ES2654543T3 - Anticuerpos neutralizantes del citomegalovirus humano y uso de los mismos - Google Patents
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Abstract
Un anticuerpo aislado, o un fragmento de unión al antígeno del mismo, que es específico de una proteína del hCMV, gB, en el que el anticuerpo o fragmento (a) comprende secuencias CDR1, CDR2 y CDR3 de la cadena pesada como se expone en las SEQ ID NOs: 336, 337 y 338, respectivamente, y secuencias CDR1, CDR2 y CDR3 de la cadena ligera como se expone en las SEQ ID NOs: 339, 340 y 341, respectivamente; (b) comprende secuencias CDR1, CDR2 y CDR3 de la cadena pesada como se expone en las SEQ ID NOs: 316, 317 y 318, respectivamente, y secuencias CDR1, CDR2 y CDR3 de la cadena ligera como se expone en las SEQ ID NOs: 319, 320 y 321 respectivamente; (c) comprende secuencias CDR1, CDR2 y CDR3 de la cadena pesada como se expone en las SEQ ID NOs: 278, 279 y 280 respectivamente, y secuencias CDR1, CDR2 y CDR3 de la cadena ligera como se expone en las SEQ ID NOs: 281, 282, y 283 respectivamente; (d) comprende secuencias CDR1, CDR2 y CDR3 de la cadena pesada como se expone en las SEQ ID NOs: 352, 279 y 280 respectivamente, y secuencias CDR1, CDR2 y CDR3 de la cadena ligera como se expone en las SEQ ID NOs: 281, 282 y 283, respectivamente; (e) comprende secuencias CDR1, CDR2 y CDR3 de la cadena pesada como se expone en las SEQ ID NOs: 296, 297 y 298, respectivamente, y secuencias CDR1, CDR2 y CDR3 de la cadena ligera como se expone en las SEQ ID NOs: 299, 300 y 301 respectivamente; o (f) comprende secuencias CDR1, CDR2 y CDR3 de la cadena pesada como se expone en las SEQ ID NOs: 360, 279 y 280 respectivamente, y secuencias CDR1, CDR2 y CDR3 de la cadena ligera como se expone en las SEQ ID NOs: 281, 282 y 361 respectivamente.
Description
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DESCRIPCION
Anticuerpos neutralizantes del citomegalovirus humano y uso de los mismos Antecedentes
El citomegalovirus humano (hCMV) es un patógeno ampliamente distribuido que puede causar una patología grave en adultos inmunodeprimidos y tras la infección del feto y que se ha visto implicado en enfermedades crónicas como la aterosclerosis. El hCMV infecta múltiples tipos de células, incluidos fibroblastos, células endoteliales, epiteliales y hematopoyéticas [1]. In vitro, las cepas atenuadas propagadas de hCMV, que se están desarrollando como vacunas candidatas, han perdido el tropismo por las células endoteliales, al tiempo que conservan la capacidad de infectar fibroblastos [2]. Se cree que dos complejos de glicoproteínas víricas controlan el tropismo celular del hCMV. Parece ser necesario un complejo de glicoproteínas como gH, gL y gO para la infección de fibroblastos, mientras que un complejo de gH, gL y proteínas codificadas por los genes UL131-UL128 está implicado en la infección de células endoteliales, células epiteliales y células dendríticas [2-8].
Las globulinas hiperinmunitarias ya se comercializan para la profilaxis de la enfermedad por hCMV asociada con el trasplante y los datos recientes indican que tienen un efecto terapéutico en mujeres embarazadas [9]. Este enfoque terapéutico está limitado por la baja cantidad de anticuerpo neutralizante que puede transferirse y, por esta razón, sería altamente deseable la disponibilidad de anticuerpos humanos (tales como anticuerpos monoclonales humanos) con alta capacidad neutralizante. Aunque algunos anticuerpos contra los productos de los genes gH, gB y UL128 y UL130 han demostrado in vitro actividades neutralizantes [7, 10, 11] y un anticuerpo contra gH se ha evaluado en ensayos clínicos (que se interrumpieron debido a la falta de efectos terapéuticos), la potencia neutralizante de los anticuerpos aislados hasta el momento es modesta. La neutralización por estos anticuerpos se observó a concentraciones de anticuerpo que varían de 0,5 a 20 pg/ml. Además, los métodos actuales generalmente miden la potencia neutralizante de anticuerpos anti-hCMV usando fibroblastos como células diana. Sin embargo, también se sabe que el hCMV causa patología al infectar otros tipos de células tales como células endoteliales, epiteliales y leucocitos. Los anticuerpos conocidos contra UL128 y UL130 muestran una potencia muy baja para neutralizar la infección de células endoteliales [7] y no parece haber ningún anticuerpo monoclonal disponible que sea capaz de neutralizar la infección de células diana no fibroblásticas con alta potencia.
Por lo tanto, existe la necesidad de anticuerpos que neutralicen la infección por hCMV, particularmente la infección por hCMV de células diana no fibroblásticas, con alta potencia, así como la elucidación de las dianas a las que se unen dichos anticuerpos.
Lantto et al. (2003) Virology 305: 201-209 divulga que las características de unión determinan el potencial neutralizante de los fragmentos de anticuerpos específicos del dominio antigénico 2 de la glicoproteína B del hCMV.
McLean et al. (2005) J. Immunol. 174:4768-4778 divulga que el reconocimiento del hCMV por las inmunoglobulinas primarias humanas identifica una base innata para una respuesta inmunitaria adaptativa.
El documento WO 2007/146024 divulga composiciones inmunogénicas y vacunas profilácticas o terapéuticas para su uso en la protección y el tratamiento contra el hCMV.
Sumario de la invención
La invención se basa, en parte, en el descubrimiento de nuevos anticuerpos que neutralizan la infección por hCMV con alta potencia así como nuevos epítopos a los que se unen los anticuerpos de la invención. Por consiguiente, en un aspecto, la invención comprende un anticuerpo y fragmentos de unión al antígeno del mismo que tiene una alta potencia en la neutralización del hCMV.
La invención proporciona un anticuerpo aislado, o un fragmento de unión al antígeno del mismo, que es específico de una proteína gB de hCMV, en el que el anticuerpo o fragmento
(a) comprende secuencias CDR1, CDR2 y CDR3 de la cadena pesada como se expone en las SEQ ID NOs: 336, 337 y 338, respectivamente, y secuencias CDR1, CDR2 y cDR3 de la cadena ligera como se expone en las SEQ ID NOs: 339, 340 y 341, respectivamente;
(b) comprende secuencias CDR1, CDR2 y CDR3 de la cadena pesada como se expone en las SEQ ID NOs: 316, 317 y 318, respectivamente, y secuencias CDR1, CDR2 y CDR3 de la cadena ligera como se expone en las SEQ ID NOs: 319, 320 y 321 respectivamente;
(c) comprende secuencias CDR1, CDR2 y CDR3 de la cadena pesada como se expone en las SEQ ID NOs: 278, 279 y 280 respectivamente, y secuencias CDR1, CDR2 y CDR3 de la cadena ligera como se expone en las SEQ ID NOs: 281, 282 y 283 respectivamente;
(d) comprende secuencias CDR1, CDR2 y CDR3 de la cadena pesada como se expone en las SEQ ID NOs: 352, 279 y 280 respectivamente, y secuencias CDR1, CDR2 y CDR3 de la cadena ligera como se expone en las SEQ ID NOs: 281, 282 y 283, respectivamente;
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(e) comprende secuencias CDR1, CDR2 y CDR3 de la cadena pesada como se expone en las SEQ ID NOs: 296, 297 y 298, respectivamente, y secuencias CDR1, CDR2 y CDR3 de la cadena ligera como se expone en las SEQ ID NOs: 299, 300 y 301 respectivamente;
o
(f) comprende secuencias CDR1, CDR2 y CDR3 de la cadena pesada como se expone en las SEQ ID NOs: 360, 279 y 280 respectivamente, y secuencias CDR1, CDR2 y CDR3 de la cadena ligera como se expone en las SEQ ID NOs: 281, 282 y 361 respectivamente.
En una realización, el anticuerpo o fragmento de la invención comprende secuencias de la región variable de la cadena pesada y ligera como se expone en las SEQ ID NOs: 348 y 349, respectivamente, SEQ ID NOs: 328 y 329, respectivamente, SEQ ID NOs: 290 y 291 , respectivamente, SeQ ID NOs: 357 y 291, respectivamente, sEq ID NOs: 308 y 309, respectivamente, o SEQ ID NOs: 367 y 368, respectivamente.
El anticuerpo o fragmento de la invención es preferiblemente un anticuerpo humano, un anticuerpo monoclonal, un anticuerpo monocatenario, Fab, Fab', F(ab')2, Fv o scFv.
La invención también proporciona una molécula de ácido nucleico aislada que comprende una secuencia de nucleótidos que codifica el anticuerpo o fragmento de la invención.
En una realización, la molécula de ácido nucleico de la invención comprende la secuencia de nucleótidos de cualquiera de las SEQ ID NOs: 342-347, 350, 351, 322-327, 330, 331, 284-289, 292, 293, 353-356, 358, 359, 287, 288, 302-307, 310, 311, 362-364, 287, 365, 366, 369 o 370, o una secuencia de nucleótidos que codifica la misma secuencia de aminoácidos que la secuencia de aminoácidos codificada por cualquiera de las SEQ ID NOs: 342-347, 350, 351, 322-327, 330, 331, 284-289, 292, 293, 353-356, 358, 359, 287, 288, 302-307, 310, 311, 362-364, 287, 365, 366, 369 o 370.
La invención proporciona además:
- un vector de expresión que comprende un ácido nucleico de acuerdo con la invención;
- una célula transformada con un vector de expresión de acuerdo con la invención; y
- una composición que comprende el anticuerpo o fragmento de uno cualquiera de la invención, o el ácido nucleico de la invención, y un diluyente o vehículo farmacéuticamente aceptable.
La composición de la invención puede comprender, además, un segundo anticuerpo, o un fragmento de unión al antígeno del mismo, que neutraliza la infección por hCMV.
El segundo anticuerpo o fragmento es preferiblemente específico de UL128, un epítopo formado por una combinación de UL130 y UL131A, un epítopo formado por una combinación de UL128, UL130 y UL131A, un epítopo formado por una combinación de gH, gL, UL128 y UL130, un segundo epítopo de gB, gH, gL, gM, gN, gO o un epítopo formado por una combinación de gM y gN. El segundo anticuerpo es preferiblemente específico de un epítopo formado por una combinación de UL130 y UL131A.
En realizaciones particulares de la invención, el segundo anticuerpo se selecciona de:
(i) un anticuerpo que comprende secuencias de la cadena pesada y ligera de las SEQ ID NOs: 61 y 62, respectivamente;
(ii) un anticuerpo que comprende secuencias CDR1, CDR2 y CDR3 de la región variable de la cadena pesada como se expone en las SEQ ID NOs: 49, 50 y 51 respectivamente y secuencias CDR1, CDR2 y CDR3 de la región variable de la cadena ligera como se expone en las SEQ ID NOs: 52, 53 y 54 respectivamente;
(iii) un anticuerpo que comprende secuencias de la cadena pesada y ligera de la SEQ ID NO: 13 y 14, respectivamente;
(iv) un anticuerpo que comprende las secuencias CDR1, CDR2 y CDR3 de la región variable de la cadena pesada como se expone en las SEQ ID NOs: 1, 2 y 3 respectivamente y las secuencias CDR1, CDR2 y CDR3 de la región variable de la cadena ligera como se expone en las SEQ ID NOs: 4, 5 y 6 respectivamente;
(v) un anticuerpo que comprende secuencias de la cadena pesada y ligera de las SEQ ID NOs: 29 y 30, respectivamente;
(vi) un anticuerpo que comprende las secuencias CDR1, CDR2 y CDR3 de la región variable de la cadena pesada como se expone en las SEQ ID NOs: 17, 18 y 19 respectivamente y las secuencias CDR1, CDR2 y CDR3 de la región variable de la cadena ligera como se expone en las SEQ ID NOs: 20 , 21 y 22 respectivamente;
(vii) un anticuerpo que comprende secuencias de la cadena pesada y ligera de las SEQ ID NOs: 45 y 46 respectivamente;
(viii) un anticuerpo que comprende las secuencias CDR1, CDR2 y CDR3 de la región variable de la cadena pesada como se expone en las SEQ ID NOs: 33, 34 y 35 respectivamente y las secuencias CDR1, CDR2 y CDR3 de la región variable de la cadena ligera como se expone en las SEQ ID NOs: 36, 37 y 38 respectivamente;
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(ix) un anticuerpo que comprende secuencias de la cadena pesada y ligera de las SEQ ID NOs: 125 y 126, respectivamente; y
(x) un anticuerpo que comprende secuencias CDR1, CDR2 y CDR3 variables de la cadena pesada como se expone en las SeQ ID NOs: 113, 114 y 115 respectivamente y secuencias CDR1, CDR2 y cDr3 de la región variable de la cadena ligera como se expone en las SEQ ID NOs: 116, 117 y 118 respectivamente.
La invención también proporciona:
- el uso del anticuerpo o fragmento de la invención, el ácido nucleico de la invención o la composición de la invención en la fabricación de un medicamento para el tratamiento de la infección por hCMV;
- el anticuerpo o fragmento de la invención, el ácido nucleico de la invención o la composición de la invención para su uso en el tratamiento de la infección por hCMV; y
- un método para producir el anticuerpo o fragmento de la invención, que comprende (i) cultivar la célula de la invención y (ii) aislar el anticuerpo o fragmento.
Breve descripción de los dibujos
La Figura 1 muestra la tinción de células HEK293T transfectadas con los genes del hCMV UL128, UL130, UL131A, gH y gL, solos o en diferentes combinaciones, mediante anticuerpos monoclonales representativos (15D8, 2C12 y 8I21).
La Figura 2 muestra experimentos de competición cruzada en los que las células HEK293T transfectadas con el gen del hCMV gH (A) o gB (B) se incubaron primero con un anticuerpo competidor no marcado seguido de tinción con un anticuerpo anti-gH o anti-gB biotinilado.
La Figura 3 muestra la tinción de células HEK293T que expresan el gen UL128 VR1814 de tipo silvestre o un gen UL128 pan-mutado por el anticuerpo monoclonal humano 15D8 y un anticuerpo monoclonal de ratón anti- UL128 no competitivo. El gen UL128 pan-mutado contiene sustituciones de la secuencia de VR1814 de tipo silvestre con variantes conocidas descritas en otros aislados clínicos y cepas de laboratorio del hCMV.
Descripción detallada de la invención
La invención se basa, en parte, en el descubrimiento de nuevos anticuerpos que neutralizan la infección por hCMV con alta potencia así como nuevos epítopos a los que se unen los anticuerpos de la invención. Tales anticuerpos son deseables, ya que solo se requieren bajas concentraciones para neutralizar una cantidad dada de virus. Esto facilita niveles más altos de protección a la vez que se administran cantidades más bajas de anticuerpos. Por consiguiente, en un aspecto, la invención comprende un anticuerpo neutralizante y fragmentos de unión al antígeno del mismo que tienen alta potencia para neutralizar la infección por hCMV. También se divulgan anticuerpos monoclonales humanos y los clones de linfocitos B inmortalizados que secretan tales anticuerpos.
Como se usa en la presente memoria, los términos “fragmento”, “fragmento de unión al antígeno” y “fragmento de anticuerpo” se usan indistintamente para referirse a cualquier fragmento de un anticuerpo que conserve la actividad de unión al antígeno de los anticuerpos. Los ejemplos de fragmentos de anticuerpos incluyen, pero no se limitan a, un anticuerpo monocatenario, Fab, Fab', F(ab')2, Fv o scFv.
Como se usa en la presente memoria, el término “alta potencia” se usa para referirse a un anticuerpo o un fragmento de unión al antígeno del mismo que neutraliza la infección por hCMV con una CI90 de menos de aproximadamente 2 pg/ml, (es decir, la concentración de anticuerpo requerida para la neutralización del 90 % de un aislado clínico de hCMV es de aproximadamente 2 pg/ml o menos, por ejemplo 1,9, 1,8, 1,75, 1,7, 1,6, 1,5, 1,4, 1,3, 1,25, 1,2, 1,15, 1,1 o 1,05 pg/ml o menos). El anticuerpo, o fragmento de unión al antígeno del mismo, puede tener una CI90 de 1 pg/ml o menos (es decir 0,95, 0,9, 0,85, 0,8, 0,75, 0,7, 0,6, 0,5, 0,4, 0,3, 0,2, 0,1, 0,05, 0,01 pg/ml o menos). El anticuerpo, o fragmento de unión al antígeno del mismo, puede tener una CI90 de 0,16 pg/ml o menos (es decir 0,15, 0,125, 0,1, 0,075, 0,05, 0,025, 0,02, 0,015, 0,0125, 0,01, 0,0075, 0,005, 0,004, 0,003, 0,002 pg/ml o menos). El anticuerpo puede neutralizar la infección por hCMV a una concentración de 0,016 pg/ml o menos (es decir a 0,015, 0,013, 0,01, 0,008, 0,005, 0,003, 0,002, 0,001, 0,0005 pg/ml o menos). Esto significa que solo se requieren concentraciones muy bajas de anticuerpos para una neutralización del 90 % de un aislado clínico de hCMV in vitro en comparación con la concentración requerida de los anticuerpos conocidos, por ejemplo, MSL-109, 8F9 o 3E3, para la neutralización del mismo título de hCMV. La potencia se puede medir usando un ensayo de neutralización estándar como es conocido por un experto en la materia.
La divulgación proporciona un anticuerpo, por ejemplo, un anticuerpo monoclonal o un anticuerpo monoclonal humano, o un fragmento de unión al antígeno del mismo, que se une a un epítopo de la proteína del hCMV UL128 y neutraliza la infección por hCMV con una CI90 de menos de aproximadamente 2 pg/ml, por ejemplo 1,9, 1,8, 1,75, 1,7, 1,6, 1,5, 1,4, 1,3, 1,25, 1,2, 1,15, 1,1, 1,05, 1, 0,95, 0,9, 0,85, 0,8, 0,75, 0,7, 0,6, 0,5, 0,4, 0,3, 0,2, 0,15, 0,125, 0,1, 0,075, 0,05, 0,025, 0,02, 0,015, 0,0125, 0,01, 0,0075, 0,005, 0,004, 0,003, 0,002, 0,001, 0,0005 pg/ml o menos.
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La divulgación proporciona un anticuerpo, o un fragmento de unión al antígeno del mismo, que se une a un epítopo formado por las proteínas del hCMV gH, gL, UL128 y UL130, y neutraliza la infección por hCMV con una CI90 de menos de aproximadamente 2 pg/ml, por ejemplo 1,9, 1,8, 1,75, 1,7, 1,6, 1,5, 1,4, 1,3, 1,25, 1,2, 1,15, 1,1, 1,05, 1, 0,95, 0,9, 0,85, 0,8, 0,75, 0,7, 0,6, 0,5, 0,4, 0,3, 0,2, 0,15, 0,125, 0,1, 0,075, 0,05, 0,025, 0,02, 0,015, 0,0125, 0,01, 0,0075, 0,005, 0,004, 0,003, 0,002, 0,001, 0,0005 pg/ml o menos.
La divulgación proporciona un anticuerpo, o un fragmento de unión al antígeno del mismo, que se une a un epítopo formado por las proteínas del hCMV UL128, UL130 y UL131A, y neutraliza la infección por hCMV con una CI90 de menos de aproximadamente 2 pg/ml, por ejemplo 1,9, 1,8, 1,75, 1,7, 1,6, 1,5, 1,4, 1,3, 1,25, 1,2, 1,15, 1,1, 1,05, 1, 0,95, 0,9, 0,85, 0,8, 0,75, 0,7, 0,6, 0,5, 0,4, 0,3, 0,2, 0,15, 0,125, 0,1, 0,075, 0,05, 0,025, 0,02, 0,015, 0,0125, 0,01, 0,0075, 0,005, 0,004, 0,003, 0,002, 0,001, 0,0005 pg/ml o menos.
La divulgación proporciona un anticuerpo, o un fragmento de unión al antígeno del mismo, que se une a un epítopo formado por las proteínas del hCMV UL130 y UL131A, y neutraliza la infección por hCMV con una CI90 de menos de aproximadamente 2 pg/ml, por ejemplo 1,9, 1,8, 1,75, 1,7, 1,6, 1,5, 1,4, 1,3, 1,25, 1,2, 1,15, 1,1, 1,05, 1, 0,95, 0,9, 0,85, 0,8, 0,75, 0,7, 0,6, 0,5, 0,4, 0,3, 0,2, 0,15, 0,125, 0,1, 0,075, 0,05, 0,025, 0,02, 0,015, 0,0125, 0,01, 0,0075, 0,005, 0,004, 0,003, 0,002, 0,001, 0,0005 pg/ml o menos.
