JP2002506079A - 種々の選択された器官または組織にホーミングする分子 - Google Patents
種々の選択された器官または組織にホーミングする分子Info
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Abstract
Description
107号の一部継続出願であり、この内容の全体を本明細書中に参考として援用
する。
8およびCA 30199のもとで政府支援が行われた。
定の器官または組織にホーミングする分子に関する。
基礎になる病理は、単一の器官または組織のみに影響を与え得る。しかし、薬物
または他の処置が、罹病器官または罹病組織のみを標的化することは稀である。
より一般的には、処置は、例えば、患者の身体全体での全身毒性効果に起因して
、望ましくない副作用をもたらす。例えば、標的器官または標的組織に関連した
疾患の処置のために器官または組織を選択的に標的化することが望ましい。詳細
には、器官または組織の標的化は、遺伝子の発現を、特定の器官または組織に指
向させるために有用であり得る。なぜなら、非標的細胞への外来遺伝子の取り込
みは、望ましくない副作用(例えば、悪性トランスフォーメーション)を生じ得
るからである。
管の内部表面の内側を覆う内皮は、標的器官または標的組織における循環治療物
質が遭遇する最初の細胞型である。これらの細胞は、治療を器官または組織へと
選択的に指向するための標的を提供する。
リンパ系の血管は、例えば、リンパ球のホーミングを導くように作用する種々の
接着タンパク質を発現する。例えば、リンパ節に存在する内皮細胞は、L−セレ
クチンについてのリガンドである細胞表面マーカーを発現し、そしてパイアー斑
細静脈における内皮細胞は、α4β7インテグリンについてのリガンドを発現する
。これらのリガンドは、それらのそれぞれのリンパ系器官への特異的リンパ球ホ
ーミングに関与する。従って、薬物をL−セレクチンまたはα4β7インテグリン
に連結することにより、この薬物を、それぞれ、罹病リンパ節またはパイアー斑
へと標的化するための手段を提供し得る。ただし、これらの分子は、有意な数の
他の器官または組織において存在する類似のリガンドには結合しない。
が、リンパ球の循環の特定の観察によって、器官特異的内皮マーカーおよび組織
特異的内皮マーカーが存在することが示唆される。同様に、特定の器官または組
織への特定の型の腫瘍細胞のホーミングまたは転移は、器官特異的マーカーおよ
び組織特異的マーカーが存在し得ることをさらに示唆する。従って、このような
器官特異的マーカーまたは組織特異的マーカーに結合し得、それゆえ、この器官
または組織にホーミングし得る分子を同定する必要性が存在する。本発明は、こ
の必要性を満たし、そして関連する利点も提供する。
巣、リンパ節、副腎、肝臓または腸を含む)に選択的にホーミングする分子を提
供する。例えば、本発明は、ペプチドCGFECVRQCPERC(配列番号1
)およびCGFELETC(配列番号2)を含む肺ホーミングペプチド(例えば
、GFEモチーフを含む肺ホーミングペプチド);CVALCREACGEGC
(配列番号3)のような皮膚ホーミングペプチド;ペプチドSWCEPGWCR
(配列番号4)のような膵臓ホーミングペプチド;ならびにペプチドCSCFR
DVCC(配列番号5)およびCRDVVSVIC(配列番号6)を含む網膜ホ
ーミングペプチド(例えば、RDVモチーフを含む網膜ホーミングペプチド)を
提供する。
子を含む、結合体を提供する。このような部分は、毒素、細胞死を阻害する薬剤
、細胞による有害もしくは有用な物質の産生もしくは活性を変化させる薬剤、ま
たはこの薬剤に曝露された細胞の増殖を変更する薬剤のような治療的薬剤であり
得る。部分はまた、放射性核種のような検出可能な薬剤、または室のあるマイク
ロデバイスまたは不溶性クロマトグラフィー支持体のようなタグであり得る。本
発明のこのような結合体は、この部分を選択された器官または組織へ指向させる
ために有用である。
するかまたは病理を有する疑いのある被験体に投与することによって、本発明の
器官ホーミング分子を使用して、肺、皮膚、膵臓、網膜、前立腺、卵巣、リンパ
節、副腎、肝臓または腸の病理を診断または処置する方法を提供する。例えば、
肺、皮膚、膵臓、網膜、前立腺、卵巣、リンパ節、副腎、肝臓または腸の病理は
、この病理を有する被験体に、治療的薬剤に連結した、適切な器官ホーミング分
子を含む結合体を投与することによって処置され得る。同様に、検出可能な薬剤
に連結した適切な器官ホーミング分子を含む結合体を被験体に投与することによ
り、選択された器官もしくは組織を同定する方法、または選択された器官におけ
る病理を診断する方法。
臓または腸のホーミング分子に対する標的分子の選択的結合を検出することによ
り、それぞれ、肺、膵臓、皮膚、網膜、前立腺、卵巣、リンパ節、副腎、肝臓ま
たは腸における標的分子を同定する方法を提供する。例えば、肺に選択的にホー
ミングするペプチドは、固体マトリックスに結合され得、肺のサンプルが入手さ
れ得、そしてこの標的分子の特異的結合を可能にする条件下でアフィニティーマ
トリックスに通過させられ得、そして標的分子が収集および同定され得る。従っ
て、本発明はまた、器官ホーミング分子、特に、肺、皮膚、膵臓、網膜、前立腺
、卵巣、リンパ節、副腎、肝臓または腸のホーミング分子を結合する標的分子を
提供する。このような標的分子は、例えば、この標的分子に特異的な抗体を惹起
するために有用であり得る。
チダーゼ(MDP)結合ホーミング分子を同定する方法が提供される。この方法
は、MDPを1以上の分子と接触させる工程;およびこのMDPへの分子の特異
的な結合を決定する工程を包含し、ここで、特異的結合の存在は、この分子を、
肺内皮に選択的にホーミングするMDP結合ホーミング分子として同定する。本
発明の1つの方法では、このMDPは、例えば、その天然の状態にあり得るか、
または実質的に精製され得、そして所望であれば、支持体に固定化される。膜ジ
ペプチダーゼは、任意の哺乳動物MDP、例えば、配列番号448を有するヒト
MDPであり得る。
グ分子に連結された部分を含む結合体を被験体に投与し、それによって、この部
分がこの被験体における肺内皮に選択的に指向されることによる、被験体におい
て、部分を肺内皮に選択的に指向させる方法が提供される。このような方法は、
例えば、肺への薬物標的化に有用であり得る。本発明の1つの方法では、MDP
結合ホーミング部分は、膜ジペプチダーゼ(MDP)を1以上の分子と接触させ
る工程;およびこのMDPへの分子の特異的な結合を決定する工程によって同定
され、ここで、特異的結合の存在は、この分子を、肺内皮に選択的にホーミング
するMDP結合ホーミング分子として同定する。種々の部分は、本発明の方法に
従って肺内皮に選択的に指向され得る。本発明において有用な部分は、例えば、
遺伝子治療ベクターまたは薬物であり得る。
を提供し、ここで、MDP結合ホーミング分子は、配列X1−G−F−E−X2(
配列番号17)を含むペプチドであり、ここで、X1およびX2の各々は、独立し
て選択される1〜10個のアミノ酸である。このようなMDP結合ホーミングペ
プチドとしては、例えば、配列CGFECVRQCPERC(配列番号1)また
はCGFELETC(配列番号2)が挙げられ得る。
提供し、ここで、MDP結合ホーミング分子は、以下の構造1:
15個の炭素原子の範囲の炭化水素ラジカルであり;これらのR2炭化水素鎖も しくはR3炭化水素鎖のいずれか1つでは、1〜6個の水素がハロゲンによって 置換され得るか、または非末端メチレンが酸素もしくは硫黄(硫黄の酸化型形態
を含む)によって置換され得;さらに、R3の末端水素もまたヒドロキシルもし くはチオールによって置換され得、これは、アシル化もしくはカルバモイル化さ
れ得;あるいは、この水素はアミノによって置換され得、これはアシルアミノ基
、ウレイド基、アミジノ基、グアニジノ(quanidino)基もしくはアル
キル基または置換されたアミノ基(四級窒素基化を含む)におけるように誘導体
化され得;あるいはカルボン酸基、ホスホン酸基もしくはスルホン酸基のような
酸性基、またはそれらのエステルもしくはアミド、またはシアノによる置換が存
在し得;あるいは末端アミノ酸基化のようなそれらの組み合わせ;ならびにR1 は、水素もしくは低級アルキル(C1-6)もしくはジアルキルアミノアルキル、 または薬学的に受容可能な陽イオンである。肺転移を低減または予防するための
このようなMDP結合ホーミング分子は、例えば、シラスタチンとしても公知の
、7−(L−2−アミノ−2−カルボキシエチルチオ)−2−(2,2−ジメチ
ルシクロプロパンカルボキサミド)−2−ヘプテン酸であり得る。
キルである、構造1を有する化合物であり得る。
アルキルであり、そしてR3が第四級窒素、アミン誘導体またはアミノ酸誘導基 である末端置換基を有する、n−アルキル(1〜9個の炭素)またはn−アルキ
ル(1〜9個の炭素)である、構造1を有する化合物であり得る。MDP結合ホ
ーミング分子は、例えば、R2が、2,2−ジメチルシクロプロピルもしくは2 ,2−ジクロロシクロプロピルであり、そしてR3が、末端置換基を有さないか 、またはトリメチルアンモニウム、アミジノ、グアニジノもしくは2−アミノ−
2−カルボエチルチオである末端置換基を有する、3〜7個の炭素原子の炭化水
素鎖である、構造1を有する化合物であり得る。
しては、以下が挙げられる:Z−2−(2,2−ジメチルシクロプロパンカルボ
キサミド)−8−トリメチルアンモニウムヒドロキシド−2−オクテン酸内部塩
;Z−2−(2,2−ジクロロシクロプロパンカルボキサミド)−8−トリメチ
ルアンモニウムヒドロキシド−2−オクテン酸内部塩;Z−2−(2,2−ジメ
チルシクロプロパンカルボキサミド)−8−グアニジノ−2−オクテン酸;Z−
2−(2,2−ジメチルクロロプロパンカルボキサミド)−8−グアニジノ−2
−オクテン酸;Z−2−(2,2−ジメチルシクロプロパンカルボキサミド)−
8−ウレイド−2−オクテン酸;Z−8−(1−2−アミノ−2−カルボキシエ
チルチオ)−2−(2,2−ジメチルシクロプロパンカルボキサミド)−2−オ
クテン酸;Z−2−(2,2−ジメチルシクロプロパンカルボキサミド)−2−
オクテン酸(ラセミ形および右旋性形);Z−2−(2,2−ジクロロシクロプ
ロパンカルボキサミド)−2−オクテン酸;7−(L−2−アミノ−2−カルボ
キシエチルチオ)−2−(2,2−ジメチルシクロプロパンカルボキサミド)−
2−へプテン酸;および6−(L−2−アミノ−2−カルボキシエチルチオ)−
2−(2,2−ジメチルシクロプロパンカルボキサミド)−2−ヘキセン酸。
与することによって、癌を有する被験体において、肺転移を低減または予防する
方法を提供する。好ましい実施態様では、MDP結合ホーミング分子は、配列X 1 −G−F−E−X2(配列番号17)を含みむ肺ホーミングペプチドである(こ
こで、X1およびX2の各々は、独立して選択される1〜10個のアミノ酸(例え
ば、配列CGFECVRQCPERC(配列番号1)またはCGFELETC(
配列番号2)を含むペプチド)である)。
、構造1を含む分子である。このようなMDP結合ホーミング分子は、例えば、
シラスタチンとして通常公知の、7−(L−2−アミノ−2−カルボキシエチル
チオ)−2−(2,2−ジメチルシクロプロパンカルボキサミド)−2−ヘプテ
ン酸であり得る。
DPインヒビターである。このようなMDPインヒビターは、例えば、MDPに
対して、1000nM以下のKiを示し得る。別の実施態様では、肺転移を低減
または予防する際に有用なMDPインヒビターは、MDPに対して100nM以
下のKi、またはMDPに対して1nM以下のKiを示す。
する被験体において、肺転移を低減または予防する方法を提供する。本発明にお
いて有用なMDP陰性調節因子は、例えば、可溶性MDPポリぺプチド、または
MDPと選択的に反応する抗体であり得る。
被験体において、肺内皮への細胞ホーミングを低減または予防する方法が提供さ
れる。肺内皮への細胞ホーミングを低減または予防するために有用なMDP陰性
調節因子は、例えば、可溶性MDPポリぺプチド、またはMDPと選択的に反応
する抗体であり得る。
の方法は、膜ジアミノペプチダーゼ(MDP)を1以上の分子と接触させる工程
;およびこの分子の存在下でのMDP活性をコントロール値と比較して決定する
工程を包含し、ここで、この分子の存在下での減少したMDP活性は、肺転移を
低減または予防する分子としてこの分子を同定する。膜ジアミノペプチダーゼは
、例えば、実質的に精製され得る。MDP活性は、例えば、Gly−D−Phe
からのD−Pheの放出により決定され得る。
予防する分子を同定する方法を提供する;MDPを1つ以上の分子と接触させる
工程;コントロール値と比較して、その分子の存在下でMDP活性を決定する工
程;癌を有する被験体に、その分子を投与する工程;および転移のコントロール
レベルと比較して、被験体における肺転移をアッセイする工程であって、ここで
その分子の存在下においてMDP活性の減少が、その分子を、肺転移を減少また
は予防する分子として同定する工程。
織に部分を標的とするためにこれらの分子を使用する方法を提供する。本発明の
分子は、インビボパンニングの方法(1997年4月22日に発行された、米国
特許第5,622,699号、これを本明細書中で参考として援用する)によっ
て本質的に同定され、種々の正常器官または組織(肺、皮膚、膵臓、網膜、前立
腺、卵巣、リンパ節、副腎、肝臓または腸を含む)および腫瘍を保有する器官(
肺腫瘍を保有する肺および膵臓腫瘍を保有する膵臓を含む)にホーミングするペ
プチドを含む。例えば、本発明は、肺ホーミングペプチドを提供し、このペプチ
ドとしては、ペプチドCGFECVRQCPERC(配列番号1)およびCGF
ELETC(配列番号2)(これらの各々は、トリペプチドGFEモチーフを含
む)、ならびにペプチドGIGEVEVC(配列番号8)が挙げられる。本発明
はまた、ペプチドCVALCREACGEGC(配列番号3)のような皮膚ホー
ミングペプチド;ペプチドSWCEPGWCR(配列番号4)のような膵臓ホー
ミングペプチドならびにペプチドCSCFRDVCC(配列番号5)およびCR
DVVSVIC(配列番号6)のような網膜ホーミングペプチド(これらの各々
は、トリペプチドRDVモチーフを含む)を提供する。前立腺、卵巣、リンパ節
、副腎、肝臓および腸にホーミングするペプチドの例もまた提供される(表2〜
11を参照のこと)。特定の器官ホーミングペプチドに共通のモチーフがこのペ
プチドの単純な検査によって同定され得ることが認識されるべきである。例えば
、表9の検査は、以下のことを明らかにする:ペプチドAGCSVTVCG(配
列番号315)およびAGCVQSQCY(配列番号370)はAGCモチーフ
を共有する;ペプチドLECRRWRCD(配列番号328)およびLECVA
NLCT(配列番号337)はLECモチーフを共有する;ならびにペプチドS
ECAYRACS(配列番号319)およびSECYTGSCP(配列番号37
5)はSECモチーフを共有する。さらに、これらのペプチドのいくつかは、1
回を超えて単離され(表9のアスタリスクを参照のこと)、このことは、そのよ
うなモチーフが、選択的にホーミングするペプチドの能力に関連することを示す
。本明細書中に開示される特定のモチーフ、および開示されたペプチドの検査に
よって同定可能な他のモチーフを含むペプチドは、このモチーフがRGDモチー
フではない場合、本願発明の範囲内であると考えられる。
有用である。従って、本発明は、部分に連結される器官ホーミング分子を含む結
合体を提供する。このような部分は、ウイルスのような治療剤;ウイルス遺伝子
療法ベクター;薬物;放射性核種のような検出可能化剤もしくは画像化剤;また
はビオチンのようなタグであり得る。本明細書中に開示されるように、本発明の
そのような器官ホーミング分子(特に、本発明の結合体)は、選択された器官も
しくは組織を検出もしくは可視化するため、または選択された器官もしくは組織
における病理を診断もしくは処置するために使用され得る。本発明の器官ホーミ
ング分子はまた、選択された器官もしくは組織において発現され、そして器官ホ
ーミング分子を結合する標的分子を単離するために使用され得る。便宜上、選択
された器官または分子にホーミングする本発明の分子は、「器官ホーミング分子
」と称される。
することによって変化され得る少なくとも1つの反応基を有する有機化合物を意
味するために幅広く使用される。有機分子は、薬物;核酸分子(RNAまたはD
NAを含む);ペプチド;改変体もしくは修飾ペプチドまたはペプチド模倣物;
タンパク質もしくはそのフラグメント;オリゴ糖;脂質;糖脂質;あるいはリポ
タンパク質であり得る。
その基を連結する結合が生物学的プロセスによって産生される天然の産物であり
得る。例えば、天然に存在する有機分子は、RNA分子またはそのフラグメント
であり得、これは、細胞から単離され得るか、または組換え核酸分子から発現さ
れ得る。同様に、ペプチドは、化学合成によって産生される場合でさえ、天然に
存在する有機分子であると考えられる。なぜなら、アミノ酸基およびその基に連
結する結合は、通常の生物学的プロセスによって産生され得、そしてペプチド自
体が、例えば、ペプチドを含有するタンパク質のタンパク質分解性分解に起因し
て細胞中で産生され得るからである。
物学的プロセスによって天然に産生されない化学基または結合を有する。例えば
、天然に存在しないヌクレオシドアナログ、またはヌクレオチドを連結しそして
ヌクレアーゼによる分解に対して保護するホスホロチオエート結合を含む核酸配
列は、天然に存在しない分子の例である。通常のヒドロキシル基のかわりに、リ
ボース残基の2’炭素原子に結合される2−メチル基を含むリボヌクレオチドは
、酵素分解および化学分解に対して耐性である天然に存在しないRNA分子の例
である。天然に存在しない有機分子の他の例としては、RNA含有2’−アミノ
ピリミジンが挙げられ、そのようなRNAは、天然に存在するRNAと比較して
、ヒト血清および尿素において1000倍を超えて安定である(Linら、Nu
cl.Acids Res.,22:5229−5234(1994);および
Jellinekら、Biochemistry,34:11363−1137
2(1995)(これらの各々を本明細書中で参考として援用する)を参照のこ
と)。
ンパク質のフラグメントを意味するように本明細書中で広く使用される。本発明
に有用な他の分子としては、ペプトイド、ペプチド模倣物などが挙げられる。本
発明の器官または組織ホーミングペプチドに関して、ペプチド模倣物(これは、
化学修飾されたペプチド、天然に存在しないアミノ酸分子を含むペプチド様分子
、ペプトイドなどを含む)は、ペプチド模倣物が由来する器官ホーミングペプチ
ドの結合活性を有する(例えば、「Burger’s Medicinal C
hemistry and Drug Discovery」第5版、第1〜3
巻(M.E.Wolff編;Wiley Interscience 1995
)(これを本明細書中で参考として援用する)を参照のこと)。ペプチド模倣物
は、ペプチドを超える様々な利点を提供し、この利点としては、ペプチド模倣物
は、被験体に投与される場合、例えば、消化管を通過する間安定であり得、それ
ゆえ経口投与に有用であることが挙げられる。
は、例えば、可能性のあるペプチド模倣物のライブラリーを含むデータベースの
スクリーニングが挙げられる。例えば、Cambridge Structur
al Databaseは、公知の結晶構造を有する300,000より多くの
化合物の収集物を含む(Allenら,Acta Crystallogr.B
項,35:2331(1979))。この構造寄託は、新しい結晶構造が決定さ
れるにつれて絶えず更新され、そして適切な形状、例えば、器官もしくは組織ホ
ーミング分子と同じ形状を有する化合物について、ならびに器官もしくは組織ホ
ーミングペプチドによって結合された標的分子への可能性のある幾何学的および
化学的に相補性についてスクリーニングされ得る。ホーミングペプチド、または
器官もしくは組織ホーミング分子を結合する標的分子の結晶構造が利用可能でな
い場合、構造は、例えば、プログラムCONCORD(Rusinkoら,J.
Chem.Inf.Comput.Sci.29:251(1989))を使用
して生成され得る。別のデータベース、Available Chemical
s Directory(Molecular Design Limited
,Informations Systems;San Leandro CA
)は、市販されている約100,000化合物を含み、そしてまた器官または組
織ホーミング分子の可能性のあるペプチド模倣物を同定するために検索され得る
。
るために幅広く使用され、このヌクレオチドは、ホスホジエステル結合のような
共有結合、チオエステル結合、またはヌクレオチドを連結するために有用かつ有
効であることが当該分野で公知の任意の様々な他の結合によって連結される。こ
のような核酸分子は、線状、環状、またはスーパーコイルであり得、そして一本
鎖もしくは二本鎖DNAもしくはRNAであり得るか、またはDNA/RNAハ
イブリッドであり得る。
味する。ライブラリーは、少数または多数の異なる分子を含み得、約2〜約10 15 分子以上まで変動する。ライブラリーの分子の化学構造は、互いに関連し得る
か、または多様であり得る。所望される場合、ライブラリーを構成する分子は、
共通タグまたは独特のタグに連結され得、このタグは、分子の回収および/また
は同定を促進し得る。
な集団を含むライブラリーを調製するための方法は、当該分野で周知であり、そ
して種々のライブラリーが市販されている(例えば、EckerおよびCroo
ke,Biotechnology 13:351−360(1995)、なら
びにBlondelleら,Trends Anal.Chem.14:83−
92(1995)、およびその中で引用される参考文献(それらの各々が参考と
して本明細書中に援用される)を参照のこと;GoodmanおよびRo,Pe
ptidomimetics for Drug Design,「Burge
r’s Medicinal Chemistry and Drug Dis
covery」第1巻(M.E.Wolff編;John Wiley & S
ons 1995),803−861頁、ならびにGordonら、J.Med
.Chem.37:1385−1401(1994)(それらの各々が参考とし
て本明細書中に援用される)も参照のこと)。ある分子が、ペプチド、タンパク
質、またはそのフラグメントである場合、その分子は、インビトロで直接生成さ
れ得るか、またはインビトロで生成され得る核酸から発現され得る。合成ペプチ
ドおよび核酸化学の方法は当該分野で周知である。
は生物から集められたmRNAからcDNA発現ライブラリーを構築することに
よって産生され得る。このようなライブラリーを産生する方法は当該分野で周知
である(例えば、Sambrookら,Molecular Cloning:
A Laboratory Manual(Cold Spring Harb
or Laboratory Press 1989)(これは参考として本明
細書中に援用される)を参照のこと)。好ましくは、cDNAによってコードさ
れるペプチドは、cDNAを含む細胞またはウイルスの表面上で発現される。例
えば、cDNAは、融合物5(実施例I)のようなファージベクター中にクロー
ン化され得、ここで、発現の際、コードされたペプチドは、そのファージの表面
上で融合タンパク質として発現される。
子は、DNA、RNA、またはそのアナログであり得る。例えば、cDNAライ
ブラリーは、目的の細胞、組織、器官、または生物から収集されるmRNAから
か、または制限エンドヌクレアーゼもしくはゲノムDNAを無作為にフラグメン
ト化する方法を使用して適切な大きさのフラグメントを生じるように処理され得
る、ゲノムDNAを収集することによって構築され得る。RNA分子を含むライ
ブラリーはまた、細胞由来のRNAを収集することによってか、またはRNA分
子を化学的に合成することによって構築され得る。核酸分子の多様なライブラリ
ーは、分子中の無作為化された領域の産生を容易にする、固相合成を使用して作
製され得る。所望される場合、無作為化は、分子中の位置で特定の割合の1以上
のヌクレオチドを含む核酸分子のライブラリーを生じるように偏られ得る(米国
特許第5,270,163号、1993年12月14日発行、これは、本明細書
中で参考として援用される)。
アナログであり得る。例えば、リボース残基に2’−O−メチルプリン置換を、
および3’末端および5’末端に短いホスホロチオエートキャップを含むRNA
分子は、ヌクレアーゼに対して抵抗性の増強を示す(Greenら、Chem.
Biol.、2:683〜695(1995)、これは、本明細書中で参考とし
て援用される)。同様に、2’−アミノ−2’−デオキシピリミジンまたは2’
−フルオロ−2’−デオキシピリミジンを含むRNAは、ヌクレアーゼ活性に対
してより感受性が低い(Pagratisら、Nature Biotechn
ol.15:68〜73(1997)、これは、本明細書中で参考として援用さ
れる)さらに、L−RNA(これは、天然に生じるD−RNAの立体異性体であ
る)は、ヌクレアーゼ活性に対して抵抗性である(Nolteら、Nature
Biotechnol.、14:1116〜1119(1996);Klob
mannら、Nature Biotechnol.、14:1112〜111
5(1996)これらの各々は、本明細書中で参考として援用される)。このよ
うなRNA分子およびこれらを産生する方法は、周知でありかつ慣用的である(
EatonおよびPiekern、Ann.Rev.Biochem.、64:
837〜863(1995)を参照のこと。これは、本明細書中で参考として援
用される)。オリゴヌクレオチドに連結されるホスホロチオエートを含むDNA
分子は、ヌクレアーゼ抵抗性である(Reedら、Cancer Res.50
:6565〜6570(1990)、これは、本明細書中で参考として援用され
る)。ホスホジエステル結合のホスホロチオエート−3’ヒドロキシプロピルア
ミン改変はまた、ヌクレアーゼ分解に対するDNA分子の感受性を減少する(T
amら、Nucl.Acids Res.、22:977〜986(1994)
(これは、本明細書中で参考として援用される)を参照のこと)。所望される場
合、DNAライブラリーの多様性は、チミジンを5−(1−ペンチニル)−2’
−デオキソウリジンと置換することによって増強され得る(Lathamら、N
ucl.Acids Res.22:2817〜2822(1994)、これは
、本明細書中で参考として援用される)。このような改変された核酸分子は、ラ
イブラリーの製造またはタグとする目的のために有用であり得る(下記)。
ためのインビボでのパニングは、被検体にライブラリーを投与する工程、器官ま
たは組織のサンプルを収集する工程および当該分野にて周知の種々の方法を使用
して、器官または組織のホーミング分子を同定する工程を包含する。一般に、収
集された器官または組織中の器官または組織ホーミング分子の存在は、ライブラ
リー中に存在する分子に共通である、1以上の特性に基づいて同定され、次いで
、特定の器官または組織のホーミング分子の構造を、決定し得る。
グラフィー(GC)のような方法との組合せのいずれかで、選択された器官また
は組織中に少量存在する場合であっても、密接に関連したホーミング分子を同定
するために使用され得る。例えば、MSとの組み合わせでGCを使用して、ラッ
トへのリドカインの注射および尿の分析の後に、2つの主要なリドカイン代謝物
および4つの微量なリドカイン代謝物を同定した(Couttsら、J.Chr
omotogr.421:267〜280(1987)、これは、本明細書中で
参考として援用される)。同様に、ライブラリーが、有機分子(例えば、薬物)
の構造に一般的に基づく多様な分子を含む場合、器官または組織のホーミング分
子は、特定分子のもとのピークの存在を決定することによって同定され得る。
して処理され得、これらの方法は、規定された範囲の分子量または極性などを有
する分子の濃縮した画分を、複雑な混合物から得るために使用され得る。次いで
、分子の濃縮した画分は、器官または組織のホーミング分子を同定するためにさ
らに分析され得る。例えば、GCおよびMSと連結したHPLCを使用して、ラ
ットへのジヒドロタキステロール3の注射および単離され灌流された腎臓の分画
後に、ビタミンDアナログの7つの代謝物を同定した(Porteousら、B
iomed.Environ.Mass Spectrum 16:87〜92
(1988)、これは、本明細書中で参考として援用される)。HPLCについ
ての条件は、特定の分子の構造に依存し、そしてその分子の知識に基づいて、当
業者により最適化され得る。
、規定された塩濃度および温度を有する溶液中でのインキュベーションにより、
そのサンプルから回収され得る。選択的な抽出もまた使用して、1以上の溶液中
で収集されたサンプルを連続してインキュベーションすることによって有機分子
の異なる画分を入手し得る。このような溶液は、異なる塩濃度を有し得るか、ま
たは特定の温度で有機ホーミング分子の抽出をもたらし得る。収集されたサンプ
ルから得られた溶出液を、別々に収集し得るか、または1以上の画分中にプール
し得、そして器官のホーミング分子を検出および同定し得る。同様に、潜在的に
妨害する細胞性物質(例えば、DNA、RNA、タンパク質、脂質または炭水化
物)の大量除去のための方法は、当該分野で周知である。このような方法を使用
して、収集されたサンプル中の潜在的に混入している物質から、特定の器官のホ
ーミング分子を濃縮し得、そしてその分子を検出する感度を上昇させ得る。
さは、種々の因子に依存し、この因子としては、潜在的に混入しているバックグ
ラウンド細胞性物質の存在が挙げられる。例えば、ホーミング分子が非タグ化ペ
プチドである場合、細胞性タンパク質のバックグランドを超える特定のペプチド
を同定するために、より多数が、器官または組織にホーミングしなければならな
い。対照的に、はるかに少量の非タグ化ホーミング分子(例えば、薬物)が同定
可能である。なぜなら、このような分子は通常、体内において、一般に存在しな
いか、または非常に少数で存在するからである。この状況において、高感度の方
法(例えば、MS)を使用して、器官のホーミング分子を同定し得る。当業者は
、分子を同定する方法が、部分的に、特定の分子の構造に依存することを認識す
る。
子が、この分子を容易に同定し得るように、選択された器官または組織に選択的
にホーミングする。例えば、特定の収集された器官において、ペプチドが2回以
上同定された(表1を参照のこと)。例えば、種々の選択された器官から配列決
定された40個のクローンのうち、腸のホーミングペプチドであるYSGKWG
K(配列番号9)は、そのクローンの22%に存在した;卵巣のホーミングペプ
チドであるEVRSRLS(配列番号10)およびRVGLVAR(配列番号1
1)の各々は、クローンの22%に存在した;そして肝臓のホーミングペプチド
であるVKSVCRT(配列番号12)は、クローンの11%に存在した(表1
を参照のこと)。同様に、肺のホーミングペプチドであるCLAKENVVC(
配列番号13)およびCGFECVRQCPERC(配列番号1);皮膚のホー
ミングペプチドであるCVALCREACGEGC(配列番号3);および網膜
のホーミングペプチドであるCGEFKVC(配列番号14)の各々は、他の器
官のホーミングペプチド(表2〜11;ペプチドをアステリスクで印を付ける)
のように、それぞれの器官のインビボでのパニングの間に、数回独立して単離さ
れた。こららの結果は、同定された器官のホーミング分子の実質的な画分が同じ
構造を有するか、または、多くの場合、保存されたモチーフを共有することを実
証する。
ミングペプチドを発現するファージを、それぞれの器官または組織から回収した
。一般に、1回のインビボでのパニングから収集されたファージを、寒天上に播
種し、約250〜約300個のクローンを選択し、5ml培養で増殖させ、次い
でプールし、そしてインビボでのパニングの引き続く回のために再投与した(「
規則的な方法」)。しかし、いくつかの実験において、1000個のクローンを
選択し、2ml培養中で増殖させ、次いでプールし、そしてスクリーニングの引
き続く回のために投与するか;または寒天プレート全体をこすり取り、そして全
てのファージを一緒に培養し、そしてスクリーニングの引き続く回のために投与
した。種々の単離されたファージのペプチド挿入物を、ホーミングした数百万の
うちの、少数の配列のみを同定するように測定した。これらの結果は、特定の型
のホーミング分子が、インビボでのホーミングの後に器官または組織中に相対的
に高い比率で存在し得、これによってその分子を同定し得る容易さを増大させる
ことを示す。
を使用して、その分子を実質的に単離または同定し得る。例えば、PCRは、ホ
ーミング分子の存在を同定するために特に有用である。なぜなら、原理的に、P
CRは、単一の核酸分子の存在を検出し得るからである(例えば、Erlich
、PCR Technology:Principles and Appli
cations for DNA Amplification(Stockt
on Press(1989)(これは、本明細書中で参考として援用される)
を参照のこと)。PCRはまた、インビトロで所定の標的に結合する核酸分子を
増幅するために使用されており、核酸がヌクレアーゼに抵抗性になり、そして被
検体に投与される場合に、それらは、生物学的プロセス(例えば、インビボでの
リンパ球輸送)を調節した(例えば、Hickeら、J.Clin.Inves
t.98:2688〜2692(1996)(これは、本明細書中で参考として
援用される)を参照のこと)。これらの知見は、インビボでのパニングを使用し
て、インビボで器官または組織に選択的にホーミングする核酸分子を同定するよ
うに、被検体の循環中に投与される場合、この核酸分子が十分に安定であること
を示す。
または同定を容易にし得る。本明細書中で使用される場合、用語「タグ」とは、
そのライブラリーの分子に連結されている、それぞれプラスチックまたは金属マ
イクロビーズ、オリゴヌクレオチド、またはバクテリオファージのような物理的
部分、化学的部分、または生物学的部分を意味する。分子をタグ化する方法は当
該分野で周知である(Hermanson,Bioconjugate Tec
hniques、(Academic Press 1996)、これは参考と
して本明細書中に援用される)。分子とタグとの間の結合は、共有結合または非
共有結合であり得、そして所望される場合、この結合は、その分子から選択的に
切断可能であり得る。
の各々の分子に共通である、物理的部分、化学的部分、または生物学的部分を意
味する。共有されたタグを使用し、サンプル中のそのライブラリーの分子の存在
を同定し得るか、またはインビボでのパニングの後に、サンプルからその分子を
実質的に単離し得る。例えば、多様な分子(例えば、核酸)の集団を含むライブ
ラリーを、共有されたタグに結合し得る。例えば、共有されたタグがビオチンで
ある場合、核酸ホーミング分子は、例えば、ストレプトアビジンアフィニティー
カラムに結合することによって、選択された器官または組織から実質的に単離さ
れ得る。器官または組織のホーミング核酸分子の存在はまた、標識されたストレ
プトアビジンと結合することによって検出され得る。血球凝集素抗原のようなペ
プチドはまた、共有されたタグであり得、これは、ライブラリー中の各分子に結
合されている場合、選択された器官または組織からホーミング分子を実質的に単
離する、血球凝集素抗原に特異的である抗体の使用を可能にする。さらに、分子
または分子を含む支持体は、4−エトキシ−メチレン−2−フェニル−2−オキ
サゾリン−5−オン(phOx)のようなハプテンに結合され、これはホーミン
グ分子を回収する手段として、磁気ビーズに連結された抗phOx抗体により結
合され得る。phOx標識された結合体を精製するための方法は、当該分野で公
知であり、そしてこれらの手順を実行するための材料は、市販されている(In
vitrogen、La Jolla CA;Promega Corp.、M
adison WI)。
るために、またはサンプルからのライブラリーの分子を実質的に単離するために
使用され得る核酸配列であり得る。例えば、ライブラリーの各々の分子は、共有
されたタグを構成する、選択された同じヌクレオチド配列に結合され得る。次い
で、共有されたタグに相補的なヌクレオチド配列を含むアフィニティーカラムは
、その分子に結合した共有されたタグにハイブリダイズすることにより、器官ま
たは組織のサンプルからホーミング分子を単離するために使用され得る。共有さ
れたタグの一部に相補的なヌクレオチド配列もまた、共有されたタグを含む分子
の存在が、PCRによってサンプル中で同定され得るように、PCRプライマー
として使用され得る。
る場合、用語「特異的タグ」とは、ライブラリー中である分子に連結される物理
的、化学的、または生物学的タグを意味し、そしてその特定の分子に対して独特
である。特異的タグは、それが容易に同定可能であるならば、特に有用である。
あるライブラリーの特定の分子に独特であるヌクレオチド配列は、特異的タグ(
例えば、あるライブラリーまたはペプチドの各ペプチドに連結された独特のオリ
ゴヌクレオチドタグ(例えば、BrennerおよびLerner,Proc.
