EA027315B1 - Молекула нуклеиновой кислоты и белок для индукции иммунного ответа против антигена рака предстательной железы, плазмида, вектор экспрессии, способ лечения и фармацевтическая композиция - Google Patents
Молекула нуклеиновой кислоты и белок для индукции иммунного ответа против антигена рака предстательной железы, плазмида, вектор экспрессии, способ лечения и фармацевтическая композиция Download PDFInfo
- Publication number
- EA027315B1 EA027315B1 EA201390689A EA201390689A EA027315B1 EA 027315 B1 EA027315 B1 EA 027315B1 EA 201390689 A EA201390689 A EA 201390689A EA 201390689 A EA201390689 A EA 201390689A EA 027315 B1 EA027315 B1 EA 027315B1
- Authority
- EA
- Eurasian Patent Office
- Prior art keywords
- sequence
- δεο
- consensus
- amino acid
- protein
- Prior art date
Links
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 title claims abstract description 244
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 title claims abstract description 229
- 239000000427 antigen Substances 0.000 title claims abstract description 171
- 108091007433 antigens Proteins 0.000 title claims abstract description 171
- 102000036639 antigens Human genes 0.000 title claims abstract description 171
- 150000007523 nucleic acids Chemical class 0.000 title claims abstract description 138
- 108020004707 nucleic acids Proteins 0.000 title claims abstract description 88
- 102000039446 nucleic acids Human genes 0.000 title claims abstract description 88
- 238000000034 method Methods 0.000 title claims abstract description 37
- 230000028993 immune response Effects 0.000 title claims abstract description 35
- 206010060862 Prostate cancer Diseases 0.000 title claims abstract description 34
- 208000000236 Prostatic Neoplasms Diseases 0.000 title claims abstract description 34
- 239000008194 pharmaceutical composition Substances 0.000 title claims abstract description 34
- 239000013612 plasmid Substances 0.000 title claims abstract description 24
- 230000001939 inductive effect Effects 0.000 title claims abstract description 7
- 238000011282 treatment Methods 0.000 title claims description 4
- 239000013604 expression vector Substances 0.000 title claims description 3
- 239000012634 fragment Substances 0.000 claims abstract description 97
- 125000000539 amino acid group Chemical group 0.000 claims description 65
- 230000002163 immunogen Effects 0.000 claims description 54
- 125000003275 alpha amino acid group Chemical group 0.000 claims description 40
- 125000003729 nucleotide group Chemical group 0.000 claims description 37
- 239000002773 nucleotide Substances 0.000 claims description 36
- 108091028043 Nucleic acid sequence Proteins 0.000 claims description 32
- 230000001105 regulatory effect Effects 0.000 claims description 8
- 239000000546 pharmaceutical excipient Substances 0.000 claims description 6
- 230000002265 prevention Effects 0.000 claims 1
- 210000002307 prostate Anatomy 0.000 abstract description 69
- 239000013598 vector Substances 0.000 abstract description 50
- 230000003053 immunization Effects 0.000 abstract description 12
- 230000001976 improved effect Effects 0.000 abstract description 8
- 229940030749 prostate cancer vaccine Drugs 0.000 abstract description 2
- 150000001413 amino acids Chemical class 0.000 description 174
- 229960005486 vaccine Drugs 0.000 description 80
- 230000000890 antigenic effect Effects 0.000 description 79
- 108020004414 DNA Proteins 0.000 description 57
- 108010076504 Protein Sorting Signals Proteins 0.000 description 48
- 238000004520 electroporation Methods 0.000 description 47
- 101710145634 Antigen 1 Proteins 0.000 description 44
- 210000004027 cell Anatomy 0.000 description 36
- 230000000875 corresponding effect Effects 0.000 description 35
- 230000014509 gene expression Effects 0.000 description 30
- 108091026890 Coding region Proteins 0.000 description 28
- 108090000765 processed proteins & peptides Proteins 0.000 description 25
- 210000001744 T-lymphocyte Anatomy 0.000 description 23
- 238000006243 chemical reaction Methods 0.000 description 23
- 108010041986 DNA Vaccines Proteins 0.000 description 17
- 229940021995 DNA vaccine Drugs 0.000 description 17
- 239000000203 mixture Substances 0.000 description 17
- 230000000295 complement effect Effects 0.000 description 15
- 230000002068 genetic effect Effects 0.000 description 15
- 210000001519 tissue Anatomy 0.000 description 15
- 108020004705 Codon Proteins 0.000 description 14
- 108091035707 Consensus sequence Proteins 0.000 description 14
- 238000004519 manufacturing process Methods 0.000 description 14
- 102000004196 processed proteins & peptides Human genes 0.000 description 14
- 241001465754 Metazoa Species 0.000 description 13
- 230000005847 immunogenicity Effects 0.000 description 13
- 230000008488 polyadenylation Effects 0.000 description 12
- 241000894007 species Species 0.000 description 12
- 241000124008 Mammalia Species 0.000 description 11
- 239000002671 adjuvant Substances 0.000 description 11
- 238000002649 immunization Methods 0.000 description 11
- 238000001890 transfection Methods 0.000 description 11
- 235000013305 food Nutrition 0.000 description 10
- 229930182817 methionine Natural products 0.000 description 10
- 108091032973 (ribonucleotides)n+m Proteins 0.000 description 9
- 241000699670 Mus sp. Species 0.000 description 9
- 239000003795 chemical substances by application Substances 0.000 description 9
- 238000009396 hybridization Methods 0.000 description 9
- 230000004936 stimulating effect Effects 0.000 description 9
- FFEARJCKVFRZRR-BYPYZUCNSA-N L-methionine Chemical compound CSCC[C@H](N)C(O)=O FFEARJCKVFRZRR-BYPYZUCNSA-N 0.000 description 8
- 102100040247 Tumor necrosis factor Human genes 0.000 description 8
- 230000001413 cellular effect Effects 0.000 description 8
- 239000000523 sample Substances 0.000 description 8
- 230000001225 therapeutic effect Effects 0.000 description 8
- 206010028980 Neoplasm Diseases 0.000 description 7
- 108060008682 Tumor Necrosis Factor Proteins 0.000 description 7
- 239000003623 enhancer Substances 0.000 description 7
- 230000008713 feedback mechanism Effects 0.000 description 7
- 238000002347 injection Methods 0.000 description 7
- 239000007924 injection Substances 0.000 description 7
- 238000003780 insertion Methods 0.000 description 7
- 230000037431 insertion Effects 0.000 description 7
- 229920001184 polypeptide Polymers 0.000 description 7
- 230000000069 prophylactic effect Effects 0.000 description 7
- 238000006467 substitution reaction Methods 0.000 description 7
- 238000013519 translation Methods 0.000 description 7
- 241000282412 Homo Species 0.000 description 6
- 102000035195 Peptidases Human genes 0.000 description 6
- 108091005804 Peptidases Proteins 0.000 description 6
- 102100038358 Prostate-specific antigen Human genes 0.000 description 6
- 239000004365 Protease Substances 0.000 description 6
- 108010029485 Protein Isoforms Proteins 0.000 description 6
- 102000001708 Protein Isoforms Human genes 0.000 description 6
- 241000700605 Viruses Species 0.000 description 6
- 201000011510 cancer Diseases 0.000 description 6
- 238000009472 formulation Methods 0.000 description 6
- 210000000987 immune system Anatomy 0.000 description 6
- 239000002502 liposome Substances 0.000 description 6
- 102000008070 Interferon-gamma Human genes 0.000 description 5
- 108010074328 Interferon-gamma Proteins 0.000 description 5
- 108091081024 Start codon Proteins 0.000 description 5
- 230000002238 attenuated effect Effects 0.000 description 5
- 230000000977 initiatory effect Effects 0.000 description 5
- 210000004962 mammalian cell Anatomy 0.000 description 5
- 239000003550 marker Substances 0.000 description 5
- 230000001737 promoting effect Effects 0.000 description 5
- MZOFCQQQCNRIBI-VMXHOPILSA-N (3s)-4-[[(2s)-1-[[(2s)-1-[[(1s)-1-carboxy-2-hydroxyethyl]amino]-4-methyl-1-oxopentan-2-yl]amino]-5-(diaminomethylideneamino)-1-oxopentan-2-yl]amino]-3-[[2-[[(2s)-2,6-diaminohexanoyl]amino]acetyl]amino]-4-oxobutanoic acid Chemical compound OC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@H](CCCN=C(N)N)NC(=O)[C@H](CC(O)=O)NC(=O)CNC(=O)[C@@H](N)CCCCN MZOFCQQQCNRIBI-VMXHOPILSA-N 0.000 description 4
- 241000196324 Embryophyta Species 0.000 description 4
- ZHNUHDYFZUAESO-UHFFFAOYSA-N Formamide Chemical compound NC=O ZHNUHDYFZUAESO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 108060003951 Immunoglobulin Proteins 0.000 description 4
- 241000699666 Mus <mouse, genus> Species 0.000 description 4
- 108010072866 Prostate-Specific Antigen Proteins 0.000 description 4
- 230000024932 T cell mediated immunity Effects 0.000 description 4
- ISAKRJDGNUQOIC-UHFFFAOYSA-N Uracil Chemical compound O=C1C=CNC(=O)N1 ISAKRJDGNUQOIC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- CVSVTCORWBXHQV-UHFFFAOYSA-N creatine Chemical compound NC(=[NH2+])N(C)CC([O-])=O CVSVTCORWBXHQV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 238000000684 flow cytometry Methods 0.000 description 4
- 230000006870 function Effects 0.000 description 4
- 102000018358 immunoglobulin Human genes 0.000 description 4
- -1 lecithin liposomes Chemical class 0.000 description 4
- 150000002632 lipids Chemical class 0.000 description 4
- 210000003205 muscle Anatomy 0.000 description 4
- 239000013642 negative control Substances 0.000 description 4
- 230000007935 neutral effect Effects 0.000 description 4
- 229920000447 polyanionic polymer Polymers 0.000 description 4
- 229920002643 polyglutamic acid Polymers 0.000 description 4
- 210000002966 serum Anatomy 0.000 description 4
- RWQNBRDOKXIBIV-UHFFFAOYSA-N thymine Chemical compound CC1=CNC(=O)NC1=O RWQNBRDOKXIBIV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 238000002255 vaccination Methods 0.000 description 4
- YYGNTYWPHWGJRM-UHFFFAOYSA-N (6E,10E,14E,18E)-2,6,10,15,19,23-hexamethyltetracosa-2,6,10,14,18,22-hexaene Chemical compound CC(C)=CCCC(C)=CCCC(C)=CCCC=C(C)CCC=C(C)CCC=C(C)C YYGNTYWPHWGJRM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 241000283690 Bos taurus Species 0.000 description 3
- 102000019034 Chemokines Human genes 0.000 description 3
- 108010012236 Chemokines Proteins 0.000 description 3
- 102100039620 Granulocyte-macrophage colony-stimulating factor Human genes 0.000 description 3
- 101000746373 Homo sapiens Granulocyte-macrophage colony-stimulating factor Proteins 0.000 description 3
- 241000022563 Rema Species 0.000 description 3
- 108010008038 Synthetic Vaccines Proteins 0.000 description 3
- BHEOSNUKNHRBNM-UHFFFAOYSA-N Tetramethylsqualene Natural products CC(=C)C(C)CCC(=C)C(C)CCC(C)=CCCC=C(C)CCC(C)C(=C)CCC(C)C(C)=C BHEOSNUKNHRBNM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 description 3
- 230000004071 biological effect Effects 0.000 description 3
- 230000015572 biosynthetic process Effects 0.000 description 3
- 230000001186 cumulative effect Effects 0.000 description 3
- PRAKJMSDJKAYCZ-UHFFFAOYSA-N dodecahydrosqualene Natural products CC(C)CCCC(C)CCCC(C)CCCCC(C)CCCC(C)CCCC(C)C PRAKJMSDJKAYCZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 229940079593 drug Drugs 0.000 description 3
- 238000005516 engineering process Methods 0.000 description 3
- 238000011534 incubation Methods 0.000 description 3
- 230000010354 integration Effects 0.000 description 3
- 229960003130 interferon gamma Drugs 0.000 description 3
- 230000004048 modification Effects 0.000 description 3
- 238000012986 modification Methods 0.000 description 3
- 239000002105 nanoparticle Substances 0.000 description 3
- 210000000056 organ Anatomy 0.000 description 3
- 210000004988 splenocyte Anatomy 0.000 description 3
- 229940031439 squalene Drugs 0.000 description 3
- TUHBEKDERLKLEC-UHFFFAOYSA-N squalene Natural products CC(=CCCC(=CCCC(=CCCC=C(/C)CCC=C(/C)CC=C(C)C)C)C)C TUHBEKDERLKLEC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 238000013518 transcription Methods 0.000 description 3
- 230000035897 transcription Effects 0.000 description 3
- 241000701161 unidentified adenovirus Species 0.000 description 3
- VBEQCZHXXJYVRD-GACYYNSASA-N uroanthelone Chemical compound C([C@@H](C(=O)N[C@H](C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)N[C@H](C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CC=1C=CC(O)=CC=1)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CC=1C2=CC=CC=C2NC=1)C(=O)N[C@@H](CC=1C2=CC=CC=C2NC=1)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(O)=O)C(C)C)[C@@H](C)O)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@H](CC(O)=O)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@H](CCC(O)=O)NC(=O)[C@@H](NC(=O)[C@H](CC=1NC=NC=1)NC(=O)[C@H](CCSC)NC(=O)[C@H](CS)NC(=O)[C@@H](NC(=O)CNC(=O)CNC(=O)[C@H](CC(N)=O)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@H](CS)NC(=O)[C@H](CC=1C=CC(O)=CC=1)NC(=O)CNC(=O)[C@H](CC(O)=O)NC(=O)[C@H](CC=1C=CC(O)=CC=1)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@H]1N(CCC1)C(=O)[C@H](CS)NC(=O)CNC(=O)[C@H]1N(CCC1)C(=O)[C@H](CC=1C=CC(O)=CC=1)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@@H](N)CC(N)=O)C(C)C)[C@@H](C)CC)C1=CC=C(O)C=C1 VBEQCZHXXJYVRD-GACYYNSASA-N 0.000 description 3
- KIUKXJAPPMFGSW-DNGZLQJQSA-N (2S,3S,4S,5R,6R)-6-[(2S,3R,4R,5S,6R)-3-Acetamido-2-[(2S,3S,4R,5R,6R)-6-[(2R,3R,4R,5S,6R)-3-acetamido-2,5-dihydroxy-6-(hydroxymethyl)oxan-4-yl]oxy-2-carboxy-4,5-dihydroxyoxan-3-yl]oxy-5-hydroxy-6-(hydroxymethyl)oxan-4-yl]oxy-3,4,5-trihydroxyoxane-2-carboxylic acid Chemical compound CC(=O)N[C@H]1[C@H](O)O[C@H](CO)[C@@H](O)[C@@H]1O[C@H]1[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](O[C@H]2[C@@H]([C@@H](O[C@H]3[C@@H]([C@@H](O)[C@H](O)[C@H](O3)C(O)=O)O)[C@H](O)[C@@H](CO)O2)NC(C)=O)[C@@H](C(O)=O)O1 KIUKXJAPPMFGSW-DNGZLQJQSA-N 0.000 description 2
- AZQWKYJCGOJGHM-UHFFFAOYSA-N 1,4-benzoquinone Chemical compound O=C1C=CC(=O)C=C1 AZQWKYJCGOJGHM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- LRFVTYWOQMYALW-UHFFFAOYSA-N 9H-xanthine Chemical compound O=C1NC(=O)NC2=C1NC=N2 LRFVTYWOQMYALW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 102000007469 Actins Human genes 0.000 description 2
- 108010085238 Actins Proteins 0.000 description 2
- 241000714230 Avian leukemia virus Species 0.000 description 2
- 102100021943 C-C motif chemokine 2 Human genes 0.000 description 2
- BHPQYMZQTOCNFJ-UHFFFAOYSA-N Calcium cation Chemical compound [Ca+2] BHPQYMZQTOCNFJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 241000283707 Capra Species 0.000 description 2
- 241000702421 Dependoparvovirus Species 0.000 description 2
- 108010024212 E-Selectin Proteins 0.000 description 2
- 102100023471 E-selectin Human genes 0.000 description 2
- 108050007372 Fibroblast Growth Factor Proteins 0.000 description 2
- 102000018233 Fibroblast Growth Factor Human genes 0.000 description 2
- 241000287828 Gallus gallus Species 0.000 description 2
- 102000003886 Glycoproteins Human genes 0.000 description 2
- 108090000288 Glycoproteins Proteins 0.000 description 2
- 108010054147 Hemoglobins Proteins 0.000 description 2
- 102000001554 Hemoglobins Human genes 0.000 description 2
- 241000238631 Hexapoda Species 0.000 description 2
- 101001091365 Homo sapiens Plasma kallikrein Proteins 0.000 description 2
- 101000605534 Homo sapiens Prostate-specific antigen Proteins 0.000 description 2
- 241000701044 Human gammaherpesvirus 4 Species 0.000 description 2
- 102100022339 Integrin alpha-L Human genes 0.000 description 2
- 102000006992 Interferon-alpha Human genes 0.000 description 2
- 108010047761 Interferon-alpha Proteins 0.000 description 2
- 102000003996 Interferon-beta Human genes 0.000 description 2
- 108090000467 Interferon-beta Proteins 0.000 description 2
- 102000014150 Interferons Human genes 0.000 description 2
- 108010050904 Interferons Proteins 0.000 description 2
- 108010064548 Lymphocyte Function-Associated Antigen-1 Proteins 0.000 description 2
- 241000282553 Macaca Species 0.000 description 2
- 102000003505 Myosin Human genes 0.000 description 2
- 108060008487 Myosin Proteins 0.000 description 2
- 108010025020 Nerve Growth Factor Proteins 0.000 description 2
- 102000015336 Nerve Growth Factor Human genes 0.000 description 2
- 108091034117 Oligonucleotide Proteins 0.000 description 2
- 108010035766 P-Selectin Proteins 0.000 description 2
- 102100023472 P-selectin Human genes 0.000 description 2
- 108010038512 Platelet-Derived Growth Factor Proteins 0.000 description 2
- 102000010780 Platelet-Derived Growth Factor Human genes 0.000 description 2
- 108020005091 Replication Origin Proteins 0.000 description 2
- FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M Sodium chloride Chemical compound [Na+].[Cl-] FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 2
- 108020005038 Terminator Codon Proteins 0.000 description 2
- DSGIVWSDDRDJIO-ZXXMMSQZSA-N Thr-Thr Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O DSGIVWSDDRDJIO-ZXXMMSQZSA-N 0.000 description 2
- 108010073929 Vascular Endothelial Growth Factor A Proteins 0.000 description 2
- 102000005789 Vascular Endothelial Growth Factors Human genes 0.000 description 2
- 108010019530 Vascular Endothelial Growth Factors Proteins 0.000 description 2
- 108010067390 Viral Proteins Proteins 0.000 description 2
- 230000005784 autoimmunity Effects 0.000 description 2
- 230000008827 biological function Effects 0.000 description 2
- 229910001424 calcium ion Inorganic materials 0.000 description 2
- 210000000170 cell membrane Anatomy 0.000 description 2
- 210000004978 chinese hamster ovary cell Anatomy 0.000 description 2
- 238000003776 cleavage reaction Methods 0.000 description 2
- 229960003624 creatine Drugs 0.000 description 2
- 239000006046 creatine Substances 0.000 description 2
- 230000016396 cytokine production Effects 0.000 description 2
- OPTASPLRGRRNAP-UHFFFAOYSA-N cytosine Chemical compound NC=1C=CNC(=O)N=1 OPTASPLRGRRNAP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 238000012217 deletion Methods 0.000 description 2
- 230000037430 deletion Effects 0.000 description 2
- 238000011161 development Methods 0.000 description 2
- 238000010790 dilution Methods 0.000 description 2
- 239000012895 dilution Substances 0.000 description 2
- 238000009826 distribution Methods 0.000 description 2
- 239000003814 drug Substances 0.000 description 2
- 230000000694 effects Effects 0.000 description 2
- 235000013601 eggs Nutrition 0.000 description 2
- 230000002708 enhancing effect Effects 0.000 description 2
- 229940126864 fibroblast growth factor Drugs 0.000 description 2
- 229940044627 gamma-interferon Drugs 0.000 description 2
- UYTPUPDQBNUYGX-UHFFFAOYSA-N guanine Chemical compound O=C1NC(N)=NC2=C1N=CN2 UYTPUPDQBNUYGX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 210000005260 human cell Anatomy 0.000 description 2
- 229920002674 hyaluronan Polymers 0.000 description 2
- 229960003160 hyaluronic acid Drugs 0.000 description 2
- FDGQSTZJBFJUBT-UHFFFAOYSA-N hypoxanthine Chemical compound O=C1NC=NC2=C1NC=N2 FDGQSTZJBFJUBT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 230000006058 immune tolerance Effects 0.000 description 2
- 230000003308 immunostimulating effect Effects 0.000 description 2
- 229940079322 interferon Drugs 0.000 description 2
- 238000001990 intravenous administration Methods 0.000 description 2
- DRAVOWXCEBXPTN-UHFFFAOYSA-N isoguanine Chemical compound NC1=NC(=O)NC2=C1NC=N2 DRAVOWXCEBXPTN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 239000012528 membrane Substances 0.000 description 2
- 125000001360 methionine group Chemical group N[C@@H](CCSC)C(=O)* 0.000 description 2
- 229940035032 monophosphoryl lipid a Drugs 0.000 description 2
- 125000001446 muramyl group Chemical group N[C@@H](C=O)[C@@H](O[C@@H](C(=O)*)C)[C@H](O)[C@H](O)CO 0.000 description 2
- 229940053128 nerve growth factor Drugs 0.000 description 2
- 238000005457 optimization Methods 0.000 description 2
- 108091033319 polynucleotide Proteins 0.000 description 2
- 102000040430 polynucleotide Human genes 0.000 description 2
- 239000002157 polynucleotide Substances 0.000 description 2
- 239000011148 porous material Substances 0.000 description 2
- 239000013641 positive control Substances 0.000 description 2
- 238000002360 preparation method Methods 0.000 description 2
- 229940124551 recombinant vaccine Drugs 0.000 description 2
- 230000004044 response Effects 0.000 description 2
- 150000003839 salts Chemical class 0.000 description 2
- 230000007017 scission Effects 0.000 description 2
- 230000003248 secreting effect Effects 0.000 description 2
- 230000028327 secretion Effects 0.000 description 2
- 229910001415 sodium ion Inorganic materials 0.000 description 2
- 239000004094 surface-active agent Substances 0.000 description 2
- 230000002459 sustained effect Effects 0.000 description 2
- 229940113082 thymine Drugs 0.000 description 2
- 230000002103 transcriptional effect Effects 0.000 description 2
- 241001515965 unidentified phage Species 0.000 description 2
- 229940035893 uracil Drugs 0.000 description 2
- 230000006444 vascular growth Effects 0.000 description 2
- 230000003612 virological effect Effects 0.000 description 2
- 238000005406 washing Methods 0.000 description 2
- DGVVWUTYPXICAM-UHFFFAOYSA-N β‐Mercaptoethanol Chemical compound OCCS DGVVWUTYPXICAM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- QGVLYPPODPLXMB-UBTYZVCOSA-N (1aR,1bS,4aR,7aS,7bS,8R,9R,9aS)-4a,7b,9,9a-tetrahydroxy-3-(hydroxymethyl)-1,1,6,8-tetramethyl-1,1a,1b,4,4a,7a,7b,8,9,9a-decahydro-5H-cyclopropa[3,4]benzo[1,2-e]azulen-5-one Chemical compound C1=C(CO)C[C@]2(O)C(=O)C(C)=C[C@H]2[C@@]2(O)[C@H](C)[C@@H](O)[C@@]3(O)C(C)(C)[C@H]3[C@@H]21 QGVLYPPODPLXMB-UBTYZVCOSA-N 0.000 description 1
- DIGQNXIGRZPYDK-WKSCXVIASA-N (2R)-6-amino-2-[[2-[[(2S)-2-[[2-[[(2R)-2-[[(2S)-2-[[(2R,3S)-2-[[2-[[(2S)-2-[[2-[[(2S)-2-[[(2S)-2-[[(2R)-2-[[(2S,3S)-2-[[(2R)-2-[[(2S)-2-[[(2S)-2-[[(2S)-2-[[2-[[(2S)-2-[[(2R)-2-[[2-[[2-[[2-[(2-amino-1-hydroxyethylidene)amino]-3-carboxy-1-hydroxypropylidene]amino]-1-hydroxy-3-sulfanylpropylidene]amino]-1-hydroxyethylidene]amino]-1-hydroxy-3-sulfanylpropylidene]amino]-1,3-dihydroxypropylidene]amino]-1-hydroxyethylidene]amino]-1-hydroxypropylidene]amino]-1,3-dihydroxypropylidene]amino]-1,3-dihydroxypropylidene]amino]-1-hydroxy-3-sulfanylpropylidene]amino]-1,3-dihydroxybutylidene]amino]-1-hydroxy-3-sulfanylpropylidene]amino]-1-hydroxypropylidene]amino]-1,3-dihydroxypropylidene]amino]-1-hydroxyethylidene]amino]-1,5-dihydroxy-5-iminopentylidene]amino]-1-hydroxy-3-sulfanylpropylidene]amino]-1,3-dihydroxybutylidene]amino]-1-hydroxy-3-sulfanylpropylidene]amino]-1,3-dihydroxypropylidene]amino]-1-hydroxyethylidene]amino]-1-hydroxy-3-sulfanylpropylidene]amino]-1-hydroxyethylidene]amino]hexanoic acid Chemical compound C[C@@H]([C@@H](C(=N[C@@H](CS)C(=N[C@@H](C)C(=N[C@@H](CO)C(=NCC(=N[C@@H](CCC(=N)O)C(=NC(CS)C(=N[C@H]([C@H](C)O)C(=N[C@H](CS)C(=N[C@H](CO)C(=NCC(=N[C@H](CS)C(=NCC(=N[C@H](CCCCN)C(=O)O)O)O)O)O)O)O)O)O)O)O)O)O)O)N=C([C@H](CS)N=C([C@H](CO)N=C([C@H](CO)N=C([C@H](C)N=C(CN=C([C@H](CO)N=C([C@H](CS)N=C(CN=C(C(CS)N=C(C(CC(=O)O)N=C(CN)O)O)O)O)O)O)O)O)O)O)O)O DIGQNXIGRZPYDK-WKSCXVIASA-N 0.000 description 1
- IIZPXYDJLKNOIY-JXPKJXOSSA-N 1-palmitoyl-2-arachidonoyl-sn-glycero-3-phosphocholine Chemical compound CCCCCCCCCCCCCCCC(=O)OC[C@H](COP([O-])(=O)OCC[N+](C)(C)C)OC(=O)CCC\C=C/C\C=C/C\C=C/C\C=C/CCCCC IIZPXYDJLKNOIY-JXPKJXOSSA-N 0.000 description 1
- XQCZBXHVTFVIFE-UHFFFAOYSA-N 2-amino-4-hydroxypyrimidine Chemical compound NC1=NC=CC(O)=N1 XQCZBXHVTFVIFE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- QTBSBXVTEAMEQO-UHFFFAOYSA-M Acetate Chemical compound CC([O-])=O QTBSBXVTEAMEQO-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- 229930024421 Adenine Natural products 0.000 description 1
- GFFGJBXGBJISGV-UHFFFAOYSA-N Adenine Chemical compound NC1=NC=NC2=C1N=CN2 GFFGJBXGBJISGV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108010088751 Albumins Proteins 0.000 description 1
- 102000009027 Albumins Human genes 0.000 description 1
- GUBGYTABKSRVRQ-XLOQQCSPSA-N Alpha-Lactose Chemical compound O[C@@H]1[C@@H](O)[C@@H](O)[C@@H](CO)O[C@H]1O[C@@H]1[C@@H](CO)O[C@H](O)[C@H](O)[C@H]1O GUBGYTABKSRVRQ-XLOQQCSPSA-N 0.000 description 1
- 244000303258 Annona diversifolia Species 0.000 description 1
- 235000002198 Annona diversifolia Nutrition 0.000 description 1
- 241000238421 Arthropoda Species 0.000 description 1
- 241000894006 Bacteria Species 0.000 description 1
- 241000283726 Bison Species 0.000 description 1
- 241000282817 Bovidae Species 0.000 description 1
- 108091003079 Bovine Serum Albumin Proteins 0.000 description 1
- 206010006187 Breast cancer Diseases 0.000 description 1
- 208000026310 Breast neoplasm Diseases 0.000 description 1
- 241000030939 Bubalus bubalis Species 0.000 description 1
- 101710155857 C-C motif chemokine 2 Proteins 0.000 description 1
- 108010084313 CD58 Antigens Proteins 0.000 description 1
- 210000001239 CD8-positive, alpha-beta cytotoxic T lymphocyte Anatomy 0.000 description 1
- 102000011727 Caspases Human genes 0.000 description 1
- 108010076667 Caspases Proteins 0.000 description 1
- 241000282693 Cercopithecidae Species 0.000 description 1
- 241000282994 Cervidae Species 0.000 description 1
- 108700010070 Codon Usage Proteins 0.000 description 1
- 108010062580 Concanavalin A Proteins 0.000 description 1
- 102000004127 Cytokines Human genes 0.000 description 1
- 108090000695 Cytokines Proteins 0.000 description 1
- 241000701022 Cytomegalovirus Species 0.000 description 1
- FBPFZTCFMRRESA-FSIIMWSLSA-N D-Glucitol Natural products OC[C@H](O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)CO FBPFZTCFMRRESA-FSIIMWSLSA-N 0.000 description 1
- FBPFZTCFMRRESA-KVTDHHQDSA-N D-Mannitol Chemical compound OC[C@@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@H](O)CO FBPFZTCFMRRESA-KVTDHHQDSA-N 0.000 description 1
- FBPFZTCFMRRESA-JGWLITMVSA-N D-glucitol Chemical compound OC[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@H](O)CO FBPFZTCFMRRESA-JGWLITMVSA-N 0.000 description 1
- 102000053602 DNA Human genes 0.000 description 1
- 238000011238 DNA vaccination Methods 0.000 description 1
- 101100289989 Drosophila melanogaster alpha-Man-Ia gene Proteins 0.000 description 1
- 241000701867 Enterobacteria phage T7 Species 0.000 description 1
- 102000004190 Enzymes Human genes 0.000 description 1
- 108090000790 Enzymes Proteins 0.000 description 1
- 241000233866 Fungi Species 0.000 description 1
- 208000001613 Gambling Diseases 0.000 description 1
- 108010010803 Gelatin Proteins 0.000 description 1
- 108700023863 Gene Components Proteins 0.000 description 1
- WQZGKKKJIJFFOK-GASJEMHNSA-N Glucose Natural products OC[C@H]1OC(O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O WQZGKKKJIJFFOK-GASJEMHNSA-N 0.000 description 1
- 244000060234 Gmelina philippensis Species 0.000 description 1
- 101000899111 Homo sapiens Hemoglobin subunit beta Proteins 0.000 description 1
- 108010000521 Human Growth Hormone Proteins 0.000 description 1
- 102000002265 Human Growth Hormone Human genes 0.000 description 1
- 239000000854 Human Growth Hormone Substances 0.000 description 1
- 241000725303 Human immunodeficiency virus Species 0.000 description 1
- UGQMRVRMYYASKQ-UHFFFAOYSA-N Hypoxanthine nucleoside Natural products OC1C(O)C(CO)OC1N1C(NC=NC2=O)=C2N=C1 UGQMRVRMYYASKQ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 206010061598 Immunodeficiency Diseases 0.000 description 1
- 208000029462 Immunodeficiency disease Diseases 0.000 description 1
- 229930010555 Inosine Natural products 0.000 description 1
- UGQMRVRMYYASKQ-KQYNXXCUSA-N Inosine Chemical compound O[C@@H]1[C@H](O)[C@@H](CO)O[C@H]1N1C2=NC=NC(O)=C2N=C1 UGQMRVRMYYASKQ-KQYNXXCUSA-N 0.000 description 1
- 108010092694 L-Selectin Proteins 0.000 description 1
- 102100033467 L-selectin Human genes 0.000 description 1
- GUBGYTABKSRVRQ-QKKXKWKRSA-N Lactose Natural products OC[C@H]1O[C@@H](O[C@H]2[C@H](O)[C@@H](O)C(O)O[C@@H]2CO)[C@H](O)[C@@H](O)[C@H]1O GUBGYTABKSRVRQ-QKKXKWKRSA-N 0.000 description 1
- 240000006240 Linum usitatissimum Species 0.000 description 1
- 235000004431 Linum usitatissimum Nutrition 0.000 description 1
- 241000406668 Loxodonta cyclotis Species 0.000 description 1
- 101150021286 MAS1 gene Proteins 0.000 description 1
- 241000282560 Macaca mulatta Species 0.000 description 1
- 101710091439 Major capsid protein 1 Proteins 0.000 description 1
- 229930195725 Mannitol Natural products 0.000 description 1
- 102000003792 Metallothionein Human genes 0.000 description 1
- 108090000157 Metallothionein Proteins 0.000 description 1
- 102000019040 Nuclear Antigens Human genes 0.000 description 1
- 108010051791 Nuclear Antigens Proteins 0.000 description 1
- 241001494479 Pecora Species 0.000 description 1
- 102000003827 Plasma Kallikrein Human genes 0.000 description 1
- 108090000113 Plasma Kallikrein Proteins 0.000 description 1
- 108010076039 Polyproteins Proteins 0.000 description 1
- 108010001267 Protein Subunits Proteins 0.000 description 1
- 102000002067 Protein Subunits Human genes 0.000 description 1
- 229940022005 RNA vaccine Drugs 0.000 description 1
- 108010008281 Recombinant Fusion Proteins Proteins 0.000 description 1
- 102000007056 Recombinant Fusion Proteins Human genes 0.000 description 1
- 108091028664 Ribonucleotide Proteins 0.000 description 1
- 241000714474 Rous sarcoma virus Species 0.000 description 1
- 241000282849 Ruminantia Species 0.000 description 1
- 240000004808 Saccharomyces cerevisiae Species 0.000 description 1
- 108020004459 Small interfering RNA Proteins 0.000 description 1
- 241000282898 Sus scrofa Species 0.000 description 1
- 108700012920 TNF Proteins 0.000 description 1
- 101150056647 TNFRSF4 gene Proteins 0.000 description 1
- 108060008683 Tumor Necrosis Factor Receptor Proteins 0.000 description 1
- 102000000852 Tumor Necrosis Factor-alpha Human genes 0.000 description 1
- 241001416177 Vicugna pacos Species 0.000 description 1
- JLCPHMBAVCMARE-UHFFFAOYSA-N [3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-hydroxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methyl [5-(6-aminopurin-9-yl)-2-(hydroxymethyl)oxolan-3-yl] hydrogen phosphate Polymers Cc1cn(C2CC(OP(O)(=O)OCC3OC(CC3OP(O)(=O)OCC3OC(CC3O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)C(COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3CO)n3cnc4c(N)ncnc34)n3ccc(N)nc3=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3ccc(N)nc3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)O2)c(=O)[nH]c1=O JLCPHMBAVCMARE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000003213 activating effect Effects 0.000 description 1
- 230000004913 activation Effects 0.000 description 1
- 230000003044 adaptive effect Effects 0.000 description 1
- 239000000654 additive Substances 0.000 description 1
- 229960000643 adenine Drugs 0.000 description 1
- 230000001857 anti-mycotic effect Effects 0.000 description 1
- 230000008349 antigen-specific humoral response Effects 0.000 description 1
- 239000002543 antimycotic Substances 0.000 description 1
- 238000013459 approach Methods 0.000 description 1
- 210000004436 artificial bacterial chromosome Anatomy 0.000 description 1
- 210000001106 artificial yeast chromosome Anatomy 0.000 description 1
- 238000003556 assay Methods 0.000 description 1
- 229940031567 attenuated vaccine Drugs 0.000 description 1
- 238000000376 autoradiography Methods 0.000 description 1
- 239000002585 base Substances 0.000 description 1
- 230000008901 benefit Effects 0.000 description 1
- RIIWUGSYXOBDMC-UHFFFAOYSA-N benzene-1,2-diamine;hydron;dichloride Chemical compound Cl.Cl.NC1=CC=CC=C1N RIIWUGSYXOBDMC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- WQZGKKKJIJFFOK-VFUOTHLCSA-N beta-D-glucose Chemical compound OC[C@H]1O[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O WQZGKKKJIJFFOK-VFUOTHLCSA-N 0.000 description 1
- 230000001588 bifunctional effect Effects 0.000 description 1
- 239000011230 binding agent Substances 0.000 description 1
- 230000003115 biocidal effect Effects 0.000 description 1
- 108010006025 bovine growth hormone Proteins 0.000 description 1
- 239000000872 buffer Substances 0.000 description 1
- 210000004899 c-terminal region Anatomy 0.000 description 1
- 238000004364 calculation method Methods 0.000 description 1
- 238000009566 cancer vaccine Methods 0.000 description 1
- 229940022399 cancer vaccine Drugs 0.000 description 1
- 239000000969 carrier Substances 0.000 description 1
- 238000004113 cell culture Methods 0.000 description 1
- 230000036755 cellular response Effects 0.000 description 1
- 210000002230 centromere Anatomy 0.000 description 1
- 230000008859 change Effects 0.000 description 1
- 239000003153 chemical reaction reagent Substances 0.000 description 1
- 210000000349 chromosome Anatomy 0.000 description 1
- 238000004891 communication Methods 0.000 description 1
- 230000000052 comparative effect Effects 0.000 description 1
- 239000002299 complementary DNA Substances 0.000 description 1
- 230000002596 correlated effect Effects 0.000 description 1
- 229940104302 cytosine Drugs 0.000 description 1
- 238000002716 delivery method Methods 0.000 description 1
- 239000005547 deoxyribonucleotide Substances 0.000 description 1
- 125000002637 deoxyribonucleotide group Chemical group 0.000 description 1
- 230000001419 dependent effect Effects 0.000 description 1
- 230000000368 destabilizing effect Effects 0.000 description 1
- 239000008121 dextrose Substances 0.000 description 1
- LOKCTEFSRHRXRJ-UHFFFAOYSA-I dipotassium trisodium dihydrogen phosphate hydrogen phosphate dichloride Chemical compound P(=O)(O)(O)[O-].[K+].P(=O)(O)([O-])[O-].[Na+].[Na+].[Cl-].[K+].[Cl-].[Na+] LOKCTEFSRHRXRJ-UHFFFAOYSA-I 0.000 description 1
- 201000010099 disease Diseases 0.000 description 1
- 208000037265 diseases, disorders, signs and symptoms Diseases 0.000 description 1
- 231100000673 dose–response relationship Toxicity 0.000 description 1
- 230000005684 electric field Effects 0.000 description 1
- 238000001962 electrophoresis Methods 0.000 description 1
- 230000010502 episomal replication Effects 0.000 description 1
- 210000003743 erythrocyte Anatomy 0.000 description 1
- 239000013613 expression plasmid Substances 0.000 description 1
- 238000000855 fermentation Methods 0.000 description 1
- 230000004151 fermentation Effects 0.000 description 1
- 239000012894 fetal calf serum Substances 0.000 description 1
- 239000000499 gel Substances 0.000 description 1
- 239000008273 gelatin Substances 0.000 description 1
- 229920000159 gelatin Polymers 0.000 description 1
- 235000019322 gelatine Nutrition 0.000 description 1
- 235000011852 gelatine desserts Nutrition 0.000 description 1
- 239000003102 growth factor Substances 0.000 description 1
- 230000036541 health Effects 0.000 description 1
- 230000028996 humoral immune response Effects 0.000 description 1
- 210000004408 hybridoma Anatomy 0.000 description 1
- 230000036039 immunity Effects 0.000 description 1
- 230000007813 immunodeficiency Effects 0.000 description 1
- 230000009851 immunogenic response Effects 0.000 description 1
- 238000009169 immunotherapy Methods 0.000 description 1
- 230000001771 impaired effect Effects 0.000 description 1
- 230000006872 improvement Effects 0.000 description 1
- 238000010348 incorporation Methods 0.000 description 1
- 229960003786 inosine Drugs 0.000 description 1
- 238000001361 intraarterial administration Methods 0.000 description 1
- 238000010212 intracellular staining Methods 0.000 description 1
- 230000008863 intramolecular interaction Effects 0.000 description 1
- 238000007918 intramuscular administration Methods 0.000 description 1
- 238000010255 intramuscular injection Methods 0.000 description 1
- 239000007927 intramuscular injection Substances 0.000 description 1
- 238000007912 intraperitoneal administration Methods 0.000 description 1
- 238000007913 intrathecal administration Methods 0.000 description 1
- PGHMRUGBZOYCAA-ADZNBVRBSA-N ionomycin Chemical compound O1[C@H](C[C@H](O)[C@H](C)[C@H](O)[C@H](C)/C=C/C[C@@H](C)C[C@@H](C)C(/O)=C/C(=O)[C@@H](C)C[C@@H](C)C[C@@H](CCC(O)=O)C)CC[C@@]1(C)[C@@H]1O[C@](C)([C@@H](C)O)CC1 PGHMRUGBZOYCAA-ADZNBVRBSA-N 0.000 description 1
- PGHMRUGBZOYCAA-UHFFFAOYSA-N ionomycin Natural products O1C(CC(O)C(C)C(O)C(C)C=CCC(C)CC(C)C(O)=CC(=O)C(C)CC(C)CC(CCC(O)=O)C)CCC1(C)C1OC(C)(C(C)O)CC1 PGHMRUGBZOYCAA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 150000002500 ions Chemical class 0.000 description 1
- 239000000644 isotonic solution Substances 0.000 description 1
- 239000008101 lactose Substances 0.000 description 1
- 229940067606 lecithin Drugs 0.000 description 1
- 235000010445 lecithin Nutrition 0.000 description 1
- 239000000787 lecithin Substances 0.000 description 1
- 230000000670 limiting effect Effects 0.000 description 1
- 108700021021 mRNA Vaccine Proteins 0.000 description 1
- 239000000594 mannitol Substances 0.000 description 1
- 235000010355 mannitol Nutrition 0.000 description 1
- 230000001404 mediated effect Effects 0.000 description 1
- 238000002844 melting Methods 0.000 description 1
- 230000008018 melting Effects 0.000 description 1
- 210000004379 membrane Anatomy 0.000 description 1
- 108020004999 messenger RNA Proteins 0.000 description 1
- 229910021645 metal ion Inorganic materials 0.000 description 1
- 230000000813 microbial effect Effects 0.000 description 1
- 244000005700 microbiome Species 0.000 description 1
- 210000004400 mucous membrane Anatomy 0.000 description 1
- 238000002887 multiple sequence alignment Methods 0.000 description 1
- 230000003287 optical effect Effects 0.000 description 1
- 230000036961 partial effect Effects 0.000 description 1
- 239000002245 particle Substances 0.000 description 1
- 244000052769 pathogen Species 0.000 description 1
- 230000035515 penetration Effects 0.000 description 1
- 229940021222 peritoneal dialysis isotonic solution Drugs 0.000 description 1
- 230000008823 permeabilization Effects 0.000 description 1
- QGVLYPPODPLXMB-QXYKVGAMSA-N phorbol Natural products C[C@@H]1[C@@H](O)[C@]2(O)[C@H]([C@H]3C=C(CO)C[C@@]4(O)[C@H](C=C(C)C4=O)[C@@]13O)C2(C)C QGVLYPPODPLXMB-QXYKVGAMSA-N 0.000 description 1
- 239000002953 phosphate buffered saline Substances 0.000 description 1
- 238000000053 physical method Methods 0.000 description 1
- 230000009894 physiological stress Effects 0.000 description 1
- 238000012545 processing Methods 0.000 description 1
- 229940021993 prophylactic vaccine Drugs 0.000 description 1
- 230000004853 protein function Effects 0.000 description 1
- 229940023143 protein vaccine Drugs 0.000 description 1
- 230000001698 pyrogenic effect Effects 0.000 description 1
- 150000004053 quinones Chemical class 0.000 description 1
- 238000003156 radioimmunoprecipitation Methods 0.000 description 1
- 230000036647 reaction Effects 0.000 description 1
- 239000011541 reaction mixture Substances 0.000 description 1
- 230000035484 reaction time Effects 0.000 description 1
- 102000005962 receptors Human genes 0.000 description 1
- 108020003175 receptors Proteins 0.000 description 1
- 238000010188 recombinant method Methods 0.000 description 1
- 230000002829 reductive effect Effects 0.000 description 1
- 230000010076 replication Effects 0.000 description 1
- 230000000717 retained effect Effects 0.000 description 1
- 230000002441 reversible effect Effects 0.000 description 1
- 239000002336 ribonucleotide Substances 0.000 description 1
- 125000002652 ribonucleotide group Chemical group 0.000 description 1
- 239000011435 rock Substances 0.000 description 1
- 238000013207 serial dilution Methods 0.000 description 1
- 210000002027 skeletal muscle Anatomy 0.000 description 1
- 239000011780 sodium chloride Substances 0.000 description 1
- 238000002415 sodium dodecyl sulfate polyacrylamide gel electrophoresis Methods 0.000 description 1
- 239000007787 solid Substances 0.000 description 1
- 239000002904 solvent Substances 0.000 description 1
- 239000000600 sorbitol Substances 0.000 description 1
- 239000003381 stabilizer Substances 0.000 description 1
- 229910001220 stainless steel Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000010935 stainless steel Substances 0.000 description 1
- 239000007858 starting material Substances 0.000 description 1
- 210000000130 stem cell Anatomy 0.000 description 1
- 230000000638 stimulation Effects 0.000 description 1
- 238000003756 stirring Methods 0.000 description 1
- 238000007920 subcutaneous administration Methods 0.000 description 1
- 239000000758 substrate Substances 0.000 description 1
- 238000001356 surgical procedure Methods 0.000 description 1
- 238000003786 synthesis reaction Methods 0.000 description 1
- 102000055501 telomere Human genes 0.000 description 1
- 108091035539 telomere Proteins 0.000 description 1
- 210000003411 telomere Anatomy 0.000 description 1
- 229940021747 therapeutic vaccine Drugs 0.000 description 1
- 230000002992 thymic effect Effects 0.000 description 1
- 238000000954 titration curve Methods 0.000 description 1
- 238000012546 transfer Methods 0.000 description 1
- 230000010474 transient expression Effects 0.000 description 1
- 230000007704 transition Effects 0.000 description 1
- 102000003298 tumor necrosis factor receptor Human genes 0.000 description 1
- 238000002604 ultrasonography Methods 0.000 description 1
- 241000701447 unidentified baculovirus Species 0.000 description 1
- 241000712461 unidentified influenza virus Species 0.000 description 1
- 239000005526 vasoconstrictor agent Substances 0.000 description 1
- 229940126580 vector vaccine Drugs 0.000 description 1
- 239000003981 vehicle Substances 0.000 description 1
- 239000013603 viral vector Substances 0.000 description 1
- 238000012800 visualization Methods 0.000 description 1
- XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N water Substances O XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229940075420 xanthine Drugs 0.000 description 1
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- C07K14/435—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
- C07K14/46—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans from vertebrates
- C07K14/47—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans from vertebrates from mammals
- C07K14/4701—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans from vertebrates from mammals not used
- C07K14/4748—Tumour specific antigens; Tumour rejection antigen precursors [TRAP], e.g. MAGE
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K31/00—Medicinal preparations containing organic active ingredients
- A61K31/70—Carbohydrates; Sugars; Derivatives thereof
- A61K31/7088—Compounds having three or more nucleosides or nucleotides
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K39/00—Medicinal preparations containing antigens or antibodies
- A61K39/0005—Vertebrate antigens
- A61K39/0011—Cancer antigens
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K39/00—Medicinal preparations containing antigens or antibodies
- A61K39/0005—Vertebrate antigens
- A61K39/0011—Cancer antigens
- A61K39/001193—Prostate associated antigens e.g. Prostate stem cell antigen [PSCA]; Prostate carcinoma tumor antigen [PCTA]; PAP or PSGR
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K39/00—Medicinal preparations containing antigens or antibodies
- A61K39/0005—Vertebrate antigens
- A61K39/0011—Cancer antigens
- A61K39/001193—Prostate associated antigens e.g. Prostate stem cell antigen [PSCA]; Prostate carcinoma tumor antigen [PCTA]; PAP or PSGR
- A61K39/001194—Prostate specific antigen [PSA]
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K39/00—Medicinal preparations containing antigens or antibodies
- A61K39/0005—Vertebrate antigens
- A61K39/0011—Cancer antigens
- A61K39/001193—Prostate associated antigens e.g. Prostate stem cell antigen [PSCA]; Prostate carcinoma tumor antigen [PCTA]; PAP or PSGR
- A61K39/001195—Prostate specific membrane antigen [PSMA]
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N9/00—Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
- C12N9/14—Hydrolases (3)
- C12N9/48—Hydrolases (3) acting on peptide bonds (3.4)
- C12N9/485—Exopeptidases (3.4.11-3.4.19)
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N9/00—Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
- C12N9/14—Hydrolases (3)
- C12N9/48—Hydrolases (3) acting on peptide bonds (3.4)
- C12N9/50—Proteinases, e.g. Endopeptidases (3.4.21-3.4.25)
- C12N9/64—Proteinases, e.g. Endopeptidases (3.4.21-3.4.25) derived from animal tissue
- C12N9/6421—Proteinases, e.g. Endopeptidases (3.4.21-3.4.25) derived from animal tissue from mammals
- C12N9/6424—Serine endopeptidases (3.4.21)
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Y—ENZYMES
- C12Y116/00—Oxidoreductases oxidizing metal ions (1.16)
- C12Y116/01—Oxidoreductases oxidizing metal ions (1.16) with NAD+ or NADP+ as acceptor (1.16.1)
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Y—ENZYMES
- C12Y304/00—Hydrolases acting on peptide bonds, i.e. peptidases (3.4)
- C12Y304/17—Metallocarboxypeptidases (3.4.17)
- C12Y304/17021—Glutamate carboxypeptidase II (3.4.17.21)
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Y—ENZYMES
- C12Y304/00—Hydrolases acting on peptide bonds, i.e. peptidases (3.4)
- C12Y304/21—Serine endopeptidases (3.4.21)
- C12Y304/21077—Semenogelase (3.4.21.77), i.e. prostate specific antigen or PSA or kallikrein 3
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K39/00—Medicinal preparations containing antigens or antibodies
- A61K2039/51—Medicinal preparations containing antigens or antibodies comprising whole cells, viruses or DNA/RNA
- A61K2039/53—DNA (RNA) vaccination
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K39/00—Medicinal preparations containing antigens or antibodies
- A61K2039/80—Vaccine for a specifically defined cancer
- A61K2039/884—Vaccine for a specifically defined cancer prostate
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K38/00—Medicinal preparations containing peptides
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K39/00—Medicinal preparations containing antigens or antibodies
-
- Y—GENERAL TAGGING OF NEW TECHNOLOGICAL DEVELOPMENTS; GENERAL TAGGING OF CROSS-SECTIONAL TECHNOLOGIES SPANNING OVER SEVERAL SECTIONS OF THE IPC; TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC CROSS-REFERENCE ART COLLECTIONS [XRACs] AND DIGESTS
- Y02—TECHNOLOGIES OR APPLICATIONS FOR MITIGATION OR ADAPTATION AGAINST CLIMATE CHANGE
- Y02A—TECHNOLOGIES FOR ADAPTATION TO CLIMATE CHANGE
- Y02A50/00—TECHNOLOGIES FOR ADAPTATION TO CLIMATE CHANGE in human health protection, e.g. against extreme weather
- Y02A50/30—Against vector-borne diseases, e.g. mosquito-borne, fly-borne, tick-borne or waterborne diseases whose impact is exacerbated by climate change
Landscapes
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Immunology (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Zoology (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Epidemiology (AREA)
- Animal Behavior & Ethology (AREA)
- Veterinary Medicine (AREA)
- Public Health (AREA)
- Pharmacology & Pharmacy (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Mycology (AREA)
- Oncology (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Cell Biology (AREA)
- Developmental Biology & Embryology (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Gastroenterology & Hepatology (AREA)
- Toxicology (AREA)
- Medicines Containing Antibodies Or Antigens For Use As Internal Diagnostic Agents (AREA)
- Peptides Or Proteins (AREA)
- Medicines That Contain Protein Lipid Enzymes And Other Medicines (AREA)
- Pharmaceuticals Containing Other Organic And Inorganic Compounds (AREA)
Abstract
Изобретение относится к молекулам нуклеиновой кислоты и белкам для индукции иммунного ответа против антигена рака предстательной железы, а также к плазмидам, векторам и фармацевтическим композициям, содержащим указанные нуклеиновые кислоты. Изобретение также относится к способам лечения пациентов, у которых диагностирован рак предстательной железы, включающим введение указанной нуклеиновой кислоты или указанного белка.
