JP2013520487A5 - - Google Patents
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Description
２つのアミノ酸配列間のパーセンテージ配列同一性についての言及は、アラインメントさせたときに、アミノ酸のそのパーセンテージが、２つの配列の比較において同じであることを意味する。このアラインメントおよびパーセント相同性または配列同一性は、当該技術分野において公知のソフトウェアプログラム、例えば参考文献２４４の７．７．１８節に記載されるものを用いて決定できる。好ましいアラインメントは、１２のギャップ開始ペナルティおよび２のギャップ伸長ペナルティ、６２のＢＬＯＳＵＭマトリックスでのアフィンギャップ検索を用いるＳｍｉｔｈ−Ｗａｔｅｒｍａｎ相同性検索アルゴリズムにより決定される。Ｓｍｉｔｈ−Ｗａｔｅｒｍａｎ相同性検索アルゴリズムは、参考文献２４５に開示されている。
特定の実施形態では、例えば以下が提供される：
（項目１）
ｉ）配列番号１に由来する少なくとも７個の連続するアミノ酸の断片であって、配列番号４のアミノ酸配列に由来するエピトープを含む、断片；
ｉｉ）配列番号１に対して少なくとも９０％の同一性を有するアミノ酸配列に由来する少なくとも７個の連続するアミノ酸の断片であって、配列番号４のアミノ酸配列に由来するエピトープに対して少なくとも９０％の同一性を有するエピトープを含む、断片；
ｉｉｉ）配列番号５に由来する少なくとも７個の連続するアミノ酸の断片であって、配列番号８のアミノ酸配列に由来するエピトープを含む、断片；
ｉｖ）配列番号５に対して少なくとも９０％の同一性を有するアミノ酸配列に由来する少なくとも７個の連続するアミノ酸の断片であって、配列番号８のアミノ酸配列に由来するエピトープに対して少なくとも９０％の同一性を有するエピトープを含む、断片
からなるポリペプチド。
（項目２）
ｉ）配列番号１に由来する断片であって、配列番号４のアミノ酸配列を含む、断片；
ｉｉ）配列番号１に対して９０％の同一性を有するアミノ酸配列に由来する断片であって、配列番号４に対して少なくとも９０％の同一性を有するアミノ酸配列を含む、断片；
ｉｉｉ）配列番号５に由来する断片であって、配列番号８のアミノ酸配列を含む、断片；
ｉｖ）配列番号５に対して少なくとも９０％の同一性を有するアミノ酸配列に由来する断片であって、配列番号８に対して少なくとも９０％の同一性を有するアミノ酸配列を含む、断片
からなる、項目１に記載のポリペプチド。
（項目３）
ｉ）配列番号４のアミノ酸配列を含む配列番号１の断片；またはｉｉ）配列番号８のアミノ酸配列を含む配列番号５に由来する断片を含むか、またはそれからなる、項目１または２に記載のポリペプチド。
（項目４）
アミノ酸配列：
Ａ−｛−Ｘ−Ｌ−｝ ｎ −Ｂ
を含むポリペプチドであって、式中、各Ｘは項目１〜３のいずれか一項に記載のポリペプチドであり；Ｌは任意選択のリンカーアミノ酸配列であり；Ａは任意選択のＮ末端アミノ酸配列であり；Ｂは任意選択のＣ末端アミノ酸配列であり；ｎは１以上の整数である、ポリペプチド。
（項目５）
配列番号１のアミノ酸配列を有する野生型ＧＢＳタンパク質および配列番号５のアミノ酸配列を有する野生型ＧＢＳタンパク質のアミノ酸配列に結合する抗体を含む抗体応答を惹起する、項目１〜４のいずれか一項に記載のポリペプチド。
（項目６）