Natl.Acad.Sci.,USA 89:5381−5383 (199
2)を参照のこと、これは参考として本明細書中に援用される))の例である。
器官または組織へのホーミングの際、そのホーミングペプチドは、独特のオリゴ
ヌクレオチドタグの配列を、例えば、PCRを用いて決定することによって同定
され得る(例えば、Erlich,PCR Technology:Princ
iples and Applications for DNA Ampli
fication(Stockton Press 1989)を参照のこと、
これは参考として本明細書中に援用される)。同様に、ファージで提示されるペ
プチドをコードする核酸配列は、特異的な核酸タグの別の例である。なぜなら、
核酸の配列決定が、発現されたペプチドのアミノ酸配列を同定するからである(
実施例Iを参照のこと)。そのような独特のオリゴヌクレオチド配列タグは、分
子の他のライブラリーに連結される場合、それに連結されたホーミング分子の配
列を同定するために使用され得る。
かな量で存在する場合、器官または組織のホーミング分子を単離し、そして同定
するために特に有用であり得る。例えば、あるライブラリーの各分子は、2つの
部分を含むオリゴヌクレオチドタグに連結され得る;内部の独特のヌクレオチド
配列タグおよびPCRにおける使用のためのプライマー結合部位として作用する
共有の隣接5’および3’ヌクレオチドタグ。従って、各分子は、そのホーミン
グ分子を同定するための独特の部分、およびPCRプライマー結合部位を提供す
るための共有部分を有するオリゴヌクレオチドタグを含む。このようなタグ化分
子は、選択された器官または組織へのホーミングの際に、共有された隣接5’お
よび3’ヌクレオチドタグにハイブリダイズするプライマーを用いてPCRを実
行すること、次いでDNA配列決定を行って内部の独特の配列タグのヌクレオチ
ド配列を決定することによって、同定され得る。そのPCR産物は、PCRプラ
イマーの一つを用いて直接配列決定され得るか、またはそのPCR産物は、ベク
ターにクローニングされ得、そしてそのDNA配列は、当該分野で周知の慣用方
法によって決定され得る。
、あるライブラリーにおけるその分子の各々は、特定のヌクレオチド配列タグに
連結され得る(例えば、BrennerおよびLerner、前出、1992を
参照のこと)。これはまた、共有された3’ヌクレオチド配列を含み、その配列
は、PCRにおける使用のためのプライマー結合部位であり得、そしてビオチン
のような共有されたタグへとさらに連結され得る。器官または組織へのホーミン
グの際に、その特定のホーミング分子は、ビオチンタグに基づいて、器官または
組織のサンプルから実質的に単離され得る。次いで、単離された分子は、例えば
、そのヌクレオチドタグの共有された3’ヌクレオチド配列をプライマー結合部
位として用いて、PCRに基づいた特異的タグのDNA配列決定によって同定さ
れ得る。
支持体」とは、分子が付着され得る所定の表面を有するタグを意味する。一般に
、支持体として有用なタグは、共有されたタグである。例えば、支持体は、ウイ
ルスまたはバクテリオファージのようなウイルス様粒子(「ファージ」);E.
coliのような細菌;あるいは酵母、昆虫、または哺乳動物細胞のような真
核生物細胞のような生物学的タグであり得;あるいはリポソームまたはマイクロ
ビーズのような物理的タグであり得、これは、プラスチック、アガロース、ゼラ
チン、または他の生物学的もしくは人工的物質から構成され得る。所望であれば
、支持体として有用な共有されたタグは、特異的タグをそこに連結し得る。
ば、肺、皮膚、膵臓、網膜、前立腺、卵巣、リンパ節、副腎、肝臓または腸)へ
、または腫瘍を含む器官もしくは組織(例えば、肺腫瘍を含む肺もしくは膵臓腫
瘍を含む膵臓)へホーミングし得ることが疑われるペプチドは、融合タンパク質
のN末端として発現され、ここで、C末端は、ファージ被覆タンパク質からなっ
た(実施例Iを参照のこと)。その融合タンパク質の発現の際に、融合タンパク
質の発現の際、C末端コートタンパク質は、N末端ペプチドがその器官または組
織において標的分子と相互作用する位置にあるように、ファージの表面に対して
融合タンパク質を連結した。従って、共有されたタグを有する分子を、ペプチド
のファージへの連結によって形成し、ここで、ファージは生物学的支持体を提供
し、ペプチド分子は融合タンパク質として連結され、融合タンパク質のファージ
コード部分はスペーサー分子として作用し、そしてそのペプチドをコードする核
酸は、器官および組織のホーミングペプチドの同定を可能にする特異的タグを提
供した。
れた分子を含み、その結果、被験体において細胞中の標的分子と相互作用し得る
疑いのある分子の一部が、相互作用に関与し得るように配置される。例えば、ホ
ーミング分子が増殖因子レセプターのリガンドである疑いがある場合、支持体に
付着された分子の結合部分は、器官または組織における細胞上の増殖因子レセプ
ターと相互作用し得るように配置される。所望であれば、適切なスペーサーが、
分子と支持体との間に配置され得、その結果、可能性のある器官または組織のホ
ーミング分子が標的分子と相互作用する能力は妨害されない。スペーサー分子は
また、反応性基を含み得、これは分子を支持体に連結する便利かつ効率的な手段
を提供し、そして所望であれば、分子の回収または同定を容易にし得るタグを含
み得る(Hermanson、前出、1996を参照のこと)。
通して比較的妨害されずに通過し得、そして循環を塞ぎ得ないように、その最短
の寸法で約10μm未満から約50μmの直径を有するべきである。さらに、支
持体は、生物学的に不活性であり得、そのため、細胞表面分子の正常発現または
被験体の正常生理状態を混乱させない。さらに、支持体は、特にインビボパニン
グに使用される被験体が選択された器官または組織をのサンプルを収集するため
に屠殺されない場合には、分泌性であり得るか、または生分解性であり得る。
て使用される場合に、用語「インビボパニング」とは、ライブラリーを被験体に
投与する工程、および被験体において器官または組織に選択的にホーミングする
分子を同定する工程によって、ライブラリーをスクリーニングする方法を意味す
る(米国特許第5,622,699号、前出を参照のこと)。分子のライブラリ
ーまたはこのようなライブラリーの一部に関して使用される場合、用語「被験体
に投与する(こと)」は、ライブラリーが、一般的に脊椎動物、特にヒトのよう
な哺乳動物である被験体において選択された器官または組織に送達されることを
意味するために、その最も広義に使用される。分子のライブラリーは、投与の任
意の経路または手段(例えば、静脈内、筋肉内、経口的、眼科的、眼球的、腹膜
内、鼻内、膣内、直腸内、子宮内、眼の房内、中枢神経系内または末梢神経系内
、吸入により、局所投与により、あるいは任意の正常な器官もしくは組織、ある
いは腫瘍または病因に関与する器官もしくは組織のような病理学的領域(特に、
その器官または組織の循環系)への注射による)によって投与され得る。
被験体の循環中にライブラリーを注射することによって被験体に投与され得;適
切な時間の後、循環は、例えば、心臓を通る灌流によって、あるいはその器官ま
たは組織のサンプルを取り出すことによって終結される(実施例I;米国特許第
5,622,699号 前出、1997;PasqualiniおよびRuos
lahti,Nature 380:364−366(1996)もまた参照の
こと、これらは、本明細書において参考として援用される。)。あるいは、カニ
ューレが被験体の血管中に挿入され得、その結果、ライブラリーは適切な時間の
灌流によって投与され、その後、そのライブラリーはカニューレを通して循環か
ら取り出され得るか、またはその被験体が器官サンプルまたは組織サンプルを収
集するために屠殺され得るか、あるいは麻酔にかけられ得る。ライブラリーはま
た、被験体における適切な血管のカニュレーションによって、選択された器官ま
たは組織を含む1つまたはいくつかの器官または組織を通して分流され得る。ラ
イブラリーがまた単離された潅流した器官または組織に投与され得ることが認識
される。単離された潅流した器官または組織におけるこのようなパニングは、そ
の器官または組織に結合する分子を同定するために有用であり得る。
、マウスにおいてファージペプチド提示ライブラリーをスクリーニングすること
、および網膜へホーミングするペプチドについて、ラットにおいて肺、膵臓、皮
膚などに選択的にホーミングするペプチドを同定することによって、本明細書中
で例示される(実施例IおよびII)。しかし、例えば、抗体または抗体の抗原
結合フラグメント(例えば、Fv、Fd、またはFabフラグメント);増殖因
子レセプターのようなホルモンレセプター;またはインテグリンまたはセレクチ
ンのような細胞接着レセプターを含む、他のタンパク質分子を提示するファージ
ライブラリーはまた、本発明を実施するために使用され得る。このような分子の
改変体は、ランダム、部位特異的、またはコドンに基づく変異誘発のような周知
の方法を使用して構築され得(Huse,1993年11月23日に発行された
米国特許第5,264,563号を参照のこと、これは本明細書中で参考として
援用される)、そして所望であれば、ペプチドは、ファージの発現後であるが被
験体への投与の前に、例えば、ジスルフィド架橋を導入することによって、化学
的に改変され得る。従って、多くの異なるタイプのファージ提示ライブラリーが
、インビボパニングによってスクリーニングされ得る。
様な集団を発現する手段を提供する。ファージ提示の種々の方法およびペプチド
の多様な集団を産生する方法は、当該分野で周知である。例えば、Ladner
ら(1993年6月29日に発行された米国特許第5,223,409号、これ
は本明細書中で参考として援用される)は、ファージの表面上の結合ドメインの
異なる集団を調製する方法を記載する。特に、Ladnerらは、ファージ提示
ライブラリーを産生するために有用なファージベクター、ならびに可能性のある
結合ドメインを選択しそしてランダムにまたは選択的に変異した結合ドメインを
産生する方法を記載する。
228−257(1993);ScottおよびSmith,Science
249:386−390(1990)もまた参照のこと、その各々は本明細書中
で参考として援用される)は、ファージペプチド提示ライブラリーを産生する方
法(発現されるペプチドの集団を多様化させるベクターおよび方法を含む)を記
載する(Huse,WO 91/07141およびWO91/07149もまた
参照のこと、その各々は本明細書中で参考として援用される;実施例Iもまた参
照のこと)。ファージ提示技術は、例えば、コドンに基づく変異誘発法とともに
使用される場合、特に強力であり得、これはランダムペプチドまたはランダムに
もしくは所望して偏ったペプチドを産生するために使用され得る(Huse,米
国特許第5,264,563号,前出,1993)。これらまたは他の周知の方
法は、ファージ提示ライブラリーを産生するために使用され得、このファージ提
示ライブラリーは、選択された器官または組織へホーミングするペプチドを同定
するために、本発明のインビボパニング方法に供され得る。
ングは、種々の他のタイプのライブラリーをスクリーニングするために使用され
得る。例えば、細胞表面レセプターに結合する核酸分子が記載されている(O’
Connellら、Proc.Natl.Acad.Sci.USA 93:5
883−5887(1996);TuerkおよびGold、Science
249:505−510(1990);Goldら、前出(1995)を参照の
こと、これらの各々は、本明細書において参考として援用される)。これらのイ
ンビトロの結果は、核酸分子のライブラリーもまた、インビボパニングによって
試験されて、選択された器官または組織へホーミングする核酸分子を同定し得る
ことを示す。スクリーニングに適したさらなるライブラリーは、例えば、オリゴ
サッカリドライブラリー(Yorkら、Carb.Res.285:99−12
8(1996);Liangら、Science 274:1520−1522
(1996);およびDingら、Adv.Expt.Med.Biol.37
6:261−269(1995)、これらの各々は、本明細書において参考とし
て援用される);リポタンパク質ライブラリー(de Kruifら、FEBS
Lett.399:232−236(1996)、これは、本明細書において
参考として援用される。);糖タンパク質または糖脂質のライブラリー(Kar
aogluら、J.Cell Biol,130:567−577(1995)
、これは、本明細書において参考として援用される。);または化学物質ライブ
ラリー(例えば、薬物または他の薬学的因子を含む)(Gordonら、J.M
ed.Chem. 37:1385−1401(1994);Eckerおよび
Crook、Bio/Technology 13:351−360(1995
);これらの各々は、本明細書において参考として援用される。)。そのような
ライブラリーは、所望であれば、タグ化され得、これは、以前に記載したように
器官または組織からのその分子の回収あるいはその同定を容易にし得る。
同定する方法を提供する。本明細書中で使用される場合、用語「ホーミングする
」または「選択的にホーミングする」とは、特定の分子が、被験体への投与後に
その器官または組織(特に、その器官または組織に存在する脈管)に存在する標
的分子に比較的特異的に結合することを意味する。一般に、選択的ホーミングは
、コントロール器官または組織と比較して、器官または組織への分子の少なくと
も2倍(2×)大きな選択的結合を検出することによって、一部特徴づけられる
。
織における細胞上に存在する細胞表面タンパク質のような、特定の細胞標的分子
の分子による選択的認識に起因し得る。ホーミングの選択性は、1つまたはいく
つかのみの異なる細胞型において発現される特定の標的分子に依存し、そのため
、その分子は、1つまたはいくつかのみの器官または組織へホーミングする。こ
の点に関して、ほとんどの異なる細胞型、特に、器官または組織について独特で
ある細胞型は、独特の標的分子を発現し得る。従って、肝臓、脾臓またはリンパ
節のような、その器官について特異的な細胞によって形成される洞様毛細血管を
通じて血液が循環する器官において、インビボパニングは、その特定の器官また
は組織へホーミングする分子を同定するために有用であり得る。
認識されるべきである。例えば、ファージ提示ライブラリーのインビボパニング
は、肝臓および脾臓のような器官において高いバックグラウンドを生じ得、これ
は細網内皮系(RES)の顕著な成分を含む。従って、そのような器官または組
織のRESによる取り込みに起因する分子の非特異的結合は、器官または組織の
ホーミング分子を同定することをより困難にし得る。しかし、本明細書において
開示したように、潜在的な非特異的結合は、例えば、選択された器官または組織
を収集する前に、心臓を灌流することによって、回避され得る(実施例I)。
ミングする能力における相違を検出することによって、非特異的結合から容易に
識別され得る。例えば、選択的ホーミングは、推定のホーミング分子(例えば、
ファージ上に発現されたペプチド)と、過剰の非感染性のファージまたは選択し
ていないペプチドを発現する約5倍過剰のファージとを組み合せること、この混
合物を、被験体に注射すること、およびその器官または組織のサンプルを収集す
ることによって、同定され得る。後者の場合において、例えば、器官または組織
のホーミングペプチドがその標的分子について満足するようなものではない程度
に十分低い、注射されたファージの部分の場合、器官または組織において約20
%を超えるファージがその推定のホーミング分子を含むということが決定される
ことは、そのファージによって発現されるペプチドが、選択的な器官または組織
のホーミング分子であるという実証的な証拠である。さらに、非特異的な局在化
は、例えば、推定の器官または組織のホーミングペプチドを発現するファージを
、過剰量の「遊離」ペプチドと組み合せて使用した競合実験を行うことによって
、選択的なホーミングから識別可能であり得る(実施例IIを参照のこと)。
の分子の非特異的な局在化を防止するために使用され得る。例えば、本明細書中
に開示されるように、ファージ循環の開始直後に心臓を通した溶液の灌流は、バ
ックグラウンドの結合を減少させ、そして肺および肝臓(これらの両方はRES
の成分を含む)に選択的にホーミングするペプチドの同定を可能にした(実施例
IIを参照のこと)。さらに、ファージディスプレイライブラリーと、非複製性
コントロールファージとの同時投与は、肝臓および脾臓のような器官(これらは
また、RESの成分を含む)において非特異的ファージ捕捉を減少させた。この
アプローチは、肝臓へ選択的にホーミングする分子の同定を可能にした(実施例
II)。従って、支持体に付着した分子のライブラリーは、過剰な支持体ととも
に被験体へ同時投与され、器官または組織における非特異的な結合を阻害し得る
。
るブロッキング剤を投与することによって防止され得る。例えば、ポリスチレン
ラテックス粒子またはデキストラン硫酸は、ライブラリーの投与前に被験体に投
与され得る(Kalinら、Nucl.Med.Biol.20:171〜17
4(1993);Illumら、J.Pharm.Sci.75:16〜22(
1986);Takeyaら、J.Gen.Microbiol.100:37
3〜379(1997)を参照のこと。これらの各々は、本明細書中で参考とし
て援用される)。デキストラン硫酸500またはポリスチレンミクロスフェアの
このような前投与(pre−administration)は、肝臓のRES
成分であるクッパー細胞による試験物質の非特異的取り込みをブロックするため
に使用されている(Illumら、前出、1986)。同様に、RESによる薬
剤の非特異的取り込みは、炭素粒子またはシリカ(Takeyaら、前出、19
77)またはゼラチンコロイド(Kalinら、前出、1993)を使用してブ
ロックされている。従って、RESによる非特異的取り込みを阻害するために有
用な多くの方法が当該分野において公知であり、そして慣用的に使用される。
ックグラウンド結合を示すファージの使用を含む。例えば、Merrillら(
Proc.Natl.Acad.Sci.、USA 93:3188−3192
(1996)、これは本明細書中で参考として援用される)は、RESによって
取り込まれず、そして結果として延長された時間にわたり循環中に残存する、λ
型ファージを選択した。例えば、匹敵する糸状ファージ改変体は、類似の方法を
使用して選択され得る。
較的特異的であるか否かを決定することによって実証され得る。例えば、選択さ
れた器官または組織におけるホーミング分子の量は、コントロールの器官または
組織、あるいは異なる器官または組織と比較され得る。選択的ホーミングはまた
、インビボパニングの1ラウンドによって同定されるように、器官または組織へ
ホーミングする分子が、インビボパニングのそれに続くラウンドにおいて富化さ
れることを示すことによって、証明され得る。例えば、ペプチドCGFECVR
QCPERC(配列番号1)およびCGFELETC(配列番号2)を発現する
ファージを、肺からのインビボパニングの第2ラウンドおよび第3ラウンドのた
めに富化し、そして選択されていないファージと比較した場合、それぞれ35倍
および9倍の富化を示した(実施例II.Bを参照のこと)。さらに、腎臓また
は脳に対する選択的なホーミングは、検出されなかった。
選択的にホーミングされ得る、正常器官もしくは組織、または病状を有する器官
もしくは組織(例えば、肺腫瘍を含む肺)を意味するその最も広い意味において
使用される。従って、用語「器官または組織」は、正常な細胞型または癌細胞の
ような病的細胞型を含み、この場合選択された器官または組織は原発性腫瘍また
は転移病巣であり得る、任意の組織または器官を意味するように広く使用される
。
る)を含み、これは、ホーミング分子が結合し得る細胞表面タンパク質のような
、特定の標的分子を発現する。少なくとも2ラウンドのインビボパニングを実施
することによって、選択された器官または組織についての分子のホーミングの選
択性が決定され得る。しかし、以下で議論されるように、いくつかの場合におい
て、ホーミング分子は1つより多くの選択された器官または組織にホーミングし
得、この場合において、この分子は一群の選択された器官または組織に選択的に
ホーミングし得ると考えられる。しかし一般に、本発明のホーミング分子の利点
は特定の器官または組織の標的化を可能にすることであるので、1つより多くの
、またはいくつかの異なる器官または組織にホーミングする分子は、特に有用で
はない。
器官または組織を意味するために使用される。コントロールの器官または組織は
、器官または組織のホーミング分子がコントロールの器官または組織にホーミン
グできない点で特徴付けられ、従って、コントロールの器官または組織は、選択
された器官または組織への分子の選択的な結合を同定するために有用である(実
施例II)。器官または組織のホーミング分子が、器官または組織における病的
病巣にホーミングするその能力に基づいて同定される場合、コントロールの器官
または組織は、病的病巣を示さない、選択された器官または組織の対応する部分
であり得る。
め、またはこの分子のホーミングの選択性を決定するために収集され得る。さら
に、非特異的結合は、例えば、器官または組織へホーミングしないことが公知で
あるが可能性のあるホーミング分子に化学的に類似するコントロール分子を投与
することによって、同定され得る。あるいは、投与される分子が支持体に連結さ
れる場合、支持体単独の投与もまた、非特異的結合を同定するために使用され得
る。例えば、ペプチド融合タンパク質を含まないファージが被験体に投与され得
、そして選択された器官または組織がファージ支持体の非特異的結合のレベルを
決定するために調べられ得る。
工程、およびその器官または組織にホーミングする分子を同定する工程は、イン
ビボパニングの単一のラウンドを構成する。必要ではないが、インビボパニング
の1つ以上の追加のラウンドが、一般的に実施される。インビボパニングの追加
のラウンドが行われる場合、それまでのラウンドにおいて、選択された器官また
は組織から回収された分子が、被験体に投与され、この被験体は、その器官また
は組織の一部のみが収集されたそれまでのラウンドで使用された同じ被験体であ
り得る。
された分子の相対的な結合選択性は、同定された分子を被験体に投与する工程、
選択された器官または組織を収集する工程、および第1ラウンド後に回収された
ものと比較して、特定の分子を提示する、より多くのファージが、スクリーニン
グの第2ラウンド後に器官または組織から回収されるかどうかを決定する工程に
よって決定され得る。必要ではないが、コントロールの器官または組織もまた収
集され得、そして選択された器官または組織から回収された分子は、コントロー
ルの器官または組織から回収された分子と比較され得る。理想的には、たとえあ
ったとしても、分子は、インビボパニングの第2ラウンドまたはその後のラウン
ド後にコントロールの器官または組織からほとんど回収されない。しかし、一般
には、一定の割合の分子は、コントロールの器官または組織にも存在する。この
場合には、コントロールの器官と比較した場合の、選択された組織または器官に
おける分子の比(選択された:コントロール)が決定され得る。インビボパニン
グの追加ラウンドは、特定の分子が、選択された器官もしくは組織にのみホーミ
ングするのか、あるいはもともと選択された器官もしくは組織において標的と同
一であるかまたは標的に十分に類似する、1つ以上の他の器官もしくは組織にお
いて発現される標的を認識し得るのかを決定するために使用され得る。
む、分子のライブラリーが調製され、次いで被験体に投与される。投与のいくら
かの時間の後、選択された器官または組織が収集され、そしてこの選択された器
官または組織中に存在する分子が同定される(実施例Iを参照のこと)。所望で
あれば、1つ以上の、コントロールの器官または組織、あるいはコントロールの
器官または組織の一部が同様にサンプリングされる。例えば、ファージペプチド
ディスプレイライブラリーを注射して約1〜5分後のマウスを麻酔し、次いで素
早く凍結するかあるいは心臓を通して灌流するかのいずれかでファージの循環を
終結させた。肺、膵臓もしくは他の器官または組織および1つ以上のコントロー
ルの器官をそれぞれから収集し、そして選択された器官およびコントロールの器
官に存在するファージを収集した。それぞれの器官または組織に選択的にホーミ
ングするペプチドを同定した(実施例IIおよび表1〜11)。
もしくは組織またはコントロールの器官もしくは組織を収集した。しかし、器官
または組織にホーミングする分子を回収するために、その器官または組織の一部
しか収集する必要ないことを理解するべきである。同様に、器官または組織の一
部しかコントロールとして収集する必要がない。従って、例えば、分子のライブ
ラリーの被験体への投与に続いて、選択された器官または組織の一部が生検によ
って収集され得、ホーミング分子が回収され得、所望であれば、インビボパニン
グの第2ラウンドのために、同じ被験体に増幅および再投与され得る。同じ被験
体へ2回目に投与されるべき分子が、タグ化されるかまたは例えば支持体に連結
される場合、そのタグまたは支持体は、スクリーニングのその後のラウンドを妨
害しないように、生物学的に不活性かつ生分解性または排泄性(excreta
ble)であるべきである。
胞表面レセプターに結合するペプチドを同定するために使用された(Smith
およびScott、前出、1993)。例えば、ファージペプチドディスプレイ
ライブラリーのインビトロスクリーニングは、インテグリン接着レセプター(K
oivunenら、J.Cell Biol.124:373−380(199
4a)、これは参考として本明細書中に援用される)、およびヒトウロキナーゼ
レセプター(Goodsonら、Proc.Natl.Acad.Sci.,U
SA 91:7129−7133(1994)、これは参考として本明細書中に
援用される)に特異的に結合した新規ペプチドを同定した。同様に、核酸分子の
インビトロスクリーニングは、抗体、細胞表面レセプターまたは有機分子に特異
的に結合する分子を同定した(Goldら、前出、1993、1995、199
7)。例えば、HIV−1逆転写酵素に特異的に結合するRNA分子は、精製さ
れたHIV−1逆転写酵素を標的分子として使用して同定された(Greenら
、J.Mol.Biol.、247:60〜68(1995)、これは参考とし
て本明細書中に援用される)。これらのインビトロ方法は、人工の系において、
規定され、十分に特徴付けられた標的分子を使用して実施された。しかし、この
ようなインビトロ研究は、インビトロで結合する分子がまたインビボで標的に結
合し得るか否かについての見識を提供しない。例えば、培養中で増殖させた内皮
細胞は、その組織特異的差異を失う傾向にある(PauliおよびLee、La
b.Invest.58:379〜387(1988)、これは参考として本明
細書中に援用される)。従って、インビトロで細胞上の標的に結合する分子は、
インビボで結合しないかもしれない。なぜなら、この標的はこの細胞上に存在し
ないかもしれないからである。さらに、このようなインビトロ方法は、標的分子
に関する事前の知識を必要とし、そしてインビボでの有用性に関する情報は、あ
るにしてもほとんど得られない点で制限される。例えば、Goodsonら(前
出、1994)は、培養された細胞を利用して組換えウロキナーゼレセプターを
発現させ、結合ペプチドを得た。しかし、このウロキナーゼレセプターは多くの
異なる器官および組織の細胞において発現し、従って、ウロキナーゼレセプター
に結合する分子は多くの器官または組織と相互作用し得、そして本発明の範囲内
の器官または組織のホーミング分子とは考えられない。
ビボで発現される標的分子に結合する分子を同定するための公知の標的分子の利
用可能性をも必要としない。また、「標的化されていない」器官または組織がス
クリーニングの間に存在するので、ホーミングの選択性を欠失した器官または組
織のホーミング分子を単離する見込みは、非常に減少する。さらに、インビボパ
ニングによって器官または組織のホーミング分子を得る際に、例えば、代謝活性
に起因してインビボでの循環における分解に対して特に感受性であり得る任意の
分子が、選択され、そして回収されない。従って、インビボパニングは、インビ
ボで選択的にホーミングする分子を同定することによって、以前の方法を超えて
有意な利点を提供し、そして所望であれば、標的分子は、選択された器官または
組織上に存在する。
ーミングする、器官ホーミング分子の同定は、本明細書中で例示されるように、
選択された器官または組織で発現される内皮細胞の特定の標的分子が、この器官
または組織の生理学的状態または病理学的状態を反映することを示す。器官また
は組織において生じる特定の生理学的状態または病理学的状態に基づいてこの器
官または組織に選択的にホーミングする、このような器官ホーミング分子は、イ
ンビボパニング法を使用して同定され得、そしてこの器官または組織の生理学的
状態または病理学的状態に対するホーミング分子の選択性は、免疫組織学的分析
によって確認され得る(実施例III)。例えば、膵炎に罹患した膵臓にホーミ
ングする分子は、膵炎を有する被験体のインビボパニングによって同定され得、
そしてホーミング分子の選択性は、正常膵臓におけるこの分子のホーミングと、
膵炎を罹患した膵臓におけるホーミングとを比較する免疫組織化学を使用するこ
とによって、確認され得る。
るホーミング分子は、病状の存在または非存在を検出するために有用であり得る
。例えば、被験体に対して画像化部分に結合体化された前立腺ホーミング分子の
投与の後に、前立腺が可視化され得る。画像が異常な場合、例えば、前立腺のサ
イズが、大きさおよび年齢が一致する被験体に予測されるサイズとは異なる場合
、この画像化の結果は、前立腺を冒す異常な生理学的状態または病理学的状態を
示し得る。例えば、画像化剤、および正常な前立腺にはホーミングするが異常な
前立腺にはホーミングしない前立腺ホーミング分子を含む結合体が、被験体に投
与され得る。例えば、このホーミング分子を結合しない前立腺の領域の同定は、
前立腺における異常な血流の出現を示し得、そして前立腺腫瘍の存在のような病
理学的状態の診断であり得る。前立腺腫瘍組織にホーミングするが正常な前立腺
