JP2021118695A - 自動化ネステッドリコンビナーゼポリメラーゼ増幅 - Google Patents
自動化ネステッドリコンビナーゼポリメラーゼ増幅 Download PDFInfo
- Publication number
- JP2021118695A JP2021118695A JP2021064771A JP2021064771A JP2021118695A JP 2021118695 A JP2021118695 A JP 2021118695A JP 2021064771 A JP2021064771 A JP 2021064771A JP 2021064771 A JP2021064771 A JP 2021064771A JP 2021118695 A JP2021118695 A JP 2021118695A
- Authority
- JP
- Japan
- Prior art keywords
- nucleic acid
- reaction chamber
- sample
- amplification
- acid amplification
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Pending
Links
- 238000003199 nucleic acid amplification method Methods 0.000 title claims abstract description 275
- 230000003321 amplification Effects 0.000 title claims abstract description 274
- 102000018120 Recombinases Human genes 0.000 title claims abstract description 22
- 108010091086 Recombinases Proteins 0.000 title claims abstract description 22
- 150000007523 nucleic acids Chemical class 0.000 claims abstract description 189
- 102000039446 nucleic acids Human genes 0.000 claims abstract description 176
- 108020004707 nucleic acids Proteins 0.000 claims abstract description 176
- 238000006243 chemical reaction Methods 0.000 claims abstract description 134
- 238000001514 detection method Methods 0.000 claims abstract description 103
- 239000012530 fluid Substances 0.000 claims abstract description 27
- 239000003153 chemical reaction reagent Substances 0.000 claims description 103
- 238000000034 method Methods 0.000 claims description 59
- 102000040430 polynucleotide Human genes 0.000 claims description 42
- 108091033319 polynucleotide Proteins 0.000 claims description 42
- 239000002157 polynucleotide Substances 0.000 claims description 42
- 108020004414 DNA Proteins 0.000 claims description 39
- 239000007788 liquid Substances 0.000 claims description 35
- 208000037797 influenza A Diseases 0.000 claims description 30
- 102000053602 DNA Human genes 0.000 claims description 29
- 238000002156 mixing Methods 0.000 claims description 22
- 230000003287 optical effect Effects 0.000 claims description 20
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 claims description 18
- 208000037798 influenza B Diseases 0.000 claims description 17
- 244000037640 animal pathogen Species 0.000 claims description 16
- 239000000203 mixture Substances 0.000 claims description 16
- 101710163270 Nuclease Proteins 0.000 claims description 15
- 108020004682 Single-Stranded DNA Proteins 0.000 claims description 11
- 239000011777 magnesium Substances 0.000 claims description 11
- 241001465754 Metazoa Species 0.000 claims description 10
- 241000700605 Viruses Species 0.000 claims description 10
- ZHNUHDYFZUAESO-UHFFFAOYSA-N Formamide Chemical group NC=O ZHNUHDYFZUAESO-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 8
- 108020005202 Viral DNA Proteins 0.000 claims description 8
- 241000712431 Influenza A virus Species 0.000 claims description 7
- 241000713196 Influenza B virus Species 0.000 claims description 7
- 239000000376 reactant Substances 0.000 claims description 5
- 108091032973 (ribonucleotides)n+m Proteins 0.000 claims description 4
- 101150076489 B gene Proteins 0.000 claims description 4
- 241000894006 Bacteria Species 0.000 claims description 4
- FYYHWMGAXLPEAU-UHFFFAOYSA-N Magnesium Chemical compound [Mg] FYYHWMGAXLPEAU-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 4
- 108020005196 Mitochondrial DNA Proteins 0.000 claims description 4
- 108091034117 Oligonucleotide Proteins 0.000 claims description 4
- 206010036790 Productive cough Diseases 0.000 claims description 4
- 108020000999 Viral RNA Proteins 0.000 claims description 4
- 239000008280 blood Substances 0.000 claims description 4
- 210000004369 blood Anatomy 0.000 claims description 4
- 239000003054 catalyst Substances 0.000 claims description 4
- 239000002299 complementary DNA Substances 0.000 claims description 4
- 241001493065 dsRNA viruses Species 0.000 claims description 4
- 229910052749 magnesium Inorganic materials 0.000 claims description 4
- 210000003097 mucus Anatomy 0.000 claims description 4
- 239000013612 plasmid Substances 0.000 claims description 4
- 210000003296 saliva Anatomy 0.000 claims description 4
- 210000003802 sputum Anatomy 0.000 claims description 4
- 208000024794 sputum Diseases 0.000 claims description 4
- 210000001138 tear Anatomy 0.000 claims description 4
- 210000002700 urine Anatomy 0.000 claims description 4
- KJTLSVCANCCWHF-UHFFFAOYSA-N Ruthenium Chemical compound [Ru] KJTLSVCANCCWHF-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 2
- 150000004056 anthraquinones Chemical class 0.000 claims description 2
- 238000005286 illumination Methods 0.000 claims description 2
- 229910052762 osmium Inorganic materials 0.000 claims description 2
- SYQBFIAQOQZEGI-UHFFFAOYSA-N osmium atom Chemical compound [Os] SYQBFIAQOQZEGI-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 2
- 229910052707 ruthenium Inorganic materials 0.000 claims description 2
- WJFKNYWRSNBZNX-UHFFFAOYSA-N 10H-phenothiazine Chemical compound C1=CC=C2NC3=CC=CC=C3SC2=C1 WJFKNYWRSNBZNX-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 2
- 229950000688 phenothiazine Drugs 0.000 claims 2
- VEPOHXYIFQMVHW-XOZOLZJESA-N 2,3-dihydroxybutanedioic acid (2S,3S)-3,4-dimethyl-2-phenylmorpholine Chemical compound OC(C(O)C(O)=O)C(O)=O.C[C@H]1[C@@H](OCCN1C)c1ccccc1 VEPOHXYIFQMVHW-XOZOLZJESA-N 0.000 claims 1
- PCNDJXKNXGMECE-UHFFFAOYSA-N Phenazine Natural products C1=CC=CC2=NC3=CC=CC=C3N=C21 PCNDJXKNXGMECE-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 1
- PYKYMHQGRFAEBM-UHFFFAOYSA-N anthraquinone Natural products CCC(=O)c1c(O)c2C(=O)C3C(C=CC=C3O)C(=O)c2cc1CC(=O)OC PYKYMHQGRFAEBM-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 1
- -1 ferricianide Chemical compound 0.000 claims 1
- KTWOOEGAPBSYNW-UHFFFAOYSA-N ferrocene Chemical compound [Fe+2].C=1C=C[CH-]C=1.C=1C=C[CH-]C=1 KTWOOEGAPBSYNW-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 1
- 108091069025 single-strand RNA Proteins 0.000 claims 1
- 239000000523 sample Substances 0.000 description 181
- 238000012546 transfer Methods 0.000 description 71
- 239000000047 product Substances 0.000 description 51
- 239000013615 primer Substances 0.000 description 42
- 239000007787 solid Substances 0.000 description 17
- 239000011541 reaction mixture Substances 0.000 description 15
- 108091028043 Nucleic acid sequence Proteins 0.000 description 13
