ES2873846T3 - Complementación de fragmento de anticuerpo funcional para un sistema de dos componentes para eliminación redirigida de células no deseadas - Google Patents

Complementación de fragmento de anticuerpo funcional para un sistema de dos componentes para eliminación redirigida de células no deseadas Download PDF

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Abstract

Un kit o composición para uso en el tratamiento de cáncer en donde el kit o composición comprende: a. un primer componente que comprende un agente de acoplamiento de linfocitos T dirigido que comprende: i. un primer resto de direccionamiento que es capaz de dirigirse a células cancerosas en donde el primer resto de direccionamiento es un anticuerpo o porción de unión a antígeno del mismo; ii. un primer dominio de acoplamiento de linfocitos T capaz de actividad de acoplamiento de linfocitos T cuando se une a un segundo dominio de acoplamiento de linfocitos T, en donde el segundo dominio de acoplamiento de linfocitos T no es parte del primer componente, y en donde el primer dominio de acoplamiento de linfocitos T es un dominio VH o VL; iii. una primera pareja de unión inerte para el primer dominio de acoplamiento de linfocitos T que se une al primer dominio de acoplamiento de linfocitos T de modo que el primer dominio de acoplamiento de linfocitos T no se una al segundo dominio de acoplamiento de linfocitos T a menos que se retire la pareja de unión inerte, en donde si el primer dominio de acoplamiento de linfocitos T es un dominio VH, la primera pareja de unión inerte es un dominio VL, y si el primer dominio de acoplamiento de linfocitos T es un dominio VL, la primera pareja de unión inerte es un dominio VH; y iv. un sitio de escisión de proteasa que separa el primer dominio de acoplamiento de linfocitos T y la primera pareja de unión inerte, en donde el sitio de escisión de proteasa es capaz de liberar la pareja de unión inerte del dominio de acoplamiento de linfocitos T en presencia de una proteasa: (1) expresada por las células cancerosas; o (2) colocalizada en la célula cancerosa mediante un resto de direccionamiento que es un anticuerpo o porción de unión a antígeno del mismo que se une a la célula cancerosa y que es igual o diferente al resto de direccionamiento en el agente, b. un segundo componente que comprende un segundo dominio de acoplamiento de linfocitos T capaz de actividad de acoplamiento de linfocitos T cuando se une al primer dominio de acoplamiento de linfocitos T, en donde el primer y el segundo dominios de acoplamiento de linfocitos T, cuando están emparejados entre sí, son capaces de unirse a CD3 o al receptor de linfocitos T (TCR) cuando ninguno está unido a una pareja de unión inerte y además en donde si el primer dominio de acoplamiento de linfocitos T es un dominio VH, el segundo dominio de acoplamiento de linfocitos T es un dominio VL, y si el primer dominio de acoplamiento de linfocitos T es un dominio VL, el segundo dominio de acoplamiento de linfocitos T es un dominio VH.

Description

DESCRIPCIÓN
Complementación de fragmento de anticuerpo funcional para un sistema de dos componentes para eliminación redirigida de células no deseadas
CAMPO
La presente solicitud se refiere a agentes de acoplamiento de linfocitos T dirigidos para tratar una afección caracterizada por la presencia de células no deseadas. En particular, se refiere a agentes que se pueden usar para tratar una afección caracterizada por la presencia de células no deseadas, tales como cáncer u otras células que causan enfermedades.
ANTECEDENTES
El cáncer y otras enfermedades causadas por la presencia de células no deseadas crean una pérdida significativa de vidas, sufrimiento e impacto económico. Las estrategias inmunoterapéuticas para dirigirse al cáncer han sido un área activa de investigación clínica traslacional.
Una variedad de enfoques se han explorado para inmunoterapia, pero muchos de estos enfoques anteriores carecen de suficiente especificidad para determinadas células no deseadas. Por ejemplo, se han diseñado semicuerpos, cada uno con una porción de scFv que se une a diferentes antígenos en una célula diana, un dominio Fc que permite el emparejamiento con un semicuerpo complementario y una pareja de unión capaz de formar una asociación con otra pareja de unión en un semicuerpo complementario. Documento de patente WO 2007/062466. Sin embargo, estos semicuerpos no son necesariamente específicos para células cancerosas y podrían unirse y tener actividad en otras células que expresan los mismos antígenos. Véase también el documento de patente WO 2013/104804, que proporciona un primer polipéptido con un resto de direccionamiento que se une a un primer antígeno y un primer fragmento de un dominio funcional, junto con un segundo polipéptido con un resto de direccionamiento que se une a un segundo antígeno y un segundo fragmento de un dominio funcional que es complementario al primer fragmento del dominio funcional. Del mismo modo, este enfoque no es necesariamente específico para células cancerosas y podría unirse y tener actividad en otras células que expresan los mismos antígenos.
Aunque con enfoques anteriores se han mostrado algunos datos de ensayo positivos, las estrategias terapéuticas clínicamente eficaces deben ser capaces de provocar una respuesta inmunitaria fuerte en un individuo que padece una enfermedad tal como cáncer. Además, las terapias eficaces deberían ser muy específicas y no causar efectos secundarios no deseados a otros tipos de células del organismo. El documento de patente US 2015/0183875 se refiere a una molécula que comprende: (i) un resto de direccionamiento capaz de dirigirse directa o indirectamente a células no deseadas, y (ii) un resto adicional que tiene una región de unión de células inmunitarias enmascarada para evitar la unión del resto adicional a una célula inmunitaria, en donde la región de unión de la célula inmunitaria enmascarada es capaz de desenmascararse de forma selectiva cuando la molécula está en las proximidades de las células no deseadas para permitir la unión del resto adicional a una célula inmunitaria. El documento de patente WO 2015/013671 se refiere a anticuerpos multiespecíficos y a anticuerpos activables multiespecíficos que se unen específicamente a dos o más antígenos o epítopos diferentes, así como a métodos para fabricar y usar estos anticuerpos multiespecíficos y/o anticuerpos activables multiespecíficos en una variedad de indicaciones terapéuticas, de diagnóstico y profilácticas. En este campo de la inmunoterapia redirigida se requieren desarrollos adicionales.
SUMARIO
La invención reivindicada en la actualidad es como se define en las reivindicaciones. Para evitar dudas, en la medida en la que materia objeto que no entra dentro de la invención reivindicada en la actualidad se mencione en el presente documento, se incluye simplemente con fines de referencia. De acuerdo con la descripción, los inventores describen un agente de acoplamiento de linfocitos T dirigido para tratar una afección caracterizada por la presencia de células no deseadas. Este agente incluye (a) un resto de direccionamiento que es capaz de dirigirse a las células no deseadas; (b) un primer dominio de acoplamiento de linfocitos T capaz de actividad cuando se une a un segundo dominio de acoplamiento de linfocitos T, en donde el segundo dominio de acoplamiento de linfocitos T no es parte del agente; (c) al menos una pareja de unión inerte capaz de unirse al primer dominio de unión a linfocitos T de modo que el primer dominio de unión a linfocitos T no se una al segundo dominio de unión a linfocitos T a menos que se retire la pareja de unión inerte; y (d) al menos un sitio de escisión que separa el primer dominio de acoplamiento de linfocitos células T y la pareja de unión inerte.
En el presente documento se desvela un sistema de dos componentes para tratar una afección caracterizada por la presencia de células no deseadas, comprendiendo el sistema de dos componentes un primer componente que comprende un agente de acoplamiento de linfocitos T dirigido que comprende:
a. un primer componente que comprende un agente de acoplamiento de linfocitos T dirigido que comprende: i. un primer resto de direccionamiento que es capaz de dirigirse a las células no deseadas;
ii. un primer dominio de acoplamiento de linfocitos T capaz de actividad de acoplamiento de linfocitos T cuando se une a un segundo dominio de acoplamiento de linfocitos T, en donde el segundo dominio de acoplamiento de linfocitos T no es parte del primer componente;
iii. una primera pareja de unión inerte para el primer dominio de acoplamiento de linfocitos T que se une al primer dominio de acoplamiento de linfocitos T de modo que el primer dominio de acoplamiento de linfocitos T no se una al segundo dominio de acoplamiento de linfocitos T a menos que se retire la pareja de unión inerte; y
iv. un sitio de escisión que separa el primer dominio de acoplamiento de linfocitos T y la primera pareja de unión inerte, en donde el sitio de escisión:
(1) se escinde mediante una enzima expresada por las células no deseadas;
(2) se escinde por medio de una reacción de escisión sensible al pH dentro de la célula no deseada; (3) se escinde mediante una reacción de escisión dependiente de complemento; o
(4) se escinde mediante una proteasa que está colocalizada en la célula no deseada mediante un resto de direccionamiento que es igual o diferente al resto de direccionamiento en el agente,
b. un segundo componente que comprende un segundo dominio de acoplamiento de linfocitos T capaz de actividad de acoplamiento de linfocitos T cuando se une al primer dominio de acoplamiento de linfocitos T, en donde el primer y el segundo dominios de acoplamiento de linfocitos T son capaces de unirse cuando ninguno está unido a una pareja de unión inerte.
En un primer aspecto de la invención, el sistema de dos componentes es un kit o composición para uso en el tratamiento de cáncer, en donde el kit o composición comprende
a. un primer componente que comprende un agente de acoplamiento de linfocitos T dirigido que comprende:
i. un primer resto de direccionamiento que es capaz de dirigirse a células cancerosas en donde el primer resto de direccionamiento es un anticuerpo o porción de unión a antígeno del mismo;
ii. un primer dominio de acoplamiento de linfocitos T capaz de actividad de acoplamiento de linfocitos T cuando se une a un segundo dominio de acoplamiento de linfocitos T, en donde el segundo dominio de acoplamiento de linfocitos T no es parte del primer componente, y en donde el primer dominio de acoplamiento de linfocitos T es un dominio VH o VL;
iii. una primera pareja de unión inerte para el primer dominio de acoplamiento de linfocitos T que se une al primer dominio de acoplamiento de linfocitos T de modo que el primer dominio de acoplamiento de linfocitos T no se una al segundo dominio de acoplamiento de linfocitos T a menos que se retire la pareja de unión inerte en donde, si el primer dominio de acoplamiento de linfocitos T es un dominio VH, la primera pareja de unión inerte es un dominio VL y, si el primer dominio de acoplamiento de linfocitos T es un dominio VL, la primera pareja de unión inerte es un dominio VL, la primera pareja de unión inerte es un dominio VH; y
iv. un sitio de escisión de proteasa que separa el primer dominio de acoplamiento de linfocitos T y la primera pareja de unión inerte, en donde el sitio de escisión de proteasa es capaz de liberar la pareja de unión inerte del dominio de acoplamiento de linfocitos T en presencia de una proteasa:
(1) expresada por las células cancerosas; o
(2) colocalizada en la célula cancerosa mediante un resto de direccionamiento que es un anticuerpo o porción de unión a antígeno del mismo que se une a la célula cancerosa y que es igual o diferente al resto de direccionamiento en el agente,
b. un segundo componente que comprende un segundo dominio de acoplamiento de linfocitos T capaz de actividad de acoplamiento de linfocitos T cuando se une al primer dominio de acoplamiento de linfocitos T, en donde el primer y el segundo dominios de acoplamiento de linfocitos T, cuando se emparejan entre sí, son capaces de unirse a CD3 o al receptor de linfocitos T (TCR) cuando ninguno está unido a una pareja de unión inerte y además en donde si el primer dominio de acoplamiento de linfocitos T es un dominio VH, el segundo dominio de acoplamiento de linfocitos T es un dominio Vl , y si el primer dominio de acoplamiento de linfocitos T es un dominio Vl , el segundo dominio de acoplamiento de linfocitos T es un dominio VH.
En otra divulgación, el segundo componente del sistema de dos componentes además comprende un segundo resto de direccionamiento que es capaz de dirigirse a las células no deseadas.
En otra divulgación, el segundo componente del sistema de dos componentes además comprende una segunda pareja de unión inerte para el segundo dominio de acoplamiento de linfocitos T que se une al segundo dominio de acoplamiento de linfocitos T de modo que el segundo dominio de acoplamiento de linfocitos T no se una al primer dominio de acoplamiento de linfocitos T a menos que se retire la pareja de unión inerte y
a. un sitio de escisión que separa el segundo dominio de acoplamiento de linfocitos T y la segunda pareja de unión inerte, en donde el sitio de escisión:
i. se escinde mediante una enzima expresada por las células no deseadas;
ii. se escinde por medio de una reacción de escisión sensible al ph dentro de la célula no deseada;
iii. se escinde mediante una reacción de escisión dependiente de complemento; o
iv. se escinde mediante una proteasa que está colocalizada en la célula no deseada mediante un resto de direccionamiento que es igual o diferente al resto de direccionamiento en el agente,
en donde la escisión del sitio de escisión causa la pérdida de la pareja de unión inerte y complementación con el primer dominio de acoplamiento de linfocitos T del sistema de dos componentes.
En algunas realizaciones, el primer y el segundo restos de direccionamiento del sistema de dos componentes son iguales.
En algunas realizaciones, el primer y el segundo restos de direccionamiento del sistema de dos componentes son diferentes.
El primer y el segundo sitios de escisión pueden ser iguales.
El primer y el segundo sitios de escisión pueden ser diferentes.
Se desvela en donde al menos un sitio de escisión es un sitio de escisión de proteasa. El al menos un sitio de escisión puede ser capaz de escisión fuera de las células no deseadas.
También se desvela en donde al menos una enzima expresada por las células no deseadas es una proteasa.
También se desvela en donde al menos una pareja de unión inerte se une específicamente al dominio de acoplamiento de linfocitos T.