にはホーミングしない分子を含む結合体は、前立腺腫瘍を直接的に画像化するた
めに使用され得る。
療剤を送達するために使用され得る。薬剤のこのような選択的標的化は、その標
的器官または標的組織へ送達される薬剤の有効量を増加し得る一方、その薬剤が
他の器官または組織に対して副作用を有する可能性を低減させる。例えば、嚢胞
性線維症患者の肺に対して、嚢胞性線維症膜貫通レセプター(CFTR)(これ
は、嚢胞性線維症において欠損している)をコードする遺伝子を送達するために
肺ホーミング分子を使用し得る。従って、本発明の器官ホーミング分子は、イン
ビボの遺伝子治療のために特に有用である。なぜなら、それらは遺伝子を所望の
標的器官に対して方向づけるための手段を提供し、それによって標的細胞がその
遺伝子を受容する可能性を増大し、そして正常な非標的である細胞が副作用を受
ける可能性を低減するからである。肺ホーミング分子はまた、治療剤を肺に対し
て方向付けるために使用され得、それによって非標的器官または組織をその薬剤
の毒性作用から免れさせる。例えば、肺胞細菌性肺炎において、肺ホーミング分
子は、肺の罹患した領域へ抗生物質を方向付けるために有用であり得、従って所
望の部位での薬物の有効量を増大させる。
性質に起因して、マウスもしくはラットにおいてインビボパンニングを使用して
同定される器官または組織ホーミング分子がまた、ヒトもしくは他の哺乳動物種
の選択された器官または組織において対応する標的分子に結合し得ることを当業
者は理解する。実験的動物を使用して同定されるそのようなホーミング分子は、
例えば、その分子がまた、ヒト被験体から得られる選択された器官または組織の
サンプルに対してインビトロで選択的に結合し得ることを実証することによって
、ヒト被験体の対応する器官または組織に結合するその能力について容易に試験
され得る。あるいは、ヒト器官または組織由来の初代細胞または確立された細胞
株は、そのホーミング分子のインビトロでの結合について試験するために使用さ
れ得る。同様に、特定のヒト器官もしくは組織の病理を反映する初代細胞または
確立された細胞株は、その病理に対して選択的なホーミング分子の結合を試験す
るために使用され得る。ヒト病理の動物モデル(例えば、霊長類モデル)が公知
であり、そしてインビボでのパンニングを使用する分子のホーミングについて試
験するために使用され得る。従って、実験的動物におけるインビボパンニングを
使用して同定された器官または組織ホーミング分子がまた、ヒト被験体における
器官または組織特異的標的分子を結合し得ることを確認するために、慣用的な方
法が使用され得る。さらに、選択された器官、組織、または病理を含むことが疑
われるサンプルとのホーミング分子のインビトロ接触は、サンプルにおける選択
された器官、組織、または病理の存在を同定し得る。インビボパンニングによっ
て標的分子を同定したので、当業者はその標的分子が器官ホーミング分子につい
ての真の標的であることを知り、従って、その標的分子をインビトロで使用して
、インビボでその標的分子に対して特異的である可能性を有するさらなる器官ホ
ーミング分子を同定し得るということを知る。次いで、そのような潜在能のある
器官ホーミング分子をインビボパンニングによって試験して、器官ホーミング能
力を確認し得る。
パ節、副腎、肝臓または腸、および肺腫瘍を含有する肺、または膵臓腫瘍を含有
する膵臓に対して選択的にホーミングするファージによって発現されるペプチド
を同定した(実施例IIおよびIV;表2〜11もまた参照のこと)。ファージ
の大きなサイズ(300nm)、およびそのファージを循環させる時間の短さに
起因して、実質的に多くのファージが循環系に存在していたことはないようであ
る。実際、種々の器官および組織のホーミング分子の免疫組織化学的研究は、こ
の分子が、血管系の内皮細胞表面マーカーに主にホーミングし、そしてそれに結
合することを実証した。従って、本発明は、選択された器官または組織の血管系
に選択的にホーミングするペプチドのような分子を提供する。
t(前出、1993;Koivunenら、Biotechnology 13
:265−270(1995);Koivunenら、Meth.Enzymo
l.245:346−369(1994b)もまた参照のこと。これらの各々は
、本明細書中で参考として援用される)に記載のように構築した。いくつかのラ
イブラリーにおいて、システインをコードする少なくとも1つのコドンもまた各
オリゴヌクレオチド内に含ませた。その結果、ジスルフィド結合を通して環状ペ
プチドを形成し得る(実施例I)。インビボパンニングの実施に際して、肺、膵
臓、皮膚、網膜、前立腺、卵巣、リンパ節、副腎、肝臓もしくは腸、または肺腫
瘍を含有する肺、または膵臓腫瘍を含有する膵臓に対して選択的にホーミングす
るペプチドが得られた。従って、本発明は特定の器官または組織に対して選択的
にホーミングする種々の器官ホーミング分子を提供する。
ーミングペプチドは独立して4回以上まで回収された(例として、表1を参照の
こと)。さらに、特定の器官または組織にホーンミングする種々のペプチドは、
保存されたアミノ酸配列モチーフを共有した。例えば、いくつかの肺ホーミング
ペプチドはGFEモチーフを共有し;いくつかの網膜ホーミングペプチドはRD
Vモチーフを共有し;そしていくつかの副腎ホーミングペプチドは、LPRモチ
ーフを共有した(それぞれ、表2、表6、および表11を参照のこと)。例えば
、トリペプチドRGDモチーフは、インテグリン結合に十分であることが公知で
あるので(Ruoslahti、Ann.Rev.Cell Devel.Bi
ol.12:697(1996);Koivunenら、前出、1995;WO
95/14714)、本明細書中に開示されるこの結果は、多くのリガンド/
レセプター相互作用は、トリペプチドと同じほど小さい認識モチーフからそれら
の特異性を誘導し得ることを示す。
ついての既知のリガンドと有意な類似性を示さなかった。多くの器官ホーミング
ペプチドが、より大きなペプチドまたはタンパク質内に含まれ得るが、そのより
大きな分子上でホーミング機能をそれらが提供し得るか否かは公知ではない。し
かし、より大きなペプチドおよびタンパク質内に存在する場合に、RGDがイン
テグリン結合を媒介するという以前の知見に基づいて、より大きなペプチドまた
はタンパク質内に局在化された場合にそのようなホーミングペプチドおよびモチ
ーフがホーミング機能を提供し得るということを当業者は認識する。しかし、そ
のような天然に存在する内因性のペプチドおよびタンパク質は、本発明内の器官
または組織ホーミング分子であると見なされない。
長さ約7〜13アミノ酸の範囲である。しかし、例えば、それ自体によりまたは
大きなタンパク質内に存在する場合にインテグリン結合を媒介するRGDインテ
グリン結合モチーフの能力に基づいて、本発明の器官ホーミング分子がまた、有
意により長いポリペプチド配列の状況下でそれらの器官ホーミング能力を維持す
ることが予期され得ることが認識される。従って、本発明の器官ホーミングペプ
チドは、少なくとも3アミノ酸、一般的には少なくとも6アミノ酸、または7以
上のアミノ酸であり得、そして有意により長く、例えば、約20〜50アミノ酸
または100以上のアミノ酸であり得る。
C(配列番号2)(これらは、GFEモチーフを共有する);CTLRDRNC
(配列番号15);ならびにCIGEVEVC(配列番号16;表1を参照のこ
と)(これは、CGFELETC(配列番号2)に存在するELEモチーフに類
似性であるEVEモチーフを含む)のような肺ホーミングペプチドを提供する。
例示された肺ホーミングペプチドは、CX3CX3CX3C(配列番号25)、C X7C(配列番号24)またはCX6C(配列番号26)の環状ライブラリーのマ
ウスへの注射によって同定された(実施例II)。肺ホーミングペプチドである
CGFECVRQCPERC(配列番号1)およびCGFELETC(配列番号
2)は、選択されていないファージと比較した場合に、それぞれ60倍および9
倍の富化を示し、腎臓または脳においてほとんどファージは検出されなかった(
実施例II;図1および2、ならびに表1もまた参照のこと)。さらに、肺ホー
ミングペプチドであるCTLRDRNC(配列番号15)およびCIGEVEV
C(配列番号16)は、選択されていないファージよりもそれぞれ8倍および6
倍の富化を示した(表1)。コグネイトCGFECVRQCPERC(配列番号
1)ペプチドを発現するファージとのグルタチオン−S−トランスフェラーゼ−
(GST−)CGFECVRQCPERC(配列番号1)融合ペプチドの同時注
射はホーミングを70%阻害し、そして(配列番号2)を発現するファージとの
GST−CGFELETC(配列番号2)の同時注射は肺ホーミングを30%阻
害した(図3)。肺ホーミングペプチドを提示するファージのマウスへの投与後
の肺の免疫組織化学的染色は、肺胞毛細血管内の染色を明らかにした。肺のいず
れの特定領域へのファージのホーミングについても明らかな優先性は観察されな
かった;しかし、細気管支管腔壁またはいくつかのより大きな血管において(実
施例III)、あるいは分析された多くの他の組織において、染色は全く観察さ
れなかった。これらの結果は、インビボパンニングを使用して、肺内の内皮細胞
特異性を同定および分析し、それによって示差的に肺を標的化するための手段を
提供し得ることを示す。
CX3CX3CX3C(配列番号25)環状ライブラリーのマウスへの注射によっ て同定された(実施例II))のような皮膚ホーミングペプチドを提供する。皮
膚ホーミングペプチド配列CVALCREACGEGC(配列番号3)は、選択
されていないファージよりも、ならびに脳および腎臓におけるバックグランドよ
りも皮膚に対して7倍の選択性を示した(図2;表1もまた参照のこと)。CV
ALCREACGEGC(配列番号3)を発現するファージとのGST−CVA
LCREACGEGC(配列番号3)の同時注射は、皮膚へのホーミングを55
%阻害したが、GST単独との同時注射は、ホーミングに対して全く効果を有さ
なかった(図3Bを参照のこと)。皮膚ホーミングペプチドを提示するファージ
投与後の皮膚の免疫組織化学的染色は、染色が皮下組織に局在化し;真皮には全
く染色が観察されないことを明らかにした(実施例III)。
ミングペプチドを提供する。例示された膵臓ホーミング分子は、CX7C(配列 番号24)またはX2CX4CX(配列番号23)の環状ライブラリーのマウスへ
の注射によって同定された(実施例II)。膵臓ホーミングペプチドであるSW
CEPGWCR(配列番号4)は、選択されていないファージおよび脳よりも膵
臓に対して20倍の選択性を示した(表1;図2)。しかし、GST−SWCE
PGWCR(配列番号4)の同時注射は、SWCEPGWCR(配列番号4)の
膵臓ホーミングを阻害しなかった。これはおそらく、膵臓ホーミングペプチドに
対するGSTの立体配座的効果に起因する。膵臓ホーミングペプチドを提示する
ファージの投与後の膵臓の免疫組織化学的染色は、染色が毛細血管および外分泌
膵臓のより大きな血管に局在化し;内分泌血管系において有意な染色が全く観察
されなかったことを明らかにした(実施例III)。この結果は、特定の器官内
の組織学的および生理学的に識別可能な領域が、本発明の器官ホーミング分子に
対する標的を提供する特有の標的分子を発現し得ることを実証する。従って、本
発明の器官ホーミング分子は、選択された器官または組織の特異的領域を示差的
に標的化するための手段を提供する。
CRDVVSVIC(配列番号6))もまた提供される(表6を参照のこと)。
例示された網膜ホーミング分子は、CX7C(配列番号24)環状ライブラリー のラットへの注射によって同定された(実施例II)。網膜ホーミングペプチド
であるCSCFRDVCC(配列番号5)およびCRDVVSVIC(配列番号
6)は、コントロールfdAMPLAY88ファージと別々に注射された場合に
、網膜においてそれぞれ3倍および2倍の富化を示した(実施例II)。しかし
、免疫組織化学的染色は、網膜染色の欠如を明らかにした。これはおそらく、標
的組織におけるこの網膜ホーミングファージの比較的多くない蓄積に起因する。
番号22)(これらは、X7(配列番号29)ライブラリーのマウスへの注射に よって同定された)のような前立腺ホーミングペプチドを提供する(表7)。こ
のペプチドは、正規の方法によってより単離された。前立腺ホーミングペプチド
であるSMSIARL(配列番号21)およびVSFLEYR(配列番号22)
は、脳と比較した場合に、前立腺へのホーミングにおいてそれぞれ34倍および
17倍の富化を示した(表1)。
卵巣ホーミングペプチドもまた提供される。このペプチドを、正規の方法によっ
て単離した(表8)。卵巣ホーミングペプチドのRVGLVAR(配列番号11
)およびEVRSRLS(配列番号10)は、各々、配列決定された40クロー
ンの22%を含み、そして脳と比較した場合に卵巣においてそれぞれ5倍および
3倍の富化を示した(表1)。
AD(配列番号27)およびLPRYLLS(配列番号28)、またはモチーフ
LAGG(配列番号430;表10を参照のこと)を共有するペプチドR(Y/
F)LLAGG(配列番号404)およびRYPLAGG(配列番号389)の
ような副腎ホーミングペプチドを提供する。例示された副腎ホーミングペプチド
を、X7(配列番号29)ライブラリーのマウスへの注射によって同定した。こ のペプチドを、正規の方法によって単離した。この副腎ホーミングペプチドLM
LPRAD(配列番号27)は、脳と比較した場合に副腎において50倍の富化
を示した(表1)。
、正規の方法によって単離した(以下の実施例II、表1、および表11を参照
のこと)。
ペプチドを提供する(以下の表9を参照のこと)。そのようなペプチドを、X2 CX4CX(配列番号23)ライブラリーのマウスへの注射によって同定した。 このペプチドを、正規の方法によって単離した。
56)(表1および4)(これらは、最後のアミノ酸位置においてのみ異なる)
のような腸ホーミングペプチドを提供する。このペプチドを、正規の方法によっ
て単離した。腸ホーミングペプチドのYSGKWGK(配列番号9)は、配列決
定された40クローンの22%で存在し、そして脳と比較した場合に腸において
30倍の富化された(表1)。さらに、VRRモチーフを共有するQVRRVP
E(配列番号155)およびVRRGSPQ(配列番号164)のような腸ホー
ミングペプチドを、RGSモチーフを共有するペプチドVRRGSPQ(配列番
号164)、GGRGSWE(配列番号167)、およびFRVRGSP(配列
番号169)と同様に同定した。
結合体として特に有用である。従って、本発明の肺ホーミング分子、皮膚ホーミ
ング分子、膵臓ホーミング分子、網膜ホーミング分子、前立腺ホーミング分子、
卵巣ホーミング分子、リンパ節ホーミング分子、副腎ホーミング分子、肝臓ホー
ミング分子、または腸ホーミング分子は、部分に結合され得、そのような結合体
は、この部分を特定の選択された器官に指向するために有用である。
ミング分子に連結される物理学的物質、化学的物質、または生物学的物質を意味
するように広く使用される。一般に、器官ホーミング分子に連結される部分は、
ホーミング分子に生物学的に有用な機能を与える。部分は、任意の天然または非
天然の物質、例えば、ペプチドまたはポリペプチド配列、有機分子もしくは無機
分子または有機組成物もしくは無機組成物、核酸分子、炭水化物、脂質、あるい
はそれらの組み合わせからなり得る。
ウイルス遺伝子治療ベクター、細胞、リポソーム、マイクロカプセル、マイクロ
ポンプまたは他の空洞のある(chambered)マイクロデバイス)であり
得、これは、例えば、薬物送達系として使用され得る。一般に、このようなマイ
クロデバイスは、生物学的に不活性であるべきであり、所望であれば、生分解性
または排出可能であるべきである。マイクロカプセルを含む種々の部分(薬剤を
含み得る)、および部分または空洞のあるマイクロデバイスを本発明の有機分子
に連結させる方法は、当該分野で周知であり、そして市販されている(例えば、
「Remington’s Pharmaceutical Sciences
」第18版(Mack Publishing Co.1990)、第89−9
1章;HarlowおよびLane、Antibodies:A labora
tory manual(Cold Spring Harbor Labor
atory Press 1988)を参照のこと、これらはそれぞれ本明細書
において参考として援用される;Hermason、前出、1996もまた参照
のこと)。部分のさらなる例は、当業者に公知であり、そしてそれらが本発明の
ホーミング分子に連結される場合に、生物学的に有用な機能を有する限り、この
用語の意味に含まれることが意図される。
にこの部分を連結することが、脳ホーミングペプチドの赤血球(RBC)への連
結(ここで、このペプチドは、脳へのRBCのホーミングを指向した)によって
実証された(米国特許第5,622,699号、前出、1997)。これらの結
果は、本発明の器官ホーミング分子または組織ホーミング分子が、この部分を選
択された器官または組織に指向するために、別の部分に連結され得ることを示す
。例えば、肝臓ホーミング分子または肺ホーミング分子は、CFTR遺伝子をコ
ードする核酸に連結され得、そして被験体への投与の際に、CFTRの発現が、
それぞれ肝臓または肺に標的化される。同様に、肺ホーミング分子は、肺ホーミ
ング分子およびプロテアーゼインヒビターを含む結合体を被験体に投与する際に
、このプロテアーゼインヒビターが肺に標的化されるように、プロテアーゼイン
ヒビターに連結され得る。そのような結合体は、例えば、肺における過剰なプロ
テアーゼ産生および器官の自己消化によって特徴付けられる気腫を罹患する被験
体を処置するために有用であり得る。
たは器官に、治療剤、診断剤、または画像化剤、タグまたは不溶性支持体、例え
ば透過性もしくは半透過性膜を含むリポソームまたはマイクロカプセル(ここで
、選択された器官または組織に送達されるべき薬物のような薬剤は、リポソーム
またはマイクロカプセル内に含まれる)を指向するために有用であり得る。当該
分野において公知のこれらの部分および他の部分は、本明細書中に開示されるよ
うな本発明の結合体において、および本発明の方法において使用され得る。
視化を可能にする、放射性核種または画像化剤のような検出可能な薬剤であり得
る。従って、本発明は、検出可能な薬剤に連結された、肺ホーミング分子、皮膚
ホーミング分子、膵臓ホーミング分子、網膜ホーミング分子、前立腺ホーミング
分子、卵巣ホーミング分子、リンパ節ホーミング分子、副腎ホーミング分子、肝
臓ホーミング分子、または腸ホーミング分子を含む結合体を提供する。選択され
る検出可能な薬剤の型は、適用に依存する。例えば、被験体における肺のインビ
ボ診断画像化研究のために、肺ホーミング分子は、被験体への投与の際に被験体
に対して外側で検出可能である薬剤に連結され得る。そのような内部器官または
組織(例えば、前立腺)の検出のために、γ線放出放射性核種(例えば、インジ
ウム−113、インジウム−115またはテクネチウム−99)は、前立腺ホー
ミング分子に連結され得、そして被験体への投与後に、固体シンチレーション検
出器を用いて可視化され得る。あるいは、被験体の外部表面またはその近傍の器
官または組織(例えば、網膜)について、フルオレセイン標識した網膜ホーミン
グ分子は、網膜の内皮構造が検眼鏡(opthalamoscope)および適
切な光学システムを使用して可視化され得るように、使用され得る。
その病変のサイズおよび分布が可視化され得るように適切な検出可能な薬剤に連
結され得る。例えば、器官ホーミング分子または組織ホーミング分子が正常な器
官または組織にホーミングするが、器官または組織における病理学的病変にホー
ミングしない場合、病理学的病変の存在は、器官または組織の異常な画像または
異型の画像(例えば、病変領域における検出可能な薬剤の非存在)を同定するこ
とによって検出され得る。
えば、適切な基質が存在する場合に可視シグナルを生じる酵素に連結されたホー
ミング分子を含む結合体は、ホーミング分子が指向される器官または組織の存在
を検出し得る。そのような結合体(例えば、アルカリホスファターゼまたはルシ
フェラーゼなどを含み得る)は、免疫組織化学のような方法において有用であり
得る。そのような結合体はまた、例えば標的分子の精製の間に、サンプル中の器
官ホーミング分子が結合する標的分子の存在を検出するために使用され得る。
に連結された、肺ホーミング分子、皮膚ホーミング分子、膵臓ホーミング分子、
網膜ホーミング分子、前立腺ホーミング分子、卵巣ホーミング分子、リンパ節ホ
ーミング分子、副腎ホーミング分子、肝臓ホーミング分子、または腸ホーミング
分子を含む結合体を提供する。
たは組織の部位でその機能を働かせる任意の生物学的に有用な薬剤であり得る。
例えば、治療剤は、連結された器官ホーミング分子に起因して標的細胞に連結さ
れる際に、それがその機能をもたらし得る細胞によってインターナリゼーション
を受ける有機低分子であり得る。治療剤は、所望される場合、選択される器官ま
たは組織における細胞生存、細胞増殖、または細胞死を刺激または阻害すること
に関与するタンパク質をコードする核酸分子であり得る。例えば、アポトーシス
を阻害するBcl−2のようなタンパク質をコードする核酸分子を使用して、細
胞生存を促進し得るが、アポトーシスを刺激するBaxのようなタンパク質をコ
ードする核酸分子を使用して、標的細胞の細胞死を促進し得る。
結される場合に、過剰増殖性障害(例えば、癌)を処置するのに有用であり得る
リシンである。本発明の器官ホーミング分子、および抗生物質(例えば、アンピ
シリン)または抗ウイルス剤(例えば、リバビリン)を含む結合体は、例えば、
選択された器官または組織における細菌感染またはウイルス感染を処置するため
に有用であり得る。
たは活性を阻害または促進し得る。従って、プロテアーゼインヒビターは、器官
ホーミング分子に連結される場合、選択された器官または組織(例えば、膵臓)
でのプロテアーゼ活性を阻害し得る治療剤であり得る。選択された器官または組
織におけるタンパク質の産生を補給または回復させ得るcDNAのような遺伝子
またはその機能的等価物もまた、病理学の重篤度を改善するために有用な治療剤
であり得る。治療剤はまた、その発現が有害なタンパク質の産生を阻害するアン
チセンス核酸分子であり得るか、または有害なタンパク質の活性を阻害し得るド
ミナントネガティブタンパク質またはそのフラグメントをコードする核酸分子で
あり得る。
ホーミング分子、膵臓ホーミング分子、網膜ホーミング分子、前立腺ホーミング
分子、卵巣ホーミング分子、リンパ節ホーミング分子、副腎ホーミング分子、肝
臓ホーミング分子、または腸ホーミング分子を含む結合体を提供する。タグは、
例えば、クロマトグラフィーマトリクスのような不溶性支持体、またはビオチン
、赤血球凝集素抗原、ポリヒスチジン、T7、もしくは当該分野において公知の
他の分子のような分子であり得る。タグを含むそのような結合体は、器官ホーミ
ング分子が結合する標的分子を単離するために有用であり得る。
えば、結合体および薬学的に受容可能なキャリアを含む薬学的組成物として投与
される。薬学的に受容可能なキャリアは、当該分野で周知であり、そして例えば
、水溶液(例えば、水または生理学的緩衝化生理食塩水)、あるいは他の溶媒ま
たはビヒクル(例えば、グリコール、グリセロール、オイル(例えば、オリーブ
オイル)もしくは注射可能な有機エステル)を含む。
は増加させるように作用する、生理学的に受容可能な化合物を含み得る。このよ
うな生理学的に受容可能な化合物は、例えば、炭水化物(例えば、グルコース、
スクロースもしくはデキストラン)、抗酸化剤(例えば、アスコルビン酸もしく
はグルタチオン)、キレート剤、低分子量タンパク質、または他の安定剤もしく
は賦形剤を含む。当業者には、薬学的に受容可能なキャリア(生理学的に受容可
能な化合物を含む)の選択が、例えば、組成物の投与経路に依存することを理解
する。薬学的組成物はまた、所望される場合、薬剤(例えば、ガン治療剤または
他の治療剤)を含み得る。
経口または非経口(例えば、静脈内)を含む)により被験体に投与され得ること
を理解する。組成物は、注射または挿管により投与され得る。薬学的組成物はま
た、例えば細胞死を促進または阻害する薬物を中に取り込み得る部分(例えば、
リポソームまたは他のポリマーマトリクス)に連結された器官ホーミング分子で
あり得る(Gregoriadis,Liposome Technology
,第1巻(CRC Press,Boca Raton,FL 1984)、こ
れは、本明細書中に参考として援用される)。例えば、リン脂質または他の脂質
からなるリポソームは、作製および投与するのが比較的簡単な、非毒性の、生理
学的に受容可能、かつ代謝可能なキャリアである。
ング分子を含む結合体の有効量が、被験体に投与されなければならない。「有効
量」は、所望の効果を生じる結合体の量である。有効量は、例えば、器官ホーミ
ング分子に連結された成分、および意図される用途に依存する。例えば、細胞殺
傷が所望される場合、治療目的のために投与される放射性標識分子の量と比較し
て、より少ない量の放射性標識ホーミング分子が画像化に必要とされ得る。特定
の目的のための特定結合体の有効量は、当業者に周知の方法を用いて決定され得
る。
。例えば、ペプチドは、それらが消化管において分解され得るので、経口的に投
与される場合、特に有用ではない。しかし、ペプチドを内因性プロテアーゼによ
る分解にあまり受けないようにするか、または消化管を通してより吸収可能にす
るように、ペプチドを化学的に改変するための方法は、周知である(例えば、B
londelleら、前出、1995;EckerおよびCrooke、前出、
1995;GoodmanおよびRo、前出、1995を参照のこと)。このよ
うな方法は、選択された器官または組織へホーミングするペプチド上で行われ得
る。さらに、D−アミノ酸;ペプチド構造を模倣する有機分子からなるペプチド
模倣物;またはペプトイド(例えば、ビニロガス(vinylogous)ペプ
トイド)を含むペプチドのような、ペプチドアナログのライブラリーを調製する
ための方法は、上記に記載され、そして被験体への経口投与に安定なホーミング
分子を同定するために使用され得る。
は腸を含む結合体および検出可能薬剤を被験体に投与することにより、選択され
た器官または組織を同定する方法を提供する。検出可能成分結合体に連結される
本発明の器官ホーミング分子を含む結合体は、被験体に投与され得、そして選択
された器官または組織を同定または可視化するために用いられ得る。器官、特に
内臓器官を可視化する能力は、選択された器官または組織の病状を診断する手段
を提供する。例えば、インジウム−113に連結する前立腺ホーミング分子は、
被験体に投与され、前立腺を画像化し得る。このような方法は、特に有益で有り
得る。なぜなら、前立腺を画像化するための方法は限定されているからである。
前立腺の病理症状の存在は、前立腺の領域が結合体を含まず、従って、その領域
への循環における異常を示すことを検出することによるか、または前立腺が異常
に増大されるか、もしくはその正常な境界を欠くことを検出することにより明ら
かにされ得る。網膜のような器官または組織(検眼鏡を用いて直接可視化され得
る)について、フルオレセインに連結する網膜ホーミング分子を含む結合体が、
被験体に投与され得、そして網膜における血管統合性および循環を試験するため
に用いられ得る。網膜画像の正常なまたは代表的なパターンの非存在は、この領
域における網膜病理症状の存在を示し得る。例えば、異常な網膜パターンは、過
剰増殖性病理または変性性病理を示す血管の変化を反映し得る。
果を提供するように固有の生物学的特性を有し得る。例えば、器官ホーミング分
子は、器官ホーミング分子が天然のリガンドの活性を模倣する標的分子について
天然に存在するリガンドと十分に類似であり得る。このような器官ホーミング分
子は、天然のリガンドの活性を有する治療剤として有用であり得る。例えば、器
官ホーミング分子が、選択された器官または組織により発現されるレセプターを
結合する成長因子(例えば、上皮増殖因子の活性を模倣する皮膚ホーミング分子
)の活性を模倣する場合、器官ホーミング分子の投与は、器官または組織におい
て細胞増殖を生じ得る。本発明の器官ホーミング分子のこのような固有の生物学
的活性は、選択された器官または組織の細胞をホーミング分子と接触させること
、および生物学的効果(例えば、細胞増殖、または固有の活性が毒性効果である
場合、細胞死)の証明のために細胞を試験することにより同定され得る。
合し得ないように特定の標的分子を結合する固有の活性を有し得る。例えば、種
々の型の癌細胞が特定の器官または組織に転移することは、癌細胞がその転移す
る器官内で標的分子に結合するリガンドを発現することを示すことが、公知であ
る。従って、例えば、肺に転移する腫瘍を有する被験体への、肺ホーミング分子
の投与は、潜在的に転移性の癌細胞が肺において樹立されたるのを防ぐ手段を提
供し得る。しかし、一般的に、本発明の器官ホーミング分子は、選択された器官
または組織、特に肺、皮膚、膵臓、網膜、前立腺、卵巣、リンパ節、副腎、肝臓
または腸への成分の標的化に特に有用である。従って、本発明は、治療剤に連結
する本発明の器官ホーミング分子を含む結合体を、病状を有する被験体に投与す
ることにより、選択された器官または組織における病状を処置する方法を提供す
る。
を、被験体に投与することにより処置され得る。本発明の肺ホーミング分子は、
肺の毛細血管および肺胞に局在化し得るので、これらの領域に関連する障害は、
特に、肺ホーミング分子を含む結合体で処置することが可能である。例えば、細
菌性肺炎は、しばしば肺の肺胞および毛細血管において始まる(Rubinおよ
びFarber、Pathology 第2版、(Lippincott Co
.,1994))。従って、適切な抗生物質に結合体化された肺ホーミング分子
は、肺炎を処置するために被験体に投与され得る。同様に、嚢胞性線維症は、C
FTRの欠損に起因して、肺において病理的損傷を生じる。従って、CFTRを
コードする核酸分子に結合体化される肺ホーミング分子の投与は、インビボにお
ける遺伝子治療処置方法として肺へ核酸分子を指向するための手段を提供する。
を含む結合体を投与することにより皮膚の病状を処置する方法を提供する。例え
ば、火傷の被災者は、上皮性増殖因子に連結した皮膚ホーミング分子を含む結合
体または増殖因子に由来する血小板を投与され得、その結果、増殖因子が上皮性