La divulgación proporciona un anticuerpo, o un fragmento de unión al antígeno del mismo, que se une a un epítopo de la proteína del hCMV gH y neutraliza la infección por hCMV con una CI90 de menos de aproximadamente 2 pg/ml, por ejemplo 1,9, 1,8, 1,75, 1,7, 1,6, 1,5, 1,4, 1,3, 1,25, 1,2, 1,15, 1,1, 1,05, 1, 0,95, 0,9, 0,85, 0,8, 0,75, 0,7, 0,6, 0,5, 0,4, 0,3, 0,2, 0,15, 0,125, 0,1, 0,075, 0,05, 0,025, 0,02, 0,015, 0,0125, 0,01, 0,0075, 0,005, 0,004, 0,003, 0,002, 0,001, 0,0005 pg/ml o menos.
La divulgación proporciona un anticuerpo, o un fragmento de unión al antígeno del mismo, que se une a un epítopo de la proteína del hCMV gB y neutraliza la infección por hCMV con una CI90 de menos de aproximadamente 2 pg/ml, por ejemplo 1,9, 1,8, 1,75, 1,7, 1,6, 1,5, 1,4, 1,3, 1,25, 1,2, 1,15, 1,1, 1,05, 1, 0,95, 0,9, 0,85, 0,8, 0,75, 0,7, 0,6, 0,5, 0,4, 0,3, 0,2, 0,15, 0,125, 0,1, 0,075, 0,05, 0,025, 0,02, 0,015, 0,0125, 0,01, 0,0075, 0,005, 0,004, 0,003, 0,002, 0,001, 0,0005 pg/ml o menos.
La divulgación proporciona un anticuerpo, o un fragmento de unión al antígeno del mismo, que se une a un epítopo formado por las proteínas del hCMV gM y gN y neutraliza la infección por hCMV con una CI90 de menos de aproximadamente 2 pg/ml, por ejemplo 1,9, 1,8, 1,75, 1,7, 1,6, 1,5, 1,4, 1,3, 1,25, 1,2, 1,15, 1,1, 1,05, 1, 0,95, 0,9, 0,85, 0,8, 0,75, 0,7, 0,6, 0,5, 0,4, 0,3, 0,2, 0,15, 0,125, 0,1, 0,075, 0,05, 0,025, 0,02, 0,015, 0,0125, 0,01, 0,0075, 0,005, 0,004, 0,003, 0,002, 0,001, 0,0005 pg/ml o menos.
Anticuerpos de la invención
Los anticuerpos de la invención se definen en las reivindicaciones. Los anticuerpos tienen una potencia particularmente alta para neutralizar el hCMV. Como se usa en la presente memoria, un “anticuerpo que neutraliza” es uno que previene, reduce, retrasa o interfiere con la capacidad de un patógeno, por ejemplo, hCMV, para iniciar y/o perpetuar una infección en un hospedador. Los anticuerpos de la invención y los fragmentos de unión al antígeno de los mismos son capaces de neutralizar la infección por hCMV de varios tipos de células. En una realización, un anticuerpo de acuerdo con la invención neutraliza la infección de células epiteliales, células retinianas, células endoteliales, células mieloides y células dendríticas. Los anticuerpos de la invención también pueden neutralizar la infección por hCMV de fibroblastos y células del estroma mesenquimales. Estos anticuerpos pueden usarse como agentes profilácticos o terapéuticos con una formulación apropiada, o como una herramienta de diagnóstico, como se describe en la presente memoria.
Los anticuerpos de la invención pueden ser anticuerpos monoclonales, anticuerpos humanos o anticuerpos recombinantes. En una realización, los anticuerpos de la invención son anticuerpos monoclonales, por ejemplo, anticuerpos monoclonales humanos. La invención también proporciona fragmentos de los anticuerpos de la invención que retienen la actividad de unión al antígeno de los anticuerpos y neutralizan la infección por hCMV. Aunque la especificación, incluidas las reivindicaciones, puede, en algunos lugares, referirse explícitamente a fragmento(s) de anticuerpo, variante(s) y/o derivado(s) de anticuerpos, se entiende que el término “anticuerpo” incluye todas las categorías de anticuerpos, concretamente, fragmento(s) de anticuerpo, variante(s) y derivado(s) de anticuerpos.
Los anticuerpos de la divulgación y los fragmentos de unión al antígeno de los mismos se pueden unir a una o más proteínas del hCMV. Los anticuerpos se pueden unir a un epítopo formado por una sola proteína del hCMV o por una combinación de dos o más proteínas del hCMV. Ejemplos de proteínas del hCMV incluyen, pero no se limitan a, productos de genes víricos UL55 (glicoproteína B de la envuelta, “gB”), UL75 (glicoproteína H de la envuelta, “gH”), UL100 (glicoproteína M, “gM”), uL73 (glicoproteína N, “gN”), UL115 (glicoproteína L, “gL”), UL74 (glicoproteína O, “gO”), UL128 (glicoproteína UL128, “UL128”), UL130 (glicoproteína UL130, “UL130”) o UL131A (glicoproteína UL131A, “UL131A”). Los anticuerpos se pueden unir a un epítopo formado por una sola proteína del hCMV. Los anticuerpos se pueden unir a un epítopo formado por la combinación de 2, 3 o más proteínas del hCMV.
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La invención comprende un anticuerpo, o un fragmento de anticuerpo del mismo, que se une a un epítopo de la proteína del hCMV gB. En un ejemplo de realización, el anticuerpo, o fragmento de anticuerpo, de la invención está presente en una composición con un segundo anticuerpo, o un fragmento de anticuerpo del mismo, que se une a un epítopo de la proteína del hCMV UL128, o a un epítopo formado por las proteínas del hCMV UL130 y UL131A, o a un epítopo formado por las proteínas del hCMV UL128, UL130 y UL131A, o a un epítopo formado por las proteínas del hCMV gH, gL, UL128 y UL130, o a un epítopo de la proteína del hCMV gH, o a un epítopo formado por las proteínas del hCMV gM y gN.
En una realización, el segundo anticuerpo, o un fragmento de anticuerpo del mismo se une a un epítopo de UL128. En otra realización, el segundo anticuerpo, o un fragmento de anticuerpo del mismo, se une a un epítopo formado por UL130 y UL131A. Como se usa en la presente memoria, un epítopo formado por UL130 y UL131A significa que el epítopo puede formarse por ambas proteínas UL130 y UL131A o puede estar formado por una de las dos proteínas, siendo necesaria la presencia de la otra proteína para la unión del anticuerpo. En otra realización más, el segundo anticuerpo, o un fragmento de anticuerpo del mismo, se une a un epítopo formado por UL128, UL130 y UL131A. Como se usa en la presente memoria, un epítopo formado por UL128, UL130 y UL131A significa que el epítopo puede estar formado por las tres proteínas (UL128, UL130 y UL131A) o puede estar formado por una o más proteínas, siendo necesaria la presencia de la otra proteína(s) para la unión del anticuerpo. En otra realización más, el segundo anticuerpo, o un fragmento de anticuerpo del mismo, se une a un epítopo formado por gH, gL, UL128 y UL130. Como se usa en la presente memoria, un epítopo formado por gH, gL, UL128 y UL130 significa que el epítopo puede estar formado por las cuatro proteínas (gH, gL, UL128 y UL130) o puede estar formado por una o más de las cuatro proteínas, siendo necesaria la presencia de la otra(s) proteína(s) para la unión del anticuerpo. En otra realización, el segundo anticuerpo, o un fragmento de anticuerpo del mismo, se une a un epítopo formado por gM y gN. Como se usa en la presente memoria, un epítopo formado por gM y gN significa que el epítopo puede estar formado tanto por gM como por gN o puede estar formado por una de las dos proteínas, siendo necesaria la presencia de la otra proteína para la unión del anticuerpo.
Se han determinado las secuencias de las cadenas pesadas y las cadenas ligeras de varios ejemplos de anticuerpos, comprendiendo cada una tres CDR en la cadena pesada y tres CDR en la cadena ligera. La posición de los aminoácidos de CDR se define de acuerdo con el sistema de numeración IMGT [12, 13, 14]. Las secuencias de las CDR, las cadenas pesadas, las cadenas ligeras, así como las secuencias de las moléculas de ácido nucleico que codifican las CDR, las cadenas pesadas, las cadenas ligeras se divulgan en la lista de secuencias. La Tabla 1 proporciona las SEQ ID NOs para las secuencias de las seis CDR de los ejemplos de anticuerpos. Las Tablas 2 y 3 proporcionan las SEQ ID NOs para las secuencias de las cadenas pesada y ligera, respectivamente, de los anticuerpos de ejemplo y la Tabla 4 proporciona las SEQ ID NOs para las secuencias de las moléculas de ácido nucleico que codifican las CDR, cadenas pesadas y cadenas ligeras de los anticuerpos.
Tabla 1
- Anticuerpo
- SEQ ID NOs. para CDRH1, CDRH2, CDRH3 SEQ ID NOs. para CDRL1, CDRL2, CDRL3
- 15D8
- 188, 189, 190 191, 192, 193
- 15D8 variante 1
- 188, 204, 205 191, 192, 193
- 15D8 variante 2
- 188, 189, 210 191, 192, 193
- 4N10
- 1,2, 3 4, 5, 6
- 10F7
- 17, 18, 19 20, 21, 22
- 10P3
- 33, 34, 35 36, 37, 38
- 4I22
- 49, 50, 51 52, 53, 54
- 8L13
- 113, 114, 115 116, 117, 118
- 2C12
- 65, 66, 67 68, 69, 70
- 8C15
- 81, 82, 83 84, 85, 86
- 9I6
- 97, 98, 99 100, 101, 102
- 7B13
- 129, 130, 131 132, 133, 134
- 8J16
- 145, 146, 147 148, 149, 150
- 8I21
- 174, 175, 176 177, 149, 178
- 7I13
- 113, 161, 162 163, 149, 164
- 7H3
- 316, 317, 318 319, 320, 321
- 7H3 variante 1
- 316, 317, 332 319, 320, 321
- 6B4
- 336, 337, 338 339, 340, 341
- Anticuerpo
- SEQ ID NOs. para CDRH1, CDRH2, CDRH3 SEQ ID NOs. para CDRL1, CDRL2, CDRL3
- 5F1
- 278, 279, 280 281, 282, 283
- 10C6
- 352, 279, 280 281, 282, 283
- 4H9
- 296, 297, 298 299, 300, 301
- 4H9 variante 1
- 296, 312, 298 299, 300, 301
- 11B12
- 232, 233, 234 235, 149, 236
- 13H11
- 216, 217, 218 219, 220, 221
- 3G16
- 246, 247, 248 249, 250, 251
- 2B11
- 360, 279, 280 281, 282, 361
- 6L3
- 262, 263, 264 265, 266, 267
Tabla 2
- Anticuerpo
- SEQ ID NOs para cadenas pesadas
- 15D8
- 200
- 15D8 variante 1
- 208
- 15D8 variante 2
- 212
- 4N10
- 13
- 10F7
- 29
- 10P3
- 45
- 4I22
- 61
- 8L13
- 125
- 2C12
- 77
- 8C15
- 93
- 9I6
- 109
- 7B13
- 141
- 8J16
- 157
- 8I21
- 184
- 7I13
- 170
- 7H3
- 328
- 7H3 variante 1
- 334
- 6B4
- 348
- 5F1
- 290
- 5F1 variante 1
- 294
- 10C6
- 357
- 4H9
- 308
- 4H9 variante 1
- 314
- 11B12
- 242
- 13H11
- 228
- 3G16
- 258
- 2B11
- 367
- 6L3
- 274
Tabla 3
- Anticuerpo
- SEQ ID NO para cadenas ligeras
- 15D8
- 201
- 15D8 variante 1
- 201
- 15D8 variante 2
- 213
- 4N10
- 14
- 10F7
- 30
- 10P3
- 46
- 4I22
- 62
- 8L13
- 126
- 2C12
- 78
- 8C15
- 94
- 9I6
- 110
- 7B13
- 142
- 8J16
- 158
- 8I21
- 185
- 7I13
- 171
- 7H3
- 329
- 7H3 variante 1
- 329
- 6B4
- 349
- 5F1
- 291
- 5F1 variante 1
- 291
- 10C6
- 291
- 4H9
- 309
- 4H9 variante 1
- 309
- 11B12
- 243
- 13H11
- 229
- 3G16
- 259
- 2B11
- 368
- 6L3
- 275
Tabla 4
- Anticuerpo
- SEQ ID NO para ácidos nucleicos que codifican CDR, cadenas pesadas, cadenas ligeras v variantes (CDRH1, CDRH2, CDRH3, CDRL1, CDRL2, CDRL3 v variantes; cadenas pesadas y variantes y cadenas ligeras y variantes)
- 15D8
- 194-199 y 206, 207, 211; 202 y 209, 214; 203 y 215
- 4N10
- 7-12; 15; 16
- 10F7
- 23-28; 31; 32
- 10P3
- 39-44; 47; 48
- 4I22
- 55-60; 63; 64
- 8L13
- 119-124; 127; 128
- 2C12
- 71-76; 79; 80
- 8C15
- 87-92; 95; 96
- 9I6
- 103-108, 111, 112
- 7B13
- 135-140; 143; 144
- 8J16
- 151-156; 159; 160
5
10
15
20
25
30
35
40
45
- Anticuerpo
- SEQ ID NO para ácidos nucleicos que codifican CDR, cadenas pesadas, cadenas liaeras y variantes (CDRH1, CDRh2, CDRH3, CDRL1, CDRL2, CDRL3 y variantes; cadenas pesadas y variantes y cadenas liaeras y variantes)
- 8I21
- 179-182,155,183; 186; 187
- 7I13
- 165, 166, 167, 168, 155, 169; 172; 173
- 7H3
- 322-327 y 333; 330 y 335; 331
- 6B4
- 342-347; 350; 351
- 5F1
- 284-289; 292 y 295; 293
- 10C6
- 353-355, 287, 288, 356; 358; 359
- 4H9
- 302-307 y 313; 310 y 315; 311
- 11B12
- 237-240, 155, 241; 244; 245
- 13H11
- 222-227; 230; 231
- 3G16
- 252-257; 260; 261
- 2B11
- 362-364; 287,365,366; 369; 370
- 6L3
- 268-273; 276; 277
Los anticuerpos o fragmentos de anticuerpos de la divulgación pueden comprender una o más CDR de la cadena pesada o ligera de los anticuerpos de ejemplo de la invención. En un ejemplo de realización, los anticuerpos o fragmentos de anticuerpos de la divulgación pueden comprender una secuencia de aminoácidos seleccionada del grupo que consiste en las SEQ ID NOs: 188-193, 204-205, 210, 1-6, 17-22, 33-38, 49-54, 113-118, 65-70, 81-86, 97102, 129-134, 145-150, 174-178, y 161-164.
Los anticuerpos de la divulgación pueden comprender una cadena pesada que comprende una secuencia de aminoácidos de una o más de las SEQ ID NOs: 188-190, 204, 205, 210, 1-3, 17-19,33-35,49-51, 113-115, 65-67, 8183, 97-99, 129-131, 145-147, 174-176, 161 o 162. Por ejemplo, los anticuerpos de la divulgación pueden comprender una cadena pesada que comprende SEQ ID NO: 188 para CDRH1, SeQ ID NO: 189 para CDRH2, SEQ ID NO: 190 para CDRH3; SEQ ID NO: 188 para CDRH1, SEQ ID NO; 204 para CDRH2, SEQ ID NO: 205 para CDRH3; SEQ ID NO; 188 para CDRH1, SEQ ID NO: 189 para CDRH2, SEQ ID NO: 210 para CDRH3; SEQ ID NO: 1 para CDRH1, SEQ ID NO: 2 para CDRH2, SEQ ID NO: 3 para CDRH3; SEQ ID NO; 17 para CDRH1, SEQ ID NO; 18 para CDRH2, SEQ ID NO: 19 para CDRH3; SEQ ID NO: 33 para CDRH1, SEQ ID NO: 34 para CDRH2, SEQ ID NO: 35 para CDRH3; SEQ ID NO 49 para CHRH1, SEQ ID NO: 50 para CHRH2, SEQ ID NO: 51 para CDRH3; SEQ ID NO: 113 para CDRH1, SEQ ID NO: 114 para CDRH2, SEQ ID NO: 115 para CDRH3; SEQ ID NO: 65 para CDRH1, SEQ ID NO: 66 para CDRH2, SEQ ID NO: 67 para CDRH3; SEQ ID NO: 81 para CDRH1, SEQ ID NO 82 para CDRH2, SEQ ID NO: 83 para CDRH3; SEQ ID NO: 97 para CDRH1, SEQ ID NO: 98 para CDRH2, SEQ ID NO: 99 para CDRH3; SEQ ID NO: 129 para CDRH1, SEQ ID NO: 130 para CDRH2, SEQ ID NO: 131 para CDRH3; SEQ ID NO: 145 para CDRH1, SEQ ID NO: 146 para CDRH2, SEQ ID NO: 147 para CDRH3; SEQ ID NO: 174 para CDRH1, SEQ ID NO: 175 para CDRH2, SEQ ID NO: 176 para CDRH3; y SEQ ID NO: 113 para CDRH1, SEQ ID NO: 161 para CDRH2, SEQ ID NO: 162 para CDRH3.
Los anticuerpos de la divulgación pueden comprender una cadena ligera que comprende una secuencia de aminoácidos de una o más de las SEQ ID NOs: 191-193, 4-6, 20-22, 36-38, 52-54, 116-118, 68-70, 84-86, 100-102, 132-134, 148-150, 177, 178, 163, o 164. Por ejemplo, los anticuerpos de la divulgación pueden comprender una cadena ligera que comprende SEQ ID NO: 191 para CDRL1, SEQ ID NO: 192 para CDRL2; SEQ ID NO: 193 para CDRL3; SEQ ID NO: 4 para CDRL1, SEQ ID NO: 5 para CDRL2 y SEQ ID NO: 6 para CDRL3; SEQ ID NO: 20 para CDRL1, SEQ ID NO: 21 para CDRL2, SEQ ID NO: 22 para CDRL3; SEQ ID NO; 36 para CDRL1, SEQ ID NO: 37 para CDRL2, SEQ ID NO: 38 para CDRL3; SEQ ID NO: 52 para CDRL1, SEQ ID NO: 53 para CDRL2, SEQ ID NO: 54 para CDRL3; SEQ ID NO: 116 para CDRL1, SEQ ID NO: 117 para CDRL2, SEQ ID NO: 118 para CDRL3; SEQ ID NO: 68 para CDRL1, SEQ ID NO: 69 para CDRL2, SEQ ID NO: 70 para CDRL3; SEQ ID NO 84 para CDRL1, SEQ ID NO: 85 para CDRL2, SEQ ID NO: 86 para CDRL3; SEQ ID NO: 100 para CDRL1, SEQ ID NO: 101 para CDRL2, SEQ ID NO: 102 para CDRL3; SEQ ID NO: 132 para CDRL1, SEQ ID NO: 133 para CDRL2, SEQ ID NO: 134 para CDRL3; SEQ ID NO: 148 para CDRL1, SEQ ID NO: 149 para CDRL2, SEQ ID NO: 150 para CDRL3; SEQ ID NO: 177 para CDRL1, SEQ ID NO: 149 para CDRL2, SEQ ID NO: 178 para CDRL3; SEQ ID NO: 163 para CDRL1, SEQ ID NO: 149 para CDRL2 y SEQ ID NO: 164 para CDRL3.
Los anticuerpos de la divulgación pueden comprender una cadena pesada con una secuencia de aminoácidos que es al menos 70 % idéntica a la de las SEQ ID NOs: 200, 208, 212, 13, 29, 45, 61, 125, 77, 93, 109, 141, 157, 184 o 170 y neutralizar la infección por hCMV. En una realización, el anticuerpo se une a un epítopo de la proteína del hCMV UL128 y comprende una cadena pesada que tiene una secuencia de aminoácidos que es al menos 70 %, al menos 75 %, al menos 80 %, al menos 85 %, al menos 90 %, al menos 95 %, al menos 98 %, o al menos 99 % idéntica a la secuencia de aminoácidos de las SEQ ID NOs: 200, 208 o 212, y neutraliza la infección por hCMV. Un
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anticuerpo de acuerdo con la divulgación puede comprender una cadena pesada que tiene la secuencia indicada en las SEQ ID NOs: 200, 208 o 212, y neutraliza la infección por hCMV.
El anticuerpo de la divulgación se puede unir a un epítopo formado por las proteínas del hCMV UL130 y UL131A y comprende una cadena pesada que tiene una secuencia de aminoácidos que es al menos 70 %, al menos 75 %, al menos 80 %, al menos 85 %, al menos 90 %, al menos 95 %, al menos 98 %, o al menos 99 % idéntica a la secuencia de aminoácidos de las SEQ ID NOs: 13, 29, 45, 61 o 125 y neutraliza la infección por hCMV. Un anticuerpo de acuerdo con la divulgación puede comprender una cadena pesada que tiene la secuencia indicada en las SEQ ID NOs: 13, 29, 45, 61 o 125 y neutralizar la infección por hCMV.