- 239000002609 medium Substances 0.000 description 13
- 235000018102 proteins Nutrition 0.000 description 13
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 description 13
- 238000005259 measurement Methods 0.000 description 11
- 238000003556 assay Methods 0.000 description 9
- 230000014759 maintenance of location Effects 0.000 description 9
- 241000894007 species Species 0.000 description 9
- 230000005284 excitation Effects 0.000 description 8
- 108010014303 DNA-directed DNA polymerase Proteins 0.000 description 7
- 102000016928 DNA-directed DNA polymerase Human genes 0.000 description 7
- 239000007795 chemical reaction product Substances 0.000 description 7
- 239000012634 fragment Substances 0.000 description 7
- UEGPKNKPLBYCNK-UHFFFAOYSA-L magnesium acetate Chemical compound [Mg+2].CC([O-])=O.CC([O-])=O UEGPKNKPLBYCNK-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 7
- 229940069446 magnesium acetate Drugs 0.000 description 7
- 235000011285 magnesium acetate Nutrition 0.000 description 7
- 239000011654 magnesium acetate Substances 0.000 description 7
- 239000002987 primer (paints) Substances 0.000 description 7
- 102000052510 DNA-Binding Proteins Human genes 0.000 description 6
- 238000003776 cleavage reaction Methods 0.000 description 6
- 230000008569 process Effects 0.000 description 6
- 230000007017 scission Effects 0.000 description 6
- 108700020911 DNA-Binding Proteins Proteins 0.000 description 5
- 239000002202 Polyethylene glycol Substances 0.000 description 5
- 102000001218 Rec A Recombinases Human genes 0.000 description 5
- 108010055016 Rec A Recombinases Proteins 0.000 description 5
- 239000007853 buffer solution Substances 0.000 description 5
- 238000006703 hydration reaction Methods 0.000 description 5
- 239000008188 pellet Substances 0.000 description 5
- 229920001223 polyethylene glycol Polymers 0.000 description 5
- 108700014590 single-stranded DNA binding proteins Proteins 0.000 description 5
- 241000023635 Aeromonas virus 65 Species 0.000 description 4
- 241000317507 Aeromonas virus Aeh1 Species 0.000 description 4
- OKTJSMMVPCPJKN-UHFFFAOYSA-N Carbon Chemical compound [C] OKTJSMMVPCPJKN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 241000673307 Enterobacteria phage LZ2 Species 0.000 description 4
- 241000588724 Escherichia coli Species 0.000 description 4
- 241000120979 Prochlorococcus phage P-SSM2 Species 0.000 description 4
- 241000210655 Vibrio phage nt-1 Species 0.000 description 4
- 229910052799 carbon Inorganic materials 0.000 description 4
- 239000003795 chemical substances by application Substances 0.000 description 4
- 230000000295 complement effect Effects 0.000 description 4
- 206010022000 influenza Diseases 0.000 description 4
- 238000003780 insertion Methods 0.000 description 4
- 230000037431 insertion Effects 0.000 description 4
- 230000003278 mimic effect Effects 0.000 description 4
- 230000035772 mutation Effects 0.000 description 4
- 125000006850 spacer group Chemical group 0.000 description 4
- 241000499087 Acinetobacter virus 133 Species 0.000 description 3
- 241000632298 Aeromonas virus 25 Species 0.000 description 3
- 108060002716 Exonuclease Proteins 0.000 description 3
- BQCADISMDOOEFD-UHFFFAOYSA-N Silver Chemical compound [Ag] BQCADISMDOOEFD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 150000001875 compounds Chemical class 0.000 description 3
- 239000004020 conductor Substances 0.000 description 3
- 230000000694 effects Effects 0.000 description 3
- 238000000835 electrochemical detection Methods 0.000 description 3
- 102000013165 exonuclease Human genes 0.000 description 3
- 239000011888 foil Substances 0.000 description 3
- 239000013642 negative control Substances 0.000 description 3
- 230000003647 oxidation Effects 0.000 description 3
- 238000007254 oxidation reaction Methods 0.000 description 3
- 229910052709 silver Inorganic materials 0.000 description 3
- 239000004332 silver Substances 0.000 description 3
- 230000003612 virological effect Effects 0.000 description 3
- 108091093088 Amplicon Proteins 0.000 description 2
- 229920000742 Cotton Polymers 0.000 description 2
- 229920002307 Dextran Polymers 0.000 description 2
- 102000004190 Enzymes Human genes 0.000 description 2
- 108090000790 Enzymes Proteins 0.000 description 2
- 101900234631 Escherichia coli DNA polymerase I Proteins 0.000 description 2
- 229920001917 Ficoll Polymers 0.000 description 2
- WHNWPMSKXPGLAX-UHFFFAOYSA-N N-Vinyl-2-pyrrolidone Chemical compound C=CN1CCCC1=O WHNWPMSKXPGLAX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 102000007999 Nuclear Proteins Human genes 0.000 description 2
- 108010089610 Nuclear Proteins Proteins 0.000 description 2
- 229920002538 Polyethylene Glycol 20000 Polymers 0.000 description 2
- 239000004372 Polyvinyl alcohol Substances 0.000 description 2
- 238000011529 RT qPCR Methods 0.000 description 2
- 102000002490 Rad51 Recombinase Human genes 0.000 description 2
- 108010068097 Rad51 Recombinase Proteins 0.000 description 2
- MTCFGRXMJLQNBG-UHFFFAOYSA-N Serine Natural products OCC(N)C(O)=O MTCFGRXMJLQNBG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 241000688788 Synechococcus phage S-PM2 Species 0.000 description 2
- 125000003275 alpha amino acid group Chemical group 0.000 description 2
- 235000001014 amino acid Nutrition 0.000 description 2
- CKLJMWTZIZZHCS-REOHCLBHSA-N aspartic acid group Chemical group N[C@@H](CC(=O)O)C(=O)O CKLJMWTZIZZHCS-REOHCLBHSA-N 0.000 description 2
- 230000008901 benefit Effects 0.000 description 2
- 230000027455 binding Effects 0.000 description 2
- 230000015572 biosynthetic process Effects 0.000 description 2
- 210000001124 body fluid Anatomy 0.000 description 2
- 239000010839 body fluid Substances 0.000 description 2
- 239000000872 buffer Substances 0.000 description 2
- 239000007850 fluorescent dye Substances 0.000 description 2
- WHUUTDBJXJRKMK-VKHMYHEASA-L glutamate group Chemical group N[C@@H](CCC(=O)[O-])C(=O)[O-] WHUUTDBJXJRKMK-VKHMYHEASA-L 0.000 description 2
- HNDVDQJCIGZPNO-UHFFFAOYSA-N histidine Natural products OC(=O)C(N)CC1=CN=CN1 HNDVDQJCIGZPNO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 230000000887 hydrating effect Effects 0.000 description 2
- 238000002372 labelling Methods 0.000 description 2
- 239000000463 material Substances 0.000 description 2
- 229920002113 octoxynol Polymers 0.000 description 2
- 230000037361 pathway Effects 0.000 description 2
