JP2021500867A5 - - Google Patents
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Description
一部のそのような方法では、ヌクレアーゼ剤は、Casタンパク質(例えば、Cas9タンパク質)およびガイドRNAを含む。一部のそのような方法では、標的化ベクターは長さが少なくとも10kbであるか、または5’および3’相同アームの合計が少なくとも10kbの長さである、大きな標的化ベクターである。一部のそのような方法では、非ヒト動物は、マウスまたはラットである。一部のそのような方法では、非ヒト動物は、マウスである。
特定の実施形態では、例えば、以下が提供される:
(項目1)
TTRコード配列と非コード配列の両方を含むヒトTTR配列を含む遺伝子改変内因性Ttr遺伝子座をそのゲノムに含む、非ヒト動物。
(項目2)
Ttrコード配列と非コード配列の両方を含む前記内因性Ttr遺伝子座のある領域が欠失し、TTRコード配列と非コード配列の両方を含む対応するヒトTTR配列で置き換えられている、項目1に記載の非ヒト動物。
(項目3)
前記遺伝子改変内因性Ttr遺伝子座が内因性Ttrプロモーターを含み、前記ヒトTTR配列が前記内因性Ttrプロモーターに作動可能に連結されている、項目1または2に記載の非ヒト動物。
(項目4)
前記内因性Ttr遺伝子座の少なくとも1つのイントロンおよび少なくとも1つのエクソンが欠失し、前記対応するヒトTTR配列で置き換えられている、前記項目のいずれかに記載の非ヒト動物。
(項目5)
前記内因性Ttr遺伝子座の前記Ttrコード配列全体が欠失し、前記対応するヒトTTR配列で置き換えられている、前記項目のいずれかに記載の非ヒト動物。
(項目6)
Ttr開始コドンからTtr停止コドンまでの前記内因性Ttr遺伝子座の領域が欠失し、前記対応するヒトTTR配列で置き換えられている、項目5に記載の非ヒト動物。
(項目7)
前記遺伝子改変内因性Ttr遺伝子座がヒトTTR 3’非翻訳領域を含む、前記項目のいずれかに記載の非ヒト動物。
(項目8)
内因性Ttr 5’非翻訳領域は欠失しておらず、前記対応するヒトTTR配列で置き換えられていない、前記項目のいずれかに記載の非ヒト動物。
(項目9)
前記Ttr開始コドンから前記Ttr停止コドンまでの前記内因性Ttr遺伝子座の領域が欠失し、前記対応するヒトTTR配列およびヒトTTR 3’非翻訳領域を含むヒトTTR配列で置き換えられており、
前記内因性Ttr 5’非翻訳領域は欠失しておらず、前記対応するヒトTTR配列で置き換えられておらず、
前記内因性Ttrプロモーターは欠失しておらず、前記対応するヒトTTR配列で置き換えられていない、
前記項目のいずれかに記載の非ヒト動物。
(項目10)
(i)前記遺伝子改変内因性Ttr遺伝子座の前記ヒトTTR配列が、配列番号18に示す配列と少なくとも90%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一である配列を含むか;または
(ii)前記遺伝子改変内因性Ttr遺伝子座が、配列番号1に示す配列と少なくとも90%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一である配列を含むタンパク質をコードし;
(iii)前記遺伝子改変内因性Ttr遺伝子座が、配列番号90に示す配列と少なくとも90%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一である配列を含むコード配列を含むか;または、
(iv)前記遺伝子改変内因性Ttr遺伝子座が、配列番号14または15に示す配列と少なくとも90%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一である配列を含む、
項目9に記載の非ヒト動物。
(項目11)
前記遺伝子改変内因性Ttr遺伝子座がシグナルペプチドを含むトランスサイレチン前駆体タンパク質をコードし、前記シグナルペプチドをコードする前記内因性Ttr遺伝子座の領域が欠失しておらず、前記対応するヒトTTR配列で置き換えられていない、項目1から4のいずれか一項に記載の非ヒト動物。
(項目12)
前記内因性Ttr遺伝子座の第1のエクソンが欠失しておらず、前記対応するヒトTTR配列で置き換えられていない、項目11に記載の非ヒト動物。
(項目13)
前記内因性Ttr遺伝子座の第1のエクソンおよび第1のイントロンが欠失しておらず、前記対応するヒトTTR配列で置き換えられていない、項目12に記載の非ヒト動物。
(項目14)
第2のTtrエクソンの開始からTtr停止コドンまでの前記内因性Ttr遺伝子座の領域が欠失し、前記対応するヒトTTR配列で置き換えられている、項目11から13のいずれか一項に記載の非ヒト動物。
(項目15)
前記遺伝子改変内因性Ttr遺伝子座がヒトTTR 3’非翻訳領域を含む、項目11から14のいずれか一項に記載の非ヒト動物。
(項目16)
前記第2のTtrエクソンから前記Ttr停止コドンまでの前記内因性Ttr遺伝子座の領域が欠失し、前記対応するヒトTTR配列およびヒトTTR 3’非翻訳領域を含むヒトTTR配列で置き換えられており、