El anticuerpo de la divulgación se puede unir a un epítopo formado por las proteínas del hCMV UL128, UL130 y UL131A y comprende una cadena pesada que tiene una secuencia de aminoácidos que es al menos 70 %, al menos 75 %, al menos 80 %, al menos 85 %, al menos 90 %, al menos 95 %, al menos 98 %, o al menos 99 % idéntica a la secuencia de aminoácidos de las SEQ ID NOs: 77, 93, 109, 141, 157 o 170 y neutralizar la infección por hCMV . El anticuerpo de acuerdo con la divulgación puede comprender una cadena pesada que tiene la secuencia indicada en las SEQ ID NOs: 77, 93, 109, 141, 157 o 170 y neutralizar la infección por hCMV.
El anticuerpo de la divulgación se puede unir a un epítopo formado por las proteínas del hCMV gH, gL, UL128 y UL130 y comprende una cadena pesada que tiene una secuencia de aminoácidos que es al menos 70 %, al menos 75 %, al menos 80 %, al menos 85 %, al menos 90 %, al menos 95 %, al menos 98 %, o al menos 99 % idéntica a la secuencia de aminoácidos de la SEQ ID NO: 184 y neutralizar la infección por hCMV. Un anticuerpo de acuerdo con la divulgación puede comprender una cadena pesada que tiene la secuencia indicada en la SEQ ID NO: 184, y neutralizar la infección por hCMV.
Los anticuerpos de la divulgación pueden comprender una cadena ligera con una secuencia de aminoácidos que es al menos 70 % idéntica a la de las SEQ ID NOs: 201, 213, 14, 30, 46, 62, 126, 78, 94, 110, 142, 158, 185 o 171 y neutralizar la infección por hCMV.
El anticuerpo de la divulgación puede unirse a un epítopo de la proteína hCMV UL128 y comprender una cadena ligera que tiene una secuencia de aminoácidos que es al menos 70 %, al menos 75 %, al menos 80 %, al menos 85 %, al menos 90 %, al menos 95 %, al menos 98 %, o al menos 99 % idéntica a la secuencia de aminoácidos de las SEQ ID NOs: 201 o 213, y neutralizan la infección por hCMV. Un anticuerpo de acuerdo con la divulgación puede comprender una cadena ligera que tiene la secuencia indicada en las SEQ ID NOs: 201 o 213, y neutralizar la infección por hCMV.
El anticuerpo de la divulgación puede unirse a un epítopo formado por las proteínas del hCMV UL130 y UL131A y comprender una cadena ligera que tiene una secuencia de aminoácidos que es al menos 70 %, al menos 75 %, al menos 80 %, al menos 85 %, al menos 90 %, al menos 95 %, al menos 98 %, o al menos 99 % idéntica a la secuencia de aminoácidos de las SEQ ID NOs: 14, 30, 46, 62 o 126, y neutralizar la infección por hCMV. Un anticuerpo de acuerdo con la divulgación puede comprender una cadena ligera que tiene la secuencia indicada en las SEQ ID NOs: 14, 30, 46, 62 o 126, y neutralizar la infección por hCMV.
El anticuerpo de la divulgación se puede unir a un epítopo formado por las proteínas del hCMV UL128, UL130 y UL131A y comprende una cadena ligera que tiene una secuencia de aminoácidos que es al menos 70 %, al menos 75 %, al menos 80 %, al menos 85 %, al menos 90 %, al menos 95 %, al menos 98 %, o al menos 99 % idéntica a la secuencia de aminoácidos de las SEQ ID NOs: 78, 94, 110, 142, 158 o 171, y neutralizar la infección por hCMV. Un anticuerpo de acuerdo con la divulgación puede comprender una cadena ligera que tiene la secuencia indicada en las SEQ ID NOs: 78, 94, 110, 142, 158 o 171, y neutralizar la infección por hCMV.
El anticuerpo de la divulgación se puede unir a un epítopo formado por las proteínas del hCMV gH, gL, UL128 y UL130 y comprende una cadena ligera que tiene una secuencia de aminoácidos que es al menos 70 %, al menos 75 %, al menos 80 %, al menos 85 %, al menos 90 %, al menos 95 %, al menos 98 %, o al menos 99 % idéntica a la secuencia de aminoácidos de la SEQ ID NO: 185, y neutralizar la infección por hCMV. Un anticuerpo de acuerdo con la divulgación puede comprender una cadena ligera que tiene la secuencia indicada en la sEq ID NO: 185, y neutralizar la infección por hCMV.
Los anticuerpos o fragmentos de anticuerpos de la divulgación pueden comprender una o más CDR de la cadena pesada o ligera de los anticuerpos de ejemplo de la invención. Los anticuerpos o fragmentos de anticuerpos de la invención comprenden las secuencias de aminoácidos seleccionadas del grupo que consiste en SEQ ID NOs: 316321, SEQ ID NOs: 336-341, SEQ ID NOs: 352 y 279-283, SEQ ID NOs: 296-301, SEQ ID NOs: 360, 279-282 y 361 y SEQ ID NOs: 278-283, y neutralizan la infección por hCMV.
Los anticuerpos de la invención comprenden una cadena pesada que comprende SEQ ID NO: 316 para CDRH1, SEQ ID NO: 317 para CDRH2, SEQ ID NO: 318 para CDRH3; SEQ ID NO: 336 para CDRH1, SEQ ID NO: 337 para CDRH2, SEQ ID NO: 338 para CDRH3; SEQ ID NO: 278 para CDRH1, SEQ ID NO: 279 para CDRH2, SEQ ID NO: 280 para CDRH3; SEQ ID NO: 352 para CDRH1, SEQ ID NO: 279 para CDRH2, SEQ ID NO: 280 para CDRH3;
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SEQ ID NO: 296 para CDRH1, SEQ ID NO: 297 para CDRH2, SEQ ID NO: 298 para CDRH3; y SEQ ID NO: 360 para CDRH1, SEQ ID NO: 279 para CDRH2, SEQ ID NO: 280 para CDRH3.
Los anticuerpos de la invención comprenden una cadena ligera que comprende SEQ ID NO: 319 para CDRL1, SEQ ID NO: 320 para CDRL2, SEQ ID NO: 321 para CDRL3; SEQ ID NO: 339 para CDRL1, SEQ ID NO: 340 para CDRL2, SEQ ID NO: 341 para CDRL3; SEQ ID NO: 281 para CDRL1, SEQ ID NO: 282 para CDRL2, SEQ ID NO: 283 para CDRL3; SEQ ID NO: 299 para CDRL1, SEQ ID NO: 300 para CDRL2, SEQ ID NO: 301 para CDRL3; y SEQ ID NO: 281 para CDRL1, SEQ ID NO: 282 para CDRL2, SEQ ID NO: 361 para CDRL3.
Los anticuerpos de la divulgación pueden comprender una cadena pesada con una secuencia de aminoácidos que es al menos 70 % idéntica a las de las SEQ ID NOs: 328, 334, 348, 290, 294, 357, 308, 314, 242, 228, 258, 367 o 274 y neutralizar la infección por hCMV.
El anticuerpo se puede unir a un epítopo de la proteína hCMV gB y comprende una cadena pesada que tiene una secuencia de aminoácidos que es al menos 70 %, al menos 75 %, al menos 80 %, al menos 85 %, al menos 90 %, a al menos 95 %, al menos 98 %, o al menos 99 % idéntica a la secuencia de aminoácidos de la SEQ ID NO: 328, 334, 348, 290, 294, 308, 357, 314 o 367, y neutralizar la infección por hCMV. En una realización, un anticuerpo de acuerdo con la invención comprende una cadena pesada que tiene la secuencia indicada en SEQ ID NO: 328, 348, 290, 308, 357 o 367 y neutraliza la infección por hCMV.
El anticuerpo de la divulgación puede unirse a un epítopo de la proteína del hCMV gH y comprende una cadena pesada que tiene una secuencia de aminoácidos que es al menos 70 %, al menos 75 %, al menos 80 %, al menos 85 %, al menos 90 %, al menos 95 %, al menos 98 %, o al menos 99 % idéntica a la secuencia de aminoácidos de las SEQ ID NOs: 242, 228 o 258, y neutralizar la infección por hCMV. Un anticuerpo de acuerdo con la divulgación puede comprender una cadena pesada que tiene la secuencia indicada en las SEQ ID NOs: 242, 228 o 258, y neutralizar la infección por hCMV.
El anticuerpo de la divulgación se puede unir a un epítopo formado por las proteínas del hCMV gM y gN y comprende una cadena pesada que tiene una secuencia de aminoácidos que es al menos 70 %, al menos 75 %, al menos 80 %, al menos 85 %, al menos 90 %, al menos 95 %, al menos 98 %, o al menos 99 % idéntica a la secuencia de aminoácidos de la SEQ ID NO: 274, y neutralizar la infección por hCMV. Un anticuerpo de acuerdo con la divulgación puede comprender una cadena pesada que tiene la secuencia indicada en la SEQ ID NO: 274, y neutralizar la infección por hCMV.
Los anticuerpos de la divulgación pueden comprender una cadena ligera con una secuencia de aminoácidos que es al menos 70 % idéntica a la de las SEQ ID Nos: 329, 349, 291, 309, 243, 229, 259, 368 o 275, y neutralizar la infección por el hCMV.
El anticuerpo puede unirse a un epítopo de la proteína del hCMV gB y comprende una cadena ligera que tiene una secuencia de aminoácidos que es al menos 70 %, al menos 75 %, al menos 80 %, al menos 85 %, al menos 90 %, al menos 95 %, al menos 98 %, o al menos 99 % idéntica a la secuencia de aminoácidos de la SEQ ID NO: 329, 349, 291, 309 o 368 y neutralizar la infección por hCMV. En una realización, un anticuerpo de acuerdo con la invención comprende una cadena ligera que tiene la secuencia indicada en las SEQ ID NOs: 329, 349, 291, 309 o 368, y neutralizar la infección por hCMV.
El anticuerpo de la divulgación puede unirse a un epítopo de la proteína del hCMV gH y comprende una cadena ligera que tiene una secuencia de aminoácidos que es al menos 70 %, al menos 75 %, al menos 80 %, al menos 85 %, al menos 90 %, al menos 95 %, al menos 98 %, o al menos 99 % idéntica a la secuencia de aminoácidos de las SEQ ID NOs: 243, 229 o 259, y neutralizar la infección por hCMV. Un anticuerpo de acuerdo con la divulgación puede comprender una cadena ligera que tiene la secuencia indicada en las SEQ ID NOs: 243, 229 o 259, y neutralizar la infección por hCMV.
El anticuerpo de la divulgación se puede unir a un epítopo formado por las proteínas del hCMV gM y gN y comprende una cadena ligera que tiene una secuencia de aminoácidos que es al menos 70 %, al menos 75 %, al menos 80 %, al menos 85 %, al menos 90 %, al menos 95 %, al menos 98 %, o al menos 99 % idéntica a la secuencia de aminoácidos de la SEQ ID NO: 275, y neutralizar la infección por hCMV. Un anticuerpo de acuerdo con la divulgación puede comprender una cadena ligera que tiene la secuencia indicada en la SEQ ID NO: 275, y neutralizar la infección por hCMV.
El anticuerpo de la invención no es MSL-109, 8F9, 3E3 o R551A. El anticuerpo de la invención no es 1F11, 2F4, 5A2 o 6G4, divulgado en las solicitudes de los Estados Unidos números 11/969.104 y 12/174.568.
Ejemplos de anticuerpos incluyen, pero no se limitan a, 15D8, 4N10, 10F7, 10P3, 4I22, 8L13, 2C12, 8C15, 9I6, 7B13, 8J16, 8I21, 7I13, 7H3, 6B4, 5F1, 10C6, 4H9, 2B11, 11B12, 13H11, 3G16 y 6L3.
Las variantes de 15D8 que neutralizan la infección por hCMV consisten en una variante de la cadena pesada que
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tiene la secuencia de aminoácidos indicada en la SEQ ID NO: 208 (“15D8 variante 1”) y la SEQ ID NO: 212 (“15D8 variante 2”) y una cadena ligera que tiene la secuencia de aminoácidos indicada en la SEQ ID NO: 213 (15D8 variante 2). Las secuencias de ácido nucleico que codifican las variantes de la cadena pesada se indican en la SEQ ID NO: 209 (15D8 variante 1) y en la SEQ ID NO: 214 (15D8 variante 2). El ácido nucleico que codifica la cadena ligera variante se indica en la SEQ ID NO: 215 (15D8 variante 2). Por lo tanto, se divulgan anticuerpos que comprenden las cadenas pesadas variantes de 15D8 (SEQ ID NOs: 208, 212) y la cadena ligera variante (SEQ ID NO: 213) que neutralizan la infección por hCMV.
Como se usa en la presente memoria, el término “15D8” se usa para referirse a cualquiera y/o todas las variantes de 15D8 que neutralizan la infección por hCMV, por ejemplo, aquellas con cadenas pesadas correspondientes a las SEQ ID NOs: 208 y 212 y cadenas ligeras correspondientes a la SEQ ID NO: 213.
Una variante de 7H3 que neutraliza la infección por hCMV consiste en una cadena pesada que tiene la secuencia de aminoácidos indicada en la SEQ ID NO: 334 (“7H3 variante 1”). La secuencia de ácido nucleico que codifica la cadena pesada variante se indica en la SEQ ID NO: 335. Por lo tanto, se divulgan los anticuerpos que comprenden la cadena pesada variante de 7H3 (SEQ ID NO: 334) que neutralizan la infección por hCMV.
Como se usa en la presente memoria, el término “7H3” se usa para referirse a cualquiera y/o todas las variantes de 7H3 que neutralizan la infección por hCMV, por ejemplo, aquellas con cadenas pesadas correspondientes a la SEQ ID NO: 334.
Una variante de 5F1 que neutraliza la infección por hCMV consiste en una cadena pesada que tiene la secuencia de aminoácidos indicada en la SEQ ID NO: 294 (“5F1 variante 1”). La secuencia de ácido nucleico que codifica la cadena pesada variante se indica en la SEQ ID NO: 295. Por lo tanto, se divulgan los anticuerpos que comprenden la cadena pesada variante de 5F1 (SEQ ID NO: 294) que neutralizan la infección por hCMV.
Como se usa en la presente memoria, el término “5F1” se usa para referirse a cualquiera y/o todas las variantes de 5F1 que neutralizan la infección por hCMV, por ejemplo, aquellas con cadenas pesadas correspondientes a la SEQ ID NO: 294.
Una variante de 4H9 que neutraliza la infección por hCMV consiste en una cadena pesada que tiene la secuencia de aminoácidos indicada en la SEQ ID NO: 314 (“4H9 variante 1”). La secuencia de ácido nucleico que codifica la cadena pesada variante se indica en la SEQ ID NO: 315. Por lo tanto, se divulgan los anticuerpos que comprenden la cadena pesada variante de 4H9 (SEQ ID NO: 314), que neutralizan la infección por hCMV.
Como se usa en la presente divulgación, el término “4H9” se usa para referirse a cualquiera y/o a todas las variantes de 4H9 que neutralizan la infección por hCMV, por ejemplo, aquellas con cadenas pesadas correspondientes a la SEQ ID NO: 314.
Un anticuerpo de la divulgación, o fragmento de unión al antígeno del mismo, puede comprender todas las CDR del anticuerpo 15D8 como se indica en la Tabla 1, y neutralizar la infección por hCMV en un hospedador humano. Un anticuerpo de la divulgación, o fragmento de unión al antígeno del mismo, puede comprender todas las CDR del anticuerpo 15D8 variante 1 como se indica en la Tabla 1, y neutralizar la infección por hCMV en un hospedador humano. Un anticuerpo de la divulgación, o fragmento de unión al antígeno del mismo, puede comprender todas las CDR del anticuerpo 15D8 variante 2 como se indica en la Tabla 1, y neutralizar la infección por hCMV en un hospedador humano. Un anticuerpo de la divulgación, o fragmento de unión al antígeno del mismo, puede comprender todas las CDR del anticuerpo 8I21 como se indica en la Tabla 1, y neutralizar la infección por hCMV en un hospedador humano.
Un anticuerpo de la divulgación, o fragmento de unión al antígeno del mismo, puede comprender todas las CDR del anticuerpo 4N10 como se indica en la Tabla 1, y neutralizar la infección por hCMV en un hospedador humano. Un anticuerpo de la divulgación, o fragmento de unión al antígeno del mismo, puede comprender todas las CDR del anticuerpo 10F7 como se indica en la Tabla 1, y neutralizar la infección por hCMV en un hospedador humano. Un anticuerpo de la divulgación, o fragmento de unión al antígeno del mismo, puede comprender todas las CDR del anticuerpo 10P3 como se indica en la Tabla 1, y neutralizar la infección por hCMV en un hospedador humano. Un anticuerpo de la divulgación, o fragmento de unión al antígeno del mismo, puede comprender todas las CDR del
anticuerpo 4I22 como se indica en la Tabla 1, y neutralizar la infección por hCMV en un hospedador humano. Un
anticuerpo de la divulgación, o fragmento de unión al antígeno del mismo, puede comprender todas las CDR del
anticuerpo 8L13 como se indica en la Tabla 1, y neutralizar la infección por hCMV en un hospedador humano.
Un anticuerpo de la divulgación, o fragmento de unión al antígeno del mismo, puede comprender todas las CDR del anticuerpo 2C12 como se indica en la Tabla 1, y neutralizar la infección por hCMV en un hospedador humano. Un anticuerpo de la divulgación, o fragmento de unión al antígeno del mismo, puede comprender todas las CDR del anticuerpo 8C15 como se indica en la Tabla 1, y neutralizar la infección por hCMV en un hospedador humano. Un anticuerpo de la divulgación, o fragmento de unión al antígeno del mismo, puede comprender todas las CDR del
anticuerpo 9I6 como se indica en la Tabla 1, y neutralizar la infección por hCMV en un hospedador humano. Un
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anticuerpo de la divulgación, o fragmento de unión al antígeno del mismo, puede comprender todas las CDR del anticuerpo 7B13 como se indica en la Tabla 1, y neutralizar la infección por hCMV en un hospedador humano. Un anticuerpo de la divulgación, o fragmento de unión al antígeno del mismo, puede comprender todas las CDR del anticuerpo 8J16 como se indica en la Tabla 1, y neutralizar la infección por hCMV en un hospedador humano. Un anticuerpo de la divulgación, o fragmento de unión al antígeno del mismo, puede comprender todas las CDR del anticuerpo 7I13 como se indica en la Tabla 1, y neutralizar la infección por hCMV en un hospedador humano.
En otra realización más, un anticuerpo de la invención, o fragmento de unión al antígeno del mismo, comprende todas las CDR del anticuerpo 7H3 como se indica en la Tabla 1, y neutraliza la infección por hCMV en un hospedador humano. Un anticuerpo de la divulgación, o fragmento de unión al antígeno del mismo, puede comprender todas las CDR del anticuerpo 7H3 variante 1 como se indica en la Tabla 1, y neutralizar la infección por hCMV en un hospedador humano. En otra realización, un anticuerpo de la invención, o fragmento de unión al antígeno del mismo, comprende todas las CDR del anticuerpo 6B4 como se indica en la Tabla 1, y neutraliza la infección por hCMV en un hospedador humano. En otra realización, un anticuerpo de la invención, o fragmento de unión al antígeno del mismo, comprende todas las CDR del anticuerpo 5F1 como se indica en la Tabla 1, y neutraliza la infección por hCMV en un hospedador humano. En otra realización, un anticuerpo de la invención, o fragmento de unión al antígeno del mismo, comprende todas las CDR del anticuerpo 10C6 como se indica en la Tabla 1, y neutraliza la infección por hCMV en un hospedador humano. En otra realización, un anticuerpo de la invención, o fragmento de unión al antígeno del mismo, comprende todas las CDR del anticuerpo 4H9 como se indica en la Tabla 1, y neutraliza la infección por hCMV en un hospedador humano. Un anticuerpo de la divulgación, o fragmento de unión al antígeno del mismo, puede comprender todas las CDR del anticuerpo 4H9 variante 1 como se indica en la Tabla 1, y neutraliza la infección por hCMV en un hospedador humano. En otra realización, un anticuerpo de la invención, o fragmento de unión al antígeno del mismo, comprende todas las CDR del anticuerpo 2B11 como se indica en la Tabla 1, y neutraliza la infección por hCMV en un hospedador humano.
Un anticuerpo de la divulgación, o fragmento de unión al antígeno del mismo, puede comprender todas las CDR del anticuerpo 11B12 como se indica en la Tabla 1, y neutraliza la infección por hCMV en un hospedador humano. En otra realización, un anticuerpo de la divulgación, o fragmento de unión al antígeno del mismo, puede comprender todas las CDR del anticuerpo 13H11 como se indica en la Tabla 1, y neutralizar la infección por hCMV en un hospedador humano. Un anticuerpo de la divulgación, o fragmento de unión al antígeno del mismo, puede comprender todas las CDR del anticuerpo 3G16 como se indica en la Tabla 1, y neutralizar la infección por hCMV en un hospedador humano. Un anticuerpo de la divulgación, o fragmento de unión al antígeno del mismo, puede comprender todas las CDR del anticuerpo 6L3 como se indica en la Tabla 1, y neutralizar la infección por hCMV en un hospedador humano.
La divulgación comprende además un anticuerpo, o fragmento del mismo, que se une a un epítopo capaz de unirse a un anticuerpo de la invención, o un anticuerpo que compite con un anticuerpo de la invención.
