ES2464815T3 - Anticuerpos SP35 y usos de éstos - Google Patents

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Abstract

Un anticuerpo aislado o fragmento de unión a antígeno de éste que puede unirse específicamente a un polipéptido Sp35, en el que el anticuerpo o fragmento de éste comprende una región VH que comprende las secuencias CDR1, CDR2 y CDR3 de la VH de SEQ ID NO: 436, SEQ ID NO: 437 y SEQ ID NO: 438, respectivamente; y una región VL que comprende las secuencias CDR1, CDR2 y CDR3 de la VL de SEQ ID NO: 442, SEQ ID NO: 443 y SEQ ID NO: 444, respectivamente en el que el anticuerpo o fragmento de éste se une a un polipéptido Sp35 con una afinidad caracterizada por una constante de disociación no mayor de 5 x 10-10M según se mide usando FACS en células CHO transfectadas de manera estable con Sp35 humano.

Description

Anticuerpos SP35 y usos de éstos
Antecedentes de la invención
Campo de la invención
Esta invención se refiere a neurología, neurobiología y biología molecular. Más particularmente, esta invención se refiere a anticuerpos Sp35, así como a dichos anticuerpos para uso en el tratamiento de enfermedades, trastornos y lesiones neurológicas tales como lesión en la médula espinal.
Antecedentes de la invención
Los axones y las dendritas se extienden a partir de las neuronas. La punta distal de un axón o neurita en extensión incluye una región especializada, conocida como el cono de crecimiento. Los conos de crecimiento perciben el entorno local y guían el crecimiento axonal hacia una célula diana de la neurona. Los conos de crecimiento responden a señales del entorno, por ejemplo, adhesividad superficial, factores de crecimiento, neurotransmisores y campos eléctricos. Los conos de crecimiento avanzan generalmente a una velocidad de uno a dos milímetros al día. El cono de crecimiento explora el área por delante de él y a cada lado, mediante elongaciones clasificadas como lamelipodio y filopodio. Cuando una elongación se pone en contacto con una superficie desfavorable, se para. Cuando una elongación se pone en contacto con una superficie de crecimiento favorable, continúa extendiéndose y guía el cono de crecimiento en esa dirección. Cuando el cono de crecimiento alcanza una célula diana apropiada se crea una conexión sináptica.
La función de la célula nerviosa se ve influida por el contacto entre las neuronas y otras células en su entorno inmediato (Rutishauser, et al., 1988, Physiol. Rev, 68: 819). Estas células incluyen células gliales especializadas, oligodendrocitos en el sistema nervioso central (SNC) y células de Schwann en el sistema nervioso periférico (SNP), que revisten el axón neuronal con mielina (Lemke, 1992, en An Introduction to Molecular Neurobiology, Z. Hall, Ed., p. 281, Sinauer).
Las neuronas del SNC tienen el potencial inherente de regenerarse después de una lesión, pero está acción se inhibe por proteínas inhibidoras presentes en la mielina (Brittis et al., 2001, Neuron 30: 11-14; Jones et al., 2002, J. Neurosci.
22: 2792-2803; Grimpe et al., 2002, J. Neurosci. 22: 3144-3160).
Se han caracterizado varias proteínas inhibidoras de mielina encontradas en los oligodendrocitos. Los ejemplos conocidos de proteínas inhibidoras de mielina incluyen NogoA (Chen et al., Nature, 2000, 403, 434-439; Grandpre et al., Nature, 2000, 403, 439-444), glicoproteína asociada a mielina (MAG) (McKerracher et al., 1994, Neuron 13: 805-811; Mukhopadhyay et al., 1994, Neuron 13: 757-767) y glicoproteína de oligodendrocitos (OM-gp), Mikol et al., 1988, J. Cell. Biol. 106: 1273-1279). Se ha mostrado separadamente que cada una de estas proteínas es un ligando para el receptor neuronal Nogo 1 ((NgR1 (Wang et al., Nature 2002, 417, 941-944; Grandpre et al., Nature 2000, 403, 439-444; Chen et al., Nature, 2000, 403, 434-439; Domeniconi et al., Neuron 2002, publicado en línea el 28 de junio, 2002).
El receptor Nogo-1 (NgR1) es una proteína de membrana anclada por GPI que contiene 8 repeticiones ricas en leucina (Fournier et al., 2001, Nature, 409: 341-346). Después de la interacción con proteínas inhibidoras (por ejemplo, NogoA, MAG y OM-gp), el complejo NgR1 transduce las señales que dan lugar al colapso del cono de crecimiento y a la inhibición del crecimiento de las neuritas.
Existe una necesidad insatisfecha de moléculas y métodos para inhibir el colapso del cono de crecimiento mediado por NgR1 y la inhibición resultante del crecimiento de las neuritas. Además, existe una necesidad de moléculas que incrementen la supervivencia neuronal y la regeneración de los axones. Particularmente para el tratamiento de enfermedades, trastornos o lesiones que implican lesión axonal, muerte celular neuronal o de oligodendrocitos, desmielinización o dismielinización o que están relacionados de forma general con el sistema nervioso.
Dichas enfermedades, trastornos o lesiones incluyen pero no están limitadas a, esclerosis múltiple (MS), leucoencefalopatía multifocal progresiva (PML), encefalomielitis (EPL), mielinolisis pontina central (CPM), adrenoleucodistrofia, enfermedad de Alexander, enfermedad de Pelizaeus Merzbacher (PMZ), Leucodistrofia de células Globoides (enfermedad de Krabbe) y Degeneración Walleriana, neuritis óptica, mielitis transversa, esclerosis lateral amiotrófica (ALS), enfermedad de Huntington, enfermedad de Alzheimer, enfermedad de Parkinson, lesión en la médula espinal, lesión cerebral traumática, lesión post radiación, complicaciones neurológicas de quimioterapia, ictus, neuropatía óptica isquémica aguda, deficiencia de vitamina E, síndrome de deficiencia de vitamina E aislado, AR, síndrome de Bassen-Kornzweig, síndrome de Marchiafava-Bignami, leucodistrofia metacromática, neuralgia del trigémino y parálisis de Bell. Entre estas enfermedades, la MS es la más extendida, afectando aproximadamente a 2,5 millones de personas en todo el mundo.
La MS empieza generalmente con un patrón de recaída-remisión de implicación neurológica, que progresa a una fase crónica con daño neurológico creciente. La MS está asociada con la destrucción de la mielina, oligodendrocitos y axones localizados en lesiones crónicas. La desmielinización observada en MS no es siempre permanente y se ha documentado remielinización en estadios tempranos de la enfermedad. La remielinización de las neuronas requiere oligodendrocitos.
Varios tratamientos modificadores de la enfermedad están disponibles para MS, incluyendo el uso de corticosteroides e inmunomoduladores tales como interferón beta y Tysabri®. Además, debido al papel central de los oligodendrocitos y mielinización en MS, ha habido esfuerzos para desarrollar terapias para incrementar los números de oligodendrocitos o aumentar la mielinización. Véanse, por ejemplo, Cohen et al., Pat. U.S. No. 5.574.009; Chang et al., N. Engl. J. Med,
346: 165-73 (2002). WO 2007/008547 describe anticuerpos específicos para Sp35 y métodos para usar dichos anticuerpos como antagonistas de la función Sp35 endógena. Sin embargo, permanece una necesidad urgente de idear terapias adicionales para MS y otros trastornos de desmielinización y dismielinización.
Resumen breve de la invención
La presente descripción se basa en el descubrimiento de que Sp35 (Sp35 también se designa en la bibliografía como LINGO-1 y LRRN6) se expresa en oligodendrocitos y células neuronales y regula negativamente la diferenciación, supervivencia de oligodendrocitos/neuronal y mielinización de axones. Además, determinados antagonistas de Sp35 estimulan la supervivencia, proliferación y diferenciación de oligodendrocitos y células neuronales, así como la mielinización de neuronas. Tomando como base estos descubrimientos, la descripción, que incluye la presente invención, se refiere generalmente a anticuerpos, fragmento de unión a antígeno o derivados de éstos que pueden usarse como un antagonista de Sp35.
Más particularmente, la presente invención proporciona un anticuerpo aislado o fragmento de unión a antígeno de éste que puede unirse específicamente a un polipéptido Sp35, en el que el anticuerpo o fragmento de éste comprende:
una región VH que comprende las secuencias CDR1, CDR2 y CDR3 de la VH de SEQ ID NO: 436, SEQ ID NO: 437 y SEQ ID NO: 438, respectivamente; y
una región VL que comprende las secuencias CDR1, CDR2 y CDR3 de la VL de SEQ ID NO: 442, SEQ ID NO: 443 y SEQ ID NO: 444, respectivamente
en el que el anticuerpo o fragmento de éste se une a un polipéptido Sp35 con una afinidad caracterizada por una constante de disociación no mayor de 5 x 10-10M según se mide usando FACS en células CHO transfectadas de manera estable con Sp35 humano.
Los aspectos y realizaciones adicionales de la invención se muestran en las reivindicaciones adjuntas.
Descripción breve de los dibujos/figuras
FIG. 1: Gel de SDS-PAGE que muestra la inmunoprecipitación de Sp35 por anticuerpos monoclonales 1A7 y 2F3.
FIG. 2: Resultado de FACS que muestra que los MAbs 1A7 y 2F3 se unieron a células COS-7 ó 293 que expresan Sp35, pero no a células control sin expresión de Sp35.
FIG. 3: Los MAbs 1A7 y 2F3 protegieron a las neuronas DRG de la inhibición mediada por mielina del crecimiento de las neuritas.
FIG. 4A-G: Tinción inmunohistoquímica (“IHC”) de cocultivos de neuronas DRG y oligodendrocitos tratados con los anticuerpos monoclonales 1A7 y 2F3, o anticuerpo control. Los paneles D y E son aumentos de los paneles B y C, respectivamente. Tinción con anticuerpo anti-�III-tubulina para identificar los axones, o anticuerpo anti-MBP para identificar los oligodendrocitos. F: Cuantificación de células mielinizantes MBP+ después de tratamiento de cocultivos con 1A7 ó 2F3. G: Análisis por transferencia Western para cuantificar el MBP producido por cocultivos de neuronas DRG y oligodendrocitos tratados con los anticuerpos monoclonales 1A7 y 2F3.