Description
Настоящее изобретение относится к последовательностям нуклеиновых кислот, кодирующим консенсусные белки простаты и их фрагменты; усовершенствованным вакцинам от рака простаты, усовершенствованным способам для стимуляции иммунных реакций против клеток рака простаты, усовершенствованным способам для профилактической и/или терапевтической иммунизации пациентов против рака простаты.
Уровень техники изобретения
Рак простаты является важной целью иммунной терапии. Совершенствование иммунного терапевтического подхода является комплексным, при этом иммуногены необходимо разрабатывать таким образом, чтобы они были способны индуцировать сильные иммунные реакции, включая предпочтительные СТЬ реакции.
Прямое введение последовательностей нуклеиновых кислот для вакцинации против болезней животных и человека изучалось, и много усилий было сосредоточено на эффективных и действенных средствах доставки нуклеиновой кислоты для того, чтобы вызвать необходимую экспрессию желаемых антигенов, приводящую к иммуногенной реакции и в конечном счете к успеху этого способа.
ДНК вакцины обладают многими концептуальными преимуществами по сравнению с более традиционными способами вакцинации, такими как живые ослабленные вирусы и вакцины, основанные на рекомбинантном белке. ДНК вакцины безопасны, стабильны, легко производятся и хорошо переносились людьми в доклинических исследованиях, показавших небольшое свидетельство интеграции плазмид [МагНп, Т., е! а1., Р1акт1б ΌΝΑ ша1апа уассше: !Не ροϊοηΐίαΐ Гог депотю ш!едга!юп айег ш!гашикси1аг Щ)ес!юп. Нит Сепе ТНег, 1999. 10(5): р. 759-68; №сНо1к, е! а1., Ро1епИа1 ΌΝΆ уассше ш!едга!юп ίηΐο
Нок! се11 депоте. Апп N Υ Лсаб δα, 1995. 772: р. 30-9]. Кроме того, ДНК вакцины хорошо подходят для повторного введения вследствие того факта, что на эффективность вакцины не влияют ранее существовавшие титры антител к вектору [СНа!!егдооп, М., 1. Воуег, апб Ό.Β. \Уешег. СепеНс штшш/аПоп: а пе\у ега ш уассшек апб 1ттипе !Негареи!1ск. ΡΑδΕΒ 1, 1997. 11(10): р. 753-63]. Однако основное препятствие для клинического внедрения ДНК вакцин заключается в уменьшении базовой иммуногенности при переходе к более крупным животным [Ыц, М.А. апб ΙΒ. и1тег, Нитап сйтса1 1па1к оГ р1акт1б ΌΝΑ уассшек. Αάν Сепе!, 2005. 55: р. 25-40]. Последние технологические достижения в разработке иммуногенной ДНКвакцины, такие как оптимизация кодонов, оптимизация РНК и добавление лидерных последовательностей иммуноглобулина улучшили экспрессию и иммуногенность ДНК-вакцин [Апбге, δ., е! а1., 1псгеакеб 1ттипе гекропке еНсйеб Ьу ΌΝΑ уасс1пабоп \\йН а куп!НеНс др120 кесщепсе χνίΐΐι орШт/еб собоп икаде. 1. У1го1, 1998. 72(2): р. 1497-503; Эетк Ь., е! а1., МиШр1е еГГес!к оГ собоп икаде орШш/аПоп оп ехргеккюп апб ттшподешсйу оГ ΌΝΑ сапб1ба!е уассшек епсобшд !Не Нитап ттшпобеПаепсу νίτυκ !уре 1 Сад рго!еш 1. У1го1, 2001. 75(22): р. 10991-1001; Ьаббу, Ό.Ι, е! а1., 1ттиподетсйу оГ ηονе1 сопкепкик-Ьакеб ΌΝΑ уассшек адатк! а\аап тПиеп/а. Уассше, 2007. 25(16): р. 2984-9; РгеНп, Ь., е! а1., Собоп орПни/аПоп апб тΚ.NΑ атрНЛсаНоп еПссПуе1у епНапсек !Не ттшподешсйу оГ !Не Нераббк С уник попк!гис!ига1 3/4Α депе. Сепе ТНег, 2004. 11(6): р. 522-33].
Последние технологические достижения в системах доставки плазмид улучшили экспрессию и иммуногенность ДНК-вакцин, включая такие технологии, как электропорация [Нйао, ΗΑ., е! а1., 1п!габегта1/киЬси!апеоик штшш/аПоп Ьу е1ес!горога!юп Птргоуек р1акт1б уассше беПуегу апб ро!епсу ш ртдк апб гНекик тасасщек. Уассше, 2008. 26(3): р. 440-8; Ьискау, Α., е! а1., ЕГГес! оГ р1акт1б ΌΝΑ уассше беыдп апб ш саго е1ес!горога!юп оп !Не гекиШпд уассше-креаЛс 1ттипе гекропкек ш гНекик тасасщек. 1. Уйо1, 2007. 81(10): р. 5257-69; ЛЫеи С., е! а1., 1п νί\Ό е1ес!горога!юп епНапсек !Не 1ттиподетсйу оГ НераННк С уник поп8!гис!ига1 3/4Α ΌΝΑ Ьу шсгеакеб 1оса1 ΌΝΑ ир!аке, рго!еш ехргеккюп 1пПатта!юп, апб тЛНгаПоп оГ СП3+ Т се11к. 1. 1ттипо1, 2007. 179(7): р. 4741-53].
Кроме того, исследования подтверждают, что использование консенсусных иммуногенов может повышать размах клеточной иммунной реакции по сравнению с одними природными антигенами ^ап, 1., е! а1., ЕпНапсеб се11и1аг 1ттипе гекропкек еНсйеб Ьу ап епдтеегеб Н1У-1 киЬ!уре В сопкепкик-Ьакеб епуе1оре ΌΝΑ уассше. Мо1 ТНег, 2007. 15(2): р. 411-21; Ко11апб, М., е! а1., Ресопк1гисПоп апб ГипсЛоп оГ апсек!га1 сеп!ег-оГ-!гее Нитап ттшпобеПаепсу у1гик !уре 1 рго!ешк. 1. УНо1, 2007. 81(16): р. 8507-14]. Однако общепризнано, что нарушение иммунной толерантности к раковым антигенам и выработка аутоиммунитета является основным препятствием для вакцин против рака.
Все еще остается потребность в конструктах нуклеиновых кислот, которые кодируют антигены рака простаты, и в составах, пригодных для стимуляции иммунных ответов на антигены рака простаты и нарушения таким образом иммунной толерантности. Остается потребность в эффективных профилактических и терапевтических вакцинах против рака простаты, которые являются экономичными и эффективными.
- 1 027315
Сущность изобретения
Аспекты настоящего изобретения включают молекулы нуклеиновых кислот, содержащие кодирующую последовательность, кодирующую один или более белков, выбранных из группы, содержащей а) 8ЕО ГО N0: 2; белок, который на 98% гомологичен 8Е0 ГО N0: 2, при условии, что сохранились аминокислоты 69, 78, 80, 82, 102, 110, 137, 139, 165, 189, 203, 220, 232 и 248 из 8Е0 ГО N0: 2; или иммуногенный фрагмент 8Е0 ГО N0: 2, содержащий аминокислоты, соответствующие по меньшей мере 256 аминокислотным остаткам 8Е0 ГО N0: 2, при условии, что сохранились аминокислоты 69, 78, 80, 82, 102, 110, 137, 139, 165, 189, 203, 220, 232 и 248 из 8ЕО ГО N0: 2; б) 8ЕО ГО N0: 4; белок, который на 98% гомологичен 8Е0 ГО N0: 4, при условии, что сохранились аминокислоты 21, 86, 127, 129, 154, 156, 182, 195, 206, 218, 220, 237, 249, 255, 265, 271 и 275 из 8Е0 ГО N0: 4; или иммуногенный фрагмент 8Е0 ГО N0: 4, содержащий аминокислоты, соответствующие по меньшей мере 274 аминокислотным остаткам 8Е0 ГО N0: 4, при условии, что сохранились аминокислоты 21, 86, 127, 129, 154, 156, 182, 195, 206, 218, 220, 237, 249, 255, 265, 271 и 275 из 8Е0 ГО N0: 4; в) 8Е0 ГО N0: 6; белок, который на 98% гомологичен 8Е0 ГО N0: 6, при условии, что сохранились аминокислоты 14, 15, 32, 47, 58, 79,111, 157, 223, 320, 350, 475, 499, 569, 613, 624, 653, 660, 663, 733 и 734 из 8Е0 ГО N0: 6; или иммуногенный фрагмент 8Е0 ГО N0: 6, содержащий аминокислоты, соответствующие по меньшей мере 735 аминокислотным остаткам 8Е0 ГО N0: 6, при условии, что сохранились аминокислоты 14, 15, 32, 47, 58, 79,111, 157, 223, 320, 350, 475, 499, 569, 613, 624, 653, 660, 663, 733 и 734 из 8ЕО ГО N0: 6; г) 8ЕО ГО N0: 8; белок, который на 98% гомологичен 8Е0 ГО N0: 8, при условии, что сохранились аминокислоты 20, 30, 31, 48, 63, 74, 95, 127, 173, 239, 336, 366, 491, 515, 564, 585, 629, 640, 669, 676, 679, 749 и 750 из 8ЕО ГО N0: 8; или иммуногенный фрагмент 8Е0 ГО N0: 8, содержащий аминокислоты, соответствующие по меньшей мере 751 аминокислотным остаткам 8Е0 ГО N0: 8, при условии, что сохранились аминокислоты 20, 30, 31, 48, 63, 74, 95, 127, 173, 239, 336, 366, 491, 515, 564, 585, 629, 640, 669, 676, 679, 749 и 750 из 8ЕО ГО N0: 8; д) 8ЕО ГО N0: 10; белок, который на 98% гомологичен 8Е0 ГО N0: 10; или иммуногенный фрагмент 8Е0 ГО N0: 10, содержащий аминокислоты, соответствующие по меньшей мере 333 аминокислотным остаткам 8Е0 ГО N0: 10; е) 8Е0 ГО N0: 12; белок, который на 98% гомологичен 8Е0 ГО N0: 12; или иммуногенный фрагмент 8Е0 ГО N0: 12, содержащий аминокислоты, соответствующие по меньшей мере 349 аминокислотным остаткам 8Е0 ГО N0: 12; ж) 8Е0 ГО N0: 14; белок, который на 98% гомологичен 8Е0 ГО N0: 14 или иммуногенный фрагмент 8Е0 ГО N0: 14, содержащий аминокислоты, соответствующие по меньшей мере 129 аминокислотным остаткам 8Е0 ГО N0: 14; или з) сигнальный пептид, связанный с аминокислотами 19-131 из 8Е0 ГО N0: 14; белок, который имеет сигнальный пептид, связанный с аминокислотной последовательностью, которая на 98% гомологична аминокислотам 19-131 из 8Е0 ГО N0: 14; или белок, который имеет сигнальный пептид, связанный с иммуногенным фрагментом аминокислот 19-131 из 8Е0 ГО N0: 14, фрагмент, содержащий по меньшей мере 110 аминокислотных остатков 8Е0 ГО N0: 14 и связанный с сигнальным пептидом. В некоторых вариантах воплощения молекулы нуклеиновой кислоты выбираются из молекул нуклеиновой кислоты, кодирующих белки а), б), в), или г).
В другом аспекте изобретение включает способы лечения пациента, у которого диагностирован рак простаты, включающие введение пациенту молекулы нуклеиновой кислоты, описанной в настоящем изобретении.
В другом аспекте предоставляются белки, выбранные из группы, состоящей из а) 8Е0 ГО N0: 2; белка, который на 98% гомологичен 8Е0 ГО N0: 2, при условии, что сохранились аминокислоты 69, 78, 80, 82, 102, 110, 137, 139, 165, 189, 203, 220, 232 и 248 из 8Е0 ГО N0: 2; или иммуногенного фрагмента 8Е0 ГО N0: 2, содержащего аминокислоты, соответствующие по меньшей мере 261 аминокислотным остаткам 8Е0 ГО N0: 2, при условии, что сохранились аминокислоты 69, 78, 80, 82, 102, 110, 137, 139, 165, 189, 203, 220, 232 и 248 из 8Е0 ГО N0: 2; б) 8Е0 ГО N0: 4; белка, который на 98% гомологичен 8Е0 ГО N0: 4, при условии, что сохранились аминокислоты 21, 86, 127, 129, 154, 156, 182, 195, 206, 218, 220, 237, 249, 255, 265, 271 и 275 из 8Е0 ГО N0: 4; или иммуногенного фрагмента 8Е0 ГО N0: 4, содержащего аминокислоты, соответствующие по меньшей мере 274 аминокислотным остаткам 8Е0 ГО N0: 4, при условии, что сохранились аминокислоты 21, 86, 127, 129, 154, 156, 182, 195, 206, 218, 220, 237, 249, 255, 265, 271 и 275 из 8Е0 ГО N0: 4; в) 8Е0 ГО N0: 6; белка, который на 98% гомологичен 8Е0 ГО N0: 6, при условии, что сохранились аминокислоты 14, 15, 32, 47, 58, 79,111, 157, 223, 320, 350, 475, 499, 569, 613, 624, 653, 660, 663, 733 и 734 из 8Е0 ГО N0: 6; или иммуногенного фрагмента 8Е0 ГО N0: 6, содержащего аминокислоты, соответствующие по меньшей мере 735 аминокислотным остаткам 8Е0 ГО N0: 6, при условии, что сохранились аминокислоты 14, 15, 32, 47, 58, 79,111, 157, 223, 320, 350, 475, 499, 569, 613, 624, 653, 660, 663, 733 и 734 из 8Е0 ГО N0: 6; г) 8Е0 ГО N0: 8; белка, который на 98% гомологичен 8Е0 ГО N0: 8, при условии, что сохранились аминокислоты 20, 30, 31, 48, 63, 74, 95, 127, 173, 239, 336, 366, 491, 515, 564, 585, 629, 640, 669, 676, 679, 749 и 750 из 8Е0 ГО N0: 8; или иммуногенного фрагмента 8Е0 ГО N0: 8, содержащего аминокислоты, соответствующие по меньшей мере 751 аминокислотным остаткам 8Е0 ГО N0: 8, при условии, что сохранились аминокислоты 20, 30, 31, 48, 63, 74, 95, 127, 173, 239, 336, 366, 491, 515, 564, 585, 629, 640, 669, 676, 679, 749 и 750 из 8ЕО ГОЫ0:8; д) 8ЕО ГО N0: 10; белка, который на 98% гомологичен 8Е0 ГО N0: 10; или иммуногенного фрагмента 8Е0 ГО N0: 10, содержащего аминокислоты, соответствующие по меньшей мере 333 аминокислотным остаткам 8Е0 ГО N0: 10;
- 2 027315
е) δΕΟ ΙΌ N0: 12; белка, который на 98% гомологичен δΕΟ ГО N0: 12; или иммуногенного фрагмента δΕΟ ГО N0: 12, содержащего аминокислоты, соответствующие по меньшей мере 349 аминокислотным остаткам δΕΟ ГО N0: 12; ж) δΕΟ ГО N0: 14; белка, который на 98% гомологичен δΕΟ ГО N0: 14; или иммуногенного фрагмента δΕΟ ГО N0: 14, содержащего аминокислоты, соответствующие по меньшей мере 129 аминокислотным остаткам δΕΟ ГО N0: 14; или з) сигнального пептида, связанного с аминокислотами 19-131 из δΕΟ ГО N0: 14; белка, который имеет сигнальный пептид, связанный с аминокислотной последовательностью, которая на 98% гомологична аминокислотам 19-131 из δΕΟ ГО N0: 14; или белка, который имеет сигнальный пептид, связанный с иммуногенным фрагментом аминокислот 19-131 из δΕΟ ГО N0: 14, фрагментом, содержащим по меньшей мере 110 аминокислотных остатков δΕΟ ГО N0: 14 и связанным с сигнальным пептидом. В некоторых вариантах воплощения белок выбирается из группы, содержащей белки а), б), в) или г).
Некоторые аспекты изобретения включают способы лечения пациента, у которого диагностировался рак простаты, включающие доставку упомянутому пациенту белка, описанного в настоящем изобретении.
Другими аспектами изобретения являются фармацевтические составы, содержащие молекулы нуклеиновой кислоты, предоставляемые в настоящем изобретении, и фармацевтически приемлемое вспомогательное вещество.
Краткое описание фигур
Фиг. 1 показывает результаты трансляции ίη νίίτο, проведенной для подтверждения экспрессии ΡδΑ и ΡδΜΑ антигенов.
Фиг. 2А показывает данные по клеточной иммуногенности. Клеточная иммуногенность ΡδΆ антигенов определялась по интерферон-гамма ΕΕΙδροΐ.
Фиг. 2В показывает данные по клеточной иммуногенности. Клеточная иммуногенность ΡδΑ антигенов определялась по интерферон-гамма ΕΕΙδροΐ.
Фиг. 3А-С показывают реакции СГО4+ Т-клеток, как охарактеризовано по проточной цитометрии путем демонстрации графиков, показывающих ΡδΑ-специфичную (левая вставка), ΡδΜΑ-специфичную (средняя вставка) и совокупную вакциноспецифичную (правая вставка) продукцию цитокинов:% ГЕИу продуцирующие СГО4+ Т-клетки (фиг. 3А);% ГО-2 продуцирующие СГО4+ Т-клетки (фиг. 3В);% ФНОа продуцирующие СГО4+ Т-клетки (фиг. 3С).
Фиг. 4А-С показывают реакции СГО8+ Т-клеток, как охарактеризовано посредством проточной цитометрии при демонстрации графиков, показывающих ΡδΑ-специфичную (левая вставка), ΡδΜΑспецифичную (средняя вставка) и совокупную вакциноспецифичную (правая вставка) продукцию цитокинов:% ГЕИу продуцирующих СГО8+ Т-клеток (фиг. 4А);% ГО-2 продуцирующих СГО8+ Т-клеток (фиг. 4В);% ФНО-альфа-продуцирующих СГО8+ Т-клеток (фиг. 4С).
Фиг. 5А, В показывают данные ΕΌΙδΑ для ΡδΑ-специфичных антител через одну неделю после последней иммунизации. Фиг. 5А - ΡδΑ Ι§0 конечные титры. Фиг. 5В - репрезентативные кривые титрования 1§С.
Подробное описание
В настоящем изобретении предоставляются консенсусные последовательности белков простаты и выделенные молекулы нуклеиновых кислот, которые их кодируют, и, в частности, антигены простаты, простатоспецифический антиген (ΡδΑ), мембранный простатоспецифический антиген (ΡδΜΑ), эпителиальный антиген простаты, содержащий шесть трансмембранных доменов (δΤΕΑΡ) и простатоспецифический антиген стволовых клеток (Ρδί'Ά).
Антигены рака простаты, описанные здесь, представляют собой консенсусные последовательности, полученные из пула гомологичных антигенов множества видов, включая вид, являющийся целевым для вакцины. Выбранные виды, антигенные последовательности которых выравниваются для образования консенуса, следует выбирать на основе тесной близости видов на филогенетическом древе, например, Н.8ар1еп5 (люди), Μ.ιηιιΕιΙΙα (макаки-резусы), и Μ.ΠίδοίοιιΕιπδ (яванские макаки). Консенсусный антиген не идентичен природному антигену простаты, но будет иметь близкую идентичность, если последовательности идентичны по меньшей мере на 85% и предпочтительно на 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, или 99%. Эти описанные консенсусные раковые антигены способны нарушать толерантность целевого вида (или быть причиной аутоиммунитета) и вырабатывать эффективную иммунную реакцию против антигена рака простаты. В настоящем изобретении предоставляются способы производства ДНК-вакцины, основанной на консенсусных раковых антигенах.
Аспекты настоящего изобретения включают молекулы нуклеиновых кислот, содержащие кодирующую последовательность, которая кодирует один или более белков, выбранных из группы, содержащей а) δΕΟ ΙΌ N0: 2; белок, который на 98% гомологичен δΕΟ ΙΌ N0: 2, при условии сохранения аминокислот 69, 78, 80, 82, 102, 110, 137, 139, 165, 189, 203, 220, 232 и 248 из δΕΟ ΙΌ N0: 2; или иммуногенный фрагмент δΕΟ ГО N0: 2, содержащий аминокислоты, соответствующие по меньшей мере 256 аминокислотным остаткам δΕΟ ΙΌ N0: 2, при условии сохранения аминокислот 69, 78, 80, 82, 102, 110, 137, 139, 165, 189, 203, 220, 232 и 248 из δΕΟ ΙΌ N0: 2; б) δΕΟ ΙΌ N0: 4; белок, который на 98% гомологичен
- 3 027315 δΕΟ ΙΌ N0: 4, при условии сохранения аминокислот 21, 86, 127, 129, 154, 156, 182, 195, 206, 218, 220, 237, 249, 255, 265, 271 и 275 из δΕΟ ΙΌ N0: 4; или иммуногенный фрагмент δΕΟ ΙΌ N0: 4, содержащий аминокислоты, соответствующие по меньшей мере 274 аминокислотным остаткам δΕΟ ΙΌ N0: 4, при условии сохранения аминокислот 21, 86, 127, 129, 154, 156, 182, 195, 206, 218, 220, 237, 249, 255, 265, 271 и 275 из δΕΟ ΙΌ N0: 4; в) δΕΟ ΙΌ N0: 6; белок, который на 98% гомологичен δΕΟ ΙΌ N0: 6, при условии сохранения аминокислот 14, 15, 32, 47, 58, 79,111, 157, 223, 320, 350, 475, 499, 569, 613, 624, 653, 660, 663, 733 и 734 из δΕΟ ΙΌ N0: 6; или иммуногенный фрагмент δΕΟ ΙΌ N0: 6, содержащий аминокислоты, соответствующие по меньшей мере 735 аминокислотным остаткам δΕΟ ΙΌ N0: 6, при условии сохранения аминокислот 14, 15, 32, 47, 58, 79,111, 157, 223, 320, 350, 475, 499, 569, 613, 624, 653, 660, 663, 733 и 734 из δΕΟ ΙΌ N0: 6; г) δΕΟ ΙΌ N0: 8; белок, который на 98% гомологичен δΕΟ ΙΌ N0: 8, при условии сохранения аминокислот 20, 30, 31, 48, 63, 74, 95, 127, 173, 239, 336, 366, 491, 515, 564, 585, 629, 640, 669, 676, 679, 749 и 750 из δΕΟ ΙΌ N0: 8; или иммуногенный фрагмент δΕΟ ΙΌ N0: 8, содержащий аминокислоты, соответствующие по меньшей мере 751 аминокислотным остаткам δΕΟ ΙΌ N0: 8, при условии сохранения аминокислот 20, 30, 31, 48, 63, 74, 95, 127, 173, 239, 336, 366, 491, 515, 564, 585, 629, 640, 669, 676, 679, 749 и 750 из δΕΟ ΙΌ N0: 8; д) δΕΟ ΙΌ N0: 10; белок, который на 98% гомологичен δΕΟ ΙΌ N0: 10; или иммуногенный фрагмент δΕΟ ΙΌ N0: 10, содержащий аминокислоты, соответствующие по меньшей мере 333 аминокислотным остаткам δΕΟ ΙΌ N0: 10; е) δΕΟ ΙΌ N0: 12; белок, который на 98% гомологичен δΕΟ ΙΌ N0: 12; или иммуногенный фрагмент δΕΟ ΙΌ N0: 12, содержащий аминокислоты, соответствующие по меньшей мере 349 аминокислотным остаткам δΕΟ ΙΌ N0: 12; ж) δΕΟ ΙΌ N0: 14; белок, который на 98% гомологичен δΕΟ ΙΌ N0: 14; или иммуногенный фрагмент δΕΟ ΙΌ N0: 14, содержащий аминокислоты, соответствующие по меньшей мере 129 аминокислотным остаткам δΕΟ ΙΌ N0: 14; или иммуногенный фрагмент δΕΟ ΙΌ N0: 14, содержащий по меньшей мере 129 аминокислотных остатков δΕΟ ΙΌ N0: 14; или з) сигнальный пептид, связанный с аминокислотами 19-131 из δΕΟ ΙΌ N0: 14; белок, который имеет сигнальный пептид, связанный с аминокислотной последовательностью, которая на 98% гомологична аминокислотам 19-131 из δΕΟ ΙΌ N0: 14; или белок, который имеет сигнальный пептид, связанный с иммуногенным фрагментом аминокислот 19-131 из δΕΟ ΙΌ N0: 14, фрагментом, содержащим по меньшей мере 110 аминокислотных остатков из δΕΟ ΙΌ N0: 14 и связанным с сигнальным пептидом. Раскрыты две консенсусных белковых последовательности для ΡδΑ: консенсусная антигенная последовательность 1 ΡδΑ (δΕΟ ΙΌ N0: 2) и консенсусная антигенная последовательность 2 ΡδΑ (δΕΟ ΙΌ N0: 4). Раскрыты две консенсусных белковых последовательности для ΡδΜΑ: консенсусная антигенная последовательность 1 ΡδΜΑ (δΕΟ ΙΌ N0: 6) и консенсусная антигенная последовательность 2 ΡδΜΑ (δΕΟ ΙΌ N0: 8). Раскрыты две консенсусных белковых последовательности для δΤΕΑΡ (также обозначаемого здесь как δΤΕΑΡ1): консенсусная антигенная последовательность 1 δΤΕΑΡ (δΕΟ ΙΌ N0: 10) и консенсусная антигенная последовательность 2 δΤΕΑΡ (δΕΟ ΙΌ N0: 12). Раскрыта одна консенсусная белковая последовательность Ρδί'Ά: консенсусная антигенная последовательность Ρδί'Ά (δΕΟ ΙΌ N0: 14). δΕΟ ΙΌ N0: 14 включает Ι§Ε сигнальный пептид. В некоторых вариантах воплощения консенсусный антиген Ρδί'Ά может включать аминокислоты 19-131 из δΕΟ ΙΌ N0: 14, связанные с сигнальной последовательностью, отличной от Ι§Ε сигнала в δΕΟ ΙΌ N0: 14. В некоторых вариантах воплощения молекулы нуклеиновой кислоты выбираются из тех, которые кодируют белки а), б), в) или г), перечисленные выше. В других вариантах воплощения молекулы нуклеиновой кислоты представляют собой те, которые кодируют один или более белков, выбранных из группы, содержащей по меньшей мере один, выбранный из тех, которые кодируют белки или а) или б), и по меньшей мере один, выбранный из тех, которые кодируют белки или в) или г).
Кроме того, молекулы нуклеиновой кислоты могут быть молекулами, кодирующими один или более белков, выбранных из группы, содержащей δΕΟ ΙΌ N0: 2; δΕΟ ΙΌ N0: 4; δΕΟ ΙΌ N0: 6; δΕΟ ΙΌ N0: 8; δΕΟ ΙΌ N0: 10; δΕί) ΙΌ N0: 12 или δΕί) ΙΌ N0: 14; и предпочтительно δΕί) ΙΌ N0: 2; δΕί) ΙΌ N0: 4; δΕΟ ΙΌ N0: 6; или δΕΟ ΙΌ N0: 8. В некоторых вариантах воплощения молекула нуклеиновой кислоты может быть одной из тех, которые кодируют один или более белков, выбранных из группы, содержащей по меньшей мере один, выбранный или из δΕΟ ΙΌ N0: 2, или из δΕΟ ΙΌ N0: 4, и по меньшей мере один, выбранный или из δΕΟ ΙΌ N0: 6, или из δΕΟ ΙΌ N0: 8.
В другом аспекте предоставляются белки, выбранные из группы, состоящей из а) δΕΟ ΙΌ N0: 2; белка, который на 98% гомологичен δΕΟ ΙΌ N0: 2, при условии, что сохранились аминокислоты 69, 78, 80, 82, 102, 110, 137, 139, 165, 189, 203, 220, 232 и 248 из δΕΟ ΙΌ N0: 2; или иммуногенный фрагмент δΕΟ ΙΌ N0: 2, содержащий аминокислоты, соответствующие по меньшей мере 256 аминокислотным остаткам δΕΟ ΙΌ N0: 2, при условии, что сохранились аминокислоты 69, 78, 80, 82, 102, 110, 137, 139, 165, 189, 203, 220, 232 и 248 из δΕΟ ΙΌ N0: 2; б) δΕΟ ΙΌ N0: 4; белка, который на 98% гомологичен δΕΟ ΙΌ N0: 4, при условии, что сохранились аминокислоты 21, 86, 127, 129, 154, 156, 182, 195, 206, 218, 220, 237, 249, 255, 265, 271 и 275 из δΕΟ ΙΌ N0: 4; или иммуногенный фрагмент δΕΟ ΙΌ N0: 4, содержащий аминокислоты, соответствующие по меньшей мере 274 аминокислотным остаткам δΕΟ ΙΌ N0: 4, при условии, что сохранились аминокислоты 21, 86, 127, 129, 154, 156, 182, 195, 206, 218, 220, 237, 249, 255, 265, 271 и 275 из δΕΟ ΙΌ N0: 4; в) δΕΟ ΙΌ N0: 6; белка, который на 98% гомологичен δΕΟ ΙΌ N0: 6, при условии, что сохранились аминокислоты 14, 15, 32, 47, 58, 79,111, 157, 223, 320, 350, 475, 499, 569, 613,
- 4 027315
624, 653, 660, 663, 733 и 734 из 8ЕО ГО N0: 6; или иммуногенный фрагмент 8Е0 ГО N0: 6, содержащий аминокислоты, соответствующие по меньшей мере 735 аминокислотным остаткам 8Е0 ГО N0: 6, при условии, что сохранились аминокислоты 14, 15, 32, 47, 58, 79,111, 157, 223, 320, 350, 475, 499, 569, 613, 624, 653, 660, 663, 733 и 734 из 8Е0 ГО N0: 6; г) 8Е0 ГО N0: 8; белка, который на 98% гомологичен 8Е0 ГО N0: 8, при условии, что сохранились аминокислоты 20, 30, 31, 48, 63, 74, 95, 127, 173, 239, 336, 366, 491, 515, 564, 585, 629, 640, 669, 676, 679, 749 и 750 из 8Е0 ГО N0: 8; или иммуногенный фрагмент 8Е0 ГО N0: 8, содержащий аминокислоты, соответствующие по меньшей мере 751 аминокислотным остаткам 8Е0 ГО N0: 8, при условии, что сохранились аминокислоты 20, 30, 31, 48, 63, 74, 95, 127, 173, 239, 336, 366, 491, 515, 564, 585, 629, 640, 669, 676, 679, 749 и 750 из 8ΙΤ) ГО N0: 8; д) 8ΙΤ) ГО N0: 10; белка, который на 98% гомологичен 8Е0 ГО N0: 10; или иммуногенный фрагмент 8Е0 ГО N0: 10, содержащий аминокислоты, соответствующие по меньшей мере 333 аминокислотным остаткам 8Е0 ГО N0: 10; е) 8Е0 ГО N0: 12; белка, который на 98% гомологичен 8Е0 ГО N0: 12; или иммуногенный фрагмент 8Е0 ГО N0: 12, содержащий аминокислоты, соответствующие по меньшей мере 349 аминокислотным остаткам 8Е0 ГО N0: 12; ж) 8Е0 ГО N0: 14; белка, который на 98% гомологичен 8Е0 ГО N0: 14; или иммуногенный фрагмент 8Е0 ГО N0: 14, содержащий аминокислоты, соответствующие по меньшей мере 129 аминокислотным остаткам 8Е0 ГО N0: 14; или з) сигнального пептида, связанного с аминокислотами 19131 из 8Е0 ГО N0: 14; белка, который имеет сигнальный пептид, связанный с аминокислотной последовательностью, которая на 98% гомологична аминокислотам 19-131 из 8Е0 ГО N0: 14; или белок, который имеет сигнальный пептид, связанный с иммуногенным фрагментом аминокислот 19-131 из 8Е0 ГО N0: 14, фрагментом, содержащим по меньшей мере 110 аминокислотных остатков 8Е0 ГО N0: 14 и связанным с сигнальным пептидом.
В некоторых вариантах воплощения белок выбирается из группы, содержащей белки а), б), в) или г). В других вариантах воплощения белки являются белками, кодирующими один или более белков, выбранных из группы, содержащей по меньшей мере один, выбранный из белков или а) или б), и по меньшей мере один, выбранный из белков или в) или г).
Кроме того, белки могут быть белками, выбранными из группы, содержащей 8Е0 ГО N0: 2; 8Е0 ГО N0: 4; 8ΙΤ) ГО N0: 6; 8ΙΤ) ГО N0: 8; 8ΙΤ) ГО N0: 10; 8ΙΤ) ГО N0: 12; или 8ΙΤ) ГО N0: 14; и предпочтительно, 8Е0 ГО N0: 2; 8Е0 ГО N0: 4; 8Е0 ГО N0: 6 или 8Е0 ГО N0: 8. В некоторых вариантах воплощения белки могут быть белками, которые выбраны из группы, содержащей по меньшей мере один, выбранный или из 8Е0 ГО N0: 2, или из 8Е0 ГО N0: 4, и по меньшей мере один, выбранный или из 8Е0 ГО N0: 6, или из 8Е0 ГО N0: 8.
Кодирующие последовательности нуклеиновой кислоты были созданы для усиления и оптимизации экспрессии. Кодоны, используемые в этих молекулах нуклеиновой кислоты, были отобраны для производства РНК, имеющей редуцированную вторичную структуру, образовавшуюся в результате внутримолекулярной гибридизации. Раскрыты последовательности нуклеиновой кислоты, кодирующие консенсусную антигенную последовательность 1 Р8А (8Е0 ГО N0: 1) и консенсусную антигенную последовательность 2 Р8А (8Е0 ГО N0: 3). Подобным образом, предоставляются кодирующая последовательность нуклеиновой кислоты для консенсусной антигенной последовательности 1 Р8МА (8Е0 ГО N0: 5 или нуклеотиды 1-2250 из 8Е0 ГО N0: 5) и консенсусной антигенной последовательности 2 Р8МА (8Е0 ГО N0: 7 или нуклеотиды 1-2301 из 8Е0 ГО N0: 7), а также консенсусной антигенной последовательности 1 8ТЕАР (8Е0 ГО N0: 9), консенсусной антигенной последовательности 2 8ТЕАР (8Е0 ГО N0: 11) и консенсусной антигенной последовательности Р8СА (8Е0 ГО N0: 13). Также предоставляются последовательности нуклеиновой кислоты, которые на 98% гомологичны 8Е0 ГО N0: 1 и кодируют или консенсусную антигенную последовательность 1 Р8А (8Е0 ГО N0: 2), или белок, на до 98% гомологичный 8Е0 ГО N0: 2, предпочтительно включающий аминокислоты 69, 78, 80, 82, 102, 110, 137, 139, 165, 189, 203, 220, 232 и 248 из 8Е0 ГО N0: 2, и последовательности нуклеиновой кислоты, которые на 98% гомологичны 8Е0 ГО N0: 3 и кодируют или консенсусную антигенную последовательность 2 Р8А (8Е0 ГО N0: 4), или белок, на до 98% гомологичный 8Е0 ГО N0: 4, предпочтительно включающий аминокислоты 21, 86, 127, 129, 154, 156, 182, 195, 206, 218, 220, 237, 249, 255, 265, 271 и 275 из 8ΙΤ) ГО N0: 4. Подобным образом, предоставляются последовательности нуклеиновой кислоты, которые на 98% гомологичны нуклеотидам 2250 из 8Е0 ГО N0: 5 и кодируют или консенсусную антигенную последовательность 1 Р8МА (8Е0 ГО N0: 6), или белок, на до 98% гомологичный 8Е0 ГО N0: 6, предпочтительно включающий аминокислоты 14, 15, 32, 47, 58, 79,111, 157, 223, 320, 350, 475, 499, 569, 613, 624, 653, 660, 663, 733 и 734 из 8Е0 ГО N0: 6, или последовательности нуклеиновой кислоты, которые на 98% гомологичны нуклеотидам 2301 из 8Е0 ГО N0: 7 и кодируют или консенсусную антигенную последовательность 1 Р8МА (8Е0 ГО N0: 8), или белок, на до 98% гомологичный 8Е0 ГО N0: 8, предпочтительно включающий аминокислоты 20, 30, 31, 48, 63, 74, 95, 127, 173, 239, 336, 366, 491, 515, 564, 585, 629, 640, 669, 676, 679, 749 и 750 из 8Е0 ГО N0: 8, а также нуклеотиды, которые на 98% гомологичны 8Е0 ГО N0 9 и кодируют или консенсусную антигенную последовательность 1 8ТЕАР (8Е0 ГО N0: 10), или белок, который на до 98% гомологичен 8Е0 ГО N0: 10, нуклеотиды, которые на 98% гомологичны 8Е0 ГО N0: 11 и кодируют или консенсусную антигенную последовательность 2 8ТЕАР (8Е0 ГО N0: 12), или белок, который на до 98% гомологичен 8Е0 ГО N0: 12, и нуклеотиды, которые на 98% гомологичны 8Е0 ГО N0: 13
- 5 027315 и кодируют или консенсусную антигенную последовательность Р8СА (8ЕО ГО N0: 14), или белок, который на до 98% гомологичен 8Е0 ГО N0: 14. В некоторых вариантах воплощения молекулы нуклеиновой кислоты кодируют белок, который содержит сигнальный пептид 1дЕ (например, 8Е0 ГО N0: 3, которая кодирует 8Е0 ГО N0: 4; нуклеотиды 1-2301 из 8Е0 ГО N0: 7 которые кодируют 8Е0 ГО N0: 8; 8Е0 ГО N0: 11, которая кодирует 8Е0 ГО N0: 12, и 8Е0 ГО N0: 13, которая кодирует 8Е0 ГО N0: 14).
Составы, содержащие молекулы нуклеиновых кислот, которые содержат кодирующие последовательности молекул выделенных нуклеиновых кислот, предоставленные в настоящем изобретении, могут быть пригодны для стимуляции иммунных реакций на белок простаты при введении в животное. Составы, содержащие одну или более из этих последовательностей нуклеиновых кислот, могут использоваться как вакцины или компоненты вакцины для профилактической или терапевтической иммунизации к раку простаты. Подобным образом, составы, содержащие консенсусные белки, могут быть пригодны для стимуляции иммунных реакций на белок простаты при введении в животное. Комбинации составов, содержащих молекулы нуклеиновых кислот, которые содержат кодирующие последовательности выделенных молекул нуклеиновых кислот, представленные здесь, могут быть пригодны для стимуляции иммунных реакций на белок простаты и могут вместе использоваться как вакцины или компоненты вакцины для профилактической или терапевтической иммунизации к раку простаты. Подобным образом, составы, содержащие консенсусные белки, могут быть пригодны для стимуляции иммунных реакций на белок простаты при введении в животное. Составы, содержащие один или более из этих консенсусных белков, могут использоваться как вакцины или компоненты вакцины для профилактической или терапевтической иммунизации к раку простаты.
Предоставляются вакцины, которые содержат последовательности нуклеиновых кислот, предоставляемые здесь. В некоторых вариантах воплощения предоставляются вакцины, которые содержат последовательности нуклеиновых кислот, кодирующие один или более консенсусных антигенов простаты, выбранных из группы, состоящей из консенсусного Р8А-антигена 1, консенсусного Р8А-антигена 2, консенсусного Р8МА-антигена 1, консенсусного Р8МА антигена-2, консенсусного 8ТЕАР антигена-1, консенсусного 8ТЕАР антигена-2, и консенсусного Р8СА. Способы стимуляции иммунных реакций с использованием последовательностей нуклеиновых кислот, кодирующих один или более антигенов простаты, выбираются из группы, состоящей из консенсусного Р8А антигена-1, консенсусного Р8А антигена-2, консенсусного Р8МА антигена-1, консенсусного Р8МА антигена-2, консенсусного 8ТЕАР антигена-1, консенсусного 8ТЕАР антигена-2, и консенсусного Р8СА.
Предоставляются вакцины, которые содержат один или более консенсусный Р8А антиген-1, консенсусный Р8А антиген-2, консенсусный Р8МА антиген-1, консенсусный Р8МА антиген-2, консенсусный 8ТЕАР антиген-1, консенсусный 8ТЕАР антиген-2, и консенсусный Р8СА. Также предоставляются способы стимуляции иммунных реакций с использованием одного или более консенсусного Р8А антигена-1, консенсусного Р8А антигена-2, консенсусного Р8МА антигена-1, консенсусного Р8МА антигена-2, консенсусного 8ТЕАР антигена-1, консенсусного 8ТЕАР антигена-2 и консенсусного Р8СА.
Предоставляются способы защиты пациента от рака простаты или лечения пациента, который идентифицирован как имеющий рак простаты. Способы содержат этап введения упомянутому пациенту эффективного количества одной или более молекул нуклеиновой кислоты, содержащих одну или более последовательностей нуклеиновой кислоты, предоставляемые здесь. В некоторых способах доставке молекул нуклеиновых кислот способствует электропорация ткани-мишени или ткани, которая получает молекулы нуклеиновой кислоты. Последовательность нуклеиновой кислты экспрессируется в клетках пациента и стимулируется иммунная реакция против белка простаты, кодируемого последовательностью нуклеиновой кислоты.
1. Определения.
Терминология, используемая в настоящем изобретении, служит только для цели описания определенных вариантов воплощения, и предполагается, что она не имеет ограничительного характера. При использовании в спецификации и прилагаемой формуле изобретения единственные формы включают отсыл ко множественным, если контекст очевидно не диктует обратное.
При перечислении числовых диапазонов в настоящем изобретении, недвусмысленно предполагается каждое промежуточное число в пределах одной степени точности. Например, в диапазоне 6-9 в дополнение к 6 и 9 предполагаются числа 7 и 8, и в диапазоне 6,0-7,0 недвусмысленно предполагаются числа 6,0; 6,1; 6,2; 6,3; 6,4; 6,5; 6,6; 6,7; 6,8; 6,9 и 7,0.
а. Адьювант.
Адъювант при использовании в настоящем изобретении означает любую молекулу, добавленную к ДНК-плазмидным вакцинам, описанным в настоящем изобретении, для усиления иммуногенности антигенов, кодируемых плазмидами ДНК и кодирующими нуклеиновыми последовательностями, описанными далее.
б. Антитело.
Антитело при использовании в настоящем изобретении означает антитело классов 1дС. 1дМ, 1дА, 1§0 или 1дЕ, или его фрагменты, его фрагменты или производные, включая РаЬ, Р(аЬ')2, Ρά, и одноцепочечные антитела, диатела, биспецифичные антитела, бифункциональные антитела и их производные.
- 6 027315
Антитело может быть антителом, выделенным из образца сыворотки млекопитающего, поликлональным антителом, аффинно-очищенным антителом, или их смесями, которое демонстрирует достаточную специфичность связывания с желаемым эпитопом или полученной из него последовательностью.
в. Кодирующая последовательность.
Кодирующая последовательность или кодирующая нуклеиновая кислота при использовании в настоящем изобретении означает нуклеиновые кислоты (молекулу РНК или ДНК), которые содержат нуклеотидную последовательность, которая кодирует белок. Кодирующая последовательность может также включать сигналы инициации и терминации, функционально связанные с регуляторными элементами, включая промотор и сигнал полиаденилирования, способный направлять экспрессию в клетках человека или млекопитающего, которому введена нуклеиновая кислота.
г. Комплемент.
Комплемент или Комплементарный при использовании в настоящем изобретении означает спаривание оснований по Уотсону-Крику (например, А-Т/и и С-О) или Хустингу между нуклеотидами или аналогами нуклеотидов нуклеиновых молекул.
д. Консенсус или консенсусная последовательность.
Консенсус или консенсусная последовательность при использовании в настоящем изобретении означает полипептидную последовательность, основанную на анализе выравнивания множественных субтипов определенного антигена простаты. Могут быть подготовлены последовательности нуклеиновых кислот, которые кодируют консенсусную полипептидную последовательность. Вакцины, содержащие белки, которые содержат консенсусные последовательности и/или молекулы нуклеиновых кислот, которые кодируют такие белки, могут быть использованы для стимуляции широкого иммунитета к определенному антигену простаты.
е. Электропорация.
Электропорация, электропермеабилизация или электро-кинетическая стимуляция (ЭП) при использовании взаимозаменяемо в настоящем изобретении означает использование трансмембранного импульса электрического поля для получения микроскопических путей (пор) в био-мембране; их присутствие позволяет биомолекулам, таким как плазмиды, олигонуклеотиды, миРНК, лекарствам, ионам и воде проходить с одной стороны клеточной мембраны на другую.
ж. Фрагмент.
Фрамент при использовании здесь в отношении последовательностей нуклеиновых кислот означает последовательность нуклеиновой кислоты или ее часть, которая кодирует полипептид, способный вызывать иммунную реакцию у млекопитающего, которая дает перекрестную реакцию с антигеном простаты полной длины. Фрагменты могут быть ДНК-фрагментами, выбранными из по меньшей мере одной из различных нуклеотидных последовательностей, которые кодируют консенсусные аминокислотные последовательности и конструкты, содержащие такие последовательности. ДНК-фрагменты могут содержать кодирующие последовательности для иммуноглобулинового лидера, такие как 1дЕ или 1дО последовательности. ДНК-фрагменты могут кодировать белковые фрагменты, перечисленные ниже.
Фрагмент в отношении полипептидных последовательностей означает полипептид, способный вызывать иммунную реакцию у млекопитающего, которая дает перекрестную реакцию с антигеном простаты, включая, например, Р8А, Р8МА, 8ТЕАР и Р8СА.
Последовательность Р8А человека состоит из около 261 аминокислоты. Фрагменты консенсусного антигена 1 Р8А могут содержать по меньшей мере 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 или 99% 8ЕО ГО N0: 2 и предпочтительно 98 или 99% при условии, что фрагменты включают одну или более из аминокислот 69, 78, 80, 82, 102, 110, 137, 139, 165, 189, 203, 220, 232 и 248. Фрагменты консенсусного антигена 1 Р8А могут содержать 255, 256, 257, 258, 259 или 260 аминокислот 8ЕО ГО N0: 2, но предпочтительно 256 аминокислот или более. Фрагменты консенсусного антигена 2 Р8А могут содержать по меньшей мере 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 или 99% 8Е0 ГО N0: 4 и предпочтительно 98 или 99% при условии, что фрагменты включают одну или более из аминокислот 21, 86, 127, 129, 154, 156, 182, 195, 206, 218, 220, 237, 249, 255, 265, 271 и 275. Все такие фрагменты консенсусного антигена 2 Р8А могут также необязательно исключать аминокислоты 1-17. В некоторых вариантах воплощения фрагменты консенсусного антигена 2 Р8А могут необязательно содержать одну или более из аминокислот 1-17 и из аминокислот от аминокислоты 18 до аминокислоты 278, фрагменты консенсусного антигена 2 Р8А могут также содержать 255, 256, 257, 258, 259 или 260 аминокислот 8Е0 ГО N0: 4, но предпочтительно 274 аминокислоты или более.
Последовательность Р8МА человека содержит около 749-750 аминокислот. Фрагменты консенсусного антигена 1 Р8МА могут содержать по меньшей мере 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 или 99% из 8Е0 ГО N0: 6 и предпочтительно 98 или 99%, при условии, что фрагменты включают одну или более из аминокислот 14, 15, 32, 47, 58, 79,111, 157, 223, 320, 350, 475, 499, 569, 613, 624, 653, 660, 663, 733 и 734. Фрагменты консенсунсного антигена 1 Р8МА могут содержать 745, 746, 747, 748 или 749 аминокислот 8Е0 ГО N0: 6, но предпочтительно 735 аминокислот или более. Фрагменты консенсунсного антигена 2 Р8МА могут содержать по меньшей мере 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 или 99% из 8Е0 ГО N0: 8 и предпочтительно 98 или 99%, при условии, что фрагменты включают одну или более из аминокислот 20,
- 7 027315
30, 31, 48, 63, 74, 95, 127, 173, 239, 336, 366, 491, 515, 564, 585, 629, 640, 669, 676, 679, 749 и 750. Все такие фрагменты консенсусного антигена 2 ΡδΑ могут также необязательно исключать аминокислоты 1-16. В некоторых вариантах воплощения фрагменты консенсусного антигена 2 ΡδΆ могут необязательно содержать одну или более из аминокислот 1-16 и из аминокислот от аминокислоты 17 до аминокислоты 766, фрагменты консенсусного антигена 2 ΡδΜΑ могут также содержать 760, 761, 762, 763, 764 или 765 аминокислот δΕΟ ГО N0: 8, но предпочтительно 751 аминокислоту или более.
