JP2014500724A5 - - Google Patents

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本発明のいくつかの態様は、以下のa)〜h)を含む群から選ばれる1つ以上のタンパク質をコードするコード配列を含んでなる核酸分子を含む:a)配列番号2;配列番号2のアミノ酸69、78、80、82、102、110、137、139、165、189、203、220、232、および248が保存されることを条件として、配列番号2と98%相同のタンパク質;もしくは、配列番号2のアミノ酸69、78、80、82、102、110、137、139、165、189、203、220、232、および248が保存されることを条件として、配列番号2の少なくとも256個のアミノ酸残基に対応するアミノ酸を含む配列番号2の免疫原性断片;b)配列番号4;配列番号4のアミノ酸21、86、127、129、154、156、182、195、206、218、220、237、249、255、265、271、および275が保存されることを条件として、配列番号4と98%相同のタンパク質;もしくは、配列番号4のアミノ酸21、86、127、129、154、156、182、195、206、218、220、237、249、255、265、271、および275が保存されることを条件として、配列番号4の少なくとも274個のアミノ酸残基に対応するアミノ酸を含む配列番号4の免疫原性断片;c)配列番号6;配列番号6のアミノ酸14、15、32、47、58、79、111、157、223、320、350、475、499、569、613、624、653、660、663、733、および734が保存されることを条件として、配列番号6と98%相同のタンパク質;もしくは、配列番号6のアミノ酸14、15、32、47、58、79、111、157、223、320、350、475、499、569、613、624、653、660、663、733、および734が保存されることを条件として、配列番号6の少なくとも735個のアミノ酸残基に対応するアミノ酸を含む配列番号6の免疫原性断片;d)配列番号8;配列番号8のアミノ酸2、3、3、4、6、7、9、12、17、240、33、36、49、51、56、58、630、64、670、67、680、750、および75が保存されることを条件として、配列番号8と98%相同のタンパク質;もしくは、配列番号8のアミノ酸2、3、3、4、6、7、9、12、17、240、33、36、49、51、56、58、630、64、670、67、680、750、および75が保存されることを条件として、配列番号8の少なくとも75個のアミノ酸残基に対応するアミノ酸を含む配列番号8の免疫原性断片;e)配列番号10;配列番号10と98%相同のタンパク質;もしくは、配列番号10の少なくとも333個のアミノ酸残基に対応するアミノ酸を含む配列番号10の免疫原性断片;f)配列番号12;配列番号12と98%相同のタンパク質;もしくは、配列番号12の少なくとも349個のアミノ酸残基に対応するアミノ酸を含む配列番号12の免疫原性断片;g)配列番号14;配列番号14と98%相同のタンパク質;もしくは、配列番号14の少なくとも129個のアミノ酸残基に対応するアミノ酸を含む配列番号14の免疫原性断片;または、h)配列番号14のアミノ酸19〜131に連結したシグナルペプチド;配列番号14のアミノ酸19〜131と98%相同のアミノ酸配列に連結したシグナルペプチドを有するタンパク質;もしくは、配列番号14のアミノ酸19〜131の免疫原性断片に連結したシグナルペプチドを有するタンパク質であって、この断片は配列番号14の少なくとも110個のアミノ酸残基を含み、かつシグナルペプチドに連結している、タンパク質。いくつかの実施形態では、核酸は、タンパク質a)、b)、c)、またはd)をコードするものから選ばれる。
別の態様では、以下のa)〜h)からなる群より選ばれるタンパク質を提供する:a)配列番号2;配列番号2のアミノ酸69、78、80、82、102、110、137、139、165、189、203、220、232、および248が保存されることを条件として、配列番号2と98%相同のタンパク質;もしくは、配列番号2のアミノ酸69、78、80、82、102、110、137、139、165、189、203、220、232、および248が保存されることを条件として、配列番号2の少なくとも261個のアミノ酸残基に対応するアミノ酸を含む配列番号2の免疫原性断片;b)配列番号4;配列番号4のアミノ酸21、86、127、129、154、156、182、195、206、218、220、237、249、255、265、271、および275が保存されることを条件として、配列番号4と98%相同のタンパク質;もしくは、配列番号4のアミノ酸21、86、127、129、154、156、182、195、206、218、220、237、249、255、265、271、および275が保存されることを条件として、配列番号4の少なくとも274個のアミノ酸残基に対応するアミノ酸を含む配列番号4の免疫原性断片;c)配列番号6;配列番号6のアミノ酸14、15、32、47、58、79、111、157、223、320、350、475、499、569、613、624、653、660、663、733、および734が保存されることを条件として、配列番号6と98%相同のタンパク質;もしくは、配列番号6のアミノ酸14、15、32、47、58、79、111、157、223、320、350、475、499、569、613、624、653、660、663、733、および