前記内因性Ttr 5’非翻訳領域が欠失しておらず、前記対応するヒトTTR配列で置き換えられておらず、
前記内因性Ttrプロモーターが欠失しておらず、前記対応するヒトTTR配列で置き換えられていない、
項目11から15のいずれか一項に記載の非ヒト動物。
(項目17)
(i)前記遺伝子改変内因性Ttr遺伝子座の前記ヒトTTR配列が、配列番号19に示す配列と少なくとも90%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一である配列を含むか;または
(ii)前記遺伝子改変内因性Ttr遺伝子座が、配列番号2に示す配列と少なくとも90%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一である配列を含むタンパク質をコードし;
(iii)前記遺伝子改変内因性Ttr遺伝子座が、配列番号91に示す配列と少なくとも90%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一である配列を含むコード配列を含むか;または
(iv)前記遺伝子改変内因性Ttr遺伝子座が、配列番号16または17に示す配列と少なくとも90%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一である配列を含む、
項目16に記載の非ヒト動物。
(項目18)
前記遺伝子改変内因性Ttr遺伝子座が選択カセットもレポーター遺伝子も含まない、前記項目のいずれかに記載の非ヒト動物。
(項目19)
前記遺伝子改変内因性Ttr遺伝子座についてホモ接合性である、前記項目のいずれかに記載の非ヒト動物。
(項目20)
哺乳動物である、前記項目のいずれかに記載の非ヒト動物。
(項目21)
ラットまたはマウスである、項目20に記載の非ヒト動物。
(項目22)
マウスである、項目21に記載の非ヒト動物。
(項目23)
in vivoでヒトTTR標的化試薬の活性を評価する方法であって、
(a)項目1から22のいずれか一項に記載の非ヒト動物に前記ヒトTTR標的化試薬を投与すること;および
(b)前記非ヒト動物における前記ヒトTTR標的化試薬の活性を評価すること
を含む方法。
(項目24)
前記投与することが、アデノ随伴ウイルス(AAV)媒介性送達、脂質ナノ粒子(LNP)媒介性送達または流体力学的送達(HDD)を含む、項目23に記載の方法。
(項目25)
前記投与することがLNP媒介性送達を含む、項目24に記載の方法。
(項目26)
前記LNPの用量が約0.1mg/kgから約2mg/kgの間にある、項目25に記載の方法。
(項目27)
前記投与することがAAV8媒介性送達を含む、項目24に記載の方法。
(項目28)
ステップ(b)が、前記非ヒト動物から肝臓を単離し、前記肝臓における前記ヒトTTR標的化試薬の活性を評価することを含む、項目23から27のいずれか一項に記載の方法。
(項目29)
ステップ(b)が、前記肝臓以外の臓器または組織における前記ヒトTTR標的化試薬の活性を評価することをさらに含む、項目28に記載の方法。
(項目30)
前記ヒトTTR標的化試薬がゲノム編集剤であり、前記評価することが前記遺伝子改変Ttr遺伝子座の改変を評価することを含む、項目23から29のいずれか一項に記載の方法。
(項目31)
前記評価することが、前記遺伝子改変Ttr遺伝子座内の挿入または欠失の頻度を測定することを含む、項目30に記載の方法。
(項目32)
前記評価することが、前記遺伝子改変Ttr遺伝子座によってコードされるTtrメッセンジャーRNAの発現を測定することを含む、項目23から31のいずれか一項に記載の方法。
(項目33)
前記評価することが、前記遺伝子改変Ttr遺伝子座によってコードされるTTRタンパク質の発現を測定することを含む、項目23から32のいずれか一項に記載の方法。
(項目34)
前記TTRタンパク質の発現を評価することが、前記非ヒト動物における前記TTRタンパク質の血清レベルを測定することを含む、項目33に記載の方法。
(項目35)
前記活性が前記非ヒト動物の前記肝臓で評価される、項目30から33のいずれか一項に記載の方法。
(項目36)
前記ヒトTTR標的化試薬が、ヒトTTR遺伝子のある領域を標的にするように設計されたヌクレアーゼ剤を含む、項目23から35のいずれか一項に記載の方法。
(項目37)
前記ヌクレアーゼ剤が、Casタンパク質、および前記ヒトTTR遺伝子におけるガイドRNA標的配列を標的にするように設計されたガイドRNAを含む、項目36に記載の方法。
(項目38)
前記Casタンパク質がCas9タンパク質である、項目37に記載の方法。
(項目39)
前記ヒトTTR標的化試薬が外因性ドナー核酸をさらに含み、前記外因性ドナー核酸が前記ヒトTTR遺伝子と組み換わるように設計されている、項目36から38のいずれか一項に記載の方法。
(項目40)
前記外因性ドナー核酸が一本鎖オリゴデオキシヌクレオチド(ssODN)である、項目39に記載の方法。
(項目41)
in vivoでヒトTTR標的化試薬の活性を最適化する方法であって、
(I)TTRコード配列と非コード配列の両方を含むヒトTTR配列を含む遺伝子改変内因性Ttr遺伝子座をそのゲノムに含む第1の非ヒト動物において、項目23から40のいずれか一項に記載の方法を1回目に実行すること、