- 230000002572 peristaltic effect Effects 0.000 description 2
- 229920002451 polyvinyl alcohol Polymers 0.000 description 2
- 238000005086 pumping Methods 0.000 description 2
- 230000009467 reduction Effects 0.000 description 2
- 230000000717 retained effect Effects 0.000 description 2
- 239000000126 substance Substances 0.000 description 2
- 238000006467 substitution reaction Methods 0.000 description 2
- 241000607534 Aeromonas Species 0.000 description 1
- 102100027211 Albumin Human genes 0.000 description 1
- 108010088751 Albumins Proteins 0.000 description 1
- 241000193830 Bacillus <bacterium> Species 0.000 description 1
- 241001453380 Burkholderia Species 0.000 description 1
- 101000909256 Caldicellulosiruptor bescii (strain ATCC BAA-1888 / DSM 6725 / Z-1320) DNA polymerase I Proteins 0.000 description 1
- 108010017826 DNA Polymerase I Proteins 0.000 description 1
- 102000004594 DNA Polymerase I Human genes 0.000 description 1
- 239000003155 DNA primer Substances 0.000 description 1
- 102100033934 DNA repair protein RAD51 homolog 2 Human genes 0.000 description 1
- 102100034484 DNA repair protein RAD51 homolog 3 Human genes 0.000 description 1
- 102100034483 DNA repair protein RAD51 homolog 4 Human genes 0.000 description 1
- 102100027830 DNA repair protein XRCC2 Human genes 0.000 description 1
- 102100027829 DNA repair protein XRCC3 Human genes 0.000 description 1
- 230000004543 DNA replication Effects 0.000 description 1
- 230000006820 DNA synthesis Effects 0.000 description 1
- 108010063362 DNA-(Apurinic or Apyrimidinic Site) Lyase Proteins 0.000 description 1
- 102100035619 DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase Human genes 0.000 description 1
- 101710116602 DNA-Binding protein G5P Proteins 0.000 description 1
- 230000004568 DNA-binding Effects 0.000 description 1
- 241000196324 Embryophyta Species 0.000 description 1
- 102100031780 Endonuclease Human genes 0.000 description 1
- 108010042407 Endonucleases Proteins 0.000 description 1
- 101000939283 Escherichia coli (strain K12) Protein UmuC Proteins 0.000 description 1
- 101000939288 Escherichia coli (strain K12) Protein UmuD Proteins 0.000 description 1
- 101900044441 Escherichia coli DNA polymerase II Proteins 0.000 description 1
- 101900044337 Escherichia coli DNA polymerase IV Proteins 0.000 description 1
- 101000587453 Escherichia coli Plasmid-derived single-stranded DNA-binding protein Proteins 0.000 description 1
- 101000587458 Escherichia coli Plasmid-derived single-stranded DNA-binding protein Proteins 0.000 description 1
- 101000700922 Escherichia coli Plasmid-derived single-stranded DNA-binding protein Proteins 0.000 description 1
- 101000826084 Escherichia coli Plasmid-derived single-stranded DNA-binding protein Proteins 0.000 description 1
- 101000906736 Escherichia phage Mu DNA circularization protein N Proteins 0.000 description 1
- 241000233866 Fungi Species 0.000 description 1
- 241000193385 Geobacillus stearothermophilus Species 0.000 description 1
- 241000282412 Homo Species 0.000 description 1
- 101001132271 Homo sapiens DNA repair protein RAD51 homolog 3 Proteins 0.000 description 1
- 101001132266 Homo sapiens DNA repair protein RAD51 homolog 4 Proteins 0.000 description 1
- 101000649306 Homo sapiens DNA repair protein XRCC2 Proteins 0.000 description 1
- 101000949825 Homo sapiens Meiotic recombination protein DMC1/LIM15 homolog Proteins 0.000 description 1
- 101001046894 Homo sapiens Protein HID1 Proteins 0.000 description 1
- 208000026350 Inborn Genetic disease Diseases 0.000 description 1
- 241000124008 Mammalia Species 0.000 description 1
- 102100035285 Meiotic recombination protein DMC1/LIM15 homolog Human genes 0.000 description 1
- 208000024556 Mendelian disease Diseases 0.000 description 1
- 102000008300 Mutant Proteins Human genes 0.000 description 1
- 108010021466 Mutant Proteins Proteins 0.000 description 1
- 102000011931 Nucleoproteins Human genes 0.000 description 1
- 108010061100 Nucleoproteins Proteins 0.000 description 1
- 108020005187 Oligonucleotide Probes Proteins 0.000 description 1
- 240000007594 Oryza sativa Species 0.000 description 1
- 235000007164 Oryza sativa Nutrition 0.000 description 1
- 229920003171 Poly (ethylene oxide) Polymers 0.000 description 1
- 229920002534 Polyethylene Glycol 1450 Polymers 0.000 description 1
- 229920002560 Polyethylene Glycol 3000 Polymers 0.000 description 1
- 229920002594 Polyethylene Glycol 8000 Polymers 0.000 description 1
- 239000004793 Polystyrene Substances 0.000 description 1
- 101000902592 Pyrococcus furiosus (strain ATCC 43587 / DSM 3638 / JCM 8422 / Vc1) DNA polymerase Proteins 0.000 description 1
- 101710018890 RAD51B Proteins 0.000 description 1
- 102000018780 Replication Protein A Human genes 0.000 description 1
- 108010027643 Replication Protein A Proteins 0.000 description 1
- 101710162453 Replication factor A Proteins 0.000 description 1
- 101710176758 Replication protein A 70 kDa DNA-binding subunit Proteins 0.000 description 1
- 101710176276 SSB protein Proteins 0.000 description 1
- 101710082933 Single-strand DNA-binding protein Proteins 0.000 description 1
- 101710126859 Single-stranded DNA-binding protein Proteins 0.000 description 1
- 101000764570 Streptomyces phage phiC31 Probable tape measure protein Proteins 0.000 description 1
- 101100117496 Sulfurisphaera ohwakuensis pol-alpha gene Proteins 0.000 description 1
- 108010074310 X-ray repair cross complementing protein 3 Proteins 0.000 description 1
- 238000010521 absorption reaction Methods 0.000 description 1
- 238000009825 accumulation Methods 0.000 description 1
- 239000002253 acid Substances 0.000 description 1
- 150000001412 amines Chemical class 0.000 description 1
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 description 1
- 108700028529 archaeal RadA Proteins 0.000 description 1
- 238000000149 argon plasma sintering Methods 0.000 description 1
- 238000005452 bending Methods 0.000 description 1
- 230000033228 biological regulation Effects 0.000 description 1
- 108091092356 cellular DNA Proteins 0.000 description 1
- 230000008859 change Effects 0.000 description 1
- 230000000052 comparative effect Effects 0.000 description 1
- MTHSVFCYNBDYFN-UHFFFAOYSA-N diethylene glycol Chemical compound OCCOCCO MTHSVFCYNBDYFN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000001903 differential pulse voltammetry Methods 0.000 description 1