Los anticuerpos de la divulgación también incluyen moléculas de anticuerpos híbridos que comprenden una o más CDR de un anticuerpo de la invención y una o más CDR de otro anticuerpo para el mismo epítopo. En una realización, dichos anticuerpos híbridos comprenden tres CDR de un anticuerpo de la invención y tres CDR de otro anticuerpo para el mismo epítopo. Ejemplos de anticuerpos híbridos comprenden i) las tres CDR de cadena ligera de un anticuerpo de la invención y las tres CDR de la cadena pesada de otro anticuerpo para el mismo epítopo, o ii) las tres CDR de la cadena pesada de un anticuerpo de la invención y las tres CDR de cadena ligera de otro anticuerpo para el mismo epítopo.
En otro aspecto, la invención también incluye secuencias de ácido nucleico que codifican las cadenas ligeras y pesadas y las CDR de los anticuerpos de la presente invención. En una realización, las secuencias de ácido nucleico incluyen secuencias de ácido nucleico que tienen al menos 70 %, al menos 75 %, al menos 80 %, al menos 85 %, al menos 90 %, al menos 95 %, al menos 98 %, o al menos 99 % de identidad con el ácido nucleico que codifica una cadena pesada o ligera de un anticuerpo de la invención. Una secuencia de ácido nucleico de la divulgación puede tener la secuencia de un ácido nucleico que codifica una CDR de la cadena pesada o ligera de un anticuerpo de la invención. Por ejemplo, una secuencia de ácido nucleico de acuerdo con la invención comprende las secuencias de ácido nucleico de las SEQ ID NOs: 284-289, 292, 293, 302-307, 310, 311, 322-327, 330, 331, 333, 335, 342-347, 350, 351, 353-356, 358, 359, 362-364, 365, 366, 369 y 370. Se divulga una secuencia de ácido nucleico que comprende una secuencia que es al menos 80 %, al menos 85 %, al menos 90 %, al menos 95 %, al menos 97 %, al menos 98 %, o al menos 99 % idéntica a las secuencias de ácido nucleico de las SEQ ID NOs mencionadas anteriormente.
Debido a la redundancia del código genético, existirán variantes de estas secuencias que codifican las mismas secuencias de aminoácidos. Estas variantes están incluidas dentro del alcance de la invención.
También se divulgan anticuerpos variantes que neutralizan la infección por hCMV. Por lo tanto, también se divulgan variantes de las secuencias enumeradas en la solicitud. Tales variantes incluyen variantes naturales generadas por mutaciones somáticas in vivo durante la respuesta inmunitaria o in vitro tras el cultivo de clones de linfocitos B inmortalizados. En otra alternativa, pueden surgir variantes debido a la degeneración del código genético, como se
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mencionó anteriormente o pueden producirse debido a errores en la transcripción o traducción.
Se pueden obtener variantes adicionales de las secuencias de anticuerpo que tienen una afinidad y/o potencia mejoradas usando métodos conocidos en la técnica. Por ejemplo, las sustituciones de aminoácidos se pueden usar para obtener anticuerpos con afinidad mejorada adicional. En otra alternativa, se puede usar la optimización de codones de la secuencia de nucleótidos para mejorar la eficacia de la traducción en los sistemas de expresión para la producción del anticuerpo. Además, también se divulgan polinucleótidos que comprenden una secuencia optimizada para la especificidad del anticuerpo o actividad neutralizante mediante la aplicación de un método de evolución dirigida a cualquiera de las secuencias de ácido nucleico de la invención.
Las secuencias de anticuerpos variantes que neutralizan la infección por hCMV pueden compartir el 70 % o más (es decir 75 %, 80 %, 85 %, 90 %, 95 %, 97 %, 98 %, 99 % o más) de identidad de secuencia de aminoácidos con las secuencias enumeradas en la solicitud. Dicha identidad de secuencia se puede calcular con respecto a la longitud completa de la secuencia de referencia (es decir la secuencia enumerada en la solicitud). El porcentaje de identidad, como se menciona en la presente memoria, se puede determinar utilizando la versión 2.1.3 de BLAST usando los parámetros predeterminados especificados por el NCBI (Centro Nacional de Información Biotecnológica) [matriz Blosum 62; penalización por apertura de hueco = 11 y penalización por extensión de hueco = 1].
Además se incluyen dentro del alcance de la invención los vectores de expresión, que comprenden una secuencia de ácido nucleico de acuerdo con la invención. Las células transformadas con tales vectores también se incluyen dentro del alcance de la invención. Los ejemplos de tales células incluyen, pero no se limitan a, células eucariotas, por ej., células de levadura, células animales o células de plantas. En una realización, las células son de mamífero, por ej., células humanas, CHO, HEK293T, PER.C6, NS0, mieloma o hibridoma.
La divulgación también se refiere a anticuerpos monoclonales que se unen a un epítopo capaz de unirse a los anticuerpos de la invención, que incluyen, pero no se limitan a, un anticuerpo monoclonal seleccionado del grupo que consiste en 15D8, 4N10, 10F7, 10P3, 4I22, 8L13, 2C12, 8C15, 9I6, 7B13, 8J16, 8I21, 7I13, 7H3, 6B4, 5F1, 10C6, 4H9, 11B12, 13H11, 3G16, 2B11 y 6L3.
Los anticuerpos monoclonales y recombinantes son particularmente útiles en la identificación y purificación de los polipéptidos individuales u otros antígenos contra los que están dirigidos. Los anticuerpos tienen una utilidad adicional ya que pueden emplearse como reactivos en inmunoensayos, radioinmunoensayos (RIA) o ensayos inmunoabsorbentes ligados a enzimas (ELISA). En estas aplicaciones, los anticuerpos pueden marcarse con un reactivo detectable analíticamente tal como un radioisótopo, una molécula fluorescente o una enzima. Los anticuerpos también pueden usarse para la identificación y caracterización molecular (mapeo de epítopos) de antígenos.
Los anticuerpos se pueden acoplar a un fármaco para su administración a un sitio de tratamiento o acoplarse a un marcador detectable para facilitar la formación de imágenes de un sitio que comprende células de interés, tales como células infectadas con el hCMV. Los métodos para acoplar anticuerpos a fármacos y marcadores detectables son bien conocidos en la técnica, como lo son los métodos para la formación de imágenes usando marcadores detectables. Los anticuerpos marcados se pueden emplear en una amplia variedad de ensayos, que emplean una amplia variedad de marcadores. La detección de la formación de un complejo anticuerpo-antígeno entre un anticuerpo y un epítopo de interés (un epítopo de hCMV) puede facilitarse uniendo una sustancia detectable al anticuerpo. Los medios de detección adecuados incluyen el uso de marcadores tales como radionucleidos, enzimas, coenzimas, fluorescentes, quimioluminiscentes, cromógenos, sustratos o cofactores de enzimas, inhibidores de enzimas, complejos de grupos prostéticos, radicales libres, partículas, colorantes y similares. Los ejemplos de enzimas adecuadas incluyen peroxidasa de rábano picante, fosfatasa alcalina, p-galactosidasa o acetilcolinesterasa; ejemplos de complejos de grupos prostéticos adecuados incluyen estreptavidina/biotina y avidina/biotina; ejemplos de materiales fluorescentes adecuados incluyen umbeliferona, fluoresceína, isotiocianato de fluoresceína, rodamina, diclorotriazinilamina fluoresceína, cloruro de dansilo o ficoeritrina; un ejemplo de un material luminiscente es luminol; ejemplos de materiales bioluminiscentes incluyen luciferasa, luciferina y aequorina; y ejemplos de material radiactivo adecuado incluyen 125I, 131I, 35S, o 3H. Tales reactivos marcados pueden usarse en una variedad de ensayos bien conocidos, tales como radioinmunoensayos, inmunoensayos enzimáticos, por ejemplo, ELISA, inmunoensayos fluorescentes y similares. Véase por ejemplo, referencias 15-18.
Un anticuerpo puede conjugarse con un resto terapéutico tal como una citotoxina, un agente terapéutico o un ion de metal radiactivo o radioisótopo. Los ejemplos de radioisótopos incluyen, pero no están limitados a, I-131, I-123, I- 125, Y-90, Re-188, Re-186, At-211, Cu-67, Bi-212, Bi-213, Pd-109, Tc-99, In-111 y similares. Dichos conjugados de anticuerpos pueden usarse para modificar una respuesta biológica dada; la fracción de fármaco no debe interpretarse como limitada a agentes terapéuticos químicos clásicos. Por ejemplo, la fracción de fármaco puede ser una proteína o polipéptido que posee una actividad biológica deseada. Dichas proteínas pueden incluir, por ejemplo, una toxina tal como abrina, ricina A, exotoxina de pseudomonas o la toxina de la difteria.
Las técnicas para conjugar tal fracción terapéutica a anticuerpos son bien conocidas. Ver, por ejemplo, Arnon et al. (1985) “Monoclonal Antibodies for Immunotargeting of Drugs in Cancer Therapy”, en Monoclonal Antibodies and
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Cáncer Therapy, ed. Reisfeld et al. (Alan R. Liss, Inc.), páginas 243-256; ed. Hellstrom et al. (1987) “Antibodies for Drug Delivery”, en Controlled Drug Delivery, ed. Robinson et al. (2a ed, Marcel Dekker, Inc.), páginas 623-653; Thorpe (1985) “Antibody Carriers of Cytotoxic Agents in Cancer Therapy: A Review”, en Monoclonal Antibodies '84: Biological and Clinical Applications, ed. Pinchera et al. páginas. 475-506 (Editrice Kurtis, Milano, Italia, 1985)); “Analysis, Results, and Future Prospective of the Therapeutic Use of Radiolabeled Antibody in Cancer Therapy”, en Monoclonal Antibodies for Cancer Detection and Therapy ed. Baldwin et al. (Academic Press, Nueva York, 1985), páginas 303-316; y Thorpe et al. (1982) Immunol.
Rev. 62:119-158.
En otra alternativa, un anticuerpo puede conjugarse con un segundo anticuerpo para formar un heteroconjugado de anticuerpo como se describe en la referencia 19. Además, se pueden usar conectores entre los marcadores y los anticuerpos de la invención [20]. Los anticuerpos o fragmentos de unión al antígeno de los mismos se pueden marcar directamente con yodo radiactivo, indio, itrio u otra partícula radiactiva conocida en la técnica [21]. El tratamiento puede consistir en una combinación de tratamiento con anticuerpos conjugados y no conjugados administrados simultáneamente o posteriormente [22, 23].
Los anticuerpos también pueden unirse a un soporte sólido.
Adicionalmente, los anticuerpos, o fragmentos de anticuerpos funcionales de los mismos, pueden modificarse químicamente mediante conjugación covalente con un polímero para, por ejemplo, aumentar su semivida circulante, por ejemplo. Los ejemplos de polímeros y los métodos para unirlos a los péptidos se muestran en las referencias 2427. En algunas realizaciones, los polímeros se pueden seleccionar de polioles polioxietilados y polietilenglicol (PEG). El PEG es soluble en agua a temperatura ambiente y tiene la fórmula general: R(O--CH2 --CH2)n O—R donde R puede ser hidrógeno, o un grupo protector tal como un grupo alquilo o alcanol. En una realización, el grupo protector puede tener entre 1 y 8 átomos de carbono. En una realización adicional, el grupo protector es metilo. El símbolo n es un número entero positivo. En una realización, n está entre 1 y 1.000. En otra realización, n está entre 2 y 500. En una realización, el PEG tiene un peso molecular medio entre 1.000 y 40.000. En una realización adicional, el PEG tiene un peso molecular entre 2.000 y 20.000. En otra realización más, el PEG tiene un peso molecular de entre 3.000 y 12.000. En una realización, el PEG tiene al menos un grupo hidroxi. En otra realización, el PEG tiene un grupo hidroxi terminal. En aún otra realización, es el grupo hidroxi terminal el que se activa para que reaccione con un grupo amino libre sobre el inhibidor. Sin embargo, se entenderá que el tipo y la cantidad de los grupos reactivos se pueden variar para conseguir un PEG/anticuerpo conjugado covalentemente.
Los polioles polioxietilados solubles en agua también son útiles. Incluyen sorbitol polioxietilado, glucosa polioxietilada, glicerol polioxietilado (POG) y similares. En una realización, se usa POG. Sin estar sujetos a ninguna teoría, debido a que la cadena principal de glicerol del glicerol polioxietilado es la misma cadena principal que se encuentra naturalmente en, por ejemplo, animales y seres humanos en mono-, di-, triglicéridos, esta ramificación no necesariamente se consideraría un agente extraño en el cuerpo. En algunas realizaciones, el POG tiene un peso molecular en el mismo intervalo que PEG. La estructura de pOg se muestra en la referencia 28, y en la referencia 24 se encuentra una descripción de los conjugados POG/IL-2.
Otro sistema de administración de fármacos que se puede usar para aumentar la semivida circulatoria es el liposoma. Los métodos para preparar sistemas de administración de liposomas se describen en las referencias 29, 30 y 31. Otros sistemas de administración de fármacos son conocidos en la técnica y se describen en, por ejemplo, las referencias 32 y 33.
Los anticuerpos de la invención se pueden proporcionar en forma purificada. Generalmente, el anticuerpo estará presente en una composición que está sustancialmente exenta de otros polipéptidos, por ejemplo, donde menos del 90 % (en peso), habitualmente menos del 60 % y más habitualmente menos del 50 % de la composición se compone de otros polipéptidos.
Los anticuerpos pueden ser inmunogénicos en hospedadores no humanos (o heterólogos) por ejemplo en ratones. En particular, los anticuerpos pueden tener un idiotipo que es inmunogénico en hospedadores no humanos, pero no en un hospedador humano. Los anticuerpos para su uso humano incluyen aquellos que no pueden aislarse fácilmente de hospedadores tales como ratones, cabras, conejos, ratas, mamíferos que no son primates, etc. y generalmente no se pueden obtener por humanización o a partir de ratones xeno.
Los anticuerpos pueden ser de cualquier isotipo (por ej. IgA, IgG, IgM es decir una cadena pesada a, y o p), pero generalmente será IgG. Dentro del isotipo IgG, los anticuerpos pueden ser de subclase IgG1, IgG2, IgG3 o IgG4. Los anticuerpos pueden tener una cadena ligera k o A.
Producción de anticuerpos
Los anticuerpos monoclonales se pueden preparar mediante cualquier método conocido en la técnica. La metodología general para fabricar anticuerpos monoclonales utilizando tecnología de hibridoma es bien conocida [34, 35]. Preferiblemente, se usa el método alternativo de inmortalización del EBV descrito en la referencia 36.
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Usando el método descrito en la referencia 36, los linfocitos B que producen el anticuerpo de la invención se pueden transformar con el EBV en presencia de un activador de linfocitos B policlonal. La transformación con el EBV es una técnica estándar y puede adaptarse fácilmente para incluir activadores de linfocitos B policlonales.
Se pueden añadir estimulantes adicionales de crecimiento y diferenciación celular durante la etapa de transformación para mejorar aún más la eficacia. Estos estimulantes pueden ser citocinas tales como IL-2 e IL-15. En un aspecto, se añade IL-2 durante la etapa de inmortalización para mejorar aún más la eficacia de la inmortalización, pero su uso no es esencial.
Los linfocitos B inmortalizadas producidos usando estos métodos pueden luego cultivarse usando métodos conocidos en la técnica y aislarse los anticuerpos a partir de los mismos.
Los anticuerpos también se pueden preparar cultivando células de plasma individuales en placas de cultivo de micropocillos usando el método descrito en la Solicitud de patente del Reino Unido 0819376.5. Además, a partir de cultivos de células plasmáticas individuales, se puede extraer ARN y se puede realizar la PCR de células individuales usando métodos conocidos en la técnica. Las regiones VH y Vl de los anticuerpos se pueden amplificar por RT-PCR, secuenciar y clonar en un vector de expresión que luego se transfecta en células HEK293T u otras células del hospedador. La clonación del ácido nucleico en vectores de expresión, la transfección de células hospedadoras, el cultivo de las células hospedadoras transfectadas y el aislamiento del anticuerpo producido se puede realizar usando cualquier método conocido por los expertos en la materia.
Los anticuerpos monoclonales se pueden purificar adicionalmente, si se desea, usando filtración, centrifugación y diversos métodos cromatográficos tales como HPLC o cromatografía de afinidad. Las técnicas para la purificación de anticuerpos monoclonales, que incluyen técnicas para producir anticuerpos de calidad farmacéutica, son bien conocidas en la técnica.
Se pueden obtener fragmentos de anticuerpos monoclonales a partir de anticuerpos monoclonales mediante métodos que incluyen digestión con enzimas, tales como pepsina o papaína, y/o mediante escisión de enlaces disulfuro por reducción química. En otra alternativa, se pueden obtener fragmentos de los anticuerpos monoclonales por clonación y expresión de parte de las secuencias de las cadenas pesada o ligera. Los “fragmentos” de anticuerpos pueden incluir fragmentos Fab, Fab', F(ab')2 y Fv. La invención también abarca fragmentos Fv monocatenarios (scFv) derivados de las cadenas pesada y ligera de un anticuerpo monoclonal de la invención, por ej., la invención incluye un scFv que comprende las CDR de un anticuerpo de la invención. También se incluyen monómeros y dímeros de cadena pesada o ligera, así como anticuerpos monocatenarios, por ej., Fv monocatenario en el que los dominios variables de la cadena pesada y ligera están unidos por un enlazador peptídico.
Se pueden usar técnicas estándar de biología molecular para preparar secuencias de ADN que codifican los anticuerpos o fragmentos de los anticuerpos de la presente invención. Las secuencias de ADN deseadas se pueden sintetizar completamente o en parte usando técnicas de síntesis de oligonucleótidos. La mutagénesis dirigida al sitio y las técnicas de reacción en cadena de la polimerasa (PCR) se pueden usar según corresponda.
Se puede usar cualquier sistema de célula hospedadora/vector adecuado para la expresión de las secuencias de ADN que codifican las moléculas de anticuerpo o fragmentos de las mismas. Se pueden usar sistemas bacterianos, por ejemplo, E coli y otros sistemas microbianos, en parte, para la expresión de fragmentos de anticuerpos tales como fragmentos Fab y F(ab')2 y especialmente fragmentos Fv y fragmentos de anticuerpos monocatenarios, por ejemplo, Fvs monocatenarios. Se pueden usar sistemas de expresión en células hospedadoras eucariotas, por ejemplo, de mamífero para la producción de moléculas de anticuerpo más grandes, que incluyen moléculas de anticuerpo completas. Las células hospedadoras de mamífero adecuadas incluyen células CHO, HEK293T, PER.C6, NS0, mieloma o hibridoma.
La presente invención también proporciona un proceso para la producción de una molécula de anticuerpo de acuerdo con la presente invención que comprende cultivar una célula hospedadora que comprende un vector de la presente invención en condiciones adecuadas para conducir a la expresión de proteína a partir del ADN que codifica la molécula de anticuerpo de la presente invención y aislar la molécula de anticuerpo.
Una molécula de anticuerpo puede comprender solo un polipéptido de la cadena pesada o ligera, en cuyo caso solo se necesita usar una secuencia codificante de polipéptido de la cadena pesada o ligera para transfectar las células hospedadoras. Para la producción de productos que comprenden tanto cadenas pesadas como ligeras, la línea celular puede transfectarse con dos vectores, un primer vector que codifica un polipéptido de cadena ligera y un segundo vector que codifica un polipéptido de la cadena pesada. Como alternativa, se puede usar un único vector, incluyendo el vector secuencias que codifican polipéptidos de la cadena ligera y de la cadena pesada.
Como alternativa, los anticuerpos pueden producirse i) expresando una secuencia de ácido nucleico de acuerdo con la invención en una célula, y ii) aislando el producto de anticuerpo expresado. Adicionalmente, el método puede incluir iii) purificar el anticuerpo.
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Selección y aislamiento de linfocitos B
Los linfocitos B transformados pueden seleccionarse para obtener aquellos que producen anticuerpos de la especificidad de antígeno deseada, y a continuación pueden producirse clones de linfocitos B individuales a partir de las células positivas.
La etapa de selección puede llevarse a cabo mediante ELISA, mediante tinción de tejidos o células (que incluyen células transfectadas), un ensayo de neutralización o uno de varios otros métodos conocidos en la técnica para identificar la especificidad de antígeno deseada. El ensayo puede seleccionarse basándose en el reconocimiento de antígeno simple, o puede seleccionarse basándose adicionalmente en una función deseada, por ej., para seleccionar anticuerpos neutralizantes en lugar de solo anticuerpos que se unen a antígenos, seleccionar anticuerpos que puedan cambiar las características de las células diana, como sus cascadas de señalización, su forma, su tasa de crecimiento, su capacidad de influir en otras células, su respuesta a la influencia de otras células o por otros reactivos o por un cambio en las condiciones, su estado de diferenciación, etc.
La etapa de clonación para separar clones individuales de la mezcla de células positivas se puede llevar a cabo usando dilución limitante, micromanipulación, deposición de células individuales mediante clasificación celular u otro método conocido en la técnica.