734が保存されることを条件として、配列番号6の少なくとも735個のアミノ酸残基に対応するアミノ酸を含む配列番号6の免疫原性断片;d)配列番号8;配列番号8のアミノ酸2、3、3、4、6、7、9、12、17、240、33、36、49、51、56、58、630、64、670、67、680、750、および75が保存されることを条件として、配列番号8と98%相同のタンパク質;もしくは、配列番号8のアミノ酸2、3、3、4、6、7、9、12、17、240、33、36、49、51、56、58、630、64、670、67、680、750、および75が保存されることを条件として、配列番号8の少なくとも75個のアミノ酸残基に対応するアミノ酸を含む配列番号8の免疫原性断片;e)配列番号10;配列番号10と98%相同のタンパク質;もしくは、配列番号10の少なくとも333個のアミノ酸残基に対応するアミノ酸を含む配列番号10の免疫原性断片;f)配列番号12;配列番号12と98%相同のタンパク質;もしくは、配列番号12の少なくとも349個のアミノ酸残基に対応するアミノ酸を含む配列番号12の免疫原性断片;g)配列番号14;配列番号14と98%相同のタンパク質;もしくは、配列番号14の少なくとも129個のアミノ酸残基に対応するアミノ酸を含む配列番号14の免疫原性断片;またはh)配列番号14のアミノ酸19〜131に連結したシグナルペプチド;配列番号14のアミノ酸19〜131と98%相同のアミノ酸配列に連結したシグナルペプチドを有するタンパク質;もしくは、配列番号14のアミノ酸19〜131の免疫原性断片に連結したシグナルペプチドを有するタンパク質であって、この断片は配列番号14の少なくとも110個のアミノ酸残基を含み、かつシグナルペプチドに連結している、タンパク質。いくつかの実施形態では、タンパク質は、タンパク質a)、b)、c)、またはd)を含む群から選ばれる。

本発明の他の態様は、本明細書で提供する核酸分子と、薬剤的に許容可能な賦形剤と、を含む医薬組成物である。
例えば、本発明は、以下の項目を提供する:
(項目1)
以下を含む群から選ばれる1つ以上のタンパク質をコードするコード配列を含む核酸分子:
a)配列番号2、配列番号2のアミノ酸69、78、80、82、102、110、137、139、165、189、203、220、232、および248が保存されることを条件として、配列番号2と98%相同のタンパク質、もしくは、配列番号2のアミノ酸69、78、80、82、102、110、137、139、165、189、203、220、232、および248が保存されることを条件として、配列番号2の少なくとも256個のアミノ酸残基に対応するアミノ酸を含む配列番号2の免疫原性断片;
b)配列番号4、配列番号4のアミノ酸21、86、127、129、154、156、182、195、206、218、220、237、249、255、265、271、もしくは275が保存されることを条件として、配列番号4と98%相同のタンパク質、もしくは、配列番号4のアミノ酸21、86、127、129、154、156、182、195、206、218、220、237、249、255、265、271、もしくは275が保存されることを条件として、配列番号4の少なくとも274個のアミノ酸残基に対応するアミノ酸を含む配列番号4の免疫原性断片;
c)配列番号6、配列番号6のアミノ酸14、15、32、47、58、79、111、157、223、320、350、475、499、569、613、624、653、660、663、733、および734が保存されることを条件として、配列番号6と98%相同のタンパク質、もしくは、配列番号6のアミノ酸14、15、32、47、58、79、111、157、223、320、350、475、499、569、613、624、653、660、663、733、および734が保存されることを条件として、配列番号6の少なくとも735個のアミノ酸残基に対応するアミノ酸を含む配列番号6の免疫原性断片;
d)配列番号8、配列番号8のアミノ酸21、31、32、49、64、75、96、128、174、240、337、367、492、516、565、586、630、641、670、677、680、750、および751が保存されることを条件として、配列番号8と98%相同のタンパク質、もしくは、配列番号8のアミノ酸21、31、32、49、64、75、96、128、174、240、337、367、492、516、565、586、630、641、670、677、680、750、および751が保存されることを条件として、配列番号8の少なくとも752個のアミノ酸残基に対応するアミノ酸を含む配列番号8の免疫原性断片;
e)配列番号10、配列番号10と98%相同のタンパク質、もしくは、配列番号10の少なくとも333個のアミノ酸残基に対応するアミノ酸を含む配列番号10の免疫原性断片;
f)配列番号12、配列番号12と98%相同のタンパク質、もしくは、配列番号12の少なくとも349個のアミノ酸残基に対応するアミノ酸を含む配列番号12の免疫原性断片;または
g)配列番号14、配列番号14と98%相同のタンパク質、もしくは、配列番号14の少なくとも129個のアミノ酸残基に対応するアミノ酸を含む配列番号14の免疫原性断片。
(項目2)
要素a)、b)、c)、またはd)を含む群から選ばれる1つ以上のタンパク質をコードする、項目1に記載の核酸分子。
(項目3)
要素a)またはb)から選ばれる少なくとも1つ、および要素c)またはd)から選ばれる少なくとも1つ、を含む群から選ばれる、1つ以上のタンパク質をコードする、項目1に記載の核酸分子。
(項目4)
