JP2024512029A - T細胞共培養効力アッセイのための方法及び組成物、ならびに細胞療法製品との使用 - Google Patents

T細胞共培養効力アッセイのための方法及び組成物、ならびに細胞療法製品との使用 Download PDF

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Abstract

本発明は、ヒトがん療法を含む治療法に使用するための腫瘍浸潤リンパ球(TIL)製品の効力及び/または機能性を分析またはアッセイするための、ならびに骨髄浸潤リンパ球(MIL)製品及び末梢血リンパ球(PBL)製品などの他のポリクローナル製品の効力及び/または機能性を分析またはアッセイするための新規のプロセス、組成物、及び方法を提供する。TIL製品、MIL製品、及びPBL製品を使用して調製し、がんを治療するための組成物、方法、及びキットも提供される。【選択図】なし

Description

腫瘍浸潤リンパ球(TIL)の養子自家移入を使用した巨大な不応性がんの治療は、予後不良の患者の治療に対する強力なアプローチとなる。Gattinoni,et al.,Nat.Rev.Immunol.2006,6,383-393。IL-2ベースのTIL拡張とそれに続く「急速拡張プロセス」(REP)は、その速度及び効率のためにTIL拡張の好ましい方法になっている。Dudley,et al.,Science2002,298,850-54、Dudley,et al.,J.Clin.Oncol.2005,23,2346-57、Dudley,et al.,J.Clin.Oncol.2008,26,5233-39、Riddell,et al.,Science 1992,257,238-41、Dudley,et al.,J.Immunother.2003,26,332-42。黒色腫におけるTIL療法への応答を改善し、TIL療法を他の腫瘍タイプに拡大するための多くのアプローチが限られた成功を収めており、この分野は依然として困難である。Goff,et al.,J.Clin.Oncol.2016,34,2389-97、Dudley,et al.,J.Clin.Oncol.2008,26,5233-39、Rosenberg,et al.,Clin.Cancer Res.2011,17,4550-57。単一免疫チェックポイント阻害剤との併用研究も記載されているが、さらなる研究が進行中であり、追加の治療方法が必要である(Kverneland,et al.,Oncotarget,2020,11(22),2092-2105)。
さらに、現行のTILの製造及び治療プロセスは、長さ、コスト、無菌性の懸念、及び本明細書に記載される他の要因によって制限されているため、他のチェックポイント阻害剤療法に対して不応性である患者を治療する可能性は厳しく制限されている。TIL製造プロセス及び実行可能な治療選択肢がほとんどまたはまったく残っていない患者を治療する際に使用するのに適したかかるプロセスに基づく治療法の品質制御プロセスを提供することが緊急に必要である。本発明は、拡張TILの効力及び/または機能性を評価するための機序を提供する追加のステップを用いて、TILを生成する際に使用するための短縮製造プロセスを提供することによって、この必要性を満たす。
本発明は、例えば、がんの治療のための治療効果が増加した治療効果を有する治療的TIL集団を調製するために、TILを含むT細胞の効力及び/または機能性を調製及び評価するための改善されたプロセス、方法、及び組成物を提供する。これらの効力アッセイは、当該技術分野で知られているアッセイと比較して、とりわけ、優れた性能、T細胞製品の効力に対するより良い制御、及び生物学的関連性の増加といった改善を提供することができる。効力アッセイを使用した製造プロセス、投与方法、及び薬学的組成物も記載されている。これらのプロセス及び方法は、追加として、本明細書に記載のCTLA-4ならびにPD-1阻害剤及び/またはPD-L1阻害剤と組み合わせて、TILの投与とともに使用することができる。
拡張TIL、ならびに骨髄浸潤リンパ球(MIL)及び末梢血リンパ球(PBL)を含む他のポリクローナルT細胞製品の効力及び/または機能性を評価するための方法であって、TIL、MIL、PBL、またはこれらの方法によって評価される他のポリクローナルT細胞製品を投与することによってがんの治療に用いることができる、方法が本明細書に提供される。
一態様では、T細胞製品の効力を決定する方法であって、
a.T細胞製品細胞との標的細胞の共培養を、第1の期間行うステップと、
b.共培養から採取物を取得するステップと、
c.採取物を、(1)T細胞製品細胞上の1つ以上のマーカーの発現について評価するか、または(2)T細胞製品細胞から分泌された1つ以上の分析物について評価して、1つ以上の観測値を取得し、T細胞製品の効力を決定するステップと、を含む、方法を提供する。
いくつかの実施形態では、この方法は、
d.T細胞製品細胞との(i)細胞または(ii)ヒト白血球抗原(HLA)遮断抗体及び標的細胞を含む陰性対照の第2の共培養を、第2の期間行う追加のステップと、
e.第2の共培養から第2の採取物を取得する追加のステップと、
f.第2の採取物を、(1)T細胞製品細胞上の1つ以上のマーカーの発現について評価するか、または(2)T細胞製品細胞から分泌された1つ以上の分析物について評価して、1つ以上の対照値を取得する追加のステップと、
g.ステップcからの1つ以上の観測値をステップfからの1つ以上の対照値と比較して、T細胞製品の効力を決定する追加のステップであって、各々の観測値が対応する対照値と比較される、T細胞製品の効力を決定する追加のステップと、を含む。
いくつかの実施形態では、T細胞製品は、腫瘍浸潤リンパ球(TIL)製品、骨髄浸潤リンパ球(MIL)製品、または末梢血リンパ球(PBL)製品からなる群から選択される。
いくつかの実施形態では、T細胞製品は、ヒト由来のTIL製品であり、TIL製品が、腫瘍の切除または腫瘍の断片化もしくは消化によって取得され、急速拡張プロトコルステップを含むTIL拡張プロセスによって製造される。
いくつかの実施形態では、方法は、ヒト患者の治療において使用するためにT細胞製品を放出するステップを含む。
いくつかの実施形態では、標的細胞は、照射されたRaji細胞またはその誘導体、バリアント、修飾、もしくは子孫である。
いくつかの実施形態では、陰性対照細胞は、MHCまたはHLAクラスI及びMHCまたはHLAクラスII発現を欠いている。
いくつかの実施形態では、陰性対照細胞は、照射されたK562細胞またはその誘導体、バリアント、修飾、もしくは子孫である。
いくつかの実施形態では、HLA遮断抗体は、HLA-I遮断抗体、HLA-II遮断抗体、またはそれらの組み合わせを含む。
いくつかの実施形態では、TIL製品細胞の数と標的細胞の数との比は、5:1~1:5である。
いくつかの実施形態では、TIL製品細胞の数と陰性対照細胞の数との比は、5:1~1:5である。
いくつかの実施形態では、TIL製品細胞の数と標的細胞の数との比は、3:1~1:3である。
いくつかの実施形態では、TIL製品細胞の数と陰性対照細胞の数との比は、3:1~1:3である。
いくつかの実施形態では、TIL製品細胞の数と標的細胞の数との間の比は、1:2~1:4である。
いくつかの実施形態では、TIL製品細胞の数と陰性対照細胞の数との比は、1:2~1:4である。
いくつかの実施形態では、TIL製品細胞の数と標的細胞の数との比は、1:25~1:35である。
いくつかの実施形態では、TIL製品細胞の数と陰性対照細胞の数との比は、1:25~1:35である。
いくつかの実施形態では、TIL製品細胞の数と標的細胞の数との比は、約1:2である。
いくつかの実施形態では、TIL製品細胞の数と陰性対照細胞の数との比は、約1:2である。
いくつかの実施形態では、TIL製品細胞の数と標的細胞の数との比は、約1:3である。
いくつかの実施形態では、TIL製品細胞の数と陰性対照細胞の数との比は、約1:3である。
いくつかの実施形態では、TIL製品細胞の数と標的細胞の数との比は、約1:4である。
いくつかの実施形態では、TIL製品細胞の数と陰性対照細胞の数との比は、約1:4である。
いくつかの実施形態では、共培養は、凍結保存されたTIL製品、MIL製品、またはPBL製品を解凍し、解凍されたTIL製品、MIL製品、またはPBL製品を、12時間、24時間、36時間、48時間、60時間、及び72時間からなる群から選択される期間、インキュベーション下で回復させた後に行われる。
いくつかの実施形態では、第1の期間は、約6時間~約48時間である。
いくつかの実施形態では、第2の期間は、約6時間~約48時間である。
いくつかの実施形態では、第1の期間は、約12時間、約18時間、及び約24時間からなる群から選択される。
いくつかの実施形態では、第2の期間は、約12時間、約18時間、及び約24時間からなる群から選択される。
いくつかの実施形態では、第1の期間及び第2の期間は、同じ期間である。
いくつかの実施形態では、T細胞製品上の1つ以上のマーカーが、CD25、CD69、CD134、CD137、CD150、KLRG1、またはそれらの組み合わせからなる群から選択される。
いくつかの実施形態では、T細胞製品から分泌された1つ以上の分析対象物は、IFN-α、IFN-β、IFN-γ、グランザイムB、パーフォリン、TNF-α、IL-1α、IL-1β、IL-2、IL-3、IL-4、IL-5、IL-6、IL-8、IL-9、IL-10、IL-13、IL-14、IL-16、IL-17、IL-18、IL-22、IL-25、IL-26、MIP-1β、及びそれらの組み合わせからなる群から選択される。
いくつかの実施形態では、TIL製品から分泌された1つ以上の分析物は、IFN-α、IFN-β、IFN-γ、グランザイムB、パーフォリン、TNF-α、IL-1α、IL-1β、IL-2、IL-3、IL-4、IL-5、IL-6、IL-8、IL-9、IL-10、IL-13、IL-14、IL-16、IL-17、IL-18、IL-22、IL-25、IL-26、MIP-1β、及びそれらの組み合わせからなる群から選択され、観測値の量は、1つ以上の分析物の各々について対照値の量に対して正規化され、1つ以上の分析物の各々について対照値を上回る観測値の増加は、少なくとも1倍、少なくとも1.5倍、少なくとも2倍、少なくとも2.5倍、少なくとも3倍、少なくとも3.5倍、少なくとも4倍、少なくとも4.5倍、及び少なくとも5倍からなる群から選択される。
いくつかの実施形態では、TIL製品は、外科的切除、針生検、コア生検、小生検、またはヒト患者からの腫瘍細胞とTIL細胞との混合物を含有する試料を取得するための他の手段によって取得された腫瘍から製造される。
別の態様では、本発明は、がんの治療を必要とする患者において腫瘍浸潤リンパ球(TIL)の集団でそれを治療する方法であって、
(a)外科的切除、針生検、コア生検、小生検、または患者から取得された腫瘍試料を(i)複数の腫瘍断片もしくは(ii)腫瘍消化物に処理することによる他の手段によって患者から切除された腫瘍から第1のTIL集団を取得及び/または受容するステップと、
(b)第1のTIL集団を閉鎖系に付加するステップと、
(c)IL-2を含む細胞培養培地中で第1のTIL集団を培養することによって第1の拡張を行い、第2のTIL集団を産生するステップであって、第1の拡張が、第1のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われ、第1の拡張が、約3~14日間行われて、第2のTIL集団を取得し、ステップ(b)からステップ(c)への移行が、系を開くことなく起こる、第2のTIL集団を産生するステップと、
(d)第2のTIL集団の細胞培養培地を追加のIL-2、OKT-3、及び抗原提示細胞(APC)で補充することによって第2の拡張を行い、第3のTIL集団を産生するステップであって、第2の拡張が、約7~14日間行われて、第3のTIL集団を取得し、第3のTIL集団が、治療的TIL集団であり、第2の拡張が、第2のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われ、ステップ(c)からステップ(d)への移行が、系を開くことなく起こる、第3のTIL集団を産生するステップと、
(e)ステップ(d)から取得された治療的TIL集団を採取するステップであって、ステップ(d)からステップ(e)への移行が、系を開くことなく起こる、採取するステップと、
(f)治療的TIL集団の効力を決定するステップであって、
i.治療的TIL集団の部分との標的細胞の共培養を、第1の期間行うことと、
ii.共培養から採取物を取得することと、
iii.採取物を、(1)治療的TIL集団の部分上の1つ以上のマーカーの発現について評価するか、または(2)治療的TIL集団の部分から分泌された1つ以上の分析物について評価して、1つ以上の観測値を取得して、治療的TIL集団の効力を決定することと、
iv.治療的TIL集団の第2の部分との、陰性対照細胞または(i)陰性対照細胞もしくは(ii)ヒト白血球抗原遮断抗体の、第2の共培養を、第2の期間行うことと、
v.第2の共培養から第2の採取物を取得することと、
vi.第2の採取物を、(1)治療的TIL集団の第2の部分上の1つ以上のマーカーの発現について評価するか、または(2)治療的TIL集団の第2の部分から分泌された1つ以上の分析物について評価して、1つ以上の対照値を取得することと、
vii.1つ以上の観測値を1つ以上の対照値と比較して、治療的TIL集団の効力を決定することであって、各観測値が、その対応する対照値と比較される、治療的TIL集団の効力を決定することと、を含む、治療的TIL集団の効力を決定するステップと、
(g)ステップ(e)からの治療的TIL集団を注入バッグに移すステップであって、ステップ(e)から(g)への移行が、系を開くことなく起こる、移すステップと、
(h)任意選択で、凍結保存プロセスを使用して、ステップ(g)からの治療的TIL集団を含む注入バッグを凍結保存することと、
(i)治療的TIL集団が有効であると決定された場合、治療上有効な投与量の治療的TIL集団を、ステップ(g)または(h)の注入バッグから患者に投与するステップと、を含む、方法を提供する。
いくつかの実施形態では、採取されたTILの効力及び/または機能性を調べることは、凍結保存後に、または任意選択で凍結保存ステップの前後に行われる。
いくつかの実施形態では、患者は、切除不能、転移性、耐性、またはCTLA-4阻害剤、PD-1阻害剤、もしくはPD-L1阻害剤に対して不応性である腫瘍を有し、任意選択で、患者は、CTLA-4阻害剤、PD-1阻害剤、またはPD-L1阻害剤で以前に治療されている。
いくつかの実施形態では、ステップ(c)の第2のTIL集団は、第1のTIL集団よりも数が少なくとも50倍多い。
いくつかの実施形態では、第1の拡張は、約10~約12日の期間にわたって行われる。
いくつかの実施形態では、第2の拡張は、約10~約12日の期間にわたって行われる。
いくつかの実施形態では、第1の拡張は、約11日の期間にわたって行われる。
いくつかの実施形態では、第2の拡張は、約11日の期間にわたって行われる。
いくつかの実施形態では、IL-2は、第1の拡張において、細胞培養培地中に1000IU/mL~6000IU/mLの初期濃度で存在する。
いくつかの実施形態では、第2の拡張ステップにおいて、IL-2は、1000IU/mL~6000IU/mLの初期濃度で存在し、OKT-3抗体は、約30ng/mLの初期濃度で存在する。
いくつかの実施形態では、この方法は、TILを患者に投与する前に、骨髄非破壊的リンパ球枯渇レジメンで患者を治療するステップをさらに含む。
いくつかの実施形態では、骨髄非破壊的リンパ球枯渇レジメンが、シクロホスファミドを60mg/m/日の用量で2日間投与し、続いてフルダラビンを25mg/m/日の用量で5日間投与するステップを含む。
いくつかの実施形態では、骨髄非破壊的リンパ球枯渇レジメンが、シクロホスファミドを60mg/m/日の用量で、フルダラビンを25mg/m/日の用量で2日間投与し、続いてフルダラビンを25mg/m/日の用量で3日間投与するステップを含む。
いくつかの実施形態では、この方法は、治療的TIL集団を患者に投与した翌日から開始するIL-2レジメンで患者を治療するステップをさらに含む。
いくつかの実施形態では、この方法は、治療的TIL集団を患者に投与したのと同じ日に開始するIL-2レジメンで患者を治療するステップをさらに含む。
いくつかの実施形態では、IL-2レジメンは、治療的TIL集団の患者への投与の完了の約3~約24時間後に投与される。
いくつかの実施形態では、IL-2レジメンは、許容範囲まで8時間毎に15分間のボーラス静脈内注入として投与される、600,000もしくは720,000IU/kgのアルデスロイキン、またはそのバイオシミラーもしくはバリアントを含む高用量IL-2レジメンである。
いくつかの実施形態では、ステップ(a)において患者から取得された腫瘍試料を腫瘍消化物に処理することは、腫瘍試料を酵素培地中でインキュベートすることをさらに含む。
いくつかの実施形態では、ステップ(a)において患者から取得された腫瘍試料を腫瘍消化物に処理することは、腫瘍試料を機械的に破壊して腫瘍試料を解離することをさらに含む。
いくつかの実施形態では、ステップ(a)において患者から取得された腫瘍試料を腫瘍消化物に処理することは、密度勾配分離を使用して解離された腫瘍試料を精製することをさらに含む。
いくつかの実施形態では、酵素培地は、DNaseを含む。
いくつかの実施形態では、酵素培地は、30単位/mLのDNaseを含む。
いくつかの実施形態では、酵素培地は、コラゲナーゼを含む。
いくつかの実施形態では、酵素培地は、約1.0mg/mLのコラゲナーゼを含む。
いくつかの実施形態では、がんは、黒色腫、卵巣癌、膵臓癌、子宮内膜癌、甲状腺癌、子宮頸癌、非小細胞肺癌、小細胞肺癌、膀胱癌、乳癌、頭頸部癌、神経膠芽細胞腫、胃腸癌、腎臓癌、肉腫、及び腎細胞癌からなる群から選択される。
いくつかの実施形態では、方法は、PD-1阻害剤、PD-L1阻害剤、またはCTLA-4阻害剤を患者に投与するステップを含む。
別の態様では、T細胞製品の効力を決定する方法であって、
a.T細胞製品細胞との標的細胞の少なくとも3つの共培養を、異なる標的細胞濃度で行うステップと、
b.T細胞参照標準細胞との標的細胞の少なくとも3つの共培養を、異なる標的細胞濃度で行うステップと、
c.共培養の各々から上清を抽出するステップと、
d.上清を、T細胞製品細胞及びT細胞参照標準細胞から分泌されたサイトカインについて評価して、T細胞製品の効力を決定するための用量濃度を取得するステップと、を含み、
標的細胞が、単球細胞である、方法を提供する。
いくつかの実施形態では、T細胞製品は、腫瘍浸潤リンパ球(TIL)製品、骨髄浸潤リンパ球(MIL)製品、または末梢血リンパ球(PBL)製品である。
いくつかの実施形態では、単球細胞は、U937もしくはThp1細胞またはその誘導体、バリアント、修飾、もしくは子孫であり、サイトカインは、インターフェロン-γである。
いくつかの実施形態では、共培養は、約6時間、約12時間、約18時間、約24時間、約30時間、約36時間、約42時間、及び約48時間からなる群から選択される期間行われる。
いくつかの実施形態では、T細胞製品は、TIL製品であり、1ウェル当たり約4×10、約2×10、約1×10、及び約0.5×10標的細胞の4つの標的細胞用量濃度、ならびに1ウェル当たり約1.5×10TILの単一のTIL細胞濃度が使用される。
いくつかの実施形態では、T細胞製品細胞との標的細胞の少なくとも4つの共培養及びT細胞参照標準細胞との標的細胞の少なくとも4つの共培養を使用し、平行線分析を行い、1つの外れ値標的細胞用量濃度を破棄する。
いくつかの実施形態では、方法は、効力アッセイマトリックスの構成要素である。
いくつかの実施形態では、効力アッセイマトリックスは、CD3、CD28、及び/またはCD137刺激及び報告インターフェロン-γ、グランザイムB、または腫瘍壊死因子-αを使用したビーズまたはプレートベースのアッセイ、総生細胞についてのアッセイ、生細胞パーセンテージについてのアッセイ、CD4細胞含有量についてのアッセイ、CD8細胞含有量についてのアッセイ、TEM細胞含有量についてのアッセイ、TCM細胞含有量についてのアッセイ、LAG3細胞含有量についてのアッセイ、及びKLRG1細胞含有量についてのアッセイ、CD101細胞含有量についてのアッセイ、CD69細胞含有量についてのアッセイ、TSCM細胞含有量についてのアッセイ、TEMRA細胞含有量についてのアッセイ、Treg細胞含有量についてのアッセイ、PD-1細胞含有量についてのアッセイ、TIM3細胞含有量についてのアッセイ、CD25細胞含有量についてのアッセイ、CD27細胞含有量についてのアッセイ、CD28細胞含有量についてのアッセイ、CD56細胞含有量についてのアッセイ、CTLA-4細胞含有量についてのアッセイ、TIGIT細胞含有量についてのアッセイ、及びCD57細胞含有量についてのアッセイからなる群から選択される1つ以上のアッセイを含む。
別の態様では、本発明は、がんを有する対象を治療するための方法であって、
(a)腫瘍消化物または腫瘍断片を閉鎖系に追加することであって、腫瘍消化物または腫瘍断片が、第1のTIL集団を含み、対象から切除された腫瘍から取得される、追加することと、
(b)IL-2を含む細胞培養培地中で第1のTIL集団を培養することによって第1の拡張を行い、第2のTIL集団を産生することであって、第1の拡張が、第1のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われ、第1の拡張が、約3~11日間行われて、第2のTIL集団を取得し、ステップ(b)からステップ(c)への移行が、系を開くことなく起こる、第2のTIL集団を産生することと、
(c)IL-2、OKT-3、及び抗原提示細胞(APC)を含む追加の細胞培養培地を補充することによって第2の拡張を行い、第3のTIL集団を産生することであって、第2の拡張が、約7~11日間行われて、第3のTIL集団を取得し、第2の拡張が、第2のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われ、ステップ(b)からステップ(c)への移行が、系を開くことなく起こる、第3のTIL集団を産生することと、
(d)ステップ(c)から取得された第3のTIL集団を採取することであって、ステップ(c)からステップ(d)への移行が、系を開くことなく起こる、採取することと、
(e)ステップ(d)からの採取された第3のTIL集団を注入バッグに移すことであって、ステップ(d)から(e)への移行が、系を開くことなく起こる、移すことと、
(f)凍結保存プロセスを使用して、ステップ(e)からの採取されたTIL集団を含む注入バッグを凍結保存することと、
(g)治療上有効な投与量の第3のTIL集団を、ステップ(f)における注入バッグから対象に投与することと、を含む、拡張された腫瘍浸潤リンパ球(TIL)を投与することを含み、
APCが、Raji、Ramos、Daudi、U937、もしくはThp1細胞、またはそれらの誘導体、バリアント、修飾、もしくは子孫からなる群から選択される、方法を提供する。
いくつかの実施形態では、がんは、黒色腫(転移性黒色腫及びブドウ膜黒色腫を含む)、卵巣癌、子宮頸癌、非小細胞肺癌(NSCLC)、小細胞肺癌、膀胱癌、乳癌、ヒトパピローマウイルスによって引き起こされるがん、頭頸部癌(頭頸部扁平上皮癌(HNSCC)を含む)、食道癌、食道・胃接合部癌、胃癌、胃腸癌、腎癌、及び腎細胞癌からなる群から選択される。
いくつかの実施形態では、ステップ(a)における第1の拡張及びステップ(b)における第2の拡張は、各々11日間の期間内に個別に行われる。
いくつかの実施形態では、ステップ(a)~(d)は、約10日~約22日で行われる。
いくつかの実施形態では、TILの効力は、本明細書に記載の方法を使用して決定されている。
いくつかの実施形態では、TILの効力は、本明細書に記載の方法を使用して決定されている。
ステップA~Fの概要を提供する例示的なGen2(プロセス2A)チャート。 TIL製造のためのGen2(プロセス2A)の実施形態のプロセスフローチャート。 TIL製造のためのGen2(プロセス2A)の実施形態のプロセスフローチャート。 TIL製造のためのGen2(プロセス2A)の実施形態のプロセスフローチャート。 凍結保存されたTILの例示的な製造プロセス(約22日)の実施形態の図を示す。 TIL製造のための22日プロセスである、Gen2(プロセス2A)の実施形態の図を示す。 TIL製造のためのプロセス1C及びGen2(プロセス2A)の例示的な実施形態からのステップA~Fの比較表。 TIL製造のためのプロセス1Cの実施形態とGen2(プロセス2A)の実施形態との詳細な比較。 例示的なGen3型TIL製造プロセス。 TIL製造のための2Aプロセス(およそ22日プロセス)とGen3プロセス(およそ14日~16日プロセス)の実施形態との比較を示す。 ステップA~Fの概要を提供する例示的なプロセスGen3チャート(およそ14日~16日プロセス)。 3つのプロセスバリエーションの各々について、ステップA~F(およそ14日~16日プロセス)の概要とともに3つの例示的なGen3プロセスを提供するチャート。 ステップA~Fの概要を提供する例示的な修正Gen2様プロセス(およそ22日プロセス)。 Gen2(プロセス2A)とGen3プロセスとの比較のための実験フローチャートを提供する。 様々なGen2(プロセス2A)とGen3.1プロセス実施形態との比較を示す。 Gen2、Gen2.1及びGen3.0プロセスの実施形態の様々な特徴を説明する表。 Gen3.1と称される、Gen3プロセスの実施形態のための培地条件の概要。 Gen2、Gen2.1及びGen3.0プロセスの実施形態の様々な特徴を説明する表。 Gen2及びGen3.0プロセスの実施形態の様々な特徴を比較する表。 記載された拡張プロセスの様々な実施形態における培地の使用を提供する表。 Gen3プロセス(16日プロセス)の例示的な実施形態の概略図。 Gen3拡張プラットフォームを使用して造血器悪性腫瘍からT細胞を拡張するための方法の例示的な実施形態の概略図。 構造I-A及びI-Bを提供する。円筒は、個々のポリペプチド結合ドメインを指す。構造I-A及びI-Bは、例えば、4-1BBLまたは4-1BBに結合する抗体から誘導される3つの線形に結合したTNFRSF結合ドメインを含み、これらを折り畳んで三価タンパク質を形成し、次いでこれをIgG1-Fc(CH3及びCH2ドメインを含む)によって第2の三価タンパク質に結合し、次いでこれを使用して、三価タンパク質のうちの2つをジスルフィド結合(小さい長楕円)によって一緒に結合し、構造を安定化し、6つの受容体及びシグナル伝達タンパク質の細胞内シグナル伝達ドメインを一緒にして、シグナル伝達複合体を形成することができるアゴニストを提供する。円筒として示されるTNFRSF結合ドメインは、例えば、親水性残基及び柔軟性のためのGly及びSer配列、ならびに溶解性のためのGlu及びLysを含み得るリンカーによって結合されたV鎖及びV鎖を含む、scFvドメインであり得る。 Gen3プロセス(16日プロセス)の例示的な実施形態の概略図。 Gen3.1プロセス(16日プロセス)の例示的な実施形態のプロセス概要を提供する。 Gen3.1試験プロセス(16~17日プロセス)の例示的な実施形態の概略図。 Gen3プロセス(16日プロセス)の例示的な実施形態の概略図。 例示的なGen2プロセス及び例示的なGen3プロセスの比較表。 Gen3プロセス(16~17日プロセス)の調製タイムラインの例示的な実施形態の概略図。 Gen3プロセス(14~16日プロセス)の例示的な実施形態の概略図。 Gen3プロセス(16日プロセス)の例示的な実施形態の概略図。 Gen3プロセス(16日プロセス)の例示的な実施形態の概略図。 Gen3プロセス(16日プロセス)の例示的な実施形態の概略図。 Gen2、Gen2.1、及びGen3プロセス(16日プロセス)の実施形態の比較。 Gen2、Gen2.1、及びGen3プロセス(16日プロセス)の実施形態の比較。 Gen3実施形態の構成要素。 Gen3実施形態のフローチャート比較(Gen3.0、Gen3.1対照、Gen3.1試験)。 Gen3プロセス(16~17日プロセス)の例示的な実施形態の構成要素が示される。 承認基準表。 TIL-K562陰性対照、ならびにMLR(患者適合型PBMC)及びビーズベースの陽性対照を用いたTIL-Raji共培養アッセイの実施形態の図。 TIL-Raji共培養アッセイを使用して、肺腫瘍(L4224)及び黒色腫腫瘍(M1152)について異なる共培養期間及びTIL:標的比のフローサイトメトリー(CD3の%)によって観察されたCD25レベル。 TIL-Raji共培養アッセイを使用して、肺腫瘍(L4224)及び黒色腫腫瘍(M1152)について異なる共培養期間及びTIL:標的比のフローサイトメトリー(CD3の%)によって観察されたCD69レベル。 TIL-Raji共培養アッセイを使用して、肺腫瘍(L4224)及び黒色腫腫瘍(M1152)について異なる共培養期間及びTIL:標的比のフローサイトメトリー(CD3の%)によって観察されたCD137(4-1BB)レベル。 TIL-Raji共培養アッセイを使用して、肺腫瘍(L4224)及び黒色腫腫瘍(M1152)について異なる共培養期間及びTIL:標的比のフローサイトメトリー(CD3の%)によって観察されたCD134(OX40)レベル。 TIL-Raji共培養アッセイを使用して、肺腫瘍(L4224)及び黒色腫腫瘍(M1152)について異なる共培養期間及びTIL:標的比のIFN-γ分泌。 TIL-Raji共培養アッセイを使用して、肺腫瘍(L4224)及び黒色腫腫瘍(M1152)について異なる共培養期間及びTIL:標的比のCCL4分泌。 TIL-Raji共培養アッセイを使用して、肺腫瘍(L4224)及び黒色腫腫瘍(M1152)について異なる共培養期間及びTIL:標的比のグランザイムB分泌。 TIL-K562陰性対照を用いたTIL-Raji共培養アッセイの実施形態の図。 TIL-Raji細胞ベースの効力アッセイの例示的な実施形態のための共培養実験設定。 TIL-Raji共培養アッセイにおける活性化マーカーの表現型発現。 TIL-Raji共培養におけるCD69(Gen2 TIL:301-001)の表現型発現。 IFN-γ分泌レベル(pg/mL)。 グランザイムB分泌レベル(pg/mL)。 IFN-γ及びグランザイムB分泌レベル。 IFN-γ放出の倍率変化:TIL+細胞株/TIL単独。 グランザイムの倍率変化:TIL+細胞株/TIL単独。 サイトカイン放出の倍率変化:TIL+細胞株/TIL単独。 IFN-γ放出の倍率変化:TIL+細胞株/TIL+K562。 グランザイムB放出の倍率変化:TIL+細胞株/TIL+K562。 サイトカイン放出の倍率変化:TIL+細胞株/TIL+K562。 IFN-γ及びグランザイムB分泌の要約表。 MHC優性認識によるTIL活性化を示す、TIL-Raji細胞ベースの効力アッセイの実施形態の概略図。 TIL-Raji細胞ベースの効力アッセイの例示的な実施形態のための共培養実験プレート設定。 任意選択のTIL-K562陰性対照を用いたTIL-Raji共培養アッセイの実施形態の図。 3:1、1:1、及び1:3のTIL:RajiまたはTIL:K562の比の黒色腫TILロットのIFN-γ分泌(pg/mL)。分泌レベル(pg/mL)はy軸に示され、TIL:標的比は、x軸に示される。 3:1、1:1、及び1:3のTIL:RajiまたはTIL:K562の比の黒色腫TILロットのIFN-γ分泌(pg/mL)。分泌レベル(pg/mL)はy軸に示され、TIL:標的比は、x軸に示される。 3:1、1:1、及び1:3のTIL:RajiまたはTIL:K562の比の黒色腫TILロットのIFN-γ分泌(pg/mL)。分泌レベル(pg/mL)はy軸に示され、TIL:標的比は、x軸に示される。 3:1、1:1、及び1:3のTIL:RajiまたはTIL:K562の比の黒色腫TILロットの、TIL単独からのIFN-γ放出に対するTIL+RajiまたはK562細胞についてのIFN-γ放出の倍率変化。倍率変化はy軸に示され、TIL:標的比は、x軸に示される。 3:1、1:1、及び1:3のTIL:RajiまたはTIL:K562の比の黒色腫TILロットの、TIL単独からのIFN-γ放出に対するTIL+RajiまたはK562細胞についてのIFN-γ放出の倍率変化。倍率変化はy軸に示され、TIL:標的比は、x軸に示される。 3:1、1:1、及び1:3のTIL:RajiまたはTIL:K562の比の黒色腫TILロットの、TIL単独からのIFN-γ放出に対するTIL+RajiまたはK562細胞についてのIFN-γ放出の倍率変化。倍率変化はy軸に示され、TIL:標的比は、x軸に示される。 3:1、1:1、及び1:3のTIL:RajiまたはTIL:K562の比の黒色腫TILロットの、TIL+K562細胞からのIFN-γ放出に対するTIL+RajiまたはK562細胞についてのIFN-γ放出の倍率変化。倍率変化はy軸に示され、TIL:標的比は、x軸に示される。 3:1、1:1、及び1:3のTIL:RajiまたはTIL:K562の比の黒色腫TILロットの、TIL+K562細胞からのIFN-γ放出に対するTIL+RajiまたはK562細胞についてのIFN-γ放出の倍率変化。倍率変化はy軸に示され、TIL:標的比は、x軸に示される。 3:1、1:1、及び1:3のTIL:RajiまたはTIL:K562の比の黒色腫TILロットの、TIL+K562細胞からのIFN-γ放出に対するTIL+RajiまたはK562細胞についてのIFN-γ放出の倍率変化。倍率変化はy軸に示され、TIL:標的比は、x軸に示される。 12及び18時間のインキュベーション時間におけるTIL単独に対するTIL+RajiまたはK562細胞についてのIFN-γ放出の倍率変化であり、1:3のTIL:RajiまたはTIL:K562細胞比での累積データセットを示し、*は、0.05以下のp値を示し、**は、0.01以下のp値を示し、***は、0.001以下のp値を示す。 12及び18時間のインキュベーション時間におけるTIL単独またはK562細胞に対するTIL+RajiまたはK562細胞についてのIFN-γ放出の倍率変化であり、1:3のTIL:RajiまたはTIL:K562細胞比での累積データセットを示し、*は、0.05以下のp値を示し、**は、0.01以下のp値を示し、***は、0.001以下のp値を示す。 12及び18時間のインキュベーション時間におけるTIL+K562細胞またはTILに対するTIL+Raji細胞についてのIFN-γ放出の倍率変化であり、1:3のTIL:RajiまたはTIL:K562細胞比での累積データセットを示し、*は、0.05以下のp値を示し、NSは、フルスケールで有意でないことを示す。 12及び18時間のインキュベーション時間におけるTIL+K562細胞またはTILに対するTIL+Raji細胞についてのIFN-γ放出の変化であり、1:3のTIL:RajiまたはTIL:K562細胞比での累積データを示し、より低い倍率変化レベルの詳細を示すように拡張された。 3:1、1:1、及び1:3のTIL:RajiまたはTIL:K562の比の黒色腫TILロットのグランザイムB分泌(pg/mL)。分泌レベル(pg/mL)はy軸に示され、TIL:標的比は、x軸に示される。 3:1、1:1、及び1:3のTIL:RajiまたはTIL:K562の比の黒色腫TILロットのグランザイムB分泌(pg/mL)。分泌レベル(pg/mL)はy軸に示され、TIL:標的比は、x軸に示される。 3:1、1:1、及び1:3のTIL:RajiまたはTIL:K562の比の黒色腫TILロットのグランザイムB分泌(pg/mL)。分泌レベル(pg/mL)はy軸に示され、TIL:標的比は、x軸に示される。 3:1、1:1、及び1:3のTIL:RajiまたはTIL:K562の比の黒色腫TILロットの、TIL単独からのグランザイムB放出に対するTIL+RajiまたはK562細胞についてのグランザイムBの倍率変化。倍率変化はy軸に示され、TIL:標的比は、x軸に示される。 3:1、1:1、及び1:3のTIL:RajiまたはTIL:K562の比の黒色腫TILロットの、TIL単独からのグランザイムB放出に対するTIL+RajiまたはK562細胞についてのグランザイムB放出の倍率変化。倍率変化はy軸に示され、TIL:標的比は、x軸に示される。 3:1、1:1、及び1:3のTIL:RajiまたはTIL:K562の比の黒色腫TILロットの、TIL単独からのグランザイムB放出に対するTIL+RajiまたはK562細胞についてのグランザイムBの倍率変化。倍率変化はy軸に示され、TIL:標的比は、x軸に示される。 3:1、1:1、及び1:3のTIL:RajiまたはTIL:K562の比の黒色腫TILロットの、TIL+K562細胞からのグランザイムB放出に対するTIL+RajiまたはK562細胞についてのグランザイムB放出の倍率変化。倍率変化はy軸に示され、TIL:標的比は、x軸に示される。 3:1、1:1、及び1:3のTIL:RajiまたはTIL:K562の比の黒色腫TILロットの、TIL+K562細胞からのグランザイムB放出に対するTIL+RajiまたはK562細胞についてのグランザイムBの倍率変化。倍率変化はy軸に示され、TIL:標的比は、x軸に示される。 3:1、1:1、及び1:3のTIL:RajiまたはTIL:K562の比の黒色腫TILロットの、TIL+K562細胞からのグランザイムB放出に対するTIL+RajiまたはK562細胞についてのグランザイムB放出の倍率変化。倍率変化はy軸に示され、TIL:標的比は、x軸に示される。 12及び18時間のインキュベーション時間におけるTILのグランザイムB放出(pg/mL/TIL)。 12及び18時間のインキュベーション時間におけるTIL単独に対するTIL+RajiまたはK562細胞についてのグランザイムB放出であり、1:3のTIL:RajiまたはTIL:K562細胞比での累積データセットを示し、***は、0.001以下のp値を示し、****は、0.0001以下のp値を示す。 12及び18時間のインキュベーション時間におけるK562細胞に対するTIL+RajiまたはK562細胞についてのグランザイムB放出であり、1:3のTIL:RajiまたはTIL:K562細胞比での累積データセットを示し、****は、0.0001以下のp値を示す。 12及び18時間のインキュベーション時間におけるTIL+K562細胞またはTILに対するTIL+Raji細胞についてのグランザイムB放出の倍率変化であり、1:3のTIL:RajiまたはTIL:K562細胞比での累積データセットを示し、**は、0.01以下のp値を示し、NSは、有意でないことを示す。 3:1、1:1、及び1:3のTIL:RajiまたはTIL:K562の比の黒色腫TILロットのTNF-α分泌(pg/mL)。分泌レベル(pg/mL)はy軸に示され、TIL:標的比は、x軸に示される。 3:1、1:1、及び1:3のTIL:RajiまたはTIL:K562の比の黒色腫TILロットのTNF-α分泌(pg/mL)。分泌レベル(pg/mL)はy軸に示され、TIL:標的比は、x軸に示される。 3:1、1:1、及び1:3のTIL:RajiまたはTIL:K562の比の黒色腫TILロットのTNF-α分泌(pg/mL)。分泌レベル(pg/mL)はy軸に示され、TIL:標的比は、x軸に示される。 3:1、1:1、及び1:3のTIL:RajiまたはTIL:K562の比の黒色腫TILロットの、TIL単独からのグランザイムB放出に対するTIL+RajiまたはK562細胞についてのTNF-α放出の倍率変化。倍率変化はy軸に示され、TIL:標的比は、x軸に示される。 3:1、1:1、及び1:3のTIL:RajiまたはTIL:K562の比の黒色腫TILロットの、TIL単独からのグランザイムB放出に対するTIL+RajiまたはK562細胞についてのTNF-α放出の倍率変化。倍率変化はy軸に示され、TIL:標的比は、x軸に示される。 3:1、1:1、及び1:3のTIL:RajiまたはTIL:K562の比の黒色腫TILロットの、TIL単独からのグランザイムB放出に対するTIL+RajiまたはK562細胞についてのTNF-αの倍率変化。倍率変化はy軸に示され、TIL:標的比は、x軸に示される。 3:1、1:1、及び1:3のTIL:RajiまたはTIL:K562の比の黒色腫TILロットの、TIL+K562細胞からのグランザイムB放出に対するTIL+RajiまたはK562細胞についてのTNF-α放出の倍率変化。倍率変化はy軸に示され、TIL:標的比は、x軸に示される。 3:1、1:1、及び1:3のTIL:RajiまたはTIL:K562の比の黒色腫TILロットの、TIL+K562細胞からのグランザイムB放出に対するTIL+RajiまたはK562細胞についてのTNF-α放出の倍率変化。倍率変化はy軸に示され、TIL:標的比は、x軸に示される。 3:1、1:1、及び1:3のTIL:RajiまたはTIL:K562の比の黒色腫TILロットの、TIL+K562細胞からのグランザイムB放出に対するTIL+RajiまたはK562細胞についてのTNF-α放出の倍率変化。倍率変化はy軸に示され、TIL:標的比は、x軸に示される。 18時間のインキュベーション時間におけるTIL単独に対するTIL+RajiまたはK562細胞についてのTNF-αの倍率変化であり、1:3のTIL:RajiまたはTIL:K562細胞比での累積データセットを示し、****は、0.0001以下のp値を示す。 18時間のインキュベーション時間におけるK562細胞に対するTIL+RajiまたはK562細胞についてのTNF-α放出のバイルラスタであり、1:3のTIL:RajiまたはTIL:K562細胞比での累積データセットを示し、****は、0.0001以下のp値を示す。 18時間のインキュベーション時間におけるTIL単独またはTIL+K562細胞に対するTIL+Raji細胞についてのTNF-α放出の倍率変化であり、1:3のTIL:RajiまたはTIL:K562細胞比での累積データセットを示し、****は、0.0001以下のp値を示す。 Raji細胞共培養アッセイの実施形態を使用して試験した22個の試料のグランザイムB及びIFN-γ結果の要約表。 任意選択のTIL-K562陰性対照を用いたTIL-Raji共培養アッセイの実施形態の図。 TILロットM1173のアッセイ結果。 TILロットM1152のアッセイ結果。 TILロットM1187のアッセイ結果。 TILロットM1179のアッセイ結果。 TILロットM1183のアッセイ結果。 異なる解凍後回復時間におけるTIL単独に対するTIL+K562またはRaji細胞の倍率変化を示す、IFN-γのサイトカイン分泌結果。 異なる解凍後回復時間におけるTIL+K562細胞に対するTIL+K562またはRaji細胞の倍率変化を示す、IFN-γのサイトカイン分泌結果。 異なる解凍後回復時間におけるTIL単独に対するTIL+K562またはRaji細胞の倍率変化を示す、グランザイムBのサイトカイン分泌結果。 異なる解凍後回復時間におけるTIL+K562細胞に対するTIL+K562またはRaji細胞の倍率変化を示す、グランザイムBのサイトカイン分泌結果。 同種異系認識アッセイの実施形態。 同種異系認識アッセイ検出方法の実施形態。 解凍後状態1の結果(解凍後18~24時間一晩静置した)。試験したエフェクター:標的(E:T)比は、35:1~2.5:1の範囲であり、試験した共培養持続時間は、4時間、8時間、16時間、及び36時間であった。 解凍後状態2の結果(解凍後の静置なし)。試験したエフェクター:標的(E:T)比は、10:1~1:10の範囲であり、共培養持続時間は、一晩(16~24時間)であった。卵巣癌腫瘍(OV8178)及び黒色腫腫瘍(M1203)から産生されたTILを試験した。 TIL-Raji細胞ベースの効力アッセイの例示的な実施形態。 総生細胞(TVC、上部プロット)及び生存率%(下部プロット)対静置時間。 300IU/mLのIL-2の有無にかかわらず、2つのTIL細胞株を用いたRaji及びK562共培養実験の結果であり、IFN-γ分泌(pg/mL)を示す。 300IU/mLのIL-2の有無にかかわらず、2つのTIL細胞株を用いたRaji及びK562共培養実験の結果であり、IFN-γ分泌(倍率変化の単位)を示す。 異なる共培養条件下での2つのTIL細胞株とのRaji及びK562共培養実験の結果であり、IFN-γ分泌(pg/mL)を示す。 異なる共培養条件下での2つのTIL細胞株を用いたRaji及びK562共培養実験の結果であり、IFN-γ分泌(倍率変化の単位)を示す。 TIL解凍後の回復期間が延長されるにつれてサイトカイン分泌効果を評価するための、異なる共培養条件下での2つのTIL細胞株を用いたRaji及びK562の共培養実験の結果であり、IFN-γ分泌(pg/mL)を示す。 TIL解凍後の回復期間が延長されるにつれてサイトカイン分泌効果を評価するための、本発明の実施形態である、異なる共培養条件下での2つのTIL細胞株とのRaji及びK562共培養実験の結果であり、IFN-γ分泌(倍数変化の単位)を示す。 72時間の静置期間における共培養条件の2つの実施形態における、TIL株M1179の親生体集団の残留細胞集団のフローサイトメトリー分析。 Raji細胞株の増殖プロファイル。 K562細胞株の増殖プロファイル。 本発明の実施形態でもある、TIL:腫瘍細胞株共培養アッセイの実験計画の図。 本発明の実施形態である、3つのTIL:標的細胞の比(3:1、1:1、及び1:3)での試験した標的(Raji、Ramos、Thp1及びU937)細胞株及び陰性対照(K562)細胞株(pg/mL、絶対値)のIFN-γ分泌。 本発明の実施形態である、3つのTIL:標的細胞の比(3:1、1:1、及び1:3)での試験した標的(Raji、Ramos、Thp1及びU937)細胞株及び陰性対照(K562)細胞株([TIL+標的]/[TIL単独]の倍率変化)のIFN-γ分泌。 本発明の実施形態である、3つのTIL:標的細胞の比(3:1、1:1、及び1:3)での試験した標的(Raji、Ramos、Thp1及びU937)細胞株及び陰性対照(K562)細胞株([TIL+標的]/[TIL+K562])のIFN-γ分泌。 本発明の実施形態である、3つのTIL:標的細胞の比(3:1、1:1、及び1:3)での試験した標的(Raji、Ramos、Thp1及びU937)細胞株及び陰性対照(K562)細胞株(pg/mL、絶対値)のTNF-α分泌。 本発明の実施形態である、3つのTIL:標的細胞の比(3:1、1:1、及び1:3)での試験した標的(Raji、Ramos、Thp1及びU937)細胞株及び陰性対照(K562)細胞株([TIL+標的]/[TIL単独]の倍率変化)のTNF-α分泌。 本発明の実施形態である、3つのTIL:標的細胞の比(3:1、1:1、及び1:3)での試験した標的(Raji、Ramos、Thp1及びU937)細胞株及び陰性対照(K562)細胞株([TIL+標的]/[TIL+K562])のTNF-α分泌。 本発明の実施形態でもある、TIL:腫瘍細胞株共培養アッセイの実験計画の図。 本発明の実施形態である、試験した標的及び陰性対照(K562)細胞株のIFN-γ分泌(pg/mL)。 本発明の実施形態である、試験した標的及び陰性対照(K562)細胞株のIFN-γ分泌([TIL+標的]/[TIL単独]の倍率変化)。 本発明の実施形態である、試験した標的及び陰性対照(K562)細胞株([TIL+標的]/[TIL+K562]の倍数変化)のIFN-γ分泌。 TIL単独(左パネル)に対するTIL+標的細胞株(または組み合わせ)、及びTIL+K562(右パネル)に対するTIL+標的細胞株(または組み合わせ)の倍率変化の平均及び範囲。 黒色腫TIL株M1152、M1187、M1198、及びM1200についての、組み合わせ標的細胞株を含む、試験した標的及び陰性対照細胞株のTNF-α分泌(pg/mL)。 黒色腫TIL株M1152、M1187、M1198、及びM1200についての、組み合わせ標的細胞株を含む、試験した標的及び陰性対照細胞株のTNF-α分泌([TIL+腫瘍細胞株または組み合わせ]/[TIL単独]の倍率変化)。 黒色腫TIL株M1152、M1187、M1198、及びM1200についての、組み合わせ標的細胞株を含む、試験した標的及び陰性対照細胞株のTNF-α分泌([TIL+腫瘍細胞株または組み合わせ]/[TIL+K562]の倍率変化)。 黒色腫TIL株M1152、M1187、M1198、及びM1200についての、組み合わせ標的細胞株を含む、試験した標的及び陰性対照細胞株のグランザイムB分泌(pg/mL)。 黒色腫TIL株M1152、M1187、M1198、及びM1200についての、組み合わせ標的細胞株を含む、試験した標的及び陰性対照細胞株のグランザイムB分泌([TIL+腫瘍細胞株または組み合わせ]/[TIL単独]の倍率変化)。 黒色腫TIL株M1152、M1187、M1198、及びM1200についての、組み合わせ標的細胞株を含む、試験した標的及び陰性対照細胞株のグランザイムB分泌([TIL+腫瘍細胞株または組み合わせ]/[TIL+K562]の倍率変化)。 本発明の実施形態でもある、TIL:腫瘍細胞株共培養アッセイの実験計画の図。 研究NSCLC TIL株L4253、L4254、L4262、及びL4270についての、組み合わせ標的細胞株を含む、試験した標的及び陰性対照細胞株のIFN-γ分泌(pg/mL)。黒色の点線:3:1 TIL単独。灰色の点線:1:1 TIL単独。 研究NSCLC TIL株L4253、L4254、L4262、及びL4270についての、組み合わせ標的細胞株を含む、試験した標的及びNSCLC細胞株の倍率IFN-γ分泌(TIL+腫瘍細胞株/TIL単独)。 研究NSCLC TIL株L4253、L4254、L4262、及びL4270についての、組み合わせ標的細胞株を含む、試験した標的及びNSCLC細胞株の倍率IFN-γ分泌(TIL+腫瘍細胞株/[TIL+K562])。 臨床NSCLC TIL株1013-304、1036-307、1057-304、1004-303、1057-302、及び1088-303についての、組み合わせ標的細胞株を含む、試験した標的及び陰性対照細胞株のIFN-γ分泌(pg/mL)。黒色の点線:TIL単独。データは、1:1のTIL:標的比で取得した。
臨床NSCLC TIL株1013-304、1036-307、1057-304、1004-303、1057-302、及び1088-303についての、組み合わせ標的細胞株を含む、試験した標的及び陰性対照細胞株の倍率IFN-γ分泌(TIL+腫瘍細胞株/TIL単独)。黒色の点線:TIL単独。データは、1:1のTIL:標的比で取得した。 臨床NSCLC TIL株1013-304、1036-307、1057-304、1004-303、1057-302、及び1088-303についての、組み合わせ標的細胞株を含む、試験した標的及び陰性対照細胞株の倍率IFN-γ分泌(TIL+腫瘍細胞株/[TIL+K562])。黒色の点線:TIL単独。データは、1:1のTIL:標的比で取得した。 臨床NSCLC TIL株1013-304、1036-307、1057-304、1004-303、1057-302、及び1088-303についての、試験した標的及び陰性対照細胞株のIFN-γ分泌(TIL+腫瘍細胞株/TIL単独)の倍率変化の要約。塗りつぶされた赤い記号は、臨床的部分応答を表し、残りの記号は、臨床的に安定した疾患応答を表す。 臨床NSCLC TIL株1013-304、1036-307、1057-304、1004-303、1057-302、及び1088-303についての、試験した標的及び陰性対照細胞株のIFN-γ分泌(TIL+腫瘍細胞株/[TIL+K562])の倍率変化の要約。塗りつぶされた赤い記号は、臨床的部分応答を表し、残りの記号は、臨床的安定した疾患応答を表す。 19の研究及び臨床黒色腫及びNSCLC TIL株についての試験された標的及び陰性対照細胞株についての、IFN-γ分泌(TIL+腫瘍細胞株/TIL単独)の倍率変化の要約。ボックスは、平均のいずれかの側にある1つの標準偏差を表し、これは線で示される。 19の研究及び臨床黒色腫及びNSCLC TIL株についての試験された標的及び陰性対照細胞株についての、IFN-γ分泌(TIL+腫瘍細胞株/[TIL+K562]の倍率変化の要約。ボックスは、平均のいずれかの側にある1つの標準偏差を表し、これは線で示される。 24時間の共培養中のRaji細胞及びK562細胞の増殖(総生細胞、TVC)に対する照射の影響。 2つの子宮頸癌TILロットについて、照射されていないRaji細胞及び照射されたRaji細胞との共培養時の分泌されたIFN-γの濃度。 照射を伴う(「Irr.」)及び照射を伴わない(「Non-irr.」)3つのマーカーについて、フローサイトメトリーによって決定されたK562及びRaji細胞上の表面マーカー発現。 3つの黒色腫、2つの子宮頸部、及び1つのNSCLC TIL株を使用した、TIL単独に対するIFN-γ倍率変化(3重試料)対アッセイ共培養期間(時間)。 本発明の実施形態でもある、TIL:腫瘍細胞株共培養アッセイの実験計画の図。 12の黒色腫TIL株についての1.0×10TVC/ウェルのTIL単独に対する腫瘍細胞株のIFN-γ+TILの平均倍率変化。ボックスは、平均のいずれかの側にある1つの標準偏差を表し、これは線で示される。 12の黒色腫TIL株についての2.0×10TVC/ウェルのTIL単独に対する腫瘍細胞株+TILのIFN-γの平均倍率変化。ボックスは、平均のいずれかの側にある1つの標準偏差を表し、これは線で示される。 12の黒色腫TIL株についての1.0×10TVC/ウェルのK562陰性対照細胞に対する腫瘍細胞株+TILのIFN-γの平均倍率変化。ボックスは、平均のいずれかの側にある1つの標準偏差を表し、これは線で示される。 12の黒色腫TIL株について2.0×10TVC/ウェルのK562陰性対照細胞に対する腫瘍細胞株+TILのIFN-γの平均倍率変化。ボックスは、平均のいずれかの側にある1つの標準偏差を表し、これは線で示される。 本発明の実施形態でもある、野生型(WT)及び遺伝子修飾型の2つのタイプのThp1(THP-1)単球細胞株についてのTIL:腫瘍細胞株共培養アッセイの実験計画の図。 WT及び遺伝子修飾型Thp1標的細胞について取得されたIFN-γ値(pg/mL)の比較。 WT及び遺伝子修飾型Thp1標的細胞について取得されたTIL単独値に対するIFN-γ倍率変化の比較。 ある特定の実施形態における本発明のアッセイの陰性対照である、HLA遮断を示す図。 各単球細胞株について生存率パーセントによって測定される、異なる抗体濃度でのThp1(THP-1)及びU937単球細胞株に対するHLA-I遮断の効果。 各単球細胞株について生存率パーセントによって測定される、異なる抗体濃度でのThp1(THP-1)及びU937単球細胞株に対するHLA-II遮断の効果。 Raji細胞及び遺伝子修飾されたRaji細胞(B2M KO)の生存率パーセントによって測定される、異なる抗体濃度でのRaji細胞に対するHLA-II遮断の効果。 TIL細胞株M1213に対するHLA-I(aMHC I)及びHLA-II(aMHC II)抗体遮断の効果。 TIL細胞株M1214に対するHLA-I(aMHC I)及びHLA-II(aMHC II)抗体遮断の効果。 TIL細胞株PD-LIM-20-08に対するHLA-I(aMHC I)及びHLA-II(aMHC II)抗体遮断の効果。 HLA(MHC)クラスI及びII抗体用量滴定の結果。HLA遮断陰性対照法の実施形態Iは、20μg/mLのHLA-I遮断抗体及び10μg/mLのHLA-II遮断抗体を使用して行った。HLA遮断陰性対照法の実施形態IIは、10μg/mLのHLA-I遮断抗体及び5μg/mLのHLA-II遮断抗体を使用して行った。 各々が3回行われた、抗HLA-I抗体(αMHC Iと表記される)及び抗HLA-II抗体(αMHC IIと表記される)の添加時の10個のTIL株からのバックグラウンドIFN-γ分泌の結果。実施形態I及び実施形態IIは、それぞれ、図173及び図184に示され、本明細書の他の箇所に記載される実験実施形態を指し、実施形態Iについては20μg/mLのHLA-I遮断抗体及び10μg/mLのHLA-II遮断抗体、ならびに実施形態IIについては10μg/mLのHLA-I遮断抗体及び5μg/mLのHLA-II遮断抗体の使用を含む。 陰性対照細胞株の代わりにHLA遮断抗体を陰性対照として使用する、TIL:腫瘍細胞株共培養アッセイの実験計画の図であり、これらのアッセイは、本明細書では、該当する場合「実施形態I」と総称され、本発明の実施形態でもある。 IFN-γのpg/mLとして報告される、標的細胞及び対照としてのK562細胞と共培養された黒色腫TIL株M1152のHLA遮断陰性対照実験の結果。 IFN-γのpg/mLとして報告される、標的細胞及び対照としてのK562細胞と共培養された黒色腫TIL株M1187のHLA遮断陰性対照実験の結果。 IFN-γのpg/mLとして報告される、標的細胞及び対照としてのK562細胞と共培養された黒色腫TIL株M1164のHLA遮断陰性対照実験の結果。 IFN-γのpg/mLとして報告される、標的細胞及び対照としてのK562細胞と共培養された黒色腫TIL株M1213のHLA遮断陰性対照実験の結果。 IFN-γのpg/mLとして報告される、標的細胞及び対照としてのK562細胞と共培養された黒色腫TIL株M1214のHLA遮断陰性対照実験の結果。 TIL単独に対するIFN-γ放出の倍率増強として報告される、標的細胞及び対照としてのK562細胞と共培養された黒色腫TIL株M1152のHLA遮断陰性対照実験の結果。 TIL単独に対するIFN-γ放出の倍率増強として報告される、標的細胞及び対照としてのK562細胞と共培養された黒色腫TIL株M1187のHLA遮断陰性対照実験の結果。 TIL単独に対するIFN-γ放出の倍率増強として報告される、標的細胞及び対照としてのK562細胞と共培養された黒色腫TIL株M1164のHLA遮断陰性対照実験の結果。 TIL単独に対するIFN-γ放出の倍率増強として報告される、標的細胞及び対照としてのK562細胞と共培養された黒色腫TIL株M1213のHLA遮断陰性対照実験の結果。 TIL単独に対するIFN-γ放出の倍率増強として報告される、標的細胞及び対照としてのK562細胞と共培養された黒色腫TIL株M1214のHLA遮断陰性対照実験の結果。 陰性対照細胞株の代わりにHLA遮断抗体を陰性対照として使用する、TIL:腫瘍細胞株共培養アッセイの実験計画の図であり、これらのアッセイは、本明細書では、該当する場合「実施形態II」と総称され、本発明の実施形態でもある。 IFN-γのpg/mLとして報告される、標的細胞及び対照としてのK562細胞と共培養された黒色腫TIL株M1161のHLA遮断陰性対照実験の結果。M1161のCD4集団及びCD8集団は、フローサイトメトリーによってそれぞれ1.4%及び97.6%であることが決定された。 IFN-γのpg/mLとして報告される、標的細胞及び対照としてのK562細胞と共培養された黒色腫TIL株M1163のHLA遮断陰性対照実験の結果。M1163のCD4集団及びCD8集団を、フローサイトメトリーによってそれぞれ60.6%及び34.9%であることが決定された。 IFN-γのpg/mLとして報告される、標的細胞及び対照としてのK562細胞と共培養された黒色腫TIL株M1172のHLA遮断陰性対照実験の結果。M1172のCD4集団及びCD8集団は、フローサイトメトリーによってそれぞれ71.8%及び22.2%であることが決定された。 IFN-γのpg/mLとして報告される、標的細胞及び対照としてのK562細胞と共培養された黒色腫TIL株M1173のHLA遮断陰性対照実験の結果。M1173のCD4集団及びCD8集団を、フローサイトメトリーによってそれぞれ13.4%及び81.6%であることが決定された。 IFN-γのpg/mLとして報告される、標的細胞及び対照としてのK562細胞と共培養された黒色腫TIL株M1174のHLA遮断陰性対照実験の結果。M1174のCD4集団及びCD8集団は、フローサイトメトリーによってそれぞれ92.3%及び6.2%であることが決定された。 TIL単独に対するIFN-γ放出の倍率増強として報告される、標的細胞及び対照としてのK562細胞と共培養された黒色腫TIL株M1161のHLA遮断陰性対照実験の結果。M1161のCD4集団及びCD8集団は、フローサイトメトリーによってそれぞれ1.4%及び97.6%であることが決定された。 TIL単独に対するIFN-γ放出の倍率増強として報告される、標的細胞及び対照としてのK562細胞と共培養された黒色腫TIL株M1163のHLA遮断陰性対照実験の結果。M1163のCD4集団及びCD8集団を、フローサイトメトリーによってそれぞれ60.6%及び34.9%であることが決定された。 TIL単独に対するIFN-γ放出の倍率増強として報告される、標的細胞及び対照としてのK562細胞と共培養された黒色腫TIL株M1172のHLA遮断陰性対照実験の結果。M1172のCD4集団及びCD8集団は、フローサイトメトリーによってそれぞれ71.8%及び22.2%であることが決定された。 TIL単独に対するIFN-γ放出の倍率増強として報告される、標的細胞及び対照としてのK562細胞と共培養された黒色腫TIL株M1173のHLA遮断陰性対照実験の結果。M1173のCD4集団及びCD8集団を、フローサイトメトリーによってそれぞれ13.4%及び81.6%であることが決定された。 TIL単独に対するIFN-γ放出の倍率増強として報告される、標的細胞及び対照としてのK562細胞と共培養された黒色腫TIL株M1174のHLA遮断陰性対照実験の結果。M1174のCD4集団及びCD8集団は、フローサイトメトリーによってそれぞれ92.3%及び6.2%であることが決定された。 陰性対照細胞株の代わりに、またはTIL単独対照実験に加えて、HLA遮断抗体を陰性対照として使用する、TIL:腫瘍細胞株共培養アッセイの実験計画の図であり、これらのアッセイのすべてもまた、本発明の実施形態である。15個の黒色腫細胞株が使用される。 U937標的細胞と共培養した15個の黒色腫TIL株のHLA遮断陰性対照実験の結果。 Thp1(THP-1)標的細胞と共培養した15個の黒色腫TIL株のHLA遮断陰性対照実験の結果。 Thp1細胞に対する有効TIL濃度の決定。星は、2×10TVCでの3:1のTIL:Thp1比を示す。 U937細胞に対する有効TIL濃度の決定。星は、2×10TVCでの3:1のTIL:U937比を示す。 Thp1及びU937標的細胞を使用した、3つのTILロット(M1164、M1163、及びM1169)の用量反応曲線。 Thp1及びU937標的細胞を使用した、3つの追加のTILロット(M1218、M1174、及びM1150A)の用量反応曲線。 U937標的細胞を使用した、6つのTILロットの平行線分析。6つのTILはすべて、明確な用量反応を示す。 Thp1標的細胞を使用した、6つのTILロットの平行線分析。TIL M1173及びTIL M1213は、明確な用量反応を示す。 U937標的細胞を使用した、HLA遮断抗体の有無にかかわらず1.5×10TIL濃度での3つのTILロット(M1145、M1161、及びM1173)の用量反応曲線。3つのTILロットはすべて、明確な用量反応を示し、また抗体処置によるシグナルの完全な阻害(特異的阻害)を示す。 U937標的細胞を使用した、HLA遮断抗体の有無にかかわらず1.5×10TIL濃度での3つのTILロット(M1197、M1213、及びM1214)の用量反応曲線。3つのTILロットはすべて、明確な用量反応を示し、また抗体処置によるシグナルの完全な阻害(特異的阻害)を示す。 黒色腫TIL臨床試料についての、フローサイトメトリーによるLAG3発現のヒストグラム。 黒色腫TIL臨床試料についての、フローサイトメトリーによるKLRG1発現のヒストグラム。 U937アロ反応性共培養アッセイを使用した、28個の過去の臨床ロットの相対効力に関するヒストグラムの対数分布評価。各TILロットについて計算された相対効力測定値を対数変換したところ、得られた分布は正規分布であり、基礎となる分布が対数正規分布であることを示す。 REP中にU937細胞または同種異系PBMCとインキュベートしたTILの拡張。 U937細胞または同種異系PBMCによるREP後に、抗CD3及び抗CD28ビーズで刺激されたTILにおけるIFN-γ分泌。 T細胞効力試験のための、本発明のアロ反応性共培養アッセイ(「allo-pMHC-TCR相互作用誘導T細胞」と表示される)の実施形態と、従来の抗体ビーズベースのアッセイとの比較。
配列表の簡単な説明
配列番号1は、ムロモナブの重鎖のアミノ酸配列である。
配列番号2は、ムロモナブの軽鎖のアミノ酸配列である。
配列番号3は、組換えヒトIL-2タンパク質のアミノ酸配列である。
配列番号4は、アルデスロイキンのアミノ酸配列である。
配列番号5は、IL-2形態である。
配列番号6は、IL-2形態である。
配列番号7は、IL-2形態である。
配列番号8は、ムチンドメインポリペプチドである。
配列番号9は、組換えヒトIL-4タンパク質のアミノ酸配列である。
配列番号10は、組換えヒトIL-7タンパク質のアミノ酸配列である。
配列番号11は、組換えヒトIL-15タンパク質のアミノ酸配列である。
配列番号12は、組換えヒトIL-21タンパク質のアミノ酸配列である。
配列番号13は、IL-2配列である。
配列番号14は、IL-2ムテイン配列である。
配列番号15は、IL-2ムテイン配列である。
配列番号16は、IgG.IL2R67A.H1のHCDR1_IL-2である。
配列番号17は、IgG.IL2R67A.H1のHCDR2である。
配列番号18は、IgG.IL2R67A.H1のHCDR3である。
配列番号19は、IgG.IL2R67A.H1のHCDR1_IL-2カバットである。
配列番号20は、IgG.IL2R67A.H1のHCDR2カバットである。
配列番号21は、IgG.IL2R67A.H1のHCDR3カバットである。
配列番号22は、IgG.IL2R67A.H1のHCDR1_IL-2クロチアである。
配列番号23は、IgG.IL2R67A.H1のHCDR2クロチアである。
配列番号24は、IgG.IL2R67A.H1のHCDR3クロチアである。
配列番号25は、IgG.IL2R67A.H1のHCDR1_IL-2 IMGTである。
配列番号26は、IgG.IL2R67A.H1のHCDR2 IMGTである。
配列番号27は、IgG.IL2R67A.H1のHCDR3 IMGTである。
配列番号28は、IgG.IL2R67A.H1のV鎖である。
配列番号29は、IgG.IL2R67A.H1の重鎖である。
配列番号30は、IgG.IL2R67A.H1のLCDR1カバットである。
配列番号31は、IgG.IL2R67A.H1のLCDR2カバットである。
配列番号32は、IgG.IL2R67A.H1のLCDR3カバットである。
配列番号33は、IgG.IL2R67A.H1のLCDR1 chothiaである。
配列番号34は、IgG.IL2R67A.H1のLCDR2 chothiaである。
配列番号35は、IgG.IL2R67A.H1のLCDR3 chothiaである。
配列番号36は、V鎖である。
配列番号37は、軽鎖である。
配列番号38は、軽鎖である。
配列番号39は、軽鎖である。
配列番号40は、ヒト4-1BBのアミノ酸配列である。
配列番号41は、マウス4-1BBのアミノ酸配列である。
配列番号42は、4-1BBアゴニストモノクローナル抗体ウトミルマブ(PF-05082566)の重鎖である。
配列番号43は、4-1BBアゴニストモノクローナル抗体ウトミルマブ(PF-05082566)の軽鎖である。
配列番号44は、4-1BBアゴニストモノクローナル抗体ウトミルマブ(PF-05082566)の重鎖可変領域(V)である。
配列番号45は、4-1BBアゴニストモノクローナル抗体ウトミルマブ(PF-05082566)の軽鎖可変領域(V)である。
配列番号46は、4-1BBアゴニストモノクローナル抗体ウトミルマブ(PF-05082566)の重鎖CDR1である。
配列番号47は、4-1BBアゴニストモノクローナル抗体ウトミルマブ(PF-05082566)の重鎖CDR2である。
配列番号48は、4-1BBアゴニストモノクローナル抗体ウトミルマブ(PF-05082566)の重鎖CDR3である。
配列番号49は、4-1BBアゴニストモノクローナル抗体ウトミルマブ(PF-05082566)の軽鎖CDR1である。
配列番号50は、4-1BBアゴニストモノクローナル抗体ウトミルマブ(PF-05082566)の軽鎖CDR2である。
配列番号51は、4-1BBアゴニストモノクローナル抗体ウトミルマブ(PF-05082566)の軽鎖CDR3である。
配列番号52は、4-1BBアゴニストモノクローナル抗体ウレルマブ(BMS-663513)の重鎖である。
配列番号53は、4-1BBアゴニストモノクローナル抗体ウレルマブ(BMS-663513)の軽鎖である。
配列番号54は、4-1BBアゴニストモノクローナル抗体ウレルマブ(BMS-663513)の重鎖可変領域(VH)である。
配列番号55は、4-1BBアゴニストモノクローナル抗体ウレルマブ(BMS-663513)の軽鎖可変領域(VL)である。
配列番号56は、4-1BBアゴニストモノクローナル抗体ウレルマブ(BMS-663513)の重鎖CDR1である。
配列番号57は、4-1BBアゴニストモノクローナル抗体ウレルマブ(BMS-663513)の重鎖CDR2である。
配列番号58は、4-1BBアゴニストモノクローナル抗体ウレルマブ(BMS-663513)の重鎖CDR3である。
配列番号59は、4-1BBアゴニストモノクローナル抗体ウレルマブ(BMS-663513)の軽鎖CDR1である。
配列番号60は、4-1BBアゴニストモノクローナル抗体ウレルマブ(BMS-663513)の軽鎖CDR2である。
配列番号61は、4-1BBアゴニストモノクローナル抗体ウレルマブ(BMS-663513)の軽鎖CDR3である。
配列番号62は、TNFRSFアゴニスト融合タンパク質のFcドメインである。
配列番号63は、TNFRSFアゴニスト融合タンパク質のリンカーである。
配列番号64は、TNFRSFアゴニスト融合タンパク質のリンカーである。
配列番号65は、TNFRSFアゴニスト融合タンパク質のリンカーである。
配列番号66は、TNFRSFアゴニスト融合タンパク質のリンカーである。
配列番号67は、TNFRSFアゴニスト融合タンパク質のリンカーである。
配列番号68は、TNFRSFアゴニスト融合タンパク質のリンカーである。
配列番号69は、TNFRSFアゴニスト融合タンパク質のリンカーである。
配列番号70は、TNFRSFアゴニスト融合タンパク質のリンカーである。
配列番号71は、TNFRSFアゴニスト融合タンパク質のリンカーである。
配列番号72は、TNFRSFアゴニスト融合タンパク質のリンカーである。
配列番号73は、TNFRSFアゴニスト融合タンパク質のFcドメインである。
配列番号74は、TNFRSFアゴニスト融合タンパク質のリンカーである。
配列番号75は、TNFRSFアゴニスト融合タンパク質のリンカーである。
配列番号76は、TNFRSFアゴニスト融合タンパク質のリンカーである。
配列番号77は、4-1BBリガンド(4-1BBL)アミノ酸配列である。
配列番号78は、4-1BBLポリペプチドの可溶性部分である。
配列番号79は、4-1BBアゴニスト抗体4B4-1-1バージョン1の重鎖可変領域(V)である。
配列番号80は、4-1BBアゴニスト抗体4B4-1-1バージョン1の軽鎖可変領域(V)である。
配列番号81は、4-1BBアゴニスト抗体4B4-1-1バージョン2の重鎖可変領域(V)である。
配列番号82は、4-1BBアゴニスト抗体4B4-1-1バージョン2の軽鎖可変領域(V)である。
配列番号83は、4-1BBアゴニスト抗体H39E3-2の重鎖可変領域(V)である。
配列番号84は、4-1BBアゴニスト抗体H39E3-2の軽鎖可変領域(V)である。
配列番号85は、ヒトOX40のアミノ酸配列である。
配列番号86は、マウスOX40のアミノ酸配列である。
配列番号87は、OX40アゴニストモノクローナル抗体タボリキシズマブ(MEDI-0562)の重鎖である。
配列番号88は、OX40アゴニストモノクローナル抗体タボリキシズマブ(MEDI-0562)の軽鎖である。
配列番号89は、OX40アゴニストモノクローナル抗体タボリキシズマブ(MEDI-0562)の重鎖可変領域(V)である。
配列番号90は、OX40アゴニストモノクローナル抗体タボリキシズマブ(MEDI-0562)の軽鎖可変領域(V)である。
配列番号91は、OX40アゴニストモノクローナル抗体タボリキシズマブ(MEDI-0562)の重鎖CDR1である。
配列番号92は、OX40アゴニストモノクローナル抗体タボリキシズマブ(MEDI-0562)の重鎖CDR2である。
配列番号93は、OX40アゴニストモノクローナル抗体タボリキシズマブ(MEDI-0562)の重鎖CDR3である。
配列番号94は、OX40アゴニストモノクローナル抗体タボリキシズマブ(MEDI-0562)の軽鎖CDR1である。
配列番号95は、OX40アゴニストモノクローナル抗体タボリキシズマブ(MEDI-0562)の軽鎖CDR2である。
配列番号96は、OX40アゴニストモノクローナル抗体タボリキシズマブ(MEDI-0562)の軽鎖CDR3である。
配列番号97は、OX40アゴニストモノクローナル抗体11D4の重鎖である。
配列番号98は、OX40アゴニストモノクローナル抗体11D4の軽鎖である。
配列番号99は、OX40アゴニストモノクローナル抗体11D4の重鎖可変領域(V)である。
配列番号100は、OX40アゴニストモノクローナル抗体11D4の軽鎖可変領域(V)である。
配列番号101は、OX40アゴニストモノクローナル抗体11D4の重鎖CDR1である。
配列番号102は、OX40アゴニストモノクローナル抗体11D4の重鎖CDR2である。
配列番号103は、OX40アゴニストモノクローナル抗体11D4の重鎖CDR3である。
配列番号104は、OX40アゴニストモノクローナル抗体11D4の軽鎖CDR1である。
配列番号105は、OX40アゴニストモノクローナル抗体11D4の軽鎖CDR2である。
配列番号106は、OX40アゴニストモノクローナル抗体11D4の軽鎖CDR3である。
配列番号107は、OX40アゴニストモノクローナル抗体18D8の重鎖である。
配列番号108は、OX40アゴニストモノクローナル抗体18D8の軽鎖である。
配列番号109は、OX40アゴニストモノクローナル抗体18D8の重鎖可変領域(V)である。
配列番号110は、OX40アゴニストモノクローナル抗体18D8の軽鎖可変領域(V)である。
配列番号111は、OX40アゴニストモノクローナル抗体18D8の重鎖CDR1である。
配列番号112は、OX40アゴニストモノクローナル抗体18D8の重鎖CDR2である。
配列番号113は、OX40アゴニストモノクローナル抗体18D8の重鎖CDR3である。
配列番号114は、OX40アゴニストモノクローナル抗体18D8の軽鎖CDR1である。
配列番号115は、OX40アゴニストモノクローナル抗体18D8の軽鎖CDR2である。
配列番号116は、OX40アゴニストモノクローナル抗体18D8の軽鎖CDR3である。
配列番号117は、OX40アゴニストモノクローナル抗体Hu119-122の重鎖可変領域(V)である。
配列番号118は、OX40アゴニストモノクローナル抗体Hu119-122の軽鎖可変領域(V)である。
配列番号119は、OX40アゴニストモノクローナル抗体Hu119-122の重鎖CDR1である。
配列番号120は、OX40アゴニストモノクローナル抗体Hu119-122の重鎖CDR2である。
配列番号121は、OX40アゴニストモノクローナル抗体Hu119-122の重鎖CDR3である。
配列番号122は、OX40アゴニストモノクローナル抗体Hu119-122の軽鎖CDR1である。
配列番号123は、OX40アゴニストモノクローナル抗体Hu119-122の軽鎖CDR2である。
配列番号124は、OX40アゴニストモノクローナル抗体Hu119-122の軽鎖CDR3である。
配列番号125は、OX40アゴニストモノクローナル抗体Hu106-222の重鎖可変領域(V)である。
配列番号126は、OX40アゴニストモノクローナル抗体Hu106-222の軽鎖可変領域(V)である。
配列番号127は、OX40アゴニストモノクローナル抗体Hu106-222の重鎖CDR1である。
配列番号128は、OX40アゴニストモノクローナル抗体Hu106-222の重鎖CDR2である。
配列番号129は、OX40アゴニストモノクローナル抗体Hu106-222の重鎖CDR3である。
配列番号130は、OX40アゴニストモノクローナル抗体Hu106-222の軽鎖CDR1である。
配列番号131は、OX40アゴニストモノクローナル抗体Hu106-222の軽鎖CDR2である。
配列番号132は、OX40アゴニストモノクローナル抗体Hu106-222の軽鎖CDR3である。
配列番号133は、OX40リガンド(OX40L)アミノ酸配列である。
配列番号134は、OX40Lポリペプチドの可溶性部分である。
配列番号135は、OX40Lポリペプチドの代替可溶性部分である。
配列番号136は、OX40アゴニストモノクローナル抗体008の重鎖可変領域(V)である。
配列番号137は、OX40アゴニストモノクローナル抗体008の軽鎖可変領域(V)である。
配列番号138は、OX40アゴニストモノクローナル抗体011の重鎖可変領域(V)である。
配列番号139は、OX40アゴニストモノクローナル抗体011の軽鎖可変領域(V)である。
配列番号140は、OX40アゴニストモノクローナル抗体021の重鎖可変領域(V)である。
配列番号141は、OX40アゴニストモノクローナル抗体021の軽鎖可変領域(V)である。
配列番号142は、OX40アゴニストモノクローナル抗体023の重鎖可変領域(V)である。
配列番号143は、OX40アゴニストモノクローナル抗体023の軽鎖可変領域(V)である。
配列番号144は、OX40アゴニストモノクローナル抗体の重鎖可変領域(V)である。
配列番号145は、OX40アゴニストモノクローナル抗体の軽鎖可変領域(V)である。
配列番号146は、OX40アゴニストモノクローナル抗体の重鎖可変領域(V)である。
配列番号147は、OX40アゴニストモノクローナル抗体の軽鎖可変領域(V)である。
配列番号148は、ヒト化OX40アゴニストモノクローナル抗体の重鎖可変領域(V)である。
配列番号149は、ヒト化OX40アゴニストモノクローナル抗体の重鎖可変領域(V)である。
配列番号150は、ヒト化OX40アゴニストモノクローナル抗体の軽鎖可変領域(V)である。
配列番号151は、ヒト化OX40アゴニストモノクローナル抗体の軽鎖可変領域(V)である。
配列番号152は、ヒト化OX40アゴニストモノクローナル抗体の重鎖可変領域(V)である。
配列番号153は、ヒト化OX40アゴニストモノクローナル抗体の重鎖可変領域(V)である。
配列番号154は、ヒト化OX40アゴニストモノクローナル抗体の軽鎖可変領域(V)である。
配列番号155は、ヒト化OX40アゴニストモノクローナル抗体の軽鎖可変領域(V)である。
配列番号156は、OX40アゴニストモノクローナル抗体の重鎖可変領域(V)である。
配列番号157は、OX40アゴニストモノクローナル抗体の軽鎖可変領域(V)である。
配列番号158は、PD-1阻害剤ニボルマブの重鎖アミノ酸配列である。
配列番号159は、PD-1阻害剤ニボルマブの軽鎖アミノ酸配列である。
配列番号160は、PD-1阻害剤ニボルマブの重鎖可変領域(V)アミノ酸配列である。
配列番号161は、PD-1阻害剤ニボルマブの軽鎖可変領域(V)アミノ酸配列である。
配列番号162は、PD-1阻害剤ニボルマブの重鎖CDR1アミノ酸配列である。
配列番号163は、PD-1阻害剤ニボルマブの重鎖CDR2アミノ酸配列である。
配列番号164は、PD-1阻害剤ニボルマブの重鎖CDR3アミノ酸配列である。
配列番号165は、PD-1阻害剤ニボルマブの軽鎖CDR1アミノ酸配列である。
配列番号166は、PD-1阻害剤ニボルマブの軽鎖CDR2アミノ酸配列である。
配列番号167は、PD-1阻害剤ニボルマブの軽鎖CDR3アミノ酸配列である。
配列番号168は、PD-1阻害剤ペムブロリズマブの重鎖アミノ酸配列である。
配列番号169は、PD-1阻害剤ペムブロリズマブの軽鎖アミノ酸配列である。
配列番号170は、PD-1阻害剤ペムブロリズマブの重鎖可変領域(V)アミノ酸配列である。
配列番号171は、PD-1阻害剤ペムブロリズマブの軽鎖可変領域(V)アミノ酸配列である。
配列番号172は、PD-1阻害剤ペムブロリズマブの重鎖CDR1アミノ酸配列である。
配列番号173は、PD-1阻害剤ペムブロリズマブの重鎖CDR2アミノ酸配列である。
配列番号174は、PD-1阻害剤ペムブロリズマブの重鎖CDR3アミノ酸配列である。
配列番号175は、PD-1阻害剤ペムブロリズマブの軽鎖CDR1アミノ酸配列である。
配列番号176は、PD-1阻害剤ペムブロリズマブの軽鎖CDR2アミノ酸配列である。
配列番号177は、PD-1阻害剤ペムブロリズマブの軽鎖CDR3アミノ酸配列である。
配列番号178は、PD-L1阻害剤デュルバルマブの重鎖アミノ酸配列である。
配列番号179は、PD-L1阻害剤デュルバルマブの軽鎖アミノ酸配列である。
配列番号180は、PD-L1阻害剤デュルバルマブの重鎖可変領域(V)アミノ酸配列である。
配列番号181は、PD-L1阻害剤デュルバルマブの軽鎖可変領域(V)アミノ酸配列である。
配列番号182は、PD-L1阻害剤デュルバルマブの重鎖CDR1アミノ酸配列である。
配列番号183は、PD-L1阻害剤デュルバルマブの重鎖CDR2アミノ酸配列である。
配列番号184は、PD-L1阻害剤デュルバルマブの重鎖CDR3アミノ酸配列である。
配列番号185は、PD-L1阻害剤デュルバルマブの軽鎖CDR1アミノ酸配列である。
配列番号186は、PD-L1阻害剤デュルバルマブの軽鎖CDR2アミノ酸配列である。
配列番号187は、PD-L1阻害剤デュルバルマブの軽鎖CDR3アミノ酸配列である。
配列番号188は、PD-L1阻害剤アベルマブの重鎖アミノ酸配列である。
配列番号189は、PD-L1阻害剤アベルマブの軽鎖アミノ酸配列である。
配列番号190は、PD-L1阻害剤アベルマブの重鎖可変領域(V)アミノ酸配列である。
配列番号191は、PD-L1阻害剤アベルマブの軽鎖可変領域(V)アミノ酸配列である。
配列番号192は、PD-L1阻害剤アベルマブの重鎖CDR1アミノ酸配列である。
配列番号193は、PD-L1阻害剤アベルマブの重鎖CDR2アミノ酸配列である。
配列番号194は、PD-L1阻害剤アベルマブの重鎖CDR3アミノ酸配列である。
配列番号195は、PD-L1阻害剤アベルマブの軽鎖CDR1アミノ酸配列である。
配列番号196は、PD-L1阻害剤アベルマブの軽鎖CDR2アミノ酸配列である。
配列番号197は、PD-L1阻害剤アベルマブの軽鎖CDR3アミノ酸配列である。
配列番号198は、PD-L1阻害剤アテゾリズマブの重鎖アミノ酸配列である。
配列番号199は、PD-L1阻害剤アテゾリズマブの軽鎖アミノ酸配列である。
配列番号200は、PD-L1阻害剤アテゾリズマブの重鎖可変領域(V)アミノ酸配列である。
配列番号201は、PD-L1阻害剤アテゾリズマブの軽鎖可変領域(V)アミノ酸配列である。
配列番号202は、PD-L1阻害剤アテゾリズマブの重鎖CDR1アミノ酸配列である。
配列番号203は、PD-L1阻害剤アテゾリズマブの重鎖CDR2アミノ酸配列である。
配列番号204は、PD-L1阻害剤アテゾリズマブの重鎖CDR3アミノ酸配列である。
配列番号205は、PD-L1阻害剤アテゾリズマブの軽鎖CDR1アミノ酸配列である。
配列番号206は、PD-L1阻害剤アテゾリズマブの軽鎖CDR2アミノ酸配列である。
配列番号207は、PD-L1阻害剤アテゾリズマブの軽鎖CDR3アミノ酸配列である。
配列番号208は、CTLA-4阻害剤イピリムマブの重鎖アミノ酸配列である。
配列番号209は、CTLA-4阻害剤イピリムマブの軽鎖アミノ酸配列である。
配列番号210は、CTLA-4阻害剤イピリムマブの重鎖可変領域(V)アミノ酸配列である。
配列番号211は、CTLA-4阻害剤イピリムマブの軽鎖可変領域(V)アミノ酸配列である。
配列番号212は、CTLA-4阻害剤イピリムマブの重鎖CDR1アミノ酸配列である。
配列番号213は、CTLA-4阻害剤イピリムマブの重鎖CDR2アミノ酸配列である。
配列番号214は、CTLA-4阻害剤イピリムマブの重鎖CDR3アミノ酸配列である。
配列番号215は、CTLA-4阻害剤イピリムマブの軽鎖CDR1アミノ酸配列である。
配列番号216は、CTLA-4阻害剤イピリムマブの軽鎖CDR2アミノ酸配列である。
配列番号217は、CTLA-4阻害剤イピリムマブの軽鎖CDR3アミノ酸配列である。
配列番号218は、CTLA-4阻害剤トレメリムマブの重鎖アミノ酸配列である。
配列番号219は、CTLA-4阻害剤トレメリムマブの軽鎖アミノ酸配列である。
配列番号220は、CTLA-4阻害剤トレメリムマブの重鎖可変領域(V)アミノ酸配列である。
配列番号221は、CTLA-4阻害剤トレメリムマブの軽鎖可変領域(V)アミノ酸配列である。
配列番号222は、CTLA-4阻害剤トレメリムマブの重鎖CDR1アミノ酸配列である。
配列番号223は、CTLA-4阻害剤トレメリムマブの重鎖CDR2アミノ酸配列である。
配列番号224は、CTLA-4阻害剤トレメリムマブの重鎖CDR3アミノ酸配列である。
配列番号225は、CTLA-4阻害剤トレメリムマブの軽鎖CDR1アミノ酸配列である。
配列番号226は、CTLA-4阻害剤トレメリムマブの軽鎖CDR2アミノ酸配列である。
配列番号227は、CTLA-4阻害剤トレメリムマブの軽鎖CDR3アミノ酸配列である。
配列番号228は、CTLA-4阻害剤ザリフレリマブの重鎖アミノ酸配列である。
配列番号229は、CTLA-4阻害剤ザリフレリマブの軽鎖アミノ酸配列である。
配列番号230は、CTLA-4阻害剤ザリフレリマブの重鎖可変領域(V)アミノ酸配列である。
配列番号231は、CTLA-4阻害剤ザリフレリマブの軽鎖可変領域(V)アミノ酸配列である。
配列番号232は、CTLA-4阻害剤ザリフレリマブの重鎖CDR1アミノ酸配列である。
配列番号233は、CTLA-4阻害剤ザリフレリマブの重鎖CDR2アミノ酸配列である。
配列番号234は、CTLA-4阻害剤ザリフレリマブの重鎖CDR3アミノ酸配列である。
配列番号235は、CTLA-4阻害剤ザリフレリマブの軽鎖CDR1アミノ酸配列である。
配列番号236は、CTLA-4阻害剤ザリフレリマブの軽鎖CDR2アミノ酸配列である。
配列番号237は、CTLA-4阻害剤ザリフレリマブの軽鎖CDR3アミノ酸配列である。
I.導入
急速拡張プロトコル(REP)によってエクスビボで培養されたTILを利用した養子細胞療法は、黒色腫などのがんを有する患者の宿主免疫抑制後の養子細胞療法に成功している。現在の注入受容パラメータは、TIL(例えば、CD28、CD8、またはCD4陽性)の組成の読み取り値、ビーズベースの効力アッセイ(IFN-γなど)における刺激時の様々なサイトカイン及び他のマーカーの発現、ならびにREP製品の拡張及び生存率の数値倍率に依存している。当該技術分野で知られているアッセイと比較して、とりわけ、優れた性能、T細胞製品の効力に対するより良い制御、及び生物学的関連性の増加といった改善を提供することができる、効力アッセイが本明細書に記載される。
II.定義
他に定義されない限り、本明細書で使用されるすべての技術用語及び科学用語は、本発明が属する技術分野の当業者によって一般に理解される意味と同じである。本明細書で参照されるすべての特許及び刊行物は、参照によりそれらの全体が組み込まれる。
本明細書で使用される「同時投与」、「同時投与すること」、「組み合わせて投与される」、「組み合わせて投与すること」、「同時(simultaneous)」、及び「同時(concurrent)」という用語は、対象または患者への2つ以上の医薬品有効成分(本発明の好ましい実施形態では、例えば、複数のTIL)の投与を包含し、医薬品有効成分及び/またはそれらの代謝物の両方が、対象または患者において同時に存在するようにする。同時投与には、別個の組成物での同時投与、別個の組成物での異なる時間での投与、または2つ以上の医薬品有効成分が存在する組成物での投与が含まれる。別個の組成物での同時投与及び両方の薬剤が存在する組成物での投与が好ましい。
「インビボ」という用語は、対象の体内または患者の体内で起こる事象を指す。
「インビトロ」という用語は、対象の体外または患者の体外で起こる事象を指す。インビトロアッセイには、生きている細胞または死んでいる細胞が用いられる細胞ベースのアッセイが包含され、無傷の細胞が用いられない無細胞アッセイも含み得る。
「エクスビボ」という用語は、対象の体または患者の体から除去された細胞、組織、及び/または器官に対して治療または処置を行うことを伴う事象を指す。適切には、細胞、組織、及び/または器官は、外科手術または治療の方法で対象の体または患者の体に戻され得る。
「急速拡張」という用語は、1週間の期間にわたって少なくとも約3倍(または4、5、6、7、8、もしくは9倍)、より好ましくは1週間の期間にわたって少なくとも約10倍(または20、30、40、50、60、70、80、もしくは90倍)、あるいは最も好ましくは1週間の期間にわたって少なくとも約100倍の抗原特異的TILの数の増加を意味する。本明細書では、いくつかの急速拡張プロトコルが説明されている。
本明細書における「腫瘍浸潤リンパ球」または「TIL」とは、対象の血流を離れて腫瘍に移動した白血球として最初に取得された細胞の集団を意味する。TILには、CD8+細胞傷害性T細胞(リンパ球)、Th1及びTh17 CD4+T細胞、ナチュラルキラー細胞、樹状細胞、ならびにM1マクロファージが含まれるが、これらに限定されない。TILには、一次TIL及び二次TILの両方が含まれる。「一次TIL」は、本明細書に概説されるように患者組織試料から得られるもの(「新たに採取された」と称されることもある)であり、「二次TIL」は、本明細書で考察される拡張または増殖された任意のTIL細胞集団であり、バルクTIL及び拡張TIL(「REP TIL」または「post-REP TIL」)が含まれるが、これらに限定されない。TIL細胞集団には、遺伝子修飾TILが含まれ得る。
本明細書における「細胞の集団」(TILを含む)とは、共通の形質を共有するいくつかの細胞を意味する。一般に、集団は、概して1×10~1×1010の数の範囲であり、異なるTIL集団は、異なる数を含む。例えば、IL-2の存在下での一次TILの初期成長は、およそ1×10細胞のバルクTILの集団をもたらす。REP拡張は、一般に、注入用の1.5×10~1.5×1010細胞の集団を提供するために行われる。
本明細書における「凍結保存されたTIL」とは、一次、バルク、または拡張(REP TIL)のいずれかのTILが、約-150℃~-60℃の範囲で処理及び保管されることを意味する。凍結保存のための一般的な方法は、実施例を含む本明細書の他の場所にも記載されている。明確にするために、「凍結保存されたTIL」は、一次TILのソースとして使用される可能性のある凍結組織試料と区別することができる。
本明細書における「解凍された凍結保存TIL」とは、以前に凍結保存され、その後、細胞培養温度またはTILが患者に投与され得る温度を含むがこれらに限定されない、室温以上に戻るように処理されたTILの集団を意味する。
TILは、一般に、細胞表面マーカーを使用して生化学的に定義されるか、または腫瘍に浸潤して治療を達成するそれらの能力によって機能的に定義されるかのいずれかであり得る。TILは、一般に、CD4、CD8、TCRαβ、CD27、CD28、CD56、CCR7、CD45Ra、CD95、PD-1、及びCD25のうちの1つ以上のバイオマーカーの発現によって分類され得る。さらに及び代替的に、TILは、患者への再導入時に固形腫瘍に浸潤する能力により機能的に定義され得る。
「凍結保存培地(cryopreservation media)」または「凍結保存培地(cryopreservation medium)」という用語は、細胞の凍結保存に使用できる任意の培地を指す。かかる培地は、7%~10%のDMSOを含む培地を含むことができる。例示的な培地には、CryoStor CS10、Hyperthermasol、ならびにそれらの組み合わせが含まれる。「CS10」という用語は、Stemcell TechnologiesまたはBiolife Solutionsから入手した凍結保存培地を指す。CS10培地は、商品名「CryoStor(登録商標)CS10」と称され得る。CS10培地は、DMSOを含む無血清の動物成分を含まない培地である。
「セントラルメモリーT細胞」という用語は、ヒトではCD45R0+であり、CCR7(CCR7hiまたはCCR7)及びCD62L(CD62hi)を構成的に発現するT細胞のサブセットを指す。セントラルメモリーT細胞の表面表現型には、TCR、CD3、CD127(IL-7R)、及びIL-15Rも含まれる。セントラルメモリーT細胞の転写因子には、BCL-6、BCL-6B、MBD2、及びBMI1が含まれる。セントラルメモリーT細胞は、TCRトリガー後、エフェクター分子としてIL-2及びCD40Lを主に分泌する。セントラルメモリーT細胞は、血液中のCD4コンパートメントで優勢であり、ヒトではリンパ節及び扁桃腺において比例して濃縮される。自己再生幹メモリーT細胞、または「TSCM」は、TCMまたはTEM細胞に分化することができるサブセットであり、Gattinoni,et al.,Nature Med.2011,17,1290-97に記載されている。
「エフェクターメモリーT細胞」、「エフェクターメモリーT細胞」または「TEM」という用語は、セントラルメモリーT細胞と同様にCD45R0+であるが、CCR7(CCR7loまたはCCR)の構成的発現を失っており、CD62L発現が不均一であるかまたは低い(CD62Llo)、ヒトまたは哺乳動物T細胞のサブセットを指す。セントラルメモリーT細胞の表面表現型には、TCR、CD3、CD127(IL-7R)、及びIL-15Rも含まれる。セントラルメモリーT細胞の転写因子には、BLIMP1が含まれる。エフェクターメモリーT細胞は、インターフェロンγ、IL-4、及びIL-5を含む、抗原刺激後に高レベルの炎症性サイトカインを急速に分泌する。エフェクターメモリーT細胞は、血液中のCD8コンパートメントで優勢であり、ヒトでは肺、肝臓、及び腸において比例して濃縮される。CD8エフェクターメモリーT細胞は、大量のパーフォリンを担持する。CD45RAマーカーを再発現する末端分化TEM細胞は、「TEMRA」または「TEMRA」細胞と称される。
「閉鎖系」という用語は、外部環境に対して閉鎖されている系を指す。細胞培養法に適した任意の閉鎖系を、本発明の方法で用いることができる。閉鎖系には、例えば、密閉G容器が含まれるが、これに限定されない。腫瘍セグメントが閉鎖系に付加されると、TILを患者に投与する準備ができるまで、系は外部環境に開かれない。
腫瘍を破壊するためのプロセスを説明するために本明細書で使用される「断片化すること」、「断片」、及び「断片化された」という用語は、腫瘍組織を破砕、スライス、分割、及び細切するなどの機械的断片化法、ならびに腫瘍組織の物理的構造を破壊するための任意の他の方法を含む。
「末梢血単核細胞」及び「PBMC」という用語は、リンパ球(T細胞、B細胞、NK細胞)及び単球を含む、丸い核を有する末梢血細胞を指す。抗原提示細胞として使用される場合(PBMCは抗原提示細胞の一種である)、末梢血単核細胞は、好ましくは、照射された同種異系末梢血単核細胞である。
「末梢血リンパ球」及び「PBL」という用語は、末梢血から拡張したT細胞を指す。いくつかの実施形態では、PBLは、ドナーからの全血またはアフェレーシス産物から分離される。いくつかの実施形態では、PBLは、CD3+CD45+のT細胞表現型などのT細胞表現型の正または負の選択によって、ドナー由来の全血またはアフェレーシス産物から分離される。
「主要組織適合性複合体」または「MHC」という用語は、適応免疫系の機能に不可欠な、MHC分子として知られる細胞表面タンパク質をコードする一連の密接に連結された多型遺伝子を含む脊椎動物DNA上の大きな遺伝子座を指す。MHC遺伝子は、非常に多型であり、2つの主要産物、MHCクラスI及びMHCクラスII分子をもたらす。MHCクラスIタンパク質は、細胞質から発生する内因性抗原を提示する。MHCクラスIIタンパク質は、細菌などの異物から細胞外に発生する外因性抗原を提示する。
「MHC優性認識」という用語は、T細胞のTCR複合体と標的細胞のHLA-ペプチド複合体との同種異系相互作用を指す。MHC優性認識は、Felix and Allen,Nat.Rev.Immunol.,2007,7(12),942-53、Matzinger and Bevan,Cell Immunol.,1977,29(1),1-5、及びJaneway,The Major Histocompatibility Complex and Its Functions in Immunobiology:The Immune System in Health and Disease,5th edition,Garland Science,2001に記載されており、これらの各々の開示は参照により本明細書に組み込まれる。MHC優性認識では、同種異系MHC分子は、T細胞受容体により適合し、MHC分子に結合するペプチドへの依存性が低い強結合をもたらし得る。
「ヒト白血球抗原」または「HLA」または「HLA複合体」という用語は、ヒト細胞の表面上で発現したMHC分子を指す。ヒト白血球抗原は、ヒトにおけるMHC遺伝子複合体によってコードされる。
「標的細胞」及び「標的細胞株」という用語は、TIL、MIL、またはPBLなどのT細胞のアッセイ標的である細胞を指す。ある実施形態では、標的細胞は、MHCクラスI及び/またはクラスIIを発現する。ある実施形態では、標的細胞は、Raji細胞及びその誘導体、バリアント、修飾、及び子孫、ならびにMHCクラスI及び/またはクラスIIを発現する他の細胞を含む。ある実施形態では、標的細胞は、Thp1細胞及びその誘導体、バリアント、修飾、及び子孫を含む。ある実施形態では、標的細胞は、Ramos細胞及びその誘導体、バリアント、修飾、及び子孫を含む。ある実施形態では、標的細胞は、U937細胞及びその誘導体、バリアント、修飾、及び子孫を含む。ある実施形態では、標的細胞は、Daudi細胞及びその誘導体、バリアント、修飾、及び子孫を含む。ある実施形態では、標的細胞は、照射される。ある実施形態では、標的細胞は、照射されない。ある実施形態では、標的細胞株は、Raji細胞株、Thp1細胞株、Ramos細胞株、U937細胞株、及びDaudi細胞株のうちの任意の2つの組み合わせである。ある実施形態では、標的細胞株は、Raji細胞株、Thp1細胞株、Ramos細胞株、U937細胞株、及びDaudi細胞株のうちの任意の3つの組み合わせである。ある実施形態では、標的細胞株は、Raji細胞株、Thp1細胞株、Ramos細胞株、U937細胞株、及びDaudi細胞株のうちの任意の4つの組み合わせである。ある実施形態では、標的細胞株は、Raji細胞株、Thp1細胞株、Ramos細胞株、U937細胞株、及びDaudi細胞株の組み合わせである。ある実施形態では、標的細胞株は、混合腫瘍標的細胞株である。ある実施形態では、標的細胞株は、アロ反応性標的細胞株である。ある実施形態では、標的細胞株は、混合腫瘍アロ反応性標的細胞株である。ある実施形態では、標的細胞株は、次の細胞株:Raji細胞株、Ramos細胞株、Thp1細胞株、U937細胞株、及びDaudi細胞株のうちの少なくとも2つの組み合わせを含む混合腫瘍アロ反応性標的細胞株である。
「Raji細胞」または「Raji細胞株」という用語は、American Type Culture Collection(Manassas,VA,USA)を含む複数のベンダーから入手可能なB細胞特性を有するバーキットリンパ腫細胞株、ならびにその誘導体、バリアント、修飾、及び子孫を意味する。Raji細胞は、Theofilopoulos,et al.,J.Clin.Invest.1976,57,169-182、Sobel and Bokisch,Fed.Proc.1975,34,965、及びTheofilopoulos,et al.,J.Exp.Med.1974,140,1230-1244に記載されており、これらの各々の開示は参照により本明細書に組み込まれる。Raji細胞は、膜結合免疫グロブリンを欠いているが、IgG Fc、C3b、C3d、及びClqに対する受容体を有する。ある実施形態では、Raji細胞またはその誘導体、バリアント、修飾、もしくは子孫が、標的細胞である。ある実施形態では、Raji細胞は、蛍光、リン光、化学発光、または生物発光標識を発現するように遺伝子修飾され、それによりその細胞膜が破壊されると、蛍光、リン光、化学発光、または生物発光標識が、検出において潜在的に使用するために培地に放出される。例えば、米国特許第10,415,015号(その開示は参照により本明細書に組み込まれる)に記載される生物発光検出のための遺伝子修飾アプローチは、Raji細胞の修飾に用いられ得る。
「Thp1細胞」または「Thp1細胞株」という用語は、「THP-1細胞」または「THP-1細胞株」とも呼ばれ、American Type Culture Collection(Manassas,VA,USA)を含む複数のベンダーから入手可能なヒト急性単球性白血病細胞株、ならびにその誘導体、バリアント、修飾、及び子孫を意味する。Thp1細胞株は、Tsuchiya,et al.,Int.J.Cancer 1980,26,171-176及びBosshart and Heinzelmann,Ann.Transl.Med.2016,4(21),438に記載されており、これらの各々の開示は参照により本明細書に組み込まれる。ある実施形態では、Thp1細胞またはその誘導体、バリアント、修飾、もしくは子孫が、標的細胞である。ある実施形態では、Thp1細胞は、蛍光、リン光、化学発光、または生物発光標識を発現するように遺伝子修飾され、それによりその細胞膜が破壊されると、蛍光、リン光、化学発光、または生物発光標識が、検出において潜在的に使用するために培地に放出される。例えば、米国特許第10,415,015号(その開示は参照により本明細書に組み込まれる)に記載される生物発光検出のための遺伝子修飾アプローチは、Thp1細胞の修飾に用いられ得る。
「Ramos細胞」または「Ramos細胞株」という用語は、American Type Culture Collection(Manassas,VA,USA)を含む複数のベンダーから入手可能なヒトバーキットリンパ腫細胞株、ならびにその誘導体、バリアント、修飾、及び子孫を意味する。Ramos細胞株は、Benjamin,et al.J.Immunol.1982,129,1336-1342に記載されており、その開示は参照により本明細書に組み込まれる。ある実施形態では、Ramos細胞またはその誘導体、バリアント、修飾、もしくは子孫が、標的細胞である。ある実施形態では、Ramos細胞は、蛍光、リン光、化学発光、または生物発光標識を発現するように遺伝子修飾され、それによりその細胞膜が破壊されると、蛍光、リン光、化学発光、または生物発光標識が、検出において潜在的に使用するために培地に放出される。例えば、米国特許第10,415,015号(その開示は参照により本明細書に組み込まれる)に記載される生物発光検出のための遺伝子修飾アプローチは、Ramos細胞の修飾に用いられ得る。
「U937細胞」または「U937細胞株」という用語は、American Type Culture Collection(Manassas,VA,USA)を含む複数のベンダーから入手可能なヒト組織球性リンパ腫細胞株、ならびにその誘導体、バリアント、修飾、及び子孫を意味する。U937細胞株は、Kraus,et al.,J.Clin.Microbiol.2007,45,3777-3780に記載されており、その開示は参照により本明細書に組み込まれる。ある実施形態では、U937細胞またはその誘導体、バリアント、修飾、もしくは子孫は、標的細胞である。ある実施形態では、U937細胞は、蛍光、リン光、化学発光、または生物発光標識を発現するように遺伝子修飾され、それによりその細胞膜が破壊されると、蛍光、リン光、化学発光、または生物発光標識が、検出において潜在的に使用するために培地に放出される。例えば、米国特許第10,415,015号(その開示は参照により本明細書に組み込まれる)に記載される生物発光検出のための遺伝子修飾アプローチは、U937細胞の修飾に用いられ得る。
「Daudi細胞」または「Daudi細胞株」という用語は、American Type Culture Collection(Manassas,VA,USA)を含む複数のベンダーから入手可能なヒトバーキットリンパ腫細胞株、ならびにその誘導体、バリアント、修飾、及び子孫を意味する。Daudi細胞株は、Gao,et al.,J.Virol.1997,71,84-94に記載されており、その開示は参照により本明細書に組み込まれる。ある実施形態では、Daudi細胞またはその誘導体、バリアント、修飾、もしくは子孫が、標的細胞である。ある実施形態では、Daudi細胞は、蛍光、リン光、化学発光、または生物発光標識を発現するように遺伝子修飾され、それによりその細胞膜が破壊されると、蛍光、リン光、化学発光、または生物発光標識が、検出において潜在的に使用するために培地に放出される。例えば、米国特許第10,415,015号(その開示は参照により本明細書に組み込まれる)に記載される生物発光検出のための遺伝子修飾アプローチは、Daudi細胞の修飾に用いられ得る。
「陰性対照」、「陰性対照細胞」、及び「陰性対照細胞株」という用語は、TIL、MIL、またはPBLアッセイを含むT細胞アッセイの陰性対照として使用される細胞を指す。ある実施形態では、標的細胞は、MHCクラスI及びクラスII発現を欠いている。ある実施形態では、標的細胞は、MHCクラスI発現を欠いている。ある実施形態では、標的細胞は、MHCまたはHLAクラスI発現を欠いている。ある実施形態では、標的細胞は、MHCまたはHLAクラスI及び/またはクラスIIを最小レベルで発現する。
「K562細胞」または「K562細胞株」という用語は、American Type Culture Collection(Manassas,VA,USA)を含む複数のベンダーから入手可能なリンパ芽球形態を有するヒト白人慢性骨髄性白血病細胞株を意味する。K562細胞は、Lozzio and Lozzio,Blood,1975,45,321-34に記載されており、ある実施形態では、陰性対照細胞は、K562細胞及びその誘導体、バリアント、修飾、及び子孫、ならびにMHCまたはHLAクラスIもしくはクラスIIを発現しない他の細胞を含む。
「抗CD3抗体」という用語は、成熟T細胞のT細胞抗原受容体におけるCD3受容体に対するヒト、ヒト化、キメラ、またはマウス抗体を含む、抗体またはそのバリアント、例えば、モノクローナル抗体を指す。抗CD3抗体には、ムロモナブとしても知られるOKT-3が含まれる。抗CD3抗体には、T3及びCD3εとしても知られるUHCT1クローンも含まれる。他の抗CD3抗体には、例えば、オテリキシズマブ、テプリズマブ、及びビシリズマブが含まれる。
「OKT-3」(本明細書では「OKT3」とも称される)という用語は、成熟T細胞のT細胞抗原受容体におけるCD3受容体に対するヒト、ヒト化、キメラ、またはマウス抗体を含む、モノクローナル抗体またはそのバイオシミラーもしくはバリアントを指し、市販の形態、例えば、OKT-3(30ng/mL、MACS GMP CD3 pure、Miltenyi Biotech,Inc.,San Diego,CA,USA)及びムロモナブ、またはそれらのバリアント、保存的アミノ酸置換物、グリコフォーム、またはバイオシミラーを含む。ムロモナブの重鎖及び軽鎖のアミノ酸配列を表1に示す(配列番号1及び配列番号2)。OKT-3を産生することができるハイブリドーマは、American Type Culture Collectionに寄託され、ATCC受託番号CRL8001が割り当てられている。OKT-3を産生することができるハイブリドーマは、European Collection of Authenticated Cell Cultures(ECACC)にも寄託され、カタログ番号86022706が割り当てられている。
Figure 2024512029000001
「IL-2」(本明細書では「IL2」とも称される)という用語は、インターロイキン-2として知られるT細胞成長因子を指し、ヒト及び哺乳動物形態、保存的アミノ酸置換物、グリコフォーム、バイオシミラー、及びバリアントを含む、IL-2のすべての形態を含む。IL-2は、例えば、Nelson,J.Immunol.2004,172,3983-88及びMalek,Annu.Rev.Immunol.2008,26,453-79に記載されており、その開示は参照により本明細書に組み込まれる。本発明での使用に好適な組換えヒトIL-2のアミノ酸配列を表2に示す(配列番号3)。例えば、IL-2という用語は、アルデスロイキン(PROLEUKIN、単回使用バイアル当たり2200万IUで複数の供給業者から市販されている)などのヒト組換えIL-2形態、ならびにCellGenix,Inc.,Portsmouth,NH,USA(CELLGRO GMP)またはProSpec-Tany TechnoGene Ltd.,East Brunswick,NJ,USAによって市販されている組換えIL-2形態(カタログ番号CYT-209-b)及び他のベンダーからの他の商用同等物を包含する。アルデスロイキン(デス-アラニル-1、セリン-125ヒトIL-2)は、およそ15kDaの分子量を有する非グリコシル化ヒト組換えIL-2形態である。本発明での使用に好適なアルデスロイキンのアミノ酸配列を表2に示す(配列番号4)。IL-2という用語は、Nektar Therapeutics(South San Francisco,CA,USA)から入手可能なペグ化IL2プロドラッグNKTR-214を含む、本明細書に記載のペグ化IL-2形態も包含する。本発明での使用に好適なNKTR-214及びペグ化IL-2は、米国特許出願公開第US2014/0328791A1号及び国際特許出願公開番号WO2012/065086A1号に記載されており、それらの開示は参照により本明細書に組み込まれる。本発明での使用に好適なコンジュゲートされたIL-2の代替形態は、米国特許第4,766,106号、同第5,206,344号、同第5,089,261号、及び同第4902,502号に記載されており、それらの開示は参照により本明細書に組み込まれる。本発明での使用に好適なIL-2の製剤は、米国特許第6,706,289号に記載されており、その開示は参照により本明細書に組み込まれる。
いくつかの実施形態では、本発明での使用に好適なIL-2形態は、THOR-707である。本発明での使用に好適なIL-2の追加の代替形態は、米国特許出願公開第US2020/0181220A1号及び米国特許出願公開第US2020/0330601A1号に記載されており、それらの開示は参照により本明細書に組み込まれる。いくつかの実施形態では、本発明での使用に好適なIL-2形態は、ALKS-4230である。本発明での使用に好適なIL-2の追加の代替形態は、米国特許出願公開第US2021/0038684A1号及び米国特許第10,183,979号に記載されており、それらの開示は参照により本明細書に組み込まれる。いくつかの実施形態では、本発明での使用に好適なIL-2形態は、単離及び精製IL-2ポリペプチドと、K35、T37、R38、T41、F42、K43、F44、Y45、E61、E62、E68、K64、P65、V69、L72、及びY107から選択されるアミノ酸位置で単離及び精製IL-2ポリペプチドに結合する複合部分と、を含む、インターロイキン2(IL-2)コンジュゲートであり、アミノ酸残基の番号付けは、米国特許出願公開第US2020/018120号における配列番号1に対応する。いくつかの実施形態では、アミノ酸位置は、T37、R38、T41、F42、F44、Y45、E61、E62、E68、K64、P65、V69、L72、及びY107から選択される。いくつかの実施形態では、アミノ酸位置は、T37、R38、T41、F42、F44、Y45、E61、E62、E68、P65、V69、L72、及びY107から選択される。いくつかの実施形態では、アミノ酸位置は、T37、T41、F42、F44、Y45、P65、V69、L72、及びY107から選択される。いくつかの実施形態では、アミノ酸位置は、R38及びK64から選択される。いくつかの実施形態では、アミノ酸位置は、E61、E62、及びE68から選択される。いくつかの実施形態では、アミノ酸位置は、E62である。いくつかの実施形態では、K35、T37、R38、T41、F42、K43、F44、Y45、E61、E62、E68、K64、P65、V69、L72、及びY107から選択されるアミノ酸残基は、リジン、システイン、またはヒスチジンにさらに変異する。いくつかの実施形態では、アミノ酸残基は、システインに変異する。いくつかの実施形態では、アミノ酸残基は、リジンに変異する。いくつかの実施形態では、K35、T37、R38、T41、F42、K43、F44、Y45、E61、E62、E68、K64、P65、V69、L72、及びY107から選択されるアミノ酸残基は、非天然アミノ酸にさらに変異する。いくつかの実施形態では、非天然アミノ酸は、N6-アジドエトキシ-L-リジン(AzK)、N6-プロパルギルエトキシ-L-リジン(PraK)、BCN-L-リジン、ノルボルネンリジン、TCO-リジン、メチルテトラジンリジン、アリルオキシカルボニルリジン、2-アミノ-8-オキソノナン酸、2-アミノ-8-オキソオクタン酸、p-アセチル-L-フェニルアラニン、p-アジドメチル-L-フェニルアラニン(pAMF)、p-ヨード-L-フェニルアラニン、m-アセチルフェニルアラニン、2-アミノ-8-オキソノナン酸、p-プロパルギルオキシフェニルアラニン、p-プロパルギル-フェニルアラニン、3-メチル-フェニルアラニン、L-ドーパ、フッ素化フェニルアラニン、イソプロピル-L-フェニルアラニン、p-アジド-L-フェニルアラニン、p-アシル-L-フェニルアラニン、p-ベンゾイル-L-フェニルアラニン、p-ブロモフェニルアラニン、p-アミノ-L-フェニルアラニン、イソプロピル-L-フェニルアラニン、O-アリルチロシン、O-メチル-L-チロシン、O-4-アリル-L-チロシン、4-プロピル-L-チロシン、ホスホノチロシン、トリ-O-アセチル-GlcNAcp-セリン、L-ホスホセリン、ホスホノセリン、L-3-(2-ナフチル)アラニン、2-アミノ-3-((2-((3-(ベンジルオキシ)-3-オキソプロピル)アミノ)エチル)セラニル)プロパン酸、2-アミノ-3-(フェニルセラニル)プロパン酸、またはセレノシステインを含む。いくつかの実施形態では、IL-2コンジュゲートは、野生型IL-2ポリペプチドと比較して、IL-2受容体α(IL-2Rα)サブユニットに対する減少した親和性を有する。いくつかの実施形態では、減少した親和性は、野生型IL-2ポリペプチドと比較して、IL-2Rαに対する結合親和性の約10%、20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、90%、95%、99%、または99%を超える減少である。いくつかの実施形態では、減少した親和性は、野生型IL-2ポリペプチドと比較して、約1倍、2倍、3倍、4倍、5倍、6倍、7倍、8倍、9倍、10倍、30倍、50倍、100倍、200倍、300倍、500倍、1000倍以上である。いくつかの実施形態では、複合部分は、IL-2とIL-2Rαとの結合を損なうかまたは遮断する。いくつかの実施形態では、複合部分は、水溶性ポリマーを含む。いくつかの実施形態では、追加の複合部分は、水溶性ポリマーを含む。いくつかの実施形態では、水溶性ポリマーの各々は、独立して、ポリエチレングリコール(PEG)、ポリ(プロピレングリコール)(PPG)、エチレングリコール及びプロピレングリコールのコポリマー、ポリ(オキシエチル化ポリオール)、ポリ(オレフィンアルコール)、ポリ(ビニルピロリドン)、ポリ(ヒドロキシアルキルメタクリルアミド)、ポリ(ヒドロキシアルキルメタクリレート)、ポリ(サッカライド)、ポリ(α-ヒドロキシ酸)、ポリ(ビニルアルコール)、ポリホスファゼン、ポリオキサゾリン(POZ)、ポリ(N-アクリロイルモルホリン)、またはそれらの組み合わせを含む。いくつかの実施形態では、水溶性ポリマーの各々は、独立して、PEGを含む。いくつかの実施形態では、PEGは、直鎖状PEGまたは分岐状PEGである。いくつかの実施形態では、水溶性ポリマーの各々は、独立して、ポリサッカライドを含む。いくつかの実施形態では、ポリサッカライドは、デキストラン、ポリシアル酸(PSA)、ヒアルロン酸(HA)、アミロース、ヘパリン、ヘパランサルフェート(HS)、デキストリン、またはヒドロキシエチルデンプン(HES)を含む。いくつかの実施形態では、水溶性ポリマーの各々は、独立して、グリカンを含む。いくつかの実施形態では、水溶性ポリマーの各々は、独立して、ポリアミンを含む。いくつかの実施形態では、複合部分は、タンパク質を含む。いくつかの実施形態では、追加の複合部分は、タンパク質を含む。いくつかの実施形態では、タンパク質の各々は、独立して、アルブミン、トランスフェリン、またはトランスサイレチンを含む。いくつかの実施形態では、タンパク質の各々は、独立して、Fc部分を含む。いくつかの実施形態では、タンパク質の各々は、独立して、IgGのFc部分を含む。いくつかの実施形態では、複合部分は、ポリペプチドを含む。いくつかの実施形態では、追加の複合部分は、ポリペプチドを含む。いくつかの実施形態では、タンパク質の各々は、独立して、XTENペプチド、グリシンリッチホモアミノ酸ポリマー(HAP)、PASポリペプチド、エラスチン様ポリペプチド(ELP)、CTPペプチド、またはゼラチン様タンパク質(GLK)ポリマーを含む。いくつかの実施形態では、単離及び精製IL-2ポリペプチドは、グルタミル化によって修飾される。いくつかの実施形態では、複合部分は、単離及び精製IL-2ポリペプチドと直接的に結合される。いくつかの実施形態では、複合部分は、リンカーを介して単離及び精製されたIL-2ポリペプチドと間接的に結合される。いくつかの実施形態では、リンカーは、ホモ二官能性リンカーを含む。いくつかの実施形態では、ホモ二官能性リンカーは、ロマント試薬ジチオビス(スクシンイミジルプロピオネート)DSP、3’3’-ジチオビス(スルホスクシンイミジルプロピオネート)(DTSSP)、ジスクシンイミジルスベラート(DSS)、ビス(スルホスクシンイミジル)スベラート(BS)、ジスクシンイミジルタータラート(DST)、ジスルホスクシンイミジルタータラート(スルホDST)、エチレングリコビス(スクシンイミジルスクシネート)(EGS)、ジスクシンイミジルグルタラート(DSG)、N,N’-ジスクシンイミジルカーボナート(DSC)、ジメチルアジピミデート(DMA)、ジメチルピメリミデート(DMP)、ジメチルスベリミデート(DMS)、ジメチル-3,3’-ジチオビスプロピオンイミデート(DTBP)、1,4-ジ-(3’-(2’-ピリジルジチオ)プロピオンアミド)ブタン(DPDPB)、ビスマレイミドヘキサン(BMH)、ハロゲン化アリール含有化合物(DFDNB)、例えば、1,5-ジフルオロ-2,4-ジニトロベンゼンまたは1,3-ジフルオロ-4,6-ジニトロベンゼン、4,4’-ジフルオロ-3,3’-ジニトロフェニルスルホン(DFDNPS)、ビス-[β-(4-アジドサリチルアミド)エチル]ジスルフィド(BASED)、ホルムアルデヒド、グルタルアルデヒド、1,4-ブタンジオールジグリシジルエーテル、アジピン酸ジヒドラジド、カルボヒドラジド、o-トルイジン、3,3’-ジメチルベンジジン、ベンジジン、α,α’-p-ジアミノジフェニル、ジヨード-p-キシレンスルホン酸、N,N’-エチレン-ビス(ヨードアセトアミド)、またはN,N’-ヘキサメチレンビス(ヨードアセトアミド)を含む。いくつかの実施形態では、リンカーは、ヘテロ二官能性リンカーを含む。いくつかの実施形態では、ヘテロ二官能性リンカーは、N-スクシンイミジル3-(2-ピリジルジチオ)プロピオネート(sPDP)、長鎖N-スクシンイミジル3-(2-ピリジルジチオ)プロピオネート(LC-sPDP)、水溶性長鎖N-スクシンイミジル3-(2-ピリジルジチオ)プロピオネート(スルホ-LC-sPDP)、スクシンイミジルオキシカルボニル-α-メチル-α-(2-ピリジルジチオ)トルエン(sMPT)、スルホスクシンイミジル-6-[α-メチル-α-(2-ピリジルジチオ)トルアミド]ヘキサノエート(スルホ-LC-sMPT)、スクシンイミジル-4-(N-マレイミドメチル)シクロヘキサン-1-カルボキシレート(sMCC)、スルホスクシンイミジル-4-(N-マレイミドメチル)シクロヘキサン-1-カルボキシレート(スルホ-sMCC)、m-マレイミドベンゾイル-N-ヒドロキシスクシンイミドエステル(MB)、m-マレイミドベンゾイル-N-ヒドロキシスルホスクシンイミドエステル(スルホ-MB)、N-スクシンイミジル(4-ヨードアセチル)アミノベンゾエート(sIAB)、スルホスクシンイミジル(4-ヨードアセチル)アミノベンゾエート(スルホ-sIAB)、スクシンイミジル-4-(p-マレイミドフェニル)ブチレート(sMPB)、スルホスクシンイミジル-4-(p-マレイミドフェニル)ブチレート(スルホ-sMPB)、N-(γ-マレイミドブチリルオキシ)スクシンイミドエステル(GMB)、N-(γ-マレイミドブチリルオキシ)スルホスクシンイミドエステル(スルホ-GMB)、スクシンイミジル6-((ヨードアセチル)アミノ)ヘキサノエート(sIAX)、スクシンイミジル6-[6-(((ヨードアセチル)アミノ)ヘキサノイル)アミノ]ヘキサノエート(slAXX)、スクシンイミジル4-(((ヨードアセチル)アミノ)メチル)シクロヘキサン-1-カルボキシレート(sIAC)、スクシンイミジル6-(((((4-ヨードアセチル)アミノ)メチル)シクロヘキサン-1-カルボニル)アミノ)ヘキサノエート(sIACX)、p-ニトロフェニルヨードアセテート(NPIA)、カルボニル反応性及びスルフヒドリル反応性架橋剤、例えば、4-(4-N-マレイミドフェニル)酪酸ヒドラジド(MPBH)、4-(N-マレイミドメチル)シクロヘキサ








ン-1-カルボキシル-ヒドラジド-8(M2C2H)、3-(2-ピリジルジチオ)プロピオニルヒドラジド(PDPH)、N-ヒドロキシスクシンイミジル-4-アジドサリチル酸(NHs-AsA)、N-ヒドロキシスルホスクシンイミジル-4-アジドサリチル酸(スルホ-NHs-AsA)、スルホスクシンイミジル-(4-アジドサリチルアミド)ヘキサノエート(スルホ-NHs-LC-AsA)、スルホスクシンイミジル-2-(p-アジドサリチルアミド)エチル-1,3’-ジチオプロピオネート(sAsD)、N-ヒドロキシスクシンイミジル-4-アジドベンゾエート(HsAB)、N-ヒドロキシスルホスクシンイミジル-4-アジドベンゾエート(スルホ-HsAB)、N-スクシンイミジル-6-(4’-アジド-2’-ニトロフェニルアミノ)ヘキサノエート(sANPAH)、スルホスクシンイミジル-6-(4’-アジド-2’-ニトロフェニルアミノ)ヘキサノエート(スルホ-sANPAH)、N-5-アジド-2-ニトロベンゾイルオキシスクシンイミド(ANB-NO)、スルホスクシンイミジル-2-(m-アジド-o-ニトロベンズアミド)-エチル-1,3’-ジチオプロピオネート(sAND)、N-スクシンイミジル-4(4-アジドフェニル)1,3’-ジチオプロピオネート(sADP)、N-スルホスクシンイミジル(4-アジドフェニル)-1,3’-ジチオプロピオネート(スルホ-sADP)、スルホスクシンイミジル4-(p-アジドフェニル)ブチレート(スルホ-sAPB)、スルホスクシンイミジル2-(7-アジド-4-メチルクマリン-3-アセトアミド)エチル-1,3’-ジチオプロピオネート(sAED)、スルホスクシンイミジル7-アジド-4-メチルクマリン-3-アセテート(スルホ-sAMCA)、p-ニトロフェニルジアゾピルベート(pNPDP)、p-ニトロフェニル-2-ジアゾ-3,3,3-トリフルオロプロピオネート(PNP-DTP)、1-(ρ-アジドサリチルアミド)-4-(ヨードアセトアミド)ブタン(AsIB)、N-[4-(ρ-アジドサリチルアミド)ブチル]-3’-(2’-ピリジルジチオ)プロピオンアミド(APDP)、ベンゾフェノン-4-ヨードアセトアミド、p-アジドベンゾイルヒドラジド(ABH)、4-(ρ-アジドサリチルアミド)ブチルアミン(AsBA)、またはp-アジドフェニルグリオキサール(APG)を含む。いくつかの実施形態では、リンカーは、任意選択でジペプチドリンカーを含む、切断可能なリンカーを含む。いくつかの実施形態では、ジペプチドリンカーは、Val-Cit、Phe-Lys、Val-Ala、またはVal-Lysを含む。いくつかの実施形態では、リンカーは、切断不可能なリンカーを含む。いくつかの実施形態では、リンカーは、任意選択で、マレイミドカプロイル(mc)、スクシンイミジル-4-(N-マレイミドメチル)シクロヘキサン-1-カルボキシレート(sMCC)、またはスルホスクシンイミジル-4-(N-マレイミドメチル)シクロヘキサン-1-カルボキシレート(スルホ-sMCC)を含むマレイミド基を含む。いくつかの実施形態では、リンカーは、スペーサーをさらに含む。いくつかの実施形態では、スペーサーは、p-アミノベンジルアルコール(PAB)、p-アミノベンジルオキシカルボニル(PABC)、その誘導体、または類似体を含む。いくつかの実施形態では、複合部分は、IL-2コンジュゲートの血清半減期を延長することができる。いくつかの実施形態では、追加の複合部分は、IL-2コンジュゲートの血清半減期を延長することができる。いくつかの実施形態では、本発明での使用に好適なIL-2形態は、本明細書に記載のIL-2形態のうちのいずれかの断片である。いくつかの実施形態では、本発明での使用に好適なIL-2形態は、米国特許出願公開第US2020/0181220A1号及び米国特許出願公開第US2020/0330601A1号に開示されているようにペグ化されている。いくつかの実施形態では、本発明での使用に好適なIL-2形態は、ポリエチレングリコール(PEG)を含む複合部分に共有結合したN6-アジドエトキシ-L-リジン(AzK)を含むIL-2ポリペプチドを含む、IL-2コンジュゲートであり、IL-2ポリペプチドは、米国特許出願公開第2020/0330601における配列番号1(本明細書では表2に配列番号5として列挙される)に対して少なくとも80%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含み、AzKは、米国特許出願公開第US2020/0330601号における配列番号1(本明細書では表2に配列番号5として列挙される)内のアミノ酸位置に関して、K35位、F42位、F44位、K43位、E62位、P65位、R38位、T41位、E68位、Y45位、V69位、またはL72位でアミノ酸を置換する。いくつかの実施形態では、IL-2ポリペプチドは、米国特許公開出願第US2020/0330601号における配列番号1(本明細書では表2に配列番号5として列挙される)に対して1残基のN末端欠失を含む。いくつかの実施形態では、本発明での使用に好適なIL-2形態は、IL-2Rアルファ鎖会合を欠いているが、中間親和性IL-2Rベータ-ガンマシグナル伝達複合体との正常な結合を保持している。いくつかの実施形態では、本発明での使用に好適なIL-2形態は、ALKS-4230である。本発明での使用に好適なIL-2の形態は、米国特許出願公開第US2021/0038684A1号に配列番号1として記載されている(本明細書では表2に配列番号6として列挙されている)。いくつかの実施形態では、本発明での使用に好適なIL-2形態は、米国特許第10,183,979号における配列番号2(本明細書では表2に配列番号7として列挙される、米国特許第10,183,979号における配列番号2)のアミノ酸24~452を含む融合タンパク質である。いくつかの実施形態では、本発明での使用に好適なIL-2形態は、米国特許第10,183,979号における配列番号2のアミノ酸24~452を含む融合タンパク質、または米国特許第10,183,979号における配列番号2のアミノ酸24~452と相同なアミノ酸配列であり、米国特許第10,183,979号における配列番号2のアミノ酸24~452の全長にわたって少なくとも98%のアミノ酸配列同一性を有し、米国特許第10,183,979号における配列番号2のアミノ酸24~452の受容体アンタゴニスト活性を有する。任意選択で、いくつかの実施形態では、本発明での使用に好適なIL-2形態は、ムチンドメインポリペプチドリンカーによって第2の融合パートナーと連結された第1の融合パートナーを含む融合タンパク質であり、第1の融合パートナーは、IL-1Rα、またはIL-1Rαと少なくとも98%のアミノ酸配列同一性を有し、IL-Rαの受容体アンタゴニスト活性を有するタンパク質であり、第2の融合パートナーは、Fc領域を含む免疫グロブリンの全部または一部を含み、ムチンドメインポリペプチドリンカーは、米国特許第10,183,979号における配列番号14(本明細書では表2に配列番号8として列挙される)または米国特許第10,183,979号における配列番号14(本明細書では表2に配列番号8として列挙される)に対して少なくとも90%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含み、融合タンパク質の半減期は、ムチンドメインポリペプチドリンカーの非存在下での第2の融合パートナーとの第1の融合パートナー

Figure 2024512029000002
いくつかの実施形態では、本発明での使用に好適なIL-2形態は、相補性決定領域HCDR1、HCDR2、HCDR3を含む、重鎖可変領域(V)と、LCDR1、LCDR2、LCDR3を含む軽鎖可変領域(V)と、VまたはVのCDRに移植されたIL-2分子またはその断片と、を含む抗体サイトカイン移植タンパク質を含み、抗体サイトカイン移植タンパク質は、制御性T細胞よりもTエフェクター細胞を優先的に拡張させる。ある実施形態では、抗体サイトカイン移植タンパク質は、相補性決定領域HCDR1、HCDR2、HCDR3を含む、重鎖可変領域(V)と、LCDR1、LCDR2、LCDR3を含む軽鎖可変領域(V)と、VまたはVのCDRに移植されたIL-2分子またはその断片と、を含み、IL-2分子は、ムテインであり、抗体サイトカイン移植タンパク質は、制御性T細胞よりもTエフェクター細胞を優先的に拡張させる。ある実施形態では、IL-2レジメンは、米国特許出願公開第2020/0270334A1号に記載されている抗体の投与を含み、その開示は参照により本明細書に組み込まれる。ある実施形態では、抗体サイトカイン移植タンパク質は、相補性決定領域HCDR1、HCDR2、HCDR3を含む、重鎖可変領域(VH)と、LCDR1、LCDR2、LCDR3を含む軽鎖可変領域(VL)と、VまたはVのCDRに移植されたIL-2分子またはその断片と、を含み、IL-2分子は、ムテインであり、抗体サイトカイン移植タンパク質は、制御性T細胞よりもTエフェクター細胞を優先的に拡張させ、抗体は、米国特許第出願公開第US2020/0270334A1における配列番号69を含むIgGクラス軽鎖及び米国特許第出願公開第US2020/0270334A1における配列番号53を含むIgGクラス重鎖、米国特許第出願公開第US2020/0270334A1における配列番号37を含むIgGクラス軽鎖及び米国特許第出願公開第US2020/0270334A1における配列番号21を含むIgGクラス重鎖、米国特許第出願公開第US2020/0270334A1における配列番号69を含むIgGクラス軽鎖及び米国特許第出願公開第US2020/0270334A1における配列番号21を含むIgGクラス重鎖、ならびに配列番号37を含むIgGクラス軽鎖及び米国特許第出願公開第US2020/0270334A1における配列番号53を含むIgGクラス重鎖からなる群から選択されたIgGクラス重鎖及びIgGクラス軽鎖をさらに含む。
ある実施形態では、IL-2分子またはその断片は、VHのHCDR1に移植され、IL-2分子は、ムテインである。ある実施形態では、IL-2分子またはその断片は、VHのHCDR2に移植され、IL-2分子は、ムテインである。ある実施形態では、IL-2分子またはその断片は、VHのHCDR3に移植され、IL-2分子は、ムテインである。ある実施形態では、IL-2分子またはその断片は、VLのLCDR1に移植され、IL-2分子は、ムテインである。ある実施形態では、IL-2分子またはその断片は、VLのLCDR2に移植され、IL-2分子は、ムテインである。ある実施形態では、IL-2分子またはその断片は、VLのLCDR3に移植され、IL-2分子は、ムテインである。
IL-2分子の挿入は、CDRのN末端領域もしくはその近く、CDRの中間領域、またはCDRのC末端領域もしくはその近くであり得る。いくつかの実施形態では、抗体サイトカイン移植タンパク質は、CDRに組み込まれたIL-2分子を含み、IL2配列はCDR配列をフレームシフトしない。いくつかの実施形態では、抗体サイトカイン移植タンパク質は、CDRに組み込まれたIL-2分子を含み、IL-2配列はCDR配列のすべてまたは一部を置き換える。IL-2分子による置き換えは、CDRのN末端領域、CDRの中間領域、またはCDRのC末端領域もしくはその近くであり得る。IL-2分子による置き換えは、CDR配列のわずか1個もしくは2個のアミノ酸、またはCDR配列全体であり得る。
いくつかの実施形態では、IL-2分子は、ペプチドリンカーなしで、CDR配列とIL-2配列との間に追加のアミノ酸なしで、CDRに直接的に移植される。いくつかの実施形態では、IL-2分子は、ペプチドリンカーを用いて、CDR配列とIL-2配列との間に1つ以上の追加のアミノ酸を伴って、CDRに間接的に移植される。
いくつかの実施形態では、本明細書に記載のIL-2分子は、IL-2ムテインである。いくつかの事例では、IL-2ムテインは、R67A置換を含む。いくつかの実施形態では、IL-2ムテインは、米国特許出願公開第2020/0270334A1号のアミノ酸配列配列番号4または配列番号6を含む。いくつかの実施形態では、IL-2ムテインは、米国特許出願公開第US2020/0270334A1号の表1のアミノ酸配列を含み、その開示は参照により本明細書に組み込まれる。
ある実施形態では、抗体サイトカイン移植タンパク質は、米国特許出願公開第US2020/0270334A1号の配列番号7、配列番号10、配列番号13及び配列番号16からなる群から選択されるHCDR1を含む。ある実施形態では、抗体サイトカイン移植タンパク質は、米国特許出願公開第2020/0270334A1号の配列番号7、配列番号10、配列番号13及び配列番号16からなる群から選択されるHCDR1、ならびに配列番号8、配列番号11、配列番号14及び配列番号17からなる群から選択されるHCDR2を含む。ある実施形態では、抗体サイトカイン移植タンパク質は、米国特許出願公開第US2020/0270334A1号の配列番号7、配列番号10、配列番号13及び配列番号16からなる群から選択されるHCDR1、配列番号8、配列番号11、配列番号14及び配列番号17からなる群から選択されるHCDR2、ならびに配列番号9、配列番号12、配列番号15及び配列番号18からなる群から選択されるHCDR3を含む。ある実施形態では、抗体サイトカイン移植タンパク質は、米国特許出願公開第US2020/0270334A1号の配列番号19のアミノ酸配列を含むVH領域を含む。ある実施形態では、抗体サイトカイン移植タンパク質は、米国特許出願公開第US2020/0270334A1号の配列番号21のアミノ酸配列を含む重鎖を含む。ある実施形態では、抗体サイトカイン移植タンパク質は、米国特許出願公開第US2020/0270334A1号の配列番号35のアミノ酸配列を含むVL領域を含む。ある実施形態では、抗体サイトカイン移植タンパク質は、米国特許公開第US2020/0270334A1号の配列番号37のアミノ酸配列を含む軽鎖を含む。ある実施形態では、抗体サイトカイン移植タンパク質は、米国特許出願公開第US2020/0270334A1号の配列番号19のアミノ酸配列を含むVH領域、及び配列番号35のアミノ酸配列を含むVL領域を含む。ある実施形態では、抗体サイトカイン移植タンパク質は、米国特許出願公開第US2020/0270334A1号の配列番号21のアミノ酸配列を含む重鎖領域、及び配列番号37のアミノ酸配列を含む軽鎖領域を含む。ある実施形態では、抗体サイトカイン移植タンパク質は、米国特許出願公開第2020/0270334A1号のIgG.IL2R67A.H1を含む。ある実施形態では、本明細書に記載の抗体サイトカイン移植タンパク質の抗体成分は、免疫グロブリン配列、フレームワーク配列、またはパリビズマブのCDR配列を含む。
いくつかの実施形態では、本明細書に記載の抗体サイトカイン移植タンパク質は、アルデスロイキン(Proleukin(登録商標))または同等の分子などであるがこれらに限定されない野生型IL-2分子よりも長い血清半減期を有する。
ある実施形態では、本明細書に記載の抗体サイトカイン移植タンパク質は、表3に記載される配列を有する。
Figure 2024512029000003