- 238000002848 electrochemical method Methods 0.000 description 1
- 230000005518 electrochemistry Effects 0.000 description 1
- 238000011156 evaluation Methods 0.000 description 1
- 108010052305 exodeoxyribonuclease III Proteins 0.000 description 1
- 238000002474 experimental method Methods 0.000 description 1
- 230000036541 health Effects 0.000 description 1
- 208000015181 infectious disease Diseases 0.000 description 1
- 230000000977 initiatory effect Effects 0.000 description 1
- 230000000873 masking effect Effects 0.000 description 1
- 238000001823 molecular biology technique Methods 0.000 description 1
- 239000002773 nucleotide Substances 0.000 description 1
- 125000003729 nucleotide group Chemical group 0.000 description 1
- 239000002751 oligonucleotide probe Substances 0.000 description 1
- 244000052769 pathogen Species 0.000 description 1
- 239000013610 patient sample Substances 0.000 description 1
- 125000001791 phenazinyl group Chemical class C1(=CC=CC2=NC3=CC=CC=C3N=C12)* 0.000 description 1
- 125000001484 phenothiazinyl group Chemical class C1(=CC=CC=2SC3=CC=CC=C3NC12)* 0.000 description 1
- 125000001644 phenoxazinyl group Chemical class C1(=CC=CC=2OC3=CC=CC=C3NC12)* 0.000 description 1
- 238000012123 point-of-care testing Methods 0.000 description 1
- 229920002223 polystyrene Polymers 0.000 description 1
- 229920000036 polyvinylpyrrolidone Polymers 0.000 description 1
- 239000001267 polyvinylpyrrolidone Substances 0.000 description 1
- 235000013855 polyvinylpyrrolidone Nutrition 0.000 description 1
- 239000013641 positive control Substances 0.000 description 1
- 238000007639 printing Methods 0.000 description 1
- 238000012545 processing Methods 0.000 description 1
- 230000002250 progressing effect Effects 0.000 description 1
- 238000010791 quenching Methods 0.000 description 1
- 230000000171 quenching effect Effects 0.000 description 1
- 101710197907 rDNA transcriptional regulator pol5 Proteins 0.000 description 1
- 230000035484 reaction time Effects 0.000 description 1
- 101150079601 recA gene Proteins 0.000 description 1
- 230000008263 repair mechanism Effects 0.000 description 1
- 230000008439 repair process Effects 0.000 description 1
- 235000009566 rice Nutrition 0.000 description 1
- 238000007650 screen-printing Methods 0.000 description 1
- 238000007789 sealing Methods 0.000 description 1
- 230000035945 sensitivity Effects 0.000 description 1
- 125000003607 serino group Chemical group [H]N([H])[C@]([H])(C(=O)[*])C(O[H])([H])[H] 0.000 description 1
- 230000000087 stabilizing effect Effects 0.000 description 1
- 230000001225 therapeutic effect Effects 0.000 description 1
- 239000006163 transport media Substances 0.000 description 1
- 241000712461 unidentified influenza virus Species 0.000 description 1
Images
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6844—Nucleic acid amplification reactions
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/70—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving virus or bacteriophage
- C12Q1/701—Specific hybridization probes
-
- B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
- B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
- B01L—CHEMICAL OR PHYSICAL LABORATORY APPARATUS FOR GENERAL USE
- B01L3/00—Containers or dishes for laboratory use, e.g. laboratory glassware; Droppers
- B01L3/50—Containers for the purpose of retaining a material to be analysed, e.g. test tubes
- B01L3/502—Containers for the purpose of retaining a material to be analysed, e.g. test tubes with fluid transport, e.g. in multi-compartment structures
- B01L3/5027—Containers for the purpose of retaining a material to be analysed, e.g. test tubes with fluid transport, e.g. in multi-compartment structures by integrated microfluidic structures, i.e. dimensions of channels and chambers are such that surface tension forces are important, e.g. lab-on-a-chip
- B01L3/502715—Containers for the purpose of retaining a material to be analysed, e.g. test tubes with fluid transport, e.g. in multi-compartment structures by integrated microfluidic structures, i.e. dimensions of channels and chambers are such that surface tension forces are important, e.g. lab-on-a-chip characterised by interfacing components, e.g. fluidic, electrical, optical or mechanical interfaces
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6806—Preparing nucleic acids for analysis, e.g. for polymerase chain reaction [PCR] assay
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6844—Nucleic acid amplification reactions
- C12Q1/686—Polymerase chain reaction [PCR]
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6876—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
- C12Q1/6888—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for detection or identification of organisms
- C12Q1/689—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for detection or identification of organisms for bacteria
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/70—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving virus or bacteriophage
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N27/00—Investigating or analysing materials by the use of electric, electrochemical, or magnetic means
- G01N27/26—Investigating or analysing materials by the use of electric, electrochemical, or magnetic means by investigating electrochemical variables; by using electrolysis or electrophoresis
- G01N27/416—Systems
-
- B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
- B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
- B01L—CHEMICAL OR PHYSICAL LABORATORY APPARATUS FOR GENERAL USE
- B01L2200/00—Solutions for specific problems relating to chemical or physical laboratory apparatus
- B01L2200/04—Exchange or ejection of cartridges, containers or reservoirs
-
- B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
- B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
- B01L—CHEMICAL OR PHYSICAL LABORATORY APPARATUS FOR GENERAL USE
- B01L2200/00—Solutions for specific problems relating to chemical or physical laboratory apparatus
- B01L2200/10—Integrating sample preparation and analysis in single entity, e.g. lab-on-a-chip concept
-
- B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
- B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
- B01L—CHEMICAL OR PHYSICAL LABORATORY APPARATUS FOR GENERAL USE
