JP2011097927A5

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Publication number: JP2011097927A5
Application number: JP2010225225A
Authority: JP
Filing date: 2010-10-04
Publication date: 2014-04-10
Anticipated expiration: 2030-10-04

Claims

ヒト第１番染色体の１ｑ３２．１〜１ｑ３２．２領域（Ｄ１Ｓ２４９〜Ｄ１Ｓ２８９１）における、アリル頻度がくせ毛形質を有する集団と非くせ毛形質を有する集団との間で統計学的に有意に異なる一塩基多型（ＳＮＰ）マーカーに対する連鎖不平衡解析により決定され、且つ配列番号１〜３のいずれかで示される塩基配列からなるハプロタイプブロックの塩基配列の部分塩基配列であって、アリル頻度がくせ毛形質を有する集団と非くせ毛形質を有する集団との間で統計学的に有意に異なる一塩基多型（ＳＮＰ）及び当該ＳＮＰと連鎖しているＳＮＰを一以上含む連続する塩基配列からなる部分塩基配列を含む、オリゴまたはポリヌクレオチドあるいはそれらの相補鎖である、毛髪形状判定マーカー。
前記ＳＮＰが以下からなる群より選択される塩基におけるＳＮＰである、請求項１記載の毛髪形状判定マーカー：
（１）配列番号１で表される塩基配列中、塩基番号１（ｄｂＳＮＰデータベースＩＤ：ｒｓ５７６６９７、ＴまたはＣ）、１６３５（ｒｓ６４５３９０、ＧまたはＡ）、２５２７（ｒｓ３７６７５４２、ＧまたはＡ）、及び３７６６（ｒｓ６７５５０８、ＣまたはＡ）で示される塩基；
（２）配列番号２で表される塩基配列中、塩基番号７５１９（ｒｓ２２７１７６３、ＧまたはＡ）、１６９０１（ｒｓ１０９２０２６０、ＴまたはＧ）、３０２７０（ｒｓ１６８４９３８７、ＡまたはＧ）、３１３３３（ｒｓ１２１２７３７５、ＣまたはＧ）、５００３８（ｒｓ１４９５８４０、ＴまたはＡ）、及び６３００８（ｒｓ１０９２０２６９、ＧまたはＴ）で示される塩基；ならびに
（３）配列番号３で表される塩基配列中、塩基番号２４５２４（ｒｓ３８０５、ＴまたはＧ）、及び６０７０１（ｒｓ８２３１１４、ＧまたはＡ）で示される塩基。
１０〜６０１塩基長の連続した塩基配列からなる、請求項１又は２記載の毛髪形状判定マーカー。
以下の工程（ａ）〜（ｃ）を含む被験者の毛髪形状に対する遺伝的感受性の判定方法：
（ａ）被験者由来のゲノムＤＮＡを調製する工程；
（ｂ）当該ゲノムＤＮＡから、ヒト第１番染色体の１ｑ３２．１〜１ｑ３２．２領域（Ｄ１Ｓ２４９〜Ｄ１Ｓ２８９１）における、アリル頻度がくせ毛形質を有する集団と非くせ毛形質を有する集団との間で統計学的に有意に異なる一塩基多型（ＳＮＰ）マーカーに対する連鎖不平衡解析により決定され、且つ配列番号１〜３のいずれかで示される塩基配列からなるハプロタイプブロックに存在する、アリル頻度がくせ毛形質を有する集団と非くせ毛形質を有する集団との間で統計学的に有意に異なる一塩基多型（ＳＮＰ）及び当該ＳＮＰと連鎖している一塩基多型（ＳＮＰ）を検出する工程；及び
（ｃ）当該検出したＳＮＰのアリル頻度が非くせ毛者集団におけるよりもくせ毛者集団において統計学的に有意に高い場合、当該被験者はくせ毛の遺伝的素因を有していると判定し、当該検出したＳＮＰのアリル頻度がくせ毛者集団におけるよりも任意の非くせ毛者集団において統計学的に有意に高い場合、当該被験者はくせ毛の遺伝的素因を有していないと判定する工程。
被験者由来のゲノムＤＮＡ中の配列番号１〜３で表される塩基配列における下記表に示される塩基番号の塩基のいずれか一以上において、当該塩基が塩基(i)であるか塩基(ii)であるかを識別し、塩基(i)である場合には被験者がくせ毛の素因を有していると判定し、塩基(ii)である場合には被験者がくせ毛の素因を有していないと判定する工程を含む、被験者の毛髪形状に対する遺伝的感受性の判定方法。