En una divulgación del sistema de dos componentes, al menos una pareja de unión inerte es un dominio VH o VL. En algunas realizaciones de la invención, el primer dominio de acoplamiento de linfocitos T es un dominio VH y la primera pareja de unión inerte es un dominio VL, y cuando el primer dominio de acoplamiento de linfocitos T es un dominio VL, la primera pareja de unión inerte es un dominio VH. En algunas realizaciones de la invención, el segundo dominio de acoplamiento de linfocitos T es un dominio VH y la segunda pareja de unión inerte es un dominio VL, y cuando el segundo dominio de acoplamiento de linfocitos T es un dominio VL, la segunda pareja de unión inerte es un dominio VH.
Se desvela en donde al menos un resto de direccionamiento es un anticuerpo o fragmento funcional del mismo. En algunas realizaciones de la invención, la al menos una pareja de unión inerte es capaz de disociación una vez que se ha escindido al menos un sitio de escisión y después de la disociación de los dos dominios de acoplamiento de linfocitos T son capaces de unirse entre sí y exhibir actividad de acoplamiento de linfocitos T.
En un segundo aspecto de la invención, un conjunto de moléculas de ácido nucleico codifica el primer y el segundo componentes del primer aspecto de la invención. También se desvela en donde una molécula de ácido nucleico codifica el componente para uso en un sistema de dos componentes.
En algunas realizaciones de la invención, un dominio de acoplamiento de linfocitos T es un dominio VH y el otro dominio de acoplamiento de linfocitos T es un dominio VL.
En otra divulgación, un componente para uso en un sistema de dos componentes para tratar una afección caracterizada por la presencia de células no deseadas que comprende un primer agente de acoplamiento de linfocitos T dirigido comprende:
a. un resto de direccionamiento que es capaz de dirigirse a las células no deseadas;
b. un primer dominio de acoplamiento de linfocitos T capaz de actividad de acoplamiento de linfocitos T cuando se une a un segundo dominio de acoplamiento de linfocitos T, en donde el segundo dominio de acoplamiento de linfocitos T no es parte del primer agente de acoplamiento de linfocitos T dirigido;
c. una pareja de unión inerte para el primer dominio de acoplamiento de linfocitos T que se une al primer dominio de acoplamiento de linfocitos T de modo que el primer dominio de acoplamiento de linfocitos T no se una al segundo dominio de acoplamiento de linfocitos T a menos que se retire la pareja de unión inerte; y
d. un sitio de escisión que separa el primer dominio de acoplamiento de linfocitos T y la pareja de unión inerte, en donde el sitio de escisión:
i. se escinde mediante una enzima expresada por las células no deseadas;
ii. se escinde por medio de una reacción de escisión sensible al ph dentro de la célula no deseada;
iii. se escinde mediante una reacción de escisión dependiente de complemento; o
se escinde mediante una proteasa que está colocalizada en la célula no deseada mediante un resto de direccionamiento que es igual o diferente al resto de direccionamiento en el agente, en donde la escisión del sitio de escisión causa la pérdida de la pareja de unión inerte y permite complementación con el segundo dominio de acoplamiento de linfocitos T que no es parte del agente.
También se desvela un método para tratar en un paciente una enfermedad caracterizada por la presencia de células no deseadas, método que comprende administrar al paciente el sistema de dos componentes desvelado. También se desvela un método para dirigir una respuesta inmunitaria de un paciente a células no deseadas, método que comprende administrar el sistema de dos componentes desvelado. Estas células no deseadas pueden ser células cancerosas. El cáncer puede ser uno cualquiera de cáncer de mama, cáncer de ovario, cáncer de endometrio, cáncer de cuello uterino, cáncer de vejiga, cáncer renal, melanoma, cáncer de pulmón, cáncer de próstata, cáncer testicular, cáncer de tiroides, cáncer cerebral, cáncer de esófago, cáncer gástrico, cáncer pancreático, cáncer colorrectal, cáncer de hígado, leucemia, mieloma, linfoma no Hodgkin, linfoma de Hodgkin, leucemia mieloide aguda, leucemia linfoblástica aguda, leucemia linfoblástica crónica, trastorno linfoproliferativo, trastorno mielodisplásico, enfermedad mieloproliferativa o enfermedad premaligna.
Los objetos y ventajas adicionales se presentarán en parte en la descripción que sigue a continuación, y en parte serán evidentes a partir de la descripción, o se pueden aprender con la práctica. Los objetos y ventajas de la invención se realizarán y alcanzarán por medio de los elementos y combinaciones de acuerdo con las reivindicaciones adjuntas.
Se debe entender que tanto la descripción general mencionada anteriormente como la descripción detallada que sigue a continuación son únicamente a modo de ejemplo y explicativas y no limitan las reivindicaciones.
Los dibujos adjuntos, que se incorporan y forman parte de la presente memoria descriptiva, ilustran una (varias) realización o realizaciones y, junto con la descripción, sirven para explicar los principios que se describen en el presente documento.
BREVE DESCRIPCIÓN DE LOS DIBUJOS
La Figura 1 muestra un ejemplo de un primer componente de un sistema de dos componentes, donde el primer componente es un agente de acoplamiento de linfocitos T dirigido en un estado inactivo con una pareja de unión inerte.
La Figura 2 muestra el proceso mediante el cual se escinde el conector escindible y la pareja de unión inerte se libera para crear una entidad activa.
La Figura 3 ilustra la creación de un agente de acoplamiento de linfocitos T, dirigido activo después de liberar la pareja de unión inerte de un par de componentes complementarios en un sistema de dos componentes.
Las Figuras 4A-C ilustran la escisión del proceso por etapas del par de componentes complementarios en un sistema de dos componentes que se unen a la célula diana (A), la escisión del conector que une las parejas de unión inertes (A y B) y la unión para crear un resto activo competente de linfocitos T.
Las Figuras 5A-B proporcionan la evaluación de los constructos mediante SDS PAGE y tinción con azul de Coomassie.
La Figura 6 muestra la expresión de IFNy como una aproximación para la respuesta de los linfocitos T cuando las células cancerosas se trataron con diversos constructos y combinaciones individuales, con 6245 sirviendo como control positivo y la combinación de 6248 y 6249 mostrando resultados beneficiosos.
La Figura 7 muestra la expresión de IFNy como aproximación para la respuesta de los linfocitos T cuando las células cancerosas se trataron con diversos constructos y combinaciones individuales, con 6245 como control positivo y la combinación de 6248 y 6249 mostrando resultados beneficiosos.
La Figura 8 muestra la expresión de IFNy como aproximación para la respuesta de los linfocitos T cuando las células cancerosas se trataron con diferentes concentraciones de constructos, con 6245 como control positivo y la combinación de 6248 y 6249 mostrando resultados beneficiosos.
Las Figuras 9A-B muestran la expresión de IFNy como aproximación para la respuesta de los linfocitos T cuando las células cancerosas se trataron con controles o diferentes concentraciones de constructos, con 6245 como control positivo y la combinación de 6248 y 6249 mostrando resultados beneficiosos. PHA también sirvió como control positivo para la activación inespecífica de linfocitos T.
La Figura 10 muestra la expresión de IFNy como aproximación para la respuesta de los linfocitos T cuando las células cancerosas se trataron con controles o diferentes concentraciones de constructos, con niveles muy bajos de los constructos que tienen solo un VH o VL para el scFv anti-CDE3, pero los constructos biespecíficos de control positivo (tanto 9332 como 9333) mostraron niveles de actividad más altos.
La Figura 11 proporciona una evaluación estequiométrica de constructos complementarios de un sistema de dos componentes.
La Figura 12 muestra la expresión de IFNy como aproximación para la respuesta de los linfocitos T cuando las células cancerosas MCF-7 se trataron con controles o diferentes concentraciones de constructos.
La Figura 13 muestra la expresión de IFNy como aproximación para la respuesta de los linfocitos T cuando las células cancerosas se trataron con controles o diferentes concentraciones de constructos que se dirigen a EpCAM.
La Figura 14 muestra la expresión de IFNy como aproximación para la respuesta de los linfocitos T cuando las células cancerosas se trataron con controles o diferentes concentraciones de constructos que se dirigen a epítopos de EGFR biparatópicos o una combinación de direccionamiento de EpCAM y EGFR.
La Figura 15 muestra el impacto de los inhibidores de proteasa en constructos que contienen sitios de escisión de proteasa o que no contienen sitios de escisión de proteasa.
La Figura 16 muestra que se pueden usar diferentes tipos de restos de direccionamiento, emparejando de forma satisfactoria un constructo que tiene un resto de direccionamiento de VHH con un constructo que tiene un resto de scFv.
La Figura 17 muestra un esquema de secuencias para los constructos 6248 y 6249 con los diversos conectores encuadrados y el sitio de escisión de proteasa en negrita y subrayado. La etiqueta His también está en negrita.
DESCRIPCIÓN DE LAS SECUENCIAS
Las Tablas 1A y 1B proporcionan un listado de ciertas secuencias a las que se hace referencia en el presente documento.
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DESCRIPCION DETALLADA
I. Sistema de dos componentes que comprende al menos un agente de acoplamiento de linfocitos T dirigido Se describe una variedad de agentes de acoplamiento de linfocitos T dirigidos, que se incluyen como parte de un sistema de dos componentes que comprende un primer componente y un segundo componente. En cada divulgación, sin embargo, se puede usar un resto de direccionamiento para suministrar el agente de acoplamiento de linfocitos T dirigido a una zona de células no deseadas, lo que permite un efecto terapéutico al suministrarse por vía local. El agente de acoplamiento de linfocitos T dirigido también contiene un primer dominio de acoplamiento de linfocitos T capaz de actividad cuando se une a un segundo dominio de acoplamiento de linfocitos T, pero el segundo dominio de acoplamiento de linfocitos T no es parte del agente de acoplamiento de linfocitos T dirigido. En otras palabras, sin el segundo dominio de acoplamiento de linfocitos T que no es parte del agente de acoplamiento de linfocitos T dirigido, el primer dominio de acoplamiento de linfocitos T no es capaz de actividad de acoplamiento de linfocitos T. El agente de acoplamiento de linfocitos T dirigido también comprende una pareja de unión inerte capaz de unirse al primer dominio de acoplamiento de linfocitos T y evitar que se una a un segundo dominio de acoplamiento de linfocitos T. En otras palabras, la pareja de unión inerte se une al primer dominio de acoplamiento de linfocitos T de modo que el primer dominio de acoplamiento de linfocitos T no se una al segundo dominio de acoplamiento de linfocitos T a menos que se retire la pareja de unión inerte. Al no unirse, la aplicación no excluye la unión no específica o bajos niveles de unión (por ejemplo, < 1 %, < 5 %, < 10 %). El concepto es uno de insuficiencia funcional con la complementación de VH/VL de novo suficiente para unirse a diana de linfocitos T. La escisión proteolítica libera los grupos VH o VL inertes permitiendo la oportunidad de volver a emparejar los pares VH y VL activos en la superficie celular. Además, el agente de acoplamiento de linfocitos T dirigido incluye un sitio de escisión que separa el primer dominio de acoplamiento de linfocitos T y la pareja de unión inerte. El sitio de escisión se escinde cuando el agente de acoplamiento de linfocitos T dirigido está en el microentorno de las células no deseadas.
El segundo dominio de acoplamiento de linfocitos T puede ser parte de un segundo agente de acoplamiento de linfocitos T dirigido. Por lo tanto, un kit o composición puede comprender dos agentes de acoplamiento de linfocitos T dirigidos, uno con un primer dominio de acoplamiento de linfocitos T y otro con un segundo dominio de acoplamiento de linfocitos T. En tal kit o composición, las parejas de unión inertes pueden ser capaces de disociación una vez que se ha escindido el sitio de escisión en cada agente; después de la disociación, los dos dominios de acoplamiento de linfocitos T pueden ser capaces de unirse entre sí y exhibir actividad.
En divulgaciones con dos agentes de acoplamiento de linfocitos T dirigidos, el sistema de dos componentes comprende un dominio de acoplamiento de linfocitos T que puede ser un dominio VH y otro dominio de acoplamiento de linfocitos T que puede ser un dominio VL. En divulgaciones con dos agentes de acoplamiento de linfocitos T dirigidos, los restos de direccionamiento en el primer componente y en el segundo componente pueden ser iguales o pueden ser diferentes.
En divulgaciones con dos agentes de acoplamiento de linfocitos T dirigidos, los sitios de escisión en el primer componente y en el segundo componente pueden ser iguales o pueden ser diferentes.
La Figura 1 muestra un ejemplo de un constructo de agente de acoplamiento de linfocitos T dirigido que comprende (a) un dominio de direccionamiento de scFv que comprende un dominio VH y un dominio VL que se unen a la diana, en donde el dominio VH y el dominio VL están conectados mediante un conector flexible; (b) un dominio de acoplamiento de linfocitos T inactivo que comprende un dominio VL que se une a un dominio VH inerte, en donde los dominios VH y VL están conectados mediante un conector flexible que tiene un sitio de escisión, y (c) un conector flexible que se une al dominio de direccionamiento y al dominio de acoplamiento de linfocitos T inactivo.
La Figura 2 muestra el proceso mediante el cual se escinde el conector escindible y la pareja de unión inerte se libera para crear una entidad sin una pareja de unión inerte. Esta entidad aún es inactiva porque el dominio VL en el dominio de acoplamiento de linfocitos T no es activo por sí mismo.
La Figura 3 ilustra la creación de un agente de acoplamiento de linfocitos T dirigido después de liberar la pareja de unión inerte de un par de agentes de acoplamiento de linfocitos T dirigidos complementarios.
Las Figuras 4A-C ilustran la escisión del proceso por etapas de los agentes de acoplamiento de linfocitos T dirigidos que se unen a la célula diana (4A), la escisión de las parejas de unión inertes (4A y 4B), y la unión para crear un agente de acoplamiento de linfocitos T dirigido activo (4C).