および深在真皮の再生または修復を促進し得、増殖因子は、皮膚に局在化される
。さらに、本発明の方法は、抗生物質に連結される皮膚ホーミング分子を含む結
合体を被験体に投与することによって、細菌性感染、特に皮下組織および真皮を
通じて伝播する感染、またはそれらの領域に局在化される感染により生じる皮膚
の病状を処置するために有用であり得る。
を含む結合体を投与することにより、膵臓の病状を処置する方法を提供する。特
に、本発明の膵臓ホーミング分子は、膵臓外分泌部に局在化し得るので、膵臓外
分泌部に関連する病状は処置され得、そしてある場合には、膵臓内分泌部に有害
に影響し得ない。本発明の方法は、分泌されたプロテアーゼが器官を傷害するこ
とにより生じる膵臓外分泌部の炎症性状態である急性膵炎を処置するために特に
有用であり得る。プロテアーゼインヒビターに連結される膵臓ホーミング分子を
含む結合体は、組織のプロテアーゼ媒介性崩壊を阻害するために用いられ得、従
って、病状の重篤度を軽減する。このような結合体において有用な適切なプロテ
アーゼインヒビターは、膵炎に関連する酵素を阻害するものであり、これには、
例えば、トリプシンのインヒビター、キモトリプシン、エラスターゼ、カルボキ
シペプチダーゼおよび膵臓リパーゼのインヒビターが挙げられる。本発明の方法
はまた、膵臓にホーミングする分子に連結する治療剤を含む結合体を被験体に投
与することにより、膵臓癌(例えば、腺管癌)を有する被験体を処置するために
用いられ得る。
グ分子を含む結合体を投与することにより、眼、特に網膜の病理症状を処置する
ために用いられ得る。例えば、増殖性網膜症は、網膜虚血(例えば、糖尿病に起
因する)に対する応答における網膜の新生血管形成と関連する。従って、アポト
ーシスを刺激する遺伝子(例えば、Bax)に連結する網膜ホーミング分子を含
む結合体の投与は、増殖性網膜症を処置するために用いられ得る。同様に本発明
の方法は、本明細書において開示される適切な器官または組織のホーミング分子
を、単独かあるいは所望の成分と連結してかのいずれかで用いて、前立腺、卵巣
、リンパ節、副腎、肝臓または腸の病状を診断または処置するために用いられ得
る。
して、治療剤または検出剤を標的化するために有用である。さらに、器官または
組織のホーミング分子は、サンプル中の標的分子の存在を同定するために用いら
れ得る。本明細書中において用いる場合、用語「サンプル」は、身体から単離さ
れる細胞、組織、器官またはその部分を意味する最も広い意味で用いられる。サ
ンプルは、例えば、生検により得られた組織切片もしくは標品もしくは組織培養
に置かれるかまたはそれに適応される細胞であり得る。
合する標的分子を単離するための最初の工程であり得るホモジナイズ(homo
genization)により処理され得る。
グ分子により認識される標的分子(特に細胞表面タンパク質)の存在を同定する
ために、または標的分子を実質的に単離するために有用で有り得る。従って、本
発明は、肺ホーミング分子、皮膚ホーミング分子、膵臓ホーミング分子、網膜ホ
ーミング分子、前立腺ホーミング分子、卵巣ホーミング分子、リンパ節ホーミン
グ分子、副腎ホーミング分子、肝臓ホーミング分子または腸ホーミング分子を選
択的に結合する標的分子の同定の方法を提供する。このような方法は、選択され
た器官または組織(例えば、前立腺)のサンプルを前立腺ホーミング分子に接触
する工程、そしてサンプルの成分の選択的結合を検出する工程を包含する。ここ
で、このような結合は、標的分子の存在を確認する。
(例えばクロマトグラフィーマトリックスのような固体支持体)に連結され得る
。次いで、固定された器官ホーミング分子は、特定の標的分子に対して前立腺ホ
ーミング分子の特異的結合を可能にする条件下で、マトリックスを含有するカラ
ムに、前立腺組織の適切に処理されたサンプルを通過させることによりアフィニ
ティークロマトグラフィーに用いられ得る(例えば、Deutscher、Me
th.Enzymol.,Guide to Protein Purific
ation(Academic Press,Inc.,編.M.P.Deut
scher,1990),第182巻(これは、参考として本明細書において援
用されている)を参照のこと;例えば、357〜379頁を参照のこと)。未結
合物質および非特異的結合物質は、取り除かれ得、そして標的分子(前立腺ホー
ミング分子と複合体を形成する)は、カラムから溶出され、そして実質的に単離
された形態で収集される。次いで、実質的に単離された前立腺標的分子は、周知
の方法を用いて特徴付けられ得る。器官または組織のホーミング分子はまた、検
出可能な因子(例えば、放射性核種、蛍光分子、酵素または標識化ビオチンタグ
)に連結され得、そして例えば、標的分子の存在を検出するためにか、またはそ
の単離工程の間に標的分子を追跡するために、サンプルをスクリーニングするた
めに用いられ得る。
ンプルを用いることに替えて、選択された器官もしくは組織に由来する培養細胞
の抽出物、または培養された内皮細胞の抽出物が、開始物質として用いられ得る
。標的分子を含有する細胞の選択は、結合アッセイおよび細胞接着アッセイを用
いることにより決定され得る(Barryら.,Nature Med.2:2
99〜305 1996(これは参考として本明細書に援用される)を参照のこ
と)。標的分子を含有するそれらの細胞は、上記のように、標的分子の単離およ
び同定のための抽出物を調製するために用いられ得る。
れたアミノ酸を含有する培地中において細胞を増殖させることにより標識され得
る。放射性標識化アミノ酸は、標的分子に組み込まれ、従って、これは、精製の
間のその同定を容易にする。次いで、標識化細胞は、オクチルグルコシドで抽出
され得、そしてこの抽出物は、セファロースのようなマトリックスに結合した膵
臓ホーミング分子を用いて、アフィニティークロマトグラフィーにより分画され
得る。例えば、ヒト臍静脈内皮細胞から調製された抽出物が、コントロールとし
て用いられ得る。次いで、精製された標的分子はマイクロ配列決定され得、そし
て抗体が調製され得る。所望の場合、オリゴヌクレオチドプローブが調製され得
、そして標的レセプターをコードするcDNAクローンを単離するために使用さ
れ得る。あるいは、抗レセプター抗体を使用して、発現ライブラリーからcDN
Aクローンを単離し得る(Argravesら、J.Cell.Biol.10
5:1183−1190(1987)(これは、本明細書中で参考として援用さ
れる)を参照のこと)。
例えば、標的分子を発現するクローンについての膵臓cDNA発現ライブラリー
をスクリーニングするための化学的プローブとして膵臓ホーミング分子を用いる
ことにより単離され得る。例えば、膵臓cDNAライブラリーを発現する細菌は
、膜に付着され、溶解され、そして例えば、比色シグナルまたは蛍光シグナルを
産生する酵素に結合体化された膵臓ホーミング分子を用いてスクリーニングされ
得る。標的分子を発現している細菌性クローンは、同定され、そして標的分子を
コードするcDNAが単離され得る。さらに、COS細胞系のような哺乳動物細
胞発現クローニング系が、標的分子を同定するために用いられ得る。例えば、c
DNAライブラリーは、発現ベクターにクローニングされ得る膵臓初代細胞由来
のmRNAを用いて調製され得る。次いで、標的分子をコードするcDNAを発
現している細胞は、例えば、プレートに付着する膵臓ホーミングペプチドに対す
る細胞クローンのパニングにより、プローブとして、膵臓ホーミングペプチドを
用いて、選択され得る。あるいは、ファージは、膵臓ホーミングペプチドを提示
するために用いられ得、そして、例えば、抗M13抗体(Pharmacia)
を用いてコートされた磁気ビーズに付着され得る。次いで、膵臓ホーミングペプ
チドに結合する標的分子を発現する細胞が、回収され、そしてレセプターをコー
ドするプラスミドが、単離され得る。回収されたプラスミド調製物はプール中へ
分割され得、そしてCOS細胞トランスフェクションにおいて試験され得る。こ
の手順は、COS細胞が膵臓ホーミングペプチドを結合するのを可能にする単一
のプラスミドが得られるまで繰り返され得る。
同定する方法を提供する。この方法は、膜ジペプチダーゼ(MDP)を1つ以上
の分子と接触させる工程;および分子のMDPへの特異的結合を決定する工程を
包含し、ここで特異的結合の存在により、肺内皮に選択的にホーミングするMD
P結合ホーミング分子として、その分子を同定する。本発明の方法において、膜
ジペプチダーゼは、実質的に精製され得、そして例えば、支持体に固定され得る
。この膜ジペプチダーゼは、任意の哺乳動物MDP(例えば、配列番号448を
有するヒトMDP)であり得る。
1)ペプチドは、静脈注射後、マウス肺血管系に選択的に結合し得る(実施例I
IA)。さらに、実施例IVBに記載されるように、GFE−1(CGFECV
RQCPERC;配列番号1)を選択的に結合する55kDaの肺細胞表面タン
パク質を、アフィニティークロマトグラフィーを用いてラット肺抽出物から単離
した。トリプシン処理による消化および質量分析による配列決定は、55kDa
のタンパク質由来の2つのペプチドが、ラット膜ジペプチダーゼ(EC 3.4
.13.19)の一部分に完全に同一であることを明らかにした。さらなる実験
が、ラットの肺細胞抽出物のGFE−1(配列番号1)アフィニティー精製画分
が、特異的MDP基質Gly−D−PheのD−Pheへの時間依存的な変換に
よって示されるように、膜ジペプチダーゼ活性を有することを示した(実施例I
VCおよび図5)。さらに、GFE−1ファージ(CGFECVRQCPERC
;配列番号1)の、およびより少ない程度では、GFE−2ファージ(CGFE
LETC;配列番号2)の、膜ジペプチダーゼでトランスフェクトされたCOS
細胞への結合は、関連しないペプチド配列を有するファージの結合より、有意に
高かった(実施例IVDおよび図6B)。このことは、膜ジペプチダーゼがGF
E−1(配列番号1)レセプターであることを示す。
ダーゼは、肺内皮に対する分子の選択的ホーミングについてのレセプターとして
働く。膜ジペプチダーゼを標的化することによって、肺内皮に選択的にホーミン
グする分子の例証的な分類は、GFEモチーフ(例えば、CGFECVRQCP
ERC(配列番号1))を保有するペプチドの分類である。
ドロペプチダーゼ−1、またはMDPとしてもまた知られ、そして近年EC3.
4.13.19(以前は、EC3.4.13.11)として分類された)は、形
質膜グリコシルホスファチジルイノシトール−固定化糖タンパク質である(Ke
ynanら、Hooper編、Zinc Metalloproteases
in Health and Disease Taylor and Fra
ncis,London、285−309頁(1996)、これは、本明細書中
に参考として援用される)。このジンクメタロプロテアーゼ(これは主に、肺お
よび腎臓刷子縁において発現される)は、インビボでは、グルタチオンの腎臓代
謝、およびペプチジルロイコトリエンの肺代謝に関与する。さらに、MDPは、
哺乳動物β−ラクタマーゼの唯一公知の例である。MDPは、ジスルフィド結合
ホモダイマーを形成し、これは、起源種に依存して約48〜59kDaの範囲の
分子量のモノマーを有する(Keynanら、Biochem.35:1251
1−12517(1996)、これは、本明細書中で参考として援用される;ま
た実施例IVBを参照のこと)。
肺および腎臓において発現される。肝臓、膵臓、小腸および脳由来の全抽出物に
おいて低いレベルのMDP活性の報告が存在しているが、他では、これらの器官
において検出可能な活性は見出されていない。マウスにおいて、4つの異なるM
DP mRNAが存在し、そしてそれらは、いくつかの器官において示差的に発
現される(Habibら、J.Biol.Chem.271:16273−16
280(1996))。ブタMDP N結合グリコシル化の性質および程度の器
官特異的差異もまた、報告されている(Hooperら、Biochem.J.
324:151−157(1997))。
される。肺において、MDP発現は、内皮細胞ならびに誘導気道、肺胞管、毛細
管、ならびに肺胞および終末細気管支の基底膜を含む、多くの細胞型において検
出されている(Habibら、前出、1996);Inamuraら、Pros
taglandins Leukotrienes and Essentia
l Fatty Acids 50:85−92(1994))。MDP発現は
また、ヒト気管における粘膜下微細血管の内皮細胞において観察されている(Y
amayaら、Resp.Physiol.111:101−109(1998
)。MDP活性のレベルは、肺において最も高い(Hirotaら、Eur.J
.Biochem.160:521−525(1986);Habibら、Pr
oc.Natl.Acad.Sci.USA 95:4859−4863(19
98))。この発現パターンは、GFE−1(配列番号1)のような分子の強力
な肺の分子のホーミングと相関する。
であり、そして近年EC 3.4.13.19(以前はEC 3.4.13.1
1)として分類され、そして腎性もしくはミクロソームのジペプチダーゼまたは
デヒドロペプチダーゼ−1としてもまた公知である酵素をいう。この用語、膜ジ
ペプチダーゼは、任意の哺乳動物の膜ジぺプチダーゼ(例えば、ヒト、ブタ、マ
ウス、ラットおよびウサギのホモログを含み、これらは、図9中の配列番号44
8〜452に示されるアミノ酸配列を有する)、ならびにこれらのポリペプチド
の1つに対して実質的なアミノ酸配列類似性を有する関連ポリペプチドを含む。
このような関連ポリペプチドは、他のジンクメタロプロテアーゼまたはペプチダ
ーゼ(例えば、ジペプチジルペプチダーゼIV)に対してよりも、配列番号44
8、449、450、451、または452に対してより大きな配列類似性を示
し、そして、MDPの代替的にスプライスされた形態および図9に示されるアミ
ノ酸配列のアイソタイプ改変体を含む。従って、用語MDPは、異なる哺乳動物
種から得られた相同なポリペプチド、ならびに他の改変体および一般に配列番号
448、449、450、451または452の約65%より大きな、好ましく
は、約70%より大きな、およびより好ましくは約80%または90%より大き
な、アミノ酸同一性を有する関連ポリペプチドを含む。本発明の方法は、好まし
くは、ヒト膜ジペプチダーゼ(配列番号448)を使用する。
的に精製される」とは、ポリぺプチドが、混入脂質、核酸、非関連ポリペプチド
および細胞中で膜ジペプチダーゼと通常結合しない他の細胞物質を比較的含まな
い形態であることを、意味する。
インビトロで実施され得、そして膜ジペプチダーゼは多くの供給源から得られ得
る。膜ジペプチダーゼの供給源としては、細胞全体あるいは内因性MDPまたは
外因性MDPを含む細胞抽出物が挙げられる。MDPのさらなる供給源は、部分
的に精製された細胞抽出物;生化学的に精製された酵素(例えば、アフィニティ
ー精製されたMDP);組換えポリペプチド;およびトランスフェクトされた細
胞株を含む。
ジペプチダーゼを精製または部分的に精製するために特に有用であり得る。例え
ば、膜ジペプチダーゼは、実施例IVCにおいてマウスおよびラット膜ジペプチ
ダーゼについて記載されるように、固定化GFE−1ペプチド(配列番号1)を
使用して、アフィニティークロマトグラフィーによって肺細胞抽出物から精製さ
れ得る。同様に、膜ジペプチダーゼは、他の固定化リガンド(例えば、シラスタ
チン)を使用して、アフィニティークロマトグラフィーによって得られ得る。例
えば、膜ジペプチダーゼは、Littlewoodら、Biochem.J.2
57:361−367(1989);およびCampbellら、J.Biol
.Chem.259:14586−14590(1984)(これらの各々は、
本明細書中で参考として援用される)に記載されるように、シラスタチン−セフ
ァロースアフィニティークロマトグラフィーに結合した細菌性ホスファチジルイ
ノシトール特異的ホスホリパーゼC(PI−PLC)による、MDPの選択的放
出を通じて、2つの工程で効率的に精製され得る。
のMDPホモログのアミノ酸配列および核酸配列は、当該分野において公知であ
る。図9に示される膜ジペプチダーゼポリペプチドをコードする核酸配列は、例
えば、GenBankのようなデータベースからかまたは文献(例えば、Gen
bank登録番号第D13139号および同第285150号;Adachiら
、J.Biol.Chem.265:3992−3995(1990);Rac
hedら、1990;Keynanら、FEBS Letts.349:50−
54(1994);Satohら、Biochim.Biophys.Acta
1163:234−242(1993);Adachiら、Biochem.
Biophys.Acta 1132:311−314(1992);Anら、
Biochim.Biophys.Acta 1226:337−340(19
4);ならびにIgarashiおよびKarniski、Biochem.J
.280:71−78(1991)、これらの各々は、本明細書中に参考として
援用される)から得られ得る。新規な膜ジペプチダーゼcDNAは、分子生物学
の分野において周知の方法を使用して、ヌクレオチド配列を、プローブまたはプ
ライマーとして用いて、さらなる哺乳動物種から単離され得る(Innisら(
編)、PCR Protocols、San Diego:Academic
Press、Inc.(1990);Erlich、前出、1989;Samb
rookら、前出、1989、これらの各々は、本明細書中で参考として援用さ
れる)。当業者は、MDPのコード核酸の発現および、後の組換えMDPポリペ
プチドの単離のための種々の方法を知っている。
本発明の方法において、分子のMDPへの特異的結合は、その分子を、肺内皮に
選択的にホーミングするMDP結合ホーミング分子として同定する。分子および
MDPに関して本明細書中で使用される用語「特異的結合」とは、その分子が、
非特異的相互作用とは測定可能に異なるMDPの親和性を有することを意味する
。特異的結合は、例えば、コントロール分子の結合と比較した分子の結合の決定
によって、測定され得る。これは、一般的に、結合活性を有さない類似した構造
の分子、例えば、GFEモチーフを欠失した類似した大きさのぺプチドである。
この場合、特異的結合は、分子がコントロール分子より、膜ジペプチダーゼに対
して測定可能により高い親和性を有するかどうかが示される。結合の特異性はま
た、例えば、MDPに結合することが公知であるコントロール分子(例えば、G
FEモチーフを含むペプチド)との競合によって決定され得る。
高い親和性特異的結合の両方を含む。特異的結合は、例えば、膜ジペプチダーゼ
について約10-4M〜約10-7MのKdを有する低親和性MDP結合ホーミング 分子によって提示され得る。特異的結合はまた、高い親和性MDP結合ホーミン
グ分子(例えば、膜ジペプチダーゼについて少なくとも約10-7M、少なくとも
約10-8M、少なくとも約10-9M、少なくとも約10-10M、または少なくと も約10-11Mもしくは10-12Mまたはそれより大きいKdを有するMDP結合 ホーミング分子)によって提示され得る。配列X1−G−F−E−X2(配列番号
17)(ここでX1およびX2各々が独立して選択された1〜10のアミノ酸であ
る)を含むMDP結合ホーミングペプチドは、例えば、膜ジペプチダーゼについ
て約2×10-5M〜10-7MのKd、例えば約10-6〜10-7MのKdを有し得る
。肺内皮に選択的にホーミングする、低親和性MDP結合ホーミング分子および
高親和性MDP結合ホーミング分子の両方が、以下にさらに記載されるように、
被験体において部分を肺内皮に選択的に指向するのに有用であり得る。
への分子の特異的結合を決定し得る。特異的結合に適切な条件が、例えば実施例
IVBにおいて記載される。特異的結合はまた、MDP発現欠損細胞を、例えば
、実施例IVDに記載されるように、MDPを用いてトランスフェクトすること
によって決定され得る。この場合、特異的結合は、一部には、分子の非トランス
フェクト細胞への結合よりもMDPトランスフェクト細胞への結合が有意に高い
ことによって、決定される。
も関わらず、肺血管系に特異的にホーミングするという、驚くべき発見に関する
。本明細書中に開示されるように、MDP結合GFE−1(配列番号1)保有フ
ァージのマウスの循環への注射によって、隣接細胞上でいくらかの拡散染色を伴
って、ファージの肺微小血管系への迅速な結合を生じた。同じ結果が、GFE−
1(配列番号1)保有ファージのラット循環への注射によって得られた。特に、
例えば、MDP結合GFE−1ファージは、腎近位細管の刷子縁(高いレベルの
MDPを発現する)に結合しなかった。これらの結果は、肺内皮細胞の管腔表面
上のMDPの発現が、MDP結合ファージが循環から肺内皮へホーミングするの
を媒介し得、一方、MDP結合ファージは、腎臓MDPに接近し得ずかつホーミ
ングし得ないことを示す。従って、MDPは、分子が他の内皮細胞に優先して、
肺内皮に選択的ホーミングすることを媒介する。
ファージのような部分が、MDP結合ホーミング分子に結合され得、それによっ
て肺内皮へ選択的に指向され得ることをさらに示す。従って、本発明は、肺の障
害の処置のために肺内皮に対して、部分(例えば、ファージ、遺伝子治療ベクタ
ー、または抗生物質)を選択的に標的化する方法を提供する。
内皮へ選択的にホーミングするMDP結合ホーミング分子に連結された部分を含
む結合体を被験体に投与し、それによって、その部分が被験体中の肺内皮に選択
的に指向される工程を含む。MDP結合ホーミング分子は、膜ジペプチダーゼ(
MDP)を1つ以上の分子と接触させること;および分子のMDPとの特異的結
合を決定することによって同定され、ここで、特異的結合の存在が、その分子を
肺内皮へ選択的にホーミングするMDP結合ホーミング分子として同定する。本
発明の方法は、例えば、肺炎;ぜん息;気腫;呼吸器感染;慢性気管支炎;慢性
間質性肺疾患;肺癌;胸膜炎または嚢胞性線維症に罹患している被験体の肺への
遺伝子または薬物を標的化することのために有用であり得る。所望される場合、
本発明の方法は、予防的に、例えば部分を、肺障害の家族歴を有する個体、また
は例えば、肺感染に感受性の個体の肺内皮に選択的に指向させるように、使用さ
れ得る。
(例えば、ウイルス、ウイルス遺伝子治療ベクター、細胞、リポソーム、マイク
ロカプセル、マイクロポンプまたは他のチャンバー化マイクロデバイス)であり
得、これらは、例えば薬物送達システムとして使用され得る。このようなマイク
ロデバイスは、一般に、生物学的に不活性であり、そして所望される場合、これ
らは生分解性または排出可能であり得る。薬剤を含み得る種々の部分(マイクロ
カプセルを含む)、および部分またはチャンバー化マイクロデバイスを有機分子
に連結させるための方法は、当該分野において周知であり、そして本明細書上記
に記載のように市販されている。治療用結合体を生成するために、肺内皮に選択
的にホーミングするMDP結合ホーミング分子に連結され得る例示的な部分は、
治療的抗菌性バクテリオファージ;アンピシリンのような抗生物質;およびリバ
ビリンのような抗ウイルス剤を含む(上記を参照のこと)。
クテリオファージ(「ファージ」)であり得る。ファージは、無毒であることが
示されており(Ochsら、J.Clin.Invest.50:2559−2
568(1971)、これは本明細書中に参考として援用される)、そしてファ
ージ療法の使用は、細菌感染(例えば、抗生物質耐性感染)の処置について当該
分野で公知である(BarrowおよびSoothill、Trends in
Microbiology 5:268−271(1997);Slopek
ら、Arch.Immunol.Ther.Exp.35:553−561(1
987);およびMerrillら、Proc.Natl.Acad.Sci.
、USA 93:3188−3192(1996)、これらの各々は本明細書中
に参考として援用される;Practical Applications o
f Bacteriophages CRC Press、Boca Rato
n、Floridaもまた参照のこと)。例えば、抗生物質療法で首尾よく処置
されなかった大部分である一連の550人の患者において、ファージ療法は、種
々の感染(気道化膿性感染および気管支肺炎(broncopneumonia
)(Slopekら、前出、1987)を含む)を軽減するにおいて75〜10
0%の成功を生じた。ファージ療法は、院内感染および多剤耐性感染を処置する
において特に有用であり得る。
を使用して可能であることを示した。この研究は、ファージがインビボで増殖す
ることを示す。従って、ファージ療法は、ファージがインビボで複製する能力の
ために、抗生物質(例えば、ストレプトマイシン、テトラサイクリン、アンピシ
リン、およびスルファフラゾール)による従来の処置より有効であり得る。所望
であれば、MDP結合ホーミング分子を含有するファージ結合体での処置が、抗
生物質薬物療法と組み合わせられ得る。
ある。このようなファージは、肺内皮に選択的に指向される結合体を生成するた
めにMDP結合ホーミングペプチド(例えば、GFE−1(配列番号1))をコ
ードするように、標準的な遺伝子技術によって容易に改変され得る。本発明の方
法において有用なファージは、例えば、T4関連ファージ(これはまた、「T偶
数ファージファミリー」のメンバーとして公知である)を含む。当業者は、処置
される感染に特徴的な細菌に対するレセプター特異性を有するファージ部分(例
えば、Staphylococcus、Klebsiella、Proteus
、Escherichia、Shigella、Pseudomonas、また
はSalmonellaに対するレセプター特異性を有するファージ)が、選択
されることを理解する。所望であれば、病原性細菌は、分類化され得、そしてフ
ァージ感受性についてモニタリングされ得る。耐性細菌の処置のために、ファー
ジ結合体は、所望であれば、種々のタイプの細菌に対する異なるレセプター特異
性を有するファージの混合物を含み得る。
され得る。このような結合体はまた、例えば、各食事の一時間半前に、10ml
滅菌ファージ溶解物として経口投与され得る。胃液が、Vichy水、重曹、ま
たはゼラチンによって中和される。経口投与後、ファージ/MDP結合ホーミン
グ結合体は、血液に接近し、続いて肺内皮に選択的に指向される。必要であれば
、投与は、数週間または数ヶ月の期間にわたって毎日繰り返され得る。ファージ
結合体の適当な用量は、当業者によって容易に決定され得、そして一般に、約1
00〜約1010プラーク形成単位(pfu)、通常、約100〜106pfuの 範囲内である。
であり得る。本明細書中で使用される用語「遺伝子治療ベクター」は、宿主細胞
に送達されたとき、インビボでその宿主細胞においてコードされる遺伝子産物を
一過的または永続的に発現する核酸成分を含有するベクターを意味する。
子治療ベクターもまた、当該分野で公知である。このようなベクターには、ウイ
ルスおよび非ウイルスベクター、例えば、レトロウイルスベクター、アデノウイ
ルスベクター、アデノ随伴ベクター(AAV)、ヘルペスウイルスベクター、お
よびリポソームプラスミドベクターが挙げられる(Chang、Somatic
Gene Therapy CRC Press、Boca Raton、F
lorida (1995)、その各々は、本明細書中に参考として援用される
)。レトロウイルスベクターおよびAAVベクターは、例えば、永続的な発現の
ために有用であり得、一方、アデノウイルスベクター、ヘルペスウイルスベクタ
ー、およびリポソーム−プラスミドベクターは、一般に、一過性発現を与える。
例えば、アデノウイルスベクターは、肺において、嚢胞性線維芽症膜貫通レセプ
ター(CFTR)および組換えα1−アンチトリプシンを発現させるために使用
されている(Rosenfeldら、Cell、68:143 (1992);
Rosenfeldら、Science 252:431 (1991)、これ
らの各々は、本明細書中に参考として援用されている)。リポソームDNA複合
体もまた、肺への遺伝子移入を生じさせるために使用されている(例えば、Zh
uら、Science 261:209(1993)(これは、本明細書中に参
考として援用されている)を参照のこと)。ファージベクターもまた、所望の核
酸をインビボで発現させるために有用であり得る(例えば、Ivanenkov
ら、Biochimica et Biophysica Acta 1448
:450−462(1999);Ivanekovら、Biochimica
et Biophysica Acta 1448:463−472(1999
)(これらの各々は、本明細書中に参考として援用されている)を参照のこと)
。
合体を用いて肺内皮に部分を選択的に指向させるための、本発明の方法は、種々
の肺障害の治療的取り扱いにおいて有用であり得る。例えば、サイトカインをコ
ードする遺伝子治療ベクターを肺内皮に選択的に指向させることにより、本発明
の方法は、免疫療法のために有用であり得る。種々のサイトカインまたはケモカ
インは、本発明の方法に従って投与された場合、免疫応答(例えば、抗癌免疫応
答もしくは抗ウイルス免疫応答)の刺激において有用であり得る。このようなサ
イトカインまたはケモカインは、GM−CSF、G−CSF、IFN−γ、IF
N−α、TNF−α、TNF−β、IL−1、IL−2、IL−3、IL−4、
IL−6、IL−7、IL−10、IL−12、リンホタクチン(lympho
tactin)、またはDC−CK1(Pardoll、Annu.Rev.I
mmunol.13:399−415(1995);Huntら、J.Immu
notherapy 14:314−321(1993);Chang、前出、
1995、これらの各々は、本明細書中に参考として援用されている)を含む。
本発明の方法は、循環中のサイトカインの半減期が短いことおよびそれらの肺へ
の標的化がないことに起因して、組換えサイトカインの投与よりも有効であり得
る。
(例えば、ストレプトマイシン、テトラサイクリン、アンピシリン、もしくはス
ルファフラゾール)を肺内皮へ選択的に指向させることにより肺感染を治療する
ために有用であり得る。例えば、本発明の方法は、後天性免疫不全症候群(AI
DS)または嚢胞性線維症に続発性の感染を処置するために有用であり得る。
えば、α1−アンチトリプシン欠損および嚢胞性線維症)の置換遺伝子治療のた
めに使用され得る(AltonおよびGeddes、Brit.J.Hosp.
