JP2015502134A5

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Publication number: JP2015502134A5
Application number: JP2014528740A
Authority: JP
Filing date: 2012-12-17
Publication date: 2016-03-31
Anticipated expiration: 2032-12-17

Claims

細胞内の転写産物レベルを低減するための医薬組成物であって、
該医薬組成物は、第２の核酸鎖がアニーリングしている第１の核酸鎖を含む二本鎖核酸複合体を含み、
（ｉ）第１の核酸鎖は、
前記転写産物にハイブリダイズし、そして
（ａ）前記転写産物にハイブリダイズした際に、ＲＮａｓｅＨによって認識される少なくとも４つの連続したＤＮＡヌクレオチドもしくは修飾ＤＮＡヌクレオチドを含み、さらに
（ｂ）前記ＲＮａｓｅＨにより認識される少なくとも４つの連続したＤＮＡヌクレオチドもしくは修飾ＤＮＡヌクレオチドの５’末側に配置された１又は複数のヌクレオチドアナログもしくは修飾ヌクレオチドアナログを含む５’ウイング領域、ならびに／または
（ｃ）前記ＲＮａｓｅＨにより認識される少なくとも４つの連続したＤＮＡヌクレオチドもしくは修飾ＤＮＡヌクレオチドの３’末側に配置された１又は複数のヌクレオチドアナログもしくは修飾ヌクレオチドアナログを含む３’ウイング領域を含む核酸鎖であり、かつ、
（ｉｉ）第２の核酸鎖は、
（ａ）少なくとも４つの連続したＲＮＡヌクレオチドと、さらに
（ｂ）前記少なくとも４つの連続したＲＮＡヌクレオチドの５’末側に配置された１又は複数の修飾ヌクレオチド、ヌクレオチドアナログおよび／もしくは修飾ヌクレオチドアナログ、ならびに／または
（ｃ）前記少なくとも４つの連続したＲＮＡヌクレオチドの３’末側に配置された１又は複数の修飾ヌクレオチド、ヌクレオチドアナログおよび／もしくは修飾ヌクレオチドアナログとを含む核酸鎖である、医薬組成物。
第２の核酸鎖は、
（ｉ）ＲＮＡヌクレオチドと、任意にヌクレオチドアナログと、任意にＤＮＡヌクレオチドとを含み、
（ｉｉ）ＤＮＡヌクレオチド及び／又はヌクレオチドアナログを含み、又は、
（ｉｉｉ）ＰＮＡヌクレオチドを含む
核酸鎖である、請求項１に記載の医薬組成物。
前記転写産物は、タンパク質をコードするｍＲＮＡ転写産物である、請求項１又は２に記載の医薬組成物。
前記転写産物は、タンパク質をコードしない転写産物である、請求項１又は２に記載の医薬組成物。
請求項１〜４のいずれか一項に記載の医薬組成物であって、第１の核酸鎖におけるヌクレオチド及び任意に含まれるヌクレオチドアナログの前記総数と、第２の核酸鎖におけるＲＮＡヌクレオチド、ＤＮＡヌクレオチド、ヌクレオチドアナログ及びＰＮＡヌクレオチドの総数とが同じである医薬組成物。
請求項１〜４のいずれか一項に記載の医薬組成物であって、第１の核酸鎖におけるヌクレオチド及び任意に含まれるヌクレオチドアナログの前記総数と、第２の核酸鎖におけるＲＮＡヌクレオチド、ＤＮＡヌクレオチド、ヌクレオチドアナログ及びＰＮＡヌクレオチドの総数とが異なる、医薬組成物。
請求項６に記載の医薬組成物であって、第２の核酸鎖におけるＲＮＡヌクレオチド、ＤＮＡヌクレオチド、ヌクレオチドアナログ及びＰＮＡヌクレオチドの前記総数が、第１の核酸鎖におけるヌクレオチド及び任意に含まれるヌクレオチドアナログの前記総数よりも大きい、医薬組成物。