Figure 2024512029000004

Figure 2024512029000005

Figure 2024512029000006
「IL-4」(本明細書では「IL4」とも称される)という用語は、インターロイキン4として知られるサイトカインを指し、これは、Th2 T細胞、ならびに好酸球、好塩基球、及び肥満細胞によって産生される。IL-4は、ナイーブヘルパーT細胞(Th0細胞)からTh2 T細胞への分化を調節する。Steinke and Borish,Respir.Res.2001,2,66-70。IL-4によって活性化されると、Th2 T細胞は、その後、正のフィードバックループで追加のIL-4を産生する。IL-4は、B細胞増殖及びクラスII MHC発現も刺激し、B細胞からのIgE及びIgG発現へのクラス切り替えを誘導する。本発明での使用に好適な組換えヒトIL-4は、ProSpec-Tany TechnoGene Ltd.,East Brunswick,NJ,USA(カタログ番号CYT-211)及びThermoFisher Scientific,Inc.,Waltham,MA,USA(ヒトIL-15組換えタンパク質、カタログ番号Gibco CTP0043)を含む、複数の供給業者から市販されている。本発明での使用に好適な組換えヒトIL-4のアミノ酸配列を表2に示す(配列番号9)。
「IL-7」(本明細書では「IL7」とも称される)という用語は、インターロイキン7として知られるグリコシル化組織由来のサイトカインを指し、これは、間質細胞及び上皮細胞、ならびに樹状細胞から得ることができる。Fry and Mackall,Blood 2002,99,3892-904。IL-7は、T細胞の発達を刺激することができる。IL-7は、IL-7受容体アルファ及び共通ガンマ鎖受容体からなるヘテロ二量体であるIL-7受容体に結合し、これは、胸腺内でのT細胞発生及び末梢内での生存に重要な一連のシグナルである。本発明での使用に好適な組換えヒトIL-7は、ProSpec-Tany TechnoGene Ltd.,East Brunswick,NJ,USA(カタログ番号CYT-254)及びThermoFisher Scientific,Inc.,Waltham,MA,USA(ヒトIL-15組換えタンパク質、カタログ番号Gibco PHC0071)を含む、複数の供給業者から市販されている。本発明での使用に好適な組換えヒトIL-7のアミノ酸配列を表2に示す(配列番号10)。
「IL-15」(本明細書では「IL15」とも称される)という用語は、インターロイキン-15として知られるT細胞成長因子を指し、ヒト及び哺乳動物形態、保存的アミノ酸置換物、グリコフォーム、バイオシミラー、及びバリアントを含む、IL-2のすべての形態を含む。IL-15は、例えば、Fehniger and Caligiuri,Blood 2001,97,14-32に記載されており、その開示は参照により本明細書に組み込まれる。IL-15は、β及びγシグナル伝達受容体サブユニットをIL-2と共有する。組換えヒトIL-15は、12.8kDaの分子量を有する114個のアミノ酸(及びN末端メチオニン)を含む単一の非グリコシル化ポリペプチド鎖である。組換えヒトIL-15は、ProSpec-Tany TechnoGene Ltd.,East Brunswick,NJ,USA(カタログ番号CYT-230-b)及びThermoFisher Scientific,Inc.,Waltham,MA,USA(ヒトIL-15組換えタンパク質、カタログ番号34-8159-82)を含む、複数の供給業者から市販されている。本発明での使用に好適な組換えヒトIL-15のアミノ酸配列を表2に示す(配列番号11)。
「IL-21」(本明細書では「IL21」とも称される)という用語は、インターロイキン-21として知られる多面発現性サイトカインタンパク質を指し、ヒト及び哺乳動物形態、保存的アミノ酸置換物、グリコフォーム、バイオシミラー、及びバリアントを含む、IL-21のすべての形態を含む。IL-21は、例えば、Spolski and Leonard,Nat.Rev.Drug.Disc.2014,13,379-95に記載されており、その開示は参照により本明細書に組み込まれる。IL-21は、主にナチュラルキラーT細胞及び活性化ヒトCD4T細胞によって産生される。組換えヒトIL-21は、15.4kDaの分子量を有する132個のアミノ酸を含む単一の非グリコシル化ポリペプチド鎖である。組換えヒトIL-21は、ProSpec-Tany TechnoGene Ltd.,East Brunswick,NJ,USA(カタログ番号CYT-408-b)及びThermoFisher Scientific,Inc.,Waltham,MA,USA(ヒトIL-21組換えタンパク質、カタログ番号14-8219-80)を含む、複数の供給業者から市販されている。本発明での使用に好適な組換えヒトIL-21のアミノ酸配列を表2に示す(配列番号12)。
「抗腫瘍有効量」、「腫瘍阻害有効量」、または「治療量」が示される場合、投与される本発明の組成物の正確な量は、患者(対象)の年齢、体重、腫瘍サイズ、感染または転移の程度、及び健康状態の個人差を考慮して、医師によって決定され得る。一般に、本明細書に記載される腫瘍浸潤リンパ球(例えば、二次TILまたは遺伝子改変された細胞傷害性リンパ球)は、体重1kg当たり10~1011細胞(例えば、体重1kg当たり10~10、10~1010、10~1011、10~1010、10~1011、10~1011、10~1010、10~1011、10~1010、10~1011、または10~1010細胞)(それらの範囲内のすべての整数値を含む)の投与量で投与され得る。腫瘍浸潤リンパ球(場合によっては、遺伝子改変された細胞傷害性リンパ球を含む)組成物もまた、これらの投与量で複数回投与され得る。腫瘍浸潤リンパ球(場合によっては、遺伝的を含む)は、免疫療法で一般的に知られている注入技法を使用することにより投与することができる(例えば、Rosenberg et al.,New Eng.J.of Med.319:1676,1988を参照)。特定の患者に最適な投薬量及び治療レジーム(regime)は、患者を疾患の兆候について監視し、適宜に治療を調整することによって、医学分野の技術者によって容易に決定され得る。
「血液学的悪性腫瘍」、「血液系悪性腫瘍」という用語または相関する意味の用語は、血液、骨髄、リンパ節、及びリンパ系の組織を含むが、これらに限定されない、哺乳動物の造血組織及びリンパ組織のがん及び腫瘍を指す。血液学的悪性腫瘍は、「液体腫瘍」とも称される。血液学的悪性腫瘍には、急性リンパ芽球性白血病(ALL)、慢性リンパ性リンパ腫(CLL)、小リンパ球性リンパ腫(SLL)、急性骨髄性白血病(AML)、慢性骨髄性白血病(CML)、急性単球性白血病(AMoL)、ホジキンリンパ腫、及び非ホジキンリンパ腫が含まれ得るが、これらに限定されない。「B細胞血液学的悪性腫瘍」という用語は、B細胞を冒す血液学的悪性腫瘍を指す。
「液体腫瘍」という用語は、本来流体である異常な細胞塊を指す。液体腫瘍癌には、白血病、骨髄腫、及びリンパ腫、ならびに他の血液学的悪性腫瘍が含まれるが、これらに限定されない。液体腫瘍から取得されたTILは、本明細書では骨髄浸潤リンパ球(MIL)とも称され得る。末梢血中で循環する液体腫瘍を含む液体腫瘍から得られるTILは、本明細書ではPBLとも称され得る。MIL、TIL、及びPBLという用語は、本明細書で互換的に使用され、細胞が由来する組織タイプに基づいてのみ異なる。
本明細書で使用される「微小環境」という用語は、全体としての固形もしくは血液学的腫瘍微小環境、または微小環境内の細胞の個々のサブセットを指し得る。本明細書で使用される腫瘍微小環境は、Swartz,et al.,Cancer Res.,2012,72,2473に記載されるように、「腫瘍性形質転換を促進し、腫瘍成長及び浸潤を支持し、腫瘍を宿主免疫から保護し、治療抵抗性を助長し、かつ優勢な転移を成功させるニッチを提供する、細胞、可溶性因子、シグナル伝達分子、細胞外マトリックス、及び機械的手がかり」の複合混合物を指す。腫瘍はT細胞によって認識されるべき抗原を発現するが、微小環境による免疫抑制のため、免疫系による腫瘍クリアランスはまれである。
ある実施形態では、本発明は、TIL集団でがんを治療する方法を含み、患者は、本発明によるTILの注入前に骨髄非破壊的化学療法で前治療される。いくつかの実施形態では、TIL集団が提供され得、患者は、本発明によるTILの注入前に骨髄非破壊的化学療法で前治療される。ある実施形態では、骨髄非破壊的化学療法は、シクロホスファミド60mg/kg/日で2日間(TIL注入の27日前及び26日前)、ならびにフルダラビン25mg/m2/日で5日間(TIL注入の27日前~23日前)である。ある実施形態では、本発明による骨髄非破壊的化学療法及びTIL注入(0日目)後、患者は、生理学的許容範囲まで8時間毎に720,000IU/kgでIL-2の静脈内注入を受ける。
実験的発見は、腫瘍特異的Tリンパ球の養子移入前のリンパ球枯渇が、制御性T細胞及び免疫系の競合要素(「サイトカインシンク」)を排除することによって治療有効性を増強する上で重要な役割を果たすことを示す。したがって、本発明のいくつかの実施形態は、本発明のTILを導入する前に、患者に対してリンパ球枯渇ステップ(「免疫抑制コンディショニング」と称されることもある)を利用する。
「有効量」または「治療有効量」という用語は、疾患治療を含むが、これに限定されない、意図された用途を達成するのに十分である、本明細書に記載の化合物または化合物の組み合わせの量を指す。治療有効量は、意図される用途(インビトロもしくはインビボ)、または治療される対象及び病状(例えば、対象の体重、年齢、及び性別)、病状の重症度、または投与方法に応じて異なり得る。この用語は、標的細胞において特定の応答(例えば、血小板粘着及び/または細胞遊走の低減)を誘導する用量にも適用される。特定の用量は、選択された特定の化合物、従うべき投薬レジメン、化合物が他の化合物と組み合わせて投与されるか、投与のタイミング、それが投与される組織、及び化合物が運ばれる物理的送達系に応じて異なる。
「治療」、「治療すること」、「治療する」などの用語は、所望の薬理学的及び/または生理学的効果を得ることを指す。その効果は、その疾患または症状を完全にまたは部分的に予防するという観点において予防的であり得、及び/または疾患及び/またはその疾患に起因する副作用の部分的または完全な治癒という観点において治療的であり得る。「治療」は、本明細書で使用される場合、哺乳動物、特にヒトにおける疾患の任意の治療を包含し、(a)疾患にかかりやすい可能性があるが、まだ疾患を有すると診断されていない対象に疾患が生じるのを予防すること、(b)疾患を抑制すること、すなわち、その発症または進行を抑止すること、及び(c)疾患を軽減すること、すなわち、疾患の退行を引き起こし、及び/または1つ以上の疾患症状を軽減することを含む。「治療」は、疾患または状態がない場合でさえも、薬理学的効果を提供するための薬剤の送達を包含するようにも意図されている。例えば、「治療」は、病状がない場合、例えば、ワクチンの場合に免疫応答を誘発するか、または免疫を与えることができる組成物の送達を包含する。
「異種」という用語は、核酸またはタンパク質の一部に関して使用される場合、核酸またはタンパク質が、自然界では互いに同じ関係では見出されない2つ以上の部分配列を含むことを示す。例えば、核酸は、典型的には、組換え的に産生され、新たな機能的核酸、例えば、ある供給源からのプロモーター及び別の供給源からのコード領域、または異なる供給源からのコード領域を作製するように配置された無関係の遺伝子由来の2つ以上の配列を有する。同様に、異種タンパク質は、そのタンパク質が、自然界では互いに同じ関係では見出されない2つ以上の部分配列を含むことを示す(例えば、融合タンパク質)。
2つ以上の核酸またはポリペプチドの文脈における「配列同一性」、「同一性パーセント」、及び「配列同一性パーセント」(もしくはそれらの同義語、例えば「99%同一」)という用語は、同じであるか、または配列同一性の一部としていかなる保存的アミノ酸置換も考慮せずに、最大一致のために比較し整列させた場合(必要に応じてギャップを導入する)、特定のパーセンテージの同じヌクレオチドもしくはアミノ酸残基を有する2つ以上の配列または部分配列を指す。同一性パーセントは、配列比較ソフトウェアもしくはアルゴリズムを使用して、または目視検査によって測定することができる。アミノ酸またはヌクレオチド配列のアラインメントを取得するために使用され得る様々なアルゴリズム及びソフトウェアが当該技術分野で知られている。配列同一性パーセントの決定に好適なプログラムには、例えば、米国政府の国立生物工学情報センターのBLASTウェブサイトから入手可能なBLASTプログラム一式が含まれる。2つの配列間の比較は、BLASTNまたはBLASTPアルゴリズムのいずれかを使用して実行することができる。BLASTNは、核酸配列を比較するために使用され、BLASTPは、アミノ酸配列を比較するために使用される。DNASTARから入手可能なALIGN、ALIGN-2(Genentech,South San Francisco,California)、またはMegAlignは、配列を整列させるために使用することができる追加の公的に入手可能なソフトウェアプログラムである。当業者であれば、特定のアラインメントソフトウェアによって最大アラインメントに適切なパラメータを決定することができる。ある特定の実施形態では、アラインメントソフトウェアのデフォルトパラメータが使用される。
本明細書で使用される場合、「バリアント」という用語は、参照抗体のアミノ酸配列内または隣接する特定の位置における1つ以上の置換、欠失、及び/または付加により参照抗体のアミノ酸配列とは異なるアミノ酸配列を含む抗体または融合タンパク質を包含するが、これらに限定されない。バリアントは、参照抗体のアミノ酸配列と比較して、そのアミノ酸配列に1つ以上の保存的置換を含み得る。保存的置換は、例えば、同様に荷電したまたは非荷電のアミノ酸の置換を含み得る。バリアントは、参照抗体の抗原に特異的に結合する能力を保持している。バリアントという用語は、ペグ化抗体またはタンパク質も含む。
本明細書における「腫瘍浸潤リンパ球」または「TIL」とは、対象の血流を離れて腫瘍に移動した白血球として最初に取得された細胞の集団を意味する。TILには、CD8細胞傷害性T細胞(リンパ球)、Th1及びTh17 CD4T細胞、ナチュラルキラー細胞、樹状細胞、ならびにM1マクロファージが含まれるが、これらに限定されない。TILには、一次TIL及び二次TILの両方が含まれる。「一次TIL」は、本明細書に概説されるように患者組織試料から得られるもの(「新たに採取された」と称されることもある)であり、「二次TIL」は、本明細書で考察されるように拡張または増殖された任意のTIL細胞集団であり、本明細書で考察されるバルクTIL、拡張TIL(「REP TIL」)、ならびに「reREP TIL」が含まれるが、これらに限定されない。reREP TILは、例えば、第2の拡張TILまたは第2の追加の拡張TIL(例えば、reREP TILと称されるTILを含む、図8のステップDに記載されているものなど)を含み得る。
TILは、一般に、細胞表面マーカーを使用して生化学的に定義されるか、または腫瘍に浸潤して治療を達成するそれらの能力によって機能的に定義されるかのいずれかであり得る。TILは、一般に、CD4、CD8、TCRαβ、CD27、CD28、CD56、CCR7、CD45Ra、CD95、PD-1、及びCD25のうちの1つ以上のバイオマーカーの発現によって分類され得る。さらに及び代替的に、TILは、患者への再導入時に固形腫瘍に浸潤する能力により機能的に定義され得る。TILは、効力によってさらに特徴付けられ得、例えば、インターフェロン(IFN)放出が、約50pg/mLを超える、約100pg/mLを超える、約150pg/mLを超える、または約200pg/mLを超える場合、TILは強力であるとみなされ得る。
「デオキシリボヌクレオチド」という用語は、天然及び合成の、未修飾及び修飾デオキシリボヌクレオチドを包含する。修飾には、糖部分、塩基部分、及び/またはオリゴヌクレオチド中のデオキシリボヌクレオチド間の結合への変更が含まれる。
「RNA」という用語は、少なくとも1つのリボヌクレオチド残基を含む分子を定義する。「リボヌクレオチド」という用語は、b-D-リボフラノース部分の2’位にヒドロキシル基を有するヌクレオチドを定義する。RNAという用語には、二本鎖RNA、一本鎖RNA、部分的に精製されたRNAなどの単離されたRNA、本質的に純粋なRNA、合成RNA、組換え的に産生されたRNA、ならびに1つ以上のヌクレオチドの付加、欠失、置換、及び/または変化によって天然に存在するRNAとは異なる変化したRNAが含まれる。本明細書に記載のRNA分子のヌクレオチドはまた、非天然に存在するヌクレオチドまたは化学的に合成されたヌクレオチドもしくはデオキシヌクレオチドなどの非標準ヌクレオチドを含み得る。これらの変化したRNAは、類似体または天然に存在するRNAの類似体と称され得る。
「薬学的に許容される担体」または「薬学的に許容される賦形剤」という用語は、ありとあらゆる溶媒、分散媒、コーティング、抗細菌剤及び抗真菌剤、等張剤及び吸収遅延剤、ならびに不活性成分を含むよう意図されている。医薬品有効成分のためのかかる薬学的に許容される担体または薬学的に許容される賦形剤の使用は、当該技術分野で周知である。任意の従来の薬学的に許容される担体または薬学的に許容される賦形剤が医薬品有効成分と適合しない場合を除いて、本発明の治療用組成物におけるその使用が企図される。他の薬物などの追加の医薬品有効成分を、記載された組成物及び方法に組み込むこともできる。
「約」及び「およそ」という用語は、値の統計的に有意な範囲内を意味する。かかる範囲は、所与の値または範囲の1桁以内、好ましくは50%以内、より好ましくは20%以内、なおより好ましくは10%以内、さらにより好ましくは5%以内であり得る。「約」または「およそ」という用語によって包含される許容偏差は、研究中の特定のシステムに依存し、当業者によって容易に理解され得る。さらに、本明細書で使用される場合、「約」及び「およそ」という用語は、寸法、サイズ、配合、パラメータ、形状、ならびに他の量及び特徴が正確でなく、かつ正確である必要はないが、公差、変換係数、四捨五入、測定誤差など、及び当業者に知られている他の要因を反映して、必要に応じて、およそであってもよく、及び/またはそれよりも大きくても小さくてもよいことを意味する。一般に、寸法、サイズ、配合、パラメータ、形状、または他の量もしくは特徴は、そのように明示的に述べられているかにかかわらず、「約」または「およそ」である。非常に異なるサイズ、形状、及び寸法の実施形態が記載された配置を採用し得ることに留意されたい。
添付の特許請求の範囲で使用される場合、「含む」、「から本質的になる」、及び「からなる」という移行用語は、元の形式及び補正された形式で、存在する場合、列挙されていない追加のクレーム要素またはステップが特許請求の範囲(複数可)から除外されるかに関して特許請求の範囲を定義する。「含む」という用語は、包括的または自由形式であるよう意図されており、いずれの追加の列挙されていない要素、方法、ステップ、または材料も除外しない。「からなる」という用語は、特許請求の範囲で指定されたもの以外のいずれの要素、ステップ、または材料も除外し、後者の場合、指定された材料(複数可)に通常関連する不純物も除外する。「から本質的になる」という用語は、特許請求の範囲を、特定の要素、ステップ、または材料(複数可)、及び特許請求された本発明の基本的及び新規の特徴(複数可)に実質的に影響を及ぼさないに限定する。本発明を具体化する本明細書に記載のすべての組成物、方法、及びキットは、代替の実施形態では、「含む」、「から本質的になる」、及び「からなる」という移行用語のうちのいずれかによってより具体的に定義され得る。
「抗体」及びその複数形の「抗体」という用語は、免疫グロブリン全体及び任意の抗原結合断片(「抗原結合部分」)またはその一本鎖を指す。「抗体」はさらに、ジスルフィド結合によって相互接続された少なくとも2つの重鎖(H)鎖及び2つの軽(L)鎖を含む糖タンパク質、またはその抗原結合部分を指す。各重鎖は、重鎖可変領域(本明細書ではVと略される)及び重鎖定常領域で構成される。重鎖定常領域は、CH1、CH2、及びCH3の3つのドメインで構成される。各軽鎖は、軽鎖可変領域(本明細書ではVと略される)及び軽鎖定常領域で構成される。軽鎖定常領域は、1つのドメイン、Cで構成される。抗体のV及びV領域は、相補性決定領域(CDR)または超可変領域(HVR)と称され、フレームワーク領域(FR)と呼ばれる、より保存された領域が点在し得る、超可変性の領域にさらに細分化することができる。各V及びVは、アミノ末端からカルボキシ末端へと以下の順序で配列された3つのCDR及び4つのFRで構成される:FR1、CDR1、FR2、CDR2、FR3、CDR3、FR4。重鎖及び軽鎖の可変領域は、1つまたは複数の抗原エピトープと相互作用する結合ドメインを含む。抗体の定常領域は、免疫系の様々な細胞(例えば、エフェクター細胞)及び古典的な補体系の第1の成分(Clq)を含む宿主組織または因子への免疫グロブリンの結合を媒介し得る。
「抗原」という用語は、免疫応答を誘導する物質を指す。いくつかの実施形態では、抗原は、主要組織適合遺伝子複合体(MHC)分子によって提示される場合、抗体またはTCRによって結合されることができる分子である。本明細書で使用される「抗原」という用語はまた、T細胞エピトープを包含する。抗原は、追加として免疫系によって認識されることができる。いくつかの実施形態では、抗原は、体液性免疫応答または細胞性免疫応答を誘導することができ、Bリンパ球及び/またはTリンパ球の活性化につながる。場合によっては、これは、抗原がTh細胞エピトープを含むか、またはそれに結合されることを必要とし得る。抗原はまた、1つ以上のエピトープ(例えば、B-及びT-エピトープ)を有し得る。いくつかの実施形態では、抗原は、好ましくは、典型的には非常に特異的かつ選択的な方法で、対応する抗体またはTCRと反応し、他の抗原によって誘導され得る多数の他の抗体またはTCRとは反応しない。
「モノクローナル抗体」、「mAb」、「モノクローナル抗体組成物」という用語、またはそれらの複数形は、単一分子組成の抗体分子の調製物を指す。モノクローナル抗体組成物は、特定のエピトープに対して単一の結合特異性及び親和性を示す。特定の受容体に特異的なモノクローナル抗体は、試験対象に好適な抗原を注入し、次いで、所望の配列または機能的特徴を有する抗体を発現するハイブリドーマを単離するという当該技術分野における知識及び技術を使用して作製することができる。モノクローナル抗体をコードするDNAは、従来の手順を使用して(例えば、モノクローナル抗体の重鎖及び軽鎖をコードする遺伝子に特異的に結合することができるオリゴヌクレオチドプローブを使用することによって)容易に単離され、配列決定される。ハイブリドーマ細胞は、かかるDNAの好ましい供給源として機能する。一旦単離されると、DNAは、発現ベクターに入れられ、次いで、E.coli細胞、サルCOS細胞、チャイニーズハムスター卵巣(CHO)細胞、または免疫グロブリンタンパク質を産生しない骨髄腫細胞などの宿主細胞にトランスフェクトされて、組換え宿主細胞におけるモノクローナル抗体の合成を取得することができる。抗体の組換え産生については、以下でより詳細に説明する。
本明細書で使用される、抗体の「抗原結合部分」または「抗原結合断片」(または単に「抗体部分」もしくは「断片」)という用語は、抗原に特異的に結合する能力を保持する抗体の1つ以上の断片を指す。抗体の抗原結合機能は、完全長抗体の断片によって行われ得ることが示されている。抗体の「抗原結合部分」という用語に包含される結合断片の例には、(i)V、V、C、及びCH1ドメインからなる一価断片である、Fab断片、(ii)ヒンジ領域でジスルフィド架橋によって結合された2つのFab断片を含む二価断片である、F(ab’)2断片、(iii)V及びCH1ドメインからなるFd断片、(iv)抗体の単一アームのV及びVドメインからなるFv断片、(v)VまたはVドメインからなり得るドメイン抗体(dAb)断片(Ward,et al.,Nature,1989,341,544-546)、ならびに(vi)単離した相補性決定領域(CDR)が含まれる。Fv断片の2つのドメイン、V及びVは、別個の遺伝子によってコードされるが、これらは、組換え方法を使用して、V及びV領域が対合して、一本鎖Fv(scFv)として知られる一価分子を形成する単一タンパク質鎖としてそれらを作製することを可能にする合成リンカーによって接合され得、例えば、Bird,et al.,Science 1988,242,423-426、及びHuston,et al.,Proc.Natl.Acad.Sci.USA1988,85,5879-5883)を参照されたい。かかるscFv抗体はまた、抗体の「抗原結合部分」または「抗原結合断片」という用語に包含されることを意図している。これらの抗体断片は、当業者に知られている従来の技法を使用して得られ、断片は、無傷の抗体と同じ方法で有用性についてスクリーニングされる。
本明細書で使用される「ヒト抗体」という用語は、フレームワーク及びCDR領域の両方が、ヒト生殖細胞系免疫グロブリン配列に由来する可変領域を有する抗体を含むことを意図している。さらに、抗体が定常領域を含む場合、定常領域はまた、ヒト生殖細胞系免疫グロブリン配列に由来する。本発明のヒト抗体は、ヒト生殖細胞系免疫グロブリン配列によってコードされないアミノ酸残基を含み得る(例えば、インビトロでのランダムもしくは部位特異的変異誘発によって、またはインビボでの体細胞変異によって導入される変異)。本明細書で使用される「ヒト抗体」という用語は、マウスなどの別の哺乳動物種の生殖細胞系に由来するCDR配列が、ヒトフレームワーク配列に移植されている抗体を含むことを意図しない。
「ヒトモノクローナル抗体」という用語は、フレームワーク領域及びCDR領域の両方がヒト生殖細胞系免疫グロブリン配列に由来する可変領域を有する単一の結合特異性を示す抗体を指す。ある実施形態では、ヒトモノクローナル抗体は、不死化細胞に融合したヒト重鎖導入遺伝子及び軽鎖導入遺伝子を含むゲノムを有する、トランスジェニック非ヒト動物、例えばトランスジェニックマウスから得られたB細胞を含むハイブリドーマによって産生される。
本明細書で使用される「組換えヒト抗体」という用語は、組換え手段によって調製、発現、作成、または単離されるすべてのヒト抗体、例えば(a)ヒト免疫グロブリン遺伝子またはそれから調製されたハイブリドーマ(以下でさらに説明される)についてトランスジェニックまたはトランス染色体である動物(マウスなど)から単離された抗体、(b)ヒト抗体を発現するように形質転換された宿主細胞から、例えば、トランスフェクトーマから単離された抗体、(c)組換えコンビナトリアルヒト抗体ライブラリーから単離された抗体、及び(d)ヒト免疫グロブリン遺伝子配列を他のDNA配列にスプライシングすることを含む、任意の他の手段によって調製、発現、作成、または単離された抗体を含む。かかる組換えヒト抗体は、フレームワーク及びCDR領域がヒト生殖細胞系免疫グロブリン配列に由来する可変領域を有する。しかしながら、ある特定の実施形態では、かかる組換えヒト抗体は、インビトロ変異誘発(または、ヒトIg配列についてトランスジェニックな動物が使用される場合、インビボ体細胞変異誘発)に供され得、したがって、組換え抗体のV及びV領域のアミノ酸配列は、ヒト生殖細胞系V及びV配列に由来し、関連しているが、インビボでヒト抗体生殖細胞系レパートリー内に自然に存在しない可能性がある配列である。
本明細書で使用される場合、「アイソタイプ」は、重鎖定常領域遺伝子によってコードされる抗体クラス(例えば、IgMまたはIgG1)を指す。
「抗原を認識する抗体」及び「抗原に特異的な抗体」という句は、本明細書では「抗原に特異的に結合する抗体」という用語と交換可能に使用される。
「ヒト抗体誘導体」という用語は、抗体と別の医薬品有効成分または抗体とのコンジュゲートを含む、ヒト抗体の任意の修飾形態を指す。「コンジュゲート」、「抗体薬物コンジュゲート」、「ADC」、または「免疫コンジュゲート」という用語は、別の治療部分にコンジュゲートされた抗体またはその断片を指し、これは当該技術分野において使用可能な方法を使用して、本明細書に記載の抗体にコンジュゲートされ得る。
「ヒト化抗体」、「ヒト化抗体(複数)」、及び「ヒト化」という用語は、マウスなどの別の哺乳動物種の生殖細胞系に由来するCDR配列が、ヒトフレームワーク配列に移植されている抗体を指すことを意図している。追加のフレームワーク領域の修飾は、ヒトフレームワーク配列内で行うことができる。非ヒト(例えば、マウス)抗体のヒト化形態は、非ヒト免疫グロブリンに由来する最小限の配列を含むキメラ抗体である。ほとんどの場合、ヒト化抗体は、ヒト免疫グロブリン(レシピエント抗体)であり、レシピエントの超可変領域からの残基が、所望の特異性、親和性、及び能力を有するマウス、ラット、ウサギなどの非ヒト種(ドナー抗体)または非ヒト霊長類の15超可変領域からの残基によって置き換えられる。場合によっては、ヒト免疫グロブリンのFvフレームワーク(FR)残基は、対応する非ヒト残基によって置き換えられる。さらに、ヒト化抗体は、レシピエント抗体またはドナー抗体には見られない残基を含み得る。これらの修飾は、抗体の性能をさらに向上させるために行われる。一般に、ヒト化抗体は、超可変ループのすべてまたは実質的にすべてが非ヒト免疫グロブリンのものに対応し、FR領域のすべてまたは実質的にすべてがヒト免疫グロブリン配列のものである、少なくとも1つ、典型的には2つの可変ドメインの実質的すべてを含むことになる。ヒト化抗体はまた、任意選択で、免疫グロブリン定常領域(Fc)、典型的にはヒト免疫グロブリンの定常領域の少なくとも一部を含むであろう。さらなる詳細については、Jones,et al.,Nature1986,321,522-525、Riechmann,et al.,Nature1988,332,323-329、及びPresta,Curr.Op.Struct.Biol.1992,2,593-596を参照されたい。本明細書に記載される抗体はまた、エフェクター機能及び/またはFcR結合の改善(例えば、低減)を与えることが知られている任意のFcバリアントを用いるように修飾され得る。Fcバリアントは、例えば、国際特許出願公開第WO1988/07089A1号、同第WO1996/14339A1号、同第WO1998/05787A1号、同第WO1998/23289A1号、同第WO1999/51642A1号、同第WO99/58572A1号、同第WO2000/09560A2号、同第WO2000/32767A1号、同第WO2000/42072A2号、同第WO2002/44215A2号、同第WO2002/060919A2号、同第WO2003/074569A2号、同第WO2004/016750A2号、同第WO2004/029207A2号、同第WO2004/035752A2号、同第WO2004/063351A2号、同第WO2004/074455A2号、同第WO2004/099249A2号、同第WO2005/040217A2号、同第WO2005/070963A1号、同第WO2005/077981A2号、同第WO2005/092925A2号、同第WO2005/123780A2号、同第WO2006/019447A1号、同第WO2006/047350A2号、及び同第WO2006/085967A2号、ならびに米国特許第5,648,260号、同第5,739,277号、同第5,834,250号、同第5,869,046号、同第6,096,871号、同第6,121,022号、同第6,194,551号、同第6,242,195号、同第6,277,375号、同第6,528,624号、同第6,538,124号、同第6,737,056号、同第6,821,505号、同第6,998,253号、及び同第7,083,784号(それらの開示は参照により本明細書に組み込まれる)に開示されるアミノ酸置換のうちのいずれか1つを含み得る。
「キメラ抗体」という用語は、可変領域配列が1つの種に由来し、定常領域配列が別の種に由来する抗体、例えば、可変領域配列がマウス抗体に由来し、定常領域配列がヒト抗体に由来する抗体を指すことを意図している。
「二重特異性抗体(diabody)」は、2つの抗原結合部位を有する小さな抗体断片である。断片は、同じポリペプチド鎖(V-VまたはV-V)中に軽鎖可変ドメイン(V)に接続された重鎖可変ドメイン(V)を含む。同じ鎖上の2つのドメインをペアリングするには短すぎるリンカーを使用すると、ドメインは別のチェーンの相補ドメインとペアリングさせられ、2つの抗原結合部位が作成される。二重特異性抗体は、例えば、欧州特許第EP404,097号、国際特許公開第WO93/11161号、及びBolliger,et al.,Proc.Natl.Acad.Sci.USA1993,90,6444-6448においてより完全に記載されている。
「グリコシル化」という用語は、抗体の修飾誘導体を指す。非グリコシル化抗体は、グリコシル化を欠いている。グリコシル化は、例えば、抗原に対する抗体の親和性を増加させるように変化され得る。かかる炭水化物修飾は、例えば、抗体配列内の1つ以上のグリコシル化部位を変化させることによって達成され得る。例えば、1つ以上の可変領域フレームワークのグリコシル化部位の排除をもたらす、1つ以上のアミノ酸置換を行ない、それによってその部位でのグリコシル化を排除することができる。米国特許第5,714,350号及び同第6,350,861号に記載されているように、非グリコシル化は、抗原に対する抗体の親和性を高める可能性がある。加えてまたは代替的に、改変した種類のグリコシル化を有する抗体、例えば、フコシル残基の量が低減した低フコシル化抗体または二分GlcNac構造が増加した抗体が作製され得る。かかるグリコシル化パターンの変化は、抗体の能力を増加させることが実証されている。かかる炭水化物修飾は、例えば、抗体をグリコシル化機構が変化した宿主細胞で発現させることによって達成され得る。グリコシル化機構が変化した細胞については、当該技術分野で説明されており、本発明の組換え抗体を発現させ、それによりグリコシル化が変化した抗体を産生する宿主細胞として使用され得る。例えば、Ms704、Ms705、及びMs709細胞株で発現される抗体が、それらの炭水化物上のフコースを欠くように、細胞株Ms704、Ms705、及びMs709は、フコシルトランスフェラーゼ遺伝子FUT8(アルファ(1,6)フコシルトランスフェラーゼ)を欠く。Ms704、Ms705、及びMs709 FUT8-/-細胞株は、2つの置換ベクターを使用したCHO/DG44細胞中のFUT8遺伝子の標的破壊によって作成された(例えば、米国特許公開第2004/0110704号またはYamane-Ohnuki,et al.,Biotechnol.Bioeng.,2004,87,614-622を参照)。別の例として、欧州特許第EP1,176,195号は、フコシルトランスフェラーゼをコードし、それによりかかる細胞株で発現される抗体が、アルファ1,6結合関連酵素を低減または排除することによって低フコシル化を示す、機能的に破壊されたFUT8遺伝子を有する細胞株を説明しており、抗体のFc領域に結合するN-アセチルグルコサミンにフコースを付加するための酵素活性が低いか、または酵素活性を有しない細胞株、例えばラット骨髄腫細胞株YB2/0(ATCC CRL 1662)についても説明している。国際特許公開第WO03/035835号は、フコースをAsn(297)結合型炭水化物に付着させる能力が低減し、さらにその宿主細胞で発現される抗体の低フコシル化ももたらすバリアントCHO細胞株、Lec13細胞について説明している(Shields,et al.,J.Biol.Chem.2002,277,26733-26740も参照)。国際特許公開第WO99/54342号は、糖タンパク質修飾グリコシルトランスフェラーゼ(例えば、ベータ(1,4)-N-アセチルグルコサミニルトランスフェラーゼIII(GnTIII))を発現するように操作され、それにより操作された細胞株で発現される抗体が、二分性GlcNac構造の増加を示し、抗体のADCC活性の増加をもたらす、細胞株について記載している(Umana,et al.,Nat.Biotech.1999,17,176-180も参照)。代替てきに、フコシダーゼ酵素を使用して、抗体のフコース残基を切断でき得る。例えば、フコシダーゼアルファ-L-フコシダーゼは、Tarentino,et al.,Biochem.1975,14,5516-5523に記載されているように、抗体からフコシル残基を除去する。
「ペグ化」は、1つ以上のPEG基が抗体または抗体断片に付着する条件下で、PEGの反応性エステルまたはアルデヒド誘導体などのポリエチレングリコール(PEG)と反応させる、修飾抗体またはその断片を指す。ペグ化は、例えば、抗体の生物学的(例えば、血清)半減期を増加させることができる。好ましくは、ペグ化は、反応性PEG分子(または類似の反応性水溶性ポリマー)とのアシル化反応またはアルキル化反応を介して実行される。本明細書で使用される場合、「ポリエチレングリコール」という用語は、モノ(C~C10)アルコキシ-もしくはアリールオキシ-ポリエチレングリコール、またはポリエチレングリコール-マレイミドなどの、他のタンパク質を誘導体化するために使用されているPEGの形態のうちのいずれかを包含することが意図される。ペグ化される抗体は、非グリコシル化抗体であり得る。ペグ化のための方法は、当該技術分野で知られており、例えば欧州特許第EP0154316号及び同第EP0401384号、ならびに米国特許第5,824,778号(各々の開示は参照により本明細書に組み込まれる)に記載されているように、本発明の抗体に適用することができる。
「バイオシミラー」という用語は、モノクローナル抗体またはタンパク質を含む、臨床的に不活性な成分にわずかな違いがあるにもかかわらず、米国で認可された参照バイオ製品と非常に類似しており、製品の安全性、純度、及び効力に関してバイオ製品と参照製品との間に臨床的に意味のある差異がない、バイオ製品を意味する。さらに、類似のバイオまたは「バイオシミラー」医薬品は、欧州医薬品庁によって既に使用が許可されている別のバイオ医薬品に類似したバイオ医薬品である。「バイオシミラー」という用語は、他の国及び地域の規制機関によっても同義的に使用されている。バイオ製品またはバイオ医薬品は、細菌または酵母などの生物源によって作製された、またはそれに由来する医薬品である。それらは、ヒトインスリンもしくはエリスロポエチンなどの比較的小さな分子、またはモノクローナル抗体などの複雑な分子からなり得る。例えば、参照IL-2タンパク質がアルデスロイキン(PROLEUKIN)である場合、アルデスロイキンに関して薬物規制当局によって承認されたタンパク質は、アルデスロイキンの「バイオシミラー」であるか、またはアルデスロイキンの「そのバイオシミラー」である。欧州では、類似のバイオまたは「バイオシミラー」医薬品は、欧州医薬品庁(EMA)によって既に使用が許可されている別のバイオ医薬品に類似したバイオ医薬品である。欧州における同様の生物学的用途に関連する法的根拠は、補正されたRegulation(EC)No 726/2004の第6条及びDirective 2001/83/ECの第10(4)条であり、したがって欧州では、バイオシミラーは、Regulation(EC)No 726/2004の第6条及びDirective 2001/83/ECの第10(4)条の下で、認可または認可申請の対象について認可、承認され得る。既に認可されているオリジナルのバイオ医薬品は、欧州では「参照医薬品」と称されることがある。バイオシミラーとみなされる製品に対する要件のうちのいくつかは、バイオシミラー医薬品に関するCHMPガイドラインに概説されている。さらに、モノクローナル抗体バイオシミラーに関連するガイドラインを含む製品固有のガイドラインは、EMAによって製品毎に提供され、そのウェブサイトで公開されている。本明細書に記載のバイオシミラーは、品質特徴、生物活性、作用機序、安全性プロファイル、及び/または有効性の点で、参照医薬品に類似している可能性がある。さらに、バイオシミラーは、参照医薬品と同じ状態を治療するために使用され得るか、または使用を意図され得る。したがって、本明細書に記載のバイオシミラーは、参照医薬品と類似または非常に類似した品質特徴を有するとみなされ得る。代替的に、またはさらに、本明細書に記載のバイオシミラーは、参照医薬品と類似または非常に類似した生物活性を有するとみなされ得る。代替的に、またはさらに、本明細書に記載のバイオシミラーは、参照医薬品と類似または非常に類似した安全性プロファイルを有するとみなされ得る。代替的に、またはさらに、本明細書に記載のバイオシミラーは、参照医薬品と類似または非常に類似した効力を有するとみなされ得る。本明細書に記載されているように、欧州におけるバイオシミラーは、EMAによって認可された参照医薬品と比較される。しかしながら、場合によっては、バイオシミラーは、特定の研究で欧州経済領域外で認可されたバイオ医薬品(EEA認可されていない「コンパレーター」)と比較される場合がある。かかる研究には、例えば、特定の臨床研究及びインビボ非臨床研究が含まれる。本明細書で使用される場合、「バイオシミラー」という用語は、EEA認可されていないコンパレーターと比較された、または比較され得るバイオ医薬品にも関する。特定のバイオシミラーは、抗体、抗体断片(例えば、抗原結合部分)、及び融合タンパク質などのタンパク質である。タンパク質バイオシミラーは、ポリペプチドの機能に有意な影響を及ぼさない、アミノ酸構造にわずかな修飾(例えば、アミノ酸の欠失、付加、及び/または置換を含む)を有するアミノ酸配列を有し得る。バイオシミラーは、その参照医薬品のアミノ酸配列に対して97%以上、例えば、97%、98%、99%、または100%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含み得る。バイオシミラーは、その違いが医薬品の安全性及び/または有効性の変化をもたらさないならば、1つ以上の翻訳後修飾、例えば、限定されないが、参照医薬品の翻訳後修飾とは異なる、グリコシル化、酸化、脱アミド化、及び/または切断を含み得る。バイオシミラーは、参照医薬品と同一または異なるグリコシル化パターンを有し得る。特に、排他的ではないが、バイオシミラーは、その違いが参照医薬品に関連する安全性の懸念に対処するか、対処することを意図している場合、異なるグリコシル化パターンを有し得る。加えて、バイオシミラーは、医薬品の安全性及び有効性が損なわれないならば、例えば、その強度、剤形、製剤、賦形剤、及び/または提示において参照医薬品から逸脱する可能性がある。バイオシミラーは、参照医薬品と比較して、例えば薬物動態(PK)及び/または薬力学的(PD)プロファイルの違いを含み得るが、それでも、認可される、または認可に適しているとみなされるように、参照医薬品と十分に類似しているとみなされる。特定の状況において、バイオシミラーは、参照医薬品と比較して異なる結合特徴を示し、異なる結合特徴は、EMAなどの規制当局によって類似のバイオ製品としての認可の障壁ではないとみなされる。「バイオシミラー」という用語は、他の国及び地域の規制機関によっても同義的に使用されている。
III.効力アッセイ方法及び組成物
いかなる特定の理論にも限定されることなく、商業的に実行可能なTIL及びT細胞効力アッセイは、ネオ抗原発現標的細胞の利用不可能性、患者とその腫瘍によって発現されるネオ抗原との間の重複の欠如、ならびにアッセイを構築するためにすべての関連するネオ抗原を時間内に同定することができないことによって制限されると考えられる。その結果、場合によっては標的ベースのアッセイを使用して規制上の承認を受けている形質導入されたキメラ抗原受容体を使用する市販及び臨床T細胞療法とは異なり、標的ベースのアッセイは、TIL、MIL、またはPBL療法または製品などのポリクローナルT細胞製品のための効果的ながん療法に必要な時間スケールで実行可能ではない。同時に、ビーズベースのアッセイは、TILまたはT細胞の自然な活性化及び殺傷能力を再現することができないことによって制限される。例えば、抗CD3コーティングを利用するビーズベースまたはプレートベースのアッセイは、TCR自体に結合することがより好ましいときに、TCRと非共有結合的に会合しているTILまたはT細胞上のCD3ε鎖に結合する。したがって、CD3を用いるビーズベースのアッセイの欠点は、それらの相互作用のためにTCRのアルファ及びベータ成分を使用しないことである。ビーズ上のCD28またはCD137(4-1BB)などの他の共刺激分子の存在はまた、少なくとも、これらの共刺激分子の活性化が、TILなどの腫瘍に存在する細胞に対して選択性が低いアッセイをもたらすため、不自然であまり好ましくない相互作用をもたらす。本発明は、これらの問題に対する解決策を提供する。いかなる特定の理論にも限定されることなく、TIL、MIL、またはPBLを含むT細胞のTCRとの標的細胞上のMHCまたはHLAの相互作用は、がんのための療法の製造または提供を支援するためのその効力、同一性、または他の有用な特性などの、TIL、MIL、またはPBLを含むT細胞の1つ以上の特性を評価するために、MHC陰性対照と共培養されたTIL、MIL、またはPBLを含むT細胞によって産生された分析物と比較され得る分析物を産生すると考えられる。さらに、いかなる特定の理論にも限定されることなく、TIL及びMILなどのT細胞が腫瘍の部位に見出されるか、またはPBLが腫瘍曝露によって以前に活性化されているため、TIL、MIL、及びPBLを含むそのようなT細胞は、既にクロスプライミングまたはプライミングされたT細胞であり、CD28及び4-1BBが既に活性化されていると考えられる。
ある実施形態では、本発明は、培地中で共培養されたRaji細胞及びTILなどのT細胞を含む効力アッセイ組成物を含む。ある実施形態では、本発明は、培地中で共培養されたThp1細胞及びTILなどのT細胞を含む効力アッセイ組成物を含む。ある実施形態では、本発明は、培地中で共培養されたRamos細胞及びTILなどのT細胞を含む効力アッセイ組成物を含む。ある実施形態では、本発明は、培地中で共培養されたU937細胞及びTILなどのT細胞を含む効力アッセイ組成物を含む。ある実施形態では、本発明は、培地中で共培養されたDaudi細胞及びTILなどのT細胞を含む効力アッセイ組成物を含む。ある実施形態では、効力アッセイ組成物は、培地中で共培養され、陰性対照として使用されるK562細胞及びTILなどのT細胞を含む。ある実施形態では、効力アッセイ組成物は、培地中で共培養され、混合リンパ球反応(MLR)陽性対照として使用される末梢血単核細胞(PBMC)及びTILなどのT細胞を含む。ある実施形態では、前述の実施形態におけるTIL及びPBMCは、同じ患者由来である。ある実施形態では、TILは、Gen2もしくはGen3プロセス、または本明細書に記載の他の製造プロセスを使用して製造される。ある実施形態では、TILは、少なくとも1つのREPステップを使用して製造される。ある実施形態では、効力アッセイは、本明細書に記載の拡張または製造プロセスを使用して産生されたTIL、MIL、またはPBLを使用して行われる。ある実施形態では、TILは、米国特許出願公開第US2018/0282694A1または米国特許第10,130,659号、同第10,166,257号、同第10,272,113号、同第10,363,273号、同第10,398,734号、同第10,420,799号、同第10,463,697号、同第10,537,595号、同第10,646,517号、同第10,653,723号、同第10,693,330号、同第10,695,372号、同第10,894,063号、及び同第10,905,718号(これらの各々の開示は参照により本明細書に組み込まれる)に記載のプロセスを用いて製造した後、本明細書に記載の効力アッセイで試験される。ある実施形態では、TILは、米国特許第10,918,666号(その開示は参照により本明細書に組み込まれる)に記載のプロセスを用いて製造した後に、本明細書に記載の効力アッセイで試験される。ある実施形態では、TILは、米国特許出願公開第2020/0277573A1号(その開示は参照により本明細書に組み込まれる)に記載のプロセスを用いて製造した後に、本明細書に記載の効力アッセイで試験される。ある実施形態では、TILは、国際特許出願公開第2019/210131A1号(その開示は参照により本明細書に組み込まれる)に記載のプロセスを用いて製造した後に、本明細書に記載の効力アッセイで試験される。ある実施形態では、TILは、国際特許出願公開第2019/136456A1号(その開示は参照により本明細書に組み込まれる)に記載のプロセスを用いて製造した後に、本明細書に記載の効力アッセイで試験される。ある実施形態では、TILは、国際特許出願公開第2021/123832A1号(その開示は参照により本明細書に組み込まれる)に記載のプロセスを用いて製造した後に、本明細書に記載の効力アッセイで試験される。ある実施形態では、MIL及びPBLは、米国特許出願公開第2020/0224161A1号(その開示は参照により本明細書に組み込まれる)に記載のプロセスを用いて製造した後に、本明細書に記載の効力アッセイで試験される。ある実施形態では、TILは、国際特許出願公開第2019/145711A1号(その開示は参照により本明細書に組み込まれる)に記載のプロセスを用いて製造した後に、本明細書に記載の効力アッセイで試験される。ある実施形態では、TILは、国際特許出願公開第2020/152451A1号(その開示は参照により本明細書に組み込まれる)に記載のプロセスを用いて製造した後に、本明細書に記載の効力アッセイで試験される。
A.アッセイ方法
ある実施形態では、本発明は、T細胞受容体に結合可能な標的細胞を使用してT細胞製品の効力を決定するための方法を含む。ある実施形態では、本発明は、T細胞またはTIL、MIL、もしくはPBL TCR複合体と、標的細胞のHLA-ペプチド複合体との同種異系相互作用(MHC優性認識とも称される)に基づくアッセイを含む。ある実施形態では、本発明は、T細胞またはTIL、MIL、もしくはPBL TCR複合体と、標的細胞とのMHC優性認識を利用して分析物を産生するアッセイを含み、これは、MHC陰性対照とのT細胞またはTIL共培養によって産生された分析物と比較される。ある実施形態では、T細胞またはTIL、MIL、もしくはPBL TCR複合体の、標的細胞への結合は、そのアルファ(α)鎖及びベータ(β)鎖を介して起こる。ある実施形態では、標的細胞は、HLAを発現する。ある実施形態では、標的細胞は、B細胞である。ある実施形態では、標的細胞は、B細胞リンパ芽細胞またはBリンパ芽細胞である。ある実施形態では、標的細胞は、バーキットリンパ腫細胞である。ある実施形態では、標的細胞は、骨髄系細胞である。ある実施形態では、標的細胞は、単球である。ある実施形態では、標的細胞は、急性単球性白血病細胞である。ある実施形態では、標的細胞は、M5サブタイプの急性単球性白血病細胞である。ある実施形態では、標的細胞は、Raji細胞またはその誘導体、バリアント、修飾、もしくは子孫である。ある実施形態では、標的細胞は、Thp1細胞またはその誘導体、バリアント、修飾、もしくは子孫である。ある実施形態では、標的細胞は、Ramos細胞、またはその誘導体、バリアント、修飾、もしくは子孫である。ある実施形態では、標的細胞は、U937細胞またはその誘導体、バリアント、修飾、もしくは子孫である。ある実施形態では、標的細胞は、Daudi細胞またはその誘導体、バリアント、修飾、もしくは子孫である。ある実施形態では、標的細胞は、メラノサイト細胞である。ある実施形態では、標的細胞は、HLA-A-02陽性メラノサイト細胞である。ある実施形態では、標的細胞は、黒色腫細胞である。ある実施形態では、標的細胞は、HLA-A-02陽性黒色腫細胞である。ある実施形態では、標的細胞は、Sk-MEL-5、Malme-3M、SK-MEL-28、SK-MEL-3、SH-4、SK-MEL-24、RPMI-7951、SK-MEL-1、A375、G-361、及びそれらの組み合わせからなる群から選択される黒色腫細胞である。
ある実施形態では、本発明は、腫瘍細胞と、本明細書に記載の拡張または製造プロセスを使用して産生されたTIL、MIL、またはPBLなどのT細胞との間で生じるアロ反応性TCRまたはHLA認識に基づくアッセイを含む。ある実施形態では、本発明は、Raji、Thp1、Ramos、U937、もしくはDaudi細胞、またはその誘導体、バリアント、修飾、もしくは子孫と、本明細書に記載の拡張または製造プロセスを使用して産生されたTIL、MIL、またはPBLなどのT細胞との間で生じるアロ反応性TCRまたはHLA認識に基づくアッセイを含む。ある実施形態では、本発明は、本明細書に記載の陰性対照と組み合わせた前述の実施形態の使用を含む。ある実施形態では、陰性対照は、MHC優性認識に基づくT細胞アッセイと比較するための、TIL、MIL、またはPBLなどのT細胞の基礎またはベースライン活性レベルとして機能する。ある実施形態では、陰性対照は、HLAクラスI及び/またはHLAクラスII発現を欠く細胞株である。ある実施形態では、陰性対照は、MHCクラスI及び/またはMHCクラスII発現を欠く細胞株である。ある実施形態では、陰性対照は、アッセイ変動性を制御するためのHLAまたはMHCを欠く細胞株である。ある実施形態では、陰性対照は、MHC優性認識が効力アッセイの一次変数であることを実証するための、HLAまたはMHCを欠く細胞株である。
ある実施形態では、本発明は、TIL製品、MIL製品、またはPBL製品などのT細胞製品をK562細胞と共培養することによる、本明細書に記載の陰性対照としてのK562細胞、またはその誘導体、バリアント、修飾、もしくは子孫の使用を含む。陰性対照としてのK562細胞の使用は、本明細書に記載のアッセイとともに、ならびにIFN-γに対する抗CD3プレートアッセイなどのビーズ及びプレート結合抗体刺激バイオアッセイとともに用いることができる。
ある実施形態では、本発明は、TIL製品、MIL製品、またはPBL製品などのT細胞製品の、陰性対照としての標的細胞または標的細胞の組み合わせとの共培養による、1つ以上のHLA遮断抗体、またはそれらの断片、誘導体、バリアント、もしくは修飾の使用を含む。陰性対照としてのHLA遮断抗体または複数のHLA遮断抗体の使用は、本明細書に記載のアッセイとともに用いることができる。
いくつかの実施形態では、本明細書に記載されるか、または当該技術分野で公知の方法によって産生された拡張TILの効力及び/または機能性を調べる。拡張TILの効力及び/または機能性を調べることは、臨床TIL製品ロットの特徴付けを可能にする。ある実施形態では、TIL効力は、任意選択で、K562細胞と比較して、Raji細胞との共培養時に、マーカー陽性細胞のパーセンテージまたは平均蛍光強度(MFI)として表される選択的表面マーカーの増加した発現として定義される。あるいは、Raji細胞、K562及びTILを単独で培養してもよい。いくつかの実施形態では、TILまたはMILが取得される同じ患者由来のPBMCを、対照として使用する。いくつかの実施形態では、ビーズベースのCD3/CD28刺激を、対照として使用することもできる。いくつかの実施形態では、ビーズベースのCD3/CD28/CD137刺激を、対照として使用することもできる。いくつかの実施形態では、CD28に対するマウスモノクローナル抗体の添加を使用して、T細胞応答を増幅するための追加の共刺激を確実にする。いくつかの実施形態では、PBMCは、MLR応答の陽性対照として各TILロットと共培養されてもよい。
ある実施形態では、効力アッセイは、共培養が30分、1時間、2時間、3時間、4時間、5時間、6時間、7時間、8時間、9時間、10時間、11時間、12時間、13時間、14時間、15時間、16時間、17時間、18時間、19時間、20時間、21時間、22時間、23時間、24時間、25時間、26時間、27時間、28時間、29時間、30時間、31時間、32時間、33時間、34時間、35時間、36時間、37時間、38時間、39時間、40時間、41時間、42時間、43時間、44時間、45時間、46時間、47時間、48時間、49時間、及び50時間からなる群から選択される期間にわたって行われる、共培養ステップを含む。ある実施形態では、効力アッセイは、共培養が6時間、12時間、18時間、24時間、及び32時間からなる群から選択される期間にわたって行われる、共培養ステップを含む。
ある実施形態では、効力アッセイは、共培養が30分、1時間、2時間、3時間、4時間、5時間、6時間、7時間、8時間、9時間、10時間、11時間、12時間、13時間、14時間、15時間、16時間、17時間、18時間、19時間、20時間、21時間、22時間、23時間、24時間、25時間、26時間、27時間、28時間、29時間、30時間、31時間、32時間、33時間、34時間、35時間、36時間、37時間、38時間、39時間、40時間、41時間、42時間、43時間、44時間、45時間、46時間、47時間、48時間、49時間、及び50時間からなる群から選択される期間にわたって行われる、標的細胞及びT細胞(TIL、MIL、またはPBLを含む)共培養ステップを含む。ある実施形態では、効力アッセイは、共培養が6時間、12時間、18時間、24時間、及び32時間からなる群から選択される期間にわたって行われる、共培養ステップを含む。
ある実施形態では、効力アッセイは、共培養が30分、1時間、2時間、3時間、4時間、5時間、6時間、7時間、8時間、9時間、10時間、11時間、12時間、13時間、14時間、15時間、16時間、17時間、18時間、19時間、20時間、21時間、22時間、23時間、24時間、25時間、26時間、27時間、28時間、29時間、30時間、31時間、32時間、33時間、34時間、35時間、36時間、37時間、38時間、39時間、40時間、41時間、42時間、43時間、44時間、45時間、46時間、47時間、48時間、49時間、及び50時間からなる群から選択される期間にわたって行われる、陰性対照細胞及びT細胞(TIL、MIL、またはPBLを含む)共培養ステップを含む。ある実施形態では、効力アッセイは、共培養が6時間、12時間、18時間、24時間、及び32時間からなる群から選択される期間にわたって行われる、共培養ステップを含む。
ある実施形態では、本発明は、臨床的利益に関連するTIL、MIL、PBLまたは他のT細胞製品の効力を決定するための効力アッセイ方法を含む。臨床的利益は、インビトロでの細胞機能の実証、疾患制御率、全奏効率、奏効期間、または臨床的利益もしくは潜在的臨床的利益の他の科学的尺度を含むが、これらに限定されない、複数の方法で測定することができる。
いくつかの実施形態では、拡張または製剤化されたTIL、MIL、及びPBLの効力は、本明細書に記載の共培養アッセイによって調べられる。拡張または製剤化されたTIL、MIL、及びPBLの効力を調べることは、TIL製品ロット、MIL製品ロット、またはPBL製品ロットの特徴付けを可能にする。活性化とも称されるTIL、MIL、またはPBLの効力は、TIL、MIL、またはPBLの、K562細胞との共培養と比較して、TIL、MIL、またはPBLの、Raji細胞またはその誘導体、バリアント、修飾、もしくは子孫との共培養時に、マーカー陽性細胞のパーセンテージまたは平均蛍光強度(MFI)として表される選択的表面マーカーの増加した発現として定義される。
ある実施形態では、本発明は、T細胞受容体に結合することができる標的細胞を使用してT細胞製品の効力を決定するための方法を含み、効力を決定するための方法は、アロ認識アッセイである。ある実施形態では、本発明は、T細胞受容体に結合することができる標的細胞を使用してT細胞製品の効力を決定するための方法を含み、効力を決定するための方法は、アロ認識アッセイである。ある実施形態では、本発明は、T細胞受容体に結合することができるRaji細胞、またはその誘導体、バリアント、修飾、もしくは子孫を使用してT細胞製品の効力を決定するための方法を含み、効力を決定するための方法は、アロ認識アッセイである。ある実施形態では、本発明は、T細胞受容体に結合することができるThp1細胞、またはその誘導体、バリアント、修飾、もしくは子孫を使用してT細胞製品の効力を決定するための方法を含み、効力を決定するための方法は、アロ認識アッセイである。ある実施形態では、本発明は、T細胞受容体に結合することができるRamos細胞、またはその誘導体、バリアント、修飾体、もしくは子孫を使用してT細胞製品の効力を決定するための方法を含み、効力を決定するための方法は、アロ認識アッセイである。ある実施形態では、本発明は、T細胞受容体に結合することができるU937細胞、またはその誘導体、バリアント、修飾、もしくは子孫を使用してT細胞製品の効力を決定するための方法を含み、効力を決定するための方法は、アロ認識アッセイである。ある実施形態では、本発明は、T細胞受容体に結合することができるDaudi細胞、またはその誘導体、バリアント、修飾、もしくは子孫を使用してT細胞製品の効力を決定するための方法を含み、効力を決定するための方法は、アロ認識アッセイである。
ある実施形態では、本発明は、T細胞受容体に結合可能な標的細胞を使用してT細胞製品の効力を決定するための方法を含み、タンパク質の分泌または発現は、酵素結合免疫吸着アッセイ(ELISA)検出方法を使用して検出される。さらなる実施形態では、ELISA方法は、ELLAシステム(BioTechne,Inc.,San Jose,CA,USAのProteinSimple部門から入手可能)、ISOPLEXISシステム(Isoplexis,Inc.,Branford,CT,USAから入手可能)、またはLUNARISシステム(AYOXXA Biosystems GmbH,Cologne,Germanyから入手可能)などの自動化またはロボットシステムを使用して自動化される。ある実施形態では、効力アッセイ検出は、LUMINEXシステム(BioTechne,Inc.,Minnesota,MN,USAのR&D Systems部門から入手可能)などの多重アッセイ検出を使用して行われる。ある実施形態では、本発明は、フローサイトメトリー検出方法を使用する効力アッセイ方法を含む。ある実施形態では、本発明は、分泌タンパク質に対する効力アッセイ方法を含む。ある実施形態では、本発明は、細胞表面または結合タンパク質に対する効力アッセイ方法を含む。ある実施形態では、本発明は、結合アッセイ検出方法を使用する効力アッセイ方法を含む。ある実施形態では、ELLAシステムは、本明細書に記載の共培養アッセイの活性化後のIFN-γ濃度を測定し、共培養から収集された上清は、各マルチウェル(72ウェルなど)の商業的に検証されたカートリッジでのIFN-γ産生についてスクリーニングされる。ある実施形態では、ELLA自動化システムは、ダイナミックレンジ内の感度の4つのログを含む、サブピコグラムレベルの感度まで行う。ある実施形態では、アッセイの反復性及び精度は、従来のELISA方法と比較して、ELLAシステムを使用して手順上のエラーを最小限に抑えることによって増加する。
ある実施形態では、本発明は、T細胞受容体に結合可能な標的細胞を使用してT細胞製品の効力を決定するための方法を含み、分析物の分泌または発現は、検出方法を使用して検出される。ある実施形態では、検出される分析物は、タンパク質である。ある実施形態では、検出される分析物は、サイトカインである。ある実施形態では、検出される分析物は、インターフェロンである。ある実施形態では、検出される分析物は、IFN-αまたはIFNαとも称される、インターフェロン-アルファである。ある実施形態では、検出される分析物は、IFN-βまたはIFNβとも称される、インターフェロン-アルファである。ある実施形態では、検出される分析物は、IFN-γまたはIFNγとも称される、インターフェロン-ガンマである。ある実施形態では、検出される分析物は、GzmBとも称される、グランザイムBである。ある実施形態では、検出される分析物は、パーフォリンである。ある実施形態では、検出される分析物は、TNF-αまたはTNFαとも称される、腫瘍壊死因子アルファである。ある実施形態では、検出される分析物は、インターロイキンである。ある実施形態では、検出される分析物は、IL-1α、IL-1β、IL-2、IL-3、IL-4、IL-5、IL-6、IL-8、IL-9、IL-10、IL-13、IL-14、IL-16、IL-17、IL-18、IL-22、IL-25、またはIL-26である。ある実施形態では、検出される分析物は、CD25である。ある実施形態では、検出される分析物は、CD69である。ある実施形態では、検出される分析物は、CD137(4-1BB)である。ある実施形態では、検出される分析物は、CD134(OX40)である。ある実施形態では、検出される分析物は、CCL4である。ある実施形態では、検出される分析物は、CD150、別名SLAM、SLAM F1、またはシグナルリンパ球活性化分子1である。ある実施形態では、検出される分析物は、KLRG1である。ある実施形態では、検出される分析物は、KLRG1である。ある実施形態では、検出される分析物は、分泌MIP-1βである。
ある実施形態では、本発明は、T細胞受容体に結合可能な標的細胞を使用してT細胞製品の効力を決定するための方法を含み、分析物の分泌または発現は、検出方法を使用して検出され、T細胞製品は、TIL製品であり、分析物は、CD25、CD69、CD134、CD137、及びCD150からなる群から選択される細胞表面マーカーである。
ある実施形態では、本発明は、T細胞受容体に同種異系結合することができる細胞を使用してT細胞製品の効力を決定するための方法を含み、MHC I及びMHC II発現を欠く細胞を含む陰性対照を、T細胞製品(TIL製品、MIL製品またはPBL製品など)の、標的細胞との共培養との比較に使用する。ある実施形態では、本発明は、T細胞受容体に同種異系結合することができるRaji細胞を使用してTIL製品の効力を決定するための方法を含み、MHC I及びMHC II発現を欠くK562細胞を含む陰性対照を、TIL製品の、Raji細胞との共培養との比較に使用する。
いくつかの実施形態では、Raji細胞との共培養時のマーカー陽性細胞のパーセンテージまたは平均蛍光強度(MFI)として表される選択的な表面マーカーの発現の増加は、K562細胞と比較して、少なくとも10%、少なくとも15%、少なくとも20%、少なくとも30%、少なくとも40%、少なくとも50%、少なくとも60%、少なくとも70%、少なくとも80%、少なくとも90%、または少なくとも100%の増加である。
いくつかの実施形態では、Raji細胞との共培養時のマーカー陽性細胞のパーセンテージまたは平均蛍光強度(MFI)として表される選択的な表面マーカーの発現の増加は、K562細胞と比較して、少なくとも10%、少なくとも15%、少なくとも20%、少なくとも30%、少なくとも40%、少なくとも50%、少なくとも60%、少なくとも70%、少なくとも80%、少なくとも90%、または少なくとも100%の増加である。
いくつかの実施形態では、本明細書に記載の共培養方法からの上清を、共培養から除去した直後に試験する。ある実施形態では、本明細書に記載の共培養方法からの上清を、共培養からの除去の1時間、2時間、3時間、4時間、5時間、6時間、7時間、8時間、10時間、12時間、18時間、24時間、または48時間後に試験する。ある実施形態では、本明細書に記載の共培養方法からの上清は、共培養からの除去後に凍結され、後で試験のために解凍される。いくつかの実施形態では、本明細書に記載の共培養方法からの上清を、IFN-γ、グランザイムB、TNF-α、CCL4、及び/またはMIP-1β分泌について評価する。
いくつかの実施形態では、本発明は、任意選択で、アゴニストまたは超アゴニスト抗CD28抗体を用いて、a)Raji細胞及びK562細胞を照射するステップと、(b)照射されたRaji細胞及び照射されたK562細胞を、TILと以下の標的比(50:1、25:1、12.5:1、6.25:1、3:1、1:1、1:3、1:6.25、1:12.5、1:25)のうちの1つ以上で共培養するステップと、(c)6~24時間後に、ステップ(b)において共培養細胞から上清を収集するステップと、(d)ステップ(b)から細胞を採取し、T細胞活性化の表面マーカー発現を測定するステップと、(e)ステップ(c)において収集された共培養細胞からの上清を、T細胞活性化のマーカーについてアッセイするステップと、を含む、TIL活性をアッセイするための方法を提供する。
いくつかの実施形態では、拡張TILの効力及び/または機能性は、TILの凍結保存前に調べられる。いくつかの実施形態では、拡張TILの効力及び/または機能性は、凍結保存前に調べられる。ある実施形態では、TIL製品、MIL製品、またはPBL製品の効力は、医薬品の放出試験の一部として調べられる。ある実施形態では、TIL製品、MIL製品、またはPBL製品の効力は、医薬品の安定性試験の一部として、例えば、凍結保存された製品の解凍後、または以前に解凍された、もしくは異なる環境条件下で定義された期間の間決して凍結されなかった製品の貯蔵後に調べられる。
いくつかの実施形態では、Raji細胞との共培養時のマーカー陽性細胞のパーセンテージまたは平均蛍光強度(MFI)として表される選択的な表面マーカーの発現の増加は、K562細胞と比較して、少なくとも10%、少なくとも15%、少なくとも20%、少なくとも30%、少なくとも40%、少なくとも50%、少なくとも60%、少なくとも70%、少なくとも80%、少なくとも90%、または少なくとも100%の増加である。
いくつかの実施形態では、Raji細胞との共培養時のマーカー陽性細胞のパーセンテージまたは平均蛍光強度(MFI)として表される選択的表面マーカーの発現の増加は、K562細胞と比較して、少なくとも1倍、少なくとも1.5倍、少なくとも2倍、少なくとも2.5倍、少なくとも3倍、少なくとも3.5倍、少なくとも4倍、少なくとも4.5倍、少なくとも5倍、少なくとも5.5倍、少なくとも6倍、少なくとも6.5倍、少なくとも7倍、少なくとも7.5倍、少なくとも8倍、少なくとも8.5倍、少なくとも9倍、少なくとも9.5倍、少なくとも10倍、少なくとも11倍、少なくとも12倍、少なくとも13倍、少なくとも14倍、少なくとも15倍、少なくとも16倍、少なくとも17倍、少なくとも18倍、少なくとも19倍、少なくとも20倍、少なくとも25倍、少なくとも30倍、少なくとも35倍、少なくとも40倍、少なくとも45倍、少なくとも50倍、少なくとも55倍、少なくとも60倍、少なくとも70倍、少なくとも80倍、少なくとも90倍、または少なくとも100倍の増加である。
いくつかの実施形態では、Raji細胞との共培養時のマーカー陽性細胞のパーセンテージまたは平均蛍光強度(MFI)として表されるCD25の発現の増加は、K562細胞と比較して、少なくとも10%、少なくとも15%、少なくとも20%、少なくとも30%、少なくとも40%、少なくとも50%、少なくとも60%、少なくとも70%、少なくとも80%、少なくとも90%、または少なくとも100%の増加である。
いくつかの実施形態では、Raji細胞との共培養時のマーカー陽性細胞のパーセンテージまたは平均蛍光強度(MFI)として表されるCD25の発現の増加は、K562細胞と比較して、少なくとも1倍、少なくとも1.5倍、少なくとも2倍、少なくとも2.5倍、少なくとも3倍、少なくとも3.5倍、少なくとも4倍、少なくとも4.5倍、少なくとも5倍、少なくとも5.5倍、少なくとも6倍、少なくとも6.5倍、少なくとも7倍、少なくとも7.5倍、少なくとも8倍、少なくとも8.5倍、少なくとも9倍、少なくとも9.5倍、少なくとも10倍、少なくとも11倍、少なくとも12倍、少なくとも13倍、少なくとも14倍、少なくとも15倍、少なくとも16倍、少なくとも17倍、少なくとも18倍、少なくとも19倍、少なくとも20倍、少なくとも25倍、少なくとも30倍、少なくとも35倍、少なくとも40倍、少なくとも45倍、少なくとも50倍、少なくとも55倍、少なくとも60倍、少なくとも70倍、少なくとも80倍、少なくとも90倍、または少なくとも100倍の増加である。
いくつかの実施形態では、Raji細胞との共培養時のマーカー陽性細胞のパーセンテージまたは平均蛍光強度(MFI)として表されるCD69の発現の増加は、K562細胞と比較して、少なくとも10%、少なくとも15%、少なくとも20%、少なくとも30%、少なくとも40%、少なくとも50%、少なくとも60%、少なくとも70%、少なくとも80%、少なくとも90%、または少なくとも100%の増加である。
いくつかの実施形態では、Raji細胞との共培養時のマーカー陽性細胞のパーセンテージまたは平均蛍光強度(MFI)として表されるCD69の発現の増加は、K562細胞と比較して、少なくとも1倍、少なくとも1.5倍、少なくとも2倍、少なくとも2.5倍、少なくとも3倍、少なくとも3.5倍、少なくとも4倍、少なくとも4.5倍、少なくとも5倍、少なくとも5.5倍、少なくとも6倍、少なくとも6.5倍、少なくとも7倍、少なくとも7.5倍、少なくとも8倍、少なくとも8.5倍、少なくとも9倍、少なくとも9.5倍、少なくとも10倍、少なくとも11倍、少なくとも12倍、少なくとも13倍、少なくとも14倍、少なくとも15倍、少なくとも16倍、少なくとも17倍、少なくとも18倍、少なくとも19倍、少なくとも20倍、少なくとも25倍、少なくとも30倍、少なくとも35倍、少なくとも40倍、少なくとも45倍、少なくとも50倍、少なくとも55倍、少なくとも60倍、少なくとも70倍、少なくとも80倍、少なくとも90倍、または少なくとも100倍の増加である。
いくつかの実施形態では、Raji細胞との共培養時のマーカー陽性細胞のパーセンテージまたは平均蛍光強度(MFI)として表されるCD134の発現の増加は、K562細胞と比較して、少なくとも10%、少なくとも15%、少なくとも20%、少なくとも30%、少なくとも40%、少なくとも50%、少なくとも60%、少なくとも70%、少なくとも80%、少なくとも90%、または少なくとも100%の増加である。
いくつかの実施形態では、Raji細胞との共培養時のマーカー陽性細胞のパーセンテージまたは平均蛍光強度(MFI)として表されるCD134の発現の増加は、K562細胞と比較して、少なくとも1倍、少なくとも1.5倍、少なくとも2倍、少なくとも2.5倍、少なくとも3倍、少なくとも3.5倍、少なくとも4倍、少なくとも4.5倍、少なくとも5倍、少なくとも5.5倍、少なくとも6倍、少なくとも6.5倍、少なくとも7倍、少なくとも7.5倍、少なくとも8倍、少なくとも8.5倍、少なくとも9倍、少なくとも9.5倍、少なくとも10倍、少なくとも11倍、少なくとも12倍、少なくとも13倍、少なくとも14倍、少なくとも15倍、少なくとも16倍、少なくとも17倍、少なくとも18倍、少なくとも19倍、少なくとも20倍、少なくとも25倍、少なくとも30倍、少なくとも35倍、少なくとも40倍、少なくとも45倍、少なくとも50倍、少なくとも55倍、少なくとも60倍、少なくとも70倍、少なくとも80倍、少なくとも90倍、または少なくとも100倍の増加である。
いくつかの実施形態では、Raji細胞との共培養時のマーカー陽性細胞のパーセンテージまたは平均蛍光強度(MFI)として表されるCD137の発現の増加は、K562細胞と比較して、少なくとも10%、少なくとも15%、少なくとも20%、少なくとも30%、少なくとも40%、少なくとも50%、少なくとも60%、少なくとも70%、少なくとも80%、少なくとも90%、または少なくとも100%の増加である。
いくつかの実施形態では、Raji細胞との共培養時のマーカー陽性細胞のパーセンテージまたは平均蛍光強度(MFI)として表されるCD137の発現の増加は、K562細胞と比較して、少なくとも1倍、少なくとも1.5倍、少なくとも2倍、少なくとも2.5倍、少なくとも3倍、少なくとも3.5倍、少なくとも4倍、少なくとも4.5倍、少なくとも5倍、少なくとも5.5倍、少なくとも6倍、少なくとも6.5倍、少なくとも7倍、少なくとも7.5倍、少なくとも8倍、少なくとも8.5倍、少なくとも9倍、少なくとも9.5倍、少なくとも10倍、少なくとも11倍、少なくとも12倍、少なくとも13倍、少なくとも14倍、少なくとも15倍、少なくとも16倍、少なくとも17倍、少なくとも18倍、少なくとも19倍、少なくとも20倍、少なくとも25倍、少なくとも30倍、少なくとも35倍、少なくとも40倍、少なくとも45倍、少なくとも50倍、少なくとも55倍、少なくとも60倍、少なくとも70倍、少なくとも80倍、少なくとも90倍、または少なくとも100倍の増加である。
いくつかの実施形態では、Raji細胞との共培養時のマーカー陽性細胞のパーセンテージまたは平均蛍光強度(MFI)として表されるCD150の発現の増加は、K562細胞と比較して、少なくとも10%、少なくとも15%、少なくとも20%、少なくとも30%、少なくとも40%、少なくとも50%、少なくとも60%、少なくとも70%、少なくとも80%、少なくとも90%、または少なくとも100%の増加である。
いくつかの実施形態では、Raji細胞との共培養時のマーカー陽性細胞のパーセンテージまたは平均蛍光強度(MFI)として表されるCD150の発現の増加は、K562細胞と比較して、少なくとも1倍、少なくとも1.5倍、少なくとも2倍、少なくとも2.5倍、少なくとも3倍、少なくとも3.5倍、少なくとも4倍、少なくとも4.5倍、少なくとも5倍、少なくとも5.5倍、少なくとも6倍、少なくとも6.5倍、少なくとも7倍、少なくとも7.5倍、少なくとも8倍、少なくとも8.5倍、少なくとも9倍、少なくとも9.5倍、少なくとも10倍、少なくとも11倍、少なくとも12倍、少なくとも13倍、少なくとも14倍、少なくとも15倍、少なくとも16倍、少なくとも17倍、少なくとも18倍、少なくとも19倍、少なくとも20倍、少なくとも25倍、少なくとも30倍、少なくとも35倍、少なくとも40倍、少なくとも45倍、少なくとも50倍、少なくとも55倍、少なくとも60倍、少なくとも70倍、少なくとも80倍、少なくとも90倍、または少なくとも100倍の増加である。
いくつかの実施形態では、Raji細胞との共培養時のELISA検出分析物または平均蛍光強度(MFI)として表されるか、または分泌されるグランザイムBの発現の増加は、K562細胞と比較して、少なくとも10%、少なくとも15%、少なくとも20%、少なくとも30%、少なくとも40%、少なくとも50%、少なくとも60%、少なくとも70%、少なくとも80%、少なくとも90%、または少なくとも100%の増加である。
いくつかの実施形態では、Raji細胞との共培養時のELISA検出分析物のパーセンテージまたは平均蛍光強度(MFI)として表されるか、または分泌されるグランザイムBの発現の増加は、K562細胞と比較して、少なくとも1倍、少なくとも1.5倍、少なくとも2倍、少なくとも2.5倍、少なくとも3倍、少なくとも3.5倍、少なくとも4倍、少なくとも4.5倍、少なくとも5倍、少なくとも5.5倍、少なくとも6倍、少なくとも6.5倍、少なくとも7倍、少なくとも7.5倍、少なくとも8倍、少なくとも8.5倍、少なくとも9倍、少なくとも9.5倍、少なくとも10倍、少なくとも11倍、少なくとも12倍、少なくとも13倍、少なくとも14倍、少なくとも15倍、少なくとも16倍、少なくとも17倍、少なくとも18倍、少なくとも19倍、少なくとも20倍、少なくとも25倍、少なくとも30倍、少なくとも35倍、少なくとも40倍、少なくとも45倍、少なくとも50倍、少なくとも55倍、少なくとも60倍、少なくとも70倍、少なくとも80倍、少なくとも90倍、または少なくとも100倍の増加である。
いくつかの実施形態では、Raji細胞との共培養時のELISA検出分析物のパーセンテージまたは平均蛍光強度(MFI)として表されるか、または分泌されるIFN-γの発現の増加は、K562細胞と比較して、少なくとも10%、少なくとも15%、少なくとも20%、少なくとも30%、少なくとも40%、少なくとも50%、少なくとも60%、少なくとも70%、少なくとも80%、少なくとも90%、または少なくとも100%の増加である。
いくつかの実施形態では、Raji細胞との共培養時のELISA検出分析物のパーセンテージまたは平均蛍光強度(MFI)として表されるか、または分泌されるIFN-γの発現の増加は、K562細胞と比較して、少なくとも1倍、少なくとも1.5倍、少なくとも2倍、少なくとも2.5倍、少なくとも3倍、少なくとも3.5倍、少なくとも4倍、少なくとも4.5倍、少なくとも5倍、少なくとも5.5倍、少なくとも6倍、少なくとも6.5倍、少なくとも7倍、少なくとも7.5倍、少なくとも8倍、少なくとも8.5倍、少なくとも9倍、少なくとも9.5倍、少なくとも10倍、少なくとも11倍、少なくとも12倍、少なくとも13倍、少なくとも14倍、少なくとも15倍、少なくとも16倍、少なくとも17倍、少なくとも18倍、少なくとも19倍、少なくとも20倍、少なくとも25倍、少なくとも30倍、少なくとも35倍、少なくとも40倍、少なくとも45倍、少なくとも50倍、少なくとも55倍、少なくとも60倍、少なくとも70倍、少なくとも80倍、少なくとも90倍、または少なくとも100倍の増加である。
いくつかの実施形態では、Raji細胞との共培養時のELISA検出分析物または平均蛍光強度(MFI)として表されるか、または分泌されるTNF-αの発現の増加は、K562細胞と比較して、少なくとも10%、少なくとも15%、少なくとも20%、少なくとも30%、少なくとも40%、少なくとも50%、少なくとも60%、少なくとも70%、少なくとも80%、少なくとも90%、または少なくとも100%の増加である。
いくつかの実施形態では、Raji細胞との共培養時のELISA検出分析物のパーセンテージまたは平均蛍光強度(MFI)として表されるか、または分泌されるTNF-αの発現の増加は、K562細胞と比較して、少なくとも1倍、少なくとも1.5倍、少なくとも2倍、少なくとも2.5倍、少なくとも3倍、少なくとも3.5倍、少なくとも4倍、少なくとも4.5倍、少なくとも5倍、少なくとも5.5倍、少なくとも6倍、少なくとも6.5倍、少なくとも7倍、少なくとも7.5倍、少なくとも8倍、少なくとも8.5倍、少なくとも9倍、少なくとも9.5倍、少なくとも10倍、少なくとも11倍、少なくとも12倍、少なくとも13倍、少なくとも14倍、少なくとも15倍、少なくとも16倍、少なくとも17倍、少なくとも18倍、少なくとも19倍、少なくとも20倍、少なくとも25倍、少なくとも30倍、少なくとも35倍、少なくとも40倍、少なくとも45倍、少なくとも50倍、少なくとも55倍、少なくとも60倍、少なくとも70倍、少なくとも80倍、少なくとも90倍、または少なくとも100倍の増加である。
いくつかの実施形態では、Raji細胞との共培養時のELISA検出分析物のパーセンテージまたは平均蛍光強度(MFI)として表されるか、または分泌されるパーフォリンの発現の増加は、K562細胞と比較して、少なくとも10%、少なくとも15%、少なくとも20%、少なくとも30%、少なくとも40%、少なくとも50%、少なくとも60%、少なくとも70%、少なくとも80%、少なくとも90%、または少なくとも100%の増加である。
いくつかの実施形態では、Raji細胞との共培養時のELISA検出分析物のパーセンテージまたは平均蛍光強度(MFI)として表されるか、または分泌されるパーフォリンの発現の増加は、K562細胞と比較して、少なくとも1倍、少なくとも1.5倍、少なくとも2倍、少なくとも2.5倍、少なくとも3倍、少なくとも3.5倍、少なくとも4倍、少なくとも4.5倍、少なくとも5倍、少なくとも5.5倍、少なくとも6倍、少なくとも6.5倍、少なくとも7倍、少なくとも7.5倍、少なくとも8倍、少なくとも8.5倍、少なくとも9倍、少なくとも9.5倍、少なくとも10倍、少なくとも11倍、少なくとも12倍、少なくとも13倍、少なくとも14倍、少なくとも15倍、少なくとも16倍、少なくとも17倍、少なくとも18倍、少なくとも19倍、少なくとも20倍、少なくとも25倍、少なくとも30倍、少なくとも35倍、少なくとも40倍、少なくとも45倍、少なくとも50倍、少なくとも55倍、少なくとも60倍、少なくとも70倍、少なくとも80倍、少なくとも90倍、または少なくとも100倍の増加である。
いくつかの実施形態では、Raji細胞との共培養時のELISA検出分析物または平均蛍光強度(MFI)として表されるか、または分泌されるCCL4の発現の増加は、K562細胞と比較して、少なくとも10%、少なくとも15%、少なくとも20%、少なくとも30%、少なくとも40%、少なくとも50%、少なくとも60%、少なくとも70%、少なくとも80%、少なくとも90%、または少なくとも100%の増加である。
いくつかの実施形態では、Raji細胞との共培養時のELISA検出分析物のパーセンテージまたは平均蛍光強度(MFI)として表されるか、または分泌されるCCL4の発現の増加は、K562細胞と比較して、少なくとも1倍、少なくとも1.5倍、少なくとも2倍、少なくとも2.5倍、少なくとも3倍、少なくとも3.5倍、少なくとも4倍、少なくとも4.5倍、少なくとも5倍、少なくとも5.5倍、少なくとも6倍、少なくとも6.5倍、少なくとも7倍、少なくとも7.5倍、少なくとも8倍、少なくとも8.5倍、少なくとも9倍、少なくとも9.5倍、少なくとも10倍、少なくとも11倍、少なくとも12倍、少なくとも13倍、少なくとも14倍、少なくとも15倍、少なくとも16倍、少なくとも17倍、少なくとも18倍、少なくとも19倍、少なくとも20倍、少なくとも25倍、少なくとも30倍、少なくとも35倍、少なくとも40倍、少なくとも45倍、少なくとも50倍、少なくとも55倍、少なくとも60倍、少なくとも70倍、少なくとも80倍、少なくとも90倍、または少なくとも100倍の増加である。
いくつかの実施形態では、Raji細胞との共培養時のELISA検出分析物のパーセンテージまたは平均蛍光強度(MFI)として表されるか、または分泌されるMIP-1βの発現の増加は、K562細胞と比較して、少なくとも10%、少なくとも15%、少なくとも20%、少なくとも30%、少なくとも40%、少なくとも50%、少なくとも60%、少なくとも70%、少なくとも80%、少なくとも90%、または少なくとも100%の増加である。
いくつかの実施形態では、Raji細胞との共培養時のELISA検出分析物のパーセンテージまたは平均蛍光強度(MFI)として表されるか、または分泌されるMIP-1βの発現の増加は、K562細胞と比較して、少なくとも1倍、少なくとも1.5倍、少なくとも2倍、少なくとも2.5倍、少なくとも3倍、少なくとも3.5倍、少なくとも4倍、少なくとも4.5倍、少なくとも5倍、少なくとも5.5倍、少なくとも6倍、少なくとも6.5倍、少なくとも7倍、少なくとも7.5倍、少なくとも8倍、少なくとも8.5倍、少なくとも9倍、少なくとも9.5倍、少なくとも10倍、少なくとも11倍、少なくとも12倍、少なくとも13倍、少なくとも14倍、少なくとも15倍、少なくとも16倍、少なくとも17倍、少なくとも18倍、少なくとも19倍、少なくとも20倍、少なくとも25倍、少なくとも30倍、少なくとも35倍、少なくとも40倍、少なくとも45倍、少なくとも50倍、少なくとも55倍、少なくとも60倍、少なくとも70倍、少なくとも80倍、少なくとも90倍、または少なくとも100倍の増加である。
いくつかの実施形態では、Raji細胞との共培養時に分泌されるグランザイムBの量は、少なくとも20pg/mL、少なくとも30pg/mL、少なくとも40pg/mL、少なくとも50pg/mL、少なくとも60pg/mL、少なくとも70pg/mL、少なくとも80pg/mL、少なくとも90pg/mL、少なくとも100pg/mL、少なくとも150pg/mL、少なくとも200pg/mL、少なくとも250pg/mL、少なくとも300pg/mL、少なくとも350pg/mL、少なくとも400pg/mL、少なくとも450pg/mL、少なくとも500pg/mL、少なくとも600pg/mL、少なくとも700pg/mL、少なくとも800pg/mL、少なくとも900pg/mL、少なくとも1000pg/mL、少なくとも1100pg/mL、または少なくとも1200pg/mLであり、各mLの被験試料は、1×10TIL、2×10TIL、3×10TIL、4×10TIL、5×10TIL、6×10TIL、7×10TIL、8×10TIL、9×10TIL、または10×10TILを含有する。
いくつかの実施形態では、Raji細胞との共培養時に分泌されるIFN-γの量は、少なくとも20pg/mL、少なくとも30pg/mL、少なくとも40pg/mL、少なくとも50pg/mL、少なくとも60pg/mL、少なくとも70pg/mL、少なくとも80pg/mL、少なくとも90pg/mL、少なくとも100pg/mL、少なくとも150pg/mL、少なくとも200pg/mL、少なくとも250pg/mL、少なくとも300pg/mL、少なくとも350pg/mL、少なくとも400pg/mL、少なくとも450pg/mL、少なくとも500pg/mL、少なくとも600pg/mL、少なくとも700pg/mL、少なくとも800pg/mL、少なくとも900pg/mL、少なくとも1000pg/mL、少なくとも1100pg/mL、または少なくとも1200pg/mLであり、各mLの被験試料は、1×10TIL、2×10TIL、3×10TIL、4×10TIL、5×10TIL、6×10TIL、7×10TIL、8×10TIL、9×10TIL、または10×10TILを含有する。
いくつかの実施形態では、Raji細胞との共培養時に分泌されるTNF-αの量は、少なくとも20pg/mL、少なくとも30pg/mL、少なくとも40pg/mL、少なくとも50pg/mL、少なくとも60pg/mL、少なくとも70pg/mL、少なくとも80pg/mL、少なくとも90pg/mL、少なくとも100pg/mL、少なくとも150pg/mL、少なくとも200pg/mL、少なくとも250pg/mL、少なくとも300pg/mL、少なくとも350pg/mL、少なくとも400pg/mL、少なくとも450pg/mL、少なくとも500pg/mL、少なくとも600pg/mL、少なくとも700pg/mL、少なくとも800pg/mL、少なくとも900pg/mL、少なくとも1000pg/mL、少なくとも1100pg/mL、または少なくとも1200pg/mLであり、各mLの被験試料は、1×10TIL、2×10TIL、3×10TIL、4×10TIL、5×10TIL、6×10TIL、7×10TIL、8×10TIL、9×10TIL、または10×10TILを含有する。
いくつかの実施形態では、Raji細胞との共培養時に分泌されるパーフォリンの量は、少なくとも20pg/mL、少なくとも30pg/mL、少なくとも40pg/mL、少なくとも50pg/mL、少なくとも60pg/mL、少なくとも70pg/mL、少なくとも80pg/mL、少なくとも90pg/mL、少なくとも100pg/mL、少なくとも150pg/mL、少なくとも200pg/mL、少なくとも250pg/mL、少なくとも300pg/mL、少なくとも350pg/mL、少なくとも400pg/mL、少なくとも450pg/mL、少なくとも500pg/mL、少なくとも600pg/mL、少なくとも700pg/mL、少なくとも800pg/mL、少なくとも900pg/mL、少なくとも1000pg/mL、少なくとも1100pg/mL、または少なくとも1200pg/mLであり、各mLの被験試料は、1×10TIL、2×10TIL、3×10TIL、4×10TIL、5×10TIL、6×10TIL、7×10TIL、8×10TIL、9×10TIL、または10×10TILを含有する。
いくつかの実施形態では、Raji細胞との共培養時に分泌されるCCL4の量は、少なくとも20pg/mL、少なくとも30pg/mL、少なくとも40pg/mL、少なくとも50pg/mL、少なくとも60pg/mL、少なくとも70pg/mL、少なくとも80pg/mL、少なくとも90pg/mL、少なくとも100pg/mL、少なくとも150pg/mL、少なくとも200pg/mL、少なくとも250pg/mL、少なくとも300pg/mL、少なくとも350pg/mL、少なくとも400pg/mL、少なくとも450pg/mL、少なくとも500pg/mL、少なくとも600pg/mL、少なくとも700pg/mL、少なくとも800pg/mL、少なくとも900pg/mL、少なくとも1000pg/mL、少なくとも1100pg/mL、または少なくとも1200pg/mLであり、各mLの被験試料は、1×10TIL、2×10TIL、3×10TIL、4×10TIL、5×10TIL、6×10TIL、7×10TIL、8×10TIL、9×10TIL、または10×10TILを含有する。
いくつかの実施形態では、Raji細胞との共培養時に分泌されるMIP-1βの量は、少なくとも20pg/mL、少なくとも30pg/mL、少なくとも40pg/mL、少なくとも50pg/mL、少なくとも60pg/mL、少なくとも70pg/mL、少なくとも80pg/mL、少なくとも90pg/mL、少なくとも100pg/mL、少なくとも150pg/mL、少なくとも200pg/mL、少なくとも250pg/mL、少なくとも300pg/mL、少なくとも350pg/mL、少なくとも400pg/mL、少なくとも450pg/mL、少なくとも500pg/mL、少なくとも600pg/mL、少なくとも700pg/mL、少なくとも800pg/mL、少なくとも900pg/mL、少なくとも1000pg/mL、少なくとも1100pg/mL、または少なくとも1200pg/mLであり、各mLの被験試料は、1×10TIL、2×10TIL、3×10TIL、4×10TIL、5×10TIL、6×10TIL、7×10TIL、8×10TIL、9×10TIL、または10×10TILを含有する。
ある実施形態では、標的細胞対T細胞(TIL、MILまたはPBLを含む)の比は、約1:1.1、約1:1.2、約1:1.3、約1:1.4、約1:1.5、約1:1.6、約1:1.7、約1:1.8、約1:1.9、約1:2、約1:2.1、約1:2.2、約1:2.3、約1:2.4、約1:2.5、約1:2.6、約1:2.7、約1:2.8、約1:2.9、約1:3、約1:3.1、約1:3.2、約1:3.3、約1:3.4、約1:3.5、約1:3.6、約1:3.7、約1:3.8、約1:3.9、約1:4、約1:4.1、約1:4.2、約1:4.3、約1:4.4、約1:4.5、約1:4.6、約1:4.7、約1:4.8、約1:4.9、約1:5、約1:5.1、約1:5.2、約1:5.3、約1:5.4、約1:5.5、約1:5.6、約1:5.7、約1:5.8、約1:5.9、約1:6、約1:6.1、約1:6.2、約1:6.25、約1:6.3、約1:6.4、約1:6.5、約1:6.6、約1:6.7、約1:6.8、約1:6.9、約1:7、約1:7.1、約1:7.2、約1:7.3、約1:7.4、約1:7.5、約1:7.6、約1:7.7、約1:7.8、約1:7.9、約1:8、約1:8.1、約1:8.2、約1:8.3、約1:8.4、約1:8.5、約1:8.6、約1:8.7、約1:8.8、約1:8.9、約1:9、約1:9.1、約1:9.2、約1:9.3、約1:9.4、約1:9.5、約1:9.6、約1:9.7、約1:9.8、約1:9.9、約1:10、約1:11、約1:12、約1:12.5、約1:13、約1:14、約1:15、約1:16、約1:17、約1:18、約1:19、約1:20、約1:25、約1:30、約1:35、約1:40、約1:45、約1:50、約1:60、約1:70、約1:80、約1:90、または約1:100からなる群から選択される。
ある実施形態では、T細胞(TIL、MILまたはPBLを含む)対標的細胞の比は、約1:1.1、約1:1.2、約1:1.3、約1:1.4、約1:1.5、約1:1.6、約1:1.7、約1:1.8、約1:1.9、約1:2、約1:2.1、約1:2.2、約1:2.3、約1:2.4、約1:2.5、約1:2.6、約1:2.7、約1:2.8、約1:2.9、約1:3、約1:3.1、約1:3.2、約1:3.3、約1:3.4、約1:3.5、約1:3.6、約1:3.7、約1:3.8、約1:3.9、約1:4、約1:4.1、約1:4.2、約1:4.3、約1:4.4、約1:4.5、約1:4.6、約1:4.7、約1:4.8、約1:4.9、約1:5、約1:5.1、約1:5.2、約1:5.3、約1:5.4、約1:5.5、約1:5.6、約1:5.7、約1:5.8、約1:5.9、約1:6、約1:6.1、約1:6.2、約1:6.25、約1:6.3、約1:6.4、約1:6.5、約1:6.6、約1:6.7、約1:6.8、約1:6.9、約1:7、約1:7.1、約1:7.2、約1:7.3、約1:7.4、約1:7.5、約1:7.6、約1:7.7、約1:7.8、約1:7.9、約1:8、約1:8.1、約1:8.2、約1:8.3、約1:8.4、約1:8.5、約1:8.6、約1:8.7、約1:8.8、約1:8.9、約1:9、約1:9.1、約1:9.2、約1:9.3、約1:9.4、約1:9.5、約1:9.6、約1:9.7、約1:9.8、約1:9.9、約1:10、約1:11、約1:12、約1:12.5、約1:13、約1:14、約1:15、約1:16、約1:17、約1:18、約1:19、約1:20、約1:25、約1:30、約1:35、約1:40、約1:45、約1:50、約1:60、約1:70、約1:80、約1:90、または約1:100からなる群から選択される。
ある実施形態では、Raji細胞対T細胞(TIL、MILまたはPBLを含む)の比は、約1:1.1、約1:1.2、約1:1.3、約1:1.4、約1:1.5、約1:1.6、約1:1.7、約1:1.8、約1:1.9、約1:2、約1:2.1、約1:2.2、約1:2.3、約1:2.4、約1:2.5、約1:2.6、約1:2.7、約1:2.8、約1:2.9、約1:3、約1:3.1、約1:3.2、約1:3.3、約1:3.4、約1:3.5、約1:3.6、約1:3.7、約1:3.8、約1:3.9、約1:4、約1:4.1、約1:4.2、約1:4.3、約1:4.4、約1:4.5、約1:4.6、約1:4.7、約1:4.8、約1:4.9、約1:5、約1:5.1、約1:5.2、約1:5.3、約1:5.4、約1:5.5、約1:5.6、約1:5.7、約1:5.8、約1:5.9、約1:6、約1:6.1、約1:6.2、約1:6.25、約1:6.3、約1:6.4、約1:6.5、約1:6.6、約1:6.7、約1:6.8、約1:6.9、約1:7、約1:7.1、約1:7.2、約1:7.3、約1:7.4、約1:7.5、約1:7.6、約1:7.7、約1:7.8、約1:7.9、約1:8、約1:8.1、約1:8.2、約1:8.3、約1:8.4、約1:8.5、約1:8.6、約1:8.7、約1:8.8、約1:8.9、約1:9、約1:9.1、約1:9.2、約1:9.3、約1:9.4、約1:9.5、約1:9.6、約1:9.7、約1:9.8、約1:9.9、約1:10、約1:11、約1:12、約1:12.5、約1:13、約1:14、約1:15、約1:16、約1:17、約1:18、約1:19、約1:20、約1:25、約1:30、約1:35、約1:40、約1:45、約1:50、約1:60、約1:70、約1:80、約1:90、または約1:100からなる群から選択される。
ある実施形態では、T細胞(TIL、MILまたはPBLを含む)対Raji細胞の比は、約1:1.1、約1:1.2、約1:1.3、約1:1.4、約1:1.5、約1:1.6、約1:1.7、約1:1.8、約1:1.9、約1:2、約1:2.1、約1:2.2、約1:2.3、約1:2.4、約1:2.5、約1:2.6、約1:2.7、約1:2.8、約1:2.9、約1:3、約1:3.1、約1:3.2、約1:3.3、約1:3.4、約1:3.5、約1:3.6、約1:3.7、約1:3.8、約1:3.9、約1:4、約1:4.1、約1:4.2、約1:4.3、約1:4.4、約1:4.5、約1:4.6、約1:4.7、約1:4.8、約1:4.9、約1:5、約1:5.1、約1:5.2、約1:5.3、約1:5.4、約1:5.5、約1:5.6、約1:5.7、約1:5.8、約1:5.9、約1:6、約1:6.1、約1:6.2、約1:6.25、約1:6.3、約1:6.4、約1:6.5、約1:6.6、約1:6.7、約1:6.8、約1:6.9、約1:7、約1:7.1、約1:7.2、約1:7.3、約1:7.4、約1:7.5、約1:7.6、約1:7.7、約1:7.8、約1:7.9、約1:8、約1:8.1、約1:8.2、約1:8.3、約1:8.4、約1:8.5、約1:8.6、約1:8.7、約1:8.8、約1:8.9、約1:9、約1:9.1、約1:9.2、約1:9.3、約1:9.4、約1:9.5、約1:9.6、約1:9.7、約1:9.8、約1:9.9、約1:10、約1:11、約1:12、約1:12.5、約1:13、約1:14、約1:15、約1:16、約1:17、約1:18、約1:19、約1:20、約1:25、約1:30、約1:35、約1:40、約1:45、約1:50、約1:60、約1:70、約1:80、約1:90、または約1:100からなる群から選択される。
ある実施形態では、陰性対照細胞対T細胞(TIL、MILまたはPBLを含む)の比は、約1:1.1、約1:1.2、約1:1.3、約1:1.4、約1:1.5、約1:1.6、約1:1.7、約1:1.8、約1:1.9、約1:2、約1:2.1、約1:2.2、約1:2.3、約1:2.4、約1:2.5、約1:2.6、約1:2.7、約1:2.8、約1:2.9、約1:3、約1:3.1、約1:3.2、約1:3.3、約1:3.4、約1:3.5、約1:3.6、約1:3.7、約1:3.8、約1:3.9、約1:4、約1:4.1、約1:4.2、約1:4.3、約1:4.4、約1:4.5、約1:4.6、約1:4.7、約1:4.8、約1:4.9、約1:5、約1:5.1、約1:5.2、約1:5.3、約1:5.4、約1:5.5、約1:5.6、約1:5.7、約1:5.8、約1:5.9、約1:6、約1:6.1、約1:6.2、約1:6.25、約1:6.3、約1:6.4、約1:6.5、約1:6.6、約1:6.7、約1:6.8、約1:6.9、約1:7、約1:7.1、約1:7.2、約1:7.3、約1:7.4、約1:7.5、約1:7.6、約1:7.7、約1:7.8、約1:7.9、約1:8、約1:8.1、約1:8.2、約1:8.3、約1:8.4、約1:8.5、約1:8.6、約1:8.7、約1:8.8、約1:8.9、約1:9、約1:9.1、約1:9.2、約1:9.3、約1:9.4、約1:9.5、約1:9.6、約1:9.7、約1:9.8、約1:9.9、約1:10、約1:11、約1:12、約1:12.5、約1:13、約1:14、約1:15、約1:16、約1:17、約1:18、約1:19、約1:20、約1:25、約1:30、約1:35、約1:40、約1:45、約1:50、約1:60、約1:70、約1:80、約1:90、または約1:100からなる群から選択される。
ある実施形態では、T細胞(TIL、MILまたはPBLを含む)対陰性対照細胞の比は、約1:1.1、1:1.2、1:1.3、1:1.4、1:1.5、1:1.6、1:1.7、1:1.8、1:1.9、1:2、1:2.1、1:2.2、1:2.3、1:2.4、1:2.5、1:2.6、1:2.7、1:2.8、1:2.9、1:3、1:3.1、1:3.2、1:3.3、1:3.4、1:3.5、1:3.6、1:3.7、1:3.8、1:3.9、1:4、1:4.1、1:4.2、1:4.3、1:4.4、1:4.5、1:4.6、1:4.7、1:4.8、1:4.9、1:5、1:5.1、1:5.2、1:5.3、1:5.4、1:5.5、1:5.6、1:5.7、1:5.8、1:5.9、1:6、1:6.1、1:6.2、1:6.25、1:6.3、1:6.4、1:6.5、1:6.6、1:6.7、1:6.8、1:6.9、1:7、1:7.1、1:7.2、1:7.3、1:7.4、1:7.5、1:7.6、1:7.7、1:7.8、1:7.9、1:8、1:8.1、1:8.2、1:8.3、1:8.4、1:8.5、1:8.6、1:8.7、1:8.8、1:8.9、1:9、1:9.1、1:9.2、1:9.3、1:9.4、1:9.5、1:9.6、1:9.7、1:9.8、1:9.9、1:10、1:11、1:12、1:12.5、1:13、1:14、1:15、1:16、1:17、1:18、1:19、1:20、1:25、1:30、1:35、1:40、1:45、1:50、1:60、1:70、1:80、1:90、または1:100からなる群から選択される。
ある実施形態では、K562細胞対T細胞(TIL、MILまたはPBLを含む)の比は、約1:1.1、1:1.2、1:1.3、1:1.4、1:1.5、1:1.6、1:1.7、1:1.8、1:1.9、1:2、1:2.1、1:2.2、1:2.3、1:2.4、1:2.5、1:2.6、1:2.7、1:2.8、1:2.9、1:3、1:3.1、1:3.2、1:3.3、1:3.4、1:3.5、1:3.6、1:3.7、1:3.8、1:3.9、1:4、1:4.1、1:4.2、1:4.3、1:4.4、1:4.5、1:4.6、1:4.7、1:4.8、1:4.9、1:5、1:5.1、1:5.2、1:5.3、1:5.4、1:5.5、1:5.6、1:5.7、1:5.8、1:5.9、1:6、1:6.1、1:6.2、1:6.25、1:6.3、1:6.4、1:6.5、1:6.6、1:6.7、1:6.8、1:6.9、1:7、1:7.1、1:7.2、1:7.3、1:7.4、1:7.5、1:7.6、1:7.7、1:7.8、1:7.9、1:8、1:8.1、1:8.2、1:8.3、1:8.4、1:8.5、1:8.6、1:8.7、1:8.8、1:8.9、1:9、1:9.1、1:9.2、1:9.3、1:9.4、1:9.5、1:9.6、1:9.7、1:9.8、1:9.9、1:10、1:11、1:12、1:12.5、1:13、1:14、1:15、1:16、1:17、1:18、1:19、1:20、1:25、1:30、1:35、1:40、1:45、1:50、1:60、1:70、1:80、1:90、または1:100からなる群から選択される。
ある実施形態では、T細胞(TIL、MILまたはPBLを含む)対K562細胞の比は、約1:1.1、1:1.2、1:1.3、1:1.4、1:1.5、1:1.6、1:1.7、1:1.8、1:1.9、1:2、1:2.1、1:2.2、1:2.3、1:2.4、1:2.5、1:2.6、1:2.7、1:2.8、1:2.9、1:3、1:3.1、1:3.2、1:3.3、1:3.4、1:3.5、1:3.6、1:3.7、1:3.8、1:3.9、1:4、1:4.1、1:4.2、1:4.3、1:4.4、1:4.5、1:4.6、1:4.7、1:4.8、1:4.9、1:5、1:5.1、1:5.2、1:5.3、1:5.4、1:5.5、1:5.6、1:5.7、1:5.8、1:5.9、1:6、1:6.1、1:6.2、1:6.25、1:6.3、1:6.4、1:6.5、1:6.6、1:6.7、1:6.8、1:6.9、1:7、1:7.1、1:7.2、1:7.3、1:7.4、1:7.5、1:7.6、1:7.7、1:7.8、1:7.9、1:8、1:8.1、1:8.2、1:8.3、1:8.4、1:8.5、1:8.6、1:8.7、1:8.8、1:8.9、1:9、1:9.1、1:9.2、1:9.3、1:9.4、1:9.5、1:9.6、1:9.7、1:9.8、1:9.9、1:10、1:11、1:12、1:12.5、1:13、1:14、1:15、1:16、1:17、1:18、1:19、1:20、1:25、1:30、1:35、1:40、1:45、1:50、1:60、1:70、1:80、1:90、または1:100からなる群から選択される。
ある実施形態では、標的細胞対T細胞(TIL、MILまたはPBLを含む)の比は、1:1~1:2、1:2~1:3、1:3~1:4、1:4~1:5、1:5~1:6、1:6~1:7、1:7~1:8、1:8~1:9、1:9~1:10、1:10~1:11、1:11~1:12、1:12~1:13、1:13~1:14、1:14~1:15、1:15~1:16、1:16~1:17、1:17~1:18、1:18~1:19、1:19~1:20、1:20~1:25、1:25~1:30、1:30~1:35、1:35~1:40、1:40~1:45、1:45~1:50、1:50~1:55、1:55~1:60、1:60~1:70、1:70~1:80、1:80~1:90、もしくは1:90~1:100、または代替的に、1:0.5~1:100、1:0.5~1:50、1:0.5~1:40、1:0.5~1:30、1:0.5~1:25、1:0.5~1:20、1:0.5~1:15、1:0.5~1:10、1:0.5~1:5、1:0.75~1:50、1:0.75~1:40、1:0.75~1:30、1:0.75~1:25、1:0.75~1:20、1:0.75~1:15、1:0.75~1:10、1:0.75~1:5、1:0.5~1:2.5、1:1~1:20、1:1~1:10、1:1~1:5、1:1~1:2.5、1:2~1:5、1:2.5~1:5、もしくは1:3~1:5である。
ある実施形態では、T細胞(TIL、MILまたはPBLを含む)対標的細胞の比は、1:1~1:2、1:2~1:3、1:3~1:4、1:4~1:5、1:5~1:6、1:6~1:7、1:7~1:8、1:8~1:9、1:9~1:10、1:10~1:11、1:11~1:12、1:12~1:13、1:13~1:14、1:14~1:15、1:15~1:16、1:16~1:17、1:17~1:18、1:18~1:19、1:19~1:20、1:20~1:25、1:25~1:30、1:30~1:35、1:35~1:40、1:40~1:45、1:45~1:50、1:50~1:55、1:55~1:60、1:60~1:70、1:70~1:80、1:80~1:90、もしくは1:90~1:100、または代替的に、1:0.5~1:100、1:0.5~1:50、1:0.5~1:40、1:0.5~1:30、1:0.5~1:25、1:0.5~1:20、1:0.5~1:15、1:0.5~1:10、1:0.5~1:5、1:0.75~1:50、1:0.75~1:40、1:0.75~1:30、1:0.75~1:25、1:0.75~1:20、1:0.75~1:15、1:0.75~1:10、1:0.75~1:5、1:0.5~1:2.5、1:1~1:20、1:1~1:10、1:1~1:5、1:1~1:2.5、1:2~1:5、1:2.5~1:5、もしくは1:3~1:5である。
ある実施形態では、Raji細胞対T細胞(TIL、MILまたはPBLを含む)の比は、1:1~1:2、1:2~1:3、1:3~1:4、1:4~1:5、1:5~1:6、1:6~1:7、1:7~1:8、1:8~1:9、1:9~1:10、1:10~1:11、1:11~1:12、1:12~1:13、1:13~1:14、1:14~1:15、1:15~1:16、1:16~1:17、1:17~1:18、1:18~1:19、1:19~1:20、1:20~1:25、1:25~1:30、1:30~1:35、1:35~1:40、1:40~1:45、1:45~1:50、1:50~1:55、1:55~1:60、1:60~1:70、1:70~1:80、1:80~1:90、もしくは1:90~1:100、または代替的に、1:0.5~1:100、1:0.5~1:50、1:0.5~1:40、1:0.5~1:30、1:0.5~1:25、1:0.5~1:20、1:0.5~1:15、1:0.5~1:10、1:0.5~1:5、1:0.75~1:50、1:0.75~1:40、1:0.75~1:30、1:0.75~1:25、1:0.75~1:20、1:0.75~1:15、1:0.75~1:10、1:0.75~1:5、1:0.5~1:2.5、1:1~1:20、1:1~1:10、1:1~1:5、1:1~1:2.5、1:2~1:5、1:2.5~1:5、もしくは1:3~1:5である。
ある実施形態では、T細胞(TIL、MILまたはPBLを含む)対Raji細胞の比は、1:1~1:2、1:2~1:3、1:3~1:4、1:4~1:5、1:5~1:6、1:6~1:7、1:7~1:8、1:8~1:9、1:9~1:10、1:10~1:11、1:11~1:12、1:12~1:13、1:13~1:14、1:14~1:15、1:15~1:16、1:16~1:17、1:17~1:18、1:18~1:19、1:19~1:20、1:20~1:25、1:25~1:30、1:30~1:35、1:35~1:40、1:40~1:45、1:45~1:50、1:50~1:55、1:55~1:60、1:60~1:70、1:70~1:80、1:80~1:90、もしくは1:90~1:100、または代替的に、1:0.5~1:100、1:0.5~1:50、1:0.5~1:40、1:0.5~1:30、1:0.5~1:25、1:0.5~1:20、1:0.5~1:15、1:0.5~1:10、1:0.5~1:5、1:0.75~1:50、1:0.75~1:40、1:0.75~1:30、1:0.75~1:25、1:0.75~1:20、1:0.75~1:15、1:0.75~1:10、1:0.75~1:5、1:0.5~1:2.5、1:1~1:20、1:1~1:10、1:1~1:5、1:1~1:2.5、1:2~1:5、1:2.5~1:5、もしくは1:3~1:5である。
ある実施形態では、陰性対照細胞対T細胞(TIL、MILまたはPBLを含む)の比は、1:1~1:2、1:2~1:3、1:3~1:4、1:4~1:5、1:5~1:6、1:6~1:7、1:7~1:8、1:8~1:9、1:9~1:10、1:10~1:11、1:11~1:12、1:12~1:13、1:13~1:14、1:14~1:15、1:15~1:16、1:16~1:17、1:17~1:18、1:18~1:19、1:19~1:20、1:20~1:25、1:25~1:30、1:30~1:35、1:35~1:40、1:40~1:45、1:45~1:50、1:50~1:55、1:55~1:60、1:60~1:70、1:70~1:80、1:80~1:90、もしくは1:90~1:100、または代替的に、1:0.5~1:100、1:0.5~1:50、1:0.5~1:40、1:0.5~1:30、1:0.5~1:25、1:0.5~1:20、1:0.5~1:15、1:0.5~1:10、1:0.5~1:5、1:0.75~1:50、1:0.75~1:40、1:0.75~1:30、1:0.75~1:25、1:0.75~1:20、1:0.75~1:15、1:0.75~1:10、1:0.75~1:5、1:0.5~1:2.5、1:1~1:20、1:1~1:10、1:1~1:5、1:1~1:2.5、1:2~1:5、1:2.5~1:5、もしくは1:3~1:5である。
ある実施形態では、T細胞(TIL、MILまたはPBLを含む)対陰性対照細胞の比は、1:1~1:2、1:2~1:3、1:3~1:4、1:4~1:5、1:5~1:6、1:6~1:7、1:7~1:8、1:8~1:9、1:9~1:10、1:10~1:11、1:11~1:12、1:12~1:13、1:13~1:14、1:14~1:15、1:15~1:16、1:16~1:17、1:17~1:18、1:18~1:19、1:19~1:20、1:20~1:25、1:25~1:30、1:30~1:35、1:35~1:40、1:40~1:45、1:45~1:50、1:50~1:55、1:55~1:60、1:60~1:70、1:70~1:80、1:80~1:90、もしくは1:90~1:100、または代替的に、1:0.5~1:100、1:0.5~1:50、1:0.5~1:40、1:0.5~1:30、1:0.5~1:25、1:0.5~1:20、1:0.5~1:15、1:0.5~1:10、1:0.5~1:5、1:0.75~1:50、1:0.75~1:40、1:0.75~1:30、1:0.75~1:25、1:0.75~1:20、1:0.75~1:15、1:0.75~1:10、1:0.75~1:5、1:0.5~1:2.5、1:1~1:20、1:1~1:10、1:1~1:5、1:1~1:2.5、1:2~1:5、1:2.5~1:5、もしくは1:3~1:5である。
ある実施形態では、K562細胞対T細胞(TIL、MILまたはPBLを含む)の比は、1:1~1:2、1:2~1:3、1:3~1:4、1:4~1:5、1:5~1:6、1:6~1:7、1:7~1:8、1:8~1:9、1:9~1:10、1:10~1:11、1:11~1:12、1:12~1:13、1:13~1:14、1:14~1:15、1:15~1:16、1:16~1:17、1:17~1:18、1:18~1:19、1:19~1:20、1:20~1:25、1:25~1:30、1:30~1:35、1:35~1:40、1:40~1:45、1:45~1:50、1:50~1:55、1:55~1:60、1:60~1:70、1:70~1:80、1:80~1:90、もしくは1:90~1:100、または代替的に、1:0.5~1:100、1:0.5~1:50、1:0.5~1:40、1:0.5~1:30、1:0.5~1:25、1:0.5~1:20、1:0.5~1:15、1:0.5~1:10、1:0.5~1:5、1:0.75~1:50、1:0.75~1:40、1:0.75~1:30、1:0.75~1:25、1:0.75~1:20、1:0.75~1:15、1:0.75~1:10、1:0.75~1:5、1:0.5~1:2.5、1:1~1:20、1:1~1:10、1:1~1:5、1:1~1:2.5、1:2~1:5、1:2.5~1:5、もしくは1:3~1:5である。
ある実施形態では、T細胞(TIL、MILまたはPBLを含む)対K562細胞の比は、1:1~1:2、1:2~1:3、1:3~1:4、1:4~1:5、1:5~1:6、1:6~1:7、1:7~1:8、1:8~1:9、1:9~1:10、1:10~1:11、1:11~1:12、1:12~1:13、1:13~1:14、1:14~1:15、1:15~1:16、1:16~1:17、1:17~1:18、1:18~1:19、1:19~1:20、1:20~1:25、1:25~1:30、1:30~1:35、1:35~1:40、1:40~1:45、1:45~1:50、1:50~1:55、1:55~1:60、1:60~1:70、1:70~1:80、1:80~1:90、もしくは1:90~1:100、または代替的に、1:0.5~1:100、1:0.5~1:50、1:0.5~1:40、1:0.5~1:30、1:0.5~1:25、1:0.5~1:20、1:0.5~1:15、1:0.5~1:10、1:0.5~1:5、1:0.75~1:50、1:0.75~1:40、1:0.75~1:30、1:0.75~1:25、1:0.75~1:20、1:0.75~1:15、1:0.75~1:10、1:0.75~1:5、1:0.5~1:2.5、1:1~1:20、1:1~1:10、1:1~1:5、1:1~1:2.5、1:2~1:5、1:2.5~1:5、もしくは1:3~1:5である。
ある実施形態では、標的細胞共培養におけるTIL対Raji細胞の比は、約15:1、約14:1、約13:1、約12:1、約11:1、約10:1、約9:1、約8:1、約7:1、約6:1、約5:1、約4.5:1、約4:1、約3.5:1、約3:1、約2.5:1、約2:1、約1.5:1、約1:1、約1:1.5、約1:2、約1:2.5、約1:3、約1:3.5、約1:4、約1:4.5、約1:5、約1:6、約1.7、約1:8、約1:9、約1:10、約1:11、約1:12、約1:13、約1:14、及び約1:15からなる群から選択される。
ある実施形態では、標的細胞共培養におけるTIL対K562細胞の比は、約15:1、約14:1、約13:1、約12:1、約11:1、約10:1、約9:1、約8:1、約7:1、約6:1、約5:1、約4.5:1、約4:1、約3.5:1、約3:1、約2.5:1、約2:1、約1.5:1、約1:1、約1:1.5、約1:2、約1:2.5、約1:3、約1:3.5、約1:4、約1:4.5、約1:5、約1:6、約1.7、約1:8、約1:9、約1:10、約1:11、約1:12、約1:13、約1:14、及び約1:15からなる群から選択される。
ある実施形態では、約1×10~10×10TILを、約1×10~10×10Raji細胞と共培養する。ある実施形態では、約3×10~7×10TILを、約1×10~3×10Raji細胞と共培養する。ある実施形態では、約5×10~6×10TILを、約3×10~7×10Raji細胞と共培養する。ある実施形態では、約4×10TILを、約5×10Raji細胞と共培養する。ある実施形態では、約5×10TILを、約5×10Raji細胞と共培養する。ある実施形態では、約5×10TILを、約4×10Raji細胞と共培養する。ある実施形態では、約3×10~7×10TILを、約7×10~20×10Raji細胞と共培養する。ある実施形態では、約4×10~4×10TILを、約10×10~15×10Raji細胞と共培養する。ある実施形態では、約5×10TILを、約15×10Raji細胞と共培養する。
いくつかの実施形態では、本発明は、TIL活性をアッセイするための方法であって、a)Raji細胞及びK562細胞を照射するステップと、(b)照射されたRaji細胞及び照射されたK562細胞を、TILと50:1、25:1、12.5:1、6.25:1、1:1、1:6.25、1:12.5、及び1:25)からなる群から選択される標的比で共培養するステップであって、かかる共培養が、任意選択で抗CD28抗体を使用して行われる、共培養するステップと、(c)6~24時間後に、ステップ(b)における共培養細胞から上清を収集するステップと、(d)ステップ(b)から細胞を採取し、T細胞活性化の表面マーカー発現を測定するステップと、(e)ステップ(c)において収集された共培養細胞からの上清を、T細胞活性化のマーカーについてアッセイするステップと、を含む、方法を提供する。
ある実施形態では、効力アッセイは、TIL凍結保存製品、MIL凍結保存製品、またはPBL凍結保存製品を解凍し、4時間、5時間、6時間、7時間、8時間、9時間、10時間、11時間、12時間、13時間、14時間、15時間、16時間、17時間、18時間、19時間、20時間、21時間、22時間、23時間、24時間、25時間、26時間、27時間、28時間、29時間、30時間、31時間、32時間、33時間、34時間、35時間、36時間、37時間、38時間、39時間、40時間、41時間、42時間、43時間、44時間、45時間、46時間、47時間、48時間、49時間、50時間、51時間、52時間、53時間、54時間、55時間、56時間、57時間、58時間、59時間、60時間、61時間、62時間、63時間、64時間、65時間、66時間、67時間、68時間、69時間、70時間、71時間、72時間、73時間、74時間、75時間、76時間、77時間、78時間、79時間、80時間、85時間、90時間、95時間、100時間、110時間、及び120時間からなる群から選択される期間、周囲温度または冷蔵温度での回復を可能にする、回復ステップを含む。ある実施形態では、効力アッセイは、TIL凍結保存製品、MIL凍結保存製品、またはPBL凍結保存製品を解凍し、約12時間、約24時間、約48時間、約72時間、及び約96時間からなる群から選択される期間、周囲温度または冷蔵温度での回復を可能にする、回復ステップを含む。前述の持続時間は、解凍プロセスの完了から、または解凍プロセスの開始から測定され得る。
ある実施形態では、本発明は、T細胞製品の効力を決定する方法を含み、この方法は、
a.T細胞製品細胞との標的細胞の共培養を、第1の期間行うステップと、
b.共培養から採取物を取得するステップと、
c.採取物を、(1)T細胞製品細胞上の1つ以上のマーカーの発現について評価するか、または(2)T細胞製品細胞から分泌された1つ以上の分析物について評価して、1つ以上の観測値を取得し、T細胞製品の効力を決定するステップと、を含む。
ある実施形態では、本発明は、T細胞製品の効力を決定する方法を含み、この方法は、
a.T細胞製品細胞との標的細胞の共培養を、第1の期間行うステップと、
b.共培養から採取物を取得するステップと、
c.採取物を、(1)T細胞製品細胞上の1つ以上のマーカーの発現について評価するか、または(2)T細胞製品細胞から分泌された1つ以上の分析物について評価して、1つ以上の観測値を取得し、T細胞製品の効力を決定するステップと、を含み、
前述の方法は、CD3、CD28、及び/またはCD137刺激及び報告インターフェロン-γ、グランザイムB、または腫瘍壊死因子-αを使用したビーズまたはプレートベースのアッセイ、総生細胞についてのアッセイ、生細胞パーセンテージについてのアッセイ、CD4細胞含有量についてのアッセイ、CD8細胞含有量についてのアッセイ、TEM細胞含有量についてのアッセイ、TCM細胞含有量についてのアッセイ、LAG3細胞含有量についてのアッセイ、及びKLRG1細胞含有量についてのアッセイ、CD101細胞含有量についてのアッセイ、CD69細胞含有量についてのアッセイ、TSCM細胞含有量についてのアッセイ、TEMRA細胞含有量についてのアッセイ、Treg細胞含有量についてのアッセイ、PD-1細胞含有量についてのアッセイ、TIM3細胞含有量についてのアッセイ、CD25細胞含有量についてのアッセイ、CD27細胞含有量についてのアッセイ、CD28細胞含有量についてのアッセイ、CD56細胞含有量についてのアッセイ、CTLA-4細胞含有量についてのアッセイ、TIGIT細胞含有量についてのアッセイ、及びCD57細胞含有量についてのアッセイからなる群から選択される少なくとも1つの他のアッセイを含む、効力アッセイマトリックスの構成要素である。ある実施形態では、前述のアッセイは、フローサイトメトリーアッセイである。
ある実施形態では、本発明は、T細胞製品の効力を決定する方法を含み、この方法は、
a.T細胞製品細胞との標的細胞の共培養を、第1の期間行うステップと、
b.共培養から採取物を取得するステップと、
c.採取物を、(1)T細胞製品細胞上の1つ以上のマーカーの発現について評価するか、または(2)T細胞製品細胞から分泌された1つ以上の分析物について評価して、1つ以上の観測値を取得し、T細胞製品の効力を決定するステップと、
d.T細胞製品細胞との陰性対照細胞の第2の共培養を、第2の期間行うステップと、
e.第2の共培養から第2の採取物を取得するステップと、
f.第2の採取物を、(1)T細胞製品細胞上の1つ以上のマーカーの発現について評価するか、または(2)T細胞製品細胞から分泌された1つ以上の分析物について評価して、1つ以上の対照値を取得するステップと、
g.各々の観測値が対応する対照値と比較される、ステップcからの1つ以上の観測値をステップfからの1つ以上の対照値と比較して、T細胞製品の効力を決定するステップと、を含む。
ある実施形態では、本発明は、T細胞製品の効力を決定する方法を含み、この方法は、
a.T細胞製品細胞との標的細胞の共培養を、第1の期間行うステップと、
b.共培養から採取物を取得するステップと、
c.採取物を、(1)T細胞製品細胞上の1つ以上のマーカーの発現について評価するか、または(2)T細胞製品細胞から分泌された1つ以上の分析物について評価して、1つ以上の観測値を取得し、T細胞製品の効力を決定するステップと、
d.T細胞製品細胞との陰性対照細胞の第2の共培養を、第2の期間行うステップと、
e.第2の共培養から第2の採取物を取得するステップと、
f.第2の採取物を、(1)T細胞製品細胞上の1つ以上のマーカーの発現について評価するか、または(2)T細胞製品細胞から分泌された1つ以上の分析物について評価して、1つ以上の対照値を取得するステップと、
g.各々の観測値が対応する対照値と比較される、ステップcからの1つ以上の観測値をステップfからの1つ以上の対照値と比較して、T細胞製品の効力を決定するステップと、を含み、
T細胞製品は、腫瘍浸潤リンパ球(TIL)製品、骨髄浸潤リンパ球(MIL)製品、または末梢血リンパ球(PBL)製品からなる群から選択される。
ある実施形態では、本発明は、T細胞製品の効力を決定する方法を含み、この方法は、
a.T細胞製品細胞との標的細胞の共培養を、第1の期間行うステップと、
b.共培養から採取物を取得するステップと、
c.採取物を、(1)T細胞製品細胞上の1つ以上のマーカーの発現について評価するか、または(2)T細胞製品細胞から分泌された1つ以上の分析物について評価して、1つ以上の観測値を取得し、T細胞製品の効力を決定するステップと、
d.T細胞製品細胞との陰性対照細胞の第2の共培養を、第2の期間行うステップと、
e.第2の共培養から第2の採取物を取得するステップと、
f.第2の採取物を、(1)T細胞製品細胞上の1つ以上のマーカーの発現について評価するか、または(2)T細胞製品細胞から分泌された1つ以上の分析物について評価して、1つ以上の対照値を取得するステップと、
g.各々の観測値が対応する対照値と比較される、ステップcからの1つ以上の観測値をステップfからの1つ以上の対照値と比較して、T細胞製品の効力を決定するステップと、を含み、
T細胞製品は、ヒト由来のTIL製品であり、TIL製品は、腫瘍の切除または腫瘍の断片化もしくは消化によって取得され、急速拡張プロトコルステップを含むTIL拡張プロセスによって製造される。
ある実施形態では、本発明は、T細胞製品の効力を決定する方法を含み、この方法は、
a.T細胞製品細胞との標的細胞の共培養を、第1の期間行うステップと、
b.共培養から採取物を取得するステップと、
c.採取物を、(1)T細胞製品細胞上の1つ以上のマーカーの発現について評価するか、または(2)T細胞製品細胞から分泌された1つ以上の分析物について評価して、1つ以上の観測値を取得し、T細胞製品の効力を決定するステップと、
d.T細胞製品細胞との陰性対照細胞の第2の共培養を、第2の期間行うステップと、
e.第2の共培養から第2の採取物を取得するステップと、
f.第2の採取物を、(1)T細胞製品細胞上の1つ以上のマーカーの発現について評価するか、または(2)T細胞製品細胞から分泌された1つ以上の分析物について評価して、1つ以上の対照値を取得するステップと、
g.各々の観測値が対応する対照値と比較される、ステップcからの1つ以上の観測値をステップfからの1つ以上の対照値と比較して、T細胞製品の効力を決定するステップと、
h.ヒト患者の治療において使用するためのT細胞製品を放出することと、を含み、
T細胞製品は、ヒト由来のTIL製品であり、TIL製品は、腫瘍の切除または腫瘍の断片化もしくは消化によって取得され、急速拡張プロトコルステップを含むTIL拡張プロセスによって製造される。
ある実施形態では、本発明は、T細胞製品の効力を決定する方法を含み、この方法は、
a.T細胞製品細胞との標的細胞の共培養を、第1の期間行うステップと、
b.共培養から採取物を取得するステップと、
c.採取物を、(1)T細胞製品細胞上の1つ以上のマーカーの発現について評価するか、または(2)T細胞製品細胞から分泌された1つ以上の分析物について評価して、1つ以上の観測値を取得し、T細胞製品の効力を決定するステップと、
d.T細胞製品細胞との陰性対照細胞の第2の共培養を、第2の期間行うステップと、
e.第2の共培養から第2の採取物を取得するステップと、
f.第2の採取物を、(1)T細胞製品細胞上の1つ以上のマーカーの発現について評価するか、または(2)T細胞製品細胞から分泌された1つ以上の分析物について評価して、1つ以上の対照値を取得するステップと、
g.各々の観測値が対応する対照値と比較される、ステップcからの1つ以上の観測値をステップfからの1つ以上の対照値と比較して、T細胞製品の効力を決定するステップと、
h.ヒト患者の治療において使用するためのT細胞製品を放出することと、を含み、
T細胞製品は、ヒト由来のTIL製品であり、TIL製品は、腫瘍の切除、または腫瘍の断片化もしくは消化によって取得され、急速拡張プロトコルステップを含むTIL拡張プロセスによって製造され、標的細胞は、照射されたRaji細胞、Ramos細胞、Daudi細胞、U937細胞、もしくはThp1細胞、またはそれらの誘導体、バリアント、修飾、もしくは子孫である。
ある実施形態では、本発明は、T細胞製品の効力を決定する方法を含み、この方法は、
a.T細胞製品細胞との標的細胞の共培養を、第1の期間行うステップと、
b.共培養から採取物を取得するステップと、
c.採取物を、(1)T細胞製品細胞上の1つ以上のマーカーの発現について評価するか、または(2)T細胞製品細胞から分泌された1つ以上の分析物について評価して、1つ以上の観測値を取得し、T細胞製品の効力を決定するステップと、
d.T細胞製品細胞との陰性対照細胞の第2の共培養を、第2の期間行うステップと、
e.第2の共培養から第2の採取物を取得するステップと、
f.第2の採取物を、(1)T細胞製品細胞上の1つ以上のマーカーの発現について評価するか、または(2)T細胞製品細胞から分泌された1つ以上の分析物について評価して、1つ以上の対照値を取得するステップと、
g.各々の観測値が対応する対照値と比較される、ステップcからの1つ以上の観測値をステップfからの1つ以上の対照値と比較して、T細胞製品の効力を決定するステップと、
h.ヒト患者の治療において使用するためのT細胞製品を放出することと、を含み、
T細胞製品は、ヒト由来のTIL製品であり、TIL製品は、腫瘍の切除、または腫瘍の断片化もしくは消化によって取得され、急速拡張プロトコルステップを含むTIL拡張プロセスによって製造され、標的細胞は、照射されたRaji細胞、Ramos細胞、Daudi細胞、U937細胞、もしくはThp1細胞、またはそれらの誘導体、バリアント、修飾、もしくは子孫であり、陰性対照細胞は、MHCクラスI及びMHCクラスII発現を欠いている。
ある実施形態では、本発明は、T細胞製品の効力を決定する方法を含み、この方法は、
a.T細胞製品細胞との標的細胞の共培養を、第1の期間行うステップと、
b.共培養から採取物を取得するステップと、
c.採取物を、(1)T細胞製品細胞上の1つ以上のマーカーの発現について評価するか、または(2)T細胞製品細胞から分泌された1つ以上の分析物について評価して、1つ以上の観測値を取得し、T細胞製品の効力を決定するステップと、
d.T細胞製品細胞との陰性対照細胞の第2の共培養を、第2の期間行うステップと、
e.第2の共培養から第2の採取物を取得するステップと、
f.第2の採取物を、(1)T細胞製品細胞上の1つ以上のマーカーの発現について評価するか、または(2)T細胞製品細胞から分泌された1つ以上の分析物について評価して、1つ以上の対照値を取得するステップと、
g.各々の観測値が対応する対照値と比較される、ステップcからの1つ以上の観測値をステップfからの1つ以上の対照値と比較して、T細胞製品の効力を決定するステップと、
h.ヒト患者の治療において使用するためのT細胞製品を放出することと、を含み、
T細胞製品は、ヒト由来のTIL製品であり、TIL製品は、腫瘍の切除、または腫瘍の断片化もしくは消化によって取得され、急速拡張プロトコルステップを含むTIL拡張プロセスによって製造され、標的細胞は、照射されたRaji細胞、Ramos細胞、Daudi細胞、U937細胞、もしくはThp1細胞、またはそれらの誘導体、バリアント、修飾、もしくは子孫であり、陰性対照細胞は、照射されたK562細胞またはその誘導体、バリアント、修飾、もしくは子孫である。
ある実施形態では、本発明は、T細胞製品の効力を決定する方法を含み、この方法は、
a.T細胞製品細胞との標的細胞の共培養を、第1の期間行うステップと、
b.共培養から採取物を取得するステップと、
c.採取物を、(1)T細胞製品細胞上の1つ以上のマーカーの発現について評価するか、または(2)T細胞製品細胞から分泌された1つ以上の分析物について評価して、1つ以上の観測値を取得し、T細胞製品の効力を決定するステップと、
d.T細胞製品細胞との陰性対照細胞の第2の共培養を、第2の期間行うステップと、
e.第2の共培養から第2の採取物を取得するステップと、
f.第2の採取物を、(1)T細胞製品細胞上の1つ以上のマーカーの発現について評価するか、または(2)T細胞製品細胞から分泌された1つ以上の分析物について評価して、1つ以上の対照値を取得するステップと、
g.各々の観測値が対応する対照値と比較される、ステップcからの1つ以上の観測値をステップfからの1つ以上の対照値と比較して、T細胞製品の効力を決定するステップと、
h.ヒト患者の治療において使用するためのT細胞製品を放出することと、を含み、
T細胞製品は、ヒト由来のTIL製品であり、TIL製品は、腫瘍の切除、または腫瘍の断片化もしくは消化によって取得され、急速拡張プロトコルステップを含むTIL拡張プロセスによって製造され、標的細胞は、照射されたRaji細胞、Ramos細胞、Daudi細胞、U937細胞、もしくはThp1細胞、またはそれらの誘導体、バリアント、修飾、もしくは子孫であり、陰性対照細胞は、照射されたK562細胞またはその誘導体、バリアント、修飾、もしくは子孫であり、TIL製品細胞の数と標的細胞の数との比は、5:1~1:5である。
ある実施形態では、本発明は、T細胞製品の効力を決定する方法を含み、この方法は、
a.T細胞製品細胞との標的細胞の共培養を、第1の期間行うステップと、
b.共培養から採取物を取得するステップと、
c.採取物を、(1)T細胞製品細胞上の1つ以上のマーカーの発現について評価するか、または(2)T細胞製品細胞から分泌された1つ以上の分析物について評価して、1つ以上の観測値を取得し、T細胞製品の効力を決定するステップと、
d.T細胞製品細胞との陰性対照細胞の第2の共培養を、第2の期間行うステップと、
e.第2の共培養から第2の採取物を取得するステップと、
f.第2の採取物を、(1)T細胞製品細胞上の1つ以上のマーカーの発現について評価するか、または(2)T細胞製品細胞から分泌された1つ以上の分析物について評価して、1つ以上の対照値を取得するステップと、
g.各々の観測値が対応する対照値と比較される、ステップcからの1つ以上の観測値をステップfからの1つ以上の対照値と比較して、T細胞製品の効力を決定するステップと、
h.ヒト患者の治療において使用するためのT細胞製品を放出することと、を含み、
T細胞製品は、ヒト由来のTIL製品であり、TIL製品は、腫瘍の切除、または腫瘍の断片化もしくは消化によって取得され、急速拡張プロトコルステップを含むTIL拡張プロセスによって製造され、標的細胞は、照射されたRaji細胞、Ramos細胞、Daudi細胞、U937細胞、もしくはThp1細胞、またはそれらの誘導体、バリアント、修飾、もしくは子孫であり、陰性対照細胞は、照射されたK562細胞またはその誘導体、バリアント、修飾、もしくは子孫であり、TIL製品細胞の数と標的細胞の数との比は、5:1~1:5であり、TIL製品細胞の数と陰性対照細胞の数との比は、5:1~1:5である。
ある実施形態では、本発明は、T細胞製品の効力を決定する方法を含み、この方法は、
a.T細胞製品細胞との標的細胞の共培養を、第1の期間行うステップと、
b.共培養から採取物を取得するステップと、
c.採取物を、(1)T細胞製品細胞上の1つ以上のマーカーの発現について評価するか、または(2)T細胞製品細胞から分泌された1つ以上の分析物について評価して、1つ以上の観測値を取得し、T細胞製品の効力を決定するステップと、
d.T細胞製品細胞との陰性対照細胞の第2の共培養を、第2の期間行うステップと、
e.第2の共培養から第2の採取物を取得するステップと、
f.第2の採取物を、(1)T細胞製品細胞上の1つ以上のマーカーの発現について評価するか、または(2)T細胞製品細胞から分泌された1つ以上の分析物について評価して、1つ以上の対照値を取得するステップと、
g.各々の観測値が対応する対照値と比較される、ステップcからの1つ以上の観測値をステップfからの1つ以上の対照値と比較して、T細胞製品の効力を決定するステップと、
h.ヒト患者の治療において使用するためのT細胞製品を放出することと、を含み、
T細胞製品は、ヒト由来のTIL製品であり、TIL製品は、腫瘍の切除、または腫瘍の断片化もしくは消化によって取得され、急速拡張プロトコルステップを含むTIL拡張プロセスによって製造され、標的細胞は、照射されたRaji細胞、Ramos細胞、Daudi細胞、U937細胞、もしくはThp1細胞、またはそれらの誘導体、バリアント、修飾、もしくは子孫であり、陰性対照細胞は、照射されたK562細胞またはその誘導体、バリアント、修飾、もしくは子孫であり、第1の期間は、約6時間~約48時間であり、第2の期間は、約6時間~約48時間である。
ある実施形態では、本発明は、T細胞製品の効力を決定する方法を含み、この方法は、
a.T細胞製品細胞との標的細胞の共培養を、第1の期間行うステップと、
b.共培養から採取物を取得するステップと、
c.採取物を、(1)T細胞製品細胞上の1つ以上のマーカーの発現について評価するか、または(2)T細胞製品細胞から分泌された1つ以上の分析物について評価して、1つ以上の観測値を取得し、T細胞製品の効力を決定するステップと、
d.T細胞製品細胞との陰性対照細胞の第2の共培養を、第2の期間行うステップと、
e.第2の共培養から第2の採取物を取得するステップと、
f.第2の採取物を、(1)T細胞製品細胞上の1つ以上のマーカーの発現について評価するか、または(2)T細胞製品細胞から分泌された1つ以上の分析物について評価して、1つ以上の対照値を取得するステップと、
g.各々の観測値が対応する対照値と比較される、ステップcからの1つ以上の観測値をステップfからの1つ以上の対照値と比較して、T細胞製品の効力を決定するステップと、
h.ヒト患者の治療において使用するためのT細胞製品を放出することと、を含み、
T細胞製品は、ヒト由来のTIL製品であり、TIL製品は、腫瘍の切除、または腫瘍の断片化もしくは消化によって取得され、急速拡張プロトコルステップを含むTIL拡張プロセスによって製造され、標的細胞は、照射されたRaji細胞、Ramos細胞、Daudi細胞、U937細胞、もしくはThp1細胞、またはそれらの誘導体、バリアント、修飾、もしくは子孫であり、陰性対照細胞は、照射されたK562細胞またはその誘導体、バリアント、修飾、もしくは子孫であり、第1の期間は、約12時間、約18時間、及び約24時間からなる群から選択され、第2の期間は、約12時間、約18時間、及び約24時間からなる群から選択される。
ある実施形態では、本発明は、T細胞製品の効力を決定する方法を含み、この方法は、
a.T細胞製品細胞との標的細胞の共培養を、第1の期間行うステップと、
b.共培養から採取物を取得するステップと、
c.採取物を、(1)T細胞製品細胞上の1つ以上のマーカーの発現について評価するか、または(2)T細胞製品細胞から分泌された1つ以上の分析物について評価して、1つ以上の観測値を取得し、T細胞製品の効力を決定するステップと、
d.T細胞製品細胞との陰性対照細胞の第2の共培養を、第2の期間行うステップと、
e.第2の共培養から第2の採取物を取得するステップと、
f.第2の採取物を、(1)T細胞製品細胞上の1つ以上のマーカーの発現について評価するか、または(2)T細胞製品細胞から分泌された1つ以上の分析物について評価して、1つ以上の対照値を取得するステップと、
g.各々の観測値が対応する対照値と比較される、ステップcからの1つ以上の観測値をステップfからの1つ以上の対照値と比較して、T細胞製品の効力を決定するステップと、
h.ヒト患者の治療において使用するためのT細胞製品を放出することと、を含み、
T細胞製品は、ヒト由来のTIL製品であり、TIL製品は、腫瘍の切除、または腫瘍の断片化もしくは消化によって取得され、急速拡張プロトコルステップを含むTIL拡張プロセスによって製造され、標的細胞は、照射されたRaji細胞、Ramos細胞、Daudi細胞、U937細胞、もしくはThp1細胞、またはそれらの誘導体、バリアント、修飾、もしくは子孫であり、陰性対照細胞は、照射されたK562細胞またはその誘導体、バリアント、修飾、もしくは子孫であり、T細胞製品上の1つ以上のマーカーは、CD25、CD69、CD134、CD137、CD150、KLRG1、またはそれらの組み合わせからなる群から選択される。
ある実施形態では、本発明は、T細胞製品の効力を決定する方法を含み、この方法は、
a.T細胞製品細胞との標的細胞の共培養を、第1の期間行うステップと、
b.共培養から採取物を取得するステップと、
c.採取物を、(1)T細胞製品細胞上の1つ以上のマーカーの発現について評価するか、または(2)T細胞製品細胞から分泌された1つ以上の分析物について評価して、1つ以上の観測値を取得し、T細胞製品の効力を決定するステップと、
d.T細胞製品細胞との陰性対照細胞の第2の共培養を、第2の期間行うステップと、
e.第2の共培養から第2の採取物を取得するステップと、
f.第2の採取物を、(1)T細胞製品細胞上の1つ以上のマーカーの発現について評価するか、または(2)T細胞製品細胞から分泌された1つ以上の分析物について評価して、1つ以上の対照値を取得するステップと、
g.各々の観測値が対応する対照値と比較される、ステップcからの1つ以上の観測値をステップfからの1つ以上の対照値と比較して、T細胞製品の効力を決定するステップと、
h.ヒト患者の治療において使用するためのT細胞製品を放出することと、を含み、
T細胞製品は、ヒト由来のTIL製品であり、TIL製品は、腫瘍の切除、または腫瘍の断片化もしくは消化によって取得され、急速拡張プロトコルステップを含むTIL拡張プロセスによって製造され、標的細胞は、照射されたRaji細胞、Ramos細胞、Daudi細胞、U937細胞、もしくはThp1細胞、またはそれらの誘導体、バリアント、修飾、もしくは子孫であり、陰性対照細胞は、照射されたK562細胞またはその誘導体、バリアント、修飾、もしくは子孫であり、T細胞製品から選択される1つ以上の分析物は、IFN-α、IFN-β、IFN-γ、グランザイムB、パーフォリン、TNF-α、IL-1α、IL-1β、IL-2、IL-3、IL-4、IL-5、IL-6、IL-8、IL-9、IL-10、IL-13、IL-14、IL-16、IL-17、IL-18、IL-22、IL-25、IL-26、MIP-1β、及びそれらの組み合わせからなる群から選択される。
ある実施形態では、本発明は、T細胞製品の効力を決定する方法を含み、この方法は、
a.T細胞製品細胞との標的細胞の共培養を、第1の期間行うステップと、
b.共培養から採取物を取得するステップと、
c.採取物を、(1)T細胞製品細胞上の1つ以上のマーカーの発現について評価するか、または(2)T細胞製品細胞から分泌された1つ以上の分析物について評価して、1つ以上の観測値を取得し、T細胞製品の効力を決定するステップと、
d.T細胞製品細胞との陰性対照細胞の第2の共培養を、第2の期間行うステップと、
e.第2の共培養から第2の採取物を取得するステップと、
f.第2の採取物を、(1)T細胞製品細胞上の1つ以上のマーカーの発現について評価するか、または(2)T細胞製品細胞から分泌された1つ以上の分析物について評価して、1つ以上の対照値を取得するステップと、
g.各々の観測値が対応する対照値と比較される、ステップcからの1つ以上の観測値をステップfからの1つ以上の対照値と比較して、T細胞製品の効力を決定するステップと、
h.ヒト患者の治療において使用するためのT細胞製品を放出することと、を含み、
T細胞製品は、ヒト由来のTIL製品であり、TIL製品は、腫瘍の切除、または腫瘍の断片化もしくは消化によって取得され、かつ急速拡張プロトコルステップを含むTIL拡張プロセスによって製造され、標的細胞は、照射されたRaji細胞、Ramos細胞、Daudi細胞、U937細胞、もしくはThp1細胞、またはその誘導体、バリアント、修飾、もしくは子孫であり、陰性対照細胞は、照射されたK562細胞、またはその誘導体、バリアント、修飾、もしくは子孫であり、T細胞製品から分泌された1つ以上の分析物は、IFN-α、IFN-β、IFN-γ、グランザイムB、パーフォリン、TNF-α、IL-1α、IL-1β、IL-2、IL-3、IL-4、IL-5、IL-6、IL-8、IL-9、IL-10、IL-13、IL-14、IL-16、IL-17、IL-18、IL-22、IL-25、IL-26、MIP-1β、及びそれらの組み合わせからなる群から選択され、TIL製品から分泌された1つ以上の分析物は、IFN-α、IFN-β、IFN-γ、グランザイムB、パーフォリン、TNF-α、IL-1α、IL-1β、IL-2、IL-3、IL-4、IL-5、IL-6、IL-8、IL-9、IL-10、IL-13、IL-14、IL-16、IL-17、IL-18、IL-22、IL-25、IL-26、MIP-1β、及びそれらの組み合わせからなる群から選択され、観測値の量は、1つ以上の分析物の各々についての対照値の量に正規化され、1つ以上の分析物の各々についての対照値を上回る観測値の増加は、少なくとも1倍、少なくとも1.5倍、少なくとも2倍、少なくとも2.5倍、少なくとも3倍、少なくとも3.5倍、少なくとも4倍、少なくとも4.5倍、及び少なくとも5倍からなる群から選択される。
前述の実施形態のうちのいずれにおいても、腫瘍消化は、本明細書に記載の方法によって、または当該技術分野で知られている方法によって行われ得る。前述の実施形態のうちのいずれにおいても、腫瘍消化は、国際特許公開第WO2021/123832A1号(その開示は参照により本明細書に組み込まれる)に記載の方法に従って、またはその組成物またはデバイスを使用して行われる。
いくつかの実施形態では、本発明は、TIL、MIL、PBL、または評価される他のポリクローナルT細胞製品を投与することによってがんの治療に用いることができる、拡張TIL、ならびにMIL及びPBLを含む他のポリクローナルT細胞製品の効力及び/または機能性を評価するためのTIL多機能活性をアッセイするための方法を提供し、この方法は、
a.T細胞製品細胞との標的細胞の共培養を、第1の期間行うステップと、
b.共培養から採取物を取得するステップと、
c.採取物を、(1)T細胞製品細胞上の1つ以上のマーカーの発現について評価するか、または(2)T細胞製品細胞から分泌された2つ以上の分析物について評価して、1つ以上の観測値を取得し、T細胞製品の効力を決定するステップと、を含む。
いくつかの実施形態では、この方法は、
d.T細胞製品細胞との陰性対照細胞の第2の共培養を、第2の期間行う追加のステップと、
e.第2の共培養から第2の採取物を取得する追加のステップと、
f.第2の採取物を、(1)T細胞製品細胞上の1つ以上のマーカーの発現について評価するか、または(2)T細胞製品細胞から分泌された2つ以上の分析物について評価して、1つ以上の対照値を取得する追加のステップと、
g.各々の観測値が対応する対照値と比較される、ステップcからの1つ以上の観測値をステップfからの1つ以上の対照値と比較して、T細胞製品の効力を決定する追加のステップと、を含み、
TIL製品から分泌された2つ以上の分析物は、IFN-α、IFN-β、IFN-γ、グランザイムB、パーフォリン、TNF-α、IL-1α、IL-1β、IL-2、IL-3、IL-4、IL-5、IL-6、IL-8、IL-9、IL-10、IL-13、IL-14、IL-16、IL-17、IL-18、IL-22、IL-25、IL-26、MIP-1β、及びそれらの組み合わせからなる群から選択され、観測値の量は、2つ以上の分析物の各々について対照値の量に対して正規化され、2つ以上の分析物の各々について対照値を上回る観測値の増加は、少なくとも1倍、少なくとも1.5倍、少なくとも2倍、少なくとも2.5倍、少なくとも3倍、少なくとも3.5倍、少なくとも4倍、少なくとも4.5倍、及び少なくとも5倍、少なくとも6倍、少なくとも7倍、少なくとも8倍、少なくとも9倍、及び少なくとも10倍からなる群から選択される。
いくつかの実施形態では、本発明は、TIL、MIL、PBL、または評価される他のポリクローナルT細胞製品を投与することによってがんの治療に用いることができる、拡張TIL、ならびにMIL及びPBLを含む他のポリクローナルT細胞製品の効力及び/または機能性を評価するためのTIL多機能活性をアッセイするための方法を提供し、この方法は、
a.T細胞製品細胞との標的細胞の共培養を、第1の期間行うステップと、
b.共培養から採取物を取得するステップと、
c.採取物を、(1)T細胞製品細胞上の1つ以上のマーカーの発現について評価するか、または(2)T細胞製品細胞から分泌された3つ以上の分析物について評価して、1つ以上の観測値を取得し、T細胞製品の効力を決定するステップと、を含む。
いくつかの実施形態では、この方法は、
d.T細胞製品細胞との陰性対照細胞の第2の共培養を、第2の期間行う追加のステップと、
e.第2の共培養から第2の採取物を取得する追加のステップと、
f.第2の採取物を、(1)T細胞製品細胞上の1つ以上のマーカーの発現について評価するか、または(2)T細胞製品細胞から分泌された3つ以上の分析物について評価して、1つ以上の対照値を取得する追加のステップと、
g.各々の観測値が対応する対照値と比較される、ステップcからの1つ以上の観測値をステップfからの1つ以上の対照値と比較して、T細胞製品の効力を決定する追加のステップと、を含み、
TIL製品から分泌された3つ以上の分析物は、IFN-α、IFN-β、IFN-γ、グランザイムB、パーフォリン、TNF-α、IL-1α、IL-1β、IL-2、IL-3、IL-4、IL-5、IL-6、IL-8、IL-9、IL-10、IL-13、IL-14、IL-16、IL-17、IL-18、IL-22、IL-25、IL-26、MIP-1β、及びそれらの組み合わせからなる群から選択され、観測値の量は、3つ以上の分析物の各々について対照値の量に対して正規化され、3つ以上の分析物の各々について対照値を上回る観測値の増加は、少なくとも1倍、少なくとも1.5倍、少なくとも2倍、少なくとも2.5倍、少なくとも3倍、少なくとも3.5倍、少なくとも4倍、少なくとも4.5倍、及び少なくとも5倍、少なくとも6倍、少なくとも7倍、少なくとも8倍、少なくとも9倍、及び少なくとも10倍からなる群から選択される。
いくつかの実施形態では、本発明は、TIL、MIL、PBL、または評価される他のポリクローナルT細胞製品を投与することによってがんの治療に用いることができる、拡張TIL、ならびにMIL及びPBLを含む他のポリクローナルT細胞製品の効力及び/または機能性を評価するためのTIL多機能活性をアッセイするための方法を提供し、この方法は、
a.複数のT細胞製品細胞との複数の標的細胞の共培養を、第1の期間行うステップと、
b.共培養から採取物を取得するステップと、
c.採取物を、(1)T細胞製品細胞上の1つ以上のマーカーの発現について評価するか、または(2)T細胞製品細胞から分泌された1つ以上の分析物について評価して、1つ以上の観測値を取得し、T細胞製品の効力を決定するステップと、を含む。
いくつかの実施形態では、この方法は、
d.T細胞製品細胞との複数の陰性対照細胞の第2の共培養を、第2の期間行う追加のステップと、
e.第2の共培養から第2の採取物を取得する追加のステップと、
f.第2の採取物を、(1)T細胞製品細胞上の1つ以上のマーカーの発現について評価するか、または(2)T細胞製品細胞から分泌された1つ以上の分析物について評価して、1つ以上の対照値を取得する追加のステップと、
g.各々の観測値が対応する対照値と比較される、ステップcからの1つ以上の観測値をステップfからの1つ以上の対照値と比較して、T細胞製品の効力を決定する追加のステップと、を含み、
TIL製品から分泌された1つ以上の分析物は、IFN-α、IFN-β、IFN-γ、グランザイムB、パーフォリン、TNF-α、IL-1α、IL-1β、IL-2、IL-3、IL-4、IL-5、IL-6、IL-8、IL-9、IL-10、IL-13、IL-14、IL-16、IL-17、IL-18、IL-22、IL-25、IL-26、MIP-1β、及びそれらの組み合わせからなる群から選択され、観測値の量は、1つ以上の分析物の各々について対照値の量に対して正規化され、1つ以上の分析物の各々について対照値を上回る観測値の増加は、少なくとも1倍、少なくとも1.5倍、少なくとも2倍、少なくとも2.5倍、少なくとも3倍、少なくとも3.5倍、少なくとも4倍、少なくとも4.5倍、及び少なくとも5倍、少なくとも6倍、少なくとも7倍、少なくとも8倍、少なくとも9倍、及び少なくとも10倍からなる群から選択される。
ある実施形態では、本発明は、上記方法を含み、標的細胞は、Raji細胞、Thp1細胞、Ramos細胞、U937細胞、Daudi細胞、及びそれらの組み合わせからなる群から選択される。ある実施形態では、標的細胞は、2つ以上の細胞株の組み合わせである。ある実施形態では、標的細胞は、2つ以上の細胞株の1:1の組み合わせである。ある実施形態では、標的細胞は、2つ以上の細胞株の1:1の組み合わせであり、2つ以上の細胞株は、異なるものであり、各々独立して、Raji細胞、Thp1細胞、Ramos細胞、U937細胞、及びDaudi細胞からなる群から選択される。ある実施形態では、標的細胞は、3つ以上の細胞株の1:1:1の組み合わせであり、3つ以上の細胞株は、異なるものであり、各々独立して、Raji細胞、Thp1細胞、Ramos細胞、U937細胞、及びDaudi細胞からなる群から選択される。ある実施形態では、標的細胞は、4つ以上の細胞株の1:1:1:1の組み合わせであり、4つ以上の細胞株は、異なるものであり、各々独立して、Raji細胞、Thp1細胞、Ramos細胞、U937細胞、及びDaudi細胞からなる群から選択される。ある実施形態では、標的細胞は、2つ以上の細胞株の1:1:1:1:1の組み合わせであり、2つ以上の細胞株は、異なるものであり、各々独立して、Raji細胞、Thp1細胞、Ramos細胞、U937細胞、及びDaudi細胞からなる群から選択される。
ある実施形態では、標的細胞は、Raji細胞とThp1細胞との組み合わせであり、Raji細胞対Thp1細胞の比は、5:1、4:1、3:1、2:1、1:1、1:2、1:3、1:4、及び1:5からなる群から選択される。ある実施形態では、標的細胞は、Raji細胞とRamos細胞との組み合わせであり、Raji細胞対Ramos細胞の比は、5:1、4:1、3:1、2:1、1:1、1:2、1:3、1:4、及び1:5からなる群から選択される。ある実施形態では、標的細胞は、Raji細胞とU937細胞との組み合わせであり、Raji細胞対U937細胞の比は、5:1、4:1、3:1、2:1、1:1、1:2、1:3、1:4、及び1:5からなる群から選択される。ある実施形態では、標的細胞は、Raji細胞とDaudi細胞との組み合わせであり、Raji細胞対Daudi細胞の比は、5:1、4:1、3:1、2:1、1:1、1:2、1:3、1:4、及び1:5からなる群から選択される。
ある実施形態では、本発明は、前述の方法を含み、共培養は、細胞培養培地を含む。ある実施形態では、本発明は、前述の方法を含み、共培養は、CM1培地を含む。ある実施形態では、本発明は、前述の方法を含み、共培養は、AIM-V培地(L-グルタミン、50μMの硫酸ストレプトマイシン、及び10μMの硫酸ゲンタマイシン)を含み、これは、Invitrogen(Carlsbad,CA)から市販されているAIM V培地とも称される。ある実施形態では、本発明は、前述の方法を含み、共培養及び第2の共培養は、細胞培養培地を含む。ある実施形態では、本発明は、前述の方法を含み、共培養及び第2の共培養は、各々CM1培地を含む。ある実施形態では、本発明は、前述の方法を含み、共培養及び第2の共培養は、各々AIM-V培地を含む。ある実施形態では、共培養は、IL-2を含み、IL-2は、共培養中に連続的に添加され、IL-2は、共培養中に50IU/mL~1000IU/mLの濃度で維持される。ある実施形態では、共培養は、IL-2を含み、IL-2は、共培養中に連続的に添加され、IL-2は、共培養中に100IU/mL~500IU/mLの濃度で維持される。ある実施形態では、共培養は、IL-2を含み、IL-2は、共培養中に連続的に添加され、IL-2は、共培養中に200IU/mL~400IU/mLの濃度で維持される。ある実施形態では、共培養は、IL-2を含み、IL-2は、共培養中に連続的に添加され、IL-2は、約50IU/mL、約100IU/mL、約150IU/mL、約200IU/mL、約250IU/mL、約300IU/mL、約350IU/mL、約400IU/mL、約450IU/mL、及び約500IU/mLからなる群から選択される濃度で維持される。
ある実施形態では、本発明は、T細胞製品の効力を決定する方法を含み、この方法は、
a.T細胞製品細胞との標的細胞の共培養を、第1の期間行うステップと、
b.共培養から採取物を取得するステップと、
c.採取物を、(1)T細胞製品細胞上の1つ以上のマーカーの発現について評価するか、または(2)T細胞製品細胞から分泌された1つ以上の分析物について評価して、1つ以上の観測値を取得し、T細胞製品の効力を決定するステップと、を含み、
IL-2は、共培養中に連続的に添加され、IL-2は、約50IU/mL、約100IU/mL、約150IU/mL、約200IU/mL、約250IU/mL、約300IU/mL、約350IU/mL、約400IU/mL、約450IU/mL、及び約500IU/mLからなる群から選択される共培養中の濃度で維持される。
ある実施形態では、本発明は、T細胞製品の効力を決定する方法を含み、この方法は、
a.T細胞製品細胞との標的細胞の共培養を、第1の期間行うステップと、
b.共培養から採取物を取得するステップと、
c.採取物を、(1)T細胞製品細胞上の1つ以上のマーカーの発現について評価するか、または(2)T細胞製品細胞から分泌された1つ以上の分析物について評価して、1つ以上の観測値を取得し、T細胞製品の効力を決定するステップと、
d.T細胞製品細胞との陰性対照細胞の第2の共培養を、第2の期間行う追加のステップと、
e.第2の共培養から第2の採取物を取得する追加のステップと、
f.第2の採取物を、(1)T細胞製品細胞上の1つ以上のマーカーの発現について評価するか、または(2)T細胞製品細胞から分泌された1つ以上の分析物について評価して、1つ以上の対照値を取得する追加のステップと、
g.ステップcからの1つ以上の観測値をステップfからの1つ以上の対照値と比較して、T細胞製品の効力を決定する追加のステップであって、各々の観測値が対応する対照値と比較される、T細胞製品の効力を決定する追加のステップと、を含み、
IL-2は、共培養及び第2の共培養中に連続的に添加され、IL-2は、約50IU/mL、約100IU/mL、約150IU/mL、約200IU/mL、約250IU/mL、約300IU/mL、約350IU/mL、約400IU/mL、約450IU/mL、及び約500IU/mLからなる群から選択される濃度で、共培養及び第2の共培養の各々における濃度で維持される。
ある実施形態では、本発明は、T細胞製品の効力を決定する方法を含み、この方法は、
a.T細胞製品細胞との標的細胞の共培養を、第1の期間行うステップと、
b.共培養から採取物を取得するステップと、
c.採取物を、(1)T細胞製品細胞上の1つ以上のマーカーの発現について評価するか、または(2)T細胞製品細胞から分泌された1つ以上の分析物について評価して、1つ以上の観測値を取得し、T細胞製品の効力を決定するステップと、を含み、
IL-2は、共培養中に連続的に添加され、IL-2は、50IU/mL~1000IU/mLの共培養における濃度で維持される。
ある実施形態では、本発明は、T細胞製品の効力を決定する方法を含み、この方法は、
a.T細胞製品細胞との標的細胞の共培養を、第1の期間行うステップと、
b.共培養から採取物を取得するステップと、
c.採取物を、(1)T細胞製品細胞上の1つ以上のマーカーの発現について評価するか、または(2)T細胞製品細胞から分泌された1つ以上の分析物について評価して、1つ以上の観測値を取得し、T細胞製品の効力を決定するステップと、
d.T細胞製品細胞との陰性対照細胞の第2の共培養を、第2の期間行うステップと、
e.第2の共培養から第2の採取物を取得する追加のステップと、
f.第2の採取物を、(1)T細胞製品細胞上の1つ以上のマーカーの発現について評価するか、または(2)T細胞製品細胞から分泌された1つ以上の分析物について評価して、1つ以上の対照値を取得する追加のステップと、
g.各々の観測値が対応する対照値と比較される、ステップcからの1つ以上の観測値をステップfからの1つ以上の対照値と比較して、T細胞製品の効力を決定する追加のステップと、を含み、
IL-2は、共培養及び第2の共培養中に連続的に添加され、IL-2は、共培養及び第2の共培養の各々において、50IU/mL~1000IU/mLの濃度で維持される。
いくつかの実施形態では、本発明は、TIL活性、MIL活性、またはPBL活性をアッセイするための方法を提供し、殺傷アッセイが使用される。いくつかの実施形態では、本発明は、TIL活性、MIL活性、またはPBL活性をアッセイするための方法を提供し、殺傷アッセイが使用され、細胞溶解エンドポイントが検出される。いくつかの実施形態では、本発明は、TIL活性、MIL活性、またはPBL活性をアッセイするための方法を提供し、殺傷アッセイが使用される。いくつかの実施形態では、本発明は、TIL活性、MIL活性、またはPBL活性をアッセイするための方法を提供し、殺傷アッセイが使用され、溶解されたときに蛍光、化学発光、または生物発光タンパク質を発現するように、標的細胞株の遺伝子修飾によって細胞溶解エンドポイントが検出される。好適な遺伝子修飾及びアッセイとしては、米国特許第9,631,225号に記載されるものなどのルシフェラーゼアッセイが挙げられ、その開示は参照により本明細書に組み込まれる。例えば、米国特許第10,415,015号(その開示は参照により本明細書に組み込まれる)において生物発光検出について記載される遺伝子修飾アプローチは、Raji細胞、K562細胞、Daudi細胞、Ramos細胞、U937細胞、またはThp1細胞などの標的細胞の修飾に用いられ得る。
ある実施形態では、本発明は、T細胞製品の効力をアッセイするための方法を提供し、この方法は、標的細胞を事前照射して増殖を停止させるステップをさらに含む。ある実施形態では、本発明は、T細胞製品の効力をアッセイするための方法を提供し、この方法は、増殖を停止させるために照射されていない標的細胞の使用を含む。ある実施形態では、本発明は、T細胞製品の効力をアッセイするための方法を提供し、この方法は、標的細胞を化学的または生物学的に処理して増殖を停止させるステップをさらに含む。
ある実施形態では、本発明は、T細胞製品の効力をアッセイするための方法を提供し、この方法は、陰性対照細胞を事前照射して増殖を停止させるステップをさらに含む。ある実施形態では、本発明は、T細胞製品の効力をアッセイするための方法を提供し、この方法は、増殖を停止させるために照射されていない陰性対照細胞の使用を含む。ある実施形態では、本発明は、T細胞製品の効力をアッセイするための方法を提供し、この方法は、陰性対照細胞を化学的または生物学的に処理して増殖を停止させるステップをさらに含む。
ある実施形態では、標的細胞には、X線またはガンマ線を使用して、約5Gy、10Gy、15Gy、20Gy、25Gy、30Gy、35Gy、40Gy、45Gy、50Gy、55Gy、60Gy、65Gy、70Gy、75Gy、80Gy、85Gy、90Gy、95Gy、100Gy、105Gy、110Gy、115Gy、120Gy、125Gy、130Gy、135Gy、140Gy、145Gy、150Gy、155Gy、160Gy、165Gy、170Gy、175Gy、180Gy、185Gy、190Gy、または200Gyの総吸収線量の放射線が照射される。
ある実施形態では、標的細胞には、X線またはガンマ線を使用して、約100rads、200rads、300rads、400rads、500rads、600rads、700rads、800rads、900rads、1000rads、1100rads、1200rads、1300rads、1400rads、1500rads、1600rads、1700rads、1800rads、1900rads、2000rads、2100rads、2200rads、2300rads、2400rads、2500rads、2600rads、2700rads、2800rads、2900rads、3000rads、3100rads、3200rads、3300rads、3400rads、3500rads、3600rads、3700rads、3800rads、3900rads、4000rads、4100rads、4200rads、4300rads、4400rads、4500rads、4600rads、4700rads、4800rads、4900rads、5000rads、5100rads、5200rads、5300rads、5400rads、5500rads、5600rads、5700rads、5800rads、5900rads、6000rads、6100rads、6200rads、6300rads、6400rads、6500rads、6600rads、6700rads、6800rads、6900rads、7000rads、7500rads、8000rads、8500rads、9000rads、9500rads、または10000radsの総吸収線量の放射線が照射される。
ある実施形態では、標的細胞は、X線またはガンマ線を使用して、約20rads/分、40rads/分、60rads/分、80rads/分、100rads/分、120rads/分、140rads/分、160rads/分、180rads/分、200rads/分、220rads/分、240rads/分、260rads/分、280rads/分、300rads/分、320rads/分、340rads/分、360rads/分、380rads/分、400rads/分、420rads/分、440rads/分、460rads/分、480rads/分、500rads/分、520rads/分、540rads/分、560rads/分、580rads/分、600rads/分、620rads/分、640rads/分、660rads/分、680rads/分、または700rads/分の吸収線量の放射線の速度で照射される。ある実施形態では、標的細胞は、X線またはガンマ線を使用して、約50rads/分、100rads/分、150rads/分、200rads/分、250rads/分、300rads/分、350rads/分、400rads/分、450rads/分、500rads/分、550rads/分、600rads/分、650rads/分、700rads/分、750rads/分、800rads/分、850rads/分、900rads/分、950rads/分、1000rads/分、1050rads/分、1100rads/分、1150rads/分、1200rads/分、1250rads/分、1300rads/分、1350rads/分、1400rads/分、1450rads/分、1500rads/分、1550rads/分、1600rads/分、1650rads/分、1700rads/分、1750rads/分、1800rads/分、1850rads/分、1900rads/分、1950rads/分、または2000rads/分の吸収線量の放射線の速度で照射される。
ある実施形態では、本発明は、TIL製品、MIL製品、またはPBL製品などのT細胞製品の効力を決定するための混合腫瘍アロ反応性アッセイ方法開示を行うための方法を含む。ある実施形態では、本発明は、T細胞製品の効力を決定する方法を含み、この方法は、
a.T細胞製品細胞との混合腫瘍アロ反応性細胞株の共培養を、第1の期間行うステップと、
b.共培養から採取物を取得するステップと、
c.採取物を、(1)T細胞製品細胞上の1つ以上のマーカーの発現について評価するか、または(2)T細胞製品細胞から分泌された1つ以上の分析物について評価して、1つ以上の観測値を取得し、T細胞製品の効力を決定するステップと、を含み、
IL-2は、共培養中に連続的に添加され、IL-2は、約50IU/mL、約100IU/mL、約150IU/mL、約200IU/mL、約250IU/mL、約300IU/mL、約350IU/mL、約400IU/mL、約450IU/mL、及び約500IU/mLからなる群から選択される共培養中の濃度で維持される。
ある実施形態では、本発明は、T細胞製品の効力を決定する方法を含み、この方法は、
a.T細胞製品細胞との混合腫瘍アロ反応性細胞株の共培養を、第1の期間行うステップであって、混合腫瘍アロ反応性細胞株が、混合腫瘍細胞株である、共培養を第1の期間行うステップと、
b.共培養から採取物を取得するステップと、
c.採取物を、(1)T細胞製品細胞上の1つ以上のマーカーの発現について評価するか、または(2)T細胞製品細胞から分泌された1つ以上の分析物について評価して、1つ以上の観測値を取得し、T細胞製品の効力を決定するステップと、
d.T細胞製品細胞との陰性対照細胞の第2の共培養を、第2の期間行うステップと、
e.第2の共培養から第2の採取物を取得するステップと、
f.第2の採取物を、(1)T細胞製品細胞上の1つ以上のマーカーの発現について評価するか、または(2)T細胞製品細胞から分泌された1つ以上の分析物について評価して、1つ以上の対照値を取得するステップと、
g.ステップcからの1つ以上の観測値をステップfからの1つ以上の対照値と比較して、T細胞製品の効力を決定する追加のステップであって、各々の観測値が対応する対照値と比較される、T細胞製品の効力を決定する追加のステップと、を含み、
IL-2は、共培養及び第2の共培養中に連続的に添加され、IL-2は、約50IU/mL、約100IU/mL、約150IU/mL、約200IU/mL、約250IU/mL、約300IU/mL、約350IU/mL、約400IU/mL、約450IU/mL、及び約500IU/mLからなる群から選択される濃度で、共培養及び第2の共培養の各々における濃度で維持される。
ある実施形態では、本発明は、T細胞製品の効力を決定する方法を含み、この方法は、
a.T細胞製品細胞との混合腫瘍アロ反応性細胞株の共培養を、第1の期間行うステップと、
b.共培養から採取物を取得するステップと、
c.採取物を、(1)T細胞製品細胞上の1つ以上のマーカーの発現について評価するか、または(2)T細胞製品細胞から分泌された1つ以上の分析物について評価して、1つ以上の観測値を取得し、T細胞製品の効力を決定するステップと、を含み、
IL-2は、共培養中に連続的に添加され、IL-2は、50IU/mL~1000IU/mLの共培養中の濃度に維持される。
ある実施形態では、本発明は、T細胞製品の効力を決定する方法を含み、この方法は、
a.T細胞製品細胞との混合腫瘍アロ反応性細胞株の共培養を、第1の期間行うステップと、
b.共培養から採取物を取得するステップと、
c.採取物を、(1)T細胞製品細胞上の1つ以上のマーカーの発現について評価するか、または(2)T細胞製品細胞から分泌された1つ以上の分析物について評価して、1つ以上の観測値を取得し、T細胞製品の効力を決定するステップと、
d.T細胞製品細胞との陰性対照細胞の第2の共培養を、第2の期間行うステップと、
e.第2の共培養から第2の採取物を取得するステップと、
f.第2の採取物を、(1)T細胞製品細胞上の1つ以上のマーカーの発現について評価するか、または(2)T細胞製品細胞から分泌された1つ以上の分析物について評価して、1つ以上の対照値を取得するステップと、
g.ステップcからの1つ以上の観測値をステップfからの1つ以上の対照値と比較して、T細胞製品の効力を決定する追加のステップであって、各々の観測値が対応する対照値と比較される、T細胞製品の効力を決定する追加のステップと、を含み、
IL-2は、共培養及び第2の共培養中に連続的に添加され、IL-2は、共培養及び第2の共培養の各々において、50IU/mL~1000IU/mLの濃度で維持される。
ある実施形態では、本発明は、標的細胞株または標的細胞株の組み合わせが、最大のHLA多様性のために最適化される、効力アッセイを行うための方法を含む。ある実施形態では、本発明は、標的細胞株または標的細胞株の組み合わせが、最大のヘテロ接合性のために最適化される、効力アッセイを行うための方法を含む。ある実施形態では、本発明は、標的細胞株または標的細胞株の組み合わせが、最大の免疫原性のために最適化される、効力アッセイを行うための方法を含む。ある実施形態では、本発明は、標的細胞株または標的細胞株の組み合わせが、最大のHLA-A2免疫原性のために最適化される、効力アッセイを行うための方法を含む。ある実施形態では、本発明は、標的細胞株または標的細胞株の組み合わせが、HLA特性に基づいて選択される、効力アッセイを行うための方法を含む。ある実施形態では、本発明は、標的細胞株または標的細胞株の組み合わせが、HLA-A、HLA-B、HLA-C、HLA-DQ(A1)、HLA-DQ(A2)、HLA-DR(B1)、HLA-DP(B1)、HLA-DP(B2)、またはそれらの組み合わせを発現する、効力アッセイを行うための方法を含む。ある実施形態では、本発明は、標的細胞株または標的細胞株の組み合わせが、最大の同種異系HLA-TCR相互作用のために最適化される、効力アッセイを行うための方法を含む。ある実施形態では、本発明は、標的細胞株または標的細胞株の組み合わせが、最大の非抗原特異的HLA-TCR相互作用のために最適化される、効力アッセイを行うための方法を含む。
ある実施形態では、本発明は、バイアルまたはウェル当たりのTIL及び標的細胞の総数が、およそ1×10、2×10、3×10、4×10、5×10、6×10、7×10、8×10、9×10、1×10、1.5×10、2×10、2.5×10、3×10、3.5×10、4×10、4.5×10、または5×10である、効力アッセイを行うための方法を含む。ある実施形態では、バイアルまたはウェルは、約0.5mL、1mL、1.5mL、2mL、2.5mL、3mL、3.5mL、4mL、4.5mL、または5mLの体積を有する。
いくつかの実施形態では、HLA-I遮断抗体は、陰性対照として、約0.1μg/mL、約0.2μg/mL、約0.3μg/mL、約0.4μg/mL、約0.5μg/mL、約0.6μg/mL、約0.7μg/mL、約0.8μg/mL、約0.9μg/mL、約1μg/mL、約2μg/mL、約3μg/mL、約4μg/mL、約5μg/mL、約6μg/mL、約7μg/mL、約8μg/mL、約9μg/mL、約10μg/mL、約11μg/mL、約12μg/mL、約13μg/mL、約14μg/mL、約15μg/mL、約16μg/mL、約17μg/mL、約18μg/mL、約19μg/mL、約20μg/mL、約21μg/mL、約22μg/mL、約23μg/mL、約24μg/mL、約25μg/mL、約26μg/mL、約27μg/mL、約28μg/mL、約29μg/mL、約30μg/mL、約35μg/mL、約40μg/mL、約45μg/mL、または約50μg/mLの濃度で使用される。前述の実施形態のうちのいずれにおいても、HLA-I遮断抗体は、Biolegend,Inc.(San Diego,CA,USA)から入手可能なクローンW6/32(抗HLA-ABC)である。
いくつかの実施形態では、HLA-II遮断抗体は、陰性対照として、約0.1μg/mL、約0.2μg/mL、約0.3μg/mL、約0.4μg/mL、約0.5μg/mL、約0.6μg/mL、約0.7μg/mL、約0.8μg/mL、約0.9μg/mL、約1μg/mL、約2μg/mL、約3μg/mL、約4μg/mL、約5μg/mL、約6μg/mL、約7μg/mL、約8μg/mL、約9μg/mL、約10μg/mL、約11μg/mL、約12μg/mL、約13μg/mL、約14μg/mL、約15μg/mL、約16μg/mL、約17μg/mL、約18μg/mL、約19μg/mL、約20μg/mL、約21μg/mL、約22μg/mL、約23μg/mL、約24μg/mL、約25μg/mL、約26μg/mL、約27μg/mL、約28μg/mL、約29μg/mL、約30μg/mL、約35μg/mL、約40μg/mL、約45μg/mL、または約50μg/mLの濃度で使用される。前述の実施形態のうちのいずれにおいても、HLA-II遮断抗体は、BD Biosciences,Inc.(Franklin Lakes,NJ,USA)から入手可能なクローンTU39(HLA-DR、DP、DQ)である。
ある実施形態では、本発明は、TIL製品の効力を決定する方法を含み、この方法は、
a.TIL細胞との標的細胞の共培養を、第1の期間行うステップと、
b.共培養から採取物を取得するか、または上清を抽出するステップと、
c.(1)採取物を、TIL細胞上の1つ以上のマーカーの発現について評価するか、または(2)上清を、TIL細胞から分泌された1つ以上の分析物について評価して、1つ以上の観測値を取得して、TIL製品の効力を決定するステップと、を含み、
TIL対標的細胞の比は、約3:1であり、標的細胞は、単球細胞であり、ステップ(a)の共培養における総細胞は、約1×10/mLである。
ある実施形態では、本発明は、TIL製品の効力を決定する方法を含み、この方法は、
a.TIL細胞との標的細胞の共培養を、第1の期間行うステップと、
b.共培養から採取物を取得するか、または上清を抽出するステップと、
c.(1)採取物を、TIL細胞上の1つ以上のマーカーの発現について評価するか、または(2)上清を、TIL細胞から分泌された1つ以上の分析物について評価して、1つ以上の観測値を取得して、TIL製品の効力を決定するステップと、を含み、
TIL対標的細胞比は、約3:1であり、標的細胞は、単球細胞であり、ステップ(a)の共培養における総細胞は、約1×10/mLであり、前述の方法は、サイトカインについてのビーズまたはプレートベースのアッセイ、総生細胞についてのアッセイ、生細胞パーセンテージについてのアッセイ、CD4細胞含有量についてのアッセイ、CD8細胞含有量についてのアッセイ、TEM細胞含有量についてのアッセイ、TCM細胞含有量についてのアッセイ、LAG3細胞含有量についてのアッセイ、及びKLRG1細胞含有量についてのアッセイ、CD101細胞含有量についてのアッセイ、CD69細胞含有量についてのアッセイ、TSCM細胞含有量についてのアッセイ、TEMRA細胞含有量についてのアッセイ、Treg細胞含有量についてのアッセイ、PD-1細胞含有量についてのアッセイ、TIM3細胞含有量についてのアッセイ、CD25細胞含有量についてのアッセイ、CD27細胞含有量についてのアッセイ、CD28細胞含有量についてのアッセイ、CD56細胞含有量についてのアッセイ、CTLA-4細胞含有量についてのアッセイ、TIGIT細胞含有量についてのアッセイ、及びCD57細胞含有量についてのアッセイからなる群から選択される少なくとも1つの他のアッセイを含む効力アッセイマトリックスの構成要素である。ある実施形態では、前述のアッセイは、フローサイトメトリーアッセイである。
ある実施形態では、本発明は、TIL製品の効力を決定する方法を含み、この方法は、
a.TIL細胞との標的細胞の共培養を、第1の期間行うステップと、
b.共培養から採取物を取得するか、または上清を抽出するステップと、
c.(1)採取物を、TIL細胞上の1つ以上のマーカーの発現について評価するか、または(2)上清を、TIL細胞から分泌された1つ以上の分析物について評価して、1つ以上の観測値を取得して、TIL製品の効力を決定するステップと、を含み、
TIL対標的細胞の比は、約3:1であり、標的細胞は、単球細胞であり、ステップ(a)の共培養における総細胞は、約2×10/mLである。
ある実施形態では、本発明は、TIL製品の効力を決定する方法を含み、この方法は、
a.TIL細胞との標的細胞の共培養を、第1の期間行うステップと、
b.共培養から採取物を取得するか、または上清を抽出するステップと、
c.(1)採取物を、TIL細胞上の1つ以上のマーカーの発現について評価するか、または(2)上清を、TIL細胞から分泌された1つ以上の分析物について評価して、1つ以上の観測値を取得して、TIL製品の効力を決定するステップと、を含み、
TIL対標的細胞比は、約3:1であり、標的細胞は、単球細胞であり、ステップ(a)の共培養における総細胞は、約2×10/mLであり、前述の方法は、CD3、CD28、及び/またはCD137刺激を使用し、インターフェロン-γ、グランザイムB、または腫瘍壊死因子-αを報告するビーズまたはプレートベースのアッセイ、総生細胞についてのアッセイ、生細胞パーセンテージについてのアッセイ、CD4細胞含有量についてのアッセイ、CD8細胞含有量についてのアッセイ、TEM細胞含有量についてのアッセイ、TCM細胞含有量についてのアッセイ、LAG3細胞含有量についてのアッセイ、及びKLRG1細胞含有量についてのアッセイ、CD101細胞含有量についてのアッセイ、CD69細胞含有量についてのアッセイ、TSCM細胞含有量についてのアッセイ、TEMRA細胞含有量についてのアッセイ、Treg細胞含有量についてのアッセイ、PD-1細胞含有量についてのアッセイ、TIM3細胞含有量についてのアッセイ、CD25細胞含有量についてのアッセイ、CD27細胞含有量についてのアッセイ、CD28細胞含有量についてのアッセイ、CD56細胞含有量についてのアッセイ、CTLA-4細胞含有量についてのアッセイ、TIGIT細胞含有量についてのアッセイ、及びCD57細胞含有量についてのアッセイからなる群から選択される少なくとも1つの他のアッセイを含む効力アッセイマトリックスの構成要素である。ある実施形態では、前述のアッセイは、フローサイトメトリーアッセイである。
ある実施形態では、本発明は、TIL製品の効力を決定する方法を含み、この方法は、
a.TIL細胞との標的細胞の共培養を、第1の期間行うステップと、
b.共培養から採取物を取得するか、または上清を抽出するステップと、
c.(1)採取物を、TIL細胞上の1つ以上のマーカーの発現について評価するか、または(2)上清を、TIL細胞から分泌された1つ以上の分析物について評価して、1つ以上の観測値を取得して、TIL製品の効力を決定するステップと、を含み、
TIL対標的細胞の比は、約1:1であり、標的細胞は、単球細胞であり、ステップ(a)の共培養における総細胞は、約1×10/mLである。
ある実施形態では、本発明は、TIL製品の効力を決定する方法を含み、この方法は、
a.TIL細胞との標的細胞の共培養を、第1の期間行うステップと、
b.共培養から採取物を取得するか、または上清を抽出するステップと、
c.(1)採取物を、TIL細胞上の1つ以上のマーカーの発現について評価するか、または(2)上清を、TIL細胞から分泌された1つ以上の分析物について評価して、1つ以上の観測値を取得して、TIL製品の効力を決定するステップと、を含み、
標的細胞は、単球細胞であり、ステップ(a)の共培養における総細胞は、約1×10/mLであり、前述の方法は、CD3、CD28、及び/またはCD137刺激及び報告インターフェロン-γ、グランザイムB、または腫瘍壊死因子-αを使用したビーズまたはプレートベースのアッセイ、総生細胞についてのアッセイ、生細胞パーセンテージについてのアッセイ、CD4細胞含有量についてのアッセイ、CD8細胞含有量についてのアッセイ、TEM細胞含有量についてのアッセイ、TCM細胞含有量についてのアッセイ、LAG3細胞含有量についてのアッセイ、及びKLRG1細胞含有量についてのアッセイ、CD101細胞含有量についてのアッセイ、CD69細胞含有量についてのアッセイ、TSCM細胞含有量についてのアッセイ、TEMRA細胞含有量についてのアッセイ、Treg細胞含有量についてのアッセイ、PD-1細胞含有量についてのアッセイ、TIM3細胞含有量についてのアッセイ、CD25細胞含有量についてのアッセイ、CD27細胞含有量についてのアッセイ、CD28細胞含有量についてのアッセイ、CD56細胞含有量についてのアッセイ、CTLA-4細胞含有量についてのアッセイ、TIGIT細胞含有量についてのアッセイ、及びCD57細胞含有量についてのアッセイからなる群から選択される少なくとも1つの他のアッセイを含む、効力アッセイマトリックスの構成要素である。ある実施形態では、前述のアッセイは、フローサイトメトリーアッセイである。
ある実施形態では、本発明は、TIL製品の効力を決定する方法を含み、この方法は、
a.TIL細胞との標的細胞の共培養を、第1の期間行うステップと、
b.共培養から採取物を取得するか、または上清を抽出するステップと、
c.(1)採取物を、TIL細胞上の1つ以上のマーカーの発現について評価するか、または(2)上清を、TIL細胞から分泌された1つ以上の分析物について評価して、1つ以上の観測値を取得して、TIL製品の効力を決定するステップと、を含み、
TIL対標的細胞の比は、約1:1であり、標的細胞は、単球細胞であり、ステップ(a)の共培養における総細胞は、約2×10/mLである。
ある実施形態では、本発明は、TIL製品の効力を決定する方法を含み、この方法は、
a.TIL細胞との標的細胞の共培養を、第1の期間行うステップと、
b.共培養から採取物を取得するか、または上清を抽出するステップと、
c.(1)採取物を、TIL細胞上の1つ以上のマーカーの発現について評価するか、または(2)上清を、TIL細胞から分泌された1つ以上の分析物について評価して、1つ以上の観測値を取得して、TIL製品の効力を決定するステップと、
d.TIL細胞及び標的細胞との、ヒト白血球抗原(HLA)遮断抗体を含む陰性対照の第2の共培養を、第2の期間(かかる第2の期間は、任意選択で、第1の期間と同時に起こる)行うステップと、
e.第2の共培養から第2の採取物を取得するか、または第2の上清を抽出するステップと、
f.(1)第2の採取物を、TIL細胞上の1つ以上のマーカーの発現について評価するか、または(2)第2の上清を、TIL細胞から分泌された1つ以上の分析物について評価して、1つ以上の対照値を取得するステップと、
g.各々の観測値が対応する対照値と比較される、ステップcからの1つ以上の観測値をステップfからの1つ以上の対照値と比較して、TIL製品の効力を決定するステップと、を含み、
TIL対標的細胞比は、3:1~1:1であり、標的細胞は、単球細胞であり、ステップ(a)の共培養及びステップ(d)の第2の共培養における総細胞は、0.5×10/mL~3×10/mLであり、HLA遮断抗体は、HLA-I遮断抗体、HLA-II遮断抗体、及びそれらの組み合わせからなる群から選択される。
ある実施形態では、本発明は、TIL製品の効力を決定する方法を含み、この方法は、
a.TIL細胞との標的細胞の共培養を、第1の期間行うステップと、
b.共培養から採取物を取得するか、または上清を抽出するステップと、
c.(1)採取物を、TIL細胞上の1つ以上のマーカーの発現について評価するか、または(2)上清を、TIL細胞から分泌された1つ以上の分析物について評価して、1つ以上の観測値を取得して、TIL製品の効力を決定するステップと、
d.TIL細胞及び標的細胞との、ヒト白血球抗原(HLA)遮断抗体を含む陰性対照の第2の共培養を、第2の期間(かかる第2の期間は、任意選択で、第1の期間と同時に起こる)行うステップと、
e.第2の共培養から第2の採取物を取得するか、または第2の上清を抽出するステップと、
f.(1)第2の採取物を、TIL細胞上の1つ以上のマーカーの発現について評価するか、または(2)第2の上清を、TIL細胞から分泌された1つ以上の分析物について評価して、1つ以上の対照値を取得するステップと、
g.各々の観測値が対応する対照値と比較される、ステップcからの1つ以上の観測値をステップfからの1つ以上の対照値と比較して、TIL製品の効力を決定するステップと、を含み、
TIL対標的細胞比は、3:1~1:1であり、標的細胞は、Thp1細胞、またはその誘導体、バリアント、修飾、もしくは子孫であり、ステップ(a)の共培養及びステップ(d)の第2の共培養における総細胞は、0.5×10/mL~3×10/mLであり、HLA遮断抗体は、HLA-I遮断抗体、HLA-II遮断抗体、及びそれらの組み合わせからなる群から選択される。
ある実施形態では、本発明は、TIL製品の効力を決定する方法を含み、この方法は、
a.TIL細胞との標的細胞の共培養を、第1の期間行うステップと、
b.共培養から採取物を取得するか、または上清を抽出するステップと、
c.(1)採取物を、TIL細胞上の1つ以上のマーカーの発現について評価するか、または(2)上清を、TIL細胞から分泌された1つ以上の分析物について評価して、1つ以上の観測値を取得して、TIL製品の効力を決定するステップと、
d.TIL細胞及び標的細胞との、ヒト白血球抗原(HLA)遮断抗体を含む陰性対照の第2の共培養を、第2の期間(かかる第2の期間は、任意選択で、第1の期間と同時に起こる)行うステップと、
e.第2の共培養から第2の採取物を取得するか、または第2の上清を抽出するステップと、
f.(1)第2の採取物を、TIL細胞上の1つ以上のマーカーの発現について評価するか、または(2)第2の上清を、TIL細胞から分泌された1つ以上の分析物について評価して、1つ以上の対照値を取得するステップと、
g.各々の観測値が対応する対照値と比較される、ステップcからの1つ以上の観測値をステップfからの1つ以上の対照値と比較して、TILの効力を決定するステップと、を含み、
TIL対標的細胞比は、3:1~1:1であり、標的細胞は、U937細胞、またはその誘導体、バリアント、修飾、もしくは子孫であり、ステップ(a)の共培養及びステップ(d)の第2の共培養における総細胞は、0.5×10/mL~3×10/mLであり、HLA遮断抗体は、HLA-I遮断抗体、HLA-II遮断抗体、及びそれらの組み合わせからなる群から選択される。
ある実施形態では、本発明は、TIL製品の効力を決定する方法を含み、この方法は、
a.TIL細胞との標的細胞の共培養を、第1の期間行うステップと、
b.共培養から採取物を取得するか、または上清を抽出するステップと、
c.(1)採取物を、TIL細胞上の1つ以上のマーカーの発現について評価するか、または(2)上清を、TIL細胞から分泌された1つ以上の分析物について評価して、1つ以上の観測値を取得して、TIL製品の効力を決定するステップと、
d.TIL細胞及び標的細胞との、ヒト白血球抗原クラスI(HLA-I)遮断抗体及びヒト白血球抗原クラスII(HLA-II)遮断抗体を含む陰性対照の第2の共培養を、第2の期間(かかる第2の期間は、任意選択で、第1の期間と同時に起こる)行うステップと、
e.第2の共培養から第2の採取物を取得するか、または第2の上清を抽出するステップと、
f.(1)第2の採取物を、TIL細胞上の1つ以上のマーカーの発現について評価するか、または(2)第2の上清を、TIL細胞から分泌された1つ以上の分析物について評価して、1つ以上の対照値を取得するステップと、
g.各々の観測値が対応する対照値と比較される、ステップcからの1つ以上の観測値をステップfからの1つ以上の対照値と比較して、TIL製品の効力を決定するステップと、を含み、
TIL対標的細胞比は、3:1~1:1であり、標的細胞は、Thp1細胞、またはその誘導体、バリアント、修飾、もしくは子孫であり、ステップ(a)の共培養及びステップ(d)の第2の共培養における総細胞は、0.5×10/mL~3×10/mLであり、HLA-I遮断抗体の濃度は、5μg/mL~20μg/mLであり、HLA-II遮断抗体の濃度は、5μg/mL~10μg/mLである。
ある実施形態では、本発明は、TIL製品の効力を決定する方法を含み、この方法は、
a.TIL細胞との標的細胞の共培養を、第1の期間行うステップと、
b.共培養から採取物を取得するか、または上清を抽出するステップと、
c.(1)採取物を、TIL細胞上の1つ以上のマーカーの発現について評価するか、または(2)上清を、TIL細胞から分泌された1つ以上の分析物について評価して、1つ以上の観測値を取得して、TIL製品の効力を決定するステップと、
d.TIL細胞及び標的細胞との、ヒト白血球抗原クラスI(HLA-I)遮断抗体及びヒト白血球抗原クラスII(HLA-II)遮断抗体を含む陰性対照の第2の共培養を、第2の期間(かかる第2の期間は、任意選択で、第1の期間と同時に起こる)行うステップと、
e.第2の共培養から第2の採取物を取得するか、または第2の上清を抽出するステップと、
f.(1)第2の採取物を、TIL細胞上の1つ以上のマーカーの発現について評価するか、または(2)第2の上清を、TIL細胞から分泌された1つ以上の分析物について評価して、1つ以上の対照値を取得するステップと、
g.各々の観測値が対応する対照値と比較される、ステップcからの1つ以上の観測値をステップfからの1つ以上の対照値と比較して、TIL製品の効力を決定するステップと、を含み、
TIL対標的細胞比は、3:1~1:1であり、標的細胞は、Thp1細胞、またはその誘導体、バリアント、修飾、もしくは子孫であり、ステップ(a)の共培養及びステップ(d)の第2の共培養における総細胞は、0.5×10/mL~3×10/mLであり、HLA遮断抗体の濃度は、5μg/mL~20μg/mLであり、HLA-II遮断抗体の濃度は、5μg/mL~10μg/mLである。
ある実施形態では、本発明は、TIL製品の効力を決定する方法を含み、この方法は、
a.TIL細胞との標的細胞の共培養を、第1の期間行うステップと、
b.共培養から採取物を取得するか、または上清を抽出するステップと、
c.(1)採取物を、TIL細胞上の1つ以上のマーカーの発現について評価するか、または(2)上清を、TIL細胞から分泌された1つ以上の分析物について評価して、1つ以上の観測値を取得して、TIL製品の効力を決定するステップと、
d.TIL細胞及び標的細胞との、ヒト白血球抗原クラスI(HLA-I)遮断抗体及びヒト白血球抗原クラスII(HLA-II)遮断抗体を含む陰性対照の第2の共培養を、第2の期間(かかる第2の期間は、任意選択で、第1の期間と同時に起こる)行うステップと、
e.第2の共培養から第2の採取物を取得するか、または第2の上清を抽出するステップと、
f.(1)第2の採取物を、TIL細胞上の1つ以上のマーカーの発現について評価するか、または(2)第2の上清を、TIL細胞から分泌された1つ以上の分析物について評価して、1つ以上の対照値を取得するステップと、
g.各々の観測値が対応する対照値と比較される、ステップcからの1つ以上の観測値をステップfからの1つ以上の対照値と比較して、TIL製品の効力を決定するステップと、を含み、
TIL対標的細胞比は、3:1~1:1であり、標的細胞は、Thp1細胞、またはその誘導体、バリアント、修飾、もしくは子孫であり、ステップ(a)の共培養及びステップ(d)の第2の共培養における総細胞は、0.5×10/mL~3×10/mLであり、HLA-I遮断抗体の濃度は、5μg/mL~20μg/mLであり、HLA-II遮断抗体の濃度は、5μg/mL~10μg/mLであり、TIL細胞から分泌された1つ以上の分析物は、インターフェロン-γを含む。
ある実施形態では、本発明は、TIL製品の効力を決定する方法を含み、この方法は、
a.TIL細胞との標的細胞の共培養を、第1の期間行うステップと、
b.共培養から採取物を取得するか、または上清を抽出するステップと、
c.(1)採取物を、TIL細胞上の1つ以上のマーカーの発現について評価するか、または(2)上清を、TIL細胞から分泌された1つ以上の分析物について評価して、1つ以上の観察された値を取得して、TIL製品の効力を決定するステップと、
d.TIL細胞及び標的細胞との、ヒト白血球抗原クラスI(HLA-I)遮断抗体及びヒト白血球抗原クラスII(HLA-II)遮断抗体を含む陰性対照の第2の共培養を、第2の期間(かかる第2の期間は、任意選択で、第1の期間と同時に起こる)行うステップと、
e.第2の共培養から第2の採取物を取得するか、または第2の上清を抽出するステップと、
f.(1)第2の採取物を、TIL細胞上の1つ以上のマーカーの発現について評価するか、または(2)第2の上清を、TIL細胞から分泌された1つ以上の分析物について評価して、1つ以上の対照値を取得するステップと、
g.各々の観測値が対応する対照値と比較される、ステップcからの1つ以上の観測値をステップfからの1つ以上の対照値と比較して、TIL製品の効力を決定するステップと、を含み、
TIL対標的細胞比は、3:1~1:1であり、標的細胞は、Thp1細胞、またはその誘導体、バリアント、修飾、もしくは子孫であり、ステップ(a)の共培養及びステップ(d)の第2の共培養における総細胞は、0.5×10/mL~3×10/mLであり、HLA-I遮断抗体の濃度は、5μg/mL~20μg/mLであり、HLA-II遮断抗体の濃度は、5μg/mL~10μg/mLであり、TIL細胞から分泌された1つ以上の分析物は、インターフェロン-γを含む。
ある実施形態では、本発明は、TIL製品の効力を決定する方法を含み、この方法は、
a.TIL製品からのTIL細胞との標的細胞の共培養を、第1の期間行うステップと、
b.共培養から上清を抽出するステップと、
c.上清を、TIL細胞から分泌されたインターフェロン-γについて評価して、観測値を取得するステップと、
d.TIL製品からのTIL細胞及び標的細胞との、ヒト白血球抗原クラスI(HLA-I)遮断抗体及びヒト白血球抗原クラスII(HLA-II)遮断抗体を含む陰性対照の第2の共培養を、第2の期間(かかる第2の期間は、任意選択で、第1の期間と同時に起こる)行うステップと、
e.第2の共培養から第2の上清を抽出するステップと、
f.第2の上清を、TIL細胞から分泌されたインターフェロン-γについて評価して、対照値を取得するステップと、
g.倍率増強が計算される、ステップcからの観測値をステップfからの対照値と比較して、TIL製品の効力を決定するステップと、を含み、
TIL対標的細胞比は、3:1~1:1であり、標的細胞は、Thp1細胞、またはその誘導体、バリアント、修飾、もしくは子孫であり、ステップ(a)の共培養及びステップ(d)の第2の共培養における総細胞は、0.5×10/mL~3×10/mLであり、HLA-I遮断抗体の濃度は、5μg/mL~20μg/mLであり、HLA-II遮断抗体の濃度は、5μg/mL~10μg/mLである。
ある実施形態では、本発明は、TIL製品の効力を決定する方法を含み、この方法は、
a.TIL製品からのTIL細胞との標的細胞の共培養を、第1の期間行うステップと、
b.共培養から上清を抽出するステップと、
c.上清を、TIL細胞から分泌されたインターフェロン-γについて評価して、観測値を取得するステップと、
d.TIL製品からのTIL細胞及び標的細胞との、ヒト白血球抗原クラスI(HLA-I)遮断抗体及びヒト白血球抗原クラスII(HLA-II)遮断抗体を含む陰性対照の第2の共培養を、第2の期間(かかる第2の期間は、任意選択で、第1の期間と同時に起こる)行うステップと、
e.第2の共培養から第2の上清を抽出するステップと、
f.第2の上清を、TIL細胞から分泌されたインターフェロン-γについて評価して、対照値を取得するステップと、
g.倍率増強が計算される、ステップcからの観測値をステップfからの対照値と比較して、TIL製品の効力を決定するステップと、を含み、
TIL対標的細胞比は、3:1~1:1であり、標的細胞は、U937細胞、またはその誘導体、バリアント、修飾、もしくは子孫であり、ステップ(a)の共培養における総細胞は、0.5×10/mL~3×10/mLであり、HLA-I遮断抗体の濃度は、5μg/mL~20μg/mLであり、HLA-II遮断抗体の濃度は、5μg/mL~10μg/mLである。
ある実施形態では、本発明は、TIL製品の効力を決定する方法を含み、この方法は、
a.TIL製品からのTIL細胞との標的細胞の共培養を、第1の期間行うステップと、
b.共培養から上清を抽出するステップと、
c.上清を、TIL細胞から分泌されたインターフェロン-γについて評価して、観測値を取得するステップと、
d.TIL製品からのTIL細胞及び標的細胞との、ヒト白血球抗原クラスI(HLA-I)遮断抗体及びヒト白血球抗原クラスII(HLA-II)遮断抗体を含む陰性対照の第2の共培養を、第2の期間(かかる第2の期間は、任意選択で、第1の期間と同時に起こる)行うステップと、
e.第2の共培養から第2の上清を抽出するステップと、
f.第2の上清を、TIL細胞から分泌されたインターフェロン-γについて評価して、対照値を取得するステップと、
g.倍率増強が計算される、ステップcからの観測値をステップfからの対照値と比較して、TIL製品の効力を決定するステップと、を含み、
TIL対標的細胞比は、3:1~1:1であり、標的細胞は、Thp1細胞、またはその誘導体、バリアント、修飾、もしくは子孫であり、ステップ(a)の共培養及びステップ(d)の第2の共培養における総細胞は、1×10/mL~3×10/mLであり、HLA-I遮断抗体の濃度は、5μg/mL~20μg/mLであり、HLA-II遮断抗体の濃度は、5μg/mL~10μg/mLであり、IL-2は、共培養及び第2の共培養中に連続的に添加され、IL-2は、共培養及び第2の共培養の各々において、100IU/mL~500IU/mの濃度で維持され、共培養及び第2の共培養は、AIM-V培地を使用して行われる。
ある実施形態では、本発明は、TIL製品の効力を決定する方法を含み、この方法は、
a.TIL製品からのTIL細胞との標的細胞の共培養を、第1の期間行うステップと、
b.共培養から上清を抽出するステップと、
c.上清を、TIL細胞から分泌されたインターフェロン-γについて評価して、観測値を取得するステップと、
d.TIL製品からのTIL細胞及び標的細胞との、ヒト白血球抗原クラスI(HLA-I)遮断抗体及びヒト白血球抗原クラスII(HLA-II)遮断抗体を含む陰性対照の第2の共培養を、第2の期間(かかる第2の期間は、任意選択で、第1の期間と同時に起こる)行うステップと、
e.第2の共培養から第2の上清を抽出するステップと、
f.第2の上清を、TIL細胞から分泌されたインターフェロン-γについて評価して、対照値を取得するステップと、
g.倍率増強が計算される、ステップcからの観測値をステップfからの対照値と比較して、TIL製品の効力を決定するステップと、を含み、
TIL対標的細胞比は、3:1~1:1であり、標的細胞は、U937細胞、またはその誘導体、バリアント、修飾、もしくは子孫であり、ステップ(a)の共培養及びステップ(d)の第2の共培養における総細胞は、1×10/mL~3×10/mLであり、HLA-I遮断抗体の濃度は、5μg/mL~20μg/mLであり、HLA-II遮断抗体の濃度は、5μg/mL~10μg/mLであり、IL-2は、共培養及び第2の共培養中に連続的に添加され、IL-2は、共培養及び第2の共培養の各々において、100IU/mL~500IU/mの濃度で維持され、共培養及び第2の共培養は、AIM-V培地を使用して行われる。
ある実施形態では、本発明は、TIL製品の効力を決定する方法を含み、この方法は、
a.TIL製品からのTIL細胞との標的細胞の共培養を、第1の期間行うステップと、
b.共培養から上清を抽出するステップと、
c.上清を、TIL細胞から分泌されたインターフェロン-γについて評価して、観測値を取得するステップと、
d.TIL製品からのTIL細胞及び標的細胞との、ヒト白血球抗原クラスI(HLA-I)遮断抗体及びヒト白血球抗原クラスII(HLA-II)遮断抗体を含む陰性対照の第2の共培養を、第2の期間(かかる第2の期間は、任意選択で、第1の期間と同時に起こる)行うステップと、
e.第2の共培養から第2の上清を抽出するステップと、
f.第2の上清を、TIL細胞から分泌されたインターフェロン-γについて評価して、対照値を取得するステップと、
g.倍率増強が計算される、ステップcからの観測値をステップfからの対照値と比較して、TIL製品の効力を決定するステップと、を含み、
TIL対標的細胞の比は、3:1~1:1であり、標的細胞は、U937細胞、またはその誘導体、バリアント、修飾、もしくは子孫であり、ステップ(a)の共培養及びステップ(d)の第2の共培養における総細胞は、1×10/mL~3×10/mLであり、HLA-I遮断抗体の濃度は、5μg/mL~20μg/mLであり、HLA-II遮断抗体の濃度は、5μg/mL~10μg/mLであり、IL-2は、共培養及び第2の共培養中に連続的に添加され、IL-2は、共培養及び第2の共培養の各々において、100IU/mL~500IU/mの濃度で維持され、共培養及び第2の共培養は、AIM-V培地を使用して行われ、前述の方法は、CD3、CD28、及び/またはCD137刺激を使用し、インターフェロン-γ、グランザイムB、または腫瘍壊死因子-αを報告するビーズまたはプレートベースのアッセイ、総生細胞についてのアッセイ、生細胞パーセンテージについてのアッセイ、CD4細胞含有量についてのアッセイ、CD8細胞含有量についてのアッセイ、TEM細胞含有量についてのアッセイ、TCM細胞含有量についてのアッセイ、LAG3細胞含有量についてのアッセイ、及びKLRG1細胞含有量についてのアッセイ、CD101細胞含有量についてのアッセイ、CD69細胞含有量についてのアッセイ、TSCM細胞含有量についてのアッセイ、TEMRA細胞含有量についてのアッセイ、Treg細胞含有量についてのアッセイ、PD-1細胞含有量についてのアッセイ、TIM3細胞含有量についてのアッセイ、CD25細胞含有量についてのアッセイ、CD27細胞含有量についてのアッセイ、CD28細胞含有量についてのアッセイ、CD56細胞含有量についてのアッセイ、CTLA-4細胞含有量についてのアッセイ、TIGIT細胞含有量についてのアッセイ、及びCD57細胞含有量についてのアッセイからなる群から選択される少なくとも1つの他のアッセイを含む、効力アッセイマトリックスの構成要素である。ある実施形態では、前述のアッセイは、フローサイトメトリーアッセイである。
いくつかの実施形態では、標的細胞株は、2倍以下、3倍以下、4倍以下、5倍以下、6倍以下、7倍以下、8倍以下、9倍以下、または10倍以下で継代したマスターセルバンクから調製される。前述の実施形態の別の実施形態では、継代の総数は、標的細胞株のプロバイダーによって報告された継代の数と比較することによって決定され得る。
いくつかの実施形態では、Raji、Ramos、Daudi、U937、もしくはThp1細胞株、またはそれらの組み合わせは、2倍以下、3倍以下、4倍以下、5倍以下、6倍以下、7倍以下、8倍以下、9倍以下、または10倍以下で継代したマスターセルバンクから調製される。前述の実施形態の別の実施形態では、継代の総数は、Raji、Ramos、Daudi、U937、もしくはThp1細胞株、またはそれらの組み合わせのプロバイダー(複数可)によって報告された継代の数と比較することによって決定され得る。
いくつかの実施形態では、陰性対照細胞株は、2倍以下、3倍以下、4倍以下、5倍以下、6倍以下、7倍以下、8倍以下、9倍以下、または10倍以下で継代したマスターセルバンクから調製される。前述の実施形態の別の実施形態では、継代の総数は、陰性対照細胞株のプロバイダーによって報告された継代の数と比較することによって決定され得る。
いくつかの実施形態では、K562細胞株は、2倍以下、3倍以下、4倍以下、5倍以下、6倍以下、7倍以下、8倍以下、9倍以下、または10倍以下で継代したマスターセルバンクから調製される。前述の実施形態の別の実施形態では、継代の総数は、K562細胞株のプロバイダーによって報告された継代の数と比較することによって決定され得る。
いくつかの実施形態では、標的細胞株は、2倍以下、3倍以下、4倍以下、5倍以下、6倍以下、7倍以下、8倍以下、9倍以下、または10倍以下で継代したワーキングセルバンクから調製される。前述の実施形態の別の実施形態では、継代の総数は、標的細胞株のプロバイダーによって報告された継代の数と比較することによって決定され得る。
いくつかの実施形態では、Raji、Ramos、Daudi、U937、もしくはThp1細胞株、またはそれらの組み合わせは、2倍以下、3倍以下、4倍以下、5倍以下、6倍以下、7倍以下、8倍以下、9倍以下、または10倍以下で継代したワーキングセルバンクから調製される。前述の実施形態の別の実施形態では、継代の総数は、Raji、Ramos、Daudi、U937、もしくはThp1細胞株、またはそれらの組み合わせのプロバイダー(複数可)によって報告された継代の数と比較することによって決定され得る。
いくつかの実施形態では、陰性対照細胞株は、2倍以下、3倍以下、4倍以下、5倍以下、6倍以下、7倍以下、8倍以下、9倍以下、または10倍以下で継代したワーキングセルバンクから調製される。前述の実施形態の別の実施形態では、継代の総数は、陰性対照細胞株のプロバイダーによって報告された継代の数と比較することによって決定され得る。
いくつかの実施形態では、K562細胞株は、2倍以下、3倍以下、4倍以下、5倍以下、6倍以下、7倍以下、8倍以下、9倍以下、または10倍以下で継代したワーキングセルバンクから調製される。前述の実施形態の別の実施形態では、継代の総数は、K562細胞株のプロバイダーによって報告された継代の数と比較することによって決定され得る。
いくつかの実施形態では、陰性対照細胞株は、標的細胞株(単球細胞株、またはRaji、Ramos、Daudi、U937、もしくはThp1細胞株など)との共培養で使用される条件での培養後のタンパク質(IFN-γまたはグランザイムBなど)の分泌または発現について試験されたTIL細胞株であるが、ただし、標的細胞株はTIL細胞株とともに含まれない。これらの陰性対照実験は、場合によっては「TIL単独」対照実験と本明細書で称される。倍率増強及び平行線分析計算は、TIL単独陰性対照実験と併せて用いてもよい。例えば、TIL株の共培養は、本明細書に記載の方法に従って単球標的細胞株とともに行うことができ、同じ条件下で同時に実行する別個の実験では、TIL株を単独で培養することができる。次いで、両方の実験は、IFN-γ発現について分析され得、倍率増強を計算するために比較され得るか、または平行線分析勾配または他の分析基準の計算に使用され得る。
前述の実施形態のうちのいくつかでは、陽性対照TIL細胞株も含まれ、これは、本明細書に記載される方法(例えば、関連する前述の実施形態におけるステップ(a)~(c))を使用して、実験間、日間、分析間、または実験室間ベースでの再現性を確保するために測定される。
いくつかの実施形態では、前述の方法は、データ分析ステップとともに使用される。いくつかの実施形態では、データ分析ステップは、本明細書の他の箇所に詳細に記載されるように、倍率増強計算である。いくつかの実施形態では、データ分析ステップは、本明細書の他の箇所に詳細に記載されるように、平行線分析計算である。統計分析及び合格/不合格放出または安定性の決定に対する平行線分析アプローチは、1つまたは2つの外れ値(例えば、1つの外れ値を除去した4つの標的細胞濃度)を任意選択で除去して、単一のTILロット濃度に対する2、3、4、または5つの標的細胞濃度の測定と併せて用量反応を決定することを含む、前述のアッセイ実施形態のうちのいずれかとともに使用されてもよい。平行線分析は、USP Chapter<1032>Design and Development of Biological Assays.USP Pharmacopeial Convention:Rockville,MD,2013、USP Chapter<111>Design and Analysis of Biological Assays.US Pharmacopeial Convention:Rockville,MD,2014、USP Chapter<1033>Biological Assay Validation.USP Pharmacopeial Convention:Rockville,MD,2013、USP Chapter<1034>Analysis of Biological Assays.US Pharmacopeial Convention:Rockville,MD,2013、Hauck,et al.,PDA J.Pharma.Sci.Technol.2005,59(2),127-137、Callahan and Sajjadi,BioProcessing J.2003,2(2),71-77、Findlay,et al.,J.Pharm.Biomed.Anal.2000,21,1249-1273、及びGottschalk and Dunn,J.Biopharm.Stat.2005,15(3),437-463に記載されており、これらの各々の開示は参照により本明細書に組み込まれる。
いくつかの実施形態では、前述の方法は、USP<1032>Design and Development of Biological Assays(その開示は参照により本明細書に組み込まれる)に従って行われるデータ分析ステップとともに使用される。いくつかの実施形態では、前述の方法は、データがUSP<1032>Design and Development of Biological Assays及びUSP<1033>Biological Assay Validation(これらの各々の開示は参照により本明細書に組み込まれる)に従ってログ変換されるデータ分析ステップとともに使用され、効力範囲にわたる測定における対称性、正規分布、及び変動性の均一性の要件を満たす。いくつかの実施形態では、前述の方法は、外れ値がUSP<1034>Analysis of Biological Assays(その開示は参照により本明細書に組み込まれる)に記載されるように評価され、分析から省略されるデータ分析ステップとともに使用される。いくつかの実施形態では、前述の方法は、線形回帰が、曲線の飽和に起因する最も高い濃度または最も低い濃度のいずれかのマスキング(必要であれば)を用いて、4点用量曲線にわたって行われるデータ分析ステップとともに使用される。いくつかの実施形態では、前述の方法は、少なくとも3つ、好ましくは4つの隣接する[用量-]濃度が使用されるデータ分析ステップとともに使用される。いくつかの実施形態では、前述の方法は、線形セグメントの勾配が十分に急であることが必要であるデータ分析ステップとともに使用される。いくつかの実施形態では、前述の方法は、線が標準に適合し、試験試料が直線であり、線が平行であることが必要であるデータ分析ステップとともに使用される。いくつかの実施形態では、前述の方法は、USP<1032>Design and Development of Biological Assaysに従って、TIL被験試料と参照標準との間で平行線分析が行われるデータ分析ステップとともに使用され、その開示は参照により本明細書に組み込まれる。いくつかの実施形態では、前述の方法は、平行度によって測定された参照標準とTIL被験試料との間の統計的類似性が、TIL被験試料の参照標準に対する生物学的類似性を実証するデータ分析ステップとともに使用される。いくつかの実施形態では、前述の方法は、平行度勾配比、直線性比、回帰(R)、及び二乗平均平方根誤差(RMSE)が計算され、報告されるデータ分析ステップとともに使用される。いくつかの実施形態では、前述の方法は、平行度及び直線性のアッセイの適合性及び妥当性をランク付けし、USP<1033>Biological Assay Validationによる制限内で妥当性基準に「合格」であるかまたは「不合格」であるかが決定されるデータ分析ステップとともに使用され、その開示は参照により本明細書に組み込まれる。いくつかの実施形態では、前述の方法は、耐性のパーセントの範囲として95%信頼区間内の相対効力が「報告可能」または「決定的でない」と決定されるデータ分析ステップとともに使用される。理論によって拘束されることはないが、USP<1032>Design and Development of Biological Assaysによれば、相対効力は、絶対値から導出される効力よりも好ましい。なぜなら、生体試料に固有の変動性及び細胞挙動の影響を時間の経過とともに無効にするキャリブレーターであるからである。
いくつかの実施形態では、本発明は、TIL製品、MIL製品、またはPBL製品の効力を決定するための前述の方法のうちの1つを含み、他の効力アッセイ及び/または同一性アッセイと併せて前述の方法のうちの1つを使用して、効力アッセイ(もしくは効力及び同一性アッセイ)マトリックスを形成することをさらに含む。かかるマトリックスは、TIL製品、MIL製品、またはPBL製品の効力(もしくは効力及び同一性)を決定するための複数のステップを含む。効力アッセイマトリックスは、U.S.Food and Drug Administration’s Guidance for Industry:Potency Tests for Cellular and Gene Therapy Products,2011,76 Fed.Reg.9028に記載されており、その開示は参照により本明細書に組み込まれる。いくつかの実施形態では、本発明は、同種異系共培養アッセイ、例えば、Raji、Ramos、Daudi、U937、またはThp1標的細胞を使用する同種異系共培養アッセイ、ならびに少なくとも1つの追加のアッセイを含むマトリックスを含む。いくつかの実施形態では、本発明は、同種異系共培養アッセイ、例えば、Raji、Ramos、Daudi、U937、またはThp1標的細胞を使用する同種異系共培養アッセイ、ならびに少なくとも2つの追加のアッセイを含むマトリックスを含む。いくつかの実施形態では、本発明は、同種異系共培養アッセイ、例えば、Raji、Ramos、Daudi、U937、またはThp1標的細胞を使用する同種異系共培養アッセイ、ならびに少なくとも3つの追加のアッセイを含むマトリックスを含む。いくつかの実施形態では、本発明は、同種異系共培養アッセイ、例えば、Raji、Ramos、Daudi、U937、またはThp1標的細胞を使用する同種異系共培養アッセイ、ならびに少なくとも4つの追加のアッセイを含むマトリックスを含む。いくつかの実施形態では、本発明は、同種異系共培養アッセイ、例えば、Raji、Ramos、Daudi、U937、またはThp1標的細胞を使用する同種異系共培養アッセイ、ならびに少なくとも5つの追加のアッセイを含むマトリックスを含む。いくつかの実施形態では、本発明は、同種異系共培養アッセイ、例えば、Raji、Ramos、Daudi、U937、またはThp1標的細胞を使用する同種異系共培養アッセイ、ならびに少なくとも6つの追加のアッセイを含むマトリックスを含む。いくつかの実施形態では、本発明は、同種異系共培養アッセイ、例えば、Raji、Ramos、Daudi、U937、またはThp1標的細胞を使用する同種異系共培養アッセイ、ならびに少なくとも7つの追加のアッセイを含むマトリックスを含む。いくつかの実施形態では、本発明は、同種異系共培養アッセイ、例えば、Raji、Ramos、Daudi、U937、またはThp1標的細胞を使用する同種異系共培養アッセイ、ならびに少なくとも8つの追加のアッセイを含むマトリックスを含む。いくつかの実施形態では、本発明は、同種異系共培養アッセイ、例えば、Raji、Ramos、Daudi、U937、またはThp1標的細胞を使用する同種異系共培養アッセイ、ならびに少なくとも9つの追加のアッセイを含むマトリックスを含む。いくつかの実施形態では、本発明は、同種異系共培養アッセイ、例えば、Raji、Ramos、Daudi、U937、またはThp1標的細胞を使用する同種異系共培養アッセイ、ならびに少なくとも10の追加のアッセイを含むマトリックスを含む。いくつかの実施形態では、本発明は、同種異系共培養アッセイ、例えば、Raji、Ramos、Daudi、U937、またはThp1標的細胞を使用する同種異系共培養アッセイ、ならびに少なくとも11の追加のアッセイを含むマトリックスを含む。いくつかの実施形態では、本発明は、同種異系共培養アッセイ、例えば、Raji、Ramos、Daudi、U937、またはThp1標的細胞を使用する同種異系共培養アッセイ、ならびに少なくとも12の追加のアッセイを含むマトリックスを含む。
いくつかの実施形態では、本発明は、T細胞製品の効力を決定するための方法を含み、IFN-γ、グランザイムB、またはTNF-αのレベルは、抗CD3、抗CD28、及び/または抗CD137抗体による刺激を含む、ビーズまたはプレートベースの刺激法によって測定される。かかる方法は、異なる機序を介してTIL、MIL、またはPBLの活性化を検出し、TIL治療製品、MIL治療製品、またはPBL治療製品の機能性または活性についてさらに報告するという点で、本明細書に記載の同種異系共培養アッセイと直交する。したがって、かかる方法は、本明細書に記載の効力アッセイマトリックスに、単独で、または本明細書に記載の同種異系共培養アッセイと併せて含めてもよい。好適なビーズ及びプレートベースの方法は、米国特許第10,130,659号、同第11,083,752号、同第10,918,666号、同第11,168,303号、及び同第11,026,974号、ならびに米国特許出願公開第US2019/0276802A1号に記載されており、それらの開示は参照により本明細書に組み込まれる。
いくつかの実施形態では、本発明は、T細胞製品の効力を決定するための方法を含み、TCM細胞の数またはパーセンテージが測定される。いくつかの実施形態では、本発明は、T細胞製品の効力を決定するための方法を含み、TEM細胞の数またはパーセンテージが測定される。いくつかの実施形態では、本発明は、T細胞製品の効力を決定するための方法を含み、TSCM細胞の数またはパーセンテージが測定される。いくつかの実施形態では、本発明は、T細胞製品の効力を決定するための方法を含み、TEMRA細胞の数またはパーセンテージが測定される。いくつかの実施形態では、TIL製品、MIL製品、またはPBL製品の効力は、フローサイトメトリーによるCD45RACCR7発現細胞のパーセンテージによるTEM細胞の測定によって決定され、CD45RACCR7の発現は、CD3細胞またはTCRαβ陽性細胞の5%超、10%超、15%超、20%超、25%超、30%超、35%超、40%超、45%超、50%超、55%超、60%超、65%超、70%超、75%超、80%超、85%超、90%超、または95%超で検出される。いくつかの実施形態では、TIL製品、MIL製品、またはPBL製品の効力は、フローサイトメトリーによるCD45RACCR7発現細胞のパーセンテージによるTCM細胞の測定によって決定され、CD45RACCR7の発現は、CD3細胞またはTCRαβ陽性細胞の5%超、10%超、15%超、20%超、25%超、30%超、35%超、40%超、45%超、50%超、55%超、60%超、65%超、70%超、75%超、80%超、85%超、90%超、または95%超で検出される。いくつかの実施形態では、本発明は、T細胞製品の効力を決定するための方法を含み、全TEM及びTCM細胞集団は、100×10超、150×10超、200×10超、250×10超、300×10超、350×10超、400×10超、450×10超、500×10超、550×10超、600×10超、650×10超、700×10超、750×10超、800×10超、850×10超、900×10超、950×10超、1×10超、1.5×10超、2.0×10超、2.5×10超、3.0×10超、3.5×10超、4.0×10超、5.0×10超、6.0×10超、7.0×10超、8.0×10超、9.0×10超、または10×10超の細胞である。
いくつかの実施形態では、本発明は、T細胞製品の効力を決定する方法を含み、CD8の発現パーセンテージが測定される。いくつかの実施形態では、CD8の測定は、フローサイトメトリーによるものである。いくつかの実施形態では、TIL製品、MIL製品、またはPBL製品の効力は、フローサイトメトリーによるCD8の測定によって決定される。いくつかの実施形態では、TIL製品、MIL製品、またはPBL製品の効力は、フローサイトメトリーによるCD8の測定によって決定され、測定は、アッセイマトリックスに従って行われる一連の測定の一部である。いくつかの実施形態では、TIL製品、MIL製品、またはPBL製品の効力は、フローサイトメトリーによるCD8の測定によって決定され、測定は、アッセイマトリックスに従って行われる一連の測定の一部であり、さらにアッセイマトリックスは、本明細書の他の箇所に記載されるアロ反応性共培養アッセイも含む。いくつかの実施形態では、TIL製品、MIL製品、またはPBL製品の効力は、フローサイトメトリーによるCD8の測定によって決定され、CD8の発現は、CD3細胞またはTCRαβ陽性細胞の5%超、10%超、15%超、20%超、25%超、30%超、35%超、40%超、45%超、50%超、55%超、60%超、65%超、70%超、75%超、80%超、85%超、90%超、または95%超で検出される。
いくつかの実施形態では、本発明は、T細胞製品の効力を決定する方法を含み、CD8の発現パーセンテージが測定される。いくつかの実施形態では、CD8の測定は、フローサイトメトリーによるものである。いくつかの実施形態では、TIL製品、MIL製品、またはPBL製品の効力は、フローサイトメトリーによるCD8の測定によって決定される。いくつかの実施形態では、TIL製品、MIL製品、またはPBL製品の効力は、フローサイトメトリーによるCD8の測定によって決定され、測定は、アッセイマトリックスに従って行われる一連の測定の一部である。いくつかの実施形態では、TIL製品、MIL製品、またはPBL製品の効力は、フローサイトメトリーによるCD8の測定によって決定され、測定は、アッセイマトリックスに従って行われる一連の測定の一部であり、さらにアッセイマトリックスは、本明細書の他の箇所に記載されるアロ反応性共培養アッセイも含む。いくつかの実施形態では、TIL製品、MIL製品、またはPBL製品の効力は、フローサイトメトリーによるCD8の測定によって決定され、CD8の発現は、CD3細胞またはTCRαβ陽性細胞の2%超、3%超、4%超、5%超、10%超、15%超、20%超、25%超、30%超、35%超、40%超、45%超、50%超、55%超、60%超、65%超、70%超、75%超、80%超、85%超、90%超、または95%超で検出される。
いくつかの実施形態では、本発明は、T細胞製品の効力を決定する方法を含み、CD4の発現パーセンテージが測定される。いくつかの実施形態では、CD4の測定は、フローサイトメトリーによるものである。いくつかの実施形態では、TIL製品、MIL製品、またはPBL製品の効力は、フローサイトメトリーによるCD4の測定によって決定される。いくつかの実施形態では、TIL製品、MIL製品、またはPBL製品の効力は、フローサイトメトリーによるCD8の測定によって決定され、測定は、アッセイマトリックスに従って行われる一連の測定の一部である。いくつかの実施形態では、TIL製品、MIL製品、またはPBL製品の効力は、フローサイトメトリーによるCD4の測定によって決定され、測定は、アッセイマトリックスに従って行われる一連の測定の一部であり、さらにアッセイマトリックスは、本明細書の他の箇所に記載されるアロ反応性共培養アッセイも含む。いくつかの実施形態では、TIL製品、MIL製品、またはPBL製品の効力は、フローサイトメトリーによるCD4の測定によって決定され、CD4の発現は、CD3細胞またはTCRαβ陽性細胞の2%超、3%超、4%超、5%超、10%超、15%超、20%超、25%超、30%超、35%超、40%超、45%超、50%超、55%超、60%超、65%超、70%超、75%超、80%超、85%超、90%超、または95%超で検出される。
いくつかの実施形態では、本発明は、T細胞製品の効力を決定する方法を含み、CD4及びCD8の両方の発現パーセンテージが測定される。いくつかの実施形態では、CD4及びCD8の両方の測定は、フローサイトメトリーによるものである。いくつかの実施形態では、TIL製品、MIL製品、またはPBL製品の効力は、フローサイトメトリーによるCD4及びCD8の両方の測定によって決定される。いくつかの実施形態では、TIL製品、MIL製品、またはPBL製品の効力は、フローサイトメトリーによるCD4及びCD8の両方の測定によって決定され、測定は、アッセイマトリックスに従って行われる一連の測定の一部である。いくつかの実施形態では、TIL製品、MIL製品、またはPBL製品の効力は、フローサイトメトリーによるCD4及びCD8の両方の測定によって決定され、測定は、アッセイマトリックスに従って行われる一連の測定の一部であり、さらにアッセイマトリックスは、本明細書の他の箇所に記載されるアロ反応性共培養アッセイも含む。いくつかの実施形態では、TIL製品、MIL製品、またはPBL製品の効力は、フローサイトメトリーによるCD4及びCD8の両方の測定によって決定され、CD4+CD8の発現は、CD3細胞またはTCRαβ陽性細胞の50%超、55%超、60%超、65%超、70%超、75%超、80%超、85%超、90%超、または95%超で検出される。
いくつかの実施形態では、本発明は、T細胞製品の効力を決定するための方法を含み、単一陽性CD4、単一陽性CD8、及び二重陽性サブセットを含む全CD4及びCD8細胞集団は、100×10超、150×10超、200×10超、250×10超、300×10超、350×10超、400×10超、450×10超、500×10超、550×10超、600×10超、650×10超、700×10超、750×10超、800×10超、850×10超、900×10超、950×10超、1×10超、1.5×10超、2.0×10超、2.5×10超、3.0×10超、3.5×10超、4.0×10超、5.0×10超、6.0×10超、7.0×10超、8.0×10超、9.0×10超、または10×10超の細胞である。
いくつかの実施形態では、本発明は、T細胞製品の効力を決定する方法を含み、LAG3の発現パーセンテージが測定される。いくつかの実施形態では、LAG3の測定は、フローサイトメトリーによるものである。いくつかの実施形態では、TIL製品、MIL製品、またはPBL製品の効力は、フローサイトメトリーによるLAG3の測定によって決定される。いくつかの実施形態では、TIL製品、MIL製品、またはPBL製品の効力は、フローサイトメトリーによるLAG3の測定によって決定され、測定は、アッセイマトリックスに従って行われる一連の測定の一部である。いくつかの実施形態では、TIL製品、MIL製品、またはPBL製品の効力は、フローサイトメトリーによるLAG3の測定によって決定され、測定は、アッセイマトリックスに従って行われる一連の測定の一部であり、さらにアッセイマトリックスは、本明細書の他の箇所に記載されるアロ反応性共培養アッセイも含む。いくつかの実施形態では、TIL製品、MIL製品、またはPBL製品の効力は、フローサイトメトリーによるLAG3の測定によって決定され、LAG3の発現は、CD3細胞またはTCRαβ陽性細胞の5%未満、10%未満、15%未満、20%未満、25%未満、30%未満、35%未満、40%未満、45%未満、50%未満、55%未満、60%未満、65%未満、70%未満、75%未満、80%未満、85%未満、90%未満、または95%未満で検出される。いくつかの実施形態では、TIL製品、MIL製品、またはPBL製品の効力は、フローサイトメトリーによるLAG3の測定によって決定され、LAG3の発現は、CD3細胞またはTCRαβ陽性細胞の5%超、10%超、15%超、20%超、25%超、30%超、35%超、40%超、45%超、50%超、55%超、60%超、65%超、70%超、75%超、80%超、85%超、90%超、または95%超で検出される。いくつかの実施形態では、TIL製品、MIL製品、またはPBL製品の効力は、LAG3細胞の総数の測定によって決定され、LAG3細胞の総数は、50×10超、100×10超、150×10超、200×10超、250×10超、300×10超、350×10超、400×10超、450×10超、500×10超、550×10超、600×10超、650×10超、700×10超、750×10超、800×10超、850×10超、900×10超、950×10超、1×10超、1.5×10超、2.0×10超、2.5×10超、3.0×10超、3.5×10超、4.0×10超、5.0×10超、6.0×10超、7.0×10超、8.0×10超、9.0×10超、または10×10超の細胞である。
いくつかの実施形態では、本発明は、T細胞製品の効力を決定する方法を含み、KLRG1の発現パーセンテージが測定される。いくつかの実施形態では、KLRG1の測定は、フローサイトメトリーによるものである。いくつかの実施形態では、TIL製品、MIL製品、またはPBL製品の効力は、フローサイトメトリーによるKLRG1の測定によって決定される。いくつかの実施形態では、TIL製品、MIL製品、またはPBL製品の効力は、フローサイトメトリーによるKLRG1の測定によって決定され、測定は、アッセイマトリックスに従って行われる一連の測定の一部である。いくつかの実施形態では、TIL製品、MIL製品、またはPBL製品の効力は、フローサイトメトリーによるKLRG1の測定によって決定され、測定は、アッセイマトリックスに従って行われる一連の測定の一部であり、さらにアッセイマトリックスは、本明細書の他の箇所に記載されるアロ反応性共培養アッセイも含む。いくつかの実施形態では、TIL製品、MIL製品、またはPBL製品の効力は、フローサイトメトリーによるKLRG1の測定によって決定され、KLRG1の発現は、CD3細胞またはTCRαβ陽性細胞の5%未満、10%未満、15%未満、20%未満、25%未満、30%未満、35%未満、40%未満、45%未満、50%未満、55%未満、60%未満、65%未満、70%未満、75%未満、80%未満、85%未満、90%未満、または95%未満で検出される。いくつかの実施形態では、TIL製品、MIL製品、またはPBL製品の効力は、フローサイトメトリーによるKLRG1の測定によって決定され、KLRG1の発現は、CD3細胞またはTCRαβ陽性細胞の5%超、10%超、15%超、20%超、25%超、30%超、35%超、40%超、45%超、50%超、55%超、60%超、65%超、70%超、75%超、80%超、85%超、90%超、または95%超で検出される。いくつかの実施形態では、TIL製品、MIL製品、またはPBL製品の効力は、KLRG1細胞の総数の測定によって決定され、KLRG1細胞の総数は、50×10超、100×10超、150×10超、200×10超、250×10超、300×10超、350×10超、400×10超、450×10超、500×10超、550×10超、600×10超、650×10超、700×10超、750×10超、800×10超、850×10超、900×10超、950×10超、1×10超、1.5×10超、2.0×10超、2.5×10超、3.0×10超、3.5×10超、4.0×10超、5.0×10超、6.0×10超、7.0×10超、8.0×10超、9.0×10超、または10×10超の細胞である。
いくつかの実施形態では、本発明は、T細胞製品の効力を決定する方法を含み、CD101の発現パーセンテージが測定される。いくつかの実施形態では、CD101の測定は、フローサイトメトリーによるものである。いくつかの実施形態では、TIL製品、MIL製品、またはPBL製品の効力は、フローサイトメトリーによるCD101の測定によって決定される。いくつかの実施形態では、TIL製品、MIL製品、またはPBL製品の効力は、フローサイトメトリーによるCD101の測定によって決定され、測定は、アッセイマトリックスに従って行われる一連の測定の一部である。いくつかの実施形態では、TIL製品、MIL製品、またはPBL製品の効力は、フローサイトメトリーによるCD101の測定によって決定され、測定は、アッセイマトリックスに従って行われる一連の測定の一部であり、さらにアッセイマトリックスは、本明細書の他の箇所に記載されるアロ反応性共培養アッセイも含む。いくつかの実施形態では、TIL製品、MIL製品、またはPBL製品の効力は、フローサイトメトリーによるCD101の測定によって決定され、CD101の発現は、CD3細胞またはTCRαβ陽性細胞の5%未満、10%未満、15%未満、20%未満、25%未満、30%未満、35%未満、40%未満、45%未満、50%未満、55%未満、60%未満、65%未満、70%未満、75%未満、80%未満、85%未満、90%未満、または95%未満で検出される。いくつかの実施形態では、TIL製品、MIL製品、またはPBL製品の効力は、フローサイトメトリーによるCD101の測定によって決定され、CD101の発現は、CD3細胞またはTCRαβ陽性細胞の5%超、10%超、15%超、20%超、25%超、30%超、35%超、40%超、45%超、50%超、55%超、60%超、65%超、70%超、75%超、80%超、85%超、90%超、または95%超で検出される。いくつかの実施形態では、TIL製品、MIL製品、またはPBL製品の効力は、CD101細胞の総数の測定によって決定され、CD101細胞の総数は、50×10超、100×10超、150×10超、200×10超、250×10超、300×10超、350×10超、400×10超、450×10超、500×10超、550×10超、600×10超、650×10超、700×10超、750×10超、800×10超、850×10超、900×10超、950×10超、1×10超、1.5×10超、2.0×10超、2.5×10超、3.0×10超、3.5×10超、4.0×10超、5.0×10超、6.0×10超、7.0×10超、8.0×10超、9.0×10超、または10×10超の細胞である。
いくつかの実施形態では、本発明は、T細胞製品の効力を決定する方法を含み、CD69の発現パーセンテージが測定される。いくつかの実施形態では、CD69の測定は、フローサイトメトリーによるものである。いくつかの実施形態では、TIL製品、MIL製品、またはPBL製品の効力は、フローサイトメトリーによるCD69の測定によって決定される。いくつかの実施形態では、TIL製品、MIL製品、またはPBL製品の効力は、フローサイトメトリーによるCD69の測定によって決定され、測定は、アッセイマトリックスに従って行われる一連の測定の一部である。いくつかの実施形態では、TIL製品、MIL製品、またはPBL製品の効力は、フローサイトメトリーによるCD69の測定によって決定され、測定は、アッセイマトリックスに従って行われる一連の測定の一部であり、さらにアッセイマトリックスは、本明細書の他の箇所に記載されるアロ反応性共培養アッセイも含む。いくつかの実施形態では、TIL製品、MIL製品、またはPBL製品の効力は、フローサイトメトリーによるCD69の測定によって決定され、CD69の発現は、CD3細胞またはTCRαβ陽性細胞の5%未満、10%未満、15%未満、20%未満、25%未満、30%未満、35%未満、40%未満、45%未満、50%未満、55%未満、60%未満、65%未満、70%未満、75%未満、80%未満、85%未満、90%未満、または95%未満で検出される。いくつかの実施形態では、TIL製品、MIL製品、またはPBL製品の効力は、フローサイトメトリーによるCD69の測定によって決定され、CD69の発現は、CD3細胞またはTCRαβ陽性細胞の5%超、10%超、15%超、20%超、25%超、30%超、35%超、40%超、45%超、50%超、55%超、60%超、65%超、70%超、75%超、80%超、85%超、90%超、または95%超で検出される。いくつかの実施形態では、TIL製品、MIL製品、またはPBL製品の効力は、CD69細胞の総数の測定によって決定され、CD69細胞の総数は、50×10超、100×10超、150×10超、200×10超、250×10超、300×10超、350×10超、400×10超、450×10超、500×10超、550×10超、600×10超、650×10超、700×10超、750×10超、800×10超、850×10超、900×10超、950×10超、1×10超、1.5×10超、2.0×10超、2.5×10超、3.0×10超、3.5×10超、4.0×10超、5.0×10超、6.0×10超、7.0×10超、8.0×10超、9.0×10超、または10×10超の細胞である。
いくつかの実施形態では、本発明は、T細胞製品の効力を決定する方法を含み、PD-1の発現パーセンテージが測定される。いくつかの実施形態では、PD-1の測定は、フローサイトメトリーによるものである。いくつかの実施形態では、TIL製品、MIL製品、またはPBL製品の効力は、フローサイトメトリーによるPD-1の測定によって決定される。いくつかの実施形態では、TIL製品、MIL製品、またはPBL製品の効力は、フローサイトメトリーによるPD-1の測定によって決定され、測定は、アッセイマトリックスに従って行われる一連の測定の一部である。いくつかの実施形態では、TIL製品、MIL製品、またはPBL製品の効力は、フローサイトメトリーによるPD-1の測定によって決定され、測定は、アッセイマトリックスに従って行われる一連の測定の一部であり、さらにアッセイマトリックスは、本明細書の他の箇所に記載されるアロ反応性共培養アッセイも含む。いくつかの実施形態では、TIL製品、MIL製品、またはPBL製品の効力は、フローサイトメトリーによるPD-1の測定によって決定され、PD-1の発現は、CD3細胞またはTCRαβ陽性細胞の5%未満、10%未満、15%未満、20%未満、25%未満、30%未満、35%未満、40%未満、45%未満、50%未満、55%未満、60%未満、65%未満、70%未満、75%未満、80%未満、85%未満、90%未満、または95%未満で検出される。いくつかの実施形態では、TIL製品、MIL製品、またはPBL製品の効力は、フローサイトメトリーによるPD-1の測定によって決定され、PD-1の発現は、CD3細胞またはTCRαβ陽性細胞の5%超、10%超、15%超、20%超、25%超、30%超、35%超、40%超、45%超、50%超、55%超、60%超、65%超、70%超、75%超、80%超、85%超、90%超、または95%超で検出される。いくつかの実施形態では、TIL製品、MIL製品、またはPBL製品の効力は、PD-1細胞の総数の測定によって決定され、PD-1細胞の総数は、50×10超、100×10超、150×10超、200×10超、250×10超、300×10超、350×10超、400×10超、450×10超、500×10超、550×10超、600×10超、650×10超、700×10超、750×10超、800×10超、850×10超、900×10超、950×10超、1×10超、1.5×10超、2.0×10超、2.5×10超、3.0×10超、3.5×10超、4.0×10超、5.0×10超、6.0×10超、7.0×10超、8.0×10超、9.0×10超、または10×10超の細胞である。
いくつかの実施形態では、本発明は、T細胞製品の効力を決定する方法を含み、TIM3の発現パーセンテージが測定される。いくつかの実施形態では、TIM3の測定は、フローサイトメトリーによるものである。いくつかの実施形態では、TIL製品、MIL製品、またはPBL製品の効力は、フローサイトメトリーによるTIM3の測定によって決定される。いくつかの実施形態では、TIL製品、MIL製品、またはPBL製品の効力は、フローサイトメトリーによるTIM3の測定によって決定され、測定は、アッセイマトリックスに従って行われる一連の測定の一部である。いくつかの実施形態では、TIL製品、MIL製品、またはPBL製品の効力は、フローサイトメトリーによるTIM3の測定によって決定され、測定は、アッセイマトリックスに従って行われる一連の測定の一部であり、さらにアッセイマトリックスは、本明細書の他の箇所に記載されるアロ反応性共培養アッセイも含む。いくつかの実施形態では、TIL製品、MIL製品、またはPBL製品の効力は、フローサイトメトリーによるTIM3の測定によって決定され、TIM3の発現は、CD3細胞またはTCRαβ陽性細胞の5%未満、10%未満、15%未満、20%未満、25%未満、30%未満、35%未満、40%未満、45%未満、50%未満、55%未満、60%未満、65%未満、70%未満、75%未満、80%未満、85%未満、90%未満、または95%未満で検出される。いくつかの実施形態では、TIL製品、MIL製品、またはPBL製品の効力は、フローサイトメトリーによるTIM3の測定によって決定され、TIM3の発現は、CD3細胞またはTCRαβ陽性細胞の5%超、10%超、15%超、20%超、25%超、30%超、35%超、40%超、45%超、50%超、55%超、60%超、65%超、70%超、75%超、80%超、85%超、90%超、または95%超で検出される。いくつかの実施形態では、TIL製品、MIL製品、またはPBL製品の効力は、TIM3細胞の総数の測定によって決定され、TIM3細胞の総数は、50×10超、100×10超、150×10超、200×10超、250×10超、300×10超、350×10超、400×10超、450×10超、500×10超、550×10超、600×10超、650×10超、700×10超、750×10超、800×10超、850×10超、900×10超、950×10超、1×10超、1.5×10超、2.0×10超、2.5×10超、3.0×10超、3.5×10超、4.0×10超、5.0×10超、6.0×10超、7.0×10超、8.0×10超、9.0×10超、または10×10超の細胞である。
いくつかの実施形態では、本発明は、T細胞製品の効力を決定する方法を含み、CD25の発現パーセンテージが測定される。いくつかの実施形態では、CD25の測定は、フローサイトメトリーによるものである。いくつかの実施形態では、TIL製品、MIL製品、またはPBL製品の効力は、フローサイトメトリーによるCD25の測定によって決定される。いくつかの実施形態では、TIL製品、MIL製品、またはPBL製品の効力は、フローサイトメトリーによるCD25の測定によって決定され、測定は、アッセイマトリックスに従って行われる一連の測定の一部である。いくつかの実施形態では、TIL製品、MIL製品、またはPBL製品の効力は、フローサイトメトリーによるCD25の測定によって決定され、測定は、アッセイマトリックスに従って行われる一連の測定の一部であり、さらにアッセイマトリックスは、本明細書の他の箇所に記載されるアロ反応性共培養アッセイも含む。いくつかの実施形態では、TIL製品、MIL製品、またはPBL製品の効力は、フローサイトメトリーによるCD25の測定によって決定され、CD25の発現は、CD3細胞またはTCRαβ陽性細胞の5%未満、10%未満、15%未満、20%未満、25%未満、30%未満、35%未満、40%未満、45%未満、50%未満、55%未満、60%未満、65%未満、70%未満、75%未満、80%未満、85%未満、90%未満、または95%未満で検出される。いくつかの実施形態では、TIL製品、MIL製品、またはPBL製品の効力は、フローサイトメトリーによるCD25の測定によって決定され、CD25の発現は、CD3細胞またはTCRαβ陽性細胞の5%超、10%超、15%超、20%超、25%超、30%超、35%超、40%超、45%超、50%超、55%超、60%超、65%超、70%超、75%超、80%超、85%超、90%超、または95%超で検出される。いくつかの実施形態では、TIL製品、MIL製品、またはPBL製品の効力は、CD25細胞の総数の測定によって決定され、CD25細胞の総数は、50×10超、100×10超、150×10超、200×10超、250×10超、300×10超、350×10超、400×10超、450×10超、500×10超、550×10超、600×10超、650×10超、700×10超、750×10超、800×10超、850×10超、900×10超、950×10超、1×10超、1.5×10超、2.0×10超、2.5×10超、3.0×10超、3.5×10超、4.0×10超、5.0×10超、6.0×10超、7.0×10超、8.0×10超、9.0×10超、または10×10超の細胞である。
いくつかの実施形態では、本発明は、T細胞製品の効力を決定する方法を含み、CD27の発現パーセンテージが測定される。いくつかの実施形態では、CD27の測定は、フローサイトメトリーによるものである。いくつかの実施形態では、TIL製品、MIL製品、またはPBL製品の効力は、フローサイトメトリーによるCD27の測定によって決定される。いくつかの実施形態では、TIL製品、MIL製品、またはPBL製品の効力は、フローサイトメトリーによるCD27の測定によって決定され、測定は、アッセイマトリックスに従って行われる一連の測定の一部である。いくつかの実施形態では、TIL製品、MIL製品、またはPBL製品の効力は、フローサイトメトリーによるCD27の測定によって決定され、測定は、アッセイマトリックスに従って行われる一連の測定の一部であり、さらにアッセイマトリックスは、本明細書の他の箇所に記載されるアロ反応性共培養アッセイも含む。いくつかの実施形態では、TIL製品、MIL製品、またはPBL製品の効力は、フローサイトメトリーによるCD27の測定によって決定され、CD27の発現は、CD3細胞またはTCRαβ陽性細胞の5%未満、10%未満、15%未満、20%未満、25%未満、30%未満、35%未満、40%未満、45%未満、50%未満、55%未満、60%未満、65%未満、70%未満、75%未満、80%未満、85%未満、90%未満、または95%未満で検出される。いくつかの実施形態では、TIL製品、MIL製品、またはPBL製品の効力は、フローサイトメトリーによるCD27の測定によって決定され、CD27の発現は、CD3細胞またはTCRαβ陽性細胞の5%超、10%超、15%超、20%超、25%超、30%超、35%超、40%超、45%超、50%超、55%超、60%超、65%超、70%超、75%超、80%超、85%超、90%超、または95%超で検出される。いくつかの実施形態では、TIL製品、MIL製品、またはPBL製品の効力は、CD27細胞の総数の測定によって決定され、CD27細胞の総数は、50×10超、100×10超、150×10超、200×10超、250×10超、300×10超、350×10超、400×10超、450×10超、500×10超、550×10超、600×10超、650×10超、700×10超、750×10超、800×10超、850×10超、900×10超、950×10超、1×10超、1.5×10超、2.0×10超、2.5×10超、3.0×10超、3.5×10超、4.0×10超、5.0×10超、6.0×10超、7.0×10超、8.0×10超、9.0×10超、または10×10超の細胞である。
いくつかの実施形態では、本発明は、T細胞製品の効力を決定する方法を含み、CD28の発現パーセンテージが測定される。いくつかの実施形態では、CD28の測定は、フローサイトメトリーによるものである。いくつかの実施形態では、TIL製品、MIL製品、またはPBL製品の効力は、フローサイトメトリーによるCD28の測定によって決定される。いくつかの実施形態では、TIL製品、MIL製品、またはPBL製品の効力は、フローサイトメトリーによるCD28の測定によって決定され、測定は、アッセイマトリックスに従って行われる一連の測定の一部である。いくつかの実施形態では、TIL製品、MIL製品、またはPBL製品の効力は、フローサイトメトリーによるCD28の測定によって決定され、測定は、アッセイマトリックスに従って行われる一連の測定の一部であり、さらにアッセイマトリックスは、本明細書の他の箇所に記載されるアロ反応性共培養アッセイも含む。いくつかの実施形態では、TIL製品、MIL製品、またはPBL製品の効力は、フローサイトメトリーによるCD28の測定によって決定され、CD28の発現は、CD3細胞またはTCRαβ陽性細胞の5%未満、10%未満、15%未満、20%未満、25%未満、30%未満、35%未満、40%未満、45%未満、50%未満、55%未満、60%未満、65%未満、70%未満、75%未満、80%未満、85%未満、90%未満、または95%未満で検出される。いくつかの実施形態では、TIL製品、MIL製品、またはPBL製品の効力は、フローサイトメトリーによるCD28の測定によって決定され、CD28の発現は、CD3細胞またはTCRαβ陽性細胞の5%超、10%超、15%超、20%超、25%超、30%超、35%超、40%超、45%超、50%超、55%超、60%超、65%超、70%超、75%超、80%超、85%超、90%超、または95%超で検出される。いくつかの実施形態では、TIL製品、MIL製品、またはPBL製品の効力は、CD28細胞の総数の測定によって決定され、CD28細胞の総数は、50×10超、100×10超、150×10超、200×10超、250×10超、300×10超、350×10超、400×10超、450×10超、500×10超、550×10超、600×10超、650×10超、700×10超、750×10超、800×10超、850×10超、900×10超、950×10超、1×10超、1.5×10超、2.0×10超、2.5×10超、3.0×10超、3.5×10超、4.0×10超、5.0×10超、6.0×10超、7.0×10超、8.0×10超、9.0×10超、または10×10超の細胞である。
いくつかの実施形態では、本発明は、T細胞製品の効力を決定する方法を含み、CD56の発現パーセンテージが測定される。いくつかの実施形態では、CD56の測定は、フローサイトメトリーによるものである。いくつかの実施形態では、TIL製品、MIL製品、またはPBL製品の効力は、フローサイトメトリーによるCD56の測定によって決定される。いくつかの実施形態では、TIL製品、MIL製品、またはPBL製品の効力は、フローサイトメトリーによるCD56の測定によって決定され、測定は、アッセイマトリックスに従って行われる一連の測定の一部である。いくつかの実施形態では、TIL製品、MIL製品、またはPBL製品の効力は、フローサイトメトリーによるCD56の測定によって決定され、測定は、アッセイマトリックスに従って行われる一連の測定の一部であり、さらにアッセイマトリックスは、本明細書の他の箇所に記載されるアロ反応性共培養アッセイも含む。いくつかの実施形態では、TIL製品、MIL製品、またはPBL製品の効力は、フローサイトメトリーによるCD56の測定によって決定され、CD56の発現は、CD3細胞またはTCRαβ陽性細胞の5%未満、10%未満、15%未満、20%未満、25%未満、30%未満、35%未満、40%未満、45%未満、50%未満、55%未満、60%未満、65%未満、70%未満、75%未満、80%未満、85%未満、90%未満、または95%未満で検出される。いくつかの実施形態では、TIL製品、MIL製品、またはPBL製品の効力は、フローサイトメトリーによるCD56の測定によって決定され、CD56の発現は、CD3細胞またはTCRαβ陽性細胞の5%超、10%超、15%超、20%超、25%超、30%超、35%超、40%超、45%超、50%超、55%超、60%超、65%超、70%超、75%超、80%超、85%超、90%超、または95%超で検出される。いくつかの実施形態では、TIL製品、MIL製品、またはPBL製品の効力は、CD56細胞の総数の測定によって決定され、CD56細胞の総数は、50×10超、100×10超、150×10超、200×10超、250×10超、300×10超、350×10超、400×10超、450×10超、500×10超、550×10超、600×10超、650×10超、700×10超、750×10超、800×10超、850×10超、900×10超、950×10超、1×10超、1.5×10超、2.0×10超、2.5×10超、3.0×10超、3.5×10超、4.0×10超、5.0×10超、6.0×10超、7.0×10超、8.0×10超、9.0×10超、または10×10超の細胞である。
いくつかの実施形態では、本発明は、T細胞製品の効力を決定する方法を含み、CD57の発現パーセンテージが測定される。いくつかの実施形態では、CD57の測定は、フローサイトメトリーによるものである。いくつかの実施形態では、TIL製品、MIL製品、またはPBL製品の効力は、フローサイトメトリーによるCD57の測定によって決定される。いくつかの実施形態では、TIL製品、MIL製品、またはPBL製品の効力は、フローサイトメトリーによるCD57の測定によって決定され、測定は、アッセイマトリックスに従って行われる一連の測定の一部である。いくつかの実施形態では、TIL製品、MIL製品、またはPBL製品の効力は、フローサイトメトリーによるCD57の測定によって決定され、測定は、アッセイマトリックスに従って行われる一連の測定の一部であり、さらにアッセイマトリックスは、本明細書の他の箇所に記載されるアロ反応性共培養アッセイも含む。いくつかの実施形態では、TIL製品、MIL製品、またはPBL製品の効力は、フローサイトメトリーによるCD57の測定によって決定され、CD57の発現は、CD3細胞またはTCRαβ陽性細胞の5%未満、10%未満、15%未満、20%未満、25%未満、30%未満、35%未満、40%未満、45%未満、50%未満、55%未満、60%未満、65%未満、70%未満、75%未満、80%未満、85%未満、90%未満、または95%未満で検出される。いくつかの実施形態では、TIL製品、MIL製品、またはPBL製品の効力は、フローサイトメトリーによるCD57の測定によって決定され、CD57の発現は、CD3細胞またはTCRαβ陽性細胞の5%超、10%超、15%超、20%超、25%超、30%超、35%超、40%超、45%超、50%超、55%超、60%超、65%超、70%超、75%超、80%超、85%超、90%超、または95%超で検出される。いくつかの実施形態では、TIL製品、MIL製品、またはPBL製品の効力は、CD57細胞の総数の測定によって決定され、CD57細胞の総数は、50×10超、100×10超、150×10超、200×10超、250×10超、300×10超、350×10超、400×10超、450×10超、500×10超、550×10超、600×10超、650×10超、700×10超、750×10超、800×10超、850×10超、900×10超、950×10超、1×10超、1.5×10超、2.0×10超、2.5×10超、3.0×10超、3.5×10超、4.0×10超、5.0×10超、6.0×10超、7.0×10超、8.0×10超、9.0×10超、または10×10超の細胞である。
いくつかの実施形態では、本発明は、T細胞製品の効力を決定する方法を含み、CTLA-4の発現パーセンテージが測定される。いくつかの実施形態では、CTLA-4の測定は、フローサイトメトリーによるものである。いくつかの実施形態では、TIL製品、MIL製品、またはPBL製品の効力は、フローサイトメトリーによるCTLA-4の測定によって決定される。いくつかの実施形態では、TIL製品、MIL製品、またはPBL製品の効力は、フローサイトメトリーによるCTLA-4の測定によって決定され、測定は、アッセイマトリックスに従って行われる一連の測定の一部である。いくつかの実施形態では、TIL製品、MIL製品、またはPBL製品の効力は、フローサイトメトリーによるCTLA-4の測定によって決定され、測定は、アッセイマトリックスに従って行われる一連の測定の一部であり、さらにアッセイマトリックスは、本明細書の他の箇所に記載されるアロ反応性共培養アッセイも含む。いくつかの実施形態では、TIL製品、MIL製品、またはPBL製品の効力は、フローサイトメトリーによるCTLA-4の測定によって決定され、CTLA-4の発現は、CD3細胞またはTCRαβ陽性細胞の5%未満、10%未満、15%未満、20%未満、25%未満、30%未満、35%未満、40%未満、45%未満、50%未満、55%未満、60%未満、65%未満、70%未満、75%未満、80%未満、85%未満、90%未満、または95%未満で検出される。いくつかの実施形態では、TIL製品、MIL製品、またはPBL製品の効力は、フローサイトメトリーによるCTLA-4の測定によって決定され、CTLA-4の発現は、CD3細胞またはTCRαβ陽性細胞の5%超、10%超、15%超、20%超、25%超、30%超、35%超、40%超、45%超、50%超、55%超、60%超、65%超、70%超、75%超、80%超、85%超、90%超、または95%超で検出される。いくつかの実施形態では、TIL製品、MIL製品、またはPBL製品の効力は、CTLA-4細胞の総数の測定によって決定され、CTLA-4細胞の総数は、50×10超、100×10超、150×10超、200×10超、250×10超、300×10超、350×10超、400×10超、450×10超、500×10超、550×10超、600×10超、650×10超、700×10超、750×10超、800×10超、850×10超、900×10超、950×10超、1×10超、1.5×10超、2.0×10超、2.5×10超、3.0×10超、3.5×10超、4.0×10超、5.0×10超、6.0×10超、7.0×10超、8.0×10超、9.0×10超、または10×10超の細胞である。
いくつかの実施形態では、本発明は、TIGITの発現パーセンテージが測定される、T細胞製品の効力を決定するための方法を含む。いくつかの実施形態では、TIGITの測定は、フローサイトメトリーによるものである。いくつかの実施形態では、TIL製品、MIL製品、またはPBL製品の効力は、フローサイトメトリーによるTIGITの測定によって決定される。いくつかの実施形態では、TIL製品、MIL製品、またはPBL製品の効力は、フローサイトメトリーによるTIGITの測定によって決定され、測定は、アッセイマトリックスに従って行われる一連の測定の一部である。いくつかの実施形態では、TIL製品、MIL製品、またはPBL製品の効力は、フローサイトメトリーによるTIGITの測定によって決定され、測定は、アッセイマトリックスに従って行われる一連の測定の一部であり、さらにアッセイマトリックスは、本明細書の他の箇所に記載されるアロ反応性共培養アッセイも含む。いくつかの実施形態では、TIL製品、MIL製品、またはPBL製品の効力は、フローサイトメトリーによるTIGITの測定によって決定され、TIGITの発現は、CD3細胞またはTCRαβ陽性細胞の5%未満、10%未満、15%未満、20%未満、25%未満、30%未満、35%未満、40%未満、45%未満、50%未満、55%未満、60%未満、65%未満、70%未満、75%未満、80%未満、85%未満、90%未満、または95%未満で検出される。いくつかの実施形態では、TIL製品、MIL製品、またはPBL製品の効力は、フローサイトメトリーによるTIGITの測定によって決定され、TIGITの発現は、CD3細胞またはTCRαβ陽性細胞の5%超、10%超、15%超、20%超、25%超、30%超、35%超、40%超、45%超、50%超、55%超、60%超、65%超、70%超、75%超、80%超、85%超、90%超、または95%超で検出される。いくつかの実施形態では、TIL製品、MIL製品、またはPBL製品の効力は、TIGIT細胞の総数の測定によって決定され、TIGIT細胞の総数は、50×10超、100×10超、150×10超、200×10超、250×10超、300×10超、350×10超、400×10超、450×10超、500×10超、550×10超、600×10超、650×10超、700×10超、750×10超、800×10超、850×10超、900×10超、950×10超、1×10超、1.5×10超、2.0×10超、2.5×10超、3.0×10超、3.5×10超、4.0×10超、5.0×10超、6.0×10超、7.0×10超、8.0×10超、9.0×10超、または10×10超の細胞である。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該技術分野で知られているように、FoxP3+細胞に対する細胞内染色フローサイトメトリーアッセイを含む、Treg細胞の含有量が測定されるアッセイを含む、効力または同一性アッセイマトリックスを含む。
ある実施形態では、本発明は、T細胞受容体に結合可能な標的細胞を使用してT細胞製品の効力を決定する方法を含み、この方法は、少なくとも1つの他の効力アッセイを含む効力アッセイマトリックスで使用される。ある実施形態では、本発明は、T細胞またはTIL、MIL、もしくはPBL TCR複合体と、標的細胞のHLA-ペプチド複合体との同種異系相互作用(MHC優性認識とも称される)に基づくアッセイを含み、このアッセイは、少なくとも1つの他の効力アッセイを含む効力アッセイマトリックスで使用される。
ある実施形態では、本発明は、TIL製品の効力を決定する方法を含み、この方法は、
a.TIL製品からのTIL細胞との標的細胞の少なくとも3つの共培養を、異なる標的細胞濃度で12~48時間行うステップと、
b.共培養の各々から上清を抽出するステップと、
c.上清を、TIL細胞から分泌されたインターフェロン-γについて評価して、TIL製品の効力を決定するための用量濃度を取得するステップと、を含み、
標的細胞は、Raji、Ramos、Daudi、U937、もしくはThp1細胞、またはそれらの誘導体、バリアント、修飾、もしくは子孫である。
ある実施形態では、本発明は、TIL製品の効力を決定する方法を含み、この方法は、
a.TIL製品からのTIL細胞との標的細胞の少なくとも3つの共培養を、異なる標的細胞濃度で12~48時間行うステップと、
b.共培養の各々から上清を抽出するステップと、
c.上清を、TIL細胞から分泌されたインターフェロンγについて評価して、TIL製品の効力を決定するための用量濃度を取得するステップと、を含み、
標的細胞は、単球系細胞である。
ある実施形態では、本発明は、TIL製品の効力を決定する方法を含み、この方法は、
a.TIL製品からのTIL細胞との標的細胞の少なくとも3つの共培養を、少なくとも3つの異なる標的細胞濃度で約24時間行うステップと、
b.共培養の各々から上清を抽出するステップと、
c.上清を、TIL細胞から分泌されたインターフェロンγについて評価して、TIL製品の効力を決定するための用量濃度を取得するステップと、を含み、
標的細胞は、Thp1細胞もしくはU937細胞、またはそれらの誘導体、バリアント、修飾、もしくは子孫であり、相対効力は、TIL参照標準を使用した平行線分析によって決定される。
ある実施形態では、本発明は、TIL製品の効力を決定する方法を含み、この方法は、
a.TIL製品からのTIL細胞との標的細胞の4つの共培養を、4つの異なる標的細胞濃度で12~48時間行うステップと、
b.共培養の各々から上清を抽出するステップと、
c.上清を、TIL細胞から分泌されたインターフェロンγについて評価して、TIL製品の効力を決定するための用量濃度を取得するステップと、を含み、
標的細胞は、Raji、Ramos、Daudi、U937、もしくはThp1細胞、またはそれらの誘導体、バリアント、修飾、もしくは子孫であり、相対効力は、ステップa~cを複製する別個の一連の実験におけるTIL参照標準物を使用した平行線分析によって決定される。
ある実施形態では、本発明は、TIL製品の効力を決定する方法を含み、この方法は、
d.TIL製品からのTIL細胞との標的細胞の4つの共培養を、4つの異なる標的細胞濃度で12~48時間行うステップと、
e.共培養の各々から上清を抽出するステップと、
f.上清を、TIL細胞から分泌されたインターフェロンγについて評価して、TIL製品の効力を決定するための用量濃度を取得するステップと、を含み、
標的細胞は、Raji、Ramos、Daudi、U937、もしくはThp1細胞、またはそれらの誘導体、バリアント、修飾、もしくは子孫であり、相対効力は、ステップa~cを複製する別個の一連の実験におけるTIL参照標準物を使用して平行線分析によって決定され、1ウェル当たり4×10、2×10、1×10、及び0.5×10細胞の4つの標的細胞用量濃度、ならびに1ウェル当たり1.5×10TILの単一のTIL細胞濃度が使用される。
ある実施形態では、本発明は、TIL製品の効力を決定する方法を含み、この方法は、
a.TIL製品からのTIL細胞との標的細胞の4つの共培養を、4つの異なる標的細胞濃度で12~48時間行うステップと、
b.共培養の各々から上清を抽出するステップと、
c.上清を、TIL細胞から分泌されたインターフェロンγについて評価して、TIL製品の効力を決定するための用量濃度を取得するステップと、を含み、
標的細胞は、Raji、Ramos、Daudi、U937、もしくはThp1細胞、またはそれらの誘導体、バリアント、修飾、もしくは子孫であり、相対効力は、ステップa~cを複製する別個の一連の実験におけるTIL参照標準物を使用して平行線分析によって決定され、1ウェル当たり4×10、2×10、1×10、及び0.5×10細胞の4つの標的細胞用量濃度、ならびに1ウェル当たり1.5×10TILの単一のTIL細胞濃度が使用され、前述の方法は、サイトカインについてのビーズまたはプレートベースのアッセイ、総生細胞についてのアッセイ、生細胞パーセンテージについてのアッセイ、CD4細胞含有量についてのアッセイ、CD8細胞含有量についてのアッセイ、TEM細胞含有量についてのアッセイ、TCM細胞含有量についてのアッセイ、LAG3細胞含有量についてのアッセイ、及びKLRG1細胞含有量についてのアッセイ、CD101細胞含有量についてのアッセイ、CD69細胞含有量についてのアッセイ、TSCM細胞含有量についてのアッセイ、TEMRA細胞含有量についてのアッセイ、Treg細胞含有量についてのアッセイ、PD-1細胞含有量についてのアッセイ、TIM3細胞含有量についてのアッセイ、CD25細胞含有量についてのアッセイ、CD27細胞含有量についてのアッセイ、CD28細胞含有量についてのアッセイ、CD56細胞含有量についてのアッセイ、CTLA-4細胞含有量についてのアッセイ、TIGIT細胞含有量についてのアッセイ、及びCD57細胞含有量についてのアッセイからなる群から選択される少なくとも1つの他のアッセイを含む効力アッセイマトリックスの構成要素である。
ある実施形態では、本発明は、TIL製品の効力を決定する方法を含み、この方法は、
a.TIL製品からのTIL細胞との標的細胞の4つの共培養を、4つの異なる標的細胞濃度で12~48時間行うステップと、
b.共培養の各々から上清を抽出するステップと、
c.上清を、TIL細胞から分泌されたインターフェロンγについて評価して、TIL製品の効力を決定するための用量濃度を取得するステップと、を含み、
標的細胞は、Raji、Ramos、Daudi、U937、もしくはThp1細胞、またはそれらの誘導体、バリアント、修飾、もしくは子孫であり、相対効力は、ステップa~cを複製する別個の一連の実験におけるTIL参照標準物を使用して平行線分析によって決定され、1ウェル当たり4×10、2×10、1×10、及び0.5×10細胞の4つの標的細胞用量濃度、ならびに1ウェル当たり1.5×10TILの単一のTIL細胞濃度が使用され、前述の方法は、CD3、CD28、及び/またはCD137刺激を使用し、インターフェロン-γ、グランザイムB、または腫瘍壊死因子-αを報告するビーズまたはプレートベースのアッセイ、総生細胞についてのアッセイ、生細胞パーセンテージについてのアッセイ、CD4細胞含有量についてのアッセイ、CD8細胞含有量についてのアッセイ、TEM細胞含有量についてのアッセイ、TCM細胞含有量についてのアッセイ、LAG3細胞含有量についてのアッセイ、及びKLRG1細胞含有量についてのアッセイ、CD101細胞含有量についてのアッセイ、CD69細胞含有量についてのアッセイ、TSCM細胞含有量についてのアッセイ、TEMRA細胞含有量についてのアッセイ、Treg細胞含有量についてのアッセイ、PD-1細胞含有量についてのアッセイ、TIM3細胞含有量についてのアッセイ、CD25細胞含有量についてのアッセイ、CD27細胞含有量についてのアッセイ、CD28細胞含有量についてのアッセイ、CD56細胞含有量についてのアッセイ、CTLA-4細胞含有量についてのアッセイ、TIGIT細胞含有量についてのアッセイ、及びCD57細胞含有量についてのアッセイからなる群から選択される少なくとも1つの他のアッセイを含む効力アッセイマトリックスの構成要素である。
ある実施形態では、本発明は、TIL製品の効力を決定する方法を含み、この方法は、
a.TIL製品からのTIL細胞との標的細胞の4つの共培養を、4つの異なる標的細胞濃度で約24時間行うステップと、
b.共培養の各々から上清を抽出するステップと、
c.上清を、TIL細胞から分泌されたインターフェロンγについて評価して、TIL製品の効力を決定するための用量濃度を取得するステップと、を含み、
標的細胞は、Raji、Ramos、Daudi、U937、もしくはThp1細胞、またはそれらの誘導体、バリアント、修飾、もしくは子孫であり、相対効力は、ステップa~cを複製する別個の一連の実験におけるTIL参照標準物を使用して平行線分析によって決定され、1ウェル当たり4×10、2×10、1×10、及び0.5×10細胞の4つの標的細胞用量濃度、ならびに1ウェル当たり1.5×10TILの単一のTIL細胞濃度が使用され、1つの外れ値用量濃度が破棄され得、前述の方法は、CD3、CD28、及び/またはCD137刺激を使用し、インターフェロン-γ、グランザイムB、または腫瘍壊死因子-αを報告するビーズまたはプレートベースのアッセイ、総生細胞についてのアッセイ、生細胞パーセンテージについてのアッセイ、CD4細胞含有量についてのアッセイ、CD8細胞含有量についてのアッセイ、TEM細胞含有量についてのアッセイ、TCM細胞含有量についてのアッセイ、LAG3細胞含有量についてのアッセイ、及びKLRG1細胞含有量についてのアッセイ、CD101細胞含有量についてのアッセイ、CD69細胞含有量についてのアッセイ、TSCM細胞含有量についてのアッセイ、TEMRA細胞含有量についてのアッセイ、Treg細胞含有量についてのアッセイ、PD-1細胞含有量についてのアッセイ、TIM3細胞含有量についてのアッセイ、CD25細胞含有量についてのアッセイ、CD27細胞含有量についてのアッセイ、CD28細胞含有量についてのアッセイ、CD56細胞含有量についてのアッセイ、CTLA-4細胞含有量についてのアッセイ、TIGIT細胞含有量についてのアッセイ、及びCD57細胞含有量についてのアッセイからなる群から選択される少なくとも1つの他のアッセイを含む効力アッセイマトリックスの構成要素である。
ある実施形態では、本発明は、TIL製品の効力を決定する方法を含み、この方法は、
a.TIL製品からのTIL細胞との標的細胞の少なくとも3つの共培養を、異なる標的細胞濃度で12~48時間行うステップと、
b.共培養の各々から上清を抽出するステップと、
c.上清を、TIL細胞から分泌されたインターフェロンγについて評価して、TIL製品の効力を決定するための用量濃度を取得するステップと、を含み、
標的細胞は、単球系細胞であり、相対効力は、ステップa~cを複製する別個の一連の実験におけるTIL参照標準物を使用して平行線分析によって決定され、1ウェル当たり4×10、2×10、1×10、及び0.5×10細胞の4つの標的細胞用量濃度、ならびに1ウェル当たり1.5×10TILの単一のTIL細胞濃度が使用され、1つの外れ値用量濃度が破棄され得、前述の方法は、CD3、CD28、及び/またはCD137刺激を使用し、インターフェロン-γ、グランザイムB、または腫瘍壊死因子-αを報告するビーズまたはプレートベースのアッセイ、総生細胞についてのアッセイ、生細胞パーセンテージについてのアッセイ、CD4細胞含有量についてのアッセイ、CD8細胞含有量についてのアッセイ、TEM細胞含有量についてのアッセイ、TCM細胞含有量についてのアッセイ、LAG3細胞含有量についてのアッセイ、及びKLRG1細胞含有量についてのアッセイ、CD101細胞含有量についてのアッセイ、CD69細胞含有量についてのアッセイ、TSCM細胞含有量についてのアッセイ、TEMRA細胞含有量についてのアッセイ、Treg細胞含有量についてのアッセイ、PD-1細胞含有量についてのアッセイ、TIM3細胞含有量についてのアッセイ、CD25細胞含有量についてのアッセイ、CD27細胞含有量についてのアッセイ、CD28細胞含有量についてのアッセイ、CD56細胞含有量についてのアッセイ、CTLA-4細胞含有量についてのアッセイ、TIGIT細胞含有量についてのアッセイ、及びCD57細胞含有量についてのアッセイからなる群から選択される少なくとも1つの他のアッセイを含む効力アッセイマトリックスの構成要素である。
ある実施形態では、本発明は、TIL製品の効力を決定する方法を含み、この方法は、
a.異なる標的細胞またはTIL製品細胞濃度のTIL製品細胞との標的細胞の複数の共培養を行うステップと、
b.異なる標的細胞またはTIL参照標準細胞濃度のTIL参照標準細胞との標的細胞の複数の共培養を行うステップと、
c.共培養の各々から上清を抽出するステップと、
d.上清を、TIL製品細胞及びTIL参照標準細胞から分泌されたサイトカインについて評価して、TIL製品の効力を決定するための用量濃度を取得するステップと、を含み、
標的細胞は、単球系細胞である。
ある実施形態では、本発明は、TIL製品の効力を決定する方法を含み、この方法は、
a.TIL製品細胞との標的細胞の複数の共培養を、異なる標的細胞濃度で行うステップと、
b.TIL参照標準細胞との標的細胞の複数の共培養を、異なる標的細胞濃度で行うステップと、
c.共培養の各々から上清を抽出するステップと、
d.上清を、TIL製品細胞及びTIL参照標準細胞から分泌されたサイトカインについて評価して、TIL製品の効力を決定するための用量濃度を取得するステップと、を含み、
標的細胞は、単球系細胞である。
ある実施形態では、本発明は、TIL製品の効力を決定する方法を含み、この方法は、
a.TIL製品細胞との標的細胞の複数の共培養を、異なる標的細胞濃度で12~48時間行うステップと、
b.TIL参照標準細胞との標的細胞の複数の共培養を、異なる標的細胞濃度で12~48時間行うステップと、
c.共培養の各々から上清を抽出するステップと、
d.上清を、TIL製品細胞及びTIL参照標準細胞から分泌されたサイトカインについて評価して、TIL製品の効力を決定するための用量濃度を取得するステップと、を含み、
標的細胞は、単球系細胞である。
ある実施形態では、本発明は、TIL製品の効力を決定する方法を含み、この方法は、
a.TIL製品細胞との標的細胞の複数の共培養を、異なる標的細胞濃度で12~48時間行うステップと、
b.TIL参照標準細胞との標的細胞の複数の共培養を、異なる標的細胞濃度で12~48時間行うステップと、
c.共培養の各々から上清を抽出するステップと、
d.上清を、TIL製品細胞及びTIL参照標準細胞から分泌されたインターフェロン-γについて評価して、TIL製品の効力を決定するための用量濃度を取得するステップと、を含み、
標的細胞は、U937またはThp1細胞、またはそれらの誘導体、バリアント、修飾、もしくは子孫である。
ある実施形態では、本発明は、TIL製品の効力を決定する方法を含み、この方法は、
a.TIL製品細胞との標的細胞の複数の共培養を、異なる標的細胞濃度で12~48時間行うステップと、
b.TIL参照標準細胞との標的細胞の複数の共培養を、異なる標的細胞濃度で12~48時間行うステップと、
c.共培養の各々から上清を抽出するステップと、
d.上清を、TIL製品細胞及びTIL参照標準細胞から分泌されたインターフェロン-γについて評価して、TIL製品の効力を決定するための用量濃度を取得するステップと、を含み、
標的細胞は、単球系細胞であり、前述の方法は、少なくとも1つの他のアッセイを含む効力アッセイマトリックスの構成要素である。
ある実施形態では、本発明は、TIL製品の効力を決定する方法を含み、この方法は、
a.TIL製品細胞との標的細胞の複数の共培養を、異なる標的細胞濃度で12~48時間行うステップと、
b.TIL参照標準細胞との標的細胞の複数の共培養を、異なる標的細胞濃度で12~48時間行うステップと、
c.共培養の各々から上清を抽出するステップと、
d.上清を、TIL製品細胞及びTIL参照標準細胞から分泌されたインターフェロン-γについて評価して、TIL製品の効力を決定するための用量濃度を取得するステップと、を含み、
標的細胞は、U937もしくはThp1細胞、またはそれらの誘導体、バリアント、修飾、もしくは子孫であり、前述の方法は、少なくとも1つの他のアッセイを含む効力アッセイマトリックスの構成要素である。
ある実施形態では、本発明は、TIL製品の効力を決定する方法を含み、この方法は、
a.TIL製品細胞との標的細胞の少なくとも3つの共培養を、異なる標的細胞濃度で12~48時間行うステップと、
b.TIL参照標準細胞との標的細胞の少なくとも3つの共培養を、異なる標的細胞濃度で12~48時間行うステップと、
c.共培養の各々から上清を抽出するステップと、
d.上清を、TIL製品細胞及びTIL参照標準細胞から分泌されたインターフェロン-γについて評価して、TIL製品の効力を決定するための用量濃度を取得するステップと、を含み、
標的細胞は、U937もしくはThp1細胞、またはそれらの誘導体、バリアント、修飾、もしくは子孫であり、前述の方法は、少なくとも1つの他のアッセイを含む効力アッセイマトリックスの構成要素である。
ある実施形態では、本発明は、TIL製品の効力を決定する方法を含み、この方法は、
a.TIL製品細胞との標的細胞の少なくとも3つの共培養を、異なる標的細胞濃度で約24時間行うステップと、
b.TIL参照標準細胞との標的細胞の少なくとも3つの共培養を、異なる標的細胞濃度で約24時間行うステップと、
c.共培養の各々から上清を抽出するステップと、
d.上清を、TIL製品細胞及びTIL参照標準細胞から分泌されたインターフェロン-γについて評価して、TIL製品の効力を決定するための用量濃度を取得するステップと、を含み、
標的細胞は、U937もしくはThp1細胞、またはそれらの誘導体、バリアント、修飾、もしくは子孫であり、前述の方法は、少なくとも1つの他のアッセイを含む効力アッセイマトリックスの構成要素である。
ある実施形態では、本発明は、TIL製品の効力を決定する方法を含み、この方法は、
a.TIL製品細胞との標的細胞の少なくとも3つの共培養を、異なる標的細胞濃度で約24時間行うステップと、
b.TIL参照標準細胞との標的細胞の少なくとも3つの共培養を、異なる標的細胞濃度で約24時間行うステップと、
c.共培養の各々から上清を抽出するステップと、
d.上清を、TIL製品細胞及びTIL参照標準細胞から分泌されたインターフェロン-γについて評価して、TIL製品の効力を決定するための用量濃度を取得するステップと、を含み、
標的細胞は、U937もしくはThp1細胞、またはそれらの誘導体、バリアント、修飾、もしくは子孫であり、1ウェル当たり4×10、2×10、1×10、及び0.5×10細胞の4つの標的細胞用量濃度、ならびに1ウェル当たり1.5×10TILの単一のTIL細胞濃度が使用され、1つの外れ値用量濃度が破棄され得、前述の方法は、CD3、CD28、及び/またはCD137刺激を使用し、インターフェロン-γ、グランザイムB、または腫瘍壊死因子-αを報告するビーズまたはプレートベースのアッセイ、総生細胞についてのアッセイ、生細胞パーセンテージについてのアッセイ、CD4細胞含有量についてのアッセイ、CD8細胞含有量についてのアッセイ、TEM細胞含有量についてのアッセイ、TCM細胞含有量についてのアッセイ、LAG3細胞含有量についてのアッセイ、及びKLRG1細胞含有量についてのアッセイ、CD101細胞含有量についてのアッセイ、CD69細胞含有量についてのアッセイ、TSCM細胞含有量についてのアッセイ、TEMRA細胞含有量についてのアッセイ、Treg細胞含有量についてのアッセイ、PD-1細胞含有量についてのアッセイ、TIM3細胞含有量についてのアッセイ、CD25細胞含有量についてのアッセイ、CD27細胞含有量についてのアッセイ、CD28細胞含有量についてのアッセイ、CD56細胞含有量についてのアッセイ、CTLA-4細胞含有量についてのアッセイ、TIGIT細胞含有量についてのアッセイ、及びCD57細胞含有量についてのアッセイからなる群から選択される少なくとも1つの他のアッセイを含む効力アッセイマトリックスの構成要素である。
ある実施形態では、本発明は、TIL製品の効力を決定する方法を含み、この方法は、
a.TIL製品細胞との標的細胞の少なくとも3つの共培養を、異なる標的細胞濃度で約24時間行うステップと、
b.TIL参照標準細胞との標的細胞の少なくとも3つの共培養を、異なる標的細胞濃度で約24時間行うステップと、
c.共培養の各々から上清を抽出するステップと、
d.上清を、TIL製品細胞及びTIL参照標準細胞から分泌されたインターフェロン-γについて評価して、TIL製品の効力を決定するための用量濃度を取得するステップと、を含み、
標的細胞は、U937もしくはThp1細胞、またはそれらの誘導体、バリアント、修飾、もしくは子孫であり、1ウェル当たり4×10、2×10、1×10、及び0.5×10細胞の4つの標的細胞用量濃度、ならびに1ウェル当たり1.5×10TILの単一のTIL細胞濃度が使用され(各々が少なくとも2つの複製で行われる)、1つの外れ値用量濃度が破棄され得、前述の方法は、CD3、CD28、及び/またはCD137刺激を使用し、インターフェロン-γ、グランザイムB、または腫瘍壊死因子-αを報告するビーズまたはプレートベースのアッセイ、総生細胞についてのアッセイ、生細胞パーセンテージについてのアッセイ、CD4細胞含有量についてのアッセイ、CD8細胞含有量についてのアッセイ、TEM細胞含有量についてのアッセイ、TCM細胞含有量についてのアッセイ、LAG3細胞含有量についてのアッセイ、及びKLRG1細胞含有量についてのアッセイ、CD101細胞含有量についてのアッセイ、CD69細胞含有量についてのアッセイ、TSCM細胞含有量についてのアッセイ、TEMRA細胞含有量についてのアッセイ、Treg細胞含有量についてのアッセイ、PD-1細胞含有量についてのアッセイ、TIM3細胞含有量についてのアッセイ、CD25細胞含有量についてのアッセイ、CD27細胞含有量についてのアッセイ、CD28細胞含有量についてのアッセイ、CD56細胞含有量についてのアッセイ、CTLA-4細胞含有量についてのアッセイ、TIGIT細胞含有量についてのアッセイ、及びCD57細胞含有量についてのアッセイからなる群から選択される少なくとも1つの他のアッセイを含む効力アッセイマトリックスの構成要素である。
ある実施形態では、本発明は、TIL製品の効力を決定する方法を含み、この方法は、
a.TIL製品細胞との標的細胞の少なくとも3つの共培養を、異なる標的細胞濃度で約24時間行うステップと、
b.TIL参照標準細胞との標的細胞の少なくとも3つの共培養を、異なる標的細胞濃度で約24時間行うステップと、
c.共培養の各々から上清を抽出するステップと、
d.上清を、TIL製品細胞及びTIL参照標準細胞から分泌されたインターフェロン-γについて評価して、TIL製品の効力を決定するための用量濃度を取得するステップと、を含み、
標的細胞は、U937もしくはThp1細胞、またはそれらの誘導体、バリアント、修飾、もしくは子孫であり、1ウェル当たり4×10、2×10、1×10、及び0.5×10細胞の4つの標的細胞用量濃度、ならびに1ウェル当たり1.5×10TILの単一のTIL細胞濃度が使用され(各々が少なくとも2つの複製で行われる)、1つの外れ値用量濃度が破棄され得、前述の方法は、CD3、CD28、及び/またはCD137刺激を使用し、インターフェロン-γ、グランザイムB、または腫瘍壊死因子-αを報告するビーズまたはプレートベースのアッセイ、総生細胞についてのアッセイ、生細胞パーセンテージについてのアッセイ、CD4細胞含有量についてのアッセイ、CD8細胞含有量についてのアッセイ、TEM細胞含有量についてのアッセイ、TCM細胞含有量についてのアッセイ、LAG3細胞含有量についてのアッセイ、及びKLRG1細胞含有量についてのアッセイ、CD101細胞含有量についてのアッセイ、CD69細胞含有量についてのアッセイ、TSCM細胞含有量についてのアッセイ、TEMRA細胞含有量についてのアッセイ、Treg細胞含有量についてのアッセイ、PD-1細胞含有量についてのアッセイ、TIM3細胞含有量についてのアッセイ、CD25細胞含有量についてのアッセイ、CD27細胞含有量についてのアッセイ、CD28細胞含有量についてのアッセイ、CD56細胞含有量についてのアッセイ、CTLA-4細胞含有量についてのアッセイ、TIGIT細胞含有量についてのアッセイ、及びCD57細胞含有量についてのアッセイからなる群から選択される少なくとも3つの他のアッセイを含む効力アッセイマトリックスの構成要素である。
ある実施形態では、本発明は、TIL製品の効力を決定する方法を含み、この方法は、
a.TIL製品細胞との標的細胞の少なくとも3つの共培養を、異なる標的細胞濃度で約24時間行うステップと、
b.TIL参照標準細胞との標的細胞の少なくとも3つの共培養を、異なる標的細胞濃度で約24時間行うステップと、
c.共培養の各々から上清を抽出するステップと、
d.上清を、TIL製品細胞及びTIL参照標準細胞から分泌されたインターフェロン-γについて評価して、TIL製品の効力を決定するための用量濃度を取得するステップと、を含み、
標的細胞は、U937もしくはThp1細胞、またはそれらの誘導体、バリアント、修飾、もしくは子孫であり、1ウェル当たり4×10、2×10、1×10、及び0.5×10細胞の4つの標的細胞用量濃度、ならびに1ウェル当たり1.5×10TILの単一のTIL細胞濃度が使用され(各々が少なくとも2つの複製で行われる)、1つの外れ値用量濃度が破棄され得、前述の方法は、CD3、CD28、及び/またはCD137刺激を使用し、インターフェロン-γ、グランザイムB、または腫瘍壊死因子-αを報告するビーズまたはプレートベースのアッセイ、総生細胞についてのアッセイ、生細胞パーセンテージについてのアッセイ、CD4細胞含有量についてのアッセイ、CD8細胞含有量についてのアッセイ、TEM細胞含有量についてのアッセイ、TCM細胞含有量についてのアッセイ、LAG3細胞含有量についてのアッセイ、及びKLRG1細胞含有量についてのアッセイ、CD101細胞含有量についてのアッセイ、CD69細胞含有量についてのアッセイ、TSCM細胞含有量についてのアッセイ、TEMRA細胞含有量についてのアッセイ、Treg細胞含有量についてのアッセイ、PD-1細胞含有量についてのアッセイ、TIM3細胞含有量についてのアッセイ、CD25細胞含有量についてのアッセイ、CD27細胞含有量についてのアッセイ、CD28細胞含有量についてのアッセイ、CD56細胞含有量についてのアッセイ、CTLA-4細胞含有量についてのアッセイ、TIGIT細胞含有量についてのアッセイ、及びCD57細胞含有量についてのアッセイからなる群から選択される少なくとも5つの他のアッセイを含む効力アッセイマトリックスの構成要素である。
いくつかの実施形態では、本発明は、TIL生成物の効力を決定する方法を含み、この方法は、マルチチャネル及びマルチカラーのフローサイトメーターを含む、フローサイトメーターを使用してフローサイトメトリー分析を行うステップを含む。好適なフローサイトメーター及び方法は、米国特許第9,645,010号、同第10,816,550号、同第10,137,479号、同第9,453,791号、同第10,935,482号、同第10,648,900号、同第9,341,562号、同第9,677,989号、同第4,710,635号、同第4,662,742号、同第4,660,971号、同第4,818,103号、同第5,057,413号、同第5,641,457号、同第5,620,842号、同第5,985,216号、同第6,079,836号、同第6,495,333号、同第6,256,096号、同第6,482,652号、同第6,700,130号、同第7,855,078号、同第7,990,525号、及び同第10,436,698号、ならびに米国特許出願公開第US2001/0006416A1号及び同第US2002/0186375A1号に記載されており、それらの開示は参照により本明細書に組み込まれる。いくつかの実施形態では、前述のフローサイトメトリー方法は、本明細書に記載の同種異系共培養アッセイと組み合わせられる。いくつかの実施形態では、前述のフローサイトメトリー方法は、CD3、CD28、及び/またはCD137刺激を使用し、ELISAベースの方法によってインターフェロン-γ、グランザイムB、または腫瘍壊死因子-αを報告する、ビーズまたはプレートベースのアッセイと組み合わせられる。
いくつかの実施形態では、前述の共培養は、インキュベーター内で行われる。いくつかの実施形態では、前述の共培養は、約40℃でインキュベーター内で行われる。いくつかの実施形態では、前述の共培養は、約35℃でインキュベーター内で行われる。いくつかの実施形態では、前述の共培養は、約37℃でインキュベーター内で行われる。いくつかの実施形態では、前述の共培養は、約5%のCOガスを伴うインキュベーター内で行われる。いくつかの実施形態では、前述の共培養は、約10%のCOガスを伴うインキュベーター内で行われる。いくつかの実施形態では、前述の共培養は、約15%のCOガスを伴うインキュベーター内で行われる。いくつかの実施形態では、前述の共培養は、約20%のCOガスを伴うインキュベーター内で行われる。いくつかの実施形態では、前述の共培養は、加湿を伴うインキュベーター内で行われる。
B.アッセイ組成物
いくつかの実施形態では、本発明は、TIL製品、MIL製品、またはPBL製品などのTIL、及び標的細胞を含む組成物を含む。いくつかの実施形態では、本発明は、TIL製品、MIL製品、またはPBL製品などのTIL、及び標的細胞を培地中に含む組成物を含む。いくつかの実施形態では、本発明は、TIL製品、MIL製品、またはPBL製品などのTIL、及び標的細胞を含む組成物を含み、標的細胞は、Raji細胞またはその誘導体、バリアント、修飾、もしくは子孫である。いくつかの実施形態では、本発明は、TIL製品、MIL製品、またはPBL製品などのTIL、及び陰性対照細胞を含む組成物を含む。いくつかの実施形態では、本発明は、TIL製品、MIL製品、またはPBL製品などのTIL、及び陰性対照細胞を培地中に含む組成物を含む。いくつかの実施形態では、本発明は、TIL製品、MIL製品、またはPBL製品などのTIL、及び標的細胞を含む組成物を含み、陰性対照細胞は、K562細胞またはその誘導体、バリアント、修飾、もしくは子孫である。ある実施形態では、本発明は、任意選択で分泌タンパク質を含有する、本明細書に記載の共培養アッセイから取得された上清を含む組成物を含む。
ある実施形態では、本発明は、培地(AIM-V培地など)と、Raji細胞株、Thp1細胞株、Ramos細胞株、U937細胞株、Daudi細胞株、及びそれらの組み合わせからなる群から選択される細胞株からの少なくとも1つの細胞と、IL-2と、を含む組成物を含む。ある実施形態では、本発明は、AIM-V培地と、Raji細胞株、Thp1細胞株、Ramos細胞株、U937細胞株、Daudi細胞株、及びそれらの組み合わせからなる群から選択される細胞株からの少なくとも1つの細胞と、IL-2と、を含む組成物を含み、IL-2は、共培養中に連続的に添加される。ある実施形態では、本発明は、AIM-V培地と、Raji細胞株、Thp1細胞株、Ramos細胞株、U937細胞株、Daudi細胞株、及びそれらの組み合わせからなる群から選択される細胞株からの少なくとも1つの細胞と、IL-2と、を含む組成物を含み、IL-2は、共培養中に連続的に添加され、IL-2は、共培養中に50IU/mL~1000IU/mLの濃度で維持される。ある実施形態では、本発明は、AIM-V培地と、Raji細胞株、Thp1細胞株、Ramos細胞株、U937細胞株、Daudi細胞株、及びそれらの組み合わせからなる群から選択される細胞株からの少なくとも1つの細胞と、IL-2と、を含む組成物を含み、IL-2は、共培養中に連続的に添加され、IL-2は、共培養中に100IU/mL~500IU/mLの濃度で維持される。ある実施形態では、本発明は、AIM-V培地と、Raji細胞株、Thp1細胞株、Ramos細胞株、U937細胞株、Daudi細胞株、及びそれらの組み合わせからなる群から選択される細胞株からの少なくとも1つの細胞と、IL-2と、を含む組成物を含み、IL-2は、共培養中に連続的に添加され、IL-2は、共培養中に200IU/mL~400IU/mLの濃度で維持される。ある実施形態では、本発明は、AIM-V培地と、Raji細胞株、Thp1細胞株、Ramos細胞株、U937細胞株、Daudi細胞株、及びそれらの組み合わせからなる群から選択される細胞株からの少なくとも1つの細胞と、IL-2と、を含む組成物を、約50IU/mL、約100IU/mL、約150IU/mL、約200IU/mL、約250IU/mL、約300IU/mL、約350IU/mL、約400IU/mL、約450IU/mL、及び約500IU/mLからなる群から選択される濃度で含む。ある実施形態では、本発明は、標的細胞を含む組成物を含み、標的細胞は、Raji細胞とThp1細胞との組み合わせであり、Raji細胞対Thp1細胞の比は、5:1、4:1、3:1、2:1、1:1、1:2、1:3、1:4、及び1:5からなる群から選択される。ある実施形態では、本発明は、標的細胞を含む組成物を含み、標的細胞は、Raji細胞とRamos細胞との組み合わせであり、Raji細胞対Ramos細胞の比は、5:1、4:1、3:1、2:1、1:1、1:2、1:3、1:4、及び1:5からなる群から選択される。ある実施形態では、本発明は、標的細胞を含む組成物を含み、標的細胞は、Raji細胞とU937細胞との組み合わせであり、Raji細胞対U937細胞の比は、5:1、4:1、3:1、2:1、1:1、1:2、1:3、1:4、及び1:5からなる群から選択される。ある実施形態では、本発明は、標的細胞を含む組成物を含み、標的細胞は、Raji細胞とDaudi細胞との組み合わせであり、Raji細胞対Daudi細胞の比は、5:1、4:1、3:1、2:1、1:1、1:2、1:3、1:4、及び1:5からなる群から選択される。
ある実施形態では、本発明は、培地(AIM-V培地など)と、B細胞株、B細胞リンパ芽腫細胞株、バーキットリンパ腫細胞株、骨髄系細胞株、単球細胞株、急性単球性白血病細胞、M5サブタイプ急性単球性白血病細胞、黒色細胞株、黒色腫細胞株、及びそれらの組み合わせからなる群から選択される細胞株からの少なくとも1つの細胞と、IL-2と、を含む組成物を含む。ある実施形態では、本発明は、AIM-V培地と、B細胞株、B細胞リンパ芽腫細胞株、バーキットリンパ腫細胞株、骨髄系細胞株、単球細胞株、急性単球性白血病細胞、M5サブタイプ急性単球性白血病細胞、黒色細胞株、黒色腫細胞株、及びそれらの組み合わせからなる群から選択される細胞株からの少なくとも1つの細胞と、IL-2と、を含む組成物を含み、IL-2は、共培養中に連続的に添加される。ある実施形態では、本発明は、AIM-V培地と、B細胞株、B細胞リンパ芽腫細胞株、バーキットリンパ腫細胞株、骨髄系細胞株、単球細胞株、急性単球性白血病細胞、M5サブタイプ急性単球性白血病細胞、黒色細胞株、黒色腫細胞株、及びそれらの組み合わせからなる群から選択される細胞株からの少なくとも1つの細胞と、IL-2と、を含む組成物を含み、IL-2は、共培養中に連続的に添加され、IL-2は、共培養中に50IU/mL~1000IU/mLの濃度で維持される。ある実施形態では、本発明は、AIM-V培地と、B細胞株、B細胞リンパ芽腫細胞株、バーキットリンパ腫細胞株、骨髄系細胞株、単球細胞株、急性単球性白血病細胞、M5サブタイプ急性単球性白血病細胞、黒色細胞株、黒色腫細胞株、及びそれらの組み合わせからなる群から選択される細胞株からの少なくとも1つの細胞と、IL-2と、を含む組成物を含み、IL-2は、共培養中に連続的に添加され、IL-2は、共培養中に100IU/mL~500IU/mLの濃度で維持される。ある実施形態では、本発明は、AIM-V培地と、B細胞株、B細胞リンパ芽腫細胞株、バーキットリンパ腫細胞株、骨髄系細胞株、単球細胞株、急性単球性白血病細胞、M5サブタイプ急性単球性白血病細胞、黒色細胞株、黒色腫細胞株、及びそれらの組み合わせからなる群から選択される細胞株からの少なくとも1つの細胞と、IL-2と、を含む組成物を含み、IL-2は、共培養中に連続的に添加され、IL-2は、共培養中に200IU/mL~400IU/mLの濃度で維持される。ある実施形態では、本発明は、AIM-V培地と、B細胞株、B細胞リンパ芽腫細胞株、バーキットリンパ腫細胞株、骨髄系細胞株、単球細胞株、急性単球性白血病細胞、M5サブタイプ急性単球性白血病細胞、黒色細胞株、黒色腫細胞株、及びそれらの組み合わせからなる群から選択される細胞株からの少なくとも1つの細胞と、IL-2と、を含む組成物を、約50IU/mL、約100IU/mL、約150IU/mL、約200IU/mL、約250IU/mL、約300IU/mL、約350IU/mL、約400IU/mL、約450IU/mL、及び約500IU/mLからなる群から選択される濃度で含む。
ある実施形態では、標的細胞の先行実施形態のうちのいずれかは、照射された標的細胞を含む。ある実施形態では、標的細胞の先行実施形態のうちのいずれかは、照射されていない標的細胞を含む。ある実施形態では、陰性対照細胞の先行実施形態のうちのいずれかは、照射された陰性対照細胞を含む。ある実施形態では、陰性対照細胞の先行実施形態のうちのいずれかは、照射されていない陰性対照細胞を含む。
ある実施形態では、本発明は、HLA-A、HLA-B、HLA-C、HLA-DQ(A1)、HLA-DQ(A2)、HLA-DR(B1)、HLA-DP(B1)、HLA-DP(B2)、またはそれらの組み合わせを発現する標的細胞株または標的細胞株の組み合わせを含む組成物を含む。ある実施形態では、本発明は、標的細胞株または標的細胞株の組み合わせが、HLA-A、HLA-B、HLA-C、HLA-DQ(A1)、HLA-DQ(A2)、HLA-DR(B1)、HLA-DP(B1)、HLA-DP(B2)、またはそれらの組み合わせを発現し、本明細書に記載の方法によって調製されたTIL、MIL、またはPBLの集団をさらに含む、効力アッセイを行うための方法を含む。いくつかの実施形態では、本発明は、標的細胞株または標的細胞株の組み合わせが、HLA-A、HLA-B、HLA-C、HLA-DQ(A1)、HLA-DQ(A2)、HLA-DR(B1)、HLA-DP(B1)、HLA-DP(B2)、またはそれらの組み合わせを発現し、本明細書に記載のGen2プロセスによって調製されたTIL、MIL、またはPBLの集団をさらに含む、効力アッセイを行うための方法を含む。いくつかの実施形態では、本発明は、標的細胞株または標的細胞株の組み合わせが、HLA-A、HLA-B、HLA-C、HLA-DQ(A1)、HLA-DQ(A2)、HLA-DR(B1)、HLA-DP(B1)、HLA-DP(B2)、またはそれらの組み合わせを発現し、本明細書に記載のGen3プロセスによって調製されたTIL、MIL、またはPBLの集団をさらに含む、効力アッセイを行うための方法を含む。ある実施形態では、本発明は、標的細胞株または標的細胞株の組み合わせが、HLA-A、HLA-B、HLA-C、HLA-DQ(A1)、HLA-DQ(A2)、HLA-DR(B1)、HLA-DP(B1)、HLA-DP(B2)、またはそれらの組み合わせを発現し、米国特許第10,894,063号、同第10,398,734号、同第10,537,595号、同第10,695,372号、及び同第10,653,723号(それらの開示は参照により本明細書に組み込まれる)に開示または特許請求される組成物に従ってTIL、MIL、またはPBLの集団をさらに含む、効力アッセイを行うための方法を含む。
ある実施形態では、本発明は、B細胞を含む標的細胞株または標的細胞株の組み合わせを含む組成物を含む。ある実施形態では、本発明は、B細胞リンパ芽球様細胞を含む標的細胞株または標的細胞株の組み合わせを含む組成物を含む。ある実施形態では、本発明は、バーキットリンパ腫細胞を含む標的細胞株または標的細胞株の組み合わせを含む組成物を含む。ある実施形態では、本発明は、骨髄系細胞を含む標的細胞株または標的細胞株の組み合わせを含む組成物を含む。ある実施形態では、本発明は、単球を含む標的細胞株または標的細胞株の組み合わせを含む組成物を含む。ある実施形態では、本発明は、急性単球性白血病細胞を含む標的細胞株または標的細胞株の組み合わせを含む組成物を含む。ある実施形態では、本発明は、M5サブタイプの急性単球性白血病細胞を含む標的細胞株または標的細胞株の組み合わせを含む組成物を含む。ある実施形態では、本発明は、Raji B2M細胞を含む、Raji細胞またはその誘導体、バリアント、修飾、もしくは子孫を含む標的細胞株または標的細胞株の組み合わせを含む組成物を含む。ある実施形態では、本発明は、Thp1細胞またはその誘導体、バリアント、修飾、もしくは子孫を含む標的細胞株または標的細胞株の組み合わせを含む組成物であって、殺傷アッセイに好適な遺伝子修飾Thp1細胞を含む組成物を含む。ある実施形態では、本発明は、Ramos細胞またはその誘導体、バリアント、修飾、もしくは子孫を含む標的細胞株または標的細胞株の組み合わせを含む組成物であって、殺傷アッセイに好適な遺伝子修飾Ramos細胞を含む組成物を含む。ある実施形態では、本発明は、U937細胞またはその誘導体、バリアント、修飾、もしくは子孫を含む標的細胞株または標的細胞株の組み合わせを含む組成物であって、殺傷アッセイに好適な遺伝子修飾U937細胞を含む組成物を含む。ある実施形態では、本発明は、Daudi細胞またはその誘導体、バリアント、修飾、もしくは子孫を含む標的細胞株または標的細胞株の組み合わせを含む組成物であって、殺傷アッセイに好適な遺伝子修飾Daudi細胞を含む組成物を含む。ある実施形態では、本発明は、メラノサイト細胞を含む標的細胞株または標的細胞株の組み合わせを含む組成物を含む。ある実施形態では、本発明は、HLA-A-02陽性メラノサイト細胞を含む標的細胞株または標的細胞株の組み合わせを含む組成物を含む。ある実施形態では、本発明は、黒色腫細胞を含む標的細胞株または標的細胞株の組み合わせを含む組成物を含む。ある実施形態では、本発明は、HLA-A-02陽性黒色腫細胞を含む標的細胞株または標的細胞株の組み合わせを含む組成物を含む。ある実施形態では、本発明は、Sk-MEL-5、Malme-3M、SK-MEL-28、SK-MEL-3、SH-4、SK-MEL-24、RPMI-7951、SK-MEL-1、A375、G-361、及びそれらの組み合わせからなる群から選択される黒色腫細胞を含む、標的細胞株または標的細胞株の組み合わせを含む組成物含む。
ある実施形態では、本発明は、培地、標的細胞、及びHLA-I遮断抗体を含む組成物を含む。ある実施形態では、本発明は、培地、標的細胞、及びHLA-II遮断抗体を含む組成物を含む。ある実施形態では、本発明は、培地、標的細胞、HLA-I遮断抗体、及びHLA-II遮断抗体を含む組成物を含む。ある実施形態では、本発明は、培地、IL-2、標的細胞、及びHLA-I遮断抗体を含む組成物を含む。ある実施形態では、本発明は、培地、IL-2、標的細胞、及びHLA-II遮断抗体を含む組成物を含む。ある実施形態では、本発明は、培地、IL-2、標的細胞、HLA-I遮断抗体、及びHLA-II遮断抗体を含む組成物を含む。前述の実施形態のうちのいずれにおいても、組成物は、分泌サイトカインをさらに含み、そのレベルは、HLA-I及び/またはHLA-II遮断抗体の存在なしで取得されたレベルと比較され得る。前述の実施形態のうちのいずれにおいても、HLA-I遮断抗体は、1μg/mL~50μg/mLの濃度で存在する。前述の実施形態のうちのいずれにおいても、HLA-I遮断抗体は、5μg/mL~20μg/mLの濃度で存在する。前述の実施形態のうちのいずれにおいても、HLA-II遮断抗体は、1μg/mL~50μg/mLの濃度で存在する。前述の実施形態のうちのいずれにおいても、HLA-II遮断抗体は、5μg/mL~20μg/mLの濃度で存在する。
いくつかの実施形態では、本明細書に記載の効力アッセイを使用して、米国特許出願公開第US2018/0282694A1号、同第US2020/0224161A1号、及び同第US2020/0277573A1号、国際特許出願公開第WO2019/210131A1号、同第WO2019/136456A1号、同第WO2019/145711A1号、同第WO2019/210131A1号、同第WO2020/152451A1号、及び同第WO2021/123832A1号、ならびに米国特許第10,130,659号、同第10,166,257号、同第10,272,113号、同第10,363,273号、同第10,398,734号、同第10,420,799号、同第10,463,697号、同第10,537,595号、同第10,646,517号、同第10,653,723号、同第10,693,330号、同第10,695,372号、同第10,894,063号、同第10,905,718号、及び同第10,918,666号(これらの各々の開示は参照により本明細書に組み込まれる)に記載される、TIL組成物、MIL組成物、及びPBL組成物を含む、T細胞組成物の効力を決定することができる。
前述の実施形態のうちのいくつかでは、効力アッセイのための標的細胞は、ワーキングセルバンクとして調製される。前述の実施形態のうちのいくつかでは、効力アッセイのための標的細胞は、マスターセルバンクとして調製される。
C.アッセイキット
ある実施形態では、本発明は、TIL製品、MIL製品、またはPBL製品などのTILの効力を試験するためのキットを含む。いくつかの実施形態では、キットは、本明細書に記載の標的細胞を含む。ある実施形態では、キットは、Raji細胞、Thp1細胞、Ramos細胞、U937細胞、Daudi細胞、それらの組み合わせ、またはそれらの誘導体、バリアント、修飾、もしくは子孫を含む。いくつかの実施形態では、キットは、本明細書に記載の陰性対照細胞を含む。ある実施形態では、キットは、K562細胞またはその誘導体、バリアント、修飾、もしくは子孫を含む。いくつかの実施形態では、キットは、培地、イムノアッセイ試薬、ELISAまたは自動ELISAシステム、分泌タンパク質を含む上清液、PBMC、本明細書に記載の陽性対照、または他の試験成分を含む。
いくつかの実施形態では、本発明は、TIL製品、MIL製品またはPBL製品などのTILの効力を試験するためのキットを含み、このキットは、1~3つの標的細胞、培地、及び共培養容器を含む。いくつかの実施形態では、1~3つの標的細胞は、Raji細胞、Thp1細胞、Ramos細胞、U937細胞、Daudi細胞、ならびにそれらの組み合わせ、誘導体、バリアント、修飾、及び子孫からなる群から選択される。いくつかの実施形態では、培地は、AIM-V培地を含む。いくつかの実施形態では、培地は、IL-2を含む。
いくつかの実施形態では、キットは、単球標的細胞株を含む。いくつかの実施形態では、キットは、骨髄系標的細胞株を含む。いくつかの実施形態では、キットは、B細胞標的細胞株を含む。いくつかの実施形態では、キットは、B細胞リンパ芽細胞標的細胞株を含む。いくつかの実施形態では、キットは、バーキットリンパ腫細胞標的細胞株を含む。いくつかの実施形態では、キットは、急性単球性白血病細胞標的細胞株を含む。いくつかの実施形態では、キットは、M5-サブタイプの急性単球性白血病細胞株を含む。
ある実施形態では、キットの先行実施形態のうちのいずれかは、照射された標的細胞を含む。ある実施形態では、キットの先行実施形態のうちのいずれかは、照射されていない標的細胞を含む。ある実施形態では、キットの先行実施形態のうちのいずれかは、照射された陰性対照細胞を含む。ある実施形態では、キットの先行実施形態のうちのいずれかは、照射されていない陰性対照細胞を含む。ある実施形態では、キットの先行実施形態のうちのいずれかは、照射されていないK562陰性対照細胞を含む。ある実施形態では、キットの先行実施形態のうちのいずれかは、照射されたK562陰性対照細胞を含む。
TIL、MIL、及びPBLを含むT細胞の効力または機能性をアッセイするために提案される方法の例示的な実施形態は、本明細書に含まれる実施例及び図面に見出すこともできる。
前述の実施形態のうちのいずれにおいても、キットはまた、HLA-I遮断抗体を含む。前述の実施形態のうちのいずれにおいても、キットはまた、HLA-II遮断抗体を含む。
前述の実施形態のうちのいずれにおいても、キットはまた、陽性対照TIL細胞株を含む。好適な陽性対照TIL細胞株としては、十分に特徴付けられ、大細胞数に拡大され、本発明の効力アッセイで再現可能に応答することが示され、後で使用するために凍結条件下で慎重に保管されたものが挙げられる。
IV.Gen2 TIL製造プロセス
これらの特徴のうちのいくつかを含む、Gen2として知られる(プロセス2Aとしても知られる)TILプロセスの例示的なファミリーが、図1及び2に示される。Gen2の実施形態を図2に示す。プロセス1Cに対する本発明のこの実施形態の利点のうちのいくつかは、参照により本明細書に組み込まれる、国際特許公開第WO2018/081473A1号に記載されている。
本明細書で考察されるように、本発明は、患者への移植前に凍結保存されたTILを再刺激して、それらの代謝活性、ひいては相対的健康を向上させることに関するステップ、及び当該代謝健康を試験する方法を含み得る。本明細書で一般に概説されるように、TILは、一般に、患者試料から採取され、患者への移植前にそれらの数を拡張するように操作される。いくつかの実施形態では、TILは、以下で考察されるように、任意で遺伝子操作され得る。
いくつかの実施形態では、TILは、凍結保存され得る。解凍した時点で、それらが再刺激されて、患者への注入前に代謝を高めることができる。
いくつかの実施形態では、以下ならびに実施例及び図で詳細に考察されるように、第1の拡張(REP前と称されるプロセス、ならびに図1にステップAとして示されるプロセスを含む)は、3~14日に短縮され、第2の拡張(REPと称されるプロセス、ならびに図1にステップBとして示されるプロセスを含む)は、7~14日に短縮される。いくつかの実施形態では、第1の拡張(例えば、図1にステップBとして記載される拡張)は、11日に短縮され、第2の拡張(例えば、図1にステップDとして記載される拡張)は、11日に短縮される。いくつかの実施形態では、以下ならびに実施例及び図で詳細に考察されるように、第1の拡張と第2の拡張との組み合わせ(例えば、図1にステップB及びステップDとして記載される拡張)は、22日に短縮される。
以下の「ステップ」表記A、B、Cなどは、図1を参照し、本明細書に記載のある特定の実施形態を参照する。以下及び図1におけるステップの順序は例示であり、ステップの任意の組み合わせまたは順序、ならびに追加のステップ、ステップの繰り返し、及び/またはステップの省略は、本出願及び本明細書に開示される方法によって企図される。
A.ステップA:患者の腫瘍試料を取得する
一般に、TILは、最初に患者の腫瘍試料から取得され(「一次TIL」)、次いで本明細書に記載されるさらなる操作のためにより大きな集団に拡張され、任意選択で凍結保存され、本明細書に概説されるように再刺激され、任意選択でTIL健康の指標として表現型及び代謝パラメータについて評価される。
患者の腫瘍試料は、一般に外科的切除、針生検、コア生検、小生検、または腫瘍細胞とTIL細胞との混合物を含有する試料を取得するための他の手段を介して、当該技術分野で知られている方法を使用して取得することができる。いくつかの実施形態では、多病変サンプリングが使用される。いくつかの実施形態では、外科的切除、針生検、コア生検、小生検、または腫瘍細胞とTIL細胞との混合物を含有する試料を取得するための他の手段は、多病変サンプリングを含む(すなわち、患者の1つ以上の腫瘍引用及び/または場所、ならびに同じ場所または近接した1つ以上の腫瘍から試料を取得する)。一般に、腫瘍試料は、原発腫瘍、浸潤性腫瘍、または転移性腫瘍を含む、任意の固形腫瘍に由来し得る。腫瘍試料は、血液系悪性腫瘍から取得された腫瘍などの液体腫瘍であり得る。固形腫瘍は、皮膚組織のものであり得る。いくつかの実施形態では、有用なTILは、黒色腫から取得される。
取得された時点で、腫瘍試料は、一般に、鋭的解剖を使用して1~約8mmの小片に断片化され、約2~3mmが特に有用である。TILは、酵素腫瘍消化物を使用してこれらの断片から培養される。かかる腫瘍消化物は、酵素培地(例えば、Roswell Park Memorial Institute(RPMI)1640緩衝液、2mMグルタメート、10mcg/mLゲンタマイシン、30単位/mL DNase、及び1.0mg/mLコラゲナーゼ)中でのインキュベーション、続いて、機械的解離(例えば、組織解離機を使用する)によって産生され得る。腫瘍消化物は、腫瘍を酵素培地に入れ、腫瘍をおよそ1分間機械的に解離させ、続いて5% CO中37℃で30分間インキュベートし、続いて小さな組織片のみが存在するまで、前述の条件下で機械的解離及びインキュベーションのサイクルを繰り返すことによって産生することができる。このプロセスの最後に、細胞懸濁液中に多数の赤血球または死細胞が含まれている場合、FICOLL分岐親水性多糖類を使用した密度勾配分離が行われて、これらの細胞を除去することができる。米国特許出願公開第2012/0244133A1号(その開示は参照により本明細書に組み込まれる)に記載されているものなどの当該技術分野で知られている代替の方法を使用することができる。前述の方法のうちのいずれかが、TILを拡張する方法またはがんを治療する方法について本明細書に記載される実施形態のうちのいずれかにおいて使用され得る。いくつかの実施形態では、腫瘍は、方法に従って、または国際特許公開第WO2021/123832A1号(その開示は参照により本明細書に組み込まれる)に記載される組成物の形態で消化される。
上に示されるように、いくつかの実施形態では、TILは、固形腫瘍に由来する。いくつかの実施形態では、固形腫瘍は、断片化されない。いくつかの実施形態では、固形腫瘍は断片化されず、全腫瘍として酵素消化に供される。いくつかの実施形態では、腫瘍は、コラゲナーゼ、DNase、及びヒアルロニダーゼを含む酵素混合物中で消化される。いくつかの実施形態では、腫瘍は、コラゲナーゼ、DNase、及びヒアルロニダーゼを含む酵素混合物中で1~2時間消化される。いくつかの実施形態では、腫瘍は、コラゲナーゼ、DNase、及びヒアルロニダーゼを含む酵素混合物中で1~2時間、37℃、5%COで消化される。いくつかの実施形態では、腫瘍は、コラゲナーゼ、DNase、及びヒアルロニダーゼを含む酵素混合物中で1~2時間、37℃、5%COで回転を伴って消化される。いくつかの実施形態では、腫瘍は、一定の回転を伴って一晩消化される。いくつかの実施形態では、腫瘍は、37℃、5%COで一定の回転を伴って一晩消化される。いくつかの実施形態では、全腫瘍が酵素と組み合わされて、腫瘍消化反応混合物が形成される。
いくつかの実施形態では、腫瘍は、滅菌緩衝液中の凍結乾燥酵素で再構成される。いくつかの実施形態では、緩衝液は、滅菌HBSSである。
いくつかの実施形態では、酵素混合物は、コラゲナーゼを含む。いくつかの実施形態では、コラゲナーゼは、コラゲナーゼIVである。いくつかの実施形態では、コラゲナーゼの作用ストックは、100mg/mLの10倍作用ストックである。
いくつかの実施形態では、酵素混合物は、DNAseを含む。いくつかの実施形態では、DNAseの作用ストックは、10,000IU/mLの10倍作用ストックである。
いくつかの実施形態では、酵素混合物は、ヒアルロニダーゼを含む。いくつかの実施形態では、ヒアルロニダーゼの作用ストックは、10mg/mLの10倍作用ストックである。
いくつかの実施形態では、酵素混合物は、10mg/mLのコラゲナーゼ、1000IU/mLのDNAse、及び1mg/mLのヒアルロニダーゼを含む。
いくつかの実施形態では、酵素混合物は、10mg/mLのコラゲナーゼ、500IU/mLのDNAse、及び1mg/mLのヒアルロニダーゼを含む。
一般に、採取された細胞懸濁液は、「一次細胞集団」または「新たに採取された」細胞集団と呼ばれる。
いくつかの実施形態では、断片化は、例えば、解剖及び消化を含む物理的断片化を含む。いくつかの実施形態では、断片化は、物理的断片化である。いくつかの実施形態では、断片化は、解剖である。いくつかの実施形態では、断片化は、消化によるものである。いくつかの実施形態では、TILは、最初に、患者から取得された酵素腫瘍消化物及び腫瘍断片から培養され得る。ある実施形態では、TILは、最初に、患者から得られた酵素腫瘍消化物及び腫瘍断片から培養され得る。
腫瘍が固形腫瘍であるいくつかの実施形態では、腫瘍試料が、例えば、ステップA(図1に提供される)で取得された後、腫瘍は物理的断片化を受ける。いくつかの実施形態では、断片化は、凍結保存前に起こる。いくつかの実施形態では、断片化は、凍結保存後に起こる。いくつかの実施形態では、断片化は、腫瘍を得た後に、いずれの凍結保存もない場合に起こる。いくつかの実施形態では、腫瘍は断片化され、10、20、30、40個またはそれ以上の断片または小片が、第1の拡張のために各容器内に配置される。いくつかの実施形態では、腫瘍は断片化され、30または40個の断片または小片が、第1の拡張のために各容器内に配置される。いくつかの実施形態では、腫瘍は断片化され、40個の断片または小片が、第1の拡張のために各容器内に配置される。いくつかの実施形態では、複数の断片は、約4~約50個の断片を含み、各断片は、約27mmの体積を有する。いくつかの実施形態では、複数の断片は、約1300mm~約1500mmの総体積を伴う約30~約60個の断片を含む。いくつかの実施形態では、複数の断片は、約1350mmの総体積を伴う約50個の断片を含む。いくつかの実施形態では、複数の断片は、約1グラム~約1.5グラムの総質量を伴う約50個の断片を含む。いくつかの実施形態では、複数の断片は、約4個の断片を含む。
いくつかの実施形態では、TILは、腫瘍断片から取得される。いくつかの実施形態では、腫瘍断片は、鋭的解剖によって取得される。いくつかの実施形態では、腫瘍断片は、約1mm~10mmである。いくつかの実施形態では、腫瘍断片は、約1mm~8mmである。いくつかの実施形態では、腫瘍断片は、約1mmである。いくつかの実施形態では、腫瘍断片は、約2mmである。いくつかの実施形態では、腫瘍断片は、約3mmである。いくつかの実施形態では、腫瘍断片は、約4mmである。いくつかの実施形態では、腫瘍断片は、約5mmである。いくつかの実施形態では、腫瘍断片は、約6mmである。いくつかの実施形態では、腫瘍断片は、約7mmである。いくつかの実施形態では、腫瘍断片は、約8mmである。いくつかの実施形態では、腫瘍断片は、約9mmである。いくつかの実施形態では、腫瘍断片は、約10mmである。いくつかの実施形態では、腫瘍は、1~4mm×1~4mm×1~4mmである。いくつかの実施形態では、腫瘍は、1mm×1mm×1mmである。いくつかの実施形態では、腫瘍は、2mm×2mm×2mmである。いくつかの実施形態では、腫瘍は、3mm×3mm×3mmである。いくつかの実施形態では、腫瘍は、4mm×4mm×4mmである。
いくつかの実施形態では、腫瘍は、各小片上の出血性、壊死性、及び/または脂肪性組織の量を最小化するために切除される。いくつかの実施形態では、腫瘍は、各小片上の出血性組織の量を最小化するために切除される。いくつかの実施形態では、腫瘍は、各小片上の壊死性組織の量を最小化するために切除される。いくつかの実施形態では、腫瘍は、各小片上の脂肪性組織の量を最小化するために切除される。
いくつかの実施形態では、腫瘍の断片化は、腫瘍の内部構造を維持するために行われる。いくつかの実施形態では、腫瘍の断片化は、メスでのこ引き動作を行うことなく行われる。いくつかの実施形態では、TILは、腫瘍消化物から取得される。いくつかの実施形態では、腫瘍消化物は、例えば、RPMI1640(2mM GlutaMAX、10mg/mLゲンタマイシン、30U/mL DNase、及び1.0mg/mLコラゲナーゼ)であるが、これに限定されない酵素培地中でのインキュベーション、続いて、機械的解離(GentleMACS,Miltenyi Biotec,Auburn,CA)によって生成された。腫瘍を酵素培地に入れた後、腫瘍は、およそ1分間機械的に解離され得る。その後、溶液が5%CO中37℃で30分間インキュベートされ、その後、およそ1分間再び機械的に破壊され得る。5% CO中37℃で30分間再びインキュベートした後、腫瘍を、およそ1分間、3回目に機械的に破壊することができる。いくつかの実施形態では、大きい組織片が存在する場合、3回目の機械的破壊後、5%CO中37℃でさらに30分間インキュベートするかにかかわらず、1回または2回の追加の機械的解離が試料に適用された。いくつかの実施形態では、細胞懸濁液が多数の赤血球または死細胞を含む場合、最終インキュベーションの終わりに、Ficollを使用した密度勾配分離が行われて、これらの細胞を除去することができる。
いくつかの実施形態では、第1の拡張ステップの前に採取された細胞懸濁液は、「一次細胞集団」または「新たに採取された」細胞集団と呼ばれる。
いくつかの実施形態では、細胞は、試料採取後に任意選択で凍結され、ステップBに記載される拡張に入る前に凍結保存され得、これは、以下でさらに詳細に説明され、図1及び図8にも例示される。
1.胸水TIL
いくつかの実施形態では、試料は、胸腔内液試料である。いくつかの実施形態では、本明細書に記載のプロセスによる拡張のためのTILの供給源は、胸腔内液試料である。いくつかの実施形態では、試料は、胸水由来試料である。いくつかの実施形態では、本明細書に記載のプロセスによる拡張のためのTILの供給源は、胸水由来試料である。例えば、米国特許公開第2014/0295426号に記載されている方法を参照されたく、これはすべての目的のためにその全体が参照により本明細書に組み込まれる。
いくつかの実施形態では、TILと思われる、及び/またはTILを含む任意の胸腔内液または胸水を利用することができる。かかる試料は、NSCLCもしくはSCLCなどの原発性または転移性肺癌に由来し得る。いくつかの実施形態では、試料は、別の臓器、例えば、乳房、卵巣、結腸、または前立腺に由来する二次転移性がん細胞であり得る。いくつかの実施形態では、本明細書に記載の拡張方法で使用する試料は、胸膜浸出液である。いくつかの実施形態では、本明細書に記載の拡張方法で使用する試料は、胸膜漏出液である。他の生体試料は、例えば、腹部からの腹水または膵嚢胞液を含む、TILを含有する他の漿液を含み得る。腹水及び胸腔内液は、非常に類似した化学系を伴い、腹部及び肺の両方が、悪性腫瘍における同じ物質の胸膜空間及び腹部空間に中皮線及び流体形態を有し、いくつかの実施形態では、かかる流体は、TILを含有する。本開示が胸水を例示するいくつかの実施形態では、同じ方法が、胸腔内液またはTILを含有する他の嚢胞液を使用して同様の結果で実行されてもよい。
いくつかの実施形態では、胸腔内液は、患者から直接除去された未処理の形態である。いくつかの実施形態では、未処理の胸腔内液は、接触ステップの前に、EDTAまたはヘパリンチューブなどの標準的な採血管に入れられる。いくつかの実施形態では、未処理の胸腔内液は、接触ステップの前に、標準的なCellSave(登録商標)チューブ(Veridex)に入れられる。いくつかの実施形態では、試料は、生存TILの数の減少を避けるために、患者から採取した直後にCellSaveチューブに入れられる。生存TILの数は、4℃であっても、未処理の胸腔内液中に放置されると、24時間以内に大幅に減少する可能性がある。いくつかの実施形態では、試料は、患者からの除去後1時間、5時間、10時間、15時間、または最大24時間以内に適切な収集チューブ内に入れられる。いくつかの実施形態では、試料は、4℃で、患者からの除去後1時間、5時間、10時間、15時間、または最大24時間以内に適切な収集チューブ内に入れられる。
いくつかの実施形態では、選択された対象からの胸腔内液試料は、希釈され得る。一実施形態では、希釈は、胸腔内液対希釈剤が1:10である。別の実施形態では、希釈は、胸腔内液対希釈剤が1:9である。別の実施形態では、希釈は、胸腔内液対希釈剤が1:8である。別の実施形態では、希釈は、胸腔内液対希釈剤が1:5である。別の実施形態では、希釈は、胸腔内液対希釈剤が1:2である。別の実施形態では、希釈は、胸腔内液対希釈剤が1:1である。いくつかの実施形態では、希釈剤には、生理食塩水、リン酸緩衝生理食塩水、別の緩衝液、または生理学的に許容される希釈剤が含まれる。いくつかの実施形態では、試料は、患者からの収集及び希釈の直後にCellSaveチューブ内に入れられ、生存TILの減少を回避し、これは、4℃であっても、未処理の胸腔内液中に放置された場合、24~48時間以内に有意に生じ得る。いくつかの実施形態では、胸腔内液試料は、患者からの除去及び希釈後1時間、5時間、10時間、15時間、24時間、36時間、最大48時間以内に適切な収集チューブ内に入れられる。いくつかの実施形態では、胸腔内液試料は、4℃で、患者からの除去及び希釈後1時間、5時間、10時間、15時間、24時間、36時間、最大48時間以内に適切な収集チューブ内に入れられる。
さらに別の実施形態では、胸腔内液試料は、さらなる処理ステップの前に、従来の手段によって濃縮される。いくつかの実施形態では、胸腔内液のこの前処理は、方法を実施する実験室への輸送のために、またはその後の分析のために(例えば、採取後24~48時間より後に)胸水を凍結保存しなければならない状況において好ましい。いくつかの実施形態では、胸腔内液試料は、それが対象から採取された後に胸腔内液試料を遠心分離し、遠心分離物またはペレットを緩衝液中に再懸濁することによって調製される。いくつかの実施形態では、胸腔内液試料は、輸送または後の分析及び/または処理のために凍結保存される前に、複数の遠心分離及び再懸濁に供される。
いくつかの実施形態では、胸腔内液試料は、濾過法を使用することによって、さらなる処理ステップの前に濃縮される。いくつかの実施形態では、接触ステップで使用される胸腔内液試料は、胸腔内液が膜を通過することを可能にするが腫瘍細胞を保持する、既知で本質的に均一な孔径を含むフィルターをとおして流体を濾過することによって調製される。いくつかの実施形態では、膜の細孔の直径は、少なくとも4μMであり得る。別の実施形態では、細孔直径は、5μM以上であり得、他の実施形態では、6、7、8、9、または10μMのうちのいずれかであり得る。濾過後、膜によって保持されたTILを含む細胞を、膜から適切な生理学的に許容される緩衝液にすすいでもよい。次いで、このように濃縮されたTILを含む細胞は、方法の接触ステップで使用することができる。
いくつかの実施形態では、胸腔内液試料(例えば、未処理の胸腔内液を含む)、希釈胸腔内液、または再懸濁細胞ペレットは、試料中に存在する無核赤血球を特異的に溶解する溶解試薬と接触させる。いくつかの実施形態では、このステップは、胸腔内液がかなりの数のRBCを含む状況で、さらなる処理ステップの前に行われる。好適な溶解試薬には、単一の溶解試薬もしくは溶解試薬及びクエンチ試薬、または溶解剤、クエンチ試薬及び固定試薬が含まれる。好適な溶解システムは市販されており、BD Pharm Lyse(商標)システム(Becton Dickenson)が含まれる。他の溶解システムには、Versalyse(商標)システム、FACSlyse(商標)システム(Becton Dickenson)、Immunoprep(商標)システム、またはErythrolyse IIシステム(Beckman Coulter,Inc.)、または塩化アンモニウムシステムが含まれる。いくつかの実施形態では、溶解試薬は、赤血球の効率的な溶解、ならびに胸水におけるTIL及びTILの表現型特性の保存のような主要な要件によって異なり得る。溶解のための単一の試薬を利用することに加えて、本明細書に記載の方法に有用な溶解システムは、第2の試薬、例えば、方法の残りのステップ中に溶解試薬の効果をクエンチまたは遅延させるもの、例えばStabilyse(商標)試薬(Beckman Coulter,Inc.)を含むことができる。溶解試薬の選択または方法の好ましい実施に応じて、従来の固定試薬を使用することもできる。
いくつかの実施形態では、本明細書に記載されるように、未処理、希釈または多重遠心分離または処理された胸腔内液試料は、本明細書で提供されるようにさらに処理及び/または拡張される前に、約-140℃の温度で凍結保存される。
B.ステップB:第1の拡張
いくつかの実施形態では、本方法は、対象/患者への投与時に複製サイクルを増加させることができ、したがって、より古いTIL(すなわち、対象/患者への投与前により多くの複製ラウンドをさらに受けたTIL)よりも追加の治療的利益を提供し得る、若いTILを得ることを提供する。若いTILの特徴は、文献、例えば、Donia,at al.,Scandinavian Journal of Immunology,75:157-167(2012)、Dudley et al.,Clin Cancer Res,16:6122-6131(2010)、Huang et al.,J Immunother,28(3):258-267(2005)、Besser et al.,Clin Cancer Res,19(17):OF1-OF9(2013)、Besser et al.,J Immunother 32:415-423(2009)、Robbins,et al.,J Immunol 2004;173:7125-7130、Shen et al.,J Immunother,30:123-129(2007)、Zhou,et al.,J Immunother,28:53-62(2005)、及びTran,et al.,J Immunother,31:742-751(2008)に記載されており、これらはすべて、参照によりそれらの全体が本明細書に組み込まれる。
Tリンパ球及びBリンパ球の多様な抗原受容体は、限られた数であるが、多数の遺伝子セグメントの体細胞組換えによって産生される。これらの遺伝子セグメント:V(可変)、D(多様性)、J(接合)、及びC(一定)は、免疫グロブリン及びT細胞受容体(TCR)の結合特異性及び下流での適用を決定する。本発明は、T細胞レパートリー多様性を示し、かつ増加させるTILを生成するための方法を提供する。いくつかの実施形態では、本方法によって取得されたTILは、T細胞レパートリー多様性の増加を示す。いくつかの実施形態では、本方法によって取得されたTILは、新たに採取されたTIL及び/または例えば、図1に具体化されるもの以外の方法を含む、本明細書で提供されるもの以外の方法を使用して調製されたTILと比較して、T細胞レパートリー多様性の増加を示す。いくつかの実施形態では、本方法によって取得されたTILは、新たに採取されたTIL及び/または図5及び/または図6に例示されるようにプロセス1Cと称される方法を使用して調製されたTILと比較して、T細胞レパートリー多様性の増加を示す。いくつかの実施形態では、第1の拡張で取得されたTILは、T細胞レパートリー多様性の増加を示す。いくつかの実施形態では、多様性の増加は、免疫グロブリン多様性及び/またはT細胞受容体多様性の増加である。いくつかの実施形態では、多様性は、免疫グロブリンにあり、免疫グロブリン重鎖にある。いくつかの実施形態では、多様性は、免疫グロブリンにあり、免疫グロブリン軽鎖にある。いくつかの実施形態では、多様性は、T細胞受容体にある。いくつかの実施形態では、多様性は、アルファ、ベータ、ガンマ、及びデルタ受容体からなる群から選択されるT細胞受容体のうちの1つにある。いくつかの実施形態では、T細胞受容体(TCR)アルファ及び/またはベータの発現が増加する。いくつかの実施形態では、T細胞受容体(TCR)アルファの発現が増加する。いくつかの実施形態では、T細胞受容体(TCR)ベータの発現が増加する。いくつかの実施形態では、TCRab(すなわち、TCRα/β)の発現が増加する。
例えば、図1のステップAに記載されるものなどの腫瘍断片の解剖または消化後に、結果として得られた細胞は、腫瘍及び他の細胞よりもTILの成長を好む条件下で、IL-2を含む血清中で培養される。いくつかの実施形態では、腫瘍消化物は、6000IU/mLのIL-2を有する不活性化ヒトAB血清を含む培地中2mLのウェル中でインキュベートされる。この一次細胞集団は、数日間、一般に3~14日間培養され、その結果、バルクTIL集団、一般に約1×10バルクTIL細胞を生じる。いくつかの実施形態では、この一次細胞集団は、7~14日間培養され、その結果、バルクTIL集団、一般に約1×10バルクTIL細胞を生じる。いくつかの実施形態では、この一次細胞集団は、10~14日間培養され、その結果、バルクTIL集団、一般に約1×10バルクTIL細胞を生じる。いくつかの実施形態では、この一次細胞集団は、約11日間培養され、その結果、バルクTIL集団、一般に約1×10バルクTIL細胞を生じる。
好ましい実施形態では、TILの拡張は、以下及び本明細書に記載の初期バルクTIL拡張ステップ(例えば、REP前と称されるプロセスを含み得る、図1のステップBに記載のものなど)、続いて以下のステップD及び本明細書に記載の第2の拡張(ステップD、急速拡張プロトコル(REP)ステップと称されるプロセスを含む)、続いて任意の凍結保存、続いて以下及び本明細書に記載の第2のステップD(再刺激REPステップと称されるプロセスを含む)を使用して行われ得る。このプロセスから取得されたTILは、本明細書に記載の表現型特徴及び代謝パラメータについて任意で特徴付けられ得る。
TIL培養物が24ウェルプレートで開始される実施形態では、例えば、Costar 24ウェル細胞培養クラスター、平底(Corning Incorporated,Corning,NY)を使用して、IL-2(6000IU/mL、Chiron Corp.,Emeryville,CA)を含む2mLの完全培地(CM)中の1×10個の腫瘍消化細胞または1つの腫瘍断片を、各ウェルに播種することができる。いくつかの実施形態では、腫瘍断片は、約1mm~10mmである。
いくつかの実施形態では、第1の拡張培養培地は、培養培地の略語である「CM」と称される。いくつかの実施形態では、ステップBのCMは、10%ヒトAB血清、25mM Hepes、及び10mg/mLゲンタマイシンを補充した、GlutaMAXを含むRPMI 1640からなる。培養物が40mL容量及び10cmガス透過性シリコン底部(例えば、G-Rex 10、Wilson Wolf Manufacturing,New Brighton,MN)を有するガス透過性フラスコ内で開始される実施形態では、各フラスコに、IL-2を含む10~40mLのCM中の10~40×10個の生きた腫瘍消化細胞または5~30個の腫瘍断片を装填した。G-Rex 10及び24ウェルプレートの両方を、5% CO中37℃の加湿インキュベーター内でインキュベートし、培養開始から5日後、培地の半分を取り除き、新たなCM及びIL-2と交換し、5日目の後に培地の半分を2~3日毎に交換した。
腫瘍断片の調製後、結果として得られた細胞(すなわち、断片)は、腫瘍及び他の細胞よりもTILの成長を好む条件下で、IL-2を含む血清中で培養される。いくつかの実施形態では、腫瘍消化物は、6000IU/mLのIL-2を有する不活性化ヒトAB血清を含む培地中2mLのウェル中(または、いくつかの事例では、本明細書で概説されるように、aAPC細胞集団の存在下)でインキュベートされる。この一次細胞集団は、数日間、一般に10~14日間培養され、その結果、バルクTIL集団、一般に約1×10個のバルクTIL細胞を生じる。いくつかの実施形態では、第1の拡張中の成長培地は、IL-2またはそのバリアントを含む。いくつかの実施形態では、ILは、組換えヒトIL-2(rhIL-2)である。いくつかの実施形態では、IL-2ストック溶液は、1mgバイアルにつき20~30×10IU/mgの比活性を有する。いくつかの実施形態では、IL-2ストック溶液は、1mgバイアルにつき20×10IU/mgの比活性を有する。いくつかの実施形態では、IL-2ストック溶液は、1mgバイアルにつき25×10IU/mgの比活性を有する。いくつかの実施形態では、IL-2ストック溶液は、1mgバイアルにつき30×10IU/mgの比活性を有する。いくつかの実施形態では、IL-2ストック溶液は、4~8×10IU/mgのIL-2の最終濃度を有する。いくつかの実施形態では、IL-2ストック溶液は、5~7×10IU/mgのIL-2の最終濃度を有する。いくつかの実施形態では、IL-2ストック溶液は、6×10IU/mgのIL-2の最終濃度を有する。いくつかの実施形態では、IL-2ストック溶液は、実施例5に記載されるように調製される。いくつかの実施形態では、第1の拡張培養培地は、約10,000IU/mLのIL-2、約9,000IU/mLのIL-2、約8,000IU/mLのIL-2、約7,000IU/mLのIL-2、約6000IU/mLのIL-2、または約5,000IU/mLのIL-2を含む。いくつかの実施形態では、第1の拡張培養培地は、約9,000IU/mLのIL-2~約5,000IU/mLのIL-2を含む。いくつかの実施形態では、第1の拡張培養培地は、約8,000IU/mLのIL-2~約6,000IU/mLのIL-2を含む。いくつかの実施形態では、第1の拡張培養培地は、約7,000IU/mLのIL-2~約6,000IU/mLのIL-2を含む。いくつかの実施形態では、第1の拡張培養培地は、約6,000IU/mLのIL-2を含む。ある実施形態では、細胞培養培地は、IL-2をさらに含む。いくつかの実施形態では、細胞培養培地は、約3000IU/mLのIL-2を含む。ある実施形態では、細胞培養培地は、IL-2をさらに含む。好ましい実施形態では、細胞培養培地は、約3000IU/mLのIL-2を含む。ある実施形態では、細胞培養培地は、約1000IU/mL、約1500IU/mL、約2000IU/mL、約2500IU/mL、約3000IU/mL、約3500IU/mL、約4000IU/mL、約4500IU/mL、約5000IU/mL、約5500IU/mL、約6000IU/mL、約6500IU/mL、約7000IU/mL、約7500IU/mL、または約8000IU/mLのIL-2を含む。ある実施形態では、細胞培養培地は、1000~2000IU/mL、2000~3000IU/mL、3000~4000IU/mL、4000~5000IU/mL、5000~6000IU/mL、6000~7000IU/mL、7000~8000IU/mL、または8000IU/mLのIL-2を含む。