Los clones de linfocitos B inmortalizados de la invención se pueden usar de varias maneras por ej., como fuente de anticuerpos monoclonales, como fuente de ácido nucleico (ADN o ARNm) que codifica un anticuerpo monoclonal de interés, para investigación, etc.
La divulgación proporciona una composición que comprende linfocitos de memoria B inmortalizados, en la que las células producen anticuerpos con alta potencia neutralizante específica para hCMV, y en la que los anticuerpos se producen a >5 pg por célula por día. La divulgación también proporciona una composición que comprende clones de una célula de memoria B inmortalizada, en la que los clones producen un anticuerpo monoclonal con una alta afinidad específica para hCMV, y en la que el anticuerpo se produce a > 5 pg por célula por día. Preferiblemente, dichos clones producen un anticuerpo monoclonal con una alta potencia para neutralizar la infección por hCMV.
Ejemplos de clones de linfocitos B inmortalizados incluyen, pero no se limitan a, 15D8, 4N10, 10F7, 10P3, 4I22, 8L13, 2C12, 8C15, 9I6, 7B13, 8J16, 8I21, 7I13, 7H3, 6B4, 5F1, 10C6, 4H9, 11B12, 13H11, 3G16, 2B11 y 6L3.
Epítopos
Como se ha mencionado anteriormente, los anticuerpos pueden usarse para cartografiar los epítopos a los que se unen. Los inventores han descubierto que los diversos anticuerpos que neutralizan la infección por hCMV de células endoteliales, células epiteliales, células retinianas y células dendríticas, están dirigidos hacia epítopos en la proteína del hCMV UL128, epítopos formados por las proteínas del hCMV UL130 y UL131A, epítopos formados por las proteínas del hCMV Ul128, UL130 y UL131A, epítopos formados por las proteínas del hCMV gH, gL, UL128 y UL130, gB, gH, o epítopos formados por las proteínas del hCMV gM y gN. Los epítopos a los que se unen los anticuerpos pueden ser lineales (continuos) o conformacionales (discontinuos) y formados por una sola proteína del hCMV o por la combinación de 2, 3 o más proteínas del hCMV.
Los epítopos reconocidos por los anticuerpos pueden tener varios usos. El epítopo y mimotopos de los mismos en forma purificada o sintética se pueden usar para generar respuestas inmunitarias (es decir como una vacuna, o para la producción de anticuerpos para otros usos) o para seleccionar suero del paciente para obtener anticuerpos que inmunoreaccionan con el epítopo o mimotopos de los mismos. En una realización, dicho epítopo o mimotopo, o antígeno que comprende dicho epítopo o mimotopo, se puede usar como una vacuna para generar una respuesta inmunitaria. Los anticuerpos y fragmentos de anticuerpos también se pueden usar en un método para controlar la calidad de las vacunas. En particular, los anticuerpos pueden usarse para comprobar que el antígeno en una vacuna contiene el epítopo inmunogénico específico en la conformación correcta.
El epítopo también puede ser útil para la selección de ligandos que se unen a dicho epítopo. Dichos ligandos incluyen, pero no se limitan a, anticuerpos; incluidos los de camellos, tiburones y otras especies, fragmentos de anticuerpos, péptidos, productos de tecnología de presentación en fagos, aptámeros, adnectinas o fragmentos de otras proteínas víricas o celulares, pueden bloquear el epítopo y así prevenir la infección.
Expresión recombinante
Los linfocitos de memoria B inmortalizados también se pueden usar como una fuente de ácido nucleico para la clonación de genes de anticuerpos para la expresión recombinante posterior. La expresión de fuentes recombinantes es más común para fines farmacéuticos que la expresión de linfocitos B o hibridomas por ej. por razones de estabilidad, reproducibilidad, facilidad de cultivo, etc.
Por lo tanto, la divulgación proporciona un método para preparar una célula recombinante, que comprende las
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etapas de: (i) obtener uno o más ácidos nucleicos (por ej., genes de la cadena pesada y/o ligera) del clon de linfocitos B que codifica el anticuerpo de interés; y (ii) insertar el ácido nucleico en un hospedador de expresión para permitir la expresión del anticuerpo de interés en ese hospedador de interés.
De forma similar, la divulgación proporciona un método para preparar una célula recombinante, que comprende las etapas de: (i) secuenciación de ácido(s) nucleico(s) del clon de linfocitos B que codifica el anticuerpo de interés; y (ii) usar la información de secuencia de la etapa (i) para preparar ácido(s) nucleico(s) para su inserción en un hospedador de expresión para permitir la expresión del anticuerpo de interés en ese hospedador. El ácido nucleico puede, pero no necesita, manipularse entre las etapas (i) y (ii) para introducir sitios de restricción, cambiar el uso de codones y/u optimizar las secuencias reguladoras de transcripción y/o traducción.
La divulgación también proporciona un método para preparar una célula recombinante, que comprende la etapa de transformar una célula hospedadora con uno o más ácidos nucleicos que codifican un anticuerpo monoclonal de interés, en el que los ácidos nucleicos son ácidos nucleicos que se derivaron de un clon de linfocitos B inmortalizado. . Por lo tanto, los procedimientos para preparar primero el o los ácidos nucleicos y luego usarlos para transformar una célula hospedadora pueden realizarse en diferentes momentos por diferentes personas en diferentes lugares (por ej. en diferentes países).
Estas células recombinantes pueden usarse luego para fines de expresión y cultivo. Son particularmente útiles para la expresión de anticuerpos para producción farmacéutica a gran escala. También se pueden usar como el principio activo de una composición farmacéutica. Se puede utilizar cualquier técnica de cultivo adecuada, que incluye, pero no se limita a, cultivo estático, cultivo en botella giratoria, fluido de ascitis, cartucho de biorreactor de fibra hueca, minifermentador modular, tanque agitado, cultivo de microvehículos, perfusión de núcleo cerámico, etc.
Los métodos para obtener y secuenciar genes de inmunoglobulina de linfocitos B son bien conocidos en la técnica (por ej., ver referencia 37).
El hospedador de expresión es preferiblemente una célula eucariota, que incluye células de levadura y animales, particularmente células de mamífero (por ej., células CHO, células NS0, células humanas tales como células PER.C6 [Crucell; referencia 38] o HKB-11 [Bayer; referencias 39 y 40], células de mieloma [41 y 42], etc.), así como las células vegetales. Los hospedadores de expresión preferidos pueden glicosilar el anticuerpo, particularmente con estructuras de carbohidratos que no son inmunogénicas en los seres humanos. En una realización, el hospedador de expresión puede ser capaz de crecer en medios sin suero. En una realización adicional, el hospedador de expresión puede crecer en cultivo sin la presencia de productos derivados de animales.
El hospedador de expresión se puede cultivar para dar una línea celular.
La invención proporciona un método para preparar una o más moléculas de ácido nucleico (por ej., genes de la cadena pesada y ligera) que codifican un anticuerpo de interés, que comprende las etapas de: (i) preparar un clon de linfocitos B inmortalizado; (ii) obtener del clon de linfocitos B ácido nucleico que codifica el anticuerpo de interés. La divulgación también proporciona un método para obtener una secuencia de ácido nucleico que codifica un anticuerpo de interés, que comprende las etapas de: (i) preparar un clon de linfocitos B inmortalizado de acuerdo con la invención; (ii) secuenciar el ácido nucleico del clon de linfocitos B que codifica el anticuerpo de interés.
La divulgación también proporciona un método para preparar molécula(s) de ácido nucleico que codifica un anticuerpo de interés, que comprende la etapa de obtener el ácido nucleico a partir de un clon de linfocitos B que se obtuvo a partir de un linfocito B transformado de la invención. Por lo tanto, los procedimientos para obtener primero el clon de linfocitos B y luego preparar el ácido(s) nucleico(s) a partir de este se pueden realizar en momentos muy diferentes por diferentes personas en diferentes lugares (por ej., en diferentes países).
La divulgación proporciona un método para preparar un anticuerpo (por ej., para su uso farmacéutico), que comprende las etapas de: (i) obtener y/o secuenciar uno o más ácidos nucleicos (por ej., genes de la cadena pesada y ligera) del clon de linfocitos B seleccionado que expresa el anticuerpo de interés; (ii) insertar el o los ácidos nucleicos o usar el o los ácidos nucleicos para preparar un hospedador de expresión que pueda expresar el anticuerpo de interés; (iii) cultivar o subcultivar el hospedador de expresión en condiciones en las que se expresa el anticuerpo de interés; y, opcionalmente, (iv) purificar el anticuerpo de interés.
La divulgación también proporciona un método para preparar un anticuerpo que comprende las etapas de: cultivar o subcultivar una población de células hospedadoras de expresión en condiciones en las que se expresa el anticuerpo de interés y, opcionalmente, purificar el anticuerpo de interés, en el que dicha población de células hospedadoras de expresión se ha preparado (i) proporcionando ácido o ácidos nucleicos del linfocito B seleccionado que codifica el anticuerpo de interés producido por una población de linfocitos de memoria B preparados como se describió anteriormente, (ii) insertando el ácido o ácidos nucleicos en un hospedador de expresión que puede expresar el anticuerpo de interés, y (iii) cultivando o subcultivando hospedadores de expresión que comprenden dichos ácidos nucleicos insertados para producir dicha población de células hospedadoras de expresión. Por lo tanto, los procedimientos para preparar primero el hospedador de expresión recombinante y luego cultivarlo para expresar el
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anticuerpo pueden realizarse en momentos muy diferentes por diferentes personas en diferentes lugares (por ej., en diferentes países).
Además, las líneas celulares que expresan ejemplos de anticuerpos de la invención, 4N10, 2C12, 8C15, 8I21, 6B4, 10C6, 4H9, 11B12, 3G16 y 6L3 se depositaron en el Advanced Biotechnology Center (ABC), Largo Rossana Benzi 10, 16132 Génova ( Italia), en los términos del Tratado de Budapest, el 9 de julio de 2008, (con los números de acceso PD 08009, PD 08007, PD 08006, PD 08005, PD 08004, PD 08014, PD 08013, PD 08011, PD 08012, y PD 08010, respectivamente) y una línea de linfocitos B inmortalizada que expresa 7H3 se depositó el 16 de julio de 2008 con el número de acceso PD 08017. Un anticuerpo, o un fragmento de unión al antígeno del mismo, expresado a partir de las líneas celulares anteriores que expresan 6B4, 10C6, 4H9 y 7H3 así como anticuerpos, y fragmentos de unión al antígeno del mismo, con la misma secuencia de aminoácidos expresada a partir de las líneas celulares anteriores que expresan 6B4, 10C6, 4H9 y 7H3 también se consideran dentro del alcance de la invención.
Estos depósitos se proporcionan para la comodidad de los expertos en la materia y no son una admisión de que tales depósitos se requieran para practicar la invención ni que las realizaciones equivalentes no estén dentro del conocimiento de la técnica a la vista de la presente divulgación. La disponibilidad pública de estos depósitos no es una concesión de una licencia para hacer, usar o vender los materiales depositados bajo esta u otras patentes.
Composiciones farmacéuticas
La invención proporciona una composición farmacéutica que contiene los anticuerpos y/o fragmentos de anticuerpos de la invención y/o el ácido nucleico que codifica dichos anticuerpos. Una composición farmacéutica también puede contener un vehículo farmacéuticamente aceptable para permitir la administración. El vehículo no debe inducir la producción de anticuerpos perjudiciales para el individuo que recibe la composición y no debe ser tóxico. Los vehículos adecuados pueden ser macromoléculas grandes, de metabolismo lento, tales como proteínas, polipéptidos, liposomas, polisacáridos, ácidos polilácticos, ácidos poliglicólicos, aminoácidos poliméricos, copolímeros de aminoácidos y partículas de virus inactivas.
Se pueden usar sales farmacéuticamente aceptables, por ejemplo sales de ácidos minerales, tales como hidrocloruros, hidrobromuros, fosfatos y sulfatos, o sales de ácidos orgánicos, tales como acetatos, propionatos, malonatos y benzoatos.
Los vehículos farmacéuticamente aceptables en composiciones terapéuticas pueden contener adicionalmente líquidos tales como agua, solución salina, glicerol y etanol. Adicionalmente, sustancias auxiliares, tales como agentes humectantes o emulsionantes o sustancias tamponantes del pH, pueden estar presentes en tales composiciones. Tales vehículos permiten que las composiciones farmacéuticas se formulen como comprimidos, píldoras, grageas, cápsulas, líquidos, geles, jarabes, suspensiones y suspensiones, para su ingestión por el paciente.
Las formas de administración pueden incluir aquellas formas adecuadas para administración parenteral, por ej., por inyección o infusión, por ejemplo mediante inyección en bolo o infusión continua. Cuando el producto es para inyección o infusión, puede tomar la forma de una suspensión, solución o emulsión en un vehículo aceitoso o acuoso y puede contener agentes de formulación, tales como agentes de suspensión, conservantes, estabilizantes y/o dispersantes. Como alternativa, la molécula de anticuerpo puede estar en forma seca, para su reconstitución antes del uso con un líquido estéril apropiado.
Una vez formuladas, las composiciones de la invención se pueden administrar directamente al sujeto. En una realización, las composiciones están adaptadas para administración a sujetos humanos.
Las composiciones farmacéuticas de esta invención pueden administrarse por cualquier número de vías que incluyen, entre otras, oral, intravenosa, intramuscular, intraarterial, intramedular, intraperitoneal, intratecal, intraventricular, transdérmica, transcutánea, tópica, subcutánea, intranasal, enteral , sublingual, intravaginal o rectal. Los hiposprays también pueden usarse para administrar las composiciones farmacéuticas de la invención. Generalmente, las composiciones terapéuticas se pueden preparar como inyectables, como soluciones líquidas o suspensiones. También se pueden preparar formas sólidas adecuadas para solución o suspensión en vehículos líquidos antes de la inyección.
La administración directa de las composiciones generalmente se realizará por inyección, por vía subcutánea, intraperitoneal, intravenosa o intramuscular, o se administrará al espacio intersticial de un tejido. Las composiciones también se pueden administrar en una lesión. El tratamiento de dosificación puede ser un esquema de dosis única o un esquema de dosis múltiple. Los productos farmacéuticos conocidos a base de anticuerpos brindan orientación relacionada con la frecuencia de administración por ej., si un medicamento debe ser administrado diariamente, semanalmente, mensualmente, etc. La frecuencia y la dosis también pueden depender de la gravedad de los síntomas.
Las composiciones de la invención se pueden preparar de diversas formas. Por ejemplo, las composiciones se
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pueden preparar como inyectables, como soluciones líquidas o suspensiones. También se pueden preparar formas sólidas adecuadas para solución o suspensión en vehículos líquidos antes de la inyección (por ej., una composición liofilizada, como Synagis™ y Herceptin™, para la reconstitución con agua estéril que contiene un conservante). La composición puede prepararse para administración tópica por ej., como una pomada, crema o polvo. La composición puede prepararse para administración oral por ej., como un comprimido o cápsula, como un aerosol, o como un jarabe (opcionalmente con sabor). La composición puede prepararse para administración pulmonar por ej., como inhalador, usando un polvo fino o un aerosol. La composición puede prepararse como un supositorio o pesario. La composición puede prepararse para administración nasal, aural u ocular por ej., como gotas. La composición puede estar en forma de kit, diseñada de modo que una composición combinada se reconstituya justo antes de la administración a un paciente. Por ejemplo, un anticuerpo liofilizado se puede proporcionar en forma de kit con agua estéril o un tampón estéril.
Se apreciará que el principio activo en la composición será una molécula de anticuerpo, un fragmento de anticuerpo o variantes y derivados de los mismos. Como tal, será susceptible a la degradación en el tracto gastrointestinal. Por lo tanto, si la composición se va a administrar mediante una ruta que usa el tracto gastrointestinal, la composición necesitará contener agentes que protejan al anticuerpo contra la degradación pero que liberen el anticuerpo una vez que se haya absorbido del tracto gastrointestinal.
Una descripción completa de vehículos farmacéuticamente aceptables está disponible en Gennaro (2000) Remington: The Science and Practice of Pharmacy, 20a edición, ISBN: 0683306472.
Las composiciones farmacéuticas de la invención generalmente tienen un pH entre 5,5 y 8,5, en algunas realizaciones esto puede estar entre 6 y 8, y en realizaciones adicionales aproximadamente 7. El pH puede mantenerse mediante el uso de un tampón. La composición puede ser estéril y/o estar exenta de pirógenos. La composición puede ser isotónica con respecto a los seres humanos. En una realización, las composiciones farmacéuticas de la invención se suministran en recipientes herméticamente cerrados.
Las composiciones farmacéuticas incluirán una cantidad efectiva de uno o más anticuerpos y/o uno o más ácidos nucleicos, es decir una cantidad que es suficiente para tratar, mejorar o prevenir una enfermedad o afección deseada, o para exhibir un efecto terapéutico detectable. Los efectos terapéuticos también incluyen la reducción de los síntomas físicos. La cantidad eficaz precisa para cualquier sujeto particular dependerá de su tamaño y estado de salud, la naturaleza y el alcance de la afección, y los fármacos o combinación de fármacos seleccionados para la administración. La cantidad efectiva para una situación dada se determina mediante experimentación de rutina y está dentro del juicio de un médico. Para los fines de la presente invención, una dosis eficaz generalmente será de aproximadamente 0,01 mg/kg a aproximadamente 50 mg/kg, o de aproximadamente 0,05 mg/kg a aproximadamente 10 mg/kg de las composiciones de la presente invención en el individuo al que es administrado. Los productos farmacéuticos a base de anticuerpos conocidos proporcionan orientación a este respecto, por ej., Herceptin™ se administra por perfusión intravenosa de una solución de 21 mg/ml, con una dosis de carga inicial de 4 mg/kg de peso corporal y una dosis de mantenimiento semanal de 2 mg/kg de peso corporal; Rituxan™ se administra semanalmente a 375 mg/m2; etc.
Las composiciones pueden incluir más de uno (por ej., 2, 3, 4, 5, etc.) anticuerpos de la divulgación para proporcionar un efecto terapéutico aditivo o sinérgico. La composición puede comprender uno o más (por ej., 2, 3, 4, 5, etc.) anticuerpos de la divulgación y uno o más (por ej., 2, 3, 4, 5, etc.) anticuerpos adicionales que neutralizan la infección por hCMV.
Por ejemplo, un anticuerpo puede unirse a un epítopo de la proteína del hCMV UL128, un epítopo formado por las proteínas del hCMV UL130 y UL131A, un epítopo formado por las proteínas del hCMV UL128, uL130 y UL131A, un epítopo formado por las proteínas del hCMV gH, gL, UL128 y UL130, un epítopo de la proteína del hCMV gB, un epítopo de la proteína del hCMV gH, o un epítopo formado por las proteínas del hCMV gM y gN, mientras que otro puede unirse a un epítopo diferente de la proteína del hCMV UL128, un epítopo formado por UL130 y UL131A, un epítopo formado por UL128, UL130 y UL131A, un epítopo formado por gH, gL, UL128 y UL130, gB, gH, gL, gM, gN, gO, o un epítopo formado por gM y gN. Sin estar ligados a ninguna teoría, un anticuerpo puede dirigirse al mecanismo que media la infección de fibroblastos, mientras que el otro anticuerpo puede estar dirigido al mecanismo que media la infección de células endoteliales. Para un efecto clínico óptimo, puede ser ventajoso abordar ambos mecanismos de infección por hCMV y su mantenimiento.
La divulgación proporciona una composición farmacéutica que comprende dos o más anticuerpos, en la que el primer anticuerpo es específico de un primer epítopo UL128, y el segundo anticuerpo es específico de un segundo epítopo UL128, una combinación de UL130 y UL131A, una combinación de UL128, Ul130 y UL131A, una combinación de gH, gL, UL128 y UL130, gB, gH, gL, gM, gN, gO, o una combinación de gM y gN.
La divulgación proporciona una composición farmacéutica que comprende dos o más anticuerpos, en la que el primer anticuerpo es específico de un primer epítopo de una combinación de UL130 y 131A, y el segundo anticuerpo es específico de UL128, un segundo epítopo de una combinación de UL130 y 131A, una combinación de UL128, UL130 y UL131A, una combinación de gH, gL, UL128 y UL130, gB, gH, gL, gM, gN, gO, o una combinación de gM y
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La divulgación proporciona una composición farmacéutica que comprende dos o más anticuerpos, en la que el primer anticuerpo es específico de un primer epítopo de una combinación de UL128, UL130 y 131A, y el segundo anticuerpo es específico de UL128, una combinación de UL130 y UL131A, un segundo epítopo de una combinación de UL128, UL130 y 131A, una combinación de gH, gL, UL128 y UL130, gB, gH, gL, gM, gN, gO, o una combinación de gM y gN.
La divulgación proporciona una composición farmacéutica que comprende dos o más anticuerpos, en la que el primer anticuerpo es específico de un primer epítopo de una combinación de gH, gL, UL128, UL130 y UL131A, y el segundo anticuerpo es específico de UL128, una combinación de UL130 y UL131A, una combinación de UL128, UL130 y 131A, un segundo epítopo de una combinación de gH, gL, UL128 y UL130, gB, gH, gL, gM, gN, gO, o una combinación de gM y gN.