配列番号2、配列番号4、配列番号6、配列番号8、配列番号10、配列番号12、または配列番号14を含む群から選ばれる1つ以上のタンパク質をコードする、項目1〜3のいずれか一項に記載の核酸分子。
(項目5)
配列番号2、配列番号4、配列番号6、または配列番号8を含む群から選ばれる1つ以上のタンパク質をコードする、項目1〜3のいずれか一項に記載の核酸分子。
(項目6)
以下を含む群から選ばれる1つ以上の配列を含む、項目に記載の核酸分子:
a)配列番号1、もしくは配列番号1と98%相同のコード配列;
b)配列番号3、もしくは配列番号3と98%相同のコード配列;
c)配列番号5のヌクレオチド1〜2250、もしくは配列番号5のヌクレオチド1〜2250と98%相同のコード配列;
d)配列番号7のヌクレオチド1〜2301、もしくは配列番号7のヌクレオチド1〜2301と98%相同のコード配列;
e)配列番号9、もしくは配列番号9と98%相同のコード配列;
f)配列番号11、もしくは配列番号11と98%相同のコード配列;または
g)配列番号13、もしくは配列番号13と98%相同のコード配列。
(項目7)
要素a)、b)、c)、またはd)を含む群から選ばれる1つ以上のヌクレオチド配列を含む、項目6に記載の核酸分子。
(項目8)
要素a)またはb)から選ばれる少なくとも1つ、および要素c)またはd)から選ばれる少なくとも1つ、を含む群から選ばれる、1つ以上のヌクレオチド配列を含む、項目6に記載の核酸分子。
(項目9)
配列番号1、配列番号3、配列番号5のヌクレオチド1〜2250、配列番号7のヌクレオチド1〜2301、配列番号9、配列番号11、または配列番号13を含む群から選ばれる1つ以上のヌクレオチド配列を含む、項目6〜8のいずれか一項に記載の核酸分子。
(項目10)
上記核酸分子がプラスミドである、項目1〜9のいずれか一項に記載の核酸分子。
(項目11)
上記核酸分子が発現ベクターであり、上記1つ以上のタンパク質をコードする配列は調節要素と機能的に連結する、項目1〜10のいずれか一項に記載の核酸分子。
(項目12)
前立腺癌と診断された個体を治療する方法であって、項目1〜11のいずれか一項に記載の核酸分子を個体に投与することを含む、方法。
(項目13)
以下からなる群より選ばれるタンパク質:
a)配列番号2、配列番号2のアミノ酸69、78、80、82、102、110、137、139、165、189、203、220、232、および248が保存されることを条件として、配列番号2と98%相同のタンパク質、もしくは、配列番号2のアミノ酸69、78、80、82、102、110、137、139、165、189、203、220、232、および248が保存されることを条件として、配列番号2の少なくとも256個のアミノ酸残基に対応するアミノ酸を含む配列番号2の免疫原性断片;
b)配列番号4、配列番号4のアミノ酸21、86、127、129、154、156、182、195、206、218、220、237、249、255、265、271、もしくは275が保存されることを条件として、配列番号4と98%相同のタンパク質、もしくは、配列番号4のアミノ酸21、86、127、129、154、156、182、195、206、218、220、237、249、255、265、271、もしくは275が保存されることを条件として、配列番号4の少なくとも274個のアミノ酸残基に対応するアミノ酸を含む配列番号4の免疫原性断片;
c)配列番号6、配列番号6のアミノ酸14、15、32、47、58、79、111、157、223、320、350、475、499、569、613、624、653、660、663、733、および734が保存されることを条件として、配列番号6と98%相同のタンパク質、もしくは、配列番号6のアミノ酸14、15、32、47、58、79、111、157、223、320、350、475、499、569、613、624、653、660、663、733、および734が保存されることを条件として、配列番号6の少なくとも735個のアミノ酸残基に対応するアミノ酸を含む配列番号6の免疫原性断片;
d)配列番号8、配列番号8のアミノ酸21、31、32、49、64、75、96、128、174、240、337、367、492、516、565、586、630、641、670、677、680、750、および751が保存されることを条件として、配列番号8と98%相同のタンパク質、もしくは、配列番号8のアミノ酸21、31、32、49、64、75、96、128、174、240、337、367、492、516、565、586、630、641、670、677、680、750、および751が保存されることを条件として、配列番号8の少なくとも752個のアミノ酸残基に対応するアミノ酸を含む配列番号8の免疫原性断片;
e)配列番号10、配列番号10と98%相同のタンパク質、もしくは、配列番号10の少なくとも333個のアミノ酸残基に対応するアミノ酸を含む配列番号10の免疫原性断片;
f)配列番号12、配列番号12と98%相同のタンパク質、もしくは、配列番号12の少なくとも349個のアミノ酸残基に対応するアミノ酸を含む配列番号12の免疫原性断片;
g)配列番号14、配列番号14と98%相同のタンパク質、もしくは、配列番号14の少なくとも129個のアミノ酸残基に対応するアミノ酸を含む配列番号14の免疫原性断片;または
h)配列番号14のアミノ酸19〜131に連結したシグナルペプチド、配列番号14のアミノ酸19〜131と98%相同のアミノ酸配列に連結したシグナルペプチドを有するタンパク質、もしくは、配列番号14のアミノ酸19〜131の免疫原性断片に連結したシグナルペプチドを有するタンパク質であって、該断片は配列番号14の少なくとも110個のアミノ酸残基を含み、かつシグナルペプチドに連結している、タンパク質。