Alternativamente, el segundo dominio de acoplamiento de linfocitos T puede no estar unido a un resto de direccionamiento y/o puede no comprender un sitio de escisión y una pareja de unión inerte. En algunos casos, el segundo dominio de acoplamiento de linfocitos T puede estar conjugado o unido a un resto de direccionamiento (ya sea un resto de direccionamiento igual o un resto de direccionamiento diferente), pero en la divulgación podría no estar conjugado o unido a una pareja de unión inerte. En tal divulgación, solo el primer dominio de acoplamiento de linfocitos T está unido a una pareja de unión inerte. En otra divulgación, el segundo dominio de acoplamiento de linfocitos T también puede comprender un resto de direccionamiento, un sitio de escisión, y una pareja de unión inerte, cada uno tal como se describe en el presente documento.
La disposición estructural desde el extremo N-terminal al extremo C-terminal del primer componente puede comprender IBVL-L1-TCEVH-L2-TVL-L3-TVH. La disposición estructural desde el extremo N-terminal al extremo C-terminal del segundo componente puede comprender TCEVL-L2-TVH-L3-TVL. La disposición estructural desde el extremo N-terminal al extremo C-terminal del segundo componente puede comprender IBVH-L1-TCEVL-L2-TBVH-L3-TBVL. En cada uno de estos, IB significa pareja de unión inerte e IBVL es una pareja de unión inerte de VL, mientras que IBVH es un dominio de unión de inserción de VH. TCE significa acoplamiento de linfocitos T y un TCEVL es una porción VL de un dominio de acoplamiento de linfocitos T y un TCEVH es una porción VH de un dominio de acoplamiento de linfocitos T. TB significa dominio de unión a diana y un TBVH es una porción VH de un dominio de unión a diana y un TBVL es una porción de VL de un dominio de unión a diana. L1 es un conector con un sitio de escisión de proteasa, mientras que L2 y L3 son opcionalmente conectores que opcionalmente no se pueden escindir por la misma proteasa que L1.
A. Resto de direccionamiento
El resto de direccionamiento funciona en el agente de acoplamiento de linfocitos T dirigido suministrando el agente al entorno local de las células no deseadas, lo que permite una estrategia de tratamiento localizada. En ciertos casos, el resto de direccionamiento se dirige a las células no deseadas uniéndose específicamente a las células no deseadas. En algunos casos, el resto de direccionamiento se une específicamente a las células no deseadas incluso mientras la pareja de unión inerte se une al primer dominio de acoplamiento de linfocitos T.
En algunas divulgaciones, un primer resto de direccionamiento está unido, opcionalmente mediante un conector, a un primer dominio de acoplamiento de linfocitos T y, como parte de un constructo separado, un segundo resto de direccionamiento está unido, opcionalmente mediante un conector, a un segundo dominio de acoplamiento de linfocitos T. De esta manera, cada parte complementaria del dominio de acoplamiento de linfocitos T se suministra a las células no deseadas mediante un resto de direccionamiento separado. En algunas divulgaciones, los restos de direccionamiento son del mismo tipo y, en otras, los restos de direccionamiento son diferentes. Cuando los restos de direccionamiento son de diferentes tipos, se pueden dirigir a diferentes epítopos (ya sea superpuestos o no superpuestos) en la misma proteína diana de la célula no deseada o se pueden dirigir a diferentes proteínas diana. En situaciones en las que los restos de direccionamiento se dirigen a diferentes proteínas, la célula no deseada expresará un antígeno que corresponde a cada uno de los dos tipos de restos diana, proporcionando una especificidad adicional para este enfoque.
El resto de direccionamiento puede ser un anticuerpo o parte funcional del mismo. Por parte funcional, los investigadores se refieren a cualquier fragmento de anticuerpo que conserva su actividad de unión a la diana en la célula no deseada, tal como un scFv o VHH u otro fragmento funcional que incluya una inmunoglobulina desprovista de cadenas ligeras, Fab, Fab', F(ab')2 , Fv, fragmento de anticuerpo, diacuerpo, scAB, anticuerpo de cadena pesada de dominio único, anticuerpo de cadena ligera de dominio único, Fd, regiones CDR o cualquier porción o secuencia peptídica del anticuerpo que sea capaz de unirse al antígeno o epítopo. A menos que se indique específicamente como "anticuerpo de longitud completa", cuando la solicitud se refiere a un anticuerpo, incluye inherentemente una referencia a una parte funcional del mismo.
Ciertas dianas de anticuerpo (con los ejemplos de tipos de células no deseadas entre paréntesis) pueden incluir: Her2/Neu (neoplasias malignas epiteliales); CD22 (linfocitos B, autoinmunes o malignos); EpCAM (CD326) (neoplasias malignas epiteliales); EGFR (neoplasias malignas epiteliales); PMSA (carcinoma de próstata); CD30 (neoplasias malignas de linfocitos B); CD20 (linfocitos B, autoinmunes, alérgicos o malignos); c D33 (neoplasias malignas mieloides); lgE de membrana (linfocitos B alérgicos); receptor de lgE (CD23) (mastocitos o linfocitos B en enfermedades alérgicas), CD80 (linfocitos B, autoinmunes, alérgicos o malignos); CD86 (linfocitos B, autoinmunes, alérgicos o malignos); CD2 (linfomas de linfocitos T o linfocitos NK); CA125 (cánceres múltiples, incluyendo carcinoma de ovario); anhidrasa carbónica IX (cánceres múltiples, incluyendo carcinoma de células renales); CD70 (linfocitos B, autoinmunes, alérgicos o malignos); CD74 (linfocitos B, autoinmunes, alérgicos o malignos); CD56 (linfomas de linfocitos T o linfocitos NK); CD40 (linfocitos B, autoinmunes, alérgicos o malignos); CD19 (linfocitos B, autoinmunes, alérgicos o malignos); c-met/HGFR (neoplasias malignas del tracto gastrointestinal y hepáticas; TRAIL-R1 (neoplasias malignas múltiples incluyendo carcinoma de ovario y colorrectal); DRS (neoplasias malignas múltiples incluyendo carcinoma de ovario y colorrectal); PD-1 (linfocitos B, autoinmunes, alérgicos o malignos); PD1L (neoplasias malignas múltiples incluyendo adenocarcinoma epitelial); IGF-1R (la mayoría de las neoplasias malignas incluyendo adenocarcinoma epitelial); VEGF-R2 (la vasculatura asociada a la mayoría de las neoplasias malignas incluyendo adenocarcinomas epiteliales; antígeno de células madre prostáticas (PSCA) (adenocarcinoma de próstata); MUC1 (neoplasias malignas epiteliales); CanAg (tumores tales como carcinomas de colon y páncreas); mesotelina (muchos tumores incluyendo mesotelioma y adenocarcinoma de ovario y pancreático); P-cadherina (neoplasias malignas epiteliales, incluyendo adenocarcinoma de mama); miostatina (GDF8) (muchos tumores incluyendo sarcoma y adenocarcinoma de ovario y pancreático); Cripto (TDGF1) (neoplasias malignas epiteliales incluyendo cánceres de colon, mama, pulmón, ovario y pancreáticos); ACVRL 1/ALK1 (neoplasias malignas múltiples incluyendo leucemias y linfomas); MUC5AC (neoplasias malignas epiteliales, incluyendo adenocarcinoma de mama); CEACAM (neoplasias malignas epiteliales, incluyendo adenocarcinoma de mama); CD137 (linfocitos B o linfocitos T, autoinmunes, alérgicos o malignos); CXCR4 (linfocitos B o linfocitos T, autoinmunes, alérgicos o malignos); Neuropilina 1 (neoplasias malignas epiteliales, incluyendo cáncer de pulmón); Glipicanos (cánceres múltiples incluyendo cánceres de hígado, cerebro y mama); HER3/EGFR (neoplasias malignas epiteliales); PDGFRa (neoplasias malignas epiteliales); EphA2 (cánceres múltiples incluyendo neuroblastoma, melanoma, cáncer de mama, y carcinoma de pulmón microcítico); CD38 (mieloma); CD138 (mieloma); a4-integrina (AML, mieloma, CLL, y la mayoría de los linfomas).
Los anticuerpos pueden incluir un anticuerpo anti-receptor del factor de crecimiento epidérmico tal como Cetuximab, un anticuerpo anti-Her2, un anticuerpo anti-CD20 tal como Rituximab, un anticuerpo anti-CD22 tal como Inotuzumab, G544 o BU59, un anticuerpo anti-CD70, un anticuerpo anti-CD33 tal como hp67.6 o Gemtuzumab, un anticuerpo anti-MUCl tal como GP1.4 y SM3, un anticuerpo anti-CD40, un anticuerpo anti-CD74, un anticuerpo anti-P-cadherina, un anticuerpo anti-EpCAM , un anticuerpo anti-CD138, un anticuerpo anti-E-cadherina, un anticuerpo anti­ CEA, un anticuerpo anti-FGFR3 y un anticuerpo anti-a4-integrina tal como natalizumab.
La Tabla 2A proporciona ejemplos no limitantes de tipos de cáncer, posibles restos diana y proteasas que son expresadas por esos tipos de cáncer. Para preparar un sistema de dos componentes, el cáncer se puede identificar a partir de la columna 1, una o dos dianas elegidas para el resto de direccionamiento (si se desea) y también una o dos proteasas elegidas para el tipo de cáncer (si se desea). Otras secciones de la presente solicitud discuten cuándo usar uno frente a dos restos de direccionamiento y uno frente a dos sitios de escisión de proteasa.
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Por ejemplo, cuando los restos de direccionamiento en el primer y el segundo componentes son diferentes, la Tabla 2B proporciona un listado no limitante de restos de direccionamiento potenciales para usar en combinación con tipos de cáncer en particular. En un sistema de dos componentes, un resto de direccionamiento podría estar presente para el primer componente y opcionalmente puede estar presente un segundo resto de direccionamiento para el segundo componente. Si solo el primer componente tiene un resto de direccionamiento o si el primer y el segundo componentes tienen el mismo resto de direccionamiento, cualquier resto de direccionamiento enumerado en la columna 1 o en la columna 2 de la tabla se puede usar cuando el tipo de cáncer está enumerado en la columna 3.
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También se desvela en donde el resto de direccionamiento no es un anticuerpo, pero es otro tipo de resto de direccionamiento. Por ejemplo, un resto de direccionamiento puede ser una pareja de unión para una proteína conocida por su expresión en la célula no deseada. Tales niveles de expresión pueden incluir sobreexpresión. Por ejemplo, las siguientes parejas de unión se pueden unir a las siguientes dianas en una célula no deseada:
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No es necesario que la pareja de unión comprenda la secuencia de longitud completa o de tipo silvestre para las parejas de unión que se enumeran en la Tabla 3. Todo lo que se requiere es que la pareja de unión se una a la diana en la célula no deseada y, por lo tanto, puede incluir formas truncadas, análogos, variantes, y derivados que se conocen bien en la técnica.
Además, la pareja de unión puede ser un aptámero que es capaz de unirse a una proteína conocida por qué se expresa en la célula no deseada. Los aptámeros que se unen a células no deseadas, tales como células cancerosas, se conocen bien y se conocen métodos para diseñarlos.
Para seleccionar un panel de aptámeros específicos de células diana de una biblioteca de candidatos aleatorios se pueden usar sistemas SELEX basados en células. Un conjunto de ADNss se puede disolver en tampón de unión y se puede desnaturalizarse y a continuación se puede incubar con células diana. Después del lavado, los ADN unidos se pueden eluir calentando y a continuación se pueden incubar con células negativas (si se desea), centrifugar y retirar el sobrenadante. El sobrenadante se puede amplificar mediante PCR con cebadores marcados con biotina. El ADNss de sentido (codificante) seleccionado se puede separar de la hebra biotinada antisentido (no codificante) usando perlas revestidas con estreptavidina. Para aumentar la afinidad, se puede aumentar la fuerza del lavado aumentando el tiempo de lavado, el volumen de tampón y el número de lavados. Después de las rondas de selección deseadas, el conjunto de ADNss seleccionado se puede amplificar por PCR y se puede clonar en E. coli y secuenciar. Véase Shangguan et al., Aptamers evolved from live cells as effective molecular probes for cancer study, PNAS 103 (32:11838-11843 (2006); Lyu et al., Generating Cell Targeting Aptamers for Nanotherapeutics Using Cell-SELEX, Theranostics 6(9): 1440-1452 (2016); véase también Li et al., Inhibition of Cell Proliferation by an Anti-EGFR Aptamer, PLoS One 6(6): e20229 (2011). Estas referencias describen enfoques específicos para diseñar aptámeros y aptámeros específicos que se unen a células cancerosas.
Por ejemplo, un aptámero puede comprender las SEQ ID NO: 94 a 164. En algunas realizaciones, un aptámero puede comprender la SEQ ID NO: 95. Estos aptámeros están dirigidos a EGFR y se proporcionan solo como representativos de los aptámeros que se pueden unir a las dianas presentadas en células no deseadas. Otros aptámeros frente a otras dianas en células no deseadas se describen en Zhu et al., Progress in Aptamer Mediated Drug Delivery Vehicles for Cancer Targeting, Theranostics 4(9): 931-944 (2014).
Los aptámeros para uso en el presente documento se pueden unir a la diana en la célula no deseada con una Kd en el intervalo nanomolar a picomolar (tal como de 1 picomolar a 500 nanomolar o de 1 picomolar a 100 nanomolar).