Последовательность δΤΕΑΡ человека состоит из около 339 аминокислот. Консенсусные δΤΕΑΡ последовательности могут содержать аминокислотные последовательности для иммуноглобулинового лидера, такие как ΙβΕ или 1§С. Консенсусный антиген 2 δΤΕΑΡ содержит 18 аминокислот лидерной последовательности взамен метионина в положении 1. Фрагменты консенсусного антигена 2 ΡδΜΑ могут содержать лидерную последовательность и по меньшей мере 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 или 99% аминокислот 18-356 из δΕΟ ГО N0: 12 и предпочтительно 98 или 99%. Фрагменты консенсусного антигена 1 ΡδΜΑ могут содержать аминокислоты 1-350, 1-351, 1-352, 1-353, 1-354 или 1-355 из δΕΟ ΙΌ N0: 12.
Последовательность Ρδί'Ά человека состоит из около 114 аминокислот. Консенсусные δΤΕΑΡ последовательности могут содержать аминокислотные последовательности для иммуноглобулинового лидера, такие как Ι§Ε или 1§С. Консенсусный антиген Ρδί'Ά содержит 18 аминокислот лидерной последовательности взамен метионина в положении 1. Фрагменты консенсусного антигена Ρδί'Ά могут содержать лидерную последовательность и по меньшей мере 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 или 99% аминокислот 18-131 из δΕΟ ГО N0: 14, и предпочтительно 98 или 99%. Фрагменты консенсусного антигена 1 ΡδΜΑ могут содержать аминокислоты 1-125, 1-126, 1-127, 1-128, 1-129 или 1-130 из δΕΟ ΙΌ N0: 14.
з. Генетический конструкт.
При использовании в настоящем изобретении термин генетический конструкт обозначает молекулы ДНК или РНК, которые содержат нуклеотидную последовательность, которая кодирует белок. Кодирующая последовательность включает сигналы инициации и терминации, фукнционально связанные с регуляторными элементами, включая промотор и сигнал полиаденилирования, способные направлять экспрессию в клетках пациента, которому введена молекула нуклеиновой кислоты. При использовании здесь термин экспрессируемая форма относится к генным конструктам, которые содержат необходимые регуляторные элементы, функционально связанные с кодирующей последовательностью, которая кодирует белок, таким образом, что при присутствии в клетке пациента кодирующая последовательность будет экспрессироваться.
и. Гомология.
Гомология множественных выравниваний последовательностей и филограмма создавались с использованием С1и51а1\У. основной программы для целей выравнивания последовательностей ДНК или белков.
к. Идентичный.
Идентичный или идентичность при использовании здесь в контексте двух или более нуклеиновых кислот или полипептидных последовательностей означает, что эти последовательности имеют определенный процент остатков, которые являются одинаковыми на протяжении определенного участка. Процент может быть вычислен путем оптимального выравнивания двух последовательностей, сравнения двух последовательностей на протяжении определенного участка, определения количества положений, в которых в обеих последовательностях находятся идентичные остатки, для получения количества совпадающих положений, деления количества совпадающих положений на общее число положений в определенном участке, и умножение результата на 100 для получения процента идентичности последовательности. В случаях, когда две последовательности имеют различную длину или в результате выравнивания получается один или более несимметричных концов и определенный сравниваемый участок включает только единственную последовательность, остатки единственной последовательности включаются в знаменатель, но не в числитель расчета. При сравнении ДНК и РНК, тимин (Т) и урацил (И) могут считаться эквивалентами. Идентичность может быть определена вручную или с использованием компьютерного алгоритма, такого как ΒΕΑδΤ или ΒΕΑδΤ 2.0.
л. Иммунная реакция.
Иммунная реакция при использовании в настоящем изобретении означает активацию иммунной системы носителя, например, млекопитающего, в ответ на введение антигена, такого как консенсусный антиген простаты. Иммунная реакция может быть в форме клеточной или гуморальной реакции или обеих.
м. Нуклеиновая кислота.
Нуклеиновая кислота или олигонуклеотид или полинуклеотид при использовании в настоящем изобретении означает по меньшей мере два нуклеотида, ковалентно связанных вместе. Описание одной цепи также определяет последовательность комплементарной цепи. Таким образом, нуклеиновая кислота также охватывает комплементарную цепь обозначенной одиночной цепи. Множество вариантов нуклеиновой кислоты может быть использовано для той же цели, что и данная нуклеиновая кислота. Таким образом, нуклеиновая кислота также охватывает по существу идентичные нуклеиновые кислоты и их комплементарные цепи. Одиночная цепь предоставляет зонд, который может гибридизоваться с по- 8 027315 следовательностью-мишенью при жестких условиях гибридизации. Таким образом, нуклеиновая кислота также охзватывает зонд, который гибридизуется при жесткихусловиях гибридизации.
Нуклеиновые кислоты могут быть одноцепочечными или двуцепочечными или могут содержать части как двуцепочечной, так и одноцепочечной последовательности. Нуклеиновая кислота может быть ДНК как геномной, так и кДНК, РНК или гибридом, где нуклеиновая кислота может содержать комбинации дезоксирибо- и рибонуклеотидов, и комбинации оснований, включая урацил, аденин, тимин, цитозин, гуанин, инозин, ксантин, гипоксантин, изоцитозин и изогуанин. Нуклеиновые кислоты могут быть получены с помощью способов химического синтеза или рекомбинантных способов.
н. Функционально связанный.
Фукционально связанный при использовании в настоящем изобретении означает, что экспрессия гена находится под контролем промотора, с которым он пространственно соединен. Промотор может находиться в положении 5' (выше) или 3' (ниже) по отношению к гену, который он контролирует. Расстояние между промотором и геном может быть приблизительно таким же, как расстояние между промотором и геном, который он контролирует в том гене, из которого происходит промотор. Как известно специалистам, можно подобрать вариацию этого расстояния без потери фукнции промотора.
о. Промотор.
Промотор при использовании в настоящем изобретении означает синтетическую или природную молекулу, которая способна вызывать, активировать или усиливать экспрессию нуклеиновой кислоты в клетке. Промотор может содержать одну или более специфических регулирующих транскрипцию последовательностей для дополнительного усиления экспрессии и/или для изменения пространственной экспрессии и/или временной экспрессии того же участка. Промотор может также содержать дистальные энхансерные или репрессорные элементы, которые могут находиться на расстоянии до нескольких тысяч пар оснований от сайта начала транскрипции. Промотор может быть получен из источников, включающих вирусы, бактерии, грибы, растения, насекомых и животных. Промотор может регулировать экспрессию генного компонента конститутивно или различным образом в зависимости от клетки, ткани или органа, в которых происходит экспрессия, или в зависимости от стадии развития, на которой происходит экспрессия, или в зависимости от внешних стимулов, таких как физиологический стресс, патогены, ионы металлов или индукторы. Репрезентативные примеры промоторов включают промотор бактериофага Т7, промотор бактериофага Т3, 8Р6 промотор, промоторно-операторную область 1ас-оперона, 1ае-промотор, поздний промотор 8У40, ранний промотор 8У40, промотор К8У-ЬТК, СМУ ΙΕ промотор, ранний промотор 8У40 или поздний промотор 8У40 и СМУ ΙΕ промотор.
п. Жесткие условия гибридизации.
Жесткие условия гибридизации при использовании в настоящем изобретении означают условия, при которых первая последовательность нуклеиновой кислоты (например, зонд) будет гибридизоваться со второй последовательностью нуклеиновой кислоты (например, мишенью), такой как комплексная смесь нуклеиновых кислот. Жесткие условия зависят от последовательности и будут различными при различных обстоятельствах. Жесткие условия могут быть выбраны на около 5-10°С ниже, чем температура плавления (Тт) для определенной последовательности при определенной ионной силе рН. Тт может быть температурой (при определенной ионной силе, рН, и концентрации нуклеотидов), при которой 50% зондов, комплементарных мишени, гибридизуются с последовательностью-мишенью равновесно (поскольку последовательности-мишени присутствуют в избытке, при Тт, 50% зондов в состоянии равновесия остаются связанными). Жесткие условия могут быть такими, при каких солевая концентрация составляет менее чем около 1,0 М ионов натрия, например, около 0,01-1,0 М концентрация ионов натрия (или других солей) при рН от 7,0 до 8.3 и при температуре по меньшей мере около 30°С для коротких зондов (например, около 10-50 нуклеотидов) и по меньшей мере около 60°С для длинных зондов (например, более чем около 50 нуклеотидов). Жесткие условия могут быть также достигнуты добавлением дестабилизирующих агентов, таких как формамид. Для селективной или специфичной гибридизации положительный сигнал может быть по меньшей мере от 2 до 10 раз выше фоновой гибридизации. Примеры жестких условий гибридизации включают следующие: 50% формамида, 5х 88С, и 1% ДСН, инкубация при 42°С или 5х 88С, 1% ДСН, инкубация при 65°С, с промывкой в 0,2х 88С, и 0,1% ДСН при 65°С.
р. По существу комплементарный.
По существу комплементарный при использовании в настоящем изобретении означает, что первая последовательность по меньшей мере на 60, 65, 70, 75, 80, 85, 90, 95, 97, 98 или 99% идентична комплементарной цепи второй последовательности на протяжении участка из 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 30, 35, 40, 45, 50, 55, 60, 65, 70, 75, 80, 85, 90, 95, 100, 180, 270, 360, 450, 540, 630, 720, 810, 900, 990, 1080, 1170, 1260, 1350, 1440, 1530, 1620, 1710, 1800, 1890, 1980, 2070 или более нуклеотидов или аминокислот или что две последовательности гибридизуются при жестких условиях гибридизации.
с. По существу идентичный.
По существу идентичный при использовании в настоящем изобретении означает, что первая и вторая последовательность по меньшей мере на 60, 65, 70, 75, 80, 85, 90, 95, 97, 98 или 99% идентичны на протяжении участка из 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 30, 35, 40, 45, 50, 55,
- 9 027315
60, 65, 70, 75, 80, 85, 90, 95, 100, 180, 270, 360, 450, 540, 630, 720, 810, 900, 990, 1080, 1170, 1260, 1350, 1440, 1530, 1620, 1710, 1800, 1890, 1980, 2070 или более нуклеотидов или аминокислот, или, в отношении нуклеиновых кислот, если первая последовательность по существу комплементарна комплементарной цепи второй последовательности.
т. Субтип или серотип.
Субтип или серотип: при использовании в настоящем изобретении, взаимозаменяемо, и по отношению к антигенам рака простаты, означает генетические варианты антигена рака простаты, такие как один субтип (или вариант), распознаваемый иммунной системой отлично от другого субтипа.
у. Вариант.
Вариант при использовании в настоящем изобретении по отношению к нуклеиновой кислоте означает (ί) часть или фрагмент эталонной нуклеотидной последовательности; (ίί) комплементарную цепь эталонной нуклеотидной последовательности или ее часть; (ίίί) нуклеиновую кислоту, которая по существу идентична эталонной нуклеиновой кислоте или ее комплементу; или (ίν) нуклеиновую кислоту, которая гибридизуется при жестких условиях с эталонной нуклеиновой кислотой, ее комплементарной цепью, или последовательностями, по существу идентичными им.
Вариант по отношению к пептиду или полипептиду означает, что он отличается по аминокислотной последовательности благодаря инсерции, делеции или консервативной замене аминокислот, но сохраняет по меньшей мере одну биологическую активность. Вариант также может означать белок с аминокислотной последовательностью, которая по существу идентична эталонному белку с аинокислотной последовательностью, которая сохраняет по меньшей мере одну биологическую активность. Консервативная замена аминокислоты, то есть замещение аминокислоты другой аминокислотой со сходными свойствами (например, гидрофильностью, степенью и распределением заряженных участков) признается специалистами как типично включающая незначительное изменение. Такие незначительные изменения могут идентифицироваться, частично, если учесть индекс гидрофобности аминокислот, как понятно специалистам. Ку1е е! а1., 1. Μοί. ΒίοΙ. 157:105-132 (1982). Индекс гидрофобности аминокислоты основывается на учете ее гидрофобности и заряда. Специалистам известно, что аминокислоты со сходными индексами гидрофобности могут замещать друг друга, и функция белка при этом остается прежней. В одном аспекте, замещаются аминокислоты, имеющие индексы гидрофобности ±2. Гидрофильность аминокислот может также быть использована для выявления замещений, в результате которых белки сохраняли бы биологическую функцию. Анализ гидрофильности аминокислот в контексте пептида дает возможность расчета наибольшей местной средней гидрофильности этого пептида, который представляет собой полезный показатель, про который сообщается, что он хорошо коррелирует с антигенностью и иммуногенностью. Патент США № 4554101 полностью включен в настоящее изобретение посредством ссылки. В результате замещения аминокислот, имеющих сходные значения гидрофильности, может сохраняться биологическая активность пептидов, например, иммуногенность, как понятно специалистам. Замены могут быть проведены с аминокислотами, имеющими значения гидрофильности в пределах ±2 по отношению друг к другу. Как на индекс гидрофобности, так и на значение гидрофильности аминокислот влияет определенная боковая цепь этой аминокислоты. Согласно этому наблюдению, представляется, что замены аминокислот, которые сравнимы по биологической функции, зависят от сравнительного сходства аминокислот, и в особенности боковых цепей этих аминокислот, как показывают гидрофобность, гидрофильность, заряд, размер и другие свойства.
ф. Вектор.
Вектор при использовании в настоящем изобретении означает последовательность нуклеиновой кислоты, содержащую начало репликации. Вектор может быть вектором, бактериофагом, бактериальной искусственной хромосомой или дрожжевой искусственной хромосомой. Вектор может быть ДНК или РНК вектором. Вектор может быть самореплицирующимся внехромосомным вектором, и, предпочтительно, является ДНК-плазмидой.
2. Консенсусные антигены простаты.
В настоящем изобретении предоставляются консенсусные антигены, способные вызывать у млекопитающего иммунную реакцию на антиген простаты. Консенсусный антиген может содержать эпитопы, которые делают его особенно эффективным как возможный иммуноген против рака простаты. Консенсусный антиген простаты может содержать полной длины продукт трансляции, его вариант, его фрагмент или их комбинацию.
Разработано семь различных консенсусных антигенов простаты. Два из консенсусных антигенов простаты представляют собой консенсусный антиген 1 Ρ8Ά (8ЕО ГО N0: 2) и консенсусный антиген 2 Ρ8Ά (8ЕО ГО N0: 4). Два из консенсусных антигенов простаты представляют собой консенсусный антиген 1 Ρ8ΜΆ (8ЕС ГО N0: 6) и консенсусный антиген 2 Ρ8ΜΆ (8ЕО ГО N0: 8). Два из консенсусных антигенов простаты представляют собой консенсусный антиген 1 8ΤΕΆΡ (8ЕО ГО N0: 10) и консенсусный антиген 2 8ΤΕΆΡ (8ЕО ГО N0: 12). Один из консенсусных антигенов простаты представляет собой консенсусный антиген Ρδί'Ά (8ЕО ГО N0: 14). Белки могут содержать последовательности, гомологичные антигенам простаты, фрагментам антигенов простаты и белкам с последовательностями, гомологичными
- 10 027315 фрагментам антигенов простаты.
Консенсусный антиген 1 ΡδΑ (δΕΟ ГО N0: 2) на около 91% гомологичен последовательностям ΡδΑ человека, на около 95% гомологичен ΡδΆ М. Гахасиапх и на около 96% гомологичен ΡδΆ М. ти1айа. Консенсусный антиген 1 ΡδΑ отличается от последовательностей ΡδΑ человека по аминокислотам 69, 78, 80, 82, 102, 110, 137, 139, 165, 189, 203, 220, 232 и 248 из δΕί) ΙΌ N0: 2.
Консенсусный антиген 2 ΡδΑ (δΕΟ ГО N0: 4) на около 90-91% гомологичен последовательностям ΡδΑ человека, на около 95% гомологичен ΡδΑ М. Гаксюиапк и на около 95% гомологичен ΡδΑ М. ти1айа. Консенсусный антиген 2 ΡδΑ содержит лидерную последовательность на своем Ν-конце. Консенсусный антиген 2 ΡδΑ также отличается от последовательностей ΡδΑ человека по аминокислотам 21, 86, 127, 129, 154, 156, 182, 195, 206, 218, 220, 237, 249, 255, 265, 271 и 275 из δΕί) ΙΌ N0: 4.
Консенсусный антиген 1 ΡδМΑ (δΕΟ ГО N0: 6) на около 96% гомологичен последовательностям ΡδМΑ человека и на около 94% гомологичен ΡδМΑ М. ти1айа. Консенсусный антиген 1 ΡδМΑ отличается от последовательностей ΡδМΑ человека по аминокислотам 14, 15, 32, 47, 58, 79,111, 157, 223, 320, 350, 475, 499, 569, 613, 624, 653, 660, 663, 733 и 734 из δΕί) ΙΌ N0: 6.
Консенсусный антиген 2 ΡδМΑ (δΕΟ ГО N0: 8) на около 96% гомологичен последовательностям ΡδΑ человека и на около 94% гомологичен ΡδΑ М. ти1айа. Консенсусный антиген 2 ΡδМΑ содержит лидерную последовательность на своем Оконце. Консенсусный антиген 2 ΡδМΑ также отличается от последовательностей ΡδΑ человека по аминокислотам 20, 30, 31, 48, 63, 74, 95, 127, 173, 239, 336, 366, 491, 515, 564, 585, 629, 640, 669, 676, 679, 749 и 750 из δΕ(') ΙΌ N0: 8.
Консенсусный антиген 1 δΤΕΑΡ (δΕΟ ΙΌ N0: 10) на около 94% гомологичен некоторым последовательностям δΤΕΑΡ человека и на около 99% гомологичен другим последовательностям δΤΕΑΡ человека. Консенсусный антиген 1 δΤΕΑΡ (δΕΟ ΙΌ N0: 10) также на около 94% гомологичен ΡδМΑ М. ти1айа.
Консенсусный антиген 2 δΤΕΑΡ (δΕΟ ΙΌ N0: 12) на около 88% гомологичен некоторым последовательностям δΤΕΑΡ человека и на около 94% гомологичен другим последовательностям δΤΕΑΡ человека. Консенсусный антиген 2 δΤΕΑΡ (δΕΟ ΙΌ N0: 12) также на около 94% гомологичен ΡδМΑ М. ти1айа. Консенсусный антиген 2 δΤΕΑΡ содержит лидерную последовательность на своем Оконце.
Консенсусный антиген Ρδί'Ά (δΕΟ ΙΌ N0: 14) на около 87% гомологичен человеческому Ρδί'Ά Консенсусный антиген Ρδί'Ά (δΕΟ ΙΌ N0: 14) отличается от человеческого Ρδί'Ά путем включения лидерной последовательности на своем Оконце.
Белки могут иметь последовательности, на 98% гомологичные консенсусной антигенной последовательности 1 ΡδΑ (δΕΟ ΙΌ N0: 2), консенсусной антигенной последовательности 2 ΡδΑ (δΕΟ ΙΌ N0: 4), консенсусной антигенной последовательности 1 ΡδМΑ (δΕΟ ΙΌ N0: 6), консенсусной антигенной последовательности 2 ΡδМΑ (δΕΟ ΙΌ N0: 8), консенсусной антигенной последовательности 1 δΤΕΑΡ (δΕΟ ΙΌ N0: 10), консенсусной антигенной последовательности 2 δΤΕΑΡ (δΕΟ ΙΌ N0: 12) или консенсусной антигенной последовательности Ρδί'Ά (δΕΟ ΙΌ N0: 14).
Белки могут иметь последовательности, на 99% гомологичные консенсусной антигенной последовательности 1 ΡδΑ (δΕΟ ΙΌ N0: 2), консенсусной антигенной последовательности 2 ΡδΑ (δΕΟ ΙΌ N0: 4), консенсусной антигенной последовательности 1 ΡδМΑ (δΕΟ ΙΌ N0: 6), консенсусной антигенной последовательности 2 ΡδМΑ (δΕΟ ΙΌ N0: 8), консенсусной антигенной последовательности 1 δΤΕΑΡ (δΕΟ ΙΌ N0: 10), консенсусной антигенной последовательности 2 δΤΕΑΡ (δΕΟ ΙΌ N0: 12) или консенсусной антигенной последовательности Ρδί'Ά (δΕΟ ΙΌ N0: 14).
Как отмечено выше, некоторые варианты воплощения содержат лидерную последовательность на Оконце. В некоторых вариантах воплощения лидерная последовательность представляет собой лидерную последовательность Ι§Ε, которая представляет собой δΕΟ ΙΌ N0: 16. В некоторых вариантах воплощения белковых последовательностей, предоставляемых здесь, δΕΟ ΙΌ N0: 16 удаляется из них. Подобным образом, в некоторых вариантах воплощения последовательностей нуклеиновых кислот, предоставляемых здесь, δΕΟ ΙΌ N0: 15 (которая кодирует δΕΟ ΙΌ N0: 16) удаляется из них.
Соответственно, некоторые варианты воплощения относятся к белку, который содержит сигнальный пептид, связанный с δΕΟ ΙΌ N0: 2, δΕΟ ΙΌ N0: 6 или δΕΟ ΙΌ N0: 10 взамен метионина на Оконце, упомянутого в формуле изобретения (кодирующая последовательность сигнального пептида обычно включает стартовый кодон, кодирующий метионин на Оконце). Некоторые варианты воплощения относятся к белку, который содержит сигнальный пептид, связанный с аминокислотами 19-131 из δΕΟ ΙΌ N0: 14. Некоторые варианты воплощения относятся к белкам, которые содержат сигнальный пептид, связанный с белком, на 98% гомологичным δΕΟ ΙΌ N0: 2, при условии, что сохранились аминокислоты 69, 78, 80, 82, 102, 110, 137, 139, 165, 189, 203, 220, 232 и 248 из δΕ(') ΙΌ N0: 2. Некоторые варианты воплощения относятся к белкам, которые содержат сигнальный пептид, связанный с белком, на 98% гомологичным δΕΟ ΙΌ N0: 6, при условии, что сохранились аминокислоты 14, 15, 32, 47, 58, 79,111, 157, 223, 320, 350, 475, 499, 569, 613, 624, 653, 660, 663, 733 и 734 из δΕΟ ΙΌ N0: 6. Некоторые варианты воплощения относятся к белкам, которые содержат сигнальный пептид, связанный с белком, на 98% гомологичным δΕΟ ΙΌ N0: 10. В каждом случае, если сигнальный пептид связан с ^концом, он связан взамен метионина на Оконце, упомянутого в формуле изобретения (кодирующая последовательность сигнального пептида обычно включает стартовый кодон, кодирующий метионин на Оконце). Некоторые вари- 11 027315 анты воплощения относятся к белку, который содержит сигнальный пептид, связанный с белком, на 98% гомологичным аминокислотам 19-131 из 5>ЕО ГО N0: 14. Некоторые варианты воплощения относятся к белку, который содержит сигнальный пептид, связанный с иммуногенным фрагментом 5>Е0 ГО N0: 2, содержащим аминокислоты, соответствующие по меньшей мере 256 аминокислотным остаткам 5>Е0 ГО N0: 2, при условии, что сохранились аминокислоты 69, 78, 80, 82, 102, 110, 137, 139, 165, 189, 203, 220, 232 и 248 из 5>Е0 ГО N0: 2. Некоторые варианты воплощения относятся к белку, который содержит сигнальный пептид, связанный с иммуногенным фрагментом 5>Е0 ГО N0: 6, содержащим аминокислоты, соответствующие по меньшей мере 735 аминокислотным остаткам 5>Е0 ГО N0: 6, при условии, что сохранились аминокислоты 14, 15, 32, 47, 58, 79,111, 157, 223, 320, 350, 475, 499, 569, 613, 624, 653, 660, 663, 733 и 734 из 5>Е0 ГО N0: 6. Некоторые варианты воплощения относятся к белку, который содержит сигнальный пептид, связанный с иммуногенным фрагментом 5>Е0 ГО N0: 10, содержащим аминокислоты, соответствующие по меньшей мере 333 аминокислотным остаткам 5>Е0 ГО N0: 10. Некоторые варианты воплощения относятся к белку, который содержит сигнальный пептид, связанный с белком, который имеет сигнальный пептид, связанный с иммуногенным фрагментом аминокислот 19-131 из 5>Е0 ГО N0: 14, причем этот фрагмент содержит по меньшей мере 110 аминокислотных остатков 5>Е0 ГО N0: 14.
3. Г енетические последовательности, конструкты и плазмиды.
Молекулы нуклеиновой кислоты, кодирующие консенсусные аминокислотные последовательности, были произведены для оптимизации стабильности и экспрессии у людей. Селекция кодонов определялась на основе ш!ег айа, стремления минимизировать внутримолекулярные взаимодействия и образование вторичной структуры, а также использования кодонов, которые приводят к усилению экспрессии. Вакцины могут содержать одну или более последовательностей нуклеиновых кислот, которые кодируют одну или более консенсусных версий иммуногенных белков, выбранных из этой группы последовательностей, произведенных для оптимизации стабильности и экспрессии у людей. Были произведены последовательности нуклеиновой кислоты, включающие кодирующую последовательность для 1дЕ-лидера на 5' конце оптимизированной, консенсусной кодирующей последовательности нуклеиновой кислоты, которые кодировали белки, имеющие лидерную последовательность 1дЕ на Оконце консенсусной аминокислотной последовательности. В некоторых вариантах воплощения последовательность нуклеиновой кислоты, которая кодирует 1дЕ-лидер, представляет собой 5>ЕС ГО N0: 15
Предоставляются последовательности нуклеиновой кислоты, которые кодируют Консенсусную Антигенную последовательность 1 ΡδΑ (белковая последовательность 5>ЕС ГО N0: 2; последовательность нуклеиновой кислоты 5>ЕС ГО N0: 1), консенсусную антигенную последовательность 2 ΡδΆ (белковая последовательность 5ЕС ГО N0: 4; последовательность нуклеиновой кислоты 5ЕС ГО N0: 3), консенсусную антигенную последовательность 1 ΡδΜΑ (белковая последовательность 5ЕС ГО N0: 6; последовательность нуклеиновой кислоты, имеющая нуклеотиды 1-2250 из 5ЕС ГО N0: 5), консенсусную антигенную последовательность 2 ΡδΜΑ (белковая последовательность δΞρ ГО N0: 8; последовательность нуклеиновой кислоты, имеющая нуклеотиды 1-2301 из δΞρ ГО N0: 7), консенсусную антигенную последовательность 1 δΤΒΑΡ (белковая последовательность δΞρ ГО N0: 10; последовательность нуклеиновой кислоты δЕ^ ГО N0: 9), консенсусную антигенную последовательность 2 δΤΒΑΡ (белковая последовательность δЕ^ ГО N0: 12; последовательность нуклеиновой кислоты δЕ^ ГО N0: 11) или консенсусную антигенную последовательность ΡδΟΑ (белковая последовательность δЕ^ ГО N0: 14; последовательность нуклеиновой кислоты δЕ^ ГО N0: 13). Последовательность нуклеиновой кислоты δЕ^ ГО N0: 5, которая кодирует консенсусную антигенную последовательность 1 ΡδΜΑ, содержит, в дополнение к кодирующим ΡδΜΑ нуклеотидам, дополнительные 9 кодонов (27 нуклеотидов) непосредственно перед стоп-кодонами, которые кодируют маркер НА (ЪЕС ГО N0: 32), не показанный в δЕ^ ГО N0: 6. Маркер НА представляет собой пептидную последовательность, которая соответствует эпитопу вируса гриппа, используемому в числе прочего для обнаружения белковой экспрессии с использованием имеющихся в продаже антител против маркера НА. δЕ^ ГО N0: 5 кодирует δЕ^ ГО N0: 6 плюс дополнительно 9 аминокислот последовательности δЕ^ ГО N0: 32, связанной на своем Оконце с С-концом δЕ^ ГО N0: 6. В некоторых вариантах воплощения ΡδΜΑ-1 консенсусный антиген кодируется δЕ^ ГО N0: 5 и содержит белки, имеющие аминокислотную последовательность δЕ^ ГО N0: 6, связанную на своем С-конце с N концом δЕ^ ГО N0: 32. В некоторых вариантах воплощения ΡδΜΑ-1 Консенсусный антиген кодируется нуклеотидами 1-2250 из δЕ^ ГО N0: 5 и содержит белки, имеющие аминокислотную последовательность δЕ^ ГО N0: 6. Кодирующая последовательность, имеющая нуклеотиды 1-2250 из δЕ^ ГО N0: 5, имеет один или более стоп-кодонов на своем 3'-конце. Последовательность нуклеиновой кислоты δЕ^ ГО N0: 7, которая кодирует консенсусную антигенную последовательность 2 ΡδΜΑ, содержит, в дополнение к нуклеотидам, кодирующим сигнальный пептид 1дЕ, связанный с ΡδΜΑ, белок плюс дополнительные 9 кодонов (27 нуклеотидов) непосредственно перед стоп-кодонами, которые кодируют маркер НА (ЪЕС ГО N0: 32), не показанный в δΞρ ΙΌ N0: 8. δΞρ ΙΌ N0: 7 кодирует δΞρ ΙΌ N0: 8 плюс дополнительную 9 аминокислотную последовательность δΞρ ГО N0: 32, связанную на своем Оконце с С-концом δΞρ ГО N0: 8. В некоторых вариантах воплощения ΡδΜΑ-2 консенсусный антиген кодируется δΞρ ГО N0: 7 и содержит белки, имеющие аминокислотную последовательность δΞρ ГО N0: 8, сязанную на своем Сконце с ^концом δΞρ ГО N0: 32. В некоторых вариантах воплощения ΡδΜΑ-2 консенсусный антиген
- 12 027315 кодируется нуклеотидами 1-2301 из δΕΟ ГО N0: 7 и содержит белки, имеющие аминокислотную последовательность δΕΟ ГО N0: 8. Кодирующая последовательность, имеющая нуклеотиды 1-2301 из δΕΟ ГО N0: 7, имеет один или более стоп-кодонов на своем З'-конце.
Выделенные молекулы нуклеиновой кислоты могут кодировать белки, которые имеют последовательности, на 98% гомологичные консенсусной антигенной последовательности 1 ΡδΑ (δΕΟ ГО N0: 2), при условии, что сохранились аминокислоты 69, 78, 80, 82, 102, 110, 137, 139, 165, 189, 203, 220, 232 и 248 из 5>Е0 ГО N0: 2, консенсусной антигенной последовательности 2 ΡδΆ (δΕΟ ΙΌ N0: 4), при условии, что сохранились аминокислоты 21, 86, 127, 129, 154, 156, 182, 195, 206, 218, 220, 237, 249, 255, 265, 271 и 275 из δΕΟ ΙΌ N0: 4, консенсусной антигенной последовательности 1 ΡδΜΑ (δΕΟ ΙΌ N0: 6), при условии, что сохранились аминокислоты 14, 15, 32, 47, 58, 79,111, 157, 223, 320, 350, 475, 499, 569, 613, 624, 653, 660, 663, 733 и 734 из δΕΟ ΙΌ N0: 6, консенсусной антигенной последовательности 2 ΡδΜΑ (δΕΟ ΙΌ N0: 8), при условии, что сохранились аминокислоты 20, 30, 31, 48, 63, 74, 95, 127, 173, 239, 336, 366, 491, 515, 564, 585, 629, 640, 669, 676, 679, 749 и 750 из δΕΟ ΙΌ N0: 8, консенсусной антигенной последовательности 1 δΤΕΑΡ (δΕΟ ΙΌ N0: 10), консенсусной антигенной последовательности 2 δΤΕΑΡ (δΕΟ ΙΌ N0: 12) или консенсусной антигенной последовательности Ρδί'Ά (δΕΟ ΙΌ N0: 14).
Выделенные молекулы нуклеиновой кислоты могут кодировать белки, которые имеют последовательности, на 99% гомологичные консенсусной антигенной последовательности 1 ΡδΑ (δΕΟ ΙΌ N0: 2), при условии, что сохранились аминокислоты 69, 78, 80, 82, 102, 110, 137, 139, 165, 189, 203, 220, 232 и 248 из δΕΟ ΙΌ N0: 2, консенсусной антигенной последовательности 2 ΡδΑ (δΕΟ ΙΌ N0: 4), при условии, что сохранились аминокислоты 21, 86, 127, 129, 154, 156, 182, 195, 206, 218, 220, 237, 249, 255, 265, 271 и 275 из δΕΟ ΙΌ N0: 4, консенсусной антигенной последовательности 1 ΡδΜΑ (δΕΟ ΙΌ N0: 6), при условии, что сохранились аминокислоты 14, 15, 32, 47, 58, 79,111, 157, 223, 320, 350, 475, 499, 569, 613, 624, 653, 660, 663, 733 и 734 из δΕΟ ΙΌ N0: 6, консенсусной антигенной последовательности 2 ΡδΜΑ (δΕΟ ΙΌ N0: 8), при условии, что сохранились аминокислоты 20, 30, 31, 48, 63, 74, 95, 127, 173, 239, 336, 366, 491, 515, 564, 585, 629, 640, 669, 676, 679, 749 и 750 из δΕΟ ΙΌ N0: 8, консенсусной антигенной последовательности 1 δΤΕΑΡ (δΕΟ ΙΌ N0: 10), консенсусной антигенной последовательности 2 δΤΕΑΡ (δΕΟ ΙΌ N0: 12) или консенсусной антигенной последовательности Ρδί'Ά (δΕΟ ΙΌ N0: 14).
Выделенные молекулы нуклеиновой кислоты могут кодировать белки, которые имеют последовательности, на 98% гомологичные последовательности, кодирующей консенсусную антигенную последовательность 1 ΡδΑ (δΕΟ ΙΌ N0: 1), консенсусную антигенную последовательность 2 ΡδΑ (δΕΟ ΙΌ N0: 3), консенсусную антигенную последовательность 1 ΡδΜΑ (δΕΟ ΙΌ N0: 5 или предпочтительно нуклеотиды 1-2250 из δΕΟ ΙΌ N0: 5), консенсусную антигенную последовательность 2 ΡδΜΑ (δΕΟ ΙΌ N0: 7 или предпочтительно нуклеотиды 1-2301 из δΕΟ ΙΌ N0: 7), консенсусную антигенную последовательность 1 δΤΕΑΡ (δΕΟ ΙΌ N0: 9), консенсусную антигенную последовательность 2 δΤΕΑΡ (δΕΟ ΙΌ N0: 11) или консенсусную антигенную последовательность Ρδί'Ά (δΕΟ ΙΌ N0: 13).
Выделенные молекулы нуклеиновой кислоты могут кодировать белки, которые имеют последовательности, на 99% гомологичные последовательности, кодирующей консенсусную антигенную последовательность 1 ΡδΑ (δΕΟ ΙΌ N0: 1), консенсусную антигенную последовательность 2 ΡδΑ (δΕΟ ΙΌ N0: 3), консенсусную антигенную последовательность 1 ΡδΜΑ (δΕΟ ΙΌ N0: 5 или предпочтительно нуклеотиды 1-2250 из δΕΟ ΙΌ N0: 5), консенсусную антигенную последовательность 2 ΡδΜΑ (δΕΟ ΙΌ N0: 7 или предпочтительно нуклеотиды 1-2301 из δΕΟ ΙΌ N0: 7), консенсусную антигенную последовательность 1 δΤΕΑΡ (δΕΟ ΙΌ N0: 9), консенсусную антигенную последовательность 2 δΤΕΑΡ (δΕΟ ΙΌ N0: 11) или консенсусную антигенную последовательность Ρδί'Ά (δΕΟ ΙΌ N0: 13).
Выделенные молекулы нуклеиновой кислоты могут кодировать белки, которые содержат лидерную последовательность на Оконце. В некоторых вариантах воплощения молекулы нуклеиновой кислоты могут кодировать Ι§Ε лидерную последовательность, которая представляет собой δΕΟ ΙΌ N0: 16. В некоторых вариантах воплощения выделенные молекулы нуклеиновой кислоты могут кодировать белки, которые содержат сигнальный пептид, связанный с δΕΟ ΙΌ N0: 2, δΕΟ ΙΌ N0: 6, или δΕΟ ΙΌ N0: 10 взамен метионина на Оконце, упомянутого в формуле изобретения (кодирующая последовательность сигнального пептида обычно включает стартовый кодон, кодирующий метионин на Оконце). В некоторых вариантах воплощения выделенные молекулы нуклеиновой кислоты могут кодировать белки, которые содержат сигнальный пептид, связанный с аминокислотой 19-131 из δΕΟ ΙΌ N0: 14. В некоторых вариантах воплощения выделенные молекулы нуклеиновой кислоты могут кодировать белки, которые содержат сигнальный пептид, связанный с белком, на 98% гомологичным δΕΟ ΙΌ N0: 2, при условии, что сохранились аминокислоты 69, 78, 80, 82, 102, 110, 137, 139, 165, 189, 203, 220, 232 и 248 из δΕΟ ΙΌ N0: 2. В некоторых вариантах воплощения выделенные молекулы нуклеиновой кислоты могут кодировать белки, которые содержат сигнальный пептид, связанный с белком, на 98% гомологичным δΕΟ ΙΌ N0: 6, при условии, что сохранились аминокислоты 14, 15, 32, 47, 58, 79,111, 157, 223, 320, 350, 475, 499, 569, 613, 624, 653, 660, 663, 733 и 734 из δΕΟ ΙΌ N0: 6. В некоторых вариантах воплощения выделенные молекулы нуклеиновой кислоты могут кодировать белки, которые содержат сигнальный пептид, связанный с белком, на 98% гомологичным δΕΟ ΙΌ N0: 10. В случае, если предоставляется кодирующая последовательность для сигнального пептида, сегнальный пептид связывается с пептидной последователь- 13 027315 ностью в месте метионина на Ν-конце, как указано при показе последовательностей (кодирующая последовательность сигнального пептида обычно включает стартовый кодон, кодирующий метионин на N конце). В некоторых вариантах воплощения выделенные молекулы нуклеиновой кислоты могут кодировать белки, которые содержат сигнальный пептид, связанный с белком, на 98% гомологичным аминокислоте 19-131 из 8ЕО ГО N0: 14. В некоторых вариантах воплощения выделенные молекулы нуклеиновой кислоты могут кодировать белки, которые содержат сигнальный пептид, связанный с иммуногенным фрагментом 8Е0 ГО N0: 2, содержащим аминокислоты, соответствующие по меньшей мере 256 аминокислотным остаткам из 8Е0 ГО N0: 2, при условии, что сохранились аминокислоты 69, 78, 80, 82, 102, 110, 137, 139, 165, 189, 203, 220, 232 и 248 из 8Е0 ГО N0: 2. В некоторых вариантах воплощения выделенные молекулы нуклеиновой кислоты могут кодировать белки, которые содержат сигнальный пептид, связанный с иммуногенным фрагментом 8Е0 ГО N0: 6, содержащим аминокислоты, соответствующие по меньшей мере 735 аминокислотным остаткам 8Е0 ГО N0: 6, при условии, что сохранились аминокислоты 14, 15, 32, 47, 58, 79,111, 157, 223, 320, 350, 475, 499, 569, 613, 624, 653, 660, 663, 733 и 734 из 8ЕО ГО N0: 6. 8 В некоторых вариантах воплощения выделенные молекулы нуклеиновой кислоты могут кодировать белки, которые содержат сигнальный пептид, связанный с иммуногенным фрагментом из 8Е0 ГО N0: 10, содержащим аминокислоты, соответствующие по меньшей мере 333 аминокислотным остаткам 8Е0 ГО N0: 10. В некоторых вариантах воплощения выделенные молекулы нуклеиновой кислоты могут кодировать белки, которые содержат сигнальный пептид, связанный с белком, который имеет сигнальный пептид, связанный с иммуногенным фрагментом аминокислот 19-131 из 8Е0 ГО N0: 14, фрагментом, содержащим по меньшей мере 110 аминокислотных остатков 8Е0 ГО N0: 14.
В настоящем изобретении предоставляются генетические конструкты, которые могут содержать последовательность нуклеиновой кислоты, которая кодирует раскрытый в настоящем изобретении консенсусный антиген простаты, включающий последовательности консенсусного белка, последовательности, гомологичные последовательностям консенсусного белка, фрагменты последовательностей консенсусного белка и последовательности, гомологичные фрагментам последовательностей консенсусного белка. Генетический конструкт может быть представлен в клетке как функционирующая внехромосомная молекула. Генетический конструкт может быть линейной минихромосомой, включающей центромер, теломеры или плазмиды или космиды.
Генетический конструкт также может быть частью генома рекомбинантного вирусного вектора, включая рекомбинантный аденовирус, рекомбинантный аденоассоциированный вирус и рекомбинантную вакцину. Генетический конструкт может быть частью генетического материала ослабленных живых микроорганизмов или рекомбинантных микробных векторов, которые живут в клетках.
Генетические конструкты могут содержать регуляторные элементы для генной экспрессии кодирующих последовательностей нуклеиновой кислоты. Регуляторные элементы могут быть промотором, энхансером, инициирующим кодоном, стоп-кодоном или сигналом полиаденилирования.
Последовательности нуклеиновых кислот могут составлять генетический конструкт, который может быть вектором. Вектор может быть способен к экспрессии антигена в клетке млекопитающего в количестве, эффективном для стимуляции иммунной реакции у млекопитающего. Вектор может быть рекомбинантным. Вектор может содержать гетерологичную нуклеиновую кислоту, кодирующую антиген. Вектор может быть плазмидой. Вектор может использоваться для трансфекции клеток нуклеиновой кислотой, кодирующей антиген, когда трансформируемая клетка-носитель культивируется и содержится в условиях, при которых имеет место экспрессия антигена.
В некоторых вариантах воплощения кодирующие последовательности для одного консенсусного антигена простаты предоставляются в одном векторе. В некоторых вариантах воплощения кодирующие последовательности для нескольких консенсусных антигенов простаты предоставляются в одном векторе. В некоторых вариантах воплощения предоставляются составы, содержащие кодирующие последовательности для нескольких консенсусных антигенов простаты в нескольких векторах, либо один антиген на вектор, либо же несколько антигенов на вектор.
В некоторых вариантах воплощения кодирующие последовательности для двух или более различных консенсусных антигенов простаты могут предоставляться в единственном векторе. В некоторых вариантах воплощения кодирующие последовательности могут иметь раздельные промоторы, контролирующие экспрессию. В некоторых вариантах воплощения кодирующие последовательности могут иметь единственные промоторы, контролирующие экспрессию с 1КЕ8-последовательности, разделяющей кодирующую последовательность. Присутствие 1КЕ8-последовательности приводит к раздельной трансляции транскрипционного продукта. В некоторых вариантах воплощения кодирующие последовательности могут иметь единственные промоторы, контролирующие экспрессию с кодирующей последовательности, кодирующей протеолитически расщепляемую пептидную последовательность, разделяющую кодирующие последовательности антигенов. Производится единственный продукт трансляции, который затем обрабатывается протеазой, которая распознает сайт расщепления протеазой, для получения отдельных белковых молекул. Используемые сайты расщепления протеазой обычно распознаются протеазой, эндогенно присутствующей в клетке, в которой происходит экспрессия. В некоторых вариантах воплощения отдельная кодирующая последовательность для протеазы может быть включена для того, чтобы
- 14 027315 обеспечить образование протеазы, необходимой для обработки полипротеинового продукта трансляции. В некоторых вариантах воплощения векторы содержат кодирующие последовательности для одного, двух, трех, четырех, пяти, шести или всех семи консенсусных антигенов простаты.
В каждом отдельном случае, упомянутом в настоящем изобретении, кодирующие последовательности могут быть оптимизированы для стабильности и высоких уровней экспрессии. В некоторых случаях кодоны выбираются для уменьшения формирования вторичной структуры РНК, такой как та, которая формируется из-за внутримолекулярного связывания.
Вектор может содержать гетерологичную нуклеиновую кислоту, кодирующую антиген, и может также содержать инициирующий кодон, который может находиться выше антигенной кодирующей последовательности, и стоп-кодон, который может находиться ниже антигенной кодирующей последовательности. Кодон инициации и терминации может находиться в одной рамке считывания с антигенной кодирующей последовательностью. Вектор также может содежать промотор, который функционально связан с антигенной кодирующей последовательностью. Промотор, функционально связанный с антигенной кодирующей последовательностью, может быть промотором из вируса обезьяны 40 (§У40), промотором вируса опухоли молочной железы мыши (ММТУ), промотором вируса иммунодефицита человека (Ηΐν), таким как промотор длинного концевого повтора (ЬТК) вируса иммунодефицита крупного рогатого скота (Βΐν), промотором вируса Молони, промотором вируса лейкоза птиц (АйУ), промотором цитомегаловируса (СМУй таким как СМУ предранний промотор, промотором вируса Эпштейна-Барра (ΕΒν), или промотором вируса саркомы Рауса (КБУ). Промотор также может быть промотором из человеческого гена, таким как человеческий актин, человеческий миозин, человеческий гемоглобин, человеческий мышечный креатин, или человеческий металлотионеин. Промотор также может быть тканеспецифичным промотором, таким как мышечный или кожный специфичный промотор, природным или синтетическим. Примеры таких промоторов описаны в публикации заявки на патент США И8 № 20040175727, содержание которой включено в настоящее изобретение во всей полноте.
Вектор также может содержать сигнал полиаденилирования, который может находиться ниже кодирующей последовательности консенсусного антигена простаты. Сигнал полиаденилирования может являться сигналом полиаденилирования §ν40, ЬТК сигналом полиаденилирования, сигналом полиаденилирования бычьего гормона роста (БОН), сигналом полиаденилирования гормона роста человека (ЬСН), или сигналом полиаденилирования человеческого β-глобина. δν40 сигнал полиаденилирования может быть сигналом полиаденилирования из рСЕР4 вектора (1иуйгодеи, §аи Ωίοβο. СА).
Вектор также может содержать энхансер выше кодирующей последовательности консенсусного антигена простаты. Энхансер может быть необходим для экспрессии ДНК. Энхансер может быть человеческим актином, человеческим миозином, человеческим гемоглобином, человеческим мышечным креатином или вирусным энхансером, таким как энхансер из СМУ, НА, Κδν или ΕΒν. Полинуклеотиды с функцией энхансера описаны в патенте США № 5593972, 5962428 и ^094/016737, содержание каждого полностью включено в настоящее изобретение посредством ссылки.
Вектор также может содержать точку начала репликации млекопитающих для того, чтобы поддерживать вектор экстрахромосомно и продуцировать множественные копии вектора в клетке. Вектор может представлять собой ρνΑΧΙ, рСЕР4 или рКЕР4 от 1иуйгодеи (§аи О1едо, СА), который может содержать точку начала репликации вируса Эпштейна-Барр и кодирующий участок ядерного антигена ΕΒΝΑ1, который может производить многокопийную эписомальную репликацию без интеграции. Основой вектора может быть ρΑν0242. Вектор может быть вектором на основе аденовируса типа 5, дефектного по репликации (Ай5).
Вектор также может содержать регуляторную последовательность, которая может подходить для генной экспрессии в клетке млекопитающего или человека, в которую введен вектор. Кодирующая последовательность консенсусного антигена простаты может содержать кодон, который может делать возможной более эффективную транскрипцию кодирующей последовательности в клетке-носителе.
Вектор может представлять собой р§Е420 (1иуйгодеи, §аи О1едо, Сайр), который может использоваться для производства белка в ЕксйейсЫа сой (Е. сой). Вектор также может представлять собой рУЕ§2 (1пу11годеп, §аи О1едо, СайГ.), который может использоваться для производства белка в дрожжевых штаммах Бассйаготусек сегеу181ае. Вектор также может представлять собой МАХВАС™ полную бакуловирусную систему экспрессии (1иу11годеи, §ап О1едо, СайГ.), которая может использоваться для производства белка в клетках насекомых. Вектор также может представлять собой ρс^NА I или ρс^NА3 (Ιηνί1годеи, §ап О1едо, СайГ.), который может использоваться для производства белка в клетках млекопитающих, таких как клетки яичников китайского хомячка (СНО). Вектор может векторами экспрессии или системами для производства белка с помощью рутинных способов и легко доступных исходных материалов, включая §атЬгоок е! а1., Мо1еси1аг С1ошпд апй ЬаЬога1огу Мапиа1, 8есопй Ей., Со1й 8ргшд Нагйог (1989), которая полностью включена сюда посредством ссылки.
Вакцины могут содержать один или более антигенов простаты, перечисленных в настоящем изобретении, и/или вакцины могут содержать одну или более последовательностей нуклеиновых кислот, которые кодируют один или более консенсусных антигенов простаты, выбранных из этой группы. Вак- 15 027315 цины могут содержать один или более консенсусных антигенов простаты, перечисленных в настоящем изобретении, в комбинации с другими иммуногенными белками простаты с последовательностями, отличными от консенсусных последовательностей, раскрытых в настоящем изобретении, включая природные последовательности, и/или вакцины могут содержать одну или более последовательностей нуклеиновых кислот, которые кодируют один или более консенсусных антигенов простаты, выбранных из этой группы, в комбинации с с молекулами нуклеиновой кислоты, которые кодируют другие антигены простаты с последовательности, отличными от консенсусных последовательностей, раскрытых в настоящем изобретении.
Не ограничиваясь рамками научной теории, вакцина, которую можно использовать для стимуляции полиспецифичной иммунной реакции (гуморальной, клеточной или обеих) против клеток рака простаты, может содержать одну или более из следующих последовательностей нуклеиновых кислот, которая кодирует один или более белков, выбранных из группы, состоящей из консенсусного Р8А антигена 1, консенсусного Р8А антигена 2, консенсусного Р8МА антигена 1, консенсусного Р8МА антигена 2, консенсусного 8ТЕАР антигена 1, консенсусного 8ТЕАР антигена 2 и консенсусного Р8СА антигена 1. Кодирующие последовательности могут также включать те, которые предоставлены в настоящем изобретении, которые содержат гомологичные последовательности, фрагменты и гомологичные последовательности фрагментов.