FIG. 5A-C: A: Tinción con anticuerpo CC1 de oligodendrocitos de ratón en el modelo cuprizona. B. Tinción con anticuerpo anti-proteína MBP o luxol fast blue de neuronas de ratón en el modelo cuprizona. C: Cuantificación de oligodendrocitos positivos para el anticuerpo CC1 a las cuatro semanas y 6 semanas.
FIG. 6: RGC supervivientes. Tratamiento con el anticuerpo monoclonal 1A7. Los animales tratados con el anticuerpo anti-Sp35 1A7 mostraron una supervivencia neuronal significativa (80%) cuando se comparan con los animales tratados con el anticuerpo control o PBS, cada uno de los cuales sólo mostró aproximadamente 50% de supervivencia neuronal.
FIG. 7. Puntuaciones BBB de ratones que recibieron anticuerpo anti-Sp35 1A7 después de lesión en la médula espinal como se describe en el Ejemplo 8.
FIG. 8. Transferencia Western de oligodendrocitos y DRG co-cultivados después de incubación con los anticuerpos anti-Sp35 Li05, Li06 y 3, 10 y 30 mg de Sp35-Fc (LINGO-1-Ig) como se describe en el Ejemplo 9.
FIG. 9. Fotografías de los nervios ópticos de A) Ratas Normales; B) Ratas con Encefalomielitis Autoinmune Experimental (EAE) inducida por la Glicoproteína Mielínica de los Oligodendrocitos (MOG); y C) Ratas con Encefalomielitis Autoinmune Experimental (EAE) inducida por la Glicoproteína Mielínica de los Oligodendrocitos (MOG) tratadas con el anticuerpo Sp35 1A7. Se muestran micrografías electrónicas de cada nervio óptico debajo de cada fotografía del nervio óptico.
FIG. 10. Gráfico del número de fibras neuronales regenerativas por sección contado en animales que recibieron una inyección intravítrea del anticuerpo Sp35 1A7 después del aplastamiento del nervio óptico.
FIG. 11. Resultado de FACS que muestra que los MAb 3B5.2 (3B5) y 7P1D5.1G9 (1D5) se unen a células CHO transfectadas de manera estable con Sp35 (LINGO-1).
Descripción detallada de la invención
I. Definiciones
Debe observarse que el término “un” o “una” entidad se refiere a una o más de esa entidad; por ejemplo, “un anticuerpo Sp35”, se entiende que representa uno o más anticuerpos Sp35. Como tales, los términos “un” (o “una”), “uno o más”, y “al menos uno” pueden usarse indistintamente en la presente memoria.
Tal y como se usa en la presente memoria, el término “polipéptido” se pretende que englobe un “polipéptido” en singular así como “polipéptidos” en plural, y se refiere a una molécula compuesta por monómeros (aminoácidos) unidos de manera lineal por enlaces amida (también conocidos como enlaces peptídicos). El término “polipéptido” se refiere a cualquier cadena o cadenas de dos o más aminoácidos y no se refiere a una longitud específica del producto. Así, péptidos, dipéptidos, tripéptidos, oligopéptidos, “proteína”, “cadena de aminoácidos” o cualquier otro término usado para referirse a una cadena o cadenas de dos o más aminoácidos, están incluidos en la definición de “polipéptido” y el término “polipéptido” puede usarse en lugar de, o indistintamente con, cualquiera de estos términos. El término “polipéptido” también se pretende que se refiera a los productos de las modificaciones posteriores a la expresión del polipéptido, incluyendo sin limitación glicosilación, acetilación, fosforilación, amidación, derivatización por grupos protectores/bloqueantes conocidos, escisión proteolítica, o modificación por aminoácidos no naturales. Un polipéptido puede derivar de una fuente biológica natural o producirse por tecnología recombinante, pero no se traduce necesariamente a partir de una secuencia de ácido nucleico designada. Puede generarse de cualquier manera, incluyendo por síntesis química.
Un polipéptido de la descripción puede tener un tamaño de aproximadamente 3 o más, 5 o más, 10 o más, 20 o más, 25
o más, 50 o más, 75 o más, 100 o más, 200 o más, 500 o más, 1.000 o más ó 2.000 o más aminoácidos. Los polipéptidos pueden tener una estructura tridimensional definida, aunque no tienen necesariamente dicha estructura. Los polipéptidos con una estructura tridimensional definida se refieren como plegados y los polipéptidos que no poseen una estructura tridimensional definida, pero en su lugar pueden adoptar una gran número de conformaciones diferentes, y se refieren como no plegados. Tal y como se usa en la presente memoria, el término glicoproteína se refiere a una proteína acoplada al menos a un resto de carbohidrato que está unido a la proteína mediante una cadena lateral que contiene oxígeno o que contiene nitrógeno de un residuo de aminoácido, por ejemplo, un residuo de serina o un residuo de asparagina.
Por un polipéptido “aislado” o un fragmento, variante, o derivado de éste se pretende un polipéptido que no está en su medio natural. No se requiere ningún nivel particular de purificación. Por ejemplo, un polipéptido aislado puede extraerse de su entorno nativo o natural. Los polipéptidos y proteínas producidos recombinantemente expresados en células huésped se consideran aislados para los propósitos de la descripción ya que son polipéptidos nativos o recombinantes que se han separado, fraccionado o purificado parcialmente o sustancialmente por cualquier técnica adecuada.
También se incluyen como polipéptidos de la presente descripción los fragmentos, derivados, análogos o variantes de los polipéptidos anteriores, y cualquier combinación de éstos. Los términos “fragmento”, “variante”, “derivado” y “análogo” cuando se refieren a anticuerpos Sp35 o polipéptidos de anticuerpo incluyen cualesquiera polipéptidos que retienen al menos parte de las propiedades de unión a antígeno del anticuerpo o polipéptido nativo correspondiente. Los fragmentos de polipéptidos incluyen fragmentos proteolíticos, así como fragmentos de deleción, además de los fragmentos de anticuerpo específicos que se discuten en otro lugar de la presente memoria. Las variantes de los anticuerpos Sp35 y polipéptidos de anticuerpo incluyen fragmentos como se ha descrito anteriormente y también polipéptidos con
secuencias de aminoácidos alteradas debido a sustituciones, deleciones o inserciones de aminoácidos. Las variantes pueden ocurrir naturalmente o pueden no ser naturales. Las variantes no naturales pueden producirse usando técnicas de mutagénesis conocidas en la técnica. Los polipéptidos variantes pueden comprender sustituciones, deleciones o adiciones de aminoácidos conservativas o no conservativas. Los derivados de los anticuerpos Sp35 y los polipéptidos de anticuerpo, son polipéptidos que se han alterado de manera que presentan características adicionales no encontradas en el polipéptido nativo. Los ejemplos incluyen proteínas de fusión. Los polipéptidos variantes también pueden referirse en la presente memoria como "análogos de polipéptido". Tal y como se usa en la presente memoria, un “derivado” de un anticuerpo Sp35 o polipéptido de anticuerpo se refiere a un polipéptido que tiene uno o más residuos derivatizados químicamente por reacción de un grupo lateral funcional. También se incluyen como “derivados” aquellos péptidos que contienen uno o más derivados de aminoácidos naturales de los veinte aminoácidos estándar. Por ejemplo, 4hidroxiprolina puede sustituirse por prolina; 5-hidroxilisina puede sustituirse por lisina; 3-metilhistidina puede sustituirse por histidina; homoserina puede sustituirse por serina; y ornitina puede sustituirse por lisina.
El término “polinucleótido” se pretende que englobe un ácido nucleico singular así como ácidos nucleicos en plural, y se refiere a una molécula o construcción de ácido nucleico aislada, por ejemplo, ARN mensajero /ARNm) o ADN plasmídico (ADNp). Un polinucleótido puede comprender un enlace fosfodiéster convencional o un enlace no convencional (por ejemplo, un enlace amida, tal como se encuentra en los ácidos nucleicos peptídicos (PNA)). El término “ácido nucleico” se refiere a uno cualquiera o más segmentos de ácido nucleico, por ejemplo, fragmentos de ADN o ARN, presentes en un polinucleótido. Por ácido nucleico o polinucleótido “aislado” se pretende una molécula de ácido nucleico, ADN o ARN, que se ha extraído de su entorno nativo. Por ejemplo, un polinucleótido recombinante que codifica un anticuerpo Sp35 contenido en un vector se considera aislado para los propósitos de la presente descripción. Los ejemplos adicionales de un polinucleótido aislado incluyen polinucleótidos recombinantes mantenidos en células huésped heterólogas o polinucleótidos purificados (parcialmente o sustancialmente) en disolución. Las moléculas de ARN aisladas incluyen transcritos de ARN in vivo o in vitro de polinucleótidos. Los polinucleótidos o ácidos nucleicos aislados incluyen además dichas moléculas producidas sintéticamente. Además, el polinucleótido o un ácido nucleico puede ser o puede incluir un elemento regulador tal como un promotor, sitio de unión a ribosomas o un terminador de la transcripción.
Tal y como se usa en la presente memoria, una “región codificadora” es una parte de ácido nucleico que consiste en codones traducidos en aminoácidos. Aunque un “codón de parada” (TAG, TGA o TAA) no se traduce en un aminoácido, puede considerarse que es parte de una región codificadora, pero cualquier secuencia flanqueante, por ejemplo promotores, sitios de unión a ribosomas, terminadores transcripcionales, intrones, y semejantes, no son parte de una región codificadora. Dos o más regiones codificadoras de la presente descripción pueden estar presentes en una única construcción de polinucleótido, por ejemplo, en un único vector, o en construcciones separadas de polinucleótidos, por ejemplo, en vectores separados (diferentes). Además, cualquier vector puede contener una única región codificadora, o puede comprender dos o más regiones codificadoras, por ejemplo, un único vector puede codificar separadamente una región variable de cadena pesada de inmunoglobulina y una región variable de cadena ligera de inmunoglobulina. Además, un vector, polinucleótido, o ácido nucleico de la descripción puede codificar regiones codificadoras heterólogas, bien fusionadas o no fusionadas a un ácido nucleico que codifica un anticuerpo Sp35 o fragmento, variante o derivado de éste. Las regiones codificadoras heterólogas incluyen sin limitación elementos o restos especializados, tales como un péptido señal secretor o un dominio funcional heterólogo.
