JP2021178828A - B型肝炎ウイルス感染に対するRNAi療法 - Google Patents
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Abstract
Description
料だが、複製サイクルは、プレゲノムRNAをDNAにコピーする逆転写工程を含んでいる。B
型肝炎ウイルスはヘパドナウイルスの一員に分類され、ヘパドナウイルス科のファミリー
に属している。成人がB型肝炎ウイルスに初感染すると急性肝炎が起こり、臓器の炎症、
発熱、黄疸、血液中の肝臓トランスアミナーゼ増加という症状を伴う。ウイルス感染を克
服できない患者は長年にわたって慢性疾患の進行に苦しむことになり、肝硬変や肝臓がん
になるリスクが増大する。B型肝炎ウイルスに感染した母親から新生児への周産期感染も
慢性肝炎につながる。
その場所でDNA鎖の合成が完了し、ギャップが修復されて3.2 kbの共有結合閉環状(ccc)
スーパーコイルDNAが生じる。このcccDNAは、長さがそれぞれ3.5 kb、2.4 kb、2.1 kb、0
.7 kbである4つの主要なウイルスmRNAの転写のための鋳型として機能する。すべてのmRNA
が5'-キャップ状態であり、3'末端がポリアデニル化されている。4つすべてのmRNAの間で
3'末端に配列の重複がある。
る。それに加え、その同じ転写産物がプレゲノム複製中間体として機能し、ウイルスのポ
リメラーゼがDNAへの逆転写を開始できるようにする。コアタンパク質はヌクレオカプシ
ドの形成に必要とされる。それに加え、逐次的なプロセシング活動によっていくつかのコ
アタンパク質が分泌可能なe-抗原に変換される。血液中のe-抗原の量は肝臓内でのB型肝
炎ウイルスの複製と相関しているため、疾患の進行を監視するための1つの重要な診断マ
ーカーとして機能する。
るためのプレ-S1、プレ-S2、Sというオープンリーディングフレームを有する。s-抗原は
、感染性の完全な粒子と関係している。それに加え、感染した患者の血液には、s-抗原の
みに由来してゲノムDNAやポリメラーゼのない非感染性粒子も含まれている。これら粒子
の機能は完全にはわかっていない。血液中に検出可能なs-抗原がまったくない状態が継続
することが、B型肝炎ウイルス消失の信頼できる指標と見なされており、したがって治療
の成功と見なされる。
率的な転写にとって重要であり、宿主での遺伝子発現に関するトランス活性化因子として
も作用する。その因子の活性は、肝臓がんが進行する間の肝細胞の変化にとって重要であ
るように見える。
染していると見なされる。逆転写酵素活性の阻害剤としてのヌクレオシド類似体が、多く
の患者にとって治療の典型的な第一選択肢となる。ラミブジン、テノホビル、エンテカビ
ルは、B型肝炎ウイルスの複製を抑制し、ときには検出できないレベルにする。肝機能の
改善と肝臓の炎症の低下が、最も重要な利点である。しかしごく少数の患者だけが、治療
の終了後に完全かつ継続的な寛解を達成する。さらに、B型肝炎ウイルスは、治療期間が
長くなると薬剤耐性を発達させる。これは、B型肝炎とヒト免疫不全に同時に感染してい
る患者にとって特に厳しい。どちらのウイルスもヌクレオシド類似体薬に感受性があり、
耐性を同時に発達させる可能性がある。
の期間にわたって高用量のインターフェロン-αを投与される。アジア遺伝子型Bは奏効率
が非常に低い。D型肝炎またはヒト免疫不全ウイルスにも同時に感染していると、インタ
ーフェロン-α療法が完全に無効になることが判明している。肝臓の損傷が激しく重い線
維状態になっている患者には、インターフェロン-α療法は適切でない。
ウイルスの遺伝子発現を選択的かつ効率的に沈黙させ、複製を阻止し、ウイルス負荷を低
減させることのできる薬剤が依然として必要とされている。
本明細書は、B型肝炎ウイルス(HBV)の発現を選択的かつ効率的に減らすことのできる
HBV特異的RNA干渉(RNAi)トリガー分子(RNAi剤、RNAiトリガー、トリガーとも呼ぶ)、
及びB型肝炎ウイルス遺伝子の発現、特にB型肝炎ウイルスの複製または発症に関連する遺
伝子の発現を阻害するためのRNA干渉の介在における使用について記載される。それぞれ
のRNAiトリガーは、少なくともセンス鎖とアンチセンス鎖を含んでいる。センス鎖とアン
チセンス鎖は、互いに、一部が相補的である、または実質的に相補的である、または完全
に相補的であることが可能である。本明細書に記載したRNAiトリガーのセンス鎖とアンチ
センス鎖それぞれの長さは、16〜30ヌクレオチドにすることができる。いくつかの実施態
様では、センス鎖とアンチセンス鎖は、長さが独立に17〜26ヌクレオチドである。センス
鎖とアンチセンス鎖は、同じ長さにすること、または異なる長さにすることができる。本
明細書に記載したRNAiトリガーは、HBVを発現する細胞に送達されると、生体内で1つ以上
のHBV遺伝子の発現を抑制する。HBV RNAiトリガーで使用できるHBV RNAiトリガーのセン
ス鎖とアンチセンス鎖の例は、表1Aと表1Bに提示されている。HBV RNAiトリガーデュープ
レックスの例は表2に提示されている。
含むアンチセンス鎖(ガイド鎖)を含んでいる。いくつかの実施態様では、センス鎖は、
B型肝炎ウイルスのmRNAの少なくとも一部と少なくとも90%一致したコア配列を含んでい
る。アンチセンス鎖は、B型肝炎ウイルス遺伝子をコードするmRNAの少なくとも一部と実
質的に相補的なヌクレオチド配列を含んでいる。いくつかの実施態様では、相補性領域は
長さが30ヌクレオチド未満である。いくつかの実施態様では、RNAiトリガーデュープレッ
クスの長さは約16〜30ヌクレオチドの範囲である。いくつかの実施態様では、RNAiトリガ
ーデュープレックスの長さは約15〜25ヌクレオチドの範囲である。いくつかの実施態様で
は、HBV RNAiトリガーは、デュープレックスの長さが約18、または19、または20、または
21、または22、または23、または24ヌクレオチドである。配列の例は表1Aと表1Bに提示さ
れている。
基は、HBV RNAiトリガーのセンス鎖またはアンチセンス鎖の3'末端または5'末端に連結さ
せることができる。いくつかの実施態様では、標的化基は、センス鎖の3'末端または5'末
端に連結される。いくつかの実施態様では、標的化基は、センス鎖の5'末端に連結される
。いくつかの実施態様では、標的化基は、20個以上の炭素原子を有する疎水性基を含んで
いる。いくつかの実施態様では、疎水性基は、コレステロール基またはコレステリル基を
含んでいる。いくつかの実施態様では、標的化基は、ガラクトース三量体を含んでいる。
なリンカーの非限定的な例に含まれるのは、-(CH2)n-(ただしnは1〜10であり、いくつか
の実施態様ではn=6、すなわち本明細書で用いるC6である)と、-(O-CH2-CH2) nまたは-(
CH2-CH2-O) n(ただしnは1〜10であり、いくつかの実施態様ではn=3、すなわちトリエチ
レングリコール(TEG)である)である。標的化基を有するリンカー、または標的化基の
ないリンカーを、表1Aと表1Bに開示されているセンス鎖および/またはアンチセンス鎖の
5'末端または3'末端に付着させることができる。
せを記述する。いくつかの実施態様では、その少なくとも2つ以上の異なるHBV RNAiトリ
ガーは、それぞれが標的化基に連結される。いくつかの実施態様では、その少なくとも2
つ以上の異なるHBV RNAiトリガーは、それぞれがコレステロール標的化基に連結される。
いくつかの実施態様では、その少なくとも2つ以上の異なるHBV RNAiトリガーは、それぞ
れがガラクトース三量体標的化基に連結される。いくつかの実施態様では、2つの異なる
トリガーを使用するとき、第1のトリガーはコレステロールに連結され、第2のトリガーは
ガラクトース三量体に連結される。いくつかの実施態様では、2つ以上のトリガーを使用
するとき、その2つのトリガーは、同じリンカーまたは似たリンカーを用いてそれぞれの
標的化基に連結される。いくつかの実施態様では、2つ以上のトリガーを使用するとき、
その2つのトリガーは、異なるリンカーを用いてそれぞれの標的化基に連結される。いく
つかの実施態様では、第1の標的化基はC6リンカーを介して第1のHBV RNAiトリガーに連結
され、第2の標的化基はTEGリンカーを介して第2のHBV RNAiトリガーに連結される。いく
つかの実施態様では、第1と第2の標的化基は、両方とも、コレステロール基またはコレス
テリル基を含むか、コレステロール基またはコレステリル基からなる。いくつかの実施態
様では、第1と第2の標的化基は、両方とも、ガラクトース三量体またはガラクトース四量
体を含むか、ガラクトース三量体またはガラクトース四量体からなる。異なるリンカーを
用いると、トリガーの識別を改善することと、トリガーを定量的に分析することが可能に
なる。
送達する組成物が記載されている。いくつかの実施態様では、標的化基は、ガラクトース
三量体またはコレステロールである。
て、a)アシアロ糖タンパク質受容体(ASGPr)を標的とする可逆的にマスクされたメリチ
ン様ペプチド(MLP)、すなわちMLP送達ペプチド(または単純に送達ペプチド)と、b)
少なくとも20個の炭素原子を有する疎水性基(非限定的な例は、コレステロール基または
コレステリル基)に共役したHBV RNAiトリガー(RNA-共役体)を含む組成物が記載されて
いる。MLP送達ペプチドとRNAiトリガー-共役体は別々に合成され、別々の容器で、または
単一の容器で供給することができる。いくつかの実施態様では、HBV RNAiトリガーは送達
ペプチドに共役されない。
MLP-(L-T)x(ただし-L-Tは、-CO-C(CH3)=C(T)-COOHまたは-CO-C(T)=C(CH3)-COOHで表され
る構造を持ち、Tは、アシアロ糖タンパク質受容体に対する親和性を有する標的化リガン
ドを含み、xは、MLPの集団の第一級アミンの数の80%超である)と、b)表1Aに提示され
ている任意のアンチセンス配列のヌクレオチド2〜15、2〜19、1〜17、1〜21、1〜26のい
ずれかを含むアンチセンス鎖と、表1Bに提示されていてTEG基を介してコレステリル基に
共有結合した対応する任意のセンス配列を含むセンス鎖を含む第1のHBV RNAiトリガーと
、c)表1Aに提示されている任意のアンチセンス配列のヌクレオチド2〜15、2〜19、1〜17
、1〜21、1〜26のいずれかを含むアンチセンス鎖と、表1Bに提示されていてC6基を介して
コレステリル基に共有結合した対応する任意のセンス配列を含むセンス鎖を含む第2のHBV
RNAiトリガーを含む組成物を記述する。いくつかの実施態様では、表1Bに提示されてい
るセンス鎖ヌクレオチド配列は、5'または3'をChol-TEGまたはChol-C6で修飾することが
できる。
送達ペプチドを、医薬として許容可能な基剤または希釈剤の中に入れて哺乳動物に投与す
る。いくつかの実施態様では、哺乳動物はヒトである。いくつかの実施態様では、RNAiト
リガーと送達ペプチドを溶液の中で組み合わせた後に哺乳動物に投与する。いくつかの実
施態様では、送達ペプチドとRNAiトリガーを別々の溶液で哺乳動物に同時に投与する。い
くつかの実施態様では、送達ペプチドとRNAiトリガーを哺乳動物に順番に投与する。順番
に投与するには、送達ペプチドを投与した後にRNAiトリガーを投与することができる。そ
の代わりに、順番に投与するため、RNAiトリガーを投与した後に送達ペプチドを投与する
ことができる。
び/または予防する方法が提供される。記載したHBV RNAiトリガーは、RNA干渉を通じてB
型肝炎ウイルスの複製および/または病因に必要な1つ以上の遺伝子の発現を抑制する。H
BV RNAiは特に、細胞、または組織、または哺乳動物において、ウイルスのポリメラーゼ
、および/またはコアタンパク質、および/または表面抗原、および/またはe-抗原、お
よび/またはXタンパク質の抑制を開始させる。HBV RNAiトリガーは、B型肝炎ウイルス感
染症の治療に用いることができる。HBV RNAiトリガーは、B型肝炎ウイルス感染に付随す
る慢性肝臓疾患/異常、炎症、線維状態、増殖性異常(がんなど)の治療または予防に用
いることもできる。いくつかの実施態様では、配列は長さが少なくとも13個の連続ヌクレ
オチドである。このような方法は、HBV RNAiトリガーをHBVに感染したヒトまたは動物に
投与することを含んでいる。さらに、HBV RNAiトリガーを生体内で肝臓細胞に送達するた
めの組成物を記述する。
追加の(すなわち第2、第3などの)治療薬と組み合わされる。第2の治療薬として、別のH
BV RNAiトリガー(例えば、HBVゲノム内の異なる配列を標的とするHBV RNAiトリガー)が
可能である。追加の治療薬として、小分子薬、および/または抗体、および/または抗体
断片、および/またはワクチンも可能である。1つ以上の追加の薬を組み合わせた、また
は組み合わせないHBV RNAiトリガーを1つ以上の賦形剤と組み合わせて医薬組成物を形成
することができる。
かに応じ、多数のやり方で投与することができる。投与の非限定的な例として、静脈内投
与、動脈内投与、皮下投与、腹腔内投与、(例えば埋め込んだ装置を通じた)皮下投与、
柔組織内投与が可能である。
症または疾患または異常を治療する方法で使用することができる。そのような方法は、本
明細書に記載したHBV RNAiトリガーを対象(例えばヒト対象または動物対象)に投与する
ことを含んでいる。
者が一般に理解しているのと同じ意味を持つ。本発明を実施したり試験したりするのに本
明細書に記載したのと同様または同等の方法と材料を使用できるが、適切な方法と材料を
以下に記述する。本明細書で言及するあらゆる刊行物、特許出願、特許、他の参考文献は
、引用によってその全体が組み込まれている。係争が生じた場合、定義を含めて本明細書
が優先する。それに加え、材料、方法、実施例は単なる例示であり、本発明を制限する意
図はない。
明らかになろう。
本明細書に記載するのは、B型肝炎ウイルスの発現を抑制するためのRNAiトリガー(本
明細書ではHBV RNAiトリガーと呼ぶ)である。それぞれのHBV RNAiトリガーは、センス鎖
とアンチセンス鎖を含んでいる。センス鎖とアンチセンス鎖は、互いに、一部が相補的で
ある、または実質的に相補的である、または完全に相補的である。いくつかの実施態様で
は、本明細書に記載したRNAiトリガーのセンス鎖とアンチセンス鎖の長さは、独立に、16
〜30ヌクレオチドである。いくつかの実施態様では、本明細書に記載したRNAiトリガーの
センス鎖とアンチセンス鎖の長さは、独立に、17〜26ヌクレオチドである。いくつかの実
施態様では、本明細書に記載したRNAiトリガーのセンス鎖とアンチセンス鎖の長さは、独
立に、17、または18、または19、または20、または21、または22、または23、または24、
または25、または26ヌクレオチドである。センス鎖とアンチセンス鎖は、同じ長さにする
こと、または異なる長さにすることができる。いくつかの実施態様では、センス鎖は長さ
が約19ヌクレオチドであるのに対し、アンチセンス鎖は長さが約21ヌクレオチドである。
いくつかの実施態様では、センス鎖は長さが約21ヌクレオチドであるのに対し、アンチセ
ンス鎖は長さが約23ヌクレオチドである。別の実施態様では、センス鎖とアンチセンス鎖
の長さは、独立に、17〜21ヌクレオチドである。いくつかの実施態様では、センス鎖とア
ンチセンス鎖の両方とも、長さがそれぞれ21〜26ヌクレオチドである。いくつかの実施態
様では、センス鎖とアンチセンス鎖の両方とも長さが26ヌクレオチドである。HBV RNAiト
リガー分子を形成するのに用いるヌクレオチド配列の例は、表1Aと表1Bに提示されている
。
23ヌクレオベースのコア配列を含んでいる。アンチセンス鎖のコア配列は、HBV mRNAに存
在するあるヌクレオチド配列(「標的配列」と呼ぶことがある)と100%(完全に)相補
的であるか、少なくとも90%(実質的に)相補的である。センス鎖のコア配列は、アンチ
センス鎖の中のある配列と100%(完全に)相補的であるか、少なくとも90%(実質的に
)相補的であるため、HBV mRNAに存在するあるヌクレオチド配列(標的配列)と完全に一
致するか、少なくとも90%一致する。センス鎖のコア配列は、対応するアンチセンス鎖の
コア配列と同じ長さにすること、または異なる長さにすることができる。いくつかの実施
態様では、アンチセンス鎖のコア配列は、長さが16、または17、または18、または19、ま
たは20、または21、または22、または23ヌクレオチドである。いくつかの実施態様では、
センス鎖のコア配列は、長さが16、または17、または18、または19、または20、または21
