JP2017536825A5 - - Google Patents

Claims (24)

1. 突然変異エピトープに対し抗原特異性を有する、単離又は精製されたＴ細胞受容体（ＴＣＲ）であって、突然変異エピトープが、（ａ）ＶＶＶＧＡＤＧＶＧＫ（配列番号２）を含むか、又は（ｂ）ＶＶＶＧＡＶＧＶＧＫ（配列番号３３）若しくはＶＶＧＡＶＧＶＧＫ（配列番号３５）から成る、ＴＣＲ。
2. ＴＣＲが、ＨＬＡ−Ａ１１分子に関連して提示される突然変異エピトープに対し抗原特異性を有する、請求項１に記載のＴＣＲ。
3. （ａ）配列番号３のアミノ酸配列を含むα鎖の相補性決定領域（ＣＤＲ）１、配列番号４のアミノ酸配列を含むα鎖のＣＤＲ２、配列番号５のアミノ酸配列を含むα鎖のＣＤＲ３、配列番号６のアミノ酸配列を含むβ鎖のＣＤＲ１、配列番号７のアミノ酸配列を含むβ鎖のＣＤＲ２、及び配列番号８のアミノ酸配列を含むβ鎖のＣＤＲ３；
   （ｂ）配列番号１２５のアミノ酸配列を含むα鎖のＣＤＲ１、配列番号１２６のアミノ酸配列を含むα鎖のＣＤＲ２、配列番号１２７のアミノ酸配列を含むα鎖のＣＤＲ３、配列番号１２８のアミノ酸配列を含むβ鎖のＣＤＲ１、配列番号１２９のアミノ酸配列を含むβ鎖のＣＤＲ２、及び配列番号１３０のアミノ酸配列を含むβ鎖のＣＤＲ３；
   （ｃ）配列番号１３７のアミノ酸配列を含むα鎖のＣＤＲ１、配列番号１３８のアミノ酸配列を含むα鎖のＣＤＲ２、配列番号１３９のアミノ酸配列を含むα鎖のＣＤＲ３、配列番号１４０のアミノ酸配列を含むβ鎖のＣＤＲ１、配列番号１４１のアミノ酸配列を含むβ鎖のＣＤＲ２、及び配列番号１４２のアミノ酸配列を含むβ鎖のＣＤＲ３；
   （ｄ）配列番号１４９のアミノ酸配列を含むα鎖のＣＤＲ１、配列番号１５０のアミノ酸配列を含むα鎖のＣＤＲ２、配列番号１５１のアミノ酸配列を含むα鎖のＣＤＲ３、配列番号１５２のアミノ酸配列を含むβ鎖のＣＤＲ１、配列番号１５３のアミノ酸配列を含むβ鎖のＣＤＲ２、及び配列番号１５４のアミノ酸配列を含むβ鎖のＣＤＲ３；又は
   （ｅ）配列番号１４９のアミノ酸配列を含むα鎖のＣＤＲ１、配列番号１５０のアミノ酸配列を含むα鎖のＣＤＲ２、配列番号２０７のアミノ酸配列を含むα鎖のＣＤＲ３、配列番号１５２のアミノ酸配列を含むβ鎖のＣＤＲ１、配列番号１５３のアミノ酸配列を含むβ鎖のＣＤＲ２、及び配列番号１５４のアミノ酸配列を含むβ鎖のＣＤＲ３
   を含む、請求項１又は２の単離又は精製されたＴＣＲ。
4. （ａ）配列番号９のアミノ酸配列を含むα鎖の可変領域及び配列番号１０のアミノ酸配列を含むβ鎖の可変領域；
   （ｂ）配列番号１３１のアミノ酸配列を含むα鎖の可変領域及び配列番号１３２のアミノ酸配列を含むβ鎖の可変領域；
   （ｃ）配列番号１４３のアミノ酸配列を含むα鎖の可変領域及び配列番号１４４のアミノ酸配列を含むβ鎖の可変領域；
   （ｄ）配列番号１５５のアミノ酸配列を含むα鎖の可変領域及び配列番号１５６のアミノ酸配列を含むβ鎖の可変領域；又は
   （ｅ）配列番号２０８のアミノ酸配列を含むα鎖の可変領域及び配列番号１５６のアミノ酸配列を含むβ鎖の可変領域
   を含む、請求項１〜３のいずれか１項の単離又は精製されたＴＣＲ。
5. （ａ）配列番号１３のアミノ酸配列を含むα鎖の定常領域及び配列番号１４のアミノ酸配列を含むβ鎖の定常領域；
   （ｂ）配列番号１３５のアミノ酸配列を含むα鎖の定常領域及び配列番号１３６のアミノ酸配列を含むβ鎖の定常領域；
   （ｃ）配列番号１４７のアミノ酸配列を含むα鎖の定常領域及び配列番号１４８のアミノ酸配列を含むβ鎖の定常領域；又は
   （ｄ）配列番号１５９のアミノ酸配列を含むα鎖の定常領域及び配列番号１６０のアミノ酸配列を含むβ鎖の定常領域
   を更に含む、請求項１〜４のいずれか１項の単離又は精製されたＴＣＲ。
6. （ａ）配列番号１１のアミノ酸配列を含むα鎖及び配列番号１２のアミノ酸配列を含むβ鎖；
   （ｂ）配列番号１３３のアミノ酸配列を含むα鎖及び配列番号１３４のアミノ酸配列を含むβ鎖；