請求項１〜３のいずれか１項記載の毛髪形状判定マーカーにストリンジェントな条件下でハイブリダイズするプローブ及び／又はプライマーを含む、被験者の毛髪形状に対する遺伝的感受性の判定用試薬。
前記プローブ及び／又はプライマーが前記マーカーにおける請求項２記載のＳＮＰを含む領域とハイブリダイズする、請求項６記載の試薬。
請求項６又は７記載の試薬を含む、被験者の毛髪形状に対する遺伝的感受性判定用キット。
以下の工程（ａ）及び（ｂ）を含む毛髪形状調節剤をスクリーニングする方法：
（ａ）以下の（i）又は（ii）の遺伝子を含有する細胞に被験物質を投与する工程
（i）ヒト第１番染色体の１ｑ３２．１〜１ｑ３２．２領域（Ｄ１Ｓ２４９〜Ｄ１Ｓ２８９１）における、アリル頻度がくせ毛形質を有する集団と非くせ毛形質を有する集団との間で統計学的に有意に異なる一塩基多型（ＳＮＰ）マーカーに対する連鎖不平衡解析により決定され、且つ配列番号１〜３のいずれかで示される塩基配列からなるハプロタイプブロックにオーバーラップする遺伝子であって、当該ハプロタイプブロックの塩基配列の一部または全てを含有する遺伝子
（ii）ＣＳＲＰ１、ＮＡＶ１、ＩＰＯ９、ＴＭＥＭ５８及びＮＵＣＫＳ１から選択される遺伝子；及び
（ｂ）投与した被験物質の中から、当該（i）又は（ii）の遺伝子上又はその近傍に存在する、アリル頻度がくせ毛形質を有する集団と非くせ毛形質を有する集団との間で統計学的に有意に異なる一塩基多型（ＳＮＰ）及び当該ＳＮＰと連鎖している一塩基多型（ＳＮＰ）マーカーの塩基の多型をもう一方の多型に変換させる物質を毛髪形状調節剤として選択する工程。
配列番号４２、配列番号４４若しくは配列番号４６に示される塩基配列、これらと相補的な塩基配列からなるポリヌクレオチド、又はこれらの部分ポリヌクレオチドからなるか、あるいは配列番号４３、配列番号４５若しくは配列番号４７に示されるアミノ酸配列からなるポリペプチド又はその部分ポリペプチドからなる、毛髪形状タイプのマーカー。
部分ポリヌクレオチドが１５塩基以上のポリヌクレオチドである請求項１０記載のマーカー。
配列番号４２、配列番号４４若しくは配列番号４６に示される塩基配列又はこれと相補的な塩基配列からなるポリヌクレオチドの部分ポリヌクレオチドからなる、請求項１０記載のマーカーを増幅するためのプライマー。
配列番号４２、配列番号４４若しくは配列番号４６に示される塩基配列又はこれと相補的な塩基配列からなるポリヌクレオチド、又はこれらの部分ポリヌクレオチドからなる、請求項１０記載のマーカーを検出するためのプローブ。
配列番号４３、配列番号４５若しくは配列番号４７に示されるアミノ酸配列からなるポリペプチド又はその部分ポリペプチドを特異的に認識する、請求項１０記載のマーカーを検出するための抗体。
下記の工程（ａ）〜（ｃ）を含む毛髪形状タイプの検出及び／又は判定方法：
（ａ）被験者由来の試料における請求項１０に記載のマーカーの発現量を測定する工程、
（ｂ）当該（ａ）の測定結果を非くせ毛者のそれと比較する工程；及び
（ｃ）（ｂ）の結果に基づいて毛髪形状タイプを判断する工程。
前記被験者由来の試料が、被験者より採取された生体試料から調製されたＲＮＡ又は当該ＲＮＡから転写された相補的ポリヌクレオチドである、請求項１５記載の方法。
前記工程（ａ）が、被験者より採取された生体試料と請求項１４記載の抗体とを接触させて、当該抗体と結合した当該生体試料中の請求項１０記載のマーカーの量を測定する工程である、請求項１５記載の方法。
被験者より採取された生体試料が上皮系組織又は上皮系細胞由来のものである、請求項１５〜１７のいずれか１項に記載の方法。
以下の（ａ）〜（ｄ）の工程を含むことを特徴とする毛髪形状調節剤の評価又は選択方法。
（ａ）以下の（i）又は（ii）の遺伝子又は当該遺伝子にコードされたタンパク質が発現可能な細胞に、被験物質を接触させる工程
