 2010-02-23 | Helicos Biosciences Corporation | Single molecule sequencing of captured nucleic acids |
US7666584B2 (en) | 2005-09-01 | 2010-02-23 | Philadelphia Health & Education Coporation | Identification of a pin specific gene and protein (PIN-1) useful as a diagnostic treatment for prostate cancer |
CA2624900A1 (en) | 2005-10-04 | 2007-04-19 | The Research Foundation Of State University Of New York | Fibronectin polypeptides and methods of use |
NZ569697A (en) | 2006-01-20 | 2012-01-12 | Women S & Children S Health Res Inst | Method of treatment, prophylaxis and diagnosis of pathologies of the bone by the modulation of GPC3 |
CA2635343C (en) | 2006-01-27 | 2018-05-15 | Athena Diagnostics, Inc. | Methods of detecting mutations associated with ataxia-ocular apraxia 2 (aoa2) |
US9445025B2 (en) | 2006-01-27 | 2016-09-13 | Affymetrix, Inc. | System, method, and product for imaging probe arrays with small feature sizes |
CA2642288C (en) | 2006-02-14 | 2014-10-07 | Dana-Farber Cancer Institute, Inc. | Histone deacetylase inhibitors |
JP5441416B2 (ja) | 2006-02-14 | 2014-03-12 | プレジデント アンド フェロウズ オブ ハーバード カレッジ | 二官能性ヒストンデアセチラーゼインヒビター |
AU2007248656B2 (en) | 2006-05-03 | 2013-04-04 | Dana-Farber Cancer Institute, Inc. | Histone deacetylase and tubulin deacetylase inhibitors |
US10522240B2 (en) | 2006-05-03 | 2019-12-31 | Population Bio, Inc. | Evaluating genetic disorders |
US7702468B2 (en) | 2006-05-03 | 2010-04-20 | Population Diagnostics, Inc. | Evaluating genetic disorders |
KR100954322B1 (ko) | 2006-06-14 | 2010-04-21 | 주식회사 엘지생명과학 | 췌장암과 관련된 신규한 lbfl313 유전자 |
WO2008013918A2 (en) | 2006-07-26 | 2008-01-31 | Myelin Repair Foundation, Inc. | Cell cycle regulation and differentiation |
WO2008016335A1 (en) | 2006-08-03 | 2008-02-07 | National University Of Singapore | A microarray system and a process for producing microarrays |
ES2548759T3 (es) | 2006-08-24 | 2015-10-20 | Surface Logix, Inc. | Compuestos farmacocinéticamente mejorados |
EP2069377A4 (en) | 2006-09-27 | 2009-11-11 | Univ California | METHOD AND COMPOSITIONS FOR THE TREATMENT OF SKIN DISEASES AND SKIN FUNCTIONAL DISORDERS |
US8236244B2 (en) | 2006-10-06 | 2012-08-07 | Sharp Laboratories Of America, Inc. | Micro-pixelated fluid-assay structure with on-board addressable, pixel-specific functionalization |
US8232108B2 (en) | 2006-10-06 | 2012-07-31 | Sharp Laboratories Of America, Inc. | Method of making micro-pixelated fluid-assay structure |
US8236571B2 (en) | 2006-10-06 | 2012-08-07 | Sharp Laboratories Of America, Inc. | Method of making micro-pixelated fluid-assay precursor structure |
US8236245B2 (en) | 2006-10-06 | 2012-08-07 | Sharp Laboratories Of America, Inc. | Micro-pixelated fluid-assay precursor structure |
US8231831B2 (en) | 2006-10-06 | 2012-07-31 | Sharp Laboratories Of America, Inc. | Micro-pixelated fluid-assay structure |
JP5420414B2 (ja) | 2006-10-06 | 2014-02-19 | シリゲン グループ リミテッド | 指向性バイオマーカシグナル増幅用の蛍光方法および材料 |
US8232109B2 (en) | 2006-10-06 | 2012-07-31 | Sharp Laboratories Of America, Inc. | Micro-pixelated active-matrix fluid-assay performance |
US20110218176A1 (en) | 2006-11-01 | 2011-09-08 | Barbara Brooke Jennings-Spring | Compounds, methods, and treatments for abnormal signaling pathways for prenatal and postnatal development |
US8338109B2 (en) | 2006-11-02 | 2012-12-25 | Mayo Foundation For Medical Education And Research | Predicting cancer outcome |
US20110294782A1 (en) | 2006-11-10 | 2011-12-01 | Massachusetts Institute Of Technology | Small molecule pak inhibitors |
KR101582321B1 (ko) | 2006-12-05 | 2016-01-05 | 디코드 제네틱스 이에이치에프 | 심장성 부정맥의 위험 관리를 위한 유전적 마커 |
ATE528286T1 (de) | 2006-12-20 | 2011-10-15 | Bayer Healthcare Llc | 4-ä4-ä(ä3-tert-butyl-1-ä3-(hydroxymethyl)phenyl - 1h-pyrazol-5-ylücarbamoyl)-aminoü-3- chlorophenoxyü-n-methylpyridin-2-carboxamid als inhibitor der vegfr kinase zur behandlung von krebs |
