ES2818103T3 - Anticuerpos y receptores de antígenos quiméricos específicos para ROR1 - Google Patents
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Abstract
Un anticuerpo anti-ROR1 o un fragmento de union a antigeno, que comprende una region variable de cadena pesada (VH) que comprende una region determinante de complementariedad de cadena pesada 1 (CDR-H1), CDRH2 y CDR-H3, y una region variable de cadena ligera (VL) que comprende una CDR-L1, CDR-L2 y CDR-L3, en el que: la CDR-H1, la CDR-H2 y la CDR-H3 comprenden las secuencias de los SEQ ID NO: 20, 21 y 22, respectivamente, y la CDR-L1, la CDR-L2 y la CDR-L3 comprenden las secuencias de los SEQ ID NO: 23, 24 y 25, respectivamente; la CDR-H1, la CDR-H2 y la CDR-H3 comprenden las secuencias de los SEQ ID NO: 20, 26 y 22, respectivamente, y la CDR-L1, la CDR-L2 y la CDR-L3 comprenden las secuencias de los SEQ ID NO: 23, 24 y 25, respectivamente; la CDR-H1, la CDR-H2 y la CDR-H3 comprenden las secuencias de los SEQ ID NO: 27, 28 y 29, respectivamente, y la CDR-L1, la CDR-L2 y la CDR-L3 comprenden las secuencias de los SEQ ID NO: 218, 229 y 39, respectivamente; la CDR-H1, la CDR-H2 y la CDR-H3 comprenden las secuencias de los SEQ ID NO: 27, 28 y 29, respectivamente, y la CDR-L1, la CDR-L2 y la CDR-L3 comprenden las secuencias de los SEQ ID NO: 30, 31 y 32, respectivamente; la CDR-H1, la CDR-H2 y la CDR-H3 comprenden las secuencias de los SEQ ID NO: 27, 28 y 29, respectivamente, y la CDR-L1, la CDR-L2 y la CDR-L3 comprenden las secuencias de los SEQ ID NO: 216, 227 y 40, respectivamente; la CDR-H1, la CDR-H2 y la CDR-H3 comprenden las secuencias de los SEQ ID NO: 33, 34 y 35, respectivamente, y la CDR-L1, la CDR-L2 y la CDR-L3 comprenden las secuencias de los SEQ ID NO: 217, 228 y 41, respectivamente; la CDR-H1, la CDR-H2 y la CDR-H3 comprenden las secuencias de los SEQ ID NO: 33, 34 y 35, respectivamente, y la CDR-L1, la CDR-L2 y la CDR-L3 comprenden las secuencias de los SEQ ID NO: 212, 223 y 42, respectivamente; la CDR-H1, la CDR-H2 y la CDR-H3 comprenden las secuencias de los SEQ ID NO: 33, 34 y 35, respectivamente, y la CDR-L1, la CDR-L2 y la CDR-L3 comprenden las secuencias de los SEQ ID NO: 36, 37 y 38, respectivamente; la CDR-H1, la CDR-H2 y la CDR-H3 comprenden las secuencias de los SEQ ID NO: 27, 28 y 29, respectivamente, y la CDR-L1, la CDR-L2 y la CDR-L3 comprenden las secuencias de los SEQ ID NO: 219, 230 y 43, respectivamente; la CDR-H1, la CDR-H2 y la CDR-H3 comprenden las secuencias de los SEQ ID NO: 33, 34 y 35, respectivamente, y la CDR-L1, la CDR-L2 y la CDR-L3 comprenden las secuencias de los SEQ ID NO: 215, 226 y 44, respectivamente; y la CDR-H1, la CDR-H2 y la CDR-H3 comprenden las secuencias de los SEQ ID NO: 27, 164 y 45, respectivamente, y la CDR-L1, la CDR-L2 y la CDR-L3 comprenden las secuencias de los SEQ ID NO: 220, 231 y 46, respectivamente, en donde el anticuerpo o el fragmento de union a antigeno es humano; y en donde el anticuerpo o el fragmento compiten por unirse a una proteina ROR1 humana con el anticuerpo anti- ROR1 R12 o un fragmento de union a antigeno del mismo, que es opcionalmente un fragmento scFv de R12.
Description
DESCRIPCIÓN
Anticuerpos y receptores de antígenos quiméricos específicos para ROR1
Referencia cruzada a solicitudes relacionadas
La presente solicitud reivindica prioridad de la solicitud provisional de EE. UU. N.° 62/104.664 presentada el 16 de enero de 2015, titulada "Anticuerpos y receptores de antígenos quiméricos específicos para ROR1".
Campo
La presente divulgación se refiere en algunos aspectos a moléculas de unión a ROR1, en particular, a los anticuerpos anti-ROR1, incluyendo fragmentos de anticuerpos. La presente divulgación se refiere además a receptores recombinantes que contienen tales anticuerpos, incluidos los receptores de antígenos quiméricos (CAR), que contienen tales anticuerpos. La divulgación se refiere además a células modificadas por ingeniería genética que expresan tales receptores y anticuerpos, y a su uso en terapia celular adoptiva.
Antecedentes
El receptor orphan similar a la tirosina quinasa 1 (ROR1) es un receptor transmembrana que se expresa durante la embriogénesis, pero generalmente no se expresa en células adultas normales. ROR1, sin embargo, se expresa en el contexto de varios cánceres diferentes, donde participa en la señalización celular para promover la supervivencia de las células tumorales. Debido a que ROR1 generalmente no se expresa en células normales, ROR1 es una diana terapéutica específica de un tumor y/o asociada a un tumor. Están disponibles diversas moléculas de unión a ROR1, incluidos los anticuerpos anti-ROR1. El documento WO2014031174 desvela anticuerpos y composiciones farmacéuticas que comprenden anticuerpos que se unen específicamente a ROR1 y se usan para inhibir la metástasis.
Los receptores de antígenos quiméricos que contienen porciones de anticuerpos anti-ROR1, y células que expresan dichos receptores quiméricos, también están disponibles. Se necesitan moléculas de unión a ROR1 mejoradas y células dirigidas a ROR1 modificadas por ingeniería. Por ejemplo, existe la necesidad de moléculas y células con inmunogenicidad reducida y anticuerpos completamente humanos, incluyendo fragmentos de anticuerpos, que se unen específicamente a ROR1 y receptores quiméricos que expresan dichos anticuerpos humanos para su uso en terapia celular adoptiva. Se proporcionan realizaciones que satisfacen tales necesidades.
Sumario
Se proporcionan moléculas de unión a ROR1, incluyendo polipéptidos, tales como los anticuerpos anti-ROR1, según se define en las reivindicaciones adjuntas al presente documento, incluidos los fragmentos de anticuerpos que se unen al antígeno, tales como los anticuerpos de dominio único (por ejemplo, Vh solo), fragmentos monocatenarios que incluyen fragmentos scFv y polipéptidos que contienen dichos anticuerpos, incluyendo proteínas de fusión, receptores, por ejemplo, receptores recombinantes, incluidos los receptores quiméricos, como los receptores de antígenos quiméricos (CAR) que contienen el anticuerpo como componente de reconocimiento de antígenos. En realizaciones particulares, los anticuerpos son anticuerpos humanos, tales como fragmentos monocatenarios humanos que incluyen scFv.
Siempre que sean anticuerpos o fragmentos de unión a antígeno de los mismos, incluidos aquellos que se unen específicamente a ROR1, tales como los que se unen específicamente a ROR1 humano. De acuerdo con la invención, los anticuerpos contienen regiones determinantes de complementariedad (CDR) particulares, incluidas las CDR de cadena pesada (CDR-H) y las CDR de cadena ligera (CDR-L), tal como se define en las reivindicaciones. En algunas realizaciones, el anticuerpo o el fragmento de unión a antígeno del mismo incluye una región variable de cadena pesada (Vh). En algunas realizaciones, el anticuerpo o el fragmento de unión a antígeno del mismo incluye una región Vh y una región variable de cadena ligera (Vl).
En algunas realizaciones o aspectos de la divulgación, se enseñan anticuerpos o fragmentos de unión a antígeno de los mismos que incluyen una región variable de cadena pesada (Vh) que contiene una región determinante de complementariedad de cadena pesada 3 (CDR-H3) que tiene la secuencia de aminoácidos establecida en los SEQ ID NO: 22, 29, 35, 45, 50, 51, 52, 53, 54, 55, 56, 57, 58, 59, 60, 61, 62, 63, 64, 65, 66, 67, 68, 69, 70, 71 o 174 y/o una CDR-H3 contenida dentro de la secuencia variable de cadena pesada (Vh) establecida en los SEQ ID NO: 8, 10, 13, 15, 17, 19, 175, 176, 177, 178, 179, 180, 181, 182, 183, 184, 185, 186, 187, 188, 189, 190, 191, 192, 193, 194, 195, 196, 197, 198, 199, 200, 201,202, 203, 204, 205, 206, 207, 208 o 209.
Se enseñan anticuerpos o fragmentos de unión a antígeno del mismo que incluyen una región variable de cadena pesada (Vh) que comprende al menos un 90 % de identidad de secuencia con la secuencia de aminoácidos de la región Vh establecida en la SEQ ID NO: 8, 10, 13, 15, 17, 19, 175, 176, 177, 178, 179, 180, 181, 182, 183, 184, 185, 186, 187, 188, 189, 190, 191, 192, 193, 194, 195, 196, 197, 198, 199, 200, 201, 202, 203, 204, 205, 206, 207, 208 o 209. En algunas realizaciones o aspectos de la divulgación, se proporcionan anticuerpos o fragmentos de unión a
antígeno de los mismos que incluyen una región variable de cadena pesada (Vh) que tiene al menos un 90 % de identidad de secuencia con la secuencia de aminoácidos de la región Vh establecida en la SEQ ID NO: 8, 10, 13, 15,
17 o 19, tal como al menos el 91 %, el 92 %, el 93 %, el 94 %, el 95 %, el 96 %, el 97 %, el 98 % o el 99 % de identidad de secuencia con la misma.
En algunas de tales realizaciones o aspectos de la divulgación, la región Vh comprende una región determinante de complementariedad de cadena pesada 3 (CDR-H3) que comprende la secuencia de aminoácidos establecida en la
SEQ ID NO: 22, 29, 35, 45, 50, 51, 52, 53, 54, 55, 56, 57, 58, 59, 60, 61, 62, 63, 64, 65, 66, 67, 68, 69, 70, 71 o 174;
o una CDR-H3 contenida dentro de la secuencia VH establecida en la SEQ ID NO: 8, 10, 13, 15, 17, 19, 175, 176,
177, 178, 179, 180, 181, 182, 183, 184, 185, 186, 187, 188, 189, 190, 191, 192, 193, 194, 195, 196, 197, 198, 199,
200, 201,202, 203, 204, 205, 206, 207, 208 o 209. En algunas de tales realizaciones o aspectos de la divulgación, la región VH incluye una región determinante de complementariedad de la cadena pesada 3 (CDR-H3) que tiene la secuencia de aminoácidos establecida en los SEQ iD NO: 22, 29, 35, 45, 50, 51,52, 53, 54, 55, 56, 57, 58, 59, 60, 61,
62, 63, 64, 65, 66, 67, 68, 69, 70, 71 o 174 y/o una CDR-H3 contenida en la secuencia de Vh establecida en los SEQ
ID NO: 8, 10, 13, 15, 17 o 19. En algunos aspectos de la divulgación, la región Vh incluye una región determinante de complementariedad de cadena pesada 3 (CDR-H3) que tiene la secuencia de aminoácidos establecida en la SEQ ID
NO: 72 y/o una CDR-H3 contenida dentro de la secuencia de Vh establecida en la SEQ ID NO: 85.
En algunas de tales realizaciones o aspectos de la divulgación, la región Vh incluye una región determinante de complementariedad de la cadena pesada 1 (CDR-H1) que comprende la secuencia de aminoácidos establecida en los
SEQ ID NO: 20, 27, 33, 155, 156, 157, 158, 159, 160, 161, 162 o 163, y/o que comprende la secuencia de aminoácidos establecida en los SEQ ID NO: 269, 270, 271,272, 273, 274, 275, 276, 278 o 279 y/o que comprende la secuencia de aminoácidos establecida en los SEQ ID NO: 75, 77, 79, 280, 281,282, 283, 284, 285, 286, 287, 288 o 289 y/o un CDR-H1 contenida dentro de la secuencia de Vh establecida en los SEQ ID NO: 8, 10, 13, 15, 17, 19, 175, 176, 177, 178,
179, 180, 181, 182, 183, 184, 185, 186, 187, 188, 189, 190, 191, 192, 193, 194, 195, 196, 197, 198, 199, 200, 201,
202, 203, 204, 205, 206, 207, 208 o 209; y/o una región determinante de complementariedad de la cadena pesada 2
(CDR-H2) que comprende la secuencia de aminoácidos indicada en los SEQ ID NO: 21, 26, 28, 34, 164, 165, 166,
167, 168, 169, 170, 171, 172,173 o 318 y/o que comprende la secuencia de aminoácidos establecida en los SEQ ID
NO: 291,292, 293, 294, 295, 296, 297, 298, 299, 300, 301,302 o 303 y/o que comprende la secuencia de aminoácidos establecida en los SEQ ID NO: 304, 305, 306, 307, 308, 309, 310, 311, 312, 313, 314, 315, 316 o 317 y/o una CDR-H2 contenida dentro de la secuencia de Vh establecida en los SEQ ID NO: 8, 10, 13, 15, 17, 19, 175, 176, 177, 178,
179, 180, 181, 182, 183, 184, 185, 186, 187, 188, 189, 190, 191, 192, 193, 194, 195, 196, 197, 198, 199, 200, 201,
202, 203, 204, 205, 206, 207, 208 o 209. En algunas de tales realizaciones o aspectos de la divulgación, la región Vh incluye una región determinante de complementariedad de cadena pesada 1 (CDR-H1) que tiene la secuencia de aminoácidos establecida en los SEQ ID NO: 20, 27 o 33 y/o una CDR-H1 contenida dentro de la secuencia de Vh indicada en los SEQ ID NO: 8, 10, 13, 15, 17 o 19; y/o una región determinante de complementariedad de la cadena pesada 2 (CDR-H2) que tiene la secuencia de aminoácidos establecida en los SEQ ID NO: 21, 26, 28 o 34 y/o una
CDR-H2 contenida dentro de la secuencia de Vh establecida en los SEQ ID NO: 8, 10, 13, 15, 17 o 19.
Se enseñan anticuerpos o fragmentos de unión a antígeno de los mismos que incluyen una región variable de cadena pesada (VH) que comprende una región determinante de complementariedad de cadena pesada 1 (CDR-H1), CDR-H2 y CDR-H3, donde la CDR-H1 comprende la secuencia de aminoácidos establecida en los SEQ iD NO: 20, 27, 33,
74, 75, 76, 77, 78, 79, 155, 156, 157, 158, 159, 160, 161, 162 o 163; la CDR-H2 comprende la secuencia de aminoácidos establecida en los SEQ ID NO: 21, 26, 28, 34, 80, 81, 82, 83, 164, 165, 166, 167, 168, 169, 170, 171,
172, 173 o 318; y/o la CDR-H3 comprende la secuencia de aminoácidos establecida en los SEQ ID NO: 22, 29, 35,
45, 50, 51,52, 53, 54, 55, 56, 57, 58, 59, 60, 61,62, 63, 64, 65, 66, 67, 68, 69, 70, 71 o 174. En algunas realizaciones o aspectos de la divulgación, se enseñan anticuerpos o fragmentos de unión a antígeno de los mismos que incluyen una CDR-H1 que tiene la secuencia de aminoácidos establecida en los SEQ ID NO: 20, 27 o 33; una CDR-H2 que tiene la secuencia de aminoácidos establecida en los SEQ ID NO: 21, 26, 28 o 34; y una CDR-H3 que tiene la secuencia de aminoácidos establecida en los SEQ ID NO: 22, 29, 35, 45, 50, 51,52, 53, 54, 55, 56, 57, 58, 59, 60, 61,
62, 63, 64, 65, 66, 67, 68, 69, 70, 71 o 174.
En algunas de tales realizaciones o aspectos de la divulgación, el anticuerpo incluye una CDR-H3 que tiene la secuencia de aminoácidos VSNYEYYFDY (SEQ ID NO: 29), DFGRWGYYFDY (SEQ ID NO: 52), DFGRWSYYFDY
(SEQ ID NO: 35) o DSSYDAFDI (SEQ ID NO: 22).
En algunas de tales realizaciones o aspectos de la divulgación, el anticuerpo incluye una región Vh que incluye la
CDR-H1, la CDR-H2 y la CDR-H3 que tienen las secuencias de los SEQ ID NO: 20, 21 y 22, respectivamente; la Cd R-H1, la CDR-H2 y la CDR-H3 que tienen las secuencias de los SEQ ID NO: 20, 26 y 22, respectivamente; la CDR-H1, la CDR-H2 y la CDR-H3 que tienen las secuencias de los SEQ ID NO: 27, 28 y 29, respectivamente; la CDR-H1, la
CDR-H2 y la CDR-H3 que tienen las secuencias de los SEQ ID NO: 33, 34 y 35, respectivamente; la CDR-H1, la CDR-H2 y la CDR-H3 que tienen las secuencias de los SEQ ID NO: 33, 34 y 52, respectivamente; la CDR-H1, la CDR-H2 y la CDR-H3 comprenden las secuencias de los SEQ ID NO: 27, 164 y 45, respectivamente; la CDR-H1, la CDR-H2 y la CDR-H3 comprenden las secuencias de los SEQ ID NO: 27, 164 y 68, respectivamente; la CDR la CDR-H3 comprenden las secuencias de los SEQ ID NO: 27, 164 y 64, respectivamente; la CDR la CDR-H3 comprenden las secuencias de los SEQ ID NO: 27, 164 y 66, respectivamente; la CDR
la CDR-H3 que tienen las secuencias de los SEQ ID NO: 33, 318 y 35, respectivamente; la CDR-H1, la CDR-H2 y la
CDR-H3 comprenden las secuencias de los SEQ ID NO: 33, 34 y 70, respectivamente; la CDR-H1, la CDR-H2 y la
CDR-H3 comprenden las secuencias de los SEQ ID NO: 33, 34 y 55, respectivamente; la CDR-H1, la CDR-H2 y la
CDR-H3 comprenden las secuencias de los SEQ ID NO: 33, 34 y 53, respectivamente; la CDR-H1, la CDR-H2 y la
CDR-H3 comprenden las secuencias de los SEQ ID NO: 33, 34 y 56, respectivamente; la CDR-H1, la CDR-H2 y la
CDR-H3 comprenden las secuencias de los SEQ ID NO: 33, 34 y 61, respectivamente; la CDR-H1, la CDR-H2 y la
CDR-H3 comprenden las secuencias de los SEQ ID NO: 33, 34 y 59, respectivamente; la CDR-H1, la CDR-H2 y la
CDR-H3 comprenden las secuencias de los SEQ ID NO: 33, 171 y 60, respectivamente; la CDR-H1, la CDR-H2 y la
CDR-H3 comprenden las secuencias de los SEQ ID NO: 155, 34 y 35, respectivamente; la CDR-H1, la CDR-H2 y la
CDR-H3 comprenden las secuencias de los SEQ ID NO: 156, 34 y 35, respectivamente; la CDR-H1, la CDR-H2 y la
CDR-H3 comprenden las secuencias de los SEQ ID NO: 162, 170 y 50, respectivamente; la CDR-H1, la CDR-H2 y la
CDR-H3 comprenden las secuencias de los SEQ ID NO: 162, 170 y 51, respectivamente; la CDR-H1, la CDR-H2 y la
CDR-H3 comprenden las secuencias de los SEQ ID NO: 161, 169 y 54, respectivamente; la CDR-H1, la CDR-H2 y la
CDR-H3 comprenden las secuencias de los SEQ ID NO: 159, 167 y 57, respectivamente; la CDR-H1, la CDR-H2 y la
CDR-H3 comprenden las secuencias de los SEQ ID NO: 160, 168 y 58, respectivamente; la CDR-H1, la CDR-H2 y la
CDR-H3 comprenden las secuencias de los SEQ ID NO: 158, 166 y 62, respectivamente; la CDR-H1, la CDR-H2 y la
CDR-H3 comprenden las secuencias de los SEQ ID NO: 158, 166 y 63, respectivamente; la CDR-H1, la CDR-H2 y la
CDR-H3 comprenden las secuencias de los SEQ ID NO: 158, 166 y 65, respectivamente; la CDR-H1, la CDR-H2 y la
CDR-H3 comprenden las secuencias de los SEQ ID NO: 157, 165 y 67, respectivamente; la CDR-H1, la CDR-H2 y la
CDR-H3 comprenden las secuencias de los SEQ ID NO: 163, 173 y 69, respectivamente; la CDR-H1, la CDR-H2 y la
CDR-H3 comprenden las secuencias de los SEQ ID NO: 160, 172, 71, respectivamente; o la CDR-H1, la CDR-H2 y la
CDR-H3 comprenden las secuencias de los SEQ ID NO: 160, 172, 174, respectivamente. En algunas realizaciones o
aspectos de la divulgación, cualquiera de los anticuerpos o fragmentos enseñados anteriormente puede contener la
CDR correspondiente (por ejemplo, CDR-H1 o CDR-H2) de acuerdo con un esquema de numeración alternativo tal
como se describe y conoce por un experto en la materia.
En algunas de tales realizaciones o aspectos de la divulgación, el anticuerpo incluye una región Vh que incluye la
CDR-H1, la CDR-H2 y la CDR-H3 que tienen las secuencias de los SEQ ID NO: 20, 21 y 22, respectivamente; la Cd R-H1, la CDR-H2 y la CDR-H3 que tienen las secuencias de los SEQ ID NO: 20, 26 y 22, respectivamente; la CDR-H1,
la CDR-H2 y la CDR-H3 que tienen las secuencias de los SEQ ID NO: 27, 28 y 29, respectivamente; la CDR-H1, la
CDR-H2 y la CDR-H3 que tienen las secuencias de los SEQ ID NO: 33, 34 y 35, respectivamente; o la CDR-H1, la
CDR-H2 y la CDR-H3 que tienen las secuencias de los SEQ ID NO: 33, 34 y 52, respectivamente. En algunas
realizaciones, el anticuerpo incluye una región Vh que incluye la CDR-H1, la CDR-H2 y la CDR-H3 que tienen las
secuencias de los SEQ iD NO: 27, 28 y 29, respectivamente; o la CDR-H1, la CDR-H2 y la CDR-H3 comprenden las
secuencias de los SEQ ID NO: 33, 34 y 52, respectivamente. En algunas realizaciones, el anticuerpo incluye una
región Vh que incluye la CDR-H1, la CDR-H2 y la CDR-H3 que tienen las secuencias de los SEQ ID NO: 20, 21 y 22,
respectivamente; la CDR-H1, la CDR-H2 y la CDR-H3 que tienen las secuencias de los SEQ respectivamente; la CDR-H1, CDR-H3 que tienen las secuencias de los SEQ respectivamente; la CDR-H1, CDR-H3 que tienen las secuencias de los SEQ respectivamente.
Se proporcionan o se enseñan anticuerpos o fragmentos de unión a antígeno de los mismos que incluyen una región
determinante de complementariedad de cadena pesada 1 (CDR-H1), una CDR-H2 y una CDR-H3, respectivamente,
que comprenden las secuencias de aminoácidos de una CDR-H1, una CDR-H2, y una CDR-H3 contenida dentro de
la secuencia de aminoácidos de la región Vh establecida en los SEQ ID NO: 8, 10, 13, 15, 17, 19, 175, 176, 177, 178,
179, 180, 181, 182, 183, 184, 185, 186, 187, 188, 189, 190, 191, 192, 193, 194, 195, 196, 197, 198, 199, 200, 201,
202, 203, 204, 205, 206, 207, 208 o 209. En algunas realizaciones o aspectos de la divulgación, se enseñan
anticuerpos o fragmentos de unión a antígeno de los mismos que incluyen una región Vh que incluye una CDR-H1 de
cadena pesada, una CDR-H2 y una CDR-H3, teniendo respectivamente las secuencias de aminoácidos de una CDR-H1, una CDR-H2, y una CDR-H3 contenidas dentro de la secuencia de aminoácidos de la región Vh establecida en
los SEQ ID NO: 8, 10, 13, 15, 17 o 19. En algunas realizaciones, el anticuerpo incluye una región Vh que incluye una
CDR-H1 de cadena pesada, una CDR-H2 y una CDR-H3, teniendo respectivamente las secuencias de aminoácidos
de una CDR-H1, una CDR-H2, y una CDR-H3 contenidas dentro de la secuencia de aminoácidos de la región Vh
establecida en la SEQ ID NO: 8 o 10. En algunas realizaciones, el anticuerpo incluye una región Vh que incluye una
CDR-H1 de cadena pesada, una CDR-H2 y una CDR-H3, teniendo respectivamente las secuencias de aminoácidos
de una CDR-H1, una CDR-H2, y una CDR-H3 contenidas dentro de la secuencia de aminoácidos de la región Vh
establecida en los SEQ ID NO: 13, 15, 17 o 19.
En algunas de tales realizaciones o aspectos de la divulgación, la región Vh contiene una región marco 1 (FR1), una
FR2, una FR3 y/o una FR4 que comprende al menos un 90 % de identidad de secuencia, respectivamente, con una
FR1, FR2, FR3 y/o FR4 de la secuencia de aminoácidos establecida en los SEQ ID NO: 8, 10, 13, 15, 17, 19, 175,
176, 177, 178, 179, 180, 181, 182, 183, 184, 185, 186, 187, 188, 189, 190, 191, 192, 193, 194, 195, 196, 197, 198,
199, 200, 201,202, 203, 204, 205, 206, 207, 208 o 209. En algunas de tales realizaciones o aspectos de la divulgación,
la región Vh contiene una secuencia de una región marco 1 (FR1), una FR2, una FR3 y/o una FR4 que tiene al menos
un 90 % de identidad de secuencia, respectivamente, con una FR1, FR2, FR3 y/o FR4 de la secuencia de aminoácidos
establecida en los SEQ ID NO: 8, 10, 13, 15, 17 o 19. En algunas realizaciones, la región Vh contiene una secuencia
de una región marco 1 (FR1), una FR2, una FR3 y/o una FR4 que tiene al menos el 91 %, el 92 %, el 93 %, el 94 %, el 95 %, el 96 %, el 97 %, el 98 %, el 98 %, el 99 % de identidad de secuencia, respectivamente, con una FR1, FR2, FR3 y/o FR4 de la secuencia de aminoácidos establecida en los SEQ ID NO: 8, 10, 13, 15, 17 o 19. En algunas realizaciones o aspectos de la divulgación, la región Vh contiene una secuencia de una región marco 1 (FR1), una FR2, una FR3 y una FR4 que tiene al menos el 90 %, el 91 %, el 92 %, el 93 %, el 94 %, el 95 %, el 96 %, el 97 %, el 98 %, el 98 %, el 99 % de identidad de secuencia, respectivamente, con una FR1, FR2, FR3 y FR4 de la secuencia de aminoácidos establecida en los SEQ ID NO: 8, 10, 13, 15, 17 o 19.
En algunas de tales realizaciones o aspectos de la divulgación, la región Vh tiene la secuencia de aminoácidos establecida en los SEQ ID NO: 8, 10, 13, 15, 17, 19, 175, 176, 177, 178, 179, 180, 181, 182, 183, 184, 185, 186, 187, 188, 189, 190, 191, 192, 193, 194, 195, 196, 197, 198, 199, 200, 201, 202, 203, 204, 205, 206, 207, 208 o 209. En algunas de tales realizaciones o aspectos de la divulgación, la región Vh tiene la secuencia de aminoácidos establecida en los SEQ ID NO: 8, 10, 13, 15, 17 o 19. En algunas realizaciones o aspectos de la divulgación, la región Vh tiene la secuencia de aminoácidos establecida en los SEQ ID NO: 8 o 10. En algunas realizaciones o aspectos de la divulgación, la región Vh tiene la secuencia de aminoácidos establecida en los SEQ ID NO: 13, 15, 17 o 19.
En algunas de tales realizaciones o aspectos de la divulgación, la región Vh comprende la CDR-H1, la CDR-H2 y la CDR-H3 establecidas en los SEQ ID NO: 20, 26 y 22, respectivamente, y/o la región Vh comprende la secuencia de aminoácidos establecida en la SEQ ID NO: 19. En algunas de tales realizaciones o aspectos de la divulgación, la región Vh comprende la CDR-H1, la CDR-H2 y la CDR-H3 establecidas en los SEQ ID NO: 33, 34 y 52, respectivamente, y/o la región Vh comprende la secuencia de aminoácidos establecida en la SEQ ID NO: 10. En algunas de tales realizaciones o aspectos de la divulgación, la región Vh comprende la CDR-H1, la CDR-H2 y la CDR-H3 establecidas en los SEQ ID NO: 33, 34 y 35, respectivamente, y/o la región Vh comprende la secuencia de aminoácidos establecida en la SEQ ID NO: 13. En algunas de tales realizaciones o aspectos de la divulgación, la región Vh comprende la CDR-H1, la CDR-H2 y la CDR-H3 establecidas en los SEQ ID NO: 27, 28 y 29, respectivamente, y/o la región Vh comprende la secuencia de aminoácidos establecida en la SEQ ID NO: 15.
En algunos aspectos de la divulgación, el anticuerpo o el fragmento de unión a antígeno es solo una cadena pesada, una VH solo, y/o no incluye una VL o una porción de unión a antígeno del mismo y/o el sitio de unión a antígeno del anticuerpo o el fragmento incluye solo restos de la cadena pesada y/o no incluye restos de una cadena ligera.
En algunos aspectos de la divulgación, el anticuerpo o el fragmento no contiene una región variable de cadena ligera (Vl), no contiene una CDR-L1, CDR-L2 y/o CDR-L3, y/o es un anticuerpo de dominio único (sdAb) que contiene solo la región Vh. En algunos aspectos de la divulgación, el anticuerpo o el fragmento es un sdAb que solo contiene una región VH de cualquiera de las descritas.
En algunas realizaciones o aspectos de la divulgación, cualquiera de los anticuerpos o fragmentos que contienen cualquiera de las secuencias de la región VH anteriores contiene además una región variable de cadena ligera (Vl). En algunas de tales realizaciones o aspectos de la divulgación, la región Vl tiene al menos un 90 % de identidad de secuencia con la secuencia de aminoácidos de la región Vl establecida en los SEQ ID NO: 14, 16, 18, 234, 235, 236, 237, 238, 239, 240, 241,242, 243, 244, 245, 246, 247 o 248, tal como al menos el 91 %, el 92 %, el 93 %, el 94 %, el 95 %, el 96 %, el 97 %, el 98 %, el 99 % de identidad de secuencia con la secuencia de aminoácidos de la región Vl establecida en los SEQ ID NO: 14, 16, 18, 234, 235, 236, 237, 238, 239, 240, 241,242, 243, 244, 245, 246, 247 o 248. En algunas de tales realizaciones o aspectos de la divulgación, la región Vl tiene al menos un 90 % de identidad de secuencia con la secuencia de aminoácidos de la región Vl establecida en los SEQ ID NO: 14, 16 o 18, tal como al menos el 91 %, el 92 %, el 93 %, el 94 %, el 95 %, el 96 %, el 97 %, el 98 %, el 99 % de identidad de secuencia con la secuencia de aminoácidos de la región Vl establecida en los SEQ ID NO: 14, 16 o 18.
En algunas de tales realizaciones o aspectos de la divulgación, la región Vl comprende una región determinante de complementariedad de cadena ligera 3 (CDR-L3) que comprende la secuencia de aminoácidos establecida en los SEQ ID NO: 25, 32, 38, 39, 40, 41,42, 43, 44, 46, 47, 48, 49, 232 o 233. En algunas de tales realizaciones o aspectos de la divulgación, la región Vl contiene una región determinante de complementariedad de la cadena ligera 3 (CDR-L3) que tiene la secuencia de aminoácidos establecida en los SEQ ID NO: 25, 32, 38, 39, 40, 41,42, 43, 44, 46, 47, 48 o 49.
En algunas de tales realizaciones o aspectos de la divulgación, la región Vl contiene una región determinante de complementariedad de cadena ligera 1 (CDR-L1) que comprende la secuencia de aminoácidos establecida en los SEQ ID NO: 23, 30, 36, 210, 211, 212, 213, 214, 215, 217, 216, 218, 219 o 220 y/o un CDR-L1 contenida en la secuencia de Vl establecida en los SEQ ID NO: 14, 16, 18, 234, 235, 236, 237, 238, 239, 240, 241, 242, 243, 244, 245, 246, 247 o 248; y/o una región determinante de complementariedad de la cadena ligera 2 (CDR-L2) que comprende la secuencia de aminoácidos establecida en los SEQ ID NO: 24, 31,37, 221,222, 223, 224, 225, 226, 227, 228, 229, 230 o 231 y/o una CDR-L2 contenida dentro de la secuencia de Vl establecida en los SEQ ID NO: 14, 16, 18, 234, 235, 236, 237, 238, 239, 240, 241, 242, 243, 244, 245, 246, 247 o 248. En algunas de tales realizaciones o aspectos de la divulgación, la región Vl contiene una región determinante de complementariedad de cadena ligera 1 (CDR-L1) que tiene la secuencia de aminoácidos establecida en los SEQ ID NO: 23, 30 o 36 y/o una CDR-L1 contenida dentro de la secuencia de Vl establecida en los SEQ ID NO: 14, 16 o 18; y/o una región determinante de
complementariedad de la cadena ligera 2 (CDR-L2) que tiene la secuencia de aminoácidos establecida en SEQ ID NO: 24, 31 o 37 y/o una CDR-L2 contenida dentro de la secuencia de Vl establecida en los SEQ ID NO: 14, 16 o 18.
En algunas de tales realizaciones o aspectos de la divulgación, la región Vl contiene una CDR-L1 que contiene la secuencia de aminoácidos establecida en los SEQ ID NO: 23, 30, 36, 210, 211, 212, 213, 214, 215, 217, 216, 218, 219 o 220; una CDR-L2 que contiene la secuencia de aminoácidos establecida en la SEQ ID NO: 24, 31,37, 221,222, 223, 224, 225, 226, 227, 228, 229, 230 o 231; y una CDR-L3 que contiene la secuencia de aminoácidos establecida en los SEQ ID NO: 25, 32, 38, 39, 40, 41,42, 43, 44, 46, 47, 48, 49, 232 o 233. En algunas de tales realizaciones o aspectos de la divulgación, la región Vl contiene una CDR-L1 que tiene la secuencia de aminoácidos establecida en los SEQ ID NO: 23, 30 o 36; una CDR-L2 que tiene la secuencia de aminoácidos establecida en los SEQ ID NO: 24, 31 o 37; y una CDR-L3 que tiene la secuencia de aminoácidos establecida en los SEQ ID NO: 25, 32, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 46, 47, 48 o 49.
En algunas de tales realizaciones o aspectos de la divulgación, la CDR-L3 tiene la secuencia de aminoácidos establecida en los SEQ ID NO: 25, 32 o 38.
En algunas de tales realizaciones o aspectos de la divulgación, el anticuerpo incluye una región Vl que incluye la CDR-L1, la CDR-L2 y la CDR-L3 que comprenden las secuencias de los SEQ iD NO: 23, 24 y 25, respectivamente; la CDR-L1, la CDR-L2 y la CDR-L3 que comprenden las secuencias de los SEQ ID NO: 30, 31 y 32, respectivamente; la CDR-L1, la CDR-L2 y la CDR-L3 que comprenden las secuencias de los SEQ ID NO: 36, 37 y 38, respectivamente; la CDR-L1, la CDR-L2 y la CDR-L3 que comprenden las secuencias de los SEQ ID NO: 216, 227 y 40, respectivamente; la CDR-L1, la Cd R-L2 y la CDR-L3 que comprenden las secuencias de los SEQ ID NO: 218, 229 y 39, respectivamente; la CDR-L1, la Cd R-L2 y la c Dr -L3 que comprenden las secuencias de los SEQ ID NO: 219, 230 y 43, respectivamente; la CDR-L1, la CDR-L2 y la CDR-L3 que comprenden las secuencias de los SEQ ID NO: 220, 231 y 46, respectivamente; la CDR-L1, la CDR-L2 y la CDR-L3 que comprenden las secuencias de los SEQ ID NO: 210, 221 y 49, respectivamente; la CDR-L1, la CDR-L2 y la CDR-L3 que comprenden las secuencias de los SEQ ID NO: 210, 221 y 233, respectivamente; la CDR-L1, la CDR-L2 y la Cd R-L3 que comprenden las secuencias de los SEQ ID NO: 211, 222 y 48, respectivamente; la CDR-L1, la CDR-L2 y la CDR-L3 que comprenden las secuencias de los SEQ ID NO: 212, 223 y 42, respectivamente; la CDR-L1, la CDR-L2 y la CDR-L3 que comprenden las secuencias de los SEQ ID NO: 214, 225 y 232, respectivamente; la CDR-L1, la Cd R-L2 y la CDR-L3 que comprenden las secuencias de los SEQ ID NO: 215, 226 y 44, respectivamente; la CDR-L1, la CDR-L2 y la CDR-L3 que comprenden las secuencias de los SEQ ID NO: 217, 228 y 41, respectivamente; la CDR-L1, la CDR-L2 y la CDR-L3 que comprenden las secuencias de los SEQ ID NO: 36, 37 y 38, respectivamente; o la CDR-L1, la CDR-L2 y la CDR-L3 que comprenden las secuencias de los SEQ ID NO: 213, 224 y 47, respectivamente. En algunas de tales realizaciones o aspectos de la divulgación, el anticuerpo o el fragmento incluye una región Vl que incluye la CDR-L1, la CDR-L2 y la CDR-L3 que comprenden las secuencias de los SEQ ID NO: 23, 24 y 25, respectivamente; la CDR-L1, la CDR-L2 y la CDR-L3 que comprenden las secuencias de los SEQ ID NO: 30, 31 y 32, respectivamente; o la CDR-L1, la CDR-L2 y la CDR-L3 que comprenden las secuencias de los SEQ ID NO: 36, 37 y 38, respectivamente.
En algunas de tales realizaciones o aspectos de la divulgación, la región Vl contiene la CDR-L1, CDR-L2 y CDR-L3, respectivamente, contenidas dentro de la secuencia de aminoácidos de la región Vl establecida en los s Eq ID NO: 14, 16, 18, 234, 235, 236, 237, 238, 239, 240, 241, 242, 243, 244, 245, 246, 247 o 248. En algunas de tales realizaciones o aspectos de la divulgación, la región Vl contiene la CDR-L1, CDR-L2 y CDR-L3, respectivamente, contenidas dentro de la secuencia de aminoácidos de la región Vl establecida en los SEQ ID NO: 14, 16 o 18.
En algunas de tales realizaciones o aspectos de la divulgación, la región Vl contiene una región marco 1 (FR1), una FR2, una FR3 y/o una FR4 que tiene al menos un 90 % de identidad de secuencia, respectivamente, con la FR1, FR2, FR3 y/o FR4 de la secuencia de aminoácidos establecida en los SEQ ID NO: 14, 16 o 18. En algunas realizaciones o aspectos de la divulgación, la región Vl contiene una secuencia de una región marco 1 (FR1), una FR2, una FR3 y/o una FR4 que tiene al menos el 91 %, el 92 %, el 93 %, el 94 %, el 95 %, el 96 %, el 97 %, el 98 %, el 98 %, el 99 % de identidad de secuencia, respectivamente, con una FR1, FR2, FR3 y/o FR4 de la secuencia de aminoácidos establecida en los SEQ ID NO: 14, 16 o 18. En algunas realizaciones o aspectos de la divulgación, la región Vl contiene una secuencia de una región marco 1 (FR1), una FR2, una FR3 y una FR4 que tiene al menos el 90 %, el 91 %, el 92 %, el 93 %, el 94 %, el 95 %, el 96 %, el 97 %, el 98 %, el 98 %, el 99 % de identidad de secuencia, respectivamente, con una FR1, FR2, FR3 y FR4 de la secuencia de aminoácidos establecida en los SEQ ID NO: 14, 16 o 18.
En algunas de tales realizaciones o aspectos de la divulgación, la región VL tiene la secuencia de aminoácidos establecida en los SEQ ID NO: 14, 16, 18, 234, 235, 236, 237, 238, 239, 240, 241,242, 243, 244, 245, 246, 247 o 248. En algunas de tales realizaciones o aspectos de la divulgación, la región VL tiene la secuencia de aminoácidos establecida en los SEQ ID NO: 14, 16 o 18.
Se enseñan anticuerpos o fragmentos de unión a antígeno de los mismos que contienen las secuencias de aminoácidos de las secuencias de CDR-H1, CDR-H2 y CDR-H3 contenidas dentro de la secuencia de aminoácidos de la región Vh establecida en los SEQ ID NO: 8, 10, 13, 15, 17, 19, 175, 176, 177, 178, 179, 180, 181, 182, 183, 184, 185, 186, 187, 188, 189, 190, 191, 192, 193, 194, 195, 196, 197, 198, 199, 200, 201, 202, 203, 204, 205, 206, 207,
208 o 209; y/o contienen las secuencias de aminoácidos de las secuencias de CDR-L1, CDR-L2 y CDR-L3 contenidas dentro de la secuencia de aminoácidos de la región variable de cadena ligera (VL) establecida en los SEQ ID NO: 14, 16, 18, 234, 235, 236, 237, 238, 239, 240, 241, 242, 243, 244, 245, 246, 247 o 248. En algunos aspectos de las divulgaciones, se enseñan anticuerpos o fragmentos de unión a antígeno de los mismos que contienen las secuencias de aminoácidos de las secuencias de CDR-H1, CDR-H2 y CDR-H3 contenidas dentro de la secuencia de aminoácidos de la región Vh establecida en los SEQ ID NO: 8, 10, 13, 15, 17 o 19; y/o contienen las secuencias de aminoácidos de las secuencias de CDR-L1, CDR-L2 y CDR-L3 contenidas dentro de la secuencia de aminoácidos de la región variable de cadena ligera (VL) expuesta en la SEQ ID NO: 14, 16 o 18.
En algunas realizaciones o aspectos de la divulgación, se encuentran anticuerpos o fragmentos de unión a antígeno de los mismos que incluyen las regiones Vh y Vl que tienen secuencias de aminoácidos que tienen al menos el 90 %, el 91 %, el 92 %, el 93 %, el 94 %, el 95 %, el 96 %, el 97 %, el 98 % o el 99 % de identidad con los SEQ ID NO: 19 y 18, respectivamente; las regiones Vh y Vl que tienen secuencias de aminoácidos que tienen al menos el 90 %, el 91 %, el 92 %, el 93 %, el 94 %, el 95 %, el 96 %, el 97 %, el 98 % o el 99 % de identidad con los SEQ ID NO: 17 y 18, respectivamente; las regiones Vh y Vl que tienen secuencias de aminoácidos que tienen al menos el 90 %, el 91 %, el 92 %, el 93 %, el 94 %, el 95 %, el 96 %, el 97 %, el 98 % o el 99 % de identidad con los SEQ ID NO: 15 y 16, respectivamente; las regiones Vh y Vl que tienen secuencias de aminoácidos que tienen al menos el 90 %, el 91 %, el 92 %, el 93 %, el 94 %, el 95 %, el 96 %, el 97 %, el 98 % o el 99 % de identidad con los SEQ ID NO: 13 y 14, respectivamente; unas regiones Vh y Vl que comprenden secuencias de aminoácidos que tienen al menos el 90 %, el 91 %, el 92 %, el 93 %, el 94 %, el 95 %, el 96 %, el 97 %, el 98 % o el 99 % de identidad con los SEQ ID NO: 182 y 242 respectivamente; unas regiones Vh y Vl que comprenden secuencias de aminoácidos que tienen al menos el 90 %, el 91 %, el 92 %, el 93 %, el 94 %, el 95 %, el 96 %, el 97 %, el 98 % o el 99 % de identidad con los SEQ ID NO: 182 y 246, respectivamente; unas regiones Vh y Vl que comprenden secuencias de aminoácidos que tienen al menos el 90 %, el 91 %, el 92 %, el 93 %, el 94 %, el 95 %, el 96 %, el 97 %, el 98 % o el 99 % de identidad con los SEQ ID NO: 182 y 247, respectivamente; unas regiones Vh y Vl que comprenden secuencias de aminoácidos que tienen al menos el 90 %, el 91 %, el 92 %, el 93 %, el 94 %, el 95 %, el 96 %, el 97 %, el 98 % o el 99 % de identidad con los SEQ ID NO: 185 y 248, respectivamente; unas regiones Vh y Vl que comprenden secuencias de aminoácidos que tienen al menos el 90 %, el 91 %, el 92 %, el 93 %, el 94 %, el 95 %, el 96 %, el 97 %, el 98 % o el 99 % de identidad con los SEQ ID NO: 186 y 248, respectivamente; unas regiones Vh y Vl que comprenden secuencias de aminoácidos que tienen al menos el 90 %, el 91 %, el 92 %, el 93 %, el 94 %, el 95 %, el 96 %, el 97 %, el 98 % o el 99 % de identidad con los SEQ ID NO: 175 y 234, respectivamente; unas regiones Vh y Vl que comprenden secuencias de aminoácidos que tienen al menos el 90 %, el 91 %, el 92 %, el 93 %, el 94 %, el 95 %, el 96 %, el 97 %, el 98 % o el 99 % de identidad con los SEQ ID NO: 175 y 235, respectivamente; unas regiones Vh y Vl que comprenden secuencias de aminoácidos que tienen al menos el 90 %, el 91 %, el 92 %, el 93 %, el 94 %, el 95 %, el 96 %, el 97 %, el 98 % o el 99 % de identidad con los SEQ ID NO: 176 y 236, respectivamente; unas regiones Vh y Vl que comprenden secuencias de aminoácidos que tienen al menos el 90 %, el 91 %, el 92 %, el 93 %, el 94 %, el 95 %, el 96 %, el 97 %, el 98 % o el 99 % de identidad con los SEQ ID NO: 176 y 237, respectivamente; unas regiones Vh y Vl que comprenden secuencias de aminoácidos que tienen al menos el 90 %, el 91 %, el 92 %, el 93 %, el 94 %, el 95 %, el 96 %, el 97 %, el 98 % o el 99 % de identidad con los SEQ ID NO: 177 y 238, respectivamente; unas regiones Vh y Vl que comprenden secuencias de aminoácidos que tienen al menos el 90 %, el 91 %, el 92 %, el 93 %, el 94 %, el 95 %, el 96 %, el 97 %, el 98 % o el 99 % de identidad con los SEQ ID NO: 179 y 240 respectivamente; unas regiones Vh y Vl que comprenden secuencias de aminoácidos que tienen al menos el 90 %, el 91 %, el 92 %, el 93 %, el 94 %, el 95 %, el 96 %, el 97 %, el 98 % o el 99 % de identidad con los SEQ ID NO: 180 y 241, respectivamente; unas regiones Vh y Vl que comprenden secuencias de aminoácidos que tienen al menos el 90 %, el 91 %, el 92 %, el 93 %, el 94 %, el 95 %, el 96 %, el 97 %, el 98 % o el 99 % de identidad con los SEQ ID NO: 181 y 241, respectivamente; unas regiones Vh y Vl que comprenden secuencias de aminoácidos que tienen al menos el 90 %, el 91 %, el 92 %, el 93 %, el 94 %, el 95 %, el 96 %, el 97 %, el 98 % o el 99 % de identidad con los SEQ ID NO: 183 y 243 respectivamente; unas regiones Vh y Vl que comprenden secuencias de aminoácidos que tienen al menos el 90 %, el 91 %, el 92 %, el 93 %, el 94 %, el 95 %, el 96 %, el 97 %, el 98 % o el 99 % de identidad con los SEQ ID NO: 183 y 244 respectivamente; unas regiones Vh y Vl que comprenden secuencias de aminoácidos que tienen al menos el 90 %, el 91 %, el 92 %, el 93 %, el 94 %, el 95 %, el 96 %, el 97 %, el 98 % o el 99 % de identidad con los SEQ ID NO: 184 y 243, respectivamente; unas regiones Vh y Vl que comprenden secuencias de aminoácidos que tienen al menos el 90 %, el 91 %, el 92 %, el 93 %, el 94 %, el 95 %, el 96 %, el 97 %, el 98 % o el 99 % de identidad con los SEQ ID NO: 184 y 244 respectivamente; unas regiones Vh y Vl que comprenden secuencias de aminoácidos que tienen al menos el 90 %, el 91 %, el 92 %, el 93 %, el 94 %, el 95 %, el 96 %, el 97 %, el 98 % o el 99 % de identidad con los SEQ ID NO: 183 y 245, respectivamente; unas regiones Vh y Vl que comprenden secuencias de aminoácidos que tienen al menos el 90 %, el 91 %, el 92 %, el 93 %, el 94 %, el 95 %, el 96 %, el 97 %, el 98 % o el 99 % de identidad con los SEQ ID NO: 184 y 245, respectivamente; o unas regiones Vh y Vl que comprenden secuencias de aminoácidos que tienen al menos el 90 %, el 91 %, el 92 %, el 93 %, el 94 %, el 95 %, el 96 %, el 97 %, el 98 % o el 99 % de identidad con los SEQ ID NO: 178 y 239, respectivamente.
En algunas realizaciones o aspectos de la divulgación, se proporcionan anticuerpos o fragmentos de unión a antígeno de los mismos que incluyen las regiones Vh y Vl que tienen secuencias de aminoácidos establecidas en los SEQ ID NO: 19 y 18, respectivamente; las regiones Vh y Vl que tienen las secuencias de aminoácidos establecidas en los SEQ ID NO: 17 y 18, respectivamente; las regiones Vh y Vl que tienen las secuencias de aminoácidos establecidas en los SEQ ID NO: 15 y 16, respectivamente; las regiones Vh y V l que tienen las secuencias de aminoácidos establecidas en los SEQ ID NO: 13 y 14, respectivamente; las regiones Vh y Vl que comprenden las secuencias de
aminoácidos establecidas en los SEQ ID NO: 182 y 242 respectivamente; las regiones Vh y Vl que comprenden las secuencias de aminoácidos establecidas en los s Eq ID NO: 182 y 246, respectivamente; las regiones Vh y Vl que comprenden las secuencias de aminoácidos establecidas en los SEQ ID NO: 182 y 247, respectivamente; las regiones Vh y Vl que comprenden las secuencias de aminoácidos establecidas en los SEQ ID NO: 185 y 248, respectivamente; las regiones Vh y Vl que comprenden las secuencias de aminoácidos establecidas en los SEQ ID NO: 186 y 248, respectivamente; las regiones VH y VL que comprenden las secuencias de aminoácidos establecidas en los SEQ ID NO: 175 y 234, respectivamente; las regiones Vh y Vl que comprenden las secuencias de aminoácidos establecidas en los SEQ ID NO: 175 y 235, respectivamente; las regiones Vh y Vl que comprenden las secuencias de aminoácidos establecidas en los SEQ ID NO: 176 y 236, respectivamente; las regiones Vh y Vl que comprenden las secuencias de aminoácidos establecidas en los SEQ ID NO: 176 y 237, respectivamente; las regiones Vh y Vl que comprenden las secuencias de aminoácidos establecidas en los SEq ID NO: 177 y 238, respectivamente; las regiones Vh y Vl que comprenden las secuencias de aminoácidos establecidas en los SEQ ID NO: 179 y 240 respectivamente; las regiones Vh y Vl que comprenden las secuencias de aminoácidos establecidas en los SEQ ID NO: 180 y 241, respectivamente; las regiones Vh y Vl que comprenden las secuencias de aminoácidos establecidas en los SEQ ID NO: 181 y 241, respectivamente; las regiones VH y VL que comprenden las secuencias de aminoácidos establecidas en los SEQ ID NO: 183 y 243 respectivamente; las regiones Vh y Vl que comprenden las secuencias de aminoácidos establecidas en los SEQ ID NO: 183 y 244 respectivamente; las regiones Vh y Vl que comprenden las secuencias de aminoácidos establecidas en los SEQ ID NO: 184 y 243, respectivamente; las regiones Vh y Vl que comprenden las secuencias de aminoácidos establecidas en los SEQ ID NO: 184 y 244 respectivamente; las regiones Vh y Vl que comprenden las secuencias de aminoácidos establecidas en los SEq ID NO: 183 y 245, respectivamente; las regiones Vh y Vl que comprenden las secuencias de aminoácidos establecidas en los SEQ ID NO: 184 y 245, respectivamente; o las regiones Vh y Vl que comprenden las secuencias de aminoácidos establecidas en los SEQ ID NO: 178 y 239, respectivamente.
En algunas de tales realizaciones o aspectos de la divulgación, las regiones Vh y Vl incluyen las secuencias de aminoácidos de los SEQ ID NO: 19 y 18, respectivamente; las regiones Vh y Vl incluyen las secuencias de aminoácidos de los SEQ ID NO: 17 y 18, respectivamente; las regiones Vh y Vl incluyen las secuencias de aminoácidos de los SEQ ID NO: 15 y 16 respectivamente; o las regiones Vh y Vl incluyen las secuencias de aminoácidos de los SEQ ID NO: 13 y 14 respectivamente.
En algunas de tales realizaciones o aspectos de la divulgación, el anticuerpo o el fragmento se une específicamente a una proteína ROR1. En algunas realizaciones o aspectos de la divulgación, el anticuerpo o el fragmento tiene una afinidad de unión por una proteína ROR1 con una CE50 que es de aproximadamente 0,1 nM a 100 nM, 0,5 nM a 50 nM o 1 nM a 10 nM. En algunas realizaciones, el anticuerpo o el fragmento tiene una afinidad de unión por una proteína ROR1 con una CE50 menor que o menos de aproximadamente 100 nM, menor que o menos de aproximadamente 50 nM, menor que o menos de aproximadamente 10 nM o menor que o menos de aproximadamente 1 nM.
En algunas de tales realizaciones o aspectos de la divulgación, el anticuerpo o el fragmento tiene una afinidad de unión por una proteína ROR1, tal como una proteína ROR1 humana, que es al menos tan alta o sustancialmente tan alta como la afinidad de unión por la misma proteína ROR1 de la forma correspondiente del anticuerpo anti-ROR1 R12 o su fragmento de unión a antígeno, que es opcionalmente un fragmento scFv de R12.
En algunas de tales realizaciones o aspectos de la divulgación, el anticuerpo o el fragmento se une específicamente al mismo o un epítopo superpuesto de una proteína ROR1, tal como una proteína ROR1 humana, como el epítopo unido específicamente por el anticuerpo anti-ROR1 R12 o un fragmento de unión a antígeno del mismo, que es opcionalmente un fragmento scFv de R12. En algunas realizaciones o aspectos de la divulgación, el anticuerpo o el fragmento inhibe la unión del anticuerpo anti-ROR1 R12 o un fragmento de unión a antígeno del mismo, que es opcionalmente un fragmento scFv de R12, a una proteína ROR1, tal como una proteína ROR1 humana, en más de o más de aproximadamente el 80 %, el 81 %, el 82 %, el 83 %, el 84 %, el 85 %, el 86 %, el 87 %, el 88 %, el 89 %, el 90 %, el 91 %, el 92 %, el 93 %, el 94 %, el 95 %, el 96 %, el 97 %, el 98 % o el 99 %, tal como mayor que o más de aproximadamente el 80 % o mayor que o más de aproximadamente el 90 %.
En algunas de tales realizaciones o aspectos de la divulgación, la proteína ROR1 es una proteína ROR1 humana y el anticuerpo o el fragmento se une a una proteína ROR1 humana. En algunas realizaciones o aspectos de la divulgación, la proteína ROR1 humana tiene la secuencia de aminoácidos establecida en la SEQ ID NO: 103. En algunas realizaciones, se proporcionan anticuerpos anti-ROR1 humana.