(II)TTRコード配列と非コード配列の両方を含む前記ヒトTTR配列を含む前記遺伝子改変内因性Ttr遺伝子座をそのゲノムに含む第2の非ヒト動物において、変数を変更し、ステップ(I)の方法を変更した前記変数で2回目に実行すること;および
(III)ステップ(I)の前記ヒトTTR標的化試薬の活性をステップ(II)の前記ヒトTTR標的化試薬の活性と比較し、より高い活性をもたらす方法を選択すること
を含む方法。
(項目42)
ステップ(II)の変更した前記変数が、前記ヒトTTR標的化試薬を前記非ヒト動物に導入する送達方法である、項目41に記載の方法。
(項目43)
前記投与することがLNP媒介性送達を含み、ステップ(II)の変更した前記変数がLNP製剤である、項目42に記載の方法。
(項目44)
ステップ(II)の変更した前記変数が、前記ヒトTTR標的化試薬を前記非ヒト動物に導入する投与経路である、項目41に記載の方法。
(項目45)
ステップ(II)の変更した前記変数が、前記非ヒト動物に導入される前記ヒトTTR標的化試薬の濃度または量である、項目41に記載の方法。
(項目46)
ステップ(II)の変更した前記変数が、前記非ヒト動物に導入される前記ヒトTTR標的化試薬の形態である、項目41に記載の方法。
(項目47)
ステップ(II)の変更した前記変数が、前記非ヒト動物に導入される前記ヒトTTR標的化試薬である、項目41に記載の方法。
(項目48)
前記ヒトTTR標的化試薬が、Casタンパク質、およびヒトTTR遺伝子のガイドRNA標的配列を標的にするように設計されたガイドRNAを含む、項目41に記載の方法。
(項目49)
ステップ(II)の変更した前記変数が、ガイドRNA配列または前記ガイドRNA標的配列である、項目48に記載の方法。
(項目50)
前記Casタンパク質および前記ガイドRNAの各々がRNAの形態で投与され、ステップ(II)の変更した前記変数がCas mRNAのガイドRNAに対する比である、項目48に記載の方法。
(項目51)
ステップ(II)の変更した前記変数がガイドRNAの改変である、項目48に記載の方法。
(項目52)
項目1から22のいずれか一項に記載の非ヒト動物を作製する方法であって、
(a)非ヒト動物胚性幹(ES)細胞に:
(i)前記内因性Ttr遺伝子座の標的配列を標的にするヌクレアーゼ剤;および
(ii)前記内因性Ttr遺伝子座の5’標的配列に対応する5’相同アームおよび前記内因性Ttr遺伝子座の3’標的配列に対応する3’相同アームによって挟まれた前記ヒトTTR配列を含む核酸挿入断片を含む標的化ベクター
を導入するステップであって、前記標的化ベクターは、前記内因性Ttr遺伝子座で組み換えて、前記ヒトTTR配列を含む前記遺伝子改変内因性Ttr遺伝子座をそのゲノムに含む遺伝子改変非ヒトES細胞を生成する、ステップと;
(b)前記遺伝子改変非ヒトES細胞を非ヒト動物宿主の胚に導入するステップと;
(c)代理母で前記非ヒト動物宿主の胚を懐胎させるステップであって、前記代理母が、前記ヒトTTR配列を含む前記遺伝子改変内因性Ttr遺伝子座をそのゲノムに含むF0後代の遺伝子改変非ヒト動物を生成するステップと
を含む方法。
(項目53)
前記ヌクレアーゼ剤がCasタンパク質およびガイドRNAを含む、項目52に記載の方法。
(項目54)
前記Casタンパク質がCas9タンパク質である、項目53に記載の方法。
(項目55)
前記標的化ベクターは、長さが少なくとも10kbであるか、または前記5’および3’相同アームの長さの合計が少なくとも10kbである、大きな標的化ベクターである、項目52から54のいずれか一項に記載の方法。
(項目56)
前記非ヒト動物がマウスまたはラットである、項目52から55のいずれか一項に記載の方法。
(項目57)
前記非ヒト動物がマウスである、項目56に記載の方法。
(項目58)
TTRコード配列と非コード配列の両方を含むヒトTTR配列を含む遺伝子改変内因性Ttr遺伝子座をそのゲノムに含む、非ヒト動物細胞。
(項目59)
TTRコード配列と非コード配列の両方を含むヒトTTR配列を含む遺伝子改変内因性Ttr遺伝子座を含む、非ヒト動物ゲノム。
(項目60)
内因性非ヒト動物Ttr遺伝子座の5’標的配列に対応する5’相同アームおよび前記内因性非ヒト動物Ttr遺伝子座の3’標的配列に対応する3’相同アームによって挟まれた、TTRコード配列と非コード配列の両方を含むヒトTTR配列を含む核酸挿入断片を含む標的化ベクター。
特定の実施形態では、例えば、以下が提供される:
(項目1)
TTRコード配列と非コード配列の両方を含むヒトTTR配列を含む遺伝子改変内因性Ttr遺伝子座をそのゲノムに含む、非ヒト動物。
(項目2)
Ttrコード配列と非コード配列の両方を含む前記内因性Ttr遺伝子座のある領域が欠失し、TTRコード配列と非コード配列の両方を含む対応するヒトTTR配列で置き換えられている、項目1に記載の非ヒト動物。
(項目3)
前記遺伝子改変内因性Ttr遺伝子座が内因性Ttrプロモーターを含み、前記ヒトTTR配列が前記内因性Ttrプロモーターに作動可能に連結されている、項目1または2に記載の非ヒト動物。
(項目4)
前記内因性Ttr遺伝子座の少なくとも1つのイントロンおよび少なくとも1つのエクソンが欠失し、前記対応するヒトTTR配列で置き換えられている、前記項目のいずれかに記載の非ヒト動物。