- B01L2200/00—Solutions for specific problems relating to chemical or physical laboratory apparatus
- B01L2200/16—Reagents, handling or storing thereof
-
- B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
- B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
- B01L—CHEMICAL OR PHYSICAL LABORATORY APPARATUS FOR GENERAL USE
- B01L2300/00—Additional constructional details
- B01L2300/04—Closures and closing means
- B01L2300/041—Connecting closures to device or container
- B01L2300/043—Hinged closures
-
- B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
- B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
- B01L—CHEMICAL OR PHYSICAL LABORATORY APPARATUS FOR GENERAL USE
- B01L2300/00—Additional constructional details
- B01L2300/06—Auxiliary integrated devices, integrated components
- B01L2300/0627—Sensor or part of a sensor is integrated
- B01L2300/0645—Electrodes
-
- B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
- B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
- B01L—CHEMICAL OR PHYSICAL LABORATORY APPARATUS FOR GENERAL USE
- B01L2300/00—Additional constructional details
- B01L2300/06—Auxiliary integrated devices, integrated components
- B01L2300/0627—Sensor or part of a sensor is integrated
- B01L2300/0654—Lenses; Optical fibres
-
- B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
- B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
- B01L—CHEMICAL OR PHYSICAL LABORATORY APPARATUS FOR GENERAL USE
- B01L2300/00—Additional constructional details
- B01L2300/08—Geometry, shape and general structure
- B01L2300/0809—Geometry, shape and general structure rectangular shaped
- B01L2300/0816—Cards, e.g. flat sample carriers usually with flow in two horizontal directions
-
- B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
- B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
- B01L—CHEMICAL OR PHYSICAL LABORATORY APPARATUS FOR GENERAL USE
- B01L2300/00—Additional constructional details
- B01L2300/08—Geometry, shape and general structure
- B01L2300/0861—Configuration of multiple channels and/or chambers in a single devices
- B01L2300/0864—Configuration of multiple channels and/or chambers in a single devices comprising only one inlet and multiple receiving wells, e.g. for separation, splitting
-
- B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
- B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
- B01L—CHEMICAL OR PHYSICAL LABORATORY APPARATUS FOR GENERAL USE
- B01L2300/00—Additional constructional details
- B01L2300/08—Geometry, shape and general structure
- B01L2300/0887—Laminated structure
-
- B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
- B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
- B01L—CHEMICAL OR PHYSICAL LABORATORY APPARATUS FOR GENERAL USE
- B01L3/00—Containers or dishes for laboratory use, e.g. laboratory glassware; Droppers
- B01L3/50—Containers for the purpose of retaining a material to be analysed, e.g. test tubes
- B01L3/502—Containers for the purpose of retaining a material to be analysed, e.g. test tubes with fluid transport, e.g. in multi-compartment structures
- B01L3/5027—Containers for the purpose of retaining a material to be analysed, e.g. test tubes with fluid transport, e.g. in multi-compartment structures by integrated microfluidic structures, i.e. dimensions of channels and chambers are such that surface tension forces are important, e.g. lab-on-a-chip
-
- B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
- B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
- B01L—CHEMICAL OR PHYSICAL LABORATORY APPARATUS FOR GENERAL USE
- B01L7/00—Heating or cooling apparatus; Heat insulating devices
- B01L7/52—Heating or cooling apparatus; Heat insulating devices with provision for submitting samples to a predetermined sequence of different temperatures, e.g. for treating nucleic acid samples
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q2521/00—Reaction characterised by the enzymatic activity
- C12Q2521/50—Other enzymatic activities
- C12Q2521/507—Recombinase
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q2549/00—Reactions characterised by the features used to influence the efficiency or specificity
- C12Q2549/10—Reactions characterised by the features used to influence the efficiency or specificity the purpose being that of reducing false positive or false negative signals
- C12Q2549/119—Reactions characterised by the features used to influence the efficiency or specificity the purpose being that of reducing false positive or false negative signals using nested primers
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q2565/00—Nucleic acid analysis characterised by mode or means of detection
- C12Q2565/60—Detection means characterised by use of a special device
- C12Q2565/629—Detection means characterised by use of a special device being a microfluidic device
Landscapes
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Zoology (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Analytical Chemistry (AREA)
- Immunology (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
- Virology (AREA)
- Pathology (AREA)
- Electrochemistry (AREA)
- General Physics & Mathematics (AREA)
- Clinical Laboratory Science (AREA)
- Hematology (AREA)
- Dispersion Chemistry (AREA)
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
- Apparatus Associated With Microorganisms And Enzymes (AREA)
- Automatic Analysis And Handling Materials Therefor (AREA)
- Enzymes And Modification Thereof (AREA)
Abstract
Description
本出願は、2016年3月4日に出願された米国特許出願第62/303、934号、名称「自動化ネステッドリコンビナーゼポリメラーゼ増幅」の優先権を主張し、その全体が参照により本明細書に組み込まれる。
本発明は米国保健福祉省によって認可されたHHSO100201400011Cの下で政府支援がなされた。政府は本発明に特定の権利を有する。
本発明はインフルエンザアッセイシステム、特に、サンプルモジュール、マイクロ流体核酸増幅デバイス、および分析装置を含み、サンプルモジュールを介して核酸増幅デバイスに送達されるサンプルにおける全自動ネステッドリコンビナーゼポリメラーゼ増幅(RPA)を促進するシステムに関する。
ポリヌクレオチド配列の微量検出は、病原体および遺伝性疾患の検出において重要な役割を担うでき、特定の感染または遺伝子型に対して適応する治療処方計画を立てるのに役立つ。特定の等温核酸増幅法は、標的ポリヌクレオチド配列を微量から非常に高い検出可能な量まで短時間で増幅することができる。このような等温法、例えば、リコンビナーゼポリメラーゼ増幅(RPA)、またはニッキングおよび伸長増幅反応(NEAR)は、使用者が微量の特定配列を検出することができるようにし、ポイントオブケア検査を促進し、診断の利用し易さおよび速さを高める。
例1:ネステッドRPA増幅
図19A〜19Dは本明細書で説明されるマイクロ流体カードでネステッドRPAを実施する方法を用いて行われた分析結果を示す。結果は異なる既知標的を有するサンプル間を区別するネステッドRPAアッセイの能力を示す。サンプルはインフルエンザ陽性およびインフルエンザ陰性サンプル材料の供給業者から得た。一連の測定を全90例のサンプルを用いて実施し、30例のサンプルはインフルエンザA(InfA)が陽性であることが分かっており、10例のサンプルはインフルエンザB(InfB)が陽性であることが分かっており、50例のサンプルはインフルエンザAまたはBが含まれないこと(陰性)が分かっていた。各サンプルを単一のアッセイデバイスに加え、測定をアッセイカードの4つの検出チャンバーのそれぞれから得た。
InfA[PA]第一増幅プライマー