En algunas de tales realizaciones o aspectos de la divulgación, el anticuerpo o el fragmento se une a un epítopo dentro de una porción extracelular de la proteína ROR1, tal como una proteína ROR1 humana. En algunas realizaciones o aspectos de la divulgación, la porción extracelular de ROR1 contiene los aminoácidos 1-377 del SEQ ID NO: 103. En algunas de tales realizaciones o aspectos de la divulgación, el anticuerpo o el fragmento se une a un epítopo de una proteína ROR1, tal como una proteína ROR1 humana, que contiene restos dentro del dominio fz o el dominio Ig de la proteína ROR1. En algunas realizaciones o aspectos de la divulgación, el epítopo contiene un resto dentro del dominio fz de la proteína ROR1 y un resto dentro del dominio Ig de la proteína ROR1. En algunas realizaciones o aspectos de la divulgación, el dominio de Ig es uno que contiene los restos 13-118 de la secuencia de aminoácidos establecida en la SEQ ID NO: 103; y/o el dominio fz contiene los restos 136-270 de la secuencia de aminoácidos establecida en la
SEQ ID NO:103.
En algunas realizaciones o aspectos de la divulgación, la proteína ROR1 es una proteína ROR1 de ratón y el anticuerpo o el fragmento se une a una proteína ROR1 de ratón. En algunas realizaciones o aspectos de la divulgación, la proteína ROR1 de ratón tiene la secuencia de aminoácidos indicada en la SEQ ID NO:106. En algunas realizaciones o aspectos de la divulgación, el anticuerpo o el fragmento se une a un epítopo superpuesto de una proteína ROR1 humana como el epítopo unido específicamente por el anticuerpo anti-ROR1 R12 o un fragmento de unión a antígeno del mismo, que es opcionalmente un fragmento scFv de R12 y el anticuerpo o el fragmento también se une al ROR1 de ratón.
En algunas de tales realizaciones o aspectos de la divulgación, el anticuerpo o el fragmento no se une específicamente a una proteína ROR1 de ratón o no se une específicamente a una proteína que tiene la secuencia de aminoácidos establecida en la SEQ ID NO: 106.
En algunas de tales realizaciones o aspectos de la divulgación, el anticuerpo o el fragmento no contiene la las secuencias de CDR-H1, CDR-H2, CDR-H3 y/o CDR-L1, CDR-L2, CDR-L3 del anticuerpo anti-ROR1, R12 y/o del anticuerpo anti-ROR1 2A2. En algunas realizaciones o aspectos de la divulgación, el anticuerpo o el fragmento no contiene las secuencias CDR-H1, CDR-H2, CDR-H3, CDR-L1, CDR-L2 y/o CDR-L3 que tienen al menos el 90 %, el 91 %, el 92 %, el 93 %, el 94 %, el 95 %, el 96 %, el 97 %, el 98 % o el 99 % de identidad con las secuencias CDR-H1, CDR-H2, CDR-H3 y/o CDR-L1, CDR-L2, CDR-L3 del anticuerpo anti-ROR1, R12 y/o del anticuerpo anti-ROR1 2A2.
En algunas de estas realizaciones, el anticuerpo o el fragmento es humano.
Se enseñan anticuerpos humanos o fragmentos de unión a antígeno de los mismos que se unen específicamente al mismo o a un epítopo superpuesto de una proteína ROR1, tal como una proteína ROR1 humana, como el epítopo unido específicamente por cualquiera de los anticuerpos o fragmentos de unión a antígeno de los mismos proporcionados anteriormente o por el anticuerpo anti-ROR1 designado R12 o un fragmento de unión a antígeno del mismo. También se enseñan anticuerpos humanos o fragmentos de unión a antígeno de los mismos que se unen específicamente a ROR1 y compiten por unirse a ROR1, tal como una proteína ROR1 humana, con cualquiera de los anticuerpos o fragmentos de unión a antígeno de los mismos proporcionados anteriormente o por el anticuerpo anti-ROR1 designado R12 o fragmento de unión a antígeno del mismo. En algunas de tales realizaciones o aspectos de la divulgación, el anticuerpo o el fragmento humano contiene una CDR-H1, CDR-H2, CDR-H3, CDR-L1, CDR-L2 y/o CDR-L3 que es distinta de una correspondiente CDR-H1, CDR-H2, CDR-H3, CDR-L1, CDR-L2 y/o CDR-L3 presentes en un anticuerpo designado R12 y/o 2A2.
En algunas de tales realizaciones o aspectos de la divulgación, el anticuerpo o humano o su fragmento contiene una región Vh con una porción que tiene al menos el 95 %, el 96 %, el 97 %, el 98 %, el 99 % o el 100 % de identidad de secuencia con una secuencia de aminoácidos codificada por un segmento V de cadena pesada humana de nucleótidos de la línea germinal, una porción con al menos el 95 %, el 96 %, el 97 %, el 98 %, el 99 % o el 100 % de identidad de secuencia con una secuencia de aminoácidos codificada por un segmento D de cadena pesada humana de nucleótidos de la línea germinal, y/o una porción que tiene al menos el 95 %, el 96 %, el 97 %, el 98 %, el 99 % o el 100 % de identidad de secuencia con una secuencia de aminoácidos codificada por un segmento J de cadena pesada humana de nucleótidos de la línea germinal. En algunas de tales realizaciones o aspectos de la divulgación, el anticuerpo o el fragmento humano contiene una región vaie con una porción con al menos el 95 %, el 96 %, el 97 %, el 98 %, el 99 % o el 100 % de identidad de secuencia con una secuencia de aminoácidos codificada por un segmento V de cadena kappa o lambda de nucleótidos de la línea germinal, y/o una porción con al menos el 95 %, el 96 %, el 97 %, el 98 %, el 99 % o el 100 % de identidad de secuencia con una secuencia de aminoácidos codificada por un segmento J de cadena kappa o lambda de nucleótidos de la línea germinal humana.
En algunas de tales realizaciones o aspectos de la divulgación, el anticuerpo o el fragmento humano contiene una CDR-H1 y/o CDR-H2 que tiene una secuencia 100 % idéntica o con no más de un aminoácido de diferencia en comparación con una secuencia de aminoácidos de una CDR-H1 y/o CDR-H2, respectivamente, dentro de una secuencia codificada por un segmento V de cadena pesada humana de nucleótidos de la línea germinal; y/o contiene una CDR-L1 y/o CDR-L2 que tiene una secuencia 100 % idéntica o con no más de un aminoácido de diferencia en comparación con una secuencia de aminoácidos de una CDR-L1 y/o CDR-L2, respectivamente, dentro de una secuencia codificada por un segmento kappa o lambda v humano de nucleótidos de la línea germinal.
En algunas de tales realizaciones o aspectos de la divulgación, el anticuerpo o el fragmento es recombinante. En algunas de tales realizaciones o aspectos de la divulgación, el anticuerpo o el fragmento es monoclonal.
En algunas de tales realizaciones o aspectos de la divulgación, el anticuerpo o el fragmento es un fragmento de unión a antígeno. En algunas realizaciones o aspectos de la divulgación, el anticuerpo es un fragmento de cadena sencilla. En algunos aspectos de la divulgación, el anticuerpo es un anticuerpo de dominio único, tal como un anticuerpo de dominio único que contiene solo una región Vh. En algunas realizaciones o aspectos de la divulgación, el anticuerpo contiene tanto una región Vh como una región Vl y es un fragmento en el que las regiones variables del anticuerpo
están unidas por un enlazador flexible.
En algunas de tales realizaciones o aspectos de la divulgación, el fragmento es un scFv. En algunas realizaciones o aspectos de la divulgación, el scFv contiene un enlazador que tiene la secuencia establecida en la SEQ ID NO: 91. En algunas realizaciones o aspectos de la divulgación, el scFv contiene la secuencia de aminoácidos establecida en los SEQ ID NO: 2, 4, 6, 12, 249, 250, 251,252, 253, 254, 255, 256, 257, 258, 259, 260, 261,262, 263, 264, 265, 266, 267 o 268, o una secuencia de aminoácidos que presenta al menos el 90 %, el 91 %, el 92 %, el 93 %, el 94 %, el 95 %, el 96 %, el 97 %, el 98 % o el 99 % de identidad de secuencia con la secuencia de aminoácidos establecida en los SEQ ID NO: 2, 4, 6, 12, 249, 250, 251,252, 253, 254, 255, 256, 257, 258, 259, 260, 261,262, 263, 264, 265, 266, 267 o 268. En algunas realizaciones o aspectos de la divulgación, el scFv contiene la secuencia de aminoácidos establecida en los SEQ ID NO: 2, 4, 6 o 12, o una secuencia de aminoácidos que presenta al menos el 90 %, el 91 %, el 92 %, el 93 %, el 94 %, el 95 %, el 96 %, el 97 %, el 98 % o el 99 % de identidad de secuencia con la secuencia de aminoácidos establecida en los SEQ ID NO: 2, 4, 6 o 12. En algunas realizaciones o aspectos de la divulgación, el scFv contiene la secuencia de aminoácidos establecida en los SEQ ID NO: 2, 4, 6 o 12.
En algunas realizaciones o aspectos de la divulgación, el scFv contiene la VH, el enlazador y la VL tal como se establece en los SEQ ID NO: 2, 4, 6, 12, 249, 250, 251,252, 253, 254, 255, 256, 257, 258, 259, 260, 261,262, 263, 264, 265, 266, 267 o 268, o una secuencia de al menos el 90 % o aproximadamente, el 91 %, el 92 %, el 93 %, el 94 %, el 95 %, el 96 %, el 97 %, el 98 % o el 99 % idéntica a tal secuencia, pero en la que VH y VL están configuradas en la orientación opuesta, es decir, VL-VH, en comparación con dicha secuencia.
En algunas realizaciones o aspectos de la divulgación, el anticuerpo o el fragmento comprende la región Vh establecida en la SEQ ID NO: 19 y la región Vl establecida en la SEQ ID NO: 18, y/o el anticuerpo o el fragmento comprende la secuencia de aminoácidos establecida en la SEQ ID NO: 12. En algunas realizaciones o aspectos de la divulgación, el anticuerpo o el fragmento comprende la región Vh establecida en la SEQ ID NO: 13 y la región Vl establecida en la SEQ ID NO: 14, y/o el anticuerpo o el fragmento comprende la secuencia de aminoácidos establecida en la SEQ ID NO: 6. En algunas realizaciones o aspectos de la divulgación, el anticuerpo o el fragmento comprende la región Vh establecida en la SEQ ID NO: 15 y la región Vl establecida en la SEQ ID NO: 16, y/o el anticuerpo o el fragmento comprende la secuencia de aminoácidos establecida en la SEQ ID NO: 4. En algunas realizaciones o aspectos de la divulgación, el anticuerpo o el fragmento comprende la región Vh establecida en la SEQ ID NO: 17 y la región Vl establecida en la SEQ ID NO: 18, y/o el anticuerpo o el fragmento comprende la secuencia de aminoácidos establecida en la SEQ ID NO: 2.
En el presente documento se enseña una proteína de la superficie celular de cadena simple que contiene cualquiera de los fragmentos de anticuerpo de cadena simple proporcionados. En algunos aspectos de la divulgación, la proteína de la superficie celular de cadena simple contiene cualquiera de los anticuerpos de dominio único proporcionados. En algunos aspectos de la divulgación, la proteína de superficie celular de cadena simple contiene la secuencia Vh establecida en los SEQ ID NO: 8, 10, 13, 15, 17, 19, 175, 176, 177, 178, 179, 180, 181, 182, 183, 184, 185, 186, 187, 188, 189, 190, 191, 192, 193, 194, 195, 196, 197, 198, 199, 200, 201, 202, 203, 204, 205, 206, 207, 208 o 209. En algunos aspectos, la proteína de superficie celular de cadena simple contiene la secuencia de la región VH que tiene la secuencia establecida en los SEQ ID NO: 8, 10, 13, 15, 17 o 19. En algunos aspectos, la proteína de la superficie celular de cadena simple contiene cualquiera de los fragmentos de anticuerpo scFv proporcionados. En algunos aspectos, la proteína de superficie celular de cadena simple contiene la secuencia de scFv de los SEQ ID NO: 2, 4, 6, 12, 249, 250, 251,252, 253, 254, 255, 256, 257, 258, 259, 260, 261,262, 263, 264, 265, 266, 267 o 268. En algunos aspectos, la proteína de la superficie celular de cadena simple contiene la secuencia scFv de los SEQ ID NO: 2, 4, 6 o 12. En algunos aspectos, la proteína de superficie celular de cadena simple contiene la secuencia scFv de los SEQ ID NO: 2, 4, 6, 12, 249, 250, 251, 252, 253, 254, 255, 256, 257, 258, 259, 260, 261, 262, 263, 264, 265, 266, 267 o 268, pero en la que VH y VL están configuradas en la orientación opuesta, es decir, VL-VH, en comparación con dicha secuencia.
En algunas de tales realizaciones o aspectos de la divulgación, el anticuerpo o el fragmento contiene además al menos una porción de una región constante de inmunoglobulina. En algunas realizaciones o aspectos de la divulgación, el anticuerpo o el fragmento contiene además un espaciador. En algunas realizaciones o aspectos de la divulgación, el anticuerpo o el fragmento contiene un espaciador establecido en la SEQ ID NO: 108. En algunas realizaciones o aspectos de la divulgación, el anticuerpo o el fragmento contiene un espaciador establecido en la SEQ ID NO: 142. En algunas realizaciones o aspectos de la divulgación, el anticuerpo o el fragmento contiene un espaciador establecido en la SEQ ID NO: 143. En algunas realizaciones o aspectos de la divulgación, el anticuerpo o el fragmento contiene una región constante de inmunoglobulina que contiene una región Fc. En algunas realizaciones o aspectos de la divulgación, la región Fc es una región Fc de una IgG humana.
También se proporciona o se enseña un conjugado que contiene cualquiera de los anticuerpos o fragmentos proporcionados. También se proporciona o se enseña un conjugado que contiene cualquiera de las proteínas de superficie celular de cadena única proporcionadas. En algunas realizaciones o aspectos de la divulgación, el conjugado contiene un resto heterólogo que está unido directa o indirectamente al anticuerpo o al fragmento de unión a antígeno. En algunas realizaciones o aspectos de la divulgación, el conjugado puede ser una proteína de fusión o una molécula quimérica. En algunas realizaciones o aspectos de la divulgación, el resto heterólogo es un dominio de
efecto.
En algunas realizaciones o aspectos de la divulgación, se proporciona un conjugado, una proteína de fusión o una molécula quimérica que contiene a) cualquiera de los anticuerpos o fragmentos de unión a antígeno proporcionados y b) un dominio efector. En algunas realizaciones o aspectos de la divulgación, el dominio efector no está asociado de forma natural en una única cadena polipeptídica con el anticuerpo o el fragmento de unión a antígeno del mismo. En algunas realizaciones o aspectos de la divulgación, el dominio efector es un agente quimioterapéutico o una toxina. En algunas realizaciones o aspectos de la divulgación, el dominio efector contiene un dominio de señalización que es capaz de enviar una señal a una célula, tal como una célula inmunitaria, tal como un linfocito, por ejemplo, una señal de activación, una señal coestimuladora, una señal supresora y/o una señal inhibidora.
También se proporciona un receptor de antígeno quimérico (CAR) que incluye una porción extracelular que contiene cualquiera de los anticuerpos o fragmentos de unión a antígeno proporcionados y un dominio de señalización intracelular. En algunas realizaciones, el anticuerpo o el fragmento es un scFv y el dominio de señalización intracelular contiene un ITAM. En algunas realizaciones, el dominio de señalización intracelular contiene un dominio de señalización de una cadena zeta de una cadena CD3-zeta (CD3Z).
En algunas de estas realizaciones, el CAR también contiene un dominio transmembrana que une el dominio extracelular y el dominio de señalización intracelular. En algunas realizaciones, el dominio transmembrana contiene una porción transmembrana de una molécula coestimuladora, tal como una molécula coestimuladora de linfocitos T, por ejemplo, CD28 y/o 41BB. En algunas realizaciones, la molécula coestimuladora de linfocitos T es CD28 o 41BB. En algunas realizaciones, el dominio de señalización intracelular también incluye un dominio intracelular de una molécula coestimuladora de linfocitos T. En algunos aspectos, la molécula coestimuladora de linfocitos T es CD28 o 41BB.
En algunas realizaciones de cualquiera de los CAR proporcionados, el CAR contiene un anticuerpo o un fragmento de unión a antígeno tal como se proporciona en el presente documento, un dominio transmembrana que es una porción de CD28 o una variante del mismo, y un dominio de señalización intracelular que contiene una porción de señalización de CD28 o una variante funcional del mismo y una porción de señalización de CD3 zeta o una variante funcional del mismo. En algunas de tales realizaciones, el receptor incluye además un espaciador que contiene una bisagra de Ig, por ejemplo, una bisagra de IgG4, tal como un espaciador solo de bisagra, entre el anticuerpo o el fragmento de unión a antígeno y el dominio transmembrana.
En algunas realizaciones de cualquiera de los CAR proporcionados, el CAR contiene un anticuerpo o un fragmento de unión a antígeno tal como se proporciona en el presente documento, un dominio transmembrana que es una porción de CD28 o una variante del mismo, y un dominio de señalización intracelular que contiene una porción de señalización de 4-1BB o una variante funcional del mismo y una porción de señalización de CD3 zeta o una variante funcional del mismo. En algunas de tales realizaciones, el receptor incluye además un espaciador que contiene una bisagra de Ig, por ejemplo, una bisagra de IgG4, tal como un espaciador solo de bisagra, entre el anticuerpo o el fragmento de unión a antígeno y el dominio transmembrana.
En el presente documento se enseñan ácidos nucleicos que codifican cualquiera de los anticuerpos proporcionados o fragmentos de los mismos, cualquiera de las proteínas de la superficie celular de cadena única enseñadas, cualquiera de los conjugados proporcionados, o cualquiera de los CAR proporcionados. En algunas realizaciones o aspectos de la divulgación, la molécula de ácido nucleico que codifica un anticuerpo o un fragmento de unión a antígeno comprende la secuencia de nucleótidos establecida en los SEQ ID NO: 7 o 9 o una secuencia de nucleótidos que presenta al menos el 90 %, el 91 %, el 92 %, el 93 %, el 94 %, el 95 %, el 96 %, el 97 %, el 98 %, el 99 % o más de identidad de secuencia con la secuencia establecida en los SEQ ID NO: 7 o 9. En algunas realizaciones o aspectos de la divulgación, la molécula de ácido nucleico que codifica un anticuerpo o un fragmento de unión a antígeno comprende la secuencia de nucleótidos establecida en los SEQ ID NO: 1, 3, 5 u 11 o una secuencia de nucleótidos que presenta al menos el 90 %, el 91 %, el 92 %, el 93 %, el 94 %, el 95 %, el 96 %, el 97 %, el 98 %, el 99 % o más de identidad de secuencia con la secuencia establecida en los SEQ ID NO: 1, 3, 5 u 11.
También se enseñan células que contienen cualquiera de los anticuerpos o fragmentos proporcionados, cualquiera de las proteínas de la superficie celular de cadena única enseñadas, cualquiera de los conjugados proporcionados, o cualquiera de los CAR proporcionados. En algunas realizaciones o aspectos de la divulgación, la célula es una célula modificada genéticamente que expresa un receptor y contiene cualquiera de los anticuerpos o fragmentos proporcionados, cualquiera de las proteínas de cadena simple de la superficie celular, cualquiera de los conjugados proporcionados, o cualquiera de los CAR proporcionados. En algunas realizaciones o aspectos de la divulgación, la célula o célula modificada genéticamente es un linfocito T.
En el presente documento se enseñan composiciones o composiciones farmacéuticas que contienen cualquiera de los anticuerpos o fragmentos proporcionados, cualquiera de las proteínas de la superficie celular de cadena única enseñadas, cualquiera de los conjugados proporcionados, cualquiera de los CAR proporcionados o cualquiera de las células proporcionadas. En algunas realizaciones o aspectos de la divulgación, la composición o la composición farmacéutica contiene un excipiente farmacéuticamente aceptable.
Se enseñan métodos de tratamientos que incluyen administrar cualquiera de las composiciones o composiciones farmacéuticas proporcionadas o enseñadas a un sujeto que tiene una enfermedad o trastorno asociado con ROR1. Se enseñan métodos de tratamiento que incluyen la administración de cualquiera de los anticuerpos o fragmentos proporcionados o enseñados, cualquiera de las proteínas de superficie celular de cadena simple proporcionadas o enseñadas, cualquiera de los conjugados proporcionados o enseñados, cualquiera de los CAR proporcionados o enseñados o cualquiera de las células proporcionadas o enseñadas a un sujeto que tiene una enfermedad o trastorno asociado con ROR1.
Se proporcionan cualquiera de las composiciones proporcionadas o composiciones farmacéuticas para su uso en el tratamiento de una enfermedad o trastorno asociado con ROR1. Se proporciona el uso de cualquiera de las composiciones proporcionadas o composiciones farmacéuticas para la fabricación de un medicamento para tratar una enfermedad o trastorno asociado con ROR1.
En algunas de estas realizaciones, la enfermedad o trastorno es un cáncer que expresa ROR-1. En algunas realizaciones, el cáncer que expresa ROR-1 es una leucemia de linfocitos B, linfoma, leucemia linfocítica crónica de linfocitos B (LLC), LMA, leucemia mieloide aguda (LMA), leucemia linfocítica aguda (LLA), linfoma de Burkett, linfoma de células del manto (MCL), cáncer de pulmón no microcítico (CPNM), neuroblastoma, carcinoma de células renales, cáncer de colon, cáncer colorrectal, cáncer de mama, cáncer de células escamosas epiteliales, melanoma, mieloma, cáncer de estómago, cáncer de cerebro, cáncer de pulmón, cáncer de páncreas, cáncer de cuello del útero, cáncer de ovario, cáncer de hígado, cáncer de vejiga, cáncer de próstata, cáncer de testículos, cáncer de tiroides, cáncer de útero, cáncer suprarrenal o cáncer de cabeza y cuello.
En algunas realizaciones, la administración del anticuerpo o receptor, o conjugado o célula que lo contenga, se asocia con un menor grado de inmunogenicidad en comparación con la administración de un anticuerpo de referencia (o receptor que contiene el anticuerpo de referencia) que compite por unirse con el anticuerpo o se une a un epítopo superpuesto. En algunos aspectos, el anticuerpo de referencia es un anticuerpo humanizado, quimérico o no humano.
Breve descripción de los dibujos
La FIG. 1A muestra actividad citolítica de linfocitos T CD8+ primarios humanos que expresan varios CAR específicos anti-ROR1 contra células que expresan ROR1. tEGFR solo es un control negativo; R12 es R12 scFv c A r . La FIG 1B muestra la secreción de citocinas de linfocitos T CD8+ primarios humanos que expresan diversos CAR específicos anti-ROR1 después del cocultivo con células que expresan ROR1. tEGFR solo es un control negativo; R12 es R12 scFv CAR.
La FIG. 2 muestra la secreción de citocinas de linfocitos T CD8+ primarios humanos que expresan varios CAR específicos anti-ROR1 después de cocultivo con células que expresan ROR1 humana (hROR1) o células que expresan ROR1 de ratón (mROR1). tEGFR solo es un control negativo; R12 es R12 scFv CAR.
Descripción detallada
Se proporcionan moléculas de unión a ROR1, incluidos los anticuerpos (incluidos los fragmentos de anticuerpos de unión a antígeno, tales como regiones variables de cadena pesada (VH) y fragmentos de cadena simple, incluyendo scFv) y receptores recombinantes, incluyendo receptores quiméricos que contienen tales anticuerpos y fragmentos, ácidos nucleicos que codifican dichos anticuerpos y fragmentos, y células, tales como las células recombinantes, que expresan y para la producción de estos anticuerpos y fragmentos, según se define en las reivindicaciones adjuntas al presente documento. También se describen en el presente documento métodos para fabricar y usar los anticuerpos y fragmentos, así como células que expresan o contienen los anticuerpos y fragmentos.
I. Moléculas de unión a ROR1
Se proporcionan anticuerpos de ROR1 (incluidos fragmentos de unión a antígeno) que se unen específicamente a proteínas ROR1, tales como la proteína ROR1 humana. También se proporcionan receptores de antígenos quiméricos, que contienen tales anticuerpos.
A. Anticuerpos ROR1
Se proporcionan anticuerpos anti-ROR1, incluyendo fragmentos de anticuerpos funcionales tal como se definen en las reivindicaciones adjuntas con el presente documento. También se desvelan en el presente documento anticuerpos que son anticuerpos de dominio único, que contienen una cadena pesada variable que sin emparejarse con un sitio de unión a antígeno de cadena ligera y/o sin ningún dominio de anticuerpo o sitio de unión adicional son capaces de unirse específicamente a ROR1. De acuerdo con la invención, los anticuerpos son anticuerpos multidominio que contienen los dominios Vh y Vl tal como se definen en las reivindicaciones, y pueden estar compuestos por el dominio Vh o el sitio de unión a antígeno del mismo del anticuerpo de dominio único. Los anticuerpos incluyen una cadena pesada variable y una cadena ligera variable, tal como scFvs. Los anticuerpos incluyen anticuerpos que se unen específicamente a la proteína ROR1 humana tal como se define en las reivindicaciones. Entre los anticuerpos anti
ROR1 proporcionados se encuentran los anticuerpos humanos. Los anticuerpos incluyen anticuerpos aislados. Las moléculas incluyen moléculas aisladas. En el presente documento se describen moléculas que contienen dichos anticuerpos, por ejemplo, proteínas de cadena simple, proteínas de fusión y/o receptores recombinantes tales como receptores quiméricos, incluidos los receptores de antígenos. Se proporcionan receptores de antígenos quiméricos tal como se definen en las reivindicaciones.
El término "anticuerpo" se usa en el presente documento en el sentido más amplio e incluye anticuerpos policlonales y monoclonales, incluyendo anticuerpos intactos y fragmentos de anticuerpos funcionales (de unión a antígeno), incluyendo fragmentos de unión a antígeno (Fab), fragmentos F(ab')2, fragmentos Fab', fragmentos Fv, fragmentos de IgG recombinante (rIgG), regiones de cadena pesada variable (Vh) capaces de unirse específicamente al antígeno, fragmentos de anticuerpos de cadena simple, incluyendo fragmentos variables de cadena simple (scFv) y fragmentos de anticuerpos de dominio único (por ejemplo, sdAb, sdFv, nanocuerpo). El término abarca formas de inmunoglobulinas modificadas genéticamente y/o de otro modo, tales como intracuerpos, pepticuerpos, anticuerpos quiméricos, anticuerpos completamente humanos, anticuerpos humanizados y anticuerpos heteroconjugados, multiespecíficos, por ejemplo, biespecíficos, anticuerpos, diacuerpos, triacuerpos y tetracuerpos, di-scFv en tándem, tri-scFv en tándem. Salvo que se especifique lo contrario, debe entenderse que el término "anticuerpo" abarca fragmentos de anticuerpos funcionales del mismo. El término también incluye anticuerpos intactos o de longitud completa, incluyendo anticuerpos de cualquier clase o subclase, incluyendo IgG y sus subclases, IgM, IgE, IgA e IgD.
Las expresiones "región determinante de complementariedad", y "CDR", sinónimo de "región hipervariable" o "HVR", son conocidas en la técnica por referirse a secuencias no contiguas de aminoácidos dentro de regiones variables de anticuerpos, que confieren especificidad de antígeno y afinidad de unión. Hay tres CDR en cada región variable de cadena pesada (CDR-H1, Cd R-H2, CDR-H3) y tres c Dr en cada región variable de cadena ligera (CDR-L1, CDR-L2, CDR-L3). Las "regiones marco" y "FR" se conocen en la técnica para referirse a las porciones que no son CDR de las regiones variables de las cadenas pesada y ligera. En general, hay cuatro FR en cada región variable de cadena pesada de longitud completa (FR-H1, FR-H2, FR-H3 y FR-H4) y cuatro FR en cada región variable de cadena ligera de longitud completa (f R-L1, Fr -L2, FR-L3 y FR-L4).
Los límites exactos de la secuencia de aminoácidos de una CDR o FR dada se pueden determinar fácilmente usando cualquiera de una serie de esquemas bien conocidos, incluidos los descritos por Kabat et al. (1991), "Sequences of Proteins of Immunological Interest", 5a Ed. Public Health Service, National Institutes of Health, Bethesda, MD (esquema de numeración "Kabat"), Al-Lazikani et al., (1997) JMB 273,927-948 (esquema de numeración "Chothia"), MacCallum et al., J. Mol. Biol. 262:732-745 (1996), "Antibody-antigen interactions: Contact analysis and binding site topography", J. Mol. Biol. 262, 732-745," (Esquema de numeración "Contact"), Martin et al., Proc. Natl. Acad. Sci., 86:9268-9272 (1989) (esquema de numeración "AbM"), Lefranc MP et al., "IMGT unique numbering for immunoglobulin and T cell receptor variable domains and Ig superfamily V-like domains", Dev Comp Immunol, Enero de 2003;27(1):55-77 (esquema de numeración "IMGT"), y Honegger A y Plückthun A, "Yet another numbering scheme for immunoglobulin variable domains: an automatic modeling and analysis tool", J Mol Biol, 8 de junio de 2001;309(3):657-70, (Esquema de numeración "Aho").
Los límites de una determinada CDR o FR pueden variar según el esquema utilizado para la identificación. Por ejemplo, el esquema de Kabat se basa en alineaciones estructurales, mientras que el esquema de Chothia se basa en información estructural. La numeración de los esquemas de Kabat y Chothia se basa en las longitudes de secuencia de las regiones de anticuerpos más comunes, con inserciones acomodadas por letras de inserción, por ejemplo, "30a", y deleciones que aparecen en algunos anticuerpos. Los dos esquemas colocan ciertas inserciones y deleciones ("indels") en diferentes posiciones, dando como resultado la numeración diferencial. El esquema de Contact se basa en el análisis de estructuras cristalinas complejas y es similar en muchos aspectos al esquema de numeración de Chothia.
La Tabla 1, a continuación, enumera los límites de posición a modo de ejemplo de CDR-L1, CDR-L2, CDR-L3 y CDR-H1, CDR-H2, CDR-H3 tal como se identifica por los esquemas de Kabat, Chothia y Contact, respectivamente. Para CDR-H1, la numeración de restos se enumera utilizando los esquemas de numeración de Kabat y Chothia. Las FR se encuentran entre las CDR, por ejemplo, con FR-L1 ubicado entre CDR-L1 y CDR-L2, y así sucesivamente. Se observa que debido a que el esquema de numeración de Kabat que se muestra coloca inserciones en H35A y H35B, el final del bucle Chothia CDR-H1 cuando se numera utilizando la convención de numeración de Kabat que se muestra varía entre H32 y H34, dependiendo de la longitud del bucle.
Tabla 1
(continuación)
Por lo tanto, a menos que se especifique de otro modo, una "CDR" o "región determinante de complementariedad", o CDR específicas individuales (por ejemplo, "CDR-H1, CDR-H2), de un anticuerpo dado o región del mismo, tal como una región variable del mismo, debe entenderse que abarca una (o la región determinante de complementariedad específica) definida por cualquiera de los esquemas mencionados anteriormente. Por ejemplo, cuando se indica que una CDR particular (por ejemplo, una CDR-H3) contiene la secuencia de aminoácidos de una CDR correspondiente en una secuencia de aminoácidos de Vh o Vl dada, se entiende que dicha CDR tiene una secuencia de la CDR correspondiente (por ejemplo, CDR-H3) dentro de la región variable, tal como se define en cualquiera de los esquemas mencionados anteriormente. En algunas realizaciones, se especifican secuencias de CDR específicas.
Igualmente, a menos que se especifique de otro modo, una FR o una FR individual especificada (por ejemplo, FR-H1, FR-H2), de un anticuerpo dado o región del mismo, tal como una región variable del mismo, debe entenderse que abarca una región marco (o la específica) definida por cualquiera de los esquemas conocidos. En algunos casos, se especifica el esquema para la identificación de una CDR, f R, o FRs o CDRs, tal como la CDR según lo definido por el método Kabat, Chothia o Contact. En otros casos, se proporciona la secuencia de aminoácidos particular de una CDR o FR.
La expresión "región variable" o "dominio variable" se refiere al dominio de una cadena pesada o ligera de anticuerpo que está implicada en la unión del anticuerpo al antígeno. Los dominios variables de la cadena pesada y la cadena ligera (Vh y Vl, respectivamente) de un anticuerpo natural tienen generalmente estructuras similares, comprendiendo cada dominio cuatro regiones marco conservadas (FR) y tres CDR. (Véase, por ejemplo, Kindt et al. Kuby Immunology, 6a ed., W.H. Freeman y Co., página 91 (2007)). Un solo dominio Vh o Vl puede ser suficiente para conferir especificidad de unión a antígeno. Adicionalmente, se pueden aislar anticuerpos que se unen a un antígeno particular usando un dominio Vh o Vl de un anticuerpo que se une al antígeno para efectuar una detección sistemática de una biblioteca de dominios Vl o Vh complementarios, respectivamente. Véase, por ejemplo, Portolano et al., J. Immunol. 150:880-887 (1993); Clarkson et al., Nature 352:624-628 (1991).
Entre los anticuerpos proporcionados se encuentran fragmentos de anticuerpos. Un "fragmento de anticuerpo" se refiere a una molécula distinta de un anticuerpo intacto que comprende una porción de un anticuerpo intacto que se une al antígeno al que se une el anticuerpo intacto. Los ejemplos de fragmentos de anticuerpo incluyen, pero sin limitación, Fv, Fab, Fab', Fab'-SH, F(ab')2; diacuerpos; anticuerpos lineales; regiones de cadena pesada variable (Vh), moléculas de anticuerpos monocatenarios tales como scFv y anticuerpos simples de dominio único Vh; y anticuerpos multiespecíficos formados a partir de fragmentos de anticuerpos. En realizaciones particulares, los anticuerpos son fragmentos de anticuerpos de cadena simple que comprenden una región de cadena pesada variable y/o una región de cadena ligera variable, tal como scFvs.
Los anticuerpos de dominio único son fragmentos de anticuerpo que comprenden la totalidad o una porción del dominio variable de cadena pesada o la totalidad o una porción del dominio variable de cadena ligera de un anticuerpo. Un anticuerpo de dominio único puede ser un anticuerpo de dominio único humano.
Los fragmentos de anticuerpo se pueden preparar mediante diversas técnicas, incluyendo, pero sin limitación, la digestión proteolítica de un anticuerpo intacto, así como la producción por células hospedadoras recombinantes. En algunas realizaciones, los anticuerpos son fragmentos producidos de forma recombinante, tales como fragmentos que comprenden disposiciones que no se dan de manera natural, tales como aquellos con dos o más regiones de anticuerpos o cadenas unidas por enlazadores sintéticos, por ejemplo, enlazadores peptídicos y/o que pueden no producirse por digestión enzimática de un anticuerpo intacto de origen natural. En algunos aspectos, los fragmentos de anticuerpos son scFv.
Un anticuerpo "humanizado" es un anticuerpo en el que todos o sustancialmente todos los restos de aminoácidos de CDR provienen de CDR no humanas y todos o sustancialmente todos los restos de aminoácidos de FR provienen de FR humanas. Un anticuerpo humanizado puede incluir opcionalmente al menos una porción de una región constante de anticuerpo que proviene de un anticuerpo humano. Una "forma humanizada" de un anticuerpo no humano, se refiere a una variante del anticuerpo no humano que se ha humanizado, normalmente para reducir la inmunogenicidad en humanos, a la vez que se conserva la especificidad y la afinidad del anticuerpo no humano precursor. Se pueden sustituir algunos restos de FR en un anticuerpo humanizado por restos correspondientes de un anticuerpo no humano (por ejemplo, el anticuerpo del que proceden los restos de la CDR), por ejemplo, para restaurar o mejorar la especificidad o afinidad del anticuerpo.
Los anticuerpos anti-ROR1 proporcionados son anticuerpos humanos. Un "anticuerpo humano" es un anticuerpo con una secuencia de aminoácidos que se corresponde con la de un anticuerpo producido por un ser humano o una célula humana o una fuente no humana que utiliza repertorios de anticuerpo humanos u otras secuencias codificantes de anticuerpo humanas, incluyendo bibliotecas de anticuerpos humanos. La expresión excluye formas humanizadas de anticuerpos no humanos que comprenden regiones de unión a antígeno no humanas, tales como aquellas en las que todas o sustancialmente todas las CDR son no humanas. El término incluye fragmentos de unión a antígeno de anticuerpos humanos.
Se pueden preparar anticuerpos humanos administrando un inmunógeno a un animal transgénico que se ha modificado para producir anticuerpos humanos intactos o anticuerpos intactos con regiones variables humanas en respuesta a la exposición a antígenos. Dichos animales normalmente contienen la totalidad o una parte de los loci de inmunoglobulina humanos, que reemplazan a los loci de inmunoglobulina endógenos o que están presentes extracromosómicamente o integrados aleatoriamente en los cromosomas del animal. En tales animales transgénicos, generalmente se han inactivado los loci de inmunoglobulina endógenos. Los anticuerpos humanos también se pueden obtener de bibliotecas de anticuerpos humanos, incluyendo bibliotecas de presentación en fago y libres de células, que contienen secuencias que codifican anticuerpos que provienen de un repertorio humano.
Entre los anticuerpos proporcionados se encuentran los anticuerpos monoclonales, incluyendo fragmentos de anticuerpos monoclonales. La expresión "anticuerpo monoclonal", como se usa en el presente documento, se refiere a un anticuerpo obtenido a partir de o en una población de anticuerpos sustancialmente homogénea, es decir, los anticuerpos individuales que componen la población son idénticos, excepto por posibles variantes que contengan mutaciones naturales o que surjan durante la producción de una preparación de anticuerpos monoclonales, estando presentes dichas variantes generalmente en cantidades menores. A diferencia de las preparaciones de anticuerpos policlonales, que incluyen normalmente diferentes anticuerpos dirigidos contra diferentes epítopos, cada anticuerpo monoclonal de una preparación de anticuerpos monoclonales está dirigido contra un solo epítopo en un antígeno. No debe interpretarse que el término requiera la producción del anticuerpo por cualquier método concreto. Un anticuerpo monoclonal se puede preparar mediante varias técnicas, incluyendo pero sin limitación la generación a partir de un hibridoma, métodos de ADN recombinante, la presentación en fago y otros métodos de presentación de anticuerpos.
Los términos "polipéptido" y "proteína" se usan indistintamente para referirse a un polímero de restos de aminoácidos, y no se limitan a una longitud mínima. Los polipéptidos, incluidos los anticuerpos y las cadenas de anticuerpos y otros péptidos proporcionados, por ejemplo, enlazadores y péptidos de unión a ROR1, pueden incluir restos de aminoácidos que incluyen restos de aminoácidos naturales y/o no naturales. Los términos también incluyen modificaciones posteriores a la expresión del polipéptido, por ejemplo, glucosilación, sialilación, acetilación, fosforilación, y similares. En algunos aspectos, los polipéptidos pueden contener modificaciones con respecto a una secuencia nativa o natural, siempre que la proteína mantenga la actividad deseada. Estas modificaciones pueden ser deliberadas, como a través de mutagénesis dirigida al sitio, o pueden ser accidentales, como a través de mutaciones de hospedadores que producen las proteínas o errores debidos a la amplificación por PCR.
Anticuerpos de ejemplo
De acuerdo con la invención, el anticuerpo anti-ROR1, por ejemplo, los fragmentos de anticuerpo de unión a antígeno, contienen una secuencia de región variable de cadena ligera y pesada (Vh o Vl) tal como se describe en las reivindicaciones adjuntas. El anticuerpo anti-ROR1, por ejemplo, los fragmentos de anticuerpo de unión a antígeno, contiene una secuencia de la región Vh que contiene una CDR-H1, CDR-H2 y CDR-H3 tal como se describe. El anticuerpo anti-ROR1, por ejemplo, los fragmentos de anticuerpo de unión a antígeno, también contiene una secuencia de la región Vl que contiene una CDR-L1, CDR-L2 y CDR-L3 tal como se describe. También entre los anticuerpos proporcionados se encuentran aquellos que tienen secuencias al menos en o aproximadamente el 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 o el 99 % idénticas a dicha secuencia.
En algunas realizaciones o aspectos de la divulgación, el anticuerpo, por ejemplo, un fragmento de unión a antígeno del mismo, tiene una región variable de cadena pesada (VH) que tiene la secuencia de aminoácidos establecida en la SEQ ID NO: 8, 10, 13, 15, 17 o 19, o una secuencia de aminoácidos que tiene al menos el 90 %, el 91 %, el 92 %, el 93 %, el 94 %, el 95 %, el 96 %, el 97 %, el 98 % o el 99 % de identidad de secuencia con la secuencia de aminoácidos de la región Vh establecida en los SEQ ID NO: 8, 10, 13, 15, 17 o 19, o contiene una CDR-H1, CDR-H2 y/o CDR-H3 presentes en tal secuencia Vh.
En algunos aspectos de la divulgación, la región Vh del anticuerpo anti-ROR1 es una que incluye una región determinante de complementariedad de cadena pesada 3 (CDR-H3) que contiene la secuencia de aminoácidos: X1X2X3X4X5X6X7X8X9X10X11X12X13X14X15X16 (SEQ ID NO: 92), en donde Xi es D, V, Q, I, T, G, A o E; X2 es S, F, N, R, G, T, Y, D, Q, M, K, I, L o P; X3 es S, N, G, E, D, P, I, V, R, F, N, o L; X4 es Y, R, V, G, S, P, E, A o L; X5 es D, E, W, R, S, L, A, V, G, o P; Xs es A, W, S, E, G, Y, R, F, H, V, D, S o Q; X7 es F, Y, A, W, L, G, D, V, N, S, K o R; X8 es F, Y, H, E, L, W, V, N, I, D, o nulo; X9 es F, L, V, S, E, W, G, P, Y, o nulo; X10 es S, E, L, Y, W, F, N, G, P, o nulo; X11 es Y, V, L, F, I, W, N, o nulo; X12 es F, Y, W, o nulo; X13 es Y, F, T, o nulo; X14 es F o nulo; X15 es D o Q; y Xi6 es I, Y, o P. En algunos de estos aspectos de la divulgación, en dicha CDR-H3, Xi es D o V; X2 es S o F; X3 es S, N, G o E; X4 es
Y, R o V; X5 es D, E, W o R; X6 es A, Y, S o E; X7 es F, Y o A; X8 es F, Y, H o nulo; X9 es F, L o nulo; X10 es S o nulo; X11 es Y o nulo; X12 es F o nulo; X13 es nulo; X14 es nulo; X15 es D; y X16 es I o Y. En algunos de tales aspectos de la divulgación, en dicha CDR-H3, Xi es V o D; X2 es S o F; X3 es N o G; X4 es Y o R; X5 es E o W; X6 es Y o G; X7 es Y; X8 es F o Y; X9 es F o nulo; X10 es nulo; X11 es nulo; X12 es nulo; X13 es nulo; X14 es nulo; X15 es D; y Xi6 es Y.
En algunos aspectos de la divulgación, la región Vh del anticuerpo anti-ROR1 es una que incluye una CDR-H3 que contiene la secuencia de aminoácidos: X1X2X3X4X5X6X7X8X9X10X11X12DX14 (SEQ ID NO: 93), en donde Xi es D o V; X2 es S o F; X3 es S, N, G o E; X4 es Y, R o V; X5 es D, E, W o R; Xs es A, Y, S o E; X7 es F, Y o A; X8 es F, Y, H o nulo; X9 es F, L o nulo; X10 es S o nulo; X11 es Y o nulo; X12 es F o nulo; y X14 es I o Y.
En algunos aspectos de la divulgación, la región Vh del anticuerpo anti-ROR1 es una que incluye una CDR-H3 que contiene la secuencia de aminoácidos: X1X2X3X4X5X6YX8X9DY (SEQ ID NO: 94), en donde Xi es V o D; X2 es S o F; X3 es N o G; X4 es Y o R; X5 es E o W; X6 es Y o G; X8 es F o Y; y X9 es F o nulo.
En algunos aspectos de la divulgación, la región Vh del anticuerpo anti-ROR1 es una que incluye una CDR-H3 que contiene la secuencia de aminoácidos: X1SX3YX5X6 X7X8DX10 (SEq ID NO: 109), en donde X1 es V o D; X3 es S o N; X5 es D o E; X6 es Y o A; X7 es F o Y; X8 es F o nulo; y X10 es I o Y.
En algunos aspectos de la divulgación, la región Vh del anticuerpo anti-ROR1 es una que incluye una CDR-H3 que contiene la secuencia de aminoácidos: VX2X3X4EYYFDY (SEQ iD NO: 110), en donde X2 es S o N o R; X3 es N o G; X4 es Y o G o S.
En algunas realizaciones o aspectos de la divulgación, el anticuerpo proporcionado contiene una CDR-H3 que tiene la secuencia de aminoácidos establecida en los SEQ ID NO: 22, 29, 35, 45, 50, 51, 52, 53, 54, 55, 56, 57, 58, 59, 60, 61, 62, 63, 64, 65, 66, 67, 68, 69, 70, 71 o 174. En cualquiera de tales ejemplos, el anticuerpo proporcionado puede contener una secuencia de la región Vh establecida en cualquiera de los SEQ ID NO: 8, 10, 13, 15, 17, 19, 175, 176, 177, 178, 179, 180, 181, 182, 183, 184, 185, 186, 187, 188, 189, 190, 191, 192, 193, 194, 195, 196, 197, 198, 199, 200, 201, 202, 203, 204, 205, 206, 207, 208 o 209 en el que la correspondiente secuencia CDR-H3 contenida en la misma (por ejemplo, correspondiente a los restos de aminoácidos H95-H102 por numeración de Kabat) se reemplaza por la secuencia de CDR-H3 establecida en los SEQ ID NO: 22, 29, 35, 45, 50, 51, 52, 53, 54, 55, 56, 57, 58, 59, 60, 61,62, 63, 64, 65, 66, 67, 68, 69, 70, 71 o 174.
En algunas realizaciones o aspectos de la divulgación, el anticuerpo proporcionado contiene una CDR-H3 que tiene la secuencia de aminoácidos establecida en los SEQ ID NO: 22, 29, 35, 45 o 52. En algunas realizaciones, el anticuerpo proporcionado contiene una CDR-H3 establecida en los SEQ ID NO: 22, 29 o 35. En algunas realizaciones, el anticuerpo proporcionado contiene una CDR-H3 establecida en los SEQ ID NO: 29 o 35. En algunas realizaciones o aspectos de la divulgación, el anticuerpo proporcionado contiene una CDR-H3 que tiene la secuencia de aminoácidos establecida en los SEQ ID NO: 29 o 52. En algunos aspectos de la divulgación, el anticuerpo proporcionado contiene una CDR-H3 contenida dentro de la CDR-H3 de la secuencia de aminoácidos de la región Vh establecida en los SEQ ID NO: 8, 10, 13, 15, 17, 19, 175, 176, 177, 178, 179, 180, 181, 182, 183, 184, 185, 186, 187, 188, 189, 190, 191, 192, 193, 194, 195, 196, 197, 198, 199, 200, 201, 202, 203, 204, 205, 206, 207, 208 o 209. En algunos aspectos de la divulgación, el anticuerpo proporcionado contiene una CDR-H3 contenida dentro de la CDR-H3 de la secuencia de aminoácidos de la región Vh establecida en los SEQ ID NO: 8 o 10. En algunos aspectos de la divulgación, el anticuerpo proporcionado contiene una CDR-H3 contenida dentro de la CDR-H3 de la secuencia de aminoácidos de la región Vh establecida en los SEQ ID NO: 10, 13, 15, 17 o 19. En algunos aspectos de la divulgación, el anticuerpo proporcionado contiene una CDR-H3 contenida dentro de la CDR-H3 de la secuencia de aminoácidos de la región Vh establecida en los SEQ ID NO: 13, 15 o 19. En algunos aspectos de la divulgación, el anticuerpo proporcionado contiene una CDR-H3 contenida dentro de la CDR-H3 de la secuencia de aminoácidos de la región Vh establecida en los SEQ ID NO: 13 o 15.
En algunos aspectos de la divulgación, la región VH del anticuerpo anti-ROR1 es una que incluye una región determinante de complementariedad de cadena pesada 1 (CDR-H1) que contiene la secuencia de aminoácidos: X1X2X3MX5 (SEQ ID NO: 95), en donde Xi es S, D o N; X2 es Y o A; X3 es Y, A o W; y X5 es H o S. En algunas realizaciones, en dicha CDR-H1, Xi es D o N; X2 es Y o A; X3 es A o W; y X5 es S.
En algunos aspectos de la divulgación, la región Vh del anticuerpo anti-ROR1 es una que incluye una CDR-H1 que contiene la secuencia de aminoácidos: XiX2X3MS (SEQ ID NO: 97), en donde Xi es D o N; X2 es Y o A; y X3 es A o W.
En algunas realizaciones o aspectos de la divulgación, el anticuerpo proporcionado contiene una CDR-H1 que tiene la secuencia de aminoácidos establecida en los SEQ ID NO: 20, 27, 33, 155, 156, 157, 158, 159, 160, 161, 162 o 163. En algunos aspectos de la divulgación, el anticuerpo proporcionado contiene una CDR-H1 que tiene la secuencia de aminoácidos establecida en los SEQ ID NO: 269, 270, 271, 272, 273, 274, 275, 276, 277, 278 o 279. En algunos aspectos de la divulgación, el anticuerpo proporcionado contiene una CDR-H1 que tiene la secuencia de aminoácidos establecida en los SEQ ID NO: 75, 77, 79, 280, 281, 282, 283, 284, 285, 286, 287, 288, 289 o 290. En algunas realizaciones o aspectos de la divulgación, el anticuerpo proporcionado contiene una CDR-H1 que tiene la secuencia
de aminoácidos establecida en los SEQ ID NO: 20, 27, 33, 75, 77, 79, 269, 270 o 271. En algunas realizaciones o aspectos de la divulgación, el anticuerpo proporcionado contiene una CDR-H1 que tiene la secuencia de aminoácidos establecida en los SEQ ID NO: 27, 33, 77, 79, 270 o 271. En algunos aspectos de la divulgación, el anticuerpo proporcionado contiene una CDR-H1 que tiene la secuencia de aminoácidos establecida en los SEQ ID NO: 74, 76 o 78. En algunos aspectos de la divulgación, el anticuerpo proporcionado contiene una CDR-H1 contenida dentro de la CDR-H1 de la secuencia de aminoácidos de la región Vh establecida en los SEQ ID NO: 8, 10, 13, 15, 17, 19, 175, 176, 177, 178, 179, 180, 181, 182, 183, 184, 185, 186, 187, 188, 189, 190, 191, 192, 193, 194, 195, 196, 197, 198, 199, 200, 201, 202, 203, 204, 205, 206, 207, 208 o 209. En algunos aspectos de la divulgación, el anticuerpo proporcionado contiene una CDR-H1 contenida dentro de la CDR-H1 de la secuencia de aminoácidos de la región VH establecida en los SEQ ID NO: 8 o 10. En algunos aspectos de la divulgación, el anticuerpo proporcionado contiene una CDR-H1 contenida dentro de la CDR-H1 de la secuencia de aminoácidos de la región Vh establecida en los SEQ ID NO: 10, 13, 15, 17 o 19. En algunos aspectos de la divulgación, el anticuerpo proporcionado contiene una CDR-H1 contenida dentro de la CDR-H1 de la secuencia de aminoácidos de la región Vh establecida en los SEQ ID NO: 13, 15 o 19. En algunos aspectos de la divulgación, el anticuerpo proporcionado contiene una CDR-H1 contenida dentro de la CDR-H1 de la secuencia de aminoácidos de la región Vh establecida en los SEQ ID NO: 13 o 15.
En algunos aspectos de la divulgación, la región Vh del anticuerpo anti-ROR1 es una que incluye una región determinante de complementariedad de cadena pesada 2 (CDR-H2) que contiene la secuencia de aminoácidos: X1IX3X4X5X6X7GX9X10TX12X13AX15X16X17X18G (SEQ ID NO: 96), en donde Xi es I, S o R; X3 es N, S o K; X4 es P, G o S; X5 es K o nulo; X6 es T o nulo; X7 es S, D o N; X9 es G o R; X10 es S o T; X12 es S o D; X13 es Y o H; X15 es Q, D o A; Xi6 es K, Y o P; X17 es F o V; y Xi8 es Q o K. En algunos aspectos de la divulgación, dicha CDR-H2, Xi es S o R; X3 es S o K; X4 es G o S; X5 es K o nulo; X6 es T o nulo; X7 es S o D; X9 es G o R; X10 es S o T; X12 es D; X13 es Y o H; X15 es D o A; Xi6 es Y o P; X17 es F; y Xi8 es K
En algunos aspectos de la divulgación, la región Vh del anticuerpo anti-ROR1 es una que incluye una CDR-H2 que contiene la secuencia de aminoácidos:
X1IX3X4X5X6X7GX9X10TX12X13AX15X16X17X18G (SEQ ID NO: 98), en donde Xi es I, S o R; X3 es N, S o K; X4 es P, G o S; X5 es K o nulo; X6 es T o nulo; X7 es S, D o N; X9 es G o R; X10 es S o T; X12 es S o D; X13 es Y o H; X15 es Q, D o A; Xi6 es K, Y o P; X17 es F o V; y Xi8 es Q o K.
En algunas realizaciones o aspectos de la divulgación, el anticuerpo proporcionado contiene una CDR-H2 que tiene la secuencia de aminoácidos establecida en los SEQ ID NO: 21, 26, 28, 34, 164, 165, 166, 167, 168, 169, 170, 171, 172, 173 o 318. En algunos aspectos de la divulgación, el anticuerpo proporcionado contiene una CDR-H2 que tiene la secuencia de aminoácidos establecida en los SEQ ID NO: 291, 292, 293, 294, 295, 296, 297, 298, 299, 300, 301, 302 o 303. En algunos aspectos de la divulgación, el anticuerpo proporcionado contiene una CDR-H2 que tiene la secuencia de aminoácidos establecida en los SEQ ID NO: 304, 305, 306, 307, 308, 309, 310, 311,312, 313, 314, 315, 316 o 317. En algunas realizaciones o aspectos de la divulgación, el anticuerpo proporcionado contiene una CDR-H2 que tiene la secuencia de aminoácidos establecida en los SEQ ID NO: 21, 26, 28, 34, 291, 292, 293, 294, 304, 305, 306, 307. En algunas realizaciones o aspectos de la divulgación, el anticuerpo proporcionado contiene una CDR-H2 que tiene la secuencia de aminoácidos establecida en los SEQ ID NO: 26, 28, 34, 291,292, 294, 304, 305 o 307. En algunas realizaciones o aspectos de la divulgación, el anticuerpo proporcionado contiene una CDR-H2 que tiene la secuencia de aminoácidos establecida en los SEQ ID NO: 28, 34, 291, 292, 304 o 305. En algunos aspectos de la divulgación, el anticuerpo proporcionado contiene una CDR-H2 que tiene la secuencia de aminoácidos establecida en los SEQ ID NO: 80, 81, 82 u 83. En algunos aspectos de la divulgación, el anticuerpo proporcionado contiene una CDR-H2 contenida dentro de la CDR-H2 de la secuencia de aminoácidos de la región VH establecida en los SEQ ID NO: 8, 10, 13, 15, 17, 19, 175, 176, 177, 178, 179, 180, 181, 182, 183, 184, 185, 186, 187, 188, 189, 190, 191, 192, 193, 194, 195, 196, 197, 198, 199, 200, 201, 202, 203, 204, 205, 206, 207, 208 o 209. En algunos aspectos de la divulgación, el anticuerpo proporcionado contiene una CDR-H2 contenida dentro de la CDR-H2 de la secuencia de aminoácidos de la región Vh establecida en los SEQ ID NO: 8 o 10. En algunos aspectos de la divulgación, el anticuerpo proporcionado contiene una CDR-H2 contenida dentro de la CDR-H2 de la secuencia de aminoácidos de la región Vh establecida en los SEQ ID NO: 10, 13, 15, 17 o 19. En algunos aspectos de la divulgación, el anticuerpo proporcionado contiene una CDR-H2 contenida dentro de la CDR-H2 de la secuencia de aminoácidos de la región VH establecida en los SEQ ID NO: 13, 15 o 19. En algunos aspectos de la divulgación, el anticuerpo proporcionado contiene una CDR-H2 contenida dentro de la CDR-H2 de la secuencia de aminoácidos de la región VH establecida en los SEQ ID NO: 13 o 15.