Medicine 58:38−40(1997);Wood、Radiolo
gy 204:1−10(1997)、これらの各々は、本明細書中に参考とし
て援用されている)。野生型α1−アンチトリプシン(α1−AT)および嚢胞
性線維症膜貫通レセプター(CFTR)をコードする遺伝子が、単離されており
(Riordanら、Science 245:1066−1073(1989
);Richら、Nature 347:358:63(1990);Rose
nfeldら、Science 252:431−434(1991)、これら
の各々は、本明細書中に参考として援用されている)、そしてMDP結合ホーミ
ング分子(例えば、GFE−1(配列番号1))に連結された遺伝子治療ベクタ
ーにおいて肺に選択的に移入され得る。
って、ここでMDP結合ホーミング分子が配列X1−G−F−E−X2(配列番号
17)(ここで、X1およびX2の各々は、1〜10の独立して選択されたアミノ
酸である)を含むペプチドである、方法を提供する。このようなMDP結合ホー
ミングペプチドは、例えば、配列CGFECVRQCPERC(配列番号1)ま
たはCGFELETC(配列番号2)を含み得る。
あって、ここでMDP結合ホーミング分子が以下の構造1を含む、方法を提供す
る:
囲の炭化水素ラジカルであり;これらR2またはR3炭化水素鎖のいずれか一方で
、1〜6の水素が、ハロゲンで置換され得るか、または非末端メチレンが、酸素
または硫黄(後者の酸化型を含む)で置換され得;さらに、R3中の末端水素も また、ヒドロキシルまたはチオール(これはアシル化またはカルバモイル化され
得る)で置換され得;あるいは、水素が、アミノ(これは、アシルアミノ、ウレ
イド、アミジノ、グアニジノ、もしくはアルキルにおけるように誘導体化され得
る)または置換アミノ基(第4級窒素基(grouping)を含む)で置換さ
れ得る;あるいは、酸基(例えば、カルボン酸基、ホスホン酸基、またはスルホ
ン酸基)またはそれらのエステルもしくはアミド、またはシアノによる置換が存
在し得る;あるいは、それらの組み合わせ(例えば、末端アミノ酸基を含む);
そしてR1は、水素もしくは低級アルキル(C1-6)もしくはジアルキルアミノア
ルキル、または薬学的に受容可能なカチオンである。このようなMDP結合ホー
ミング分子は、例えば、7−(L−2−アミノ−2−カルボキシエチルチオ)−
2−(2,2−ジメチルシクロプロパンカルボキサミド)−2−ヘプテン酸(h
eptenoic acid)(シラスタチンとしても公知であ る)であり得る。
る、構造1を有する化合物であり得る。
であり、そしてR3が、n−アルキル(1〜9炭素)、または第4級窒素、アミ ン誘導体、もしくはアミノ酸誘導基である末端置換基を有するn−アルキル(1
〜9炭素)である、構造1を有する化合物であり得る。MDP結合ホーミング分
子は、例えば、例えば、R2が、2,2−ジメチルシクロプロピルまたは2,2 −ジクロロシクロプロピルであり、そしてR3が、末端置換基を有さない3〜7 炭素原子の炭化水素鎖であるか、またはトリメチルアンモニウム、アミジノ、グ
アニジノもしくは2−アミノ2−カルボエチルチオである末端置換基を有する3
〜7炭素原子の炭化水素鎖である、構造1を有する化合物であり得る。
子には、以下が含まれる:Z−2−(2,2−ジメチルシクロプロパンカルボキ
サミド)−8−トリメチルアンモニウムヒドロキシド−2−オクテン酸内部塩;
Z−2−(2,2−ジクロロシクロプロパンカルボキサミド)−8−トリメチル
アンモニウムヒドロキシド−2−オクテン酸内部塩;Z−2−(2,2−ジメチ
ルシクロプロパンカルボキサミド)−8−グアニジノ−2−オクテン酸;Z−2
−(2,2−ジメチルシクロプロパンカルボキサミド)−8−グアニジノ−2−
オクテン酸;Z−2−(2,2−ジメチルシクロプロパンカルボキサミド)−8
−ウレイド−2−オクテン酸;Z−8−(1−2−アミノ−2−カルボキシエチ
ルチオ)−2−(2,2−ジメチルシクロプロパンカルボキサミド)−2−オク
テン酸;Z−2−(2,2−ジメチルシクロプロパンカルボキサミド)−2−オ
クテン酸(ラセミ型および右旋性型);Z−2−(2,2−ジクロロシクロプロ
パンカルボキサミド)−2−オクテン酸;7−(L−2−アミノ−2−カルボキ
シエチルチオ)−2−(2,2−ジメチルシクロプロパンカルボキサミド)−2
−ヘプテン酸;および6−(L−2−アミノ−2−カルボキシエチルチオ)−2
−(2,2−ジメチルシクロプロパンカルボキサミド)−2−ヘキセン酸。
ーミング分子を用いて実施され得、このMDP結合ホーミング分子は、以下の構
造1を有する、Z−2−アシルアミノ−3−モノ置換プロペネートである:
範囲の炭化水素ラジカルである。これら炭化水素ラジカルR2およびR3のいずれ
か一方で、6までの水素が、ハロゲンで置換され得るか、または非末端メチレン
が、酸素または硫黄(後者の酸化型を含む)で置換され得る。
ル化(アルキルおよびジアルキルカルバメート誘導体を含む)され得る)で置換
され得;あるいは、水素が、アミノ基(これは、アシルアミノ、ウレイド、アミ
ジノ、グアニジノ、またはアルキルもしくは置換アルキルアミノ基(第4級窒素
基を含む)におけるように誘導体化され得る)で置換され得る;あるいは、酸基
(例えば、カルボン酸基、ホスホン酸基、またはスルホン酸基)またはそれらの
エステルもしくはアミド、ならびにシアノによる置換が存在し得る;あるいは、
それらの組み合わせ(例えば、末端アミノ酸基を含む)。
またはシクロアルキルラジカル(C3-10)である。R3が、1〜4炭素原子の直 鎖低級アルキルである場合、R2は、フェニルまたは1〜4炭素原子の直鎖低級 アルキルではあり得ない。R1は、水素、低級アルキル(C1−C6)またはジア ルキルアミノアルキル(例えば、−CH2CH2N(C2H5)2、−CH2CH(C
H3)N(CH3)2)である。
Z−2−(2,2−ジメチルシクロプロパンカルボキサミド)−2−オクテン酸
が、分離されている。活性は、右旋性異性体に存在する。これはS−配置を有す
る。
てシクロアルキル基上に別の環を形成し得る1または2のいずれかのアルキル置
換基であるか、あるいは、R5およびR6は、R2の定義において上述したように 置換され得る;そして −R7R8 ここで、R7は、1〜3炭素原子のアルキレン基であり、そしてR8は、3〜6炭
素原子のシクロアルキルであり、この炭素原子は、R2およびR3の定義において
上述したように置換され得る。
末端置換基を有するn−アルキル(1〜9炭素)を含む。
ubstituted)窒素または複素環式芳香族の窒素を意味するために本明
細書中で使用される。これは1〜7個の炭素原子を有する炭化水素基(それらは
同じまたは異なり得る)で置換された、アンモニウム部分を意味する。
そのアミノ誘導体、アシルアミノ誘導体、ウレイド誘導体、アミジノ誘導体、グ
アニジノ誘導体およびアルキル(1〜7個の炭素原子)誘導体のような基を意味
する。
、システイニル(−SCH2CH(NH2)COOH)またはサルコシル(−N(
CH3)CH2COOH)のような部分を意味し、ここで、公知のアミノ酸O、N
またはSに結合する水素は置換される。
ルアンモニウム、アミジノ、グアニジノ、または2−アミノ−2−カルボキシエ
チルチオである末端置換基を有する3〜7個の炭素原子の炭化水素鎖である、ホ
ーミング分子である。
Z−2−(2,2−ジメチルシクロプロパンカルボキシアミド)−8−トリメチ
ルアンモニウムヒドロキシド−2−オクテン酸内部塩;Z−2−(2,2−ジク
ロロシクロプロパンカルボキサミド)−8−トリメチルアンモニウムヒドロキシ
ド−2−オクテン酸内部塩;Z−2−(2,2−ジメチルシクロプロパンカルボ
キサミド)−8−ホルムアミジノ−2−オクテン酸;Z−2−(2,2−ジメチ
ルシクロプロパンカルボキサミド)−8−グアニジノ−2−オクテン酸;Z−2
−(2,2−ジメチルシクロプロパンカルボキサミド)−8−ウレイド−2−オ
クテン酸;Z−8−(L−2−アミノ−2−カルボキシエチルチオ)−2−(2
,2−ジメチルシクロプロパンカルボキサミド)−2−オクテン酸;Z−2−(
2,2−ジメチルシクロプロパンカルボキサミド)−2−オクテン酸(ラセミ型
および右旋回型);Z−2−(2,2−ジクロロシクロプロパンカルボキサミド
)−2−オクテン酸;7−(L−2−アミノ−2−カルボキシエチルチオ)−2
−(2,2−ジメチルシクロプロパンカルボキサミド)−2−ヘプテン酸;およ
び6−(L−2−アミノ−2−カルボキシエチルチオ)−2−(2,2−ジメチ
ルシクロプロパンカルボキサミド)−2−ヘキセン酸。
書中に開示され、そして当該分野で公知である。このようなMDP−結合ホーミ
ング分子を調製するためのいくつかの方法は、実施例VIに示される(また、K
ahanらに対する米国特許第4,616,038号(本明細書中で参考として
援用される)も参照のこと)。
に従って、肺内皮に対して選択的に遺伝子または医薬を標的にするために使用さ
れ得る。このようなMDP−結合ホーミング分子は、以下の構造2:
は複素環式基またはフェニル基であり、これは置換されてもよく、置換されなく
てもよい)、ならびに低級アルキル(C1〜C6)エステルおよびその薬学的に受
容可能な塩を含む。
ジル、ピリミジニル、テトラゾリル、イミダゾリル、チアゾリニルなどを意味す
る。このような複素環式環およびフェニル環は、置換されなくてもよく、あるい
はヒドロキシル、オキソ、カルボニル、またはメチルで置換されてもよい。構造
2におけるY基としては、例えば、2−ピリジニル;4−ピリジニル;3−ヒド
ロキシ−2−ピリジニル;3−カルボキシ−2−ピリジニル;5−カルボキシ−
2−ピリジニル;2−カルボキシフェニル;1−メチル−1,2,3,4−テト
ラゾール−5−イル;および4−カルボキシ−6−ヒドロキシ−2−ピリミジニ
ルが挙げられる。
ロピル中心の立体配置は、好ましくは、S(+)であるが、化合物のR,S(+
/−)ラセミ混合物もまた、本発明の方法において使用され得る。
Yが3−カルボキシ−2−ピリジルまたは3−ヒドロキシ−2−ピリジル(各々
S形態の)である、ホーミング分子である。構造2を有する模範的なMDP−結
合ホーミング分子は、以下を含む:Z−7−(3−ヒドロキシ−2−ピリジルチ
オ)−2−(2,2−ジメチルシクロプロパンカルボキシアミド)−2−ヘプテ
ン酸およびZ−(5−カルボキシ−2−ピリジルチオ)−2−(2,2−ジメチ
ルシクロプロパンカルボキシアミド)−2−ヘプテン酸。
な誘導体(例えば、アルカリ金属塩およびアルカリ土類金属塩、アンモニウム塩
またはアミン塩など(これらもまた本発明において有用である))は、慣用的な
方法を使用して当業者により調製され得る。構造2を有するMDP−結合ホーミ
ング分子は、例えば、Ashtonらに対する米国特許第4,406,902号
(これは、本明細書中に参考として援用される)に記載のように、例えば、ブロ
モアルケン酸を適切なメルカプタンであるYSHと、周囲温度で炭酸水素ナトリ
ウム存在下の水中で縮合することにより調製され得る。
:
キルチオ、C7〜C10のアラルキルオキシ、C7〜C16のアラルキルチオの1以上
のものにより置換され得; R2は、 (a)HまたはC1〜C12の直鎖または分枝のアルキル; (b)C2〜C12の直鎖または分枝のモノアルケニル; (c)C7〜C20のアラルキルであって、ここで、そのアルキル鎖が直鎖または 分枝のC1〜C8であり、かつそのアリール部分がC6〜C12である、アラルキル ; (d)複素環式アルキルであって、ここで、そのアルキル鎖が直鎖または分枝の
C1〜C8であり、かつその複素環部分は5〜6員の、必要に応じて、ベンゼン環
と融合される完全芳香族であり、以下:O、NまたはSのヘテロ原子の1〜2個
を含む、複素環式アルキル; (e)C3〜C7のシクロアルキル; (f)C4〜C10シクロアルキルアルキル; であって、ここで、R2についての上記の価が、以下:ハロ、ヒドロキシ、カル ボキシ、C1〜C4のアルコキシカルボニル、C7〜C16のアリールアルコキシカ ルボニル、C3〜C7のシクロアルキル、C1〜C4のアルコキシ、C6〜C12のア リールオキシ、C3〜C6のシクロアルキルオキシ、C3〜C6のシクロアルキルチ
オ、アミノ、C1〜C8のモノ−またはジ−アルキルアミノ、チオ、C1〜C4のア
ルキルチオ、C6〜C12のアリールチオ、C7〜C16のアラルキルチオ、またはラ
ジカル−S−(CH2)n−CH(NH2)COOHに示す1以上のものにより置 換され得; R5は、 (a)HまたはC1〜C12の直鎖または分枝のアルキル; (b)C2〜C12の直鎖または分枝のモノアルケニル; (c)C7〜C20のアラルキルであって、ここで、そのアルキル鎖が直鎖または 分枝のC1〜C8であり、かつそのアリール部分がC6〜C12である、アラルキル ; (d)複素環式アルキルであって、ここで、そのアルキル鎖が直鎖または分枝の
C1〜C8であり、かつその複素環部分は5〜6員の、必要に応じて、ベンゼン環
と融合される完全芳香族であり、以下:O、NまたはSのヘテロ原子の1〜2個
を含む、複素環式アルキル; (e)C4〜C10シクロアルキルアルキル; (f)C3〜C7のシクロアルキル; であって、ここで、R5についての上記の価が、以下:ハロ、ヒドロキシ、カル ボキシ、C1〜C4のアルコキシカルボニル、C7〜C16のアリールアルコキシカ ルボニル、C3〜C7のシクロアルキル、C1〜C4のアルコキシ、C6〜C12のア リールオキシ、C3〜C6のシクロアルキルオキシ、C3〜C6のシクロアルキルチ
オ、アミノ、C1〜C8のモノ−またはジ−アルキルアミノ、チオ、C1〜C4のア
ルキルチオ、C6〜C12のアリールチオ、C7〜C16のアラルキルチオ、またはラ
ジカル−S−(CH2)n−CH(NH2)COOHに示す1以上のものにより置 換され得る; そして、その構造3および4のMDP−結合立体異性体ならびにラセミ化合物を
含む、ホスフィン酸であり得る。
n−ペンチル、イソペンチル、n−ヘキシル、n−ヘプチル、n−オクチル、イ
ソ−オクチル、n−デシル、n−ウンデシル、n−ドデシルなどを含む。この系
列においては、n−ブチル、イソブチル、n−ペンチルおよびn−ヘキシルが好
ましい。
チオ、エチルチオ、プロピルチオ、ブチルチオ、シクロペンチルオキシ、シクロ
ペンチルチオ、シクロプロピルチオ、ベンジルチオ、2−フェネチルチオ、2−
フェネチルチオなど。
ル、1−ブテニル、2−ブテニル、1−ペンテニル、2−ペンテニル、2−メチ
ル−2−ブテニルなどを含む。
ル、プロピニル、1−ブチニル、2−ブチニル、2−メチル−3−ペンチニルな
どを含む。
エチル、1−フェニルエチル、4−メチルフェニル−メチルなどを含む。この系
列においては、ベンジルが好ましい。
:シクロヘキシルメチル、シクロペンチルメチル、2−シクロヘキシルエチル、
2−シクロオクチルエチルなど。この系列においては、シクロペンチルメチルお
よびシクロヘキシルメチルが好ましい。
いては、シクロペンチルおよびシクロヘキシルが好ましい。
ルオキシ、ベンジルチオ、2−フェニルエチルチオなど。
の価は、他で示される場合を除いて、直鎖または分枝の、2〜12炭素原子から
のアルキルおよびモノアルケニルおよび鎖状炭化水素ラジカル(例えば、エチル
、n−プロピル、イソプロピル、n−ブチル、イソブチル、sec−ブチル、t
−ブチル、n−ペンチル、イソペンチル、n−ヘプチル、n−ノニル、4,4−
ジメチルペンチル、またはビニル、アリル、1−ブテニル、2−ブテニル、5−
ヘキセニルなど)を含む。イソプロピル、n−ブチル、n−ペンチル、n−ヘプ
チルまたは1−ブテニルが好ましい。
クロペンチルエチル、シクロヘキシルメチル、シクロヘキシルエチル、シクロプ
ロピルなど。
を有し、そしてここで示される「アリール」は、フェニル、ナフチル、またはビ
フェニルを表す。代表的な例としては、ベンジル、フェネチル、4−フェニル−
n−ブチル、1−フェニル−n−オクチルなどが挙げられる。
族複素環、すなわち「ヘテロアリール」置換基は、同義であり、そして上記に引
用されるものは、1〜3個のO、NまたはSヘテロ原子、好ましくは、1個のO
またはSあるいは1〜3個のNヘテロ原子を含む、5員または6員の芳香環、例
えば、ピリジル、チエニル、フリル、イミダゾリル、およびチアゾリルならびに
これらの任意の二環式基誘導体(ここで、上記の任意の複素環式環は、ベンゼン
環(例えば、インドリル、キノリニル、イソキノリニル、ベンジミダゾリル、ベ
ンゾチアゾリル、ベンゾフリル、およびベンゾチエニルのような)に融合される
)を表す。
アラルキル基、複素環アルキル基およびヘテロアリール基における芳香環上にも
同様に存在し得る。置換部位は、任意の利用可能な部位であり得、そして置換は
、1以上の同じかまたは異なる基を含み得る。
を意味する);ヒドロキシ;カルボキシ;C1〜C4の直鎖または分枝のアルコキ
シカルボキシ(例えば、メトキシカルボニルおよびエトキシカルボニル);C7 〜C16のアリールアルコキシカルボニル(例えば、ベンジルオキシカルボニル、
n−ブチルオキシカルボニル);C3〜C7のシクロアルキル(例えば、シクロペ
ンチルおよびシクロヘキシル);C1〜C4のアルコキシ(例えば、t−ブトキシ
およびエトキシ);C6〜C12のアリールオキシ(例えば、ビフェニルオキシ、 ベンジルオキシ);アミノ;モノ−またはジ−C1〜C8のジアルキルアミノ(例
えば、メチルアミノ、イソプロピルアミノ、n−ブチルアミノ、イソへキシルア
ミノ、N,N−ジエチルアミノ、メチルエチルアミノ、メチル−t−ブチルアミ
ノ、ジ−n−オクチルアミノ;チオ;C1〜C4のアルキルチオ(例えば、メチル
チオ、エチルチオ);C6〜C12のアリールチオ(例えば、フェニルチオ);C7 〜C16のアラルキルチオ(例えば、ベンジルチオ、ナフチル−メチルチオ);ラ
ジカル−S−CH2−CH(NH2)COOHおよび−S−(CH2)2−CH(N
H2)COOH(両方とも、好ましくはL立体配置);そしてチオ置換基が存在 する場合、R2またはR5は、少なくとも1つのC2のアルキル基でなければなら ない。アリールまたはヘテロアリール基が、置換基に存在する場合、環上の炭素
は、以下の1以上のものによりさらに置換され得る:直鎖または分枝のC1−C4 アルキル(例えば、メチル、エチル、イソプロピル、t−ブチル);トリハロメ
チル(「ハロ」は、上記と同じ意味を有する)(例えば、トリクロロメチル、ト
リフルオロメチル);ニトロ、シアノまたはスルホンアミド。
イソブチルであり、R2およびR3は:C3−C7シクロアルキル;置換しているか
または置換していない、C1−C10直鎖または分枝アルキル;置換しているかま たは置換していない、C7−C14アラルキルである化合物である。ここで、これ らの基は、ハロ、アミノ、モノ−もしくはジ−C1−C4直鎖または分枝アルキル
アミノ、カルボキシル、C1−C4アルコキシカルボニル、ヒドロキシ、C1−C4 アルコキシ、C5−C6シクロアルキル、C6−C10アリロキシ(aryroxy )、チオ、C1−C4直鎖または分枝アルキルチオ、C6−C10アリールチオ、C7 −C14アラルキルチオ、−S−(CH2−)n−CH(NH2)CO2Hで置換され
得;ここで、このアリール基環炭素はさらに、直鎖または分枝C1−C4アルキル
によって置換され得;R3およびR4は、水素、C1−C4直鎖または分枝アルキル
、例えば、メチル、エチル、またはC7−C14アラルキル(例えば、ベンジル) である。
しくは(R)または(RS)立体配置のR1に、より好ましくは(R)に結合さ れ、そしてR2に結合した炭素は、(R)、(RS)または(S)立体配置、好 ましくは(RS)または(S)であり、そしてR5が存在する場合、その二重結 合は好ましくはZ立体配置にある。当業者は、構造3に基づくMDP−結合ホー
ミング分子が、無機または有機の酸および塩基に由来する塩の形態において使用
され得ることを理解する。
当該分野において周知である。例えば、Parsonsら、Biochemis
try International 23:1107〜1115(1191)
;および米国特許第5,145,990号を参照のこと。これらのそれぞれは、
本明細書中において参考として援用される。
法に従って、遺伝子または薬剤を選択的に肺内皮に指向させるために有用であり
得る。このようなMDP−結合ホーミング分子は、Kahanら、米国特許第4
,616,038;Ashtonら、米国特許第4,406,902号;Par
sonsら、米国特許第5.145,990号;Parsonsら、Bioch
em.International 23:1107〜1115(1991);
Uchidaら、米国特許第5,061,730号;Hashimotoら、J
.Antibiotics XLIII:281〜285(1990);および
Takaseら、J.Antibiotics XLIII:38〜42(19
90)に記載される分子を含み、これらの各々は本明細書中で参考として援用さ
れる。
腫瘍からの逸脱、細胞外マトリックスの接着および突出、ならびに微小血管系へ
の侵入を可能にする。大部分のこのような細胞は、通常肺中で、狭い毛細管の網
とのそれらの細胞の最初の衝突に際して、幾何学的および血流力学的な力によっ
て破壊される。肺への転移の頻度は単に腫瘍細胞塞栓の機械的な捕捉に起因して
いるが、特定の腫瘍細胞型は、特定の標的器官に転移することを好むことが長期
にわたって観察されてきた。
その標的器官の内皮との間の特異的な相互作用によって媒介されることを示す(
Albelda,Lab.Invest.68:4〜17(1993);Aue
rbachら、Cancer Res.47:1492〜1496(1987)
;Johnsonら、Cancer Res.51:394〜399(1991
)、これらの各々は、本明細書中に参考として援用される)。肺においては、2
つの血管のレセプターが転移細胞の接着を媒介することが見出されている。Lu
ECAM−1は、塩素チャネルと相同な配列を有する内皮表面タンパク質であり
、悪性のメラノーマ細胞の肺内皮への接着を媒介する(Elbleら、J.Bi
ol.Chem.272:27853〜27861(1997)、これは、本明
細書中で参考として援用される)。さらに、プロテアーゼである、肺内皮ジペプ
チジルペプチダーゼIV(DPP IV/CD 26)は、転移性の乳癌細胞お
よび前立腺癌細胞の肺へのホーミングを促進する(Johnsonら、J.Ce
ll.Biol.121:1423〜1432(1993)、これは、本明細書
中で参考として援用される)。転移細胞の表面に存在するフィブロネクチンは、
乳癌細胞の肺血管へのDPP IV依存性ホーミングのためのリガンドであるこ
とが示された(Chenら、J.Biol.Chem.273:24207〜2
4215(1998)、これは、本明細書中で参考として援用される)。これら
の結果は、器官選択的ホーミングが、古典的な細胞接着分子および他の分子によ
って媒介され得ることを示す。
内皮への選択的ホーミングは、細胞表面プロテアーゼであるMDPによって媒介
される。本明細書中でさらに開示されるように、GFE−1(配列番号1)の投
与は、マウスにおける2つのメラノーマ細胞系統(ヒトC8161およびマウス
B16)の実験的肺転移を阻害し得る。これは、GFE−1(配列番号1)が、
同じレセプターに結合することについて腫瘍細胞を転移させることと競合し得る
ことを実証する(図8を参照のこと)。これらの結果は、MDPが肺血管におい
て腫瘍細胞を転移させるためのレセプターをして働くこと、およびMDP−結合
ホーミング分子が、肺転移の固着を減少させ得るか、または妨害し得ることを示
す。
ミング分子を投与することによって、その患者における肺転移を減少させるか、
または妨害する方法を提供する。一般に肺に拡散した原発性腫瘍は、乳癌、結腸
直腸癌、肺癌、精巣癌、膵臓癌、食道癌、胃癌、卵巣癌、腎細胞癌、および前立
腺癌、骨原性肉腫、軟部組織肉腫およびメラノーマを含む(Smith、Sem
inars Oncology Nurs、14:178〜186(1988)
、これは、本明細書中で参考として援用される)。本発明の方法は、例えば、乳
癌、腎臓癌、メラノーマ、膀胱癌、子宮頸部癌、卵巣癌、前立腺癌、結腸直腸癌
、または肺癌の肺転移を減少または妨害するために使用され得る。
、1つの部位から、直接的にその部位と連絡していない別の部位への悪性細胞の
移動を意味する。従って、転移細胞は、原発性腫瘍から剥離するようになり、身
体の他の部分に移動し、そして別個の腫瘍の塊として増殖する。当業者は、悪性
細胞が、器官内の第1の部位から同じ器官内の第2の部位に局所的に移動し得る
か、または身体内の異なる器官に離れて移動し得ることを理解する。さらに、転
移の悪性細胞は、それ自体がさらなる転移を生じ得る。
巣を形成後、第1の部位とは直接的には連絡していない肺の中の1つ以上の部位
への悪性細胞の移動をいう。肺の中で生じる癌細胞の剥離した塊は、肺「転移」
または二次腫瘍と呼ばれる。肺転移は、種々の原発性腫瘍から生じ得、これは、
それらが一般的に組織学的に類似するものである。例えば、乳癌、腎臓癌、およ
びメラノーマは、しばしば肺に転移する。さらに、膀胱癌、子宮頸部癌、卵巣癌
、および前立腺癌は肺に転移し、より少ない頻度では、結腸直腸癌、または原発
性肺癌は、肺における1つ以上の第2の部位に転移する。
れる場合、肺転移の速度または程度が減少されることを意味する。従って、肺転
移は、肺転移の発生が完全に防止されるか、もしくは顕著に遅延された場合に減
少または妨害されるか;または肺転移の大きさもしくは数が顕著に減少した場合
に、減少または妨害される。当業者は、肺転移の発生の遅延または肺転移の大き
さもしくは数の減少が、本発明の方法に従って、MDP−結合ホーミング分子を
用いて処置していない1以上のコントロール被験体における肺転移の速度または
程度と比較して、測定されることを理解する。
たは防止するために、MDP−結合ホーミング分子を用いて予防的に処置され得
る。このようは被験体は、例えば、癌を有することが疑われ得るか、または家族
が癌の病歴を有し得る。
ミングを示し、そして部分的には、膜ジペプチダーゼに対して特異的結合を示す
ことによって特徴付けられる。肺転移を減少または妨害するうえで有用なMDP
−結合ホーミング分子は、本明細書中上記に記載したように、MDPへの特異的
結合によって容易に同定され得る。所望の場合、さらなるMDP−結合ホーミン
グ分子はまた、公知のMDP−結合ペプチド(例えば、GFE−1(配列番号1
))または細胞(例えば、C8161細胞)の膜ジペプチダーゼへの結合を競合
的に阻害する能力によって同定され得る。
結合ホーミング分子は、配列X1−G−F−E−X2(配列番号17)を含む肺ホ
ーミングペプチドである。ここで、X1およびX2のそれぞれは、1〜10の独立
して選択されるアミノ酸であり、例えば、配列CGFECVRQCPERC(配
列番号1)またはCGFELETC(配列番号2)を含むペプチドである。この
ようなMDP−結合ホーミング分子は、例えば、ペプチドCGFECVRQCP
ERC(配列番号1)またはCGFELETC(配列番号2)であり得る。配列
X1−G−F−E−X2(配列番号17)を含むさらなるMDP−結合ホーミング
分子(ここで、X1およびX2のそれぞれは、1〜10の独立して選択されるアミ
ノ酸である)は、以下に記載するように、例えば、不変の残基としてモチーフG
FEを含むコンビナトリアルペプチドライブラリーをスクリーニングすることに
よって同定され得る。
ンヒビターである。本明細書中で使用される場合、用語「膜ジペプチダーゼイン
ヒビター」は、「MDPインヒビター」と同義語であり、そして膜ジペプチダー
ゼの酵素活性を選択的に減少させる有機分子を意味する。一般的に、MDPイン
ヒビターは、MDPの活性部位に結合する分子である。MDPインヒビターは、
