JP2011503223A - ペルシリル化ペプチドを製造する方法 - Google Patents
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Abstract
(a)トリメチルシリルシアニド以外のシリル化剤との反応によって対応するペプチドをシリル化することによりペルシリル化ペプチドまたはペルシリル化ペプチド類似体を製造する工程と、
(b)式(I)X−A−COOH(式中、Xはアミノ保護基であり、Aは、アミノ酸残基、ペプチド残基またはペプチド類似体残基であり、−COOHは任意に活性化されたカルボキシル基を表す)の化合物を4〜15個のアミノ酸を含有するペルシリル化ペプチドまたはペルシリル化ペプチド類似体と反応させる工程と
を含む方法。
Description
本発明は、ペルシリル化技術を利用するペプチドまたはペプチド類似体を製造する方法に関する。
式(I)X−A−COOH(式中、Xはアミノ保護基であり、Aは、アミノ酸残基、ペプチド残基またはペプチド類似体残基であり、−COOHは任意に活性化されたカルボキシル基を表す)の化合物を4〜15個のアミノ酸を含有するペルシリル化ペプチドまたはペルシリル化ペプチド類似体と反応させる工程を含む方法に関する。
本発明における「ペプチド類似体」は、特に、アミノ酸から本質的になる化合物であって、ヘテロ置換カルボン酸、例えばヒドロキシカルボン酸またはメルカプトカルボン酸などのペプチドに導入され得る他の化合物を任意に含む化合物を表すと理解される。ペプチド類似体は、通常、ウレタン結合、ウレア結合、エステル結合またはチオエステル結合などのアミド結合とは異なる、ペプチド配列中に少なくとも1つの結合を含む。本発明におけるペプチドまたはペプチド類似体は、線状、環式または分岐であることが可能であり、好ましくは線状である。
それらの非天然鏡像異性体を用いることも可能である。
本発明による方法において、ペルシリル化ペプチドは、4、5、6、7または8個のアミノ酸、より好ましくは、4、5または6個のアミノ酸を含有する。これらの数が、ペプチド類似体における連結単位の数に同様に当てはまることは言うまでもない。
H−Leu−Arg−Pro−(D)AlaNH2(配列番号3)、
H−Ser−Tyr−(D)Cit−Leu−Arg−Pro−(D)AlaNH2(配列番号4)、
H−Ser(tBu)−Thr−Cys(Trt)−Val−Leu−Gly−OH(配列番号5)
H−Trp−Ser−Tyr−(D)Ser(tBu)−Leu−Arg−Pro−NHNHCONH2(配列番号6)
が挙げられる。
工程(a)の反応において、シリル化されるべき官能基のモル量を基準として一般には0.5〜5当量、好ましくは0.7〜2当量、より好ましくは約1または1〜1.5当量のシリル化剤が用いられる。シリル化されるべき官能基のモル量を基準として2〜4当量のシリル化剤の使用も可能である。「シリル化されるべき官能基」は、特に、アミノ基、ヒドロキシル基、メルカプト基またはカルボキシル基などのシリル化剤と反応する活性水素原子を有する基を表すと理解される。
シリル化を溶媒の存在下で行うとき、前記溶媒は、好ましくは極性有機溶媒、より好ましくは極性非プロトン性有機溶媒である。N,N−ジメチルホルムアミドまたは特にN,N−ジメチルアセトアミド(DMAC)などのアミド型溶媒は、より特に好ましい。
別の実施形態において、シリル化は、シリル化剤およびペプチドまたはペプチド類似体から本質的になる液体シリル化媒体中で行われる。
Z−Asp(OtBu)−Ala−OH
Z−Ser−Tyr−(D)Cit−OH
Ac−(D)Nal−(D)Cph−(D)Pal−OH
Boc−Cys(Trt)−Ser(tBu)−Asn−Leu−OH(配列番号7)
Fmoc−His(Trt)−OH
が挙げられる。