En algunas realizaciones o aspectos de la divulgación, el anticuerpo proporcionado contiene una CDR-H1 que tiene la secuencia de aminoácidos establecida en los SEQ ID NO: 20, 27, 33, 155, 156, 157, 158, 159, 160, 161, 162 o 163; una CDR-H2 que tiene la secuencia de aminoácidos establecida en los SEQ ID NO: 21, 26, 28, 34, 164, 165, 166, 167, 168, 169, 170, 171, 172, 173 o 318; y una CDR-H3 que tiene la secuencia de aminoácidos establecida en los SEQ ID NO: 22, 29, 35, 45, 50, 51, 52, 53, 54, 55, 56, 57, 58, 59, 60, 61, 62, 63, 64, 65, 66, 67, 68, 69, 70, 71 o 174. En algunos aspectos de la divulgación, el anticuerpo proporcionado contiene una CDR-H1 que tiene la secuencia de aminoácidos establecida en los SEQ ID NO: 269, 270, 271, 272, 273, 274, 275, 276, 277, 278 o 279; una CDR-H2 que tiene la secuencia de aminoácidos establecida en los SEQ ID NO: 291, 292, 293, 294, 295, 296, 297, 298, 299, 300, 301, 302 o 303; y una CDR-H3 que tiene la secuencia de aminoácidos establecida en los SEQ ID NO: 22, 29, 35, 45, 50, 51, 52, 53, 54, 55, 56, 57, 58, 59, 60, 61, 62, 63, 64, 65, 66, 67, 68, 69, 70, 71 o 174. En algunos aspectos de la
divulgación, el anticuerpo proporcionado contiene una CDR-H1 que tiene la secuencia de aminoácidos establecida en los SEQ ID NO: 75, 77, 79, 280, 281,282, 283, 284, 285, 286, 287, 288 o 289; una CDR-H2 que tiene la secuencia de aminoácidos establecida en los SEQ ID NO: 304, 305, 306, 307, 308, 309, 310, 311, 312, 313, 314, 315, 316 o 317; y una CDR-H3 que tiene la secuencia de aminoácidos establecida en los SEQ ID NO: 22, 29, 35, 45, 50, 51,52, 53, 54, 55, 56, 57, 58, 59, 60, 61,62, 63, 64, 65, 66, 67, 68, 69, 70, 71 o 174.
En algunas realizaciones o aspectos de la divulgación, el anticuerpo proporcionado contiene una CDR-H1 que tiene la secuencia de aminoácidos establecida en los SEQ ID NO: 20, 27, 33, 75, 77, 79, 269, 270 o 271; una CDR-H2 que tiene la secuencia de aminoácidos establecida en los SEQ ID NO: 21,26, 28, 34, 291,292, 293, 294, 304, 305, 306 o 307; y una CDR-H3 que tiene la secuencia de aminoácidos establecida en los SEQ ID NO: 22, 29, 35, 45, 50, 51, 52, 53, 54, 55, 56, 57, 58, 59, 60, 61,62, 63, 64, 65, 66, 67, 68, 69, 70, 71 o 174. En algunas realizaciones o aspectos de la divulgación, el anticuerpo proporcionado contiene una CDR-H1 que tiene la secuencia de aminoácidos establecida en los SEQ ID NO: 20, 27, 33, 75, 77, 79, 269, 270 o 271; una CDR-H2 que tiene la secuencia de aminoácidos establecida en los SEQ ID NO: 21, 26, 28, 34,291, 292, 293, 294, 304, 305, 306 o 307; y una CDR-H3 que tiene la secuencia de aminoácidos establecida en los SEQ ID NO: 22, 29, 35 o 52. En algunas realizaciones o aspectos de la divulgación, el anticuerpo proporcionado contiene una CDR-H1 que tiene la secuencia de aminoácidos establecida en los SEQ ID NO: 27, 33, 77, 79, 269, 271; una CDR-H2 que tiene la secuencia de aminoácidos establecida en los SEQ ID NO: 28, 34, 291,292, 304 o 305; y una CDR-H3 que tiene la secuencia de aminoácidos establecida en los SEQ ID NO: 29 o 352.
En algunas realizaciones, la CDR-H1, la CDR-H2 y la CDR-H3 contienen las secuencias de los SEQ ID NO: 20, 21 y 22, respectivamente; la CDR-H1, la CDR-H2 y la CDR-H3 contienen las secuencias de los SEQ ID NO: 20, 26 y 22, respectivamente; la CDR-H1, la CDR-H2 y la CDR-H3 contienen las secuencias de los SEQ ID NO: 27, 28 y 29, respectivamente; la CDR-H1, la CDR-H2 y la CDR-H3 contienen las secuencias de los SEQ ID NO: 33, 34 y 35, respectivamente; y la CDR-H1, la CDR-H2 y la CDR-H3 contienen las secuencias de los SEQ ID NO: 27, 164 y 45, respectivamente. En algunos aspectos de la divulgación, la CDR-H1, la CDR-H2 y la CDR-H3 contienen las secuencias de los SEQ ID NO: 33, 34 y 52, respectivamente; la CDR-H1, la CDR-H2 y la CDR-H3 contienen las secuencias de los SEQ ID NO: 27, 164 y 68, respectivamente; la CDR-H1, la CDR-H2 y la CDR-H3 contienen las secuencias de los SEQ ID NO: 27, 164 y 64, respectivamente; la CDR-H1, la CDR-H2 y la CDR-H3 contienen las secuencias de los SEQ ID NO: 27, 164 y 66, respectivamente; la CDR-H1, la CDR-H2 y la CDR-H3 que tienen las secuencias de los SEQ ID NO: 33, 318 y 35, respectivamente; la CDR-H1, la CDR-H2 y la CDR-H3 contienen las secuencias de los SEQ ID NO: 33, 34 y 70, respectivamente; la CDR-H1, la CDR-H2 y la CDR-H3 contienen las secuencias de los SEQ ID NO: 33, 34 y 55, respectivamente; la CDR-H1, la CDR-H2 y la CDR-H3 contienen las secuencias de los SEQ ID NO: 33, 34 y 53, respectivamente; la CDR-H1, la CDR-H2 y la CDR-H3 contienen las secuencias de los SEQ ID NO: 33, 34 y 56, respectivamente; la CDR-H1, la CDR-H2 y la CDR-H3 contienen las secuencias de los SEQ ID NO: 33, 34 y 61, respectivamente; la CDR-H1, la CDR-H2 y la CDR-H3 contienen las secuencias de los SEQ ID NO: 33, 34 y 59, respectivamente; la CDR-H1, la CDR-H2 y la CDR-H3 contienen las secuencias de los SEQ ID NO: 33, 171 y 60, respectivamente; la CDR-H1, la CDR-H2 y la CDR-H3 contienen las secuencias de los SEQ ID NO: 155, 34 y 35, respectivamente; la CDR-H1, la CDR-H2 y la CDR-H3 contienen las secuencias de los SEQ ID NO: 156, 34 y 35, respectivamente; la CDR-H1, la CDR-H2 y la CDR-H3 contienen las secuencias de los SEQ ID NO: 162, 170 y 50, respectivamente; la CDR-H1, la CDR-H2 y la CDR-H3 contienen las secuencias de los SEQ ID NO: 162, 170 y 51, respectivamente; la CDR-H1, la CDR-H2 y la CDR-H3 contienen las secuencias de los SEQ ID NO: 161, 169 y 54, respectivamente; la CDR-H1, la CDR-H2 y la CDR-H3 contienen las secuencias de los SEQ ID NO: 159, 167 y 57, respectivamente; la CDR-H1, la CDR-H2 y la CDR-H3 contienen las secuencias de los SEQ ID NO: 160, 168 y 58, respectivamente; la CDR-H1, la CDR-H2 y la CDR-H3 contienen las secuencias de los SEQ ID NO: 158, 166 y 62, respectivamente; la CDR-H1, la CDR-H2 y la CDR-H3 contienen las secuencias de los SEQ ID NO: 158, 166 y 63, respectivamente; la CDR-H1, la CDR-H2 y la CDR-H3 contienen las secuencias de los SEQ ID NO: 158, 166 y 65, respectivamente; la CDR-H1, la CDR-H2 y la CDR-H3 contienen las secuencias de los SEQ ID NO: 157, 165 y 67, respectivamente; la CDR-H1, la CDR-H2 y la CDR-H3 contienen las secuencias de los SEQ ID NO: 163, 173 y 69, respectivamente; la CDR-H1, la CDR-H2 y la CDR-H3 contienen las secuencias de los SEQ ID NO: 160, 172, 71, respectivamente; o la CDR-H1, la CDR-H2 y la CDR-H3 contienen las secuencias de los SEQ ID NO: 160, 172, 174, respectivamente.
En algunos aspectos de la divulgación, la CDR-H1, la CDR-H2 y la CDR-H3 contienen las secuencias de los SEQ ID NO: 269, 293 y 22, respectivamente; la CDR-H1, la CDR-H2 y la CDR-H3 contienen las secuencias de los SEQ ID NO: 269, 294 y 22, respectivamente; la CDR-H1, la CDR-H2 y la CDR-H3 contienen las secuencias de los SEQ ID NO: 270, 292 y 29, respectivamente; la CDR-H1, la CDR-H2 y la CDR-H3 contienen las secuencias de los SEQ ID NO: 271, 291 y 35, respectivamente; la CDR-H1, la CDR-H2 y la CDR-H3 contienen las secuencias de los SEQ ID NO: 276, 291 y 35, respectivamente; la CDR-H1, la CDR-H2 y la CDR-H3 contienen las secuencias de los SEQ ID NO: 271, 291 y 52, respectivamente; la CDR-H1, la CDR-H2 y la CDR-H3 contienen las secuencias de los SEQ ID NO: 276, 291 y 52, respectivamente; la CDR-H1, la CDR-H2 y la CDR-H3 contienen las secuencias de los SEQ ID NO: 270, 296 y 45, respectivamente; la CDR-H1, la CDR-H2 y la CDR-H3 contienen las secuencias de los SEQ ID NO: 270, 296 y 68, respectivamente; la CDR-H1, la CDR-H2 y la CDR-H3 contienen las secuencias de los SEQ ID NO: 270, 296 y 64, respectivamente; la CDR-H1, la CDR-H2 y la CDR-H3 contienen las secuencias de los SEQ ID NO: 270, 296 y 66, respectivamente; la CDR-H1, la CDR-H2 y la CDR-H3 que tienen las secuencias de los SEQ ID NO: 271, 295 y 35, respectivamente; la CDR-H1, la CDR-H2 y la CDR-H3 que tienen las secuencias de los SEQ ID
NO: 276, 295 y 35, respectivamente la CDR-H1, la CDR-H2 y la CDR-H3 contienen las secuencias de los SEQ ID NO: 271, 291 y 70, respectivamente la CDR-H1, la CDR-H2 y la CDR-H3 contienen las secuencias de los SEQ ID NO: 276, 291 y 70, respectivamente la CDR-H1, la CDR-H2 y la CDR-H3 contienen las secuencias de los SEQ ID NO: 271, 291 y 55, respectivamente la CDR-H1, la CDR-H2 y la CDR-H3 contienen las secuencias de los SEQ ID NO: 276, 291 y 55, respectivamente la CDR-H1, la CDR-H2 y la CDR-H3 contienen las secuencias de los SEQ ID NO: 271, 291 y 53, respectivamente la CDR-H1, la CDR-H2 y la CDR-H3 contienen las secuencias de los SEQ ID NO: 276, 291 y 53, respectivamente la CDR-H1, la CDR-H2 y la CDR-H3 contienen las secuencias de los SEQ ID NO: 271, 291 y 56, respectivamente la CDR-H1, la CDR-H2 y la CDR-H3 contienen las secuencias de los SEQ ID NO: 276, 291 y 56, respectivamente la CDR-H1, la CDR-H2 y la CDR-H3 contienen las secuencias de los SEQ ID NO: 271, 291 y 61, respectivamente la CDR-H1, la CDR-H2 y la CDR-H3 contienen las secuencias de los SEQ ID NO: 276, 291 y 61, respectivamente la CDR-H1, la CDR-H2 y la CDR-H3 contienen las secuencias de los SEQ ID NO: 271, 291 y 59, respectivamente la CDR-H1, la CDR-H2 y la CDR-H3 contienen las secuencias de los SEQ ID NO: 276, 291 y 59, respectivamente la CDR-H1, la CDR-H2 y la CDR-H3 contienen las secuencias de los SEQ ID NO: 271, 291 y 60, respectivamente la CDR-H1, la CDR-H2 y la CDR-H3 contienen las secuencias de los SEQ ID NO: 276, 291 y 60, respectivamente la CDR-H1, la CDR-H2 y la CDR-H3 contienen las secuencias de los SEQ ID NO: 274, 291 y 35, respectivamente la CDR-H1, la CDR-H2 y la CDR-H3 contienen las secuencias de los SEQ ID NO: 275, 291 y 35, respectivamente la CDR-H1, la CDR-H2 y la CDR-H3 contienen las secuencias de los SEQ ID NO: 273, 302 y 50, respectivamente la CDR-H1, la CDR-H2 y la CDR-H3 contienen las secuencias de los SEQ ID NO: 273, 302 y 51, respectivamente la CDR-H1, la CDR-H2 y la CDR-H3 contienen las secuencias de los SEQ ID NO: 279, 301 y 54, respectivamente la CDR-H1, la CDR-H2 y la CDR-H3 contienen las secuencias de los SEQ ID NO: 277, 299 y 57, respectivamente la CDR-H1, la CDR-H2 y la CDR-H3 contienen las secuencias de los SEQ ID NO: 278, 300 y 58, respectivamente la CDR-H1, la CDR-H2 y la CDR-H3 contienen las secuencias de los SEQ ID NO: 273, 298 y 62, respectivamente la CDR-H1, la CDR-H2 y la CDR-H3 contienen las secuencias de los SEQ ID NO: 273, 298 y 63, respectivamente la CDR-H1, la CDR-H2 y la CDR-H3 contienen las secuencias de los SEQ ID NO: 273, 298 y 65, respectivamente la CDR-H1, la CDR-H2 y la CDR-H3 contienen las secuencias de los SEQ ID NO: 272, 297 y 67, respectivamente la CDR-H1, la CDR-H2 y la CDR-H3 contienen las secuencias de los SEQ ID NO: 273, 303 y 69, respectivamente la CDR-H1, la CDR-H2 y la CDR-H3 contienen las secuencias de los SEQ ID NO: 278, 300, 71, respectivamente; o la CDR-H1, la CDR-H2 y la CDR-H3 contienen las secuencias de los SEQ ID NO: 278, 300, 174, respectivamente.
En algunos aspectos de la divulgación, la CDR-H1, la CDR-H2 y la CDR-H3 contienen las secuencias de los SEQ ID NO: 75, 306 y 22, respectivamente; la CDR-H1, la CDR-H2 y la CDR-H3 contienen las secuencias de los SEQ ID NO: 75, 307 y 22, respectivamente; la CDR-H1, la CDR-H2 y la CDR-H3 contienen las secuencias de los SEQ ID NO: 77, 305 y 29, respectivamente; la CDR-H1, la CDR-H2 y la CDR-H3 contienen las secuencias de los SEQ ID NO: 79, 304 y 35, respectivamente; la CDR-H1, la CDR-H2 y la CDR-H3 contienen las secuencias de los SEQ ID NO: 79, 304 y 52, respectivamente; la CDR-H1, la CDR-H2 y la CDR-H3 contienen las secuencias de los SEQ ID NO: 77, 309 y 45, respectivamente; la CDR-H1, la CDR-H2 y la CDR-H3 contienen las secuencias de los SEQ ID NO: 77, 309 y 68, respectivamente; la CDR-H1, la CDR-H2 y la CDR-H3 contienen las secuencias de los SEQ ID NO: 77, 309 y 64, respectivamente; la CDR-H1, la CDR-H2 y la CDR-H3 contienen las secuencias de los SEQ ID NO: 77, 309 y 66, respectivamente; la CDR-H1, la CDR-H2 y la CDR-H3 que tienen las secuencias de los SEQ ID NO: 79, 308 y 35, respectivamente; la CDR-H1, la CDR-H2 y la CDR-H3 contienen las secuencias de los SEQ ID NO: 79, 304 y 70, respectivamente; la CDR-H1, la CDR-H2 y la CDR-H3 contienen las secuencias de los SEQ ID NO: 79, 304 y 55, respectivamente; la CDR-H1, la CDR-H2 y la CDR-H3 contienen las secuencias de los SEQ ID NO: 284, 304 y 55, respectivamente; la CDR-H1, la CDR-H2 y la CDR-H3 contienen las secuencias de los SEQ ID NO: 79, 304 y 53, respectivamente; la CDR-H1, la CDR-H2 y la CDR-H3 contienen las secuencias de los SEQ ID NO: 79, 304 y 56, respectivamente; la CDR-H1, la CDR-H2 y la CDR-H3 contienen las secuencias de los SEQ ID NO: 79, 304 y 61, respectivamente; la CDR-H1, la CDR-H2 y la CDR-H3 contienen las secuencias de los SEQ ID NO: 79, 304 y 59, respectivamente; la CDR-H1, la CDR-H2 y la CDR-H3 contienen las secuencias de los SEQ ID NO: 79, 304 y 60, respectivamente; la CDR-H1, la CDR-H2 y la CDR-H3 contienen las secuencias de los SEQ ID NO: 280, 304 y 35, respectivamente; la CDR-H1, la CDR-H2 y la CDR-H3 contienen las secuencias de los SEQ ID NO: 283, 304 y 35, respectivamente; la CDR-H1, la CDR-H2 y la CDR-H3 contienen las secuencias de los SEQ ID NO: 288, 315 y 50, respectivamente; la CDR-H1, la CDR-H2 y la CDR-H3 contienen las secuencias de los SEQ ID NO: 288, 315 y 51, respectivamente; la CDR-H1, la CDR-H2 y la CDR-H3 contienen las secuencias de los SEQ ID NO: 287, 314 y 54, respectivamente; la CDR-H1, la CDR-H2 y la CDR-H3 contienen las secuencias de los SEQ ID NO: 285, 312 y 57, respectivamente; la CDR-H1, la CDR-H2 y la CDR-H3 contienen las secuencias de los SEQ ID NO: 286 o 289, 313 y 58, respectivamente; la CDR-H1, la CDR-H2 y la CDR-H3 contienen las secuencias de los SEQ ID NO: 282, 311 y 62, respectivamente; la CDR-H1, la CDR-H2 y la CDR-H3 contienen las secuencias de los SEQ ID NO: 282, 311 y 63, respectivamente; la CDR-H1, la CDR-H2 y la CDR-H3 contienen las secuencias de los SEQ ID NO: 282, 311 y 65, respectivamente; la CDR-H1, la CDR-H2 y la CDR-H3 contienen las secuencias de los SEQ ID NO: 281, 310 y 67, respectivamente; la CDR-H1, la CDR-H2 y la CDR-H3 contienen las secuencias de los SEQ ID NO: 290, 317 y 69, respectivamente; la CDR-H1, la CDR-H2 y la CDR-H3 contienen las secuencias de los SEQ ID NO: 286 o 289, 316, 71, respectivamente; o la CDR-H1, la Cd R-H2 y la CDR-H3 contienen las secuencias de los SEQ ID NO: 286 o 289, 316, 174, respectivamente.
En algunos aspectos de la divulgación, la CDR-H1, la CDR-H2 y la CDR-H3 contienen las secuencias de los SEQ ID NO: 20, 80 y 22, respectivamente; la CDR-H1, la CDR-H2 y la CDR-H3 contienen las secuencias de los SEQ ID NO:
20, 83 y 22, respectivamente; la CDR-H1, la CDR-H2 y la CDR-H3 contienen las secuencias de los SEQ ID NO: 27, 81 y 29, respectivamente; la CDR-H1, la CDR-H2 y la CDR-H3 contienen las secuencias de los SEQ ID NO: 33, 82 y 35, respectivamente; o la CDR-H1, la CDR-H2 y la CDR-H3 contienen las secuencias de los SEQ ID NO: 33, 82 y 52, respectivamente.
En algunos aspectos de la divulgación, la CDR-H1, la CDR-H2 y la CDR-H3 contienen las secuencias de los SEQ ID NO: 269, 293 y 22, respectivamente; la CDR-H1, la CDR-H2 y la CDR-H3 contienen las secuencias de los SEQ ID NO: 269, 294 y 22, respectivamente; la CDR-H1, la CDR-H2 y la CDR-H3 contienen las secuencias de los SEQ ID NO: 270, 292 y 29, respectivamente; la CDR-H1, la CDR-H2 y la CDR-H3 contienen las secuencias de los SEQ ID NO: 271, 291 y 35, respectivamente; o la CDR-H1, la CDR-H2 y la CDR-H3 contienen las secuencias de los SEQ ID NO: 271,291 y 52, respectivamente.
En algunos aspectos de la divulgación, la CDR-H1, la CDR-H2 y la CDR-H3 contienen las secuencias de los SEQ ID NO: 75, 306 y 22, respectivamente; la CDR-H1, la CDR-H2 y la CDR-H3 contienen las secuencias de los SEQ ID NO: 75, 307 y 22, respectivamente; la CDR-H1, la CDR-H2 y la CDR-H3 contienen las secuencias de los SEQ ID NO: 77, 305 y 29, respectivamente; la CDR-H1, la CDR-H2 y la CDR-H3 contienen las secuencias de los SEQ ID NO: 79, 304 y 35, respectivamente; o la CDR-H1, la CDR-H2 y la CDR-H3 contienen las secuencias de los SEQ ID NO: 79, 304 y 52, respectivamente.
En algunas realizaciones o aspectos de la divulgación, el anticuerpo proporcionado contiene una CDR-H1, CDR-H2 y CDR-H3, respectivamente, contenidas dentro de la secuencia de aminoácidos de la región Vh establecida en los SEQ ID NO: 8, 10, 13, 15, 17, 19, 175, 176, 177, 178, 179, 180, 181, 182, 183, 184, 185, 186, 187, 188, 189, 190, 191, 192, 193, 194, 195, 196, 197, 198, 199, 200, 201, 202, 203, 204, 205, 206, 207, 208 o 209. En algunas realizaciones o aspectos de la divulgación, el anticuerpo proporcionado contiene una CDR-H1, CDR-H2 y CDR-H3, respectivamente, contenidas dentro de la secuencia de aminoácidos de la región Vh establecida en los SEQ ID NO: 8, 10, 13, 15, 17 o 19. En algunos aspectos de la divulgación, el anticuerpo proporcionado contiene una CDR-H1, CDR-H2 y CDR-H3, respectivamente, contenidas dentro de la secuencia de aminoácidos de la región Vh establecida en los SEQ ID NO: 8 o 10. En algunas realizaciones o aspectos de la divulgación, el anticuerpo proporcionado contiene una CDR-H1, CDR-H2 y CDR-H3, respectivamente, contenidas dentro de la secuencia de aminoácidos de la región Vh establecida en los SEQ ID NO: 10, 13, 15, 17 o 19. En algunas realizaciones o aspectos de la divulgación, el anticuerpo proporcionado contiene una CDR-H1, CDR-H2 y CDR-H3, respectivamente, contenidas dentro de la secuencia de aminoácidos de la región Vh establecida en los s Eq ID NO: 13, 15 o 19. En algunas realizaciones o aspectos de la divulgación, el anticuerpo proporcionado contiene una CDR-H1, CDR-H2 y CDR-H3, respectivamente, contenidas dentro de la secuencia de aminoácidos de la región Vh establecida en los SEQ ID NO: 13 o 15.
En algunas realizaciones o aspectos de la divulgación, la región Vh contiene cualquiera de las CDR-H1, CDR-H2 y CDR-H3 tal como se describe y contiene una región marco que contiene al menos el 90 %, el 91 %, el 92 %, el 93 %, el 94 %, el 95 %, el 96 %, el 97 %, el 98 %, el 99 % de identidad de secuencia con la región marco establecida en la secuencia de aminoácidos de la región Vh establecida en los SEQ ID NO: 8, 10, 13, 15, 17, 19, 175, 176, 177, 178, 179, 180, 181, 182, 183, 184, 185, 186, 187, 188, 189, 190, 191, 192, 193, 194, 195, 196, 197, 198, 199, 200, 201, 202, 203, 204, 205, 206, 207, 208 o 209. En algunas realizaciones o aspectos de la divulgación, el anticuerpo anti-ROR1 puede contener una CDR-H1, CDR-H2 y CDR-H3, respectivamente, contenida dentro de la secuencia de aminoácidos de la región Vh establecida en los SEQ ID NO: 8, 10, 13, 15, 17, 19, 175, 176, 177, 178, 179, 180, 181, 182, 183, 184, 185, 186, 187, 188, 189, 190, 191, 192, 193, 194, 195, 196, 197, 198, 199, 200, 201, 202, 203, 204, 205, 206, 207, 208 o 209, y una región marco que contiene al menos el 90 %, el 91 %, el 92 %, el 93 %, el 94 %, el 95 %, el 96 %, el 97 %, el 98 %, el 99 % de identidad de secuencia con la región marco de la secuencia de aminoácidos establecida en los SEQ ID NO: 8, 10, 13, 15, 17, 19, 175, 176, 177, 178, 179, 180, 181, 182, 183, 184, 185, 186, 187, 188, 189, 190, 191, 192, 193, 194, 195, 196, 197, 198, 199, 200, 201,202, 203, 204, 205, 206, 207, 208 o 209.
En algunas realizaciones o aspectos de la divulgación, la región Vh contiene cualquiera de las CDR-H1, CDR-H2 y CDR-H3 tal como se describe y contiene una región marco que contiene al menos el 90 %, el 91 %, el 92 %, el 93 %, el 94 %, el 95 %, el 96 %, el 97 %, el 98 %, el 99 % de identidad de secuencia con la región marco establecida en la secuencia de aminoácidos de la región Vh establecida en los SEQ ID NO: 8, 10, 13, 15, 17 o 19. Por ejemplo, en algunas realizaciones y aspectos de la divulgación, el anticuerpo anti-ROR1 puede contener una CDR-H1, CDR-H2 y CDR-H3, respectivamente, contenidas dentro de la secuencia de aminoácidos de la región Vh establecida en los SEQ ID NO: 8, 10, 13, 15, 17 o 19, y una región marco que contiene al menos el 90 %, el 91 %, el 92 %, el 93 %, el 94 %, el 95 %, el 96 %, el 97 %, el 98 %, el 99 % de identidad de secuencia con la región marco de la secuencia de aminoácidos expuesta en los SEQ ID NO: 8, 10, 13, 15, 17 o 19.
En algunas realizaciones o aspectos de la divulgación, el anticuerpo contiene una región Vh que tiene la secuencia de aminoácidos establecida en los SEQ ID NO: 8, 10, 13, 15, 17, 19, 175, 176, 177, 178, 179, 180, 181, 182, 183, 184, 185, 186, 187, 188, 189, 190, 191, 192, 193, 194, 195, 196, 197, 198, 199, 200, 201, 202, 203, 204, 205, 206, 207, 208 o 209. En algunas realizaciones o aspectos de la divulgación, el anticuerpo contiene una región VH que tiene la secuencia de aminoácidos establecida en los SEQ ID NO: 8, 10, 13, 15, 17 o 19. En algunas realizaciones o aspectos de la divulgación, el anticuerpo contiene una región Vh que tiene la secuencia de aminoácidos establecida en los SEQ ID NO: 10, 13, 15 o 19. En algunas realizaciones o aspectos de la divulgación, el anticuerpo contiene la región Vh que
tiene la secuencia de aminoácidos establecida en los SEQ ID NO: 13, 15 o 19. En algunas realizaciones o aspectos de la divulgación, el anticuerpo contiene una región Vh que tiene la secuencia de aminoácidos establecida en los SEQ ID NO: 13 o 15.
También se proporcionan o enseñan anticuerpos que tienen secuencias de al menos o aproximadamente el 90 %, el 91 %, el 92 %, el 93 %, el 94 %, el 95 %, el 96 %, el 97 %, el 98 % o el 99 % idénticos a tales secuencias.
También se desvela un anticuerpo de dominio único (sdAb) que contiene solo la secuencia de la región Vh, tal como cualquiera de las secuencias de la región Vh descritas anteriormente o una porción de unión a antígeno suficiente del mismo.
De acuerdo con la invención, el anticuerpo anti-ROR1 que contiene una región Vh que contiene además una cadena ligera o una porción de unión a antígeno suficiente del mismo. El anticuerpo contiene una región Vh y una región Vl, o una porción de unión a antígeno de una región Vh y Vl suficiente. En algunas realizaciones o aspectos de la divulgación, una secuencia de la región Vh puede ser cualquiera de las secuencias de Vh. En algunas de tales realizaciones, el anticuerpo es un fragmento de unión a antígeno, tal como un Fab o un scFv. En algunas de tales realizaciones, el anticuerpo es un anticuerpo de longitud completa o intacto que también contiene una región constante.
En algunas realizaciones o aspectos de la divulgación, el anticuerpo, por ejemplo, un fragmento de unión a antígeno del mismo, tiene una región variable de cadena ligera (VL) que tiene la secuencia de aminoácidos establecida en los SEQ ID NO: 14, 16, 18, 234, 235, 236, 237, 238, 239, 240, 241,242, 243, 244, 245, 246, 247 o 248, o una secuencia de aminoácidos que tenga al menos el 90 %, el 91 %, el 92 %, el 93 %, el 94 %, el 95 %, el 96 %, el 97 %, el 98 % o el 99 % de identidad de secuencia con la secuencia de aminoácidos de la región Vh establecida en los SEQ ID NO: 14, 16, 18, 234, 235, 236, 237, 238, 239, 240, 241, 242, 243, 244, 245, 246, 247 o 248. En algunas realizaciones o aspectos de la divulgación, el anticuerpo, por ejemplo, un fragmento de unión a antígeno del mismo, tiene una región variable de cadena ligera (Vl) que tiene la secuencia de aminoácidos establecida en los SEQ ID NO: 14, 16 o 18, o una secuencia de aminoácidos que tiene al menos el 90 %, el 91 %, el 92 %, el 93 %, el 94 %, el 95 %, el 96 %, el 97 %, el 98 % o el 99 % de identidad de secuencia con la secuencia de aminoácidos de la región VH establecida en los SEQ ID NO: 14, 16 o 18.
En algunos aspectos de la divulgación, la región VL del anticuerpo anti-ROR1 es una que incluye una región determinante de complementariedad de la cadena ligera 3 (CDR-L3) que contiene la secuencia de aminoácidos: X1X2X3X4X5X6X7X8X9X10X11X12X13X14 (SEQ ID NO: 99), en donde Xi es Q, A o K; X2 es Q, V, A o S; X3 es Y, W o L; X4 es E, D, K o N; X5 es S, D, N o G; X6 es L, T, S, D, R o Y; X7 es P, G, L, S, N o T; X8 es D, S, N, o nulo; X9 es H, G, L o nulo; X10 es Y, P, V, R, H o L; y X11 es T, V, S o M. En algunas realizaciones, en dicha CDR-L3, Xi es Q o A; X2 es Q, V o A; X3 es Y o W; X4 es E o D; X5 es S o D; X6 es L, T o S; X7 es P, G o L; X8 es D, S o nulo; X9 es H, G o nulo; X10 es Y, P o V; y X11 es T o V.
En algunos aspectos de la divulgación, la región VL del anticuerpo anti-ROR1 es una que incluye una región determinante de complementariedad de la cadena ligera 3 (CDR-L3) que contiene la secuencia de aminoácidos: X1X2X3X4X5X6X7X8X9X10X11X12X13X14 (SEQ ID NO: 100), en donde Xi es Q o A; X2 es Q, V o A; X3 es Y o W; X4 es E o D; X5 es S o D; X6 es L, T o S; X7 es P, G o L; X8 es D, S o nulo; X9 es H, G o nulo; X10 es Y, P o V; y X11 es T o V.
En algunas realizaciones o aspectos de la divulgación, el anticuerpo proporcionado contiene una CDR-L3 que tiene la secuencia de aminoácidos establecida en los SEQ ID NO: 25, 32, 38, 39, 40, 41,42, 43, 44, 46, 47, 48, 49, 232 o 233. En algunas realizaciones o aspectos de la divulgación, el anticuerpo proporcionado puede contener una secuencia de la región Vl establecida en los SEQ ID NO: 14, 16, 18, 234, 235, 236, 237, 238, 239, 240, 241, 242, 243, 244, 245, 246, 247 o 248 en la que la correspondiente secuencia de CDR-L3 contenida en la misma (por ejemplo, correspondiente a los restos de aminoácidos L89 a L97 por numeración de Kabat) se reemplaza por la secuencia CDR-L3 establecida en los SEQ ID NO: 25, 32, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 46, 47, 48, 49, 232 o 233. En algunas realizaciones o aspectos de la divulgación, el anticuerpo proporcionado puede contener una secuencia de la región VL establecida en los SEQ ID NO: 14, 16 o 18 en la que la secuencia de CDR-L3 correspondiente contenida en ella (por ejemplo, correspondiente a los restos de aminoácidos L89 a L97 por numeración de Kabat) se reemplaza por la secuencia de CDR-L3 establecida en los SEQ ID NO: 25, 32, 38, 39, 40, 41,42, 43, 44, 46, 47, 48 y 49.
En algunas realizaciones, el anticuerpo proporcionado contiene una CDR-L3 que tiene la secuencia de aminoácidos establecida en los SEQ ID NO: 25, 32 o 38. En algunas realizaciones, el anticuerpo proporcionado contiene una CDR-L3 contenida dentro de la CDR-L3 de la secuencia de aminoácidos de la región Vl establecida en los SEQ ID NO: 14, 16 o 18. En algunas realizaciones, el anticuerpo proporcionado contiene una CDR-L3 que tiene la secuencia de aminoácidos establecida en los SEQ ID NO: 32 o 38. En algunas realizaciones, el anticuerpo proporcionado contiene una CDR-L3 contenida dentro de la CDR-L3 de la secuencia de aminoácidos de la región Vl establecida en los SEQ ID NO: 14 o 16.
En algunos aspectos de la divulgación, la región VL del anticuerpo anti-ROR1 es una que incluye una región determinante de complementariedad de la cadena ligera 1 (CDR-L1) que contiene la secuencia de aminoácidos: X1X2SX4X5X6X7X8SX10X11X12X13 (SEQ ID NO: 101), en donde Xi es Q, G o S; X2 es A o G; X4 es Q, N o S; X5 es S o
nulo; X6 es N o nulo; X7 es D o I; X8 es I o G; X10 es N o E; X11 es Y o S; X12 es L o V; y X13 es N o Y.
En algunas realizaciones o aspectos de la divulgación, el anticuerpo proporcionado contiene una CDR-L1 que tiene la secuencia de aminoácidos establecida en los SEQ ID NO: 23, 30, 36, 210, 211, 212, 213, 214, 215, 217, 216, 218, 219 o 220. En algunas realizaciones o aspectos de la divulgación, el anticuerpo proporcionado contiene una CDR-L1 contenida dentro de la CDR-L1 de la secuencia de aminoácidos de la región Vl establecida en los SEQ ID NO: 234, 235, 236, 237, 238, 239, 240, 241, 242, 243, 244, 245, 246, 247 o 248. En algunas realizaciones, el anticuerpo proporcionado contiene una CDR-L1 que tiene la secuencia de aminoácidos establecida en los SEQ ID NO: 23, 30 o 36. En algunas realizaciones, el anticuerpo proporcionado contiene una CDR-L1 contenida dentro de la CDR-L1 de la secuencia de aminoácidos de la región Vl establecida en los SEQ ID NO: 14, 16 o 18.
En algunos aspectos de la divulgación, la región Vl del anticuerpo anti-ROR1 es una que incluye una región determinante de complementariedad de la cadena ligera 2 (CDR-L2) que contiene la secuencia de aminoácidos de X1X2X3X4X5X6X7 (SEQ ID NO: 102), en donde Xi es D o R; X2 es A, T o N; X3 es S, T o N; X4 es Y, D o Q; X5 es L o R; X6 es E o P; y X7 es T o S.
En algunas realizaciones o aspectos de la divulgación, el anticuerpo proporcionado contiene una CDR-L2 que tiene la secuencia de aminoácidos establecida en los SEQ ID NO: 24, 31, 37, 221, 222, 223, 224, 225, 226, 227, 228, 229, 230 o 231. En algunas realizaciones o aspectos de la divulgación, el anticuerpo proporcionado contiene una CDR-L2 contenida dentro de la CDR-L2 de la secuencia de aminoácidos de la región Vl establecida en los SEQ ID NO: 234, 235, 236, 237, 238, 239, 240, 241, 242, 243, 244, 245, 246, 247 o 248. En algunas realizaciones, el anticuerpo proporcionado contiene una CDR-L2 que tiene la secuencia de aminoácidos establecida en los SEQ ID NO: 24, 31 o 37. En algunas realizaciones, el anticuerpo proporcionado contiene una CDR-L2 contenida dentro de la CDR-L2 de la secuencia de aminoácidos de la región Vl establecida en los SEQ ID NO: 14, 16 o 18.
En algunas realizaciones o aspectos de la divulgación, el anticuerpo proporcionado contiene una CDR-L1 que tiene la secuencia de aminoácidos establecida en los SEQ ID NO: 23, 30, 36, 210, 211, 212, 213, 214, 215, 216, 217, 218, 219 o 220; una CDR-L2 que tiene la secuencia de aminoácidos establecida en los SEQ ID NO: 24, 31, 37, 221, 222, 223, 224, 225, 226, 227, 228, 229, 230 o 231; y una CDR-L3 que tiene la secuencia de aminoácidos establecida en los SEQ ID NO: 25, 32, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 46, 47, 48, 49 o 233. En algunas realizaciones o aspectos de la divulgación, el anticuerpo proporcionado contiene una CDR-L1 que tiene la secuencia de aminoácidos establecida en los SEQ ID NO: 23, 30 o 36; una CDR-L2 que tiene la secuencia de aminoácidos establecida en los SEQ ID NO: 24, 31 o 37; y una CDR-L3 que tiene la secuencia de aminoácidos establecida en los SEQ ID NO: 25, 32, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 46, 47, 4849 o 233. En algunas realizaciones, el anticuerpo proporcionado contiene una CDR-L1 que tiene la secuencia de aminoácidos establecida en los SEQ ID NO: 23, 30 o 36; una CDR-L2 que tiene la secuencia de aminoácidos establecida en los SEQ ID NO: 24, 31 o 37; y una CDR-L3 que tiene la secuencia de aminoácidos establecida en los SEQ ID NO: 25, 32 o 38.
En algunas realizaciones, la CDR-L1, la CDR-L2 y la CDR-L3 contienen las secuencias de los SEQ ID NO: 23, 24 y 25, respectivamente; la CDR-L1, la CDR-L2 y la CDR-L3 contienen las secuencias de los SEQ ID NO: 30, 31 y 32, respectivamente; la CDR-L1, la CDR-L2 y la CDR-L3 que comprenden las secuencias de los SEQ ID NO: 36, 37 y 38, respectivamente; la CDR-L1, la CDR-L2 y la CDR-L3 contienen las secuencias de los SEQ ID NO: 216, 227 y 40, respectivamente; la CDR-L1, la CDR-L2 y la CDR-L3 contienen las secuencias de los SEQ ID NO: 218, 229 y 39, respectivamente; la CDR-L1, la CDR-L2 y la CDR-L3 contienen las secuencias de los SEQ ID NO: 219, 230 y 43, respectivamente; la CDR-L1, la CDR-L2 y la CDR-L3 contienen las secuencias de los SEQ ID NO: 220, 231 y 46, respectivamente; la CDR-L1, la CDR-L2 y la CDR-L3 contienen las secuencias de los SEQ ID NO: 212, 223 y 42, respectivamente; la CDR-L1, la CDR-L2 y la CDR-L3 contienen las secuencias de los SEQ ID NO: 215, 226 y 44, respectivamente; la CDR-L1, la CDR-L2 y la CDR-L3 contienen las secuencias de los SEQ ID NO: 217, 228 y 41;. En algunos aspectos de la divulgación, la CDR-L1, la CDR-L2 y la CDR-L3 contienen las secuencias de los SEQ ID NO: 210, 221 y 49, respectivamente; la CDR-L1, la CDR-L2 y la CDR-L3 contienen las secuencias de los SEQ ID NO: 210, 221 y 233, respectivamente; la CDR-L1, la CDR-L2 y la CDR-L3 contienen las secuencias de los SEQ ID NO: 211, 222 y 48, respectivamente; la CDR-L1, la CDR-L2 y la CDR-L3 contienen las secuencias de los SEQ ID NO: 214, 225 y 232, respectivamente; o la CDR-L1, la CDR-L2 y la CDR-L3 contienen las secuencias de los SEQ ID NO: 213, 224 y 47, respectivamente.
En algunas realizaciones o en algunos aspectos de la divulgación, el anticuerpo proporcionado contiene una CDR-L1, CDR-L2 y CDR-L3, respectivamente, contenidas dentro de la secuencia de aminoácidos de la región Vl establecida en los SEQ ID NO: 14, 16, 18, 234, 235, 236, 237, 238, 239, 240, 241,242, 243, 244, 245, 246, 247 o 248. En algunas realizaciones, el anticuerpo proporcionado contiene una CDR-L1, CDR-L2 y CDR-L3, respectivamente, contenidas dentro de la secuencia de aminoácidos de la región Vl establecida en los SEQ ID NO: 14, 16 o 18. En algunas realizaciones, el anticuerpo proporcionado contiene una CDR-L1, CDR-L2 y CDR-L3, respectivamente, contenidas dentro de la secuencia de aminoácidos de la región Vl establecida en los SEQ ID NO: 14 o 16.
En algunas realizaciones, la región Vl contiene cualquiera de las CDR-L1, CDR-L2 y CDR-L3 proporcionadas y contiene una región marco que contiene al menos el 90 %, el 91 %, el 92 %, el 93 %, el 94 %, el 95 %, el 96 %, el 97 %, el 98 %, el 99 % de identidad de secuencia con la región marco de la secuencia de aminoácidos establecida en
los SEQ ID NO: 14, 16, 18, 234, 235, 236, 237, 238, 239, 240, 241,242, 243, 244, 245, 246, 247 o 248. Por ejemplo, en algunas realizaciones o en algunos aspectos de la divulgación, el anticuerpo anti-ROR1 puede contener una c DR-L1, CDR-L2 y CDR-L3, respectivamente, contenidas dentro de la secuencia de aminoácidos de la región Vl establecida en los SEQ ID NO: 14, 16, 18, 234, 235, 236, 237, 238, 239, 240, 241,242, 243, 244, 245246, 247 o 248, y una región marco que contiene al menos el 90 %, el 91 %, el 92 %, el 93 %, el 94 %, el 95 %, el 96 %, el 97 %, el 98 %, el 99 % de identidad de secuencia con la región marco de la secuencia de aminoácidos establecida en los SEQ ID NO: 14, 16, 18, 234, 235, 236, 237, 238, 239, 240, 241,242, 243, 244, 245, 246, 247 o 248.
En algunas realizaciones, la región Vl contiene cualquiera de las CDR-L1, CDR-L2 y CDR-L3 proporcionadas y contiene una región marco que contiene al menos el 90 %, el 91 %, el 92 %, el 93 %, el 94 %, el 95 %, el 96 %, el 97 %, el 98 %, el 99 % de identidad de secuencia con la región marco de la secuencia de aminoácidos establecida en los SEQ ID NO: 14, 16 o 18. Por ejemplo, el anticuerpo anti-ROR1 puede contener una CDR-L1, CDR-L2 y CDR-L3, respectivamente, contenida dentro de la secuencia de aminoácidos de la región Vl establecida en los SEQ ID NO: 14, 16 o 18, y una región marco que contiene al menos el 90 %, el 91 %, el 92 %, el 93 %, el 94 %, el 95 %, el 96 %, el 97 %, el 98 %, el 99 % de identidad de secuencia con la región marco de la secuencia de aminoácidos establecida en los SEQ ID NO: 14, 16 o 18.
En algunas realizaciones o aspectos de la divulgación, el anticuerpo proporcionado contiene una región VL que tiene la secuencia de aminoácidos establecida en los SEQ ID NO: 14, 16, 18, 234, 235, 236, 237, 238, 239, 240, 241,242, 243, 244, 245246, 247 o 248. En algunas realizaciones, el anticuerpo proporcionado contiene una región VL que tiene la secuencia de aminoácidos establecida en los SEQ ID NO: 14, 16 o 18. En algunas realizaciones, el anticuerpo proporcionado contiene una región Vl que tiene la secuencia de aminoácidos establecida en los SEQ ID NO: 14 o 16.
También se proporcionan anticuerpos que tienen secuencias al menos en o aproximadamente al menos el 90 %, el 91 %, el 92 %, el 93 %, el 94 %, el 95 %, el 96 %, el 97 %, el 98 % o el 99 % idénticos a tales secuencias.
En algunas realizaciones o aspectos de la divulgación, la región Vh del anticuerpo o el fragmento comprende la secuencia de aminoácidos establecida en los SEQ ID NO: 8, 10, 13, 15, 17, 19, 175, 176, 177, 178, 179, 180, 181, 182, 183, 184, 185, 186, 187, 188, 189, 190, 191, 192, 193, 194, 195, 196, 197, 198, 199, 200, 201, 202, 203, 204, 205, 206, 207, 208 o 209 y la región VL del anticuerpo o el fragmento comprende la secuencia de aminoácidos establecida en los SEQ ID NO: 14, 16, 18, 234, 235, 236, 237, 238, 239, 240, 241,242, 243, 244, 245246, 247 o 248. En algunas realizaciones o aspectos de la divulgación, la región VH del anticuerpo o el fragmento comprende la secuencia de aminoácidos establecida en los SEQ ID NO: 8, 10, 13, 15, 17 o 19 y la región Vl del anticuerpo o el fragmento comprende la secuencia de aminoácidos establecida en los SEQ ID NO: 14, 16 o 18. En algunas realizaciones o aspectos de la divulgación, la región VH del anticuerpo o el fragmento comprende la secuencia de aminoácidos establecida en los SEQ ID NO: 10, 13, 15 o 19 y la región Vl del anticuerpo o el fragmento comprende la secuencia de aminoácidos establecida en los SEQ ID NO: 14, 16 o 18. En algunas realizaciones, la región Vh del anticuerpo o el fragmento comprende la secuencia de aminoácidos establecida en la SEQ ID NO: 13, 15 o 19 y la región Vl del anticuerpo o el fragmento comprende la secuencia de aminoácidos establecida en los SEQ ID NO: 14, 16 o 18. En algunas realizaciones, la región Vh del anticuerpo o el fragmento comprende la secuencia de aminoácidos establecida en los SEQ ID NO: 13 o 15 y la región Vl del anticuerpo o el fragmento comprende la secuencia de aminoácidos establecida en los SEQ ID NO: 14 o 16.
También se proporcionan anticuerpos que tienen secuencias al menos en o aproximadamente al menos el 90 %, el 91 %, el 92 %, el 93 %, el 94 %, el 95 %, el 96 %, el 97 %, el 98 % o el 99 % idénticos a tales secuencias.
En algunas realizaciones o aspectos de la divulgación, la región Vh del anticuerpo contiene la CDR-H1, CDR-H2 y CDR-H3, respectivamente contenidas dentro de la secuencia de aminoácidos de la región Vh establecida en los SEQ ID NO: 8, 10, 13, 15, 17,19, 175, 176, 177, 178, 179, 180, 181, 182, 183, 184, 185, 186, 187, 188, 189, 190, 191, 192, 193, 194, 195, 196, 197, 198, 199, 200, 201, 202, 203, 204, 205, 206, 207, 208 o 209; y contiene las secuencias de CDR-L1, CDR-L2 y CDR-L3 contenidas dentro de la secuencia de aminoácidos de la región variable de cadena ligera (VL) establecida en los SEQ ID NO: 14, 16, 18, 234, 235, 236, 237, 238, 239, 240, 241,242, 243, 244, 245, 246, 247 o 248. En algunas realizaciones o aspectos de la divulgación, la región Vh del anticuerpo contiene la CDR-H1, CDR-H2 y CDR-H3, respectivamente contenidas dentro de la secuencia de aminoácidos de la región VH establecida en los Se Q ID NO: 8, 10, 13, 15, 17 o 19; y contienen las secuencias de CDR-L1, CDR-L2 y CDR-L3 contenidas dentro de la secuencia de aminoácidos de la región variable de cadena ligera (VL) establecida en los SEQ ID NO: 14, 16 o 18. En algunas realizaciones o aspectos de la divulgación, la región Vh del anticuerpo contiene la CDR-H1, CDR-H2 y CDR-H3, respectivamente contenidas dentro de la secuencia de aminoácidos de la región VH establecida en los SEQ ID NO: 10, 13, 15, 17 o 19; y contienen las secuencias de CDR-L1, CDR-L2 y CDR-L3 contenidas dentro de la secuencia de aminoácidos de la región variable de cadena ligera (VL) establecida en los SEQ ID NO: 14, 16 o 18. En algunas realizaciones, la región Vh del anticuerpo contiene la CDR-H1, CDR-H2 y CDR-H3, respectivamente contenidas dentro de la secuencia de aminoácidos de la región Vh establecida en los SEQ ID NO: 13, 15 o 19; y contienen las secuencias de CDR-L1, CDR-L2 y CDR-L3 contenidas dentro de la secuencia de aminoácidos de la región variable de cadena ligera (VL) establecida en los SEQ ID NO: 14, 16 o 18. En algunas realizaciones, la región Vh del anticuerpo contiene la CDR-H1, CDR-H2 y CDR-H3, respectivamente contenidas dentro de la secuencia de aminoácidos de la región Vh establecida en los s Eq ID NO: 13 o 15; y contienen las secuencias de CDR-L1, CDR-L2
y CDR-L3 contenidas dentro de la secuencia de aminoácidos de la región variable de cadena ligera (VL) establecida en los SEQ ID NO: 14 o 16.
En algunas realizaciones, las regiones Vh y Vl del anticuerpo o del fragmento comprenden las secuencias de aminoácidos de los SEQ ID NO: 19 y 18, respectivamente; las regiones Vh y Vl del anticuerpo o del fragmento comprenden las secuencias de aminoácidos de los SEQ ID NO: 17 y 18, respectivamente; las regiones Vh y Vl del anticuerpo o del fragmento comprenden las secuencias de aminoácidos de los SEQ ID NO: 15 y 16 respectivamente; las regiones Vh y Vl del anticuerpo o del fragmento comprenden las secuencias de aminoácidos de los SEQ ID NO: 13 y 14, respectivamente; las regiones Vh y Vl del anticuerpo o del fragmento comprenden las secuencias de aminoácidos de los SEQ ID NO: 182 y 242 respectivamente; las regiones Vh y Vl del anticuerpo o del fragmento comprenden las secuencias de aminoácidos de los SEQ ID NO: 182 y 246, respectivamente; las regiones Vh y Vl del anticuerpo o del fragmento comprenden las secuencias de aminoácidos de los SEQ ID NO: 182 y 247, respectivamente; las regiones VH y VL del anticuerpo o del fragmento comprenden las secuencias de aminoácidos de los SEQ ID NO: 185 y 248, respectivamente; las regiones Vh y Vl del anticuerpo o del fragmento comprenden las secuencias de aminoácidos de los SEQ ID NO: 186 y 248, respectivamente; las regiones Vh y Vl del anticuerpo o del fragmento comprenden las secuencias de aminoácidos de los SEQ ID NO: 177 y 238, respectivamente; las regiones Vh y Vl del anticuerpo o del fragmento comprenden las secuencias de aminoácidos de los SEQ ID NO: 180 y 241, respectivamente; las regiones VH y VL del anticuerpo o del fragmento comprenden las secuencias de aminoácidos de los SEQ ID NO: 181 y 241, respectivamente; las regiones Vh y Vl del anticuerpo o del fragmento comprenden las secuencias de aminoácidos de los SEQ ID NO: 183 y 243 respectivamente; las regiones Vh y Vl del anticuerpo o del fragmento comprenden las secuencias de aminoácidos de los SEQ ID NO: 183 y 244 respectivamente; las regiones Vh y Vl del anticuerpo o del fragmento comprenden las secuencias de aminoácidos de los SEQ ID NO: 184 y 243, respectivamente; las regiones Vh y Vl del anticuerpo o del fragmento comprenden las secuencias de aminoácidos de los SEQ ID NO: 184 y 244 respectivamente; las regiones V h y Vl del anticuerpo o del fragmento comprenden las secuencias de aminoácidos de los SEQ ID NO: 183 y 245, respectivamente; las regiones Vh y Vl del anticuerpo o del fragmento comprenden las secuencias de aminoácidos de los SEQ ID NO: 184 y 245, respectivamente. En algunos aspectos de la divulgación, las regiones Vh y Vl del anticuerpo o del fragmento comprenden las secuencias de aminoácidos de los SEQ ID NO: 175 y 234, respectivamente; las regiones Vh y Vl del anticuerpo o del fragmento comprenden las secuencias de aminoácidos de los SEQ ID NO: 175 y 235, respectivamente; las regiones Vh y Vl del anticuerpo o del fragmento comprenden las secuencias de aminoácidos de los SEQ ID NO: 176 y 236, respectivamente; las regiones VH y VL del anticuerpo o del fragmento comprenden las secuencias de aminoácidos de los SEQ ID NO: 176 y 237, respectivamente; las regiones Vh y Vl del anticuerpo o del fragmento comprenden las secuencias de aminoácidos de los SEQ ID NO: 179 y 240 respectivamente; o las regiones Vh y Vl del anticuerpo o del fragmento comprenden las secuencias de aminoácidos de los SEQ ID NO: 178 y 239, respectivamente.
También se proporcionan o enseñan anticuerpos que tienen secuencias de al menos o aproximadamente el 90 %, el 91 %, el 92 %, el 93 %, el 94 %, el 95 %, el 96 %, el 97 %, el 98 % o el 99 % idénticos a tales secuencias.
En algunas realizaciones, el anticuerpo es un fragmento de anticuerpo de cadena simple, tal como un scFv o diacuerpo. En algunas realizaciones, el anticuerpo de cadena simple incluye uno o más enlazadores que se unen a dos dominios o regiones de anticuerpos, tales como una región de cadena pesada variable (VH) y una cadena ligera variable (Vl). El enlazador normalmente es un enlazador peptídico, por ejemplo, un enlazador peptídico flexible y/o soluble. Entre los enlazadores se encuentran los ricos en glicina y serina y/o en algunos casos treonina. En algunas realizaciones, los enlazadores incluyen además restos cargados tales como lisina y/o glutamato, que pueden mejorar la solubilidad. En algunas realizaciones, los enlazadores incluyen además una o más prolinas.
Por consiguiente, los anticuerpos anti-ROR1 proporcionados incluyen fragmentos de anticuerpos de cadena simple, tales como scFv y diacuerpos, en particular, fragmentos de cadena simple humana, que comprenden normalmente enlazadores que unen dos dominios o regiones de anticuerpos, tales como los dominios Vh y Vl. El enlazador normalmente es un enlazador peptídico, por ejemplo, un enlazador peptídico flexible y/o soluble, tal como una rica en glicina y serina.