(項目5)
前記内因性Ttr遺伝子座の前記Ttrコード配列全体が欠失し、前記対応するヒトTTR配列で置き換えられている、前記項目のいずれかに記載の非ヒト動物。
(項目6)
Ttr開始コドンからTtr停止コドンまでの前記内因性Ttr遺伝子座の領域が欠失し、前記対応するヒトTTR配列で置き換えられている、項目5に記載の非ヒト動物。
(項目7)
前記遺伝子改変内因性Ttr遺伝子座がヒトTTR 3’非翻訳領域を含む、前記項目のいずれかに記載の非ヒト動物。
(項目8)
内因性Ttr 5’非翻訳領域は欠失しておらず、前記対応するヒトTTR配列で置き換えられていない、前記項目のいずれかに記載の非ヒト動物。
(項目9)
前記Ttr開始コドンから前記Ttr停止コドンまでの前記内因性Ttr遺伝子座の領域が欠失し、前記対応するヒトTTR配列およびヒトTTR 3’非翻訳領域を含むヒトTTR配列で置き換えられており、
前記内因性Ttr 5’非翻訳領域は欠失しておらず、前記対応するヒトTTR配列で置き換えられておらず、
前記内因性Ttrプロモーターは欠失しておらず、前記対応するヒトTTR配列で置き換えられていない、
前記項目のいずれかに記載の非ヒト動物。
(項目10)
(i)前記遺伝子改変内因性Ttr遺伝子座の前記ヒトTTR配列が、配列番号18に示す配列と少なくとも90%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一である配列を含むか;または
(ii)前記遺伝子改変内因性Ttr遺伝子座が、配列番号1に示す配列と少なくとも90%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一である配列を含むタンパク質をコードし;
(iii)前記遺伝子改変内因性Ttr遺伝子座が、配列番号90に示す配列と少なくとも90%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一である配列を含むコード配列を含むか;または、
(iv)前記遺伝子改変内因性Ttr遺伝子座が、配列番号14または15に示す配列と少なくとも90%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一である配列を含む、
項目9に記載の非ヒト動物。
(項目11)
前記遺伝子改変内因性Ttr遺伝子座がシグナルペプチドを含むトランスサイレチン前駆体タンパク質をコードし、前記シグナルペプチドをコードする前記内因性Ttr遺伝子座の領域が欠失しておらず、前記対応するヒトTTR配列で置き換えられていない、項目1から4のいずれか一項に記載の非ヒト動物。
(項目12)
前記内因性Ttr遺伝子座の第1のエクソンが欠失しておらず、前記対応するヒトTTR配列で置き換えられていない、項目11に記載の非ヒト動物。
(項目13)
前記内因性Ttr遺伝子座の第1のエクソンおよび第1のイントロンが欠失しておらず、前記対応するヒトTTR配列で置き換えられていない、項目12に記載の非ヒト動物。
(項目14)
第2のTtrエクソンの開始からTtr停止コドンまでの前記内因性Ttr遺伝子座の領域が欠失し、前記対応するヒトTTR配列で置き換えられている、項目11から13のいずれか一項に記載の非ヒト動物。
(項目15)
前記遺伝子改変内因性Ttr遺伝子座がヒトTTR 3’非翻訳領域を含む、項目11から14のいずれか一項に記載の非ヒト動物。
(項目16)
前記第2のTtrエクソンから前記Ttr停止コドンまでの前記内因性Ttr遺伝子座の領域が欠失し、前記対応するヒトTTR配列およびヒトTTR 3’非翻訳領域を含むヒトTTR配列で置き換えられており、
前記内因性Ttr 5’非翻訳領域が欠失しておらず、前記対応するヒトTTR配列で置き換えられておらず、
前記内因性Ttrプロモーターが欠失しておらず、前記対応するヒトTTR配列で置き換えられていない、
項目11から15のいずれか一項に記載の非ヒト動物。
(項目17)
(i)前記遺伝子改変内因性Ttr遺伝子座の前記ヒトTTR配列が、配列番号19に示す配列と少なくとも90%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一である配列を含むか;または
(ii)前記遺伝子改変内因性Ttr遺伝子座が、配列番号2に示す配列と少なくとも90%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一である配列を含むタンパク質をコードし;
(iii)前記遺伝子改変内因性Ttr遺伝子座が、配列番号91に示す配列と少なくとも90%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一である配列を含むコード配列を含むか;または
(iv)前記遺伝子改変内因性Ttr遺伝子座が、配列番号16または17に示す配列と少なくとも90%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一である配列を含む、
項目16に記載の非ヒト動物。
(項目18)
前記遺伝子改変内因性Ttr遺伝子座が選択カセットもレポーター遺伝子も含まない、前記項目のいずれかに記載の非ヒト動物。
(項目19)