B. Dominio de acoplamiento de linfocitos T
El agente de acoplamiento de linfocitos T dirigido comprende un primer dominio de acoplamiento de linfocitos T que es incapaz de acoplarse al un linfocito T solo. En su lugar, el primer dominio de acoplamiento de linfocitos T es capaz de actividad cuando se une a un segundo dominio de acoplamiento de linfocitos T, que no es parte del agente de acoplamiento de linfocitos T dirigido. Por lo tanto, el primer y el segundo dominios de acoplamiento de linfocitos T puede ser cualquiera de dos restos que no tengan actividad de acoplamiento de linfocitos T solos, pero que la tienen cuando se combinan entre sí. En otras palabras, el primer y el segundo dominios de acoplamiento de linfocitos T son mitades complementarias de una proteína activa funcional.
Cuando los dos dominios de acoplamiento de linfocitos T están asociados juntos en el sistema de dos componentes, se pueden unir al antígeno CD3 y/o al receptor de linfocitos T en la superficie del linfocito T, ya que estos activan los linfocitos T. CD3 está presente en todos los linfocitos T y consta de subunidades denominadas y, 6, £, Z, y n. La cola citoplasmática de CD3 es suficiente para transducir las señales necesarias para la activación de los linfocitos T en ausencia de los otros componentes del complejo receptor de TCR. Normalmente, la activación de la citotoxicidad de los linfocitos T depende en primer lugar de la unión del TCR con una proteína del complejo principal de histocompatibilidad (MHC), que a su vez se une a un antígeno extraño, ubicado en una célula separada. En una situación normal, solamente cuando se ha producido esta unión inicial de TCR-MHC, puede resultar la cascada significativa dependiente de CD3 responsable de la expansión clonal de los linfocitos T y, por último, de la citotoxicidad de los linfocitos T. Sin embargo, en algunos casos, cuando el sistema de dos componentes se une a CD3 y/o al TCR, la activación de los linfocitos T citotóxicos en ausencia de TCR-MHC independiente se puede producir en virtud de la reticulación de las moléculas de CD3 y/o TCR imitando una formación de sinapsis inmunitaria. Esto significa que los linfocitos T se pueden activar por vía citotóxica de una manera clonalmente independiente, es decir, de una manera que es independiente del clon de TCR específico portado por el linfocito T. Esto permite la activación de todo el compartimento de los linfocitos T en lugar de solo los linfocitos T específicos de una determinada identidad clonal.
En una divulgación, el primer dominio de acoplamiento de linfocitos T es un dominio VH y el segundo dominio de acoplamiento de linfocitos T es un dominio VL. En otra divulgación, el primer dominio de acoplamiento de linfocitos T es un dominio VL y el segundo dominio de acoplamiento de linfocitos T es un dominio VH. En tales divulgaciones, cuando se emparejan juntos, el primer y el segundo dominios de acoplamiento de linfocitos T pueden comprender un scFv.
Si el primer y el segundo dominios de acoplamiento de linfocitos T son un par de dominios VH y VL, los dominios VH y VL pueden ser específicos para un antígeno expresado en la superficie de un linfocito T, tal como CD3 o TCR. Si el antígeno es CD3, un dominio de acoplamiento de linfocitos T potencial se puede obtener a partir de muromonab.
C. Pareja de unión inerte
El agente de acoplamiento de linfocitos T dirigido también comprende al menos una pareja de unión inerte capaz de unirse al primer dominio de acoplamiento de linfocitos T y evitar que se una a un segundo dominio de acoplamiento de linfocitos T a menos que se produzcan ciertas condiciones. Cuando el primer dominio de acoplamiento de linfocitos T está unido a la al menos una pareja de unión inerte, no tiene una actividad de acoplamiento de linfocitos T. En otras palabras, la al menos una pareja de unión inerte paraliza la función del primer dominio de acoplamiento de linfocitos T bloqueando la unión de su par complementario (el segundo dominio de acoplamiento de linfocitos T) y evitando que los dos dominios se unan juntos para tener una actividad de acoplamiento de linfocitos T. En otras palabras, la pareja de unión inerte se une al primer dominio de acoplamiento de linfocitos T de modo que el primer dominio de acoplamiento de linfocitos T no se una al segundo dominio de acoplamiento de linfocitos T a menos que se retire la pareja de unión inerte. Al no unirse, la aplicación no excluye la unión inespecífica o bajos niveles de unión (por ejemplo, < 1 %, < 5 %, < 10 %).
La pareja de unión inerte se puede unir específicamente al dominio de acoplamiento de linfocitos T.
La al menos una pareja de unión inerte puede ser un dominio VH o VL. Cuando el dominio de acoplamiento de linfocitos T en el agente de acoplamiento de linfocitos T dirigido es un dominio VH, la pareja de unión inerte puede ser un dominio VL y cuando el primer dominio de acoplamiento de linfocitos T es un dominio VL, la pareja de unión inerte puede ser un dominio VH.
Si un primer componente comprende un resto de direccionamiento y un dominio de acoplamiento de linfocitos T de VL y una pareja de unión inerte de VH, la pareja de unión inerte de VH puede tener una constante de disociación de equilibrio para unirse al dominio de acoplamiento de linfocitos T de VL, que es mayor que la constante de disociación de equilibrio del dominio de acoplamiento de linfocitos T de VL para su pareja de dominio de acoplamiento de linfocitos T de VH en el segundo componente. La frase anterior puede ser igualmente cierta cuando VH se cambia por VL y viceversa.
Basándose en la evidencia empírica de los ejemplos, se cree que el uso de la pareja de unión inerte como pareja de emparejamiento incorrecto con el dominio de acoplamiento de linfocitos T en el constructo da como resultado constructos que son más estables y más fáciles de fabricar.
D. Sitio de escisión
A modo de visión de conjunto, el sitio de escisión se puede (i) escindir mediante una enzima expresada por las células no deseadas; (ii) escindir por medio de una reacción de escisión sensible al pH dentro de la célula no deseada; (iii) escindir mediante una reacción de escisión dependiente de complemento; o (iv) escindir mediante una proteasa que está colocalizada en la célula no deseada mediante un resto de direccionamiento que es igual o diferente al resto de direccionamiento en el agente. El sitio de escisión puede ser un sitio de escisión de proteasa.
Los sitios de escisión funcionan para liberar la pareja de unión inerte del primer dominio de acoplamiento de linfocitos T. Los sitios de escisión pueden funcionar de diferentes maneras para liberar la pareja de unión inerte de los epítopo sus de linfocitos T del primer dominio de acoplamiento de linfocitos T en el microentorno de las células no deseadas. La escisión se puede producir dentro de la célula no deseada o fuera de la célula no deseada, dependiendo de la estrategia empleada. Si la escisión se produce fuera de la célula no deseada, el dominio de acoplamiento de linfocitos T se puede presentar sin internalizarse primero en una célula y acoplarse en las rutas clásicas de procesamiento de antígenos.
Al menos un sitio de escisión se puede escindir mediante una enzima expresada por las células no deseadas. Se sabe que las células cancerosas, por ejemplo, expresan ciertas enzimas, tales como proteasas, y estas se pueden emplear en esta estrategia para escindir el sitio de escisión del agente de acoplamiento de linfocitos T dirigido. A modo de ejemplo no limitante, la catepsina B escinde FR, FK, VA y VR entre otros; la catepsina D escinde PRSFFRLGK (SEQ ID NO: 45), ADAM28 escinde KPAKFFRL (SEQ ID NO: 1), DPAKFFRL (SEQ ID NO: 2), KPMKFFRL (SEQ ID NO: 3) y LPAKFFRL (SEQ ID NO: 4); y MMP2 escinde AIPVSLR (SEQ ID NO: 46), SLPLGLWAPNFN (SEQ ID NO: 47), HPVGLLAR (SEQ ID NO: 48), GPLGVRGK (SEQ ID NO: 49), y GPLGLWAQ (SEQ ID NO: 50), por ejemplo. También se pueden emplear otros sitios de escisión enumerados en las Tablas 1A o 2A. Los sitios de escisión de proteasa y las proteasas asociadas con el cáncer se conocen bien en la técnica. Oncomine (www.oncomine.org) es una base de datos de expresión génica del cáncer en línea, por lo que cuando el agente que se desvela en el presente documento es para tratar el cáncer, la persona con experiencia puede buscar en la base de datos Oncomine para identificar un sitio de escisión de proteasa en particular (o dos sitios de escisión de proteasa) que será apropiado para tratar un tipo de cáncer dado. Las bases de datos alternativas incluyen el European Bioinformatic Institute (www.ebi.ac.uk), en particular (www.ebi.ac.uk/gxa). Las bases de datos de proteasas incluyen PMAP (www.proteolysis.org), corte peptídico ExPASy (ca.expasy.org/tools/peptidecutter) y PMAP.Cut DB (cutdb.burnham.org).
Al menos un sitio de escisión se puede escindir por medio de una reacción de escisión sensible al pH dentro de la célula no deseada. Si el agente de acoplamiento de linfocitos T dirigido se internaliza en la célula, la reacción de escisión se puede producir dentro de la célula y se puede desencadenar por un cambio en el pH entre el microentorno fuera de la célula no deseada y el interior de la célula. Específicamente, se sabe que algunos tipos de cáncer tienen entornos ácidos en el interior de las células cancerosas. Este enfoque se puede emplear cuando el tipo de célula no deseada interior tiene un pH característicamente diferente del microentorno extracelular, tal como particularmente el glicocáliz. Dado que la escisión por pH se puede producir en todas las células de las lisozimas, la selección de un agente de direccionamiento, cuando se usa un sitio de escisión sensible al pH, puede requerir, cuando se desee, más especificidad. Por ejemplo, cuando se usa un sitio de escisión sensible al pH, se puede desear un agente de direccionamiento que se una solo o muy preferentemente a las células cancerosas (tal como, por ejemplo, un anticuerpo que se une a la mesotelina para el tratamiento del cáncer de pulmón).
Al menos un sitio de escisión se puede escindir mediante una reacción de escisión dependiente de complemento. Una vez que los agentes de acoplamiento de linfocitos T dirigidos se unen a la célula no deseada, se puede activar la cascada del complemento del paciente. En tal caso, la cascada del complemento también se puede usar para escindir la pareja de unión inerte del primer dominio de acoplamiento de linfocitos T mediante el uso de un sitio de escisión sensible a una proteasa del complemento. Por ejemplo, C1r y C1s y las convertasas C3 (C4B,2a y C3b,Bb) son serina proteasas. C3/C5 y C5 también son proteasas del complemento. También se pueden usar proteínas de unión asociadas a manosa (MASP), serina proteasas que también participan en la cascada del complemento y son responsables de la escisión de C4 y C2 en C4b2b (una convertasa C3). Por ejemplo, y sin limitación, C1s escinde YlGrSYKV y MQLGRX. Se cree que MASP2 escinde SLGRKIQI. Se cree que el componente del complemento C2a y el factor del complemento Bb escinden GLARSNLDE.
Al menos un sitio de escisión se puede escindir mediante una proteasa que está colocalizada en la célula no deseada mediante un resto de direccionamiento que es igual o diferente al resto de direccionamiento en el agente de acoplamiento de linfocitos T dirigido. Por ejemplo, cualquier proteasa se puede dirigir simultáneamente al microentorno de las células no deseadas conjugando la proteasa con un agente de direccionamiento que suministra la proteasa a esa ubicación. El agente de direccionamiento puede ser cualquier agente de direccionamiento que se describe en el presente documento. La proteasa se puede fijar al agente de direccionamiento mediante un péptido o conector químico y puede mantener suficiente actividad enzimática cuando se une al agente de direccionamiento. Tanto el primer componente como el segundo componente pueden presentar emparejamiento incorrecto con una pareja de unión inerte. En una divulgación, el sitio de escisión de proteasa en el primer componente y en el segundo componente es el mismo iguales. En otra divulgación, los sitios de escisión de proteasa en el primer componente y en el segundo componente son diferentes sitios de escisión para la misma proteasa. En otra divulgación, los sitios de escisión de proteasa en el primer componente y en el segundo componente son sitios de escisión para diferentes proteasas. En algunas divulgaciones que emplean dos proteasas diferentes, la célula no deseada expresa ambas proteasas.
En una divulgación, en un primer componente, la pareja de unión inerte en un estado no escindido interfiere con la unión específica de un dominio de acoplamiento de linfocitos T, VL o VH, a su pareja de dominio de acoplamiento de linfocitos T, VH o VL, respectivamente, en un segundo componente. En una divulgación, la pareja de unión inerte en un estado no escindido inhibe la unión del dominio de acoplamiento de linfocitos T, VL o VH, a su pareja de dominio de acoplamiento de linfocitos T, VH o VL, respectivamente, en un segundo componente de modo que la constante de disociación (Kd) del dominio de acoplamiento de linfocitos T, VL o VH, para su pareja de dominio de acoplamiento de linfocitos T, VH o VL, respectivamente, en un segundo componente en un estado no escindido sea al menos 100 veces mayor que la Kd del dominio de acoplamiento de linfocitos T, VL o VH, para su pareja de dominio de acoplamiento de linfocitos T, VH o VL, respectivamente, en un segundo componente en estado escindido.
E. Conectores
Además del sitio de escisión, opcionalmente se pueden usar conectores para unir las partes separadas de los agentes de acoplamiento de linfocitos T dirigidos juntas. Por conector, los investigadores incluyen cualquier resto químico que una estas partes. En algunas realizaciones, los conectores pueden ser conectores flexibles. Los conectores incluyen péptidos, polímeros, nucleótidos, ácidos nucleicos, polisacáridos y especies orgánicas lipídicas (tal como polietilenglicol). En algunas realizaciones, el conector es un conector peptídico. Los conectores peptídicos pueden tener una longitud de aproximadamente 2-100, 10-50 o 15-30 aminoácidos. En algunas realizaciones, los conectores peptídicos pueden tener al menos 10, al menos 15 o al menos 20 aminoácidos de longitud y no más de 80, no más de 90 o no más de 100 aminoácidos de longitud. En algunas realizaciones, el conector es un conector peptídico que tiene una secuencia o secuencias GGGGS (SEQ ID NO: 85), GGGS (SEQ ID NO: 86), GS (SEQ ID NO: 87), GSGGS (SEQ ID NO: 88), GGSG (SEQ ID NO: 89), GGSGG (SEQ ID NO: 90), GSGSG (SEQ ID NO: 91), GSGGG (SEQ ID NO: 92), GGGSG (SEQ ID NO: 93), y/o GSSSG (SEQ ID NO: 94) únicas o de repetición.