>FluAPAR111
TGCATGTGTGAGGAAGGAGTTGAACCAAG*A (SEQ ID NO.1)
>FluAPAF523
AAATTGCTTCTCATTGTTCAGGCACTTAGGG*A(SEQ ID NO.2)
InfA[PB2]第一増幅プライマー
>FluAPB2F201
GAACTGAGTAACCTTGCAAARGGGGAAAAGG*C (SEQ ID NO.3)
>FluAPB2F218
GAACTGAGTAACCTTGCAAAAGGGGAAAAAG*C(SEQ ID NO.4)
>FluAPB2R103
AYTAATTGATGGCCATCCGAATTCTTTTGGTCGCT*G (SEQ ID NO.5)
InfB[PA]第一増幅プライマー
>FluBPAF44
AAGGATTGGCTGATGATTACTTTTGGAAAAAGAAA*G(SEQ ID NO.6)
>FluBPAR42
TAATTCAGCCTGAAGTTCTGTGAGTCTGCTTAG*C (SEQ ID NO.7)
Xcon第一増幅プライマー
>XConF7
AATCATGAACCTCATGGCATCTTCCCTCGCCGC*C(SEQ ID NO.8)
>XConR6
ACAATGCAATCATATGCTTCTGCTATGTTAAGC*G(SEQ ID NO.9)
InfA[PA]第二増幅プライマー
>FLUPAF507ii
AACCTGGGACCTTTGATCTTGGGGGGCTATAT*G(SEQ ID NO.10)
>FLUAPAR106ii
ATGTGTTAGGAAGGAGTTGAACCAAGAAGCAT*T(SEQ ID NO.11)
InfA[PA]Exoプローブ
>FluAPAExoP12dFAM F=dT−FAM、H=THF(脱塩基部位模倣体)、Q=dT−BHQ−1、3’=ブロックC3スペーサー
GAACCAAGATGCATTRAGCAAAACCCAGGGAFHAQTAATCAGGCACTC(SEQ ID NO.12)
InfA[PB2]第二増幅プライマー
>FluAPB2F403
AATGTGCTAATYGGGCAAGGAGACGTGGTGTTG*G(SEQ ID NO.13)
>FluAPB2R703
GGCCATCCGAATTCTTTTGGTCGCTGTCTGG*C(SEQ ID NO.14)
InfA[PB2]Exoプローブ
>FluAPB2ExoP2 F=dT−FAM、H=THF(脱塩基部位模倣体)、Q=dT−BHQ−1、3’=ブロックC3スペーサー
CGAATTCTTTTGGTCGCTGTCTGGCTGTCAGTAAGFHQGCTAGAGTCCCG(SEQ ID NO.15)
InfB[PA]第二増幅プライマー
>MSFBPA_F6+1−2
GGAAAAAGAAAGAAAAGCTGGGAAATAGCATG*G(SEQ ID NO.16)
>MSFBPA_R6+1
GCTTAGCACTCTCCCTTTCCCTTCCTCATCCAAT*G(SEQ ID NO.17)
InfB[PA]Exoプローブ
>MSFBPAx1 F=dT−FAM、H=THF(脱塩基部位模倣体)、Q=dT−BHQ−1、3’=ブロックC3スペーサー
ACTGATGATATTCAGCTACAATCAAGACFAHQCGTTAAGTAATGAA(SEQ ID NO.18)
Xcon第二増幅プライマー
>XConR13
TTCCAGTCAGTCCTAGTCAGAAACGGTCCTTAGAC*G (SEQ ID NO.19)
>APOBEXTF
GCCAGGTTTATAGCACACTTGTCACCTA*C(SEQ ID NO.20)
Xcon Exoプローブ
>APOB1FAM F=dT−FAM、H=THF(脱塩基部位模倣体)、Q=dT−BHQ−1、3’=ブロックC3スペーサー
GCCAGGTTTATAGCACACTTGTCACCTACAQTHCFGATTGGTGGACTCT(SEQ ID NO.21)
本発明の多くの実施形態が説明されている。しかし、様々な変更が本発明の精神および範囲から逸脱することなくなされ得ることが理解されるであろう。従って、他の実施形態は後述の請求項の範囲内である。
Claims (85)
- サンプルをマイクロ流体デバイスに加え、前記サンプルにおける標的ポリヌクレオチド配列を増幅することを含む方法であって、前記増幅が、前記サンプルに増幅の第一ラウンドを実施して第一増幅産物を産生し、前記第一増幅産物に増幅の第二ラウンドを実施して第二増幅産物を産生することを含み、前記第二増幅産物は増幅の前記第一ラウンドの際に産生される前記第一増幅産物内に完全に含まれる、より小さい配列を含む、方法。
- 前記第二増幅産物を検出することをさらに含む、請求項1に記載の方法。
- 前記第二増幅産物の検出が、前記第二増幅産物をフルオロフォアおよびクエンチャーと連結された第一オリゴヌクレオチドによって標識して標識第二産物を得、前記標識第二増幅産物からクエンチャーを切断し、フルオロフォアからのシグナルを光学的に検出することを含み、検出可能なシグナルが前記第二増幅産物の存在の指標である、請求項2に記載の方法。
- 前記クエンチャーを切断することがヌクレアーゼを用いて実施される、請求項3に記載の方法。
- 前記ヌクレアーゼが二本鎖DNAを標的にする、請求項4に記載の方法。
- 前記ヌクレアーゼがホルムアミドピリミン−DNAグリコシラーゼである、請求項5に記載の方法。
- 前記第二増幅産物の検出が、前記第二増幅産物を酸化還元部分と連結された第一オリゴヌクレオチドによって標識して標識第二増殖産物を得、前記標識第二増幅産物から酸化還元部分を切断し、前記切断酸化還元部分からシグナルを電気化学的に検出することを含み、検出可能なシグナルが前記第二増幅産物の存在の指標である、請求項2に記載の方法。
- 前記酸化還元部分がフェノチアジン、フェノキサジン、フェロセン、フェリシアン化物、ルテニウム(III)、オスミウム(II)、アントラキノン、フェナジン、およびこれらの誘導体からなる群から選択される、請求項7に記載の方法。
- 前記酸化還元がヌクレアーゼを用いて実施される、請求項7に記載の方法。
- 前記ヌクレアーゼが二本鎖DNAを標的にする、請求項9に記載の方法。
- 前記ヌクレアーゼがホルムアミドピリミン−DNAグリコシラーゼである、請求項10に記載の方法。
- 前記第二増幅産物に増幅の第三ラウンドを実施して第三増幅産物を産生し、前記第三増幅産物を検出することをさらに含み、前記第三増幅産物は増幅の第二ラウンドの際に産生される前記第二増幅産物内に完全に含まれる、より小さい配列を含む、請求項1に記載の方法。
- 前記サンプルが動物から得られる、請求項1に記載の方法。
- 動物から得られる前記サンプルが前記動物の血液、喀痰、粘液、唾液、涙、または尿から得られる、請求項13に記載の方法。
- 前記サンプルがヒトから得られる、請求項13に記載の方法。
- 前記標的ポリヌクレオチド配列が、標的核酸に含まれる、請求項1に記載の方法。
- 前記標的核酸が、動物病原体から得られる、請求項16に記載の方法。
- 前記動物病原体が、一本鎖DNAウイルス、二本鎖DNAウイルス、または一本鎖RNAウイルスである、請求項17に記載の方法。
- 前記動物病原体が細菌である、請求項17に記載の方法。
- 前記標的核酸が、二本鎖DNA、一本鎖DNA、またはRNAである、請求項16に記載の方法。
- 前記標的核酸が、ゲノムDNA、プラスミドDNA、ウイルスDNA、ミトコンドリアDNA、cDNA、合成二本鎖DNA、および合成一本鎖DNAからなる群から選択される、請求項16に記載の方法。
- 前記標的核酸がウイルスDNAまたはウイルスRNAである、請求項16に記載の方法。
- 前記動物病原体が、インフルエンザAウイルスまたはインフルエンザBウイルスである、請求項17に記載の方法。
- 前記サンプルにおける2種類以上の標的ポリヌクレオチド配列が増幅される、請求項1に記載の方法。
- インフルエンザA遺伝子配列を含む標的ポリヌクレオチド配列およびインフルエンザB遺伝子配列を含む標的ポリヌクレオチド配列が増幅される、請求項24に記載の方法。
- 2種類以上の増幅産物が検出される、請求項2に記載の方法。
- インフルエンザA遺伝子配列を含む第二増幅産物およびインフルエンザB遺伝子配列を含む第二増幅産物が検出される、請求項26に記載の方法。
- (i)第一反応チャンバーであって、前記反応チャンバーにおけるサンプル流体に第一核酸増幅を実施して第一増幅産物を生成するように構成される第一反応チャンバー、および
(ii)1つ以上の第二反応チャンバーであって、前記第一増幅産物に第二核酸増幅を実施して第二増幅産物を生成するように構成される各第二反応チャンバー
を含む、カード本体、
前記サンプル流体を前記第一反応チャンバーに供給するための通路、
前記1つ以上の第二反応チャンバーと流体接続される1つ以上の検出チャンバー、ならびに
各検出チャンバーと結合される検出モジュール
を含む、診断カード。 - 前記検出モジュールが光学的モジュールである、請求項28に記載の診断カード。
- 前記検出モジュールが蛍光検出器である、請求項28に記載の診断カード。
- 前記蛍光検出器が、照明光を前記1つ以上の検出チャンバーに向ける単一光パイプ、および各検出チャンバーから反射した光を受容する個別光パイプを含む、請求項30に記載の診断カード。
- 前記検出モジュールが電極モジュールである、請求項28に記載の診断カード。
- 前記検出モジュールが、各検出チャンバー用の電極で終結する一連の伝導路を含む、請求項32に記載の診断カード。
- 前記デバイスが追加の伝導路および電極を含んでマイクロ流体カード全体を通して液体の位置を検出する、請求項32に記載の診断カード。
- 前記増幅がリコンビナーゼポリメラーゼ増幅(RPA)反応を含む、請求項28に記載の診断カード。
- 混合手段、ポンプ、およびサンプルモジュールに接続するための接続ポートをさらに含む、請求項28に記載の診断カード。
- 前記第一反応チャンバーがヒーターと結合される、請求項28に記載の診断カード。
- 前記第一反応チャンバーが混合手段を含む、または混合手段と結合される、請求項28に記載の診断カード。
- 各第二反応チャンバーが試薬を含む、請求項28に記載の診断カード。
- 前記試薬がRPA試薬を含む、請求項39に記載の診断カード。
- 前記RPA試薬が凍結乾燥されている、請求項40に記載の診断カード。
- 前記第一反応チャンバーが試薬を含む、請求項28に記載の診断カード。
- 前記試薬がRPA試薬を含む、請求項42に記載の診断カード。
- 前記RPA試薬が凍結乾燥されている、請求項43に記載の診断カード。
- 前記サンプル流体が動物から得られるサンプルである、請求項28に記載の診断カード。
- 動物から得られる前記サンプルが、前記動物の血液、喀痰、粘液、唾液、涙、または尿から得られる、請求項45に記載の診断カード。
- 前記サンプル流体がヒトから得られるサンプルである、請求項45に記載の診断カード。
- 前記サンプル流体が標的核酸を含む、請求項28に記載の診断カード。
- 前記標的核酸が動物病原体から得られる、請求項48に記載の診断カード。
- 前記動物病原体が、一本鎖DNAウイルス、二本鎖DNAウイルス、または一本鎖RNAウイルスである、請求項49に記載の診断カード。
- 前記動物病原体が細菌である、請求項49に記載の診断カード。
- 前記標的核酸が二本鎖DNA、一本鎖DNA、またはRNAである、請求項48に記載の診断カード。
- 前記標的核酸が、ゲノムDNA、プラスミドDNA、ウイルスDNA、ミトコンドリアDNA、cDNA、合成二本鎖DNA、および合成一本鎖DNAからなる群から選択される、請求項48に記載の診断カード。
- 前記標的核酸がウイルスDNAまたはウイルスRNAである、請求項48に記載の診断カード。
- 前記動物病原体が、インフルエンザAウイルスまたはインフルエンザBウイルスである、請求項49に記載の診断カード。
- 前記第二増幅産物が、前記サンプル流体の前記診断カードへの送達後、30分以内、15分以内、10分以内、または5分以内で産生される、請求項28に記載の診断カード。
- 前記診断カードが使い捨てである、請求項28に記載の診断カード。
- さらに追加の反応チャンバーを含み、それぞれが核酸増幅反応の追加のラウンドを実施して追加の増幅産物を生成し、これによって増幅の各連続したn+1ラウンドから得られる前記増幅産物は、前n回目ラウンドの前記増幅産物内に完全に含まれる、より小さい配列である、請求項28に記載の診断カード。
- 請求項28に記載の診断カードを受容するように構成されるリーダーであって、前記リーダーが前記第二反応チャンバーにおける前記第二増幅産物の存在を検出するように構成される検出器を含む、リーダー。
- 第一流入口および第一流出口と流体接続される第一反応チャンバー、
第二流入口および第二流出口と流体接続される第二反応チャンバー、
検出チャンバー、
第一ポンプ、ここで前記第一流入口が前記第一ポンプを介して前記第一反応チャンバーと流体接続され、前記第一流出口が第一反応チャンバーと流体接続され、
第二ポンプ、ここで前記第一反応チャンバーが前記第二ポンプを介して前記第二反応チャンバーと流体接続され、前記第二流出口が前記第二反応チャンバーと流体接続され、
第三ポンプ、ここで前記第二流入口は前記第三ポンプを介して前記第二反応チャンバーと流体接続される、
を含む、核酸増幅デバイス。 - 前記核酸増幅デバイスがマイクロ流体デバイスである、請求項60に記載の核酸増幅デバイス。
- 前記第一反応チャンバーが試薬を含む、請求項60に記載の核酸増幅デバイス。
- 前記第一反応チャンバーが触媒を含む、請求項62に記載の核酸増幅デバイス。
- 前記触媒がマグネシウムを含む、請求項63に記載の核酸増幅デバイス。
- 試薬リサーバをさらに含み、前記第二ポンプおよび前記第三ポンプが第一試薬リサーバを介して各第二反応チャンバーと流体接続される、請求項60に記載の核酸増幅デバイス。
- 前記第二ポンプおよび前記第三ポンプが第一試薬リサーバおよび第二試薬リサーバを介して各第二反応チャンバーと流体接続される、請求項60に記載の核酸増幅デバイス。
- 前記第一試薬リサーバおよび前記第二試薬リサーバが直列である、請求項66に記載の核酸増幅デバイス。
- 前記第一試薬リサーバがオリゴマーを含む、請求項67に記載の核酸増幅デバイス。
- 前記第二試薬リサーバがマグネシウムを含む、請求項67に記載の核酸増幅デバイス。
- 各第二反応チャンバーが検出チャンバーである、請求項66に記載の核酸増幅デバイス。
- 各検出チャンバーの一部が光学的に透明である、請求項70に記載の核酸増幅デバイス。