AU2008204338B2 (en) | 2007-01-11 | 2014-03-06 | Erasmus University Medical Center | Circular chromosome conformation capture (4C) |
JP2010516625A (ja) | 2007-01-24 | 2010-05-20 | インサート セラピューティクス, インコーポレイテッド | 制御された薬物送達のためのテザー基を有するポリマー−薬物コンジュゲート |
KR100827449B1 (ko) * | 2007-02-07 | 2008-05-07 | 삼성전자주식회사 | 광분해성 화합물과 상기 화합물이 커플링된 올리고머프로브 어레이용 기판, 올리고머 프로브 어레이 및 이의제조 방법 |
BRPI0807236A2 (pt) | 2007-02-07 | 2019-09-24 | Decode Genetics Ehf | métodos para determinar uma suscetibilidade para câncer de próstata em um indivíduo humano, para identificar um marcador para uso em avaliação de suscetibilidade para câncer de próstata e para genotipificar uma amostra de ácido nucleico obtida de um indivíduo humano sob risco de, ou diagnosticado com, câncer de prostáta, para avaliar um indivíduo humano para probabiliade da resposta a um agente terapêutico para prevenir e/ou melhorar sintomas associados com câncer de próstata, para predizer prognóstico de um indivíduo diagnosticado com câncer e para monitorar progresso de um tratamento de um indivíduo sofrendo tratamento para câncer de próstata, kit para avaliar suscetibilidade para câncer de próstata em um indivíduo humano, uso de uma sonda de oligonucleotídeo, meio legível por computador, e , aparelho para determinar um indicador genético para câncer de próstata em um indivíduo humano. |
EP2959914A1 (en) | 2007-02-09 | 2015-12-30 | Blanchette Rockefeller Neurosciences, Institute | Therapeutic effects of bryologs on head trauma-induced memory impairment and brain injury |
WO2008100450A2 (en) | 2007-02-09 | 2008-08-21 | Blanchette Rockefeller Neurosciences Institute | Therapeutic effects of bryostatins, bryologs, and other related substances on ischemia/stroke-induced memory impairment and brain injury |
KR100819006B1 (ko) * | 2007-02-13 | 2008-04-03 | 삼성전자주식회사 | 마이크로 어레이용 마스크 세트, 이의 제조 방법, 및마스크 세트를 이용한 마이크로 어레이의 제조 방법 |
NZ579445A (en) | 2007-02-21 | 2012-02-24 | Decode Genetics Ehf | Genetic susceptibility variants associated with cardiovascular disease |
US20080228699A1 (en) | 2007-03-16 | 2008-09-18 | Expanse Networks, Inc. | Creation of Attribute Combination Databases |
ES2529790T3 (es) | 2007-04-13 | 2015-02-25 | Dana-Farber Cancer Institute, Inc. | Métodos de tratamiento de cáncer resistente a agentes terapéuticos de ERBB |
US20100120045A1 (en) | 2007-04-30 | 2010-05-13 | Decode Genetics Ehf | Genetic variants useful for risk assessments of coronary artery disease and myocardial infarction |
CA2688312A1 (en) | 2007-05-25 | 2008-12-04 | Decode Genetics Ehf. | Genetic variants on chr 5p12 and 10q26 as markers for use in breast cancer risk assessment, diagnosis, prognosis and treatment |
EP2162554A4 (en) | 2007-05-31 | 2010-07-28 | Univ Queensland | DIAGNOSTIC MARKERS FOR ANKYLOSING SPONDYLARTHRITIS AND USES THEREOF |
CA2688433A1 (en) | 2007-06-06 | 2008-12-11 | Domantis Limited | Methods for selecting protease resistant polypeptides |
EP2167111A4 (en) | 2007-06-14 | 2010-06-09 | Univ New York State Res Found | POLYPEPTIDES AND METHOD OF USE |
JP5312459B2 (ja) | 2007-08-02 | 2013-10-09 | ジリード バイオロジクス,インク. | Loxおよびloxl2阻害剤ならびにこれらの使用 |
WO2009023676A1 (en) | 2007-08-12 | 2009-02-19 | Integrated Dna Technologies, Inc. | Microarray system with improved sequence specificity |
WO2009022236A2 (en) | 2007-08-16 | 2009-02-19 | Tripep Ab | Immunogen platform |
AU2009204346A1 (en) | 2008-01-02 | 2009-07-16 | Suregene Llc | Genetic markers of mental illness |
EP2581454B1 (en) | 2008-01-17 | 2015-09-16 | Suregene LLC | Genetic markers of mental illness |
US9074244B2 (en) | 2008-03-11 | 2015-07-07 | Affymetrix, Inc. | Array-based translocation and rearrangement assays |