、または22、または23ヌクレオチドである。
ックス(二本鎖)を形成する。相補的デュープレックス領域では、センス鎖のコア配列は
、アンチセンス鎖のコア配列と少なくとも90%相補的であるか、100%相補的である。い
くつかの実施態様では、センス鎖のコア配列は、アンチセンス鎖のコア配列の対応する16
、または17、または18、または19、または20、または21ヌクレオチドの配列と少なくとも
90%、または100%相補的である、少なくとも16、少なくとも17、少なくとも18、少なく
とも19、少なくとも20、少なくとも21ヌクレオチドからなる配列を含んでいる(すなわち
HBV RNAiトリガーのセンス鎖とアンチセンス鎖のコア配列は、少なくとも90%の塩基が対
を形成する、または100%の塩基が対を形成する少なくとも16、少なくとも17、少なくと
も18、少なくとも19、少なくとも20、少なくとも21ヌクレオチドからなる領域を有する)
。
)、マイクロRNA(miRNA)、短いヘアピンRNA(shRNA)、ダイサー(dicer)基質(例え
ばアメリカ合衆国特許第8,084,599号、第8,349,809号、第8,513,207号)である。本明細
書に記載したRNAiトリガーは、HBV遺伝子を発現する細胞に送達されると、RNA干渉(RNAi
)という生物学的プロセスを通じて生体内で1つ以上のHBV遺伝子の発現を抑制またはノッ
クダウンする。
(核酸塩基)、および/またはヌクレオチド、および/またはヌクレオシドの連なりまた
は順番を意味し、ヌクレオチドの標準的命名法で用いる文字列と、本明細書に記載した修
飾されたヌクレオチドのための鍵で記述する。
端に、または5'末端に、または3'末端と5'末端の両方に、追加の1個、または2個、または
3個、または4個、または5個、または6個のヌクレオチド(伸長部)を含んでいる。アンチ
センス鎖の追加のヌクレオチドは、存在する場合には、HBV mRNAの対応する配列と相補的
であってもなくてもよい。センス鎖の追加のヌクレオチドは、存在する場合には、HBV mR
NAの対応する配列と相補的であってもなくてもよい。アンチセンス鎖の追加のヌクレオチ
ドは、存在する場合には、対応するセンス鎖に存在する場合の追加のヌクレオチドと相補
的であってもなくてもよい。
配列の5'末端および/または3'末端に位置する1個、または2個、または3個、または4個、
または5個、または6個のヌクレオチドを含んでいる。センス鎖上の伸長ヌクレオチドは、
対応するアンチセンス鎖のヌクレオチド(コア配列ヌクレオチドまたは伸長ヌクレオチド
)と相補的であってもなくてもよい。逆に、アンチセンス鎖上の伸長ヌクレオチドは、対
応するセンス鎖のヌクレオチド(コア配列ヌクレオチドまたは伸長ヌクレオチド)と相補
的であってもなくてもよい。いくつかの実施態様では、RNAiトリガーのセンス鎖とアンチ
センス鎖の両方が3'伸長部と5'伸長部を含んでいる。いくつかの実施態様では、一方の鎖
の1つ以上の3'伸長ヌクレオチドが、他方の鎖の1つ以上の5'伸長ヌクレオチドと塩基対を
形成する。別の実施態様では、一方の鎖の1つ以上の3'伸長ヌクレオチドが、他方の鎖の1
つ以上の5'伸長ヌクレオチドと塩基対を形成しない。いくつかの実施態様では、HBV RNAi
トリガーは、3'伸長部を有するアンチセンス鎖と、5'伸長部を有するセンス鎖を持ってい
る。
ことによって形成される。いくつかの実施態様では、HBV RNAiトリガーのアンチセンス鎖
は、表1Aの任意の配列のヌクレオチド配列を含んでいる。いくつかの実施態様では、HBV
RNAiトリガーのアンチセンス鎖は、表1Aの任意の配列のヌクレオチド配列1〜17、2〜15、
2〜17、1〜18、2〜18、1〜19、2〜19、1〜20、2〜20、1〜21、2〜21、1〜22、2〜22、1〜
23、2〜23、1〜24、2〜24、1〜25、2〜25、1〜26、2〜26のいずれかを含む。いくつかの
実施態様では、HBV RNAiトリガーのセンス鎖は、表1Bの任意の配列のヌクレオチド配列を
含んでいる。いくつかの実施態様では、HBV RNAiトリガーのセンス鎖は、表1Bの任意の配
列のヌクレオチド配列1〜18、1〜19、1〜20、1〜21、1〜22、1〜23、1〜24、1〜25、1〜2
6、2〜19、2〜20、2〜21、2〜22、2〜23、2〜24、2〜25、2〜26、3〜20、3〜21、3〜22、
3〜23、3〜24、3〜25、3〜26、4〜21、4〜22、4〜23、4〜24、4〜25、4〜26、5〜22、5〜
23、5〜24、5〜25、5〜26、6〜23、6〜24、6〜25、6〜26、7〜24、7〜25、7〜26、8〜25
、8〜26のいずれかを含む。
ンス鎖は、同数のヌクレオチドを含む。いくつかの実施態様では、本明細書に記載したHB
V RNAiトリガーのセンス鎖とアンチセンス鎖は、異なる数のヌクレオチドを含む。いくつ
かの実施態様では、RNAiトリガーのセンス鎖の5'末端とアンチセンス鎖の3'末端が平滑末
端を形成している。RNAiトリガーのセンス鎖の3'末端とアンチセンス鎖の5'末端が平滑末
端を形成している。いくつかの実施態様では、RNAiトリガーの両方の末端が平滑末端を形
成している。いくつかの実施態様では、RNAiトリガーのどちらの末端も平滑末端ではない
。本明細書では、平滑末端は、2本のアニールされた鎖の末端ヌクレオチドが相補的であ
る(相補的な塩基対を形成する)二本鎖トリガー分子の末端を意味する。いくつかの実施
態様では、RNAiトリガーのセンス鎖の5'末端とアンチセンス鎖の3'末端がほどけた末端を
形成する。いくつかの実施態様では、RNAiトリガーのセンス鎖の3'末端とアンチセンス鎖
の5'末端がほどけた末端を形成する。いくつかの実施態様では、RNAiトリガーの両方の末
端がほどけた末端を形成する。いくつかの実施態様では、RNAiトリガーのどちらの末端も
ほどけた末端ではない。本明細書では、ほどけた末端は、2本のアニールされた鎖の末端
ヌクレオチドが対を形成する(すなわちオーバーハングを形成しない)が相補的ではない
(すなわち非相補的な対を形成する)二本鎖RNAiトリガー分子の末端を意味する。本明細
書では、オーバーハングは、二本鎖RNAiトリガー分子の1本の鎖の末端に位置する1つ以上
の不対ヌクレオチドの伸長部である。不対ヌクレオチドはセンス鎖上にあってもアンチセ
ンス鎖上にあってもよく、3'オーバーハングまたは5'オーバーハングを生じさせる。いく
つかの実施態様では、RNAiトリガー分子は、平滑末端とほどけた末端を含むか、平滑末端
と5'オーバーハング末端を含むか、平滑末端と3'オーバーハング末端を含むか、ほどけた
末端と5'オーバーハング末端を含むか、ほどけた末端と3'オーバーハング末端を含むか、
2つの5'オーバーハング末端を含むか、2つの3'オーバーハング末端を含むか、5'オーバー
ハング末端と3'オーバーハング末端を含むか、2つのほどけた末端を含むか、2つの平滑末
端を含む。
素環のピリミジン化合物またはプリン化合物であり、アデニン(A)、グアニン(G)、シ
トシン(C)、チミン(T)、ウラシル(U)を含んでいる。本明細書では、「G」、「g」
、「C」、「c」、「A」、「a」、「U」、「u」、「T」のそれぞれは、一般に、塩基とし
てグアニン、シトシン、アデニン、ウラシル、チミジンを含むヌクレオベース、ヌクレオ
シド、ヌクレオチド、ヌクレオチド模倣体を表わす。本明細書では、「ヌクレオチド」と
いう用語に、修飾されたヌクレオチド、修飾されたヌクレオチド模倣体、非塩基部位、代
理置換部分を含めることができる。
ヌクレオチド)以外のヌクレオチドである。いくつかの実施態様では、HBV RNAiトリガー
は、1つ以上の修飾されたヌクレオチドを含んでいる。いくつかの実施態様では、ヌクレ
オチドの少なくとも50%、または少なくとも60%、または少なくとも70%、または少なく
とも80%、または少なくとも90%、または少なくとも95%、または100%が修飾されてい
る。修飾されたヌクレオチドの非限定的な例には、デオキシヌクレオチド、ヌクレオチド
模倣体、非塩基ヌクレオチド(本明細書ではXまたはAbで表わす)、2'修飾ヌクレオチド
、3'→3'連結(逆転)ヌクレオチド(本明細書ではinvdN、invN、invn、invXで表わす)
、非天然の塩基を含むヌクレオチド、架橋したヌクレオチド、ペプチド核酸、2',3'-セコ
ヌクレオチド模倣体(ロックされていないヌクレオベース類似体であり、本明細書ではNU
NAまたはNUNAで表わす)、ロックされたヌクレオチド(本明細書ではNLNAまたはNLNAで表
わす)、3'-O-メトキシ(2'ヌクレオチド間連結)ヌクレオチド(本明細書では3'-OMenで
表わす)、2'-F-アラビノヌクレオチド(本明細書ではNfANAまたはNfANAで表わす)、モ
ルホリノヌクレオチド、ホスホン酸ビニルデオキシリボヌクレオチド(本明細書ではvpdN
で表わす)、ホスホン酸ビニルヌクレオチド(本明細書ではvpNで表わす)が含まれる。2
'修飾ヌクレオチド(すなわち、5員糖環の2'位にヒドロキシル基以外の基を有するヌクレ
オチド)の非限定的な例には、2'-O-メチルヌクレオチド(本明細書では、ヌクレオチド
配列の中の小文字「n」で表わす)、2'-デオキシ-2'-フルオロヌクレオチド(本明細書で
はNfで表わすが、本明細書で2'-フルオロヌクレオチドとも表記する)、2'-デオキシヌク
レオチド(本明細書ではdNで表わす)、2'-メトキシエチル(2'-O-2-メトキシエチル)ヌ
クレオチド(本明細書ではNMまたは2'-MOEで表わす)、2'-アミノヌクレオチド、2'-アル
キルヌクレオチドが含まれる。所与の化合物のあらゆる位置が一様に修飾される必要はな
い。逆に、単一のHBV RNAiトリガーに2つ以上の修飾を組み込むこと、それどころかそのH
BV RNAiトリガーの単一のヌクレオチドに2つ以上の修飾を組み込むことさえできる。HBV
RNAiトリガーのセンス鎖とアンチセンス鎖は、本分野で知られている方法で合成および/
または修飾することができる。1つのヌクレオチドの修飾は、別のヌクレオチドの修飾と
は独立である。
れる。修飾されたヌクレオベースの非限定的な例には、合成されたヌクレオベース、天然
のヌクレオベース、5置換されたピリミジン、6-アザピリミジン、N-2置換プリン、N-6置
換プリン、O-6置換プリンが含まれ、その中には2-アミノプロピルアデニン、5-プロピニ
ルウラシル、5-プロピニルシトシン、5-メチルシトシン(5-me-C)、5-ヒドロキシメチル
シトシン、キサンチン、ヒポキサンチン、2-アミノアデニン、アデニンとグアニンの6-メ
チルとそれ以外のアルキルの誘導体、アデニンとグアニンの2-プロピルとそれ以外のアル
キルの誘導体、2-チオウラシル、2-チオチミン、2-チオシトシン、5-ハロウラシル、5-ハ
ロシトシン、5-プロピニルウラシル、5-プロピニルシトシン、6-アゾウラシル、6-アゾシ
トシン、6-アゾチミン、5-ウラシル(シュードウラシル)、4-チオウラシル、8-ハロアデ
ニン、8-ハログアニン、8-アミノアデニン、8-アミノグアニン、8-チオールアデニン、8-
チオールグアニン、8-チオアルキルアデニン、8-チオアルキルグアニン、8-ヒドロキシル
アデニン、8-ヒドロキシルグアニン、他の8置換されたアデニンとグアニン、5-ハロウラ
シルと5-ハロシトシン(特に、5-ブロモウラシルと5-ブロモシトシン、5-トリフルオロメ
チルウラシルと5-トリフルオロメチルシトシン、他の5置換されたウラシルとシトシン)
、7-メチルグアニンと7-メチルアデニン、8-アザグアニンと8-アザアデニン、7-デアザグ
アニンと7-デアザアデニン、3-デアザグアニンと3-デアザアデニンが含まれる。
結または骨格(すなわち修飾されたヌクレオシド間連結または修飾されたヌクレオシド間
骨格)によって連結される。いくつかの実施態様では、修飾されたヌクレオシド間連結は
、非リン酸含有共有結合性ヌクレオシド間連結である。修飾されたヌクレオシド間連結ま
たは修飾されたヌクレオシド間骨格の非限定的な例には、ホスホロチオエート、5'-ホス
ホロチオエート基(本明細書ではヌクレオチドの前に小文字「s」を付けてsN、sn、sNf、
sdNと表わす)、キラルホスホロチオエート、チオホスフェート、ホスホロジチオエート
、ホスホトリエステル、アミノアルキルホスホトリエステル、メチルホスホネートと他の
アルキルホスホネート(3'-アルキレンホスフェートとキラルホスホネートが含まれる)
、ホスフィネート、ホスホロアミデート(3'-アミノホスホロアミデート、アミノアルキ
ルホスホロアミデート、チオノホスホロアミデートが含まれる)、チオノアルキルホスホ
ネート、チオノアルキルホスホトリエステル、モルホリノ連結、通常の3'-5'連結を有す
るボラノホスフェート、これらの2'-5'連結類似体、極性が逆転していてヌクレオシド単
位の隣接したペアの連結が3'-5'→5'-3'または2'-5'→5'-2'であるものが含まれる。別の
実施態様では、修飾されたヌクレオシド間連結または修飾されたヌクレオシド間骨格は、
リン原子を欠いている。リン原子が欠けた修飾されたヌクレオシド間連結の非限定的な例
には、短鎖アルキル糖間連結または短鎖シクロアルキル糖間連結、混合ヘテロ原子糖間連
結、アルキル糖間連結またはシクロアルキル糖間連結、1つ以上の短鎖ヘテロ原子糖間連
結または短鎖複素環糖間連結が含まれる。いくつかの実施態様では、修飾されたヌクレオ
シド間骨格の非限定的な例に、シロキサン骨格、スルフィド骨格、スルホキシド骨格、ス
ルホン骨格;ホルムアセチル骨格とチオホルムアセチル骨格、メチレンホルムアセチル骨
格とメチレンチオホルムアセチル骨格、アルケン含有骨格、スルファメート骨格、メチレ
ンイミノ骨格とメチレンヒドラジノ骨格、スルホネート骨格とスルホンアミド骨格、アミ
ド骨格;N、O、S、CH2構成部分を混合して有する他のものが含まれる。
、1つ以上の修飾されたヌクレオシド間連結を含んでいる。いくつかの実施態様では、2'
が修飾されたヌクレオチドを、修飾されたヌクレオシド間連結と組み合わせる。例えばい
くつかの実施態様では、HBV RNAiトリガーのセンス鎖が、1個、または2個、または3個、
または4個のホスホロチオエート連結を含むことができる;または、HBV RNAiトリガーの
アンチセンス鎖が、1個、または2個、または3個、または4個のホスホロチオエート連結を
含むことができる;または、センス鎖とアンチセンス鎖の両方が、独立に、1個、または2
個、または3個、または4個のホスホロチオエート連結を含むことができる。
デュープレックスを含み、その鎖の一方または両方を化学的に修飾することができ、それ
ぞれの鎖は約17個〜約29個のヌクレオチドである。いくつかの実施態様では、HBV RNAiト
リガーは、1つ以上の修飾されたヌクレオチドを含みつつ、細胞または再構成されたイン
ビトロ系の内部でRNAiが機能する能力を維持している。HBV RNAiトリガーは修飾すること
ができ、その場合の化学的修飾は、1つ以上(例えば約1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、
またはそれ以上)のヌクレオチドを含んでいる。いくつかの実施態様では、HBV RNAiトリ
ガーは、修飾されたヌクレオチドを、そのHBV RNAiトリガーの中に存在するヌクレオチド
の全数のある割合で含んでいる。そのためHBV RNAiトリガーは、一般に、約5%〜100%の
ヌクレオチド位置(例えば約5%、または10%、または15%、または20%、または25%、
または30%、または35%、または40%、または45%、または50%、または55%、または60
%、または65%、または70%、または75%、または80%、または85%、または90%、また
は95%、または100%のヌクレオチド位置)に修飾されたヌクレオチドを含むことができ
る。所与のHBV RNAiトリガーに存在する修飾されたヌクレオチドの実際の割合は、そのHB
V RNAiトリガーに存在するヌクレオチドの全数に依存する。パーセント修飾は、センス鎖
、またはアンチセンス鎖、またはセンス鎖とアンチセンス鎖の両方に存在するヌクレオチ
ドの全数を基準にすることができる。それに加え、所与のHBV RNAiトリガーに存在する修
飾されたヌクレオチドの実際の割合は、そのHBV RNAiトリガーに存在するプリンヌクレオ
チドとピリミジンヌクレオチドの全数にも依存する可能性がある。例えばHBV RNAiトリガ
ーに存在する全ピリミジンヌクレオチドおよび/または全プリンヌクレオチドが修飾され
る。
。いくつかの実施態様では、HBV RNAiトリガーは、本明細書に提示した任意のデュープレ
ックスID番号からなる。いくつかの実施態様では、HBV RNAiトリガーは、本明細書に提示