En determinados casos, el polinucleótido o ácido nucleico es ADN. En el caso de ADN, un polinucleótido que comprende un ácido nucleico que codifica un polipéptido puede incluir normalmente un promotor y/o otros elementos de control de la transcripción o traducción asociados de manera operativa con una o más regiones codificadoras. Una asociación operativa es cuando una región codificadora para un producto génico, por ejemplo, un polipéptido, está asociada con una o más secuencias reguladoras de tal manera que la expresión del producto génico se pone bajo la influencia o control de la o las secuencias reguladoras. Dos fragmentos de ADN (tales como una región codificadora de un polipéptido y un promotor asociado con ella) están “asociados de manera operativa” si la inducción de la función promotora resulta en la transcripción del ARNm que codifica el producto génico deseado y si la naturaleza de la unión entre los dos fragmentos de ADN no interfiere con la capacidad de las secuencias reguladoras de la expresión para dirigir la expresión del producto génico o interfiere con la capacidad del molde de ADN para ser transcrito. Así, una región promotora estaría asociada de manera operativa con un ácido nucleico que codifica un polipéptido si el promotor fuera capaz de efectuar la transcripción de ese ácido nucleico. El promotor puede ser un promotor específico de célula que dirige la transcripción sustancial del ADN sólo en células predeterminadas. Otros elementos de control de la transcripción, además de un promotor, por ejemplo potenciadores, operadores, represores y señales de terminación de la transcripción, pueden asociarse de manera operativa con el polinucleótido para dirigir la transcripción específica de célula. Los promotores y otras regiones de control de la transcripción adecuadas se describen en la presente memoria.
Los expertos en la técnica conocen una variedad de regiones de control de la transcripción. Éstas incluyen, sin limitación, regiones de control de la transcripción que funcionan en células de vertebrados, tales como, pero no limitadas a, segmentos promotores y potenciadores de citomegalovirus (el promotor temprano inmediato, conjuntamente con el intrón-A), virus de simio 40 (el promotor temprano) y retrovirus (tal como virus de sarcoma de Rous). Otras regiones de
control de la transcripción incluyen aquellas derivadas de genes de vertebrados tales como actina, proteína de choque térmico, hormona de crecimiento bovina y -globina de conejo, así como otras secuencias capaces de controlar la expresión génica en células eucariotas. Las regiones de control de la transcripción adecuadas adicionales incluyen promotores y potenciadores específicos de tejido así como promotores inducibles por linfoquinas (por ejemplo, promotores inducibles por interferones o interleuquinas).
De manera similar, los expertos en la técnica conocen una variedad de elementos de control de la traducción. Éstos incluyen, pero no están limitados a, sitios de unión a ribosomas, codones de inicio y terminación de la traducción y elementos derivados de picornavirus (particularmente un sitio interno de entrada de ribosoma, o IRES, también referido como una secuencia CITE).
En otros casos, un polinucleótido de la presente descripción es ARN, por ejemplo, en la forma de ARN mensajero (ARNm).
Las regiones codificadoras de polinucleótido y ácido nucleico de la presente descripción pueden estar asociadas con regiones codificadoras adicionales que codifican péptidos secretores o señal, que dirigen la secreción de un polipéptido codificado por un polinucleótido de la presente descripción. Según la hipótesis de la señal, las proteínas secretadas por células de mamífero tienen un péptido señal o secuencia líder de secreción que se escinde de la proteína madura una vez que se ha iniciado la exportación de la cadena proteica creciente a través del retículo endoplásmico rugoso. Los expertos en la técnica son conscientes de que los polipéptidos secretados por las células de vertebrados tienen generalmente un péptido señal fusionado al extremo N del polipéptido, que se escinde del polipéptido completo o de “longitud completa” para producir una forma secretada o “madura” del polipéptido. En determinados casos, se usa el péptido señal nativo, por ejemplo, un péptido señal de cadena pesada o cadena ligera de inmunoglobulina o un derivado funcional de esa secuencia que retiene la capacidad de dirigir la secreción del polipéptido que está asociado de manera operativa con él. Alternativamente, puede usarse un péptido señal de mamíferos heterólogo, o un derivado funcional de éste. Por ejemplo, la secuencia líder de tipo salvaje puede sustituirse con la secuencia líder del activador de plasminógeno tisular humano (TPA) o -glucuronidasa de ratón.
La presente descripción está dirigida a determinados anticuerpos Sp35, o fragmentos de unión a antígeno, variantes o derivados de éstos. A no ser que se refiera específicamente a anticuerpos de tamaño completo tales como anticuerpos naturales, el término “anticuerpos Sp35” engloba anticuerpos de tamaño completo así como fragmentos de unión a antígeno, variantes, análogos o derivados de dichos anticuerpos, por ejemplo, moléculas de anticuerpo o inmunoglobulina naturales o moléculas de anticuerpo preparadas por ingeniería o fragmentos que unen antígeno de una manera similar a las moléculas de anticuerpo.
Los términos “anticuerpo” e “inmunoglobulina” se usan indistintamente en la presente memoria. Un anticuerpo o inmunoglobulina comprende al menos el dominio variable de una cadena pesada, y normalmente comprende al menos los dominios variables de una cadena pesada y una cadena ligera. Las estructuras básicas de inmunoglobulina en los sistemas de vertebrados se entienden relativamente bien. Véase, por ejemplo, Harlow et al., Antibodies: A Laboratory Manual, (Cold Spring Harbor Laboratory Press, 2ª ed. 1988).
Como se discutirá con más detalle más adelante, el término “inmunoglobulina” comprende varias clases amplias de polipéptidos que pueden distinguirse bioquímicamente. Los expertos en la técnica apreciarán que las cadenas pesadas se clasifican como gamma. mu, alfa, delta o épsilon (y, 1, a, 0, E) con algunas subclases entre ellas (por ejemplo, y1-y4). Es la naturaleza de esta cadena la que determina la “clase” del anticuerpo como IgG, IgM, IgA, IgG, o IgE, respectivamente. Las subclases (isotipos) de inmunoglobulinas, por ejemplo, IgG1, IgG2, IgG3, IgG4, IgA1, etc. están bien caracterizadas y se sabe que confieren especialización funcional. Las versiones modificadas de cada una de estas clases e isotipos son fácilmente discernibles por el experto en la técnica a la vista de la presente descripción y, de acuerdo con esto, están en el alcance de la descripción. Todas las clases de inmunoglobulinas están claramente en el alcance de la descripción, la discusión siguiente estará dirigida generalmente a la clase IgG de moléculas de inmunoglobulina. Respecto a IgG, una molécula de inmunoglobulina estándar comprende dos polipéptidos de cadena ligera idénticos con un peso molecular de aproximadamente 23.000 Daltons y dos polipéptidos de cadena pesada idénticos con un peso molecular de 53.000-70.000. Las cuatro cadenas están unidas típicamente por enlaces disulfuro en una configuración en “Y” en la que las cadenas ligeras reúnen a las cadenas pesadas empezando en la boca de la “Y” y continuando a través de la región variable.
Las cadenas ligeras se clasifican como kappa o lambda (K, A). Cada clase de cadena pesada puede estar unida con una cadena ligera kappa o lambda. En general, las cadenas ligeras y pesadas están unidas covalentemente entre sí y las partes de “cola” de las dos cadenas pesadas están unidas entre sí por uniones disulfuro covalentes o uniones no covalentes cuando las inmunoglobulinas se generan bien por hibridomas, células B o células huésped modificadas genéticamente por ingeniería. En la cadena pesada, las secuencias de aminoácidos van desde un extremo N en los extremos en horquilla de la configuración Y hasta el extremo C en el final de cada cadena.
Tanto las cadenas ligeras como pesadas están divididas en regiones de homología estructural y funcional. Los términos “constante” y “variable” se usan funcionalmente. A este respecto, se apreciará que los dominios variables tanto de las partes de cadena ligera (VL) como pesada (VH) determinan el reconocimiento y especificidad de antígeno. A la inversa, los dominios constantes de la cadena ligera (CL) y la cadena pesada (CH1, CH2o CH3) confieren propiedades biológicas importantes tales como secreción, movilidad transplacentaria, unión a receptor Fc, unión a complemento y semejantes. Por convención, la numeración de los dominios de región constante se incrementa al alejarse del sitio de unión a antígeno o extremo amino del anticuerpo. La parte N terminal es una región variable y la parte C terminal es una región constante; los dominios CH3 y CL comprenden realmente el extremo carboxi de la cadena pesada y ligera, respectivamente.
Como se ha indicado anteriormente, la región variable permite al anticuerpo reconocer selectivamente y unirse específicamente a epítopos en antígenos. Esto es, el dominio VL y el dominio VH, o subconjunto de las regiones determinantes de la complementariedad (CDR), de un anticuerpo se combinan para formar la región variable que define un sitio de unión a antígeno tridimensional. Esta estructura cuaternaria de anticuerpo forma el sitio de unión a antígeno presente en el extremo de cada brazo de la Y. Más específicamente, el sitio de unión a antígeno está definido por tres CDR en cada una de las cadenas VH y VL. En algunos casos, por ejemplo, determinadas moléculas de inmunoglobulina derivadas de especies de camélido o preparadas por ingeniería tomando como base inmunoglobulinas de camélido, una molécula completa de inmunoglobulina puede consistir sólo en cadenas pesadas, sin cadenas ligeras. Véase, por ejemplo, Hamers-Casterman, et al., Nature 363: 446-448 (1993).