WO2009134768A1 (en) * | 2008-05-01 | 2009-11-05 | Massachusetts Institute Of Technology (Mit) | Devices and processes for analyzing nucleic acid damage and repair using electrophoresis |
JP2010043063A (ja) | 2008-05-09 | 2010-02-25 | Agency For Science Technology & Research | 川崎病の診断及び治療 |
EP2806054A1 (en) | 2008-05-28 | 2014-11-26 | Genomedx Biosciences Inc. | Systems and methods for expression-based discrimination of distinct clinical disease states in prostate cancer |
US10407731B2 (en) | 2008-05-30 | 2019-09-10 | Mayo Foundation For Medical Education And Research | Biomarker panels for predicting prostate cancer outcomes |
US8440716B2 (en) | 2008-07-23 | 2013-05-14 | President And Fellows Of Harvard College | Deacetylase inhibitors and uses thereof |
EP2868753A1 (en) | 2008-09-25 | 2015-05-06 | SureGene LLC | Genetic markers for optimizing treatment for Schizophrenia |
US10236078B2 (en) | 2008-11-17 | 2019-03-19 | Veracyte, Inc. | Methods for processing or analyzing a sample of thyroid tissue |
US9495515B1 (en) | 2009-12-09 | 2016-11-15 | Veracyte, Inc. | Algorithms for disease diagnostics |
SG194383A1 (en) | 2008-12-05 | 2013-11-29 | Glaxo Group Ltd | Methods for selecting protease resistant polypeptides |
US8108406B2 (en) | 2008-12-30 | 2012-01-31 | Expanse Networks, Inc. | Pangenetic web user behavior prediction system |
WO2010077336A1 (en) | 2008-12-31 | 2010-07-08 | 23Andme, Inc. | Finding relatives in a database |
US9074258B2 (en) | 2009-03-04 | 2015-07-07 | Genomedx Biosciences Inc. | Compositions and methods for classifying thyroid nodule disease |
US20100261228A1 (en) | 2009-04-09 | 2010-10-14 | California Institute Of Technology | Multiplexed sites for polymer synthesis |
CA2753916C (en) | 2009-04-29 | 2020-08-25 | Genomedx Biosciences Inc. | Systems and methods for expression-based classification of thyroid tissue |
EP2427575B1 (en) | 2009-05-07 | 2018-01-24 | Veracyte, Inc. | Methods for diagnosis of thyroid conditions |
US20100304996A1 (en) | 2009-05-29 | 2010-12-02 | Regents Of The University Of California | B cell signature associated with tolerance in transplant recipients |
WO2010151807A1 (en) | 2009-06-26 | 2010-12-29 | Sirigen, Inc. | Signal amplified biological detection with conjugated polymers |
WO2011019393A2 (en) | 2009-08-11 | 2011-02-17 | President And Fellows Of Harvard College | Class- and isoform-specific hdac inhibitors and uses thereof |
US7972793B2 (en) | 2009-11-04 | 2011-07-05 | Suregene, Llc | Methods and compositions for the treatment of psychotic disorders through the identification of the SULT4A1-1 haplotype |
US8501122B2 (en) | 2009-12-08 | 2013-08-06 | Affymetrix, Inc. | Manufacturing and processing polymer arrays |
US10446272B2 (en) | 2009-12-09 | 2019-10-15 | Veracyte, Inc. | Methods and compositions for classification of samples |
FR2954349A1 (fr) | 2009-12-22 | 2011-06-24 | Agronomique Inst Nat Rech | Sulfatase modifiant selectivement les glycosaminoglycanes |
US8575303B2 (en) | 2010-01-19 | 2013-11-05 | Sirigen Group Limited | Reagents for directed biomarker signal amplification |
WO2011091435A2 (en) | 2010-01-25 | 2011-07-28 | Mount Sinai School Of Medicine | Methods of treating liver disease |
CN102781517B (zh) | 2010-02-01 | 2015-11-25 | 小利兰·斯坦福大学托管委员会 | 诊断和治疗非胰岛素依赖性糖尿病的方法 |
CN103079567A (zh) | 2010-04-17 | 2013-05-01 | 拜尔健康护理有限责任公司 | 用于疾病和病症的治疗和预防的氟取代的ω-羧基芳基二苯脲的合成代谢产物 |
EP2580325A4 (en) | 2010-07-16 | 2013-11-20 | Tocagen Inc | RETRO VIRUS DETECTION |
EP2601609B1 (en) | 2010-08-02 | 2017-05-17 | Population Bio, Inc. | Compositions and methods for discovery of causative mutations in genetic disorders |
WO2012058532A2 (en) | 2010-10-28 | 2012-05-03 | Yale University | Methods and compositions for assessing and treating cancer |