(項目14)
要素a)、b)、c)、またはd)を含む群から選ばれる1つ以上のタンパク質をコードする、項目13に記載のタンパク質。
(項目15)
要素a)またはb)から選ばれる少なくとも1つ、および要素c)またはd)から選ばれる少なくとも1つ、を含む群から選ばれる、1つ以上のタンパク質をコードする、項目13に記載のタンパク質。
(項目16)
配列番号2、配列番号4、配列番号6、配列番号8、配列番号10、配列番号12、または配列番号14を含む群から選ばれるタンパク質をコードする、項目13〜15のいずれか一項に記載のタンパク質。
(項目17)
配列番号2、配列番号4、配列番号6、または配列番号8を含む群から選ばれるタンパク質をコードする、項目13〜15のいずれか一項に記載のタンパク質。
(項目18)
前立腺癌と診断された個体を治療する方法であって、項目13〜17のいずれか一項に記載のタンパク質を該個体に送達することを含む、方法。
(項目19)
項目1〜11のいずれか一項に記載の核酸分子と、薬剤的に許容可能な賦形剤と、を含む医薬組成物。

本発明のいくつかの態様は、以下のa)〜h)を含む群から選ばれる1つ以上のタンパク質をコードするコード配列を含んでなる核酸分子を含む:a)配列番号2;配列番号2のアミノ酸69、78、80、82、102、110、137、139、165、189、203、220、232、および248が保存されることを条件として、配列番号2と98%相同のタンパク質;もしくは、配列番号2のアミノ酸69、78、80、82、102、110、137、139、165、189、203、220、232、および248が保存されることを条件として、配列番号2の少なくとも256個のアミノ酸残基に対応するアミノ酸を含む配列番号2の免疫原性断片;b)配列番号4;配列番号4のアミノ酸21、86、127、129、154、156、182、195、206、218、220、237、249、255、265、271、および275が保存されることを条件として、配列番号4と98%相同のタンパク質;もしくは、配列番号4のアミノ酸21、86、127、129、154、156、182、195、206、218、220、237、249、255、265、271、および275が保存されることを条件として、配列番号4の少なくとも274個のアミノ酸残基に対応するアミノ酸を含む配列番号4の免疫原性断片;c)配列番号6;配列番号6のアミノ酸14、15、32、47、58、79、111、157、223、320、350、475、499、569、613、624、653、660、663、733、および734が保存されることを条件として、配列番号6と98%相同のタンパク質;もしくは、配列番号6のアミノ酸14、15、32、47、58、79、111、157、223、320、350、475、499、569、613、624、653、660、663、733、および734が保存されることを条件として、配列番号6の少なくとも735個のアミノ酸残基に対応するアミノ酸を含む配列番号6の免疫原性断片;d)配列番号8;配列番号8のアミノ酸2、3、3、4、6、7、9、12、17、240、33、36、49、51、56、58、630、64、670、67、680、750、および75が保存されることを条件として、配列番号8と98%相同のタンパク質;もしくは、配列番号8のアミノ酸2、3、3、4、6、7、9、12、17、240、33、36、49、51、56、58、630、64、670、67、680、750、および75が保存されることを条件として、配列番号8の少なくとも75個のアミノ酸残基に対応するアミノ酸を含む配列番号8の免疫原性断片;e)配列番号10;配列番号10と98%相同のタンパク質;もしくは、配列番号10の少なくとも333個のアミノ酸残基に対応するアミノ酸を含む配列番号10の免疫原性断片;f)配列番号12;配列番号12と98%相同のタンパク質;もしくは、配列番号12の少なくとも349個のアミノ酸残基に対応するアミノ酸を含む配列番号12の免疫原性断片;g)配列番号14;配列番号14と98%相同のタンパク質;配列番号14の少なくとも129個のアミノ酸残基に対応するアミノ酸を含む配列番号14の免疫原性断片;もしくは、配列番号14の少なくとも129個のアミノ酸残基を含む配列番号14の免疫原性断片;または、h)配列番号14のアミノ酸19〜131に連結したシグナルペプチド;配列番号14のアミノ酸19〜131と98%相同のアミノ酸配列に連結したシグナルペプチドを有するタンパク質;もしくは、配列番号14のアミノ酸19〜131の免疫原性断片に連結したシグナルペプチドを有するタンパク質であって、この断片は配列番号14の少なくとも110個のアミノ酸残基を含み、かつシグナルペプチドに連結している、タンパク質。PSAの2つのコンセンサスタンパク質配列:PSAコンセンサス抗原配列1(配列番号2)とPSAコンセンサス抗原配列2(配列番号4)が開示される。PSMAの2つのコンセンサスタンパク質配列:PSMAコンセンサス抗原配列1(配列番号6)とPSMAコンセンサス抗原配列2(配列番号8)が開示される。STEAP(本明細書ではSTEAP1とも称する)の2つのコンセンサスタンパク質配列:STEAPコンセンサス抗原配列1(配列番号10)とSTEAPコンセンサス抗原配列2(配列番号12)が開示される。PSCAの1つのコンセンサスタンパク質配列:PSCAコンセンサス抗原配列(配列番号14)が開示される。配列番号14は、IgEシグナルペプチドを含む。いくつかの実施形態では、PSCAコンセンサス抗原は、配列番号14のIgEシグナル以外のシグナル配列に連結した、配列番号14のアミノ酸19〜131を含み得る。いくつかの実施形態では、核酸分子は、上記タンパク質a)、b)、c)、またはd)をコードするものから選ばれる。他の実施形態では、核酸分子は、タンパク質a)またはb)をコードするものから選ばれる少なくとも1つ、およびタンパク質c)またはd)をコードするものから選ばれる少なくとも1つ、を含む群より選ばれる1つ以上のタンパク質をコードする核酸分子である。