本発明による使用において、極性有機溶媒は、好ましくは、N,N,ジメチルホルムアミドおよびN,N−ジメチルアセトアミドならびにN−メチルピロリドンから選択される好ましくはアミド型溶媒である。より好ましくは、溶媒はN,N−ジメチルアセトアミドである。この溶媒は、副生物の実質的な生成なしで生成したペプチドまたはペプチド類似体の特に効率的な処理および回収を見込んでいる。
本発明による使用において、部分シリル化ペプチドまたは部分シリル化ペプチド類似体は、好ましくは、前に本明細書に記載された本発明による方法によって得られる。
本発明による使用の特に好ましい実施形態において、溶液は−40℃〜+10℃の温度で均質である。
これらの実施例において且つ本明細書全体を通して、用いられた略号を次の通り定義する。
AcOHは酢酸であり、AcOEtは酢酸エチルであり、Bocはt−ブトキシカルボニルであり、n−BuOHはn−ブタノールであり、i−BuOHはイソブタノールであり、Cbzはベンジルオキシカルボニルであり、DCCは1,3−ジシクロヘキシルカルボジイミドであり、DCMはジクロロメタンであり、DICは1,3−ジイソプロピルカルボジイミドであり、DIPEAはN,N−ジイソプロピルエチルアミンであり、DMFはN,N−ジメチルホルムアミドであり、DMAはN,N−ジメチルアセトアミドであり、EDCは1−(3−ジメチルアミノプロピル)−3−エチルカルボジイミドであり、Fmocはフルオレニルメチルオキシカルボニルであり、HBTUはN,N,N’,N’−テトラメチル−O−(1H−ベンゾトリアゾール−1−イル)ウロニウム−ヘキサフルオロルホスフェート)であり、HOBTは1−ヒドロキシベンゾトリアゾールであり、HOOBTは3,4−ジヒドロ−3−ヒドロキシ−4−オキソ−1,2,3−ベンゾトリアジンであり、IBCFはイソブチルクロロホルメートであり、i−BuOHはイソブタノールであり、IPEはジイソプロピルエーテルであり、MeCNはアセトニトリルであり、MeOHはメタノールであり、MSAはN−メチル−N−トリメチルシリルアセトアミドであり、NMMはN−メチルモルホリンであり、NMPは1−メチル−2−ピロリドンであり、tBuはt−ブチルであり、TEAはトリエチルアミンであり、THFはテトラヒドロフランであり、Tosはトシルであり、Trtはトリチルである。
窒素雰囲気下で、Phe−Ile−Gly−Leu(配列番号2)(1.0当量)をDCMに分散させ、MSAにより室温で溶解した。窒素雰囲気下で、Z−Asp(OtBu)−Ala(1.05当量)およびTEA(1.0当量)を25℃±5でCH2Cl2/DMFの混合物に溶解し、その後−15℃に冷却した。カルボキシル官能基をピリジン(1.0当量)および塩化ピバロイル(1.0当量)の添加によって活性化させた。10分後、シリル化ペプチドを活性化ペプチド上に移送した。均質であったカップリング反応媒体を水で希釈し、2相系に導いた。CH2Cl2を真空下で除去し、それによってペプチドは沈殿し、濾過によってZ−Asp(OtBut)−Ala−Phe−Ile−Gly−Leuを単離し、水で洗浄し、その後、真空下で乾燥させた。本出願人らは少なくとも70質量%の収率で白色固体を得た。
窒素雰囲気下で、LeuArgPro(D)AlaNH2(配列番号3)(1.05当量)をDMAに溶解し、最高40℃でMSAによりシリル化させ、その後、溶液を約5℃に冷却した。窒素雰囲気下で、ZSerTyr(D)CitOH(1.0当量)およびHOOBt(1.05当量)を最高40℃でMSAに溶解し、溶液を約−5℃に冷却した。その後、溶液Aを溶液Bに移送し、EDCの添加によってカップリングを開始した。HCl(1.1当量)および反応混合物を少なくとも1時間にわたり−5℃で、その後、少なくとも3時間の間約5℃で攪拌した。反応の終わりをHPLCによって調べた。溶媒を真空下で除去し、その後、濃縮物をNaClの1%水溶液中で希釈し、pHを希HClの制御された添加によって2.5〜3.3の間に調節した。HOOBtおよびDMAを除去するために、水溶液をDCMで洗浄し、その後、ペプチドをn−BuOHで3回抽出した。含水率が1質量%以下になるまで減圧下での蒸発によって溶媒を除去した。約45℃で温度を維持することによりスラリーをアセトンで漸次希釈して、ペプチドを白色固体として沈殿させた。約20℃で少なくとも1時間の間攪拌後に白色固体を濾過した。固体をアセトンで、最後にアセトニトリルで洗浄した。アセトン含有率が20質量%以下になるまで沈殿物を乾燥させた。本出願人らは少なくとも70質量%の収率で白色固体を得た。