DK2643470T3 (en) | 2010-11-24 | 2016-05-17 | Univ Yale | Preparations and methods for treating ischemic injury with D-DT |
WO2012109157A2 (en) | 2011-02-07 | 2012-08-16 | The Governing Council Of The University Of Toronto | Bioprobes and methods of use thereof |
WO2012139045A1 (en) | 2011-04-08 | 2012-10-11 | Gilead Biologics, Inc. | Methods and compositions for normalization of tumor vasculature by inhibition of loxl2 |
US8741564B2 (en) | 2011-05-04 | 2014-06-03 | Htg Molecular Diagnostics, Inc. | Quantitative nuclease protection assay (QNPA) and sequencing (QNPS) improvements |
AU2012271386A1 (en) | 2011-06-17 | 2014-01-16 | Dana-Farber Cancer Institute, Inc. | Mutation signatures for predicting the survivability of Myelodysplastic Syndrome subjects |
WO2012178007A1 (en) | 2011-06-22 | 2012-12-27 | Yale University | COMPOSITIONS AND METHODS OF DIAGNOSING DISEASES AND DISORDERS ASSOCIATED WITH β CELL DEATH |
KR101554448B1 (ko) | 2011-07-25 | 2015-09-18 | 씨에스아이알 | 어레이 프린팅 |
EP2763540A4 (en) | 2011-09-09 | 2015-04-22 | Univ Yale | COMPOSITIONS AND METHODS FOR EVALUATION AND TREATMENT OF DISEASES AND INFLAMMATORY DISORDERS |
US20130090329A1 (en) | 2011-10-07 | 2013-04-11 | Suregene, Llc | Methods and Compositions for the Treatment of Psychotic Disorders Through the Identification of the Olanzapine Poor Response Predictor Genetic Signature |
US10221454B2 (en) | 2011-10-10 | 2019-03-05 | The Hospital For Sick Children | Methods and compositions for screening and treating developmental disorders |
US11180807B2 (en) | 2011-11-04 | 2021-11-23 | Population Bio, Inc. | Methods for detecting a genetic variation in attractin-like 1 (ATRNL1) gene in subject with Parkinson's disease |
US10437858B2 (en) | 2011-11-23 | 2019-10-08 | 23Andme, Inc. | Database and data processing system for use with a network-based personal genetics services platform |
US10513737B2 (en) | 2011-12-13 | 2019-12-24 | Decipher Biosciences, Inc. | Cancer diagnostics using non-coding transcripts |
CA2863887C (en) | 2012-02-09 | 2023-01-03 | Population Diagnostics, Inc. | Methods of screening low frequency gdna variation biomarkers for pervasive developmental disorder (pdd) or pervasive developmental disorder - not otherwise specified (pdd_nos) |
CA2873964A1 (en) | 2012-05-21 | 2013-11-28 | Steven F. Dowdy | Generation of human ips cells by a synthetic self-replicative rna |
CA3132310C (en) | 2012-08-07 | 2024-01-09 | Children's Medical Center Corporation | Potassium channel openers for treating neurodegenerative diseases |
CA2881627A1 (en) | 2012-08-16 | 2014-02-20 | Genomedx Biosciences Inc. | Cancer diagnostics using biomarkers |
EP2895621B1 (en) | 2012-09-14 | 2020-10-21 | Population Bio, Inc. | Methods and compositions for diagnosing, prognosing, and treating neurological conditions |
EP2900835A4 (en) | 2012-09-27 | 2016-05-11 | Population Diagnotics Inc | METHODS AND COMPOSITIONS FOR DETECTING AND TREATING DEVELOPMENTAL DISORDERS |
WO2014055493A1 (en) | 2012-10-02 | 2014-04-10 | Cerulean Pharma Inc. | Methods and systems for polymer precipitation and generation of particles |
EP2722105A1 (en) * | 2012-10-22 | 2014-04-23 | Universität Wien | Method of in situ synthesizing microarrays |
EP2757374A1 (en) * | 2013-01-17 | 2014-07-23 | F. Hoffmann-La Roche AG | Method for preparing an outer surface of a planar waveguide to be capable of binding target samples along a plurality of predetermined lines and a planar waveguide |
US9411930B2 (en) | 2013-02-01 | 2016-08-09 | The Regents Of The University Of California | Methods for genome assembly and haplotype phasing |
GB2519255B (en) | 2013-02-01 | 2016-01-06 | Univ California | Methods for genome assembly and haplotype phasing |
US11976329B2 (en) | 2013-03-15 | 2024-05-07 | Veracyte, Inc. | Methods and systems for detecting usual interstitial pneumonia |