別の態様では、以下のa)〜h)からなる群より選ばれるタンパク質を提供する:a)配列番号2;配列番号2のアミノ酸69、78、80、82、102、110、137、139、165、189、203、220、232、および248が保存されることを条件として、配列番号2と98%相同のタンパク質;もしくは、配列番号2のアミノ酸69、78、80、82、102、110、137、139、165、189、203、220、232、および248が保存されることを条件として、配列番号2の少なくとも256個のアミノ酸残基に対応するアミノ酸を含む配列番号2の免疫原性断片;b)配列番号4;配列番号4のアミノ酸21、86、127、129、154、156、182、195、206、218、220、237、249、255、265、271、および275が保存されることを条件として、配列番号4と98%相同のタンパク質;もしくは、配列番号4のアミノ酸21、86、127、129、154、156、182、195、206、218、220、237、249、255、265、271、および275が保存されることを条件として、配列番号4の少なくとも274個のアミノ酸残基に対応するアミノ酸を含む配列番号4の免疫原性断片;c)配列番号6;配列番号6のアミノ酸14、15、32、47、58、79、111、157、223、320、350、475、499、569、613、624、653、660、663、733、および734が保存されることを条件として、配列番号6と98%相同のタンパク質;もしくは、配列番号6のアミノ酸14、15、32、47、58、79、111、157、223、320、350、475、499、569、613、624、653、660、663、733、および734が保存されることを条件として、配列番号6の少なくとも735個のアミノ酸残基に対応するアミノ酸を含む配列番号6の免疫原性断片;d)配列番号8;配列番号8のアミノ酸2、3、3、4、6、7、9、12、17、240、33、36、49、51、56、58、630、64、670、67、680、750、および75が保存されることを条件として、配列番号8と98%相同のタンパク質;もしくは、配列番号8のアミノ酸2、3、3、4、6、7、9、12、17、240、33、36、49、51、56、58、630、64、670、67、680、750、および75が保存されることを条件として、配列番号8の少なくとも75個のアミノ酸残基に対応するアミノ酸を含む配列番号8の免疫原性断片;e)配列番号10;配列番号10と98%相同のタンパク質;もしくは、配列番号10の少なくとも333個のアミノ酸残基に対応するアミノ酸を含む配列番号10の免疫原性断片;f)配列番号12;配列番号12と98%相同のタンパク質;もしくは、配列番号12の少なくとも349個のアミノ酸残基に対応するアミノ酸を含む配列番号12の免疫原性断片;g)配列番号14;配列番号14と98%相同のタンパク質;もしくは、配列番号14の少なくとも129個のアミノ酸残基に対応するアミノ酸を含む配列番号14の免疫原性断片;または、h)配列番号14のアミノ酸19〜131に連結したシグナルペプチド;配列番号14のアミノ酸19〜131と98%相同のアミノ酸配列に連結したシグナルペプチドを有するタンパク質;もしくは、配列番号14のアミノ酸19〜131の免疫原性断片に連結したシグナルペプチドを有するタンパク質であって、この断片は配列番号14の少なくとも110個のアミノ酸残基を含み、かつシグナルペプチドに連結している、タンパク質。いくつかの実施形態では、タンパク質は、タンパク質a)、b)、c)、またはd)を含む群から選ばれる。他の実施形態では、タンパク質は、タンパク質a)またはb)から選ばれる少なくとも1つ、およびタンパク質c)またはd)から選ばれる少なくとも1つ、を含む群より選ばれる1つ以上のタンパク質をコードするタンパク質である。

発現を改善し最適化するための核酸コード配列を生成した。分子内ハイブリダイズによる二次構造の形成が低減されたRNAを生成するように、これらの核酸分子で使われるコドンを選択した。PSAコンセンサス抗原配列1をコードする核酸配列(配列番号1)およびPSAコンセンサス抗原配列2をコードする核酸配列(配列番号3)を開示する。同様に、PSMAコンセンサス抗原配列1の核酸コード配列(配列番号5、または配列番号5のヌクレオチド1〜2250)、およびPSMAコンセンサス抗原配列2の核酸コード配列(配列番号7、または配列番号7のヌクレオチド1〜2301)、ならびにSTEAPコンセンサス抗原配列1の核酸コード配列(配列番号9)、STEAPコンセンサス抗原配列2の核酸コード配列(配列番号11)、およびPSCAコンセンサス抗原配列の核酸コード配列(配列番号13)を提供する。