En los anticuerpos naturales, las seis “regiones determinantes de la complementariedad” o “CDR” presentes en cada dominio de unión a antígeno son secuencias de aminoácidos cortas, no contiguas que están situadas específicamente para formar el dominio de unión a antígeno al asumir el anticuerpo su configuración tridimensional en un entorno acuoso. Los aminoácidos restantes en los dominios de unión a antígeno, referidos como regiones “marco”, muestran menos variabilidad inter-molecular. Las regiones marco adoptan en gran medida una conformación de lámina y las CDR forman bucles que conectan, y en algunos casos forman parte de, la estructura de lámina . Así, las regiones marco actúan para formar un andamio que proporciona el posicionamiento de las CDR en una orientación correcta por interacciones inter-cadena, no covalentes. El dominio de unión a antígeno formado por las CDR posicionadas define una superficie complementaria al epítopo en el antígeno inmunoreactivo. Esta superficie complementaria estimula la unión no covalente del anticuerpo a su epítopo correspondiente. Los aminoácidos que comprenden las CDR y las regiones marco, respectivamente, pueden ser identificados fácilmente para cualquier región variable de cadena pesada o ligera dada por un experto en la técnica, ya que han sido definidos de manera precisa (véase, “Sequences of Proteins of Immunological Interest”, Kabat, E., et al., U.S. Department of Health and Human Services, (1983); y Chothia y Lesk, J. Mol. Biol., 196: 901-917 (1987).
En el caso en el que existen dos o más definiciones de un término que se usa y/o acepta en la técnica, la definición del término tal y como se usa en la presente memoria se pretende que incluya todos estos significados a no ser que se indique explícitamente lo contrario. Un ejemplo específico es el uso del término “región determinante de la complementariedad” (“CDR”) para describir los sitios de combinación a antígeno no contiguos encontrados en la región variable de los polipéptidos tanto de cadena pesada como ligera. Esta región particular ha sido descrita por Kabat et al.,
U.S.
Dept. of Health and Human Services, “Sequences of Proteins of Immunological Interest” (1983) y por Chothia et al.,
J.
Mol. Biol., 196: 901-917 (1987), en las que las definiciones incluyen superposición o subconjuntos de residuos de aminoácidos cuando se compara una frente a la otra. Sin embargo, la aplicación de cualquier definición para referirse a una CDR de un anticuerpo o variantes de éste se pretende que esté en el alcance del término como se define y usa en la presente memoria. Los residuos apropiados de aminoácidos que engloban las CDR como se define por cada una de las referencias citadas anteriormente se muestran más adelante en la Tabla 1 como una comparación. Los números exactos de los residuos que engloban una CDR particular variarán dependiendo de la secuencia y tamaño de la CDR. Los expertos en la técnica pueden determinar rutinariamente qué residuos comprenden una CDR particular dada la secuencia de aminoácidos de la región variable del anticuerpo.
Tabla 1. Definiciones de CDR1
1La numeración de todas las definiciones de CDR en la Tabla 1 es según las convenciones de numeración mostradas por Kabat et al. (véase más adelante).
Kabat et al, también definieron un sistema de numeración para secuencias de dominio variable que es aplicable a cualquier anticuerpo. Un experto en la técnica puede asignar sin ambigüedad este sistema de “numeración de Kabat” a cualquier secuencia de dominio variable, sin depender de ningún dato experimental más allá de la secuencia en sí misma. Tal y como se usa en la presente memoria, la “numeración de Kabat” se refiere al sistema de numeración mostrado por Kabat et al., U.S. Dept. of Health and Human Services, “Sequence of Proteins of Immunological Interest” (1983). A no ser que se especifique otra cosa, las referencias a la numeración de posiciones específicas de residuos de aminoácidos en un anticuerpo Sp35 o fragmento de unión a antígeno, variante o derivado de éste son según el sistema de numeración de Kabat.
En especies de camélido, la región variable de cadena pesada, referida como VHH, forma el dominio completo de unión a antígeno. Las diferencias principales entre las regiones variables VHH de camélidos y aquellas derivadas de anticuerpos convencionales (VH) incluyen (a) más aminoácidos hidrofóbicos en la superficie de contacto de la cadena ligera de VH comparado con la región correspondiente en VHH, (b) una CDR3 más larga en VHH, y (c) la aparición frecuente de un enlace disulfuro entre CDR1 y CDR3 en VHH.
Los anticuerpos o fragmentos de unión a antígeno, variantes o derivados de éstos de la descripción incluyen,, pero no están limitados a, anticuerpos policlonales, monoclonales, multiespecíficos, humanos, humanizados, primatizados o quiméricos, anticuerpos de cadena única, fragmentos de unión a epítopo, por ejemplo, Fab, Fab’ y F(ab’)2, Fd, Fvs, Fvs de cadena única (scFV), anticuerpos de cadena única, Fvs unidos por disulfuro (sdFv), fragmentos que comprenden bien un dominio VL o VH, fragmentos producidos por una biblioteca de expresión Fab y anticuerpos anti-idiotípicos (anti-Id) (incluyendo, por ejemplo, anticuerpos anti-Id para anticuerpos Sp35 descritos en la presente memoria). Las moléculas ScFv son conocidas en la técnica y se describen, por ejemplo, en la patente US 5.892.019. Las moléculas de inmunoglobulina o anticuerpo de la descripción pueden ser de cualquier tipo (por ejemplo, IgG, IgE, IgM, IgD, IgA e IgY), clase (por ejemplo, IgG1, IgG2, IgG3, IgG4, IgA1 e IgA2) o subclase de molécula de inmunoglobulina.
Los fragmentos de anticuerpo, incluyendo anticuerpos de cadena única, pueden comprender la o las regiones variables solas o en combinación con todo o una parte de lo siguiente: región bisagra, dominios CH1, CH2y CH3. También están incluidos en la descripción fragmentos de unión a antígeno que también comprenden cualquier combinación de región o regiones variables con una región bisagra, dominios CH1, CH2y CH3. Los anticuerpos o fragmentos inmunoespecíficos de éstos para usarse en los métodos de diagnóstico y terapéuticos descritos en la presente memoria pueden tener cualquier origen animal incluyendo pájaros y mamíferos. Preferiblemente, los anticuerpos son anticuerpos humanos, murinos, de burro, conejo, cabra, cobaya, camello, llama, caballo o pollo. En otro caso, la región variable puede tener origen condrictoide (por ejemplo, de tiburones). Tal y como se usa en la presente memoria, los anticuerpos “humanos” incluyen anticuerpos que tienen la secuencia de aminoácidos de una inmunoglobulina humana e incluyen anticuerpos aislados de bibliotecas de inmunoglobulinas humanas o de animales transgénicos para una o más inmunoglobulinas humanas y que no expresan inmunoglobulinas endógenas, como se describe más adelante y, por ejemplo en, Pat. U.S. No. 5.939.598 por Kucherlapati et al.
Tal y como se usa en la presente memoria, el término “parte de cadena pesada” incluye las secuencias de aminoácidos derivadas de la cadena pesada de una inmunoglobulina. Un polipéptido que comprende una parte de cadena pesada comprende al menos uno de: un dominio CH1, un dominio bisagra (por ejemplo, región bisagra superior, media y/o inferior), un dominio CH2, un dominio CH3, o una variante o fragmento de estos. Por ejemplo, un polipéptido de unión puede comprender una cadena polipeptídica que comprende un dominio CH1; una cadena polipeptídica que comprende un dominio CH1, al menos una parte de un dominio bisagra y un dominio CH2; una cadena polipeptídica que comprende un dominio CH1 y un dominio CH3; una cadena polipeptídica que comprende un dominio CH1, al menos una parte de un dominio bisagra y un dominio CH3 o una cadena polipeptídica que comprende un dominio CH1, al menos una parte de un dominio bisagra, un dominio CH2 y un dominio CH3. En otro caso, un polipéptido de la descripción comprende una cadena polipeptídica que comprende un dominio CH3. Además, un polipéptido de unión para usarse en la descripción puede carecer de al menos una parte de un dominio CH2 (por ejemplo, todo o parte de un dominio CH2). Como se ha mostrado anteriormente, un experto en la técnica entenderá que estos dominios (por ejemplo, las partes de cadena pesada) pueden modificarse de manera que varían en la secuencia de aminoácidos respecto a la molécula de inmunoglobulina natural.
En determinados anticuerpos Sp35, o fragmentos de unión a antígeno, variantes o derivados de éstos descritos en la presente memoria, las partes de cadena pesada de una cadena polipeptídica de un multímero son idénticas a aquellas en una segunda cadena polipeptídica del multímero. Alternativamente, los monómeros que contienen la parte de cadena pesada de la descripción no son idénticos. Por ejemplo, cada monómero puede comprender un sitio de unión a diana diferente, formando, por ejemplo, un anticuerpo biespecífico.
Las partes de cadena pesada de un polipéptido de unión para usarse en los métodos de diagnóstico y tratamiento descritos en la presente memoria pueden derivar de diferentes moléculas de inmunoglobulina. Por ejemplo, una parte de cadena pesada de un polipéptido puede comprender un dominio CH1 derivado de una molécula IgG1 y una región bisagra derivada de una molécula IgG3. En otro ejemplo, una parte de cadena pesada puede comprender una región bisagra derivada, en parte, de una molécula IgG1 y, en parte, de una molécula IgG3. En otro ejemplo, una parte de cadena pesada puede comprender una bisagra quimérica derivada, en parte, de una molécula IgG1 y, en parte, de una molécula IgG4.
Tal y como se usa en la presente memoria, el término “parte de cadena ligera” incluye secuencias de aminoácidos derivadas de una cadena ligera de inmunoglobulina. Preferiblemente, la parte de cadena ligera comprende al menos uno de un dominio VL o CL.