窒素雰囲気下で、SerTyr(D)CitLeuArgPro(D)AlaNH2(配列番号4)(1.05当量)をDMAに溶解し、少なくとも60分にわたり最高40℃でMSAによりシリル化させ、その後、溶液を約−5℃に冷却した。窒素雰囲気下で、Ac(D)Nal(D)Cph(D)PalOH(1.0当量)およびHOOBt(1.05当量)を最高40℃でDMAに溶解し、溶液を約−5℃に冷却した。その後、溶液Aを溶液Bに移送し、EDCの添加によってカップリングを開始した。HCl(1.1当量)および反応混合物を少なくとも2時間にわたり−5℃で、その後、少なくとも8時間の間約5℃±5で攪拌した。反応の終わりをHPLCによって調べた。反応全体を通して均質なままであった反応混合物を水で希釈し、HClの希釈水溶液によりpHを2.0±0.5で調節した。その後、溶液を±35℃でDCMで2回洗浄し、その後、n−BuOHでペプチドを3回抽出した。組み合わせた有機相を最後に水で洗浄した。含水率が2質量%以下になるまで減圧下での蒸発によって溶媒を除去した。スラリーをアセトンで希釈して、ペプチドを白色固体として沈殿させた。約15℃で少なくとも1時間の間攪拌後に白色固体を濾過した。固体をアセトンで洗浄した。アセトン含有率が5質量%以下になるまで沈殿物を乾燥させた。その後、少なくとも1時間の間約20℃でMeOHとアセトンの1/1混合物中で、乾燥させた固体を粉砕し、濾過し、アセトンで洗浄した。本出願人らは少なくとも70質量%の収率で白色固体を得た。
窒素雰囲気下で、Ser(tBu)Thr−Cys(Trt)Val Leu GlyOH(配列番号5)(1.0当量)をNMPに溶解し、少なくとも90分にわたり最高50℃でMSAによりシリル化させ、その後、溶液を約5℃に冷却した。窒素雰囲気下で、Boc−Cys(Trt)−Ser(tBu)−Asn−Leu OH(配列番号7)(1.02当量)およびNMM(1.05当量)をNMPに溶解し、その後、溶液を約−15℃±5に冷却した。その後、カルボキシル部分をIBCF(1.05当量)の添加によって活性化した。その後、溶液Aを溶液Bに移送し、反応混合物を少なくとも60分にわたり0℃で攪拌した。反応全体を通して均質なままであった反応混合物をKHSO4の水溶液で希釈し、それはペプチドを沈殿させた。固体を濾過し、水、その後、アセトンと水の9/1混合物で洗浄した。乾燥後、本出願人らは少なくとも75質量%の収率で白色固体を得た。
窒素雰囲気下で、H−TrpSerTyr(D)Ser(tBu)LeuArgProNHNHCONH2(配列番号6)(1.0当量)をDMAに溶解し、少なくとも60分にわたり最高40℃でMSAによりシリル化させた。溶液を約±25℃に冷却し、Fmoc−His(Trt)−OH(1.0当量)およびHBTU(1.1当量)を添加し、完全に溶解するまで±25℃で溶液を混合し、次に約−5℃まで冷却した。DIPEA(1.1当量)の制御された添加によってカップリングを開始した。反応の終わりをHPLCによって調べた。カップリング中に均質なままであった反応混合物をKHSO4の水溶液で希釈し、それはペプチドを沈殿させた。固体を濾過し、水で洗浄した。乾燥後、本出願人らは少なくとも70質量%の収率で白色固体を得た。
Claims (23)
- ペプチドまたはペプチド類似体を製造する方法であって、
(a)トリメチルシリルシアニド以外のシリル化剤との反応によって対応するペプチドをシリル化することによりペルシリル化ペプチドまたはペルシリル化ペプチド類似体を製造する工程と、