- 各検出チャンバーと接続される電極をさらに含む、請求項70に記載の核酸増幅デバイス。
- 3つの電極が各検出チャンバーに接続される、請求項72に記載の核酸増幅デバイス。
- 流体検出領域をさらに含む、請求項60に記載の核酸増幅デバイス。
- 前記第一ポンプおよび前記第一反応チャンバーが第一検出領域を介して接続される、請求項74に記載の核酸増幅デバイス。
- 前記第二ポンプおよび前記第二反応チャンバーが第二検出領域を介して接続される、請求項74に記載の核酸増幅デバイス。
- 前記第三ポンプおよび前記第二反応チャンバーが第三検出領域を介して接続される、請求項74に記載の核酸増幅デバイス。
- 前記第三ポンプおよび前記第一反応チャンバーが第四検出領域を介して接続される、請求項74に記載の核酸増幅デバイス。
- 各検出領域の一部が光学的に透明である、請求項74に記載の核酸増幅デバイス。
- 各検出領域と接続されるフロー検出チャンバーをさらに含む、請求項74に記載の核酸増幅デバイス。
- 前記第一反応チャンバーと接続されるヒーターをさらに含む、請求項60に記載の核酸増幅デバイス。
- 前記第一反応チャンバーがスターラーを含む、請求項60に記載の核酸増幅デバイス。
- 前記第一ポンプが、前記核酸増幅デバイスに送達されるサンプルを、前記第一流入口を介して前記第一反応チャンバーに供給するように構成される、請求項60に記載の核酸増幅デバイス。
- 前記第二および第三ポンプが、前記第二流入口を介して核酸増幅デバイス本体に送達される試薬を、前記第一反応チャンバーからの産物と混合して反応物混合を生じるように構成される、請求項60に記載の核酸増幅デバイス。
- 前記第二および第三ポンプが、前記反応物混合の一部を前記第二反応チャンバーのそれぞれに供給するように構成される、請求項84に記載の核酸増幅デバイス。
Priority Applications (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
JP2023088617A JP2023123447A (ja) | 2016-03-04 | 2023-05-30 | 自動化ネステッドリコンビナーゼポリメラーゼ増幅 |
Applications Claiming Priority (3)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
US201662303934P | 2016-03-04 | 2016-03-04 | |
US62/303,934 | 2016-03-04 | ||
JP2018546635A JP2019508043A (ja) | 2016-03-04 | 2017-03-03 | 自動化ネステッドリコンビナーゼポリメラーゼ増幅 |
Related Parent Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
JP2018546635A Division JP2019508043A (ja) | 2016-03-04 | 2017-03-03 | 自動化ネステッドリコンビナーゼポリメラーゼ増幅 |
Related Child Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
JP2023088617A Division JP2023123447A (ja) | 2016-03-04 | 2023-05-30 | 自動化ネステッドリコンビナーゼポリメラーゼ増幅 |
Publications (1)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
JP2021118695A true JP2021118695A (ja) | 2021-08-12 |
Family
ID=59744470
Family Applications (3)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
JP2018546635A Pending JP2019508043A (ja) | 2016-03-04 | 2017-03-03 | 自動化ネステッドリコンビナーゼポリメラーゼ増幅 |
JP2021064771A Pending JP2021118695A (ja) | 2016-03-04 | 2021-04-06 | 自動化ネステッドリコンビナーゼポリメラーゼ増幅 |
JP2023088617A Pending JP2023123447A (ja) | 2016-03-04 | 2023-05-30 | 自動化ネステッドリコンビナーゼポリメラーゼ増幅 |
Family Applications Before (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
JP2018546635A Pending JP2019508043A (ja) | 2016-03-04 | 2017-03-03 | 自動化ネステッドリコンビナーゼポリメラーゼ増幅 |
Family Applications After (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
JP2023088617A Pending JP2023123447A (ja) | 2016-03-04 | 2023-05-30 | 自動化ネステッドリコンビナーゼポリメラーゼ増幅 |
Country Status (11)
Country | Link |
---|---|
US (1) | US20200232050A1 (ja) |
EP (2) | EP4275794A3 (ja) |
JP (3) | JP2019508043A (ja) |
KR (2) | KR102473905B1 (ja) |
CN (1) | CN109072289A (ja) |
AU (1) | AU2017228401B2 (ja) |
BR (1) | BR112018067739A2 (ja) |
CA (1) | CA3016582A1 (ja) |
ES (1) | ES2950618T3 (ja) |
MX (1) | MX2018010575A (ja) |
WO (1) | WO2017152122A2 (ja) |
Families Citing this family (18)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US9617587B1 (en) | 2016-04-04 | 2017-04-11 | Nat Diagnostics, Inc. | Isothermal amplification components and processes |
US11299777B2 (en) | 2016-04-04 | 2022-04-12 | Nat Diagnostics, Inc. | Isothermal amplification components and processes |
USD834724S1 (en) * | 2016-10-14 | 2018-11-27 | Life Technologies Corporation | Illumination and imaging instrument |
US10632464B2 (en) | 2017-02-28 | 2020-04-28 | Alere San Diego, Inc. | Microfluidic devices and related methods |
CN108103247A (zh) * | 2018-02-01 | 2018-06-01 | 上海海洋大学 | 基于rpa技术检测ⅲ型草鱼呼肠孤病毒的试剂盒及其专用引物和探针 |
USD909605S1 (en) * | 2019-01-21 | 2021-02-02 | Life Technologies Corporation | Polymerase chain reaction instrument |
CN111235316B (zh) * | 2020-03-23 | 2022-11-25 | 中国检验检疫科学研究院 | 鉴定新型冠状病毒的引物探针及在三重荧光rpa的应用 |
WO2021212523A1 (zh) * | 2020-04-25 | 2021-10-28 | Huang Wanqiu | 利用巢式RPA技术检测SARS-CoV-2的引物对、探针、试剂盒及其应用 |
CN111621597A (zh) * | 2020-05-09 | 2020-09-04 | 清华大学 | 一种病毒重组酶-聚合酶扩增检测方法 |
WO2021226754A1 (zh) * | 2020-05-09 | 2021-11-18 | 杭州梓晶生物有限公司 | 一种病毒重组酶-聚合酶扩增检测方法 |
US20210381067A1 (en) * | 2020-06-08 | 2021-12-09 | Ampliwise Inc. | Nucleic acid amplification and detection with attenuaiting probe |
CN112481358A (zh) * | 2020-11-11 | 2021-03-12 | 清华大学 | 一种巢式重组酶-聚合酶扩增方法及其应用 |
CN112501262A (zh) * | 2020-12-15 | 2021-03-16 | 苏州点晶生物科技有限公司 | 一种基于双重多酶介导的核酸扩增检测方法及试剂 |
CN112760417B (zh) * | 2021-01-20 | 2022-05-17 | 中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所 | 一种rap基因检测试剂盒、检测方法和应用及rap病毒检测试剂盒 |
WO2022174377A1 (zh) * | 2021-02-19 | 2022-08-25 | 清华大学 | 一种巢式重组酶-聚合酶扩增的方法及其应用 |
CN112899404B (zh) * | 2021-03-16 | 2022-12-27 | 广东省农业科学院动物卫生研究所 | 鳜蛙虹彩病毒的Nested-RAA检测引物对及其应用和检测方法 |
WO2023088952A1 (en) * | 2021-11-17 | 2023-05-25 | Lex diagnostics Ltd. | Devices, systems, and methods for nucleic acid amplification |
WO2024064317A2 (en) * | 2022-09-23 | 2024-03-28 | Customarray Inc. | Reagent delivery system with fluidic device and sensor |
Citations (7)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
JP2008500831A (ja) * | 2004-06-01 | 2008-01-17 | エーエスエム サイエンティフィック, インコーポレイテッド | リコンビナーゼポリメラーゼ増幅 |
JP2008517632A (ja) * | 2004-10-27 | 2008-05-29 | セフィード | 閉鎖系の多段階核酸増幅反応 |
JP2008532748A (ja) * | 2005-03-09 | 2008-08-21 | ザ リージェンツ オブ ザ ユニバーシティ オブ カリフォルニア | 液体用マイクロ流体バルブ |
JP2009529883A (ja) * | 2006-03-15 | 2009-08-27 | マイクロニクス, インコーポレイテッド | 一体型の核酸アッセイ |
JP2014516512A (ja) * | 2011-04-07 | 2014-07-17 | アリーア サン ディエゴ, インコーポレイテッド | リコンビナーゼポリメラーゼ増幅混合物のモニタリング |
WO2014182847A1 (en) * | 2013-05-07 | 2014-11-13 | Micronics, Inc. | Device for preparation and analysis of nucleic acids |
WO2015015178A2 (en) * | 2013-07-29 | 2015-02-05 | Atlas Genetics Limited | A Valve which Depressurises, and a Valve System |
Family Cites Families (15)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US7399590B2 (en) | 2002-02-21 | 2008-07-15 | Asm Scientific, Inc. | Recombinase polymerase amplification |
US7270981B2 (en) | 2002-02-21 | 2007-09-18 | Asm Scientific, Inc. | Recombinase polymerase amplification |
WO2006087574A2 (en) * | 2005-02-19 | 2006-08-24 | Geneform Technologies Limited | Isothermal nucleic acid amplification |
EP1929049B1 (en) | 2005-07-25 | 2013-04-10 | Alere San Diego, Inc. | Methods for multiplexing recombinase polymerase amplification |
EP1991700B1 (en) * | 2006-02-13 | 2012-01-11 | The Government of the United States of America as Represented by the Secretary of the Department of Health and Human Services | Primers and probes for detection and discrimination of types and subtypes of influenza viruses |