WO2014201265A1 (en) | 2013-06-14 | 2014-12-18 | Pacific Biosciences Of California, Inc. | Bis-biotinylation tags |
KR102291045B1 (ko) | 2013-08-05 | 2021-08-19 | 트위스트 바이오사이언스 코포레이션 | 드 노보 합성된 유전자 라이브러리 |
EP3726213A1 (en) | 2013-08-19 | 2020-10-21 | Singular Bio Inc. | Assays for single molecule detection and use thereof |
WO2015069787A1 (en) | 2013-11-05 | 2015-05-14 | Htg Molecular Diagnostics, Inc. | Methods for detecting nucleic acids |
DK2891722T3 (en) | 2013-11-12 | 2019-01-07 | Population Bio Inc | METHODS AND COMPOSITIONS FOR DIAGNOSTICING, PROGRAMMING AND TREATMENT OF ENDOMETRIOSIS |
EP3122905B1 (en) | 2014-03-27 | 2020-09-09 | Yale University | Circulating micrornas as biomarkers for endometriosis |
US10526641B2 (en) | 2014-08-01 | 2020-01-07 | Dovetail Genomics, Llc | Tagging nucleic acids for sequence assembly |
EP3188741A4 (en) | 2014-08-28 | 2018-03-28 | Yale University | Compositions and methods for the treating an inflammatory disease or disorder |
US10724096B2 (en) | 2014-09-05 | 2020-07-28 | Population Bio, Inc. | Methods and compositions for inhibiting and treating neurological conditions |
EP3215170A4 (en) | 2014-11-05 | 2018-04-25 | Veracyte, Inc. | Systems and methods of diagnosing idiopathic pulmonary fibrosis on transbronchial biopsies using machine learning and high dimensional transcriptional data |
WO2016126882A1 (en) | 2015-02-04 | 2016-08-11 | Twist Bioscience Corporation | Methods and devices for de novo oligonucleic acid assembly |
CA2975855A1 (en) | 2015-02-04 | 2016-08-11 | Twist Bioscience Corporation | Compositions and methods for synthetic gene assembly |
SG10202000731WA (en) | 2015-02-17 | 2020-03-30 | Dovetail Genomics Llc | Nucleic acid sequence assembly |
CN113528623A (zh) | 2015-02-18 | 2021-10-22 | 卓异生物公司 | 用于单分子检测的测定及其应用 |
WO2016154540A1 (en) | 2015-03-26 | 2016-09-29 | Dovetail Genomics Llc | Physical linkage preservation in dna storage |
US9981239B2 (en) | 2015-04-21 | 2018-05-29 | Twist Bioscience Corporation | Devices and methods for oligonucleic acid library synthesis |
US10844373B2 (en) | 2015-09-18 | 2020-11-24 | Twist Bioscience Corporation | Oligonucleic acid variant libraries and synthesis thereof |
CN108698012A (zh) | 2015-09-22 | 2018-10-23 | 特韦斯特生物科学公司 | 用于核酸合成的柔性基底 |
JP6836586B2 (ja) | 2015-09-29 | 2021-03-03 | エイチティージー モレキュラー ダイアグノスティクス, インコーポレイテッド | びまん性大細胞型b細胞性リンパ腫(dlbcl)を亜型決定するための方法 |
AU2016341198B2 (en) | 2015-10-19 | 2023-03-09 | Dovetail Genomics, Llc | Methods for genome assembly, haplotype phasing, and target independent nucleic acid detection |
CN115920796A (zh) | 2015-12-01 | 2023-04-07 | 特韦斯特生物科学公司 | 功能化表面及其制备 |
SG11201807117WA (en) | 2016-02-23 | 2018-09-27 | Dovetail Genomics Llc | Generation of phased read-sets for genome assembly and haplotype phasing |
SG11201810088SA (en) | 2016-05-13 | 2018-12-28 | Dovetail Genomics Llc | Recovering long-range linkage information from preserved samples |
GB2568444A (en) | 2016-08-22 | 2019-05-15 | Twist Bioscience Corp | De novo synthesized nucleic acid libraries |
EP3504348B1 (en) | 2016-08-24 | 2022-12-14 | Decipher Biosciences, Inc. | Use of genomic signatures to predict responsiveness of patients with prostate cancer to post-operative radiation therapy |
US10417457B2 (en) | 2016-09-21 | 2019-09-17 | Twist Bioscience Corporation | Nucleic acid based data storage |
US11725232B2 (en) | 2016-10-31 | 2023-08-15 | The Hong Kong University Of Science And Technology | Compositions, methods and kits for detection of genetic variants for alzheimer's disease |
WO2018098241A1 (en) | 2016-11-22 | 2018-05-31 | University Of Rochester | Methods of assessing risk of recurrent prostate cancer |
CA3047128A1 (en) | 2016-12-16 | 2018-06-21 | Twist Bioscience Corporation | Variant libraries of the immunological synapse and synthesis thereof |