Некоторые варианты воплощения изобретения предоставляют способы получения иммунных реакций на клетки рака простаты, содержащие введение пациенту одного или более составов, которые совместно содержат одну или более кодирующих последовательностей или комбинаций, описанных в настоящем изобретении. Некоторые варианты воплощения предоставляют способы профилактического вакцинирования пациента от рака простаты, содержащие введение одного или более составов, которые вместе содержат одну или более кодирующих последовательностей или комбинацй, описанных в настоящем изобретении. Некоторые варианты воплощения предоставляют способы терапевтического вакцинирования пациента, имеющего рак простаты, которые содержат введение одного или более составов, которые вместе содержат одну или более кодирующих последовательностей или комбинаций, описанных в настоящем изобретении.
4. Фармацевтические составы.
В настоящем изобретении предоставляются фармацевтические составы в соответствии с настоящим изобретением, которые содержат от около 1 нг до около 10 мг ДНК. В некоторых вариантах воплощения фармацевтические составы в соответствии с настоящим изобретением содержат от и между: 1) по меньшей мере 10, 15, 20, 25, 30, 35, 40, 45, 50, 55, 60, 65, 70, 75, 80, 85, 90, 95 или 100 нг, или по меньшей мере 1, 5, 10, 15, 20, 25, 30, 35, 40, 45, 50, 55, 60, 65, 70, 75, 80, 85, 90, 95,100, 105, 110, 115, 120, 125, 130, 135, 140, 145, 150, 155, 160, 165, 170, 175, 180, 185, 190, 195, 200, 205, 210, 215, 220, 225, 230, 235, 240, 245,
250, 255, 260, 265, 270, 275, 280, 285, 290, 295, 300, 305, 310, 315, 320, 325, 330, 335, 340, 345, 350, 355,
360, 365, 370, 375, 380, 385, 390, 395, 400, 405, 410, 415, 420, 425, 430, 435, 440, 445, 450, 455, 460, 465,
470, 475, 480, 485, 490, 495, 500, 605, 610, 615, 620, 625, 630, 635, 640, 645, 650, 655, 660, 665, 670, 675,
680, 685, 690, 695, 700, 705, 710, 715, 720, 725, 730, 735, 740, 745, 750, 755, 760, 765, 770, 775, 780, 785,
790, 795, 800, 805, 810, 815, 820, 825, 830, 835, 840, 845, 850, 855, 860, 865, 870, 875, 880, 885, 890, 895,
900, 905, 910, 915, 920, 925, 930, 935, 940, 945, 950, 955, 960, 965, 970, 975, 980, 985, 990, 995 или 1000 мкг, или по меньшей мере 1,5; 2; 2,5; 3; 3,5; 4; 4,5; 5; 5,5; 6; 6,5; 7; 7,5; 8; 8,5; 9; 9,5 или 10 мг или более; и 2) выше и включая 15, 20, 25, 30, 35, 40, 45, 50, 55, 60, 65, 70, 75, 80, 85, 90, 95 или 100 нг, или выше и включая 1, 5, 10, 15, 20, 25, 30, 35, 40, 45, 50, 55, 60, 65, 70, 75, 80, 85, 90, 95,100, 105, 110, 115, 120, 125, 130, 135, 140, 145, 150, 155, 160, 165, 170, 175, 180, 185, 190, 195, 200, 205, 210, 215, 220, 225, 230, 235,
240, 245, 250, 255, 260, 265, 270, 275, 280, 285, 290, 295, 300, 305, 310, 315, 320, 325, 330, 335, 340, 345,
350, 355, 360, 365, 370, 375, 380, 385, 390, 395, 400, 405, 410, 415, 420, 425, 430, 435, 440, 445, 450, 455,
460, 465, 470, 475, 480, 485, 490, 495, 500, 605, 610, 615, 620, 625, 630, 635, 640, 645, 650, 655, 660, 665,
670, 675, 680, 685, 690, 695, 700, 705, 710, 715, 720, 725, 730, 735, 740, 745, 750, 755, 760, 765, 770, 775,
780, 785, 790, 795, 800, 805, 810, 815, 820, 825, 830, 835, 840, 845, 850, 855, 860, 865, 870, 875, 880, 885,
890, 895, 900, 905, 910, 915, 920, 925, 930, 935, 940, 945, 950, 955, 960, 965, 970, 975, 980, 985, 990, 995, или 1000 мкг, или выше и включая 1,5; 2; 2,5; 3; 3,5; 4; 4,5; 5; 5,5; 6; 6,5; 7; 7,5; 8; 8,5; 9; 9,5 или 10 мг. В некоторых вариантах воплощения фармацевтические составы в соответствии с настоящим изобретением содержат от около 5 нг до около 10 мг ДНК. В некоторых вариантах воплощения фармацевтические составы в соответствии с настоящим изобретением содержат от около 25 нг до около 5 мг ДНК. В некоторых вариантах воплощения фармацевтические составы содержат от около 50 нг до около 1 мг ДНК. В некоторых вариантах воплощения фармацевтические составы содержат от около 0,1 до около 500 мкг ДНК. В некоторых вариантах воплощения фармацевтические составы содержат от около 1 до около 350 мкг ДНК. В некоторых вариантах воплощения фармацевтические составы содержат от около 5 до около 250 мкг ДНК. В некоторых вариантах воплощения фармацевтические составы содержат от около 10 до около 200 мкг ДНК. В некоторых вариантах воплощения фармацевтические составы содержат от около 15 до около 150 мкг ДНК. В некоторых вариантах воплощения фармацевтические составы содержат от около 20 до около 100 мкг ДНК. В некоторых вариантах воплощения фармацевтические составы содер- 16 027315 жат от около 25 до около 75 мкг ДНК. В некоторых вариантах воплощения фармацевтические составы содержат от около 30 до около 50 мкг ДНК. В некоторых вариантах воплощения фармацевтические составы содержат от около 35 до около 40 мкг ДНК. В некоторых вариантах воплощения фармацевтические составы содержат от около 100 до около 200 мкг ДНК. В некоторых вариантах воплощения фармацевтические составы содержат от около 10 мкг до около 100 мкг ДНК. В некоторых вариантах воплощения фармацевтические составы содержат от около 20 мкг до около 80 мкг ДНК. В некоторых вариантах воплощения фармацевтические составы содержат от около 25 мкг до около 60 мкг ДНК. В некоторых вариантах воплощения фармацевтические составы содержат от около 30 нг до около 50 мкг ДНК. В некоторых вариантах воплощения фармацевтические составы содержат от около 35 нг до около 45 мкг ДНК. В некоторых предпочтительных вариантах воплощения фармацевтические составы содержат от около 0,1 до около 500 мкг ДНК. В некоторых предпочтительных вариантах воплощения фармацевтические составы содержат от около 1 до около 350 мкг ДНК. В некоторых предпочтительных вариантах воплощения фармацевтические составы содержат от около 25 до около 250 мкг ДНК. В некоторых предпочтительных вариантах воплощения фармацевтические составы содержат от около 100 до около 200 мкг ДНК.
Фармацевтические составы в соответствии с настоящим изобретением разрабатываются в сответствии с используемым способом введения. В случаях, если фармацевтические составы являются инъецируемыми фармацевтическими составами, они являются стерильными, непирогенными и не сыпучими. Предпочтительно использовать изотонический состав. Обычно добавки для изотоничности могут включать хлорид натрия, декстрозу, маннит, сорбит и лактозу. В некоторых случаях предпочтительны изотонические растворы, такие как фосфатный буферный солевой раствор. Стабилизаторы включают желатин и альбумин. В некоторых вариантах воплощения к составу добавляется сосудосуживающее средство.
Предпочтительно фармацевтический состав представляет собой вакцину и более предпочтительно ДНК-вакцину.
Вакцина может быть ДНК-вакциной. ДНК-вакцина может содержать множество одинаковых или различных плазмид, содержащих нуклеиновую кислоту, кодирующую последовательности для одного или более консенсусных антигенов простаты. ДНК-вакцина может содержать одну или более последовательностей нуклеиновой кислоты, которые кодируют один или более консенсусных антигенов простаты. Если ДНК-вакцина содержит кодирующие последовательности более чем одного консенсусного антигена простаты, все такие последовательности могут быть представлены в единственной плазмиде, или каждая из таких последовательностей может быть представлена в различных плазмидах.
В некоторых вариантах воплощения вакцины могут содержать последовательности нуклеиновой кислоты, которые кодируют один или более консенсусных антигенов простаты в комбинации с одним или более консенсусными антигенами простаты.
ДНК-вакцины раскрыты в патентах США № 5593972, 5739118, 5817637, 5830876, 5962428, 5981505, 5580859, 5703055 и 5676594, которые включены в настоящее изобретение полностью посредством ссылки. ДНК-вакцина может дополнительно содержать элементы или реагенты, которые подавляют ее интеграцию в хромосому. Вакцина может быть РНК антигена простаты. РНК-вакцина может быть интродуцирована в клетку.
Вакцина может быть рекомбинантной вакциной, содержащей генетический конструкт или антиген, описанный выше. Вакцина также может содержать один или более консенсусных белков простаты в форме одной или более субъединиц белка, или одну или более ослабленных вирусных частиц, содержащих один или более консенсусных антигенов простаты. Ослабленная вакцина может быть ослабленными живыми вакцинами, убитыми вакцинами и вакцинами, которые используют рекомбинантные векторы для доставки чужеродных генов, которые кодируют один или более консенсусных антигенов простаты, а также субъединичной и гликопротеиновой вакциной. Примеры ослабленных живых вакцин, которые используют рекомбинантные векторы для доставки антигенов простаты, субъединичных и гликопротеиновых вакцин описаны в патентах США № 4510245; 4797368; 4722848; 4790987; 4920209; 5017487; 5077044; 5110587; 5112749; 5174993; 5223424; 5225336; 5240703; 5242829; 5294441; 5294548; 5310668; 5387744; 5389368; 5424065; 5451499; 5453364; 5462734; 5470734; 5474935; 5482713; 5591439; 5643579; 5650309; 5698202; 5955088; 6034298; 6042836; 6156319 и 6589529, каждый из которых включен в настоящее изобретение посредством ссылки.
Предоставляемая вакцина может быть использована для стимуляции иммунных реакций, включая терапевтические или профилактические иммунные реакции. Могут быть произведены антитела и/или киллерные Т-клетки, которые направлены на консенсусный антиген простаты. Такие антитела могут быть выделены.
Вакцина может дополнительно содержать фармацевтически приемлемый наполнитель. Фармацевтически приемлемый наполнитель может быть функциональными молекулами, таким как связующие вещества, адъюванты, носители или растворители. Фармацевтически приемлемый наполнитель может быть способствующим трансфекции средством, которые могут включать поверхностно-активные средства, такие как иммуностимулирующие комплексы (IδС0Μδ), неполный адъювант Фрейнда, аналог ΕΡδ, включая монофосфорил-липид А, мурамилпептиды, аналоги хинона, везикулы, такие как сквален и сква- 17 027315 лен, гиалуроновая кислота, липиды, липосомы, ионы кальция, вирусные белки, полианионы, поликатионы или наночастицы, или другие известные способствующие трансфекции средства.
Способствующее трансфекции средство представляет собой полианион, поликатион, включая полиЬ-глутамат (ЬС8), или липид. Способствующее трансфекции средство представляет собой поли-Ьглутамат и более предпочтительно поли-Ь-глутамат присутствует в вакцине в концентрации менее чем 6 мг/мл. Способствующее трансфекции средство также может включать поверхностно-активные средства, такие как иммуностимулирующие комплексы (18СОМ8), неполный адъювант Фрейнда, аналог ЬР8, включая монофосфорил-липид А, мурамилпептиды, аналоги хинона и везикулы, такие как сквален и сквален, и гиалуроновая кислота также может использоваться, вводясь вместе с генетическим конструктом. В некоторых вариантах воплощения ДНК-векторные вакцины также могут включать способствующее трансфекции средство, такое как липиды, липосомы, включая лецитиновые липосомы, или другие липосомы, известные специалистам, такие как смесь ДНК-липосом (см., например, \У09324640), ионы кальция, вирусные белки, полианионы, поликатионы или наночастицы, или другие известные способствующие трансфекции средства. Предпочтительно способствующее трансфекции средство представляет собой полианион, поликатион, включая поли-Ь-глутамат (ЬС8) или липид. Концентрация трансфекционного средства в вакцине менее чем 4 мг/мл, менее чем 2 мг/мл, менее чем 1 мг/мл, менее чем 0,750 мг/мл, менее чем 0,500 мг/мл, менее чем 0,250 мг/мл, менее чем 0,100 мг/мл, менее чем 0,050 мг/мл, или менее чем 0,010 мг/мл.
Фармацевтически приемлемое вспомогательное вещество может быть адъювантом. Адъювант может быть другими генами, которые экспрессируются в альтернативной плазмиде или доставляются как белки в комбинации с вышеупомянутой плазмидой в вакцине. Адъювант может быть выбран из группы, состоящей из α-интерферона (ΙΡΝ-α), β-интерферона (ΙΡΝ-β), γ-интерферона, тромбоцитарным фактором роста (ΡΌΟΡ), ФНОа, ФНОв, ГМКСФ, эпидермального фактора роста (ЭФР), кожного привлекающего Т-клетки хемокина(СТАСК), эпителиального экспрессируемого тимусом хемокина (ТЕСК), связанного со слизистыми оболочками эпителиального хемокина (МЕС), 1Ь-12, 1Ь-15, МНС, СЭ80, СЭ86, включая 1Ь-15, имеющий делецию сигнальной последовательности, и необязательно включая сигнальный пептид из 1дЕ. Адъювант может быть 1Ь-12, 1Ь-15, 1Ь-28, СТАСК, ТЕСК, тромбоцитарным фактором роста (ΡΌΟΡ), ФНОа, ФНОв, ГМКСФ, эпидермального фактора роста (ЭФР), 1Ь-1, 1Ь-2, 1Ь-4, 1Ь-5, 1Ь-6, 1Ь-10, 1Ь-12, 1Ь-18, или их комбинации.
Другие гены, которые могу быть пригодными адъювантами, включают те, которые кодируют МСР1, М1Р-1а, М1Р-1р, 1Ь-8, ΚΑΝΓΕ8, Ь-селектин, Р-селектин, Е-селектин, СЭ34, С1уСАМ-1, МабСАМ-1, ЬРА-1, УЬА-1, Мас-1, р150.95, РЕСАМ, 1САМ-1, 1САМ-2, 1САМ-3, СЬ2, ЬРА-3, М-С8Р, С-С8Р, 1Ь-4, мутантные формы Ш-18, СЭ40, СЬ40Ь, фактор роста сосудов, фактор роста фибробластов, 1Ь-7, фактор роста нервов, фактор роста эндотелия сосудов, Рак, рецептор ФНО, Ρΐΐ, Аро-1, р55, \У8Ь-1, ΌΚ3, ТКАМР, Аро-3, А1К, ЬАКО, ΝΟΒΕ, ΌΚ4, ΌΚ5, К1ЬЬЕК, ТКА1Ь-К2, ТК1СК2, ΌΚ6, Каспаза 1СЕ, Рок, с-.щп, 8р-1, Ар-1, Ар-2, р38, р65Ке1, М\О88, 1КАК, ТКАР6, 1кВ, неактивный ΝΙΙ<, 8АР К, 8АР-1, ЖК, гены интерферонной реакции, №кВ, Вах, ТКАШ, ТКАШтес, ТКАШтесОКС5, ТКА1Ь-К3, ТКА1Ь-К4, КАЯК, КАИК ЬЮАЫЭ, Ох40, Ох40 Ι.ΙΟΆΜλ МчСЫХ М1СА, М1СВ, ИКО2А, ИКО2В, ИКО2С, ИКО2Е, ИКО2Р, ТАР1, ТАР2 и их функциональные фрагменты.
Вакцина может дополнительно включать средство, улучшающее работу генетической вакцины, как описано в США Серийный Νο. 021579, поданном 1 апреля 1994, который полностью включен сюда посредством ссылки.
5. Способы доставки.
В настоящем изобретении предоставляется способ доставки фармацевтических лекарственных средств, предпочтительно вакцин, для предоставления генетических конструктов и консенсусного антигена простаты, который содержит эпитопы, делающие их особенно эффективными иммуногенами, к которым может быть вызвана иммунная реакция на раковые клетки простаты. Может предоставляться способ доставки вакцины, или вакцинации для стимуляции терапевтической и/или профилактической иммунной реакции. Вакцина может быть доставлена пациенту для модуляции активности иммунной системы млекопитающего и усиления иммунного ответа.
После доставки вакцины млекопитающему, и доставки вследствие этого вектора в клетки млекопитающего, трансфицированные клетки будут экспрессировать и секретировать соответствующий консенсусный белок простаты. Такие секретируемые белки, или синтетические антигены, будут распознаваться иммунной системой, которая разовьет иммунную реакцию, что может включать антитела к антигенам и Т-клеточную реакцию, специфичную к антигену. В некоторых примерах млекопитающее, вакцинированное вакцинами, обсуждаемыми здесь, будет иметь примированную иммунную систему. Вакцина может быть доставлена пациенту для модуляции активности иммунной системы пациента, тем самым усиливая иммунную реакцию.
Вакцина может быть доставлена в форме ДНК-вакцины, и способы доставки ДНК-вакцин описаны в патентах США № 4945050 и 5036006, которые полностью включены сюда посредством ссылки.
Вакцина может вводиться млекопитающему для получения иммунной реакции у млекопитающего.
- 18 027315
Млекопитающее может быть человеком, не являющимся человеком приматом, коровой, свиньей, овцой, козой, антилопой, бизоном, водяным буйволом, полорогим жвачным животным, оленем, ежом, слоном, ламой, альпакой, мышью, крысой или курицей, и предпочтительно человеком, коровой, свиньей или курицей.
а. Комбинированное лечение.
Фармацевтические составы, предпочтительно вакцины, могут вводиться в комбинации с одним или более других белков простаты или генов. Вакцина может вводиться в комбинации с белками или генами, кодирующими адъюванты, которые могут включать α-интерферон (ГОП-а), β-интерферон (^N-3), γинтерферон, ГО-12, ГО-15, ГО-28, СТАСК, ТЕСК, тромбоцитарный фактор роста (ΡΌ0Ρ), ФНОа, ФНО3, ГМКСФ, эпидермальный фактор роста (ЭФР), ГО-1, ГО-2, ГО-4, ГО-5, ГО-6, ГО-10, ГО-12, ГО-18, МСР-1, ΜΙΡ-1α. ΜΙΡ-1ρ, ГО-8, ΚΑ^Εδ, Ь-селектин, Р-селектин, Е-селектин, СЭ34. Ο1νί’ΛΜ-1. Μ;·ιύί'ΆΜ-1. ΌΡΑ1, νΣΑ-1, Μο-1, ρ150.95, ΡΕСΛΜ, ΚΑΜ-1, ΚΑΜ-2, ΚΑΜ-3, СЭ2, ΕΡΑ-3, Μ-СЗР, С-С8Р, ГО-4, мутантные формы ГО-18, СЭ40, СО40Ь, фактор роста сосудов, фактор роста фибробластов, ГО-7, фактор роста нервов, фактор роста эндотелия сосудов, Рак, ГОР рецептор, Ρ1ΐ, Αρο-1, р55, ^δΌ-1, ΌΚ3, ΤΚΑΜΡ, Αρο3, ΑΙΚ, ΕΑΚΌ, Κ0ΚΡ, ΌΚ4, ΌΚ5, ΚΙΙ,Ι,ΕΙΕ ΤΚΑΙΒ-Κ2, ΤΚΚΚ2, ΌΚ6, Каспазу ΙϋΕ, Ροκ, с-.)ип, δρ-1, Αρ-1, Αρ-2, ρ38, ρ65^1, ΜγΌ88, ΙΚΑΚ, ΤΚΑΡ6, ΙΚΒ, неактивный №Κ, δΑΡ Κ, δΑΡ-1, ГОК, гены реакции на интерферон, ПРкВ, Вах, ΤΚΑΙΕ, ΤΚΑΙΕκ^ ΤΚΛI^^ес^ΚС5, ΤΚΑΙΕ-Κ3, ΤΚΑΙΕ-Κ4, ΚΑλΚ, ΚΑΠΚ ЬЮΛN^. 0x40, 0x40 ΕΙΟ/ΑΜΕ \Κ0,2Ιλ ΜIСΑ, ΜIСВ, ΠΚ02Α, ΜΚ02Β, Ж02С, ΠΚ02Ε, ΠΚ02Ρ, ΤΑΡ1, или ТАР2, или их функциональные фрагменты.
б. Пути введения.
Вакцина может вводиться различными путями, включая пероральный, парентеральный, подъязычный, трансдермальный, ректальный, трансмукозальный, местно, посредством ингаляции, посредством буккального введения, внутриплеврально, внутривенно, внутриартериально, внутрибрюшинно, подкожно, внутримышечно, интраназально, интратекально, внутрисуставно или их комбинациями. Для ветеринарного использования состав может вводиться по ситуации как приемлемое лекарственное средство в соответствии с нормальной ветеринарной практикой. Ветеринар может легко определить режим дозирования и путь введения, который наиболее подходит для определенного животного. Вакцина может вводиться путем традиционной хирургии, приспособлений для безыгольной инъекции, пистолетов для баллистической трансфекции , или другими физическими способами, такими как электропорация (ЕР), гидродинамический способ, или ультразвук.
Вектор вакцины может доставляться млекопитающему с помощью нескольких хорошо известных технологий, включая ДНК-инъекцию (также называемую ДНК-вакцинацией) с электропорацией ίη νίνο и без нее, опосредованную липосомами, облегченную наночастицами, рекомбинантные векторы, такие как рекомбинантный аденовирус, рекомбинантный аденоассоциированный вирус и рекомбинантную вакцину. Антиген простаты может доставляться посредоством инъекции ДНК и вместе с электропорацией ίη νίνο.
в. Электропорация.
Введение вакцины посредством электропорации плазмид вакцины может осуществляться с использованием устройств для электропорации, которые могут быть настроены для доставки в желаемую ткань млекопитающего импульса энергии, эффективного для создания обратимых пор в клеточных мембранах, и в некоторых вариантах воплощения импульс энергии представляет собой постоянный ток, подобный заданному постоянному току, введенному пользователем.
В некоторых вариантах воплощения, где используется электропорация, устройство для электропорации может содержать электропорационный компонент и набор электродов или набор рукояток. Электропорационный компонент может включать в себя и содержать один или более различных элементов электропорационных устройств, включая контроллер, генератор кривой тока, прибор для измерения импеданса, регистратор формы волн, входной элемент, элемент отчета о состоянии, коммуникационный порт, компонент памяти, источник питания и сетевой выключатель. Элекропорация может проводиться с использованием ίη νίνο электропорационного устройства, например, системы СΕ^^ΕСΤΚΑ® ЕР (Ιηονίο ΡЬа^тасеиΐ^са15, ГОс., В1ие Ве11, ΡΑ) или электропоратора Ε1^η (Ιηονίο ΡЬа^тасеиΐ^са15, ГОс., В1ие Ве11, ΡΑ) для облегчения трансфекции клеток плазмидой.
Электропорационный компонент может функционировать как один элемент электропорационных устройств, а другие элементы являются отдельными элементами (или компонентами), связанными с электропорационным компонентом. Электропорационный компонент может функционировать как более чем один элемент электропорационных устройств, которые могут быть связаны с другими элементами электропорационных устройств, отдельными от электропорационного компонента. Элементы электропорационных устройств, существующие как части одного электромеханического или механического устройства, могут быть не ограничены как элементы, которые могут функционировать как одно устройство или как раздельные элементы, передающие друг другу информацию. Электропорационный компонент может быть способен доставлять импульс энергии, который производит постоянный ток в желаемой ткани, и включает механизм обратной связи. Набор электродов может включать комплект электродов,
- 19 027315 имеющий множество электродов, определенным образом расположенных в пространстве, где набор электродов получает импульс энергии от электропорационного компонента и доставляет его желаемой ткани через электроды. По меньшей мере один из множества электродов нейтрален во время доставки импульса энергии и измеряет импеданс в желаемой ткани и осуществляет связь импеданса с электропорационным компонентом. Механизм обратной связи может получить измеренный импеданс и может отрегулировать импульс энергии, доставленный электропорационным компонентом для поддержания постоянного тока.
Множество электродов может доставлять импульс энергии децентрализованным образом через контроль электродов программируемой последовательностью, и программируемая последовательность вводится ползователем в электропорационный компонент. Программируемая последовательность может содержать множество импульсов, доставляемых в последовательности, где каждый импульс из множества импульсов доставляется по меньшей мере двумя активными электродами с одним нейтральным электродом, который измеряет импеданс, и где последующий импульс множества импульсов доставлется одним другим из по меньшей мере двух активных электродов с одним нейтральным электродом, который измеряет импеданс.
Механизм обратной связи может осуществляться или с помощью аппаратуры, или с помощью программного обеспечения. Механизм обратной связи может осуществляться аналоговой системой управления с обратной связью. Обратная связь происходит каждые 50, 20, 10 или 1 мкс, но предпочтительна обратная связь в режиме реального времени или мгновенно (то есть по существу мгновенно, как определяется доступными способами для определения времени реакции). Нейтральный электрод может измерять импеданс желаемой ткани и передает импеданс механизму обратной связи, и механизм обратной связи реагирует на импеданс и регулирует импульс энергии для поддержания значения постоянного тока, подобного заданному. Механизм обратной связи может поддерживать постоянный ток безостановочно и незамедлительно во время доставки импульса энергии.
Примеры электропорационных устройств и электропорационных способов, которые могут способствовать доставке ДНК-вакцин настоящего изобретения, включают те, которые описаны в патенте США № 7245963, принадлежащем ИгадЫа-Лкй, с1 а1., патента США 2005/0052630, представленной 8шКЬ, с1 а1., содержание которых включено сюда во всей полноте посредством ссылки. Другие электропорационные устройства и электропорационные способы, которые могут быть использованы для улучшения доставки ДНК-вакцин, включают те, которые предоставлены в совместно поданной и находящейся в совместной собственности Заявке на Патент США, Серийный № 11/874072, поданной 17 октября 2007 г., которая утверждает приоритет по 35 И8С 119(е) согласно предварительным заявкам США Сер. № 60/852149, поданной 17 октября 2006 г., и 60/978982, поданной 10 октября 2007 г., все из которых сюда включены во всей полноте.
Патент США № 7245963, принадлежащий ИгадПа-АкБ, с1 а1., описывает модульные системы электродов и их использование для улучшения внедрения биомолекулы в клетки выбранной ткани в организме животного или растения. Модульные системы электродов могут содержать множество игольных электродов; подкожную иглу; электрический разъем, который предоставляет электропроводящее соединение от программируемого контроллера импульса постоянного тока ко множеству игольных электродов; и источник питания. Оператор может управлять множеством игольных электродов, которые смонтированы на опорной структуре, прочно вставляя их в выбранную ткань в организме животного или растения. Биомолекулы затем доставляются посредством подкожной иглы в выбранную ткань. Программируемый импульсный контроллер постоянного тока активируется и электрический импульс постоянного тока используется во множестве игольных электродов. Используемый электрический импульс постоянного тока способствует интродукции биомолекулы в клетку между множеством электродов. Полное содержание патента США № 7245963 включено сюда посредством ссылки.
Патент США 2005/0052630, представленный 8ιηί11ι. с1 а1., описывает электропорационное устройство, которое может быть использовано для эффективного улучшения интродукции биомолекулы в клетки выбранной ткани в организме животного или растения. Электропорационное устройство содержит электрокинетическое устройство (ΕΚΌ устройство), работа которого определяется программным обеспечением или аппаратурой. ΕΚΌ устройство производит серии программируемых паттернов импульса постоянного тока между электродами в порядке, основанном на контроле пользователя и вводе параметров импульса, и делает возможным хранение и получение данных о форме волн тока. Электропорационное устройство также содержит заменяемый электродный диск, имеющий комплект игольных электродов, центральный инъекционный канал для инъекционной иглы, и съемную установочную шайбу. Полное содержание патента США 2005/0052630 включено сюда посредством ссылки.
Электродные комплекты и способы, описанные в патенте США № 7245963 и патента США 2005/0052630, могут быть адаптированы для глубокого проникновения не только в мышечные ткани, но также в другие ткани или органы. В зависимости от конфигурации электродного комплекта, инъекционная игла (для доставки биомолекулы по выбору) также вводится полностью в целевой орган, и инъекция делается перпендикулярно целевой ткани, в область, которая предварительно намечена электродами. Электроды, описанные в патенте США № 7245963 и патента США 2005/005263, предпочтительны 20 мм
- 20 027315 в длину и 21 размера.
Кроме того, рассмотренные в некоторых вариантах воплощения, включающие в себя электропорационные устройства и их использование, существуют электропорационные устройства, которые описаны в следующих патентах: патент США 5273525, опубликованный 28 декабря 1993 г., патент США 6110161, опубликованный 29 августа 2000 г., 6261281, опубликованный 17 июля 2001 г., и 6958060, опубликованный 25 октября 2005 г., и патент США 6939862, опубликованный 6 сентября 2005 г. Кроме того, в настоящем изобретении рассмотрены патенты, распространяющиеся на объект изобретения, предоставляемый в патенте США 6697669, опубликованном 24 февраля 2004 г., который относится к доставке ДНК с использованием любого из множества устройств, и патенте США 7328064, опубликованном 5 февраля 2008 г., который относится к способу инъекции ДНК. Вышеперечисленные патенты включены сюда во всей полноте посредством ссылки. Другой вариант воплощения электропорационного устройства для использования с раковыми антигенами, описанными в настоящем изобретении, представляет собой Е1деп ЕР устройство (Ιηονίο РЬагтасеийса1к, 1пс., В1ие Ве11, РА).
г. Способ приготовления вакцины.
В настоящем изобретении предоставляются способы приготовления ДНК-плазмид, которые содежат ДНК-вакцины, описанные в настоящем изобретении. ДНК-плазмиды, после конечного этапа субклонирования в плазмиду экспрессии млекопитающего, могут быть использованы для инокулирования клеточной культуры в резервуаре для крупномасштабной ферментации, с использованием способов, известных специалистам.
ДНК-плазмиды для использования с ЕР устройствами настоящего изобретения могут быть поставлены или произведены с использованием комбинации известных устройств и способов, но предпочтительно они производятся с использованием оптимизированного способа производства плазмид, который описан в составляющей предмет лицензии, совместно поданной предварительной заявке США Серийный № 60/939792, которая была подана 23 мая 2007 года. В некоторых примерах плазмиды ДНК, используемые в этих исследованиях, могут быть поставлены в концентрациях, более чем или эквавалентных 10 мг/мл. Технология производства также включает или содержит в себе различные устройства и протоколы, которые хорошо известны средним специалистам в данной области техники, в дополнение к тем, которые описаны в США серийный № 60/939792, включая описанные в составляющем предмет лицензии патенте,
Патент США № 7238522, который был опубликован 3 июля 2007 г. Заявка и патент, на которые ссылаются выше, США серийный № 60/939792 и патент США № 7238522, соответственно, включены сюда во всей полноте.
Примеры
Настоящее изобретение дополнительно иллюстрируется в следующих примерах. Следует понимать, что эти примеры, хотя и указывают на предпочтительные варианты воплощения изобретения, даются только для иллюстрации. Из вышеследующего обсуждения и этих примеров специалист в данной области техники может установить необходимые характеристики этого изобретения, и без отхода от сущности и объема изобретения может внести различные изменения и модификации в изобретение для адаптации его к различным вариантам использования и условиям. Таким образом, различные модификации изобретения в дополнение к тем, которые показаны и описаны в настоящем изобретении, будут очевидны специалистам в данной области техники из нижеследующего описания. Предполагается также, что такие модификации попадают в объем прилагаемой формулы изобретения.
Пример 1.
Консенсусные иммуногены для Р8А и Р8МА были сконструированы из доступных полной длины последовательностей человека и макак в базе данных ОепВапк, как описано ранее Ьаййу, И.Е, Уап, 1., СогЬй!, Ν, КоЬака, И., КоЬшдег, О.Р., ХУетег, И.В. (2007). ПнншподешсПу оГ ηονе1 сопзепкик-Ьакей ИУА \'асстек адатк! аν^аη тПиеп/а. Уассше. 25, 2984-2989, и Ьаййу, И.Е, Уап, 1., Кн1/1ег, М., КоЬака, И., КоЬшдег, О.Р., КЬап, А.8., ОгеепЬоике, 1., 8агйекаг КУ., ИгадЫа-АкП, К., ХУешег, И.В. (2008). НеЮгокиЬ1урю Рго!есйоп адашк! РаШодетс Нитап апй А\аап 1пГ1неп/а Уникек \аа 1п Ушо Е1ес!горогайоп оГ 8уп1ЬеИс Сопкепкик ИУА Апйдепк. РЬо8 0ИЕ. 3,е2517.
Консенсусные антигенные последовательности были синтезированы при помощи Сепе8спр1 (Р1кса1а\уау, N1). Маркер НА был включен в С-конец антигенной последовательности. Антигенные последовательности были оптимизированы по стабильности мРНК и использованию кодонов у людей. Итоговые последовательности клонировались в ВатН1 и ХЬо1 сайтах рУАХ1 вектора Оптагодеп, Сат1кЬай, СА).
Был произведен консенсусный Р8А антиген 1 (8ЕО ГО N0: 2). Эта последовательность, которая содержит 261 аминокислоту, сравнивалась с каждой из Р8А последовательностей, перечисленных в табл. 1. Использованные Р8А последовательности включают две последовательности человека, последовательность из М. ГаксюЫапк, и последовательность из М. ти1айа. Табл. 1 включает 8ЕО ГО N0 и номер доступа для каждой последовательности, использованной при сравнении с консенсусным Р8А антигеном 1 (8ЕС ГО N0: 2).
- 21 027315
ЗЕО | Виды и белок | Номер доступа | Количество | Таблица 1 % |
ΙΡΝΟ | аминокислот | гомологии с | ||
8Ε0ΙΡ | ||||
N0:2 | ||||
17 | Н. 8ар1еп8 ΡδΑ Ϊ8θ1 | ΝΡ001639.1 | 261 | 91 |
18 | Н. 8ар1еп8 РЗА | §ЬААА60193.1 | 262 | 91 |
19 | М. 1а8с1си1ап8 КЕКЗ | ζ)6ΡΤ45.1 | 261 | 95 |
20 | М. ши1а11а РЗА | ΝΡΟΟ1036241.1 р | 261 | 96 |
Было осуществлено множественное выравнивание Ρ8Ά последовательностей Н. Вар1епз (ВЕР ГО N0: 17 и ВЕР ГО N0: 18), Μ. ши1айа (ВЕР ГО N0: 20) и М. £ас1си1апз (ВЕР ГО N0: 19) с консенсусным ΡΒΑ антигеном 1 (ВЕР ГО N0: 2). КЬК3 (калликреин 3) представляет собой ген, кодирующий ΡΒΑ и являющийся псевдонимом ΡΒΑ. ΡΒΑ антиген 1 на 91% гомологичен Н. зар1епз, на 96% гомологичен М. ши1айа и на 95% гомологичен М. £ас1си1апз ΡΒΑ белковым последовательностям полной длины.
Пример 2.
Был произведен консенсусный ΡΒΑ антиген 2 (ВЕР ГО N0: 4). Эта последовательность, которая содержит 279 аминокислот, включая лидерную последовательность 1дЕ, сравнивалась с каждой из ΡΒΑ последовательностей, перечисленных в табл. 2. Использованные ΡΒΑ последовательности включают две последовательности человека, последовательность из М. £азс1си1апз и последовательность из М. тн1а11а. Табл. 2 включает ВЕР ГО N0 и номер доступа для каждой последовательности, использованной при сравнении с консенсусным ΡΒΑ антигеном 2 (ВЕР ГО N0: 4).
8Е0 Виды и белок Номер доступа
ΙΡΝΟ
17 | Н. 8ар1еп8 Р8А Ϊ8θ1 | ΝΡ001639.1 |
18 | Н. 8ар1еп8 РЗА | §ЬААА60193.1 |
19 | М. 1а8С1си1аг18 КЕКЗ | Р6РТ45.1 |
21 | М. ши1а11а РЗА | ΑΑΖ82258.1 |
Таблица 2
Количество | % |
аминокислот | гомологии с 8Ε0ΙΡ N0:4 |
261 | 91 |
262 | 90 |
261 | 95 |
244 | 95 |
Было осуществлено множественное выравнивание ΡΒΑ последовательностей Н. Вар1епз (ВЕР ГО N0: 17 и ВЕР ГО N0: 18), М. ти1а11о (ВЕР ГО N0: 21) и М. £ас1си1апз (ВЕР ГО N0: 19) с консенсусным ΡΒΑ антигеном 1 (ВЕР ГО N0: 4). КЬК3 (калликреин 3) представляет собой ген, кодирующий ΡΒΑ и являющийся псевдонимом ΡΒΑ. ΡΒΑ антиген 1 на 90-91% гомологичен Н. зар1епз и на 95% гомологичен М. £ас1си1аг18, и на 95% гомологичен М. ти1а!1а ΡΒΑ частичной белковой последовательности.
Пример 3.
Был произведен консенсусный ΡΒΜΑ антиген 1 (ВЕР ГО N0: 6). Эта последовательность, которая содержит 750 аминокислот, сравнивалась с каждой из ΡΒΜΑ последовательностей, перечисленных в табл. 3. Использованные ΡΒΜΑ последовательности включают две последовательности человека и последовательность из М. ти1аНа. Табл. 3 включает ВЕР ГО N0 и номер доступа для каждой последовательности, использованной при сравнении с консенсусным ΡΒΜΑ антигеном 1 (ВЕР ГО N0: 6).
Таблица 3
Номер доступа
8Е0 Виды и белок ΙΡΝΟ
Количество % аминокислот гомологии с
8Ε0ΙΡ
22 | Н. 8ар1еп8 Р8МА ОСРП_18о1 | ΝΡ_004467.1 | 750 | N0:6 96 |
23 | Н. 8ар1еп8 Р8МА | ААС83972.1 | 749 | 96 |
24 | М. ши1а11а ОСРП Ϊ8θ1 | ХР-001096141.2 | 735 | 94 |
Было осуществлено множественное выравнивание ΡΒΜΑ последовательностей Н. Вар1епз и М. ти1а11а с ΡΒΜΑ антигеном 1. ΡΒΜΑ антиген 1 консенсусная последовательность (ВЕР ГО N0: 6) на 96% гомологична Н. зар1епз ΡΒΜΑ (ВЕР ГО N0: 22 и ВЕР ГО N0: 23) и на 94% гомологична М. ти1а1£а ΡΒΜΑ белковой последовательности полной длины (ВЕР ГО N0: 24).
- 22 027315
Пример 4.
Был произведен консенсусный ΡδΜΑ антиген 2 (δΕρ ΙΌ N0: 8). Эта последовательность, которая содержит 766 аминокислот, включая лидерную последовательность Ι§Ε, сравнивалась с каждой из ΡδΜΑ последовательностей, перечисленных в табл. 4. Использованные ΡδΜΑ последовательности включают две последовательности человека и последовательность из М. ши1а11а. Табл. 4 включает δΕρ ΙΌ N0 и номер доступа для каждой последовательности, использованной при сравнении с консенсусным ΡδΜΑ антигеном 2 (δΕρ ΙΌ N0: 8).
5Е0 | Виды и белок | Номер доступа | Количество | Таблица 4 % |
ΌΝΟ | аминокислот | гомологии с | ||
ЗЕО ГО | ||||
N0:8 | ||||
22 | Н. §ар1еп§ ΡδΜΑ ОСРП_1§о1 | ΝΡ_004467.1 | 750 | 96 |
23 | Н. §ар1еп§ ΡδΜΑ | ААС83972.1 | 749 | 96 |
24 | М. ши1а11а ОСРП ϊδοί | ХР_001096141.2 | 735 | 94 |
25 | М. ши!а11а ОСРП ί§ο2 | ХР_002799784.1 | 704 | 94 |
Было осуществлено множественное выравнивание Н. 8ар1еп§ (δΕρ ΙΌ N0: 22 и δΕρ ΙΌ N0: 23) и М. ши1аИа ΡδΜΑ последовательностей (δΕρ ΙΌ N0: 24 и δΕρ ΙΌ N0: 25) с ΡδΜΑ антигеном 2. ΡδΜΑ антиген 2 консенсусная последовательность (δΕρ ΙΌ N0: 8) на 96% гомологична Н. §ар1еп§ ΡδΜΑ белковым последовательностям и на 94% гомологична М. ши1а11а ΡδΜΑ белковым последовательностям.
Пример 5.
Был произведен консенсусный δΤΕΑΡ антиген 1 (δΕ(1 ΙΌ N0: 10). Эта последовательность, которая содержит 339 аминокислот, сравнивалась с каждой из δΤΕΑΡ последовательностей, перечисленных в табл. 5. Использованные δΤΕΑΡ последовательности включают две полной длины последовательности человека, полной длины последовательность из М. ши1аИа и две более коротких последовательности человека. Табл. 5 включает δΕρ ΙΌ N0 и номер доступа для каждой последовательности, использованной при сравнении с консенсусным δΤΕΑΡ антигеном 1 (δΕρ ΙΌ N0: 10).
Таблица 5 | ||||
ЗЕО ГО N0 | Виды и белок | Номер доступа | Количество аминокислот | % гомологии с 3ΕΟΙΟ N0:10 |
26 | Н. 8ар1еи8 δΤΕΑΡ 1 | ΝΡ_036581.1 | 339 | 99 |
27 | Н. 8ар1еиз δΤΕΑΡ 1 | Ο6_ΕΑΌ24167.1 | 339 | 99 |
28 | М. ши1аИа δ ТЕ АР 1 | ХР_001103605.1 | 339 | 98 |
29 | Н. §ар1еп8 δΤΕΑΡ 1 СКА Ь | ЕА\У93751.1 | 259 | 94 |
30 | Н. зар1епз δΤΕΑΡ 1 изоформа | ΕΑλΥ93749.1 | 258 | 94 |
Было осуществлено множественное выравнивание Н. δ;η^'η8 и М. ши1аИа δΤΕΑΡ последовательнсотей с консенсусным δΤΕΑΡ антигеном 1. δΤΕΑΡ антиген 1 консенсусная последовательность (δΕ(1 ΙΌ N0: 10) на 99% гомологична человеческим полной длины изоформам (δΕρ ΙΌ N0: 26 и δΕρ ΙΌ N0: 27), на 94% гомологична укороченным Н. 8ар1еп§ изоформам (δΕρ ΙΌ N0: 29 и δΕρ ΙΌ N0: 30), и на 94% гомологична М. ши1а11а полной длины δΤΕΑΡ1 белковой последовательности (δΕρ ΙΌ N0: 28).
Пример 6.
Был произведен консенсусный δΤΕΑΡ антиген 2 (δΕ(1 ΙΌ N0: 12). Эта последовательность, которая содержит 356 аминокислот, сравнивалась с каждой из δΤΕΑΡ последовательностей, перечисленных в табл. 6. Используемые δΤΕΑΡ последовательности включают две полной длины последовательности человека, полной длины последовательность из М. ши1айа и две более коротких последовательности человека. Табл. 6 включает δΕρ ΙΌ N0 и номер доступа для каждой последовательности, использованной при сравнении с консенсусным δΤΕΑΡ антигеном 2 (δΕρ ΙΌ N0: 12).
- 23 027315
ЗЕО | Виды и белок | Номер доступа | Количество | Таблица 6 % |
ГО N0 | аминокислот | гомологии с 5Е0ГО N0:12 | ||
26 | Н. 8ар1еп§ ЗТЕАР1 | ΝΡ_036581.1 | 339 | 94 |
27 | Н. §ар1еп8 8ТЕАР1 | ОЬ_ЕАЕ24167.1 | 339 | 94 |
28 | М. ти1аНа 5ТЕАР1 | ХР_001103605.1 | 339 | 94 |
29 | Н. 8ар1епк ЗТЕАР1 СКА Ь | ЕААУ93751.1 | 259 | 88 |
30 | Н. 8ар1епк 8ТЕАР1 изоформа | ΕΑλ¥93749.1 | 258 | 88 |
Было осуществлено множественное выравнивание Н. δαρίοπδ и М. ти1аИа δΤΕΑΡ1 последовательностей с консенсусным δΤΕΑΡ1 антигеном 2. δΤΕΑΡ1 антиген 2 консенсусная последовательность (δΕ^ ГО N0: 12) на 94% гомологична полной длины человеческим изоформам (δΕ^ ГО N0: 26 и δΗΟ ГО N0: 27), на 88% гомологична укороченным Н. δαρίοπδ изоформам (δΕ^ ГО N0: 29 и δΗ) ГО N0: 30), и на 94% гомологична М. ши1айа полной длины δΤΕΑΡ 1 белковым последовательностям (δΕ^ ГО N0: 28).
Пример 7.
Был произведен консенсусный ΡδΟΑ антиген (δΕ^ ГО N0: 14). Эта последовательность, которая содержит 131 аминокислоту, включая лидерную последовательность ΙβΕ, сравнивалась с ΡδΟΑ последовательностью, указанной в табл. 7. Используемая ΡδΟΑ последовательность была человеческой последовательностью полной длины. Табл. 7 включает δΗ) ГО N0 и номер доступа для последовательности, использованной при сравнении с консенсусным ΡδΟΑ антигеном (δΕ^ ГО N0: 14).
Таблица 7
ЗЕО ГО N0 | Виды и белок | Номер доступа | Количество аминокислот | % гомологии с 8Е0ГО N0:14 |
31 | Н. §ар1еп§ Р8СА | ΝΡ_005663.2 | 114 | 87 |
Было произведено множественное выравнивание Н. δаρ^еηδ ΡδΟΑ последовательности (δΕ^ ГО N0: 31) с консенсусным ΡδΟΑ антигеном (δΕ^ ГО N0: 14). ΡδΟΑ антигенная консенсусная последовательность на 87% гомологична полной длины Н. δаρ^еηδ ΡδΟΑ.
Пример 8.
Ιη νΐΐΐΌ трансляция проводилась для подтверждения экспрессии ΡδΑ и ΡδΜΑ антигенов. Использовались ΤΠΤ® сопряженная система транскрипции /трансляции и 35δ-метионин (Егошеда). ρνΑΧ вектор сам по себе (отрицательный контроль) или каркас ρνΑΧ с ΡδΑ или ΡδΜΑ антигенными вставками и 35δ-метионин был добавлен к реакционной смеси в соответствии с инструкциями производителя. Реакция проводилась при 30°С в течение 2 ч. Меченые белки иммунопреципитировались с аффинным гелем против НА (апй-ΗΑ ΑΕΕϊηϊΐγ Ое1) ^1§ша, δΐ. Εουίδ, МО) при перемешивании в течение ночи в в буфере для радиоиммунопреципитационного анализа (ΚΙΡΑ) при 4°С. Иммунопреципитированные белки подвергались электрофорезу в ДСН-ПААГ, который затем фиксировался и высушивался. Экспрессия 35δмеченых белков определялась путем авторадиографии. Результаты показаны на фиг. 1.
Пример 9.
Клеточная иммуногенность ΡδΑ и ΡδΜΑ антигенов определялась с помощью интерферон-гамма ΕΕΙδροΐ.
Самки мышей в возрасте от 4 до 6 недель ΒΑΕΒ/с были приобретены у Лабораторий 1аекзоп (Ваг НагЬог, ΜΕ). Все животные содержались в Университете Пенсильвании в условиях с контролируемой температурой и световым циклом. Уход за животными проводился в соответствии с руководствами Национального института здоровья и Комитета университета Пенсильвании по институционному уходу и использованию.
Для исследований по клеточной иммуногенности 10 или 20 мкг каждого антигена доставлялось в переднюю болыпеберцовую мышцу мышей Ва1Ь/с посредством внутримышечной инъекции, после чего следовала электропорация с использованием ΟΕΕΕΕΟΤΚΑ® адаптивного устройства постоянного тока (Ιηονΐο Ρйа^тасеиΐ^са1δ, Нс., В1ие Ве11, ΡΑ). Мыши (п=5 на группу) получали 2 иммунизации в недели 0 и 2. Два 0,1 ампер постоянного тока прямоугольных импульсов доставлялись посредством треугольного 3электродного комплекта, состоящего из твердых электродов из нержавеющей стали 26 размера. Каждый импульс продолжался 52 мс с промежутком в 1 с между импульсами. Мыши получили всего 2 иммунизации, которые вводились с промежутком 2 недели. Мыши были гуманно забиты через 1 неделю после второй иммунизации для анализа клеточных и гуморальных иммунных реакций.
- 24 027315
Клеточные и реакции оценивались через 1 неделю после последней иммунизации (неделя 5). ЕЫ8ро1 анализ использовался для определения антиген-специфичной секреции ГРИу. Иммобилизованное антитело против ГРИу мыши (Κ&Ό 8у51ст5. М1ппеароЙ8, МИ) использовалось для покрытия плоскодонных планшетов 1ттоЫ1оп-Р (МЛНроге, ВШепса, МА) на ночь при 4°С. Спленоциты были стерильно выделены и ресуспендированы при в К10 среде (Ко5е\уе11 Рагк Мешопа1 1п8Йи1е теЛшт 1640 с добавкой 10% эмбриональной телячьей сыворотки, 1% антибиотика-антимикотика и 0,1% 2-меркаптоэтанола). 2х105 спленоцитов из иммунизированных мышей были добавлены к каждой лунке 96-луночного планшета и стимулировались в течение ночи при 37°С, 5% СО2, в присутствии К10 (отрицательный контроль), конканавалина А (положительный контроль) (81дта, 8ΐ. Ьошк, МО) или антиген-специфичных пептидных пулов. На следующий день идентифицирующее антитело против ШЫу мыши (Κ&Ό 8у51ет5, МитеароПк, МИ) было добавлено в планшеты, которые затем инкубировались в течение ночи при 4°С. На следующий день стрептавидин-АЬР (МаЬТесЬ, 8\уеЛеп) был добавлен к планшетам на 2 ч и антигенспецифичные метки визуализировались с ВСЛР/ИРТ субстратом (МаЬТесЬ, 8\уеЛеп). Р8А и Р8МА пептиды были 15-членными пептидами, распределенными о всей длине консенсусного иммуногена, не включая маркер НА или лидерную последовательность, перекрывающимися на 11 аминокислот, и синтезировались при помощи Сеп8спр1 (Р15са1а\уау, N1). Р8А и Р8МА пептиды были использованы в конечной концентрации 1,0 мкг/мл для каждого пептида. ШЫу ЕЬ18ро! использовался для оценки антигенспецифичных клеточных реакций через 1 неделю после последней иммунизации. Для Р8А, ШЫу реакции были подобны дозам вакцины 10 мкг (772,2±138,2 СОЕ) и 20 мкг (771,1±155,2 СОЕ) (фиг. 2А). Напротив, было дозозависимое возрастание Р8МА-специфичных РИу реакций с 20 мкг вакцины (1585,0±194,0 8РИ) в сравнении с 10 мкг вакцины (1047,2±160,7 8РИ) (фиг. 2В). Минимальный фон наблюдался для Р8А или Р8МА реакций наивных мышей.