した任意のデュープレックスID番号を含んでいる。いくつかの実施態様では、HBV RNAiト
リガーは、本明細書に提示した任意のデュープレックスID番号のセンス鎖とアンチセンス
鎖の配列を含んでいる。いくつかの実施態様では、HBV RNAiトリガーは、本明細書に提示
した任意のデュープレックスID番号のセンス鎖とアンチセンス鎖の配列と、そのセンス鎖
とアンチセンス鎖に共有結合した標的化基および/または連結基を含んでいる。いくつか
の実施態様では、HBV RNAiトリガーは、本明細書に提示した任意のデュープレックスID番
号のセンス鎖とアンチセンス鎖の修飾されたヌクレオチド配列を含んでいる。いくつかの
実施態様では、HBV RNAiトリガーは、本明細書に提示した任意のデュープレックスID番号
のセンス鎖とアンチセンス鎖の修飾されたヌクレオチド配列と、そのセンス鎖とアンチセ
ンス鎖に共有結合した標的化基および/または連結基を含んでいる。
よび/または送達ポリマー、および/または送達ビヒクル、および/または他の非ヌクレ
オチド基を含むか、これらに共役している。標的化基、および/または連結基、および/
または送達ポリマー、および/または送達ビヒクル、および/または他の非ヌクレオチド
基は、センス鎖および/またはアンチセンス鎖の3'末端および/または5'末端に共有結合
させることができる。いくつかの実施態様では、HBV RNAiトリガーは、センス鎖の3'末端
および/または5'末端に連結した標的化基、または連結基、または送達ポリマー、または
送達ビヒクル、または他の非ヌクレオチド基を含んでいる。いくつかの実施態様では、標
的化基、または連結基、または送達ポリマー、または送達ビヒクル、または他の非ヌクレ
オチド基は、HBV RNAiトリガーのセンス鎖の5'末端に連結している。いくつかの実施態様
では、標的化基、または連結基、または送達ポリマー、または送達ビヒクル、または他の
非ヌクレオチド基は、リンカー/連結基を介してトリガーに直接または間接に連結してい
る。いくつかの実施態様では、標的化基、および/または連結基、および/または送達ポ
リマー、および/または送達ビヒクル、および/または他の非ヌクレオチド基は、不安定
な、または開裂可能な、または可逆的な結合またはリンカーを介してHBV RNAiトリガーの
センス鎖および/またはアンチセンス鎖に連結している。
たは生体分布特性を向上させて、その共役体の細胞特異的分布または組織特異的分布と細
胞特異的取り込みを改善することができる。いくつかの場合には、細胞または細胞受容体
へに標的化基を結合させてエンドサイトーシスを開始させることができる。標的化基は、
1価、または2価、または3価、または4価であること、またはより大きな価数を持つことが
できる。代表的な標的化基の非限定的な例には、細胞表面分子への親和性を有する化合物
、細胞受容体リガンド、ハプテン、抗体、モノクローナル抗体、抗体断片、細胞表面分子
への親和性を有する抗体模倣体が含まれる。
提示されている。HBV RNAiトリガーを形成するとき、表1Aと表1Bに掲載されている修飾さ
れていない配列のそれぞれに含まれる各ヌクレオチドとして、修飾されていないヌクレオ
チドが可能である。修飾されていないヌクレオチドを含むアンチセンス鎖とセンス鎖の非
限定的な例も表1Aと表1Bに提示されている。表1Aと表1Bでは、以下の表記を用いて修飾さ
れたヌクレオチドを示す:N=2'-OH(修飾されていない)リボヌクレオチド(fまたはdの
ない大文字);n=2'-O-メチル(2'-OMe)ヌクレオチド;Nf=2'-デオキシ-2'-フルオロ
ヌクレオチド(2'-フルオロ修飾ヌクレオチドとも呼ぶ);dN=2'-デオキシヌクレオチド
(デオキシヌクレオチド);NUNA=2',3'-セコヌクレオチド模倣体(ロックされていない
ヌクレオベース類似体);NM=2'-メトキシエチルヌクレオチド(2'-MOEとしても示す)
;(invdN)=3'-3'連結(逆転)デオキシリボヌクレオチド(3'-3'連結ヌクレオチド);(
invAb)=3'-3'連結(逆転)非塩基ヌクレオチド((invX)としても示す);x=非塩基部位
;s=ホスホロチオエート連結ヌクレオチド;p=ホスフェート;vp=ホスホン酸ビニル含
有ヌクレオチド。
調製または提供される。
)、(Chol-C6)、(Chol-ALNY)、(NH2-C6)、(C6-SS-Alk-Me)、(Alk-SS-C6)、(C11-PEG3-NAG3
)、(NAG13)、(NAG25)、(Toc)、及び(TEG-ビオチン)が含まれる。いくつかの実施態様では
、表1Bに掲載されていて3'または5'の標的化基または連結基を含むHBV RNAiトリガーのセ
ンス鎖のどれも、3'または5'の標的化基または連結基を含んでいなくてもよく、異なる3'
または5'の標的化基または連結基を含んでいてもよい。
ともに、図1と図2に示す(RNAiトリガーはRNAまたはトリガーで示す)。
されている。いくつかの実施態様では、送達ビヒクルを用いることができる。送達ビヒク
ルは、細胞へのRNAi剤の送達を改善する化合物である。送達ビヒクルの非限定的な例とし
て、ポリマー(両親媒性ポリマー、膜活性化ポリマーなど)、ペプチド(メリチン、メリ
チン様ペプチドなど)、可逆的に修飾されたポリマーまたはペプチド、脂質が可能である
。いくつかの実施態様では、HBV RNAiトリガーは、ガラクトース誘導体を含む標的リガン
ドに連結される。いくつかの実施態様では、HBV RNAiトリガーは、ガラクトース三量体を
含むかガラクトース三量体からなる標的リガンドに連結される。いくつかの実施態様には
、小さな送達ペプチドと、ミツバチの毒ペプチドに由来するMLPと、1つ以上の独立な標的
化なHBV RNAiトリガーを含むHBV RNAiトリガー送達系が記載されている。
連結される。本明細書では、ガラクトース三量体という用語に、ガラクトースと、アシア
ロ糖タンパク質受容体に対する親和性がガラクトースの親和性と等しいかより大きいガラ
クトースの誘導体の両方が含まれる。ガラクトース三量体は、3つまたは4つのガラクトー
ス誘導体を含み、そのそれぞれがC-1炭素を通じて中央分岐点に連結している。いくつか
の実施態様では、ガラクトース誘導体は、リンカーまたはスペーサを介して中央分岐点に
連結している。いくつかの実施態様では、リンカーまたはスペーサは、可撓性のある親水
性スペーサであり(アメリカ合衆国特許第5,885,968号;Biessen他、J. Med. Chem. 1995
年、第39巻、1538〜1546ページ)、非限定的な例としてPEGスペーサがある。いくつかの
実施態様では、PEGスペーサはPEG3スペーサである。分岐点として、3〜4個のガラクトー
ス誘導体が付着できて、さらにその分岐点がRNAi剤に付着できる任意の小分子が可能であ
る。RNAi剤への分岐点の付着は、リンカーまたはスペーサを通じて起こることができる。
いくつかの実施態様では、リンカーまたはスペーサは、可撓性のある親水性スペーサを含
んでいる(PEGスペーサがその非限定的な例)。いくつかの実施態様では、PEGスペーサは
PEG3スペーサである(3エチレン単位)。別の実施態様では、PEGスペーサは1〜20個のエ
チレン単位を有する(PEG1〜PEG20)。いくつかの実施態様では、ガラクトース誘導体は
、N-アセチルガラクトサミン(GalNAcまたはNAG)を含んでいる。アシアロ糖タンパク質
受容体に対する親和性を有する他の糖類誘導体の選択は、ガラクトース、ガラクトサミン
、N-ホルミル-ガラクトサミン、N-アセチル-ガラクトサミン、N-プロピオニル-ガラクト
サミン、N-n-ブタノイルガラクトサミン、N-イソ-ブタノイルガラクトサミンを含むリス
トからなすことができる。アシアロ糖タンパク質受容体に対する多数のガラクトース誘導
体の親和性が研究されてきており(例えばIobst, S.T.とDrickamer, K. J.B.C. 1996年、
第271巻、6686ページを参照のこと)、その親和性は本分野で周知かつ一般に使用されて
いる方法を利用して容易に決定される。3つの末端ガラクトース誘導体を有するガラクト
ース三量体に関する本分野で一般的な他の用語には、3分枝型ガラクトース、3価ガラクト
ースが含まれる。ガラクトース三量体に関する本分野で一般的な他の用語には、ガラクト
ースクラスターが含まれる。3分枝型ガラクトース誘導体クラスターは、2分枝型ガラクト
ース誘導体構造または単分枝型ガラクトース誘導体構造よりも大きな親和性でASGPrに結
合する(BaenzigerとFiete、1980年、Cell、第22巻、611〜620ページ;Connolly他、1982
年、J. Biol. Chem.、第257巻、939〜945ページ)。
MLP-(L-M)x+N-T
を含む組成物が記載されている。ただし、NはHBV RNAiトリガーであり、Tは標的化基(コ
レステロールなど、20個以上の炭素原子を有する疎水性基が含まれる)であり、MLPは本
明細書に記載したメリチン様ペプチドであり、マスキング剤Mは、生理学的に不安定な可
逆的連結Lを通じてMLPに共有結合した本明細書に記載のASGPrリガンドを含んでいる。本
明細書では、MLP-(L-M)xは、MLP送達ペプチドまたは送達ペプチドである。Lの開裂によっ
てMLP上の修飾されていないアミンが復元される。いくつかの実施態様では、オプション
の基Yが、MLPのアミノ末端、またはカルボキシル末端、またはシステインに連結される。
Yは、存在する場合には、ASGPrリガンド、ポリエチレングリコール(PEG)、ASGPrリガン
ド-PEGのいずれかを含むことができる。xは1よりも大きい整数である。MLPは、修飾され
ていない状態では膜活性である。しかし送達ペプチドMLP-(L-M)xは膜活性ではない。Mを
付着させることによるMLP第一級アミンの可逆的修飾により、MLPの膜活性が可逆的に抑制
または不活性化される。十分な割合のMLP第一級アミンを修飾してこのポリマーの膜活性
を抑制し、肝細胞を標的とする。いくつかの実施態様では、xを、あらゆるマスキング剤
の不在下でのMLP上の第一級アミンの量によって求めると、MLP上の第一級アミンの数の80
%超、または90%超、または95%超の値を持つ。より具体的には、xは、MLP上の第一級ア
ミンの80%超かつ100%までの値を持つ。MLPは、典型的には3〜5個の第一級アミンを含む
ことに注意されたい(アミノ末端(修飾されていない場合)と、典型的には2〜4個のリシ
ン残基を含む)。したがってアミンの割合の変更には、MLP集団の中のMLPアミンの割合の
変更が反映されることを意味する。MLP集団は、当業者にとって重要であると考えられる
所定のサンプルサイズの中のMLP集団(例えば容器、用量、製造されたバッチの中の集団
)を意味する。いくつかの実施態様では、MLP集団は、製造されたバッチの中のMLPプール
である。可逆的連結Lが開裂すると、修飾されていないアミンが復元され、そのことによ
ってMLPが修飾されていない膜活性状態に戻る。いくつかの実施態様では、可逆的連結は
、pH不安定性連結、例えば二置換されたマレアメート連結である。MLP-(L-M)x、すなわち
ASGPrを標的とする可逆的にマスクされた膜活性ポリマー(送達ペプチド)と、T-N、すな
わちポリヌクレオチド-共役体は、別々に合成または製造される。TもNも、MLP、L、Mに直
接または間接に共有結合していない。マスクされたポリマーまたはマスクされていないポ
リマーとのポリヌクレオチドまたはポリヌクレオチド-共役体の静電的会合または疎水性
会合は、生体内でポリヌクレオチドを肝臓に送達するのに必要とされない。マスクされた
ポリマーとポリヌクレオチド-共役体は、同じ容器で、または別々の容器で供給すること
ができる。これらは、組み合わせた後に投与すること、または同時に投与すること、また
は順番に投与することができる。
ンとASGPrリガンド含有マスキング剤の反応によって可逆的に修飾されたMLPを含んでいる
。アミンは、修飾基の開裂によってアミンが復元される場合に可逆的に修飾される。本明
細書に開示したマスキング剤を用いたMLPの可逆的修飾により、MLPの膜活性が抑制される
。可逆的にマスクされたMLPは、マスクされた状態では、膜破壊活性を示さない。いくつ
かの実施態様では、MLP上のアミンの80%超、または90%超が可逆的に修飾されている。
由来する、約23〜約32個のアミノ酸を含む小さな両親媒性膜活性ペプチドである。自然に
発生するメリチンは26個のアミノ酸を含み、アミノ末端では疎水性が優勢であり、カルボ
キシ末端では親水性(カチオン性)が優勢である。いくつかの実施態様では、MLPは生物
源または合成物から単離される。合成ポリマーは、「人手による」化学的プロセスによっ
て調製または製造され、自然に生じる生物プロセスによっては生まれない。本明細書では
、MLPに、MLPファミリーの自然に発生するミツバチ毒ペプチドが包含される。その毒ペプ
チドを見いだせるのは、例えばApis florea、Apis mellifera、Apis cerana、Apis dorsa
ta、Vespula maculifrons、Vespa magnified、Vespa velutina、Polistes属のHQL-2001種
、Polistes hebraeusという種の毒の中である。本明細書では、MLPに、自然に発生するML
Pとアミノ酸配列が同じか似た合成ペプチドも包含される。具体的には、MLPのアミノ酸配
列に、表3に示した配列が包含される。メリチンに固有の大きな膜活性を保持しているア
ミノ酸に加え、1〜8個のアミノ酸をこのペプチドのアミノ末端またはカルボキシ末端に付
加することができる。具体的には、システイン残基をアミノ末端またはカルボキシ末端に
付加することができる。表3のリストはすべてを網羅したものではなく、他の保存された
アミノ酸置換を容易に思いつく。合成MLPは、自然に発生するL-アミノ酸または鏡像異性
体D-アミノ酸(インベルソ)を含むことができる。MLPのアミノ酸配列は、逆転させるこ
ともできる(レトロ)。レトロMLPは、L-アミノ酸またはD-アミノ酸を持つことができる
(レトロインベルソ)。2つのMLPを共有結合させてMLP二量体を形成することもできる。M
LPは、マスキング剤以外に、ペプチドのアミノ末端またはカルボキシ末端に付着して組織
標的化を増進したり生体内循環を容易にしたりする修飾基を持つことができる。しかし本
明細書では、MLPに、互いに共有結合したり、別の1つのポリマーまたは足場と共有結合し
たりしている2つ以上のMLPを含む鎖またはポリマーは含まれない。
たはヒメミツバチ)のメリチン、Apis mellifera(セイヨウミツバチまたは大きいミツバ
チ)のメリチン、Apis dorsata(オオミツバチ)のメリチン、Apis cerana(トウヨウミ
ツバチ)のメリチン、またはこれらの誘導体(アミノ酸置換を含む)を含んでいる。いく
つかの実施態様では、MLPは、Xaa1-Xaa2-Xaa3-Ala-Xaa5-Leu-Xaa7-Val-Leu-Xaa10-Xaa11-
Xaa12-Leu-Pro-
Xaa15-Leu-Xaa17-Xaa18-Trp-Xaa20-Xaa21-Xaa22-Xaa23-Xaa24-Xaa25-Xaa26という配列を
含んでいる。式中、
Xaa1は、ロイシン、D-ロイシン、イソロイシン、ノルロイシン、チロシン、トリプトフ
ァン、バリン、アラニン、ジメチルグリシン、グリシン、ヒスチジン、フェニルアラニン
又はシステインであり、
Xaa2は、イソロイシン、ロイシン、ノルロイシン又はバリンであり、
Xaa3は、グリシン、ロイシン又はバリンであり、
Xaa5は、イソロイシン、ロイシン、ノルロイシン又はバリンであり、
Xaa7は、リシン、セリン、アスパラギン、アラニン、アルギニン又はヒスチジンであり
、
Xaa10は、アラニン、トレオニン又はロイシンであり、
Xaa11は、トレオニン又はシステインであり、
Xaa12は、グリシン、ロイシン又はトリプトファン、
Xaa15は、トレオニン又はアラニンであり、
Xaa17は、イソロイシン、ロイシン、ノルロイシン又はバリンであり、
Xaa18は、セリン又はシステインであり、
Xaa20は、イソロイシン、ロイシン、ノルロイシン又はバリン、
Xaa21は、リシン又はアラニンであり、
Xaa22は、アスパラギン又はアルギニンであり、
Xaa23は、リシン又はアラニンであり、
Xaa24は、アルギニン又はリシンであり、
Xaa25は、リシン、アラニン又はグルタミンであり、
Xaa26は任意であり、存在する場合には、グルタミン、システイン、グルタミン-NH2又
はシステイン-NH2であり、
Xaa21、Xaa23、Xaa25のうちの少なくとも2つはリシンである。