US11208697B2 (en) | 2017-01-20 | 2021-12-28 | Decipher Biosciences, Inc. | Molecular subtyping, prognosis, and treatment of bladder cancer |
US10240205B2 (en) | 2017-02-03 | 2019-03-26 | Population Bio, Inc. | Methods for assessing risk of developing a viral disease using a genetic test |
CA3054303A1 (en) | 2017-02-22 | 2018-08-30 | Twist Bioscience Corporation | Nucleic acid based data storage |
WO2018165600A1 (en) | 2017-03-09 | 2018-09-13 | Genomedx Biosciences, Inc. | Subtyping prostate cancer to predict response to hormone therapy |
WO2018170169A1 (en) | 2017-03-15 | 2018-09-20 | Twist Bioscience Corporation | Variant libraries of the immunological synapse and synthesis thereof |
US10729741B2 (en) | 2017-03-27 | 2020-08-04 | Neomatrix Therapeutics Inc. | Methods of treating burns with i.v. cP12 in a window from 2 to 6 hours after injury |
US11078542B2 (en) | 2017-05-12 | 2021-08-03 | Decipher Biosciences, Inc. | Genetic signatures to predict prostate cancer metastasis and identify tumor aggressiveness |
CA3063283A1 (en) | 2017-05-17 | 2018-11-22 | Microbio Pty Ltd | Methods and agents for identifying or classifying microbes based on polymorphisms within ribosomal rna genes |
WO2018231864A1 (en) | 2017-06-12 | 2018-12-20 | Twist Bioscience Corporation | Methods for seamless nucleic acid assembly |
WO2018231872A1 (en) | 2017-06-12 | 2018-12-20 | Twist Bioscience Corporation | Methods for seamless nucleic acid assembly |
US11217329B1 (en) | 2017-06-23 | 2022-01-04 | Veracyte, Inc. | Methods and systems for determining biological sample integrity |
JP2020536504A (ja) | 2017-09-11 | 2020-12-17 | ツイスト バイオサイエンス コーポレーション | Gpcr結合タンパク質およびその合成 |
WO2019079769A1 (en) | 2017-10-20 | 2019-04-25 | Twist Bioscience Corporation | HEATED NANOWELLS FOR THE SYNTHESIS OF POLYNUCLEOTIDES |
AU2019205269A1 (en) | 2018-01-04 | 2020-07-30 | Twist Bioscience Corporation | DNA-based digital information storage |
SG11202011467RA (en) | 2018-05-18 | 2020-12-30 | Twist Bioscience Corp | Polynucleotides, reagents, and methods for nucleic acid hybridization |
SI3625368T1 (sl) | 2018-08-08 | 2023-04-28 | Pml Screening, Llc | Postopki z genetskim testiranjem za oceno tveganja za razvoj progresivne multifokalne levkoencefalopatije, ki jo povzroča virus John Cunningham |
CN113365661A (zh) | 2019-01-31 | 2021-09-07 | 新加坡科技研究局 | 用于治疗或预防癌症的cnx/erp57抑制剂 |
SG11202109283UA (en) | 2019-02-26 | 2021-09-29 | Twist Bioscience Corp | Variant nucleic acid libraries for antibody optimization |
CN113766930A (zh) | 2019-02-26 | 2021-12-07 | 特韦斯特生物科学公司 | Glp1受体的变异核酸文库 |
EP3987019A4 (en) | 2019-06-21 | 2023-04-19 | Twist Bioscience Corporation | BARCODE-BASED NUCLEIC ACID SEQUENCE ARRANGEMENT |
Family Cites Families (23)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
DE2150691C2 (de) * | 1971-10-12 | 1982-09-09 | Basf Ag, 6700 Ludwigshafen | Lichtempfindliches Gemisch und Verwendung eines lichtempfindlichen Gemisches zur Herstellung einer Flachdruckplatte |
DE2612359C3 (de) * | 1976-03-24 | 1978-10-26 | Konishiroku Photo Ind. Co., Ltd., Tokio | Elektrophotographisches Aufzeichnungsmaterial |
US4269933A (en) * | 1978-06-08 | 1981-05-26 | E. I. Du Pont De Nemours And Company | Methods of developing photopolymerizable compositions containing an 0-nitroaromatic compound as photoinhibitor |
US4478967A (en) * | 1980-08-11 | 1984-10-23 | Minnesota Mining And Manufacturing Company | Photolabile blocked surfactants and compositions containing the same |
FR2488691A1 (fr) * | 1980-08-14 | 1982-02-19 | Commissariat Energie Atomique | Procede et dispositif pour la detection et la quantification d'agglutinats en temps reel |