Пример 10.
Вакцино-индуцированная продукция ГРИу, 1Ь-2 и ФНО а СЭ4+ и СЭ8+ Т клетками.
Клеточная иммуногенность также была охарактеризована посредством проточной цитометрии для совместно доставленных Р8А и Р8МА вакцин. Антиген-специфичная продукция СЭ4+ и СЭ8+ Т клетками ГРИу, 1Ь-2 и ФНОа определялась для совокупной вакцин-специфичной реакции и Р8А и Р8МА компонентов совокупной вакцин-специфичной реакции (п=5).
Клеточные иммунные реакции также определялись с помощью внутриклеточного окрашивания цитокинов и проточной цитометрии с использованием Су1оР|х/Су1оРегт набора по инструкциям производителя (ΒΌ Вюкшепсек, 8ап П1едо, СА). Спленоциты, собранные от иммунизированных мышей, промывались РВ8 и затем ресуспендировались в К10 среде до конечной концентрации 107 клеток/мл. Клетки высевали в круглодонных 96-луночных планшетах в объеме 100 мкл и в дополнительных 100 мкл К10 среды (отрицательный контроль), добавляли среду, содержащую пулы антиген-специфичных пептидов, или среду, содержащую форболмиристацетат (РМА, 10 нг/мл) и иономицин (250 нг/мл; положительный контроль) (81дта, 8ΐ. Ьошк, МО), и планшеты инкубировались при 37°С, 5% СО2, в течение 6 ч. Все стимулирующие среды содержали по 1 мкг/мкл Со1д1Р1ид и Со1д|81ор (ΒΌ Вюкшепсек, 8ап О|едо, СА). В конце инкубационного периода планшеты переворачивались и промывались дважды РВ8. Клетки затем окрашивались фиолетовым красителем для визуализации (иУЕ/ОЕАО Ую1е1 У1аЬЛЬу Оуе, 1пуПгодеп; СагкЬаЛ, СА) в течение 30 мин при 4°С. После промывания РВ8, как указано выше, клетки окрашивались извне в течение 30 мин анти-СО4 РегСРСу5.5 и анти-СЭ8 АРС при 4°С, после чего следовала фиксация и пермеабилизация. Добавлялись анти-СЭ3 РЕ-Су5, анти-1Ь-2 РЕ, ати-ШКу А1ехаР1иог-700 и анти-ФНОа Р1ТС (ВО Вюкаепсек, 8ап О|едо, СА), и клетки снова инкубировались при 4°С в течение 30 мин. Клетки затем последний раз промывались РВ8 и фиксировались в 1% ПФА.
Совместная доставка Р8А и Р8МА вакцины индуцировала устойчивую ί'Ό4+ секрецию ГРИу, 1Ь-2 и ФНОа. Процент ί'Ό4+ Т клеток, продуцирующих Р8А-специфичный (0,21%) и Р8МА-специфичный (0,24%) ГРИу давал равный вклад в совокупную вакциноспецифичную ГРИу реакцию СЭ4+ Т клеток (0,44%) (фиг. 3А). Р8МА-специфичные СЭ4+ Т клетки, продуцирующие ΣΕ-2 (1,08%), содержали большинство совокупного процента ί'Ό4+ Т клеток, продуцирующих вакциноспецифичный ]Е-2 (1,40%) (фиг. 3В). Процент Р8А (0,31%) и Р8МА (0,29%) индуцированной продукции ФНОа ί'Ό4+ Т клетками давал равный вклад в совокупную вакциноспецифичную реакцию (0,60%) (фиг. 3С). В целом реакции ί'Ό4+ Т клеток были хорошо сбалансированы между Р8А и Р8МА, за исключением Р8МА, вызывающих основную часть продукции ί'Ό4+ Т клетками вакциноспецифичного ]Е-2.
Вакцина индуцировала сильную антиген-специфичную продукцию СЭ8+ Т клетками ГРИу и ]Е-2 и, в меньшей степени, ФНОа. Как Р8А (0,70%), так и Р8МА (0,67%) вызывали устойчивую выработку ί'Ό8+ Т клетками ГРИу. Фактически, вакциноспецифичные СЭ8+ Т клетки, секретирующие ГРИу, составляли 1,37% от общей популяции ί'Ό8+ Т клеток (фиг. 4А). Вакцина также вызывала сильную ]Е-2 реакцию ί'Ό8+ Т клеток (1,54%). Подобно ΣΕ-2 реакции СЭ4+ Т клеток, процент Р8МА-специфичных (1,06%) ί'Ό8+ Т клеток, секретирующих ΣΕ-2, был приблизительно в 2 раза выше, чем Р8А-специфичных (0,47%) (фиг. 4В). Совокупный процент вакциноспецифичной продукции ФНОа ί'Ό8+ Т клетками
- 25 027315 (0,11%) коррелировал с ΡδΑ компонентом вакцины (фиг. 4С). Подводя итог, имелся высокий процент вакциноспецифичной выработки СЭ8+ Т клетками ΙΕ^ и ΙΕ-2. Подобно реакциям С1)4- Т клеток, выработка №N7 была равно сбалансирована между ΡδΑ и ΡδМΑ, и величина ΙΕ-2 ΡδМΑ-специфичной реакции была выше, чем ΡδΑ-специфичной реакции.
Пример 11.
ΡδΑ-специфичная ΙΑ.ί сероконверсия.
Реакция антител может играть важную роль в терапии опухолей. Соответственно мы затем исследовали этот параметр иммунной реакции на ΡδΑ антиген на основе доступности белковой мишени.
Для определения ΡδΑ-специфичных титров сывороточных антител 96-луночные Nиηс-Iттиηο Мах^огр планшеты ^ипс, Косйез1ег, NΥ) покрывались на ночь при 4°С с 1 мкг/лунку рекомбинантного ΡδΑ белка (РП/дегак! !п4из1пез. ЛсЮп. МΑ), разбавленного в ΡΒδ. Планшеты промывались ΡΒδ, 0,05% 4\\ееп 20 (ΡΒδΤ), блокировались в течение 1 ч при комнатной температуре с 10% БСА/ΡΒδΤ, и инкубировались с серийными разведениями сыворотки от иммунизированых или наивных животных в течение 1 ч при комнатной температуре. Планшеты затем промывались 3 раза ΡΒδΤ и антитело козы против ΙρΟ мыши (8ап!а Сш/, δаηίа Сш/, СΑ) добавляли в разведении 1:5000 в ΡΒδΤ. Связанный фермент определялся с помощью δ^дтаΕΑδΤ О-фенилендиамина дигидрохлорида, (0ΡΙ): δ^дта-Α1ά^^сй, δί. Еошз, МО), и оптическая плотность определялась при 450 нм на Ню1ек (Аапоозка νΤ) планшетных ридерах, показанных на Фигуре 5В. Конечные титры определялись, как описано выше (Ргеу, Α. еί а1. 1998). Вкратце, лимит прогнозирования рассчитывался с использованием ί-распределения Стьюдента. Математическая формула, которая определяет лимит прогнозирования, выражается как стандартное отклонение, умноженное на множитель, основанный на количестве отрицательных контролей и (п=5) и доверительном уровне (95%). Конечный титр сообщался как обратное от последнего разведения выше верхнего предела прогнозирования.
В дополнение к подтверждению устойчивого иммунитета, опосредованного клетками, ΡδΑ вакцина также вызывала сильные антиген-специфичные гуморальные реакции. Титры антител определялись с помощью ΕΟδΑ в выделенной из мышей сыворотке через одну неделю после последней иммунизации (п=5). Вакцина вызывала средний ΡδΑ-специфичный конечный титр антител 4427 (диапазон 1581-15811) (фиг. 5А). Также может быть важна продолжительность таких реакций.
Пример 12.
Аминокислотные последовательности специфичного антигена простаты, доступные в ΟеηΒаηк, включают следующие:
§Ь_Е А\У71923.1_Н.зар1епз_к1кЗ_СКАЬ;
_001639.1_Н.зар1епз_Р8А_1зо1_препробелок;
§Ь_ААА59995.1_Н.зар1епз_Р8А_предшественник; §Ъ_ААА60193.1_Н.зар1епз_Р8А;
§Ь_Е А\У71933.1_Н.зар1епз_к1кЗ_СКА_1;
14Р_001025218.1_Н.зар1епз_РЗА_1зоЗ_препробелок; §Ъ_САО54617.1_Н.зар1епз_РЗА; §Ъ_САО30844.1_Н.зар1епз_Р8А; §Ъ_ААА59996.1_Н.зар1епз_РЗА_предшественник;
§Ь_ААϋ 14185.1_Н.зар1епз_РЗА; ζ)6ϋΤ45.1_МТазс1си1апз_КЕКЗ;
ΝΡ 001036241.1_М.ти1айа_РЗА_предшественник; ΑΑΖ82258.1_М.ти1а11а_РЗА;
АА782255.1_О.§огШа_РЗА; §И 1638386661геТ1КР_001106216.11 сыворотки калликреин [Рарю апиЫз]; βίΙ73746696Ι§6ΙΑΑΖ82261.11 специфический антиген простаты [Рарю апиЫз]; ίΙ73746692Ι§6ΙΑΑΖ82259.1Ι специфический антиген простаты [ЕгуйносеЪиз ра1аз];
βίΙ73746694Ιβ6ΙΑΑΖ82260.11 специфический антиген простаты [Сегсорййесиз серйиз];
βίΙ73746682Ιβ6ΙΑΑΖ82254.11 специфический антиген простаты [Рап рашзсиз];
βίΙ73746680Ιβ6ΙΑΑΖ82253.11 специфический антиген простаты [Рап 1го§1ос1у1ез];
βίΙ73746686Ιβ6ΙΑΑΖ82256.11 специфический антиген простаты [Роп§о ру§таеиз]; и
3746688Ιβ6ΙΑΑΖ82257.1Ι специфический антиген простаты [ЕГотазсиз §аЬпе11ае].
ΡδМΑ аминокислотные последовательности, доступные в ОепЕапк. включают следующие: NΡ_004467.1_Ηитап_ССΡII_^зо1; Ηитап_ΡδМΑ_ΑΑС83972.1; М.ти1аίίа_ΟСΡII_13о1 ΧΡ_001096141.2; и \1.ти1аиа ССТИ 1зо2 ΧΡ 002799784.1.
δΤΕΑΡ аминокислотные последовательности, доступные в СтепНапк. включают следующие:
- 26 027315
ΝΡ036581.1_Нишап_8ТЕАР1; ЕАЫ24167.1_Нишап_8ТЕАР1;
ХР001103605.1_М.ши1а«а_8ТЕАР1_18оЗ; ΕΑλ¥93751.1_Нишап_8ТЕАР1_СКАЬ; ЕА\¥93749.1_Нитап_8ТЕАР1_СКАа; ХР001164838.1_Р.1го§1ос1у1е8_ЗТЕАР18о2;
ХР002818311.1_Р.аЬеШ_8ТЕАР1; ΝΡ001162459.1_Р.апиЫ8_ЗТЕАР1; ЫР_999470.1_5.§сгоГа_5ТЕАР1; и ЫР_081675.2_М.ти8си1из_8ТЕАР1.
NΡ_005663.2_Ηитаη_ΡδСΑ является номером доступа ΡδϋΑ аминокислотной последовательности, доступной в ОепБапк.
ПЕРЕЧЕНЬ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЕЙ <110> ТНЕ ТВиЗТЕЕЗ ОЕ ТНЕ υΝίνΕΚδΙΤΥ ОЕ ΡΕΝΝδΥΠνΑΝΙΑ №ΕΙΝΕΚ, Ε^νίά ΥΑΝ, Лап
ЕЕККАКО, ВегпаДеЬЬе 5АКЮЕ5А1, Νίταπ^απ ΡΑΜΑΝΑ^ΑΝ, МаЬПига <12 0> КОНСЕНСУСНЫЕ АНТИГЕНЫ ПРОСТАТЫ, МОЛЕКУЛА НУКЛЕИНОВОЙ КИСЛОТЫ, КОДИРУЮЩАЯ ИХ, И ВАКЦИНА, И ИСПОЛЬЗОВАНИЕ, ВКЛЮЧАЮЩЕЕ ИХ <130> υρνοοο36 <150> из 61/413,176 <151> 2010-11-12 <150> из 61/417,817 <151> 2010-11-29 <160> 31 <170> Патентная версия 3.5 <210> 1 <211> 789 <212> ДНК <213> Искусственная последовательность <220>
<223> Последовательность нуклеиновых кислот антигена Ρ3Α 1 <400> 1
аЬдЬдддЬсс | ЬддЬддЬдЬЬ | ссЬдасЬсЬд | адсдЬсасаЬ | ддаЬсддсдс | сдсЬссасЬд | 60 |
аЬЬсЬдадсс | дссЬддЬддд | сдддЬдддад | Ьдсдаааадс | асЬсссадсс | аЬддсаддЬд | 120 |
сЬддЬсдсЬЬ | сЬаддддссд | адсадЬдЬдс | ддаддсдЬдс | ЬддЬссассс | ЬсадЬдддЬс | 180 |
сЬдассдсад | сссаЬЬдЬаЬ | ссдасадаад | адсдЬдаЬЬс | ЬдсЬддддсд | асассадсса | 240 |
ЬЬсЬассссд | аддасасадд | асаддЬдЬЬс | саддЬсЬсЬс | асадЬЬЬЬсс | ссаЬссЬсЬд | 300 |
ЬасаасаЬда | дссЬдсЬдаа | ааасадаЬаЬ | сЬдддассЬд | дсдасдаЬад | сЬсссаЬдаЬ | 360 |
сЬдаЬдсЬдс | ЬдаддсЬдЬс | сдадссадсс | даасЬдасЬд | асдсЬдЬдса | ддЬссЬддаЬ | 420 |
сЬдсссассс | аддадссЬдс | ссЬдддаасс | асаЬдЬЬаЬд | сЬЬсаддсЬд | ддддадсаЬс | 480 |
даассададд | аасаЬсЬдас | Ьсссаадааа | сЬдсадЬдсд | ЬддассЬдса | ссЬдаЬЬадЬ | 540 |
аасдаЬдЬдЬ | дрдсасаддр | ссаЬЬсасад | ааддЬдасаа | адЬЬсаЬдсЬ | дрдсдссддс | 600 |
- 27 027315
КсККддаКдд | дсддсаадКс аасККдсадс ддддасКссд дсдддссасК ддКдКдКдаК | 660 |
ддадКссКдс | адддсаКсас сКсККддддс адКсадссКК дКдсссКдсс Ксддадасса | 720 |
адКсКдКаса | сКааддКддК ссддКаКадд аааКддаККс аддасасКаК КдссдсКаас | 780 |
сссКдаКаа | 789 |
<210> 2 <211> 261 <212> БЕЛОК <213> Искусственная последовательность <220>
<223> Последовательность аминокислот антигена РЗА 1 <400> 2
МеК 1 | Тгр | Уа1 | Ьеи | Уа1 5 | Уа1 | РПе | Ьеи | ТПг | Ьеи 10 | Зег | Уа1 | ТПг | Тгр | 11е 15 | С1у |
А1а | А1а | Рго | Ьеи | 11е | Ьеи | Зег | Агд | Ьеи | Уа1 | С1у | С1у | Тгр | С1и | Суз | С1и |
20 | 25 | 30 | |||||||||||||
Ьуз | Н1з | Зег | С1п | Рго | Тгр | С1п | Уа1 | Ьеи | Уа1 | А1а | Зег | Агд | С1у | Агд | А1а |
35 | 40 | 45 | |||||||||||||
Уа1 | Суз | С1у | С1у | Уа1 | Ьеи | Уа1 | Н1з | Рго | С1п | Тгр | Уа1 | Ьеи | ТПг | А1а | А1а |
50 | 55 | 60 | |||||||||||||
Н1з | Суз | 11е | Агд | С1п | Ьуз | Зег | Уа1 | 11е | Ьеи | Ьеи | С1у | Агд | Н1з | С1п | Рго |
65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
РПе | Туг | Рго | С1и | Азр | ТПг | С1у | С1п | Уа1 | РПе | С1п | Уа1 | Зег | Н1з | Зег | РПе |
85 | 90 | 95 | |||||||||||||
Рго | Н1з | Рго | Ьеи | Туг | Азп | МеК | Зег | Ьеи | Ьеи | Ьуз | Азп | Агд | Туг | Ьеи | С1у |
100 | 105 | 110 | |||||||||||||
Рго | С1у | Азр | Азр | Зег | Зег | Н1з | Азр | Ьеи | МеК | Ьеи | Ьеи | Агд | Ьеи | Зег | С1и |
115 | 120 | 125 | |||||||||||||
Рго | А1а | С1и | Ьеи | ТПг | Азр | А1а | Уа1 | С1п | Уа1 | Ьеи | Азр | Ьеи | Рго | ТПг | С1п |
130 | 135 | 140 | |||||||||||||
С1и | Рго | А1а | Ьеи | С1у | ТПг | ТПг | Суз | Туг | А1а | Зег | С1у | Тгр | С1у | Зег | 11е |
145 | 150 | 155 | 160 | ||||||||||||
С1и | Рго | С1и | С1и | Н1з | Ьеи | ТПг | Рго | Ьуз | Ьуз | Ьеи | С1п | Суз | Уа1 | Азр | Ьеи |
165 | 170 | 175 |
- 28 027315
Н1з | Ьеи | 11е | Зег 180 | Азп | Азр | Уа1 | Суз | А1а 185 | С1п | Уа1 | Н1з | Зег | С1п 190 | Ьуз | Уа1 |
ТНг | Ьуз | РНе | МеЬ | Ьеи | Суз | А1а | С1у | Зег | Тгр | МеЬ | С1у | С1у | Ьуз | Зег | ТНг |
195 | 200 | 205 | |||||||||||||
Суз | Зег | С1у | Азр | Зег | С1у | С1у | Рго | Ьеи | Уа1 | Суз | Азр | С1у | Уа1 | Ьеи | С1п |
210 | 215 | 220 | |||||||||||||
С1у | 11е | ТНг | Зег | Тгр | С1у | Зег | С1п | Рго | Суз | А1а | Ьеи | Рго | Агд | Агд | Рго |
225 | 230 | 235 | 240 | ||||||||||||
Зег | Ьеи | Туг | ТНг | Ьуз | Уа1 | Уа1 | Агд | Туг | Агд | Ьуз | Тгр | 11е | С1п | Азр | ТНг |
245 | 250 | 255 | |||||||||||||
11е | А1а | А1а | Азп | Рго |
260 <210> 3 <211> 840 <212> ДНК <213> Искусственная последовательность <220>
<223> Последовательность нуклеиновых кислот антигена РЗА 2 <400> 3
аЬддасЬдда | саЬддаЬЬсЬ | дЬЬссЬддЬс | дссдссдсаа | сЬсдсдЬдса | ЬЬссЬдддЬс | 60 |
сЬддЬддЬдЬ | ЬссЬдасЬсЬ | дадсдЬсаса | ЬддаЬсддсд | ссдсЬссасЬ | даЬЬсЬдадс | 120 |
сдссЬддЬдд | дсдддЬддда | дЬдсдаааад | сасЬсссадс | саЬддсаддЬ | дсЬддЬсдсЬ | 180 |
ЬсЬаддддсс | дадсадЬдЬд | сддаддсдЬд | сЬддЬссасс | сЬсадЬдддЬ | ссЬдассдса | 240 |
дсссаЬЬдЬа | Ьссдасадаа | дадсдЬдаЬЬ | сЬдсЬддддс | дасассадсс | аЬЬсЬасссс | 300 |
даддасасад | дасаддЬдЬЬ | ссаддЬсЬсЬ | сасадЬЬЬЬс | сссаЬссЬсЬ | дЬасаасаЬд | 360 |
адссЬдсЬда | аааасадаЬа | ЬсЬдддассЬ | ддсдасдаЬа | дсЬсссаЬда | ЬсЬдаЬдсЬд | 420 |
сЬдаддсЬдЬ | ссдадссадс | сдаасЬдасЬ | дасдсЬдЬдс | аддЬссЬдда | ЬсЬдсссасс | 480 |
саддадссЬд | сссЬдддаас | сасаЬдЬЬаЬ | дсЬЬсаддсЬ | дддддадсаь | сдаассадад | 540 |
даасаЬсЬда | сЬсссаадаа | асЬдсадЬдс | дЬддассЬдс | ассЬдаЬЬад | ЬаасдаЬдЬд | 600 |
ЬдЬдсасадд | ЬссаЬЬсаса | дааддЬдаса | аадЬЬсаЬдс | ЬдЬдсдссдд | сЬсЬЬддаЬд | 660 |
ддсддсаадЬ | саасЬЬдсад | сддддасЬсс | ддсдддссас | ЬддЬдЬдЬда | ЬддадЬссЬд | 720 |
садддсаЬса | ссЬсЬЬдддд | садЬсадссЬ | ЬдЬдсссЬдс | сЬсддадасс | аадЬсЬдЬас | 780 |
асЬааддЬдд | ЬссддЬаЬад | даааЬддаЬЬ | саддасасЬа | ЬЬдссдсЬаа | ссссЬдаЬаа | 840 |
- 29 027315 <210> 4 <211> 278 <212> БЕЛОК <213> Искусственная последовательность <220>
<223> Последовательность аминокислот антигена РЗА 2 <400> 4
МеК 1 | Азр | Тгр | ТПг | Тгр 5 | 11е | Ьеи | РПе | Ьеи | Уа1 10 | А1а | А1а | А1а | ТПг | Агд 15 | Уа1 |
Н1з | Зег | Тгр | Уа1 | Ьеи | Уа1 | Уа1 | РПе | Ьеи | ТПг | Ьеи | Зег | Уа1 | ТПг | Тгр | 11е |
20 | 25 | 30 | |||||||||||||
С1у | А1а | А1а | Рго | Ьеи | 11е | Ьеи | Зег | Агд | Ьеи | Уа1 | С1у | С1у | Тгр | С1и | Суз |
35 | 40 | 45 | |||||||||||||
С1и | Ьуз | Н1з | Зег | С1п | Рго | Тгр | С1п | Уа1 | Ьеи | Уа1 | А1а | Зег | Агд | С1у | Агд |
50 | 55 | 60 | |||||||||||||
А1а | Уа1 | Суз | С1у | С1у | Уа1 | Ьеи | Уа1 | Н1з | Рго | С1п | Тгр | Уа1 | Ьеи | ТПг | А1а |
65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
А1а | Н1з | Суз | 11е | Агд | С1п | Ьуз | Зег | Уа1 | 11е | Ьеи | Ьеи | С1у | Агд | Н1з | С1п |
85 | 90 | 95 | |||||||||||||
Рго | РПе | Туг | Рго | С1и | Азр | ТПг | С1у | С1п | Уа1 | РПе | С1п | Уа1 | Зег | Н1з | Зег |
100 | 105 | 110 | |||||||||||||
РПе | Рго | Н1з | Рго | Ьеи | Туг | Азп | МеК | Зег | Ьеи | Ьеи | Ьуз | Азп | Агд | Туг | Ьеи |
115 | 120 | 125 | |||||||||||||
С1у | Рго | С1у | Азр | Азр | Зег | Зег | Н1з | Азр | Ьеи | МеК | Ьеи | Ьеи | Агд | Ьеи | Зег |
130 | 135 | 140 | |||||||||||||
С1и | Рго | А1а | С1и | Ьеи | ТПг | Азр | А1а | Уа1 | С1п | Уа1 | Ьеи | Азр | Ьеи | Рго | ТПг |
145 | 150 | 155 | 160 | ||||||||||||
С1п | 61и | Рго | А1а | Ьеи | С1у | ТПг | ТПг | Суз | Туг | А1а | Зег | С1у | Тгр | С1у | Зег |
165 | 170 | 175 | |||||||||||||
11е | 61и | Рго | С1и | С1и | Н1з | Ьеи | ТПг | Рго | Ьуз | Ьуз | Ьеи | С1п | Суз | Уа1 | Азр |
180 | 185 | 190 | |||||||||||||
Ьеи | Н1з | Ьеи | 11е | Зег | Азп | Азр | Уа1 | Суз | А1а | С1п | Уа1 | Н1з | Зег | С1п | Ьуз |
195 | 200 | 205 | |||||||||||||
Уа1 | ТПг | Ьуз | РПе | МеК | Ьеи | Суз | А1а | С1у | Зег | Тгр | МеК | С1у | С1у | Ьуз | Зег |
- 30 027315
210 | 215 | 220 | |||||||||||||
ТНг | Суз | Зег | С1у | Азр | Зег | С1у | С1у | Рго | Ьеи | Уа1 | Суз | Азр | С1у | Уа1 | Ьеи |
225 | 230 | 235 | 240 | ||||||||||||
С1п | С1у | 11е | ТНг | Зег | Тгр | С1у | Зег | С1п | Рго | Суз | А1а | Ьеи | Рго | Агд | Агд |
245 | 250 | 255 | |||||||||||||
Рго | Зег | Ьеи | Туг | ТНг | Ьуз | Уа1 | Уа1 | Агд | Туг | Агд | Ьуз | Тгр | 11е | С1п | Азр |
260 | 265 | 270 | |||||||||||||
ТНг | 11е | А1а | А1а | Азп | Рго |
275 <210> 5 <211> 2283 <212> ДНК <213> Искусственная последовательность <220>
<223> Последовательность нуклеиновых кислот антигена РЗМА 1
<400> 5 аЬдЬддаасд | сасЬдсаЬда | дасЬдаЬЬсЬ | дсЬдЬсдсас | Ьдддасддад | ассссддЬдд | 60 |
сЬдЬдсдсЬд | дадсасЬддЬ | дсЬддссддс | дддддаььсс | ЬдсЬдддаЬЬ | ссЬдЬЬЬддс | 120 |
ЬддЬЬЬаЬса | ааадсЬссад | сдаддсЬасс | ааЬаЬЬассс | сЬаадсасаа | Ьаадааадса | 180 |
ЬЬссЬддаЬд | аасЬдааадс | сдадаасаЬс | аадаааЬЬсс | ЬдЬасаасЬЬ | сасаадааЬЬ | 240 |
ссасаЬсЬдд | сЬддсасЬда | дсадаасЬЬс | садсЬддсаа | аасадаЬсса | дадЬсадЬдд | 300 |
ааддааЬЬЬд | ддсЬддасЬс | адЬддадсЬд | асссасЬасд | аЬдЬссЬдсЬ | дЬссЬаЬсса | 360 |
ааЬаадасЬс | аЬсссаасЬа | саЬсЬсЬаЬс | аЬЬаасдаад | асддаааЬда | даЬЬЬЬсаас | 420 |
ассЬсЬсЬдЬ | ЬЬдаассссс | Ьссасссддс | ЬаЬдадааЬд | ЬсадЬдасдЬ | ддЬсссЬсса | 480 |
ЬЬсЬсадссЬ | Ьсадссссса | ддддаЬдссЬ | дадддадаЬс | ЬддЬдЬасдЬ | сааЬЬаЬдсЬ | 540 |
адаасадаад | асЬЬсЬЬЬаа | дсЬддададд | даЬаЬдаааа | ЬсаасЬдЬЬс | сддсаадаЬс | 600 |
дЬдаЬЬдссс | ддЬасдддаа | ддЬдЬЬсада | ддаааЬаадд | Ьсааааасдс | ЬсадсЬддсс | 660 |
ддадсЬассд | дсдЬдаЬссЬ | дЬасадсдас | сссдсЬдаЬЬ | аЬЬЬЬдсасс | ЬддсдЬдаад | 720 |
ЬссЬаЬссад | асддаЬддаа | ЬсЬдсссддс | дддддадьдс | ададдддааа | саЬссЬдаас | 780 |
сЬдааЬддад | ссддсдаЬсс | ЬсЬдасЬсса | ддаЬассссд | ссаасдааЬа | сдсЬЬаЬсдс | 840 |
сддддааЬЬд | сададдссдЬ | дддссЬдссЬ | адсаЬсссад | ЬссаЬсссаЬ | ЬддсЬаЬЬас | 900 |
даЬдсссада | адсЬдсЬдда | дааааЬдддс | дддадсдсЬс | ссссЬдасЬс | ЬадЬЬддаад | 960 |
ддсЬсссЬда | аадЬдссЬЬа | сааЬдЬсддд | ссаддаЬЬса | сЬдддаасЬЬ | ЬЬсЬасссад | 1020 |
ааддЬдаааа | ЬдсасаЬсса | ЬадЬассадс | даддЬдасас | дааЬсЬасаа | сдЬсаЬЬддс | 1080 |
- 31 027315
асссЕдадад | дсдссдЕдда | дссЕдаЕсдс | ЕаЕдЕсаЕЕс | Едддаддсса | сададасЕса | 1140 |
ЕдддЕдЕЕсд | ддддааЕсда | Ессасададс | ддадсадсЕд | ЕддЕссаЕда | ааЕЕдЕдсдс | 1200 |
адсЕЕЕддда | сссЕдаадаа | ададддаЕдд | сдасссаддс | дсасааЕссЕ | дЕЕсдсаЕсс | 1260 |
Едддасдссд | аддааЕЕЕдд | дсЕдсЕдддс | адсасадааЕ | дддссдадда | аааЕЕсЕсдс | 1320 |
сЕдсЕдсадд | адсдаддддЕ | ддсЕЕасаЕс | ааЕдсадасЕ | саадсаЕЕда | аддааасЕаЕ | 1380 |
асссЕдсддд | ЕддаЕЕдсас | ассссЕдаЕд | ЕасадЕсЕдд | ЕсЕаЕаассЕ | дасаааддад | 1440 |
сЕдаааЕсас | сЕдасдаддд | сЕЕсдааддд | аааадссЕдЕ | асдааЕссЕд | дасЕдадаад | 1500 |
адсссаЕссс | ссдааЕЕсад | сддсаЕдссЕ | аддаЕсЕсЕа | адсЕдддсад | ЕдддаасдаЕ | 1560 |
ЕЕЕдаддЕдЕ | ЕсЕЕЕсадсд | ссЕдддааЕЕ | дссЕсЕддсс | дадсЕсддЕа | сасааааааЕ | 1620 |
ЕдддадасЕа | асаадЕЕсЕс | сЕсЕЕассса | сЕдЕаЕсаса | дсдЕдЕасда | дасЕЕаЕдаа | 1680 |
сЕддЕсдада | ааЕЕсЕасда | ссссасЕЕЕЕ | аадЕаЕсаЕс | ЕдассдЕддс | асаддЕсадд | 1740 |
ддсдддаЕдд | ЕдЕЕсдаасЕ | ддссааЕадс | аЕсдЕссЕдс | саЕЕЕдасЕд | ЕсдадаЕЕас | 1800 |
дсЕдЕддЕсс | ЕдсддаадЕа | сдсадасаад | аЕсЕаЕааса | ЕсЕссаЕдаа | дсасссссад | 1860 |
дадаЕдаадд | ссЕаЕЕсЕдЕ | дадЕЕЕсдаЕ | ЕсссЕдЕЕЕЕ | сЕдссдЕсаа | аааЕЕЕсасс | 1920 |
даааЕсдсЕа | дЕаадЕЕЕЕс | ададсдссЕд | саддассЕдд | аЕаадЕссаа | ЕсссаЕссЕд | 1980 |
сЕдсддаЕЕа | ЕдаасдаЕса | дсЕдаЕдЕЕс | сЕддааадад | ссЕЕЕаЕсда | сссЕсЕдддс | 2040 |
сЕдссЕдаЕа | дассаЕЕсЕа | саддсасдЕд | аЕсЕасдсас | сЕадЕЕсаса | ЕаасаадЕас | 2100 |
дссддсдадЕ | сЕЕЕсссадд | даЕсЕаЕдас | дсЕсЕдЕЕЕд | аЕаЕЕдааЕс | аааддЕддас | 2160 |
сссадсааад | саЕддддсда | ддЕсаадада | садаЕсадса | ЕЕдсадссЕЕ | ЕасадЕдсад | 2220 |
дссдссдссд | ааасссЕдЕс | сдаадЕсдсЕ | ЕасссаЕасд | аЕдЕссссда | ЕЕасдсаЕда | 2280 |
Еаа 2283 <210> 6 <211> 750 <212> БЕЛОК <213> Искусственная последовательность <220>
<223> Последовательность аминокислот антигена РЗМА 1 <400> 6
МеЕ 1 | Тгр | Азп | А1а | ^еυ 5 | Н1з | С1и | ТПг | Азр | Зег 10 | А1а | Уа1 | А1а | ^еυ | С1у 15 | Агд |
Агд | Рго | Агд | Тгр | ^еυ | Суз | А1а | С1у | А1а | ^еυ | Уа1 | ^еυ | А1а | С1у | С1у | С1у |
20 | 25 | 30 | |||||||||||||
РПе | ^еυ | ^еυ | С1у | РПе | ^еυ | РПе | С1у | Тгр | РПе | 11е | ^уз | Зег | Зег | Зег | С1и |
- 32 027315
35 | 40 | 45 | |||||||||||||
А1а | ТЬг | Азп | 11е | ТЬг | Рго | Ьуз | Н1з | Азп | Ьуз | Ьуз | А1а | РЬе | Ьеи | Азр | С1и |
50 | 55 | 60 | |||||||||||||
Ьеи | Ьуз | А1а | С1и | Азп | 11е | Ьуз | Ьуз | РЬе | Ьеи | Туг | Азп | РЬе | ТЬг | Агд | 11е |
65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
Рго | Н1з | Ьеи | А1а | С1у | ТЬг | С1и | С1п | Азп | РЬе | С1п | Ьеи | А1а | Ьуз | С1п | 11е |
85 | 90 | 95 | |||||||||||||
С1п | Зег | С1п | Тгр | Ьуз | С1и | РЬе | С1у | Ьеи | Азр | Зег | Уа1 | С1и | Ьеи | ТЬг | Н1з |
100 | 105 | 110 | |||||||||||||
Туг | Азр | Уа1 | Ьеи | Ьеи | Зег | Туг | Рго | Азп | Ьуз | ТЬг | Н1з | Рго | Азп | Туг | 11е |
115 | 120 | 125 | |||||||||||||
Зег | 11е | 11е | Азп | С1и | Азр | С1у | Азп | С1и | 11е | РЬе | Азп | ТЬг | Зег | Ьеи | РЬе |
130 | 135 | 140 | |||||||||||||
С1и | Рго | Рго | Рго | Рго | С1у | Туг | С1и | Азп | Уа1 | Зег | Азр | Уа1 | Уа1 | Рго | Рго |
145 | 150 | 155 | 160 | ||||||||||||
РЬе | Зег | А1а | РЬе | Зег | Рго | С1п | С1у | МеЬ | Рго | С1и | С1у | Азр | Ьеи | Уа1 | Туг |
165 | 170 | 175 | |||||||||||||
ναι | Азп | Туг | А1а | Агд | ТЬг | С1и | Азр | РЬе | РЬе | Ьуз | Ьеи | С1и | Агд | Азр | МеЬ |
180 | 185 | 190 | |||||||||||||
Ьуз | 11е | Азп | Суз | Зег | С1у | Ьуз | 11е | Уа1 | 11е | А1а | Агд | Туг | С1у | Ьуз | Уа1 |
195 | 200 | 205 | |||||||||||||
РЬе | Агд | С1у | Азп | Ьуз | Уа1 | Ьуз | Азп | А1а | С1п | Ьеи | А1а | С1у | А1а | ТЬг | С1у |
210 | 215 | 220 | |||||||||||||
ναι | 11е | Ьеи | Туг | Зег | Азр | Рго | А1а | Азр | Туг | РЬе | А1а | Рго | С1у | Уа1 | Ьуз |
225 | 230 | 235 | 240 | ||||||||||||
Зег | Туг | Рго | Азр | С1у | Тгр | Азп | Ьеи | Рго | С1у | С1у | С1у | Уа1 | С1п | Агд | С1у |
245 | 250 | 255 | |||||||||||||
Азп | 11е | Ьеи | Азп | Ьеи | Азп | С1у | А1а | С1у | Азр | Рго | Ьеи | ТЬг | Рго | С1у | Туг |
260 | 265 | 270 | |||||||||||||
Рго | А1а | Азп | С1и | Туг | А1а | Туг | Агд | Агд | С1у | 11е | А1а | С1и | А1а | Уа1 | С1у |
275 | 280 | 285 |
- 33 027315
Ьеи | Рго 290 | Зег | 11е | Рго | Уа1 | Н1з 295 | Рго | 11е | С1у | Туг | Туг 300 | Азр | А1а | С1п | Ьуз |
Ьеи | Ьеи | С1и | Ьуз | МеЬ | С1у | С1у | Зег | А1а | Рго | Рго | Азр | Зег | Зег | Тгр | Ьуз |
305 | 310 | 315 | 320 | ||||||||||||
С1у | Зег | Ьеи | Ьуз | Уа1 | Рго | Туг | Азп | Уа1 | С1у | Рго | С1у | РЕе | ТЕг | С1у | Азп |
325 | 330 | 335 | |||||||||||||
РЕе | Зег | ТЕг | С1п | Ьуз | Уа1 | Ьуз | МеЬ | Н1з | 11е | Н1з | Зег | ТЕг | Зег | С1и | Уа1 |
340 | 345 | 350 | |||||||||||||
ТЕг | Агд | 11е | Туг | Азп | Уа1 | 11е | С1у | ТЕг | Ьеи | Агд | С1у | А1а | Уа1 | С1и | Рго |
355 | 360 | 365 | |||||||||||||
Азр | Агд | Туг | Уа1 | 11е | Ьеи | С1у | С1у | Н1з | Агд | Азр | Зег | Тгр | Уа1 | РЕе | С1у |
370 | 375 | 380 | |||||||||||||
С1у | 11е | Азр | Рго | С1п | Зег | С1у | А1а | А1а | Уа1 | Уа1 | Н1з | С1и | 11е | Уа1 | Агд |
385 | 390 | 395 | 400 | ||||||||||||
Зег | РЕе | С1у | ТЕг | Ьеи | Ьуз | Ьуз | С1и | С1у | Тгр | Агд | Рго | Агд | Агд | ТЕг | 11е |
405 | 410 | 415 | |||||||||||||
Ьеи | РЕе | А1а | Зег | Тгр | Азр | А1а | С1и | С1и | РЕе | С1у | Ьеи | Ьеи | С1у | Зег | ТЕг |
420 | 425 | 430 | |||||||||||||
С1и | Тгр | А1а | С1и | С1и | Азп | Зег | Агд | Ьеи | Ьеи | С1п | С1и | Агд | С1у | Уа1 | А1а |
435 | 440 | 445 | |||||||||||||
Туг | 11е | Азп | А1а | Азр | Зег | Зег | 11е | С1и | С1у | Азп | Туг | ТЕг | Ьеи | Агд | Уа1 |
450 | 455 | 460 | |||||||||||||
Лзр | Суз | ТЕг | Рго | Ьеи | МеЬ | Туг | Зег | Ьеи | Уа1 | Туг | Азп | Ьеи | ТЕг | Ьуз | С1и |
465 | 470 | 475 | 480 | ||||||||||||
Ьеи | Ьуз | Зег | Рго | Азр | С1и | С1у | РЕе | С1и | С1у | Ьуз | Зег | Ьеи | Туг | С1и | Зег |
485 | 490 | 495 | |||||||||||||
Тгр | ТЕг | С1и | Ьуз | Зег | Рго | Зег | Рго | С1и | РЕе | Зег | С1у | МеЬ | Рго | Агд | 11е |
500 | 505 | 510 | |||||||||||||
Зег | Ьуз | Ьеи | С1у | Зег | С1у | Азп | Азр | РЕе | С1и | Уа1 | РЕе | РЕе | С1п | Агд | Ьеи |
515 | 520 | 525 | |||||||||||||
С1у | 11е | А1а | Зег | С1у | Агд | А1а | Агд | Туг | ТЕг | Ьуз | Азп | Тгр | С1и | ТЕг | Азп |
530 | 535 | 540 | |||||||||||||
Ьуз | РЕе | Зег | Зег | Туг | Рго | Ьеи | Туг | Н1з | Зег | Уа1 | Туг | С1и | ТЕг | Туг | С1и |
545 | 550 | 555 | 560 |
- 34 027315
Ьеи | ναι | С1и | Ьуз | РНе 565 | Туг | Азр | Рго | ТНг | РНе 570 | Ьуз | Туг | Н1з | Ьеи | ТНг 575 | Уа1 |
А1а | С1п | ναι | Агд | С1у | С1у | МеК | Уа1 | РНе | С1и | Ьеи | А1а | Азп | Зег | 11е | Уа1 |
580 | 585 | 590 | |||||||||||||
Ьеи | Рго | РНе | Азр | Суз | Агд | Азр | Туг | А1а | Уа1 | Уа1 | Ьеи | Агд | Ьуз | Туг | А1а |
595 | 600 | 605 | |||||||||||||
Азр | Ьуз | 11е | Туг | Азп | 11е | Зег | МеК | Ьуз | Н1з | Рго | С1п | С1и | МеК | Ьуз | А1а |
610 | 615 | 620 | |||||||||||||
Туг | Зег | Уа1 | Зег | РНе | Азр | Зег | Ьеи | РНе | Зег | А1а | Уа1 | Ьуз | Азп | РНе | ТНг |
625 | 630 | 635 | 640 | ||||||||||||
С1и | 11е | А1а | Зег | Ьуз | РНе | Зег | С1и | Агд | Ьеи | С1п | Азр | Ьеи | Азр | Ьуз | Зег |
645 | 650 | 655 | |||||||||||||
Азп | Рго | 11е | Ьеи | Ьеи | Агд | 11е | МеК | Азп | Азр | С1п | Ьеи | МеК | РНе | Ьеи | С1и |
660 | 665 | 670 | |||||||||||||
Агд | А1а | РНе | 11е | Азр | Рго | Ьеи | С1у | Ьеи | Рго | Азр | Агд | Рго | РНе | Туг | Агд |
675 | 680 | 685 | |||||||||||||
Н1з | ναι | 11е | Туг | А1а | Рго | Зег | Зег | Н1з | Азп | Ьуз | Туг | А1а | С1у | С1и | Зег |
690 | 695 | 700 | |||||||||||||
РНе | Рго | С1у | 11е | Туг | Азр | А1а | Ьеи | РНе | Азр | 11е | С1и | Зег | Ьуз | Уа1 | Азр |
705 | 710 | 715 | 720 | ||||||||||||
Рго | Зег | Ьуз | А1а | Тгр | С1у | С1и | Уа1 | Ьуз | Агд | С1п | 11е | Зег | 11е | А1а | А1а |
725 | 730 | 735 | |||||||||||||
РНе | ТНг | Уа1 | С1п | А1а | А1а | А1а | С1и | ТНг | Ьеи | Зег | С1и | Уа1 | А1а | ||
740 | 745 | 750 |
<210> 7 <211> 2334 <212> ДНК <213> Искусственная последовательность <220>
<223> Последовательность нуклеиновых кислот антигена РЗМА 2 <400> 7 аКддасКдда саКддаККсК дККссКддКс дссдссдсаа сКсдсдКдса ККссКддаас дсасКдсаКд адасКдаККс КдсКдКсдса сКдддасдда дассссддКд дсКдКдсдсК
120
- 35 027315
ддадсасЕдд | ЕдсЕддссдд | сдддддаЕЕс | сЕдсЕдддаЕ | ЕссЕдЕЕЕдд | сЕддЕЕЕаЕс | 180 |
аааадсЕсса | дсдаддсЕас | сааЕаЕЕасс | ссЕаадсаса | аЕаадааадс | аЕЕссЕддаЕ | 240 |
даасЕдааад | ссдадаасаЕ | саадаааЕЕс | сЕдЕасаасЕ | ЕсасаадааЕ | ЕссасаЕсЕд | 300 |
дсЕддсасЕд | адсадаасЕЕ | ссадсЕддса | ааасадаЕсс | ададЕсадЕд | дааддааЕЕЕ | 360 |
дддсЕддасЕ | садЕддадсЕ | дасссасЕас | даЕдЕссЕдс | ЕдЕссЕаЕсс | аааЕаадасЕ | 420 |
саЕсссаасЕ | асаЕсЕсЕаЕ | саЕЕаасдаа | дасддаааЕд | адаЕЕЕЕсаа | сассЕсЕсЕд | 480 |
ЕЕЕдаасссс | сЕссасссдд | сЕаЕдадааЕ | дЕсадЕдасд | ЕддЕсссЕсс | аЕЕсЕсадсс | 540 |
ЕЕсадссссс | аддддаЕдсс | ЕдадддадаЕ | сЕддЕдЕасд | ЕсааЕЕаЕдс | Еадаасадаа | 600 |
дасЕЕсЕЕЕа | адсЕддадад | ддаЕаЕдааа | аЕсаасЕдЕЕ | ссддсаадаЕ | сдЕдаЕЕдсс | 660 |
сддЕасддда | аддЕдЕЕсад | аддаааЕаад | дЕсааааасд | сЕсадсЕддс | сддадсЕасс | 720 |
ддсдЕдаЕсс | ЕдЕасадсда | ссссдсЕдаЕ | ЕаЕЕЕЕдсас | сЕддсдЕдаа | дЕссЕаЕсса | 780 |
дасддаЕдда | аЕсЕдсссдд | сдддддадЕд | сададдддаа | асаЕссЕдаа | ссЕдааЕдда | 840 |
дссддсдаЕс | сЕсЕдасЕсс | аддаЕасссс | дссаасдааЕ | асдсЕЕаЕсд | ссддддааЕЕ | 900 |
дсададдссд | ЕдддссЕдсс | ЕадсаЕссса | дЕссаЕссса | ЕЕддсЕаЕЕа | сдаЕдсссад | 960 |
аадсЕдсЕдд | адааааЕддд | сдддадсдсЕ | сссссЕдасЕ | сЕадЕЕддаа | дддсЕсссЕд | 1020 |
ааадЕдссЕЕ | асааЕдЕсдд | дссаддаЕЕс | асЕдддаасЕ | ЕЕЕсЕассса | дааддЕдааа | 1080 |
аЕдсасаЕсс | аЕадЕассад | сдаддЕдаса | сдааЕсЕаса | асдЕсаЕЕдд | сасссЕдада | 1140 |
ддсдссдЕдд | адссЕдаЕсд | сЕаЕдЕсаЕЕ | сЕдддаддсс | асададасЕс | аЕдддЕдЕЕс | 1200 |
дддддааЕсд | аЕссасадад | сддадсадсЕ | дЕддЕссаЕд | аааЕЕдЕдсд | садсЕЕЕддд | 1260 |
асссЕдаада | аададддаЕд | дсдасссадд | сдсасааЕсс | ЕдЕЕсдсаЕс | сЕдддасдсс | 1320 |
даддааЕЕЕд | ддсЕдсЕддд | садсасадаа | Едддссдадд | ааааЕЕсЕсд | ссЕдсЕдсад | 1380 |
дадсдадддд | ЕддсЕЕасаЕ | сааЕдсадас | ЕсаадсаЕЕд | ааддааасЕа | ЕасссЕдсдд | 1440 |
дЕддаЕЕдса | сассссЕдаЕ | дЕасадЕсЕд | дЕсЕаЕаасс | Едасааадда | дсЕдаааЕса | 1500 |
ссЕдасдадд | дсЕЕсдаадд | даааадссЕд | ЕасдааЕссЕ | ддасЕдадаа | дадсссаЕсс | 1560 |
сссдааЕЕса | дсддсаЕдсс | ЕаддаЕсЕсЕ | аадсЕдддса | дЕдддаасда | ЕЕЕЕдаддЕд | 1620 |
ЕЕсЕЕЕсадс | дссЕдддааЕ | ЕдссЕсЕддс | сдадсЕсддЕ | асасаааааа | ЕЕдддадасЕ | 1680 |
аасаадЕЕсЕ | ссЕсЕЕассс | асЕдЕаЕсас | адсдЕдЕасд | адасЕЕаЕда | асЕддЕсдад | 1740 |
аааЕЕсЕасд | ассссасЕЕЕ | ЕаадЕаЕсаЕ | сЕдассдЕдд | сасаддЕсад | дддсдддаЕд | 1800 |
дЕдЕЕсдаас | ЕддссааЕад | саЕсдЕссЕд | ссаЕЕЕдасЕ | дЕсдадаЕЕа | сдсЕдЕддЕс | 1860 |
сЕдсддаадЕ | асдсадасаа | даЕсЕаЕаас | аЕсЕссаЕда | адсассссса | ддадаЕдаад | 1920 |
дссЕаЕЕсЕд | ЕдадЕЕЕсда | ЕЕсссЕдЕЕЕ | ЕсЕдссдЕса | ааааЕЕЕсас | сдаааЕсдсЕ | 1980 |
адЕаадЕЕЕЕ | сададсдссЕ | дсаддассЕд | даЕаадЕсса | аЕсссаЕссЕ | дсЕдсддаЕЕ | 2040 |
- 36 027315
аКдаасдаКс | адсКдаКдКК | ссКддааада | дссКККаКсд | асссКсКддд | ссКдссКдаК | 2100 |
адассаККсК | асаддсасдК | даКсКасдса | ссКадККсас | аКаасаадКа | сдссддсдад | 2160 |
КсКККсссад | ддаКсКаКда | сдсКсКдККК | даКаККдааК | саааддКдда | ссссадсааа | 2220 |
дсаКддддсд | аддКсаадад | асадаКсадс | аККдсадссК | ККасадКдса | ддссдссдсс | 2280 |
дааасссКдК | ссдаадКсдс | ККасссаКас | даКдКссссд | аККасдсаКд | аКаа | 2334 |
<210> 8 <211> 766 <212> БЕЛОК <213> Искусственная последовательность <220>
<223> Последовательность аминокислот антигена РЗМА 2 <400> 8
МеК 1 | Азр | Тгр | ТПг | Тгр 5 | 11е | Ьеи | РПе | Ьеи | Уа1 10 | А1а | А1а | А1а | ТПг | Агд 15 | Уа1 |
Н1з | Зег | Тгр | Азп | А1а | Ьеи | Н1з | С1и | ТПг | Азр | Зег | А1а | Уа1 | А1а | Ьеи | С1у |
20 | 25 | 30 | |||||||||||||
Агд | Агд | Рго | Агд | Тгр | Ьеи | Суз | А1а | С1у | А1а | Ьеи | Уа1 | Ьеи | А1а | С1у | С1у |
35 | 40 | 45 | |||||||||||||
С1у | РПе | Ьеи | Ьеи | С1у | РПе | Ьеи | РПе | С1у | Тгр | РПе | 11е | Ьуз | Зег | Зег | Зег |
50 | 55 | 60 | |||||||||||||
С1и | А1а | ТПг | Азп | 11е | ТПг | Рго | Ьуз | Н1з | Азп | Ьуз | Ьуз | А1а | РПе | Ьеи | Азр |
65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
С1и | Ьеи | Ьуз | А1а | С1и | Азп | 11е | Ьуз | Ьуз | РПе | Ьеи | Туг | Азп | РПе | ТПг | Агд |
85 | 90 | 95 | |||||||||||||
11е | Рго | Н1з | Ьеи | А1а | С1у | ТПг | С1и | С1п | Азп | РПе | С1п | Ьеи | А1а | Ьуз | С1п |
100 | 105 | 110 | |||||||||||||
11е | С1п | Зег | С1п | Тгр | Ьуз | С1и | РПе | С1у | Ьеи | Азр | Зег | Уа1 | С1и | Ьеи | ТПг |
115 | 120 | 125 | |||||||||||||
Н1з | Туг | Азр | Уа1 | Ьеи | Ьеи | Зег | Туг | Рго | Азп | Ьуз | ТПг | Н1з | Рго | Азп | Туг |
130 | 135 | 140 | |||||||||||||
11е | Зег | 11е | 11е | Азп | С1и | Азр | С1у | Азп | С1и | 11е | РПе | Азп | ТПг | Зег | Ьеи |
145 | 150 | 155 | 160 | ||||||||||||
РПе | С1и | Рго | Рго | Рго | Рго | С1у | Туг | С1и | Азп | Уа1 | Зег | Азр | Уа1 | Уа1 | Рго |
- 37 027315
165 170 175
Рго | РЬе | Зег | А1а 180 | РЬе | Зег | Рго | С1п | С1у 185 | МеЬ | Рго | С1и | С1у | Азр 190 | Ьеи | Уа1 |
Туг | Уа1 | Азп | Туг | А1а | Агд | ТЬг | С1и | Азр | РЬе | РЬе | Ьуз | Ьеи | С1и | Агд | Азр |
195 | 200 | 205 | |||||||||||||
МеЬ | Ьуз | 11е | Азп | Суз | Зег | С1у | Ьуз | 11е | Уа1 | 11е | А1а | Агд | Туг | С1у | Ьуз |
210 | 215 | 220 | |||||||||||||
ναι | РЬе | Агд | С1у | Азп | Ьуз | Уа1 | Ьуз | Азп | А1а | С1п | Ьеи | А1а | С1у | А1а | ТЬг |
225 | 230 | 235 | 240 | ||||||||||||
С1у | Уа1 | 11е | Ьеи | Туг | Зег | Азр | Рго | А1а | Азр | Туг | РЬе | А1а | Рго | С1у | Уа1 |
245 | 250 | 255 | |||||||||||||
Ьуз | Зег | Туг | Рго | Азр | С1у | Тгр | Азп | Ьеи | Рго | С1у | С1у | С1у | Уа1 | С1п | Агд |
