JP2014103924A - Dna合成酵素−シリカ系ナノ空孔材料複合体、その製造方法及び用途 - Google Patents
Dna合成酵素−シリカ系ナノ空孔材料複合体、その製造方法及び用途 Download PDFInfo
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Abstract
【解決手段】シリカ系ナノ空孔材料のシリカ細孔にDNA合成能を有するDNA合成酵素を備える酵素内包複合体であって、酵素反応前後において酵素が前記シリカ系ナノ空孔材料のシリカ細孔に安定に固定されており、上記酵素内包複合体が反応基質である核酸(DNA)と相互作用を示し、酵素活性を安定に発現できる複合化状態にある、DNA合成酵素−シリカ系ナノ空孔材料複合体、前記のDNA合成酵素−シリカ系ナノ空孔材料複合体からなり、DNA合成反応における繰り返し使用においても、酵素をシリカ系ナノ空孔材料のシリカ細孔に安定に吸着、固定、保持でき、かつ、DNA合成能を安定に発現できるDNA合成酵素内包高耐久性部材、及び前記のDNA合成酵素−シリカ系ナノ空孔材料複合体による、極微量サンプルからのDNAの増幅方法。
【選択図】図1
Description
(1)シリカ系ナノ空孔材料のシリカ細孔にDNA合成能を有するDNA合成酵素を備える酵素内包複合体であって、酵素反応前後においてDNA合成酵素が前記シリカ系ナノ空孔材料のシリカ細孔に吸着、固定されていて、上記酵素内包複合体が反応基質である核酸(DNA)と相互作用を示し、酵素活性を発現できる複合化状態にある構造を有することを特徴とするDNA合成酵素−シリカ系ナノ空孔材料複合体。
(2)前記シリカ系ナノ空孔材料が、1)ケイ素原子と酸素原子を必須成分として含む化合物の多孔体メソポーラスシリカであり、2)細孔のサイズが直径で2〜50nmであり、3)全細孔容積が0.1〜2.0mL/gであり、4)比表面積が200〜1500m2/gである、前記(1)に記載のDNA合成酵素−シリカ系ナノ空孔材料複合体。
(3)前記シリカ系ナノ空孔材料が、該材料へのDNA分子の非特異的吸着を抑制することができ、かつ、DNA合成酵素を選択的に固定化することができる、前記(1)又は(2)に記載のDNA合成酵素−シリカ系ナノ空孔材料複合体。
(4)前記酵素が、高耐熱性又は低耐熱性を有するDNA合成酵素である、前記(1)から(3)のいずれか一項に記載のDNA合成酵素−シリカ系ナノ空孔材料複合体。
(5)前記酵素反応が、環状及び直鎖状、又は、一本鎖及び二本鎖の基質DNAを対象とした、ポリメラーゼ連鎖反応(PCR法)、等温DNA増幅(LAMP法)、Rolling Circle Amplification(RCA法)、又は、Multiple Displacement Amplification(MDA法)、である、前記(1)から(4)のいずれか一項に記載のDNA合成酵素−シリカ系ナノ空孔材料複合体。
(6)シリカ系ナノ空孔材料のシリカ細孔にDNA合成酵素の全体あるいは一部分を吸着させ、該シリカ細孔に固定させることにより上記DNA合成酵素が反応基質DNAと相互作用を示し、酵素活性を発現できる複合化状態にある酵素内包複合体を作製することを特徴とするDNA合成酵素−シリカ系ナノ空孔材料複合体の製造方法。
(7)シリカ系ナノ空孔材料の中心細孔直径の違いにより、分子サイズの異なる各種DNA合成酵素の固定化状態の適正化を行い、かつ、DNA合成酵素の活性発現によるDNA増幅活性の程度を制御する、前記(6)に記載の製造方法。
(8)前記(1)から(5)のいずれかに記載のDNA合成酵素−シリカ系ナノ空孔材料複合体からなり、DNA合成反応における繰り返し使用においても、酵素がシリカ系ナノ空孔材料のシリカ細孔に吸着、固定、保持され、かつ、DNA合成能を持続して発現することを特徴とするDNA合成酵素内包高耐久性部材。