いくつかの実施形態では、第1の拡張培養培地は、約500IU/mLのIL-15、約400IU/mLのIL-15、約300IU/mLのIL-15、約200IU/mLのIL-15、約180IU/mLのIL-15、約160IU/mLのIL-15、約140IU/mLのIL-15、約120IU/mLのIL-15、または約100IU/mLのIL-15を含む。いくつかの実施形態では、第1の拡張培養培地は、約500IU/mLのIL-15~約100IU/mLのIL-15を含む。いくつかの実施形態では、第1の拡張培養培地は、約400IU/mLのIL-15~約100IU/mLのIL-15を含む。いくつかの実施形態では、第1の拡張培養培地は、約300IU/mLのIL-15~約100IU/mLのIL-15を含む。いくつかの実施形態では、第1の拡張培養培地は、約200IU/mLのIL-15を含む。いくつかの実施形態では、細胞培養培地は、約180IU/mLのIL-15を含む。ある実施形態では、細胞培養培地は、IL-15をさらに含む。好ましい実施形態では、細胞培養培地は、約180IU/mLのIL-15を含む。
いくつかの実施形態では、第1の拡張培養培地は、約20IU/mLのIL-21、約15IU/mLのIL-21、約12IU/mLのIL-21、約10IU/mLのIL-21、約5IU/mLのIL-21、約4IU/mLのIL-21、約3IU/mLのIL-21、約2IU/mLのIL-21、約1IU/mLのIL-21、または約0.5IU/mLのIL-21を含む。いくつかの実施形態では、第1の拡張培養培地は、約20IU/mLのIL-21~約0.5IU/mLのIL-21を含む。いくつかの実施形態では、第1の拡張培養培地は、約15IU/mLのIL-21~約0.5IU/mLのIL-21を含む。いくつかの実施形態では、第1の拡張培養培地は、約12IU/mLのIL-21~約0.5IU/mLのIL-21を含む。いくつかの実施形態では、第1の拡張培養培地は、約10IU/mLのIL-21~約0.5IU/mLのIL-21を含む。いくつかの実施形態では、第1の拡張培養培地は、約5IU/mLのIL-21~約1IU/mLのIL-21を含む。いくつかの実施形態では、第1の拡張培養培地は、約2IU/mLのIL-21を含む。いくつかの実施形態では、細胞培養培地は、約1IU/mLのIL-21を含む。いくつかの実施形態では、細胞培養培地は、約0.5IU/mLのIL-21を含む。ある実施形態では、細胞培養培地は、IL-21をさらに含む。好ましい実施形態では、細胞培養培地は、約1IU/mLのIL-21を含む。
ある実施形態では、細胞培養培地は、OKT-3抗体を含む。いくつかの実施形態では、細胞培養培地は、約30ng/mLのOKT-3抗体を含む。ある実施形態では、細胞培養培地は、約0.1ng/mL、約0.5ng/mL、約1ng/mL、約2.5ng/mL、約5ng/mL、約7.5ng/mL、約10ng/mL、約15ng/mL、約20ng/mL、約25ng/mL、約30ng/mL、約35ng/mL、約40ng/mL、約50ng/mL、約60ng/mL、約70ng/mL、約80ng/mL、約90ng/mL、約100ng/mL、約200ng/mL、約500ng/mL、及び約1μg/mLのOKT-3抗体を含む。ある実施形態では、細胞培養培地は、0.1ng/mL~1ng/mL、1ng/mL~5ng/mL、5ng/mL~10ng/mL、10ng/mL~20ngの間、20ng/mL~30ng/mL、30ng/mL~40ng/mL、40ng/mL~50ng/mL、及び50ng/mL~100ng/mLのOKT-3抗体を含む。いくつかの実施形態では、細胞培養培地は、OKT-3抗体を含まない。いくつかの実施形態では、OKT-3抗体は、ムロモナブである。
いくつかの実施形態では、細胞培養培地は、細胞培養培地中に1つ以上のTNFRSFアゴニストを含む。いくつかの実施形態では、TNFRSFアゴニストは、4-1BBアゴニストを含む。いくつかの実施形態では、TNFRSFアゴニストは4-1BBアゴニストであり、4-1BBアゴニストは、ウレルマブ、ウトミルマブ、EU-101、融合タンパク質、ならびにそれらの断片、誘導体、バリアント、バイオシミラー、及び組み合わせからなる群から選択される。いくつかの実施形態では、TNFRSFアゴニストは、0.1μg/mL~100μg/mLの細胞培養培地中濃度を達成するのに十分な濃度で追加される。いくつかの実施形態では、TNFRSFアゴニストは、20μg/mL~40μg/mLの細胞培養培地中濃度を達成するのに十分な濃度で追加される。
いくつかの実施形態では、1つ以上のTNFRSFアゴニストに加えて、細胞培養培地は、IL-2を約3000IU/mLの初期濃度で、及びOKT-3を約30ng/mLの初期濃度でさらに含み、1つ以上のTNFRSFアゴニストが、4-1BBアゴニストを含む。
いくつかの実施形態では、第1の拡張培養培地は、培養培地の略語である「CM」と称される。いくつかの実施形態では、それは、CM1(培養培地1)と称される。いくつかの実施形態では、CMは、10%ヒトAB血清、25mM Hepes、及び10mg/mLゲンタマイシンを補充した、GlutaMAXを含むRPMI1640からなる。培養物が40mL容量及び10cmガス透過性シリコン底部(例えば、G-Rex 10、Wilson Wolf Manufacturing,New Brighton,MN)を有するガス透過性フラスコ内で開始される実施形態では、各フラスコに、IL-2を含む10~40mLのCM中の10~40×10個の生きた腫瘍消化細胞または5~30個の腫瘍断片を装填した。G-Rex 10及び24ウェルプレートの両方を、5% CO中37℃の加湿インキュベーター内でインキュベートし、培養開始から5日後、培地の半分を取り除き、新たなCM及びIL-2と交換し、5日目の後に培地の半分を2~3日毎に交換した。いくつかの実施形態では、CMは、実施例に記載されるCM1であり、実施例1を参照されたい。いくつかの実施形態では、第1の拡張は、初期細胞培養培地または第1の細胞培養培地中で起こる。いくつかの実施形態では、初期細胞培養培地または第1の細胞培養培地は、IL-2を含む。
いくつかの実施形態では、実施例及び図で考察されるように、第1の拡張(例えば、REP前と称されることもあるものを含み得る、図1のステップBに記載されるものなどのプロセスを含む)プロセスは、3~14日に短縮される。いくつかの実施形態では、実施例で考察され、かつ図4及び図5に示されるように、例えば、図1のステップBに記載される拡張も含む、第1の拡張(例えば、REP前と称されることもあるものを含み得る、図1のステップBに記載されるものなどのプロセスを含む)は、7~14日に短縮される。いくつかの実施形態では、ステップBの第1の拡張は、10~14日に短縮される。いくつかの実施形態では、第1の拡張は、例えば、図1のステップBに記載される拡張において考察されるように、11日に短縮される。
いくつかの実施形態では、第1のTIL拡張は、1日、2日、3日、4日、5日、6日、7日、8日、9日、10日、11日、12日、13日、または14日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第1のTIL拡張は、1日~14日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第1のTIL拡張は、2日~14日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第1のTIL拡張は、3日~14日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第1のTIL拡張は、4日~14日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第1のTIL拡張は、5日~14日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第1のTIL拡張は、6日~14日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第1のTIL拡張は、7日~14日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第1のTIL拡張は、8日~14日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第1のTIL拡張は、9日~14日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第1のTIL拡張は、10日~14日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第1のTIL拡張は、11日~14日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第1のTIL拡張は、12日~14日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第1のTIL拡張は、13日~14日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第1のTIL拡張は、14日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第1のTIL拡張は、1日~11日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第1のTIL拡張は、2日~11日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第1のTIL拡張は、3日~11日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第1のTIL拡張は、4日~11日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第1のTIL拡張は、5日~11日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第1のTIL拡張は、6日~11日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第1のTIL拡張は、7日~11日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第1のTIL拡張は、8日~11日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第1のTIL拡張は、9日~11日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第1のTIL拡張は、10日~11日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第1のTIL拡張は、11日間続行することができる。
いくつかの実施形態では、IL-2、IL-7、IL-15、及び/またはIL-21の組み合わせは、第1の拡張中に組み合わせとして用いられる。いくつかの実施形態では、IL-2、IL-7、IL-15、及び/またはIL-21、ならびにそれらの任意の組み合わせは、例えば、図1よる、かつ本明細書に記載されるステップBのプロセス中を含む、第1の拡張中に含まれ得る。いくつかの実施形態では、IL-2、IL-15、及びIL-21の組み合わせは、第1の拡張中に組み合わせとして用いられる。いくつかの実施形態では、IL-2、IL-15、及びIL-21、ならびにそれらの任意の組み合わせは、図1による、かつ本明細書に記載されるステップBのプロセス中に含まれ得る。
いくつかの実施形態では、実施例及び図で考察されるように、第1の拡張(REP前と称されるプロセスを含む、例えば、図1によるステップB)プロセスは、3~14日に短縮される。いくつかの実施形態では、ステップBの第1の拡張は、7~14日に短縮される。いくつかの実施形態では、ステップBの第1の拡張は、10~14日に短縮される。いくつかの実施形態では、第1の拡張は、11日に短縮される。
いくつかの実施形態では、第1の拡張、例えば、図1によるステップBは、閉鎖系バイオリアクター内で行われる。いくつかの実施形態では、本明細書に記載されるように、閉鎖系がTIL拡張のために用いられる。いくつかの実施形態では、単一のバイオリアクターが用いられる。いくつかの実施形態では、用いられる単一のバイオリアクターは、例えば、G-Rex 10またはG-Rex 100である。いくつかの実施形態では、閉鎖系バイオリアクターは、単一のバイオリアクターである。
C.ステップC:第1の拡張から第2の拡張へと移行
いくつかの事例では、例えば、図1に示されるステップBから取得されたTIL集団を含む、第1の拡張から取得されたバルクTIL集団は、以下で考察されるプロトコルを使用して、直ちに凍結保存され得る。あるいは、第2のTIL集団と称される第1の拡張から取得されたTIL集団は、以下で考察されるように、第2の拡張(REPと称されることもある拡張を含み得る)に供され、その後、凍結保存され得る。同様に、遺伝子修飾TILが治療に使用される場合、第1のTIL集団(バルクTIL集団と称されることもある)または第2のTIL集団(いくつかの実施形態では、REP TIL集団と称される集団を含み得る)は、拡張前または第1の拡張後及び第2の拡張前に、好適な治療のために遺伝子修飾に供され得る。
いくつかの実施形態では、第1の拡張から(例えば、図1に示されるステップBから)取得されたTILは、選択のために表現型決定されるまで保管される。いくつかの実施形態では、第1の拡張から(例えば、図1に示されるステップBから)取得されたTILは保管されず、第2の拡張に直接進む。いくつかの実施形態では、第1の拡張から取得されたTILは、第1の拡張後及び第2の拡張前に凍結保存されない。いくつかの実施形態では、第1の拡張から第2の拡張への移行は、断片化が起こってから約3日、4日、5日、6日、7日、8日、9日、10日、11日、12日、13日、または14日で起こる。いくつかの実施形態では、第1の拡張から第2の拡張への移行は、断片化が起こってから約3日~14日で起こる。いくつかの実施形態では、第1の拡張から第2の拡張への移行は、断片化が起こってから約4日~14日で起こる。いくつかの実施形態では、第1の拡張から第2の拡張への移行は、断片化が起こってから約4日~10日で起こる。いくつかの実施形態では、第1の拡張から第2の拡張への移行は、断片化が起こってから約7日~14日で起こる。いくつかの実施形態では、第1の拡張から第2の拡張への移行は、断片化が起こってから約14日で起こる。
いくつかの実施形態では、第1の拡張から第2の拡張への移行は、断片化が起こってから1日、2日、3日、4日、5日、6日、7日、8日、9日、10日、11日、12日、13日、または14日で起こる。いくつかの実施形態では、第1の拡張から第2の拡張への移行は、断片化が起こってから1日~14日で起こる。いくつかの実施形態では、第1のTIL拡張は、2日~14日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第1の拡張から第3の拡張への移行は、断片化が起こってから2日~14日で起こる。いくつかの実施形態では、第1の拡張から第4の拡張への移行は、断片化が起こってから2日~14日で起こる。いくつかの実施形態では、第1の拡張から第5の拡張への移行は、断片化が起こってから2日~14日で起こる。いくつかの実施形態では、第1の拡張から第6の拡張への移行は、断片化が起こってから2日~14日で起こる。いくつかの実施形態では、第1の拡張から第7の拡張への移行は、断片化が起こってから2日~14日で起こる。いくつかの実施形態では、第1の拡張から第8の拡張への移行は、断片化が起こってから2日~14日で起こる。いくつかの実施形態では、第1の拡張から第9の拡張への移行は、断片化が起こってから2日~14日で起こる。いくつかの実施形態では、第1の拡張から第10の拡張への移行は、断片化が起こってから2日~14日で起こる。いくつかの実施形態では、第1の拡張から第11の拡張への移行は、断片化が起こってから2日~14日で起こる。いくつかの実施形態では、第1の拡張から第12の拡張への移行は、断片化が起こってから2日~14日で起こる。いくつかの実施形態では、第1の拡張から第13の拡張への移行は、断片化が起こってから2日~14日で起こる。いくつかの実施形態では、第1の拡張から第2の拡張への移行は、断片化が起こってから14日で起こる。いくつかの実施形態では、第1の拡張から第2の拡張への移行は、断片化が起こってから1日~11日で起こる。いくつかの実施形態では、第1の拡張から第2の拡張への移行は、断片化が起こってから2日~11日で起こる。いくつかの実施形態では、第1の拡張から第3の拡張への移行は、断片化が起こってから2日~11日で起こる。いくつかの実施形態では、第1の拡張から第4の拡張への移行は、断片化が起こってから2日~11日で起こる。いくつかの実施形態では、第1の拡張から第5の拡張への移行は、断片化が起こってから2日~11日で起こる。いくつかの実施形態では、第1の拡張から第6の拡張への移行は、断片化が起こってから2日~11日で起こる。いくつかの実施形態では、第1の拡張から第7の拡張への移行は、断片化が起こってから2日~11日で起こる。いくつかの実施形態では、第1の拡張から第8の拡張への移行は、断片化が起こってから2日~11日で起こる。いくつかの実施形態では、第1の拡張から第9の拡張への移行は、断片化が起こってから2日~11日で起こる。いくつかの実施形態では、第1の拡張から第10の拡張への移行は、断片化が起こってから2日~11日で起こる。いくつかの実施形態では、第1の拡張から第2の拡張への移行は、断片化が起こってから11日で起こる。
いくつかの実施形態では、TILは、第1の拡張後及び第2の拡張前に保管されず、TILは、第2の拡張に直接進む(例えば、いくつかの実施形態では、図1に示されるステップBからステップDへの移行中に保管されない)。いくつかの実施形態では、移行は、本明細書に記載されるように、閉鎖系内で起こる。いくつかの実施形態では、第1の拡張由来のTILである第2のTIL集団は、移行期間なしで第2の拡張に直接進む。
いくつかの実施形態では、第1の拡張から第2の拡張への移行、例えば、図1によるステップCは、閉鎖系バイオリアクター内で行われる。いくつかの実施形態では、本明細書に記載されるように、閉鎖系がTIL拡張のために用いられる。いくつかの実施形態では、単一のバイオリアクターが用いられる。いくつかの実施形態では、用いられる単一のバイオリアクターは、例えば、G-Rex 10またはG-Rex 100である。いくつかの実施形態では、閉鎖系バイオリアクターは、単一のバイオリアクターである。
1.サイトカイン
本明細書に記載の拡張方法は、一般に、当該技術分野で知られているように、高用量のサイトカイン、特にIL-2を含む培養培地を使用する。
あるいは、米国特許出願公開第US2017/0107490A1及び国際特許出願公開第WO2015/189357号(これらの各々は参照によりそれら全体が本明細書に明示的に組み込まれる)に記載されているように、TILの急速拡張及びまたは第2の拡張のためにサイトカインの組み合わせを使用することもさらに可能であり、組み合わせは、IL-2、IL-15、及びIL-21のうちの2つ以上である。したがって、可能な組み合わせには、IL-2及びIL-15、IL-2及びIL-21、IL-15及びIL-21、ならびにIL-2、IL-15、及びIL-21が含まれ、後者は多くの実施形態において特定の用途を見出す。サイトカインの組み合わせの使用は、リンパ球、特にそこに記載されているようにT細胞の生成に特に有利に働く。
D.ステップD:第2の拡張
いくつかの実施形態では、TIL細胞集団は、採取及び初期バルク処理後、例えば、図1に示される、ステップA及びステップB、ならびにステップCと称される移行後に数が拡張される)。このさらなる拡張は、本明細書では第2の拡張と称され、これは、当該技術分野で一般に急速拡張プロセス(REP、ならびに図1のステップDに示されるプロセス)と称される拡張プロセスを含み得る。第2の拡張は、一般に、フィーダー細胞、サイトカイン源、及び抗CD3抗体を含むいくつかの成分を含む培養培地を使用して、ガス透過性容器内で達成される。
いくつかの実施形態では、第2の拡張または第2のTIL拡張(REPと称されることもある拡張、ならびに図1のステップDに示されるプロセスを含み得る)は、当業者に知られている任意のTILフラスコまたは容器を使用して行われ得る。いくつかの実施形態では、第2のTIL拡張は、7日、8日、9日、10日、11日、12日、13日、または14日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第2のTIL拡張は、約7日~約14日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第2のTIL拡張は、約8日~約14日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第2のTIL拡張は、約9日~約14日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第2のTIL拡張は、約10日~約14日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第2のTIL拡張は、約11日~約14日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第2のTIL拡張は、約12日~約14日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第2のTIL拡張は、約13日~約14日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第2のTIL拡張は、約14日間続行することができる。
ある実施形態では、第2の拡張は、本開示の方法(例えば、REPと称される拡張、ならびに図1のステップDに示されるプロセスを含む)を使用して、ガス透過性容器内で行われ得る。例えば、TILは、インターロイキン-2(IL-2)またはインターロイキン-15(IL-15)の存在下で非特異的T細胞受容体刺激を使用して、急速に拡張され得る。非特異的T細胞受容体刺激は、例えば、抗CD3抗体、例えば約30ng/mLのOKT3、マウスモノクローナル抗CD3抗体(Ortho-McNeil,Raritan,NJもしくはMiltenyi Biotech,Auburn,CAから市販)またはUHCT-1(BioLegend,San Diego,CA,USAから市販)を含み得る。TILは、がんのエピトープ(複数可)などの抗原性部分を含む、第2の拡張中に1つ以上の抗原を含むことによって、インビトロでTILのさらなる刺激を誘導するように拡張することができ、これは任意選択で、ベクター、例えば、ヒト白血球抗原A2(HLA-A2)結合ペプチド、例えば、0.3μM MART-1:26-35(27L)またはgpl 00:209-217(210M)から、任意選択で300IU/mLのIL-2またはIL-15などのT細胞成長因子の存在下で発現され得る。他の好適な抗原には、例えば、NY-ESO-1、TRP-1、TRP-2、チロシナーゼがん抗原、MAGE-A3、SSX-2、及びVEGFR2、またはそれらの抗原性部分が含まれ得る。TILは、HLA-A2を発現する抗原提示細胞にパルスされたがんの同じ抗原(複数可)で再刺激することによっても急速に拡張され得る。あるいは、TILは、例えば、例として照射された自己リンパ球または照射されたHLA-A2+同種異系リンパ球及びIL-2でさらに再刺激され得る。いくつかの実施形態では、再刺激は、第2の拡張の一部として起こる。いくつかの実施形態では、第2の拡張は、照射された自己リンパ球の存在下で、または照射されたHLA-A2+同種異系リンパ球及びIL-2を用いて起こる。
ある実施形態では、細胞培養培地は、IL-2をさらに含む。いくつかの実施形態では、細胞培養培地は、約3000IU/mLのIL-2を含む。ある実施形態では、細胞培養培地は、約1000IU/mL、約1500IU/mL、約2000IU/mL、約2500IU/mL、約3000IU/mL、約3500IU/mL、約4000IU/mL、約4500IU/mL、約5000IU/mL、約5500IU/mL、約6000IU/mL、約6500IU/mL、約7000IU/mL、約7500IU/mL、または約8000IU/mLのIL-2を含む。ある実施形態では、細胞培養培地は、1000~2000IU/mL、2000~3000IU/mL、3000~4000IU/mL、4000~5000IU/mL、5000~6000IU/mL、6000~7000IU/mL、7000~8000IU/mL、または8000IU/mLのIL-2を含む。
ある実施形態では、細胞培養培地は、OKT-3抗体を含む。いくつかの実施形態では、細胞培養培地は、約30ng/mLのOKT-3抗体を含む。ある実施形態では、細胞培養培地は、約0.1ng/mL、約0.5ng/mL、約1ng/mL、約2.5ng/mL、約5ng/mL、約7.5ng/mL、約10ng/mL、約15ng/mL、約20ng/mL、約25ng/mL、約30ng/mL、約35ng/mL、約40ng/mL、約50ng/mL、約60ng/mL、約70ng/mL、約80ng/mL、約90ng/mL、約100ng/mL、約200ng/mL、約500ng/mL、及び約1μg/mLのOKT-3抗体を含む。ある実施形態では、細胞培養培地は、0.1ng/mL~1ng/mL、1ng/mL~5ng/mL、5ng/mL~10ng/mL、10ng/mL~20ngの間、20ng/mL~30ng/mL、30ng/mL~40ng/mL、40ng/mL~50ng/mL、及び50ng/mL~100ng/mLのOKT-3抗体を含む。いくつかの実施形態では、細胞培養培地は、OKT-3抗体を含まない。いくつかの実施形態では、OKT-3抗体は、ムロモナブである。
いくつかの実施形態では、細胞培養培地は、細胞培養培地中に1つ以上のTNFRSFアゴニストを含む。いくつかの実施形態では、TNFRSFアゴニストは、4-1BBアゴニストを含む。いくつかの実施形態では、TNFRSFアゴニストは4-1BBアゴニストであり、4-1BBアゴニストは、ウレルマブ、ウトミルマブ、EU-101、融合タンパク質、ならびにそれらの断片、誘導体、バリアント、バイオシミラー、及び組み合わせからなる群から選択される。いくつかの実施形態では、TNFRSFアゴニストは、0.1μg/mL~100μg/mLの細胞培養培地中濃度を達成するのに十分な濃度で追加される。いくつかの実施形態では、TNFRSFアゴニストは、20μg/mL~40μg/mLの細胞培養培地中濃度を達成するのに十分な濃度で追加される。
いくつかの実施形態では、1つ以上のTNFRSFアゴニストに加えて、細胞培養培地は、IL-2を約3000IU/mLの初期濃度で、及びOKT-3を約30ng/mLの初期濃度でさらに含み、1つ以上のTNFRSFアゴニストが、4-1BBアゴニストを含む。
いくつかの実施形態では、IL-2、IL-7、IL-15、及び/またはIL-21の組み合わせは、第2の拡張中に組み合わせとして用いられる。いくつかの実施形態では、IL-2、IL-7、IL-15、及び/またはIL-21、ならびにそれらの任意の組み合わせは、例えば、図1による、かつ本明細書に記載されるステップDのプロセス中を含む、第2の拡張中に含まれ得る。いくつかの実施形態では、IL-2、IL-15、及びIL-21の組み合わせは、第2の拡張中に組み合わせとして用いられる。いくつかの実施形態では、IL-2、IL-15、及びIL-21、ならびにそれらの任意の組み合わせは、図1による、かつ本明細書に記載されるステップDのプロセス中に含まれ得る。
いくつかの実施形態では、第2の拡張は、IL-2、OKT-3、抗原提示フィーダー細胞、及び任意でTNFRSFアゴニストを含む補充された細胞培養培地において実施され得る。いくつかの実施形態では、第2の拡張は、補充された細胞培養培地中で起こる。いくつかの実施形態では、補充された細胞培養培地は、IL-2、OKT-3、及び抗原提示フィーダー細胞を含む。いくつかの実施形態では、第2の細胞培養培地は、IL-2、OKT-3、及び抗原提示細胞(APC、抗原提示フィーダー細胞とも称される)を含む。いくつかの実施形態では、第2の拡張は、IL-2、OKT-3、及び抗原提示フィーダー細胞(すなわち、抗原提示細胞)を含む細胞培養培地中で起こる。
いくつかの実施形態では、第2の拡張培養培地は、約500IU/mLのIL-15、約400IU/mLのIL-15、約300IU/mLのIL-15、約200IU/mLのIL-15、約180IU/mLのIL-15、約160IU/mLのIL-15、約140IU/mLのIL-15、約120IU/mLのIL-15、または約100IU/mLのIL-15を含む。いくつかの実施形態では、第2の拡張培養培地は、約500IU/mLのIL-15~約100IU/mLのIL-15を含む。いくつかの実施形態では、第2の拡張培養培地は、約400IU/mLのIL-15~約100IU/mLのIL-15を含む。いくつかの実施形態では、第2の拡張培養培地は、約300IU/mLのIL-15~約100IU/mLのIL-15を含む。いくつかの実施形態では、第2の拡張培養培地は、約200IU/mLのIL-15を含む。いくつかの実施形態では、細胞培養培地は、約180IU/mLのIL-15を含む。ある実施形態では、細胞培養培地は、IL-15をさらに含む。好ましい実施形態では、細胞培養培地は、約180IU/mLのIL-15を含む。
いくつかの実施形態では、第2の拡張培養培地は、約20IU/mLのIL-21、約15IU/mLのIL-21、約12IU/mLのIL-21、約10IU/mLのIL-21、約5IU/mLのIL-21、約4IU/mLのIL-21、約3IU/mLのIL-21、約2IU/mLのIL-21、約1IU/mLのIL-21、または約0.5IU/mLのIL-21を含む。いくつかの実施形態では、第2の拡張培養培地は、約20IU/mLのIL-21~約0.5IU/mLのIL-21を含む。いくつかの実施形態では、第2の拡張培養培地は、約15IU/mLのIL-21~約0.5IU/mLのIL-21を含む。いくつかの実施形態では、第2の拡張培養培地は、約12IU/mLのIL-21~約0.5IU/mLのIL-21を含む。いくつかの実施形態では、第2の拡張培養培地は、約10IU/mLのIL-21~約0.5IU/mLのIL-21を含む。いくつかの実施形態では、第2の拡張培養培地は、約5IU/mLのIL-21~約1IU/mLのIL-21を含む。いくつかの実施形態では、第2の拡張培養培地は、約2IU/mLのIL-21を含む。いくつかの実施形態では、細胞培養培地は、約1IU/mLのIL-21を含む。いくつかの実施形態では、細胞培養培地は、約0.5IU/mLのIL-21を含む。ある実施形態では、細胞培養培地は、IL-21をさらに含む。好ましい実施形態では、細胞培養培地は、約1IU/mLのIL-21を含む。
いくつかの実施形態では、抗原提示フィーダー細胞(APC)は、PBMCである。ある実施形態では、急速拡張及び/または第2の拡張におけるTILのPBMC及び/または抗原提示細胞に対する比率は、約1:25、約1:50、約1:100、約1:125、約1:150、約1:175、約1:200、約1:225、約1:250、約1:275、約1:300、約1:325、約1:350、約1:375、約1:400、または約1:500である。ある実施形態では、急速拡張及び/または第2の拡張におけるTILのPBMCに対する比率は、1:50~1:300である。ある実施形態では、急速拡張及び/または第2の拡張におけるTILのPBMCに対する比率は、1:100~1:200である。
ある実施形態では、REP及び/または第2の拡張は、バルクTILが150mLの培地中の100倍または200倍過剰の不活性化フィーダー細胞、30mg/mLのOKT3抗CD3抗体、及び3000IU/mLのIL-2と混合されているフラスコ内で行われる。細胞が代替の成長チャンバに移されるまで、培地交換が行われる(一般に、新鮮な培地との呼吸による3分の2の培地交換)。代替の成長チャンバには、以下でより完全に考察されるように、G-Rexフラスコ及びガス透過性容器が含まれる。
いくつかの実施形態では、実施例及び図で考察されるように、第2の拡張(REPプロセスと称されるプロセスを含み得る)は、7~14日に短縮される。いくつかの実施形態では、第2の拡張は、11日に短縮される。
ある実施形態では、REP及び/または第2の拡張は、以前に記載されたT-175フラスコ及びガス透過性バッグ(Tran,et al.,J.Immunother.2008,31,742-51、Dudley,et al.,J.Immunother.2003,26,332-42)またはガス透過性培養器具(G-Rexフラスコ)を使用して行われ得る。いくつかの実施形態では、第2の拡張(急速拡張と称される拡張を含む)は、T-175フラスコ内で行われ、150mLの培地に懸濁された約1×10個のTILが、各T-175フラスコに添加され得る。TILは、3000IU/mLのIL-2及び30ng/mLの抗CD3を補充した、1:1のCMとAIM-V培地との混合物中で培養され得る。T-175フラスコを、5% CO中37℃でインキュベートすることができる。培地の半分が、3000IU/mLのIL-2を含む50/50培地を使用して5日目に交換され得る。いくつかの実施形態では、7日目に、2つのT-175フラスコからの細胞が3Lバッグ内で組み合わせられ得、5%ヒトAB血清及び3000IU/mLのIL-2を含む300mLのAIM Vが、300mLのTIL懸濁液に添加された。各バッグ内の細胞の数が毎日または隔日計数され、新鮮な培地が添加されて、0.5~2.0×10細胞/mLの細胞数を維持した。
ある実施形態では、第2の拡張(REPと称される拡張、ならびに図1のステップDで参照される拡張を含み得る)は、100cmのガス透過性シリコン底部(G-Rex 100、Wilson Wolf Manufacturing Corporation,New Brighton,MN,USAから市販されている)を有する500mL容量のガス透過性フラスコ内で行われ得る。5×10または10×10TILは、5%ヒトAB血清、3000IU/mLのIL-2、及び30ng/mLの抗CD3(OKT3)を補充した400mLの50/50培地中、PBMCで培養され得る。G-Rex 100フラスコは、5%CO中37℃でインキュベートされ得る。5日目に、250mLの上清が除去され、遠心分離ボトルに入れられ、1500rpm(491×g)で10分間遠心分離される。TILペレットが、5%ヒトAB血清、3000IU/mLのIL-2を含む150mLの新鮮な培地で再懸濁され、元のG-Rex 100フラスコに戻し添加され得る。TILがG-Rex 100フラスコ内で連続的に拡張される場合、7日目に、各G-Rex 100内のTILが、各フラスコに存在する300mLの培地に懸濁され得、細胞懸濁液が3つの100mLアリコートに分割され得、それを使用して、3つのG-Rex 100フラスコに播種することができる。その後、5%ヒトAB血清及び3000IU/mLのIL-2を含む150mLのAIM-Vが各フラスコに添加され得る。G-Rex 100フラスコが、5% CO中37℃でインキュベートされ得、4日後に、3000IU/mLのIL-2を含む150mLのAIM-Vが、各G-Rex 100フラスコに添加され得る。培養14日目に、細胞が採取され得る。
ある実施形態では、第2の拡張(REPと称される拡張を含む)は、バルクTILが150mLの培地中の100倍または200倍過剰の不活性化フィーダー細胞、30mg/mLのOKT3抗CD3抗体、及び3000IU/mLのIL-2と混合されているフラスコで行われる。いくつかの実施形態では、培地交換は、細胞が代替の成長チャンバに移されるまで行われる。いくつかの実施形態では、培地の3分の2が、新鮮な培地と呼吸によって交換される。いくつかの実施形態では、代替の成長チャンバには、以下でより完全に考察されるように、G-Rexフラスコ及びガス透過性容器が含まれる。
ある実施形態では、第2の拡張(REPと称される拡張を含む)が行われ、TILが優れた腫瘍反応性のために選択されるステップをさらに含む。当該技術分野で知られている任意の選択方法が使用され得る。例えば、米国特許出願公開第2016/0010058A1号(その開示は参照により本明細書に組み込まれる)に記載されている方法が、優れた腫瘍反応性のためのTILの選択に使用され得る。
任意選択で、細胞生存率アッセイは、当該技術分野で知られている標準的なアッセイを使用して、第2の拡張(REP拡張と称される拡張を含む)後に行われ得る。例えば、死細胞を選択的に標識し、生存率の評価を可能にするトリパンブルー排除アッセイが、バルクTILの試料上で行われ得る。いくつかの実施形態では、TIL試料は、Cellometer K2自動セルカウンター(Nexcelom Bioscience,Lawrence,MA)を使用して計数され、生存率が決定され得る。いくつかの実施形態では、生存率は、標準のCellometer K2 Image Cytometer Automatic Cell Counterプロトコルに従って決定される。
いくつかの実施形態では、TILの第2の拡張(REPと称される拡張を含む)は、以前に記載されているT-175フラスコ及びガス透過性バッグ(Tran KQ,Zhou J,Durflinger KH,et al.,2008,J Immunother.,31:742-751及びDudley ME,Wunderlich JR,Shelton TE,et al.2003,J Immunother.,26:332-342)またはガス透過性G-Rexフラスコを使用して行われ得る。いくつかの実施形態では、第2の拡張は、フラスコを使用して行われる。いくつかの実施形態では、第2の拡張は、ガス透過性G-Rexフラスコを使用して行われる。いくつかの実施形態では、第2の拡張は、T-175フラスコ内で行われ、約1×10個のTILが約150mLの培地に懸濁され、これが各T-175フラスコに添加される。TILは、「フィーダー」細胞として1対100の比で照射された(50Gy)同種異系PBMCと培養され、細胞が、3000IU/mLのIL-2及び30ng/mLの抗CD3を補充した、1:1のCMとAIM-V培地との混合物(50/50培地)中で培養された。T-175フラスコを、5% CO中37℃でインキュベートする。いくつかの実施形態では、培地の半分が、3000IU/mLのIL-2を含む50/50培地を使用して5日目に交換される。いくつかの実施形態では、7日目に、2つのT-175フラスコからの細胞が3Lバッグ内で組み合わせられ、5%ヒトAB血清及び3000IU/mLのIL-2を含む300mLのAIM-Vが、300mLのTIL懸濁液に添加される。各バッグ内の細胞の数が毎日または隔日計数され得、新鮮な培地が添加されて、約0.5~約2.0×10細胞/mLの細胞数を維持することができる。
いくつかの実施形態では、第2の拡張(REPと称される拡張を含む)は、100cmのガス透過性シリコン底部(G-Rex 100、Wilson Wolf)を有する500mL容量のフラスコ内で行われ、約5×10または10×10TILが、3000IU/mLのIL-2及び30ng/mLの抗CD3を補充した、400mLの50/50培地中、1対100の比で照射された同種異系PBMCと培養される。G-Rex 100フラスコは、5%CO中37℃でインキュベートされる。いくつかの実施形態では、5日目に、250mLの上清が除去され、遠心分離ボトルに入れられ、1500rpm(491g)で10分間遠心分離される。その後、TILペレットが、3000IU/mLのIL-2を含む150mLの新鮮な50/50培地に再懸濁され、元のG-Rex 100フラスコに戻し添加され得る。TILがG-Rex 100フラスコ内で連続的に拡張される実施形態では、7日目に、各G-Rex 100内のTILが、各フラスコ内に存在する300mLの培地に懸濁され、細胞懸濁液が3つの100mLアリコートに分割されて、それを使用して、3つのG-Rex 100フラスコに播種された。その後、5%ヒトAB血清及び3000IU/mLのIL-2を含む150mLのAIM-Vが各フラスコに添加される。G-Rex 100フラスコが5%CO中37℃でインキュベートされ、4日後に、3000IU/mLのIL-2を含む150mLのAIM-Vが、各G-Rex 100フラスコに添加される。培養14日目に、細胞が採取される。
Tリンパ球及びBリンパ球の多様な抗原受容体は、限られた数であるが、多数の遺伝子セグメントの体細胞組換えによって産生される。これらの遺伝子セグメント:V(可変)、D(多様性)、J(接合)、及びC(一定)は、免疫グロブリン及びT細胞受容体(TCR)の結合特異性及び下流での適用を決定する。本発明は、T細胞レパートリー多様性を示し、かつ増加させるTILを生成するための方法を提供する。いくつかの実施形態では、本方法によって取得されたTILは、T細胞レパートリー多様性の増加を示す。いくつかの実施形態では、第2の拡張において取得されたTILは、T細胞レパートリー多様性の増加を示す。いくつかの実施形態では、多様性の増加は、免疫グロブリン多様性及び/またはT細胞受容体多様性の増加である。いくつかの実施形態では、多様性は、免疫グロブリンにあり、免疫グロブリン重鎖にある。いくつかの実施形態では、多様性は、免疫グロブリンにあり、免疫グロブリン軽鎖にある。いくつかの実施形態では、多様性は、T細胞受容体にある。いくつかの実施形態では、多様性は、アルファ、ベータ、ガンマ、及びデルタ受容体からなる群から選択されるT細胞受容体のうちの1つにある。いくつかの実施形態では、T細胞受容体(TCR)アルファ及び/またはベータの発現が増加する。いくつかの実施形態では、T細胞受容体(TCR)アルファの発現が増加する。いくつかの実施形態では、T細胞受容体(TCR)ベータの発現が増加する。いくつかの実施形態では、TCRab(すなわち、TCRα/β)の発現が増加する。
いくつかの実施形態では、第2の拡張培養培地(例えば、CM2または第2の細胞培養培地と称されることもある)は、以下でさらに詳細に考察されるように、IL-2、OKT-3、ならびに抗原提示フィーダー細胞(APC)を含む。
いくつかの実施形態では、第2の拡張、例えば、図1によるステップDは、閉鎖系バイオリアクター内で行われる。いくつかの実施形態では、本明細書に記載されるように、閉鎖系がTIL拡張のために用いられる。いくつかの実施形態では、単一のバイオリアクターが用いられる。いくつかの実施形態では、用いられる単一のバイオリアクターは、例えば、G-Rex 10またはG-Rex 100である。いくつかの実施形態では、閉鎖系バイオリアクターは、単一のバイオリアクターである。
1.フィーダー細胞及び抗原提示細胞
ある実施形態では、本明細書に記載の第2の拡張手順(例えば、図1のステップDに記載されるような拡張、ならびにREPと称されるものを含む)は、REP TIL拡張中及び/または第2の拡張中に過剰のフィーダー細胞を必要とする。多くの実施形態では、フィーダー細胞は、健康な献血者由来の標準の全血単位から得られる末梢血単核細胞(PBMC)である。PBMCは、Ficoll-Paque勾配分離などの標準の方法を使用して取得される。
一般に、同種異系PBMCは、照射または熱処理のいずれかによって不活性化され、実施例に記載されるように、REP手順で使用され、これは、照射された同種異系PBMCの複製無能力を評価するための例示的なプロトコルを提供する。
いくつかの実施形態では、14日目の生細胞の総数が、REPの0日目及び/または第2の拡張の0日目(すなわち、第2の拡張の開始日)に培養された初期の生細胞数よりも少ない場合、PBMCは、複製能力がないとみなされ、本明細書に記載のTIL拡張手順での使用が認められる。
いくつかの実施形態では、7日目及び14日目のOKT3及びIL-2の存在下で培養された生細胞の総数が、REPの0日目及び/または第2の拡張の0日目(すなわち、第2の拡張の開始日)に培養された初期の生細胞数から増加しなかった場合、PBMCは、複製能力がないとみなされ、本明細書に記載のTIL拡張手順での使用が認められる。いくつかの実施形態では、PBMCは、30ng/mLのOKT3抗体及び3000IU/mLのIL-2の存在下で培養される。
いくつかの実施形態では、7日目及び14日目のOKT3及びIL-2の存在下で培養された生細胞の総数が、REPの0日目及び/または第2の拡張の0日目(すなわち、第2の拡張の開始日)に培養された初期の生細胞数から増加しなかった場合、PBMCは、複製能力がないとみなされ、本明細書に記載のTIL拡張手順での使用が認められる。いくつかの実施形態では、PBMCは、5~60ng/mLのOKT3抗体及び1000~6000IU/mLのIL-2の存在下で培養される。いくつかの実施形態では、PBMCは、10~50ng/mLのOKT3抗体及び2000~5000IU/mLのIL-2の存在下で培養される。いくつかの実施形態では、PBMCは、20~40ng/mLのOKT3抗体及び2000~4000IU/mLのIL-2の存在下で培養される。いくつかの実施形態では、PBMCは、25~35ng/mLのOKT3抗体及び2500~3500IU/mLのIL-2の存在下で培養される。
いくつかの実施形態では、抗原提示フィーダー細胞は、PBMCである。いくつかの実施形態では、抗原提示フィーダー細胞は、人工抗原提示フィーダー細胞である。ある実施形態では、第2の拡張におけるTILの抗原提示フィーダー細胞に対する比率は、約1:25、約1:50、約1:100、約1:125、約1:150、約1:175、約1:200、約1:225、約1:250、約1:275、約1:300、約1:325、約1:350、約1:375、約1:400、または約1:500である。ある実施形態では、第2の拡張におけるTILの抗原提示フィーダー細胞に対する比率は、1:50~1:300である。ある実施形態では、第2の拡張におけるTILの抗原提示フィーダー細胞に対する比率は、1:100~1:200である。
ある実施形態では、本明細書に記載の第2の拡張手順は、約2.5×10フィーダー細胞:約100×10TILの比を必要とする。別の実施形態では、本明細書に記載の第2の拡張手順は、約2.5×10フィーダー細胞:約50×10TILの比を必要とする。さらに別の実施形態では、本明細書に記載の第2の拡張手順は、約2.5×10フィーダー細胞:約25×10TILを必要とする。
ある実施形態では、本明細書に記載の第2の拡張手順は、第2の拡張中に過剰のフィーダー細胞を必要とする。多くの実施形態では、フィーダー細胞は、健康な献血者由来の標準の全血単位から得られる末梢血単核細胞(PBMC)である。PBMCは、Ficoll-Paque勾配分離などの標準の方法を使用して取得される。ある実施形態では、人工抗原提示(aAPC)細胞が、PBMCの代わりに使用される。
一般に、同種異系PBMCは、照射または熱処理のいずれかによって不活性化され、図及び実施例に記載される例示的な手順を含む、本明細書に記載のTIL拡張手順で使用される。
ある実施形態では、aAPCは、PBMCの代替物として、またはPBMCと組み合わせて、第2の拡張で使用される。
ある実施形態では、Gen2プロセスの第2の拡張で使用される抗原提示細胞は、単球細胞である。ある実施形態では、抗原提示細胞は、B細胞である。ある実施形態では、抗原提示細胞は、B細胞リンパ芽細胞またはB-リンパ芽細胞である。ある実施形態では、抗原提示細胞は、バーキットリンパ腫細胞である。ある実施形態では、抗原提示細胞は、骨髄系細胞である。ある実施形態では、抗原提示細胞は、単球である。ある実施形態では、抗原提示細胞は、HLA-A-02陽性単球である。ある実施形態では、抗原提示細胞は、急性単球性白血病細胞である。ある実施形態では、抗原提示細胞は、M5サブタイプの急性単球性白血病細胞である。ある実施形態では、抗原提示細胞は、Raji細胞またはその誘導体、バリアント、修飾、もしくは子孫である。ある実施形態では、抗原提示細胞は、Thp1細胞またはその誘導体、バリアント、修飾、もしくは子孫である。ある実施形態では、抗原提示細胞は、Ramos細胞またはその誘導体、バリアント、修飾、もしくは子孫である。ある実施形態では、抗原提示細胞は、U937細胞またはその誘導体、バリアント、修飾、もしくは子孫である。ある実施形態では、抗原提示細胞は、Daudi細胞またはその誘導体、バリアント、修飾、もしくは子孫である。ある実施形態では、抗原提示細胞は、メラノサイト細胞である。ある実施形態では、抗原提示細胞は、HLA-A-02陽性メラノサイト細胞である。ある実施形態では、抗原提示細胞は、黒色腫細胞である。ある実施形態では、抗原提示細胞は、HLA-A-02陽性黒色腫細胞である。ある実施形態では、抗原提示細胞は、Sk-MEL-5、Malme-3M、SK-MEL-28、SK-MEL-3、SH-4、SK-MEL-24、RPMI-7951、SK-MEL-1、A375、G-361、及びそれらの組み合わせ、またはそれらの誘導体、バリアント、修飾、もしくは子孫からなる群から選択される。前述の実施形態のうちのいずれにおいても、抗原提示細胞は、本明細書の他の箇所に記載されるように照射され得るか、または照射されなくてもよい。
ある実施形態では、aAPCは、Gen2プロセスの第2の拡張で使用される。ある実施形態では、aAPCは、遺伝子修飾単球細胞である。ある実施形態では、aAPCは、遺伝子修飾B細胞である。ある実施形態では、aAPCは、遺伝子修飾B細胞リンパ芽細胞またはB-リンパ芽細胞である。ある実施形態では、aAPCは、遺伝子修飾バーキットリンパ腫細胞である。ある実施形態では、aAPCは、遺伝子修飾骨髄系譜細胞である。ある実施形態では、aAPCは、遺伝子修飾単球である。ある実施形態では、aAPCは、遺伝子修飾HLA-A-02陽性単球細胞である。ある実施形態では、aAPCは、遺伝子修飾急性単球性白血病細胞である。ある実施形態では、aAPCは、遺伝子修飾M5サブタイプ急性単球性白血病細胞である。ある実施形態では、aAPCは、遺伝子修飾Raji細胞またはその誘導体、バリアント、修飾、もしくは子孫である。ある実施形態では、aAPCは、遺伝子修飾Thp1細胞またはその誘導体、バリアント、修飾、もしくは子孫である。ある実施形態では、aAPCは、遺伝子修飾Ramos細胞またはその誘導体、バリアント、修飾、もしくは子孫である。ある実施形態では、aAPCは、遺伝子修飾U937細胞またはその誘導体、バリアント、修飾、もしくは子孫である。ある実施形態では、aAPCは、遺伝子修飾Daudi細胞またはその誘導体、バリアント、修飾、もしくは子孫である。ある実施形態では、aAPCは、遺伝子修飾メラノサイト細胞である。ある実施形態では、aAPCは、遺伝子修飾HLA-A-02陽性メラノサイト細胞である。ある実施形態では、aAPCは、遺伝子修飾黒色腫細胞である。ある実施形態では、aAPCは、遺伝子修飾HLA-A-02陽性黒色腫細胞である。ある実施形態では、aAPCは、Sk-MEL-5、Malme-3M、SK-MEL-28、SK-MEL-3、SH-4、SK-MEL-24、RPMI-7951、SK-MEL-1、A375、G-361、及びそれらの組み合わせ、またはそれらの誘導体、バリアント、修飾、もしくは子孫からなる群から選択される遺伝子修飾抗原提示細胞である。ある実施形態では、遺伝子修飾細胞は、米国特許第10,415,015号(その開示は参照により本明細書に組み込まれる)に記載されているように、CD86、OX40L、4-1BBL、OX-40アゴニスト抗体、4-1BBアゴニスト抗体、OKT-3のFc鎖に結合可能な抗体、及び/またはICOS-Lを発現するように修飾される。前述の実施形態のうちのいずれにおいても、遺伝子修飾aAPCは、本明細書の他の箇所に記載されるように照射され得るか、または照射されなくてもよい。
2.サイトカイン
本明細書に記載の拡張方法は、一般に、当該技術分野で知られているように、高用量のサイトカイン、特にIL-2を含む培養培地を使用する。
あるいは、米国特許出願公開第US2017/0107490A1及び国際特許出願公開第WO2015/189357号(これらの各々は参照によりそれら全体が本明細書に明示的に組み込まれる)に記載されているように、TILの急速拡張及びまたは第2の拡張のためにサイトカインの組み合わせを使用することもさらに可能であり、組み合わせは、IL-2、IL-15、及びIL-21のうちの2つ以上である。したがって、可能な組み合わせには、IL-2及びIL-15、IL-2及びIL-21、IL-15及びIL-21、ならびにIL-2、IL-15、及びIL-21が含まれ、後者は多くの実施形態において特定の用途を見出す。サイトカインの組み合わせの使用は、リンパ球、特にそこに記載されているようにT細胞の生成に特に有利に働く。
E.ステップE:TILを採取する
第2の拡張ステップ後、細胞が採取され得る。いくつかの実施形態では、TILは、例えば、図1に提供されるように、1、2、3、4つ、またはそれ以上の拡張ステップ後に採取される。いくつかの実施形態では、TILは、例えば、図1に提供されるように、2つの拡張ステップ後に採取される。
TILは、例えば、遠心分離を含む、任意の適切な滅菌様式で採取され得る。TILを採取するための方法は、当該技術分野で周知であり、いずれかのかかる既知の方法が本プロセスで用いられ得る。いくつかの実施形態では、TILは、自動化システムを使用して採取される。
細胞採取機及び/または細胞処理システムは、例えば、Fresenius Kabi、Tomtec Life Science、Perkin Elmer、及びInotech Biosystems International,Incを含む、様々な供給源から市販されている。任意の細胞ベースの採取機が本方法とともに用いられ得る。いくつかの実施形態では、細胞採取機及び/または細胞処理システムは、膜ベースの細胞採取機である。いくつかの実施形態では、細胞採取は、LOVOシステム(Fresenius Kabiによって製造されたもの)などの細胞処理システムによるものである。「LOVO細胞処理システム」という用語は、細胞を含む溶液を、滅菌及び/または閉鎖系環境で回転膜または回転フィルターなどの膜またはフィルターをとおしてポンプ輸送し、連続フローを可能にし、細胞を処理して、ペレット化せずに上清または細胞培養培地を除去する、任意のベンダーによって製造された任意の機器または装置も指す。いくつかの実施形態では、細胞採取機及び/または細胞処理システムは、滅菌閉鎖系内で、細胞分離、洗浄、流体交換、濃縮、及び/または他の細胞処理ステップを行うことができる。
いくつかの実施形態では、採取、例えば、図1によるステップEは、閉鎖系バイオリアクターから行われる。いくつかの実施形態では、本明細書に記載されるように、閉鎖系がTIL拡張のために用いられる。いくつかの実施形態では、単一のバイオリアクターが用いられる。いくつかの実施形態では、用いられる単一のバイオリアクターは、例えば、G-Rex 10またはG-Rex 100である。いくつかの実施形態では、閉鎖系バイオリアクターは、単一のバイオリアクターである。
いくつかの実施形態では、図1によるステップEは、実施例14に記載のプロセスに従って行われる。いくつかの実施形態では、閉鎖系は、閉鎖系の無菌性及び閉鎖性を維持するために、滅菌条件下でシリンジを介してアクセスされる。いくつかの実施形態では、実施例14に記載の閉鎖系が用いられる。
いくつかの実施形態では、TILは、実施例14に記載の方法に従って採取される。いくつかの実施形態では、1日目~11日目のTILは、記載されるような方法を使用して採取される(実施例14では11日目のTIL採取と称される)。いくつかの実施形態では、12日目~22日目のTILは、記載されるような方法を使用して採取される(実施例14では22日目のTIL採取と称される)。
F.ステップF:拡張TILのアッセイ
いくつかの実施形態では、上記で提供されるステップからの拡張TILの効力及び/または機能性は、本明細書に記載のアッセイ方法のうちの1つを使用して調べられる。
ある実施形態では、本発明は、本明細書に記載されるGen2 TIL製品の効力を決定する方法を含み、この方法は、
a.Gen2 TIL細胞との標的細胞の共培養を、第1の期間行うステップと、
b.共培養から採取物を取得するステップと、
c.採取物を、(1)Gen2 TIL細胞製品細胞上の1つ以上のマーカーの発現について評価するか、または(2)Gen2 TIL細胞製品細胞から分泌された1つ以上の分析物について評価して、1つ以上の観測値を取得し、Gen2 TIL細胞製品の効力を決定するステップと、を含む。
あるいは、いくつかの実施形態では、拡張TILを、IFN-γ、グランザイムB、パーフォリン、及びTNF-αからなる群から選択される少なくとも2つの分析物の、ELISAまたは自動ELISA(例えば、ELLA)検出によるCD3またはCD3/CD28ビーズベースの刺激を含む複合アッセイを使用して分析する。ある実施形態では、かかる複合アッセイの仕様は、少なくとも2つの選択された分析物について少なくとも500pg/mL、少なくとも2つの選択された分析物について少なくとも600pg/mL、少なくとも2つの選択された分析物について少なくとも700pg/mL、少なくとも2つの選択された分析物について少なくとも800pg/mL、少なくとも2つの選択された分析物について少なくとも900pg/mL、少なくとも2つの選択された分析物について少なくとも1000pg/mL、少なくとも2つの選択された分析物について少なくとも1100pg/mL、または少なくとも2つの選択された分析物について少なくとも1200pg/mLであり、被験試料の各mLは、1×10TIL、2×10TIL、3×10TIL、4×10TIL、5×10TIL、6×10TIL、7×10TIL、8×10TIL、9×10TIL、または10×10TILを含有する。
G.ステップG:最終製剤及び輸液容器への移行
図1に例示的な順序で提供されるステップA~E、ならびに上及び本明細書で詳細に概説されるステップFが完了した後、細胞は、患者への投与に使用するために容器に移される。いくつかの実施形態では、治療的に十分な数のTILが上記の拡張方法を使用して取得されると、それらは、本明細書に記載の薬学的組成物を含む薬学的組成物として患者に投与する際に使用するために、注入バッグまたは無菌バイアルを含み得る容器に移される。TILは、かかる容器への移送後に効力について評価されてもよく、これは、安定性試験のためなど、移送直後または容器が一定期間保管された直後に起こり得る。
ある実施形態では、薬学的組成物は、滅菌緩衝液中のTIL懸濁液である。本開示のPBMCを使用して拡張されたTILは、当該技術分野で知られている任意の好適な経路によって投与され得る。いくつかの実施形態では、T細胞は、単回の動脈内または静脈内注入として投与され、これは、好ましくは、およそ30~60分続く。他の好適な投与経路には、腹腔内、髄腔内、及びリンパ内投与が含まれる。
V.Gen3 TIL製造プロセス
いかなる特定の理論にも限定されることなく、本発明の方法に記載される、T細胞の活性化をプライミングする、プライミングによる第1の拡張と、それに続くT細胞の活性化を促進する急速な第2の拡張により、「より若い」表現型を保持する拡張されたT細胞の調製が可能になると考えられ、したがって、本発明の拡張されたT細胞が、他の方法によって拡張されたT細胞よりも高いがん細胞に対する細胞傷害性を示すことが予想される。特に、本発明の方法によって教示される、抗CD3抗体(例えば、OKT-3)、IL-2、及び任意選択で抗原提示細胞(APC)への曝露によってプライミングされ、その後、追加の抗CD-3抗体(例えば、OKT-3)、IL-2、及びAPCへのその後の曝露によって促進されるT細胞の活性化が、培養下でT細胞の成熟を限定または回避し、成熟度の低い表現型を有するT細胞集団を産生し、これらのT細胞が、培養下での拡張によってあまり疲弊せず、より高いがん細胞に対する細胞傷害性を示すと考えられる。例示的なプロセスを図8に示す。いくつかの実施形態では、急速な第2の拡張ステップは、複数のステップに分けられて、(a)T細胞を、第1の容器、例えば、G-Rex 100MCS容器内での小規模培養で約3~4日間培養することによって急速な第2の拡張を行うことと、その後、(b)小規模培養でのT細胞を、第1の容器よりも大きい第2の容器、例えば、G-Rex 500MCS容器に移し、小規模培養由来のT細胞を、第2の容器内でのより大規模な培養で約4~7日間培養することとによって、培養のスケールアップを達成する。いくつかの実施形態では、急速拡張ステップは、複数のステップに分けられて、(a)T細胞を、第1の容器、例えば、G-Rex 100MCS容器内での第1の小規模培養で約3~4日間培養することによって急速な第2の拡張を行うことと、その後、(b)第1の小規模培養由来のT細胞を、第1の容器とサイズが等しい少なくとも2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、または20個の第2の容器に移して配分することとによって、培養のスケールアウトを達成し、各第2の容器内で、第1の小規模培養由来のかかる第2の容器に移されたT細胞の一部が、第2の小規模培養で約4~7日間培養される。いくつかの実施形態では、急速拡張ステップは、複数のステップに分けられて、(a)T細胞を、第1の容器、例えば、G-Rex 100MCS容器内での小規模培養で約3~4日間培養することによって急速な第2の拡張を行うことと、その後、(b)小規模培養由来のT細胞を、第1の容器よりもサイズが大きい少なくとも2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、または20個の第2の容器、例えば、G-Rex 500MCS容器に移して配分することとによって、培養のスケールアウト及びスケールアップを達成し、各第2の容器内で、小規模培養由来のかかる第2の容器に移されたT細胞の一部が、より大規模な培養で約4~7日間培養される。いくつかの実施形態では、急速拡張ステップは、複数のステップに分けられて、(a)T細胞を、第1の容器、例えば、G-Rex 100MCS容器内での小規模培養で約4日間培養することによって急速な第2の拡張を行うことと、その後、(b)小規模培養由来のT細胞を、第1の容器よりもサイズが大きい2、3、または4個の第2の容器、例えば、G-Rex 500MCS容器に移して配分することとによって、培養のスケールアウト及びスケールアップを達成し、各第2の容器内で、小規模培養由来のかかる第2の容器に移されたT細胞の一部が、より大規模な培養で約5日間培養される。
いくつかの実施形態では、急速な第2の拡張は、プライミングによる第1の拡張によってもたらされるT細胞の活性化が減少、軽減、衰退、または沈静化し始めた後に行われる。
いくつかの実施形態では、急速な第2の拡張は、プライミングによる第1の拡張によってもたらされるT細胞の活性化が、正確にまたは約1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、50、51、52、53、54、55、56、57、58、59、60、61、62、63、64、65、66、67、68、69、70、71、72、73、74、75、76、77、78、79、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、99、または100%減少した後に行われる。
いくつかの実施形態では、急速な第2の拡張は、プライミングによる第1の拡張によってもたらされるT細胞の活性化が、正確にまたは約1%~100%の範囲のパーセンテージ減少した後に行われる。
いくつかの実施形態では、急速な第2の拡張は、プライミングによる第1の拡張によってもたらされるT細胞の活性化が、正確にまたは約1%~10%、10%~20%、20%~30%、30%~40%、40%~50%、50%~60%、60%~70%、70%~80%、80%~90%、または90%~100%の範囲のパーセンテージ減少した後に行われる。
いくつかの実施形態では、急速な第2の拡張は、プライミングによる第1の拡張によってもたらされるT細胞の活性化が、少なくとも正確にまたは約1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、50、51、52、53、54、55、56、57、58、59、60、61、62、63、64、65、66、67、68、69、70、71、72、73、74、75、76、77、78、79、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99%減少した後に行われる。
いくつかの実施形態では、急速な第2の拡張は、プライミングによる第1の拡張によってもたらされるT細胞の活性化が、最大で正確にまたは約1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、50、51、52、53、54、55、56、57、58、59、60、61、62、63、64、65、66、67、68、69、70、71、72、73、74、75、76、77、78、79、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、99、または100%減少した後に行われる。
いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張によってもたらされるT細胞の活性化の減少は、抗原による刺激に応答してT細胞によって放出されるインターフェロンγの量の減少によって決定される。
いくつかの実施形態では、T細胞のプライミングによる第1の拡張は、最大で正確にまたは約7日または約8日の期間中に行われる。
いくつかの実施形態では、T細胞のプライミングによる第1の拡張は、最大で正確にまたは約1日、2日、3日、4日、5日、6日、7日、または8日の期間中に行われる。
いくつかの実施形態では、T細胞のプライミングによる第1の拡張は、1日、2日、3日、4日、5日、6日、7日、または8日の期間中に行われる。
いくつかの実施形態では、T細胞の急速な第2の拡張は、最大で正確にまたは約11日の期間中に行われる。
いくつかの実施形態では、T細胞の急速な第2の拡張は、最大で正確にまたは約1日、2日、3日、4日、5日、6日、7日、8日、9日、10日、または11日の期間中に行われる。
いくつかの実施形態では、T細胞の急速な第2の拡張は、1日、2日、3日、4日、5日、6日、7日、8日、9日、10日、または11日の期間中に行われる。
いくつかの実施形態では、T細胞のプライミングによる第1の拡張は、正確にまたは約1日~正確にまたは約7日の期間中に行われ、T細胞の急速な第2の拡張は、正確にまたは約1日~正確にまたは約11日の期間中に行われる。
いくつかの実施形態では、T細胞のプライミングによる第1の拡張は、最大で正確にまたは約1日、2日、3日、4日、5日、6日、7日、または8日の期間中に行われ、T細胞の急速な第2の拡張は、最大で正確にまたは約1日、2日、3日、4日、5日、6日、7日、8日、9日、10日、または11日の期間中に行われる。
いくつかの実施形態では、T細胞のプライミングによる第1の拡張は、正確にまたは約1日~正確にまたは約8日の期間中に行われ、T細胞の急速な第2の拡張は、正確にまたは約1日~正確にまたは約9日の期間中に行われる。
いくつかの実施形態では、T細胞のプライミングによる第1の拡張は、8日の期間中に行われ、T細胞の急速な第2の拡張は、9日の期間中に行われる。
いくつかの実施形態では、T細胞のプライミングによる第1の拡張は、正確にまたは約1日~正確にまたは約7日の期間中に行われ、T細胞の急速な第2の拡張は、正確にまたは約1日~正確にまたは約9日の期間中に行われる。
いくつかの実施形態では、T細胞のプライミングによる第1の拡張は、7日の期間中に行われ、T細胞の急速な第2の拡張は、9日の期間中に行われる。
いくつかの実施形態では、T細胞は、腫瘍浸潤リンパ球(TIL)である。
いくつかの実施形態では、T細胞は、骨髄浸潤リンパ球(MIL)である。
いくつかの実施形態では、T細胞は、末梢血リンパ球(PBL)である。
いくつかの実施形態では、T細胞は、がんに罹患しているドナーから取得される。
いくつかの実施形態では、T細胞は、がんに罹患している患者から切除された腫瘍から取得されたTILである。
いくつかの実施形態では、T細胞は、黒色腫に罹患している患者から切除された腫瘍から取得されたTILである。
いくつかの実施形態では、T細胞は、血液系悪性腫瘍に罹患している患者の骨髄から取得されたMILである。
いくつかの実施形態では、T細胞は、ドナー由来の末梢血単核細胞(PBMC)から取得されたPBLである。いくつかの実施形態では、ドナーは、がんに罹患している。いくつかの実施形態では、がんは、黒色腫、卵巣癌、子宮内膜癌、甲状腺癌、子宮頸癌、非小細胞肺癌(NSCLC)、肺癌、膀胱癌、乳癌、ヒト乳頭腫ウイルスによって引き起こされるがん、頭頸部癌(頭頸部扁平上皮癌(HNSCC)を含む)、神経膠芽細胞腫(GBMを含む)、胃腸癌、腎癌、及び腎細胞癌からなる群から選択される。いくつかの実施形態では、がんは、黒色腫、卵巣癌、子宮頸癌、非小細胞肺癌(NSCLC)、肺癌、膀胱癌、乳癌、ヒト乳頭腫ウイルスによって引き起こされるがん、頭頸部癌(頭頸部扁平上皮癌(HNSCC)を含む)、神経膠芽細胞腫(GBMを含む)、胃腸癌、腎癌、及び腎細胞癌からなる群から選択される。いくつかの実施形態では、ドナーは、腫瘍に罹患している。いくつかの実施形態では、腫瘍は、液体腫瘍である。いくつかの実施形態では、腫瘍は、固形腫瘍である。いくつかの実施形態では、ドナーは、血液系悪性腫瘍に罹患している。
本開示の特定の態様では、免疫エフェクター細胞、例えば、T細胞は、FICOLL分離などの当業者に知られている任意の数の技法を使用して対象から収集された血液の単位から得ることができる。好ましい一態様では、個体の循環血液由来の細胞は、アフェレーシスによって取得される。アフェレーシス産物は、典型的には、リンパ球、例えば、T細胞、単球、顆粒球、B細胞、他の有核白血球、赤血球、血小板を含む。一態様では、アフェレーシスによって収集された細胞が洗浄されて、血漿画分が除去され、任意選択で、その後の処理ステップのために細胞を適切な緩衝液または培地に入れられ得る。一実施形態では、細胞は、リン酸緩衝生理食塩水(PBS)で洗浄される。代替の実施形態では、洗浄溶液は、カルシウムを欠き、マグネシウムを欠き得るか、またはすべてではないが多くの二価カチオンを欠き得る。一態様では、T細胞は、赤血球を溶解し、かつ単球を枯渇させることによって、例えば、PERCOLL勾配による遠心分離によって、または対向流遠心溶出法によって末梢血リンパ球から単離される。
いくつかの実施形態では、T細胞は、ドナー由来のリンパ球が濃縮された全血またはアフェレーシス産物から分離されたPBLである。いくつかの実施形態では、ドナーは、がんに罹患している。いくつかの実施形態では、がんは、黒色腫、卵巣癌、子宮内膜癌、甲状腺癌、子宮頸癌、非小細胞肺癌(NSCLC)、肺癌、膀胱癌、乳癌、ヒト乳頭腫ウイルスによって引き起こされるがん、頭頸部癌(頭頸部扁平上皮癌(HNSCC)を含む)、神経膠芽細胞腫(GBMを含む)、胃腸癌、腎癌、及び腎細胞癌からなる群から選択されるがんである。いくつかの実施形態では、がんは、黒色腫、卵巣癌、子宮頸癌、非小細胞肺癌(NSCLC)、肺癌、膀胱癌、乳癌、ヒト乳頭腫ウイルスによって引き起こされるがん、頭頸部癌(頭頸部扁平上皮癌(HNSCC)を含む)、神経膠芽細胞腫(GBMを含む)、胃腸癌、腎癌、及び腎細胞癌からなる群から選択される。いくつかの実施形態では、ドナーは、腫瘍に罹患している。いくつかの実施形態では、腫瘍は、液体腫瘍である。いくつかの実施形態では、腫瘍は、固形腫瘍である。いくつかの実施形態では、ドナーは、血液系悪性腫瘍に罹患している。いくつかの実施形態では、PBLは、正または負の選択方法を使用することによって、すなわち、T細胞表現型について、マーカー(複数可)、例えば、CD3+CD45+を使用してPBLを除去することによって、または非T細胞表現型細胞を除去してPBLを残すことによって、リンパ球が濃縮された全血またはアフェレーシス産物から単離される。他の実施形態では、PBLは、勾配遠心分離によって単離される。ドナー組織からPBLを単離した時点で、PBLのプライミングによる第1の拡張は、本明細書に記載される方法のうちのいずれかのプライミングによる第1の拡張ステップに従って、プライミングによる第1の拡張培養下で好適な数の単離されたPBL(いくつかの実施形態では、およそ1×10PBL)を播種することによって開始され得る。
これらの特徴のうちのいくつかを含む、プロセス3として知られる(本明細書ではGen3とも称される)例示的なTILプロセスが、図8(特に、例えば図8B及び/または図8C)に示され、本発明のこの実施形態の、プロセス2Aを超える利点のうちのいくつかが、図1、2、8、30、及び31(特に、例えば図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D)に記載される。プロセス3(Gen3)の実施形態は、図8及び30(特に、例えば図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D)に示される。プロセス2AまたはGen2はまた、米国特許公開第2018/0280436号に記載されており、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる。Gen3プロセスはまた、国際特許公開第WO2020/096988号に記載されている。
本明細書で考察され、かつ一般に概説されるように、TILは、患者試料から採取され、本明細書に記載され、かつGen3と称されるTIL拡張プロセスを使用して患者に移植する前に、それらの数を拡張するように操作される。いくつかの実施形態では、TILは、以下で考察されるように、任意で遺伝子操作され得る。いくつかの実施形態では、TILは、拡張前または拡張後に凍結保存され得る。解凍した時点で、それらが再刺激されて、患者への注入前に代謝を高めることができる。
いくつかの実施形態では、以下ならびに実施例及び図において詳細に考察されるように、プライミングによる第1の拡張(本明細書において急速拡張前(REP前)と称されるプロセス、ならびに図8(特に、例えば図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D)においてステップBとして示されるプロセスを含む)は、1~8日に短縮され、急速な第2の拡張(本明細書において急速拡張プロトコル(REP)と称されるプロセス、ならびに図1(特に、例えば図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D)においてステップDとして示されるプロセスを含む)は、1~9日に短縮される。いくつかの実施形態では、以下ならびに実施例及び図において詳細に考察されるように、プライミングによる第1の拡張(本明細書において急速拡張前(REP前)と称されるプロセス、ならびに図8(特に、例えば図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D)においてステップBとして示されるプロセスを含む)は、1~8日に短縮され、急速な第2の拡張(本明細書において急速拡張プロトコル(REP)と称されるプロセス、ならびに図8(特に、例えば図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D)においてステップDとして示されるプロセスを含む)は、1~8日に短縮される。いくつかの実施形態では、以下ならびに実施例及び図において詳細に考察されるように、プライミングによる第1の拡張(本明細書において急速拡張前(REP前)と称されるプロセス、ならびに図8(特に、例えば図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D)においてステップBとして示されるプロセスを含む)は、1~7日に短縮され、急速な第2の拡張(本明細書において急速拡張プロトコル(REP)と称されるプロセス、ならびに図8(特に、例えば図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D)においてステップDとして示されるプロセスを含む)は、1~9日に短縮される。いくつかの実施形態では、以下ならびに実施例及び図において詳細に考察されるように、プライミングによる第1の拡張(本明細書において急速拡張前(REP前)と称されるプロセス、ならびに図8(特に、例えば図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D)においてステップBとして示されるプロセスを含む)は、1~7日間であり、急速な第2の拡張(本明細書において急速拡張プロトコル(REP)と称されるプロセス、ならびに図8(特に、例えば図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D)においてステップDとして示されるプロセスを含む)は、1~10日間である。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張(例えば、図8(特に、例えば図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D)においてステップBとして記載される拡張)は、8日に短縮され、急速な第2の拡張(例えば、図8(特に、例えば図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D)においてステップDに記載される拡張)は、7~9日間である。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張(例えば、図8(特に、例えば図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D)においてステップBとして記載される拡張)は、8日間であり、急速な第2の拡張(例えば、図8(特に、例えば図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D)においてステップDに記載される拡張)は、8~9日間である。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張(例えば、図8(特に、例えば図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D)においてステップBとして記載される拡張)は、7日に短縮され、急速な第2の拡張(例えば、図1(特に、例えば図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D)においてステップDに記載される拡張)は、7~8日間である。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張(例えば、図8(特に、例えば図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D)においてステップBとして記載される拡張)は、8日に短縮され、急速な第2の拡張(例えば、図8(特に、例えば図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D)においてステップDに記載される拡張)は、8日間である。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張(例えば、図8(特に、例えば図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D)においてステップBとして記載される拡張)は、8日間であり、急速な第2の拡張(例えば、図8(特に、例えば図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D)においてステップDに記載される拡張)は、9日間である。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張(例えば、図8(特に、例えば図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D)においてステップBとして記載される拡張)は、8日間であり、急速な第2の拡張(例えば、図8(特に、例えば図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D)においてステップDに記載される拡張)は、10日間である。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張(例えば、図8(特に、例えば図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D)においてステップBとして記載される拡張)は、7日間であり、急速な第2の拡張(例えば、図8(特に、例えば図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D)においてステップDに記載される拡張)は、7~10日間である。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張(例えば、図8(特に、例えば図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D)においてステップBとして記載される拡張)は、7日間であり、急速な第2の拡張(例えば、図8(特に、例えば図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D)においてステップDに記載される拡張)は、8~10日間である。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張(例えば、図8(特に、例えば図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D)においてステップBとして記載される拡張)は、7日間であり、急速な第2の拡張(例えば、図8(特に、例えば図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D)においてステップDに記載される拡張)は、9~10日間である。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張(例えば、図8(特に、例えば図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D)においてステップBとして記載される拡張)は、7日に短縮され、急速な第2の拡張(例えば、図8(特に、例えば図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D)においてステップDに記載される拡張)は、7~9日間である。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張と急速な第2の拡張(例えば、図8(特に、例えば図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D)においてステップB及びステップDとして記載される拡張)との組み合わせは、以下ならびに実施例及び図面において詳細に考察されるように、14~16日間である。特に、本発明のある特定の実施形態が、IL-2の存在下での抗CD3抗体、例えば、OKT-3への曝露、または少なくともIL-2及び抗CD3抗体、例えば、OKT-3の存在下での抗原への曝露によってTILが活性化される、プライミングによる第1の拡張ステップを含むと考えられる。ある特定の実施形態では、上記のようにプライミングによる第1の拡張ステップで活性化されるTILは、第1のTIL集団であり、すなわち、一次細胞集団である。
以下の「ステップ」指定A、B、Cなどは、図8(特に、例えば図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D)における非限定的な例を参照し、本明細書に記載されるある特定の非限定的な実施形態を参照している。以下及び図8(特に、例えば図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D)におけるステップの順序は例示であり、ステップの任意の組み合わせまたは順序、ならびに追加のステップ、ステップの繰り返し、及び/またはステップの省略は、本出願及び本明細書に開示される方法によって企図される。
A.ステップA:患者の腫瘍試料を取得する
一般に、TILは、最初に患者の腫瘍試料(「一次TIL」)から、またはTIL様の特徴を有する末梢血リンパ球を含む末梢血リンパ球などの循環リンパ球から得られ、その後、本明細書に記載されるように、さらなる操作のためにより大きな集団に拡張され、任意選択で凍結保存され、任意選択でTILの健康の指標として表現型及び代謝パラメータについて評価される。
患者の腫瘍試料は、一般に、外科的切除、針生検、または腫瘍細胞とTIL細胞との混合物を含有する試料を得るための他の手段により、当該技術分野で知られている方法を使用して得ることができる。一般に、腫瘍試料は、原発腫瘍、浸潤性腫瘍、または転移性腫瘍を含む、任意の固形腫瘍に由来し得る。腫瘍試料は、血液系悪性腫瘍から取得された腫瘍などの液体腫瘍であり得る。固形腫瘍は、皮膚(扁平上皮癌、基底細胞癌、及び黒色腫を含むが、これらに限定されない)を含むが、これに限定されない、任意の種類のがんであり得る。いくつかの実施形態では、がんは、黒色腫である。いくつかの実施形態では、悪性黒色腫腫瘍が特に高レベルのTILを有することが報告されているため、有用なTILは、悪性黒色腫腫瘍から取得される。
取得された時点で、腫瘍試料は、一般に、鋭的解剖を使用して1~約8mmの小片に断片化され、約2~3mmが特に有用である。TILは、酵素腫瘍消化物を使用してこれらの断片から培養される。かかる腫瘍消化物は、酵素培地(例えば、Roswell Park Memorial Institute(RPMI)1640緩衝液、2mMのグルタメート、10mcg/mLのゲンタマイシン、30単位/mLのDNase、及び1.0mg/mLのコラゲナーゼ)中でのインキュベーション、続いて、機械的解離(例えば、組織解離機を使用する)によって産生され得る。腫瘍消化物は、腫瘍を酵素培地に入れ、腫瘍をおよそ1分間機械的に解離させ、続いて5% CO中37℃で30分間インキュベートし、続いて小さな組織片のみが存在するまで、前述の条件下で機械的解離及びインキュベーションのサイクルを繰り返すことによって産生することができる。このプロセスの最後に、細胞懸濁液中に多数の赤血球または死細胞が含まれている場合、FICOLL分岐親水性多糖類を使用した密度勾配分離が行われて、これらの細胞を除去することができる。米国特許出願公開第2012/0244133A1号(その開示は参照により本明細書に組み込まれる)に記載されているものなどの当該技術分野で知られている代替の方法を使用することができる。前述の方法のうちのいずれかが、TILを拡張する方法またはがんを治療する方法について本明細書に記載される実施形態のうちのいずれかにおいて使用され得る。
腫瘍解離酵素混合物には、1つ以上の解離(消化)酵素、例えば、限定されないが、コラゲナーゼ(任意のブレンドまたはコラゲナーゼの種類を含む)、Accutase(商標)、Accumax(商標)、ヒアルロニダーゼ、中性プロテアーゼ(ディスパーゼ)、キモトリプシン、キモパパイン、トリプシン、カゼイナーゼ、エラスターゼ、パパイン、XIV型プロテアーゼ(プロナーゼ)、デオキシリボヌクレアーゼI(DNase)、トリプシン阻害剤、任意の他の解離酵素またはタンパク質分解酵素、及びそれらの任意の組み合わせが含まれ得る。
いくつかの実施形態では、解離酵素は、凍結乾燥酵素から再構成される。いくつかの実施形態では、凍結乾燥酵素は、HBSSなどの滅菌緩衝液の量で再構成される。
いくつかの事例では、コラゲナーゼ(アニマルフリー1型コラゲナーゼなど)を、10mLの滅菌HBSSまたは別の緩衝液で再構成する。凍結乾燥ストック酵素は、2892PZ U/バイアルの濃度であり得る。いくつかの実施形態では、コラゲナーゼは、5mL~15mLの緩衝液中で再構成される。いくつかの実施形態では、再構成後のコラゲナーゼストックは、約100PZ U/mL~約400PZ U/mLの範囲、例えば、約100PZ U/mL~約400PZ U/mL、約100PZ U/mL~約350PZ U/mL、約100PZ U/mL~約300PZ U/mL、約150PZ U/mL~約400PZ U/mL、約100PZ U/mL、約150PZ U/mL、約200PZ U/mL、約210PZ U/mL、約220PZ U/mL、約230PZ U/mL、約240PZ U/mL、約250PZ U/mL、約260PZ U/mL、約270PZ U/mL、約280PZ U/mL、約289.2PZ U/mL、約300PZ U/mL、約350PZ U/mL、または約400PZ U/mLである。
いくつかの実施形態では、中性プロテアーゼは、1mLの滅菌HBSSまたは別の緩衝液中で再構成される。凍結乾燥ストック酵素は、175DMC U/バイアルの濃度であり得る。凍結乾燥ストック酵素は、175DMCU/mLの濃度であり得る。いくつかの実施形態では、再構成後の中性プロテアーゼストックは、約100DMC/mL~約400DMC/mLの範囲、例えば、約100DMC/mL~約400DMC/mL、約100DMC/mL~約350DMC/mL、約100DMC/mL~約300DMC/mL、約150DMC/mL~約400DMC/mL、約100DMC/mL、約110DMC/mL、約120DMC/mL、約130DMC/mL、約140DMC/mL、約150DMC/mL、約160DMC/mL、約170DMC/mL、約175DMC/mL、約180DMC/mL、約190DMC/mL、約200DMC/mL、約250DMC/mL、約300DMC/mL、約350DMC/mL、または約400DMC/mLである。
いくつかの実施形態では、DNAse Iは、1mLの滅菌HBSSまたは別の緩衝液中で再構成される。凍結乾燥したストック酵素は、4KU/バイアルの濃度であった。いくつかの実施形態では、再構成後のDNase Iストックは、約1KU/mL~10KU/mL、例えば、約1KU/mL、約2KU/mL、約3KU/mL、約4KU/mL、約5KU/mL、約6KU/mL、約7KU/mL、約8KU/mL、約9KU/mL、または約10KU/mLの範囲である。
いくつかの実施形態では、酵素のストックは変化する可能性があるため、凍結乾燥ストックの濃度を確認し、それに応じて消化カクテルに追加される酵素の最終量を修正することに留意されたい。
いくつかの実施形態では、酵素混合物は、約4.7mLの滅菌HBSS中に約10.2ulの中性プロテアーゼ(0.36DMC U/mL)、21.3ulのコラゲナーゼ(1.2PZ/mL)及び250ulのDNAse I(200U/mL)を含む。
上に示されるように、いくつかの実施形態では、TILは、固形腫瘍に由来する。いくつかの実施形態では、固形腫瘍は、断片化されない。いくつかの実施形態では、固形腫瘍は断片化されず、全腫瘍として酵素消化に供される。いくつかの実施形態では、腫瘍は、コラゲナーゼ、DNase、及びヒアルロニダーゼを含む酵素混合物中で消化される。いくつかの実施形態では、腫瘍は、コラゲナーゼ、DNase、及びヒアルロニダーゼを含む酵素混合物中で1~2時間消化される。いくつかの実施形態では、腫瘍は、コラゲナーゼ、DNase、及びヒアルロニダーゼを含む酵素混合物中で1~2時間、37℃、5%COで消化される。いくつかの実施形態では、腫瘍は、コラゲナーゼ、DNase、及びヒアルロニダーゼを含む酵素混合物中で1~2時間、37℃、5%COで回転を伴って消化される。いくつかの実施形態では、腫瘍は、一定の回転を伴って一晩消化される。いくつかの実施形態では、腫瘍は、37℃、5%COで一定の回転を伴って一晩消化される。いくつかの実施形態では、全腫瘍が酵素と組み合わされて、腫瘍消化反応混合物が形成される。
いくつかの実施形態では、腫瘍は、滅菌緩衝液中の凍結乾燥酵素で再構成される。いくつかの実施形態では、緩衝液は、滅菌HBSSである。
いくつかの実施形態では、酵素混合物は、コラゲナーゼを含む。いくつかの実施形態では、コラゲナーゼは、コラゲナーゼIVである。いくつかの実施形態では、コラゲナーゼの作用ストックは、100mg/mLの10倍作用ストックである。
いくつかの実施形態では、酵素混合物は、DNAseを含む。いくつかの実施形態では、DNAseの作用ストックは、10,000IU/mLの10倍作用ストックである。
いくつかの実施形態では、酵素混合物は、ヒアルロニダーゼを含む。いくつかの実施形態では、ヒアルロニダーゼの作用ストックは、10mg/mLの10倍作用ストックである。
いくつかの実施形態では、酵素混合物は、10mg/mLのコラゲナーゼ、1000IU/mLのDNAse、及び1mg/mLのヒアルロニダーゼを含む。
いくつかの実施形態では、酵素混合物は、10mg/mLのコラゲナーゼ、500IU/mLのDNAse、及び1mg/mLのヒアルロニダーゼを含む。
一般に、腫瘍から取得された細胞懸濁液は、「一次細胞集団」または「新たに取得された」または「新たに単離された」細胞集団と呼ばれる。ある特定の実施形態では、新たに取得されたTIL細胞集団は、抗原提示細胞、IL-12、及びOKT-3を含む細胞培養培地に曝露される。
いくつかの実施形態では、断片化には、例えば、解剖及び消化を含む物理的断片化が含まれる。いくつかの実施形態では、断片化は、物理的断片化である。いくつかの実施形態では、断片化は、解剖である。いくつかの実施形態では、断片化は、消化によるものである。いくつかの実施形態では、TILは、最初に、患者から取得された酵素腫瘍消化物及び腫瘍断片から培養され得る。ある実施形態では、TILは、最初に、患者から得られた酵素腫瘍消化物及び腫瘍断片から培養され得る。
腫瘍が固形腫瘍であるいくつかの実施形態では、腫瘍試料が、例えば、ステップA(図8(特に、例えば図8B及び/または図8C)に提供される)で得られた後、腫瘍は物理的断片化を受ける。いくつかの実施形態では、断片化は、凍結保存前に起こる。いくつかの実施形態では、断片化は、凍結保存後に起こる。いくつかの実施形態では、断片化は、腫瘍を得た後に、いずれの凍結保存もない場合に起こる。いくつかの実施形態では、断片化ステップは、インビトロまたはエクスビボプロセスである。いくつかの実施形態では、腫瘍が断片化され、10、20、30、40個、またはそれ以上の断片または小片が、プライミングによる第1の拡張のために各容器に入れられる。いくつかの実施形態では、腫瘍が断片化され、30個または40個の断片または小片が、プライミングによる第1の拡張のために各容器に入れられる。いくつかの実施形態では、腫瘍が断片化され、40個の断片または小片が、プライミングによる第1の拡張のために各容器に入れられる。いくつかの実施形態では、複数の断片は、約4~約50個の断片を含み、各断片は、約27mmの体積を有する。いくつかの実施形態では、複数の断片は、約1300mm~約1500mmの総体積を伴う約30~約60個の断片を含む。いくつかの実施形態では、複数の断片は、約1350mmの総体積を伴う約50個の断片を含む。いくつかの実施形態では、複数の断片は、約1グラム~約1.5グラムの総質量を伴う約50個の断片を含む。いくつかの実施形態では、複数の断片は、約4個の断片を含む。
いくつかの実施形態では、TILは、腫瘍断片から取得される。いくつかの実施形態では、腫瘍断片は、鋭的解剖によって取得される。いくつかの実施形態では、腫瘍断片は、約1mm~10mmである。いくつかの実施形態では、腫瘍断片は、約1mm~8mmである。いくつかの実施形態では、腫瘍断片は、約1mmである。いくつかの実施形態では、腫瘍断片は、約2mmである。いくつかの実施形態では、腫瘍断片は、約3mmである。いくつかの実施形態では、腫瘍断片は、約4mmである。いくつかの実施形態では、腫瘍断片は、約5mmである。いくつかの実施形態では、腫瘍断片は、約6mmである。いくつかの実施形態では、腫瘍断片は、約7mmである。いくつかの実施形態では、腫瘍断片は、約8mmである。いくつかの実施形態では、腫瘍断片は、約9mmである。いくつかの実施形態では、腫瘍断片は、約10mmである。いくつかの実施形態では、腫瘍断片は、1~4mm×1~4mm×1~4mmである。いくつかの実施形態では、腫瘍断片は、1mm×1mm×1mmである。いくつかの実施形態では、腫瘍断片は、2mm×2mm×2mmである。いくつかの実施形態では、腫瘍断片は、3mm×3mm×3mmである。いくつかの実施形態では、腫瘍断片は、4mm×4mm×4mmである。
いくつかの実施形態では、腫瘍は、各小片上の出血性、壊死性、及び/または脂肪性組織の量を最小限に抑えるために断片化される。いくつかの実施形態では、腫瘍は、各小片上の出血性組織の量を最小限に抑えるために断片化される。いくつかの実施形態では、腫瘍は、各小片上の壊死性組織の量を最小限に抑えるために断片化される。いくつかの実施形態では、腫瘍は、各小片上の脂肪性組織の量を最小限に抑えるために断片化される。ある特定の実施形態では、腫瘍の断片化ステップは、インビトロまたはエクスビボ方法である。
いくつかの実施形態では、腫瘍の断片化は、腫瘍の内部構造を維持するために行われる。いくつかの実施形態では、腫瘍の断片化は、メスでのこ引き動作を行うことなく行われる。いくつかの実施形態では、TILは、腫瘍消化物から取得される。いくつかの実施形態では、腫瘍消化物は、例えば、RPMI1640(2mM GlutaMAX、10mg/mLゲンタマイシン、30U/mL DNase、及び1.0mg/mLコラゲナーゼ)であるが、これに限定されない酵素培地中でのインキュベーション、続いて、機械的解離(GentleMACS,Miltenyi Biotec,Auburn,CA)によって生成された。腫瘍を酵素培地に入れた後、腫瘍は、およそ1分間機械的に解離され得る。その後、溶液が5%CO中37℃で30分間インキュベートされ、その後、およそ1分間再び機械的に破壊され得る。5% CO中37℃で30分間再びインキュベートした後、腫瘍を、およそ1分間、3回目に機械的に破壊することができる。いくつかの実施形態では、大きい組織片が存在する場合、3回目の機械的破壊後、5%CO中37℃でさらに30分間インキュベートするかにかかわらず、1回または2回の追加の機械的解離が試料に適用された。いくつかの実施形態では、細胞懸濁液が多数の赤血球または死細胞を含む場合、最終インキュベーションの終わりに、Ficollを使用した密度勾配分離が行われて、これらの細胞を除去することができる。
いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張ステップ前の細胞懸濁液は、「一次細胞集団」または「新たに取得された」または「新たに単離された」細胞集団と呼ばれる。
いくつかの実施形態では、細胞は、試料単離後(例えば、腫瘍試料を得た後及び/または腫瘍試料から細胞懸濁液を得た後)、任意選択で凍結され得、ステップBに記載の拡張に入る前に凍結保存され得、これは以下でさらに詳細に説明されるとともに、図8(特に、例えば図8B)に例示される。
1.コア/小生検由来のTIL
いくつかの実施形態では、TILは、最初に、コア生検または同様の手順によって取得された患者腫瘍試料(「一次TIL」)から得られ、その後、本明細書に記載されるように、さらなる操作のためにより大きい集団に拡張され、任意で凍結保存され、任意で表現型及び代謝パラメータについて評価される。
いくつかの実施形態では、患者の腫瘍試料は、一般に、小生検、コア生検、針生検、または腫瘍細胞とTIL細胞との混合物を含有する試料を得るための他の手段により、当該技術分野で知られている方法を使用して取得することができる。一般に、腫瘍試料は、原発腫瘍、浸潤性腫瘍、または転移性腫瘍を含む、任意の固形腫瘍に由来し得る。腫瘍試料は、血液系悪性腫瘍から取得された腫瘍などの液体腫瘍であり得る。いくつかの実施形態では、試料は、複数の小さい腫瘍試料または生検に由来し得る。いくつかの実施形態では、試料は、同じ患者由来の単一の腫瘍からの複数の腫瘍試料を含むことができる。いくつかの実施形態では、試料は、同じ患者由来の1、2、3、または4つの腫瘍からの複数の腫瘍試料を含むことができる。いくつかの実施形態では、試料は、同じ患者由来の複数の腫瘍からの複数の腫瘍試料を含むことができる。固形腫瘍は、黒色腫である。
一般に、腫瘍コアまたは断片から取得された細胞懸濁液は、「一次細胞集団」または「新たに取得された」または「新たに単離された」細胞集団と呼ばれる。ある特定の実施形態では、新たに取得されたTIL細胞集団は、抗原提示細胞、IL-2、及びOKT-3を含む細胞培養培地に曝露される。
いくつかの実施形態では、腫瘍が転移性であり、かつ原発性病変が過去に効率的に治療/除去された場合、転移性病変のうちの1つの除去が必要とされ得る。いくつかの実施形態では、最も侵襲性の低いアプローチは、皮膚病変、または利用可能な場合、首または腋窩領域のリンパ節を除去することである。いくつかの実施形態では、皮膚病変が除去されるか、またはその小生検が除去される。いくつかの実施形態では、リンパ節またはその小生検が除去される。いくつかの実施形態では、腫瘍は、黒色腫である。いくつかの実施形態では、黒色腫の小生検は、ほくろまたはその一部分を含む。
いくつかの実施形態では、小生検は、パンチ生検である。いくつかの実施形態では、パンチ生検は、皮膚に押し込まれた円形の刃で取得される。いくつかの実施形態では、パンチ生検は、疑わしいほくろの周りの皮膚に押し込まれた円形の刃で得られる。いくつかの実施形態では、パンチ生検は、皮膚に押し込まれた円形の刃で得られ、丸い皮膚片が採取される。いくつかの実施形態では、小生検は、パンチ生検であり、腫瘍の丸い部分が採取される。
いくつかの実施形態では、小生検は、切除生検である。いくつかの実施形態では、小生検は、切除生検であり、ほくろまたは増殖全体が除去される。いくつかの実施形態では、小生検は、切除生検であり、ほくろまたは増殖全体が、正常に見える皮膚の小縁とともに除去される。
いくつかの実施形態では、小生検は、切開生検である。いくつかの実施形態では、小生検は、切開生検であり、ほくろまたは増殖の最も不規則な部分のみが採取される。いくつかの実施形態では、小生検は、切開生検であり、切開生検は、疑わしいほくろが非常に大きい場合など、他の技法を達成することができない場合に使用される。
「固形腫瘍」という用語は、通常、嚢胞または液体領域を含まない異常な組織塊を指す。固形腫瘍は、良性または悪性であり得る。「固形腫瘍癌」という用語は、悪性、腫瘍性、またはがん性の固形腫瘍を指す。いくつかの実施形態では、がんは、黒色腫である。固形腫瘍の組織構造には、実質(がん細胞)を含む相互依存的組織区画、及びがん細胞が分散しており、かつ支持微小環境を提供し得る支持間質細胞が含まれる。
いくつかの実施形態では、腫瘍由来の試料は、細針吸引物(FNA)、コア生検、小生検(例えば、パンチ生検を含む)として取得される。いくつかの実施形態では、試料は、最初にG-Rex 10に入れられる。いくつかの実施形態では、1つまたは2つのコア生検及び/または小生検試料が存在する場合、試料は、最初にG-Rex 10に入れられる。いくつかの実施形態では、3、4、5、6、8、9、または10個以上のコア生検及び/または小生検試料が存在する場合、試料は、最初にG-Rex 100に入れられる。いくつかの実施形態では、3、4、5、6、8、9、または10個以上のコア生検及び/または小生検試料が存在する場合、試料は、最初にG-Rex500に入れられる。
FNAは、例えば、黒色腫を含む皮膚腫瘍から取得することができる。いくつかの事例では、黒色腫を有する患者は、外科的治療を以前に受けたことがある。
本明細書に記載のTILは、FNA試料から得られ得る。いくつかの事例では、FNA試料は、18ゲージ針~25ゲージ針の範囲の細いゲージ針を使用して、患者から得られるか、または単離される。細いゲージ針は、18ゲージ、19ゲージ、20ゲージ、21ゲージ、22ゲージ、23ゲージ、24ゲージ、または25ゲージであり得る。いくつかの実施形態では、患者由来のFNA試料は、少なくとも400,000個のTIL、例えば、400,000個のTIL、450,000個のTIL、500,000個のTIL、550,000個のTIL、600,000個のTIL、650,000個のTIL、700,000個のTIL、750,000個のTIL、800,000個のTIL、850,000個のTIL、900,000個のTIL、950,000個のTIL、またはそれ以上を含み得る。
いくつかの事例では、本明細書に記載のTILは、コア生検試料から取得される。いくつかの事例では、コア生検試料は、11ゲージ針~16ゲージ針の範囲の外科用または医療用針を使用して、患者から得られるか、または単離される。針は、11ゲージ、12ゲージ、13ゲージ、14ゲージ、15ゲージ、または16ゲージであり得る。いくつかの実施形態では、患者由来のコア生検試料は、少なくとも400,000個のTIL、例えば、400,000個のTIL、450,000個のTIL、500,000個のTIL、550,000個のTIL、600,000個のTIL、650,000個のTIL、700,000個のTIL、750,000個のTIL、800,000個のTIL、850,000個のTIL、900,000個のTIL、950,000個のTIL、またはそれ以上を含み得る。
一般に、採取された細胞懸濁液は、「一次細胞集団」または「新たに採取された」細胞集団と呼ばれる。
いくつかの実施形態では、TILは、腫瘍消化物から得られない。いくつかの実施形態では、固形腫瘍コアは、断片化されない。
いくつかの実施形態では、TILは、腫瘍消化物から取得される。いくつかの実施形態では、腫瘍消化物は、例えば、RPMI1640(2mM GlutaMAX、10mg/mLゲンタマイシン、30U/mL DNase、及び1.0mg/mLコラゲナーゼ)であるが、これに限定されない酵素培地中でのインキュベーション、続いて、機械的解離(GentleMACS,Miltenyi Biotec,Auburn,CA)によって生成された。腫瘍を酵素培地に入れた後、腫瘍は、およそ1分間機械的に解離され得る。その後、溶液が5%CO中37℃で30分間インキュベートされ、その後、およそ1分間再び機械的に破壊され得る。5% CO中37℃で30分間再びインキュベートした後、腫瘍を、およそ1分間、3回目に機械的に破壊することができる。いくつかの実施形態では、大きい組織片が存在する場合、3回目の機械的破壊後、5%CO中37℃でさらに30分間インキュベートするかにかかわらず、1回または2回の追加の機械的解離が試料に適用された。いくつかの実施形態では、細胞懸濁液が多数の赤血球または死細胞を含む場合、最終インキュベーションの終わりに、Ficollを使用した密度勾配分離が行われて、これらの細胞を除去することができる。
いくつかの実施形態では、第1のTIL集団を取得することは、多病変サンプリング法を含む。
腫瘍解離酵素混合物には、1つ以上の解離(消化)酵素、例えば、限定されないが、コラゲナーゼ(任意のブレンドまたはコラゲナーゼの種類を含む)、Accutase(商標)、Accumax(商標)、ヒアルロニダーゼ、中性プロテアーゼ(ディスパーゼ)、キモトリプシン、キモパパイン、トリプシン、カゼイナーゼ、エラスターゼ、パパイン、XIV型プロテアーゼ(プロナーゼ)、デオキシリボヌクレアーゼI(DNase)、トリプシン阻害剤、任意の他の解離酵素またはタンパク質分解酵素、及びそれらの任意の組み合わせが含まれ得る。
いくつかの実施形態では、解離酵素は、凍結乾燥酵素から再構成される。いくつかの実施形態では、凍結乾燥酵素は、HBSSなどの滅菌緩衝液の量で再構成される。
いくつかの事例では、コラゲナーゼ(アニマルフリー1型コラゲナーゼなど)は、10mLの滅菌HBSSまたは別の緩衝液中で再構成される。凍結乾燥ストック酵素は、2892PZ U/バイアルの濃度であり得る。いくつかの実施形態では、コラゲナーゼは、5mL~15mLの緩衝液中で再構成される。いくつかの実施形態では、再構成後のコラゲナーゼストックは、約100PZ U/mL~約400PZ U/mLの範囲、例えば、約100PZ U/mL~約400PZ U/mL、約100PZ U/mL~約350PZ U/mL、約100PZ U/mL~約300PZ U/mL、約150PZ U/mL~約400PZ U/mL、約100PZ U/mL、約150PZ U/mL、約200PZ U/mL、約210PZ U/mL、約220PZ U/mL、約230PZ U/mL、約240PZ U/mL、約250PZ U/mL、約260PZ U/mL、約270PZ U/mL、約280PZ U/mL、約289.2PZ U/mL、約300PZ U/mL、約350PZ U/mL、または約400PZ U/mLである。
いくつかの実施形態では、中性プロテアーゼは、1mLの滅菌HBSSまたは別の緩衝液中で再構成される。凍結乾燥ストック酵素は、175DMC U/バイアルの濃度であり得る。凍結乾燥ストック酵素は、175DMC/mLの濃度であり得る。いくつかの実施形態では、再構成後の中性プロテアーゼストックは、約100DMC/mL~約400DMC/mLの範囲、例えば、約100DMC/mL~約400DMC/mL、約100DMC/mL~約350DMC/mL、約100DMC/mL~約300DMC/mL、約150DMC/mL~約400DMC/mL、約100DMC/mL、約110DMC/mL、約120DMC/mL、約130DMC/mL、約140DMC/mL、約150DMC/mL、約160DMC/mL、約170DMC/mL、約175DMC/mL、約180DMC/mL、約190DMC/mL、約200DMC/mL、約250DMC/mL、約300DMC/mL、約350DMC/mL、または約400DMC/mLである。
いくつかの実施形態では、DNAse Iは、1mLの滅菌HBSSまたは別の緩衝液中で再構成される。凍結乾燥したストック酵素は、4KU/バイアルの濃度であった。いくつかの実施形態では、再構成後のDNase Iストックは、約1KU/mL~10KU/mL、例えば、約1KU/mL、約2KU/mL、約3KU/mL、約4KU/mL、約5KU/mL、約6KU/mL、約7KU/mL、約8KU/mL、約9KU/mL、または約10KU/mLの範囲である。
いくつかの実施形態では、酵素のストックは変化する可能性があるため、凍結乾燥ストックの濃度を確認し、それに応じて消化カクテルに追加される酵素の最終量を修正することに留意されたい。
いくつかの実施形態では、酵素混合物は、約4.7mLの滅菌HBSS中に約10.2ulの中性プロテアーゼ(0.36DMC U/mL)、21.3ulのコラゲナーゼ(1.2PZ/mL)及び250ulのDNAse I(200U/mL)を含む。
2.胸水TIL
いくつかの実施形態では、試料は、胸腔内液試料である。いくつかの実施形態では、本明細書に記載のプロセスによる拡張のためのTILの供給源は、胸腔内液試料である。いくつかの実施形態では、試料は、胸水由来試料である。いくつかの実施形態では、本明細書に記載のプロセスによる拡張のためのTILの供給源は、胸水由来試料である。例えば、米国特許公開第US2014/0295426号に記載されている方法を参照されたく、これはすべての目的のためにその全体が参照により本明細書に組み込まれる。
いくつかの実施形態では、TILと思われる、及び/またはTILを含む任意の胸腔内液または胸水を利用することができる。かかる試料は、NSCLCもしくはSCLCなどの原発性または転移性肺癌に由来し得る。いくつかの実施形態では、試料は、別の臓器、例えば、乳房、卵巣、結腸、または前立腺に由来する二次転移性がん細胞であり得る。いくつかの実施形態では、本明細書に記載の拡張方法で使用する試料は、胸膜浸出液である。いくつかの実施形態では、本明細書に記載の拡張方法で使用する試料は、胸膜漏出液である。他の生体試料は、例えば、腹部からの腹水または膵嚢胞液を含む、TILを含有する他の漿液を含み得る。腹水及び胸腔内液は、非常に類似した化学系を伴い、腹部及び肺の両方が、悪性腫瘍における同じ物質の胸膜空間及び腹部空間に中皮線及び流体形態を有し、いくつかの実施形態では、かかる流体は、TILを含有する。本開示が胸水を例示するいくつかの実施形態では、同じ方法が、胸腔内液またはTILを含有する他の嚢胞液を使用して同様の結果で実行されてもよい。
いくつかの実施形態では、胸腔内液は、患者から直接除去された未処理の形態である。いくつかの実施形態では、未処理の胸腔内液は、接触ステップの前に、EDTAまたはヘパリンチューブなどの標準的な採血管に入れられる。いくつかの実施形態では、未処理の胸腔内液は、接触ステップの前に、標準的なCellSave(登録商標)チューブ(Veridex)に入れられる。いくつかの実施形態では、試料は、生存TILの数の減少を避けるために、患者から採取した直後にCellSaveチューブに入れられる。生存TILの数は、4℃であっても、未処理の胸腔内液中に放置されると、24時間以内に大幅に減少する可能性がある。いくつかの実施形態では、試料は、患者からの除去後1時間、5時間、10時間、15時間、または最大24時間以内に適切な収集チューブ内に入れられる。いくつかの実施形態では、試料は、4℃で、患者からの除去後1時間、5時間、10時間、15時間、または最大24時間以内に適切な収集チューブ内に入れられる。
いくつかの実施形態では、選択された対象からの胸腔内液試料は、希釈され得る。一実施形態では、希釈は、胸腔内液対希釈剤が1:10である。別の実施形態では、希釈は、胸腔内液対希釈剤が1:9である。別の実施形態では、希釈は、胸腔内液対希釈剤が1:8である。別の実施形態では、希釈は、胸腔内液対希釈剤が1:5である。別の実施形態では、希釈は、胸腔内液対希釈剤が1:2である。別の実施形態では、希釈は、胸腔内液対希釈剤が1:1である。いくつかの実施形態では、希釈剤には、生理食塩水、リン酸緩衝生理食塩水、別の緩衝液、または生理学的に許容される希釈剤が含まれる。いくつかの実施形態では、試料は、患者からの収集及び希釈の直後にCellSaveチューブ内に入れられ、生存TILの減少を回避し、これは、4℃であっても、未処理の胸腔内液中に放置された場合、24~48時間以内に有意に生じ得る。いくつかの実施形態では、胸腔内液試料は、患者からの除去及び希釈後1時間、5時間、10時間、15時間、24時間、36時間、最大48時間以内に適切な収集チューブ内に入れられる。いくつかの実施形態では、胸腔内液試料は、4℃で、患者からの除去及び希釈後1時間、5時間、10時間、15時間、24時間、36時間、最大48時間以内に適切な収集チューブ内に入れられる。
さらに別の実施形態では、胸腔内液試料は、さらなる処理ステップの前に、従来の手段によって濃縮される。いくつかの実施形態では、胸腔内液のこの前処理は、方法を実施する実験室への輸送のために、またはその後の分析のために(例えば、採取後24~48時間より後に)胸水を凍結保存しなければならない状況において好ましい。いくつかの実施形態では、胸腔内液試料は、それが対象から採取された後に胸腔内液試料を遠心分離し、遠心分離物またはペレットを緩衝液中に再懸濁することによって調製される。いくつかの実施形態では、胸腔内液試料は、輸送または後の分析及び/または処理のために凍結保存される前に、複数の遠心分離及び再懸濁に供される。
いくつかの実施形態では、胸腔内液試料は、濾過法を使用することによって、さらなる処理ステップの前に濃縮される。いくつかの実施形態では、接触ステップで使用される胸腔内液試料は、胸腔内液が膜を通過することを可能にするが腫瘍細胞を保持する、既知で本質的に均一な孔径を含むフィルターをとおして流体を濾過することによって調製される。いくつかの実施形態では、膜の細孔の直径は、少なくとも4μMであり得る。別の実施形態では、細孔直径は、5μM以上であり得、他の実施形態では、6、7、8、9、または10μMのうちのいずれかであり得る。濾過後、膜によって保持されたTILを含む細胞を、膜から適切な生理学的に許容される緩衝液にすすいでもよい。次いで、このように濃縮されたTILを含む細胞は、方法の接触ステップで使用することができる。
いくつかの実施形態では、胸腔内液試料(例えば、未処理の胸腔内液を含む)、希釈胸腔内液、または再懸濁細胞ペレットは、試料中に存在する無核赤血球を特異的に溶解する溶解試薬と接触させる。いくつかの実施形態では、このステップは、胸腔内液がかなりの数のRBCを含む状況で、さらなる処理ステップの前に行われる。好適な溶解試薬には、単一の溶解試薬もしくは溶解試薬及びクエンチ試薬、または溶解剤、クエンチ試薬及び固定試薬が含まれる。好適な溶解システムは市販されており、BD Pharm Lyse(商標)システム(Becton Dickenson)が含まれる。他の溶解システムには、Versalyse(商標)システム、FACSlyse(商標)システム(Becton Dickenson)、Immunoprep(商標)システム、またはErythrolyse IIシステム(Beckman Coulter,Inc.)、または塩化アンモニウムシステムが含まれる。いくつかの実施形態では、溶解試薬は、赤血球の効率的な溶解、ならびに胸水におけるTIL及びTILの表現型特性の保存のような主要な要件によって異なり得る。溶解のための単一の試薬を利用することに加えて、本明細書に記載の方法に有用な溶解システムは、第2の試薬、例えば、方法の残りのステップ中に溶解試薬の効果をクエンチまたは遅延させるもの、例えばStabilyse(商標)試薬(Beckman Coulter,Inc.)を含むことができる。溶解試薬の選択または方法の好ましい実施に応じて、従来の固定試薬を使用することもできる。
いくつかの実施形態では、本明細書に記載されるように、未処理、希釈または多重遠心分離または処理された胸腔内液試料は、本明細書で提供されるようにさらに処理及び/または拡張される前に、約-140℃の温度で凍結保存される。
3.末梢血から末梢血リンパ球(PBL)を拡張する方法
PBL方法1。本発明のある実施形態では、PBLは、本明細書に記載のプロセスを使用して拡張される。本発明のある実施形態では、この方法は、全血からPBMC試料を得ることを含む。ある実施形態では、この方法は、非CD19+画分の負の選択を使用して、PBMCから純粋なT細胞を単離することによってT細胞を濃縮することを含む。ある実施形態では、この方法は、非CD19+画分の磁気ビーズベースの負の選択を使用して、PBMCから純粋なT細胞を単離することによってT細胞を濃縮することを含む。
本発明のある実施形態では、PBL方法1は、以下のように行われる。0日目に、凍結保存されたPBMC試料を解凍し、PBMCを計数する。T細胞を、ヒトPan T細胞単離キット及びLSカラム(Miltenyi Biotec)を使用して単離する。
PBL方法2。本発明のある実施形態では、PBLは、全血からPBMC試料を得ることを含むPBL方法2を使用して拡張される。PBMC由来のT細胞は、PBMCを37℃で少なくとも3時間インキュベートし、その後、次いで非接着細胞を単離することによって濃縮される。
本発明のある実施形態では、PBL方法2は、以下のように行われる。0日目に、凍結保存されたPMBC試料を解凍し、PBMC細胞を、CM-2培地中の6ウェルプレートに600万細胞/ウェルで播種し、37℃で3時間インキュベートする。3時間後、PBLである非接着細胞を取り出し、計数する。
PBL方法3。本発明のある実施形態では、PBLは、末梢血からPBMC試料を得ることを含むPBL方法3を使用して拡張される。B細胞は、CD19+選択を使用して単離され、T細胞は、PBMC試料の非CD19+画分の負の選択を使用して選択される。
本発明のある実施形態では、PBL方法3は、以下のように行われる。0日目に、末梢血から取得された凍結保存されたPBMCを解凍し、計数する。CD19+B細胞を、CD19 Multisortキット、ヒト(Miltenyi Biotec)を使用して選別する。非CD19+細胞画分のうち、T細胞を、ヒトPan T細胞単離キット及びLSカラム(Miltenyi Biotec)を使用して精製する。
ある実施形態では、PBMCは、全血試料から単離される。ある実施形態では、PBMC試料は、PBLを拡張するための出発材料として使用される。ある実施形態では、試料は、拡張プロセス前に凍結保存される。別の実施形態では、新鮮な試料が、PBLを拡張するための出発材料として使用される。本発明のある実施形態では、T細胞は、当該技術分野で知られている方法を使用してPBMCから単離される。ある実施形態では、T細胞は、ヒトPan T細胞単離キット及びLSカラムを使用して単離される。本発明のある実施形態では、T細胞は、当該技術分野で知られている抗体選択方法、例えば、CD19の負の選択を使用して、PBMCから単離される。
本発明のある実施形態では、PBMC試料は、非接着細胞を特定するのに有効な所望の温度である期間インキュベートされる。本発明のある実施形態では、インキュベーション時間は、約3時間である。本発明のある実施形態では、温度は、約37℃である。その後、非接着細胞は、上記のプロセスを使用して拡張される。
いくつかの実施形態では、PBMC試料は、キナーゼ阻害剤またはITK阻害剤を含むレジメンで任意選択で前治療された対象または患者由来のものである。いくつかの実施形態では、腫瘍試料は、キナーゼ阻害剤またはITK阻害剤を含むレジメンで前治療された対象または患者由来のものである。いくつかの実施形態では、PBMC試料は、キナーゼ阻害剤またはITK阻害剤を含むレジメンで前治療されており、少なくとも1ヶ月間、少なくとも2ヶ月間、少なくとも3ヶ月間、少なくとも4ヶ月間、少なくとも5ヶ月間、少なくとも6ヶ月間、または1年間、またはそれ以上治療を受けた対象または患者由来のものである。別の実施形態では、PBMCは、イブルチニブなどのITK阻害剤レジメンを現在受けている患者に由来する。
いくつかの実施形態では、PBMC試料は、キナーゼ阻害剤またはITK阻害剤を含むレジメンで前治療されており、キナーゼ阻害剤またはイブルチニブなどのITK阻害剤での治療に不応性である対象または患者由来のものである。
いくつかの実施形態では、PBMC試料は、キナーゼ阻害剤またはITK阻害剤を含むレジメンで前治療されたが、もはやキナーゼ阻害剤またはITK阻害剤での治療を受けていない対象または患者由来のものである。いくつかの実施形態では、PBMC試料は、キナーゼ阻害剤またはITK阻害剤を含むレジメンで前治療されたが、もはやキナーゼ阻害剤またはITK阻害剤での治療を受けておらず、少なくとも1ヶ月間、少なくとも2ヶ月間、少なくとも3ヶ月間、少なくとも4ヶ月間、少なくとも5ヶ月間、少なくとも6ヶ月間、または少なくとも1年間、またはそれ以上治療を受けていない対象または患者由来のものである。別の実施形態では、PBMCは、ITK阻害剤に以前に曝露されたが、少なくとも3ヶ月、少なくとも6ヶ月、少なくとも9ヶ月、または少なくとも1年以内に治療されていない患者に由来する。
本発明のある実施形態では、0日目に、細胞がCD19+について選択され、それに応じて選別される。本発明のある実施形態では、選択は、抗体結合ビーズを使用して行われる。本発明のある実施形態では、純粋なT細胞が、0日目にPBMCから単離される。
本発明のある実施形態では、イブルチニブまたは他のITK阻害剤で前治療されていない患者の場合、10~15mLのバフィーコートは、約5×10個のPBMCを産生し、これは、次いで、約5.5×10個のPBLを産生する。
本発明のある実施形態では、イブルチニブまたは他のITK阻害剤で前治療された患者の場合、拡張プロセスは、約20×10個のPBLを産生する。本発明のある実施形態では、40.3×10個のPBMCは、約4.7×10個のPBLを産生する。
前述の実施形態のうちのいずれにおいても、PBMCは、全血試料から、アフェレーシスによって、バフィーコートから、またはPBMCを得るための当該技術分野で知られている任意の他の方法から得られ得る。
4.骨髄由来のPBMCから骨髄浸潤リンパ球(MIL)を拡張する方法
MIL方法3。本発明のある実施形態では、この方法は、骨髄からPBMCを得ることを含む。0日目に、PBMCがCD3+/CD33+/CD20+/CD14+について選択され、選別され、非CD3+/CD33+/CD20+/CD14+細胞画分が超音波処理され、超音波処理された細胞画分の一部が選択された細胞画分に戻し追加される。
本発明のある実施形態では、MIL方法3は、以下のように行われる。0日目に、凍結保存されたPBMC試料を解凍し、PBMCを計数する。細胞を、CD3、CD33、CD20、及びCD14抗体で染色し、選別されたS3e細胞(Bio-Rad)を使用して選別する。細胞を、免疫細胞画分(またはMIL画分)(CD3+CD33+CD20+CD14+)及びAML芽球画分(非CD3+CD33+CD20+CD14+)の2つの画分に選別する。
本発明のある実施形態では、PBMCは、骨髄から得られる。ある実施形態では、PBMCは、アフェレーシス、吸引、針生検、または当該技術分野で知られている他の同様の手段により骨髄から得られる。ある実施形態では、PBMCは、新鮮である。別の実施形態では、PBMCは、凍結保存される。
本発明のある実施形態では、MILは、10~50mLの骨髄穿刺液から拡張される。本発明のある実施形態では、10mLの骨髄穿刺液が患者から取得される。別の実施形態では、20mLの骨髄穿刺液が患者から取得される。別の実施形態では、30mLの骨髄穿刺液が患者から取得される。別の実施形態では、40mLの骨髄穿刺液が患者から取得される。別の実施形態では、50mLの骨髄穿刺液が患者から取得される。
本発明のある実施形態では、約10~50mLの骨髄穿刺液から産生されたPBMCの数は、約5×10~約10×10個のPBMCである。別の実施形態では、産生されたPMBCの数は、約7×10個のPBMCである。
本発明のある実施形態では、約5×10~約10×10個のPBMCは、約0.5×10~約1.5×10個のMILを産生する。本発明のある実施形態では、約1×10個のMILが産生される。
本発明のある実施形態では、骨髄吸引物から得られた12×10個のPBMCは、およそ1.4×10個のMILを産生する。
前述の実施形態のうちのいずれにおいても、PBMCは、全血試料から、骨髄から、アフェレーシスによって、バフィーコートから、またはPBMCを得るための当該技術分野で知られている任意の他の方法から得られ得る。
B.ステップB:プライミングによる第1の拡張
いくつかの実施形態では、本方法は、より古いTIL(すなわち、対象/患者への投与前により多くの複製ラウンドをさらに受けたTIL)よりも追加の治療的利益を提供し得る、より若いTILを提供する。若いTILの特徴は、文献、例えば、Donia,at al.,Scandinavian Journal of Immunology,75:157-167(2012)、Dudley et al.,Clin Cancer Res,16:6122-6131(2010)、Huang et al.,J Immunother,28(3):258-267(2005)、Besser et al.,Clin Cancer Res,19(17):OF1-OF9(2013)、Besser et al.,J Immunother 32:415-423(2009)、Robbins,et al.,J Immunol 2004;173:7125-7130、Shen et al.,J Immunother,30:123-129(2007)、Zhou,et al.,J Immunother,28:53-62(2005)、及びTran,et al.,J Immunother,31:742-751(2008)に記載されており、これらはすべて、参照によりそれらの全体が本明細書に組み込まれる。
例えば、図1(特に、例えば、図1B及び/または図8C)のステップAに記載されるものなどの腫瘍断片及び/または腫瘍断片の解剖または消化後に、得られた細胞は、腫瘍及び他の細胞よりもTILの成長を好む条件下で、IL-2、OKT-3、及びフィーダー細胞(例えば、抗原提示フィーダー細胞)を含有する血清中で培養される。いくつかの実施形態では、IL-2、OKT-3、及びフィーダー細胞は、腫瘍消化物及び/または腫瘍断片とともに培養開始時に(例えば、0日目に)追加される。いくつかの実施形態では、腫瘍消化物及び/または腫瘍断片は、1容器当たり最大60個の断片及び6000IU/mLのIL-2を含む容器内でインキュベートされる。いくつかの実施形態では、この一次細胞集団は、数日間、一般に1~8日間培養され、その結果、バルクTIL集団、一般に約1×10のバルクTIL細胞を生じる。いくつかの実施形態では、この一次細胞集団は、数日間、一般に1~7日間培養され、その結果、バルクTIL集団、一般に約1×10のバルクTIL細胞を生じる。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張は、1~8日間起こり、その結果、バルクTIL集団、一般に約1×10のバルクTIL細胞を生じる。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張は、1~7日間起こり、その結果、バルクTIL集団、一般に約1×10のバルクTIL細胞を生じる。いくつかの実施形態では、このプライミングによる第1の拡張は、5~8日間起こり、その結果、バルクTIL集団、一般に約1×10のバルクTIL細胞を生じる。いくつかの実施形態では、このプライミングによる第1の拡張は、5~7日間起こり、その結果、バルクTIL集団、一般に約1×10のバルクTIL細胞を生じる。いくつかの実施形態では、このプライミングによる第1の拡張は、約6~8日間起こり、その結果、バルクTIL集団、一般に、約1×10のバルクTIL細胞を生じる。いくつかの実施形態では、このプライミングによる第1の拡張は、約6~7日間起こり、その結果、バルクTIL集団、一般に、約1×10のバルクTIL細胞を生じる。いくつかの実施形態では、このプライミングによる第1の拡張は、約7~8日間起こり、その結果、バルクTIL集団、一般に、約1×10のバルクTIL細胞を生じる。いくつかの実施形態では、このプライミングによる第1の拡張は、約7日間起こり、その結果、バルクTIL集団、一般に約1×10のバルクTIL細胞をもたらす。いくつかの実施形態では、このプライミングによる第1の拡張は、約8日間起こり、その結果、バルクTIL集団、一般に約1×10のバルクTIL細胞をもたらす。
好ましい実施形態では、TILの拡張は、以下及び本明細書に記載されるプライミングによる第1の拡張ステップ(例えば、pre-REPまたはプライミングREPと称されるプロセスを含み得、0日目及び/または培養開始からのフィーダー細胞を含有する、図8(特に、例えば図8B及び/または図8C)のステップBに記載されるものなど)、続いて以下のステップD及び本明細書に記載される急速な第2の拡張(ステップD、急速拡張プロトコル(REP)ステップと称されるプロセスを含む)、続いて任意に凍結保存、続いて以下及び本明細書に記載される第2のステップD(再刺激REPステップと称されるプロセスを含む)を使用して行うことができる。このプロセスから取得されたTILは、本明細書に記載の表現型特徴及び代謝パラメータについて任意で特徴付けられ得る。いくつかの実施形態では、腫瘍断片は、約1mm~10mmである。
いくつかの実施形態では、第1の拡張培養培地は、培養培地の略語である「CM」と称される。いくつかの実施形態では、ステップBのCMは、10%ヒトAB血清、25mM Hepes、及び10mg/mLゲンタマイシンを補充した、GlutaMAXを含むRPMI 1640からなる。
いくつかの実施形態では、240個以下の腫瘍断片が存在する。いくつかの実施形態では、4つ以下の容器に入れられた240個以下の腫瘍断片が存在する。いくつかの実施形態では、容器は、G-Rex 100MCSフラスコである。いくつかの実施形態では、60個以下の腫瘍断片が1つの容器に入れられる。いくつかの実施形態では、各容器は、1容器当たり500mL以下の培地を含む。いくつかの実施形態では、培地は、IL-2を含む。いくつかの実施形態では、培地は、6000IU/mLのIL-2を含む。いくつかの実施形態では、培地は、抗原提示フィーダー細胞(本明細書では「抗原提示細胞」とも称される)を含む。いくつかの実施形態では、培地は、容器当たり2.5×10の抗原提示フィーダー細胞を含む。いくつかの実施形態では、培地は、OKT-3を含む。いくつかの実施形態では、培地は、容器当たり30ng/mLのOKT-3を含む。いくつかの実施形態では、容器は、G-Rex 100MCSフラスコである。いくつかの実施形態では、培地は、6000IU/mLのIL-2、30ngのOKT-3、及び2.5×10の抗原提示フィーダー細胞を含む。いくつかの実施形態では、培地は、容器当たり6000IU/mLのIL-2、30ng/mLのOKT-3、及び2.5×10の抗原提示フィーダー細胞を含む。
腫瘍断片の調製後、結果として得られた細胞(すなわち、一次細胞集団である断片)は、腫瘍及び他の細胞よりもTILの成長を好み、かつ0日目の培養開始からTILプライミング及び加速された成長を可能にする条件下で、IL-2、抗原提示フィーダー細胞、及びOKT-3を含む培地中で培養される。いくつかの実施形態では、腫瘍消化物及び/または腫瘍断片は、6000IU/mLのIL-2、ならびに抗原提示フィーダー細胞及びOKT-3とインキュベートされる。この一次細胞集団は、数日間、一般に1~8日間培養され、その結果、バルクTIL集団、一般に約1×10のバルクTIL細胞をもたらす。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張中の成長培地は、IL-2またはそのバリアント、ならびに抗原提示フィーダー細胞及びOKT-3を含む。いくつかの実施形態では、この一次細胞集団は、数日間、一般に1~7日間培養され、その結果、バルクTIL集団、一般に約1×10のバルクTIL細胞をもたらす。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張中の成長培地は、IL-2またはそのバリアント、ならびに抗原提示フィーダー細胞及びOKT-3を含む。いくつかの実施形態では、IL-2は、組換えヒトIL-2(rhIL-2)である。いくつかの実施形態では、IL-2ストック溶液は、1mgバイアルにつき20~30×10IU/mgの比活性を有する。いくつかの実施形態では、IL-2ストック溶液は、1mgバイアルにつき20×10IU/mgの比活性を有する。いくつかの実施形態では、IL-2ストック溶液は、1mgバイアルにつき25×10IU/mgの比活性を有する。いくつかの実施形態では、IL-2ストック溶液は、1mgバイアルにつき30×10IU/mgの比活性を有する。いくつかの実施形態では、IL-2ストック溶液は、4~8×10IU/mgのIL-2の最終濃度を有する。いくつかの実施形態では、IL-2ストック溶液は、5~7×10IU/mgのIL-2の最終濃度を有する。いくつかの実施形態では、IL-2ストック溶液は、6×10IU/mgのIL-2の最終濃度を有する。いくつかの実施形態では、IL-2ストック溶液は、実施例Cに記載されるように調製される。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張培養培地は、約10,000IU/mLのIL-2、約9,000IU/mLのIL-2、約8,000IU/mLのIL-2、約7,000IU/mLのIL-2、約6000IU/mLのIL-2、または約5,000IU/mLのIL-2を含む。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張培養培地は、約9,000IU/mLのIL-2~約5,000IU/mLのIL-2を含む。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張培養培地は、約8,000IU/mLのIL-2~約6,000IU/mLのIL-2を含む。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張培養培地は、約7,000IU/mLのIL-2~約6,000IU/mLのIL-2を含む。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張培養培地は、約6,000IU/mLのIL-2を含む。ある実施形態では、細胞培養培地は、IL-2をさらに含む。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張細胞培養培地は、約3000IU/mLのIL-2を含む。ある実施形態では、プライミングによる第1の拡張細胞培養培地は、IL-2をさらに含む。好ましい実施形態では、プライミングによる第1の拡張細胞培養培地は、約3000IU/mLのIL-2を含む。ある実施形態では、プライミングによる第1の拡張細胞培養培地は、約1000IU/mL、約1500IU/mL、約2000IU/mL、約2500IU/mL、約3000IU/mL、約3500IU/mL、約4000IU/mL、約4500IU/mL、約5000IU/mL、約5500IU/mL、約6000IU/mL、約6500IU/mL、約7000IU/mL、約7500IU/mL、または約8000IU/mLのIL-2を含む。ある実施形態では、プライミングによる第1の拡張細胞培養培地は、1000~2000IU/mL、2000~3000IU/mL、3000~4000IU/mL、4000~5000IU/mL、5000~6000IU/mL、6000~7000IU/mL、7000~8000IU/mL、または約8000IU/mLのIL-2を含む。
いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張培養培地は、約500IU/mLのIL-15、約400IU/mLのIL-15、約300IU/mLのIL-15、約200IU/mLのIL-15、約180IU/mLのIL-15、約160IU/mLのIL-15、約140IU/mLのIL-15、約120IU/mLのIL-15、または約100IU/mLのIL-15を含む。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張培養培地は、約500IU/mLのIL-15~約100IU/mLのIL-15を含む。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張培養培地は、約400IU/mLのIL-15~約100IU/mLのIL-15を含む。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張培養培地は、約300IU/mLのIL-15~約100IU/mLのIL-15を含む。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張培養培地は、約200IU/mLのIL-15を含む。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張細胞培養培地は、約180IU/mLのIL-15を含む。ある実施形態では、プライミングによる第1の拡張細胞培養培地は、IL-15をさらに含む。好ましい実施形態では、プライミングによる第1の拡張細胞培養培地は、約180IU/mLのIL-15を含む。
いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張培養培地は、約20IU/mLのIL-21、約15IU/mLのIL-21、約12IU/mLのIL-21、約10IU/mLのIL-21、約5IU/mLのIL-21、約4IU/mLのIL-21、約3IU/mLのIL-21、約2IU/mLのIL-21、約1IU/mLのIL-21、または約0.5IU/mLのIL-21を含む。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張培養培地は、約20IU/mLのIL-21~約0.5IU/mLのIL-21を含む。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張培養培地は、約15IU/mLのIL-21~約0.5IU/mLのIL-21を含む。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張培養培地は、約12IU/mLのIL-21~約0.5IU/mLのIL-21を含む。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張培養培地は、約10IU/mLのIL-21~約0.5IU/mLのIL-21を含む。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張培養培地は、約5IU/mLのIL-21~約1IU/mLのIL-21を含む。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張培養培地は、約2IU/mLのIL-21を含む。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張細胞培養培地は、約1IU/mLのIL-21を含む。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張細胞培養培地は、約0.5IU/mLのIL-21を含む。ある実施形態では、細胞培養培地は、IL-21をさらに含む。好ましい実施形態では、プライミングによる第1の拡張細胞培養培地は、約1IU/mLのIL-21を含む。
ある実施形態では、プライミングによる第1の拡張細胞培養培地は、OKT-3抗体を含む。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張細胞培養培地は、約30ng/mLのOKT-3抗体を含む。ある実施形態では、プライミングによる第1の拡張細胞培養培地は、約0.1ng/mL、約0.5ng/mL、約1ng/mL、約2.5ng/mL、約5ng/mL、約7.5ng/mL、約10ng/mL、約15ng/mL、約20ng/mL、約25ng/mL、約30ng/mL、約35ng/mL、約40ng/mL、約50ng/mL、約60ng/mL、約70ng/mL、約80ng/mL、約90ng/mL、約100ng/mL、約200ng/mL、約500ng/mL、及び約1μg/mLのOKT-3抗体を含む。ある実施形態では、細胞培養培地は、0.1ng/mL~1ng/mL、1ng/mL~5ng/mL、5ng/mL~10ng/mL、10ng/mL~20ngの間、20ng/mL~30ng/mL、30ng/mL~40ng/mL、40ng/mL~50ng/mL、及び50ng/mL~100ng/mLのOKT-3抗体を含む。ある実施形態では、細胞培養培地は、15ng/mL~30ng/mLのOKT-3抗体を含む。ある実施形態では、細胞培養培地は、30ng/mLのOKT-3抗体を含む。いくつかの実施形態では、OKT-3抗体は、ムロモナブである。
いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張細胞培養培地は、細胞培養培地中に1つ以上のTNFRSFアゴニストを含む。いくつかの実施形態では、TNFRSFアゴニストは、4-1BBアゴニストを含む。いくつかの実施形態では、TNFRSFアゴニストは4-1BBアゴニストであり、4-1BBアゴニストは、ウレルマブ、ウトミルマブ、EU-101、融合タンパク質、ならびにそれらの断片、誘導体、バリアント、バイオシミラー、及び組み合わせからなる群から選択される。いくつかの実施形態では、TNFRSFアゴニストは、0.1μg/mL~100μg/mLの細胞培養培地中濃度を達成するのに十分な濃度で追加される。いくつかの実施形態では、TNFRSFアゴニストは、20μg/mL~40μg/mLの細胞培養培地中濃度を達成するのに十分な濃度で追加される。
いくつかの実施形態では、1つ以上のTNFRSFアゴニストに加えて、プライミングによる第1の拡張細胞培養培地は、IL-2を約3000IU/mLの初期濃度で、及びOKT-3を約30ng/mLの初期濃度でさらに含み、1つ以上のTNFRSFアゴニストが、4-1BBアゴニストを含む。いくつかの実施形態では、1つ以上のTNFRSFアゴニストに加えて、プライミングによる第1の拡張細胞培養培地は、IL-2を約6000IU/mLの初期濃度で、及びOKT-3を約30ng/mLの初期濃度でさらに含み、1つ以上のTNFRSFアゴニストが、4-1BBアゴニストを含む。
いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張培養培地は、培養培地の略語である「CM」と称される。いくつかの実施形態では、それは、CM1(培養培地1)と称される。いくつかの実施形態では、CMは、10%ヒトAB血清、25mM Hepes、及び10mg/mLゲンタマイシンを補充した、GlutaMAXを含むRPMI1640からなる。いくつかの実施形態では、CMは、実施例に記載されるCM1であり、実施例Aを参照されたい。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張は、初期細胞培養培地または第1の細胞培養培地中で起こる。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張培地または初期細胞培養培地または第1の細胞培養培地は、IL-2、OKT-3、及び抗原提示フィーダー細胞(本明細書ではフィーダー細胞とも称される)を含む。
いくつかの実施形態では、本明細書に開示される拡張プロセスで使用される培地は、無血清培地または合成培地である。いくつかの実施形態では、無血清または合成培地は、基礎細胞培地ならびに血清サプリメント及び/または血清代替物を含む。いくつかの実施形態では、無血清または合成培地は、血清含有培地のロット間の変動に部分的に起因する実験変動を防止及び/または減少させるために使用される。
いくつかの実施形態では、無血清または合成培地は、基礎細胞培地ならびに血清サプリメント及び/または血清代替物を含む。いくつかの実施形態では、基礎細胞培地には、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion Basal Medium、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-Cell Expansion SFM、CTS(商標)AIM-V Medium、CTS(商標)AIM-V SFM、LymphoONE(商標)T-Cell Expansion Xeno-Free Medium、ダルベッコ改変イーグル培地(DMEM)、最小必須培地(MEM)、イーグル基礎培地(BME)、RPMI1640、F-10、F-12、最小必須培地(αMEM)、グラスゴー最小必須培地(G-MEM)、RPMI成長培地、及びイスコフ改変ダルベッコ培地が含まれるが、これらに限定されない。
いくつかの実施形態では、血清サプリメントまたは血清代替物には、CTS(商標)OpTmizer T-Cell Expansion Serum Supplement、CTS(商標)Immune Cell Serum Replacement、1つ以上のアルブミンまたはアルブミン代用物、1つ以上のアミノ酸、1つ以上のビタミン、1つ以上のトランスフェリンまたはトランスフェリン代用物、1つ以上の抗酸化剤、1つ以上のインスリンまたはインスリン代用物、1つ以上のコラーゲン前駆体、1つ以上の抗生物質、及び1つ以上の微量元素のうちの1つ以上が含まれるが、これらに限定されない。いくつかの実施形態では、合成培地は、アルブミンと、グリシン、L-ヒスチジン、L-イソロイシン、L-メチオニン、L-フェニルアラニン、L-プロリン、L-ヒドロキシプロリン、L-セリン、L-スレオニン、L-トリプトファン、L-チロシン、L-バリン、チアミン、還元型グルタチオン、L-アスコルビン酸-2-リン酸塩、鉄飽和トランスフェリン、インスリン、ならびに微量元素部分Ag、Al3+、Ba2+、Cd2+、Co2+、Cr3+、Ge4+、Se4+、Br、T、Mn2+、P、Si4+、V5+、Mo6+、Ni2+、Rb、Sn2+、及びZr4+を含有する化合物からなる群から選択される1つ以上の成分と、を含む。いくつかの実施形態では、合成培地は、L-グルタミン、重炭酸ナトリウム、及び/または2-メルカプトエタノールをさらに含む。
いくつかの実施形態では、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Immune Cell Serum Replacementは、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion Basal Medium、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion SFM、CTS(商標)AIM-V Medium、CTS(商標)AIM-V SFM、LymphoONE(商標)T-Cell Expansion Xeno-Free Medium、ダルベッコ改変イーグル培地(DMEM)、最小必須培地(MEM)、イーグル基礎培地(BME)、RPMI1640、F-10、F-12、最小必須培地(αMEM)、グラスゴー最小必須培地(G-MEM)、RPMI成長培地、及びイスコフ改変ダルベッコ培地を含むが、これらに限定されない、従来の成長培地とともに使用される。
いくつかの実施形態では、無血清または合成培地中の総血清代替物濃度(vol%)は、総無血清または合成培地の約1体積%、2体積%、3体積%、4体積%、5体積%、6体積%、7体積%、8体積%、9体積%、10体積%、11体積%、12体積%、13体積%、14体積%、15体積%、16体積%、17体積%、18体積%、19体積%、または20体積%である。いくつかの実施形態では、総血清代替物濃度は、無血清または合成培地の総体積の約3%である。いくつかの実施形態では、総血清代替物濃度は、無血清または合成培地の総体積の約5%である。いくつかの実施形態では、総血清代替物濃度は、無血清または合成培地の総体積の約10%である。
いくつかの実施形態では、無血清または合成培地は、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion SFM(ThermoFisher Scientific)である。CTS(商標)OpTmizer(商標)のいずれの製剤も、本発明において有用である。CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion SFMは、1LのCTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion Basal Mediumと、26mLのCTS(商標)OpTmizer(商標)T-Cell Expansion Supplementとの組み合わせであり、これらは使用前に一緒に混合される。いくつかの実施形態では、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion SFMには、約3%のCTS(商標)Immune Cell Serum Replacement(SR)(ThermoFisher Scientific)が補充されている。いくつかの実施形態では、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion SFMには、55mMの2-メルカプトエタノールとともに、約3%のCTS(商標)Immune Cell Serum Replacement(SR)(ThermoFisher Scientific)が補充されている。いくつかの実施形態では、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion SFMには、約3%のCTS(商標)Immune Cell Serum Replacement(SR)(ThermoFisher Scientific)が補充されており、培地中の2-メルカプトエタノールの最終濃度は、55μMである。
いくつかの実施形態では、合成培地は、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion SFM(ThermoFisher Scientific)である。CTS(商標)OpTmizer(商標)のいずれの製剤も、本発明において有用である。CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion SFMは、1LのCTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion Basal Mediumと、26mLのCTS(商標)OpTmizer(商標)T-Cell Expansion Supplementとの組み合わせであり、これらは使用前に一緒に混合される。いくつかの実施形態では、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion SFMには、55mMの2-メルカプトエタノールとともに、約3%のCTS(商標)Immune Cell Serum Replacement(SR)(ThermoFisher Scientific)が補充されている。いくつかの実施形態では、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion SFMには、約3%のCTS(商標)Immune Cell Serum Replacement(SR)(ThermoFisher Scientific)、55mMの2-メルカプトエタノール、及び2mMのL-グルタミンが補充されている。いくつかの実施形態では、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion SFMには、約3%のCTS(商標)Immune Cell Serum Replacement(SR)(ThermoFisher Scientific)、55mMの2-メルカプトエタノール、及び2mMのL-グルタミンが補充されており、約1000IU/mL~約8000IU/mLのIL-2をさらに含む。いくつかの実施形態では、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion SFMには、約3%のCTS(商標)Immune Cell Serum Replacement(SR)(ThermoFisher Scientific)、55mMの2-メルカプトエタノール、及び2mMのL-グルタミンが補充されており、約3000IU/mLのIL-2をさらに含む。いくつかの実施形態では、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion SFMには、約3%のCTS(商標)Immune Cell Serum Replacement(SR)(ThermoFisher Scientific)、55mMの2-メルカプトエタノール、及び2mMのL-グルタミンが補充されており、約6000IU/mLのIL-2をさらに含む。いくつかの実施形態では、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion SFMには、約3%のCTS(商標)Immune Cell Serum Replacement(SR)(ThermoFisher Scientific)及び55mMの2-メルカプトエタノールが補充されており、約1000IU/mL~約8000IU/mLのIL-2をさらに含む。いくつかの実施形態では、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion SFMには、約3%のCTS(商標)Immune Cell Serum Replacement(SR)(ThermoFisher Scientific)及び55mMの2-メルカプトエタノールが補充されており、約3000IU/mLのIL-2をさらに含む。いくつかの実施形態では、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion SFMには、約3%のCTS(商標)Immune Cell Serum Replacement(SR)(ThermoFisher Scientific)及び55mMの2-メルカプトエタノールが補充されており、約1000IU/mL~約6000IU/mLのIL-2をさらに含む。いくつかの実施形態では、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion SFMには、約3%のCTS(商標)Immune Cell Serum Replacement(SR)(ThermoFisher Scientific)及び約2mMのグルタミンが補充されており、約1000IU/mL~約8000IU/mLのIL-2をさらに含む。いくつかの実施形態では、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion SFMには、約3%のCTS(商標)Immune Cell Serum Replacement(SR)(ThermoFisher Scientific)及び約2mMのグルタミンが補充されており、約3000IU/mLのIL-2をさらに含む。いくつかの実施形態では、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion SFMには、約3%のCTS(商標)Immune Cell Serum Replacement(SR)(ThermoFisher Scientific)及び約2mMのグルタミンが補充されており、約6000IU/mLのIL-2をさらに含む。いくつかの実施形態では、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion SFMには、約3%のCTS(商標)Immune Cell Serum Replacement(SR)(ThermoFisher Scientific)が補充されており、培地中の2-メルカプトエタノールの最終濃度は、55μMである。
いくつかの実施形態では、無血清培地または合成培地には、約0.1mM~約10mM、0.5mM~約9mM、1mM~約8mM、2mM~約7mM、3mM~約6mM、または4mM~約5mMの濃度でグルタミン(すなわち、GlutaMAX(登録商標))が補充されている。いくつかの実施形態では、無血清培地または合成培地には、約2mMの濃度でグルタミン(すなわち、GlutaMAX(登録商標))が補充されている。
いくつかの実施形態では、無血清培地または合成培地には、約5mM~約150mM、10mM~約140mM、15mM~約130mM、20mM~約120mM、25mM~約110mM、30mM~約100mM、35mM~約95mM、40mM~約90mM、45mM~約85mM、50mM~約80mM、55mM~約75mM、60mM~約70mM、または約65mMの濃度で2-メルカプトエタノールが補充されている。いくつかの実施形態では、無血清培地または合成培地には、約55mMの濃度で2-メルカプトエタノールが補充されている。いくつかの実施形態では、培地中の2-メルカプトエタノールの最終濃度は、55μMである。
いくつかの実施形態では、参照により本明細書に組み込まれる国際PCT公開第WO/1998/030679号に記載されている合成培地は、本発明において有用である。その刊行物には、無血清真核細胞培養培地が記載されている。無血清真核細胞培養培地には、無血清培養下で細胞の成長を支持することができる無血清サプリメントを補充した基礎細胞培養培地が含まれる。無血清真核細胞培養培地サプリメントは、1つ以上のアルブミンまたはアルブミン代用物、1つ以上のアミノ酸、1つ以上のビタミン、1つ以上のトランスフェリンまたはトランスフェリン代用物、1つ以上の抗酸化剤、1つ以上のインスリンまたはインスリン代用物、1つ以上のコラーゲン前駆体、1つ以上の微量元素、及び1つ以上の抗生物質からなる群から選択される1つ以上の成分を含むか、またはそれらを組み合わせることによって取得される。いくつかの実施形態では、合成培地は、L-グルタミン、重炭酸ナトリウム、及び/またはベータ-メルカプトエタノールをさらに含む。いくつかの実施形態では、合成培地は、アルブミンまたはアルブミン代用物と、1つ以上のアミノ酸、1つ以上のビタミン、1つ以上のトランスフェリンまたはトランスフェリン代用物、1つ以上の抗酸化剤、1つ以上のインスリンまたはインスリン代用物、1つ以上のコラーゲン前駆体、及び1つ以上の微量元素からなる群から選択される1つ以上の成分と、を含む。いくつかの実施形態では、合成培地は、アルブミンと、グリシン、L-ヒスチジン、L-イソロイシン、L-メチオニン、L-フェニルアラニン、L-プロリン、L-ヒドロキシプロリン、L-セリン、L-スレオニン、L-トリプトファン、L-チロシン、L-バリン、チアミン、還元型グルタチオン、L-アスコルビン酸-2-リン酸塩、鉄飽和トランスフェリン、インスリン、ならびに微量元素部分Ag、Al3+、Ba2+、Cd2+、Co2+、Cr3+、Ge4+、Se4+、Br、T、Mn2+、P、Si4+、V5+、Mo6+、Ni2+、Rb、Sn2+、及びZr4+を含有する化合物からなる群から選択される1つ以上の成分と、を含む。いくつかの実施形態では、基礎細胞培地は、ダルベッコ改変イーグル培地(DMEM)、最小必須培地(MEM)、イーグル基礎培地(BME)、RPMI1640、F-10、F-12、最小必須培地(αMEM)、グラスゴー最小必須培地(G-MEM)、RPMI成長培地、及びイスコフ改変ダルベッコ培地からなる群から選択される。
いくつかの実施形態では、合成培地中のグリシンの濃度は、約5~200mg/Lの範囲であり、L-ヒスチジンの濃度は、約5~250mg/Lであり、L-イソロイシンの濃度は、約5~300mg/Lであり、L-メチオニンの濃度は、約5~200mg/Lであり、L-フェニルアラニンの濃度は、約5~400mg/Lであり、L-プロリンの濃度は、約1~1000mg/Lであり、L-ヒドロキシプロリンの濃度は、約1~45mg/Lであり、L-セリンの濃度は、約1~250mg/Lであり、L-スレオニンの濃度は、約10~500mg/Lであり、L-トリプトファンの濃度は、約2~110mg/Lであり、L-チロシンの濃度は、約3~175mg/Lであり、L-バリンの濃度は、約5~500mg/Lであり、チアミンの濃度は、約1~20mg/Lであり、還元型グルタチオンの濃度は、約1~20mg/Lであり、L-アスコルビン酸-2-リン酸塩の濃度は、約1~200mg/Lであり、鉄飽和トランスフェリンの濃度は、約1~50mg/Lであり、インスリンの濃度は、約1~100mg/Lであり、亜セレン酸ナトリウムの濃度は、約0.000001~0.0001mg/Lであり、アルブミン(例えば、AlbuMAX(登録商標)I)の濃度は、約5000~50,000mg/Lである。
いくつかの実施形態では、合成培地中の非微量元素部分成分は、以下の表4の「1×培地中の濃度範囲」という見出しの下の列にリストされた濃度範囲で存在する。他の実施形態では、合成培地中の非微量元素部分成分は、以下の表3の「1×培地の好ましい実施形態」という見出しの下の列にリストされた最終濃度で存在する。他の実施形態では、合成培地は、無血清サプリメントを含む基礎細胞培地である。これらの実施形態のうちのいくつかでは、無血清サプリメントは、以下の表4の「サプリメント中の好ましい実施形態」という見出しの下の列にリストされたタイプ及び濃度の非微量部分成分を含む。
Figure 2024512029000007
いくつかの実施形態では、合成培地の浸透圧は、約260~350mOsmolである。いくつかの実施形態では、浸透圧は、約280~310mOsmolである。いくつかの実施形態では、合成培地には、最大約3.7g/L、または約2.2g/Lの重炭酸ナトリウムが補充されている。合成培地には、L-グルタミン(最終濃度約2mM)、1つ以上の抗生物質、非必須アミノ酸(NEAA、最終濃度約100μM)、2-メルカプトエタノール(最終濃度約100μM)がさらに補充されていてもよい。
いくつかの実施形態では、Smith,et al.,“Ex vivo expansion of human T cells for adoptive immunotherapy using the novel Xeno-free CTS Immune Cell Serum Replacement,”Clin.Transl.Immunology,4(1)2015(doi:10.1038/cti.2014.31)に記載の定義された培地が、本発明において有用である。簡潔には、RPMIまたはCTS(商標)OpTmizerを基礎細胞培地として使用し、0、2%、5%、または10%のいずれかのCTS(商標)Immune Cell Serum Replacementを補充した。
ある実施形態では、第1及び/または第2のガス透過性容器内の細胞培地は、ろ過されていない。濾過されていない細胞培地の使用は、細胞の数を拡張するために必要な手順を簡素化することができる。ある実施形態では、第1及び/または第2のガス透過性容器内の細胞培地は、β-メルカプトエタノール(BMEまたはβME、2-メルカプトエタノールとしても知られる、CAS60-24-2)を欠いている。
いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張(例えば、図8(特に、例えば図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D)のステップBに記載されるものなどのプロセスを含み、これは、REP前またはプライミングREPと称されることもあるものを含み得る)プロセスは、実施例及び図において考察されるように、1~8日間である。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張(例えば、図8(特に、例えば図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D)のステップBに記載されるものなどのプロセスを含み、これは、REP前またはプライミングREPと称されることもあるものを含み得る)プロセスは、2~8日間である。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張(例えば、図8(特に、例えば図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D)のステップBに記載されるものなどのプロセスを含み、これは、REP前またはプライミングREPと称されることもあるものを含み得る)プロセスは、3~8日間である。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張(例えば、図8(特に、例えば図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D)のステップBに記載されるものなどのプロセスを含み、これは、REP前またはプライミングREPと称されることもあるものを含み得る)プロセスは、実施例及び図において考察されるように、4~8日間である。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張(例えば、図8(特に、例えば図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D)のステップBに記載されるものなどのプロセスを含み、これは、REP前またはプライミングREPと称されることもあるものを含み得る)プロセスは、実施例及び図において考察されるように、1~7日間である。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張(例えば、図8(特に、例えば図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D)のステップBに記載されるものなどのプロセスを含み、これは、REP前またはプライミングREPと称されることもあるものを含み得る)プロセスは、2~8日間である。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張(例えば、図8(特に、例えば図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D)のステップBに記載されるものなどのプロセスを含み、これは、REP前またはプライミングREPと称されることもあるものを含み得る)プロセスは、2~7日間である。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張(例えば、図8(特に、例えば図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D)のステップBに記載されるものなどのプロセスを含み、これは、REP前またはプライミングREPと称されることもあるものを含み得る)プロセスは、3~8日間である。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張(例えば、図8(特に、例えば図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D)のステップBに記載されるものなどのプロセスを含み、これは、REP前またはプライミングREPと称されることもあるものを含み得る)プロセスは、3~7日間である。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張(例えば、図8(特に、例えば図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D)のステップBに記載されるものなどのプロセスを含み、これは、REP前またはプライミングREPと称されることもあるものを含み得る)プロセスは、4~8日間である。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張(例えば、図8(特に、例えば図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D)のステップBに記載されるものなどのプロセスを含み、これは、REP前またはプライミングREPと称されることもあるものを含み得る)プロセスは、4~7日間である。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張(例えば、図8(特に、例えば図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D)のステップBに記載されるものなどのプロセスを含み、これは、REP前またはプライミングREPと称されることもあるものを含み得る)プロセスは、5~8日間である。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張(例えば、図8(特に、例えば図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D)のステップBに記載されるものなどのプロセスを含み、これは、REP前またはプライミングREPと称されることもあるものを含み得る)プロセスは、5~7日間である。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張(例えば、図8(特に、例えば図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D)のステップBに記載されるものなどのプロセスを含み、これは、REP前またはプライミングREPと称されることもあるものを含み得る)プロセスは、6~8日間である。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張(例えば、図8(特に、例えば図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D)のステップBに記載されるものなどのプロセスを含み、これは、REP前またはプライミングREPと称されることもあるものを含み得る)プロセスは、6~7日間である。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張(例えば、図1及び/または図8(特に、例えば図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D)のステップBに提供されるものなどのプロセスを含み、これは、REP前またはプライミングREPと称されることもあるものを含み得る)プロセスは、7~8日間である。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張(例えば、図8(特に、例えば図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D)のステップBに提供されるものなどのプロセスを含み、これは、REP前またはプライミングREPと称されることもあるものを含み得る)プロセスは、8日間である。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張(例えば、図8(特に、例えば図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D)のステップBに提供されるものなどのプロセスを含み、これは、REP前またはプライミングREPと称されることもあるものを含み得る)プロセスは、7日間である。
いくつかの実施形態では、プライミングによる第1のTIL拡張は、断片化が起こったとき及び/またはプライミングによる第1の拡張ステップが開始されたときから1日~8日間続行することができる。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1のTIL拡張は、断片化が起こったとき及び/またはプライミングによる第1の拡張ステップが開始されたときから1日~7日間続行することができる。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1のTIL拡張は、断片化が起こったとき及び/またはプライミングによる第1の拡張ステップが開始されたときから2日~8日間続行することができる。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1のTIL拡張は、断片化が起こったとき及び/またはプライミングによる第1の拡張ステップが開始されたときから2日~7日間続行することができる。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1のTIL拡張は、断片化が起こったとき及び/またはプライミングによる第1の拡張ステップが開始されたときから3日~8日間続行することができる。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1のTIL拡張は、断片化が起こったとき及び/またはプライミングによる第1の拡張ステップが開始されたときから3日~7日間続行することができる。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1のTIL拡張は、断片化が起こったとき及び/またはプライミングによる第1の拡張ステップが開始されたときから4日~8日間続行することができる。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1のTIL拡張は、断片化が起こったとき及び/またはプライミングによる第1の拡張ステップが開始されたときから4日~7日間続行することができる。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1のTIL拡張は、断片化が起こったとき及び/またはプライミングによる第1の拡張ステップが開始されたときから5日~8日間続行することができる。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1のTIL拡張は、断片化が起こったとき及び/またはプライミングによる第1の拡張ステップが開始されたときから5日~7日間続行することができる。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1のTIL拡張は、断片化が起こったとき及び/またはプライミングによる第1の拡張ステップが開始されたときから6日~8日間続行することができる。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1のTIL拡張は、断片化が起こったとき及び/またはプライミングによる第1の拡張ステップが開始されたときから6日~7日間続行することができる。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1のTIL拡張は、断片化が起こったとき及び/またはプライミングによる第1の拡張ステップが開始されたときから7日~8日間続行することができる。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1のTIL拡張は、断片化が起こったとき及び/またはプライミングによる第1の拡張ステップが開始されたときから8日間続行することができる。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1のTIL拡張は、断片化が起こったとき及び/またはプライミングによる第1の拡張ステップが開始されたときから7日間続行することができる。
いくつかの実施形態では、TILのプライミングによる第1の拡張は、1日、2日、3日、4日、5日、6日、7日、または8日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第1のTIL拡張は、1日~8日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第1のTIL拡張は、1日~7日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第1のTIL拡張は、2日~8日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第1のTIL拡張は、2日~7日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第1のTIL拡張は、3日~8日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第1のTIL拡張は、3日~7日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第1のTIL拡張は、4日~8日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第1のTIL拡張は、4日~7日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第1のTIL拡張は、5日~8日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第1のTIL拡張は、5日~7日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第1のTIL拡張は、6日~8日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第1のTIL拡張は、6日~7日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第1のTIL拡張は、7日~8日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第1のTIL拡張は、8日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第1のTIL拡張は、7日間続行することができる。
いくつかの実施形態では、IL-2、IL-7、IL-15、及び/またはIL-21の組み合わせは、プライミングによる第1の拡張中に組み合わせとして用いられる。いくつかの実施形態では、IL-2、IL-7、IL-15、及び/またはIL-21、ならびにそれらの任意の組み合わせは、例えば、図8(特に、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D)による、ならびに本明細書に記載されるステップBプロセス中を含む、プライミングによる第1の拡張中に含まれ得る。いくつかの実施形態では、IL-2、IL-15、及びIL-21の組み合わせは、プライミングによる第1の拡張中に組み合わせとして用いられる。いくつかの実施形態では、IL-2、IL-15、及びIL-21、ならびにそれらの任意の組み合わせは、図8(特に、例えば図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D)による、及び本明細書に記載されるステップBプロセス中に含まれ得る。
いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張、例えば、図8によるステップB(特に、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D)は、閉鎖系バイオリアクターにおいて行われる。いくつかの実施形態では、本明細書に記載されるように、閉鎖系がTIL拡張のために用いられる。いくつかの実施形態では、バイオリアクターが用いられる。いくつかの実施形態では、バイオリアクターが容器として用いられる。いくつかの実施形態では、用いられるバイオリアクターは、例えば、G-Rex-10またはG-Rex-100である。いくつかの実施形態では、用いられるバイオリアクターは、G-Rex-100である。いくつかの実施形態では、用いられるバイオリアクターは、G-Rex-10である。
1.フィーダー細胞及び抗原提示細胞
ある実施形態では、本明細書に記載されるプライミングによる第1の拡張手順(例えば、図1(特に、例えば図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D)からのステップBに記載されるもの、ならびにREP前またはプライミングREPと称されるものなどの拡張を含む))は、TIL拡張の開始時にフィーダー細胞(本明細書では「抗原提示細胞」とも称される)を必要とせず、むしろプライミングによる第1の拡張中に追加される。ある実施形態では、本明細書に記載されるプライミングによる第1の拡張手順(例えば、図8(特に、例えば図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D)からのステップBに記載されるもの、ならびにREP前またはプライミングREPと称されるものなどの拡張を含む))は、TIL拡張の開始時にフィーダー細胞(本明細書では「抗原提示細胞」とも称される)を必要とせず、むしろ4~8日目の間の任意の時点でプライミングによる第1の拡張中に追加される。ある実施形態では、本明細書に記載されるプライミングによる第1の拡張手順(例えば、図8(特に、例えば図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D)からのステップBに記載されるもの、ならびにREP前またはプライミングREPと称されるものなどの拡張を含む))は、TIL拡張の開始時にフィーダー細胞(本明細書では「抗原提示細胞」とも称される)を必要とせず、むしろ4~7日目の間の任意の時点でプライミングによる第1の拡張中に追加される。ある実施形態では、本明細書に記載されるプライミングによる第1の拡張手順(例えば、図8(特に、例えば図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D)からのステップBに記載されるもの、ならびにREP前またはプライミングREPと称されるものなどの拡張を含む))は、TIL拡張の開始時にフィーダー細胞(本明細書では「抗原提示細胞」とも称される)を必要とせず、むしろ5~8日目の間の任意の時点でプライミングによる第1の拡張中に追加される。ある実施形態では、本明細書に記載されるプライミングによる第1の拡張手順(例えば、図8(特に、例えば図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D)からのステップBに記載されるもの、ならびにREP前またはプライミングREPと称されるものなどの拡張を含む))は、TIL拡張の開始時にフィーダー細胞(本明細書では「抗原提示細胞」とも称される)を必要とせず、むしろ5~7日目の間の任意の時点でプライミングによる第1の拡張中に追加される。ある実施形態では、本明細書に記載されるプライミングによる第1の拡張手順(例えば、図8(特に、例えば図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D)からのステップBに記載されるもの、ならびにREP前またはプライミングREPと称されるものなどの拡張を含む))は、TIL拡張の開始時にフィーダー細胞(本明細書では「抗原提示細胞」とも称される)を必要とせず、むしろ6~8日目の間の任意の時点でプライミングによる第1の拡張中に追加される。ある実施形態では、本明細書に記載されるプライミングによる第1の拡張手順(例えば、図8(特に、例えば図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D)からのステップBに記載されるもの、ならびにREP前またはプライミングREPと称されるものなどの拡張を含む))は、TIL拡張の開始時にフィーダー細胞(本明細書では「抗原提示細胞」とも称される)を必要とせず、むしろ6~7日目の間の任意の時点でプライミングによる第1の拡張中に追加される。ある実施形態では、本明細書に記載されるプライミングによる第1の拡張手順(例えば、図8(特に、例えば図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D)からのステップBに記載されるもの、ならびにREP前またはプライミングREPと称されるものなどの拡張を含む))は、TIL拡張の開始時にフィーダー細胞(本明細書では「抗原提示細胞」とも称される)を必要とせず、むしろ7日目または8日目の間の任意の時点でプライミングによる第1の拡張中に追加される。ある実施形態では、本明細書に記載されるプライミングによる第1の拡張手順(例えば、図8(特に、例えば図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D)からのステップBに記載されるもの、ならびにREP前またはプライミングREPと称されるものなどの拡張を含む))は、TIL拡張の開始時にフィーダー細胞(本明細書では「抗原提示細胞」とも称される)を必要とせず、むしろ7日目の間の任意の時点でプライミングによる第1の拡張中に追加される。ある実施形態では、本明細書に記載されるプライミングによる第1の拡張手順(例えば、図8(特に、例えば図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D)からのステップBに記載されるもの、ならびにREP前またはプライミングREPと称されるものなどの拡張を含む))は、TIL拡張の開始時にフィーダー細胞(本明細書では「抗原提示細胞」とも称される)を必要とせず、むしろ8日目の間の任意の時点でプライミングによる第1の拡張中に追加される。
ある実施形態では、本明細書に記載されるプライミングによる第1の拡張手順(例えば、図8(特に、例えば図8B)からのステップBに記載されるもの、ならびにpre-REPまたはプライミングREPと称されるものなどの拡張を含む))は、TIL拡張の開始時及びプライミングによる第1の拡張中にフィーダー細胞(本明細書では「抗原提示細胞」とも称される)を必要する。多くの実施形態では、フィーダー細胞は、同種異系の健康な献血者由来の標準の全血単位から取得される末梢血単核細胞(PBMC)である。PBMCは、Ficoll-Paque勾配分離などの標準の方法を使用して取得される。いくつかの実施形態では、2.5×10のフィーダー細胞が、プライミングによる第1の拡張中に使用される。いくつかの実施形態では、容器当たり2.5×10のフィーダー細胞が、プライミングによる第1の拡張中に使用される。いくつかの実施形態では、GREX-10当たり2.5×10のフィーダー細胞が、プライミングによる第1の拡張中に使用される。いくつかの実施形態では、GREX-100当たり2.5×10のフィーダー細胞が、プライミングによる第1の拡張中に使用される。
一般に、同種異系PBMCは、照射または熱処理のいずれかによって不活性化され、実施例に記載されるように、REP手順で使用され、これは、照射された同種異系PBMCの複製無能力を評価するための例示的なプロトコルを提供する。
いくつかの実施形態では、14日目の総生細胞数が、プライミングによる第1の拡張の0日目に培養された初期の生細胞数よりも少ない場合、PBMCは、複製能力がないとみなされ、本明細書に記載のTIL拡張手順での使用が認められる。
いくつかの実施形態では、7日目のOKT3及びIL-2の存在下で培養された総生細胞数が、プライミングによる第1の拡張の0日目に培養された初期の生細胞数から増加しなかった場合、PBMCは、複製能力がないとみなされ、本明細書に記載のTIL拡張手順での使用が認められる。いくつかの実施形態では、PBMCは、30ng/mLのOKT3抗体及び3000IU/mLのIL-2の存在下で培養される。いくつかの実施形態では、PBMCは、30ng/mLのOKT3抗体及び6000IU/mLのIL-2の存在下で培養される。
いくつかの実施形態では、7日目のOKT3及びIL-2の存在下で培養された総生細胞数が、プライミングによる第1の拡張の0日目に培養された初期の生細胞数から増加しなかった場合、PBMCは、複製能力がないとみなされ、本明細書に記載のTIL拡張手順での使用が認められる。いくつかの実施形態では、PBMCは、5~60ng/mLのOKT3抗体及び1000~6000IU/mLのIL-2の存在下で培養される。いくつかの実施形態では、PBMCは、10~50ng/mLのOKT3抗体及び2000~5000IU/mLのIL-2の存在下で培養される。いくつかの実施形態では、PBMCは、20~40ng/mLのOKT3抗体及び2000~4000IU/mLのIL-2の存在下で培養される。いくつかの実施形態では、PBMCは、25~35ng/mLのOKT3抗体及び2500~3500IU/mLのIL-2の存在下で培養される。いくつかの実施形態では、PBMCは、30ng/mLのOKT3抗体及び6000IU/mLのIL-2の存在下で培養される。いくつかの実施形態では、PBMCは、15ng/mLのOKT3抗体及び3000IU/mLのIL-2の存在下で培養される。いくつかの実施形態では、PBMCは、15ng/mLのOKT3抗体及び6000IU/mLのIL-2の存在下で培養される。
いくつかの実施形態では、抗原提示フィーダー細胞は、PBMCである。いくつかの実施形態では、抗原提示フィーダー細胞は、人工抗原提示フィーダー細胞である。ある実施形態では、第2の拡張におけるTILの抗原提示フィーダー細胞に対する比率は、約1:25、約1:50、約1:100、約1:125、約1:150、約1:175、約1:200、約1:225、約1:250、約1:275、約1:300、約1:325、約1:350、約1:375、約1:400、または約1:500である。ある実施形態では、第2の拡張におけるTILの抗原提示フィーダー細胞に対する比率は、1:50~1:300である。ある実施形態では、第2の拡張におけるTILの抗原提示フィーダー細胞に対する比率は、1:100~1:200である。
ある実施形態では、本明細書に記載のプライミングによる第1の拡張手順は、約2.5×10フィーダー細胞:約100×10TILの比率を必要とする。別の実施形態では、本明細書に記載のプライミングによる第1の拡張手順は、約2.5×10フィーダー細胞:約50×10TILの比率を必要とする。さらに別の実施形態では、本明細書に記載のプライミングによる第1の拡張は、約2.5×10フィーダー細胞:約25×10TILを必要とする。さらに別の実施形態では、本明細書に記載のプライミングによる第1の拡張には、約2.5×10のフィーダー細胞が必要である。さらに別の実施形態では、プライミングによる第1の拡張は、急速な第2の拡張で使用されるフィーダー細胞の数の4分の1、3分の1、12分の5、または半分を必要とする。
いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張における培地は、IL-2を含む。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張における培地は、6000IU/mLのIL-2を含む。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張における培地は、抗原提示フィーダー細胞を含む。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張における培地は、容器当たり2.5×10の抗原提示フィーダー細胞を含む。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張における培地は、OKT-3を含む。いくつかの実施形態では、培地は、容器当たり30ngのOKT-3を含む。いくつかの実施形態では、容器は、G-Rex 100MCSフラスコである。いくつかの実施形態では、培地は、6000IU/mLのIL-2、30ng/mLのOKT-3、及び2.5×10の抗原提示フィーダー細胞を含む。いくつかの実施形態では、培地は、容器当たり6000IU/mLのIL-2、30ng/mLのOKT-3、及び2.5×10の抗原提示フィーダー細胞を含む。いくつかの実施形態では、培地は、容器当たり500mLの培養培地及び2.5×10の抗原提示フィーダー細胞当たり15μgのOKT-3を含む。いくつかの実施形態では、培地は、容器当たり500mLの培養培地及び15μgのOKT-3を含む。いくつかの実施形態では、容器は、G-Rex 100MCSフラスコである。いくつかの実施形態では、培地は、500mLの培養培地、6000IU/mLのIL-2、30ng/mLのOKT-3、及び2.5×10の抗原提示フィーダー細胞を含む。いくつかの実施形態では、培地は、容器当たり500mLの培養培地、6000IU/mLのIL-2、15μgのOKT-3、及び2.5×10の抗原提示フィーダー細胞を含む。いくつかの実施形態では、培地は、容器当たり500mLの培養培地及び2.5×10の抗原提示フィーダー細胞当たり15μgのOKT-3を含む。
ある実施形態では、本明細書に記載のプライミングによる第1の拡張手順は、第2の拡張中にTILを超える過剰のフィーダー細胞を必要とする。多くの実施形態では、フィーダー細胞は、同種異系の健康な献血者由来の標準の全血単位から取得される末梢血単核細胞(PBMC)である。PBMCは、Ficoll-Paque勾配分離などの標準の方法を使用して取得される。ある実施形態では、人工抗原提示(aAPC)細胞がPBMCの代わりに使用される。
一般に、同種異系PBMCは、照射または熱処理のいずれかによって不活性化され、図及び実施例に記載される例示的な手順を含む、本明細書に記載のTIL拡張手順で使用される。
ある実施形態では、人工抗原提示細胞は、PBMCの代替物として、またはPBMCと組み合わせて、プライミングによる第1の拡張において使用される。
ある実施形態では、Gen3プロセスのプライミングによる第1の拡張で使用される抗原提示細胞は、単球細胞である。ある実施形態では、抗原提示細胞は、B細胞である。ある実施形態では、抗原提示細胞は、B細胞リンパ芽細胞またはB-リンパ芽細胞である。ある実施形態では、抗原提示細胞は、バーキットリンパ腫細胞である。ある実施形態では、抗原提示細胞は、骨髄系細胞である。ある実施形態では、抗原提示細胞は、単球である。ある実施形態では、抗原提示細胞は、HLA-A-02陽性単球である。ある実施形態では、抗原提示細胞は、急性単球性白血病細胞である。ある実施形態では、抗原提示細胞は、M5サブタイプの急性単球性白血病細胞である。ある実施形態では、抗原提示細胞は、Raji細胞またはその誘導体、バリアント、修飾、もしくは子孫である。ある実施形態では、抗原提示細胞は、Thp1細胞またはその誘導体、バリアント、修飾、もしくは子孫である。ある実施形態では、抗原提示細胞は、Ramos細胞またはその誘導体、バリアント、修飾、もしくは子孫である。ある実施形態では、抗原提示細胞は、U937細胞またはその誘導体、バリアント、修飾、もしくは子孫である。ある実施形態では、抗原提示細胞は、Daudi細胞またはその誘導体、バリアント、修飾、もしくは子孫である。ある実施形態では、抗原提示細胞は、メラノサイト細胞である。ある実施形態では、抗原提示細胞は、HLA-A-02陽性メラノサイト細胞である。ある実施形態では、抗原提示細胞は、黒色腫細胞である。ある実施形態では、抗原提示細胞は、HLA-A-02陽性黒色腫細胞である。ある実施形態では、抗原提示細胞は、Sk-MEL-5、Malme-3M、SK-MEL-28、SK-MEL-3、SH-4、SK-MEL-24、RPMI-7951、SK-MEL-1、A375、G-361、及びそれらの組み合わせ、またはそれらの誘導体、バリアント、修飾、もしくは子孫からなる群から選択される。前述の実施形態のうちのいずれにおいても、抗原提示細胞は、本明細書の他の箇所に記載されるように照射され得るか、または照射されなくてもよい。
ある実施形態では、aAPCは、Gen3プロセスのプライミングによる第1の拡張で使用される。ある実施形態では、aAPCは、遺伝子修飾単球細胞である。ある実施形態では、aAPCは、遺伝子修飾B細胞である。ある実施形態では、aAPCは、遺伝子修飾B細胞リンパ芽細胞またはB-リンパ芽細胞である。ある実施形態では、aAPCは、遺伝子修飾バーキットリンパ腫細胞である。ある実施形態では、aAPCは、遺伝子修飾骨髄系譜細胞である。ある実施形態では、aAPCは、遺伝子修飾単球である。ある実施形態では、aAPCは、遺伝子修飾HLA-A-02陽性単球細胞である。ある実施形態では、aAPCは、遺伝子修飾急性単球性白血病細胞である。ある実施形態では、aAPCは、遺伝子修飾M5サブタイプ急性単球性白血病細胞である。ある実施形態では、aAPCは、遺伝子修飾Raji細胞またはその誘導体、バリアント、修飾、もしくは子孫である。ある実施形態では、aAPCは、遺伝子修飾Thp1細胞またはその誘導体、バリアント、修飾、もしくは子孫である。ある実施形態では、aAPCは、遺伝子修飾Ramos細胞またはその誘導体、バリアント、修飾、もしくは子孫である。ある実施形態では、aAPCは、遺伝子修飾U937細胞またはその誘導体、バリアント、修飾、もしくは子孫である。ある実施形態では、aAPCは、遺伝子修飾Daudi細胞またはその誘導体、バリアント、修飾、もしくは子孫である。ある実施形態では、aAPCは、遺伝子修飾メラノサイト細胞である。ある実施形態では、aAPCは、遺伝子修飾HLA-A-02陽性メラノサイト細胞である。ある実施形態では、aAPCは、遺伝子修飾黒色腫細胞である。ある実施形態では、aAPCは、遺伝子修飾HLA-A-02陽性黒色腫細胞である。ある実施形態では、aAPCは、Sk-MEL-5、Malme-3M、SK-MEL-28、SK-MEL-3、SH-4、SK-MEL-24、RPMI-7951、SK-MEL-1、A375、G-361、及びそれらの組み合わせ、またはそれらの誘導体、バリアント、修飾、もしくは子孫からなる群から選択される遺伝子修飾抗原提示細胞である。ある実施形態では、遺伝子修飾細胞は、米国特許第10,415,015号(その開示は参照により本明細書に組み込まれる)に記載されているように、CD86、OX40L、4-1BBL、OX-40アゴニスト抗体、4-1BBアゴニスト抗体、OKT-3のFc鎖に結合可能な抗体、及び/またはICOS-Lを発現するように修飾される。前述の実施形態のうちのいずれにおいても、遺伝子修飾aAPCは、本明細書の他の箇所に記載されるように照射され得るか、または照射されなくてもよい。
2.サイトカイン
本明細書に記載の拡張方法は、一般に、当該技術分野で知られているように、高用量のサイトカイン、特にIL-2を含む培養培地を使用する。
あるいは、米国特許出願公開第US2017/0107490A1及び国際特許出願公開第WO2015/189357号(これらの各々は参照によりそれら全体が本明細書に明示的に組み込まれる)に記載されているように、TILのプライミングによる第1の拡張のためにサイトカインの組み合わせを使用することもさらに可能であり、組み合わせは、IL-2、IL-15、及びIL-21のうちの2つ以上である。したがって、可能な組み合わせには、IL-2及びIL-15、IL-2及びIL-21、IL-15及びIL-21、ならびにIL-2、IL-15、及びIL-21が含まれ、後者は多くの実施形態で特に有用である。サイトカインの組み合わせの使用は、リンパ球、特にそこに記載されているようにT細胞の生成に特に有利に働く。
C.ステップC:プライミングによる第1の拡張から急速な第2の拡張への移行
場合によっては、例えば図8(特に、例えば図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D)に示されるようにステップBから取得されるTIL集団を含む、プライミングによる第1の拡張から取得されたバルクTIL母集団(REP前と称されることもある拡張を含み得る)は、急速な第2の拡張(これは、急速拡張プロトコル(REP)と称されることもある拡張を含み得る)に供され、次いで、以下で考察されるように凍結保存され得る。同様に、遺伝子修飾TILが療法に使用される場合、プライミングによる第1の拡張由来の拡張TIL集団または急速な第2の拡張由来の拡張TIL集団は、拡張ステップ前またはプライミングによる第1の拡張後及び急速な第2の拡張前に好適な治療のために遺伝子修飾に供され得る。
いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張から(例えば、図8(特に、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D)に示されるステップBから)取得されたTILは、選択のために表現型決定されるまで保管される。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張から(例えば、図8(特に、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D)に示されるステップBから)取得されたTILは保管されず、急速な第2の拡張に直接進む。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張から取得されたTILは、プライミングによる第1の拡張後及び急速な第2の拡張前に凍結保存されない。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張から第2の拡張への移行は、腫瘍の断片化が起こったとき及び/またはプライミングによる第1の拡張ステップが開始されたときから約2日、3日、4日、5日、6日、7日、または8日で起こる。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張から急速な第2の拡張への移行は、断片化が起こったとき及び/またはプライミングによる第1の拡張ステップが開始されたときから約3日~7日で起こる。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張から急速な第2の拡張への移行は、断片化が起こったとき及び/またはプライミングによる第1の拡張ステップが開始されたときから約3日~8日で起こる。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張から第2の拡張への移行は、断片化が起こったとき及び/またはプライミングによる第1の拡張ステップが開始されたときから約4日~7日で起こる。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張から第2の拡張への移行は、断片化が起こったとき及び/またはプライミングによる第1の拡張ステップが開始されたときから約4日~8日で起こる。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張から第2の拡張への移行は、断片化が起こったとき及び/またはプライミングによる第1の拡張ステップが開始されたときから約5日~7日で起こる。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張から第2の拡張への移行は、断片化が起こったとき及び/またはプライミングによる第1の拡張ステップが開始されたときから約5日~8日で起こる。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張から第2の拡張への移行は、断片化が起こったとき及び/またはプライミングによる第1の拡張ステップが開始されたときから約6日~7日で起こる。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張から第2の拡張への移行は、断片化が起こったとき及び/またはプライミングによる第1の拡張ステップが開始されたときから約6日~8日で起こる。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張から第2の拡張への移行は、断片化が起こったとき及び/またはプライミングによる第1の拡張ステップが開始されたときから約7日~8日で起こる。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張から第2の拡張への移行は、断片化が起こったとき及び/またはプライミングによる第1の拡張ステップが開始されたときから約7日で起こる。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張から第2の拡張への移行は、断片化が起こったとき及び/またはプライミングによる第1の拡張ステップが開始されたときから約8日で起こる。
いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張から急速な第2の拡張への移行は、断片化が起こったとき及び/またはプライミングによる第1の拡張ステップが開始されたときから1日、2日、3日、4日、5日、6日、7日、または8日で起こる。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張から急速な第2の拡張への移行は、断片化が起こったとき及び/またはプライミングによる第1の拡張ステップが開始されたときから1日~7日で起こる。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張から急速な第2の拡張への移行は、断片化が起こったとき及び/またはプライミングによる第1の拡張ステップが開始されたときから1日~8日で起こる。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張から急速な第2の拡張への移行は、断片化が起こったとき及び/またはプライミングによる第1の拡張ステップが開始されたときから2日~7日で起こる。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張から急速な第2の拡張への移行は、断片化が起こったとき及び/またはプライミングによる第1の拡張ステップが開始されたときから2日~8日で起こる。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張から急速な第2の拡張への移行は、断片化が起こったとき及び/またはプライミングによる第1の拡張ステップが開始されたときから3日~7日で起こる。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張から急速な第2の拡張への移行は、断片化が起こったとき及び/またはプライミングによる第1の拡張ステップが開始されたときから3日~8日で起こる。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張から急速な第2の拡張への移行は、断片化が起こったとき及び/またはプライミングによる第1の拡張ステップが開始されたときから4日~7日で起こる。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張から急速な第2の拡張への移行は、断片化が起こったとき及び/またはプライミングによる第1の拡張ステップが開始されたときから4日~8日で起こる。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張から急速な第2の拡張への移行は、断片化が起こったとき及び/またはプライミングによる第1の拡張ステップが開始されたときから5日~7日で起こる。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張から急速な第2の拡張への移行は、断片化が起こったとき及び/またはプライミングによる第1の拡張ステップが開始されたときから5日~8日で起こる。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張から急速な第2の拡張への移行は、断片化が起こったとき及び/またはプライミングによる第1の拡張ステップが開始されたときから6日~7日で起こる。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張から急速な第2の拡張への移行は、断片化が起こったとき及び/またはプライミングによる第1の拡張ステップが開始されたときから6日~8日で起こる。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張から急速な第2の拡張への移行は、断片化が起こったとき及び/またはプライミングによる第1の拡張ステップが開始されたときから7日~8日で起こる。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張から急速な第2の拡張への移行は、断片化が起こったとき、及び/またはプライミングによる第1の拡張ステップが開始されたときから7日で起こる。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張から急速な第2の拡張への移行は、断片化が起こったとき、及び/またはプライミングによる第1の拡張ステップが開始されたときから8日で起こる。
いくつかの実施形態では、TILは、一次の第1の拡張後、及び急速な第2の拡張前に保存されず、TILは、急速な第2の拡張に直接進行する(例えば、いくつかの実施形態では、図8(特に、例えば図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D)に示されるようにステップBからステップDへの移行中の保存がない)。いくつかの実施形態では、移行は、本明細書に記載されるように、閉鎖系内で起こる。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張由来のTILである第2のTIL集団は、移行期間なしで急速な第2の拡張に直接進む。
いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張から急速な第2の拡張への移行、例えば、図8(特に、例えば図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D)によるステップCは、閉鎖系バイオリアクター内で行われる。いくつかの実施形態では、本明細書に記載されるように、閉鎖系がTIL拡張のために用いられる。いくつかの実施形態では、単一のバイオリアクターが用いられる。いくつかの実施形態では、用いられる単一のバイオリアクターは、例えば、GREX-10またはGREX-100である。いくつかの実施形態では、閉鎖系バイオリアクターは、単一のバイオリアクターである。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張から急速な第2の拡張への移行は、容器サイズのスケールアップを伴う。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張は、急速な第2の拡張よりも小さい容器内で行われる。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張は、GREX-100内で行われ、急速な第2の拡張は、GREX-500内で行われる。
D.ステップD:急速な第2の拡張
いくつかの実施形態では、TIL細胞集団は、採取及びプライミングによる第1の拡張後、ステップA及びステップB、ならびに図8(特に、例えば図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D)に示されるように、ステップCと称される移行後に数がさらに拡張される。このさらなる拡張は、本明細書では急速な第2の拡張と称され、これは、当該技術分野で一般に、急速拡張プロセス(急速拡張プロトコルまたはREP、ならびに図8(特に、例えば図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D)のステップDに示されるプロセス)と称される拡張プロセスを含み得る。急速な第2の拡張は、一般に、フィーダー細胞、サイトカイン源、及び抗CD3抗体を含む、いくつかの成分を含む培養培地を使用して、ガス透過性容器内で達成される。いくつかの実施形態では、急速な第2の拡張開始の1日、2日、3日、または4日後(すなわち、Gen3プロセス全体の8、9、10、または11日目)に、TILは、より大容量の容器に移される。
いくつかの実施形態では、TILの急速な第2の拡張(REPと称されることもある拡張、ならびに図8(特に、例えば図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D)のステップDに示されるプロセスを含み得る)は、当業者に知られている任意のTILフラスコまたは容器を使用して行うことができる。いくつかの実施形態では、第2のTIL拡張は、急速な第2の拡張の開始後、1日、2日、3日、4日、5日、6日、7日、8日、9日、または10日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第1のTIL拡張は、急速な第2の拡張の開始後、約2日~約9日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第1のTIL拡張は、急速な第2の拡張の開始後、約2日~約10日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第2のTIL拡張は、急速な第2の拡張の開始後、約2日~約9日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第2のTIL拡張は、急速な第2の拡張の開始後、約2日~約10日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第3のTIL拡張は、急速な第2の拡張の開始後、約2日~約9日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第3のTIL拡張は、急速な第2の拡張の開始後、約2日~約10日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第4のTIL拡張は、急速な第2の拡張の開始後、約2日~約9日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第4のTIL拡張は、急速な第2の拡張の開始後、約2日~約10日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第5のTIL拡張は、急速な第2の拡張の開始後、約2日~約9日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第5のTIL拡張は、急速な第2の拡張の開始後、約2日~約10日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第6のTIL拡張は、急速な第2の拡張の開始後、約2日~約9日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第6のTIL拡張は、急速な第2の拡張の開始後、約2日~約10日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第7のTIL拡張は、急速な第2の拡張の開始後、約2日~約9日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第7のTIL拡張は、急速な第2の拡張の開始後、約2日~約10日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第8のTIL拡張は、急速な第2の拡張の開始後、約2日~約9日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第8のTIL拡張は、急速な第2の拡張の開始後、約2日~約10日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第9のTIL拡張は、急速な第2の拡張の開始後、約2日~約10日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第2のTIL拡張は、急速な第2の拡張の開始後、約1日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第2のTIL拡張は、急速な第2の拡張の開始後、約2日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第2のTIL拡張は、急速な第2の拡張の開始後、約3日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第2のTIL拡張は、急速な第2の拡張の開始後、約4日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第2のTIL拡張は、急速な第2の拡張の開始後、約5日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第2のTIL拡張は、急速な第2の拡張の開始後、約6日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第2のTIL拡張は、急速な第2の拡張の開始後、約7日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第2のTIL拡張は、急速な第2の拡張の開始後、約8日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第2のTIL拡張は、急速な第2の拡張の開始後、約9日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第2のTIL拡張は、急速な第2の拡張の開始後、約10日間続行することができる。
ある実施形態では、急速な第2の拡張は、本開示の方法(例えば、REPと称される拡張、ならびに図8(特に、例えば図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D)のステップDに示されるプロセスを含む)を使用して、ガス透過性容器内で行うことができる。いくつかの実施形態では、TILは、IL-2、OKT-3、及びフィーダー細胞(本明細書では「抗原提示細胞」とも称される)の存在下での急速な第2の拡張において拡張される。いくつかの実施形態では、TILは、IL-2、OKT-3、及びフィーダー細胞の存在下での急速な第2の拡張において拡張され、フィーダー細胞は、プライミングによる第1の拡張において存在するフィーダー細胞の濃度の2倍、2.4倍、2.5倍、3倍、3.5倍、または4倍である最終濃度まで追加される。例えば、TILは、インターロイキン-2(IL-2)またはインターロイキン-15(IL-15)の存在下で非特異的T細胞受容体刺激を使用して、急速に拡張され得る。非特異的T細胞受容体刺激は、例えば、抗CD3抗体、例えば約30ng/mLのOKT3、マウスモノクローナル抗CD3抗体(Ortho-McNeil,Raritan,NJもしくはMiltenyi Biotech,Auburn,CAから市販されている)またはUHCT-1(BioLegend,San Diego,CA,USAから市販)を含み得る。TILは、がんのエピトープ(複数可)などの抗原性部分を含む、第2の拡張中に1つ以上の抗原を含むことによって、インビトロでTILのさらなる刺激を誘導するように拡張することができ、これは任意選択で、ベクター、例えば、ヒト白血球抗原A2(HLA-A2)結合ペプチド、例えば、0.3μM MART-1:26-35(27L)またはgpl 00:209-217(210M)から、任意選択で300IU/mLのIL-2またはIL-15などのT細胞成長因子の存在下で発現され得る。他の好適な抗原には、例えば、NY-ESO-1、TRP-1、TRP-2、チロシナーゼがん抗原、MAGE-A3、SSX-2、及びVEGFR2、またはそれらの抗原性部分が含まれ得る。TILは、HLA-A2を発現する抗原提示細胞にパルスされたがんの同じ抗原(複数可)で再刺激することによっても急速に拡張され得る。あるいは、TILは、例えば、例として照射された自己リンパ球または照射されたHLA-A2+同種異系リンパ球及びIL-2でさらに再刺激され得る。いくつかの実施形態では、再刺激は、第2の拡張の一部として起こる。いくつかの実施形態では、第2の拡張は、照射された自己リンパ球の存在下で、または照射されたHLA-A2+同種異系リンパ球及びIL-2を用いて起こる。
ある実施形態では、細胞培養培地は、IL-2をさらに含む。いくつかの実施形態では、細胞培養培地は、約3000IU/mLのIL-2を含む。ある実施形態では、細胞培養培地は、約1000IU/mL、約1500IU/mL、約2000IU/mL、約2500IU/mL、約3000IU/mL、約3500IU/mL、約4000IU/mL、約4500IU/mL、約5000IU/mL、約5500IU/mL、約6000IU/mL、約6500IU/mL、約7000IU/mL、約7500IU/mL、または約8000IU/mLのIL-2を含む。ある実施形態では、細胞培養培地は、1000~2000IU/mL、2000~3000IU/mL、3000~4000IU/mL、4000~5000IU/mL、5000~6000IU/mL、6000~7000IU/mL、7000~8000IU/mL、または8000IU/mLのIL-2を含む。
ある実施形態では、細胞培養培地は、OKT-3抗体を含む。いくつかの実施形態では、細胞培養培地は、約30ng/mLのOKT-3抗体を含む。ある実施形態では、細胞培養培地は、約0.1ng/mL、約0.5ng/mL、約1ng/mL、約2.5ng/mL、約5ng/mL、約7.5ng/mL、約10ng/mL、約15ng/mL、約20ng/mL、約25ng/mL、約30ng/mL、約35ng/mL、約40ng/mL、約50ng/mL、約60ng/mL、約70ng/mL、約80ng/mL、約90ng/mL、約100ng/mL、約200ng/mL、約500ng/mL、及び約1μg/mLのOKT-3抗体を含む。ある実施形態では、細胞培養培地は、0.1ng/mL~1ng/mL、1ng/mL~5ng/mL、5ng/mL~10ng/mL、10ng/mL~20ngの間、20ng/mL~30ng/mL、30ng/mL~40ng/mL、40ng/mL~50ng/mL、及び50ng/mL~100ng/mLのOKT-3抗体を含む。ある実施形態では、細胞培養培地は、15ng/mL~30ng/mLのOKT-3抗体を含む。ある実施形態では、細胞培養培地は、30ng/mL~60ng/mLのOKT-3抗体を含む。ある実施形態では、細胞培養培地は、約30ng/mLのOKT-3を含む。ある実施形態では、細胞培養培地は、約60ng/mLのOKT-3を含む。いくつかの実施形態では、OKT-3抗体は、ムロモナブである。
いくつかの実施形態では、急速な第2の拡張における培地は、IL-2を含む。いくつかの実施形態では、培地は、6000IU/mLのIL-2を含む。いくつかの実施形態では、急速な第2の拡張における培地は、抗原提示フィーダー細胞を含む。いくつかの実施形態では、急速な第2の拡張における培地は、容器当たり7.5×10の抗原提示フィーダー細胞を含む。いくつかの実施形態では、急速な第2の拡張における培地は、OKT-3を含む。いくつかの実施形態では、急速な第2の拡張培地中に、容器当たり500mLの培養培地及び30μgのOKT-3を含む。いくつかの実施形態では、容器は、G-Rex 100MCSフラスコである。いくつかの実施形態では、急速な第2の拡張培地中に、6000IU/mLのIL-2、60ng/mLのOKT-3、及び7.5×10の抗原提示フィーダー細胞を含む。いくつかの実施形態では、培地は、容器当たり500mLの培養培地、6000IU/mLのIL-2、30μgのOKT-3、及び7.5×10の抗原提示フィーダー細胞を含む。
いくつかの実施形態では、急速な第2の拡張における培地は、IL-2を含む。いくつかの実施形態では、培地は、6000IU/mLのIL-2を含む。いくつかの実施形態では、急速な第2の拡張における培地は、抗原提示フィーダー細胞を含む。いくつかの実施形態では、培地は、容器当たり5×10~7.5×10の抗原提示フィーダー細胞を含む。いくつかの実施形態では、急速な第2の拡張における培地は、OKT-3を含む。いくつかの実施形態では、急速な第2の拡張における培地は、容器当たり500mLの培養培地及び30μgのOKT-3を含む。いくつかの実施形態では、容器は、G-Rex 100MCSフラスコである。いくつかの実施形態では、急速な第2の拡張における培地は、6000IU/mLのIL-2、60ng/mLのOKT-3、及び5×10~7.5×10の抗原提示フィーダー細胞を含む。いくつかの実施形態では、急速な第2の拡張における培地は、容器当たり500mLの培養培地、ならびに6000IU/mLのIL-2、30μgのOKT-3、及び5×10~7.5×10の抗原提示フィーダー細胞を含む。
いくつかの実施形態では、細胞培養培地は、細胞培養培地中に1つ以上のTNFRSFアゴニストを含む。いくつかの実施形態では、TNFRSFアゴニストは、4-1BBアゴニストを含む。いくつかの実施形態では、TNFRSFアゴニストは4-1BBアゴニストであり、4-1BBアゴニストは、ウレルマブ、ウトミルマブ、EU-101、融合タンパク質、ならびにそれらの断片、誘導体、バリアント、バイオシミラー、及び組み合わせからなる群から選択される。いくつかの実施形態では、TNFRSFアゴニストは、0.1μg/mL~100μg/mLの細胞培養培地中濃度を達成するのに十分な濃度で追加される。いくつかの実施形態では、TNFRSFアゴニストは、20μg/mL~40μg/mLの細胞培養培地中濃度を達成するのに十分な濃度で追加される。
いくつかの実施形態では、1つ以上のTNFRSFアゴニストに加えて、細胞培養培地は、IL-2を約3000IU/mLの初期濃度で、及びOKT-3を約30ng/mLの初期濃度でさらに含み、1つ以上のTNFRSFアゴニストが、4-1BBアゴニストを含む。
いくつかの実施形態では、IL-2、IL-7、IL-15、及び/またはIL-21の組み合わせは、第2の拡張中に組み合わせとして用いられる。いくつかの実施形態では、IL-2、IL-7、IL-15、及び/またはIL-21、ならびにそれらの任意の組み合わせは、例えば、図8(特に、例えば図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D)による、ならびに本明細書に記載されるステップDプロセス中を含む、第2の拡張中に含まれ得る。いくつかの実施形態では、IL-2、IL-15、及びIL-21の組み合わせは、第2の拡張中に組み合わせとして用いられる。いくつかの実施形態では、IL-2、IL-15、及びIL-21、ならびにそれらの任意の組み合わせは、図8(特に、例えば図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D)による、及び本明細書に記載されるステップDプロセス中に含まれ得る。
いくつかの実施形態では、第2の拡張は、IL-2、OKT-3、抗原提示フィーダー細胞、及び任意でTNFRSFアゴニストを含む補充された細胞培養培地において実施され得る。いくつかの実施形態では、第2の拡張は、補充された細胞培養培地中で起こる。いくつかの実施形態では、補充された細胞培養培地は、IL-2、OKT-3、及び抗原提示フィーダー細胞を含む。いくつかの実施形態では、第2の細胞培養培地は、IL-2、OKT-3、及び抗原提示細胞(APC、抗原提示フィーダー細胞とも称される)を含む。いくつかの実施形態では、第2の拡張は、IL-2、OKT-3、及び抗原提示フィーダー細胞(すなわち、抗原提示細胞)を含む細胞培養培地中で起こる。
いくつかの実施形態では、第2の拡張培養培地は、約500IU/mLのIL-15、約400IU/mLのIL-15、約300IU/mLのIL-15、約200IU/mLのIL-15、約180IU/mLのIL-15、約160IU/mLのIL-15、約140IU/mLのIL-15、約120IU/mLのIL-15、または約100IU/mLのIL-15を含む。いくつかの実施形態では、第2の拡張培養培地は、約500IU/mLのIL-15~約100IU/mLのIL-15を含む。いくつかの実施形態では、第2の拡張培養培地は、約400IU/mLのIL-15~約100IU/mLのIL-15を含む。いくつかの実施形態では、第2の拡張培養培地は、約300IU/mLのIL-15~約100IU/mLのIL-15を含む。いくつかの実施形態では、第2の拡張培養培地は、約200IU/mLのIL-15を含む。いくつかの実施形態では、細胞培養培地は、約180IU/mLのIL-15を含む。ある実施形態では、細胞培養培地は、IL-15をさらに含む。好ましい実施形態では、細胞培養培地は、約180IU/mLのIL-15を含む。
いくつかの実施形態では、第2の拡張培養培地は、約20IU/mLのIL-21、約15IU/mLのIL-21、約12IU/mLのIL-21、約10IU/mLのIL-21、約5IU/mLのIL-21、約4IU/mLのIL-21、約3IU/mLのIL-21、約2IU/mLのIL-21、約1IU/mLのIL-21、または約0.5IU/mLのIL-21を含む。いくつかの実施形態では、第2の拡張培養培地は、約20IU/mLのIL-21~約0.5IU/mLのIL-21を含む。いくつかの実施形態では、第2の拡張培養培地は、約15IU/mLのIL-21~約0.5IU/mLのIL-21を含む。いくつかの実施形態では、第2の拡張培養培地は、約12IU/mLのIL-21~約0.5IU/mLのIL-21を含む。いくつかの実施形態では、第2の拡張培養培地は、約10IU/mLのIL-21~約0.5IU/mLのIL-21を含む。いくつかの実施形態では、第2の拡張培養培地は、約5IU/mLのIL-21~約1IU/mLのIL-21を含む。いくつかの実施形態では、第2の拡張培養培地は、約2IU/mLのIL-21を含む。いくつかの実施形態では、細胞培養培地は、約1IU/mLのIL-21を含む。いくつかの実施形態では、細胞培養培地は、約0.5IU/mLのIL-21を含む。ある実施形態では、細胞培養培地は、IL-21をさらに含む。好ましい実施形態では、細胞培養培地は、約1IU/mLのIL-21を含む。
いくつかの実施形態では、抗原提示フィーダー細胞(APC)は、PBMCである。ある実施形態では、急速拡張及び/または第2の拡張におけるTILのPBMC及び/または抗原提示細胞に対する比率は、約1:10、約1:15、約1:20、約1:25、約1:30、約1:35、約1:40、約1:45、約1:50、約1:75、約1:100、約1:125、約1:150、約1:175、約1:200、約1:225、約1:250、約1:275、約1:300、約1:325、約1:350、約1:375、約1:400、または約1:500である。ある実施形態では、急速拡張及び/または第2の拡張におけるTILのPBMCに対する比率は、1:50~1:300である。ある実施形態では、急速拡張及び/または第2の拡張におけるTILのPBMCに対する比率は、1:100~1:200である。
ある実施形態では、REP及び/または急速な第2の拡張は、バルクTILを、100倍または200倍過剰の不活性化フィーダー細胞(フィーダー細胞濃度は、プライミングによる第1の拡張におけるフィーダー細胞濃度の少なくとも1.1倍(1.1×)、1.2×、1.3×、1.4×、1.5×、1.6×、1.7×、1.8×、1.8×、2×、2.1×、2.2×、2.3×、2.4×、2.5×、2.6×、2.7×、2.8×、2.9×、3.0×、3.1×、3.2×、3.3×、3.4×、3.5×、3.6×、3.7×、3.8×、3.9×または4.0×である)、30ng/mLのOKT3抗CD3抗体、及び6000IU/mLのIL-2と150mLの培地中で混合して、フラスコ内で行われる。培地交換(一般に、使用済み培地の3分の2の吸引及び等量の新鮮な培地との交換による、3分の2培地交換)は、細胞が代替の成長チャンバに移されるまで行われる。代替の成長チャンバには、以下でより完全に考察されるように、G-Rexフラスコ及びガス透過性容器が含まれる。
いくつかの実施形態では、急速な第2の拡張(REPプロセスと称されるプロセスを含み得る)は、実施例及び図で論じられるように、7~9日間である。いくつかの実施形態では、第2の拡張は、7日間である。いくつかの実施形態では、第2の拡張は、8日間である。いくつかの実施形態では、第2の拡張は、9日間である。
ある実施形態では、第2の拡張(REPと称される拡張、ならびに図8(特に、例えば図8B及び/または図8C)のステップDで参照される拡張を含み得る)は、100cmのガス透過性シリコン底部(G-Rex 100、Wilson Wolf Manufacturing Corporation,New Brighton,MN,USAから市販)を有する500mL容量のガス透過性フラスコ内で行うことができ、5×10または10×10TILは、5%ヒトAB血清、3000IU/mLのIL-2、及び30ng/mLの抗CD3(OKT3)が補充された400mLの50/50培地中でPBMCとともに培養され得る。G-Rex 100フラスコは、5%CO中37℃でインキュベートされ得る。5日目に、250mLの上清が除去され、遠心分離ボトルに入れられ、1500rpm(491×g)で10分間遠心分離される。TILペレットが、5%ヒトAB血清、6000IU/mLのIL-2を含む150mLの新鮮な培地で再懸濁され、元のGREX-100フラスコに戻し追加され得る。TILがGREX-100フラスコで連続して拡張される場合、10日目または11日目に、TILは、GREX-500などのより大きいフラスコに移され得る。培養14日目に、細胞が採取され得る。培養15日目に、細胞が採取され得る。培養16日目に、細胞が採取され得る。いくつかの実施形態では、培地交換は、細胞が代替の成長チャンバに移されるまで行われる。いくつかの実施形態では、培地の3分の2は、使用済み培地の吸引及び等体積の新鮮な培地との交換によって交換される。いくつかの実施形態では、代替の成長チャンバには、以下でより完全に考察されるように、GREXフラスコ及びガス透過性容器が含まれる。
いくつかの実施形態では、本明細書に開示される拡張プロセスで使用される培地は、無血清培地または合成培地である。いくつかの実施形態では、無血清または合成培地は、基礎細胞培地ならびに血清サプリメント及び/または血清代替物を含む。いくつかの実施形態では、無血清または合成培地は、血清含有培地のロット間の変動に部分的に起因する実験変動を防止及び/または減少させるために使用される。
いくつかの実施形態では、無血清または合成培地は、基礎細胞培地ならびに血清サプリメント及び/または血清代替物を含む。いくつかの実施形態では、基礎細胞培地には、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion Basal Medium、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-Cell Expansion SFM、CTS(商標)AIM-V Medium、CTS(商標)AIM-V SFM、LymphoONE(商標)T-Cell Expansion Xeno-Free Medium、ダルベッコ改変イーグル培地(DMEM)、最小必須培地(MEM)、イーグル基礎培地(BME)、RPMI1640、F-10、F-12、最小必須培地(αMEM)、グラスゴー最小必須培地(G-MEM)、RPMI成長培地、及びイスコフ改変ダルベッコ培地が含まれるが、これらに限定されない。
いくつかの実施形態では、血清サプリメントまたは血清代替物には、CTS(商標)OpTmizer T-Cell Expansion Serum Supplement、CTS(商標)Immune Cell Serum Replacement、1つ以上のアルブミンまたはアルブミン代用物、1つ以上のアミノ酸、1つ以上のビタミン、1つ以上のトランスフェリンまたはトランスフェリン代用物、1つ以上の抗酸化剤、1つ以上のインスリンまたはインスリン代用物、1つ以上のコラーゲン前駆体、1つ以上の抗生物質、及び1つ以上の微量元素のうちの1つ以上が含まれるが、これらに限定されない。いくつかの実施形態では、合成培地は、アルブミンと、グリシン、L-ヒスチジン、L-イソロイシン、L-メチオニン、L-フェニルアラニン、L-プロリン、L-ヒドロキシプロリン、L-セリン、L-スレオニン、L-トリプトファン、L-チロシン、L-バリン、チアミン、還元型グルタチオン、L-アスコルビン酸-2-リン酸塩、鉄飽和トランスフェリン、インスリン、ならびに微量元素部分Ag、Al3+、Ba2+、Cd2+、Co2+、Cr3+、Ge4+、Se4+、Br、T、Mn2+、P、Si4+、V5+、Mo6+、Ni2+、Rb、Sn2+、及びZr4+を含有する化合物からなる群から選択される1つ以上の成分と、を含む。いくつかの実施形態では、合成培地は、L-グルタミン、重炭酸ナトリウム、及び/または2-メルカプトエタノールをさらに含む。
いくつかの実施形態では、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Immune Cell Serum Replacementは、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion Basal Medium、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion SFM、CTS(商標)AIM-V Medium、CST(商標)AIM-V SFM、LymphoONE(商標)T-Cell Expansion Xeno-Free Medium、ダルベッコ改変イーグル培地(DMEM)、最小必須培地(MEM)、イーグル基礎培地(BME)、RPMI1640、F-10、F-12、最小必須培地(αMEM)、グラスゴー最小必須培地(G-MEM)、RPMI成長培地、及びイスコフ改変ダルベッコ培地を含むが、これらに限定されない、従来の成長培地とともに使用される。
いくつかの実施形態では、無血清または合成培地中の総血清代替物濃度(vol%)は、総無血清または合成培地の約1体積%、2体積%、3体積%、4体積%、5体積%、6体積%、7体積%、8体積%、9体積%、10体積%、11体積%、12体積%、13体積%、14体積%、15体積%、16体積%、17体積%、18体積%、19体積%、または20体積%である。いくつかの実施形態では、総血清代替物濃度は、無血清または合成培地の総体積の約3%である。いくつかの実施形態では、総血清代替物濃度は、無血清または合成培地の総体積の約5%である。いくつかの実施形態では、総血清代替物濃度は、無血清または合成培地の総体積の約10%である。
いくつかの実施形態では、無血清または合成培地は、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion SFM(ThermoFisher Scientific)である。CTS(商標)OpTmizer(商標)のいずれの製剤も、本発明において有用である。CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion SFMは、1LのCTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion Basal Mediumと、26mLのCTS(商標)OpTmizer(商標)T-Cell Expansion Supplementとの組み合わせであり、これらは使用前に一緒に混合される。いくつかの実施形態では、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion SFMには、55mMの2-メルカプトエタノールとともに、約3%のCTS(商標)Immune Cell Serum Replacement(SR)(ThermoFisher Scientific)が補充されている。
いくつかの実施形態では、合成培地は、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion SFM(ThermoFisher Scientific)である。CTS(商標)OpTmizer(商標)のいずれの製剤も、本発明において有用である。CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion SFMは、1LのCTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion Basal Mediumと、26mLのCTS(商標)OpTmizer(商標)T-Cell Expansion Supplementとの組み合わせであり、これらは使用前に一緒に混合される。いくつかの実施形態では、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion SFMには、55mMの2-メルカプトエタノールとともに、約3%のCTS(商標)Immune Cell Serum Replacement(SR)(ThermoFisher Scientific)が補充されている。いくつかの実施形態では、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion SFMには、約3%のCTS(商標)Immune Cell Serum Replacement(SR)(ThermoFisher Scientific)、55mMの2-メルカプトエタノール、及び2mMのL-グルタミンが補充されている。いくつかの実施形態では、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion SFMには、約3%のCTS(商標)Immune Cell Serum Replacement(SR)(ThermoFisher Scientific)、55mMの2-メルカプトエタノール、及び2mMのL-グルタミンが補充されており、約1000IU/mL~約8000IU/mLのIL-2をさらに含む。いくつかの実施形態では、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion SFMには、約3%のCTS(商標)Immune Cell Serum Replacement(SR)(ThermoFisher Scientific)、55mMの2-メルカプトエタノール、及び2mMのL-グルタミンが補充されており、約3000IU/mLのIL-2をさらに含む。いくつかの実施形態では、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion SFMには、約3%のCTS(商標)Immune Cell Serum Replacement(SR)(ThermoFisher Scientific)、55mMの2-メルカプトエタノール、及び2mMのL-グルタミンが補充されており、約6000IU/mLのIL-2をさらに含む。いくつかの実施形態では、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion SFMには、約3%のCTS(商標)Immune Cell Serum Replacement(SR)(ThermoFisher Scientific)及び55mMの2-メルカプトエタノールが補充されており、約1000IU/mL~約8000IU/mLのIL-2をさらに含む。いくつかの実施形態では、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion SFMには、約3%のCTS(商標)Immune Cell Serum Replacement(SR)(ThermoFisher Scientific)及び55mMの2-メルカプトエタノールが補充されており、約3000IU/mLのIL-2をさらに含む。いくつかの実施形態では、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion SFMには、約3%のCTS(商標)Immune Cell Serum Replacement(SR)(ThermoFisher Scientific)及び55mMの2-メルカプトエタノールが補充されており、約1000IU/mL~約6000IU/mLのIL-2をさらに含む。いくつかの実施形態では、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion SFMには、約3%のCTS(商標)Immune Cell Serum Replacement(SR)(ThermoFisher Scientific)及び約2mMのグルタミンが補充されており、約1000IU/mL~約8000IU/mLのIL-2をさらに含む。いくつかの実施形態では、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion SFMには、約3%のCTS(商標)Immune Cell Serum Replacement(SR)(ThermoFisher Scientific)及び約2mMのグルタミンが補充されており、約3000IU/mLのIL-2をさらに含む。いくつかの実施形態では、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion SFMには、約3%のCTS(商標)Immune Cell Serum Replacement(SR)(ThermoFisher Scientific)及び約2mMのグルタミンが補充されており、約6000IU/mLのIL-2をさらに含む。
いくつかの実施形態では、無血清培地または合成培地には、約0.1mM~約10mM、0.5mM~約9mM、1mM~約8mM、2mM~約7mM、3mM~約6mM、または4mM~約5mMの濃度でグルタミン(すなわち、GlutaMAX(登録商標))が補充されている。いくつかの実施形態では、無血清培地または合成培地には、約2mMの濃度でグルタミン(すなわち、GlutaMAX(登録商標))が補充されている。
いくつかの実施形態では、無血清培地または合成培地には、約5mM~約150mM、10mM~約140mM、15mM~約130mM、20mM~約120mM、25mM~約110mM、30mM~約100mM、35mM~約95mM、40mM~約90mM、45mM~約85mM、50mM~約80mM、55mM~約75mM、60mM~約70mM、または約65mMの濃度で2-メルカプトエタノールが補充されている。いくつかの実施形態では、無血清培地または合成培地には、約55mMの濃度で2-メルカプトエタノールが補充されている。
いくつかの実施形態では、国際特許公開第WO/1998/030679号(これは参照により本明細書に組み込まれる)に記載されている合成培地は、本発明において有用である。その刊行物には、無血清真核細胞培養培地が記載されている。無血清真核細胞培養培地には、無血清培養下で細胞の成長を支持することができる無血清サプリメントを補充した基礎細胞培養培地が含まれる。無血清真核細胞培養培地サプリメントは、1つ以上のアルブミンまたはアルブミン代用物、1つ以上のアミノ酸、1つ以上のビタミン、1つ以上のトランスフェリンまたはトランスフェリン代用物、1つ以上の抗酸化剤、1つ以上のインスリンまたはインスリン代用物、1つ以上のコラーゲン前駆体、1つ以上の微量元素、及び1つ以上の抗生物質からなる群から選択される1つ以上の成分を含むか、またはそれらを組み合わせることによって取得される。いくつかの実施形態では、合成培地は、L-グルタミン、重炭酸ナトリウム、及び/またはベータ-メルカプトエタノールをさらに含む。いくつかの実施形態では、合成培地は、アルブミンまたはアルブミン代用物と、1つ以上のアミノ酸、1つ以上のビタミン、1つ以上のトランスフェリンまたはトランスフェリン代用物、1つ以上の抗酸化剤、1つ以上のインスリンまたはインスリン代用物、1つ以上のコラーゲン前駆体、及び1つ以上の微量元素からなる群から選択される1つ以上の成分と、を含む。いくつかの実施形態では、合成培地は、アルブミンと、グリシン、L-ヒスチジン、L-イソロイシン、L-メチオニン、L-フェニルアラニン、L-プロリン、L-ヒドロキシプロリン、L-セリン、L-スレオニン、L-トリプトファン、L-チロシン、L-バリン、チアミン、還元型グルタチオン、L-アスコルビン酸-2-リン酸塩、鉄飽和トランスフェリン、インスリン、ならびに微量元素部分Ag、Al3+、Ba2+、Cd2+、Co2+、Cr3+、Ge4+、Se4+、Br、T、Mn2+、P、Si4+、V5+、Mo6+、Ni2+、Rb、Sn2+、及びZr4+を含有する化合物からなる群から選択される1つ以上の成分と、を含む。いくつかの実施形態では、基礎細胞培地は、ダルベッコ改変イーグル培地(DMEM)、最小必須培地(MEM)、イーグル基礎培地(BME)、RPMI1640、F-10、F-12、最小必須培地(αMEM)、グラスゴー最小必須培地(G-MEM)、RPMI成長培地、及びイスコフ改変ダルベッコ培地からなる群から選択される。
いくつかの実施形態では、合成培地中のグリシンの濃度は、約5~200mg/Lの範囲であり、L-ヒスチジンの濃度は、約5~250mg/Lであり、L-イソロイシンの濃度は、約5~300mg/Lであり、L-メチオニンの濃度は、約5~200mg/Lであり、L-フェニルアラニンの濃度は、約5~400mg/Lであり、L-プロリンの濃度は、約1~1000mg/Lであり、L-ヒドロキシプロリンの濃度は、約1~45mg/Lであり、L-セリンの濃度は、約1~250mg/Lであり、L-スレオニンの濃度は、約10~500mg/Lであり、L-トリプトファンの濃度は、約2~110mg/Lであり、L-チロシンの濃度は、約3~175mg/Lであり、L-バリンの濃度は、約5~500mg/Lであり、チアミンの濃度は、約1~20mg/Lであり、還元型グルタチオンの濃度は、約1~20mg/Lであり、L-アスコルビン酸-2-リン酸塩の濃度は、約1~200mg/Lであり、鉄飽和トランスフェリンの濃度は、約1~50mg/Lであり、インスリンの濃度は、約1~100mg/Lであり、亜セレン酸ナトリウムの濃度は、約0.000001~0.0001mg/Lであり、アルブミン(例えば、AlbuMAX(登録商標)I)の濃度は、約5000~50,000mg/Lである。
いくつかの実施形態では、合成培地中の非微量元素部分成分は、以下の表4の「1×培地中の濃度範囲」という見出しの下の列にリストされた濃度範囲で存在する。他の実施形態では、合成培地中の非微量元素部分成分は、「1×培地の好ましい実施形態」(上の表4を参照)という見出しの下の列にリストされた最終濃度で存在する。他の実施形態では、合成培地は、無血清サプリメントを含む基礎細胞培地である。これらの実施形態のうちのいくつかでは、無血清サプリメントは、「サプリメント中の好ましい実施形態」(上の表4を参照)という見出しの下の列にリストされたタイプ及び濃度の非微量部分成分を含む。
いくつかの実施形態では、合成培地の浸透圧は、約260~350mOsmolである。いくつかの実施形態では、浸透圧は、約280~310mOsmolである。いくつかの実施形態では、合成培地には、最大約3.7g/L、または約2.2g/Lの重炭酸ナトリウムが補充されている。合成培地には、L-グルタミン(最終濃度約2mM)、1つ以上の抗生物質、非必須アミノ酸(NEAA、最終濃度約100μM)、2-メルカプトエタノール(最終濃度約100μM)がさらに補充されていてもよい。
いくつかの実施形態では、Smith,et al.,“Ex vivo expansion of human T cells for adoptive immunotherapy using the novel Xeno-free CTS Immune Cell Serum Replacement,”Clin Transl Immunology,4(1)2015(doi:10.1038/cti.2014.31)に記載の合成培地が、本発明において有用である。簡潔には、RPMIまたはCTS(商標)OpTmizerを基礎細胞培地として使用し、0、2%、5%、または10%のいずれかのCTS(商標)Immune Cell Serum Replacementを補充した。
ある実施形態では、第1及び/または第2のガス透過性容器内の細胞培地は、ろ過されていない。濾過されていない細胞培地の使用は、細胞の数を拡張するために必要な手順を簡素化することができる。ある実施形態では、第1及び/または第2のガス透過性容器内の細胞培地は、β-メルカプトエタノール(BMEまたはβME、2-メルカプトエタノールとしても知られる、CAS60-24-2)を欠いている。
ある実施形態では、急速な第2の拡張(REPと称される拡張を含む)が行われ、優れた腫瘍反応性のためにTILが選択されるステップをさらに含む。当該技術分野で知られている任意の選択方法が使用され得る。例えば、米国特許出願公開第2016/0010058A1号(その開示は参照により本明細書に組み込まれる)に記載されている方法が、優れた腫瘍反応性のためのTILの選択に使用され得る。
任意選択で、細胞生存率アッセイは、当該技術分野で知られている標準のアッセイを使用して、急速な第2の拡張(REP拡張と称される拡張を含む)後に行われ得る。例えば、死細胞を選択的に標識し、生存率の評価を可能にするトリパンブルー排除アッセイが、バルクTILの試料上で行われ得る。いくつかの実施形態では、TIL試料は、Cellometer K2自動セルカウンター(Nexcelom Bioscience,Lawrence,MA)を使用して計数され、生存率が決定され得る。いくつかの実施形態では、生存率は、標準のCellometer K2 Image Cytometer Automatic Cell Counterプロトコルに従って決定される。
Tリンパ球及びBリンパ球の多様な抗原受容体は、限られた数であるが、多数の遺伝子セグメントの体細胞組換えによって産生される。これらの遺伝子セグメント:V(可変)、D(多様性)、J(接合)、及びC(一定)は、免疫グロブリン及びT細胞受容体(TCR)の結合特異性及び下流での適用を決定する。本発明は、T細胞レパートリー多様性を示し、かつ増加させるTILを生成するための方法を提供する。いくつかの実施形態では、本方法によって取得されたTILは、T細胞レパートリー多様性の増加を示す。いくつかの実施形態では、第2の拡張において取得されたTILは、T細胞レパートリー多様性の増加を示す。いくつかの実施形態では、多様性の増加は、免疫グロブリン多様性及び/またはT細胞受容体多様性の増加である。いくつかの実施形態では、多様性は、免疫グロブリンにあり、免疫グロブリン重鎖にある。いくつかの実施形態では、多様性は、免疫グロブリンにあり、免疫グロブリン軽鎖にある。いくつかの実施形態では、多様性は、T細胞受容体にある。いくつかの実施形態では、多様性は、アルファ、ベータ、ガンマ、及びデルタ受容体からなる群から選択されるT細胞受容体のうちの1つにある。いくつかの実施形態では、T細胞受容体(TCR)アルファ及び/またはベータの発現が増加する。いくつかの実施形態では、T細胞受容体(TCR)アルファの発現が増加する。いくつかの実施形態では、T細胞受容体(TCR)ベータの発現が増加する。いくつかの実施形態では、TCRab(すなわち、TCRα/β)の発現が増加する。
いくつかの実施形態では、急速な第2の拡張培養培地(例えば、CM2または第2の細胞培養培地とも称される)は、以下でさらに詳細に論じられるように、IL-2、OKT-3、ならびに抗原提示フィーダー細胞(APC)を含む。いくつかの実施形態では、急速な第2の拡張培養培地(例えば、CM2または第2の細胞培養培地とも称される)は、以下でさらに詳細に論じられるように、6000IU/mLのIL-2、30ug/フラスコのOKT-3、ならびに7.5×10の抗原提示フィーダー細胞(APC)を含む。いくつかの実施形態では、急速な第2の拡張培養培地(例えば、CM2または第2の細胞培養培地とも称される)は、以下でさらに詳細に論じられるように、IL-2、OKT-3、ならびに抗原提示フィーダー細胞(APC)を含む。いくつかの実施形態では、急速な第2の拡張培養培地(例えば、CM2または第2の細胞培養培地とも称される)は、以下でさらに詳細に論じられるように、6000IU/mLのIL-2、30ug/フラスコのOKT-3、ならびに5×10の抗原提示フィーダー細胞(APC)を含む。
いくつかの実施形態では、急速な第2の拡張、例えば、図8(特に、例えば図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D)によるステップDは、閉鎖系バイオリアクターにおいて行われる。いくつかの実施形態では、本明細書に記載されるように、閉鎖系がTIL拡張のために用いられる。いくつかの実施形態では、バイオリアクターが用いられる。いくつかの実施形態では、バイオリアクターが容器として用いられる。いくつかの実施形態では、用いられるバイオリアクターは、例えば、G-Rex-100またはG-Rex-500である。いくつかの実施形態では、用いられるバイオリアクターは、G-Rex-100である。いくつかの実施形態では、用いられるバイオリアクターは、G-Rex-500である。
1.フィーダー細胞及び抗原提示細胞
ある実施形態では、本明細書に記載される急速な第2の拡張手順(例えば、図8(特に、例えば図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D)のステップDに記載されるような拡張、ならびにREPと称されるものを含む)は、REP TIL拡張中及び/または急速な第2の拡張中に過剰のフィーダー細胞を必要とする。多くの実施形態では、フィーダー細胞は、健康な献血者由来の標準の全血単位から得られる末梢血単核細胞(PBMC)である。PBMCは、Ficoll-Paque勾配分離などの標準の方法を使用して取得される。
一般に、同種異系PBMCは、照射または熱処理のいずれかによって不活性化され、実施例に記載されるように、REP手順で使用され、これは、照射された同種異系PBMCの複製無能力を評価するための例示的なプロトコルを提供する。
いくつかの実施形態では、7日目または14日目の総生細胞数が、REPの0日目及び/または第2の拡張の0日目(すなわち、第2の拡張の開始日)に培養された初期の生細胞数よりも少ない場合、PBMCは、複製能力がないとみなされ、本明細書に記載のTIL拡張手順での使用が認められる。
いくつかの実施形態では、7日目及び14日目のOKT3及びIL-2の存在下で培養された総生細胞数が、REPの0日目及び/または第2の拡張の0日目(すなわち、第2の拡張の開始日)に培養された初期の生細胞数から増加しなかった場合、PBMCは、複製能力がないとみなされ、本明細書に記載のTIL拡張手順での使用が認められる。いくつかの実施形態では、PBMCは、30ng/mLのOKT3抗体及び3000IU/mLのIL-2の存在下で培養される。いくつかの実施形態では、PBMCは、60ng/mLのOKT3抗体及び6000IU/mLのIL-2の存在下で培養される。いくつかの実施形態では、PBMCは、60ng/mLのOKT3抗体及び3000IU/mLのIL-2の存在下で培養される。いくつかの実施形態では、PBMCは、30ng/mLのOKT3抗体及び6000IU/mLのIL-2の存在下で培養される。
いくつかの実施形態では、7日目及び14日目のOKT3及びIL-2の存在下で培養された総生細胞数が、REPの0日目及び/または第2の拡張の0日目(すなわち、第2の拡張の開始日)に培養された初期の生細胞数から増加しなかった場合、PBMCは、複製能力がないとみなされ、本明細書に記載のTIL拡張手順での使用が認められる。いくつかの実施形態では、PBMCは、30~60ng/mLのOKT3抗体及び1000~6000IU/mLのIL-2の存在下で培養される。いくつかの実施形態では、PBMCは、30~60ng/mLのOKT3抗体及び2000~5000IU/mLのIL-2の存在下で培養される。いくつかの実施形態では、PBMCは、30~60ng/mLのOKT3抗体及び2000~4000IU/mLのIL-2の存在下で培養される。いくつかの実施形態では、PBMCは、30~60ng/mLのOKT3抗体及び2500~3500IU/mLのIL-2の存在下で培養される。いくつかの実施形態では、PBMCは、30~60ng/mLのOKT3抗体及び6000IU/mLのIL-2の存在下で培養される。
いくつかの実施形態では、抗原提示フィーダー細胞は、PBMCである。いくつかの実施形態では、抗原提示フィーダー細胞は、人工抗原提示フィーダー細胞である。ある実施形態では、第2の拡張におけるTILの抗原提示フィーダー細胞に対する比率は、約1:10、約1:25、約1:50、約1:100、約1:125、約1:150、約1:175、約1:200、約1:225、約1:250、約1:275、約1:300、約1:325、約1:350、約1:375、約1:400、または約1:500である。ある実施形態では、第2の拡張におけるTILの抗原提示フィーダー細胞に対する比率は、1:50~1:300である。ある実施形態では、第2の拡張におけるTILの抗原提示フィーダー細胞に対する比率は、1:100~1:200である。
ある実施形態では、本明細書に記載の第2の急速拡張手順は、約5×10フィーダー細胞:約100×10TILの比率を必要とする。ある実施形態では、本明細書に記載の第2の急速拡張手順は、約7.5×10フィーダー細胞:約100×10TILの比率を必要とする。別の実施形態では、本明細書に記載の第2の急速拡張手順は、約5×10フィーダー細胞:約50×10TILの比率を必要とする。別の実施形態では、本明細書に記載の第2の急速拡張手順は、約7.5×10フィーダー細胞:約50×10TILの比率を必要とする。さらに別の実施形態では、本明細書に記載の第2の拡張手順は、約5×10フィーダー細胞:約25×10TILを必要とする。さらに別の実施形態では、本明細書に記載の第2の拡張手順は、約7.5×10フィーダー細胞:約25×10TILを必要とする。さらに別の実施形態では、急速な第2の拡張は、急速な第2の拡張の2倍の数のフィーダー細胞を必要とする。さらに別の実施形態では、本明細書に記載のプライミングによる第1の拡張が約2.5×10フィーダー細胞を必要とする場合、急速な第2の拡張は、約5×10フィーダー細胞を必要とする。さらに別の実施形態では、本明細書に記載のプライミングによる第1の拡張が約2.5×10フィーダー細胞を必要とする場合、急速な第2の拡張は、約7.5×10フィーダー細胞を必要とする。さらに別の実施形態では、急速な第2の拡張は、プライミングによる第1の拡張の2倍(2.0×)、2.5×、3.0×、3.5×、または4.0×の数のフィーダー細胞を必要とする。
ある実施形態では、本明細書に記載の急速な第2の拡張手順は、急速な第2の拡張中に過剰のフィーダー細胞を必要とする。多くの実施形態では、フィーダー細胞は、同種異系の健康な献血者由来の標準の全血単位から取得される末梢血単核細胞(PBMC)である。PBMCは、Ficoll-Paque勾配分離などの標準の方法を使用して取得される。ある実施形態では、人工抗原提示(aAPC)細胞がPBMCの代わりに使用される。いくつかの実施形態では、PBMCは、プライミングによる第1の拡張に追加されたPBMCの2倍の濃度で、急速な第2の拡張に追加される。
一般に、同種異系PBMCは、照射または熱処理のいずれかによって不活性化され、図及び実施例に記載される例示的な手順を含む、本明細書に記載のTIL拡張手順で使用される。
ある実施形態では、人工抗原提示細胞は、PBMCの代替物として、またはPBMCと組み合わせて、急速な第2の拡張において使用される。
ある実施形態では、Gen3プロセスの急速な第2の拡張で使用される抗原提示細胞は、単球細胞である。ある実施形態では、抗原提示細胞は、B細胞である。ある実施形態では、抗原提示細胞は、B細胞リンパ芽細胞またはB-リンパ芽細胞である。ある実施形態では、抗原提示細胞は、バーキットリンパ腫細胞である。ある実施形態では、抗原提示細胞は、骨髄系細胞である。ある実施形態では、抗原提示細胞は、単球である。ある実施形態では、抗原提示細胞は、HLA-A-02陽性単球である。ある実施形態では、抗原提示細胞は、急性単球性白血病細胞である。ある実施形態では、抗原提示細胞は、M5サブタイプの急性単球性白血病細胞である。ある実施形態では、抗原提示細胞は、Raji細胞またはその誘導体、バリアント、修飾、もしくは子孫である。ある実施形態では、抗原提示細胞は、Thp1細胞またはその誘導体、バリアント、修飾、もしくは子孫である。ある実施形態では、抗原提示細胞は、Ramos細胞またはその誘導体、バリアント、修飾、もしくは子孫である。ある実施形態では、抗原提示細胞は、U937細胞またはその誘導体、バリアント、修飾、もしくは子孫である。ある実施形態では、抗原提示細胞は、Daudi細胞またはその誘導体、バリアント、修飾、もしくは子孫である。ある実施形態では、抗原提示細胞は、メラノサイト細胞である。ある実施形態では、抗原提示細胞は、HLA-A-02陽性メラノサイト細胞である。ある実施形態では、抗原提示細胞は、黒色腫細胞である。ある実施形態では、抗原提示細胞は、HLA-A-02陽性黒色腫細胞である。ある実施形態では、抗原提示細胞は、Sk-MEL-5、Malme-3M、SK-MEL-28、SK-MEL-3、SH-4、SK-MEL-24、RPMI-7951、SK-MEL-1、A375、G-361、及びそれらの組み合わせ、またはそれらの誘導体、バリアント、修飾、もしくは子孫からなる群から選択される。前述の実施形態のうちのいずれにおいても、抗原提示細胞は、本明細書の他の箇所に記載されるように照射され得るか、または照射されなくてもよい。
ある実施形態では、aAPCは、Gen3プロセスの急速な第2の拡張で使用される。ある実施形態では、aAPCは、遺伝子修飾単球細胞である。ある実施形態では、aAPCは、遺伝子修飾B細胞である。ある実施形態では、aAPCは、遺伝子修飾B細胞リンパ芽細胞またはB-リンパ芽細胞である。ある実施形態では、aAPCは、遺伝子修飾バーキットリンパ腫細胞である。ある実施形態では、aAPCは、遺伝子修飾骨髄系譜細胞である。ある実施形態では、aAPCは、遺伝子修飾単球である。ある実施形態では、aAPCは、遺伝子修飾HLA-A-02陽性単球細胞である。ある実施形態では、aAPCは、遺伝子修飾急性単球性白血病細胞である。ある実施形態では、aAPCは、遺伝子修飾M5サブタイプ急性単球性白血病細胞である。ある実施形態では、aAPCは、遺伝子修飾Raji細胞またはその誘導体、バリアント、修飾、もしくは子孫である。ある実施形態では、aAPCは、遺伝子修飾Thp1細胞またはその誘導体、バリアント、修飾、もしくは子孫である。ある実施形態では、aAPCは、遺伝子修飾Ramos細胞またはその誘導体、バリアント、修飾、もしくは子孫である。ある実施形態では、aAPCは、遺伝子修飾U937細胞またはその誘導体、バリアント、修飾、もしくは子孫である。ある実施形態では、aAPCは、遺伝子修飾Daudi細胞またはその誘導体、バリアント、修飾、もしくは子孫である。ある実施形態では、aAPCは、遺伝子修飾メラノサイト細胞である。ある実施形態では、aAPCは、遺伝子修飾HLA-A-02陽性メラノサイト細胞である。ある実施形態では、aAPCは、遺伝子修飾黒色腫細胞である。ある実施形態では、aAPCは、遺伝子修飾HLA-A-02陽性黒色腫細胞である。ある実施形態では、aAPCは、Sk-MEL-5、Malme-3M、SK-MEL-28、SK-MEL-3、SH-4、SK-MEL-24、RPMI-7951、SK-MEL-1、A375、G-361、及びそれらの組み合わせ、またはそれらの誘導体、バリアント、修飾、もしくは子孫からなる群から選択される遺伝子修飾抗原提示細胞である。ある実施形態では、遺伝子修飾細胞は、米国特許第10,415,015号(その開示は参照により本明細書に組み込まれる)に記載されているように、CD86、OX40L、4-1BBL、OX-40アゴニスト抗体、4-1BBアゴニスト抗体、OKT-3のFc鎖に結合可能な抗体、及び/またはICOS-Lを発現するように修飾される。前述の実施形態のうちのいずれにおいても、遺伝子修飾aAPCは、本明細書の他の箇所に記載されるように照射され得るか、または照射されなくてもよい。
2.サイトカイン
本明細書に記載の急速な第2の拡張方法は、一般に、当該技術分野で知られているように、高用量のサイトカイン、特にIL-2を含む培養培地を使用する。
あるいは、WO2015/189356及びWO2015/189357(参照によりそれらの全体が本明細書に明示的に組み込まれる)に一般に概説されているように、IL-2、IL-15、及びIL-21のうちの2つ以上の組み合わせで、TILの急速な第2の拡張のためにサイトカインの組み合わせを使用することもさらに可能である。したがって、可能な組み合わせには、IL-2及びIL-15、IL-2及びIL-21、IL-15及びIL-21、ならびにIL-2、IL-15、及びIL-21が含まれ、後者は多くの実施形態で特に有用である。サイトカインの組み合わせの使用は、リンパ球、特にそこに記載されているようにT細胞の生成に特に有利に働く。
E.ステップE:TILを採取する
急速な第2の拡張ステップ後、細胞が採取され得る。いくつかの実施形態では、TILは、例えば、図8(特に、例えば図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D)に提供されるように、1、2、3、4、またはそれ以上の拡張ステップ後に採取される。いくつかの実施形態では、TILは、例えば、図8(特に、例えば図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D)に提供されるように、2つの拡張ステップ後に採取される。いくつかの実施形態では、TILは、2つの拡張ステップ、例えば、図8(特に、例えば図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D)に提供されるように、1回のプライミングによる第1の拡張及び1回の急速な第2の拡張の後に採取される。
TILは、任意の適切な滅菌様式で、例えば、遠心分離によって採取され得る。TILを採取するための方法は、当該技術分野で周知であり、任意のかかる既知の方法が本プロセスとともに用いられ得る。いくつかの実施形態では、TILは、自動化システムを使用して採取される。
細胞採取機及び/または細胞処理システムは、例えば、Fresenius Kabi、Tomtec Life Science、Perkin Elmer、及びInotech Biosystems International,Incを含む、様々な供給源から市販されている。任意の細胞ベースの採取機が本方法とともに用いられ得る。いくつかの実施形態では、細胞採取機及び/または細胞処理システムは、膜ベースの細胞採取機である。いくつかの実施形態では、細胞採取は、LOVOシステム(Fresenius Kabiによって製造されたもの)などの細胞処理システムによるものである。「LOVO細胞処理システム」という用語は、細胞を含む溶液を、滅菌及び/または閉鎖系環境で回転膜または回転フィルターなどの膜またはフィルターをとおしてポンプ輸送し、連続フローを可能にし、細胞を処理して、ペレット化せずに上清または細胞培養培地を除去する、任意のベンダーによって製造された任意の機器または装置も指す。いくつかの実施形態では、細胞採取機及び/または細胞処理システムは、滅菌閉鎖系内で、細胞分離、洗浄、流体交換、濃縮、及び/または他の細胞処理ステップを行うことができる。
いくつかの実施形態では、急速な第2の拡張、例えば、図8(特に、例えば図8B及び/または図8C)によるステップDは、閉鎖系バイオリアクター内で行われる。いくつかの実施形態では、本明細書に記載されるように、閉鎖系がTIL拡張のために用いられる。いくつかの実施形態では、バイオリアクターが用いられる。いくつかの実施形態では、バイオリアクターが容器として用いられる。いくつかの実施形態では、用いられるバイオリアクターは、例えば、G-Rex-100またはG-Rex-500である。いくつかの実施形態では、用いられるバイオリアクターは、G-Rex-100である。いくつかの実施形態では、用いられるバイオリアクターは、G-Rex-500である。
いくつかの実施形態では、図8(特に、例えば図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D)によるステップEは、本明細書に記載のプロセスに従って行われる。いくつかの実施形態では、閉鎖系は、閉鎖系の無菌性及び閉鎖性を維持するために、滅菌条件下でシリンジを介してアクセスされる。いくつかの実施形態では、本明細書に記載されるような閉鎖系が用いられる。
いくつかの実施形態では、TILは、本明細書に記載の方法に従って採取される。いくつかの実施形態では、14~16日目のTILが本明細書に記載の方法を使用して採取される。いくつかの実施形態では、TILは、本明細書に記載の方法を使用して14日目に採取される。いくつかの実施形態では、TILは、本明細書に記載の方法を使用して15日目に採取される。いくつかの実施形態では、TILは、本明細書に記載の方法を使用して16日目に採取される。
F.ステップF:拡張TILのアッセイ
いくつかの実施形態では、上記で提供されるステップからの拡張TILの効力及び/または機能性は、本明細書に記載のアッセイ方法のうちの1つを使用して調べられる。
ある実施形態では、本発明は、本明細書に記載されるGen3 TIL製品の効力を決定する方法を含み、この方法は、
a.Gen3 TIL細胞との標的細胞の共培養を、第1の期間行うステップと、
b.共培養から採取物を取得するステップと、
c.採取物を、(1)Gen3 TIL細胞製品細胞上の1つ以上のマーカーの発現について評価するか、または(2)Gen3 TIL細胞製品細胞から分泌された1つ以上の分析物について評価して、1つ以上の観測値を取得し、Gen3 TIL細胞製品の効力を決定するステップと、を含む。
あるいは、いくつかの実施形態では、拡張TILを、IFN-γ、グランザイムB、パーフォリン、及びTNF-αからなる群から選択される少なくとも2つの分析物の、ELISAまたは自動ELISA(例えば、ELLA)検出によるCD3またはCD3/CD28ビーズベースの刺激を含む複合アッセイを使用して分析する。ある実施形態では、かかる複合アッセイの製品放出仕様は、少なくとも2つの選択された分析物について少なくとも500pg/mL、少なくとも2つの選択された分析物について少なくとも600pg/mL、少なくとも2つの選択された分析物について少なくとも700pg/mL、少なくとも2つの選択された分析物について少なくとも800pg/mL、少なくとも2つの選択された分析物について少なくとも900pg/mL、少なくとも2つの選択された分析物について少なくとも1000pg/mL、少なくとも2つの選択された分析物について少なくとも1100pg/mL、または少なくとも2つの選択された分析物について少なくとも1200pg/mLであり、被験試料の各mLは、1×10TIL、2×10TIL、3×10TIL、4×10TIL、5×10TIL、6×10TIL、7×10TIL、8×10TIL、9×10TIL、または10×10TILを含有する。
G.ステップG:最終製剤及び輸液容器への移行
図8(特に、例えば図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D)に例示的な順序で提供され、かつ上及び本明細書で詳細に概説されるステップA~Eが完了した後、細胞は、患者への投与に使用するために、注入バッグまたは無菌バイアルなどの容器に移される。いくつかの実施形態では、治療的に十分な数のTILが上記の拡張方法を使用して取得されると、それらは、本明細書に記載の薬学的組成物を含む薬学的組成物として患者に投与する際に使用するために、注入バッグまたは無菌バイアルを含み得る容器に移される。TILは、かかる容器への移送後に効力について評価されてもよく、これは、安定性試験のためなど、移送直後または容器が一定期間保管された直後に起こり得る。
ある実施形態では、本開示の方法を使用して拡張されたTILは、薬学的組成物として患者に投与される。ある実施形態では、薬学的組成物は、滅菌緩衝液中のTIL懸濁液である。本明細書に開示されるように拡張されたTILは、当該技術分野で知られている任意の好適な経路によって投与され得る。いくつかの実施形態では、TILは、単回の動脈内または静脈内注入として投与され、これは、好ましくは、およそ30~60分続く。他の好適な投与経路には、腹腔内、髄腔内、及びリンパ内投与が含まれる。
VI.さらなるGen2、Gen3、及び他のTIL製造プロセスの実施形態
A.PBMCフィーダー細胞比
いくつかの実施形態では、本明細書に記載の拡張方法で使用される培地(例えば、図8(特に、例えば図8B及び/または図8C)を参照)は、抗CD3抗体、例えばOKT-3を含む。IL-2と組み合わせた抗CD3抗体は、TIL集団におけるT細胞活性化及び細胞分裂を誘導する。この効果は、全長抗体、ならびにFab及びF(ab’)2断片で見ることができ、前者が一般に好まれ、例えば、Tsoukas et al.,J.Immunol.1985,135,1719(参照によりその全体が本明細書に組み込まれる)を参照されたい。
ある実施形態では、PBMCフィーダー層の数は、以下のように計算される。
A.T細胞の体積(10μm直径):V=(4/3)πr=523.6μm
B.40μm(4細胞)の高さを有するG-Rex 100(M)のカラム:V=(4/3)πr=4×1012μm
C.カラムBを充填するために必要な細胞数:4×1012μm/523.6μm=7.6×10μm*0.64=4.86×10
D.四次元空間で最適に活性化され得る細胞の数:4.86×108/24=20.25×10
E.G-Rex 500に外挿されるフィーダー及びTILの数:TIL:100×10及びフィーダー:2.5×10
この計算では、100cm2の底部を有するシリンジ中でのTILの活性化のために二十面体形状を提供するのに必要な単核細胞の数の近似値が使用される。この計算は、Jin,et.al.,J.Immunother.2012,35,283-292に記載されているように、NCI実験データを密接に反映するT細胞の閾値活性化について、約5×10の実験結果を導き出す。(C)では、乗数(0.64)は、Jaeger and Nagel,Science,1992,255,1523-3によって計算された等価球のランダム充填密度である。(D)において、除数24は、Musin,Russ.Math.Surv.2003,58,794-795に記載されているように、四次元空間において同様の物体に接触し得る等価球の数、または「ニュートン数」である。
ある実施形態では、プライミングによる第1の拡張中に外因的に供給される抗原提示フィーダー細胞の数は、急速な第2の拡張中に外因的に供給される抗原提示フィーダー細胞の数のおよそ半分である。ある特定の実施形態では、この方法は、急速な第2の拡張の細胞培養培地と比較しておよそ50%少ない抗原提示細胞を含む細胞培養培地中でプライミングによる第1の拡張を行うことを含む。
別の実施形態では、急速な第2の拡張中に外因的に供給される抗原提示フィーダー細胞(APC)の数は、プライミングによる第1の拡張中に外因的に供給されるAPCの数よりも多い。
別の実施形態では、急速な第2の拡張中に外因的に供給されるAPCの数と、プライミングによる第1の拡張中に外因的に供給されるAPCの数との比率は、正確にまたは約1.1:1~正確にまたは約20:1の範囲から選択される。
別の実施形態では、急速な第2の拡張中に外因的に供給されるAPCの数と、プライミングによる第1の拡張中に外因的に供給されるAPCの数との比率は、正確にまたは約1.1:1~正確にまたは約10:1の範囲から選択される。
別の実施形態では、急速な第2の拡張中に外因的に供給されるAPCの数と、プライミングによる第1の拡張中に外因的に供給されるAPCの数との比率は、正確にまたは約1.1:1~正確にまたは約9:1の範囲から選択される。
別の実施形態では、急速な第2の拡張中に外因的に供給されるAPCの数と、プライミングによる第1の拡張中に外因的に供給されるAPCの数との比率は、正確にまたは約1.1:1~正確にまたは約8:1の範囲から選択される。
別の実施形態では、急速な第2の拡張中に外因的に供給されるAPCの数と、プライミングによる第1の拡張中に外因的に供給されるAPCの数との比率は、正確にまたは約1.1:1~正確にまたは約7:1の範囲から選択される。
別の実施形態では、急速な第2の拡張中に外因的に供給されるAPCの数と、プライミングによる第1の拡張中に外因的に供給されるAPCの数との比率は、正確にまたは約1.1:1~正確にまたは約6:1の範囲から選択される。
別の実施形態では、急速な第2の拡張中に外因的に供給されるAPCの数と、プライミングによる第1の拡張中に外因的に供給されるAPCの数との比率は、正確にまたは約1.1:1~正確にまたは約5:1の範囲から選択される。
別の実施形態では、急速な第2の拡張中に外因的に供給されるAPCの数と、プライミングによる第1の拡張中に外因的に供給されるAPCの数との比率は、正確にまたは約1.1:1~正確にまたは約4:1の範囲から選択される。
別の実施形態では、急速な第2の拡張中に外因的に供給されるAPCの数と、プライミングによる第1の拡張中に外因的に供給されるAPCの数との比率は、正確にまたは約1.1:1~正確にまたは約3:1の範囲から選択される。
別の実施形態では、急速な第2の拡張中に外因的に供給されるAPCの数と、プライミングによる第1の拡張中に外因的に供給されるAPCの数との比率は、正確にまたは約1.1:1~正確にまたは約2.9:1の範囲から選択される。
別の実施形態では、急速な第2の拡張中に外因的に供給されるAPCの数と、プライミングによる第1の拡張中に外因的に供給されるAPCの数との比率は、正確にまたは約1.1:1~正確にまたは約2.8:1の範囲から選択される。
別の実施形態では、急速な第2の拡張中に外因的に供給されるAPCの数と、プライミングによる第1の拡張中に外因的に供給されるAPCの数との比率は、正確にまたは約1.1:1~正確にまたは約2.7:1の範囲から選択される。
別の実施形態では、急速な第2の拡張中に外因的に供給されるAPCの数と、プライミングによる第1の拡張中に外因的に供給されるAPCの数との比率は、正確にまたは約1.1:1~正確にまたは約2.6:1の範囲から選択される。
別の実施形態では、急速な第2の拡張中に外因的に供給されるAPCの数と、プライミングによる第1の拡張中に外因的に供給されるAPCの数との比率は、正確にまたは約1.1:1~正確にまたは約2.5:1の範囲から選択される。
別の実施形態では、急速な第2の拡張中に外因的に供給されるAPCの数と、プライミングによる第1の拡張中に外因的に供給されるAPCの数との比率は、正確にまたは約1.1:1~正確にまたは約2.4:1の範囲から選択される。
別の実施形態では、急速な第2の拡張中に外因的に供給されるAPCの数と、プライミングによる第1の拡張中に外因的に供給されるAPCの数との比率は、正確にまたは約1.1:1~正確にまたは約2.3:1の範囲から選択される。
別の実施形態では、急速な第2の拡張中に外因的に供給されるAPCの数と、プライミングによる第1の拡張中に外因的に供給されるAPCの数との比率は、正確にまたは約1.1:1~正確にまたは約2.2:1の範囲から選択される。
別の実施形態では、急速な第2の拡張中に外因的に供給されるAPCの数と、プライミングによる第1の拡張中に外因的に供給されるAPCの数との比率は、正確にまたは約1.1:1~正確にまたは約2.1:1の範囲から選択される。
別の実施形態では、急速な第2の拡張中に外因的に供給されるAPCの数と、プライミングによる第1の拡張中に外因的に供給されるAPCの数との比率は、正確にまたは約1.1:1~正確にまたは約2:1の範囲から選択される。
別の実施形態では、急速な第2の拡張中に外因的に供給されるAPCの数と、プライミングによる第1の拡張中に外因的に供給されるAPCの数との比率は、正確にまたは約2:1~正確にまたは約10:1の範囲から選択される。
別の実施形態では、急速な第2の拡張中に外因的に供給されるAPCの数と、プライミングによる第1の拡張中に外因的に供給されるAPCの数との比率は、正確にまたは約2:1~正確にまたは約5:1の範囲から選択される。
別の実施形態では、急速な第2の拡張中に外因的に供給されるAPCの数と、プライミングによる第1の拡張中に外因的に供給されるAPCの数との比率は、正確にまたは約2:1~正確にまたは約4:1の範囲から選択される。
別の実施形態では、急速な第2の拡張中に外因的に供給されるAPCの数と、プライミングによる第1の拡張中に外因的に供給されるAPCの数との比率は、正確にまたは約2:1~正確にまたは約3:1の範囲から選択される。
別の実施形態では、急速な第2の拡張中に外因的に供給されるAPCの数と、プライミングによる第1の拡張中に外因的に供給されるAPCの数との比率は、正確にまたは約2:1~正確にまたは約2.9:1の範囲から選択される。
別の実施形態では、急速な第2の拡張中に外因的に供給されるAPCの数と、プライミングによる第1の拡張中に外因的に供給されるAPCの数との比率は、正確にまたは約2:1~正確にまたは約2.8:1の範囲から選択される。
別の実施形態では、急速な第2の拡張中に外因的に供給されるAPCの数と、プライミングによる第1の拡張中に外因的に供給されるAPCの数との比率は、正確にまたは約2:1~正確にまたは約2.7:1の範囲から選択される。
別の実施形態では、急速な第2の拡張中に外因的に供給されるAPCの数と、プライミングによる第1の拡張中に外因的に供給されるAPCの数との比率は、正確にまたは約2:1~正確にまたは約2.6:1の範囲から選択される。
別の実施形態では、急速な第2の拡張中に外因的に供給されるAPCの数と、プライミングによる第1の拡張中に外因的に供給されるAPCの数との比率は、正確にまたは約2:1~正確にまたは約2.5:1の範囲から選択される。
別の実施形態では、急速な第2の拡張中に外因的に供給されるAPCの数と、プライミングによる第1の拡張中に外因的に供給されるAPCの数との比率は、正確にまたは約2:1~正確にまたは約2.4:1の範囲から選択される。
別の実施形態では、急速な第2の拡張中に外因的に供給されるAPCの数と、プライミングによる第1の拡張中に外因的に供給されるAPCの数との比率は、正確にまたは約2:1~正確にまたは約2.3:1の範囲から選択される。
別の実施形態では、急速な第2の拡張中に外因的に供給されるAPCの数と、プライミングによる第1の拡張中に外因的に供給されるAPCの数との比率は、正確にまたは約2:1~正確にまたは約2.2:1の範囲から選択される。
別の実施形態では、急速な第2の拡張中に外因的に供給されるAPCの数と、プライミングによる第1の拡張中に外因的に供給されるAPCの数との比率は、正確にまたは約2:1~正確にまたは約2.1:1の範囲から選択される。
別の実施形態では、急速な第2の拡張中に外因的に供給されるAPCの数と、プライミングによる第1の拡張中に外因的に供給されるAPCの数との比率は、正確にまたは約2:1である。
別の実施形態では、急速な第2の拡張中に外因的に供給されるAPCの数と、プライミングによる第1の拡張中に外因的に供給されるAPCの数との比率は、正確にまたは約1.1:1、1.2:1、1.3:1、1.4:1、1.5:1、1.6:1、1.7:1、1.8:1、1.9:1、2:1、2.1:1、2.2:1、2.3:1、2.4:1、2.5:1、2.6:1、2.7:1、2.8:1、2.9:1、3:1、3.1:1、3.2:1、3.3:1、3.4:1、3.5:1、3.6:1、3.7:1、3.8:1、3.9:1、4:1、4.1:1、4.2:1、4.3:1、4.4:1、4.5:1、4.6:1、4.7:1、4.8:1、4.9:1、または5:1である。
別の実施形態では、プライミングによる第1の拡張中に外因的に供給されるAPCの数は、正確にまたは約1×10、1.1×10、1.2×10、1.3×10、1.4×10、1.5×10、1.6×10、1.7×10、1.8×10、1.9×10、2×10、2.1×10、2.2×10、2.3×10、2.4×10、2.5×10、2.6×10、2.7×10、2.8×10、2.9×10、3×10、3.1×10、3.2×10、3.3×10、3.4×10、または3.5×10APCであり、急速な第2の拡張中に外因的に供給されるAPCの数は、正確にまたは約3.5×10、3.6×10、3.7×10、3.8×10、3.9×10、4×10、4.1×10、4.2×10、4.3×10、4.4×10、4.5×10、4.6×10、4.7×10、4.8×10、4.9×10、5×10、5.1×10、5.2×10、5.3×10、5.4×10、5.5×10、5.6×10、5.7×10、5.8×10、5.9×10、6×10、6.1×10、6.2×10、6.3×10、6.4×10、6.5×10、6.6×10、6.7×10、6.8×10、6.9×10、7×10、7.1×10、7.2×10、7.3×10、7.4×10、7.5×10、7.6×10、7.7×10、7.8×10、7.9×10、8×10、8.1×10、8.2×10、8.3×10、8.4×10、8.5×10、8.6×10、8.7×10、8.8×10、8.9×10、9×10、9.1×10、9.2×10、9.3×10、9.4×10、9.5×10、9.6×10、9.7×10、9.8×10、9.9×10、または1×10APCである。
別の実施形態では、プライミングによる第1の拡張中に外因的に供給されるAPCの数は、正確にまたは約1.5×10APC~正確にまたは約3×10APCの範囲から選択され、急速な第2の拡張中に外因的に供給されるAPCの数は、正確にまたは約4×10APC~正確にまたは約7.5×10APCの範囲から選択される。
別の実施形態では、プライミングによる第1の拡張中に外因的に供給されるAPCの数は、正確にまたは約2×10APC~正確にまたは約2.5×10APCの範囲から選択され、急速な第2の拡張中に外因的に供給されるAPCの数は、正確にまたは約4.5×10APC~正確にまたは約5.5×10APCの範囲から選択される。
別の実施形態では、プライミングによる第1の拡張中に外因的に供給されるAPCの数は、正確にまたは約2.5×10APCであり、急速な第2の拡張中に外因的に供給されるAPCの数は、正確にまたは約5×10APCである。
ある実施形態では、プライミングによる第1の拡張の0日目に添加されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数は、プライミングによる第1の拡張の7日目(例えば、この方法の7日目)に添加されるPBMCの数のおよそ半分である。ある特定の実施形態では、方法は、プライミングによる第1の拡張の0日目に抗原提示細胞を第1のTIL集団に追加することと、7日目に抗原提示細胞を第2のTIL集団に追加することとを含み、0日目に追加される抗原提示細胞の数は、プライミングによる第1の拡張の7日目(例えば、方法の7日目)に追加される抗原提示細胞の数のおよそ50%である。
別の実施形態では、急速な第2の拡張の7日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数は、プライミングによる第1の拡張の0日目に外因的に供給されるPBMCの数よりも多い。
別の実施形態では、プライミングによる第1の拡張において外因的に供給されるAPCは、正確にまたは約1.0×10APC/cm~正確にまたは約4.5×10APC/cmの範囲から選択される密度で培養フラスコに播種される。
別の実施形態では、プライミングによる第1の拡張において外因的に供給されるAPCは、正確にまたは約1.5×10APC/cm~正確にまたは約3.5×10APC/cmの範囲から選択される密度で培養フラスコに播種される。
別の実施形態では、プライミングによる第1の拡張において外因的に供給されるAPCは、正確にまたは約2×10APC/cm~正確にまたは約3×10APC/cmの範囲から選択される密度で培養フラスコに播種される。
別の実施形態では、プライミングによる第1の拡張において外因的に供給されるAPCは、正確にまたは約2×10APC/cmの密度で培養フラスコに播種される。
別の実施形態では、プライミングによる第1の拡張において外因的に供給されるAPCは、正確にまたは約1.0×10、1.1×10、1.2×10、1.3×10、1.4×10、1.5×10、1.6×10、1.7×10、1.8×10、1.9×10、2×10、2.1×10、2.2×10、2.3×10、2.4×10、2.5×10、2.6×10、2.7×10、2.8×10、2.9×10、3×10、3.1×10、3.2×10、3.3×10、3.4×10、3.5×10、3.6×10、3.7×10、3.8×10、3.9×10、4×10、4.1×10、4.2×10、4.3×10、4.4×10、または4.5×10APC/cmの密度で培養フラスコに播種される。
別の実施形態では、急速な第2の拡張において外因的に供給されるAPCは、正確にまたは約2.5×10APC/cm~正確にまたは約7.5×10APC/cmの範囲から選択される密度で培養フラスコに播種される。
別の実施形態では、急速な第2の拡張において外因的に供給されるAPCは、正確にまたは約3.5×10APC/cm~約6.0×10APC/cmの範囲から選択される密度で培養フラスコに播種される。
別の実施形態では、急速な第2の拡張において外因的に供給されるAPCは、正確にまたは約4.0×10APC/cm~約5.5×10APC/cmの範囲から選択される密度で培養フラスコに播種される。
別の実施形態では、急速な第2の拡張において外因的に供給されるAPCは、正確にまたは約4.0×10APC/cmの範囲から選択される密度で培養フラスコに播種される。
別の実施形態では、急速な第2の拡張において外因的に供給されるAPCは、正確にまたは約2.5×10APC/cm、2.6×10APC/cm、2.7×10APC/cm、2.8×10、2.9×10、3×10、3.1×10、3.2×10、3.3×10、3.4×10、3.5×10、3.6×10、3.7×10、3.8×10、3.9×10、4×10、4.1×10、4.2×10、4.3×10、4.4×10、4.5×10、4.6×10、4.7×10、4.8×10、4.9×10、5×10、5.1×10、5.2×10、5.3×10、5.4×10、5.5×10、5.6×10、5.7×10、5.8×10、5.9×10、6×10、6.1×10、6.2×10、6.3×10、6.4×10、6.5×10、6.6×10、6.7×10、6.8×10、6.9×10、7×10、7.1×10、7.2×10、7.3×10、7.4×10、または7.5×10APC/cmの密度で培養フラスコに播種される。
別の実施形態では、プライミングによる第1の拡張において外因的に供給されるAPCは、正確にまたは約1.0×10、1.1×10、1.2×10、1.3×10、1.4×10、1.5×10、1.6×10、1.7×10、1.8×10、1.9×10、2×10、2.1×10、2.2×10、2.3×10、2.4×10、2.5×10、2.6×10、2.7×10、2.8×10、2.9×10、3×10、3.1×10、3.2×10、3.3×10、3.4×10、3.5×10、3.6×10、3.7×10、3.8×10、3.9×10、4×10、4.1×10、4.2×10、4.3×10、4.4×10、または4.5×10APC/cmの密度で培養フラスコに播種され、急速な第2の拡張において外因的に供給されるAPCは、正確にまたは約2.5×10APC/cm、2.6×10APC/cm、2.7×10APC/cm、2.8×10、2.9×10、3×10、3.1×10、3.2×10、3.3×10、3.4×10、3.5×10、3.6×10、3.7×10、3.8×10、3.9×10、4×10、4.1×10、4.2×10、4.3×10、4.4×10、4.5×10、4.6×10、4.7×10、4.8×10、4.9×10、5×10、5.1×10、5.2×10、5.3×10、5.4×10、5.5×10、5.6×10、5.7×10、5.8×10、5.9×10、6×10、6.1×10、6.2×10、6.3×10、6.4×10、6.5×10、6.6×10、6.7×10、6.8×10、6.9×10、7×10、7.1×10、7.2×10、7.3×10、7.4×10、または7.5×10APC/cmの密度で培養フラスコに播種される。
別の実施形態では、プライミングによる第1の拡張において外因的に供給されるAPCは、正確にまたは約1.0×10APC/cm~正確にまたは約4.5×10APC/cmの範囲から選択される密度で培養フラスコに播種され、急速な第2の拡張において外因的に供給されるAPCは、正確にまたは約2.5×10APC/cm~正確にまたは約7.5×10APC/cmの範囲から選択される密度で培養フラスコに播種される。
別の実施形態では、プライミングによる第1の拡張において外因的に供給されるAPCは、正確にまたは約1.5×10APC/cm~正確にまたは約3.5×10APC/cmの範囲から選択される密度で培養フラスコに播種され、急速な第2の拡張において外因的に供給されるAPCは、正確にまたは約3.5×10APC/cm~正確にまたは約6×10APC/cmの範囲から選択される密度で培養フラスコに播種される。
別の実施形態では、プライミングによる第1の拡張において外因的に供給されるAPCは、正確にまたは約2×10APC/cm~正確にまたは約3×10APC/cmの範囲から選択される密度で培養フラスコに播種され、急速な第2の拡張において外因的に供給されるAPCは、正確にまたは約4×10APC/cm~正確にまたは約5.5×10APC/cmの範囲から選択される密度で培養フラスコに播種される。
別の実施形態では、プライミングによる第1の拡張において外因的に供給されるAPCは、正確にまたは約2×10APC/cmの密度で培養フラスコに播種され、急速な第2の拡張において外因的に供給されるAPCは、正確にまたは約4×10APC/cmの密度で培養フラスコに播種される。
別の実施形態では、急速な第2の拡張の7日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数と、プライミングによる第1の拡張の0日目に外因的に供給されるPBMCの数との比率は、正確にまたは約1.1:1~正確にまたは約20:1の範囲から選択される。
別の実施形態では、急速な第2の拡張の7日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数と、プライミングによる第1の拡張の0日目に外因的に供給されるPBMCの数との比率は、正確にまたは約1.1:1~正確にまたは約10:1の範囲から選択される。
別の実施形態では、急速な第2の拡張の7日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数と、プライミングによる第1の拡張の0日目に外因的に供給されるPBMCの数との比率は、正確にまたは約1.1:1~正確にまたは約9:1の範囲から選択される。
別の実施形態では、急速な第2の拡張の7日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数と、プライミングによる第1の拡張の0日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数との比率は、正確にまたは約1.1:1~正確にまたは約8:1の範囲から選択される。
別の実施形態では、急速な第2の拡張の7日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数と、プライミングによる第1の拡張の0日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数との比率は、正確にまたは約1.1:1~正確にまたは約7:1の範囲から選択される。
別の実施形態では、急速な第2の拡張の7日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数と、プライミングによる第1の拡張の0日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数との比率は、正確にまたは約1.1:1~正確にまたは約6:1の範囲から選択される。
別の実施形態では、急速な第2の拡張の7日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数と、プライミングによる第1の拡張の0日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数との比率は、正確にまたは約1.1:1~正確にまたは約5:1の範囲から選択される。
別の実施形態では、急速な第2の拡張の7日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数と、プライミングによる第1の拡張の0日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数との比率は、正確にまたは約1.1:1~正確にまたは約4:1の範囲から選択される。
別の実施形態では、急速な第2の拡張の7日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数と、プライミングによる第1の拡張の0日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数との比率は、正確にまたは約1.1:1~正確にまたは約3:1の範囲から選択される。
別の実施形態では、急速な第2の拡張の7日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数と、プライミングによる第1の拡張の0日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数との比率は、正確にまたは約1.1:1~正確にまたは約2.9:1の範囲から選択される。
別の実施形態では、急速な第2の拡張の7日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数と、プライミングによる第1の拡張の0日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数との比率は、正確にまたは約1.1:1~正確にまたは約2.8:1の範囲から選択される。
別の実施形態では、急速な第2の拡張の7日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数と、プライミングによる第1の拡張の0日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数との比率は、正確にまたは約1.1:1~正確にまたは約2.7:1の範囲から選択される。
別の実施形態では、急速な第2の拡張の7日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数と、プライミングによる第1の拡張の0日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数との比率は、正確にまたは約1.1:1~正確にまたは約2.6:1の範囲から選択される。
別の実施形態では、急速な第2の拡張の7日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数と、プライミングによる第1の拡張の0日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数との比率は、正確にまたは約1.1:1~正確にまたは約2.5:1の範囲から選択される。
別の実施形態では、急速な第2の拡張の7日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数と、プライミングによる第1の拡張の0日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数との比率は、正確にまたは約1.1:1~正確にまたは約2.4:1の範囲から選択される。
別の実施形態では、急速な第2の拡張の7日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数と、プライミングによる第1の拡張の0日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数との比率は、正確にまたは約1.1:1~正確にまたは約2.3:1の範囲から選択される。
別の実施形態では、急速な第2の拡張の7日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数と、プライミングによる第1の拡張の0日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数との比率は、正確にまたは約1.1:1~正確にまたは約2.2:1の範囲から選択される。
別の実施形態では、急速な第2の拡張の7日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数と、プライミングによる第1の拡張の0日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数との比率は、正確にまたは約1.1:1~正確にまたは約2.1:1の範囲から選択される。
別の実施形態では、急速な第2の拡張の7日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数と、プライミングによる第1の拡張の0日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数との比率は、正確にまたは約1.1:1~正確にまたは約2:1の範囲から選択される。
別の実施形態では、急速な第2の拡張の7日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数と、プライミングによる第1の拡張の0日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数との比率は、正確にまたは約2:1~正確にまたは約10:1の範囲から選択される。
別の実施形態では、急速な第2の拡張の7日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数と、プライミングによる第1の拡張の0日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数との比率は、正確にまたは約2:1~正確にまたは約5:1の範囲から選択される。
別の実施形態では、急速な第2の拡張の7日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数と、プライミングによる第1の拡張の0日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数との比率は、正確にまたは約2:1~正確にまたは約4:1の範囲から選択される。
別の実施形態では、急速な第2の拡張の7日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数と、プライミングによる第1の拡張の0日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数との比率は、正確にまたは約2:1~正確にまたは約3:1の範囲から選択される。
別の実施形態では、急速な第2の拡張の7日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数と、プライミングによる第1の拡張の0日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数との比率は、正確にまたは約2:1~正確にまたは約2.9:1の範囲から選択される。
別の実施形態では、急速な第2の拡張の7日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数と、プライミングによる第1の拡張の0日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数との比率は、正確にまたは約2:1~正確にまたは約2.8:1の範囲から選択される。
別の実施形態では、急速な第2の拡張の7日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数と、プライミングによる第1の拡張の0日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数との比率は、正確にまたは約2:1~正確にまたは約2.7:1の範囲から選択される。
別の実施形態では、急速な第2の拡張の7日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数と、プライミングによる第1の拡張の0日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数との比率は、正確にまたは約2:1~正確にまたは約2.6:1の範囲から選択される。
別の実施形態では、急速な第2の拡張の7日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数と、プライミングによる第1の拡張の0日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数との比率は、正確にまたは約2:1~正確にまたは約2.5:1の範囲から選択される。
別の実施形態では、急速な第2の拡張の7日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数と、プライミングによる第1の拡張の0日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数との比率は、正確にまたは約2:1~正確にまたは約2.4:1の範囲から選択される。
別の実施形態では、急速な第2の拡張の7日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数と、プライミングによる第1の拡張の0日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数との比率は、正確にまたは約2:1~正確にまたは約2.3:1の範囲から選択される。
別の実施形態では、急速な第2の拡張の7日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数と、プライミングによる第1の拡張の0日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数との比率は、正確にまたは約2:1~正確にまたは約2.2:1の範囲から選択される。
別の実施形態では、急速な第2の拡張の7日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数と、プライミングによる第1の拡張の0日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数との比率は、正確にまたは約2:1~正確にまたは約2.1:1の範囲から選択される。
別の実施形態では、急速な第2の拡張の7日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数と、プライミングによる第1の拡張の0日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数との比率は、正確にまたは約2:1である。
別の実施形態では、急速な第2の拡張の7日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数と、プライミングによる第1の拡張の0日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数との比率は、正確にまたは約1.1:1、1.2:1、1.3:1、1.4:1、1.5:1、1.6:1、1.7:1、1.8:1、1.9:1、2:1、2.1:1、2.2:1、2.3:1、2.4:1、2.5:1、2.6:1、2.7:1、2.8:1、2.9:1、3:1、3.1:1、3.2:1、3.3:1、3.4:1、3.5:1、3.6:1、3.7:1、3.8:1、3.9:1、4:1、4.1:1、4.2:1、4.3:1、4.4:1、4.5:1、4.6:1、4.7:1、4.8:1、4.9:1、または5:1である。
別の実施形態では、プライミングによる第1の拡張の0日目外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数は、正確にまたは約1×10、1.1×10、1.2×10、1.3×10、1.4×10、1.5×10、1.6×10、1.7×10、1.8×10、1.9×10、2×10、2.1×10、2.2×10、2.3×10、2.4×10、2.5×10、2.6×10、2.7×10、2.8×10、2.9×10、3×10、3.1×10、3.2×10、3.3×10、3.4×10、または3.5×10APC(例えば、PBMCを含む)であり、急速な第2の拡張の7日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数は、正確にまたは約3.5×10、3.6×10、3.7×10、3.8×10、3.9×10、4×10、4.1×10、4.2×10、4.3×10、4.4×10、4.5×10、4.6×10、4.7×10、4.8×10、4.9×10、5×10、5.1×10、5.2×10、5.3×10、5.4×10、5.5×10、5.6×10、5.7×10、5.8×10、5.9×10、6×10、6.1×10、6.2×10、6.3×10、6.4×10、6.5×10、6.6×10、6.7×10、6.8×10、6.9×10、7×10、7.1×10、7.2×10、7.3×10、7.4×10、7.5×10、7.6×10、7.7×10、7.8×10、7.9×10、8×10、8.1×10、8.2×10、8.3×10、8.4×10、8.5×10、8.6×10、8.7×10、8.8×10、8.9×10、9×10、9.1×10、9.2×10、9.3×10、9.4×10、9.5×10、9.6×10、9.7×10、9.8×10、9.9×10、または1×10APC(例えば、PBMCを含む)である。
別の実施形態では、プライミングによる第1の拡張の0日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数は、正確にまたは約1×10APC(例えば、PBMCを含む)~正確にまたは約3.5×10APC(例えば、PBMCを含む)の範囲から選択され、急速な第2の拡張の7日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数は、正確にまたは約3.5×10APC(例えば、PBMCを含む)~正確にまたは約1×10APC(例えば、PBMCを含む)の範囲から選択される。
別の実施形態では、プライミングによる第1の拡張の0日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数は、正確にまたは約1.5×10APC~正確にまたは約3×10APC(例えば、PBMCを含む)の範囲から選択され、急速な第2の拡張の7日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数は、正確にまたは約4×10APC(例えば、PBMCを含む)~正確にまたは約7.5×10APC(例えば、PBMCを含む)の範囲から選択される。
別の実施形態では、プライミングによる第1の拡張の0日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数は、正確にまたは約2×10APC(例えば、PBMCを含む)~正確にまたは約2.5×10APC(例えば、PBMCを含む)の範囲から選択され、急速な第2の拡張の7日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数は、正確にまたは約4.5×10APC(例えば、PBMCを含む)~正確にまたは約5.5×10APC(例えば、PBMCを含む)の範囲から選択される。
別の実施形態では、プライミングによる第1の拡張の0日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数は、正確にまたは約2.5×10APC(例えば、PBMCを含む)であり、急速な第2の拡張の7日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数は、正確にまたは約5×10APC(例えば、PBMCを含む)である。
ある実施形態では、プライミングによる第1の拡張の0日目に添加されるAPC(例えば、PBMCを含む)層の数は、急速な第2の拡張の7日目に添加されるAPC(例えば、PBMCを含む)層の数のおよそ半分である。ある特定の実施形態では、方法は、プライミングによる第1の拡張の0日目に抗原提示細胞層を第1のTIL集団に追加することと、7日目に抗原提示細胞を第2のTIL集団に追加することとを含み、0日目に追加される抗原提示細胞層の数は、7日目に追加される抗原提示細胞層の数のおよそ50%である。
別の実施形態では、急速な第2の拡張の7日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)層の数は、プライミングによる第1の拡張の0日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)層の数よりも多い。
別の実施形態では、プライミングによる第1の拡張の0日目は、正確にまたは約2細胞層の平均厚さを有する層状APC(例えば、PBMCを含む)の存在下で起こり、急速な第2の拡張の7日目は、正確にまたは約4細胞層の平均厚さを有する層状APC(例えば、PBMCを含む)の存在下で起こる。
別の実施形態では、プライミングによる第1の拡張の0日目は、正確にまたは約1細胞層の平均厚さを有する層状APC(例えば、PBMCを含む)の存在下で起こり、第3の急速拡張の7日目は、正確にまたは約2細胞層の平均厚さを有する層状APC(例えば、PBMCを含む)の存在下で起こる。
別の実施形態では、プライミングによる第1の拡張の0日目は、正確にまたは約1.5細胞層~正確にまたは約2.5細胞層の平均厚さを有する層状APC(例えば、PBMCを含む)の存在下で起こり、急速な第2の拡張の7日目は、正確にまたは約3細胞層の平均厚さを有する層状APC(例えば、PBMCを含む)の存在下で起こる。
別の実施形態では、プライミングによる第1の拡張の0日目は、正確にまたは約1細胞層の平均厚さを有する層状APC(例えば、PBMCを含む)の存在下で起こり、急速な第2の拡張の7日目は、正確にまたは約2細胞層の平均厚さを有する層状APC(例えば、PBMCを含む)の存在下で起こる。
別の実施形態では、プライミングによる第1の拡張の0日目は、正確にまたは約1、1.1、1.2、1.3、1.4、1.5、1.6、1.7、1.8、1.9、2、2.1、2.2、2.3、2.4、2.5、2.6、2.7、2.8、2.9、または3細胞層の平均厚さを有する層状APC(例えば、PBMCを含む)の存在下で起こり、急速な第2の拡張の7日目は、正確にまたは約3.1、3.2、3.3、3.4、3.5、3.6、3.7、3.8、3.9、4、4.1、4.2、4.3、4.4、4.5、4.6、4.7、4.8、4.9、5、5.1、5.2、5.3、5.4、5.5、5.6、5.7、5.8、5.9、6、6.1、6.2、6.3、6.4、6.5、6.6、6.7、6.8、6.9、7、7.1、7.2、7.3、7.4、7.5、7.6、7.7、7.8、7.9、または8細胞層の平均厚さを有する層状APC(例えば、PBMCを含む)の存在下で起こる。
別の実施形態では、プライミングによる第1の拡張の0日目は、正確にまたは約1細胞層~正確にまたは約2細胞層の平均厚さを有する層状APC(例えば、PBMCを含む)の存在下で起こり、急速な第2の拡張の7日目は、正確にまたは約3細胞層~正確にまたは約10細胞層の平均厚さを有する層状APC(例えば、PBMCを含む)の存在下で起こる。
別の実施形態では、プライミングによる第1の拡張の0日目は、正確にまたは約2細胞層~正確にまたは約3細胞層の平均厚さを有する層状APC(例えば、PBMCを含む)の存在下で起こり、急速な第2の拡張の7日目は、正確にまたは約4細胞層~正確にまたは約8細胞層の平均厚さを有する層状APC(例えば、PBMCを含む)の存在下で起こる。
別の実施形態では、プライミングによる第1の拡張の0日目は、正確にまたは約2細胞層の平均厚さを有する層状APC(例えば、PBMCを含む)の存在下で起こり、急速な第2の拡張の7日目は、正確にまたは約4細胞層~正確にまたは約8細胞層の平均厚さを有する層状APC(例えば、PBMCを含む)の存在下で起こる。
別の実施形態では、プライミングによる第1の拡張の0日目は、正確にまたは約1、2、または3細胞層の平均厚さを有する層状APC(例えば、PBMCを含む)の存在下で起こり、急速な第2の拡張の7日目は、正確にまたは約3、4、5、6、7、8、9、または10細胞層の平均厚さを有する層状APC(例えば、PBMCを含む)の存在下で起こる。
別の実施形態では、プライミングによる第1の拡張の0日目は、APC(例えば、PBMCを含む)の第1の層の数に等しい第1の平均厚さを有する層状APC(例えば、PBMCを含む)の存在下で起こり、急速な第2の拡張の7日目は、APC(例えば、PBMCを含む)の第2の層の数に等しい第2の平均厚さを有する層状APC(例えば、PBMCを含む)の存在下で起こり、APC(例えば、PBMCを含む)の第1の層の数とAPC(例えば、PBMCを含む)の第2の層の数との比率は、正確にまたは約1:1.1~正確にまたは約1:10の範囲から選択される。
別の実施形態では、プライミングによる第1の拡張の0日目は、APC(例えば、PBMCを含む)の第1の層の数に等しい第1の平均厚さを有する層状APC(例えば、PBMCを含む)の存在下で起こり、急速な第2の拡張の7日目は、APC(例えば、PBMCを含む)の第2の層の数に等しい第2の平均厚さを有する層状APC(例えば、PBMCを含む)の存在下で起こり、APC(例えば、PBMCを含む)の第1の層の数とAPC(例えば、PBMCを含む)の第2の層の数との比率は、正確にまたは約1:1.1~正確にまたは約1:8の範囲から選択される。
別の実施形態では、プライミングによる第1の拡張の0日目は、APC(例えば、PBMCを含む)の第1の層の数に等しい第1の平均厚さを有する層状APC(例えば、PBMCを含む)の存在下で起こり、急速な第2の拡張の7日目は、APC(例えば、PBMCを含む)の第2の層の数に等しい第2の平均厚さを有する層状APC(例えば、PBMCを含む)の存在下で起こり、APC(例えば、PBMCを含む)の第1の層の数とAPC(例えば、PBMCを含む)の第2の層の数との比率は、正確にまたは約1:1.1~正確にまたは約1:7の範囲から選択される。
別の実施形態では、プライミングによる第1の拡張の0日目は、APC(例えば、PBMCを含む)の第1の層の数に等しい第1の平均厚さを有する層状APC(例えば、PBMCを含む)の存在下で起こり、急速な第2の拡張の7日目は、APC(例えば、PBMCを含む)の第2の層の数に等しい第2の平均厚さを有する層状APC(例えば、PBMCを含む)の存在下で起こり、APC(例えば、PBMCを含む)の第1の層の数とAPC(例えば、PBMCを含む)の第2の層の数との比率は、正確にまたは約1:1.1~正確にまたは約1:6の範囲から選択される。
別の実施形態では、プライミングによる第1の拡張の0日目は、APC(例えば、PBMCを含む)の第1の層の数に等しい第1の平均厚さを有する層状APC(例えば、PBMCを含む)の存在下で起こり、急速な第2の拡張の7日目は、APC(例えば、PBMCを含む)の第2の層の数に等しい第2の平均厚さを有する層状APC(例えば、PBMCを含む)の存在下で起こり、APC(例えば、PBMCを含む)の第1の層の数とAPC(例えば、PBMCを含む)の第2の層の数との比率は、正確にまたは約1:1.1~正確にまたは約1:5の範囲から選択される。
別の実施形態では、プライミングによる第1の拡張の0日目は、APC(例えば、PBMCを含む)の第1の層の数に等しい第1の平均厚さを有する層状APC(例えば、PBMCを含む)の存在下で起こり、急速な第2の拡張の7日目は、APC(例えば、PBMCを含む)の第2の層の数に等しい第2の平均厚さを有する層状APC(例えば、PBMCを含む)の存在下で起こり、APC(例えば、PBMCを含む)の第1の層の数とAPC(例えば、PBMCを含む)の第2の層の数との比率は、正確にまたは約1:1.1~正確にまたは約1:4の範囲から選択される。
別の実施形態では、プライミングによる第1の拡張の0日目は、APC(例えば、PBMCを含む)の第1の層の数に等しい第1の平均厚さを有する層状APC(例えば、PBMCを含む)の存在下で起こり、急速な第2の拡張の7日目は、APC(例えば、PBMCを含む)の第2の層の数に等しい第2の平均厚さを有する層状APC(例えば、PBMCを含む)の存在下で起こり、APC(例えば、PBMCを含む)の第1の層の数とAPC(例えば、PBMCを含む)の第2の層の数との比率は、正確にまたは約1:1.1~正確にまたは約1:3の範囲から選択される。
別の実施形態では、プライミングによる第1の拡張の0日目は、APC(例えば、PBMCを含む)の第1の層の数に等しい第1の平均厚さを有する層状APC(例えば、PBMCを含む)の存在下で起こり、急速な第2の拡張の7日目は、APC(例えば、PBMCを含む)の第2の層の数に等しい第2の平均厚さを有する層状APC(例えば、PBMCを含む)の存在下で起こり、APC(例えば、PBMCを含む)の第1の層の数とAPC(例えば、PBMCを含む)の第2の層の数との比率は、正確にまたは約1:1.1~正確にまたは約1:2の範囲から選択される。
別の実施形態では、プライミングによる第1の拡張の0日目は、APC(例えば、PBMCを含む)の第1の層の数に等しい第1の平均厚さを有する層状APC(例えば、PBMCを含む)の存在下で起こり、急速な第2の拡張の7日目は、APC(例えば、PBMCを含む)の第2の層の数に等しい第2の平均厚さを有する層状APC(例えば、PBMCを含む)の存在下で起こり、APC(例えば、PBMCを含む)の第1の層の数とAPC(例えば、PBMCを含む)の第2の層の数との比率は、正確にまたは約1:1.2~正確にまたは約1:8の範囲から選択される。
別の実施形態では、プライミングによる第1の拡張の0日目は、APC(例えば、PBMCを含む)の第1の層の数に等しい第1の平均厚さを有する層状APC(例えば、PBMCを含む)の存在下で起こり、急速な第2の拡張の7日目は、APC(例えば、PBMCを含む)の第2の層の数に等しい第2の平均厚さを有する層状APC(例えば、PBMCを含む)の存在下で起こり、APC(例えば、PBMCを含む)の第1の層の数とAPC(例えば、PBMCを含む)の第2の層の数との比率は、正確にまたは約1:1.3~正確にまたは約1:7の範囲から選択される。
別の実施形態では、プライミングによる第1の拡張の0日目は、APC(例えば、PBMCを含む)の第1の層の数に等しい第1の平均厚さを有する層状APC(例えば、PBMCを含む)の存在下で起こり、急速な第2の拡張の7日目は、APC(例えば、PBMCを含む)の第2の層の数に等しい第2の平均厚さを有する層状APC(例えば、PBMCを含む)の存在下で起こり、APC(例えば、PBMCを含む)の第1の層の数とAPC(例えば、PBMCを含む)の第2の層の数との比率は、正確にまたは約1:1.4~正確にまたは約1:6の範囲から選択される。
別の実施形態では、プライミングによる第1の拡張の0日目は、APC(例えば、PBMCを含む)の第1の層の数に等しい第1の平均厚さを有する層状APC(例えば、PBMCを含む)の存在下で起こり、急速な第2の拡張の7日目は、APC(例えば、PBMCを含む)の第2の層の数に等しい第2の平均厚さを有する層状APC(例えば、PBMCを含む)の存在下で起こり、APC(例えば、PBMCを含む)の第1の層の数とAPC(例えば、PBMCを含む)の第2の層の数との比率は、正確にまたは約1:1.5~正確にまたは約1:5の範囲から選択される。
別の実施形態では、プライミングによる第1の拡張の0日目は、APC(例えば、PBMCを含む)の第1の層の数に等しい第1の平均厚さを有する層状APC(例えば、PBMCを含む)の存在下で起こり、急速な第2の拡張の7日目は、APC(例えば、PBMCを含む)の第2の層の数に等しい第2の平均厚さを有する層状APC(例えば、PBMCを含む)の存在下で起こり、APC(例えば、PBMCを含む)の第1の層の数とAPC(例えば、PBMCを含む)の第2の層の数との比率は、正確にまたは約1:1.6~正確にまたは約1:4の範囲から選択される。
別の実施形態では、プライミングによる第1の拡張の0日目は、APC(例えば、PBMCを含む)の第1の層の数に等しい第1の平均厚さを有する層状APC(例えば、PBMCを含む)の存在下で起こり、急速な第2の拡張の7日目は、APC(例えば、PBMCを含む)の第2の層の数に等しい第2の平均厚さを有する層状APC(例えば、PBMCを含む)の存在下で起こり、APC(例えば、PBMCを含む)の第1の層の数とAPC(例えば、PBMCを含む)の第2の層の数との比率は、正確にまたは約1:1.7~正確にまたは約1:3.5の範囲から選択される。
別の実施形態では、プライミングによる第1の拡張の0日目は、APC(例えば、PBMCを含む)の第1の層の数に等しい第1の平均厚さを有する層状APC(例えば、PBMCを含む)の存在下で起こり、急速な第2の拡張の7日目は、APC(例えば、PBMCを含む)の第2の層の数に等しい第2の平均厚さを有する層状APC(例えば、PBMCを含む)の存在下で起こり、APC(例えば、PBMCを含む)の第1の層の数とAPC(例えば、PBMCを含む)の第2の層の数との比率は、正確にまたは約1:1.8~正確にまたは約1:3の範囲から選択される。
別の実施形態では、プライミングによる第1の拡張の0日目は、APC(例えば、PBMCを含む)の第1の層の数に等しい第1の平均厚さを有する層状APC(例えば、PBMCを含む)の存在下で起こり、急速な第2の拡張の7日目は、APC(例えば、PBMCを含む)の第2の層の数に等しい第2の平均厚さを有する層状APC(例えば、PBMCを含む)の存在下で起こり、APC(例えば、PBMCを含む)の第1の層の数とAPC(例えば、PBMCを含む)の第2の層の数との比率は、正確にまたは約1:1.9~正確にまたは約1:2.5の範囲から選択される。
別の実施形態では、プライミングによる第1の拡張の0日目は、APC(例えば、PBMCを含む)の第1の層の数に等しい第1の平均厚さを有する層状APC(例えば、PBMCを含む)の存在下で起こり、急速な第2の拡張の7日目は、APC(例えば、PBMCを含む)の第2の層の数に等しい第2の平均厚さを有する層状APC(例えば、PBMCを含む)の存在下で起こり、APC(例えば、PBMCを含む)の第1の層の数の、APC(例えば、PBMCを含む)の第2の層の数に対する比は、正確にまたは約1:2である。
別の実施形態では、プライミングによる第1の拡張の0日目は、APC(例えば、PBMCを含む)の第1の層の数に等しい第1の平均厚さを有する層状APC(例えば、PBMCを含む)の存在下で起こり、急速な第2の拡張の7日目は、APC(例えば、PBMCを含む)の第2の層の数に等しい第2の平均厚さを有する層状APC(例えば、PBMCを含む)の存在下で起こり、APC(例えば、PBMCを含む)の第1の層の数とAPC(例えば、PBMCを含む)の第2の層の数との比率は、正確にまたは約1:1.1、1:1.2、1:1.3、1:1.4、1:1.5、1:1.6、1:1.7、1:1.8、1:1.9、1:2、1:2.1、1:2.2、1:2.3、1:2.4、1:2.5、1:2.6、1:2.7、1:2.8、1:2.9、1:3、1:3.1、1:3.2、1:3.3、1:3.4、1:3.5、1:3.6、1:3.7、1:3.8、1:3.9、1:4、1:4.1、1:4.2、1:4.3、1:4.4、1:4.5、1:4.6、1:4.7、1:4.8、1:4.9、1:5、1:5.1、1:5.2、1:5.3、1:5.4、1:5.5、1:5.6、1:5.7、1:5.8、1:5.9、1:6、1:6.1、1:6.2、1:6.3、1:6.4、1:6.5、1:6.6、1:6.7、1:6.8、1:6.9、1:7、1:7.1、1:7.2、1:7.3、1:7.4、1:7.5、1:7.6、1:7.7、1:7.8、1:7.9、1:8、1:8.1、1:8.2、1:8.3、1:8.4、1:8.5、1:8.6、1:8.7、1:8.8、1:8.9、1:9、1:9.1、1:9.2、1:9.3、1:9.4、1:9.5、1:9.6、1:9.7、1:9.8、1:9.9、または1:10から選択される。
いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張におけるAPCの数は、約1.0×10APC/cm~約4.5×10APC/cmの範囲から選択され、急速な第2の拡張におけるAPCの数は、約2.5×10APC/cm~約7.5×10APC/cmの範囲から選択される。
いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張におけるAPCの数は、約1.5×10APC/cm~約3.5×10APC/cmの範囲から選択され、急速な第2の拡張におけるAPCの数は、約3.5×10APC/cm~約6.0×10APC/cmの範囲から選択される。
いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張におけるAPCの数は、約2.0×10APC/cm~約3.0×10APC/cmの範囲から選択され、急速な第2の拡張におけるAPCの数は、約4.0×10APC/cm~約5.5×10APC/cmの範囲から選択される。
B.任意選択の細胞培地成分
1.抗CD3抗体
いくつかの実施形態では、本明細書に記載の拡張方法で使用される培養培地(REPと称されるものを含む、例えば、図1及び8(特に、例えば図8B)を参照)は、抗CD3抗体を含む。IL-2と組み合わせた抗CD3抗体は、TIL集団におけるT細胞活性化及び細胞分裂を誘導する。この効果は、全長抗体、ならびにFab及びF(ab’)2断片で見ることができ、前者が一般に好まれ、例えば、Tsoukas et al.,J.Immunol.1985,135,1719(参照によりその全体が本明細書に組み込まれる)を参照されたい。
当業者によって理解されるように、マウス、ヒト、霊長類、ラット、及びイヌ抗体を含むが、これらに限定されない、様々な哺乳動物由来の抗ヒトCD3ポリクローナル及びモノクローナル抗体を含む、本発明での使用が見出されるいくつかの好適な抗ヒトCD3抗体が存在する。特定の実施形態では、抗CD3抗体であるOKT3が使用される(Ortho-McNeil,Raritan,NJまたはMiltenyi Biotech,Auburn,CAから市販されている)。
2.4-1BB(CD137)アゴニスト
ある実施形態では、プライミングによる第1の拡張及び/または急速な第2の拡張の細胞培養培地は、TNFRSFアゴニストを含む。ある実施形態では、TNFRSFアゴニストは、4-1BB(CD137)アゴニストである。4-1BBアゴニストは、当該技術分野で知られている任意の4-1BB結合分子であり得る。4-1BB結合分子は、ヒトまたは哺乳動物4-1BBに結合することができるモノクローナル抗体または融合タンパク質であり得る。4-1BBアゴニストまたは4-1BB結合分子は、任意のアイソタイプ(例えば、IgG、IgE、IgM、IgD、IgA、及びIgY)、クラス(例えば、IgG1、IgG2、IgG3、IgG4、IgA1、及びIgA2)、またはサブクラスの免疫グロブリン分子の免疫グロブリン重鎖を含み得る。4-1BBアゴニストまたは4-1BB結合分子は、重鎖及び軽鎖の両方を有し得る。本明細書で使用される場合、結合分子という用語は、抗体(全長抗体を含む)、モノクローナル抗体(全長モノクローナル抗体を含む)、ポリクローナル抗体、多重特異性抗体(例えば、二重特異性抗体)、ヒト、ヒト化またはキメラ抗体、及び抗体断片、例えば、Fab断片、F(ab’)断片、Fab発現ライブラリーによって産生された断片、上記のうちのいずれかのエピトープ結合断片、ならびに4-1BBに結合する抗体の操作された形態、例えば、scFv分子も含む。ある実施形態では、4-1BBアゴニストは、完全ヒト抗体である抗原結合タンパク質である。ある実施形態では、4-1BBアゴニストは、ヒト化抗体である抗原結合タンパク質である。いくつかの実施形態では、本明細書に開示される方法及び組成物に使用するための4-1BBアゴニストには、抗4-1BB抗体、ヒト抗4-1BB抗体、マウス抗4-1BB抗体、哺乳動物抗4-1BB抗体、モノクローナル抗4-1BB抗体、ポリクローナル抗4-1BB抗体、キメラ抗4-1BB抗体、抗4-1BBアドネクチン、抗4-1BBドメイン抗体、一本鎖抗4-1BB断片、重鎖抗4-1BB断片、軽鎖抗4-1BB断片、抗4-1BB融合タンパク質、及びそれらの断片、誘導体、コンジュゲート、バリアント、またはバイオシミラーが含まれる。アゴニスト抗4-1BB抗体は、強力な免疫応答を誘導することが知られている。Lee,et al.,PLOS One 2013,8,e69677。好ましい実施形態では、4-1BBアゴニストは、アゴニスト、抗4-1BBヒト化、または完全ヒトモノクローナル抗体(すなわち、単一の細胞株に由来する抗体)である。ある実施形態では、4-1BBアゴニストは、EU-101(Eutilex Co.Ltd.)、ウトミルマブ、もしくはウレルマブ、またはそれらの断片、誘導体、コンジュゲート、バリアント、もしくはバイオシミラーである。好ましい実施形態では、4-1BBアゴニストは、ウトミルマブもしくはウレルマブ、またはそれらの断片、誘導体、コンジュゲート、バリアント、もしくはバイオシミラーである。
好ましい実施形態では、4-1BBアゴニストまたは4-1BB結合分子は、融合タンパク質である場合もある。好ましい実施形態では、三量体または六量体4-1BBアゴニスト(3つまたは6つのリガンド結合ドメインを有する)などの多量体4-1BBアゴニストは、典型的に2つのリガンド結合ドメインを有するアゴニストモノクローナル抗体と比較して、優れた受容体(4-1BBL)クラスター化及び内部細胞シグナル伝達複合体形成を誘導し得る。3つのTNFRSF結合ドメイン及びIgG1-Fcを含み、かつ任意選択でこれらの融合タンパク質のうちの2つ以上をさらに結合する三量体(三価)または六量体(もしくは六価)またはそれ以上の融合タンパク質は、例えば、Gieffers,et al.,Mol.Cancer Therapeutics 2013,12,2735-47に記載されている。
アゴニスト4-1BB抗体及び融合タンパク質は、強い免疫応答を誘導することが知られている。好ましい実施形態では、4-1BBアゴニストは、毒性を低減するのに十分な様式で4-1BB抗原に特異的に結合するモノクローナル抗体または融合タンパク質である。いくつかの実施形態では、4-1BBアゴニストは、抗体依存性細胞毒性(cellular toxicity)(ADCC)、例えば、NK細胞細胞傷害性(cytotoxicity)を抑制するアゴニスト4-1BBモノクローナル抗体または融合タンパク質である。いくつかの実施形態では、4-1BBアゴニストは、抗体依存性細胞食作用(ADCP)を抑制するアゴニスト4-1BBモノクローナル抗体または融合タンパク質である。いくつかの実施形態では、4-1BBアゴニストは、補体依存性細胞傷害性(CDC)を抑制するアゴニスト4-1BBモノクローナル抗体または融合タンパク質である。いくつかの実施形態では、4-1BBアゴニストは、Fc領域機能性を抑制するアゴニスト4-1BBモノクローナル抗体または融合タンパク質である。
いくつかの実施形態では、4-1BBアゴニストは、高い親和性及びアゴニスト活性でヒト4-1BB(配列番号40)に結合することを特徴とする。ある実施形態では、4-1BBアゴニストは、ヒト4-1BB(配列番号40)に結合する結合分子である。ある実施形態では、4-1BBアゴニストは、マウス4-1BB(配列番号41)に結合する結合分子である。4-1BBアゴニストまたは結合分子が結合する4-1BB抗原のアミノ酸配列を表5に要約する。