Xaa11-Xaa12-Leu-Pro-Xaa15-Leu-Xaa17-Ser-Trp-Xaa20-Lys-Xaa22-Lys-Arg-Lys-Xaa26と
いう配列を含んでいる。ただし
Xaa1は、ロイシン、D-ロイシン、イソロイシン、ノルロイシン、チロシンのいずれかで
あり、
Xaa2は、イソロイシン、ロイシン、ノルロイシン、バリンのいずれかであり、
Xaa3は、グリシン、ロイシン、バリンのいずれかであり、
Xaa5は、イソロイシン、バリン、ロイシン、ノルロイシンのいずれかであり、
Xaa7は、リシン、セリン、アスパラギン、アラニン、アルギニン、ヒスチジンのいずれ
かであり、
Xaa10は、アラニン、トレオニン、ロイシンのいずれかであり、
Xaa11は、トレオンまたはシステインであり、
Xaa12は、グリシン、ロイシン、又はトリプトファンのであり、
Xaa15は、トレオニンまたはアラニンであり、
Xaa17は、イソロイシン、ロイシン、又はノルロイシンであり、
Xaa20は、イソロイシン、ロイシン、又はノルロイシンであり、
Xaa22は、アスパラギンまたはアルギニンであり、
Xaa26は、グルタミンまたはシステインである。
1-
Gly-Leu-Pro-Thr-Leu-Xaa17-Ser-Trp-Xaa20-Lys-Xaa22-Lys-Arg-Lys-Xaa26という配列を
含んでいる。ただし、
Xaa1、Xaa2、Xaa5、Xaa17、Xaa20は、独立に、イソロイシン、ロイシン、ノルロイシン
のいずれかであり、
Xaa11は、トレオンまたはシステインであり、
Xaa22は、アスパラギンまたはアルギニンであり、
Xaa26は、グルタミンまたはシステインである。
置換された無水マレイン酸アミン反応基に連結されたASGPrリガンドを含んでいる。いく
つかの実施態様では、ASGPrリガンドは、ASGPrに対し、ガラクトース(ガラクトース誘導
体)に対するのと同じかそれよりも大きな親和性を有する。ガラクトース誘導体の非限定
的な例には、ガラクトサミン、N-アセチルガラクトサミン、ラクトース、N-ホルミルガラ
クトサミン、N-アセチルガラクトサミン、N-プロピオニルガラクトサミン、N-n-ブタノイ
ルガラクトサミン、N-イソ-ブタノイル-ガラクトサミンが含まれる。
(式中、R1は、アシアロ糖タンパク質受容体(ASGPr)リガンドを含み、アルキルの非限
定的な例として、メチル(-CH3)、エチル(-CH2CH3)、プロピル(-CH2CH2CH3)であっ
てもよい)。置換されたアルキルマレイン酸無水物の一例は、2-プロピオン性-3-アルキ
ルマレイン酸無水物誘導体からなる。中性の親水性2-プロピオン性-3-アルキルマレイン
酸無水物誘導体は、中性の親水性基を、2-プロピオン性-3-アルキルマレイン酸無水物γ-
カルボキシル基:
れる。式中、R1は中性ASGPrリガンドを含み、n=0または1である。いくつかの実施態様で
は、ASGPrリガンドは、短いPEGリンカーを介して無水物に連結される。
れる。
できる。過剰なマスキング剤を共役した送達ペプチドから除去した後にその送達ペプチド
を投与することができる。
動態特性または生体分布特性を向上させ、その共役体の細胞特異的分布と細胞特異的取り
込みを改善する。生体内で分子を肝細胞の表面に発現したアシアロ糖タンパク質受容体(
ASGPr)に結合させることを通じて肝細胞に向かわせるのにガラクトース誘導体が用いら
れてきた。本明細書では、ASGPrリガンドは、ASGPrに対してガラクトース(ガラクトース
誘導体)に対するのと同じかそれよりも大きな親和性を有するガラクトース誘導体を含ん
でいる。ASGPrは、ASGPrリガンドが結合することで、肝細胞へと細胞特異的に向かうこと
と肝細胞へのエンドサイトーシスが容易になる。ASGPrリガンドの選択は、ラクトース、
ガラクトース、N-アセチルガラクトサミン(GalNAc)、ガラクトサミン、N-ホルミルガラ
クトサミン、N-アセチル-ガラクトサミン、N-プロピオニルガラクトサミン、N-n-ブタノ
イルガラクトサミン、N-イソ-ブタノイルガラクトサミンを含むグループからなすことが
できる(Iobst, S.T.とDrickamer, K.、J. B.C. 1996年、第271巻、6686ページ)。ASGPr
リガンドは、単量体(例えば単一のガラクトサミンを有する)または多量体(例えば多数
のガラクトサミンを有する)が可能である。いくつかの実施態様では、MLPはASGPrリガン
ドマスキング剤をペプチド上の80%以上または90%以上の第一級アミンに付着させること
によって可逆的にマスクされる。
RNAiトリガー共役体とMLP送達ペプチドの同時投与により、HBV RNAiトリガーが生体内で
肝臓細胞、特に肝細胞に効率的、機能的に送達されることを見いだした。いくつかの実施
態様では、HBV RNAiトリガーは疎水性基に共有結合で共役している。トリガーは、反応基
Aを含むように合成または修飾することができる。標的化基も反応基Bを含むように合成ま
たは修飾することができる。反応基AとBは、本分野で知られている方法を利用して共有結
合を通じて連結させることができるように選択される。疎水性基は、HBV RNAiトリガーの
3'末端または5'末端に連結させることができる。いくつかの実施態様では、疎水性基は、
RNAiトリガーのセンス鎖またはアンチセンス鎖に連結される。いくつかの実施態様では、
疎水性基は、RNAiトリガーのセンス鎖に連結される。
、アルキル基、アルケニル基、アルキニル基、アリール基、アラルキル基、アラルケニル
基、アラルキニル基(そのそれぞれは、直線状、分岐式、環式のいずれでもよい)、コレ
ステロール、コレステロール誘導体、ステロール、ステロイド、ステロイド誘導体からな
るグループからなすことができる。疎水性標的化部分は、典型的には、炭素原子と水素原
子だけを含む炭化水素である。いくつかの実施態様では、疎水性基の非限定的な例として
、コレステロール、ジコレステロール、トコフェロール、ジトコフェロール、ジデシル、
ジドデシル、ジオクタデシル、イソプレノイド、コレアミドが可能である。送達ペプチド
を同時に投与しないと、HBV RNAiトリガーに疎水性標的化基を付着させてもそのHBV RNAi
トリガーが生体内で効率的、機能的に送達されることはない。siRNA-コレステロール共役
体がsiRNA(siRNA-コレステロール)を追加の送達ビヒクルなしに生体内で肝臓細胞に送
達することが別の研究者によって報告されているが、高濃度のsiRNAが必要とされるため
、送達効率は低い。本明細書に記載した送達ペプチドと組み合わせると、RNAiトリガーの
送達が大きく改善される。HBV RNAiトリガー-コレステロールと送達ペプチドを用意する
ことにより、HBV RNAiトリガーの効率が約100倍大きくなる。いくつかの実施態様では、
標的化基をRNAiトリガーのセンス鎖またはアンチセンス鎖に連結させる。疎水性を維持す
る置換またはヘテロ原子(例えばフッ素)が許される。疎水性標的化基は、本分野で知ら
れている方法を利用してHBV RNAiトリガーの3'末端または5'末端に付着させることができ
る。2つの鎖を有するHBV RNAiトリガーに関しては、疎水性基をいずれかの鎖に付着させ
ることができる。
のような化学基は水溶性ではなく、水素結合を形成しない傾向がある。疎水性基は、脂肪
、油、脂質、非極性溶媒に溶解し、水素結合を形成する能力をほとんど持たないか、まっ
たく持たない。二(2)個以上の炭素原子を含む炭化水素、いくつかの置換された炭化水
素、コレステロール、コレステロール誘導体が、疎水性基と疎水性化合物の例である。疎
水性基は、典型的には、炭素原子と水素原子だけを含む炭化水素である。いくつかの実施
態様では、疎水性を維持していて例えばフッ素を含む非極性置換または非極性へテロ原子
が許容される。この用語には、脂肪族基、芳香族基、アシル基、アルキル基、アルケニル
基、アルキニル基、アリール基、アラルキル基、アラルケニル基、アラルキニル基(その
それぞれは、直線状、分岐式、環式が可能である)が含まれる。疎水性基という用語には
、ステロール、ステロイド、コレステロール、ステロイド誘導体、コレステロール誘導体
も含まれる。本明細書では、コレステリル基は、コレステロールまたはコレステロール誘
導体を含む化合物を意味する。
できる、表面活性のある両親媒性ペプチドである。その効果とは、非膜透過性分子が細胞
の中に入ったり膜を横断したりできるようにする膜の変化または破壊、膜への孔形成、膜
の分裂、膜の破壊または溶解である。本明細書では、膜または細胞膜は、脂質二重層を含
んでいる。膜の変化または破壊は、赤血球細胞溶解(溶血)アッセイ、リポソーム漏出ア
ッセイ、リポソーム融合アッセイ、細胞融合アッセイ、細胞溶解アッセイ、エンドソーム
放出アッセイのうちの少なくとも1つのアッセイにおけるペプチドの活性によって機能的
に定義することができる。細胞膜の溶解を引き起こすことのできる膜活性ペプチドは、膜
溶解性ペプチドとも呼ばれる。形質膜上でエンドソームまたはリソソームの破壊を優先的
に引き起こすペプチドは、エンドソーム溶解性であると見なされる。細胞膜に対する膜活
性ペプチドの効果は一過性である可能性がある。膜活性ペプチドは膜に対する親和性を持
っていて、二層構造の変性または変形を引き起こす。
チドを含むポリマーを意味する専門用語である。ヌクレオチドは、ポリヌクレオチドポリ
マーのモノマー単位である。モノマー単位が120個未満のポリヌクレオチドはオリゴヌク
レオチドと呼ばれることがしばしばある。天然の核酸はデオキシリボース骨格またはリボ
ース-リン酸骨格を有する。非天然または合成のポリヌクレオチドは、インビトロまたは
無細胞系で重合されたポリヌクレオチドであり、同じか似た塩基を含んでいるが、天然の
リボース骨格またはデオキシリボース-リン酸骨格とは異なるタイプの骨格を含んでいて
もよい。ポリヌクレオチドは、本分野で知られている任意の技術を利用して合成すること
ができる。本分野で知られているポリヌクレオチド骨格には、PNA(ペプチド核酸)、ホ
スホロチオエート、ホスホロジアミデート、モルホリノや、天然の核酸のリン酸骨格の他
のバリアントが含まれる。塩基にはプリンとピリミジンが含まれ、そこにはさらに、天然
の化合物であるアデニン、チミン、グアニン、シトシン、ウラシル、イノシンと、天然の
類似体が含まれる。プリンとピリミジンの合成誘導体の非限定的な例には、ヌクレオチド
に新たな反応基(アミン、アルコール、チオール、カルボキシレート、アルキルハロゲン
化物などだが、これらに限定されない)を配置する修飾が含まれる。塩基という用語には
、DNAとRNAの既知の任意の塩基類似体が包含される。ポリヌクレオチドは、リボヌクレオ
チド、デオキシリボヌクレオチド、合成ヌクレオチドや、これらの適切な任意の組み合わ
せを含むことができる。ポリヌクレオチドはインビトロで重合させることができ、組み換
えであってもよく、キメラ配列やこれらの基の誘導体を含むことができる。ポリヌクレオ
チドは、5'末端に、または3'末端に、または5'末端と3'末端の両方に末端キャップ基を含
むことができる。キャップ基の非限定的な例として、逆転したデオキシ非塩基基、逆転し
たデオキシチミジン、チミジン、3'グリセリル修飾が可能である。
A干渉を誘導して配列特異的なやり方で導入遺伝子のメッセンジャーRNA(mRNA)転写産物
の翻訳を低下させる、または抑制することのできる分子である。2つの主要なHBV RNAiト
リガーは、小さい(または短い)干渉RNA(siRNA)とマイクロRNA(miRNA)である。HBV
RNAiトリガーの選択は、siRNA、マイクロRNA(miRNA)、二本鎖RNA(dsRNA)、短いヘア
ピンRNA(shRNA)、RNA干渉を誘導できるRNAをコードしている発現カセットを含むグルー
プからなすことができる。RNAiトリガーは、典型的には15〜50個の塩基対を含む二本鎖構
造を含んでいる。いくつかの実施態様では、RNAiトリガーは、17〜26個の塩基対を含み細
胞内で発現した標的遺伝子またはRNAのコード配列と同じかほぼ同じ(部分的に相補的)
ヌクレオチド配列を有する二本鎖構造を含んでいる。RNAiトリガーは、ジヌクレオチド3'
オーバーハングを持つことができる。RNAiトリガーは、2つのアニールされたポリヌクレ
オチドで構成すること、またはヘアピン構造を形成する単一のポリヌクレオチドで構成す
ることができる。RNAiトリガーは、センス領域とアンチセンス領域を含んでいる。いくつ
かの実施態様では、RNAiトリガーは、2つのオリゴヌクレオチド断片から組み立てられる
。そのとき一方の断片はそのRNAiトリガーのアンチセンス領域のヌクレオチド配列を含み
、第2の断片はそのRNAiトリガーのセンス領域のヌクレオチド配列を含んでいる。いくつ
かの実施態様では、センス鎖はリンカー分子(ポリヌクレオチドリンカーや非ヌクレオチ
ドリンカーなど)を介してアンチセンス鎖に接続される。マイクロRNA(miRNA)は、長さ
が約22個のヌクレオチドからなる小さい非コードRNA遺伝子産物であり、そのmRNA標的の
破壊または転写抑制を指揮する。miRNAと標的mRNAの間の相補性が部分的である場合、標
的mRNAの翻訳が抑制される。相補性が広範囲にわたる場合、標的mRNAが開裂する。miRNA
の場合、複合体は、一般にmiRNAとほんの一部しか相同性を共有していないmRNAの3'UTRに
通常位置する標的部位に結合する。「種領域」(miRNAの5'末端における約七(7)個の連
続したヌクレオチドからなり、対応する標的と完全な塩基対を形成する伸長部)が、miRN
Aの特異性において鍵となる役割を果たす。mRNAにRISC/miRNA複合体が結合することで、
タンパク質翻訳、またはmRNAの開裂と分解を抑制することができる。最近のデータは、mR
NAの開裂が優先的に起こるのは、miRNAとその標的の全長にわたって完全な相同性が存在
している場合であり、種領域でだけ完全な塩基対形成を示す場合ではないことを示してい
る(Pillai他、2007年)。
的な例に含まれるのは、ホスホロチオエートヌクレオチド間連結、2'-O-メチルリボヌク
レオチド、2'-デオキシ-2'-フルオロリボヌクレオチド、2'-デオキシリボヌクレオチド、
「普遍的塩基」ヌクレオチド、5-C-メチルヌクレオチド、逆転したデオキシ非塩基残基組
み込みである。これらの化学的修飾は、さまざまなポリヌクレオチドコンストラクトで用
いるとき、細胞内でポリヌクレオチド活性を維持すると同時に、これら化合物の血清安定
性を増大させることが示されている。化学的に修飾されたRNAiトリガーは、ヒトでインタ
ーフェロン活性を増大させる可能性を最小にすることもできる。
ン-クリック方式によって、または他の非伝統的な方式によって水素結合を形成する能力
を意味する。ポリヌクレオチド分子に関し、あるポリヌクレオチド分子が対応する標的(
エフェクタ結合部位)または相補的配列と結合する自由エネルギーは、そのポリヌクレオ
チドの重要な機能(例えば酵素によるmRNAの開裂または翻訳の抑制)が進行することを可
能にするのに十分である。核酸分子が結合する自由エネルギーを求める方法は本分野で周
知である(Frier他 1986年、Turner他 1987年)。パーセント相補性は、第1のポリヌクレ
オチド分子の連続した鎖のうちで第2のポリヌクレオチド配列と水素結合を形成すること
(例えばワトソン-クリック型塩基対形成)が可能な塩基の割合を示す(例えば10個のう
ちの5個、6個、7個、8個、9個、10個、すなわち50%、60%、70%、80%、90%、100%の
相補性)。完全な相補性は、ポリヌクレオチド配列の連続した鎖の中のすべての塩基が第
2のポリヌクレオチド配列の中の同数の連続した塩基と水素結合することを意味する。
れたRNAのレベル、またはそのRNAから翻訳されたポリペプチド、タンパク質、タンパク質
サブユニットのレベルを測定したとき、その遺伝子の発現が、阻止機能のあるポリヌクレ
オチド-共役体の不在下で観察されたよりも低下していることを意味する。いくつかの実
施態様では、記載した組成物によって送達されたポリヌクレオチドを用いた遺伝子発現の
抑制、下方調節、ノックダウンにより、対照である不活性な核酸、またはスクランブル配
列を有する核酸、または不活性にするミスマッチの存在下で観察されるレベル、またはマ
スクされたポリマーへのポリヌクレオチドの共役の不在下で観察されるレベルよりも低く
なる。
る経路である。一般に、哺乳動物を治療するための薬や核酸を投与する方法は本分野で周
知であり、記載した組成物の投与に適用できる。いくつかの実施態様では、記載した組成
物は、適切な任意の経路(非限定的な例として非経口経路がある)を通じ、その経路に適
するようにした調製物として投与することができる。したがっていくつかの実施態様では