En algunas realizaciones, el conector es un conector de maleimida (MPA) o SMCC.
F. Métodos de fabricación
Los agentes de acoplamiento de linfocitos T dirigidos, como se describe en el presente documento, se pueden fabricar usando técnicas de ingeniería genética. Específicamente, un ácido nucleico se puede expresar en un hospedador adecuado para producir un agente de acoplamiento de linfocitos T dirigido. Por ejemplo, se puede preparar un vector que comprenda una secuencia de ácidos nucleicos que codifique el agente de acoplamiento de linfocitos T dirigido incluyendo todas sus partes componentes y conectores y ese vector se puede usar para transformarse en una célula hospedadora apropiada.
En el vector también se pueden usar diversos elementos reguladores, dependiendo de la naturaleza del hospedador y la forma de introducción del ácido nucleico en el hospedador, y, si se desea, el mantenimiento o la integración episómica.
También se pueden emplear técnicas de enlace químico, tales como el uso de conectores de maleimida o SMCC. En los casos en los que la pareja de unión es un aptámero, una persona con experiencia habitual en la materia podría comprender cómo conjugar un aptámero con una proteína, es decir, el dominio de acoplamiento de linfocitos T. Los aptámeros se pueden conjugar usando un enlace tiol u otras químicas de conjugación estándar. Un grupo maleimido, succinimido o SH se puede añadir al aptámero para unirlo al dominio de acoplamiento de linfocitos T. II. Composiciones farmacéuticas
Los agentes de acoplamiento de linfocitos T dirigidos se pueden emplear como composiciones farmacéuticas. Como tales, se pueden preparar junto con un vehículo farmacéuticamente aceptable. Si se desea la administración parenteral, por ejemplo, los agentes de acoplamiento de linfocitos T dirigidos se pueden proporcionar en agua para inyección estéril, sin pirógenos o solución salina estéril, sin pirógenos. Alternativamente, los agentes de acoplamiento de linfocitos T dirigidos se pueden proporcionar en forma liofilizada para resuspensión con la adición de un vehículo líquido estéril.
III. Métodos de tratamiento
A. Reducción de células no deseadas, direccionamiento de la respuesta inmunitaria y tratamiento del cáncer Los agentes de acoplamiento de linfocitos T dirigidos que se describe en el presente documento se pueden usar en un método de tratamiento de una enfermedad en un paciente caracterizada por la presencia de células no deseadas que comprende administrar un sistema de dos componentes que comprende al menos un agente de acoplamiento de linfocitos T dirigido y un segundo componente al paciente, ya que cada uno de los componentes se ha descrito en detalle de varias formas anteriormente. Además, los agentes que se describen en el presente documento también se pueden usar en un método para dirigir la propia respuesta inmunitaria del paciente a células no deseadas que comprende administrar un sistema de dos componentes al paciente.
La cantidad de agente administrado al paciente la puede elegir el médico del paciente para proporcionar una cantidad eficaz para tratar la afección en cuestión. El primer componente y el segundo componente del sistema de dos componentes se pueden administrar en la misma formulación o en dos formulaciones diferentes dentro de un periodo de tiempo suficientemente cercano para que sean activos en el paciente.
El paciente que recibe el tratamiento puede ser un ser humano. El paciente puede ser un primate o cualquier mamífero. Alternativamente, el paciente puede ser un animal, tal como un animal domesticado (por ejemplo, un perro o un gato), un animal de laboratorio (por ejemplo, un roedor de laboratorio, tal como un ratón, rata o conejo) o un animal importante en agricultura (tal como caballos, bovinos, ovinos o caprinos).
La afección caracterizada por células no deseadas puede incluir cáncer. El cáncer puede ser una neoplasia maligna sólida o no sólida. El cáncer puede ser un tumor sólido en donde el tumor sólido no es un Linfoma. El cáncer puede ser cualquier cáncer tal como cáncer de mama, cáncer de ovario, cáncer de endometrio, cáncer de cuello uterino, cáncer de vejiga, cáncer renal, melanoma, cáncer de pulmón, cáncer de próstata, cáncer testicular, cáncer de tiroides, cáncer de cerebro, cáncer de esófago, cáncer gástrico, cáncer pancreático, cáncer colorrectal, cáncer de hígado, leucemia, mieloma, linfoma no Hodgkin, linfoma de Hodgkin, leucemia mieloide aguda, leucemia linfoblástica aguda, leucemia linfoblástica crónica, trastorno linfoproliferativo, trastorno mielodisplásico, enfermedad mieloproliferativa y enfermedad premaligna.
El sistema de dos componentes se puede administrar solo o en conjunto con otras formas de terapia, incluyendo cirugía, radiación o quimioterapia tradicional.
Ejemplos
Ejemplo 1. Preparación de constructos
En los ejemplos se prepararon y usaron diversos constructos, tanto de control como experimentales.
A. Constructos biespecíficos de scFv de cadena única
En la presente solicitud se usó un constructo de scFv de cadena única para que sirviera como control positivo. El constructo 6245 (SEQ ID NO: 165) se preparó como un anticuerpo biespecífico que comprende un scFv anti-EPCAM y un scFv anti-CD3E. Este constructo no comprende ningún emparejamiento incorrecto con una pareja de unión inerte y tiene restos tanto de direccionamiento activo como de acoplamiento de linfocitos T.
B. Constructos de sistemas de dos componentes escindidos previamente que usan un scFv de direccionamiento
Los constructos 6246 (SEQ ID NO: 166) y 6247 (SEQ ID NO: 167) son constructos escindidos previamente complementarios en un sistema de dos componentes. Por escindido previamente, la descripción se refiere a un constructo con un resto de direccionamiento funcional y un resto de acoplamiento de linfocitos T no emparejado (es decir, uno que no tiene un emparejamiento incorrecto con una pareja de unión inerte y uno que tampoco está emparejado todavía con su pareja correcta para formar un complejo de acoplamiento de linfocitos T funcional). Ambos constructos comprenden un scFv anti-EPCAM. El constructo 6246 comprende un dominio VH anti-CD3E, mientras que el constructo 6247 comprende un dominio VL anti-CD3E. Ninguna construcción contiene una pareja de unión inerte como pareja de emparejamiento incorrecto.
C. Constructos de sistema de dos componentes que usan un scFv de direccionamiento y un dominio de acoplamiento de linfocitos T emparejado incorrectamente con una pareja de unión inerte, así como un sitio de escisión de proteasa para liberar la pareja de unión inerte
Los constructos 6248 (SEQ ID NO: 168) y 6249 (SEQ ID NO: 169) son constructos complementarios en un sistema de dos componentes. Ambos constructos comprenden un scFv anti-EPCAM. El constructo 6248 comprende un dominio VH anti-CD3E unido mediante un conector de 25-meros que tiene un sitio de escisión de MMP2 (AIPVSLR (SEQ ID NO: 46)) a un dominio VL de pareja de unión inerte de gantenerumab. El constructo 6249 comprende un dominio VL anti-CD3E unido mediante un conector de 25-meros que tiene un sitio de escisión de MMP2 (AIPVSLR (SEQ ID NO: 46)) a un dominio VH de pareja de unión inerte del anticuerpo alfa-MUC1-1 de clon.
D. Constructos de sistema de dos componentes con un resto de direccionamiento, y un dominio de acoplamiento de linfocitos T emparejado incorrectamente con una pareja de unión inerte sin un sitio de escisión de proteasa para liberar la pareja de unión inerte
Los constructos 9327 (SEQ ID NO: 170) y 9328 (SEQ ID NO: 171) son constructos de sistema de los componentes que usan un dominio de direccionamiento de scFv; sin embargo, no tienen un sitio de escisión de proteasa para liberar la pareja de unión inerte que sirva como resto de emparejamiento incorrecto. Ambos constructos comprenden un scFv anti-EpCAM para dirigir los constructos a las células no deseadas que expresan EpCAM. El constructo 9327 comprende un dominio VH anti-CD3E unido por un conector de 25-meros que no tiene un sitio de escisión de proteasa correspondiente a una proteasa usada en los ejemplos a un dominio VL de pareja de unión inerte de gantenerumab. El constructo 9328 comprende un dominio Vl anti-CD3E unido por un conector de 25-meros que no tiene un sitio de escisión de proteasa correspondiente a una proteasa usada en los ejemplos a un dominio Vh de pareja de unión inerte del anticuerpo alfa-MUC1-1 clon.
Dado que estos constructos no tienen un sitio de escisión de proteasa correspondiente a una proteasa usada en los ejemplos, la pareja de unión inerte permanecerá unida al constructo, evitando que los dos posibles componentes complementarios del sistema de dos componentes se unan para crear un scFv anti-CD3E activo.
E. Constructos que proporcionan diferentes restos de direccionamiento
Los constructos 9329 (SEQ ID NO: 172) y 9330 (SEQ ID NO: 173) proporcionan diferentes restos de direccionamiento. Se pretendía usar estos constructos en sistemas de dos componentes donde un constructo se dirige a un primer antígeno en una célula cancerosa y el segundo constructo se dirige a un segundo antígeno en la misma célula cancerosa. Dado que el tamaño relativo de los restos de direccionamiento de scFv y VHH son similares, se pretendía que estos constructos se "mezclaran y emparejaran" con los constructos emparejables que tienen un dominio VL anti-CD3E.
El constructo 9329 comprende una secuencia de VHH anti-glipicano-3. También comprende un dominio VH anti-CD3E unido por un conector de 25-meros que comprende un sitio de escisión de MMP2 (AIPVSLR (SEQ ID NO: 46)) a un dominio VL de pareja de unión inerte de gantenerumab.
El constructo 9330 comprende un scFv anti-SDC1 de indatuximab como resto de direccionamiento. También comprende un dominio VH anti-CD3E unido por un conector de 25-meros que comprende un sitio de escisión de MMP2 (AIPVSLR (SEQ ID NO: 46)) a un dominio VL de pareja de unión inerte de gantenerumab.
F. Constructos biespecíficos de VHH/scFv
Los constructos 9332 (SEQ ID NO: 174) y 9333 (SEQ ID NO: 175) son constructos biespecíficos de VHH/scFv que comprenden una porción de VHH anti-EGFR y una porción de scFv anti-CD3E. Estos dos constructos no comprenden un dominio de unión de inserto.
G. Constructos de sistema de dos componentes que usan un dominio VHH de direccionamiento, un dominio de acoplamiento de linfocitos T emparejado incorrectamente con una pareja de unión inerte y que comprende un sitio de escisión de proteasa para liberar la pareja de unión inerte
Los constructos 9334 (SEQ ID NO: 176) y 9335 (SEQ ID NO: 177) son constructos de sistemas de dos componentes complementarios que usan un dominio VHH de direccionamiento. Ambos constructos comprenden un dominio VHH anti-EGFR para dirigirse a las células no deseadas que expresan EGFR. El constructo 9334 comprende un dominio VH anti-CD3E unido por un conector de 25 meros que tiene un sitio de escisión de MMP2 (AIPVSLR (SEQ ID NO: 46)) a un dominio VL de pareja de unión inerte de gantenerumab. El constructo 9335 se preparó comprendiendo un dominio VH anti-CD3E unido por un conector de 25-meros que tiene un sitio de escisión de MMP2 (AIPVSLR (SEQ ID NO: 46)) a un dominio VH de pareja de unión inerte del anticuerpo alfa-MUC1-1 de clon.
Por lo tanto, como resumen, los constructos son los que se proporcionan en la Tabla 4, con más detalles y secuencias proporcionadas anteriormente en la Tabla 1B, con IBD representando la pareja de unión inerte.
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H. Preparación y almacenamiento de todos los constructos
Los constructos se generaron mediante DNA2.0 (Newark, California) y se expresaron en células HEK293T. Se diseñaron oligonucleótidos monocatenarios para cubrir una secuencia específica con una etiqueta de hexahistidina C-terminal para ayudar con la purificación en dirección descendente. Los oligonucleótidos se sintetizaron por vía química y a continuación se ensamblaron usando una variedad de protocolos patentados dependiendo de las características de la secuencia. En algunos casos, se usó PCR independiente del molde. En algunos casos, se ensamblaron secuencias más pequeñas para crear secuencias más grandes mediante el uso de digestión con enzimas de restricción estándar y ensamblaje mediado por ligasa. A continuación, los oligonucleótidos ensamblados se clonaron en plásmidos de E. coli estándar y la secuencia bicatenaria completa se verificó mediante secuenciación automática de Sanger en el hardware ABI. Los constructos se expresaron mediante transfección transitoria en células HEK293T a una escala de 150 ml y los fragmentos de anticuerpos se purificaron usando cromatografía de afinidad.
Antes de que comenzaran los experimentos, los constructos se descongelaron en hielo y se dividieron en alícuotas en condiciones estériles en tubos de baja unión a proteínas. Las alícuotas se almacenaron a - 80 °C hasta que se requirieron. Las alícuotas se descongelaron en hielo inmediatamente antes de su uso. Se usaron alícuotas durante un máximo de cinco ciclos de congelación-descongelación.