La invención proporciona una composición farmacéutica que comprende dos o más anticuerpos, en la que el primer anticuerpo es específico de un primer epítopo gB, y el segundo anticuerpo es específico de UL128, una combinación de UL130 y UL131A, una combinación de UL128, UL130 y UL131A, una combinación de gH, gL, UL128 y UL130, un segundo epítopo gB, gH, gL, gM, gN, gO, o una combinación de gM y gN.
La divulgación proporciona una composición farmacéutica que comprende dos o más anticuerpos, en la que el primer anticuerpo es específico de un primer epítopo gH, y el segundo anticuerpo es específico de UL128, una combinación de UL130 y UL131A, una combinación de uL128, UL130 y UL131A, una combinación de gH, gL, UL128 y UL130, gB, un segundo epítopo de gH, gL, gM, gN, gO, o una combinación de gM y gN.
La divulgación proporciona una composición farmacéutica que comprende dos o más anticuerpos, en la que el primer anticuerpo es específico de un primer epítopo de una combinación de gM y gN, y el segundo anticuerpo es específico de UL128, una combinación de UL130 y UL131A, una combinación de UL128, UL130 y UL131A, una combinación de gH, gL, UL128 y UL130, gB, gH, gL, gM, gN, gO, o un segundo epítopo de una combinación de gM
y gN.
Los ejemplos de anticuerpos para su uso en una composición farmacéutica que se unen a un epítopo de la proteína del hCMV UL128 incluyen, pero no se limitan a, 15D8. Los ejemplos de anticuerpos para su uso en una composición farmacéutica que se unen a un epítopo formado por las proteínas del hCMV UL130 y UL131A incluyen, pero no se limitan a, 4N10, 10F7, 10P3, 4I22, 8L13, 1F11, 2F4 y 5A2 (véase la Solicitud de los Estados Unidos N.° 11/ 969.104, presentada el 3 de enero de 2008 publicada como US 2008/0213265) Los ejemplos de anticuerpos para su uso en una composición farmacéutica que se unen a un epítopo formado por las proteínas del hCMV UL128, UL130 y UL131A incluyen, pero no se limitan a, 2C12, 7B13, 7113, 8C15, 8J16, 9I6 y 6g4 (véase la solicitud de los Estados Unidos N.° 12/174,568, presentada el 16 de julio de 2008 publicada como US 2009/0081230). Los ejemplos de anticuerpos para su uso en una composición farmacéutica que se unen a un epítopo formado por las proteínas del hCMV gH, gL, UL128 y UL130 incluyen, pero no se limitan a, 8I21. Los ejemplos de anticuerpos de la invención para su uso en una composición farmacéutica que se unen a un epítopo de la proteína del hCMV gB incluyen, pero no se limitan a, 7H3, 10C6, 5F1, 6B4, 4H9 y 2B11. Los ejemplos de anticuerpos para su uso en una composición farmacéutica que se unen a un epítopo de la proteína del hCMV gH incluyen, pero no se limitan a, 11B12, 13H11 y 3G16. Los ejemplos de anticuerpos de la invención para su uso en una composición farmacéutica que se unen a un epítopo formado por las proteínas del hCMV gM y gN incluyen, pero no se limitan a, 6L3. La invención proporciona además una composición farmacéutica que comprende dos o más anticuerpos, en la que el primer anticuerpo es un anticuerpo o fragmento de anticuerpo de la invención y el segundo anticuerpo es un anticuerpo ahora conocido en la técnica, o descubierto posteriormente, que neutraliza la infección por hCMV. Los ejemplos de tales anticuerpos incluyen, pero no se limitan a, MSL-109, 8F9 o 3E3.
La divulgación proporciona una composición farmacéutica que comprende el anticuerpo 15D8 o un fragmento de unión al antígeno del mismo, y un vehículo farmacéuticamente aceptable. La divulgación proporciona una composición farmacéutica que comprende el anticuerpo 15D8 variante 1 o un fragmento de unión al antígeno del mismo, y un vehículo farmacéuticamente aceptable. La divulgación proporciona una composición farmacéutica que comprende el anticuerpo 15D8 variante 2 o un fragmento de unión al antígeno del mismo, y un vehículo farmacéuticamente aceptable. La divulgación proporciona una composición farmacéutica que comprende el anticuerpo 8I21 o un fragmento de unión al antígeno del mismo, y un vehículo farmacéuticamente aceptable.
La divulgación proporciona una composición farmacéutica que comprende el anticuerpo 2C12 o un fragmento de unión al antígeno del mismo, y un vehículo farmacéuticamente aceptable. La divulgación proporciona una composición farmacéutica que comprende el anticuerpo 8C15 o un fragmento de unión al antígeno del mismo, y un vehículo farmacéuticamente aceptable. La divulgación proporciona una composición farmacéutica que comprende el anticuerpo 9I6 o un fragmento de unión al antígeno del mismo, y un vehículo farmacéuticamente aceptable. La divulgación proporciona una composición farmacéutica que comprende el anticuerpo 7B13 o un fragmento de unión al antígeno del mismo, y un vehículo farmacéuticamente aceptable. La divulgación proporciona una composición farmacéutica que comprende el anticuerpo 8J16 o un fragmento de unión al antígeno del mismo, y un vehículo
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La divulgación proporciona una composición farmacéutica que comprende el anticuerpo 4N10 o un fragmento de unión al antígeno del mismo, y un vehículo farmacéuticamente aceptable. La divulgación proporciona una composición farmacéutica que comprende el anticuerpo 10F7 o un fragmento de unión al antígeno del mismo, y un vehículo farmacéuticamente aceptable. La divulgación proporciona una composición farmacéutica que comprende el anticuerpo 10P3 o un fragmento de unión al antígeno del mismo, y un vehículo farmacéuticamente aceptable. La divulgación proporciona una composición farmacéutica que comprende el anticuerpo 4I22 o un fragmento de unión al antígeno del mismo, y un vehículo farmacéuticamente aceptable. La divulgación proporciona una composición farmacéutica que comprende el anticuerpo 8L13 o un fragmento de unión al antígeno del mismo, y un vehículo farmacéuticamente aceptable.
En una realización, la invención proporciona una composición farmacéutica que comprende el anticuerpo 7H3 o un fragmento de unión al antígeno del mismo, y un vehículo farmacéuticamente aceptable. La divulgación proporciona una composición farmacéutica que comprende el anticuerpo 7H3 variante 1 o un fragmento de unión al antígeno del mismo, y un vehículo farmacéuticamente aceptable. En otra realización, la invención proporciona una composición farmacéutica que comprende el anticuerpo 10C6 o un fragmento de unión al antígeno del mismo, y un vehículo farmacéuticamente aceptable. En otra realización, la invención proporciona una composición farmacéutica que comprende el anticuerpo 5F1 o un fragmento de unión al antígeno del mismo, y un vehículo farmacéuticamente aceptable. En otra realización, la invención proporciona una composición farmacéutica que comprende el anticuerpo 6B4 o un fragmento de unión al antígeno del mismo, y un vehículo farmacéuticamente aceptable. En otra realización, la invención proporciona una composición farmacéutica que comprende el anticuerpo 4H9 o un fragmento de unión al antígeno del mismo, y un vehículo farmacéuticamente aceptable. La divulgación proporciona una composición farmacéutica que comprende el anticuerpo 4H9 variante 1 o un fragmento de unión al antígeno del mismo, y un vehículo farmacéuticamente aceptable. En otra realización, la invención proporciona una composición farmacéutica que comprende el anticuerpo 2B11 o un fragmento de unión al antígeno del mismo, y un vehículo farmacéuticamente aceptable.
La divulgación proporciona una composición farmacéutica que comprende el anticuerpo 13H11 o un fragmento de unión al antígeno del mismo, y un vehículo farmacéuticamente aceptable. La divulgación proporciona una composición farmacéutica que comprende el anticuerpo 11B12 o un fragmento de unión al antígeno del mismo, y un vehículo farmacéuticamente aceptable. La divulgación proporciona una composición farmacéutica que comprende el anticuerpo 3G16 o un fragmento de unión al antígeno del mismo, y un vehículo farmacéuticamente aceptable. La divulgación proporciona una composición farmacéutica que comprende el anticuerpo 6L3 o un fragmento de unión al antígeno del mismo, y un vehículo farmacéuticamente aceptable.
En una realización, las composiciones farmacéuticas de la invención pueden comprender los anticuerpos anteriores de la invención o fragmentos de unión al antígeno de los mismos, como el único principio activo. La composición farmacéutica puede comprender 2 o más, por ej., 2,3, 4, 5, 6, 7, 8 o más de los anticuerpos anteriores o fragmento de unión al antígeno del mismo. Como se describe en la presente memoria, las composiciones farmacéuticas de la invención también pueden comprender un segundo anticuerpo, o fragmento de unión al antígeno del mismo, que neutraliza la infección por hCMV.
Los anticuerpos de la invención se pueden administrar (ya sea combinados o por separado) con otros productos terapéuticos por ej., con compuestos quimioterapéuticos, con radioterapia, etc. Los compuestos terapéuticos preferidos incluyen compuestos antivíricos tales como ganciclovir, foscarnet y ciclofovir. Dicha terapia de combinación proporciona una mejora aditiva o sinérgica en la eficacia terapéutica con respecto a los agentes terapéuticos individuales cuando se administran solos. El término “sinergia” se usa para describir un efecto combinado de dos o más agentes activos que es mayor que la suma de los efectos individuales de cada agente activo respectivo. Por lo tanto, cuando el efecto combinado de dos o más agentes da como resultado la “inhibición sinérgica” de una actividad o proceso, se pretende que la inhibición de la actividad o proceso sea mayor que la suma de los efectos inhibidores de cada agente activo respectivo. La expresión “efecto terapéutico sinérgico” se refiere a un efecto terapéutico observado con una combinación de dos o más terapias en el que el efecto terapéutico (medido por cualquiera de un número de parámetros) es mayor que la suma de los efectos terapéuticos individuales observados con las respectivas terapias individuales
Los anticuerpos se pueden administrar a aquellos pacientes que previamente no han mostrado respuesta al tratamiento de la infección por hCMV, es decir que han demostrado ser resistentes al tratamiento anti-hCMV. Tal tratamiento puede incluir tratamiento previo con un agente antivírico. Esto puede ser debido, por ejemplo, a la infección con una cepa del hCMV resistente a los antivíricos.
En las composiciones de la invención que incluyen anticuerpos de la invención, los anticuerpos pueden constituir al menos 50 % en peso (por ej., 60 %, 70 %, 75 %, 80 %, 85 %, 90 %, 95 %, 97 %, 98 %, 99 % o más) de la proteína total en la composición. Los anticuerpos están así en forma purificada.
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La divulgación proporciona un método para preparar un producto farmacéutico, que comprende las etapas de: (i) preparar un anticuerpo de la invención; y (ii) mezclar el anticuerpo purificado con uno o más vehículos farmacéuticamente aceptables.
La divulgación también proporciona un método para preparar un producto farmacéutico, que comprende la etapa de mezclar un anticuerpo con uno o más vehículos farmacéuticamente aceptables, en la que el anticuerpo es un anticuerpo monoclonal que se obtuvo a partir de un linfocito B transformado de la invención. Por lo tanto, los procedimientos para obtener primero el anticuerpo monoclonal y luego preparar el producto farmacéutico pueden realizarse en momentos muy diferentes por diferentes personas en diferentes lugares (por ej., en diferentes países).
Como alternativa a la administración de anticuerpos o linfocitos B con fines terapéuticos, es posible administrar ácido nucleico (generalmente ADN) que codifica el anticuerpo monoclonal (o fragmento activo del mismo) de interés a un sujeto, de modo que el ácido nucleico se puede expresar en el sujeto in situ para proporcionar un efecto terapéutico deseado. Los vectores de administración para terapia génica y de ácidos nucleicos adecuados son conocidos en la técnica.
Las composiciones de la divulgación pueden ser composiciones inmunogénicas, y en algunas realizaciones pueden ser composiciones de vacuna que comprenden un antígeno que comprende un epítopo de la proteína del hCMV UL128, formado por las proteínas del hCMV UL130 y UL131A, formadas por las proteínas del hCMV UL128, UL130 y UL131A, formadas por las proteínas del hCMV gH, gL, UL128 y UL130, en la proteína del hCMV gB, en la proteína del hCMV gH, o formada por las proteínas del hCMV gM y gN. Las composiciones alternativas pueden comprender (i) un antígeno que comprende un epítopo formado por una combinación de proteínas del hCMV UL128, UL130 y UL131A, y (ii) un antígeno que comprende un epítopo encontrado en gB, gH, gL, gM, gN, gO, UL128, UL130 o UL131A, o una combinación de los mismos. Las vacunas de acuerdo con la invención pueden ser profilácticas (es decir para prevenir la infección) o terapéuticas (es decir para tratar la infección).
Las composiciones pueden incluir un agente antimicrobiano, particularmente si está empaquetado en un formato de dosis múltiple. Pueden comprender un detergente por ej., un Tween (polisorbato), tal como Tween 80. Los detergentes generalmente están presentes en niveles bajos por ej., <0.01 %. Las composiciones también pueden incluir sales de sodio (por ej., cloruro de sodio) para dar tonicidad. Una concentración de 10 ± 2 mg/ml de NaCl es típica.
Las composiciones pueden comprender un alcohol de azúcar (por ej., manitol) o un disacárido (por ej., sacarosa o trehalosa) por ej., a alrededor de 15-30 mg/ml (por ej., 25 mg/ml), particularmente si van a ser liofilizadas o si incluyen material que ha sido reconstituido a partir de material liofilizado. El pH de una composición para liofilización puede ajustarse a aproximadamente 6,1 antes de la liofilización.
Las composiciones también pueden comprender uno o más agentes inmunorreguladores. En una realización, uno o más de los agentes inmunorreguladores incluyen un adyuvante.
Las composiciones de epítopo pueden provocar tanto una respuesta inmunitaria mediada por células como una respuesta inmunitaria humoral con el fin de atacar eficazmente una infección por hCMV. Esta respuesta inmunitaria puede inducir anticuerpos de larga duración (por ej., neutralizantes) y una inmunidad mediada por células que puede responder rápidamente después de la exposición al hCMV.
Tratamientos y usos médicos
Los anticuerpos, fragmentos de anticuerpos de la invención o derivados y variantes de los mismos se pueden usar para el tratamiento de la infección por hCMV, para la prevención de la infección por hCMV o para el diagnóstico de la infección por hCMV.
Los métodos de diagnóstico pueden incluir poner en contacto un anticuerpo o un fragmento de anticuerpo con una muestra. Tales muestras pueden ser muestras de tejido tomadas de, por ejemplo, glándulas salivales, pulmón, hígado, páncreas, riñón, oreja, ojo, placenta, tracto alimentario, corazón, ovarios, hipófisis, glándulas suprarrenales, tiroides, cerebro o piel. Los métodos de diagnóstico también pueden incluir la detección de un complejo antígeno/anticuerpo.
Por lo tanto, la divulgación proporciona (i) un anticuerpo, un fragmento de anticuerpo o variantes y derivados del mismo de acuerdo con la invención, (ii) un clon de linfocitos B inmortalizado de acuerdo con la invención, (iii) un epítopo capaz de unirse a un anticuerpo de la invención o (iv) un ligando, preferiblemente un anticuerpo, capaz de unirse a un epítopo que se une a un anticuerpo de la invención para su uso en terapia.
También se divulga un método para tratar a un paciente que comprende administrar a ese paciente (i) un anticuerpo, un fragmento de anticuerpo, o variantes y derivados del mismo de acuerdo con la invención, o un ligando, preferiblemente un anticuerpo, capaz de unirse a un epítopo que se une un anticuerpo de la invención.
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La invención también proporciona el uso de (i) un anticuerpo o un fragmento de anticuerpo de acuerdo con la invención en la fabricación de un medicamento para el tratamiento de la infección por hCMV.
La invención proporciona un anticuerpo o fragmento de anticuerpo de la invención, un ácido nucleico de la invención o una composición de la invención para su uso en el tratamiento de la infección por hCMV. La divulgación también proporciona el uso de un anticuerpo y/o una proteína que comprende un epítopo al que se une dicho anticuerpo en la fabricación de un medicamento para el tratamiento de un paciente y/o diagnóstico en un paciente. También proporciona un método para tratar un sujeto que necesita tratamiento, que comprende la etapa de administrar una composición de la invención al sujeto. En algunas realizaciones, el sujeto puede ser un ser humano. Una forma de verificar la eficacia del tratamiento terapéutico implica controlar los síntomas de la enfermedad después de la administración de la composición de la invención. El tratamiento puede ser un esquema de dosis única o un esquema de dosis múltiples.
En una realización, un anticuerpo, un fragmento de unión al antígeno del mismo, un epítopo o una composición de la invención se administra a un sujeto que necesita dicho tratamiento profiláctico o terapéutico. Tal sujeto incluye, pero no se limita a, alguien que está particularmente en riesgo de infección por hCMV o es susceptible a ella. Los ejemplos de sujetos incluyen, pero no se limitan a, sujetos inmunodeprimidos o mujeres embarazadas hCMV- seronegativas o infectadas recientemente con el hCMV. Los ejemplos de sujetos inmunodeprimidos incluyen, pero no se limitan a, aquellos afectados por el VIH o aquellos sometidos a terapia inmunosupresora.
Los anticuerpos y fragmentos de unión al antígeno de los mismos también se pueden usar en la inmunización pasiva. Además, también se pueden usar en un kit para el diagnóstico de la infección por hCMV.
Los epítopos capaces de unirse a un anticuerpo, por ejemplo, los anticuerpos monoclonales 15D8, 4N10, 10F7, 10P3, 4I22, 8L13, 2C12, 8C15, 9I6, 7B13, 8J16, 8I21, 7I13, 7H3, 6B4, 5F1, 10C6, 4H9, 2B11, 11B12, 13H11, 3G16, y 6L3 se pueden usar en un kit para controlar la eficacia de los procedimientos de vacunación detectando la presencia de anticuerpos anti-hCMV protectores.
Los anticuerpos, fragmentos de anticuerpos, o variantes y derivados de los mismos, como se describe en la presente memoria, también pueden usarse en un kit para controlar la fabricación de vacunas con la inmunogenicidad deseada.
La divulgación también proporciona un método para preparar un producto farmacéutico, que comprende la etapa de mezclar un anticuerpo monoclonal con uno o más vehículos farmacéuticamente aceptables, en la que el anticuerpo monoclonal es un anticuerpo monoclonal que se obtuvo a partir de un hospedador de expresión de la invención. Por lo tanto, los procedimientos para obtener primero el anticuerpo monoclonal (por ej., expresarlo y/o purificarlo) y luego mezclarlo con el vehículo o los vehículos farmacéuticos se puede realizar en momentos muy diferentes por diferentes personas en diferentes lugares (por ej., en diferentes países).
Comenzando con un linfocito B transformado de la invención, se pueden realizar varias etapas de cultivo, subcultivo, clonación, subclonación, secuenciación, preparación de ácido nucleico etc. con el fin de perpetuar el anticuerpo expresado por el linfocito B transformado, con optimización opcional en cada etapa. En una realización preferida, los métodos anteriores comprenden además técnicas de optimización (por ej., afinidad de maduración u optimización) aplicadas a los ácidos nucleicos que codifican el anticuerpo. La invención abarca todas las células, ácidos nucleicos, vectores, secuencias, anticuerpos etc. usados y preparados durante tales etapas.
En todos estos métodos, el ácido nucleico usado en el hospedador de expresión puede manipularse para insertar, eliminar o modificar ciertas secuencias de ácido nucleico. Los cambios de dicha manipulación incluyen, pero no se limitan a, cambios para introducir sitios de restricción, para modificar el uso de codones, para añadir u optimizar secuencias reguladoras de la transcripción y/o traducción, etc. También es posible cambiar el ácido nucleico para alterar los aminoácidos codificados. Por ejemplo, puede ser útil introducir uno o más (por ej., 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, etc.) sustituciones, deleciones y/o inserciones de aminoácidos en la secuencia de aminoácidos del anticuerpo. Tales mutaciones puntuales pueden modificar las funciones efectoras, la afinidad de unión al antígeno, las modificaciones postraduccionales, la inmunogenicidad, etc., pueden introducir aminoácidos para la unión de grupos covalentes (por ej., marcadores) o pueden introducir etiquetas (por ej., para fines de purificación). Las mutaciones se pueden introducir en sitios específicos o se pueden introducir al azar, seguido de selección (por ej., evolución molecular). Por ejemplo, uno o más ácidos nucleicos que codifican cualquiera de las regiones CDR, regiones variables de la cadena pesada o regiones variables de cadena ligera de anticuerpos pueden mutarse al azar o direccionalmente para introducir diferentes propiedades en los aminoácidos codificados. Dichos cambios pueden ser el resultado de un proceso iterativo en el que se retienen los cambios iniciales y se introducen nuevos cambios en otras posiciones de nucleótidos. Además, los cambios logrados en etapas independientes pueden combinarse. Las diferentes propiedades introducidas en los aminoácidos codificados pueden incluir, pero no se limitan a, afinidad mejorada.
