JP2019507384A5

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Publication number: JP2019507384A5
Application number: JP2018544146A
Authority: JP
Filing date: 2017-02-22
Publication date: 2020-04-02
Anticipated expiration: 2037-02-22

Claims

生物試料の向上された被写界深度を持つ合成２Ｄ画像を生成するためのシステムであって、
顕微鏡スキャナと、
処理ユニットと、
を有し、
前記顕微鏡スキャナは、当該生物試料の第１横方向位置における第１画像データ及び該生物試料の第２横方向位置における第２画像データを取得し、
前記顕微鏡スキャナは、前記第１横方向位置における第３画像データ及び前記第２横方向位置における第４画像データを取得し、前記第３画像データは前記第１画像データに対するものとは異なる深度において取得され、前記第４画像データは前記第２画像データに対するものとは異なる深度において取得され、
前記処理ユニットは前記第１横方向位置に関する第１作業画像データを生成し、該生成は前記第１画像データ及び前記第３画像データの焦点合成アルゴリズムによる処理を含み、前記処理ユニットは前記第２横方向位置に関する第２作業画像データを生成し、該生成は該第２横方向位置に関する第２作業画像データを生成するための前記焦点合成アルゴリズムによる前記第２画像データ及び前記第４画像データの処理を含み、
前記処理ユニットは、画像データの取得の間において、前記第１作業画像データ及び前記第２作業画像データを組み合わせて当該生物試料の向上された被写界深度を持つ合成２Ｄ画像を生成する、
システム。
前記顕微鏡スキャナが前記生物試料の斜め断面の画像データを取得する検出器を有する、請求項１に記載のシステム。
前記検出器が少なくとも２つの活性領域を有する２Ｄ検出器である、請求項２に記載のシステム。
前記顕微鏡スキャナが、前記第１画像データ及び前記第２画像データを取得するために前記生物試料の第１断面の画像データを取得し、該顕微鏡スキャナが、前記第３画像データ及び前記第４画像データを取得するために該生物試料の第２断面の画像データを取得する、請求項１に記載のシステム。
前記顕微鏡スキャナは、前記生物試料の前記第１横方向位置において且つ第１深度において前記第１画像データを取得すると同時に、該生物試料の前記第２横方向位置において且つ第２深度において前記第２画像データを取得し、ここで、前記第１深度は前記第２深度とは相違し、前記顕微鏡スキャナは、前記第１横方向位置において且つ第３深度において前記第３画像データを取得すると同時に、前記第２横方向位置において且つ第４深度において前記第４画像データを取得し、ここで、前記第３深度は前記第４深度とは相違する、請求項１に記載のシステム。
前記顕微鏡スキャナが、前記第１横方向位置において、及び、前記第２横方向位置において、前記第１画像データが取得される深度と前記第２画像データが取得される深度との間の深さの距離よりも何れも大きくはない焦点深度を有する、請求項１に記載のシステム。
前記生物試料が前記第１画像データ及び前記第２画像データを取得するために前記顕微鏡スキャナの光軸に対して第１位置にあり、該生物試料が前記第３画像データ及び前記第４画像データの取得のために該光軸に対して第２位置にある、請求項１に記載のシステム。
前記画像データが複数のカラーを有し、前記処理ユニットが、該複数のカラーのうちの１以上を有する前記画像データに基づいて、画像データを前記焦点合成アルゴリズムによって処理する、請求項１に記載のシステム。
生物試料の向上された被写界深度の合成２Ｄ画像を生成する方法であって、
ａ）顕微鏡スキャナにより前記生物試料の第１横方向位置における第１画像データを取得し、前記顕微鏡スキャナにより該生物試料の第２横方向位置における第２画像データを取得するステップと、
ｂ）前記顕微鏡スキャナにより前記第１横方向位置における第３画像データを取得し、前記顕微鏡スキャナにより前記第２横方向位置における第４画像データを取得するステップであって、前記第３画像データを前記第１画像データに対するものとは異なる深度において取得し、前記第４画像データを前記第２画像データに対するものとは異なる深度において取得するステップと、