Figure 2024512029000008
いくつかの実施形態では、記載される組成物、プロセス、及び方法は、ヒトもしくはマウス4-1BBに約100pM以下のKで結合する、ヒトもしくはマウス4-1BBに約90pM以下のKで結合する、ヒトもしくはマウス4-1BBに約80pM以下のKで結合する、ヒトもしくはマウス4-1BBに約70pM以下のKで結合する、ヒトもしくはマウス4-1BBに約60pM以下のKで結合する、ヒトもしくはマウス4-1BBに約50pM以下のKで結合する、ヒトもしくはマウス4-1BBに約40pM以下のKで結合する、またはヒトもしくはマウス4-1BBに約30pM以下のKで結合する4-1BBアゴニストを含む。
いくつかの実施形態では、記載される組成物、プロセス、及び方法は、ヒトもしくはマウス4-1BBに約7.5×101/M・s以上のkassocで結合する、ヒトもしくはマウス4-1BBに約7.5×101/M・s以上のkassocで結合する、ヒトもしくはマウス4-1BBに約8×101/M・s以上のkassocで結合する、ヒトもしくはマウス4-1BBに約8.5×101/M・s以上のkassocで結合する、ヒトもしくはマウス4-1BBに約9×101/M・s以上のkassocで結合する、ヒトもしくはマウス4-1BBに約9.5×101/M・s以上のkassocで結合する、またはヒトもしくはマウス4-1BBに約1×101/M・s以上のkassocで結合する4-1BBアゴニストを含む。
いくつかの実施形態では、記載される組成物、プロセス、及び方法は、ヒトもしくはマウス4-1BBに約2×10-51/s以下のkdissocで結合する、ヒトもしくはマウス4-1BBに約2.1×10-51/s以下のkdissocで結合する、ヒトもしくはマウス4-1BBに約2.2×10-51/s以下のkdissocで結合する、ヒトもしくはマウス4-1BBに約2.3×10-51/s以下のkdissocで結合する、ヒトもしくはマウス4-1BBに約2.4×10-51/s以下のkdissocで結合する、ヒトもしくはマウス4-1BBに約2.5×10-51/s以下のkdissocで結合する、ヒトもしくはマウス4-1BBに約2.6×10-51/s以下のkdissocで結合する、またはヒトもしくはマウス4-1BBに約2.7×10-51/s以下のkdissocで結合する、ヒトもしくはマウス4-1BBに約2.8×10-51/s以下のkdissocで結合する、ヒトもしくはマウス4-1BBに約2.9×10-51/s以下のkdissocで結合する、またはヒトもしくはマウス4-1BBに約3×10-51/s以下のkdissocで結合する4-1BBアゴニストを含む。
いくつかの実施形態では、記載される組成物、プロセス及び方法は、ヒトもしくはマウス4-1BBに約10nM以下のIC50で結合する、ヒトもしくはマウス4-1BBに約9nM以下のIC50で結合する、ヒトもしくはマウス4-1BBに約8nM以下のIC50で結合する、ヒトもしくはマウス4-1BBに約7nM以下のIC50で結合する、ヒトもしくはマウス4-1BBに約6nM以下のIC50で結合する、ヒトもしくはマウス4-1BBに約5nM以下のIC50で結合する、ヒトもしくはマウス4-1BBに約4nM以下のIC50で結合する、ヒトもしくはマウス4-1BBに約3nM以下のIC50で結合する、ヒトもしくはマウス4-1BBに約2nM以下のIC50で結合する、ヒトもしくはマウス4-1BBに約1nM以下のIC50で結合する、4-1BBアゴニストを含む。
好ましい実施形態では、4-1BBアゴニストは、PF-05082566もしくはMOR-7480としても知られるウトミルマブ、またはその断片、誘導体、バリアント、もしくはバイオシミラーである。ウトミルマブは、Pfizer,Inc.から入手可能である。ウトミルマブは、免疫グロブリンG2-ガンマ、抗[ホモサピエンスTNFRSF9(腫瘍壊死因子受容体(TNFR)スーパーファミリーメンバー9、4-1BB、T細胞抗原ILA、CD137)]、ホモサピエンス(完全ヒト)モノクローナル抗体である。ウトミルマブのアミノ酸配列を表6に示す。ウトミルマブは、Asn59及びAsn292にグリコシル化部位、22-96位(V-V)、143-199位(C1-C)、256-316位(C2)、及び362-420位(C3)に重鎖鎖内ジスルフィド架橋、22’-87’位(V-V)及び136’-195’位(C1-C)に軽鎖鎖内ジスルフィド架橋、IgG2Aアイソフォーム218-218、219-219、222-222、及び225-225位、IgG2A/Bアイソフォーム218-130、219-219、222-222、及び225-225位、ならびにIgG2Bアイソフォーム219-130(2)、222-222、及び225-225位に鎖間重鎖-重鎖ジスルフィド架橋、ならびにIgG2Aアイソフォーム130-213’(2)位、IgG2A/Bアイソフォーム218-213’位、及び130-213’位、ならびにIgG2Bアイソフォーム218-213’(2)位に鎖間重鎖-軽鎖ジスルフィド架橋を含む。ウトミルマブならびにそのバリアント及び断片の調製及び特性は、米国特許第8,821,867号、同第8,337,850号、及び同第9,468,678号、ならびに国際特許出願公開第WO2012/032433A1(これらの各々の開示は参照により本明細書に組み込まれる)に記載されている。ウトミルマブの前臨床特徴は、Fisher,et al.,Cancer Immunolog.&Immunother.2012,61,1721-33に記載されている。様々な血液学的及び固形腫瘍適応症におけるウトミルマブの現在の臨床試験には、米国国立衛生研究所のclinicaltrials.gov識別子NCT02444793、NCT01307267、NCT02315066、及びNCT02554812が含まれる。
ある実施形態では、4-1BBアゴニストは、配列番号42によって示される重鎖及び配列番号43によって示される軽鎖を含む。ある実施形態では、4-1BBアゴニストは、それぞれ、配列番号42及び配列番号43に示される配列を有する重鎖及び軽鎖、またはそれらの抗原結合断片、Fab断片、一本鎖可変断片(scFv)、バリアント、もしくはコンジュゲートを含む。ある実施形態では、4-1BBアゴニストは、各々が、それぞれ、配列番号42及び配列番号43に示される配列と少なくとも99%同一である重鎖及び軽鎖を含む。ある実施形態では、4-1BBアゴニストは、各々が、それぞれ、配列番号42及び配列番号43に示される配列と少なくとも98%同一である重鎖及び軽鎖を含む。ある実施形態では、4-1BBアゴニストは、各々が、それぞれ、配列番号42及び配列番号43に示される配列と少なくとも97%同一である重鎖及び軽鎖を含む。ある実施形態では、4-1BBアゴニストは、各々が、それぞれ、配列番号42及び配列番号43に示される配列と少なくとも96%同一である重鎖及び軽鎖を含む。ある実施形態では、4-1BBアゴニストは、各々が、それぞれ、配列番号42及び配列番号43に示される配列と少なくとも95%同一である重鎖及び軽鎖を含む。
ある実施形態では、4-1BBアゴニストは、ウトミルマブの重鎖及び軽鎖CDRまたは可変領域(VR)を含む。ある実施形態では、4-1BBアゴニスト重鎖可変領域(V)は、配列番号44に示される配列を含み、4-1BBアゴニスト軽鎖可変領域(V)は、配列番号45に示される配列、及びその保存的アミノ酸置換を含む。ある実施形態では、4-1BBアゴニストは、各々が、それぞれ、配列番号44及び配列番号45に示される配列と少なくとも99%同一であるV領域及びV領域を含む。ある実施形態では、4-1BBアゴニストは、各々が、それぞれ、配列番号44及び配列番号45に示される配列と少なくとも98%同一であるV領域及びV領域を含む。ある実施形態では、4-1BBアゴニストは、各々が、それぞれ、配列番号44及び配列番号45に示される配列と少なくとも97%同一であるV領域及びV領域を含む。ある実施形態では、4-1BBアゴニストは、各々が、それぞれ、配列番号44及び配列番号45に示される配列と少なくとも96%同一であるV領域及びV領域を含む。ある実施形態では、4-1BBアゴニストは、各々が、それぞれ、配列番号44及び配列番号45に示される配列と少なくとも95%同一であるV領域及びV領域を含む。ある実施形態では、4-1BBアゴニストは、各々が、配列番号44及び配列番号45に示される配列と少なくとも99%同一であるV領域及びV領域を含むscFv抗体を含む。
ある実施形態では、4-1BBアゴニストは、それぞれ、配列番号46、配列番号47、及び配列番号48に示される配列を有する重鎖CDR1、CDR2、及びCDR3ドメイン、ならびにそれらの保存的アミノ酸置換と、それぞれ、配列番号49、配列番号50、及び配列番号51に示される配列を有する軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3ドメイン、ならびにそれらの保存的アミノ酸置換と、を含む。
ある実施形態では、4-1BBアゴニストは、ウトミルマブに関して薬物規制当局によって承認された4-1BBアゴニストバイオシミラーモノクローナル抗体である。ある実施形態では、バイオシミラーモノクローナル抗体は、参照医薬品または参照生物学的製品のアミノ酸配列と少なくとも97%の配列同一性、例えば、97%、98%、99%、または100%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含み、かつ参照医薬品または参照生物学的製品と比較して1つ以上の翻訳後修飾を含む4-1BB抗体を含み、参照医薬品または参照生物学的製品は、ウトミルマブである。いくつかの実施形態では、1つ以上の翻訳後修飾は、グリコシル化、酸化、脱アミド化、及び切断のうちの1つ以上から選択される。いくつかの実施形態では、バイオシミラーは、認可されたまたは認可を得るために提出された4-1BBアゴニスト抗体であり、4-1BBアゴニスト抗体は、参照医薬品または参照バイオ製品の製剤とは異なる製剤で提供され、参照医薬品または参照バイオ製品は、ウトミルマブである。4-1BBアゴニスト抗体は、米国FDA及び/または欧州連合EMAなどの薬物規制当局によって認可され得る。いくつかの実施形態では、バイオシミラーは、1つ以上の賦形剤をさらに含む組成物として提供され、1つ以上の賦形剤は、参照医薬品または参照バイオ製品に含まれる賦形剤と同じまたは異なるものであり、参照医薬品または参照バイオ製品は、ウトミルマブである。いくつかの実施形態では、バイオシミラーは、1つ以上の賦形剤をさらに含む組成物として提供され、1つ以上の賦形剤は、参照医薬品または参照バイオ製品に含まれる賦形剤と同じまたは異なるものであり、参照医薬品または参照バイオ製品は、ウトミルマブである。
Figure 2024512029000009
好ましい実施形態では、4-1BBアゴニストは、BMS-663513及び20H4.9.h4aとしても知られるモノクローナル抗体ウレルマブ、またはそれらの断片、誘導体、バリアント、もしくはバイオシミラーである。ウレルマブは、Bristol-Myers Squibb,Inc.及びCreative Biolabs,Inc.から入手可能である。ウレルマブは、免疫グロブリンG4-カッパ、抗[ホモサピエンスTNFRSF9(腫瘍壊死因子受容体スーパーファミリーメンバー9、4-1BB、T細胞抗原ILA、CD137)]、ホモサピエンス(完全ヒト)モノクローナル抗体である。ウレルマブのアミノ酸配列を表7に示す。ウレルマブは、298位(及び298’’)にN-グリコシル化部位、22-95位(V-V)、148-204位(C1-C)、262-322位(C2)、及び368-426位(C3)(22’’-95’’、148’’-204’’、262’’-322’’、及び368’’-426’’位)に重鎖鎖内ジスルフィド架橋、23’-88’位(V-V)及び136’-196’位(C1-C)(23’’’-88’’’及び136’’’-196’’’位)に軽鎖鎖内ジスルフィド架橋、227-227’’位及び230-230’’位に鎖間重鎖-重鎖ジスルフィド架橋ならびに135-216’及び135’’-216’’’に鎖間重鎖-軽鎖ジスルフィド架橋を含む。ウレルマブならびにそのバリアント及び断片の調製及び特性は、米国特許第7,288,638号及び同第8,962,804号に記載されており、それらの開示は参照により本明細書に組み込まれる。ウレルマブの前臨床及び臨床特徴は、Segal,et al.,Clin.Cancer Res.2016に記載されており、http:/dx.doi.org/10.1158/1078-0432.CCR-16-1272で入手可能である。様々な血液学的及び固形腫瘍適応症におけるウレルマブの現在の臨床試験には、米国国立衛生研究所のclinicaltrials.gov識別子NCT01775631、NCT02110082、NCT02253992、及びNCT01471210が含まれる。
ある実施形態では、4-1BBアゴニストは、配列番号52によって示される重鎖及び配列番号53によって示される軽鎖を含む。ある実施形態では、4-1BBアゴニストは、それぞれ、配列番号52及び配列番号53に示される配列を有する重鎖及び軽鎖、またはそれらの抗原結合断片、Fab断片、一本鎖可変断片(scFv)、バリアント、もしくはコンジュゲートを含む。ある実施形態では、4-1BBアゴニストは、各々が、それぞれ、配列番号52及び配列番号53に示される配列と少なくとも99%同一である重鎖及び軽鎖を含む。ある実施形態では、4-1BBアゴニストは、各々が、それぞれ、配列番号52及び配列番号53に示される配列と少なくとも98%同一である重鎖及び軽鎖を含む。ある実施形態では、4-1BBアゴニストは、各々が、それぞれ、配列番号52及び配列番号53に示される配列と少なくとも97%同一である重鎖及び軽鎖を含む。ある実施形態では、4-1BBアゴニストは、各々が、それぞれ、配列番号52及び配列番号53に示される配列と少なくとも96%同一である重鎖及び軽鎖を含む。ある実施形態では、4-1BBアゴニストは、各々が、それぞれ、配列番号52及び配列番号53に示される配列と少なくとも95%同一である重鎖及び軽鎖を含む。
ある実施形態では、4-1BBアゴニストは、ウレルマブの重鎖及び軽鎖CDRまたは可変領域(VR)を含む。ある実施形態では、4-1BBアゴニスト重鎖可変領域(V)は、配列番号54に示される配列を含み、4-1BBアゴニスト軽鎖可変領域(V)は、配列番号55に示される配列、及びその保存的アミノ酸置換を含む。ある実施形態では、4-1BBアゴニストは、各々が、それぞれ、配列番号54及び配列番号55に示される配列と少なくとも99%同一であるV領域及びV領域を含む。ある実施形態では、4-1BBアゴニストは、各々が、それぞれ、配列番号54及び配列番号55に示される配列と少なくとも98%同一であるV領域及びV領域を含む。ある実施形態では、4-1BBアゴニストは、各々が、それぞれ、配列番号54及び配列番号55に示される配列と少なくとも97%同一であるV領域及びV領域を含む。ある実施形態では、4-1BBアゴニストは、各々が、それぞれ、配列番号54及び配列番号55に示される配列と少なくとも96%同一であるV領域及びV領域を含む。ある実施形態では、4-1BBアゴニストは、各々が、それぞれ、配列番号54及び配列番号55に示される配列と少なくとも95%同一であるV領域及びV領域を含む。ある実施形態では、4-1BBアゴニストは、各々が、配列番号54及び配列番号55に示される配列と少なくとも99%同一であるV領域及びV領域を含むscFv抗体を含む。
ある実施形態では、4-1BBアゴニストは、それぞれ、配列番号56、配列番号57、及び配列番号58に示される配列を有する重鎖CDR1、CDR2、及びCDR3ドメイン、ならびにそれらの保存的アミノ酸置換と、それぞれ、配列番号59、配列番号60、及び配列番号61に示される配列を有する軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3ドメイン、ならびにそれらの保存的アミノ酸置換と、を含む。
ある実施形態では、4-1BBアゴニストは、ウレルマブに関して薬物規制当局によって承認された4-1BBアゴニストバイオシミラーモノクローナル抗体である。ある実施形態では、バイオシミラーモノクローナル抗体は、参照医薬品または参照生物学的製品のアミノ酸配列と少なくとも97%の配列同一性、例えば、97%、98%、99%、または100%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含み、かつ参照医薬品または参照生物学的製品と比較して1つ以上の翻訳後修飾を含む4-1BB抗体を含み、参照医薬品または参照生物学的製品は、ウレルマブである。いくつかの実施形態では、1つ以上の翻訳後修飾は、グリコシル化、酸化、脱アミド化、及び切断のうちの1つ以上から選択される。いくつかの実施形態では、バイオシミラーは、認可されたまたは認可を得るために提出された4-1BBアゴニスト抗体であり、4-1BBアゴニスト抗体は、参照医薬品または参照バイオ製品の製剤とは異なる製剤で提供され、参照医薬品または参照バイオ製品は、ウレルマブである。4-1BBアゴニスト抗体は、米国FDA及び/または欧州連合EMAなどの薬物規制当局によって認可され得る。いくつかの実施形態では、バイオシミラーは、1つ以上の賦形剤をさらに含む組成物として提供され、1つ以上の賦形剤は、参照医薬品または参照バイオ製品に含まれる賦形剤と同じまたは異なるものであり、参照医薬品または参照バイオ製品は、ウレルマブである。いくつかの実施形態では、バイオシミラーは、1つ以上の賦形剤をさらに含む組成物として提供され、1つ以上の賦形剤は、参照医薬品または参照バイオ製品に含まれる賦形剤と同じまたは異なるものであり、参照医薬品または参照バイオ製品は、ウレルマブである。
Figure 2024512029000010
ある実施形態では、4-1BBアゴニストは、1D8、3Elor、4B4(BioLegend 309809)、H4-1BB-M127(BD Pharmingen 552532)、BBK2(Thermo Fisher MS621PABX)、145501(Leinco Technologies B591)、ATCC番号HB-11248として寄託された細胞株によって産生され、米国特許第6,974,863号に開示される抗体、5F4(BioLegend 31 1503)、C65-485(BD Pharmingen 559446)、米国特許出願公開第US2005/0095244号に開示される抗体、米国特許第7,288,638号に開示される抗体(例えば、20H4.9-IgGl(BMS-663031))、米国特許第6,887,673号に開示される抗体(例えば、4E9もしくはBMS-554271)、米国特許第7,214,493号に開示される抗体、米国特許第6,303,121号に開示される抗体、米国特許第6,569,997号に開示される抗体、米国特許第6,905,685号に開示される抗体(例えば、4E9もしくはBMS-554271)、米国特許第6,362,325号に開示される抗体(例えば、1D8もしくはBMS-469492、3H3もしくはBMS-469497、または3El)、米国特許第6,974,863号に開示される抗体(例えば、53A2)、米国特許第6,210,669号に開示される抗体(例えば、1D8、3B8、もしくは3El)、米国特許第5,928,893号に開示される抗体、米国特許第6,303,121号に開示される抗体、米国特許第6,569,997号に開示される抗体、国際特許出願公開第WO2012/177788号、同第WO2015/119923号、及び同第WO2010/042433号に開示される抗体、ならびにそれらの断片、誘導体、コンジュゲート、バリアント、またはバイオシミラーからなる群から選択され、前述の特許または特許出願公開の各々の開示は、参照により本明細書に組み込まれる。
ある実施形態では、4-1BBアゴニストは、国際特許出願公開第WO2008/025516A1号、同第WO2009/007120A1号、同第WO2010/003766A1号、同第WO2010/010051A1号、及び同第WO2010/078966A1号、米国特許出願公開第US2011/0027218A1号、同第US2015/0126709A1号、同第US2011/0111494A1号、同第US2015/0110734A1号、及び同第US2015/0126710A1号、ならびに米国特許第9,359,420号、同第9,340,599号、同第8,921,519号、及び同第8,450,460号に記載される4-1BBアゴニスト融合タンパク質であり、それらの開示は参照により本明細書に組み込まれる。
ある実施形態では、4-1BBアゴニストは、構造I-A(C末端Fc抗体断片融合タンパク質)もしくは構造I-B(N末端Fc抗体断片融合タンパク質)に示されるような4-1BBアゴニスト融合タンパク質、またはそれらの断片、誘導体、コンジュゲート、多様体、もしくはバイオシミラーである(図18を参照)。構造I-A及びI-Bにおいて、円筒は、個々のポリペプチド結合ドメインを指す。構造I-A及びI-Bは、例えば、4-1BBL(4-1BBリガンド、CD137リガンド(CD137L)、もしくは腫瘍壊死因子スーパーファミリーメンバー9(TNFSF9))または4-1BBに結合する抗体に由来する3つの直線的に連結されたTNFRSF結合ドメインを含み、これらが折り重なって三価タンパク質を形成し、その後、これがIgG1-Fc(C3及びC2ドメインを含む)によって第2の三価タンパク質に連結され、その後、これを使用して、三価タンパク質のうちの2つをジスルフィド結合(小さく長細い楕円)によって一緒に連結し、構造を安定化し、6つの受容体及びシグナル伝達タンパク質の細胞内シグナル伝達ドメインを一緒にして、シグナル伝達複合体を形成することができるアゴニストを提供する。円筒として示されるTNFRSF結合ドメインは、例えば、親水性残基及び柔軟性のためのGly及びSer配列、ならびに溶解性のためのGlu及びLysを含み得るリンカーによって結合されたV鎖及びV鎖を含む、scFvドメインであり得る。de Marco,Microbial Cell Factories,2011,10,44、Ahmad,et al.,Clin.&Dev.Immunol.2012,980250、Monnier,et al.,Antibodies,2013,2,193-208、または本明細書の他の場所に組み込まれている参照文献に記載されるものなどの任意のscFvドメイン設計が使用され得る。この形態の融合タンパク質構造は、米国特許第9,359,420号、同第9,340,599号、同第8,921,519号、及び同第8,450,460号に記載されており、それらの開示は参照により本明細書に組み込まれる。
図18に示される構造I-Aの他のポリペプチドドメインのアミノ酸配列は、表8に見出される。Fcドメインは、好ましくは、完全な定常ドメイン(配列番号62のアミノ酸17~230)、完全なヒンジドメイン(配列番号62のアミノ酸1~16)、またはヒンジドメインの一部(例えば、配列番号62のアミノ酸4~16)を含む。C末端Fc抗体を結合するための好ましいリンカーは、追加のポリペプチドの融合に好適なリンカーを含む、配列番号63~配列番号72に示される実施形態から選択され得る。
Figure 2024512029000011
図18に示される構造I-Bの他のポリペプチドドメインのアミノ酸配列は、表9に見出される。Fc抗体断片が構造I-BにあるようなTNRFSF融合タンパク質のN末端に融合される場合、Fcモジュールの配列は、好ましくは、配列番号73に示されるものであり、リンカー配列は、好ましくは、配列番号74~配列番号76に示される実施形態から選択される。
Figure 2024512029000012
ある実施形態では、構造I-AまたはI-Bによる4-1BBアゴニスト融合タンパク質は、ウトミルマブの可変重鎖及び可変軽鎖、ウレルマブの可変重鎖及び可変軽鎖、ウトミルマブの可変重鎖及び可変軽鎖、表10に記載の可変重鎖及び可変軽鎖から選択される可変重鎖及び可変軽鎖、前述の可変重鎖及び可変軽鎖の任意の組み合わせ、ならびにそれらの断片、誘導体、コンジュゲート、バリアント、及びバイオシミラーからなる群から選択される1つ以上の4-1BB結合ドメインを含む。
ある実施形態では、構造I-AまたはI-Bによる4-1BBアゴニスト融合タンパク質は、4-1BBL配列を含む1つ以上の4-1BB結合ドメインを含む。ある実施形態では、構造I-AまたはI-Bによる4-1BBアゴニスト融合タンパク質は、配列番号77による配列を含む1つ以上の4-1BB結合ドメインを含む。ある実施形態では、構造I-AまたはI-Bによる4-1BBアゴニスト融合タンパク質は、可溶性4-1BBL配列を含む1つ以上の4-1BB結合ドメインを含む。ある実施形態では、構造I-AまたはI-Bによる4-1BBアゴニスト融合タンパク質は、配列番号78による配列を含む1つ以上の4-1BB結合ドメインを含む。
ある実施形態では、構造I-AまたはI-Bによる4-1BBアゴニスト融合タンパク質は、各々が、それぞれ、配列番号43及び配列番号44に示される配列と少なくとも95%同一であるV領域及びV領域を含むscFvドメインである1つ以上の4-1BB結合ドメインを含み、Vドメイン及びVドメインは、リンカーによって結合されている。ある実施形態では、構造I-AまたはI-Bによる4-1BBアゴニスト融合タンパク質は、各々が、それぞれ、配列番号54及び配列番号55に示される配列と少なくとも95%同一であるV領域及びV領域を含むscFvドメインである1つ以上の4-1BB結合ドメインを含み、VドメインとVドメインはリンカーによって結合されている。ある実施形態では、構造I-AまたはI-Bによる4-1BBアゴニスト融合タンパク質は、各々が表10に示されるV配列及びV配列と少なくとも95%同一であるV領域及びV領域を含むscFvドメインである1つ以上の4-1BB結合ドメインを含み、VドメインとVドメインはリンカーによって結合されている。
Figure 2024512029000013
ある実施形態では、4-1BBアゴニストは、(i)第1の可溶性4-1BB結合ドメイン、(ii)第1のペプチドリンカー、(iii)第2の可溶性4-1BB結合ドメイン、(iv)第2のペプチドリンカー、及び(v)第3の可溶性4-1BB結合ドメインを含む4-1BBアゴニスト一本鎖融合ポリペプチドであり、N末端及び/またはC末端に追加のドメインをさらに含み、追加のドメインは、FabまたはFc断片ドメインである。ある実施形態では、4-1BBアゴニストは、(i)第1の可溶性4-1BB結合ドメイン、(ii)第1のペプチドリンカー、(iii)第2の可溶性4-1BB結合ドメイン、(iv)第2のペプチドリンカー、及び(v)第3の可溶性4-1BB結合ドメインを含む4-1BBアゴニスト一本鎖融合ポリペプチドであり、N末端及び/またはC末端に追加のドメインをさらに含み、追加のドメインは、FabまたはFc断片ドメインであり、可溶性4-1BBドメインは各々、茎領域(三量体化に寄与し、細胞膜まである特定の距離を提供するが、4-1BB結合ドメインの一部ではない)を欠き、第1及び第2のペプチドリンカーは独立して、3~8アミノ酸長を有する。
ある実施形態では、4-1BBアゴニストは、(i)第1の可溶性腫瘍壊死因子(TNF)スーパーファミリーサイトカインドメイン、(ii)第1のペプチドリンカー、(iii)第2の可溶性TNFスーパーファミリーサイトカインドメイン、(iv)第2のペプチドリンカー、及び(v)第3の可溶性TNFスーパーファミリーサイトカインドメインを含む4-1BBアゴニスト一本鎖融合ポリペプチドであり、可溶性TNFスーパーファミリーサイトカインドメインは各々、茎領域を欠き、第1及び第2のペプチドリンカーは独立して、3~8アミノ酸長であり、各TNFスーパーファミリーサイトカインドメインは、4-1BB結合ドメインである。
ある実施形態では、4-1BBアゴニストは、前述のVドメインのうちのいずれかに連結された前述のVドメインのうちのいずれかを含む4-1BBアゴニストscFv抗体である。
ある実施形態では、4-1BBアゴニストは、BPS Bioscience(San Diego,CA,USA)から市販されているBPS Bioscience 4-1BBアゴニスト抗体カタログ番号79097-2である。ある実施形態では、4-1BBアゴニストは、Creative Biolabs(Shirley,NY,USA)から市販されているCreative Biolabs 4-1BBアゴニスト抗体カタログ番号MOM-18179である。
3.OX40(CD134)アゴニスト
ある実施形態では、TNFRSFアゴニストは、OX40(CD134)アゴニストである。OX40アゴニストは、当該技術分野で知られている任意のOX40結合分子であり得る。OX40結合分子は、ヒトまたは哺乳動物OX40に結合することができるモノクローナル抗体または融合タンパク質であり得る。OX40アゴニストまたはOX40結合分子は、任意のアイソタイプ(例えば、IgG、IgE、IgM、IgD、IgA、及びIgY)、クラス(例えば、IgG1、IgG2、IgG3、IgG4、IgA1、及びIgA2)、またはサブクラスの免疫グロブリン分子の免疫グロブリン重鎖を含み得る。OX40アゴニストまたはOX40結合分子は、重鎖及び軽鎖の両方を有し得る。本明細書で使用される場合、結合分子という用語は、抗体(全長抗体を含む)、モノクローナル抗体(全長モノクローナル抗体を含む)、ポリクローナル抗体、多重特異性抗体(例えば、二重特異性抗体)、ヒト、ヒト化またはキメラ抗体、及び抗体断片、例えば、Fab断片、F(ab’)断片、Fab発現ライブラリーによって産生された断片、上記のうちのいずれかのエピトープ結合断片、ならびにOX40に結合する抗体の操作された形態、例えば、scFv分子も含む。ある実施形態では、OX40アゴニストは、完全ヒト抗体である抗原結合タンパク質である。ある実施形態では、OX40アゴニストは、ヒト化抗体である抗原結合タンパク質である。いくつかの実施形態では、本明細書に開示される方法及び組成物に使用するためのOX40アゴニストには、抗OX40抗体、ヒト抗OX40抗体、マウス抗OX40抗体、哺乳動物抗OX40抗体、モノクローナル抗OX40抗体、ポリクローナル抗OX40抗体、キメラ抗OX40抗体、抗OX40アドネクチン、抗OX40ドメイン抗体、一本鎖抗OX40断片、重鎖抗OX40断片、軽鎖抗OX40断片、抗OX40融合タンパク質、及びそれらの断片、誘導体、コンジュゲート、バリアント、またはバイオシミラーが含まれる。好ましい実施形態では、OX40アゴニストは、アゴニスト、抗OX40ヒト化、または完全ヒトモノクローナル抗体(すなわち、単一の細胞株に由来する抗体)である。
好ましい実施形態では、OX40アゴニストまたはOX40結合分子は、融合タンパク質である場合もある。OX40Lに融合されたFcドメインを含むOX40融合タンパク質は、例えば、Sadun,et al.,J.Immunother.2009,182,1481-89に記載されている。好ましい実施形態では、三量体または六量体OX40アゴニスト(3つまたは6つのリガンド結合ドメインを有する)などの多量体OX40アゴニストは、典型的に2つのリガンド結合ドメインを有するアゴニストモノクローナル抗体と比較して、優れた受容体(OX40L)クラスター化及び内部細胞シグナル伝達複合体形成を誘導し得る。3つのTNFRSF結合ドメイン及びIgG1-Fcを含み、かつ任意選択でこれらの融合タンパク質のうちの2つ以上をさらに結合する三量体(三価)または六量体(もしくは六価)またはそれ以上の融合タンパク質は、例えば、Gieffers,et al.,Mol.Cancer Therapeutics 2013,12,2735-47に記載されている。
アゴニストOX40抗体及び融合タンパク質は、強い免疫応答を誘導することが知られている。Curti,et al.,Cancer Res.2013,73,7189-98。好ましい実施形態では、OX40アゴニストは、毒性を低減するのに十分な様式でOX40抗原に特異的に結合するモノクローナル抗体または融合タンパク質である。いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、抗体依存性細胞毒性(cellular toxicity)(ADCC)、例えば、NK細胞細胞傷害性(cytotoxicity)を抑制するアゴニストOX40モノクローナル抗体または融合タンパク質である。いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、抗体依存性細胞食作用(ADCP)を抑制するアゴニストOX40モノクローナル抗体または融合タンパク質である。いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、補体依存性細胞傷害性(CDC)を抑制するアゴニストOX40モノクローナル抗体または融合タンパク質である。いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、Fc領域機能性を抑制するアゴニストOX40モノクローナル抗体または融合タンパク質である。
いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、高い親和性及びアゴニスト活性でヒトOX40(配列番号85)に結合することを特徴とする。ある実施形態では、OX40アゴニストは、ヒトOX40(配列番号85)に結合する結合分子である。ある実施形態では、OX40アゴニストは、マウスOX40(配列番号86)に結合する結合分子である。OX40アゴニストまたは結合分子が結合するOX40抗原のアミノ酸配列を表11に要約する。
Figure 2024512029000014
いくつかの実施形態では、記載される組成物、プロセス、及び方法は、ヒトもしくはマウスOX40に約100pM以下のKで結合する、ヒトもしくはマウスOX40に約90pM以下のKで結合する、ヒトもしくはマウスOX40に約80pM以下のKで結合する、ヒトもしくはマウスOX40に約70pM以下のKで結合する、ヒトもしくはマウスOX40に約60pM以下のKで結合する、ヒトもしくはマウスOX40に約50pM以下のKで結合する、ヒトもしくはマウスOX40に約40pM以下のKで結合する、またはヒトもしくはマウスOX40に約30pM以下のKで結合するOX40アゴニストを含む。
いくつかの実施形態では、記載される組成物、プロセス、及び方法は、ヒトもしくはマウスOX40に約7.5×101/M・s以上のkassocで結合する、ヒトもしくはマウスOX40に約7.5×101/M・s以上のkassocで結合する、ヒトもしくはマウスOX40に約8×101/M・s以上のkassocで結合する、ヒトもしくはマウスOX40に約8.5×101/M・s以上のkassocで結合する、ヒトもしくはマウスOX40に約9×101/M・s以上のkassocで結合する、ヒトもしくはマウスOX40に約9.5×101/M・s以上のkassocで結合する、またはヒトもしくはマウスOX40に約1×101/M・s以上のkassocで結合するOX40アゴニストを含む。
いくつかの実施形態では、記載される組成物、プロセス、及び方法は、ヒトもしくはマウスOX40に約2×10-51/s以下のkdissocで結合する、ヒトもしくはマウスOX40に約2.1×10-51/s以下のkdissocで結合する、ヒトもしくはマウスOX40に約2.2×10-51/s以下のkdissocで結合する、ヒトもしくはマウスOX40に約2.3×10-51/s以下のkdissocで結合する、ヒトもしくはマウスOX40に約2.4×10-51/s以下のkdissocで結合する、ヒトもしくはマウスOX40に約2.5×10-51/s以下のkdissocで結合する、ヒトもしくはマウスOX40に約2.6×10-51/s以下のkdissocで結合する、またはヒトもしくはマウスOX40に約2.7×10-51/s以下のkdissocで結合する、ヒトもしくはマウスOX40に約2.8×10-51/s以下のkdissocで結合する、ヒトもしくはマウスOX40に約2.9×10-51/s以下のkdissocで結合する、またはヒトもしくはマウスOX40に約3×10-51/s以下のkdissocで結合するOX40アゴニストを含む。
いくつかの実施形態では、記載される組成物、プロセス、及び方法は、ヒトもしくはマウスOX40に約10nM以下のIC50で結合する、ヒトもしくはマウスOX40に約9nM以下のIC50で結合する、ヒトもしくはマウスOX40に約8nM以下のIC50で結合する、ヒトもしくはマウスOX40に約7nM以下のIC50で結合する、ヒトもしくはマウスOX40に約6nM以下のIC50で結合する、ヒトもしくはマウスOX40に約5nM以下のIC50で結合する、ヒトもしくはマウスOX40に約4nM以下のIC50で結合する、ヒトもしくはマウスOX40に約3nM以下のIC50で結合する、ヒトもしくはマウスOX40に約2nM以下のIC50で結合する、ヒトもしくはマウスOX40に約1nM以下のIC50で結合する、OX40アゴニストを含む。
いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、MEDI0562またはMEDI-0562としても知られるタボリキシズマブである。タボリキシズマブは、AstraZeneca,Inc.の子会社であるMedImmuneから入手可能である。タボリキシズマブは、免疫グロブリンG1-カッパ、抗[ホモサピエンスTNFRSF4(腫瘍壊死因子受容体(TNFR)スーパーファミリーメンバー4、OX40、CD134)]、ヒト化及びキメラモノクローナル抗体である。タボリキシズマブのアミノ酸配列を表12に示す。タボリキシズマブは、301及び301’’位にN-グリコシル化部位(フコシル化複合二分岐CHO型グリカンを有する)、22-95位(V-V)、148-204位(C1-C)、265-325位(C2)、及び371-429位(C3)(及び22’’-95’’、148’’-204’’、265’’-325’’、及び371’’-429’’位)に重鎖鎖内ジスルフィド架橋、23’-88’位(V-V)及び134’-194’位(C1-C)(及び23’’’-88’’’及び134’’’-194’’’位)に軽鎖鎖内ジスルフィド架橋、230-230”及び233-233”位に鎖間重鎖-重鎖ジスルフィド架橋、ならびに224-214’及び224’’-214’’’に鎖間重鎖-軽鎖ジスルフィド架橋を含む。様々な固形腫瘍適応症におけるタボリキシズマブの現在の臨床試験には、米国国立衛生研究所のclinicaltrials.gov識別子NCT02318394及びNCT02705482が含まれる。
ある実施形態では、OX40アゴニストは、配列番号87によって示される重鎖及び配列番号88によって示される軽鎖を含む。ある実施形態では、OX40アゴニストは、それぞれ、配列番号87及び配列番号88に示される配列を有する重鎖及び軽鎖、またはそれらの抗原結合断片、Fab断片、一本鎖可変断片(scFv)、バリアント、もしくはコンジュゲートを含む。ある実施形態では、OX40アゴニストは、各々が、それぞれ、配列番号87及び配列番号88に示される配列と少なくとも99%同一である重鎖及び軽鎖を含む。ある実施形態では、OX40アゴニストは、各々が、それぞれ、配列番号87及び配列番号88に示される配列と少なくとも98%同一である重鎖及び軽鎖を含む。ある実施形態では、OX40アゴニストは、各々が、それぞれ、配列番号87及び配列番号88に示される配列と少なくとも97%同一である重鎖及び軽鎖を含む。ある実施形態では、OX40アゴニストは、各々が、それぞれ、配列番号87及び配列番号88に示される配列と少なくとも96%同一である重鎖及び軽鎖を含む。ある実施形態では、OX40アゴニストは、各々が、それぞれ、配列番号87及び配列番号88に示される配列と少なくとも95%同一である重鎖及び軽鎖を含む。
ある実施形態では、OX40アゴニストは、タボリキシズマブの重鎖及び軽鎖CDRまたは可変領域(VR)を含む。ある実施形態では、OX40アゴニスト重鎖可変領域(V)は、配列番号89に示される配列を含み、OX40アゴニスト軽鎖可変領域(V)は、配列番号90に示される配列、及びその保存的アミノ酸置換を含む。ある実施形態では、OX40アゴニストは、各々が、それぞれ、配列番号89及び配列番号90に示される配列と少なくとも99%同一であるV領域及びV領域を含む。ある実施形態では、OX40アゴニストは、各々が、それぞれ、配列番号89及び配列番号90に示される配列と少なくとも98%同一であるV領域及びV領域を含む。ある実施形態では、OX40アゴニストは、各々が、それぞれ、配列番号89及び配列番号90に示される配列と少なくとも97%同一であるV領域及びV領域を含む。ある実施形態では、OX40アゴニストは、各々が、それぞれ、配列番号89及び配列番号90に示される配列と少なくとも96%同一であるV領域及びV領域を含む。ある実施形態では、OX40アゴニストは、各々が、それぞれ、配列番号89及び配列番号90に示される配列と少なくとも95%同一であるV領域及びV領域を含む。ある実施形態では、OX40アゴニストは、各々が、配列番号89及び配列番号90に示される配列と少なくとも99%同一であるV領域及びV領域を含むscFv抗体を含む。
ある実施形態では、OX40アゴニストは、それぞれ、配列番号91、配列番号92、及び配列番号93に示される配列を有する重鎖CDR1、CDR2、及びCDR3ドメイン、ならびにそれらの保存的アミノ酸置換と、それぞれ、配列番号94、配列番号95、及び配列番号96に示される配列を有する軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3ドメイン、ならびにそれらの保存的アミノ酸置換と、を含む。
ある実施形態では、OX40アゴニストは、タボリキシズマブに関して薬物規制当局によって承認されたOX40アゴニストバイオシミラーモノクローナル抗体である。ある実施形態では、バイオシミラーモノクローナル抗体は、参照医薬品または参照生物学的製品のアミノ酸配列と少なくとも97%の配列同一性、例えば、97%、98%、99%、または100%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含み、かつ参照医薬品または参照生物学的製品と比較して1つ以上の翻訳後修飾を含むOX40抗体を含み、参照医薬品または参照生物学的製品は、タボリキシズマブである。いくつかの実施形態では、1つ以上の翻訳後修飾は、グリコシル化、酸化、脱アミド化、及び切断のうちの1つ以上から選択される。いくつかの実施形態では、バイオシミラーは、認可されたまたは認可を得るために提出されたOX40アゴニスト抗体であり、OX40アゴニスト抗体は、参照医薬品または参照バイオ製品の製剤とは異なる製剤で提供され、参照医薬品または参照バイオ製品は、タボリキシズマブである。OX40アゴニスト抗体は、米国FDA及び/または欧州連合EMAなどの薬物規制当局によって認可され得る。いくつかの実施形態では、バイオシミラーは、1つ以上の賦形剤をさらに含む組成物として提供され、1つ以上の賦形剤は、参照医薬品または参照バイオ製品に含まれる賦形剤と同じまたは異なるものであり、参照医薬品または参照バイオ製品は、タボリキシズマブである。いくつかの実施形態では、バイオシミラーは、1つ以上の賦形剤をさらに含む組成物として提供され、1つ以上の賦形剤は、参照医薬品または参照バイオ製品に含まれる賦形剤と同じまたは異なるものであり、参照医薬品または参照バイオ製品は、タボリキシズマブである。
Figure 2024512029000015
いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、Pfizer,Inc.から入手可能な完全ヒト抗体である11D4である。11D4の調製及び特性は、米国特許第7,960,515号、同第8,236,930号、及び同第9,028,824号に記載されており、それらの開示は参照により本明細書に組み込まれる。11D4のアミノ酸配列を表13に示す。
ある実施形態では、OX40アゴニストは、配列番号97によって示される重鎖及び配列番号98によって示される軽鎖を含む。ある実施形態では、OX40アゴニストは、それぞれ、配列番号97及び配列番号98に示される配列を有する重鎖及び軽鎖、またはそれらの抗原結合断片、Fab断片、一本鎖可変断片(scFv)、バリアント、もしくはコンジュゲートを含む。ある実施形態では、OX40アゴニストは、各々が、それぞれ、配列番号97及び配列番号98に示される配列と少なくとも99%同一である重鎖及び軽鎖を含む。ある実施形態では、OX40アゴニストは、各々が、それぞれ、配列番号97及び配列番号98に示される配列と少なくとも98%同一である重鎖及び軽鎖を含む。ある実施形態では、OX40アゴニストは、各々が、それぞれ、配列番号97及び配列番号98に示される配列と少なくとも97%同一である重鎖及び軽鎖を含む。ある実施形態では、OX40アゴニストは、各々が、それぞれ、配列番号97及び配列番号98に示される配列と少なくとも96%同一である重鎖及び軽鎖を含む。ある実施形態では、OX40アゴニストは、各々が、それぞれ、配列番号97及び配列番号98に示される配列と少なくとも95%同一である重鎖及び軽鎖を含む。
ある実施形態では、OX40アゴニストは、11D4の重鎖及び軽鎖CDRまたは可変領域(VR)を含む。ある実施形態では、OX40アゴニスト重鎖可変領域(VH)は、配列番号99に示される配列を含み、OX40アゴニスト軽鎖可変領域(VL)は、配列番号100に示される配列、及びその保存的アミノ酸置換を含む。ある実施形態では、OX40アゴニストは、各々が、それぞれ、配列番号99及び配列番号100に示される配列と少なくとも99%同一であるVH領域及びVL領域を含む。ある実施形態では、OX40アゴニストは、各々が、それぞれ、配列番号99及び配列番号100に示される配列と少なくとも98%同一であるVH領域及びVL領域を含む。ある実施形態では、OX40アゴニストは、各々が、それぞれ、配列番号99及び配列番号100に示される配列と少なくとも97%同一であるVH領域及びVL領域を含む。ある実施形態では、OX40アゴニストは、各々が、それぞれ、配列番号99及び配列番号100に示される配列と少なくとも96%同一であるVH領域及びVL領域を含む。ある実施形態では、OX40アゴニストは、各々が、それぞれ、配列番号99及び配列番号100に示される配列と少なくとも95%同一であるVH領域及びVL領域を含む。
ある実施形態では、OX40アゴニストは、それぞれ、配列番号101、配列番号102、及び配列番号103に示される配列を有する重鎖CDR1、CDR2、及びCDR3ドメイン、ならびにそれらの保存的アミノ酸置換と、それぞれ、配列番号104、配列番号105、及び配列番号106に示される配列を有する軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3ドメイン、ならびにそれらの保存的アミノ酸置換と、を含む。
ある実施形態では、OX40アゴニストは、11D4に関して薬物規制当局によって承認されたOX40アゴニストバイオシミラーモノクローナル抗体である。ある実施形態では、バイオシミラーモノクローナル抗体は、参照医薬品または参照生物学的製品のアミノ酸配列と少なくとも97%の配列同一性、例えば、97%、98%、99%、または100%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含み、かつ参照医薬品または参照生物学的製品と比較して1つ以上の翻訳後修飾を含むOX40抗体を含み、参照医薬品または参照生物学的製品は、11D4である。いくつかの実施形態では、1つ以上の翻訳後修飾は、グリコシル化、酸化、脱アミド化、及び切断のうちの1つ以上から選択される。いくつかの実施形態では、バイオシミラーは、認可されたまたは認可を得るために提出されたOX40アゴニスト抗体であり、OX40アゴニスト抗体は、参照医薬品または参照バイオ製品の製剤とは異なる製剤で提供され、参照医薬品または参照バイオ製品は、11D4である。OX40アゴニスト抗体は、米国FDA及び/または欧州連合EMAなどの薬物規制当局によって認可され得る。いくつかの実施形態では、バイオシミラーは、1つ以上の賦形剤をさらに含む組成物として提供され、1つ以上の賦形剤は、参照医薬品または参照バイオ製品に含まれる賦形剤と同じまたは異なるものであり、参照医薬品または参照バイオ製品は、11D4である。いくつかの実施形態では、バイオシミラーは、1つ以上の賦形剤をさらに含む組成物として提供され、1つ以上の賦形剤は、参照医薬品または参照バイオ製品に含まれる賦形剤と同じまたは異なるものであり、参照医薬品または参照バイオ製品は、11D4である。
Figure 2024512029000016
いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、Pfizer,Inc.から入手可能な完全ヒト抗体である18D8である。18D8の調製及び特性は、米国特許第7,960,515号、同第8,236,930号、及び同第9,028,824号に記載されており、それらの開示は参照により本明細書に組み込まれる。18D8のアミノ酸配列を表14に示す。
ある実施形態では、OX40アゴニストは、配列番号107によって示される重鎖及び配列番号108によって示される軽鎖を含む。ある実施形態では、OX40アゴニストは、それぞれ、配列番号107及び配列番号108に示される配列を有する重鎖及び軽鎖、またはそれらの抗原結合断片、Fab断片、一本鎖可変断片(scFv)、バリアント、もしくはコンジュゲートを含む。ある実施形態では、OX40アゴニストは、各々が、それぞれ、配列番号107及び配列番号108に示される配列と少なくとも99%同一である重鎖及び軽鎖を含む。ある実施形態では、OX40アゴニストは、各々が、それぞれ、配列番号107及び配列番号108に示される配列と少なくとも98%同一である重鎖及び軽鎖を含む。ある実施形態では、OX40アゴニストは、各々が、それぞれ、配列番号107及び配列番号108に示される配列と少なくとも97%同一である重鎖及び軽鎖を含む。ある実施形態では、OX40アゴニストは、各々が、それぞれ、配列番号107及び配列番号108に示される配列と少なくとも96%同一である重鎖及び軽鎖を含む。ある実施形態では、OX40アゴニストは、各々が、それぞれ、配列番号107及び配列番号108に示される配列と少なくとも95%同一である重鎖及び軽鎖を含む。
ある実施形態では、OX40アゴニストは、18D8の重鎖及び軽鎖CDRまたは可変領域(VR)を含む。ある実施形態では、OX40アゴニスト重鎖可変領域(V)は、配列番号109に示される配列を含み、OX40アゴニスト軽鎖可変領域(V)は、配列番号110に示される配列、及びその保存的アミノ酸置換を含む。ある実施形態では、OX40アゴニストは、各々が、それぞれ、配列番号109及び配列番号110に示される配列と少なくとも99%同一であるV領域及びV領域を含む。ある実施形態では、OX40アゴニストは、各々が、それぞれ、配列番号109及び配列番号110に示される配列と少なくとも98%同一であるV領域及びV領域を含む。ある実施形態では、OX40アゴニストは、各々が、それぞれ、配列番号109及び配列番号110に示される配列と少なくとも97%同一であるV領域及びV領域を含む。ある実施形態では、OX40アゴニストは、各々が、それぞれ、配列番号109及び配列番号110に示される配列と少なくとも96%同一であるV領域及びV領域を含む。ある実施形態では、OX40アゴニストは、各々が、それぞれ、配列番号109及び配列番号110に示される配列と少なくとも95%同一であるV領域及びV領域を含む。
ある実施形態では、OX40アゴニストは、それぞれ、配列番号111、配列番号112、及び配列番号113に示される配列を有する重鎖CDR1、CDR2、及びCDR3ドメイン、ならびにそれらの保存的アミノ酸置換と、それぞれ、配列番号114、配列番号115、及び配列番号116に示される配列を有する軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3ドメイン、ならびにそれらの保存的アミノ酸置換と、を含む。
ある実施形態では、OX40アゴニストは、18D8に関して薬物規制当局によって承認されたOX40アゴニストバイオシミラーモノクローナル抗体である。ある実施形態では、バイオシミラーモノクローナル抗体は、参照医薬品または参照生物学的製品のアミノ酸配列と少なくとも97%の配列同一性、例えば、97%、98%、99%、または100%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含み、かつ参照医薬品または参照生物学的製品と比較して1つ以上の翻訳後修飾を含むOX40抗体を含み、参照医薬品または参照生物学的製品は、18D8である。いくつかの実施形態では、1つ以上の翻訳後修飾は、グリコシル化、酸化、脱アミド化、及び切断のうちの1つ以上から選択される。いくつかの実施形態では、バイオシミラーは、認可されたまたは認可を得るために提出されたOX40アゴニスト抗体であり、OX40アゴニスト抗体は、参照医薬品または参照バイオ製品の製剤とは異なる製剤で提供され、参照医薬品または参照バイオ製品は、18D8である。OX40アゴニスト抗体は、米国FDA及び/または欧州連合EMAなどの薬物規制当局によって認可され得る。いくつかの実施形態では、バイオシミラーは、1つ以上の賦形剤をさらに含む組成物として提供され、1つ以上の賦形剤は、参照医薬品または参照バイオ製品に含まれる賦形剤と同じまたは異なるものであり、参照医薬品または参照バイオ製品は、18D8である。いくつかの実施形態では、バイオシミラーは、1つ以上の賦形剤をさらに含む組成物として提供され、1つ以上の賦形剤は、参照医薬品または参照バイオ製品に含まれる賦形剤と同じまたは異なるものであり、参照医薬品または参照バイオ製品は、18D8である。
Figure 2024512029000017
いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、GlaxoSmithKline plc.から入手可能なヒト化抗体であるHu119-122である。Hu119-122の調製及び特性は、米国特許第9,006,399号及び同第9,163,085号、ならびに国際特許公開第WO2012/027328号に記載されており、それらの開示は参照により本明細書に組み込まれる。Hu119-122のアミノ酸配列を表15に示す。
ある実施形態では、OX40アゴニストは、Hu119-122の重鎖及び軽鎖CDRまたは可変領域(VR)を含む。ある実施形態では、OX40アゴニスト重鎖可変領域(V)は、配列番号117に示される配列を含み、OX40アゴニスト軽鎖可変領域(V)は、配列番号118に示される配列、及びその保存的アミノ酸置換を含む。ある実施形態では、OX40アゴニストは、各々が、それぞれ、配列番号117及び配列番号118に示される配列と少なくとも99%同一であるV領域及びV領域を含む。ある実施形態では、OX40アゴニストは、各々が、それぞれ、配列番号117及び配列番号118に示される配列と少なくとも98%同一であるV領域及びV領域を含む。ある実施形態では、OX40アゴニストは、各々が、それぞれ、配列番号117及び配列番号118に示される配列と少なくとも97%同一であるV領域及びV領域を含む。ある実施形態では、OX40アゴニストは、各々が、それぞれ、配列番号117及び配列番号118に示される配列と少なくとも96%同一であるV領域及びV領域を含む。ある実施形態では、OX40アゴニストは、各々が、それぞれ、配列番号117及び配列番号118に示される配列と少なくとも95%同一であるV領域及びV領域を含む。
ある実施形態では、OX40アゴニストは、それぞれ、配列番号119、配列番号120、及び配列番号121に示される配列を有する重鎖CDR1、CDR2、及びCDR3ドメイン、ならびにそれらの保存的アミノ酸置換と、それぞれ、配列番号122、配列番号123、及び配列番号124に示される配列を有する軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3ドメイン、ならびにそれらの保存的アミノ酸置換と、を含む。
ある実施形態では、OX40アゴニストは、Hu119-122に関して薬物規制当局によって承認されたOX40アゴニストバイオシミラーモノクローナル抗体である。ある実施形態では、バイオシミラーモノクローナル抗体は、参照医薬品または参照生物学的製品のアミノ酸配列と少なくとも97%の配列同一性、例えば、97%、98%、99%、または100%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含み、かつ参照医薬品または参照生物学的製品と比較して1つ以上の翻訳後修飾を含むOX40抗体を含み、参照医薬品または参照生物学的製品は、Hu119-122である。いくつかの実施形態では、1つ以上の翻訳後修飾は、グリコシル化、酸化、脱アミド化、及び切断のうちの1つ以上から選択される。いくつかの実施形態では、バイオシミラーは、認可されたまたは認可を得るために提出されたOX40アゴニスト抗体であり、OX40アゴニスト抗体は、参照医薬品または参照バイオ製品の製剤とは異なる製剤で提供され、参照医薬品または参照バイオ製品は、Hu119-122である。OX40アゴニスト抗体は、米国FDA及び/または欧州連合EMAなどの薬物規制当局によって認可され得る。いくつかの実施形態では、バイオシミラーは、1つ以上の賦形剤をさらに含む組成物として提供され、1つ以上の賦形剤は、参照医薬品または参照バイオ製品に含まれる賦形剤と同じまたは異なるものであり、参照医薬品または参照バイオ製品は、Hu119-122である。いくつかの実施形態では、バイオシミラーは、1つ以上の賦形剤をさらに含む組成物として提供され、1つ以上の賦形剤は、参照医薬品または参照バイオ製品に含まれる賦形剤と同じまたは異なるものであり、参照医薬品または参照バイオ製品は、Hu119-122である。