、記載した組成物は、注射によって、例えば静脈内注射、筋肉内注射、皮内注射、皮下注
射、腹腔内注射によって投与することができる。いくつかの実施態様では、医薬として許
容可能な基剤または賦形剤を含む医薬組成物を記載する。
脈内、動脈内)注射、筋肉内注射、柔組織内注射、皮内注射、皮下注射、腫瘍内注射、腹
腔内注射、硬膜下腔内注射、硬膜下注射、硬膜外注射、リンパ管内注射である。本明細書
では、血管内は、体内の組織または臓器につながっていて血管と呼ばれる管構造の中を意
味する。管構造の空洞の中を体液が身体の部分へと流れていったり、身体の部分から流れ
てきたりする。体液の例には、血液、脳脊髄液(CSF)、リンパ液、胆汁が含まれる。血
管の例には、動脈、小動脈、毛細血管、小静脈、洞様毛細血管、静脈、リンパ管、胆管、
唾液腺またはそれ以外の外分泌腺の管が含まれる。血管内経路には、血管(動脈や静脈な
ど)を通じた送達が含まれる。血液循環系は、医薬を全身に広げる。
に投与される。同時に投与するとは、HBV RNAiトリガーと送達ペプチドを、その両方が同
時に哺乳動物の中に存在するようにその哺乳動物に投与することを意味する。HBV RNAiト
リガー-標的化基共役体と送達ペプチドは、同時に投与すること、または逐次的に送達す
ることができる。同時投与のためには、その両者を混合した後に投与することができる。
逐次投与のためには、HBV RNAiトリガー-標的化基共役体または送達ペプチドを最初に投
与することができる。
下または抑制からの恩恵があると考えられる対象を治療するための医薬組成物の調製に用
いる。その医薬組成物は、細胞、組織、臓器のいずれかにおけるHBVの発現抑制に有用で
ある。いくつかの実施態様では、記載した医薬組成物は、HBV発現の低下または抑制から
の恩恵があると考えられる疾患または異常を持つ対象を治療するのに用いられる。
を薬学的に有効な量含むとともに、1つ以上の医薬として許容可能な賦形剤を含んでいる
。医薬として許容可能な賦形剤(賦形剤)は、安全性の評価が適切になされていて薬送達
系に意図的に含まれるようにした活性医薬成分(API、治療用製品、例えばRNAiトリガー
)以外の物質である。賦形剤は、想定する用量では、治療効果を及ぼさないか、及ぼすと
は想定されていない。賦形剤は、a)製造中に薬送達系の処理を助ける、および/またはb
)APIの安定性、生体利用性、患者の受容性を保護、サポート、増進する、および/また
はc)製品の同定を助ける、および/またはd)保管中または使用中にAPIの全体的な安全
性、有効性、送達の他のあらゆる属性を増進するという作用を持つことができる。医薬と
して許容可能な賦形剤は、不活性な物質であってもなくてもよい。
衝剤、基剤、被覆剤、着色剤、送達増進剤、デキストラン、デキストロース、希釈剤、崩
壊剤、乳化剤、増量剤、充填剤、香料、流動促進剤、湿潤剤、潤滑剤、油、ポリマー、保
存剤、生理食塩水、塩類、溶媒、糖類、懸濁剤、持続放出マトリックス、甘味剤、増粘剤
、等張剤、ビヒクル、撥水剤、湿潤剤が含まれる。
のような追加成分の非限定的な例には、かゆみ止め、収斂剤、局所麻酔剤、抗炎症剤(例
えば抗ヒスタミン、ジフェンヒドラミンなど)が含まれる。本明細書に規定したRNAiトリ
ガーを発現する、または含む細胞、組織、単離された臓器を「医薬組成物」として用いる
ことも考えられる。
は、想定する薬学的結果、治療結果、予防効果を生み出すRNAiトリガーの量を意味する。
は治療剤と組み合わされる。治療薬または治療剤の非限定的な例には、第2のHBV RNAiト
リガーかそれ以外のRNAi剤、小分子薬、抗体、抗体断片、ワクチンが含まれる。
は、キット、容器、パック、ディスペンサーいずれかの中に収容すること、または含める
ことができる。HBV RNAiトリガーと、そのHBV RNAiトリガーを含む医薬組成物は、あらか
じめ充填した注射器またはバイアルの中に収容することができる。
象を治療するのに用いられる。いくつかの実施態様では、記載したHBV RNAiトリガーは、
HBVに感染した対象の少なくとも1つの症状を治療するのに用いられる。その対象は、記載
したRNAiトリガーのうちのどれか1つ以上を、治療に有効な量投与される。
または管理するのに用いられる。その対象には、1つ以上のHBV RNAiトリガー、または本
明細書に記載したHBV RNAiトリガーを含む組成物が、治療に有効な量で投与される。いく
つかの実施態様では、治療法は、本明細書に記載したHBV RNAiトリガー分子を含む組成物
を治療すべき対象に投与することを含んでいる。
調節する」、「ノックダウンする」という用語は、HBV遺伝子に関して用いる場合、そのH
BV遺伝子の転写がなされる細胞、細胞群、組織の中でその遺伝子から転写されたRNAのレ
ベル、またはmRNAから翻訳されたポリペプチド、タンパク質、タンパク質サブユニットの
レベルによって測定されるその遺伝子の発現が、記載したHBV RNAiトリガーを用いて細胞
、細胞群、組織を治療するときには、そのような治療がなされていない第2の細胞、細胞
群、組織と比べて、またはHBV RNAiトリガーを投与する前の同じ細胞、細胞群、組織と比
べて低下することを意味する。
伝子の遺伝子発現レベルおよび/またはmRNAのレベルは、そのHBV RNAiトリガーを投与さ
れる前の対象、またはHBV RNAiトリガーを投与されていない対象と比べて少なくとも約5
%、または約10%、または約15%、または約20%、または約25%、または約30%、または
約35%、または約40%、または約45%、または約50%、または約55%、または約60%、ま
たは約65%、または約70%、または約75%、または約80%、または約85%、または約90%
、または約95%、または約98%低下する。対象における遺伝子発現レベルおよび/または
mRNAのレベルは、その対象の細胞、および/または細胞群、および/または組織において
低下する可能性がある。いくつかの実施態様では、記載したHBV RNAiトリガーを投与され
た対象におけるHBVのタンパク質レベルは、そのHBV RNAiトリガーを投与される前の対象
、またはHBV RNAiトリガーを投与されていない対象と比べて少なくとも約5%、または約1
0%、または約15%、または約20%、または約25%、または約30%、または約35%、また
は約40%、または約45%、または約50%、または約55%、または約60%、または約65%、
または約70%、または約75%、または約80%、または約85%、または約90%、または約95
%、または約98%低下する。対象におけるタンパク質レベルは、その対象の細胞、および
/または細胞群、および/または組織、および/または血液、および/またはそれ以外の
体液で低下する可能性がある。遺伝子発現、またはmRNA、またはタンパク質のレベルの低
下は、本分野で知られている任意の方法で評価することができる。HBV mRNAのレベルおよ
び/またはタンパク質のレベルの低下または減少は、本明細書ではまとめてHBVの低下ま
たは減少、またはHBVの発現の抑制または減少と呼ぶ。
内に機能可能に送達することを意味する。機能可能な送達とは、RNAiトリガーが細胞に送
達されて予想される生物活性(例えば遺伝子発現の配列特異的抑制)を持つことを意味す
る。
めに薬と核酸を投与する方法は本分野において周知であり、本明細書に記載した組成物の
投与に適用することができる。本明細書に記載した化合物は、適切な任意の経路を通じ、
その特定の経路に適するようにした調製物の中に入れて投与することができる。したがっ
て本明細書に記載した化合物は、例えば静脈内注射、筋肉内注射、皮内注射、皮下注射、
腹腔内注射によって投与することができる。
すべてのMLPを、本分野で標準的なペプチド合成技術を利用して作製した。適切なMLPとし
て、あらゆるL-アミノ酸、あらゆるD-アミノ酸(インベルソ)が可能である。L系である
かD系であるかに関係なく、MLP配列は逆転させることができる(レトロ)。
CKLK-MLP(20 mg/ml)とTCEP-HCl(28.7 mg/ml、100 mM)とMES-Na(21.7 mg/ml、100 mM
)の溶液をdH2Oの中に調製した。20 mlのシンチレーションバイアルの中で、CKLK-MLP(0
.030ミリモル、5 ml)を1.7モル当量のTCEP-HCl(0.051ミリモル、0.51 ml)と反応させ
、室温で30分間撹拌し続けた。次に、最終濃度が10 mg/ml MLPかつ20 mM MES-Naとなる量
のMES-Na(2 ml)と水(1.88 ml)を添加した。pHを調べ、pH 6.5〜7に調節した。NAG-PE
G2-Br(100 mg/ml)の溶液をdH2Oの中に調製した。NAG-PEG2-Br(4.75当量、0.142ミリモ
ル、0.61 ml)を添加し、溶液を室温で48時間撹拌し続けた。
を1.7モル当量のTCEP-HCl(0.010ミリモル、100μl)と反応させ、室温で30分間撹拌し続
けた。最終濃度が10 mg/ml MLPかつ20 mM MES-Naとなる量のMES-Na(400μl)と水(390
μl)を添加した。pHを調べ、pH 6.5〜7に調節した。NAG-PEG8-マレイミド(100 mg/ml)
の溶液をdH2Oの中に調製した。NAG-PEG8-マレイミド(2当量、0.012ミリモル、110μl)
を添加し、溶液を室温で48時間撹拌し続けた。
Aと緩衝液B:MeCN、10%イソプロピルアルコール、0.1%TFA。流速は15 ml/分、20分間で
35%Aから62.5%Bへ。
し、カルボキシル末端にシステインを有するMLPをアミノ末端にシステインを有するMLPで
置換した。
nは1〜120の整数である(PEGの分子量は約5 kDaまで)
末端に、末端システイン残基ではなく、アセチル、ジメチル、ステアロイル、ミリストイ
ル、PEGという修飾を有するペプチドを樹脂表面に作製した。
クトサミン)の合成。CDM(300 mg、0.16ミリモル)を50 mlの塩化メチレンに溶かした溶
液に塩化オキサリル(2 g、10重量当量)とジメチルホルムアミド(5μl)を添加した。
一晩反応させた後、過剰な塩化オキサリルと塩化メチレンをロータリーエバポレーション
によって除去すると、CDM酸塩化物が得られた。この酸塩化物を1 mlの塩化メチレンに溶
かした。この溶液に、CDM-PEGのためのポリエチレングリコールモノメチルエーテル(平
均分子量550)、またはCDM-NAG のための(アミノエトキシ)エトキシ-2-(アセチルアミノ)
-2-デオキシ-β-D-ガラクトピラノシド(すなわちアミノビスエトキシ-エチルNAG)を1.1
モル当量と、ピリジン(200μl、1.5当量)を含む10 mlの塩化メチレンを添加した。次に
この溶液を1.5時間撹拌した。次に溶媒を除去し、得られた固形物を5 mlの水に溶かし、0
.1%TFA水/アセトニトリル勾配を用いた逆相HPLCを利用して精製した。
Rはメチルまたはエチルであり、nは2〜100の整数である。いくつかの実施態様では、PEG
は5〜20個のエチレン単位を含んでいる(nは5〜20の整数)。いくつかの実施態様では、P
EGは10〜14個のエチレン単位を含んでいる(nは10〜14の整数)。PEGは長さを変えること
ができ、平均長は5〜20個または10〜14個のエチレン単位である。あるいはPEGは、単分散
状態、均一状態、離散状態にすることができ、例えば正確に11個または13個のエチレン単
位を有する。
nは1〜10の整数である。上に示したように、PEGスペーサは無水物基とASGPrリガンドの間
に位置させることができる。いくつかの実施態様では、PEGスペーサは1〜10個のエチレン
単位を含んでいる。
できる。いくつかの実施態様では、親水性のスペーサまたはリンカーを用いる。いくつか
の実施態様では、中性のスペーサまたはリンカーを用いる。
イン酸マスキング剤(例えばCDM-NAG)を氷酢酸の0.1%水溶液から凍結乾燥させた。乾燥
させた二置換無水マレイン酸マスキング剤に、x mgのMLPを0.2x mlの等張グルコースに溶
かした溶液と、10x mgの無HEPES塩基を添加した。無水物を完全に溶解させてからこの溶
液を室温で少なくとも30分間インキュベートした後、動物に投与した。二置換無水マレイ
ン酸マスキング剤とペプチドの反応によって
とポリマーアミンの間の反応で生じた無水カルボキシルは、電荷が予想の約1/20である(
Rozema他、Bioconjugate Chemistry、2003年)。したがってこの膜活性ポリマーは、負電
荷が大きいポリアニオンに変換されるのではなく、うまく中性化されている。
gのデキストラン1K、3.18 mgの炭酸ナトリウム、588 mgの炭酸水素ナトリウムを5 mlの水
の中に含む溶液の中に存在していた。いくつかの実施態様では、MLP-(CDM-NAG)は凍結乾
燥された。
ーゼで開裂可能な基質のアミン反応性炭酸p-ニトロフェニル誘導体またはアミン反応性炭
酸N-ヒドロキシスクシンイミド誘導体を2〜6x mg添加することにより、1x mgのペプチド
と10x mgのHEPES塩基を、ペプチドが1〜10 mg/mlの状態でマスクした。次にこの溶液を室
温(RT)で少なくとも1時間インキュベートした後、動物に注射した。
カ合衆国)からの5'-カルボキシ修飾剤C10アミダイトを用いてRNAiトリガーの5'-C10-NHS
エステル修飾センス鎖(NHSC10-RNAiトリガー、またはCOC9-RNAiトリガー)を調製した。
固体支持体にまだ付着している活性化されたRNAを、下記の表4に掲載した親油性アミンと
共役させるのに用いた。100 mgのセンス鎖CPG(量は60マイクロモル/g、0.6マイクロモル
のRNA)を、Sigma Aldrich Chemie GmbH社(タウフキルヒェン、ドイツ国)またはFluka
社(Sigma Aldrich社、ブーフス、スイス国)から取得した0.25ミリモルの対応するアミ
ンと混合した。
ウム水溶液(NH3、33%)を45℃で一晩用いて保護を外した。TEA×3HFを65℃で3.5時間用
いて2'-保護基を除去した。粗オリゴリボヌクレオチドをRP-HPLCによって精製した(Reso
urce RPC 3 ml、緩衝液:A:水中の100 mM TEAA、B:95%CH3CNの中の100 mM TEAA、勾配
: 15 CVの中で3%Bから70%Bへ。ただし番号7は例外であり、15 CVの中で3%Bから100%
Bへという勾配)。
とアンチセンス鎖をアニーリング緩衝液(20 mMのリン酸ナトリウム、pH 6.8;100 mMの
塩化ナトリウム)の中で混合し、3分間80℃に加熱し、3〜4時間かけて室温まで冷却した
。因子VIIのmRNAに向かうRNAiトリガーをゲル電気泳動によって特徴づけた。
HBV RNAiトリガー-コレステロール共役体を合成した。コレステロールは、トリガーのセ
ンス鎖またはアンチセンス鎖の5'末端または3'末端に付着させることができる。いくつか
の実施態様では、付着は、トリガーのセンス鎖の5'末端に対してなされる。トリガー-コ
レステロールは、トリガーを合成した後に、本分野で標準的な方法を利用し、反応基(例
えばチオール、アミン、カルボキシル)を含むRNA鎖を用いて作製することもできる。
RNAiトリガーとマスクされたMLPを上記のようにして合成した。6〜8週齢のマウス(株C57
BL/6またはICR、それぞれ約18〜20 g)をHarlan Sprague Dawley社(インディアナポリス
、イリノイ州)から取得した。注入の前にマウスを少なくとも2日間飼育した。食餌は、H
arlan Teklad Rodent Diet(Harlan社、マディソン、ウィスコンシン州)を自由に摂取さ
せた。マウスの尾の静脈に0.2 mlの送達ペプチド溶液と0.2 mlのRNAiトリガー共役体を注
入した。送達ペプチドとRNAiトリガーを同時に注入するため、修飾されたペプチドにRNAi
トリガー-共役体を添加した後に注入し、全量を注入した。組成物は生理的条件下では可
溶性であり、凝集しなかった。溶液を輸液によって尾の静脈に注入した。他の血管(例え
ば後眼窩注入)への注入は、同じように有効であることが予想される。
に、指示された量のMLPを、指示された量のApoB RNAiトリガー-コレステロール共役体と
同時に注入した。ApoBのレベルに対する効果を上記のようにして求めた。
炎ウイルス(HBV)の低減
ID)マウスに、ハイドロダイナミック法で尾の静脈に注射すること(Yang PL他、「ハイ
ドロダイナミック法によるウイルスDNAの注射:急性B型肝炎ウイルス感染のマウスモデル
」、PNAS USA 2002年、第99巻:13825〜13830ページ)によってMC-HBV1.3を一過性に生体
トランスフェクトした。MC-HBV1.3はプラスミドに由来するミニサークルであり、HBV1.3.