Ejemplo 2. Fabricación de constructo de evaluación
A. Figura 5A: Evaluación de constructos mediante SDS PAGE y tinción con azul de Coomassie
Las alícuotas de anticuerpo descongelaron en hielo, y se diluyeron en Tris 25 mM a pH 7,4 hasta una concentración final de 2,0 mg/ml. Si los constructos tuvieran una dilución mayor que la mencionada, se podría omitir la etapa de dilución. A cada muestra se añadió un volumen apropiado de 6X tampón de muestra en gel (Tris 0,5 M a pH 6,8, SDS al 12 % (p/v), glicerol al 25 % (v/v), EDTA 5 mM, N-etilmaleimida 200 mM), que a continuación se calentó a 90 °C durante 10 minutos.
Se desarrollaron 10 pg de cada constructo en un gel de gradiente al 4-20 % fabricado previamente. Una vez desarrollados, los geles se fijaron durante 30 minutos en tampón de tinción (ácido acético al 10 %, metanol al 50 % (v/v) y dH2Ü al 40 % (v/v)) y a continuación se hizo tinción durante 2 horas con azul de Coomassie R-250 (0,25 % en tampón de tinción), seguido de desteñido de 2 a 3 horas en tampón de tinción con varios cambios de tampón si fuera necesario. Los geles se almacenaron en ácido acético al 7 % (v/v) antes de la documentación.
Los resultados se muestran en la Figura 5A. Esto muestra que las proteínas se han preparado y tienen una pureza muy alta, junto con la masa molecular correcta predicha por su secuencia.
B. Figura 5B
En la Figura 5B se evaluaron constructos adicionales. El método usado para la Figura 5A se usó para 5B.
Los constructos 6245 (el constructo biespecífico que no requiere emparejamiento), 6248 y 6248 (constructos emparejables con una pareja de unión inerte y un sitio de escisión de MMP2) se produjeron de forma adecuada. Los constructos 6246 y 6247 (que no contienen una pareja de unión inerte) se produjeron con rendimientos bajos y se cree que son inestables. Es probable que el emparejamiento de VH/VL sea importante para la estabilidad del fragmento.
Por lo tanto, los investigadores creen que los constructos con emparejamientos incorrectos con una pareja de unión inerte son más estables y más fáciles de fabricar.
C. Rendimiento
El rendimiento de los constructos evaluados en la Figura 5B fue el que sigue a continuación:
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Ejemplo 3. Evaluación de la expresión de IFNy en linfocitos T mezclados con líneas de células tumorales y tratados con diversos constructos
Las preparaciones de constructos individuales y constructos mixtos se sometieron a ensayo para determinar su expresión de IFNy para probar la capacidad de los constructos complementarios en un sistema de dos componentes para provocar una respuesta de linfocitos T.
Antecedentes de los ensayos de IFNy en general: Se sabe que la expresión de marcadores de citoquinas in vitro, tal como la expresión de IFNy, tiene un valor predictivo para las respuestas de los linfocitos T y, por lo tanto, predice resultados in vivo. Como se describe en Ghanekar et al., Clin Diag Lab Immunol j8(3): 628-31 (2001), la expresión de IFNy en linfocitos T CD8+ medida por citometría de flujo de citoquinas (CFC) es un marcador sustituto para la respuesta de linfocitos T citotóxicos. Ghanekar en 628. Algunos trabajos anteriores demostraron que existe una fuerte correlación entre la expresión de IFNy por los linfocitos T CD8+ y la actividad de las células efectoras CTL. Ghanekar en 630. Algunos trabajos anteriores muestran que el uso de datos sobre la expresión de IFNy permite una mayor precisión en la evaluación de las respuestas de los linfocitos T CD8+ en un entorno clínico. Id. en 631. Esto demuestra que se sabía que los ensayos de expresión de citoquinas en el presente documento tenían un valor predictivo para las respuestas in vivo y clínicas. Aunque los métodos del presente documento no siguen las etapas exactas del método de Ghanekar porque hay múltiples formas de evaluar la expresión de IFNy, Ghanekar demuestra que la expresión de IFNy es una aproximación para la actividad de los linfocitos T.
Cultivo de líneas de linfocitos T: En los ensayos de IFNy se usaron linfocitos T citotóxicos y se cultivaron en medio RPMI-1640 que contenía L-glutamina 4,0 mM, penicilina y estreptomicina al 1 %, FBS inactivado por calor al 10 %, suero humano inactivado por calor al 1 % (suero AB combinado, TCS Bioscience) y 1.000 U/ml de IL-2. Las células se mantuvieron a una densidad de 1-2 x 106 células/ml y se alimentaron reemplazando tres cuartos del medio cada 48 horas. Se generaron originalmente mediante la adición de 10 ug de péptido NLVPMVATV viral restringido por HLA-A*0201 a 10 millones de células mononucleares de sangre periférica (PBMC) de un donante para HLA-A * 0201. Las células se cultivaron en medio RPMI-1640 que contenía L-glutamina 4,0 mM, penicilina y estreptomicina al 1 %, FBS inactivado por calor al 10 % y suero humano inactivado por calor al 1 % (suero AB combinado, TCS Bioscience) durante cuatro días antes de cambiar el medio para que incluyera 1000 U/ml de IL-2. Los linfocitos T eran predominantemente linfocitos T CD8+ con una pequeña cantidad de linfocitos T CD4+ también.
Cultivo de líneas celulares tumorales: Se usaron las siguientes líneas celulares: SW620, MCF-7, SNU398 y U266. Las células se cultivaron en DMEM que contenía FBS al 10 %, y solución de penicilina/estreptomicina al 1 % excepto las células SNU398 y U266 que se cultivaron en medio RPMI-1640 que contenía FBS inactivado por calor al 10 %, glutamina 2 mM y solución de penicilina/estreptomicina al 1 %. Las células SW620 se obtienen a partir de una metástasis de cáncer de colon humano. Las células MCF-7 se obtienen a partir de un sitio metastásico de cáncer de mama humano (derrame pleural). Las células SNU398 se obtienen a partir de un paciente con carcinoma hepatocelular anaplásico humano en 1990. Las células U266 se obtienen a partir de un paciente con mieloma múltiple masculino que secreta IgE.
Impacto de los constructos en la producción de IFNy : Las líneas de células adherentes se sembraron en placas de 96 pocillos (100.000 células por pocillo) durante al menos 16 horas. Las células no adherentes (100.000 células por pocillo) se sembraron en placas el día del experimento centrifugando el cultivo a 400 x g durante 5 minutos y resuspendiendo las células en medio de linfocitos T. Se añadieron 20.000 linfocitos T en medio de linfocitos T. Los constructos se prepararon en medio de linfocitos T y se añadieron a los cultivos. Cuando se usaron mezclas de constructos, estas se mezclaron previamente antes de la adición a los cultivos. El volumen final en el cultivo fue de 200 pl por pocillo. Los cultivos se incubaron durante 24 horas a 37 °C, CO2 al 5 % y una humedad relativa de un 100 %. Los cultivos se centrifugaron a 400 x g durante 5 minutos y los sobrenadantes se aspiraron y se colocaron en una placa separada. Los sobrenadantes se almacenaron a -20 °C hasta que se analizaron para determinar el IFNy.
ELISA de IFNy: Los niveles de IFNy en sobrenadantes de cultivo tisular se sometieron a ensayo usando un kit de ELISA Ready-Set-Go de eBioscience (n.° de cat. 88-7316-88) o un kit ELISA Max de IFNy humano de BioLegend (n.° de cat. 430106) de acuerdo con las instrucciones del fabricante.
A. Figura 6
El IFNy se evaluó para diversos constructos individuales y constructos mixtos. La producción de IFNy y los protocolos de ensayo de ELISA proporcionados anteriormente se usaron, excepto en los casos indicados. Las células SW620 se cultivaron en DMEM que contenía FBS al 10 %, y solución de penicilina/estreptomicina al 1 %. Las células se sembraron en placas en una placa de 96 pocillos (100.000 células por pocillo) el día antes del experimento. El día del experimento el medio se aspiró y se descartó. Se añadieron 20.000 linfocitos T en medio de linfocitos T. Los constructos (concentración final de 1 pg/ml) se prepararon en medio de linfocitos T y se añadieron al cultivo. Los controles fueron PHA-M (concentración final de 10 pg/ml), células SW620 más linfocitos T sin adiciones, y células SW620 sin linfocitos T u otras adiciones. Cada condición se desarrolló por triplicado. El volumen final en el cultivo fue de 200 pl por pocillo. El cultivo se incubó durante 24 horas a 37 °C, CO2 al 5 % y una humedad relativa de un 100 %. El cultivo se centrifugó a 400 x g durante 5 minutos y los sobrenadantes se aspiraron y se colocaron en una placa separada. Los sobrenadantes se almacenaron a -20 °C hasta que se analizaron para determinar el IFNy.
El IFNy se evaluó para diversos constructos individuales y constructos mixtos. Los constructos individuales se evaluaron, con el constructo 6425 (un scFv biespecífico para EpCAM y CD3E) sirviendo como control positivo. El valor inicial de IFNy se evaluó en linfocitos T con células cancerosas SW620, células cancerosas SW620 solas, y linfocitos T estimulados de forma no específica con fitohemaglutinina (PHA) para mostrar la capacidad de los linfocitos T para expresión de IFNy.
En las células tumorales SW620, los constructos se usaron a una concentración final de 1 pg/ml. Los cultivos se incubaron durante 4 horas y los sobrenadantes se sometieron ensayo para IFNy. Se proporciona la media ± desviación estándar de triplicados. Se evaluó para diversos constructos individuales y constructos mixtos. Los cultivos se incubaron durante 4 horas y los sobrenadantes se sometieron ensayo para IFNy. Se proporciona la media ± desviación estándar de triplicados. Los constructos se usaron a una concentración final de 1 pg/ml. Los cultivos se incubaron durante 24 horas y los sobrenadantes se sometieron ensayo para IFNy. Se proporciona la media ± desviación estándar de triplicados.
El constructo 6245 sirve como control positivo porque este constructo tiene un direccionamiento tanto de scFv antiEpCAM como de scFv anti-CD3E; por lo tanto, es un constructo biespecífico que no requiere emparejamiento para actividad de acoplamiento de linfocitos T (TCE).
Los constructos 6248 y 6249 (pares de un sistema de dos componentes que tiene cada uno una pareja de unión inerte separada del VL o VH de acoplamiento de linfocitos T anti-CD3E, respectivamente, mediante un conector con un sitio de escisión de MMP2) mostraron más expresión de IFNy cuando se emparejaron juntos que cuando se administraron solos. La combinación de 6246 y 6247 (pares de un sistema de dos componentes sin ningún emparejamiento incorrecto con una pareja de unión inerte o sitio de escisión de proteasa requerido para que se asocien) proporciona una respuesta mucho menor que la combinación de 6248 y 6249 probablemente debido a que 6246 y 6247 no están protegidos durante la fabricación mediante la pareja de unión inerte, que se cree que estabiliza los dominios VH y VL anti-CD3E sin emparejar en cada constructo, respectivamente. Por lo tanto, los investigadores creen que los constructos con emparejamientos incorrectos que tienen una pareja de unión inerte son más estables y más fáciles de fabricar que los constructos escindidos previamente que tienen un dominio VH o VL anti-CD3E sin emparejar.
B. Figura 7
El IFNy se evaluó para diversos constructos individuales y constructos mixtos. Las células SW620 se cultivaron en DMEM que contenía FBS al 10 %, y solución de penicilina/estreptomicina al 1 %. Las células se sembraron en placas en una placa de 96 pocillos (100.000 células por pocillo) el día antes del experimento. El día del experimento el medio se aspiró y se descartó. Se añadieron 20.000 linfocitos T en medio de linfocitos T. Los constructos (concentración final de 1 pg/ml) se prepararon en medio de linfocitos T y se añadieron al cultivo. Cuando se usaron mezclas de constructos, estas se mezclaron previamente antes de la adición a los cultivos (la concentración final de los constructos fue de 1 pg/ml por constructo). Los controles fueron PHA-M ((concentración final de 10 pg/ml), células SW620 más linfocitos T sin adiciones, y células SW620 sin linfocitos T u otras adiciones. Cada condición se desarrolló por triplicado. El volumen final en el cultivo fue de 200 pl por pocillo. El cultivo se incubó durante 24 horas a 37 °C, CO2 al 5 % y una humedad relativa de un 100 %. El cultivo se centrifugó a 400 x g durante 5 minutos y los sobrenadantes se aspiraron y se colocaron en una placa separada. Los sobrenadantes se almacenaron a -20 °C hasta que se analizaron para determinar el IFNy. Se proporciona la media ± desviación estándar de triplicados.
El constructo 6245 sirve como control positivo porque este constructo tiene un direccionamiento tanto de scFv anti-EpCAM como de scFv anti-CD3E; por lo tanto, es un constructo biespecífico que no requiere emparejamiento para actividad de acoplamiento de linfocitos T (TCE).
Los constructos 6248 y 6249 (pares de un sistema de dos componentes que tiene cada uno una pareja de unión inerte separada del VL o VH de acoplamiento de linfocitos T anti-CD3E, respectivamente, mediante un conector con un sitio de escisión de MMP2) mostraron más expresión de IFNy cuando se emparejaron juntos que cuando se administraron solos. La combinación de 6246 y 6247 (pares de un sistema de dos componentes sin ningún dominio de unión o sitio de escisión de proteasa requerido para que se asocien) proporciona una respuesta mucho menor que la combinación de 6248 y 6249 probablemente debido a que 6246 y 6247 no están protegidos durante la fabricación mediante la pareja de unión inerte, que se cree que estabiliza los dominios VH y VL anti-CD3E sin emparejar en cada constructo, respectivamente. Por lo tanto, los investigadores creen que los constructos con emparejamientos incorrectos que tienen una pareja de unión inerte son más estables y más fáciles de fabricar que los constructos con un dominio VH o VL anti-CD3E sin emparejar.