配列番号９のアミノ酸配列を有する野生型ＧＢＳタンパク質（ＣＪＢ１１１株）、配列番号１３のアミノ酸配列を有する野生型ＧＢＳタンパク質（５１５株）、配列番号１７のアミノ酸配列を有する野生型ＧＢＳタンパク質（ＮＥＭ３１６株）、配列番号２１のアミノ酸配列を有する野生型ＧＢＳタンパク質（ＤＫ２１株）、および配列番号２５のアミノ酸配列を有する野生型ＧＢＳタンパク質（ＣＪＢ１１０株）に結合する抗体を含む抗体応答を惹起する、項目１〜５のいずれか一項に記載のポリペプチド。
（項目７）
糖部分とキャリアタンパク質部分とを含む結合体であって、該キャリアタンパク質部分が項目１〜６のいずれかに記載のポリペプチドを含む、結合体。
（項目８）
項目１〜６のいずれか一項に記載のポリペプチドをコードする核酸。
（項目９）
項目１〜６のいずれか一項に記載のポリペプチド、項目７に記載の結合体または項目８に記載の核酸を含む免疫原性組成物。
（項目１０）
治療に使用するための、項目１〜６のいずれか一項に記載のポリペプチド、項目７に記載の結合体、項目８に記載の核酸または項目９に記載の免疫原性組成物。
（項目１１）
髄膜炎の処置または予防を含む、ＧＢＳにより引き起こされる疾患および／または感染の処置または予防に使用するための、項目１〜６のいずれか一項に記載のポリペプチド、項目７に記載の結合体、項目８に記載の核酸または項目９に記載の免疫原性組成物。
（項目１２）
項目１〜６のいずれか一項に記載のポリペプチド、項目７に記載の結合体、項目８に記載の核酸または項目９に記載の免疫原性組成物の有効量を投与することを含む、哺乳動物におけるＧＢＳにより引き起こされる疾患および／または感染、好ましくは髄膜炎を処置または予防する方法。
（項目１３）
項目１〜６のいずれか一項に記載のポリペプチドを発現する細菌。
特定の実施形態では、例えば以下が提供される：
（項目１）
ｉ）配列番号１に由来する少なくとも７個の連続するアミノ酸の断片であって、配列番号４のアミノ酸配列に由来するエピトープを含む、断片；
ｉｉ）配列番号１に対して少なくとも９０％の同一性を有するアミノ酸配列に由来する少なくとも７個の連続するアミノ酸の断片であって、配列番号４のアミノ酸配列に由来するエピトープに対して少なくとも９０％の同一性を有するエピトープを含む、断片；
ｉｉｉ）配列番号５に由来する少なくとも７個の連続するアミノ酸の断片であって、配列番号８のアミノ酸配列に由来するエピトープを含む、断片；
ｉｖ）配列番号５に対して少なくとも９０％の同一性を有するアミノ酸配列に由来する少なくとも７個の連続するアミノ酸の断片であって、配列番号８のアミノ酸配列に由来するエピトープに対して少なくとも９０％の同一性を有するエピトープを含む、断片
からなるポリペプチド。
（項目２）
ｉ）配列番号１に由来する断片であって、配列番号４のアミノ酸配列を含む、断片；
ｉｉ）配列番号１に対して９０％の同一性を有するアミノ酸配列に由来する断片であって、配列番号４に対して少なくとも９０％の同一性を有するアミノ酸配列を含む、断片；
ｉｉｉ）配列番号５に由来する断片であって、配列番号８のアミノ酸配列を含む、断片；
ｉｖ）配列番号５に対して少なくとも９０％の同一性を有するアミノ酸配列に由来する断片であって、配列番号８に対して少なくとも９０％の同一性を有するアミノ酸配列を含む、断片
からなる、項目１に記載のポリペプチド。
（項目３）
ｉ）配列番号４のアミノ酸配列を含む配列番号１の断片；またはｉｉ）配列番号８のアミノ酸配列を含む配列番号５に由来する断片を含むか、またはそれからなる、項目１または２に記載のポリペプチド。