US4477556A (en) * | 1982-08-18 | 1984-10-16 | E. I. Du Pont De Nemours And Company | Acidic o-nitroaromatics as photoinhibitors of polymerization in positive working films |
NZ207394A (en) * | 1983-03-08 | 1987-03-06 | Commw Serum Lab Commission | Detecting or determining sequence of amino acids |
GB8314523D0 (en) * | 1983-05-25 | 1983-06-29 | Lowe C R | Diagnostic device |
US4517338A (en) * | 1983-06-20 | 1985-05-14 | Chiron Corporation | Multiple reactor system and method for polynucleotide synthesis |
EP0194132A3 (en) * | 1985-03-06 | 1988-08-03 | Murex Corporation | Imaging immunoassay detection system and method |
US4631211A (en) * | 1985-03-25 | 1986-12-23 | Scripps Clinic & Research Foundation | Means for sequential solid phase organic synthesis and methods using the same |
JPS6221151A (ja) * | 1985-07-19 | 1987-01-29 | Matsushita Electric Ind Co Ltd | パタ−ン形成方法 |
FR2590637B1 (fr) * | 1985-10-28 | 1990-01-12 | Valeo | Mecanisme d'embrayage a rondelle belleville, notamment pour vehicule automobile, et embrayage correspondant |
GB8529684D0 (en) * | 1985-12-02 | 1986-01-08 | Medical Res Council | Photo-labile protecting agents |
EP0302881A4 (en) * | 1986-04-02 | 1992-01-15 | E.I. Du Pont De Nemours And Company | Polynucleotide probes on solid support through photo-labile linkage |
EP0266881A3 (en) * | 1986-09-30 | 1990-04-04 | Astromed Limited | Method and apparatus for multiple optical assaying |
US4762881A (en) * | 1987-01-09 | 1988-08-09 | E. I. Du Pont De Nemours And Company | Photoreactive benzoylphenylalanines and related peptides |
JPH01233447A (ja) * | 1988-03-15 | 1989-09-19 | Oki Electric Ind Co Ltd | 感光性組成物 |
US5002867A (en) * | 1988-04-25 | 1991-03-26 | Macevicz Stephen C | Nucleic acid sequence determination by multiple mixed oligonucleotide probes |
JP2897027B2 (ja) * | 1988-10-27 | 1999-05-31 | スズキ株式会社 | 免疫学的凝集反応検出装置 |
JPH0372496A (ja) * | 1989-05-26 | 1991-03-27 | Applied Immune Sci Inc | 固相多重ペプチド合成 |
US5143854A (en) * | 1989-06-07 | 1992-09-01 | Affymax Technologies N.V. | Large scale photolithographic solid phase synthesis of polypeptides and receptor binding screening thereof |
JPH05501611A (ja) * | 1989-11-13 | 1993-03-25 | アフィマックス テクノロジーズ ナームロゼ ベノートスハップ | 表面上への抗リガンドの空間的アドレス可能な固定化 |
-
1991
- 1991-11-20 EP EP92903279A patent/EP0562025B1/en not_active Expired - Lifetime
- 1991-11-20 DE DE69132531T patent/DE69132531T2/de not_active Expired - Lifetime
- 1991-11-20 AU AU91534/91A patent/AU663300B2/en not_active Expired
- 1991-11-20 DE DE69133293T patent/DE69133293T2/de not_active Expired - Lifetime
- 1991-11-20 JP JP4503660A patent/JPH06504997A/ja not_active Withdrawn
- 1991-11-20 EP EP00202667A patent/EP1046421B8/en not_active Expired - Lifetime
- 1991-11-20 AT AT00202667T patent/ATE244065T1/de not_active IP Right Cessation
- 1991-11-20 AT AT92903279T patent/ATE199054T1/de not_active IP Right Cessation
- 1991-11-20 ES ES92903279T patent/ES2155822T3/es not_active Expired - Lifetime
- 1991-11-20 CA CA002097708A patent/CA2097708A1/en not_active Abandoned
- 1991-11-20 DK DK92903279T patent/DK0562025T3/da active
- 1991-11-20 WO PCT/US1991/008693 patent/WO1992010092A1/en active IP Right Grant
- 1991-11-26 NZ NZ240744A patent/NZ240744A/en not_active IP Right Cessation
- 1991-11-28 IL IL10019391A patent/IL100193A/xx not_active IP Right Cessation
- 1991-12-05 MX MX9102400A patent/MX9102400A/es not_active IP Right Cessation
- 1991-12-06 ZA ZA919650A patent/ZA919650B/xx unknown
-
2001
- 2001-04-20 GR GR20010400623T patent/GR3035773T3/el not_active IP Right Cessation
-
2005
- 2005-02-24 JP JP2005049797A patent/JP2005194285A/ja not_active Withdrawn
- 2005-12-05 JP JP2005351375A patent/JP4112582B2/ja not_active Expired - Lifetime
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
DE69133293D1 (de) | 2003-08-07 |
JPH06504997A (ja) | 1994-06-09 |
