因此本发明考虑了一种用于制造肽或肽类似物的方法,该方法包括使一种具有式(I)X-A-COOH的化合物与一种含有4至15个氨基酸的全硅烷化肽或全硅烷化肽类似物进行反应,其中X是一种氨基保护基团,A是一种氨基酸、肽或肽类似物残基,并且-COOH表示一种任选活化的羧基基团。
已经发现大规模的制备性全硅烷化作用对于高级肽(例如,四肽、五肽、等等)是可能的,并且后者具有足够的反应性和溶解性以便允许高产量地制造具有高纯度(特别是光学纯度)的更长链的肽和肽类似物。也已经发现除了三甲基氰硅烷之外的硅烷化试剂是适于使更长链的肽硅烷化的。
在本发明中,“肽”应当被理解为是特别地表示一种化合物,该化合物基本上由通过酰胺键彼此连接的多个氨基酸构成的。
在本发明中,“肽类似物”应当被理解为是特别地表示一种化合物,该化合物基本上由多个氨基酸构成并且任选地包括可以结合到一种肽中的其他化合物,例如杂取代的羧酸,例如羟基羧酸或巯基羧酸。肽类似物在肽序列中经常包括至少1个键,该键不同于酰胺键,例如尿烷,脲,酯或硫代酯键。在本发明中肽或肽类似物可以是直链的,环的或分支的,并且优选地是直链的。
在本发明中作为肽或肽类似物以及残基“A”的组分是有用的氨基酸包括天然的以及非天然的氨基酸。”这些氨基酸可以选自例如以下的天然氨基酸:丙氨酸、缬氨酸、正缬氨酸、亮氨酸、正亮氨酸、异亮氨酸、丝氨酸、异丝氨酸、同型丝氨酸、苏氨酸、别苏氨酸、甲硫氨酸、乙硫氨酸、谷氨酸、天冬氨酸、天冬酰胺、半胱氨酸、胱氨酸、苯丙氨酸、酪氨酸、色氨酸、赖氨酸、精氨酸、组氨酸、鸟氨酸、谷氨酰胺以及瓜氨酸。
特别地,含有丝氨酸、异丝氨酸、同型丝氨酸和/或酪氨酸、更特别地是丝氨酸和/或酪氨酸的全硅烷化片段是优选的。
还可以使用它们的非天然的对映异构体。
这些氨基酸可以选自例如以下的合成起源的氨基酸,它们是:(1-萘基)丙氨酸、(2-萘基)丙氨酸、高苯丙氨酸、(4-氯苯基)丙氨酸、(4-氟苯基)丙氨酸、(3-吡啶基)丙氨酸、苯基甘氨酸、二氨基庚二酸(2,6-二氨基庚烷-1,7-二酸)、2氨基丁酸、2氨基四氢化萘-2-羧酸、赤型-β-甲基苯丙氨酸、苏型-β-甲基苯丙氨酸、(2-甲氧苯基)苯基、1氨基-5-羟基茚满-2-羧酸、2-氨基庚烷-1,7-二酸、(2,6-二甲基-4-羟苯基)丙氨酸、赤型-β-甲基酪氨酸、或苏型-β-甲基酪氨酸。
根据本发明的方法的操作步骤总体上是在液相中进行的。
在根据本发明的方法中,这种全硅烷化肽优选地含有4、5、6、7或8个氨基酸,更优选地4、5或6个氨基酸。应当理解,这些数字类似地施用于在一种肽类似物中所连接的单元的数目。
在根据本发明的方法中可以适合以全硅烷化形式进行反应的肽序列的具体例子包括:
H-Phe-Ile-Gly-Leu-OH(SEQ ID NO:2)
H-Leu-Arg-Pro-(D)AlaNH2(SEQ ID NO:3)
H-Ser-Tyr-(D)Cit-Leu-Arg-Pro-(D)AlaNH2(SEQ ID NO:4)
H-Ser(tBu)-Thr-Cys(Trt)-Val-Leu-Gly-OH(SEQ ID NO:5)
H-Trp-Ser-Tyr-(D)Ser(tBu)-Leu-Arg-Pro-NHNHCONH2(SEQ ID NO:6)