C. Figura 8
Las células SW620 se cultivaron en DMEM que contenía FBS al 10 %, y solución de penicilina/estreptomicina al 1 %. Las células se sembraron en placas en una placa de 96 pocillos (100.000 células por pocillo) el día antes del experimento. El día del experimento el medio se aspiró y se descartó. Se añadieron 20.000 linfocitos T en medio de linfocitos T. Los constructos (concentración final que varía de 1 ng/ml a 1 pg/ml) se prepararon en medio de linfocitos T y se añadieron al cultivo. Cuando se usaron mezclas de constructos, estas se mezclaron previamente antes de la adición a los cultivos (la concentración final de los constructos varió de 1 ng/ml a 1 pg/ml por constructo). Los controles fueron células SW620 más linfocitos T sin adiciones, y células SW620 sin linfocitos T u otras adiciones. Cada condición se desarrolló por triplicado. El volumen final en el cultivo fue de 200 pl por pocillo. El cultivo se incubó durante 24 horas a 37 °C, CO2 al 5 % y una humedad relativa de un 100 %. El cultivo se centrifugó a 400 x g durante 5 minutos y los sobrenadantes se aspiraron y se colocaron en una placa separada. Los sobrenadantes se almacenaron a -20 °C hasta que se analizaron para determinar el IFNy. En la Figura 8 se muestra la media ± desviación estándar de triplicados.
Los constructos 6245 sirvieron como control positivo y se evaluaron los constructos emparejados 6248 y 6249. Tanto el constructo de control como el sistema de dos componentes emparejados mostraron expresión de IFNy. Esto demuestra que los dominios inertes VL y VH se están escindiendo a partir de los constructos 6248 y 6249, respectivamente, y que estos dos constructos se están emparejando para crear un scFv anti-CD3E completo, que es capaz de acoplarse a linfocitos T.
El sistema de dos componentes (6248 y 6249) tiene una potencia menor que el constructo 6245 biespecífico, aunque todavía está en un intervalo aceptable y realmente puede ofrecer ventajas de dosificación al evitar efectos secundarios.
D. Figuras 9A-B
Las células SW620 se cultivaron en DMEM que contenía FBS al 10 %, y solución de penicilina/estreptomicina al 1 %. Las células se sembraron en placas en una placa de 96 pocillos (100.000 células por pocillo) el día antes del experimento. El día del experimento el medio se aspiró y se descartó. Se añadieron 20.000 linfocitos T en medio de linfocitos T. Los constructos (concentración final que varía de 1 ng/ml a 1 pg/ml) se prepararon en medio de linfocitos T y se añadieron al cultivo. Cuando se usaron mezclas de constructos, estas se mezclaron previamente antes de la adición a los cultivos (la concentración final de los constructos varió de 10 ng/ml a 10 pg/ml por constructo). Los controles fueron PHA-M ((concentración final de 10 pg/ml), células SW620 más linfocitos T sin adiciones, y células SW620 sin linfocitos T u otras adiciones. Cada condición se desarrolló por triplicado. El volumen final en el cultivo fue de 200 pl por pocillo. El cultivo se incubó durante 24 horas a 37 °C, CO2 al 5 % y una humedad relativa de un 100 %. El cultivo se centrifugó a 400 x g durante 5 minutos y los sobrenadantes se aspiraron y se colocaron en una placa separada. Los sobrenadantes se almacenaron a -200 °C hasta que se analizaron para determinar el IFNy. En las Figuras 9A-B se muestra la media ± desviación estándar de triplicados.
Tanto el constructo de control como el sistema de dos componentes emparejados mostraron expresión de IFNy. Esto demuestra que los dominios inertes VL y VH se están escindiendo a partir de los constructos 6248 y 6249, respectivamente, y que estos dos constructos se están emparejando para crear un scFv anti-CD3E completo, que es capaz de acoplarse a linfocitos T.
El sistema de dos componentes (6248 y 6249) tiene una potencia menor que el constructo 6245 biespecífico, aunque todavía está en un intervalo aceptable y realmente puede ofrecer ventajas de dosificación al evitar efectos secundarios.
E. Figura 10
Las células SW620 se cultivaron en DMEM que contenía FBS al 10 %, y solución de penicilina/estreptomicina al 1 %. Las células se sembraron en placas en una placa de 96 pocillos (100.000 células por pocillo) el día antes del experimento. El día del experimento el medio se aspiró y se descartó. Se añadieron 20.000 linfocitos T en medio de linfocitos T. Los constructos (concentración final de 1 pg/ml) se prepararon en medio de linfocitos T y se añadieron al cultivo. Cuando se usaron mezclas de constructos, estas se mezclaron previamente antes de la adición a los cultivos (la concentración final de los constructos fue de 1 pg/ml por constructo). Los controles fueron PHA-M ((concentración final de 10 pg/ml), células SW620 más linfocitos T sin adiciones, y células SW620 sin linfocitos T u otras adiciones. Cada condición se desarrolló por triplicado. El volumen final en el cultivo fue de 200 pl por pocillo. El cultivo se incubó durante 24 horas a 37 °C, CO2 al 5 % y una humedad relativa de un 100 %. El cultivo se centrifugó a 400 x g durante 5 minutos y los sobrenadantes se aspiraron y se colocaron en una placa separada. Los sobrenadantes se almacenaron a -20 °C hasta que se analizaron para determinar el IFNy. La Figura 10 proporciona la media ± desviación estándar de triplicados.
La Figura 10 muestra un nivel muy bajo de expresión de IFNy para los constructos que tienen solo un VH o VL para el scFv anti-CD3E; sin embargo, los constructos biespecíficos positivos con un scFv completo (9332 y 9333) mostraron niveles de expresión de IFNy más altos.
F. Evaluación estequiometría de constructos complementarios de un sistema de dos componentes (Figura 11)
Los constructos complementarios de un sistema de dos componentes (6248 y 6249) se añadieron juntos en relaciones variables, como se muestra en la Figura 11.
Las células SW620 se cultivaron en DMEM que contenía FBS al 10 %, y solución de penicilina/estreptomicina al 1 %. Las células se sembraron en placas en una placa de 96 pocillos (100.000 células por pocillo) el día antes del experimento. El día del experimento el medio se aspiró y se descartó. Se añadieron 20.000 linfocitos T en medio de linfocitos T. Los constructos se mezclaron previamente en las relaciones especificadas en medio de linfocitos T y se añadieron al cultivo (la concentración final de los constructos fue de 1 pg/ml en total). Los dos componentes, 6248 y 6249, uno conteniendo el dominio VH del resto de activación de CD3 (6249) y el otro conteniendo el dominio VL del resto de activación de CD3 (6248), se mezclaron previamente en las relaciones 100:0, 90:10, 75:25, 50:50, 25:75, 10:90 y 0:100. Las mezclas de los dos componentes se añadieron a 100.000 células tumorales no deseadas y 20.000 linfocitos T. Los controles fueron PHA-M ((concentración final de 10 pg/ml), células SW620 más linfocitos T sin adiciones, y células SW620 sin linfocitos T u otras adiciones. Cada condición se desarrolló por triplicado. El volumen final en el cultivo fue de 200 pl por pocillo. El cultivo se incubó durante 24 horas a 37 °C, CO2 al 5 % y una humedad relativa de un 100 %. El cultivo se centrifugó a 400 x g durante 5 minutos y los sobrenadantes se aspiraron y se colocaron en una placa separada. Los sobrenadantes se almacenaron a -20 °C hasta que se analizaron para determinar el IFNy.
Los resultados de la Figura 11 demuestran una activación creciente de los linfocitos T a medida que la proporción de los dos componentes alcanza el equilibrio. Cuando hay un exceso del componente que contiene el dominio VH del resto de activación de CD3 (6249) o del otro componente que contiene el dominio VL del resto de activación de CD3 (6248), la activación de los linfocitos T disminuye ya que la activación es dependiente tanto en el VH como en el VL del resto de activación de CD3 que se unen. Por lo tanto, los niveles de expresión de IFNy eran mucho más bajos cuando todos o casi todos los constructos proporcionados eran de un tipo u otro. El nivel de expresión de IFNy más alto corresponde al escenario en donde se proporcionó una cantidad igual de cada uno de los dos constructos complementarios. Esto proporciona evidencia adicional que demuestra que la expresión de IFNy está causada por las dos mitades del scFv anti-CD3E que se unen a partir de los dos constructos en el sistema de dos componentes.
G. Uso de células MCF-7 (Figura 12)
La Figura 12 muestra experimentos realizados en la línea de células tumorales MCF-7. Se cultivaron células MCF-7 en DMEM que contenía FBS al 10 %, y solución de penicilina/estreptomicina al 1 %. Las células se sembraron en placas en una placa de 96 pocillos (100.000 células por pocillo) el día antes del experimento. El día del experimento el medio se aspiró y se descartó. Se añadieron 20.000 linfocitos T en medio de linfocitos T. Los constructos (concentración final de 1 pg/ml) se prepararon en medio de linfocitos T y se añadieron al cultivo. Los controles fueron PHA-M ((concentración final de 10 pg/ml), células MCF-7 más linfocitos T sin adiciones, y células MCF-7 sin linfocitos T u otras adiciones. Cada condición se desarrolló por triplicado. El volumen final en el cultivo fue de 200 pl por pocillo. El cultivo se incubó durante 24 horas a 37 °C, CO2 al 5 % y una humedad relativa de un 100 %. El cultivo se centrifugó a 400 x g durante 5 minutos y los sobrenadantes se aspiraron y se colocaron en una placa separada. Los sobrenadantes se almacenaron a -20 °C hasta que se analizaron para determinar el IFNy.
Se obtuvieron resultados similares a los de las otras líneas celulares usadas. En la Figura 12, los constructos 6245, 9332 y 9333 de control positivo (cada uno con un scFv anti-CD3E completo) mostraron niveles de expresión de IFNy mucho más altos que cualquiera de los componentes individuales que comprenden solo un dominio VH o VL del anticuerpo anti-CD3E. La Figura 12 también proporciona niveles de expresión de IFNy basales para células MCF-7 solas o linfocitos T estimulados de forma inespecífica con PHA.
H. Figuras 13-14
Las células SW620 se cultivaron en DMEM que contenía FBS al 10 %, y solución de penicilina/estreptomicina al 1 %. Las células se sembraron en placas en una placa de 96 pocillos (100.000 células por pocillo) el día antes del experimento. El día del experimento el medio se aspiró y se descartó. Se añadieron 20.000 linfocitos T en medio de linfocitos T. Los constructos (concentración final de 1 pg/ml) se prepararon en medio de linfocitos T y se añadieron al cultivo. Cuando se usaron mezclas de constructos, estas se mezclaron previamente antes de la adición a los cultivos (la concentración final de los constructos fue de 1 pg/ml por constructo). Los controles fueron PHA-M ((concentración final de 10 pg/ml), células SW620 más linfocitos T sin adiciones, y células SW620 sin linfocitos T u otras adiciones. Cada condición se desarrolló por triplicado. El volumen final en el cultivo fue de 200 pl por pocillo. El cultivo se incubó durante 24 horas a 37 °C, CO2 al 5 % y una humedad relativa de un 100 %. El cultivo se centrifugó a 400 x g durante 5 minutos y los sobrenadantes se aspiraron y se colocaron en una placa separada. Los sobrenadantes se almacenaron a -20 °C hasta que se analizaron para determinar el IFNy.
En la Figura 13, los datos muestran que el sistema de dos componentes de 6248 y 6249 funciona como se esperaba porque estos constructos tienen una pareja de unión inerte que se puede escindir mediante un sitio de escisión de MMP2 y dominios de variables anti-CD3E emparejables (un Vh en 6248 y un VL en 6249). Los constructos 9327 y 9328 no generan una señal de IFNy fuerte porque ninguno de estos constructos tiene un sitio de escisión entre la pareja de unión inerte y el dominio variable anti-CD3E.
Los constructos 9327 y 6248 no muestran ninguna actividad porque ambos tienen dominios VH para el anticuerpo anti-CD3E y no pueden producir un scFv anti-CD3E funcional; además, 9327 no tiene un sitio de escisión. 9327 y 6249 muestran un nivel de actividad muy bajo porque 9327 tiene sin sitio de escisión y 6249 tiene un sitio de escisión, pero los dos juntos pueden formar un scFv anti-CD3E si se produce algún nivel bajo de escisión espontánea.
En la Figura 14, el emparejamiento de los constructos 9334 y 9335 (que proporciona un enfoque biparatópico de direccionamiento a EFGR, con los scFv de anticuerpo de direccionamiento a diferentes epítopos en EGFR) no creó una señal de IFNy. Se cree que los epítopos en EGFR estaban demasiado separados para que los dos dominios variables anti-CD3E se alcanzaran entre sí o el epítopo o los epítopos estaban demasiado cerca y creaban un impedimento estérico para la unión en el lado del anticuerpo. Sin embargo, es muy razonable someter al ensayo combinaciones biparatópicas. En este enfoque se puede identificar y someter a ensayo otro anticuerpo para EGFr para combinaciones.
La Figura 14 también muestra el direccionamiento de dos proteínas diferentes expresadas en la misma célula cancerosa. El constructo 6248 se une a EpCAM y se empareja de manera satisfactoria con 9335, que se une a EGFR. El constructo 6249 también se une a EpCAM y se empareja de manera satisfactoria con 9334. Esto establece que en una célula cancerosa se pueden dirigir diferentes moléculas, proporcionando una capa adicional de especificidad para algunas versiones del sistema de dos componentes que se describe en el presente documento. Esto también proporciona más evidencias de que los componentes 9335 y 9334 funcionan en otros contextos y sugiere además que estos componentes estaban demasiado cerca o demasiado lejos entre sí en su combinación entre sí descrita anteriormente.