Los anticuerpos Sp35, o fragmentos de unión a antígeno, variantes o derivados de éstos descritos en la presente memoria pueden describirse o especificarse en términos del epítopo o epítopos o parte o partes de un antígeno, por ejemplo, un polipéptido diana (Sp35) que reconocen o unen específicamente. La parte de un polipéptido diana que interacciona específicamente con el dominio de unión a antígeno de un anticuerpo es un “epítopo” o un “determinante antigénico”. Un polipéptido diana puede comprender un único epítopo, pero típicamente comprende al menos dos epítopos y puede incluir cualquier número de epítopos, dependiendo del tamaño, conformación y tipo de antígeno. Además, debe observarse que un “epítopo” en un polipéptido diana puede ser o incluir elementos no polipeptídicos, por ejemplo, un “epítopo” puede incluir una cadena lateral de carbohidrato.
Se piensa que el tamaño mínimo de un epítopo de péptido o polipéptido para un anticuerpo es aproximadamente cuatro a cinco aminoácidos. Los epítopos de péptido o polipéptido contienen preferiblemente al menos siete, más preferiblemente al menos nueve y lo más preferiblemente entre al menos aproximadamente 15 a aproximadamente 30 aminoácidos. Como una CDR puede reconocer un péptido o polipéptido antigénico en su forma terciaria, los aminoácidos que comprenden un epítopo no necesitan ser contiguos, y en algunos casos, incluso pueden no estar en la misma cadena peptídica. En la presente descripción, el epítopo de péptido o polipéptido reconocido por los anticuerpos Sp35 de la presente descripción contiene una secuencia de al menos 4, al menos 5, al menos 6, al menos 7, más preferiblemente al menos 8, al menos 9, al menos 10, al menos 15, al menos 20, al menos 25 o entre aproximadamente 15 a aproximadamente 30 aminoácidos contiguos o no contiguos de Sp35.
Por “se une específicamente”, se quiere decir generalmente que un anticuerpo se une a un epítopo a través de su dominio de unión a antígeno y que la unión conlleva alguna complementariedad entre el dominio de unión a antígeno y el epítopo. Según esta definición, se dice que un anticuerpo “se une específicamente” a un epítopo cuando se une a ese epítopo, a través de su dominio de unión a antígeno más fácilmente de lo que se uniría a un epítopo al azar, no relacionado. El término “especificidad” se usa en la presente memoria para calificar la afinidad relativa por la que un determinado anticuerpo se une a un determinado epítopo. Por ejemplo, el anticuerpo “A” puede considerarse que tiene una mayor especificidad para un epítopo dado que el anticuerpo “B” o puede decirse que el anticuerpo “A” se une al epítopo “C” con una mayor especificidad de la que tiene para un epítopo relacionado “D”.
Por “se une preferentemente” se quiere decir que el anticuerpo se une específicamente a un epítopo más fácilmente de lo que se uniría a un epítopo relacionado, similar, homólogo o análogo. Así, un anticuerpo que “se une preferentemente” a un epítopo dado se unirá más probablemente a ese epítopo que a un epítopo relacionado, a pesar de que dicho anticuerpo puede reaccionar de manera cruzada con el epítopo relacionado.
Como ejemplo no limitativo, puede considerarse que un anticuerpo se une a un primer epítopo preferentemente si se une a dicho primer epítopo con una constante de disociación (KD) que es menor que la KD del anticuerpo para el segundo epítopo. En otro ejemplo no limitativo, puede considerarse que un anticuerpo se une a un primer antígeno preferentemente si se une al primer epítopo con una afinidad que es al menos un orden de magnitud menor que la KD del anticuerpo para el segundo epítopo. En otro ejemplo no limitativo, puede considerarse que un anticuerpo se une a un primer epítopo preferentemente si se une al primer epítopo con una afinidad que es al menos dos órdenes de magnitud menor que la KD del anticuerpo para el segundo epítopo.
En otro ejemplo no limitativo, puede considerarse que un anticuerpo se une a un primer epítopo preferentemente si se une al primer epítopo con una velocidad de disociación (k(off)) que es menor que la k(off) del anticuerpo para el segundo epítopo. En otro ejemplo no limitativo, puede considerarse que un anticuerpo se une a un primer epítopo preferentemente si se une al primer epítopo con una afinidad que es al menos un orden de magnitud menor que la k(off) del anticuerpo para el segundo epítopo. En otro ejemplo no limitativo, puede considerarse que un anticuerpo se une a un primer epítopo preferentemente si se une al primer epítopo con una afinidad que es al menos dos órdenes de magnitud menor que la k(off) del anticuerpo para el segundo epítopo.
Puede decirse que un anticuerpo o fragmento de unión a antígeno, variante o derivado descrito en la presente memoria se une a un polipéptido diana descrito en la presente memoria o un fragmento o variante de éste con una velocidad de
disociación (k(off)) de menos de o igual a 5 x 10-2 seg-1, 10-2 seg-1, 5 X 10-3 seg-1 ó 10-3 seg-1. Más preferiblemente, puede decirse que un anticuerpo de la descripción se une a un polipéptido diana descrito en la presente memoria o un fragmento o variante de éste con una velocidad de disociación (k(off)) menor de o igual a 5 X 10-4 seg-1, 10-4 seg-1, 5 X
10-5 -1
seg-1 ó 10-5 seg-1, 5 X 10-6 seg-1, 10-6 seg-1, 5 X 10-7 seg-1 ó 10-7 seg.
Puede decirse que un anticuerpo o fragmento de unión a antígeno, variante o derivado descrito en la presente memoria se une a un polipéptido diana descrito en la presente memoria o un fragmento o variante de éste con una velocidad de asociación (k(on)) mayor de o igual a 103 M-1 seg-1, 5 X 103 M-1 seg-1, 104 M-1 seg-1 ó 5 X 104 M-1 seg-1. Más preferiblemente, puede decirse que un anticuerpo de la descripción se une a un polipéptido diana descrito en la presente memoria o un fragmento o variante de éste con una velocidad de asociación (k(on)) mayor de o igual a 105 M-1 seg-1, 5 X
105 M-1 -1
seg-1, 106 M-1 seg-1 ó 5 X 106 M-1 seg-1 ó 107 M-1 seg.
Se dice que un anticuerpo inhibe competitivamente la unión de un anticuerpo de referencia a un epítopo dado si se une preferentemente a ese epítopo hasta el punto en el que bloquea, en algún grado, la unión del anticuerpo de referencia al epítopo. La inhibición competitiva puede determinarse por cualquier método conocido en la técnica, por ejemplo, ensayos de ELISA de competición. Puede decirse que un anticuerpo inhibe competitivamente la unión del anticuerpo de referencia a un epítopo dado al menos un 90%, al menos 80%, al menos 70%, al menos 60% o al menos 50%.
Tal y como se usa en la presente memoria, el término “afinidad” se refiere a una medida de la fuerza de la unión de un epítopo individual con la CDR de una molécula de inmunoglobulina. Véase, por ejemplo, Harlow et al., Antibodies: A Laboratory Manual, (Cold Spring Harbor Laboratory Press, 2ª ed. 1988) en las páginas 27-28. Tal y como se usa en la presente memoria, el término “avidez” se refiere a la estabilidad global del complejo entre una población de inmunoglobulinas y un antígeno, esto es, la fuerza de combinación funcional de una mezcla de inmunoglobulina con el antígeno. Véase, por ejemplo, Harlow en las páginas 29-34. La avidez está relacionada tanto con la afinidad de las moléculas de inmunoglobulina individuales en la población con epítopos específicos como también con las valencias de las inmunoglobulinas y el antígeno. Por ejemplo, la interacción entre un anticuerpo monoclonal bivalente y un antígeno con una estructura de epítopo altamente repetitiva, tal como un polímero, sería una de alta avidez.
Los anticuerpos Sp35 o fragmentos de unión a antígeno, variantes o derivados de éstos también pueden describirse o especificarse en términos de su reactividad cruzada. Tal y como se usa en la presente memoria, el término “reactividad cruzada” se refiere a la capacidad de un anticuerpo, específico para un antígeno, de reaccionar con un segundo antígeno; una medida de relación entre dos sustancias antigénicas diferentes. Así, un anticuerpo reacciona de manera cruzada si se une a un epítopo distinto del que indujo su formación. El epítopo que reacciona de manera cruzada contiene generalmente muchas de las mismas características estructurales complementarias que el epítopo inductor, y en algunos casos, realmente puede ajustarse mejor que el original.
Por ejemplo, determinados anticuerpos tienen algún grado de reactividad cruzada, respecto a que se unen a epítopos relacionados, pero no idénticos, por ejemplo, epítopos con al menos 95%, al menos 90%, al menos 85%, al menos 80%, al menos 75%, al menos 70%, al menos 65%, al menos 60%, al menos 55% y al menos 50% de identidad (según se calcula usando métodos conocidos en la técnica y descritos en la presente memoria) con un epítopo de referencia. Puede decirse que un anticuerpo tiene poca o ninguna reactividad cruzada si no se une a epítopos con menos de 95%, menos de 90%, menos de 85%, menos de 80%, menos de 75%, menos de 70%, menos de 65%, menos de 60%, menos de 55% y menos de 50% de identidad (según se calcula usando métodos conocidos en la técnica y descritos en la presente memoria) con un epítopo de referencia. Un anticuerpo puede considerarse “altamente específico” para un determinado epítopo, si no se une a ningún otro análogo, ortólogo u homólogo de ese epítopo.
Los anticuerpos Sp35 o fragmentos de unión a antígeno, variantes o derivados de éstos también pueden describirse o especificarse en términos de su afinidad de unión a un polipéptido. Las afinidades de unión preferidas incluyen aquellas con una constante de disociación o Kd de menos de 5 X 10-2 M, 10-2 M, 5 X 10-3 M, 10-3 M, 5 X 10-4 M, 10-4 M, 5 X 10-5 M, 10-5 M, 5 X 10-6 M, 10-6 M, 5 X 10-7 M, 10-7 M, 5 X 10-8 M, 10-8 M, 5 X 10-9 M, 10-9 M, 5 X 10-10 M, 10-10 M, 5 X 10-11 M, 10-11 M, 5 X 10-12 M, 10-12 M, 5 X 10-13 M, 10-13 M, 5 X 10-14 M, 10-14 M, 5 X 10-15 M ó 10-15 M.