En algunos aspectos, los enlazadores ricos en glicina y serina (y/o treonina) incluyen al menos el 80 %, el 85 %, el 90 %, el 91 %, el 92 %, el 93 %, el 94 %, el 95 %, el 96 %, el 97 %, el 98 % o el 99 % de tales aminoácidos. En algunas realizaciones, incluyen al menos en o alrededor del 50 %, el 55 %, el 60 %, el 70 % o el 75 %, glicina, serina y/o treonina. En algunas realizaciones, el enlazador está compuesto sustancialmente por completo de glicina, serina y/o treonina. Los enlazadores generalmente tienen entre aproximadamente 5 y aproximadamente 50 aminoácidos de longitud, normalmente entre o aproximadamente 10 y en o aproximadamente 30, por ejemplo, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21,22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29 o 30, y en algunos ejemplos entre 10 y 25 aminoácidos de longitud. Los enlazadores a modo de ejemplo incluyen enlazadores que tienen diversos números de repeticiones de la secuencia GGGGS (4GS; SEQ ID NO:111) o GGGS (3GS; Se Q ID NO: 112), tal como entre 2, 3, 4 y 5 repeticiones de dicha secuencia. Los enlazadores a modo de ejemplo incluyen aquellos que tienen o consisten en una secuencia establecida en la SEQ ID NO: 91 (GGGGSGGGGSGGGGS). Los enlazadores a modo de ejemplo incluyen además aquellos que tienen o consisten en la secuencia establecida en la SEQ ID NO: 113 (GSTSGSGKPGSGEGSTKG).
Por consiguiente, en algunas realizaciones, las realizaciones proporcionadas incluyen fragmentos de cadena simple,
por ejemplo, scFv, que comprenden uno o más de los enlazadores mencionados anteriormente, tales como enlazadores ricos en glicina/serina, incluidos enlazadores que tienen repeticiones de GGGS o GGGGS, tales como el enlazador establecido como la SEQ ID NO: 91.
En algunas realizaciones, el enlazador tiene una secuencia de aminoácidos que contiene la secuencia establecida en la SEQ ID NO: 91. El fragmento, por ejemplo, scFv, puede incluir una región Vh o parte de la misma, seguida del enlazador, seguida de una Vl o partes de la misma. El fragmento, por ejemplo, el scFv, puede incluir la Vl, seguida del enlazador, seguido por la VH
En algunas realizaciones o aspectos de la divulgación, el scFv tiene la secuencia de aminoácidos establecida en los SEQ ID NO: 2, 4, 6, 12, 249, 250, 251,252, 253, 254, 255, 256, 257, 258, 259, 260, 261,262, 263, 264, 265, 266, 267 o 268, o tiene una secuencia de al menos el 90 % o aproximadamente, el 91 %, el 92 %, el 93 %, el 94 %, el 95 %, el 96 %, el 97 %, el 98 % o el 99 % idéntica a la secuencia de aminoácidos establecida en los SEQ ID NO: 2, 4, 6, 12, 249, 250, 251, 252, 253, 254, 255, 256, 257, 258, 259, 260, 261, 262, 263, 264, 265, 266, 267 o 268. En algunos aspectos, el scFv tiene la secuencia de aminoácidos establecida en los SEQ ID NO: 2, 4, 6 o 12, o tiene una secuencia de al menos o aproximadamente el 90 %, el 91 %, el 92 %, el 93 %, el 94 %, el 95 %, el 96 %, el 97 %, el 98 % o el 99 % idéntica a la secuencia de aminoácidos establecida en los SEQ ID NO: 2, 4, 6 o 12. En algunos aspectos, el scFv tiene la secuencia de aminoácidos establecida en los SEQ ID NO: 4 o 6, o tiene una secuencia al menos en o aproximadamente el 90 %, el 91 %, el 92 %, el 93 %, el 94 %, el 95 %, el 96 %, el 97 %, el 98 % o el 99 % idéntica a la secuencia de aminoácidos establecida en los SEQ ID NO: 4 o 6.
En algunas realizaciones o aspectos de la divulgación, el scFv contiene la VH, el enlazador y la VL tal como se establece en los SEQ ID NO: 2, 4, 6, 12, 249, 250, 251,252, 253, 254, 255, 256, 257, 258, 259, 260, 261,262, 263, 264, 265, 266, 267 o 268, o una secuencia de al menos el 90 % o aproximadamente, el 91 %, el 92 %, el 93 %, el 94 %, el 95 %, el 96 %, el 97 %, el 98 % o el 99 % idéntica a tal secuencia, pero en la que VH y VL están configuradas en la orientación opuesta, es decir, VL-VH, en comparación con dicha secuencia. En algunos aspectos, el scFv tiene la secuencia de aminoácidos establecida en los SEQ ID NO: 2, 4, 6 o 12, o tiene una secuencia de al menos o aproximadamente el 90 %, el 91 %, el 92 %, el 93 %, el 94 %, el 95 %, el 96 %, el 97 %, el 98 % o el 99 % idéntica a la secuencia de aminoácidos establecida en los SEQ ID NO: 2, 4, 6 o 12, pero en la que VH y VL están configuradas en la orientación opuesta, es decir, VL-VH, en comparación con dicha secuencia. En algunas realizaciones, el scFv tiene la secuencia de aminoácidos establecida en la SEQ ID NO: 12, pero en la que VH y VL están configuradas en la orientación opuesta, es decir, VL-VH, en comparación con dicha secuencia. En algunas realizaciones, el scFv tiene la secuencia de aminoácidos establecida en la SEQ ID NO: 6, pero en la que VH y VL están configuradas en la orientación opuesta, es decir, VL-VH, en comparación con dicha secuencia.
También se proporcionan anticuerpos humanos anti-ROR1, por ejemplo, fragmentos de anticuerpos de unión a antígeno que se unen específicamente al mismo epítopo o al epítopo superpuesto de una proteína ROR1, tal como una proteína ROR1 humana, tal como el epítopo unido específicamente por un anticuerpo de referencia. Dicho anticuerpo puede ser cualquiera de los anticuerpos proporcionados.
También se proporcionan anticuerpos humanos anti-ROR1, por ejemplo, los fragmentos de anticuerpo de unión a antígeno, que se unen específicamente a una proteína ROR1 humana y compiten por la unión a la proteína ROR1 con un anticuerpo de referencia que es el anticuerpo anti-ROR1 designado R12 o un fragmento de unión a antígeno del mismo.
En algunas de tales realizaciones o aspectos de la divulgación, el anticuerpo de referencia puede ser un scFv que comprende la secuencia de aminoácidos establecida en la SEQ ID NO: 2, 4, 6, 12, 249, 250, 251,252, 253, 254, 255, 256, 257, 258, 259, 260, 261, 262, 263, 264, 265, 266, 267 o 268, o que tiene una secuencia de al menos o aproximadamente el 90 %, el 91 %, el 92 %, el 93 %, el 94 %, el 95 %, el 96 %, el 97 %, el 98 % o el 99 % idéntica a la secuencia de aminoácidos establecida en los SEQ ID NO: 2, 4, 6, 12, 249, 250, 251, 252, 253, 254, 255, 256, 257, 258, 259, 260, 261,262, 263, 264, 265, 266, 267 o 268. En algunas de tales realizaciones o aspectos de la divulgación, el anticuerpo de referencia puede ser un scFv que comprende la secuencia de aminoácidos establecida en los SEQ ID NO: 2, 4, 6 o 12, o que tiene una secuencia de al menos o aproximadamente el 90 %, el 91 %, el 92 %, el 93 %, el 94 %, el 95 %, el 96 %, el 97 %, el 98 % o el 99 % idéntica a la secuencia de aminoácidos establecida en los SEQ ID NO: 2, 4, 6 o 12. En algunas realizaciones o aspectos de la divulgación, el anticuerpo de referencia puede ser un anticuerpo que contiene la Vh y Vl de un scFv que comprende la secuencia de aminoácidos establecida en los SEQ ID NO: 2, 4, 6, 12, 249, 250, 251, 252, 253, 254, 255, 256, 257, 258, 259, 260, 261, 262, 263, 264, 265, 266, 267 o 268, tal como se establece en los SEQ ID NO: 2, 4, 6 o 12.
En algunas realizaciones o aspectos de la divulgación de un anticuerpo anti-ROR1 humano proporcionado, el anticuerpo humano contiene una región Vh que contiene una porción que tiene al menos el 95 %, el 96 %, el 97 %, el 98 %, el 99 % o el 100 % de identidad de secuencia con una secuencia de aminoácidos codificada por un segmento V de cadena pesada humana de nucleótidos de la línea germinal, una porción con al menos el 95 %, el 96 %, el 97 %, el 98 %, el 99 % o el 100 % de identidad con una secuencia de aminoácidos codificada por un segmento D de cadena pesada humana de nucleótidos de la línea germinal, y/o una porción que tiene al menos el 95 %, el 96 %, el 97 %, el 98 %, el 99 % o el 100 % de identidad con una secuencia de aminoácidos codificada por un segmento J de cadena
pesada humana de nucleótidos de la línea germinal; y/o contiene una región Vl que contiene una porción con al menos el 95 %, el 96 %, el 97 %, el 98 %, el 99 % o el 100 % de identidad con una secuencia de aminoácidos codificada por un segmento V de cadena kappa o lambda de nucleótidos de la línea germinal, y/o una porción con al menos el 95 %, el 96 %, el 97 %, el 98 %, el 99 % o el 100 % de identidad con una secuencia de aminoácidos codificada por un segmento J de cadena kappa o lambda de nucleótidos de la línea germinal humana. En algunas realizaciones o aspectos de la divulgación, la porción de la región Vh se corresponde con la CDR-H1, CDR-H2 y/o CDR-H3. En algunas realizaciones o aspectos de la divulgación, la porción de la región Vh se corresponde con la región marco 1 (FR1), FR2, FR2 y/o FR4. En algunas realizaciones o aspectos de la divulgación, la porción de la región Vl se corresponde con la CDR-L1, CDR-L2 y/o CDR-L3. En algunas realizaciones o aspectos de la divulgación, la porción de la región Vl se corresponde con la FR1, FR2, FR2 y/o FR4.
En algunas realizaciones o aspectos de la divulgación, el anticuerpo humano contiene una CDR-H1 que tiene al menos el 95 %, el 96 %, el 97 %, el 98 %, el 99 % o el 100 % de identidad de secuencia con una secuencia de aminoácidos de la correspondiente región CDR-H1 dentro de una secuencia codificada por un segmento V de cadena pesada humana de nucleótidos de la línea germinal. Por ejemplo, el anticuerpo humano en algunas realizaciones o aspectos contiene una CDR-H1 que tiene una secuencia que es 100 % idéntica o con no más de una, dos o tres diferencias de aminoácidos en comparación con la correspondiente región CDR-H1 dentro de una secuencia codificada por un segmento V de cadena pesada humana de nucleótidos de la línea germinal.
En algunas realizaciones o aspectos de la divulgación, el anticuerpo humano contiene una CDR-H2 que tiene al menos el 95 %, el 96 %, el 97 %, el 98 %, el 99 % o el 100 % de identidad de secuencia con una secuencia de aminoácidos de la correspondiente región CDR-H2 dentro de una secuencia codificada por un segmento V de cadena pesada humana de nucleótidos de la línea germinal. Por ejemplo, el anticuerpo humano en algunas realizaciones o aspectos contiene una CDR-H2 que tiene una secuencia que es 100 % idéntica o con no más de una, dos o tres diferencias de aminoácidos en comparación con la correspondiente región CDR-H2 dentro de una secuencia codificada por un segmento V de cadena pesada humana de nucleótidos de la línea germinal.
En algunas realizaciones o aspectos de la divulgación, el anticuerpo humano contiene una CDR-H3 que tiene al menos el 95 %, el 96 %, el 97 %, el 98 %, el 99 % o el 100 % de identidad de secuencia con una secuencia de aminoácidos de la correspondiente región CDR-H3 dentro de una secuencia codificada por un segmento V, un segmento D y un segmento J de cadena pesada humana de nucleótidos de la línea germinal. Por ejemplo, el anticuerpo humano en algunas realizaciones o aspectos contiene una CDR-H3 que tiene una secuencia que es 100 % idéntica o con no más de una, dos o tres diferencias de aminoácidos en comparación con la correspondiente región CDR-H3 dentro de una secuencia codificada por un segmento V, un segmento D y un segmento J de cadena pesada humana de nucleótidos de la línea germinal.
En algunas realizaciones o aspectos de la divulgación, el anticuerpo humano contiene una CDR-L1 que tiene al menos el 95 %, el 96 %, el 97 %, el 98 %, el 99 % o el 100 % de identidad de secuencia con una secuencia de aminoácidos de la correspondiente región CDR-L1 dentro de una secuencia codificada por un segmento V de cadena ligera humana de nucleótidos de la línea germinal. Por ejemplo, el anticuerpo humano en algunas realizaciones o aspectos contiene una CDR-L1 que tiene una secuencia que es 100 % idéntica o con no más de una, dos o tres diferencias de aminoácidos en comparación con la correspondiente región CDR-L1 dentro de una secuencia codificada por un segmento V de cadena ligera humana de nucleótidos de la línea germinal.
En algunas realizaciones o aspectos de la divulgación, el anticuerpo humano contiene una CDR-L2 que tiene al menos el 95 %, el 96 %, el 97 %, el 98 %, el 99 % o el 100 % de identidad de secuencia con una secuencia de aminoácidos de la correspondiente región CDR-L2 dentro de una secuencia codificada por un segmento V de cadena ligera humana de nucleótidos de la línea germinal. Por ejemplo, el anticuerpo humano en algunas realizaciones o aspectos contiene una CDR-L2 que tiene una secuencia que es 100 % idéntica o con no más de una, dos o tres diferencias de aminoácidos en comparación con la correspondiente región CDR-L2 dentro de una secuencia codificada por un segmento V de cadena ligera humana de nucleótidos de la línea germinal.
En algunas realizaciones o aspectos de la divulgación, el anticuerpo humano contiene una CDR-L3 que tiene al menos el 95 %, el 96 %, el 97 %, el 98 %, el 99 % o el 100 % de identidad de secuencia con una secuencia de aminoácidos de la correspondiente región CDR-L3 dentro de una secuencia codificada por un segmento V y un segmento J de cadena ligera humana de nucleótidos de la línea germinal. Por ejemplo, el anticuerpo humano en algunas realizaciones o aspectos contiene una CDR-L3 que tiene una secuencia que es 100 % idéntica o con no más de una, dos o tres diferencias de aminoácidos en comparación con la correspondiente región CDR-L3 dentro de una secuencia codificada por un segmento V y un segmento J de cadena ligera humana de nucleótidos de la línea germinal.
En algunas realizaciones o aspectos de la divulgación, el anticuerpo humano contiene una región marco que contiene secuencias de segmentos de genes de la línea germinal humana. Por ejemplo, en algunas realizaciones o aspectos, el anticuerpo humano contiene una región Vh en la que la región marco, por ejemplo, FR1, FR2, FR3 y FR4, tiene al menos el 95 %, el 96 %, el 97 %, el 98 %, el 99 % o el 100 % de identidad de secuencia con una región marco codificada por un segmento de anticuerpo de la línea germinal humana, tal como un segmento V y/o J. En algunas realizaciones o aspectos de la divulgación, el anticuerpo humano contiene una región VL en la que la región marco,
por ejemplo, FR1, FR2, FR3 y FR4, tiene al menos el 95 %, el 96 %, el 97 %, el 98 %, el 99 % o el 100 % de identidad de secuencia con una región marco codificada por un segmento de anticuerpo de la línea germinal humana, tal como un segmento V. Por ejemplo, en algunas de tales realizaciones o aspectos, la secuencia marco de la secuencia de Vh y/o Vl difiere en no más de 10 aminoácidos, tal como no más de 9, 8, 7, 6, 5, 4, 3, 2 o 1 aminoácidos, en comparación con la región marco codificada por un segmento de anticuerpo de la línea germinal humana.
El anticuerpo, por ejemplo, el fragmento de anticuerpo, puede contener al menos una parte de una región constante de inmunoglobulina, tal como uno o más dominios de región constante. En algunas realizaciones, las regiones constantes incluyen una región constante de cadena ligera y/o una región constante de cadena pesada 1 (CH1). En algunas realizaciones, el anticuerpo incluye un dominio CH2 y/o CH3, tal como una región Fc. En algunas realizaciones, la región Fc es una región Fc de una IgG humana, tal como una IgG1 o IgG4.
También se proporcionan ácidos nucleicos que codifican los anticuerpos y/o porciones, por ejemplo, cadenas, del mismo. Entre los ácidos nucleicos proporcionados se encuentran los que codifican los anticuerpos anti-ROR descritos en el presente documento. Los ácidos nucleicos pueden incluir los que abarcan nucleótidos y bases naturales y/o no naturales, por ejemplo, incluidos aquellos con modificaciones en la estructura principal. Las expresiones "molécula de ácido nucleico", "ácido nucleico" y "polinucleótido" se pueden usar indistintamente y se refieren a un polímero de nucleótidos. Tales polímeros de nucleótidos pueden contener nucleótidos naturales y/o no naturales, e incluyen, pero sin limitación, ADN, ARN y APN. "Secuencia de ácido nucleico" se refiere a la secuencia lineal de nucleótidos que comprende la molécula de ácido nucleico o polinucleótido.
También se enseñan los vectores que contienen los ácidos nucleicos, las células hospedadoras que contienen los vectores, por ejemplo, para producir los anticuerpos. También se enseñan métodos para producir los anticuerpos. El ácido nucleico puede codificar una secuencia de aminoácidos que comprende la Vl y/o una secuencia de aminoácidos que comprende la Vh del anticuerpo (por ejemplo, las cadenas ligeras y/o pesadas del anticuerpo). Se desvelan uno o más vectores (por ejemplo, vectores de expresión) que comprenden dicho ácido nucleico. Se proporciona una célula hospedadora que comprende dicho ácido nucleico. Una célula hospedadora puede comprender (por ejemplo, se puede transformar con): un vector que comprende un ácido nucleico que codifica una secuencia de aminoácidos que comprende la Vh del anticuerpo. Una célula hospedadora puede comprender (por ejemplo, se puede transformar con): (1) un vector que comprende un ácido nucleico que codifica una secuencia de aminoácidos que comprende la Vl del anticuerpo y una secuencia de aminoácidos que comprende la Vh del anticuerpo o (2) un primer vector que comprende un ácido nucleico que codifica una secuencia de aminoácidos que comprende la Vl del anticuerpo y un segundo vector que comprende un ácido nucleico que codifica una secuencia de aminoácidos que comprende la Vh del anticuerpo.
También se desvelan métodos para preparar los anticuerpos anti-ROR1 (incluidos los fragmentos de unión a antígeno). Para la producción recombinante del anticuerpo anti-ROR1, el ácido nucleico que codifica un anticuerpo, por ejemplo, como se ha descrito anteriormente, se puede aislar e insertar en uno o más vectores para la clonación y/o expresión adicional en una célula hospedadora. Dicho ácido nucleico puede aislarse y secuenciarse fácilmente usando procedimientos convencionales (por ejemplo, usando sondas de oligonucleótidos que son capaces de unirse específicamente a genes que codifican las cadenas pesadas y ligeras del anticuerpo). En algunos aspectos de la divulgación, se enseña un método para fabricar el anticuerpo anti-ROR1, en donde el método comprende cultivar una célula hospedadora que comprende un ácido nucleico que codifica el anticuerpo, según lo dispuesto anteriormente, en condiciones adecuadas para la expresión del anticuerpo y opcionalmente, recuperar el anticuerpo de la célula hospedadora (o del medio de cultivo de la célula hospedadora).
Además de procariotas, los microbios eucariotas, tales como hongos filamentosos o levaduras, son hospedadores de clonación o expresión adecuados para vectores que codifican anticuerpos, incluyendo cepas de hongos y levaduras cuyas vías de glicosilación se han modificado para imitar o aproximarse a las de las células humanas, lo que da como resultado la producción de un anticuerpo con un patrón de glucosilación parcial o completamente humano. Véase Gerngross, Nat. Biotech. 22:1409-1414 (2004), y Li et al., Nat. Biotech. 24:210-215 (2006).
Las células eucariotas a modo de ejemplo que se pueden usar para expresar polipéptidos incluyen, pero sin limitación, células COS, incluyendo células COS 7; células 293, incluyendo células 293-6E; células CHO, incluyendo CHO-S, células CHO DG44. Lec13 y células FUT8 CHO; células PER.C6®; y células NSO. Las cadenas pesadas y/o cadenas ligeras del anticuerpo se pueden expresar en levadura. Véase, por ejemplo, la Publicación de EE.Uu . N.° US 2006/0270045 A1. Se puede seleccionar una célula hospedadora eucariota particular en función de su capacidad para realizar modificaciones postraduccionales deseadas en las cadenas pesadas y/o cadenas ligeras. Por ejemplo, las células CHO producen polipéptidos que tienen un mayor nivel de sialilación que el mismo polipéptido producido en células 293.
El anticuerpo se puede producir en un sistema sin células. Se describen ejemplos de sistemas libres de células, por ejemplo, en Sitaraman et al., Methods Mol. Biol. 498: 229-44 (2009); Spirin, Trends Biotechnol. 22 : 538-45 (2004); Endo et al., Biotechnol. Adv. 21: 695-713 (2003).
Algunos aspectos de la divulgación incluyen además vectores y células hospedadoras y otros sistemas de expresión para expresar y producir los anticuerpos y otras proteínas de unión, incluyendo células hospedadoras eucariotas y
procariotas, incluyendo bacterias, hongos filamentosos y levaduras, así como células de mamíferos tales como células humanas, así como sistemas de expresión libres de células.
Características a modo de ejemplo
En algunos aspectos, los anticuerpos proporcionados tienen una o más características funcionales especificadas, tales como propiedades de unión, incluida la unión a epítopos particulares, tal como epítopos que son similares o se superponen con aquellos específicamente unidos por otros anticuerpos tales como anticuerpos de referencia, la capacidad de competir por la unión con otros anticuerpos tales como anticuerpos de referencia y/o afinidades de unión particulares.
En algunas realizaciones, los anticuerpos se unen específicamente a la proteína ROR1. En algunas realizaciones, la ROR1 se refiere a la ROR1 humana. La observación de que un anticuerpo u otra molécula de unión se une a ROR1 o se une específicamente a ROR1 no significa necesariamente que se una a ROR1 de todas las especies. Por ejemplo, en algunas realizaciones, características de la unión a ROR1, tales como la capacidad de unirse específicamente a la misma y/o competir por la unión a la misma con un anticuerpo de referencia, y/o unirse con una afinidad particular o competir en un grado particular, en algunas realizaciones, se refiere a la capacidad con respecto a una proteína ROR1 humana y el anticuerpo puede no tener esta característica con respecto a un ROR1 de otra especie tal como el ratón. En algunas realizaciones, el anticuerpo se une a la ROR1 humana y se une a la ROR1 de otra especie, tal como ratón.
En algunas realizaciones, los anticuerpos se unen específicamente a ROR1 humana, tal como a un epítopo o región de ROR1 humana, tal como la ROR1 humana establecida en la SEQ ID NO: 103 (N.° de GenBank NP_0050032, tal como codificado por nucleótidos establecidos en el N.° de GenBank NM_005012.3), o una variante alélica o variante de corte y empalme de la misma. En una realización, la ROR1 humana es una variante de transcripción o isoforma que tiene la secuencia de aminoácidos establecida en la SEQ ID NO: 104 o la SEQ ID NO: 105.
En algunas realizaciones, el anticuerpo se une a ROR1 no humana, tal como la ROR1 de mono, conejo, rata, ratón u otras especies. En algunas realizaciones, el anticuerpo se une a la ROR1 de ratón, tal como a un epítopo o región de ROR1 de ratón, tal como la ROR1 de ratón establecida en la SEQ ID NO: 106 (N.° de GenBank NP_038873, tal como la codificada por nucleótidos establecida en el N.° de GenBank NM_013845). En algunas realizaciones, el anticuerpo se une a la ROR1 humana y se une a la ROR1 de ratón. En algunas realizaciones, el grado de unión de un anticuerpo anti-ROR1 a una ROR1 no humana, tal como la ROR1 de ratón, es al menos o aproximadamente al menos el 75 %, el 80 %, el 90 %, el 95 %, el 100 %, el 110 %, el 120 %, el 130 %, el 140 %, el 150 % o más de la unión del anticuerpo a ROR1.
En algunas realizaciones, los anticuerpos no se unen a ROR1 de ratón, tal como la ROR1 de ratón establecida en la SEQ ID NO: 106 (N.° de GenBank NP_038873, tal como codificada por nucleótidos establecida en el N.° de GenBank NM_013845).
En una realización, el alcance de la unión de un anticuerpo anti-ROR1 a una proteína no relacionada, proteína que no es ROR1 o una ROR1 no humana u otra proteína que no es ROR1, es menor de o aproximadamente el 10 % de la unión del anticuerpo a la ROR1 humana medida, por ejemplo, mediante un radioinmunoensayo (RIA). En algunas realizaciones, entre los anticuerpos proporcionados están los anticuerpos en los que la unión a ROR1 de ratón es menor o igual o aproximadamente el 10 % de la unión del anticuerpo a ROR1 humana. En algunas realizaciones, entre los anticuerpos proporcionados están los anticuerpos en los que se unen a una ROR2, tal como una ROR2 humana, es menor o igual o aproximadamente el 10 % de la unión del anticuerpo a ROR1 humana.
En algunas realizaciones, los anticuerpos proporcionados son capaces de unirse a ROR1, tal como ROR1 humana y/o ROR1 de ratón, con al menos cierta afinidad, medido por cualquiera de una serie de métodos conocidos. En algunas realizaciones, la afinidad está representada por una constante de disociación (Kd). En algunas realizaciones, la afinidad está representada por la CE50.
En algunas realizaciones, la afinidad de unión (CE50) y/o la constante de disociación del anticuerpo a ROR1, tal como ROR1 humana o ROR1 de ratón, es de aproximadamente 0,1 nM a 500 nM, 0,1 nM a 100 nM, 0,1 nM a 50 nM, 0,1 nM a 10 nM, 0,1 nM a 1 nM, 1 nM a 500 nM, 1 nM a 100 nM, 1 nM a 50 nM, 1 nM a 10 nM, 10 nM a 500 nM, 10 nM a 100 nM, 10 nM a 50 nM, 50 nM a 500 nM, 50 nM a 100 nM o 100 nM a 500 nM. En ciertas realizaciones, la afinidad de unión (CE50) y/o la constante de disociación del anticuerpo a ROR1, tal como ROR1 humana o ROR1 de ratón, es igual o inferior a 100 nM o aproximadamente, 50 nM, 40 nM, 30 nM, 25 nM, 20 nM, 19 nM, 18 nM, 17 nM, 16 nM, 15 nM, 14 nM, 13 nM, 12 nM, 11 nM, 10 nM, 9 nM, 8 nM, 7 nM, 6 nM, 5 nM, 4 nM, 3 nM, 2 nM o 1 nM. En algunas realizaciones, los anticuerpos se unen a ROR1, tal como ROR1 humana o ROR1 de ratón, con una afinidad de unión sub-nanomolar, por ejemplo, con una afinidad de unión inferior a 1 nM, tal como menos de 0,9 nM, 0,8 nM, 0,7 nM, 0,6 nM, 0,5 nM, 0,4 nM, 0,3 nM, 0,2 nM o 0,1 nM.
En algunas realizaciones, los anticuerpos, tales como los anticuerpos humanos, se unen específicamente a un epítopo o región particular de ROR1, tal como generalmente un epítopo o región extracelular. ROR1 es una proteína de membrana de tipo I que contiene una región extracelular que contiene un dominio de inmunoglobulina (Ig), un dominio
frizzled (Fz) y un dominio kringle (Kr) seguido de un dominio transmembrana. Con referencia a la ROR1 humana establecida en la SEQ ID NO: 103, la región extracelular se corresponde con los aminoácidos 1-377, en donde los aminoácidos 13-118 se corresponden con el dominio Ig, los aminoácidos 136-270 se corresponden con el dominio Fz y los aminoácidos 283-362 se corresponden con el dominio Kr. En algunas realizaciones, los anticuerpos, tales como anticuerpos humanos, se unen a un epítopo que comprende restos dentro del dominio Ig, el dominio Fz y/o el dominio Kr. En algunas realizaciones, los anticuerpos, tales como anticuerpos humanos, se unen a un epítopo que comprende restos con el dominio Ig y/o el dominio Fz. En algunas realizaciones, los anticuerpos, tales como anticuerpos humanos, se unen a un epítopo que comprende restos dentro de los dominios Ig y Fz.
De acuerdo con la invención, algunas de las propiedades o características de los anticuerpos proporcionados se describen en relación con las propiedades observadas para otro anticuerpo, por ejemplo, un anticuerpo de referencia. El anticuerpo de referencia es el anticuerpo IgG1 de conejo/humano quimérico designado R12 (véase, por ejemplo, Yang et al. (2011) PloS ONE, 6:e21018; la solicitud de patente de EE.UU. N.° US 2013/0251642), y/o un fragmento obtenido del mismo tal como un fragmento scFv del mismo. Se ha demostrado que un receptor de antígeno quimérico (CAR) que contiene un fragmento scFv de unión a antígeno de R12 promueve eficazmente la reactividad antitumoral en una terapia CAR (Hudecek et al. (2013) Clin. Cancer Res., 19:3153; solicitud PCT publicada internacionalmente. N.° WO2014031687).
Por ejemplo, en algunas realizaciones, el anticuerpo de referencia tiene una región Vh que contiene la secuencia establecida en la SEQ ID NO: 85, o comprende la CDR1, la CDR2 y/o la CDR3 dentro de dicha secuencia, y/o tiene una Vl que contiene la secuencia establecida en la SEQ ID NO: 86, o comprende la CDR1, la CDR2 y/o la CDR3 dentro de dicha secuencia. Por ejemplo, el anticuerpo de referencia puede ser un anticuerpo que contiene una secuencia CDR-H1 de AYYMS (SEQ ID NO:87), una secuencia CDR-H2 de TIYPSSGKTYYATWVNG (establecida en la SEQ ID NO:88), una secuencia CDR-H3 de DSYADDGALFN (SEQ ID NO:72), una secuencia CDR-L1 de TLSSAHKTDTID (SEQ ID NO:89), una secuencia CDR-L2 de GSYTKRP (SEQ ID NO:90) y/o una secuencia CDR-L3 de GADYIGGYV (SEQ ID NO:73). En algunas realizaciones, el anticuerpo de referencia es un scFv que comprende la secuencia de aminoácidos establecida en la SEQ ID NO:84.
En algunos aspectos de la divulgación, el anticuerpo de referencia es el anticuerpo de ratón anti-ROR1 humano designado 2A2, y/o un fragmento obtenido del mismo, tal como un fragmento scFv del mismo, y/o un anticuerpo que contiene las secuencias de Vh y Vl de tal anticuerpo y/o las CDR de cadena pesada y ligera de tal anticuerpo (véase, por ejemplo, Baskar et al. (2012) I, 4:349-361; Solicitud de Patente de EE.UU. publicada. N.° US2012/20058051).
Por ejemplo, en algunos aspectos de la divulgación, el anticuerpo de referencia tiene una región Vh que contiene la secuencia establecida en la SEQ ID NO: 114, o comprende la CDR1, la CDR2 y/o la CDR3 dentro de dicha secuencia, y/o tiene una Vl que contiene la secuencia establecida en la SEQ ID NO: 115, o comprende la CDR1, la CDR2 y/o la CDR3 dentro de dicha secuencia. Por ejemplo, el anticuerpo de referencia puede ser un anticuerpo que contiene una secuencia CDR-H1 de DYEMH (SEQ ID NO:116), una secuencia CDR-H2 de AIDPETGGTAYNQKFKG (establecida en la SEQ ID NO:117), una secuencia CDR-H3 de YYDYDSFTY (SEQ ID NO:118), una secuencia CDR-L1 de KASQNVDAAVA (SEQ ID NO:119), una secuencia CDR-L2 de SASNRYT (SEQ ID NO:120) y/o una secuencia CDR-L3 de QQYDIYPYT (SEQ ID NO:121). En algunos aspectos de la divulgación, el anticuerpo de referencia es una forma scFv del anticuerpo 2A2.
En algunos aspectos de la divulgación, el anticuerpo de referencia es un anticuerpo anti-ROR1 humano o humanizado. Se describen anticuerpos anti-ROR1 humanizados a modo de ejemplo en la Sol. Internacional PCT N.° WO2014/031174. En algunos aspectos de la divulgación, el anticuerpo de referencia es una variante humanizada de un anticuerpo designado 99961. En algunos aspectos de la divulgación, el anticuerpo de referencia tiene una región Vh que contiene la secuencia establecida en los SEQ ID NO: 122, 123, 124 o 125, o comprende la CDR1, la CDR2 y/o la CDR3 dentro de dicha secuencia, y/o tiene una Vl que contiene la secuencia establecida en los SEQ ID NO: 126, 127, 128 o 129 o comprende la CDR1, la CDR2 y/o la CDR3 dentro de dicha secuencia. En algunos aspectos de la divulgación, el anticuerpo de referencia puede ser un anticuerpo que contiene una secuencia CDR-H1 establecida en los SEQ ID NO: 130 o 133, una secuencia de CDR-H2 establecida en los SEQ ID NO:131 o 134, una secuencia de CDR-H3 establecida en los SEQ ID NO:132 o 135, una secuencia de CDR-L1 establecida en los SEQ ID NO:136 o 139, una secuencia de CDR-L2 establecida en los SEQ ID NO:137 o 140 y/o una secuencia de CDR-L3 establecida en los SEQ ID NO: 138 o 141.
En algunos aspectos de la divulgación, el anticuerpo proporcionado contiene CDR de cadena pesada y ligera que son distintas de las CDR presentes en el anticuerpo o anticuerpos de referencia. En algunos aspectos de la divulgación, el anticuerpo proporcionado contiene CDR de cadena pesada y ligera que son distintas de las CDR presentes en el anticuerpo designado R12, tal como las presente en la región Vh establecida en la SEQ ID NO: 85 y/o la región Vl establecida en la SEQ ID NO: 86. En algunos aspectos de la divulgación, el anticuerpo proporcionado contiene CDR de cadena pesada y ligera que son distintas de las CDR presentes en el anticuerpo designado 2A2, tal como las presente en la región Vh establecida en la SEQ ID NO: 104 y/o la región Vl establecida en la SEQ ID NO: 105. En algunos aspectos de la divulgación, el anticuerpo proporcionado contiene las CDR de cadena pesada y ligera que son distintas de las CDR presentes en una variante humanizada del anticuerpo designado 99961, tales como las presentes en la región Vh establecida en los SEQ ID NO: 122, 123, 124 o 125 y/o la región Vl establecida en los SEQ ID NO:
126, 127, 128 o 129.
Entre los anticuerpos proporcionados están aquellos que compiten por unirse y/o se unen a los mismos epítopos de ROR1 o superpuestos que los unidos por el anticuerpo de referencia R12, pero, no obstante, contienen Cd R distintas, por ejemplo, distintas CDR1, CDR2 y CDR3 de cadena ligera y/o pesada.
En algunas realizaciones, el anticuerpo de referencia tiene una secuencia presente en un anticuerpo o parte del mismo tal como se describe en el presente documento, tal como cualquiera de los ejemplos de anticuerpos proporcionados. Por ejemplo, en algunas realizaciones o aspectos de la divulgación, el anticuerpo de referencia contiene una CDR-H1 que comprende la secuencia de aminoácidos establecida en los SEQ ID NO: 20, 27 o 33; una CDR-H2 que comprende la secuencia de aminoácidos establecida en los SEQ ID NO: 21,26, 28 o 34; una CDR-H3 que comprende la secuencia de aminoácidos establecida en los SEQ ID NO: 22, 29, 35, 46, 50, 51, 52, 53, 54, 55, 56, 57, 58, 59, 60, 61, 62, 63, 64, 65, 66, 67, 68, 69, 70, 71 o 174; una CDR-L1 que comprende la secuencia de aminoácidos establecida en los SEQ ID NO: 23, 30 o 36; una CDR-L2 que comprende la secuencia de aminoácidos establecida en los SEQ ID NO: 24, 31 o 37; y/o una CDR-L3 que comprende la secuencia de aminoácidos establecida en los SEQ ID NO: 25, 32, 38, 39, 40, 41,42, 43, 44, 45, 47, 48 y 49. Por ejemplo, en algunas realizaciones o aspectos de la divulgación, el anticuerpo de referencia tiene una secuencia de aminoácidos de la región variable de cadena ligera (Vl) establecida en los s Eq ID NO: 14, 16 o 18 y/o tiene una región variable de cadena pesada (VH) establecida en los SEQ ID NO: 8, 10, 13, 15, 17 o 19. En algunas de tales realizaciones, el anticuerpo tiene las CDR 1,2 y/o 3 de cadena pesada y/o ligera tal como están presentes en dicho anticuerpo.
En algunas realizaciones, el anticuerpo tiene afinidad, por ejemplo, CE50 o Kd, aproximadamente igual o menor que el de la forma correspondiente del anticuerpo de referencia, por ejemplo, no más de aproximadamente 1,5 veces o no más de aproximadamente 2 veces mayor, no más de 3 veces mayor y/o no más de 10 veces mayor, que la CE50 o Kd de la forma correspondiente del anticuerpo de referencia. En algunas realizaciones, el anticuerpo tiene afinidad, por ejemplo, CE50 o Kd, que es mayor que o más de aproximadamente 5 veces, 10 veces, 20 veces, 30 veces, 40 veces, 50 veces, 60 veces, 70 veces, 80 veces, 90 veces, 100 veces, 150 veces, 200 veces, 250 veces o más que la CE50 o Kd de la forma correspondiente del anticuerpo de referencia.
En algunas realizaciones, los anticuerpos muestran una preferencia de unión para las células que expresan ROR1 en comparación con las células negativas para ROR1, tales como células particulares conocidas y/o descritas en el presente documento que expresan ROR1 y que se sabe que no expresan ROR1. En algunas realizaciones, la preferencia de unión se observa cuando se mide un grado significativamente mayor de unión a las células que expresan ROR1, en comparación con las que no lo expresan. En algunas realizaciones, el múltiplo de variación en el grado de unión detectado, por ejemplo, medido por la intensidad media de fluorescencia en un ensayo basado en citometría de flujo y/o la constante de disociación o CE50, a las células que expresan ROR1 en comparación con las células que no expresan ROR1, es al menos en o aproximadamente 1,5, 2, 3, 4, 5, 6 o más, y/o es aproximadamente igual de grande, aproximadamente el mismo, al menos tan grande o al menos tan grande, o mayor, que el múltiplo de variación observado para la forma correspondiente del anticuerpo de referencia. En algunos casos, el grado total de unión observada a ROR1 o a las células que expresan ROR1 es aproximadamente el mismo, al menos igual o mayor que el observado para la forma correspondiente del anticuerpo de referencia.
En algunos aspectos de la divulgación, la afinidad es aproximadamente del mismo grado o sustancialmente el mismo grado de afinidad en comparación con la forma correspondiente del anticuerpo de referencia, tal como el anticuerpo de ROR1 de conejo. En algunas realizaciones, la afinidad es al menos el 80, 85, 90, 95 o 99 % igual que la de la forma correspondiente del anticuerpo de referencia.
En algunas realizaciones, el anticuerpo se une específicamente a un epítopo que se solapa con el epítopo de ROR1 unido por un anticuerpo de referencia. En algunos aspectos, entre dichos anticuerpos se encuentran los anticuerpos que se unen al mismo o un epítopo similar que el anticuerpo de referencia. En algunas realizaciones, dos anticuerpos se unen específicamente al mismo epítopo y/o un epítopo solapado si todas o esencialmente todas las mutaciones de aminoácidos en el antígeno que reducen o eliminan la unión de un anticuerpo reducen o eliminan la unión del otro anticuerpo.
En algunas realizaciones, los anticuerpos se unen al mismo o un epítopo similar o un epítopo dentro de la misma región o que contienen restos dentro de la misma región de ROR1 como anticuerpo de referencia, tal como el anticuerpo anti-ROR1 R12 o un fragmento scFv del mismo (establecido en la SEQ ID NO: 84; véase, por ejemplo, Yang et al. (2011) PloS ONE, 6:e21018). En algunas de tales realizaciones, los anticuerpos se unen a un epítopo que contiene aminoácidos dentro del dominio Ig y el dominio Fz de un ROR1 humano, tal como un epítopo que comprende restos de ambos dominios y/o en la conjunción de los dominios Ig y Fz. En algunas realizaciones, los anticuerpos se unen a un epítopo del ROR1 que se solapa con el epítopo unido específicamente por R12 y/o un fragmento scFv del mismo y/o compiten por unirse con dicho anticuerpo.
En algunas realizaciones, el anticuerpo inhibe la unión y compite por la unión a ROR1 humana, con el anticuerpo de referencia. En algunas realizaciones, el anticuerpo inhibe la unión y compite por la unión a ROR1 humana, con R12 o una IgG o un fragmento de unión a antígeno de la misma.
Un anticuerpo "compite por unirse" a ROR1 con un anticuerpo de referencia si inhibe competitivamente la unión del anticuerpo de referencia a ROR1, y/o si el anticuerpo de referencia inhibe competitivamente la unión del anticuerpo a ROR1. Un anticuerpo inhibe competitivamente la unión de un anticuerpo de referencia a un antígeno si la presencia del anticuerpo en exceso inhibe (bloquea) de manera detectable la unión del otro anticuerpo a su antígeno. Se puede especificar un grado particular de inhibición.
Los ensayos de inhibición competitiva son conocidos e incluyen ELISA, ensayos basados en citometría de flujo y ensayos basados en RIA. En algunos aspectos, los ensayos de inhibición competitiva se llevan a cabo incorporando un exceso de una forma no marcada de uno de los anticuerpos y evaluando su capacidad para bloquear la unión del otro anticuerpo, que está marcado con un marcador detectable, de tal manera que el grado de unión y reducción del mismo se puede evaluar mediante la detección de la etiqueta o marcador.
En algunas realizaciones, la adición del anticuerpo proporcionado en exceso, por ejemplo, un exceso de 1, 2, 5, 10, 50 o 100 veces, en comparación con la cantidad o concentración del anticuerpo de referencia, inhibe la unión a antígeno por el anticuerpo de referencia (o viceversa). En algunas realizaciones, la inhibición de la unión es de al menos el 50 % y, en algunas realizaciones, de al menos el 75 %, el 90 % o el 99 %. En algunos aspectos, la inhibición competitiva se mide en un ensayo de unión competitiva (véase, por ejemplo, Junghans et al., Cancer Res. 1990: 50:1495-1502).
En algunas realizaciones, cuando el anticuerpo de referencia está presente en una concentración de aproximadamente 2 nM, el anticuerpo proporcionado inhibe la unión del anticuerpo de referencia con una CI50 de menos de 200 nM o aproximadamente, 150 nM, 100 nM, 50 nM, 40 nM, 30 nM, 25 nM, 20 nM, 19 nM, 18 nM, 17 nM, 16 nM, 15 nM, 14 nM, 13 nM, 12 nM, 11 nM, o 10 nM, o menos de o aproximadamente 9 nM, 8 nM, 7 nM, 6 nM o 5 nM. En algunas realizaciones, cuando el anticuerpo proporcionado está presente en una concentración de o aproximadamente 2 nM, el anticuerpo de referencia inhibe la unión del anticuerpo proporcionado con una CI50 de menos de o aproximadamente 200 nM, 150 nM, 100 nM, 50 nM, 40 nM, 30 nM, 25 nM, 20 nM, 19 nM, 18 nM, 17 nM, 16 nM, 15 nM, 14 nM, 13 nM, 12 nM, 11 nM, o 10 nM, o menos de o aproximadamente 9 nM, 8 nM, 7 nM, 6 nM o 5 nM.
En algunas realizaciones, la inhibición competitiva de la unión del anticuerpo de referencia por el anticuerpo proporcionado (o viceversa) es en o aproximadamente o al menos en o aproximadamente el mismo grado que el grado de inhibición competitiva de la unión del anticuerpo de referencia por el propio anticuerpo de referencia, por ejemplo, anticuerpo de referencia sin marcar. En algunas realizaciones, el anticuerpo proporcionado inhibe la unión del anticuerpo de referencia, tal como la unión de R12 scFv, a la ROR1 humana en al menos el 70 %, el 75 %, el 80 %, el 85 %, el 90 %, el 91 %, el 92 %, el 93 %, el 94 %, el 95 %, el 96 %, el 97 %, el 98 % o el 99 %.
Los anticuerpos anti-ROR1 proporcionados en el presente documento se pueden identificar, someterse a detección sistemática o caracterizarse respecto de sus propiedades fisicoquímicas y/o sus actividades biológicas mediante diversos ensayos conocidos. En un aspecto, el anticuerpo se prueba para determinar su actividad de unión a antígeno, por ejemplo, mediante métodos conocidos, tales como ELISA, análisis por transferencia de Western y/o ensayos de citometría de flujo, incluidos los ensayos de unión basados en células, por ejemplo, evaluar la unión del anticuerpo (por ejemplo, conjugado con un marcador fluorescente o marcado) a una célula que expresa el antígeno diana, por ejemplo, ROR1, en algunos casos, en comparación con los resultados que utilizan células que no expresan el antígeno diana, por ejemplo, ROR1. La afinidad de unión se puede medir como Kd o CE50.
Se pueden usar ensayos de competición para identificar un anticuerpo que compita con cualquiera de los anticuerpos descritos en el presente documento. También se pueden usar y son conocidos ensayos para mapear epítopos unidos por los anticuerpos y anticuerpos de referencia.
Inmunoconjugados
En algunas realizaciones, el anticuerpo es o es parte de un inmunoconjugado, en el que el anticuerpo se conjuga con una o más moléculas heterólogas, tales como, aunque sin limitación, un citotóxico o un agente de obtención de imágenes. Los agentes citotóxicos incluyen, pero sin limitación, isótopos radiactivos (por ejemplo, At211, 1131, 1125, Y90, Re186, Re188, Sm153, Bi212, P32, Pb212 e isótopos radiactivos de Lu); agentes quimioterapéuticos (por ejemplo, metotrexato, adriamicina, alcaloides de la vinca (vincristina, vinblastina, etopósido), doxorrubicina, melfalán, mitomicina C, clorambucilo, daunorrubicina u otros agentes intercalantes); agentes inhibidores del crecimiento; enzimas y fragmentos de las mismas, tales como enzimas nucleolíticas; antibióticos; toxinas tales como toxinas de moléculas pequeñas o toxinas enzimáticamente activas. En algunas realizaciones, el anticuerpo está conjugado con uno o más agentes citotóxicos, tales como agentes o fármacos quimioterapéuticos, agentes inhibidores del crecimiento, toxinas (por ejemplo, toxinas proteicas, toxinas activas enzimáticamente de origen bacteriano, fúngico, vegetal o animal, o fragmentos de las mismas) o isótopos radiactivos.
Entre los inmunoconjugados se encuentran los conjugados anticuerpo-fármaco (CAF), en los que un anticuerpo se conjuga con uno o más fármacos, incluyendo, pero sin limitación, un maitansinoide (véanse las Patentes de los Estados Unidos n.° 5.208.020, 5.416.064 y la Patente Europea EP 0425 235 B1); una auristatina, tales como los
restos DE y DF de monometilauristatina (MMAE y MMAF) (véanse las Patentes de los Estados Unidos n.° 5.635.483 y 5.780.588 y 7.498.298); una dolastatina; una calicheamicina (véanse las Patentes de los Estados Unidos n.° 5.712.374, 5.714.586, 5.739.116, 5.767.285, 5.770.701,5.770.710, 5.773.001 y 5.877.296; Hinman et al., Cancer Res.
53:3336-3342 (1993); y Lode et al., Cancer Res. 58:2925-2928 (1998)); una antraciclina, tal como daunomicina o doxorrubicina (véase Kratz et al., Current Med. Chem. 13:477-523 (2006); Jeffrey et al., Bioorganic & Med. Chem. Letters 16:358-362 (2006); Torgov et al., Bioconj. Chem. 16:717-721 (2005); Nagy et al., Proc. Natl. Acad. Sci. EE.UU.
97:829-834 (2000); Dubowchik et al., Bioorg. & Med. Chem. Letters 12:1529-1532 (2002); King et al., J. Med. Chem.
45:4336-4343 (2002); y la Patente de los Estados Unidos n.° 6.630.579); metotrexato; vindesina; un taxano, tal como docetaxel, paclitaxel, larotaxel, tesetaxel y ortataxel; un tricoteceno; y CC1065.
También entre los inmunoconjugados se encuentran aquellos en los que el anticuerpo está conjugado con una toxina enzimáticamente activa o un fragmento de la misma, incluyendo, pero sin limitación, cadena A de difteria, fragmentos activos sin unión de toxina de la difteria, cadena A de la exotoxina (de Pseudomonas aeruginosa), la cadena A de ricina, la cadena A de abrina, la cadena A de modeccina, alfa-sarcina, proteínas de Aleurites fordii, proteínas de diantina, proteínas de Phytolaca americana (PAPI, PAPII y PAP-S), el inhibidor de Momordica charantia, curcina, crotina, el inhibidor de Sapaonaria officinalis, gelonina, mitogelina, restrictocina, fenomicina, enomicina y los tricotecenos.
También entre los inmunoconjugados se encuentran aquellos en los que el anticuerpo se conjuga con un átomo radiactivo para formar un radioconjugado. Los isótopos radiactivos a modo de ejemplo incluyen At211, I131, I125, Y90, Re186, Re188, Sm153, Bi212, P32, Pb212 e isótopos radioactivos de Lu.
Se pueden preparar conjugados de un anticuerpo y un agente citotóxico usando cualquiera de los agentes de acoplamiento de proteínas conocidos, por ejemplo, enlazadores, (véase Vitetta et al., Science 238:1098 (1987)), el documento WO94/11026. El enlazador puede ser un "enlazador escindible" que facilita la liberación de un fármaco citotóxico en la célula, tal como enlazadores lábiles al ácido, enlazadores sensible a peptidasa, enlazadores fotolábiles, enlazadores de dimetilo o enlazadores que contienen disulfuro (Chari et al., Cancer Res. 52:127-131 (1992); Patente de Estados Unidos N.° 5.208.020).
Anticuerpos multiespecíficos
En ciertas realizaciones, las moléculas de unión a ROR1, por ejemplo, anticuerpos o polipéptidos tales como receptores quiméricos que contienen los mismos, son multiespecíficas. Entre las moléculas de unión multiespecíficas se encuentran los anticuerpos multiespecíficos, incluyendo, por ejemplo, los biespecíficos. Los miembros de unión multiespecíficos, por ejemplo, anticuerpos, tienen especificidades de unión para al menos dos sitios diferentes, que pueden estar en el mismo o en diferentes antígenos. En ciertas realizaciones, una de las especificidades de unión es para ROR1 y la otra es para otro antígeno. En ciertas realizaciones, los anticuerpos biespecíficos se pueden unir a dos epítopos diferentes de ROR1. También se pueden usar anticuerpos biespecíficos para localizar agentes citotóxicos en células que expresan ROR1. Se pueden preparar anticuerpos biespecíficos como anticuerpos de longitud completa o como fragmentos de anticuerpo. Entre los anticuerpos multiespecíficos se encuentran los anticuerpos de cadena simple multiespecíficos, por ejemplo, diacuerpos, triacuerpos y tetracuerpos, di-scFv en tándem y tri-scFv en tándem. También se proporcionan receptores quiméricos multiespecíficos, tales como los CAR multiespecíficos, que contienen los anticuerpos. También se proporcionan células multiespecíficas que contienen los anticuerpos o polipéptidos que los incluyen, tales como células que contienen una proteína de la superficie celular que incluye el anticuerpo anti-ROR1 y una proteína adicional de la superficie celular, tal como un receptor quimérico adicional, que se une a un antígeno diferente o un epítopo diferente en ROR1.
Los antígenos adicionales a modo de ejemplo incluyen antígenos específicos de linfocitos B, otros antígenos específicos de tumores, tales como antígenos expresados específicamente o asociados con la leucemia de linfocitos B, linfoma, leucemia linfocítica crónica de linfocitos B (LLC), LMA, leucemia mieloide aguda (LMA), leucemia linfocítica aguda (LLA), linfoma de Burkett, linfoma de células del manto (MCL), cáncer de pulmón no microcítico (CPNM), neuroblastoma, carcinoma de células renales, cáncer de colon, cáncer colorrectal, cáncer de mama, cáncer de células escamosas epiteliales, melanoma, mieloma, cáncer de estómago, cáncer de cerebro, cáncer de pulmón, cáncer de páncreas, cáncer de cuello del útero, cáncer de ovario, cáncer de hígado, cáncer de vejiga, cáncer de próstata, cáncer de testículos, cáncer de tiroides, cáncer de útero, cáncer suprarrenal y/o cáncer de cabeza y cuello, y antígenos expresados en linfocitos T. Los antígenos a modo de ejemplo incluyen CD4, CD5, CD8, CD14, CD15, CD19, CD20, CD21, CD22, CD23, CD25, CD33, CD37, CD38, CD40, CD40L, CD46, CD52, CD54, CD74, CD80, CD126, CD138, B7, MUC-1, la, HM1.24, HLA-DR, tenascina, un factor de angiogénesis, VEGF, PIGF, Fibronectina ED-B, un oncogén, un producto oncogénico, CD66a-d, antígenos de necrosis, li, IL-2, T101, TAC, IL-6, TRAIL-R1 (DR4) y TRAIL-R2 (DR5).
Variantes
En ciertas realizaciones, los anticuerpos incluyen una o más variaciones de aminoácidos, por ejemplo, sustituciones, deleciones, inserciones y/o mutaciones, en comparación con la secuencia de un anticuerpo descrito en el presente documento. Las variantes a modo de ejemplo incluyen aquellas modificadas para mejorar la afinidad de unión y/u otras
propiedades biológicas del anticuerpo. Se pueden preparar variantes de secuencia de aminoácidos de un anticuerpo mediante la introducción de modificaciones adecuadas en la secuencia de nucleótidos que codifica el anticuerpo o mediante síntesis peptídica. Dichas modificaciones incluyen, por ejemplo, deleciones de y/o inserciones en y/o sustituciones de restos dentro de las secuencias de aminoácidos del anticuerpo. Puede efectuarse cualquier combinación de deleción, inserción y sustitución para llegar a la construcción final, siempre que la construcción final posea las características deseadas, por ejemplo, unión a antígeno.
En ciertas realizaciones, los anticuerpos incluyen una o más sustituciones de aminoácidos, por ejemplo, en comparación con una secuencia de anticuerpos descrita en el presente documento y/o en comparación con una secuencia de un repertorio natural, por ejemplo, repertorio humano. Los sitios de interés para la mutagénesis de sustitución incluyen las CDR y las FR. Se pueden introducir sustituciones de aminoácidos en un anticuerpo de interés y los productos se pueden someter a detección sistemática respecto de una actividad deseada, por ejemplo, unión a antígeno conservada/mejorada, disminución de la inmunogenicidad, vida media mejorada y/o función efectora mejorada, tal como la capacidad para promover la citotoxicidad celular dependiente de anticuerpos (ADCC) o la citotoxicidad dependiente del complemento (CDC).
En algunas realizaciones, uno o más restos dentro de una CDR de un anticuerpo parental están sustituidos. En algunas realizaciones, la sustitución se realiza para revertir una secuencia o posición en la secuencia a una secuencia de línea germinal, tal como una secuencia de anticuerpos que se encuentra en la línea germinal (por ejemplo, la línea germinal humana), por ejemplo, para reducir la probabilidad de inmunogenicidad, por ejemplo, tras la administración a un sujeto humano.
En algunas realizaciones, se realizan alteraciones en los "puntos calientes" de las CDR, restos codificados por codones que sufren mutación con elevada frecuencia durante el proceso de maduración somática (véase, por ejemplo, Chowdhury, Methods Mol. Biol. 207:179-196 (2008)) y/o restos que entran en contacto con el antígeno, con la variante resultante de Vh o Vl siendo probada para la afinidad de unión. La maduración por afinidad mediante la construcción y reselección de bibliotecas secundarias se ha descrito, por ejemplo, en Hoogenboom et al. en Methods in Molecular Biology 178:1-37 (O'Brien et al., ed., Human Press, Totowa, NJ, (2001)). En algunas realizaciones de maduración por afinidad, se introduce diversidad en los genes variables seleccionados para su maduración mediante cualquiera de diversos métodos (por ejemplo, PCR propensa a errores, barajado de cadenas, o mutagénesis dirigida por oligonucleótidos). Después, se crea una biblioteca secundaria. Posteriormente, se somete la biblioteca a detección sistemática para identificar cualquier variante de anticuerpo con la afinidad deseada. Otro método para introducir diversidad implica estrategias dirigidas a las CDR, en las que se aleatorizan varios restos de CDR (por ejemplo, 4-6 restos a la vez). Se pueden identificar específicamente restos de CDR implicados en la unión a antígeno, por ejemplo, usando mutagénesis o modelado de barrido de alanina. Normalmente se usan como diana, en particular, CDR-H3 y CDR-L3.