請求項１〜７のいずれか一項に記載の医薬組成物であって、第１の核酸鎖に含まれるヌクレオチドの総数が１０〜３５ヌクレオチドである、医薬組成物。
請求項１〜８のいずれか一項に記載の医薬組成物であって、第１の核酸鎖が、ＲＮａｓｅＨによって認識される前記少なくとも４つの連続したヌクレオチドの５’及び／又は３’側に位置する１又は複数のヌクレオチドアナログを含む核酸鎖である、医薬組成物。
請求項１〜９のいずれか一項に記載の医薬組成物であって、第１の核酸鎖が、
ＲＮａｓｅＨによって認識される前記少なくとも４つの連続したヌクレオチドの５’側に位置する１又は複数のヌクレオチドアナログからなる５’ウィング領域、及び／又は、
ＲＮａｓｅＨによって認識される前記少なくとも４つの連続したヌクレオチドの３’側に位置する１又は複数のヌクレオチドアナログからなる３’ウィング領域を含む核酸鎖である、医薬組成物。
請求項１０に記載の医薬組成物であって、第１の核酸鎖が、前記５’ウィング領域及び３’ウィング領域を含み、該５’ウィング領域が少なくとも２つのヌクレオチドアナログを含み、かつ、該３’ウィング領域が少なくとも２つのヌクレオチドアナログを含む核酸鎖である、医薬組成物。
請求項１１に記載の医薬組成物であって、前記５’ウィング領域及び前記３’ウィング領域が、独立して２〜１０個のヌクレオチドアナログを含む、医薬組成物。
請求項１２に記載の医薬組成物であって、前記５’ウィング領域及び前記３’ウィング領域が、独立して２〜３個のヌクレオチドアナログを含む、医薬組成物。
請求項１〜１３のいずれか一項に記載の医薬組成物であって、第１の核酸鎖が、２’−Ｏ−ＣＨ_３基又は２’−Ｏ−ＣＨ_２ＣＨ_２ＯＣＨ_３（ＭＯＥ）基を含むヌクレオチドを少なくとも１つ含む核酸鎖である、医薬組成物。
請求項１〜１４のいずれか一項に記載の医薬組成物であって、第１の核酸鎖が、少なくとも１つのヌクレオチドアナログを含み、該ヌクレオチドアナログが架橋化ヌクレオチドである、医薬組成物。
請求項１５に記載の医薬組成物であって、第１の核酸鎖が、ＬＮＡ、ｃＥｔ−ＢＮＡ、アミドＢＮＡ（ＡｍＮＡ）及びｃＭＯＥ−ＢＮＡから独立して選択される架橋化ヌクレオチドを含む核酸鎖である、医薬組成物。
請求項１５に記載の医薬組成物であって、第１の核酸鎖が、４’−（ＣＨ_２）ｐ−Ｏ−２’、４’−（ＣＨ_２）ｐ−Ｓ−２’、４’−（ＣＨ_２）ｐ−ＯＣＯ−２’、４’−（ＣＨ_２）ｎ−Ｎ（Ｒ_３）−Ｏ−（ＣＨ_２）ｍ−２’によって、２’位の炭素と４’位の炭素とが架橋されているリボヌクレオチドから、独立して選択される架橋化ヌクレオチドを含む核酸鎖である、医薬組成物（ｐ、ｍ及びｎは、各々１〜４、０〜２及び１〜３の整数である。Ｒ_３は、水素原子、アルキル基、アルケニル基、シクロアルキル基、アリール基、アラルキル基、アシル基、スルホニル基、蛍光あるいは化学発光標識分子、核酸切断活性官能基、又は、細胞内若しくは核内移行シグナルペプチドを示す）。
請求項１〜１７のいずれか一項に記載の医薬組成物であって、第１の核酸鎖における少なくとも１つのヌクレオチドがホスホロチオエート化されている、医薬組成物。
請求項１〜１８のいずれか一項に記載の医薬組成物であって、第１の核酸鎖における少なくとも１つのヌクレオチドアナログがホスホロチオエート化されている、医薬組成物。
請求項１〜１９のいずれか一項に記載の医薬組成物であって、第１の核酸鎖が、前記転写産物にハイブリダイズした際に、ＲＮａｓｅＨによって認識される４〜２０個の連続したヌクレオチドを含む核酸鎖である、医薬組成物。
請求項１０〜２０のいずれか一項に記載の医薬組成物であって、