En esta figura la combinación de 9334 y 6249 proporciona información útil, lo que demuestra que el direccionamiento doble se puede conseguir porque el constructo 9334 se dirige a EGFR y 9249 se dirige a EpCAM.
No se esperaba que la combinación de 9334 y 6248 tuviera actividad porque ambos constructos comprenden un VH del anticuerpo anti-CD3E y ningún constructor comprende un VL de ese anticuerpo.
I. Figura 15
Las células SNU398 se cultivaron en RPMI1640 que contenía FBS al 10 %, glutamina 2 mM y solución de penicilina/estreptomicina al 1 %. Las células se sembraron en placas en una placa de 96 pocillos (100.000 células por pocillo) el día antes del experimento. El día del experimento el medio se aspiró y se descartó. Se añadieron 20.000 linfocitos T en medio de linfocitos T. Los constructos (concentración final de 1 pg/ml) se prepararon en medio de linfocitos T y se añadieron al cultivo. Cuando se usaron mezclas de constructos, estas se mezclaron previamente antes de la adición a los cultivos (la concentración final de los constructos fue de 1 pg/ml por constructo). Los controles fueron PHA-M ((concentración final de 10 pg/ml), células SNU398 más linfocitos T sin adiciones, y células SNU398 sin linfocitos T u otras adiciones. Cada condición se desarrolló por triplicado. El volumen final en el cultivo fue de 200 pl por pocillo. El cultivo se incubó durante 24 horas a 37 °C, CO2 al 5 % y una humedad relativa de un 100 %. El cultivo se centrifugó a 400 x g durante 5 minutos y los sobrenadantes se aspiraron y se colocaron en una placa separada. Los sobrenadantes se almacenaron a -20 °C hasta que se analizaron para determinar el IFNy. La Figura 15 muestra que la adición de un inhibidor de proteasa reduce la expresión de IFNy del sistema de dos componentes que tiene un sitio de escisión de proteasa (constructos 6248 y 6249). El inhibidor de proteasa no influye en el constructor biespecífico 6245 ya que para la actividad no se requieren escisiones ni emparejamientos. J. Figura 16
Las células SW620 se cultivaron en DMEM que contenía FBS al 10 %, y solución de penicilina/estreptomicina al 1 %. Las células se sembraron en placas en una placa de 96 pocillos (100.000 células por pocillo) el día antes del experimento. El día del experimento el medio se aspiró y se descartó. Se añadieron 20.000 linfocitos T en medio de linfocitos T. Los constructos (concentración final de 1 pg/ml) se prepararon en medio de linfocitos T y se añadieron al cultivo. Cuando se usaron mezclas de constructos, estas se mezclaron previamente antes de la adición a los cultivos (la concentración final de los constructos fue de 1 pg/ml por constructo). Los controles fueron PHA-M ((concentración final de 10 pg/ml), células SW620 más linfocitos T sin adiciones, y células SW620 sin linfocitos T u otras adiciones. Cada condición se desarrolló por triplicado. El volumen final en el cultivo fue de 200 pl por pocillo. El cultivo se incubó durante 24 horas a 37 °C, CO2 al 5 % y una humedad relativa de un 100 %. El cultivo se centrifugó a 400 x g durante 5 minutos y los sobrenadantes se aspiraron y se colocaron en una placa separada. Los sobrenadantes se almacenaron a -20 °C hasta que se analizaron para determinar el IFNy.
La combinación funcional de 9335 y 6248 muestra que diferentes tipos de fragmentos de anticuerpos se pueden combinar en un primer componente y un segundo componente, respectivamente. 9335 emplea un VHH anti-EGFR como resto de direccionamiento y 6248 emplea un scFv anti-EPCAM como resto de direccionamiento.
Ejemplo 4. Direccionamiento in vivo de linfoma de linfocitos B mediante un sistema de dos componentes Un sistema de dos componentes que comprende un primer componente y un segundo componente se administra a un paciente que tiene linfoma. El primer componente comprende Rituximab o un anticuerpo anti-CD22 como resto de direccionamiento, un dominio VH de un anticuerpo que se une a CD3 como dominio de acoplamiento de linfocitos T, un dominio VL como pareja de unión inerte y el sitio de escisión de ADAM28, KPAKFFRL. El segundo componente también comprende Rituximab o un anticuerpo anti-CD22 como resto de direccionamiento, el dominio VL complementario de un anticuerpo que se une a CD3 como dominio de acoplamiento de linfocitos T, VH como una pareja de unión inerte, y el sitio de escisión de ADAM28, KPAKFFRL. El dominio VH de un anticuerpo que se une a CD3 como dominio de acoplamiento de linfocitos T del primer componente y el dominio VL de un anticuerpo que se une a CD3 como un dominio de acoplamiento de linfocitos T del segundo componente son capaces de unirse entre sí cuando no se unen a una pareja de unión inerte y que posee la actividad para acoplarse a un linfocito T.
El paciente recibe una infusión del agente, que se dirige a todos los linfocitos B, sanos y malignos. Después de unirse a las células malignas, el agente entra en contacto con proteasas, de modo que la escisión del dominio de reconocimiento de proteasa libere las parejas de unión inerte del primer y segundo dominios de acoplamiento de linfocitos T.
Los linfocitos B malignos que están unidos por el complejo del sistema de dos componentes ahora activado atraen al sistema inmunitario del hospedador para citólisis por linfocitos T debido a la presencia y actividad del complejo del primer y el segundo dominios de acoplamiento de linfocitos T.
Ejemplo 5. Ejemplos específicos de sistemas de dos componentes
Un sistema de dos componentes elegido del Sistema A-E se prepara de acuerdo con la Tabla 3 y se administra a un paciente que tiene cáncer. Si un artículo se describe como opcional, la fila de la tabla describe ambos sistemas de dos componentes que tienen o no ese artículo.
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EQUIVALENTES
La memoria descriptiva escrita anteriormente se considera suficiente para permitir que un experto en la materia ponga en práctica las realizaciones de la invención. La descripción mencionada anteriormente y los Ejemplos detallan ciertas realizaciones de la invención y otras divulgaciones, y describe el mejor modo contemplado por los inventores. Se apreciará, sin embargo, que no importa lo detallado que pueda aparecer en el texto lo mencionado anteriormente, la realización se puede poner en práctica de muchas formas y se debería interpretar de acuerdo con las reivindicaciones adjuntas.
Como se usa en el presente documento, el término aproximadamente se refiere a un valor numérico, que incluye, por ejemplo, números enteros, fracciones y porcentajes, indicados de forma explícita o no. El término aproximadamente generalmente se refiere a un intervalo de valores numéricos (por ejemplo, /- 5-10 % del intervalo mencionado) que alguien con la experiencia habitual en la materia podría considerar equivalente al valor mencionado (por ejemplo, que tenga la misma función o resultado). Cuando los términos tales como al menos y aproximadamente preceden a un listado de valores o intervalos numéricos, los términos modifican todos los valores o intervalos que se proporcionan en el listado. En algunos casos, el término aproximadamente puede incluir valores numéricos que se redondean a la cifra significativa más cercana.

Claims (12)

REIVINDICACIONES
1. Un kit o composición para uso en el tratamiento de cáncer en donde el kit o composición comprende:
a. un primer componente que comprende un agente de acoplamiento de linfocitos T dirigido que comprende: i. un primer resto de direccionamiento que es capaz de dirigirse a células cancerosas en donde el primer resto de direccionamiento es un anticuerpo o porción de unión a antígeno del mismo;
ii. un primer dominio de acoplamiento de linfocitos T capaz de actividad de acoplamiento de linfocitos T cuando se une a un segundo dominio de acoplamiento de linfocitos T, en donde el segundo dominio de acoplamiento de linfocitos T no es parte del primer componente, y en donde el primer dominio de acoplamiento de linfocitos T es un dominio VH o v L;
iii. una primera pareja de unión inerte para el primer dominio de acoplamiento de linfocitos T que se une al primer dominio de acoplamiento de linfocitos T de modo que el primer dominio de acoplamiento de linfocitos T no se una al segundo dominio de acoplamiento de linfocitos T a menos que se retire la pareja de unión inerte, en donde si el primer dominio de acoplamiento de linfocitos T es un dominio VH, la primera pareja de unión inerte es un dominio VL, y si el primer dominio de acoplamiento de linfocitos T es un dominio VL, la primera pareja de unión inerte es un dominio VH; y
iv. un sitio de escisión de proteasa que separa el primer dominio de acoplamiento de linfocitos T y la primera pareja de unión inerte, en donde el sitio de escisión de proteasa es capaz de liberar la pareja de unión inerte del dominio de acoplamiento de linfocitos T en presencia de una proteasa:
(1) expresada por las células cancerosas; o
(2) colocalizada en la célula cancerosa mediante un resto de direccionamiento que es un anticuerpo o porción de unión a antígeno del mismo que se une a la célula cancerosa y que es igual o diferente al resto de direccionamiento en el agente,
b. un segundo componente que comprende un segundo dominio de acoplamiento de linfocitos T capaz de actividad de acoplamiento de linfocitos T cuando se une al primer dominio de acoplamiento de linfocitos T, en donde el primer y el segundo dominios de acoplamiento de linfocitos T, cuando están emparejados entre sí, son capaces de unirse a CD3 o al receptor de linfocitos T (TCR) cuando ninguno está unido a una pareja de unión inerte y además en donde si el primer dominio de acoplamiento de linfocitos T es un dominio VH, el segundo dominio de acoplamiento de linfocitos T es un dominio VL, y si el primer dominio de acoplamiento de linfocitos T es un dominio VL, el segundo dominio de acoplamiento de linfocitos T es un dominio VH.
2. El kit o composición para uso de acuerdo con la reivindicación 1, en donde el segundo componente además comprende un segundo resto de direccionamiento que es capaz de dirigirse a las células cancerosas en donde el segundo resto de direccionamiento es un anticuerpo o porción de unión a antígeno del mismo.
3. El kit o composición para uso de acuerdo con la reivindicación 2, en donde el segundo componente además comprende una segunda pareja de unión inerte para el segundo dominio de acoplamiento de linfocitos T que se une al segundo dominio de acoplamiento de linfocitos T de modo que el segundo dominio de acoplamiento de linfocitos T no se una al primer dominio de acoplamiento de linfocitos T a menos que se retire la pareja de unión inerte, en donde si el segundo dominio de acoplamiento de linfocitos T es un dominio VH, la segunda pareja de unión inerte es un dominio VL, y si el segundo dominio de acoplamiento de linfocitos T es un dominio VL, la segunda pareja de unión inerte es un dominio VH y
a. un sitio de escisión de proteasa que separa el segundo dominio de acoplamiento de linfocitos T y la segunda pareja de unión inerte, en donde el sitio de escisión de proteasa:
i. se escinde mediante una proteasa expresada por las células cancerosas; o
ii. se escinde mediante una proteasa que está colocalizada en la célula cancerosa mediante un resto de direccionamiento que es un anticuerpo o porción de unión a antígeno del mismo que se une a la célula cancerosa y que es igual o diferente al resto de direccionamiento en el agente,
en donde la escisión del sitio de escisión de proteasa causa la pérdida de la pareja de unión inerte y complementación con el primer dominio de acoplamiento de linfocitos T del kit o composición.
4. El kit o composición para uso de acuerdo con la reivindicación 3, en donde el primer y el segundo restos de direccionamiento son diferentes.
5. El kit o composición para uso de acuerdo con la reivindicación 3, en donde los sitios de escisión de proteasa del primer componente y del segundo componente son diferentes.
6. El kit o composición para uso de acuerdo con la reivindicación 3, en donde al menos un sitio de escisión de proteasa se escinde mediante una proteasa expresada por las células cancerosas.
7. El kit o composición para uso de acuerdo con la reivindicación 3, en donde al menos un sitio de escisión de proteasa se escinde mediante una proteasa que está colocalizada en el cáncer mediante un resto de direccionamiento que es un anticuerpo o porción de unión a antígeno del mismo que se une a la célula cancerosa y que es igual o diferente al resto de direccionamiento en el agente.
8. El kit o composición para uso de acuerdo con la reivindicación 3, en donde la al menos una pareja de unión inerte es capaz de disociación una vez que se ha escindido al menos un sitio de escisión y, después de la disociación, los dos dominios de acoplamiento de linfocitos T son capaces de unirse entre sí y exhibir actividad de acoplamiento de linfocitos T.
9. Un conjunto de moléculas de ácido nucleico que codifican el primer y el segundo componentes del kit o composición de la reivindicación 1.
10. El kit o composición para uso de acuerdo con una cualquiera de las reivindicaciones 1-3, en donde el cáncer es uno cualquiera de cáncer de mama, cáncer de ovario, cáncer de endometrio, cáncer de cuello uterino, cáncer de vejiga, cáncer renal, melanoma, cáncer de pulmón, cáncer de próstata, cáncer testicular, cáncer de tiroides, cáncer de cerebro, cáncer de esófago, cáncer gástrico, cáncer pancreático, cáncer colorrectal, cáncer de hígado, leucemia, mieloma, linfoma no Hodgkin, linfoma de Hodgkin, leucemia mieloide aguda, leucemia linfoblástica aguda, leucemia linfoblástica crónica, trastorno linfoproliferativo, trastorno mielodisplásico, enfermedad mieloproliferativa o enfermedad premaligna.
11. El kit o composición para uso de acuerdo con la reivindicación 3 en donde el kit o composición dirige una respuesta inmunitaria de un paciente a células cancerosas.
12. El kit o composición para uso de acuerdo con la reivindicación 1, en donde el primer y el segundo dominios de acoplamiento de linfocitos T son capaces de formar un scFv.
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