32トランスジェニックマウスと同じ末端冗長ヒトB型肝炎ウイルス配列HBV1.3を含んでい
る(GenBank登録#V01460)(Guidotti LG他、「トランスジェニックマウスにおける高レ
ベルのB型肝炎ウイルス複製」、J Virol 1995年、第69巻、6158〜6169ページ)。10μgの
MC-HBV1.3を全体積がマウスの体重の10%のリンゲル溶液に入れて尾の静脈からマウスに
注入し、慢性HBV感染のpHBVモデルを作製した。この溶液の注入は、以前に報告されてい
る(Zhang G他、「裸のプラスミドDNAを尾の静脈から注入した後の肝細胞における高レベ
ルの外来遺伝子発現」、Human Gene Therapy 1999年、第10巻、1735〜1737ページ)よう
にして、27ゲージの針を通じて5〜7秒で実施した。トランスフェクションの3週間後であ
る-21日目、血清中のB型肝炎表面抗原(HBsAg)の発現レベルをELISAによって測定し、マ
ウスを平均HBsAg発現レベルに従ってグループ分けした。
)、1:1のモル比で組み合わせた。組み合わせたそのRNAiトリガーをその後の全手続きで
使用した。
メリカ合衆国特許第8,809,293号)に記載されており、その内容は参照によって本明細書
に組み込まれている。
(G1L MLP、L系))に5:1(w/w)の比で室温にて添加し、30分間インキュベートすると
、MLP送達ペプチドが得られた。4M NaOHを用いてこの反応混合物のpHを9.0に調節した。2
,4,6-トリニトロベンゼン-スルホン酸を用いて反応の程度を調べ、95%超であると判断し
た。MLP送達ペプチドを10 mM炭酸水素塩緩衝液(pH 9.0)の中でタンジェンシャルフロー
によって精製し、そこに10%デキストラン(w/w)を添加した。精製した最終材料を凍結
乾燥させた。
の水に再懸濁させた。次に、MLP送達ペプチドをHBV RNAiトリガーと1:1の比(w/w)(約
5.49:1のモル比)で組み合わせた。等張グルコースを必要に応じて添加し、1回ごとの注
入体積を200μlにした。
性一水和物と0.071 g/lのリン酸ナトリウム二塩基性七水和物も含んでいる溶液中で26 g/
lの濃度であった。
25.0 g/lのMLP-(CDM-NAG)と、0.066 g/lのリン酸ナトリウム一塩基性一水和物と、0.068
g/lのリン酸ナトリウム二塩基性七水和物と、0.1 g/lのデキストラン1Kと、0.318 g/lの
炭酸ナトリウムと、0.588 g/lの炭酸水素ナトリウムを含んでいた。
ペプチド+HBV RNAiトリガー、または等張グルコース、または8 mg/kgのMLP送達ペプチド
を含む200μlを1回だけ静脈内投与した。
、またはMLP送達ペプチドだけの投与の前と後のさまざまな時点で、血清HBsAg、または血
清HBV DNA、または肝臓HBV RNAを測定した。HBVの発現レベルは、等張グルコースを注入
した対照マウスに規格化した。
収して血清分離管(Sarstedt AG&Co.社、ニュムブレヒト、ドイツ国)に入れた。血液を
周囲温度で20分間放置して凝固させた。血清分離管を8,000×gで3分間遠心分離して血清
を分離し、4℃で保管した。
中で10〜2000倍に希釈した。その無脂乳溶液の中に希釈した二次HBsAg基準を、10μgのHB
sAg 発現プラスミドpRc/CMV-HBs(Aldevron社、ファルゴ、ノースダコタ州)をトランス
フェクトしてあったICRマウス(Harlan Sprague Dawley社)の血清から調製した。HBsAg
のレベルは、GS HBsAg EIA 3.0キット(BioRad Laboratories, Inc.社、レッドモンド、
ワシントン州)を製造者が記載しているようにして用いて求めた。組み換えHBsAgタンパ
ク質のaywサブタイプをやはりPBS中の無脂乳に希釈して一次標準として用いた(Aldevron
社)。
、等張グルコースを注入した対照群のマウスに規格化した。最初に、ある時点での各マウ
スのHBsAgのレベルをそのマウスにおける処理前(-1日目)の発現レベルで割り算し、「
処理前レベルに規格化した」発現の比を求めた。次に、個々のマウスについて「処理前レ
ベルに規格化した」比を、等張グルコース対照群の全マウスの「処理前レベルに規格化し
た」比の平均値で割り算することによって特定の時点での発現を対照群に規格化した。
積を100μlにした。QIAmp MinElute Virus Spin Kit(Qiagen社、ヴァレンシア、カリフ
ォルニア州)を製造者の指示に従って用いてDNAを血清サンプルから単離した。無菌0.9%
生理食塩水を各サンプルに添加して最終体積を200μlにした。緩衝液とプロテアーゼを入
れた試験管に血清サンプルを添加した。少量のDNAを単離しやすくするためキャリアRNAを
添加した。1 ngのpHCR/UbC-SEAPプラスミドDNA(Wooddell CI他、「成体マウスにおける
最適化したsiRNA発現コンストラクトからの長期RNA干渉」、Biochem Biophys Res Commun
(2005年)第334巻、117〜127ページ)を回復対照として添加した。56℃で15分間インキ
ュベートした後、エタノールを用いて核酸をライセートから沈殿させ、全溶液をカラムに
適用した。洗浄後、サンプルを体積50μlの緩衝液AVEの中に溶離させた。
て求めた。S遺伝子内でHBVゲノムの短い区画(GenBank登録番号#V01460塩基353〜777)を
コードしているプラスミドpSEAP-HBV353-777を用いて6 log標準曲線を作成した。pHCR/Ub
C-SEAPの検出に基づき、DNAの回復が平均値から2標準偏差未満であるサンプルを除外した
。TaqMan化学に基づいていてfluor/ZEN/IBFQを有するプライマーとプローブを用いた。
HBVプライマー:
5'-GCCGGACCTGCATGACTA-3'(配列ID番号 740)及び
5'-GGTACAGCAACAGGAGGGATACATA-3'(配列ID番号 741)
HBVプローブ:6-カルボキシフルオレセイン(FAM)で標識したレポータ:
5'-FAM/CTGCTCAAGGAACCTC-3'(配列ID番号 742)
hHCR(HCR/UbC-SEAP)プライマー:
5'-CATGCCACCTCCAACATCCACTC-3'(配列ID番号 743)
5'-GGCATAGCCACTTACTGACGACTC-3'(配列ID番号 744)
hHCRプローブ:
5'-FAM/TTGTCCTGGC/ZEN/GTGGTTTAGGTAGTGTGA/IBFQ-3'(配列ID番号 745)
アッセイを実施した。血清中のHBV DNAを評価するため、プールした群血清サンプルから2
回の精製工程でDNAを単離した。HBV DNAと回復対照プラスミドの定量を3回繰り返して実
施したqPCR反応によって求めた。各反応にはHBCとpHCR/UbC-SEAPを定量するためのプロー
ブが含まれていた。
I試薬RT(Molecular Research Center, Inc.社、シンシナチ、オハイオ州)を収容した50
mlの円錐管に入れた。全RNAを、製造者が推奨するようにして単離した。簡単に述べると
、Bio-Gen PRO200組織ホモジェナイザー(Pro Scientific, Inc.社、オックスフォード、
コネティカット州)を約30秒間用いてTRI試薬の中の肝臓をホモジェネートにした。1 ml
のホモジェネートを0.2 mlのクロロホルムに添加し、混合し、遠心分離によって相を分離
した。0.1 mlの水相を取り出し、イソプロピルアルコールで沈殿させ、遠心分離した。得
られたペレットを75%エタノールで洗浄し、0.4〜0.6 mlの無ヌクレアーゼ水の中に再懸
濁させた。High Capacity cDNA Reverse Transcription Kit(Life Technologies社、グ
ランド・アイランド、ニューヨーク州)を用いて全RNA(50〜500 ng)を逆転写した。次
にcDNAを1:50に希釈した後、HBVを検出するため、順プライマー5'-GCCGGACCTGCATGACTA-
3'(配列ID番号746)と、逆プライマー5'-GGTACAGCAACAGGAGGGATACATA-3'(配列ID番号74
7)と、6-カルボキシフルオレセイン(FAM)で標識したレポータ5'-CTGCTCAAGGAACCTC-3'
(配列ID番号748)を用いた5'エキソヌクレアーゼ化学を利用してマルチプレックスRT-qP
CRを実施した。
べてのHBV RNAに結合する。そのためこのプローブで全HBV RNAを測定した。HBV、マウス
のβ-アクチン、Gene Expression Master Mix(Life Technologies社、グランド・アイラ
ンド、ニューヨーク州)の遺伝子発現アッセイを利用した。相対的定量の比較CT法(Liva
k KJ他、「リアルタイム定量PCRと2(-デルタデルタC(T)を利用した相対的遺伝子発現の分
析)」、Method. Methods、2001年、第25巻、402〜408ページ)を利用して遺伝子発現デー
タを分析した。
によって調べ、HBV全RNAと、内在性対照であるマウスβ-アクチンmRNAを同じ反応で測定
した。
ΔΔCT=(CT標的-CT対照)サンプル-(CT標的-CT対照)基準
相対的発現=2-ΔΔCT
個別の相対的発現=反復測定の幾何平均
範囲の下端及び範囲の上端は、2-平均ΔΔCT+標準偏差ΔCT及び2-平均ΔΔCT-標準偏差Δ
CTを指す。
全ガイド鎖、全完全長ガイド鎖、5'-ホスホリル化完全長ガイド鎖の肝臓におけるレベル
をさまざまな時点で蛍光PNAプローブハイブリダイゼーションとHPLCアニオン交換クロマ
トグラフィによって測定した。ガイド鎖は内在性細胞質CLP1キナーゼによって5'-ホスホ
リル化される(Weizer S他、「ヒトRNAキナーゼhCLp1は3'トランスファーRNAエキソンと
短い干渉RNAに対して活性である」、Nature 2007年、第447巻、222〜227ページ)。ガイ
ド鎖にハイブリダイズした蛍光標識付き配列特異的ペプチド核酸(PNA)プローブを、均
質化した肝臓組織に添加した。プローブ-ガイド鎖ハイブリッドをHPLCアニオン交換クロ
マトグラフィによって分析すると、電荷に基づいてガイド鎖が分離された。
。25 mgまでの凍結粉末を、50μg/mlのプロテイナーゼKを含む1 mlの希釈Affymetrix Lys
is Solution(1部のAffymetrix Lysis Solutionと、2部の無ヌクレアーゼ水)に溶解させ
た。サンプルをマイクロ・スティック超音波処理装置で超音波処理し、65℃で30分間イン
キュベートした。サンプルをさらに希釈する必要がある場合、ハイブリダイゼーション工
程の前に、上記のように希釈したAffymetrix Lysis Solutionを用いてそれを実施した。R
NAiトリガー標準の段階希釈物も希釈したLysis Solutionの中に調製した。
RNAiトリガー標準:RD74
センス (NH2C6)CfuGfuAfgGfcAfuAfaAfuUfgGfuAf(invdT)(配列ID番号 749)
アンチセンス pdTAfcCfaAfuUfuAfuGfcCfuAfcAfgdTsdT (配列ID番号 750)
RNAiトリガー標準:RD77
センス (NH2C6)AfcCfuCfuGfcCfuAfaUfcAfuCfuAf(invdT)(配列ID番号 751)
アンチセンス pdTAfgAfuGfaUfuAfgGfcAfgAfgGfudTsdT (配列ID番号 752)
n=2'-O-メチル、Nf=2'-フルオロ、dN=デオキシリボース、inv=逆転した、s=ホスホ
ロチオエート結合。
ルから沈殿させた。氷の上で10分間インキュベートした後、サンプルを2,700×gで15分間
遠心分離した。上清でRNAiトリガーの定量を実施した。
ンカー(OO=PEG2;PNA Bio社、サウザンド・オークス、カリフォルニア州)を介してPNA
鎖に付着させたN末端の蛍光Atto 425標識を含む配列特異的ペプチド核酸(PNA)プローブ
を設計した。
ペプチド核酸(PNA)プローブ
AD00009用 Atto425-OO-CTGTAGGCATAAATT(配列ID番号 753)
AD00010用 Atto425-OO-ACCTCTGCCTAATCA(配列ID番号 754)
アーゼ水と、11μlの200 mMトリス-HCl(pH 8)と、11μlの1μM AD9またはAD10 PNAプロ
ーブ溶液を添加した。このプレートを密封し、サーマルサイクラーの中で95℃にて15分間
インキュベートした。サーマルサイクラーの温度を54℃に下げてサンプルをさらに15分間
インキュベートした。インキュベーションの後、サンプルをHPLC分析のためにオートサン
プラーに装填するまで4℃で保管した。
ラムオーブン(Shimadzu Scientific Instruments社、コロンビア、メリーランド州)を
備えたShimadzu HPLCシステムを用いてHPLC分析を実施した。ハイブリダイゼーション工
程からの96ウエルのプレートをオートサンプラーに装着した。4×50 mmガードカラム(#D
XSP4016;Fisher Scientific社、ピッツバーグ、ペンシルヴェニア州)を取り付けたDNAP
ac PA-100 4×250 mm分析カラム(#DX043010;Fisher Scientific社、ピッツバーグ、ペ
ンシルヴェニア州)への注入体積を100μlにした。分析は、流速を1 ml/分、カラムオー
ブンの温度を50℃にして実施した。移動相A(10 mMトリス-HCl(pH 7)、100 mM NaCl、3
0%(v/v)アセトニトリル)と移動相B(10 mMトリス-HCl(pH 7)、900 mM NaCl、30%
(v/v)アセトニトリル)を利用した勾配溶離。
。12点外部標準較正曲線を用いて7〜10分の間に溶離した分析物の濃度を計算した。較正
曲線は、PNAがハイブリダイズした完全長ホスホリル化RNAiトリガーであるRD74とRD77を
用いて作成した。
インディアナ州)化学分析装置を製造者の指示に従って用いてマウス血清中の臨床化学マ
ーカーを測定した。
ーで処理したマウスで8日目と15日目に起こった。血清中の全HBV DNAは、それぞれ1/294
と1/345に低下した。29日目、マウス血清中のHBV DNAは、処理していない対照マウスの1/
13.5に留まっていた。全HBV DNAは、4 mg/kgと2 mg/kgのMLP送達ペプチド+HBV RNAiトリ
ガーで処理したマウスでは8日目にそれぞれ1/91.8と1/6.5に低下した。
で処理したマウスで8日目と15日目に起こった。血清中のHBsAgは、それぞれ1/270と1/139
に低下した。29日目、血清中のHBsAgは、処理していない対照マウスの1/7.3であった。血
清中のHBsAgは、4 mg/kgと2 mg/kgのMLP送達ペプチド+HBV RNAiトリガーで処理したマウ
スでは8日目にそれぞれ1/71.4と1/5.4に低下した。
NAは、22日目の間は95%超低下していた。(HBV RNAiトリガーなしで)MLP送達ペプチド
を注入したマウスからの血清中のHBV DNAとHBsAgのレベルは、等張グルコースを1回だけ
注入したマウスにおけるレベルと同等に留まった(表7)。
ーで処理したマウスで8日目に起こった。肝臓内の全HBV RNAは、平均して1/12.5に低下し
た。29日目、肝臓内の全HBV RNAは、処理していない対照マウスの平均の1/3.4であった。
全HBV RNAは、4 mg/kgと2 mg/kgのMLP送達ペプチド+HBV RNAiトリガーで処理したマウス
では8日目にそれぞれ1/5.8と1/1.6に低下した(表7)。
デルマウスに注入すると、8日目に肝細胞の細胞質に約80 ng/gのHBV RNAiトリガーが得ら
れた。これは、それぞれ約40 ng/gの完全長AD00009ガイド鎖と完全長AD00010ガイド鎖が5
'ホスホリル化されたことの証拠となる。8日目に得られた薬物動態効果は、全HBV RNAが9
3%ノックダウンされたことと、血清中のHBsAgとHBV DNAが99%超低下したことであった
。22日目、肝臓内のほぼすべてのガイド鎖が5'ホスホリル化されていて、完全長であった
(表7)。
)評価した。臨床化学検査でMLP送達ペプチド+HBV RNAiトリガーに関係する変化はなく
、MLP送達ペプチド+HBV RNAiトリガーの投与からも、MLP送達ペプチド単独投与からも、
毒性の証拠はまったくなかった。
慢性感染した1匹のチンパンジー(チンパンジー4x0139;遺伝子型B;ウイルス量は約7×1
09GE/ml、51.3〜51.5 kg)にMLP送達ペプチド+HBV RNAiトリガー(AD00009とAD00010)
を静脈内輸液によって与えた。本試験の前2年間のこの動物のウイルスHBV DNA力価は、4
×109〜1.3×1010ゲノム当量/ml(この研究のベースライン値)の範囲であった。血液サ
ンプルを健診時(-7日目)に採取し、投与の直前(1日目)にも再び採取し、ベースライ
ンサンプルとして用いた。健診には、物理的検査、CBC、全血化学が含まれていた。2 mg/
kgのMLP送達ペプチド+HBV RNAiトリガー(5 mg/mlのMLP送達ペプチドを20.6 ml)を1日
目に静脈内プッシュによって3分間かけて投与した。3 mg/kgのMLP送達ペプチド+HBV RNA
iトリガー(5 mg/mlのMLP送達ペプチドを30.9 ml)を15日目に静脈内プッシュによって3
分間かけて投与した。血液サンプルを4日目、8日目、11日目、15日目、22日目、29日目、
36日目、43日目、57日目、64日目、71日目、78日目、85日目に取得した。肝臓生検サンプ
ルは、健診時、29日目、57日目の3回取得した。動物は、すべての手続きで鎮静させた。
採血と投与のための鎮静は、運動抑制剤としてTelazol(商標)(2 mg/kg)とキサラジン
(100 mg)を筋肉内投与することによって実現した。手続きの終了時にヨヒンビンをキサ
ラジンの拮抗剤として用いる。
して血清サンプルと肝臓生検サンプルでHBV DNAのレベルを求めた(ベースライン、29日
目、57日目)。両方のアッセイで全ゲノムが検出されるはずである。Qiagen QiaAmp DNA
Mini Kit(カタログ番号51304)を製造者のプロトコルに従って用いて100μlの血清また
は肝臓組織ホモジェネートからDNAを精製した。HBVコア遺伝子に対して設計したプライマ
ーとプローブを用い、TaqMan 技術を利用してDNAサンプルをリアルタイムPCRによって分
析した。
順プライマー、HBVコアF 5' CGAGGCAGGTCCCCTAGAAG 3'(配列ID番号 755)
逆プライマー、HBVコアR 5' TGCGACGCGGYGATTG 3'(配列ID番号 756)
プローブ、HBVコアプローブ 5' 6-FAM/AGAACTCCCTCGCCTCGCAGACG-6-TAM 3'(配列ID
番号 757)
HBV X遺伝子に対するプライマーとプローブを用いて肝臓のDNAとRNAも分析した。
順プライマー、HBV X F-CCGTCTGTGCCTTCTCATCTG(配列ID番号 758)
逆プライマー、HBV X R-AGTCCAAGAGTYCTCTTATGYAAGACCTT(配列ID番号 759)
プローブ、HBV X 5' 6-FAM/CCGTGTGCACTTCGCTTCACCTCTGC-6-TAM 3'(配列ID番号 76
0)
万GEまでの範囲で標準曲線を作成した。TaqManアッセイではABI 7500配列検出装置を用い
てサンプルを分析した。そのとき用いたサイクルパラメータは、50℃で2分間/95℃で10
分間/95℃で15秒間を45サイクル/60℃で1分間である。
)と1/2.7(X領域PCRアッセイ)に低下した。
レベルは8日目〜15日目に上昇し、ベースラインの1/18.8から1/6.7になった。15日目に2
回目の投与を実施した後、ウイルスDNAの低下が観察され、22日目にベースラインの1/35.