前記遺伝子改変内因性Ttr遺伝子座についてホモ接合性である、前記項目のいずれかに記載の非ヒト動物。
(項目20)
哺乳動物である、前記項目のいずれかに記載の非ヒト動物。
(項目21)
ラットまたはマウスである、項目20に記載の非ヒト動物。
(項目22)
マウスである、項目21に記載の非ヒト動物。
(項目23)
in vivoでヒトTTR標的化試薬の活性を評価する方法であって、
(a)項目1から22のいずれか一項に記載の非ヒト動物に前記ヒトTTR標的化試薬を投与すること;および
(b)前記非ヒト動物における前記ヒトTTR標的化試薬の活性を評価すること
を含む方法。
(項目24)
前記投与することが、アデノ随伴ウイルス(AAV)媒介性送達、脂質ナノ粒子(LNP)媒介性送達または流体力学的送達(HDD)を含む、項目23に記載の方法。
(項目25)
前記投与することがLNP媒介性送達を含む、項目24に記載の方法。
(項目26)
前記LNPの用量が約0.1mg/kgから約2mg/kgの間にある、項目25に記載の方法。
(項目27)
前記投与することがAAV8媒介性送達を含む、項目24に記載の方法。
(項目28)
ステップ(b)が、前記非ヒト動物から肝臓を単離し、前記肝臓における前記ヒトTTR標的化試薬の活性を評価することを含む、項目23から27のいずれか一項に記載の方法。
(項目29)
ステップ(b)が、前記肝臓以外の臓器または組織における前記ヒトTTR標的化試薬の活性を評価することをさらに含む、項目28に記載の方法。
(項目30)
前記ヒトTTR標的化試薬がゲノム編集剤であり、前記評価することが前記遺伝子改変Ttr遺伝子座の改変を評価することを含む、項目23から29のいずれか一項に記載の方法。
(項目31)
前記評価することが、前記遺伝子改変Ttr遺伝子座内の挿入または欠失の頻度を測定することを含む、項目30に記載の方法。
(項目32)
前記評価することが、前記遺伝子改変Ttr遺伝子座によってコードされるTtrメッセンジャーRNAの発現を測定することを含む、項目23から31のいずれか一項に記載の方法。
(項目33)
前記評価することが、前記遺伝子改変Ttr遺伝子座によってコードされるTTRタンパク質の発現を測定することを含む、項目23から32のいずれか一項に記載の方法。
(項目34)
前記TTRタンパク質の発現を評価することが、前記非ヒト動物における前記TTRタンパク質の血清レベルを測定することを含む、項目33に記載の方法。
(項目35)
前記活性が前記非ヒト動物の前記肝臓で評価される、項目30から33のいずれか一項に記載の方法。
(項目36)
前記ヒトTTR標的化試薬が、ヒトTTR遺伝子のある領域を標的にするように設計されたヌクレアーゼ剤を含む、項目23から35のいずれか一項に記載の方法。
(項目37)
前記ヌクレアーゼ剤が、Casタンパク質、および前記ヒトTTR遺伝子におけるガイドRNA標的配列を標的にするように設計されたガイドRNAを含む、項目36に記載の方法。
(項目38)
前記Casタンパク質がCas9タンパク質である、項目37に記載の方法。
(項目39)
前記ヒトTTR標的化試薬が外因性ドナー核酸をさらに含み、前記外因性ドナー核酸が前記ヒトTTR遺伝子と組み換わるように設計されている、項目36から38のいずれか一項に記載の方法。
(項目40)
前記外因性ドナー核酸が一本鎖オリゴデオキシヌクレオチド(ssODN)である、項目39に記載の方法。
(項目41)
in vivoでヒトTTR標的化試薬の活性を最適化する方法であって、
(I)TTRコード配列と非コード配列の両方を含むヒトTTR配列を含む遺伝子改変内因性Ttr遺伝子座をそのゲノムに含む第1の非ヒト動物において、項目23から40のいずれか一項に記載の方法を1回目に実行すること、
(II)TTRコード配列と非コード配列の両方を含む前記ヒトTTR配列を含む前記遺伝子改変内因性Ttr遺伝子座をそのゲノムに含む第2の非ヒト動物において、変数を変更し、ステップ(I)の方法を変更した前記変数で2回目に実行すること;および
(III)ステップ(I)の前記ヒトTTR標的化試薬の活性をステップ(II)の前記ヒトTTR標的化試薬の活性と比較し、より高い活性をもたらす方法を選択すること
を含む方法。
(項目42)
ステップ(II)の変更した前記変数が、前記ヒトTTR標的化試薬を前記非ヒト動物に導入する送達方法である、項目41に記載の方法。
(項目43)
前記投与することがLNP媒介性送達を含み、ステップ(II)の変更した前記変数がLNP製剤である、項目42に記載の方法。
(項目44)
ステップ(II)の変更した前記変数が、前記ヒトTTR標的化試薬を前記非ヒト動物に導入する投与経路である、項目41に記載の方法。
(項目45)
ステップ(II)の変更した前記変数が、前記非ヒト動物に導入される前記ヒトTTR標的化試薬の濃度または量である、項目41に記載の方法。
(項目46)
ステップ(II)の変更した前記変数が、前記非ヒト動物に導入される前記ヒトTTR標的化試薬の形態である、項目41に記載の方法。
(項目47)
ステップ(II)の変更した前記変数が、前記非ヒト動物に導入される前記ヒトTTR標的化試薬である、項目41に記載の方法。
(項目48)