第１の核酸鎖が、前記５’ウィング領域及び３’ウィング領域を含み、
（ｉ）該５’ウィング領域におけるヌクレオチドアナログは架橋化ヌクレオチドであり、
（ｉｉ）該３’ウィング領域におけるヌクレオチドアナログは架橋化ヌクレオチドであり、かつ、
（ｉｉｉ）前記転写産物にハイブリダイズした際に、ＲＮａｓｅＨによって認識される前記連続したヌクレオチドは、ＤＮＡヌクレオチドである、医薬組成物。
請求項１〜２１のいずれか一項に記載の医薬組成物であって、第１の核酸鎖におけるヌクレオチド及びヌクレオチドアナログの総数が、１２〜２５ヌクレオチドである、医薬組成物。
請求項２２に記載の医薬組成物であって、第２の核酸鎖が第１の核酸鎖にアニーリングした際に、ＲＮａｓｅＨによって切断される、少なくとも４つの連続したヌクレオチドを含む核酸鎖である、医薬組成物。
請求項２３に記載の医薬組成物であって、第２の核酸鎖が、前記少なくとも４つの連続したヌクレオチドの５’及び／又は３’側に、１又は複数のホスホロチオエート化されているヌクレオチドを含む核酸鎖である、医薬組成物。
請求項２４に記載の医薬組成物であって、第２の核酸鎖が、
前記少なくとも４つの連続したヌクレオチドの５’側に位置する１又は複数のヌクレオチドアナログからなる５’ウィング領域、及び／又は、
前記少なくとも４つの連続したヌクレオチドの３’側に位置する１又は複数のヌクレオチドアナログからなる３’ウィング領域を含む核酸鎖である、医薬組成物。
請求項２５に記載の医薬組成物であって、第２の核酸鎖が、前記５’ウィング領域及び前記３’ウィング領域を含み、該５’ウィング領域が少なくとも２つのヌクレオチドアナログを含み、かつ、第１の核酸鎖における前記３’ウィング領域が少なくとも２つのヌクレオチドアナログを含む核酸鎖である、医薬組成物。
請求項２６に記載の医薬組成物であって、前記５’ウィング領域及び前記３’ウィング領域が、独立して２〜１０個のヌクレオチドアナログを含む、医薬組成物。
請求項２７に記載の医薬組成物であって、前記５’ウィング領域及び前記３’ウィング領域が、独立して２〜３個のヌクレオチドアナログを含む、医薬組成物。
請求項２３〜２８のいずれか一項に記載の医薬組成物であって、第２の核酸鎖が、２’−Ｏ−ＣＨ_３基又は２’−Ｏ−ＣＨ_２ＣＨ_２ＯＣＨ_３（ＭＯＥ）基を含むＲＮＡヌクレオチドを少なくとも１つ含む核酸鎖である、医薬組成物。
請求項２３〜２９のいずれか一項に記載の医薬組成物であって、第２の核酸鎖が、少なくとも１つのヌクレオチドアナログを含み、該ヌクレオチドアナログが架橋化ヌクレオチドである、医薬組成物。
請求項３０に記載の医薬組成物であって、第２の核酸鎖が、ＬＮＡ、ｃＥｔ−ＢＮＡ、アミドＢＮＡ（ＡｍＮＡ）及びｃＭＯＥ−ＢＮＡから独立して選択される架橋化ヌクレオチドを含む核酸鎖である、医薬組成物。
請求項３０に記載の医薬組成物であって、第２の核酸鎖が、４’−（ＣＨ_２）ｐ−Ｏ−２’、４’−（ＣＨ_２）ｐ−Ｓ−２’、４’−（ＣＨ_２）ｐ−ＯＣＯ−２’、４’−（ＣＨ_２）ｎ−Ｎ（Ｒ_３）−Ｏ−（ＣＨ_２）ｍ−２’によって、２’位の炭素と４’位の炭素とが架橋されているリボヌクレオチドから、独立して選択される架橋化ヌクレオチドを含む核酸鎖である、医薬組成物（ｐ、ｍ及びｎは、各々１〜４、０〜２及び１〜３の整数である。Ｒ_３は、水素原子、アルキル基、アルケニル基、シクロアルキル基、アリール基、アラルキル基、アシル基、スルホニル基、蛍光あるいは化学発光標識分子、核酸切断活性官能基、又は、細胞内若しくは核内移行シグナルペプチドを示す）。