(9)前記(1)から(5)のいずれかに記載のDNA合成酵素−シリカ系ナノ空孔材料複合体を用いて、前記(5)に記載の酵素反応により反応基質のDNAを増幅させることを特徴とする、DNAの増幅方法。
本発明は、規則性細孔を有するシリカ系ナノ空孔材料(メソポーラスシリカ)のシリカ細孔にDNA合成酵素を固定化して複合化することにより、シリカ系ナノ空孔材料のシリカ細孔のナノ空孔を反応場とした高効率・長寿命のDNA増幅システムを構築し、提供するものである。本発明では、分子サイズの異なる種々のDNA合成酵素を、各々に対応したサイズのシリカ系ナノ空孔材料のシリカ細孔のナノ空孔に内包化することでDNA合成酵素を安定に配列化でき、それにより、耐熱性や耐久性など酵素機能を向上させることを可能とするものである。
(1)酵素反応前後において、シリカ系ナノ空孔材料の細孔内部にDNA合成酵素の全体あるいは一部分を、酵素活性部位を露出させた形態で安定に吸着させ、固定化したDNA合成酵素−シリカ系ナノ空孔材料複合体を提供することができる。
(2)該固定化酵素は、反応基質の核酸(基質DNA)と相互作用を示し、酵素活性を安定に発現できるような複合化形態を有している。
(3)シリカ系ナノ空孔材料に固定化したDNA合成酵素と反応基質(DNA)を溶液中で相互作用させた場合、該シリカ系ナノ空孔材料へのDNA分子の非特異的吸着を抑制でき、また、DNA合成酵素を選択的に固定化することができる。
(4)シリカ系ナノ空孔材料による、前記DNAの非特異的吸着の抑制効果により、精製酵素試料に付随的に含有される微量のDNA不純物を排除することが可能となり、その結果、極微量の反応基質、例えば、難培養性微生物の一細胞ゲノムDNA、を対象とした、高精度のDNA増幅手法を提供することができる。
(5)シリカ系ナノ空孔材料の中心細孔直径の違いによって、分子サイズの異なる各種DNA合成酵素の固定化の適正を行うことができ、更に、該DNA合成酵素のDNA増幅活性を高度に制御することができる。
(6)酵素反応後の遠心分離操作により、DNA増幅産物とDNA合成酵素−シリカ系ナノ空孔材料複合体を容易に分離、回収することが可能となる。
(7)前記遠心分離操作の際に、任意の緩衝溶液、又は反応溶液に容易に交換可能であり、更に、DNA合成酵素−シリカ系ナノ空孔材料複合体の繰り返し使用における、安定的な酵素固定化状態の保持と、高い反応性を持続させることができる。
(1)合成例1
ヘキサデシルトリメチルアンモニウムクロライド(3.2g)、或いは、ドコシルトリメチルアンモニウムクロライド(4.24g)を、70℃の水100ミリリットルに添加し、溶解後、カネマイト5gを更に添加し、70℃に加熱しながら、ホモミキサーで3時間撹拌した。これに、2規定塩酸を約1時間かけて添加し、pH8.5の状態で、約3時間撹拌した。
Pluronic P123[BASF社製](10g)を、水300ミリリットルに添加し、35℃で一晩撹拌し溶解させた後、これに、塩酸21.87g及びオルトケイ酸テトラエチル21.32gを更に添加し、ホットスターラーを用いて35℃に加熱しながら、約20時間撹拌した。これを、異なる合成温度(a:35℃、b:80℃、又は、c:130℃)で24時間静置した。
Pluronic P123(4g)を、水120ミリリットルに添加し、更に、これに塩化カリウム6.08gを添加し、常温で1時間撹拌し溶解させた後、これに、塩酸23.6g及びメシチレン3gを更に添加し、常温で2時間撹拌した。これに、オルトケイ酸テトラエチル8.5gを更に添加し、10分間激しく撹拌した後、35℃で24時間静置した。これを、異なる合成温度(a:100℃、また、b:130℃)で24時間静置した。