在根据本发明的方法的步骤(a)中,该全硅烷化肽或肽类似物是通过与一种硅烷化剂的反应(优选在一种有机溶剂中)通过使一种对应的肽(类似物)硅烷化来获得的。可以将这种全硅烷化肽或肽类似物分离并纯化,如果希望的话。然而,优选的是原位使用这种全硅烷化肽或肽类似物,例如通过将一种含有全硅烷化肽或肽类似物的溶液与一种含有(可任选地活化的)具有式(I)的化合物的溶液相组合。
在本发明中,优选的是使用不含有氰基基团的硅烷化剂,例如N-三烷基甲硅烷基胺类或N-三烷基甲硅烷基酰胺类。此类硅烷化剂的例子包括N,O-双(三甲基硅烷基)乙酰胺、N,O-双(三甲基硅烷基)三氟乙酰胺、六甲基二硅氮烷、N-甲基-N-三甲基硅烷基乙酰胺(MSA)、N,-甲基-N-三甲基硅烷基三氟乙酰胺、N-(三甲基硅烷基)乙酰胺、N-(三甲基硅烷基)二乙胺、N-(三甲基硅烷基)二甲胺、1-(三甲基硅烷基)咪唑、3-(三甲基硅烷基)-2-噁唑烷酮N-甲基-N-三甲基硅烷基乙酰胺(MSA)是优选的。
总体上,步骤(a)的反应是在从0℃至100℃,优选地从25℃至50℃的温度下进行的。
在步骤(a)的反应中,总体上相对于有待硅烷化的官能团的摩尔量,使用了0.5至5当量、优选0.7至1.5当量的硅烷化剂。使用相对于有待硅烷化的官能团的摩尔量的2至4当量的硅烷化剂也是可能的。“有待硅烷化的官能团”应当被认为特别地表示以下基团,这些基团具有一个与该硅烷化剂进行反应的活性氢原子,例如氨基,羟基,巯基或羧基的基团。
应当理解,“全硅烷化”旨在特别地表示一种肽或肽类似物,其中这些具有一种可以与该硅烷化剂进行反应的活性氢原子的基团被充分地硅烷化以确保得到一种用于偶联的步骤(b)的均相反应介质。
当在一种溶剂的存在下进行这种硅烷化时,所述溶剂优选地是一种极性有机溶剂,更优选地是一种极性疏质子有机溶剂。一种酰胺类型的溶剂,例如N,N-二甲基甲酰胺,或特别是N,N-二甲基乙酰胺(DMAC)是更加特别优选的。
在另一个实施方案中,硅烷化是在一种液体硅烷化介质中进行的,该介质基本上由硅烷化剂以及肽或肽类似物构成。
在本发明中,肽或肽类似物残基A应当理解为特别地表示一种肽或肽类似物,该肽或肽类似物在它的N端或在一种肽类似物中的任选地相应位置上键合到氨基受到保护的A的羧基基团上,这种氨基受到保护的A包括优选地从2至20个氨基酸,并且更优选地2、3、4、5、6、7、8或9个氨基酸。
在根据本发明的方法中可以适当地反应的具有化学式A的化合物的序列的具体例子包括:
Z-Asp(OtBu)-Ala-OH
Z-Ser-Tyr-(D)Cit-OH
Ac-(D)Nal-(D)Cph-(D)Pal-OH
Boc-Cys(Trt)-Ser(tBu)-Asn-Leu-OH(SEQ ID NO:7)
Fmoc-His(Trt)-OH
根据本发明的方法可以特别地施用于以下反应:
术语“氨基保护基团X”是指能够用来替换一个氨基基团的酸性质子以降低其亲核性的保护基团。典型地,在将有待加入的下一个氨基酸加入到这种增长的肽链之前在脱保护反应中除去该氨基保护基团X。该氨基保护基团X优选地是具有位阻的。术语“位阻”旨在特别地表示一种取代基,该取代基包括至少3个碳原子,特别地是至少4个碳原子,包括至少一个仲、叔或季碳原子。这个位阻基团经常包括最多100个,优选地最多50个碳原子。