En ciertas realizaciones, sustituciones, inserciones o deleciones dentro de una o más CDR siempre que dichas alteraciones no reduzcan sustancialmente la capacidad del anticuerpo para unirse al antígeno. Por ejemplo, se pueden hacer alteraciones conservativas (por ejemplo, sustituciones conservativas como se proporcionan en el presente documento) que no reduzcan sustancialmente la afinidad de unión en las CDR. Tales alteraciones pueden, por ejemplo, estar fuera de los restos de contacto con el antígeno en las CDR. En determinadas formas de realización de las variantes de secuencias de VH y VL proporcionadas anteriormente, cada CDR está inalterada o no contiene más de una, dos o tres sustituciones de aminoácidos.
Las inserciones de secuencias de aminoácidos incluyen fusiones en extremo amino y/o carboxilo terminal que varían en su longitud, desde un resto hasta polipéptidos que contienen cien o más restos, así como inserciones intrasecuencia de restos de aminoácidos individuales o múltiples. Los ejemplos de inserciones terminales incluyen un anticuerpo con un resto de metionilo N-terminal. Otras variantes de inserción de la molécula de anticuerpo incluyen la fusión al extremo N o C del anticuerpo a una enzima o un polipéptido que aumenta la semivida en suero del anticuerpo.
Modificaciones
En ciertas realizaciones, el anticuerpo se altera para aumentar o disminuir el grado en que el anticuerpo está glicosilado, por ejemplo, eliminando o insertando uno o más sitios de glicosilación alterando la secuencia de aminoácidos y/o modificando los oligosacáridos unidos a los sitios de glicosilación, por ejemplo, usando ciertas líneas celulares.
En algunas realizaciones, una glicosilación N-ligada, que es un sitio de glicosilación que se produce en las asparaginas en la secuencia consenso -Asn-Xaa-Ser/Thr se elimina o se inserta. Por ejemplo, un ejemplo de secuencia consenso N-ligada se corresponde con los restos N52/P52A/S53, mediante numeración de Kabat, de la cadena pesada a modo de ejemplo establecida en la SEQ ID NO: 17. En algunas realizaciones, uno o más restos correspondientes a N52, P52A y/o S53 se reemplazan con otro aminoácido para eliminar el sitio de glicosilación. Un ejemplo de una modificación es S53N, tal como se proporciona en la cadena pesada a modo de ejemplo establecida en la SEQ ID NO: 19.
Modificaciones a modo de ejemplo, variantes y líneas celulares se describen, por ejemplo, en las Publicaciones de Patente N.° US 2003/0157108, US 2004/0093621, US 2003/0157108; WO 2000/61739; WO 2001/29246; US 2003/0115614; US 2002/0164328; US 2004/0093621; US 2004/0132140; US 2004/0110704; US 2004/0110282; US 2004/0109865; WO 2003/085119; WO 2003/084570; WO 2005/035586; WO 2005/035778; WO2005/053742; WO2002/031140; Okazaki et al. J. Mol. Biol. 336:1239-1249 (2004); Yamane-Ohnuki et al. Biotech. Bioeng. 87: 614 (2004). Ripka et al. Arch. Biochem. Biophys. 249:533-545 (1986); la Solicitud de Patente de los EE.UU. N.° 2003/0157108 A1, Presta, L; y el documento WO 2004/056312 A1, Yamane-Ohnuki et al. Biotech. Bioeng. 87: 614 (2004); Kanda, Y. et al., Biotechnol. Bioeng., 94(4):680-688 (2006); y el documento WO2003/085107); el documento WO 2003/011878 (Jean-Mairet et al.); la Patente de los Estados Unidos N.° 6.602.684 (Umana et al.); y el documento US 2005/0123546 (Umana et al.); el documento WO 1997/30087 (Patel et al.); el documento WO 1998/58964 (Raju, S.); y el documento WO 1999/22764 (Raju, S.).
Entre los anticuerpos modificados se encuentran los que tienen una o más modificaciones de aminoácidos en la región Fc, tales como los que tienen una secuencia de la región Fc humana u otra parte de una región constante (por ejemplo, una región Fc de IgG 1, IgG2, IgG3 o IgG4 humana) que comprende una modificación de aminoácidos (por ejemplo, una sustitución) en una o más posiciones de aminoácidos.
Tales modificaciones se pueden realizar, por ejemplo, para mejorar la vida media, alterar la unión a uno o más tipos de receptores Fc y/o alterar las funciones efectoras.
También entre las variantes se encuentran los anticuerpos modificados con cisteína tales como "thioMAbs" y otras variantes modificadas con cisteína, en las que se sustituyen uno o más restos de un anticuerpo por restos de cisteína, para generar grupos de tiol reactivos en sitios accesibles, por ejemplo, para su uso en la conjugación de agentes y agentes enlazadores, para producir inmunoconjugados. Se describen anticuerpos modificados con cisteína, por ejemplo, en las Patentes de Ee .UU. N.° 7.855.275 y 7.521.541.
En algunas realizaciones, los anticuerpos se modifican para contener restos no proteináceos adicionales, incluyendo polímeros solubles en agua. Los polímeros ilustrativos incluyen, pero sin limitación, polietilenglicol (PEG), copolímeros de etilenglicol/propilenglicol, carboximetilcelulosa, dextrano, alcohol polivinílico, polivinilpirrolidona, poli-1,3-dioxolano, poli-1, 3,6-trioxano, copolímero de etileno/anhídrido maleico, poliaminoácidos (homopolímeros o copolímeros aleatorios) y dextrano o poli(n-vinilpirrolidona)polietilenglicol, homopolímeros de propropilenglicol, copolímeros de óxido de prolipropileno/óxido de etileno, polioles polioxietilados (por ejemplo, glicerol), alcohol polivinílico, y mezclas de los mismos. El propionaldehído de polietilenglicol puede tener ventajas en la fabricación debido a su estabilidad en agua. El polímero puede tener cualquier peso molecular y puede ser ramificado o no ramificado. La cantidad de polímeros unidos al anticuerpo puede variar y si se une más de un polímero, pueden ser moléculas iguales o diferentes. En general, el número y/o tipo de polímeros usados para la derivatización se puede determinar basándose en consideraciones que incluyen, aunque sin limitación, las propiedades o funciones particulares del anticuerpo a mejorar, si el derivado de anticuerpo se usará en una terapia en condiciones definidas, etc.
B. Receptores recombinantes
Entre las moléculas de unión proporcionadas, por ejemplo, moléculas de unión a ROR1, están los receptores recombinantes que incluyen uno de los anticuerpos proporcionados. Los receptores incluyen receptores de antígenos quiméricos (CAR) que se unen específicamente a r Or 1, es decir, los receptores contienen los anticuerpos anti-ROR1 proporcionados, por ejemplo, fragmentos de anticuerpos. También se proporcionan células que expresan los receptores recombinantes y dichas células para su uso en el tratamiento de enfermedades y trastornos asociados con la expresión de ROR1.
Los receptores de antígenos a modo de ejemplo, incluidos los CAR, los y métodos para modificar e introducir dichos receptores en las células, incluyen los descritos, por ejemplo, en las publicaciones de solicitud de patente internacional números WO200014257, WO2013126726, WO2012/129514, WO2014031687, WO2013/166321, WO2013/071154, WO2013/123061, los números de publicación de solicitud de patente de EE.UU. US2002131960, US2013287748, US20130149337, las patentes de EE.UU. N.°: 6.451.995, 7.446.190, 8.252.592, 8.339.645, 8.398.282, 7.446.179, 6.410.319, 7.070.995, 7.265.209, 7.354.762, 7.446.191, 8.324.353 y 8.479.118, y la solicitud de patente europea número EP2537416, y/o las descritas por Sadelain et al., Cancer Discov. abril de 2013; 3(4): 388-398; Davila et al. (2013) PLoS ONE 8(4): e61338; Turtle et al., Curr. Opin. Immunol., octubre de 2012; 24(5): 633-39; Wu et al., Cancer, marzo de 2012 18(2): 160-75. En algunos aspectos, los receptores de antígeno incluyen un CAR tal como se describe en la Patente de EE.UU. N.°: 7.446.190 y los descritos en la publicación de solicitud de patente internacional N.°: WO/2014055668 A1. Los ejemplos de los CAR incluyen los CAR tal como se desvelan en cualquiera de las publicaciones mencionadas anteriormente, tales como WO2014031687, US 8.339.645, US 7.446.179, US 2013/0149337, la patente de Estados Unidos N.°: 7.446.190, la patente de EE.UU. N.°: 8.389.282, por ejemplo, y en la que la porción de unión a antígeno, por ejemplo, scFv, se reemplaza por un anticuerpo, por ejemplo, tal como se proporciona en el presente documento.
Los CAR incluyen un dominio de unión a antígeno extracelular que incluye, es, o está comprendido en, uno de los anticuerpos anti-ROR1 proporcionados. Por lo tanto, los CAR normalmente incluyen en sus porciones extracelulares
una o más moléculas de unión a ROR1, tales como uno o más fragmentos de unión a antígeno, dominio, o porción, o uno o más dominios variables de anticuerpo, y/o moléculas de anticuerpo, tales como los descritos en el presente documento. En algunas realizaciones, el CAR incluye una porción de unión a ROR1 o porciones de la molécula de anticuerpo, tales como una región variable de cadena pesada (VH) y/o una región variable de cadena ligera (Vl) del anticuerpo, por ejemplo, un fragmento de anticuerpo scFv.
Se describen los CAR que se dirigen a ROR1, por ejemplo, por Hudecek et al., Clin Cancer Res, 19(12), 3153-3164 (2013) y Baskar et al. MAbs. 4(3): 349-361 (2012). Véase también el documento WO2014031687.
En algunas realizaciones, el receptor recombinante, tal como la porción de anticuerpo del mismo, además incluye un espaciador, que puede ser o incluir al menos una parte de una región constante de inmunoglobulina o una variante o versión modificada de la misma, tal como una región de bisagra, por ejemplo, una región de bisagra de IgG4 y/o una región CH1/CL y/o Fc. En algunas realizaciones, la región o porción constante es de una IgG humana, tal como IgG4 o IgG1. En algunos aspectos, la porción de la región constante sirve como una región espaciadora entre el componente de reconocimiento de antígeno, por ejemplo, scFv y dominio transmembrana. El espaciador puede tener una longitud que proporcione una mayor capacidad de respuesta de la célula después de la unión del antígeno, en comparación con en ausencia del espaciador. En algunos ejemplos, el espaciador tiene aproximadamente 12 aminoácidos de longitud o no tiene más de 12 aminoácidos de longitud. Los espaciadores a modo de ejemplo incluyen aquellos que tienen al menos de aproximadamente 10 a 229 aminoácidos, de aproximadamente 10 a 200 aminoácidos, de aproximadamente 10 a 175 aminoácidos, de aproximadamente 10 a 150 aminoácidos, de aproximadamente 10 a 125 aminoácidos, de aproximadamente 10 a 100 aminoácidos, de aproximadamente 10 a 75 aminoácidos, de aproximadamente 10 a 50 aminoácidos, de aproximadamente 10 a 40 aminoácidos, de aproximadamente 10 a 30 aminoácidos, de aproximadamente de 10 a 20 aminoácidos, o de aproximadamente de 10 a 15 aminoácidos y que incluyen cualquier número entero entre los extremos de cualquiera de los intervalos enumerados. En algunas realizaciones, una región espaciadora tiene aproximadamente 12 aminoácidos o menos, aproximadamente 119 aminoácidos o menos, o aproximadamente 229 aminoácidos o menos. Los espaciadores a modo de ejemplo incluyen la bisagra de IgG4 sola, la bisagra de IgG4 unida a los dominios CH2 y CH3, o la bisagra de IgG4 unida al dominio CH3. Los espaciadores a modo de ejemplo incluyen, pero sin limitación, los descritos en Hudecek et al. (2013) Clin. Cancer Res., 19:3153 o la publicación de solicitud de patente internacional número WO2014031687. En algunas realizaciones, el espaciador tiene la secuencia establecida en la SEQ ID NO: 108, y está codificada por la secuencia establecida en la SEQ ID NO: 107. En algunas realizaciones, el espaciador tiene la secuencia establecida en la SEQ ID NO: 142. En algunas realizaciones, el espaciador tiene la secuencia establecida en la SEQ ID NO: 143.
En algunas realizaciones, la región o porción constante es de IgD. En algunas realizaciones, el espaciador tiene la secuencia establecida en la SEQ ID NO:144. En algunas realizaciones, el espaciador tiene una secuencia de aminoácidos que presenta al menos el 85 %, el 86 %, el 87 %, el 88 %, el 89 %, el 90 %, el 91 %, el 92 %, el 93 %, el 94 %, el 95 %, el 96 %, el 97 %, el 98 %, el 99 % o más de identidad de secuencia con cualquiera de los SEQ ID NO: 108, 142, 143 o 144.
El dominio de reconocimiento de antígeno está unido a uno o más componentes de señalización intracelular, tales como componentes de señalización que imitan la activación a través de un complejo de receptor de antígeno, tal como un complejo de TCR. Por lo tanto, en algunas realizaciones, el componente de unión específico de ROR1 (por ejemplo, anticuerpo) está unido a uno o más dominios de señalización transmembrana e intracelular. En algunas realizaciones, el dominio transmembrana se fusiona con el dominio extracelular. En una realización, se usa un dominio transmembrana que se asocia de manera natural con uno de los dominios en el receptor. En algunos casos, el dominio transmembrana se selecciona o se modifica mediante sustitución de aminoácidos para evitar la unión de dichos dominios a los dominios transmembrana de las mismas proteínas de membrana de superficie o diferentes para minimizar las interacciones con otros miembros del complejo de receptor.
El dominio transmembrana en algunas realizaciones proviene de una fuente natural o de una fuente sintética. Cuando la fuente es natural, el dominio en algunos aspectos proviene de cualquier proteína unida a la membrana o transmembrana. Las regiones transmembrana incluyen las obtenidas de (es decir, comprenden al menos la región o regiones transmembrana de la cadena alfa, beta o zeta del receptor de linfocitos T, CD28, CD3 épsilon, CD45, CD4, CD5, CDS, CD9, CD 16, CD22, CD33, CD37, CD64, CD80, CD86, CD 134, CD137, CD 154. Como alternativa, el dominio transmembrana en algunas realizaciones es sintético. En algunos aspectos, el dominio transmembrana sintético comprende predominantemente restos hidrófobos tales como leucina y valina. En algunos aspectos, se encontrará un triplete de fenilalanina, triptófano y valina en cada extremo de un dominio transmembrana sintético. En algunas realizaciones, el enlace es por enlazadores, espaciadores y/o dominio(s) transmembrana.
Entre los dominios de señalización intracelular se encuentran aquellos que imitan o se aproximan a una señal a través de un receptor de antígeno natural, una señal a través de dicho receptor en combinación con un receptor coestimulador, y/o una señal a través de un receptor coestimulador solo. En algunas realizaciones, un enlazador oligo o polipeptídico corto, por ejemplo, un enlazador de entre 2 y 10 aminoácidos de longitud, tal como uno que contiene glicinas y serinas, por ejemplo, doblete de glicina-serina, está presente y forma un enlace entre el dominio transmembrana y el dominio de señalización citoplásmica del CAR.
El receptor incluye al menos un componente o componentes de señalización intracelular. En algunas realizaciones, el receptor incluye un componente intracelular de un complejo de TCR, tal como una cadena CD3 de TCR que media la activación y citotoxicidad de los linfocitos T, por ejemplo, cadena zeta de CD3. Por lo tanto, en algunos aspectos, el anticuerpo de unión a ROR1 está unido a uno o más módulos de señalización celular. En algunas realizaciones, los módulos de señalización celular incluyen el dominio transmembrana CD3, los dominios de señalización intracelular de CD3 y/u otros dominios transmembrana de CD. En algunas realizaciones, el receptor incluye además una porción de una o más moléculas adicionales tales como el receptor Fc y, CD8, CD4, CD25 o CD16. Por ejemplo, en algunos aspectos, el CAR incluye una molécula quimérica entre CD3-zeta (CD3-Z) o el receptor Fc y y CD8, CD4, CD25 o CD16.
En algunas realizaciones, tras la unión del CAR, el dominio citoplásmico o el dominio de señalización intracelular del CAR activa al menos una de las funciones efectoras normales o respuestas de la célula inmunitaria, por ejemplo, el linfocito T modificado para expresar el CAR. Por ejemplo, en algunos contextos, el CAR induce una función de un linfocito T, tal como la actividad citolítica o la actividad de los linfocitos T colaboradores, tal como la secreción de citocinas u otros factores. En algunas realizaciones, se usa una porción truncada de un dominio de señalización intracelular de un componente receptor de antígeno o molécula coestimuladora en lugar de una cadena inmunoestimuladora intacta, por ejemplo, si transduce la señal de la función efectora. En algunas realizaciones, el dominio o dominios de señalización intracelular incluyen las secuencias citoplásmicas del receptor de linfocitos T (TCR) y, en algunos aspectos, también las de los correceptores que, en el contexto natural, actúan en concierto con dicho receptor para iniciar la transducción de señales después de la participación del receptor del antígeno, y/o cualquier derivado o variante de dichas moléculas, y/o cualquier secuencia sintética que tenga la misma capacidad funcional.
En el contexto de un TCR natural, la activación completa generalmente requiere no solo la señalización a través del TCR, sino también una señal coestimuladora. Por lo tanto, en algunas realizaciones, para promover la activación completa, también se incluye en el CAR un componente para generar una señal secundaria o coestimuladora. En otras realizaciones, el CAR no incluye un componente para generar una señal coestimuladora. En algunos aspectos, un CAR adicional se expresa en la misma célula y proporciona el componente para generar la señal secundaria o coestimuladora.
La activación de los linfocitos T se describe en algunos aspectos como mediada por dos clases de secuencias de señalización citoplasmática: las que inician la activación primaria dependiente de antígeno a través del TCR (secuencias de señalización citoplasmáticas primarias) y las que actúan de forma independiente del antígeno para proporcionar una señal secundaria o coestimuladora (secuencias de señalización citoplásmicas secundarias). En algunos aspectos, el CAR incluye uno o ambos componentes de señalización.
En algunos aspectos, el CAR incluye una secuencia de señalización citoplásmica primaria que regula la activación primaria del complejo TCR. Las secuencias de señalización citoplásmicas primarias que actúan de manera estimulante pueden contener motivos de señalización que se conocen como motivos de activación inmunorreceptores basados en tirosina o ITAM. Ejemplos de ITAM que contienen secuencias de señalización citoplásmicas primarias incluyen las derivadas de TCR o CD3 zeta, FcR gamma, FcR beta, CD3 gamma, CD3 delta, CD3 épsilon, CDS, CD22, CD79a, CD79b y CD66d. En algunas realizaciones, las moléculas de señalización citoplasmática en el CAR contienen un dominio de señalización citoplásmica, porción del mismo, o secuencia derivada de CD3 zeta.
En algunas realizaciones, el CAR incluye un dominio de señalización y/o una porción transmembrana de un receptor coestimulador, tal como CD28, 4-1BB, OX40, DAP10 e ICOS. En algunos aspectos, el mismo CAR incluye tanto el componente activador como el coestimulador.
En algunas realizaciones, el dominio de activación está incluido dentro de un CAR, mientras que el componente coestimulador lo proporciona otro CAR que reconoce otro antígeno. En algunas realizaciones, los CAR incluyen CAR activadores o estimuladores y CAR coestimuladores, ambos expresados en la misma célula (véase el documento WO2014/055668). En algunos aspectos, el CAR que se dirige a ROR1 es el CAR estimulador o activador; en otros aspectos, es el CAR coestimulador. En algunas realizaciones, las células incluyen además CAR inhibidores (iCAR, véase Fedorov et al., Sci. Transl. Medicine, 5 (215) (diciembre de 2013), tal como un CAR que reconoce un antígeno distinto de ROR1, por lo que una señal de activación entregada a través del CAR que se dirige a ROR1 se reduce o inhibe por la unión del CAR inhibidor a su ligando, por ejemplo, para reducir los efectos fuera de la diana.
En ciertas realizaciones, el dominio de señalización intracelular comprende un dominio transmembrana de CD28 y un dominio de señalización unido a un dominio intracelular de CD3 (por ejemplo, CD3-zeta). En algunas realizaciones, el dominio de señalización intracelular comprende dominios coestimuladores CD28 y CD137 (4-1BB, TNFRSF9) quiméricos, unidos a un dominio intracelular CD3 zeta.
En algunas realizaciones, el CAR abarca uno o más, por ejemplo, dos o más, dominios coestimuladores y un dominio de activación, por ejemplo, un dominio de activación principal, en la porción citoplásmica. Los CAR a modo de ejemplo incluyen componentes intracelulares de CD3-zeta, CD28 y 4-1BB.
En algunas realizaciones, el CAR u otro receptor de antígeno incluye además un marcador, tal como un marcador de
superficie celular, que se puede usar para confirmar la transducción o la modificación genética de la célula para expresar el receptor, tal como una versión truncada de un receptor de superficie celular, tal como EGFR truncado (tEGFR). En algunos aspectos, el marcador incluye todo o parte (por ejemplo, forma truncada) de CD34, un NGFR o receptor del factor de crecimiento epidérmico (por ejemplo, tEGFR). En algunas realizaciones, el ácido nucleico que codifica el marcador está operativamente unido a un polinucleótido que codifica una secuencia enlazadora, tal como una secuencia enlazadora escindible, por ejemplo, T2A. Véase el documento WO2014031687. En algunas realizaciones, la introducción de una construcción que codifica CAR y EGFRt separada por un interruptor de ribosoma T2A puede expresar dos proteínas a partir de la misma construcción, de tal manera que el EGFRt se puede utilizar como marcador para detectar células que expresan tal construcción. En algunas realizaciones, un marcador, y opcionalmente una secuencia enlazadora, puede ser cualquiera de los desvelados en la solicitud de patente publicada N.° WO2014031687. Por ejemplo, el marcador puede ser un EGFR truncado (tEGFR), es decir, opcionalmente, unido a una secuencia enlazadora, tal como una secuencia enlazadora escindible T2A. Un polipéptido a modo de ejemplo para un EGFR truncado (por ejemplo, tEGFR) comprende la secuencia de aminoácidos establecida en la SEQ ID NO: 154 o una secuencia de aminoácidos que presenta al menos el 85 %, el 86 %, el 87 %, el 88 %, el 89 %, el 90 %, el 91 %, el 92 %, el 93 %, el 94 %, el 95 %, el 96 %, el 97 %, el 98 %, el 99 % o más de identidad de secuencia con la SEQ ID NO: 154. Una secuencia de enlazador T2A a modo de ejemplo comprende la secuencia de aminoácidos establecida en la SEQ ID NO: 153 o una secuencia de aminoácidos que presenta al menos el 85 %, el 86 %, el 87 %, el 88 %, el 89 %, el 90 %, el 91 %, el 92 %, el 93 %, el 94 %, el 95 %, el 96 %, el 97 %, el 98 %, el 99 % o más de identidad de secuencia con la SEQ ID NO: 153.
En algunas realizaciones, el marcador es una molécula, por ejemplo, una proteína de la superficie celular, no se encuentra naturalmente en los linfocitos T o no se encuentra naturalmente en la superficie de los linfocitos T, o una parte de los mismos.
En algunas realizaciones, la molécula es una molécula no propia, por ejemplo, una proteína no propia, es decir, uno que no es reconocido como "propio" por el sistema inmunológico del hospedador al que se transferirán adoptivamente las células.
En algunas realizaciones, el marcador no tiene ninguna función terapéutica y/o no produce ningún efecto que no sea el de ser utilizado como marcador para la ingeniería genética, por ejemplo, para seleccionar células modificadas genéticamente con éxito. En otras realizaciones, el marcador puede ser una molécula terapéutica o una molécula que de otro modo ejerza algún efecto deseado, tal como un ligando para encontrar una célula in vivo, tal como una molécula de punto de control coestimuladora o inmune para mejorar y/o atenuar las respuestas de las células tras la transferencia adoptiva y el encuentro con el ligando.
En algunos casos, los CAR se denominan como CAR de primera, segunda y/o tercera generación. En algunos aspectos, un CAR de primera generación es uno que proporciona únicamente una señal inducida por la cadena CD3 tras la unión del antígeno; en algunos aspectos, un CAR de segunda generación es aquel que proporciona dicha señal y señal coestimuladora, tal como uno que incluye un dominio de señalización intracelular de un receptor coestimulador tal como CD28 o CD137; en algunos aspectos, un CAR de tercera generación en algunos aspectos es uno que incluye múltiples dominios coestimuladores de diferentes receptores coestimuladores.
En algunas realizaciones, el receptor de antígeno quimérico incluye una porción extracelular que contiene el anticuerpo o el fragmento descrito en el presente documento. En algunas realizaciones, el receptor de antígeno quimérico incluye una porción extracelular que contiene el anticuerpo o el fragmento descrito en el presente documento y un dominio de señalización intracelular. En algunas realizaciones, el anticuerpo o el fragmento incluye un scFv o un anticuerpo de un solo dominio Vh y el dominio intracelular contiene un ITAM. En algunos aspectos, el dominio de señalización intracelular incluye un dominio de señalización de una cadena zeta de una cadena CD3-zeta (CD3Z). En algunas realizaciones, el receptor de antígeno quimérico incluye un dominio transmembrana que une el dominio extracelular y el dominio de señalización intracelular.
En algunos aspectos, el dominio transmembrana contiene una porción transmembrana de CD28. El dominio extracelular y el transmembrana se pueden unir directa o indirectamente. En algunas realizaciones, el dominio extracelular y el transmembrana están unidos por un espaciador, tal como cualquiera descrito en el presente documento. En algunas realizaciones, el receptor de antígeno quimérico contiene un dominio intracelular de una molécula coestimuladora de linfocitos T, tal como entre el dominio transmembrana y el dominio de señalización intracelular. En algunos aspectos, la molécula coestimuladora de linfocitos T es CD28 o 41BB.
En algunas realizaciones, el CAR contiene un anticuerpo, por ejemplo, un fragmento de anticuerpo, un dominio transmembrana que es o contiene una porción transmembrana de CD28 o una variante funcional del mismo, y un dominio de señalización intracelular que contiene una porción de señalización de CD28 o una variante funcional del mismo y una porción de señalización de CD3 zeta o una variante funcional del mismo. En algunas realizaciones, el CAR contiene un anticuerpo, por ejemplo, el fragmento de anticuerpo, un dominio transmembrana que o contiene es una porción transmembrana de CD28 o una variante funcional del mismo, y un dominio de señalización intracelular que contiene una porción de señalización de 4-1 BB o una variante funcional del mismo y una porción de señalización de CD3 zeta o una variante funcional del mismo. En algunas de tales realizaciones, el receptor incluye además un
espaciador que contiene una porción de una molécula de Ig, tal como una molécula de Ig humana, tal como una bisagra de Ig, por ejemplo, una bisagra de IgG4, tal como un espaciador solo de bisagra.
En algunas realizaciones, el dominio transmembrana del receptor, es decir, el CAR es un dominio transmembrana de CD28 humano o una variante del mismo, por ejemplo, un dominio transmembrana de 27 aminoácidos de un CD28 humano (número de referencia: P10747.1), o es un dominio transmembrana que comprende la secuencia de aminoácidos establecida en la SEQ ID NO: 145 o una secuencia de aminoácidos que presenta al menos el 85 %, el 86 %, el 87 %, el 88 %, el 89 %, el 90 %, el 91 %, el 92 %, el 93 %, el 94 %, el 95 %, el 96 %, el 97 %, el 98 %, el 99 % o más de identidad de secuencia con la SEQ ID NO:145; en algunas realizaciones, la porción que contiene el dominio transmembrana del receptor recombinante comprende la secuencia de aminoácidos establecida en la SEQ ID NO:146 o una secuencia de aminoácidos que tiene al menos o aproximadamente el 85 %, el 86 %, el 87 %, el 88 %, el 89 %, el 90 %, el 91 %, el 92 %, el 93 %, el 94 %, el 95 %, el 96 %, el 97 %, el 98 %, el 99 % o más de identidad de secuencia con la misma.
En algunas realizaciones, el receptor de antígeno quimérico contiene un dominio intracelular de una molécula coestimuladora de linfocitos T. En algunos aspectos, la molécula coestimuladora de linfocitos T es CD28 o 41BB.
En algunas realizaciones, el dominio de señalización intracelular comprende un dominio de señalización coestimulador intracelular de CD28 humano o una variante funcional o parte del mismo, tal como un dominio de 41 aminoácidos del mismo y/o tal dominio con una sustitución de LL a GG en las posiciones 186-187 de una proteína CD28 natural. En algunas realizaciones, el dominio de señalización intracelular puede comprender la secuencia de aminoácidos establecida en la SEQ ID NO: 147 o 148 o una secuencia de aminoácidos que presenta al menos el 85 %, el 86 %, el 87 %, el 88 %, el 89 %, el 90 %, el 91 %, el 92 %, el 93 %, el 94 %, el 95 %, el 96 %, el 97 %, el 98 %, el 99 % o más de identidad de secuencia con la SEQ ID NO: 147 o 148. En algunas realizaciones, el dominio intracelular comprende un dominio de señalización coestimulador intracelular de 41BB o una variante funcional o parte del mismo, tal como un dominio citoplasmático de 42 aminoácidos de un 4-1BB humano (número de referencia Q07011.1) o una variante funcional o una parte del mismo, tal como la secuencia de aminoácidos establecida en la SEQ ID NO: 149 o una secuencia de aminoácidos que presenta al menos el 85 %, el 86 %, el 87 %, el 88 %, el 89 %, el 90 %, el 91 %, el 92 %, el 93 %, el 94 %, el 95 %, el 96 %, el 97 %, el 98 %, el 99 % o más de identidad de secuencia con la SEQ ID NO: 149.
En algunas realizaciones, el dominio de señalización intracelular comprende un dominio de señalización estimulador zeta de CD3 humano o una variante funcional del mismo, tal como un dominio citoplasmático de 112 AA de la isoforma 3 de CD3Z humano (número de referencia: P20963.2) o un dominio de señalización CD3 zeta tal como se describe en la Patente de EE. UU. N.°: 7.446.190 o la patente de Estados Unidos N.° 8.911.993. En algunas realizaciones, el dominio de señalización intracelular comprende la secuencia de aminoácidos establecida en los SEQ ID NO: 150, 151 o 152 o una secuencia de aminoácidos que presenta al menos el 85 %, el 86 %, el 87 %, el 88 %, el 89 %, el 90 %, el 91 %, el 92 %, el 93 %, el 94 %, el 95 %, el 96 %, el 97 %, el 98 %, el 99 % o más de identidad de secuencia con los SEQ ID NO: 150, 151 o 152.
En algunos aspectos, el espaciador contiene solo una región de bisagra de una IgG, tal como solo una bisagra de IgG4 o IgG 1, tal como solo el espaciador de bisagra establecido en la SEQ ID NO:108. En otras realizaciones, el espaciador es una bisagra de Ig, por ejemplo, y bisagra de IgG4, unida a los dominios CH2 y/o CH3. En algunas realizaciones, el espaciador es una bisagra de Ig, por ejemplo, una bisagra de IgG4, unida a los dominios CH2 y CH3, tal como se establece en la SEQ ID NO: 143. En algunas realizaciones, el espaciador es una bisagra de Ig, por ejemplo, una bisagra de IgG4, unida a un dominio CH3 únicamente, tal como se establece en la SEQ ID NO:142. En algunas realizaciones, el espaciador es o comprende una secuencia rica en glicina-serina u otro enlazador flexible tal como los enlazadores flexibles conocidos.
Por ejemplo, en algunas realizaciones, el CAR incluye un anticuerpo o un fragmento de ROR-1, tal como cualquiera de los anticuerpos ROR1 humanos, incluyendo sdAb (por ejemplo, que solo contiene la región Vh) y scFv, descrita en el presente documento, un espaciador tal como cualquiera de los espaciadores que contienen bisagra de Ig, un dominio transmembrana CD28, un dominio de señalización intracelular de CD28 y un dominio de señalización zeta de CD3. En algunas realizaciones, el CAR incluye el anticuerpo o el fragmento de ROR-1, tal como cualquiera de los anticuerpos ROR1 humanos, incluyendo sdAb y scFv descritos en el presente documento, un espaciador tal como cualquiera de los espaciadores que contienen bisagra de Ig, un dominio transmembrana CD28, un dominio de señalización intracelular de CD28 y un dominio de señalización zeta de CD3. En algunas realizaciones, tales construcciones de CAR incluyen además un elemento de salto ribosómico T2A y/o una secuencia tEGFR, por ejemplo, aguas abajo del CAR.
C .Células modificadas genéticamente
También se enseñan células tales como células que contienen un receptor de antígeno modificado genéticamente, por ejemplo, que contiene un dominio extracelular que incluye el anticuerpo o el fragmento anti-ROR1, descrito en el presente documento. También se enseñan poblaciones de tales células, composiciones que contienen tales células y/o enriquecidas para tales células, como en el que las células que expresan la molécula de unión a ROR1 constituyen
al menos el 50, 60, 70, 80, 90, 91,92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99 por ciento o más del total de células en la composición o células de un cierto tipo, tal como linfocitos T o células CD8+ o CD4+. Entre las composiciones se encuentran composiciones farmacéuticas y formulaciones para administración, tal como para la terapia celular adoptiva. También se enseñan métodos terapéuticos para administrar las células y composiciones a sujetos, por ejemplo, los pacientes.
Por lo tanto, también se proporcionan células modificadas genéticamente que expresan los receptores recombinantes que contienen los anticuerpos, por ejemplo, células que contienen los CAR. Las células generalmente son células eucariotas, tales como células de mamífero, y normalmente son células humanas. En algunas realizaciones, las células se obtienen de la sangre, la médula ósea, la linfa o de los órganos linfoides, son células del sistema inmunitario, tales como las células de la inmunidad innata o adaptativa, por ejemplo, células mieloides o linfoides, incluyendo linfocitos, normalmente linfocitos T y/o linfocitos citolíticos naturales. Otras células a modo de ejemplo incluyen células madre, tales como las células madre multipotentes y pluripotentes, incluidas las células madre pluripotentes inducidas (iPSC). Las células suelen ser células primarias, tales como las aisladas directamente de un sujeto y/o aisladas de un sujeto y congeladas. En algunas realizaciones, las células incluyen uno o más subconjuntos de linfocitos T u otros tipos de células, tales como poblaciones de linfocitos T completas, células CD4+, células CD8+ y subpoblaciones de las mismas, tales como las definidas por su función, estado de activación, madurez, potencial de diferenciación, expansión, recirculación, localización y/o capacidades de persistencia, especificidad de antígeno, tipo de receptor de antígeno, presencia en un órgano o compartimento en particular, marcador o perfil de secreción de citoquinas, y/o grado de diferenciación. Con referencia al sujeto que se va a tratar, las células pueden ser alogénicas y/o autólogas. Entre los métodos se incluyen los métodos existentes. En algunos aspectos, como para tecnologías existentes, las células son pluripotentes y/o multipotentes, tales como las células madre, tales como las células madre pluripotentes inducidas (iPSC). En algunas realizaciones, los métodos incluyen aislar células del sujeto, la preparación, el procesamiento, el cultivo y/o la modificación genética de las mismas, tal como se describe en el presente documento, y la reintroducción en el mismo paciente, antes o después de la criopreservación.
Entre los subtipos y subpoblaciones de linfocitos T y/o de linfocitos T CD4+ y/o de T CD8+ están los linfocitos T sin exposición previa (Tn), los linfocitos T efectores (Teff), los linfocitos T de memoria y los subtipos de los mismos, tales como los linfocitos T madre de memoria (Tscm), T de memoria central (Tcm), T de memoria efectora (Tem), o linfocitos T efectores de memoria diferenciados terminalmente, linfocitos infiltrantes de tumores (TIL), linfocitos T inmaduros, linfocitos T maduros, linfocitos T colaboradores, linfocitos T citotóxicos, linfocitos T invariantes asociados a mucosas (MAIT), linfocitos T reguladores (Treg) adaptativos y de origen natural, linfocitos T colaboradores, tales como los linfocitos TH1, linfocitos TH2, linfocitos TH3, linfocitos TH17, linfocitos TH9, linfocitos TH22, linfocitos T colaboradores foliculares, linfocitos T alfa/beta y linfocitos T delta/gamma.
En algunas realizaciones, las células son linfocitos citolíticos naturales (NK). En algunas realizaciones, las células son monocitos o granulocitos, por ejemplo, células mieloides, macrófagos, neutrófilos, células dendríticas, mastocitos, eosinófilos y/o basófilos.
En algunas realizaciones, las células incluyen uno o más ácidos nucleicos introducidos mediante ingeniería genética, y de ese modo expresan productos recombinantes o manipulados genéticamente de dichos ácidos nucleicos. En algunas realizaciones, los ácidos nucleicos son heterólogos, es decir, normalmente no están presente en una célula o muestra obtenida de la célula, tal como uno obtenido de otro organismo o célula, que por ejemplo, normalmente no se encuentra en la célula que se está modificando genéticamente y/o en un organismo del que se obtiene dicha célula. En algunas realizaciones, los ácidos nucleicos no son de origen natural, tal como un ácido nucleico que no se encuentra en la naturaleza, incluyendo uno que comprende combinaciones quiméricas de ácidos nucleicos que codifican diversos dominios de múltiples tipos de células diferentes.
Vectores y métodos para la ingeniería genética
También se enseñan métodos, ácidos nucleicos, composiciones y kits, para expresar las moléculas de unión, incluyendo receptores que comprenden los anticuerpos, y para producir las células manipuladas genéticamente que expresan dichas moléculas de unión. La ingeniería genética generalmente implica la introducción de un ácido nucleico que codifica el componente recombinante modificado genéticamente en la célula, tal como por transducción retrovírica, transfección o transformación.
En algunos aspectos de la divulgación, la transferencia de genes se logra estimulando primero la célula, tal como mediante combinación con un estímulo que induce una respuesta tal como la proliferación, la supervivencia y/o la activación, por ejemplo, tal como se mide por la expresión de una citocina o un marcador de activación, seguido de la transducción de las células activadas y la expansión en cultivo hasta cantidades suficientes para aplicaciones clínicas.
En algunos contextos, la sobreexpresión de un factor estimulante (por ejemplo, una linfocina o una citocina) puede ser tóxica para un sujeto. Por lo tanto, en algunos contextos, las células modificadas genéticamente incluyen segmentos de genes que hacen que las células sean susceptibles a la selección negativa in vivo, tal como tras la administración en inmunoterapia adoptiva. Por ejemplo, en algunos aspectos, las células están genéticamente modificadas para que se puedan eliminar como resultado de un cambio en la afección in vivo del paciente al que se administran. El fenotipo seleccionable negativo puede ser resultado de la inserción de un gen que confiere sensibilidad a un agente
administrado, por ejemplo, un compuesto. Los genes seleccionables negativos incluyen el gen de la timidina quinasa tipo I del virus del herpes simple (HSV-I TK) (Wigler et al., Cell II: 223, 1977) que confiere sensibilidad al ganciclovir; el gen de la hipoxantina fosforribosiltransferasa celular (HPRT), el gen de la adenina fosforribosiltransferasa celular (APRT), citosina desaminasa bacteriana, (Mullen et al., Proc. Natl. Acad. Sci. EE.UU. 89:33 (1992)).
En algunos aspectos, además, las células están modificadas para promover la expresión de citocinas u otros factores. Diversos métodos para la introducción de componentes transgénicos, por ejemplo, receptores de antígenos, por ejemplo, los CAR, son bien conocidos y se pueden usar con los métodos y composiciones enseñados. Los métodos a modo de ejemplo incluyen aquellos para la transferencia de ácidos nucleicos que codifican los receptores, incluso vía vírica, por ejemplo, retrovírica o lentivírica, transducción, transposones y electroporación.
En algunos aspectos de la divulgación, los ácidos nucleicos recombinantes se transfieren a las células utilizando partículas de virus infecciosos recombinantes, tales como, por ejemplo, vectores obtenidos del virus del simio 40 (SV40), adenovirus, virus adenoasociado (AAV). En algunos aspectos de la divulgación, los ácidos nucleicos recombinantes se transfieren a los linfocitos T utilizando vectores lentivíricos recombinantes o vectores retrovíricos, tales como los vectores gamma-retrovíricos (véase, por ejemplo, Koste et al. (2014) Gene Therapy 3 de abril de 2014. doi: 10.1038/gt.2014.25; Carlens et al. (2000) Exp Hematol 28(10): 1137-46; Alonso-Camino et al. (2013) Mol Ther Nucl Acids 2, e93; Park et al., Trends Biotechnol. Noviembre de 2011 29(11): 550-557.
El vector retrovírico puede tener una secuencia de repetición terminal larga (LTR), por ejemplo, un vector retrovírico obtenido del virus de la leucemia murina de Moloney (MoMLV), el virus del sarcoma mieloproliferativo (MPSV), el virus de células madre embrionarias murinas (MESV), el virus de células madre murinas (MSCV), el virus formador de focos del bazo (SFFV) o el virus adenoasociado (AAV). La mayoría de los vectores retrovíricos se obtienen de retrovirus murinos. Los retrovirus pueden incluir los obtenidos de cualquier fuente de células de aves o mamíferos. Los retrovirus suelen ser anfotrópicos, lo que significa que son capaces de infectar células hospedadoras de varias especies, incluyendo seres humanos. En un aspecto de la divulgación, el gen que se va a expresar sustituye el hueco retrovírico, las secuencias pol y/o env. Se han descrito varios sistemas retrovíricos a modo de ejemplo (por ejemplo, las Patentes de Estados Unidos N.° 5.219.740; 6.207.453; 5.219.740; Miller y Rosman (1989) BioTechniques 7:980-990; Miller, A. D. (1990) Human Gene Therapy 1:5-14; Scarpa et al. (1991) Virology 180:849-852; Burns et al. (1993) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 90:8033-8037; y Boris-Lawrie y Temin (1993) Cur. Opin. Genet. Develop. 3:102-109.
Se conocen métodos de transducción lentivírica. Los métodos a modo de ejemplo se describen en, por ejemplo, Wang et al. (2012) J. Immunother. 35(9): 689-701; Cooper et al. (2003) Blood. 101:1637-1644; Verhoeyen et al. (2009) Methods Mol Biol. 506: 97-114; y Cavalieri et al. (2003) Blood. 102(2): 497-505.
En algunos aspectos de la divulgación, los ácidos nucleicos recombinantes se transfieren a los linfocitos T mediante electroporación (véase, por ejemplo, Chicaybam et al, (2013) PLoS ONE 8(3): e60298 y Van Tedeloo et al. (2000) Gene Therapy 7(16): 1431-1437). En algunos aspectos de la divulgación, los ácidos nucleicos recombinantes se transfieren a los linfocitos T mediante transposición (véase, por ejemplo, Manuri et al. (2010) Hum Gene Ther 21(4): 427-437; Sharma et al. (2013) Molec Ther Nucl Acids 2, e74; y Huang et al. (2009) Methods Mol Biol 506: 115-126). Otros métodos para introducir y expresar material genético en células inmunes incluyen la transfección con fosfato de calcio (por ejemplo, tal como se describe en Current Protocols in Molecular Biology, John Wiley y Sons, Nueva York. N.Y.), fusión de protoplastos, transfección mediada por liposomas catiónicos; bombardeo de micropartículas facilitado por partículas de tungsteno (Johnston, Nature, 346: 776-777 (1990)); y coprecipitación de ADN de fosfato de estroncio (Brash et al., Mol. Cell Biol., 7: 2031-2034 (1987)).
Otros enfoques y vectores para la transferencia de los ácidos nucleicos que codifican los productos recombinantes son los descritos, por ejemplo, en la solicitud de patente internacional, N.° de publicación: WO2014055668 y la Patente de Estados Unidos N.° 7.446.190.
Entre los ácidos nucleicos adicionales, por ejemplo, los genes de introducción son los que mejoran la eficacia de la terapia, tal como promoviendo la viabilidad y/o función de las células transferidas; genes para proporcionar un marcador genético para la selección y/o evaluación de las células, tales como para evaluar la supervivencia o localización in vivo; genes para mejorar la seguridad, por ejemplo, haciendo que la célula sea susceptible a la selección negativa in vivo tal como lo describe Lupton S. D. et al., Mol. and Cell Biol., 11:6 (1991); y Riddell et al., Human Gene Therapy 3:319-338 (1992); véanse también las publicaciones PCT/US91/08442 y PCT/US94/05601 de Lupton et al. que describen el uso de genes de fusión seleccionables bifuncionales obtenidos de la fusión de un marcador seleccionable positivo dominante con un marcador seleccionable negativo. Véase, por ejemplo, Riddell et al., la Patente de Estados Unidos N.° 6.040.177, en las columnas 14-17.
Preparación de células para diseño genético
En algunos aspectos de la divulgación, la preparación de las células modificadas genéticamente incluye una o más etapas de cultivo y/o preparación. Las células para la introducción de la molécula de unión a ROR1, por ejemplo, CAR, se pueden aislar de una muestra, tal como una muestra biológica, por ejemplo, una obtenida o derivada de un sujeto. En algunos aspectos de la divulgación, el sujeto del que se aísla la célula es uno que tiene la enfermedad o afección
o que necesita una terapia celular o al que se administrará la terapia celular. El sujeto en algunas realizaciones es un ser humano que necesita una intervención terapéutica particular, tal como la terapia celular adoptiva para la que se aíslan células, se procesan y/o se modifican genéticamente.
Por consiguiente, las células en algunas realizaciones son células primarias, por ejemplo, células humanas primarias. Las muestras incluyen tejido, fluido y otras muestras tomadas directamente del sujeto, así como muestras resultantes de una o más etapas de procesamiento, tales como la separación, la centrifugación, la ingeniería genética (por ejemplo, transducción con vector vírico), el lavado y/o la incubación. La muestra biológica puede ser una muestra obtenida directamente de una fuente biológica o una muestra que se procesa. Las muestras biológicas incluyen, pero sin limitación, fluidos corporales, tales como sangre, plasma, suero, líquido cefalorraquídeo, líquido sinovial, orina y sudor, muestras de tejidos y órganos, incluidas las muestras procesadas obtenidas de los mismos.
En algunos aspectos, la muestra de la que se obtienen o aíslan las células es sangre o una muestra derivada de la sangre, o es o se obtiene de un producto de aféresis o leucocitaféresis. Las muestras a modo de ejemplo incluyen sangre completa, células mononucleares de sangre periférica (PBMC), leucocitos, la médula ósea, timo, biopsia de tejido, tumor, leucemia, linfoma, ganglio linfático, tejido linfoide asociado al intestino, tejido linfoide asociado a mucosas, bazo, otros tejidos linfoides, hígado, pulmón, estómago, intestino, colon, riñón, páncreas, mama, hueso, próstata, cuello del útero, testículos, ovarios, amígdala u otro órgano y/o células derivadas de los mismos. Las muestras incluyen, en el contexto de la terapia celular, por ejemplo, terapia celular adoptiva, muestras de fuentes autólogas y alogénicas.
En algunas realizaciones, las células se obtienen de líneas celulares, por ejemplo, líneas de linfocitos T. Las células en algunas realizaciones se obtienen de una fuente xenogénica, por ejemplo, de ratón, rata, primate no humano o cerdo.
En algunos aspectos de la divulgación, el aislamiento de las células incluye una o más etapas de preparación y/o separación de células no basadas en afinidad. En algunos ejemplos, las células se lavan, se centrifugan y/o se incuban en presencia de uno o más reactivos, por ejemplo, para eliminar componentes no deseados, enriquecer los componentes deseados, lisar o eliminar las células sensibles a determinados reactivos. En algunos ejemplos, las células se separan en función de una o más propiedades, tales como la densidad, propiedades adherentes, tamaño, sensibilidad y/o resistencia a componentes particulares.
En algunos ejemplos, se obtienen células de la sangre en circulación de un sujeto, por ejemplo, por aféresis o leucocitaféresis. Las muestras, en algunos aspectos, contienen linfocitos, incluyendo linfocitos T, monocitos, granulocitos, linfocitos B, otros glóbulos blancos nucleados, glóbulos rojos y/o plaquetas, y en algunos aspectos contiene células distintas de los glóbulos rojos y las plaquetas.
En algunos aspectos de la divulgación, se lavan las células sanguíneas recogidas del sujeto, por ejemplo, para eliminar la fracción de plasma y colocar las células en un tampón o medio apropiado para las etapas de procesamiento posteriores. En algunos aspectos, las células se lavan con solución salina tamponada con fosfato (PBS). En algunos aspectos, la solución de lavado carece de calcio y/o magnesio y/o muchos o todos los cationes divalentes. En algunos aspectos, una etapa de lavado se lleva a cabo en una centrífuga de "flujo continuo" semiautomática (por ejemplo, el procesador de células Cobe 2991, Baxter) de acuerdo con las instrucciones del fabricante. En algunos aspectos, una etapa de lavado se logra mediante filtración de flujo tangencial (TFF) de acuerdo con las instrucciones del fabricante. En algunos aspectos, las células se resuspenden en varios tampones biocompatibles después del lavado, tales como, por ejemplo, PBS libre de Ca +/Mg +. En determinados aspectos, los componentes de una muestra de células sanguíneas se extraen y las células se resuspenden directamente en el medio de cultivo.
En algunos aspectos de la divulgación, los métodos incluyen métodos de separación celular basados en la densidad, tales como la preparación de glóbulos blancos a partir de sangre periférica mediante la lisis de los glóbulos rojos y la centrifugación a través de un gradiente de Percoll o Ficoll.
En algunos aspectos de la divulgación, los métodos de aislamiento incluyen la separación de diferentes tipos de células basándose en la expresión o presencia en la célula de una o más moléculas específicas, tales como marcadores de superficie, por ejemplo, proteínas de superficie, marcadores intracelulares o ácido nucleico. En algunos aspectos, se puede utilizar cualquier método conocido para la separación basado en tales marcadores. En algunos aspectos, la separación es una separación basada en afinidad o inmunoafinidad. Por ejemplo, el aislamiento en algunos aspectos incluye la separación de células y poblaciones de células en función de la expresión de las células o el nivel de expresión de uno o más marcadores, normalmente marcadores de superficie celular, por ejemplo, por incubación con un anticuerpo o un miembro de unión que se une específicamente a dichos marcadores, seguido generalmente por etapas de lavado y separación de las células que se han unido al anticuerpo o al miembro de unión, de aquellas células que no se han unido al anticuerpo o al miembro de unión.
Estas etapas de separación se pueden basar en una selección positiva, en la que las células que se han unido a los reactivos se retienen para su uso posterior y/o selección negativa, en la que se retienen las células que no se han unido al anticuerpo o al miembro de unión. En algunos ejemplos, ambas fracciones se conservan para su uso posterior.
En algunos aspectos, la selección negativa puede ser particularmente útil cuando no hay ningún anticuerpo disponible que identifique específicamente un tipo de célula en una población heterogénea, de modo que la separación se lleve a cabo mejor basándose en marcadores expresados por células distintas de la población deseada.
No es necesario que la separación dé como resultado un enriquecimiento del 100 % o la eliminación de una población celular particular o células que expresan un marcador particular. Por ejemplo, la selección positiva o el enriquecimiento de células de un tipo particular, tales como las que expresan un marcador, se refiere al aumento del número o porcentaje de dichas células, pero no tiene por qué dar como resultado una ausencia completa de células que no expresan el marcador. Igualmente, la selección negativa, la eliminación o el agotamiento de células de un tipo particular, tales como las que expresan un marcador, se refieren a disminuir el número o porcentaje de dichas células, pero no tiene por qué resultar en la eliminación completa de todas esas células.
En algunos ejemplos, se llevan a cabo múltiples rondas de etapas de separación, en donde la fracción seleccionada positiva o negativamente de una etapa se somete a otra etapa de separación, tal como una selección posterior positiva o negativa. En algunos ejemplos, una sola etapa de separación puede agotar las células que expresan múltiples marcadores de manera simultánea, tal como incubando células con una pluralidad de anticuerpos o miembros de unión, cada uno específico para un marcador dirigido a la selección negativa. Igualmente, se pueden seleccionar de manera simultánea múltiples tipos de células de forma positiva incubando células con una pluralidad de anticuerpos o miembros de unión expresados en los diversos tipos de células.
Por ejemplo, en algunos aspectos de la divulgación, subpoblaciones específicas de linfocitos T, tal como células positivas o que expresan altos niveles de uno o más marcadores de superficie, por ejemplo, linfocitos T CD28+, CD62L+, CCR7+, CD27+, CD127+, CD4+, CD8+, CD45RA+ y/o CD45RO+, se aíslan mediante técnicas de selección positiva o negativa.
Por ejemplo, los linfocitos T CD3+, CD28+ se pueden seleccionar positivamente usando perlas magnéticas conjugadas CD3/CD28 (por ejemplo, DYNABEADS® M-450 CD3/CD28 T Cell Expander).
En algunos aspectos de la divulgación, el aislamiento se lleva a cabo mediante el enriquecimiento de una población celular particular mediante selección positiva, o el agotamiento de una población celular particular, por selección negativa. En algunos aspectos, la selección positiva o negativa se logra incubando células con uno o más anticuerpos u otro agente de unión que se une específicamente a uno o más marcadores de superficie expresados o expresados (marcador+) a un nivel relativamente más alto (marcador3110) en las células seleccionadas positiva o negativamente, respectivamente.
En algunos aspectos de la divulgación, los linfocitos T se separan de una muestra de PBMC mediante la selección negativa de marcadores expresados en células que no son linfocitos T, tales como los linfocitos B, monocitos u otros glóbulos blancos, tales como CD14. En algunos aspectos, se usa una etapa de selección CD4+ o CD8+ para separar linfocitos T CD4+ colaboradores y linfocitos T CD8+ citotóxicos. Tales poblaciones de CD4+ y CD8+ se pueden clasificar en subpoblaciones mediante la selección positiva o negativa de los marcadores expresados o expresados en un grado relativamente mayor en una o más subpoblaciones de linfocitos T sin exposición previa, de memoria y/o efectores.
En algunos aspectos de la divulgación, las células CD8+ se enriquecen aún más o se reducen en células sin exposición previa, de memoria central, de memoria efectora, y células madre de memoria central, tal como por selección positiva o negativa basada en antígenos de superficie asociados con la subpoblación respectiva. En algunos aspectos, el enriquecimiento para los linfocitos T de memoria central (Tcm) se lleva a cabo para aumentar la eficacia, tal como para mejorar la supervivencia a largo plazo, la expansión y/o injerto después de la administración, que en algunos aspectos es particularmente consistente en tales subpoblaciones. Véase Terakura et al. (2012) Blood. 1:72-82; Wang et al. (2012) J Immunother. 35(9):689-701. En algunas realizaciones, combinar linfocitos TCD8+ y linfocitos T CD4+ enriquecidos en TCM mejora adicionalmente su eficacia.
En algunas realizaciones, los linfocitos T de memoria están presentes en los subconjuntos CD62L+ y CD62L- de linfocitos CD8+ de sangre periférica. Las PBMC se pueden enriquecer o reducir en las fracciones Cd 62L-CD8+ y/o CD62L+CD8+, tales como el uso de anticuerpos anti-CD8 y anti-CD62L.