（項目４）
アミノ酸配列：
Ａ−｛−Ｘ−Ｌ−｝ ｎ −Ｂ
を含むポリペプチドであって、式中、各Ｘは項目１〜３のいずれか一項に記載のポリペプチドであり；Ｌは任意選択のリンカーアミノ酸配列であり；Ａは任意選択のＮ末端アミノ酸配列であり；Ｂは任意選択のＣ末端アミノ酸配列であり；ｎは１以上の整数である、ポリペプチド。
（項目５）
配列番号１のアミノ酸配列を有する野生型ＧＢＳタンパク質および配列番号５のアミノ酸配列を有する野生型ＧＢＳタンパク質のアミノ酸配列に結合する抗体を含む抗体応答を惹起する、項目１〜４のいずれか一項に記載のポリペプチド。
（項目６）
配列番号９のアミノ酸配列を有する野生型ＧＢＳタンパク質（ＣＪＢ１１１株）、配列番号１３のアミノ酸配列を有する野生型ＧＢＳタンパク質（５１５株）、配列番号１７のアミノ酸配列を有する野生型ＧＢＳタンパク質（ＮＥＭ３１６株）、配列番号２１のアミノ酸配列を有する野生型ＧＢＳタンパク質（ＤＫ２１株）、および配列番号２５のアミノ酸配列を有する野生型ＧＢＳタンパク質（ＣＪＢ１１０株）に結合する抗体を含む抗体応答を惹起する、項目１〜５のいずれか一項に記載のポリペプチド。
（項目７）
糖部分とキャリアタンパク質部分とを含む結合体であって、該キャリアタンパク質部分が項目１〜６のいずれかに記載のポリペプチドを含む、結合体。
（項目８）
項目１〜６のいずれか一項に記載のポリペプチドをコードする核酸。
（項目９）
項目１〜６のいずれか一項に記載のポリペプチド、項目７に記載の結合体または項目８に記載の核酸を含む免疫原性組成物。
（項目１０）
治療に使用するための、項目１〜６のいずれか一項に記載のポリペプチド、項目７に記載の結合体、項目８に記載の核酸または項目９に記載の免疫原性組成物。
（項目１１）
髄膜炎の処置または予防を含む、ＧＢＳにより引き起こされる疾患および／または感染の処置または予防に使用するための、項目１〜６のいずれか一項に記載のポリペプチド、項目７に記載の結合体、項目８に記載の核酸または項目９に記載の免疫原性組成物。
（項目１２）
項目１〜６のいずれか一項に記載のポリペプチド、項目７に記載の結合体、項目８に記載の核酸または項目９に記載の免疫原性組成物の有効量を投与することを含む、哺乳動物におけるＧＢＳにより引き起こされる疾患および／または感染、好ましくは髄膜炎を処置または予防する方法。
（項目１３）
項目１〜６のいずれか一項に記載のポリペプチドを発現する細菌。
Claims (13)
- ｉ）配列番号１に由来する少なくとも７個の連続するアミノ酸の断片であって、配列番号４のアミノ酸配列に由来するエピトープを含む、断片；
ｉｉ）配列番号１に対して少なくとも９０％の同一性を有するアミノ酸配列に由来する少なくとも７個の連続するアミノ酸の断片であって、配列番号４のアミノ酸配列に由来するエピトープに対して少なくとも９０％の同一性を有するエピトープを含む、断片；
ｉｉｉ）配列番号５に由来する少なくとも７個の連続するアミノ酸の断片であって、配列番号８のアミノ酸配列に由来するエピトープを含む、断片；
ｉｖ）配列番号５に対して少なくとも９０％の同一性を有するアミノ酸配列に由来する少なくとも７個の連続するアミノ酸の断片であって、配列番号８のアミノ酸配列に由来するエピトープに対して少なくとも９０％の同一性を有するエピトープを含む、断片
からなるポリペプチド。 - ｉ）配列番号１に由来する断片であって、配列番号４のアミノ酸配列を含む、断片；