Figure 2024512029000018
いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、GlaxoSmithKline plc.から入手可能なヒト化抗体であるHu106-222である。Hu106-222の調製及び特性は、米国特許第9,006,399号及び同第9,163,085号、ならびに国際特許公開第WO2012/027328号に記載されており、それらの開示は参照により本明細書に組み込まれる。Hu106-222のアミノ酸配列を表16に示す。
ある実施形態では、OX40アゴニストは、Hu106-222の重鎖及び軽鎖CDRまたは可変領域(VR)を含む。ある実施形態では、OX40アゴニスト重鎖可変領域(V)は、配列番号125に示される配列を含み、OX40アゴニスト軽鎖可変領域(V)は、配列番号126に示される配列、及びその保存的アミノ酸置換を含む。ある実施形態では、OX40アゴニストは、各々が、それぞれ、配列番号125及び配列番号126に示される配列と少なくとも99%同一であるV領域及びV領域を含む。ある実施形態では、OX40アゴニストは、各々が、それぞれ、配列番号125及び配列番号126に示される配列と少なくとも98%同一であるV領域及びV領域を含む。ある実施形態では、OX40アゴニストは、各々が、それぞれ、配列番号125及び配列番号126に示される配列と少なくとも97%同一であるV領域及びV領域を含む。ある実施形態では、OX40アゴニストは、各々が、それぞれ、配列番号125及び配列番号126に示される配列と少なくとも96%同一であるV領域及びV領域を含む。ある実施形態では、OX40アゴニストは、各々が、それぞれ、配列番号125及び配列番号126に示される配列と少なくとも95%同一であるV領域及びV領域を含む。
ある実施形態では、OX40アゴニストは、それぞれ、配列番号127、配列番号128、及び配列番号129に示される配列を有する重鎖CDR1、CDR2、及びCDR3ドメイン、ならびにそれらの保存的アミノ酸置換と、それぞれ、配列番号130、配列番号131、及び配列番号132に示される配列を有する軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3ドメイン、ならびにそれらの保存的アミノ酸置換と、を含む。
ある実施形態では、OX40アゴニストは、Hu106-222に関して薬物規制当局によって承認されたOX40アゴニストバイオシミラーモノクローナル抗体である。ある実施形態では、バイオシミラーモノクローナル抗体は、参照医薬品または参照生物学的製品のアミノ酸配列と少なくとも97%の配列同一性、例えば、97%、98%、99%、または100%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含み、かつ参照医薬品または参照生物学的製品と比較して1つ以上の翻訳後修飾を含むOX40抗体を含み、参照医薬品または参照生物学的製品は、Hu106-222である。いくつかの実施形態では、1つ以上の翻訳後修飾は、グリコシル化、酸化、脱アミド化、及び切断のうちの1つ以上から選択される。いくつかの実施形態では、バイオシミラーは、認可されたまたは認可を得るために提出されたOX40アゴニスト抗体であり、OX40アゴニスト抗体は、参照医薬品または参照バイオ製品の製剤とは異なる製剤で提供され、参照医薬品または参照バイオ製品は、Hu106-222である。OX40アゴニスト抗体は、米国FDA及び/または欧州連合EMAなどの薬物規制当局によって認可され得る。いくつかの実施形態では、バイオシミラーは、1つ以上の賦形剤をさらに含む組成物として提供され、1つ以上の賦形剤は、参照医薬品または参照バイオ製品に含まれる賦形剤と同じまたは異なるものであり、参照医薬品または参照バイオ製品は、Hu106-222である。いくつかの実施形態では、バイオシミラーは、1つ以上の賦形剤をさらに含む組成物として提供され、1つ以上の賦形剤は、参照医薬品または参照バイオ製品に含まれる賦形剤と同じまたは異なるものであり、参照医薬品または参照バイオ製品は、Hu106-222である。
Figure 2024512029000019
いくつかの実施形態では、OX40アゴニスト抗体は、MEDI6469(9B12とも称される)である。MEDI6469は、マウスモノクローナル抗体である。Weinberg,et al.,J.Immunother.2006,29,575-585。いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、Weinberg,et al.,J.Immunother.2006,29,575-585に記載されているように、Biovest Inc.(Malvern,MA,USA)に寄託された9B12ハイブリドーマによって産生された抗体であり、その開示は参照によりその全体が本明細書に組み込まれる。いくつかの実施形態では、抗体は、MEDI6469のCDR配列を含む。いくつかの実施形態では、抗体は、MEDI6469の重鎖可変領域配列及び/または軽鎖可変領域配列を含む。
ある実施形態では、OX40アゴニストは、L106 BD(Pharmingen製品番号340420)である。いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、抗体L106(BD Pharmingen製品番号340420)のCDRを含む。いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、抗体L106(BD Pharmingen製品番号340420)の重鎖可変領域配列及び/または軽鎖可変領域配列を含む。ある実施形態では、OX40アゴニストは、ACT35(Santa Cruz Biotechnology、カタログ番号20073)である。いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、抗体ACT35(Santa Cruz Biotechnology、カタログ番号20073)のCDRを含む。いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、抗体ACT35(Santa Cruz Biotechnology、カタログ番号20073)の重鎖可変領域配列及び/または軽鎖可変領域配列を含む。ある実施形態では、OX40アゴニストは、InVivoMAb、BioXcell Inc(West Lebanon,NH)から市販されているマウスモノクローナル抗体抗mCD134/mOX40(クローンOX86)である。
ある実施形態では、OX40アゴニストは、国際特許出願公開第WO95/12673号、同第WO95/21925号、同第WO2006/121810号、同第WO2012/027328号、同第WO2013/028231号、同第WO2013/038191号、及び同第WO2014/148895号、欧州特許出願第EP0672141号、米国特許出願公開第US2010/136030号、同第US2014/377284号、同第US2015/190506号、及び同第US2015/132288号(クローン20E5及び12H3を含む)、ならびに米国特許第7,504,101号、同第7,550,140号、同第7,622,444号、同第7,696,175号、同第7,960,515号、同第7,961,515号、同第8,133,983号、同第9,006,399号、及び同第9,163,085号(各々の開示は参照によりその全体が本明細書に組み込まれる)に記載されるOX40アゴニストから選択される。
ある実施形態では、OX40アゴニストは、構造I-A(C末端Fc抗体断片融合タンパク質)もしくは構造I-B(N末端Fc抗体断片融合タンパク質)に示されるOX40アゴニスト融合タンパク質、またはそれらの断片、誘導体、コンジュゲート、バリアント、もしくはバイオシミラーである。構造I-A及びI-Bの特性は、上記及び米国特許第9,359,420号、同第9,340,599号、同第8,921,519号、及び同第8,450,460号に記載されており、それらの開示は参照により本明細書に組み込まれる。図18に示される構造I-Aのポリペプチドドメインのアミノ酸配列は、表9に見出される。Fcドメインは、好ましくは、完全な定常ドメイン(配列番号62のアミノ酸17~230)、完全なヒンジドメイン(配列番号62のアミノ酸1~16)、またはヒンジドメインの一部(例えば、配列番号62のアミノ酸4~16)を含む。C末端Fc抗体を結合するための好ましいリンカーは、追加のポリペプチドの融合に好適なリンカーを含む、配列番号63~配列番号72に示される実施形態から選択され得る。同様に、図18に示される構造I-Bのポリペプチドドメインのアミノ酸配列は、表10に見出される。Fc抗体断片が構造I-BにあるようなTNRFSF融合タンパク質のN末端に融合される場合、Fcモジュールの配列は、好ましくは、配列番号73に示されるものであり、リンカー配列は、好ましくは、配列番号74~配列番号76に示される実施形態から選択される。
ある実施形態では、構造I-AまたはI-BによるOX40アゴニスト融合タンパク質は、タボリキシズマブの可変重鎖及び可変軽鎖、11D4の可変重鎖及び可変軽鎖、18D8の可変重鎖及び可変軽鎖、Hu119-122の可変重鎖及び可変軽鎖、Hu106-222の可変重鎖及び可変軽鎖、表17に記載の可変重鎖及び可変軽鎖から選択される可変重鎖及び可変軽鎖、前述の可変重鎖及び可変軽鎖の任意の組み合わせ、ならびにそれらの断片、誘導体、コンジュゲート、バリアント、及びバイオシミラーからなる群から選択される1つ以上のOX40結合ドメインを含む。
ある実施形態では、構造I-AまたはI-BによるOX40アゴニスト融合タンパク質は、OX40L配列を含む1つ以上のOX40結合ドメインを含む。ある実施形態では、構造I-AまたはI-BによるOX40アゴニスト融合タンパク質は、配列番号133による配列を含む1つ以上のOX40結合ドメインを含む。ある実施形態では、構造I-AまたはI-BによるOX40アゴニスト融合タンパク質は、可溶性OX40L配列を含む1つ以上のOX40結合ドメインを含む。ある実施形態では、構造I-AまたはI-BによるOX40アゴニスト融合タンパク質は、配列番号134による配列を含む1つ以上のOX40結合ドメインを含む。ある実施形態では、構造I-AまたはI-BによるOX40アゴニスト融合タンパク質は、配列番号135による配列を含む1つ以上のOX40結合ドメインを含む。
ある実施形態では、構造I-AまたはI-BによるOX40アゴニスト融合タンパク質は、各々が、それぞれ、配列番号89及び配列番号90に示される配列と少なくとも95%同一であるV領域及びV領域を含むscFvドメインである1つ以上のOX40結合ドメインを含み、VドメインとVドメインはリンカーによって結合されている。ある実施形態では、構造I-AまたはI-BによるOX40アゴニスト融合タンパク質は、各々が、それぞれ、配列番号99及び配列番号100に示される配列と少なくとも95%同一であるV領域及びV領域を含むscFvドメインである1つ以上のOX40結合ドメインを含み、VドメインとVドメインはリンカーによって結合されている。ある実施形態では、構造I-AまたはI-BによるOX40アゴニスト融合タンパク質は、各々が、それぞれ、配列番号109及び配列番号110に示される配列と少なくとも95%同一であるV領域及びV領域を含むscFvドメインである1つ以上のOX40結合ドメインを含み、VドメインとVドメインはリンカーによって結合されている。ある実施形態では、構造I-AまたはI-BによるOX40アゴニスト融合タンパク質は、各々が、それぞれ、配列番号127及び配列番号128に示される配列と少なくとも95%同一であるV領域及びV領域を含むscFvドメインである1つ以上のOX40結合ドメインを含み、VドメインとVドメインはリンカーによって結合されている。ある実施形態では、構造I-AまたはI-BによるOX40アゴニスト融合タンパク質は、各々が、それぞれ、配列番号125及び配列番号126に示される配列と少なくとも95%同一であるV領域及びV領域を含むscFvドメインである1つ以上のOX40結合ドメインを含み、VドメインとVドメインはリンカーによって結合されている。ある実施形態では、構造I-AまたはI-BによるOX40アゴニスト融合タンパク質は、各々が表17に示されるV配列及びV配列と少なくとも95%同一であるV領域及びV領域を含むscFvドメインである1つ以上のOX40結合ドメインを含み、VドメインとVドメインはリンカーによって結合されている。
Figure 2024512029000020

Figure 2024512029000021
ある実施形態では、OX40アゴニストは、(i)第1の可溶性OX40結合ドメイン、(ii)第1のペプチドリンカー、(iii)第2の可溶性OX40結合ドメイン、(iv)第2のペプチドリンカー、及び(v)第3の可溶性OX40結合ドメインを含むOX40アゴニスト一本鎖融合ポリペプチドであり、N末端及び/またはC末端に追加のドメインをさらに含み、追加のドメインは、FabまたはFc断片ドメインである。ある実施形態では、OX40アゴニストは、(i)第1の可溶性OX40結合ドメイン、(ii)第1のペプチドリンカー、(iii)第2の可溶性OX40結合ドメイン、(iv)第2のペプチドリンカー、及び(v)第3の可溶性OX40結合ドメインを含むOX40アゴニスト一本鎖融合ポリペプチドであり、N末端及び/またはC末端に追加のドメインをさらに含み、追加のドメインは、FabまたはFc断片ドメインであり、可溶性OX40ドメインは各々、茎領域(三量体化に寄与し、細胞膜まである特定の距離を提供するが、OX40結合ドメインの一部分ではない)を欠き、第1及び第2のペプチドリンカーは独立して、3~8アミノ酸長を有する。
ある実施形態では、OX40アゴニストは、(i)第1の可溶性腫瘍壊死因子(TNF)スーパーファミリーサイトカインドメイン、(ii)第1のペプチドリンカー、(iii)第2の可溶性TNFスーパーファミリーサイトカインドメイン、(iv)第2のペプチドリンカー、及び(v)第3の可溶性TNFスーパーファミリーサイトカインドメインを含むOX40アゴニスト一本鎖融合ポリペプチドであり、可溶性TNFスーパーファミリーサイトカインドメインは各々、茎領域を欠き、第1及び第2のペプチドリンカーは独立して、3~8アミノ酸長であり、TNFスーパーファミリーサイトカインドメインは、OX40結合ドメインである。
いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、MEDI6383である。MEDI6383は、OX40アゴニスト融合タンパク質であり、米国特許第6,312,700号に記載されているように調製することができ、その開示は参照により本明細書に組み込まれる。
ある実施形態では、OX40アゴニストは、前述のVドメインのうちのいずれかに連結された前述のVドメインのうちのいずれかを含むOX40アゴニストscFv抗体である。
ある実施形態では、OX40アゴニストは、Creative Biolabs,Inc.(Shirley,NY,USA)から市販されているCreative Biolabs OX40アゴニストモノクローナル抗体MOM-18455である。
ある実施形態では、OX40アゴニストは、BioLegend,Inc.(San Diego,CA,USA)から市販されているOX40アゴニスト抗体クローンBer-ACT35である。
C.任意選択の細胞生存率分析
任意選択で、細胞生存率アッセイは、当該技術分野で知られている標準のアッセイを使用して、プライミングによる第1の拡張(初期バルク拡張と称されることもある)後に行われ得る。したがって、ある特定の実施形態では、方法は、プライミングによる第1の拡張後に細胞生存率アッセイを行うことを含む。例えば、死細胞を選択的に標識し、生存率の評価を可能にするトリパンブルー排除アッセイが、バルクTILの試料上で行われ得る。生存率の試験に使用する他のアッセイには、アラマーブルーアッセイ及びMTTアッセイが含まれるが、これらに限定されない。
1.細胞計数、生存率、フローサイトメトリー
いくつかの実施形態では、細胞数及び/または生存率が測定される。CD3、CD4、CD8、及びCD56などであるが、これらに限定されないマーカー、ならびに本明細書に開示または記載される任意の他のマーカーの発現は、FACSCanto(商標)フローサイトメーター(BD Biosciences,Inc.,Franklin Lakes,NJ,USA)を使用し、例えばBD Biosciences,Inc.(San Jose,CA)から市販されているものであるが、これらに限定されない抗体を用いたフローサイトメトリーによって測定され得る。細胞は、使い捨てのcチップ血球計数器(VWR,Batavia,IL,USA)を使用して手動で計数することができ、生存率は、トリパンブルー染色を含むが、これに限定されない、当該技術分野で知られている任意の方法を使用して評価することができる。細胞生存率は、米国特許出願公開第2018/0282694号(参照によりその全体が本明細書に組み込まれる)に基づいてアッセイされ得る。細胞生存率は、米国特許公開第2018/0280436号または国際特許公開第WO/2018/081473号(いずれもあらゆる目的のためにそれらの全体が本明細書に組み込まれる)に基づいてアッセイすることもできる。
いくつかの事例では、バルクTIL集団は、以下で考察されるプロトコルを使用して直ちに凍結保存され得る。あるいは、以下で論じられるように、バルクTIL集団がREPに供されて、凍結保存され得る。同様に、遺伝子修飾TILが療法に使用される場合、バルクまたはREP TIL集団が好適な治療のために遺伝子修飾に供され得る。
2.細胞培養
ある実施形態では、上で考察され、図1及び図8(特に、例えば図8B及び/または図8C)に例示されたものを含む、TILを拡張するための方法は、約5,000mL~約25,000mLの細胞培地、約5,000mL~約10,000mLの細胞培地、または約5,800mL~約8,700mLの細胞培地を使用することを含み得る。いくつかの実施形態では、培地は、無血清培地である。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張における培地は、無血清である。いくつかの実施形態では、第2の拡張における培地は、無血清である。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張及び第2の拡張(急速な第2の拡張とも称される)における培地は、両方とも無血清である。ある実施形態では、TILの数を拡張することは、わずか1種類の細胞培養培地を使用する。任意の好適な細胞培養培地、例えば、AIM V培地(Invitrogen,Carlsbad CAから市販されている)とも称される、AIM-V細胞培地(L-グルタミン、50μMの硫酸ストレプトマイシン、及び10μMの硫酸ゲンタマイシン)が使用され得る。これに関して、本発明の方法は、TILの数を拡張するために必要な培地の量及び培地の種類の数を有利に減少させる。ある実施形態では、TILの数を拡張することは、3日または4日に1回以下の頻度で細胞にフィードすることを含み得る。ガス透過性容器内で細胞の数を拡張することは、細胞を拡張するために必要なフィード頻度を減少させることによって、細胞の数を拡張するために必要な手順を簡素化する。
ある実施形態では、第1及び/または第2のガス透過性容器内の細胞培養培地は、ろ過されていない。濾過されていない細胞培地の使用は、細胞の数を拡張するために必要な手順を簡素化することができる。ある実施形態では、第1及び/または第2のガス透過性容器内の細胞培地は、β-メルカプトエタノール(BME)を欠いている。
ある実施形態では、哺乳動物から腫瘍組織試料を取得することと、プライミングによる第1の拡張として約1~8日間、例えば約7日間、またはプライミングによる第1の拡張として約8日間にわたってIL-2、1X抗原提示フィーダー細胞、及びOKT-3を含む細胞培地を含有する第1のガス透過性容器内で腫瘍組織試料を培養することと、TILを第2のガス透過性容器に移し、IL-2、2X抗原提示フィーダー細胞、及びOKT-3を含む細胞培地を含有する第2のガス透過性容器内でTILの数を約7~9日間、例えば、約7日間、約8日間、または約9日間にわたって拡張することと、を含む方法の期間。
ある実施形態では、哺乳動物から腫瘍組織試料を取得することと、プライミングによる第1の拡張として約1~7日間、例えば約7日間にわたってIL-2、1X抗原提示フィーダー細胞、及びOKT-3を含む細胞培地を含有する第1のガス透過性容器内で腫瘍組織試料を培養することと、TILを第2のガス透過性容器に移し、IL-2、2X抗原提示フィーダー細胞、及びOKT-3を含む細胞培地を含有する第2のガス透過性容器内でTILの数を約7~14日間、または約7~9日間、例えば、約7日間、約8日間、または約9日間、約10日間、または約11日間にわたって拡張することと、を含む方法の期間。
ある実施形態では、哺乳動物から腫瘍組織試料を取得することと、プライミングによる第1の拡張として約1~7日間、例えば約7日間にわたってIL-2、1×抗原提示フィーダー細胞、及びOKT-3を含む細胞培地を含有する第1のガス透過性容器内で腫瘍組織試料を培養することと、TILを第2のガス透過性容器に移し、IL-2、2×抗原提示フィーダー細胞、及びOKT-3を含む細胞培地を含有する第2のガス透過性容器内でTILの数を約7~11日間、例えば約7日間、約8日間、約9日間、約10日間、または約11日間にわたって拡張することと、を含む方法の期間。
ある実施形態では、TILは、ガス透過性容器内で拡張される。ガス透過性容器は、米国特許出願公開第2005/0106717A1号に記載されるものを含む、当該技術分野で知られている方法、組成物、及びデバイスを使用して、PBMCを使用してTILを拡張するために使用されており、その開示は参照により本明細書に組み込まれる。ある実施形態では、TILは、ガス透過性バッグ内で拡張される。ある実施形態では、TILは、Xuri Cell Expansion System W25(GE Healthcare)などのガス透過性バッグ内のTILを拡張する細胞拡張システムを使用して拡張される。ある実施形態では、TILは、Xuri Cell Expansion System W5(GE Healthcare)としても知られるWAVE Bioreactor Systemなどのガス透過性バッグ内でTILを拡張する細胞拡張システムを使用して拡張される。ある実施形態では、細胞拡張システムは、約100mL、約200mL、約300mL、約400mL、約500mL、約600mL、約700mL、約800mL、約900mL、約1L、約2L、約3L、約4L、約5L、約6L、約7L、約8L、約9L、及び約10Lからなる群から選択される体積を有するガス透過性細胞バッグを含む。
ある実施形態では、TILは、G-Rexフラスコ(Wilson Wolf Manufacturingから市販されている)内で拡張され得る。かかる実施形態は、細胞集団が約5×10細胞/cm~10×10及び30×10細胞/cmまで拡張するのを可能にする。ある実施形態では、これは、フィードなしである。ある実施形態では、これは、培地がG-Rexフラスコ内の約10cmの高さに存在する限り、フィードなしである。ある実施形態では、これは、フィードなしであるが、1つ以上のサイトカインの添加を伴う。ある実施形態では、サイトカインを培地と混合する必要なしに、サイトカインがボーラスとして添加され得る。かかる容器、装置、及び方法は、当該技術分野で知られており、TILを拡張するために使用されており、米国特許出願公開第US2014/0377739A1号、国際公開第WO2014/210036A1号、米国特許出願公開第US2013/0115617A1号、国際公開第WO2013/188427A1、米国特許出願公開第US2011/0136228A1、米国特許第US8,809,050B2号、国際公開第WO2011/072088A2号、米国特許出願公開第US2016/0208216A1号、米国特許出願公開第US2012/0244133A1号、国際公開第WO2012/129201A1号、米国特許出願公開第US2013/0102075A1号、米国特許第US8,956,860B2号、国際公開第WO2013/173835A1号、米国特許出願公開第US2015/0175966A1号に記載されるものを含み、それらの開示は参照により本明細書に組み込まれる。かかるプロセスも、Jin et al.,J.Immunotherapy,2012,35:283-292に記載されている。
D.TILの任意選択の遺伝子操作
いくつかの実施形態では、本発明の拡張TILは、タンパク質発現を一過的に変化させるために、各々本明細書で提供されるように、閉鎖滅菌製造プロセス中を含む、拡張ステップ前、拡張ステップ中、または拡張ステップ後にさらに操作される。いくつかの実施形態では、一過的に変化したタンパク質発現は、一過性の遺伝子編集によるものである。いくつかの実施形態では、本発明の拡張TILは、TILにおけるタンパク質発現を一過的に変化させることができる転写因子(TF)及び/または他の分子で処理される。いくつかの実施形態では、タンパク質発現を一過的に変化させることができるTF及び/または他の分子は、腫瘍抗原の発現の変化及び/またはTIL集団における腫瘍抗原特異的T細胞の数の変化を提供する。
ある特定の実施形態では、方法は、TIL集団を遺伝子編集することを含む。ある特定の実施形態では、この方法は、第1のTIL集団、第2のTIL集団、及び/または第3のTIL集団を遺伝子編集することを含む。
いくつかの実施形態では、本発明は、1つ以上のタンパク質の発現の促進または1つ以上のタンパク質の発現の阻害、ならびに一組のタンパク質の促進及び別の組のタンパク質の阻害の両方の組み合わせの同時発生のために、リボ核酸(RNA)挿入、例えば、メッセンジャーRNA(mRNA)または低分子(もしくは短)干渉RNA(siRNA)のTIL集団への挿入などのヌクレオチド挿入による遺伝子編集を含む。
いくつかの実施形態では、本発明の拡張TILは、タンパク質発現の一過性の変化を受ける。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、例えば、図8(特に図8B及び/または図8C)に示されるようなステップAから得られたTIL集団を含む、第1の拡張前のバルクTIL集団において起こる。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、例えば、図8(例えば、図8B及び/または図8C)に示されるように、例えば、ステップBで拡張されたTIL集団におけるものを含む、第1の拡張中に起こる。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、例えば、図8に示されるように、ステップBから取得され、ステップCに含まれるTIL集団である、例えば、第1の拡張と第2の拡張との間の移行中のTIL集団(例えば、本明細書に記載の第2のTIL集団)におけるものを含む、第1の拡張後に起こる。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、例えば、図8に示されるように、例えば、ステップCから取得され、ステップDでのその拡張前のTIL集団を含む、第2の拡張前のバルクTIL集団において起こる。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、例えば、図8に示されるように、例えば、ステップDで拡張されたTIL集団(例えば、第3のTIL集団)を含む、第2の拡張中に起こる。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、例えば、図8に示されるように、例えば、ステップDでの拡張から取得されたTIL集団を含む、第2の拡張後に起こる。
ある実施形態では、TIL集団におけるタンパク質発現を一過的に変化させる方法は、エレクトロポレーションステップを含む。エレクトロポレーション法は、当該技術分野で知られており、例えば、Tsong,Biophys.J.1991,60,297-306及び米国特許出願公開第2014/0227237A1号に記載されており、これらの各々の開示は参照により本明細書に組み込まれる。ある実施形態では、TIL集団におけるタンパク質発現を一過的に変化させる方法は、リン酸カルシウムトランスフェクションステップを含む。リン酸カルシウムトランスフェクション法(リン酸カルシウムDNA沈殿、細胞表面コーティング、及びエンドサイトーシス)は、当該技術分野で知られており、Graham and van der Eb,Virology 1973,52,456-467、Wigler,et al.,Proc.Natl.Acad.Sci.1979,76,1373-1376、及びChen and Okayarea,Mol.Cell.Biol.1987,7,2745-2752、ならびに米国特許第5,593,875号に記載されており、これらの各々の開示は参照により本明細書に組み込まれる。ある実施形態では、TIL集団におけるタンパク質発現を一過的に変化させる方法は、リポソームトランスフェクションステップを含む。リポソームトランスフェクション法、例えば、カチオン性脂質N-[1-(2,3-ジオレイルオキシ)プロピル]-n,n,n-トリメチルアンモニウムクロリド(DOTMA)及びジオレオイルホスホチジルエタノールアミン(DOPE)の1:1(w/w)リポソーム製剤を用いる方法は、当該技術分野において既知であり、Rose,et al.,Biotechniques 1991,10,520-525及びFelgner,et al.,Proc.Natl.Acad.Sci.USA,1987,84,7413-7417、ならびに米国特許第5,279,833号、同第5,908,635号、同第6,056,938号、同第6,110,490号、同第6,534,484号、及び同第7,687,070号に記載されており、これらの各々の開示は参照により本明細書に組み込まれる。ある実施形態では、TIL集団におけるタンパク質発現を一過的に変化させる方法は、米国特許第5,766,902号、同第6,025,337号、同第6,410,517号、同第6,475,994号、及び同第7,189,705号に記載されている方法を使用するトランスフェクションステップを含み、これらの各々の開示は参照により本明細書に組み込まれる。
いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、幹細胞メモリーT細胞(TSCM)の増加をもたらす。TSCMは、抗原を経験したセントラルメモリーT細胞の初期前駆細胞である。TSCMは、一般に、幹細胞を定義する長期生存、自己再生、及び多分化能を示し、一般に、効果的なTIL製品の生成に望ましいものである。TSCMは、養子細胞移植のマウスモデルにおいて他のT細胞サブセットと比較して増強された抗腫瘍活性を示している(Gattinoni et al.Nat Med 2009,2011、Gattinoni,Nature Rev.Cancer,2012、Cieri et al.Blood 2013)。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、高い割合のTSCMを含む組成を有するTIL集団をもたらす。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、TSCMパーセンテージの少なくとも5%、少なくとも10%、少なくとも10%、少なくとも20%、少なくとも25%、少なくとも30%、少なくとも35%、少なくとも40%、少なくとも45%、少なくとも50%、少なくとも55%、少なくとも60%、少なくとも65%、少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%の増加をもたらす。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、TIL集団中のTSCMの少なくとも1倍、2倍、3倍、4倍、5倍、または10倍の増加をもたらす。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、少なくとも5%、少なくとも10%、少なくとも10%、少なくとも20%、少なくとも25%、少なくとも30%、少なくとも35%、少なくとも40%、少なくとも45%、少なくとも50%、少なくとも55%、少なくとも60%、少なくとも65%、少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%のTSCMを有するTIL集団をもたらす。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、少なくとも5%、少なくとも10%、少なくとも10%、少なくとも20%、少なくとも25%、少なくとも30%、少なくとも35%、少なくとも40%、少なくとも45%、少なくとも50%、少なくとも55%、少なくとも60%、少なくとも65%、少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%のTSCMを有する治療的TIL集団をもたらす。
いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、抗原を経験したT細胞の幼若化をもたらす。いくつかの実施形態では、幼若化には、例えば、増加した増殖、増加したT細胞活性化、及び/または増加した抗原認識が含まれる。
いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、腫瘍由来のTCRレパートリーを保存するために、T細胞の大部分における発現を変化させる。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、腫瘍由来のTCRレパートリーを変化させない。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、腫瘍由来のTCRレパートリーを維持する。
いくつかの実施形態では、タンパク質の一過性の変化は、特定の遺伝子の発現の変化をもたらす。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、PD-1(PDCD1またはCC279とも称される)、TGFBR2、CCR4/5、CBLB(CBL-B)、CISH、CCR(キメラ共刺激受容体)、IL-2、IL-12、IL-15、IL-21、NOTCH 1/2 ICD、TIM3、LAG3、TIGIT、TGFβ、CCR2、CCR4、CCR5、CXCR1、CXCR2、CSCR3、CCL2(MCP-1)、CCL3(MIP-1α)、CCL4(MIP1-β)、CCL5(RANTES)、CXCL1/CXCL8、CCL22、CCL17、CXCL1/CXCL8、VHL、CD44、PIK3CD、SOCS1、及び/またはcAMPタンパク質キナーゼA(PKA)を含むが、これらに限定されない遺伝子を標的とする。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、PD-1、TGFBR2、CCR4/5、CBLB(CBL-B)、CISH、CCR(キメラ共刺激受容体)、IL-2、IL-12、IL-15、IL-21、NOTCH 1/2 ICD、TIM3、LAG3、TIGIT、TGFβ、CCR2、CCR4、CCR5、CXCR1、CXCR2、CSCR3、CCL2(MCP-1)、CCL3(MIP-1α)、CCL4(MIP1-β)、CCL5(RANTES)、CXCL1/CXCL8、CCL22、CCL17、CXCL1/CXCL8、VHL、CD44、PIK3CD、SOCS1、及び/またはcAMPタンパク質キナーゼA(PKA)からなる群から選択される遺伝子を標的とする。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、PD-1を標的とする。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、TGFBR2を標的とする。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、CCR4/5を標的とする。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性変化は、CBLBを標的とする。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性変化は、CISHを標的とする。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、CCR(キメラ共刺激受容体)を標的とする。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、IL-2を標的とする。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、IL-12を標的とする。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、IL-15を標的とする。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、IL-21を標的とする。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、NOTCH1/2 ICDを標的とする。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、TIM3を標的とする。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、LAG3を標的とする。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性変化は、TIGITを標的とする。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、TGFβを標的とする。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、CCR1を標的とする。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、CCR2を標的とする。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、CCR4を標的とする。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、CCR5を標的とする。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、CXCR1を標的とする。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、CXCR2を標的とする。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、CSCR3を標的とする。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、CCL2(MCP-1)を標的とする。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、CCL3(MIP-1α)を標的とする。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、CCL4(MIP1-β)を標的とする。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、CCL5(RANTES)を標的とする。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、CXCL1を標的とする。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、CXCL8を標的とする。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、CCL22を標的とする。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、CCL17を標的とする。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性変化は、VHLを標的とする。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、CD44を標的とする。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、PIK3CDを標的とする。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、SOCS1を標的とする。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、cAMPタンパク質キナーゼA(PKA)を標的とする。
いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、ケモカイン受容体の発現の増加及び/または過剰発現をもたらす。いくつかの実施形態では、一過性タンパク質発現によって過剰発現されるケモカイン受容体は、CCL2(MCP-1)、CCL3(MIP-1α)、CCL4(MIP1-β)、CCL5(RANTES)、CXCL1、CXCL8、CCL22、及び/またはCCL17を含むが、これらに限定されないリガンドを有する受容体を含む。
いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、PD-1、CTLA-4、TIM3、LAG3、TIGIT、TGFβR2、及び/またはTGFβの発現の低下及び/または減少をもたらす(例えば、TGFβ経路の遮断をもたらすことを含む)。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、CBLB(CBL-B)の発現の低下及び/または減少をもたらす。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、CISHの発現の低下及び/または減少をもたらす。
いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、例えば、腫瘍部位へのTILの輸送または移動を改善するために、ケモカイン受容体の発現の増加及び/または過剰発現をもたらす。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、CCR(キメラ共刺激受容体)の発現の増加及び/または過剰発現をもたらす。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、CCR1、CCR2、CCR4、CCR5、CXCR1、CXCR2、及び/またはCSCR3からなる群から選択されるケモカイン受容体の発現の増加及び/または過剰発現をもたらす。
いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、インターロイキンの発現の増加及び/または過剰発現をもたらす。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、IL-2、IL-12、IL-15、及び/またはIL-21からなる群から選択されるインターロイキンの発現の増加及び/または過剰発現をもたらす。
いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、NOTCH1/2 ICDの発現の増加及び/または過剰発現をもたらす。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、VHLの発現の増加及び/または過剰発現をもたらす。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、CD44の発現の増加及び/または過剰発現をもたらす。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、PIK3CDの発現の増加及び/または過剰発現をもたらす。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、SOCS1の発現の増加及び/または過剰発現をもたらす。
いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、cAMPタンパク質キナーゼA(PKA)の発現の低下及び/または減少をもたらす。
いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、PD-1、LAG3、TIM3、CTLA-4、TIGIT、CISH、TGFβR2、PKA、CBLB、BAFF(BR3)、及びそれらの組み合わせからなる群から選択される分子の発現の低下及び/または減少をもたらす。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、PD-1、LAG3、TIM3、CTLA-4、TIGIT、CISH、TGFβR2、PKA、CBLB、BAFF(BR3)、及びそれらの組み合わせからなる群から選択される2つの分子の発現の低下及び/または減少をもたらす。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、PD-1、ならびにLAG3、TIM3、CTLA-4、TIGIT、CISH、TGFβR2、PKA、CBLB、BAFF(BR3)、及びそれらの組み合わせからなる群から選択される1つの分子の発現の低下及び/または減少をもたらす。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、PD-1、LAG3、CISH、CBLB、TIM3、及びそれらの組み合わせの発現の低下及び/または減少をもたらす。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、PD-1、ならびにLAG3、CISH、CBLB、TIM3、及びそれらの組み合わせのうちの1つの発現の低下及び/または減少をもたらす。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、PD-1及びLAG3の発現の低下及び/または減少をもたらす。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、PD-1及びCISHの発現の減少及び/または減少をもたらす。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、PD-1及びCBLBの発現の減少及び/または減少をもたらす。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、LAG3及びCISHの発現の減少及び/または減少をもたらす。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、LAG3及びCBLBの発現の減少及び/または減少をもたらす。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、CISH及びCBLBの発現の低下及び/または減少をもたらす。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、TIM3及びPD-1の発現の低下及び/または減少をもたらす。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、TIM3及びLAG3の発現の低下及び/または減少をもたらす。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、TIM3及びCISHの発現の減少及び/または減少をもたらす。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、TIM3及びCBLBの発現の減少及び/または減少をもたらす。
いくつかの実施形態では、CCR2、CCR4、CCR5、CXCR2、CXCR3、CX3CR1、及びそれらの組み合わせからなる群から選択される接着分子は、ガンマレトロウイルスまたはレンチウイルス法によって、第1のTIL集団、第2のTIL集団、または採取されたTIL集団に挿入される(例えば、接着分子の発現が増加する)。
いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、PD-1、LAG3、TIM3、CTLA-4、TIGIT、CISH、TGFβR2、PKA、CBLB、BAFF(BR3)、及びそれらの組み合わせからなる群から選択される分子の発現の低下及び/または減少、ならびにCCR2、CCR4、CCR5、CXCR2、CXCR3、CX3CR1、及びそれらの組み合わせの発現の増加及び/または増強をもたらす。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、PD-1、LAG3、TIM3、CISH、CBLB、及びそれらの組み合わせからなる群から選択される分子の発現の低下及び/または減少、ならびにCCR2、CCR4、CCR5、CXCR2、CXCR3、CX3CR1、及びそれらの組み合わせの発現の増加及び/または増強をもたらす。
いくつかの実施形態では、発現が約5%、約10%、約10%、約20%、約25%、約30%、約35%、約40%、約45%、約50%、約55%、約60%、約65%、約70%、約75%、約80%、約85%、約90%、または約95%減少する。いくつかの実施形態では、発現が少なくとも約65%、約70%、約75%、約80%、約85%、約90%、または約95%減少する。いくつかの実施形態では、発現が少なくとも約75%、約80%、約85%、約90%、または約95%減少する。いくつかの実施形態では、発現が少なくとも約80%、約85%、約90%、または約95%減少する。いくつかの実施形態では、発現が少なくとも約85%、約90%、または約95%減少する。いくつかの実施形態では、発現が少なくとも約80%減少する。いくつかの実施形態では、発現が少なくとも約85%減少する。いくつかの実施形態では、発現が少なくとも約90%減少する。いくつかの実施形態では、発現が少なくとも約95%減少する。いくつかの実施形態では、発現が少なくとも約99%減少する。
いくつかの実施形態では、発現が約5%、約10%、約10%、約20%、約25%、約30%、約35%、約40%、約45%、約50%、約55%、約60%、約65%、約70%、約75%、約80%、約85%、約90%、または約95%増加する。いくつかの実施形態では、発現が少なくとも約65%、約70%、約75%、約80%、約85%、約90%、または約95%増加する。いくつかの実施形態では、発現が少なくとも約75%、約80%、約85%、約90%、または約95%増加する。いくつかの実施形態では、発現が少なくとも約80%、約85%、約90%、または約95%増加する。いくつかの実施形態では、発現が少なくとも約85%、約90%、または約95%増加する。いくつかの実施形態では、発現が少なくとも約80%増加する。いくつかの実施形態では、発現が少なくとも約85%増加する。いくつかの実施形態では、発現が少なくとも約90%増加する。いくつかの実施形態では、発現が少なくとも約95%増加する。いくつかの実施形態では、発現が少なくとも約99%増加する。
いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、TILにおけるタンパク質発現を一過的に変化させることができる転写因子(TF)及び/または他の分子でのTILの処理によって誘導される。いくつかの実施形態では、SQZベクターを含まないマイクロ流体プラットフォームが、タンパク質発現を一過的に変化させることができる転写因子(TF)及び/または他の分子の細胞内送達のために用いられる。転写因子を含むタンパク質を、T細胞を含む様々な初代ヒト細胞に送達する能力を実証する方法(Sharei et al.PNAS 2013、ならびにSharei et al.PLOS ONE 2015及びGreisbeck et al.J.Immunology vol.195,2015)が説明されており、例えば、国際特許公開第WO2013/059343A1号、同第WO2017/008063A1号、及び同第WO2017/123663A1号(これらはすべて参照によりそれら全体が本明細書に組み込まれる)を参照されたい。かかる方法は、国際特許公開第WO2013/059343A1号、同第WO2017/008063A1号、及び同第WO2017/123663A1号に記載されており、TIL集団を、転写因子(TF)及び/または一過性タンパク質発現を誘導することができる他の分子に曝露するために本発明で用いることができ、上述のTF、及び/または一過性タンパク質発現を誘導することができる他の分子は、腫瘍抗原の増加した発現、及び/またはTIL集団における腫瘍抗原特異的T細胞の数の増加を提供し、したがって、TIL集団の再プログラミングをもたらし、再プログラミングされていないTIL集団と比較して、再プログラミングされたTIL集団の治療的有効性の増加をもたらす。いくつかの実施形態では、再プログラミングは、本明細書に記載されるように、TIL開始集団またはTIL前集団(すなわち、再プログラミング前の)集団と比較して、エフェクターT細胞及び/またはセントラルメモリーT細胞の亜集団の増加をもたらす。
いくつかの実施形態では、転写因子(TF)には、TCF-1、NOTCH1/2 ICD、及び/またはMYBが含まれるが、これらに限定されない。いくつかの実施形態では、転写因子(TF)は、TCF-1である。いくつかの実施形態では、転写因子(TF)は、NOTCH1/2 ICDである。いくつかの実施形態では、転写因子(TF)は、MYBである。いくつかの実施形態では、転写因子(TF)は、さらなるTIL再プログラミングを誘導するために、市販のKNOCKOUT Serum Replacement(Gibco/ThermoFisher)などの誘導多能性幹細胞培養物(iPSC)とともに投与される。いくつかの実施形態では、転写因子(TF)は、さらなるTIL再プログラミングを誘導するために、iPSCカクテルとともに投与される。いくつかの実施形態では、転写因子(TF)は、iPSCカクテルなしで投与される。いくつかの実施形態では、再プログラミングは、TSCMのパーセンテージの増加をもたらす。いくつかの実施形態では、再プログラミングは、TSCMのパーセンテージの約5%、約10%、約10%、約20%、約25%、約30%、約35%、約40%、約45%、約50%、約55%、約60%、約65%、約70%、約75%、約80%、約85%、約90%、または約95%TSCMの増加をもたらす。
いくつかの実施形態では、上記のようにタンパク質発現を一過的に変化させる方法は、TILの集団を遺伝子修飾する方法と組み合わせられてもよく、1つ以上のタンパク質の産生のための遺伝子の安定した組み込みステップを含む。ある特定の実施形態では、この方法は、TIL集団を遺伝子修飾するステップを含む。ある特定の実施形態では、この方法は、第1のTIL集団、第2のTIL集団、及び/または第3のTIL集団を遺伝子修飾することを含む。ある実施形態では、TIL集団を遺伝子修飾する方法は、レトロウイルス形質導入ステップを含む。ある実施形態では、TIL集団を遺伝子修飾する方法は、レンチウイルス形質導入ステップを含む。レンチウイルス形質導入系は、当該技術分野で知られており、例えば、Levine,et al.,Proc.Nat‘l Acad.Sci.2006,103,17372-77、Zufferey,et al.,Nat.Biotechnol.1997,15,871-75、Dull,et al.,J.Virology 1998,72,8463-71、及び米国特許第6,627,442号(それらの開示は参照により本明細書に組み込まれる)に記載されている。ある実施形態では、TIL集団を遺伝子修飾する方法は、ガンマレトロウイルス形質導入ステップを含む。ガンマレトロウイルス形質導入系は、当該技術分野で知られており、例えば、Cepko and Pear,Cur.Prot.Mol.Biol.1996,9.9.1-9.9.16に記載されており、この開示は参照により本明細書に組み込まれる。ある実施形態では、TIL集団を遺伝子修飾する方法は、トランスポゾン媒介遺伝子導入ステップを含む。トランスポゾン媒介遺伝子導入系は、当該技術分野で知られており、トランスポザーゼが、DNA発現ベクターとしてまたは発現可能なRNAもしくはタンパク質として提供される系を含み、これにより、トランスポザーゼ、例えば、mRNA(例えば、キャップ及びポリA尾部を含むmRNA)として提供されるトランスポザーゼの長期発現がトランスジェニック細胞で起こらないようになる。SB10、SB11、及びSB100xなどのサケ科型Tel様トランスポザーゼ(SBまたはSleeping Beautyトランスポザーゼ)を含む好適なトランスポゾン媒介遺伝子導入系、ならびに増加した酵素活性を有する操作された酵素は、例えば、Hackett,et al.,Mol.Therapy 2010,18,674-83及び米国特許第6,489,458号に記載されており、これらの各々の開示は参照により本明細書に組み込まれる。
いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、高パーセンテージの2’-OH置換(典型的にはフッ素または-OCH)を有する化学的に合成された非対称siRNA二重鎖である自己送達RNA干渉(sdRNA)によって誘導される発現の減少であり、これはテトラエチレングリコール(TEG)リンカーを使用してその3’末端でコレステロールに複合された、20ヌクレオチドアンチセンス(ガイド)鎖及び13~15塩基センス(パッセンジャー)鎖を含む。いくつかの実施形態では、この方法は、TIL集団におけるタンパク質発現の一過性の変化を含み、これは、高パーセンテージの2’-OH置換(典型的にはフッ素または-OCH)を有する化学的に合成された非対称siRNA二重鎖である自己送達RNA干渉(sdRNA)の使用を含み、これはテトラエチレングリコール(TEG)リンカーを使用してその3’末端でコレステロールにコンジュゲートされた、20ヌクレオチドアンチセンス(ガイド)鎖及び13~15塩基センス(パッセンジャー)鎖を含む。sdRNAを使用する方法は、Khvorova and Watts,Nat.Biotechnol.2017,35,238-248、Byrne,et al.,J.Ocul.Pharmacol.Ther.2013,29,855-864、及びLigtenberg,et al.,Mol.Therapy,2018(印刷中)に記載されており、これらの開示は参照により本明細書に組み込まれる。ある実施形態では、TIL集団へのsdRNAの送達は、エレクトロポレーション、SQZ、または他の方法を使用せず、代わりに、TIL集団が培地中1μM/10,000TILの濃度でsdRNAに曝露される1~3日の期間を使用して達成される。ある特定の実施形態では、この方法は、TIL集団を培地中1μM/10,000TILの濃度で1~3日の期間にわたってsdRNAに曝露することを含む、TIL集団へのsdRNAの送達を含む。ある実施形態では、TIL集団へのsdRNAの送達は、TIL集団が培地中10μM/10,000TILの濃度でsdRNAに曝露される1~3日の期間を使用して達成される。ある実施形態では、TIL集団へのsdRNAの送達は、TIL集団が培地中50μM/10,000TILの濃度でsdRNAに曝露される1~3日の期間を使用して達成される。ある実施形態では、TIL集団へのsdRNAの送達は、TIL集団が培地中0.1μM/10,000TIL~50μM/10,000TILの濃度でsdRNAに曝露される1~3日の期間を使用して達成される。ある実施形態では、TIL集団へのsdRNAの送達は、TIL集団が培地中0.1μM/10,000TIL~50μM/10,000TILの濃度でsdRNAに曝露される1~3日の期間を使用して達成され、sdRNAへの曝露は、培地に新鮮なsdRNAを添加することによって2、3、4、または5回行われる。他の好適なプロセスは、例えば、米国特許出願公開第US2011/0039914A1号、同第US2013/0131141A1号、及び同第US2013/0131142A1号、ならびに米国特許第9,080,171号に記載されており、それらの開示は参照により本明細書に組み込まれる。
いくつかの実施形態では、sdRNAは、製造中にTIL集団に挿入される。いくつかの実施形態では、sdRNAは、NOTCH 1/2 ICD、PD-1、CTLA-4 TIM3、LAG3、TIGIT、TGFβ、TGFBR2、cAMPプロテインキナーゼA(PKA)、BAFF BR3、CISH、及び/またはCBLBに干渉するRNAをコードする。いくつかの実施形態では、発現の減少は、例えば、フローサイトメトリー及び/またはqPCRによって評価される、遺伝子サイレンシングのパーセンテージに基づいて決定される。いくつかの実施形態では、発現が約5%、約10%、約10%、約20%、約25%、約30%、約35%、約40%、約45%、約50%、約55%、約60%、約65%、約70%、約75%、約80%、約85%、約90%、または約95%減少する。いくつかの実施形態では、発現が少なくとも約65%、約70%、約75%、約80%、約85%、約90%、または約95%減少する。いくつかの実施形態では、発現が少なくとも約75%、約80%、約85%、約90%、または約95%減少する。いくつかの実施形態では、発現が少なくとも約80%、約85%、約90%、または約95%減少する。いくつかの実施形態では、発現が少なくとも約85%、約90%、または約95%減少する。いくつかの実施形態では、発現が少なくとも約80%減少する。いくつかの実施形態では、発現が少なくとも約85%減少する。いくつかの実施形態では、発現が少なくとも約90%減少する。いくつかの実施形態では、発現が少なくとも約95%減少する。いくつかの実施形態では、発現が少なくとも約99%減少する。
siRNAの化学修飾に基づく自己送達可能なRNAi技術を本発明の方法とともに用いて、本明細書に記載されるように、sdRNAをTILに首尾よく送達することができる。非対称siRNA構造の骨格修飾と疎水性リガンドとの組み合わせ(例えば、Ligtenberg,et al.,Mol.Therapy,2018及びUS20160304873を参照)により、sdRNAは、sdRNAのヌクレアーゼ安定性を利用する培養培地への単純な添加によって、追加の製剤及び方法なしで、培養された哺乳動物細胞に浸透することができる。この安定性により、単に培地中のsdRNAの活性濃度を維持することによって、標的遺伝子活性の一定レベルのRNAiを介した減少を支援することができる。理論に拘束されることはないが、sdRNAの骨格安定化は、非分裂細胞で数ヶ月間続く可能性のある遺伝子発現効果の延長された低減を提供する。
いくつかの実施形態では、TILの95%を超えるトランスフェクション効率及び様々な特定のsdRNAによる標的の発現の減少が起こる。いくつかの実施形態では、いくつかの未修飾リボース残基を含むsdRNAは、RNAi効果の効力及び/または寿命を増加させるために、完全に修飾された配列で置き換えられた。いくつかの実施形態では、発現効果の減少は、12時間、24時間、36時間、48時間、5日間、6日間、7日間、または8日間以上維持される。いくつかの実施形態では、発現効果の減少は、TILのsdRNA処理後10日以上で減少する。いくつかの実施形態では、標的発現の発現の70%を超える減少が維持される。いくつかの実施形態では、標的発現の発現の70%を超える減少が維持されるTIL。いくつかの実施形態では、PD-1/PD-L1経路における発現の減少により、TILがより強力なインビボ効果を示すことが可能になり、これは、いくつかの実施形態では、PD-1/PD-L1経路の抑制効果の回避に起因する。いくつかの実施形態では、sdRNAによるPD-1の発現の減少は、TIL増殖の増加をもたらす。
短干渉RNAまたはサイレンシングRNAとして知られることもある、低分子干渉RNA(siRNA)は、一般に19~25塩基対長の二本鎖RNA分子である。siRNAは、RNA干渉(RNAi)において使用され、相補的なヌクレオチド配列を有する特定の遺伝子の発現に干渉する。
二本鎖DNA(dsRNA)は、一般に、RNAの相補鎖の対、一般にセンス(パッセンジャー)鎖及びアンチセンス(ガイド)鎖を含む任意の分子を定義するために使用することができ、一本鎖オーバーハング領域を含み得る。siRNAとは対照的に、dsRNAという用語は、一般に、ダイサーを含む切断酵素系の作用によりより大きいdsRNA分子から放出されるsiRNA分子の配列を含む前駆体分子を指す。
sdRNA(自己送達可能なRNA)は、共有結合的に修飾された新たなクラスのRNAi化合物であり、細胞に侵入するために送達媒体を必要とせず、従来のsiRNAと比較して改善された薬理学的性質を有する。「自己送達可能なRNA」または「sdRNA」は、疎水的に修飾されたRNA干渉-アンチセンスハイブリッドであり、初代細胞においてインビトロで、及び局所投与時にインビボで非常に有効であることが実証されている。毒性のない強力な取り込み及び/またはサイレンシングが実証されている。sdRNAは、一般に、最小限の二本鎖領域を有する非対称の化学修飾された核酸分子である。sdRNA分子は、典型的に一本鎖領域及び二本鎖領域を含み、分子の一本鎖領域及び二本鎖領域の両方に様々な化学修飾を含み得る。加えて、sdRNA分子は、本明細書に記載されているように、従来の高度なステロール型分子などの疎水性コンジュゲートに結合することができる。sdRNA及びかかるsdRNAを作製するための関連方法は、例えば、US20160304873、WO2010033246、WO2017070151、WO2009102427、WO2011119887、WO2010033247A2、WO2009045457、WO2011119852にも広く記載されており、これらはすべて、参照によりそれらの全体がすべての目的のために本明細書に組み込まれる。sdRNA構造、化学的性質、標的位置、配列優先性などを最適化するために、独自のアルゴリズムが開発され、sdRNAの効力予測に利用されている(例えば、US20160304873を参照のこと)。これらの分析に基づいて、機能的なsdRNA配列は、一般に、1μMの濃度で70%を超える発現の減少を有すると定義されており、確率は40%を超える。
いくつかの実施形態では、本発明で使用されるsdRNA配列は、標的遺伝子の発現の70%の減少を示す。いくつかの実施形態では、本発明で使用されるsdRNA配列は、標的遺伝子の発現の75%の減少を示す。いくつかの実施形態では、本発明で使用されるsdRNA配列は、標的遺伝子の発現の80%の減少を示す。いくつかの実施形態では、本発明で使用されるsdRNA配列は、標的遺伝子の発現の85%の減少を示す。いくつかの実施形態では、本発明で使用されるsdRNA配列は、標的遺伝子の発現の90%の減少を示す。いくつかの実施形態では、本発明で使用されるsdRNA配列は、標的遺伝子の発現の95%の減少を示す。いくつかの実施形態では、本発明で使用されるsdRNA配列は、標的遺伝子の発現の99%の減少を示す。いくつかの実施形態では、本発明で使用されるsdRNA配列は、約0.25μM~約4μMの濃度で送達された場合、標的遺伝子の発現の減少を示す。いくつかの実施形態では、本発明で使用されるsdRNA配列は、約0.25μMの濃度で送達された場合、標的遺伝子の発現の減少を示す。いくつかの実施形態では、本発明で使用されるsdRNA配列は、約0.5μMの濃度で送達された場合、標的遺伝子の発現の減少を示す。いくつかの実施形態では、本発明で使用されるsdRNA配列は、約0.75μMの濃度で送達された場合、標的遺伝子の発現の減少を示す。いくつかの実施形態では、本発明で使用されるsdRNA配列は、約1.0μMの濃度で送達された場合、標的遺伝子の発現の減少を示す。いくつかの実施形態では、本発明で使用されるsdRNA配列は、約1.25μMの濃度で送達された場合、標的遺伝子の発現の減少を示す。いくつかの実施形態では、本発明で使用されるsdRNA配列は、約1.5μMの濃度で送達された場合、標的遺伝子の発現の減少を示す。いくつかの実施形態では、本発明で使用されるsdRNA配列は、約1.75μMの濃度で送達された場合、標的遺伝子の発現の減少を示す。いくつかの実施形態では、本発明で使用されるsdRNA配列は、約2.0μMの濃度で送達された場合、標的遺伝子の発現の減少を示す。いくつかの実施形態では、本発明で使用されるsdRNA配列は、約2.25μMの濃度で送達された場合、標的遺伝子の発現の減少を示す。いくつかの実施形態では、本発明で使用されるsdRNA配列は、約2.5μMの濃度で送達された場合、標的遺伝子の発現の減少を示す。いくつかの実施形態では、本発明で使用されるsdRNA配列は、約2.75μMの濃度で送達された場合、標的遺伝子の発現の減少を示す。いくつかの実施形態では、本発明で使用されるsdRNA配列は、約3.0μMの濃度で送達された場合、標的遺伝子の発現の減少を示す。いくつかの実施形態では、本発明で使用されるsdRNA配列は、約3.25μMの濃度で送達された場合、標的遺伝子の発現の減少を示す。いくつかの実施形態では、本発明で使用されるsdRNA配列は、約3.5μMの濃度で送達された場合、標的遺伝子の発現の減少を示す。いくつかの実施形態では、本発明で使用されるsdRNA配列は、約3.75μMの濃度で送達された場合、標的遺伝子の発現の減少を示す。いくつかの実施形態では、本発明で使用されるsdRNA配列は、約4.0μMの濃度で送達された場合、標的遺伝子の発現の減少を示す。
いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチド剤は、治療剤の安定性及び/または効力を増加させ、かつ治療される細胞または組織へのオリゴヌクレオチドの効率的な送達をもたらすための1つ以上の修飾を含む。かかる修飾には、2’-O-メチル修飾、2’-O-フルロ修飾、ジホスホロチオエート修飾、2’F修飾ヌクレオチド、2’-O-メチル修飾、及び/または2’デオキシヌクレオチドが含まれ得る。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、例えば、ステロール、コレステロール、ビタミンD、ナフチル、イソブチル、ベンジル、インドール、トリプトファン、及び/またはフェニルを含む1つ以上の疎水性修飾を含むように修飾される。追加の特定の実施形態では、化学修飾されたヌクレオチドは、ホスホロチオエート、2’-O-メチル、2’デオキシ、疎水性修飾、及びホスホロチオエートの組み合わせである。いくつかの実施形態では、糖が修飾され得、修飾された糖には、D-リボース、2’-O-アルキル(2’-O-メチル及び2’-0-エチルを含む)、すなわち、2’-アルコキシ、2’-アミノ、2’-S-アルキル、2’-ハロ(2’-フルオロを含む)、T-メトキシエトキシ、2’-アリルオキシ(-OCHCH=CH)、2’-プロパルギル、2’-プロピル、エチニル、エテニル、プロペニル、及びシアノなどが含まれ得るが、これらに限定されない。一実施形態では、糖部分は、ヘキソースであり得、Augustyns,et al.,Nucl.Acids.Res.1992,18,4711に記載されているように、オリゴヌクレオチドに組み込まれ得る。
いくつかの実施形態では、本発明の二本鎖オリゴヌクレオチドは、その全長にわたって二本鎖であり、すなわち、分子のいずれかの末端にも一本鎖配列が突出しておらず、すなわち、平滑末端である。いくつかの実施形態では、個々の核酸分子は、異なる長さであり得る。言い換えれば、本発明の二本鎖オリゴヌクレオチドは、その全長にわたって二本鎖ではない。例えば、2つの別個の核酸分子が使用される場合、アンチセンス配列を含むそれらの分子の一方、例えば、第1の分子は、それにハイブリダイズする(分子の一部分を一本鎖のままにする)第2の分子よりも長い可能性がある。いくつかの実施形態では、単一の核酸分子が使用される場合、いずれかの末端の分子の一部分は、一本鎖のままであり得る。
いくつかの実施形態では、本発明の二本鎖オリゴヌクレオチドは、ミスマッチ及び/またはループもしくはバルジを含むが、オリゴヌクレオチドの長さの少なくとも約70%にわたって二本鎖である。いくつかの実施形態では、本発明の二本鎖オリゴヌクレオチドは、オリゴヌクレオチドの長さの少なくとも約80%にわたって二本鎖である。別の実施形態では、本発明の二本鎖オリゴヌクレオチドは、オリゴヌクレオチドの長さの少なくとも約90%~95%にわたって二本鎖である。いくつかの実施形態では、本発明の二本鎖オリゴヌクレオチドは、オリゴヌクレオチドの長さの少なくとも約96%~98%にわたって二本鎖である。いくつかの実施形態では、本発明の二本鎖オリゴヌクレオチドは、少なくともまたは最大1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、または15のミスマッチを含む。
いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、例えば、3’または5’結合を修飾することによって、ヌクレアーゼから実質的に保護され得る(例えば、米国特許第5,849,902号及びWO98/13526)。例えば、オリゴヌクレオチドは、「ブロッキング基」を含めることによって耐性にすることができる。本明細書で使用される場合、「ブロッキング基」という用語は、合成のための保護基またはカップリング基のいずれかとして(例えば、FITC、プロピル(CH-CH-CH)、グリコール(-O-CH-CH-O-)ホスフェート(PO 2’’)、リン酸水素、もしくはホスホロアミダイト)、オリゴヌクレオチドまたはヌクレオモノマーに結合され得る置換基(例えば、OH基以外)を指す。「ブロッキング基」は、修飾ヌクレオチド及び非ヌクレオチドエキソヌクレアーゼ耐性構造を含む、オリゴヌクレオチドの5’及び3’末端を保護する「末端ブロッキング基」または「エキソヌクレアーゼブロッキング基」も含み得る。
いくつかの実施形態では、sdRNA内の隣接するポリヌクレオチドの少なくとも一部分は、代替の結合、例えば、ホスホロチオエート結合によって結合されている。
いくつかの実施形態では、化学修飾は、細胞取り込みの少なくとも1.5、2、3、4、5、6、7、8、9、10、15、20、25、30、35、40、45、50、55、60、65、70、75、80、85、90、95、100、105、110、115、120、125、130、135、140、145、150、155、160、165、170、175、180、185、190、195、200、225、250、275、300、325、350、375、400、425、450、475、500増強をもたらし得る。いくつかの実施形態では、C残基またはU残基の少なくとも一方が疎水性修飾を含む。いくつかの実施形態では、複数のC及びUが疎水性修飾を含む。いくつかの実施形態では、C及びUの少なくとも10%、15%、20%、30%、40%、50%、55%、60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、または少なくとも95%が疎水性修飾を含み得る。いくつかの実施形態では、C及びUのすべてが疎水性修飾を含む。
いくつかの実施形態では、sdRNAまたはsd-rxRNAは、プロトン化可能なアミンの組み込みを介したsd-rxRNA分子のエンドソーム放出の増強を示す。いくつかの実施形態では、プロトン化可能なアミンは、センス鎖(RISC負荷後に廃棄される分子の一部分)に組み込まれる。いくつかの実施形態では、本発明のsdRNA化合物は、二重鎖領域(10~15塩基長の効率的なRISC侵入に必要)及び4~12ヌクレオチド長の一本鎖領域を13ヌクレオチド二重鎖とともに含む非対称化合物を含む。いくつかの実施形態では、6ヌクレオチドの一本鎖領域が用いられる。いくつかの実施形態では、sdRNAの一本鎖領域は、2~12個のホスホロチオエートインテムクレオチド結合(ホスホロチオエート修飾と称される)を含む。いくつかの実施形態では、6~8個のホスホロチオエートインテムクレオチド結合が用いられる。いくつかの実施形態では、本発明のsdRNA化合物は、安定性を提供し、かつRISC侵入と互換性がある固有の化学修飾パターンを含む。
ガイド鎖は、例えば、RISC侵入に干渉することなく安定性を確証する任意の化学修飾によって修飾することもできる。いくつかの実施形態では、ガイド鎖における化学修飾パターンは、2’Fが修飾され、かつ5’末端がリン酸化されたC及びUヌクレオチドの大部分を含む。
いくつかの実施形態では、sdRNAまたはsd-rxRNAのヌクレオチドの少なくとも30%が修飾されている。いくつかの実施形態では、sdRNAまたはsd-rxRNAのヌクレオチドの少なくとも30%、31%、32%、33%、34%、35%、36%、37%、38%、39%、40%、41%、42%、43%、44%、45%、46%、47%、48%、49%、50%、51%、52%、53%、54%、55%、56%、57%、58%、59%、60%、61%、62%、63%、64%、65%、66%、67%、68%、69%、70%、71%、72%、73%、74%、75%、76%、77%、78%、79%、80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、または99%が修飾されている。いくつかの実施形態では、sdRNAまたはsd-rxRNAのヌクレオチドの100%が修飾されている。
いくつかの実施形態では、sdRNA分子は、最小の二本鎖領域を有する。いくつかの実施形態では、二本鎖である分子の領域は、8~15ヌクレオチド長の範囲である。いくつかの実施形態では、二本鎖である分子の領域は、8、9、10、11、12、13、14、または15ヌクレオチド長である。いくつかの実施形態では、二本鎖領域は、13ヌクレオチド長である。ガイド鎖とパッセンジャー鎖との間に100%の相補性が存在する場合もあれば、ガイド鎖とパッセンジャー鎖との間に1つ以上の不一致が存在する場合もある。いくつかの実施形態では、二本鎖分子の一端で、分子は、平滑末端であるか、または1ヌクレオチドのオーバーハングを有するかのいずれかである。分子の一本鎖領域は、いくつかの実施形態では、4~12ヌクレオチド長である。いくつかの実施形態では、一本鎖領域は、4、5、6、7、8、9、10、11または12ヌクレオチド長であり得る。いくつかの実施形態では、一本鎖領域は、4ヌクレオチド長未満または12ヌクレオチド長超であることもできる。ある特定の実施形態では、一本鎖領域は、6または7ヌクレオチド長である。
いくつかの実施形態では、sdRNA分子は、増加した安定性を有する。いくつかの事例では、化学修飾されたsdRNAまたはsd-rxRNA分子は、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24時間以上、または24時間超(任意の中間値を含む)の培地中での半減期を有する。いくつかの実施形態では、sd-rxRNAは、12時間以上の培地中での半減期を有する。
いくつかの実施形態では、sdRNAは、効力の増加及び/または毒性の低減のために最適化されている。いくつかの実施形態では、ガイド鎖及び/またはパッセンジャー鎖のヌクレオチド長、及び/またはガイド鎖及び/またはパッセンジャー鎖におけるホスホロチオエート修飾の数が、いくつかの態様では、RNA分子の効力に影響を与え得る一方で、2’-フルオロ(2’F)修飾の2’-0-メチル(2’OMe)修飾での置き換えは、いくつかの態様では、分子の毒性に影響を与え得る。いくつかの実施形態では、分子の2’F含有量の減少は、分子の毒性を低減すると予測される。いくつかの実施形態では、RNA分子におけるホスホロチオエート修飾の数は、細胞への分子の取り込み、例えば、細胞への分子の受動的取り込みの効率に影響を及ぼし得る。いくつかの実施形態では、sdRNAは、2’F修飾を有しないが、それにもかかわらず、細胞取り込み及び組織浸透における同等の有効性を特徴とする。
いくつかの実施形態では、ガイド鎖は、およそ18~19ヌクレオチド長であり、およそ2~14個のリン酸修飾を有する。例えば、ガイド鎖は、リン酸修飾された2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14個、または14個超のヌクレオチドを含み得る。ガイド鎖は、RISCの侵入に干渉することなく増加した安定性を付与する1つ以上の修飾を含み得る。ホスホロチオエート修飾ヌクレオチドなどのリン酸修飾ヌクレオチドは、3’末端にあるか、5’末端にあるか、またはガイド鎖全体に広がっている可能性がある。いくつかの実施形態では、ガイド鎖の3’末端10ヌクレオチドは、1、2、3、4、5、6、7、8、9、または10個のホスホロチオエート修飾ヌクレオチドを含む。ガイド鎖は、分子全体に位置し得る2’F及び/または2’OMe修飾も含み得る。いくつかの実施形態では、ガイド鎖の1位のヌクレオチド(ガイド鎖の最も5’側のヌクレオチド)は、2’OMe修飾及び/またはリン酸化されている。ガイド鎖内のC及びUヌクレオチドは、2’F修飾されていてもよい。例えば、19ntガイド鎖の2~10位(または異なる長さのガイド鎖における対応する位置)のC及びUヌクレオチドは、2’F修飾されていてもよい。ガイド鎖内のC及びUヌクレオチドは、2’OMe修飾されている場合もある。例えば、19ntガイド鎖の11~18位(または異なる長さのガイド鎖における対応する位置)のC及びUヌクレオチドは、2’OMe修飾されていてもよい。いくつかの実施形態では、ガイド鎖の最も3’側の末端のヌクレオチドは修飾されていない。ある特定の実施形態では、ガイド鎖内のC及びUの大部分は2’F修飾されており、ガイド鎖の5’末端はリン酸化されている。他の実施形態では、1位及び11~18位のCまたはUは2’OMe修飾されており、ガイド鎖の5’末端はリン酸化されている。他の実施形態では、位置1及び位置11~18のCsまたはUsは2’OMe修飾されており、ガイド鎖の5’末端はリン酸化されており、2~10位のCまたはUは2’F修飾されている。
自己送達可能なRNAi技術は、追加の製剤または技法を必要とすることなくRNAi剤で細胞を直接トランスフェクトする方法を提供する。トランスフェクションが困難な細胞株をトランスフェクトする能力、高いインビボ活性、及び使用の単純さは、従来のsiRNAベースの技法に優る重大な機能的利点を提示する組成物及び方法の特徴であり、したがって、sdRNA法は、本発明のTILにおける標的遺伝子の発現を減少させる方法に関連するいくつかの実施形態で用いられる。sdRNAi法により、化学合成された化合物をエクスビボ及びインビボの両方で広範囲の一次細胞及び組織に直接送達することが可能になる。本明細書における本発明のいくつかの実施形態に記載のsdRNAは、Advirna LLC(Worcester,MA,USA)から市販されている。
sdRNAは、疎水的に修飾されたsiRNA-アンチセンスオリゴヌクレオチドハイブリッド構造として形成され、例えば、Byrne et al.,December 2013,J.Ocular Pharmacology and Therapeutics,29(10):855-864(参照によりその全体が本明細書に組み込まれる)に開示されている。
いくつかの実施形態では、sdRNAオリゴヌクレオチドは、滅菌エレクトロポレーションを使用して本明細書に記載のTILに送達され得る。ある特定の実施形態では、この方法は、sdRNAオリゴヌクレオチドを送達するためにTIL集団の滅菌エレクトロポレーションを含む。
いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、膜貫通送達システムと組み合わせて細胞に送達され得る。いくつかの実施形態では、この膜貫通送達システムは、脂質、ウイルスベクターなどを含む。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチド剤は、自己送達RNAi剤であり、いかなる送達剤も必要としない。ある特定の実施形態では、この方法は、sdRNAオリゴヌクレオチドをTIL集団に送達するために膜貫通送達システムの使用を含む。
オリゴヌクレオチド及びオリゴヌクレオチド組成物は、本明細書に記載のTILと接触し(例えば、接触させられ、本明細書では投与または送達されるとも称される)、TILによって取り込まれる(TILによる受動的取り込みを含む)。sdRNAは、第1の拡張中(例えば、ステップB)、第1の拡張後(例えば、ステップC中)、第2の拡張前または拡張中(例えば、ステップDの前またはステップD中)、ステップEにおける採取前、ステップFにおける採取中または採取後、ステップFにおける最終製剤化及び/または注入バッグへの移行前または移行中、ならびにステップFにおける任意選択の凍結保存ステップ前に、本明細書に記載のTILに添加され得る。さらに、sdRNAは、ステップFにおける任意の凍結保存ステップから解凍した後に添加され得る。ある実施形態では、PD-1、LAG3、TIM3、CISH、及びCBLBを含む、本明細書に記載の1つ以上のsdRNA標的遺伝子が、100nM~20mM、200nM~10mM、500nm~1mM、1μM~100μM、及び1μM~100μMからなる群から選択される濃度でTIL及び他の薬剤を含む細胞培養培地に添加され得る。ある実施形態では、PD-1、LAG3、TIM3、CISH、及びCBLBを含む、本明細書に記載の1つ以上のsdRNA標的遺伝子は、0.1μM sdRNA/10,000TIL/100μL培地、0.5μM sdRNA/10,000TIL/100μL培地、0.75μM sdRNA/10,000TIL/100μL培地、1μM sdRNA/10,000TIL/100μL培地、1.25μM sdRNA/10,000TIL/100μL培地、1.5μM sdRNA/10,000TIL/100μL培地、2μM sdRNA/10,000TIL/100μL培地、5μM sdRNA/10,000TIL/100μL培地、または10μM sdRNA/10,000TIL/100μL培地からなる群から選択される量でTIL及び他の薬剤を含む細胞培養培地に添加され得る。ある実施形態では、PD-1、LAG3、TIM3、CISH、及びCBLBを含む、本明細書に記載の1つ以上のsdRNA標的遺伝子は、REP前段階またはREP段階中に1日2回、1日1回、2日毎、3日毎、4日毎、5日毎、6日毎、または7日毎にTIL培養物に添加され得る。
sdRNAを含む本発明のオリゴヌクレオチド組成物は、例えば、細胞培養培地にsdRNAを高濃度で溶解し、かつ受動的取り込みが起こるのに十分な時間を許容することによって、拡張プロセス中に本明細書に記載のTILと接触することができる。ある特定の実施形態では、本発明の方法は、TIL集団を、本明細書に記載のオリゴヌクレオチド組成物と接触させることを含む。ある特定の実施形態では、この方法は、オリゴヌクレオチド、例えば、sdRNAを細胞培養培地に溶解することと、細胞培養培地をTIL集団と接触させることとを含む。TILは、本明細書に記載の第1の集団、第2の集団、及び/または第3の集団であり得る。
いくつかの実施形態では、細胞へのオリゴヌクレオチドの送達は、リン酸カルシウム、DMSO、グリセロールもしくはデキストラン、エレクトロポレーションを含む好適な当該技術分野で認められている方法によって、またはトランスフェクションによって、例えば、当該技術分野で知られている方法を使用してカチオン性、アニオン性、もしくは中性脂質組成物またはリポソームを使用して増強され得る(例えば、WO90/14074、WO91/16024、WO91/17424、米国特許第4,897,355号、Bergan et a 1993.Nucleic Acids Research.21:3567を参照)。
いくつかの実施形態では、2つ以上のsdRNAが、標的遺伝子の発現を減少させるために使用される。いくつかの実施形態では、PD-1、TIM3、CBLB、LAG3、及び/またはCISHを標的とするsdRNAのうちの1つ以上が一緒に使用される。いくつかの実施形態では、PD-1 sdRNAは、2つ以上の遺伝子標的の発現を減少させるために、TIM3、CBLB、LAG3、及び/またはCISHのうちの1つ以上とともに使用される。いくつかの実施形態では、LAG3 sdRNAは、両方の標的の遺伝子発現を減少させるために、CISHを標的とするsdRNAと組み合わせて使用される。いくつかの実施形態では、本明細書におけるPD-1、TIM3、CBLB、LAG3、及び/またはCISHのうちの1つ以上を標的とするsdRNAは、Advirna LLC(Worcester,MA,USA)から市販されている。
いくつかの実施形態では、sdRNAは、PD-1、LAG3、TIM3、CTLA-4、TIGIT、CISH、TGFβR2、PKA、CBLB、BAFF(BR3)、及びそれらの組み合わせからなる群から選択される遺伝子を標的とする。いくつかの実施形態では、sdRNAは、PD-1、LAG3、TIM3、CTLA-4、TIGIT、CISH、TGFβR2、PKA、CBLB、BAFF(BR3)、及びそれらの組み合わせからなる群から選択される遺伝子を標的とする。いくつかの実施形態では、1つのsdRNAは、PD-1を標的とし、別のsdRNAは、LAG3、TIM3、CTLA-4、TIGIT、CISH、TGFβR2、PKA、CBLB、BAFF(BR3)、及びそれらの組み合わせからなる群から選択される遺伝子を標的とする。いくつかの実施形態では、sdRNAは、PD-1、LAG3、CISH、CBLB、TIM3、及びそれらの組み合わせから選択される遺伝子を標的とする。いくつかの実施形態では、sdRNAは、PD-1、ならびにLAG3、CISH、CBLB、TIM3のうちの1つ、及びそれらの組み合わせから選択される遺伝子を標的とする。いくつかの実施形態では、1つのsdRNAがPD-1を標的とし、1つのsdRNAがLAG3を標的とする。いくつかの実施形態では、1つのsdRNAがPD-1を標的とし、1つのsdRNAがCISHを標的とする。いくつかの実施形態では、1つのsdRNAがPD-1を標的とし、1つのsdRNAがCBLBを標的とする。いくつかの実施形態では、1つのsdRNAがLAG3を標的とし、1つのsdRNAがCISHを標的とする。いくつかの実施形態では、1つのsdRNAがLAG3を標的とし、1つのsdRNAがCBLBを標的とする。いくつかの実施形態では、1つのsdRNAがCISHを標的とし、1つのsdRNAがCBLBを標的とする。いくつかの実施形態では、1つのsdRNAがTIM3を標的とし、1つのsdRNAがPD-1を標的とする。いくつかの実施形態では、1つのsdRNAがTIM3を標的とし、1つのsdRNAがLAG3を標的とする。いくつかの実施形態では、1つのsdRNAがTIM3を標的とし、1つのsdRNAがCISHを標的とする。いくつかの実施形態では、1つのsdRNAがTIM3を標的とし、1つのsdRNAがCBLBを標的とする。
上で考察されたように、本発明の実施形態は、それらの治療効果を増強するために遺伝子編集を介して遺伝子修飾されたものを提供する。本発明の実施形態は、1つ以上のタンパク質の発現の促進及び1つ以上のタンパク質の発現の阻害の両方、ならびにそれらの組み合わせのために、TIL集団へのヌクレオチド挿入(RNAまたはDNA)による遺伝子編集を包含する。本発明の実施形態は、TILを治療用集団に拡張するための方法も提供し、方法は、TILを遺伝子編集することを含む。TIL集団を遺伝子修飾するために使用され得るいくつかの遺伝子編集技術が存在し、それらは本発明による使用に好適である。
いくつかの実施形態では、本方法は、1つ以上のタンパク質の産生のための遺伝子の安定な組み込みのステップを含む、TIL集団を遺伝子修飾する方法を含む。ある実施形態では、TIL集団を遺伝子修飾する方法は、レトロウイルス形質導入ステップを含む。ある実施形態では、TIL集団を遺伝子修飾する方法は、レンチウイルス形質導入ステップを含む。レンチウイルス形質導入系は、当該技術分野で知られており、例えば、Levine,et al.,Proc.Nat‘l Acad.Sci.2006,103,17372-77、Zufferey,et al.,Nat.Biotechnol.1997,15,871-75、Dull,et al.,J.Virology 1998,72,8463-71、及び米国特許第6,627,442号(それらの開示は参照により本明細書に組み込まれる)に記載されている。ある実施形態では、TIL集団を遺伝子修飾する方法は、ガンマレトロウイルス形質導入ステップを含む。ガンマレトロウイルス形質導入系は、当該技術分野で知られており、例えば、Cepko and Pear,Cur.Prot.Mol.Biol.1996,9.9.1-9.9.16に記載されており、この開示は参照により本明細書に組み込まれる。ある実施形態では、TIL集団を遺伝子修飾する方法は、トランスポゾン媒介遺伝子導入ステップを含む。トランスポゾン媒介遺伝子導入系は、当該技術分野で知られており、トランスポザーゼが、DNA発現ベクターとしてまたは発現可能なRNAもしくはタンパク質として提供される系を含み、これにより、トランスポザーゼ、例えば、mRNA(例えば、キャップ及びポリA尾部を含むmRNA)として提供されるトランスポザーゼの長期発現がトランスジェニック細胞で起こらないようになる。SB10、SB11、及びSB100xなどのサケ科型Tel様トランスポザーゼ(SBまたはSleeping Beautyトランスポザーゼ)を含む好適なトランスポゾン媒介遺伝子導入系、ならびに増加した酵素活性を有する操作された酵素は、例えば、Hackett,et al.,Mol.Therapy 2010,18,674-83及び米国特許第6,489,458号に記載されており、これらの各々の開示は参照により本明細書に組み込まれる。
ある実施形態では、この方法は、TIL集団、例えば、本明細書に記載の第1の集団、第2の集団、及び/または第3の集団を遺伝子改変する方法を含む。ある実施形態では、TIL集団を遺伝子改変する方法は、1つ以上のタンパク質の産生または阻害(例えば、サイレンシング)のために遺伝子の安定した組み込みステップを含む。ある実施形態では、TIL集団を遺伝子改変する方法は、エレクトロポレーションステップを含む。エレクトロポレーション法は、当該技術分野で知られており、例えば、Tsong,Biophys.J.1991,60,297-306及び米国特許出願公開第2014/0227237A1号に記載されており、これらの各々の開示は参照により本明細書に組み込まれる。米国特許第5,019,034号、同第5,128,257号、同第5,137,817号、同第5,173,158号、同第5,232,856号、同第5,273,525号、同第5,304,120号、同第5,318,514号、同第6,010,613号、及び同第6,078,490号(それらの開示は参照により本明細書に組み込まれる)に記載されるものなどの当該技術分野で知られている他のエレクトロポレーション法が使用され得る。ある実施形態では、エレクトロポレーション法は、滅菌エレクトロポレーション法である。ある実施形態では、エレクトロポレーション法は、パルスエレクトロポレーション法である。ある実施形態では、エレクトロポレーション法は、TILをパルス電場で処理して、TILの定義及び制御された永続的または一時的変更を変える、操作する、または引き起こすステップを含むパルスエレクトロポレーション法であり、100V/cm以上の電界強度を有する、少なくとも3つの単一オペレーターが制御する、独立してプログラムされたDC電気パルス列をTILに適用するステップを含み、少なくとも3つのDC電気パルス列は、以下の特徴のうちの1つ、2つ、または3つを有する:(1)少なくとも3つのパルスのうちの少なくとも2つのパルス振幅が互いに異なる、(2)少なくとも3つのパルスのうちの少なくとも2つのパルス幅が互いに異なる、及び(3)少なくとも3つのパルスのうちの2つの第1のセットの第1のパルス間隔が、少なくとも3つのパルスのうちの2つの第2のセットの第2のパルス間隔とは異なる。ある実施形態では、エレクトロポレーション法は、TILをパルス電場で処理して、TILの定義及び制御された永続的または一時的変更を変える、操作する、または引き起こすステップを含むパルスエレクトロポレーション法であり、100V/cm以上の電界強度を有する、少なくとも3つの単一オペレーターが制御する、独立してプログラムされたDC電気パルス列をTILに適用するステップを含み、少なくとも3つのパルスのうちの少なくとも2つのパルス振幅が互いに異なる。ある実施形態では、エレクトロポレーション法は、TILをパルス電場で処理して、TILの定義及び制御された永続的または一時的変更を変える、操作する、または引き起こすステップを含むパルスエレクトロポレーション法であり、100V/cm以上の電界強度を有する、少なくとも3つの単一オペレーターが制御する、独立してプログラムされたDC電気パルス列をTILに適用するステップを含み、少なくとも3つのパルスのうちの少なくとも2つのパルス幅が互いに異なる。ある実施形態では、エレクトロポレーション法は、TILをパルス電場で処理して、TILの定義及び制御された永続的または一時的変更を変える、操作する、または引き起こすステップを含むパルスエレクトロポレーション法であり、100V/cm以上の電界強度を有する、少なくとも3つの単一オペレーターが制御する、独立してプログラムされたDC電気パルス列をTILに適用するステップを含み、少なくとも3つのパルスのうちの少なくとも2つの第1のセットの第1のパルス間隔が、少なくとも3つのパルスのうちの2つの第2のセットの第2のパルス間隔とは異なる。ある実施形態では、エレクトロポレーション法は、TILをパルス電場で処理して、TILにおける細孔形成を誘導するステップを含むパルスエレクトロポレーション法であり、100V/cm以上の電界強度を有する、少なくとも3つのDC電気パルス列をTILに適用するステップを含み、少なくとも3つのDC電気パルス列は、以下の特徴のうちの1つ、2つ、または3つを有する:(1)少なくとも3つのパルスのうちの少なくとも2つのパルス振幅が互いに異なる、(2)少なくとも3つのパルスのうちの少なくとも2つのパルス幅が互いに異なる、及び(3)少なくとも3つのパルスのうちの2つの第1のセットの第1のパルス間隔が、少なくとも3つのパルスのうちの2つの第2のセットの第2のパルス間隔とは異なり、これにより、誘導された細孔が比較的長期間にわたって持続され、TILの生存率が維持される。ある実施形態では、TIL集団を遺伝子改変する方法は、リン酸カルシウムトランスフェクションステップを含む。リン酸カルシウムトランスフェクション法(リン酸カルシウムDNA沈殿、細胞表面コーティング、及びエンドサイトーシス)は、当該技術分野で知られており、Graham and van der Eb,Virology 1973,52,456-467、Wigler,et al.,Proc.Natl.Acad.Sci.1979,76,1373-1376、及びChen and Okayarea,Mol.Cell.Biol.1987,7,2745-2752、ならびに米国特許第5,593,875号に記載されており、これらの各々の開示は参照により本明細書に組み込まれる。ある実施形態では、TIL集団を遺伝子改変する方法は、リポソームトランスフェクションステップを含む。リポソームトランスフェクション法、例えば、カチオン性脂質N-[1-(2,3-ジオレイルオキシ)プロピル]-n,n,n-トリメチルアンモニウムクロリド(DOTMA)及びジオレオイルホスホチジルエタノールアミン(DOPE)の1:1(w/w)リポソーム製剤を用いる方法は、当該技術分野において既知であり、Rose,et al.,Biotechniques 1991,10,520-525及びFelgner,et al.,Proc.Natl.Acad.Sci.USA,1987,84,7413-7417、ならびに米国特許第5,279,833号、同第5,908,635号、同第6,056,938号、同第6,110,490号、同第6,534,484号、及び同第7,687,070号に記載されており、これらの各々の開示は参照により本明細書に組み込まれる。ある実施形態では、TIL集団を遺伝子改変する方法は、米国特許第5,766,902号、同第6,025,337号、同第6,410,517号、同第6,475,994号、及び同第7,189,705号に記載の方法を使用するトランスフェクションステップを含み、これらの各々の開示は参照により本明細書に組み込まれる。TILは、本明細書に記載のTILの第1の集団、第2の集団、及び/または第3の集団であり得る。
ある実施形態によれば、遺伝子編集プロセスは、1つ以上の免疫チェックポイント遺伝子での二本鎖または一本鎖切断の生成を媒介するプログラム可能なヌクレアーゼの使用を含み得る。かかるプログラム可能なヌクレアーゼは、特定のゲノム遺伝子座に切断を導入することによって正確なゲノム編集を可能にし、すなわち、ゲノム内の特定のDNA配列の認識に依存して、ヌクレアーゼドメインをこの位置に標的し、標的配列での二本鎖切断の生成を媒介する。DNAの二本鎖切断は、その後、内因性修復機構を切断部位に動員して、非相同末端結合(NHEJ)または相同指向修復(HDR)のいずれかによるゲノム編集を媒介する。したがって、切断の修復は、標的遺伝子産物を破壊する(例えば、サイレンス、抑制、または増強する)挿入/欠失変異の導入をもたらす可能性がある。
部位特異的ゲノム編集を可能にするために開発されたヌクレアーゼの主要なクラスには、ジンクフィンガーヌクレアーゼ(ZFN)、転写活性化因子様ヌクレアーゼ(TALEN)、及びCRISPR関連ヌクレアーゼ(例えば、CRISPR/Cas9)が含まれる。これらのヌクレアーゼシステムは、DNA認識のモードに基づいて大きく2つのカテゴリーに分類され得、ZFN及びTALENは、タンパク質-DNA相互作用を介して特定のDNA結合を達成するが、Cas9などのCRISPRシステムは、標的DNAと直接塩基対を形成する短いRNAガイド分子によって、かつタンパク質-DNA相互作用によって特定のDNA配列を標的とする。例えば、Cox et al.,Nature Medicine,2015,Vol.21,No.2を参照されたい。
本発明のTIL拡張法に従って使用され得る遺伝子編集法の非限定的な例には、CRISPR法、TALE法、及びZFN法が含まれ、これらは以下でより詳細に説明される。ある実施形態によれば、TILを治療用集団に拡張するための方法は、本明細書に記載の方法のいずれかの実施形態(例えば、GEN3プロセス)に従って、またはPCT/US2017/058610、PCT/US2018/012605、もしくはPCT/US2018/012633に記載されるように実行することができ、方法は、増強された治療効果を提供することができるTILを生成するために、CRISPR法、TALE法、またはZFN法のうちの1つ以上によって、TILの少なくとも一部を遺伝子編集することをさらに含む。ある実施形態によれば、遺伝子編集されたTILは、インビトロでそれらを修飾されていないTILと比較することによって、例えば、修飾されていないTILと比較してインビトロでのエフェクター機能、サイトカインプロファイルなどを評価することによって、治療効果の改善について評価され得る。ある特定の実施形態では、この方法は、CRISPR法、TALE法、及び/またはZFN法を使用してTIL集団を遺伝子編集することを含む。
本発明のいくつかの実施形態では、エレクトロポレーションは、CRISPRシステム、TALENシステム、及びZFNシステムなどの遺伝子編集システムの送達のために使用される。本発明のいくつかの実施形態では、エレクトロポレーションシステムは、フローエレクトロポレーションシステムである。本発明のいくつかの実施形態との使用に好適な、好適なフローエレクトロポレーションシステムの例は、市販のMaxCyte STXシステムである。本発明との使用に好適であり得る、BTX-Harvard Apparatusから入手可能なAgilePulseシステムもしくはECM830、Cellaxess Elektra(Cellectricon)、Nucleofector(Lonza/Amaxa)、GenePulser MXcell(BIORAD)、iPorator-96(Primax)、またはsiPORTer96(Ambion)などのいくつかの代替の市販エレクトロポレーション機器が存在する。本発明のいくつかの実施形態では、エレクトロポレーションシステムは、TIL拡張法の残りとともに、滅菌閉鎖系を形成する。本発明のいくつかの実施形態では、エレクトロポレーションシステムは、本明細書に記載のパルスエレクトロポレーションシステムであり、TIL拡張法の残りとともに、滅菌閉鎖系を形成する。
TILを治療的集団に拡張するための方法は、本明細書に記載の方法のいずれかの実施形態(例えば、GEN3プロセス)に従って、またはPCT/US2017/058610、PCT/US2018/012605、もしくはPCT/US2018/012633に記載されるように実行することができ、この方法は、CRISPR法(例えば、CRISPR/Cas9またはCRISPR/Cpf1)によって、TILの少なくとも一部を遺伝子編集することをさらに含む。特定の実施形態によれば、TIL拡張プロセス中のCRISPR法の使用は、1つ以上の免疫チェックポイント遺伝子の発現を、治療的TIL集団の少なくとも一部分においてサイレンスまたは減少させる。あるいは、TIL拡張プロセス中のCRISPR法の使用は、1つ以上の免疫チェックポイント遺伝子の発現を、治療的TIL集団の少なくとも一部分において増強させる。
CRISPRは、「Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats(クラスター化された定期的に間隔をあけた短いパリンドロミックリピート)」の略語である。遺伝子編集のためにCRISPRシステムを使用する方法は、本明細書ではCRISPR法とも称される。RNA及びCasタンパク質を組み込み、かつ本発明に従って使用され得るCRISPRシステムには、3つの型:I型、II型、及びIII型がある。II型CRISPR(Cas9によって例示される)は、最もよく特徴付けられているシステムのうちの1つである。
CRISPR技術は、細菌及び古細菌(単細胞微生物のドメイン)の自然防御機構から適合された。これらの生物は、CRISPR由来のRNA及びCas9を含む様々なCasタンパク質を使用して、外来侵入物のDNAを切り刻んで破壊することによって、ウイルス及び他の異物による攻撃を阻止する。CRISPRは、ヌクレオチド反復配列及びスペーサーの存在という2つの異なる特徴を有するDNAの特殊な領域である。ヌクレオチドの反復配列は、CRISPR領域全体に分布しており、外来DNA(スペーサー)の短いセグメントが反復配列の間に散在している。II型CRISPR/Casシステムでは、スペーサーは、CRISPRゲノム遺伝子座内に組み込まれ、転写され、短いCRISPR RNA(crRNA)に処理される。これらのcrRNAは、トランス活性化crRNA(tracrRNA)にアニーリングし、Casタンパク質による病原性DNAの配列特異的切断及びサイレンシングを指示する。Cas9タンパク質による標的認識には、crRNA内の「シード」配列、及びcrRNA結合領域の上流にある保存されたジヌクレオチドを含むプロトスペーサー隣接モチーフ(PAM)配列が必要である。これにより、CRISPR/Casシステムが再標的されて、crRNAを再設計することにより、実質的にいずれのDNA配列も切断することができる。天然システムにおけるcrRNA及びtracrRNAは、遺伝子操作で使用するために、およそ100ヌクレオチドの単一ガイドRNA(sgRNA)に簡略化され得る。CRISPR/Casシステムは、Cas9エンドヌクレアーゼを発現するプラスミドと必要なcrRNA成分を同時送達することにより、ヒト細胞に直接運搬可能である。Casタンパク質の異なるバリアント(例えば、Cpf1などのCas9のオルソログ)を使用して、標的の制限を低減することができる。
CRISPR法によりTILを永久に遺伝子編集することによってサイレンスまたは阻害され得る遺伝子の非限定的な例には、PD-1、CTLA-4、LAG3、HAVCR2(TIM3)、Cish、TGFβ、PKA、CBL-B、PPP2CA、PPP2CB、PTPN6、PTPN22、PDCD1、BTLA、CD160、TIGIT、CD96、CRTAM、LAIR1、SIGLEC7、SIGLEC9、CD244、TNFRSF10B、TNFRSF10A、CASP8、CASP10、CASP3、CASP6、CASP7、FADD、FAS、SMAD2、SMAD3、SMAD4、SMAD10、SKI、SKIL、TGIF1、IL10RA、IL10RB、HMOX2、IL6R、IL6ST、EIF2AK4、CSK、PAG1、SIT1、FOXP3、PRDM1、BATF、GUCY1A2、GUCY1A3、GUCY1B2、及びGUCY1B3が含まれる。
CRISPR法によりTILを永久に遺伝子編集することによって増強され得る遺伝子の非限定的な例には、CCR2、CCR4、CCR5、CXCR2、CXCR3、CX3CR1、IL-2、IL12、IL-15、及びIL-21が含まれる。
CRISPR法によって標的遺伝子配列の発現を変化させるための、本発明の実施形態に従って使用され得るシステム、方法、及び組成物の例は、米国特許第8,697,359号、同第8,993,233号、同第8,795,965号、同第8,771,945号、同第8,889,356号、同第8,865,406号、同第8,999,641号、同第8,945,839号、同第8,932,814号、同第8,871,445号、同第8,906,616号、及び同第8,895,308号に記載されており、これらは参照により本明細書に組み込まれる。CRISPR/Cas9及びCRISPR/Cpf1を発現するためのプラスミドなどのCRISPR法を行うための資源は、GenScriptなどの企業から市販されている。
ある実施形態では、本明細書に記載のTIL集団の遺伝子改変は、米国特許第US9790490号に記載されているCRISPR/Cpf1システムを使用して行うことができ、この開示は参照により本明細書に組み込まれる。
TILを治療的集団に拡張するための方法は、本明細書に記載の方法のいずれかの実施形態(例えば、Gen2)に従って、またはPCT/US2017/058610、PCT/US2018/012605、もしくはPCT/US2018/012633に記載されるように実行することができ、この方法は、TALE法によってTILの少なくとも一部を遺伝子編集することをさらに含む。特定の実施形態によれば、TIL拡張プロセス中のTALE法の使用は、1つ以上の免疫チェックポイント遺伝子の発現を、治療的TIL集団の少なくとも一部分においてサイレンスまたは減少させる。あるいは、TIL拡張プロセス中のTALE法の使用は、1つ以上の免疫チェックポイント遺伝子の発現を、治療的TIL集団の少なくとも一部分において増強させる。
TALEは、TALEN(「転写活性化因子様エフェクターヌクレアーゼ」)を含む、「Transcription Activator-Like Effector(転写活性化因子様エフェクター)」タンパク質の略語である。遺伝子編集のためにTALEシステムを使用する方法は、本明細書ではTALE法とも称され得る。TALEは、植物病原菌Xanthomonas属由来の天然に存在するタンパク質であり、各々単一の塩基対を認識する一連の33~35アミノ酸反復ドメインで構成されるDNA結合ドメインを含む。TALE特異性は、反復可変二残基(RVD)として知られる2つの超可変アミノ酸によって決定される。モジュラーTALE反復配列は、隣接するDNA配列を認識するために一緒に結合される。DNA結合ドメイン内の特定のRVDは、標的遺伝子座内の塩基を認識し、予測可能なDNA結合ドメインを組み立てるための構造的特徴を提供する。TALEのDNA結合ドメインは、IIS型FokIエンドヌクレアーゼの触媒ドメインに融合して、標的可能なTALEヌクレアーゼを作製する。部位特異的変異を誘導するために、14~20塩基対のスペーサー領域によって分離された2つの個々のTALENアームがFokIモノマーを密接に接近させて二量体化し、標的とされる二本鎖切断を産生する。
様々な組み立て方法を利用したいくつかの大規模な系統的研究により、TALE反復配列を組み合わせて、実質的にすべてのユーザ定義配列を認識することができることが示されている。カスタム設計されたTALEアレイも、Cellectis Bioresearch(Paris,France)、Transposagen Biopharmaceuticals(Lexington,KY,USA)、及びLife Technologies(Grand Island,NY,USA)から市販されている。本発明での使用に好適なTALE法及びTALEN法は、米国特許公開第US2011/0201118A1、US2013/0117869A1、US2013/0315884A1、US2015/0203871A1、及びUS2016/0120906A1に記載されており、これらの開示は参照により本明細書に組み込まれる。
TALE法によりTILを永久に遺伝子編集することによってサイレンスまたは阻害され得る遺伝子の非限定的な例には、PD-1、CTLA-4、LAG3、HAVCR2(TIM3)、Cish、TGFβ、PKA、CBL-B、PPP2CA、PPP2CB、PTPN6、PTPN22、PDCD1、BTLA、CD160、TIGIT、CD96、CRTAM、LAIR1、SIGLEC7、SIGLEC9、CD244、TNFRSF10B、TNFRSF10A、CASP8、CASP10、CASP3、CASP6、CASP7、FADD、FAS、SMAD2、SMAD3、SMAD4、SMAD10、SKI、SKIL、TGIF1、IL10RA、IL10RB、HMOX2、IL6R、IL6ST、EIF2AK4、CSK、PAG1、SIT1、FOXP3、PRDM1、BATF、GUCY1A2、GUCY1A3、GUCY1B2、及びGUCY1B3が含まれる。
TALE法によりTILを永久に遺伝子編集することによって増強され得る遺伝子の非限定的な例には、CCR2、CCR4、CCR5、CXCR2、CXCR3、CX3CR1、IL-2、IL12、IL-15、及びIL-21が含まれる。
TALE法によって標的遺伝子配列の発現を変化させるための、本発明の実施形態に従って使用され得るシステム、方法、及び組成物の例は、米国特許第8,586,526号に記載されており、これは参照により本明細書に組み込まれる。
TILを治療的集団に拡張するための方法は、本明細書に記載の方法のいずれかの実施形態(例えば、GEN3プロセス)に従って、またはPCT/US2017/058610、PCT/US2018/012605、もしくはPCT/US2018/012633に記載されるように実行することができ、この方法は、ジンクフィンガーまたはジンクフィンガーヌクレアーゼ法によって、TILの少なくとも一部を遺伝子編集することをさらに含む。特定の実施形態によれば、TIL拡張プロセス中のジンクフィンガー法の使用は、1つ以上の免疫チェックポイント遺伝子の発現を、治療的TIL集団の少なくとも一部においてサイレンスまたは減少させる。あるいは、TIL拡張プロセス中のジンクフィンガー法の使用は、1つ以上の免疫チェックポイント遺伝子の発現を、治療的TIL集団の少なくとも一部において増強させる。
個々のジンクフィンガーは、保存されたββα立体配置でおよそ30個のアミノ酸を含む。αらせんの表面上のいくつかのアミノ酸は、典型的には、異なる選択性レベルでDNAの主溝の3bpと接触する。ジンクフィンガーは、2つのタンパク質ドメインを有する。第1のドメインは、DNA結合ドメインであり、真核生物転写因子を含み、ジンクフィンガーを含む。第2のドメインは、ヌクレアーゼドメインであり、FokI制限酵素を含み、DNAの触媒的切断を担っている。
個々のZFNのDNA結合ドメインは、典型的には、3~6個の個々のジンクフィンガー反復配列を含み、各々9~18塩基対を認識することができる。ジンクフィンガードメインが目的の標的部位に特異的である場合、合計18塩基対を認識する3フィンガーZFNの対でさえ、理論的には、哺乳動物ゲノムの単一遺伝子座を標的とすることができる。新たなジンクフィンガーアレイを生成するための1つの方法は、既知の特異性を有するより小さいジンクフィンガー「モジュール」を組み合わせることである。最も一般的なモジュラーアセンブリプロセスは、各々3塩基対のDNA配列を認識することができる3つの別個のジンクフィンガーを組み合わせて、9塩基対の標的部位を認識することができる3フィンガーアレイを生成することを含む。あるいは、オリゴマー化プールエンジニアリング(OPEN)などの選択ベースのアプローチを使用して、隣接するフィンガー間のコンテキスト依存的相互作用を考慮したランダム化ライブラリーから新たなジンクフィンガーアレイを選択することができる。設計されたジンクフィンガーは市販されており、Sangamo Biosciences(Richmond,CA,USA)は、Sigma-Aldrich(St.Louis,MO,USA)と協同して、ジンクフィンガー構築のための独自のプラットフォーム(CompoZr(登録商標))を開発した。
ジンクフィンガー法によりTILを永久に遺伝子編集することによってサイレンスまたは阻害され得る遺伝子の非限定的な例には、PD-1、CTLA-4、LAG3、HAVCR2(TIM3)、Cish、TGFβ、PKA、CBL-B、PPP2CA、PPP2CB、PTPN6、PTPN22、PDCD1、BTLA、CD160、TIGIT、CD96、CRTAM、LAIR1、SIGLEC7、SIGLEC9、CD244、TNFRSF10B、TNFRSF10A、CASP8、CASP10、CASP3、CASP6、CASP7、FADD、FAS、SMAD2、SMAD3、SMAD4、SMAD10、SKI、SKIL、TGIF1、IL10RA、IL10RB、HMOX2、IL6R、IL6ST、EIF2AK4、CSK、PAG1、SIT1、FOXP3、PRDM1、BATF、GUCY1A2、GUCY1A3、GUCY1B2、及びGUCY1B3が挙げられる。
ジンクフィンガー法によりTILを永久に遺伝子編集することによって増強され得る遺伝子の非限定的な例には、CCR2、CCR4、CCR5、CXCR2、CXCR3、CX3CR1、IL-2、IL12、IL-15、及びIL-21が含まれる。
ジンクフィンガー法によって標的遺伝子配列の発現を変化させるための、本発明の実施形態に従って使用され得るシステム、方法、及び組成物の例は、米国特許第6,534,261号、同第6,607,882号、同第6,746,838号、同第6,794,136号、同第6,824,978号、同第6,866,997号、同第6,933,113号、同第6,979,539号、同第7,013,219号、同第7,030,215号、同第7,220,719号、同第7,241,573号、同第7,241,574号、同第7,585,849号、同第7,595,376号、同第6,903,185号、及び同第6,479,626号に記載されており、これらは参照により本明細書に組み込まれる。
ジンクフィンガー法によって標的遺伝子配列の発現を変化させるための、本発明の実施形態に従って使用され得るシステム、方法、及び組成物の他の例は、Beane,et al.,Mol.Therapy,2015,23 1380-1390に記載されており、その開示は参照により本明細書に組み込まれる。
いくつかの実施形態では、TILは、高親和性T細胞受容体(TCR)、例えば、MAGE-1、HER2、もしくはNY-ESO-1などの腫瘍関連抗原で標的とされるTCR、または腫瘍関連細胞表面分子(例えば、メソセリン)もしくは系統制限細胞表面分子(例えば、CD19)に結合するキメラ抗原受容体(CAR)を含むが、これらに限定されない追加の機能を含むように任意選択で遺伝子操作される。いくつかの実施形態では、国際特許公開第WO2019/160829A1号(この開示は参照により本明細書に組み込まれる)に記載されている遺伝子操作方法を用いて、PD-1及びCTLA-4をコードする遺伝子などの特定の標的遺伝子のノックアウトを含むTILを遺伝子編集することができる。ある特定の実施形態では、この方法は、高親和性T細胞受容体(TCR)、例えば、MAGE-1、HER2、もしくはNY-ESO-1などの腫瘍関連抗原で標的とされるTCR、または腫瘍関連細胞表面分子(例えば、メソセリン)もしくは系統制限細胞表面分子(例えば、CD19)に結合するキメラ抗原受容体(CAR)を含むようにTIL集団を遺伝子操作することを含む。適切には、TIL集団は、本明細書に記載の第1の集団、第2の集団及び/または第3の集団であり得る。
E.TIL製造のための閉鎖系
本発明は、TIL培養プロセス中に閉鎖系の使用を提供する。かかる閉鎖系は、微生物汚染の防止及び/または低減を可能にし、より少数のフラスコの使用を可能にし、コスト削減を可能にする。いくつかの実施形態では、閉鎖系は、2つの容器を使用する。
かかる閉鎖系は当該技術分野でよく知られており、例えば、http://www.fda.gov/cber/guidelines.htm及びhttps://www.fda.gov/BiologicsBloodVaccines/GuidanceComplianceRegulatoryInformation/Guidances/Blood/ucm076779.htmで見つけることができる。
滅菌接続装置(STCD)は、互換性のある2本の管間の滅菌溶接をもたらす。この手順により、様々な容器と管径との滅菌接続が可能になる。いくつかの実施形態では、閉鎖系には、例えば、実施例14に記載のルアーロック系及びヒートシール系が含まれる。いくつかの実施形態では、閉鎖系は、閉鎖系の無菌性及び閉鎖性を維持するために、滅菌条件下でシリンジを介してアクセスされる。いくつかの実施形態では、実施例14に記載の閉鎖系が用いられる。いくつかの実施形態では、TILは、実施例14の「最終製剤及び充填」の節に記載の方法に従って、最終製品製剤容器に製剤化される。
いくつかの実施形態では、閉鎖系は、腫瘍断片が得られてから、TILを患者に投与するかまたは凍結保存する準備が整うまで、1つの容器を使用する。いくつかの実施形態では、2つの容器が使用される場合、第1の容器は密閉G容器であり、TIL集団が遠心分離され、第1の密閉G容器を開かずに注入バッグに移される。いくつかの実施形態では、2つの容器が使用される場合、注入バッグは、HypoThermosolを含有する注入バッグである。閉鎖系または閉鎖TIL細胞培養系は、腫瘍試料及び/または腫瘍断片が追加されると、系が外部からしっかりと密閉され、細菌、真菌、及び/またはいずれの他の微生物汚染も侵入しない閉鎖環境を形成することを特徴とする。
いくつかの実施形態では、微生物汚染の低減は、約5%~約100%である。いくつかの実施形態では、微生物汚染の低減は、約5%~約95%である。いくつかの実施形態では、微生物汚染の低減は、約5%~約90%である。いくつかの実施形態では、微生物汚染の低減は、約10%~約90%である。いくつかの実施形態では、微生物汚染の低減は、約15%~約85%である。いくつかの実施形態では、微生物汚染の低減は、約5%、約10%、約15%、約20%、約25%、約30%、約35%、約40%、約45%、約50%、約55%、約60%、約65%、約70%、約75%、約80%、約85%、約90%、約95%、約97%、約98%、約99%、または約100%である。
閉鎖系は、微生物汚染の不在下で及び/または微生物汚染が大幅に低減された状態で、TILの成長を可能にする。
さらに、TIL細胞培養環境のpH、二酸化炭素分圧、及び酸素分圧は各々、細胞が培養されるにつれて変化する。したがって、細胞培養に適切な培地を循環させても、TIL増殖に最適な環境として閉鎖環境を常に一定に維持する必要がある。この目的のために、閉鎖環境の培養液中のpH、二酸化炭素分圧、及び酸素分圧の物理的要因がセンサーによって監視されること、そのシグナルが培養環境の入口に設置されたガス交換器を制御するために使用されること、及び閉鎖環境のガス分圧が細胞培養環境を最適化するように培養液の変化に応じてリアルタイムで調整されることが望ましい。いくつかの実施形態では、本発明は、閉鎖環境のpH、二酸化炭素分圧、及び酸素分圧を測定する監視装置を備えたガス交換器を閉鎖環境の入口に組み込み、かつ監視装置からのシグナルに基づいてガス濃度を自動的に調整することによって細胞培養環境を最適化する閉鎖細胞培養系を提供する。
いくつかの実施形態では、閉鎖環境内の圧力は、連続的または断続的に制御される。すなわち、閉鎖環境内の圧力を、例えば、圧力維持装置によって変化させることができ、それ故に、空間が正圧状態でTILの成長に好適であることを確実にするか、または負圧状態で流体の浸出を促進し、ひいては細胞増殖を促進する。さらに、負圧を断続的に加えることにより、閉鎖環境内の体積の一時的な収縮によって、閉鎖環境内の循環液体を均一かつ効率的に置き換えることが可能である。
いくつかの実施形態では、TILの増殖に最適な培養成分を置換または追加することができ、IL-2及び/またはOKT3などの因子、ならびに組み合わせを追加することができる。
F.TILの任意選択の凍結保存
バルクTIL集団(例えば、第2のTIL集団)または拡張されたTIL集団(例えば、第3のTIL集団)のいずれかが任意選択で凍結保存され得る。いくつかの実施形態では、凍結保存は、治療的TIL集団に起こる。いくつかの実施形態では、凍結保存は、第2の拡張後に採取されたTILに起こる。いくつかの実施形態では、凍結保存は、図1及び/または8の例示的なステップF(特に、例えば、図8B及び/または図8C)においてTIL上で起こる。いくつかの実施形態では、TILは、注入バッグ内で凍結保存される。いくつかの実施形態では、TILは、注入バッグに入れる前に凍結保存される。いくつかの実施形態では、TILは、凍結保存され、注入バッグに入っていない。いくつかの実施形態では、凍結保存は、凍結保存培地を使用して行われる。いくつかの実施形態では、凍結保存培地は、ジメチルスルホキシド(DMSO)を含有する。これは、一般に、TIL集団を凍結溶液、例えば、85%補体不活性化AB血清及び15%ジメチルスルホキシド(DMSO)に入れることによって達成される。溶液中の細胞が極低温バイアルに入れられ、-80℃で24時間保存され、任意選択で凍結保存のためにガス状窒素冷凍庫に移される。Sadeghi,et al.,Acta Oncologica 2013,52,978-986を参照されたい。
適切な場合、細胞が冷凍庫から取り出され、溶液のおよそ5分の4が解凍されるまで37℃の水浴中で解凍される。細胞は、一般に、完全培地中に再懸濁され、任意で1回以上洗浄される。いくつかの実施形態では、解凍されたTILは、当該技術分野で知られているように計数され、生存率について評価され得る。
好ましい実施形態では、TIL集団は、CS10凍結保存培地(CryoStor 10、BioLife Solutions)を使用して凍結保存される。好ましい実施形態では、TIL集団は、ジメチルスルホキシド(DMSO)を含有する凍結保存培地を使用して凍結保存される。好ましい実施形態では、TIL集団は、1:1(体積:体積)比のCS10及び細胞培養培地を使用して凍結保存される。好ましい実施形態では、TIL集団は、約1:1(体積:体積)比のCS10及び細胞培養培地を使用して凍結保存され、追加のIL-2をさらに含む。
上で考察されたように、また図1及び/または8(特に、例えば図8B及び/または図8C)に示されるステップA~Eで例示されるように、凍結保存は、TIL拡張プロセス全体の様々な時点で起こり得る。いくつかの実施形態では、第1の拡張後のTILの拡張集団(例えば、ステップBに従って提供される、または図1もしくは8(特に、例えば図8B及び/または図8C)のステップDによる1回以上の第2の拡張後のTILの拡張集団を凍結保存することができる。凍結保存は、一般に、TIL集団を凍結溶液、例えば、85%補体不活性化AB血清及び15%ジメチルスルホキシド(DMSO)に入れることによって達成され得る。溶液中の細胞が極低温バイアルに入れられ、-80℃で24時間保存され、任意選択で凍結保存のためにガス状窒素冷凍庫に移される。Sadeghi,et al.,Acta Oncologica 2013,52,978-986を参照されたい。いくつかの実施形態では、TILは、5% DMSO中で凍結保存される。いくつかの実施形態では、TILは、5% DMSOを加えた細胞培養培地中で凍結保存される。いくつかの実施形態では、TILは、実施例6に提供される方法に従って凍結保存される。
適切な場合、細胞が冷凍庫から取り出され、溶液のおよそ5分の4が解凍されるまで37℃の水浴中で解凍される。細胞は、一般に、完全培地中に再懸濁され、任意で1回以上洗浄される。いくつかの実施形態では、解凍されたTILは、当該技術分野で知られているように計数され、生存率について評価され得る。
いくつかの事例では、以下で考察されるプロトコルを使用して、ステップBのTIL集団が直ちに凍結保存され得る。あるいは、バルクTIL集団がステップC及びステップDに供され、ステップDの後に凍結保存され得る。同様に、遺伝子修飾されたTILが治療に使用される場合、ステップBまたはステップDのTIL集団が好適な治療のために遺伝子修飾に供され得る。
G.拡張TILのアッセイ及び表現型特徴
いくつかの実施形態では、上記のプロセス由来のTILの効力及び/または機能性は、本明細書に記載のアッセイ方法のうちの1つを使用して調べられる。
ある実施形態では、本発明は、遺伝子操作されたTIL製品及びCD134(OX40)及び/またはCD137(4-1BB)アゴニストを使用して産生されたTIL製品を含む、上記のTIL製品の効力を決定する方法を含み、この方法は、
a.TIL製品との標的細胞の共培養を、第1の期間行うステップと、
b.共培養から採取物を取得するステップと、
c.採取物を、(1)TIL細胞製品細胞上の1つ以上のマーカーの発現について評価するか、または(2)TIL細胞製品細胞から分泌された1つ以上の分析物について評価して、1つ以上の観測値を取得し、TIL細胞製品の効力を決定するステップと、を含む。
あるいは、いくつかの実施形態では、上記のプロセスからのTILを、IFN-γ、グランザイムB、パーフォリン、及びTNF-αからなる群から選択される少なくとも2つの分析物の、ELISAまたは自動ELISA(例えば、ELLA)検出によるCD3またはCD3/CD28ビーズベースの刺激を含む複合アッセイを使用して分析する。ある実施形態では、かかる複合アッセイの製品放出仕様は、少なくとも2つの選択された分析物について少なくとも500pg/mL、少なくとも2つの選択された分析物について少なくとも600pg/mL、少なくとも2つの選択された分析物について少なくとも700pg/mL、少なくとも2つの選択された分析物について少なくとも800pg/mL、少なくとも2つの選択された分析物について少なくとも900pg/mL、少なくとも2つの選択された分析物について少なくとも1000pg/mL、少なくとも2つの選択された分析物について少なくとも1100pg/mL、または少なくとも2つの選択された分析物について少なくとも1200pg/mLであり、被験試料の各mLは、1×10TIL、2×10TIL、3×10TIL、4×10TIL、5×10TIL、6×10TIL、7×10TIL、8×10TIL、9×10TIL、または10×10TILを含有する。
いくつかの実施形態では、TILは、本明細書及び実施例に記載されているものを含む、拡張後の多数の表現型マーカーの発現について分析される。ある実施形態では、1つ以上の表現型マーカーの発現が調べられる。いくつかの実施形態では、TILの表現型特徴は、ステップBにおける第1の拡張後に分析される。いくつかの実施形態では、TILの表現型特徴は、ステップCにおける移行中に分析される。いくつかの実施形態では、TILの表現型特徴は、ステップCによる移行中及び凍結保存後に分析される。いくつかの実施形態では、TILの表現型特徴は、ステップDによる第2の拡張後に分析される。いくつかの実施形態では、TILの表現型特徴は、ステップDによる2回以上の拡張後に分析される。
いくつかの実施形態では、マーカーは、CD8及びCD28からなる群から選択される。いくつかの実施形態では、CD8の発現が調べられる。いくつかの実施形態では、CD28の発現が調べられる。いくつかの実施形態では、CD8及び/またはCD28の発現は、他のプロセス(例えば、例えば図8(特に、例えば図8B及び/または図8C)に提供されるGen3プロセス)と比較して、例えば図8(特に、例えば図8B及び/または図8C)に提供される2Aプロセスと比較して、本発明のプロセスに従って産生されたTIL上でより高い。いくつかの実施形態では、CD8の発現は、他のプロセス(例えば、例えば図8(特に、例えば図8B)に提供されるGen3プロセス)と比較して、例えば図8(特に、例えば図8B及び/または図8C)に提供される2Aプロセスと比較して、本発明のプロセスに従って産生されたTIL上でより高い。いくつかの実施形態では、CD28の発現は、他のプロセス(例えば、例えば図8(特に、例えば図8B及び/または図8C)に提供されるGen3プロセス)と比較して、例えば図8(特に、例えば図8A)に提供される2Aプロセスと比較して、本発明のプロセスに従って産生されたTIL上でより高い。いくつかの実施形態では、高いCD28発現は、より若く、より持続的なTIL表現型を示す。ある実施形態では、1つ以上の調節マーカーの発現が測定される。
ある実施形態では、CD8及び/またはCD28に基づく第1のTIL集団、第2のTIL集団、第3のTIL集団、または採取されたTIL集団の選択は、本明細書に記載の腫瘍浸潤リンパ球(TIL)を拡張するための方法のいずれのステップ中にも行われない。
いくつかの実施形態では、セントラルメモリー細胞のパーセンテージは、他のプロセス(例えば、例えば図8(特に、例えば図8B及び/または図8C)に提供されるGen3プロセス)と比較して、例えば図8(特に、例えば図8A)に提供される2Aプロセスと比較して、本発明のプロセスに従って産生されたTIL上でより高い。いくつかの実施形態では、セントラルメモリー細胞のメモリーマーカーは、CCR7及びCD62Lからなる群から選択される。
いくつかの実施形態では、CD4+及び/またはCD8+TILメモリーサブセットは、異なるメモリーサブセットに分類され得る。いくつかの実施形態では、CD4+及び/またはCD8+TILは、ナイーブ(CD45RA+CD62L+)TILを含む。いくつかの実施形態では、CD4+及び/またはCD8+TILは、セントラルメモリー(CM、CD45RA-CD62L+)TILを含む。いくつかの実施形態では、CD4+及び/またはCD8+TILは、エフェクターメモリー(EM、CD45RA-CD62L-)TILを含む。いくつかの実施形態では、CD4+及び/またはCD8+TILは、RA+エフェクターメモリー/エフェクター(TEMRA/TEFF、CD45RA+CD62L+)TILを含む。
いくつかの実施形態では、TILは、グランザイムB、パーフォリン、及びグラニュライシンからなる群から選択されるもう1つのマーカーを発現する。いくつかの実施形態では、TILは、グランザイムBを発現する。いくつかの実施形態では、TILは、パーフォリンを発現する。いくつかの実施形態では、TILは、グラニュライシンを発現する。
ある実施形態では、再刺激されたTILは、サイトカイン放出アッセイを使用して、サイトカイン放出についても評価され得る。いくつかの実施形態では、TILは、インターフェロンガンマ(IFN-γ)分泌について評価され得る。いくつかの実施形態では、IFN-γ分泌は、ELISAアッセイによって測定される。いくつかの実施形態では、IFN-γ分泌は、例えば、図8(特に、例えば、図8B及び/または図8C)に提供されるように、ステップDの後の急速な第2の拡張ステップの後のELISAアッセイによって測定される。いくつかの実施形態では、TILの健康は、IFN-ガンマ(IFN-γ)分泌によって測定される。いくつかの実施形態では、IFN-γ分泌は、活性なTILを示す。いくつかの実施形態では、IFN-γ産生の効力アッセイが用いられる。IFN-γ産生は、細胞傷害能の別の尺度である。IFN-γ産生は、CD3、CD28、及びCD137/4-1BBに対する抗体で刺激されたTILの培地中のサイトカインIFN-γのレベルを決定することによって測定され得る。これらの刺激されたTILからの培地中のIFN-γレベルは、IFN-γ放出を測定することによって決定され得る。いくつかの実施形態では、例えば図8(特に、例えば図8B及び/または図8C)TILに提供されるようなGen3プロセスのステップDにおけるIFN-γ産生の増加は、例えば、図8(特に、例えば図8A)に提供される2AプロセスのステップDと比較して、ステップD TILの細胞傷害能の増加を示している。いくつかの実施形態では、IFN-γ分泌は、1倍、2倍、3倍、4倍、または5倍以上増加する。いくつかの実施形態では、IFN-γ分泌は、1倍増加する。いくつかの実施形態では、IFN-γ分泌は、2倍増加する。いくつかの実施形態では、IFN-γ分泌は、3倍増加する。いくつかの実施形態では、IFN-γ分泌は、4倍増加する。いくつかの実施形態では、IFN-γ分泌は、5倍増加する。いくつかの実施形態では、IFN-γは、Quantikine ELISAキットを使用して測定される。いくつかの実施形態では、IFN-γは、エクスビボでのTIL中で測定される。いくつかの実施形態では、IFN-γは、例えば図8Bの方法を含む、本発明の方法によって産生されたTILを含む、TILにおいてエクスビボで測定される。
いくつかの実施形態では、少なくとも1倍、2倍、3倍、4倍、または5倍以上のIFN-γ分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8Dの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも1倍多くのIFN-γ分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8Dの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されるTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも2倍多くのIFN-γ分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8Dの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されるTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも3倍多くのIFN-γ分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8Dの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されるTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも4倍多くのIFN-γ分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8Dの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されるTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも5倍多くのIFN-γ分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8Dの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されるTILである。
いくつかの実施形態では、少なくとも100pg/mL~約1000pg/mL以上のIFN-γ分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8Dの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも200pg/mL、少なくとも250pg/mL、少なくとも300pg/mL、少なくとも350pg/mL、少なくとも400pg/mL、少なくとも450pg/mL、少なくとも500pg/mL、少なくとも550pg/mL、少なくとも600pg/mL、少なくとも650pg/mL、少なくとも700pg/mL、少なくとも750pg/mL、少なくとも800pg/mL、少なくとも850pg/mL、少なくとも900pg/mL、少なくとも950pg/mL、または少なくとも1000pg/mL以上のIFN-γ分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8Dの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも200pg/mLのIFN-γ分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8Dの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも200pg/mLのIFN-γ分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8Dの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも300pg/mLのIFN-γ分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8Dの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも400pg/mLのIFN-γ分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8Dの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも500pg/mLのIFN-γ分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8Dの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも600pg/mLのIFN-γ分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8Dの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも700pg/mLのIFN-γ分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8Dの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも800pg/mLのIFN-γ分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8Dの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも900pg/mLのIFN-γ分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8Dの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも1000pg/mLのIFN-γ分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8Dの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも2000pg/mLのIFN-γ分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8Dの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも3000pg/mLのIFN-γ分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8Dの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも4000pg/mLのIFN-γ分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8Dの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも5000pg/mLのIFN-γ分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8Dの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも6000pg/mLのIFN-γ分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8Dの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも7000pg/mLのIFN-γ分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8Dの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも8000pg/mLのIFN-γ分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8Dの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも9000pg/mLのIFN-γ分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8Dの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも10,000pg/mLのIFN-γ分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8Dの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも15,000pg/mLのIFN-γ分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8Dの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも20,000pg/mLのIFN-γ分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8Dの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも25,000pg/mLのIFN-γ分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8Dの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも30,000pg/mLのIFN-γ分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8Dの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも35,000pg/mLのIFN-γ分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8Dの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも40,000pg/mLのIFN-γ分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8Dの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも45,000pg/mLのIFN-γ分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8Dの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも50,000pg/mLのIFN-γ分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8Dの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。
いくつかの実施形態では、少なくとも100pg/mL/5×10細胞~約1000pg/mL/5×10細胞以上のIFN-γ分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8Dに示される方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも200pg/mL/5×10細胞、少なくとも250pg/mL/5×10細胞、少なくとも300pg/mL/5×10細胞、少なくとも350pg/mL/5×10細胞、少なくとも400pg/mL/5×10細胞、少なくとも450pg/mL/5×10細胞、少なくとも500pg/mL/5×10細胞、少なくとも550pg/mL/5×10細胞、少なくとも600pg/mL/5×10細胞、少なくとも650pg/mL/5×10細胞、少なくとも700pg/mL/5×10細胞、少なくとも750pg/mL/5×10細胞、少なくとも800pg/mL/5×10細胞、少なくとも850pg/mL/5×10細胞、少なくとも900pg/mL/5×10細胞、少なくとも950pg/mL/5×10細胞、または少なくとも1000pg/mL/5×10細胞以上のIFN-γ分泌は、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8Dの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも200pg/mL/5×10細胞のIFN-γ分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8Dの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも200pg/mL/5×10細胞のIFN-γ分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8Dの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも300pg/mL/5×10細胞のIFN-γ分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8Dの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも400pg/mL/5×10細胞のIFN-γ分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8Dの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも500pg/mL/5×10細胞のIFN-γ分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8Dの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも600pg/mL/5×10細胞のIFN-γ分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8Dの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも700pg/mL/5×10細胞のIFN-γ分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8Dの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも800pg/mL/5×10細胞のIFN-γ分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8Dの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも900pg/mL/5×10細胞のIFN-γ分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8Dの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも1000pg/mL/5×10細胞のIFN-γ分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8Dの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも2000pg/mL/5×10細胞のIFN-γ分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8Dの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも3000pg/mL/5×10細胞のIFN-γ分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8Dに示される方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも4000pg/mL/5×10細胞のIFN-γ分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8Dの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも5000pg/mL/5×10細胞のIFN-γ分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8Dの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも6000pg/mL/5×10細胞のIFN-γ分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8Dの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも7000pg/mL/5×10細胞のIFN-γ分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8Dの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも8000pg/mL/5×10細胞のIFN-γ分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8Dの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも9000pg/mL/5×10細胞のIFN-γ分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8Dの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも10,000pg/mL/5×10細胞のIFN-γ分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8Dの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも15,000pg/mL/5×10細胞のIFN-γ分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8Dの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも20,000pg/mL/5×10細胞のIFN-γ分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8Dの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも25,000pg/mL/5×10細胞のIFN-γ分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8Dの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも30,000pg/mL/5×10細胞のIFN-γ分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8Dの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも35,000pg/mL/5×10細胞のIFN-γ分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8Dの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも40,000pg/mL/×10細胞のIFN-γ分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8Dの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも45,000pg/mL/5×10細胞のIFN-γ分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8Dの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも50,000pg/mL/5×10細胞のIFN-γ分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8Dの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。
Tリンパ球及びBリンパ球の多様な抗原受容体は、限られた数であるが、多数の遺伝子セグメントの体細胞組換えによって産生される。これらの遺伝子セグメント:V(可変)、D(多様性)、J(接合)、及びC(一定)は、免疫グロブリン及びT細胞受容体(TCR)の結合特異性及び下流での適用を決定する。本発明は、T細胞レパートリー多様性を示し、かつ増加させるTILを生成するための方法を提供する。いくつかの実施形態では、本方法によって取得されたTILは、T細胞レパートリー多様性の増加を示す。いくつかの実施形態では、本方法によって取得されたTILは、新たに採取されたTIL及び/または例えば、図8(特に、例えば図8B及び/または図8C)に具体化されるもの以外の方法を含む、本明細書で提供されるもの以外の方法を使用して調製されたTILと比較して、T細胞レパートリー多様性の増加を示す。いくつかの実施形態では、本方法によって取得されたTILは、新たに採取されたTIL及び/または図8(特に、例えば図8A)に例示されるようにGen2と称される方法を使用して調製されたTILと比較して、T細胞レパートリー多様性の増加を示す。いくつかの実施形態では、第1の拡張で取得されたTILは、T細胞レパートリー多様性の増加を示す。いくつかの実施形態では、多様性の増加は、免疫グロブリン多様性及び/またはT細胞受容体多様性の増加である。いくつかの実施形態では、多様性は、免疫グロブリンにあり、免疫グロブリン重鎖にある。いくつかの実施形態では、多様性は、免疫グロブリンにあり、免疫グロブリン軽鎖にある。いくつかの実施形態では、多様性は、T細胞受容体にある。いくつかの実施形態では、多様性は、アルファ、ベータ、ガンマ、及びデルタ受容体からなる群から選択されるT細胞受容体のうちの1つにある。いくつかの実施形態では、T細胞受容体(TCR)アルファ及び/またはベータの発現が増加する。いくつかの実施形態では、T細胞受容体(TCR)アルファの発現が増加する。いくつかの実施形態では、T細胞受容体(TCR)ベータの発現が増加する。いくつかの実施形態では、TCRαβ(すなわち、TCRα/β)の発現が増加する。いくつかの実施形態では、本明細書に記載のプロセス(例えば、Gen3プロセス)は、他のプロセス、例えば、試料内の固有のペプチドCDRの数に基づくGen2と称されるプロセスと比較して、より高いクローン多様性を示す(例えば、図12~14を参照)。
いくつかの実施形態では、TILの活性化及び疲弊は、1つ以上のマーカーを調べることによって決定され得る。いくつかの実施形態では、活性化及び疲弊は、多色フローサイトメトリーを使用して決定され得る。いくつかの実施形態では、活性化及び疲弊のマーカーには、CD3、PD-1、2B4/CD244、CD8、CD25、BTLA、KLRG、TIM3、CD194/CCR4、CD4、TIGIT、CD183、CD69、CD95、CD127、CD103、及び/またはLAG3)からなる群から選択される1つ以上のマーカーが含まれるが、これらに限定されない。いくつかの実施形態では、活性化及び疲弊のマーカーには、BTLA、CTLA-4、ICOS、Ki67、LAG3、PD-1、TIGIT、及び/またはTIM3からなる群から選択される1つ以上のマーカーが含まれるが、これらに限定されない。いくつかの実施形態では、活性化及び疲弊のマーカーには、BTLA、CTLA-4、ICOS、Ki67、LAG3、CD103+/CD69+、CD103+/CD69-、PD-1、TIGIT及び/またはTIM3からなる群から選択される1つ以上のマーカーが含まれるが、これらに限定されない。いくつかの実施形態では、T細胞マーカー(活性化及び疲弊マーカーを含む)は、T細胞の活性化、阻害、または機能を調べるために決定及び/または分析され得る。いくつかの実施形態では、T細胞マーカーには、TIGIT、CD3、FoxP3、TIM3、PD-1、CD103、CTLA-4、LAG3、BTLA-4、ICOS、Ki67、CD8、CD25、CD45、CD4、及び/またはCD59からなる群から選択される1つ以上のマーカーが含まれ得るが、これらに限定されない。
いくつかの実施形態では、3000pg/10超のTIL~300000pg/10以上のTILグランザイムB分泌を示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8Dを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、3000pg/10超のTIL、5000pg/10超のTIL、7000pg/10超のTIL、9000pg/10超のTIL、11000pg/10超のTIL、13000pg/10超のTIL、15000pg/10超のTIL、17000pg/10超のTIL、19000pg/10超のTIL、20000pg/10超のTIL、40000pg/10超のTIL、60000pg/10超のTIL、80000pg/10超のTIL、100000pg/10超のTIL、120000pg/10超のTIL、140000pg/10超のTIL、160000pg/10超のTIL、180000pg/10超のTIL、200000pg/10超のTIL、220000pg/10超のTIL、240000pg/10超のTIL、260000pg/10超のTIL、280000pg/10超のTIL、300000pg/10以上のTILグランザイムB分泌を示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8Dを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、3000pg/10超のTILグランザイムB分泌を示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8Dを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、5000pg/10超のTILグランザイムB分泌を示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8Dを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、7000pg/10超のTILグランザイムB分泌を示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8Dを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、9000pg/10超のTILグランザイムB分泌を示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8Dを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、11000pg/10超のTILグランザイムB分泌を示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8Dを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、13000pg/10超のTILグランザイムB分泌を示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8Dを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、15000pg/10超のTILグランザイムB分泌を示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8Dを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、17000pg/10超のTILグランザイムB分泌を示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8Dを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、19000pg/10超のTILグランザイムB分泌を示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8Dを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、20000pg/10超のTILグランザイムB分泌を示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8Dを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、40000pg/10超のTILグランザイムB分泌を示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8Dを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、60000pg/10超のTILグランザイムB分泌を示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8Dを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、80000pg/10超のTILグランザイムB分泌を示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8Dを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、100000pg/10超のTILグランザイムB分泌を示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8Dを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、120000pg/10超のTILグランザイムB分泌を示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8Dを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、140000pg/10超のTILグランザイムB分泌を示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8Dを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、160000pg/10超のTILグランザイムB分泌を示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8Dを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、180000pg/10超のTILグランザイムB分泌を示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8Dを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、200000pg/10超のTILグランザイムB分泌を示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8Dを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、220000pg/10超のTILグランザイムB分泌を示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8Dを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、240000pg/10超のTILグランザイムB分泌を示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8Dを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、260000pg/10超のTILグランザイムB分泌を示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8Dを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、280000pg/10超のTILグランザイムB分泌を示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8Dを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、300000pg/10超のTILグランザイムB分泌を示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8Dを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、3000pg/10超のTIL~300000pg/10以上のTILグランザイムB分泌を示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8Dを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、3000pg/10超のTIL、5000pg/10超のTIL、7000pg/10超のTIL、9000pg/10超のTIL、11000pg/10超のTIL、13000pg/10超のTIL、15000pg/10超のTIL、17000pg/10超のTIL、19000pg/10超のTIL、20000pg/10超のTIL、40000pg/10超のTIL、60000pg/10超のTIL、80000pg/10超のTIL、100000pg/10超のTIL、120000pg/10超のTIL、140000pg/10超のTIL、160000pg/10超のTIL、180000pg/10超のTIL、200000pg/10超のTIL、220000pg/10超のTIL、240000pg/10超のTIL、260000pg/10超のTIL、280000pg/10超のTIL、300000pg/10以上のTILグランザイムB分泌を示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8Dを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、3000pg/10超のTILグランザイムB分泌を示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8Dを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、5000pg/10超のTILグランザイムB分泌を示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8Dを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、7000pg/10超のTILグランザイムB分泌を示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8Dを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、9000pg/10超のTILグランザイムB分泌を示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8Dを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、11000pg/10超のTILグランザイムB分泌を示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8Dを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、13000pg/10超のTILグランザイムB分泌を示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8Dを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、15000pg/10超のTILグランザイムB分泌を示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8Dを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、17000pg/10超のTILグランザイムB分泌を示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または