薬物;ペプチド;修飾ペプチドもしくはペプチド模倣物;タンパク質またはタン
パク質フラグメント;核酸分子(例えばリボ核酸もしくはデオキシリボ核酸);
オリゴサッカリド;脂質;糖脂質;またはリポタンパク質のような有機分子であ
り得る。本明細書中に開示される例示的なMDPインヒビターは、CGFECV
RQCPERC(配列番号1)およびシラスタチンである。
で使用される場合、インヒビターが、他のプロテアーゼのような関連するが異な
る酵素と比較した場合、MDP酵素に対して選択的な様式でMDP活性を減少さ
せることを意味する。従って、MDPインヒビターは、例えば、亜鉛メタロプロ
テアーゼの非特異的インヒビターとは異なる。従って、MDPインヒビターは、
MDP活性を選択的に減少させ得るが、例えば、ジペプチジルペプチダーゼIV
の活性にはほとんど効果を有さないか、または全く効果を有さない。
は、N−末端アミノ酸がL−立体配置にあり、かつブロックされていないジペプ
チド基質を切断する。C−末端アミノ酸は、L−またはD−立体配置のいずれか
にあり、この酵素は、D−立体配置のC−末端残基を有する基質をより迅速に加
水分解する。MDP活性は、例えば、グリシル−D−フェニルアラニン(Gly
−D−Phe)を基質として使用してアッセイされ得る(Keynanら、前出
、1996;Parsonsら、前出、1991)。MDP酵素活性のための便
利な特異的蛍光測定アッセイは、基質としてGly−D−Pheを使用し、そし
て遊離したD−PheとのD−アミノ酸オキシダーゼの引き続く反応を使用する
(例えば、実施例IVEを参照のこと;また、HeywoodおよびHoope
r、Analyt.Biochem.226:10〜14(1995)を参照の
こと、これは、本明細書中で参考として援用される)。
を示す分子であり得る。例えば、γ−グルタミルトランスペプチダーゼによって
、トリペプチドグルタチオンを切断して、グルタメートおよびシステイニルグリ
シン(Cys−Gly)を形成した後、ジペプチドCys−Glyは、ジペプチ
ドのみを切断するMDPにより認識され、そして切断される。グルタチオンのア
ミノ酸配列は、GFE−1(配列暗号1)のN−末端部分と類似しており、ここ
で最初の2つのアミノ酸は、Cys−Glyである。図7に示すように、GFE
−1(配列番号1)は、用量依存性の様式でGly−D−Phe基質の加水分解
を阻害し、これは、GFEを含むペプチド(例えば、GFE−1(配列番号1)
)が、MDPインヒビターであり得ることを示す。これらの結果はさらに、MD
Pインヒビターは、天然に存在するMDP基質に構造的に類似し得ることを示す
。
ビターは、本明細書中上記にMDP−結合ホーミング分子(例えば、構造1、構
造2、構造3、または構造4を有するMDP−結合分子)であり得る。
して、約10-4M〜約10-12MのKiを有し得る。例えば、配列X1−G−F−
E−X2(配列暗号17)を含むMDPインヒビター(ここで、X1およびX2の 各々は、1〜10の独立して選択されるアミノ酸である)は、例えば、膜ジペプ
チダーゼに対して、約2×10-5M〜10-7M、例えば、約10-6〜10-7Mの
Kiを有し得る。
0nM以下のKiを示し得る。肺転移を減少するかまたは妨害する際に有用なM
DPインヒビターはまた、例えば、MDPに対して100nM以下のKi、また
は1nM以下のKiを示し得る。例えば、構造3または構造4を有するMDPイ
ンヒビターは、例えば、約0.5nM〜10nMのKiを有する強固に結合する
インヒビターであり得る。従って、構造3または構造4を有するMDPインヒビ
ターは、癌を有する被験体にMDPインヒビターを投与することによって肺転移
を減少するかまたは妨害するための本発明の方法において特に有用であり得る。
でR2およびR3は、それぞれ3〜10および1〜15の炭素原子の範囲の炭化水
素ラジカルである;これらのR2またはR3炭化水素鎖のいずれの1つにおいても
、1〜6の水素が、ハロゲンによって置換され得るか、または非末端メチレンが
、酸素もしくはイオウで置換され得、これらには後者の酸化型が含まれる;さら
に、R3における末端水素はまた、ヒドロキシルまたはチオールによって置換さ れ得、これは、アシル化され得るか、またはカルバモイル化され得る;あるいは
、水素は、アミノで置換され得、これは、アシルアミノ、ウレイド、アミジノ、
グアニジノ(quanidino)、またはアルキル、あるいは置換されたアミ
ノ基(4級窒素基を含む)において誘導体化され得;あるいはこれらはカルボキ
シル基、ホスホン酸基、またはスルホン酸基のような酸性基、またはそのエステ
ルもしくはそのアミド、またはシアノ;あるいはその組み合わせ(例えば、末端
アミノ基)によって置換され得;そしてR1は、水素または低級アルキル(C1-6 )またはジアルキルアミノアルキル、あるいは薬学的に受容可能なカチオンであ
る。肺転移を減少するかまたは妨害するためのこのようなMDPインヒビターは
、例えば、7−(L−2−アミノ−2−カルボキシエチルチオ)−2−(2,2
−ジメチルシクロプロパンカルボキサミド)−2−ヘプテン酸(シラスタチンと
してもまた公知)であり得る。
アルキルまたはシクロアルキルである。
、そしてR3が、n−アルキル(1−9炭素)または4級の窒素、アミン誘導体 またはアミノ酸誘導基である末端置換基を有するn−アルキル(1−9炭素)で
ある構造1を有する化合物であり得る。例えば、MDPインヒビターは、R2が 2,2−ジメチルシクロプロピルまたは2,2−ジクロロシクロプロピルであり
、そしてR3は、末端置換基を有さないかまたはトリメチルアンモニウム、アミ ジノ、グアニジノもしくは2−アミノ−2−カルボエチルチオである末端置換基
を有する3〜7の炭素原子の炭化水素鎖である構造1を有する化合物であり得る
。
以下が挙げられる:Z−2−(2,2−ジメチルシクロプロパンカルボキサミド
)−8−トリメチル水酸化アンモニウム−2−オクテン酸内部塩;Z−2−(2
,2−ジクロロシクロプロパンカルボキサミド)−8−トリメチル水酸化アンモ
ニウム−2−オクテン酸内部塩;Z−2−(2,2−ジメチルシクロプロパンカ
ルボキサミド)−8−グアニジノ−2−オクテン酸;Z−2−(2,2−ジメチ
ルシクロプロパンカルボキサミド)−8−グアニジノ−2−オクテン酸;Z−2
−(2,2−ジメチルシクロプロパンカルボキサミド)−8−ウレイド−2−オ
クテン酸;Z−8−(1−2−アミノ−2−カルボキシエチルチオ)−2−(2
,2−ジメチルシクロプロパンカルボキサミド)−2−オクテン酸;Z−2−(
2,2−ジメチルシクロプロパンカルボキサミド)−2−オクテン酸(ラセミ形
態および右旋性形態);Z−2−(2,2−ジクロロシクロプロパンカルボキサ
ミド)−2−オクテン酸;7−(L−2−アミノ−2−カルボキシエチルチオ)
−2−(2,2−ジメチルシクロプロパンカルボキサミド)−2−ヘプテン酸;
および6−(L−2−アミノ−2−カルボキシエチルチオ)−2−(2,2−ジ
メチルシクロプロパンカルボキシアミド)−2−ヘキセン酸。
有する被験体において肺転移を減少するかまたは予防する方法を提供する。本発
明に役立つMDPの負の調節薬剤は、例えば、可溶性MDPポリペプチドまたは
MDPと選択的に反応する抗体であり得る。
することによって被験体内の肺内皮への細胞ホーミングを減少するかまたは予防
する方法である。肺内皮への細胞ホーミングを減少するか予防するのに有用なM
DPの負の調節薬剤は、例えば、可溶性MDPポリペプチドか、またはMDPと
選択的に反応する抗体であり得る。
たは間接的にMDPの発現または活性を選択的に減少する有機分子を意味する。
例えば、このようなMDPの負の調節薬剤は以下であり得る:薬物;リボ核酸分
子およびデオキシリボ核酸分子を含む核酸分子;ペプチド;改変体または改変化
ペプチドもしくはペプチド模倣物;タンパク質またはそれらのフラグメント;抗
体またはそれらのフラグメント;オリゴ糖類;脂質;糖脂質;またはリポタンパ
ク質。
種々の機構によって作用し得ることを当業者は理解する。MDPの負の調節薬剤
は、例えば、肺内皮において発現された機能的MDPの量を減少するように作用
する有機分子であり得る。このような薬剤は、MDPの転写または翻訳を選択的
に減少し得て、そして、例えば、アンチセンスオリゴヌクレオチド、MDPの発
現を負に調節する転写因子、またはこのような転写因子をコードする核酸であり
得る。
競合し、転移細胞もしくは他の細胞が肺内皮におけるMDPへ選択的にホーミン
グすることを減少するかまたは予防するMDPのフラグメントであり得る。可溶
性の細胞外で発現される形態のMDP、またはMDPの他の優性な負のフラグメ
ントは、本発明において有用なMDPの負の調節薬剤であり得る。MDP調節薬
剤はまた、MDP模倣物であり得る。MDP模倣物は、MDPまたはその下位区
分(subpart)と三次構造的相同性を共有するタンパク質または他の有機
分子であり、そしてMDP模倣物は、発現される場合、転移細胞またはリンパ球
のような他のホーミング細胞へ結合するために、内因性MDPと競合する。MD
P模倣物は、転移細胞と接触するMDPの領域に構造的に共通点があり得;MD
P模倣物は、例えば、MDPの活性部位に構造的に共通点があり得る。
る抗体である。本明細書中で使用される場合、「MDPと選択的に反応する」抗
体とは、別の亜鉛金属プロテアーゼのような無関係のポリペプチドに対してより
も、膜ジペプチダーゼに対して実質的により高い親和性で結合する。用語「抗体
」は、その最も広範な意味では、ポリクローナル抗体およびモノクローナル抗体
、ならびに少なくとも約1×105M-1の膜ジペプチダーゼに対する選択的親和 性を保持する抗体のポリペプチドフラグメントを含むように本明細書中で使用さ
れる。Fab、F(ab’)2およびFvフラグメントのような抗体フラグメン トは、膜ジペプチダーゼと選択的に反応し得、それ故に、本明細書中で定義され
る場合、用語抗体の意味の範囲内に含まれる。用語抗体は、本明細書中で使用さ
れる場合、膜ジペプチダーゼと選択的に反応する天然に存在する抗体、ならびに
キメラ抗体およびヒト化抗体のような天然に存在しない抗体ならびにフラグメン
トを含む。
供給源から調製され得るかまたは組換え的に産生され得る膜ジペプチダーゼある
いはそのフラグメント(例えば合成ペプチド)は、免疫原として用いられ得る。
非免疫原性フラグメントまたは合成ペプチドは、ハプテンをウシ血清アルブミン
(BSA)またはキーホールリンペットヘモシアニン(KLH)のようなキャリ
ア分子と結合することによって、免疫原性にされ得る。さらに、種々の他のキャ
リア分子およびキャリア分子とハプテンを結合する方法は、例えば、本明細書中
で参考として援用されるHarlowおよびLane,Antibodies:
A Laboratory Manual(Cold Spring Harb
or Laboratory Press,1988)に記載されるように当該
分野において周知である。キメラ抗体およびヒト化抗体のような天然に存在しな
い抗体を含む抗体はまた、固相ペプチド合成を用いて構築され得るか、組換え的
に生成され得るか、または例えば、本明細書中で参考として援用されるBorr
ebaeck(編)、Antibody Engineering(第2版)N
ew York:Oxford University Press(1995
)によって記載されるような可変性の重鎖および可変性の軽鎖からなるコンビナ
トリアルライブラリーをスクリーニングすることによって得られ得る。
である。本明細書中で使用される場合、用語「可溶性ポリペプチド」とは、膜に
結合しないポリペプチドを意味する。本発明において有用な可溶性MDPポリペ
プチドは分泌され、したがって細胞外で発現される。
の付加のために必要とされる1つ以上のC末端残基を欠失する短縮型または変異
型MDPポリペプチドであり得る(図9を参照のこと)。特定の短縮型または変
異型MDP誘導体は可溶性であるかどうか決定するために、その誘導体は、例え
ば、COS細胞において発現され得、そしてトランスフェクトした細胞および上
清はその後、MDP活性についてアッセイされ、MDPが膜に結合されるか、ま
たは可溶性であるかを決定され得る。
;およびこの分子の存在下でMDP活性を、コントロール値と比較して決定する
工程によって、肺転移を減少するかまたは予防する分子を同定する方法を提供す
る。ここで、この分子の存在下で減少したMDP活性は、この分子を肺転移を減
少するかまたは予防する分子と同定する。膜ジペプチダーゼは、例えば、実質的
に精製され得る。MDP活性が、例えば、Gly−D−PheからのD−Phe
の放出によって決定され得る。
、膜ジペプチダーゼ(MDP)を1つ以上の分子と接触する工程;この分子の存
在下でのMDP活性を、コントロール値と比較して決定する工程;この分子を、
癌を有する被験体に投与する工程;およびこの被験体における肺転移を、転移の
コントロールレベルと比較してアッセイする工程によって同定され得る。ここで
この分子の存在下で減少したMDP活性は、この分子を肺転移を減少するかまた
は予防する分子と同定する。
うには意図されない。
ニングを使用してライブラリーをスクリーニングし、選択された器官または組織
へホーミングするペプチドを発現するファージを同定する方法を示す。
;またKoivunenら、前出、1994bを参照のこと)によって記載され
るように融合5ベクターを使用して構築した。CX6C(配列番号26)、CX7 C(配列番号24)、CX10C(配列番号30)、およびCX3CX3CX3C( 配列番号25)、X2CX4CX(配列番号23)、およびX7(配列番号29) と命名したペプチドをコードするライブラリーを調製した。ここで「C」はシス
テインを示し、そして「XN」は別々に選択したアミノ酸の所定の数を示す。こ れらのライブラリーは、少なくとも2つのシステイン残基がペプチド内に存在す
る場合、環状ペプチドを表し得る。
コードされ、そして「XN」がNNKによってコードされるように(ここで、「 N」はA、C、G,およびTの等モル混合物であり、そしてここで「K」はGお
よびTの等モル混合物である)構築したオリゴヌクレオチドを使用して作製した
。従って、CX6C(配列番号26)によって表されるペプチドを、配列TGT (NNK)6TGT(配列番号31)を有するオリゴヌクレオチドによって表し 得る。オリゴヌクレオチドを3サイクルのPCR増幅によって2本鎖にし、精製
し、そして、発現に際して、ペプチドが遺伝子IIIタンパク質のN末端に融合
タンパク質として存在するように融合5ベクター中に遺伝子IIIタンパク質を
コードする核酸に連結した。
クトした。細菌を20μg/mlテトラサイクリンの存在下で24時間培養し、
次いでファージをポリエチレングリコールを使用して2回沈澱させることによっ
て上清から回収した。各ライブラリーは、約1012形質導入単位/ml(TU;
個々の組換えファージ)を含んだ。
、200μl DMEMで希釈し、そして麻酔したBALB/cマウス(2ヶ月
齢;Harlan Sprague Dawley;San Diego CA
)の尾静脈に注射した;AVERTIN (0.017ml/g)を麻酔薬とし
て使用した(PasqualiniおよびRuoslahti、前出、1996
)。1〜4分後、マウスを液体窒素中で急速凍結した。あるいはファージの循環
の約5分後、このマウスを5〜10mlのDMEM(SIGMA;St.Lou
is MO)で心臓を通して灌流した。ファージを回収するために、灌流したマ
ウスからの器官、または急速凍結したマウスから部分的に解凍した器官を、回収
しそして重量を測定し、次いで1ml DMEM−PI(プロテアーゼインヒビ
ター(PI);フェニルメチルスルホニルフルオリド(PMSF;1mM)、ア
プロチニン(20μg/ml)、ロイペプチン(1μg/ml)を含むDMEM
)中でホモジナイズした。
Iで3回洗浄し、次いで1ml K91−kan細菌とともに1時間直接的にイ
ンキュベートした。0.2μg/mlテトラサイクリンを含む10mlのNZY
培地(NZY/tet)を、細菌培養物に添加し、混合物を37℃振盪機中で1
時間インキュベートし、次いで200μlアリコートを、40μg/mlテトラ
サイクリンを含む寒天プレート(tet/寒天)にプレートした。
毛による汚染を回避するために用いた。このマウスに、上に記載されるようにフ
ァージを静脈注射し、心臓を通した灌流後、皮膚を大きな切片で切り出し、そし
て皮下組織を上に向けて氷冷プレート上に置いた。この皮膚をメスでかき出し、
大部分の皮下組織を除去した。次いで皮膚を、以下に記載されるようにファージ
を回収するためにプロセス化した。
ino ラットを、マウスよりも大きな組織サンプルを提供するために用いた。
このラットを、フェノバルビタール(50mg/kg体重)で麻酔し、そして深
い麻酔下の間に、ラットの腹腔を開腹し、そして1010TUのファージライブラ
リーを横隔膜を通じて心臓の左心室へ注射した。ファージの循環の2〜5分後、
目をとり出し、次いで70%EtOHで一回およびPBSで一回洗浄した。角膜
および水晶体と共に前眼房をとり出し、そして網膜を残りの後眼房から剥がした
。組織を秤量し、プロテアーゼインヒビター(1mMのPMSF、20μg/m
lのアプロチニンおよび1μg/mlのロイペプチン;全てSIGMA;St.
Louis MOから)を含む1mlの氷冷DMEM中でシリンジバルブ(bu
lb)を用いてホモジナイズした。組織を1mlのDMEMで3回洗浄し、そし
てファージを以下に記載されるように回収した。
細菌コロニーを、5mlのNZY/tet中にて16時間増殖した。いくつかの
実験において、ファージを含む約1000の個々の細菌を精選し、そしてファー
ジを2mlのNZY/tet中で増幅するか、またはファージを含むプレート全
体をかき出し、プールし、大量に増殖し、そして注射のためにプロセシングした
。ファージを別々に培養した場合、この培養物をプールし、そしてファージを、
2回目のインビボパニングについて上に記載されるように、マウスまたはラット
へ注射した。いくつかの実験において、3回目または4回目のパニングを行った
。ファージDNAを、得られた個々の細菌コロニーから精製し、そして選択され
たファージによって発現されたペプチドをコードするDNA配列を決定した(K
oivunenら、前出、1994bを参照のこと)。
れた器官または組織(RESの成分を含む器官を含む)に選択的にホーミングす
ることを実証する。
つのペプチドを同定した。ペプチド配列CGFECVRQCPERC(配列番号
1;GFE−1)およびCGFELETC(配列番号2;GFE−2)は、肺に
繰り返し出現し、そしてCX6C(配列番号26)ライブラリー由来の2つのペ プチド配列CTLRDRNC(配列番号15)およびCIGEVEVC(配列番
号16)もまた、肺にホーミングすることが見出された(以下の表2を参照のこ
と)。
ドをディスプレイするファージを個々に増幅し、同じ投入力価に希釈し、そして
マウスに投与した。投与後、コントロールの腎臓器官および脳器官を取り出し、
そして肺、腎臓および脳におけるファージのTU数を決定した。図2に示された
結果は、ペプチド配列CGFECVRQCPERC(配列番号1;GFE−1)
を有する10×および35×を超えるファージが、それぞれ、腎臓および脳より
、肺に結合したことを示す。図2はまた、CGFELETC(配列番号2;GF
E−2)が、12×および20×より高いレベルで、それぞれ、腎臓および脳よ
り、肺において見出されたことを示す。肺ホーミングペプチド、CGFECVR
QCPERC(配列番号1;GFE−1)、CGFELETC(配列番号2;G
FE−2)、CTLRDRNC(配列番号15)およびCIGEVEVC(配列
番号16)は、非選択ファージに対して、肺において、それぞれ35×、9×、
6×、および5×に富化される(図2を参照のこと)。従って、コントロールの
脳および腎臓と比較して、そして非選択ファージと比較して、肺に結合するファ
ージの実質的な富化が観察された。
合実験によって決定した。GFE−1(配列番号1)を同時投与したGST−G
FE−1(配列番号1)融合ペプチドは、肺にホーミングするGFE−1(配列
番号1)を阻害した一方で、GSTは、ホーミングに対する効果を有さなかった
(図3A)。さらに、GST−GFE−1(配列番号1)のホーミングに対する
阻害効果は、用量依存性であり;500μgのGST−GFE−1(配列番号1
)融合タンパク質を注射した場合、70%のホーミング阻害が生じた(図3B)
。GST−GFE−2(配列番号2)のGFE−2(配列番号2)との同時注射
は、より少ない程度にホーミングを阻害し;500μgのGST−GFE−2(
配列番号2)融合タンパク質を注射した場合、30%のホーミング阻害が生じた
(図3B)。興味深いことに、GST−GFE−1(配列番号1)融合物は、肺
にホーミングするGFE−2(配列番号2)の阻害においてより有効であった;
500μgのGST−GFE−1(配列番号1)融合タンパク質を注射した場合
、60%のGFE−2(配列番号2)ホーミング阻害が生じた(図3B)。しか
し、GST−GFE−2(配列番号2)を同時注射した場合、GFE−1(配列
番号1)ホーミングの阻害効果は全く観察されなかった。このことは、GFE−
2(配列番号2)より、共有標的分子に対してより高い親和性を有するGFE−
1(配列番号1)によって説明され得る。
めに決定した(表2を参照のこと)。GFEモチーフを含むペプチドが優勢であ
った(表1を参照のこと;配列番号1および2)。肺に1回を超えて存在した他
のペプチドを、表2(以下)中でアスタリスクをつけて示し、そして残りのペプ
チドは、各々1回同定された。
るペプチドをディスプレイするいくつかの独立したファージの選択的な結合を示
し、そして例えば、ファージ増幅に起因する人為的結果ではないことを示す。さ
らに、いくつかの場合、同じアミノ酸配列を有するペプチドを発現するファージ
は、異なる配列を有するオリゴヌクレオチドによってコードされ、従って、肺に
特定のファージがホーミングすることが、このファージで発現された特定のペプ
チドに起因することを確認した。
するファージを同定するために、インビボパニングを使用して、ファージディス
プレイライブラリーをスクリーニングし得ることを実証する。
ALCREACGEGC(配列番号3)(これは、皮膚に繰り返し出現した)を
同定した(表1)。配列CVALCREACGEGC(配列番号3)の皮膚ホー
ミングの特異性を決定するために、ペプチドをディスプレイするファージを個々
に増幅し、同じ投入力価に希釈し、そしてマウスに投与した。投与後、コントロ
ールの腎臓器官および脳器官を取り出し、そして皮膚、腎臓および脳におけるフ
ァージのTU数を決定した。
レイする7×を超えるファージが、腎臓および脳より、皮膚に結合したことを示
す(図2;表1を参照のこと)。配列CVALCREACGEGC(配列番号3
)は、非選択ファージに対して、皮膚において、7×に富化された(図2)。従
って、コントロールの脳および腎臓と比較して、そして非選択ファージと比較し
て、皮膚に結合するファージの実質的な富化が観察された。
ージディスプレイライブラリーをスクリーニングすることによって得た;アミノ
酸配列を、以下の表5に示すように、挿入のために決定した。スクリーニングの
間に1回を超えて同定されたペプチドを、アスタリスクをつけて示す。例えば、
頭皮にホーミングした、回収したCX3CX3CX3C(配列番号25)ファージ の14%は、配列CVDVCCDGCPVCC(配列番号437)を有した。配
列RVPLSGDVEH(配列番号438)、LRVMSFTSGQ(配列番号
439)、またはRFSVGSLFGS(配列番号440)を有するファージは
、各々、頭皮にホーミングする、回収したCX10C(配列番号30)ファージの
14%を構成した。尾部皮膚にホーミングすることに対するスクリーニングは、
回収したCX3CX3CX3C(配列番号25)ファージの12%が、配列CGA TCEMQCPSGC(配列番号441)を有したことを示した。
競合実験によって決定した。図3Bは、CVALCREACGEGC(配列番号
3)を同時投与したGST−CVALCREACGEGC(配列番号3)融合ペ
プチドが、皮膚へのホーミングを阻害した一方で、GSTは、ホーミングに対す
る効果を全く有さなかったことを示す。500μgのGST−CVALCREA
CGEGC(配列番号3)融合タンパク質を注射した場合、ホーミングに対する
GST−GFE−1の阻害効果は、約55%であった(図3)。
であるペプチドを発現するファージを同定するために、インビボパニングを使用
して、ファージディスプレイライブラリーをスクリーニングし得ることを実証す
る。
チドを同定した(表3)。特に、ペプチド配列SWCEPGWCR(配列番号4
)は、膵臓に繰り返し出現した。SWCEPGWCR(配列番号4)の特異性を
決定するために、この配列をディスプレイするファージを、個々に増幅し、同じ
投入力価に希釈し、そしてマウスに投与した。投与後、コントロールの脳器官を
取り出し、そして各膵臓におけるファージのTU数を決定した。図2に示された
結果は、ペプチド配列SWCEPGWCR(配列番号4)をディスプレイする1
0×を超えるファージが、脳より膵臓に結合したことを示し、そしてさらなる実
験は、脳と比較して、膵臓において20×まで富化されたことを示した(表1)
。さらに、SWCEPGWCR(配列番号4)は、非選択ファージと比較した場
合、膵臓への22×のファージの富化を示した(図2を参照のこと)。従って、
コントロール組織(脳)と比較して、そして非選択ファージと比較して、膵臓に
結合するファージの実質的な富化が観察された。
る分子を同定し得ることを実証する。さらに、これらの結果は、インビボパニン
グが、同じペプチドをコードする独立したファージを同定することを示す。
VCC(配列番号5)およびCRDVVSVIC(配列番号6)を網膜において
同定した。組織サンプルのサイズが小さいため、単離したファージを正確に定量
できなかった。従って、これらのペプチドをディスプレイするファージの選択性
を、これらの配列をディスプレイするファージを個々に増幅し、そしてこのファ
ージを、コントロールファージfdAMPLAY88とともに、ラットに投与す
ることにより決定した。このfd−アンピシリンファージは、同じ感染性を有す
るという点で、fd−テトラサイクリン(融合5型(fuse 5−based
))に類似である。
号6)およびfdAMPLAY88ファージをラットに注射した。投与後、網膜
へのホーミングを、網膜から回収したテトラサイクリンプレート上で選択したフ
ァージのTU数、およびアンピシリンプレート上でのfdAMPLAY88のT
U数を比較することによって評価した。
いてCSCFRDVCC(配列番号5)が3×の富化を示し、そしてCRDVV
SVIC(配列番号6)が2×の富化を示したことを示した。従って、コントロ
ールファージと比較して、網膜に結合するファージの実質的な富化が観察された
。
ために決定した(以下の表6)。1回を超えて出現したペプチドを示す。特に、
RDVトリペプチドモチーフは、いくつかの異なる配列状況において存在し、こ
のことは、このペプチドをコードする核酸が、多くの独立したファージに由来す
ることを示した。
るペプチドをディスプレイするいくつかの独立したファージの選択的な結合を示
し、そして例えば、ファージ増幅に起因する人為的結果ではないことを示す。さ
らに、いくつかの場合で、同じアミノ酸配列を有するペプチドを発現するファー
ジは、異なる配列を有するオリゴヌクレオチドによってコードされ、従って、網
膜に特定のファージがホーミングすることが、このファージで発現された特定の
ペプチドに起因することを確認した。