前記ヒトTTR標的化試薬が、Casタンパク質、およびヒトTTR遺伝子のガイドRNA標的配列を標的にするように設計されたガイドRNAを含む、項目41に記載の方法。
(項目49)
ステップ(II)の変更した前記変数が、ガイドRNA配列または前記ガイドRNA標的配列である、項目48に記載の方法。
(項目50)
前記Casタンパク質および前記ガイドRNAの各々がRNAの形態で投与され、ステップ(II)の変更した前記変数がCas mRNAのガイドRNAに対する比である、項目48に記載の方法。
(項目51)
ステップ(II)の変更した前記変数がガイドRNAの改変である、項目48に記載の方法。
(項目52)
項目1から22のいずれか一項に記載の非ヒト動物を作製する方法であって、
(a)非ヒト動物胚性幹(ES)細胞に:
(i)前記内因性Ttr遺伝子座の標的配列を標的にするヌクレアーゼ剤;および
(ii)前記内因性Ttr遺伝子座の5’標的配列に対応する5’相同アームおよび前記内因性Ttr遺伝子座の3’標的配列に対応する3’相同アームによって挟まれた前記ヒトTTR配列を含む核酸挿入断片を含む標的化ベクター
を導入するステップであって、前記標的化ベクターは、前記内因性Ttr遺伝子座で組み換えて、前記ヒトTTR配列を含む前記遺伝子改変内因性Ttr遺伝子座をそのゲノムに含む遺伝子改変非ヒトES細胞を生成する、ステップと;
(b)前記遺伝子改変非ヒトES細胞を非ヒト動物宿主の胚に導入するステップと;
(c)代理母で前記非ヒト動物宿主の胚を懐胎させるステップであって、前記代理母が、前記ヒトTTR配列を含む前記遺伝子改変内因性Ttr遺伝子座をそのゲノムに含むF0後代の遺伝子改変非ヒト動物を生成するステップと
を含む方法。
(項目53)
前記ヌクレアーゼ剤がCasタンパク質およびガイドRNAを含む、項目52に記載の方法。
(項目54)
前記Casタンパク質がCas9タンパク質である、項目53に記載の方法。
(項目55)
前記標的化ベクターは、長さが少なくとも10kbであるか、または前記5’および3’相同アームの長さの合計が少なくとも10kbである、大きな標的化ベクターである、項目52から54のいずれか一項に記載の方法。
(項目56)
前記非ヒト動物がマウスまたはラットである、項目52から55のいずれか一項に記載の方法。
(項目57)
前記非ヒト動物がマウスである、項目56に記載の方法。
(項目58)
TTRコード配列と非コード配列の両方を含むヒトTTR配列を含む遺伝子改変内因性Ttr遺伝子座をそのゲノムに含む、非ヒト動物細胞。
(項目59)
TTRコード配列と非コード配列の両方を含むヒトTTR配列を含む遺伝子改変内因性Ttr遺伝子座を含む、非ヒト動物ゲノム。
(項目60)
内因性非ヒト動物Ttr遺伝子座の5’標的配列に対応する5’相同アームおよび前記内因性非ヒト動物Ttr遺伝子座の3’標的配列に対応する3’相同アームによって挟まれた、TTRコード配列と非コード配列の両方を含むヒトTTR配列を含む核酸挿入断片を含む標的化ベクター。
Claims (45)
- TTRコード配列と非コード配列の両方を含むヒトTTR配列を含む遺伝子改変内因性Ttr遺伝子座をそのゲノムに含む、非ヒト動物。
- Ttrコード配列と非コード配列の両方を含む前記内因性Ttr遺伝子座のある領域が欠失し、TTRコード配列と非コード配列の両方を含む対応するヒトTTR配列で置き換えられている、請求項1に記載の非ヒト動物。
- 前記遺伝子改変内因性Ttr遺伝子座が内因性Ttrプロモーターを含み、前記ヒトTTR配列が前記内因性Ttrプロモーターに作動可能に連結されている、請求項1または2に記載の非ヒト動物。
- 前記内因性Ttr遺伝子座の少なくとも1つのイントロンおよび少なくとも1つのエクソンが欠失し、前記対応するヒトTTR配列で置き換えられている、請求項1から3のいずれか一項に記載の非ヒト動物。
- 前記内因性Ttr遺伝子座の前記Ttrコード配列全体が欠失し、前記対応するヒトTTR配列で置き換えられている、請求項1から4のいずれか一項に記載の非ヒト動物。
- Ttr開始コドンからTtr停止コドンまでの前記内因性Ttr遺伝子座の領域が欠失し、前記対応するヒトTTR配列で置き換えられている、請求項5に記載の非ヒト動物。
- 前記遺伝子改変内因性Ttr遺伝子座がヒトTTR 3’非翻訳領域を含む、請求項1から6のいずれか一項に記載の非ヒト動物。
- 内因性Ttr 5’非翻訳領域は欠失しておらず、前記対応するヒトTTR配列で置き換えられていない、請求項1から7のいずれか一項に記載の非ヒト動物。
- 前記Ttr開始コドンから前記Ttr停止コドンまでの前記内因性Ttr遺伝子座の領域が欠失し、前記対応するヒトTTR配列およびヒトTTR 3’非翻訳領域を含むヒトTTR配列で置き換えられており、
前記内因性Ttr 5’非翻訳領域は欠失しておらず、前記対応するヒトTTR配列で置き換えられておらず、
前記内因性Ttrプロモーターは欠失しておらず、前記対応するヒトTTR配列で置き換えられていない、
請求項1から8のいずれか一項に記載の非ヒト動物。 - (i)前記遺伝子改変内因性Ttr遺伝子座の前記ヒトTTR配列が、配列番号18に示す配列と少なくとも90%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一である配列を含むか;または