260 | 265 | 270 | |||||||||||||
С1у | Азп | 11е | Ьеи | Азп | Ьеи | Азп | С1у | А1а | С1у | Азр | Рго | Ьеи | ТЬг | Рго | С1у |
275 | 280 | 285 | |||||||||||||
Туг | Рго | А1а | Азп | С1и | Туг | А1а | Туг | Агд | Агд | С1у | 11е | А1а | С1и | А1а | Уа1 |
290 | 295 | 300 | |||||||||||||
С1у | Ьеи | Рго | Зег | 11е | Рго | Уа1 | Н1з | Рго | 11е | С1у | Туг | Туг | Азр | А1а | С1п |
305 | 310 | 315 | 320 | ||||||||||||
Ьуз | Ьеи | Ьеи | С1и | Ьуз | МеЬ | С1у | С1у | Зег | А1а | Рго | Рго | Азр | Зег | Зег | Тгр |
325 | 330 | 335 | |||||||||||||
Ьуз | С1у | Зег | Ьеи | Ьуз | Уа1 | Рго | Туг | Азп | Уа1 | С1у | Рго | С1у | РЬе | ТЬг | С1у |
340 | 345 | 350 | |||||||||||||
Азп | РЬе | Зег | ТЬг | С1п | Ьуз | Уа1 | Ьуз | МеЬ | Н1з | 11е | Н1з | Зег | ТЬг | Зег | С1и |
355 | 360 | 365 | |||||||||||||
ναι | ТЬг | Агд | 11е | Туг | Азп | Уа1 | 11е | С1у | ТЬг | Ьеи | Агд | С1у | А1а | Уа1 | С1и |
370 | 375 | 380 | |||||||||||||
Рго | Азр | Агд | Туг | Уа1 | 11е | Ьеи | С1у | С1у | Н1з | Агд | Азр | Зег | Тгр | Уа1 | РЬе |
385 | 390 | 395 | 400 | ||||||||||||
С1у | С1у | 11е | Азр | Рго | С1п | Зег | С1у | А1а | А1а | Уа1 | Уа1 | Н1з | С1и | 11е | Уа1 |
405 | 410 | 415 | |||||||||||||
Агд | Зег | РЬе | С1у | ТЬг | Ьеи | Ьуз | Ьуз | С1и | С1у | Тгр | Агд | Рго | Агд | Агд | ТЬг |
420 | 425 | 430 |
- 38 027315
11е | ^еυ | РПе 435 | А1а | Зег | Тгр | Азр | А1а 440 | С1и | С1и | РПе | С1у | ^еυ 445 | ^еυ | С1у | Зег |
ТПг | С1и | Тгр | А1а | С1и | С1и | Азп | Зег | Агд | ^еυ | ^еυ | С1п | С1и | Агд | С1у | Уа1 |
450 | 455 | 460 | |||||||||||||
А1а | Туг | 11е | Азп | А1а | Азр | Зег | Зег | 11е | С1и | С1у | Азп | Туг | ТПг | ^еυ | Агд |
465 | 470 | 475 | 480 | ||||||||||||
Уа1 | Азр | Суз | ТПг | Рго | ^еυ | МеЕ | Туг | Зег | ^еυ | Уа1 | Туг | Азп | ^еυ | ТПг | ^уз |
485 | 490 | 495 | |||||||||||||
С1и | ^еυ | ^уз | Зег | Рго | Азр | С1и | С1у | РПе | С1и | С1у | ^уз | Зег | ^еυ | Туг | С1и |
500 | 505 | 510 | |||||||||||||
Зег | Тгр | ТПг | С1и | ^уз | Зег | Рго | Зег | Рго | С1и | РПе | Зег | С1у | МеЕ | Рго | Агд |
515 | 520 | 525 | |||||||||||||
11е | Зег | ^уз | ^еυ | С1у | Зег | С1у | Азп | Азр | РПе | С1и | Уа1 | РПе | РПе | С1п | Агд |
530 | 535 | 540 | |||||||||||||
^еυ | С1у | 11е | А1а | Зег | С1у | Агд | А1а | Агд | Туг | ТПг | ^уз | Азп | Тгр | С1и | ТПг |
545 | 550 | 555 | 560 | ||||||||||||
Азп | ^уз | РПе | Зег | Зег | Туг | Рго | ^еυ | Туг | Н1з | Зег | Уа1 | Туг | С1и | ТПг | Туг |
565 | 570 | 575 | |||||||||||||
С1и | ^еυ | Уа1 | С1и | ^уз | РПе | Туг | Азр | Рго | ТПг | РПе | ^уз | Туг | Н1з | ^еυ | ТПг |
580 | 585 | 590 | |||||||||||||
Уа1 | А1а | С1п | Уа1 | Агд | С1у | С1у | МеЕ | Уа1 | РПе | С1и | ^еυ | А1а | Азп | Зег | 11е |
595 | 600 | 605 | |||||||||||||
Уа1 | ^еυ | Рго | РПе | Азр | Суз | Агд | Азр | Туг | А1а | Уа1 | Уа1 | ^еυ | Агд | ^уз | Туг |
610 | 615 | 620 | |||||||||||||
А1а | Азр | ^уз | 11е | Туг | Азп | 11е | Зег | МеЕ | ^уз | Н1з | Рго | С1п | С1и | МеЕ | ^уз |
625 | 630 | 635 | 640 | ||||||||||||
А1а | Туг | Зег | Уа1 | Зег | РПе | Азр | Зег | ^еυ | РПе | Зег | А1а | Уа1 | ^уз | Азп | РПе |
645 | 650 | 655 | |||||||||||||
ТПг | С1и | 11е | А1а | Зег | ^уз | РПе | Зег | С1и | Агд | ^еυ | С1п | Азр | ^еυ | Азр | ^уз |
660 | 665 | 670 | |||||||||||||
Зег | Азп | Рго | 11е | ^еυ | ^еυ | Агд | 11е | МеЕ | Азп | Азр | С1п | ^еυ | МеЕ | РПе | ^еυ |
- 39 027315
675 | 680 | 685 | |||||||||||||
С1и | Агд | А1а | РНе | 11е | Азр | Рго | Ьеи | С1у | Ьеи | Рго | Азр | Агд | Рго | РНе | Туг |
690 | 695 | 700 | |||||||||||||
Агд | Н1з | Уа1 | 11е | Туг | А1а | Рго | Зег | Зег | Н1з | Азп | Ьуз | Туг | А1а | С1у | С1и |
705 | 710 | 715 | 720 | ||||||||||||
Зег | РНе | Рго | С1у | 11е | Туг | Азр | А1а | Ьеи | РНе | Азр | 11е | С1и | Зег | Ьуз | Уа1 |
725 | 730 | 735 | |||||||||||||
Азр | Рго | Зег | Ьуз | А1а | Тгр | С1у | С1и | Уа1 | Ьуз | Агд | С1п | 11е | Зег | 11е | А1а |
740 | 745 | 750 | |||||||||||||
А1а | РНе | ТНг | Уа1 | С1п | А1а | А1а | А1а | С1и | ТНг | Ьеи | Зег | С1и | Уа1 | А1а | |
755 | 760 | 765 |
<210> 9 <211> 1023 <212> ДНК <213> Искусственная последовательность <220>
<223> Последовательность нуклеиновых кислот антигена ЗТЕАР 1
<400> 9 аКддададсс | дсааддасаК | сасаааКсад | даададсКдК | ддаадаКдаа | ассасддада | 60 |
аассКддадд | аадасдаККа | ссКдсасаад | дасассддсд | ааасаадКаК | дсКдаааада | 120 |
ссадКдсКдс | КдсассКдса | КсадасКдсК | саКдсадасд | адКККдаККд | ссссКсКдаа | 180 |
сКдсадсаса | сссаддадсК | дККсссасад | КддсаКсКдс | ссаКсаадаК | КдссдсКаКс | 240 |
аККдсККсас | КдасаКККсК | дКаКасКсКд | сКдададаад | КдаКссассс | КсКддссасс | 300 |
адссаКсадс | адКасККсКа | КаадаКсссК | аККсКддКса | КсаасааддК | ссКдссааКд | 360 |
дКдадсаКса | сасКдсКддс | ссКддКсКас | сКдссКддсд | КдаКсдсадс | саККдКссад | 420 |
сКдсасаасд | даасааадКа | саадаадККс | ссасаККддс | КддаКаадКд | даКдсКдасК | 480 |
аддааасадК | КсдддсКдсК | дКссККсККК | ККсдссдКдс | КдсасдсКаК | сКасадссКд | 540 |
КссКаКссса | КдаддсдсКс | ККассдаКаК | аадсКдсКда | асКдддсККа | ссадсаддКд | 600 |
садсадааса | аддаддасдс | аКддаККдаа | сасдаКдКдК | ддсддаКдда | ааКсКаКдКд | 660 |
КсКсКдддса | ККдКсдддсК | ддссаКссКд | дсКсКдсКдд | садКдассад | КаКсссККсК | 720 |
дКсадКдасК | сасКдасаКд | дсдсдадККК | сасКасаККс | ададсаадсК | дддааКсдКд | 780 |
КсссКдсКдс | КдддсассаК | ссаКдсасКд | аКККККдссК | ддааКаадКд | даКсдаКаКс | 840 |
аадсадККсд | КдКддКаКас | КсссссКасс | КККаКдаККд | ссдКсККссК | дсссаКсдКд | 900 |
дКссКдаККК | ККаадКссаК | ссКдККссКд | ссККдКсКдс | дааадааааК | ссКдааааКс | 960 |
- 40 027315 сдасаЕдддЕ дддаадасдЕ дасаааааЕс ааЕаадассд аааЕсЕсаад ссадсЕдЕда
Еаа
1020
1023 <210> 10 <211> 339 <212> БЕЛОК <213> Искусственная последовательность <220>
<223> Последовательность аминокислот антигена ЗТЕАР 1 <400> 10
МеЕ 1 | С1и | Зег | Агд | Ьуз 5 | Азр | 11е | ТПг | Азп | С1п 10 | С1и | С1и | Ьеи | Тгр | Ьуз 15 | МеЕ |
Ьуз | Рго | Агд | Агд | Азп | Ьеи | С1и | С1и | Азр | Азр | Туг | Ьеи | Н1з | Ьуз | Азр | ТПг |
20 | 25 | 30 | |||||||||||||
С1у | С1и | ТПг | Зег | МеЕ | Ьеи | Ьуз | Агд | Рго | Уа1 | Ьеи | Ьеи | Н1з | Ьеи | Н1з | С1п |
35 | 40 | 45 | |||||||||||||
ТПг | А1а | Н1з | А1а | Азр | С1и | РПе | Азр | Суз | Рго | Зег | С1и | Ьеи | С1п | Н1з | ТПг |
50 | 55 | 60 | |||||||||||||
С1п | С1и | Ьеи | РПе | Рго | С1п | Тгр | Н1з | Ьеи | Рго | 11е | Ьуз | 11е | А1а | А1а | 11е |
65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
11е | А1а | Зег | Ьеи | ТПг | РПе | Ьеи | Туг | ТПг | Ьеи | Ьеи | Агд | С1и | Уа1 | 11е | Н1з |
85 | 90 | 95 | |||||||||||||
Рго | Ьеи | А1а | ТПг | Зег | Н1з | С1п | С1п | Туг | РПе | Туг | Ьуз | 11е | Рго | 11е | Ьеи |
100 | 105 | 110 | |||||||||||||
Уа1 | 11е | Азп | Ьуз | Уа1 | Ьеи | Рго | МеЕ | Уа1 | Зег | 11е | ТПг | Ьеи | Ьеи | А1а | Ьеи |
115 | 120 | 125 | |||||||||||||
Уа1 | Туг | Ьеи | Рго | С1у | Уа1 | 11е | А1а | А1а | 11е | Уа1 | С1п | Ьеи | Н1з | Азп | С1у |
130 | 135 | 140 | |||||||||||||
ТПг | Ьуз | Туг | Ьуз | Ьуз | РПе | Рго | Н1з | Тгр | Ьеи | Азр | Ьуз | Тгр | МеЕ | Ьеи | ТПг |
145 | 150 | 155 | 160 | ||||||||||||
Агд | Ьуз | С1п | РПе | С1у | Ьеи | Ьеи | Зег | РПе | РПе | РПе | А1а | Уа1 | Ьеи | Н1з | А1а |
165 | 170 | 175 | |||||||||||||
11е | Туг | Зег | Ьеи | Зег | Туг | Рго | МеЕ | Агд | Агд | Зег | Туг | Агд | Туг | Ьуз | Ьеи |
180 | 185 | 190 |
- 41 027315
Ьеи | Азп | Тгр 195 | А1а | Туг | С1п | С1п | Уа1 200 | С1п | С1п | Азп | Ьуз | С1и 205 | Азр | А1а | Тгр |
11е | С1и | Н1з | Азр | Уа1 | Тгр | Агд | МеК | С1и | 11е | Туг | Уа1 | Зег | Ьеи | С1у | 11е |
210 | 215 | 220 | |||||||||||||
Уа1 | С1у | Ьеи | А1а | 11е | Ьеи | А1а | Ьеи | Ьеи | А1а | Уа1 | ТНг | Зег | 11е | Рго | Зег |
225 | 230 | 235 | 240 | ||||||||||||
Уа1 | Зег | Азр | Зег | Ьеи | ТНг | Тгр | Агд | С1и | РНе | Н1з | Туг | 11е | С1п | Зег | Ьуз |
245 | 250 | 255 | |||||||||||||
Ьеи | С1у | 11е | Уа1 | Зег | Ьеи | Ьеи | Ьеи | С1у | ТНг | 11е | Н1з | А1а | Ьеи | 11е | РНе |
260 | 265 | 270 | |||||||||||||
А1а | Тгр | Азп | Ьуз | Тгр | 11е | Азр | 11е | Ьуз | С1п | РНе | Уа1 | Тгр | Туг | ТНг | Рго |
275 | 280 | 285 | |||||||||||||
Рго | ТНг | РНе | МеК | 11е | А1а | Уа1 | РНе | Ьеи | Рго | 11е | Уа1 | Уа1 | Ьеи | 11е | РНе |
290 | 295 | 300 | |||||||||||||
Ьуз | Зег | 11е | Ьеи | РНе | Ьеи | Рго | Суз | Ьеи | Агд | Ьуз | Ьуз | 11е | Ьеи | Ьуз | 11е |
305 | 310 | 315 | 320 | ||||||||||||
Агд | Н1з | С1у | Тгр | С1и | Азр | Уа1 | ТНг | Ьуз | 11е | Азп | Ьуз | ТНг | С1и | 11е | Зег |
325 | 330 | 335 |
Зег С1п Ьеи <210> 11 <211> 1074 <212> ДНК <213> Искусственная последовательность <220>
<223> Последовательность нуклеиновых кислот антигена ЗТЕАР 2 <400> 11
аКддасКдда | саКддаККсК | дКККсКддКс | дсКдссдсаа | сссдсдКдса | ККсадададс | 60 |
сдсааддаса | КсасаааКса | ддаададсКд | КддаадаКда | аассасддад | ааассКддад | 120 |
даадасдаКК | ассКдсасаа | ддасассддс | дааасаадКа | КдсКдаааад | ассадКдсКд | 180 |
сКдсассКдс | аКсадасКдс | КсаКдсадас | дадКККдаКК | дссссКсКда | асКдсадсас | 240 |
асссаддадс | КдККсссаса | дКддсаКсКд | сссаКсаада | ККдссдсКаК | саККдсККса | 300 |
сКдасаКККс | КдКаКасКсК | дсКдададаа | дКдаКссасс | сКсКддссас | садссаКсад | 360 |
садКасККсК | аКаадаКссс | КаККсКддКс | аКсаасаадд | КссКдссааК | ддКдадсаКс | 420 |
- 42 027315
асасЕрсЕрр | сссЕддЕсЕа | ссЕдссЕддс | дЕдаЕсдсад | ссаЕЕдЕсса | дсЕдсасаас | 480 |
рраасааарЕ | асаадаадЕЕ | сссасаЕЕдд | сЕддаЕаадЕ | ддаЕдсЕдас | Еаддааасад | 540 |
ЕЕсдддсЕдс | ЕдЕссЕЕсЕЕ | ЕЕЕсдссдЕд | сЕдсасдсЕа | ЕсЕасадссЕ | дЕссЕаЕссс | 600 |
аЕдаддсдсЕ | сЕЕассдаЕа | ЕаадсЕдсЕд | аасЕдддсЕЕ | ассадсаддЕ | дсадсадаас | 660 |
ааддаддасд | саЕддаЕЕда | асасдаЕдЕд | ЕддсддаЕдд | аааЕсЕаЕдЕ | дЕсЕсЕдддс | 720 |
аЕЕдЕсдддс | ЕддссаЕссЕ | ддсЕсЕдсЕд | дсадЕдасса | дЕаЕсссЕЕс | ЕдЕсадЕдас | 780 |
ЕсасЕдасаЕ | ддсдсдадЕЕ | ЕсасЕасаЕЕ | сададсаадс | ЕдддааЕсдЕ | дЕсссЕдсЕд | 840 |
сЕдддсасса | ЕссаЕдсасЕ | даЕЕЕЕЕдсс | ЕддааЕаадЕ | ддаЕсдаЕаЕ | саадсадЕЕс | 900 |
дЕдЕддЕаЕа | сЕсссссЕас | сЕЕЕаЕдаЕЕ | дссдЕсЕЕсс | ЕдсссаЕсдЕ | ддЕссЕдаЕЕ | 960 |
ЕЕЕаадЕсса | ЕссЕдЕЕссЕ | дссЕЕдЕсЕд | сдааадаааа | ЕссЕдааааЕ | ссдасаЕддд | 1020 |
Едддаадасд | ЕдасаааааЕ | сааЕаадасс | даааЕсЕсаа | дссадсЕдЕд | аЕаа | 1074 |
<210> 12 <211> 356 <212> БЕЛОК <213> Искусственная последовательность
<220> | |||||||||||||||
<223> | Последовательность аминокислот антигена : | ЗΤΕΑΡ | 2 | ||||||||||||
<400> | 12 | ||||||||||||||
МеЕ | Α3ρ | Тгр | ТЕг | Тгр | 11е | Ьеи | РЕе | Ьеи | Vа1 | Α^ | Α^ | Α^ | ТЕг | Ατρ | Vа1 |
1 | 5 | 10 | 15 | ||||||||||||
Н1з | Зег | С1и | Зег | Ατρ | Ьуз | Α3ρ | 11е | ТЕг | Αзη | С1п | С1и | С1и | Ьеи | Тгр | Ьуз |
20 | 25 | 30 | |||||||||||||
МеЕ | Ьуз | Рго | Ατρ | Ατρ | Α3η | Ьеи | С1и | С1и | Αзρ | Αзρ | Туг | Ьеи | Н1з | Ьуз | Αзρ |
35 | 40 | 45 | |||||||||||||
ТЕг | С1у | С1и | ТЕг | Зег | МеЕ | Ьеи | Ьуз | Ατρ | Рго | Vа1 | Ьеи | Ьеи | Н1з | Ьеи | Н1з |
50 | 55 | 60 | |||||||||||||
С1п | ТЕг | Α^ | Н1з | Α^ | Α3ρ | С1и | РЕе | Αзρ | Суз | Рго | Зег | С1и | Ьеи | С1п | Н1з |
65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
ТЕг | С1п | Θ1υ | Ьеи | РЕе | Рго | С1п | Тгр | Н1з | Ьеи | Рго | 11е | Ьуз | 11е | Α^ | Α^ |
85 | 90 | 95 | |||||||||||||
11е | 11е | Α^ | Зег | Ьеи | ТЕг | РЕе | Ьеи | Туг | ТЕг | Ьеи | Ьеи | Ατρ | С1и | Vа1 | 11е |
100 | 105 | 110 | |||||||||||||
Н1з | Рго | Ьеи | Α^ | ТЕг | Зег | Н1з | С1п | С1п | Туг | РЕе | Туг | Ьуз | 11е | Рго | 11е |
- 43 027315
115 | 120 | 125 | |||||||||||||
Ьеи | Уа1 | 11е | Азп | Ьуз | Уа1 | Ьеи | Рго | МеЬ | Уа1 | Зег | 11е | ТЬг | Ьеи | Ьеи | А1а |
130 | 135 | 140 | |||||||||||||
Ьеи | Уа1 | Туг | Ьеи | Рго | С1у | Уа1 | 11е | А1а | А1а | 11е | Уа1 | С1п | Ьеи | Н1з | Азп |
145 | 150 | 155 | 160 | ||||||||||||
С1у | ТЬг | Ьуз | Туг | Ьуз | Ьуз | РЬе | Рго | Н1з | Тгр | Ьеи | Азр | Ьуз | Тгр | МеЬ | Ьеи |
165 | 170 | 175 | |||||||||||||
ТЬг | Агд | Ьуз | С1п | РЬе | С1у | Ьеи | Ьеи | Зег | РЬе | РЬе | РЬе | А1а | Уа1 | Ьеи | Н1з |
180 | 185 | 190 | |||||||||||||
А1а | 11е | Туг | Зег | Ьеи | Зег | Туг | Рго | МеЬ | Агд | Агд | Зег | Туг | Агд | Туг | Ьуз |
195 | 200 | 205 | |||||||||||||
Ьеи | Ьеи | Азп | Тгр | А1а | Туг | С1п | С1п | Уа1 | С1п | С1п | Азп | Ьуз | С1и | Азр | А1а |
210 | 215 | 220 | |||||||||||||
Тгр | 11е | С1и | Н1з | Азр | Уа1 | Тгр | Агд | МеЬ | С1и | 11е | Туг | Уа1 | Зег | Ьеи | С1у |
225 | 230 | 235 | 240 | ||||||||||||
11е | Уа1 | С1у | Ьеи | А1а | 11е | Ьеи | А1а | Ьеи | Ьеи | А1а | Уа1 | ТЬг | Зег | 11е | Рго |
245 | 250 | 255 | |||||||||||||
Зег | Уа1 | Зег | Азр | Зег | Ьеи | ТЬг | Тгр | Агд | С1и | РЬе | Н1з | Туг | 11е | С1п | Зег |
260 | 265 | 270 | |||||||||||||
Ьуз | Ьеи | С1у | 11е | Уа1 | Зег | Ьеи | Ьеи | Ьеи | С1у | ТЬг | 11е | Н1з | А1а | Ьеи | 11е |
275 | 280 | 285 | |||||||||||||
РЬе | А1а | Тгр | Азп | Ьуз | Тгр | 11е | Азр | 11е | Ьуз | С1п | РЬе | Уа1 | Тгр | Туг | ТЬг |
290 | 295 | 300 | |||||||||||||
Рго | Рго | ТЬг | РЬе | МеЬ | 11е | А1а | Уа1 | РЬе | Ьеи | Рго | 11е | Уа1 | Уа1 | Ьеи | 11е |
305 | 310 | 315 | 320 | ||||||||||||
РЬе | Ьуз | Зег | 11е | Ьеи | РЬе | Ьеи | Рго | Суз | Ьеи | Агд | Ьуз | Ьуз | 11е | Ьеи | Ьуз |
325 | 330 | 335 | |||||||||||||
11е | Агд | Н1з | С1у | Тгр | С1и | Азр | Уа1 | ТЬг | Ьуз | 11е | Азп | Ьуз | ТЬг | С1и | 11е |
340 | 345 | 350 |
Зег Зег С1п Ьеи 355
- 44 027315 <210> 13 <211> 399 <212> ДНК <213> Искусственная последовательность <220>
<223> Последовательность нуклеиновых кислот антигена РЗСА <400> 13
аЕддасЕдда | саЕддаЕЕсЕ | дЕЕЕсЕддЕс | дссдссдсаа | сссдсдЕдса | ЕЕсЕдсЕддс | 60 |
сЕддсасЕдс | адссЕддаас | сдсссЕдсЕд | ЕдсЕасЕсЕЕ | дЕааддссса | ддЕдадЕаас | 120 |
даддасЕдсс | ЕдсаддЕсда | аааЕЕдЕасЕ | садсЕдддад | адсадЕдсЕд | дассдсасдд | 180 |
аЕсададсад | ЕдддасЕдсЕ | дасадЕсаЕЕ | адсааадддЕ | дсЕсссЕдаа | сЕдЕдЕддас | 240 |
даЕадссадд | аЕЕасЕаЕдЕ | сддааадааа | аасаЕсассЕ | дсЕдЕдасас | адаЕсЕдЕдЕ | 300 |
ааЕдсЕЕсЕд | дсдсссасдс | ЕсЕдсадссс | дсадссдсЕа | ЕЕсЕддсЕсЕ | дсЕдсссдсЕ | 360 |
сЕдддасЕдс | ЕдсЕдЕдддд | асссддасад | сЕдЕдаЕаа | 399 |
<210> 14 <211> 131 <212> БЕЛОК <213> Искусственная последовательность <220>
<223> Последовательность аминокислот антигена РЗСЛ <400> 14
МеЕ 1 | Азр | Тгр | ТНг | Тгр 5 | 11е | Ьеи | РНе | Ьеи | Уа1 10 | А1а | А1а | А1а | ТНг | Агд 15 | Уа1 |
Н1з | Зег | А1а | С1у 20 | Ьеи | А1а | Ьеи | С1п | Рго 25 | С1у | ТНг | А1а | Ьеи | Ьеи 30 | Суз | Туг |
Зег | Суз | Ьуз 35 | А1а | С1п | Уа1 | Зег | Азп 40 | С1и | Азр | Суз | Ьеи | С1п 45 | Уа1 | С1и | Азп |
Суз | ТНг 50 | С1п | Ьеи | С1у | С1и | С1п 55 | Суз | Тгр | ТНг | А1а | Агд 60 | 11е | Агд | А1а | Уа1 |
С1у 65 | Ьеи | Ьеи | ТНг | Уа1 | 11е 70 | Зег | Ьуз | С1у | Суз | Зег 75 | Ьеи | Азп | Суз | Уа1 | Азр 80 |
Азр | Зег | С1п | Азр | Туг 85 | Туг | Уа1 | С1у | Ьуз | Ьуз 90 | Азп | 11е | ТНг | Суз | Суз 95 | Азр |
ТНг | Азр | Ьеи | Суз 100 | Азп | А1а | Зег | С1у | А1а 105 | Н1з | А1а | Ьеи | С1п | Рго 110 | А1а | А1а |
А1а | 11е | Ьеи | А1а | Ьеи | Ьеи | Рго | А1а | Ьеи | С1у | Ьеи | Ьеи | Ьеи | Тгр | С1у | Рго |
- 45 027315
115
120
125
С1у С1п Ьеи
130 <210> 15 <211> 54 <212> ДНК <213> Искусственная последовательность <220>
<223> Лидерная последовательность нуклеиновых кислот 1дЕ <400> 15 аКддасКдда саКддаККсК дКККсКддКс дсКдссдсаа сссдсдКдса ККса <210> 16 <211> 17 <212> БЕЛОК <213> Искусственная последовательность <220>
<223> Лидерная последовательность аминокислот 1дЕ <400> 16
МеК Тгр ТЬг Тгр 11е Ьеи РЬе Ьеи Уа1 А1а А1а А1а ТЬг Агд Уа1 Н1з 1 5 10 15
Зег <210> 17 <211> 261 <212> БЕЛОК <213> Искусственная последовательность <220>
<223> ИР_001639.1_Н.зар1епз_РЗА_1зо1_ргергоргоКе1п <400> 17
МеК 1 | Тгр | Уа1 | Рго | Уа1 5 | Уа1 | РЬе | Ьеи | ТЬг | Ьеи 10 | Зег | Уа1 | ТЬг | Тгр | 11е 15 | С1у |
А1а | А1а | Рго | Ьеи 20 | 11е | Ьеи | Зег | Агд | 11е 25 | Уа1 | С1у | С1у | Тгр | С1и 30 | Суз | С1и |
Ьуз | Н1з | Зег 35 | С1п | Рго | Тгр | С1п | Уа1 40 | Ьеи | Уа1 | А1а | Зег | Агд 45 | С1у | Агд | А1а |
Уа1 | Суз 50 | С1у | С1у | Уа1 | Ьеи | Уа1 55 | Н1з | Рго | С1п | Тгр | Уа1 60 | Ьеи | ТЬг | А1а | А1а |
- 46 027315
Н1з 65 | Суз | 11е | Агд | Азп | Ьуз 70 | Зег | Уа1 | 11е | Ьеи | Ьеи 75 | С1у | Агд | Н1з | Зег | Ьеи 80 |
РЬе | Н1з | Рго | С1и | Азр | ТЬг | С1у | С1п | Уа1 | РЬе | С1п | Уа1 | Зег | Н1з | Зег | РЬе |
85 | 90 | 95 | |||||||||||||
Рго | Н1з | Рго | Ьеи | Туг | Азр | МеЕ | Зег | Ьеи | Ьеи | Ьуз | Азп | Агд | РЬе | Ьеи | Агд |
100 | 105 | 110 | |||||||||||||
Рго | С1у | Азр | Азр | Зег | Зег | Н1з | Азр | Ьеи | МеЕ | Ьеи | Ьеи | Агд | Ьеи | Зег | С1и |
115 | 120 | 125 | |||||||||||||
Рго | А1а | С1и | Ьеи | ТЬг | Азр | А1а | Уа1 | Ьуз | Уа1 | МеЕ | Азр | Ьеи | Рго | ТЬг | С1п |
130 | 135 | 140 | |||||||||||||
С1и | Рго | А1а | Ьеи | С1у | ТЬг | ТЬг | Суз | Туг | А1а | Зег | С1у | Тгр | С1у | Зег | 11е |
145 | 150 | 155 | 160 | ||||||||||||
С1и | Рго | С1и | С1и | РЬе | Ьеи | ТЬг | Рго | Ьуз | Ьуз | Ьеи | С1п | Суз | Уа1 | Азр | Ьеи |
165 | 170 | 175 | |||||||||||||
Н1з | Уа1 | 11е | Зег | Азп | Азр | Уа1 | Суз | А1а | С1п | Уа1 | Н1з | Рго | С1п | Ьуз | Уа1 |
180 | 185 | 190 | |||||||||||||
ТЬг | Ьуз | РЬе | МеЕ | Ьеи | Суз | А1а | С1у | Агд | Тгр | ТЬг | С1у | С1у | Ьуз | Зег | ТЬг |
195 | 200 | 205 | |||||||||||||
Суз | Зег | С1у | Азр | Зег | С1у | С1у | Рго | Ьеи | Уа1 | Суз | Азп | С1у | Уа1 | Ьеи | С1п |
210 | 215 | 220 | |||||||||||||
С1у | 11е | ТЬг | Зег | Тгр | С1у | Зег | С1и | Рго | Суз | А1а | Ьеи | Рго | С1и | Агд | Рго |
225 | 230 | 235 | 240 | ||||||||||||
Зег | Ьеи | Туг | ТЬг | Ьуз | Уа1 | Уа1 | Н1з | Туг | Агд | Ьуз | Тгр | 11е | Ьуз | Азр | ТЬг |
245 | 250 | 255 | |||||||||||||
11е | Уа1 | А1а | Азп | Рго |
260 <210> 18 <211> 262 <212> БЕЛОК <213> Искусственная последовательность <220>
<223> дЬ_ААА60193.1_Н.зар1епз_РЗА <400> 18
МеЕ Тгр Уа1 Рго Уа1 Уа1 РЬе Ьеи ТЬг Ьеи Зег Уа1 ТЬг Тгр 11е С1у
- 47 027315
5 10 15
А1а | А1а | Рго | Ьеи 20 | 11е | Ьеи | Зег | Агд | 11е 25 | Уа1 | С1у | С1у | Тгр | С1и 30 | Суз | С1и |
Ьуз | Н1з | Зег | С1п | Рго | Тгр | С1п | Уа1 | Ьеи | Уа1 | А1а | Зег | Агд | С1у | Агд | А1а |
35 | 40 | 45 | |||||||||||||
ναι | Суз | С1у | С1у | Уа1 | Ьеи | Уа1 | Н1з | Рго | С1п | Тгр | Уа1 | Ьеи | ТЬг | А1а | А1а |
50 | 55 | 60 | |||||||||||||
Н1з | Суз | 11е | Агд | Ьуз | Суз | Ьуз | Зег | Уа1 | 11е | Ьеи | Ьеи | С1у | Агд | Н1з | Зег |
65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
Ьеи | РЬе | Н1з | Рго | С1и | Азр | ТЬг | С1у | С1п | Уа1 | РЬе | С1п | Уа1 | Зег | Н1з | Зег |
85 | 90 | 95 | |||||||||||||
РЬе | Рго | Н1з | Рго | Ьеи | Туг | Азр | МеЬ | Зег | Ьеи | Ьеи | Ьуз | Азп | Агд | РЬе | Ьеи |
100 | 105 | 110 | |||||||||||||
Агд | Рго | С1у | Азр | Азр | Зег | Зег | Н1з | Азр | Ьеи | МеЬ | Ьеи | Ьеи | Агд | Ьеи | Зег |
115 | 120 | 125 | |||||||||||||
С1и | Рго | А1а | С1и | Ьеи | ТЬг | Азр | А1а | Уа1 | Ьуз | Уа1 | МеЬ | Азр | Ьеи | Рго | ТЬг |
130 | 135 | 140 | |||||||||||||
С1п | С1и | Рго | А1а | Ьеи | С1у | ТЬг | ТЬг | Суз | Туг | А1а | Зег | С1у | Тгр | С1у | Зег |
145 | 150 | 155 | 160 | ||||||||||||
11е | С1и | Рго | С1и | С1и | РЬе | Ьеи | ТЬг | Рго | Ьуз | Ьуз | Ьеи | С1п | Суз | Уа1 | Азр |
165 | 170 | 175 | |||||||||||||
Ьеи | Н1з | Уа1 | 11е | Зег | Азп | Азр | Уа1 | Суз | А1а | С1п | Уа1 | Н1з | Рго | С1п | Ьуз |
180 | 185 | 190 | |||||||||||||
ναι | ТЬг | Ьуз | РЬе | МеЬ | Ьеи | Суз | А1а | С1у | Агд | Тгр | ТЬг | С1у | С1у | Ьуз | Зег |
195 | 200 | 205 | |||||||||||||
ТЬг | Суз | Зег | С1у | Азр | Зег | С1у | С1у | Рго | Ьеи | Уа1 | Суз | Азп | С1у | Уа1 | Ьеи |
210 | 215 | 220 | |||||||||||||
С1п | С1у | 11е | ТЬг | Зег | Тгр | С1у | Зег | С1и | Рго | Суз | А1а | Ьеи | Рго | С1и | Агд |
225 | 230 | 235 | 240 | ||||||||||||
Рго | Зег | Ьеи | Туг | ТЬг | Ьуз | Уа1 | Уа1 | Н1з | Туг | Агд | Ьуз | Тгр | 11е | Ьуз | Азр |
245 250 255
- 48 027315
ТЬг 11е Уа1 А1а Азп Рго 260 <210> 19 <211> 261 <212> БЕЛОК <213> Искусственная последовательность <220>
<223> О6БТ45.1_М.£азс1си1аг±з_КЬК3 <400> 19
МеК 1 | Тгр | Уа1 | Ьеи | Уа1 5 | Уа1 | РЬе | Ьеи | ТЬг | Ьеи 10 | Зег | Уа1 | ТЬг | Тгр | 11е 15 | С1у |
А1а | А1а | Рго | Ьеи | 11е | Ьеи | Зег | Агд | 11е | Уа1 | С1у | С1у | Тгр | С1и | Суз | С1и |
20 | 25 | 30 | |||||||||||||
Ьуз | Н£з | Зег | С1п | Рго | Тгр | С1п | Уа1 | Ьеи | Уа1 | А1а | Зег | Н£з | С1у | Агд | А1а |
35 | 40 | 45 | |||||||||||||
Уа1 | Суз | С1у | С1у | Уа1 | Ьеи | Уа1 | Н£з | Рго | С1п | Тгр | Уа1 | Ьеи | ТЬг | А1а | А1а |
50 | 55 | 60 | |||||||||||||
Н£з | Суз | 11е | Агд | Зег | Н1з | Зег | Уа1 | 11е | Ьеи | Ьеи | С1у | Агд | Н£з | Азп | Рго |
65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
Туг | Туг | Рго | С1и | Азр | ТЬг | С1у | С1п | Уа1 | РЬе | С1п | Уа1 | Зег | Н£з | Зег | РЬе |
85 | 90 | 95 | |||||||||||||
Рго | Н£з | Рго | Ьеи | Туг | Азп | МеК | Зег | Ьеи | Ьеи | Ьуз | Азп | Агд | Туг | Ьеи | С1у |
100 | 105 | 110 | |||||||||||||
Рго | С1у | Азр | Азр | Зег | Зег | Н£з | Азр | Ьеи | МеК | Ьеи | Ьеи | Агд | Ьеи | Зег | С1и |
115 | 120 | 125 | |||||||||||||
Рго | А1а | С1и | 11е | ТЬг | Азр | А1а | Уа1 | С1п | Уа1 | Ьеи | Азр | Ьеи | Рго | ТЬг | Тгр |
130 | 135 | 140 | |||||||||||||
С1и | Рго | С1и | Ьеи | С1у | ТЬг | ТЬг | Суз | Туг | А1а | Зег | С1у | Тгр | С1у | Зег | 11е |
145 | 150 | 155 | 160 | ||||||||||||
С1и | Рго | С1и | С1и | Н£з | Ьеи | ТЬг | Рго | Ьуз | Ьуз | Ьеи | С1п | Суз | Уа1 | Азр | Ьеи |
165 | 170 | 175 | |||||||||||||
Н£з | 11е | 11е | Зег | Азп | Азр | Уа1 | Суз | А1а | С1п | Уа1 | Н£з | Зег | С1п | Ьуз | Уа1 |
180 | 185 | 190 | |||||||||||||
ТЬг | Ьуз | РЬе | МеК | Ьеи | Суз | А1а | С1у | Зег | Тгр | МеК | С1у | С1у | Ьуз | Зег | ТЬг |
- 49 027315
195 | 200 | 205 | |||||||||||||
Суз | Зег | С1у | Азр | Зег | С1у | С1у | Рго | Ьеи | Уа1 | Суз | Азр | С1у | Уа1 | Ьеи | С1п |
210 | 215 | 220 | |||||||||||||
С1у | 11е | ТЬг | Зег | Тгр | С1у | Зег | С1п | Рго | Суз | А1а | Ьеи | Рго | Агд | Агд | Рго |
225 | 230 | 235 | 240 | ||||||||||||
Зег | Ьеи | Туг | ТЬг | Ьуз | Уа1 | Уа1 | Агд | Туг | Агд | Ьуз | Тгр | 11е | С1п | Азр | ТЬг |
245 | 250 | 255 | |||||||||||||
11е | МеК | А1а | Азп | Рго |
260 <210> 20 <211> 261 <212> БЕЛОК <213> Искусственная последовательность <220>
<223> | ЫР_001036241. | . 1_М. | .ти1аККа_РЗА_ргесигзог |
<400> | 20 | ||
МеК Тгр | Уа1 Ьеи Уа1 | Уа1 | РЬе Ьеи ТЬг Ьеи Зег Уа1 ТЬг Тгр 11е С1у |
1 | 5 | 10 15 | |
А1а А1а | Рго Ьеи 11е | Ьеи | Зег Агд 11е Уа1 С1у С1у Тгр С1и Суз С1и |
20 | 25 30 | ||
Ьуз Н1з | Зег С1п Рго | Тгр | С1п Уа1 Ьеи Уа1 А1а Зег Агд С1у Агд А1а |
35 | 40 45 | ||
Уа1 Суз | С1у С1у Уа1 | Ьеи | Уа1 Н1з Рго С1п Тгр Уа1 Ьеи ТЬг А1а А1а |
50 | 55 60 | ||
Н1з Суз | 11е Агд Зег | Азп | Зег Уа1 11е Ьеи Ьеи С1у Агд Н1з Азп Рго |
65 | 70 | 75 80 | |
Туг Туг | Рго С1и Азр | ТЬг | С1у С1п Уа1 РЬе С1п Уа1 Зег Н1з Зег РЬе |
85 | 90 95 | ||
Рго Н1з | Рго Ьеи Туг | Азп | МеК Зег Ьеи Ьеи Ьуз Азп Агд Туг Ьеи С1у |
100 | 105 110 | ||
Рго С1у | Азр Азр Зег | Зег | Н1з Азр Ьеи МеК Ьеи Ьеи Агд Ьеи Зег С1и |
115 | 120 125 | ||
Рго А1а | С1и 11е ТЬг | Азр | А1а Уа1 С1п Уа1 Ьеи Азр Ьеи Рго ТЬг Тгр |
130 | 135 140 |
- 50 027315
С1и 145 | Рго | С1и | Ьеи | С1у | ТЬг 150 | ТЬг | Суз | Туг | А1а | Зег 155 | С1у | Тгр | С1у | Зег | 11е 160 |
С1и | Рго | С1и | С1и | Н1з | Ьеи | ТЬг | Рго | Ьуз | Ьуз | Ьеи | С1п | Суз | Уа1 | Азр | Ьеи |
165 | 170 | 175 | |||||||||||||
Н1з | 11е | 11е | Зег | Азп | Азр | Уа1 | Суз | А1а | С1п | Уа1 | Н1з | Зег | С1п | Ьуз | Уа1 |
180 | 185 | 190 | |||||||||||||
ТЬг | Ьуз | РЬе | МеЕ | Ьеи | Суз | А1а | С1у | Зег | Тгр | МеЕ | С1у | С1у | Ьуз | Зег | ТЬг |
195 | 200 | 205 | |||||||||||||
Суз | Зег | С1у | Азр | Зег | С1у | С1у | Рго | Ьеи | Уа1 | Суз | Азр | С1у | Уа1 | Ьеи | С1п |
210 | 215 | 220 | |||||||||||||
С1у | 11е | ТЬг | Зег | Тгр | С1у | Зег | С1п | Рго | Суз | А1а | Ьеи | Рго | Агд | Агд | Рго |
225 | 230 | 235 | 240 | ||||||||||||
Зег | Ьеи | Туг | ТЬг | Ьуз | Уа1 | Уа1 | Агд | Туг | Агд | Ьуз | Тгр | 11е | С1п | Азр | ТЬг |
245 | 250 | 255 | |||||||||||||
11е | МеЕ | А1а | Азп | Рго |
260 <210> 21 <211> 244 <212> БЕЛОК <213> Искусственная последовательность <220>
<223> | ААЬ82258 . | . 1_М. | . ти1аЕЕа_ | РЗА | |||||||||||
<400> | 21 | ||||||||||||||
А1а | Рго | Ьеи | 11е | Ьеи | Зег | Агд | 11е | Уа1 | С1у | С1у | Тгр | С1и | Суз | С1и | Ьуз |
1 | 5 | 10 | 15 | ||||||||||||
Н1з | Зег | С1п | Рго | Тгр | С1п | Уа1 | Ьеи | Уа1 | А1а | Зег | Агд | С1у | Агд | А1а | Уа1 |
20 | 25 | 30 | |||||||||||||
Суз | С1у | С1у | Уа1 | Ьеи | Уа1 | Н1з | Рго | С1п | Тгр | Уа1 | Ьеи | ТЬг | А1а | А1а | Н1з |
35 | 40 | 45 | |||||||||||||
Суз | 11е | Агд | Зег | Азп | Зег | Уа1 | 11е | Ьеи | Ьеи | С1у | Агд | Н1з | Азп | Рго | Туг |
50 | 55 | 60 | |||||||||||||
Туг | Рго | С1и | Азр | ТЬг | С1у | С1п | Уа1 | РЬе | С1п | Уа1 | Зег | Н1з | Зег | РЬе | Рго |
65 | 70 | 75 | 80 |
- 51 027315
Н1з | Рго | Ьеи | Туг | Азп 85 | МеЬ | Зег | Ьеи | Ьеи | Ьуз 90 | Азп | Агд | Туг | Ьеи | С1у 95 | Рго |
С1у | Азр | Азр | Зег | Зег | Н1з | Азр | Ьеи | МеЬ | Ьеи | Ьеи | Агд | Ьеи | Зег | С1и | Рго |
100 | 105 | 110 | |||||||||||||
А1а | С1и | 11е | ТЬг | Азр | А1а | Уа1 | С1п | Уа1 | Ьеи | Азр | Ьеи | Рго | ТЬг | Тгр | С1и |
115 | 120 | 125 | |||||||||||||
Рго | С1и | Ьеи | С1у | ТЬг | ТЬг | Суз | Туг | А1а | Зег | С1у | Тгр | С1у | Зег | 11е | С1и |
130 | 135 | 140 | |||||||||||||
Рго | С1и | С1и | Н1з | Ьеи | ТЬг | Рго | Ьуз | Ьуз | Ьеи | С1п | Суз | Уа1 | Азр | Ьеи | Н1з |
145 | 150 | 155 | 160 | ||||||||||||
11е | 11е | Зег | Азп | Азр | Уа1 | Суз | А1а | С1п | Уа1 | Н1з | Зег | С1п | Ьуз | Уа1 | ТЬг |
165 | 170 | 175 | |||||||||||||
Ьуз | РЬе | МеЬ | Ьеи | Суз | А1а | С1у | Зег | Тгр | МеЬ | С1у | С1у | Ьуз | Зег | ТЬг | Суз |
180 | 185 | 190 | |||||||||||||
Зег | С1у | Азр | Зег | С1у | С1у | Рго | Ьеи | Уа1 | Суз | Азр | С1у | Уа1 | Ьеи | С1п | С1у |
195 | 200 | 205 | |||||||||||||
11е | ТЬг | Зег | Тгр | С1у | Зег | С1п | Рго | Суз | А1а | Ьеи | Рго | Агд | Агд | Рго | Зег |
210 | 215 | 220 | |||||||||||||
Ьеи | Туг | ТЬг | Ьуз | Уа1 | Уа1 | Агд | Туг | Агд | Ьуз | Тгр | 11е | С1п | Азр | ТЬг | 11е |
225 | 230 | 235 | 240 | ||||||||||||
МеЬ | А1а | Азп | Рго |
<210> 22 <211> 750 <212> БЕЛОК <213> Искусственная последовательность <220>
<223> ИР_004467 | . 1_ | Нитап | ._еСРЬЬ_ | 1зо1 | ||||||||
<400> 22 | ||||||||||||
МеЬ Тгр Азп 1 | Ьеи | Ьеи 5 | Н1з | С1и ТЬг | Азр | Зег 10 | А1а | Уа1 | А1а | ТЬг | А1а 15 | Агд |
Агд Рго Агд | Тгр 20 | Ьеи | Суз | А1а С1у | А1а 25 | Ьеи | Уа1 | Ьеи | А1а | С1у 30 | С1у | РЬе |
- 52 027315
РЬе | Ьеи | Ьеи 35 | С1у | РЬе | Ьеи | РЬе | С1у 40 | Тгр | РЬе | 11е | Ьуз | Зег 45 | Зег | Азп | С1и |
А1а | ТЬг | Азп | 11е | ТЬг | Рго | Ьуз | Н1з | Азп | МеК | Ьуз | А1а | РЬе | Ьеи | Азр | С1и |
50 | 55 | 60 | |||||||||||||
Ьеи | Ьуз | А1а | С1и | Азп | 11е | Ьуз | Ьуз | РЬе | Ьеи | Туг | Азп | РЬе | ТЬг | С1п | 11е |
65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
Рго | Н1з | Ьеи | А1а | С1у | ТЬг | С1и | С1п | Азп | РЬе | С1п | Ьеи | А1а | Ьуз | С1п | 11е |
85 | 90 | 95 | |||||||||||||
С1п | Зег | С1п | Тгр | Ьуз | С1и | РЬе | С1у | Ьеи | Азр | Зег | Уа1 | С1и | Ьеи | А1а | Н1з |
100 | 105 | 110 | |||||||||||||
Туг | Азр | Уа1 | Ьеи | Ьеи | Зег | Туг | Рго | Азп | Ьуз | ТЬг | Н1з | Рго | Азп | Туг | 11е |
115 | 120 | 125 | |||||||||||||
Зег | 11е | 11е | Азп | С1и | Азр | С1у | Азп | С1и | 11е | РЬе | Азп | ТЬг | Зег | Ьеи | РЬе |
130 | 135 | 140 | |||||||||||||
С1и | Рго | Рго | Рго | Рго | С1у | Туг | С1и | Азп | Уа1 | Зег | Азр | 11е | Уа1 | Рго | Рго |
145 | 150 | 155 | 160 | ||||||||||||
РЬе | Зег | А1а | РЬе | Зег | Рго | С1п | С1у | МеК | Рго | С1и | С1у | Азр | Ьеи | Уа1 | Туг |
165 | 170 | 175 | |||||||||||||
Уа1 | Азп | Туг | А1а | Агд | ТЬг | С1и | Азр | РЬе | РЬе | Ьуз | Ьеи | С1и | Агд | Азр | МеК |
180 | 185 | 190 | |||||||||||||
Ьуз | 11е | Азп | Суз | Зег | С1у | Ьуз | 11е | Уа1 | 11е | А1а | Агд | Туг | С1у | Ьуз | Уа1 |
195 | 200 | 205 | |||||||||||||
РЬе | Агд | С1у | Азп | Ьуз | Уа1 | Ьуз | Азп | А1а | С1п | Ьеи | А1а | С1у | А1а | Ьуз | С1у |
210 | 215 | 220 | |||||||||||||
Уа1 | 11е | Ьеи | Туг | Зег | Азр | Рго | А1а | Азр | Туг | РЬе | А1а | Рго | С1у | Уа1 | Ьуз |
225 | 230 | 235 | 240 | ||||||||||||
Зег | Туг | Рго | Азр | С1у | Тгр | Азп | Ьеи | Рго | С1у | С1у | С1у | Уа1 | С1п | Агд | С1у |
245 | 250 | 255 | |||||||||||||
Азп | 11е | Ьеи | Азп | Ьеи | Азп | С1у | А1а | С1у | Азр | Рго | Ьеи | ТЬг | Рго | С1у | Туг |
260 | 265 | 270 | |||||||||||||
Рго | А1а | Азп | С1и | Туг | А1а | Туг | Агд | Агд | С1у | 11е | А1а | С1и | А1а | Уа1 | С1у |
275 | 280 | 285 |
- 53 027315
Ьеи | Рго 290 | Зег | 11е | Рго | Уа1 | Н1з 295 | Рго | 11е | С1у | Туг | Туг 300 | Азр | А1а | С1п | Ьуз |
Ьеи | Ьеи | С1и | Ьуз | МеЬ | С1у | С1у | Зег | А1а | Рго | Рго | Азр | Зег | Зег | Тгр | Агд |
305 | 310 | 315 | 320 | ||||||||||||
С1у | Зег | Ьеи | Ьуз | Уа1 | Рго | Туг | Азп | Уа1 | С1у | Рго | С1у | РЕе | ТЕг | С1у | Азп |
325 | 330 | 335 | |||||||||||||
РЕе | Зег | ТЕг | С1п | Ьуз | Уа1 | Ьуз | МеЬ | Н1з | 11е | Н1з | Зег | ТЕг | Азп | С1и | Уа1 |
340 | 345 | 350 | |||||||||||||
ТЕг | Агд | 11е | Туг | Азп | Уа1 | 11е | С1у | ТЕг | Ьеи | Агд | С1у | А1а | Уа1 | С1и | Рго |
355 | 360 | 365 | |||||||||||||
Азр | Агд | Туг | Уа1 | 11е | Ьеи | С1у | С1у | Н1з | Агд | Азр | Зег | Тгр | Уа1 | РЕе | С1у |
370 | 375 | 380 | |||||||||||||
С1у | 11е | Азр | Рго | С1п | Зег | С1у | А1а | А1а | Уа1 | Уа1 | Н1з | С1и | 11е | Уа1 | Агд |
385 | 390 | 395 | 400 | ||||||||||||
Зег | РЕе | С1у | ТЕг | Ьеи | Ьуз | Ьуз | С1и | С1у | Тгр | Агд | Рго | Агд | Агд | ТЕг | 11е |
405 | 410 | 415 | |||||||||||||
Ьеи | РЕе | А1а | Зег | Тгр | Азр | А1а | С1и | С1и | РЕе | С1у | Ьеи | Ьеи | С1у | Зег | ТЕг |
420 | 425 | 430 | |||||||||||||
С1и | Тгр | А1а | С1и | С1и | Азп | Зег | Агд | Ьеи | Ьеи | С1п | С1и | Агд | С1у | Уа1 | А1а |
435 | 440 | 445 | |||||||||||||
Туг | 11е | Азп | А1а | Азр | Зег | Зег | 11е | С1и | С1у | Азп | Туг | ТЕг | Ьеи | Агд | Уа1 |
450 | 455 | 460 | |||||||||||||
Азр | Суз | ТЕг | Рго | Ьеи | МеЬ | Туг | Зег | Ьеи | Уа1 | Н1з | Азп | Ьеи | ТЕг | Ьуз | С1и |
465 | 470 | 475 | 480 | ||||||||||||
Ьеи | Ьуз | Зег | Рго | Азр | С1и | С1у | РЕе | С1и | С1у | Ьуз | Зег | Ьеи | Туг | С1и | Зег |
485 | 490 | 495 | |||||||||||||
Тгр | ТЕг | Ьуз | Ьуз | Зег | Рго | Зег | Рго | С1и | РЕе | Зег | С1у | МеЬ | Рго | Агд | 11е |
500 | 505 | 510 | |||||||||||||
Зег | Ьуз | Ьеи | С1у | Зег | С1у | Азп | Азр | РЕе | С1и | Уа1 | РЕе | РЕе | С1п | Агд | Ьеи |
515 | 520 | 525 | |||||||||||||
С1у | 11е | А1а | Зег | С1у | Агд | А1а | Агд | Туг | ТЕг | Ьуз | Азп | Тгр | С1и | ТЕг | Азп |
530 535 540
- 54 027315
^уз 545 | РПе | Зег | С1у | Туг | Рго 550 | ^еυ | Туг | Н1з | Зег | Уа1 555 | Туг | С1и | ТПг | Туг | С1и 560 |