提及由X在此所代表的氨基保护基团的非限制性例子,可以特别提到的是取代或未取代的酰基类型的基团,例如甲酰基、丙烯酰基(acrylyl)(Acr)、苯甲酰基(Bz)、乙酰基(Ac)、三氟乙酰基,芳烷基氧基羰基类型的取代或未取代基团,例如苄氧基羰基(Z)、对氯苄氧基羰基、对溴苄氧基羰基、对硝基苄氧基羰基、对甲氧基苄氧基羰基、二苯甲氧基羰基、2(对联苯基)异丙基氧基羰基、2(3,5二甲氧基苯基)异丙基氧基羰基、对苯基偶氮基苄氧基羰基、三苯基膦酰基乙基氧基羰基或9芴甲氧羰基基团(Fmoc),烷氧基羰基类型的取代或未取代的基团,例如叔丁氧羰基(BOC)、叔戊氧基羰基、二异丙基甲氧基羰基、异丙基氧基羰基、乙氧基羰基、烯丙氧羰基、2甲基磺酰基乙氧基羰基或2,2,2三氯乙氧基羰基,环烷氧基羰基类型的基团,例如环戊基氧基羰基、环己基氧基羰基、金刚烷基氧基羰基或异冰片基氧基羰基的基团,以及含有一个杂原子的基团,例如苯磺酰基、对甲苯磺酰基、均三甲苯磺酰基、甲氧基三甲基苯磺酰基、2-硝基苯磺酰基、2-硝基苯次磺酰基、4-硝基苯磺酰基、或4-硝基苯次磺酰基的基团在这些基团X中,那些包括一个羰基、次磺酰基或磺酰基基团的基团是优选的。一种氨基保护基团X是优选地选自:烯丙氧羰基基团、叔丁氧基羰基(BOC)、苄氧基羰基(Z)、9-芴甲氧羰基(Fmoc)、4-硝基苯磺酰基(Nosyl)、2-硝基苯次磺酰基(Nps)以及取代的衍生物。更优选地,该氨基保护基团X是叔丁氧羰基(BOC)。
氨基保护基团X可以通过不同方法而被引入,例如通过将适当的酸卤化物(例如,苄氧羰基氯)或酸酐(例如,乙酸酐以及二碳酸二叔丁酯(BOC2O))进行反应。另一方面,可以通过酸解、氢解、用稀氨水处理、用钠处理、用氨基钠处理、用肼处理,或酶促水解来去除氨基保护基团X。根据本发明的方法经常进一步包括将基团X从通过这种具有式(I)的化合物与该全硅烷化肽的反应而产生的化合物中去除。
在根据本发明的方法中,在这种具有式(I)的化合物与该全硅烷化肽之间的反应经常是在一种羧基基团活化剂的存在下进行的。在那种情况下,这种羧酸活化剂是适当地选自:碳二亚胺、酰卤、磷鎓盐以及脲鎓或胍鎓盐。更优选地,该羧酸活化剂是一种酰卤。仍然更优选地,它是从氯甲酸异丁酯和新戊酰氯中选择出的
当使用额外的羧基活化剂时经常得到良好的结果,这些活化剂降低了副反应和/或增加了反应效率。例如,磷鎓和脲鎓盐在一种叔碱(例如,二异丙基乙胺(DIPEA)和三乙胺(TEA))的存在下可以将受保护的氨基酸转化成活化的种类(例如,BOP、PyBOP、HBTU、以及TBTU都生成HOBt酯)。其他试剂通过提供一种保护剂有助于防止外消旋作用。这些试剂包括碳二亚胺(例如,DCC或WSCDI),它们具有一个添加的辅助亲核体(例如,1-羟基-苯并三唑(HOBt)、1-羟基-氮杂苯并三唑(HOAt)、或HOSu)或它们的衍生物。可以使用的另一种试剂是TBTU。还使用了使用氯甲酸异丁酯的混合酸酐法(具有或不具有一种添加的辅助亲核体),叠氮化物法也是如此,这是由于与它相关的低外消旋作用的缘故。这些类型的化合物也可以增加碳二亚胺介导的偶合的速率,连同阻止了Asn和Gln残基的脱水。典型的额外的试剂也包括碱类,例如N,N-二异丙基乙胺(DIPEA)、三乙胺(TEA)或N-甲基吗啉(NMM)。