   （ｃ）配列番号１４５のアミノ酸配列を含むα鎖及び配列番号１４６のアミノ酸配列を含むβ鎖；
   （ｄ）配列番号１５７のアミノ酸配列を含むα鎖及び配列番号１５８のアミノ酸配列を含むβ鎖；又は
   （ｅ）配列番号２０９のアミノ酸配列を含むα鎖及び配列番号１５８のアミノ酸配列を含むβ鎖
   を含む、請求項１〜５のいずれか１項の単離又は精製されたＴＣＲ。
7. ＶＶＶＧＡＤＧＶＧＫ（配列番号２）を含む突然変異エピトープに対し抗原特異性を有する、請求項１〜６のいずれか１項のＴＣＲ。
8. ＶＶＶＧＡＶＧＶＧＫ（配列番号３３）又はＶＶＧＡＶＧＶＧＫ（配列番号３５）から成る突然変異エピトープに対し抗原特異性を有する、請求項１〜６のいずれか１項のＴＣＲ。
9. 請求項１〜６のいずれか１項のＴＣＲの機能的部分を含む単離又は精製されたポリペプチドであって、機能的部分が：
   （ｉ）（ａ）配列番号３〜５、（ｂ）配列番号６〜８、若しくは（ｃ）配列番号３〜８のアミノ酸配列；
   （ｉｉ）（ａ）配列番号１２５〜１２７、（ｂ）配列番号１２８〜１３０、若しくは（ｃ）配列番号１２５〜１３０のアミノ酸配列；
   （ｉｉｉ）（ａ）配列番号１３７〜１３９、（ｂ）配列番号１４０〜１４２、若しくは（ｃ）配列番号１３７〜１４２のアミノ酸配列；
   （ｉｖ）（ａ）配列番号１４９〜１５１、（ｂ）配列番号１５２〜１５４、若しくは（ｃ）配列番号１４９〜１５４のアミノ酸配列；又は
   （ｖ）（ａ）配列番号１４９〜１５０及び２０７、（ｂ）配列番号１５２〜１５４、若しくは（ｃ）配列番号１４９〜１５０，２０７及び１５２〜１５４のアミノ酸配列
   を含む、ポリペプチド。
10. 請求項１〜６のいずれか１項のＴＣＲの機能的部分を含む単離又は精製されたポリペプチドであって、機能的部分が：
    （ｉ）（ａ）配列番号９、（ｂ）配列番号１０、若しくは（ｃ）配列番号９及び１０の両方のアミノ酸配列；
    （ｉｉ）（ａ）配列番号１３１、（ｂ）配列番号１３２、若しくは（ｃ）配列番号１３１及び１３２の両方のアミノ酸配列；
    （ｉｉｉ）（ａ）配列番号１４３、（ｂ）配列番号１４４、若しくは（ｃ）配列番号１４３及び１４４の両方のアミノ酸配列；
    （ｉｖ）（ａ）配列番号１５５、（ｂ）配列番号１５６、若しくは（ｃ）配列番号１５５及び１５６の両方のアミノ酸配列；又は
    （ｖ）（ａ）配列番号２０８、（ｂ）配列番号１５６、若しくは（ｃ）配列番号２０８及び１５６の両方のアミノ酸配列
    を含む、ポリペプチド。
11. 請求項１〜６のいずれか１項のＴＣＲの機能的部分を含む単離又は精製されたポリペプチドであって、機能的部分が：
    （ｉ）（ａ）配列番号１１、（ｂ）配列番号１２、若しくは（ｃ）配列番号１１及び１２の両方のアミノ酸配列；
    （ｉｉ）（ａ）配列番号１３３、（ｂ）配列番号１３４、若しくは（ｃ）配列番号１３３及び１３４の両方のアミノ酸配列；
    （ｉｉｉ）（ａ）配列番号１４５、（ｂ）配列番号１４６、若しくは（ｃ）配列番号１４５及び１４６の両方のアミノ酸配列；
    （ｉｖ）（ａ）配列番号１５７、（ｂ）配列番号１５８、若しくは（ｃ）配列番号１５７及び１５８の両方のアミノ酸配列；又は
    （ｖ）（ａ）配列番号２０９、（ｂ）配列番号１５８、若しくは（ｃ）配列番号２０９及び１５８の両方のアミノ酸配列
    を含む、ポリペプチド。
12. 請求項９〜１１のいずれか１項のポリペプチドの少なくとも１つを含む、単離又は精製されたタンパク質。
13. （ａ）配列番号３〜５のアミノ酸配列を含む第１のポリペプチド鎖及び配列番号６〜８のアミノ酸配列を含む第２のポリペプチド鎖；
    （ｂ）配列番号１２５〜１２７のアミノ酸配列を含む第１のポリペプチド鎖及び配列番号１２８〜１３０のアミノ酸配列を含む第２のポリペプチド鎖；
    （ｃ）配列番号１３７〜１３９のアミノ酸配列を含む第１のポリペプチド鎖及び配列番号１４０〜１４２のアミノ酸配列を含む第２のポリペプチド鎖；
    （ｄ）配列番号１４９〜１５１のアミノ酸配列を含む第１のポリペプチド鎖及び配列番号１５２〜１５４のアミノ酸配列を含む第２のポリペプチド鎖；又は