（i）ヒト第１番染色体の１ｑ３２．１〜１ｑ３２．２領域（Ｄ１Ｓ２４９〜Ｄ１Ｓ２８９１）における、アリル頻度がくせ毛形質を有する集団と非くせ毛形質を有する集団との間で統計学的に有意に異なる一塩基多型（ＳＮＰ）マーカーに対する連鎖不平衡解析により決定され、且つ配列番号１〜３のいずれかで示される塩基配列からなるハプロタイプブロックにオーバーラップする遺伝子であって、当該ハプロタイプブロックの塩基配列の一部または全てを含有する遺伝子
（ii）ＣＳＲＰ１、ＮＡＶ１、ＩＰＯ９、ＴＭＥＭ５８及びＮＵＣＫＳ１から選択される遺伝子
（ｂ）接触させた細胞の当該遺伝子又は当該タンパク質の発現量を測定する工程
（ｃ）（ｂ）で測定された発現量を被験物質に接触させない対照細胞の当該遺伝子又は当該タンパク質の発現量と比較する工程
（ｄ）（ｃ）の結果に基づいて、当該遺伝子又は当該タンパク質の発現量を減少又は増加させる被験物質を毛髪形状調節剤として選択する工程
以下の（ａ）〜（ｃ）の工程を含むことを特徴とする毛髪形状調節剤の評価又は選択方法。
（ａ）以下の（i）又は（ii）の遺伝子が発現可能な細胞に、当該遺伝子の発現制御領域とレポーター遺伝子との融合遺伝子を導入し、当該細胞を被験物質の存在下及び非存在下で培養する工程
（i）ヒト第１番染色体の１ｑ３２．１〜１ｑ３２．２領域（Ｄ１Ｓ２４９〜Ｄ１Ｓ２８９１）における、アリル頻度がくせ毛形質を有する集団と非くせ毛形質を有する集団との間で統計学的に有意に異なる一塩基多型（ＳＮＰ）マーカーに対する連鎖不平衡解析により決定され、且つ配列番号１〜３のいずれかで示される塩基配列からなるハプロタイプブロックにオーバーラップする遺伝子であって、当該ハプロタイプブロックの塩基配列の一部または全てを含有する遺伝子
（ii）ＣＳＲＰ１、ＮＡＶ１、ＩＰＯ９、ＴＭＥＭ５８及びＮＵＣＫＳ１から選択される遺伝子、
（ｂ）被験物質の存在下で培養した細胞培養物中のレポーター遺伝子発現産物の発現量を測定し、当該量を被験物質の非存在下で培養した細胞培養物中のレポーター遺伝子発現産物の発現量と比較する工程、
（ｃ）上記（ｂ）の比較結果に基づいて、レポーター遺伝子発現産物の発現量の発現量を増減させる被験物質を毛髪形状調節剤として選択する工程。
以下の（ａ）〜（ｃ）の工程を含むことを特徴とする毛髪形状調節剤の評価又は選択方法。
（ａ）被験物質と以下の（i）又は（ii）の遺伝子にコードされるタンパク質を含む水溶液、細胞又は当該細胞から調製した細胞画分とを接触させる工程
（i）ヒト第１番染色体の１ｑ３２．１〜１ｑ３２．２領域（Ｄ１Ｓ２４９〜Ｄ１Ｓ２８９１）における、アリル頻度がくせ毛形質を有する集団と非くせ毛形質を有する集団との間で統計学的に有意に異なる一塩基多型（ＳＮＰ）マーカーに対する連鎖不平衡解析により決定され、且つ配列番号１〜３のいずれかで示される塩基配列からなるハプロタイプブロックにオーバーラップする遺伝子であって、当該ハプロタイプブロックの塩基配列の一部または全てを含有する遺伝子
（ii）ＣＳＲＰ１、ＮＡＶ１、ＩＰＯ９、ＴＭＥＭ５８及びＮＵＣＫＳ１から選択される遺伝子、
（ｂ）被験物質を接触させた水溶液、細胞又は細胞画分における当該タンパク質の機能又は活性を測定し、当該機能又は活性を、被験物質を接触させない対照水溶液、対照細胞又は対照細胞画分における上記当該タンパク質の機能又は活性と比較する工程、
（ｃ）上記（ｂ）の比較結果に基づいて、当該タンパク質の機能又は活性を増減させる被験物質を毛髪形状調節剤として選択する工程。
ヒト毛髪毛根部における以下の（i）又は（ii）の遺伝子の発現を制御することを特徴とする毛髪形状タイプの調節方法。
（i）ヒト第１番染色体の１ｑ３２．１〜１ｑ３２．２領域（Ｄ１Ｓ２４９〜Ｄ１Ｓ２８９１）における、アリル頻度がくせ毛形質を有する集団と非くせ毛形質を有する集団との間で統計学的に有意に異なる一塩基多型（ＳＮＰ）マーカーに対する連鎖不平衡解析により決定され、且つ配列番号１〜３のいずれかで示される塩基配列からなるハプロタイプブロックにオーバーラップする遺伝子であって、当該ハプロタイプブロックの塩基配列の一部または全てを含有する遺伝子
（ii）ＣＳＲＰ１、ＮＡＶ１、ＩＰＯ９、ＴＭＥＭ５８及びＮＵＣＫＳ１から選択される遺伝子