En algunos aspectos de la divulgación, el enriquecimiento de los linfocitos T de memoria central (Tcm) se basa en una expresión de superficie alta o positiva de CD45RO, CD62L, CCR7, CD28, CD3 y/o CD 127; en algunos aspectos, se basa en la selección negativa de células que expresan o expresan mucho CD45RA y/o granzima B. En algunos aspectos, aislamiento de una población CD8+ enriquecida para células Tcm se lleva a cabo mediante el agotamiento de las células que expresan CD4, CD14, CD45RA y selección positiva o enriquecimiento de células que expresan CD62L. En un aspecto, el enriquecimiento para los linfocitos T de memoria central (Tcm) se lleva a cabo a partir de una fracción negativa de células seleccionadas en función de la expresión de CD4, que se somete a una selección negativa basada en la expresión de CD14 y CD45RA, y una selección positiva basada en CD62L. Dichas selecciones en algunos aspectos se realizan de forma simultánea y en otros aspectos se llevan a cabo de forma secuencial, en cualquier orden. En algunos aspectos, la misma etapa de selección basada en la expresión de CD4 utilizada en la preparación de la población o subpoblación de células CD8+, también se usa para generar la población o subpoblación
de células CD4+, de manera que tanto las fracciones positivas como las negativas de la separación basada en CD4 se conserven y utilicen en las etapas posteriores de los métodos, opcionalmente tras una o más etapas de selección positiva o negativa adicionales.
En un ejemplo particular, una muestra de PBMC u otra muestra de glóbulos blancos se somete a selección de células CD4+, en donde se retienen las fracciones negativas y positivas. Después, la fracción negativa se somete a una selección negativa basada en la expresión de CD14 y CD45RA o ROR1, y a una selección positiva basada en un marcador característico de los linfocitos T de memoria central, tales como CD62L o CCR7, en donde las selecciones positivas y negativas se llevan a cabo en cualquier orden.
Los linfocitos T CD4+ colaboradores se pueden clasificar en células sin exposición previa, de memoria central y efectoras mediante la identificación de poblaciones celulares que tienen antígenos de superficie celular. Los linfocitos CD4+ se pueden obtener mediante métodos convencionales. Los linfocitos T CD4+ sin exposición previa pueden ser linfocitos T CD45RO-, CD45RA+, CD62L+, CD4+. Las células CD4+ de memoria central pueden ser CD62L+ y CD45RO+. Las células CD4+ efectoras pueden ser CD62L- y CD45RO-.
En un ejemplo, para el enriquecimiento en células CD4+ por selección negativa, un cóctel de anticuerpos monoclonales normalmente incluye anticuerpos contra CD14, CD20, CD11b, CD16, HLA-DR y CD8. En algunos aspectos de la divulgación, el anticuerpo o miembro de unión está unido a un soporte sólido o matriz, tal como una perla magnética o una perla paramagnética, para permitir la separación de células para la selección positiva y/o negativa. Por ejemplo, en algunos aspectos de la divulgación, las células y las poblaciones de células se separan o aíslan mediante técnicas de separación inmunomagnéticas (o magnéticas por afinidad) (revisadas en Methods in Molecular Medicine, vol. 58: Metastasis Research Protocols, Vol. 2: Cell Behavior In Vitro and In Vivo, p 17-25 Editado por: SA Brooks y U. Schumacher © Humana Press Inc., Totowa, NJ).
En algunos aspectos de la divulgación, la muestra o composición de células que se va a separar se incuba con pequeños materiales magnetizables o magnéticamente sensibles, tales como partículas o micropartículas magnéticamente sensibles, tales como perlas paramagnéticas (por ejemplo, perlas Dynabeads o MACS). El material magnéticamente sensible, por ejemplo, partículas, generalmente está unido directa o indirectamente a un miembro de unión, por ejemplo, un anticuerpo, que se une específicamente a una molécula, por ejemplo, un marcador de superficie, presente en la célula, células, o población de células que se desea separar, por ejemplo, que se desea seleccionar negativa o positivamente.
En algunos aspectos de la divulgación, la partícula o perla magnética comprende un material magnéticamente sensible unido a un miembro de unión específico, tal como usando un anticuerpo u otro miembro de unión. Hay muchos materiales magnéticamente sensibles bien conocidos que se utilizan en métodos de separación magnética. Las partículas magnéticas adecuadas incluyen las descritas en Molday, Patente de EE.UU. 4.452.773, y en la Memoria descriptiva de la Patente Europea EP 452342 B, que se incorporan en el presente documento a modo de referencia. Las partículas de tamaño coloidal, tales como las descritas en la patente de EE.UU. N.° 4.795.698 y Liberti et al., la Patente de EE.UU. 5.200.084 son otros ejemplos.
La incubación generalmente se lleva a cabo en condiciones en las que los anticuerpos o miembros de unión, o moléculas, tales como anticuerpos secundarios u otros reactivos, que se unen específicamente a dichos anticuerpos o miembros de unión, que están adheridos a la partícula o perla magnética, se unen específicamente a las moléculas de la superficie celular si están presentes en las células dentro de la muestra.
En algunos aspectos de la divulgación, la muestra se coloca en un campo magnético, y aquellas células que tienen partículas magnéticamente sensibles o magnetizables unidas a la misma serán atraídas por el imán y separadas de las células no marcadas. Para una selección positiva, se retienen las células que son atraídas por el imán; para la selección negativa, se retienen las células que no son atraídas (células sin marcar). En algunos aspectos, se realiza una combinación de selección positiva y negativa durante la misma etapa de selección, en donde las fracciones positivas y negativas se retienen y se procesan adicionalmente o se someten a etapas de separación adicionales.
En determinados aspectos de la divulgación, las partículas magnéticamente sensibles están recubiertas de anticuerpos primarios u otros miembros de unión, anticuerpos secundarios, lectinas, enzimas o estreptavidina. Las partículas magnéticas se pueden unir a las células mediante un recubrimiento de anticuerpos primarios específicos para uno o más marcadores. Las células, en lugar de las perlas, se pueden marcar con un anticuerpo primario o un miembro de unión, y luego se añaden partículas magnéticas recubiertas con un anticuerpo secundario específico del tipo celular u otro miembro de unión (por ejemplo, estreptavidina). Las partículas magnéticas recubiertas de estreptavidina se pueden usar junto con anticuerpos primarios o secundarios biotinilados.
En algunos aspectos de la divulgación, las partículas magnéticamente sensibles se dejan adheridas a las células que se incubarán posteriormente, se cultivarán y/o modificarán genéticamente; en algunos aspectos, las partículas se dejan adheridas a las células para su administración a un paciente. En algunos aspectos de la divulgación, las partículas magnetizables o magnéticamente sensibles se eliminan de las células. Los métodos para eliminar partículas magnetizables de las células son conocidos e incluyen, por ejemplo, el uso de anticuerpos competidores no marcados,
partículas magnetizables o anticuerpos conjugados con enlazadores escindibles, etc. En algunos aspectos, las partículas magnetizables son biodegradables.
En algunos aspectos de la divulgación, la selección basada en afinidad se realiza mediante clasificación de células activadas magnéticamente (MACS) (Miltenyi Biotech, Auburn, CA). Los sistemas de clasificación de células activadas magnéticamente (MACS) son capaces de realizar una selección de alta pureza de células que tienen partículas magnetizadas unidas a las mismas. En determinados aspectos de la divulgación, los MACS funcionan en un modo en el que las especies diana y no diana se eluyen de manera secuencial después de la aplicación del campo magnético externo. Es decir, las células adheridas a las partículas magnetizadas se mantienen en su lugar mientras se eluyen las especies no adheridas. Entonces, después de que se complete esta primera etapa de elución, las especies que quedaron atrapadas en el campo magnético y se impidió que eluyesen se liberan de alguna manera, de modo que se puedan eluir y recuperar. En determinados aspectos de la divulgación, las células no diana se marcan y se agotan de la población heterogénea de células.
En determinados aspectos de la divulgación, el aislamiento o separación se realiza mediante un sistema, dispositivo o aparato que lleva a cabo uno o más de las etapas de aislamiento, preparación celular, separación, procesamiento, incubación, cultivo y/o formulación de los métodos. En algunos aspectos, el sistema se utiliza para realizar cada una de estas etapas en un entorno cerrado o estéril, por ejemplo, para minimizar el error, la manipulación y/o contaminación del usuario. En un ejemplo, el sistema es un sistema tal como se describe en la Solicitud de Patente Internacional, Número de publicación WO2009/072003 o US 20110003380 A1.
En algunos aspectos de la divulgación, el sistema o aparato realiza una o más, por ejemplo, la totalidad de las etapas de aislamiento, procesamiento, ingeniería y formulación en un sistema integrado o autónomo, y/o de forma automatizada o programable. En algunos aspectos, el sistema o aparato incluye un ordenador y/o un programa informático en comunicación con el sistema o aparato, que permite a un usuario programar, controlar, evaluar el resultado y/o ajustar diversos aspectos de las etapas de procesamiento, aislamiento, modificación genética y formulación.
En algunos aspectos de la divulgación, la separación y/u otras etapas se llevan a cabo utilizando el sistema CliniMACS (Miltenyi Biotic), por ejemplo, para la separación automática de células a nivel clínico en un sistema cerrado y estéril. Los componentes pueden incluir un microordenador integrado, una unidad de separación magnética, una bomba peristáltica y diversas válvulas de manguito. El ordenador integrado en algunos aspectos controla todos los componentes del equipo y dirige el sistema para que realice procedimientos repetidos en una secuencia estandarizada. La unidad de separación magnética en algunos aspectos incluye un imán permanente móvil y un soporte para la columna de selección. La bomba peristáltica controla el caudal en todo el conjunto de tubos y, junto con las válvulas de manguito, asegura el flujo controlado de tampón a través del sistema y la suspensión continua de células.
El sistema CliniMACS en algunos aspectos de la divulgación utiliza partículas magnetizables acopladas a anticuerpos que se suministran en una solución estéril no pirógena. En algunos aspectos de la divulgación, después del marcaje de las células con partículas magnéticas, las células se lavan para eliminar el exceso de partículas. Luego se conecta una bolsa de preparación celular al conjunto de tubos, que a su vez está conectado a una bolsa que contiene tampón y una bolsa de recolección de células. El conjunto de tubos consta de tubos estériles premontados, incluyendo una precolumna y una columna de separación, y son para un solo uso. Después del inicio del programa de separación, el sistema aplica automáticamente la muestra de células en la columna de separación. Las células marcadas se retienen dentro de la columna, mientras que las células no marcadas se eliminan mediante una serie de etapas de lavado. En algunos aspectos de la divulgación, las poblaciones de células para su uso con los métodos descritos en el presente documento no están marcadas y no se retienen en la columna. En algunos aspectos, las poblaciones de células para su uso con los métodos descritos en el presente documento están marcadas y se retienen en la columna. En algunos aspectos, las poblaciones de células para su uso con los métodos descritos en el presente documento se eluyen de la columna después de la eliminación del campo magnético y se recogen dentro de la bolsa de recogida de células.
En determinados aspectos de la divulgación, la separación y/u otras etapas se llevan a cabo utilizando el sistema CliniMACS Prodigy (Miltenyi Biotec). El sistema CliniMACS Prodigy, en algunos aspectos, está equipado con una unidad de procesamiento de células que permite el lavado y el fraccionamiento automatizados de las células por centrifugación. El sistema CliniMACS Prodigy también puede incluir una cámara integrada y un programa informático de reconocimiento de imágenes que determina el punto final de fraccionamiento celular óptimo al discernir las capas macroscópicas del producto de la célula de origen. Por ejemplo, la sangre periférica se puede separar automáticamente en capas de eritrocitos, glóbulos blancos y plasma. El sistema CliniMACS Prodigy también puede incluir una cámara de cultivo celular integrada que cumple protocolos de cultivo celular tales como, por ejemplo, diferenciación y expansión celular, carga de antígeno y cultivo celular a largo plazo. Los puertos de entrada pueden permitir la extracción estéril y el reabastecimiento de los medios y las células se pueden monitorear usando un microscopio integrado. Véase, por ejemplo, Klebanoff etal. (2012) J Immunother. 35(9): 651-660, Terakuraet al. (2012) Blood.1:72-82 y Wang et al. (2012) J Immunother. 35(9):689-701.
En algunos aspectos de la divulgación, una población de células descrita en el presente documento se recolecta y
enriquece (o agota) mediante citometría de flujo, en la que las células teñidas para múltiples marcadores de superficie celular se transportan en una corriente fluídica. En algunos aspectos, una población de células descrita en el presente documento se recolecta y enriquece (o agota) mediante selección a escala preparativa (FACS). En determinados aspectos de la divulgación, una población celular descrita en el presente documento se recolecta y enriquece (o agota) mediante el uso de microplacas de sistemas microelectromecánicos (MEMS) en combinación con un sistema de detección basado en FACS (véase, por ejemplo, el documento WO 2010/033140, Cho et al. (2010) Lab Chip 10, 1567 1573; y Godin et al. (2008) J Biophoton. 1(5):355-376. En ambos casos, las células se pueden marcar con múltiples marcadores, lo que permite el aislamiento de subconjuntos de linfocitos T bien definidos con alta pureza.
En algunos aspectos de la divulgación, los anticuerpos o miembros de unión están marcados con uno o más marcadores detectables, para facilitar la separación por selección positiva y/o negativa. Por ejemplo, la separación se puede basar en la unión a anticuerpos marcados con fluorescencia. En algunos ejemplos, la separación de células basada en la unión de anticuerpos u otros miembros de unión específicos para uno o más marcadores de superficie celular se lleva a cabo en una corriente fluídica, tal como por selección de células activadas por fluorescencia (FACS), incluyendo microplacas de escala preparativa (FACS) y/o sistemas microelectromecánicos (MEMS), por ejemplo, en combinación con un sistema de detección de citometría de flujo. Dichos métodos permiten la selección positiva y negativa basada en múltiples marcadores de manera simultánea.
En algunos aspectos de la divulgación, los métodos de preparación incluyen etapas para congelar, por ejemplo, criopreservar, las células, ya sea antes o después del aislamiento, incubación y/o el diseño genético. En algunos aspectos de la divulgación, la etapa de congelación y descongelación posterior elimina los granulocitos y, hasta cierto punto, los monocitos en la población celular. En algunos aspectos, las células se suspenden en una solución de congelación, por ejemplo, tras una etapa de lavado para eliminar el plasma y las plaquetas. Se puede usar cualquiera de varias soluciones y parámetros de congelación conocidos en algunos aspectos. Un ejemplo implica el uso de PBS que contiene un DMSO al 20 % y albúmina de suero humano (HSA) al 8 % u otros medios de congelación de células adecuados. Esto luego se diluye a 1:1 con medio de modo que la concentración final de DMSO y HSA sea del 10 % y del 4 %, respectivamente. Después, las células se congelan a -80 °C. a razón de 1° por minuto y se almacenan en la fase de vapor de un tanque de almacenamiento de nitrógeno líquido.
En algunos aspectos de la divulgación, los métodos proporcionados incluyen las etapas de cultivo, incubación, cultivo y/o diseño genético. Por ejemplo, en algunos aspectos, se enseñan métodos para incubar y/o modificar genéticamente las poblaciones de células empobrecidas y las composiciones que inician el cultivo.
Por lo tanto, en algunos aspectos de la divulgación, las poblaciones de células se incuban en una composición de iniciación de cultivo. La incubación y/o la modificación genética se pueden llevar a cabo en un recipiente de cultivo, tal como una unidad, cámara, pocillo, columna, tubo, conjunto de tubos, válvula, vial, placa de cultivo, bolsa u otro recipiente para el cultivo de células.
Las células se pueden incubar y/o cultivar antes de o en conexión con el diseño genético. Las de incubación pueden incluir cultivo, estimulación, activación y/o propagación. En algunos aspectos de la divulgación, las composiciones o células se incuban en presencia de condiciones estimulantes o un agente estimulador. Tales condiciones incluyen las modificadas para inducir la proliferación, expansión, activación y/o supervivencia de células en la población, para imitar la exposición al antígeno y/o para cebar las células para el diseño genético, tal como para la introducción de un receptor de antígeno recombinante.
Las condiciones pueden incluir uno o más de medios particulares, temperatura, contenido de oxígeno, contenido de dióxido de carbono, tiempo, agentes, por ejemplo, nutrientes, aminoácidos, antibióticos, iones y/o factores estimulantes, tales como citocinas, quimiocinas, antígenos, miembros de unión, proteínas de fusión, receptores solubles recombinantes y cualquier otro agente modificado para activar las células.
En algunos aspectos de la divulgación, las condiciones o agentes estimuladores incluyen uno o más agentes, por ejemplo, ligando, que es capaz de activar un dominio de señalización intracelular de un complejo de TCR. En algunos aspectos, el agente activa o inicia la cascada de señalización intracelular de TCR/CD3 en un linfocito T. Dichos agentes pueden incluir anticuerpos, tales como los específicos para un componente de TCR y/o receptor coestimulador, por ejemplo, anti-CD3, anti-CD28, por ejemplo, unido a un soporte sólido tal como una perla, y/o una o más citocinas. Opcionalmente, el método de expansión puede comprender además la etapa de añadir anticuerpo anti-CD3 y/o anti CD28 al medio de cultivo (por ejemplo, a una concentración de al menos aproximadamente 0,5 ng/ml). En algunos aspectos de la divulgación, los agentes estimuladores incluyen IL-2 y/o IL-15, por ejemplo, una concentración de IL-2 de al menos aproximadamente 10 unidades/ml.
En algunos aspectos de la divulgación, la incubación se lleva a cabo de acuerdo con técnicas tales como las descritas en la patente de EE.UU. N.° 6.040.1 77 de Riddell. et al., Klebanoff et al.(2012) J Immunother. 35(9): 651-660, Terakuraet al. (2012) Blood. 1:72-82 y/o Wang et al. (2012) J Immunother. 35(9):689-701.
En algunos aspectos de la divulgación, los linfocitos T se expanden añadiendo a la composición de inicio del cultivo células alimentadoras, tales como las células mononucleares de sangre periférica que no se dividen (PBMC), (por
ejemplo, de manera que la población de células resultante contenga al menos aproximadamente 5, 10, 20 o 40 o más células alimentadoras de PBMC por cada linfocito T en la población inicial que se va a expandir); e incubar el cultivo (por ejemplo, durante un tiempo suficiente para expandir el número de linfocitos T). En algunos aspectos, las células alimentadoras que no se dividen pueden comprender células alimentadoras de PBMC irradiadas con rayos gamma. En algunos aspectos de la divulgación, las PBMC se irradian con rayos gamma en el intervalo de aproximadamente 3000 a 3600 rads para evitar la división celular. En algunos aspectos, las células alimentadoras se añaden al medio de cultivo antes de la adición de las poblaciones de linfocitos T.
En algunos aspectos de la divulgación, las condiciones estimulantes incluyen temperatura adecuada para el crecimiento de linfocitos T humanos, por ejemplo, al menos unos 25 grados Celsius, generalmente al menos aproximadamente 30 grados, y generalmente en o aproximadamente 37 grados Celsius. Opcionalmente, la incubación puede comprender además la adición de células linfoblastoides (LCL) transformadas con EBV que no se dividen como células alimentadoras. El LCL se puede irradiar con rayos gamma en el intervalo de aproximadamente 6000 a 10.000 rads. Las células alimentadoras LCL en algunos aspectos se proporcionan en cualquier cantidad adecuada, tal como una proporción de células alimentadoras de LCL a linfocitos T iniciales de al menos aproximadamente 10:1.
Los linfocitos T específicos de antígeno, tales como linfocitos T CD4+ y/o CD8+ específicos de antígeno, se puede obtener estimulando linfocitos T sin exposición previa o específicos de antígeno con antígeno. Por ejemplo, se pueden generar líneas o clones de linfocitos T específicos de antígeno para antígenos de citomegalovirus aislando linfocitos T de sujetos infectados y estimulando las células in vitro con el mismo antígeno.
II. Composiciones, métodos y usos
También se proporcionan composiciones que incluyen las moléculas de unión a ROR1 y las células modificadas genéticamente, según se define en las reivindicaciones adjuntas al presente documento, incluyendo composiciones y formulaciones farmacéuticas. También se desvelan en el presente documento métodos de uso y usos de las moléculas y composiciones, tales como en el tratamiento de enfermedades, afecciones y trastornos en los que se expresa ROR1 y/o métodos de detección, diagnóstico y pronóstico.
A. Composiciones y formulaciones farmacéuticas
Se proporcionan formulaciones farmacéuticas que incluyen la molécula de unión a ROR1 tal como se define en las reivindicaciones adjuntas al presente documento, por ejemplo, anticuerpo o receptor quimérico, y/o las células modificadas genéticamente que expresan las moléculas. Las composiciones y formulaciones farmacéuticas generalmente incluyen uno o más vehículos o excipientes opcionales farmacéuticamente aceptables. En algunas realizaciones, la composición incluye al menos un agente terapéutico adicional.
La expresión "formulación farmacéutica" se refiere a una preparación que se encuentra en una forma tal que permite que sea eficaz la actividad biológica de un principio activo contenido en la misma y que no contiene componentes adicionales que sean inaceptablemente tóxicos para un sujeto al que se administraría la formulación.
Un "vehículo farmacéuticamente aceptable" se refiere a un ingrediente en una formulación farmacéutica, distinto del principio activo, que no es tóxico para un sujeto. Un vehículo farmacéuticamente aceptable incluye, pero no se limita a, un tampón, un excipiente, estabilizante o conservante.
En algunos aspectos, la elección del vehículo se determina en parte por la célula en particular, la molécula de unión y/o el anticuerpo y/o por el método de administración. Por consiguiente, existe varias formulaciones adecuadas. Por ejemplo, la composición farmacéutica puede contener conservantes. Los conservantes adecuados pueden incluir, por ejemplo, metilparabeno, propilparabeno, benzoato de sodio y cloruro de benzalconio. En algunos aspectos, se utiliza una mezcla de dos o más conservantes. El conservante o las mezclas de los mismos están normalmente presentes en una cantidad de aproximadamente el 0,0001 % a aproximadamente el 2 % en peso de la composición total. Los vehículos se describen, por ejemplo, por Remington's Pharmaceutical Sciences 16a edición, Osol, A. Ed. (1980). Los vehículos farmacéuticamente aceptables normalmente son no tóxicos para los receptores a las dosis y concentraciones empleadas e incluyen, aunque no de forma limitativa: tampones, tales como fosfato, citrato y otros ácidos orgánicos; antioxidantes, incluyendo ácido ascórbico y metionina; conservantes (tales como cloruro de octadecildimetilbencilamonio; cloruro de hexametonio; cloruro de benzalconio; cloruro de bencetonio; fenol, alcohol butílico o bencílico; alquil parabenos tales como metil o propil parabeno; catecol; resorcinol; ciclohexanol; 3-pentanol; y m-cresol); polipéptidos de bajo peso molecular (menos de aproximadamente 10 restos); proteínas, tales como seroalbúmina, gelatina o inmunoglobulinas; polímeros hidrófilos tales como polivinilpirrolidona; aminoácidos tales como glicina, glutamina, asparagina, histidina, arginina o lisina; monosacáridos, disacáridos y otros hidratos de carbono incluyendo glucosa, manosa o dextrinas; agentes quelantes, tales como EDTA; azúcares, tales como sacarosa, manitol, trehalosa o sorbitol; contraiones formadores de sales, tales como sodio; complejos metálicos (por ejemplo complejos de Zn-proteína); y/o tensioactivos no iónicos, tales como polietilenglicol (PEG).
Los agentes tamponadores en algunos aspectos se incluyen en las composiciones. Los agentes tamponadores adecuados incluyen, por ejemplo, ácido cítrico, citrato sódico, ácido fosfórico, fosfato de potasio y diversos otros ácidos
y sales. En algunos aspectos, se usa una mezcla de dos o más agentes tamponadores. El agente tamponador o mezclas de los mismos están normalmente presentes en una cantidad de aproximadamente el 0,001 % a aproximadamente el 4 % en peso de la composición total. Se conocen métodos para preparar composiciones farmacéuticas administrables. Los métodos a modo de ejemplo se describen con más detalle en, por ejemplo, Remington: The Science and Practice of Pharmacy, Lippincott Williams & Wilkins; 21a ed. (1 de mayo de 2005).
Las formulaciones de los anticuerpos pueden incluir formulaciones liofilizadas y soluciones acuosas.
La formulación o composición también puede contener más de un principio activo útil para la indicación particular, enfermedad o afección que se está tratando con las moléculas o células de unión, preferentemente aquellas con actividades complementarias a la molécula o célula de unión, en donde las actividades respectivas no se afecten negativamente entre sí. Dichos principios activos están presentes de manera adecuada en combinaciones en cantidades que son eficaces para el fin previsto. Por lo tanto, en algunas realizaciones, la composición farmacéutica incluye además otros agentes o fármacos farmacéuticamente activos, tales como agentes quimioterapéuticos, por ejemplo, asparaginasa, busulfano, carboplatino, cisplatino, daunorrubicina, doxorrubicina, fluorouracilo, gemcitabina, hidroxiurea, metotrexato, paclitaxel, rituximab, vinblastina, vincristina, etc. En algunas realizaciones, las células o los anticuerpos se administran en forma de sal, por ejemplo, una sal farmacéuticamente aceptable. Las sales de adición de ácido farmacéuticamente aceptables adecuadas incluyen las derivadas de ácidos minerales, tales como ácido clorhídrico, bromhídrico, fosfórico, metafosfórico, nítrico y sulfúrico y ácidos orgánicos, tales como ácido tartárico, acético, cítrico, málico, láctico, fumárico, benzoico, glicólico, glucónico, succínico y arilsulfónico, por ejemplo, ácido ptoluenosulfónico.
Los principios activos pueden atraparse en microcápsulas, en sistemas de administración de fármacos coloidales (por ejemplo, liposomas, microesferas de albúmina, microemulsiones, nanopartículas y nanocápsulas) o en macroemulsiones. En ciertas realizaciones, la composición farmacéutica está formulada como un complejo de inclusión, tal como el complejo de inclusión de ciclodextrina o como un liposoma. Los liposomas pueden servir para dirigir las células hospedadoras (por ejemplo, linfocitos T o células NK) a un tejido particular. Hay muchos métodos disponibles para preparar liposomas, tales como los descritos en, por ejemplo, Szoka et al., Ann. Rev. Biophys. Bioeng., 9: 467 (1980), y las Patentes de Estados Unidos 4.235.871,4.501.728, 4.837.028 y 5.019.369.
En algunos aspectos, la composición farmacéutica puede emplear sistemas de administración de liberación prolongada, de liberación retardada y de liberación sostenida de modo que la administración de la composición se produzca antes y con tiempo suficiente para provocar, la sensibilización del sitio que se vaya a tratar. Hay muchos tipos de sistemas de administración de liberación disponibles y conocidos. Dichos sistemas pueden evitar administraciones repetidas de la composición, aumentando así la comodidad para el sujeto y el médico.
La composición farmacéutica en algunas realizaciones contiene las moléculas de unión y/o células en cantidades eficaces para tratar o prevenir la enfermedad o afección, tales como una cantidad terapéuticamente eficaz o profilácticamente eficaz. La eficacia terapéutica o profiláctica en algunas realizaciones se controla mediante la evaluación periódica de los sujetos tratados. Para administraciones repetidas a lo largo de varios días o un periodo mayor, dependiendo de la afección, se repite el tratamiento hasta que se produzca una supresión deseada de los síntomas de enfermedad. Sin embargo, otros regímenes de dosificación pueden ser útiles y se pueden determinar. La dosis deseada se puede administrar mediante la administración de un solo bolo de la composición, mediante múltiples administraciones de bolo de la composición, o mediante la administración de infusión continua de la composición.
En determinadas realizaciones [[o jjde ja divulgación, en el contexto de células modificadas genéticamente que contienen las moléculas de unión, a un sujeto se le administra en el intervalo de aproximadamente un millón a aproximadamente 100 mil millones de células, tales como, por ejemplo, de 1 millón a aproximadamente 50 mil millones de células (por ejemplo, aproximadamente 5 millones de células, aproximadamente 25 millones de células, aproximadamente 500 millones de células, aproximadamente mil millones de células, aproximadamente 5 mil millones de células, aproximadamente 20 mil millones de células, aproximadamente 30 mil millones de células, aproximadamente 40 mil millones de células o un intervalo definido por dos de los valores anteriores), tal como de aproximadamente 10 millones a aproximadamente 100 mil millones de células (por ejemplo, aproximadamente 20 millones de células, aproximadamente 30 millones de células, aproximadamente 40 millones de células, aproximadamente 60 millones de células, aproximadamente 70 millones de células, aproximadamente 80 millones de células, aproximadamente 90 millones de células, aproximadamente 10 mil millones de células, aproximadamente 25 mil millones de células, aproximadamente 50 mil millones de células, aproximadamente 75 mil millones de células, aproximadamente 90 mil millones de células, o un intervalo definido por dos de los valores anteriores) y, en algunos casos, aproximadamente 100 millones de células y aproximadamente 50 mil millones de células (por ejemplo, aproximadamente 120 millones de células, aproximadamente 250 millones de células, aproximadamente 350 millones de células, aproximadamente 450 millones de células, aproximadamente 650 millones de células, aproximadamente 800 millones de células, aproximadamente 900 millones de células, aproximadamente 3 mil millones de células, aproximadamente 30 mil millones de células, aproximadamente 45 mil millones de células) o cualquier valor entre estos intervalos y/o tal número de células por kilogramo de peso corporal del sujeto.
Esto se puede administrar utilizando técnicas de administración, formulaciones y/o dispositivos convencionales. Se
proporcionan formulaciones y dispositivos, tales como jeringas y viales, para el almacenamiento y la administración de las composiciones. La administración de las células puede ser autóloga o heteróloga. Por ejemplo, se pueden obtener células o progenitores inmunosensibles de un sujeto y administrarlas al mismo sujeto o a un sujeto diferente compatible. Las células inmunosensibles obtenidas de sangre periférica o su progenie (por ejemplo, obtenidas in vivo, ex vivo o in vitro) se pueden administrar mediante inyección localizada, incluida la administración por catéter, inyección sistémica, inyección localizada, inyección intravenosa o administración parenteral. Cuando se administra una composición terapéutica (por ejemplo, una composición farmacéutica que contiene una célula inmunosensible modificada genéticamente), generalmente se formulará en forma de dosis unitaria inyectable (solución, suspensión, emulsión).
Las formulaciones incluyen aquellas para administración oral, intravenosa, intraperitoneal, subcutánea, pulmonar, transdérmica, intramuscular, intranasal, bucal, sublingual o por supositorio. En algunas realizaciones, las poblaciones de células se administran por vía parenteral. El término "parenteral", tal como se usa en el presente documento, incluye la administración intravenosa, intramuscular, subcutánea, rectal, vaginal, intracraneal, intratorácica e intraperitoneal. En algunas realizaciones, las poblaciones de células se administran a un sujeto mediante administración sistémica periférica por inyección intravenosa, intraperitoneal o subcutánea.
Las composiciones en algunas realizaciones se proporcionan como preparaciones líquidas estériles, por ejemplo, soluciones acuosas isotónicas, suspensiones, emulsiones, dispersiones o composiciones viscosas, que, en algunos aspectos, pueden tamponarse a un pH seleccionado. Las preparaciones líquidas son normalmente más fáciles de preparar que los geles, otras composiciones viscosas y composiciones sólidas. De forma adicional, las composiciones líquidas son algo más cómodas de administrar, especialmente por inyección. Las composiciones viscosas, por otro lado, se pueden formular dentro del intervalo de viscosidad apropiado para proporcionar períodos de contacto más largos con tejidos específicos. Las composiciones líquidas o viscosas pueden comprender vehículos, que pueden ser un disolvente o medio de dispersión que contenga, por ejemplo, agua, solución salina, solución salina tamponada con fosfato, polioi (por ejemplo, glicerol, propilenglicol, polietilenglicol líquido) y mezclas adecuadas de los mismos.
Se pueden preparar soluciones inyectables estériles incorporando la molécula de unión en un disolvente, tal como en mezcla con un vehículo adecuado, diluyente o excipiente tal como agua esterilizada, solución salina fisiológica, glucosa, dextrosa o similares. Las composiciones también se pueden liofilizar. Las composiciones pueden contener sustancias auxiliares tales como humectantes, agentes dispersantes o emulsionantes (por ejemplo, metilcelulosa), agentes tamponadores del pH, aditivos gelificantes o potenciadores de viscosidad, conservantes, agentes aromatizantes, colores, y similares, dependiendo de la vía de administración y la preparación deseada. En algunos aspectos, se pueden consultar los textos convencionales para preparar preparaciones adecuadas.
Se pueden añadir diversos aditivos que mejoran la estabilidad y esterilidad de las composiciones, incluidos los conservantes antimicrobianos, antioxidantes, agentes quelantes y tampones. Se puede asegurar la prevención de la acción de microorganismos mediante diversos agentes antibacterianos y antifúngicos, por ejemplo, parabenos, clorobutanol, fenol, ácido sórbico y similares. La absorción prolongada de la forma farmacéutica inyectable se puede conseguir por la inclusión de agentes que retrasan la absorción, por ejemplo, monoestearato de aluminio y gelatina.
Se pueden preparar preparaciones de liberación sostenida. Los ejemplos adecuados de preparaciones de liberación sostenida incluyen matrices semipermeables de polímeros hidrófobos sólidos que contienen el anticuerpo, teniendo dichas matrices una forma de artículos conformados, por ejemplo, películas o microcápsulas.
Las formulaciones que se van a usar para la administración in vivo son, generalmente, estériles. Puede lograrse fácilmente la esterilidad, por ejemplo, mediante filtración a través de membranas de esterilización por filtración.
B. Métodos y usos terapéuticos y profilácticos
También se desvelan métodos de administración y usos, tales como los usos terapéuticos y profilácticos, de las moléculas de unión a ROR1, incluidos los anticuerpos anti-ROR1, por ejemplo, fragmentos de anticuerpos y proteínas que contienen los mismos, tales como los receptores quiméricos, y/o células manipuladas que expresan los receptores recombinantes. Dichos métodos y usos incluyen métodos y usos terapéuticos, por ejemplo, que implica la administración de las moléculas, células, o composiciones que contengan las mismas, a un sujeto que tiene una enfermedad, afección o trastorno que expresa o está asociado con la expresión de ROR1, y/o en el que las células o tejidos se expresan, por ejemplo, expresan de manera específica, ROR1. En algunos aspectos de la divulgación, la molécula, célula y/o composición se administra en una cantidad eficaz para efectuar el tratamiento de la enfermedad o trastorno. Los usos incluyen usos de las moléculas de unión, los CAR, anticuerpos y células en dichos métodos y tratamientos, y en la preparación de un medicamento para llevar a cabo dichos métodos terapéuticos. En algunos aspectos de la divulgación, los métodos se llevan a cabo mediante la administración de los anticuerpos o células, o composiciones que los comprenden, al sujeto que tiene, que está teniendo o que se sospecha que tiene la enfermedad o afección. En algunos aspectos de la divulgación, los métodos de ese modo tratan la enfermedad o afección o trastorno en el sujeto.
Tal como se usa en el presente documento, "tratamiento" (y variaciones gramaticales del mismo tales como "tratar" o
"que trata") se refiere a la mejora o reducción completa o parcial de una enfermedad o afección o trastorno, o un síntoma, efecto o resultado adverso, o fenotipo asociado con el mismo. Los efectos deseables del tratamiento incluyen, pero sin limitación, prevenir la aparición o recidiva de la enfermedad, el alivio de los síntomas, la disminución de cualesquiera consecuencias patológicas directas o indirectas de la enfermedad, prevenir la metástasis, disminuir la velocidad de progresión de la enfermedad, mejora o paliación de la patología y remisión o pronóstico mejorado. Los términos no implican la curación completa de una enfermedad o la eliminación completa de cualquier síntoma o efecto(s) en todos los síntomas o resultados.
Tal como se usa en el presente documento, "retrasar el desarrollo de una enfermedad" significa diferir, impedir, ralentizar, retardar, estabilizar, suprimir y/o posponer el desarrollo de la enfermedad (como el cáncer). Este retraso puede ser de diferentes períodos de tiempo, dependiendo de los antecedentes de la enfermedad y/o del individuo que se trate. Como es evidente para un experto en la materia, un retraso suficiente o significativo puede, en efecto, incluir la prevención, en el sentido de que el individuo no desarrolla la enfermedad. Por ejemplo, un cáncer en estadio avanzado, tal como el desarrollo de metástasis, puede retrasarse.
"Prevenir", tal como se usa en el presente documento, incluye proporcionar profilaxis con respecto a la aparición o recurrencia de una enfermedad en un sujeto que puede estar predispuesto a la enfermedad pero que aún no ha sido diagnosticado con la enfermedad. En algunos aspectos de la divulgación, las moléculas y composiciones proporcionadas se usan para retrasar el desarrollo de una enfermedad o para frenar la progresión de una enfermedad.
Tal como se usa en el presente documento, "suprimir" una función o actividad es reducir la función o actividad en comparación con las mismas condiciones, excepto por una condición o parámetro de interés, o alternativamente, en comparación con otra condición. Por ejemplo, un anticuerpo o composición o célula que suprime el crecimiento tumoral reduce la tasa de crecimiento del tumor en comparación con la tasa de crecimiento del tumor en ausencia del anticuerpo o composición o célula.
Una "cantidad eficaz" de un agente, por ejemplo, una formulación farmacéutica, molécula de unión, anticuerpo, o células, o composición, en el contexto de la administración, se refiere a una cantidad eficaz, a las dosis/cantidades y durante los periodos de tiempo necesarios, para lograr un resultado deseado, tal como un resultado terapéutico o profiláctico.
Una "cantidad terapéuticamente eficaz" de un agente, por ejemplo, una formulación farmacéutica, anticuerpo o células, se refiere a una cantidad eficaz, a las dosis y durante los periodos de tiempo necesarios, para lograr un resultado terapéutico deseado, tal como para el tratamiento de una enfermedad, afección o trastorno y/o efecto farmacocinético o farmacodinámico del tratamiento. La cantidad terapéuticamente eficaz puede variar de acuerdo con factores tales como el estado de la enfermedad, la edad, el sexo, el peso del sujeto y las poblaciones de células administradas. En algunos aspectos de la divulgación, los métodos implican administrar las moléculas, células y/o composiciones en cantidades eficaces, por ejemplo, cantidades terapéuticamente eficaces.
Una "cantidad profilácticamente eficaz" se refiere a una cantidad que es eficaz, a las dosis y durante los periodos de tiempo necesarios, para lograr el resultado profiláctico deseado. Generalmente, pero no necesariamente, dado que se usa una dosis profiláctica en sujetos antes de o en una etapa más temprana de la enfermedad, la cantidad profilácticamente eficaz será menor que la cantidad terapéuticamente eficaz.
Tal como se usa en el presente documento, un "sujeto" es un mamífero, tal como un ser humano u otro animal, y normalmente es un ser humano.
Entre las enfermedades que se van a tratar se encuentra cualquier enfermedad o afección asociada a ROR1 o enfermedad o afección en la que se expresa específicamente ROR1. En determinadas enfermedades y afecciones, ROR1 se expresa en células malignas y cánceres. En algunas realizaciones, la enfermedad o afección es un cáncer que expresa ROR1. Entre las enfermedades o afecciones asociadas con ROR1 que se pueden tratar se incluyen, pero sin limitación, leucemia de linfocitos B, linfoma, leucemia linfocítica crónica de linfocitos B (LLC), LMA, leucemia mieloide aguda (LMA), leucemia linfocítica aguda (LLA), linfoma de Burkett, linfoma de células del manto (MCL), cáncer de pulmón no microcítico (CPNM), neuroblastoma, carcinoma de células renales, cáncer de colon, cáncer colorrectal, cáncer de mama, cáncer de células escamosas epiteliales, melanoma, mieloma, cáncer de estómago, cáncer de cerebro, cáncer de pulmón, cáncer de páncreas, cáncer de cuello del útero, cáncer de ovario, cáncer de hígado, cáncer de vejiga, cáncer de próstata, cáncer de testículos, cáncer de tiroides, cáncer de útero, cáncer suprarrenal y cáncer de cabeza y cuello.
En algunas enseñanzas, los métodos pueden identificar a un sujeto que tiene, se sospecha que tiene o está en riesgo de desarrollar una enfermedad o trastorno asociado a ROR1. Por lo tanto, se enseñan métodos para identificar sujetos con enfermedades o trastornos asociados con una expresión elevada de ROR1 y seleccionarlos para el tratamiento con una molécula de unión a ROR1 proporcionada, incluyendo cualquiera de los anticuerpos anti-ROR1, por ejemplo, fragmentos de anticuerpos y proteínas que contienen los mismos, tales como los receptores quiméricos, y/o células manipuladas que expresan los receptores recombinantes.
Por ejemplo, un sujeto puede ser examinado para detectar la presencia de una enfermedad o trastorno asociado con una expresión elevada de ROR1, tal como un cáncer que expresa ROR1. En algunos aspectos de la divulgación, los métodos incluyen el cribado o la detección de la presencia de una enfermedad asociada a ROR1, por ejemplo, un tumor. Por lo tanto, en algunos aspectos, se puede obtener una muestra de un paciente sospechoso de tener una enfermedad o trastorno asociado con una expresión elevada de ROR1 y analizar el nivel de expresión de ROR1. En algunos aspectos, un sujeto que da positivo para una enfermedad o trastorno asociado a ROR1 se puede seleccionar para el tratamiento mediante los presentes métodos, y se le puede administrar una cantidad terapéuticamente eficaz de un anticuerpo de ROR1, CAR que expresa ROR1, células que contienen un CAR o una composición farmacéutica del mismo tal como se describe en el presente documento. En algunos aspectos de la divulgación, los métodos se pueden utilizar para controlar el tamaño o la densidad de un tejido que expresa ROR1, por ejemplo, tumor, con el tiempo, por ejemplo, antes, durante o después del tratamiento con los métodos.
En algunas enseñanzas, el sujeto tiene una enfermedad persistente o recidivante, por ejemplo, después del tratamiento con otro anticuerpo específico de ROR1 y/o células que expresan un receptor quimérico dirigido a ROR1 y/u otra terapia, incluida la quimioterapia, radiación y/o trasplante de células madre hematopoyéticas (TCMH), por ejemplo, TCMH alogénico. En algunas enseñanzas, la administración trata eficazmente al sujeto a pesar de que el sujeto se ha vuelto resistente a otra terapia dirigida a ROR1. En algunas enseñanzas, el sujeto no ha recaído, pero se determina que está en riesgo de recaída, como con alto riesgo de recaída y, por lo tanto, el compuesto o composición se administra de forma profiláctica, por ejemplo, para reducir la probabilidad de recaída o prevenirla.
En algunas enseñanzas, el tratamiento no induce una respuesta inmunitaria por parte del sujeto a la terapia y/o no induce tal respuesta en un grado que impida el tratamiento eficaz de la enfermedad o afección. En algunos aspectos de la divulgación, el grado de inmunogenicidad y/o respuesta de injerto contra huésped es menor que el observado con un tratamiento diferente pero comparable. Por ejemplo, en el caso de la terapia celular adoptiva utilizando células que expresan CAR, incluidos los anticuerpos anti-ROR1 proporcionados, el grado de inmunogenicidad en algunas realizaciones se reduce en comparación con los CAR que incluyen un anticuerpo diferente que se une a un anticuerpo similar, por ejemplo, epítopo superpuesto y/o que compite por unirse a ROR1 con el anticuerpo proporcionado, tal como un anticuerpo de ratón o conejo o humanizado.
En algunas enseñanzas, los métodos incluyen la terapia celular adoptiva, por lo que se administran a sujetos células modificadas genéticamente que expresan los receptores que contienen anti-ROR1 proporcionados (por ejemplo, CAR dirigidos a ROR1). Dicha administración puede promover la activación de las células (por ejemplo, activación de linfocitos T) de una manera dirigida a ROR1, de tal manera que las células de la enfermedad o trastorno se dirijan a la destrucción.
Por lo tanto, los métodos y usos enseñados incluyen métodos y usos para la terapia celular adoptiva. En algunas enseñanzas, los métodos incluyen la administración de las células o una composición que contiene las células a un sujeto, tejido o células, tal como uno que tiene, está en riesgo o sospecha de tener la enfermedad, afección o trastorno. En algunas enseñanzas, las células, poblaciones, y las composiciones se administran a un sujeto que tiene la enfermedad o afección particular que se va a tratar, por ejemplo, mediante terapia celular adoptiva, como la terapia adoptiva de linfocitos T. En algunas enseñanzas, las células o composiciones se administran al sujeto, tal como un sujeto que tiene o está en riesgo de tener la enfermedad o afección. En algunas enseñanzas, los métodos de ese modo tratan, por ejemplo, reduce uno o más síntomas de una enfermedad o afección, tal como reduciendo la carga tumoral en un cáncer que expresa ROR1.
Los métodos para la administración de células para terapia celular adoptiva son conocidos y se pueden usar en relación con los métodos y composiciones desvelados. Por ejemplo, se describen los métodos de terapia adoptiva de linfocitos T, por ejemplo, en la Publicación de Solicitud de Patente de Estados Unidos N.° 2003/0170238 de Gruenberg et al; la Patente de Estados Unidos N.° 4.690.915 de Rosenberg; Rosenberg (2011) Nat Rev Clin Oncol. 8(10):577-85). Véase, por ejemplo, Themeli et al. (2013) Nat Biotechnol. 31(10): 928-933; Tsukahara et al. (2013) Biochem Biophys Res Commun 438(1): 84-9; Davila et al. (2013) PLoS ONE 8(4): e61338.
En algunas enseñanzas, la terapia celular, por ejemplo, terapia celular adoptiva, por ejemplo, terapia adoptiva de linfocitos T, se realiza mediante transferencia autóloga, en la que las células se aíslan y/o se preparan de otro modo a partir del sujeto que va a recibir la terapia celular, o de una muestra obtenida de dicho sujeto. Por lo tanto, en algunas enseñanzas, las células se obtienen de un sujeto, por ejemplo, paciente, que necesita un tratamiento y las células, después del aislamiento y el procesamiento se administran al mismo sujeto.
En algunas enseñanzas, la terapia celular, por ejemplo, terapia celular adoptiva, por ejemplo, terapia adoptiva de linfocitos T, se lleva a cabo mediante transferencia alogénica, en la que las células se aíslan y/o preparan de otro modo a partir de un sujeto que no sea un sujeto que va a recibir o que finalmente recibe la terapia celular, por ejemplo, un primer sujeto. En tales enseñanzas, las células luego se administran a un sujeto diferente, por ejemplo, un segundo sujeto, de la misma especie. El primer y segundo sujetos pueden ser genéticamente idénticos. En algunas enseñanzas, los sujetos primero y segundo son genéticamente similares. En algunas enseñanzas, el segundo sujeto expresa la misma clase o supertipo de HLA que el primer sujeto.
En algunas enseñanzas, el sujeto, al que se le administran las células, poblaciones celulares o composiciones es un primate, tal como un ser humano. En algunas enseñanzas, el primate es un mono o un simio. El sujeto puede ser hombre o mujer y puede tener cualquier edad adecuada, incluido un sujeto bebé, juvenil, adolescente, adulto y geriátrico. En algunas enseñanzas, el sujeto es un mamífero no primate, tal como un roedor. En algunos ejemplos, el paciente o sujeto es un modelo animal validado para la enfermedad, terapia celular adoptiva y/o para evaluar resultados tóxicos tales como el síndrome de liberación de citocinas (CRS).
Las moléculas de unión a ROR1 definidas por las reivindicaciones adjuntas, tales como anticuerpos y receptores quiméricos que contienen los anticuerpos y células que expresan los mismos, se pueden administrar por cualquier medio adecuado, por ejemplo, mediante inyección, por ejemplo, inyecciones intravenosas o subcutáneas, inyección intraocular, inyección periocular, inyección subretiniana, inyección intravítrea, inyección transeptal, inyección subescleral, inyección intracoroidea, inyección intracameral, inyección subconjuntiva, inyección de sub-Tenon, inyección retrobulbar, inyección peribulbar o administración yuxtascleral posterior. En algunas realizaciones, se administran por vía parenteral, intrapulmonar e intranasal y, si se desea para un tratamiento local, administración intralesional. Las infusiones parenterales incluyen la administración intramuscular, intravenosa, intraarterial, intraperitoneal, intracraneal, intratorácica o subcutánea. La dosificación y la administración pueden depender en parte de si la administración es breve o crónica. Diversas pautas de dosificación incluyen, pero no se limitan a, administraciones únicas o múltiples en diversos puntos de tiempo, administración de bolo e infusión de pulsos.
Para la prevención o el tratamiento de la enfermedad, la dosis adecuada de la molécula o célula de unión puede depender del tipo de enfermedad que se va a tratar, del tipo de molécula de unión, de la gravedad y del trascurso de la enfermedad, de si la molécula de unión se administra con fines preventivos o terapéuticos, de la terapia previa, del historial clínico del paciente y de la respuesta a la molécula de unión y del criterio del médico tratante. En algunas realizaciones, las composiciones, moléculas y células se administran adecuadamente al paciente de una vez o durante una serie de tratamientos.
Dependiendo del tipo y de la gravedad de la enfermedad, las dosis de anticuerpos pueden incluir aproximadamente de 1 jg/kg a 15 mg/kg (por ejemplo, 0,1 mg/kg-10 mg/kg), aproximadamente de 1 jg/kg a 100 mg/kg o más, aproximadamente de 0,05 mg/kg a aproximadamente 10 mg/kg, 0,5 mg/kg, 2,0 mg/kg, 4,0 mg/kg o 10 mg/kg. Se pueden administrar varias dosis de forma intermitente, por ejemplo, cada semana o cada tres semanas. Se puede administrar una dosis de carga inicial superior, seguida de una o más dosis inferiores.
En ciertas enseñanzas, en el contexto de células modificadas genéticamente que contienen las moléculas de unión, a un sujeto se le administra el intervalo de aproximadamente un millón a aproximadamente 100 mil millones de células y/o esa cantidad de células por kilogramo de peso corporal, tales como, por ejemplo, de 1 millón a aproximadamente 50 mil millones de células (por ejemplo, aproximadamente 5 millones de células, aproximadamente 25 millones de células, aproximadamente 500 millones de células, aproximadamente mil millones de células, aproximadamente 5 mil millones de células, aproximadamente 20 mil millones de células, aproximadamente 30 mil millones de células, aproximadamente 40 mil millones de células o un intervalo definido por dos de los valores anteriores), tal como alrededor de 10 millones a alrededor de 100 mil millones de células (por ejemplo, alrededor de 20 millones de células, aproximadamente 30 millones de células, aproximadamente 40 millones de células, aproximadamente 60 millones de células, aproximadamente 70 millones de células, aproximadamente 80 millones de células, aproximadamente 90 millones de células, aproximadamente 10 mil millones de células, aproximadamente 25 mil millones de células, aproximadamente 50 mil millones de células, aproximadamente 75 mil millones de células, aproximadamente 90 mil millones de células, o un intervalo definido por dos de los valores anteriores) y, en algunos casos, aproximadamente 100 millones de células y aproximadamente 50 mil millones de células (por ejemplo, aproximadamente 120 millones de células, aproximadamente 250 millones de células, aproximadamente 350 millones de células, aproximadamente 450 millones de células, aproximadamente 650 millones de células, aproximadamente 800 millones de células, aproximadamente 900 millones de células, aproximadamente 3 mil millones de células, aproximadamente 30 mil millones de células, aproximadamente 45 mil millones de células) o cualquier valor entre estos intervalos y/o por kilogramo de peso corporal. De nuevo, las dosis pueden variar dependiendo de los atributos particulares de la enfermedad o trastorno y/o del paciente y/u otros tratamientos.
En algunas enseñanzas, las células o los anticuerpos se administran como parte de un tratamiento combinado, tal como de manera simultánea o de manera secuencial con, en cualquier orden, otra intervención terapéutica, tal como otro anticuerpo o célula o receptor o agente modificado genéticamente, tal como un agente citotóxico o terapéutico.
Las células o los anticuerpos se pueden coadministrar con uno o más agentes terapéuticos adicionales o en conexión con otra intervención terapéutica, bien de forma simultánea o secuencial en cualquier orden. En algunos contextos, las células se coadministran con otra terapia lo suficientemente cercana en el tiempo como para que las poblaciones de células mejoren el efecto de uno o más agentes terapéuticos adicionales, o viceversa. En algunas enseñanzas, las células o los anticuerpos se administran antes que uno o más agentes terapéuticos adicionales. En algunas enseñanzas, las células o anticuerpos se administran después al uno o más agentes terapéuticos adicionales.
Una vez que las células se administran a un mamífero (por ejemplo, a un ser humano), la actividad biológica de las poblaciones de células manipuladas y/o anticuerpos en algunos aspectos se mide mediante cualquiera de varios
métodos conocidos. Los parámetros a evaluar incluyen la unión específica de un linfocito T natural o modificado genéticamente u otra célula inmunitaria al antígeno, in vivo, por ejemplo, por obtención de imágenes, o ex vivo, por ejemplo, por ELISA o citometría de flujo. La capacidad de las células modificadas genéticamente para destruir las células diana se puede medir utilizando cualquier método adecuado conocido en la técnica, tal como los ensayos de citotoxicidad descritos en, por ejemplo, Kochenderfer et al., J. Immunotherapy, 32(7): 689-702 (2009) y Herman et al. J. Immunological Methods, 285(1): 25-40 (2004). En ciertas enseñanzas, la actividad biológica de las células también se puede medir analizando la expresión y/o secreción de ciertas citocinas, tales como CD 107a, IFNy, IL-2 y TNF. En algunas enseñanzas, la actividad biológica se mide evaluando el resultado clínico, tal como la reducción de la carga o carga tumoral.
En ciertas enseñanzas, las células modificadas genéticamente se modifican de diversas formas, de manera que se incremente su eficacia terapéutica o profiláctica. Por ejemplo, el CAR o TCR modificado genéticamente expresado por la población en algunas realizaciones se conjuga directa o indirectamente a través de un enlazador con un resto de direccionamiento. La práctica de conjugar compuestos, por ejemplo, el CAR o TCR, con restos de direccionamiento es conocida en la técnica. Véase, por ejemplo, Wadwa et al., J. Drug Targeting 3: 111 (1995), y la Patente de Estados Unidos 5.087.616.
C. Métodos de diagnóstico y detección
También se enseñan métodos que implican el uso de las moléculas de unión proporcionadas, por ejemplo, anticuerpos, en la detección de ROR1, por ejemplo, en métodos de diagnóstico y/o pronóstico en asociación con una enfermedad o afección que expresa ROR1. Los métodos pueden incluir incubar una muestra biológica con el anticuerpo y/o administrar el anticuerpo a un sujeto. Una muestra biológica puede incluir una célula o tejido, tal como tejido tumoral o canceroso. En determinados aspectos de la divulgación, el contacto se realiza en condiciones permisivas para la unión del anticuerpo anti-ROR1 a ROR1 y para detectar si se forma un complejo entre el anticuerpo anti-ROR1 y ROR1. Dicho método puede ser un método in vitro o in vivo. En un aspecto de la divulgación, se usa un anticuerpo anti-ROR1 para seleccionar sujetos elegibles para la terapia con un anticuerpo anti-ROR1 o receptor de antígeno modificado genéticamente, por ejemplo, donde ROR1 es un biomarcador para la selección de pacientes.
En algunos aspectos de la divulgación, una muestra, tal como una célula, muestra de tejido, lisado, composición, u otra muestra obtenida de los mismos se pone en contacto con el anticuerpo anti-ROR1 y se determina o detecta la unión o formación de un complejo entre el anticuerpo y la muestra (por ejemplo, ROR1 en la muestra). Cuando se demuestra o detecta la unión en la muestra de prueba en comparación con una célula de referencia del mismo tipo de tejido, puede indicar la presencia de una enfermedad o afección asociada. En algunos aspectos de la divulgación, la muestra es de tejidos humanos.