また、配列番号1と98%相同の核酸配列であって、PSAコンセンサス抗原配列1(配列番号2)または配列番号2と最大98%相同のタンパク質、好ましくは配列番号2のアミノ酸69、78、80、82、102、110、137、139、165、189、203、220、232、および248を含むタンパク質をコードする核酸配列、ならびに、配列番号3と98%相同の核酸配列であって、PSAコンセンサス抗原配列2(配列番号4)または配列番号4と最大98%相同のタンパク質、好ましくは配列番号4のアミノ酸21、86、127、129、154、156、182、195、206、218、220、237、249、255、265、271、および275を含むタンパク質をコードする核酸配列も提供する。同様に、配列番号5のヌクレオチド2250と98%相同の核酸配列であって、PSMAコンセンサス抗原配列1(配列番号6)もしくは配列番号6と最大で98%相同のタンパク質、好ましくは配列番号6のアミノ酸14、15、32、47、58、79,111、157、223、320、350、475、499、569、613、624、653、660、663、733、および734を含むタンパク質をコードする核酸配列、または、配列番号7のヌクレオチド2301と98%相同の核酸配列であり、PSMAコンセンサス抗原配列1(配列番号8)もしくは配列番号8と最大で98%相同のタンパク質、好ましくは配列番号8のアミノ酸2、3、3、4、6、7、9、12、17、240、33、36、49、51、56、58、630、64、670、67、680、750、および75を含むタンパク質をコードする核酸配列、ならびに、配列番号9と98%相同のヌクレオチドであって、STEAPコンセンサス抗原配列1(配列番号10)もしくは配列番号10と最大で98%相同のタンパク質をコードするヌクレオチド、配列番号11と98%相同のヌクレオチドであって、STEAPコンセンサス抗原配列2(配列番号12)もしくは配列番号12と最大で98%相同のタンパク質をコードするヌクレオチド、および配列番号13と98%相同のヌクレオチドであって、PSCAコンセンサス抗原配列(配列番号14)もしくは配列番号14と最大で98%相同のタンパク質をコードするヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、核酸分子は、IgEシグナルペプチドを含むタンパク質をコードする(例えば、配列番号4をコードする配列番号3;配列番号8をコードする配列番号7のヌクレオチド1〜2301;配列番号12をコードする配列番号11;および配列番号14をコードする配列番号13)。

ヒトPSMA配列は、約749〜750個のアミノ酸である。PSMAコンセンサス抗原1の断片は、アミノ酸14、15、32、47、58、79,111、157、223、320、350、475、499、569、613、624、653、660、663、733、および734のうちの1つ以上を含むことを条件として、配列番号6の少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、または99%を含み得、好ましくは98%または99%を含む。PSMAコンセンサス抗原1の断片は、配列番号6の745、746、747、748、または749個のアミノ酸を含み得るが、好ましくは735個以上のアミノ酸を含む。PSMAコンセンサス抗原2の断片は、アミノ酸2、3、3、4、6、7、9、12、17、240、33、36、49、51、56、58、630、64、670、67、680、750、および75のうちの1つ以上を含むことを条件として、配列番号8の少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、または99%を含み得、好ましくは98%または99%を含む。このようなPSAコンセンサス抗原2のすべての断片は、任意選択で、アミノ酸1〜1を除外してもよい。いくつかの実施形態では、PSAコンセンサス抗原2の断片は、任意選択で、アミノ酸1〜1の1つ以上、およびアミノ酸1〜アミノ酸76のアミノ酸を含んでもよく、また、PSMAコンセンサス抗原2の断片は、配列番号8の76、76、76、76、76、または76個のアミノ酸を含み得るが、好ましくは75個以上のアミノ酸を含む。

コンセンサスPSMA抗原2(配列番号8)は、ヒトPSA配列と約96%相同であり、M.mulattaPSAと約94%相同である。コンセンサスPSMA抗原2は、そのN末端にリーダー配列を含む。また、コンセンサスPSMA抗原2は、配列番号8のアミノ酸2、3、3、4、6、7、9、12、17、240、33、36、49、51、56、58、630、64、670、67、680、750、および75
がヒトPSA配列と異なる。

単離された核酸分子は、配列番号2のアミノ酸69、78、80、82、102、110、137、139、165、189、203、220、232、および248が保存されることを条件として、PSAコンセンサス抗原配列1(配列番号2)と99%相同の配列を有するタンパク質、配列番号4のアミノ酸21、86、127、129、154、156、182、195、206、218、220、237、249、255、265、271、および275が保存されることを条件として、PSAコンセンサス抗原配列2(配列番号4)と99%相同の配列を有するタンパク質、配列番号6のアミノ酸14、15、32、47、58、79,111、157、223、320、350、475、499、569、613、624、653、660、663、733、および734が保存されることを条件として、PSMAコンセンサス抗原配列1(配列番号6)と99%相同の配列を有するタンパク質、配列番号8のアミノ酸2、3、3、4、6、7、9、12、17、240、33、36、49、51、56、58、630、64、670、67、680、750、および75が保存されることを条件として、PSMAコンセンサス抗原配列2(配列番号8)と99%相同の配列を有するタンパク質、STEAPコンセンサス抗原配列1(配列番号10)と99%相同の配列を有するタンパク質、STEAPコンセンサス抗原配列2(配列番号12)と99%相同の配列を有するタンパク質、または、PSCAコンセンサス抗原配列(配列番号14)と99%相同の配列を有するタンパク質をコードすることができる。