図8Dを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、19000pg/10超のTILグランザイムB分泌を示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8Dを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、20000pg/10超のTILグランザイムB分泌を示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8Dを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、40000pg/10超のTILグランザイムB分泌を示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8Dを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、60000pg/10超のTILグランザイムB分泌を示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8Dを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、80000pg/10超のTILグランザイムB分泌を示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8Dを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、100000pg/10超のTILグランザイムB分泌を示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8Dを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、120000pg/10超のTILグランザイムB分泌を示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8Dを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、140000pg/10超のTILグランザイムB分泌を示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8Dを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、160000pg/10超のTILグランザイムB分泌を示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8Dを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、180000pg/10超のTILグランザイムB分泌を示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8Dを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、200000pg/10超のTILグランザイムB分泌を示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8Dを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、220000pg/10超のTILグランザイムB分泌を示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8Dを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、240000pg/10超のTILグランザイムB分泌を示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8Dを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、260000pg/10超のTILグランザイムB分泌を示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8Dを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、280000pg/10超のTILグランザイムB分泌を示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8Dを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、300000pg/10超のTILグランザイムB分泌を示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8Dを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。
いくつかの実施形態では、1000pg/mL超~300000pg/mL以上のグランザイムB分泌を示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8Dを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、1000pg/mL超、2000pg/mL超、3000pg/mL超、4000pg/mL超、5000pg/mL超、6000pg/mL超、7000pg/mL超、8000pg/mL超、9000pg/mL超、10000pg/mL超、20000pg/mL超、30000pg/mL超、40000pg/mL超、50000pg/mL超、60000pg/mL超、70000pg/mL超、80000pg/mL超、90000pg/mL超、100000pg/mL超またはそれ以上のグランザイムB分泌を示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8Dを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、1000pg/mL超のグランザイムBを示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8Dを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、2000pg/mL超のグランザイムBを示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8Dを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、3000pg/mL超のグランザイムBを示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8Dを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、4000pg/mL超のグランザイムBを示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8Dを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、5000pg/mL超のグランザイムBを示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8Dを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、6000pg/mL超のグランザイムBを示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8Dを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、7000pg/mL超のグランザイムBを示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8Dを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、8000pg/mL超のグランザイムBを示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8Dを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、9000pg/mL超のグランザイムBを示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8Dを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、10000pg/mL超のグランザイムBを示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8Dを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、20000pg/mL超のグランザイムBを示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8Dを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、30000pg/mL超のグランザイムBを示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8Dを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、40000pg/mL超のグランザイムBを示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8Dを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、50000pg/mL超のグランザイムBを示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8Dを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、60000pg/mL超のグランザイムBを示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8Dを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、70000pg/mL超のグランザイムBを示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8Dを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、80000pg/mL超のグランザイムBを示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8Dを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、90000pg/mL超のグランザイムBを示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8Dを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、100000pg/mL超のグランザイムBを示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8Dを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、120000pg/mL超のグランザイムBを示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8Dを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、140000pg/mL超のTILグランザイムBを示すTILは、TILグランザイムBは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8Dを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、160000pg/mL超のグランザイムBを示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8Dを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、180000pg/mL超のグランザイムBを示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8Dを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、200000pg/mL超のグランザイムBを示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8Dを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、220000pg/mL超のグランザイムBを示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8Dを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、240000pg/mL超のグランザイムBを示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8Dを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、260000pg/mL超のグランザイムBを示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8Dを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、280000pg/mL超のグランザイムBを示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8Dを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、300000pg/mL超のグランザイムBを示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8Dを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。
いくつかの実施形態では、本発明の拡張方法は、拡張されていないTIL集団と比較して、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8Dに提供されるようなTILを含む、インビトロで増加したグランザイムB分泌を示す拡張されたTIL集団を産生する。いくつかの実施形態では、本発明の拡張されたTIL集団のグランザイムB分泌は、拡張されていないTIL集団と比較して、少なくとも1倍~50倍以上増加する。いくつかの実施形態では、IFN-γ分泌は、拡張されていないTIL集団と比較して、1倍、少なくとも2倍、少なくとも3倍、少なくとも4倍、少なくとも5倍、少なくとも6倍、少なくとも7倍、少なくとも8倍、少なくとも9倍、少なくとも10倍、少なくとも20倍、少なくとも30倍、少なくとも40倍、少なくとも50倍以上増加する。いくつかの実施形態では、本発明の拡張されたTIL集団のグランザイムB分泌は、拡張されていないTIL集団と比較して、少なくとも1倍増加する。いくつかの実施形態では、本発明の拡張されたTIL集団のグランザイムB分泌は、拡張されていないTIL集団と比較して、少なくとも2倍増加する。いくつかの実施形態では、本発明の拡張されたTIL集団のグランザイムB分泌は、拡張されていないTIL集団と比較して、少なくとも3倍増加する。いくつかの実施形態では、本発明の拡張されたTIL集団のグランザイムB分泌は、拡張されていないTIL集団と比較して、少なくとも4倍増加する。いくつかの実施形態では、本発明の拡張されたTIL集団のグランザイムB分泌は、拡張されていないTIL集団と比較して、少なくとも5倍増加する。いくつかの実施形態では、本発明の拡張されたTIL集団のグランザイムB分泌は、拡張されていないTIL集団と比較して、少なくとも6倍増加する。いくつかの実施形態では、本発明の拡張されたTIL集団のグランザイムB分泌は、拡張されていないTIL集団と比較して、少なくとも7倍増加する。いくつかの実施形態では、本発明の拡張されたTIL集団のグランザイムB分泌は、拡張されていないTIL集団と比較して、少なくとも8倍増加する。いくつかの実施形態では、本発明の拡張されたTIL集団のグランザイムB分泌は、拡張されていないTIL集団と比較して、少なくとも9倍増加する。いくつかの実施形態では、本発明の拡張されたTIL集団のグランザイムB分泌は、拡張されていないTIL集団と比較して、少なくとも10倍増加する。いくつかの実施形態では、本発明の拡張されたTIL集団のグランザイムB分泌は、拡張されていないTIL集団と比較して、少なくとも20倍増加する。いくつかの実施形態では、本発明の拡張されたTIL集団のグランザイムB分泌は、拡張されていないTIL集団と比較して、少なくとも30倍増加する。いくつかの実施形態では、本発明の拡張されたTIL集団のグランザイムB分泌は、拡張されていないTIL集団と比較して、少なくとも40倍増加する。いくつかの実施形態では、本発明の拡張されたTIL集団のグランザイムB分泌は、拡張されていないTIL集団と比較して、少なくとも50倍増加する。
いくつかの実施形態では、IFN-γ分泌と比較して、少なくとも1倍、2倍、3倍、4倍、または5倍以上低いレベルのTNF-α(すなわち、TNF-アルファ)分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8Dの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、IFN-γ分泌と比較して、少なくとも1倍低いレベルのTNF-α分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8Dの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、IFN-γ分泌と比較して、少なくとも2倍低いレベルのTNF-α分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8Dの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、IFN-γ分泌と比較して、少なくとも3倍低いレベルのTNF-α分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8Dの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、IFN-γ分泌と比較して、少なくとも4倍低いレベルのTNF-α分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8Dの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、IFN-γ分泌と比較して、少なくとも5倍低いレベルのTNF-α分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8Dの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。
いくつかの実施形態では、少なくとも200pg/mL/5×10細胞~約10,000pg/mL/5×10細胞以上のTNF-α(すなわち、TNF-アルファ)分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8Dの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも500pg/mL/5×10細胞~約10,000pg/mL/5×10細胞以上のTNF-α分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8Dの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも1000pg/mL/5×10細胞~約10,000pg/mL/5×10細胞以上のTNF-α分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8Dの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも2000pg/mL/5×10細胞~約10,000pg/mL/5×10細胞以上のTNF-α分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8Dの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも3000pg/mL/5×10細胞~約10,000pg/mL/5×10細胞以上のTNF-α分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8Dの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも4000pg/mL/5×10細胞~約10,000pg/mL/5×10細胞以上のTNF-α分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8Dの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも5000pg/mL/5×10細胞~約10,000pg/mL/5×10細胞以上のTNF-α分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8Dの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも6000pg/mL/5×10細胞~約10,000pg/mL/5×10細胞以上のTNF-α分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8Dの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも7000pg/mL/5×10細胞~約10,000pg/mL/5×10細胞以上のTNF-α分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8Dの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも8000pg/mL/5×10細胞~約10,000pg/mL/5×10細胞以上のTNF-α分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8Dの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも9000pg/mL/5×10細胞~約10,000pg/mL/5×10細胞以上のTNF-α分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8Dの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。
いくつかの実施形態では、IFN-γ及びグランザイムBのレベルを測定して、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8Dの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILの表現型特徴を決定する。いくつかの実施形態では、IFN-γ及びTNF-αのレベルを測定して、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8Dの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILの表現型特徴を決定する。いくつかの実施形態では、グランザイムB及びTNF-αのレベルを測定して、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8Dの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILの表現型特徴を決定する。いくつかの実施形態では、IFN-γ、グランザイムB及びTNF-αのレベルを測定して、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8Dの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILの表現型特徴を決定する。
いくつかの実施形態では、表現型特徴付けは、凍結保存後に行われる。
H.追加のプロセスの実施形態
いくつかの実施形態では、本発明は、腫瘍浸潤リンパ球(TIL)を治療的TIL集団に拡張するための方法であって、(a)対象から取得された腫瘍試料を複数の腫瘍断片に処理することによって、対象から切除された腫瘍から第1のTIL集団を取得することと、(b)IL-2及びOKT-3を含む細胞培養培地中で第1のTIL集団を培養することによってプライミングによる第1の拡張を行うことであって、プライミングによる第1の拡張を約1~7日間または約1~8日間行って第2のTIL集団を取得し、第2のTIL集団が、第1のTIL集団よりも数が多い、プライミングによる第1の拡張を行うことと、(c)第2のTIL集団を、IL-2、OKT-3、及び外因性抗原提示細胞(APC)を含む細胞培養培地と接触させて急速な第2の拡張を行って第3のTIL集団を産生することであって、急速な第2の拡張を約1~11日間または約1~10日間行って第3のTIL集団を取得し、第3のTIL集団が、治療的TIL集団である、第3のTIL集団を産生することと、(d)ステップ(c)から取得された治療的TIL集団を採取することと、を含む、方法を提供する。いくつかの実施形態では、急速な第2の拡張ステップは、複数のステップに分けられて、(1)第2のTIL集団を、第1の容器、例えば、G-Rex 100MCS容器内での小規模培養で約3~4日間、または約2~4日間培養することによって急速な第2の拡張を行うことと、その後、(2)小規模培養由来の第2のTIL集団を、第1の容器よりも大きい第2の容器、例えば、G-Rex 500MCS容器に移すこととによって、培養のスケールアップを達成し、第2の容器内で、小規模培養由来の第2のTIL集団が、より大規模な培養で約4~7日間、または約4~8日間培養される。いくつかの実施形態では、急速拡張ステップは、複数のステップに分けられて、(1)第2のTIL集団を、第1の容器、例えば、G-Rex 100MCS容器内での第1の小規模培養で約3~4日間培養することによって急速な第2の拡張を行うことと、その後、(2)第1の小規模培養由来の第2のTIL集団を、第1の容器とサイズが等しい少なくとも2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、または20個の第2の容器に移して配分することとによって、培養のスケールアウトを達成し、各第2の容器内で、第1の小規模培養由来のかかる第2の容器に移された第2のTIL集団の一部が、第2の小規模培養で約4~7日間、または約4~8日間培養される。いくつかの実施形態では、急速拡張ステップは、複数のステップに分けられて、(1)第2のTIL集団を、第1の容器、例えば、G-Rex 100MCS容器内での小規模培養で約3~4日間、または約2~4日間培養することによって急速な第2の拡張を行うことと、その後、(2)第1の小規模培養由来の第2のTIL集団を、第1の容器よりもサイズが大きい少なくとも2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、または20個の第2の容器、例えば、G-Rex 500MCS容器に移して配分することとによって、培養のスケールアウト及びスケールアップを達成し、各第2の容器内で、小規模培養由来のかかる第2の容器に移された第2のTIL集団の一部が、より大規模な培養で約4~7日間、または約4~8日間培養される。いくつかの実施形態では、急速拡張ステップは、複数のステップに分けられて、(1)第2のTIL集団を、第1の容器、例えば、G-Rex 100MCS容器内での小規模培養で約3~4日間培養することによって急速な第2の拡張を行うことと、その後、(2)第1の小規模培養由来の第2のTIL集団を、第1の容器よりもサイズが大きい2、3、または4個の第2の容器、例えば、G-Rex 500MCS容器に移して配分することとによって、培養のスケールアウト及びスケールアップを達成し、各第2の容器内で、小規模培養由来のかかる第2の容器に移された第2のTIL集団の一部が、より大規模な培養で約5~7日間培養される。
いくつかの実施形態では、本発明は、腫瘍浸潤リンパ球(TIL)を治療的TIL集団に拡張するための方法であって、(a)対象から取得された腫瘍試料を複数の腫瘍断片に処理することによって、対象から切除された腫瘍から第1のTIL集団を取得することと、(b)IL-2及びOKT-3を含む細胞培養培地中で第1のTIL集団を培養することによってプライミングによる第1の拡張を行うことであって、プライミングによる第1の拡張が約1~8日間行われて第2のTIL集団が取得され、第2のTIL集団は第1のTIL集団よりも数が多い、プライミングによる第1の拡張を行うことと、(c)第2のTIL集団を、IL-2、OKT-3及び外因性抗原提示細胞(APC)を含む細胞培養培地と接触させることによって急速な第2の拡張を行い、第3のTIL集団を産生することであって、急速な第2の拡張が約1~8日間行われて第3のTIL集団が取得され、第3のTIL集団が治療的TIL集団である、第3のTIL集団を産生することと、(d)ステップ(c)から取得された治療的TIL集団を採取することと、を含む、方法を提供する。いくつかの実施形態では、急速な第2の拡張ステップは、複数のステップに分けられて、(1)第2のTIL集団を、第1の容器、例えば、G-Rex 100MCS容器内での小規模培養で約2~4日間培養することによって急速な第2の拡張を行うことと、その後、(2)小規模培養由来の第2のTIL集団を、第1の容器よりも大きい第2の容器、例えば、G-Rex 500MCS容器に移すこととによって、培養のスケールアップを達成し、第2の容器内で、小規模培養由来の第2のTIL集団が、より大規模な培養で約4~8日間培養される。いくつかの実施形態では、急速拡張ステップは、複数のステップに分けられて、(1)第2のTIL集団を、第1の容器、例えば、G-Rex 100MCS容器内での第1の小規模培養で約2~4日間培養することによって急速な第2の拡張を行うことと、その後、(2)第1の小規模培養由来の第2のTIL集団を、第1の容器とサイズが等しい少なくとも2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、または20個の第2の容器に移して配分することとによって、培養のスケールアウトを達成し、各第2の容器内で、第1の小規模培養由来のかかる第2の容器に移された第2のTIL集団の一部が、第2の小規模培養で約4~6日間培養される。いくつかの実施形態では、急速拡張ステップは、複数のステップに分けられて、(1)第2のTIL集団を、第1の容器、例えば、G-Rex 100MCS容器内での小規模培養で約2~4日間培養することによって急速な第2の拡張を行うことと、その後、(2)第1の小規模培養由来の第2のTIL集団を、第1の容器よりもサイズが大きい少なくとも2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、または20個の第2の容器、例えば、G-Rex 500MCS容器に移して配分することとによって、培養のスケールアウト及びスケールアップを達成し、各第2の容器内で、小規模培養由来のかかる第2の容器に移された第2のTIL集団の一部が、より大規模な培養で約4~6日間培養される。いくつかの実施形態では、急速拡張ステップは、複数のステップに分けられて、(1)第2のTIL集団を、第1の容器、例えば、G-Rex 100MCS容器内での小規模培養で約3~4日間培養することによって急速な第2の拡張を行うことと、その後、(2)第1の小規模培養由来の第2のTIL集団を、第1の容器よりもサイズが大きい2、3、または4個の第2の容器、例えば、G-Rex 500MCS容器に移して配分することとによって、培養のスケールアウト及びスケールアップを達成し、各第2の容器内で、小規模培養由来のかかる第2の容器に移された第2のTIL集団の一部が、より大規模な培養で約4~5日間培養される。
いくつかの実施形態では、本発明は、腫瘍浸潤リンパ球(TIL)を治療的TIL集団に拡張するための方法であって、(a)対象から取得された腫瘍試料を複数の腫瘍断片に処理することによって、対象から切除された腫瘍から第1のTIL集団を取得することと、(b)IL-2及びOKT-3を含む細胞培養培地中で第1のTIL集団を培養することによってプライミングによる第1の拡張を行うことであって、プライミングによる第1の拡張が約1~7日間行われて第2のTIL集団が取得され、第2のTIL集団は第1のTIL集団よりも数が多い、プライミングによる第1の拡張を行うことと、(c)第2のTIL集団を、IL-2、OKT-3及び外因性抗原提示細胞(APC)を含む細胞培養培地と接触させることによって急速な第2の拡張を行い、第3のTIL集団を産生することであって、急速な第2の拡張が約1~11日間行われて第3のTIL集団が取得され、第3のTIL集団が治療的TIL集団である、第3のTIL集団を産生することと、(d)ステップ(c)から取得された治療的TIL集団を採取することと、を含む、方法を提供する。いくつかの実施形態では、急速な第2の拡張ステップは、複数のステップに分けられて、(1)第2のTIL集団を、第1の容器、例えば、G-Rex 100MCS容器内での小規模培養で約3~4日間培養することによって急速な第2の拡張を行うことと、その後、(2)小規模培養由来の第2のTIL集団を、第1の容器よりも大きい第2の容器、例えば、G-Rex 500MCS容器に移すこととによって、培養のスケールアップを達成し、第2の容器内で、小規模培養由来の第2のTIL集団が、より大規模な培養で約4~7日間培養される。いくつかの実施形態では、急速拡張ステップは、複数のステップに分けられて、(1)第2のTIL集団を、第1の容器、例えば、G-Rex 100MCS容器内での第1の小規模培養で約3~4日間培養することによって急速な第2の拡張を行うことと、その後、(2)第1の小規模培養由来の第2のTIL集団を、第1の容器とサイズが等しい少なくとも2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、または20個の第2の容器に移して配分することとによって、培養のスケールアウトを達成し、各第2の容器内で、第1の小規模培養由来のかかる第2の容器に移された第2のTIL集団の一部が、第2の小規模培養で約4~7日間培養される。いくつかの実施形態では、急速拡張ステップは、複数のステップに分けられて、(1)第2のTIL集団を、第1の容器、例えば、G-Rex 100MCS容器内での小規模培養で約3~4日間培養することによって急速な第2の拡張を行うことと、その後、(2)第1の小規模培養由来の第2のTIL集団を、第1の容器よりもサイズが大きい少なくとも2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、または20個の第2の容器、例えば、G-Rex 500MCS容器に移して配分することとによって、培養のスケールアウト及びスケールアップを達成し、各第2の容器内で、小規模培養由来のかかる第2の容器に移された第2のTIL集団の一部が、より大規模な培養で約4~7日間培養される。いくつかの実施形態では、急速拡張ステップは、複数のステップに分けられて、(1)第2のTIL集団を、第1の容器、例えば、G-Rex 100MCS容器内での小規模培養で約4日間培養することによって急速な第2の拡張を行うことと、その後、(2)第1の小規模培養由来の第2のTIL集団を、第1の容器よりもサイズが大きい2、3、または4個の第2の容器、例えば、G-Rex 500MCS容器に移して配分することとによって、培養のスケールアウト及びスケールアップを達成し、各第2の容器内で、小規模培養由来のかかる第2の容器に移された第2のTIL集団の一部が、より大規模な培養で約5日間培養される。
別の実施形態では、本発明は、ステップ(b)において、第1の初期拡張が、第1のTIL集団を、外因性抗原提示細胞(APC)をさらに含む培養培地と接触させることによって行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法であって、ステップ(c)における培養培地中のAPCの数が、ステップ(b)における培養培地中のAPCの数よりも多い、方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、ステップ(c)において培養培地に追加の外因性APCが補充されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、急速な第2の拡張において添加されたAPCの数とステップ(b)において添加されたAPCの数との比率が、正確にまたは約1.1:1~正確にまたは約20:1の範囲から選択されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、急速な第2の拡張において添加されたAPCの数とステップ(b)において添加されたAPCの数との比率が、正確にまたは約1.1:1~正確にまたは約10:1の範囲から選択されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、急速な第2の拡張において添加されたAPCの数とステップ(b)において添加されたAPCの数との比率が、正確にまたは約1.1:1~正確にまたは約9:1の範囲から選択されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、急速な第2の拡張において添加されたAPCの数とステップ(b)において添加されたAPCの数との比率が、正確にまたは約1.1:1~正確にまたは約8:1の範囲から選択されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、急速な第2の拡張において添加されたAPCの数とステップ(b)において添加されたAPCの数との比率が、正確にまたは約1.1:1~正確にまたは約7:1の範囲から選択されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、急速な第2の拡張において添加されたAPCの数とステップ(b)において添加されたAPCの数との比率が、正確にまたは約1.1:1~正確にまたは約6:1の範囲から選択されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、急速な第2の拡張において添加されたAPCの数とステップ(b)において添加されたAPCの数との比率が、正確にまたは約1.1:1~正確にまたは約5:1の範囲から選択されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、急速な第2の拡張において添加されたAPCの数とステップ(b)において添加されたAPCの数との比率が、正確にまたは約1.1:1~正確にまたは約4:1の範囲から選択されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、急速な第2の拡張において添加されたAPCの数とステップ(b)において添加されたAPCの数との比率が、正確にまたは約1.1:1~正確にまたは約3:1の範囲から選択されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、急速な第2の拡張において添加されたAPCの数とステップ(b)において添加されたAPCの数との比率が、正確にまたは約1.1:1~正確にまたは約2.9:1の範囲から選択されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、急速な第2の拡張において添加されたAPCの数とステップ(b)において添加されたAPCの数との比率が、正確にまたは約1.1:1~正確にまたは約2.8:1の範囲から選択されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、急速な第2の拡張において添加されたAPCの数とステップ(b)において添加されたAPCの数との比率が、正確にまたは約1.1:1~正確にまたは約2.7:1の範囲から選択されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、急速な第2の拡張において添加されたAPCの数とステップ(b)において添加されたAPCの数との比率が、正確にまたは約1.1:1~正確にまたは約2.6:1の範囲から選択されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、急速な第2の拡張において添加されたAPCの数とステップ(b)において添加されたAPCの数との比率が、正確にまたは約1.1:1~正確にまたは約2.5:1の範囲から選択されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、急速な第2の拡張において添加されたAPCの数とステップ(b)において添加されたAPCの数との比率が、正確にまたは約1.1:1~正確にまたは約2.4:1の範囲から選択されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、急速な第2の拡張において添加されたAPCの数とステップ(b)において添加されたAPCの数との比率が、正確にまたは約1.1:1~正確にまたは約2.3:1の範囲から選択されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、急速な第2の拡張において添加されたAPCの数とステップ(b)において添加されたAPCの数との比率が、正確にまたは約1.1:1~正確にまたは約2.2:1の範囲から選択されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、急速な第2の拡張において添加されたAPCの数とステップ(b)において添加されたAPCの数との比率が、正確にまたは約1.1:1~正確にまたは約2.1:1の範囲から選択されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、急速な第2の拡張において添加されたAPCの数とステップ(b)において添加されたAPCの数との比率が、正確にまたは約1.1:1~正確にまたは約2:1の範囲から選択されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、急速な第2の拡張において添加されたAPCの数とステップ(b)において添加されたAPCの数との比率が、正確にまたは約2:1~正確にまたは約10:1の範囲から選択されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、急速な第2の拡張において添加されたAPCの数とステップ(b)において添加されたAPCの数との比率が、正確にまたは約2:1~正確にまたは約5:1の範囲から選択されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、急速な第2の拡張において添加されたAPCの数とステップ(b)において添加されたAPCの数との比率が、正確にまたは約2:1~正確にまたは約4:1の範囲から選択されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、急速な第2の拡張において添加されたAPCの数とステップ(b)において添加されたAPCの数との比率が、正確にまたは約2:1~正確にまたは約3:1の範囲から選択されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、急速な第2の拡張において添加されたAPCの数とステップ(b)において添加されたAPCの数との比率が、正確にまたは約2:1~正確にまたは約2.9:1の範囲から選択されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、急速な第2の拡張において添加されたAPCの数とステップ(b)において添加されたAPCの数との比率が、正確にまたは約2:1~正確にまたは約2.8:1の範囲から選択されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、急速な第2の拡張において添加されたAPCの数とステップ(b)において添加されたAPCの数との比率が、正確にまたは約2:1~正確にまたは約2.7:1の範囲から選択されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、急速な第2の拡張において添加されたAPCの数とステップ(b)において添加されたAPCの数との比率が、正確にまたは約2:1~正確にまたは約2.6:1の範囲から選択されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、急速な第2の拡張において添加されたAPCの数とステップ(b)において添加されたAPCの数との比率が、正確にまたは約2:1~正確にまたは約2.5:1の範囲から選択されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、急速な第2の拡張において添加されたAPCの数とステップ(b)において添加されたAPCの数との比率が、正確にまたは約2:1~正確にまたは約2.4:1の範囲から選択されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、急速な第2の拡張において添加されたAPCの数とステップ(b)において添加されたAPCの数との比率が、正確にまたは約2:1~正確にまたは約2.3:1の範囲から選択されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、急速な第2の拡張において添加されたAPCの数とステップ(b)において添加されたAPCの数との比率が、正確にまたは約2:1~正確にまたは約2.2:1の範囲から選択されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、急速な第2の拡張において添加されたAPCの数とステップ(b)において添加されたAPCの数との比率が、正確にまたは約2:1~正確にまたは約2.1:1の範囲から選択されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、急速な第2の拡張において添加されたAPCの数とステップ(b)において添加されたAPCの数との比率が、正確にまたは約2:1になるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、急速な第2の拡張において添加されたAPCの数とステップ(b)において添加されたAPCの数との比率が、正確にまたは約1.1:1、1.2:1、1.3:1、1.4:1、1.5:1、1.6:1、1.7:1、1.8:1、1.9:1、2:1、2.1:1、2.2:1、2.3:1、2.4:1、2.5:1、2.6:1、2.7:1、2.8:1、2.9:1、3:1、3.1:1、3.2:1、3.3:1、3.4:1、3.5:1、3.6:1、3.7:1、3.8:1、3.9:1、4:1、4.1:1、4.2:1、4.3:1、4.4:1、4.5:1、4.6:1、4.7:1、4.8:1、4.9:1、または5:1になるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、第1の初期拡張において添加されるAPCの数が、正確にまたは約1×10、1.1×10、1.2×10、1.3×10、1.4×10、1.5×10、1.6×10、1.7×10、1.8×10、1.9×10、2×10、2.1×10、2.2×10、2.3×10、2.4×10、2.5×10、2.6×10、2.7×10、2.8×10、2.9×10、3×10、3.1×10、3.2×10、3.3×10、3.4×10、または3.5×10APCになるように、かつ急速な第2の拡張において添加されるAPCの数が、正確にまたは約3.5×10、3.6×10、3.7×10、3.8×10、3.9×10、4×10、4.1×10、4.2×10、4.3×10、4.4×10、4.5×10、4.6×10、4.7×10、4.8×10、4.9×10、5×10、5.1×10、5.2×10、5.3×10、5.4×10、5.5×10、5.6×10、5.7×10、5.8×10、5.9×10、6×10、6.1×10、6.2×10、6.3×10、6.4×10、6.5×10、6.6×10、6.7×10、6.8×10、6.9×10、7×10、7.1×10、7.2×10、7.3×10、7.4×10、7.5×10、7.6×10、7.7×10、7.8×10、7.9×10、8×10、8.1×10、8.2×10、8.3×10、8.4×10、8.5×10、8.6×10、8.7×10、8.8×10、8.9×10、9×10、9.1×10、9.2×10、9.3×10、9.4×10、9.5×10、9.6×10、9.7×10、9.8×10、9.9×10、または1×10APCになるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、一次の第1の拡張において添加されたAPCの数が、正確にまたは約1×10APC~正確にまたは約3.5×10APCの範囲から選択され、急速な第2の拡張において添加されたAPCの数が、正確にまたは約3.5×10APC~正確にまたは約1×10APCの範囲から選択されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、一次の第1の拡張において添加されたAPCの数が、正確にまたは約1.5×10APC~正確にまたは約3×10APCの範囲から選択され、急速な第2の拡張において添加されたAPCの数が、正確にまたは約4×10APC~正確にまたは約7.5×10APCの範囲から選択されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、一次の第1の拡張において添加されたAPCの数が、正確にまたは約2×10APC~正確にまたは約2.5×10APCの範囲から選択され、急速な第2の拡張において添加されたAPCの数が、正確にまたは約4.5×10APC~正確にまたは約5.5×10APCの範囲から選択されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、正確にまたは約2.5×10APCが第1の初期拡張に添加され、かつ正確にまたは約5×10APCが急速な第2の拡張に添加されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、抗原提示細胞が末梢血単核細胞(PBMC)であるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、複数の腫瘍断片が複数の別個の容器に分配され、それらの別個の容器の各々内で、第1のTIL集団がステップ(a)において得られ、第2のTIL集団がステップ(b)において得られ、第3のTIL集団がステップ(c)において得られ、ステップ(c)における複数の容器からの治療的TIL集団が組み合わせられて、ステップ(d)から採取されたTIL集団を産生するように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、複数の腫瘍が複数の別個の容器に均一に分配されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、複数の別個の容器が少なくとも2個の別個の容器を含むように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、複数の別個の容器が2~20個の別個の容器を含むように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、複数の別個の容器が2~15個の別個の容器を含むように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、複数の別個の容器が2~10個の別個の容器を含むように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、複数の別個の容器が2~5個の別個の容器を含むように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、複数の別個の容器が2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、または20個の別個の容器を含むように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、プライミングによる第1の拡張がステップ(b)において第1のTIL集団で行われる各容器の場合、ステップ(c)における急速な第2の拡張が、同じ容器内でかかる第1のTIL集団から産生された第2のTIL集団で行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、別個の容器の各々が第1のガス透過性表面積を含むように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、複数の腫瘍断片が単一の容器に分配されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、単一の容器が第1のガス透過性表面積を含むように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、ステップ(b)において、第1の初期拡張が、第1のTIL集団の細胞培養培地に追加の抗原提示細胞(APC)を補充することによって行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法であって、ステップ(c)において添加されるAPCの数が、ステップ(b)において添加されるAPCの数よりも多く、ステップ(b)において、APCが、正確にまたは約1細胞層~正確にまたは約3細胞層の平均厚さで第1のガス透過性表面積上に層状化される、方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、ステップ(b)において、APCが、正確にまたは約1.5細胞層~正確にまたは約2.5細胞層の平均厚さで第1のガス透過性表面積上に層状化されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、ステップ(b)において、APCが、正確にまたは約2細胞層の平均厚さで第1のガス透過性表面積上に層状化されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、ステップ(b)において、APCが、正確にまたは約1、1.1、1.2、1.3、1.4、1.5、1.6、1.7、1.8、1.9、2、2.1、2.2、2.3、2.4、2.5、2.6、2.7、2.8、2.9、または3細胞層の平均厚さで第1のガス透過性表面積上に層状化されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、ステップ(c)において、APCが、正確にまたは約3細胞層~正確にまたは約10細胞層の平均厚さで第1のガス透過性表面積上に層状化されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、ステップ(c)において、APCが、正確にまたは約4細胞層~正確にまたは約8細胞層の平均厚さで第1のガス透過性表面積上に層状化されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、ステップ(c)において、APCが、正確にまたは約3、4、5、6、7、8、9、または10細胞層の平均厚さで第1のガス透過性表面積上に層状化されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、ステップ(c)において、APCが、正確にまたは約4、4.1、4.2、4.3、4.4、4.5、4.6、4.7、4.8、4.9、5、5.1、5.2、5.3、5.4、5.5、5.6、5.7、5.8、5.9、6、6.1、6.2、6.3、6.4、6.5、6.6、6.7、6.8、6.9、7、7.1、7.2、7.3、7.4、7.5、7.6、7.7、7.8、7.9、または8細胞層の平均厚さで第1のガス透過性表面積上に層状化されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、ステップ(b)において、プライミングによる第1の拡張が、第1のガス透過性表面積を含む第1の容器内で行われ、ステップ(c)において、急速な第2の拡張が、第2のガス透過性表面積を含む第2の容器内で行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、第2の容器が第1の容器よりも大きいように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、ステップ(b)において、第1の初期拡張が、第1のTIL集団の細胞培養培地に追加の抗原提示細胞(APC)を補充することによって行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法であって、ステップ(c)において添加されるAPCの数が、ステップ(b)において添加されるAPCの数よりも多く、ステップ(b)において、APCが、正確にまたは約1細胞層~正確にまたは約3細胞層の平均厚さで第1のガス透過性表面積上に層状化される、方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、ステップ(b)において、APCが、正確にまたは約1.5細胞層~正確にまたは約2.5細胞層の平均厚さで第1のガス透過性表面積上に層状化されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、ステップ(b)において、APCが、正確にまたは約2細胞層の平均厚さで第1のガス透過性表面積上に層状化されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、ステップ(b)において、APCが、正確にまたは約1、1.1、1.2、1.3、1.4、1.5、1.6、1.7、1.8、1.9、2、2.1、2.2、2.3、2.4、2.5、2.6、2.7、2.8、2.9、または3細胞層の平均厚さで第1のガス透過性表面積上に層状化されるように修正された、該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、ステップ(c)において、APCが、正確にまたは約3細胞層~正確にまたは約10細胞層の平均厚さで第2のガス透過性表面積上に層状化されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、ステップ(c)において、APCが、正確にまたは約4細胞層~正確にまたは約8細胞層の平均厚さで第2のガス透過性表面積上に層状化されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、ステップ(c)において、APCが、正確にまたは約3、4、5、6、7、8、9、または10細胞層の平均厚さで第2のガス透過性表面積上に層状化されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、ステップ(c)において、APCが、約4、4.1、4.2、4.3、4.4、4.5、4.6、4.7、4.8、4.9、5、5.1、5.2、5.3、5.4、5.5、5.6、5.7、5.8、5.9、6、6.1、6.2、6.3、6.4、6.5、6.6、6.7、6.8、6.9、7、7.1、7.2、7.3、7.4、7.5、7.6、7.7、7.8、7.9、または8細胞層の平均厚さで第2のガス透過性表面積上に層状化されるように修正された、該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、ステップ(b)において、プライミングによる第1の拡張が、第1のガス透過性表面積を含む第1の容器内で行われ、ステップ(c)において、急速な第2の拡張が、第1の容器内で行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、ステップ(b)において、第1の初期拡張が、第1のTIL集団の細胞培養培地に追加の抗原提示細胞(APC)を補充することによって行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法であって、ステップ(c)において添加されるAPCの数が、ステップ(b)において添加されるAPCの数よりも多く、ステップ(b)において、APCが、正確にまたは約1細胞層~正確にまたは約3細胞層の平均厚さで第1のガス透過性表面積上に層状化される、方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、ステップ(b)において、APCが、正確にまたは約1.5細胞層~正確にまたは約2.5細胞層の平均厚さで第1のガス透過性表面積上に層状化されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、ステップ(b)において、APCが、正確にまたは約2細胞層の平均厚さで第1のガス透過性表面積上に層状化されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、ステップ(b)において、APCが、約1、1.1、1.2、1.3、1.4、1.5、1.6、1.7、1.8、1.9、2、2.1、2.2、2.3、2.4、2.5、2.6、2.7、2.8、2.9、または3細胞層の平均厚さで第1のガス透過性表面積上に層状化されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、ステップ(c)において、APCが、正確にまたは約3細胞層~正確にまたは約10細胞層の平均厚さで第1のガス透過性表面積上に層状化されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、ステップ(c)において、APCが、正確にまたは約4細胞層~正確にまたは約8細胞層の平均厚さで第1のガス透過性表面積上に層状化されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、ステップ(c)において、APCが、正確にまたは約3、4、5、6、7、8、9、または10細胞層の平均厚さで第1のガス透過性表面積上に層状化されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、ステップ(c)において、APCが、正確にまたは約4、4.1、4.2、4.3、4.4、4.5、4.6、4.7、4.8、4.9、5、5.1、5.2、5.3、5.4、5.5、5.6、5.7、5.8、5.9、6、6.1、6.2、6.3、6.4、6.5、6.6、6.7、6.8、6.9、7、7.1、7.2、7.3、7.4、7.5、7.6、7.7、7.8、7.9、または8細胞層の平均厚さで第1のガス透過性表面積上に層状化されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、ステップ(b)において、第1のTIL集団の細胞培養培地を追加の抗原提示細胞(APC)で補足することにより一次の第1の拡張が行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供し、ステップ(c)において添加されたAPCの数は、ステップ(b)において添加されたAPCの数よりも多く、ステップ(b)において層状化されたAPCの平均層数とステップ(c)において層状化されたAPCの平均層数との比率は、正確にまたは約1:1.1~正確にまたは約1:10の範囲から選択される。
別の実施形態では、本発明は、ステップ(b)において、第1のTIL集団の細胞培養培地を追加の抗原提示細胞(APC)で補足することにより一次の第1の拡張が行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供し、ステップ(c)において添加されたAPCの数は、ステップ(b)において添加されたAPCの数よりも多く、ステップ(b)において層状化されたAPCの平均層数とステップ(c)において層状化されたAPCの平均層数との比率は、正確にまたは約1:1.1~正確にまたは約1:9の範囲から選択される。
別の実施形態では、本発明は、ステップ(b)において、第1のTIL集団の細胞培養培地を追加の抗原提示細胞(APC)で補足することにより一次の第1の拡張が行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供し、ステップ(c)において添加されたAPCの数は、ステップ(b)において添加されたAPCの数よりも多く、ステップ(b)において層状化されたAPCの平均層数とステップ(c)において層状化されたAPCの平均層数との比率は、正確にまたは約1:1.1~正確にまたは約1:8の範囲から選択される。
別の実施形態では、本発明は、ステップ(b)において、第1のTIL集団の細胞培養培地を追加の抗原提示細胞(APC)で補足することにより一次の第1の拡張が行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供し、ステップ(c)において添加されたAPCの数は、ステップ(b)において添加されたAPCの数よりも多く、ステップ(b)において層状化されたAPCの平均層数とステップ(c)において層状化されたAPCの平均層数との比率は、正確にまたは約1:1.1~正確にまたは約1:7の範囲から選択される。
別の実施形態では、本発明は、ステップ(b)において、第1のTIL集団の細胞培養培地を追加の抗原提示細胞(APC)で補足することにより一次の第1の拡張が行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供し、ステップ(c)において添加されたAPCの数は、ステップ(b)において添加されたAPCの数よりも多く、ステップ(b)において層状化されたAPCの平均層数とステップ(c)において層状化されたAPCの平均層数との比率は、正確にまたは約1:1.1~正確にまたは約1:6の範囲から選択される。
別の実施形態では、本発明は、ステップ(b)において、第1のTIL集団の細胞培養培地を追加の抗原提示細胞(APC)で補足することにより一次の第1の拡張が行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供し、ステップ(c)において添加されたAPCの数は、ステップ(b)において添加されたAPCの数よりも多く、ステップ(b)において層状化されたAPCの平均層数とステップ(c)において層状化されたAPCの平均層数との比率は、正確にまたは約1:1.1~正確にまたは約1:5の範囲から選択される。
別の実施形態では、本発明は、ステップ(b)において、第1のTIL集団の細胞培養培地を追加の抗原提示細胞(APC)で補足することにより一次の第1の拡張が行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供し、ステップ(c)において添加されたAPCの数は、ステップ(b)において添加されたAPCの数よりも多く、ステップ(b)において層状化されたAPCの平均層数とステップ(c)において層状化されたAPCの平均層数との比率は、正確にまたは約1:1.1~正確にまたは約1:4の範囲から選択される。
別の実施形態では、本発明は、ステップ(b)において、第1のTIL集団の細胞培養培地を追加の抗原提示細胞(APC)で補足することにより一次の第1の拡張が行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供し、ステップ(c)において添加されたAPCの数は、ステップ(b)において添加されたAPCの数よりも多く、ステップ(b)において層状化されたAPCの平均層数とステップ(c)において層状化されたAPCの平均層数との比率は、正確にまたは約1:1.1~正確にまたは約1:3の範囲から選択される。
別の実施形態では、本発明は、ステップ(b)において、第1のTIL集団の細胞培養培地を追加の抗原提示細胞(APC)で補足することにより一次の第1の拡張が行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供し、ステップ(c)において添加されたAPCの数は、ステップ(b)において添加されたAPCの数よりも多く、ステップ(b)において層状化されたAPCの平均層数とステップ(c)において層状化されたAPCの平均層数との比率は、正確にまたは約1:1.1~正確にまたは約1:2の範囲から選択される。
別の実施形態では、本発明は、ステップ(b)において、第1のTIL集団の細胞培養培地を追加の抗原提示細胞(APC)で補足することにより一次の第1の拡張が行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供し、ステップ(c)において添加されたAPCの数は、ステップ(b)において添加されたAPCの数よりも多く、ステップ(b)において層状化されたAPCの平均層数とステップ(c)において層状化されたAPCの平均層数との比率は、正確にまたは約1:1.2~正確にまたは約1:8の範囲から選択される。
別の実施形態では、本発明は、ステップ(b)において、第1のTIL集団の細胞培養培地を追加の抗原提示細胞(APC)で補足することにより一次の第1の拡張が行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供し、ステップ(c)において添加されたAPCの数は、ステップ(b)において添加されたAPCの数よりも多く、ステップ(b)において層状化されたAPCの平均層数とステップ(c)において層状化されたAPCの平均層数との比率は、正確にまたは約1:1.3~正確にまたは約1:7の範囲から選択される。
別の実施形態では、本発明は、ステップ(b)において、第1のTIL集団の細胞培養培地を追加の抗原提示細胞(APC)で補足することにより一次の第1の拡張が行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供し、ステップ(c)において添加されたAPCの数は、ステップ(b)において添加されたAPCの数よりも多く、ステップ(b)において層状化されたAPCの平均層数とステップ(c)において層状化されたAPCの平均層数との比率は、正確にまたは約1:1.4~正確にまたは約1:6の範囲から選択される。
別の実施形態では、本発明は、ステップ(b)において、第1のTIL集団の細胞培養培地を追加の抗原提示細胞(APC)で補足することにより一次の第1の拡張が行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供し、ステップ(c)において添加されたAPCの数は、ステップ(b)において添加されたAPCの数よりも多く、ステップ(b)において層状化されたAPCの平均層数とステップ(c)において層状化されたAPCの平均層数との比率は、正確にまたは約1:1.5~正確にまたは約1:5の範囲から選択される。
別の実施形態では、本発明は、ステップ(b)において、第1のTIL集団の細胞培養培地を追加の抗原提示細胞(APC)で補足することにより一次の第1の拡張が行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供し、ステップ(c)において添加されたAPCの数は、ステップ(b)において添加されたAPCの数よりも多く、ステップ(b)において層状化されたAPCの平均層数とステップ(c)において層状化されたAPCの平均層数との比率は、正確にまたは約1:1.6~正確にまたは約1:4の範囲から選択される。
別の実施形態では、本発明は、ステップ(b)において、第1のTIL集団の細胞培養培地を追加の抗原提示細胞(APC)で補足することにより一次の第1の拡張が行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供し、ステップ(c)において添加されたAPCの数は、ステップ(b)において添加されたAPCの数よりも多く、ステップ(b)において層状化されたAPCの平均層数とステップ(c)において層状化されたAPCの平均層数との比率は、正確にまたは約1:1.7~正確にまたは約1:3.5の範囲から選択される。
別の実施形態では、本発明は、ステップ(b)において、第1のTIL集団の細胞培養培地を追加の抗原提示細胞(APC)で補足することにより一次の第1の拡張が行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供し、ステップ(c)において添加されたAPCの数は、ステップ(b)において添加されたAPCの数よりも多く、ステップ(b)において層状化されたAPCの平均層数とステップ(c)において層状化されたAPCの平均層数との比率は、正確にまたは約1:1.8~正確にまたは約1:3の範囲から選択される。
別の実施形態では、本発明は、ステップ(b)において、第1のTIL集団の細胞培養培地を追加の抗原提示細胞(APC)で補足することにより一次の第1の拡張が行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供し、ステップ(c)において添加されたAPCの数は、ステップ(b)において添加されたAPCの数よりも多く、ステップ(b)において層状化されたAPCの平均層数とステップ(c)において層状化されたAPCの平均層数との比率は、正確にまたは約1:1.9~正確にまたは約1:2.5の範囲から選択される。
別の実施形態では、本発明は、ステップ(b)において、第1のTIL集団の細胞培養培地を追加の抗原提示細胞(APC)で補足することにより一次の第1の拡張が行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供し、ステップ(c)において添加されたAPCの数は、ステップ(b)において添加されたAPCの数よりも多く、ステップ(b)において層状化されたAPCの平均層数とステップ(c)において層状化されたAPCの平均層数との比率は、正確にまたは約1:2の範囲から選択される。
別の実施形態では、本発明は、ステップ(b)において、第1の初期拡張が、第1のTIL集団の細胞培養培地に追加の抗原提示細胞(APC)を補充することによって行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法であって、ステップ(c)において添加されるAPCの数が、ステップ(b)において添加されるAPCの数よりも多く、ステップ(b)において層状化されるAPCの層の平均数の、ステップ(c)において層状化されるAPCの層の平均数に対する比率が、正確にまたは約1:1.1、1:1.2、1:1.3、1:1.4、1:1.5、1:1.6、1:1.7、1:1.8、1:1.9、1:2、1:2.1、1:2.2、1:2.3、1:2.4、1:2.5、1:2.6、1:2.7、1:2.8、1:2.9、1:3、1:3.1、1:3.2、1:3.3、1:3.4、1:3.5、1:3.6、1:3.7、1:3.8、1:3.9、1:4、1:4.1、1:4.2、1:4.3、1:4.4、1:4.5、1:4.6、1:4.7、1:4.8、1:4.9、1:5、1:5.1、1:5.2、1:5.3、1:5.4、1:5.5、1:5.6、1:5.7、1:5.8、1:5.9、1:6、1:6.1、1:6.2、1:6.3、1:6.4、1:6.5、1:6.6、1:6.7、1:6.8、1:6.9、1:7、1:7.1、1:7.2、1:7.3、1:7.4、1:7.5、1:7.6、1:7.7、1:7.8、1:7.9、1:8、1:8.1、1:8.2、1:8.3、1:8.4、1:8.5、1:8.6、1:8.7、1:8.8、1:8.9、1:9、1:9.1、1:9.2、1:9.3、1:9.4、1:9.5、1:9.6、1:9.7、1:9.8、1:9.9、または1:10から選択される、方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、第2のTIL集団中のTILの数の第1のTIL集団中のTILの数に対する比率が、正確にまたは約1.5:1~正確にまたは約100:1であるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、第2のTIL集団中のTILの数の第1のTIL集団中のTILの数に対する比率が、正確にまたは約50:1であるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、第2のTIL集団中のTILの数の第1のTIL集団中のTILの数に対する比率が、正確にまたは約25:1であるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、第2のTIL集団中のTILの数の第1のTIL集団中のTILの数に対する比率が、正確にまたは約20:1であるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、第2のTIL集団中のTILの数の第1のTIL集団中のTILの数に対する比率が、正確にまたは約10:1であるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、第2のTIL集団の数が、第1のTIL集団よりも少なくとも正確にまたは約50倍多いように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、第2のTIL集団の数が、第1のTIL集団よりも少なくとも正確にまたは約1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、または50倍多いように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、ステップ(c)における第2の期間の開始の正確にまたは約2日または正確にまたは約3日後に、細胞培養培地に追加のIL-2が補充されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、凍結保存プロセスを使用して、ステップ(d)において採取されたTIL集団を凍結保存するステップをさらに含むように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、ステップ(d)の後に、ステップ(d)から採取されたTIL集団を、任意選択でHypoThermosolを含有する注入バッグに移す追加のステップ(e)を行うことを含むように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、凍結保存プロセスを使用して、ステップ(e)において採取されたTIL集団を含む注入バッグを凍結保存するステップを含むように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、凍結保存プロセスが、1:1の採取されたTIL集団の凍結保存培地に対する比率を使用して行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、抗原提示細胞が末梢血単核細胞(PBMC)であるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、PBMCが照射され、かつ同種異系であるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、ステップ(b)において細胞培養に添加されるAPCの総数が2.5×10であるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、ステップ(c)において細胞培養に添加されるAPCの総数が5×10であるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、APCがPBMCであるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、PBMCが照射され、かつ同種異系であるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、抗原提示細胞が人工抗原提示細胞であるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、ステップ(d)での採取が膜ベースの細胞処理システムを使用して行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、ステップ(d)での採取がLOVO細胞処理システムを使用して行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、ステップ(b)において、複数の断片が1容器当たり正確にまたは約5~正確にまたは約60個の断片を含むように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、ステップ(b)において、複数の断片が1容器当たり正確にまたは約10~正確にまたは約60個の断片を含むように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、ステップ(b)において、複数の断片が1容器当たり正確にまたは約15~正確にまたは約60個の断片を含むように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、ステップ(b)において、複数の断片が1容器当たり正確にまたは約20~正確にまたは約60個の断片を含むように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、ステップ(b)において、複数の断片が1容器当たり正確にまたは約25~正確にまたは約60個の断片を含むように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、ステップ(b)において、複数の断片が1容器当たり正確にまたは約30~正確にまたは約60個の断片を含むように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、ステップ(b)において、複数の断片が1容器当たり正確にまたは約35~正確にまたは約60個の断片を含むように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、ステップ(b)において、複数の断片が1容器当たり正確にまたは約40~正確にまたは約60個の断片を含むように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、ステップ(b)において、複数の断片が1容器当たり正確にまたは約45~正確にまたは約60個の断片を含むように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、ステップ(b)において、複数の断片が1容器当たり正確にまたは約50~正確にまたは約60個の断片を含むように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、ステップ(b)において、複数の断片が1容器当たり正確にまたは約2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、50、51、52、53、54、55、56、57、58、59、または60個の断片(複数可)を含むように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、各断片が正確にまたは約27mmの体積を有するように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、各断片が正確にまたは約20mm~正確にまたは約50mmの体積を有するように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、各断片が正確にまたは約21mm~正確にまたは約30mmの体積を有するように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、各断片が正確にまたは約22mm~正確にまたは約29.5mmの体積を有するように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、各断片が正確にまたは約23mm~正確にまたは約29mmの体積を有するように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、各断片が正確にまたは約24mm~正確にまたは約28.5mmの体積を有するように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、各断片が正確にまたは約25mm~正確にまたは約28mmの体積を有するように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、各断片が正確にまたは約26.5mm~正確にまたは約27.5mmの体積を有するように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、各断片が正確にまたは約21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、または50mmの体積を有するように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、複数の断片が正確にまたは約30~正確にまたは約60個の断片を含み、正確にまたは約1300mm~正確にまたは約1500mmの総体積を有するように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、複数の断片が正確にまたは約50個の断片を含み、正確にまたは約1350mmの総体積を有するように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、複数の断片が正確にまたは約50個の断片を含み、正確にまたは約1グラム~正確にまたは約1.5グラムの総質量を有するように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、細胞培養培地がG容器またはXuriセルバッグである容器内に提供されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、細胞培養培地中のIL-2濃度が約10,000IU/mL~約5000IU/mLであるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、細胞培養培地中のIL-2濃度が約6,000IU/mLであるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、凍結保存培地がジメチルスルホキシド(DMSO)を含むように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、凍結保存培地が7%~10%DMSOを含むように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、ステップ(b)における第1の期間が正確にまたは約1日、2日、3日、4日、5日、6日、または7日の期間内に行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、ステップ(c)における第2の期間が正確にまたは約1日、2日、3日、4日、5日、6日、7日、8日、9日、10日、または11日の期間内に行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、ステップ(b)における第1の期間及びステップ(c)における第2の期間が各々、正確にまたは約1日、2日、3日、4日、5日、6日、または7日の期間内に個別に行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、ステップ(b)における第1の期間及びステップ(c)における第2の期間が各々、正確にまたは約5日、6日、または7日の期間内に個別に行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、ステップ(b)における第1の期間及びステップ(c)における第2の期間が各々、正確にまたは約7日の期間内に個別に行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、ステップ(a)~(d)が合計で正確にまたは約14日~正確にまたは約18日で行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、ステップ(a)~(d)が合計で正確にまたは約15日~正確にまたは約18日で行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、ステップ(a)~(d)が合計で正確にまたは約16日~正確にまたは約18日で行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、ステップ(a)~(d)が合計で正確にまたは約17日~正確にまたは約18日で行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、ステップ(a)~(d)が合計で正確にまたは約14日~正確にまたは約17日で行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、ステップ(a)~(d)が合計で正確にまたは約15日~正確にまたは約17日で行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、ステップ(a)~(d)が合計で正確にまたは約16日~正確にまたは約17日で行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、ステップ(a)~(d)が合計で正確にまたは約14日~正確にまたは約16日で行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、ステップ(a)~(d)が合計で正確にまたは約15日~正確にまたは約16日で行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、ステップ(a)~(d)が合計で正確にまたは約14日で行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、ステップ(a)~(d)が合計で正確にまたは約15日で行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、ステップ(a)~(d)が合計で正確にまたは約16日で行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、ステップ(a)~(d)が合計で正確にまたは約17日で行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、ステップ(a)~(d)が合計で正確にまたは約18日で行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、ステップ(a)~(d)が合計で正確にまたは約14日以内で行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、ステップ(a)~(d)が合計で正確にまたは約15日以内で行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、ステップ(a)~(d)が合計で正確にまたは約16日以内で行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、ステップ(a)~(d)が合計で正確にまたは約18日以内で行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、ステップ(d)で採取された治療的TIL集団が、TILの治療上有効な投与量に十分なTILを含むように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、治療上有効な投与量に十分なTILの数が、正確にまたは約2.3×1010~正確にまたは約13.7×1010であるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、ステップ(c)における第3のTIL集団が、増加した有効性、増加したインターフェロンγ産生、及び/または増加したポリクローン性を提供するように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、ステップ(c)における第3のTIL集団が、16日以上のプロセスによって調製されたTILと比較して、少なくとも1倍~5倍以上のインターフェロンγ産生を提供するように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、ステップ(c)における第3のTIL集団が、17日以上のプロセスによって調製されたTILと比較して、少なくとも1倍~5倍以上のインターフェロンγ産生を提供するように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、ステップ(c)における第3のTIL集団が、18日以上のプロセスによって調製されたTILと比較して、少なくとも1倍~5倍以上のインターフェロンγ産生を提供するように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、ステップ(c)の第3のTIL集団から得られたエフェクターT細胞及び/またはセントラルメモリーT細胞が、ステップ(b)の第2の細胞集団から得られたエフェクターT細胞及び/またはセントラルメモリーT細胞と比較して増加したCD8及びCD28発現を示すように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、方法に列挙された各容器が密閉容器であるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、方法に列挙された各容器がG容器であるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、方法に列挙された各容器がGREX-10であるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、方法に列挙された各容器がGREX-100であるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、方法に列挙された各容器がGREX-500であるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法によって作製された腫瘍浸潤リンパ球(TIL)の治療用集団を提供する。
別の実施形態では、本発明は、患者の腫瘍組織から調製された腫瘍浸潤リンパ球(TIL)の治療的集団を提供し、この治療的TIL集団は、第1のTIL拡張が抗原提示細胞(APC)またはOKT3を添加せずに行われるプロセスによって調製されたTILと比較して、増加した有効性、増加したインターフェロンγ産生、及び/または増加したポリクローン性を提供する。
別の実施形態では、本発明は、患者の腫瘍組織から調製された腫瘍浸潤リンパ球(TIL)の治療的集団を提供し、この治療的TIL集団は、第1のTIL拡張が抗原提示細胞(APC)を添加せずに行われるプロセスによって調製されたTILと比較して、増加した有効性、増加したインターフェロンγ産生、及び/または増加したポリクローン性を提供する。
別の実施形態では、本発明は、患者の腫瘍組織から調製された腫瘍浸潤リンパ球(TIL)の治療的集団を提供し、この治療的TIL集団は、第1のTIL拡張がOKT3を添加せずに行われるプロセスによって調製されたTILと比較して、増加した有効性、増加したインターフェロンγ産生、及び/または増加したポリクローン性を提供する。
別の実施形態では、本発明は、患者の腫瘍組織から調製された腫瘍浸潤リンパ球(TIL)の治療的集団を提供し、この治療的TIL集団は、第1のTIL拡張が抗原提示細胞(APC)もOKT3も添加せずに行われるプロセスによって調製されたTILと比較して、増加した有効性、増加したインターフェロンγ産生、及び/または増加したポリクローン性を提供する。
別の実施形態では、本発明は、患者の腫瘍組織から調製された腫瘍浸潤リンパ球(TIL)の治療的集団を提供し、この治療的TIL集団は、16日以上のプロセスによってプロセスによって調製されたTILと比較して、増加した有効性、増加したインターフェロンγ産生、及び/または増加したポリクローン性を提供する。
別の実施形態では、本発明は、患者の腫瘍組織から調製された腫瘍浸潤リンパ球(TIL)の治療的集団を提供し、この治療的TIL集団は、17日以上のプロセスによってプロセスによって調製されたTILと比較して、増加した有効性、増加したインターフェロンγ産生、及び/または増加したポリクローン性を提供する。
別の実施形態では、本発明は、患者の腫瘍組織から調製された腫瘍浸潤リンパ球(TIL)の治療的集団を提供し、この治療的TIL集団は、18日以上のプロセスによってプロセスによって調製されたTILと比較して、増加した有効性、増加したインターフェロンγ産生、及び/または増加したポリクローン性を提供する。
別の実施形態では、本発明は、増加したインターフェロンγ産生を提供する、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の治療的TIL集団を提供する。
別の実施形態では、本発明は、増加したポリクローン性を提供する、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載された治療的TIL集団を提供する。
別の実施形態では、本発明は、増加した有効性を提供する、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の治療的TIL集団を提供する。
別の実施形態では、本発明は、治療的TIL集団が、16日以上のプロセスによって調製されたTILと比較して、少なくとも1倍多いインターフェロンγ産生が可能であるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の治療的TIL集団を提供する。別の実施形態では、本発明は、治療的TIL集団が、17日以上のプロセスによって調製されたTILと比較して、少なくとも1倍多いインターフェロンγ産生が可能であるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の治療的TIL集団を提供する。別の実施形態では、本発明は、治療的TIL集団が、18日以上のプロセスによって調製されたTILと比較して、少なくとも1倍多いインターフェロンγ産生が可能であるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の治療的TIL集団を提供する。いくつかの実施形態では、TILは、例えば、上記のステップA~Fに記載されるように、または上記のステップA~Fに従って(また、例えば、図8(特に、例えば図8B及び/または図8C)に示されているように)、本明細書に記載される拡張プロセスに起因する少なくとも1倍多いインターフェロンγ産生が可能になる。
別の実施形態では、本発明は、治療的TIL集団が、16日以上のプロセスによって調製されたTILと比較して、少なくとも2倍多いインターフェロンγ産生が可能であるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の治療的TIL集団を提供する。別の実施形態では、本発明は、治療的TIL集団が、17日以上のプロセスによって調製されたTILと比較して、少なくとも2倍多いインターフェロンγ産生が可能であるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の治療的TIL集団を提供する。別の実施形態では、本発明は、治療的TIL集団が、18日以上のプロセスによって調製されたTILと比較して、少なくとも2倍多いインターフェロンγ産生が可能であるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の治療的TIL集団を提供する。いくつかの実施形態では、TILは、例えば、上記のステップA~Fに記載されるように、または上記のステップA~Fに従って(また、例えば、図8(特に、例えば図8B及び/または図8C)に示されているように)、本明細書に記載される拡張プロセスに起因する少なくとも2倍多いインターフェロンγ産生が可能になる。
別の実施形態では、本発明は、治療的TIL集団が、16日以上のプロセスによって調製されたTILと比較して、少なくとも3倍多いインターフェロンγ産生が可能であるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の治療的TIL集団を提供する。別の実施形態では、本発明は、治療的TIL集団が、17日以上のプロセスによって調製されたTILと比較して、少なくとも3倍多いインターフェロンγ産生が可能であるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の治療的TIL集団を提供する。別の実施形態では、本発明は、治療的TIL集団が、18日以上のプロセスによって調製されたTILと比較して、少なくとも3倍多いインターフェロンγ産生が可能であるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の治療的TIL集団を提供する。いくつかの実施形態では、TILは、例えば、上記のステップA~Fに記載されるように、または上記のステップA~Fに従って(また、例えば、図8(特に、例えば図8B及び/または図8C)に示されているように)、本明細書に記載される拡張プロセスに起因する少なくとも3倍多いインターフェロンγ産生が可能になる。
別の実施形態では、本発明は、第1のTIL拡張が抗原提示細胞(APC)を添加せずに行われるプロセスによって調製されたTILと比較して、少なくとも1倍多いインターフェロンγ産生が可能である腫瘍浸潤リンパ球(TIL)の治療的集団を提供する。いくつかの実施形態では、TILは、例えば、上記のステップA~Fに記載されるように、または上記のステップA~Fに従って(また、例えば、図8(特に、例えば図8B及び/または図8C)に示されているように)、本明細書に記載される拡張プロセスに起因する少なくとも1倍多いインターフェロンγ産生が可能になる。
別の実施形態では、本発明は、第1のTIL拡張がOKT3を添加せずに行われるプロセスによって調製されたTILと比較して、少なくとも1倍多いインターフェロンγ産生が可能である腫瘍浸潤リンパ球(TIL)の治療的集団を提供する。いくつかの実施形態では、TILは、例えば、上記のステップA~Fに記載されるように、または上記のステップA~Fに従って(また、例えば、図8(特に、例えば図8B及び/または図8C)に示されているように)、本明細書に記載される拡張プロセスに起因する少なくとも1倍多いインターフェロンγ産生が可能になる。
別の実施形態では、本発明は、第1のTIL拡張がAPCを添加せずに行われるプロセスによって調製されたTILと比較して、少なくとも2倍多いインターフェロンγ産生が可能であるTILの治療的集団を提供する。いくつかの実施形態では、TILは、例えば、上記のステップA~Fに記載されるように、または上記のステップA~Fに従って(また、例えば、図8(特に、例えば図8B及び/または図8C)に示されているように)、本明細書に記載される拡張プロセスに起因する少なくとも2倍多いインターフェロンγ産生が可能になる。
別の実施形態では、本発明は、第1のTIL拡張がOKT3を添加せずに行われるプロセスによって調製されたTILと比較して、少なくとも2倍多いインターフェロンγ産生が可能である治療的TIL集団を提供する。いくつかの実施形態では、TILは、例えば、上記のステップA~Fに記載されるように、または上記のステップA~Fに従って(また、例えば、図8(特に、例えば図8B及び/または図8C)に示されているように)、本明細書に記載される拡張プロセスに起因する少なくとも2倍多いインターフェロンγ産生が可能になる。
別の実施形態では、本発明は、第1のTIL拡張がAPCを添加せずに行われるプロセスによって調製されたTILと比較して、少なくとも3倍多いインターフェロンγ産生が可能である治療的TIL集団を提供する。いくつかの実施形態では、TILは、例えば、上記のステップA~Fに記載されるように、または上記のステップA~Fに従って(また、例えば、図8(特に、例えば図8B及び/または図8C)に示されているように)、本明細書に記載される拡張プロセスに起因する少なくとも1倍多いインターフェロンγ産生が可能になる。
別の実施形態では、本発明は、第1のTIL拡張がOKT3を添加せずに行われるプロセスによって調製されたTILと比較して、少なくとも3倍多いインターフェロンγ産生が可能である治療的TIL集団を提供する。いくつかの実施形態では、TILは、例えば、上記のステップA~Fに記載されるように、または上記のステップA~Fに従って(また、例えば、図8(特に、例えば図8B及び/または図8C)に示されているように)、本明細書に記載される拡張プロセスに起因する少なくとも3倍多いインターフェロンγ産生が可能になる。
別の実施形態では、本発明は、腫瘍断片が、小生検(例えば、パンチ生検を含む)、コア生検、コア針生検、または細針吸引物であるように修正された、上記の該当する前の段落のいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、腫瘍断片がコア生検であるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、腫瘍断片が細針吸引物であるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、腫瘍断片が小生検(例えば、パンチ生検を含む)であるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、腫瘍断片がコア針生検であるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、(i)方法が、対象由来の腫瘍組織の1つ以上の小生検(例えば、パンチ生検を含む)、コア生検、コア針生検、または細針吸引物から第1のTIL集団を取得することを含み、(ii)方法が、プライミングによる第1の拡張ステップを行う前に、IL-2を含む細胞培養培地中で第1のTIL集団を約3日間培養するステップを行うことを含み、(iii)方法が、プライミングによる第1の拡張を約8日間行うことを含み、及び(iv)方法が、急速な第2の拡張を約11日間行うことを含むように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。前述の実施形態のうちのいくつかでは、方法のこれらのステップは、約22日で完了する。
別の実施形態では、本発明は、(i)方法が、対象由来の腫瘍組織の1つ以上の小生検(例えば、パンチ生検を含む)、コア生検、コア針生検、または細針吸引物から第1のTIL集団を取得することを含み、(ii)方法が、プライミングによる第1の拡張ステップを行う前に、IL-2を含む細胞培養培地中で第1のTIL集団を約3日間培養するステップを行うことを含み、(iii)方法が、プライミングによる第1の拡張を約8日間行うことを含み、かつ(iv)方法が、第2のTIL集団の培養物を約5日間培養し、培養物を最大5つの継代培養物に分割し、かつ継代培養物を約6日間培養することによって、急速な第2の拡張を行うことを含むように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。前述の実施形態のうちのいくつかでは、最大5つの継代培養物が各々、第2のTIL集団の培養が急速な第2の拡張で開始される容器と同じサイズのまたはそれよりも大きい容器内で培養される。前述の実施形態のうちのいくつかでは、第2のTIL集団の培養物は、最大5つの継代培養物間で均等に分けられる。前述の実施形態のうちのいくつかでは、方法のこれらのステップは、約22日で完了する。
別の実施形態では、本発明は、第1のTIL集団が、対象由来の腫瘍組織の1~約20個の小生検(例えば、パンチ生検を含む)、コア生検、コア針生検、または細針吸引物から取得されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、第1のTIL集団が、対象由来の腫瘍組織の1~約10個の小生検(例えば、パンチ生検を含む)、コア生検、コア針生検、または細針吸引物から取得されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、第1のTIL集団が、対象由来の腫瘍組織の1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、または20個の小生検(例えば、パンチ生検を含む)、コア生検、コア針生検、または細針吸引物から取得されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、第1のTIL集団が、対象由来の腫瘍組織の1、2、3、4、5、6、7、8、9、または10個の小生検(例えば、パンチ生検を含む)、コア生検、コア針生検、または細針吸引物から取得されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、第1のTIL集団が、対象由来の腫瘍組織の1~約20個のコア生検から取得されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、第1のTIL集団が、対象由来の腫瘍組織の1~約10個のコア生検から取得されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、第1のTIL集団が、対象由来の腫瘍組織の1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、または20個のコア生検から取得されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、第1のTIL集団が、対象由来の腫瘍組織の1、2、3、4、5、6、7、8、9、または10個のコア生検から取得されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、第1のTIL集団が、対象由来の腫瘍組織の1~約20個の細針吸引物から取得されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、第1のTIL集団が、対象由来の腫瘍組織の1~約10個の細針吸引物から取得されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、第1のTIL集団が、対象由来の腫瘍組織の1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、または20個の細針吸引物から取得されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、第1のTIL集団が、対象由来の腫瘍組織の1、2、3、4、5、6、7、8、9、または10個の細針吸引物から取得されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、第1のTIL集団が、対象由来の腫瘍組織の1~約20個のコア針生検から取得されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、第1のTIL集団が、対象由来の腫瘍組織の1~約10個のコア針生検から取得されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、第1のTIL集団が、対象由来の腫瘍組織の1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、または20個のコア針生検から取得されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、第1のTIL集団が、対象由来の腫瘍組織の1、2、3、4、5、6、7、8、9、または10個のコア針生検から取得されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、第1のTIL集団が、対象由来の腫瘍組織の1~約20個の小生検(例えば、パンチ生検を含む)から取得されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、第1のTIL集団が、対象由来の腫瘍組織の1~約10個の小生検(例えば、パンチ生検を含む)から取得されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、第1のTIL集団が、対象由来の腫瘍組織の1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、または20個の小生検(例えば、パンチ生検を含む)から取得されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、第1のTIL集団が、対象由来の腫瘍組織の1、2、3、4、5、6、7、8、9、または10個の小生検(例えば、パンチ生検を含む)から取得されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、(i)方法が、対象由来の腫瘍組織の1~約10個のコア生検から第1のTIL集団を得ることを含み、(ii)方法が、第1のプライミング拡張ステップを行う前に、IL-2を含む細胞培養培地中で第1のTIL集団を約3日間培養するステップを行うことを含み、(iii)方法が、第1のTIL集団を、IL-2、OKT-3、及び抗原提示細胞(APC)を含む培養培地中で約8日間培養することによって第1のプライミング拡張ステップを行い、第2のTIL集団を得ることを含み、かつ(iv)方法が、第2のTIL集団を、IL-2、OKT-3、及びAPCを含む培養培地中で約11日間培養することによって第2の急速拡張ステップを行うことを含むように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。前述の実施形態のうちのいくつかでは、方法のこれらのステップは、約22日で完了する。
別の実施形態では、本発明は、(i)方法が、対象由来の腫瘍組織の1~約10個のコア生検から第1のTIL集団を得ることを含み、(ii)方法が、第1のプライミング拡張ステップを行う前に、IL-2を含む細胞培養培地中で第1のTIL集団を約3日間培養するステップを行うことを含み、(iii)方法が、第1のTIL集団を、IL-2、OKT-3、及び抗原提示細胞(APC)を含む培養培地中で約8日間培養することによって第1のプライミング拡張ステップを行い、第2のTIL集団を得ることを含み、かつ(iv)方法が、第2のTIL集団の培養物を、IL-2、OKT-3、及びAPCを含む培養培地中で約5日間培養し、培養物を最大5つの継代培養物に分割し、かつ継代培養物の各々を、IL-2を含む培養培地中で約6日間培養することによって、第2の急速拡張を行うことを含むように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。前述の実施形態のうちのいくつかでは、最大5つの継代培養物が各々、第2のTIL集団の培養が急速な第2の拡張で開始される容器と同じサイズのまたはそれよりも大きい容器内で培養される。前述の実施形態のうちのいくつかでは、第2のTIL集団の培養物は、最大5つの継代培養物間で均等に分けられる。前述の実施形態のうちのいくつかでは、方法のこれらのステップは、約22日で完了する。
別の実施形態では、本発明は、(i)方法が、対象由来の腫瘍組織の1~約10個のコア生検から第1のTIL集団を取得することを含み、(ii)方法が、プライミングによる第1の拡張ステップを行う前に、G-Rex 100Mフラスコ内の0.5LのCM1培養培地中6000IU IL-2/mLを含む細胞培養培地中で第1のTIL集団を約3日間培養するステップを行うことを含み、(iii)方法が、6000IU/mLのIL-2、30ng/mLのOKT-3、及び約10個のフィーダー細胞を含有する0.5LのCM1培養培地を添加し、約8日間培養することによって、プライミングによる第1の拡張を行うことを含み、かつ(iv)方法が、(a)第2のTIL集団を、3000IU/mLのIL-2、30ng/mLのOKT-3、及び5×10個のフィーダー細胞を有する5LのCM2培養培地を含有するG-Rex 500MCSフラスコに移し、約5日間培養することと、(b)10個のTILを、3000IU/mLのIL-2を有する5LのAIM-V培地を含有する最大5つのG-Rex 500MCSフラスコの各々に移すことによって培養物を最大5つの継代培養物に分割し、継代培養物を約6日間培養することとによって、急速な第2の拡張を行うことを含むように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。前述の実施形態のうちのいくつかでは、方法のこれらのステップは、約22日で完了する。
別の実施形態では、本発明は、T細胞を拡張する方法であって、(a)第1のT細胞集団を培養することによってドナーから取得された第1のT細胞集団のプライミングによる第1の拡張を行って成長をもたらし、第1のT細胞集団の活性化をプライミングすることと、(b)ステップ(a)においてプライミングされた第1のT細胞集団の活性化が減衰し始めた後、第1のT細胞集団を培養することによって第1のT細胞集団の急速な第2の拡張を行って成長をもたらし、第1のT細胞集団の活性化を促進して第2のT細胞集団を取得することと、(c)第2のT細胞集団を採取することと、を含む、T細胞を拡張する方法を提供する。別の実施形態では、急速な第2の拡張ステップは、複数のステップに分けられて、(a)第1のT細胞集団を、第1の容器、例えば、G-Rex 100MCS容器内での小規模培養で約3~4日間培養することによって急速な第2の拡張を行うことと、その後、(b)小規模培養での第1のT細胞集団を、第1の容器よりも大きい第2の容器、例えば、G-Rex 500MCS容器に移し、小規模培養由来の第1のT細胞集団を、第2の容器内でのより大規模な培養で約4~7日間培養することとによって、培養のスケールアップを達成する。別の実施形態では、急速拡張ステップは、複数のステップに分けられて、(a)第1のT細胞集団を、第1の容器、例えば、G-Rex 100MCS容器内での第1の小規模培養で約3~4日間培養することによって急速な第2の拡張を行うことと、その後、(b)第1の小規模培養由来の第1のT細胞集団を、第1の容器とサイズが等しい少なくとも2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、または20個の第2の容器に移して配分することとによって、培養のスケールアウトを達成し、各第2の容器内で、第1の小規模培養由来のかかる第2の容器に移された第1のT細胞集団の一部が、第2の小規模培養で約4~7日間培養される。別の実施形態では、急速拡張ステップは、複数のステップに分けられて、(a)第1のT細胞集団を、第1の容器、例えば、G-Rex 100MCS容器内での小規模培養で約3~4日間培養することによって急速な第2の拡張を行うことと、その後、(b)小規模培養由来の第1のT細胞集団を、第1の容器よりもサイズが大きい少なくとも2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、または20個の第2の容器、例えば、G-Rex 500MCS容器に移して配分することとによって、培養のスケールアウト及びスケールアップを達成し、各第2の容器内で、小規模培養由来のかかる第2の容器に移された第1のT細胞集団の一部が、より大規模な培養で約4~7日間培養される。別の実施形態では、急速拡張ステップは、複数のステップに分けられて、(a)第1のT細胞集団を、第1の容器、例えば、G-Rex 100MCS容器内での小規模培養で約4日間培養することによって急速な第2の拡張を行うことと、その後、(b)小規模培養由来の第1のT細胞集団を、第1の容器よりもサイズが大きい2、3、または4個の第2の容器、例えば、G-Rex 500MCS容器に移して配分することとによって、培養のスケールアウト及びスケールアップを達成し、各第2の容器内で、小規模培養由来のかかる第2の容器に移された第1のT細胞集団の一部が、より大規模な培養で約5日間培養される。
別の実施形態では、本発明は、急速な第2の拡張のステップが、複数のステップに分けられて、(a)第1のT細胞集団を、第1の容器、例えば、G-Rex 100MCS容器内での小規模培養で約2~4日間培養することによって急速な第2の拡張を行うことと、その後、(b)小規模培養での第1のT細胞集団を、第1の容器よりも大きい第2の容器、例えば、G-Rex 500MCS容器に移し、小規模培養由来の第1のT細胞集団を、第2の容器内でのより大規模な培養で約5~7日間培養することとによって、培養のスケールアップを達成する。
別の実施形態では、本発明は、急速拡張のステップが、複数のステップに分けられて、(a)第1のT細胞集団を、第1の容器、例えば、G-Rex 100MCS容器内での第1の小規模培養で約2~4日間培養することによって急速な第2の拡張を行うことと、その後、(b)第1の小規模培養由来の第1のT細胞集団を、第1の容器とサイズが等しい少なくとも2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、または20個の第2の容器に移して配分することとによって、培養のスケールアウトを達成し、各第2の容器内で、第1の小規模培養由来のかかる第2の容器に移された第1のT細胞集団の一部が、第2の小規模培養で約5~7日間培養される。
別の実施形態では、本発明は、急速拡張のステップが、複数のステップに分けられて、(a)第1のT細胞集団を、第1の容器、例えば、G-Rex 100MCS容器内での小規模培養で約2~4日間培養することによって急速な第2の拡張を行うことと、その後、(b)小規模培養由来の第1のT細胞集団を、第1の容器よりもサイズが大きい少なくとも2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、または20個の第2の容器、例えば、G-Rex 500MCS容器に移して配分することとによって、培養のスケールアウト及びスケールアップを達成し、各第2の容器内で、小規模培養由来のかかる第2の容器に移された第1のT細胞集団の一部が、より大規模な培養で約5~7日間培養される。
別の実施形態では、本発明は、急速拡張のステップが、複数のステップに分けられて、(a)第1のT細胞集団を、第1の容器、例えば、G-Rex 100MCS容器内での小規模培養で約3~4日間培養することによって急速な第2の拡張を行うことと、その後、(b)小規模培養由来の第1のT細胞集団を、第1の容器よりもサイズが大きい2、3、または4個の第2の容器、例えば、G-Rex 500MCS容器に移して配分することとによって、培養のスケールアウト及びスケールアップを達成し、各第2の容器内で、小規模培養由来のかかる第2の容器に移された第1のT細胞集団の一部が、より大規模な培養で約5~6日間培養される。
別の実施形態では、本発明は、急速拡張のステップが、複数のステップに分けられて、(a)第1のT細胞集団を、第1の容器、例えば、G-Rex 100MCS容器内での小規模培養で約3~4日間培養することによって急速な第2の拡張を行うことと、その後、(b)小規模培養由来の第1のT細胞集団を、第1の容器よりもサイズが大きい2、3、または4個の第2の容器、例えば、G-Rex 500MCS容器に移して配分することとによって、培養のスケールアウト及びスケールアップを達成し、各第2の容器内で、小規模培養由来のかかる第2の容器に移された第1のT細胞集団の一部が、より大規模な培養で約5日間培養される。
別の実施形態では、本発明は、急速拡張のステップが、複数のステップに分けられて、(a)第1のT細胞集団を、第1の容器、例えば、G-Rex 100MCS容器内での小規模培養で約3~4日間培養することによって急速な第2の拡張を行うことと、その後、(b)小規模培養由来の第1のT細胞集団を、第1の容器よりもサイズが大きい2、3、または4個の第2の容器、例えば、G-Rex 500MCS容器に移して配分することとによって、培養のスケールアウト及びスケールアップを達成し、各第2の容器内で、小規模培養由来のかかる第2の容器に移された第1のT細胞集団の一部が、より大規模な培養で約6日間培養される。
別の実施形態では、本発明は、急速拡張のステップが、複数のステップに分けられて、(a)第1のT細胞集団を、第1の容器、例えば、G-Rex 100MCS容器内での小規模培養で約3~4日間培養することによって急速な第2の拡張を行うことと、その後、(b)小規模培養由来の第1のT細胞集団を、第1の容器よりもサイズが大きい2、3、または4個の第2の容器、例えば、G-Rex 500MCS容器に移して配分することとによって、培養のスケールアウト及びスケールアップを達成し、各第2の容器内で、小規模培養由来のかかる第2の容器に移された第1のT細胞集団の一部が、より大規模な培養で約7日間培養される。
別の実施形態では、本発明は、ステップ(a)のプライミングによる第1の拡張が最大7日の期間中に行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、ステップ(b)の急速な第2の拡張が最大8日の期間中に行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、ステップ(b)の急速な第2の拡張が最大9日の期間中に行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、ステップ(b)の急速な第2の拡張が最大10日の期間中に行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、ステップ(b)の急速な第2の拡張が最大11日の期間中に行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、ステップ(a)におけるプライミングによる第1の拡張が7日の期間中に行われ、かつステップ(b)の急速な第2の拡張が最大9日の期間中に行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、ステップ(a)におけるプライミングによる第1の拡張が7日の期間中に行われ、かつステップ(b)の急速な第2の拡張が最大10日の期間中に行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、ステップ(a)におけるプライミングによる第1の拡張が7日または8日の期間中に行われ、かつステップ(b)の急速な第2の拡張が最大9日の期間中に行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、ステップ(a)におけるプライミングによる第1の拡張が7日または8日の期間中に行われ、かつステップ(b)の急速な第2の拡張が最大10日の期間中に行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、ステップ(a)におけるプライミングによる第1の拡張が8日の期間中に行われ、かつステップ(b)の急速な第2の拡張が最大9日の期間中に行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、ステップ(a)におけるプライミングによる第1の拡張が8日の期間中に行われ、かつステップ(b)の急速な第2の拡張が最大8日の期間中に行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、ステップ(a)において、第1のT細胞集団がOKT-3及びIL-2を含む第1の培養培地中で培養されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、第1の培養培地が4-1BBアゴニスト、OKT-3、及びIL-2を含むように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、第1の培養培地がOKT-3、IL-2、及び抗原提示細胞(APC)を含むように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、第1の培養培地が4-1BBアゴニスト、OKT-3、IL-2、及び抗原提示細胞(APC)を含むように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、ステップ(b)において、第1のT細胞集団がOKT-3、IL-2、及び抗原提示細胞(APC)を含む第2の培養培地中で培養されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、第2の培養培地が4-1BBアゴニスト、OKT-3、IL-2、及び抗原提示細胞(APC)を含むように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、ステップ(a)において、第1のT細胞集団が、第1のガス透過性表面を含む容器内の第1の培養培地中で培養され(ここで、第1の培養培地が、OKT-3、IL-2、及び第1の抗原提示細胞(APC)集団を含み、第1のAPC集団が、第1のT細胞集団のドナーに対して外因性であり、第1のAPC集団が、第1のガス透過性表面上に層状化される)、ステップ(b)において、第1のT細胞集団が、容器内の第2の培養培地中で培養される(ここで、第2の培養培地が、OKT-3、IL-2、及び第2のAPC集団を含み、第2のAPC集団が、第1のT細胞集団のドナーに対して外因性であり、第2のAPC集団が、第1のガス透過性表面上に層状化され、第2のAPC集団が、第1のAPC集団よりも多い)ように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、ステップ(a)において、第1のT細胞集団が、第1のガス透過性表面を含む容器内の第1の培養培地中で培養され(ここで、第1の培養培地が、4-1BBアゴニスト、OKT-3、IL-2、及び第1の抗原提示細胞(APC)集団を含み、第1のAPC集団が、第1のT細胞集団のドナーに対して外因性であり、第1のAPC集団が、第1のガス透過性表面上に層状化される)、ステップ(b)において、第1のT細胞集団が、容器内の第2の培養培地中で培養される(ここで、第2の培養培地が、OKT-3、IL-2、及び第2のAPC集団を含み、第2のAPC集団が、第1のT細胞集団のドナーに対して外因性であり、第2のAPC集団が、第1のガス透過性表面上に層状化され、第2のAPC集団が、第1のAPC集団よりも多い)ように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、ステップ(a)において、第1のT細胞集団が、第1のガス透過性表面を含む容器内の第1の培養培地中で培養され(ここで、第1の培養培地が、OKT-3、IL-2、及び第1の抗原提示細胞(APC)集団を含み、第1のAPC集団が、第1のT細胞集団のドナーに対して外因性であり、第1のAPC集団が、第1のガス透過性表面上に層状化される)、ステップ(b)において、第1のT細胞集団が、容器内の第2の培養培地中で培養される(ここで、第2の培養培地が、4-1BBアゴニスト、OKT-3、IL-2、及び第2のAPC集団を含み、第2のAPC集団が、第1のT細胞集団のドナーに対して外因性であり、第2のAPC集団が、第1のガス透過性表面上に層状化され、第2のAPC集団が、第1のAPC集団よりも多い)ように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、ステップ(a)において、第1のT細胞集団が、第1のガス透過性表面を含む容器内の第1の培養培地中で培養され(ここで、第1の培養培地が、4-1BBアゴニスト、OKT-3、IL-2、及び第1の抗原提示細胞(APC)集団を含み、第1のAPC集団が、第1のT細胞集団のドナーに対して外因性であり、第1のAPC集団が、第1のガス透過性表面上に層状化される)、ステップ(b)において、第1のT細胞集団が、容器内の第2の培養培地中で培養される(ここで、第2の培養培地が、4-1BBアゴニスト、OKT-3、IL-2、及び第2のAPC集団を含み、第2のAPC集団が、第1のT細胞集団のドナーに対して外因性であり、第2のAPC集団が、第1のガス透過性表面上に層状化され、第2のAPC集団が、第1のAPC集団よりも多い)ように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、第2のAPC集団中のAPCの数の第1のAPC集団中のAPCの数に対する比率が約2:1であるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、第1のAPC集団中のAPCの数が約2.5×10あり、第2のAPC集団中のAPCの数が約5×10であるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、ステップ(a)において、第1のAPC集団が、2層のAPCの平均厚さで第1のガス透過性表面上に層状化されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、ステップ(b)において、第2のAPC集団が、4~8層のAPCから選択される平均厚さで第1のガス透過性表面上に層状化されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、ステップ(b)において第1のガス透過性表面上に層状化されたAPCの平均層数の、ステップ(a)において第1のガス透過性表面上に層状化されたAPCの平均層数に対する比率は、2:1である。
別の実施形態では、本発明は、ステップ(a)において、第1のAPC集団が正確にまたは約1.0×10APC/cm~正確にまたは約4.5×10APC/cmの範囲から選択される密度で第1のガス透過性表面に播種されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、ステップ(a)において、第1のAPC集団が正確にまたは約1.5×10APC/cm~正確にまたは約3.5×10APC/cmの範囲から選択される密度で第1のガス透過性表面に播種されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、ステップ(a)において、第1のAPC集団が正確にまたは約2.0×10APC/cm~正確にまたは約3.0×10APC/cmの範囲から選択される密度で第1のガス透過性表面に播種されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、ステップ(a)において、第1のAPC集団が正確にまたは約2.0×10APC/cmの密度で第1のガス透過性表面に播種されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、ステップ(b)において、第2のAPC集団が正確にまたは約2.5×10APC/cm~正確にまたは約7.5×10APC/cmの範囲から選択される密度で第1のガス透過性表面に播種されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、ステップ(b)において、第2のAPC集団が正確にまたは約3.5×10APC/cm~正確にまたは約6.0×10APC/cmの範囲から選択される密度で第1のガス透過性表面に播種されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、ステップ(b)において、第2のAPC集団が正確にまたは約4.0×10APC/cm~正確にまたは約5.5×10APC/cmの範囲から選択される密度で第1のガス透過性表面に播種されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、ステップ(b)において、第2のAPC集団が正確にまたは約4.0×10APC/cmの密度で第1のガス透過性表面に播種されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、ステップ(a)において、第1のAPC集団が正確にまたは約1.0×10APC/cm~正確にまたは約4.5×10APC/cmの範囲から選択される密度で第1のガス透過性表面に播種され、ステップ(b)において、第2のAPC集団が、正確にまたは約2.5×10APC/cm~正確にまたは約7.5×10APC/cmの範囲から選択される密度で第1のガス透過性表面に播種されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、ステップ(a)において、第1のAPC集団が正確にまたは約1.5×10APC/cm~正確にまたは約3.5×10APC/cmの範囲から選択される密度で第1のガス透過性表面に播種され、ステップ(b)において、第2のAPC集団が、正確にまたは約3.5×10APC/cm~正確にまたは約6.0×10APC/cmの範囲から選択される密度で第1のガス透過性表面に播種されるように修正された、該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、ステップ(a)において、第1のAPC集団が正確にまたは約2.0×10APC/cm~正確にまたは約3.0×10APC/cmの範囲から選択される密度で第1のガス透過性表面に播種され、ステップ(b)において、第2のAPC集団が、正確にまたは約4.0×10APC/cm~正確にまたは約5.5×10APC/cmの範囲から選択される密度で第1のガス透過性表面に播種されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、ステップ(a)において、第1のAPC集団が正確にまたは約2.0×10APC/cmの密度で第1のガス透過性表面に播種され、ステップ(b)において、第2のAPC集団が正確にまたは約4.0×10APC/cmの密度で第1のガス透過性表面に播種されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、APCが末梢血単核細胞(PBMC)であるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、PBMCが照射され、第1のT細胞集団のドナーに対して外因性であるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、T細胞が腫瘍浸潤リンパ球(TIL)であるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、T細胞が骨髄浸潤リンパ球(MIL)であるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、T細胞が末梢血リンパ球(PBL)であるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、第1のT細胞集団がドナーの全血からの分離によって得られるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、第1のT細胞集団がドナーのアフェレーシス産物からの分離によって得られるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、第1のT細胞集団が、T細胞表現型の正または負の選択によってドナーの全血またはアフェレーシス産物から分離されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、T細胞表現型がCD3+及びCD45+であるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、第1のT細胞集団のプライミングによる第1の拡張を行う前に、T細胞がNK細胞から分離されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。別の実施形態では、T細胞は、第1のT細胞集団からのCD3-CD56+細胞の除去によって、第1のT細胞集団中のNK細胞から分離される。別の実施形態では、CD3-CD56+細胞は、CD3-CD56+細胞画分を除去し、かつ陰性画分を回収するゲーティング戦略を使用して、第1のT細胞集団を細胞選別に供することによって、第1のT細胞集団から除去される。別の実施形態では、前述の方法は、高いNK細胞パーセンテージを特徴とする第1のT細胞集団におけるT細胞の拡張のために利用される。別の実施形態では、前述の方法は、高いCD3-CD56+細胞パーセンテージを特徴とする第1のT細胞集団におけるT細胞の拡張のために利用される。別の実施形態では、前述の方法は、多数のNK細胞の存在を特徴とする腫瘍組織におけるT細胞の拡張のために利用される。別の実施形態では、前述の方法は、多数のCD3-CD56+細胞を特徴とする腫瘍組織におけるT細胞の拡張のために利用される。別の実施形態では、前述の方法は、多数のNK細胞の存在を特徴とする腫瘍に罹患している患者から得られた腫瘍組織におけるT細胞の拡張のために利用される。別の実施形態では、前述の方法は、多数のCD3-CD56+細胞の存在を特徴とする腫瘍に罹患している患者から得られた腫瘍組織におけるT細胞の拡張のために利用される。別の実施形態では、前述の方法は、卵巣癌に罹患している患者から得られた腫瘍組織におけるT細胞の拡張のために利用される。
別の実施形態では、本発明は、第1のT細胞集団由来の正確にまたは約1×10T細胞が容器内に播種されて、かかる容器内で主要な第1の拡張を開始するように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、第1のT細胞集団が複数の容器に分配され、各容器内で、第1のT細胞集団由来の正確にまたは約1×10T細胞が播種されて、かかる容器内で主要な第1の拡張を開始するように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、ステップ(c)において採取された第2のT細胞集団が治療的TIL集団であるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、第1のT細胞集団が、ドナー由来の腫瘍組織の1つ以上の小生検(例えば、パンチ生検を含む)、コア生検、コア針生検、または細針吸引物から得られるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、第1のT細胞集団が、ドナー由来の腫瘍組織の1~20個の小生検(例えば、パンチ生検を含む)、コア生検、コア針生検、または細針吸引物から得られるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、第1のT細胞集団が、ドナー由来の腫瘍組織の1~10個の小生検(例えば、パンチ生検を含む)、コア生検、コア針生検、または細針吸引物から得られるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、第1のT細胞集団が、ドナー由来の腫瘍組織の1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、または20個の小生検(例えば、パンチ生検を含む)、コア生検、コア針生検、または細針吸引物から得られるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、第1のT細胞集団が、ドナー由来の腫瘍組織の1、2、3、4、5、6、7、8、9、または10個の小生検(例えば、パンチ生検を含む)、コア生検、コア針生検、または細針吸引物から得られるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、第1のT細胞集団が、ドナー由来の腫瘍組織の1つ以上のコア生検から得られるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、第1のT細胞集団が、ドナー由来の腫瘍組織の1~20個のコア生検から得られるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、第1のT細胞集団が、ドナー由来の腫瘍組織の1~10個のコア生検から得られるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、第1のT細胞集団が、ドナー由来の腫瘍組織の1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、または20個のコア生検から得られるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、第1のT細胞集団が、ドナー由来の腫瘍組織の1、2、3、4、5、6、7、8、9、または10個のコア生検から得られるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、第1のT細胞集団が、ドナー由来の腫瘍組織の1つ以上の細針吸引物から得られるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、第1のT細胞集団が、ドナー由来の腫瘍組織の1~20個の細針吸引物から得られるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、第1のT細胞集団が、ドナー由来の腫瘍組織の1~10個の細針吸引物から得られるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、第1のT細胞集団が、ドナー由来の腫瘍組織の1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、または20個の細針吸引物から得られるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、第1のT細胞集団が、ドナー由来の腫瘍組織の1、2、3、4、5、6、7、8、9、または10個の細針吸引物から得られるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、第1のT細胞集団が、ドナー由来の腫瘍組織の1つ以上の小生検(例えば、パンチ生検を含む)から得られるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、第1のT細胞集団が、ドナー由来の腫瘍組織の1~20個の小生検(例えば、パンチ生検を含む)から得られるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、第1のT細胞集団が、ドナー由来の腫瘍組織の1~10個の小生検(例えば、パンチ生検を含む)から得られるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、第1のT細胞集団が、ドナー由来の腫瘍組織の1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、または20個の小生検(例えば、パンチ生検を含む)から得られるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、第1のT細胞集団が、ドナー由来の腫瘍組織の1、2、3、4、5、6、7、8、9、または10個の小生検(例えば、パンチ生検を含む)から得られるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、第1のT細胞集団が、ドナー由来の腫瘍組織の1つ以上のコア針生検から得られるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、第1のT細胞集団が、ドナー由来の腫瘍組織の1~20個のコア針生検から得られるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、第1のT細胞集団が、ドナー由来の腫瘍組織の1~10個のコア針生検から得られるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、第1のT細胞集団が、ドナー由来の腫瘍組織の1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、または20個のコア針生検から得られるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、第1のT細胞集団が、ドナー由来の腫瘍組織の1、2、3、4、5、6、7、8、9、または10個のコア針生検から得られるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、腫瘍浸潤リンパ球(TIL)を治療的TIL集団に拡張するための方法であって、i)IL-2を含む第1の細胞培養倍地中で腫瘍試料を約3日間培養することによって対象における腫瘍の1つ以上の小生検、コア生検、または針生検から得られた腫瘍試料から第1のTIL集団を得る及び/または受容することと、(ii)IL-2、OKT-3、及び抗原提示細胞(APC)を含む第2の細胞培養倍地中で第1のTIL集団を培養することによって第1のプライミング拡張を行い、第2のTIL集団を産生することであって、第1のプライミング拡張が第1のガス透過性表面積を含む容器内で行われ、第1のプライミング拡張が約7日または8日間の第1の期間行われて、第2のTIL集団が得られ、第2のTIL集団は第1のTIL集団よりも数が多い、第2のTIL集団を産生することと、(iii)第2のTIL集団の第2の細胞培養倍地に追加のIL-2、OKT-3、及びAPCを補充することによって第2の急速拡張を行い、第3のTIL集団を産生することであって、第2の急速拡張において添加されるAPCの数が、ステップ(ii)において添加されるAPCの数の少なくとも2倍であり、第2の急速拡張が約11日間の第2の期間行われて、第3のTIL集団が得られ、第3のTIL集団が治療的TIL集団であり、第2の急速拡張が第2のガス透過性表面積を含む容器内で行われる、第3のTIL集団を産生することと、(iv)ステップ(iii)から得られた治療的TIL集団を採取することと、(v)ステップ(iv)からの採取されたTIL集団を注入バッグに移すことと、を含む、方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、腫瘍浸潤リンパ球(TIL)を治療的TIL集団に拡張するための方法であって、(i)IL-2を含む第1の細胞培養倍地中で腫瘍試料を約3日間培養することによって対象における腫瘍の1つ以上の小生検、コア生検、または針生検から取得された腫瘍試料から第1のTIL集団を取得及び/または受容することと、(ii)IL-2、OKT-3、及び抗原提示細胞(APC)を含む第2の細胞培養倍地中で第1のTIL集団を培養することによってプライミングによる第1の拡張を行い、第2のTIL集団を産生することであって、プライミングによる第1の拡張が約7日または8日間の第1の期間行われて、第2のTIL集団が取得され、第2のTIL集団は第1のTIL集団よりも数が多い、第2のTIL集団を産生することと、(iii)第2のTIL集団を、IL-2、OKT-3、及びAPCを含む第3の細胞培養培地と接触させることによって急速な第2の拡張を行い、第3のTIL集団を産生することであって、急速な第2の拡張が約11日間の第2の期間行われて、第3のTIL集団が取得され、第3のTIL集団が治療的TIL集団である、第3のTIL集団を産生することと、(iv)ステップ(iii)から取得された治療的TIL集団を採取することと、を含む、方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、第2の期間の5日目の後に、培養物が2つ以上の継代培養物に分割され、各継代培養物に追加量の第3の培養培地が補充され、約6日間培養されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、第2の期間の5日目の後に、培養物が2つ以上の継代培養物に分割され、各継代培養物にIL-2を含む第4の培養培地が補充され、約6日間培養されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、第2の期間の5日目の後に、培養物が最大5つの継代培養物に分割されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、方法におけるすべてのステップが約22日で完了するように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、T細胞を拡張する方法であって、(i)第1のT細胞集団を培養することによって、ドナーにおける腫瘍の1つ以上の小生検、コア生検、または針生検から取得された腫瘍細胞由来の第1のT細胞集団のプライミングによる第1の拡張を行って成長をもたらし、第1のT細胞集団の活性化をプライミングすることと、(ii)ステップ(a)においてプライミングされた第1のT細胞集団の活性化が減衰し始めた後に、第1のT細胞集団を培養することによって第1のT細胞集団の急速な第2の拡張を行って成長をもたらし、第1のT細胞集団の活性化を促進して第2のT細胞集団を取得することと、(iv)第2のT細胞集団を採取することと、を含む、T細胞を拡張する方法を提供する。いくつかの実施形態では、腫瘍試料は、複数のコア生検から得られる。いくつかの実施形態では、複数のコア生検は、2、3、4、5、6、7、8、9及び10個のコア生検からなる群から選択される。
いくつかの実施形態では、本発明は、T細胞またはTILが腫瘍消化物から取得されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載される方法。いくつかの実施形態では、腫瘍消化物は、例えば、RPMI1640、2mM GlutaMAX、10mg/mLゲンタマイシン、30U/mL DNase、及び1.0mg/mLコラゲナーゼであるが、これらに限定されない酵素培地中で腫瘍をインキュベートすること、続いて、機械的解離(GentleMACS,Miltenyi Biotec,Auburn,CA)によって生成される。いくつかの実施形態では、腫瘍は、コラゲナーゼ(任意のブレンドまたはタイプのコラゲナーゼを含む)、Accutase(商標)、Accumax(商標)、ヒアルロニダーゼ、中性プロテアーゼ(ディスパーゼ)、キモトリプシン、キモパパイン、トリプシン、カゼイナーゼ、エラスターゼ、パパイン、プロテアーゼタイプXIV(プロナーゼ)、デオキシリボヌクレアーゼI(DNase)、トリプシン阻害剤、任意の他の解離酵素またはタンパク質分解酵素、及びこれらの任意の組み合わせ等の1つ以上の解離(消化)酵素を含むが、これらに限定されない腫瘍解離酵素混合物の中に配置される。他の実施形態では、腫瘍は、コラゲナーゼ(任意のブレンドまたはタイプのコラゲナーゼを含む)、中性プロテアーゼ(ディスパーゼ)及びデオキシリボヌクレアーゼI(DNase)を含む腫瘍解離酵素混合物中に配置される。
薬学的組成物、投与量、及び投薬レジメン
ある実施形態では、本開示の方法を使用して拡張されたTILは、薬学的組成物として患者に投与される。ある実施形態では、薬学的組成物は、滅菌緩衝液中のTIL懸濁液である。本開示のPBMCを使用して拡張されたTILは、当該技術分野で知られている任意の好適な経路によって投与され得る。いくつかの実施形態では、T細胞は、単回の動脈内または静脈内注入として投与され、これは、好ましくは、およそ30~60分続く。他の好適な投与経路には、腹腔内、髄腔内、及びリンパ内投与が含まれる。
任意の好適な用量のTILが投与され得る。いくつかの実施形態では、特にがんが黒色腫である場合、約2.3×1010~約13.7×1010のTILが投与され、平均約7.8×1010TILである。ある実施形態では、約1.2×1010~約4.3×1010のTILが投与される。いくつかの実施形態では、約3×1010~約12×1010のTILが投与される。いくつかの実施形態では、約4×1010~約10×1010のTILが投与される。いくつかの実施形態では、約5×1010~約8×1010のTILが投与される。いくつかの実施形態では、約6×1010~約8×1010のTILが投与される。いくつかの実施形態では、約7×1010~約8×1010のTILが投与される。いくつかの実施形態では、治療上有効な投与量は、約2.3×1010~約13.7×1010である。いくつかの実施形態では、特にがんが黒色腫である場合、治療上有効な投与量は、約7.8×1010のTILである。いくつかの実施形態では、治療上有効な投与量は、約1.2×1010~約4.3×1010のTILである。いくつかの実施形態では、治療上有効な投与量は、約3×1010~約12×1010のTILである。いくつかの実施形態では、治療上有効な投与量は、約4×1010~約10×1010のTILである。いくつかの実施形態では、治療上有効な投与量は、約5×1010~約8×1010のTILである。いくつかの実施形態では、治療上有効な投与量は、約6×1010~約8×1010のTILである。いくつかの実施形態では、治療上有効な投与量は、約7×1010~約8×1010のTILである。
いくつかの実施形態では、本発明の薬学的組成物で提供されるTILの数は、約1×10、2×10、3×10、4×10、5×10、6×10、7×10、8×10、9×10、1×10、2×10、3×10、4×10、5×10、6×10、7×10、8×10、9×10、1×10、2×10、3×10、4×10、5×10、6×10、7×10、8×10、9×10、1×10、2×10、3×10、4×10、5×10、6×10、7×10、8×10、9×10、1×1010、2×1010、3×1010、4×1010、5×1010、6×1010、7×1010、8×1010、9×1010、1×1011、2×1011、3×1011、4×1011、5×1011、6×1011、7×1011、8×1011、9×1011、1×1012、2×1012、3×1012、4×1012、5×1012、6×1012、7×1012、8×1012、9×1012、1×1013、2×1013、3×1013、4×1013、5×1013、6×1013、7×1013、8×1013、及び9×1013である。ある実施形態では、本発明の薬学的組成物中に提供されるTILの数は、1×10~5×10、5×10~1×10、1×10~5×10、5×10~1×10、1×10~5×10、5×10~1×10、1×10~5×10、5×10~1×1010、1×1010~5×1010、5×1010~1×1011、5×1011~1×1012、1×1012~5×1012、及び5×1012~1×1013の範囲内である。
いくつかの実施形態では、本発明の薬学的組成物中に提供されるTILの濃度は、例えば、薬学的組成物の100%、90%、80%、70%、60%、50%、40%、30%、20%、19%、18%、17%、16%、15%、14%、13%、12%、11%、10%、9%、8%、7%、6%、5%、4%、3%、2%、1%、0.5%、0.4%、0.3%、0.2%、0.1%、0.09%、0.08%、0.07%、0.06%、0.05%、0.04%、0.03%、0.02%、0.01%、0.009%、0.008%、0.007%、0.006%、0.005%、0.004%、0.003%、0.002%、0.001%、0.0009%、0.0008%、0.0007%、0.0006%、0.0005%、0.0004%、0.0003%、0.0002%、または0.0001%w/w、w/v、またはv/v未満である。
いくつかの実施形態では、本発明の薬学的組成物中に提供されるTILの濃度は、薬学的組成物の90%、80%、70%、60%、50%、40%、30%、20%、19.75%、19.50%、19.25%、19%、18.75%、18.50%、18.25%、18%、17.75%、17.50%、17.25%、17%、16.75%、16.50%、16.25%、16%、15.75%、15.50%、15.25%、15%、14.75%、14.50%、14.25%、14%、13.75%、13.50%、13.25%、13%、12.75%、12.50%、12.25%、12%、11.75%、11.50%、11.25%、11%、10.75%、10.50%、10.25%、10%、9.75%、9.50%、9.25%、9%、8.75%、8.50%、8.25%、8%、7.75%、7.50%、7.25%、7%、6.75%、6.50%、6.25%、6%、5.75%、5.50%、5.25%、5%、4.75%、4.50%、4.25%、4%、3.75%、3.50%、3.25%、3%、2.75%、2.50%、2.25%、2%、1.75%、1.50%、125%、1%、0.5%、0.4%、0.3%、0.2%、0.1%、0.09%、0.08%、0.07%、0.06%、0.05%、0.04%、0.03%、0.02%、0.01%、0.009%、0.008%、0.007%、0.006%、0.005%、0.004%、0.003%、0.002%、0.001%、0.0009%、0.0008%、0.0007%、0.0006%、0.0005%、0.0004%、0.0003%、0.0002%、または0.0001%w/w、w/v、またはv/v超である。
いくつかの実施形態では、本発明の薬学的組成物中に提供されるTILの濃度は、薬学的組成物の約0.0001%~約50%、約0.001%~約40%、約0.01%~約30%、約0.02%~約29%、約0.03%~約28%、約0.04%~約27%、約0.05%~約26%、約0.06%~約25%、約0.07%~約24%、約0.08%~約23%、約0.09%~約22%、約0.1%~約21%、約0.2%~約20%、約0.3%~約19%、約0.4%~約18%、約0.5%~約17%、約0.6%~約16%、約0.7%~約15%、約0.8%~約14%、約0.9%~約12%、または約1%~約10%w/w、w/v、またはv/vの範囲内である。
いくつかの実施形態では、本発明の薬学的組成物中に提供されるTILの濃度は、薬学的組成物の約0.001%~約10%、約0.01%~約5%、約0.02%~約4.5%、約0.03%~約4%、約0.04%~約3.5%、約0.05%~約3%、約0.06%~約2.5%、約0.07%~約2%、約0.08%~約1.5%、約0.09%~約1%、約0.1%~約0.9%w/w、w/v、またはv/vの範囲内である。
いくつかの実施形態では、本発明の薬学的組成物中に提供されるTILの量は、10g、9.5g、9.0g、8.5g、8.0g、7.5g、7.0g、6.5g、6.0g、5.5g、5.0g、4.5g、4.0g、3.5g、3.0g、2.5g、2.0g、1.5g、1.0g、0.95g、0.9g、0.85g、0.8g、0.75g、0.7g、0.65g、0.6g、0.55g、0.5g、0.45g、0.4g、0.35g、0.3g、0.25g、0.2g、0.15g、0.1g、0.09g、0.08g、0.07g、0.06g、0.05g、0.04g、0.03g、0.02g、0.01g、0.009g、0.008g、0.007g、0.006g、0.005g、0.004g、0.003g、0.002g、0.001g、0.0009g、0.0008g、0.0007g、0.0006g、0.0005g、0.0004g、0.0003g、0.0002g、または0.0001g以下である。
いくつかの実施形態では、本発明の薬学的組成物中に提供されるTILの量は、0.0001g、0.0002g、0.0003g、0.0004g、0.0005g、0.0006g、0.0007g、0.0008g、0.0009g、0.001g、0.0015g、0.002g、0.0025g、0.003g、0.0035g、0.004g、0.0045g、0.005g、0.0055g、0.006g、0.0065g、0.007g、0.0075g、0.008g、0.0085g、0.009g、0.0095g、0.01g、0.015g、0.02g、0.025g、0.03g、0.035g、0.04g、0.045g、0.05g、0.055g、0.06g、0.065g、0.07g、0.075g、0.08g、0.085g、0.09g、0.095g、0.1g、0.15g、0.2g、0.25g、0.3g、0.35g、0.4g、0.45g、0.5g、0.55g、0.6g、0.65g、0.7g、0.75g、0.8g、0.85g、0.9g、0.95g、1g、1.5g、2g、2.5、3g、3.5、4g、4.5g、5g、5.5g、6g、6.5g、7g、7.5g、8g、8.5g、9g、9.5g、または10g超である。
本発明の薬学的組成物中に提供されるTILは、広い投与量範囲にわたって有効である。正確な投与量は、投与経路、化合物が投与される形態、治療される対象の性別及び年齢、治療される対象の体重、ならびに主治医の選好及び経験に依存するであろう。適切な場合、TILの臨床的に確立された投与量が使用される場合もある。TILの投与量などの本明細書の方法を使用して投与される薬学的組成物の量は、治療されるヒトまたは哺乳動物、障害または状態の重症度、投与速度、医薬品有効成分の性質、及び処方医師の裁量に依存するであろう。
いくつかの実施形態では、TILは、単回用量で投与され得る。かかる投与は、注射、例えば、静脈内注射によるものであり得る。いくつかの実施形態では、TILは、複数回用量で投与され得る。投薬は、1年に1回、2回、3回、4回、5回、6回、または6回超であり得る。投薬は、月1回、2週間に1回、週1回、または隔日に1回であり得る。TILの投与は、必要な限り継続することができる。
いくつかの実施形態では、TILの有効な投与量は、約1×10、2×10、3×10、4×10、5×10、6×10、7×10、8×10、9×10、1×10、2×10、3×10、4×10、5×10、6×10、7×10、8×10、9×10、1×10、2×10、3×10、4×10、5×10、6×10、7×10、8×10、9×10、1×10、2×10、3×10、4×10、5×10、6×10、7×10、8×10、9×10、1×1010、2×1010、3×1010、4×1010、5×1010、6×1010、7×1010、8×1010、9×1010、1×1011、2×1011、3×1011、4×1011、5×1011、6×1011、7×1011、8×1011、9×1011、1×1012、2×1012、3×1012、4×1012、5×1012、6×1012、7×1012、8×1012、9×1012、1×1013、2×1013、3×1013、4×1013、5×1013、6×1013、7×1013、8×1013、及び9×1013である。いくつかの実施形態では、TILの有効な投与量は、1×10~5×10、5×10~1×10、1×10~5×10、5×10~1×10、1×10~5×10、5×10~1×10、1×10~5×10、5×10~1×1010、1×1010~5×1010、5×1010~1×1011、5×1011~1×1012、1×1012~5×1012、及び5×1012~1×1013の範囲内である。
いくつかの実施形態では、TILの有効な投与量は、約0.01mg/kg~約4.3mg/kg、約0.15mg/kg~約3.6mg/kg、約0.3mg/kg~約3.2mg/kg、約0.35mg/kg~約2.85mg/kg、約0.15mg/kg~約2.85mg/kg、約0.3mg~約2.15mg/kg、約0.45mg/kg~約1.7mg/kg、約0.15mg/kg~約1.3mg/kg、約0.3mg/kg~約1.15mg/kg、約0.45mg/kg~約1mg/kg、約0.55mg/kg~約0.85mg/kg、約0.65mg/kg~約0.8mg/kg、約0.7mg/kg~約0.75mg/kg、約0.7mg/kg~約2.15mg/kg、約0.85mg/kg~約2mg/kg、約1mg/kg~約1.85mg/kg、約1.15mg/kg~約1.7mg/kg、約1.3mg/kg~約1.6mg/kg、約1.35mg/kg~約1.5mg/kg、約2.15mg/kg~約3.6mg/kg、約2.3mg/kg~約3.4mg/kg、約2.4mg/kg~約3.3mg/kg、約2.6mg/kg~約3.15mg/kg、約2.7mg/kg~約3mg/kg、約2.8mg/kg~約3mg/kg、または約2.85mg/kg~約2.95mg/kgの範囲内である。
いくつかの実施形態では、TILの有効な投与量は、約1mg~約500mg、約10mg~約300mg、約20mg~約250mg、約25mg~約200mg、約1mg~約50mg、約5mg~約45mg、約10mg~約40mg、約15mg~約35mg、約20mg~約30mg、約23mg~約28mg、約50mg~約150mg、約60mg~約140mg、約70mg~約130mg、約80mg~約120mg、約90mg~約110mg、または約95mg~約105mg、約98mg~約102mg、約150mg~約250mg、約160mg~約240mg、約170mg~約230mg、約180mg~約220mg、約190mg~約210mg、約195mg~約205mg、または約198~約207mgの範囲内である。
TILの有効量は、鼻腔内経路及び経皮経路を含む、同様の有用性を有する薬剤の認められた投与様式のうちのいずれかによって、動脈内注射によって、静脈内、腹腔内、非経口、筋肉内、皮下、局所、移植によって、または吸入によって、単回用量または複数回用量のいずれかで投与され得る。
別の実施形態では、本発明は、上記の前段落のうちのいずれかに記載の治療的TIL集団を含む注入バッグを提供する。
別の実施形態では、本発明は、上記の前段落のうちのいずれかに記載の治療的TIL集団及び薬学的に許容される担体を含む腫瘍浸潤リンパ球(TIL)組成物を提供する。
別の実施形態では、本発明は、上記の前段落のうちのいずれかに記載のTIL組成物を含む注入バッグを提供する。
別の実施形態では、本発明は、上記の前段落のうちのいずれかに記載の治療的TIL集団の凍結保存された調製物を提供する。
別の実施形態では、本発明は、上記の前段落のうちのいずれかに記載の治療的TIL集団及び凍結保存された培地を含む腫瘍浸潤リンパ球(TIL)組成物を提供する。
別の実施形態では、本発明は、凍結保存培地がDMSOを含むように修正された、上記の前段落のうちのいずれかに記載のTIL組成物を提供する。
別の実施形態では、本発明は、凍結保存培地が7~10%のDMSOを含むように修正された、上記の前段落のうちのいずれかに記載のTIL組成物を提供する。
別の実施形態では、本発明は、上記の前段落のうちのいずれかに記載のTIL組成物の凍結保存された調製物を提供する。
ある実施形態では、本開示の方法を使用して拡張されたTILは、薬学的組成物として患者に投与される。ある実施形態では、薬学的組成物は、滅菌緩衝液中のTIL懸濁液である。本開示のPBMCを使用して拡張されたTILは、当該技術分野で知られている任意の好適な経路によって投与され得る。いくつかの実施形態では、T細胞は、単回の動脈内または静脈内注入として投与され、これは、好ましくは、およそ30~60分続く。他の好適な投与経路には、腹腔内、髄腔内、及びリンパ内投与が含まれる。
任意の好適な用量のTILが投与され得る。いくつかの実施形態では、特にがんが黒色腫である場合、約2.3×1010~約13.7×1010のTILが投与され、平均約7.8×1010TILである。ある実施形態では、約1.2×1010~約4.3×1010のTILが投与される。いくつかの実施形態では、約3×1010~約12×1010のTILが投与される。いくつかの実施形態では、約4×1010~約10×1010のTILが投与される。いくつかの実施形態では、約5×1010~約8×1010のTILが投与される。いくつかの実施形態では、約6×1010~約8×1010のTILが投与される。いくつかの実施形態では、約7×1010~約8×1010のTILが投与される。いくつかの実施形態では、治療上有効な投与量は、約2.3×1010~約13.7×1010である。いくつかの実施形態では、特にがんが黒色腫である場合、治療上有効な投与量は、約7.8×1010TILである。いくつかの実施形態では、治療上有効な投与量は、約1.2×1010~約4.3×1010TILである。いくつかの実施形態では、治療上有効な投与量は、約3×1010~約12×1010TILである。いくつかの実施形態では、治療上有効な投与量は、約4×1010~約10×1010TILである。いくつかの実施形態では、治療上有効な投与量は、約5×1010~約8×1010TILである。いくつかの実施形態では、治療上有効な投与量は、約6×1010~約8×1010TILである。いくつかの実施形態では、治療上有効な投与量は、約7×1010~約8×1010TILである。
いくつかの実施形態では、本発明の薬学的組成物で提供されるTILの数は、約1×10、2×10、3×10、4×10、5×10、6×10、7×10、8×10、9×10、1×10、2×10、3×10、4×10、5×10、6×10、7×10、8×10、9×10、1×10、2×10、3×10、4×10、5×10、6×10、7×10、8×10、9×10、1×10、2×10、3×10、4×10、5×10、6×10、7×10、8×10、9×10、1×1010、2×1010、3×1010、4×1010、5×1010、6×1010、7×1010、8×1010、9×1010、1×1011、2×1011、3×1011、4×1011、5×1011、6×1011、7×1011、8×1011、9×1011、1×1012、2×1012、3×1012、4×1012、5×1012、6×1012、7×1012、8×1012、9×1012、1×1013、2×1013、3×1013、4×1013、5×1013、6×1013、7×1013、8×1013、及び9×1013である。ある実施形態では、本発明の薬学的組成物中に提供されるTILの数は、1×10~5×10、5×10~1×10、1×10~5×10、5×10~1×10、1×10~5×10、5×10~1×10、1×10~5×10、5×10~1×1010、1×1010~5×1010、5×1010~1×1011、5×1011~1×1012、1×1012~5×1012、及び5×1012~1×1013の範囲内である。
いくつかの実施形態では、本発明の薬学的組成物中に提供されるTILの濃度は、例えば、薬学的組成物の100%、90%、80%、70%、60%、50%、40%、30%、20%、19%、18%、17%、16%、15%、14%、13%、12%、11%、10%、9%、8%、7%、6%、5%、4%、3%、2%、1%、0.5%、0.4%、0.3%、0.2%、0.1%、0.09%、0.08%、0.07%、0.06%、0.05%、0.04%、0.03%、0.02%、0.01%、0.009%、0.008%、0.007%、0.006%、0.005%、0.004%、0.003%、0.002%、0.001%、0.0009%、0.0008%、0.0007%、0.0006%、0.0005%、0.0004%、0.0003%、0.0002%、または0.0001%w/w、w/v、またはv/v未満である。
いくつかの実施形態では、本発明の薬学的組成物中に提供されるTILの濃度は、薬学的組成物の90%、80%、70%、60%、50%、40%、30%、20%、19.75%、19.50%、19.25%、19%、18.75%、18.50%、18.25%、18%、17.75%、17.50%、17.25%、17%、16.75%、16.50%、16.25%、16%、15.75%、15.50%、15.25%、15%、14.75%、14.50%、14.25%、14%、13.75%、13.50%、13.25%、13%、12.75%、12.50%、12.25%、12%、11.75%、11.50%、11.25%、11%、10.75%、10.50%、10.25%、10%、9.75%、9.50%、9.25%、9%、8.75%、8.50%、8.25%、8%、7.75%、7.50%、7.25%、7%、6.75%、6.50%、6.25%、6%、5.75%、5.50%、5.25%、5%、4.75%、4.50%、4.25%、4%、3.75%、3.50%、3.25%、3%、2.75%、2.50%、2.25%、2%、1.75%、1.50%、125%、1%、0.5%、0.4%、0.3%、0.2%、0.1%、0.09%、0.08%、0.07%、0.06%、0.05%、0.04%、0.03%、0.02%、0.01%、0.009%、0.008%、0.007%、0.006%、0.005%、0.004%、0.003%、0.002%、0.001%、0.0009%、0.0008%、0.0007%、0.0006%、0.0005%、0.0004%、0.0003%、0.0002%、または0.0001%w/w、w/v、またはv/v超である。
いくつかの実施形態では、本発明の薬学的組成物中に提供されるTILの濃度は、薬学的組成物の約0.0001%~約50%、約0.001%~約40%、約0.01%~約30%、約0.02%~約29%、約0.03%~約28%、約0.04%~約27%、約0.05%~約26%、約0.06%~約25%、約0.07%~約24%、約0.08%~約23%、約0.09%~約22%、約0.1%~約21%、約0.2%~約20%、約0.3%~約19%、約0.4%~約18%、約0.5%~約17%、約0.6%~約16%、約0.7%~約15%、約0.8%~約14%、約0.9%~約12%、または約1%~約10%w/w、w/v、またはv/vの範囲内である。
いくつかの実施形態では、本発明の薬学的組成物中に提供されるTILの濃度は、薬学的組成物の約0.001%~約10%、約0.01%~約5%、約0.02%~約4.5%、約0.03%~約4%、約0.04%~約3.5%、約0.05%~約3%、約0.06%~約2.5%、約0.07%~約2%、約0.08%~約1.5%、約0.09%~約1%、約0.1%~約0.9%w/w、w/v、またはv/vの範囲内である。
いくつかの実施形態では、本発明の薬学的組成物中に提供されるTILの量は、10g、9.5g、9.0g、8.5g、8.0g、7.5g、7.0g、6.5g、6.0g、5.5g、5.0g、4.5g、4.0g、3.5g、3.0g、2.5g、2.0g、1.5g、1.0g、0.95g、0.9g、0.85g、0.8g、0.75g、0.7g、0.65g、0.6g、0.55g、0.5g、0.45g、0.4g、0.35g、0.3g、0.25g、0.2g、0.15g、0.1g、0.09g、0.08g、0.07g、0.06g、0.05g、0.04g、0.03g、0.02g、0.01g、0.009g、0.008g、0.007g、0.006g、0.005g、0.004g、0.003g、0.002g、0.001g、0.0009g、0.0008g、0.0007g、0.0006g、0.0005g、0.0004g、0.0003g、0.0002g、または0.0001g以下である。
いくつかの実施形態では、本発明の薬学的組成物中に提供されるTILの量は、0.0001g、0.0002g、0.0003g、0.0004g、0.0005g、0.0006g、0.0007g、0.0008g、0.0009g、0.001g、0.0015g、0.002g、0.0025g、0.003g、0.0035g、0.004g、0.0045g、0.005g、0.0055g、0.006g、0.0065g、0.007g、0.0075g、0.008g、0.0085g、0.009g、0.0095g、0.01g、0.015g、0.02g、0.025g、0.03g、0.035g、0.04g、0.045g、0.05g、0.055g、0.06g、0.065g、0.07g、0.075g、0.08g、0.085g、0.09g、0.095g、0.1g、0.15g、0.2g、0.25g、0.3g、0.35g、0.4g、0.45g、0.5g、0.55g、0.6g、0.65g、0.7g、0.75g、0.8g、0.85g、0.9g、0.95g、1g、1.5g、2g、2.5、3g、3.5、4g、4.5g、5g、5.5g、6g、6.5g、7g、7.5g、8g、8.5g、9g、9.5g、または10g超である。
本発明の薬学的組成物中に提供されるTILは、広い投与量範囲にわたって有効である。正確な投与量は、投与経路、化合物が投与される形態、治療される対象の性別及び年齢、治療される対象の体重、ならびに主治医の選好及び経験に依存するであろう。適切な場合、TILの臨床的に確立された投与量が使用される場合もある。TILの投与量などの本明細書の方法を使用して投与される薬学的組成物の量は、治療されるヒトまたは哺乳動物、障害または状態の重症度、投与速度、医薬品有効成分の性質、及び処方医師の裁量に依存するであろう。
いくつかの実施形態では、TILは、単回用量で投与され得る。かかる投与は、注射、例えば、静脈内注射によるものであり得る。いくつかの実施形態では、TILは、複数回用量で投与され得る。投薬は、1年に1回、2回、3回、4回、5回、6回、または6回超であり得る。投薬は、月1回、2週間に1回、週1回、または隔日に1回であり得る。TILの投与は、必要な限り継続することができる。
いくつかの実施形態では、TILの有効な投与量は、約1×10、2×10、3×10、4×10、5×10、6×10、7×10、8×10、9×10、1×10、2×10、3×10、4×10、5×10、6×10、7×10、8×10、9×10、1×10、2×10、3×10、4×10、5×10、6×10、7×10、8×10、9×10、1×10、2×10、3×10、4×10、5×10、6×10、7×10、8×10、9×10、1×1010、2×1010、3×1010、4×1010、5×1010、6×1010、7×1010、8×1010、9×1010、1×1011、2×1011、3×1011、4×1011、5×1011、6×1011、7×1011、8×1011、9×1011、1×1012、2×1012、3×1012、4×1012、5×1012、6×1012、7×1012、8×1012、9×1012、1×1013、2×1013、3×1013、4×1013、5×1013、6×1013、7×1013、8×1013、及び9×1013である。いくつかの実施形態では、TILの有効な投与量は、1×10~5×10、5×10~1×10、1×10~5×10、5×10~1×10、1×10~5×10、5×10~1×10、1×10~5×10、5×10~1×1010、1×1010~5×1010、5×1010~1×1011、5×1011~1×1012、1×1012~5×1012、及び5×1012~1×1013の範囲内である。
いくつかの実施形態では、TILの有効な投与量は、約0.01mg/kg~約4.3mg/kg、約0.15mg/kg~約3.6mg/kg、約0.3mg/kg~約3.2mg/kg、約0.35mg/kg~約2.85mg/kg、約0.15mg/kg~約2.85mg/kg、約0.3mg~約2.15mg/kg、約0.45mg/kg~約1.7mg/kg、約0.15mg/kg~約1.3mg/kg、約0.3mg/kg~約1.15mg/kg、約0.45mg/kg~約1mg/kg、約0.55mg/kg~約0.85mg/kg、約0.65mg/kg~約0.8mg/kg、約0.7mg/kg~約0.75mg/kg、約0.7mg/kg~約2.15mg/kg、約0.85mg/kg~約2mg/kg、約1mg/kg~約1.85mg/kg、約1.15mg/kg~約1.7mg/kg、約1.3mg/kg~約1.6mg/kg、約1.35mg/kg~約1.5mg/kg、約2.15mg/kg~約3.6mg/kg、約2.3mg/kg~約3.4mg/kg、約2.4mg/kg~約3.3mg/kg、約2.6mg/kg~約3.15mg/kg、約2.7mg/kg~約3mg/kg、約2.8mg/kg~約3mg/kg、または約2.85mg/kg~約2.95mg/kgの範囲内である。
いくつかの実施形態では、TILの有効な投与量は、約1mg~約500mg、約10mg~約300mg、約20mg~約250mg、約25mg~約200mg、約1mg~約50mg、約5mg~約45mg、約10mg~約40mg、約15mg~約35mg、約20mg~約30mg、約23mg~約28mg、約50mg~約150mg、約60mg~約140mg、約70mg~約130mg、約80mg~約120mg、約90mg~約110mg、または約95mg~約105mg、約98mg~約102mg、約150mg~約250mg、約160mg~約240mg、約170mg~約230mg、約180mg~約220mg、約190mg~約210mg、約195mg~約205mg、または約198~約207mgの範囲内である。
TILの有効量は、鼻腔内経路及び経皮経路を含む、同様の有用性を有する薬剤の認められた投与様式のうちのいずれかによって、動脈内注射によって、静脈内、腹腔内、非経口、筋肉内、皮下、局所、移植によって、または吸入によって、単回用量または複数回用量のいずれかで投与され得る。
I.改良された人工抗原提示細胞プロセスの実施形態
いくつかの実施形態では、本発明は、Raji細胞、Ramos細胞、Daudi細胞、U937細胞、Thp1細胞、及びそれらの誘導体、バリアント、修飾、または子孫からなる群から選択されるAPCを使用して、TIL、MIL、またはPBLを拡張するための方法を含む。いくつかの実施形態では、本発明は、APCを使用してTIL、MIL、またはPBLを拡張するための方法を含み、APCは、U937またはThp1細胞などの照射された単球系細胞もしくは照射されていない単球系細胞、またはそれらの誘導体、バリアント、修飾、または子孫である。いくつかの実施形態では、APCは、人工APCである。いくつかの実施形態では、APCは、本明細書の他の箇所に記載されるように、例えば、4-1BBLまたはOX40Lを発現するように遺伝子修飾される。ある実施形態では、遺伝子修飾細胞は、米国特許第10,415,015号(その開示は参照により本明細書に組み込まれる)に記載されているように、CD86、OX40L、4-1BBL、OX-40アゴニスト抗体、4-1BBアゴニスト抗体、OKT-3のFc鎖に結合可能な抗体、及び/またはICOS-Lを発現するように修飾される。前述の実施形態のうちのいずれにおいても、遺伝子修飾aAPCは、本明細書の他の箇所に記載されるように照射され得るか、または照射されなくてもよい。前述のGen2、Gen3、及び細胞表面マーカーの選択に基づくプロセスを含む他のTIL製造プロセスを用いてもよい。
いくつかの実施形態では、本発明は、がんを有する対象を治療するための方法であって、
(a)対象から取得された腫瘍試料を複数の腫瘍断片に処理することによって、対象から切除された腫瘍から第1のTIL集団を取得することと、
(b)腫瘍断片を閉鎖系に付加することと、
(c)IL-2を含む細胞培養培地中で第1のTIL集団を培養することによって第1の拡張を行って、第2のTIL集団を産生することであって、第1の拡張が、第1のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われ、第1の拡張が、約3~11日間行われて、第2のTIL集団を取得し、第2のTIL集団が、第1のTIL集団よりも数が少なくとも10倍多く、ステップ(b)からステップ(c)への移行が、系を開くことなく起こる、第2のTIL集団を産生することと、
(d)第2のTIL集団の細胞培養培地を追加のIL-2、OKT-3、及び抗原提示細胞(APC)で補充することによって第2の拡張を行い、第3のTIL集団を産生することであって、第2の拡張が、約7~11日間行われて、第3のTIL集団を取得し、第2の拡張が、第2のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われ、ステップ(c)からステップ(d)への移行が、系を開くことなく起こる、第3のTIL集団を産生することと、
(e)ステップ(d)から取得された治療的TIL集団を採取することであって、ステップ(d)からステップ(e)への移行が、系を開くことなく起こる、採取することと、
(f)ステップ(e)からの採取されたTIL集団を注入バッグに移すことであって、ステップ(e)から(f)への移行が、系を開くことなく起こる、移すことと、
(g)凍結保存プロセスを使用して、ステップ(f)からの採取されたTIL集団を含む注入バッグを凍結保存することと、
(h)治療上有効な投与量の第3のTIL集団を、ステップ(g)における注入バッグから対象に投与することと、を含む、拡張された腫瘍浸潤リンパ球(TIL)を投与することを含み、
APCが、Raji細胞、Ramos細胞、Daudi細胞、U937細胞、Thp1細胞、及びそれらの誘導体、バリアント、修飾、または子孫からなる群から選択される。
いくつかの実施形態では、本発明は、がんを有する対象を治療するための方法であって、
(a)対象から取得された腫瘍試料を複数の腫瘍断片に処理することによって、対象から切除された腫瘍から第1のTIL集団を取得することと、
(b)腫瘍断片を閉鎖系に付加することと、
(c)IL-2を含む細胞培養培地中で第1のTIL集団を培養することによって第1の拡張を行って、第2のTIL集団を産生することであって、第1の拡張が、第1のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われ、第1の拡張が、約3~11日間行われて、第2のTIL集団を取得し、第2のTIL集団が、第1のTIL集団よりも数が少なくとも10倍多く、ステップ(b)からステップ(c)への移行が、系を開くことなく起こる、第2のTIL集団を産生することと、
(d)第2のTIL集団の細胞培養培地を追加のIL-2、OKT-3、及び抗原提示細胞(APC)で補充することによって第2の拡張を行い、第3のTIL集団を産生することであって、第2の拡張が、約7~11日間行われて、第3のTIL集団を取得し、第2の拡張が、第2のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われ、ステップ(c)からステップ(d)への移行が、系を開くことなく起こる、第3のTIL集団を産生することと、
(e)ステップ(d)から取得された治療的TIL集団を採取することであって、ステップ(d)からステップ(e)への移行が、系を開くことなく起こる、採取することと、
(f)ステップ(e)からの採取されたTIL集団を注入バッグに移すことであって、ステップ(e)から(f)への移行が、系を開くことなく起こる、移すことと、
(g)凍結保存プロセスを使用して、ステップ(f)からの採取されたTIL集団を含む注入バッグを凍結保存することと、
(h)治療上有効な投与量の第3のTIL集団を、ステップ(g)における注入バッグから対象に投与することと、を含む、拡張された腫瘍浸潤リンパ球(TIL)を投与することを含み、
APCが、U937もしくはThp1細胞などの照射された単球系細胞もしくは照射されていない単球系細胞、またはそれらの誘導体、バリアント、修飾、もしくは子孫である。
いくつかの実施形態では、本発明は、拡張された腫瘍浸潤リンパ球(TIL)の集団を含み、拡張TIL集団は、
(a)患者から取得された腫瘍試料を複数の腫瘍断片に処理することによって、対象から切除された腫瘍から第1のTIL集団を取得することと、
(b)腫瘍断片を閉鎖系に付加することと、
(c)IL-2を含む細胞培養培地中で第1のTIL集団を培養することによって第1の拡張を行い、第2のTIL集団を産生することであって、第1の拡張が、第1のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われ、第1の拡張が、約3~11日間行われて、第2のTIL集団を取得し、ステップ(b)からステップ(c)への移行が、系を開くことなく起こる、第2のTIL集団を産生することと、
(d)第2のTIL集団の細胞培養培地を追加のIL-2、任意選択でOKT-3、及び抗原提示細胞(APC)で補充することによって第2の拡張を行い、第3のTIL集団を産生することであって、第2の拡張が、約7~11日間行われて、第3のTIL集団を取得し、第3のTIL集団が、治療的TIL集団であり、第2の拡張が、第2のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われ、ステップ(c)からステップ(d)への移行が、系を開くことなく起こる、第3のTIL集団を産生することと、
(e)ステップ(d)から取得された治療的TIL集団を採取することであって、ステップ(d)からステップ(e)への移行が、系を開くことなく起こる、採取することと、
を含む方法によって取得可能な第3のTIL集団であり、APCが、Raji細胞、Ramos細胞、Daudi細胞、U937細胞、Thp1細胞、及びそれらの誘導体、バリアント、修飾、または子孫からなる群から選択される。
いくつかの実施形態では、本発明は、拡張された腫瘍浸潤リンパ球(TIL)の集団を含み、拡張TIL集団は、
(a)患者から取得された腫瘍試料を複数の腫瘍断片に処理することによって、対象から切除された腫瘍から第1のTIL集団を取得することと、
(b)腫瘍断片を閉鎖系に付加することと、
(c)IL-2を含む細胞培養培地中で第1のTIL集団を培養することによって第1の拡張を行い、第2のTIL集団を産生することであって、第1の拡張が、第1のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われ、第1の拡張が、約3~11日間行われて、第2のTIL集団を取得し、ステップ(b)からステップ(c)への移行が、系を開くことなく起こる、第2のTIL集団を産生することと、
(d)第2のTIL集団の細胞培養培地を追加のIL-2、任意選択でOKT-3、及び抗原提示細胞(APC)で補充することによって第2の拡張を行い、第3のTIL集団を産生することであって、第2の拡張が、約7~11日間行われて、第3のTIL集団を取得し、第3のTIL集団が、治療的TIL集団であり、第2の拡張が、第2のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われ、ステップ(c)からステップ(d)への移行が、系を開くことなく起こる、第3のTIL集団を産生することと、
(e)ステップ(d)から取得された治療的TIL集団を採取することであって、ステップ(d)からステップ(e)への移行が、系を開くことなく起こる、採取することと、
を含む方法によって取得可能な第3のTIL集団であり、APCが、U937もしくはThp1細胞などの照射された単球系細胞もしくは照射されていない単球系細胞、またはそれらの誘導体、バリアント、修飾、もしくは子孫である。
いくつかの実施形態では、本発明は、腫瘍浸潤リンパ球(TIL)の治療的集団を含む凍結保存された腫瘍浸潤リンパ球(TIL)組成物を含み、凍結保存されたTIL組成物は、
(a)対象から取得された腫瘍試料を複数の腫瘍断片に処理することによって、対象から切除された腫瘍から第1のTIL集団を取得することと、
(b)腫瘍断片を閉鎖系に付加することと、
(c)IL-2を含む細胞培養培地中で第1のTIL集団を培養することによって第1の拡張を行って、第2のTIL集団を産生することであって、第1の拡張が、第1のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われ、第1の拡張が、約7~11日間行われて、第2のTIL集団を取得し、第2のTIL集団が、第1のTIL集団よりも数が少なくとも10倍多く、ステップ(b)からステップ(c)への移行が、系を開くことなく起こる、第2のTIL集団を産生することと、
(d)第2のTIL集団の細胞培養培地を追加のIL-2、OKT-3、及び抗原提示細胞(APC)で補充することによって第2の拡張を行い、第3のTIL集団を産生することであって、第2の拡張が、約7~11日間行われて、第3のTIL集団を取得し、第2の拡張が、第2のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われ、ステップ(c)からステップ(d)への移行が、系を開くことなく起こる、第3のTIL集団を産生することと、(e)ステップ(d)から取得された治療的TIL集団を採取することであって、ステップ(d)からステップ(e)への移行が、系を開くことなく起こる、採取することと、
(e)ステップ(e)からの採取されたTIL集団を注入バッグに移すことであって、ステップ(e)から(f)への移行が、系を開くことなく起こる、移すことと、
(f)凍結保存プロセスを使用して、ステップ(f)からの採取されたTIL集団を含む注入バッグを凍結保存して、凍結保存されたTIL組成物を取得することと、を含む方法によって産生され、
APCが、Raji細胞、Ramos細胞、Daudi細胞、U937細胞、Thp1細胞、及びそれらの誘導体、バリアント、修飾、または子孫からなる群から選択される。
いくつかの実施形態では、本発明は、腫瘍浸潤リンパ球(TIL)の治療的集団を含む凍結保存された腫瘍浸潤リンパ球(TIL)組成物を含み、凍結保存されたTIL組成物は、
(a)対象から取得された腫瘍試料を複数の腫瘍断片に処理することによって、対象から切除された腫瘍から第1のTIL集団を取得することと、
(b)腫瘍断片を閉鎖系に付加することと、
(c)IL-2を含む細胞培養培地中で第1のTIL集団を培養することによって第1の拡張を行って、第2のTIL集団を産生することであって、第1の拡張が、第1のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われ、第1の拡張が、約7~11日間行われて、第2のTIL集団を取得し、第2のTIL集団が、第1のTIL集団よりも数が少なくとも10倍多く、ステップ(b)からステップ(c)への移行が、系を開くことなく起こる、第2のTIL集団を産生することと、
(d)第2のTIL集団の細胞培養培地を追加のIL-2、OKT-3、及び抗原提示細胞(APC)で補充することによって第2の拡張を行い、第3のTIL集団を産生することであって、第2の拡張が、約7~11日間行われて、第3のTIL集団を取得し、第2の拡張が、第2のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われ、ステップ(c)からステップ(d)への移行が、系を開くことなく起こる、第3のTIL集団を産生することと、(e)ステップ(d)から取得された治療的TIL集団を採取することであって、ステップ(d)からステップ(e)への移行が、系を開くことなく起こる、採取することと、
(e)ステップ(e)からの採取されたTIL集団を注入バッグに移すことであって、ステップ(e)から(f)への移行が、系を開くことなく起こる、移すことと、
(f)凍結保存プロセスを使用して、ステップ(f)からの採取されたTIL集団を含む注入バッグを凍結保存して、凍結保存されたTIL組成物を取得することと、を含む方法によって産生され、
APCが、U937もしくはThp1細胞などの照射された単球系細胞もしくは照射されていない単球系細胞、またはそれらの誘導体、バリアント、修飾、もしくは子孫である。
いくつかの実施形態では、本発明は、がんを有する対象を治療するための方法であって、この方法は、
(a)対象から取得された腫瘍試料を腫瘍消化物に処理することによって、対象から切除された腫瘍から第1のTIL集団を取得することと、
(b)腫瘍消化物を閉鎖系に付加することと、
(c)IL-2を含む細胞培養培地中で第1のTIL集団を培養することによって第1の拡張を行い、第2のTIL集団を産生することであって、第1の拡張が、第1のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われ、第1の拡張が、約3~11日間行われて、第2のTIL集団を取得し、ステップ(b)からステップ(c)への移行が、系を開くことなく起こる、第2のTIL集団を産生することと、
(d)第2のTIL集団の細胞培養培地を追加のIL-2、OKT-3、及び抗原提示細胞(APC)で補充することによって第2の拡張を行い、第3のTIL集団を産生することであって、第2の拡張が、約7~11日間行われて、第3のTIL集団を取得し、第2の拡張が、第2のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われ、ステップ(c)からステップ(d)への移行が、系を開くことなく起こる、第3のTIL集団を産生することと、
(e)ステップ(d)から取得された第3のTIL集団を採取することであって、ステップ(d)からステップ(e)への移行が、系を開くことなく起こる、採取することと、
(f)ステップ(e)からの採取された第3のTIL集団を注入バッグに移すことであって、ステップ(e)から(f)への移行が、系を開くことなく起こる、移すことと、
(g)凍結保存プロセスを使用して、ステップ(f)からの採取されたTIL集団を含む注入バッグを凍結保存することと、
(h)治療上有効な投与量の第3のTIL集団を、ステップ(g)における注入バッグから対象に投与することと、を含む、拡張された腫瘍浸潤リンパ球(TIL)を投与することを含み、
APCが、Raji細胞、Ramos細胞、Daudi細胞、U937細胞、Thp1細胞、及びそれらの誘導体、バリアント、修飾、または子孫からなる群から選択される。
いくつかの実施形態では、本発明は、がんを有する対象を治療するための方法であって、この方法は、
(a)対象から取得された腫瘍試料を腫瘍消化物に処理することによって、対象から切除された腫瘍から第1のTIL集団を取得することと、
(b)腫瘍消化物を閉鎖系に付加することと、
(c)IL-2を含む細胞培養培地中で第1のTIL集団を培養することによって第1の拡張を行い、第2のTIL集団を産生することであって、第1の拡張が、第1のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われ、第1の拡張が、約3~11日間行われて、第2のTIL集団を取得し、ステップ(b)からステップ(c)への移行が、系を開くことなく起こる、第2のTIL集団を産生することと、
(d)第2のTIL集団の細胞培養培地を追加のIL-2、OKT-3、及び抗原提示細胞(APC)で補充することによって第2の拡張を行い、第3のTIL集団を産生することであって、第2の拡張が、約7~11日間行われて、第3のTIL集団を取得し、第2の拡張が、第2のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われ、ステップ(c)からステップ(d)への移行が、系を開くことなく起こる、第3のTIL集団を産生することと、
(e)ステップ(d)から取得された第3のTIL集団を採取することであって、ステップ(d)からステップ(e)への移行が、系を開くことなく起こる、採取することと、
(f)ステップ(e)からの採取された第3のTIL集団を注入バッグに移すことであって、ステップ(e)から(f)への移行が、系を開くことなく起こる、移すことと、
(g)凍結保存プロセスを使用して、ステップ(f)からの採取されたTIL集団を含む注入バッグを凍結保存することと、
(h)治療上有効な投与量の第3のTIL集団を、ステップ(g)における注入バッグから対象に投与することと、を含む、拡張された腫瘍浸潤リンパ球(TIL)を投与することを含み、
APCが、U937もしくはThp1細胞などの照射された単球系細胞もしくは照射されていない単球系細胞、またはそれらの誘導体、バリアント、修飾、もしくは子孫である。
いくつかの実施形態では、本発明は、がんを有する対象を治療するための方法であって、この方法は、
(a)患者から取得された腫瘍試料を複数の腫瘍断片に処理することによって、患者から切除された腫瘍から第1のTIL集団を取得することと、
(b)腫瘍断片を閉鎖系に付加することと、
(c)IL-2及び任意選択でOKT-3、ならびに任意選択で抗原提示細胞(APC)を含む細胞培養培地中で第1のTIL集団を培養することによって第1の拡張を行い、第2のTIL集団を産生することであって、第1の拡張が、第1のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われ、第1の拡張が、約3~14日間行われて、第2のTIL集団を取得し、ステップ(b)からステップ(c)への移行が、系を開くことなく起こる、第2のTIL集団を産生することと、
(d)第2のTIL集団の細胞培養培地を追加のIL-2、OKT-3、及びAPCで補充することによって第2の拡張を行い、第3のTIL集団を産生することであって、第2の拡張が、約4~6日間行われて、第3のTIL集団を取得し、第2の拡張が、第2のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われ、ステップ(c)からステップ(d)への移行が、系を開くことなく起こる、第3のTIL集団を産生することと、
(e)第3のTIL集団を、TILの第1の複数の2~5亜集団に分割することであって、少なくとも1.0×10個のTILが各亜集団に存在し、ステップ(d)から(e)への移行が、系を開くことなく起こる、分割することと、
(f)任意選択で、各TIL亜集団の細胞培養培地を追加のIL-2、OKT-3、及びAPCで補充することによって第1の複数のTIL亜集団の第3の拡張を行い、第2の複数のTIL亜集団を産生することであって、第3の拡張が、約5~7日間行われ、各亜集団の第3の拡張が、第3のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われ、ステップ(e)からステップ(f)への移行が、系を開くことなく起こる、第2の複数のTIL亜集団を産生することと、
(g)ステップ(f)から取得された第2の複数のTIL亜集団を採取することであって、ステップ(f)からステップ(g)への移行が、系を開くことなく起こる、採取することと、
(h)ステップ(g)からの採取されたTIL亜集団を1つ以上の注入バッグに移すことであって、ステップ(g)から(h)への移行が、系を開くことなく起こる、移すことと、
(i)凍結保存プロセスを使用して、ステップ(h)からのTILの採取された亜集団を含む1つ以上の注入バッグを凍結保存することと、
(j)治療上有効な投与量の採取されたTIL亜集団を、ステップ(i)における1つ以上の注入バッグから対象に投与するステップと、を含む、拡張された腫瘍浸潤リンパ球(TIL)を投与することを含み、
APCが、Raji細胞、Ramos細胞、Daudi細胞、U937細胞、Thp1細胞、及びそれらの誘導体、バリアント、修飾、または子孫からなる群から選択される。
いくつかの実施形態では、本発明は、がんを有する対象を治療するための方法であって、この方法は、
(a)患者から取得された腫瘍試料を複数の腫瘍断片に処理することによって、患者から切除された腫瘍から第1のTIL集団を取得することと、
(b)腫瘍断片を閉鎖系に付加することと、
(c)IL-2及び任意選択でOKT-3、ならびに任意選択で抗原提示細胞(APC)を含む細胞培養培地中で第1のTIL集団を培養することによって第1の拡張を行い、第2のTIL集団を産生することであって、第1の拡張が、第1のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われ、第1の拡張が、約3~14日間行われて、第2のTIL集団を取得し、ステップ(b)からステップ(c)への移行が、系を開くことなく起こる、第2のTIL集団を産生することと、
(d)第2のTIL集団の細胞培養培地を追加のIL-2、OKT-3、及びAPCで補充することによって第2の拡張を行い、第3のTIL集団を産生することであって、第2の拡張が、約4~6日間行われて、第3のTIL集団を取得し、第2の拡張が、第2のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われ、ステップ(c)からステップ(d)への移行が、系を開くことなく起こる、第3のTIL集団を産生することと、
(e)第3のTIL集団を、TILの第1の複数の2~5亜集団に分割することであって、少なくとも1.0×10個のTILが各亜集団に存在し、ステップ(d)から(e)への移行が、系を開くことなく起こる、分割することと、
(f)任意選択で、各TIL亜集団の細胞培養培地を追加のIL-2、OKT-3、及びAPCで補充することによって第1の複数のTIL亜集団の第3の拡張を行い、第2の複数のTIL亜集団を産生することであって、第3の拡張が、約5~7日間行われ、各亜集団の第3の拡張が、第3のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われ、ステップ(e)からステップ(f)への移行が、系を開くことなく起こる、第2の複数のTIL亜集団を産生することと、
(g)ステップ(f)から取得された第2の複数のTIL亜集団を採取することであって、ステップ(f)からステップ(g)への移行が、系を開くことなく起こる、採取することと、
(h)ステップ(g)からの採取されたTIL亜集団を1つ以上の注入バッグに移すことであって、ステップ(g)から(h)への移行が、系を開くことなく起こる、移すことと、
(i)凍結保存プロセスを使用して、ステップ(h)からのTILの採取された亜集団を含む1つ以上の注入バッグを凍結保存することと、
(j)治療上有効な投与量の採取されたTIL亜集団を、ステップ(i)における1つ以上の注入バッグから対象に投与するステップと、を含む、拡張された腫瘍浸潤リンパ球(TIL)を投与することを含み、
APCが、U937もしくはThp1細胞などの照射された単球系細胞もしくは照射されていない単球系細胞、またはそれらの誘導体、バリアント、修飾、もしくは子孫である。
VII.患者を治療する方法
治療方法は、最初のTIL収集及びTILの培養から始まる。かかる方法は両方とも、例えば、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる、Jin et al.,J.Immunother.,2012,35(3),283-292によって当該技術分野で説明されている。治療方法の実施形態は、実施例を含む以下の節全体に記載されている。
本明細書に記載の方法に従って、例えば、上記のステップA~Fに記載されるように、または上記のステップA~Fに従って(また例えば、図1及びまたは図8に示されるように)産生された拡張TILは、がんを有する患者の治療における特定の用途を見出す(例えば、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる、Goff,et al.,J.Clin.Oncol.,2016,34(20),2389-239、及び補足内容に記載される)。いくつかの実施形態では、TILは、以前に記載されたように、転移性黒色腫の切除された沈着物から増殖された(参照によりその全体が本明細書に組み込まれる、Dudley,et al.,J Immunother.,2003,26,332-342を参照)。新鮮な腫瘍は、滅菌条件下で解剖され得る。代表的な試料は、正式な病理学的分析のために収集され得る。2mm3~3mm3の単一断片が使用され得る。いくつかの実施形態では、患者当たり5、10、15、20、25、または30個の試料が取得される。いくつかの実施形態では、患者当たり20、25、または30個の試料が取得される。いくつかの実施形態では、患者当たり20、22、24、26、または28個の試料が取得される。いくつかの実施形態では、患者当たり24個の試料が取得される。試料は、24ウェルプレートの個々のウェル内に配置され、高用量IL-2(6,000IU/mL)を含む成長培地中で維持され、腫瘍の破壊及び/またはTILの増殖について監視され得る。処理後に生細胞が残っている腫瘍は、本明細書に記載されるように、単一細胞懸濁液中に酵素的に消化され、凍結保存され得る。
いくつかの実施形態では、成功裏に成長したTILは、表現型分析(CD3、CD4、CD8、及びCD56)のためにサンプリングされ、利用可能な場合、自己腫瘍に対して試験され得る。一晩の共培養によりインターフェロンガンマ(IFN-γ)レベルが200pg/mLを超え、バックグラウンドの2倍になった場合、TILは反応性があるとみなされ得る。(Goff,et al.,J Immunother.,2010,33,840-847、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる)。いくつかの実施形態では、自己反応性または十分な成長パターンの証拠を有する培養物は、急速拡張(REP)と称されることもある第2の拡張を含む、第2の拡張(例えば、図1及び/または図8のステップDに従って提供される第2の拡張)のために選択され得る。いくつかの実施形態では、高い自己反応性(例えば、第2の拡張中の高い増殖)を有する拡張TILが、追加の第2の拡張のために選択される。いくつかの実施形態では、高い自己反応性(例えば、図1及び/または図8のステップDで提供されるような第2の拡張中の高い増殖)を有するTILが、図1及び/または図8のステップDに従って、追加の第2の拡張のために選択される。
注入バッグTILの凍結保存試料の細胞表現型は、表面マーカーCD3、CD4、CD8、CCR7、及びCD45RA(BD BioSciences)のフローサイトメトリー(例えば、FlowJo)、ならびに本明細書に記載の方法のうちのいずれかによって分析され得る。血清サイトカインは、標準的な酵素結合免疫吸着アッセイ技術を使用することにより測定された。血清IFN-gの上昇は、100pg/mL超及び4 3ベースラインレベルを超えると定義された。
いくつかの実施形態では、本明細書で提供される方法、例えば図1及び/または図8に例示される方法によって産生されるTILは、TILの臨床効果の驚くべき改善を提供する。いくつかの実施形態では、本明細書で提供される方法、例えば図1及び/または図8に例示される方法によって産生されるTILは、例えば、図1及び/または図8に例示されるもの以外の方法を含む、本明細書に記載されるもの以外の方法によって産生されるTILと比較して、増加した臨床効果を示す。いくつかの実施形態では、本明細書に記載されるもの以外の方法は、プロセス1C及び/または第1世代(Gen1)と称される方法を含む。いくつかの実施形態では、増加した有効性は、DCR、ORR、及び/または他の臨床応答によって測定される。いくつかの実施形態では、本明細書で提供される方法、例えば図1に例示される方法によって産生されたTILは、例えば、図1及び/または図8に例示されるもの以外の方法、例えば、Gen1プロセスを含む、本明細書に記載されるもの以外の方法によって産生されたTILと比較して、同様の応答時間及び安全性プロファイルを示す。
いくつかの実施形態では、IFN-ガンマ(IFN-γ)は、治療有効性及び/または増加した臨床的有効性を示す。いくつかの実施形態では、TILで治療された対象の血液中のIFN-γは、活性なTILを示す。いくつかの実施形態では、IFN-γ産生の効力アッセイが用いられる。IFN-γ産生は、細胞傷害能の別の尺度である。IFN-γ産生は、例えば、図1及び/または図8に記載されるものを含む、本発明の方法によって調製されたTILで治療された対象のエクスビボでの血液、血清、またはTIL中のサイトカインIFN-γのレベルを決定することによって測定することができる。いくつかの実施形態では、IFN-γの増加は、本発明の方法によって産生されたTILで治療された患者における治療有効性を示す。いくつかの実施形態では、IFN-γは、未治療の患者と比較して、及び/または例えば、図1及び/または図8に具体化されるもの以外の方法を含む、本明細書で提供されるもの以外の方法を使用して調製されたTILで治療された患者と比較して、IFN-γが1倍、2倍、3倍、4倍、または5倍以上増加する。いくつかの実施形態では、IFN-γ分泌は、未治療の患者と比較して、及び/または例えば、図1及び/または図8に具体化されるもの以外の方法を含む、本明細書で提供されるもの以外の方法を使用して調製されたTILで治療された患者と比較して、1倍増加する。いくつかの実施形態では、IFN-γ分泌は、未治療の患者と比較して、及び/または例えば、図1及び/または図8に具体化されるもの以外の方法を含む、本明細書で提供されるもの以外の方法を使用して調製されたTILで治療された患者と比較して、2倍増加する。いくつかの実施形態では、IFN-γ分泌は、未治療の患者と比較して、及び/または例えば、図1及び/または図8に具体化されるもの以外の方法を含む、本明細書で提供されるもの以外の方法を使用して調製されたTILで治療された患者と比較して、3倍増加する。いくつかの実施形態では、IFN-γ分泌は、未治療の患者と比較して、及び/または例えば、図1及び/または図8に具体化されるもの以外の方法を含む、本明細書で提供されるもの以外の方法を使用して調製されたTILで治療された患者と比較して、4倍増加する。いくつかの実施形態では、IFN-γ分泌は、未治療の患者と比較して、及び/または例えば、図1及び/または図8に具体化されるもの以外の方法を含む、本明細書で提供されるもの以外の方法を使用して調製されたTILで治療された患者と比較して、5倍増加する。いくつかの実施形態では、IFN-γは、Quantikine ELISAキットを使用して測定される。いくつかの実施形態では、IFN-γは、例えば、図1及び/または図8に記載されるものを含む、本発明の方法によって調製されたTILで治療された対象のエクスビボでのTILにおいて測定される。いくつかの実施形態では、IFN-γは、例えば図1及び/または図8に記載されるものを含む、本発明の方法によって調製されたTILで治療された対象の血液において測定される。いくつかの実施形態では、IFN-γは、例えば、図1及び/または図8に記載されるものを含む、本発明の方法によって調製されたTILで治療された対象の血清由来のTILにおいて測定される。
いくつかの実施形態では、IFN-ガンマ(IFN-γ)は、治療有効性及び/または増加した臨床的有効性を示す。いくつかの実施形態では、TILで治療された対象の血液中のIFN-γは、活性なTILを示す。いくつかの実施形態では、IFN-γ産生の効力アッセイが用いられる。IFN-γ産生は、細胞傷害能の別の尺度である。IFN-γ産生は、例えば、図1及び/または図8に記載されるものを含む、本発明の方法によって調製されたTILで治療された対象の血液、血清、または他の組織中のサイトカインIFN-γのレベルを決定することによって測定することができる。いくつかの実施形態では、IFN-γの増加は、本発明の方法によって産生されたTILで治療された患者における治療有効性を示す。いくつかの実施形態では、IFN-γは、未治療の患者と比較して、及び/または例えば、図1及び/または図8に具体化されるもの以外の方法を含む、本明細書で提供されるもの以外の方法を使用して調製されたTILで治療された患者と比較して、IFN-γが1倍、2倍、3倍、4倍、または5倍以上増加する。
いくつかの実施形態では、例えば図1及び/または図8に記載されるものを含む、本発明の方法によって調製されるTILは、例えばプロセス1C法と称される方法を含む、図1及び/または図8に例示されていないものを含む他の方法によって産生されるTILと比較して、増加したポリクローン性を示す。いくつかの実施形態では、有意に改善されたポリクローン性及び/または増加したポリクローン性は、治療有効性及び/または増加した臨床的有効性を示す。いくつかの実施形態では、ポリクローン性は、T細胞レパートリーの多様性を指す。いくつかの実施形態では、ポリクローン性の増加は、本発明の方法によって産生されたTILの投与に関する治療有効性を示すことができる。いくつかの実施形態では、ポリクローン性は、例えば、図1及び/または図8に具体化されるもの以外の方法を含む、本明細書で提供されるもの以外の方法を使用して調製されたTILと比較して、1倍、2倍、10倍、100倍、500倍、または1000倍増加する。いくつかの実施形態では、ポリクローン性は、未治療の患者と比較して、及び/または例えば、図1及び/または図8に具体化されるもの以外の方法を含む、本明細書で提供されるもの以外の方法を使用して調製されたTILで治療された患者と比較して、1倍増加する。いくつかの実施形態では、ポリクローン性は、未治療の患者と比較して、及び/または例えば、図1及び/または図8に具体化されるもの以外の方法を含む、本明細書で提供されるもの以外の方法を使用して調製されたTILで治療された患者と比較して、2倍増加する。いくつかの実施形態では、ポリクローン性は、未治療の患者と比較して、及び/または例えば、図1及び/または図8に具体化されるもの以外の方法を含む、本明細書で提供されるもの以外の方法を使用して調製されたTILで治療された患者と比較して、10倍増加する。いくつかの実施形態では、ポリクローン性は、未治療の患者と比較して、及び/または例えば、図1及び/または図8に具体化されるもの以外の方法を含む、本明細書で提供されるもの以外の方法を使用して調製されたTILで治療された患者と比較して、100倍増加する。いくつかの実施形態では、ポリクローン性は、未治療の患者と比較して、及び/または例えば、図1及び/または図8に具体化されるもの以外の方法を含む、本明細書で提供されるもの以外の方法を使用して調製されたTILで治療された患者と比較して、500倍増加する。いくつかの実施形態では、ポリクローン性は、未治療の患者と比較して、及び/または例えば、図1及び/または図8に具体化されるもの以外の方法を含む、本明細書で提供されるもの以外の方法を使用して調製されたTILで治療された患者と比較して、1000倍増加する。
有効性の尺度には、当該技術分野で知られており、本明細書にも記載されている、疾患制御率(DCR)ならびに全応答率(ORR)が含まれ得る。
1.がん及び他の疾患を治療する方法
本明細書に記載の組成物及び方法は、疾患を治療するための方法で使用され得る。ある実施形態では、それらは、過剰増殖性障害の治療に使用するためのものである。それらは、本明細書及び以下の段落に記載される他の障害の治療にも使用され得る。
いくつかの実施形態では、過剰増殖性障害は、がんである。いくつかの実施形態では、過剰増殖性障害は、固形腫瘍がんである。いくつかの実施形態では、固形腫瘍がんは、肉腫、膵臓癌、肝臓癌、神経膠芽細胞腫、神経膠腫、胃腸癌、黒色腫、卵巣癌、子宮内膜癌、甲状腺癌、結腸直腸癌、子宮頸癌、非小細胞肺癌(NSCLC)、肺癌、膀胱癌、乳癌、胃癌、食道癌、ヒトパピローマウイルスによって引き起こされるがん、頭頸部癌(頭頸部扁平上皮癌(HNSCC)を含む)、腎癌、前立腺癌、及び腎細胞癌からなる群から選択される。いくつかの実施形態では、過剰増殖性障害は、血液学的悪性腫瘍である。いくつかの実施形態では、固形腫瘍がんは、慢性リンパ性白血病、急性リンパ芽球性白血病、びまん性大細胞型B細胞リンパ腫、非ホジキンリンパ腫、ホジキンリンパ腫、濾胞性リンパ腫、及びマントル細胞リンパ腫からなる群から選択される。いくつかの実施形態では、固形腫瘍癌は、肛門癌、膀胱癌、乳癌(トリプルネガティブ乳癌を含む)、骨癌、ヒトパピローマウイルス(HPV)によって引き起こされるがん、中枢神経系関連癌(上衣腫、髄芽腫、神経芽腫、松果体芽腫、及び未分化神経外胚葉性腫瘍を含む)、子宮頸癌(扁平上皮癌、腺扁平上皮癌、及び子宮頸部腺癌)、結腸癌、結腸直腸癌、子宮内膜癌、食道癌、食道胃接合癌、胃癌、消火器癌、消化管間質腫瘍、神経膠芽細胞腫、神経膠腫、頭頸部癌(頭頸部扁平上皮癌(HNSCC)を含む)、下咽頭癌、喉頭癌、鼻咽頭癌、中咽頭癌、及び咽頭癌)、腎臓癌、肝臓癌、肺癌(非小細胞肺癌(NSCLC)及び小細胞肺癌)、黒色腫(ブドウ膜黒色腫、脈絡膜黒色腫、毛様体黒色腫、または虹彩黒色腫を含む)、中皮腫(悪性胸膜中皮腫を含む)、卵巣癌、膵臓癌(膵管腺癌を含む)、陰茎癌、直腸癌、腎癌、腎細胞癌、肉腫(ユーイング肉腫、骨肉腫、横紋筋肉腫、ならびに他の骨及び軟部組織肉腫を含む)、甲状腺癌(未分化甲状腺癌を含む)、子宮癌、ならびに膣癌からなる群から選択される。
いくつかの実施形態では、がんは、黒色腫である。いくつかの実施形態では、がんは、黒色腫ステージIIB~IVである。
いくつかの実施形態では、本発明は、がんが黒色腫、卵巣癌、子宮頸癌、非小細胞肺癌(NSCLC)、肺癌、膀胱癌、乳癌、ヒトパピローマウイルスによって引き起こされるがん、頭頸部癌(頭頸部扁平上皮癌(HNSCC)を含む)、神経膠芽細胞腫(GBMを含む)、胃腸癌、腎癌、または腎細胞癌である、がんを有する対象を治療するための方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、がんが黒色腫、HNSCC、子宮頸癌、NSCLC、神経膠芽細胞腫(GBMを含む)、及び胃腸癌である、がんを有する対象を治療するための方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、がんが黒色腫である、本明細書に記載のがんを有する対象を治療するための方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、がんがHNSCCである、本明細書に記載のがんを有する対象を治療するための方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、がんが子宮頸癌である、本明細書に記載のがんを有する対象を治療するための方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、がんがNSCLCである、本明細書に記載のがんを有する対象を治療するための方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、がんが神経膠芽細胞腫(GBMを含む)である、本明細書に記載のがんを有する対象を治療するための方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、がんが胃腸癌である、本明細書に記載のがんを有する対象を治療するための方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、がんが高頻度変異癌である、本明細書に記載のがんを有する対象を治療するための方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、がんが小児高頻度変異癌である、本明細書に記載のがんを有する対象を治療するための方法を提供する。
いくつかの実施形態では、過剰増殖性障害は、血液学的悪性腫瘍である。いくつかの実施形態では、血液学的悪性腫瘍は、慢性リンパ性白血病、急性リンパ芽球性白血病、びまん性大細胞型B細胞リンパ腫、非ホジキンリンパ腫、ホジキンリンパ腫、濾胞性リンパ腫、マントル細胞リンパ腫、及び多発性骨髄腫からなる群から選択される。いくつかの実施形態では、本発明は、がん患者を治療する方法を含み、がんは、血液学的悪性腫瘍である。いくつかの実施形態では、本発明は、1つ以上のCCRを発現するように修飾されたTIL、MIL、またはPBLを使用して、がんを有する患者を治療する方法を含み、がんは、血液学的悪性腫瘍である。いくつかの実施形態では、本発明は、1つ以上のCCRを発現するように修飾されたMILまたはPBLを使用して、がんを有する患者を治療する方法を含み、がんは、血液学的悪性腫瘍である。
いくつかの実施形態では、がんは、高頻度変異癌または高頻度変異癌の表現型である。高頻度変異癌は、Campbell,et al.,Cell 2017,171,1042-1056(すべての目的のために参照により全体が本明細書に組み込まれる)に広く記載されている。いくつかの実施形態では、高頻度変異腫瘍は、1メガベース(Mb)当たり9~10個の変異を含む。いくつかの実施形態では、小児高頻度変異腫瘍は、1メガベース(Mb)当たり9.91個の変異を含む。いくつかの実施形態では、成人高頻度変異腫瘍は、1メガベース(Mb)当たり9個の変異を含む。いくつかの実施形態では、増強された高頻度変異腫瘍は、1メガベース(Mb)当たり10~100個の変異を含む。いくつかの実施形態では、増強された小児高頻度変異腫瘍は、1メガベース(Mb)当たり10~100個の変異を含む。いくつかの実施形態では、増強された成人高頻度変異腫瘍は、1メガベース(Mb)当たり10~100個の変異を含む。いくつかの実施形態では、超高頻度変異腫瘍は、1メガベース(Mb)当たり100個を超える変異を含む。いくつかの実施形態では、小児超高頻度変異腫瘍は、1メガベース(Mb)当たり100個を超える変異を含む。いくつかの実施形態では、成人超高頻度変異腫瘍は、1メガベース(Mb)当たり100個を超える変異を含む。
いくつかの実施形態では、超変異腫瘍は、複製修復経路に変異を有する。いくつかの実施形態では、高頻度変異腫瘍は、複製修復関連DNAポリメラーゼに変異を有する。いくつかの実施形態では、高頻度変異腫瘍は、マイクロサテライト不安定性を有する。いくつかの実施形態では、超高頻度変異腫瘍は、複製修復関連DNAポリメラーゼに変異を有し、マイクロサテライト不安定性を有する。いくつかの実施形態では、腫瘍における高頻度変異は、免疫チェックポイント阻害剤への応答と相関している。いくつかの実施形態では、高頻度変異腫瘍は、免疫チェックポイント阻害剤での治療に対して耐性である。いくつかの実施形態では、高頻度変異腫瘍は、本発明のTILを使用して治療され得る。いくつかの実施形態では、腫瘍における高頻度変異は、環境要因(外因性曝露)によって引き起こされる。例えば、紫外線光は、悪性黒色腫における多数の変異の主な原因になる可能性がある(例えば、Pfeifer,et al.Mutat.Res.2005,571,19-31、Sage,Photochem.Photobiol.1993,57,163-174を参照)。いくつかの実施形態では、腫瘍における高頻度変異は、直接変異原曝露に起因する、肺腫瘍及び喉頭腫瘍、ならびに他の腫瘍の場合、タバコの煙中の60を超える発がん物質によって引き起こされ得る(例えば、Pleasance,et al.,Nature 2010,463,184-190を参照)。いくつかの実施形態では、腫瘍における高頻度変異は、アポリポタンパク質B mRNA編集酵素触媒ポリペプチド様(APOBEC)ファミリーメンバーの調節不全によって引き起こされ、これは、広範囲のがんにおいてCからTへの移行のレベルの増加をもたらすことが示されている(例えば、Roberts,et al.,Nat.Genet.2013,45,970-976を参照)。いくつかの実施形態では、腫瘍における高頻度変異は、主要な複製酵素Pol3及びPold1によって行われる校正を損なう変異によるDNA複製修復欠陥によって引き起こされる。いくつかの実施形態では、腫瘍における高頻度変異は、結腸直腸癌、子宮内膜癌、及び他のがんにおける高頻度変異に関連するDNAミスマッチ修復の欠陥によって引き起こされる(例えば、Kandoth,et al.,Nature 2013,497,67-73、Muzny,et al.,Nature 2012,487,330-337を参照)。いくつかの実施形態では、DNA複製修復変異は、構成的または二対立遺伝子ミスマッチ修復欠損症(CMMRD)、リンチ症候群、及びポリメラーゼ校正関連ポリポーシス(PPAP)などのがん好発症候群にも見られる。
ある実施形態では、本発明は、TIL集団でがんを治療する方法を含み、がんは、高頻度変異癌である。ある実施形態では、本発明は、TIL集団でがんを治療する方法を含み、がんは、増強された高頻度変異癌である。ある実施形態では、本発明は、TIL集団でがんを治療する方法を含み、がんは、超高頻度変異癌である。
ある実施形態では、本発明は、TIL集団でがんを治療する方法を含み、患者は、本開示によるTILの注入前に骨髄非破壊的化学療法で前治療される。ある実施形態では、骨髄非破壊的化学療法は、シクロホスファミド60mg/kg/日で2日間(TIL注入の27日前及び26日前)、ならびにフルダラビン25mg/m2/日で5日間(TIL注入の27日前~23日前)である。いくつかの実施形態では、骨髄非破壊的化学療法は、シクロホスファミド60mg/kg/日で2日間(TIL注入の27日前及び26日前)、ならびにフルダラビン25mg/m/日で3日間(TIL注入の27日前~25日前)である。いくつかの実施形態では、骨髄非破壊的化学療法は、シクロホスファミド60mg/kg/日で2日間(TIL注入の27日前及び26日前)、続いてフルダラビン25mg/m/日で3日間(TIL注入の25日前~23日前)である。ある実施形態では、本開示による骨髄非破壊的化学療法及びTIL注入(0日目)後、患者は、生理学的許容範囲まで8時間毎に720,000IU/kgでIL-2の静脈内注入を受ける。
示される疾患または障害の治療、予防、及び/または管理における本明細書に記載の化合物及び化合物の組み合わせの有効性は、ヒト疾患の治療のためのガイダンスを提供する当技術分野で知られている様々なモデルを使用して試験され得る。例えば、卵巣癌の治療の有効性を決定するためのモデルは、例えば、Mullany,et al.,Endocrinology 2012,153,1585-92、及びFong,et al.,J.Ovarian Res.2009,2,12に記載されている。膵臓癌の治療の有効性を決定するためのモデルは、Herreros-Villanueva,et al.,World J.Gastroenterol.2012,18,1286-1294に記載されている。乳癌の治療の有効性を決定するためのモデルは、例えば、Fantozzi,Breast Cancer Res.2006,8,212に記載されている。黒色腫の治療の有効性を決定するためのモデルは、例えば、Damsky,et al.,Pigment Cell & Melanoma Res.2010,23,853-859に記載されている。例えば、肺癌の治療の有効性を決定するためのモデルは、例えば、Meuwissen,et al.,Genes & Development,2005,19,643-664に記載されている。肺癌の治療の有効性を決定するためのモデルは、例えば、Kim,Clin.Exp.Otorhinolaryngol.2009,2,55-60、及びSano,Head Neck Oncol.2009,1,32に記載されている。
いくつかの実施形態では、IFN-ガンマ(IFN-γ)は、過剰増殖性障害治療の治療有効性を示す。いくつかの実施形態では、TILで治療された対象の血液中のIFN-γは、活性なTILを示す。いくつかの実施形態では、IFN-γ産生の効力アッセイが用いられる。IFN-γ産生は、細胞傷害能の別の尺度である。IFN-γ産生は、例えば、図8(特に、例えば図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D)に記載される方法を含む、本発明の方法によって調製されたTILで治療された対象の血液中のサイトカインIFN-γのレベルを決定することによって測定され得る。いくつかの実施形態では、本方法によって取得されたTILは、例示された図8(特に、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D)及び本明細書全体に例示されるようにGen 3プロセスと呼ばれる方法を使用して調製されたTILで治療された対象と比較して、本方法のTILで治療された対象の血液中のIFN-γの増加を提供する。いくつかの実施形態では、IFN-γの増加は、本発明の方法によって産生されたTILで治療された患者における治療有効性を示す。いくつかの実施形態では、IFN-γは、未治療の患者と比較して、及び/または例えば、図8(特に、例えば図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D)に具体化されるもの以外の方法を含む、本明細書で提供されるもの以外の方法を使用して調製されたTILで治療された患者と比較して、1倍、2倍、3倍、4倍、または5倍以上増加する。いくつかの実施形態では、IFN-γ分泌は、未治療の患者と比較して、及び/または例えば、図8(特に、例えば図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D)に具体化されるもの以外の方法を含む、本明細書で提供されるもの以外の方法を使用して調製されたTILで治療された患者と比較して、1倍増加する。いくつかの実施形態では、IFN-γ分泌は、未治療の患者と比較して、及び/または例えば、図8(特に、例えば図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D)に具体化されるもの以外の方法を含む、本明細書で提供されるもの以外の方法を使用して調製されたTILで治療された患者と比較して、2倍増加する。いくつかの実施形態では、IFN-γ分泌は、未治療の患者と比較して、及び/または例えば、図8(特に、例えば図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D)に具体化されるもの以外の方法を含む、本明細書で提供されるもの以外の方法を使用して調製されたTILで治療された患者と比較して、3倍増加する。いくつかの実施形態では、IFN-γ分泌は、未治療の患者と比較して、及び/または例えば、図8(特に、例えば図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D)に具体化されるもの以外の方法を含む、本明細書で提供されるもの以外の方法を使用して調製されたTILで治療された患者と比較して、4倍増加する。いくつかの実施形態では、IFN-γ分泌は、未治療の患者と比較して、及び/または例えば、図8(特に、例えば図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D)に具体化されるもの以外の方法を含む、本明細書で提供されるもの以外の方法を使用して調製されたTILで治療された患者と比較して、5倍増加する。いくつかの実施形態では、IFN-γは、Quantikine ELISAキットを使用して測定される。いくつかの実施形態では、IFN-γは、Quantikine ELISAキットを使用して測定される。いくつかの実施形態では、IFN-γは、本発明の方法によって産生されたTILで治療された患者由来のエクスビボでのTIL中で測定される。いくつかの実施形態では、IFN-γは、本発明の方法によって産生されたTILで治療された患者由来の血液中で測定される。いくつかの実施形態では、IFN-γは、本発明の方法によって産生されたTILで治療された患者由来の血清中で測定される。
いくつかの実施形態では、例えば、図8(特に、例えば図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D)に記載される方法を含む、本発明の方法によって調製されたTILは、例えば、プロセス1C法と称される方法などの、図8(特に、例えば図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D)に例示されていないものを含む他の方法によって産生されたTILと比較して、増加したポリクローン性を示す。いくつかの実施形態では、有意に改善されたポリクローン性及び/または増加したポリクローン性は、がん治療に対する治療有効性及び/または増加した臨床的有効性を示す。いくつかの実施形態では、ポリクローン性は、T細胞レパートリーの多様性を指す。いくつかの実施形態では、ポリクローン性の増加は、本発明の方法によって産生されたTILの投与に関する治療有効性を示すことができる。いくつかの実施形態では、ポリクローン性は、例えば、図8(特に、例えば図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D)に具体化されるもの以外の方法を含む、本明細書で提供されるもの以外の方法を使用して調製されたTILと比較して、1倍、2倍、10倍、100倍、500倍、または1000倍増加する。いくつかの実施形態では、ポリクローン性は、未治療の患者と比較して、及び/または例えば、図8(特に、例えば図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D)に具体化されるもの以外の方法を含む、本明細書で提供されるもの以外の方法を使用して調製されたTILで治療された患者と比較して、1倍増加する。いくつかの実施形態では、ポリクローン性は、未治療の患者と比較して、及び/または例えば、図8(特に、例えば図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D)に具体化されるもの以外の方法を含む、本明細書で提供されるもの以外の方法を使用して調製されたTILで治療された患者と比較して、2倍増加する。いくつかの実施形態では、ポリクローン性は、未治療の患者と比較して、及び/または例えば、図8(特に、例えば図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D)に具体化されるもの以外の方法を含む、本明細書で提供されるもの以外の方法を使用して調製されたTILで治療された患者と比較して、10倍増加する。いくつかの実施形態では、ポリクローン性は、未治療の患者と比較して、及び/または例えば、図8(特に、例えば図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D)に具体化されるもの以外の方法を含む、本明細書で提供されるもの以外の方法を使用して調製されたTILで治療された患者と比較して、100倍増加する。いくつかの実施形態では、ポリクローン性は、未治療の患者と比較して、及び/または例えば、図8(特に、例えば図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D)に具体化されるもの以外の方法を含む、本明細書で提供されるもの以外の方法を使用して調製されたTILで治療された患者と比較して、500倍増加する。いくつかの実施形態では、ポリクローン性は、未治療の患者と比較して、及び/または例えば、図8(特に、例えば図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D)に具体化されるもの以外の方法を含む、本明細書で提供されるもの以外の方法を使用して調製されたTILで治療された患者と比較して、1000倍増加する。
2.PD-1及びPD-L1阻害剤との併用
いくつかの実施形態では、がんを有する患者に提供されるTIL療法は、治療的TIL集合単独による治療を含んでもよく、またはTILならびに1つ以上のPD-1及び/またはPD-L1阻害剤を含む併用治療を含んでもよい。例えば、PD-1を標的とし、本発明のTILとともに同時投与され得る抗体としては、ニボルマブ(BMS-936558、Bristol-Myers Squibb、Opdivo(登録商標))、ペムブロリズマブ(ラムブロリズマブ、MK03475またはMK-3475、Merck、Keytruda(登録商標))、ヒト化抗PD-1抗体JS001(ShangHai JunShi)、モノクローナル抗PD-1抗体TSR-042(Tesaro,Inc.)、ピジリズマブ(抗PD-1 mAb CT-011、Medivation)、抗PD-1モノクローナル抗体BGB-A317(BeiGene)、及び/または抗PD-1抗体SHR-1210(ShangHai HengRui)、ヒトモノクローナル抗体REGN2810(Regeneron)、ヒトモノクローナル抗体MDX-1106(Bristol-Myers Squibb)、及び/またはヒト化抗PD-1 IgG4抗体PDR001(Novartis)が含まれるが、これらに限定されない。いくつかの実施形態では、PD-1抗体は、クローン:RMP1-14(ラットIgG)-BioXcellカタログ番号BP0146である。本明細書に記載のステップA~Fに従って産生されたTILとの同時投与方法における使用に好適な他の好適な抗体は、参照により本明細書に組み込まれる米国特許第8,008,449号に開示される抗PD-1抗体である。いくつかの実施形態では、抗体またはその抗原結合部分は、PD-L1に特異的に結合し、PD-1との相互作用を阻害し、それにより、免疫活性を増加させる。PD-L1に結合し、PD-1とPD-L1との間の相互作用を破壊し、かつ抗腫瘍免疫応答を刺激する当該技術分野で知られているいずれの抗体も、本明細書に記載のステップA~Fに従って産生されたTILとの同時投与方法における使用に好適である。例えば、PD-L1を標的とし、かつ臨床試験中である抗体には、BMS-936559(Bristol-Myers Squibb)及びMPDL3280A(Genentech)が含まれる。PD-L1を標的とする他の好適な抗体は、参照により本明細書に組み込まれる米国特許第7,943,743号に開示されている。PD-1またはPD-L1に結合し、PD-1/PD-L1相互作用を破壊し、かつ抗腫瘍免疫応答を刺激するいずれの抗体も、本明細書に記載のステップA~Fに従って産生されたTILとの同時投与方法における使用に好適であることが当業者に理解されるであろう。いくつかの実施形態では、ステップA~Fに従って産生されたTILの組み合わせを投与された対象は、患者が抗PD-1抗体単独の投与に不応性であるがん型を有する場合、抗PD-1抗体と同時投与される。いくつかの実施形態では、患者が不応性黒色腫を有する場合、患者は、TILを抗PD-1と組み合わせて投与される。
プログラム死1(PD-1)は、T細胞、B細胞、ナチュラルキラー(NK)T細胞、活性化単球、及び樹状細胞によって発現される288アミノ酸の膜貫通免疫チェックポイント受容体タンパク質である。CD279としても知られるPD-1は、CD28ファミリーに属し、ヒトでは第2染色体上のPdcd1遺伝子によってコードされる。PD-1は、1つの免疫グロブリン(Ig)スーパーファミリードメイン、膜貫通領域、ならびに免疫受容体チロシンベースの阻害モチーフ(ITIM)及び免疫受容体チロシンベースのスイッチモチーフ(ITSM)を含む細胞内ドメインからなる。PD-1とそのリガンド(PD-L1及びPD-L2)は、Keir,et al.,Annu.Rev.Immunol.2008,26,677-704に記載されるように、免疫寛容において重要な役割を果たすことが知られている。PD-1は、T細胞の免疫応答を負に調節する阻害シグナルを提供する。PD-L1(B7-H1またはCD274としても知られる)及びPD-L2(B7-DCまたはCD273としても知られる)は、腫瘍細胞及び間質細胞上に発現され、PD-1を発現する活性化T細胞が遭遇する可能性があり、T細胞の免疫抑制につながる。PD-L1は、ヒト第9染色体上のCd274遺伝子によってコードされる290アミノ酸の膜貫通タンパク質である。例えば、Topalian,et al.,N.Eng.J.Med.2012,366,2443-54に記載される最近の臨床研究で実証されているように、PD-1阻害剤、PD-L1阻害剤、及び/またはPD-L2阻害剤の使用による、PD-1とそのリガンドPD-L1及びPD-L2との間の相互作用をブロックすることで、免疫抵抗を克服することができる。PD-L1は、多くの腫瘍細胞株上で発現されるが、PD-L2は、主に樹状細胞及びいくつかの腫瘍株上で発現される発現される。T細胞(活性化後にPD-1を誘導的に発現する)に加えて、PD-1は、B細胞、ナチュラルキラー細胞、マクロファージ、活性化単球、樹状細胞上でも発現される。
実施形態では、PD-1阻害剤は、当該技術分野で知られている任意のPD-1阻害剤またはPD-1遮断薬であり得る。特に、次の段落でより詳細に記載されるPD-1阻害剤または遮断剤のうちの1つである。「阻害剤」、「アンタゴニスト」、及び「遮断剤」という用語は、本明細書では、PD-1阻害剤に関して互換的に使用される。誤解を避けるために、抗体であるPD-1阻害剤への本明細書での言及は、化合物またはその抗原結合断片、バリアント、コンジュゲート、もしくはバイオシミラーを指し得る。誤解を避けるために、PD-1阻害剤への本明細書での言及はまた、小分子化合物またはその薬学的に許容される塩、エステル、溶媒和物、水和物、共結晶、もしくはプロドラッグを指し得る。
好ましい実施形態では、PD-1阻害剤は、抗体(すなわち、抗PD-1抗体)、Fab断片を含むその断片、またはその一本鎖可変断片(scFv)である。いくつかの実施形態では、PD-1阻害剤は、ポリクローナル抗体である。好ましい実施形態では、PD-1阻害剤は、モノクローナル抗体である。いくつかの実施形態では、PD-1阻害剤は、PD-1との結合について競合し、及び/またはPD-1上のエピトープに結合する。ある実施形態では、抗体は、PD-1との結合について競合し、かつ/またはPD-1上のエピトープに結合する。
いくつかの実施形態では、PD-1阻害剤は、ヒトPD-1に約100pM以下のKDで結合する、ヒトPD-1に約90pM以下のKDで結合する、ヒトPD-1に約80pM以下のKDで結合する、ヒトPD-1に約70pM以下のKDで結合する、ヒトPD-1に約60pM以下のKDで結合する、ヒトPD-1に約50pM以下のKDで結合する、ヒトPD-1に約40pM以下のKDで結合する、ヒトPD-1に約30pM以下のKDで結合する、ヒトPD-1に約20pM以下のKDで結合する、ヒトPD-1に約10pM以下のKDで結合する、またはヒトPD-1に約1pM以下のKDで結合するものである。
いくつかの実施形態では、PD-1阻害剤は、ヒトPD-1に約7.5×105l/M・s以上のkassocで結合する、ヒトPD-1に約7.5×105l/M・s以上のkassocで結合する、ヒトPD-1に約8×105l/M・s以上のkassocで結合する、ヒトPD-1に約8.5×105l/M・s以上のkassocで結合する、ヒトPD-1に約9×105l/M・s以上のkassocで結合する、ヒトPD-1に約9.5×105l/M・s以上のkassocで結合する、またはヒトPD-1に約1×106l/M・s以上のkassocで結合するものである。
いくつかの実施形態では、PD-1阻害剤は、ヒトPD-1に約2×10-5l/s以下のkdissocで結合する、ヒトPD-1に約2.1×10-5l/s以下のkdissocで結合する、ヒトPD-1に約2.2×10-5l/s以下のkdissocで結合する、ヒトPD-1に約2.3×10-5l/s以下のkdissocで結合する、ヒトPD-1に約2.4×10-5l/s以下のkdissocで結合する、ヒトPD-1に約2.5×10-5l/s以下のkdissocで結合する、ヒトPD-1に約2.6×10-5l/s以下のkdissocで結合する、またはヒトPD-1に約2.7×10-5l/s以下のkdissocで結合する、ヒトPD-1に約2.8×10-5l/s以下のkdissocで結合する、ヒトPD-1に約2.9×10-5l/s以下のkdissocで結合する、またはヒトPD-1に約3×10-5l/s以下のkdissocで結合するものである。
いくつかの実施形態では、PD-1阻害剤は、約10nM以下のIC50でのヒトPD-1へのヒトPD-L1もしくはヒトPD-L2の結合を遮断もしくは阻害し、約9nM以下のIC50でのヒトPD-1へのヒトPD-L1もしくはヒトPD-L2の結合を遮断もしくは阻害し、約8nM以下のIC50でのヒトPD-1へのヒトPD-L1もしくはヒトPD-L2の結合を遮断もしくは阻害し、約7nM以下のIC50でのヒトPD-1へのヒトPD-L1もしくはヒトPD-L2の結合を遮断もしくは阻害し、約6nM以下のIC50でのヒトPD-1へのヒトPD-L1もしくはヒトPD-L2の結合を遮断もしくは阻害し、約5nM以下のIC50でのヒトPD-1へのヒトPD-L1もしくはヒトPD-L2の結合を遮断もしくは阻害し、約4nM以下のIC50でのヒトPD-1へのヒトPD-L1もしくはヒトPD-L2の結合を遮断もしくは阻害し、約3nM以下のIC50でのヒトPD-1へのヒトPD-L1もしくはヒトPD-L2の結合を遮断もしくは阻害し、約2nM以下のIC50でのヒトPD-1へのヒトPD-L1もしくはヒトPD-L2の結合を遮断もしくは阻害し、または約1nM以下のIC50でのヒトPD-1へのヒトPD-L1もしくはヒトPD-L2の結合を遮断もしくは阻害するものである。
ある実施形態では、PD-1阻害剤は、ニボルマブ(Bristol-Myers Squibb Co.からOPDIVOとして市販されている)、またはそれらのバイオシミラー、抗原結合断片、コンジュゲート、もしくは多様体である。ニボルマブは、PD-1受容体を遮断する完全ヒトIgG4抗体である。ある実施形態では、抗PD-1抗体は、免疫グロブリンG4κ、抗(ヒトCD274)抗体である。ニボルマブには、Chemical Abstracts Service(CAS)登録番号946414-94-4が割り当てられており、5C4、BMS-936558、MDX-1106、及びONO-4538としても知られている。ニボルマブの調製及び特性は、米国特許第8,008,449号及び国際特許公開第WO2006/121168号に記載されており、それらの開示は参照により本明細書に組み込まれる。様々な形態のがんにおけるニボルマブの臨床的安全性及び有効性は、Wang,et al.,Cancer Immunol.Res.2014,2,846-56、Page,et al.,Ann.Rev.Med.,2014,65,185-202、及びWeber,et al.,J.Clin.Oncology,2013,31,4311-4318に記載されており、それらの開示は参照により本明細書に組み込まれる。ニボルマブのアミノ酸配列を表18に示す。ニボルマブは、22-96、140-196、254-314、360-418、22’’-96’’、140’’-196’’、254’’-314’’、及び360’’-418’’における重鎖内ジスルフィド結合;23’-88’、134’-194’、23’’’-88’’’、及び134’’’-194’’’における軽鎖内ジスルフィド結合;127-214’、127’’-214’’’における重鎖-軽鎖間ジスルフィド結合;219-219’’及び222-222’’における重鎖-重鎖間ジスルフィド結合;ならびに290、290’’におけるN-グリコシル化部位(H CH2 84.4)を有する。
ある実施形態では、PD-1阻害剤は、配列番号158によって与えられる重鎖及び配列番号159によって与えられる軽鎖を含む。ある実施形態では、PD-1阻害剤は、それぞれ、配列番号158及び配列番号159に示される配列を有する重鎖及び軽鎖、またはそれらの抗原結合断片、Fab断片、一本鎖可変断片(scFv)、多様体、もしくはコンジュゲートを含む。ある実施形態では、PD-1阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号158及び配列番号159に示される配列と少なくとも99%同一である重鎖及び軽鎖を含む。ある実施形態では、PD-1阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号158及び配列番号159に示される配列と少なくとも98%同一である重鎖及び軽鎖を含む。ある実施形態では、PD-1阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号158及び配列番号159に示される配列と少なくとも97%同一である重鎖及び軽鎖を含む。ある実施形態では、PD-1阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号158及び配列番号159に示される配列と少なくとも96%同一である重鎖及び軽鎖を含む。ある実施形態では、PD-1阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号463及び配列番号159に示される配列と少なくとも95%同一である重鎖及び軽鎖を含む。
ある実施形態では、PD-1阻害剤は、ニボルマブの重鎖及び軽鎖CDRまたは可変領域(VR)を含む。ある実施形態では、PD-1阻害剤重鎖可変領域(VH)は、配列番号160に示される配列を含み、PD-1阻害剤軽鎖可変領域(VL)は、配列番号161に示される配列、及びその保存的アミノ酸置換を含む。ある実施形態では、PD-1阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号160及び配列番号161に示される配列と少なくとも99%同一であるVH領域及びVL領域を含む。ある実施形態では、PD-1阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号160及び配列番号161に示される配列と少なくとも98%同一であるVH領域及びVL領域を含む。ある実施形態では、PD-1阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号160及び配列番号161に示される配列と少なくとも97%同一であるVH領域及びVL領域を含む。ある実施形態では、PD-1阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号160及び配列番号161に示される配列と少なくとも96%同一であるVH領域及びVL領域を含む。ある実施形態では、PD-1阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号160及び配列番号161に示される配列と少なくとも95%同一であるVH領域及びVL領域を含む。
ある実施形態では、PD-1阻害剤は、それぞれ、配列番号162、配列番号163、及び配列番号164に示される配列を有する重鎖CDR1、CDR2、及びCDR3ドメイン、ならびにそれらの保存的アミノ酸置換と、それぞれ、配列番号165、配列番号166、及び配列番号167に示される配列を有する軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3ドメイン、ならびにそれらの保存的アミノ酸置換と、を含む。ある実施形態では、抗体は、前述の抗体のうちのいずれかと結合するために競合し、かつ/またはPD-1上の同じエピトープに結合する。
ある実施形態では、PD-1阻害剤は、ニボルマブに関して薬物規制当局によって承認された抗PD-1バイオシミラーモノクローナル抗体である。ある実施形態では、バイオシミラーは、参照医薬品または参照バイオ製品のアミノ酸配列に対して少なくとも97%の配列同一性、例えば、97%、98%、99%、または100%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含み、参照医薬品または参照バイオ製品と比較して、1つ以上の翻訳後修飾を含む、PD-1抗体を含み、参照医薬品または参照バイオ製品は、ニボルマブである。いくつかの実施形態では、1つ以上の翻訳後修飾は、グリコシル化、酸化、脱アミド化、及び切断のうちの1つ以上から選択される。いくつかの実施形態では、バイオシミラーは、認可された、または認可のために提出された抗PD-1抗体であり、抗PD-1抗体は、参照医薬品または参照バイオ製品の製剤とは異なる製剤で提供され、参照医薬品または参照バイオ製品は、ニボルマブである。抗PD-1抗体は、米国FDA及び/または欧州連合のEMAなどの薬物規制当局によって認可され得る。いくつかの実施形態では、バイオシミラーは、1つ以上の賦形剤をさらに含む組成物として提供され、1つ以上の賦形剤は、参照医薬品または参照バイオ製品に含まれる賦形剤と同じまたは異なるものであり、参照医薬品または参照バイオ製品は、ニボルマブである。いくつかの実施形態では、バイオシミラーは、1つ以上の賦形剤をさらに含む組成物として提供され、1つ以上の賦形剤は、参照医薬品または参照バイオ製品に含まれる賦形剤と同じまたは異なるものであり、参照医薬品または参照バイオ製品は、ニボルマブである。
Figure 2024512029000022
いくつかの実施形態では、PD-1阻害剤は、ニボルマブまたはそのバイオシミラーであり、ニボルマブは、約0.5mg/kg~約10mg/kgの用量で投与される。いくつかの実施形態では、PD-1阻害剤は、ニボルマブまたはそのバイオシミラーであり、ニボルマブは、約0.5mg/kg、約1mg/kg、約1.5mg/kg、約2mg/kg、約2.5mg/kg、約3mg/kg、約3.5mg/kg、約4mg/kg、約4.5mg/kg、約5mg/kg、約5.5mg/kg、約6mg/kg、約6.5mg/kg、約7mg/kg、約7.5mg/kg、約8mg/kg、約8.5mg/kg、約9mg/kg、約9.5mg/kg、または約10mg/kgの用量で投与される。いくつかの実施形態では、ニボルマブ投与は、IL-2投与後1、2、3、4、または5日で開始される。いくつかの実施形態では、ニボルマブ投与は、IL-2投与後1、2、または3日で開始される。いくつかの実施形態では、ニボルマブはまた、切除前1、2、3、4、または5週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)投与することができる。いくつかの実施形態では、ニボルマブはまた、切除前1、2、または3週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)投与することができる。
いくつかの実施形態では、PD-1阻害剤は、ニボルマブまたはそのバイオシミラーであり、ニボルマブは、約200mg~約500mgの用量で投与される。いくつかの実施形態では、PD-1阻害剤は、ニボルマブまたはそのバイオシミラーであり、ニボルマブは、約200mg、約220mg、約240mg、約260mg、約280mg、約300mg、約320mg、約340mg、約360mg、約380mg、約400mg、約420mg、約440mg、約460mg、約480mg、または約500mgの用量で投与される。いくつかの実施形態では、ニボルマブ投与は、IL-2投与後1、2、3、4、または5日で開始される。いくつかの実施形態では、ニボルマブ投与は、IL-2投与後1、2、または3日で開始される。いくつかの実施形態では、ニボルマブはまた、切除前1、2、3、4、または5週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)投与することができる。いくつかの実施形態では、ニボルマブはまた、切除前1、2、または3週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)投与することができる。
いくつかの実施形態では、PD-1阻害剤は、ニボルマブまたはそのバイオシミラーであり、ニボルマブは、2週間毎、3週間毎、4週間毎、5週間毎、または6週間毎に投与される。いくつかの実施形態では、ニボルマブ投与は、IL-2投与後1、2、3、4、または5日で開始される。いくつかの実施形態では、ニボルマブ投与は、IL-2投与後1、2、または3日で開始される。いくつかの実施形態では、ニボルマブはまた、切除前1、2、3、4、または5週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)投与することができる。いくつかの実施形態では、ニボルマブはまた、切除前1、2、または3週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)投与することができる。
いくつかの実施形態では、ニボルマブは、切除不能または転移性黒色腫を治療するために投与される。いくつかの実施形態では、ニボルマブは、切除不能または転移性黒色腫を治療するために投与され、2週間毎に約240mgで投与される。いくつかの実施形態では、ニボルマブは、切除不能または転移性黒色腫を治療するために投与され、4週間毎に約480mgで投与される。いくつかの実施形態では、ニボルマブは、切除不能または転移性黒色腫を治療するために、約1mg/kgで投与され、続いて同じ日にイピリムマブ3mg/kgを3週間毎に4用量、次いで240mgを2週間毎、または480mgを4週間毎に投与される。いくつかの実施形態では、ニボルマブ投与は、IL-2投与後1、2、3、4、または5日で開始される。いくつかの実施形態では、ニボルマブ投与は、IL-2投与後1、2、または3日で開始される。いくつかの実施形態では、ニボルマブはまた、切除前1、2、3、4、または5週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)投与することができる。いくつかの実施形態では、ニボルマブはまた、切除前1、2、または3週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)投与することができる。
いくつかの実施形態では、ニボルマブは、黒色腫のアジュバント治療のために投与される。いくつかの実施形態では、ニボルマブは、黒色腫のアジュバント治療のために、2週間毎に約240mgで投与される。いくつかの実施形態では、ニボルマブは、黒色腫のアジュバント治療のために、4週間毎に約480mgで投与される。いくつかの実施形態では、ニボルマブ投与は、IL-2投与後1、2、3、4、または5日で開始される。いくつかの実施形態では、ニボルマブ投与は、IL-2投与後1、2、または3日で開始される。いくつかの実施形態では、ニボルマブはまた、切除前1、2、3、4、または5週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)投与することができる。いくつかの実施形態では、ニボルマブはまた、切除前1、2、または3週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)投与することができる。
いくつかの実施形態では、ニボルマブは、転移性非小細胞肺癌を治療するために投与される。いくつかの実施形態では、ニボルマブは、転移性非小細胞肺癌を治療するために、2週間毎に約3mg/kgで、6週間毎に1mg/kgのイピリムマブとともに投与される。いくつかの実施形態では、ニボルマブは、転移性非小細胞肺癌を治療するために、3週間毎に約360mgで、6週間毎に1mg/kgのイピリムマブ及び2サイクルのプラチナダブレット化学療法とともに投与される。いくつかの実施形態では、ニボルマブは、転移性非小細胞肺癌を治療するために、2週間毎に約240mgまたは4週間毎に480mg投与される。いくつかの実施形態では、ニボルマブ投与は、IL-2投与後1、2、3、4、または5日で開始される。いくつかの実施形態では、ニボルマブ投与は、IL-2投与後1、2、または3日で開始される。いくつかの実施形態では、ニボルマブはまた、切除前1、2、3、4、または5週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)投与することができる。いくつかの実施形態では、ニボルマブはまた、切除前1、2、または3週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)投与することができる。
いくつかの実施形態では、ニボルマブは、小細胞肺癌を治療するために投与される。いくつかの実施形態では、ニボルマブは、小細胞肺癌を治療するために、2週間毎に約240mgで投与される。いくつかの実施形態では、ニボルマブ投与は、IL-2投与後1、2、3、4、または5日で開始される。いくつかの実施形態では、ニボルマブ投与は、IL-2投与後1、2、または3日で開始される。いくつかの実施形態では、ニボルマブはまた、切除前1、2、3、4、または5週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)投与することができる。いくつかの実施形態では、ニボルマブはまた、切除前1、2、または3週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)投与することができる。
いくつかの実施形態では、ニボルマブは、悪性胸膜中皮腫を治療するために、3週間毎に約360mgで、6週間毎に1mg/kgのイピリムマブとともに投与される。いくつかの実施形態では、ニボルマブ投与は、IL-2投与後1、2、3、4、または5日で開始される。いくつかの実施形態では、ニボルマブ投与は、IL-2投与後1、2、または3日で開始される。いくつかの実施形態では、ニボルマブはまた、切除前1、2、3、4、または5週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)投与することができる。いくつかの実施形態では、ニボルマブはまた、切除前1、2、または3週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)投与することができる。
いくつかの実施形態では、ニボルマブは、進行性腎細胞癌を治療するために投与される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブは、進行性腎細胞癌を治療するために、2週間毎に約240mgで投与される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブは、進行性腎細胞癌を治療するために、4週間毎に約480mgで投与される。いくつかの実施形態では、ニボルマブは、進行性腎細胞癌を治療するために、約3mg/kgで投与され、続いて同じ日にイピリムマブ約1mg/kgを3週間毎に4用量、次いで240mgを2週間毎に投与される。いくつかの実施形態では、ニボルマブは、進行性腎細胞癌を治療するために、約3mg/kgで投与され、続いて同じ日にイピリムマブ約1mg/kgを3週間毎に4用量、次いで240mgを2週間毎、480mgを4週間毎に投与される。いくつかの実施形態では、ニボルマブ投与は、IL-2投与後1、2、3、4、または5日で開始される。いくつかの実施形態では、ニボルマブ投与は、IL-2投与後1、2、または3日で開始される。いくつかの実施形態では、ニボルマブはまた、切除前1、2、3、4、または5週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)投与することができる。いくつかの実施形態では、ニボルマブはまた、切除前1、2、または3週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)投与することができる。
いくつかの実施形態では、ニボルマブは、古典的ホジキンリンパ腫を治療するために投与される。いくつかの実施形態では、ニボルマブは、古典的ホジキンリンパ腫を治療するために、2週間毎に約240mgで投与される。いくつかの実施形態では、ニボルマブは、古典的ホジキンリンパ腫を治療するために、4週間毎に約480mgで投与される。いくつかの実施形態では、ニボルマブ投与は、IL-2投与後1、2、3、4、または5日で開始される。いくつかの実施形態では、ニボルマブ投与は、IL-2投与後1、2、または3日で開始される。いくつかの実施形態では、ニボルマブはまた、切除前1、2、3、4、または5週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)投与することができる。いくつかの実施形態では、ニボルマブはまた、切除前1、2、または3週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)投与することができる。
いくつかの実施形態では、ニボルマブは、頭頸部の再発性または転移性扁平上皮癌を治療するために投与される。いくつかの実施形態では、ニボルマブは、頭頸部の再発性または転移性扁平上皮癌を治療するために、2週間毎に約240mgで投与される。いくつかの実施形態では、ニボルマブは、頭頸部の再発性または転移性扁平上皮癌を治療するために、4週間毎に約480mgで投与される。いくつかの実施形態では、ニボルマブ投与は、IL-2投与後1、2、3、4、または5日で開始される。いくつかの実施形態では、ニボルマブ投与は、IL-2投与後1、2、または3日で開始される。いくつかの実施形態では、ニボルマブはまた、切除前1、2、3、4、または5週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)投与することができる。いくつかの実施形態では、ニボルマブはまた、切除前1、2、または3週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)投与することができる。
いくつかの実施形態では、ニボルマブは、局所進行性または転移性尿路上皮癌を治療するために、2週間毎に約240mgで投与される。いくつかの実施形態では、ニボルマブは、局所進行性または転移性尿路上皮癌を治療するために、4週間毎に約480mgで投与される。いくつかの実施形態では、ニボルマブ投与は、IL-2投与後1、2、3、4、または5日で開始される。いくつかの実施形態では、ニボルマブ投与は、IL-2投与後1、2、または3日で開始される。いくつかの実施形態では、ニボルマブはまた、切除前1、2、3、4、または5週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)投与することができる。いくつかの実施形態では、ニボルマブはまた、切除前1、2、または3週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)投与することができる。
いくつかの実施形態では、ニボルマブは、高頻度マイクロサテライト不安定性(MSI-H)またはミスマッチ修復欠損(dMMR)転移性結腸直腸癌を治療するために投与される。いくつかの実施形態では、ニボルマブは、成人及び小児患者における高頻度マイクロサテライト不安定性(MSI-H)またはミスマッチ修復欠損(dMMR)転移性結腸直腸癌を治療するために投与される。いくつかの実施形態では、ニボルマブは、40kg以上の成人及び小児患者における高頻度マイクロサテライト不安定性(MSI-H)またはミスマッチ修復欠損(dMMR)転移性結腸直腸癌を治療するために、2週間毎に約240mgで投与される。いくつかの実施形態では、ニボルマブは、40kg以上の成人及び小児患者における高頻度マイクロサテライト不安定性(MSI-H)またはミスマッチ修復欠損(dMMR)転移性結腸直腸癌を治療するために、4週間毎に約480mgで投与される。いくつかの実施形態では、ニボルマブ投与は、IL-2投与後1、2、3、4、または5日で開始される。いくつかの実施形態では、ニボルマブ投与は、IL-2投与後1、2、または3日で開始される。いくつかの実施形態では、ニボルマブはまた、切除前1、2、3、4、または5週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)投与することができる。いくつかの実施形態では、ニボルマブはまた、切除前1、2、または3週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)投与することができる。
いくつかの実施形態では、ニボルマブは、40kg未満の小児患者における高頻度マイクロサテライト不安定性(MSI-H)またはミスマッチ修復欠損(dMMR)転移性結腸直腸癌を治療するために、2週間毎に約3mg/kgで投与される。いくつかの実施形態では、ニボルマブは、40kg以上の成人及び小児患者における高頻度マイクロサテライト不安定性(MSI-H)またはミスマッチ修復欠損(dMMR)転移性結腸直腸癌を治療するために、約3mg/kgで投与され、続いて同じ日にイピリムマブ1mg/kgを3週間毎に4用量、次いで240mgを2週間毎に投与される。いくつかの実施形態では、ニボルマブは、40kg以上の成人及び小児患者における高頻度マイクロサテライト不安定性(MSI-H)またはミスマッチ修復欠損(dMMR)転移性結腸直腸癌を治療するために、約3mg/kgで投与され、続いて同じ日にイピリムマブ1mg/kgを3週間毎に4用量、次いで480mgを4週間毎に投与される。いくつかの実施形態では、ニボルマブ投与は、IL-2投与後1、2、3、4、または5日で開始される。いくつかの実施形態では、ニボルマブ投与は、IL-2投与後1、2、または3日で開始される。いくつかの実施形態では、ニボルマブはまた、切除前1、2、3、4、または5週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)投与することができる。いくつかの実施形態では、ニボルマブはまた、切除前1、2、または3週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)投与することができる。
いくつかの実施形態では、ニボルマブは、肝細胞癌を治療するために投与される。いくつかの実施形態では、ニボルマブは、肝細胞癌を治療するために、2週間毎に約240mgで投与される。いくつかの実施形態では、ニボルマブは、肝細胞癌を治療するために、4週間毎に約480mgで投与される。いくつかの実施形態では、ニボルマブは、肝細胞癌を治療するために、約1mg/kgで投与され、続いて同じ日にイピリムマブ3mg/kgを3週間毎に4用量、次いで240mgを2週間毎に投与される。いくつかの実施形態では、ニボルマブは、肝細胞癌を治療するために、約1mg/kgで投与され、続いて同じ日にイピリムマブ3mg/kgを3週間毎に4用量、次いで480mgを4週間毎に投与される。いくつかの実施形態では、ニボルマブ投与は、IL-2投与後1、2、3、4、または5日で開始される。いくつかの実施形態では、ニボルマブ投与は、IL-2投与後1、2、または3日で開始される。いくつかの実施形態では、ニボルマブはまた、切除前1、2、3、4、または5週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)投与することができる。いくつかの実施形態では、ニボルマブはまた、切除前1、2、または3週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)投与することができる。
いくつかの実施形態では、ニボルマブは、食道扁平上皮癌を治療するために投与される。いくつかの実施形態では、ニボルマブは、食道扁平上皮癌を治療するために、2週間毎に約240mgで投与される。いくつかの実施形態では、ニボルマブは、食道扁平上皮癌を治療するために、4週間毎に約480mgで投与される。いくつかの実施形態では、ニボルマブ投与は、IL-2投与後1、2、3、4、または5日で開始される。いくつかの実施形態では、ニボルマブ投与は、IL-2投与後1、2、または3日で開始される。いくつかの実施形態では、ニボルマブはまた、切除前1、2、3、4、または5週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)投与することができる。いくつかの実施形態では、ニボルマブはまた、切除前1、2、または3週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)投与することができる。
別の実施形態では、PD-1阻害剤は、ペムブロリズマブ(Merck&Co.,Inc(Kenilworth,NJ,USA)からKEYTRUDAとして市販されている)、またはそれらの抗原結合断片、コンジュゲート、もしくは多様体を含む。ペムブロリズマブには、CAS登録番号1374853-91-4が割り当てられており、ラムブロリズマブ、MK-3475、及びSCH-900475としても知られている。ペムブロリズマブは、免疫グロブリンG4、抗(ヒトタンパク質PDCD1(プログラム細胞死1))(ヒト-ハツカネズミモノクローナル重鎖)、ヒト-ハツカネズミモノクローナル軽鎖、二量体構造を有するジスルフィドを有する。ペムブロリズマブの構造は、免疫グロブリンG4、抗(ヒトプログラム細胞死1);ヒト化マウスモノクローナルκ軽鎖二量体(226-226’’:229-229’’)-ビスジスルフィドを有するヒト化マウスモノクローナル[228-L-プロリン(H10-S>P)]γ4重鎖(134-218’)-ジスルフィドとしても記載され得る。ペムブロリズマブの特性、使用、及び調製は、国際特許公開第WO2008/156712A1号、米国特許第8,354,509号、ならびに米国特許出願公開第US2010/0266617A1号、同第US2013/0108651A1号、及び同第US2013/0109843A2に記載されており、それらの開示は参照により本明細書に組み込まれる。様々な形態のがんにおけるペムブロリズマブの臨床的安全性及び有効性は、Fuerst,Oncology Times,2014,36,35-36、Robert,et al.,Lancet,2014,384,1109-17、及びThomas,et al.,Exp.Opin.Biol.Ther.,2014,14,1061-1064に記載されている。ペムブロリズマブのアミノ酸配列を表19に示す。ペムブロリズマブは、ジスルフィド架橋:22-96、22’’-96’’、23’-92’、23’’’-92’’’、134-218’、134’’-218’’’、138’-198’、138’’’-198’’’、147-203、147’’-203’’、226-226’’、229-229’’、261-321、261’’-321’’、367-425、及び367’’-425’’、ならびにグリコシル化部位(N):Asn-297及びAsn-297’’を含む。ペムブロリズマブは、Fc領域に安定化S228P変異を有するIgG4/カッパアイソタイプであり、この変異をIgG4ヒンジ領域に挿入すると、IgG4抗体で典型的に観察される半分子の形成が防止される。ペムブロリズマブは、各重鎖のFcドメイン内のAsn297で不均一にグリコシル化されており、無傷の抗体の分子量はおよそ149kDaになる。ペムブロリズマブの優性グリコフォームは、フコシル化アガラクト二分性グリカンフォーム(G0F)である。
ある実施形態では、PD-1阻害剤は、配列番号168によって与えられる重鎖及び配列番号169によって与えられる軽鎖を含む。ある実施形態では、PD-1阻害剤は、それぞれ、配列番号168及び配列番号169に示される配列を有する重鎖及び軽鎖、またはそれらの抗原結合断片、Fab断片、一本鎖可変断片(scFv)、多様体、もしくはコンジュゲートを含む。ある実施形態では、PD-1阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号168及び配列番号169に示される配列と少なくとも99%同一である重鎖及び軽鎖を含む。ある実施形態では、PD-1阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号168及び配列番号169に示される配列と少なくとも98%同一である重鎖及び軽鎖を含む。ある実施形態では、PD-1阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号168及び配列番号169に示される配列と少なくとも97%同一である重鎖及び軽鎖を含む。ある実施形態では、PD-1阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号168及び配列番号169に示される配列と少なくとも96%同一である重鎖及び軽鎖を含む。ある実施形態では、PD-1阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号168及び配列番号169に示される配列と少なくとも95%同一である重鎖及び軽鎖を含む。
ある実施形態では、PD-1阻害剤は、ペムブロリズマブの重鎖及び軽鎖CDRまたは可変領域(VR)を含む。ある実施形態では、PD-1阻害剤重鎖可変領域(VH)は、配列番号170に示される配列を含み、PD-1阻害剤軽鎖可変領域(VL)は、配列番号171に示される配列、及びその保存的アミノ酸置換を含む。ある実施形態では、PD-1阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号170及び配列番号171に示される配列と少なくとも99%同一であるVH領域及びVL領域を含む。ある実施形態では、PD-1阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号170及び配列番号171に示される配列と少なくとも98%同一であるVH領域及びVL領域を含む。ある実施形態では、PD-1阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号170及び配列番号171に示される配列と少なくとも97%同一であるVH領域及びVL領域を含む。ある実施形態では、PD-1阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号170及び配列番号171に示される配列と少なくとも96%同一であるVH領域及びVL領域を含む。ある実施形態では、PD-1阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号170及び配列番号171に示される配列と少なくとも95%同一であるVH領域及びVL領域を含む。
ある実施形態では、PD-1阻害剤は、それぞれ、配列番号172、配列番号173、及び配列番号174に示される配列を有する重鎖CDR1、CDR2、及びCDR3ドメイン、ならびにそれらの保存的アミノ酸置換と、それぞれ、配列番号175、配列番号176、及び配列番号177に示される配列を有する軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3ドメイン、ならびにそれらの保存的アミノ酸置換と、を含む。ある実施形態では、抗体は、前述の抗体のうちのいずれかと結合するために競合し、かつ/またはPD-1上の同じエピトープに結合する。
ある実施形態では、PD-1阻害剤は、ペムブロリズマブに関して薬物規制当局によって承認された抗PD-1バイオシミラーモノクローナル抗体である。ある実施形態では、バイオシミラーは、参照医薬品または参照バイオ製品のアミノ酸配列に対して少なくとも97%の配列同一性、例えば、97%、98%、99%、または100%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含み、参照医薬品または参照バイオ製品と比較して、1つ以上の翻訳後修飾を含む、PD-1抗体を含み、参照医薬品または参照バイオ製品は、ペムブロリズマブである。いくつかの実施形態では、1つ以上の翻訳後修飾は、グリコシル化、酸化、脱アミド化、及び切断のうちの1つ以上から選択される。いくつかの実施形態では、バイオシミラーは、認可された、または認可のために提出された抗PD-1抗体であり、抗PD-1抗体は、参照医薬品または参照バイオ製品の製剤とは異なる製剤で提供され、参照医薬品または参照バイオ製品は、ペムブロリズマブである。抗PD-1抗体は、米国FDA及び/または欧州連合のEMAなどの薬物規制当局によって認可され得る。いくつかの実施形態では、バイオシミラーは、1つ以上の賦形剤をさらに含む組成物として提供され、1つ以上の賦形剤は、参照医薬品または参照バイオ製品に含まれる賦形剤と同じまたは異なるものであり、参照医薬品または参照バイオ製品は、ペムブロリズマブである。いくつかの実施形態では、バイオシミラーは、1つ以上の賦形剤をさらに含む組成物として提供され、1つ以上の賦形剤は、参照医薬品または参照バイオ製品に含まれる賦形剤と同じまたは異なるものであり、参照医薬品または参照バイオ製品は、ペムブロリズマブである。
Figure 2024512029000023
いくつかの実施形態では、PD-1阻害剤は、ペムブロリズマブまたはそのバイオシミラーであり、ペムブロリズマブは、約0.5mg/kg~約10mg/kgの用量で投与される。いくつかの実施形態では、PD-1阻害剤は、ペムブロリズマブまたはそのバイオシミラーであり、ペムブロリズマブは、約0.5mg/kg、約1mg/kg、約1.5mg/kg、約2mg/kg、約2.5mg/kg、約3mg/kg、約3.5mg/kg、約4mg/kg、約4.5mg/kg、約5mg/kg、約5.5mg/kg、約6mg/kg、約6.5mg/kg、約7mg/kg、約7.5mg/kg、約8mg/kg、約8.5mg/kg、約9mg/kg、約9.5mg/kg、または約10mg/kgの用量で投与される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブ投与は、IL-2投与後1、2、3、4、または5日で開始される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブ投与は、IL-2投与後1、2、または3日で開始される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブはまた、切除前1、2、3、4、または5週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)投与することができる。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブはまた、切除前1、2、または3週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)投与することができる。
いくつかの実施形態では、PD-1阻害剤は、ペムブロリズマブまたはそのバイオシミラーであり、ペムブロリズマブは、約200mg~約500mgの用量で投与される。いくつかの実施形態では、PD-1阻害剤は、ペムブロリズマブまたはそのバイオシミラーであり、ニボルマブは、約200mg、約220mg、約240mg、約260mg、約280mg、約300mg、約320mg、約340mg、約360mg、約380mg、約400mg、約420mg、約440mg、約460mg、約480mg、または約500mgの用量で投与される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブ投与は、IL-2投与後1、2、3、4、または5日で開始される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブ投与は、IL-2投与後1、2、または3日で開始される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブはまた、切除前1、2、3、4、または5週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)投与することができる。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブはまた、切除前1、2、または3週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)投与することができる。
いくつかの実施形態では、PD-1阻害剤は、ペムブロリズマブまたはそのバイオシミラーであり、ペムブロリズマブは、2週間毎、3週間毎、4週間毎、5週間毎、または6週間毎に投与される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブ投与は、IL-2投与後1、2、3、4、または5日で開始される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブ投与は、IL-2投与後1、2、または3日で開始される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブはまた、切除前1、2、3、4、または5週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)投与することができる。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブはまた、切除前1、2、または3週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)投与することができる。
いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブは、黒色腫を治療するために投与される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブは、黒色腫を治療するために、3週間毎に約200mgで投与される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブは、黒色腫を治療するために、6週間毎に約400mgで投与される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブ投与は、IL-2投与後1、2、3、4、または5日で開始される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブ投与は、IL-2投与後1、2、または3日で開始される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブはまた、切除前1、2、3、4、または5週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)投与することができる。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブはまた、切除前1、2、または3週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)投与することができる。
いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブは、NSCLCを治療するために投与される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブは、NSCLCを治療するために、3週間毎に約200mgで投与される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブは、NSCLCを治療するために、6週間毎に約400mgで投与される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブ投与は、IL-2投与後1、2、3、4、または5日で開始される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブ投与は、IL-2投与後1、2、または3日で開始される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブはまた、切除前1、2、3、4、または5週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)投与することができる。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブはまた、切除前1、2、または3週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)投与することができる。
いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブは、小細胞肺癌(SCLC)を治療するために投与される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブは、SCLCを治療するために、3週間毎に約200mgで投与される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブは、SCLCを治療するために、6週間毎に約400mgで投与される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブ投与は、IL-2投与後1、2、3、4、または5日で開始される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブ投与は、IL-2投与後1、2、または3日で開始される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブはまた、切除前1、2、3、4、または5週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)投与することができる。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブはまた、切除前1、2、または3週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)投与することができる。
いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブは、頭頸部扁平上皮癌(HNSCC)を治療するために投与される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブは、HNSCCを治療するために、3週間毎に約200mgで投与される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブは、HNSCCを治療するために、6週間毎に約400mgで投与される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブ投与は、IL-2投与後1、2、3、4、または5日で開始される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブ投与は、IL-2投与後1、2、または3日で開始される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブはまた、切除前1、2、3、4、または5週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)投与することができる。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブはまた、切除前1、2、または3週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)投与することができる。
いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブは、古典的ホジキンリンパ腫(cHL)または縦隔原発B細胞性大細胞型リンパ腫(PMBCL)を治療するために、3週間毎に約200mgで投与される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブは、古典的ホジキンリンパ腫(cHL)または縦隔原発B細胞性大細胞型リンパ腫(PMBCL)を治療するために、成人に対して6週間毎に約400mgで投与される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブは、古典的ホジキンリンパ腫(cHL)または縦隔原発B細胞性大細胞型リンパ腫(PMBCL)を治療するために、小児に対して3週間毎に約2mg/kg(最大200mg)で投与される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブ投与は、IL-2投与後1、2、3、4、または5日で開始される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブ投与は、IL-2投与後1、2、または3日で開始される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブはまた、切除前1、2、3、4、または5週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)投与することができる。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブはまた、切除前1、2、または3週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)投与することができる。
いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブは、尿路上皮癌を治療するために、3週間毎に約200mgで投与される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブは、尿路上皮癌を治療するために、6週間毎に約400mgで投与される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブ投与は、IL-2投与後1、2、3、4、または5日で開始される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブ投与は、IL-2投与後1、2、または3日で開始される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブはまた、切除前1、2、3、4、または5週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)投与することができる。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブはまた、切除前1、2、または3週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)投与することができる。
いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブは、高頻度マイクロサテライト不安定性(MSI-H)またはミスマッチ修復欠損(dMMR)癌を治療するために、3週間毎に約200mgで投与される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブは、MSI-HまたはdMMR癌を治療するために、成人の場合、6週間毎に約400mgで投与される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブは、MSI-HまたはdMMR癌を治療するために、小児の場合、3週間毎に約2mg/kg(最大200mg)で投与される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブ投与は、IL-2投与後1、2、3、4、または5日で開始される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブ投与は、IL-2投与後1、2、または3日で開始される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブはまた、切除前1、2、3、4、または5週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)投与することができる。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブはまた、切除前1、2、または3週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)投与することができる。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブ投与は、IL-2投与後1、2、3、4、または5日で開始される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブ投与は、IL-2投与後1、2、または3日で開始される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブはまた、切除前1、2、3、4、または5週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)投与することができる。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブはまた、切除前1、2、または3週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)投与することができる。
いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブは、高頻度マイクロサテライト不安定性(MSI-H)またはミスマッチ修復欠損結腸直腸癌(dMMR CRCを治療するために、3週間毎に約200mgで投与される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブは、MSI-HまたはdMMR CRCを治療するために、6週間毎に約400mgで投与される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブ投与は、IL-2投与後1、2、3、4、または5日で開始される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブ投与は、IL-2投与後1、2、または3日で開始される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブはまた、切除前1、2、3、4、または5週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)投与することができる。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブはまた、切除前1、2、または3週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)投与することができる。
いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブは、胃癌を治療するために、3週間毎に約200mgで投与される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブは、胃癌を治療するために、6週間毎に約400mgで投与される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブ投与は、IL-2投与後1、2、3、4、または5日で開始される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブ投与は、IL-2投与後1、2、または3日で開始される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブはまた、切除前1、2、3、4、または5週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)投与することができる。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブはまた、切除前1、2、または3週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)投与することができる。
いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブは、食道癌を治療するために、3週間毎に約200mgで投与される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブは、食道癌を治療するために、6週間毎に約400mgで投与される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブ投与は、IL-2投与後1、2、3、4、または5日で開始される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブ投与は、IL-2投与後1、2、または3日で開始される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブはまた、切除前1、2、3、4、または5週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)投与することができる。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブはまた、切除前1、2、または3週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)投与することができる。
いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブは、子宮頸癌を治療するために、3週間毎に約200mgで投与される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブは、子宮頸癌を治療するために、6週間毎に約400mgで投与される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブ投与は、IL-2投与後1、2、3、4、または5日で開始される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブ投与は、IL-2投与後1、2、または3日で開始される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブはまた、切除前1、2、3、4、または5週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)投与することができる。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブはまた、切除前1、2、または3週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)投与することができる。
いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブは、肝細胞癌(HCC)を治療するために、3週間毎に約200mgで投与される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブは、HCCを治療するために、6週間毎に約400mgで投与される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブ投与は、IL-2投与後1、2、3、4、または5日で開始される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブ投与は、IL-2投与後1、2、または3日で開始される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブはまた、切除前1、2、3、4、または5週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)投与することができる。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブはまた、切除前1、2、または3週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)投与することができる。
いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブは、メルケル細胞癌(MCC)を治療するために、成人の場合、3週間毎に約200mgで投与される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブは、MCCを治療するために、成人の場合、6週間毎に約400mgで投与される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブは、MCCを治療するために、小児の場合、3週間毎に約2mg/kg(最大200mg)で投与される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブ投与は、IL-2投与後1、2、3、4、または5日で開始される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブ投与は、IL-2投与後1、2、または3日で開始される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブはまた、切除前1、2、3、4、または5週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)投与することができる。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブはまた、切除前1、2、または3週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)投与することができる。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブ投与は、IL-2投与後1、2、3、4、または5日で開始される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブ投与は、IL-2投与後1、2、または3日で開始される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブはまた、切除前1、2、3、4、または5週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)投与することができる。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブはまた、切除前1、2、または3週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)投与することができる。
いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブは、腎細胞癌(RCC)を治療するために、3週間毎に約200mgで投与される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブは、RCCを治療するために、6週間毎に約400mgで、経口で1日2回のアキシチニブ5mgとともに投与される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブ投与は、IL-2投与後1、2、3、4、または5日で開始される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブ投与は、IL-2投与後1、2、または3日で開始される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブはまた、切除前1、2、3、4、または5週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)投与することができる。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブはまた、切除前1、2、または3週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)投与することができる。
いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブは、子宮内膜癌を治療するために、3週間毎に約200mgで投与される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブは、子宮内膜癌を治療するために、MSI-HまたはdMMRではない腫瘍に対して、6週間毎に約400mgで、20mgのレンバチニブとともに1日1回で経口投与される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブ投与は、IL-2投与後1、2、3、4、または5日で開始される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブ投与は、IL-2投与後1、2、または3日で開始される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブはまた、切除前1、2、3、4、または5週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)投与することができる。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブはまた、切除前1、2、または3週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)投与することができる。
いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブは、高遺伝子変異量(TMB-H)癌を治療するために、成人の場合、3週間毎に約200mgで投与される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブは、TMB-H癌を治療するために、成人の場合、6週間毎に約400mgで投与される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブは、TMB-H癌を治療するために、小児の場合、3週間毎に約2mg/kg(最大200mg)で投与される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブ投与は、IL-2投与後1、2、3、4、または5日で開始される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブ投与は、IL-2投与後1、2、または3日で開始される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブはまた、切除前1、2、3、4、または5週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)投与することができる。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブはまた、切除前1、2、または3週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)投与することができる。
いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブは、皮膚扁平上皮癌(cSCC)を治療するために、3週間毎に約200mgで投与される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブは、cSCCを治療するために、6週間毎に約400mgで投与される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブ投与は、IL-2投与後1、2、3、4、または5日で開始される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブ投与は、IL-2投与後1、2、または3日で開始される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブはまた、切除前1、2、3、4、または5週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)投与することができる。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブはまた、切除前1、2、または3週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)投与することができる。
いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブは、トリプルネガティブ乳癌(TNBC)を治療するために、3週間毎に約200mgで投与される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブは、TNBCを治療するために、6週間毎に約400mgで投与される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブ投与は、IL-2投与後1、2、3、4、または5日で開始される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブ投与は、IL-2投与後1、2、または3日で開始される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブはまた、切除前1、2、3、4、または5週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)投与することができる。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブはまた、切除前1、2、または3週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)投与することができる。
ある実施形態では、患者または対象が成人である場合、すなわち、成人適応症の治療、及び6週間毎の400mgの追加の投薬レジメンが用いられ得る。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブ投与は、IL-2投与後1、2、3、4、または5日で開始される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブ投与は、IL-2投与後1、2、または3日で開始される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブはまた、切除前1、2、3、4、または5週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)投与することができる。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブはまた、切除前1、2、または3週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)投与することができる。
ある実施形態では、PD-1阻害剤または抗PD-1抗体は、Regeneron,Inc.から市販されている、セミプリマブ、またはその断片、バリアント、コンジュゲート、もしくはバイオシミラーである。ある実施形態では、PD-1阻害剤または抗PD-1抗体は、Novartis AG and Beigene Co.,Ltd.から市販されている、チスレリズマブ、またはその断片、バリアント、コンジュゲート、もしくはバイオシミラーである。ある実施形態では、PD-1阻害剤または抗PD-1抗体は、Eli Lilly and Co.から市販されている、シンチリマブ、またはその断片、バリアント、コンジュゲート、もしくはバイオシミラーである。ある実施形態では、PD-1阻害剤または抗PD-1抗体は、Junshi Biosciences Co.,Ltd.及びCoherus BioSciences,Inc.から市販されている、トリパリマブ、またはその断片、バリアント、コンジュゲート、もしくはバイオシミラーである。ある実施形態では、PD-1阻害剤または抗PD-1抗体は、GlaxoSmithKline plc.から市販されている、ドスタルリマブ、またはその断片、バリアント、コンジュゲート、もしくはバイオシミラーである。
ある実施形態では、PD-1阻害剤は、抗m-PD-1クローンJ43(カタログ番号BE0033-2)及びRMP1-14(カタログ番号BE0146)(Bio X Cell,Inc.,West Lebanon,NH,USA)などの市販の抗PD-1モノクローナル抗体である。いくつかの市販の抗PD-1抗体が、当業者に知られている。
ある実施形態では、PD-1阻害剤は、米国特許第8,354,509号または米国特許出願公開第2010/0266617A1号、同第2013/0108651A1号、同第2013/0109843A2号に開示されている抗体であり、それらの開示は参照により本明細書に組み込まれる。ある実施形態では、PD-1阻害剤は、米国特許第8,287,856号、同第8,580,247号、及び同第8,168,757号、ならびに米国特許出願公開第2009/0028857A1号、同第2010/0285013A1号、同第2013/0022600A1号、及び同第2011/0008369A1号に記載されている抗PD-1抗体であり、それらの教示は参照により本明細書に組み込まれる。別の実施形態では、PD-1阻害剤は、米国特許第8,735,553B1号に開示されている抗PD-1抗体であり、その開示は参照により本明細書に組み込まれる。ある実施形態では、PD-1阻害剤は、CT-011としても知られるピジリズマブであり、これは米国特許第8,686,119号に記載されており、その開示は参照により本明細書に組み込まれる。
ある実施形態では、PD-1阻害剤は、米国特許第8,907,053号、同第9,096,642号、及び同第9,044,442号、ならびに米国特許出願公開第US2015/0087581号に記載されるものなどの小分子またはペプチドもしくはペプチド誘導体;米国特許出願公開第2015/0073024号に記載されるものなどの1,2,4-オキサジアゾール化合物及び誘導体;米国特許出願公開第US2015/0073042号に記載されるものなどの環状ペプチド模倣化合物及び誘導体;米国特許出願公開第US2015/0125491号に記載されるものなどの環状化合物及び誘導体;国際特許出願公開第WO2015/033301号に記載されるものなどの1,3,4-オキサジアゾール及び1,3,4-チアジアゾール化合物ならびに誘導体;国際特許出願公開第WO2015/036927号及びWO2015/04490号に記載されるものなどのペプチド系化合物及び誘導体、または米国特許出願公開第US2014/0294898号に記載されるものなどの大環状ペプチド系化合物及び誘導体であり得、各々の開示は参照によりそれらの全体が本明細書に組み込まれる。ある実施形態では、PD-1阻害剤は、Regeneron,Inc.から市販されている、セミプリマブである。ある実施形態では、PD-1阻害剤は、Novartis AG及びBeigene Co.,Ltd.から入手可能である、チスレリズマブである。ある実施形態では、PD-1阻害剤は、Eli Lilly and Co.から入手可能である、シンチリマブである。ある実施形態では、PD-1阻害剤は、Junshi Biosciences Co.,Ltd.及びCoherus BioSciences,Inc.から入手可能である、トリパリマブである。
ある実施形態では、PD-L1またはPD-L2阻害剤は、当該技術分野で知られている任意のPD-L1もしくはPD-L2阻害剤、アンタゴニスト、または遮断薬であり得る。特に、次の段落でより詳細に記載されるPD-L1もしくはPD-L2阻害剤、アンタゴニスト、または遮断剤のうちの1つである。「阻害剤」、「アンタゴニスト」、及び「遮断剤」という用語は、本明細書では、PD-L1及びPD-L2阻害剤に関して交換可能に使用される。誤解を避けるために、抗体であるPD-L1またはPD-L2阻害剤への本明細書での言及は、化合物またはその抗原結合断片、バリアント、コンジュゲート、もしくはバイオシミラーを指し得る。誤解を避けるために、PD-L1またはPD-L2阻害剤への本明細書での言及は、化合物またはその薬学的に許容される塩、エステル、溶媒和物、水和物、共結晶、もしくはプロドラッグを指し得る。
いくつかの実施形態では、本明細書に記載の組成物、プロセス、及び方法は、PD-L1またはPD-L2阻害剤を含む。いくつかの実施形態では、PD-L1またはPD-L2阻害剤は、小分子である。好ましい実施形態では、PD-L1またはPD-L2阻害剤は、抗体(すなわち、抗PD-1抗体)、Fab断片を含むその断片、またはその一本鎖可変断片(scFv)である。いくつかの実施形態では、PD-L1またはPD-L2阻害剤は、ポリクローナル抗体である。好ましい実施形態では、PD-L1またはPD-L2阻害剤は、モノクローナル抗体である。いくつかの実施形態では、PD-L1またはPD-L2阻害剤は、PD-L1もしくはPD-L2との結合について競合し、及び/またはPD-L1もしくはPD-L2上のエピトープに結合する。ある実施形態では、抗体は、PD-L1もしくはPD-L2との結合について競合し、かつ/またはPD-L1もしくはPD-L2上のエピトープに結合する。
いくつかの実施形態では、本明細書で提供されるPD-L1阻害剤は、化合物が、PD-L2受容体を含む他の受容体と結合または相互作用するよりも実質的に低い濃度でPD-L1と結合または相互作用するという点で、PD-L1に対して選択的である。特定の実施形態では、化合物は、PD-L2受容体に対するより少なくとも約2倍高い濃度、約3倍高い濃度、約5倍高い濃度、約10倍高い濃度、約20倍高い濃度、約30倍高い濃度、約50倍高い濃度、約100倍高い濃度、約200倍高い濃度、約300倍高い濃度、または約500倍高い濃度である結合定数でPD-L1受容体に結合する。
いくつかの実施形態では、本明細書で提供されるPD-L2阻害剤は、化合物が、PD-L1受容体を含む他の受容体と結合または相互作用するよりも実質的に低い濃度でPD-L2と結合または相互作用するという点で、PD-L2に対して選択的である。特定の実施形態では、化合物は、PD-L1受容体に対するより少なくとも約2倍高い濃度、約3倍高い濃度、約5倍高い濃度、約10倍高い濃度、約20倍高い濃度、約30倍高い濃度、約50倍高い濃度、約100倍高い濃度、約200倍高い濃度、約300倍高い濃度、または約500倍高い濃度である結合定数でPD-L2受容体に結合する。
いかなる理論にも縛られることなく、腫瘍細胞はPD-L1を発現し、T細胞はPD-1を発現すると考えられている。しかしながら、腫瘍細胞によるPD-L1の発現は、PD-1またはPD-L1の阻害剤または遮断剤の有効性には必要とされない。ある実施形態では、腫瘍細胞は、PD-L1を発現する。別の実施形態では、腫瘍細胞は、PD-L1を発現しない。いくつかの実施形態では、方法は、TILと組み合わせて、本明細書に記載されるものなどのPD-1及びPD-L1抗体の組み合わせを含むことができる。PD-1及びPD-L1抗体とTILとの組み合わせの投与は、同時または連続的であり得る。
いくつかの実施形態では、PD-L1及び/またはPD-L2阻害剤は、ヒトPD-L1及び/またはPD-L2に約100pM以下のKDで結合する、ヒトPD-L1及び/またはPD-L2に約90pM以下のKDで結合する、ヒトPD-L1及び/またはPD-L2に約80pM以下のKDで結合する、ヒトPD-L1及び/またはPD-L2に約70pM以下のKDで結合する、ヒトPD-L1及び/またはPD-L2に約60pM以下のKDで結合する、ヒトPD-L1及び/またはPD-L2に約50pM以下のKDで結合する、ヒトPD-L1及び/またはPD-L2に約40pM以下のKDで結合する、またはヒトPD-L1及び/またはPD-L2に約30pM以下のKDで結合するものである。
いくつかの実施形態では、PD-L1及び/またはPD-L2阻害剤は、ヒトPD-L1及び/またはPD-L2に約7.5×105l/M・s以上のkassocで結合する、ヒトPD-L1及び/またはPD-L2に約8×105l/M・s以上のkassocで結合する、ヒトPD-L1及び/またはPD-L2に約8.5×105l/M・s以上のkassocで結合する、ヒトPD-L1及び/またはPD-L2に約9×105l/M・s以上のkassocで結合する、ヒトPD-L1及び/またはPD-L2に約9.5×105l/M・s以上のkassocで結合する、またはヒトPD-L1及び/またはPD-L2に約1×106l/M・s以上のkassocで結合するものである。
いくつかの実施形態では、PD-L1及び/またはPD-L2阻害剤は、ヒトPD-L1もしくはPD-L2に約2×10-5l/s以下のkdissocで結合する、ヒトPD-1に約2.1×10-5l/s以下のkdissocで結合する、ヒトPD-1に約2.2×10-5l/s以下のkdissocで結合する、ヒトPD-1に約2.3×10-5l/s以下のkdissocで結合する、ヒトPD-1に約2.4×10-5l/s以下のkdissocで結合する、ヒトPD-1に約2.5×10-5l/s以下のkdissocで結合する、ヒトPD-1に約2.6×10-5l/s以下のkdissocで結合する、ヒトPD-L1もしくはPD-L1に約2.7×10-5l/s以下のkdissocで結合する、またはヒトPD-L1もしくはPD-L2に約3×10-5l/s以下のkdissocで結合するものである。
いくつかの実施形態では、PD-L1及び/またはPD-L2阻害剤は、約10nM以下のIC50でのヒトPD-1へのヒトPD-L1もしくはヒトPD-L2の結合を遮断もしくは阻害し、約9nM以下のIC50でのヒトPD-1へのヒトPD-L1もしくはヒトPD-L2の結合を遮断もしくは阻害し、約8nM以下のIC50でのヒトPD-1へのヒトPD-L1もしくはヒトPD-L2の結合を遮断もしくは阻害し、約7nM以下のIC50でのヒトPD-1へのヒトPD-L1もしくはヒトPD-L2の結合を遮断もしくは阻害し、約6nM以下のIC50でのヒトPD-1へのヒトPD-L1もしくはヒトPD-L2の結合を遮断もしくは阻害し、約5nM以下のIC50でのヒトPD-1へのヒトPD-L1もしくはヒトPD-L2の結合を遮断もしくは阻害し、約4nM以下のIC50でのヒトPD-1へのヒトPD-L1もしくはヒトPD-L2の結合を遮断もしくは阻害し、約3nM以下のIC50でのヒトPD-1へのヒトPD-L1もしくはヒトPD-L2の結合を遮断もしくは阻害し、約2nM以下のIC50でのヒトPD-1へのヒトPD-L1もしくはヒトPD-L2の結合を遮断もしくは阻害し、または約1nM以下のIC50でのヒトPD-1へのヒトPD-L1もしくはヒトPD-L2の結合を遮断するものである。
ある実施形態では、PD-L1阻害剤は、MEDI4736としても知られるデュルバルマブ(これは、AstraZeneca plc.の子会社であるMedimmune,LLC(Gaithersburg,Maryland)から市販されている)、またはその抗原結合断片、コンジュゲート、もしくは多様体である。ある実施形態では、PD-L1阻害剤は、米国特許第8,779,108号または米国特許出願公開第2013/0034559号に開示されている抗体であり、その開示は参照により本明細書に組み込まれる。デュルバルマブの臨床的有効性は、Page,et al.,Rev.Med.,2014,65,185-202、Brahmer,et al.,J.Clin.Oncol.2014,32,5s(補足、要約8021)、及びMcDermott,et al.,Cancer Treatment Rev.,2014,40,1056-64に記載されている。デュルバルマブの調製及び特性は、米国特許第8,779,108号に記載されており、その開示は参照により本明細書に組み込まれる。デュルバルマブのアミノ酸配列を表20に示す。デュルバルマブモノクローナル抗体は、22-96、22’’-96’’、23’-89’、23’’’-89’’’、135’-195’、135’’’-195’’’、148-204、148’’-204’’、215’-224、215’’’-224’’’、230-230’’、233-233’’、265-325、265’’-325’’、371-429、及び371’’-429’におけるジスルフィド結合、ならびにAsn-301及びAsn-301’’におけるN-グリコシル化部位を含む。
ある実施形態では、PD-L1阻害剤は、配列番号178によって与えられる重鎖及び配列番号179によって与えられる軽鎖を含む。ある実施形態では、PD-L1阻害剤は、それぞれ、配列番号178及び配列番号179に示される配列を有する重鎖及び軽鎖、またはそれらの抗原結合断片、Fab断片、一本鎖可変断片(scFv)、多様体、もしくはコンジュゲートを含む。ある実施形態では、PD-L1阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号178及び配列番号179に示される配列と少なくとも99%同一である重鎖及び軽鎖を含む。ある実施形態では、PD-L1阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号178及び配列番号179に示される配列と少なくとも98%同一である重鎖及び軽鎖を含む。ある実施形態では、PD-L1阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号178及び配列番号179に示される配列と少なくとも97%同一である重鎖及び軽鎖を含む。ある実施形態では、PD-L1阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号178及び配列番号179に示される配列と少なくとも96%同一である重鎖及び軽鎖を含む。ある実施形態では、PD-L1阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号178及び配列番号179に示される配列と少なくとも95%同一である重鎖及び軽鎖を含む。
ある実施形態では、PD-L1阻害剤は、デュルバルマブの重鎖及び軽鎖CDRまたは可変領域(VR)を含む。ある実施形態では、PD-L1阻害剤重鎖可変領域(VH)は、配列番号180に示される配列を含み、PD-L1阻害剤軽鎖可変領域(VL)は、配列番号181に示される配列、及びその保存的アミノ酸置換を含む。ある実施形態では、PD-L1阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号180及び配列番号181に示される配列と少なくとも99%同一であるVH領域及びVL領域を含む。ある実施形態では、PD-L1阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号180及び配列番号181に示される配列と少なくとも98%同一であるVH領域及びVL領域を含む。ある実施形態では、PD-L1阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号180及び配列番号181に示される配列と少なくとも97%同一であるVH領域及びVL領域を含む。ある実施形態では、PD-L1阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号180及び配列番号181に示される配列と少なくとも96%同一であるVH領域及びVL領域を含む。ある実施形態では、PD-L1阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号180及び配列番号181に示される配列と少なくとも95%同一であるVH領域及びVL領域を含む。
ある実施形態では、PD-L1阻害剤は、それぞれ、配列番号182、配列番号183、及び配列番号184に示される配列を有する重鎖CDR1、CDR2、及びCDR3ドメイン、ならびにそれらの保存的アミノ酸置換と、それぞれ、配列番号185、配列番号186、及び配列番号187に示される配列を有する軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3ドメイン、ならびにそれらの保存的アミノ酸置換と、を含む。ある実施形態では、抗体は、前述の抗体のうちのいずれかと結合するために競合し、かつ/またはPD-L1上の同じエピトープに結合する。
ある実施形態では、PD-L1阻害剤は、ペムブロリズマブに関して薬物規制当局によって承認された抗PD-L1バイオシミラーモノクローナル抗体である。ある実施形態では、バイオシミラーは、参照医薬品または参照バイオ製品のアミノ酸配列に対して少なくとも97%の配列同一性、例えば、97%、98%、99%、または100%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含み、参照医薬品または参照バイオ製品と比較して、1つ以上の翻訳後修飾を含む、PD-L1抗体を含み、参照医薬品または参照バイオ製品は、デュルバルマブである。いくつかの実施形態では、1つ以上の翻訳後修飾は、グリコシル化、酸化、脱アミド化、及び切断のうちの1つ以上から選択される。いくつかの実施形態では、バイオシミラーは、認可された、または認可のために提出された抗PD-L1抗体であり、抗PD-L1抗体は、参照医薬品または参照バイオ製品の製剤とは異なる製剤で提供され、参照医薬品または参照バイオ製品は、デュルバルマブである。抗PD-L1抗体は、米国FDA及び/または欧州連合のEMAなどの薬物規制当局によって認可され得る。いくつかの実施形態では、バイオシミラーは、1つ以上の賦形剤をさらに含む組成物として提供され、1つ以上の賦形剤は、参照医薬品または参照バイオ製品に含まれる賦形剤と同じまたは異なるものであり、参照医薬品または参照バイオ製品は、デュルバルマブである。いくつかの実施形態では、バイオシミラーは、1つ以上の賦形剤をさらに含む組成物として提供され、1つ以上の賦形剤は、参照医薬品または参照バイオ製品に含まれる賦形剤と同じまたは異なるものであり、参照医薬品または参照バイオ製品は、デュルバルマブである。
Figure 2024512029000024
ある実施形態では、PD-L1阻害剤は、MSB0010718C(Merck KGaA/EMD Seronoから市販されている)としても知られるアベルマブ、またはその抗原結合断片、コンジュゲート、もしくは多様体である。アベルマブの調製及び特性は、米国特許出願公開第US2014/0341917A1号に記載されており、その開示は参照により本明細書に具体的に組み込まれる。アベルマブのアミノ酸配列を表21に示す。アベルマブは、22-96、147-203、264-324、370-428、22’’-96’’、147’’-203’’、264’’-324’’、及び370’’-428’’における重鎖内ジスルフィド結合(C23-C104);22’-90’、138’-197’、22’’’-90’’’、及び138’’’-197’’’における軽鎖内ジスルフィド結合(C23-C104);223-215’及び223’’-215’’’における重鎖-軽鎖内ジスルフィド結合(h5-CL126);229-229’’及び232-232’’における重鎖-重鎖内ジスルフィド結合(h11、h14);300、300’’におけるN-グリコシル化部位(H CH2 N84.4);フコシル化複合体二分性CHO型グリカン;ならびに450及び450’におけるH CHS K2 C末端リジンクリッピングを有する。
ある実施形態では、PD-L1阻害剤は、配列番号188によって与えられる重鎖及び配列番号189によって与えられる軽鎖を含む。ある実施形態では、PD-L1阻害剤は、それぞれ、配列番号188及び配列番号189に示される配列を有する重鎖及び軽鎖、またはそれらの抗原結合断片、Fab断片、一本鎖可変断片(scFv)、多様体、もしくはコンジュゲートを含む。ある実施形態では、PD-L1阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号188及び配列番号189に示される配列と少なくとも99%同一である重鎖及び軽鎖を含む。ある実施形態では、PD-L1阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号188及び配列番号189に示される配列と少なくとも98%同一である重鎖及び軽鎖を含む。ある実施形態では、PD-L1阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号188及び配列番号189に示される配列と少なくとも97%同一である重鎖及び軽鎖を含む。ある実施形態では、PD-L1阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号188及び配列番号189に示される配列と少なくとも96%同一である重鎖及び軽鎖を含む。ある実施形態では、PD-L1阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号188及び配列番号189に示される配列と少なくとも95%同一である重鎖及び軽鎖を含む。
ある実施形態では、PD-L1阻害剤は、アベルマブの重鎖及び軽鎖CDRまたは可変領域(VR)を含む。ある実施形態では、PD-L1阻害剤重鎖可変領域(VH)は、配列番号190に示される配列を含み、PD-L1阻害剤軽鎖可変領域(VL)は、配列番号191に示される配列、及びその保存的アミノ酸置換を含む。ある実施形態では、PD-L1阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号190及び配列番号191に示される配列と少なくとも99%同一であるVH領域及びVL領域を含む。ある実施形態では、PD-L1阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号190及び配列番号191に示される配列と少なくとも98%同一であるVH領域及びVL領域を含む。ある実施形態では、PD-L1阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号190及び配列番号191に示される配列と少なくとも97%同一であるVH領域及びVL領域を含む。ある実施形態では、PD-L1阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号190及び配列番号191に示される配列と少なくとも96%同一であるVH領域及びVL領域を含む。ある実施形態では、PD-L1阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号190及び配列番号191に示される配列と少なくとも95%同一であるVH領域及びVL領域を含む。
ある実施形態では、PD-L1阻害剤は、それぞれ、配列番号192、配列番号193、及び配列番号194に示される配列を有する重鎖CDR1、CDR2、及びCDR3ドメイン、ならびにそれらの保存的アミノ酸置換と、それぞれ、配列番号195、配列番号196、及び配列番号197に示される配列を有する軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3ドメイン、ならびにそれらの保存的アミノ酸置換と、を含む。ある実施形態では、抗体は、前述の抗体のうちのいずれかと結合するために競合し、かつ/またはPD-L1上の同じエピトープに結合する。
ある実施形態では、PD-L1阻害剤は、アベルマブに関して薬物規制当局によって承認された抗PD-L1バイオシミラーモノクローナル抗体である。ある実施形態では、バイオシミラーは、参照医薬品または参照バイオ製品のアミノ酸配列に対して少なくとも97%の配列同一性、例えば、97%、98%、99%、または100%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含み、参照医薬品または参照バイオ製品と比較して、1つ以上の翻訳後修飾を含む、PD-L1抗体を含み、参照医薬品または参照バイオ製品は、アベルマブである。いくつかの実施形態では、1つ以上の翻訳後修飾は、グリコシル化、酸化、脱アミド化、及び切断のうちの1つ以上から選択される。いくつかの実施形態では、バイオシミラーは、認可された、または認可のために提出された抗PD-L1抗体であり、抗PD-L1抗体は、参照医薬品または参照バイオ製品の製剤とは異なる製剤で提供され、参照医薬品または参照バイオ製品は、アベルマブである。抗PD-L1抗体は、米国FDA及び/または欧州連合のEMAなどの薬物規制当局によって認可され得る。いくつかの実施形態では、バイオシミラーは、1つ以上の賦形剤をさらに含む組成物として提供され、1つ以上の賦形剤は、参照医薬品または参照バイオ製品に含まれる賦形剤と同じまたは異なるものであり、参照医薬品または参照バイオ製品は、アベルマブである。いくつかの実施形態では、バイオシミラーは、1つ以上の賦形剤をさらに含む組成物として提供され、1つ以上の賦形剤は、参照医薬品または参照バイオ製品に含まれる賦形剤と同じまたは異なるものであり、参照医薬品または参照バイオ製品は、アベルマブである。
Figure 2024512029000025
ある実施形態では、PD-L1阻害剤は、MPDL3280AまたはRG7446としても知られるアテゾリズマブ(Roche Holding AG(Basel,Switzerland)の子会社であるGenentech,Inc.からTECENTRIQとして市販されている)、またはその抗原結合断片、コンジュゲート、もしくは多様体である。ある実施形態では、PD-L1阻害剤は、米国特許第8,217,149号に開示されている抗体であり、その開示は参照により本明細書に具体的に組み込まれる。ある実施形態では、PD-L1阻害剤は、米国特許出願公開第2010/0203056A1号、同第2013/0045200A1号、同第2013/0045201A1号、同第2013/0045202A1号、または同第2014/0065135A1号に開示されている抗体であり、その開示は参照により本明細書に具体的に組み込まれる。アテゾリズマブの調製及び特性は、米国特許第8,217,149号に記載されており、その開示は参照により本明細書に組み込まれる。アテゾリズマブのアミノ酸配列を表22に示す。アテゾリズマブは、22-96、145-201、262-322、368-426、22’’-96’’、145’’-201’’、262’’-322’’、及び368’’-426’’における重鎖内ジスルフィド結合(C23-C104);23’-88’、134’-194’、23’’’-88’’’、及び134’’’-194’’’における軽鎖内ジスルフィド結合(C23-C104);221-214’及び221’’-214’’’における重鎖-軽鎖内ジスルフィド結合(h5-CL126);227-227’’及び230-230’’における重鎖-重鎖内ジスルフィド結合(h11、h14);ならびに298及び298’におけるN-グリコシル化部位(H CH2 N84.4>A)を有する。
ある実施形態では、PD-L1阻害剤は、配列番号198によって与えられる重鎖及び配列番号199によって与えられる軽鎖を含む。ある実施形態では、PD-L1阻害剤は、それぞれ、配列番号198及び配列番号199に示される配列を有する重鎖及び軽鎖、またはそれらの抗原結合断片、Fab断片、一本鎖可変断片(scFv)、多様体、もしくはコンジュゲートを含む。ある実施形態では、PD-L1阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号198及び配列番号199に示される配列と少なくとも99%同一である重鎖及び軽鎖を含む。ある実施形態では、PD-L1阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号198及び配列番号199に示される配列と少なくとも98%同一である重鎖及び軽鎖を含む。ある実施形態では、PD-L1阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号198及び配列番号199に示される配列と少なくとも97%同一である重鎖及び軽鎖を含む。ある実施形態では、PD-L1阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号198及び配列番号199に示される配列と少なくとも96%同一である重鎖及び軽鎖を含む。ある実施形態では、PD-L1阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号198及び配列番号199に示される配列と少なくとも95%同一である重鎖及び軽鎖を含む。
ある実施形態では、PD-L1阻害剤は、アテゾリズマブの重鎖及び軽鎖CDRまたは可変領域(VR)を含む。ある実施形態では、PD-L1阻害剤重鎖可変領域(VH)は、配列番号200に示される配列を含み、PD-L1阻害剤軽鎖可変領域(VL)は、配列番号201に示される配列、及びその保存的アミノ酸置換を含む。ある実施形態では、PD-L1阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号200及び配列番号201に示される配列と少なくとも99%同一であるVH領域及びVL領域を含む。ある実施形態では、PD-L1阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号200及び配列番号201に示される配列と少なくとも98%同一であるVH領域及びVL領域を含む。ある実施形態では、PD-L1阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号200及び配列番号201に示される配列と少なくとも97%同一であるVH領域及びVL領域を含む。ある実施形態では、PD-L1阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号200及び配列番号201に示される配列と少なくとも96%同一であるVH領域及びVL領域を含む。ある実施形態では、PD-L1阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号200及び配列番号201に示される配列と少なくとも95%同一であるVH領域及びVL領域を含む。
ある実施形態では、PD-L1阻害剤は、それぞれ、配列番号202、配列番号203、及び配列番号204に示される配列を有する重鎖CDR1、CDR2、及びCDR3ドメイン、ならびにそれらの保存的アミノ酸置換と、それぞれ、配列番号205、配列番号206、及び配列番号207に示される配列を有する軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3ドメイン、ならびにそれらの保存的アミノ酸置換と、を含む。ある実施形態では、抗体は、前述の抗体のうちのいずれかと結合するために競合し、かつ/またはPD-L1上の同じエピトープに結合する。
ある実施形態では、抗PD-L1抗体は、アテゾリズマブに関して薬物規制当局によって承認された抗PD-L1バイオシミラーモノクローナル抗体である。ある実施形態では、バイオシミラーは、参照医薬品または参照バイオ製品のアミノ酸配列に対して少なくとも97%の配列同一性、例えば、97%、98%、99%、または100%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含み、参照医薬品または参照バイオ製品と比較して、1つ以上の翻訳後修飾を含む、PD-L1抗体を含み、参照医薬品または参照バイオ製品は、アテゾリズマブである。いくつかの実施形態では、1つ以上の翻訳後修飾は、グリコシル化、酸化、脱アミド化、及び切断のうちの1つ以上から選択される。いくつかの実施形態では、バイオシミラーは、認可された、または認可のために提出された抗PD-L1抗体であり、抗PD-L1抗体は、参照医薬品または参照バイオ製品の製剤とは異なる製剤で提供され、参照医薬品または参照バイオ製品は、アテゾリズマブである。抗PD-L1抗体は、米国FDA及び/または欧州連合のEMAなどの薬物規制当局によって認可され得る。いくつかの実施形態では、バイオシミラーは、1つ以上の賦形剤をさらに含む組成物として提供され、1つ以上の賦形剤は、参照医薬品または参照バイオ製品に含まれる賦形剤と同じまたは異なるものであり、参照医薬品または参照バイオ製品は、アテゾリズマブである。いくつかの実施形態では、バイオシミラーは、1つ以上の賦形剤をさらに含む組成物として提供され、1つ以上の賦形剤は、参照医薬品または参照バイオ製品に含まれる賦形剤と同じまたは異なるものであり、参照医薬品または参照バイオ製品は、アテゾリズマブである。
Figure 2024512029000026
ある実施形態では、PD-L1阻害剤または抗PD-L1抗体は、Incyte,Inc.から入手可能である、レチファンリマブ、またはその断片、バリアント、コンジュゲート、もしくはバイオシミラーである。
ある実施形態では、PD-L1阻害剤は、米国特許出願公開第US2014/0341917A1号に記載されている抗体を含み、その開示は参照により本明細書に組み込まれる。別の実施形態では、PD-L1への結合についてこれらの抗体のうちのいずれかと競合する抗体も含まれる。ある実施形態では、抗PD-L1抗体は、BMS-935559としても知られるMDX-1105であり、これは米国特許第US7,943,743号に開示されており、その開示は参照により本明細書に組み込まれる。ある実施形態では、抗PD-L1抗体は、参照により本明細書に組み込まれる米国特許第US7,943,743号に開示されている抗PD-L1抗体から選択される。
ある実施形態では、PD-L1阻害剤は、INVIVOMAB抗m-PD-L1クローン10F.9G2(カタログ番号BE0101、Bio X Cell,Inc.,West Lebanon,NH,USA)などの市販のモノクローナル抗体である。ある実施形態では、抗PD-L1抗体は、AFFYMETRIX EBIOSCIENCE(MIH1)などの市販のモノクローナル抗体である。いくつかの市販の抗PD-L1抗体が、当業者に知られている。
ある実施形態では、PD-L2阻害剤は、BIOLEGEND 24F.10C12マウスIgG2a、κアイソタイプ(カタログ番号329602 Biolegend,Inc.,San Diego,CA)、SIGMA抗PD-L2抗体(カタログ番号SAB3500395,Sigma-Aldrich Co.,St.Louis,MO)、または当業者に知られている他の市販のPD-L2抗体などの市販のモノクローナル抗体である。
3.CTLA-4阻害剤との併用
いくつかの実施形態では、がんを有する患者に提供されるTIL療法は、治療的TIL集合単独による治療を含んでもよく、またはTIL及び1つ以上のCTLA-4阻害剤を含む併用治療を含んでもよい。
細胞傷害性Tリンパ球抗原4(CTLA-4)は、免疫グロブリンスーパーファミリーのメンバーであり、ヘルパーT細胞の表面で発現する。CTLA-4は、CD28依存性T細胞活性化の負の制御因子であり、適応免疫応答のチェックポイントとして機能する。T細胞共刺激タンパク質CD28と同様に、CTLA-4結合抗原は、細胞上でCD80及びCD86を提示する。CTLA-4は抑制シグナルをT細胞に伝達し、CD28は刺激シグナルを伝達する。ヒトCTLA-4に対するヒト抗体は、ウイルス感染及び細菌感染を治療または予防すること、ならびにがんを治療するためのものなど、多くの疾患状態における免疫刺激調節因子として記載されている(WO01/14424及びWO00/37504)。イピリムマブ(MDX-010)及びトレメリムマブ(CP-675,206)を含むが、これらに限定されない、様々な種類の固形腫瘍の治療のためのいくつかの完全ヒト抗ヒトCTLA-4モノクローナル抗体(mAb)が、臨床試験で研究されている。
いくつかの実施形態では、CTLA-4阻害剤は、当技術分野で知られている任意のCTLA-4阻害剤またはCTLA-4遮断剤であり得る。特に、次の段落でより詳細に記載されるCTLA-4阻害剤または遮断剤のうちの1つである。「阻害剤」、「アンタゴニスト」、及び「遮断剤」という用語は、本明細書では、CTLA-4阻害剤に関して互換的に使用される。誤解を避けるために、抗体であるCTLA-4阻害剤への本明細書での言及は、化合物またはその抗原結合断片、バリアント、コンジュゲート、もしくはバイオシミラーを指し得る。誤解を避けるために、CTLA-4阻害剤への本明細書での言及はまた、小分子化合物またはその薬学的に許容される塩、エステル、溶媒和物、水和物、共結晶、もしくはプロドラッグを指し得る。
本発明の方法で使用するための好適なCTLA-4阻害剤には、抗CTLA-4抗体、ヒト抗CTLA-4抗体、マウス抗CTLA-4抗体、哺乳動物抗CTLA-4抗体、ヒト化抗CTLA-4抗体、モノクローナル抗CTLA-4抗体、ポリクローナル抗CTLA-4抗体、キメラ抗CTLA-4抗体、MDX-010(イピリムマブ)、トレメリムマブ、抗CD28抗体、抗CTLA-4アドネクチン、抗CTLA-4ドメイン抗体、一本鎖抗CTLA-4断片、重鎖抗CTLA-4断片、軽鎖抗CTLA-4断片、共刺激経路を刺激するCTLA-4の阻害剤、PCT公開第WO2001/014424号に開示される抗体、PCT公開第WO2004/035607号に開示される抗体、米国特許出願公開第2005/0201994号に開示される抗体、ならびに付与された欧州特許第EP 1212422 B1号に開示された抗体が含まれるが、これらに限定されず、各々の開示が参照により本明細書に組み込まれる。さらなるCTLA-4抗体は、米国特許第5,811,097号、同第5,855,887号、同第6,051,227号、及び同第6,984,720号、PCT公開第WO01/14424号及び同第WO00/37504号、ならびに米国公開第2002/0039581号及び同第2002/086014号に記載されており、各々の開示が参照により本明細書に組み込まれる。本発明の方法で使用することができる他の抗CTLA-4抗体には、例えば、WO98/42752、米国特許第6,682,736号及び同第6,207,156号、Hurwitz et al.,Proc.Natl.Acad.Sci.USA,95(17):10067-10071(1998)、Camacho et al.,J.Clin.Oncology,22(145):Abstract No.2505(2004)(抗体CP-675206)、Mokyr et al.,Cancer Res.,58:5301-5304(1998)、ならびに米国特許第5,977,318号、同第6,682,736号、同第7,109,003号、及び同第7,132,281号に開示されるものが含まれ、これらの各々の開示は、参照により本明細書に組み込まれる。
さらなるCTLA-4阻害剤には、CD28抗原がその同族リガンドと結合する能力を妨害すること、CTLA-4がその同族リガンドと結合する能力を阻害すること、共刺激経路を介してT細胞応答を増強すること、B7がCD28及び/またはCTLA-4と結合する能力を破壊すること、B7が共刺激経路を活性化する能力を破壊すること、CD80がCD28及び/またはCTLA-4と結合する能力を破壊すること、CD80が共刺激経路を活性化する能力を破壊すること、CD86がCD28及び/またはCTLA-4と結合する能力を破壊すること、CD86が共刺激経路を活性化する能力を破壊すること、及び共刺激経路を一般に活性化されることから破壊することが可能である任意の阻害剤が含まれるが、これらに限定されない。これには、共刺激経路の他のメンバーのなかでもCD28、CD80、CD86、CTLA-4の小分子阻害剤、共刺激経路の他のメンバーのなかでもCD28、CD80、CD86、CTLA-4に対する抗体、共刺激経路の他のメンバーのなかでもCD28、CD80、CD86、CTLA-4に指向するアンチセンス分子、共刺激経路の他のメンバーのなかでもCD28、CD80、CD86、CTLA-4に指向するアドネクチン、他のCTLA-4阻害剤のなかでも共刺激経路の他のメンバーのなかでもCD28、CD80、CD86、CTLA-4のRNAi阻害剤(一本鎖及び二本鎖の両方)が必ず含まれる。
いくつかの実施形態では、CTLA-4阻害剤は、約10-6M以下、10-7M以下、10-8M以下、10-9M以下、10-10M以下、10-11M以下、10-12M以下、例えば、10-13M~10-16M、またはエンドポイントとして前述の値のうちのいずれか2つを有する任意の範囲内のKでCTLA-4と結合する。いくつかの実施形態では、CTLA-4阻害剤は、同じアッセイを使用して比較した場合、イピリムマブのKの10倍以下のKでCTLA-4と結合する。いくつかの実施形態では、CTLA-4阻害剤は、同じアッセイを使用して比較した場合、イピリムマブとほぼ同じかまたはそれ以下(例えば、最大10倍低いか、または最大100倍低い)のKdでCTLA-4と結合する。いくつかの実施形態では、CD80またはCD86とのCTLA-4結合のCTLA-4阻害剤による阻害のIC50値は、同じアッセイを使用して比較した場合、それぞれCD80またはCD86とのCTLA-4結合のイピリムマブ媒介阻害より10倍以下で大きい。いくつかの実施形態では、CD80またはCD86とのCTLA-4結合のCTLA-4阻害剤による阻害のIC50値は、同じアッセイを使用して比較した場合、それぞれCD80またはCD86とのCTLA-4結合のイピリムマブ媒介性阻害とほぼ同じかまたはそれ以下(例えば、最大10倍低い、または最大100倍低い)である。
いくつかの実施形態では、CTLA-4阻害剤は、好適な対照と比較して、少なくとも20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、90%、95%、または100%、例えば、50%~75%、75%~90%、または90%~100%の間でCTLA-4の発現を阻害する、及び/または生物学的活性を減少させるのに十分な量で使用される。いくつかの実施形態では、CTLA-4経路阻害剤は、好適な対照と比較して、少なくとも20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、90%、95%、または100%、例えば、50%~75%、75%~90%、または90%~100%の間でCTLA-4のCD80、CD86、またはその両方との結合を減少させることにより、CTLA-4の生物学的活性を減少させるのに十分な量で使用される。対象となる薬剤の効果を評価または定量化する状況下における好適な対照は、典型的には、対象となる薬剤、例えば、CTLA-4経路阻害剤に曝露されていないか、または治療されていない(または僅かな量に曝露されているか、または治療されている)同等の生物学的システム(例えば、細胞または対象)である。いくつかの実施形態では、生物学的システムは、それ自体の対照として機能し得る(例えば、生物学的システムは、薬剤への曝露または治療の前に評価され得、曝露または治療が開始または終了した後の状態と比較され得る。いくつかの実施形態では、歴史的対照が使用され得る。
ある実施形態では、CTLA-4阻害剤は、イピリムマブ(Bristol-Myers Squibb Co.からYervoyとして市販されている)、またはそのバイオシミラー、抗原結合断片、コンジュゲート、もしくはバリアントである。当該技術分野で知られているように、イピリムマブは、機能的ヒトレパートリーを生成するための重鎖及び軽鎖をコードするヒト遺伝子を有するトランスジェニックマウスに由来する完全ヒトIgG 1κ抗体である、抗CTLA-4抗体を指す。イピリムマブは、そのCAS登録番号477202-00-9及びPCT公開第WO01/14424号で参照することもでき、その全体がすべての目的で参照により本明細書に組み込まれる。それは抗体10DIとして開示されている。具体的には、イピリムマブは、軽鎖可変領域及び重鎖可変領域(配列番号211を含む軽鎖可変領域を有し、配列番号210を含む重鎖可変領域を有する)を含む。イピリムマブの薬学的組成物は、イピリムマブ及び1つ以上の希釈剤、ビヒクル、または賦形剤を含有するすべての薬学的に許容される組成物を含む。イピリムマブを含有する薬学的組成物の例は、国際特許出願公開第WO2007/67959号に記載されている。イピリムマブは、静脈内(IV)投与され得る。
ある実施形態では、CTLA-4阻害剤は、配列番号208によって与えられる重鎖及び配列番号209によって与えられる軽鎖を含む。ある実施形態では、CTLA-4阻害剤は、それぞれ、配列番号208及び配列番号209に示される配列を有する重鎖及び軽鎖、またはそれらの抗原結合断片、Fab断片、一本鎖可変断片(scFv)、多様体、もしくはコンジュゲートを含む。ある実施形態では、CTLA-4阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号208及び配列番号209に示される配列と少なくとも99%同一である重鎖及び軽鎖を含む。ある実施形態では、CTLA-4阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号208及び配列番号209に示される配列と少なくとも98%同一である重鎖及び軽鎖を含む。ある実施形態では、CTLA-4阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号208及び配列番号209に示される配列と少なくとも97%同一である重鎖及び軽鎖を含む。ある実施形態では、CTLA-4阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号208及び配列番号209に示される配列と少なくとも96%同一である重鎖及び軽鎖を含む。ある実施形態では、CTLA-4阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号208及び配列番号209に示される配列と少なくとも95%同一である重鎖及び軽鎖を含む。
ある実施形態では、CTLA-4阻害剤は、イピリムマブの重鎖及び軽鎖CDRまたは可変領域(VR)を含む。ある実施形態では、CTLA-4阻害剤重鎖可変領域(V)は、配列番号210に示される配列を含み、CTLA-4阻害剤軽鎖可変領域(V)は、配列番号211に示される配列、及びその保存的アミノ酸置換を含む。ある実施形態では、CTLA-4阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号210及び配列番号211に示される配列と少なくとも99%同一であるV及びV領域を含む。ある実施形態では、CTLA-4阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号210及び配列番号211に示される配列と少なくとも98%同一であるV及びV領域を含む。ある実施形態では、CTLA-4阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号210及び配列番号211に示される配列と少なくとも97%同一であるV及びV領域を含む。ある実施形態では、CTLA-4阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号210及び配列番号211に示される配列と少なくとも96%同一であるV及びV領域を含む。ある実施形態では、CTLA-4阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号210及び配列番号211に示される配列と少なくとも95%同一であるV及びV領域を含む。
ある実施形態では、CTLA-4阻害剤は、それぞれ、配列番号212、配列番号213、及び配列番号214に示される配列を有する重鎖CDR1、CDR2、及びCDR3ドメイン、ならびにそれらの保存的アミノ酸置換と、それぞれ、配列番号215、配列番号216、及び配列番号217に示される配列を有する軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3ドメイン、ならびにそれらの保存的アミノ酸置換と、を含む。ある実施形態では、抗体は、前述の抗体のうちのいずれかと結合するために競合し、かつ/またはCTLA-4上の同じエピトープに結合する。
ある実施形態では、CTLA-4阻害剤は、イピリムマブに関して薬物規制当局によって承認されたCTLA-4バイオシミラーモノクローナル抗体である。ある実施形態では、バイオシミラーは、参照医薬品または参照バイオ製品のアミノ酸配列に対して少なくとも97%の配列同一性、例えば、97%、98%、99%、または100%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含み、参照医薬品または参照バイオ製品と比較して、1つ以上の翻訳後修飾を含む、抗CTLA-4抗体を含み、参照医薬品または参照バイオ製品は、イピリムマブである。いくつかの実施形態では、1つ以上の翻訳後修飾は、グリコシル化、酸化、脱アミド化、及び切断のうちの1つ以上から選択される。イピリムマブのアミノ酸配列を表23に示す。いくつかの実施形態では、バイオシミラーは、認可された、または認可のために提出された抗CTLA-4抗体であり、抗CTLA-4抗体は、参照医薬品または参照バイオ製品の製剤とは異なる製剤で提供され、参照医薬品または参照バイオ製品は、イピリムマブである。抗CTLA-4抗体は、米国FDA及び/または欧州連合のEMAなどの薬物規制当局によって認可され得る。いくつかの実施形態では、バイオシミラーは、1つ以上の賦形剤をさらに含む組成物として提供され、1つ以上の賦形剤は、参照医薬品または参照バイオ製品に含まれる賦形剤と同じまたは異なるものであり、参照医薬品または参照バイオ製品は、イピリムマブである。いくつかの実施形態では、バイオシミラーは、1つ以上の賦形剤をさらに含む組成物として提供され、1つ以上の賦形剤は、参照医薬品または参照バイオ製品に含まれる賦形剤と同じまたは異なるものであり、参照医薬品または参照バイオ製品は、イピリムマブである。
Figure 2024512029000027
いくつかの実施形態では、CTLA-4阻害剤は、イピリムマブまたはそのバイオシミラーであり、イピリムマブは、約0.5mg/kg~約10mg/kgの用量で投与される。いくつかの実施形態では、CTLA-4阻害剤は、イピリムマブまたはそのバイオシミラーであり、イピリムマブは、約0.5mg/kg、約1mg/kg、約1.5mg/kg、約2mg/kg、約2.5mg/kg、約3mg/kg、約3.5mg/kg、約4mg/kg、約4.5mg/kg、約5mg/kg、約5.5mg/kg、約6mg/kg、約6.5mg/kg、約7mg/kg、約7.5mg/kg、約8mg/kg、約8.5mg/kg、約9mg/kg、約9.5mg/kg、または約10mg/kgの用量で投与される。いくつかの実施形態では、イピリムマブ投与は、切除前1、2、3、4、または5週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)開始される。いくつかの実施形態では、イピリムマブ投与は、切除前1、2、または3週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)開始される。
いくつかの実施形態では、CTLA-4阻害剤は、イピリムマブまたはそのバイオシミラーであり、イピリムマブは、約200mg~約500mgの用量で投与される。いくつかの実施形態では、CTLA-4阻害剤は、イピリムマブまたはそのバイオシミラーであり、イピリムマブは、約200mg、約220mg、約240mg、約260mg、約280mg、約300mg、約320mg、約340mg、約360mg、約380mg、約400mg、約420mg、約440mg、約460mg、約480mg、または約500mgの用量で投与される。いくつかの実施形態では、イピリムマブ投与は、切除前1、2、3、4、または5週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)開始される。いくつかの実施形態では、イピリムマブ投与は、切除前1、2、または3週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)開始される。
いくつかの実施形態では、CTLA-4阻害剤は、イピリムマブまたはそのバイオシミラーであり、イピリムマブは、2週間毎、3週間毎、4週間毎、5週間毎、または6週間毎に投与される。いくつかの実施形態では、イピリムマブ投与は、切除前1、2、3、4、または5週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)開始される。いくつかの実施形態では、イピリムマブ投与は、切除前1、2、または3週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)開始される。
いくつかの実施形態では、イピリムマブは、切除不能または転移性黒色腫を治療するために投与される。いくつかの実施形態では、イピリムマブは、切除不能または転移性黒色腫を治療するために、3週間毎に約mg/kgで最大4用量投与される。いくつかの実施形態では、イピリムマブ投与は、切除前1、2、3、4、または5週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)開始される。いくつかの実施形態では、イピリムマブ投与は、切除前1、2、または3週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)開始される。
いくつかの実施形態では、イピリムマブは、黒色腫のアジュバント治療のために投与される。いくつかの実施形態では、イピリムマブは、黒色腫のアジュバント治療のために、約10mg/kgで3週間毎に4用量、続いて10mg/kgで12週間毎に最大3年間投与される。いくつかの実施形態では、イピリムマブ投与は、切除前1、2、3、4、または5週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)開始される。いくつかの実施形態では、イピリムマブ投与は、切除前1、2、または3週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)開始される。
いくつかの実施形態では、イピリムマブは、進行性腎細胞癌を治療するために投与される。いくつかの実施形態では、イピリムマブは、進行性腎細胞癌を治療するために、約1mg/kgで投与され、直後に同じ日にニボルマブ3mg/kgを3週間毎に4用量投与される。いくつかの実施形態では、4用量の組み合わせを完了した後、ニボルマブは、進行性腎細胞癌及び/または腎細胞癌の標準的な投薬レジメンに従って単剤として投与され得る。いくつかの実施形態では、イピリムマブ投与は、切除前1、2、3、4、または5週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)開始される。いくつかの実施形態では、イピリムマブ投与は、切除前1、2、または3週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)開始される。
いくつかの実施形態では、イピリムマブは、高頻度マイクロサテライト不安定性(MSI-H)またはミスマッチ修復欠損(dMMR)転移性結腸直腸癌を治療するために投与される。いくつかの実施形態では、イピリムマブは、高頻度マイクロサテライト不安定性(MSI-H)またはミスマッチ修復欠損(dMMR)転移性結腸直腸癌を治療するために、約1mg/kgで静脈内に30分間にわたって投与され、直後に同じ日にイピリムマブ3mg/kgを静脈内に30分間にわたって3週間毎に4用量投与される。いくつかの実施形態では、4用量の組み合わせを完了した後、高頻度マイクロサテライト不安定性(MSI-H)またはミスマッチ修復欠損(dMMR)転移性結腸直腸癌の標準的な投薬レジメンに従って推奨されるように単剤としてニボルマブを投与する。いくつかの実施形態では、イピリムマブ投与は、切除前1、2、3、4、または5週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)開始される。いくつかの実施形態では、イピリムマブ投与は、切除前1、2、または3週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)開始される。
いくつかの実施形態では、イピリムマブは、肝細胞癌を治療するために投与される。いくつかの実施形態では、イピリムマブは、肝細胞癌を治療するために、約3mg/kgで静脈内に30分間にわたって投与され、直後に同じ日にニボルマブ1mg/kgを静脈内に30分間にわたって3週間毎に4用量投与される。いくつかの実施形態では、4用量の組み合わせを完了した後、肝細胞癌のための標準的な投薬レジメンに従って単剤としてニボルマブを投与する。いくつかの実施形態では、イピリムマブ投与は、切除前1、2、3、4、または5週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)開始される。いくつかの実施形態では、イピリムマブ投与は、切除前1、2、または3週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)開始される。
いくつかの実施形態では、イピリムマブは、転移性非小細胞肺癌を治療するために投与される。いくつかの実施形態では、イピリムマブは、転移性非小細胞肺癌を治療するために、6週間毎に約1mg/kgで、2週間毎に3mg/kgのニボルマブとともに投与される。いくつかの実施形態では、イピリムマブは、転移性非小細胞肺癌を治療するために、6週間毎に約1mg/kgで、3週間毎に360mgのニボルマブ及び2サイクルのプラチナダブレット化学療法とともに投与される。いくつかの実施形態では、イピリムマブ投与は、切除前1、2、3、4、または5週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)開始される。いくつかの実施形態では、イピリムマブ投与は、切除前1、2、または3週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)開始される。
いくつかの実施形態では、イピリムマブは、悪性胸膜中皮腫を治療するために投与される。いくつかの実施形態では、イピリムマブは、悪性胸膜中皮腫を治療するために、6週間毎に約1mg/kgで、3週間毎に360mgのニボルマブとともに投与される。いくつかの実施形態では、イピリムマブ投与は、切除前1、2、3、4、または5週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)開始される。いくつかの実施形態では、イピリムマブ投与は、切除前1、2、または3週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)開始される。
トレメリムマブ(CP-675,206としても知られる)は、完全ヒトIgG2モノクローナル抗体であり、CAS番号745013-59-6を有する。トレメリムマブは、米国特許第6,682,736号(参照により本明細書に組み込まれる)において抗体11.2.1として開示されている。トレメリムマブの重鎖及び軽鎖のアミノ酸配列を、それぞれ配列番号218及び219に示す。トレメリムマブは、黒色腫及び乳癌を含む種々の腫瘍の治療のための臨床試験において研究されており、トレメリムマブは、0.01及び15mg/kgの用量範囲で4週間または12週間毎に単回用量または複数回用量として静脈内投与される。本発明によって提供されるレジメンでは、トレメリムマブは、局所的に、特に皮内または皮下に投与される。皮内または皮下投与されるトレメリムマブの有効量は、典型的には、人当たり5~200mg/用量の範囲である。いくつかの実施形態では、トレメリムマブの有効量は、用量当たり人当たり10~150mg/用量の範囲である。いくつかの特定の実施形態では、トレメリムマブの有効量は、人当たり約10、25、37.5、40、50、75、100、125、150、175、または200mg/用量である。
ある実施形態では、CTLA-4阻害剤は、配列番号218によって与えられる重鎖及び配列番号219によって与えられる軽鎖を含む。ある実施形態では、CTLA-4阻害剤は、それぞれ、配列番号218及び配列番号219に示される配列を有する重鎖及び軽鎖、またはそれらの抗原結合断片、Fab断片、一本鎖可変断片(scFv)、多様体、もしくはコンジュゲートを含む。ある実施形態では、CTLA-4阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号218及び配列番号219に示される配列と少なくとも99%同一である重鎖及び軽鎖を含む。ある実施形態では、CTLA-4阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号218及び配列番号219に示される配列と少なくとも98%同一である重鎖及び軽鎖を含む。ある実施形態では、CTLA-4阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号218及び配列番号219に示される配列と少なくとも97%同一である重鎖及び軽鎖を含む。ある実施形態では、CTLA-4阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号218及び配列番号219に示される配列と少なくとも96%同一である重鎖及び軽鎖を含む。ある実施形態では、CTLA-4阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号218及び配列番号219に示される配列と少なくとも95%同一である重鎖及び軽鎖を含む。
ある実施形態では、CTLA-4阻害剤は、トレメリムマブの重鎖及び軽鎖CDRまたは可変領域(VR)を含む。ある実施形態では、CTLA-4阻害剤重鎖可変領域(V)は、配列番号220に示される配列を含み、CTLA-4阻害剤軽鎖可変領域(V)は、配列番号221に示される配列、及びその保存的アミノ酸置換を含む。ある実施形態では、CTLA-4阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号220及び配列番号221に示される配列と少なくとも99%同一であるV及びV領域を含む。ある実施形態では、CTLA-4阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号220及び配列番号221に示される配列と少なくとも98%同一であるV及びV領域を含む。ある実施形態では、CTLA-4阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号220及び配列番号221に示される配列と少なくとも97%同一であるV及びV領域を含む。ある実施形態では、CTLA-4阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号220及び配列番号221に示される配列と少なくとも96%同一であるV及びV領域を含む。ある実施形態では、CTLA-4阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号220及び配列番号221に示される配列と少なくとも95%同一であるV及びV領域を含む。
ある実施形態では、CTLA-4阻害剤は、それぞれ、配列番号222、配列番号223、及び配列番号224に示される配列を有する重鎖CDR1、CDR2、及びCDR3ドメイン、ならびにそれらの保存的アミノ酸置換と、それぞれ、配列番号225、配列番号226、及び配列番号227に示される配列を有する軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3ドメイン、ならびにそれらの保存的アミノ酸置換と、を含む。ある実施形態では、抗体は、前述の抗体のうちのいずれかと結合するために競合し、かつ/またはCTLA-4上の同じエピトープに結合する。
ある実施形態では、CTLA-4阻害剤は、トレメリムマブに関して薬物規制当局によって承認された抗CTLA-4バイオシミラーモノクローナル抗体である。ある実施形態では、バイオシミラーは、参照医薬品または参照バイオ製品のアミノ酸配列に対して少なくとも97%の配列同一性、例えば、97%、98%、99%、または100%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含み、参照医薬品または参照バイオ製品と比較して、1つ以上の翻訳後修飾を含む、抗CTLA-4抗体を含み、参照医薬品または参照バイオ製品は、トレメリムマブである。いくつかの実施形態では、1つ以上の翻訳後修飾は、グリコシル化、酸化、脱アミド化、及び切断のうちの1つ以上から選択される。トレメリムマブのアミノ酸配列を表24に示す。いくつかの実施形態では、バイオシミラーは、認可された、または認可のために提出された抗CTLA-4抗体であり、抗CTLA-4抗体は、参照医薬品または参照バイオ製品の製剤とは異なる製剤で提供され、参照医薬品または参照バイオ製品は、トレメリムマブである。抗CTLA-4抗体は、米国FDA及び/または欧州連合のEMAなどの薬物規制当局によって認可され得る。いくつかの実施形態では、バイオシミラーは、1つ以上の賦形剤をさらに含む組成物として提供され、1つ以上の賦形剤は、参照医薬品または参照バイオ製品に含まれる賦形剤と同じまたは異なるものであり、参照医薬品または参照バイオ製品は、トレメリムマブである。いくつかの実施形態では、バイオシミラーは、1つ以上の賦形剤をさらに含む組成物として提供され、1つ以上の賦形剤は、参照医薬品または参照バイオ製品に含まれる賦形剤と同じまたは異なるものであり、参照医薬品または参照バイオ製品は、トレメリムマブである。
Figure 2024512029000028
いくつかの実施形態では、CTLA-4阻害剤は、トレメリムマブまたはそのバイオシミラーであり、トレメリムマブは、約0.5mg/kg~約10mg/kgの用量で投与される。いくつかの実施形態では、CTLA-4阻害剤は、トレメリムマブまたはそのバイオシミラーであり、トレメリムマブは、約0.5mg/kg、約1mg/kg、約1.5mg/kg、約2mg/kg、約2.5mg/kg、約3mg/kg、約3.5mg/kg、約4mg/kg、約4.5mg/kg、約5mg/kg、約5.5mg/kg、約6mg/kg、約6.5mg/kg、約7mg/kg、約7.5mg/kg、約8mg/kg、約8.5mg/kg、約9mg/kg、約9.5mg/kg、または約10mg/kgの用量で投与される。いくつかの実施形態では、トレメリムマブ投与は、切除前1、2、3、4、または5週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)開始される。いくつかの実施形態では、トレメリムマブ投与は、切除前1、2、または3週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)開始される。
いくつかの実施形態では、CTLA-4阻害剤は、トレメリムマブまたはそのバイオシミラーであり、トレメリムマブは、約200mg~約500mgの用量で投与される。いくつかの実施形態では、CTLA-4阻害剤は、トレメリムマブまたはそのバイオシミラーであり、トレメリムマブは、約200mg、約220mg、約240mg、約260mg、約280mg、約300mg、約320mg、約340mg、約360mg、約380mg、約400mg、約420mg、約440mg、約460mg、約480mg、または約500mgの用量で投与される。いくつかの実施形態では、トレメリムマブ投与は、切除前1、2、3、4、または5週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)開始される。いくつかの実施形態では、トレメリムマブ投与は、切除前1、2、または3週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)開始される。
いくつかの実施形態では、CTLA-4阻害剤は、トレメリムマブまたはそのバイオシミラーであり、トレメリムマブは、2週間毎、3週間毎、4週間毎、5週間毎、または6週間毎に投与される。いくつかの実施形態では、トレメリムマブ投与は、切除前1、2、3、4、または5週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)開始される。いくつかの実施形態では、トレメリムマブ投与は、切除前1、2、または3週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)開始される。
ある実施形態では、CTLA-4阻害剤は、Agenusからのザリフレリマブ、またはそのバイオシミラー、抗原結合断片、コンジュゲート、もしくはバリアントである。ザリフレリマブは、完全ヒトモノクローナル抗体である。ザリフレリマブには、Chemical Abstracts Service(CAS)登録番号2148321-69-9が割り当てられており、AGEN1884としても知られている。ザリフレリマブの調製及び特性は、米国特許第10,144,779号及び米国特許出願公開第US2020/0024350A1号に記載されており、それらの開示は参照により本明細書に組み込まれる。
ある実施形態では、CTLA-4阻害剤は、配列番号228によって与えられる重鎖及び配列番号229によって与えられる軽鎖を含む。ある実施形態では、CTLA-4阻害剤は、それぞれ、配列番号228及び配列番号229に示される配列を有する重鎖及び軽鎖、またはそれらの抗原結合断片、Fab断片、一本鎖可変断片(scFv)、多様体、もしくはコンジュゲートを含む。ある実施形態では、CTLA-4阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号228及び配列番号229に示される配列と少なくとも99%同一である重鎖及び軽鎖を含む。ある実施形態では、CTLA-4阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号228及び配列番号229に示される配列と少なくとも98%同一である重鎖及び軽鎖を含む。ある実施形態では、CTLA-4阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号228及び配列番号229に示される配列と少なくとも97%同一である重鎖及び軽鎖を含む。ある実施形態では、CTLA-4阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号228及び配列番号229に示される配列と少なくとも96%同一である重鎖及び軽鎖を含む。ある実施形態では、CTLA-4阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号228及び配列番号229に示される配列と少なくとも95%同一である重鎖及び軽鎖を含む。
ある実施形態では、CTLA-4阻害剤は、ザリフレリマブの重鎖及び軽鎖CDRまたは可変領域(VR)を含む。ある実施形態では、CTLA-4阻害剤重鎖可変領域(V)は、配列番号230に示される配列を含み、CTLA-4阻害剤軽鎖可変領域(V)は、配列番号231に示される配列、及びその保存的アミノ酸置換を含む。ある実施形態では、CTLA-4阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号230及び配列番号231に示される配列と少なくとも99%同一であるV及びV領域を含む。ある実施形態では、CTLA-4阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号230及び配列番号231に示される配列と少なくとも98%同一であるV及びV領域を含む。ある実施形態では、CTLA-4阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号230及び配列番号231に示される配列と少なくとも97%同一であるV及びV領域を含む。ある実施形態では、CTLA-4阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号230及び配列番号231に示される配列と少なくとも96%同一であるV及びV領域を含む。ある実施形態では、CTLA-4阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号230及び配列番号231に示される配列と少なくとも95%同一であるV及びV領域を含む。
ある実施形態では、CTLA-4阻害剤は、それぞれ、配列番号231、配列番号233、及び配列番号234に示される配列を有する重鎖CDR1、CDR2、及びCDR3ドメイン、ならびにそれらの保存的アミノ酸置換と、それぞれ、配列番号235、配列番号236、及び配列番号237に示される配列を有する軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3ドメイン、ならびにそれらの保存的アミノ酸置換と、を含む。ある実施形態では、抗体は、前述の抗体のうちのいずれかと結合するために競合し、かつ/またはCTLA-4上の同じエピトープに結合する。
ある実施形態では、CTLA-4阻害剤は、ザリフレリマブに関して薬物規制当局によって承認されたCTLA-4バイオシミラーモノクローナル抗体である。ある実施形態では、バイオシミラーは、参照医薬品または参照バイオ製品のアミノ酸配列に対して少なくとも97%の配列同一性、例えば、97%、98%、99%、または100%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含み、参照医薬品または参照バイオ製品と比較して、1つ以上の翻訳後修飾を含む、抗CTLA-4抗体を含み、参照医薬品または参照バイオ製品は、ザリフレリマブである。いくつかの実施形態では、1つ以上の翻訳後修飾は、グリコシル化、酸化、脱アミド化、及び切断のうちの1つ以上から選択される。ザリフレリマブのアミノ酸配列を表25に示す。いくつかの実施形態では、バイオシミラーは、認可された、または認可のために提出された抗CTLA-4抗体であり、抗CTLA-4抗体は、参照医薬品または参照バイオ製品の製剤とは異なる製剤で提供され、参照医薬品または参照バイオ製品は、ザリフレリマブである。抗CTLA-4抗体は、米国FDA及び/または欧州連合のEMAなどの薬物規制当局によって認可され得る。いくつかの実施形態では、バイオシミラーは、1つ以上の賦形剤をさらに含む組成物として提供され、1つ以上の賦形剤は、参照医薬品または参照バイオ製品に含まれる賦形剤と同じまたは異なるものであり、参照医薬品または参照バイオ製品は、ザリフレリマブである。いくつかの実施形態では、バイオシミラーは、1つ以上の賦形剤をさらに含む組成物として提供され、1つ以上の賦形剤は、参照医薬品または参照バイオ製品に含まれる賦形剤と同じまたは異なるものであり、参照医薬品または参照バイオ製品は、ザリフレリマブである。
Figure 2024512029000029
さらなる抗CTLA-4抗体の例には、AGEN1181、BMS-986218、BCD-145、ONC-392、CS1002、REGN4659、及びADG116が含まれるが、これらに限定されず、これらは当業者に即知である。
いくつかの実施形態では、抗CTLA-4抗体は、以下の特許公開(参照により本明細書に組み込まれる)のうちのいずれかに開示される抗CTLA-4抗体である:US2019/0048096A1、US2020/0223907、US2019/0201334、US2019/0201334、US2005/0201994、EP1212422B1、WO2018/204760、WO2018/204760、WO2001/014424、WO2004/035607、WO2003/086459、WO2012/120125、WO2000/037504、WO2009/100140、WO2006/09649、WO2005/092380、WO2007/123737、WO2006/029219、WO2010/0979597、WO2006/12168、及びWO1997/020574。さらなるCTLA-4抗体は、米国特許第5,811,097号、同第5,855,887号、同第6,051,227号、及び同第6,984,720号、PCT公開第WO01/14424号及び同第WO00/37504号、ならびに米国公開第2002/0039581号及び同第2002/086014号、及び/または米国特許第5,977,318号、同第6,682,736号、同第7,109,003号、及び同第7,132,281号に記載されており、参照により本明細書に組み込まれる。いくつかの実施形態では、抗CTLA-4抗体は、例えば、WO98/42752、米国特許第6,682,736号及び同第6,207,156号、Hurwitz et al.,Proc.Natl.Acad.Sci.USA,95(17):10067-10071(1998)、Camacho et al.,J.Clin.Oncol.,22(145):Abstract No.2505(2004)(抗体CP-675206)、Mokyr et al.,Cancer Res.,58:5301-5304(1998)(参照により本明細書に組み込まれる)に開示されるものである。
いくつかの実施形態では、CTLA-4阻害剤は、WO1996/040915(参照により本明細書に組み込まれる)に開示されるCTLA-4リガンドである。
いくつかの実施形態では、CTLA-4阻害剤は、CTLA-4発現の核酸阻害剤である。例えば、抗CTLA-4 RNAi分子は、PCT公開第WO1999/032619及びWO2001/029058、米国公開第2003/0051263号、同第2003/0055020号、同第2003/0056235号、同第2004/265839号、同第2005/0100913号、同第2006/0024798号、同第2008/0050342号、同第2008/0081373号、同第2008/0248576号、同第2008/055443号、及び/または米国特許第6,506,559号、同第7,282,564号、同第7,538,095号、及び同第7,560,438号(参照により本明細書に組み込まれる)においてMello及びFireによって記載された分子の形態を取り得る。いくつかの事例では、抗CTLA-4 RNAi分子は、欧州特許第EP1309726号(参照により本明細書に組み込まれる)においてTuschlによって記載された二本鎖RNAi分子の形態を取る。いくつかの事例では、抗CTLA-4 RNAi分子は、米国特許第7,056,704号及び同第7,078,196号(参照により本明細書に組み込まれる)においてTuschlによって記載された二本鎖RNAi分子の形態を取る。いくつかの実施形態では、CTLA-4阻害剤は、PCT公開第WO2004/081021(参照により本明細書に組み込まれる)に記載されたアプタマーである。
他の実施形態では、本発明の抗CTLA-4 RNAi分子は、米国特許第5,898,031号、同第6,107,094号、同第7,432,249号、及び同第7,432,250号、ならびに欧州出願第EP0928290号(参照により本明細書に組み込まれる)においてCrookeによって記載されたRNA分子である。
4.患者の任意のリンパ球枯渇プレコンディショニング
ある実施形態では、本発明は、TIL集団でがんを治療する方法を含み、患者は、本開示によるTILの注入前に骨髄非破壊的化学療法で前治療される。ある実施形態では、本発明は、骨髄非破壊的化学療法で前治療された患者のがんの治療に使用するためのTIL集団を含む。ある実施形態では、TIL集団は、注入による投与用である。ある実施形態では、骨髄非破壊的化学療法は、シクロホスファミド60mg/kg/日で2日間(TIL注入の27日前及び26日前)、ならびにフルダラビン25mg/m/日で5日間(TIL注入の27日前~23日前)である。いくつかの実施形態では、骨髄非破壊的化学療法は、シクロホスファミド60mg/kg/日で2日間(TIL注入の27日前及び26日前)、ならびにフルダラビン25mg/m2/日で3日間(TIL注入の27日前~25日前)である。いくつかの実施形態では、骨髄非破壊的化学療法は、シクロホスファミド60mg/kg/日で2日間(TIL注入の27日前及び26日前)、続いてフルダラビン25mg/m2/日で3日間(TIL注入の25日前~23日前)である。ある実施形態では、本開示による骨髄非破壊的化学療法及びTIL注入(0日目)後、患者は、生理学的許容範囲まで8時間毎に720,000IU/kgで静脈内的にIL-2(PROLEUKINとして市販されている、アルデスロイキン)の静脈内注入を受ける。ある特定の実施形態では、TIL集団は、IL-2と組み合わせてがんを治療する際に使用するためのものであり、IL-2は、TIL集団の後に投与される。
実験結果は、腫瘍特異的Tリンパ球の養子移入前のリンパ球枯渇が、調節性T細胞及び免疫系の競合要素(「サイトカインシンク」)を排除することによって治療有効性を増強する上で重要な役割を果たすことを示している。したがって、本発明のいくつかの実施形態は、本発明のTILを導入する前に、患者に対してリンパ球枯渇ステップ(「免疫抑制コンディショニング」と称されることもある)を利用する。
一般に、リンパ球枯渇は、フルダラビンまたはシクロホスファミド(マホスファミドと称される活性形態)及びそれらの組み合わせの投与を使用して達成される。かかる方法は、Gassner,et al.,Cancer Immunol.Immunother.2011,60,75-85、Muranski,et al.,Nat.Clin.Pract.Oncol.,2006,3,668-681、Dudley,et al.,J.Clin.Oncol.2008,26,5233-5239、及びDudley,et al.,J.Clin.Oncol.2005,23,2346-2357に記載されており、これらはすべて、参照によりそれらの全体が本明細書に組み込まれる。
いくつかの実施形態では、フルダラビンは、0.5μg/mL~10μg/mLのフルダラビン濃度で投与される。いくつかの実施形態では、フルダラビンは、1μg/mLのフルダラビン濃度で投与される。いくつかの実施形態では、フルダラビン治療は、1日、2日、3日、4日、5日、6日、または7日以上投与される。いくつかの実施形態では、フルダラビンは、10mg/kg/日、15mg/kg/日、20mg/kg/日、25mg/kg/日、30mg/kg/日、35mg/kg/日、40mg/kg/日、または45mg/kg/日の投与量で投与される。いくつかの実施形態では、フルダラビン治療は、35mg/kg/日で2~7日間投与される。いくつかの実施形態では、フルダラビン治療は、35mg/kg/日で4~5日間投与される。いくつかの実施形態では、フルダラビン治療は、25mg/kg/日で4~5日間投与される。
いくつかの実施形態では、シクロホスファミドの活性形態であるマホスファミドは、シクロホスファミドの投与により、0.5μg/mL~10μg/mLの濃度で得られる。いくつかの実施形態では、シクロホスファミドの活性形態であるマホスファミドは、シクロホスファミドの投与により、1μg/mLの濃度で取得される。いくつかの実施形態では、シクロホスファミド治療は、1日、2日、3日、4日、5日、6日、または7日以上投与される。いくつかの実施形態では、シクロホスファミドは、100mg/m/日、150mg/m/日、175mg/m/日、200mg/m/日、225mg/m/日、250mg/m/日、275mg/m/日、または300mg/m/日の投与量で投与される。いくつかの実施形態では、シクロホスファミドは、静脈内(すなわち、i.v.)投与される。いくつかの実施形態では、シクロホスファミド治療は、35mg/kg/日で2~7日間投与される。いくつかの実施形態では、シクロホスファミド治療は、250mg/m/日で4~5日間i.v.投与される。いくつかの実施形態では、シクロホスファミド治療は、250mg/m/日で4日間i.v.投与される。
いくつかの実施形態では、リンパ球枯渇は、患者にフルダラビンとシクロホスファミドを一緒に投与することによって行われる。いくつかの実施形態では、フルダラビンは、25mg/m/日でi.v.投与され、シクロホスファミドは、250mg/m/日で4日間にわたってi.v投与される。
ある実施形態では、リンパ球枯渇は、シクロホスファミドを60mg/m/日の用量で2日間投与し、続いてフルダラビンを25mg/m/日の用量で5日間投与することによって行われる。
ある実施形態では、リンパ球枯渇が、シクロホスファミドを60mg/m/日の用量で2日間投与し、フルダラビンを25mg/m/日の用量で5日間投与することによって行われ、シクロホスファミド及びフルダラビンは、両方とも最初の2日間に投与され、リンパ球枯渇は合計5日間で行われる。
ある実施形態では、リンパ球枯渇が、シクロホスファミドを約50mg/m/日の用量で2日間投与し、フルダラビンを約25mg/m/日の用量で5日間投与することによって行われ、シクロホスファミド及びフルダラビンは、両方とも最初の2日間に投与され、リンパ球枯渇は合計5日間で行われる。
ある実施形態では、リンパ球枯渇が、シクロホスファミドを約50mg/m/日の用量で2日間投与し、フルダラビンを約20mg/m/日の用量で5日間投与することによって行われ、シクロホスファミド及びフルダラビンは、両方とも最初の2日間に投与され、リンパ球枯渇は合計5日間で行われる。
ある実施形態では、リンパ球枯渇が、シクロホスファミドを約40mg/m/日の用量で2日間投与し、フルダラビンを約20mg/m/日の用量で5日間投与することによって行われ、シクロホスファミド及びフルダラビンは、両方とも最初の2日間に投与され、リンパ球枯渇は合計5日間で行われる。
ある実施形態では、リンパ球枯渇が、シクロホスファミドを約40mg/m/日の用量で2日間投与し、フルダラビンを約15mg/m/日の用量で5日間投与することによって行われ、シクロホスファミド及びフルダラビンは、両方とも最初の2日間に投与され、リンパ球枯渇は合計5日間で行われる。
ある実施形態では、リンパ球枯渇が、シクロホスファミドを60mg/m/日の用量で、フルダラビンを25mg/m/日の用量で2日間、続いてフルダラビンを25mg/m/日の用量で3日間投与することによって行われる。
ある実施形態では、シクロホスファミドは、メスナとともに投与される。ある実施形態では、メスナは、15mg/kgで投与される。メスナが注入されるある実施形態では、連続的に注入される場合、メスナは、およそ2時間にわたってシクロホスファミドとともに注入することができ(-5日目及び/または-4日目)、次いで残りの22時間は3mg/kg/時間の速度で、各シクロホスファミド用量と同時に開始して24時間にわたって注入することができる。
ある実施形態では、リンパ球枯渇は、第3のTIL集団を患者に投与した翌日から開始するIL-2レジメンで患者を治療するステップをさらに含む。
ある実施形態では、リンパ球枯渇は、第3のTIL集団を患者に投与したのと同じ日に開始するIL-2レジメンで患者を治療するステップを含む。
いくつかの実施形態では、リンパ球枯渇は、5日間のプレコンディショニング治療を含む。いくつかの実施形態では、該日は、-5日から-1日、または0日から4日として示される。いくつかの実施形態では、レジメンは、-5日目及び-4日目(すなわち、0日目及び1日目)にシクロホスファミドを含む。いくつかの実施形態では、レジメンは、-5日目及び-4日目(すなわち、0日目及び1日目)に静脈内シクロホスファミドを含む。いくつかの実施形態では、レジメンは、-5日目及び-4日目(すなわち、0日目及び1日目)に60mg/kgの静脈内シクロホスファミドを含む。いくつかの実施形態では、シクロホスファミドは、メスナとともに投与される。いくつかの実施形態では、レジメンは、フルダラビンをさらに含む。いくつかの実施形態では、レジメンは、静脈内フルダラビンをさらに含む。いくつかの実施形態では、レジメンは、25mg/mの静脈内フルダラビンをさらに含む。いくつかの実施形態では、レジメンは、-5日目及び-1日目(すなわち、0~4日目)に25mg/mの静脈内フルダラビンをさらに含む。いくつかの実施形態では、レジメンは、-5日目及び-1日目(すなわち、0~4日目)に25mg/mの静脈内フルダラビンをさらに含む。
いくつかの実施形態では、骨髄非破壊的リンパ球枯渇レジメンが、シクロホスファミドを60mg/m2/日の用量で、フルダラビンを25mg/m/日の用量で2日間投与し、続いてフルダラビンを25mg/m/日の用量で5日間投与するステップを含む。
いくつかの実施形態では、骨髄非破壊的リンパ球枯渇レジメンが、シクロホスファミドを60mg/m2/日の用量で、フルダラビンを25mg/m/日の用量で2日間投与し、続いてフルダラビンを25mg/m/日の用量で3日間投与するステップを含む。
いくつかの実施形態では、骨髄非破壊的リンパ球枯渇レジメンが、シクロホスファミドを60mg/m/日の用量で、及びフルダラビンを25mg/m/日の用量で2日間投与するとともに、フルダラビンを25mg/m/日の用量で2日間、続いてフルダラビンを25mg/m/日の用量で1日間投与するステップを含む。
いくつかの実施形態では、骨髄非破壊的リンパ球枯渇レジメンが、シクロホスファミドを60mg/m/日の用量で、及びフルダラビンを25mg/m/日の用量で2日間投与するとともに、フルダラビンを25mg/m/日の用量で2日間、続いてフルダラビンを25mg/m/日の用量で2日間投与するステップを含む。
いくつかの実施形態では、骨髄非破壊的リンパ球枯渇レジメンが、シクロホスファミドを60mg/m/日の用量で、及びフルダラビンを25mg/m/日の用量で2日間投与するとともに、フルダラビンを25mg/m/日の用量で2日間、続いてフルダラビンを25mg/m/日の用量で3日間投与するステップを含む。
いくつかの実施形態では、骨髄非破壊的リンパ球枯渇レジメンは、5日間のプレコンディショニング治療を含む。いくつかの実施形態では、該日は、-5日から-1日、または0日から4日として示される。いくつかの実施形態では、レジメンは、-5日目及び-4日目(すなわち、0日目及び1日目)にシクロホスファミドを含む。いくつかの実施形態では、レジメンは、-5日目及び-4日目(すなわち、0日目及び1日目)に静脈内シクロホスファミドを含む。いくつかの実施形態では、レジメンは、-5日目及び-4日目(すなわち、0日目及び1日目)に300mg/kgの静脈内シクロホスファミドを含む。いくつかの実施形態では、シクロホスファミドは、メスナとともに投与される。いくつかの実施形態では、レジメンは、フルダラビンをさらに含む。いくつかの実施形態では、レジメンは、静脈内フルダラビンをさらに含む。いくつかの実施形態では、レジメンは、30mg/mの静脈内フルダラビンをさらに含む。いくつかの実施形態では、レジメンは、-5日目及び-1日目(すなわち、0~4日目)に30mg/mの静脈内フルダラビンをさらに含む。いくつかの実施形態では、レジメンは、-5日目及び-1日目(すなわち、0~4日目)に30mg/mの静脈内フルダラビンをさらに含む。
いくつかの実施形態では、骨髄非破壊的リンパ球枯渇レジメンは、シクロホスファミドを300mg/m/日の用量で、及びフルダラビンを30mg/m/日の用量で2日間投与し、続いてフルダラビンを30mg/m/日の用量で5日間投与するステップを含む。
いくつかの実施形態では、骨髄非破壊的リンパ球枯渇レジメンは、シクロホスファミドを60mg/m/日の用量で、及びフルダラビンを30mg/m/日の用量で2日間投与し、続いてフルダラビンを30mg/m/日の用量で3日間投与するステップを含む。
いくつかの実施形態では、骨髄非破壊的リンパ球枯渇レジメンが、シクロホスファミドを60mg/m/日の用量で、及びフルダラビンを30mg/m/日の用量で2日間投与するとともに、フルダラビンを30mg/m/日の用量で2日間、続いてフルダラビンを30mg/m/日の用量で1日間投与するステップを含む。
いくつかの実施形態では、骨髄非破壊的リンパ球枯渇レジメンが、シクロホスファミドを300mg/m/日の用量で、及びフルダラビンを30mg/m/日の用量で2日間投与するとともに、フルダラビンを30mg/m/日の用量で2日間、続いてフルダラビンを30mg/m/日の用量で2日間投与するステップを含む。
いくつかの実施形態では、骨髄非破壊的リンパ球枯渇レジメンが、シクロホスファミドを300mg/m/日の用量で、及びフルダラビンを30mg/m/日の用量で2日間投与するとともに、フルダラビンを30mg/m/日の用量で2日間、続いてフルダラビンを30mg/m/日の用量で3日間投与するステップを含む。
いくつかの実施形態では、骨髄非破壊的リンパ球枯渇レジメンは、表26に従って投与される。
Figure 2024512029000030
いくつかの実施形態では、骨髄非破壊的リンパ球枯渇レジメンは、表27に従って投与される。
Figure 2024512029000031
いくつかの実施形態では、骨髄非破壊的リンパ球枯渇レジメンは、表28に従って投与される。
Figure 2024512029000032
いくつかの実施形態では、骨髄非破壊的リンパ球枯渇レジメンは、表29に従って投与される。
Figure 2024512029000033
いくつかの実施形態では、骨髄非破壊的リンパ球枯渇レジメンは、表30に従って投与される。
Figure 2024512029000034
いくつかの実施形態では、骨髄非破壊的リンパ球枯渇レジメンは、表31に従って投与される。
Figure 2024512029000035
いくつかの実施形態では、骨髄非破壊的リンパ球枯渇レジメンは、表32に従って投与される。
Figure 2024512029000036
いくつかの実施形態では、骨髄非破壊的リンパ球枯渇レジメンは、表33に従って投与される。
Figure 2024512029000037
いくつかの実施形態では、骨髄非破壊的リンパ球枯渇レジメンは、TIL注入日の1日前、2日前、または3日前の経過にわたって100mg/mの総用量まで投与されるメルファランを含む。いくつかの実施形態では、骨髄非破壊的リンパ球枯渇レジメンは、TIL注入日の1日前、2日前、または3日前の経過にわたって200mg/mの総用量まで投与されるメルファランを含む。いくつかの実施形態では、骨髄非破壊的リンパ球枯渇レジメンは、TIL注入日の1日前、2日前、または3日前の経過にわたって100mg/mの総用量まで投与されるメルファラン、及び30mg/m/日の用量で投与されるフルダラビンを含む。いくつかの実施形態では、骨髄非破壊的リンパ球枯渇レジメンは、TIL注入日の1日前、2日前、または3日前の経過にわたって200mg/mの総用量まで投与されるメルファラン、及び30mg/m/日の用量で投与されるフルダラビンを含む。
いくつかの実施形態では、骨髄破壊的リンパ球枯渇レジメンの前述の実施形態で使用されるTIL注入は、本明細書に記載の任意のTIL組成物であり得、また、TIL注入の代わりにMIL及びPBLの注入、ならびに本明細書に記載のIL-2レジメンの追加及び併用療法(PD-1及び/またはPD-L1阻害剤など)の投与を含み得る。
5.IL-2レジメン
ある実施形態では、IL-2レジメンは、高用量IL-2レジメンを含み、高用量IL-2レジメンは、治療的TIL集団の治療有効部分を投与した翌日から静脈内投与されるアルデスロイキン、またはそのバイオシミラーもしくは多様体を含み、アルデスロイキンまたはそのバイオシミラーもしくは多様体が、0.037mg/kgまたは0.044mg/kgIU/kg(患者の体重)の用量で、耐性まで8時間毎に最大14用量にわたって15分のボーラス静脈内注入を使用して投与される。9日間の休止後、このスケジュールは、さらに14用量、合計最大28用量にわたって繰り返され得る。いくつかの実施形態では、IL-2は、1、2、3、4、5、または6用量で投与される。いくつかの実施形態では、IL-2は、最大6用量の最大投与量で投与される。いくつかの実施形態では、高用量IL-2レジメンは、小児の使用に適合される。いくつかの実施形態では、最大6用量まで、8~12時間毎に600,000国際単位(IU)/kgのアルデスロイキンの用量が使用される。いくつかの実施形態では、最大6用量まで、8~12時間毎に500,000国際単位(IU)/kgのアルデスロイキンの用量が使用される。いくつかの実施形態では、最大6用量まで、8~12時間毎に400,000国際単位(IU)/kgのアルデスロイキンの用量が使用される。いくつかの実施形態では、最大6用量まで、8~12時間毎に500,000国際単位(IU)/kgのアルデスロイキンの用量が使用される。いくつかの実施形態では、最大6用量まで、8~12時間毎に300,000国際単位(IU)/kgのアルデスロイキンの用量が使用される。いくつかの実施形態では、最大6用量まで、8~12時間毎に200,000国際単位(IU)/kgのアルデスロイキンの用量が使用される。いくつかの実施形態では、最大6用量まで、8~12時間毎に100,000国際単位(IU)/kgのアルデスロイキンの用量が使用される。
ある実施形態では、IL-2レジメンは、デクレッシェンドIL-2レジメンを含む。デクレッシェンドIL-2レジメンは、O’Day,et al.,J.Clin.Oncol.1999,17,2752-61、及びEton,et al.,Cancer 2000,88,1703-9に記載されており、それらの開示は参照により本明細書に組み込まれる。ある実施形態では、デクレッシェンドIL-2レジメンは、6時間にわたって静脈内投与される18×10IU/m、続いて12時間にわたって静脈内投与される18×10IU/m、続いて24時間にわたって静脈内投与される18×10IU/m、続いて72時間かけて静脈内投与される4.5×10IU/mを含む。この治療サイクルは、28日毎に最大4サイクル繰り返され得る。ある実施形態では、デクレッシェンドIL-2レジメンは、1日目の18,000,000IU/m、2日目の9,000,000IU/m、3日目及び4日目の4,500,000IU/mを含む。
ある実施形態では、IL-2レジメンは、0.10mg/日~50mg/日の用量で、1、2、4、6、7、14、または21日毎にペグ化IL-2を投与することを含む。
ある実施形態では、IL-2レジメンは、抗体骨格に移植されたIL-2断片の投与を含む。ある実施形態では、IL-2レジメンは、IL-2低親和性受容体に結合する抗体-サイトカイン移植タンパク質の投与を含む。ある実施形態では、IL-2レジメンは、IL-2Rα受容体への結合に影響を及ぼすことなく、アルデスロイキンと比較して、IL-2Rβ及び/またはIL-2Rγ受容体への結合が強化された抗体-サイトカイン移植タンパク質の投与を含む。
いくつかの実施形態では、本明細書に記載の抗体サイトカイン移植タンパク質は、アルデスロイキン(Proleukin(登録商標))または同等の分子などであるがこれらに限定されない野生型IL-2分子よりも長い血清半減期を有する。
6.追加の治療方法
別の実施形態では、本発明は、治療上有効な投与量の、上記の前段落のうちのいずれかに記載の治療的TIL集団を対象に投与することを含む、がんを有する対象を治療するための方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、治療上有効な投与量の、上記の前段落のうちのいずれかに記載のTIL組成物を対象に投与することを含む、がんを有する対象を治療するための方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、それぞれ、治療上有効な投与量の治療的TIL集団及び上記の前段落のうちのいずれかに記載のTIL組成物を投与する前に、骨髄非破壊的リンパ球枯渇レジメンが対象に投与されるように修正された、上記の前段落のうちのいずれかに記載のがんを有する対象を治療するための方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、骨髄非破壊的リンパ球枯渇レジメンが、シクロホスファミドを60mg/m/日の用量で2日間投与し、続いてフルダラビンを25mg/m/日の用量で5日間投与するステップを含むように修正された、上記の前段落のうちのいずれかに記載のがんを有する対象を治療するための方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、対象にTIL細胞を投与した翌日に開始する、高用量のIL-2レジメンで対象を治療するステップをさらに含むように修正された、上記の前段落のうちのいずれかに記載のがんを有する対象を治療するための方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、高用量IL-2レジメンが、許容範囲まで8時間毎に15分間のボーラス静脈内注入として投与される600,000または720,000IU/kgを含むように修正された、上記の前段落のうちのいずれかに記載のがんを有する対象を治療するための方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、がんが固形腫瘍であるように修正された、上記の前段落のうちのいずれかに記載のがんを有する対象を治療するための方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、がんが黒色腫であるように修正された、上記の前段落のうちのいずれかに記載のがんを有する対象を治療するための方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、がんが小児の高頻度変異癌であるように修正された、上記の前段落のうちのいずれかに記載のがんを有する対象を治療するための方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、治療上有効な投与量の治療的TIL集団を対象に投与することを含む、がんを有する対象を治療するための方法で使用するための、上記の前段落のうちのいずれかに記載の治療的TIL集団を提供する。
別の実施形態では、本発明は、治療上有効な投与量のTIL組成物を対象に投与することを含む、がんを有する対象を治療するための方法で使用するための、上記の前段落のうちのいずれかに記載のTIL組成物を提供する。
別の実施形態では、本発明は、治療上有効な投与量の、上記の前段落のうちのいずれかに記載の治療的TIL集団または上記の前段落のうちのいずれかに記載のTIL組成物を対象に投与する前に、骨髄非破壊的リンパ球枯渇レジメンが対象に投与されるように修正された、上記の前段落のうちのいずれかに記載の治療的TIL集団または上記の前段落のうちのいずれかに記載のTIL組成物を提供する。
別の実施形態では、本発明は、骨髄非破壊的リンパ球枯渇レジメンが、シクロホスファミドを60mg/m/日の用量で2日間投与し、続いてフルダラビンを25mg/m/日の用量で5日間投与するステップを含むように修正された、上記の前段落のうちのいずれかに記載の治療的TIL集団またはTIL組成物を提供する。
別の実施形態では、本発明は、TIL細胞を患者に投与した翌日から開始する、高用量IL-2レジメンで患者を治療するステップをさらに含むように修正された、上記の前段落のうちのいずれかに記載の治療的TIL集団またはTIL組成物を提供する。
別の実施形態では、本発明は、高用量IL-2レジメンが、許容範囲まで8時間毎に15分間のボーラス静脈内注入として投与される600,000または720,000IU/kgを含むように修正された、上記の前段落のうちのいずれかに記載の治療的TIL集団またはTIL組成物を提供する。
別の実施形態では、本発明は、がんが固形腫瘍であるように修正された、上記の前段落のうちのいずれかに記載の治療的TIL集団またはTIL組成物を提供する。
別の実施形態では、本発明は、がんが黒色腫であるように修正された、上記の前段落のうちのいずれかに記載の治療的TIL集団またはTIL組成物を提供する。
別の実施形態では、本発明は、がんが高頻度変異癌であるように修正された、上記の前段落のうちのいずれかに記載の治療的TIL集団またはTIL組成物を提供する。
別の実施形態では、本発明は、がんが小児の高頻度変異癌であるように修正された、上記の前段落のうちのいずれかに記載の治療的TIL集団またはTIL組成物を提供する。
別の実施形態では、本発明は、治療上有効な投与量の治療的TIL集団を対象に投与することを含む、対象におけるがんを治療する方法における上記の前段落のうちのいずれかに記載の治療的TIL集団の使用を提供する。
別の実施形態では、本発明は、治療上有効な投与量のTIL組成物を対象に投与することを含む、対象におけるがんを治療する方法における上記の前段落のうちのいずれかに記載のTIL組成物の使用を提供する。
別の実施形態では、本発明は、骨髄非破壊的リンパ球枯渇レジメンを対象に投与すること、次いで治療上有効な投与量の、上記の前段落のうちのいずれかに記載の治療的TIL集団または上記の前段落のうちのいずれかに記載のTIL組成物を対象に投与することと、を含む、対象におけるがんを治療する方法における、上記の前段落のうちのいずれかに記載の治療的TIL集団または上記の前段落のうちのいずれかに記載のTIL組成物の使用を提供する。
本明細書に包含される実施形態は、これから以下の実施例を参照して説明される。これらの実施例は、例示のみを目的として提供されており、本明細書に包含される本開示は、決してこれらの実施例に限定されると解釈されるべきではなく、むしろ、本明細書で提供される教示の結果として明らかになるありとあらゆる変形を包含すると解釈されるべきである。
実施例1:REP前プロセス及びREPプロセス用の培地の調製
この実施例は、黒色腫を含む様々な腫瘍タイプに由来するTILの培養を含むプロトコルで使用するための組織培養培地の調製手順を説明する。この培地を、本出願及び実施例に記載のTILのうちのいずれかの調製に使用することができる。
CM1の調製。以下の試薬を冷蔵から取り出し、37℃の水浴中で温めた。(RPMI1640、ヒトAB血清、200mM L-グルタミン)。濾過される体積に適した0.2umフィルターユニットの上部に成分の各々を追加することによって、以下の表34に従ってCM1培地を調製した。4℃で保存する。