Los anticuerpos Sp35 o fragmentos de unión a antígeno, variantes o derivados de éstos pueden ser “multiespecíficos”, por ejemplo, biespecíficos, triespecíficos o con una multiespecificidad mayor, lo que significa que reconoce y se une a dos o más epítopos diferentes presentes en uno o más antígenos diferentes (por ejemplo, proteínas) al mismo tiempo. Así, si un anticuerpo Sp35 es “monoespecífico” o “multiespecífico”, por ejemplo, "biespecífico", se refiere al número de epítopos diferentes con los que reacciona un polipéptido de unión. Los anticuerpos multiespecíficos pueden ser específicos para epítopos diferentes de un polipéptido diana descrito en la presente memoria o pueden ser específicos para un polipéptido diana así como para un epítopo heterólogo, tal como un polipéptido heterólogo o material de soporte sólido.
Tal y como se usa en la presente memoria, el término “valencia” se refiere al número de dominios de unión potenciales, por ejemplo, dominios de unión a antígeno, presentes en un anticuerpo Sp35, polipéptido de unión o anticuerpo. Cada
dominio de unión se une específicamente a un epítopo. Cuando un anticuerpo Sp35, polipéptido de unión o anticuerpo comprende más de un dominio de unión, cada dominio de unión puede unirse específicamente al mismo epítopo, para un anticuerpo con dos dominios de unión, denominado “monoespecífico bivalente” o a epítopos diferentes, para un anticuerpo con dos dominios de unión, denominado “biespecífico bivalente”. Un anticuerpo también puede ser biespecífico y bivalente para cada especificidad (denominado “anticuerpos tetravalentes biespecíficos”). En otro caso, pueden prepararse minicuerpos tetravalentes o anticuerpos con dominio delecionado.
Los anticuerpos bivalentes biespecíficos, y los métodos para prepararlos, se describen, por ejemplo, en las patentes U.S. Nos. 5.731.168; 5.807.706; 5.821.333: y en las Publ. Solic. U.S. Nos. 2003/020734 y 2002/0155537, incorporándose las descripciones de todas ellas por referencia en la presente memoria. Los anticuerpos tetravalentes biespecíficos, y los métodos para prepararlos, se describen, por ejemplo, en WO 02/096948 y WO 00/44788. Véanse, generalmente, las publicaciones PCT WO 93/17715; WO 92/08802; WO 91/00360; WO 92/05793; Tutt et al., J. Immunol. 147: 60-69 (1991); Pat. U.S. Nos. 4.474.893; 4.714.681; 4.925.648; 5.573.920; 5.601.819; Kostelny et al., J. Immunol. 148: 15471553 (1992).
Como se ha indicado previamente, las estructuras de subunidades y la configuración tridimensional de las regiones constantes de las diferentes clases de inmunoglobulinas son muy conocidas. Tal y como se usa en la presente memoria, el término “dominio VH” incluye el dominio variable amino terminal de una cadena pesada de inmunoglobulina y el término “dominio CH1” incluye el primer (más amino terminal) dominio de región constante de una cadena pesada de inmunoglobulina. El dominio CH1 es adyacente al dominio VH y es amino terminal respecto a la región bisagra de una molécula de cadena pesada de inmunoglobulina.
Tal y como se usa en la presente memoria, el término “dominio CH2” incluye la parte de una molécula de cadena pesada que se extiende, por ejemplo, desde aproximadamente el residuo 244 hasta el residuo 360 de un anticuerpo usando los esquemas de numeración convencionales (residuos 244 a 360, sistema de numeración Kabat; y residuos 231-340, sistema de numeración EU; véase Kabat EA et al. op. cit. El dominio CH2 es único porque no está emparejado de cerca con otro dominio. En lugar de esto, dos cadenas de carbohidrato ramificadas unidas por N están interpuestas entre los dos dominios CH2 de una molécula IgG nativa intacta. También está bien documentado que el dominio CH3 se extiende desde el dominio CH2 al C terminal de la molécula IgG y comprende aproximadamente 108 residuos.
Tal y como se usa en la presente memoria, el término “región bisagra” incluye la parte de una molécula de cadena pesada que une el dominio CH1 con el dominio CH2. Esta región bisagra comprende aproximadamente 25 residuos y es flexible, permitiendo de esta manera que las dos regiones de unión a antígeno N terminales se muevan independientemente. Las regiones bisagra pueden subdividirse en tres dominios distintos: dominios bisagra superior, medio e inferior (Roux et al., J. Immunol. 161: 4083 (1998)).
Tal y como se usa en la presente memoria, el término “enlace disulfuro” incluye el enlace covalente formado entre dos átomos de azufre. El aminoácido cisteína comprende un grupo tiol que puede formar un enlace o puente disulfuro con un segundo grupo tiol. En la mayor parte de las moléculas IgG naturales, las regiones CH1 y CL están unidas por un enlace disulfuro y las dos cadenas pesadas están unidas por dos enlaces disulfuro en posiciones correspondientes a 239 y 242 usando el sistema de numeración Kabat (posición 226 ó 229, sistema de numeración EU).
Tal y como se usa en la presente memoria, el término “anticuerpo quimérico” se mantendrá para significar cualquier anticuerpo en el que la región o sitio inmunoreactivo se obtiene o deriva de una primera especie y la región constante (que puede ser intacta, parcial o modificada según la descripción) se obtiene de una segunda especie. En casos preferidos, la región o sitio de unión diana será de una fuente no humana (por ejemplo, ratón o primate) y la región constante es humana.
Tal y como se usa en la presente memoria, el término “anticuerpo preparado por ingeniería” se refiere a un anticuerpo en el que el dominio variable en cualquiera de la cadena pesada y ligera o ambas está alterado por al menos el reemplazo parcial de una o más CDR de un anticuerpo con especificidad conocida y, si es necesario, por reemplazo parcial de la región marco y cambio de secuencia. Aunque las CDR pueden derivar de un anticuerpo de la misma clase o incluso subclase que el anticuerpo del que se derivan las regiones marco, se prevé que las CDR se derivarán de un anticuerpo de una clase diferente y preferiblemente de un anticuerpo de una especie diferente. Un anticuerpo preparado por ingeniería en el que se injertan una o más CDR “donantes” de un anticuerpo no humano con especificidad conocida en una región marco de cadena pesada o ligera humana se refiere en la presente memoria como un “anticuerpo humanizado”. Puede no ser necesario reemplazar todas las CDR con las CDR completas de la región variable del donante para transferir la capacidad de unión a antígeno de un dominio variable a otro. En lugar de esto, puede ser necesario sólo transferir aquellos residuos que son necesarios para mantener la actividad del sitio de unión diana. Dadas las explicaciones mostradas, por ejemplo, en las Pat. U. S. Nos. 5.585.089, 5.693.761, 5.693.762 y 6.180.370, estará dentro de la competencia de los expertos en la técnica, bien llevando a cabo experimentación rutinaria o por ensayo de prueba y error, obtener un anticuerpo preparado por ingeniería o humanizado funcional.
Tal y como se usa en la presente memoria, el término “polipéptido plegado apropiadamente” incluye polipéptidos (por ejemplo, anticuerpos Sp35) en los que todos los dominios funcionales que comprenden el polipéptido son claramente activos. Tal y como se usa en la presente memoria, el término “polipéptido plegado inapropiadamente” incluye polipéptidos en los que al menos uno de los dominios funcionales del polipéptido no es activo. En un caso, un polipéptido plegado apropiadamente comprende cadenas polipeptídicas unidas por al menos un enlace disulfuro y, a la inversa, un polipéptido plegado inapropiadamente comprende cadenas polipeptídicas no unidas por al menos un enlace disulfuro.
Tal y como se usa en la presente memoria, el término “preparado por ingeniería” incluye la manipulación de moléculas de ácido nucleico o polipéptido por medios sintéticos (por ejemplo, por técnicas recombinantes, síntesis de péptidos in vitro, por acoplamiento enzimático o químico de péptidos o alguna combinación de estas técnicas).
Tal y como se usan en la presente memoria, los términos “unido”, “fusionado” o “fusión” se usan indistintamente. Estos términos se refieren a la unión entre sí de dos o más elementos o componentes, por cualquier medio incluyendo conjugación química o medios recombinantes. Una “fusión en marco” se refiere a la unión de dos o más marcos de lectura abiertos (ORF) de polinucleótidos para formar un ORF continuo, más largo, de una manera que mantiene el marco de lectura de traducción correcto de los ORF originales. Así, una proteína de fusión recombinante es una única proteína que contiene dos o más segmentos que corresponden a polipéptidos codificados por los ORF originales (segmentos que normalmente no están así unidos en la naturaleza). Aunque el marco de lectura se hace así continuo a lo largo de los segmentos fusionados, los segmentos pueden estar físicamente o espacialmente separados, por ejemplo, por secuencia conectora en marco. Por ejemplo, los polinucleótidos que codifican las CDR de la región variable de una inmunoglobulina pueden estar fusionados, en marco, pero estar separados por un polinucleótido que codifica al menos una región marco de inmunoglobulina o regiones CDR adicionales, siempre que las CDR “fusionadas” se co-traduzcan como parte de un polipéptido continuo.
En el contexto de los polipéptidos, una “secuencia lineal” o una “secuencia” es un orden de aminoácidos en un polipéptido en una dirección amino a carboxi terminal en el que los residuos que son vecinos entre sí en la secuencia son contiguos en la estructura primaria del polipéptido.
El término “expresión” tal y como se usa en la presente memoria se refiere a un proceso por el que un gen produce un producto bioquímico, por ejemplo, un ARN o polipéptido. El proceso incluye cualquier manifestación de la presencia funcional del gen en la célula incluyendo, sin limitación, inactivación génica así como tanto expresión temporal como expresión estable. Incluye sin limitación la transcripción del gen en ARN mensajero (ARNm), ARN de transferencia (ARNt), ARN en horquilla pequeño (ARNsh), ARN de interferencia pequeño (ARNsi) o cualquier otro producto de ARN y la traducción de dicho ARNm en polipéptido(s). Si el producto final deseado es un producto bioquímico, la expresión incluye la creación de ese producto bioquímico y cualquier precursor. La expresión de un gen produce un “producto génico”. Tal y como se usa en la presente memoria, un producto génico puede ser bien un ácido nucleico, por ejemplo, un ARN mensajero producido por la transcripción de un gen, o un polipéptido que se traduce a partir de un transcrito. Los productos génicos descritos en la presente memoria incluyen además ácidos nucleicos con modificaciones posteriores a la transcripción, por ejemplo, poliadenilación, o polipéptidos con modificaciones posteriores a la traducción, por ejemplo, metilación, glicosilación, la adición de lípidos, asociación con otras subunidades proteicas, escisión proteolítica y semejantes.