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Generalidades
El término “que comprende” abarca “que incluye” así como “que consiste” por ej., una composición “que comprende” X puede consistir exclusivamente en X o puede incluir algo adicional por ej., X + Y.
La palabra “sustancialmente” no excluye “completamente” por ej., una composición que está “sustancialmente exenta” de Y puede estar completamente exenta de Y. Cuando sea necesario, la palabra “sustancialmente” puede omitirse de la definición de la invención.
El término “aproximadamente” en relación con un valor numérico x significa, por ejemplo, x ± 10 %.
El término “enfermedad” como se usa en la presente memoria pretende ser generalmente sinónimo, y se usa indistintamente con los términos “trastorno” y “afección” (como en afección médica), ya que todos reflejan una condición anormal del cuerpo humano o animal o de una de sus partes que deteriora el funcionamiento normal, se manifiesta generalmente por signos y síntomas distintivos, y hace que el ser humano o animal tenga una duración o calidad de vida reducida.
Como se usa en la presente memoria, la referencia al “tratamiento” de un paciente pretende incluir prevención y profilaxis. El término “paciente” significa todos los mamíferos, incluidos los seres humanos. Los ejemplos de pacientes incluyen seres humanos, vacas, perros, gatos, caballos, cabras, ovejas, cerdos y conejos. En general, el paciente es un ser humano.
Ejemplos
Las realizaciones de ejemplo de la presente invención se proporcionan en los siguientes ejemplos. Los siguientes ejemplos se presentan solo a modo de ilustración y para ayudar a un experto de conocimientos comunes en la materia en el uso de la invención. Los ejemplos no están destinados de ninguna manera a limitar de otro modo el alcance de la invención.
Ejemplo 1: clonación de linfocitos B y selección de actividad neutralizante de hCMV
Se identificaron donantes con altos títulos de anticuerpos neutralizantes de hCMV en el suero. Los linfocitos B de memoria se aislaron e inmortalizaron usando EBV y CpG como se describe en la referencia 36. Brevemente, los linfocitos B de memoria se aislaron mediante selección negativa usando perlas CD22, seguido de la eliminación de linfocitos B IgM+, IgD+ IgA+ usando anticuerpos específicos y clasificación de células. Las células clasificadas (IgG+) se inmortalizaron con EBV en presencia de CpG 2006 y se irradiaron las células mononucleares alogénicas. Los cultivos replicados que contenían cada uno 50 linfocitos B de memoria se establecieron en veinte placas de fondo U de 96 pocillos. Después de dos semanas, los sobrenadantes de cultivo se recogieron y se analizaron en cuanto a su capacidad para neutralizar la infección por hCMV de fibroblastos o células epiteliales en ensayos separados. Los clones de linfocitos B se aislaron a partir de cultivos policlonales positivos como se describe en la referencia 36. Las concentraciones de IgG en el sobrenadante de los clones seleccionados se determinaron usando un ELISA específico de IgG.
Para el ensayo de neutralización vírica, se mezcló una cantidad titulada de un aislado de hCMV clínico con un volumen igual de sobrenadante de cultivo o con diluciones de sueros humanos que contenían anticuerpos neutralizantes. Después de 1 hora de incubación a temperatura ambiente, la mezcla se añadió a monocapas confluyentes de células endoteliales (por ej., células HUVEC o células HMEC-1), células epiteliales (por ej., células retinianas ARPE), fibroblastos (por ej., mRC-9 o células estromales mesenquimales) o células mieloides (por ej., células dendríticas derivadas de monocitos) en placas de 96 pocillos de fondo plano y se incubaron a 37 °C durante dos días. El sobrenadante se descartó, las células se fijaron con metanol frío y se tiñeron con una mezcla de anticuerpos monoclonales de ratón contra antígenos tempranos del hCMV, seguido de una Ig anti-ratón de cabra marcada con fluoresceína. Las placas se analizaron usando un microscopio de fluorescencia. En ausencia de anticuerpos neutralizantes, las células infectadas fueron de 100-1.000/campo, mientras que en presencia de concentraciones saturantes de anticuerpos neutralizantes, la infección se inhibió por completo. El título neutralizante se indica como la concentración de anticuerpo (pg/ml) que proporciona una reducción del 50 % o del 90 % de la infección por hCMV.
La Tabla 5A muestra la neutralización de un aislado clínico del hCMV (VR1814) tanto en una línea celular fibroblástica (MRC-9) como en una línea celular epitelial retiniana humana (ARPE). Algunos anticuerpos neutralizaron la infección por hCMV de las células epiteliales (ARPE) pero no neutralizaron la infección de los fibroblastos (MRC-9). Esto concuerda con los datos previos de que las diferentes proteínas son responsables del tropismo hacia un tipo de célula particular [7]. La mayoría de estos anticuerpos, que son específicos de una o más proteínas del complejo proteico gH/gL/UL128/UL130/UL131A, neutralizaron la infección por hCMV de las células epiteliales a concentraciones muy bajas (50 % de reducción de la infección por hCMV en concentraciones que varían de 0,01 pg/ml y 0,001 pg/ml). Otros anticuerpos, que son específicos de la proteína del hCMV gB, gH o una combinación de gM y gN, neutralizaron la infección por hCMV de fibroblastos y células epiteliales con potencia
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comparable. Estos resultados muestran que algunos de los anticuerpos neutralizantes del hCMV son igualmente potentes tanto en fibroblastos como en células epiteliales, mientras que otros muestran actividad diferencial en los dos tipos de células.
Basándose en el análisis mostrado en la Tabla 5A, los anticuerpos se agruparon en el Grupo 1 (infección por hCMV neutralizante de fibroblastos y células epiteliales) y el Grupo 2 (infección por hCMV neutralizante de células epiteliales). La Tabla 5B muestra un experimento independiente realizado usando anticuerpos purificados. Los resultados muestran que los anticuerpos del Grupo 2 neutralizaron la infección de células epiteliales con valores de CI90 (es decir, la concentración de anticuerpo necesaria para lograr una reducción del 90 % de la infección vírica) que varían de 0,007 pg/ml a 0,003 pg/ml mientras que los anticuerpos del Grupo 1 neutralizaron la infección tanto de fibroblastos como de células epiteliales con valores de CI90 que varían de 0,1 pg/ml a 30 pg/ml. Los anticuerpos del Grupo 2 también neutralizaron la infección de células endoteliales (HUVEC) y células mieloides (células dendríticas derivadas de monocitos) (datos no mostrados). Los anticuerpos del Grupo 1 también neutralizaron la infección de células endoteliales (HUVEC), células mieloides (células dendríticas derivadas de monocitos) y células del estroma mesenquimal de médula ósea, como se muestra para algunos anticuerpos representativos en la Tabla 5C. Los anticuerpos de la invención también neutralizaron la infección de células endoteliales (HUVEC) por diferentes aislados clínicos del hCMV: VR6952 (de orina), VR3480B1 (de sangre, resistente a ganciclovir) y VR4760 (de sangre, resistente a ganciclovir y foscarnet) (datos no mostrados). )
Se prevé que los anticuerpos que neutralizan la infección de diferentes tipos de células pueden combinarse para producir un efecto de neutralización aditivo o sinérgico cuando los diferentes tipos de células están presentes durante la infección. Como ejemplo, un anticuerpo neutralizante, tal como 15D8 que es potente para neutralizar la infección de células epiteliales pero que no neutraliza la infección de fibroblastos podría combinarse con 3G16 que tiene actividad neutralizante de virus en fibroblastos. Como otro ejemplo, un anticuerpo neutralizante, tal como 9I6 que es potente para neutralizar la infección de células epiteliales pero no neutraliza la infección de fibroblastos, podría combinarse con 6B4 que tiene actividad neutralizante de virus en fibroblastos.
Tabla 5A
- Neutralización 50 %(1) Neutralización 50 %(1)
- mAb
- Donante Especificidad*21 MRC-9 ARPE
- 15D8
- GRA UL128 - + + + +
- 4N10
- GIO UL130/UL131A + + + + +
- 10F7
- PAP UL130/UL131A + + + +
- 10P3
- PEL UL130/UL131A - + + + +
- 4122
- PEL UL130/UL131A - + + +
- 8L13
- PEL UL130/UL131A - + + +
- 2C12
- PAP UL128/UL130/UL131A + + + +
- 7B13
- PAP UL128/UL130/UL131A - + + + +
- 7113
- PAP UL128/UL130/UL131A - + + +
- 8C15
- PAP UL128/UL130/UL131A - + + + +
- 8J16
- PAP UL128/UL130/UL131A - + + + +
- 916
- PEL UL128/UL130/UL131A - + + + +
- 8121
- PEL gH/gL/UL128/UL130 - + + +
- 11B12
- PAP gH + +
- 13H11
- GRA gH + + + +
- 3G16
- PEL gH + +
- 7H3
- PEL gB + -
- 10C6
- PEL gB + +
- 5F1
- PEL gB + +
- 6B4
- PEL gB + +
- 4H9
- PEL gB + +
- 6L3
- PEL gM/gN No realizado +
- 1) Valores que indican la concentración de anticuerpo necesaria para proporcionar una reducción del 50% de la
- infección por hCMV de los fibroblastos (por ej., MRC-9) o células epiteliales (por ej., La concentración es como se indica a continuación:
- células retinianas ARPE).
++++ <0,001 pg/ml; +++ <0,01 pg/ml; ++ <0,1 pg/ml; + < 2 pg/ml; - No neutralizante a la concentración más alta probada (2 pg/ml). 2) Especificidad como se define en la Tabla 6.
Tabla 5B
- Neutralización 90 %(1) Neutralización 90 %(1)
- Grupo
- mAb Donante Especificidad*21 MRC-9 ARPE
- 2
- 15D8 GRA UL128 nn(3) 0,008
- 2
- 4N10 GIO UL130/UL131A Nn 0,02
- 2
- 10F7 PAP UL130/UL131A Nn 0,002
- 2
- 10P3 PEL UL130/UL131A Nn 0,0025
- 2
- 4122 PEL UL130/UL131A Nn 0,0015
- 2
- 8L13 PEL UL130/UL131A Nn 0,001
- 2
- 2C12 PAP UL128/UL130/UL131A Nn 0,006
- 2
- 7B13 PAP UL128/UL130/UL131A Nn 0,003
- 2
- 7113 PAP UL128/UL130/UL131A Nn 0,008
- 2
- 8C15 PAP UL128/UL130/UL131A Nn 0,0025
- 2
- 8J16 PAP UL128/UL130/UL131A Nn 0,0008
- 2
- 916 PEL UL128/UL130/UL131A Nn 0,0007
- 2
- 8121 PEL gH/gL/UL128/UL130 Nn 0,03
- 1
- 11B12 PAP gH 3,5 1,2
- 1
- 13H11 GRA gH 1,12 0,4
- 1
- 3G16 PEL gH 1,0 0,3
- 1
- 7H3 PEL gB 3 0,6
- 1
- 10C6 PEL gB 0,75 0,2
- 1
- 5F1 PEL gB 0,5 0,1
- 1
- 6B4 PEL gB 1,0 0,15
- 1
- 4H9 PEL gB 10 0,4
- 1
- 2B11 PEL gB 0,75 0,2
- 1
- 6L3 PEL gM/gN 30 10
- 1) Los valores que indican la concentración de anticuerpo en pg/ml requerida para proporcionar una reducción del 90% de la infección por hCMV (VR1814) de los fibroblastos (p,ej, MRC-9) o células epiteliales (p,ej, células retinianas ARPE), 2) Especificidad como se define en la Tabla 6, 3) nn, no neutralizante a la concentración más alta probada (10 pg/ml),
Tabla 5C
- Neutralización 50 %(1)
- Grupo
- mAb Especificidad HUVEC Mo-DC BM-MSC
- 1
- 7H3 gB nd 0.06 2
- 1
- 10C6 gB 0,19 0,02 0,3
- 1
- 5F1 gB 0,21 0,05 0,3
- 1
- 6B4 gB nd 0,11 2
- 1) Los valores que indican la concentración de anticuerpo en pg/ml requerida para proporcionar una reducción del 50% de la infección por hCMV (VR1814) de las células primarias. HUVEC, células endoteliales de vena umbilical humana, Mo-DC, células dendríticas derivadas de monocitos, BM-MSC, células estromales de médula ósea mesenquimales.
Ejemplo 2: Identificación de los antígenos diana reconocidos por los anticuerpos monoclonales
Para cartografiar la especificidad de los anticuerpos neutralizantes del hCMV, se transfectaron células HEK293T con uno o más vectores que codifican las proteínas del hCMV de longitud completa UL128, UL130, UL131A, gH, gL, gB, gM y gN. Después de 36 h, las células se fijaron, se permeabilizaron y se tiñeron con los anticuerpos monoclonales humanos seguido de IgG anti-humana de cabra. La Figura 1 muestra la unión de anticuerpos representativos a 5 células HEK293T que expresan una o más proteínas del hCMV. La Tabla 6 muestra el patrón de tinción de todos los diferentes anticuerpos contra células HEK293T transfectadas con el gen del hCMV. Con la excepción del anticuerpo 15D8, que teñía las células transfectadas con UL128, todos los otros anticuerpos del Grupo 2 no tiñeron transfectantes de un solo gen, lo que sugiere que pueden reconocer epítopos que requieren la coexpresión de más de un producto génico. De hecho, cinco anticuerpos (4N10, 10F7, 10P3, 4I22 y 8L13) teñían células que 10 coexpresaban UL130 y UL131A, seis anticuerpos (2C12, 7B13, 7I13, 8C15, 8J16 y 9I6) teñían células que coexpresaban UL128, UL130 y UL131A, y un anticuerpo (8I21) teñía células transfectadas con UL128 y UL130 así como con gH y gL. Todos estos anticuerpos también tiñeron las células HEK293T transfectadas con todos los genes que forman el complejo gH/gL/UL128-130. Entre los anticuerpos del Grupo 1, tres (11B12, 13H11 y 3G16) teñían células que expresan la proteína del hCMV gH, seis (7H3, 10C6, 5F1, 6B4, 4H9 y 2B11) teñían células que 15 expresaban la proteína del hCMV gB y uno (6L3) teñía células que coexpresaban las proteínas del hCMV gM y gN.
Tabla 6
- Anticuerpo monoclonal
- Grupo 2 Grupo 1
- 15D8 4N10 2C12 8121 11B12 7H3 6L3
- Células HEK293T transfectadas con:
- 10F7 7B13 13H11 10C6
- 10P3 7113 3G16 5F1
- 4122 8C15 6B4
- 8L13 8J16 4H9
- 916 2B11
- UL128
- + - - - - - nd(1)
- UL130
- - - - - - - nd
- UL131A
- - - - - - - nd
- UL128+UL130
- + - - - - - nd
- UL128+UL131A
- + - - - - - nd
- UL130+UL131A
- - + - - - - nd
- UL128+UL130+UL131A
- + + + - - - -
- gH
- - - - - + - -
- gH+gL
- - - - - + - -
- gH+UL128+UL130+UL131A
- + + + - + nd nd
- gL+UL128+UL130+UL131A
- + + + - - nd nd
- gH+gL+UL128
- + - - - + nd nd
- gH+gL+UL130
- - - - - + nd nd
- gH+gL+UL131A
- - - - - + nd nd
- gH+gL+UL128+UL130
- + - - + + nd nd
- gH+gL+UL128+UL130+UL131A
- + + + + + - -
- gB
- - - - nd - + -
- gM
- nd - - nd nd nd -
- gN
- nd - - nd nd nd -
- gM+gN
- - - - - nd nd +
- 1) nd, no realizado
Para explorar adicionalmente la identidad de los sitios de antígeno a los que se unen los anticuerpos, se realizaron 20 experimentos de competición cruzada. Aquí, las células HEK293T se transfectaron con vectores que codifican las proteínas del hCMV de longitud completa gH, gL, UL128, UL130 y UL131A. Las células se incubaron a continuación con un exceso de 20 veces de un anticuerpo neutralizante del hCMV competidor antes de la adición de un anticuerpo biotinilado. Este procedimiento se repitió varias veces con diferentes anticuerpos competidores y anticuerpos biotinilados. En estos experimentos se incluyeron cuatro anticuerpos descritos en la Solicitud de patente
Tabla 7A
- Competidor (exceso 20 veces)
- Especificidad 11 Inhibición de la unión (%)
- UL128/UL130/UL131A 15D8-biotina 4N10-biotina 10F7-biotina 4122-biotina 1F11 -biotína 2F4-biotina 5A2-biotina
- 15D8
- UL128 100 0 0 0 0 0 0
- 4N10
- UL130/UL131A 0 100 0 0 0 0 100
- 10F7
- UL130/UL131A 0 0 100 100 100 100 0
- 10P3
- UL130/UL131A 0 nd nd 0 0 0 Nd
- 4122
- UL130/UL131A nd 0 100 100 100 100 0
- 8L13
- UL130/UL131A nd nd 100 nd 100 Nd nd
- 1F11
- UL130/UL131A 0 0 100 100 100 100 0
- 2F4
- UL130/UL131A nd 0 100 100 100 100 0
- 5A2
- UL130/UL131A nd 100 0 0 0 50<2' 100
- 2C12
- UL128/UL130/UL131A 0 0 0 0 0 0 0
- 7B13
- UL128/UL130/UL131A nd nd nd nd nd nd nd
- 7113
- UL128/UL130/UL131A nd nd nd nd 0 nd nd
- 8C15
- UL128/UL130/UL131A nd nd nd 0 nd nd nd
- 8J16
- UL128/UL130/UL131A nd nd nd 0 0 0 nd
- 916
- UL128/UL130/UL131A nd nd Nd 0 0 0 nd
- 6G4
- UL128/UL130/UL131A 0 0 0 0 0 0 0
- 8121
- gH/gL/UL128/UL130 0 90 nd 0 0 0 95
- 1) Especificidad tal como se define es la Tabla 6. 2) La competencia por debajo del 100% puede deberse al solapamiento parcial de los epitopos o al impedimento estérico o a una menor afinidad.
N.° 11/ 969,104 publicada como US 2008/0213265 (IF11, 2F4 y 5A2) y en la Solicitud de patente N.° 12/174,568 publicada como US 2009/0081230 (6G4). Los datos se muestran en la Tabla 7A, B.
Tabla 7B
- Inhibición de la unión (%)
- Competidor (exceso 20 veces)
- Especificidad111 2C12- biotina 8C15- biotina 8J16- biotina 916- biotina 6G4- biotina 8121- biotina
- 15D8
- UL128 0 nd Nd nd 0 0
- 4N10
- UL130/UL131A 0 nd Nd nd 0 90(2)
- 10F7
- UL130/UL131A 0 nd Nd nd 0 0
- 10P3
- UL130/UL131A 0 nd Nd nd 0 0
- 4122
- UL130/UL131A 0 nd 0 nd nd 0
- 8L13
- UL130/UL131A nd nd Nd nd nd nd
- 1F11
- UL130/UL131A 0 nd Nd nd 0 0
- 2F4
- UL130/UL131A 0 nd Nd 0 0 0
- 5A2
- UL130/UL131A 0 nd Nd 0 0 92
- 2C12
- UL128/UL130/UL131A 100 100 100 100 100 0
- 7B13
- UL128/UL130/UL131A 100 100 100 100 100 0
- 7113
- UL128/UL130/UL131A 0 0 0 0 0 0
- 8C15
- UL128/UL130/UL131A 100 100 100 100 100 0
- 8J16
- UL128/UL130/UL131A 100 100 100 70 100 0
- 916
- UL128/UL130/UL131A 100 100 100 100 100 0
- 6G4
- UL128/UL130/UL131A 100 100 100 100 100 0
- 8121
- gH/gL/UL128/UL130 0 nd Nd nd 0 100
- 3G16
- gH 0 nd Nd nd 0 0
- 1) Especificidad tal como se define es la Tabla 6. 2) La competencia por debajo del 100 % puede deberse al solapamiento parcial de los epítopos o a impedimento estérico o a una menor afinidad.
Basándose en los datos de la Tabla 7A, B, se pueden distinguir al menos siete sitios antigénicos distintos en el complejo del hCMV formado por gH, gL, UL128 y UL130 (Tabla 8). El sitio 1 está presente en UL128 y está definido 5 por el anticuerpo 15D8. Los sitios 2 a 4 están formados por la combinación de UL130 y UL131A y están definidos por los anticuerpos 10F7, 4I22, 8L13, 1F11 y 2F4 (sitio 2), por 4N10 y 5A2 (sitio 3), y por 10P3 (sitio 4), respectivamente. Los sitios 5 y 6 están formados por la combinación de UL128, UL130 y UL131A y están definidos por los anticuerpos 2C12, 7B13, 8C15, 8J16, 9I6 y 6G4 (sitio 5) y por 7I13 (sitio 6), respectivamente. Finalmente, el sitio 7 está formado por la combinación de gH, gL, UL128 y UL130 y está definido por el anticuerpo 8I21. Los 10 anticuerpos que definen el sitio 7 y el sitio 3 compitieron parcialmente entre sí, lo que sugiere que estos sitios pueden estar próximos en la estructura del complejo gH/gL/UL128-131A.