ｅ）前記第１横方向位置に関する第１作業画像データを生成するステップであって、該生成するステップが前記第１画像データ及び前記第３画像データを焦点合成アルゴリズムにより処理するステップを有するステップと、
ｆ）前記第２横方向位置に関する第２作業画像データを生成するステップであって、該生成するステップが前記第２画像データ及び前記第４画像データを前記焦点合成アルゴリズムにより処理するステップを有するステップと、
ｌ）画像データの取得の間において前記第１作業画像データ及び前記第２作業画像データを組み合わせて、前記生物試料の向上された被写界深度の合成２Ｄ画像を生成するステップと、
を有する、方法。
前記取得するステップａ）が、前記生物試料の前記第１横方向位置において且つ第１深度において前記第１画像データを取得すると同時に該生物試料の前記第２横方向位置において且つ第２深度において前記第２画像データを取得するステップを有し、ここで、前記第１深度は前記第２深度とは相違し、前記取得するステップｂ）が、前記第１横方向位置において且つ第３深度において前記第３画像データを取得すると同時に前記第２横方向位置において且つ第４深度において前記第４画像データを取得するステップを有し、ここで、前記第３深度は前記第４深度とは相違する、請求項９に記載の方法。
ｃ）前記第１画像データに関する第１エネルギデータを計算し、前記第３画像データに関する第３エネルギデータを計算するステップと、
ｄ）前記第２画像データに関する第２エネルギデータを計算し、前記第４画像データに関する第４エネルギデータを計算するステップと、
を有し、
前記生成するステップｅ）は、前記第１画像データ又は前記第３画像データの何れかを前記第１作業画像データとして選択するステップを有し、該選択するステップは前記第１エネルギデータ及び前記第３エネルギデータの関数を含み、
前記生成するステップｆ）は、前記第２画像データ又は前記第４画像データの何れかを前記第２作業画像データとして選択するステップを有し、該選択するステップは前記第２エネルギデータ及び前記第４エネルギデータの関数を含み、
画像データにおける周波数情報がエネルギデータを表す、請求項９に記載の方法。
ｇ）前記第１画像データが前記第１作業画像データとして選択される場合に第１作業エネルギデータを前記第１エネルギデータとして生成するか、又は前記第３画像データが前記第１作業画像データとして選択される場合に前記第１作業エネルギデータを前記第３エネルギデータとして生成するステップと、
ｈ）前記第２画像データが前記第２作業画像データとして選択される場合に第２作業エネルギデータを前記第２エネルギデータとして生成するか、又は前記第４画像データが前記第２作業画像データとして選択される場合に前記第２作業エネルギデータを前記第４エネルギデータとして生成するステップと、
を有する、請求項１１に記載の方法。
ｉ）前記第１横方向位置において第５画像データを取得し、前記第２横方向位置において第６画像データを取得するステップであって、前記第５画像データは前記第１及び第３画像データに対するものとは異なる深度において取得され、前記第６画像データは前記第２及び第４画像データに対するものとは異なる深度において取得されるステップと、
ｊ）前記第５画像データ及び前記第１作業画像データを前記焦点合成アルゴリズムにより処理して、前記第１横方向位置に関して新たな第１作業画像データを生成するステップであって、前記新たな第１作業画像データが該第１作業画像データとなるステップと、
ｋ）前記第６画像データ及び前記第２作業画像データを前記焦点合成アルゴリズムにより処理して、前記第２横方向位置に関して新たな第２作業画像データを生成するステップであって、前記新たな第２作業画像データが該第２作業画像データとなるステップと、
を更に有する、請求項９に記載の方法。
プロセッサによって実行されたときに、前記プロセッサに、
ａ）顕微鏡スキャナにより生物試料の第１横方向位置における第１画像データを取得し、前記顕微鏡スキャナにより該生物試料の第２横方向位置における第２画像データを取得することと、