請求項２５〜３２のいずれか一項に記載の医薬組成物であって、
第２の核酸鎖が、前記５’ウィング領域及び３’ウィング領域を含み、
（ｉ）該５’ウィング領域におけるヌクレオチドアナログは架橋化ヌクレオチドであり、
（ｉｉ）該３’ウィング領域におけるヌクレオチドアナログは架橋化ヌクレオチドであり、かつ、
（ｉｉｉ）第２の核酸鎖が第１の核酸鎖にアニーリングした際に、ＲＮａｓｅＨによって切断される前記連続したヌクレオチドは、ＲＮＡヌクレオチドである、医薬組成物。
請求項３３に記載の医薬組成物であって、第２の核酸鎖において、少なくとも１つのＲＮＡヌクレオチド及び又は少なくとも１つのヌクレオチドアナログが、ホスホロチオエート化されている、医薬組成物。
請求項２〜２２のいずれか一項に記載の医薬組成物であって、第２の核酸鎖がＰＮＡヌクレオチドを含む核酸鎖である、医薬組成物。
請求項２２〜３５のいずれか一項に記載の医薬組成物であって、第２の核酸鎖が、標識機能、精製機能及び標的への送達機能から選択される機能を有する機能性部分を更に含む核酸鎖である、医薬組成物。
請求項１〜４及び６〜３０のいずれか一項に記載の医薬組成物であって、前記二本鎖核酸複合体が、第２の核酸鎖にアニーリングする第３の核酸鎖を更に含む複合体である、医薬組成物。
請求項３７に記載の医薬組成物であって、第３の核酸鎖は第１の核酸鎖と同じである、医薬組成物。
請求項３７に記載の医薬組成物であって、第３の核酸鎖は、
（ｉ）ヌクレオチドと任意にヌクレオチドアナログとを含み、
（ｉｉ）第２の転写産物にハイブリダイズした際に、ＲＮａｓｅＨによって認識される少なくとも４つの連続したヌクレオチドを含み、
（ｉｉｉ）該ヌクレオチド及び任意に含まれる該ヌクレオチドアナログの総数は８〜１００であり、かつ
（ｉｖ）第２の転写産物にハイブリダイズする
核酸である、医薬組成物。
請求項３７に記載の医薬組成物であって、第３の核酸鎖はＰＮＡヌクレオチドを含む核酸鎖である、医薬組成物。
請求項３７〜４０のいずれか一項に記載の医薬組成物であって、第３の核酸鎖が、標識機能、精製機能及び標的への送達機能から選択される機能を有する機能性部分を更に含む核酸鎖である、医薬組成物。
請求項３６又は４１に記載の医薬組成物であって、前記機能性部分が、脂質、ペプチド及びタンパク質から選択される分子である、医薬組成物。
請求項４２に記載の医薬組成物であって、前記機能性部分が、前記核酸鎖の３’末端のヌクレオチド又は５’末端のヌクレオチドに結合している、医薬組成物。
請求項４２又は４３に記載の医薬組成物であって、前記機能性部分が脂質である、医薬組成物。
請求項４４に記載の医薬組成物であって、前記脂質が、コレステロール、脂肪酸、脂溶性ビタミン、糖脂質及びグリセリドから選択される、医薬組成物。
請求項４４に記載の医薬組成物であって、前記機能性部分が、コレステロール、トコフェロール及びトコトリエノールから選択される脂質である、医薬組成物。
請求項４２又は４３に記載の医薬組成物であって、前記機能性部分が、受容体のリガンド及び抗体から選択されるペプチド又はタンパク質である医薬組成物。
精製又は単離された二本鎖核酸複合体であって、
第２の核酸鎖がアニーリングしている第１の核酸鎖を含み、
（ｉ）第１の核酸鎖は、標的転写産物にハイブリダイズする核酸鎖であり、そして
（ａ）転写産物にハイブリダイズした際に、ＲＮａｓｅＨによって認識される少なくとも４つの連続したＤＮＡヌクレオチドもしくは修飾ＤＮＡヌクレオチドを含み、さらに