ｉｉ）配列番号１に対して９０％の同一性を有するアミノ酸配列に由来する断片であって、配列番号４に対して少なくとも９０％の同一性を有するアミノ酸配列を含む、断片；
ｉｉｉ）配列番号５に由来する断片であって、配列番号８のアミノ酸配列を含む、断片；
ｉｖ）配列番号５に対して少なくとも９０％の同一性を有するアミノ酸配列に由来する断片であって、配列番号８に対して少なくとも９０％の同一性を有するアミノ酸配列を含む、断片
からなる、請求項１に記載のポリペプチド。 - ｉ）配列番号４のアミノ酸配列を含む配列番号１の断片；またはｉｉ）配列番号８のアミノ酸配列を含む配列番号５に由来する断片を含むか、またはそれからなる、請求項１または２に記載のポリペプチド。
- アミノ酸配列：
Ａ−｛−Ｘ−Ｌ−｝ｎ−Ｂ
を含むポリペプチドであって、式中、各Ｘは請求項１〜３のいずれか一項に記載のポリペプチドであり；Ｌは任意選択のリンカーアミノ酸配列であり；Ａは任意選択のＮ末端アミノ酸配列であり；Ｂは任意選択のＣ末端アミノ酸配列であり；ｎは１以上の整数である、ポリペプチド。 - 配列番号１のアミノ酸配列を有する野生型ＧＢＳタンパク質および配列番号５のアミノ酸配列を有する野生型ＧＢＳタンパク質のアミノ酸配列に結合する抗体を含む抗体応答を惹起する、請求項１〜４のいずれか一項に記載のポリペプチド。
- 配列番号９のアミノ酸配列を有する野生型ＧＢＳタンパク質（ＣＪＢ１１１株）、配列番号１３のアミノ酸配列を有する野生型ＧＢＳタンパク質（５１５株）、配列番号１７のアミノ酸配列を有する野生型ＧＢＳタンパク質（ＮＥＭ３１６株）、配列番号２１のアミノ酸配列を有する野生型ＧＢＳタンパク質（ＤＫ２１株）、および配列番号２５のアミノ酸配列を有する野生型ＧＢＳタンパク質（ＣＪＢ１１０株）に結合する抗体を含む抗体応答を惹起する、請求項１〜５のいずれか一項に記載のポリペプチド。
- 糖部分とキャリアタンパク質部分とを含む結合体であって、該キャリアタンパク質部分が請求項１〜６のいずれかに記載のポリペプチドを含む、結合体。
- 請求項１〜６のいずれか一項に記載のポリペプチドをコードする核酸。
- 請求項１〜６のいずれか一項に記載のポリペプチド、請求項７に記載の結合体または請求項８に記載の核酸を含む免疫原性組成物。
- 治療に使用するための、請求項１〜６のいずれか一項に記載のポリペプチド、請求項７に記載の結合体、もしくは請求項８に記載の核酸を含む組成物、または治療に使用するための請求項９に記載の免疫原性組成物。
- 髄膜炎の処置または予防を含む、ＧＢＳにより引き起こされる疾患および／または感染の処置または予防に使用するための、請求項１〜６のいずれか一項に記載のポリペプチド、請求項７に記載の結合体、または請求項８に記載の核酸を含む組成物、あるいは髄膜炎の処置または予防を含む、ＧＢＳにより引き起こされる疾患および／または感染の処置または予防に使用するための請求項９に記載の免疫原性組成物。
- 哺乳動物におけるＧＢＳにより引き起こされる疾患および／または感染、好ましくは髄膜炎を処置または予防するための組成物であって、請求項１〜６のいずれか一項に記載のポリペプチド、請求項７に記載の結合体、または請求項８に記載の核酸を含む組成物；あるいは哺乳動物におけるＧＢＳにより引き起こされる疾患および／または感染、好ましくは髄膜炎を処置または予防するための請求項９に記載の免疫原性組成物。
- 請求項１〜６のいずれか一項に記載のポリペプチドを発現する細菌。
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