9に達した。
いてHBsAgのレベルを求めた。表面抗原の定量結果は、ODを既知の表面抗原標準と比較す
ることによって求めた。HBeAgの定量結果は、DiaSorin社からのELISAキット(ETI-EBK Pl
us)を用いてすべての血清で求めた。
1μg/mlまで下低下した。数値は、ARC 520を最初に投与してから4日目までに顕著に低下
していた(ベースラインの値と比べて18%低下)。数値は15日目まで低下を続けてベース
ラインの53%(1/2.1)になり、29日目に81%(1/5.2)という最大の低下に達した。
日目までに12.5 ng/ml(1/10.9)に低下した。レベルは15日目に46 ng/ml(ベースライン
の1/2.9)まで上昇した。2回目の注入の後、レベルは22日目に再び28 ng/mlまで低下した
。
、CXCL9(Mig)、インターフェロンγ(IFNγ)、GAPDHを定量RT-PCRによって求めた。簡
単に述べると、肝臓に由来する200 ngの全細胞RNAを、ABI Assays-on-Demand(商標)か
らのプライマーおよびプローブとABI 7500 TaqMan配列分析装置(Applied Biosystems社
/Ambion社、オースチン、テキサス州)を用いてqRT-PCRアッセイによって分析した。RNA
UltraSense(商標)One-Step Quantitative RT-PCR System(Invitrogen Corporation社
、カールスバッド、カリフォルニア州)からの試薬を用いてqRT-PCRを実施した。そのと
きのサイクル設定は、48℃、30分間;95℃、10分間;95℃、15秒間;60℃、1分間で、最
後の2つを45サイクルであった。肝臓生検サンプルをただちにRNAlater(登録商標)安定
化試薬の中に入れ、製造者が記載しているようにして処理し、全細胞RNAに対してRNA-Bee
(Tel-Test, Inc.社、フレンズウッド、テキサス州)を用いてRNAを抽出した。これら遺
伝子の実質的な誘導は見られなかった。
キット(Millipore社;ビレリカ、マサチューセッツ州)を用いるxMAP(複数分析物プラ
ットフォーム)システムでLuminex 100を用いてサイトカインとケモカインのモニタリン
グを実施した。各サイトカインのための標準の希釈物を各アッセイで評価した。各サイト
カインのための標準を各試行で評価して定量結果を得た。Luminex法を利用して血清サン
プル中の以下のサイトカイン/ケモカインを評価した:EGF、エオタキシン、FGF-2、Flt-
3リガンド、フラクタルカイン(CX3CL1)、G-CSF、GM-CSF、GRO、IFNα2、IFNγ、IL-10
、IL-12p40、IL-12p70、IL-13、IL-15、IL-17、IL-lα、IL-1β、IL-1受容体アンタゴニ
スト、IL-2、IL-3、IL-4、IL-5、IL-6、IL- 7、IL-8、IL-9、IL-10、MCP-1(CCL2)、MCP
-3(CCL7)、MDC(CCL22)、ΜΙΡ-1α(CCL3)、MIP-1β(CCL4)、sCD40L、sIL-2受容
体アンタゴニスト、TGFα、TNFα、ΤΝΡβ、VEGF。肝臓転写産物と同様、治療中にケモ
カインとサイトカインの実質的な変化は観察されなかった。
s Ltd社、オックスフォード、コネティカット州、アメリカ合衆国)を用いて血液化学検
査を実施した。全血化学検査では、以下の測定値が得られた:Na、K、Cl、Ca、CO2、Phos
、ALT、AST、GGT、LDH、直接ビリルビン、全ビリルビン、Alk Phos、BUN、クレアチン、
クレアチンキナーゼ、グルコース、全タンパク質、アルブミン、コレステロール、トリグ
リセド。同じコロニーからの感染していないマウスの値を用いて正常な範囲を確立した。
肝臓生検サンプルを標準的な手続きによって麻酔した動物から採取した。生検材料をただ
ちに分割して組織病理学のためと、DNAとRNAを分析するための分画にした。組織病理学検
査のための切片を、10%ホルマリンを含むPBSの中で固定し、パラフィン包埋し、ヘマト
キシリンとエオシンで染色した。DNA分析のための分画を瞬間凍結させた。RNA分析のため
の分画は、RNAlater(登録商標)安定化試薬の中に入れた。
包埋し、4ミクロンに切断した。スライドをEZ-DeWax(BioGenex社;HK 585-5K)2xの中で
5分間脱パラフィン化した後、水で洗浄した。抗原の賦活化を、マイクロ波圧力調理器に
入れたクエン酸塩緩衝液(抗原賦活化溶液;BioGenex社;HK 086-9K)の中で、1000ワッ
トにて15分間と、300ワットにて15分間実施した。冷却したスライドを水とPBSで洗浄し、
ペルオキシダーゼ抑制剤、ユニバーサルブロック、アビジンを順番に用いて処理した(す
べての試薬がPierce 36000 Immunohisto Peroxidase Detectiion Kitからのものである)
。スライドのインキュベーションを、ビオチンブロックを含むユニバーサルブロックの中
に希釈した一次抗体とともに室温で1時間、ビオチニル化したヤギ抗マウスIgGとともに0.
5時間、アビジン-ビオチン複合体(ABC)とともに0.5時間の順番で実施した。Immpact No
va Redペルオキシダーゼ基質(Vector社、SK-4805;バーリンゲーム、カリフォルニア州
)を用いてスライドを現像し、Mayers(Lillieの)ヘマトキシリン(DAKO社、S3309)で
対比染色し、脱水し、非水性装着媒体(Vector社、VectaMount;H-5000)に装着した。バ
キュロウイルスの中で発現した精製コア粒子からウサギ抗HBVコアを調製した。
か染色された。染色の低下が29日目に起こり、それはかなり顕著であった。
マウスモデルにおける生体内B型肝炎ウイルス(HBV)の減少
ウス染色体DNAに組み込まれたayw株(GenBank登録番号V01460)の末端重複1.3-ゲノム長
ヒトHBVゲノムの単一のコピーを含んでいる。これらマウスの肝臓で高レベルのHBV複製が
起こる(Guidotti LG他、「トランスジェニックマウスにおける高レベルのB型肝炎ウイル
ス複製」、J Virol 1995年、第69巻、6158〜6169ページ)。
均レベルが各群で同じになるようにマウスをグループ分けした。スチューデントのt検定
を利用して、対照siLuc群に対してどの群の間にも有意な差がないようにした。
を上記のようにして調製した。AD00009、AD00010、RNAiトリガー標準RD74、RNAiトリガー
標準RD77を上記のようにして調製した。
siLuc(ホタルルシフェラーゼRNAiトリガー)
センス鎖 Chol-uAuCfuUfaCfgCfuGfaGfuAfcUfuCfgAf(invdT)(配列ID番号 761)
アンチセンス鎖 UfsCfgAfaGfuAfcUfcAfgCfgUfaAfgdTsdT (配列ID番号 762)
窩静脈叢に、3 mg/kgまたは6 mg/kgのMLP送達ペプチド+HBV RNAiトリガーを20 gの体重
に対して200μlの割合で一回だけ静脈内注入した。対照マウスには、等張グルコース、ま
たは6 mg/kgのMLP送達ペプチド+siLucを注入した。
液回収管(#02-668-10、Fisher Scientific社、ピッツバーグ、ペンシルヴェニア州)を
用いて血液サンプルを後眼窩叢から回収した。血液を、回収中に60〜120分間にわたって
周囲温度にしておいたマイクロ遠心分離管に移した。次にサンプルを14,000 rpmで10分間
遠心分離して血清を分離し、それを-20℃で保管した。
の肝細胞の細胞質の中のHBVコア抗原(HBcAg)の分布を、肝臓切片の免疫組織化学染色に
よって定量評価した。細胞質HBcAgの存在は、そのタンパク質が活発に発現していること
を示す。組織サンプルを10%亜鉛緩衝化ホルマリンの中で固定し、パラフィンの中に包埋
し、切断し(3μm)、ヘマトキシリンで染色した(Chisari FV他、「B型肝炎ウイルスの
大きなエンベロープポリペプチドの発現がトランスジェニックマウスでB型肝炎表面抗原
の分泌を抑制する」、J Virol 1986年、第60巻、880〜887ページ)。HBcAgの細胞内分布
を、標識したアビジン-ビオチン検出手続きによって評価した(Guidotti LG他、「B型肝
炎ウイルスの核キャプシド粒子はトランスジェニックマウスで肝細胞の核膜を横断しない
」、J Virol 1994年、第68巻、5469〜5475ページ)。PBS(pH 7.4)の中のパラフィン包
埋切片を3%過酸化水素で37℃にて10分間処理した後、PBSで洗浄した。その切片を正常な
ヤギ血清で室温にて30分間ブロックした後、ウサギ抗HBcAg(DAKO North America, Inc.
社、カーピンテリア、カリフォルニア州)一次抗血清を1:100に希釈して37℃にて60分間
にわたって適用した。PBSで洗浄した後、ビオチンが共役したヤギ抗ウサギ免疫グロブリ
ンG F(ab9)2(Sigma-Aldrich Co. LLC.社、セントルイス、ミズーリ州)からなる二次抗
血清を1:100に希釈して37℃にて30分間にわたって適用した。抗体で被覆したスライドを
PBSで洗浄し、ストレプトマイシン-セイヨウワサビのペルオキシダーゼ共役体(ExtrAvid
in;Sigma-Aldrich Co. LLC.社、セントルイス、ミズーリ州)を1:600に希釈して用いて
37℃にて30分間にわたって処理し、3-アミノ-9-エチルカルバゾール(AEC;Shandon-Lips
haw社、ピッツバーグ、ペンシルヴェニア州)で染色し、Mayerのヘマトキシリンで対比染
色した後、装着した。肝細胞内のHBcAgのレベルと分布を目視で評価した。6 mg/kgのMLP
送達ペプチド+HBV RNAiトリガーを注入してから15日目と29日目に細胞質HBcAgは核HBcAg
と比べて大きく低下していた。これは、HBcAgの発現がノックダウンされたことを示して
いる。
抗原(HBeAg)に及ぼす効果をELISAによって調べた。マウスからの血清回収を、注入前で
ある-1日目、注入してから6時間後、3日目、8日目、15日目、22日目、29日目に実施した
。2μlのマウス血清を用い、HBe酵素固定免疫吸着アッセイ(ELISA)を製造者(Epitope
Diagnostics社、サンディエゴ、カリフォルニア州)が記載しているようにして利用してH
BeAgの分析を実施した。抗原のレベルは、アッセイの直線範囲で求めた。各マウスの各時
点におけるHBeAgのレベルは、投与前である-1日目のレベルに規格化した。MLP送達ペプチ
ド+HBV RNAiトリガーで処理した群を、等張グルコース群またはsiLuc群と別々に比較し
た。対応のあるt検定を利用して3日目から8日目までのHBeAgの発現の変化を評価した。
日目には約71〜73%低下していた。HBeAgは、6 mg/kgのメリチン送達ペプチド+HBV RNAi
トリガーで処理したマウスでは29日目に約66%低下した状態に留まった。これらトランス
ジェニックマウスは、腎臓でHBeAgを産生することが知られている。腎臓から出て循環し
ているHBeAgのレベルは不明である。
b(2種類)、0.7 kbの少なくとも6つのmRNA種を産生する。3.5 kbである一方のmRNAはHBe
Agをコードしている。HBeAgは分泌されるタンパク質である。3.5 kbである他方のmRNAは
プレゲノムRNA(pgRNA)であり、翻訳されてコアタンパク質(HBcAg)とポリメラーゼを
産生する。pgRNAは逆転写されてビリオンDNAを生み出す。HBcAgタンパク質モノマーは組
み合わされて、ビリオンDNAを取り囲むキャプシドを形成する。2.4 kbと2.1 kbのmRNAは
、S抗原(HBsAg)とも呼ばれるエンベロープ(S)タンパク質をコードしている。HBsAgタ
ンパク質は、ウイルスキャプシドの周囲にエンベロープを形成する(トランスジェニック
HBC1.3.32マウスはこのタンパク質に対する抗体を産生するため、HBsAgは測定されなかっ
た)。0.7 kbのmRNAはXタンパク質をコードしていて、通常はトランスジェニックマウス
では検出できない。
全RNAを抽出した。RNAを単離し、HBV転写産物のレベルを、ノーザンブロッティングと定
量リアルタイムPCR(RT-qPCR)により、ハウスキーピング遺伝子であるグリセルアルデヒ
ド-3-リン酸デヒドロゲナーゼ(GAPDH)に対して評価し、定量した。
ション分析を実施した。フィルタを32Pで標識したHBV(ayw株)ゲノムDNAで調べてHBV配
列を検出し、マウスのグリセルアルデヒド-3-リン酸デヒドロゲナーゼ(GAPDH)のcDNAで
調べ、内部対照として用いるGAPDH転写産物を検出した。ノーザンブロットで3.5 kbのHBV
RNAバンドと2.1 kbのRNAバンドに対応する放射性ハイブリダイゼーション信号を、同じ
マウスからのGAPDH mRNAバンドに対応する信号に規格化した。各マウスからの2.1 kbのHB
V RNA:GAPDHの比を、等張グルコースを注入した4匹のマウスとMLP送達ペプチド+siLuc
で処理した4匹のマウスからなる組み合わせ対照群におけるこの比の平均値で割り算し、2
.1 kbのHBV RNAにおける処理特異的変化を求めた。3.5 kbのHBV RNAも同じ方法で分析し
た。どちらの場合にも誤差はこの比の標準偏差として示してある。統計的有意さは、スチ
ューデントの両側t検定によって求めた。肝臓組織からの全細胞RNAのRNAフィルタハイブ
リダイゼーション(ノーザンブロット)分析からの結果を表11に示す。MLP送達ペプチド
+HBV RNAiトリガーを用いた処理によって肝臓内のウイルスRNA含量が低下した。等張グ
ルコースまたはMLP送達ペプチド+siLucを投与されたマウスの肝臓におけるウイルスRNA
のレベルに対する効果は観察されなかった。
RNAのGAPDHとHBV 3.5 kb転写産物のレベルを測定した。DNアーゼIで処理した後、TaqMan
逆転写試薬(Life Technologies社、グランド・アイランド、ニューヨーク州)を用いたc
DNA合成で1μgのRNAを使用し、次いでSYBR GreenとApplied Biosystems 7300リアルタイ
ムPCRシステムを用いてqPCRによる定量を実施した。サーマルサイクリングは、95℃で10
分間という最初の変性工程の後、40サイクルの変性(95℃で15秒間)とアニーリング/伸
長(60℃で1分間)で構成した。相対的なHBV 3.5 kb RNA発現のレベルは、マウスGAPDH R
NAに規格化した比較CT(ΔCT)法を利用して推定した。使用したPCRプライマーは、それ
ぞれ、5'-GCCCCTATCCTATCAACACTTCCGG-3'(配列ID番号763)(HBV 3.5 kb RNAセンスプラ
イマー、位置2,311〜2,335)、5'-TTCGTCTGCGAGGCGAGGG A-3'(配列ID番号764)(HBV 3.