^еυ | Уа1 | С1и | ^уз | РПе | Туг | Азр | Рго | МеЕ | РПе | ^уз | Туг | Н1з | ^еυ | ТПг | Уа1 |
565 | 570 | 575 | |||||||||||||
А1а | С1п | Уа1 | Агд | С1у | С1у | МеЕ | Уа1 | РПе | С1и | ^еυ | А1а | Азп | Зег | 11е | Уа1 |
580 | 585 | 590 | |||||||||||||
^еυ | Рго | РПе | Азр | Суз | Агд | Азр | Туг | А1а | Уа1 | Уа1 | ^еυ | Агд | ^уз | Туг | А1а |
595 | 600 | 605 | |||||||||||||
Азр | ^уз | 11е | Туг | Зег | 11е | Зег | МеЕ | ^уз | Н1з | Рго | С1п | С1и | МеЕ | ^уз | ТПг |
610 | 615 | 620 | |||||||||||||
Туг | Зег | Уа1 | Зег | РПе | Азр | Зег | ^еυ | РПе | Зег | А1а | Уа1 | ^уз | Азп | РПе | ТПг |
625 | 630 | 635 | 640 | ||||||||||||
С1и | 11е | А1а | Зег | ^уз | РПе | Зег | С1и | Агд | ^еυ | С1п | Азр | РПе | Азр | ^уз | Зег |
645 | 650 | 655 | |||||||||||||
Азп | Рго | 11е | Уа1 | ^еυ | Агд | МеЕ | МеЕ | Азп | Азр | С1п | ^еυ | МеЕ | РПе | ^еυ | С1и |
660 | 665 | 670 | |||||||||||||
Агд | А1а | РПе | 11е | Азр | Рго | ^еυ | С1у | ^еυ | Рго | Азр | Агд | Рго | РПе | Туг | Агд |
675 | 680 | 685 | |||||||||||||
Н1з | Уа1 | 11е | Туг | А1а | Рго | Зег | Зег | Н1з | Азп | ^уз | Туг | А1а | С1у | С1и | Зег |
690 | 695 | 700 | |||||||||||||
РПе | Рго | С1у | 11е | Туг | Азр | А1а | ^еυ | РПе | Азр | 11е | С1и | Зег | ^уз | Уа1 | Азр |
705 | 710 | 715 | 720 | ||||||||||||
Рго | Зег | ^уз | А1а | Тгр | С1у | С1и | Уа1 | ^уз | Агд | С1п | 11е | Туг | Уа1 | А1а | А1а |
725 | 730 | 735 | |||||||||||||
РПе | ТПг | Уа1 | С1п | А1а | А1а | А1а | С1и | ТПг | ^еυ | Зег | С1и | Уа1 | А1а |
740 745 750 <210> 23 <211> 749 <212> БЕЛОК <213> Искусственная последовательность <220>
<223> Нитап_РЗМА_ААС83972.1 <400> 23
- 55 027315
МеЕ 1 | Тгр | Αзη | Ьеи | Ьеи 5 | Н1з | С1и | ТЕг | Αзρ | Зег 10 | Α^ | Vа1 | Α^ | ТЕг | Α^ 15 | Ατρ |
Ατρ | Рго | Ατρ | Тгр | Ьеи | Суз | Α^ | С1у | Α^ | Ьеи | Vа1 | Ьеи | Α^ | С1у | С1у | РЕе |
20 | 25 | 30 | |||||||||||||
РЕе | Ьеи | Ьеи | С1у | РЕе | Ьеи | РЕе | С1у | Тгр | РЕе | 11е | Ьуз | Зег | Зег | Αзη | С1и |
35 | 40 | 45 | |||||||||||||
Α^ | ТЕг | Αзη | 11е | ТЕг | Рго | Ьуз | Н1з | Αзη | МеЕ | Ьуз | Α^ | РЕе | Ьеи | Αзρ | С1и |
50 | 55 | 60 | |||||||||||||
Ьеи | Ьуз | Α^ | С1и | Αзη | 11е | Ьуз | Ьуз | РЕе | Ьеи | Н1з | Αзη | РЕе | ТЕг | С1п | 11е |
65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
Рго | Н1з | Ьеи | Α^ | С1у | ТЕг | С1и | С1п | Αзη | РЕе | С1п | Ьеи | Α^ | Ьуз | С1п | 11е |
85 | 90 | 95 | |||||||||||||
Θ1η | Зег | С1п | Тгр | Ьуз | С1и | РЕе | С1у | Ьеи | Αзρ | Зег | Vа1 | С1и | Ьеи | Α^ | Н1з |
100 | 105 | 110 | |||||||||||||
Туг | Αзρ | Vа1 | Ьеи | Ьеи | Зег | Туг | Рго | Αзη | Ьуз | ТЕг | Н1з | Рго | Αзη | Туг | 11е |
115 | 120 | 125 | |||||||||||||
Зег | 11е | 11е | Αзη | С1и | Αзρ | С1у | Αзη | С1и | 11е | РЕе | Αзη | ТЕг | Зег | Ьеи | РЕе |
130 | 135 | 140 | |||||||||||||
С1и | Рго | Рго | Рго | Рго | С1у | Туг | С1и | Αзη | Vа1 | Зег | Αзρ | 11е | Vа1 | Рго | Рго |
145 | 150 | 155 | 160 | ||||||||||||
РЕе | Зег | Α^ | РЕе | Зег | Рго | С1п | С1у | МеЕ | Рго | С1и | С1у | Αзρ | Ьеи | Vа1 | Туг |
165 | 170 | 175 | |||||||||||||
Vа1 | Αзη | Туг | Α^ | Ατρ | ТЕг | С1и | Αзρ | РЕе | РЕе | Ьуз | Ьеи | С1и | Ατρ | Αзρ | МеЕ |
180 | 185 | 190 | |||||||||||||
Ьуз | 11е | Αзη | Суз | Зег | С1у | Ьуз | 11е | Vа1 | 11е | Α^ | Ατρ | Туг | С1у | Ьуз | Vа1 |
195 | 200 | 205 | |||||||||||||
РЕе | Ατρ | С1у | Αзη | Ьуз | Vа1 | Ьуз | Αзη | Α^ | С1п | Ьеи | Α^ | С1у | Α^ | Ьуз | С1у |
210 | 215 | 220 | |||||||||||||
Vа1 | 11е | Ьеи | Туг | Зег | Αзρ | Рго | Α^ | Αзρ | Туг | РЕе | Α^ | Рго | С1у | Vа1 | Ьуз |
225 | 230 | 235 | 240 | ||||||||||||
Зег | Туг | Рго | Αзρ | С1у | Тгр | Αзη | Ьеи | Рго | С1у | С1у | С1у | Vа1 | С1п | Ατρ | С1у |
245 250 255
- 56 027315
Азп | 11е | Ьеи | Азп 260 | Ьеи | Азп | С1у | А1а | С1у 265 | Азр | Рго | Ьеи | ТЬг | Рго 270 | С1у | Туг |
Рго | А1а | Азп | С1и | Туг | А1а | Туг | Агд | Агд | С1у | 11е | А1а | С1и | А1а | Уа1 | С1у |
275 | 280 | 285 | |||||||||||||
Ьеи | Рго | Зег | 11е | Рго | Уа1 | Н1з | Рго | 11е | С1у | Туг | Туг | Азр | А1а | С1п | Ьуз |
290 | 295 | 300 | |||||||||||||
Ьеи | Ьеи | С1и | Ьуз | МеЕ | С1у | С1у | Зег | А1а | Рго | Рго | Азр | Зег | Зег | Тгр | Агд |
305 | 310 | 315 | 320 | ||||||||||||
С1у | Зег | Ьеи | Ьуз | Уа1 | Рго | Туг | Азп | Уа1 | С1у | Рго | С1у | РЬе | ТЬг | С1у | Азп |
325 | 330 | 335 | |||||||||||||
РЬе | Зег | ТЬг | С1п | Ьуз | Уа1 | Ьуз | МеЕ | Н1з | 11е | Н1з | Зег | ТЬг | Азп | С1и | Уа1 |
340 | 345 | 350 | |||||||||||||
ТЬг | Агд | 11е | Туг | Азп | Уа1 | 11е | С1у | ТЬг | Ьеи | Агд | С1у | А1а | Уа1 | С1и | Рго |
355 | 360 | 365 | |||||||||||||
Азр | Агд | Туг | Уа1 | 11е | Ьеи | С1у | С1у | Н1з | Агд | Азр | Зег | Тгр | Уа1 | РЬе | С1у |
370 | 375 | 380 | |||||||||||||
С1у | 11е | Азр | Рго | С1п | Зег | С1у | А1а | А1а | Уа1 | Уа1 | Н1з | С1и | 11е | Уа1 | Агд |
385 | 390 | 395 | 400 | ||||||||||||
Зег | РЬе | С1у | ТЬг | Ьеи | Ьуз | Ьуз | С1и | С1у | Тгр | Агд | Рго | Агд | Агд | ТЬг | 11е |
405 | 410 | 415 | |||||||||||||
Ьеи | РЬе | А1а | Зег | Тгр | Азр | А1а | С1и | С1и | РЬе | С1у | Ьеи | Ьеи | С1у | Зег | ТЬг |
420 | 425 | 430 | |||||||||||||
С1и | Тгр | А1а | С1и | С1и | Азп | Зег | Агд | Ьеи | Ьеи | С1п | С1и | Агд | С1у | Уа1 | А1а |
435 | 440 | 445 | |||||||||||||
Туг | 11е | Азп | А1а | Азр | Зег | Зег | 11е | С1и | С1у | Азп | Туг | ТЬг | Ьеи | Агд | Уа1 |
450 | 455 | 460 | |||||||||||||
Азр | Суз | ТЬг | Рго | Ьеи | МеЕ | Туг | Зег | Ьеи | Уа1 | Н1з | Азп | Ьеи | ТЬг | Ьуз | С1и |
465 | 470 | 475 | 480 | ||||||||||||
Ьеи | Ьуз | Зег | Рго | Азр | С1и | С1у | РЬе | С1и | С1у | Ьуз | Зег | Ьеи | Туг | С1и | Зег |
485 | 490 | 495 | |||||||||||||
Тгр | ТЬг | Ьуз | Ьуз | Зег | Рго | Зег | Рго | С1и | РЬе | Зег | С1у | МеЕ | Рго | Агд | 11е |
- 57 027315
500 | 505 | 510 | |||||||||||||
Зег | Ьуз | Ьеи | С1у | Зег | С1у | Азп | Азр | РЬе | С1и | Уа1 | РЬе | РЬе | С1п | Агд | Ьеи |
515 | 520 | 525 | |||||||||||||
С1у | 11е | А1а | Зег | С1у | Агд | А1а | Агд | Туг | ТЬг | Ьуз | Азп | Тгр | С1и | ТЬг | Азп |
530 | 535 | 540 | |||||||||||||
РЬе | Зег | С1у | Туг | Рго | Ьеи | Туг | Н1з | Зег | Уа1 | Туг | С1и | ТЬг | Туг | С1и | Ьеи |
545 | 550 | 555 | 560 | ||||||||||||
Уа1 | С1и | Ьуз | РЬе | Туг | Азр | Рго | МеК | РЬе | Ьуз | Туг | Н1з | Ьеи | ТЬг | Уа1 | А1а |
565 | 570 | 575 | |||||||||||||
С1п | Уа1 | Агд | С1у | С1у | МеК | Уа1 | РЬе | С1и | Ьеи | А1а | Азп | Зег | 11е | Уа1 | Ьеи |
580 | 585 | 590 | |||||||||||||
Рго | РЬе | Азр | Суз | Агд | Азр | Туг | А1а | Уа1 | Уа1 | Ьеи | Агд | Ьуз | Туг | А1а | Азр |
595 | 600 | 605 | |||||||||||||
Ьуз | 11е | Туг | Зег | 11е | Зег | МеК | Ьуз | Н1з | Рго | С1п | С1и | МеК | Ьуз | ТЬг | Туг |
610 | 615 | 620 | |||||||||||||
Зег | Уа1 | Зег | РЬе | Азр | Зег | Ьеи | РЬе | Зег | А1а | Уа1 | Ьуз | Азп | РЬе | ТЬг | С1и |
625 | 630 | 635 | 640 | ||||||||||||
11е | А1а | Зег | Ьуз | РЬе | Зег | С1и | Агд | Ьеи | С1п | Азр | РЬе | Азр | Ьуз | Зег | Азп |
645 | 650 | 655 | |||||||||||||
Рго | 11е | Уа1 | Ьеи | Агд | МеК | МеК | Азп | Азр | С1п | Ьеи | МеК | РЬе | Ьеи | С1и | Агд |
660 | 665 | 670 | |||||||||||||
А1а | РЬе | 11е | Азр | Рго | Ьеи | С1у | Ьеи | Рго | Азр | Агд | Рго | РЬе | Туг | Агд | Н1з |
675 | 680 | 685 | |||||||||||||
Уа1 | 11е | Туг | А1а | Рго | Зег | Зег | Н1з | Азп | Ьуз | Туг | А1а | С1у | С1и | Зег | РЬе |
690 | 695 | 700 | |||||||||||||
Рго | С1у | 11е | Туг | Азр | А1а | Ьеи | РЬе | Азр | 11е | С1и | Зег | Ьуз | Уа1 | Азр | Рго |
705 | 710 | 715 | 720 | ||||||||||||
Зег | Ьуз | А1а | Тгр | С1у | С1и | Уа1 | Ьуз | Агд | С1п | 11е | Туг | Уа1 | А1а | А1а | РЬе |
725 | 730 | 735 | |||||||||||||
ТЬг | Уа1 | С1п | А1а | А1а | А1а | С1и | ТЬг | Ьеи | Зег | С1и | Уа1 | А1а | |||
740 | 745 |
- 58 027315 <210> 24 <211> 735 <212> БЕЛОК <213> Искусственная последовательность <220>
<223> М. ти1аККа_еСРЬЬ_1зо1 ХР_001096141.2 <400> 24
МеК 1 | 11е | А1а | С1у | Зег 5 | Зег | Туг | Рго | Ьеи | Ьеи 10 | Ьеи | А1а | А1а | Туг | А1а 15 | Суз |
ТИг | С1у | Суз | Ьеи | А1а | С1и | Агд | Ьеи | С1у | Тгр | РИе | 11е | Ьуз | Зег | Зег | Зег |
20 | 25 | 30 | |||||||||||||
С1и | А1а | ТИг | Азп | 11е | ТИг | Рго | Ьуз | Н1з | Азп | МеК | Ьуз | А1а | РИе | Ьеи | Азр |
35 | 40 | 45 | |||||||||||||
С1и | Ьеи | Ьуз | А1а | С1и | Азп | 11е | Ьуз | Ьуз | РИе | Ьеи | Н1з | Азп | РИе | ТИг | С1п |
50 | 55 | 60 | |||||||||||||
11е | Рго | Н1з | Ьеи | А1а | С1у | ТИг | С1и | С1п | Азп | РИе | С1п | Ьеи | А1а | Ьуз | С1п |
65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
11е | С1п | Зег | С1п | Тгр | Ьуз | С1и | РИе | С1у | Ьеи | Азр | Зег | Уа1 | С1и | Ьеи | ТИг |
85 | 90 | 95 | |||||||||||||
Н1з | Туг | Азр | Уа1 | Ьеи | Ьеи | Зег | Туг | Рго | Азп | Ьуз | ТИг | Н1з | Рго | Азп | Туг |
100 | 105 | 110 | |||||||||||||
11е | Зег | 11е | 11е | Азп | С1и | Азр | С1у | Азп | С1и | 11е | РИе | Азп | ТИг | Зег | Ьеи |
115 | 120 | 125 | |||||||||||||
РИе | С1и | Рго | Рго | Рго | А1а | С1у | Туг | С1и | Азп | Уа1 | Зег | Азр | 11е | Уа1 | Рго |
130 | 135 | 140 | |||||||||||||
Рго | РИе | Зег | А1а | РИе | Зег | Рго | С1п | С1у | МеК | Рго | С1и | С1у | Азр | Ьеи | Уа1 |
145 | 150 | 155 | 160 | ||||||||||||
Туг | Уа1 | Азп | Туг | А1а | Агд | ТИг | С1и | Азр | РИе | РИе | Ьуз | Ьеи | С1и | Агд | Азр |
165 | 170 | 175 | |||||||||||||
МеК | Ьуз | 11е | Азп | Суз | Зег | С1у | Ьуз | 11е | Уа1 | 11е | А1а | Агд | Туг | С1у | Ьуз |
180 | 185 | 190 | |||||||||||||
Уа1 | РИе | Агд | С1у | Азп | Ьуз | Уа1 | Ьуз | Азп | А1а | С1п | Ьеи | А1а | С1у | А1а | ТИг |
195 | 200 | 205 | |||||||||||||
С1у | Уа1 | 11е | Ьеи | Туг | Зег | Азр | Рго | А1а | Азр | Туг | РИе | А1а | Рго | С1у | Уа1 |
- 59 027315
210 215 220
Ьуз 225 | Зег | Туг | Рго | Азр | С1у 230 | Тгр | Азп | Ьеи | Рго | С1у 235 | С1у | С1у | Уа1 | С1п | Агд 240 |
С1у | Азп | 11е | Ьеи | Азп | Ьеи | Азп | С1у | А1а | С1у | Азр | Рго | Ьеи | ТЬг | Рго | С1у |
245 | 250 | 255 | |||||||||||||
Туг | Рго | А1а | Азп | С1и | Туг | А1а | Туг | Агд | Агд | С1у | МеЬ | А1а | С1и | А1а | Уа1 |
260 | 265 | 270 | |||||||||||||
С1у | Ьеи | Рго | Зег | 11е | Рго | Уа1 | Н1з | Рго | 11е | С1у | Туг | Туг | Азр | А1а | С1п |
275 | 280 | 285 | |||||||||||||
Ьуз | Ьеи | Ьеи | С1и | Ьуз | МеЬ | С1у | С1у | Зег | А1а | Зег | Рго | Азр | Зег | Зег | Тгр |
290 | 295 | 300 | |||||||||||||
Агд | С1у | Зег | Ьеи | Ьуз | Уа1 | Рго | Туг | Азп | Уа1 | С1у | Рго | С1у | РЬе | ТЬг | С1у |
305 | 310 | 315 | 320 | ||||||||||||
Азп | РЬе | Зег | ТЬг | С1п | Ьуз | Уа1 | Ьуз | МеЬ | Н1з | 11е | Н1з | Зег | ТЬг | Зег | С1и |
325 | 330 | 335 | |||||||||||||
Уа1 | ТЬг | Агд | 11е | Туг | Азп | Уа1 | 11е | С1у | ТЬг | Ьеи | Агд | С1у | А1а | Уа1 | С1и |
340 | 345 | 350 | |||||||||||||
Рго | Азр | Агд | Туг | Уа1 | 11е | Ьеи | С1у | С1у | Н1з | Агд | Азр | Зег | Тгр | Уа1 | РЬе |
355 | 360 | 365 | |||||||||||||
С1у | С1у | 11е | Азр | Рго | С1п | Зег | С1у | А1а | А1а | Уа1 | Уа1 | Н1з | С1и | 11е | Уа1 |
370 | 375 | 380 | |||||||||||||
Агд | Зег | РЬе | С1у | ТЬг | Ьеи | Ьуз | Ьуз | С1и | С1у | Тгр | Агд | Рго | Агд | Агд | ТЬг |
385 | 390 | 395 | 400 | ||||||||||||
11е | Ьеи | РЬе | А1а | Зег | Тгр | Азр | А1а | С1и | С1и | РЬе | С1у | Ьеи | Ьеи | С1у | Зег |
405 | 410 | 415 | |||||||||||||
ТЬг | С1и | Тгр | А1а | С1и | С1и | Азп | Зег | Агд | Ьеи | Ьеи | С1п | С1и | Агд | С1у | Уа1 |
420 | 425 | 430 | |||||||||||||
А1а | Туг | 11е | Азп | А1а | Азр | Зег | Зег | 11е | С1и | С1у | Азп | Туг | ТЬг | Ьеи | Агд |
435 | 440 | 445 | |||||||||||||
Уа1 | Азр | Суз | ТЬг | Рго | Ьеи | МеЬ | Туг | Зег | Ьеи | Уа1 | Туг | Азп | Ьеи | ТЬг | Ьуз |
450 455 460
- 60 027315
Θ1υ 465 | Ьеи | С1и | Зег | Рго | Азр 470 | С1и | С1у | РЬе | С1и | С1у 475 | Ьуз | Зег | Ьеи | Туг | С1и 480 |
Зег | Тгр | ТЬг | Ьуз | Ьуз | Зег | Рго | Зег | Рго | С1и | РЬе | Зег | С1у | МеЕ | Рго | Агд |
485 | 490 | 495 | |||||||||||||
11е | Зег | Ьуз | Ьеи | С1у | Зег | С1у | Азп | Азр | РЬе | С1и | Уа1 | РЬе | РЬе | С1п | Агд |
500 | 505 | 510 | |||||||||||||
Ьеи | С1у | 11е | А1а | Зег | С1у | Агд | А1а | Агд | Туг | ТЬг | Ьуз | Азп | Тгр | С1и | ТЬг |
515 | 520 | 525 | |||||||||||||
Азп | Ьуз | РЬе | Зег | Зег | Туг | Рго | Ьеи | Туг | Н1з | Зег | Уа1 | Туг | С1и | ТЬг | Туг |
530 | 535 | 540 | |||||||||||||
С1и | Ьеи | Уа1 | С1и | Ьуз | РЬе | Туг | Азр | Рго | МеЕ | РЬе | Ьуз | Туг | Н1з | Ьеи | ТЬг |
545 | 550 | 555 | 560 | ||||||||||||
Уа1 | А1а | С1п | Уа1 | Агд | С1у | С1у | МеЕ | Уа1 | РЬе | С1и | Ьеи | А1а | Азп | Зег | Уа1 |
565 | 570 | 575 | |||||||||||||
Уа1 | Ьеи | Рго | РЬе | Азр | Суз | Агд | Азр | Туг | А1а | Уа1 | Уа1 | Ьеи | Агд | Ьуз | Туг |
580 | 585 | 590 | |||||||||||||
А1а | Азр | Ьуз | 11е | Туг | Азп | 11е | Зег | МеЕ | Ьуз | Н1з | Рго | С1п | С1и | МеЕ | Ьуз |
595 | 600 | 605 | |||||||||||||
ТЬг | Туг | Зег | Уа1 | Зег | РЬе | Азр | Зег | Ьеи | РЬе | Зег | А1а | Уа1 | Ьуз | Азп | РЬе |
610 | 615 | 620 | |||||||||||||
ТЬг | С1и | 11е | А1а | Зег | Ьуз | РЬе | Зег | С1и | Агд | Ьеи | Агд | Азр | РЬе | Азр | Ьуз |
625 | 630 | 635 | 640 | ||||||||||||
Зег | Азп | Рго | 11е | Ьеи | Ьеи | Агд | МеЕ | МеЕ | Азп | Азр | С1п | Ьеи | МеЕ | РЬе | Ьеи |
645 | 650 | 655 | |||||||||||||
С1и | Агд | А1а | РЬе | 11е | Азр | Рго | Ьеи | С1у | Ьеи | Рго | Азр | Агд | Рго | РЬе | Туг |
660 | 665 | 670 | |||||||||||||
Агд | Н1з | Уа1 | 11е | Туг | А1а | Рго | Зег | Зег | Н1з | Азп | Ьуз | Туг | А1а | С1у | С1и |
675 | 680 | 685 | |||||||||||||
Зег | РЬе | Рго | С1у | 11е | Туг | Азр | А1а | Ьеи | РЬе | Азр | 11е | С1и | Зег | Ьуз | Уа1 |
690 | 695 | 700 | |||||||||||||
Азр | Рго | Зег | С1п | А1а | Тгр | С1у | С1и | Уа1 | Ьуз | Агд | С1п | 11е | Зег | 11е | А1а |
705 | 710 | 715 | 720 |
- 61 027315
ТЕг РЕе ТЕг ναΐ С1п А1а А1а А1а 01и ТЕг Ьеи Зег 01и Уа1 А1а 725 730 735 <210> 25 <211> 704 <212> БЕЛОК <213> Искусственная последовательность <220>
<223> М. ти1аЬЬа_ОСРЬЬ_1зо2_ХР_002799784.1 <400> 25
МеЬ 1 | 11е | А1а | С1у | Зег 5 | Зег | Туг | Рго | Ьеи | Ьеи 10 | Ьеи | А1а | А1а | Туг | А1а 15 | Суз |
ТЕг | С1у | Суз | Ьеи | А1а | С1и | Агд | Ьеи | С1у | Тгр | РЕе | 11е | Ьуз | Зег | Зег | Зег |
20 | 25 | 30 | |||||||||||||
С1и | А1а | ТЕг | Азп | 11е | ТЕг | Рго | Ьуз | Н1з | Азп | МеЬ | Ьуз | А1а | РЕе | Ьеи | Азр |
35 | 40 | 45 | |||||||||||||
С1и | Ьеи | Ьуз | А1а | С1и | Азп | 11е | Ьуз | Ьуз | РЕе | Ьеи | Н1з | Азп | РЕе | ТЕг | С1п |
50 | 55 | 60 | |||||||||||||
11е | Рго | Н1з | Ьеи | А1а | С1у | ТЕг | С1и | С1п | Азп | РЕе | С1п | Ьеи | А1а | Ьуз | С1п |
65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
11е | С1п | Зег | С1п | Тгр | Ьуз | С1и | РЕе | С1у | Ьеи | Азр | Зег | Уа1 | С1и | Ьеи | ТЕг |
85 | 90 | 95 | |||||||||||||
Н1з | Туг | Азр | Уа1 | Ьеи | Ьеи | Зег | Туг | Рго | Азп | Ьуз | ТЕг | Н1з | Рго | Азп | Туг |
100 | 105 | 110 | |||||||||||||
11е | Зег | 11е | 11е | Азп | С1и | Азр | С1у | Азп | С1и | 11е | РЕе | Азп | ТЕг | Зег | Ьеи |
115 | 120 | 125 | |||||||||||||
РЕе | С1и | Рго | Рго | Рго | А1а | С1у | Туг | С1и | Азп | Уа1 | Зег | Азр | 11е | Уа1 | Рго |
130 | 135 | 140 | |||||||||||||
Рго | РЕе | Зег | А1а | РЕе | Зег | Рго | С1п | С1у | МеЬ | Рго | С1и | С1у | Азр | Ьеи | Уа1 |
145 | 150 | 155 | 160 | ||||||||||||
Туг | Уа1 | Азп | Туг | А1а | Агд | ТЕг | С1и | Азр | РЕе | РЕе | Ьуз | Ьеи | С1и | Агд | Азр |
165 | 170 | 175 | |||||||||||||
МеЬ | Ьуз | 11е | Азп | Суз | Зег | С1у | Ьуз | 11е | Уа1 | 11е | А1а | Агд | Туг | С1у | Ьуз |
180 | 185 | 190 |
- 62 027315
Уа1 | РЬе | Агд 195 | С1у | Азп | Ьуз | Уа1 | Ьуз 200 | Азп | А1а | С1п | Ьеи | А1а 205 | С1у | А1а | ТЬг |
С1у | Уа1 | 11е | Ьеи | Туг | Зег | Азр | Рго | А1а | Азр | Туг | РЬе | А1а | Рго | С1у | Уа1 |
210 | 215 | 220 | |||||||||||||
Ьуз | Зег | Туг | Рго | Азр | С1у | Тгр | Азп | Ьеи | Рго | С1у | С1у | С1у | Уа1 | С1п | Агд |
225 | 230 | 235 | 240 | ||||||||||||
С1у | Азп | 11е | Ьеи | Азп | Ьеи | Азп | С1у | А1а | С1у | Азр | Рго | Ьеи | ТЬг | Рго | С1у |
245 | 250 | 255 | |||||||||||||
Туг | Рго | А1а | Азп | С1и | Туг | А1а | Туг | Агд | Агд | С1у | МеК | А1а | С1и | А1а | Уа1 |
260 | 265 | 270 | |||||||||||||
С1у | Ьеи | Рго | Зег | 11е | Рго | Уа1 | Н1з | Рго | 11е | С1у | Туг | Туг | Азр | А1а | С1п |
275 | 280 | 285 | |||||||||||||
Ьуз | Ьеи | Ьеи | С1и | Ьуз | МеК | С1у | С1у | Зег | А1а | Зег | Рго | Азр | Зег | Зег | Тгр |
290 | 295 | 300 | |||||||||||||
Агд | С1у | Зег | Ьеи | Ьуз | Уа1 | Рго | Туг | Азп | Уа1 | С1у | Рго | С1у | РЬе | ТЬг | С1у |
305 | 310 | 315 | 320 | ||||||||||||
Азп | РЬе | Зег | ТЬг | С1п | Ьуз | Уа1 | Ьуз | МеК | Н1з | 11е | Н1з | Зег | ТЬг | Зег | С1и |
325 | 330 | 335 | |||||||||||||
Уа1 | ТЬг | Агд | 11е | Туг | Азп | Уа1 | 11е | С1у | ТЬг | Ьеи | Агд | С1у | А1а | Уа1 | С1и |
340 | 345 | 350 | |||||||||||||
Рго | Азр | Агд | Туг | Уа1 | 11е | Ьеи | С1у | С1у | Н1з | Агд | Азр | Зег | Тгр | Уа1 | РЬе |
355 | 360 | 365 | |||||||||||||
С1у | С1у | 11е | Азр | Рго | С1п | Зег | С1у | А1а | А1а | Уа1 | Уа1 | Н1з | С1и | 11е | Уа1 |
370 | 375 | 380 | |||||||||||||
Агд | Зег | РЬе | С1у | ТЬг | Ьеи | Ьуз | Ьуз | С1и | С1у | Тгр | Агд | Рго | Агд | Агд | ТЬг |
385 | 390 | 395 | 400 | ||||||||||||
11е | Ьеи | РЬе | А1а | Зег | Тгр | Азр | А1а | С1и | С1и | РЬе | С1у | Ьеи | Ьеи | С1у | Зег |
405 | 410 | 415 | |||||||||||||
ТЬг | С1и | Тгр | А1а | С1и | С1и | Азп | Зег | Агд | Ьеи | Ьеи | С1п | С1и | Агд | С1у | Уа1 |
420 | 425 | 430 | |||||||||||||
А1а | Туг | 11е | Азп | А1а | Азр | Зег | Зег | 11е | С1и | С1у | Азп | Туг | ТЬг | Ьеи | Агд |
435 | 440 | 445 |
- 63 027315
να1 | Азр 450 | Суз | ТЬг | Рго | Ьеи | МеК 455 | Туг | Зег | Ьеи | Уа1 | Туг 460 | Азп | Ьеи | ТЬг | Ьуз |
Θ1υ | Ьеи | С1и | Зег | Рго | Азр | С1и | С1у | РЬе | С1и | С1у | Ьуз | Зег | Ьеи | Туг | С1и |
465 | 470 | 475 | 480 | ||||||||||||
Зег | Тгр | ТЬг | Ьуз | Ьуз | Зег | Рго | Зег | Рго | С1и | РЬе | Зег | С1у | МеК | Рго | Агд |
485 | 490 | 495 | |||||||||||||
11е | Зег | Ьуз | Ьеи | С1у | Зег | С1у | Азп | Азр | РЬе | С1и | Уа1 | РЬе | РЬе | С1п | Агд |
500 | 505 | 510 | |||||||||||||
Ьеи | С1у | 11е | А1а | Зег | С1у | Агд | А1а | Агд | Туг | ТЬг | Ьуз | Азп | Тгр | С1и | ТЬг |
515 | 520 | 525 | |||||||||||||
Азп | Ьуз | РЬе | Зег | Зег | Туг | Рго | Ьеи | Туг | Н1з | Зег | Уа1 | Туг | С1и | ТЬг | Туг |
530 | 535 | 540 | |||||||||||||
С1и | Ьеи | Уа1 | С1и | Ьуз | РЬе | Туг | Азр | Рго | МеК | РЬе | Ьуз | Туг | Н1з | Ьеи | ТЬг |
545 | 550 | 555 | 560 | ||||||||||||
να1 | А1а | С1п | Уа1 | Агд | С1у | С1у | МеК | Уа1 | РЬе | С1и | Ьеи | А1а | Азп | Зег | Уа1 |
565 | 570 | 575 | |||||||||||||
να1 | Ьеи | Рго | РЬе | Азр | Суз | Агд | Азр | Туг | А1а | Уа1 | Уа1 | Ьеи | Агд | Ьуз | Туг |
580 | 585 | 590 | |||||||||||||
А1а | Азр | Ьуз | 11е | Туг | Азп | 11е | Зег | МеК | Ьуз | Н1з | Рго | С1п | С1и | МеК | Ьуз |
595 | 600 | 605 | |||||||||||||
ТЬг | Туг | Зег | Уа1 | Зег | РЬе | Азр | Зег | Ьеи | РЬе | Зег | А1а | Уа1 | Ьуз | Азп | РЬе |
610 | 615 | 620 | |||||||||||||
ТЬг | С1и | 11е | А1а | Зег | Ьуз | РЬе | Зег | С1и | Агд | Ьеи | Агд | Азр | РЬе | Азр | Ьуз |
625 | 630 | 635 | 640 | ||||||||||||
Зег | Ьуз | Н1з | Уа1 | 11е | Туг | А1а | Рго | Зег | Зег | Н1з | Азп | Ьуз | Туг | А1а | С1у |
645 | 650 | 655 | |||||||||||||
С1и | Зег | РЬе | Рго | С1у | 11е | Туг | Азр | А1а | Ьеи | РЬе | Азр | 11е | С1и | Зег | Ьуз |
660 | 665 | 670 | |||||||||||||
Уа1 | Азр | Рго | Зег | С1п | А1а | Тгр | С1у | С1и | Уа1 | Ьуз | Агд | С1п | 11е | Зег | 11е |
675 | 680 | 685 | |||||||||||||
А1а | ТЬг | РЬе | ТЬг | Уа1 | С1п | А1а | А1а | А1а | С1и | ТЬг | Ьеи | Зег | С1и | Уа1 | А1а |
690 695 700
- 64 027315 <210> 26 <211> 339 <212> БЕЛОК <213> Искусственная последовательность <220>
<223> ИР036581.1_Нитап_ЗТЕАР1 <400> 26
МеЕ 1 | С1и | Зег | Агд | Ьуз 5 | Азр | 11е | ТЬг | Азп | С1п 10 | С1и | С1и | Ьеи | Тгр | Ьуз 15 | МеЕ |
Ьуз | Рго | Агд | Агд | Азп | Ьеи | С1и | С1и | Азр | Азр | Туг | Ьеи | Н1з | Ьуз | Азр | ТЬг |
20 | 25 | 30 | |||||||||||||
С1у | С1и | ТЬг | Зег | МеЕ | Ьеи | Ьуз | Агд | Рго | Уа1 | Ьеи | Ьеи | Н1з | Ьеи | Н1з | С1п |
35 | 40 | 45 | |||||||||||||
ТЬг | А1а | Н1з | А1а | Азр | С1и | РЬе | Азр | Суз | Рго | Зег | С1и | Ьеи | С1п | Н1з | ТЬг |
50 | 55 | 60 | |||||||||||||
С1п | С1и | Ьеи | РЬе | Рго | С1п | Тгр | Н1з | Ьеи | Рго | 11е | Ьуз | 11е | А1а | А1а | 11е |
65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
11е | А1а | Зег | Ьеи | ТЬг | РЬе | Ьеи | Туг | ТЬг | Ьеи | Ьеи | Агд | С1и | Уа1 | 11е | Н1з |
85 | 90 | 95 | |||||||||||||
Рго | Ьеи | А1а | ТЬг | Зег | Н1з | С1п | С1п | Туг | РЬе | Туг | Ьуз | 11е | Рго | 11е | Ьеи |
100 | 105 | 110 | |||||||||||||
Уа1 | 11е | Азп | Ьуз | Уа1 | Ьеи | Рго | МеЕ | Уа1 | Зег | 11е | ТЬг | Ьеи | Ьеи | А1а | Ьеи |
115 | 120 | 125 | |||||||||||||
Уа1 | Туг | Ьеи | Рго | С1у | Уа1 | 11е | А1а | А1а | 11е | Уа1 | С1п | Ьеи | Н1з | Азп | С1у |
130 | 135 | 140 | |||||||||||||
ТЬг | Ьуз | Туг | Ьуз | Ьуз | РЬе | Рго | Н1з | Тгр | Ьеи | Азр | Ьуз | Тгр | МеЕ | Ьеи | ТЬг |
145 | 150 | 155 | 160 | ||||||||||||
Агд | Ьуз | С1п | РЬе | С1у | Ьеи | Ьеи | Зег | РЬе | РЬе | РЬе | А1а | Уа1 | Ьеи | Н1з | А1а |
165 | 170 | 175 | |||||||||||||
11е | Туг | Зег | Ьеи | Зег | Туг | Рго | МеЕ | Агд | Агд | Зег | Туг | Агд | Туг | Ьуз | Ьеи |
180 | 185 | 190 | |||||||||||||
Ьеи | Азп | Тгр | А1а | Туг | С1п | С1п | Уа1 | С1п | С1п | Азп | Ьуз | С1и | Азр | А1а | Тгр |
195 | 200 | 205 |
- 65 027315
11е | С1и 210 | Н1з | Азр | Уа1 | Тгр | Агд 215 | МеЕ | С1и | 11е | Туг | Уа1 220 | Зег | Ьеи | С1у | 11е |
Уа1 | С1у | Ьеи | А1а | 11е | Ьеи | А1а | Ьеи | Ьеи | А1а | Уа1 | ТЬг | Зег | 11е | Рго | Зег |
225 | 230 | 235 | 240 | ||||||||||||
Уа1 | Зег | Азр | Зег | Ьеи | ТЬг | Тгр | Агд | С1и | РЬе | Н1з | Туг | 11е | С1п | Зег | Ьуз |
245 | 250 | 255 | |||||||||||||
Ьеи | С1у | 11е | Уа1 | Зег | Ьеи | Ьеи | Ьеи | С1у | ТЬг | 11е | Н1з | А1а | Ьеи | 11е | РЬе |
260 | 265 | 270 | |||||||||||||
А1а | Тгр | Азп | Ьуз | Тгр | 11е | Азр | 11е | Ьуз | С1п | РЬе | Уа1 | Тгр | Туг | ТЬг | Рго |
275 | 280 | 285 | |||||||||||||
Рго | ТЬг | РЬе | МеЕ | 11е | А1а | Уа1 | РЬе | Ьеи | Рго | 11е | Уа1 | Уа1 | Ьеи | 11е | РЬе |
290 | 295 | 300 | |||||||||||||
Ьуз | Зег | 11е | Ьеи | РЬе | Ьеи | Рго | Суз | Ьеи | Агд | Ьуз | Ьуз | 11е | Ьеи | Ьуз | 11е |
305 | 310 | 315 | 320 | ||||||||||||
Агд | Н1з | С1у | Тгр | С1и | Азр | Уа1 | ТЬг | Ьуз | 11е | Азп | Ьуз | ТЬг | С1и | 11е | Суз |
325 | 330 | 335 | |||||||||||||
Зег | С1п | Ьеи |
<210> 27 <211> 339 <212> БЕЛОК <213> Искусственная последовательность <220>
<223> | ЕАЬ24167. | .1_Нитап_ЗТЕАР1 | ||||||||
<400> | 27 | |||||||||
МеЕ С1и | Зег Агд | Ьуз Азр 11е ТЬг | Азп | С1п | С1и | С1и | Ьеи | Тгр | Ьуз | МеЕ |
1 | 5 | 10 | 15 | |||||||
Ьуз Рго | Агд Агд | Азп Ьеи С1и С1и | Азр | Азр | Туг | Ьеи | Н1з | Ьуз | Азр | ТЬг |
20 | 25 | 30 | ||||||||
С1у С1и | ТЬг Зег | МеЕ Ьеи Ьуз Агд | Рго | Уа1 | Ьеи | Ьеи | Н1з | Ьеи | С1п | С1п |
35 | 40 | 45 | ||||||||
ТЬг А1а | Н1з А1а | Азр С1и РЬе Азр | Суз | Рго | Зег | С1и | Ьеи | С1п | Н1з | ТЬг |
55 60
- 66 027315
С1п 65 | С1и | Ьеи | РЬе | Рго | С1п 70 | Тгр | Н1з | Ьеи | Рго | 11е 75 | Ьуз | 11е | А1а | А1а | 11е 80 |
11е | А1а | Зег | Ьеи | ТЬг | РЬе | Ьеи | Туг | ТЬг | Ьеи | Ьеи | Агд | С1и | Уа1 | 11е | Н1з |
85 | 90 | 95 | |||||||||||||
Рго | Ьеи | А1а | ТЬг | Зег | Н1з | С1п | С1п | Туг | РЬе | Туг | Ьуз | 11е | Рго | 11е | Ьеи |
100 | 105 | 110 | |||||||||||||
Уа1 | 11е | Азп | Ьуз | Уа1 | Ьеи | Рго | МеЬ | Уа1 | Зег | 11е | ТЬг | Ьеи | Ьеи | А1а | Ьеи |
115 | 120 | 125 | |||||||||||||
Уа1 | Туг | Ьеи | Рго | С1у | Уа1 | 11е | А1а | А1а | 11е | Уа1 | С1п | Ьеи | Н1з | Азп | С1у |
130 | 135 | 140 | |||||||||||||
ТЬг | Ьуз | Туг | Ьуз | Ьуз | РЬе | Рго | Н1з | Тгр | Ьеи | Азр | Ьуз | Тгр | МеЬ | Ьеи | ТЬг |
145 | 150 | 155 | 160 | ||||||||||||
Агд | Ьуз | С1п | РЬе | С1у | Ьеи | Ьеи | Зег | РЬе | РЬе | РЬе | А1а | Уа1 | Ьеи | Н1з | А1а |
165 | 170 | 175 | |||||||||||||
11е | Туг | Зег | Ьеи | Зег | Туг | Рго | МеЬ | Агд | Агд | Зег | Туг | Агд | Туг | Ьуз | Ьеи |
180 | 185 | 190 | |||||||||||||
Ьеи | Азп | Тгр | А1а | Туг | С1п | С1п | Уа1 | С1п | С1п | Азп | Ьуз | С1и | Азр | А1а | Тгр |
195 | 200 | 205 | |||||||||||||
11е | С1и | Н1з | Азр | Уа1 | Тгр | Агд | МеЬ | С1и | 11е | Туг | Уа1 | Зег | Ьеи | С1у | 11е |
210 | 215 | 220 | |||||||||||||
Уа1 | С1у | Ьеи | А1а | 11е | Ьеи | А1а | Ьеи | Ьеи | А1а | Уа1 | ТЬг | Зег | 11е | Рго | Зег |
225 | 230 | 235 | 240 | ||||||||||||
Уа1 | Зег | Азр | Зег | Ьеи | ТЬг | Тгр | Агд | С1и | РЬе | Н1з | Туг | 11е | С1п | Зег | Ьуз |
245 | 250 | 255 | |||||||||||||
Ьеи | С1у | 11е | Уа1 | Зег | Ьеи | Ьеи | Ьеи | С1у | ТЬг | 11е | Н1з | А1а | Ьеи | 11е | РЬе |
260 | 265 | 270 | |||||||||||||
А1а | Тгр | Азп | Ьуз | Тгр | 11е | Азр | 11е | Ьуз | С1п | РЬе | Уа1 | Тгр | Туг | ТЬг | Рго |
275 | 280 | 285 | |||||||||||||
Рго | ТЬг | РЬе | МеЬ | 11е | А1а | Уа1 | РЬе | Ьеи | Рго | 11е | Уа1 | Уа1 | Ьеи | 11е | РЬе |
290 | 295 | 300 | |||||||||||||
Ьуз | Зег | 11е | Ьеи | РЬе | Ьеи | Рго | Суз | Ьеи | Агд | Ьуз | Ьуз | 11е | Ьеи | Ьуз | 11е |
305 | 310 | 315 | 320 |
- 67 027315
Агд | Н1з | С1у | Тгр С1и Азр Уа1 | ТПг ^уз 11е Азп ^уз | ТПг С1и 11е Суз |
Зег | С1п | ^еυ | 325 | 330 | 335 |
<210> 28 <211> 339 <212> БЕЛОК <213> Искусственная последовательность <220>
<223> ХР001103605.1_М.ти1аЕЕа_ЗТЕАР1_1зо3 <400> 28
МеЕ 1 | С1и | Зег | Агд | ^уз 5 | Азр | 11е | ТПг | Азп | С1и 10 | С1и | С1и | ^еυ | Тгр | ^уз 15 | МеЕ |
^уз | Рго | Агд | Агд | Азп | ^еυ | С1и | С1и | Азр | Азр | Туг | ^еυ | Н1з | ^уз | Азр | ТПг |
20 | 25 | 30 | |||||||||||||
С1у | С1и | ТПг | Зег | МеЕ | ^еυ | ^уз | Агд | Рго | Уа1 | ^еυ | ^еυ | Н1з | ^еυ | Н1з | С1п |
35 | 40 | 45 | |||||||||||||
ТПг | А1а | Н1з | А1а | Азр | С1и | РПе | Азр | Суз | Рго | Зег | С1и | ^еυ | С1п | Н1з | ТПг |
50 | 55 | 60 | |||||||||||||
С1п | С1и | ^еυ | РПе | Рго | С1п | Тгр | Н1з | ^еυ | Рго | 11е | ^уз | 11е | А1а | А1а | 11е |
65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
11е | А1а | Зег | ^еυ | ТПг | РПе | ^еυ | Туг | ТПг | ^еυ | ^еυ | Агд | С1и | Уа1 | 11е | Н1з |
85 | 90 | 95 | |||||||||||||
Рго | ^еυ | А1а | ТПг | Зег | Н1з | С1п | С1п | Туг | РПе | Туг | ^уз | 11е | Рго | 11е | ^еυ |
100 | 105 | 110 | |||||||||||||
Уа1 | 11е | Азп | ^уз | Уа1 | ^еυ | Рго | МеЕ | Уа1 | Зег | 11е | ТПг | ^еυ | ^еυ | А1а | ^еυ |
115 | 120 | 125 | |||||||||||||
Уа1 | Туг | ^еυ | Рго | С1у | Уа1 | 11е | А1а | А1а | 11е | Уа1 | С1п | ^еυ | Н1з | Азп | С1у |
130 | 135 | 140 | |||||||||||||
ТПг | ^уз | Туг | ^уз | ^уз | РПе | Рго | Н1з | Тгр | ^еυ | Азр | ^уз | Тгр | МеЕ | ^еυ | ТПг |
145 | 150 | 155 | 160 | ||||||||||||
Агд | ^уз | С1п | РПе | С1у | ^еυ | ^еυ | Зег | РПе | РПе | РПе | А1а | Уа1 | ^еυ | Н1з | А1а |
165 | 170 | 175 |
- 68 027315
11е | Туг | Зег | Ьеи 180 | Зег | Туг | Рго | МеЕ | Ατρ 185 | Ατρ | Зег | Туг | Ατρ | Туг 190 | Ьуз | Ьеи |
Ьеи | Αзη | Тгр | Α^ | Туг | С1п | С1п | Vа1 | С1п | С1п | Αзη | Ьуз | С1и | Αзρ | Α^ | Тгр |
195 | 200 | 205 | |||||||||||||
11е | С1и | Н1з | Αзρ | Vа1 | Тгр | Ατρ | МеЕ | С1и | 11е | Туг | Vа1 | Зег | Ьеи | С1у | 11е |
210 | 215 | 220 | |||||||||||||
Vа1 | С1у | Ьеи | Α^ | 11е | Ьеи | Α^ | Ьеи | Ьеи | Α^ | Vа1 | ТЕг | Зег | 11е | Рго | Зег |
225 | 230 | 235 | 240 | ||||||||||||
Vа1 | Зег | Αзρ | Зег | Ьеи | ТЕг | Тгр | Ατρ | С1и | РЕе | Н1з | Туг | 11е | С1п | Зег | Ьуз |
245 | 250 | 255 | |||||||||||||
Ьеи | С1у | 11е | Vа1 | Зег | Ьеи | Ьеи | Ьеи | Α^ | ТЕг | 11е | Н1з | Α^ | Ьеи | 11е | РЕе |
260 | 265 | 270 | |||||||||||||
Α^ | Тгр | Αзη | Ьуз | Тгр | 11е | Αзρ | 11е | Ьуз | С1п | РЕе | Vа1 | Тгр | Туг | ТЕг | Рго |
275 | 280 | 285 | |||||||||||||
Рго | ТЕг | РЕе | МеЕ | 11е | Α^ | Vа1 | РЕе | Ьеи | Рго | Vа1 | Vа1 | Vа1 | Ьеи | 11е | РЕе |
290 | 295 | 300 | |||||||||||||
Ьуз | Зег | 11е | Ьеи | РЕе | Ьеи | Рго | Суз | Ьеи | Ατρ | Ьуз | Ьуз | 11е | Ьеи | Ьуз | 11е |
305 | 310 | 315 | 320 | ||||||||||||
Ατρ | Н1з | С1у | Тгр | С1и | Αзρ | Vа1 | ТЕг | Ьуз | 11е | Αзη | Ьуз | МеЕ | С1и | 11е | Зег |
325 | 330 | 335 | |||||||||||||
Зег | С1п | Ьеи |
<210> 29 <211> 259 <212> БЕЛОК <213> Искусственная последовательность <220>
<223> | ΕΑИ93751. | .1_Нитаη_ЗΤΕΑΡ1_СΗΑЬ | |||||||
<400> | 29 | ||||||||
МеЕ С1и | Зег Ατρ | Ьуз Αзρ 11е ТЕг Αзη | С1п | С1и | С1и | 11е | Тгр | Ьуз | МеЕ |
1 | 5 | 10 | 15 | ||||||
Ьуз Рго | Ατρ Ατρ | Αзη Ьеи С1и Αзρ Αзη | Αзρ | Туг | Ьеи | Н1з | Ьуз | Αзρ | ТЕг |
20 | 25 | 30 | |||||||
С1у С1и | ТЕг Зег | МеЕ Ьеи Ьуз Ατρ Рго | Vа1 | Ьеи | Ьеи | Н1з | Ьеи | С1п | С1п |
- 69 027315
40 45
ТЬг | А1а 50 | Н1з | А1а | Азр | С1и | РЬе 55 | Азр | Суз | Рго | Зег | С1и 60 | Ьеи | С1п | Н1з | А1а |
С1п | С1и | Ьеи | РЬе | Рго | С1п | Тгр | Н1з | Ьеи | Рго | 11е | Ьуз | 11е | А1а | А1а | Уа1 |
65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
МеК | А1а | Зег | Ьеи | ТЬг | РЬе | Ьеи | Туг | ТЬг | Ьеи | Ьеи | Агд | С1и | Уа1 | 11е | Н1з |
85 | 90 | 95 | |||||||||||||
Рго | Ьеи | А1а | ТЬг | Зег | Н1з | С1п | С1п | Туг | РЬе | Туг | Ьуз | 11е | Рго | 11е | Ьеи |
100 | 105 | 110 | |||||||||||||
Уа1 | 11е | Азп | Ьуз | Уа1 | Ьеи | Рго | МеК | Уа1 | Зег | 11е | ТЬг | Ьеи | Ьеи | А1а | Ьеи |
115 | 120 | 125 | |||||||||||||
Уа1 | Туг | Ьеи | Рго | С1у | Уа1 | 11е | А1а | А1а | 11е | Уа1 | С1п | Уа1 | Н1з | Азп | С1у |
130 | 135 | 140 | |||||||||||||
ТЬг | Ьуз | Туг | Ьуз | Ьуз | РЬе | Рго | Н1з | Тгр | Ьеи | Азр | Ьуз | Тгр | МеК | Ьеи | ТЬг |
145 | 150 | 155 | 160 | ||||||||||||
Агд | Ьуз | С1п | РЬе | С1у | Ьеи | Ьеи | Зег | Ьеи | РЬе | РЬе | А1а | Уа1 | Ьеи | Н1з | А1а |
165 | 170 | 175 | |||||||||||||
11е | Туг | ТЬг | Ьеи | Зег | Туг | А1а | МеК | Агд | Агд | Зег | Туг | Агд | Туг | Ьуз | Ьеи |
180 | 185 | 190 | |||||||||||||
Ьеи | Азп | Тгр | А1а | Туг | С1п | С1п | Уа1 | С1п | С1п | Азп | Ьуз | С1и | Азр | А1а | Тгр |
195 | 200 | 205 | |||||||||||||
11е | С1и | Н1з | Азр | Уа1 | Тгр | Агд | МеК | С1и | 11е | Туг | Уа1 | Зег | Ьеи | С1у | 11е |
210 | 215 | 220 | |||||||||||||
Уа1 | С1у | Ьеи | А1а | 11е | Ьеи | А1а | Ьеи | Ьеи | А1а | Уа1 | ТЬг | Зег | 11е | Рго | Зег |
225 | 230 | 235 | 240 | ||||||||||||
Уа1 | Зег | Азр | Зег | Ьеи | ТЬг | Тгр | Агд | С1и | РЬе | Н1з | Туг | 11е | С1п | Агд | Ьеи |
245 | 250 | 255 |
Ьеи С1п С1и <210> 30 <211> 258 <212> БЕЛОК <213> Искусственная последовательность
- 70 027315 <220>
<223> ЕАИ93749.1_Нитап_ЗТЕАР1_СНАа <400> 30
МеК 1 | С1и | Зег | Агд | Ьуз 5 | Азр | 11е | ТИг | Азп | С1п 10 | С1и | С1и | 11е | Тгр | Ьуз 15 | МеК |
Ьуз | Рго | Агд | Агд | Азп | Ьеи | С1и | Азр | Азп | Азр | Туг | Ьеи | Н1з | Ьуз | Азр | ТИг |
20 | 25 | 30 | |||||||||||||
С1у | С1и | ТИг | Зег | МеК | Ьеи | Ьуз | Агд | Рго | Уа1 | Ьеи | Ьеи | Н1з | Ьеи | С1п | С1п |
35 | 40 | 45 | |||||||||||||
ТИг | А1а | Н1з | А1а | Азр | С1и | РИе | Азр | Суз | Рго | Зег | С1и | Ьеи | С1п | Н1з | А1а |
50 | 55 | 60 | |||||||||||||