実施例4
コンセンサスPSMA抗原2(配列番号8)を生成した。この配列には、IgEリーダー配列を含めて76個のアミノ酸が含まれており、この配列を、表4に記載のPSMA配列の各々と比較した。使用したPSMA配列には、2つのヒト配列、およびM.mulatta由来の配列が含まれる。表4の記載項目には、コンセンサスPSMA抗原2(配列番号8)との比較に使用した各配列の配列番号および受入番号が含まれる。

Claims (19)

  1. 以下を含む群から選ばれる1つ以上のタンパク質をコードするコード配列を含む核酸分子:
    a)配列番号2、配列番号2のアミノ酸69、78、80、82、102、110、137、139、165、189、203、220、232、および248が保存されることを条件として、配列番号2と98%相同のタンパク質、もしくは、配列番号2のアミノ酸69、78、80、82、102、110、137、139、165、189、203、220、232、および248が保存されることを条件として、配列番号2の少なくとも256個のアミノ酸残基に対応するアミノ酸を含む配列番号2の免疫原性断片;
    b)配列番号4、配列番号4のアミノ酸21、86、127、129、154、156、182、195、206、218、220、237、249、255、265、271、もしくは275が保存されることを条件として、配列番号4と98%相同のタンパク質、もしくは、配列番号4のアミノ酸21、86、127、129、154、156、182、195、206、218、220、237、249、255、265、271、もしくは275が保存されることを条件として、配列番号4の少なくとも274個のアミノ酸残基に対応するアミノ酸を含む配列番号4の免疫原性断片;
    c)配列番号6、配列番号6のアミノ酸14、15、32、47、58、79、111、157、223、320、350、475、499、569、613、624、653、660、663、733、および734が保存されることを条件として、配列番号6と98%相同のタンパク質、もしくは、配列番号6のアミノ酸14、15、32、47、58、79、111、157、223、320、350、475、499、569、613、624、653、660、663、733、および734が保存されることを条件として、配列番号6の少なくとも735個のアミノ酸残基に対応するアミノ酸を含む配列番号6の免疫原性断片;
    d)配列番号8、配列番号8のアミノ酸2、3、3、4、6、7、9、12、17、240、33、36、49、51、56、58、630、64、670、67、680、750、および75が保存されることを条件として、配列番号8と98%相同のタンパク質、もしくは、配列番号8のアミノ酸2、3、3、4、6、7、9、12、17、240、33、36、49、51、56、58、630、64、670、67、680、750、および75が保存されることを条件として、配列番号8の少なくとも75個のアミノ酸残基に対応するアミノ酸を含む配列番号8の免疫原性断片;
    e)配列番号10、配列番号10と98%相同のタンパク質、もしくは、配列番号10の少なくとも333個のアミノ酸残基に対応するアミノ酸を含む配列番号10の免疫原性断片;
    f)配列番号12、配列番号12と98%相同のタンパク質、もしくは、配列番号12の少なくとも349個のアミノ酸残基に対応するアミノ酸を含む配列番号12の免疫原性断片;または
    g)配列番号14、配列番号14と98%相同のタンパク質、もしくは、配列番号14の少なくとも129個のアミノ酸残基に対応するアミノ酸を含む配列番号14の免疫原性断片。
  2. 要素a)、b)、c)、またはd)を含む群から選ばれる1つ以上のタンパク質をコードする、請求項1に記載の核酸分子。
  3. 要素a)またはb)から選ばれる少なくとも1つ、および要素c)またはd)から選ばれる少なくとも1つ、を含む群から選ばれる、1つ以上のタンパク質をコードする、請求項1に記載の核酸分子。
  4. 配列番号2、配列番号4、配列番号6、配列番号8、配列番号10、配列番号12、または配列番号14を含む群から選ばれる1つ以上のタンパク質をコードする、請求項1に記載の核酸分子。
  5. 配列番号2、配列番号4、配列番号6、または配列番号8を含む群から選ばれる1つ以上のタンパク質をコードする、請求項1に記載の核酸分子。
  6. 以下を含む群から選ばれる1つ以上の配列を含む、請求項に記載の核酸分子:
    a)配列番号1、もしくは配列番号1と98%相同のコード配列;
    b)配列番号3、もしくは配列番号3と98%相同のコード配列;
    c)配列番号5のヌクレオチド1〜2250、もしくは配列番号5のヌクレオチド1〜2250と98%相同のコード配列;
    d)配列番号7のヌクレオチド1〜2301、もしくは配列番号7のヌクレオチド1〜2301と98%相同のコード配列;
    e)配列番号9、もしくは配列番号9と98%相同のコード配列;
    f)配列番号11、もしくは配列番号11と98%相同のコード配列;または
    g)配列番号13、もしくは配列番号13と98%相同のコード配列。