(b)式(I)X−A−COOH(式中、Xはアミノ保護基であり、Aは、アミノ酸残基、ペプチド残基またはペプチド類似体残基であり、−COOHは任意に活性化されたカルボキシル基を表す)の化合物を4〜15個のアミノ酸を含有するペルシリル化ペプチドまたはペルシリル化ペプチド類似体と反応させる工程と
を含む方法。 - 前記ペルシリル化ペプチドが、4、5、6、7または8個のアミノ酸を含有する請求項1に記載の方法。
- 前記ペルシリル化ペプチドが、4、5または6個のアミノ酸を含有する請求項1に記載の方法。
- 工程(b)の反応が有機溶媒中で行われる請求項1〜3のいずれか一項に記載の方法。
- 前記シリル化剤が、N−トリアルキルシリルアミンおよびN−トリアルキルシリルアミドから選択され、好ましくは、N−メチル−N−トリメチルシリルアセトアミド(MSA)である請求項1〜4のいずれか一項に記載の方法。
- 前記有機溶媒が、極性有機溶媒、好ましくはアミド型溶媒、より好ましくはN,N−ジメチルアセトアミド(DMAC)である請求項4または5のいずれか一項に記載の方法。
- 工程(a)のシリル化反応が25℃〜50℃の温度で行われる請求項1〜6のいずれか一項に記載の方法。
- シリル化されるべき官能基のモル量を基準として、0.5〜5当量、好ましくは0.7〜1.5当量のシリル化剤が用いられる請求項1〜7のいずれか一項に記載の方法。
- Aが、2、3、4、5、6、7、8または9個のアミノ酸を含む請求項1〜8のいずれか一項に記載の方法。
- Xが電子求引性アミノ保護基である請求項1〜9のいずれか一項に記載の方法。
- XがBoc基である請求項10に記載の方法。
- 工程(b)の反応が、カルボキシル基活性化剤、好ましくはピバロイルクロリドまたはイソブチルクロロホルメートの存在下で行われる請求項1〜11のいずれか一項に記載の方法。
- 前記反応によって生成した化合物から基Xを除去する工程を更に含む請求項1〜12のいずれか一項に記載の方法。
- 式(I)X−A−COOH(式中、Xはアミノ保護基であり、Aは、アミノ酸残基、ペプチド残基またはペプチド類似体残基であり、−COOHは任意に活性化されたカルボキシル基を表す)の化合物をペルシリル化ペプチドまたはペルシリル化ペプチド類似体と反応させることによって得られる部分シリル化ペプチドまたは部分シリル化ペプチド類似体の溶液を提供するための極性有機溶媒の使用。
- 前記極性有機溶媒が、好ましくはN,N−ジメチルホルムアミドおよびN,N−ジメチルアセトアミドから選択されるアミド型溶媒である請求項14に記載の使用。
- 前記溶媒がN,N−ジメチルアセトアミドである請求項15に記載の使用。
- Aにおけるアミノ酸単位および任意の類似体単位の数対ペルシリル化ペプチドまたはペルシリル化ペプチド類似体におけるアミノ酸単位および任意の類似体単位の数の比が、1:5〜3:2、好ましくは1:4〜1:1である請求項14〜16のいずれか一項に記載の使用。
- 前記溶液が10質量%〜95質量%の極性有機溶媒を含有する請求項14〜17のいずれか一項に記載の使用。
- 部分シリル化ペプチドまたは部分シリル化ペプチド類似体が、請求項9または10のいずれか一項に記載の式(I)の化合物を請求項1〜3のいずれか一項に記載のペルシリル化ペプチドまたはペルシリル化ペプチド類似体と反応させることにより得られる請求項14〜18のいずれか一項に記載の使用。
- 前記溶液が−40℃〜+10℃の温度で均質である請求項14〜19のいずれか一項に記載の使用。
- 請求項14〜20のいずれか一項に記載の使用を含む、ペプチドまたはペプチド類似体を製造する方法。
- N−メチル−N−トリメチルシリルアセトアミドおよびアミド型溶媒を含有する液媒体中に4〜15個のアミノ酸を含有するペプチドまたはペプチド類似体を含む溶液。
- 前記アミド型溶媒がN,N−ジメチルアセトアミドである請求項23に記載の溶液。
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