    （ｅ）配列番号１４９，１５０、及び２０７のアミノ酸配列を含む第１のポリペプチド鎖、及び配列番号１５２〜１５４のアミノ酸配列を含む第２のポリペプチド鎖
    を含む、請求項１２に記載の単離又は精製されたタンパク質。
14. （ａ）配列番号９のアミノ酸配列を含む第１のポリペプチド鎖及び配列番号１０のアミノ酸配列を含む第２のポリペプチド鎖；
    （ｂ）配列番号１３１のアミノ酸配列を含む第１のポリペプチド鎖及び配列番号１３２のアミノ酸配列を含む第２のポリペプチド鎖；
    （ｃ）配列番号１４３のアミノ酸配列を含む第１のポリペプチド鎖及び配列番号１４４のアミノ酸配列を含む第２のポリペプチド鎖；
    （ｄ）配列番号１５５のアミノ酸配列を含む第１のポリペプチド鎖及び配列番号１５６のアミノ酸配列を含む第２のポリペプチド鎖；又は
    （ｅ）配列番号２０８のアミノ酸配列を含む第１のポリペプチド鎖及び配列番号１５６のアミノ酸配列を含む第２のポリペプチド鎖
    を含む、請求項１３に記載の単離又は精製されたタンパク質。
15. （ａ）配列番号１１のアミノ酸配列を含む第１のポリペプチド鎖及び配列番号１２のアミノ酸配列を含む第２のポリペプチド鎖；
    （ｂ）配列番号１３３のアミノ酸配列を含む第１のポリペプチド鎖及び配列番号１３４のアミノ酸配列を含む第２のポリペプチド鎖；
    （ｃ）配列番号１４５のアミノ酸配列を含む第１のポリペプチド鎖及び配列番号１４６のアミノ酸配列を含む第２のポリペプチド鎖；
    （ｄ）配列番号１５７のアミノ酸配列を含む第１のポリペプチド鎖及び配列番号１５８のアミノ酸配列を含む第２のポリペプチド鎖；又は
    （ｅ）配列番号２０９のアミノ酸配列を含む第１のポリペプチド鎖及び配列番号１５８のアミノ酸配列を含む第２のポリペプチド鎖
    を含む、請求項１２〜１４のいずれか１項の単離又は精製されたタンパク質。
16. 請求項１〜８のいずれか１項に記載のＴＣＲ、請求項９〜１１のいずれか１項に記載のポリペプチド、又は請求項１２〜１５のいずれか１項に記載のタンパク質をコードするヌクレオチド配列を含む、単離又は精製された核酸。
17. 請求項１６に記載の核酸を含む組換え発現ベクター。
18. 請求項１７の組換え発現ベクターを含む、単離された宿主細胞。
19. 細胞がヒトのである、請求項１８に記載の宿主細胞。
20. 請求項１８又は１９の、少なくとも１つの宿主細胞を含む細胞集団。
21. 請求項１〜８のいずれか１項に記載のＴＣＲ、請求項９〜１１のいずれか１項に記載のポリペプチド、請求項１２〜１５のいずれか１項に記載のタンパク質、請求項１６に記載の核酸、請求項１７の組換え発現ベクター、請求項１８若しくは１９の宿主細胞、又は請求項２０の細胞集団、及び医薬的に許容可能な担体を含む医薬組成物。
22. 哺乳動物におけるがんを検出、治療又は予防するための医薬組成物であって、請求項１〜８のいずれか１項に記載のＴＣＲ、請求項９〜１１のいずれか１項に記載のポリペプチド、請求項１２〜１５のいずれか１項に記載のタンパク質、請求項１６に記載の核酸、請求項１７の組換え発現ベクター、請求項１８又は１９の宿主細胞、又は請求項２０の細胞集団を含む、医薬組成物。
23. 哺乳動物におけるがんの存在を検出する方法であって
    哺乳動物由来の１つ以上の細胞を含む試料と、請求項１〜８のいずれか１項に記載のＴＣＲ、請求項９〜１１のいずれか１項に記載のポリペプチド、請求項１２〜１５のいずれか１項に記載のタンパク質、請求項１６に記載の核酸、請求項１７の組換え発現ベクター、請求項１８又は１９の宿主細胞、請求項２０の細胞集団、又は請求項２１の医薬組成物とを接触させることによって、複合体を形成すること、及び
    複合体を検出すること
    を含み、
    複合体の検出が、哺乳動物におけるがんの存在を示す、方法。
24. がんが、膵臓がん、結腸直腸がん、肺がん、子宮内膜がん、卵巣がん、又は前立腺がんである、請求項２２の医薬組成物又は請求項２３の方法。