  7. 要素a)、b)、c)、またはd)を含む群から選ばれる1つ以上のヌクレオチド配列を含む、請求項6に記載の核酸分子。
  8. 要素a)またはb)から選ばれる少なくとも1つ、および要素c)またはd)から選ばれる少なくとも1つ、を含む群から選ばれる、1つ以上のヌクレオチド配列を含む、請求項6に記載の核酸分子。
  9. 配列番号1、配列番号3、配列番号5のヌクレオチド1〜2250、配列番号7のヌクレオチド1〜2301、配列番号9、配列番号11、または配列番号13を含む群から選ばれる1つ以上のヌクレオチド配列を含む、請求項6に記載の核酸分子。
  10. 前記核酸分子がプラスミドである、請求項1に記載の核酸分子。
  11. 前記核酸分子が発現ベクターであり、前記1つ以上のタンパク質をコードする配列は調節要素と機能的に連結する、請求項1に記載の核酸分子。
  12. 前立腺癌と診断された個体を治療するための組成物であって、請求項1に記載の核酸分子を含む、組成物
  13. 以下からなる群より選ばれるタンパク質:
    a)配列番号2、配列番号2のアミノ酸69、78、80、82、102、110、137、139、165、189、203、220、232、および248が保存されることを条件として、配列番号2と98%相同のタンパク質、もしくは、配列番号2のアミノ酸69、78、80、82、102、110、137、139、165、189、203、220、232、および248が保存されることを条件として、配列番号2の少なくとも256個のアミノ酸残基に対応するアミノ酸を含む配列番号2の免疫原性断片;
    b)配列番号4、配列番号4のアミノ酸21、86、127、129、154、156、182、195、206、218、220、237、249、255、265、271、もしくは275が保存されることを条件として、配列番号4と98%相同のタンパク質、もしくは、配列番号4のアミノ酸21、86、127、129、154、156、182、195、206、218、220、237、249、255、265、271、もしくは275が保存されることを条件として、配列番号4の少なくとも274個のアミノ酸残基に対応するアミノ酸を含む配列番号4の免疫原性断片;
    c)配列番号6、配列番号6のアミノ酸14、15、32、47、58、79、111、157、223、320、350、475、499、569、613、624、653、660、663、733、および734が保存されることを条件として、配列番号6と98%相同のタンパク質、もしくは、配列番号6のアミノ酸14、15、32、47、58、79、111、157、223、320、350、475、499、569、613、624、653、660、663、733、および734が保存されることを条件として、配列番号6の少なくとも735個のアミノ酸残基に対応するアミノ酸を含む配列番号6の免疫原性断片;
    d)配列番号8、配列番号8のアミノ酸2、3、3、4、6、7、9、12、17、240、33、36、49、51、56、58、630、64、670、67、680、750、および75が保存されることを条件として、配列番号8と98%相同のタンパク質、もしくは、配列番号8のアミノ酸2、3、3、4、6、7、9、12、17、240、33、36、49、51、56、58、630、64、670、67、680、750、および75が保存されることを条件として、配列番号8の少なくとも75個のアミノ酸残基に対応するアミノ酸を含む配列番号8の免疫原性断片;
    e)配列番号10、配列番号10と98%相同のタンパク質、もしくは、配列番号10の少なくとも333個のアミノ酸残基に対応するアミノ酸を含む配列番号10の免疫原性断片;
    f)配列番号12、配列番号12と98%相同のタンパク質、もしくは、配列番号12の少なくとも349個のアミノ酸残基に対応するアミノ酸を含む配列番号12の免疫原性断片;
    g)配列番号14、配列番号14と98%相同のタンパク質、もしくは、配列番号14の少なくとも129個のアミノ酸残基に対応するアミノ酸を含む配列番号14の免疫原性断片;または
    h)配列番号14のアミノ酸19〜131に連結したシグナルペプチド、配列番号14のアミノ酸19〜131と98%相同のアミノ酸配列に連結したシグナルペプチドを有するタンパク質、もしくは、配列番号14のアミノ酸19〜131の免疫原性断片に連結したシグナルペプチドを有するタンパク質であって、該断片は配列番号14の少なくとも110個のアミノ酸残基を含み、かつシグナルペプチドに連結している、タンパク質。
  14. 要素a)、b)、c)、またはd)を含む群から選ばれる1つ以上のタンパク質をコードする、請求項13に記載のタンパク質。
  15. 要素a)またはb)から選ばれる少なくとも1つ、および要素c)またはd)から選ばれる少なくとも1つ、を含む群から選ばれる、1つ以上のタンパク質をコードする、請求項13に記載のタンパク質。
  16. 配列番号2、配列番号4、配列番号6、配列番号8、配列番号10、配列番号12、または配列番号14を含む群から選ばれるタンパク質をコードする、請求項13に記載のタンパク質。
  17. 配列番号2、配列番号4、配列番号6、または配列番号8を含む群から選ばれるタンパク質をコードする、請求項13に記載のタンパク質。
  18. 前立腺癌と診断された個体を治療するための組成物であって、請求項13に記載のタンパク質を含む、組成物
  19. 請求項1に記載の核酸分子と、薬剤的に許容可能な賦形剤と、を含む医薬組成物。

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