在根据本发明的方法中,步骤(b)的反应总体上是在-50℃至50℃、优选地从-40℃至10℃的温度下进行的。
另一方面,本发明考虑了使用一种极性有机溶剂来提供一种部分硅烷化的肽或肽类似物的溶液,该肽或肽类似物是通过使一种具有式(I)X-A-COOH的化合物与一种全硅烷化肽或全硅烷化肽类似物进行反应来获得的,其中X是一种氨基保护基团,A是一种氨基酸、肽或肽类似物残基,并且-COOH表示一种任选活化的羧基基团。
已经发现可能的是在整个反应中在溶液中在一种极性有机溶剂中维持部分硅烷化的、特别是具有至少5个氨基酸(或任选地类似的单元)的偶合产物,从而提供了一种均相溶液,该溶液特别适合于工作进程以及纯化或可任选的进一步的反应步骤,例如脱保护以及随后的偶联步骤。出乎意料的是,当该反应在低温下进行时这也是可能的。
该极性有机溶剂可以选自例如醚类,特别是水混溶性的醚类,例如四氢呋喃、二噁烷或来自硝基烷的1,2-二甲氧基乙烷,特别地水混溶性的硝基烷,例如硝基甲烷或来自酰胺类型的溶剂,特别是水混溶性的酰胺。
在根据本发明的用途中,该极性有机溶剂优选地是一种酰胺类型的溶剂,优选地选自:N,N-二甲基甲酰胺和N,N-二甲基乙酰胺和N-甲基吡咯烷酮。更优选地是,该溶剂是N,N-二甲基乙酰胺。该溶剂允许特别有效地工作进程以及所产生的肽或肽类似物的回收,而没有副产物的实质性形成。
在根据本发明的用途中,在该溶液中该部分烷基化的肽或肽类似物的浓度相对于该溶液的总重量总体上是等于或大于约1%重量,优选地等于或大于约5%重量。在根据本发明的用途中,在该溶液中该部分硅烷化的肽或肽类似物的浓度相对于该溶液的总重量总体上是等于或小于约20%重量,优选地等于或小于约15%重量。
在根据本发明的用途的一个具体方面,在A中氨基酸单元以及任选的类似物单元的数目与该全硅烷化肽或该全硅烷化肽类似物中氨基酸单元以及任选的类似物单元的数目的比值总体上是等于或大于1∶5,优选地等于或大于1∶4。在这个方面,所述比值总体上是等于或小于3∶2,优选地等于或小于1∶1。
在根据本发明的用途中,该溶液总体上含有相对于该溶液的总重量10%重量至95%重量的极性有机溶剂。
在根据本发明的用途中,该部分地硅烷化的肽或肽类似物是优选地通过如之前在此说明根据本发明的方法而获得的。
在根据本发明的用途的一个特别优选的实施方案中,该溶液在从-40℃至+10℃的温度下是均相的。
本发明也考虑了一种用于制造肽或肽类似物的方法,包括根据本发明的用途。
以下实例旨在说明本发明而非限制本发明。
在这些实例中并且贯穿本说明书,所采用的缩写定义如下:
AcOH是乙酸、AcOEt是乙酸乙酯、Boc是叔丁氧基羰基、n-BuOH是正丁醇、i-BuOH是异丁醇、Cbz是苄氧基羰基、DCC是1,3二环己基碳二亚胺、DCM是二氯甲烷、DIC是1,3-二异丙基碳二亚胺、DIPEA是N,N-二异丙基乙胺、DMF是N,N-二甲基甲酰胺、DMA是N,N-二甲基乙酰胺、EDC是1-(3-二甲基氨基丙基)-3-乙基碳二亚胺、Fmoc是芴甲氧羰基、HBTU是N,N,N′,N′-四甲基-O-(1H-苯并三唑-1-基)脲鎓-六氟磷酸盐)、HOBT是1-羟基苯并三唑、HOOBT是3,4-二氢-3-羟基-4-氧-1,2,3-苯并三嗪、IBCF是氯甲酸异丁酯、i-BuOH是异丁醇、IPE是二异丙醚、MeCN是乙腈、MeOH是甲醇、MSA是N-甲基-N-三甲基甲硅烷基乙酰胺、NMM是N-甲基吗啉、NMP是1-甲基-2-吡咯烷酮、tBu是叔丁基、TEA是三乙胺、THF是四氢呋喃、Tos是甲苯磺酰基、而Trt是三苯甲基。
实例1:[2+4]:Z-Asp(OtBu)-Ala-Phe-Ile-Gly-Leu-OH(SEQ ID NO:8)
在氮气氛下,将Phe-Ile-Gly-Leu(SEQ ID NO:2)(1.0当量)分散在DCM中并且在室温下用MSA将其溶解。在氮气氛下,在25℃±5下将Z-Asp(OtBut)-Ala(1.05当量)和TEA(1.0当量)溶于CH2Cl2/DMF的混合物中然后冷却到-15℃。羧基的功能通过加入吡啶(1.0当量)和新戊酰氯(1.0当量)而被激活。10分钟后,将这种烷基化的肽转移到这种活化的肽上。用水稀释这种均相的偶联反应介质,产生一种两相系统。在真空下将CH2Cl2去除,其中沉淀的肽和Z-Asp(OtBut)-Ala-Phe-Ile-Gly-Leu通过过滤被分离,用水洗涤然后真空干燥。我们得到了一种白色固体,其产率为以重量计至少70%。
实例2:[3+4]:Z-Ser-Tyr-(D)Cit-Leu-Arg-Pro-(D)AlaNH2.HCl(SEQ ID NO:4)
在氮气氛下,将LeuArgPro(D)AlaNH2(SEQ ID NO:3)(1.05当量)溶于DMA中并且在最高温度40℃下用MSA将其硅烷化,然后将该溶液冷却至大约-5℃。在氮气氛下,在最高温度40℃下将ZSerTyr(D)CitOH(1.0当量)和HOOBt(1.05当量)溶于DMA中并且将该溶液冷却至约-5℃。然后,将溶液A转到溶液B中,通过加入EDC.HCl(1.1当量)来起始偶合,并且将该反应混合物在-5℃下搅拌至少1小时然后在大约5℃下持续至少3小时。通过HPLC检查该反应的结束。在真空下将该溶剂去除,并接着在1%的NaCl水溶液中将该浓缩液稀释,并且通过稀HCl的受控加入将pH调节到2.5至3.3之间。为了去除HOOBt和DMA,用DCM洗涤该水性溶液,然后用n-BuOH对这种肽萃取三次。通过减压蒸发将这种溶剂去除直到水含量为≤1%重量。通过将温度维持在大约45℃下用丙酮逐步稀释该浆料以便使该肽作为一种白色固体而沉淀,在大约20℃下在持续至少1小时搅拌后过滤该白色固体。用丙酮并且最终用乙腈洗涤该固体。将该沉淀干燥直到丙酮含量≤2%重量,并且我们得到了一种白色固体,其产率为以重量计至少70%。
实例3:[3+7]:Ac-(D)Nal-(D)Cph-(D)Pal-Ser-Tyr-(D)Cit-Leu-Arg-Pro-(D)Ala-NH2.HCl(SEQ ID NO:1)