（ｂ）前記ＲＮａｓｅＨにより認識される少なくとも４つの連続したＤＮＡヌクレオチドもしくは修飾ＤＮＡヌクレオチドの５’末側に配置された１又は複数のヌクレオチドアナログもしくは修飾ヌクレオチドアナログを含む５’ウイング領域、ならびに／または
（ｃ）前記ＲＮａｓｅＨにより認識される少なくとも４つの連続したＤＮＡヌクレオチドもしくは修飾ＤＮＡヌクレオチドの３’末側に配置された１又は複数のヌクレオチドアナログもしくは修飾ヌクレオチドアナログを含む３’ウイング領域を含む核酸鎖であり、かつ、
（ｉｉ）第２の核酸鎖は、
（ａ）少なくとも４つの連続したＲＮＡヌクレオチドと、さらに
（ｂ）前記少なくとも４つの連続したＲＮＡヌクレオチドの５’末側に配置された１又は複数の修飾ヌクレオチド、ヌクレオチドアナログおよび／もしくは修飾ヌクレオチドアナログ、ならびに／または
（ｃ）前記少なくとも４つの連続したＲＮＡヌクレオチドの３’末側に配置された１又は複数の修飾ヌクレオチド、ヌクレオチドアナログおよび／もしくは修飾ヌクレオチドアナログとを含む核酸鎖である、二本鎖核酸複合体。
請求項４８に記載の、精製又は単離された二本鎖核酸複合体であって、
第２の核酸鎖は、
（ｉ）ＲＮＡヌクレオチドと、任意にヌクレオチドアナログと、任意にＤＮＡヌクレオチドとを含み、
（ｉｉ）ＤＮＡヌクレオチド及び／又はヌクレオチドアナログを含み、又は、
（ｉｉｉ）ＰＮＡヌクレオチドを含む、二本鎖核酸複合体。
哺乳動物を治療するための医薬組成物であって、前記転写産物が哺乳動物の転写産物であり、請求項４８又は４９に記載の二本鎖核酸複合体と、薬理学上許容される担体とを含む、医薬組成物。
哺乳動物において遺伝子の発現を低減するための薬剤を製造するための、請求項４８及び４９のいずれかに記載の二本鎖核酸複合体の使用。
哺乳動物において遺伝子の発現を低減するための、請求項４８及び４９のいずれかに記載の二本鎖核酸複合体の使用。
医薬組成物であって、
（Ａ）第２の核酸鎖がアニーリングしている第１の核酸鎖を含み、突出したヌクレオチドを有さない、二本鎖核酸複合体と、
（Ｂ）薬理学上許容される担体とを含み、
第１の核酸鎖が、
（ｉ）ヌクレオチドと任意にヌクレオチドアナログとを含み、該核酸鎖における該ヌクレオチド及び任意に含まれる該ヌクレオチドアナログの総数は８〜２５であり、
（ｉｉ）遺伝子の転写産物にハイブリダイズした際に、ＲＮａｓｅＨによって認識される少なくとも４つの連続したＤＮＡヌクレオチドを含み、
（ｉｉｉ）架橋化ヌクレオチドからなる５’ウィング領域及び３’ウィング領域を含み、
（ｉｖ）ホスホロチオエート化されているヌクレオチドを任意に含み、かつ、
（ｖ）前記転写産物にハイブリダイズする核酸鎖であり、
第２の核酸鎖が、
ｉ）ヌクレオチドと任意にヌクレオチドアナログとを含み、
ｉｉ）少なくとも４つの連続したＲＮＡヌクレオチドを含み、かつ、
ｉｉｉ）ホスホロチオエート化されているヌクレオチドを任意に含む核酸鎖である、医薬組成物。
請求項５３に記載の医薬組成物であって、第２の核酸鎖にアニーリングする第３の核酸鎖を更に含む、医薬組成物。
請求項５３及び５４のいずれか一項に記載の医薬組成物であって、第２の核酸鎖及び第３の核酸鎖のうちの少なくとも１の核酸鎖が、精製機能及び標的への送達機能から選択される機能を有する機能性部分を更に含む核酸鎖である、医薬組成物。
請求項５３〜５５のうちのいずれか一項に記載の医薬組成物であって、前記機能性部分がビタミンＥ及びコレステロールから選択される、医薬組成物。
請求項５３〜５６のうちのいずれか一項に記載の医薬組成物であって、前記架橋化ヌクレオチドがＬＮＡである、医薬組成物。