С1п | С1и | Ьеи | РИе | Рго | С1п | Тгр | Н1з | Ьеи | Рго | 11е | Ьуз | 11е | А1а | А1а | Уа1 |
65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
МеК | А1а | Зег | Ьеи | ТИг | РИе | Ьеи | Туг | ТИг | Ьеи | Ьеи | Агд | С1и | Уа1 | 11е | Н1з |
85 | 90 | 95 | |||||||||||||
Рго | Ьеи | А1а | ТИг | Зег | Н1з | С1п | С1п | Туг | РИе | Туг | Ьуз | 11е | Рго | 11е | Ьеи |
100 | 105 | 110 | |||||||||||||
Уа1 | 11е | Азп | Ьуз | Уа1 | Ьеи | Рго | МеК | Уа1 | Зег | 11е | ТИг | Ьеи | Ьеи | А1а | Ьеи |
115 | 120 | 125 | |||||||||||||
Уа1 | Туг | Ьеи | Рго | С1у | Уа1 | 11е | А1а | А1а | 11е | Уа1 | С1п | Уа1 | Н1з | Азп | С1у |
130 | 135 | 140 | |||||||||||||
ТИг | Ьуз | Туг | Ьуз | Ьуз | РИе | Рго | Н1з | Тгр | Ьеи | Азр | Ьуз | Тгр | МеК | Ьеи | ТИг |
145 | 150 | 155 | 160 | ||||||||||||
Агд | Ьуз | С1п | РИе | С1у | Ьеи | Ьеи | Зег | Ьеи | РИе | РИе | А1а | Уа1 | Ьеи | Н1з | А1а |
165 | 170 | 175 | |||||||||||||
11е | Туг | ТИг | Ьеи | Зег | Туг | А1а | МеК | Агд | Агд | Зег | Туг | Агд | Туг | Ьуз | Ьеи |
180 | 185 | 190 | |||||||||||||
Ьеи | Азп | Тгр | А1а | Туг | С1п | С1п | Уа1 | С1п | С1п | Азп | Ьуз | С1и | Азр | А1а | Тгр |
195 | 200 | 205 | |||||||||||||
11е | С1и | Н1з | Азр | Уа1 | Тгр | Агд | МеК | С1и | 11е | Туг | Уа1 | Зег | Ьеи | С1у | 11е |
210 | 215 | 220 | |||||||||||||
Уа1 | С1у | Ьеи | А1а | 11е | Ьеи | А1а | Ьеи | Ьеи | А1а | Уа1 | ТИг | Зег | 11е | Рго | Зег |
- 71 027315
225 230 235 240
Уа1 Зег Азр Зег Ьеи ТЬг Тгр Агд С1и РЬе Н1з Туг 11е С1п Уа1 Азп 245 250 255
Азп 11е <210> 31 <211> 114 <212> БЕЛОК <213> Искусственная последовательность <220>
<223> ИР_005663.2_Нишап_РЗСА <400> 31
МеК 1 | А1а | С1у | Ьеи | А1а 5 | Ьеи | С1п | Рго | С1у | ТЬг 10 | А1а | Ьеи | Ьеи | Суз | Туг 15 | Зег |
Суз | Ьуз | А1а | С1п | Уа1 | Зег | Азп | С1и | Азр | Суз | Ьеи | С1п | Уа1 | С1и | Азп | Суз |
20 | 25 | 30 | |||||||||||||
ТЬг | С1п | Ьеи | С1у | С1и | С1п | Суз | Тгр | ТЬг | А1а | Агд | 11е | Агд | А1а | Уа1 | С1у |
35 | 40 | 45 | |||||||||||||
Ьеи | Ьеи | ТЬг | Уа1 | 11е | Зег | Ьуз | С1у | Суз | Зег | Ьеи | Азп | Суз | Уа1 | Азр | Азр |
50 | 55 | 60 | |||||||||||||
Зег | С1п | Азр | Туг | Туг | Уа1 | С1у | Ьуз | Ьуз | Азп | 11е | ТЬг | Суз | Суз | Азр | ТЬг |
65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
Азр | Ьеи | Суз | Азп | А1а | Зег | С1у | А1а | Н1з | А1а | Ьеи | С1п | Рго | А1а | А1а | А1а |
85 | 90 | 95 | |||||||||||||
11е | Ьеи | А1а | Ьеи | Ьеи | Рго | А1а | Ьеи | С1у | Ьеи | Ьеи | Ьеи | Тгр | С1у | Рго | С1у |
100 | 105 | 110 |
С1п Ьеи <210> 31 <211> 9 <212> БЕЛОК <213> Искусственная последовательность <220>
<223> Марекр НА последовательности аминокислот <400> 31
Туг Рго Туг Азр Уа1 Рго Азр Туг А1а
Claims (14)
- ФОРМУЛА ИЗОБРЕТЕНИЯ1. Молекула нуклеиновой кислоты для индукции иммунного ответа против антигена рака предстательной железы, содержащая одну или более нуклеотидных последовательностей, кодирующих один или более белков, выбранных из:а) белка с аминокислотной последовательностью δΕΟ ΙΌ N0: 2 или гомологичной ей на 98% последовательностью, при условии, что сохранились аминокислотные остатки 69, 78, 80, 82, 102, 110, 137, 139, 165, 189, 203, 220, 232 и 248 последовательности δΕΟ ΙΌ N0: 2, или иммуногенного фрагмента последовательности δΕΟ ΙΌ N0: 2, содержащего по меньшей мере 256 аминокислотных остатков последовательности δΕΟ ΙΌ N0: 2, при условии, что сохранились аминокислотные остатки 69, 78, 80, 82, 102, 110, 137, 139, 165, 189, 203, 220, 232 и 248 последовательности δΕΟ ΙΌ N0: 2;б) белка с аминокислотной последовательностью δΕΟ ΙΌ N0: 4 или гомологичной ей на 98% последовательностью, при условии, что сохранились аминокислотные остатки 21, 86, 127, 129, 154, 156, 182, 195, 206, 218, 220, 237, 249, 255, 265, 271 и 275 последовательности δΕΟ ΙΌ N0: 4, или иммуногенного фрагмента последовательности δΕΟ ΙΌ N0: 4, содержащего по меньшей мере 274 аминокислотных остатка последовательности δΕΟ ΙΌ N0: 4, при условии, что сохранились аминокислотные остатки 21, 86, 127, 129, 154, 156, 182, 195, 206, 218, 220, 237, 249, 255, 265, 271 и 275 последовательности δΕΟ ΙΌ N0: 4.
- 2. Молекула нуклеиновой кислоты по п.1, дополнительно содержащая одну или более нуклеотидных последовательностей, кодирующих один или более белков, выбранных из:в) белка с аминокислотной последовательностью δΕΟ ΙΌ N0: 6 или гомологичной ей на 98% последовательностью, при условии, что сохранились аминокислотные остатки 14, 15, 32, 47, 58, 79, 111, 157, 223, 320, 350, 475, 499, 569, 613, 624, 653, 660, 663, 733 и 734 последовательности δΕΟ ΙΌ N0: 6, или иммуногенного фрагмента последовательности δΕΟ ΙΌ N0: 6, содержащего по меньшей мере 735 аминокислотных остатков последовательности δΕΟ ΙΌ N0: 6, при условии, что сохранились аминокислотные остатки 14, 15, 32, 47, 58, 79, 111, 157, 223, 320, 350, 475, 499, 569, 613, 624, 653, 660, 663, 733 и 734 последовательности δΕΟ ΙΌ N0: 6;г) белка с аминокислотной последовательностью δΕΟ ΙΌ N0: 8 или гомологичной ей на 98% последовательностью, при условии, что сохранились аминокислотные остатки 20, 30, 31, 48, 63, 74, 95, 127, 173, 239, 336, 366, 491, 515, 564, 585, 629, 640, 669, 676, 679, 749 и 750 последовательности δΕΟ ΙΌ N0: 8, или иммуногенного фрагмента последовательности δΕΟ ΙΌ N0: 8, содержащего по меньшей мере 751 аминокислотный остаток последовательности δΕΟ ΙΌ N0: 8, при условии, что сохранились аминокислотные остатки 20, 30, 31, 48, 63, 74, 95, 127, 173, 239, 336, 366, 491, 515, 564, 585, 629, 640, 669, 676, 679, 749 и 750 последовательности δΕΟ ΙΌ N0: 8.
- 3. Молекула нуклеиновой кислоты по любому из пп.1 или 2, кодирующая один или более белков с последовательностями, выбранными из δΕΟ ΙΌ N0: 2 и δΕΟ ΙΌ N0: 4.
- 4. Молекула нуклеиновой кислоты по п.1, содержащая одну или более нуклеотидных последовательностей, выбранных из:а) последовательности δΕΟ ΙΌ N0: 1 или гомологичной ей на 98% последовательности;б) последовательности δΕΟ ΙΌ N0: 3 или гомологичной ей на 98% последовательности.
- 5. Молекула нуклеиновой кислоты по п.4, дополнительно содержащая одну или более нуклеотидных последовательностей, выбранных из:в) последовательности, образованной нуклеотидами 1-2250 последовательности δΕΟ ΙΌ N0: 5, или гомологичной на 98% последовательности, образованной указанными нуклеотидами;г) последовательности, образованной нуклеотидами 1-2301 последовательности δΕΟ ΙΌ N0: 7, или гомологичной на 98% последовательности, образованной указанными нуклеотидами.
- 6. Молекула нуклеиновой кислоты по любому из пп.4 или 5, содержащая одну или более нуклеотидных последовательностей, выбранных из δΕΟ ΙΌ N0: 1 и δΕΟ ΙΌ N0: 3.
- 7. Плазмида, содержащая молекулу нуклеиновой кислоты по любому из пп.1-6.
- 8. Вектор экспрессии, содержащий молекулу нуклеиновой кислоты по любому из пп.1-6, причем одна или более указанных молекул функционально связаны с регуляторными элементами.
- 9. Способ лечения пациента, у которого диагностирован рак предстательной железы, включающий введение пациенту молекулы нуклеиновой кислоты по любому из пп.1-6.
- 10. Белок для индукции иммунного ответа против антигена рака предстательной железы, выбранный из:а) белка с аминокислотной последовательностью δΕΟ ΙΌ N0: 2 или гомологичной ей на 98% последовательностью, при условии, что сохранились аминокислотные остатки 69, 78, 80, 82, 102, 110, 137, 139, 165, 189, 203, 220, 232 и 248 последовательности δΕΟ ΙΌ N0: 2, или иммуногенного фрагмента последовательности δΕΟ ΙΌ N0: 2, содержащего по меньшей мере 256 аминокислотных остатков последовательности δΕΟ ΙΌ N0: 2, при условии, что сохранились аминокислотные остатки 69, 78, 80, 82, 102, 110, 137, 139, 165, 189, 203, 220, 232 и 248 последовательности δΕΟ ΙΌ N0: 2;б) белка с аминокислотной последовательностью δΕΟ ΙΌ N0: 4 или гомологичной ей на 98% по- 73 027315 следовательностью, при условии, что сохранились аминокислотные остатки 21, 86, 127, 129, 154, 156, 182, 195, 206, 218, 220, 237, 249, 255, 265, 271 и 275 последовательности δΕ^ ΙΌ N0: 4, или иммуногенного фрагмента последовательности δΕ^ ΙΌ N0: 4, содержащего по меньшей мере 274 аминокислотных остатка последовательности δΕ^ ΙΌ N0: 4, при условии, что сохранились аминокислотные остатки 21, 86, 127, 129, 154, 156, 182, 195, 206, 218, 220, 237, 249, 255, 265, 271 и 275 последовательности δΕ^ ΙΌ N0: 4.
- 11. Белок для индукции иммунного ответа против антигена рака предстательной железы, выбранный из:в) белка с аминокислотной последовательностью δΕ^ ΙΌ N0: 6 или гомологичной ей на 98% последовательностью, при условии, что сохранились аминокислотные остатки 14, 15, 32, 47, 58, 79, 111, 157, 223, 320, 350, 475, 499, 569, 613, 624, 653, 660, 663, 733 и 734 последовательности δΕ^ ΙΌ N0: 6, или иммуногенного фрагмента последовательности δΕ^ ΙΌ N0: 6, содержащего по меньшей мере 735 аминокислотных остатков последовательности δΕ^ ΙΌ N0: 6, при условии, что сохранились аминокислотные остатки 14, 15, 32, 47, 58, 79, 111, 157, 223, 320, 350, 475, 499, 569, 613, 624, 653, 660, 663, 733 и 734 последовательности δΕ^ ΙΌ N0: 6;г) белка с аминокислотной последовательностью δΕ^ ΙΌ N0: 8 или гомологичной ей на 98% последовательностью, при условии, что сохранились аминокислотные остатки 20, 30, 31, 48, 63, 74, 95, 127, 173, 239, 336, 366, 491, 515, 564, 585, 629, 640, 669, 676, 679, 749 и 750 последовательности δΕ^ ΙΌ N0: 8, или иммуногенного фрагмента последовательности δΕ^ ΙΌ N0: 8, содержащего по меньшей мере 751 аминокислотный остаток последовательности δΕ^ ΙΌ N0: 8, при условии, что сохранились аминокислотные остатки 20, 30, 31, 48, 63, 74, 95, 127, 173, 239, 336, 366, 491, 515, 564, 585, 629, 640, 669, 676, 679, 749 и 750 последовательности δΕ^ ΙΌ N0: 8.
- 12. Белок по п.10, включающий аминокислотную последовательность, выбранную из δΕ^ ΙΌ N0: 2 и δΕΟ ΙΌ N0: 4.
- 13. Способ лечения пациента, у которого диагностирован рак предстательной железы, включающий введение пациенту белка по любому из пп.10-12.
- 14. Фармацевтическая композиция для профилактики и лечения рака предстательной железы, содержащая молекулу нуклеиновой кислоты по любому из пп.1-8 и фармацевтически приемлемый эксципиент.
Applications Claiming Priority (3)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
US41317610P | 2010-11-12 | 2010-11-12 | |
US41781710P | 2010-11-29 | 2010-11-29 | |
PCT/US2011/060592 WO2012065164A2 (en) | 2010-11-12 | 2011-11-14 | Consensus prostate antigens nucleic acid molecule encoding the same and vaccine and uses comprising the same |
Publications (2)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
EA201390689A1 EA201390689A1 (ru) | 2013-11-29 |
EA027315B1 true EA027315B1 (ru) | 2017-07-31 |
Family
ID=46051609
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
EA201390689A EA027315B1 (ru) | 2010-11-12 | 2011-11-14 | Молекула нуклеиновой кислоты и белок для индукции иммунного ответа против антигена рака предстательной железы, плазмида, вектор экспрессии, способ лечения и фармацевтическая композиция |
Country Status (16)
Country | Link |
---|---|
US (5) | US8927692B2 (ru) |
EP (3) | EP2638055B1 (ru) |
JP (6) | JP6077450B2 (ru) |
KR (5) | KR101939150B1 (ru) |
CN (2) | CN103314002B (ru) |
AU (1) | AU2011325893B2 (ru) |
BR (1) | BR112013011705B1 (ru) |
CA (1) | CA2817709C (ru) |
DK (1) | DK2638055T3 (ru) |
EA (1) | EA027315B1 (ru) |
ES (1) | ES2718846T3 (ru) |
MX (3) | MX346784B (ru) |
PL (1) | PL3536703T3 (ru) |
SI (1) | SI3536703T1 (ru) |
WO (1) | WO2012065164A2 (ru) |
ZA (1) | ZA201303390B (ru) |
Families Citing this family (28)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
EP3578205A1 (en) | 2010-08-06 | 2019-12-11 | ModernaTX, Inc. | A pharmaceutical formulation comprising engineered nucleic acids and medical use thereof |
WO2012045082A2 (en) | 2010-10-01 | 2012-04-05 | Jason Schrum | Engineered nucleic acids and methods of use thereof |
US8927692B2 (en) | 2010-11-12 | 2015-01-06 | The Trustees Of The University Of Pennsylvania | Consensus prostate antigens, nucleic acid molecule encoding the same and vaccine and uses comprising the same |
AU2012236099A1 (en) | 2011-03-31 | 2013-10-03 | Moderna Therapeutics, Inc. | Delivery and formulation of engineered nucleic acids |
US9464124B2 (en) | 2011-09-12 | 2016-10-11 | Moderna Therapeutics, Inc. | Engineered nucleic acids and methods of use thereof |
EP3682905B1 (en) | 2011-10-03 | 2021-12-01 | ModernaTX, Inc. | Modified nucleosides, nucleotides, and nucleic acids, and uses thereof |
DK2791160T3 (da) | 2011-12-16 | 2022-05-30 | Modernatx Inc | Modificerede mrna-sammensætninger |
US9572897B2 (en) | 2012-04-02 | 2017-02-21 | Modernatx, Inc. | Modified polynucleotides for the production of cytoplasmic and cytoskeletal proteins |
US9283287B2 (en) | 2012-04-02 | 2016-03-15 | Moderna Therapeutics, Inc. | Modified polynucleotides for the production of nuclear proteins |
DE18200782T1 (de) | 2012-04-02 | 2021-10-21 | Modernatx, Inc. | Modifizierte polynukleotide zur herstellung von proteinen im zusammenhang mit erkrankungen beim menschen |
US9878056B2 (en) | 2012-04-02 | 2018-01-30 | Modernatx, Inc. | Modified polynucleotides for the production of cosmetic proteins and peptides |
PE20142406A1 (es) | 2012-05-04 | 2015-01-23 | Pfizer | Antigenos asociados a prostata y regimenes de inmunoterapia basados en vacuna |
HRP20220607T1 (hr) | 2012-11-26 | 2022-06-24 | Modernatx, Inc. | Terminalno modificirana rna |
CN104812401B (zh) * | 2012-12-13 | 2017-10-13 | 宾夕法尼亚大学理事会 | Wt1疫苗 |
KR20150093834A (ko) | 2012-12-13 | 2015-08-18 | 더 트러스티스 오브 더 유니버시티 오브 펜실바니아 | Dna 항체 작제물 및 그 이용 방법 |
US8980864B2 (en) | 2013-03-15 | 2015-03-17 | Moderna Therapeutics, Inc. | Compositions and methods of altering cholesterol levels |
AU2014228405B2 (en) * | 2013-03-15 | 2017-05-11 | The Trustees Of The University Of Pennsylvania | Cancer vaccines and methods of treatment using the same |
WO2015048744A2 (en) | 2013-09-30 | 2015-04-02 | Moderna Therapeutics, Inc. | Polynucleotides encoding immune modulating polypeptides |
EP3052521A1 (en) | 2013-10-03 | 2016-08-10 | Moderna Therapeutics, Inc. | Polynucleotides encoding low density lipoprotein receptor |
KR102196884B1 (ko) * | 2013-11-01 | 2020-12-30 | 화이자 인코포레이티드 | 전립선-연관 항원의 발현을 위한 벡터 |
RU2746406C2 (ru) | 2014-04-23 | 2021-04-13 | МОДЕРНАТиЭкс, ИНК. | Вакцины на основе нуклеиновых кислот |
CA2969214A1 (en) | 2014-12-01 | 2016-06-09 | The Trustees Of The University Of Pennsylvania | Dna antibody constructs and method of using same |
SG11201808152PA (en) * | 2016-03-21 | 2018-10-30 | David Weiner | Dna antibody constructs and method of using same |
KR20190034503A (ko) * | 2016-06-03 | 2019-04-02 | 이투빅스 코포레이션 | 전립선암-연관 항원을 사용한 종양 백신접종을 위한 조성물 및 방법 |
CN106119231A (zh) * | 2016-06-24 | 2016-11-16 | 安徽未名细胞治疗有限公司 | 一种肿瘤抗原psa的ctl识别表位肽及其应用 |
CN106581668B (zh) * | 2016-12-31 | 2020-03-24 | 广州姿生生物科技有限公司 | 一种抗原表位肽组合物及其应用 |
ES2938900T3 (es) * | 2017-12-13 | 2023-04-17 | Inovio Pharmaceuticals Inc | Vacunas contra el cáncer dirigidas al PRAME y usos de las mismas |
CN111308327B (zh) * | 2019-12-02 | 2021-01-26 | 电子科技大学 | 模拟电路故障定位与故障元件参数辨识方法 |
Citations (2)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US20020081680A1 (en) * | 2000-04-17 | 2002-06-27 | Jiangchun Xu | Compositions and methods for the therapy and diagnosis of prostate cancer |
US20050266530A1 (en) * | 2004-05-27 | 2005-12-01 | Marshall Deborah J | Cynomolgus prostate specific antigen |
Family Cites Families (81)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US21579A (en) | 1858-09-21 | Rotary valve fob steam-engines | ||
US5077044A (en) | 1980-05-19 | 1991-12-31 | The Board Of Trustees Of The Leland Stanford Jr. University | Novel non-reverting shigella live vaccines |
US4554101A (en) | 1981-01-09 | 1985-11-19 | New York Blood Center, Inc. | Identification and preparation of epitopes on antigens and allergens on the basis of hydrophilicity |
US5110587A (en) | 1981-12-24 | 1992-05-05 | Health Research, Incorporated | Immunogenic composition comprising synthetically modified vaccinia virus |
US5338683A (en) | 1981-12-24 | 1994-08-16 | Health Research Incorporated | Vaccinia virus containing DNA sequences encoding herpesvirus glycoproteins |
US4722848A (en) | 1982-12-08 | 1988-02-02 | Health Research, Incorporated | Method for immunizing animals with synthetically modified vaccinia virus |
US5174993A (en) | 1981-12-24 | 1992-12-29 | Health Research Inc. | Recombinant avipox virus and immunological use thereof |
US4510245A (en) | 1982-11-18 | 1985-04-09 | Chiron Corporation | Adenovirus promoter system |
US5643579A (en) | 1984-11-01 | 1997-07-01 | American Home Products Corporation | Oral vaccines |
ZA858044B (en) | 1984-11-01 | 1987-05-27 | American Home Prod | Oral vaccines |
US5036006A (en) | 1984-11-13 | 1991-07-30 | Cornell Research Foundation, Inc. | Method for transporting substances into living cells and tissues and apparatus therefor |
US4945050A (en) | 1984-11-13 | 1990-07-31 | Cornell Research Foundation, Inc. | Method for transporting substances into living cells and tissues and apparatus therefor |
US4797368A (en) | 1985-03-15 | 1989-01-10 | The United States Of America As Represented By The Department Of Health And Human Services | Adeno-associated virus as eukaryotic expression vector |
GB8508845D0 (en) | 1985-04-04 | 1985-05-09 | Hoffmann La Roche | Vaccinia dna |
US5223424A (en) | 1985-09-06 | 1993-06-29 | Prutech Research And Development | Attenuated herpesviruses and herpesviruses which include foreign DNA encoding an amino acid sequence |
US4790987A (en) | 1985-11-15 | 1988-12-13 | Research Corporation | Viral glycoprotein subunit vaccine |
US5310668A (en) | 1986-06-20 | 1994-05-10 | Merck & Co., Inc. | Varicella-zoster virus as a live recombinant vaccine |
US5242829A (en) | 1986-09-23 | 1993-09-07 | Therion Biologics Corporation | Recombinant pseudorabies virus |
US5387744A (en) | 1987-06-04 | 1995-02-07 | Washington University | Avirulent microbes and uses therefor: Salmonella typhi |
US5294441A (en) | 1987-06-04 | 1994-03-15 | Washington University | Avirulent microbes and uses therefor: salmonella typhi |
IL86583A0 (en) | 1987-06-04 | 1988-11-15 | Molecular Eng Ass | Vaccine containing a derivative of a microbe and method for the production thereof |
US5112749A (en) | 1987-10-02 | 1992-05-12 | Praxis Biologics, Inc. | Vaccines for the malaria circumsporozoite protein |
US5225336A (en) | 1989-03-08 | 1993-07-06 | Health Research Incorporated | Recombinant poxvirus host range selection system |
JP3044062B2 (ja) | 1989-03-08 | 2000-05-22 | ヘルス・リサーチ・インク | 組換えポックスウイルス宿主選択系 |
US5703055A (en) | 1989-03-21 | 1997-12-30 | Wisconsin Alumni Research Foundation | Generation of antibodies through lipid mediated DNA delivery |
US5591439A (en) | 1989-03-24 | 1997-01-07 | The Wistar Institute Of Anatomy And Biology | Recombinant cytomegalovirus vaccine |
ES2090129T3 (es) | 1989-03-31 | 1996-10-16 | Univ Washington | Vacunas que contienen microorganismos tipo phop avirulentos. |
EP0431668B1 (en) | 1989-12-04 | 1995-02-15 | Akzo Nobel N.V. | Recombinant herpesvirus of turkeys and live vector vaccines derived thereof |
US5294548A (en) | 1990-04-02 | 1994-03-15 | American Biogenetic Sciences, Inc | Recombianant Hepatitis a virus |
AU7906691A (en) | 1990-05-23 | 1991-12-10 | United States of America, as represented by the Secretary, U.S. Department of Commerce, The | Adeno-associated virus (aav)-based eucaryotic vectors |
US5462734A (en) | 1990-11-02 | 1995-10-31 | Wisconsin Alumni Research Foundation | Bovine herpesvirus vaccine and method of using same |
US5240703A (en) | 1991-03-01 | 1993-08-31 | Syntro Corporation | Attenuated, genetically-engineered pseudorabies virus s-prv-155 and uses thereof |
US6034298A (en) | 1991-08-26 | 2000-03-07 | Prodigene, Inc. | Vaccines expressed in plants |
US5955088A (en) | 1992-02-03 | 1999-09-21 | Cedars-Sinai Medical Center | Pharmaceutical compsition of herpes simplex virus type-1 (HSV-1), glycoproteins |
AU4528493A (en) | 1992-06-04 | 1994-01-04 | Regents Of The University Of California, The | In vivo gene therapy with intron-free sequence of interest |
US5273525A (en) | 1992-08-13 | 1993-12-28 | Btx Inc. | Injection and electroporation apparatus for drug and gene delivery |
EP0668777B2 (en) * | 1992-11-05 | 2011-02-09 | Sloan-Kettering Institute For Cancer Research | Prostate-specific membrane antigen |
NZ262582A (en) | 1993-01-26 | 1997-10-24 | David B Weiner | Compositions and methods for delivery of genetic material |
US5593972A (en) | 1993-01-26 | 1997-01-14 | The Wistar Institute | Genetic immunization |
US5981505A (en) | 1993-01-26 | 1999-11-09 | The Trustees Of The University Of Pennsylvania | Compositions and methods for delivery of genetic material |
US5864027A (en) | 1993-06-07 | 1999-01-26 | Genentech, Inc. | HIV envelope polypeptides |
US5739118A (en) | 1994-04-01 | 1998-04-14 | Apollon, Inc. | Compositions and methods for delivery of genetic material |
US6156319A (en) | 1994-07-25 | 2000-12-05 | The Trustees Of The University Of Pennsylvania | Soluble herpesvirus glycoprotein complex vaccine |
NL9401820A (nl) | 1994-11-02 | 1996-06-03 | Meyn Maschf | Inrichting voor het bewerken van aan zijn poten opgehangen gevogelte. |
US5962428A (en) | 1995-03-30 | 1999-10-05 | Apollon, Inc. | Compositions and methods for delivery of genetic material |
US5650309A (en) | 1995-05-16 | 1997-07-22 | The Regents Of The University Of California | Viral vectors |
US5698202A (en) | 1995-06-05 | 1997-12-16 | The Wistar Institute Of Anatomy & Biology | Replication-defective adenovirus human type 5 recombinant as a rabies vaccine carrier |
US6630305B1 (en) * | 1999-11-12 | 2003-10-07 | Corixa Corporation | Compositions and methods for the therapy and diagnosis of prostate cancer |
US6261281B1 (en) | 1997-04-03 | 2001-07-17 | Electrofect As | Method for genetic immunization and introduction of molecules into skeletal muscle and immune cells |
EA002087B1 (ru) | 1997-04-03 | 2001-12-24 | Электрофект Ас | Способ введения фармацевтических препаратов и нуклеиновых кислот в скелетную мышцу |
AU8444798A (en) | 1997-06-30 | 1999-01-25 | Centre National De La Recherche Scientifique | Improved method for transferring nucleic acid into the striped muscle and combination therefor |
US6833438B1 (en) * | 1999-06-01 | 2004-12-21 | Agensys, Inc. | Serpentine transmembrane antigens expressed in human cancers and uses thereof |
EP1086223B1 (en) * | 1998-06-01 | 2009-07-29 | Agensys, Inc. | Novel serpentine transmembrane antigens expressed in human cancers and uses thereof |
EP2428250A1 (en) | 1998-07-13 | 2012-03-14 | Genetronics, Inc. | Skin and muscle-targeted gene therapy by pulsed electrical field |
US6136703A (en) | 1998-09-03 | 2000-10-24 | Micron Technology, Inc. | Methods for forming phosphorus- and/or boron-containing silica layers on substrates |
EA003634B1 (ru) | 1998-10-05 | 2003-08-28 | Фармэкса А/С | Новые способы терапевтической вакцинации |
US6589529B1 (en) | 1998-10-30 | 2003-07-08 | Children's Hospital Medical Center | Rotavirus subunit vaccine |
AU7994200A (en) * | 1999-10-04 | 2001-05-10 | Corixa Corporation | Compositions and methods for therapy and diagnosis of prostate cancer |
US20030215425A1 (en) * | 2001-12-07 | 2003-11-20 | Simard John J. L. | Epitope synchronization in antigen presenting cells |
JP3543326B2 (ja) | 2001-08-30 | 2004-07-14 | ソニー株式会社 | 情報処理装置および方法、情報処理システム、情報配信装置、記録媒体、並びにプログラム |
ES2532757T3 (es) | 2001-09-06 | 2015-03-31 | Agensys, Inc. | Ácido nucleico y proteína correspondiente denominados STEAP-1 útiles en el tratamiento y la detección de cáncer |
US8209006B2 (en) | 2002-03-07 | 2012-06-26 | Vgx Pharmaceuticals, Inc. | Constant current electroporation device and methods of use |
US7245963B2 (en) | 2002-03-07 | 2007-07-17 | Advisys, Inc. | Electrode assembly for constant-current electroporation and use |
US7328064B2 (en) | 2002-07-04 | 2008-02-05 | Inovio As | Electroporation device and injection apparatus |
JP2006510735A (ja) | 2002-08-19 | 2006-03-30 | ジェネンテック・インコーポレーテッド | 腫瘍の診断と治療のための組成物と方法 |
US20040175727A1 (en) | 2002-11-04 | 2004-09-09 | Advisys, Inc. | Synthetic muscle promoters with activities exceeding naturally occurring regulatory sequences in cardiac cells |
WO2004108260A2 (en) | 2003-05-30 | 2004-12-16 | Advisys, Inc. | Devices and methods for biomaterial production |
SI1629088T1 (sl) * | 2003-05-30 | 2012-08-31 | Agensys Inc | Antigen izvornih celic prostate (psca) in njegova podzaporedja |
CA2880061C (en) * | 2004-01-23 | 2018-03-13 | Agostino Cirillo | Chimpanzee adenovirus vaccine carriers |
KR100647847B1 (ko) | 2005-05-27 | 2006-11-23 | 크레아젠 주식회사 | 인간 전립선암 동물모델 및 이를 이용한 수지상세포-유래전립선암 면역치료제의 예방 및 치료 효능을 분석하는 방법 |
EP1909828A4 (en) * | 2005-06-21 | 2008-12-10 | Cyto Pulse Sciences Inc | METHOD AND COMPOSITIONS RELATED TO A VACCINE AGAINST PROSTATE CANCER |
CN104984352A (zh) | 2005-11-21 | 2015-10-21 | 圣诺菲·帕斯图尔有限公司 | 重组病毒的稳定制剂 |
PT2061814E (pt) | 2006-10-27 | 2012-09-10 | Genentech Inc | Anticorpos e imunoconjugados e suas utilizações |
CN101990580A (zh) * | 2008-04-04 | 2011-03-23 | 宾夕法尼亚州立大学托管会 | 屈曲病毒蛋白共有序列、编码该屈曲病毒蛋白共有序列的核酸分子和组合物及其使用方法 |
ES2438495T3 (es) * | 2008-09-08 | 2014-01-17 | Psma Development Company, L.L.C. | Compuestos para exterminar células cancerosas que expresan PSMA, resistentes a taxano |
WO2010037408A1 (en) * | 2008-09-30 | 2010-04-08 | Curevac Gmbh | Composition comprising a complexed (m)rna and a naked mrna for providing or enhancing an immunostimulatory response in a mammal and uses thereof |
WO2010050939A1 (en) * | 2008-10-29 | 2010-05-06 | The Trustees Of The University Of Pennsylvania | Improved hcv vaccines and methods for using the same |
US8961994B2 (en) * | 2008-11-17 | 2015-02-24 | Vgx Pharmaceuticals, Llc | DNA constructs eliciting immune response against flavivirus and effective adjuvants |
US8927692B2 (en) * | 2010-11-12 | 2015-01-06 | The Trustees Of The University Of Pennsylvania | Consensus prostate antigens, nucleic acid molecule encoding the same and vaccine and uses comprising the same |
CN104168912B (zh) * | 2011-11-10 | 2016-08-24 | 北京艾棣维欣生物技术有限公司 | 促进剂-dna组合疫苗 |
EP3518955A4 (en) * | 2016-09-30 | 2020-10-07 | The Wistar Institute Of Anatomy And Biology | TERT IMMUNOGENIC COMPOSITIONS AND METHODS OF TREATMENT USING THEM |
-
2011
- 2011-11-14 US US13/883,978 patent/US8927692B2/en active Active
- 2011-11-14 PL PL19150850T patent/PL3536703T3/pl unknown
- 2011-11-14 KR KR1020137014954A patent/KR101939150B1/ko active IP Right Grant
- 2011-11-14 CN CN201180064660.0A patent/CN103314002B/zh active Active
- 2011-11-14 EP EP11839215.8A patent/EP2638055B1/en active Active
- 2011-11-14 EP EP21175561.6A patent/EP3909973A3/en active Pending
- 2011-11-14 AU AU2011325893A patent/AU2011325893B2/en active Active
- 2011-11-14 CN CN201610649676.2A patent/CN106434676B/zh active Active
- 2011-11-14 KR KR1020227004853A patent/KR102557275B1/ko active IP Right Grant
- 2011-11-14 BR BR112013011705-2A patent/BR112013011705B1/pt active IP Right Grant
- 2011-11-14 SI SI201131990T patent/SI3536703T1/sl unknown
- 2011-11-14 KR KR1020177035855A patent/KR102011026B1/ko active IP Right Grant
- 2011-11-14 WO PCT/US2011/060592 patent/WO2012065164A2/en active Application Filing
- 2011-11-14 JP JP2013538972A patent/JP6077450B2/ja active Active
- 2011-11-14 ES ES11839215T patent/ES2718846T3/es active Active
- 2011-11-14 MX MX2013005195A patent/MX346784B/es active IP Right Grant
- 2011-11-14 MX MX2016013461A patent/MX358725B/es unknown
- 2011-11-14 DK DK11839215.8T patent/DK2638055T3/en active
- 2011-11-14 CA CA2817709A patent/CA2817709C/en active Active
- 2011-11-14 KR KR1020207019047A patent/KR102364214B1/ko active IP Right Grant
- 2011-11-14 EP EP19150850.6A patent/EP3536703B1/en active Active
- 2011-11-14 KR KR1020197023373A patent/KR102131276B1/ko active IP Right Grant
- 2011-11-14 EA EA201390689A patent/EA027315B1/ru not_active IP Right Cessation
-
2013
- 2013-05-08 MX MX2018010616A patent/MX2018010616A/es unknown
- 2013-05-09 ZA ZA2013/03390A patent/ZA201303390B/en unknown
-
2014
- 2014-11-24 US US14/552,030 patent/US9399056B2/en active Active
-
2016
- 2016-02-16 JP JP2016026602A patent/JP6310952B2/ja active Active
- 2016-07-11 US US15/207,271 patent/US9913885B2/en active Active
-
2017
- 2017-11-20 JP JP2017222784A patent/JP7142427B2/ja active Active
-
2018
- 2018-01-31 US US15/884,594 patent/US11045535B2/en active Active
-
2020
- 2020-03-17 JP JP2020046459A patent/JP2020108396A/ja active Pending
- 2020-12-21 JP JP2020211554A patent/JP2021045171A/ja not_active Withdrawn
-
2021
- 2021-06-28 US US17/360,342 patent/US11980659B2/en active Active
-
2023
- 2023-09-25 JP JP2023160203A patent/JP2023171837A/ja active Pending
Patent Citations (2)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US20020081680A1 (en) * | 2000-04-17 | 2002-06-27 | Jiangchun Xu | Compositions and methods for the therapy and diagnosis of prostate cancer |
US20050266530A1 (en) * | 2004-05-27 | 2005-12-01 | Marshall Deborah J | Cynomolgus prostate specific antigen |
Also Published As
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
EA027315B1 (ru) | Молекула нуклеиновой кислоты и белок для индукции иммунного ответа против антигена рака предстательной железы, плазмида, вектор экспрессии, способ лечения и фармацевтическая композиция | |
ES2467678T3 (es) | Modificación del ARN, que produce unas estabilidad de transcripción y eficiencia de traducción aumentadas | |
JP6412131B2 (ja) | MERS‐CoVワクチン | |
JP2021121207A (ja) | 口蹄疫ウイルス(fmdv)コンセンサスタンパク質、そのコード配列およびそれから生成されるワクチン | |
JP7011241B2 (ja) | Wt1ワクチン | |
JP2020169216A (ja) | 抗原およびアジュバントとしてのインターロイキン−21を有するワクチン | |
EA026926B1 (ru) | Композиции, содержащие улучшенные генетические конструкции il-12, вакцины, иммунотерапевтические составы и способы их применения | |
AU2016207099A1 (en) | Virus-like particle with efficient epitope display | |
KR20130048192A (ko) | 인플루엔자 핵산 분자 및 이로부터 생산된 백신 | |
JP7123800B2 (ja) | がんのワクチン及びそれを用いた処置の方法 | |
EA023892B1 (ru) | Иммуногенные белки вируса человеческой папилломы и способы их применения | |
JP2019031511A (ja) | 低酸素誘導因子−1アルファを有する組成物および当該組成物を用いる方法 | |
JP2019518074A (ja) | Il−6及びcd126を標的とするdnaモノクローナル抗体 | |
US20070021364A1 (en) | Methods for genetic immunization | |
US20050036995A1 (en) | Genetic vaccines for cancer therapy |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
MM4A | Lapse of a eurasian patent due to non-payment of renewal fees within the time limit in the following designated state(s) |
Designated state(s): AM AZ BY KZ KG MD TJ TM |