ｂ）前記顕微鏡スキャナにより前記第１横方向位置における第３画像データを取得し、前記顕微鏡スキャナにより前記第２横方向位置における第４画像データを取得することであって、前記第３画像データを前記第１画像データに対するものとは異なる深度において取得し、前記第４画像データを前記第２画像データに対するものとは異なる深度において取得することと、
ｅ）前記第１横方向位置に関する第１作業画像データを生成することであって、該生成することが前記第１画像データ及び前記第３画像データを焦点合成アルゴリズムにより処理することを有することと、
ｆ）前記第２横方向位置に関する第２作業画像データを生成することであって、該生成することが前記第２画像データ及び前記第４画像データを前記焦点合成アルゴリズムにより処理することを有することと、
ｌ）画像データの取得の間において前記第１作業画像データ及び前記第２作業画像データを組み合わせて、前記生物試料の向上された被写界深度の合成２Ｄ画像を生成することと、
をさせるプログラムを記憶した、非一時的コンピュータ可読媒体。
前記プログラムは、ａ）前記生物試料の前記第１横方向位置において且つ第１深度において前記第１画像データを取得すると同時に該生物試料の前記第２横方向位置において且つ第２深度において前記第２画像データを取得することを前記プロセッサに実行させ、ここで、前記第１深度は前記第２深度とは相違し、また、前記プログラムは、ｂ）前記第１横方向位置において且つ第３深度において前記第３画像データを取得すると同時に前記第２横方向位置において且つ第４深度において前記第４画像データを取得することを前記プロセッサに実行させ、ここで、前記第３深度は前記第４深度とは相違する、請求項１４に記載の非一時的コンピュータ可読媒体。
前記プログラムは更に、前記プロセッサに、
ｃ）前記第１画像データに関する第１エネルギデータを計算し、前記第３画像データに関する第３エネルギデータを計算することと、
ｄ）前記第２画像データに関する第２エネルギデータを計算し、前記第４画像データに関する第４エネルギデータを計算することと、
を実行させ、
前記プログラムは、ｅ）前記第１画像データ又は前記第３画像データの何れかを前記第１作業画像データとして選択することを前記プロセッサに実行させ、該選択することは前記第１エネルギデータ及び前記第３エネルギデータの関数を含み、
前記プログラムは、ｆ）前記第２画像データ又は前記第４画像データの何れかを前記第２作業画像データとして選択することを前記プロセッサに実行させ、該選択することは前記第２エネルギデータ及び前記第４エネルギデータの関数を含み、
画像データにおける周波数情報がエネルギデータを表す、請求項１４に記載の非一時的コンピュータ可読媒体。
前記プログラムは更に、前記プロセッサに、
ｇ）前記第１画像データが前記第１作業画像データとして選択される場合に第１作業エネルギデータを前記第１エネルギデータとして生成するか、又は前記第３画像データが前記第１作業画像データとして選択される場合に前記第１作業エネルギデータを前記第３エネルギデータとして生成することと、
ｈ）前記第２画像データが前記第２作業画像データとして選択される場合に第２作業エネルギデータを前記第２エネルギデータとして生成するか、又は前記第４画像データが前記第２作業画像データとして選択される場合に前記第２作業エネルギデータを前記第４エネルギデータとして生成することと、
をさせる、請求項１６に記載の非一時的コンピュータ可読媒体。
前記プログラムは更に、前記プロセッサに、
ｉ）前記第１横方向位置において第５画像データを取得し、前記第２横方向位置において第６画像データを取得することであって、前記第５画像データは前記第１及び第３画像データに対するものとは異なる深度において取得され、前記第６画像データは前記第２及び第４画像データに対するものとは異なる深度において取得されることと、
ｊ）前記第５画像データ及び前記第１作業画像データを前記焦点合成アルゴリズムにより処理して、前記第１横方向位置に関して新たな第１作業画像データを生成することであって、前記新たな第１作業画像データが該第１作業画像データとなることと、
ｋ）前記第６画像データ及び前記第２作業画像データを前記焦点合成アルゴリズムにより処理して、前記第２横方向位置に関して新たな第２作業画像データを生成することであって、前記新たな第２作業画像データが該第２作業画像データとなることと、
をさせる、請求項１４に記載の非一時的コンピュータ可読媒体。