Tal y como se usan en la presente memoria, los términos “tratar” o “tratamiento” se refieren tanto al tratamiento terapéutico como a las medidas profilácticas o preventivas, en el que el objeto es prevenir o ralentizar (disminuir) un cambio o trastorno fisiológico no deseado, tal como la progresión de esclerosis múltiple. Los resultados clínicos beneficiosos o deseados incluyen, pero no están limitados a, alivio de los síntomas, disminución del grado de la enfermedad, estado estabilizado (es decir, sin empeoramiento) de la enfermedad, retraso o ralentización de la progresión de la enfermedad, mejora o paliación del estado de la enfermedad y remisión (ya sea parcial o total), ya sea detectable o indetectable. “Tratamiento” también puede significar prolongar la supervivencia comparado con la supervivencia esperada si no se recibe tratamiento. Aquellos que necesitan tratamiento incluyen aquellos que ya presentan la afección o trastorno así como aquellos con tendencia a tener la afección o trastorno o aquellos en los que se quiere prevenir la afección o trastorno.
Por “sujeto” o ”individuo” o “animal” o “paciente” o “mamífero” se quiere decir cualquier sujeto, particularmente un sujeto mamífero, para el que se desea diagnóstico, pronóstico o terapia. Los sujetos mamíferos incluyen seres humanos, animales domésticos, animales de granja y animales de zoo, usados en deportes o de compañía, tales como perros, gatos, cobayas, conejos, ratas, ratones, caballos, ganado, vacas, etc.
Tal y como se usan en la presente memoria, las expresiones tales como “un sujeto que se beneficiaría de la administración de un anticuerpo Sp35” y “un animal que necesita tratamiento” incluyen sujetos, tales como sujetos mamíferos, que se beneficiarían de la administración de un anticuerpo Sp35 usado, por ejemplo, para la detección de un polipéptido Sp35 (por ejemplo, para un procedimiento de diagnóstico) y/o del tratamiento, es decir, paliación o
prevención de una enfermedad tal como MS, con un anticuerpo Sp35. Como se describe con más detalle en la presente memoria, el anticuerpo Sp35 puede usarse en forma no conjugada o puede conjugarse, por ejemplo, con un fármaco, profármaco o un isótopo.
II. Sp35
5 El Sp35 humano natural (Sp35) es una proteína glicosilada específica del sistema nervioso central que se predice que tiene 614 aminoácidos (SEQ ID NO: 2), incluyendo una secuencia señal de 33 aminoácidos. Sp35 también se conoce en la técnica por los nombres LINGO-1, LRRN6, LRRN6A, FLJ14594, LERN1, MGC17422 y UNQ201. El polipéptido Sp35 humano, de longitud completa de tipo salvaje contiene un dominio LRR que consiste en 14 repeticiones ricas en leucina (incluyendo caperuzas N y C terminales), un dominio Ig, una región transmembrana y un dominio citoplásmico. El
10 dominio citoplásmico contiene un sitio de fosforilación de tirosina canónico. Además, la proteína Sp35 natural contiene una secuencia señal, una región básica corta entre el dominio LRRCT e Ig y una región transmembrana entre el dominio Ig y el dominio citoplásmico. El gen Sp35 humano (SEQ ID NO: 1) contiene codones de inicio de la traducción alternativos, de manera que seis aminoácidos adicionales, es decir, MQVSKR (SEQ ID NO:3 ) pueden estar o pueden no estar presentes en el extremo N de la secuencia señal de Sp35. La Tabla 2 lista los dominios de Sp35 y otras regiones,
15 según el número de residuo de aminoácido, tomando como base la secuencia de aminoácidos de Sp35 presentada en la presente memoria como SEQ ID NO: 2. El polipéptido Sp35 se caracteriza con más detalle en la Publicación PCT No. WO 2004/085648.
Tabla 2 – Dominios de Sp35
La distribución tisular y expresión en el desarrollo de Sp35 se han estudiado en seres humanos y ratas. La biología de Sp35 se ha estudiado en un modelo animal experimental (rata). La expresión de Sp35 de rata está localizada en neuronas y oligodendrocitos, según se determina por transferencia northern y tinción inmuno-histoquímica. El nivel de
expresión del ARNm de Sp35 de rata está regulado por el desarrollo, con un pico poco después del nacimiento, es decir, aproximadamente en el día uno postnatal. En un modelo de lesión por transección de la médula espinal en rata, Sp35 está regulado al alza en el sitio de la lesión, según se determina por RT-PCR. Véase Mi et al. Nature Neurosci. 7: 221228 (2004).
5 En el contexto de los aminoácidos que comprenden los diferentes dominios estructurales y funcionales de un polipéptido Sp35, el término “aproximadamente” incluye el valor recitado particularmente y los valores mayores o menores por varios (por ejemplo, 10, 9, 8, 7, 6, 5, 4, 3, 2 ó 1) aminoácidos. Como la localización de estos dominios según se lista en la Tabla 1 se ha predicho por gráficos de ordenador, un experto en la técnica apreciará que los residuos de aminoácidos que constituyen los dominios pueden variar ligeramente (por ejemplo, por aproximadamente 1 a 15 residuos) dependiendo de
10 los criterios usados para definir el dominio.
Los inventores han descubierto que Sp35 de tipo salvaje, de longitud completa se une a NgR1. Véase la Publicación PCT No. WO 2004/085648. Los inventores también han descubierto que Sp35 se expresa en oligodendrocitos y que la proteína Sp35 está implicada en la regulación de la mielinización de axones mediada por oligodendrocitos. Véase la Publicación de Patente U.S. No. 2006/0009388 A1.
15 La secuencia de nucleótidos para la molécula Sp35 de longitud completa es como sigue:
La secuencia polipeptídica para el polipéptido Sp35 de longitud completa es como sigue:
III. Anticuerpos Sp35
En un caso, la presente descripción está dirigida a anticuerpos Sp35, o fragmentos de unión a antígeno, variantes o derivados de éstos. Por ejemplo, la presente descripción incluye al menos los dominios de unión a antígeno de 5 determinados anticuerpos monoclonales, y fragmentos, variantes y derivados de éstos mostrados en las Tablas 3A a 3E.
La Tabla 3A describe las regiones del polipéptido Sp35 que están unidas por determinados anticuerpos de longitud completa derivados de bibliotecas de fagos. Estos anticuerpos tienen las mismas regiones variables que los fragmentos Fab derivados de la Biblioteca de Exposición en Fagos-1, según se indica en la Tabla 3B (por ejemplo, D05 en la Tabla 3A tiene la misma región variable que Li05 en la Tabla 3B, D06 en la Tabla 3A tiene la misma región variable que Li06 en
10 la Tabla 3B, etc.). Los anticuerpos se ensayaron para unión a fragmentos Sp35 según se define en la Tabla 3A, usando métodos muy conocidos en la técnica.
Las Tablas 3B-3E describen la capacidad de los anticuerpos monoclonales nombrados o fragmentos Fab para detectar Sp35 en varios ensayos tales como: Separación Celular Activada por Fluorescencia (FACS), Inmunoprecipitación (IP), Análisis por transferencia Western, Inmunohistoquímica (IHC) y Ensayo Inmunoabsorbente Ligado a Enzima (ELISA). 15 Los protocolos detallados para realizar estos ensayos se describen en la presente memoria o son muy conocidos y entendidos por los expertos en la técnica. Los anticuerpos monoclonales derivados de hibridoma listados en las Tablas 3B y 3C se produjeron por inyección de Sp35 soluble a ratones y se aislaron usando tecnología de hibridoma que es muy conocida en la técnica y se describe en la presente memoria. Los anticuerpos monoclonales y fragmentos Fab de anticuerpos listados en la Tabla 3B se aislaron a partir de dos bibliotecas de exposición en fago diferentes usando
20 técnicas conocidas en la técnica.
Tabla 3A
Fragmento Sp35
D03 (Región Variable de Li03) D05 (Región Variable de Li05) D06 (Región Variable de Li06) D08 (Región Variable de Li08) D11 (Región Variable de Li03) D13 (Región Variable de Li13) D33 (Región Variable de Li33)
1-432 Fc de rata
+ + + - + - +
417-493 Fc de rata
- +/ +/- - - - -
Ap-Sp35 (1419)
N/D + -/+ -/+ N/D N/D N/D
Ap-Sp35 (418-498)
N/D - - - N/D N/D N/D
417-498 Fc humano
- - - - - - -
417-503 Fc humano
- - - - - - -
363-498 Fc humano
- - - - - - -
244-498 Fc humano
- - - - - - -
Tal y como se usa en la presente memoria, el término “domino de unión a antígeno” incluye un sitio que se une específicamente a un epítopo en un antígeno (por ejemplo, un epítopo de Sp35). El dominio de unión a antígeno de un anticuerpo incluye típicamente al menos una parte de una región variable de cadena pesada de inmunoglobulina y al menos una parte de una región variable de cadena ligera de inmunoglobulina. El sitio de unión formado por estas regiones variables determina la especificidad del anticuerpo.