シリカ系ナノ空孔材料には、中心細孔直径の異なる7種類のシリカ系ナノ空孔材料:1)FSM−16(中心細孔直径:2.6nm)、2)FSM−22(中心細孔直径:4.2nm)、3)SBA−15(中心細孔直径:5.4nm)、4)SBA−15(中心細孔直径:7.1nm)、5)SBA−15(中心細孔直径:10.6nm)、6)SBA−15 microsphere(中心細孔直径:18.5nm)、7)SBA−15 microsphere(中心細孔直径:24.5nm)、を使用し、また、DNA合成酵素には、TaKaRa ExTaq(タカラバイオ製、分子量:約94kD)を用いた。
ポリメラーゼ連鎖反応(PCR法)における、上記DNA合成酵素−シリカ系ナノ空孔材料複合体のDNA合成活性について調べた。酵素反応は、上記DNA合成酵素−シリカ系ナノ空孔材料複合体の溶液に、更に、各々37.5pmolの2種類のプライマーDNA(T7 Promoter Primer、20mer、5’−TAATACGACTCACTATAGGG、及び、SP6 Promoter Primer、19mer、5’−GATTTAGGTGACACTATAG)を含んだ水溶液7.5μLを添加することによって開始した。
Claims (9)
- シリカ系ナノ空孔材料のシリカ細孔にDNA合成能を有するDNA合成酵素を備える酵素内包複合体であって、酵素反応前後においてDNA合成酵素が前記シリカ系ナノ空孔材料のシリカ細孔に吸着、固定されていて、上記酵素内包複合体が反応基質である核酸(DNA)と相互作用を示し、酵素活性を発現できる複合化状態にある構造を有することを特徴とするDNA合成酵素−シリカ系ナノ空孔材料複合体。
- 前記シリカ系ナノ空孔材料が、(1)ケイ素原子と酸素原子を必須成分として含む化合物の多孔体メソポーラスシリカであり、(2)細孔のサイズが直径で2〜50nmであり、(3)全細孔容積が0.1〜2.0mL/gであり、(4)比表面積が200〜1500m2/gである、請求項1に記載のDNA合成酵素−シリカ系ナノ空孔材料複合体。
- 前記シリカ系ナノ空孔材料が、該材料へのDNA分子の非特異的吸着を抑制することができ、かつ、DNA合成酵素を選択的に固定化することができる、請求項1又は2に記載のDNA合成酵素−シリカ系ナノ空孔材料複合体。
- 前記酵素が、高耐熱性又は低耐熱性を有するDNA合成酵素である、請求項1から3のいずれか一項に記載のDNA合成酵素−シリカ系ナノ空孔材料複合体。
- 前記酵素反応が、環状及び直鎖状、又は、一本鎖及び二本鎖の基質DNAを対象とした、ポリメラーゼ連鎖反応(PCR法)、等温DNA増幅(LAMP法)、Rolling Circle Amplification(RCA法)、又は、Multiple Displacement Amplification(MDA法)、である、請求項1から4のいずれか一項に記載のDNA合成酵素−シリカ系ナノ空孔材料複合体。
- シリカ系ナノ空孔材料のシリカ細孔にDNA合成酵素の全体あるいは一部分を吸着させ、該シリカ細孔に固定させることにより上記DNA合成酵素が反応基質DNAと相互作用を示し、酵素活性を発現できる複合化状態にある酵素内包複合体を作製することを特徴とするDNA合成酵素−シリカ系ナノ空孔材料複合体の製造方法。
- シリカ系ナノ空孔材料の中心細孔直径の違いにより、分子サイズの異なる各種DNA合成酵素の固定化状態の適正化を行い、かつ、DNA合成酵素の活性発現によるDNA増幅活性の程度を制御する、請求項6に記載の製造方法。
- 請求項1から5のいずれかに記載のDNA合成酵素−シリカ系ナノ空孔材料複合体からなり、DNA合成反応における繰り返し使用においても、酵素がシリカ系ナノ空孔材料のシリカ細孔に吸着、固定、保持され、かつ、DNA合成能を持続して発現することを特徴とするDNA合成酵素内包高耐久性部材。
- 請求項1から5のいずれかに記載のDNA合成酵素−シリカ系ナノ空孔材料複合体を用いて、請求項5に記載の酵素反応により反応基質のDNAを増幅させることを特徴とする、DNAの増幅方法。
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