選択された器官または組織(RESの成分を含む器官および組織を含む)にホー
ミングするペプチドを発現するファージ)をスクリーニングするために、一般に
適用可能な方法であることをさらに実証する。データベース検索は、内皮細胞レ
セプターについての公知のリガンドに対する、膵臓、肺、皮膚または網膜にホー
ミングするペプチドの有意な相同性を全く示さなかった。
験を用いて実証する。
ーミングペプチドを発現するファージ(「ペプチドファージ」)をマウスに投与
して5分後に得た組織切片を免疫染色することによって、肺、膵臓および皮膚に
おいて検出した。ペプチド−ファージの投与後、マウスを上記のように取り扱い
、そして種々の器官(肺、膵臓および皮膚を含む)を取り出し、そしてブワン(
Bouin’s)溶液(Sigma)中で固定した。組織切片を調製し、そして
抗M13(ファージ)抗体(Pharmacia Biotech;米国特許第
5,622,699号、前出、1997;PasqualiniおよびRuos
lahti、前出、1996を参照のこと)と反応させた。製造業者の指示に従
って、ペルオキシダーゼ結合体化2次抗体(Sigma)を用いて、結合した抗
M13抗体の可視化を行った。
ァージをマウスに静脈投与し、そして循環させて5分後に肺を単離し、そして上
記のように処理した。肺胞毛細管の免疫組織化学的染色を観察し、そしていずれ
の解剖部分に対する優勢も検出されなかった。しかし、気管壁およびいくつかの
大きな血管の染色では、存在しなかった。非選択ファージを注射したマウスは、
肺染色を示さず、そしてGFE−1(配列番号1)の注射後の膵臓および皮膚に
おいては、染色が観察されなかった。
4)をディスプレイするファージを使用して、膵臓において行った。これらの実
験において、膵臓ならびにコントロール器官および組織の組織学的サンプル(肺
および皮膚を含む)を調製し、そして上記のように、免疫染色によって試験した
。結果は、外分泌膵臓の毛細管およびより大きな血管において染色が検出された
一方で、内分泌膵臓の染色は、(あるとしても)ほとんど検出されないことを示
した。再び、非選択ファージは膵臓を染色せず、SWCEPGWCR(配列番号
4)をディスプレイするファージを注射したマウスの肺および皮膚も染色が全く
観察されなかった。興味深いことに、子宮内の血管のいくらかの染色がSWCE
PGWCR(配列番号4)ペプチドについて観察された。さらに、SWCEPG
WCR(配列番号4)をディスプレイするファージの静脈内注射後に、非選択フ
ァージと比較して、6×高いレベルでファージを子宮から回収した。従って、S
WCEPGWCR(配列番号4)は、膵臓および子宮の両方にホーミングする。
プレイするファージを用いて、皮膚において実験を行った。これらの実験におい
て、皮膚ならびにコントロールの器官および組織(肺および膵臓を含む)由来の
組織学的サンプルを調製し、そして上記のように免疫染色によって試験した。結
果は、皮下組織の血管において染色が示された一方で、真皮の染色は(あったと
しても)ほとんど検出されないことを示した。再び、非選択ファージは、これら
の血管を染色せず、そしてCVALCREACGEGC(配列番号3)をディス
プレイするファージを注射したマウスのコントロールの肺および膵臓において染
色は全く観察されなかった。
こした。この結果は、以前記載されたRESの成分によるファージの捕捉と一致
する。
び皮膚(特に血管系)に選択的にホーミングすることを実証する。さらに、これ
らの結果は、器官および組織は、特定の領域(おそらく、器官または組織内の標
的分子の異なる発現を反映する)内での染色パターンの差異を示し得ることを示
す。免疫組織化学的分析は、肺、膵臓および皮膚のホーミングペプチドを発現す
るファージの所在および分布を同定するための簡便なアッセイを提供する。
ジペプチダーゼである) 本実施例は、GFE−1(配列番号1)のようなペプチドを含む「GFE」に
ついてのレセプターが、膜ジペプチダーゼであることを実証する。本実施例は、
さらにGFE−1(配列番号1)が結合し、そして膜ジペプチダーゼの活性を阻
害することを実証する。
ージは、インビボで注射した場合、マウスの肺血管系に結合する。肺始原細胞に
対するファージ結合アッセイを行ない、インビボで、肺組織に結合するCGFE
CVRQCPERC(配列番号1;GFE−1)ファージの特異性が、インビト
ロにおいて再構成され得るかどうかを決定した。
/cマウス(Harlan Sprague Dawley)を、Gardne
rら、Lab.Animal Sci.45:199−204(1995)(こ
れは、本明細書中に参考として援用される)に記載されるように、0.017m
l/gのアベルチンを用いて麻酔した。深い麻酔の下で、マウスは、心臓を通し
て10mlのダルベッコ改変イーグル培地(DMEM;Irvine Scie
ntific;Santa Ana、CA)で灌流した。次いで、肺、腎臓およ
び脳を採取し、細かく刻み、0.5%BSA(Intergen;Purcha
se、NY)および0.5μg/mlのコラゲナーゼV(SIGMA)を含む2
mlのDMEM中に置き、そして37℃で25分間インキュベートした。コラゲ
ナーゼでの処理に続いて、組織を70μMの細孔の細胞濾過機(Becton
Dickinson;Franklin Lake、NJ)を強制的に通した。
濾過した細胞を、10%の血清を補給した10mlのDMEMを用いて1回洗浄
した。結合アッセイに使用したファージ粒子を、増幅および精製し、そしてファ
ージディスプレイされたインサートを、SmithおよびScott、前出、1
993に記載されるように配列決定した。試験されるべき異なるファージの等し
い投入量を保証するために、ファージを、数回K91Kan細菌を使用して力価
決定した(SmithおよびScott、前出、1993)。
を補給した1mlのDMEMで、室温にて4回、各回につき5〜10分間洗浄し
た。細胞を遠心分離し、そして細胞ペレットを100μlのDMEMに再懸濁し
、そして新しいチューブに移した。細胞に結合したファージを、1mlのK91
Kan細菌培養液(SmithおよびScott、前出、1993)の添加によ
り採取し、続いて30分間室温でインキュベートした。次いで、細菌を、0.2
μg/mlのテトラサイクリンを補給した10mlのLB培養培地で希釈し、そ
してさらに30分間室温でインキュベートした。細菌培養の段階希釈物を40μ
g/mlのテトラサイクリンを含むLBプレートにプレートした。プレートを、
一晩37℃でインキュベートした後、コロニーを計数した(形質導入単位、TU
)。
始原細胞が、インサートを欠くfd−tetファージよりも約60倍多くのCG
FECVRQCPERC(配列番号1;GFE−1)ファージを結合することを
示した。腎臓細胞へのCGFECVRQCPERC(配列番号1;GFE−1)
ファージの結合もまた、fd−tet結合よりも高かった(t検定、p<0.0
2)が、この結合は、肺細胞に対するGFE−1(配列番号1)の結合よりもず
っと低かった。インビボ研究において、GFE−1(配列番号1)のファージを
静脈内に注射した場合、腎臓に対する特異的なファージのホーミングは検出され
なかった。GFE−1(配列番号1)ファージは、インビトロにおいて始原脳細
胞(primary brain cell)に対して特異的な結合を示さなか
った。
FE−1(配列番号1)ペプチドの存在下でおよそ70%阻害されたが、一方同
じ濃度のコントロールペプチドであるGRGESP(配列番号442)は、効果
を有さなかった。インサートを欠くfd−tetファージの非特異的結合は、G
FE−1(配列番号1)ペプチドまたはコントロールペプチドの存在により影響
されなかった。これらの結果は、肺内皮に対するGFE−1(配列番号1)ペプ
チド配列の選択的なインビボでの結合を全肺始原細胞に対するインビトロアッセ
イにおいて再構成し得ること、および全肺細胞抽出物が単離のために十分な量の
GFE−1レセプターを含むことを実証する。
結合する) GFE−1(配列番号1)に結合する細胞表面分子のみを検出するために、マ
ウスの肺内皮表面タンパク質を、インビボでビオチン化し、そして全肺抽出物を
調製した。標識した抽出物を、最初にGFE−1(配列番号1)ペプチドに対す
るアフィニティーカラムで分画し;続いて、カラムを洗浄し、そして結合タンパ
ク質を、GFE−1(配列番号1)ペプチド溶液で溶出した。
uenteら、Am.J.Physiol.272:L461−L470(19
97)(これは、本明細書中に参考として援用される)に記載されるように、い
くつかの変更を伴って行なった。簡潔には、Balb/cマウスを、アベルチン
で麻酔し、そして0.5mg/mlのスルホ−NHS−LC−ビオチン(Pir
ce;Rockford、IL)を含む約15mlのPBSで10〜15分間心
臓を通してゆっくりと灌流した。次いで、よく灌流した肺または脳のような制御
組織を、採取し、そして氷上で20分間インキュベートした。次いで、この組織
をさらに以下に記載されるように抽出物を調製するためにホモジナイズした。
で、1mMのフェニルメチルスルホニルフルオライド(PMSF)、20μg/
mlのアプロチニンおよび1μg/mlのロイペプチンを含む100mMのN−
オクチル−β−D−グルコピラノシド(Calbiochem;La Joll
a、CA)を含む最小溶容量(2.5ml/gの組織)の冷PBS(PBS/オ
クチルグルコシド)中で、Brinkman Homogeizer(Brin
kman;Wesbury、NY)を用いてホモジナイズした。ホモジナイズし
た組織を、氷上で2時間インキュベートし、次いで、細胞の細片を取り除くため
に12,000×gで30分間遠心分離した。プールした上清を、アフィニティ
ークロマトグラフィーの前にあらゆる細片を取り除いた。
チドクロマトグラフィーによるインテグリンの単離のためにPytelaらによ
り確立された一般的な原則に従って、行なった(Pytelaら、Cell 4
0:191−198(1985);Pytelaら、Methods Enzy
m.144:475−489(1987)、これらの各々は、本明細書中に参考
として援用される)。全ての工程を、4℃で行なった。簡潔には、GFE−1(
配列番号1)またはコントロールペプチド(AnaSpec;San Jose
、CA)を、製造者の手引書(Pharmacia Biotech;Upps
ala、Sweden)に従って、CNBr活性化Sepharose 4Bに
結合させた。このマトリックスは、およそ2mg/mlのペプチドを含有した。
2匹のマウス肺からのビオチン標識化抽出物を、カラム緩衝液(50mMのオク
チルグリコシドおよび1mMPMSFを含むPBS)中で平衡化した500μl
のアフィニティーマトリックスに添加した。この抽出物をカラムに添加し、そし
て素通りした画分を、90分間の期間にわたって再添加した。次いで、このカラ
ムを20容量のカラム緩衝液で洗浄した。合成GFE−1(配列番号1)ペプチ
ドでの溶出を、1mg/mlのGFE−1ペプチド(配列番号1)を補充した2
倍量のカラム緩衝液を用いて、1時間以上カラムをゆっくりと洗浄することによ
り行なった。このカラムに結合した残りのタンパク質を、8Mの尿素で溶出した
。
n;Beverly、MA)を用いて5倍に濃縮した。次いで、各溶出物のアリ
コートを、成形済みのポリアクリルアミド4〜12%ゲル(Novex;San
Diego、CA)を用いてSDS−PAGEにより分離した。ビオチン標識
化抽出物を用いて行なう実験のために、このタンパク質をPVDF膜(Mill
ipore;Bedford、MA)に転写し、ストレプトアビジン−HRP(
Pierce;Rockford、IL)を用いてブロットし、そしてECL化
学発光システム(NEN;Boston、MA)を用いて発色させた。
GFE−1(配列番号1)により選択的に溶出された。溶出の前に、カラムから
の洗浄物は、検出可能なビオチン化タンパク質を示さなかった;続いて、8Mの
尿素の添加が、カラム中に非特異的に保持されている多くのビオチン化タンパク
質を溶出した。コントロールペプチド(GRGESP;配列番号442)カラム
に対して同じ手順で行なった後では、55kDaの範囲のタンパク質は、検出さ
れなかった(図4;右のパネル)。さらなるコントロールとして、インビボビオ
チン化脳細胞抽出物を、同じ条件下で、GFE−1(配列番号1)ペプチドカラ
ムを通して分画した;GFE−1(配列番号1)ペプチドカラムに特異的に結合
する、脳抽出物からのビオチン化タンパク質はなかった(データは示さず)。
表面タンパク質に特異的に結合することを示す。非還元条件下では、55kDa
のタンパク質を110kDaのバンドとして移動した(データ示さず)。従って
、これらの結果は、GFEレセプターが、ジスフィルド結合ホモ二量体であるこ
とをさらに示す。
ゼである) GFE−1(配列番号1)ファージは、循環中に注射した場合、ラットの肺血
管を選択的に標的し得る。マウス組織から入手し得るよりも大量の55kDaタ
ンパク質を精製するために、非ビオチン化抽出物を100個の凍結ラット肺から
調製した(Pel−Freez Biologicals;Rogers、AR
)。大規模な抽出物を、PBS/オクチルグリコシドの最小量を有するペレット
の第2の抽出物の添加と共に、基本的には上記のように調製した。
うにGFE−1(配列番号1)ペプチドアフィニティーカラム上で分画した。ク
マシーブルー染色により検出可能な55kDaのタンパク質を、配列番号1のG
FE−1ペプチドによりカラムから抽出した(データは示さず)。マウスの肺か
ら単離された55kDaの表面タンパク質と共に移動したこのタンパク質を、ト
リプシン消化に供し、そしてFinnigan LCQ 四重極(quadru
pole)イオントラップ質量分析計上でマイクロキャピラリー逆相HPLC直
列質量分析(μLC/MS/MS)による、Harvard Universi
ty Microchemistry Facility(Boston、MA
)での質量分析により、配列決定した。
ELLR(配列番号444)およびTTPVIDGHNDLPWQMLTLFN
NQLR(配列番号445)は、ミクロソームジペプチダーゼ、デヒドロペプチ
ダーゼ−1またはMDPとしてもまた公知のラット膜ジペプチダーゼ(EC 3
.4.13.19)と完全な同一性を示した。いくつかの他のペプチド配列は、
サンプル中でラットIgGの存在を示した。IgGでのサンプルの汚染は、この
分子量範囲で予期され、非灌流肺からの抽出物中に大量のIgGを生じた。
パク質であることを確認するために、55kDaタンパク質を膜ジペプチダーゼ
活性についてアッセイした。アフィニティークロマトグラフィー洗浄画分および
GFE−1(配列番号1)ペプチド溶出物(図4)からのサンプルを、特定のM
DP基質Gly−D−Pheの存在下でインキュベートし、そしてD−Pheを
、HeywoodおよびHooper、前出、1995(Keynanら、前出
、1996もまた参照のこと)に記載されるように正確に蛍光的に検出した。簡
潔には、サンプルを、まずMDP基質、Gly−D−Phe(1mM;SIGM
A)とともに37℃で3時間インキュベートした。次いで、放出されたD−Ph
eを、D−アミノ酸オキシダーゼ(I型;SIGMA)およびペルオキシダーゼ
(VI型;SIGMA;HeywoodおよびHooper、前出、1995)
の存在下で、6,6’−ジヒドロキシ−[1,1’−ビフェニル]−3,3’−
二酢酸に変換した。蛍光を、Molecular Devices(Sunny
vale、CA)からのfmax蛍光マイクロプレートリーダーを使用して測定
した。
FE−1ペプチド溶出物からのサンプル中での蛍光化合物へのD−Pheの変換
の時間経過を示す。洗浄画分は、蛍光の基準線レベルのみを示したが、GFE−
1(配列番号1)ペプチド溶出物は、D−Pheの時間依存的変換によって例示
したように高い膜ジペプチダーゼ活性を含んだ(図5参照のこと)。さらに、ラ
ットの肺抽出物から単離したGFE−1(配列番号1)ペプチド溶出物もまた、
強いMDP活性を示した(データは示さず)。MDP活性をまた、全肺抽出物に
おいても検出したが、GFE−1ペプチド(配列番号1)溶出物(200nmo
l D−Phe/min/mg)についての比活性は、ラットの全肺抽出物(0
.34nmol D−Phe/min/mg)についての比活性よりも約600
倍高かった。
、MDPでトランスフェクトした細胞に結合する) 低レベルまたは検出できないレベルのMDP活性を有することが公知の、CO
S−1細胞株を広範に使用して、MDPの構造および機能を研究した(Keyn
anら、前出、1996;Keynanら、Biochem.J.326:47
−51(1997))。COS−1細胞をマウスMDPでトランスフェクトし、
そして以下に記載するように、配列番号1および2への結合をアッセイするため
に使用した。
ーを以下のように調製した。全マウス肺RNAを、Qiagen RNA精製カ
ラム(Qiagen;Santa Clarita、CA)を使用して単離し、
そして逆転写酵素ならびにランダムヘキサマーおよびポリdTオリゴヌクレオチ
ドの混合物(GIBCO/BRL;Grand Island、NY)を用いる
第一鎖cDNA合成のためのテンプレートとして使用した。マウスMDP cD
NA(Pasqualiniら、J.Cell Biol.130:1189−
1196(1995))を、以下のオリゴヌクレオチド対を使用してPCRによ
り、GIBCO/BRLからのTaqポリメラーゼを使用して、cDNAプール
から増幅した:KpnIアダプターを含む、CCGCTGGTACCGCAGA
TCCCTGGGGACCTTG(配列番号446)XbaIアダプターを含む
、TCTTTCTAGAGCTCAGAGAGCACTGGAGGAG(配列番
号447)。増幅した1.3kbのマウスMDP cDNAを、KpnIおよび
XbaIで消化し、そしてNew England Biolabs(Beve
rly、MA)からのDNA制限酵素およびT4 DNAリガーゼを使用して、
pcDNA3発現ベクター(Invitrogen;Carlsbad、CA)
の同じ部位に挿入した。マウスMDPcDNAの首尾よいクローニングを、DN
A配列決定により確認した。COS−1細胞のトランスフェクションを、Qia
genからのSuperfect Reagentを用いて、製造者により推奨
されるように行なった。
ように決定した。簡潔には、107のCOS−1細胞を、10μgのMDP発現 ベクターか、またはベクターのみのいずれかでトランスフェクトした。48時間
後、細胞をディッシュから穏やかにはがし、1回洗浄し、そして上述のファージ
結合アッセイまたは膜ジペプチダーゼ活性アッセイに供した。ファージ結合アッ
セイのために、ファージインプットの5×106細胞および1010形質導入単位 (TU)を使用した。膜ジペプチダーゼ活性の測定のために、106細胞を、プ ロテアーゼインヒビターを含まない100μlのPBS/オクチルグリコシド中
に溶解した。抽出物の10μlのアリコートを使用して、MDP活性を測定した
。
、偽トランスフェクト細胞よりも少なくとも15倍高いMDP活性を示した。さ
らに、GFE−1(配列番号1)ファージは、MDPでトランスフェクトしたC
OS−1細胞に結合した。図6Bに示すように、GFE−1(配列番号1)ファ
ージは、偽トランスフェクト細胞よりも、MDPトランスフェクト細胞に4倍よ
り多く結合した。GFE−1(配列番号1)ペプチドの構造特性に類似した構造
特性を有するペプチドを提示する、ネガティブコントロールファージである、f
d−tetファージおよび皮膚ホーミングファージ(CVALCREACGEG
C;配列番号3)は、偽トランスフェクト細胞と比較した場合、MDP発現細胞
への特異的な結合を示さなかった。さらに、図6Bは、GFE−2(配列番号2
)ファージもまた、MDPトランスフェクト細胞に結合し;この結合は、上述の
インビボ肺ホーミングデータと同様に、GFE−1(配列番号1)の結合よりも
弱かったことを示す。GFE−1(配列番号1)ファージおよびGFE−2(配
列番号2)ファージの両方のMDPトランスフェクト細胞への結合は、GFE−
1ペプチドにより完全に阻害された(配列番号1;データ示さず)。これらの結
果は、GFE−1(配列番号1)ペプチドおよびGFE−2(配列番号2)ペプ
チドが、同じレセプターに結合することを示す。
(Cys−Gly)を形成するためのγ−グルタミルトランスペプチダーゼによ
るトリペプチドの切断を含む。ジペプチドCys−Glyは、実質的に認識され
、そしてMDPによって切断され、これは、ジペプチドのみを切断する。グルタ
チオンのアミノ酸配列は、GFE−1ペプチドのN末端部分、CGFECVRQ
CPERC(配列番号1)と類似しており、これは、Cys−Glyである最初
の2つのGFE−1の第一のアミノ酸を有する。
害する能力についてアッセイした。D−Pheの蛍光定量的検出を上記のように
実施した。図7は、GFE−1(配列番号1)が用量依存的な様式でGly−D
−Phe基質(0.5mM)の加水分解を阻害したことを示す。コントロールの
環状ペプチド(CARAC;配列番号443)は、この酵素を阻害しなかった。
作用し得ることを示す。
肺転移を阻害し得ることを実証する。
1998)およびPasqualiniら、Nature Med.11:11
97−1203(これらの各々は、参考として本明細書中に援用される)に本質
的に記載されるように、C8161ヒト黒色腫細胞を使用して、マウスにおいて
誘導した。簡潔には、C8161細胞を75%のコンフルエンスまで培養し、次
いで、2.5mM EDTA/PBSで収集する。C8161癌細胞を雌ヌード
BALB/cマウス(2ヶ月齢)の尾静脈中に、動物当たり105細胞の濃度で 注射した。2組の5匹のマウスをこの細胞のみ;250μgのコントロールCA
RACペプチド(配列番号443)を有する細胞、または250μgのGFE−
1ペプチド(配列番号1)を有する細胞で注射した。各注射は、200μlの総
容量であった。
腫瘍細胞の生存度に影響しないことを確認した。GFE−1(配列番号1)ペプ
チドまたはCARAC(配列番号443)ペプチドは、黒色腫細胞に対する毒性
を両方とも示さなかった(データを示さず)。
ように、GFE−1(配列番号1)ペプチドを投与されたマウスの肺重量は、黒
色腫細胞単独(「ビヒクル」)またはコントロールペプチドCARAC(配列番
号443、(「コントロールペプチド」))を有する黒色腫細胞を投与されたマ
ウスにおいて認められる肺重量より有意に少なかった。これらの結果は、GFE
−1が、ヒト癌細胞の肺転移を阻害し得ることを示す。
t.102:430−437(1998)(これは、本明細書中で参考として援
用される)に記載されるように調製した、GFE−1(配列番号1)グルタチオ
ン S−トランスフェラーゼ融合タンパク質を使用して、実施した。GFE−1
(配列番号1)グルタチオン S−トランスフェラーゼ融合タンパク質は、肺重
量の増加を阻害し、この増加は、図8に示したように配列番号1のペプチドで観
察された結果と類似の様式で、C8161ヒト黒色腫細胞の注射から得られる。
Pが肺血管系における腫瘍細胞の転移のためのレセプターとして作用することを
示す。
ミング分子の調製) この実施例は、構造1を有するMDP結合分子の調製のいくつかの方法を実証
する。
アミドを直接縮合することによって作製する。
溶媒(例えば、トルエンまたはメチルイソ吉草酸)中で約14:1の割合の酸対
アミドを混合する工程、および3〜48時間、好ましくは5〜24時間、水の共
沸除去を伴った還流加熱する工程を包含する。通常、冷却された場合、この溶液
は、結晶形態の産物を生じる。所望の場合、この産物を、塩基抽出プロセスを使
用して単離する。この産物を一般に公知の技術を使用して再結晶化する。
ルエンスルホン酸を必要とする。
いてα−アミノ酸、t−ブチルエステルを使用して調製する:
な溶媒中で生じる。次いで、生じたN−アセチル化産物をt−ブチル次亜塩素酸
塩での処理、続いてナトリウムメトキシドの添加によって酸化する。これは、α
,β−不飽和エステルである、2−メトキシ誘導体またはその脱離産物を生じる
。無水塩酸でのさらなる処理は、この2−メトキシ誘導体か、またはこの不飽和
エステルのいずれか(または両方の混合物)を、所望のα,β不飽和遊離酸に変
換する。
作製し得る。この場合、この中間体は、以下の構造を有し:
アンモニアと反応させる;グアニジノ反応をグアニジンで行う;2−アミノ−2
−カルボキシエチルチオを含むチオ誘導体を調製するために、この臭素化合物を
システイン塩酸塩または適切なメルカプタンと反応させる。誘導体化したアミノ
(例えば、ホルムアミジノ、ウレイドおよびアシルアミド(アセトアミド))を
o−ベンジルホルムイミデート塩酸塩、シアン酸カリウムおよび適切なアシル無
水物(無水酢酸)とそれぞれ反応させることによって、アミノ基を有する化合物
から作製する。
で以下:
る;次いで、塩素基を適切なメルカプタンとの反応で置換する。この反応は、キ
ラルアミドの使用を許容し、それによって、官能化された側鎖を調製するので価
値があり。あるいは、メルカプタン縮合後に調製された、ZおよびEアイソマー
の混合物を、約3のpHまで酸を添加し、そして約90℃まで、30分間加熱す
ることによって、Z型に直接異性化する。Z型のみが残存し、そして回収は、単
純かつ複雑でない。
ジメチルシクロプロパンカルボキシアミド)−2−へプテン酸ナトリウムの調製
) (1.エチル−7−クロロ−2−オキソヘプタン酸のグリニャール調製) 等モル量(各8モル)の1−ブロモ−5−クロロペンタンおよびマグネシウム
を25℃でテトラヒドロフラン(THF)(960ml)中で反応させる。この
フラスコをTHF中でマグネシウムと共に装填し、そして臭化ブロモペンタンを
1時間にわたって添加し、次いで2時間熟成した。反応が終了したと判断した後
、この反応溶液を添加する(−15℃で冷却し、1856mlのTHF中で16
モルのジエチルシュウ酸となるまで、10℃で温度を維持しながら)。3N 塩
酸を、25℃未満の温度を保ちながら、添加し、反応をクエンチする。溶媒をス
トリッピングした後、計算された収量は、48.8%のエチル−1−クロロ−6
−オキソペプタン酸であった。
43.6gのエチル−7−クロロ−2−ケトヘプタン酸、9リットルのトルエン
および12gのp−トルエンスルホン酸を22Lのフラスコに装填し、そして攪
拌しながら、加熱して還流する。23時間後、液体クロマトグラフィーは、予期
した産物の割合を示し、そして4Lのトルエンをわずかな減圧下で除去する。こ
のポットを水で装填し、2NのNaOHでpH7に中性化し、そして約5リット
ルの最終ポット容量を残して、減圧蒸留する。これを1760gの50% Na
OH水溶液(水、4リットル)を加え、そして一晩攪拌することによって加水分
解する。このフラスコを4Lの塩化メチレンで装填し、そしてpHをHClを用
いて8.8に調整する。未反応のアミドを結晶化する。有機層を水から分離し、
次いで蒸発させる。粘着性の残査を720gの50% NaOHを含む8Lの水
中で溶解し、そしてこの溶液に1818gのL−システイン塩酸塩、水、2kg
の氷、2484gの50% NaOHおよび1Lの水を装填する。室温で一晩熟
成後、この溶液のpHは、濃縮した塩酸で3.0に調整し、そして生じた粘着性
の懸濁液を95℃に加熱し、透明な溶液を生じる。30分後、1cによって検出
されたEアイソマーはなかった。混合および精製の後、産物は全体で2060g
であり、87%の収量であった。この物質をアセトニトリルから再結晶させる。
1500gの再結晶物質を6Lの水および910mlの3.88N NaOH中
で溶解し、次いで、pH7に中性化し、そして凍結乾燥し、1569g(98.