Figure 2024512029000038
使用日に、37℃の水浴中で必要量のCM1を事前に温め、6000IU/mLのIL-2を追加した。
表35に従って必要に応じて追加の補充を行った。
Figure 2024512029000039
CM2の調製。調製したCM1を冷蔵庫から取り出すか、または新鮮なCM1を調製した。AIM-V(登録商標)を冷蔵庫から取り出し、調製したCM1を滅菌培地ボトル内で同等体積のAIM-V(登録商標)と混合することによって、必要な量のCM2を調製した。使用日に3000IU/mLのIL-2をCM2培地に追加した。使用日に3000IU/mLのIL-2を含む十分な量のCM2を作製した。CM2培地ボトルにその名前、調製者のイニシャル、濾過/調製日、2週間の有効期限をラベル付けし、組織培養に必要になるまで4℃で保存した。
CM3の調製。使用が必要になった日にCM3を調製した。CM3は、AIM-V(登録商標)培地と同じであり、使用日に3000IU/mLのIL-2を補充した。IL-2ストック溶液をAIM-Vのボトルまたはバッグに直接追加することによって、実験のニーズに十分な量のCM3を調製した。穏やかに振盪することによって十分に混合した。ボトルに、AIM-Vに追加した直後に「3000IU/mL IL-2」とラベル付けする。過剰なCM3が存在する場合は、培地名、調製者のイニシャル、培地を調製した日、及びその有効期限(調製後7日)をラベル付けしたボトル内で4℃で保管した。4℃で7日間保管した後、IL-2を補充した培地を廃棄した。
CM4の調製。CM4は、CM3と同じであり、2mM GlutaMAX(商標)(最終濃度)を追加で補充した。1LのCM3毎に、10mlの200mM GlutaMAX(商標)を追加した。IL-2ストック溶液及びGlutaMAX(商標)ストック溶液をAIM-Vのボトルまたはバッグに直接追加することによって、実験のニーズに十分な量のCM4を調製した。穏やかに振盪することによって十分に混合した。ボトルに、AIM-Vに追加した直後に「3000IL/nil IL-2及びGlutaMAX」とラベル付けした。過剰なCM4が存在する場合、培地名、「GlutaMAX」、及びその有効期限(調製後7日)をラベル付けしたボトル内で4℃で保管した。4℃で7日間保管した後、IL-2を補充した培地を廃棄した。
実施例2:ガンマ線照射末梢単核細胞の個々のロットを適格性確認する
この実施例は、本明細書に記載の例示的な方法において同種異系フィーダー細胞として使用するためのガンマ線照射末梢単核細胞(PBMC、単核細胞またはMNCとしても知られる)の個々のロットを適格性確認するための簡略化された手順を説明する。
照射された各MNCフィーダーロットは、個々のドナーから調製した。各ロットまたはドナーは、精製された抗CD3(クローンOKT3)抗体及びインターロイキン-2(IL-2)の存在下でREP内のTILを拡張する能力について個々にスクリーニングした。さらに、フィーダー細胞の各ロットを、TILを添加せずに試験し、受けたガンマ線の線量がそれらを複製不全にするのに十分であることを確認した。
TILのREPには、ガンマ線を照射し、成長を停止させたMNCフィーダー細胞が必要である。フィーダーMNCの膜受容体は、抗CD3(クローンOKT3)抗体に結合し、REPフラスコ内のTILに架橋し、TILを刺激して拡張させる。フィーダーロットは、個々のドナーから採取した全血の白血球アフェレーシスから調製した。白血球アフェレーシス産物を、Ficoll-Hypaque上で遠心分離し、洗浄し、照射し、GMP条件下で凍結保存した。
TIL療法を受けた患者には、移植片対宿主病(GVHD)を引き起こす可能性があるため、生存可能なフィーダー細胞を注入しないことが重要である。したがって、フィーダー細胞は、細胞にガンマ線を照射することによって成長を停止させ、再培養時に二本鎖DNA切断が起こり、MNC細胞の細胞生存性が喪失する。
フィーダーロットを、2つの基準:1)共培養でTILを100倍超拡張する能力、及び2)複製不全で評価した。
フィーダーロットを、直立したT25組織培養フラスコ内で培養された2つの主要なREP前TIL株を利用して、mini-REP形式で試験した。各TIL株は、REPでの活性化に応答して増殖する能力が独特であるため、フィーダーロットを、2つの異なるTIL株に対して試験した。対照として、上記の基準を満たすことが歴史的に示されている多くの照射されたMNCフィーダー細胞を、試験ロットと並行して実行した。
1回の実験で試験されたすべてのロットが同等の試験を受けることを保証するために、すべての条件及びすべてのフィーダーロットを試験するために、同じREP前TIL株の十分なストックが利用可能であった。
試験したフィーダー細胞の各ロットに、合計6つのT25フラスコがあった:REP前TIL株#1(2フラスコ)、REP前TIL株#2(2フラスコ)、及びフィーダー対照(2フラスコ)。TIL株番号1及び番号2を含むフラスコは、フィーダーロットがTILを拡張する能力を評価した。フィーダー対照フラスコは、フィーダーロットの複製不全を評価した。
A.実験プロトコル
-2/3日目、TIL株の解凍。CM2培地を調製し、CM2を37℃の水浴中で温める。3000IU/mLのIL-2を補充した40mLのCM2を調製する。使用まで保温する。IL-2を含まない20mLの予熱したCM2を、使用したTIL株の名前がラベル付けされた2本の50mLコニカルチューブの各々に入れる。LN2ストレージから2つの指定されたREP前TIL株を取り出し、バイアルを組織培養室に移した。少量の氷が残るまで、37℃の水浴内の密封されたジッパーストレージバッグ内にバイアルを入れて解凍した。
無菌トランスファーピペットを使用して、各バイアルの内容物を、調製した、ラベル付けされた50mLのコニカルチューブ中の20mLのCM2に直ちに移した。細胞を洗浄し、400×CFで5分間遠心分離するために、IL-2なしのCM2を使用して40mLにQS。上清を吸引し、3000IU/mLのIL-2で補充された5mLの温かいCM2に再懸濁した。
自動セルカウンターを使用して細胞を計数するために、少量のアリコート(20μL)を重複して取り出した。計数を記録した。計数しながら、TIL細胞を含む50mLのコニカルチューブを、加湿した37℃、5% COインキュベーターに入れ、ガス交換を可能にするためにキャップを緩めた。細胞濃度を決定し、TILを、3000IU/mLのIL-2を補充したCM2中で1×10細胞/mLに希釈した。
mini-REPの0日目まで、加湿した37℃のインキュベーターで必要な数のウェルにおいて、24ウェル組織培養プレートの1ウェル当たり2mLで培養した。混乱及び潜在的な相互汚染を避けるために、別個の24ウェル組織培養プレートで異なるTIL株を培養した。
0日目、Mini-REPを開始する。試験されるフィーダーロットの数に十分なCM2培地を調製した。(例えば、一度に4つのフィーダーロットを試験するために、800mLのCM2培地を調製した)。上記で調製したCM2の一部を分注し、それを細胞の培養のために3000IU/mLのIL-2で補充した。(例えば、一度に4つのフィーダーロットを試験するために、3000IU/mLのIL-2を含む500mLのCM2培地を調製する)。
相互汚染を防ぐために各TIL株を別々に操作し、TIL培養物を入れた24ウェルプレートをインキュベーターから取り出し、BSCに移した。
無菌トランスファーピペットまたは100~1000μLピペッター及びチップを使用して、約1mLの培地を、使用されるTILの各ウェルから取り出し、24ウェル組織培養プレートの未使用のウェルに入れる。
新鮮な無菌トランスファーピペットまたは100~1000μLピペッター及びチップを使用して、残りの培地をウェル内のTILと混合して細胞を再懸濁し、次いで細胞懸濁液を、TILロット名のラベルが付いた50mLコニカルチューブに移し、容量を記録した。
予備の培地でウェルを洗浄し、その容量を同じ50mLコニカルチューブに移した。細胞を400×CFで回転させて、細胞ペレットを収集する。培地上清を吸引除去し、3000IU/mLのIL-2を含有する2~5mLのCM2培地に細胞ペレットを再懸濁し(採取したウェルの数及びペレットのサイズに基づいて使用される容量)、容量は、1.3×10細胞/mLを超える濃度を保証するのに十分である必要がある。
血清学的ピペットを使用して、細胞懸濁液を十分に混合し、容量を記録した。自動セルカウンターを使用して細胞を計数するために、200μLを取り出した。計数しながら、TIL細胞を含む50mLのコニカルチューブを、加湿した5% CO、37℃インキュベーターに入れ、ガス交換を可能にするためにキャップを緩めた。計数を記録した。
TIL細胞を含有する50mLのコニカルチューブをインキュベーターから取り出し、3000IU/mLのIL-2で補充された温かいCM2中、1.3×10細胞/mLの濃度でそれらの細胞を再懸濁した。キャップを緩めた状態で、50mLのコニカルチューブをインキュベーターに戻した。
第2のTIL株について、上記のステップを繰り返した。
TILを実験用のT25フラスコに入れる直前に、TILを、以下の通り1:10に希釈して1.3×10細胞/mLの最終濃度にした。
MACS GMP CD3ピュア(OKT3)作用溶液を調製する。OKT3のストック溶液(1mg/mL)を4℃の冷蔵庫から取り出し、BSCに入れた。mini-REPの培地では、最終濃度30ng/mLのOKT3を使用した。
実験の各T25フラスコ内の20mLに対して600ngのOKT3が必要であり、これは、20mL毎に60μLの10μg/mL溶液、または各フィーダーロットについて試験した6つのフラスコすべてで360μLに相当する。
試験した各フィーダーロットについて、400μLの1:100希釈の1mg/mL OKT3を、10μg/mLの作業濃度で作製した(例えば、4つのフィーダーロットを一度に試験する場合、1600μLの1:100希釈の1mg/mL OKT3:16μLの1mg/mL OKT3+3000IU/mLのIL-2を含む1.584mLのCM2培地を作製する)。
T25フラスコを調製する。フィーダー細胞を調製する前に、各フラスコにラベルを付け、フラスコにCM2培地を充填した。フラスコを37℃の加湿した5% COインキュベーターに入れ、残りの成分を添加するのを待つ間、培地を保温した。一旦フィーダー細胞が調製されると、各フラスコ内のCM2に成分が添加される。
Figure 2024512029000040
フィーダー細胞を調製する。このプロトコルについて試験されたロット当たり78×10フィーダー細胞の最小値が必要であった。SDBBによって凍結された各1mLバイアルは、凍結時に100×10個の生細胞を有していた。液体Nストレージからの解凍時の50%の回収率を仮定すると、ロット当たり少なくとも2つの1mLバイアルのフィーダー細胞を解凍して、各REPに推定100×10個の生細胞を与えることが推奨された。あるいは、1.8mLバイアルで供給された場合、1つのバイアルだけで十分なフィーダー細胞が提供された。
フィーダー細胞を解凍する前に、試験される各フィーダーロットにIL-2を含まないおよそ50mLのCM2を予熱した。指定されたフィーダーロットバイアルをLN2ストレージから取り出し、ジッパーストレージバッグに入れ、氷上に置いた。37℃の水浴に浸すことによって、閉じたジッパーストレージバッグ内のバイアルを解凍した。バイアルをジッパーバッグから取り出し、70% EtOHでスプレーまたはワイプし、BSCに移した。
トランスファーピペットを使用して、フィーダーバイアルの内容物を、50mLのコニカルチューブ中の30mLの温かいCM2に直ちに移した。バイアルを少量のCM2で洗浄して、バイアル内のいかなる残留細胞も除去し、400×CFで5分間遠心分離した。上清を吸引し、3000IU/mLのIL-2を加えた4mLの温かいCM2に再懸濁した。自動セルカウンターを使用して細胞を計数するために、200μLを取り出した。計数を記録した。
3000IU/mLのIL-2を加えた温かいCM2中、1.3×10細胞/mLで細胞を再懸濁した。TIL細胞を1.3×10細胞/mLから1.3×10細胞/mLに希釈した。
共培養物を準備する。TIL細胞を1.3×10細胞/mLから1.3×10細胞/mLに希釈した。4.5mLのCM2培地を15mLのコニカルチューブに添加した。インキュベーターからTIL細胞を取り出し、10mLの血清ピペットを使用して十分に再懸濁した。1.3×10細胞/mLのTIL懸濁液から0.5mLの細胞を取り出し、15mLのコニカルチューブ中の4.5mLの培地に添加した。TILストックバイアルをインキュベーターに戻した。よく混ぜた。第2のTIL株に対して繰り返した。
単一フィーダーロット用に予熱した培地を入れたフラスコを、インキュベーターからBSCに移した。1mLのピペットチップで数回上下にピペッティングすることによってフィーダー細胞を混合し、そのフィーダーロットの各フラスコに1mL(1.3×10細胞)を移した。60μLのOKT3作用ストック(10μg/mL)を各フラスコに追加した。2つの対照フラスコをインキュベーターに戻した。
各TILロットの1mL(1.3×10)を、対応するラベルの付いたT25フラスコに移した。フラスコをインキュベーターに戻し、直立させてインキュベートした。5日目まで乱さなかった。試験したすべてのフィーダーロットについて、この手順を繰り返した。
5日目、培地変更。3000IU/mLのIL-2を含むCM2を調製した。各フラスコに10mLが必要である。10mLピペットを使用して、3000IU/mLのIL-2を含む10mLの温かいCM2を各フラスコに移した。フラスコをインキュベーターに戻し、7日目まで直立させてインキュベートした。試験したすべてのフィーダーロットについて繰り返した。
7日目、採取。インキュベーターからフラスコを取り出し、BSCに移し、フラスコの底部の細胞層を乱さないように注意する。フラスコの底部で成長する細胞を乱すことなく、各試験フラスコから10mLの培地を取り出し、対照フラスコの各々から15mLの培地を取り出した。
10mLの血清ピペットを使用して、残りの培地に細胞を再懸濁し、よく混合して細胞の塊をすべて破壊した。ピペッティングすることによって細胞懸濁液を完全に混合した後、細胞計数のために200μLを取り出した。自動セルカウンター装置とともに適切な標準操作手順を使用して、TILを計数した。7日目に計数を記録した。試験したすべてのフィーダーロットについて、この手順を繰り返した。
フィーダー対照フラスコは、複製不全について評価し、TILを含有するフラスコは、0日目からの倍率拡張について評価した。
7日目、フィーダー対照フラスコの14日目までの継続。フィーダー対照フラスコの7日目の計数を完了した後、3000IU/mLのIL-2を含む15mLの新鮮なCM2培地を対照フラスコの各々に追加した。対照フラスコをインキュベーターに戻し、14日目まで直立位置でインキュベートした。
14日目、フィーダー対照フラスコの長期非増殖。インキュベーターからフラスコを取り出し、BSCに移し、フラスコの底部の細胞層を乱さないように注意した。フラスコの底部で成長する細胞を乱すことなく、各対照フラスコからおよそ17mLの培地を取り出した。5mLの血清ピペットを使用して、残りの培地に細胞を再懸濁し、よく混合して細胞の塊をすべて破壊した。各フラスコについて、容量を記録した。
ピペッティングすることによって細胞懸濁液を完全に混合した後、細胞計数のために200μLを取り出した。TILは、自動セルカウンター装置と併せて適切な標準操作手順を使用して計数し、計数を記録した。試験したすべてのフィーダーロットについて、この手順を繰り返した。
B.結果及び承認基準プロトコル
結果。ガンマ線照射の線量は、フィーダー細胞を複製不全にするのに十分であった。すべてのロットは、評価基準を満たすことが予想され、また0日目と比較して、REP培養の7日目に残っているフィーダー細胞の総有効数の低減を示した。すべてのフィーダーロットは、REP培養の7日目までのTIL成長の100倍拡張の評価基準を満たすことが予想された。フィーダー対照フラスコの14日目の計数は、7日目に見られた非増殖傾向を継続すると予想された。
承認基準。フィーダー細胞の各ロットについて試験された各複製TIL株について、以下の承認基準が満たされた。承認基準は、以下の表37に示されるように、2倍であり、これは、本明細書に記載の方法を使用して、効力アッセイ承認基準と組み合わせてもよい。
Figure 2024512029000041
30ng/mLのOKT3抗体及び3000IU/mLのIL-2の存在下で培養した場合に、MNCフィーダー細胞の複製を不全にするのに十分な放射線量を評価した。複製不全は、REPの7日目及び14日目の自動細胞計数によって決定された総生細胞数(TVC)によって評価した。
承認基準は、「成長なし」であり、これは、REPの0日目に培養された最初の生細胞数から7日目及び14日目に総生細胞数が増加していないことを意味する。
フィーダー細胞がTIL拡張をサポートする能力を評価した。TIL成長は、REPの0日目の培養開始からREPの7日目までの生細胞の倍率拡張の観点から測定された。自動細胞計数によって評価されるように、7日目に、TIL培養物は最低100倍の拡張を達成した(すなわち、REPの0日目に培養された生TIL細胞の総数の100倍超)。
承認基準を満たさないMNCフィーダーロットの偶発性試験。MNCフィーダーロットが上で概説された承認基準のうちのいずれかを満たさなかった場合は、以下のステップを実行してロットを再試験し、単純な実験者エラーを原因として除外する。
ロットの衛星試験バイアルが2つ以上残っている場合は、ロットを再試験した。ロットの衛星試験バイアルが1つ残っているか、まったく残っていない場合、上記の承認基準に従ってロットは失敗であった。
適格となるには、問題のロット及び対照ロットが、上記の承認基準を達成する必要があった。これらの基準を満たすと、ロットは使用のために放出される。
実施例3:ガンマ線照射末梢単核細胞の個々のロットを適格性確認する
この実施例は、本明細書に記載の例示的な方法において同種異系フィーダー細胞として使用するためのガンマ線照射末梢単核細胞(PBMC)の個々のロットを適格性確認するための新規の簡略化された手順を説明する。この実施例は、TILの臨床ロットの産生に使用するための照射されたPBMC細胞ロットの評価のためのプロトコルを提供する。照射された各PBMCロットは、個々のドナーから調製した。100以上の適格性確認プロトコルの過程で、すべての場合において、SDBB(San Diego Blood Bank)からの照射されたPBMCロットは、REPの7日目にTILを100倍より多く拡張することが示された。この修正された適格性確認プロトコルは、SDBBから照射されたドナーPBMCロットに適用することを意図しており、これをさらに試験して、受け取ったガンマ線の線量がそれらを複製不全にするのに十分であることを検証した。14日間にわたって複製不全が維持されたことが実証されると、ドナーPBMCロットは、TILの臨床ロットを産生するための使用に「適格」であるとみなされた。
TILの現在の標準REPには、γ線を照射し、成長を停止させたPBMCが必要であった。PBMCの膜受容体は、抗CD3(クローンOKT3)抗体に結合し、培養中のTILに架橋し、TILを刺激して拡張させる。PBMCロットは、個々のドナーから採取した全血の白血球アフェレーシスから調製した。白血球アフェレーシス産物を、Ficoll-Hypaque上で遠心分離し、洗浄し、照射し、GMP条件下で凍結保存した。
TIL療法を受けた患者には、移植片対宿主病(GVHD)を引き起こす可能性があるため、生きたPBMCを注入しないことが重要である。したがって、ドナーPBMCは、細胞にγ線を照射することによって成長を停止させ、再培養時に二本鎖DNA切断が起こり、PBMCの細胞生存性が喪失する。
照射されたPBMCロットの評価基準は、それらの複製不全であった。
フィーダーロットは、直立したT25組織培養フラスコを使用して、TILと共培養するかのようにmini-REP形式で試験した。対照ロットは、評価基準を満たすことが歴史的に示されている照射されたPBMCの1ロットであり、対照として実験ロットと並行して実行した。試験した照射ドナーPBMCの各ロットについて、複製したフラスコを実行した。
実験プロトコル-0日目。試験されるドナーPBMCの各ロットに対して約90mLのCM2培地を調製した。CM2を37℃の水浴中で保温した。6×10IU/mLのIL-2のアリコートを解凍した。CM2培地をBSCに戻し、フードに入れる前に70% EtOHで拭いた。試験したPBMCの各ロットについて、約60mLのCM2を別個の滅菌ボトルに取り出した。解凍した6×10IU/mLストック溶液からのIL-2をこの培地に添加し、最終濃度を3000IU/mLにした。このボトルに「CM2/IL2」(または同様のもの)のラベルを付けて、補足されていないCM2と区別した。
OKT3を調製する。抗CD3(OKT3)のストック溶液を4℃の冷蔵庫から取り出し、BSCに入れた。mini-REPの培地では、最終濃度30ng/mLのOKT3を使用した。1mg/mLのストック溶液から抗CD3(OKT3)の10μg/mLの作用溶液を調製した。必要になるまで冷蔵庫に入れた。
試験した各PBMCロットについて、抗CD3(OKT3)ストックの1:100希釈液150μLを調製する。例えば、一度に4つのPBMCロットを試験するために、6μLの1mg/mLストック溶液を3000IU/mLのIL-2で補足された594μlのCM2に添加することによって、600μlの10μg/mL抗CD3(OKT3)を調製する。
フラスコを調製する。フラスコ当たり19mLのCM2/IL-2をラベル付けされたT25フラスコに添加し、細胞を調製しながら37℃の加湿した5% COインキュベーターにフラスコを入れた。
照射されたPBMCを調製する。LN2ストレージから試験されるPBMCロットのバイアルを取得した。これらを-80℃に置くか、または解凍する前にドライアイス上で保持した。解凍される各ロットについて、30mLのCM2(IL-2補充なし)を、50mLのコニカルチューブに入れた。解凍されるPBMCの異なるロット番号で各管にラベルを付けた。管にキャップをしっかりと閉め、使用する前に37℃の水浴に入れた。必要に応じて、50mLのコニカルチューブをBSCに戻し、フードに入れる前に70% EtOHで拭いた。
バイアルPBMCを冷蔵から取り出し、37℃の水浴中のフローティングチューブラックに入れて解凍する。少量の氷がバイアルに残るまで解凍を進めた。滅菌トランスファーピペットを使用して、バイアルの内容物を、50mLのコニカルチューブ内の30mLのCM2にすぐに移した。約1mLの培地を管から取り出してバイアルをすすぎ、すすぎ液を50mLのコニカルチューブに戻した。キャップをしっかりと閉め、穏やかに回転させて細胞を洗浄した。
400×gで5分間、室温で遠心分離した。上清を吸引し、1000μLのピペットチップを使用して、細胞ペレットを1mLの温かいCM2/IL-2に再懸濁した。代替的に、培地を添加する前に、キャップをした管を空のチューブラックに沿って引きずることにより、細胞ペレットを再懸濁した。細胞ペレットを再懸濁した後、CM2/IL-2培地を使用して体積を4mLにした。体積を記録した。
自動セルカウンターを使用して細胞を計数するために、少量のアリコート(例えば、100μL)を取り出した。特定の自動セルカウンターSOPに従って、重複して計数を行った。細胞の計数を行う前に、PBMCの希釈を行う必要があった可能性が最も高い。推奨される開始希釈は1:10であったが、これは使用するセルカウンターのタイプによって異なっていた。計数を記録した。
CM2/IL-2培地を使用して、PBMCの濃度を1.3×10細胞/mLに調整した。穏やかに回転させるか、または血清ピペットを使用して上下に穏やかに吸引することによってよく混ぜた。
培養フラスコを準備する。2つのラベル付きT25フラスコを、組織培養インキュベーターからBSCに戻した。抗CD3/OKT3の10μg/mLバイアルをBSCに戻した。各フラスコに1mLの1.3×10PBMC細胞懸濁液を添加した。各フラスコに60μLの10μg/mL抗CD3/OKT3を添加した。キャップをしたフラスコを組織培養インキュベーターに戻し、乱すことなく14日間成長させた。次のロットで必要になるまで、抗CD3/OKT3バイアルを冷蔵庫に戻した。評価されるPBMCの各ロットについて繰り返した。
14日目、PBMCの非増殖の測定。複製したT25フラスコをBSCに戻した。各フラスコについて、新鮮な10mLの血清ピペットを使用して、各フラスコから約17mLを取り出し、残りの培地を注意深く引き上げて、フラスコに残っている体積を測定した。体積を記録した。
同じ血清ピペットを使用して上下にピペッティングすることによって、試料をよく混ぜた。
計数するために各フラスコから200μLの試料を取り出した。自動セルカウンターを使用して細胞を計数した。各ステップを、評価されるPBMCの各ロットについて繰り返した。
結果。γ線照射の線量は、フィーダー細胞を複製不全にするのに十分であると予想された。すべてのロットは、評価基準を満たすことが予想され、0日目と比較して、REP培養の14日目に残っているフィーダー細胞の総有効数の低減を示した。
承認基準。試験した各照射ドナーPBMCロットについて、以下の承認基準が満たされた:「成長なし」-14日目の生細胞の総数が、REPの0日目に培養された最初の生細胞数よりも少なかったことを意味する。
承認基準を満たさないMNCフィーダーロットの偶発性試験。照射ドナーPBMCロットが上記の承認基準を満たさなかった場合は、以下のステップを実行してロットを再試験し、単純な実験者エラーを失敗の原因として除外した。ロットの衛星試験バイアルが2つ以上残っている場合は、ロットを再試験した。ロットの衛星バイアルが1つ残っているか、まったく残っていない場合は、上記の承認基準に従ってロットが失敗した。
適格となるために、偶発性試験を通過するPBMCロットは、対照ロット及び問題のロットの両方の複製がともに承認基準を達成した。この基準を満たすと、ロットは使用のために放出された。
実施例4:IL-2ストック溶液の調製
この実施例は、精製されて凍結乾燥された組換えヒトインターロイキン-2を、rhIL-2の使用を含むものを含む、本出願及び実施例に記載されるものすべてを含む、さらなる組織培養プロトコルでの使用に好適なストック試料に溶解するプロセスを説明する。
手順。0.2%酢酸溶液(HAc)を調製した。29mLの滅菌水を、50mLのコニカルチューブに移した。1mLの1N酢酸を、50mLのコニカルチューブに追加した。チューブを2~3回反転させながら十分に混合した。Steriflipフィルターを使用した濾過によってHAc溶液を滅菌した。
PBS中の1% HSAを調製する。4mLの25% HSAストック溶液を、150mLの滅菌フィルターユニット内の96mLのPBSに追加した。溶液を濾過した。4℃で保管した。調製したrhIL-2の各バイアルについて、フォームに記入する。
rhIL-2ストック溶液を調製した(最終濃度6×10IU/mL)。rhIL-2の各ロットは異なり、必要な情報は、以下のような製造業者の分析証明書(COA)に見出された:1)バイアル当たりのrhIL-2の質量(mg)、2)rhIL-2の比活性(IU/mg)、及び3)推奨0.2% HAc再構成体積(mL)。
以下の等式を使用して、rhIL-2ロットに必要な1%HSAの体積を計算した。
Figure 2024512029000042
例えば、rhIL-2ロット10200121(Cellgenix)のCOAによると、1mgバイアルの比活性は、25×10IU/mgである。rhIL-2を2mLの0.2%HAc中で再構成することが推奨される。
Figure 2024512029000043
IL-2バイアルのゴム栓をアルコールワイプで拭いた。3mLシリンジに取り付けた16G針を使用して、推奨体積の0.2% HAcをバイアルに注入した。針を抜くときに栓が外れないように注意した。バイアルを3回反転させ、すべての粉末が溶解するまで回転させた。栓を慎重に取り外し、アルコールワイプ上に置いた。計算された容量の1% HSAをバイアルに添加した。
rhIL-2の保管:短期保管(72時間未満)の場合、4℃でバイアルを保管した。長期保管(72時間超)の場合、バイアルをより小さい体積に等分し、使用の準備が整うまで-20℃でクライオバイアル内で保管した。凍結/解凍サイクルを回避した。調製日から6ヶ月後に有効期限が切れた。RhIL-2ラベルには、ベンダー及びカタログ番号、ロット番号、有効期限、オペレーターのイニシャル、濃度、ならびにアリコートの体積が含まれた。
実施例5:凍結保存プロセス
この実施例では、CryoMed制御速度冷凍庫、モデル7454(Thermo Scientific)を使用して、本明細書に記載の手順で調製したTILの凍結保存プロセス方法について説明する。
使用した機器は以下の通りであった:アルミニウムカセットホルダーラック(CS750フリーザーバッグに対応)、750mLバッグ用凍結保存カセット、低圧(22psi)液体窒素タンク、冷蔵庫、熱電対センサー(バッグ用リボンタイプ)、及びCryoStore CS750冷凍バッグ(OriGen Scientific)。
凍結プロセスは、核形成から-20℃まで0.5℃の速度、及び-80℃の終了温度まで毎分1℃の冷却速度を提供する。プログラムパラメータは、以下の通りである:ステップ1-4℃で待つ、ステップ2:-4℃まで1.0℃/分(試料温度)、ステップ3:-45℃まで20.0℃/分(チャンバ温度)、ステップ4:-10.0℃まで10.0℃/分(チャンバ温度)、ステップ5:-20℃まで0.5℃/分(チャンバ温度)、及びステップ6:-80℃まで1.0℃/分(試料温度)。
実施例6:GEN2及びGEN3の例示的なプロセス
この実施例は、Gen2及びGen3のプロセスを示す。Gen2プロセス及びGen3プロセスのTILは、一般に腫瘍の外科的切除によって個々の患者から得られ、その後、エクスビボで拡張された自己TILで構成されている。Gen3プロセスのプライミングによる第1の拡張ステップは、インターロイキン-2(IL-2)及びモノクローナル抗体OKT3の存在下での細胞培養であり、照射された末梢血単核細胞(PBMC)の足場上のT細胞共受容体CD3を標的とする。例示的なGen2プロセスは、米国特許第11,083,752号及び同第11,168,304号に記載されており、これらの開示は参照により本明細書に組み込まれ、これらの開示は、PBMCをaAPCまたはThp1細胞もしくはU937細胞などの本明細書の他の箇所に記載される抗原提示細胞と置き換えるように修飾されてもよく、任意選択で遺伝子修飾されてもよく、任意選択で照射されてもよい。
Gen2 TIL製品の製造は、2つの相からなる:1)急速拡張前(REP前)及び2)急速拡張プロトコル(REP)。REP前中に、切除腫瘍を、各寸法2~3mmの50個以下の断片に切断し、血清含有培養培地(10% HuSABを補充したRPMI1640培地)及び6,000IU/mLのインターロイキン-2(IL-2)で11日間培養した。11日目にTILを採取し、大規模二次REP拡張に導入した。REPは、5日間の3000IU/mLのrhIL-2を補充した5L体積のCM2中の150μgのモノクローナル抗CD3抗体(OKT3)を装填した5×10個の照射された同種異系PBMCフィーダー細胞(または任意選択で遺伝子修飾され、任意選択で照射されたThp1細胞もしくはU937細胞などの、aAPCもしくは本明細書の他の箇所に記載される抗原提示細胞)の共培養におけるREP前由来の200×10個以下の生細胞の活性化からなる。16日目に、培養物を90%減容し、細胞画分を1フラスコ当たり1×10以上の生リンパ球で複数のG-Rex-500フラスコに分割し、CM4で5LにQSする。TILをさらに6日間インキュベートする。REPを22日目に採取し、洗浄し、製剤化し、凍結保存した後に、注入のために臨床現場に-150℃で発送する。
Gen3 TIL製品の製造は、3つの相からなる:1)プライミングによる第1の拡張プロトコル、2)急速な第2の拡張プロトコル(急速拡張相またはREPとも称される)、及び3)継代培養分割。プライミングによる第1の拡張TIL増殖を行うために、切除した腫瘍を各寸法2~3mm以下の120個以下の断片に切断した。プライミングによる第1の拡張の0日目に、OKT-3を装填したおよそ2.5×10個の照射された同種異系PBMCフィーダー細胞のフィーダー層を、3つの100MCS容器の各々内のおよそ100cmの表面積上に確立した。腫瘍断片を、各々が500mLの血清含有CM1培養培地及び6,000IU/mLのインターロイキン-2(IL-2)及び15ugのOKT-3を含む3つの100MCS容器に分布し、その中で7日間培養した。7日目に、OKT-3を装填したおよそ5×10個の照射された同種異系PBMCフィーダー細胞の追加のフィーダー細胞層を、3つの100MCS容器の各々内の腫瘍断片化培養相に組み込み、500mLのCM2培養培地及び6,000IU/mLのIL-2及び30μgのOKT-3で培養することによって、REPを開始した。REPの開始を、100MCS容器へのOKT3を装填したフィーダー細胞の閉鎖系流体移送を使用して、同じ容器内のプライミングによる第1の拡張培養物全体を活性化することによって増強した。Gen3の場合、TILのスケールアップまたは分割に、細胞培養物全体を閉鎖系流体移送によってより大きい容器にスケーリングし、移し(100Mフラスコから500Mフラスコに)、追加の4LのCM4培地を添加するプロセスステップを含めた。16日目にREP細胞を採取し、洗浄し、製剤化し、凍結保存した後に、注入のために臨床現場に-150℃で発送する。PBMCの代わりに、任意選択で遺伝子修飾され、任意選択で照射されたThp1またはU937細胞などの、aAPCまたは本明細書の他の箇所に記載される抗原提示細胞を用いてもよい。
全体として、Gen3プロセスは、より短く、よりスケーラブルであり、かつ簡単に修正可能な拡張プラットフォームであり、堅牢な製造及びプロセス比較可能性に適するように適応する。
Figure 2024512029000044
0日目に、両方のプロセスについて、腫瘍を3回洗浄し、断片をランダム化し、2つのプールに分けた(プロセス毎に1つのプール)。Gen2プロセスの場合、断片を、6,000IU/mLのrhIL-2を含有する1LのCM1培地を含む1つのGREX 100MCSフラスコに移した。Gen3プロセスでは、断片を、6,000IU/mLのrhIL-2、15ugのOKT-3及び2.5×10個のフィーダー細胞を含有する500mLのCM1を含む1つのG-Rex 100MCSフラスコに移した。Rep開始日のTILの播種は、各プロセスに従って異なる日に起こった。G-Rex 100MCSフラスコを90%減容したGen2プロセスの場合、収集した細胞懸濁液を新たなG-Rex 500MCSに移して、IL-2(3000IU/mL)+5×10フィーダー細胞及びOKT-3(30ng/mL)を含有するCM2培地中で11日目にREPを開始した。細胞を拡張し、プロトコルに従って16日目にIL-2(3000IU/mL)を含有するCM4培地を含む複数のG-Rex 500MCSフラスコに分割した。その後、培養物を採取し、プロトコルに従って22日目に凍結保存した。Gen3プロセスの場合、REPの開始は7日目に起こり、同じG-Rex 100MCSをREPの開始に使用した。簡潔には、IL-2(6000IU/mL)及び5×10個のフィーダー細胞を30ugのOKT-3とともに含有する500mLのCM2培地を各フラスコに添加した。9~11日目に、培養をスケールアップした。G-Rex 100Mの全体積(1L)をG-Rex 500MCSに移し、IL-2(3000IU/mL)を含有する4LのCM4を添加した。フラスコを5日間インキュベートした。培養物を採取し、16日目に凍結保存した。
比較には、2つの肺腫瘍(L4054及びL4055)と1つの黒色腫腫瘍(M1085T)の3つの異なる腫瘍を含めた。
L4054及びL4055の場合、CM1培地(培養培地1)、CM2培地(培養培地2)、及びCM4培地(培養培地4)を事前に調製し、4℃で保持した。CM1培地及びCM2培地を、培地を濾過した場合の細胞増殖と培地を濾過しなかった場合の細胞増殖を比較するために、濾過せずに調製した。
L4055腫瘍の場合、REPの開始及びスケールアップ時に、培地を事前に37℃で最大24時間温めた。
結果。達成された生細胞の総数について、Gen3の結果はGen2の30%以内であった。Gen3最終製品は、再刺激後により高いINF-γ産生を示した。Gen3最終製品は、存在する固有の全CDR3配列によって測定される、増加したクローンの多様性を示した。Gen3最終製品は、より長い平均テロメア長を示した。
Gen2及びGen3プロセスでのREP前及びREP拡張は、上記の手順に従った。各腫瘍について、2つのプールに同数の断片を含めた。腫瘍のサイズが小さいため、1フラスコ当たりの最大断片数は達成されなかった。総REP前細胞(TVC)を採取し、Gen2プロセスの場合は11日目に、Gen3プロセスの場合は7日目に計数した。2つのREP前群を比較するために、細胞計数を培養物中に提供された断片の数で割り、1断片当たりの平均生細胞を計算した。以下の表39に示されるように、Gen2プロセスは、Gen3プロセスと比較して、1断片当たりより多くの細胞を一貫して成長させた。REP前TVCを7で割り、その後、11を掛けて計算した、11日目にGen3プロセスで予想されるTVC数の外挿計算。
Figure 2024512029000045
Gen2及びGen3プロセスの場合、TVCをプロセス条件毎に計数し、生細胞パーセントをプロセス日毎に生成した。採取時に、22日目(Gen2)及び16日目(Gen3)の細胞を収集し、TVC数を確立した。その後、TVCを0日目に提供された断片の数で割り、1断片当たりの平均生細胞を計算した。倍率拡張を、採取したTVCをREP開始TVCで割ることによって計算した。表40に示されるように、Gen2とGen3を比較すると、倍率拡張はL4054の場合では同様であり、L4055の場合、倍率拡張はGen2プロセスの方が高かった。具体的には、この場合、培地をREP開始日の前に24温めた。M1085Tの場合のGen3でもより高い倍率拡張が観察された。REP TVCを16で割り、その後、22を掛けて計算した、22日目にGen3プロセスで予想されるTVC数の外挿計算。
Figure 2024512029000046
採取時に、最終TIL REP製品を生存率%の放出基準と比較した。Gen2及びGen3プロセスのすべての条件は、70%の生存率基準を超えており、プロセス及び腫瘍間で同等であった。
Figure 2024512029000047
1フラスコ当たりの断片の数が最大必要数未満であったため、採取日の推定細胞計数を腫瘍毎に計算した。推定は、臨床腫瘍が0日目に2つまたは3つのフラスコに播種するのに十分な大きさであるという予想に基づいた。