(ii)前記遺伝子改変内因性Ttr遺伝子座が、配列番号1に示す配列と少なくとも90%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一である配列を含むタンパク質をコードし;
(iii)前記遺伝子改変内因性Ttr遺伝子座が、配列番号90に示す配列と少なくとも90%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一である配列を含むコード配列を含むか;または、
(iv)前記遺伝子改変内因性Ttr遺伝子座が、配列番号14または15に示す配列と少なくとも90%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一である配列を含む、
請求項9に記載の非ヒト動物。 - 前記遺伝子改変内因性Ttr遺伝子座がシグナルペプチドを含むトランスサイレチン前駆体タンパク質をコードし、前記シグナルペプチドをコードする前記内因性Ttr遺伝子座の領域が欠失しておらず、前記対応するヒトTTR配列で置き換えられていない、請求項1から4のいずれか一項に記載の非ヒト動物。
- 前記内因性Ttr遺伝子座の第1のエクソンが欠失しておらず、前記対応するヒトTTR配列で置き換えられていない、請求項11に記載の非ヒト動物。
- 前記内因性Ttr遺伝子座の第1のエクソンおよび第1のイントロンが欠失しておらず、前記対応するヒトTTR配列で置き換えられていない、請求項12に記載の非ヒト動物。
- 第2のTtrエクソンの開始からTtr停止コドンまでの前記内因性Ttr遺伝子座の領域が欠失し、前記対応するヒトTTR配列で置き換えられている、請求項11から13のいずれか一項に記載の非ヒト動物。
- 前記遺伝子改変内因性Ttr遺伝子座がヒトTTR 3’非翻訳領域を含む、請求項11から14のいずれか一項に記載の非ヒト動物。
- 前記第2のTtrエクソンから前記Ttr停止コドンまでの前記内因性Ttr遺伝子座の領域が欠失し、前記対応するヒトTTR配列およびヒトTTR 3’非翻訳領域を含むヒトTTR配列で置き換えられており、
前記内因性Ttr 5’非翻訳領域が欠失しておらず、前記対応するヒトTTR配列で置き換えられておらず、
前記内因性Ttrプロモーターが欠失しておらず、前記対応するヒトTTR配列で置き換えられていない、
請求項11から15のいずれか一項に記載の非ヒト動物。 - (i)前記遺伝子改変内因性Ttr遺伝子座の前記ヒトTTR配列が、配列番号19に示す配列と少なくとも90%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一である配列を含むか;または
(ii)前記遺伝子改変内因性Ttr遺伝子座が、配列番号2に示す配列と少なくとも90%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一である配列を含むタンパク質をコードし;
(iii)前記遺伝子改変内因性Ttr遺伝子座が、配列番号91に示す配列と少なくとも90%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一である配列を含むコード配列を含むか;または
(iv)前記遺伝子改変内因性Ttr遺伝子座が、配列番号16または17に示す配列と少なくとも90%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一である配列を含む、
請求項16に記載の非ヒト動物。 - 前記遺伝子改変内因性Ttr遺伝子座が選択カセットもレポーター遺伝子も含まない、請求項1から17のいずれか一項に記載の非ヒト動物。
- 前記遺伝子改変内因性Ttr遺伝子座についてホモ接合性である、請求項1から18のいずれか一項に記載の非ヒト動物。
- 哺乳動物である、請求項1から19のいずれか一項に記載の非ヒト動物。
- ラットまたはマウスである、請求項20に記載の非ヒト動物。
- 前記マウスである、請求項21に記載の非ヒト動物。
- in vivoでヒトTTR標的化試薬の活性を評価する方法であって、
(a)請求項1から22のいずれか一項に記載の非ヒト動物に前記ヒトTTR標的化試薬を投与すること;および
(b)前記非ヒト動物における前記ヒトTTR標的化試薬の活性を評価すること
を含む方法。 - 前記投与することが、アデノ随伴ウイルス(AAV)媒介性送達、脂質ナノ粒子(LNP)媒介性送達または流体力学的送達(HDD)を含む、請求項23に記載の方法。
- 前記投与することがLNP媒介性送達を含む、請求項24に記載の方法。
- 前記LNPの用量が約0.1mg/kgから約2mg/kgの間にある、請求項25に記載の方法。
- 前記投与することがAAV8媒介性送達を含む、請求項24に記載の方法。
- ステップ(b)が、前記非ヒト動物から肝臓を単離し、前記肝臓における前記ヒトTTR標的化試薬の活性を評価することを含む、請求項23から27のいずれか一項に記載の方法。
- ステップ(b)が、前記肝臓以外の臓器または組織における前記ヒトTTR標的化試薬の活性を評価することをさらに含む、請求項28に記載の方法。
- 前記ヒトTTR標的化試薬がゲノム編集剤であり、前記評価することが前記遺伝子改変Ttr遺伝子座の改変を評価することを含む、請求項23から29のいずれか一項に記載の方法。