6%)の標記の化合物を生じる。
特許の引用は、以前に述べられようとなかろうと、本明細書中で参考として援用
される。
改変が本発明の精神から逸脱することなく行われ得ることが理解されるべきであ
る。従って、本発明は、特許請求の範囲によってのみ制限される。
010形質導入単位の注射の5分後に肺から回収したファージを増幅し、そして2
回継続して再注射した。1グラムの肺、腎臓または脳当たりの回収したファージ
の数を、3連のプレーティングからの平均の標準誤差を示すバーとともに、各回
について示す。
D)ホーミングペプチドを提示するファージの選択性を示す。肺(図2A、CG
FECVRQCPERC、配列番号1、「GFE−1」;図2B,CGFELE
TC、配列番号2、「GFE−2」);皮膚(図2C、CVALCREACGE
GC、配列番号3)または膵臓(図2D、SWCEPGWCR、配列番号4)に
ホーミングするペプチドを発現する選択したファージを個々に増幅し、マウスに
注射し、そして回収した(実施例I)。1グラムの肺、皮膚または膵臓あるいは
コントロール腎臓または脳当たりの回収された、選択したペプチドを提示するフ
ァージの量を決定した。肺、皮膚、膵臓、腎臓または脳から回収した非選択(コ
ントロール)ファージの量もまた決定した。バーは、3連のプレーティングから
の平均の標準誤差を示す。
ホーミングにおける、グルタチオンS−トランスフェラーゼ−(GST)−融合
タンパク質の同時投与の効果を示す。 図3Aにおいて、100μgもしくは500μgのGST−CGFECVRQ
CPERC(配列番号1、「GFE−1」)または500μgのGSTを、肺ホ
ーミング配列CGFECVRQCPERC(配列番号1)を提示する個々に増幅
したファージの109形質導入単位で、マウスに同時注射した。循環の5分後に 肺および腎臓からのファージ回収を、3連のプレーティングからの平均の標準誤
差を示すバーとともに、決定した。 図3Bにおいて、肺ホーミングペプチドCGFECVRQCPERC(配列番
号1、「GFE−1」)もしくはCGFELETC(配列番号2、「GFE−2
」)または皮膚ホーミングペプチドCVALCREACGEGC(配列番号3)
のいずれかを提示する個々に増幅したファージの109形質導入単位を、500 μgの同族GST融合ペプチドとともにマウスに同時注射した。コントロールマ
ウス(示さず)に、選択したファージおよび500μgのGSTを注射した。G
STに比較して、同族GST融合ペプチドの存在下で肺または皮膚にホーミング
する選択されたファージの阻害の割合を示す。
ドアフィニティーカラムに特異的に結合することを示す。インビボでビオチン化
した肺抽出物を、CGFECVRQCPERC(配列番号1;GFE−1)ペプ
チドカラムまたはコントロールペプチドカラム(GRGESP;配列番号442
)上に分画し、洗浄し、そしてGFE−1ペプチドで溶出した。洗浄画分(「−
」)、GFE−1ペプチド溶出物、および8M尿素溶出物からのアリコート(3
0μl)を、還元条件下で、SDS−PAGEによって分離した。分子量マーカ
ー(kDa)を、各パネルの右側に示す。
D−Phe)の蛍光検出の経時変化を示す。GFE−1ペプチドアフィニティー
カラムからの洗浄画分(白丸)およびCGFECVRQCPERC(配列番号1
;GFE−1)ペプチド溶出物(黒丸)からのサンプルを、Gly−D−Phe
基質とのMDP活性についてアッセイした。D−Pheの蛍光化合物への時間依
存性変換を示す。
FE−1)またはCGFELETC(配列番号2;GFE−2)のCOS−1細
胞発現膜ジペプチド(MDP)への結合を示す。 図6Aにおいて、COS−1細胞を、MDP発現ベクターまたはベクター単独
でトランスフェクトした。トランスフェクションの2日後、細胞抽出物を調製し
、そしてMDP活性について分析した。 図6Bにおいて、MDP発現ベクターまたはコントロール空ベクターのいずれ
かでトランスフェクトしたCOS−1細胞を、コントロールファージ(fd−t
et)または皮膚ホーミングペプチドCVALCREACGEGC(配列番号3
;「shp−1」)、CGFECVRQCPERC(配列番号1、GFE−1)
ペプチド、もしくはCGFELETC(配列番号2;GFE−2)ペプチドを保
有するファージのいずれかの等量の存在下で結合アッセイに供した。各場合にお
いて、これらの細胞からレスキューしたファージ形質導入単位の総数を示す。エ
ラーバーは、3連のプレーティングからの平均の標準偏差を示す。
るMDP活性の阻害を示す。MDPを発現するCOS−1細胞からの抽出物を、
漸増濃度のCGFECVRQCPERC(配列番号1;GFE−1)(黒丸)ま
たはCARACコントロールペプチド(配列番号443)((白丸)として示す
)の存在下でMDP活性についてアッセイした。
とを示す。肺重量は、105のC8161ヒト黒色腫細胞単独(「ビヒクル」) ;250μgのGFE−1ペプチド配列番号1(「GFE−1ペプチド」)と同
時投与した105のC8161細胞;または250μgのCARACペプチド配 列番号443(「コントロールペプチド」)と同時投与した105のC8161 細胞を注射した5週間後のマウスについて示される。
トを示す。ヒト(「HUM」;配列番号448);ブタ(「PIG」;配列番号
449);ラット(「RAT」;配列番号450);およびマウス(「MOU」
;配列晩胞451)MDPのアミノ酸配列を、ウサギMDP(「RAB」;配列
番号452)の配列とともに整列する。アステリスクは、ヒトMDPにおけるN
結合型グリコシル化部位を示す。囲まれた残基Glu125およびHis219は、活
性に必須である(Adachiら、Biochim.Biophys.Acta
1163:42−48(1993);Keynanら、FEBS Lette
rs 349:50−54(1994))。下線を付した残基は(−1〜−16
)はシグナルペプチドを示す。C末端において囲まれた残基は、成熟タンパク質
においてグリコシル−ホスファチジルイノシトール(GPI)アンカーによって
置換される疎水性シグナルを示す。GPIアンカー付加の部位を、矢印によって
示す。
Claims (123)
- 【請求項1】 前立腺の血管系に選択的にホーミングするペプチド。
- 【請求項2】 SMSIARL(配列番号21)、VSFLEYR(配列番
号22)およびRGRWLAL(配列番号279)からなる群から選択される、
請求項1に記載のペプチド。 - 【請求項3】 部分に連結された請求項1に記載のペプチドを含む、結合体
。 - 【請求項4】 前記部分が、治療的薬剤、検出可能な薬剤およびタグからな
る群から選択される、請求項3に記載の結合体。 - 【請求項5】 前立腺を同定する方法であって、該方法が以下の工程: a)組織または器官を、請求項1に記載のペプチドと接触する工程;および b)該ペプチドの該器官または該組織への結合を検出する工程であって、それ
により、該器官または該組織を前立腺として同定する、工程、 を包含する、方法。 - 【請求項6】 前立腺により発現される標的分子を同定する方法であって、
該方法が、請求項5に記載の方法を包含し、さらに、以下の工程: c)前記前立腺のサンプルを得る工程;および d)前記ペプチドにより結合される該標的分子を同定する工程、 を包含する、方法。 - 【請求項7】 被験体における前立腺病理を処置する方法であって、該方法
が、請求項1に記載のペプチドを該被験体に投与する工程を包含し、ここで、該
ペプチドが前立腺に選択的にホーミングし、それによって、該前立腺病理を処置
する、方法。 - 【請求項8】 以下のアミノ酸配列を有する肺ホーミングペプチドであって
: X1−G−F−E−X2(配列番号17) ここで、X1およびX2の各々は、独立的して選択される1〜10個のアミノ酸
である、肺ホーミングペプチド。 - 【請求項9】 CGFECVRQCPERC(配列番号1)およびCGFE
LETC(配列番号2)からなる群から選択される、請求項8に記載の肺ホーミ
ングペプチド。 - 【請求項10】 CTLRDRNC(配列番号15)およびCIGEVEV
C(配列番号16)からなる群から選択される、肺ホーミングペプチド。 - 【請求項11】 CLAKENVVC(配列番号13)、CVGNLSMC
(配列番号37)、CKGQRDFC(配列番号39)、CNMGLTRC(配
列番号41)、CHEGYLTC(配列番号42)、CLRPYLNC(配列番
号45)、CMELSKQC(配列番号47)、CLFSDENC(配列番号5
2)、CWRGDRKIC(配列番号56)、CMSWDAVSC(配列番号6
4)、CKWSRLHSC(配列番号65)、CTVNEAYKTRMC(配列
番号75)、CRLRSYGTLSLC(配列番号76)、CRPWHNQAH
TEC(配列番号82)、CSEAASRMIGVC(配列番号84)、CWE
EHPSIKWWC(配列番号85)、CGVGCPGLCGGAC(配列番号
104)およびCGGACGGVCTGGC(配列番号114)からなる群から
選択される、肺ホーミングペプチド。 - 【請求項12】 部分に連結された請求項8、請求項9、請求項10または
請求項11に記載の肺ホーミング分子を含む、結合体。 - 【請求項13】 前記部分が、治療的薬剤、検出可能な薬剤およびタグから
なる群から選択される、請求項12に記載の結合体。 - 【請求項14】 肺を同定する方法であって、該方法が以下の工程: a)組織または器官を、請求項8、請求項9、請求項10または請求項11に
記載の肺ホーミングペプチドと接触する工程;および b)該肺ホーミングペプチドの該器官または該組織への結合を検出する工程で
あって、それにより、該器官または該組織を肺として同定する、工程、 を包含する、方法。 - 【請求項15】 肺により発現される標的分子を同定する方法であって、該
方法が、請求項14に記載の方法を包含し、さらに、以下の工程: c)該肺のサンプルを得る工程;および d)前記肺ホーミングペプチドにより結合される該標的分子を同定する工程、 を包含する、方法。 - 【請求項16】 被験体における肺病理を処置する方法であって、該方法が
、請求項8、請求項9、請求項10または請求項11に記載の肺ホーミングペプ
チドを該被験体に投与する工程を包含し、ここで、該肺ホーミングペプチドが肺
に選択的にホーミングし、それによって、該肺病理を処置する、方法。 - 【請求項17】 皮膚の血管系に選択的にホーミングするペプチド。
- 【請求項18】 アミノ酸配列CVALCREACGEGC(配列番号3)
を有する、請求項17に記載のペプチド。 - 【請求項19】 CWNICPGGCRALC(配列番号175)、CKG
TCVLGCSEEC(配列番号177)、CSSGCSKNCLEMC(配列
番号181)、CAVRCDGSCVPEC(配列番号184)およびCGGG
CQWGCAGEC(配列番号191)からなる群から選択される、請求項17
に記載のペプチド。 - 【請求項20】 部分に連結された請求項17に記載のペプチドを含む、結
合体。 - 【請求項21】 前記部分が、治療的薬剤、検出可能な薬剤およびタグから
なる群から選択される、請求項20に記載の結合体。 - 【請求項22】 皮膚を同定する方法であって、該方法が以下の工程: a)組織または器官を、請求項17に記載のペプチドと接触させる工程;およ
び b)該ペプチドの該器官または該組織への結合を検出する工程であって、それ
により、該器官または該組織を皮膚として同定する、工程、 を包含する、方法。 - 【請求項23】 皮膚により発現される標的分子を同定する方法であって、
該方法が、請求項22に記載の方法を包含し、さらに、以下の工程: c)該皮膚のサンプルを得る工程;および d)前記ペプチドにより結合される該標的分子を同定する工程、 を包含する、方法。 - 【請求項24】 被験体における皮膚病理を処置する方法であって、該方法
が、請求項17に記載のペプチドを該被験体に投与する工程を包含し、ここで、
該ペプチドが皮膚に選択的にホーミングし、それによって、該皮膚病理を処置す
る、方法。 - 【請求項25】 網膜の血管系に選択的にホーミングするペプチド。
- 【請求項26】 以下のアミノ酸配列を有する、請求項25に記載のペプチ
ドであって: X1−R−D−V−X2(配列番号32) ここで、X1およびX2の各々は、独立的して選択される1〜10個のアミノ酸
である、ペプチド。 - 【請求項27】 CSCFRDVCC(配列番号5)およびCRDVVSV
IC(配列番号6)からなる群から選択される、請求項26に記載のペプチド。 - 【請求項28】 CGEFKVGC(配列番号14)、CMDSQSSC(
配列番号228)、CNQRTNRESGNC(配列番号231)、CLLNY
TYC(配列番号238)、CQASASDHC(配列番号242)、CVTS
NLRVC(配列番号250)およびCRARIRAEDISC(配列番号26
3)からなる群から選択される、請求項25に記載のペプチド。 - 【請求項29】 部分に連結された請求項25に記載のペプチドを含む、結
合体。 - 【請求項30】 前記部分が、治療的薬剤、検出可能な薬剤およびタグから
なる群から選択される、請求項29に記載の結合体。 - 【請求項31】 網膜を同定する方法であって、該方法が以下の工程: a)組織または器官を、請求項25に記載のペプチドと接触する工程;および b)該ペプチドの該器官または該組織への結合を検出する工程であって、それ
により、該器官または該組織を網膜として同定する、工程、 を包含する、方法。 - 【請求項32】 網膜により発現される標的分子を同定する方法であって、
該方法が、請求項31に記載の方法を包含し、さらに、以下の工程: c)前記網膜のサンプルを得る工程;および d)前記ペプチドにより結合される該標的分子を同定する工程、 を包含する、方法。 - 【請求項33】 被験体における網膜病理を処置する方法であって、該方法
が、請求項25に記載のペプチドを該被験体に投与する工程を包含し、ここで、
該ペプチドが網膜に選択的にホーミングし、それによって、該網膜病理を処置す
る、方法。 - 【請求項34】 膵臓の血管系に選択的にホーミングするペプチド。
- 【請求項35】 アミノ酸配列SWCEPGWCR(配列番号4)を有する
、請求項34に記載のペプチド。 - 【請求項36】 アミノ酸配列GLCNGATCM(配列番号123)を有
する、請求項34に記載のペプチド。 - 【請求項37】 部分に連結された請求項34に記載のペプチドを含む、結
合体。 - 【請求項38】 前記部分が、治療的薬剤、検出可能な薬剤およびタグから
なる群から選択される、請求項37に記載の結合体。 - 【請求項39】 膵臓を同定する方法であって、該方法が以下の工程: a)組織または器官を、請求項34に記載のペプチドと接触させる工程;およ
び b)該ペプチドの該器官または該組織への結合を検出する工程であって、それ
により、該器官または該組織を膵臓として同定する、工程、 を包含する、方法。 - 【請求項40】 膵臓により発現される標的分子を同定する方法であって、
該方法が、請求項39に記載の方法を包含し、さらに、以下の工程: c)前記膵臓のサンプルを得る工程;および d)前記ペプチドにより結合される該標的分子を同定する工程、 を包含する、方法。 - 【請求項41】 被験体における膵臓病理を処置する方法であって、該方法
が、請求項34に記載のペプチドを該被験体に投与する工程を包含し、ここで、
該ペプチドが膵臓に選択的にホーミングし、それによって、該膵臓病理を処置す
る、方法。 - 【請求項42】 腸の血管系に選択的にホーミングするペプチド。
- 【請求項43】 以下のアミノ酸配列を有する、請求項42に記載のペプチ
ドであって: Y−S−G−K−W−X1(配列番号433) ここで、X1は、独立して選択される1〜10個のアミノ酸である、ペプチド 。 - 【請求項44】 YSGKWGG(配列番号9)およびYSGKWGW(配
列番号156)からなる群から選択される、請求項43に記載のペプチド。 - 【請求項45】 以下のアミノ酸配列を有する、請求項42に記載のペプチ
ドであって: X1−R−G−S−X2(配列番号434) ここで、X1およびX2の各々は、独立して選択される1〜10個のアミノ酸で
ある、ペプチド。 - 【請求項46】 VRRGSPG(配列番号164)、GGRGSWE(配
列番号167)およびFRVRGSP(配列番号169)からなる群から選択さ
れる、請求項45に記載のペプチド。 - 【請求項47】 YAGFFLV(配列番号150)、SRRQPLS(配
列番号153)、MSPQLAT(配列番号159)、WIEEAER(配列番
号161)およびGISAVLS(配列番号166)からなる群から選択される
アミノ酸配列を有する、請求項42に記載のペプチド。 - 【請求項48】 部分に連結された請求項42に記載のペプチドを含む、結
合体。 - 【請求項49】 前記部分が、治療的薬剤、検出可能な薬剤およびタグから
なる群から選択される、請求項48に記載の結合体。 - 【請求項50】 腸を同定する方法であって、該方法が以下の工程: a)組織または器官を、請求項42に記載のペプチドと接触させる工程;およ
び b)該ペプチドの該器官または該組織への結合を検出する工程であって、それ
により、該器官または該組織を腸として同定する、工程、 を包含する、方法。 - 【請求項51】 腸により発現される標的分子を同定する方法であって、該
方法が、請求項50に記載の方法を包含し、さらに、以下の工程: c)該腸のサンプルを得る工程;および d)前記ペプチドにより結合される該標的分子を同定する工程、 を包含する、方法。 - 【請求項52】 被験体における腸病理を処置する方法であって、該方法が
、請求項42に記載のペプチドを該被験体に投与する工程を包含し、ここで、該
ペプチドが腸に選択的にホーミングし、それによって、該腸病理を処置する、方
法。 - 【請求項53】 卵巣の血管系に選択的にホーミングするペプチド。
- 【請求項54】 EVRSRLS(配列番号10)およびRVGLVAR(
配列番号11)からなる群から選択される、請求項53に記載のペプチド。 - 【請求項55】 部分に連結された請求項53に記載のペプチドを含む、結
合体。 - 【請求項56】 前記部分が、治療的薬剤、検出可能な薬剤およびタグから
なる群から選択される、請求項55に記載の結合体。 - 【請求項57】 卵巣を同定する方法であって、該方法が以下の工程: a)組織または器官を、請求項53に記載のペプチドと接触させる工程;およ
び b)該ペプチドの該器官または該組織への結合を検出する工程であって、それ
により、該器官または該組織を卵巣として同定する、工程、 を包含する、方法。 - 【請求項58】 卵巣により発現される標的分子を同定する方法であって、
該方法が、請求項57に記載の方法を包含し、さらに、以下の工程: c)該卵巣のサンプルを得る工程;および d)前記ペプチドにより結合される該標的分子を同定する工程、 を包含する、方法。 - 【請求項59】 被験体における卵巣病理を処置する方法であって、該方法
が、請求項53に記載のペプチドを該被験体に投与する工程を包含し、ここで、
該ペプチドが卵巣に選択的にホーミングし、それによって、該卵巣病理を処置す
る、方法。 - 【請求項60】 副腎の血管系に選択的にホーミングするペプチド。
- 【請求項61】 以下のアミノ酸配列を有する、請求項60に記載のペプチ
ドであって: X1−L−P−R−X2(配列番号431) ここで、X1およびX2の各々は、独立して選択される1〜10個のアミノ酸で
ある、ペプチド。 - 【請求項62】 LMLPRAD(配列番号27)およびLPRYLLS(
配列番号28)からなる群から選択される、請求項61に記載のペプチド。 - 【請求項63】 以下のアミノ酸配列を有する、請求項60に記載のペプチ
ドであって: X1−L−A−G−G−X2(配列番号432) ここで、X1は、独立して選択される1〜10個のアミノ酸であり、ここで、 X2は、独立して選択される0〜10個のアミノ酸である、ペプチド。 - 【請求項64】 R(Y/F)LLAGG(配列番号404)およびRYP
LAGG(配列番号389)からなる群から選択される、請求項63に記載のペ
プチド。 - 【請求項65】 FSDVHFW(配列番号381)およびGYVAVMT
(配列番号400)からなる群から選択される、請求項60に記載のペプチド。 - 【請求項66】 部分に連結された請求項60に記載のペプチドを含む、結
合体。 - 【請求項67】 前記部分が、治療的薬剤、検出可能な薬剤およびタグから
なる群から選択される、請求項66に記載の結合体。 - 【請求項68】 副腎を同定する方法であって、該方法が以下の工程: a)組織または器官を、請求項60に記載のペプチドと接触させる工程;およ
び b)該ペプチドの該器官または該組織への結合を検出する工程であって、それ
により、該器官または該組織を副腎として同定する、工程、 を包含する、方法。 - 【請求項69】 副腎により発現される標的分子を同定する方法であって、
該方法が、請求項68に記載の方法を包含し、さらに、以下の工程: c)該副腎のサンプルを得る工程;および d)前記ペプチドにより結合される該標的分子を同定する工程、 を包含する、方法。 - 【請求項70】 被験体における副腎病理を処置する方法であって、該方法
が、請求項60に記載のペプチドを該被験体に投与する工程を包含し、ここで、
該ペプチドが副腎に選択的にホーミングし、それによって、該副腎病理を処置す
る、方法。 - 【請求項71】 肝臓の血管系に選択的にホーミングするペプチド。
- 【請求項72】 VKSVCRT(配列番号12)、SRRFVGG(配列
番号406)、VGSFIYS(配列番号411)およびWRQNMPL(配列
番号418)からなる群から選択される、請求項71に記載のペプチド。 - 【請求項73】 部分に連結された請求項70に記載のペプチドを含む、結
合体。 - 【請求項74】 前記部分が、治療的薬剤、検出可能な薬剤およびタグから
なる群から選択される、請求項73に記載の結合体。 - 【請求項75】 肝臓を同定する方法であって、該方法が以下の工程: a)組織または器官を、請求項70に記載のペプチドと接触させる工程;およ
び b)該ペプチドの該器官または該組織への結合を検出する工程であって、それ
により、該器官または該組織を肝臓として同定する、工程、 を包含する、方法。 - 【請求項76】 肝臓により発現される標的分子を同定する方法であって、
該方法が、請求項75に記載の方法を包含し、さらに、以下の工程: c)該肝臓のサンプルを得る工程;および d)前記ペプチドにより結合される該標的分子を同定する工程、 を包含する、方法。 - 【請求項77】 被験体における肝臓病理を処置する方法であって、該方法
が、請求項70に記載のペプチドを該被験体に投与する工程を包含し、ここで、
該ペプチドが肝臓に選択的にホーミングし、それによって、該肝臓病理を処置す
る、方法。 - 【請求項78】 AGCSVTVCG(配列番号315)、GSCSMFP
CS(配列番号317)、SECAYRACS(配列番号319)、WSCAR
PLCG(配列番号320)、GLCQIDECR(配列番号329)、DRC
LDIWCL(配列番号331)、PLCMATRCA(配列番号333)、R
DCSHRSCE(配列番号334)、NPCLRAACI(配列番号335)
、PTCAYGWCA(配列番号336)、LECVANLCT(配列番号33
7)、RKCGEEVCT(配列番号338)、EPCTWNACL(配列番号
339)およびQQCQDPYCL(配列番号344)からなる群から選択され
る、リンパ節ホーミングペプチド。 - 【請求項79】 部分に連結された請求項78に記載のペプチドを含む、結
合体。 - 【請求項80】 前記部分が、治療的薬剤、検出可能な薬剤およびタグから
なる群から選択される、請求項79に記載の結合体。 - 【請求項81】 リンパ節を同定する方法であって、該方法が以下の工程: a)組織または器官を、請求項78に記載のペプチドと接触させる工程;およ
び b)該ペプチドの該器官または該組織への結合を検出する工程であって、それ
により、該器官または該組織をリンパ節として同定する、工程、 を包含する、方法。 - 【請求項82】 リンパ節により発現される標的分子を同定する方法であっ
て、該方法が、請求項81に記載の方法を包含し、さらに、以下の工程: c)該リンパ節のサンプルを得る工程;および d)前記ペプチドにより結合される該標的分子を同定する工程、 を包含する、方法。 - 【請求項83】 被験体におけるリンパ節病理を処置する方法であって、該
方法が、請求項78に記載のペプチドを該被験体に投与する工程を包含し、ここ
で、該ペプチドがリンパ節に選択的にホーミングし、それによって、該リンパ節
病理を処置する、方法。 - 【請求項84】 肺内皮細胞に選択的にホーミングする、MDP−結合ホー
ミング分子を同定する方法であって、該方法が以下の工程: a)膜ジペプチダーゼ(MDP)を1以上の分子に接触させる工程;および b)分子の該MDPへの特異的な結合を決定する工程、 を包含し、 ここで、特異的結合の存在が、肺内皮細胞に選択的にホーミングするMDP−
結合ホーミング分子として、該分子を同定する、方法。 - 【請求項85】 前記MDPが、実質的に精製されている、請求項84に記
載の方法。 - 【請求項86】 前記実質的に精製されたMDPが、支持体に固定されてい
る、請求項85に記載の方法。 - 【請求項87】 前記MDPが、配列番号448を有するヒトMDPである
請求項84に記載の方法。 - 【請求項88】 被験体において、部分を肺内皮細胞に選択的に指向する方
法であって、該被験体に、請求項84の方法によって同定されたMDP−結合ホ
ーミング分子に連結された部分を有する結合体を投与する工程、を包含し、 それにより、該被験体において、該部分が肺内皮細胞に選択的に指向される、
方法。 - 【請求項89】 前記MDP−結合ホーミング分子が、以下の配列: X1−G−F−E−X2(配列番号17) ここで、X1およびX2の各々は、独立的に選択される1〜10個のアミノ酸を
含むペプチドである、請求項88に記載の方法。 - 【請求項90】 前記MDP−結合ホーミングペプチドが、CGFECVR
QCPERC(配列番号1)およびCGFELETC(配列番号2)からなる群
から選択される配列を含む、請求項89に記載の方法。 - 【請求項91】 前記MDP−結合ホーミング分子が、以下の構造1: 【化1】 、または薬学的に受容可能な陽イオンを包含し、ここで、R2およびR3は、それ
ぞれ、3〜10個の炭素原子および1〜15個の炭素原子の範囲の炭化水素ラジ
カルであり;これらのR2炭化水素鎖もしくはR3炭化水素鎖のいずれか1つにお
ける1〜6個の水素が、ハロゲンによって置換されていてもよいか、または非末
端メチレンが酸素もしくは酸化型形態を含む硫黄によって置換されてもよく;さ
らに、R3の末端水素もまたヒドロキシル基もしくはチオール基によって置換さ れていてもよく、そのヒドロキシル基もしくはチオール基は、アシル化もしくは
カルバモイル化されていてもよく;あるいは、該水素はアミノ基によって置換さ
れていてもよく、このアミノ基はアシルアミノ基、ウレイド基、アミジノ基、ク
アニジノ基もしくはアルキル基、または置換されたアミノ基におけるように誘導
体化されていてもよく、四級窒素基を含み;あるいは、カルボン酸基、ホスホン
酸基もしくはスルホン酸基のような酸性基、またはそれらのエステルもしくはア
ミドまたはシアノ;あるいは末端アミノ酸基のようなそれらの組み合わせにより
置換されていてもよく;そしてR1は、水素もしくは低級アルキル(C1-6)もし
くはジアルキルアミノアルキルである、請求項88に記載の方法。 - 【請求項92】 前記MDP−結合ホーミング分子が、7−(L−2−アミ
ノ−2−カルボキシエチルチオ)−2−(2,2−ジメチルシクロプロパンカル
ボキサミド)−2−ヘプテン酸である、請求項91に記載の方法。 - 【請求項93】 前記R2が、カルボニルに隣接した炭素が第三級ではない というように限定された、分枝したアルキルまたはシクロアルキルである、請求
項91に記載の方法。 - 【請求項94】 前記R3が、第四級窒素、アミノ誘導体もしくはアミノ酸 誘導基である末端置換基を有する、n−アルキル(1〜9個の炭素)もしくはn
−アルキル(1〜9個の炭素)である、請求項93に記載の方法。 - 【請求項95】 前記R2が、2,2−ジメチルシクロプロピルもしくは2 ,2−ジクロロシクロプロピルであり、そして前記R3が、末端置換基を有さな いか、またはトリメチルアンモニウム、アミジノ、グアニジノ、もしくは2−ア
ミノ−2−カルボエチルチオである末端置換基を有する、3〜7個の炭素原子の
炭化水素鎖である、請求項94に記載の方法。 - 【請求項96】 前記MDP−結合ホーミング分子が、以下: Z−2−(2,2−ジメチルシクロプロパンカルボキサミド)−8−トリメチル
アンモニウムヒドロキシド−2−オクテン酸内部塩; Z−2−(2,2−ジクロロシクロプロパンカルボキサミド)−8−トリメチル
アンモニウムヒドロキシド−2−オクテン酸内部塩; Z−2−(2,2−ジメチルシクロプロパンカルボキサミド)−8−グアニジノ
−2−オクテン酸; Z−2−(2,2−ジメチルシクロプロパンカルボキサミド)−8−グアニジノ
−2−オクテン酸; Z−2−(2,2−ジメチルシクロプロパンカルボキサミド)−8−ウレイド−
2−オクテン酸; Z−8−(1−2−アミノ−2−カルボキシエチルチオ)−2(2,2−ジメチ
ルシクロプロパンカルボキサミド)−2−オクテン酸; Z−2−(2,2−ジメチルシクロプロパンカルボキサミド)−2−オクテン酸
(ラセミ形および右旋性形); Z−2−(2,2−ジクロロシクロプロパンカルボキサミド)−2−オクテン酸
; 7−(L−2−アミノ−2−カルボキシエチルチオ)−2−(2,2−ジメチル
シクロプロパンカルボキサミド)−2−へプテン酸;および 6−(L−2−アミノ−2−カルボキシエチルチオ)−2−(2,2−ジメチル
クロロプロパンカルボキサミド)−2−ヘキセン酸、 からなる群から選択される、請求項95に記載の方法。 - 【請求項97】 前記部分が遺伝子治療ベクターである、請求項88に記載
の方法。 - 【請求項98】 前記部分が薬物である、請求項88に記載の方法。
- 【請求項99】 癌を有する被験体において、肺転移を減少または防止する
方法であって、該被験体に膜ジペプチダーゼ(MDP)−結合ホーミング分子を
投与する工程を包含する、方法。 - 【請求項100】 前記MDP−結合ホーミング分子が、以下の配列: X1−G−F−E−X2(配列番号17) を含む肺ホーミングペプチドであり、ここで、X1およびX2の各々は、独立し
て選択される1〜10個のアミノ酸である、請求項99に記載の方法。 - 【請求項101】 前記MDP−結合ホーミングペプチドが、CGFECV
RQCPERC(配列番号1)およびCGFELETC(配列番号2)からなる
群から選択される配列を含む、請求項100に記載の方法。 - 【請求項102】 前記MDP−結合ホーミングペプチドが、CGFECV
RQCPERC(配列番号1)およびCGFELETC(配列番号2)からなる
群から選択されるペプチドである、請求項101に記載の方法。 - 【請求項103】 前記MDP−結合ホーミング分子が、以下の構造1: 【化2】 、または薬学的に受容可能な陽イオンを包含し、ここで、R2およびR3は、それ
ぞれ、3〜10個の炭素原子および1〜15個の炭素原子の範囲の炭化水素ラジ
カルであり;これらのR2炭化水素鎖もしくはR3炭化水素鎖のいずれか1つにお
ける1〜6個の水素がハロゲンによって置換されていてもよい、または非末端メ
チレンが酸素もしくは酸化型形態を含む硫黄によって置換されていてもよく;さ
らに、R3の末端水素もまたヒドロキシル基もしくはチオール基によって置換さ れていてもよく、これらのヒドロキシル基もしくはチオール基は、アシル化もし
くはカルバモイル化されていてもよく;あるいは、該水素はアミノ基によって置
換されていてもよく、このアミノ基はアシルアミノ基、ウレイド基、アミジノ基
、クアニジノ基、もしくはアルキル基、または置換されたアミノ基におけるよう
に誘導体化されていてもよく、第四級窒素基を含み;あるいは、カルボン酸基、
ホスホン酸基もしくはスルホン酸基のような酸性基、またはそれらのエステルも
しくはアミド、またはシアノ;あるいは末端アミノ酸基のようなそれらの組み合
わせにより置換されていてもよく;そしてR1は、水素もしくは低級アルキル( C1-6)もしくはジアルキルアミノアルキルである、請求項99に記載の方法。 - 【請求項104】 前記MDP−結合ホーミング分子が、7−(L−2−ア
ミノ−2−カルボキシエチルチオ)−2−(2,2−ジメチルシクロプロパンカ
ルボキサミド)−2−ヘプテン酸である、請求項103に記載の方法。 - 【請求項105】 前記R2が、カルボニルに隣接した炭素が第三級ではな いというように限定された、分枝したアルキルまたはシクロアルキルである、請
求項103に記載の方法。 - 【請求項106】 前記R3が、第四級窒素、アミノ誘導体もしくはアミノ 酸誘導基である末端置換基を有する、n−アルキル(1〜9個の炭素)もしくは
n−アルキル(1〜9個の炭素)である、請求項105に記載の方法。 - 【請求項107】 前記R2が、2,2−ジメチルシクロプロピルもしくは 2,2−ジクロロシクロプロピルであり、前記R3が、末端置換基を有さないか 、またはトリメチルアンモニウム、アミジノ、グアニジノもしくは2−アミノ−
2−カルボエチルチオである末端置換基を有する、3〜7個の炭素原子の炭化水
素鎖である、請求項106に記載の方法。 - 【請求項108】 前記MDP−結合ホーミング分子が、以下: Z−2−(2,2−ジメチルシクロプロパンカルボキサミド)−8−トリメチル
アンモニウムヒドロキシド−2−オクテン酸内部塩; Z−2−(2,2−ジクロロシクロプロパンカルボキサミド)−8−トリメチル
アンモニウムヒドロキシド−2−オクテン酸内部塩; Z−2−(2,2−ジメチルシクロプロパンカルボキサミド)−8−グアニジノ
−2−オクテン酸; Z−2−(2,2−ジメチルシクロプロパンカルボキサミド)−8−グアニジノ
−2−オクテン酸; Z−2−(2,2−ジメチルシクロプロパンカルボキサミド)−8−ウレイド−
2−オクテン酸; Z−8−(1−2−アミノ−2−カルボキシエチルチオ)−2(2,2−ジメチ
ルシクロプロパンカルボキサミド)−2−オクテン酸; Z−2−(2,2−ジメチルシクロプロパンカルボキサミド)−2−オクテン酸
(ラセミ形および右旋性形); Z−2−(2,2−ジクロロシクロプロパンカルボキサミド)−2−オクテン酸
; 7−(L−2−アミノ−2−カルボキシエチルチオ)−2−(2,2−ジメチル
シクロプロパンカルボキサミド)−2−へプテン酸;および 6−(L−2−アミノ−2−カルボキシエチルチオ)−2−(2,2−ジメチル
クロロプロパンカルボキサミド)−2−ヘキセン酸、 からなる群から選択される、請求項107に記載の方法。 - 【請求項109】 前記MDP−結合ホーミング分子が、MDPインヒビタ
ーである、請求項99に記載の方法。 - 【請求項110】 前記MDPインヒビターが、高くとも1000nMのM
DPに対するKiを示す、請求項109に記載の方法。 - 【請求項111】 前記MDPインヒビターが、高くとも100nMのMD
Pに対するKiを示す、請求項110に記載の方法。 - 【請求項112】 前記MDPインヒビターが、高くとも1nMのMDPに
対するKiを示す、請求項111に記載の方法。 - 【請求項113】 前記癌が黒色腫である、請求項99に記載の方法。
- 【請求項114】 癌を有する被験体において、肺転移を減少または防止す
る方法であって、該被験体に膜ジペプチダーゼ(MDP)陰性調節因子を投与す
る工程を包含する、方法。 - 【請求項115】 前記MDP陰性調節因子が可溶性MDPポリぺプチドで
ある、請求項114に記載の方法。 - 【請求項116】 前記MDP陰性調節因子がMDPと選択的に反応する抗
体である、請求項114に記載の方法。 - 【請求項117】 被験体において、肺内皮細胞への細胞ホーミングを減少
または防止する方法であって、該被験体に膜ジペプチダーゼ(MDP)陰性調節
因子を投与する工程を包含する、方法。 - 【請求項118】 前記MDP陰性調節因子が可溶性MDPポリぺプチドで
ある、請求項117に記載の方法。 - 【請求項119】 前記MDP陰性調節因子がMDPと選択的に反応する抗
体である、請求項117に記載の方法。 - 【請求項120】 肺転移を減少または防止する分子を同定する方法であっ
て、該方法が以下の工程: a)膜ジペプチダーゼ(MDP)を1以上の分子と接触させる工程;および b)該分子の存在下でのMDP活性をコントロール値と比較して決定する工程
、 を包含し、 ここで、該分子の存在下での減少したMDP活性は、該分子を肺転移を減少ま
たは防止する分子として同定する、方法。 - 【請求項121】 前記MDPが実質的に精製されている、請求項120に
記載の方法。 - 【請求項122】 MDP活性が、Gly−D−PheからのD−Pheの
放出により決定される、請求項120に記載の方法。 - 【請求項123】 請求項120に記載の方法であって、該方法が、さらに
、以下: c)前記分子を癌を有する被検体に投与する工程;および d)該被験体における肺転移を、コントロールレベルの転移と比較してアッセ
イする工程、 を包含する、方法。
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Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
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