Se pueden usar diversos métodos conocidos en la técnica para detectar la unión de anticuerpo-antígeno específico. Los inmunoensayos a modo de ejemplo incluyen inmunoensayo de polarización de fluorescencia (FPIA), inmunoensayo de fluorescencia (FIA), inmunoensayo enzimático (EIA), inmunoensayo de inhibición nefelométrica (NIA), ensayo inmunoabsorbente ligado a enzimas (ELISA) y radioinmunoensayo (RIA). Un grupo indicador o un grupo de marcaje, puede unirse a los anticuerpos del sujeto y se selecciona para satisfacer las necesidades de diversos usos del método que a menudo están dictados por la disponibilidad de los equipos de ensayo y los procedimientos de inmunoensayo compatibles. Los ejemplos de marcadores incluyen radionucleidos (por ejemplo, 125I, 131I, 35S, 3H o 32P), enzimas (por ejemplo, fosfatasa alcalina, peroxidasa de rábano picante, luciferasa o p-glactosidasa), restos o proteínas fluorescentes (por ejemplo, fluoresceína, rodamina, ficoeritrina, GFP o BFP), o restos luminiscentes (por ejemplo, nanopartículas Qdot™ suministradas por Quantum Dot Corporation, Palo Alto, Calif.). Los expertos en la técnica conocen las técnicas generales que se utilizarán para realizar los diversos inmunoensayos mencionados anteriormente.
Para fines de diagnóstico, los anticuerpos se pueden marcar con un resto detectable que incluye, pero sin limitación, radioisótopos, marcadores fluorescentes y diversos marcadores enzima-sustrato conocidos en la técnica. Los métodos para conjugar marcadores con un anticuerpo se conocen en la técnica.
En algunas realizaciones, los anticuerpos no necesitan marcarse, y la presencia de los mismos se puede detectar usando un anticuerpo marcado que se une a los anticuerpos.
Los anticuerpos proporcionados en algunas realizaciones se pueden emplear en cualquier método de ensayo conocido, tales como ensayos de unión competitiva, ensayos de tipo sándwich directos e indirectos, y ensayos de inmunoprecipitación. Zola, "Monoclonal Antibodies: A Manual of Techniques, págs. 147-158 (CRC Press, Inc. 1987).
Los anticuerpos y polipéptidos también se pueden usar para ensayos de diagnóstico in vivo, tales como obtención de imágenes in vivo. Generalmente, el anticuerpo está marcado con un radionúclido (tal como 111In, 99Tc, 14C, 131I, 125I o 3H) para que las células o el tejido de interés se puedan localizar in vivo después de la administración a un sujeto.
El anticuerpo también se puede utilizar como reactivo de tinción en patología, por ejemplo, utilizando técnicas conocidas.
III. A rtícu los de fabricación
También se desvelan en el presente documento artículos de fabricación que contienen las moléculas de unión proporcionadas, por ejemplo, anticuerpos y CAR y/o células modificadas genéticamente y/o composiciones. Los artículos de fabricación pueden incluir un envase y una etiqueta o prospecto sobre o asociado al envase. Los envases adecuados incluyen, por ejemplo, frascos, viales, jeringas, bolsas de solución IV, etc. Los envases pueden formarse a partir de diversos materiales tales como vidrio o plástico. El envase en algunos aspectos de la divulgación contiene una composición que es, por sí misma o combinada con otra composición, eficaz para tratar, prevenir y/o diagnosticar la afección. En algunos aspectos de la divulgación, el envase tiene un puerto de acceso estéril. Los envases a modo de ejemplo incluyen bolsas de solución intravenosa, viales, incluidos los que tienen tapones que se pueden perforar con una aguja para inyección. La etiqueta o prospecto puede indicar que la composición se utiliza para tratar la enfermedad o afección que expresa o se asocia con ROR1. El artículo de fabricación puede incluir (a) un primer envase con una composición contenida en el mismo, en donde la composición incluye el anticuerpo o receptor de antígeno modificado genéticamente; y (b) un segundo envase con una composición contenida en el mismo, en donde la composición incluye un agente adicional, tal como un agente citotóxico o terapéutico de otro modo. El artículo de fabricación puede incluir además un prospecto que indique que las composiciones se pueden usar para tratar una afección particular. Como alternativa o adicionalmente, el artículo de fabricación puede incluir además otro o el mismo envase que comprende un tampón farmacéuticamente aceptable. Puede incluir además otros materiales tales como otros tampones, diluyentes, filtros, agujas y/o jeringas.
Tal como se usa en el presente documento, la referencia a una "forma correspondiente" de un anticuerpo significa que cuando se compara una propiedad o actividad de dos anticuerpos, la propiedad se compara utilizando la misma forma del anticuerpo. Por ejemplo, si se establece que un anticuerpo tiene mayor actividad en comparación con la actividad de la forma correspondiente de un primer anticuerpo, eso significa que una forma particular, tal como un scFv de ese anticuerpo, tiene mayor actividad en comparación con la forma scFv del primer anticuerpo.
Las "funciones efectoras" se refieren a aquellas actividades biológicas atribuibles a la región Fc de un anticuerpo, que varían con el isotipo del anticuerpo. Los ejemplos de funciones efectoras de anticuerpo incluyen: unión a C1q y citotoxicidad dependiente de complemento (Cd C); unión al receptor Fc; citotoxicidad mediada por células dependiente de anticuerpo (CCDA); fagocitosis; regulación negativa de los receptores de la superficie celular (por ejemplo, receptor de linfocitos B); y activación de linfocitos B.
La expresión "región Fc" en el presente documento se usa para definir una región C-terminal de una cadena pesada de inmunoglobulina que contiene al menos una porción de la región constante. La expresión incluye regiones Fc de secuencia nativa y regiones Fc variantes. En una realización, una región Fc de cadena pesada de IgG humana se extiende desde Cys226 o desde Pro230, hasta el extremo carboxilo de la cadena pesada. Sin embargo, la lisina C-terminal (Lys447) de la región Fc puede estar o no presente. A menos que se especifique lo contrario en el presente documento, la numeración de los restos de aminoácidos en la región Fc o en la región constante es de acuerdo con el sistema de numeración de EU, también llamado índice de EU, tal como se describe en Kabat et al., Sequences of Proteins of Immunological Interest, 5a Ed. Public Health Service, National Institutes of Health, Bethesda, m D, 1991.
Las expresiones "anticuerpo de longitud completa", "anticuerpo intacto", y "anticuerpo completo" se usan indistintamente en el presente documento para referirse a un anticuerpo que tiene una estructura sustancialmente similar a una estructura de anticuerpo natural o que tiene cadenas pesadas que contienen una región Fc como se define en el presente documento.
Un anticuerpo "aislado" es uno que se ha separado de un componente de su ambiente natural. En algunas realizaciones, un anticuerpo se purifica hasta una pureza mayor del 95 % o 99 % determinada mediante, por ejemplo, medios electroforéticos (por ejemplo, SDS-PAGE, isoelectroenfoque (IEF), electroforesis capilar) o cromatográficos (por ejemplo, intercambio iónico o HPLC en fase reversa). Para una revisión de los métodos para la evaluación de la pureza de anticuerpos, véase, por ejemplo, Flatman et al., J. Chromatogr. B 848:79-87 (2007).
Un ácido nucleico "aislado" se refiere a una molécula de ácido nucleico que se ha separado de un componente de su ambiente natural. Un ácido nucleico aislado incluye una molécula de ácido nucleico contenida en células que normalmente contienen la molécula de ácido nucleico, pero la molécula de ácido nucleico está presente de manera extracromosómica o en una ubicación cromosómica que es diferente de su ubicación cromosómica natural.
Un "ácido nucleico aislado que codifica un anticuerpo anti-ROR1" se refiere a una o más moléculas de ácido nucleico que codifican cadenas pesadas y ligeras de anticuerpo (o fragmentos de las mismas), incluyendo dichas moléculas de ácido nucleico en un solo vector o vectores separados y dichas moléculas de ácido nucleico presentes en una o más ubicaciones de una célula hospedadora.
Las expresiones "célula hospedadora", "línea celular hospedadora", y "cultivo de células hospedadoras" se usan indistintamente y se refiere a células en las que se ha introducido ácido nucleico exógeno, incluyendo la descendencia de dichas células. Las células hospedadoras incluyen "transformantes" y "células transformadas", que incluyen a la
célula primaria transformada y a la descendencia procedente de esta, independientemente del número de pases. La descendencia puede no ser completamente idéntica en el contenido de ácido nucleico a una célula progenitora, pero puede contener mutaciones. Se incluye en el presente documento la descendencia mutante que tiene la misma función o actividad biológica detectada sistemáticamente o seleccionada en la célula transformada originalmente.
Tal como se usa en el presente documento, "porcentaje (%) de identidad de secuencia de aminoácidos" y "porcentaje de identidad" cuando se usan con respecto a una secuencia de aminoácidos (secuencia de polipéptido de referencia) se definen como el porcentaje de restos de aminoácidos en una secuencia candidata (por ejemplo, el anticuerpo o el fragmento del sujeto) que son idénticos a los restos de aminoácidos en la secuencia polipeptídica de referencia, después de alinear las secuencias e introducir huecos, en caso necesario, para lograr el porcentaje máximo de identidad de secuencia y no considerar cualquier sustitución conservativa como parte de la identidad de secuencia. El alineamiento con el fin de determinar el porcentaje de identidad de secuencia de aminoácidos puede lograrse de varias maneras que se encuentran dentro de las capacidades de la técnica, por ejemplo, usando programas informáticos disponibles de manera pública, tales como los programas BLAST, BLAST-2, ALIGN o Megalign (DNASTAR). Los expertos en la materia pueden determinar los parámetros necesarios para alinear secuencias, incluyendo cualquier algoritmo necesario para lograr una alineación máxima en la totalidad de la longitud de las secuencias que se estén comparando.
Una sustitución de aminoácidos puede incluir la sustitución de un aminoácido en un polipéptido por otro aminoácido. En la Tabla 1 se muestran sustituciones ilustrativas. Se pueden introducir sustituciones de aminoácidos en una molécula de unión, por ejemplo, anticuerpo, de interés y se pueden seleccionar los productos para una actividad deseada, por ejemplo, unión a antígeno conservada/mejorada, inmunogenicidad reducida, o CCDA o CDC mejoradas.
Los aminoácidos generalmente se pueden agrupar de acuerdo con las siguientes propiedades comunes de la cadena lateral:
(1) hidrófobos: Norleucina, Met, Ala, Val, Leu, Ile;
(2) hidrófilos neutros: Cys, Ser, Thr, Asn, Gln;
(3) ácidos: Asp, Glu;
(4) básicos: His, Lys, Arg;
(5) restos que influyen en la orientación de la cadena: Gly, Pro;
(6) aromáticos: Trp, Tyr, Phe.
Las sustituciones de aminoácidos no conservativas implicarán el intercambio de un miembro de una de estas clases por otra clase.
El término "vector", tal como se usa en el presente documento, se refiere a una molécula de ácido nucleico capaz de propagar otro ácido nucleico al que está unida. El término incluye el vector en forma de una estructura de ácido nucleico autorreplicante, así como el vector incorporado en el genoma de una célula hospedadora en la que se ha introducido. Determinados vectores son capaces de dirigir la expresión de ácidos nucleicos a los que están enlazados operativamente. Dichos vectores se citan en el presente documento como "vectores de expresión".
El término "prospecto" se usa para referirse a instrucciones habitualmente incluidas en los envases comerciales de productos terapéuticos, que contienen información sobre las indicaciones, el uso, la dosificación, la administración, terapia combinada, las contraindicaciones y/o las advertencias en referencia al uso de dichos productos terapéuticos.
A menos que se defina de otro modo, se pretende que todos los términos de la técnica, las notaciones y otros términos o terminología técnicos y científicos utilizados en el presente documento tengan el mismo significado que el que entiende habitualmente un experto en la materia a la que pertenece la materia objeto reivindicada. En algunos casos, los términos con significados comúnmente comprendidos se definen en el presente documento con fines de claridad y/o para tener una referencia inmediata, y la inclusión de dichas definiciones en el presente documento no se ha de considerar necesariamente como representativa de una diferencia sustancial frente a lo que se comprende en la técnica.
Tal como se usa en el presente documento, las formas en singular "un", "una", y "el/la" incluyen referentes en plural a menos que el contexto indique claramente lo contrario. Por ejemplo, "un" o "una" significa "al menos uno" o "uno o más". Se entiende que aspectos y variaciones descritas en el presente documento incluyen "que consiste" y/o "que consiste esencialmente en" aspectos y variaciones.
A lo largo de la presente divulgación, diversos aspectos del tema reivindicado se presentan en un formato de intervalo. Ha de comprenderse que la descripción en formato de intervalo es meramente por conveniencia y brevedad, y no debe interpretarse como una limitación inflexible del alcance de la materia objeto reivindicada. Por consiguiente, debe considerarse que la descripción de un intervalo ha divulgado específicamente todos los subintervalos posibles, así como los valores numéricos individuales dentro de ese intervalo. Por ejemplo, cuando se proporciona un intervalo de valores, se entiende que cada valor intermedio, entre el límite superior e inferior de ese intervalo y cualquier otro valor afirmado o que interviene en el intervalo comentado queda englobado dentro de la materia objeto reivindicada. Los
límites superior e inferior de estos intervalos más pequeños pueden incluirse independientemente en los intervalos más pequeños, y también están englobados dentro de la materia objeto reivindicada, sujetos a cualquier límite específicamente excluido en el intervalo indicado. Cuando el intervalo indicado incluye uno o ambos límites, los intervalos que excluyen alguno o ambos de los límites incluidos también quedan englobados en la materia objeto reivindicada. Esto se aplica independientemente de la amplitud del intervalo.
El término "aproximadamente", como se usa en el presente documento, se refiere al intervalo de error habitual para el valor correspondiente, fácilmente conocido por los expertos en este campo técnico. La referencia a "aproximadamente" un valor o parámetro en el presente documento incluye (y describe) realizaciones que se refieren a ese valor o parámetro en sí. Por ejemplo, una descripción que hace referencia a "aproximadamente X" incluye la descripción de "X".
Tal como se usa en el presente documento, una composición se refiere a cualquier mezcla de dos o más productos, sustancias o compuestos, incluyendo células. Puede ser una solución, una suspensión, líquido, polvo, una pasta, acuoso, no acuoso o cualquier combinación de los mismos.
Tal como se usa en el presente documento, una declaración de que una célula o población de células es "positiva" para un marcador en particular se refiere a la presencia detectable en la célula de un marcador en particular, normalmente un marcador de superficie. Al referirse a un marcador de superficie, el término se refiere a la presencia de expresión superficial detectada por citometría de flujo, por ejemplo, mediante tinción con un anticuerpo que se une específicamente al marcador y detectando dicho anticuerpo, en el que la tinción es detectable por citometría de flujo a un nivel sustancialmente por encima de la tinción detectada llevando a cabo el mismo procedimiento con un control de isotipo coincidente en condiciones por lo demás idénticas y/o en un nivel sustancialmente similar al de la célula que se sabe que es positiva para el marcador y/o en un nivel sustancialmente superior al de una célula que se sabe que es negativa para el marcador.
Tal como se usa en el presente documento, una declaración de que una célula o población de células es "negativa" para un marcador en particular se refiere a la ausencia de presencia sustancial detectable sobre o dentro de la célula de un marcador en particular, normalmente un marcador de superficie. Al referirse a un marcador de superficie, el término se refiere a la ausencia de expresión superficial detectada por citometría de flujo, por ejemplo, mediante tinción con un anticuerpo que se une específicamente al marcador y detectando dicho anticuerpo, en donde la tinción no es detectada por citometría de flujo a un nivel sustancialmente por encima de la tinción detectada llevando a cabo el mismo procedimiento con un control de isotipo emparejado bajo condiciones idénticas por lo demás, y/o en un nivel sustancialmente menor que el de la célula que se sabe que es positiva para el marcador, y/o en un nivel sustancialmente similar en comparación con el de una célula que se sabe que es negativa para el marcador.
Los encabezados de sección usados en el presente documento tienen fines organizativos solamente, y no deben considerarse como limitantes de la materia objeto descrita.
IV. Realizaciones/enseñanzas a modo de ejemplo
Entre las realizaciones o enseñanzas proporcionadas en el presente documento se encuentran:
1. Un anticuerpo o un fragmento de unión a antígeno del mismo, comprendiendo dicho anticuerpo o fragmento de unión a antígeno una región variable de cadena pesada (Vh) que comprende:
una región determinante de complementariedad de cadena pesada 3 (CDR-H3) que comprende la secuencia de aminoácidos establecida en los SEQ ID NO: 22, 29, 35, 45, 50, 51, 52, 53, 54, 55, 56, 57, 58, 59, 60, 61,62, 63, 64, 65, 66, 67, 68, 69, 70, 71 o 174; o
una CDR-H3 contenida dentro de la secuencia variable de cadena pesada (Vh) establecida en los SEQ ID NO: 8, 10, 13, 15, 17, 19, 175, 176, 177, 178, 179, 180, 181, 182, 183, 184, 185, 186, 187, 188, 189, 190, 191, 192, 193, 194, 195, 196, 197, 198, 199, 200, 201,202, 203, 204, 205, 206, 207, 208 o 209.
2. Un anticuerpo o un fragmento de unión a antígeno del mismo, comprendiendo dicho anticuerpo o fragmento de unión a antígeno una región variable de cadena pesada (Vh) que comprende al menos un 90 % de identidad de secuencia con la secuencia de aminoácidos de la región Vh establecida en los SEQ ID NO: 8, 10, 13, 15, 17, 19, 175, 176, 177, 178, 179, 180, 181, 182, 183, 184, 185, 186, 187, 188, 189, 190, 191, 192, 193, 194, 195, 196, 197, 198, 199, 200, 201, 202, 203, 204, 205, 206, 207, 208 o 209.
3. El anticuerpo o el fragmento de unión a antígeno del mismo de la realización/enseñanza 2, comprendiendo dicho anticuerpo o fragmento de unión a antígeno una región variable de cadena pesada (Vh) que comprende al menos un 90 % de identidad de secuencia con la secuencia de aminoácidos de la región Vh establecida en los SEQ ID NO: 8, 10, 13, 15, 17 o 19.
4. El anticuerpo o el fragmento de la realización 2 o la realización/enseñanza 3, en donde la región VH comprende una región determinante de la complementariedad de cadena pesada 3 (CDR-H3) que comprende la secuencia de aminoácidos establecida en los SEQ ID NO: 92, 93, 94, 109 o 110.
5. El anticuerpo o el fragmento de cualquiera de las realizaciones/enseñanzas 2-4, en donde la región VH
comprende:
una región determinante de complementariedad de cadena pesada 3 (CDR-H3) que comprende la secuencia
de aminoácidos establecida en los SEQ ID NO: 22, 29, 35, 45, 50, 51, 52, 53, 54, 55, 56, 57, 58, 59, 60, 61,62,
63, 64, 65, 66, 67, 68, 69, 70, 71 o 174; o
o una CDR-H3 contenida dentro de la secuencia de Vh establecida en los SEQ ID NO: 8, 10, 13, 15, 17, 19,
175, 176, 177, 178, 179, 180, 181, 182, 183, 184, 185, 186, 187, 188, 189, 190, 191, 192, 193, 194, 195, 196,
197, 198, 199, 200, 201,202, 203, 204, 205, 206, 207, 208 o 209.
6. El anticuerpo o el fragmento de cualquiera de las realizaciones/enseñanzas 2-5, en donde la región Vh
comprende:
una región determinante de complementariedad de cadena pesada 3 (CDR-H3) que comprende la secuencia
de aminoácidos establecida en los SEQ ID NO: 22, 29, 35, 45, 50, 51, 52, 53, 54, 55, 56, 57, 58, 59, 60, 61,62,
63, 64, 65, 66, 67, 68, 69, 70, 71 o 174; o
una CDR-H3 contenida en la secuencia de Vh establecida en los SEQ ID NO: 8, 10, 13, 15, 17 o 19.
7. El anticuerpo o el fragmento de cualquiera de las realizaciones/enseñanzas 2-6, en donde la región Vh
comprende:
una región determinante de la complementariedad de cadena pesada 3 (CDR-H3) que comprende la secuencia
de aminoácidos establecida en los SEQ ID NO: 22, 29, 35 o 52; o
una CDR-H3 contenida en la secuencia de Vh establecida en los SEQ ID NO: 10, 13, 15 o 19.
8. El anticuerpo o el fragmento de la realización/enseñanza 2 o la realización/enseñanza 3, en donde la región Vh
comprende una CDR-H3 que comprende la secuencia de aminoácidos establecida en la SEQ ID NO: 72 o una
CDR-H3 contenida dentro de la secuencia de Vh establecida en la SEQ ID NO: 85.
9. El anticuerpo o el fragmento de cualquiera de las realizaciones/enseñanzas 1-8, en donde la región Vh
comprende:
una región determinante de complementariedad de cadena pesada 1 (CDR-H1) que comprende la secuencia
de aminoácidos establecida en los SEQ ID NO: 95 o 97; y/o
una región determinante de complementariedad de cadena pesada 2 (CDR-H2) que comprende la secuencia
de aminoácidos establecida en los SEQ ID NO: 96 o 98.
10. El anticuerpo o el fragmento de cualquiera de las realizaciones/enseñanzas 1-9, en donde la región Vh
comprende:
una región determinante de complementariedad de la cadena pesada 1 (CDR-H1) que comprende la secuencia
de aminoácidos establecida en los SEQ ID NO: 20, 27, 33, 155, 156, 157, 158, 159, 160, 161, 162 o 163, y/o
que comprende la secuencia de aminoácidos establecida en los SEQ ID NO: 269, 270, 271, 272, 273, 274,
275, 276, 278 o 279 y/o que comprende la secuencia de aminoácidos establecida en los SEQ ID NO: 75, 77,
79, 280, 281,282, 283, 284, 285, 286, 287, 288 o 289 y/o un CDR-H1 contenida dentro de la secuencia de Vh
establecida en los SEQ ID NO: 8, 10, 13, 15, 17, 19, 175, 176, 177, 178, 179, 180, 181, 182, 183, 184, 185,
186, 187, 188, 189, 190, 191, 192, 193, 194, 195, 196, 197, 198, 199, 200, 201, 202, 203, 204, 205, 206, 207, 208 o 209; y/o
una región determinante de complementariedad de la cadena pesada 2 (CDR-H2) que comprende la secuencia
de aminoácidos indicada en los SEQ ID NO: 21, 26, 28, 34, 164, 165, 166, 167, 168, 169, 170, 171, 172,173 o
318 y/o que comprende la secuencia de aminoácidos establecida en los SEQ ID NO: 291,292, 293, 294, 295,
296, 297, 298, 299, 300, 301, 302 o 303 y/o que comprende la secuencia de aminoácidos establecida en los
SEQ ID NO: 304, 305, 306, 307, 308, 309, 310, 311,312, 313, 314, 315, 316 o 317 y/o una CDR-H2 contenida
dentro de la secuencia de Vh establecida en los SEQ ID NO: 8, 10, 13, 15, 17, 19, 175, 176, 177, 178, 179,
180, 181, 182, 183, 184, 185, 186, 187, 188, 189, 190, 191, 192, 193, 194, 195, 196, 197, 198, 199, 200, 201, 202, 203, 204, 205, 206, 207, 208 o 209.
11. El anticuerpo o el fragmento de cualquiera de las realizaciones/enseñanzas 1-10, en donde la región Vh
comprende:
una región determinante de complementariedad de cadena pesada 1 (CDR-H1) que comprende la secuencia
de aminoácidos establecida en los SEQ ID NO: 20, 27 o 33 y/o una CDR-H1 contenida dentro de la secuencia
de Vh indicada en los SEQ ID NO: 8, 10, 13, 15, 17 o 19; y/o
una región determinante de complementariedad de la cadena pesada 2 (CDR-H2) que comprende la secuencia
de aminoácidos establecida en los SEQ ID NO: 21, 26, 28 o 34 y/o una CDR-H2 contenida dentro de la
secuencia de Vh establecida en los SEQ ID NO: 8, 10, 13, 15, 17 o 19.
12. El anticuerpo o el fragmento de cualquiera de las realizaciones/enseñanzas 1-11, en donde la región Vh
comprende:
una región determinante de complementariedad de cadena pesada 1 (CDR-H1) que comprende la secuencia de aminoácidos establecida en los SEQ ID NO: 20, 27 o 33 y/o una CDR-H1 contenida dentro de la secuencia de Vh indicada en los SEQ ID NO: 10, 13, 15 o 19; y/o
una región determinante de complementariedad de la cadena pesada 2 (CDR-H2) que comprende la secuencia de aminoácidos establecida en los SEQ ID NO: 26, 28 o 34 y/o una CDR-H2 contenida dentro de la secuencia de Vh establecida en los SEQ ID NO: 10, 13, 15 o 19.
13. Un anticuerpo o un fragmento de unión a antígeno del mismo, que comprende una región variable de cadena pesada (Vh) que comprende una región determinante de complementariedad de cadena pesada 1 (CDR-H1), CDR-H2 y CDR-H3, en el que:
la CDR-H1 comprende la secuencia de aminoácidos establecida en los SEQ ID NO: 20, 27, 33, 75, 77, 79, 155, 156, 157, 158, 159, 160, 161, 162, 163, 269, 270, 271, 272, 273, 274, 275, 276, 277, 278 o 279; la CDR-H2 comprende la secuencia de aminoácidos establecida en los SEQ ID NO: 21, 26, 28, 34, 80, 81, 82, 83, 164, 165, 166, 167, 168, 169, 170, 171, 172, 173, 291, 292, 293, 294, 295, 296, 297, 298, 299, 300, 301, 302, 303 o 318; y/o
la CDR-H3 comprende la secuencia de aminoácidos establecida en los SEQ ID NO: 22, 29, 35, 45, 50, 51, 52, 53, 54, 55, 56, 57, 58, 59, 60, 61,62, 63, 64, 65, 66, 67, 68, 69, 70, 71 o 174.
14. El anticuerpo o el fragmento de unión a antígeno de la realización/enseñanza 11, en el que:
la CDR-H1 comprende la secuencia de aminoácidos establecida en los SEQ ID NO: 20, 27 o 33;
la CDR-H2 comprende la secuencia de aminoácidos establecida en los SEQ ID NO: 21,26, 28 o 34; y/o la CDR-H3 comprende la secuencia de aminoácidos establecida en los SEQ ID NO: 22, 29, 35, 45, 50, 51, 52, 53, 54, 55, 56, 57, 58, 59, 60, 61,62, 63, 64, 65, 66, 67, 68, 69, 70 o 71.
15. El anticuerpo o el fragmento de cualquiera de las realizaciones/enseñanzas 1,4-7 y 9-14, en donde la CDR-H3 comprende la secuencia de aminoácidos VSNYEYYFDY (SEQ ID NO: 29), DFGRWGYYFDY (SEQ ID NO: 52), DFGRWSYYFDY (SEQ ID NO:35) o DSSYDAFDI (SEQ ID NO:22).
16. El anticuerpo o el fragmento de cualquiera de las realizaciones/enseñanzas 1-7 y 9-15, que comprende una región variable de cadena pesada (Vh) que comprende una región determinante de complementariedad de cadena pesada 1 (CDR-H1), CDR-H2 y CDR-H3, en el que:
la CDR-H1, la CDR-H2 y la CDR-H3 comprenden las secuencias de los SEQ ID NO: 20, 21 y 22, respectivamente;
la CDR-H1, la CDR-H2 y la CDR-H3 comprenden las secuencias de los SEQ ID NO: 20, 26 y 22, respectivamente;
la CDR-H1, la CDR-H2 y la CDR-H3 comprenden las secuencias de los SEQ ID NO: 27, 28 y 29, respectivamente;
la CDR-H1, la CDR-H2 y la CDR-H3 comprenden las secuencias de los SEQ ID NO: 33, 34 y 35, respectivamente; o
la CDR-H1, la CDR-H2 y la CDR-H3 comprenden las secuencias de los SEQ ID NO: 33, 34 y 52, respectivamente;
la CDR-H1, la CDR-H2 y la CDR-H3 comprenden las secuencias de los SEQ ID NO: 27, 164 y 45, respectivamente;
la CDR-H1, la CDR-H2 y la CDR-H3 comprenden las secuencias de los SEQ ID NO: 27, 164 y 68, respectivamente;
la CDR-H1, la CDR-H2 y la CDR-H3 comprenden las secuencias de los SEQ ID NO: 27, 164 y 64, respectivamente;
la CDR-H1, la CDR-H2 y la CDR-H3 comprenden las secuencias de los SEQ ID NO: 27, 164 y 66, respectivamente;
la CDR-H1, la CDR-H2 y la CDR-H3 que tienen as secuencias de os SEQ ID NO: 33, 318 y 35, respectivamente;
la CDR-H1, la CDR-H2 y la CDR-H3 comprenden las secuencias de los SEQ ID NO: 33, 34 y 70, respectivamente;
la CDR-H1, la CDR-H2 y la CDR-H3 comprenden las secuencias de los SEQ ID NO: 33, 34 y 55, respectivamente;
la CDR-H1, la CDR-H2 y la CDR-H3 comprenden las secuencias de los SEQ ID NO: 33, 34 y 53, respectivamente;
la CDR-H1, la CDR-H2 y la CDR-H3 comprenden las secuencias de los SEQ ID NO: 33, 34 y 56, respectivamente;
la CDR-H1, la CDR-H2 y la CDR-H3 comprenden las secuencias de los SEQ ID NO: 33, 34 y 61, respectivamente;
la CDR-H1, la CDR-H2 y la CDR-H3 comprenden las secuencias de los SEQ ID NO: 33, 34 y 59,
respectivamente;
la CDR-H1, la CDR-H2 y la CDR-H3 comprenden las secuencias de los SEQ ID NO: 33, 171 y 60, respectivamente;
la CDR-H1, la CDR-H2 y la CDR-H3 comprenden las secuencias de los SEQ ID NO: 155, 34 y 35, respectivamente;
la CDR-H1, la CDR-H2 y la CDR-H3 comprenden las secuencias de los SEQ ID NO: 156, 34 y 35, respectivamente;
la CDR-H1, la CDR-H2 y la CDR-H3 comprenden las secuencias de los SEQ ID NO: 162, 170 y 50, respectivamente;
la CDR-H1, la CDR-H2 y la CDR-H3 comprenden las secuencias de los SEQ ID NO: 162, 170 y 51, respectivamente;
la CDR-H1, la CDR-H2 y la CDR-H3 comprenden las secuencias de los SEQ ID NO: 161, 169 y 54, respectivamente;
la CDR-H1, la CDR-H2 y la CDR-H3 comprenden las secuencias de los SEQ ID NO: 159, 167 y 57, respectivamente;
la CDR-H1, la CDR-H2 y la CDR-H3 comprenden las secuencias de los SEQ ID NO: 160, 168 y 58, respectivamente;
la CDR-H1, la CDR-H2 y la CDR-H3 comprenden las secuencias de los SEQ ID NO: 158, 166 y 62, respectivamente;
la CDR-H1, la CDR-H2 y la CDR-H3 comprenden las secuencias de los SEQ ID NO: 158, 166 y 63, respectivamente;
la CDR-H1, la CDR-H2 y la CDR-H3 comprenden las secuencias de los SEQ ID NO: 158, 166 y 65, respectivamente;
la CDR-H1, la CDR-H2 y la CDR-H3 comprenden las secuencias de los SEQ ID NO: 157, 165 y 67, respectivamente;
la CDR-H1, la CDR-H2 y la CDR-H3 comprenden las secuencias de los SEQ ID NO: 163, 173 y 69, respectivamente; o
la CDR-H1, la CDR-H2 y la CDR-H3 comprenden las secuencias de los SEQ ID NO: 160, 172, 71, respectivamente; o
la CDR-H1, la CDR-H2 y la CDR-H3 comprenden las secuencias de los SEQ ID NO: 160, 172, 174, respectivamente.
17. El anticuerpo o el fragmento de cualquiera de las realizaciones/enseñanzas 1-7 y 9-16, que comprende una región variable de cadena pesada (Vh) que comprende una región determinante de complementariedad de cadena pesada 1 (CDR-H1), CDR-H2 y CDR-H3, en el que:
la CDR-H1, la CDR-H2 y la CDR-H3 comprenden las secuencias de los SEQ ID NO: 20, 21 y 22, respectivamente;
la CDR-H1, la CDR-H2 y la CDR-H3 comprenden las secuencias de los SEQ ID NO: 20, 26 y 22, respectivamente;
la CDR-H1, la CDR-H2 y la CDR-H3 comprenden las secuencias de los SEQ ID NO: 27, 28 y 29, respectivamente;
la CDR-H1, la CDR-H2 y la CDR-H3 comprenden las secuencias de los SEQ ID NO: 33, 34 y 35, respectivamente; o
la CDR-H1, la CDR-H2 y la CDR-H3 comprenden las secuencias de los SEQ ID NO: 33, 34 y 52, respectivamente.
18. Un anticuerpo o un fragmento de unión a antígeno del mismo, que comprende una región variable de cadena pesada (VH) que comprende una región determinante de complementariedad de cadena pesada 1 (CDR-H1), una CDR-H2 y una CDR-H3, respectivamente, que comprenden las secuencias de aminoácidos de una CDR-H1, una CDR-H2, y una CDR-H3 contenida dentro de la secuencia de aminoácidos de la región Vh establecida en los SEQ ID NO: 8, 10, 13, 15, 17, 19, 175, 176, 177, 178, 179, 180, 181, 182, 183, 184, 185, 186, 187, 188, 189, 190, 191, 192, 193, 194, 195, 196, 197, 198, 199, 200, 201,202, 203, 204, 205, 206, 207, 208 o 209.
19. El anticuerpo o el fragmento de unión a antígeno de la realización/enseñanza 18, en donde la CDR-H1, CDR-H2 y CDR-H3, respectivamente, comprenden las secuencias de aminoácidos de una CDR-H1, una CDR-H2, y una CDR-H3 contenidas dentro de la secuencia de aminoácidos de la región Vh establecida en los SEQ ID NO: 8, 10, 13, 15, 17 o 19.
20. El anticuerpo o el fragmento de cualquiera de las realizaciones/enseñanzas 1-19, en donde la región Vh comprende una región marco 1 (FR1), una FR2, una FR3 y/o una FR4 que comprende al menos un 90 % de identidad de secuencia, respectivamente, con una FR1, f R2, FR3 y/o FR4 de la secuencia de aminoácidos establecida en los SEQ ID NO: 8, 10, 13, 15, 17, 19, 175, 176, 177, 178, 179, 180, 181, 182, 183, 184, 185, 186, 187, 188, 189, 190, 191, 192, 193, 194, 195, 196, 197, 198, 199, 200, 201, 202, 203, 204, 205, 206, 207, 208 o 209.
21. El anticuerpo o el fragmento de cualquiera de las realizaciones/enseñanzas 1-20, en donde la región Vh comprende una región marco 1 (FR1), una FR2, una FR3 y/o una FR4 que comprende al menos un 90 % de identidad de secuencia, respectivamente, con una FR1, f R2, FR3 y/o FR4 de la secuencia de aminoácidos
establecida en los SEQ ID NO: 8, 10, 13, 15, 17 o 19.
22. El anticuerpo o el fragmento de cualquiera de las realizaciones/enseñanzas 1-7 y 9-21, en donde la región Vh comprende la secuencia de aminoácidos establecida en los SEQ ID NO: 8, 10, 13, 15, 17, 19, 175, 176, 177, 178, 179, 180, 181, 182, 183, 184, 185, 186, 187, 188, 189, 190, 191, 192, 193, 194, 195, 196, 197, 198, 199, 200, 201, 202, 203, 204, 205, 206, 207, 208 o 209.
23. El anticuerpo o el fragmento de cualquiera de las realizaciones/enseñanzas 1-7 y 9-22, en donde la región Vh comprende la secuencia de aminoácidos establecida en los SEQ ID NO: 8, 10, 13, 15, 17 o 19.
24. El anticuerpo o el fragmento de la realización/enseñanza 23, en donde la región Vh comprende la secuencia de aminoácidos establecida en los SEQ ID NO: 8 o 10.
25. El anticuerpo o el fragmento de cualquiera de las realizaciones/enseñanzas 1-7 y 9-24, en donde la región Vh comprende la CDR-H1, la CDR-H2 y la CDR-H3 establecidas en los SEQ ID NO: 20, 26 y 22, respectivamente, y/o la región Vh comprende la secuencia de aminoácidos establecida en la SEQ ID NO: 19.
26. El anticuerpo o el fragmento de cualquiera de las realizaciones/enseñanzas 1-7 y 9-24, en donde la región Vh comprende la CDR-H1, la CDR-H2 y la CDR-H3 establecidas en los SEQ ID NO: 33, 34 y 52, respectivamente, y/o la región Vh comprende la secuencia de aminoácidos establecida en la SEQ ID NO: 10.
27. El anticuerpo o el fragmento de cualquiera de las realizaciones/enseñanzas 1-7 y 9-24, en donde la región Vh comprende la CDR-H1, la CDR-H2 y la CDR-H3 establecidas en los SEQ ID NO: 33, 34 y 35, respectivamente, y/o la región Vh comprende la secuencia de aminoácidos establecida en la SEQ ID NO: 13.
28. El anticuerpo o el fragmento de cualquiera de las realizaciones/enseñanzas 1-7 y 9-24, en donde la región Vh comprende la CDR-H1, la CDR-H2 y la CDR-H3 establecidas en los SEQ ID NO: 27, 28 y 29, respectivamente, y/o la región Vh comprende la secuencia de aminoácidos establecida en la SEQ ID NO: 15.
29. El anticuerpo o el fragmento de cualquiera de las realizaciones/enseñanzas 1-28, en donde el anticuerpo o el fragmento no comprende una región variable de cadena ligera (VL), no comprende una CDR-L1, una CDR-L2 y/o una CDR-L3, y/o es un anticuerpo de dominio único (sdAb) que contiene solo la región Vh.
30. El anticuerpo o el fragmento de cualquiera de las realizaciones/enseñanzas 1-29 que es un sdAb que comprende solo la región Vh.
31. El anticuerpo o el fragmento de cualquiera de las realizaciones/enseñanzas 1-28, en donde el anticuerpo o el fragmento comprende además una región variable de cadena ligera (VL).
32. El anticuerpo o el fragmento de la realización 31, en donde la región Vl comprende al menos un 90 % de identidad de secuencia con la secuencia de aminoácidos de la región Vl establecida en los SEQ ID NO: 14, 16, 18, 234, 235, 236, 237, 238, 239, 240, 241,242, 243, 244, 245, 246, 247 o 248.
33. El anticuerpo o el fragmento de la realización 31 o la realización/enseñanza 32, en donde la región Vl comprende al menos un 90 % de identidad de secuencia con la secuencia de aminoácidos de la región Vl establecida en los SEQ ID NO: 14, 16 o 18.
34. El anticuerpo del fragmento de cualquiera de las realizaciones/enseñanzas 31-33, en donde la región Vl comprende una región 3 determinante de la complementariedad de la cadena ligera (CDR-L3) que comprende la secuencia de aminoácidos establecida en los SEQ ID NO: 99 o 100.
35. El anticuerpo o el fragmento de cualquiera de las realizaciones/enseñanzas 31-34, en donde la región VL comprende una región determinante de complementariedad de cadena ligera 3 (CDR-L3) que comprende la secuencia de aminoácidos establecida en los Se Q ID NO: 25, 32, 38, 39, 40, 41,42, 43, 44, 46, 47, 48, 49, 232 o 233.
36. El anticuerpo o el fragmento de cualquiera de las realizaciones/enseñanzas 31-35, en donde la región VL comprende una región determinante de complementariedad de la cadena ligera 3 (CDR-L3) que comprende la secuencia de aminoácidos establecida en los SEQ ID NO: 25, 32, 38, 39, 40, 41,42, 43, 44, 46, 47, 48 o 49. 37. El anticuerpo o el fragmento de cualquiera de las realizaciones/enseñanzas 31-36, en donde la región Vl comprende una región determinante de complementariedad de cadena ligera 1 (CDR-L1) que comprende la secuencia de aminoácidos establecida en la s Eq ID NO: 101 y/o una región determinante de complementariedad de cadena ligera 2 (CDR-L2) que comprende la secuencia de aminoácidos establecida en la SEQ ID NO: 102. 38. El anticuerpo o el fragmento de cualquiera de las realizaciones/enseñanzas 31-38, en donde la región Vl comprende:
una región determinante de complementariedad de cadena ligera 1 (CDR-L1) que comprende la secuencia de aminoácidos establecida en los SEQ ID NO: 23, 30, 36, 210, 211,212, 213, 214, 215, 217, 216, 218, 219 o 220 y/o un CDR-L1 contenida en la secuencia de Vl establecida en los SEQ ID NO: 14, 16, 18, 234, 235, 236, 237, 238, 239, 240, 241, 242, 243, 244, 245, 246, 247 o 248; y/o
una región determinante de complementariedad de la cadena ligera 2 (CDR-L2) que comprende la secuencia de aminoácidos establecida en los SEQ ID NO: 24, 31,37, 221,222, 223, 224, 225, 226, 227, 228, 229, 230 o 231 y/o una CDR-L2 contenida dentro de la secuencia de Vl establecida en los SEQ ID NO: 14, 16, 18, 234, 235, 236, 237, 238, 239, 240, 241,242, 243, 244, 245, 246, 247 o 248.
39. El anticuerpo o el fragmento de cualquiera de las realizaciones/enseñanzas 31-38, en donde la región Vl comprende:
una región determinante de complementariedad de cadena ligera 1 (CDR-L1) que comprende la secuencia de aminoácidos establecida en los SEQ ID NO: 23, 30 o 36 y/o una CDR-L1 contenida dentro de la secuencia de Vl establecida en los SEQ ID NO: 14, 16 o 18; y/o
una región determinante de complementariedad de la cadena ligera 2 (CDR-L2) que comprende la secuencia de aminoácidos establecida en SEQ ID NO: 24, 31 o 37 y/o una CDR-L2 contenida dentro de la secuencia de Vl establecida en los SEQ ID NO: 14, 16 o 18.
40. El anticuerpo o el fragmento de cualquiera de las realizaciones/enseñanzas 31-39, en donde la región Vl comprende:
una región determinante de complementariedad de cadena ligera 1 (CDR-L1) que comprende la secuencia de aminoácidos establecida en los SEQ ID NO: 23, 30, 36, 210, 211, 212, 213, 214, 215, 217, 216, 218, 219 o 220;
una región determinante de complementariedad de cadena ligera 2 (CDR-L2) que comprende la secuencia de aminoácidos establecida en los SEQ ID NO: 24, 31, 37, 221, 222, 223, 224, 225, 226, 227, 228, 229, 230 o 231; y
una región determinante de complementariedad de cadena ligera 3 (CDR-L3) que comprende la secuencia de aminoácidos establecida en los SEQ ID NO: 25, 32, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 46, 47, 48, 49, 232 o 233.
41. El anticuerpo o el fragmento de cualquiera de las realizaciones/enseñanzas 31-40, en donde la región Vl comprende:
una región determinante de complementariedad de cadena ligera 1 (CDR-L1) que comprende la secuencia de aminoácidos establecida en la SEQ ID NO: 23, 30 o 36;
una región determinante de complementariedad de cadena ligera 2 (CDR-L2), que comprende la secuencia de aminoácidos expuesta en SEQ ID NO: 24, 31 o 37; y
una región determinante de complementariedad de cadena ligera 3 (CDR-L3) que comprende la secuencia de aminoácidos establecida en los Se Q ID NO: 25, 32, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 46, 47, 48 o 49.
42. El anticuerpo o el fragmento de cualquiera de las realizaciones/enseñanzas 36-41, en donde la CDR-L3 comprende la secuencia de aminoácidos establecida en los SEQ ID NO: 25, 32 o 38.
43. El anticuerpo o el fragmento de cualquiera de las realizaciones/enseñanzas 31-42, en donde la región Vl comprende una CDR-L1, una CDR-L2 y una CDR-L3 seleccionadas de:
la CDR-L1, la CDR-L2 y la CDR-L3 que comprenden las secuencias de los SEQ ID NO: 23, 24 y 25, respectivamente;
la CDR-L1, la CDR-L2 y la CDR-L3 que comprenden las secuencias de los SEQ ID NO: 30, 31 y 32, respectivamente;
la CDR-L1, la CDR-L2 y la CDR-L3 que comprenden las secuencias de los SEQ ID NO: 36, 37 y 38, respectivamente;
la CDR-L1, la CDR-L2 y la CDR-L3 que comprenden las secuencias de los SEQ ID NO: 216, 227 y 40, respectivamente;
la CDR-L1, la CDR-L2 y la CDR-L3 que comprenden las secuencias de los SEQ ID NO: 218, 229 y 39, respectivamente;
la CDR-L1, la CDR-L2 y la CDR-L3 que comprenden las secuencias de los SEQ ID NO: 219, 230 y 43, respectivamente;
la CDR-L1, la CDR-L2 y la CDR-L3 que comprenden las secuencias de los SEQ ID NO: 220, 231 y 46, respectivamente;
la CDR-L1, la CDR-L2 y la CDR-L3 que comprenden las secuencias de los SEQ ID NO: 210, 221 y 49, respectivamente;
la CDR-L1, la CDR-L2 y la CDR-L3 que comprenden las secuencias de los SEQ ID NO: 210, 221 y 233, respectivamente;
la CDR-L1, la CDR-L2 y la CDR-L3 que comprenden las secuencias de los SEQ ID NO: 211, 222 y 48, respectivamente;
la CDR-L1, la CDR-L2 y la CDR-L3 que comprenden las secuencias de los SEQ ID NO: 212, 223 y 42, respectivamente;
la CDR-L1, la CDR-L2 y la CDR-L3 que comprenden las secuencias de los SEQ ID NO: 214, 225 y 232, respectivamente;
la CDR-L1, la CDR-L2 y la CDR-L3 que comprenden las secuencias de los SEQ ID NO: 215, 226 y 44, respectivamente;
la CDR-L1, la CDR-L2 y la CDR-L3 que comprenden las secuencias de los SEQ ID NO: 217, 228 y 41, respectivamente; o
la CDR-L1, la CDR-L2 y la CDR-L3 que comprenden las secuencias de los SEQ ID NO: 213, 224 y 47, respectivamente.
44. El anticuerpo o el fragmento de cualquiera de las realizaciones/enseñanzas 31-43, en donde la región Vl comprende una CDR-L1, una CDR-L2 y una CDR-L3 seleccionadas de:
la CDR-L1, la CDR-L2 y la CDR-L3 que comprenden las secuencias de los SEQ ID NO: 23, 24 y 25,
respectivamente;
la CDR-L1, la CDR-L2 y la CDR-L3 que comprenden las secuencias de los SEQ ID NO: 30, 31 y 32, respectivamente; o
la CDR-L1, la CDR-L2 y la CDR-L3 que comprenden las secuencias de los SEQ ID NO: 36, 37 y 38, respectivamente.
45. El anticuerpo o el fragmento de cualquiera de las realizaciones/enseñanzas 31-44, en donde la región Vl comprende la región determinante de la complementariedad de la cadena ligera 1 (CDR-L1), CDR-L2 y CDR-L3, respectivamente, contenidas dentro de la secuencia de aminoácidos de la región Vl establecida en los SEQ ID NO: 14, 16, 18, 234, 235, 236, 237, 238, 239, 240, 241,242, 243, 244, 245, 246, 247 o 248.
46. El anticuerpo o el fragmento de cualquiera de las realizaciones/enseñanzas 31-45, en donde la región Vl comprende la región determinante de la complementariedad de la cadena ligera 1 (CDR-L1), CDR-L2 y CDR-L3, respectivamente, contenidas dentro de la secuencia de aminoácidos de la región Vl establecida en los SEQ ID NO: 14, 16 o 18.
47. El anticuerpo o el fragmento de cualquiera de las realizaciones/enseñanzas 31-46, en donde la región Vl comprende una región marco 1 (FR1), una FR2, una FR3 y/o una FR4 que comprende al menos un 90 % de identidad de secuencia, respectivamente, con la FR1, FR2, FR3 y/o FR4 de la secuencia de aminoácidos establecida en los SEQ ID n O: 14, 16 o 18.
48. El anticuerpo o el fragmento de cualquiera de las realizaciones/enseñanzas 31-47, en donde la región Vl comprende la secuencia de aminoácidos establecida en los SEQ ID NO: 14, 16, 18, 234, 235, 236, 237, 238, 239, 240, 241,242, 243, 244, 245, 246, 247 o 248.
49. El anticuerpo o el fragmento de cualquiera de las realizaciones/enseñanzas 31-48, en donde la región Vl comprende la secuencia de aminoácidos establecida en los SEQ ID NO: 14, 16 o 18.
50. Un anticuerpo o un fragmento de unión a antígeno del mismo, que comprende:
las regiones determinantes de complementariedad de cadena pesada 1,2 y 3 (CDR-H1, CDR-H2 y CDR-H3), respectivamente, que comprenden las secuencias de aminoácidos de las secuencias de CDR-H1, CDR-H2 y CDR-H3 contenidas dentro de la secuencia de aminoácidos de la región Vh establecida en los SEQ ID NO: 8, 10, 13, 15, 17, 19, 175, 176, 177, 178, 179, 180, 181, 182, 183, 184, 185, 186, 187, 188, 189, 190, 191, 192, 193, 194, 195, 196, 197, 198, 199, 200, 201,202, 203, 204, 205, 206, 207, 208 o 209; y/o
las regiones determinantes de complementariedad de cadena ligera 1, 2 y 3 (CDR-L1, CDR-L2 y CDR-L3), respectivamente, que comprenden las secuencias de aminoácidos de las secuencias de CDR-L1, CDR-L2 y CDR-L3 contenidas dentro de la secuencia de aminoácidos de la región variable de cadena ligera (VL) establecida en los SEQ ID NO: 14, 16, 18, 234, 235, 236, 237, 238, 239, 240, 241, 242, 243, 244, 245, 246, 247 o 248.
51. El anticuerpo o el fragmento de unión a antígeno de la realización/enseñanza 50, en el que:
la CDR-H1, CDR-H2 y CDR-H3, respectivamente, comprenden las secuencias de aminoácidos de las secuencias de CDR-H1, CDR-H2 y CDR-H3 contenidas dentro de la secuencia de aminoácidos de la región Vh establecida en los SEQ ID NO: 8, 10, 13, 15, 17 o 19; y/o
la CDR-L1, CDR-L2 y CDR-L3, respectivamente, comprenden las secuencias de aminoácidos de las secuencias de CDR-L1, CDR-L2 y CDR-L3 contenidas dentro de la secuencia de aminoácidos de la región variable de cadena ligera (VL) expuesta en la SEQ ID NO: 14, 16 o 18.
52. Un anticuerpo o un fragmento de unión a antígeno del mismo, que comprende:
las regiones Vh y Vl que comprenden las secuencias de aminoácidos que tienen al menos el 90 % de identidad con los SEQ ID NO: 19 y 18, respectivamente;
las regiones Vh y Vl que comprenden las secuencias de aminoácidos que tienen al menos el 90 % de identidad con los SEQ ID NO: 17 y 18, respectivamente;
las regiones Vh y Vl que comprenden las secuencias de aminoácidos que tienen al menos el 90 % de identidad con los SEQ ID NO: 15 y 16, respectivamente; o
las regiones Vh y Vl que comprenden las secuencias de aminoácidos que tienen al menos el 90 % de identidad con los SEQ ID NO: 13 y 14, respectivamente;
las regiones Vh y Vl que comprenden las secuencias de aminoácidos que tienen al menos el 90 % de identidad con los SEQ ID NO: 182 y 242 respectivamente;
las regiones Vh y Vl que comprenden las secuencias de aminoácidos que tienen al menos el 90 % de identidad con los SEQ ID NO: 182 y 246, respectivamente;
las regiones Vh y Vl que comprenden las secuencias de aminoácidos que tienen al menos el 90 % de identidad con los SEQ ID NO: 182 y 247, respectivamente;
las regiones Vh y Vl que comprenden las secuencias de aminoácidos que tienen al menos el 90 % de identidad con los SEQ ID NO: 185 y 248, respectivamente;
las regiones Vh y Vl que comprenden las secuencias de aminoácidos que tienen al menos el 90 % de identidad con los SEQ ID NO: 186 y 248, respectivamente;
las regiones Vh y Vl que comprenden las secuencias de aminoácidos que tienen al menos el 90 % de identidad
con los SEQ ID NO: 175 y 234, respectivamente;
las regiones Vh y Vl que comprenden las secuencias de aminoácidos que tienen al menos el 90 % de identidad con los SEQ ID NO: 175 y 235, respectivamente;
las regiones VH y VL que comprenden las secuencias de aminoácidos que tienen al menos el 90 % de identidad con los SEQ ID NO: 176 y 236, respectivamente;
las regiones VH y VL que comprenden las secuencias de aminoácidos que tienen al menos el 90 % de identidad con los SEQ ID NO: 176 y 237, respectivamente;
las regiones VH y VL que comprenden las secuencias de aminoácidos que tienen al menos el 90 % de identidad con los SEQ ID NO: 177 y 238, respectivamente;
las regiones VH y VL que comprenden las secuencias de aminoácidos que tienen al menos el 90 % de identidad con los SEQ ID NO: 179 y 240 respectivamente;
las regiones Vh y Vl que comprenden las secuencias de aminoácidos que tienen al menos el 90 % de identidad con los SEQ ID NO: 180 y 241, respectivamente;
las regiones Vh y Vl que comprenden las secuencias de aminoácidos que tienen al menos el 90 % de identidad con los SEQ ID NO: 181 y 241, respectivamente;
las regiones Vh y Vl que comprenden las secuencias de aminoácidos que tienen al menos el 90 % de identidad con los SEQ ID NO: 183 y 243 respectivamente;
las regiones Vh y Vl que comprenden las secuencias de aminoácidos que tienen al menos el 90 % de identidad con los SEQ ID NO: 183 y 244 respectivamente;
las regiones Vh y Vl que comprenden las secuencias de aminoácidos que tienen al menos el 90 % de identidad con los SEQ ID NO: 184 y 243, respectivamente;
las regiones Vh y Vl que comprenden las secuencias de aminoácidos que tienen al menos el 90 % de identidad con los SEQ ID NO: 184 y 244 respectivamente;
las regiones Vh y Vl que comprenden las secuencias de aminoácidos que tienen al menos el 90 % de identidad con los SEQ ID NO: 183 y 245, respectivamente;
las regiones Vh y Vl que comprenden las secuencias de aminoácidos que tienen al menos el 90 % de identidad con los SEQ ID NO: 184 y 245, respectivamente; o
las regiones Vh y Vl que comprenden las secuencias de aminoácidos que tienen al menos el 90 % de identidad con los SEQ ID NO: 178 y 239, respectivamente.
53. El anticuerpo o el fragmento de unión a antígeno de la realización/enseñanza 52, que comprende:
las regiones Vh y Vl que comprenden las secuencias de aminoácidos que tienen al menos el 90 % de identidad con los SEQ ID NO: 19 y 18, respectivamente;
las regiones Vh y Vl que comprenden las secuencias de aminoácidos que tienen al menos el 90 % de identidad con los SEQ ID NO: 17 y 18, respectivamente;
las regiones Vh y Vl que comprenden las secuencias de aminoácidos que tienen al menos el 90 % de identidad con los SEQ ID NO: 15 y 16, respectivamente; o
las regiones Vh y Vl que comprenden las secuencias de aminoácidos que tienen al menos el 90 % de identidad con los SEQ ID NO: 13 y 14, respectivamente.
54. El anticuerpo o el fragmento de la realización/enseñanza 52 o la realización/enseñanza 53, en el que:
las regiones Vh y Vl comprenden las secuencias de aminoácidos de los SEQ ID NO: 19 y 18, respectivamente; las regiones Vh y Vl comprenden las secuencias de aminoácidos de los SEQ ID NO: 17 y 18, respectivamente; las regiones Vh y Vl comprenden las secuencias de aminoácidos de los SEQ ID NO: 15 y 16 respectivamente; o
las regiones Vh y Vl comprenden las secuencias de aminoácidos de los SEQ ID NO: 13 y 14 respectivamente.