- 前記評価することが、前記遺伝子改変Ttr遺伝子座内の挿入または欠失の頻度を測定することを含む、請求項30に記載の方法。
- 前記評価することが、前記遺伝子改変Ttr遺伝子座によってコードされるTtrメッセンジャーRNAの発現を測定することを含む、請求項23から31のいずれか一項に記載の方法。
- 前記評価することが、前記遺伝子改変Ttr遺伝子座によってコードされるTTRタンパク質の発現を測定することを含む、請求項23から32のいずれか一項に記載の方法。
- 前記TTRタンパク質の発現を評価することが、前記非ヒト動物における前記TTRタンパク質の血清レベルを測定することを含む、請求項33に記載の方法。
- 前記活性が前記非ヒト動物の前記肝臓で評価される、請求項30から33のいずれか一項に記載の方法。
- 前記ヒトTTR標的化試薬が、ヒトTTR遺伝子のある領域を標的にするように設計されたヌクレアーゼ剤を含む、請求項23から35のいずれか一項に記載の方法。
- 前記ヌクレアーゼ剤が、Casタンパク質、および前記ヒトTTR遺伝子におけるガイドRNA標的配列を標的にするように設計されたガイドRNAを含む、請求項36に記載の方法。
- 前記Casタンパク質がCas9タンパク質である、請求項37に記載の方法。
- 前記ヒトTTR標的化試薬が外因性ドナー核酸をさらに含み、前記外因性ドナー核酸が前記ヒトTTR遺伝子と組み換わるように設計されている、請求項36から38のいずれか一項に記載の方法。
- 前記外因性ドナー核酸が一本鎖オリゴデオキシヌクレオチド(ssODN)である、請求項39に記載の方法。
- in vivoでヒトTTR標的化試薬の活性を最適化する方法であって、
(I)TTRコード配列と非コード配列の両方を含むヒトTTR配列を含む遺伝子改変内因性Ttr遺伝子座をそのゲノムに含む第1の非ヒト動物において、請求項23から40のいずれか一項に記載の方法を1回目に実行すること、
(II)TTRコード配列と非コード配列の両方を含む前記ヒトTTR配列を含む前記遺伝子改変内因性Ttr遺伝子座をそのゲノムに含む第2の非ヒト動物において、変数を変更し、ステップ(I)の方法を変更した前記変数で2回目に実行すること;および
(III)ステップ(I)の前記ヒトTTR標的化試薬の活性をステップ(II)の前記ヒトTTR標的化試薬の活性と比較し、より高い活性をもたらす方法を選択すること
を含む方法。 - (I)ステップ(II)の変更した前記変数が、前記ヒトTTR標的化試薬を前記非ヒト動物に導入する送達方法であり、必要に応じて、前記投与することがLNP媒介性送達を含み、ステップ(II)の変更した前記変数がLNP製剤である;
(II)ステップ(II)の変更した前記変数が、前記ヒトTTR標的化試薬を前記非ヒト動物に導入する投与経路である;
(III)ステップ(II)の変更した前記変数が、前記非ヒト動物に導入される前記ヒトTTR標的化試薬の濃度または量である;
(IV)ステップ(II)の変更した前記変数が、前記非ヒト動物に導入される前記ヒトTTR標的化試薬の形態である;
(V)ステップ(II)の変更した前記変数が、前記非ヒト動物に導入される前記ヒトTTR標的化試薬である;あるいは
(VI)前記ヒトTTR標的化試薬が、Casタンパク質、およびヒトTTR遺伝子のガイドRNA標的配列を標的にするように設計されたガイドRNAを含み、ここで
(1)ステップ(II)の変更した前記変数が、ガイドRNA配列または前記ガイドRNA標的配列である;
(2)前記Casタンパク質および前記ガイドRNAの各々がRNAの形態で投与され、ステップ(II)の変更した前記変数がCas mRNAのガイドRNAに対する比である:または
(3)ステップ(II)の変更した前記変数がガイドRNAの改変である、請求項41に記載の方法。 - 請求項1から22のいずれか一項に記載の非ヒト動物を作製するための方法であって、
(I)
(a)前記遺伝子改変内因性Ttr遺伝子座を含むように非ヒト動物の多能性幹細胞のゲノムを改変するステップと;
(b)前記遺伝子改変内因性Ttr遺伝子座を含む遺伝子改変非ヒト動物多能性幹細胞を同定または選択するステップと;
(c)前記遺伝子改変非ヒト動物多能性幹細胞を非ヒト動物宿主の胚に導入するステップと;
(d)前記非ヒト動物宿主の胚を代理非ヒト動物母に埋め込み、懐胎させるステップと
を含む、あるいは
(II)
(a)前記遺伝子改変内因性Ttr遺伝子座を含むように非ヒト動物の1細胞期胚のゲノムを改変するステップと;
(b)前記遺伝子改変内因性Ttr遺伝子座を含む遺伝子改変非ヒト動物1細胞期胚を選択するステップと;
(c)前記遺伝子改変非ヒト動物1細胞期胚を代理非ヒト動物母に埋め込み、懐胎させるステップと
を含む方法。 - TTRコード配列と非コード配列の両方を含むヒトTTR配列を含む遺伝子改変内因性Ttr遺伝子座をそのゲノムに含む、非ヒト動物細胞。
- 内因性非ヒト動物Ttr遺伝子座の5’標的配列に対応する5’相同アームおよび前記内因性非ヒト動物Ttr遺伝子座の3’標的配列に対応する3’相同アームによって挟まれた、TTRコード配列と非コード配列の両方を含むヒトTTR配列を含む核酸挿入断片を含む標的化ベクター。
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