在氮气氛下,将SerTyr(D)CitLeuArgPro(D)AlaNH2(SEQ ID NO:4)(1.05当量)溶于DMA中并且在最高温度40℃下用MSA将其硅烷化至少60分钟,然后将该溶液冷却到约-5℃。在氮气氛下,在最高温度40℃下将Ac(D)Nal(D)Cph(D)PalOH(1.0当量)和HOOBt(1.05当量)溶于DMA中,并且将该溶液冷却到大约-5℃。然后,将溶液A转移到溶液B中,通过加入EDC.HCl(1.1当量)启动偶联,并且将该反应混合物在-5℃下搅拌至少2小时然后在大约5℃±5下保持至少8小时。通过HPLC检查该反应的结束。用水稀释该反应混合物,该反应混合物在整个反应中保持均相,并且用HCl的稀水溶液将pH调节到2.0±0.5。然后,在±35℃下用DCM将该溶液洗涤2次,之后跟随用n-BuOH对这种肽的3次萃取。最后,用水洗涤这些组合的有机相。通过减压蒸发将该溶剂去除直到水含量为≤2%重量。用丙酮稀释该浆料以便将这种肽作为一种白色固体而沉淀,在大约15℃下持续至少1小时搅拌后过滤该白色固体。用丙酮洗涤该固体。将该沉淀干燥直到丙酮含量≤5%重量。然后,将这种干燥的固体在甲醇与丙酮的1/1混合物中在大约20℃下研磨持续至少1小时,过滤并用丙酮洗涤。我们得到了一种白色固体,其产率为以重量计至少70%。
实例4:[4+7]:Boc-Cys(Trt)-Ser(tBu)-Asn-Leu-Ser(tBu)-Thr-Cys(Trt)Val LeuGly OH(SEQ ID NO:9)
在氮气氛下,将Ser(tBu)-Thr-Cys(Trt)Val Leu Gly OH(SEQ ID NO:5)(1.0当量)溶于NMP中并且在最高温度50℃下用MSA将其硅烷化至少90分钟,然后将该溶液冷却到大约5℃。在氮气氛下,将Boc-Cys(Trt)-Ser(tBu)-Asn-Leu-OH(SEQ ID NO:7)(1.02当量)和NMM(1.05当量)溶于NMP中,然后将该溶液冷却到-15℃±5。然后,这个羧基的部分通过IBCF(1.05当量)的加入而被活化。然后,将溶液A转移到溶液B中,并且将该反应混合物在0℃下搅拌至少60分钟。用沉淀了这种肽的KHSO4的水性溶液稀释该反应混合物,该反应混合物在整个反应中保持均相。将该固体过滤,用水然后用丙酮与水的9/1的混合物对其进行洗涤。干燥之后,我们得到了一种白色固体,其产率为以重量计至少75%。
实例5:[4+7]:Fmoc-His(Trt)-Trp-Ser-Tyr-(D)Ser(tBu)-Leu-Arg-Pro-NHNHCONH2(SEQ ID NO:10)
在氮气氛下,将H-TrpSerTyr(D)Ser(tBu)LeuArgProNHNHCONH2(SEQ ID NO:6)(1.0当量)溶于DMA中并且在最高温度40℃下用MSA将其硅烷化至少60分钟。将该溶液冷却到±25℃,并且加入Fmoc-His(Trt)-OH(1.0当量)和HBTU(1.1当量),将该溶液在±25℃下混合直到完全溶解然后冷却到约-5℃。通过DIPEA(1.1当量)的受控加入来起始这种偶联。通过HPLC检查该反应的结束。用沉淀了这种肽的KHSO4的水性溶液稀释该反应混合物,该反应混合物在偶联过程中保持均相。将该固体过滤并且用水洗涤。干燥之后,我们得到了一种白色固体,其产率以重量至少70%。