5 kb RNAアンチセンスプライマー、位置2,401〜2,382)、5'-TCTGGAAAGCTGTGGCGTG-3'(
配列ID番号765)(マウスGAPDHセンスプライマー)、5'-CCAGTGAGCTTCCCGTTCAG-3'(配列
ID番号766)(マウスGAPDHアンチセンスプライマー)であった。
の中で凍結させ、-70℃で保管した後に全RNAを抽出した。DNAを肝臓から単離し、HBV複製
中間体を評価し、サザンブロッティングによってトランスジーンに対する相対量を定量し
た。32Pで標識したHBV(ayw株)ゲノムDNAを用い、HindIIIで消化させた20μgの全細胞DN
Aのサザンブロット分析を実施した。HBV複製中間体の相対レベル、弛緩型環状DNA(HBV R
C DNA)、一本鎖DNA(HBV SS DNA)を、ホスホイメージャで定量した後に同じマウスのHB
Vトランスジーン(HBVトランスジーンDNA)のレベルに規格化した。各マウスからのHBV R
C DNAとHBV SS DNAを組み合わせた信号:HBV Tg DNAの信号を、等張グルコースを注入し
た4匹のマウスとMLP送達ペプチドとsiLucを同時に投与した4匹のマウスからなる組み合わ
せ対照群におけるこの比の平均値で割り算し、複製中間体における処理特異的変化を求め
た。サザンブロット分析は、MLP送達ペプチド+HBV RNAiトリガーで処理したすべての群
でHBV複製中間体のレベルが低下したことを示していた(表14〜表16)。HBV DNA複製中間
体は、6 mg/kgのMLP送達ペプチド+HBV RNAiトリガーを1回だけ注入した後に4週間にわた
って大きく抑制された状態に留まっていた。複製中間体は、1週間後と2週間後には98〜99
%低下していて(1/64〜1/74)、4週間後には97%低下していた(1/29)。
マウスの肝臓にあるHBV RNAiトリガーのガイド鎖の量を、上記の蛍光ペプチド核酸(PNA
)プローブとのハイブリダイゼーションによって定量した。PNA-ハイブリダイゼーション
法により、組織の重量当たりのガイド鎖の全量を、AD00009とAD00010の代謝産物(総計、
全完全長、5'ホスホリル化完全長、非ホスホリル化完全長)を含めて定量することが可能
になった。完全長5'ホスホリル化ガイド鎖の存在は、RNAiトリガーが標的細胞の細胞質に
効率的に送達されたことを示していた。
注入する-1日前と、注入してから6時間後と48時間後に回収した。アラニンアミノトラン
スフェラーゼ(ALT)、アスパラギン酸アミノトランスフェラーゼ(AST)、血液尿窒素(
BUN)、クレアチニンの臨床化学分析を、COBAS Untegra 400(Roche Diagnostics社、イ
ンディアナポリス、インディアナ州)化学分析装置を製造者の指示に従って用いて実施し
した。各アッセイでは、検査に応じて2〜23μlの血清が必要であった。一元配置分散分析
により、マウスのすべての群からの臨床化学検査の結果を注入前と注入後で比較した。ボ
ンフェローニの多重比較検定を利用して個々の群の値を注入前と注入後で比較した。注入
の48時間後にALT、AST、BUN、クレアチニンは増加しなかった(図3〜図4)。マウスの25
種類のサイトカインからなるパネルを、MILLIPLEX MAPマウスサイトカイン/ケモカイン
磁性ビーズパネル - Premixed 25 Plex - 免疫学マルチプレックスアッセイ(カタログ番
号MCYTOMAG-70K-PMX、EMD Millipore Corporation社、ビレリカ、マサチューセッツ州)
を用いて評価した。25種類のサイトカインとは、顆粒球コロニー刺激因子(G-CSF)、顆
粒球マクロファージコロニー刺激因子(GM-CSF)、インターフェロンγ(IFN-γ)、イン
ターロイキン-1α(IL-1α)、インターロイキン-1β(IL-lβ)、インターロイキン-2(
IL-2)、インターロイキン-4(IL-4)、インターロイキン-5(IL-5)、インターロイキン
-6(IL-6)、インターロイキン-7(IL-7)、インターロイキン-9(IL-9)、インターロイ
キン-10(IL-10)、インターロイキン-12サブユニットp40(IL-12p40)、インターロイキ
ン-12サブユニットp70(IL-12p70)、インターロイキン-13(IL-13)、インターロイキン
-15(IL-15)、インターロイキン-17(IL-17)、インターフェロンγ誘導タンパク質-10
(IP-10)、ケラチノサイト由来サイトカイン(KC)、単球化学誘引タンパク質-1(MCP-1
)、マクロファージ炎症性タンパク質-1α(ΜΙΡ-1α)、マクロファージ炎症性タンパ
ク質-1β(MIP-1β)、マクロファージ炎症性タンパク質-2(MIP2)、ランテス(活性化
で調節され、正常 T細胞が発現・分泌する:RANTES)、腫瘍壊死因子α(TNF-α)である
。いくつかのサイトカインがこの取り扱い手続きによって上昇したが、MLP送達ペプチド
+HBV RNAiトリガーでの処理とは関係していないように見えた。
送達ペプチド+HBV RNAiトリガーを注入されたマウスでより大きく、6 mg/kgのMLP送達ペ
プチド+HBV RNAiトリガーを注入されたマウスで最大であり、正常値(170 pg/mlまで)
の上限の8倍であった。IL-6のレベルは、注入してから48時間後の3日目までに正常に戻っ
た。
ったが、この上昇はすべての処理群で同様であった。
の時点で2倍未満であった。しかし上昇は等張グルコース対照群でも見られた。
の群においてレベルが上昇した。
平均値は正常範囲に留まっていた。
十分に下の位置に留まった。
、6時間後の時点で、IL-7のレベルが正常値の上限よりも約3倍大きかった(80 pg/ml)。
は腎臓のための臨床化学マーカーは、注入前と比べて増加しなかった。いくつかのサイト
カインの上昇が投与前に観察され、少数のサイトカインが取り扱い手続きによって上昇し
たが、MLP送達ペプチド+HBV RNAiトリガーでの処理とは関係していないように見えた。
炎ウイルス(HBV)の減少
)マウスに、記載したハイドロダイナミック法で尾の静脈から注入することによりMC-HBV
1.3を一過性にトランスフェクトした。
MLP、L系))に5:1(w/w)の比で室温にて添加し、30分間インキュベートすると、MLP送
達ペプチドが得られた。4M NaOHを用いてこの反応混合物をpH 9.0に調節した。2,4,6-ト
リニトロベンゼン-スルホン酸を用いて反応の程度を調べ、95%超であると判断した。MLP
送達ペプチドを10 mM炭酸水素塩緩衝液(pH 9.0)の中でタンジェンシャルフローによっ
て精製し、そこに10%デキストラン(w/w)を添加した。精製した最終材料を凍結乾燥さ
せた。
水に再懸濁させた。次に、MLP送達ペプチドをHBV RNAiトリガー(AD01385またはAD01386
)とさまざまな用量レベルで組み合わせた。
Aiトリガーを含む生理食塩水を20 gの体重につき200μlの割合で一回だけ静脈内投与した
。
点で血清HBsAgと血清HBV DNAを測定した。ある時点での各マウスの血清中のHBsAgのレベ
ルをそのマウスにおける処理前のレベルで割り算し、「処理前レベルに規格化した」血清
中のHBsAgの比を求めた。ある時点における各群の血清中のHBV DNAのレベルもその群にお
ける処理前のレベルで割り算し、「処理前レベルに規格化した」血清中のHBV DNAの比を
求めた。次に、処理なしに関するMC-HBV1.3またはpHBV1.3の発現の低下を明らかにするた
め、ある時点における個々のマウスの「処理前に規格化した」比を同じ時点における生理
食塩水対照群の全マウスの「処理前レベルに規格化した」比の平均値で割り算し、血清中
の「処理前と対照のレベルに規格化した」HBsAgまたはHBV DNAの比を得た。
て血清分離管(Sarstedt AG&Co.社、ニュムブレヒト、ドイツ国)に入れた。血液を周囲
温度で20分間放置して凝固させた。血清分離管を8,000×gで3分間遠心分離して血清を分
離し、4℃で保管した。
パンジーにおけるB型肝炎ウイルス(HBV)ウイルスタンパク質HBsAgの低下
ンジー(生年月日1995年7月8日)である。研究の開始時にはこのチンパンジーはHBeAg陰
性かつ抗HBe陽性であり、HBV RNA力価が血清1ml当たり3.7×103コピーであった。
のガラス製バイアルの中に凍結乾燥させたMLP-(CDM-NAG)を125 mgの量で含んでいた。活
性医薬成分(API)のバイアル2は、殺菌した10 mlのガラス製バイアルの中に5.3 mlのリ
ン酸緩衝液中の液体として全RNAiトリガー1 ml当たりAD0009とAD0010の同モル混合物を26
mgの割合で含んでいた。バイアル2から4.8 mlの液体をバイアル1に添加し、かき混ぜて
溶解させた。得られた溶液は、5 mlの中の活性医薬成分に関し、1つのバイアルにつき125
mgの量を25 mg/mlの公称濃度で含んでいた。指示された用量の十分な数のバイアルを対
で用意した。2 mg/kgのMLP送達ペプチド+1 mg/kgのAD01385+1 mg/kgのAD01386を投与す
るため、リン酸緩衝液の中にAD01385とAD01386を同じモル数で含む26 mg/mlの溶液を用い
てバイアル1のMLP送達ペプチドを可溶化した。
チドとして調製)+1 mg/kgのAD0009+1 mg/kgのAD0010を、MLP送達ペプチドに関して輸
液速度10 mg/分で輸液した。HBsAgのレベルがARC-520で処理した後にベースラインに戻っ
てから、チンパンジーに2 mg/kgのMLP送達ペプチド+1 mg/kgのAD01385+1 mg/kgのAD013
86を輸液した。
中で104〜105倍に希釈した。それ以外はアッセイを上に記載したようにして実施した。
下しており、1 mg/kgのAD01385+AD01386を注入した後には81%低下していた。どちらの
場合も2 mg/kgのMLP送達ペプチドを用いた(図6)。
マウスに、ハイドロダイナミック法で尾の静脈に注射すること(Yang PL他、「ハイドロ
ダイナミック法によるウイルスDNAの注射:急性B型肝炎ウイルス感染のマウスモデル」、
PNAS USA 2002年、第99巻:13825〜13830ページ)によってMC-HBV1.3を一過性に生体トラ
ンスフェクトした。MC-HBV1.3はプラスミドに由来するミニサークルであり、HBV1.3.32ト
ランスジェニックマウスと同じ末端冗長ヒトB型肝炎ウイルス配列HBV1.3を含んでいる(G
enBank登録#V01460)(Guidotti LG他、「トランスジェニックマウスにおける高レベルの
B型肝炎ウイルス複製」、J Virol 1995年、第69巻、6158〜6169ページ)。5μgのMC-HBV1
.3を全体積がマウスの体重の10%のリンゲル溶液に入れて尾の静脈からマウスに注入し、
慢性HBV感染のpHBVモデルを作製した。この溶液の注入は、以前に報告されている(Zhang
G他、「裸のプラスミドDNAを尾の静脈から注入した後の肝細胞における高レベルの外来
遺伝子発現」、Human Gene Therapy 1999年、第10巻、1735〜1737ページ)ようにして、2
7ゲージの針を通じて5〜7秒で実施した。トランスフェクションの4週間後である-7日目、
血清中のB型肝炎表面抗原(HBsAg)の発現レベルをELISAによって測定し、マウスを平均H
BsAg発現レベルに従ってグループ分けした。
含む200μlを1回だけ皮下投与した。皮膚と筋肉の間で注入する(すなわち皮下注射の)
ための典型的な部位は、首と肩の領域の上方のたるんだ皮膚の中だが、軽く皺になってい
る他の部位も利用することができる。
、血清HBsAg、または血清HBV DNA、または肝臓HBV RNAを測定した。HBVの発現レベルは、
通常の生理食塩水を注入した対照マウスに規格化した。
回収して血清分離管(Sarstedt AG&Co.社、ニュムブレヒト、ドイツ国)に入れた。血液
を周囲温度で20分間放置して凝固させた。血清分離管を8,000×gで3分間遠心分離して血
清を分離し、4℃で保管した。
中で10〜2000倍に希釈した。無脂粉乳溶液に希釈した二次HBsAg基準を、10μgのHBsAg 発
現プラスミドpRc/CMV-HBs(Aldevron社、ファルゴ、ノースダコタ州)をトランスフェク
トされていたICRマウス(Harlan Sprague Dawley社)の血清から調製した。HBsAgのレベ
ルは、GS HBsAg EIA 3.0キット(BioRad Laboratories, Inc.社、レッドモンド、ワシン
トン州)を製造者が記載しているようにして用いて求めた。やはりPBS中の無脂粉乳に希
釈した組み換えHBsAgタンパク質aywサブタイプを一次標準として用いた(Aldevron社)。
、等張グルコースを注入した対照群のマウスに規格化した。最初に、ある時点での各マウ
スのHBsAgのレベルをそのマウスにおける処理前(-1日目)の発現レベルで割り算し、「
処理前レベルに規格化した」発現の比を求めた。次に、個々のマウスについて「処理前レ
ベルに規格化した」比を、等張グルコース対照群のすべてのマウスの平均「処理前レベル
に規格化した」比で割り算することによって特定の時点での発現を対照群に規格化した。
医薬成分(API)を定量することが必要とされる。薬製品が2つのAPIの混合物(例えばAD1
385とAD1386)であるとき、定量には分析による明確な分離が必要とされる。オリゴヌク
レオチドAPIに関しては、同じ長さのオリゴヌクレオチドの組成が似ているという理由で
分析による明確な分離は難しい。AD1385とAD1386の混合物のセンス鎖をクロマトグラフィ
で容易に分離できるようにするため、コレステロールとオリゴヌクレオチドの間に6個の
炭素(C6)を含むリンカーを一方の鎖に組み込み、トリエチレンオキシド(TEG)リンカ
ーを他方の鎖で用いた。これらリンカーは異なる疎水性を有するため、クロマトグラフィ
による分離が可能になる。RNAiトリガーのセンス鎖は、Thermo Scientific DNAPac PA-20
0カラムを用いたアニオン交換クロマトグラフィによって分離される。そのとき、(10 mM
NaHCO3(pH 11.3)/50 mM NaBr/45%ACN):(10 mM NaHC O3(pH 11.3)/650 mM Na
Br/45%ACN)の70:30混合物から100%の650 mM NaBr溶液へという勾配を用いた(図24
〜図28参照)。センス鎖のピークを分析して解像度(Rs)を求めた。解像度は、
Rs=(tR2-tR1)/((0.5×w1+w2)) (1)
として計算される。ここにtR2とtR1は2本の鎖の保持時間であり、w1とw2はベースライン
におけるピーク幅である。Rsが2よりも大きい場合にピークは分離されると考えられる。C
6リンカーとTEGリンカーの順列が異なるセンス鎖の混合物は、以下の解像度:
TEG:TEGの解像度Rs=0.44(分離されない)
C6:C6の解像度Rs=0.15(分離されない)
C6:TEGの解像度Rs=2.7(分離される)
を持つことが計算される。同じコレステロール標的化基リンカー(両方がC6、または両方
がTEG)を有するRNAiトリガーセンス鎖は分離されなかった。逆に、TEGリンカーとC6リン
カーはクロマトグラフィによってよく分離されるため、これら2つの混合物からTEGリンカ
ーとC6リンカーを有するセンス鎖の濃度を求めることができた。表24と図7〜図11に示し
た結果から、2つのHBV RNAiトリガーは、2つの異なるリンカーによって連結されていると
きによく分離されることがわかる。
感染を治療するための治療用RNAiを形成する。
Claims (32)
- B型肝炎ウイルス遺伝子の発現を抑制するための組成物であって、
a)MLP-(L-T)x(式中、
MLPはメリチン様ペプチドであり、
-L-Tは、-CO-C(CH3)=C(T)-COOHまたは-CO-C(T)=C(CH3)-COOHで表される構造を有し、ここ
で、Tは、アシアロ糖タンパク質受容体に対する親和性を持つ標的化リガンドを含み、
xは、MLPの集団の第一級アミンの数の80%超である)、
b)アンチセンス鎖とセンス鎖を含み、前記アンチセンス鎖が表1Aに提示された任意の
アンチセンス配列のヌクレオチド2〜18を含む第1のHBV RNAiトリガー、及び
c)アンチセンス鎖とセンス鎖を含み、前記アンチセンス鎖が表1Aに提示された任意の
アンチセンス配列のヌクレオチド2〜18を含む第2のHBV RNAiトリガー
とを含む、組成物。 - 前記第1のHBV RNAiトリガーが、表1Bに提示された対応する任意のセンス配列のヌクレ
オチド2〜18を含有するセンス鎖を含み、前記センス鎖は、任意に標的化基に連結され;
前記第2のHBV RNAiトリガーが、表1Bに提示された対応する任意のセンス配列のヌクレオ
チド2〜18を含有するセンス鎖を含み、前記センス鎖は、任意に標的化基に連結されてい
る、請求項1に記載の組成物。 - 前記第1のHBV RNAiトリガーが、TEG基を介してコレステリル基に共有結合したセンス鎖
を含み、前記第2のHBV RNAiトリガーが、C6基を介してコレステリル基に共有結合したセ
ンス鎖を含む、請求項1または2に記載の組成物。 - 前記第1のHBV RNAiトリガーがAD01385を含む、請求項1〜3のいずれか1項に記載の組成
物。 - 前記第2のHBV RNAiトリガーがAD01386を含む、請求項1〜4のいずれか1項に記載の組成
物。 - 前記第1のHBV RNAiトリガーがAD01385を含み、前記第2のHBV RNAiトリガーがAD01386を
含む、請求項1〜5のいずれか1項に記載の組成物。 - 前記MLPが、配列ID番号650、配列ID番号644、配列ID番号654、配列ID番号694、配列ID
番号700、配列ID番号701、配列ID番号751、又は配列ID番号755のアミノ酸配列を含む、請
求項1〜6のいずれか1項に記載の組成物。 - 前記MLPが、配列ID番号650のアミノ酸配列を含む、請求項7に記載の組成物。
- TがN-アセチルガラクトサミン(GalNAc)を含む、請求項8に記載の組成物。
- 前記第1のHBV RNAiトリガーの少なくとも1つが修飾されている、請求項1〜10のいずれ
か1項に記載の組成物。 - 前記第1のHBV RNAiトリガーのアンチセンス鎖が、表1Aに提示されたいずれかの修飾さ
れた配列のヌクレオチド配列を含む、請求項11に記載の組成物。 - 前記第1のHBV RNAiトリガーのセンス鎖が、表1Bに提示されたいずれかの修飾された配
列のヌクレオチド配列を含む、請求項11または12に記載の組成物。 - 前記第2のHBV RNAiトリガーの少なくとも1つのヌクレオチドが修飾されている、請求項
1〜13のいずれか1項に記載の組成物。 - 前記第2のHBV RNAiトリガーのアンチセンス鎖が、表1Aに提示されたいずれかの修飾さ
れた配列のヌクレオチド配列を含む、請求項14に記載の組成物。 - 前記第1のHBV RNAiトリガーのセンス鎖が、表1Bに提示されたいずれかの修飾された配
列のヌクレオチド配列を含む、請求項14または15に記載の組成物。 - 前記MLPが、前記HBV RNAiトリガーとは別のバイアルで提供される、請求項1〜16のいず
れか1項に記載の組成物。 - 医薬として許容可能な賦形剤をさらに含む、請求項1〜17のいずれか1項に記載の組成物
。 - 医薬として許容可能な前記賦形剤がデキストランを含む、請求項18に記載の組成物。
- 前記MLP、および/または前記第1のHBV RNAiトリガー、および/または前記第2のHBV R
NAiトリガーが凍結乾燥されている、請求項1〜19のいずれか1項に記載の組成物。 - a)アンチセンス鎖とセンス鎖を含み、前記アンチセンス鎖が、表1Aに提示された任意
のアンチセンス配列のヌクレオチド2〜18を含み、前記センス鎖が、表1Bに提示された対
応する任意のセンス配列を含む第1のHBV RNAiトリガーと、
b)アンチセンス鎖とセンス鎖を含み、前記アンチセンス鎖が、表1Aに提示された任意
のアンチセンス配列のヌクレオチド2〜18を含み、前記センス鎖が、表1Bに提示された対
応する任意のセンス配列を含む第2のHBV RNAiトリガー
とを含む組成物。 - 前記第1のHBV RNAiトリガーが、TEG基を通じてコレステリル基に共有結合したセンス鎖
を含み、前記第2のHBV RNAiトリガーが、C6基を通じてコレステリル基に共有結合したセ
ンス鎖を含む、請求項21に記載の組成物。 - アンチセンス鎖とセンス鎖を含み、前記アンチセンス鎖が、表1Aに提示された任意の修
飾されたアンチセンス配列のヌクレオチド2〜18を含むHBV RNAiトリガーを含む組成物。 - 前記センス鎖が、表1Bに提示された対応する任意の修飾されたセンス配列を含む、請求
項23に記載の組成物。 - 前記センス鎖がガラクトース三量体に共役している、請求項23または24に記載の組成物
。 - 1つ以上の追加の治療薬をさらに含む、請求項1〜25のいずれか1項に記載の組成物。
- 患者においてB型肝炎ウイルス遺伝子の発現を抑制する方法であって、請求項1〜26のい
ずれか1項に記載の組成物を前記患者に投与することを含む方法。 - 前記MLP-(L-T)x、前記第1のHBV RNAiトリガー、前記第2のHBV RNAiトリガーを連続的に
投与する、請求項27に記載の方法。 - 前記第1のHBV RNAiトリガーと前記第2のHBV RNAiトリガーは一括して投与し、前記MLP-
(L-T)xは連続的に投与する、請求項27に記載の方法。 - HBV感染を治療する方法であって、その治療を必要とする患者に請求項1〜26のいずれか
1項に記載の組成物の有効量を投与することを含む方法。 - HBV感染を治療するための、請求項1〜26のいずれか1項に記載の組成物の利用。
- HBV感染を治療するための薬を製造するための、請求項1〜26のいずれか1項に記載の組
成物の利用。
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