Se anticipa que los anticuerpos neutralizantes dirigidos a diferentes epítopos en la misma diana se pueden usar en combinación para lograr una neutralización robusta de la infección del virus, como se ejemplifica por 10F7 y 4N10 o 15 por 8J16 y 7I13. Además, se prevé que los anticuerpos neutralizantes dirigidos a diferentes moléculas diana o combinaciones de moléculas diana se puedan usar juntos para lograr una neutralización robusta del virus. Como un ejemplo, la Tabla 8 sugiere que 15D8 y 10F7, 15D8 y 2C12, u 8J16 y 8I21 podrían combinarse para producir efectos de neutralización del hCMV aditivos o sinérgicos.
20 Tabla 8
- Antígeno diana
- Sitio antigénico Anticuerpos que definen el sitio antigénico
- UL128
- 1 15D8
- UL130/UL131A
- 2 10F7, 4I22, 8L13, 1F11,2F4
- UL130/UL131A
- 3 4N10, 5A2
- UL130/UL131A
- 4 10P3
- UL128/UL130/UL131A
- 5 2C12, 7B13, 8C15, 8J16, 916, 6G4
- UL128/UL130/UL131A
- 6 7I13
- g H/g L/UL128/UL130
- 7 8I21
De una manera similar a la descrita en la Tabla 7, las células HEK293T se transfectaron con un vector que codifica gH de longitud completa para examinar la unión de competición cruzada de los anticuerpos anti-gH. Como puede verse en la Figura 2a y en la Tabla 9, se identificaron al menos dos sitios de unión diferentes en la proteína del hCMV gH. El anticuerpo 3G16 define un sitio y los anticuerpos 11B12 y 13H11 definen un segundo sitio. Finalmente, 5 las células HEK293T se transfectaron con un vector que codificaba gB de longitud completa para examinar la unión de competición cruzada de los anticuerpos anti-gB. Como se puede ver en la Figura 2B y la Tabla 10, se identificaron al menos tres sitios antigénicos diferentes en la proteína del hCMV gB. El anticuerpo 6B4 define un sitio, 7H3 define un segundo sitio y el conjunto de 10C6, 5F1, 4H9 y 2B11 define un tercer sitio. El anticuerpo 6B4 (que reconoce el sitio 1 de la gB) reaccionó mediante ELISA con el péptido gB 69-78 (CE50 de 0,044 pg/ml). Se 10 prevé que los anticuerpos que se dirigen a sitios diferentes incluso en la misma molécula diana se puedan usar en combinación para lograr una neutralización robusta del virus.
Tabla 9
- Inhibición de la unión (%) de:
- Competidor (exceso 20 veces)
- Especificidad'1 3G16-biotina 11B12-biotina 13H11-biotina Sitio antigénico en gH
- 3G16
- gH 100 0 0 1
- 11B12
- gH 0 100 100 2
- 13H11
- gH 0 100 100 2
- 1) Como se define en la Tabla 6
15 Tabla 10
- Inhibición de la unión (%) de:
- Competidor (exceso 20 veces)
- Especificidad11’ 7H3- biotina 10C6- biotina 5F1- biotina 6B4- biotina 4H9- biotina 2B11- biotina Sitio antigénico en gH
- 6B4
- gB 0 0 0 100 0 0 1
- 7H3
- gB 100 0 0 0 0 0 2
- 10C6
- gB 0 100 100 0 100 100 3
- 5F1
- gB 0 100 100 0 100 100 3
- 4H9
- gB 0 100 100 0 100 100 3
- 2B11
- gB 0 100 100 0 100 100 3
- 1) Como se define en la Tabla 6. 2) La competencia por debajo del 100 % puede deberse a una superposición parcial de epítopos, a impedimento estérico o a una menor afinidad.
Como resumen, 15D8 se une a un epítopo de UL128 que es distinto del epítopo reconocido por 2C12, 7B13, 6G4 (todos ellos específicos de una combinación de UL128, UL130 y UL131A) y del epítopo reconocido por 8I21 (específico de una combinación de gH, gL, UL128 y UL130). Además, la unión de 15D8 a su epítopo no es inhibida 20 por 4N10, 10F7, 10P3 y 1F11 (todos ellos específicos de una combinación de UL130 y UL131A).
4N10 se une a un epítopo que requiere la expresión de UL130 y UL131A y que es igual o se solapa en gran medida a los epítopos reconocidos por 5A2 (específico de una combinación de UL130 y UL131A) y 8I21 (específico de una combinación de gH, gL, UL128 y UL130 ) pero distinto de los epítopos reconocidos por 10F7, 4I22, 1F11, 2F4 (todos 25 ellos específicos de una combinación de UL130 y UL131A), 2C12 y 6G4 (ambos específicos de una combinación de
UL128, UL130 y UL131A). Además, la unión de 4N10 a su epítopo no es inhibida por 15D8 (específico de UL128).
10F7 se une a un epítopo que requiere la expresión de UL130 y UL131A que es igual o se solapa en gran medida con el epítopo o los epítopos reconocidos por 4I22, 8L13, 1F11 y 2F4 pero distinto del epítopo o epítopos 30 reconocidos por 4N10 y 5A2 (ambos específicos de una combinación de UL130 y UL131A), así como distinto de los
epítopos reconocidos por 2C12 y 6G4 (ambos específicos de una combinación de UL128, UL130 y UL131A). Además, la unión de 10F7 a su epítopo no es inhibida por 15D8 (específico de UL128) o por 13H11 (específico de gH).
35 4122 se une a un epítopo que requiere la expresión de UL130 y UL131A y que es igual o que se solapa
parcialmente al epítopo o epítopos reconocidos por 2F4, 1F11 y 10F7 pero distinto del epítopo o epítopos reconocidos por 4N10, 10P3 y 5A2 (todos ellos específicos de un combinación de UL130 y UL131A) y distinto de los epítopos reconocidos por 2C12, 8C15, 8J16, 9I6, 6G4 (todos ellos específicos de una combinación de UL128,
5
10
15
20
25
30
35
40
45
50
55
60
65
UL130 y UL131A) y 8I21 (específico de una combinación de gH, gL, UL128 y UL130. Además, la unión de 4122 a su epítopo no es inhibida por los anticuerpos 15D8 (específico de UL128) o por 13H11 (específico de gH).
2C12 se une a un epítopo que requiere la expresión de los productos de los genes del hCMV UL128, UL130 y UL131A y que es el mismo o se solapa en gran parte con el epítopo o epítopos reconocidos por 7B13, 8C15, 8J16, 9I6 y 6G4 pero distinto del epítopo reconocido por 7I13 (todos ellos específicos de una combinación de UL128, UL130 y UL131A) y distinto del epítopo o epítopos reconocidos por 15D8 (específico de UL128), 4N10, 10F7, 10P3, 4I22, 8L13, 1F11, 2f4, 5A2 (todos ellos específicos de una combinación de UL130 y UL131A) y 8I21 (específico de una combinación de gH, gL, UL128 y UL130). Además, la unión de 2C12 a su epítopo no es inhibida por 3G16 (específico de gH).
8C15 se une a un epítopo que requiere la expresión de los productos de los genes del hCMV UL128, UL130 y UL131A y que es el mismo o se solapa en gran parte con el epítopo o epítopos reconocidos por 2C12, 7B13, 8J16, 9I6 y 6G4 pero distinto del epítopo reconocido por 7I13 (todos ellos específicos de una combinación de UL128, UL130 y UL131A).
8J16 se une a un epítopo que requiere la expresión de los productos de los genes del hCMV UL128, UL130 y UL131A y que es el mismo o se solapa en gran parte con el epítopo o epítopos reconocidos por 2C12, 7B13, 8C15, 9I6 y 6G4, pero distinto del epítopo reconocido por 7I13 (todos específicos de una combinación de UL128, UL130 y UL131A) y del epítopo reconocido por 4I22 (específico de una combinación de UL130 y UL131A).
9I6 se une a un epítopo que requiere la expresión de los productos de los genes del hCMV UL128, UL130 y UL131A y que es el mismo o se solapa en gran parte con el epítopo o epítopos reconocidos por 2C12, 7B13, 8C15, 8J16 y 6G4 pero distinto del epítopo reconocido por 7I13 (todos ellos específicos de una combinación de UL128, UL130 y UL131A) y de los epítopos reconocidos por 2F4 y 5A2 (específicos de una combinación de UL130 y UL131A).
8I21 se une a un epítopo que requiere la expresión de los productos de los genes del hCMV gH, gL, UL128 y UL130 y que puede solaparse parcialmente con el epítopo o epítopos reconocidos por 4N10 y 5A2 (ambos específicos de una combinación de UL130 y UL131A) pero distinto de los epítopos reconocidos por 15D8 (específico de UL128), 10F7, 10P3, 4I22, 1F11, 2F4 (todos ellos específicos de una combinación de UL130 y UL131A), 2C12, 7B13, 7I13, 8C15, 8J16, 9I6 y 6G4 (todos ellos específicos de una combinación de UL128, UL130 y UL131A). Además, la unión de 8I21 su epítopo no es inhibida por 3G16 (específico de gH).
3G16 se une a un epítopo de gH que es distinto del epítopo o epítopos reconocidos por 11B12 y 13H11 (ambos específicos de gH).
11B12 se une a un epítopo de gH que es igual o se solapa en gran parte con el epítopo reconocido por 13H11 y distinto de los epítopos reconocidos por 3G16 (ambos específicos de gH).
13H11 se une a un epítopo de gH que es igual o se solapa en gran parte con el epítopo reconocido por 11B12 y distinto de los epítopos reconocidos por 3G16 (ambos específicos de gH).
6B4 reconoce un epítopo de gB que es distinto del epítopo o epítopos reconocidos por 7H3, 4H9, 5F1, 10C6 y 2B11 (todos ellos específicos de gB).
7H3 se une a un epítopo de gB que es distinto del epítopo o epítopos reconocidos por 6B4, 7H3, 4H9, 5F1, 10C6 y 2B11 (todos ellos específicos de gB).
10C6 se une a un epítopo de gB que es igual o parcialmente solapado con el epítopo o epítopos reconocidos por 5F1, 4H9 y 2B11, pero distinto del el epítopo o epítopos reconocidos por 7H3 y 6B4 (todos ellos específicos de gB).
5F1 se une a un epítopo de gB que es el mismo o se solapa en gran parte con el epítopo o epítopos reconocidos por 10C6, 4H9 y 2B11 pero distinto del epítopo o epítopos reconocidos por 6B4 y 7H3 (todos ellos específicos de gH).
4H9 se une a un epítopo de gB que es el mismo o se solapa en gran parte con el epítopo o epítopos reconocidos por 5F1, 10C6 y 2B11, pero distinto del epítopo o epítopos reconocidos por 6B4 y 7H3 (todos ellos específicos de gH).
2B11 se une a un epítopo de gB que es el mismo o se solapa en gran parte con el epítopo o epítopos reconocidos por 5F1, 10C6 y 4H9 pero distinto del epítopo o epítopos reconocidos por 6B4 y 7H3 (todos ellos específicos de gH).
Ejemplo 3: Amplitud de la actividad neutralizante del anticuerpo 15D8
UL128 es el gen más conservado del locus UL132-128. Sin embargo, las secuencias derivadas de varios aislados clínicos revelaron la existencia de 10 variantes con una o más mutaciones en comparación con la secuencia VR1814. Por lo tanto, investigamos si la unión del anticuerpo 15D8 específico de UL128 se vería afectada por cualquiera de estas mutaciones. Con este objetivo, se alinearon secuencias publicadas de aminoácidos de variantes
5
10
15
20
25
30
35
40
45
50
55
de UL128 de aislados clínicos (VR4603-M, VR4836-M, VR5001-M, VR4254-M, VR4969-M, VR4313-M, VR4116-M, VR5235-T, VR5055-T, VR4168-A, VR1814-PCR) y cepas de laboratorio (Towne, TB40/E, AD169, Merlin y Toledo) y se sintetizó un gen que codifica una proteína que incluye todas las sustituciones de aminoácidos descritas, así como una mutación adicional que se vio que se generaba a una frecuencia muy alta in vitro tras la amplificación por PCR (F33V). La secuencia de nucleótidos del gen sintético fue:
aactgacgagctgcaactacaatccgttatacctcgaagctgacgggcgaatacgctgcggcaaagtgagcgacaaggcgcagtacctg
ctgggcgccgctggcagcgttccctatcgatggatcaacctggaatacgacaagataacccggatcgtgggcctggatcagtacctggag
agcgttaagaaacacaaacggctggatgtgtgccgcgctaaaatgggctatatgctgcagtag.
Las células HEK293T se transfectaron con el UL128 original de VR1814 o con el gen pan-mutado y se tiñeron con diluciones en serie del anticuerpo 15D8. Como se muestra en la Figura 3, la proteína de UL128 original y del pan- mutado fueron reconocidas por 15D8 con una eficacia comparable (tinción saturada a ~ 0,2 pg/ml). Estos hallazgos indican que 15D8 reconoce un epítopo altamente conservado en la proteína codificada por UL128.
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5
10
15
20
25
30
35
40
45
50
55
60
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US 6.300.104
253-315
Claims (15)
- 5101520253035404550556065REIVINDICACIONES1. Un anticuerpo aislado, o un fragmento de unión al antígeno del mismo, que es específico de una proteína del hCMV, gB, en el que el anticuerpo o fragmento(a) comprende secuencias CDR1, CDR2 y CDR3 de la cadena pesada como se expone en las SEQ ID NOs: 336, 337 y 338, respectivamente, y secuencias CDR1, CDR2 y CDR3 de la cadena ligera como se expone en las SEQ ID NOs: 339, 340 y 341, respectivamente;(b) comprende secuencias CDR1, CDR2 y CDR3 de la cadena pesada como se expone en las SEQ ID NOs: 316, 317 y 318, respectivamente, y secuencias CDR1, CDR2 y CDR3 de la cadena ligera como se expone en las SEQ ID NOs: 319, 320 y 321 respectivamente;(c) comprende secuencias CDR1, CDR2 y CDR3 de la cadena pesada como se expone en las SEQ ID NOs: 278, 279 y 280 respectivamente, y secuencias CDR1, CDR2 y CDR3 de la cadena ligera como se expone en las SEQ ID NOs: 281, 282, y 283 respectivamente;(d) comprende secuencias CDR1, CDR2 y CDR3 de la cadena pesada como se expone en las SEQ ID NOs: 352, 279 y 280 respectivamente, y secuencias CDR1, CDR2 y CDR3 de la cadena ligera como se expone en las SEQ ID NOs: 281, 282 y 283, respectivamente;(e) comprende secuencias CDR1, CDR2 y CDR3 de la cadena pesada como se expone en las SEQ ID NOs: 296, 297 y 298, respectivamente, y secuencias CDR1, CDR2 y CDR3 de la cadena ligera como se expone en las SEQ ID NOs: 299, 300 y 301 respectivamente;o(f) comprende secuencias CDR1, CDR2 y CDR3 de la cadena pesada como se expone en las SEQ ID NOs: 360, 279 y 280 respectivamente, y secuencias CDR1, CDR2 y CDR3 de la cadena ligera como se expone en las SEQ ID NOs: 281, 282 y 361 respectivamente.
- 2. El anticuerpo o fragmento de la reivindicación 1, que comprende secuencias de la región variable de la cadena pesada y ligera como se expone en las SEQ ID NOs: 348 y 349, respectivamente, SEQ ID NOs: 328 y 329, respectivamente, SEQ ID NOs: 290 y 291, respectivamente, SeQ ID NOs: 357 y 291, respectivamente, SEQ iD NOs: 308 y 309, respectivamente, o SEQ ID NOs: 367 y 368, respectivamente.
- 3. El anticuerpo o fragmento de la reivindicación 1 o 2, en el que el anticuerpo es un anticuerpo humano, un anticuerpo monoclonal, un anticuerpo monocatenario, Fab, Fab', F(ab')2, Fv o scFv.
- 4. Una molécula de ácido nucleico aislada que comprende una secuencia de nucleótidos que codifica el anticuerpo o fragmento de una cualquiera de las reivindicaciones 1 a 3.
- 5. La molécula de ácido nucleico de la reivindicación 4, que comprende la secuencia de nucleótidos de una cualquiera de las SEQ ID NOs: 342-347, 350, 351, 322-327, 330, 331, 284-289, 292, 293, 353-356, 358, 359, 287, 288, 302-307, 310, 311, 362-364, 287, 365, 366, 369 o 370 o una secuencia de nucleótidos que codifica la misma secuencia de aminoácidos que la secuencia de aminoácidos codificada por una cualquiera de las SEQ ID NOs: 342347, 350, 351, 322-327, 330, 331, 284-289, 292, 293, 353-356, 358, 359, 287, 288, 302-307, 310, 311, 362-364, 287, 365, 366, 369 o 370.
- 6. Un vector de expresión que comprende un ácido nucleico de acuerdo con la reivindicación 4 o 5.
- 7. Una célula transformada con un vector de expresión de acuerdo con la reivindicación 6.
- 8. Una composición que comprende el anticuerpo o fragmento de una cualquiera de las reivindicaciones 1 a 3, o el ácido nucleico de la reivindicación 4 o 5, y un diluyente o vehículo farmacéuticamente aceptable.
- 9. La composición de la reivindicación 8, que comprende además un segundo anticuerpo, o un fragmento de unión al antígeno del mismo, que neutraliza la infección por hCMV.
- 10. La composición de la reivindicación 9 en la que dicho segundo anticuerpo o fragmento es específico de UL128, un epítopo formado por una combinación de UL130 y UL131A, un epítopo formado por una combinación de UL128, UL130 y UL131A, un epítopo formado por una combinación de gH, gL, UL128 y UL130, un segundo epítopo de gB, gH, gL, gM, gN, gO o un epítopo formado por una combinación de gM y gN.
- 11. La composición de la reivindicación 10, en la que dicho segundo anticuerpo es específico de un epítopo formado por una combinación de UL130 y UL131A.
- 12. La composición de la reivindicación 11, en la que dicho segundo anticuerpo se selecciona de:(i) un anticuerpo que comprende secuencias de la cadena pesada y ligera de las SEQ ID NOs: 61 y 62, respectivamente;5101520253035(ii) un anticuerpo que comprende secuencias CDR1, CDR2 y CDR3 de la región variable de la cadena pesada como se expone en las SEQ ID NOs: 49, 50 y 51 respectivamente y secuencias CDR1, CDR2 y CDR3 de la región variable de la cadena ligera como se expone en las SEQ ID NOs: 52, 53 y 54 respectivamente;(iii) un anticuerpo que comprende secuencias de la cadena pesada y ligera de la SEQ ID NO: 13 y 14, respectivamente;(iv) un anticuerpo que comprende las secuencias CDR1, CDR2 y CDR3 de la región variable de la cadena pesada como se expone en las SEQ ID NOs: 1, 2 y 3 respectivamente y las secuencias CDR1, CDR2 y CDR3 de la región variable de la cadena ligera como se expone en las SEQ ID NOs: 4, 5 y 6 respectivamente;(v) un anticuerpo que comprende secuencias de la cadena pesada y ligera de las SEQ ID NOs: 29 y 30, respectivamente;(vi) un anticuerpo que comprende las secuencias CDR1, CDR2 y CDR3 de la región variable de la cadena pesada como se expone en las SEQ ID NOs: 17, 18 y 19 respectivamente y las secuencias CDR1, CDR2 y CDR3 de la región variable de la cadena ligera como se expone en las SEQ ID NOs: 20 , 21 y 22 respectivamente;(vii) un anticuerpo que comprende secuencias de la cadena pesada y ligera de las SEQ ID NOs: 45 y 46 respectivamente;(viii) un anticuerpo que comprende las secuencias CDR1, CDR2 y CDR3 de la región variable de la cadena pesada como se expone en las SEQ ID NOs: 33, 34 y 35 respectivamente y las secuencias CDR1, CDR2 y CDR3 de la región variable de la cadena ligera como se expone en las SEQ ID NOs: 36, 37 y 38 respectivamente;(ix) un anticuerpo que comprende secuencias de la cadena pesada y ligera de las SEQ ID NOs: 125 y 126, respectivamente; y(x) un anticuerpo que comprende secuencias CDR1, CDR2 y CDR3 variables de la cadena pesada como se expone en las SeQ ID NOs: 113, 114 y 115 respectivamente y secuencias CDR1, CDR2 y cDr3 de la región variable de la cadena ligera como se expone en las SEQ ID NOs: 116, 117 y 118 respectivamente.
- 13. Uso del anticuerpo o fragmento de una cualquiera de las reivindicaciones 1 a 3, o el ácido nucleico de la reivindicación 4 o 5, o la composición de una cualquiera de las reivindicaciones 8 a 12 en la fabricación de un medicamento para el tratamiento de la infección por hCMV.
- 14. El anticuerpo o fragmento de una cualquiera de las reivindicaciones 1 a 3, o el ácido nucleico de la reivindicación 4 o 5, o la composición de una cualquiera de las reivindicaciones 8 a 12 para su uso en el tratamiento de la infección por hCMV.
- 15. Un método para producir el anticuerpo o fragmento de una cualquiera de las reivindicaciones 1 a 3, que comprende (i) cultivar la célula de la reivindicación 7 y (ii) aislar el anticuerpo o fragmento.
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