AU2007298650B2 (en) | 2006-05-04 | 2013-10-17 | Abbott Diagnostics Scarborough, Inc. | Recombinase polymerase amplification |
US9689031B2 (en) | 2007-07-14 | 2017-06-27 | Ionian Technologies, Inc. | Nicking and extension amplification reaction for the exponential amplification of nucleic acids |
US8697363B2 (en) * | 2008-08-26 | 2014-04-15 | Fluidigm Corporation | Methods for detecting multiple target nucleic acids in multiple samples by use nucleotide tags |
US9469867B2 (en) * | 2009-05-20 | 2016-10-18 | Alere San Diego, Inc. | DNA glycosylase/lyase and AP endonuclease substrates |
US9057097B2 (en) | 2009-06-05 | 2015-06-16 | Alere San Diego Inc. | Recombinase polymerase amplification reagents and kits |
ES2541710T3 (es) * | 2009-11-03 | 2015-07-23 | Sva Statens Veterinärmedicinska Anstalt | Procedimiento de genotipado |
WO2011100749A2 (en) * | 2010-02-15 | 2011-08-18 | Cascade Biosystems, Inc. | Methods and materials for detecting viral or microbial infections |
KR20230074639A (ko) * | 2013-08-28 | 2023-05-30 | 벡톤 디킨슨 앤드 컴퍼니 | 대량의 동시 단일 세포 분석 |
CN104195236B (zh) * | 2014-08-13 | 2015-08-19 | 北京恩济和生物科技有限公司 | 一种巢式pcr数字定量方法 |
US10632464B2 (en) * | 2017-02-28 | 2020-04-28 | Alere San Diego, Inc. | Microfluidic devices and related methods |
-
2017
- 2017-03-03 CA CA3016582A patent/CA3016582A1/en active Pending
- 2017-03-03 EP EP23168518.1A patent/EP4275794A3/en active Pending
- 2017-03-03 KR KR1020187028595A patent/KR102473905B1/ko active IP Right Grant
- 2017-03-03 EP EP17760946.8A patent/EP3423599B1/en active Active
- 2017-03-03 JP JP2018546635A patent/JP2019508043A/ja active Pending
- 2017-03-03 US US16/081,941 patent/US20200232050A1/en active Pending
- 2017-03-03 BR BR112018067739A patent/BR112018067739A2/pt not_active IP Right Cessation
- 2017-03-03 WO PCT/US2017/020782 patent/WO2017152122A2/en active Application Filing
- 2017-03-03 KR KR1020227042058A patent/KR20220167397A/ko not_active Application Discontinuation
- 2017-03-03 ES ES17760946T patent/ES2950618T3/es active Active
- 2017-03-03 MX MX2018010575A patent/MX2018010575A/es unknown
- 2017-03-03 AU AU2017228401A patent/AU2017228401B2/en active Active
- 2017-03-03 CN CN201780022595.2A patent/CN109072289A/zh active Pending
-
2021
- 2021-04-06 JP JP2021064771A patent/JP2021118695A/ja active Pending
-
2023
- 2023-05-30 JP JP2023088617A patent/JP2023123447A/ja active Pending
Patent Citations (7)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
JP2008500831A (ja) * | 2004-06-01 | 2008-01-17 | エーエスエム サイエンティフィック, インコーポレイテッド | リコンビナーゼポリメラーゼ増幅 |
JP2008517632A (ja) * | 2004-10-27 | 2008-05-29 | セフィード | 閉鎖系の多段階核酸増幅反応 |
JP2008532748A (ja) * | 2005-03-09 | 2008-08-21 | ザ リージェンツ オブ ザ ユニバーシティ オブ カリフォルニア | 液体用マイクロ流体バルブ |
JP2009529883A (ja) * | 2006-03-15 | 2009-08-27 | マイクロニクス, インコーポレイテッド | 一体型の核酸アッセイ |
JP2014516512A (ja) * | 2011-04-07 | 2014-07-17 | アリーア サン ディエゴ, インコーポレイテッド | リコンビナーゼポリメラーゼ増幅混合物のモニタリング |
WO2014182847A1 (en) * | 2013-05-07 | 2014-11-13 | Micronics, Inc. | Device for preparation and analysis of nucleic acids |
WO2015015178A2 (en) * | 2013-07-29 | 2015-02-05 | Atlas Genetics Limited | A Valve which Depressurises, and a Valve System |
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
AU2017228401A1 (en) | 2018-09-27 |
KR102473905B1 (ko) | 2022-12-06 |
AU2017228401B2 (en) | 2023-07-27 |
ES2950618T3 (es) | 2023-10-11 |
EP4275794A3 (en) | 2024-01-17 |
CN109072289A (zh) | 2018-12-21 |
EP4275794A2 (en) | 2023-11-15 |
KR20220167397A (ko) | 2022-12-20 |
KR20180133406A (ko) | 2018-12-14 |
MX2018010575A (es) | 2019-01-10 |
WO2017152122A3 (en) | 2017-10-19 |
EP3423599A2 (en) | 2019-01-09 |
EP3423599A4 (en) | 2020-01-08 |
JP2019508043A (ja) | 2019-03-28 |
EP3423599B1 (en) | 2023-04-19 |
WO2017152122A2 (en) | 2017-09-08 |
CA3016582A1 (en) | 2017-09-08 |
BR112018067739A2 (pt) | 2019-01-08 |
US20200232050A1 (en) | 2020-07-23 |
JP2023123447A (ja) | 2023-09-05 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
JP2021118695A (ja) | 自動化ネステッドリコンビナーゼポリメラーゼ増幅 | |
Varona et al. | Visual detection of single-nucleotide polymorphisms using molecular beacon loop-mediated isothermal amplification with centrifuge-free DNA extraction | |
US9315858B2 (en) | Apparatus for point-of-care detection of nucleic acid in a sample | |
US20190234978A1 (en) | System for nucleic acid preparation | |
JP2016163576A (ja) | 一体化された試料調製、反応、及び検出のための装置及び方法 | |
US20090011417A1 (en) | Testing Device | |
KR20200079264A (ko) | 표적 바이러스 검출을 위한 휴대용 분자 진단 디바이스 및 방법 | |
US10449541B2 (en) | Microfluidic device | |
WO2022266513A2 (en) | Devices, systems, and methods for analysis of nucleic acids | |
WO2006054690A1 (ja) | 遺伝子多型検出方法、診断方法、並びにそのための装置及び検査試薬キット | |
WO2022020393A1 (en) | High-throughput single-chamber programmable nuclease assay | |
CN115835920A (zh) | 可编程核酸酶诊断装置 | |
CN108026591B (zh) | 诊断方法和组合物 | |
JP2023527150A (ja) | 核酸の検出のための装置、アッセイ、及び方法 | |
EP4259822A1 (en) | Single-buffer compositions for nucleic acid detection | |
WO2024064704A1 (en) | Pathogen testing device and method | |
Wang et al. | Integrating Recombinase Polymerase Amplification and Photosensitization Colorimetric Detection in One Tube for Fast Screening of C. sakazakii in Formula Milk Powder | |
JP2017046633A (ja) | 加温手段を有した検出キット | |
WO2022082016A1 (en) | Flow control lines for lateral flow assays | |
EP4363605A1 (en) | Pathogen testing device |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523 Effective date: 20210420 |
|
A621 | Written request for application examination |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A621 Effective date: 20210420 |
|
A131 | Notification of reasons for refusal |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A131 Effective date: 20220510 |
|
A601 | Written request for extension of time |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A601 Effective date: 20220808 |
|
A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523 Effective date: 20221006 |
|
A02 | Decision of refusal |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A02 Effective date: 20230131 |
|
A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523 Effective date: 20230530 |
|
A911 | Transfer to examiner for re-examination before appeal (zenchi) |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A911 Effective date: 20230728 |
|
A912 | Re-examination (zenchi) completed and case transferred to appeal board |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A912 Effective date: 20230901 |