55. El anticuerpo o el fragmento de cualquiera de las realizaciones/enseñanzas 1-54, en donde dicho anticuerpo o fragmento se une específicamente a una proteína ROR1.
56. El anticuerpo o el fragmento de la realización/enseñanza 55, en donde la proteína ROR1 es una proteína ROR1 humana.
57. El anticuerpo o el fragmento de la realización/enseñanza 55, en donde la proteína ROR1 es una proteína ROR1 de ratón.
58. El anticuerpo o el fragmento de cualquiera de las realizaciones/enseñanzas 1-57, en el que:
dicho anticuerpo o fragmento tiene una afinidad de unión por una proteína ROR1 con una CE50 que es de aproximadamente 0,1 nM a 100 nM, 0,5 nM a 50 nM o 1 nM a 10 nM; o
dicho anticuerpo o fragmento tiene una afinidad de unión por una proteína ROR1 con una CE50 menor que o menos de aproximadamente 100 nM, menor que o menos de aproximadamente 50 nM, menor que o menos de aproximadamente 10 nM o menor que o menos de aproximadamente 1 nM.
59. El anticuerpo o el fragmento de cualquiera de las realizaciones/enseñanzas 1-58, en donde dicho anticuerpo o fragmento tiene una afinidad de unión por una proteína ROR1 humana que es al menos tan alta o sustancialmente tan alta como la afinidad de unión por la proteína ROR1 de la forma correspondiente del anticuerpo anti-ROR1 R12
o el fragmento de unión a antígeno del mismo, que es opcionalmente un fragmento scFv de R12.
60. El anticuerpo o el fragmento de cualquiera de las realizaciones/enseñanzas 1-59, en donde dicho anticuerpo o fragmento se une específicamente al mismo epítopo a un epítopo superpuesto de una proteína ROR1 humana como el epítopo unido específicamente por el anticuerpo anti-ROR1 R12 o un fragmento de unión a antígeno del mismo, que es opcionalmente un fragmento scFv de R12.
61. El anticuerpo o el fragmento de cualquiera de las realizaciones/enseñanzas 1-60, en donde dicho anticuerpo o fragmento compite por unirse a una proteína ROR1 humana con el anticuerpo anti-ROR1 R12 o un fragmento de unión a antígeno del mismo, que es opcionalmente un fragmento scFv de R12.
62. El anticuerpo o el fragmento de cualquiera de las realizaciones/enseñanzas 1-61, en donde dicho anticuerpo o fragmento inhibe la unión del anticuerpo anti-ROR1 R12 o un fragmento de unión a antígeno del mismo, que es opcionalmente un fragmento scFv de R12, a una proteína ROR1 humana en más de o más de aproximadamente el 80 % o más de o más de aproximadamente el 90 %.
63. El anticuerpo o el fragmento de cualquiera de las realizaciones/enseñanzas 1-62, en donde el anticuerpo o el fragmento se une a un epítopo superpuesto de una proteína ROR1 humana como el epítopo unido específicamente por el anticuerpo anti-ROR1 R12 o un fragmento de unión a antígeno del mismo, que es opcionalmente un fragmento scFv de R12 y el anticuerpo o el fragmento se une al ROR1 de ratón.
64. El anticuerpo o el fragmento de unión a antígeno de cualquiera de las realizaciones/enseñanzas 55, 56 y 58 63, en donde dicha proteína ROR1 humana comprende una secuencia de aminoácidos establecida en la SEQ ID NO: 103.
65. El anticuerpo o el fragmento de unión a antígeno de cualquiera de las realizaciones/enseñanzas 55, 56 y 58 64, que se une a un epítopo dentro de una porción extracelular de la proteína ROR1; y/o
se une a un epítopo de dicha proteína ROR1 que comprende restos dentro del dominio fz o el dominio Ig de la proteína ROR1.
66. El anticuerpo o el fragmento de unión a antígeno de la realización/enseñanza 65, en donde el epítopo comprende un resto dentro del dominio fz de la proteína ROR1 y un resto dentro del dominio Ig de la proteína ROR1.
67. El anticuerpo o el fragmento de unión a antígeno del mismo de la realización/enseñanza 65 o la realización/enseñanza 66, en donde dicho dominio de Ig comprende los restos 13-118 de la secuencia de aminoácidos establecida en la SEQ ID NO: 103; y/o dicho dominio fz comprende los restos 136-270 de la secuencia de aminoácidos establecida en la SEQ ID NO:103.
68. El anticuerpo o el fragmento de unión a antígeno de la realización/enseñanza 65, en donde la porción extracelular comprende los aminoácidos 1-377 del SEQ ID NO: 103.
69. El anticuerpo o el fragmento del mismo de cualquiera de las realizaciones/enseñanzas 1-56, 58-62 y 64-68, en donde el anticuerpo no se une específicamente a una proteína ROR1 de ratón o no se une específicamente a una proteína que tiene la secuencia de aminoácidos establecida en la SEQ ID NO: 106.
70. El anticuerpo o el fragmento de cualquiera de las realizaciones/enseñanzas 1-7 y 9-69, que no comprende las secuencias c Dr -H1, CDR-H2, CDR-H3 y/o CDR-L1, CDR-L2, CDR-L3 del anticuerpo anti-ROR1, R12 y/o del anticuerpo anti-ROR1 2A2.
71. El anticuerpo o el fragmento de cualquiera de las realizaciones/enseñanzas 1-7 y 9-70, que no comprende las secuencias c Dr -H1, CDR-H2, CDR-H3 y/o CDR-L1, CDR-L2, CDR-L3 que tienen al menos el 90 % de identidad con las secuencias CDR-H1, CDR-H2, CDR-H3 y/o CDR-L1, CDR-L2, c Dr -L3 del anticuerpo anti-ROR1, R12 y/o del anticuerpo anti-ROR1 2A2.
72. El anticuerpo o el fragmento de cualquiera de las realizaciones/enseñanzas 1-71, en donde el anticuerpo o el fragmento es humano.
73. Un anticuerpo humano o un fragmento de unión a antígeno del mismo que se une específicamente al mismo epítopo o a un epítopo superpuesto de una proteína ROR1 tal como el epítopo unido específicamente por un anticuerpo de referencia, en donde el anticuerpo de referencia es el anticuerpo o el fragmento del mismo de cualquiera de las realizaciones/enseñanzas 1-72 o es el anticuerpo anti-ROR1, R12, o el fragmento de unión a antígeno del mismo, comprendiendo dicho anticuerpo o fragmento humano las CDR de cadena pesada y ligera que son distintas de las CDR presentes en R12 y/o 2A2.
74. Un anticuerpo humano o un fragmento de unión a antígeno del mismo que se une específicamente a ROR1 y compite por unirse a ROR1 con un anticuerpo de referencia, en donde el anticuerpo de referencia es el anticuerpo o el fragmento de cualquiera de las realizaciones/enseñanzas 1-72 o es el anticuerpo anti-ROR1 R12 o un fragmento de unión a antígeno del mismo, comprendiendo dicho anticuerpo o fragmento humano las CDR de cadena pesada y ligera que son distintas de las CDR presentes en R12 y/o 2A2.
75. El anticuerpo humano o el fragmento de cualquiera de las realizaciones/enseñanzas 72-74, en el que:
el anticuerpo comprende una región variable de cadena pesada (Vh), dicha región Vh comprende una porción que tiene al menos el 95 %, el 96 %, el 97 %, el 98 %, el 99 % o el 100 % de identidad de secuencia con una secuencia de aminoácidos codificada por un segmento V de cadena pesada humana de nucleótidos de la línea germinal, una porción con al menos el 95 %, el 96 %, el 97 %, el 98 %, el 99 % o el 100 % de identidad de secuencia con una secuencia de aminoácidos codificada por un segmento D de cadena pesada humana de nucleótidos de la línea germinal, y/o una porción que tiene al menos el 95 %, el 96 %, el 97 %, el 98 %, el 99 % o el 100 % de identidad de secuencia con una secuencia de aminoácidos codificada por un segmento J de cadena pesada humana de nucleótidos de la línea germinal; y/o
el anticuerpo comprende una región variable de cadena ligera (Vl), dicha región Vl comprende una porción con
al menos el 95 %, el 96 %, el 97 %, el 98 %, el 99 % o el 100 % de identidad de secuencia con una secuencia de aminoácidos codificada por un segmento V de cadena kappa o lambda de nucleótidos de la línea germinal, y/o una porción con al menos el 95 %, el 96 %, el 97 %, el 98 %, el 99 % o el 100 % de identidad de secuencia con una secuencia de aminoácidos codificada por un segmento J de cadena kappa o lambda de nucleótidos de la línea germinal humana.
76. El anticuerpo humano o el fragmento de cualquiera de las realizaciones/enseñanzas 72-75, en el que:
la CDR-H1 y/o la CDR-H2 comprende una secuencia 100 % idéntica o con no más de un aminoácido de diferencia en comparación con una secuencia de aminoácidos de una CDR-H1 y/o CDR-H2, respectivamente, dentro de una secuencia codificada por un segmento V de cadena pesada humana de nucleótidos de la línea germinal; y/o
la CDR-L1 y/o la CDR-L2 comprende una secuencia 100 % idéntica o con no más de un aminoácido de diferencia en comparación con una secuencia de aminoácidos de una CDR-L1 y/o CDR-L2, respectivamente, dentro de una secuencia codificada por un segmento kappa o lambda v humano de nucleótidos de la línea germinal.
77. El anticuerpo o el fragmento de cualquiera de las realizaciones/enseñanzas 1-76, en donde el anticuerpo o el fragmento es recombinante.
78. El anticuerpo o el fragmento de cualquiera de las realizaciones/enseñanzas 1-77, que es monoclonal.
79. El anticuerpo o el fragmento de cualquiera de las realizaciones/enseñanzas 1-78 que es un fragmento de unión a antígeno.
80. El anticuerpo o el fragmento de cualquiera de las realizaciones/enseñanzas 1-79, que es un fragmento de cadena simple.
81. El anticuerpo o el fragmento de cualquiera de las realizaciones/enseñanzas 31-80, que es un fragmento que comprende las regiones Vh y Vl del anticuerpo unidas por un enlazador flexible.
82. El anticuerpo o el fragmento de la realización/enseñanza 80 o la realización 81, en donde el fragmento comprende un scFv.
83. El anticuerpo o el fragmento de la realización/enseñanza 82, en donde el scFv comprende un enlazador que comprende la secuencia establecida en la SEQ ID NO: 91.
84. El anticuerpo o el fragmento de la realización/enseñanza 82 o la realización/enseñanza 83, donde el scFv comprende la secuencia de aminoácidos establecida en los SEQ ID NO: 2, 4, 6, 12, 249, 250, 251,252, 253, 254, 255, 256, 257, 258, 259, 260, 261, 262, 263, 264, 265, 266, 267 o 268, o una secuencia de aminoácidos que presenta al menos el 90 % de identidad de secuencia con la secuencia de aminoácidos establecida en los SEQ ID NO: 2, 4, 6, 12, 249, 250, 251, 252, 253, 254, 255, 256, 257, 258, 259, 260, 261, 262, 263, 264, 265, 266, 267 o 268.
85. El anticuerpo o el fragmento de cualquiera de las realizaciones/enseñanzas 82-84, en donde el scFv comprende la secuencia de aminoácidos establecida en los SEQ ID NO: 2, 4, 6 o 12, o una secuencia de aminoácidos que presenta al menos el 90 % de identidad de secuencia con la secuencia de aminoácidos establecida en los SEQ ID NO: 2, 4, 6 o 12.
86. El anticuerpo o el fragmento de cualquiera de las realizaciones/enseñanzas 82-85, en donde el scFv comprende la secuencia de aminoácidos establecida en los SEQ ID NO: 2, 4, 6 o 12.
87. El anticuerpo o el fragmento de cualquiera de las realizaciones/enseñanzas 31-86, en donde el anticuerpo o el fragmento comprende la región Vh establecida en la SEQ ID NO: 19 y la región Vl establecida en la SEQ ID NO: 18, y/o el anticuerpo o el fragmento comprende la secuencia de aminoácidos establecida en la SEQ ID NO: 12.
88. El anticuerpo o el fragmento de cualquiera de las realizaciones/enseñanzas 31-86, en donde el anticuerpo o el fragmento comprende la región Vh establecida en la SEQ ID NO: 13 y la región Vl establecida en la SEQ ID NO: 14, y/o el anticuerpo o el fragmento comprende la secuencia de aminoácidos establecida en la SEQ ID NO: 6. 89. El anticuerpo o el fragmento de cualquiera de las realizaciones/enseñanzas 31-86, en donde el anticuerpo o el fragmento comprende la región Vh establecida en la SEQ ID NO: 15 y la región Vl establecida en la SEQ ID NO: 16, y/o el anticuerpo o el fragmento comprende la secuencia de aminoácidos establecida en la SEQ ID NO: 4. 90. El anticuerpo o el fragmento de cualquiera de las realizaciones/enseñanzas 31-86, en donde el anticuerpo o el fragmento comprende la región Vh establecida en la SEQ ID NO: 17 y la región Vl establecida en la SEQ ID NO: 18, y/o el anticuerpo o el fragmento comprende la secuencia de aminoácidos establecida en la SEQ ID NO: 2. 91. Una proteína de la superficie celular de cadena simple, que comprende el anticuerpo o el fragmento de cualquiera de las realizaciones/enseñanzas 1-90.
92. Una proteína de superficie celular de cadena simple que comprende la secuencia de scFv de los SEQ ID NO: 2, 4, 6, 12, 249, 250, 251,252, 253, 254, 255, 256, 257, 258, 259, 260, 261,262, 263, 264, 265, 266, 267 o 268 o que comprenden la secuencia de Vh establecida en los SEQ ID NO: 8, 10, 13, 15, 17, 19, 175, 176, 177, 178, 179, 180, 181, 182, 183, 184, 185, 186, 187, 188, 189, 190, 191, 192, 193, 194, 195, 196, 197, 198, 199, 200, 201,202, 203, 204, 205, 206, 207, 208 o 209.
93. La proteína de superficie celular de cadena simple de la realización/enseñanza 92, que comprende la secuencia de scFv de los SEQ ID NO: 2, 4, 6 o 12 o que comprende la secuencia de Vh establecida en los SEQ ID NO: 8, 10, 13, 15, 17 o 19.
94. El anticuerpo o el fragmento de cualquiera de las realizaciones/enseñanzas 1-90, que comprende además al menos una parte de una región constante de inmunoglobulina.
95. El anticuerpo o el fragmento de la realización/enseñanza 94, que comprende además un espaciador establecido en la SEQ ID NO:108.
96. El anticuerpo o el fragmento de la realización/enseñanza 94, en donde al menos una parte de una región constante de inmunoglobulina comprende una región Fc.
97. El anticuerpo o el fragmento de la realización/enseñanza 96, en donde la región Fc es una región Fc de una IgG humana.
98. Un conjugado, que comprende el anticuerpo o el fragmento de cualquiera de las realizaciones/enseñanzas 1 97 y una molécula o resto heterólogo.
99. Un receptor de antígeno quimérico (CAR) que comprende una porción extracelular que comprende el anticuerpo o el fragmento de cualquiera de las realizaciones/enseñanzas 1-97 y un dominio de señalización intracelular.
100. El receptor de antígeno quimérico de la realización/enseñanza 99, en donde el anticuerpo o el fragmento comprende un VH sdAb, un scFv y el dominio de señalización intracelular comprende un ITAM
101. El receptor de antígeno quimérico de la realización/enseñanza 99 o 100, en donde el dominio de señalización intracelular comprende un dominio de señalización de una cadena zeta de una cadena CD3-zeta (CD3Z).
102. El receptor de antígeno quimérico de cualquiera de las realizaciones/enseñanzas 99-101, que comprende además un dominio transmembrana que une el dominio extracelular y el dominio de señalización intracelular. 103. El receptor de antígeno quimérico de la realización/enseñanza 102, en donde el dominio transmembrana comprende una porción transmembrana de CD28.
104. El receptor de antígeno quimérico de cualquiera de las realizaciones/enseñanzas 99-103, que comprende además un dominio de señalización intracelular de una molécula coestimuladora de linfocitos T.
105. El receptor de antígeno quimérico de la realización/enseñanza 104, en donde la molécula coestimuladora de linfocitos T se selecciona del grupo que consiste en CD28 y 41BB.
106. Un ácido nucleico que codifica el anticuerpo o el fragmento del mismo de cualquiera de las realizaciones/enseñanzas 1-97, el conjugado de la realización/enseñanza 98 o el receptor de antígeno quimérico de cualquiera de las realizaciones/enseñanzas 99-105.
107. Una célula modificada genéticamente que expresa un receptor que comprende el anticuerpo o el fragmento de cualquiera de las realizaciones/enseñanzas 1-97, el conjugado de la realización/enseñanza 98 o el receptor de antígeno quimérico de cualquiera de las realizaciones/enseñanzas 99-105.
108. La célula modificada genéticamente de la realización/enseñanza 107, que es un linfocito T.
109. Una composición que comprende el anticuerpo o un fragmento del mismo de cualquiera de las realizaciones/enseñanzas 1-97, el conjugado de la realización/enseñanza 98, el CAR de cualquiera de las realizaciones/enseñanzas 99-105, o la célula de la realización/enseñanza 107 o 108.
110. La composición de la realización/enseñanza 109, que comprende además un excipiente farmacéuticamente aceptable.
111. Un método de tratamiento, que comprende administrar la composición de la realización/enseñanza 109 o la realización/enseñanza 110 a un sujeto que tiene una enfermedad o trastorno asociado con ROR1.
112. Un método de tratamiento, que comprende administrar un anticuerpo o un fragmento de cualquiera de las realizaciones/enseñanzas 1-97, el conjugado de la realización/enseñanza 98, un CAR de cualquiera de las realizaciones/enseñanzas 99-103 o la célula de la realización/enseñanza 107 o 108 a un sujeto que tiene una enfermedad o trastorno asociado con ROR1.
113. Un método de tratamiento, que comprende administrar la célula de la realización/enseñanza 107 o la realización/enseñanza 108 a un sujeto que tiene una enfermedad o trastorno asociado con ROR1.
114. El método de cualquiera de las realizaciones/enseñanzas 112-113, en donde la enfermedad o el trastorno es un cáncer que expresa ROR1.
115. El método de cualquiera de las realizaciones/enseñanzas 112-114, en donde el cáncer que expresa ROR1 se selecciona del grupo que consiste en leucemia de linfocitos B, linfoma, leucemia linfocítica crónica de linfocitos B (LLC), LMA, leucemia mieloide aguda (LMA), leucemia linfocítica aguda (LLA), linfoma de Burkett, linfoma de células del manto (MCL), cáncer de pulmón no microcítico (CPNM), neuroblastoma, carcinoma de células renales, cáncer de colon, cáncer colorrectal, cáncer de mama, cáncer de células escamosas epiteliales, melanoma, mieloma, cáncer de estómago, cáncer de cerebro, cáncer de pulmón, cáncer de páncreas, cáncer de cuello del útero, cáncer de ovario, cáncer de hígado, cáncer de vejiga, cáncer de próstata, cáncer de testículos, cáncer de tiroides, cáncer de útero, cáncer suprarrenal y cáncer de cabeza y cuello.
116. Una composición de la realización/enseñanza 109 o la realización/enseñanza 110 para su uso en el tratamiento de una enfermedad o trastorno asociado con ROR1.
117. Uso de una composición de la realización/enseñanza 109 o realización/enseñanza 110 para la fabricación de un medicamento para tratar una enfermedad o trastorno asociado con ROR1.
118. La composición para el uso de la realización/enseñanza 116 o el uso de la realización/enseñanza 117, en donde la enfermedad o el trastorno es un cáncer que expresa ROR1.
119. La composición para el uso o el uso de la realización/enseñanza 118, en donde el cáncer que expresa ROR1 se selecciona del grupo que consiste en leucemia de linfocitos B, linfoma, leucemia linfocítica crónica de linfocitos B (LLC), LMA, leucemia mieloide aguda (LMA), leucemia linfocítica aguda (LLA), linfoma de Burkett, linfoma de células del manto (MCL), cáncer de pulmón no microcítico (CPNM), neuroblastoma, carcinoma de células renales, cáncer de colon, cáncer colorrectal, cáncer de mama, cáncer de células escamosas epiteliales, melanoma, mieloma, cáncer de estómago, cáncer de cerebro, cáncer de pulmón, cáncer de páncreas, cáncer de cuello del útero, cáncer de ovario, cáncer de hígado, cáncer de vejiga, cáncer de próstata, cáncer de testículos, cáncer de
tiroides, cáncer de útero, cáncer suprarrenal y cáncer de cabeza y cuello.
V. Ejemplos
Los ejemplos siguientes se incluyen con fines ilustrativos únicamente y no están destinados a limitar el alcance de la invención.
Ejemplo 1: Generación y evaluación de anticuerpos anti-ROR1 (VH)
Los anticuerpos anti-ROR1 a modo de ejemplo, las cadenas pesadas variables (VH) que se unen específicamente a ROR1, incluso en ausencia de una cadena ligera variable (Vl), se generaron y se evaluaron. Los anticuerpos anti-ROR1 (VH) resultaron de selecciones basadas en la capacidad de unirse específicamente a células que expresan ROR1 y/o competir por la unión con un anticuerpo de referencia anti-ROR1 obtenido de conejo.
1A. Selección de biblioteca, generación de anticuerpos
Se generaron anticuerpos anti-ROR1 (VH) a modo de ejemplo a través de una serie de etapas de selección llevadas a cabo en bibliotecas de Vh de anticuerpos sin exposición previa codificados por ADNdc presentados en un sistema libre de células. Los miembros de una biblioteca de Vh se seleccionaron para unirse a células vivas a través de cinco rondas sucesivas, enriqueciendo los miembros que se unen específicamente a células CHOK1, K562 y/o HEK293 transfectadas de manera estable que expresan ROR1, pero no a las células K562 y/o CHOK1 originales que no expresaban ROR1. Para recuperar los aglutinantes de Vh, se realizó una selección adicional. En la rama (a), se aplicó decapado de superficie a las 5 rondas de selección para recuperar los aglutinantes de Vh de ROR1 que cubren amplios epítopos e intervalos de afinidad. En otra rama (b), después de dos rondas de decapado de superficie, se aplicó la elución competitiva utilizando un anticuerpo anti-ROR1 de conejo, scFv R12 (que tiene la secuencia establecida en la SEQ ID NO: 84, incluyendo las secuencias de Vh y Vl del anticuerpo de conejo-humano designado R12), para enriquecer los aglutinantes que compiten con el scFv R12 por unirse a ROR1, tal como el epítopo scFv R12.
Ciertos clones resultantes se secuenciaron usando cebadores directos e inversos para determinar las secuencias de aminoácidos. La Tabla 2A enumera los identificadores de secuencia de la secuencia VH de los clones a modo de ejemplo y las correspondientes CDR-H1, CDR-H2 y CDR-H3 en el mismo. La Tabla 2B enumera los identificadores de secuencia correspondientes a secuencias de aminoácidos de CDR-H3 (Kabat) a modo de ejemplo para clones a modo de ejemplo. Una secuencia de Vh para el clon V70 se establece en la SEQ ID NO: 8, que tenía secuencias de CDR-H1 y CDR-H2 (Kabat) tal como se establece en los SEQ ID NO: 27 y 28, respectivamente. Una secuencia de V h para el clon V353 se establece en la SEQ ID NO: 10, que tenía secuencias de CDR-H1 y CDR-H2 (Kabat) establecidas en los SEQ ID NO: 33 y 34, respectivamente. La Tabla 2B también enumera una secuencia de CDR-H3 (Kabat) de un anticuerpo R12 de referencia obtenido de conejo (que tiene una secuencia de Vh establecida en la SEQ ID NO: 85), un fragmento scFv del cual se usó como control en el presente estudio. El clon V355 tenía un marco de cadena pesada con una secuencia obtenida de una secuencia de Vh1 ; los clones V331 y V345 tenían marcos de cadena pesada con secuencias derivadas de secuencias Vh4 humanas. Todos los demás clones (aparte de R12) enumerados en la Tabla 2A y 2B contenían marcos con secuencias obtenidas de secuencias Vh3 humanas.
(continuación)
Tabla 2B:
1B. Afinidades de unión, competencia con el anticuerpo de referencia
Los clones de Vh a modo de ejemplo que se unen a ROR1, generados en el proceso de selección descrito en el Ejemplo 1A, se evaluaron más a fondo. Los clones se purificaron y se titularon, y sus afinidades de unión (CE50) a las
células K562 y CHOK1 que expresan ROR1 se evaluaron por citometría de flujo, con la CE50 del anticuerpo de referencia (R12 scFv) sirviendo como control positivo.
También se realizaron ensayos para evaluar la competencia de los clones con el anticuerpo de referencia (R12 scFv), para la unión a células que expresan ROR1. Los clones de Vh se titularon contra Myc-R122 nM en células ROR1/K562 y se evaluó la competencia con un anticuerpo secundario anti-Myc-Alexa647, y se determinó la concentración inhibidora semimáxima (CI50) para los respectivos clones.
De forma adicional, se calcularon el porcentaje (%) de unión máxima (máx.) a las células que expresan ROR1 y el % de competencia máxima con el anticuerpo de referencia (R12 scFv). Los valores porcentuales de unión máxima y de competencia se calcularon en función de las mesetas pronosticadas (medidas por Prism® usando regresión no lineal de cuatro parámetros), en relación con los valores de unión e inhibición de scFv R12, respectivamente, asignado como 100 % en cada estudio.
Los resultados se presentan en la Tabla 2C, que enumera la CE50 media (afinidad de unión), CI50 (competencia), % máximo de unión y el % máximo de valores de competencia, basado en el número indicado de experimentos para diversos clones. Como cabía esperar, en este estudio se confirmó que el anticuerpo de referencia (R12 scFv) se une específicamente a ROR1 y compite consigo mismo.Los resultados demostraron la unión y competencia específicas de ROR1 con el anticuerpo de referencia R12 scFv, en diversos grados para varios clones. Entre los clones generados estaban los que presentaban afinidad similar (CE50) para ROR1 y niveles similares de competencia por la unión a ROR1 con el anticuerpo de referencia.
Se probaron dos preparaciones del clon V9 en un único ensayo de competición de scFv R12 y se descubrió que no tenían ninguna actividad de unión competitiva detectable.
continuación
Ejemplo 2: Generación y evaluación de anticuerpos anti-ROR1 (scFv)
Se generaron y evaluaron anticuerpos anti-ROR1 a modo de ejemplo (scFv) que se unieron específicamente a ROR1, incluidos aquellos que compitieron por unirse con el anticuerpo de referencia scFv R12.
2A. Selección de biblioteca, generación de anticuerpos
Se generaron anticuerpos anti-ROR1 scFv a modo de ejemplo a través de diversos enfoques de selección, llevados a cabo en bibliotecas de anticuerpos humanos sin exposición previa codificadas por ADNdc presentados en un sistema libre de células. En algunas estrategias, los miembros de la biblioteca de Vl se emparejaron con anticuerpos de solo VH específicos de ROR1 generados en el estudio descrito en el Ejemplo 1.
En un enfoque, se enriqueció una biblioteca de Vh a través de tres rondas sucesivas para miembros que se unieron específicamente a células CHOK1, K562 y/o HEK293 transfectadas de manera estable que expresan ROR1, pero no a células originales negativas para ROR1. Las bibliotecas enriquecidas en Vh se convirtieron en bibliotecas de scFv al mezclarlas con una biblioteca de Vl humana sin exposición previa, en formato VH-(G4S)3-Vl. Las bibliotecas scFv barajadas se enriquecieron luego en una cuarta y quinta ronda de selección para la unión específica a células CHOK1 que expresan ROR1 (pero no originales), con elución por decapado superficial. En una sexta ronda, selección negativa enriquecida para miembros que no se unieron a células originales (K562, CHOK1), seguida de selección positiva para unirse a células K562 y/o CHOK1 que expresan ROR1. Los grupos de elución se generaron mediante (a) separación de la superficie o (b) elución competitiva de R12.
En otro enfoque, se llevó a cabo la selección de novo enriqueciendo una biblioteca scFv humana sin tratamiento previo para la unión específica de ROR1 con células ROR1-HEK293, ROR1-CHO y ROR1-K562 y no las células originales HEK293, CHO-K1 y K562 en múltiples rondas alternando líneas celulares en cada ronda, seguido de una combinación de separación superficial (R1), elución competitiva con R12 scFv (R2-4) e inmunoprecipitación (R5) para recuperar los aglutinantes de scFv.
En otro enfoque, los anticuerpos de solo Vh específicos de ROR1 generados en el estudio y descritos en el Ejemplo 1B se emparejaron de forma no covalente con miembros de una biblioteca de Vl humana sin exposición previa (construida a partir del mismo conjunto de donantes que la biblioteca de VH sin exposición previa) por presentación de ADNdc, seguido de la selección para la unión de ROR1 durante 3 rondas sucesivas con células ROR1-HEK293 y ROR1-CHO. Se utilizaron secuencias de Vl seleccionadas para generar clones de scFv.
Para los clones de scFv seleccionados en estos diversos enfoques, la unión específica a células K562 que expresan ROR1, en comparación con las células de control que no expresan ROR1, se evaluó mediante citometría de flujo con lisado celular bruto traducido in vitro o con sobrenadante producido por bacterias. Se analizaron adicionalmente ciertos clones que mostraban preferencia de unión por ROR1.
Los clones se secuenciaron utilizando cebadores directos e inversos. Las secuencias de aminoácidos de CDR-H3 (Kabat) a modo de ejemplo para los clones a modo de ejemplo y los identificadores de secuencia respectivos se enumeran en la Tabla 3A. El clon "83B" una variante de desglicosilación del clon 83, se generó mediante la introducción de una sustitución de serina (S) a asparagina (N) en la posición 53 de Vh (Kabat) para eliminar el motivo de N-glicosilación del clon 83. La Tabla 3B enumera los identificadores de secuencia para las secuencias Vh y Vl y las secuencias de CDR-H 1, 2 y 3 a modo de ejemplo (Kabat) y secuencias CDR-L de clones a modo de ejemplo. La Tabla 3A también enumera el segmento v humano de cadena ligera respectivo del que se obtienen las secuencias marco de anticuerpos individuales. Cada anticuerpo de esta tabla incluía una secuencia marco de cadena pesada obtenida de una secuencia de VH3 humana.
2B. Afinidades de unión, competencia con el anticuerpo de referencia
Los clones se purificaron y se titularon, y sus afinidades de unión (CE50) a células K562 y CHOK1 que expresan ROR1 se evaluaron por citometría de flujo. La CE50 para el anticuerpo de referencia scFv R12 en este estudio sirvió como
control positivo.
También se realizaron ensayos para evaluar la competencia (medida como la concentración inhibidora semimáxima (CI50)) de los clones con el anticuerpo de referencia scFv R12 para unirse a células que expresan ROR1, tal como se describe en el Ejemplo 1. El porcentaje (%) máximo de ROR1 y el % máximo de competencia, en comparación con el anticuerpo de referencia scFv R12, se determinaron tal como se describe en el Ejemplo 1.
Los resultados se presentan en la Tabla 3C, que enumera la CE50 media (afinidad de unión), CI50 (competencia), el % máximo de unión y el % máximo de valores de competencia para diversos clones, tal como se determina en una pluralidad de experimentos. Como cabía esperar, se confirmó que el anticuerpo de referencia presentaba unión y competencia específicas de ROR1 consigo mismo en este estudio. Los resultados demostraron diversos grados de afinidades de unión específicas de ROR1 y competencia con el anticuerpo de referencia scFv de R12 entre los diversos clones. Entre los clones ensayados se encontraban aquellos con afinidad de unión a ROR1 similar en comparación con el anticuerpo de referencia y los que competían por la unión con los anticuerpos de referencia en grados similares en comparación con el propio anticuerpo de referencia.
Ejemplo 3: Generación de receptores de antígenos quiméricos (CAR) contra ROR1, células modificadas genéticamente que expresan dichos CAR y evaluación de las funciones efectoras de dichas células que expresan CAR
Se generaron varios receptores de antígenos quiméricos (CAR) a modo de ejemplo, con regiones de unión a antígeno que contienen dominios de unión a antígeno anti-ROR1 humanos como se describe en el Ejemplo 1. Específicamente, se generaron moléculas de ácido nucleico que codificaban CAR que contenían dominios de unión a antígeno scFv en el formato VH-VL (Clon 83B, Clon 298 o Clon 48) o un dominio de unión a antígeno solo VH (Clon V70 y Clon V353). Para dominios a modo de ejemplo de unión a antígeno scFv, también se generaron construcciones que codifican un CAR que tiene las mismas secuencias VH y VL, pero presente en la orientación inversa (VL-VH). Se usó como control un CAR que contenía un scFv (R12) anti-ROR1 de conejo (en la orientación VH-VL). Cada CAR contenía además un espaciador solo de bisagra obtenido de Ig, un dominio transmembrana obtenido de CD28 humano, un dominio de señalización intracelular obtenido de 4-1BB humano, un dominio de señalización obtenido de CD3 zeta humano y una secuencia de EGFR truncada (tEGFR) para su uso como marcador de transducción, separada de la secuencia CAR por una secuencia T2A autoescindible.
Se generaron poblaciones primarias de linfocitos T humanos que expresan los diversos CAR. Las moléculas de ácido nucleico que codifican cada CAR se clonaron individualmente en un vector lentivírico, que se utilizó para transducir linfocitos T CD8+ en poblaciones aisladas de muestras de PBMC humanas obtenidas de donantes sanos (esencialmente como lo describe Yam etal. (2002) Mol. Ther. 5:479; WO2015/095895). Como control, se usó un vector lentivírico que contenía ácido nucleico que codificaba solo la secuencia de tEGFR para generar células de control que expresaban solo el tEGFR. Los linfocitos T CD8+ humanos modificado genéticamente que expresan diversos CAR que
contienen dominios de unión a antígeno anti-ROR1 humanos, producidos tal como se describe anteriormente, se evaluaron para diversas respuestas tras el cultivo conjunto con células que expresan ROR1.
A. Actividad citolítica
Las células diana que expresan ROR1 se incubaron con linfocitos T CD8+ que expresan los diversos CAR o tEGFR solo (control negativo). Después de la incubación, se controló la lisis de las células diana. Específicamente, se ensayó la lisis de células K562 transducidas con ROR1 (K562/ROR1), células JeKo-1 (línea de linfoma de células del manto) y células de control K562 no transducidas (control negativo) (Fig. 1A).
Las células diana (K562/ROR1, JeKo-1, o células de control K562 no transducidas) se marcaron durante la noche con 51Cr. Las células marcadas se lavaron e incubaron con linfocitos T efectores (células CD8+ de control negativo y que expresan CAR) en una sola proporción de efector frente a diana (E:D). Para medir la lisis espontánea, las células diana se incubaron con un volumen igual de medio pero sin células efectoras y se determinó la lisis máxima después de la incubación de las células diana con detergente para lisar completamente las células diana. Los sobrenadantes se recogieron para el recuento y después de una incubación de 4 horas. El porcentaje de lisis específica para las condiciones experimentales se calculó como:
[(Liberación experimental - Liberación espontánea)/ (Liberación máxima - Liberación espontánea)] x 100.
Los resultados se establecen en la Fig. 1A. Tal como se muestra en la Fig. 1A, los linfocitos T CD8+ que expresan diversos CAR que contienen dominios de unión a antígeno anti-ROR1 humanos mostraron actividad citolítica específica de antígeno contra las células K562/ROR1, al igual que las células que expresan el CAR que contienen scFv anti-ROR1 (R12) de conejo. Esta actividad citotóxica generalmente no se observó contra las células K562 de control que no expresaban RORl. Los resultados mostraron que las células modificadas con un CAR que contiene el clon V353 a modo de ejemplo que contiene solo el dominio VH presentaron una actividad citolítica comparable a los CAR que contienen un dominio de unión a antígeno en el formato scFv. El grado de actividad citolítica observado para las células que expresan un CAR con un scFv humano dado en la orientación VH-VL fue generalmente mayor que el observado para las células que expresan un CAR con el scFv correspondiente en la orientación VL-VH inversa (LH).
B. Liberación de citocinas
Se evaluó la liberación de citocinas después de la incubación de las células que expresan CAR con células diana de control y que expresan antígenos. Los linfocitos T CD8+ transducidos se cocultivaron con células diana (K562, K562/ROR1, JeKo-1) en una sola proporción de efector frente a diana (E:D). Las células cocultivadas se incubaron durante aproximadamente 24 horas, y luego se recogieron los sobrenadantes para la medición de IFN-y usando un inmunoensayo de citocinas.
Los resultados se establecen en la Fig. 1B. Se observó que los linfocitos T CD8+ modificados genéticamente que expresan varios CAR que contienen el dominio de unión a antígeno anti-ROR1 humano secretan IFN-y de una manera específica de antígeno después de la incubación con células K562/ROR1, al igual que las células que expresan el CAR que contienen scFv anti-ROR1 (R12) de conejo. La secreción de citocinas generalmente no se observó después de la incubación con células K562 de control que no expresaban ROR1. Los resultados mostraron que las células modificadas con un CAR que contiene el clon V353 a modo de ejemplo que contiene solo el dominio VH presentaron unos niveles de secreción de IFN-y comparable a los CAR que contienen un dominio de unión a antígeno en el formato scFv. El grado de secreción de IFN-y observado para las células que expresan un CAR con un scFv humano dado en la orientación VH-VL fue generalmente mayor que el observado para las células que expresan un CAR con el scFv correspondiente en la orientación (VL-VH) inversa.
Ejemplo 4: Evaluación de funciones efectoras de células que expresan CAR frente a células que expresan ROR1 humano o de ratón
Se generaron y utilizaron varios receptores de antígenos quiméricos (CAR) a modo de ejemplo para generar linfocitos T CD8+ que expresan CAR tal como se describe en el Ejemplo 3.
Se evaluó la liberación de citocinas después de la incubación de las células que expresan CAR con células que expresan antígeno K562/ROR1 humano (hRORI) o K562/ROR1 de ratón (mRORI). Los linfocitos T c D8+ transducidos se cultivaron conjuntamente con células que expresan antígeno en una sola proporción de efector frente a diana (E:D). Las células cocultivadas se incubaron durante aproximadamente 24 horas, y luego se recogieron los sobrenadantes para la medición de IFN-y usando un inmunoensayo de citocinas.
Los resultados se establecen en la Fig. 2. Se observó que los linfocitos T CD8+ modificados genéticamente que expresan los diversos CAR que contienen el dominio de unión a antígeno anti-ROR1 humano secretan IFN-y a niveles comparables después de la incubación con células que expresan hRORI o células que expresan mRORl. Por el contrario, se observó que las células modificadas con el scFv anti-ROR1 (R12) de conejo secretaban IFN-y solo después de la incubación con células que expresan hROR-1 y no después de la incubación con células que expresan
mROR-1. Este resultado es consistente con la especificidad documentada de R12 para ROR1 humano y no de ratón (Yang etal. (2011) PLoS ONE, 6:e21018). Por lo tanto, junto con los resultados del Ejemplo 2, los resultados mostraron que los dominios de unión de unión a antígeno anti-ROR1 humanos probados de los CAR se unen a un epítopo en ROR1 humana que puede solaparse con R12, pero también se unen a un epítopo en ROR1 de ratón que no es reconocido por R12.
La presente invención no pretende limitar su alcance a las realizaciones particulares desveladas, que se proporcionan, por ejemplo, para ilustrar diversos aspectos de la invención. Diversas modificaciones de las composiciones y métodos descritos resultarán evidentes a partir de la descripción y enseñanzas del presente documento.
SECUENCIAS
Claims (19)
1. Un anticuerpo anti-ROR1 o un fragmento de unión a antígeno, que comprende una región variable de cadena pesada (Vh) que comprende una región determinante de complementariedad de cadena pesada 1 (CDR-H1), CDR-H2 y CDR-H3, y una región variable de cadena ligera (Vl) que comprende una CDR-L1, CDR-L2 y CDR-L3, en el que:
la CDR-H1, la CDR-H2 y la CDR-H3 comprenden las secuencias de los SEQ ID NO: 20, 21 y 22, respectivamente, y la CDR-L1, la CDR-L2 y la CDR-L3 comprenden las secuencias de los SEQ ID NO: 23, 24 y 25, respectivamente; la CDR-H1, la CDR-H2 y la CDR-H3 comprenden las secuencias de los SEQ ID NO: 20, 26 y 22, respectivamente, y la CDR-L1, la CDR-L2 y la CDR-L3 comprenden las secuencias de los SEQ ID NO: 23, 24 y 25, respectivamente; la CDR-H1, la CDR-H2 y la CDR-H3 comprenden las secuencias de los SEQ ID NO: 27, 28 y 29, respectivamente, y la CDR-L1, la CDR-L2 y la CDR-L3 comprenden las secuencias de los SEQ ID NO: 218, 229 y 39, respectivamente;
la CDR-H1, la CDR-H2 y la CDR-H3 comprenden las secuencias de los SEQ ID NO: 27, 28 y 29, respectivamente, y la CDR-L1, la CDR-L2 y la CDR-L3 comprenden las secuencias de los SEQ ID NO: 30, 31 y 32, respectivamente; la CDR-H1, la CDR-H2 y la CDR-H3 comprenden las secuencias de los SEQ ID NO: 27, 28 y 29, respectivamente, y la CDR-L1, la CDR-L2 y la CDR-L3 comprenden las secuencias de los SEQ ID NO: 216, 227 y 40, respectivamente;
la CDR-H1, la CDR-H2 y la CDR-H3 comprenden las secuencias de los SEQ ID NO: 33, 34 y 35, respectivamente, y la CDR-L1, la CDR-L2 y la CDR-L3 comprenden las secuencias de los SEQ ID NO: 217, 228 y 41, respectivamente;
la CDR-H1, la CDR-H2 y la CDR-H3 comprenden las secuencias de los SEQ ID NO: 33, 34 y 35, respectivamente, y la CDR-L1, la CDR-L2 y la CDR-L3 comprenden las secuencias de los SEQ ID NO: 212, 223 y 42, respectivamente;
la CDR-H1, la CDR-H2 y la CDR-H3 comprenden las secuencias de los SEQ ID NO: 33, 34 y 35, respectivamente, y la CDR-L1, la CDR-L2 y la CDR-L3 comprenden las secuencias de los SEQ ID NO: 36, 37 y 38, respectivamente; la CDR-H1, la CDR-H2 y la CDR-H3 comprenden las secuencias de los SEQ ID NO: 27, 28 y 29, respectivamente, y la CDR-L1, la CDR-L2 y la CDR-L3 comprenden las secuencias de los SEQ ID NO: 219, 230 y 43, respectivamente;
la CDR-H1, la CDR-H2 y la CDR-H3 comprenden las secuencias de los SEQ ID NO: 33, 34 y 35, respectivamente, y la CDR-L1, la CDR-L2 y la CDR-L3 comprenden las secuencias de los SEQ ID NO: 215, 226 y 44, respectivamente;
y
la CDR-H1, la CDR-H2 y la CDR-H3 comprenden las secuencias de los SEQ ID NO: 27, 164 y 45, respectivamente, y la CDR-L1, la CDR-L2 y la CDR-L3 comprenden las secuencias de los SEQ ID NO: 220, 231 y 46, respectivamente,
en donde el anticuerpo o el fragmento de unión a antígeno es humano; y
en donde el anticuerpo o el fragmento compiten por unirse a una proteína ROR1 humana con el anticuerpo anti-ROR1 R12 o un fragmento de unión a antígeno del mismo, que es opcionalmente un fragmento scFv de R12.
2. El anticuerpo anti-ROR1 o el fragmento de unión a antígeno de la reivindicación 1, en el que:
la región Vh comprende al menos el 90 % de identidad de secuencia con la secuencia de aminoácidos establecida en los SEQ ID NO: 13, 15, 17, 19, 177, 180, 181, 182, 183, 184, 185 o 186; y
la región VL comprende al menos el 90 % de identidad de secuencia con la secuencia de aminoácidos de la región Vl establecida en los SEQ ID NO: 14, 16, 18, 238, 241,242, 243, 244, 245, 246, 247 o 248.
3. El anticuerpo anti-ROR1 o el fragmento de unión a antígeno de la reivindicación 1 o de la reivindicación 2, que comprende una región Vh y una región variable de cadena ligera (Vl), en el que:
las regiones Vh y Vl comprenden secuencias de aminoácidos que tienen al menos el 90 % de identidad con los SEQ ID NO: 19 y 18, respectivamente;
las regiones VH y VL comprenden secuencias de aminoácidos que tienen al menos el 90 % de identidad con los SEQ ID NO: 17 y 18, respectivamente;
las regiones VH y VL comprenden secuencias de aminoácidos que tienen al menos el 90 % de identidad con los SEQ ID NO: 15 y 16, respectivamente;
las regiones Vh y Vl comprenden secuencias de aminoácidos que tienen al menos el 90 % de identidad con los SEQ ID NO: 13 y 14, respectivamente;
las regiones Vh y Vl comprenden secuencias de aminoácidos que tienen al menos el 90 % de identidad con los SEQ ID NO: 182 y 242 respectivamente;
las regiones Vh y Vl comprenden secuencias de aminoácidos que tienen al menos el 90 % de identidad con los SEQ ID NO: 182 y 246, respectivamente;
las regiones Vh y Vl comprenden secuencias de aminoácidos que tienen al menos el 90 % de identidad con los SEQ ID NO: 182 y 247, respectivamente;
las regiones Vh y Vl comprenden secuencias de aminoácidos que tienen al menos el 90 % de identidad con los SEQ ID NO: 185 y 248, respectivamente;
las regiones Vh y Vl comprenden secuencias de aminoácidos que tienen al menos el 90 % de identidad con los SEQ ID NO: 186 y 248, respectivamente;
las regiones Vh y Vl comprenden secuencias de aminoácidos que tienen al menos el 90 % de identidad con los SEQ ID NO: 177 y 238, respectivamente;
las regiones Vh y Vl comprenden secuencias de aminoácidos que tienen al menos el 90 % de identidad con los SEQ ID NO: 180 y 241, respectivamente;
las regiones Vh y Vl comprenden secuencias de aminoácidos que tienen al menos el 90 % de identidad con los SEQ ID NO: 181 y 241, respectivamente;
las regiones VH y VL comprenden secuencias de aminoácidos que tienen al menos el 90 % de identidad con los SEQ ID NO: 183 y 243 respectivamente;
las regiones Vh y Vl comprenden secuencias de aminoácidos que tienen al menos el 90 % de identidad con los SEQ ID NO: 183 y 244 respectivamente;
las regiones Vh y Vl comprenden secuencias de aminoácidos que tienen al menos el 90 % de identidad con los SEQ ID NO: 184 y 243, respectivamente;
las regiones Vh y Vl comprenden secuencias de aminoácidos que tienen al menos el 90 % de identidad con los SEQ ID NO: 184 y 244 respectivamente;
las regiones Vh y Vl comprenden secuencias de aminoácidos que tienen al menos el 90 % de identidad con los SEQ ID NO: 183 y 245, respectivamente; o
las regiones Vh y Vl comprenden secuencias de aminoácidos que tienen al menos el 90 % de identidad con los SEQ ID NO: 184 y 245, respectivamente.
4. El anticuerpo anti-ROR1 o el fragmento de unión a antígeno de cualquiera de las reivindicaciones 1-3, en el que:
el anticuerpo o el fragmento de unión a antígeno comprende las regiones VH y VL que comprenden las secuencias de aminoácidos establecidas en los SEQ ID NO: 19 y 18, respectivamente;
el anticuerpo o el fragmento de unión a antígeno comprende las regiones VH y VL que comprenden las secuencias de aminoácidos establecidas en los SEQ ID NO: 17 y 18, respectivamente;
el anticuerpo o el fragmento de unión a antígeno comprende las regiones VH y VL que comprenden las secuencias de aminoácidos establecidas en los SEQ ID NO: 15 y 16, respectivamente;
el anticuerpo o el fragmento de unión a antígeno comprende las regiones VH y VL que comprenden las secuencias de aminoácidos establecidas en los SEQ ID NO: 13 y 14, respectivamente;
el anticuerpo o el fragmento de unión a antígeno comprende las regiones VH y VL que comprenden las secuencias de aminoácidos establecidas en los SEQ ID NO: 182 y 242 respectivamente;
el anticuerpo o el fragmento de unión a antígeno comprende las regiones VH y VL que comprenden las secuencias de aminoácidos establecidas en los SEQ ID NO: 182 y 246, respectivamente;
el anticuerpo o el fragmento de unión a antígeno comprende las regiones Vh y Vl que comprenden las secuencias de aminoácidos establecidas en los SEQ ID NO: 182 y 247, respectivamente;
el anticuerpo o el fragmento de unión a antígeno comprende las regiones Vh y Vl que comprenden las secuencias de aminoácidos establecidas en los SEQ ID NO: 185 y 248, respectivamente;
el anticuerpo o el fragmento de unión a antígeno comprende las regiones Vh y Vl que comprenden las secuencias de aminoácidos establecidas en los SEQ ID NO: 186 y 248, respectivamente;
el anticuerpo o el fragmento de unión a antígeno comprende las regiones Vh y Vl que comprenden las secuencias de aminoácidos establecidas en los SEQ ID NO: 177 y 238, respectivamente;
el anticuerpo o el fragmento de unión a antígeno comprende las regiones Vh y Vl que comprenden las secuencias de aminoácidos establecidas en los SEQ ID NO: 180 y 241, respectivamente;
el anticuerpo o el fragmento de unión a antígeno comprende las regiones Vh y Vl que comprenden las secuencias de aminoácidos establecidas en los SEQ ID NO: 181 y 241, respectivamente;
el anticuerpo o el fragmento de unión a antígeno comprende las regiones Vh y Vl que comprenden las secuencias de aminoácidos establecidas en los SEQ ID NO: 183 y 243 respectivamente;
el anticuerpo o el fragmento de unión a antígeno comprende las regiones Vh y Vl que comprenden las secuencias de aminoácidos establecidas en los SEQ ID NO: 183 y 244 respectivamente;
el anticuerpo o el fragmento de unión a antígeno comprende las regiones Vh y Vl que comprenden las secuencias de aminoácidos establecidas en los SEQ ID NO: 184 y 243, respectivamente;
el anticuerpo o el fragmento de unión a antígeno comprende las regiones Vh y Vl que comprenden las secuencias de aminoácidos establecidas en los SEQ ID NO: 184 y 244 respectivamente;
el anticuerpo o el fragmento de unión a antígeno comprende las regiones Vh y Vl que comprenden las secuencias de aminoácidos establecidas en los SEQ ID NO: 183 y 245, respectivamente; o
el anticuerpo o el fragmento de unión a antígeno comprende las regiones Vh y Vl que comprenden las secuencias de aminoácidos establecidas en los SEQ ID NO: 184 y 245, respectivamente.
5. El anticuerpo anti-ROR1 o el fragmento de unión a antígeno de cualquiera de las reivindicaciones 1-4, en donde dichos anticuerpo o fragmento se unen específicamente a una proteína ROR1 humana.
6. El anticuerpo anti-ROR1 o el fragmento de unión a antígeno de cualquiera de las reivindicaciones 1-5, en donde dichos anticuerpo o fragmento se unen específicamente a una proteína ROR1 de ratón.
7. El anticuerpo anti-ROR1 o el fragmento de unión a antígeno de cualquiera de las reivindicaciones 1-6, en donde el anticuerpo o el fragmento son recombinantes, opcionalmente, un anticuerpo monoclonal o un fragmento.
8. El anticuerpo anti-ROR1 o el fragmento de unión a antígeno de cualquiera de las reivindicaciones 1-7 que es un fragmento de unión a antígeno, opcionalmente un fragmento de cadena simple.
9. El anticuerpo anti-ROR1 o el fragmento de unión a antígeno de la reivindicación 8, en donde el fragmento de cadena simple comprende un scFv.
10. El anticuerpo anti-ROR1 o el fragmento de unión a antígeno de la reivindicación 9, en donde el scFv comprende la secuencia de aminoácidos establecida en los SEQ ID NO: 2, 4, 6, 12, 253, 256, 257, 258, 259, 260, 261,262, 263, 264, 265, 266, 267 o 268, o una secuencia de aminoácidos que presenta al menos el 90 % de identidad de secuencia con la secuencia de aminoácidos establecida en los SEQ ID NO: 2, 4, 6, 12, 253, 256, 257, 258, 259, 260, 261,262, 263, 264, 265, 266, 267 o 268.
11. El anticuerpo anti-ROR1 o el fragmento de unión a antígeno de cualquiera de las reivindicaciones 1-10, en donde el anticuerpo o el fragmento de unión a antígeno comprende:
la región Vh establecida en la SEQ ID NO: 19 y la región Vl establecida en la SEQ ID NO: 18, y/o el anticuerpo o el fragmento comprende la secuencia de aminoácidos establecida en la SEQ ID NO: 12;
la región Vh establecida en la SEQ ID NO: 13 y la región Vl establecida en la SEQ ID NO: 14, y/o el anticuerpo o el fragmento comprende la secuencia de aminoácidos establecida en la SEQ ID NO: 6;
la región Vh establecida en la SEQ ID NO: 15 y la región Vl establecida en la SEQ ID NO: 16, y/o el anticuerpo o el fragmento comprende la secuencia de aminoácidos establecida en la SEQ ID NO: 4; o
la región Vh establecida en la SEQ ID NO: 17 y la región Vl establecida en la SEQ ID NO: 18, y/o el anticuerpo o el fragmento comprende la secuencia de aminoácidos establecida en la SEQ ID NO: 2.
12. El anticuerpo o el fragmento de unión a antígeno de la reivindicación 1, en donde el anticuerpo o el fragmento se unen a un epítopo dentro de una porción extracelular de la proteína ROR1, en donde el epítopo comprende un resto dentro del dominio fz de la proteína ROR1 y un resto dentro del dominio Ig de la proteína ROR1.
13. Un conjugado, que comprende el anticuerpo anti-ROR1 o el fragmento de unión a antígeno de cualquiera de las reivindicaciones 1-12 y una molécula o un resto heterólogos.
14. Un receptor de antígeno quimérico (CAR) que comprende una porción extracelular que comprende el anticuerpo o el fragmento de unión a antígeno de cualquiera de las reivindicaciones 1-12 y un dominio de señalización intracelular.
15. El receptor de antígeno quimérico de la reivindicación 14, en donde el dominio de señalización intracelular comprende un dominio de señalización de una cadena zeta de una cadena CD3-zeta (CD3Z); en donde opcionalmente el receptor de antígeno quimérico comprende además:
un dominio transmembrana que une el dominio extracelular y el dominio de señalización intracelular, opcionalmente en donde el dominio transmembrana comprende una porción transmembrana de CD28; y/o
un dominio de señalización intracelular de una molécula coestimuladora de linfocitos T, en donde opcionalmente la molécula coestimuladora de linfocitos T se selecciona del grupo que consiste en CD28 y 41BB.
16. Un ácido nucleico que codifica el anticuerpo o el fragmento de unión a antígeno del mismo de cualquiera de las reivindicaciones 1-12, el conjugado de la reivindicación 13 o el receptor de antígeno quimérico de la reivindicación 14 o de la reivindicación 15.
17. Una célula modificada genéticamente que expresa un receptor que comprende el anticuerpo anti-ROR1 o el fragmento de unión a antígeno de cualquiera de las reivindicaciones 1-12, el conjugado de la reivindicación 13 o el receptor de antígeno quimérico de la reivindicación 14 o de la reivindicación 15, en donde opcionalmente la célula modificada genéticamente es un linfocito T.
18. Una composición que comprende el anticuerpo anti-ROR1 o el fragmento de unión a antígeno de cualquiera de las reivindicaciones 1-12, el conjugado de la reivindicación 13, el receptor de antígeno quimérico de la reivindicación 14 o de la reivindicación 15, o la célula de la reivindicación 17.
19. Una composición de la reivindicación 18 para su uso en el tratamiento de una enfermedad o un trastorno asociados a ROR1, opcionalmente, en donde la enfermedad o el trastorno son un cáncer que expresa ROR1.
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