Figure 2024512029000048
免疫表現型決定-TIL最終製品の表現型マーカー比較。3つの腫瘍L4054、L4055、及びM1085Tは、Gen2及びGen3プロセスの両方でTIL拡張を受けた。採取時に、REP TIL最終製品をフローサイトメトリー分析にかけ、純度、分化、及びメモリーマーカーを試験した。すべての条件で、TCR a/b+細胞パーセンテージは90%超であった。
Gen3プロセスから採取したTILは、Gen2プロセスから採取したTILと比較して、より高いCD8及びCD28発現を示した。Gen2プロセスは、より高いCD4+パーセンテージを示した。
Gen3プロセスから採取したTILは、Gen2プロセス由来のTILと比較して、セントラルメモリー区画でより高い発現を示した。
活性化及び疲弊マーカーを2つの腫瘍L4054及びL4055由来のTILで分析して、Gen2及びGen3 TIL拡張プロセス由来の最終TIL製品を比較した。活性化及び疲弊マーカーは、Gen2プロセスとGen3プロセスとの間で同等であった。
再刺激時のインターフェロンγ分泌。採取日、Gen2の場合は22日目、Gen3の場合は16日目に、TILは、L4054及びL4055の場合、コーティングした抗CD3プレートで一晩再刺激を受けた。M1085Tでの再刺激は、抗CD3、CD28、及びCD137ビーズを使用して行った。すべての条件で再刺激の24時間後に上清を収集し、上清を凍結させた。ELISAによるIFN-γ分析を、同じELISAプレートを使用して両方のプロセス由来の上清で同時に評価した。分析した3つの腫瘍で、Gen3プロセスからのIFN-γのより高い産生が観察された。
培養培地中のIL-2レベルの測定。Gen2プロセスとGen3プロセスとの間のIL-2消費量を比較するために、腫瘍L4054及びL4055で、REPの開始時、スケールアップ時、及び採取日に細胞上清を収集した。細胞培養上清中のIL-2の量を、R&D製の定量化ELISAキットによって測定した。一般的な傾向は、Gen2プロセスと比較して、Gen3プロセスではIL-2濃度が高いままであることを示す。これは、プロセス全体を通して培地のキャリーオーバーと相まってGen3のREP開始時のIL-2濃度がより高い(6000IU/mL)ことに起因する可能性がある。
代謝基質及び代謝物分析。D-グルコース及びL-グルタミンなどの代謝基質のレベルを、全培地消費量の代わりに測定した。乳酸及びアンモニアなどのそれらの相互代謝物を測定した。グルコースは、ATPの形態でエネルギーを産生するためにミトコンドリアによって利用される培地中の単糖である。グルコースが酸化されると、乳酸が産生される(乳酸塩は乳酸のエステルである)。乳酸塩は、細胞の指数関数的成長期中に強く産生される。高レベルの乳酸塩は、細胞培養プロセスに悪影響を及ぼす。
L4054及びL4055の使用済み培地を、Gen2プロセス及びGen3プロセスの両方で、REP開始時、スケールアップ時、及び採取日に収集した。使用済み培地の収集は、Gen2の場合は11日目、16日目、及び22日目、Gen3の場合は7日目、11日目、及び16日目であった。上清を、グルコース、乳酸、グルタミン、GlutaMax、及びアンモニアの濃度についてCEDEXバイオアナライザーで分析した。
L-グルタミンは、細胞培養培地製剤に必要な不安定な必須アミノ酸である。グルタミンにはアミンが含まれており、このアミド構造基は、窒素を細胞に輸送して送達することができる。L-グルタミンが酸化すると、細胞によって有毒なアンモニア副産物が産生される。L-グルタミンの分解に対抗するために、Gen2及びGen3プロセスの培地に、水溶液中でより安定しており、かつ自発的に分解しないGlutamaxを補充した。2つの腫瘍株では、Gen3アームは、プロセス中のL-グルタミン及びGlutamaxの減少、ならびにREP全体でアンモニアの増加を示した。Gen2アームでは、L-グルタミン及びGlutamaxの濃度が一定であり、アンモニア産生のわずかな増加が観察された。Gen2及びGen3のプロセスは、アンモニアについて採取日に同等であり、L-グルタミン分解にわずかな違いが見られた。
テロメアは、Flow-FISHによって繰り返される。Flow-FISH技術を使用して、Gen2及びGen3プロセスでのL4054及びL4055のテロメア反復の平均長を測定した。相対テロメア長(RTL)の決定を、DAKO製のフローサイトメトリー分析用Telomere PNAキット/FITCを使用して計算した。Gen3は、Gen2と同等のテロメア長を示した。
CD3分析。各プロセスで生成された細胞製品のクローン多様性を決定するために、L4054及びL4055の採取したTIL最終製品をサンプリングし、T細胞受容体のCDR3部分の配列決定によるクローン多様性分析のためにアッセイした。
表43は、採取したTIL細胞製品のL4054における共有される固有のCDR3配列パーセンテージに関するGen2とGen3との比較を示す。199個の配列がGen3最終製品とGen2最終製品との間で共有され、Gen3最終製品と共有されるGen2由来の固有のCDR3配列の上位80%の97.07%に相当する。

Figure 2024512029000049
表44は、採取したTIL細胞製品のL4055における共有される固有のCDR3配列パーセンテージに関するGen2とGen3との比較を示す。1833個の配列がGen3最終製品とGen2最終製品との間で共有され、Gen3最終製品と共有されるGen2由来の固有のCDR3配列の上位80%の99.45%に相当する。
Figure 2024512029000050
CM1及びCM2培地は、濾過せずに事前に調製し、腫瘍L4055の場合、Gen2及びGen3プロセスで使用するまで4℃で保持した。
Gen2及びGen3プロセスのREP開始日に、腫瘍L4055の場合、培地を37℃で事前に24時間温めた。
これらのプロセスで収集した上清中にLDHは測定されなかった。
M1085T TIL細胞計数を、K2 cellometerセルカウンターを使用して実行した。
腫瘍M1085Tでは、代謝分析用の上清、活性化及び疲弊マーカー分析用のTIL製品、テロメア長、及びCD3-TCRvb分析などの試料は入手できなかった。
結論。この実施例では、3つの独立したドナー腫瘍組織を、機能的品質属性に加えて、拡張された表現型特徴付け、ならびにGen2プロセス及びGen3プロセス間の培地消費に関して比較する。
Gen2とGen3のREP前及びREP拡張比較を、生成された総生細胞及び全有核細胞集団の生存率に関して評価した。採取日のTVC細胞用量は、Gen2(22日)とGen3(16日)との間で同等ではなかった。Gen3細胞用量は、採取時に収集した総生細胞の約40%であり、Gen2よりも低かった。
REP前採取は、7日目ではなく11日目に起こり、REP採取は、16日目ではなく22日目に起こると仮定して、Gen3プロセスの外挿細胞数を計算した。どちらの場合も、Gen3は、Gen2プロセスと比較してTVCの数値が近いことを示し、これは初期の活性化により、TILの成長に対する全体的な性能が向上する可能性があることを示す。
Gen3プロセスでの追加フラスコ(2つまたは3つ)の外挿値の場合、処理される腫瘍サイズがより大きいと仮定し、記載されるようにプロセス毎に必要な最大断片数に到達する。22日目のGen2プロセスと比較して、Gen3プロセスの16日目の採取時にTVCで同様の用量に到達可能であり得ることが観察された。この観察は重要であり、培養物の初期活性化により、より短い処理時間でより良好なTIL性能が可能になり得ることを示す。
Gen2とGen3のREP前及びREP拡張比較を、生成された総生細胞及び全有核細胞集団の生存率に関して評価した。採取日のTVC細胞用量は、Gen2(22日)とGen3(16日)との間で同等ではなかった。Gen3細胞用量は、採取時に収集した総生細胞の約40%であり、Gen2よりも低かった。
表現型特徴付けに関して、Gen2プロセスと比較してGen3プロセスでの3つの腫瘍でより高いCD8+及びCD28+発現が観察された。このデータは、Gen3プロセスがGen2と比較して改善されたTIL最終製品の属性を有することを示す。
Gen3プロセスは、Gen2プロセスと比較してわずかに高いセントラルメモリー区画を示した。
Gen2プロセス及びGen3プロセスは、Gen3プロセスの持続期間がより短いにもかかわらず、同等の活性化及び疲弊マーカーを示した。
IFNガンマ(IFN-γ)産生は、分析した3つの腫瘍において、Gen2と比較してGen3最終製品において3倍高かった。このデータは、Gen3プロセスがGen2プロセスと比較して高機能でより強力なTIL製品を生成したことを示し、Gen3でのCD8及びCD28発現がより高いことに起因する可能性がある。表現型特徴付けは、Gen2プロセスと比較して3つの腫瘍でCD8+、CD28+発現へのGen3の肯定的な傾向を示唆した。
Gen2とGen3との間のTIL最終製品のテロメア長は同等であった。
グルコース及び乳酸塩レベルは、Gen2最終製品とGen3最終製品との間で同等であり、プロセス日毎に減容除去が実行されなかったこと、及びGen2と比較してプロセスにおける培地全体の体積が少ないことに起因して、Gen3プロセスの培地の栄養素レベルが影響されなかったことを示唆する。
全体として、Gen3プロセスは、Gen2プロセスと比較してほぼ2倍の処理時間の短縮を示し、これにより、Gen3プロセスによって拡張されたTIL製品の売上原価(COG)の有意な削減がもたらされるであろう。
IL-2消費は、Gen2プロセスでのIL-2消費の一般的な傾向を示しており、Gen3プロセスでは、古い培地が除去されなかったため、IL-2が高かった。
Gen3プロセスは、CDR3 TCRab配列分析によって測定されたより高いクローン多様性を示した。
Gen3プロセスを使用して、REP前の0日目のフィーダー及びOKT-3の添加により、TILの初期活性化及びTIL成長における全体的により良好な性能が可能になった。
表45は、現在のGen2プロセスと比較したGen3プロセスの様々な実施形態及び成果を説明する。

Figure 2024512029000051
実施例7:0日目のGen3拡張プロセスの例示的な実施形態
腫瘍洗浄培地を調製した。培地を開始前に温めた。5mLのゲンタマイシン(50mg/mL)を500mLボトルのHBSSに添加した。5mLの腫瘍洗浄培地を、OKT3希釈に使用する15mLのコニカルに添加した。室温(RT)で保管する。
フィーダー細胞(PBMC)バッグを調製した。フィーダー細胞をフィーダー細胞バッグに無菌で移し、使用するまで37℃で保管するか、または凍結させた。37℃の場合、フィーダー細胞を計数した。凍結した場合は、解凍した後、フィーダー細胞を計数した。PBMCの代わりに、任意選択で遺伝子修飾され、任意選択で照射されたThp1またはU937細胞などの、aAPCまたは本明細書の他の箇所に記載される抗原提示細胞を用いてもよい。
フィーダー細胞濃度の最適範囲は、5×10~5×10細胞/mLである。4.5mLのAIM-Vを含む4つのコニカルチューブを準備した。各細胞計数について0.5mLの細胞画分を追加した。
総生フィーダー細胞数が1×10細胞以上であった場合、次のステップに進んでフィーダー細胞濃度を調整した。フィーダー細胞の体積を計算し、第1のフィーダー細胞バッグから取り出して、1×10細胞を第2のフィーダー細胞バッグに添加した。
p1000マイクロピペットを使用して、900μLの腫瘍洗浄培地をOKT3アリコート(100μL)に移した。シリンジ及び滅菌技法を使用して、0.6mLのOKT3を吸引し、第2のフィーダー細胞バッグに添加した。培地体積を全体積2Lに調整した。第2のフィーダー細胞バッグをインキュベーターに移した。
OKT3製剤の詳細:OKT3は、100μLアリコート中のバイアル(1mg/mL)からの元のストック濃度でアリコートされ、凍結されてもよい。1mLバイアル当たり約10×アリコート。-80℃で保管した。0日目:15μg/フラスコ、すなわち500mL中30ng/mL~60μL最大約1アリコート。
腫瘍試料を調製した。6ウェルプレート及び100mmペトリ皿(合計4枚)を入手した。6ウェルプレートに「過剰腫瘍片」とラベル付けした。4枚の100mmペトリ皿の各々に「洗浄_01」、「洗浄_02」、「洗浄_03」、「洗浄_04」、及び「保持」とラベル付けした。
5mLの腫瘍洗浄培地を、過剰腫瘍片とラベル付けした6ウェルプレートのすべてのウェルに添加した。解剖中に腫瘍を水和状態に保持する際に、腫瘍洗浄培地をさらなる使用のために利用可能にした。
50mLの腫瘍洗浄培地を、洗浄_01、洗浄_02、洗浄_03、及び保持というラベルの付いた各100mmペトリ皿に添加した。マーカーを使用して、各ペトリ皿に解剖1~解剖4とラベル付けする。腫瘍を洗浄_01で3分間以上、周囲温度でインキュベートした。腫瘍を洗浄_02で3分間以上、周囲温度でインキュベートした。腫瘍を洗浄_03で3分間以上、周囲温度でインキュベートした。洗浄が完了した後、腫瘍を「保持」皿に移して、組織が水和したままであることを確認する。
腫瘍インキュベーションが進行中の間、10mLの腫瘍発送培地を腫瘍発送培地とラベル付けした管に移した。10mLの腫瘍発送培地をシリンジ内に引き込み、各嫌気性及び好気性滅菌ボトルに5mLの腫瘍発送培地を接種した。
解剖プロセス全体を通して、ペトリ皿のふたの下に定規を置いた。腫瘍の長さ及び断片の数を測定し、記録した。腫瘍を4つの中間片に解剖するか、または同等の体積の4つの群に分類し、各中間片の腫瘍構造を保存した。腫瘍片を水和状態で保つ。
組織を水和状態で保つために、活発に解剖されていない中間腫瘍片を保持皿に移した。
解剖皿のふたの下の定規を参照として使用して、腫瘍を27mm断片(3×3×3mm)に解剖した。60個の断片に達するまで中間断片を解剖した。生成した最終断片の数に応じて、最終断片の総数を計数し、G-Rex 100MCSフラスコを調製した(一般に、1フラスコ当たり60個の断片)。
断片チューブ1~断片チューブ4とラベル付けしたコニカルチューブ内に好ましい組織断片を保持した。起源とする断片チューブの数に応じて、フィーダー細胞懸濁液を播種するG-Rex 100MCSフラスコの数を計算した。
フィーダー細胞バッグをインキュベーターから取り出し、G-Rex 100MCSを播種する。D0(0日目)とラベル付けする。
G-Rex-100MCS中の培養物への腫瘍断片の追加。滅菌条件下で、腫瘍断片培養(D0)1とラベル付けしたG-Rex 100MCS及び断片チューブとラベル付けした50mLのコニカルチューブのキャップを緩めた。開いた断片チューブ1を回転させ、同時にG-Rex 100MCSのキャップをわずかに持ち上げた。断片を含む培地を、回転している間にG-Rex 100MCSに添加した。G-Rex 100MCSに移送された断片の数を記録した。
断片がGREXフラスコの底に配置された時点で、7mLの培地を吸引し、7つの1mLアリコートを作製した(拡張された特徴付け用に5mL、滅菌試料用に2mL)。拡張された特徴付け用の5つのアリコート(最終断片培養上清)を、必要になるまで-20℃で保管した。
1本の嫌気性BacT/Alertボトル及び1本の好気性BacT/Alertボトルに各々1mLの最終断片培養上清を接種した。サンプリングしたフラスコ毎に繰り返す。
実施例8:7~8日目のGen3拡張プロセスの例示的な実施形態
フィーダー細胞バッグを調製した。凍結時に37℃の水浴中で3~5分間フィーダーバッグを解凍した。凍結している場合、フィーダー細胞を計数した。
フィーダー細胞濃度の最適範囲は、5×10~5×10細胞/mLである。4.5mLのAIM-Vを含む4つのコニカルチューブを準備した。各細胞計数について0.5mLの細胞画分を新しいクライオバイアル管に追加した。試料を十分に混合し、細胞計数を続けた。
総生フィーダー細胞数が2×10細胞以上であった場合、次のステップに進んでフィーダー細胞濃度を調整した。フィーダー細胞の体積を計算し、第1のフィーダー細胞バッグから取り出して、2×10細胞を第2のフィーダー細胞バッグに追加した。
p1000マイクロピペットを使用して、900μLのHBSSを100μLのOKT3アリコートに移す。上下に3回ピペッティングして混合する。2つのアリコートを調製した。
OKT3製剤の詳細:OKT3は、100μLアリコート中のバイアル(1mg/mL)からの元のストック濃度でアリコートされ、凍結されてもよい。1mLバイアル当たり約10×アリコート。-80℃で保管した。7日目/8日目:30μg/フラスコ、すなわち500mL中60ng/mL~120μl最大約2アリコート。
シリンジ及び滅菌技法を使用して、0.6mLのOKT3を吸引し、フィーダー細胞バッグに添加して、すべて添加されたことを確認した。培地量を合計2Lに調整した。第2のOKT3アリコートで繰り返し、フィーダー細胞バッグに追加した。第2のフィーダー細胞バッグをインキュベーターに移した。
フィーダー細胞懸濁液を含むG-Rex 100MCSフラスコの調製。0日目に生成されたG-Rexフラスコの数に従って処理するためにG-Rex 100MCSフラスコの数を記録した。G-Rexフラスコをインキュベーターから取り出し、第2のフィーダー細胞バッグをインキュベーターから取り出した。
フィーダー細胞懸濁液を添加する前の上清の除去。1本の10mLシリンジをG-Rex 100フラスコに接続し、5mLの培地を吸引した。5つの1mLアリコート(拡張された特徴付け用に5mL)を作製し、分析の要求があるまで、拡張された特徴付け用に5つのアリコート(最終断片培養上清)を-20℃で保管した。G-Rex 100フラスコ毎にラベル付けし、繰り返した。
フラスコの数に応じて、特徴付け用の5~20×1mL試料を調製する:
●5mL=1フラスコ
●10mL=2フラスコ
●15mL=3フラスコ
●20mL=4フラスコ
フィーダー細胞をG-Rex 100MCSに播種し続け、G-Rex 100MCSフラスコ毎に繰り返した。無菌移送法を使用して、各G-Rex 100MCSフラスコに重量で500mLの第2のフィーダー細胞バッグを重力移送し(1g=1mLと想定)、量を記録した。G-Rex 100フラスコ毎に7日目培養とラベル付けし、繰り返した。G-Rex 100MCSフラスコをインキュベーターに移した。
実施例9:10~11日目のGen3拡張プロセスの例示的な実施形態
第1のG-Rex 100MCSフラスコを取り出し、滅菌条件を使用して、10mLシリンジを使用して7mLの前処理培養上清を除去した。7つの1mLアリコートを作製した(拡張された特徴付け用に5mL、滅菌試料用に2mL)。
フラスコを注意深く混合し、新たな10mLシリンジを使用して10mLの上清を取り出し、D10/11マイコプラズマ上清とラベル付けした15mLのチューブに移す。
フラスコを注意深く混合し、新しい注射器を使用して、処理されるフラスコの数に応じて以下の量を除去した。
●1フラスコ=40mL
●2フラスコ=20mL/フラスコ
●3フラスコ=13.3mL/フラスコ
●4フラスコ=10mL/フラスコ
合計40mLをすべてのフラスコから取り出し、「10/11日目QC試料」とラベル付けした50mLのコニカルチューブにプールし、必要になるまでインキュベーター内で保管すべきである。細胞計数を行い、細胞を割り当てた。
必要になるまで-20℃以下で拡張された特徴付けのために5つのアリコート(前処理培養上清)を保管した。1本の嫌気性BacT/Alertボトル及び1本の好気性BacT/Alertボトルに各々1mLの前処理培養上清を接種した。
細胞懸濁液をG-Rex 500MCSに移し、G-Rex 100MCS毎に繰り返した。滅菌条件を使用して、各G-Rex 100MCSの内容物をG-Rex 500MCSに移し、一度に約100mLの液体移送を監視した。G-Rex 100MCSの容量が500mLに低減したとき、移送を停止した。
移送ステップ中、10mLシリンジを使用し、G-Rex 100MCSからシリンジに10mLの細胞懸濁液を吸引した。培養中のフラスコの数に従って指示に従った。1つのフラスコのみの場合:2つのシリンジを使用して合計20mLを取り出した。フラスコが2つの場合:1フラスコ当たり10mLを取り出した。フラスコが3つの場合:1フラスコ当たり7mLを取り出した。フラスコが4つの場合:1フラスコ当たり5mLを取り出した。細胞懸濁液を1本の一般的な50mLのコニカルチューブに移した。細胞計数ステップ及びQC試料までインキュベーター内で保管する。QCに必要な細胞の総数は、約20×10細胞:4×0.5mLの細胞数であった(細胞数を最初に希釈しなかった)。
アッセイに必要な細胞の量は、以下の通りである。
●本明細書に記載されるものなどの効力アッセイ、またはIFN-γもしくはグランザイムBアッセイの場合、最小10×10細胞
●マイコプラズマの場合、1×10細胞
●CD3+/CD45+のフローサイトメトリーの場合、5×10細胞
G-Rex 500MCSフラスコをインキュベーターに移した。
QC試料を調製した。この実施形態のアッセイには少なくとも15×10細胞が必要であった。細胞数及び生存率、マイコプラズマ(1×10細胞/平均生存濃度)、フロー(5×10細胞/平均生存濃度)及びIFN-γアッセイ(5×10細胞~1×10細胞を含み、8~10×10細胞が、IFN-γアッセイに必要である。
10×10細胞/mLで凍結保存のための細胞画分の体積を計算し、調製するバイアルの数を計算した。
実施例10:16~17日目のGen3拡張プロセスの例示的な実施形態
洗浄緩衝液の調製(1% HSA Plasmalyte A)。HSA及びPlasmalyteを5Lバッグに移して、LOVO洗浄緩衝液を作製した。滅菌条件を使用して、総体積125mLの25% HSAを5Lバッグに移し、これを室温で保管した。
10mLまたは40mLの洗浄緩衝液を取り出し、「IL-2 6×10IU/mL」チューブに移した(IL-2を事前に調製した場合は10mL、IL-2を新たに調製した場合は40mL)。
Plasmalyte+1% HSAに添加する再構成IL-2の量を計算した:再構成IL-2の量=(IL-2の最終濃度×最終量)/IL-2の比活性(標準アッセイに基づく)。IL-2の最終濃度は、6×10IU/mLであった。最終体積は、40mLであった。
再構成IL-2に必要なIL-2の計算された初期体積を取り出し、「IL-2 6×10IU/mL」チューブに移した。事前に調製したアリコートから100μLのIL-2 6×10IU/mLを、10mLのLOVO洗浄緩衝液を含有する「IL-2 6×10IU/mL」とラベル付けしたチューブに追加した。
約4500mLの上清をG-Rex 500MCSフラスコから取り出した。残りの上清を回転させ、細胞を細胞収集プールバッグに移した。すべてのG-Rex 500MCSフラスコで繰り返した。
60mLの上清を除去し、マイコプラズマ検出を含む品質管理アッセイのために上清チューブに添加した。+2~8℃で保管した。
細胞収集。細胞を計数した。4.5mLのAIM-Vを含む4つの15mLコニカルチューブを準備する。これらは、事前に準備してもよい。最適な範囲は、5×10~5×10細胞/mLである。(1:10希釈が推奨された)。1:10希釈の場合、事前に調製した4500μLのAIM Vに、500μLのCFを追加する。希釈倍率を記録した。
TC(総細胞)LOVO前(生+死)を計算した=
平均総細胞
濃度(TC濃度LOVO前)
(生+死)
×
ソースバッグの体積
TVC(総生細胞)LOVO前(生)を計算した=
平均総生細胞
濃度(TVC LOVO前)
(生)
×
LOVOソースバッグの体積
総細胞(TC)数が5×10超であった場合、5×10細胞を取り出して、MDA保持試料として凍結保存する。5×10÷平均TC濃度(ステップ14.44)=取り出す体積
総細胞(TC)数が5×10以下であった場合、4×10細胞を取り出して、MDA保持試料として凍結保存する。4×10÷平均TC濃度=取り出す体積。
適切なサイズのシリンジを使用して、LOVOソースバッグから必要な体積を取り出した。凍結保存ステップまでインキュベーター内で保持した。
総細胞数が決定された場合、取り出す細胞の数は、150×10生細胞の保持を可能にすべきである。TVC LOVO前5×10もしくは4×10、または該当なしを確認する。取り出す細胞の体積量を計算した。
バッグに残っている残りの総細胞を計算する。TC(総細胞)LOVO前を[平均総細胞濃度×残りの体積=残りのTC LOVO前]として計算する。
残存する細胞の総数に従って、表46の対応するプロセスを選択する。

Figure 2024512029000052
使用したプロセスに対応して添加するIL-2の量を選択する。次のように計算された体積:保持量×2×300IU/mL=必要とされるIL-2のIU。必要なIL-2のIU/6×10IU/mL=LOVO後バッグに追加するIL-2の体積。添加したすべての体積を記録した。さらなる分析のために試料をクライオバイアル内に得た。
細胞製品を十分に混合した。該当する場合、凍結保存を含むさらなる処理のためにすべてのバッグを密封した。
得られたクライオバイアル試料に対して、内毒素、IFN-γ、無菌性、及び必要に応じて他のアッセイを行った。
実施例11:例示的なGEN3プロセス(GEN3.1とも称される)
この実施例は、「TIL拡張のためのGen2プロセスとGen3プロセスとの間の比較可能性」に関するさらなる研究について説明する。Gen3プロセスを、以前に見られたような表現型及び機能プロファイルを維持しながら、最終総生細胞(TVC)出力をGen2におけるものと同等(またはそれ以上)であるように増やすことを目的として、プロセスの初期に活性化ステップを含むように修正した。
この実施例の範囲は、0日目の培養腫瘍断片に対する活性化ステップを導入によるTVC出力の評価、2つの独立した患者腫瘍にわたってGen3標準及び対照群での機能的かつ拡張された表現型特徴付けに関して比較可能性を実証すること、ならびに処理パラメータが生理学的条件で維持されたことを確認するための培地消費及び代謝物産生の分析を含む。
この実施例のすべての実行は、市販のドナー腫瘍組織を出発材料として使用して、フルスケールプラットフォームで行った。
Gen3実施形態をさらなる実施形態として修正し、本明細書ではこの実施例においてGen3.1と称する。
ある実施形態では、Gen3.1 TIL製造プロセスは、以下の4つのオペレーター介入を有する。
1.腫瘍断片の単離及び活性化:プロセスの0日目に腫瘍を解剖し、最終断片を各々約3×3mm(合計で最大240個の断片)を生成し、1~4つのG-Rex 100MCSフラスコ内で培養した。各フラスコは、最大60個の断片、500mLのCM1またはDM1培地を含有し、6,000IUのrhIL-2、15μgのOKT3、及び2.5×10個の照射した同種異系単核細胞(PBMC)で補充された。培養物を37℃で6~8日間インキュベートした。PBMCの代わりに、任意選択で遺伝子修飾され、任意選択で照射されたThp1またはU937細胞などの、aAPCまたは本明細書の他の箇所に記載される抗原提示細胞を用いてもよい。
2.TIL培養再活性化:7~8日目に、いずれの場合も6,000IUのrhIL-2、30μgのOKT3、及び5×10個の照射した同種異系単核細胞を補充したCM2またはDM1培地をゆっくり添加することによって、培養物を補充した。フラスコの底にある既存の細胞を乱さないように注意した。培養物を37℃で3~4日間インキュベートした。
3.培養のスケールアップ:10~11日目に生じる。培養のスケールアップ中に、G-Rex 100MCSの全内容物を、いずれの場合も3,000IU/mLのIL-2を補充した4LのCM4またはDM2を含むG-Rex 500MCSフラスコに移した。採取するまでフラスコを37℃で5~6日間インキュベートした。
4.採取/洗浄/製剤化:16~17日目に、フラスコを減容させ、プールする。細胞を濃縮し、1%HSAを含有するPlasmaLyte A pH7.4で洗浄した。洗浄した細胞懸濁液を、CryoStor10と1:1の比で配合し、300IU/mLの最終濃度までrhIL-2を補充した。
DPを制御された速度の凍結で凍結保存し、気相液体窒素中で保管した。完全標準TIL培地1、2、または4(CM1、CM2、CM4)は、上記のように、合成培地(DM1またはDM2)と称されるCTS(商標)OpTmizer(商標)T細胞無血清拡張培地の代用となり得る。
プロセスの説明。0日目に、腫瘍を3回洗浄し、その後、3×3×3の最終断片に断片化した。全腫瘍を断片化した時点で、最終断片を均等にランダム化し、3つのプールに分割した。1つのランダム化断片プールを各群に導入し、3つの実験マトリックス毎に同じ数の断片を添加した。
全TIL拡張プロセスにわたって、腫瘍L4063拡張を標準培地で行い、腫瘍L4064拡張を合成培地(CTS OpTmizer)で行った。培地の成分を本明細書に記載する。
CM1完全培地1:2mM Glutamax、10%ヒトAB血清、ゲンタマイシン(50ug/mL)、2-メルカプトエタノール(55uM)を補充したRPMI+グルタミン。6000IU/mLのIL-2を補充した最終培地製剤。
CM2完全培地2:50% CM1培地+50% AIM-V培地。6000IU/mLのIL-2を補充した最終培地製剤。
CM4完全培地4:Glutamax(2mM)を補充したAIM-V。3000IU/mLのIL-2を補充した最終培地製剤。
CTS(商標)OpTmizer(商標)T-Cell Expansion Supplement(26mL/L)を補充したCTS(商標)OpTmizer(商標)T-Cell Expansion Basal Medium。
DM1:CTS(商標)OpTmizer(商標)T-Cell Expansion Supplement(26mL/L)、及びCTS(商標)Immune Cell SR(3%)をGlutamax(2mM)とともに補充したCTS(商標)OpTmizer(商標)T-Cell Expansion Basal Medium。6,000IU/mLのIL-2を補充した最終製剤。
DM2:CTS(商標)OpTmizer(商標)T-Cell Expansion Supplement(26mL/L)、及びCTS(商標)Immune Cell SR(3%)をGlutamax(2mM)とともに補充したCTS(商標)OpTmizer(商標)T-Cell Expansion Basal Medium。3,000IU/mLのIL-2を補充した最終製剤。
使用したすべてのタイプの培地、すなわち、完全培地(CM)及び合成培地(DM)を事前に調製し、使用前日まで4℃で保持し、プロセス日前に事前に最長24時間にわたってインキュベーター内で37℃で温めた。
TIL培養再活性化は、両方の腫瘍で7日目に起こった。スケールアップは、L4063では10日目、L4064では11日目に起こった。両方の培養物を採取し、16日目に凍結保存した。
達成した結果。Gen3.0プロセス及びGen3.1プロセスの細胞計数及び生存率%を決定した。すべての条件下での拡張は、この実施例に説明される詳細に従った。
腫瘍毎に、断片を同数の3つのプールに分割した。腫瘍のサイズが小さいため、1フラスコ当たりの断片の最大数は達成されなかった。3つの異なるプロセスについて、総生細胞及び細胞生存率を条件毎に評価した。細胞数を、7日目の再活性化のTVC、10日目(L4064)または11日目(L4063)のスケールアップのTVC、及び16/17日目の採取時のTVCとして決定した。
7日目及び10/11日目の細胞計数をFIOで測定した。倍率拡張を、16/17日目の採取時のTVCを7日目の再活性化日のTVCで割ることによって計算した。3つの群を比較するために、採取日のTVCを、0日目の培養物中に添加した断片の数で割って、1断片当たりの生細胞の平均を計算した。
L4063及びL4064について、細胞計数及び生存率アッセイを行った。Gen3.1-試験プロセスは、両方の腫瘍でGen3.0プロセスよりも多くの1断片当たりの細胞数をもたらした。
総生細胞数及び倍率拡張、プロセス中の生存率%。再活性化時に、スケールアップして採取し、すべての条件で生存率%を行った。16/17日目の採取日に、最終TVCを生存率%の放出基準と比較した。評価したすべての条件は、70%の生存率基準を超え、プロセス及び腫瘍全体で同等であった。
免疫表現型決定-TIL最終製品の表現型特徴付け。最終製品をフローサイトメトリー分析にかけ、純度、分化、及びメモリーマーカーを試験した。集団の割合は、すべての条件で、TCRα/β細胞、CD4+細胞、及びCD8+細胞で一貫していた。
REP TILの拡張表現型分析を行った。TIL製品は、両方の腫瘍でGen3.0と比較してGen3.1条件でより高いCD4+細胞パーセンテージを示し、両方の条件でGen3.1条件と比較してGen3.0でより高いCD8+集団由来のCD28+細胞パーセンテージを示した。
Gen3.0プロセス及びGen3.1プロセスから採取したTILは、CD4+細胞及びCD8+細胞でのCD27及びCD56発現、ならびにCD4+ゲート細胞集団での同等のCD28発現と同等の表現型マーカーを示した。TIL最終製品のメモリーマーカーの比較:
16日目に採取したTILの凍結試料を分析のために染色した。TILメモリーステータスは、Gen3.0プロセスとGen3.1プロセスとの間で同等であった。TIL最終製品の活性化及び疲弊マーカーの比較:
活性化及び疲弊マーカーは、CD4+細胞及びCD8+細胞上でゲートされたGen3.0プロセスとGen3.1プロセスとの間で同等であった。
再刺激時のインターフェロンγ分泌。採取したTILは、L4063及びL4064用のコーティングされた抗CD3プレートで一晩再刺激を受けた。Gen3.0プロセスと比較して、分析した2つの腫瘍で、より高いGen3.1プロセスからのIFN-γ産生が観察された。
培養培地中のIL-2レベルの測定。すべての条件及びプロセス間のIL-2消費レベルを比較するために、細胞上清を、7日目の再活性化の開始時、10日目(L4064)/11日目(L4063)のスケールアップ時、及び16/17日目の採取及び凍結時に収集した。その後、上清を解凍し、分析した。細胞培養上清中のIL-2の量を、製造業者のプロトコルによって測定した。
全体的なGen3プロセス及びGen3.1プロセスは、同じ培地条件で評価した全プロセス中のIL-2消費に関して同等であった。L4063及びL4064用に収集した使用済み培地のIL-2濃度(pg/mL)分析。
代謝物分析。使用済み培地の上清を、L4063及びL4064について、すべての条件で、7日目の再活性化の開始時、10日目(L4064)または11日目(L4063)のスケールアップ時、及び16/17日目の採取時に、L4063及びL4064から収集した。上清を、グルコース、塩乳酸、グルタミン、GlutaMax、及びアンモニアの濃度についてCEDEXバイオアナライザーで分析した。
合成培地は、完全培地(2g/L)と比較してより高いグルコース濃度4.5g/Lを有する。全体として、グルコースの濃度及び消費量は、各培地タイプ内でGen3.0プロセス及びGen3.1プロセスにおいて同等であった。
すべての試験条件で、L4063及びL4064の両方の腫瘍に乳酸塩の増加が観察された。乳酸塩の増加は、Gen3.0条件とGen3.1条件との間、及び再活性化拡張に使用した2つの培地(L4063の場合の完全培地とL4064の場合の合成培地)間で同等であった。
L4063の場合において、標準基礎培地は、2mMのL-グルタミンを含有し、培養条件下でL-グルタミンのL-グルタミン酸塩及びアンモニアへの自然分解を補うために、2mMのGlutaMaxで補充された。
L4064腫瘍の場合、使用した合成(無血清)培地は、基礎培地にL-グルタミンを含有せず、最終濃度が2mMになるまでGlutaMaxのみで補充された。GlutaMaxは、L-アラニンとL-グルタミンのジペプチドであり、水溶液中でL-グルタミンよりも安定しており、グルタミン酸塩及びアンモニアに自発的に分解しない。代わりに、ジペプチドは、個々のアミノ酸に徐々に解離し、それにより、より低いが十分な濃度のL-グルタミンを維持して、強力な細胞成長を維持する。
L4063の場合、グルタミン濃度及びGlutaMax濃度は、スケールアップ日にわずかに減少したが、採取日には再活性化日と比較して同様またはより近いレベルへの増加を示した。L4064の場合、グルタミン濃度及びGlutaMax濃度は、全プロセス中、異なる条件間で同様の速度でわずかな分解を示した。
予想通り、アンモニア濃度は、L4064(2mMのGlutaMaxを含有する合成培地中で成長させた)よりも、L4063(2mMのグルタミン+2mMのGlutaMaxを含有する標準培地中で成長させた)について高かった。さらに、予想通り、培養の過程にわたってアンモニアの段階的増加または蓄積があった。3つの異なる試験条件間でアンモニア濃度に差はなかった。
Flow-FISHによるテロメア反復。Flow-FISH技術を使用して、Gen3プロセス及びGen3.1プロセス下でのL4063及びL4064のテロメア反復の平均長を測定した。相対テロメア長(RTL)の決定を、DAKO製のフローサイトメトリー分析用Telomere PNAキット/FITCを使用して計算した。テロメアアッセイを行った。L4063及びL4064の試料のテロメア長を、対照細胞株(1301白血病)と比較した。対照細胞株は、長くて安定したテロメアを有する四倍体細胞株であり、相対テロメア長の計算を可能にする。両方の腫瘍で評価したGen3プロセス及びGen3.1プロセスは、同等のテロメア長を示した。TCR Vβレパートリー分析
各プロセスで生成された細胞製品のクローン多様性を決定するために、TIL最終製品をT細胞受容体のCDR3部分の配列決定によるクローン多様性分析のためにアッセイした。
3つのパラメータを3つの条件間で比較した。
●固有のCDR3(uCDR3)の多様性指数
●uCDR3共有%
●uCDR3の上位80%の場合:
○共有されるuCDR3コピーの%を比較する
○固有のクロノタイプの頻度を比較する
対照及びGen3.1試験、TILで採取した細胞製品のL4063で共有される固有のCDR3配列パーセンテージ:975個の配列がGen3試験最終製品とGen3.1試験最終製品との間で共有され、Gen3.1試験最終製品と共有されるGen3由来の固有のCDR3配列の上位80%の88%に相当する。
対照及びGen3.1試験、TILで採取した細胞製品のL4064で共有される固有のCDR3配列パーセンテージ:2163個の配列がGen3試験最終製品とGen3.1試験最終製品との間で共有され、Gen3.1試験最終製品と共有されるGen3由来の固有のCDR3配列の上位80%の87%に相当する。
異なるプロセスについて、16日目の採取時に収集した1×10個の細胞から特定された固有のCD3配列の数。Gen3.1試験条件は、試料内の固有のペプチドCDRの数に基づいて、Gen3.0と比較してわずかに高いクローン多様性を示した。
シャノンエントロピー多様性指数は、比較のための信頼性の高い一般的なメトリックであり、これは両方の腫瘍に対するGen3.1条件が、Gen3プロセスよりもわずかに高い多様性を示すためであり、Gen3.1試験条件のTCR VβレパートリーがGen3.0プロセスよりもポリクローナルであることを示唆する。
加えて、Gen3.1試験条件のTCR Vβレパートリーは、腫瘍L4063及びL4064の両方でGen3.0プロセスの対応するレパートリーと87%を超える重複を示した。
再活性化日のGen3.1試験L4064の使用済み培地のIL-2濃度の値は、期待値を下回った(Gen3.1対照及びGen3.0条件と同様であった)。
低い値はピペッティングエラーに起因した可能性があったが、最小限の試料しか採取できなかったため、アッセイを繰り返すことができなかった。
試料L4064の10/11日目のスケールアップから使用済み培地は収集されず、IL-2濃度の分析及び上清の代謝物分析には含めなかった。
結論。0日目のフィーダー及びOKT-3を含むGen3.1試験条件は、Gen3.0及びGen3.1対照と比較して、16日目の採取時の細胞用量のTVCがより高いことを示した。Gen3.1試験条件のTVC最終製品は、Gen3.0よりも約2.5倍高かった。
腫瘍L4063及びL4064の両方について、0日目にOKT-3及びフィーダーを添加したGen3.1試験条件は、採取時にフラスコの最大容量に達した。これらの条件下で、0日目に最大4つのフラスコを開始した場合、最終細胞用量は、80~100×10TILである可能性があった。
最終TIL製品の純度、疲弊、活性化、及びメモリーマーカーを含む表現型特徴付けなどのすべての品質属性が、Gen3.1試験とGen3.0プロセスとの間で維持され、同等であった。TIL最終製品のテロメア長及び使用済み培地のIL-2消費量は、Gen 3.0プロセスとGen 3.1プロセスとの間で同等であった。
最終TIL製品のIFN-γ産生は、分析した2つの腫瘍において、Gen3.0と比較して、0日目にフィーダー及びOKT-3を添加したGen3.1で3倍高く、Gen3.1プロセスが強力なTIL製品を生成したことを示唆する。
試験条件にわたって、グルコースまたは乳酸塩レベルに差異は観察されなかった。培地条件にわたって、Gen3.0プロセスとGen3.1プロセスとの間でグルタミン及びアンモニアに差異は観察されなかった。培地上の低レベルのグルタミンは、細胞増殖を制限しておらず、培地へのGlutaMaxのみの添加が、細胞を増殖させるのに必要な栄養素を与えるのに十分であることを示唆する。
L4063及びL4064のスケールアップ日は、それぞれ11日目及び10日目であり、プロセスの採取日に到達した細胞数に関して大きな差異を示さず、代謝物の消費量は、全プロセスにわたって両方の場合で同等であった。この観察結果は、Gen3.0最適化プロセスが処理日に柔軟性を有し、それにより、製造スケジュールの柔軟性を促進することができることを示唆している。
0日目にフィーダー及びOKT-3を添加したGen3.1プロセスは、Gen3.0と比較して、CDR3 TCRab配列分析によって測定されたより高いクローン多様性を示した。
図32は、Gen3プロセス(Gen3最適化プロセス)の実施形態を説明する。標準培地及びCTS Optimizer無血清培地を、Gen3最適化プロセスTIL拡張に使用することができる。CTS Optimizerの場合、培地のGlutaMaxを最終濃度4mMに増加させるために無血清培地が推奨される。
実現可能性を、すべての実験のすべての研究条件に対して確立した。すべての実験及び条件にわたって、かつドナー腫瘍組織間で、すべての実験を、IL-2、ヒト血清-AB、同種異系フィーダー細胞、OKT-3などの同じロットの重要な原材料を利用して行った。
比較可能性を、凍結保存した22日目のTIL製品の以前の仕様に従って、臨床製品の放出基準を満たす任意の研究群の能力によって決定した。
実施例12:合成培地を用いた腫瘍拡張プロセス。
上記で開示されるプロセスは、CM1培地及びCM2培地を、合成培地(例えば、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-Cell Expansion SFM、ThermoFisher、例えば、DM1及びDM2を含む)で置き換えることによって行われ得る。
実施例13:凍結保存TIL細胞療法の例示的生産
この実施例は、現在の適正組織基準及び現在の適正製造基準に従った、G-Rexフラスコ内のTIL細胞療法プロセスの例示的なcGMP製造を説明する。
Figure 2024512029000053

Figure 2024512029000054
0日目のCM1培地の調製。BSC内で、試薬をRPMI1640培地ボトルに追加した。ボトル当たり追加された以下の試薬を追加した:不活化ヒトAB血清(100.0mL)、GlutaMax(10.0mL)、硫酸ゲンタマイシン、50mg/mL(1.0mL)、2-メルカプトエタノール(1.0mL)を加熱した。
BSCから不要な材料を取り出した。BSCから培地試薬を抜き取り、配合された洗浄培地の調製のために硫酸ゲンタマイシン及びHBSSをBSCの中に残した。
IL-2アリコートを解凍した。すべての氷が融解するまで、1つの1.1mLのIL-2アリコート(6×10IU/mL)(BR71424)を解凍した。IL-2:ロット番号及び有効期限を記録した。
IL-2ストック溶液を培地に移した。BSC内で、1.0mLのIL-2ストック溶液を、調製されたCM1の0日目培地ボトルに移した。CM1の0日目培地1ボトル及びIL-2(6×10IU/mL)1.0mLを追加した。
G-Rex 100MCSをBSCの中に通過させた。無菌的にG-Rex 100MCS(W3013130)をBSCの中に通過させた。
すべての完全なCM1の0日目培地をG-Rex 100MCSフラスコにポンプで注入した。組織断片コニカルまたはG-Rex 100MCS。
0日目の腫瘍洗浄培地の調製。BSC内で、5.0mLのゲンタマイシン(W3009832またはW3012735)を1本の500mLのHBSS培地(W3013128)ボトルに追加した。ボトル当たりの追加:HBSS(500.0mL)、硫酸ゲンタマイシン、50mg/mL(5.0mL)。1Lの0.22ミクロンフィルターユニット(W1218810)をとおして調製されたゲンタマイシンを含有するHBSSを濾過した。
0日目の腫瘍処理。腫瘍検体を取得し、即時に処理のために2~8℃における部屋に移した。
腫瘍洗浄培地を等分した。腫瘍洗浄1は、8インチ鉗子(W3009771)を使用して行う。腫瘍を検体ボトルから取り出し、調製した「洗浄1」皿に移す。この後、腫瘍洗浄2及び腫瘍洗浄3が続く。
腫瘍を測定し、評価した。腫瘍領域全体の30%未満が壊死及び/または脂肪性組織であることが観察されたかどうかを評価した。該当する場合、クリーンアップ解剖を行う。腫瘍が大きく、外部の組織の30%未満が壊死/脂肪性であることが観察された場合、メス及び/または鉗子の組み合わせを使用して、腫瘍の内側構造を温存しながら壊死/脂肪性組織を除去することによって、「クリーンアップ解剖」を行った。
腫瘍を切除した。メス及び/または鉗子の組み合わせを使用して、腫瘍検体を均等で適切なサイズの断片(最大6つの中間断片)に切断した。中間腫瘍断片を移した。腫瘍断片を、およそ3×3×3mmのサイズの小片に切除した。乾燥を防止するために中間断片を保存した。
中間断片の解剖を繰り返した。収集された切片の数を決定した。望ましい組織が残っている場合、「好ましい中間断片」6ウェルプレートから追加の好ましい腫瘍片を選択し、最大50片のために液滴を充填した。
コニカルチューブを準備した。腫瘍片を50mLのコニカルチューブに移した。G-Rex 100MCSのBSCを準備した。G-Rex 100MCSをインキュベーターから取り出した。無菌的にG-Rex 100MCSフラスコをBSCの中に通過させた。腫瘍断片をG-Rex 100MCSフラスコに追加した。切片を均等に分配した。
以下のパラメータでG-Rex 100MCSをインキュベートした:G-Rexフラスコをインキュベートした:温度LEDディスプレイ:37.0±2.0℃、COパーセンテージ:5.0±1.5%CO。計算:培養の時間、下限=培養の時間+252時間、上限=培養の時間+276時間。
プロセスが完了した後、いずれの残りの温められた培地も廃棄し、IL-2のアリコートを解凍した。
11日目-培地の調製。インキュベーターを監視した。インキュベーターパラメータ:温度LEDディスプレイ:37.0±2.0℃、CO2パーセンテージ:5.0±1.5%CO2。
3本の1000mLのRPMI 1640培地(W3013112)ボトル及び3本の1000mLのAIM-V(W3009501)ボトルを、インキュベーター内で30分間以上温めた。インキュベーターからRPMI1640培地を取り出した。RPMI1640培地を調製した。培地を濾過した。3つの1.1mLアリコートのIL-2(6×10IU/mL)(BR71424)を解凍した。インキュベーターからAIM-V培地を取り出した。IL-2をAIM-Vに追加した。10LのLabtainerバッグ及びリピータポンプ移送セットを、BSCの中に無菌的に移した。
10LのLabtainer培地バッグを準備した。Baxaポンプを準備した。10LのLabtainer培地バッグを準備した。培地を10LのLabtainerにポンプで注入した。Labtainerバッグからポンプマティックを取り出した。
培地を混合した。バッグを穏やかにマッサージして混合した。試料計画に従って培地をサンプリングした。20.0mLの培地を取り出し、50mLのコニカルチューブに入れた。細胞計数希釈管を準備した。BSCに、「細胞計数希釈液用」及びロット番号でラベル付けされた4.5mLのAIM-V培地を、4本の15mLコニカルチューブに追加した。試薬をBSCから2~8℃に移した。1L移送パックを準備した。(プロセス注記5.11に従って)BSC溶接の外側で、「完全なCM2の11日目培地」バッグに取り付けられた移送セットへの1L移送パックを準備した。フィーダー細胞移送パックを準備した。完全なCM2の11日目培地をインキュベートした。
11日目-TIL採取。前処理表。インキュベーターパラメータ:温度LEDディスプレイ:37.0±2.0℃、COパーセンテージ:5.0±1.5%CO。G-Rex 100MCSをインキュベーターから取り出した。300mL移送パックを準備した。移送パックをG-Rex 100MCSに溶接した。
TIL採取及びTIL採取の開始のためにフラスコを準備する。TILが採取された。GatheRexポンプを使用して、血液フィルターを介して細胞懸濁液を300mLの移送パックに移した。付着した細胞について膜を点検した。
フラスコ膜をすすいだ。G-Rex 100MCS上のクランプを閉じた。すべてのクランプが閉じられていることを確実にした。TIL及び「上清」移送パックを熱融着した。TIL懸濁液の体積を計算した。サンプリングのために上清移送パックを準備した。
Bac-T試料を引き出した。BSC内で、1L「上清」移送パックからおよそ20.0mLの上清を引き上げ、滅菌50mLコニカルチューブに分注する。
試料計画に従ってBacTを接種した。適切なサイズのシリンジを使用して調製されたBacTとラベル付けされた50mLコニカルから1.0mLの試料を取り出し、嫌気性ボトルに接種した。
TILをインキュベートした。必要とされるまで、TIL移送パックをインキュベーターに入れた。細胞計数及び計算を行った。行われた細胞計数の生細胞濃度及び生存率の平均を決定した。生存率÷2。生細胞濃度÷2。計数の上限及び下限を決定した。下限:生細胞濃度の平均×0.9。上限:生細胞濃度の平均×1.1。許容限界内の両方の計数を確認した。行われた4つすべての計数から平均生細胞濃度を決定した。
TIL懸濁液の調整された体積:細胞計数試料を取り出した後のTIL懸濁液の調整された体積を計算する。総TIL細胞体積(A)。取り出された細胞計数試料の体積(4.0mL)(B)調整された総TIL細胞体積C=A-B。
総生TIL細胞を計算した。平均生細胞濃度:総体積、総生細胞:C=A×B
フローサイトメトリーのための計算:総生TIL細胞数が、4.0×10以上であった場合、フローサイトメトリー試料のために1.0×10細胞を取得するための体積を計算した。
フローサイトメトリーに必要とされる総生細胞:1.0×10細胞。フローサイトメトリーに必要とされる細胞の体積:生細胞濃度を1.0×10細胞Aで割ったもの。
2.0×10生細胞に等しいTIL懸濁液の体積を計算した。必要に応じて、取り出すTIL細胞の過剰体積を計算し、過剰なTILを取り出し、必要に応じてTILをインキュベーターに入れた。必要に応じて、取り出された全過剰TILを計算した。
凍結のための標的細胞濃度が1.0×10細胞/mLである過剰なTIL細胞に追加するCS-10培地の量を計算した。必要に応じて、過剰なTILを遠心分離した。コニカルチューブを観察し、CS-10を追加した。
バイアルを充填した。1.0mLの細胞懸濁液を、適切なサイズの凍結バイアルに等分した。残留体積を適切なサイズのクライオバイアルに等分した。体積が0.5mL以下である場合、体積が0.5mLになるまでCS10をバイアルに追加する。
凍結保存のための1×10細胞を取得するために必要とされる細胞の体積を計算した。凍結保存のために試料を取り出した。TILをインキュベーターに入れた。
試料の凍結保存。コニカルチューブを観察し、CS-10をゆっくりと追加し、追加された0.5mLのCS10の体積を記録した。
11日目-フィーダー細胞。フィーダー細胞を取得した。LN2冷凍庫から少なくとも2つの異なるロット番号を伴うフィーダー細胞の3つのバッグを取得した。解凍する準備が整うまで、細胞をドライアイス上で保管した。水浴またはcryothermを準備した。37.0±2.0℃の水浴またはcytothermにおいて約3~5分間、または氷が消滅するまで、フィーダー細胞を解凍した。インキュベーターから培地を取り出した。解凍されたフィーダー細胞をプールした。フィーダー細胞を移送パックに追加した。シリンジから移送パックにフィーダー細胞を分注した。プールされたフィーダー細胞を混合し、移送パックをラベル付けした。
移送パック内のフィーダー細胞懸濁液の総体積を計算した。細胞計数試料を取り出した。各試料に別個の3mLシリンジを使用して、不要注入ポートを使用してフィーダー細胞懸濁液移送パックから4×1.0mLの細胞計数試料を引き出した。各試料をラベル付けされたクライオバイアルに等分した。細胞計数を行い、増倍率を決定し、プロトコルを選択し、増倍率を入力した。行われた細胞計数の生細胞濃度及び生存率の平均を決定した。計数の上限及び下限を決定し、限界内で確認した。
フィーダー細胞懸濁液の調整された体積。細胞計数試料を取り出した後のフィーダー細胞懸濁液の調整された体積を計算した。総生フィーダー細胞を計算した。必要に応じて追加のフィーダー細胞を取得した。必要に応じて追加のフィーダー細胞を解凍した。第4のフィーダー細胞バッグをジップトップバッグに入れ、37.0±2.0℃の水浴またはcytotherm内で約3~5分間解凍し、追加のフィーダー細胞をプールした。体積を測定した。シリンジ内のフィーダー細胞の体積を測定し、以下に記録した(B)。フィーダー細胞の新しい総体積を計算した。フィーダー細胞を移送パックに追加した。
必要に応じて希釈液を調製し、4.5mLのAIM-V培地を4本の15mLコニカルチューブに追加した。細胞計数を準備した。各試料に対して別個の3mLシリンジを使用して、不要注入ポートを使用して、フィーダー細胞懸濁液移送パックから4×1.0mLの細胞計数試料を取り出した。細胞計数及び計算を行った。行われた4つすべての計数から平均生細胞濃度を決定した。フィーダー細胞懸濁液の体積を調整し、細胞計数試料を取り出した後のフィーダー細胞懸濁液の調整された体積を計算した。4.0mLを差し引いた総フィーダー細胞体積を取り出した。5×10生フィーダー細胞を取得するために必要とされるフィーダー細胞懸濁液の体積を計算した。過剰なフィーダー細胞体積を計算した。取り出す過剰なフィーダー細胞の体積を計算した。過剰なフィーダー細胞を取り出した。
1.0mLシリンジ及び16G針を使用して、0.15mLのOKT3を引き上げ、OKT3を追加した。フィーダー細胞懸濁液移送パックを熱融着した。
11日目 G-Rex充填及び播種設定G-Rex500MCS。「完全なCM2の11日目培地」をインキュベーターから取り出し、培地をG-Rex500MCSにポンプで注入した。4.5Lの培地をG-Rex500MCSにポンプで注入し、フラスコ上にマークされたラインまで充填した。必要に応じてフラスコを熱融着し、インキュベートした。フィーダー細胞の懸濁液移送パックを、G-Rex500MCSに溶接した。フィーダー細胞をG-Rex500MCSに追加した。熱融着した。TIL懸濁液移送パックをフラスコに溶接した。TILをG-Rex500MCSに追加した。熱融着した。G-Rex500MCSを37.0±2.0℃でインキュベートした。CO2パーセンテージ:5.0±1.5%CO2。
インキュベーション時間帯を計算した。16日目にインキュベーターからG-Rex500MCSを取り出すための適切な時間を決定するための計算を行った。下限:インキュベーションの時間+108時間。上限:インキュベーションの時間132時間。
11日目 過剰TIL凍結保存。該当:過剰TILバイアルを凍結させた。凍結前にCRFが設定されていることを検証した。凍結保存を行った。バイアルを速度制御された冷凍庫から適切な保管場所に移した。凍結の完了時に、バイアルをCRFから適切な保管容器に移した。バイアルを適切な保管場所に移した。LN2における保管場所を記録した。
16日目 培地の調製。AIM-V培地を事前に温めた。培地バッグ1、2、及び3について培地が温められた時間を計算した。すべてのバッグが12~24時間の持続時間にわたって温められていることを確実にした。上清用の10LのLabtainerを設定した。ルアーコネクタを使用して、流体ポンプ移送セットのより大きな直径の端部を10LのLabtainerバッグのメス型ポートのうちの1つに取り付けた。上清用の10LのLabtainerを設定し、ラベル付けした。上清用の10LのLabtainerを設定した。BSCから取り出す前に、すべてのクランプが閉じられていることを確実にした。注記:上清バッグは、培地調製と同時に行われ得るTIL採取中に使用された。
IL-2を解凍した。すべての氷が融解するまで、CTS AIM-V培地の1バッグ当たり5×1.1mLアリコートのIL-2(6×10IU/mL)(BR71424)を解凍した。100.0mLのGlutaMaxを等分した。IL-2をGlutaMaxに追加した。配合用のCTS AIM-V培地バッグを準備した。配合用のCTS AIM-V培地バッグを準備した。ステージBaxaポンプ。培地を配合することを準備した。GlutaMax+IL-2をバッグにポンプで注入した。パラメータを監視した:温度LEDディスプレイ:37.0±2.0℃、COパーセンテージ:5.0±1.5%CO。完全なCM4の16日目培地を温めた。希釈液を調製した。
16日目 REP分割。インキュベーターパラメータを監視した:温度LEDディスプレイ:37.0±2.0℃、COパーセンテージ:5.0±1.5%CO。インキュベーターからG-Rex500MCSを取り出した。1Lの移送パックを準備し、TIL懸濁液としてラベル付けし、1Lの重量を量った。
G-Rex500MCSの減容。約4.5Lの培養上清をG-Rex500MCSから10LのLabtainerに移した。
TIL採取用のフラスコを準備した。上清を取り出した後に、赤色ラインへのすべてのクランプを閉じた。
TIL採取の開始。フラスコを激しく叩き、培地を旋回させて細胞を解放し、すべての細胞が引き離されていることを確実にする。
TIL採取。TIL懸濁液移送パックにつながるすべてのクランプを解放した。GatheRexを使用して、細胞懸濁液をTIL懸濁液移送パックの中に移した。注記:すべての細胞及び培地が収集されるまで、傾斜した縁を必ず維持すること。付着した細胞について膜を点検した。フラスコ膜をすすいだ。G-Rex500MCS上のクランプを閉じた。TILを含む移送パックを熱融着した。上清を含む10LのLabtainerを熱融着した。細胞懸濁液を伴う移送パックの重量を記録し、細胞懸濁液を計算した。試料を取り出すための移送パックを準備した。細胞上清から試験試料を取り出した。
無菌性及びBacT試験サンプリング。調製したBacTラベル付けされた15mLのコニカルから1.0mLの試料を取り出した。細胞計数試料を取り出した。BSC内で、各試料に別個の3mLシリンジを使用して、「TIL懸濁液」移送パックから4×1.0mLの細胞計数試料を取り出した。
マイコプラズマ試料を取り出した。3mLシリンジを使用して、TIL懸濁液移送パックから1.0mLを取り出し、調製された「マイコプラズマ希釈液」とラベル付けされた15mLコニカルチューブに入れた。
播種用の移送パックを準備した。TILをインキュベーターに入れた。細胞懸濁液をBSCから取り出し、必要とされるまでインキュベーターに入れた。細胞計数及び計算を行った。最初に、0.5mLの細胞懸濁液を調製された4.5mLのAIM-V培地に追加することによって、細胞計数試料を希釈し、1:10希釈液を生じた。行われた細胞計数の生細胞濃度及び生存率の平均を決定した。計数の上限及び下限を決定した。注記:希釈は、細胞の期待濃度に基づいて調整され得る。行われた4つすべての計数から平均生細胞濃度を決定した。TIL懸濁液の調整された体積。細胞計数試料を取り出した後のTIL懸濁液の調整された体積を計算した。5.0mLを差し引いた総TIL細胞体積が試験のために取り出された。
総生TIL細胞を計算した。播種するフラスコの総数を計算した。注記:播種するG-Rex500MCSフラスコの最大数は5であった。播種するフラスコの計算された数が5つを超えた場合、5つのみが利用可能な細胞懸濁液の体積全体を使用して播種された。
二次培養用のフラスコの数を計算した。準備されたバッグに加えて必要とされる培地バッグの数を計算した。計算されたように必要とされる2つのG-Rex-500Mフラスコ毎に「CM4の16日目培地」の1つの10Lバッグを準備した。追加の培地が調製され、温められている間に、続けて第1のGREX-500Mフラスコ(複数可)を播種した。計算された数の決定された追加の培地バッグを調製し、温めた。G-Rex500MCSを充填した。培地をポンプで注入するように準備し、4.5Lの培地をG-Rex500MCSにポンプで注入した。熱融着した。充填を繰り返した。フラスコをインキュベートした。新しいG-Rex500MCSフラスコに追加するTIL懸濁液の標的体積を計算した。フラスコの計算された数が5つを超える場合、5つのみが細胞懸濁液の体積全体を使用して播種されるであろう。播種用のフラスコを準備した。インキュベーターからG-Rex500MCSを取り出した。ポンプで注入するためのG-Rex500MCSを準備した。大型フィルターラインを除くすべてのクランプを閉じた。インキュベーターからTILを取り出した。播種用の細胞懸濁液を調製した。(プロセス注記5.11に従って)「TIL懸濁液」移送パックをポンプ入口ラインに滅菌溶接した。TIL懸濁液バッグを秤の上に置いた。
フラスコにTIL懸濁液を播種した。計算されたTIL懸濁液の体積をフラスコにポンプで注入した。熱融着した。残りのフラスコを充填した。
インキュベーターを監視した。インキュベーターパラメータ:温度LEDディスプレイ:37.0±2.0℃、COパーセンテージ:5.0±1.5%CO。フラスコをインキュベートした。
22日目にインキュベーターからG-Rex500MCSを取り出す時間範囲を決定した。
22日目 洗浄緩衝液の調製。10LのLabtainerバッグを準備した。BSC内で、ルアー接続を介して4インチ血漿移送セットを10LのLabtainerバッグに取り付けた。10LのLabtainerバッグを準備した。BSCから外に移す前に、すべてのクランプを閉じた。注記:採取される2つのG-Rex500MCSフラスコ毎に、1つの10L Labtainerバッグを準備した。Plasmalyteを3000mLバッグにポンプで注入し、ポンプを反転させてバッグの位置を操作することによって、3000mLのOrigenバッグから空気を除去した。ヒトアルブミン25%を3000mLのバッグに追加した。120.0mLの最終体積のヒトアルブミン25%を取得する。
IL-2希釈液を調製した。10mLシリンジを使用して、LOVO洗浄緩衝液バッグ上の無針注入ポートを使用して、5.0mLのLOVO洗浄緩衝液を取り出した。LOVO洗浄緩衝液を50mLのコニカルチューブに分注した。
等分されたCRFブランクバッグLOVO洗浄緩衝液。100mLのシリンジを使用して、無針注入ポートから70.0mLのLOVO洗浄緩衝液を引き上げた。
すべての氷が融解するまで、1つの1.1mLのIL-2(6×10IU/mL))を解凍した。50μLのIL-2ストック(6×10IU/mL)を「IL-2希釈液」とラベル付けされた50mLのコニカルチューブに追加した。
凍結保存調製。5つのクライオカセットを2~8℃に置き、最終製品の凍結保存のためにそれらを前調整した。
細胞計数希釈液を調製した。BSC内で、ロット番号及び「細胞計数希釈液用」でラベル付けされた4.5mLのAIM-V培地を、4本の別個の15mLコニカルチューブに追加した。細胞計数を準備した。4つのクライオバイアルをバイアル番号(1~4)でラベル付けした。使用されるBSCの下でバイアルを保存した。
22日目 TIL採取。インキュベーターを監視した。インキュベーターパラメータ温度LEDディスプレイ:37±2.0℃、CO2パーセンテージ:5%±1.5%。インキュベーターからG-Rex500MCSフラスコを取り外した。TIL収集バッグを準備し、ラベル付けした。余分な接続を密封した。減容:約4.5Lの上清をG-Rex500MCSから上清バッグに移した。
TIL採取用のフラスコを準備した。TILの収集を開始した。フラスコを激しく叩き、培地旋回させて細胞を解放した。すべての細胞が引き離されていることを確実にした。TILの収集を開始した。TIL懸濁液収集バッグにつながるすべてのクランプを解放した。TIL採取。GatheRexを使用して、TIL懸濁液を3000mLの収集バッグに移した。付着した細胞について膜を点検した。フラスコ膜をすすいだ。G-Rex500MCS上のクランプを閉じ、すべてのクランプが閉じていることを確実にした。細胞懸濁液をLOVOソースバッグの中に移した。すべてのクランプを閉じた。熱融着した。4×1.0mLの細胞計数試料を取り出した。
細胞計数を行った。NC-200及びプロセス注記5.14を利用して、細胞計数及び計算を行った。最初に、0.5mLの細胞懸濁液を調製された4.5mLのAIM-V培地に追加することによって、細胞計数試料を希釈した。これは、1:10希釈液を生じた。行われた細胞計数の平均生存率、生細胞濃度、及び総有核細胞濃度を決定した。計数の上限及び下限を決定した。行われた細胞計数の平均生存率、生細胞濃度、及び総有核細胞濃度を決定した。LOVOソースバッグの重量を量った。総生TIL細胞を計算した。総有核細胞を計算した。
マイコプラズマ希釈液を調製した。ルアー試料ポートを介して1つの上清バッグから10.0mLを取り出し、15mLコニカルに入れた。
「TIL G-Rex採取」プロトコルを行い、最終製品の標的体積を決定した。使い捨てキットを装填した。濾液バッグを取り出した。濾液容量を入力した。濾液容器をベンチトップの上に置いた。PlasmaLyteを取り付けた。PlasmaLyteが取り付けられていることを検証し、PlasmaLyteが動いていることを観察した。ソース容器をチューブに取り付け、ソース容器が取り付けられていることを検証した。PlasmaLyteが動いていることを確認した。
最終製剤及び充填。標的体積/バッグの計算。ブランクバッグを配合するためのCS-10及びLOVO洗浄緩衝液の体積を計算した。CRFブランクを調製した。
最終製品に追加するIL-2の体積を計算した。所望される最終IL-2濃度(IU/mL)-300IU/mL。IL-2作業ストック:6×10IU/mL。接続装置を組み立てた。4S-4M60をCC2細胞接続に滅菌溶接した。CS750クライオバッグを準備したハーネスに滅菌溶接した。CS-10バッグを4S-4M60のスパイクに溶接した。IL-2とともにTIL調製した。適切なサイズのシリンジを使用して、「IL-2 6×10」アリコートから決定されたIL-2の量を取り出した。配合されたTILバッグをラベル付けした。配合されたTILバッグを装置に追加した。CS10を追加した。シリンジを交換した。約10mLの空気を100mLのシリンジに引き込み、装置上の60mLシリンジを交換した。CS10を追加した。CS-750バッグを準備した。細胞を分注した。
最終製品バッグから空気を除去し、保持液を得た。最後の最終製品バッグが充填されると、すべてのクランプを閉じた。10mLの空気を新しい100mLシリンジに引き込み、装置のシリンジを交換する。保持液を50mLコニカルチューブに分注し、管を「保持液」及びロット番号としてラベル付けした。各バッグについて空気除去ステップを繰り返した。
目視検査を含み、凍結保存のための最終製品を調製した。凍結保存までクライオバッグを低温パック上で、または2~8℃で保持した。
細胞計数試料を取り出した。適切なサイズのピペットを使用して、2.0mLの保持液を取り出し、細胞計数に使用されるように15mLコニカルチューブに入れる。細胞計数及び計算を行った。注記:1つだけの試料を適切な希釈に希釈し、希釈が十分であることを検証した。追加の試料を適切な希釈倍率に希釈し、計数を進めた。行われた細胞計数の生細胞濃度及び生存率の平均を決定した。計数の上限及び下限を決定した。注記:希釈は、細胞の期待濃度に基づいて調整され得る。生細胞濃度及び生存率の平均を決定した。計数の上限及び下限を決定した。IFN-γを計算した。最終製品バッグを熱融着した。
以下の例示的試料計画に従って試料をラベル付けし、収集した。
Figure 2024512029000055
無菌性及びBacT試験。試験サンプリング。BSC内で、適切なサイズのシリンジを使用して収集された保持細胞懸濁液から1.0mLの試料を取り出し、嫌気性ボトルに接種する。好気性ボトルについて上記を繰り返す。
最終製品の凍結保存。制御速度冷凍庫(CRF)を準備した。CRFが設定されていることを検証した。CRFプローブを設定した。最終製品及び試料をCRFに入れた。4℃±1.5℃に達し、CRF実行を進めるために必要な時間を決定した。CRFが完了し、保管された。実行の完了後にCRFを停止させた。カセット及びバイアルをCRFから取り出した。保存のためにカセット及びバイアルを蒸気相LN2に移した。保管場所を記録した。
最終医薬品の後処理及び分析には、以下の試験が含まれた:(22日目)フローサイトメトリーによる22日目REPのCD3+細胞の決定、(22日目)グラム染色法(GMP)、(22日目)ゲルクロットLALアッセイ(GMP)による細菌内毒素試験、(16日目)BacT滅菌アッセイ(GMP)、(16日目)TD-PCRによるマイコプラズマDNA検出(GMP)、許容される外観属性、(22日目)BacT滅菌アッセイ(GMP)(22日目)、(22日目)IFN-ガンマアッセイ。本明細書に記載の他の効力アッセイもまた、TIL製品を分析するために用いられる。
実施例14:TIL効力アッセイパイロット研究
この実施例は、臨床TIL製品ロットの特性評価のための効力アッセイについて説明する。この実施例に記載のプロトコルを、肺腫瘍(L4224)及び黒色腫腫瘍(M1154)から調製された、Gen2製造プロセスによって生成された2つのTIL試料に適用した。TILを、照射されたRaji細胞と共培養した。K562細胞及びPBMCビーズを、それぞれ陰性対照及び陽性対照として使用した。一般的な実験スキームを図34に示す。TILの機能性は、抗CD3/抗CD28/抗4-1BBコーティングされたビーズで検証した。共刺激を提供するための抗CD28抗体の添加もまた、それが何らかの利益をもたらすか、または効果がなかったかを決定するために試験した。異なる共培養期間を観察した。
K562細胞及びRaji細胞を解凍し、計数し、6ウェルプレートまたはT25フラスコ内で10~14日間拡張した。細胞数が>160×10に達すると、細胞を35Gyで照射し、等分し、後で使用するために凍結した。Gen2の拡大TILを解凍して計数し、共培養の前に48~72時間培養して回復させた。
照射されたRaji細胞及び照射されたK562対照を解凍し、以下のTIL:標的比を使用してTILと共培養した:50:1、25:1、12.5:1、6.25:1、1:1、1:6.25、1:12.5、及び1:25、+/-抗CD28抗体。TILはまた、陽性活性化対照を提供するために、抗CD3/CD28/4-1BBでコーティングされた磁気ビーズで刺激した。TIL及び腫瘍細胞株のみの対照も含まれた。
上清を、共培養の開始から6~24時間後に採取し、-80℃で凍結した。細胞を同じ時点で採取し、T細胞活性化の表面マーカーの発現について染色した。解凍した上清を、Ellaプラットフォームを使用して、サイトカインについて評価した。染色された試料を、Ze5機器を使用して、フローサイトメトリーによって分析した。
3つの異なる細胞株を使用して、TILと共培養した。野生型Raji(カタログ番号CCL-86)及びK562(カタログ番号CCL-243)細胞は、ATCCから商業的に取得した。Raji細胞は、バーキットリンパ腫を有する患者に由来するヒトBリンパ芽球様細胞株であり、K562は、骨髄性白血病細胞株である。照射されたヒトPBMCは、San Diego Blood Bankから受領した。
2つのGen2 TILロットを、照射されたRaji細胞、K562細胞、及びPBMC細胞との共培養時の活性化について試験した。TIL活性化は、K562細胞と比較して、Raji細胞との共培養時に、マーカー陽性細胞のパーセンテージまたは平均蛍光強度(MFI)として発現される選択的表面マーカーの発現の増加として定義された。あるいは、Raji細胞、K562及びTILを単独で培養してもよい。PBMCを対照として使用した場合、CD3/CD28を使用してもよい。TIL活性化は、標的細胞とエフェクター細胞との間の異なるMHCの発現に起因すると予想される。TIL TCR複合体と標的細胞HLA-ペプチド複合体との同種異系相互作用は、MHC優性認識と称される。Felix and Allen,Nat.Rev.Immunol.,2007,7(12),942-53、Matzinger and Bevan,Cell Immunol.1977,29,1-5、及びJaneway,The major histocompatibility complex and its functions in Immunobiology:The Immune System in Health and Disease.5th edition G.Science,Editor.2001,Garland Science。
MHC I及びII発現の欠如のために、K562細胞は、TILとRaji細胞との共培養を比較するベースライン活性化レベルを提供する。CD28に対するマウスモノクローナル抗体を添加して、T細胞応答を増幅するための共刺激を提供した。PBMCを、MLR応答の陽性対照として各TILロットと共培養した。
パイロット実験のために十分な細胞が利用可能であることを確実にするために、Raji細胞を、照射前に、160×10を超えるまで拡張した。
腫瘍細胞試料の解凍及び培養。K562及びRaji腫瘍細胞を解凍し、10~14日間培養して、細胞を解凍から回復させ、培地に適応させ、実験前に適切な数に拡張した。200mLの培地を37℃の水浴内で15±5分間温めた。腫瘍細胞試料の各々について、10mLの温かい培地を用いて50mLのコニカルチューブを調製し、腫瘍株の名前をラベル付けした。
小さな氷の塊のみが残るまで、2×10~10×10細胞/1mLバイアルを含有する細胞の単一バイアルを、37℃の水浴中で解凍した。部分的に解凍されたバイアルをBSCの中に移した。解凍した腫瘍細胞の内容物を、指定されたコニカルチューブに移した。0.5mLの温かい培地をクライオバイアルにゆっくりと滴下添加し、バイアルを回転させながら培地を追加して混合する。上下に5~6回ゆっくりとピペッティングすることにより、クライオバイアルの内容物を混合した。バイアルの内容物を、50mLのコニカルチューブに移した。
コニカルチューブを400×gで5分間、室温(RT)で一緒に遠心分離した。細胞ペレットを避けて、各チューブから上清を取り出した。チューブをチューブラックに軽くこすって、細胞ペレットを緩める。細胞を毎日チェックし、細胞が約70~80%コンフルエントである場合は1:4に分割する。
腫瘍細胞の採取。フラスコまたはプレートから懸濁液中の腫瘍細胞を取り出し、腫瘍培地を有する50mLのコニカルチューブに追加した。フラスコを1×PBSまたは腫瘍培地ですすぎ、内容物を50mLのコニカルチューブに追加する。
コニカルチューブを400×gで5分間、RTで一緒に遠心分離した。細胞ペレットを避けて、各チューブから上清を慎重に取り出した。チューブをチューブラックに軽くこすって、細胞ペレットを緩める。1mLピペッターを使用して、TILを1mL培地中に再懸濁し、上下にゆっくりとピペットしてペレットをさらに破砕した。血清学的ピペットを使用して、培地を用いて細胞懸濁液を5mLにした。血清学的ピペットを用いて細胞懸濁液を上下にピペットして、完全に混合した。2つの200μLアリコートの細胞懸濁液を取り出して、K2セルカウンター上で計数した。
K562及びRaji細胞の照射。腫瘍細胞を160×10細胞を超えて拡張した後、細胞を標準的な操作手順を使用して35Gyで照射した。
照射後、K2セルカウンターを使用して細胞を計数し、生存率について評価する。次いで、細胞を、CryoStor CS10 Freeze Media(BioLife Solutions,Washington、カタログ番号210373)中、10×10細胞/mLでデュワー内で凍結させる。
TILの解凍及び回復。200mLのTIL培地(CM1)を37℃の水浴中で15±5分間温めた後、BSCに入れた。IL-2ストック溶液を調製した(6×10IU/mL)。温かい培地及びIL-2ストック溶液をBSCに移した。10μLのIL-2ストック溶液(6×10IU/mL)を培地に添加することによって、300IU/mLのIL-2で培地を補充する。
各TILロットについて、10mLの温かい培地を有する50mLのコニカルチューブを準備した。チューブにTIL番号をラベル付けする。TIL製品の利用可能性及び1バイアル当たりの細胞数に基づいて、TILロット当たり合計60×10細胞を取得するのに十分なバイアルを解凍する。
氷の小さな塊のみが残るまで、37℃の水浴中で凍結したTILバイアルを解凍した。解凍したバイアルをBSCの中に移す。解凍したTILバイアル及びPBMCの内容物を、指定されたコニカルチューブに移した。0.5mLの温かい培地をTILバイアルにゆっくりと滴下添加し、バイアルを回転させながら培地を追加して混合した。上下に5~6回ゆっくりとピペッティングすることにより、TILバイアルの内容物を混合した。TILバイアルの内容物を、50mLのコニカルチューブに移した。
コニカルチューブを400×gで5分間、RTで一緒に遠心分離した。細胞ペレットを避けて、各チューブから上清を慎重に取り出した。チューブをチューブラックに軽くこすって、細胞ペレットを緩める。1mLピペッターを使用して、TILを1mLのTIL培地中に再懸濁し、上下にゆっくりとピペットしてペレットをさらに破砕した。血清学的ピペットを使用して、培地を用いて細胞懸濁液を5mLにした。
血清学的ピペットを用いて細胞懸濁液を上下にピペットして、完全に混合した。2つの200μLアリコートの細胞懸濁液を取り出して、K2セルカウンター上で計数した。TILを、CM1培地及び3000IU/mLのIL-2中で1.5×10/3×10細胞/mLの濃度に再懸濁した。細胞を、G-Rex 10フラスコまたはG-Rex 6ウェルプレートのいずれかを使用して、48~72時間、37℃/5% COで回復させた。
共培養のためのTIL調製。200mLの培地を37℃の水浴中で15±5分間温めた後、BSCに入れた。10mLの温かい培地を有する50mLのコニカルチューブを準備した。G-Rex 10フラスコまたはG-Rex6ウェルプレートからTILを採取し、指定されたコニカルチューブに細胞を移す。コニカルチューブを400×gで5分間、RTで一緒に遠心分離した。
細胞ペレットを避けて、各チューブから上清を慎重に取り出した。チューブをチューブラックに軽くこすって、細胞ペレットを緩める。1mLピペッターを使用して、TILを1mL培地中に再懸濁し、上下にゆっくりとピペットしてペレットをさらに破砕する。血清学的ピペットを使用して、培地を用いて細胞懸濁液を2mLにした。血清学的ピペットを用いて細胞懸濁液を上下にピペットして、完全に混合した。2つの200μLアリコートの細胞懸濁液を取り出して、K2セルカウンター上で計数した。
TIL培地中で、TILを5×10細胞/mLに再懸濁した。共培養のために、照射されたK562細胞、Raji細胞、及びPBMCを解凍した。200mLの培地を37℃の水浴中で15±5分間温めた。温かい培地をBSCに移した。各細胞株について、10mLの温かい培地を有する50mLのコニカルチューブを準備した。
氷の小さな塊のみが残るまで、37℃の水浴中で凍結した腫瘍細胞株を解凍した。解凍したサテライトバイアルをBSCの中に移した。解凍した腫瘍細胞の内容物を、指定されたコニカルチューブに移した。0.5mLの温かい培地をクライオバイアルにゆっくりと滴下添加し、バイアルを回転させながら培地を追加して混合した。上下に5~6回ゆっくりとピペッティングすることにより、バイアルの内容物を混合した。細胞内容物を、50mLのコニカルチューブに移した。
コニカルチューブを400×gで5分間、室温(RT)で一緒に遠心分離した。細胞ペレットを避けて、各チューブから上清を慎重に取り出した。チューブをチューブラックに軽くこすって、細胞ペレットを緩める。1mLピペッターを使用して、TILを1mL培地中に再懸濁し、上下にゆっくりとピペットしてペレットをさらに破砕した。血清学的ピペットを使用して、培地を用いて細胞懸濁液を5mLにした。血清学的ピペットを用いて細胞懸濁液を上下にピペットして、完全に混合した。2つの200μLアリコートの細胞懸濁液を取り出して、K2セルカウンター上で計数した。TILが調製されると、細胞を腫瘍培地中で5×10細胞/mLの濃度に再懸濁し、共培養のためにインキュベーターに入れた。
TIL及び腫瘍細胞共培養の設定。各TILロットを、TIL:標的比及び以下に示される細胞数+/-抗CD28(5μg/mL)抗体を使用して、照射されたK562細胞、Raji細胞、及びPBMC(3~4人のドナー)またはビーズ刺激とは別個に共培養した。1×10個の総細胞を、48ウェルプレートの1ウェル中の1mLにプレートする。実験的設定は、パイロット及び主研究に対して同じである。図47で見ることができるように、TILロット当たり1つのプレートが必要であり、追加の対照ウェルを追加のプレートで実行する。
●50:1(9.8×10TIL:2×10標的細胞)
●25:1(9.6×10TIL:4×10標的細胞)
●12.5:1(9.2×10TIL:8×10標的細胞)
●6.25:1(8.4×10TIL:1.5×10標的細胞)
●1:1(5×10TIL:5×10標的細胞)
●1:6.25(1.5×10TIL:8.4×10標的細胞)
●1:12.5(8×10TIL:9.2×10標的細胞)
●1:25(4×10TIL:9.6×10標的細胞)
5mg/mLの抗CD28を示されたウェルに追加した。TIL培地でウェルの容量を1000μLにした。αCD3/αCD28/α4-1BBビーズを含有するウェルについては、製造業者の指示に従って洗浄、調製し、ビーズを追加した。TILロット当たりおよそ27.0×10TIL及び9×10標的細胞が必要である。
プレートをインキュベーター(5% CO、37℃)内で、選択した培養期間インキュベートした。2つのGen2研究試料を用いたパイロット研究の場合、プレートを、様々な時点(すなわち、6、12、18、及び24時間)でインキュベートしる。最適共培養期間は、最も高いRaji/K562活性化値をもたらすものとして定義され、6つのGen2 TIL臨床試料に適用された。
活性化マーカーの発現を評価するための細胞の収集。細胞懸濁液を48ウェルプレートから取り出し、事前にラベル付けされたFACSチューブに入れた。およそ3mLの1×PBSを各チューブに追加した。チューブを、室温で5分間、400×g、高加速及びブレーキで回転させた。上清をデカントした。細胞を、表50に示される例示的な抗体パネルで染色した。

Figure 2024512029000056
染色の完了時に、フローサイトメーター上で収集する準備が整うまで、試料を暗所で40℃で保管し、24時間以内にZe5上でデータを取得した。FlowJoソフトウェアを使用して、フローサイトメトリーデータを分析した。結果を、生体CD3+CD4+細胞及びCD3+CD8+細胞のマーカー陽性細胞パーセントとして表した。
上清の収集及びサイトカインの評価。インキュベーターからプレートを取り出した。プレートの底部にある細胞を乱さないこと。各ウェルの上部から80μLの上清を取り出し、80μLの試料を96ウェルUプレートに移した。さらに2つの96ウェルプレートでこのステップを繰り返して、2つのバックアッププレートを作成した。各96ウェルプレートを接着シールで密封し、プレートを-80℃の冷凍庫で保管する。結果を図35~図38に示す。
次いで、上清をELLAプラットフォームを使用して、IFN-γ、CCL4、グランザイムB、TNF-α、及びMIP-1β分泌について評価した。IFN-γの結果を図39に示す。CCL4の結果を図40に示す。グランザイムBの結果を図41に示す。プレートレイアウトを図42に示す。
実施例15:6つのTIL試料のTIL効力評価
実施例14に記載されるようなRaji細胞ベースの共培養システムを使用して、合計6つのGen2黒色腫TILロットを評価した。K562細胞を、HLA陰性対照として使用した。TIL試料を、活性化及び分泌されたサイトカインの表現型マーカーについて分析した。複数の追加のサイトカインまたは他の分泌タンパク質は、ELISAまたは自動ELISA方法を使用して監視することができる。一般的な実験スキームを図42に示す。
図43~図54は、このTIL試料のセットでの共培養効力アッセイを用いた実験の結果を示す。臨床応答を有する患者は、付随する研究で使用される基準によって分離され、応答しなかった患者から分離されるが、患者の応答状態は、アッセイの使用またはデータの分析を制限するものではない。実験は、アッセイが、Raji細胞との共培養時に、IFN-γ及びグランザイムB分泌を検出する能力を実証した。6つのGen2 TIL試料にわたって、TIL-Raji細胞共培養アッセイによって決定されたIFN-γの範囲は、42.1pg/mL(301-001)~3708pg/mLであった(患者008-002)。TIL-Raji細胞共培養アッセイによって決定されたグランザイムBの範囲は、568.3pg/mL(301-001)~8721.33pg/mL(008-002)であった。
実施例16:22個のTIL試料の多機能TIL効力評価
この実施例では、多機能性TIL効力アッセイの様々な実施形態は、TILロットの効力を評価するために、K562細胞ベースの陰性対照共培養システムと併せて使用されるRaji細胞ベースの共培養システムを使用して実証される。K562細胞及びRaji細胞を解凍し、計数し、6ウェルプレートまたはT25フラスコ内で10~14日間拡張した。細胞数が>160×10に達すると、細胞を35Gyで照射し、等分し、後で使用するために凍結した。Gen2 TILロットを解凍して計数し、共培養の前に48~72時間培養して回復させた。照射されたK562及びRaji細胞を解凍し、一定数のTIL(500,000細胞)とともに、3つのTIL:標的比(3:1、1:1、1:3)を使用してTILと共培養した。TILロットはまた、任意選択の陽性活性化対照を提供するために、抗CD3/CD28/41BBでコーティングされた磁気ビーズで刺激される。TIL及び腫瘍細胞株のみの対照も含まれる。共培養の開始後12及び18時間で上清を採取する。上清を、ELLA自動ELISAベースのプラットフォームを使用して、サイトカインについて評価する。2つの細胞株をTILと共培養する。野生型Raji(カタログ番号CCL-86)及びK562(カタログ番号CCL-243)細胞を、ATCCから商業的に取得した。Raji細胞は、バーキットリンパ腫を有する患者に由来するヒトBリンパ芽球様細胞株である。K562は、骨髄性白血病細胞株である。Raji細胞のHLA型を使用前に検証した。
当業者に知られている一般に利用可能な実験室材料に加えて、以下の材料をこの実施例に使用した。RPMI 1640培地(ATCC,VA,USA、カタログ番号ATCC 30-2001)、グルタミン酸塩(Gibco,MA,USA、カタログ番号30050-061)、β-メルカプトエタノール(Gibco,MA,USA、カタログ番号21985-023)、TIL用のヒトAB血清(Gemini,CA,USA、カタログ番号100-512)、腫瘍細胞株用のウシ胎児血清(ATCC,VA,USA、カタログ番号ATCC 30-2020)、ゲンタマイシン(Gibco,MA,USA、カタログ番号15750-060)、GMP組換えIL-2(CellGenix,Germany、カタログ番号1020-1000)、ハンクス平衡塩溶液、またはHBSS(Gibco,MA,USA、カタログ番号14175-095)、CELLSTAR T25フラスコ(Fisher Scientific,MA,USA、カタログ番号07-000-225)、G-Rex6、24ウェルプレート、及び10フラスコ(Wilson Wolf,MN,USA、カタログ番号P/N80240M、P/N80192M;番号80040S)、IFN-γ(第3世代)、グランザイムB、TNF-α(第2世代)、及びMIP-1α(BioAgilytix,NC,USA、キットID127725)用のELLAヒトマルチアナライトカートリッジ、ヒトサイトカイン凍結乾燥対照(BioAgilytix,NC,USA、カタログ番号89077)、及びCryoStor CS10凍結培地(BioLife Solutions,WA,USA、カタログ番号210373)。
当業者に知られている一般に利用可能な実験室装置に加えて、以下の装置をこの実施例に使用した。Protein Simple ELLA(BioAgilytix,NC,USA、カタログ番号500-140)、K2セルカウンター(Nexcelom,MA,USA)、K2 Counting Chambers(Nexcelom,MA,USA、カタログ番号SD100)、JUN-AIR、モデル84R-RP真空ポンプ(Sony,NY,USA)、及びSteri-Cycle i160 CO2インキュベーター(ThermoFisher Scientific,MA,USA、カタログ番号51030301)。
22個の無作為に選択された黒色腫Gen2 TILロットを、照射されたRaji細胞及びK562細胞との共培養時の活性化について試験した。
理論に拘束されることなく、本発明のある実施形態では、TIL TCR複合体と標的細胞HLA-ペプチド複合体との同種異系相互作用は、図56に示され、本明細書の他の箇所にも記載されるように、MHC優性認識としてのものである。MHC I及びII発現の欠如のために、K562細胞は、TILとRaji細胞との共培養を比較することができるベースライン活性化レベルを提供すると予想される。TIL単独の培養物をベースラインとして使用することもできる。
腫瘍細胞試料の解凍及び培養。K562及びRaji腫瘍細胞を解凍し、10~14日間培養して、細胞を解凍から回復させ、培地に適応させ、研究前に適切な数に拡張した。培地(200mL)を37℃の水浴中で15±5分間温めた後、BSCに入れた。腫瘍細胞試料の各々について、10mLの温かい培地を有する50mLのコニカルチューブを準備した。チューブには、腫瘍株名をラベル付けする。小さな氷の塊のみが残るまで、2×10~10×10細胞/1mLバイアルを含有する細胞の単一バイアルを、37℃の水浴中で解凍した。部分的に解凍されたバイアルを、生物学的安全キャビネットに移した。解凍した腫瘍細胞の内容物を指定されたコニカルチューブに移し、0.5mLの温かい培地をクライオバイアルにゆっくりと滴下添加し、バイアルを回転させながら培地を追加して混合した。次いで、上下に5~6回ゆっくりとピペッティングすることにより、クライオバイアルの内容物を混合した。バイアルの内容物を、50mLのコニカルチューブに移した。コニカルチューブを400×gで5分間、室温(RT)で遠心分離した。細胞ペレットを避けて、各チューブから上清を慎重に取り出した。チューブをチューブラックに軽くこすって、細胞ペレットを緩めた。細胞を毎日チェックし、細胞が約70~80%コンフルエントである場合は1:4に分割した。
腫瘍細胞の採取。フラスコまたはプレートから懸濁液中の腫瘍細胞を取り出し、腫瘍培地を有する50mLのコニカルチューブに追加した。フラスコを1×PBSまたは腫瘍培地ですすぎ、内容物を50mLのコニカルチューブに追加した。コニカルチューブを400×gで5分間、RTで一緒に遠心分離した。細胞ペレットを避けて、各チューブから上清を慎重に取り出した。チューブをチューブラックに軽くこすって、細胞ペレットを緩めた。1mLピペッターを使用して、TILを1mL培地中に再懸濁し、上下にゆっくりとピペットしてペレットをさらに破砕した。血清学的ピペットを使用して、細胞懸濁液を培地を用いて5mLにした。血清学的ピペットを用いて細胞懸濁液を上下にピペットして、完全に混合した。次いで、2つの200μLアリコートの細胞懸濁液を取り出して、K2セルカウンター上で計数した。
K562及びRaji細胞の照射。Raji細胞及びK562細胞を>160×10細胞に拡張した後、細胞を35Gyで照射した。照射後、K2セルカウンターを使用して細胞を計数し、生存率について評価した。細胞を、CryoStor CS10中10×10細胞/mLで凍結した。
TILの解凍及び回復。200mLのTIL培地(CM1)を37℃の水浴内で15±5分間温めた後、生物学的安全キャビネット(BSC)に入れる。IL-2ストック溶液(6×10IU/mL)を調製し、温かい培地を有するBSCに移す。10μLのIL-2ストック溶液(6×10IU/mL)を培地に添加することによって、300IU/mLのIL-2で培地を補充する。各TILロットについて、50mLのコニカルチューブを10mLの温かい培地とともに調製し、TILロット番号をラベル付けする。TIL製品の利用可能性及び1バイアル当たりの細胞数に基づいて、TILロット当たり合計60×10細胞を取得するのに十分なバイアルを解凍する。氷の小さな塊のみが残るまで、凍結したTILバイアルを37℃の水浴中で解凍した。解凍されたバイアルをBSCの中に移す。次いで、解凍されたTILバイアル及びPBMC(後者は、MLR陽性対照として使用される)の内容物を、指定されたコニカルチューブに移す。温かい培地(0.5mL)をTILバイアルにゆっくりと滴下添加しながら、バイアルを回転させ、培地を追加して混合する。上下に5~6回ゆっくりとピペッティングすることにより、TILバイアルの内容物を混合する。TILバイアルの内容物を、50mLのコニカルチューブに移す。コニカルチューブを400×gで5分間、RTで一緒に遠心分離する。細胞ペレットを避けて、各チューブから上清を慎重に取り出す。チューブをチューブラックに軽くこすって、細胞ペレットを緩める。1mLピペッターを使用して、TILロットを1mL TIL培地中に再懸濁し、上下にゆっくりとピペットしてペレットをさらに破砕した。血清学的ピペットを使用して、細胞懸濁液を培地で5mLにし、懸濁液を上下にピペットして完全に混合する。2つの200μLアリコートの細胞懸濁液を取り出して、K2セルカウンター上で計数する。TILロットを、CM1培地及び3000IU/mLのIL-2中で1.5×10/3×10細胞/mLの濃度に再懸濁する。細胞を、G-Rex 10フラスコまたはG-Rex 6ウェルプレートのいずれかを使用して、48~72時間、37℃/5% COで回復させる。
共培養のためのTIL調製。200mLの培地を37℃の水浴中で15±5分間温めた後、BSCに入れる。50mLのコニカルチューブを、10mLの温かい培地で準備する。G-Rex 10フラスコまたはG-Rex6ウェルプレートからTIL試料を採取し、指定されたコニカルチューブに移す。コニカルチューブを400×gで5分間、RTで一緒に遠心分離する。細胞ペレットを避けて、各チューブから上清を慎重に。チューブをチューブラックに軽くこすって、細胞ペレットを緩める。1mLピペッターを使用して、TILロットを1mL培地中に再懸濁し、上下にゆっくりとピペットしてペレットをさらに破砕する。血清学的ピペットを使用して、細胞懸濁液を培地で2mLにし、上下にピペットして完全に混合する。2つの200μLアリコートの細胞懸濁液を取り出して、K2セルカウンター上で計数する。TILロットを、TIL培地中5×10細胞/mLで再懸濁する。
共培養のために照射されたK562細胞、Raji細胞、及びPBMCを解凍する。200mLの培地を37℃の水浴中で15±5分間温めた後、BSCに入れる。温かい培地をBSCに移す。各細胞株について、50mLのコニカルチューブを10mLの温かい培地で準備し、適切にラベル付けする。氷の小さな塊のみが残るまで、凍結したK562及びRaji細胞を37℃の水浴中で解凍する。解凍されたサテライトバイアルをBSCの中に移す。解凍したK562及びRaji細胞の内容物を指定されたコニカルチューブに移し、0.5mLの温かい培地をクライオバイアルにゆっくりと滴下添加し、バイアルを回転させながら培地を追加して混合する。上下に5~6回ゆっくりとピペッティングすることにより、バイアルの内容物を混合する。細胞内容物を、50mLのコニカルチューブに移す。コニカルチューブを400×gで5分間、RTで一緒に遠心分離する。細胞ペレットを避けて、各チューブから上清を慎重に取り出す。チューブをチューブラックに軽くこすって、細胞ペレットを緩める。1mLピペッターを使用して、TILを1mL培地中に再懸濁し、上下にゆっくりとピペットしてペレットをさらに破砕する。血清学的ピペットを使用して、細胞懸濁液を培地で5mLにし、血清学的ピペットで上下にピペットして完全に混合する。2つの200μLアリコートの細胞懸濁液を取り出して、K2セルカウンター上で計数する。TIL試料が調製されると、細胞を腫瘍培地中で5×10細胞/mLの濃度に再懸濁し、共培養のためにインキュベーターに入れる。
TIL及び腫瘍細胞共培養の設定。各TILロットは、以下のTIL:標的比を使用して、照射されたK562細胞及びRaji細胞と別個に共培養される:3:1(5.0×10:1.67×10)、1:1(5.0×10:5.0×10)、及び1:3(5.0×10:1.5×10)。共培養のためのTIL試料は、以下に見ることができるように、合計24条件について、3回、48ウェルプレートの1ウェル中の1mLに、すべての条件で500,000個の細胞でプレートされる。プレート当たり2つのGen2 TIL株を実行することができる。一度に最大3つのプレートを設定する。1mLの培地を追加して、1ウェル当たり合計2mLにする。αCD3/αCD28/α41BBビーズ(本明細書の他の箇所に記載される任意選択の対照として使用される)を含有するウェルについて、製造業者の指示に従ってビーズを洗浄し、調製し、追加する。プレートを、選択した培養期間インキュベートする(5% CO、37℃)。プレートレイアウトを図57に示し、一般的な実験スキームを図58に示す。
上清の収集及びサイトカインの評価。プレートの底部の細胞を乱すことなく、インキュベーターからプレートを取り出す。12時間及び18時間の共培養で、50μLの上清を取り出し、エッペンドルフチューブまたは96ウェルUプレートのいずれかに移す。さらに2つの96ウェルプレートでこのステップを繰り返して、2つのバックアッププレートを作成する。プレートには、試料を識別するためにラベル付けする。バックアッププレートを、-80℃で保管する。各96ウェルプレートを接着シールで密封し、使用するまで4℃で保管する。上清を、ELLAプラットフォームを使用して、IFN-γ及びグランザイムBについて評価する。追加のフローサイトメトリー実験を行って、CD25、CD69、CD134、CD137、またはCD150などの本明細書に記載される関心対象のマーカーを評価してもよい。
結果。22個のTIL試料の結果を図59~図97に示す。すべての実験は、試料007-016(2回行ったRaji細胞及びK562細胞を用いた1:3の比条件を除いて、1回行った)、試料019-006(すべての条件で2回行った)、及び022-001(すべての条件で1回行った)を除き、3回行った。IFN-γ及びグランザイムBの結果については、12時間及び18時間の共培養期間の両方を示し、TNF-αの結果については、18時間の共培養期間を示す。結果は、IFN-γ及びグランザイムの産生の倍率増加を示すためにK562陰性対照細胞株とともに使用された場合を含む、様々なTIL試料に対するアッセイの驚くほど良好な性能を示し、共培養システムを使用して、同種異系MHC-TCRエンゲージメントを介してTILを活性化し、Gen2の製造、凍結保存及び解凍後のTIL製品の効力の尺度を提供したことを実証する。アッセイは、本質的に多官能性であり、1つの分析物または分析物の組み合わせを効率的に選択することを可能にする。一般に、IFN-γ及びグランザイムBの両方を考慮する場合、18時間の共培養時点は、より堅牢な時点であった。TNF-αもまた、12時間の時点で評価され、好適であれば利用され得る。1:3(TIL:標的)比は、この実施例で最大のサイトカイン分泌をもたらした。TIL:標的比の範囲にわたる用量反応は、TNF-αについて驚くほど顕著であった。TIL:標的比は、例えば、1:5、1:10、または1:20に増加され得る。
実施例17:回復時間の評価
この実施例では、冷凍TIL製品の解凍後の回復時間を調べる。実験スキーム(これもまた本発明の実施形態である)を図98に示す。Gen2プロセスを使用して調製した5つの研究TILロットを解凍し、解凍後72時間、48時間、または24時間のいずれかで回復させ、実施例16に記載の方法を使用して、Raji細胞及びK562細胞と1:3のTIL:標的比で共培養したときにIFN-γ及びグランザイムBについて評価した。結果を、ロットM1173については図99、ロットM1152については図100、ロットM1187については図101、ロットM1179については図102、及びロットM1183については図103に示す。IFN-γの結果を図104及び105に要約し、グランザイムBの結果を図106及び107に要約する。IFN-γの3つの読み出し(絶対値、TILに対する倍率、及びTIL+K562細胞に対する倍率)はすべて、回収条件にわたって類似していた。72時間のTIL回収は、グランザイムB分泌について、TIL+K562よりも大きなTIL+Rajiの倍率誘導をもたらした。24時間の回収試料で、低減した細胞収率及び生存率が観察された。
実施例18:マスターセルバンクの調製
この実施例では、マスターセルバンクを、Raji細胞株及びK562細胞株に対して調製する。かかるマスターセルバンクは、ヒト使用のためのTIL製品、MIL製品、またはPBL製品の放出及び/または安定性試験のためのアッセイでの使用に好適であり、かかる製品は、米国食品医薬品局などの保健当局によって規制されている。パイロット研究は、まず、25本のバイアルを使用して行い、次いで、本発明の1つ以上の効力アッセイにおける性能について評価する。次いで、Raji細胞株及びK562細胞株のマスターセルバンクを、バイアル当たり1mLの体積で、1mL当たり5×10~5×10細胞を含有する500バイアルを使用して調製する。必要に応じて細胞培養拡張を行う。次いで、直接接種による方法適合性試験、直接接種による無菌性、DNA増幅による急速なマイコプラズマ検出のための干渉試験、DNA増幅による急速なマイコプラズマ検出、インビトロ不定期ウイルスアッセイ検出(細胞株MRC-5、Vero、及びHeLa、ウイルスPIV-5)、ならびにシトクロムCオキシダーゼサブユニット1による同定を含む、特性評価及び放出を行う。分析証明書及びバッチ記録を作成する。次いで、Raji細胞株及びK562細胞株は、方法の検証及び試験手順での使用に好適に適格性確認される。Ramos、U937、Thp1、及びDaudi細胞のマスターセルバンクも同様に調製され得る。
実施例19:THP1細胞を用いたアロ反応性共培養アッセイ
この実施例では、TILとThp1(THP-1としても知られる)標的細胞株、ヒト単球性白血病細胞株との共培養を使用したアロ反応性共培養アッセイの実施形態が実証される。理論に拘束されることなく、TIL活性化は、図108に示されるように、Thp1細胞の表面でのマッチしないペプチド-MHC複合体(MHCp)のTCRによる同種認識時に誘導されると考えられる。このアッセイで読み出されるのは、標的細胞の死滅であり、これは、レポーター化学発光タンパク質の放出によって検出され得る。このアッセイは、例えば、本明細書の他の箇所に記載されるように、マスターセルバンク及びワーキングセルバンクを作製するために、GMP条件下で産生される標的細胞株の使用を必要とする。標的細胞は、β-gal酵素断片であるProLabel(登録商標)(ePL)でタグ付けされたハウスキーピングタンパク質を安定的に発現するように操作される。TIL、MIL、またはPBLを含むT細胞との共培養時、及び細胞傷害性媒介性膜破壊後に、ePL β-gal断片が培地に放出される。共培養に続いて、β-gal酵素の酵素アクセプター断片を追加し、追加された基質を加水分解する活性β-gal酵素を形成し、死滅した標的細胞の数に比例する化学発光シグナルを産生する。読み出しは、標的細胞死、例えば、Thp1またはRaji細胞の細胞死に特異的であり、それを直接測定する。前述のプロセスを図109に示す。このアッセイの作用機序は、ペプチド同種MHC複合体を認識するT細胞の能力などの同種異系応答(例えば、混合リンパ球反応、またはMLR)である。
遺伝子修飾されたThp1細胞株を、2つのTIL融解後条件(凍結TILロットから開始)を使用して試験した。(1)解凍後18~24時間一晩静置、及び(2)解凍後の静置なし。試験したエフェクター:標的(E:T)比は、第1の条件で35:1~2.5:1、第2の条件で10:1~1:10であった。両方の条件は、1ウェル当たり10,000個の標的細胞を使用した。試験した共培養持続時間は、第1の条件では4時間、8時間、16時間、及び36時間であり、第2の条件では一晩(16~24時間)であった。第1の条件では用量依存性応答及び時間依存性応答、ならびに第2の条件では用量依存性応答によって、細胞傷害性を観察した。図110は、第1の条件からの結果を示す。示されるデータは、3つの実験からの平均である。図111は、第2の条件からの結果を示す。両方の条件について、0%の細胞傷害性シグナルは、エフェクター細胞なしに対応し、100%の細胞傷害性シグナルは、完全に溶解された標的細胞に対応する。
実施例20:共培養中にIL-2を使用したTIL効力方法
この実施例では、本発明の効力方法は、共培養中に連続的に添加される300IU/mLのIL-2を有するAIM-V培地(図112に実施形態B、C、D、及びEとして例示されるように)を使用して、3000IU/mLのIL-2を最初に添加したCM1培地と比較して、上記及び図112に実施形態Aとして例示されるようにさらに評価される。実施形態B、C、D、及びEは、共培養中に添加されるAIM-V中の300IU/mLのIL-2を含み、これは最終的なGen2及びGen3製品製剤の実施形態と一致し、より良いシステム適合性を提供する。AIM-V培地は、最終的な細胞拡張に合わせて血清を含まず、より良いシステム適合性も提供する。共培養中にIL-2を添加して、サイトカイン濃度を増加させる。解凍直後(すなわち、TIL回復のための静置期間なし)の共培養の開始もまた、投与時にTIL医薬品をより密接に表すため、利点を提供し得る。静置期間が長くなると、TILの回復が促進され、安定性を示すものではなく、製造プロセスの失敗を隠すこともある。
図113は、TIL細胞株の解凍後の静置期間の関数として、異なる共培地条件下での、2つの異なるTIL細胞株、M1179及びM1183についての総生細胞数(TVC)及び生存率パーセントの評価の結果を示す。生存率パーセントの減少は、最初の24時間の期間で観察され、24時間超静置したTILでは、TVCの増加及び増殖が観察された(約1倍化/日)。これらの結果は、24時間の静置後に回復したTILが、医薬品の同じ細胞集団を表さない可能性があることを示唆する。両方のTIL細胞株について、解凍後にわずかな減少が観察され、その後に回復が始まる。
300IU/mLのIL-2の有無にかかわらず、Raji細胞及びK562細胞との共培養の比較の結果を、表51、図114、及び図115に示す。TIL株M1179及びM1183の解凍直後(すなわち、静置期間なしで)、AIM-V培地中で実験を行った。結果は、IL-2の添加がIFN-γ分泌を増強することを実証する。IFN-γの絶対濃度値及び倍率変化は、IL-2を添加すると増加する。IL-2は、TIL単独を使用して行った対照のベースラインを増加させることが観察された。反復性を、これらの実験中に共培養複製物にわたって評価した。11%の単一バイアル変動係数(CV)%を取得した。

Figure 2024512029000057
異なる培養条件及び静置期間も調査し、結果を表52、図116、及び図117に示す。結果は、AIM-V及びIL-2が共培養培地で使用される場合、良好なIFN-γ分泌に72時間の回復は必要ないことを示している。

Figure 2024512029000058
解凍後の回復期間が延長されるにつれてサイトカイン分泌効果を決定する実験も行い、結果を表53、図118、及び図119に要約した。これらの実験では、静置時培地は、3000IU/mLのIL-2を有するCM1であり、共培養培地は、300IU/mLのIL-2を有するAIM-Vであった。Raji細胞との共培養についてのすべての条件にわたって、絶対IFN-γ分泌を検出した。TIL単独に対するIFN-γの倍率変化は、すべての静置条件にわたって一貫していた。TIL単独とK562陰性対照の使用との間の倍率変化の差は、24時間を超える時点で観察され、細胞集団の変化を示し得る。
Figure 2024512029000059
72時間にわたる細胞集団の特徴を決定するために、フローサイトメトリー分析を行った。表54及び表55に提供されるように、時間研究を2つの実験で行った。
Figure 2024512029000060


Figure 2024512029000061
これらの設計に続いて、細胞を24ウェルプレート中に1×10/mLの濃度で播種し、5% COで37℃で静置した。細胞を、各特定の時点+/-1時間で採取した。生存率及びTVCを各時点で行った。細胞を、FMO対照を用いた適格性確認された残留フローアッセイを用いて染色し、同日取得を用いるBD FACSCantoフローサイトメーター(BD Biosciences,Inc.,Franklin Lakes,NJ,USA)で取得した。結果を表56及び表57に要約し、実験1及び実験2からのAIM-V+IL2結果を平均した。
Figure 2024512029000062
結果は、全集団のCD45+細胞集団%及びCD3+細胞集団%が、すべての培地においてIL-2で72時間にわたって一貫していたことを示す。しかしながら、生集団のCD45+及びCD3+集団%は、すべての条件で24時間の静置後に約50%減少する。結果は、24時間を超える静置を伴う培地条件(IL-2、血清)にわたって変化する。
Figure 2024512029000063
残留細胞集団は、解凍後のより長い静置で増加することが観察される。例えば、B細胞集団は、IL-2なしで72時間の静置で約20%増加するが、NK細胞は、24時間の静置後に4~5%増加する。医薬品の平均残留細胞集団は、典型的には、<1%である。
図120は、TIL株M1179の親生集団の残留細胞集団のフローサイトメトリー分析を示す。図121及び122は、それぞれ、Raji細胞株及びK562細胞株の増殖プロファイルを示す。
結論として、共培養における300IU/mLでのIL-2の添加は、IL-2を含まない培地上でのIFN-γのサイトカインシグナル及び倍率変化を増加させる。共培養における細胞集団は、静置の24時間後(増殖、分化、及び不均一性を含む)にCM1培地において変化することが観察され、その結果、解凍後及び共培養アッセイを開始する前のTILについての72時間の静置は、製品が回復期間中に回復及び拡張するための可用性を与えられるため、このバージョンのアッセイを製造プロセスの失敗に対する感受性を低くする。AIM-V及びIL-2は、Gen2及びGen3 TIL製品とのマトリックス適合性についてより好適である。干渉のため、リガンド結合アッセイでは血清は推奨されない。
実施例21:黒色腫TIL株及びRAJI、THP1、RAMOS、及びU937標的細胞を用いたアロ反応性共培養アッセイ
この実施例は、K562細胞株陰性対照を含む本発明の効力アッセイにおける、Raji、Thp1、Ramos、及びU937標的細胞株を含む複数の標的細胞株の使用を探求する。実験プロトコルを図123に要約する。
共培養システムを使用して、同種異系MHC-TCRエンゲージメントを介してTILを活性化した。Raji、Ramos、Thp1、及びU937細胞、ならびにK562細胞との共培養時に、4つの研究黒色腫Gen2 TIL製品を、IFN-γ及びTNF-αについて3:1、1:1、及び1:3(TIL対腫瘍細胞)の比で評価した。結果を図124~図129に示す。TNF-α及びIFN-γの両方についてのサイトカイン分泌及び倍率誘導は、評価された腫瘍細胞にわたって可変であった。一般に、ここで選択された4つのTIL細胞株にわたる腫瘍株への応答性は、最大から最小まで、以下のとおりであった:Thp1、U937、Raji、及びRamos。TIL単独またはK562細胞と比較して、Raji細胞に応答して同様のレベルのIFN-γを分泌した4つの評価されたGen2 TIL株のうちの2つは、U937またはThp1のいずれかの存在下で共培養したときにより多くのサイトカインを分泌した。TNF-αは、TILなしで共培養したとき、Raji、Ramos、Thp1、及びU937細胞によって分泌されたが、K562細胞によっては分泌されなかったことが観察された。腫瘍株によって分泌されたTNF-αの量は、異なる株にわたって変化し、腫瘍細胞の数が増加するにつれて増加し、この実施例では、1:3で最も著しい効果が観察された。
本発明の効力アッセイとともに使用するための例示的な標的細胞株のHLA特性を表58に提供する。HLA多様性及び/または免疫原性の可変度は、これらの細胞株及び当該技術分野で知られている他の好適な標的細胞株の使用から入手可能である。

Figure 2024512029000064
図134は、4つの試験した黒色腫TIL株についての異なる標的細胞株及び細胞株の組み合わせのIFN-γ性能を要約する。
図135は、黒色腫TIL株M1152、M1187、M1198、及びM1200についての、組み合わせ標的細胞株を含む、試験した標的及び陰性対照細胞株のTNF-α分泌(pg/mL)を示す。図136は、(TIL+腫瘍細胞株または組み合わせ)/TIL単独の倍率変化としてのTNF-α分泌を示し、図137は、同じ4つの黒色腫TIL株についての(TIL+腫瘍細胞株または組み合わせ)/(TIL+K562)の倍率変化としてのTNF-α分泌を示す。
図138は、黒色腫TIL株M1152、M1187、M1198、及びM1200についての、組み合わせ標的細胞株を含む、試験した標的及び陰性対照細胞株のグランザイムB分泌(pg/mL)を示す。図139は、(TIL+腫瘍細胞株または組み合わせ)/TIL単独の倍率変化としてのグランザイムB分泌を示し、図140は、同じ4つの黒色腫TIL株についての(TIL+腫瘍細胞株または組み合わせ)/(TIL+K562)の倍率変化としてのグランザイムB分泌を示す。
結果は、TIL効力の評価における異なる標的細胞株及びそれらの組み合わせの有効性を実証する。
実施例22:非小細胞肺癌TIL株及びRAJI、THP1、RAMOS、及びU937標的細胞とのアロ反応性共培養アッセイ
図141の実験プロトコルを使用して、異なる標的細胞株及び標的細胞株の組み合わせを使用して、10個の非小細胞肺癌(NSCLC)TIL株を評価した。
10個のNSCLC TIL株のうち4個は、市販のドナー腫瘍から増殖した研究細胞株であった。これらの4つのTIL株からの結果を図142~144に示す。
10個のNSCLC TIL株のうちの他の6個は、Iovance Biotherapeutics,Inc.によってスポンサーされた抗PD-1抗体による治療後のNSCLC患者におけるTIL療法の非登録研究における臨床試験参加者から取得された臨床細胞株であった。これら6個のTIL株からの結果を図145~147に示す。
TIL単独に対する倍率としてのIFN-γ分泌の臨床NSCLC結果の要約を図148に示し、K562陰性対照細胞と共培養したTILに対する倍率としてのIFN-γ分泌の臨床NSCLC結果の要約を図149として示す。
この実施例の10個のNSCLCロット及び9個の黒色腫ロットを含む19個のロットの要約を、TIL単独に対する倍率として図150に示し、IFN-γ分泌について、K562陰性対照細胞と共培養したTILに対する倍率として図151に示す。
実施例23:照射された標的細胞と照射されていない標的細胞との比較
照射されたRaji細胞及びK562細胞の使用を、増殖(総生細胞)、300IU/mLのIL-2及びAIM-V培地を用いた実施例20に記載の共培養方法を使用したIFN-γ分泌、ならびにアポトーシスについての散乱及び細胞表面マーカーによる形態及びアネキシンV染色を含むフローサイトメトリー特性を観察することによって、照射されていないRaji細胞及びK562細胞と比較した。照射は、X-Rad 160照射器(Precision X-ray,North Branford,CT,USA)を使用して、30cm及び420rads/分で5000radsの条件で行った。
図152は、Raji細胞及びK562細胞の照射が、一般に、24時間の共培養時間中に増殖に対して最小限の影響を及ぼしたことを示す。24時間の培養において、照射されたRaji細胞は、濃度にわたって増殖を18~27%増加させた。24時間の培養において、照射されていないRaji細胞は、濃度にわたって増殖を2~14%増加させた。24時間の培養において、照射されたK562細胞は、濃度にわたって15%減少~8%増加まで変化した。24時間の培養において、照射されていないK562細胞は、濃度にわたって増殖を14~34%増加させた。
図153は、試験した2つの子宮頸癌TILロットを使用して、照射されていないRaji細胞対照射されたRaji細胞で刺激した場合、TIL株が、より高い濃度のIFN-γを分泌することが見出されたことを示す。
表59及び図154のフローサイトメトリー結果は、照射が、2つの監視された細胞表面マーカーならびにHLAクラスI発現を減少させることが観察されたことを実証する。

Figure 2024512029000065
結果は、照射されていないRaji細胞及びK562細胞の増殖が、24時間、効力アッセイの実施に好適な共培養期間中わずかであったことを示した。24時間にわたる照射されていないRaji細胞の増殖(14%未満)は、照射されたRaji細胞の増殖(27%未満)よりも小さく、したがって、照射は、ここで使用されるTIL株を有するRaji細胞の24時間培養期間中の増殖の増加にほとんど影響を及ぼさなかった。IFN-γ分泌は、非照射条件に対して照射条件において減少し、これは一般に、照射されたRaji細胞におけるHLA-ABCの下方調節(MFIによって-26%)と相関していた。また、フローサイトメトリーによる前方対側方散乱観察を使用して、照射がK562及びRajiの両方で形態学的変化を誘導することが観察された。最後に、アネキシンV染色によって観察されるように非照射条件と比較して、Raji細胞の照射条件を使用して後期アポトーシスを増加させ、K562のアポトーシスのすべての段階にわたって増加させた。
要約すると、結果は、非照射Raji及びK562細胞が本発明の効力アッセイとともに使用され得ること、または代替的に、Raji(または他の標的細胞)のみが照射され得ること、またはK562細胞のみが照射され得ることを実証した。
実施例24:共培養条件の評価
照射されていないRaji標的細胞、1ウェル当たり1×10~2×10TILの範囲内の密度で播種されたTIL、及び1:1及び3:1の比の中間点に特異的な濃度範囲のRaji細胞(500,000細胞)を有する、300IU/mLのIL-2及びAIM-V培地を用いた実施例20に記載の共培養方法を使用する。IFN-γの放出を、18、24、及び30時間の3つの共培養期間にわたって3回評価した。結果を表60及び図155に示す。

Figure 2024512029000066
結果は、30時間でのシグナル飽和の証拠を示さず、TIL値にわたる倍率変化は、時点に対して比較的非感受性であった。TIL単独からのIFN-γシグナルは、30時間で最小の増加を示した。
実施例25:腫瘍標的細胞株の比較
実施例20に一般的に記載されている300IU/mLのIL-2及びAIM-V培地との共培養方法を使用して、この実施例では、腫瘍標的細胞株の追加の比較を行った。照射されていないThp1、U937、及びRaji細胞株を使用した。同様の比較は、本明細書で提供される教示に基づいて、他の方法、腫瘍標的細胞株、及び陰性対照を使用して行うことができる。図156は、12個の黒色腫TIL株の研究のための実験設計を示す。表61は、各実験のTIL及び標的細胞の数をまとめたものである。
Figure 2024512029000067
(対照としてのTIL単独に対する)1.0×10TVC/ウェルの結果を図157に要約し、(対照としてのTIL単独に対する)2.0×10TVC/ウェルの結果を図158に要約し、(対照としてのK562細胞に対する)1.0×10TVC/ウェルの結果を図159に要約し、(対照としてのK562に対する)2.0×10TVC/ウェルの結果を図160に要約する。一般に、1ウェル当たりの総TILを増加させることは、IFN-γシグナルを増強した。試験したTILロットの大部分について、3:1の比は、試験した3つの腫瘍細胞株すべてについて、IFN-γについて最大のシグナルを実証した。この研究における最適な播種密度は、およそ2×10(TVC/ウェルまたは1ウェル当たりの総細胞)であることが見出された。一般に、Thp1は、驚くべきことに、頑強なIFN-γシグナルを誘導するために、より少ないTIL細胞及びより低いTVCを必要とする。
野生型と遺伝子修飾Thp1(THP-1とも称される)細胞との比較も行った。遺伝子修飾Thp1細胞は、実施例19に記載されるように、殺傷アッセイに使用されてもよい。図161に示される実験手順を行った。結果は、7つのTIL株について、IFN-γの絶対値(pg/mL)については図162に示され、TIL単独に対する倍率変化については図163に示される。結果は、野生型及び遺伝子修飾Thp1が、共培養方法を使用して同様に機能し、IFN-γもしくは他のサイトカインを測定するかどうか、または発光による細胞死を測定するかどうかに応じて(本明細書の他の箇所に記載されているか、または当該技術分野で知られている遺伝子修飾を使用して)、TIL試料の分析に使用され得ることを示す。
実施例26:HLA遮断抗体を使用した陰性対照
本発明の共培養アッセイはまた、K562細胞の使用、標的細胞の遺伝子ノックアウト、または他の細胞ベースの陰性対照の使用の代わりに、またはそれに加えて、HLA遮断抗体を使用する陰性対照によって補充または支持され得る。この実施例は、HLA遮断抗体の使用を示す。理論に拘束されることなく、本発明のアッセイにおけるHLAの提案された遮断を図164に示す。
この実施例で使用したHLA-I遮断抗体は、Biolegend,Inc.(San Diego,CA,USA)から取得されたクローンW6/32(抗HLA-ABC)であり、ultra-leaf精製フォーマットである。この実施例で使用したHLA-II遮断抗体は、BD Biosciences,Inc.(Franklin Lakes,NJ,USA)から取得されたクローンTU39(HLA-DR、DP、DQ)であり、アジ化物及び低エンドトキシン(0.01EU/μg以下(0.001ng/μg以下))を伴わない機能グレードのフォーマットであり、保存剤を含まない緩衝水溶液中で供給され、0.2μm滅菌濾過された。
一般的な実験手順は、以下の通りであった。標的細胞を、HLAクラスI及び/またはクラスII抗体を加えてプレーティングし、TILを添加する前に、少なくとも1~2時間インキュベートした。TIL:標的比は、3:1(1.5×10TIL~5×10標的細胞)であるが、初期実験は1:1のTIL:標的比で行った。各条件は、一般に3回行った。標的細胞を解凍し、AIM-Vに再懸濁し、NC200またはK2セルカウンターで計数した。細胞を、300IU/mLのIL-2を含む1mLのAIM-V培地中、1×10で48ウェル培養プレートに播種した。HLA遮断抗体を、以下の段落に記載の濃度(1~20μg/mLの範囲;ストック濃度は1mg/mLであった)で直ちに添加した。細胞を、37℃で24時間インキュベートした。次いで、細胞を収集し、非結合抗体をリン酸緩衝生理食塩水で洗い流した。以下に示すHLA抗体結合またはアポトーシスについて細胞を染色し、BD FACSCanto IIフローサイトメーター(BD Biosciences,Inc.,Franklin Lakes,NJ,USA)で分析した。
アッセイ標的細胞の生存率に対するHLA-I及びHLA-II遮断抗体の効果を最初に評価した。固定可能な生/死生存能染料で細胞を染色する追加のステップを用いて、上記のThp1及びU937細胞の培養物に添加したHLA-I遮断抗体の結果を図165に示す。結果は、生存能の損失がないことを示す。同様に、固定可能な生/死生存能染料で細胞を染色する追加のステップを用いて、上記のThp1及びU937細胞の培養物に添加したHLA-II遮断抗体の結果を図166に示し、生存能の損失がないことも示す。図167では、Raji野生型細胞は、抗HLA-II抗体の添加及び生/死生存能染色時に生存能の損失を示すことが観察された。しかしながら、HLA-Iを発現しないRaji B2M(ベータ-2マイクログロブリン)ノックアウト細胞株(Sigma-Aldrich,Inc.,St.Louis,MO,USA)は、抗HLA-II抗体を添加し、生/死生存能染料で染色した場合に同じ効果を示さなかった。
次いで、前述の一般的な手順を使用して、TILの生存能に対するHLA-I及びHLA-II遮断抗体の効果を評価した。細胞アポトーシスは、7AAD及びアネキシンVを染色した後、フローサイトメトリーによって検出し、壊死細胞は、7AAD+アネキシンV-を介して検出し、後期アポトーシス細胞は、7AAD+アネキシンV+を介して検出し、早期アポトーシス細胞は、7AAD-アネキシンV+を介して検出し、生細胞は、7AAD-アネキシンV-によって検出した。結果を図168、169、及び170に示す。3つの異なるTIL株について、HLAクラスI及びII遮断抗体で共培養したTILにおいて、毒性は観察されなかった。
HLA-I及びHLA-II抗体の濃度を評価するための滴定実験を、1mL当たり1×10TILの標的細胞濃度に対して、0~20μg/mLの濃度でThp1及びU937細胞株に対して行った。HLA抗体の結合を、表62の薬剤を使用して、ブロック抗体と同じクローンの蛍光団コンジュゲート抗体で細胞を染色することによって分析した。
Figure 2024512029000068
結果を図171に示す。フロー抗体の結合の喪失(平均蛍光強度またはMFIによって報告されるように)は、遮断抗体によって占有される結合部位の量を示す。図171の赤い破線は、蛍光から1レベル差し引いたものを示す。
HLA-I及びHLA-II遮断抗体を有するTIL培養物のIFN-γ ELLA結果を図172に示す。図172の上部プロットは、インキュベーションの18時間後の1×10TILを有する培養物からの結果を示すが、下部プロットは、インキュベーションの24時間後の1.5×10TILからの結果を示す。結果はまた、TIL株に対するHLA-II遮断抗体効果が、5μg/mLでより顕著でなかったことを示した。
陰性対照としてHLA-I、HLA-II、または両方の遮断抗体を使用する本発明の効力アッセイのある特定の実施形態を図173に示し、このアプローチの結果を、IFN-γの絶対値について図174~図178、及びTIL単独に対する倍率増強について図179~図183に示す。陰性対照としてHLA-I、HLA-II、または両方の遮断抗体を使用する本発明の効力アッセイのさらなる実施形態を図184に提供し、このアプローチの結果を、IFN-γの絶対値について図185~図189、及びTIL単独に対する倍率増強について図190~図194に示す。結果は、陰性対照としてのHLA-I及びHLA-II遮断抗体の有効性を示す。抗HLA-I(A、B、C)による遮断は、TIL単独+抗HLA A、B、C抗体対照と同様に、TILとTHP-1またはU937標的細胞との共培養時にIFN-γ分泌を停止させ、効力アッセイのための生陰性対照を実証した。抗HLA-II(DP、DQ、DR)での処理もまた、U937及びTHP-1標的細胞からのIFN-γ分泌の低減をもたらした。抗HLA-I処理単独(10μg/mLで)は、U937及びTHP-1標的細胞によるTILの誘導活性化を下方調節するのに十分であるが、抗HLA-IIの添加もまた、陰性対照として良好に機能する。CD4/CD8比は、評価されたTIL株において可変であった(図185~図194の図の説明を参照)。TILに対するHLA-I及びHLA-II遮断の効果は、CD4及びCD8TILの比率とは無関係であった。HLA遮断抗体の添加は、TIL試料に対してわずかな毒性を有し、培養物中でTIL単独の有害な活性化を引き起こさなかった。Raji B2M細胞は、単独で、またはHLA-II抗体遮断剤と組み合わせても、有用な陰性対照として機能する。
陰性対照としてのHLA遮断(クラスI及びII)の効力、ならびにTCR複合体を介したTILのMHC-ペプチド活性化に対する本明細書に記載の効力アッセイの驚くべき特異性を、15個の黒色腫TIL細胞株においてさらに評価した。図195は、抗HLA-I、抗HLA-II、または両方の遮断抗体を陰性対照として使用する、本発明の効力アッセイのさらなる実施形態を示す。腫瘍細胞株を、+/-10μg/mLのHLAクラスI(抗HLA A、B、C)及び/または+/-5μg/mLのHLAクラスII(抗HLA DP、DQ、DR)遮断抗体で1~2時間前処理した。Gen2プロセスを使用して産生された15個の黒色腫TIL株をすべて、2×10TVCで3:1のTIL:標的比で非照射Raji、Raji β2M KO、THP-1、及びU937腫瘍細胞と24時間共培養した。
結果を、U937については図196に、Thp1については図197に要約する。抗HLA A、B、C抗体による遮断は、(TIL単独+抗HLA A、B、C抗体対照と同様に)TILとTHP-1またはU937との共培養時にIFN-γ分泌を停止させた。抗HLA A、B、Cでの処理単独(10μg/mLで)は、U937及びTHP-1により誘導されるTILの活性化を停止するのに十分であることが見出された。抗HLA DP、DQ、DR抗体(5μg/mL)での処理は、抗HLA A、B、Cによる遮断の程度ではないが、THP-1細胞におけるIFN-γ分泌の低減;及び抗HLA A、B、Cによる遮断と同様の、U937細胞におけるIFN-γ分泌の完全な遮断をもたらした。CD4/CD8比は、評価されたTIL株において可変であった。HLAクラスI及びII遮断の効果は、CD4/CD8細胞の比とは無関係であり、同種異系腫瘍細胞株との共培養時のTILの活性化がHLA制限されていないことを示している。HLA遮断によるIFNγ分泌の停止は、TILの非自己腫瘍細胞株誘導活性化が、TCR-HLAエンゲージメントを介して直接媒介されることを実証した。
実施例27:単球細胞株アッセイデータの平行線分析
この実施例では、平行線分析の使用は、本発明の実施形態であるいくつかのアッセイ及びアッセイ条件について実証される。この研究では、6つの黒色腫TILロットを使用した:M1150A、M1164、M1174、M1163、M1169、及びM1218。各TILロットの7つの濃度(2×10または2e6、1.5×10または1.5e6、1×10または1e6、5×10または5e5、2.5×10または2.5e5、1.25×10または1.25e5、及び6.25×10または6.25e4)を、2つの標的(U937及びThp1細胞)の各々について、7つの標的濃度(1e6、5e5、2.5e5、1.25e5、6.25e4、3.13×10または3.13e4、1.56×10または1.56e4)に対して試験した。アッセイ方法のための最良のTIL濃度を決定するために統計分析を行った。4つのパラメータロジスティック(4PL)分析を使用して、Hills勾配、範囲、及びEC50を決定した。平行線分析(PLA)を回帰(線形性)に使用した。
PLA方法の詳細は、USP Chapter<1032>Design and Development of Biological Assays.USP Pharmacopeial Convention:Rockville,MD,2013、USP Chapter<111>Design and Analysis of Biological Assays.US Pharmacopeial Convention:Rockville,MD,2014、USP Chapter<1033>Biological Assay Validation.USP Pharmacopeial Convention:Rockville,MD,2013、USP Chapter<1034>Analysis of Biological Assays.US Pharmacopeial Convention:Rockville,MD,2013、Hauck,et al.,PDA J.Pharma.Sci.Technol.2005,59(2),127-137、Callahan and Sajjadi,BioProcessing J.2003,2(2),71-77、Findlay,et al.,J.Pharm.Biomed.Anal.2000,21,1249-1273、及びGottschalk and Dunn,J.Biopharm.Stat.2005,15(3),437-463を含む文献に見出すことができ、これらの各々の開示は参照により本明細書に組み込まれる。
2つの標的細胞株(U937及びThp1)のTIL製品の刺激のための条件を決定するために、2つの非限定的な因子を考慮した。(i)用量曲線の線形部分上の最大数の濃度での再現性及び直線性、ならびに(ii)潜在的に、最良のシグナル対ノイズをもたらし得る、IFN-γの最大シグナル。Thp1(図198)及びU937(図199)の有効TIL濃度の関数として、IFN-γを測定した。標的濃度と相関するシグナルの顕著な低下が、6つのTILロットすべてについて見られた。1.5×10及び2.0×10TIL濃度のみが、線形範囲内の標的細胞濃度の4つの(4)濃度を超える用量反応を示した。U937は、Thp1よりも高いIFN-γシグナル及びより大きなシグナル対ノイズを示した。
図200及び図201は、アッセイを使用した6つの黒色腫TIL株の用量反応曲線を示す。1.5×10または2.0×10のTIL濃度は、アッセイ方法で使用するための許容できる結果を提供する。これにより、シグナルが増加し、シグナル対ノイズが改善され、線形線量曲線上の標的濃度が増加する。図202は、1.5×10細胞のTIL濃度でU937標的細胞を使用した6つのTILロットの平行線分析を示す。6つのTILはすべて、この標的細胞株で明確な用量反応を示すことが見られる。図203では、TIL M1173及びTIL M1213のみが明確な用量反応を示す、同じ条件下での同じ6つのTILロットの平行線分析を、Thp1標的細胞を使用して示す。図204及び205は、遮断抗体が、抗HLA-I(10μg/mL)及び抗HLA-II(5μg/mL)による6つのTILロットにわたるU937細胞とのアッセイ特異性を実証することを示す。驚くべきことに、U937細胞株は、Thp1細胞株よりも優れた性能を示した。所与の標的濃度について、U937細胞は、アッセイ方法のこの実施形態において、Thp1細胞よりも大きなIFN-γシグナルを提供する。U937細胞はまた、用量反応曲線の線形部分でより多くの濃度を提供した。4点用量曲線は、曲線ごとに1つの外れ値を除去するオプション及び曲線飽和のためのマスク(これは、最終分析に必要な曲線上の少なくとも3つの点を提供する)を伴う線形適合で使用されてもよい。外れ値のスクリーニング及び除去ならびに曲線飽和度のマスキングは、USP Chapter<1032>Design and Development of Biological Assays,US Pharmacopeial Convention:Rockville,MD,2013(この開示は参照により本明細書に組み込まれる)に記載の通り行われるように行うことができる。さらに、Thp1細胞で試験したTILロットは、ほとんどのTILロットで線形であるために、より低い濃度でのマスキングを必要としたが、U937細胞はこの要件を有していなかった。上部漸近線は、必ずしもThp1細胞で解消されたわけではなく、したがって、Thp1細胞で試験したTILロットにわたって上限範囲が定義されない場合がある。
実施例28:効力及び同一性アッセイマトリックス
この実施例では、効力及び同一性アッセイマトリックスの使用が実証される。効力及び同一性アッセイマトリックスは、TIL製品、MIL製品、及びPBL製品の放出及び安定性試験に使用され得、マトリックスの構成要素として本明細書に記載の効力アッセイを含むことができる。例示的かつ非限定的なアッセイマトリックスが表63に示され、これはまた、本発明の実施形態であり、マトリックスのメンバーを除去または追加するように修飾され得る。アッセイは、適切な場合及び/または必要に応じて、精度、正確性、特異性及び線形性について適格性確認される。
Figure 2024512029000069

Figure 2024512029000070
本明細書に記載される、例えば、実施例14~27に記載される同種異系共培養アッセイは、TCR-HLA相互作用を評価するために使用される。表63に示されるマトリックスは、U937またはThp1細胞を、陽性対照に対する相対効力及び本明細書の実施例27及び他の箇所に記載される平行線分析方法と併せて使用する一例を提示する。HLA遮断抗体を使用する陰性対照を使用して、適格性確認中のTCR-HLA相互作用に対する特異性を実証し、本明細書に記載される陽性対照参照標準に対する相対効力尺度の代替としてルーチン試験中に使用してもよい。この目的のためにバンクされ、特徴付けられた既知のTIL、MIL、またはPBL細胞株(複数可)を使用して、陽性対照を調製する。
例えば、U937共培養アッセイを使用して、以下の手順を使用した。U937細胞をATCCから調達し、2層のGMPセルバンク(MCB、250バイアル、及びWCB、500バイアル)を作製するために使用した。WCBは、バイオアッセイのための使用準備済みの(RTU)GMP非産生バンクとして製造され、バイアルから直接解凍された細胞がアッセイで使用され、それによって、細胞拡張の必要性及び汚染または変動の関連するリスクを排除した。MCBを、生細胞数、生存率%、同一性、無菌性、マイコプラズマ、及びインビトロでの不定の作用物質について試験した。WCBを、生細胞数、生存率%、無菌性、マイコプラズマ、及びインビトロでの不定の作用物質について試験した。MCB及びWCBを、堅牢性の適格性確認パラメータ内の共培養効力アッセイへの継代依存的な影響について評価したところ、著しい差はないことが判明した。陽性対照TILロットは、臨床TIL製品に使用されるのと同じGen2製造プロセスを使用してGMPの下で製造され、参照標準としても使用される。製剤化後、参照標準のための医薬品の全体がバイアルに充填され、次いで、臨床TIL医薬品製造に使用されるのと同じ装置及びプログラムを使用して、制御された速度で凍結される。バイアルを気相液体窒素中で凍結保存する。代表的なバイアルは、無菌性、マイコプラズマ、細胞計数、生存率、同一性、及び効力を含むいくつかの属性について試験され、参照標準として使用するためにTILロットを適格性確認する。適格性確認されると、参照標準の単回使用バイアル(複数可)を解凍し、各アッセイの被験試料とともに試験する。アッセイは、TIL製品ロットを、1ウェル当たり1.5×10TILの定義された設定値で参照標準TILロットとの相対効力について評価して、U937細胞の4つの用量濃度(1ウェル当たり4×10、2×10、1×10、及び0.5×10細胞;各用量濃度で3回行う)で24時間共培養することに信頼性があり、用量依存的に応答する。各U937用量濃度で各複製物から上清に放出されたIFN-γの濃度を測定する。ELLAシステム(本明細書の他の箇所に記載される)を使用して、TIL製品及びU937の共培養アッセイの活性化後のIFN-γ濃度を測定した。Simple Plex 72ウェルIFN-γ 3rd Gen Version 5カートリッジ(BioTechne,Inc.(San Jose,CA,USA)から入手可能、カタログ番号#SPCKB-CS-002697)を使用する。分泌IFN-γの後続の測定のための培地の培養及び保管は、共培養の直前に行う。上清を3つの複製96ウェルプレートに移し、60℃未満で保管する。次いで、プレートを解凍し、IFN-γについて測定する。共培養から収集された上清を、各72ウェルの商業的に検証されたカートリッジでIFN-γ産生についてスクリーニングする。データ分析は、USP<1032>,USP Pharmacopeial Convention:Rockville,MD,2013に従って行う。データを、USP<1032>及びUSP<1033>Biological Assay Validation,USP Pharmacopeial Convention:Rockville,MD,2013に従ってログ変換して、効力範囲にわたる測定値の対称性、正規分布、及び変動性の均質性の要件を満たす。外れ値は、USP<1034>Analysis of Biological Assays,USP Pharmacopeial Convention:Rockville,MD,2013に記載されるように評価し、分析から省く。線形回帰は、曲線の飽和に起因する最も高い濃度または最も低い濃度のいずれかのマスキング(必要であれば)を用いて、4点用量曲線にわたって行う。USP<1032>に従って、「少なくとも3つ、好ましくは4つの隣接する[用量-]濃度を使用し、線形セグメントの勾配が十分に急いでいることを要求し、標準試料及び試験試料に適合する線が直線であり、線が平行であることを要求する」ことが推奨される。平行線分析は、USP<1032>に従って、TIL被験試料とRSの間で行う。平行度によって測定された参照標準とTIL被験試料との間の統計的類似性は、TIL被験試料の参照標準に対する生物学的類似性を実証する。平行度勾配比、線形性比、回帰(R)及び二乗平均平方根誤差(RMSE)を計算し、報告する。平行度及び線形性のアッセイの適合性及び妥当性は、USP<1033>による制限内で、妥当性基準を「合格」または「不合格」とするようにランク付けされ、決定される。耐性のパーセントの範囲としての95%信頼区間内の相対効力は、「報告可能」または「決定的でない」として決定される。USP<1032>によれば、相対効力は、絶対値から導出される効力よりも好ましい場合があり、なぜなら、生体試料に固有の変動性及び細胞挙動の影響を時間の経過とともに無効にするキャリブレーターであるからである。最後に、予測されるIFN-γ濃度を、各U937細胞密度で報告する。U937細胞との共培養におけるTILによって産生された絶対IFN-γ濃度の、TIL単独(刺激されていない)に対する倍率増加を、各TILロットの代替または追加の報告可能な値として使用するために評価する。分析は、JMP Statistical Discovery LLC(Cary,NC,USA)のJMPソフトウェアを使用して、好適な検証で行われる。本発明の追加のアッセイの詳細及び実施形態もまた、表64に提供される。
Figure 2024512029000071
表63に示されるマトリックスはまた、抗CD3/CD28/CD137抗体でコーティングされたビーズによる活性化に応答してTILによって分泌されたIFN-γの測定を使用した直交活性化アッセイを含む。TIL製品がこれらのビーズに曝露されると、抗体は、CD3シグナル伝達複合体に含まれるCD3εと、T細胞共刺激受容体、CD28及びCD137とに結合する。抗CD3分裂促進因子抗体OKT3によるTILの刺激を使用して、Borovsky,et al.J.Biol.Chem.2002,277,21529-36(その開示は参照により本明細書に組み込まれる)に記載されるように、TIL製品の機能性を評価する。抗CD28活性は、インビトロT細胞増殖及びサイトカイン産生を増強することが知られている。CD137(4-1BB)は、腫瘍壊死因子ファミリーのメンバーである。アゴニスト抗CD137抗体は、エフェクターT細胞及びメモリーT細胞にとって特に重要な活性化共刺激分子として機能し、Tリンパ球の生存及び増殖を促進する。したがって、ビーズベースのIFN-γアッセイの設計は、抗原特異的T細胞の生理学的再刺激及び拡張に関与する3つの活性化シグナルを利用することによって、専門抗原提示細胞によるインビボT細胞活性化に応答してTIL細胞の生物学的活性を模倣することを意図している。
総生細胞及び生細胞パーセンテージも表63に含まれる。総生細胞数は、文献中のTIL製品注入に対する客観的腫瘍応答と相関するパラメータである。Seitter,et al.Clin.Cancer Res.2021,27,5289-98。細胞生存率は、総生細胞数に固有のパラメータである。生存能を維持または回復する細胞の能力は、TIL機能のために必要な前提条件であり、したがって、細胞生存能の実証は、活性の追加の尺度として機能する。TIL製品の性能に対するこれらのパラメータの重要性は、前臨床研究、ならびにこれまでに数百人の転移性黒色腫を有する患者を登録した研究におけるTIL療法の実質的な臨床経験によって支持されている。研究者らは、客観的腫瘍応答率と投与された総生細胞との間の統計的に有意な正の相関を報告しているが、これらの研究では、応答者と非応答者との間の総細胞数分布に実質的な重複が残っていた。Seitter,et al.,Clin.Cancer Res.2021,27,5289-98、Goff,et al.,J.Clin.Oncol.2016,34,2389-97。総生細胞数及び生存率パーセンテージの例示的な結果を表65に示す。
Figure 2024512029000072
表63のマトリックスにおける系統マーカーは、フローサイトメトリー及びセルカウンターによって測定される、生CD4及びCD8細胞集団の合計、CD4細胞のパーセンテージ、及びCD8細胞のパーセンテージを含む。TILは、CD4及びCD8T細胞を含むリンパ球の混合物で構成される。CD8及びCD4T細胞は、TIL製品中に可変の割合で存在し、両方の細胞系統が抗腫瘍免疫応答に寄与するように見える。Topalian,et al.,J.Immunological Methods 1987,102,127-41、Andersen,et al.Clin.Cancer Res.2016,22,3734-45、Goff,et al.J.Clin.Oncol.2016,34,2389-97。CD8T細胞は腫瘍退縮に関連しているが、CD4T細胞は免疫系の機能に重要であり、CD8T細胞の増殖及びIFN-γ分泌を増強することによってCD8T細胞の機能を増強する。Shedlock and Shen,Science 2003,300,337-9、Sun and Bevan,Science 2003,300,339-42。Seitterらは、これまでに数百人の転移性黒色腫を有する患者を登録したTIL療法の研究からの統合データを分析し、客観的腫瘍奏効率と投与された総生CD8細胞との間の統計的に有意な正の相関、ならびに応答者と非応答者との間の総細胞数分布における実質的な重複を示した。Seitter,et al.Clin.Cancer Res.2021,27,5289-98。理論に拘束されることなく、CD8及びCD4T細胞の集団を有するTIL製品は、養子細胞療法のための最も好ましい製品であり得、臨床的有効性を有する可能性が最も高いものであり得る。臨床黒色腫TILロットのCD4及びCD8発現の例示的な結果を表66に示す。
Figure 2024512029000073
表63はまた、フローサイトメトリー及びセルカウンターによって測定される、いくつかのメモリーマーカー、生セントラルメモリー(TCM)及びエフェクターメモリー(TEM)細胞集団の合計、TCM細胞のパーセンテージ、ならびにTEM細胞のパーセンテージを含む。メモリーT細胞は、トラフィックパターン、機能容量、及び系統関係によって異なる複数のサブセットとして存在する。Farber,et al.Nature Rev.Immunol.2014,14,24-35、Sallusto,et al.Ann.Rev.Immunol.2004,22,745-63。主なサブセットには、リンパ組織への輸送能力を保持するTCM細胞、及び末梢組織部位に移行するTEM細胞が含まれる。両方のサブセットは、エフェクター容量を有する。TEM細胞は、CD45RACCR7として定義され、TCM細胞は、フローサイトメトリーによって、CD45RACCR7として定義される。TIL製品中の細胞の大部分は、高レベルの機能性と一致するエフェクターメモリーT細胞表現型を有する。Goff,et al.J.Clin.Oncol.2016,34,2389-97。同様に、TEM細胞は、22日プロセス中の効率的な拡張のため、22日目の試料でGen2プロセスによって産生されたTIL試料中で優勢な集団であることが多い。臨床黒色腫TILロット中のTEM及びTCM含有量の例示的な結果を表67に示す。
Figure 2024512029000074
LAG3発現を有する細胞のパーセンテージはまた、最終TIL製品中の疲弊、したがって効力のマーカーとして表63のマトリックスに含まれる。LAG3発現は、フローサイトメトリーによって測定される。LAG3レベルは、一般に、例えば、Gen2プロセスによって上方調節される。この上方調節は、T細胞活性化及びエフェクター機能に関連しており、LAG3がモニタリングのための感受性及び代表的な疲弊マーカーである可能性が高いことを示している。Annunziato,et al.,FASEB J.1996,10,769-76。臨床黒色腫TILロットの例示的な統計を表68に示す。
Figure 2024512029000075
これらの臨床データセットにわたるLAG3発現のヒストグラムを図206に示す。
KLRG1発現を有する細胞のパーセンテージはまた、最終lifileucel製品中の分化、したがって効力のマーカーとして表63のマトリックスに含まれる。KLRG1発現は、フローサイトメトリーによって測定される。KLRG1は、T細胞の末端分化及び老化のマーカーであり、これは、メモリーT細胞の分化時に下方調節されることが示された。Henson,et al.,Blood 2009,113,6619-28、Herndler-Brandstetter,et al.,Immunity 2018,48,716-729。臨床黒色腫TILロットの例示的な統計を表69に示す。
Figure 2024512029000076
臨床データセットにわたるKLRG1発現のヒストグラムを図207に示す。
CD14/CD19/CD16/CD56フローサイトメトリーアッセイは、NK、NKT、B細胞、及び単球を検出するために、表63に示されるCD16/CD56アッセイに置き換えてもよい。
本明細書に記載され、表63のマトリックスに組み込まれるU937共培養は、上記のように臨床黒色腫TILロットの相対効力を評価するために使用され得る。結果を表70に示し、いくつかのロットが用量依存性反応を示さないことが観察され、潜在的な効力の損失を示す。
Figure 2024512029000077
表70の結果を、対数正規分布が観察されるヒストグラムとして図208にプロットする。
CD101細胞含有量についてのアッセイ、CD69細胞含有量についてのアッセイ、TSCM細胞含有量についてのアッセイ、TEMRA細胞含有量についてのアッセイ、Treg細胞含有量についてのアッセイ、PD-1細胞含有量についてのアッセイ、TIM3細胞含有量についてのアッセイ、CD25細胞含有量についてのアッセイ、CD27細胞含有量についてのアッセイ、CD28細胞含有量についてのアッセイ、CD56細胞含有量についてのアッセイ、CTLA-4細胞含有量についてのアッセイ、TIGIT細胞含有量についてのアッセイ、及び/またはCD57細胞含有量についてのアッセイを含む、追加のマーカー及び対応するフローサイトメトリーアッセイを利用してもよい。Gen2製造プロセス中のTIL製品の再活性化におけるある特定のマーカーの統計的有意性は、Simpson-Abelson,et al.,Ann.Oncol.,2020,31,S720、及びSimpson-Abelson,et al.,Iovance Generation-2 Tumor-infiltrating Lymphocyte(TIL)Product Is Reinvigorated During the Manufacturing Process ESMO Congress,Sept.19-21,2020,poster 1053P(各々の開示は参照により本明細書に組み込まれる)に記載されている。
実施例29:U937細胞を使用したTIL製品の拡張
照射されたU937細胞は、Gen2プロセスまたは同様のプロセスのREP段階(またはGen3もしくは同様のプロセスの活性化段階、または遺伝子編集されたTILプロセス及び選択されたTILプロセスにおける同様の段階)のための人工抗原プロセシング細胞(aAPC)として使用され得る。3つの黒色腫REP前TILロットを解凍し、本明細書の他の箇所(例えば、実施例6)に記載の手順を使用して、11日間、照射されたU937細胞または抗CD3(OKT-3)を有する同種異系PBMCフィーダー細胞(3人のドナー)とインキュベートし、拡張について評価した。結果を、図209に示す。U937細胞は、TIL細胞の拡張を誘導することができる。CD3及びCD28への刺激ビーズ後、TILは、図210に示されるように、応答してIFN-γを分泌し、それらが活性化することができることを示した。U937細胞をaAPCとして使用することは、TCRレパートリー分析によって(例えば、固有のCDR3ドメインについて)評価されるように、低頻度TCRクローンの成長または保存をサポートし得る。本発明のいくつかの実施形態では、Gen2、Gen3、または本明細書に記載の他のプロセスを使用してU937 aAPC(遺伝子修飾されたU937 aAPCを含む)を使用することによって拡張されたTIL、MIL、またはPBLは、低頻度TCRクローンの増加した成長または保存を示し得る。
***
上記の実施例は、当業者に対して、本発明の組成物、プロセス、アッセイ、システム及び方法の実施形態の作製方法及び使用方法の完全な開示及び説明を提供するために提示されており、本発明者らが自身の発明とみなすものの範囲を限定することを意図しない。当業者に明らかな、本発明を実施するための上記のモードの修正は、添付の特許請求の範囲内にあることを意図している。本明細書で言及するすべての特許、特許出願、及び刊行物は、本発明が属する分野の当業者のスキルレベルを示す。
すべての見出し及びセクションの指定は、明確化及び参照の目的のみのために使用されており、いかなる方法でも限定するものとしてみなされない。例えば、当業者は、本明細書に記載の本発明の趣旨及び範囲に従って異なる見出し及びセクションから様々な態様を適宜組み合わせることの有用性を理解する。
本明細書で引用されたすべての参考文献は、各個々の刊行物または特許もしくは特許出願がすべての目的のためにその全体が参照により組み込まれることが具体的かつ個別に示されているのと同じ程度にすべての目的のためにそれらの全体が参照により本明細書に組み込まれる。
当業者に明らかであるように、本出願の趣旨及び範囲から逸脱することなく、本出願の多くの修正及び変形が加えられてもよい。本明細書に記載の特定の実施形態及び実施例はほんの一例として提供されており、本出願は、特許請求の範囲が権利を与えられる等価物の全範囲に加えて、添付の特許請求の範囲の用語によってのみ限定されるべきである。

Claims (58)

  1. TILの効力を決定する方法であって、
    a.TIL細胞との標的細胞の共培養を、第1の期間行うステップと、
    b.前記共培養から採取物を取得するか、または上清を抽出するステップと、
    c.(1)前記採取物を、前記TIL細胞上の1つ以上のマーカーの発現について評価するか、または(2)前記上清を、前記TIL細胞から分泌された1つ以上の分析物について評価して、1つ以上の観測値を取得し、前記TILの効力を決定するステップと、を含む、前記方法。
  2. 前記方法が、
    d.(i)前記標的細胞との陰性対照細胞、または(ii)前記TIL細胞及び前記標的細胞とのヒト白血球抗原(HLA)遮断抗体を含む、陰性対照の第2の共培養を、第2の期間(かかる第2の期間は、任意選択で、前記第1の期間と同時に起こる)行う追加のステップと、
    e.前記第2の共培養から第2の採取物を取得するか、または第2の上清を抽出する追加のステップと、
    f.(1)前記第2の採取物を、前記TIL細胞上の前記1つ以上のマーカーの発現について評価するか、または(2)前記第2の上清を、前記TIL細胞から分泌された前記1つ以上の分析物について評価して、1つ以上の対照値を取得する追加のステップと、
    g.ステップcからの前記1つ以上の観測値をステップfからの前記1つ以上の対照値と比較して、前記TILの効力を決定する追加のステップであって、各観測値または観測値のセットが、対応する対照値または対照値のセットと比較される、前記TILの前記効力を前記決定する追加のステップと、を含む、請求項1に記載の方法。
  3. 前記TILが、腫瘍浸潤リンパ球(TIL)製品、骨髄浸潤リンパ球(MIL)製品、または末梢血リンパ球(PBL)製品からなる群から選択され、前記方法が、任意選択で、凍結保存されたTIL製品、MIL製品、またはPBL製品を解凍するステップをさらに含む、請求項1または2に記載の方法。
  4. 前記TILが、ヒト由来のTIL製品であり、前記TIL製品が、腫瘍の切除または腫瘍の断片化もしくは消化によって取得され、急速な拡張プロトコルステップを含むTIL拡張プロセスによって製造される、請求項1~3のいずれか1項に記載の方法。
  5. ヒト患者の治療に使用するための前記TILを放出するステップをさらに含む、請求項1~4のいずれか1項に記載の方法。
  6. 前記標的細胞が、単球細胞、Bリンパ芽腫細胞、バーキットリンパ腫細胞、Raji細胞、Thp1細胞、Ramos細胞、U937細胞、Daudi細胞、及びそれらの誘導体、バリアント、修飾、または子孫、ならびにそれらの組み合わせからなる群から選択され、かかる標的細胞またはそれらの組み合わせが、任意選択で照射され、前記標的細胞またはそれらの組み合わせが、任意選択で前記TIL製品、前記MIL製品、または前記PBL製品に対してアロ反応性である、請求項1~5のいずれか1項に記載の方法。
  7. 前記陰性対照細胞が、MHCまたはHLAクラスI及びMHCまたはHLAクラスII発現を欠いている、請求項2~6のいずれか1項に記載の方法。
  8. 前記陰性対照細胞が、K562細胞またはその誘導体、バリアント、修飾、もしくは子孫であり、かかる陰性対照細胞が、任意選択で照射される、請求項7に記載の方法。
  9. 前記TIL製品細胞の数と前記標的細胞の数との間の比が、5:1~1:5であり、前記TIL製品細胞の数と前記陰性対照細胞の数との間の比が、5:1~1:5である、請求項2~8のいずれか1項に記載の方法。
  10. 前記TIL製品細胞の数と前記陰性対照細胞の数との間の比が、1:2~1:4であり、前記TIL製品細胞の数と前記陰性対照細胞の数との間の比が、1:2~1:4である、請求項2~8のいずれか1項に記載の方法。
  11. 前記第1の期間が、約6時間~約48時間である、請求項1~10のいずれか1項に記載の方法。
  12. 前記第2の期間が、約6時間~約48時間である、請求項1~11のいずれか1項に記載の方法。
  13. 前記第1の期間が、約12時間、約18時間、及び約24時間からなる群から選択される、請求項1~12のいずれか1項に記載の方法。
  14. 前記第2の期間が、約12時間、約18時間、及び約24時間からなる群から選択される、請求項1~13のいずれか1項に記載の方法。
  15. 前記TIL上の前記1つ以上のマーカーが、CD25、CD69、CD134、CD137、CD150、KLRG1、またはそれらの組み合わせからなる群から選択される、請求項1~14のいずれか1項に記載の方法。
  16. 前記TILから分泌された前記1つ以上の分析物が、IFN-α、IFN-β、IFN-γ、グランザイムB、パーフォリン、TNF-α、IL-1α、IL-1β、IL-2、IL-3、IL-4、IL-5、IL-6、IL-8、IL-9、IL-10、IL-13、IL-14、IL-16、IL-17、IL-18、IL-22、IL-25、IL-26、MIP-1β、及びそれらの組み合わせからなる群から選択される、請求項1~15のいずれか1項に記載の方法。
  17. 前記TIL製品から分泌された前記1つ以上の分析物が、IFN-α、IFN-β、IFN-γ、グランザイムB、パーフォリン、TNF-α、IL-1α、IL-1β、IL-2、IL-3、IL-4、IL-5、IL-6、IL-8、IL-9、IL-10、IL-13、IL-14、IL-16、IL-17、IL-18、IL-22、IL-25、IL-26、MIP-1β、及びそれらの組み合わせからなる群から選択され、前記観測値の量が、前記1つ以上の分析物の各々について前記対照値の量に対して正規化され、前記1つ以上の分析物の各々について前記対照値を上回る観測値の増加が、少なくとも1倍、少なくとも1.5倍、少なくとも2倍、少なくとも2.5倍、少なくとも3倍、少なくとも3.5倍、少なくとも4倍、少なくとも4.5倍、及び少なくとも5倍からなる群から選択される、請求項4~15のいずれか1項に記載の方法。
  18. 前記TIL製品が、外科的切除、針生検、コア生検、小生検、またはヒト患者からの腫瘍細胞とTIL細胞との混合物を含有する試料を取得するための他の手段によって取得された腫瘍から製造される、請求項4~17のいずれか1項に記載の方法。
  19. がんの治療を必要とする患者において腫瘍浸潤リンパ球(TIL)の集団でそれを治療する方法であって、
    (a)外科的切除、針生検、コア生検、小生検、または前記患者から取得された腫瘍試料を(i)複数の腫瘍断片もしくは(ii)腫瘍消化物に処理することによる他の手段によって前記患者から切除された腫瘍から第1のTIL集団を取得及び/または受容するステップと、
    (b)前記第1のTIL集団を閉鎖系に付加するステップと、
    (c)IL-2を含む細胞培養培地中で前記第1のTIL集団を培養することによって第1の拡張を行い、第2のTIL集団を産生するステップであって、前記第1の拡張が、第1のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われ、前記第1の拡張が、約3~14日間行われて、前記第2のTIL集団を取得し、ステップ(b)からステップ(c)への移行が、前記系を開くことなく起こる、前記第2のTIL集団を産生するステップと、
    (d)前記第2のTIL集団の前記細胞培養培地を追加のIL-2、OKT-3、及び抗原提示細胞(APC)で補充することによって第2の拡張を行い、第3のTIL集団を産生するステップであって、前記第2の拡張が、約7~14日間行われて、前記第3のTIL集団を取得し、前記第3のTIL集団が、治療的TIL集団であり、前記第2の拡張が、第2のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われ、ステップ(c)からステップ(d)への移行が、前記系を開くことなく起こる、前記第3のTIL集団を産生するステップと、
    (e)ステップ(d)から取得された前記治療的TIL集団を採取するステップであって、ステップ(d)からステップ(e)への移行が、前記系を開くことなく起こる、前記採取するステップと、
    (f)ステップ(e)からの前記治療的TIL集団を注入バッグに移すステップであって、ステップ(e)から(f)への移行が、前記系を開くことなく起こる、前記移すステップと、
    (g)任意選択で、ステップ(f)からの前記治療的TIL集団を含む前記注入バッグを凍結保存するステップと、
    (h)前記治療的TIL集団の効力を決定するステップであって、
    i.前記治療的TIL集団を含む前記注入バッグが、任意選択で、ステップ(g)において凍結保存された場合、任意選択で、前記治療的TIL集団を含む前記注入バッグを解凍することと、
    ii.前記治療的TIL集団の部分との標的細胞の共培養を、第1の期間行うことと、
    iii.前記共培養から採取物または上清を取得することと、
    iv.(1)前記採取物を、前記治療的TIL集団の前記部分上の1つ以上のマーカーの発現について、または(2)前記上清を、前記治療的TIL集団の前記部分から分泌された1つ以上の分析物について評価して、1つ以上の観測値を取得して、前記治療的TIL集団の前記効力を決定することと、
    v.(i)前記治療的TIL集団の前記部分との陰性対照細胞、または(ii)前記治療的TIL集団の第2の部分及び前記標的細胞とのヒト白血球抗原(HLA)遮断抗体の、第2の共培養を、第2の期間行うことと、
    vi.前記第2の共培養から第2の採取物または第2の上清を取得することと、
    vii.(1)前記第2の採取物を、前記治療的TIL集団の前記第2の部分上の前記1つ以上のマーカーの発現について評価するか、または(2)前記第2の上清を、前記治療的TIL集団の前記第2の部分から分泌された1つ以上の分析物について評価して、1つ以上の対照値を取得することと、
    viii.前記1つ以上の観測値を前記1つ以上の対照値と比較して、前記治療的TIL集団の前記効力を決定することであって、各観測値が、その対応する対照値と比較される、前記治療的TIL集団の前記効力を前記決定することと、を含む、前記治療的TIL集団の前記効力を前記決定するステップと、
    (i)前記治療的TIL集団が有効であると決定された場合、治療上有効な投与量の前記治療的TIL集団を、ステップ(f)または(g)の前記注入バッグから前記患者に投与するステップと、を含む、前記方法。
  20. 採取された前記TILの前記効力及び/または機能性を調べることが、凍結保存後に、または任意選択で凍結保存ステップの前後に行われる、請求項19に記載の方法。
  21. 前記患者が、切除不能、転移性、耐性、またはCTLA-4阻害剤、PD-1阻害剤、もしくはPD-L1阻害剤に対して不応性である腫瘍を有し、任意選択で、前記患者が、CTLA-4阻害剤、PD-1阻害剤、またはPD-L1阻害剤で以前に治療されている、請求項19または20に記載の方法。
  22. ステップ(c)における前記第2のTIL集団が、前記第1のTIL集団よりも数が少なくとも50倍多い、請求項19~21のいずれか1項に記載の方法。
  23. 前記第1の拡張が、約10~約12日の期間にわたって行われる、請求項19~22のいずれか1項に記載の方法。
  24. 前記第2の拡張が、約10~約12日の期間にわたって行われる、請求項19~23のいずれか1項に記載の方法。
  25. 前記第1の拡張が、約11日の期間にわたって行われる、請求項19~24のいずれか1項に記載の方法。
  26. 前記第2の拡張が、約11日の期間にわたって行われる、請求項19~25のいずれか1項に記載の方法。
  27. 前記IL-2が、前記第1の拡張において、前記細胞培養培地中に1000IU/mL~6000IU/mLの初期濃度で存在する、請求項19~26のいずれか1項に記載の方法。
  28. 前記第2の拡張ステップにおいて、前記IL-2が、1000IU/mL~6000IU/mLの初期濃度で存在し、前記OKT-3抗体が、約30ng/mLの初期濃度で存在する、請求項19~27のいずれか1項に記載の方法。
  29. 前記TILを前記患者に投与する前に、骨髄非破壊的リンパ球枯渇レジメンで前記患者を治療するステップをさらに含む、請求項19~28のいずれか1項に記載の方法。
  30. 前記骨髄非破壊的リンパ球枯渇レジメンが、シクロホスファミドを60mg/m/日の用量で2日間投与し、続いてフルダラビンを25mg/m/日の用量で5日間投与するステップを含む、請求項29に記載の方法。
  31. 前記骨髄非破壊的リンパ球枯渇レジメンが、シクロホスファミドを60mg/m/日の用量で、及びフルダラビンを25mg/m/日の用量で2日間投与し、続いてフルダラビンを25mg/m/日の用量で3日間投与するステップを含む、請求項30に記載の方法。
  32. 前記患者への前記治療的TIL集団の投与の翌日に開始するIL-2レジメンで前記患者を治療するステップをさらに含む、請求項19~31のいずれか1項に記載の方法。
  33. 前記患者への前記治療的TIL集団の投与と同日に開始するIL-2レジメンで前記患者を治療するステップをさらに含む、請求項19~31のいずれか1項に記載の方法。
  34. 前記IL-2レジメンが、前記患者への前記治療的TIL集団の投与の完了の約3~約24時間後に投与される、請求項33に記載の方法。
  35. 前記IL-2レジメンが、許容範囲まで8時間毎に15分間のボーラス静脈内注入として投与される、600,000もしくは720,000IU/kgのアルデスロイキン、またはそのバイオシミラーもしくはバリアントを含む高用量IL-2レジメンである、請求項33~34のいずれか1項に記載の方法。
  36. ステップ(a)において前記患者から取得された腫瘍試料を腫瘍消化物に処理することが、前記腫瘍試料を酵素培地中でインキュベートすることをさらに含む、請求項19~35のいずれか1項に記載の方法。
  37. ステップ(a)において前記患者から取得された腫瘍試料を腫瘍消化物に処理することが、前記腫瘍試料を機械的に破壊して前記腫瘍試料を解離することをさらに含む、請求項19~36のいずれか1項に記載の方法。
  38. ステップ(a)において、前記患者から取得された腫瘍試料を、腫瘍消化物に処理することが、密度勾配分離を使用して前記解離された腫瘍試料を精製することをさらに含む、請求項19~37のいずれか1項に記載の方法。
  39. 前記酵素培地が、DNaseを含む、請求項36に記載の方法。
  40. 前記酵素培地が、約30単位/mLのDNaseを含む、請求項39に記載の方法。
  41. 前記酵素培地が、コラゲナーゼを含む、請求項36に記載の方法。
  42. 前記酵素培地が、約1.0mg/mLのコラゲナーゼを含む、請求項41に記載の方法。
  43. 前記がんが、黒色腫、卵巣癌、膵臓癌、子宮内膜癌、甲状腺癌、子宮頸癌、非小細胞肺癌、小細胞肺癌、膀胱癌、乳癌、頭頸部癌、神経膠芽細胞腫、胃腸癌、腎臓癌、肉腫、及び腎細胞癌からなる群から選択される、請求項19~42のいずれか1項に記載の方法。
  44. 前記PD-1阻害剤、PD-L1阻害剤、またはCTLA-4阻害剤を前記患者に投与するステップをさらに含む、請求項19~43のいずれか1項に記載の方法。
  45. T細胞製品の効力を決定する方法であって、
    e.T細胞製品細胞との標的細胞の少なくとも3つの共培養を、異なる標的細胞濃度で行うステップと、
    f.T細胞参照標準細胞との標的細胞の少なくとも3つの共培養を、異なる標的細胞濃度で行うステップと、
    g.前記共培養の各々から上清を抽出するステップと、
    h.前記上清を、前記T細胞製品細胞及びT細胞参照標準細胞から分泌されたサイトカインについて評価して、前記T細胞製品の効力を決定するための用量濃度を取得するステップと、を含み、
    前記標的細胞が、単球細胞である、前記方法。
  46. 前記T細胞製品が、腫瘍浸潤リンパ球(TIL)製品、骨髄浸潤リンパ球(MIL)製品、または末梢血リンパ球(PBL)製品である、請求項45に記載の方法。
  47. 前記単球細胞が、U937もしくはThp1細胞、またはその誘導体、バリアント、修飾、もしくは子孫であり、前記サイトカインが、インターフェロン-γである、請求項45または46に記載の方法。
  48. 前記共培養が、約6時間、約12時間、約18時間、約24時間、約30時間、約36時間、約42時間、及び約48時間からなる群から選択される期間行われる、請求項47に記載の方法。
  49. 前記T細胞製品が、TIL製品であり、1ウェル当たり約4×10、約2×10、約1×10、及び約0.5×10標的細胞の4つの標的細胞用量濃度、ならびに1ウェル当たり約1.5×10TILの単一のTIL細胞濃度が使用される、請求項48に記載の方法。
  50. T細胞製品細胞との標的細胞の少なくとも4つの共培養及びT細胞参照標準細胞との標的細胞の少なくとも4つの共培養を使用し、平行線分析を行い、1つの外れ値標的細胞用量濃度を破棄する、請求項49に記載の方法。
  51. 前記方法が、効力アッセイマトリックスの構成要素である、請求項50に記載の方法。
  52. 前記効力アッセイマトリックスが、CD3、CD28、及び/またはCD137刺激及び報告インターフェロン-γ、グランザイムB、または腫瘍壊死因子-αを使用したビーズまたはプレートベースのアッセイ、総生細胞についてのアッセイ、生細胞パーセンテージについてのアッセイ、CD4細胞含有量についてのアッセイ、CD8細胞含有量についてのアッセイ、TEM細胞含有量についてのアッセイ、TCM細胞含有量についてのアッセイ、LAG3細胞含有量についてのアッセイ、及びKLRG1細胞含有量についてのアッセイ、CD101細胞含有量についてのアッセイ、CD69細胞含有量についてのアッセイ、TSCM細胞含有量についてのアッセイ、TEMRA細胞含有量についてのアッセイ、Treg細胞含有量についてのアッセイ、PD-1細胞含有量についてのアッセイ、TIM3細胞含有量についてのアッセイ、CD25細胞含有量についてのアッセイ、CD27細胞含有量についてのアッセイ、CD28細胞含有量についてのアッセイ、CD56細胞含有量についてのアッセイ、CTLA-4細胞含有量についてのアッセイ、TIGIT細胞含有量についてのアッセイ、及びCD57細胞含有量についてのアッセイからなる群から選択される1つ以上のアッセイを含む、請求項51に記載の方法。
  53. がんを有する対象を治療するための方法であって、
    (a)腫瘍消化物または腫瘍断片を閉鎖系に追加することであって、前記腫瘍消化物または腫瘍断片が、第1のTIL集団を含み、前記対象から切除された腫瘍から取得される、前記追加することと、
    (b)IL-2を含む細胞培養培地中で前記第1のTIL集団を培養することによって第1の拡張を行い、第2のTIL集団を産生することであって、前記第1の拡張が、第1のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われ、前記第1の拡張が、約3~11日間行われて、前記第2のTIL集団を取得し、ステップ(b)からステップ(c)への移行が、前記系を開くことなく起こる、前記第2のTIL集団を産生することと、
    (c)IL-2、OKT-3、及び抗原提示細胞(APC)を含む追加の細胞培養培地を補充することによって第2の拡張を行い、第3のTIL集団を産生することであって、前記第2の拡張が、約7~11日間行われて、前記第3のTIL集団を取得し、前記第2の拡張が、第2のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われ、ステップ(b)からステップ(c)への移行が、前記系を開くことなく起こる、前記第3のTIL集団を産生することと、
    (d)ステップ(c)から取得された前記第3のTIL集団を採取することであって、ステップ(c)からステップ(d)への移行が、前記系を開くことなく起こる、前記採取することと、
    (e)ステップ(d)からの前記採取された第3のTIL集団を注入バッグに移すことであって、ステップ(d)から(e)への移行が、前記系を開くことなく起こる、前記移すことと、
    (f)凍結保存プロセスを使用して、ステップ(e)からの前記採取されたTIL集団を含む前記注入バッグを凍結保存することと、
    (g)治療上有効な投与量の前記第3のTIL集団を、ステップ(f)における前記注入バッグから前記対象に投与することと、を含む、拡張腫瘍浸潤リンパ球(TIL)を投与することを含み、
    前記APCが、Raji、Ramos、Daudi、U937、もしくはThp1細胞、またはそれらの誘導体、バリアント、修飾、もしくは子孫からなる群から選択される、前記方法。
  54. 前記がんが、黒色腫(転移性黒色腫及びブドウ膜黒色腫を含む)、卵巣癌、子宮頸癌、非小細胞肺癌(NSCLC)、小細胞肺癌、膀胱癌、乳癌、ヒトパピローマウイルスによって引き起こされるがん、頭頸部癌(頭頸部扁平上皮癌(HNSCC)を含む)、食道癌、食道・胃接合部癌、胃癌、胃腸癌、腎癌、及び腎細胞癌からなる群から選択される、請求項53に記載の方法。
  55. ステップ(a)における前記第1の拡張及びステップ(b)における前記第2の拡張が、各々11日間の期間内に個別に行われる、請求項54に記載の方法。
  56. ステップ(a)~(d)が、約10日~約22日で行われる、請求項54に記載の方法。
  57. 前記TILの効力が、請求項1~18のいずれか1項または請求項45~52のいずれか1項に記載の方法を使用して決定されている、請求項53~56のいずれか1項に記載の方法。
  58. 前記TILの効力が、請求項1~18のいずれか1項または請求項45~52のいずれか1項に記載の方法を使用して決定されている、請求項19~44のいずれか1項に記載の方法。
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