ES2155822T3 (es) | 2001-06-01 |
EP0562025B1 (en) | 2001-02-07 |
CA2097708A1 (en) | 1992-06-07 |
IL100193A0 (en) | 1992-08-18 |
DK0562025T3 (da) | 2001-06-18 |
ZA919650B (en) | 1993-06-07 |
EP1046421A3 (en) | 2001-09-19 |
JP2006188495A (ja) | 2006-07-20 |
MX9102400A (es) | 1992-06-01 |
JP2005194285A (ja) | 2005-07-21 |
EP0562025A4 (ja) | 1994-03-30 |
DE69132531D1 (de) | 2001-03-15 |
AU9153491A (en) | 1992-07-08 |
EP1046421A2 (en) | 2000-10-25 |
ATE199054T1 (de) | 2001-02-15 |
AU663300B2 (en) | 1995-10-05 |
GR3035773T3 (en) | 2001-07-31 |
WO1992010092A1 (en) | 1992-06-25 |
DE69133293T2 (de) | 2004-05-27 |
NZ240744A (en) | 1994-04-27 |
EP1046421B8 (en) | 2006-01-11 |
IL100193A (en) | 2000-10-31 |
ATE244065T1 (de) | 2003-07-15 |
EP1046421B1 (en) | 2003-07-02 |
DE69132531T2 (de) | 2001-09-13 |
EP0562025A1 (en) | 1993-09-29 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
JP4112582B2 (ja) | 非常に大きい規模の固定化されたポリマーの合成 | |
US6346413B1 (en) | Polymer arrays | |
US6566495B1 (en) | Very large scale immobilized polymer synthesis | |
US6491871B1 (en) | System for determining receptor-ligand binding affinity | |
US5424186A (en) | Very large scale immobilized polymer synthesis | |
US6506558B1 (en) | Very large scale immobilized polymer synthesis | |
US6955915B2 (en) | Apparatus comprising polymers | |
Fodor et al. | Light-directed, spatially addressable parallel chemical synthesis | |
US5527681A (en) | Immobilized molecular synthesis of systematically substituted compounds | |
US6468740B1 (en) | Cyclic and substituted immobilized molecular synthesis |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
A131 | Notification of reasons for refusal |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A131 Effective date: 20060623 |
|
A601 | Written request for extension of time |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A601 Effective date: 20060922 |
|
A602 | Written permission of extension of time |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A602 Effective date: 20060927 |
|
A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523 Effective date: 20061221 |
|
A02 | Decision of refusal |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A02 Effective date: 20071018 |
|
A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523 Effective date: 20071205 |
|
A911 | Transfer to examiner for re-examination before appeal (zenchi) |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A911 Effective date: 20080108 |
|
A131 | Notification of reasons for refusal |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A131 Effective date: 20080214 |
|
A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523 Effective date: 20080219 |
|
TRDD | Decision of grant or rejection written | ||
A01 | Written decision to grant a patent or to grant a registration (utility model) |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A01 Effective date: 20080401 |
|
A61 | First payment of annual fees (during grant procedure) |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A61 Effective date: 20080409 |
|
R150 | Certificate of patent or registration of utility model |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R150 |
|
FPAY | Renewal fee payment (event date is renewal date of database) |
Free format text: PAYMENT UNTIL: 20110418 Year of fee payment: 3 |
|
FPAY | Renewal fee payment (event date is renewal date of database) |
Free format text: PAYMENT UNTIL: 20110418 Year of fee payment: 3 |
|
FPAY | Renewal fee payment (event date is renewal date of database) |
Free format text: PAYMENT UNTIL: 20120418 Year of fee payment: 4 |
|
EXPY | Cancellation because of completion of term | ||
FPAY | Renewal fee payment (event date is renewal date of database) |
Free format text: PAYMENT UNTIL: 20120418 Year of fee payment: 4 |