La presente descripción está dirigida más específicamente a un anticuerpo Sp35, o fragmento de unión a antígeno, variante o derivados de éste, en el que el anticuerpo Sp35 se une al mismo epítopo que un anticuerpo monoclonal seleccionado del grupo que consiste en 201’, 3A3, 3A6, 1A7, 1G7, 2B10, 2C11, 2F3, 3P1D10.2C3, 3P1E11.3B7, 3P2C6.3G10.2H7, 3P2C9.2G4, 3P4A6.1D9, 3P4A1.2B9, 3P4C2.2D2, 3P4C5.1D8, 3P4C8.2G9, 30-C12 (Li01), 38-D01 (Li02), 35-E04 (Li03), 36-C09 (Li04), 30-A11 (Li05), 34-F02 (Li06), 29-E07 (Li07), 34-G04 (Li08), 36-A12 (Li09), 28-D02 (Li10), 30-B01 (Li11), 34-B03 (Li12), Li13, Li32, Li33, Li34, 3383 (L1a.1), 3495 (L1a.2), 3563 (L1a.3), 3564 (L1a.4), 3565 (L1a.5), 3566 (L1a.6), 3567 (L1a.7), 3568 (L1a.8), 3569 (L1a.9), 3570 (L1a.10), 3571 (L1a.11), 3582 (L1a.12), 1968 (L1a.13), 7P1D5.1G9, 3B5.2 y Li81.
La descripción está encaminada adicionalmente a un anticuerpo Sp35, o fragmento de unión a antígeno, variante o derivados de éste, en el que el anticuerpo Sp35 inhibe competitivamente la unión de un anticuerpo monoclonal seleccionado del grupo que consiste en 201’, 3A3, 3A6, 1A7, 1G7, 2B10, 2C11, 2F3, 3P1D10.2C3, 3P1E11.3B7, 3P2C6.3G10.2H7, 3P2C9.2G4, 3P4A6.1D9, 3P4A1.2B9, 3P4C2.2D2, 3P4C5.1D8, 3P4C8.2G9, 30-C12 (Li01), 38-D01 (Li02), 35-E04 (Li03), 36-C09 (Li04), 30-A11 (Li05), 34-F02 (Li06), 29-E07 (Li07), 34-G04 (Li08), 36-A12 (Li09), 28-D02 (Li10), 30-B01 (Li11), 34-B03 (Li12), Li13, Li32, Li33, Li34, 3383 (L1a.1), 3495 (L1a.2), 3563 (L1a.3), 3564 (L1a.4), 3565 (L1a.5), 3566 (L1a.6), 3567 (L1a.7), 3568 (L1a.8), 3569 (L1a.9), 3570 (L1a.10), 3571 (L1a.11), 3582 (L1a.12), 1968 (L1a.13), 7P1D5.1G9, 3B5.2 y Li81a Sp35.
La descripción también está encaminada a un anticuerpo Sp35, o fragmento de unión a antígeno, variante o derivados de éste, en el que el anticuerpo Sp35 comprende al menos la región de unión a antígeno de un anticuerpo monoclonal seleccionado del grupo que consiste en 201’, 3A3, 3A6, 1A7, 1G7, 2B10, 2C11, 2F3, 3P1D10.2C3, 3P1E11.3B7, 3P2C6.3G10.2H7, 3P2C9.2G4, 3P4A6.1D9, 3P4A1.2B9, 3P4C2.2D2, 3P4C5.1D8, 3P4C8.2G9, 30-C12 (Li01), 38-D01 (Li02), 35-E04 (Li03), 36-C09 (Li04), 30-A11 (Li05), 34-F02 (Li06), 29-E07 (Li07), 34-G04 (Li08), 36-A12 (Li09), 28-D02 (Li10), 30-B01 (Li11), 34-B03 (Li12), Li13, Li32, Li33, Li34, 3383 (L1a.1), 3495 (L1a.2), 3563 (L1a.3), 3564 (L1a.4), 3565 (L1a.5), 3566 (L1a.6), 3567 (L1a.7), 3568 (L1a.8), 3569 (L1a.9), 3570 (L1a.10), 3571 (L1a.11), 3582 (L1a.12), 1968 (L1a.13), 7P1D5.1G9, 3B5.2 y Li81.
El 27 de diciembre, 2006, los hibridomas siguientes se depositaron en la American Type Culture Collection (ATCC) en Manassas, VA: 2.P3B5.2 (Designación de Depósito ATCC PTA-8106), 7.P1D5.1.G9 (Designación de Depósito ATCC PTA- 8107). El hibridoma depositado 2.P3B5.2 produce el anticuerpo monoclonal 3B5.2, descrito en la presente memoria y el hibridoma depositado 7.P1D5.1.G9 produce el anticuerpo monoclonal 7P1D5.1.G9, descrito en la presente memoria. Los hibridomas pueden cultivarse según métodos muy conocidos en la técnica y descritos en la presente memoria.
En determinados casos, la presente descripción está dirigida a un anticuerpo, o fragmento de unión a antígeno, variante
o derivados de éste que se une específicamente o preferentemente a un fragmento o dominio particular del polipéptido Sp35. Dichos fragmentos del polipéptido Sp35 incluyen, pero no están limitados a, un polipéptido Sp35 que comprende, consiste esencialmente en, o consiste en los aminoácidos 34 a 532; 34 a 417; 34 a 425; 34 a 493; 66 a 532; 66 a 417; 66 a 426; 66 a 493; 66 a 532; 417 a 532; 417 a 425 (la región básica de Sp35); 417 a 493; 417 a 532; 419 a 493 (la región Ig de Sp35); ó 425 a 532 de SEQ ID NO: 2; o un polipéptido variante de Sp35 al menos 70%, 75%, 80%, 85%, 90% ó 95% idéntico a los aminoácidos 34 a 532; 34 a 417; 34 a 425; 34 a 493; 66 a 532; 66 a 417; 66 a 426; 66 a 493; 66 a 532; 417 a 532; 417 a 425 (la región básica de Sp35); 417 a 493; 417 a 532; 419 a 493 (la región Ig de Sp35); ó 425 a 532 de SEQ ID NO: 2.
Los fragmentos peptídicos adicionales de Sp35 a los que se unen determinados anticuerpos, o fragmentos de unión a antígeno, variantes, o derivados de éstos de la presente descripción incluyen, pero no están limitados a, aquellos fragmentos que comprenden, consisten esencialmente en, o consisten en una o más repeticiones ricas en leucina (LRR) de Sp35. Dichos fragmentos, incluyen, por ejemplo, fragmentos que comprenden, consisten esencialmente en, o consisten en los aminoácidos 66 a 89; 66 a 113; 66 a 137; 90 a 113; 114 a 137; 138 a 161; 162 a 185; 186 a 209; 210 a 233; 234 a 257; 258 a 281; 282 a 305; 306 a 329; ó 330 a 353 de SEQ ID NO: 2. También se contemplan los fragmentos correspondientes de un polipéptido variante Sp35 al menos 70%, 75%, 80%, 85%, 90% ó 95% idéntico a los aminoácidos 66 a 89; 66 a 113; 90 a 113; 114 a 137; 138 a 161; 162 a 185; 186 a 209; 210 a 233; 234 a 257; 258 a 281; 282 a 305; 306 a 329; ó 330 a 353 de SEQID NO: 2.
Los fragmentos peptídicos adicionales de Sp35 a los que se unen determinados anticuerpos, o fragmentos de unión a antígeno, variantes, o derivados de éstos de la presente descripción incluyen, pero no están limitados a, aquellos fragmentos que comprenden, consisten esencialmente en, o consisten en una o más regiones ricas en cisteína que
flanquean la LRR de Sp35. Dichos fragmentos, incluyen, por ejemplo, un fragmento que comprende, consiste esencialmente en, o consiste en los aminoácidos 34 a 64 de SEQ ID NO: 2 (la región flanqueante de LRR N-terminal (LRRNT)), o un fragmento que comprende, consiste esencialmente en, o consiste en los aminoácidos 363 a 416 de SEQ ID NO: 2 (la región flanqueante de LRR C-terminal (LRRCT)). También se contemplan los fragmentos correspondientes de un polipéptido variante Sp35 al menos 70%, 75%, 80%, 85%, 90% ó 95% idéntico a los aminoácidos 34 a 64 y 363 a 416 de SEQ ID NO: 2.
Como se conoce en la técnica, la “identidad de secuencia” entre dos polipéptidos se determina comparando la secuencia de aminoácidos de un polipéptido con la secuencia de un segundo polipéptido. Cuando se discute en la presente memoria, si cualquier polipéptido particular es al menos aproximadamente 70%, 75%, 80%, 85%, 90% ó 95% idéntico a otro polipéptido puede determinarse usando métodos y programas informáticos/software conocidos en la técnica tal como, pero no limitado a, el programa BESTFIT (Wisconsin Sequence Analysis Package, Versión 8 para Unix, Genetics Computer Group, University Research Park, 575 Science Drive, Madison, WI 53711). BESTFIT usa el algoritmo de homología local de Smith y Waterman, Advances in Applied Mathematics 2: 482-489 (1981), para encontrar el mejor segmento de homología entre dos secuencias. Cuando se usa BESTFIT u otro programa de alineamiento de secuencia para determinar si una secuencia particular es, por ejemplo, 95% idéntica a una secuencia de referencia según la presente descripción, los parámetros se ajustan, por supuesto, de manera que el porcentaje de identidad se calcula sobre la longitud completa de la secuencia del polipéptido de referencia y se permiten los huecos en homología de hasta 5% del número total de aminoácidos en la secuencia de referencia.
Los fragmentos peptídicos adicionales de Sp35 a los que se unen determinados anticuerpos, o fragmentos de unión a antígeno, variantes, o derivados de éstos de la presente descripción incluyen, pero no están limitados a, aquellos fragmentos que comprenden, consisten esencialmente en, o consisten en los aminoácidos 41 a 525 de SEQ ID NO: 2; 40 a 526 de SEQ ID NO: 2; 39 a 527 de SEQ ID NO: 2; 38 a 528 de SEQ ID NO: 2; 37 a 529 de SEQ ID NO: 2; 36 a 530 de SEQ ID NO: 2; 35 a 531 de SEQ ID NO: 2; 34 a 531 de SEQ ID NO: 2; 46 a 520 de SEQ ID NO: 2; 45 a 521 de SEQ ID NO: 2; 44 a 522 de SEQ ID NO: 2; 43 a 523 de SEQ ID NO: 2; y 42 a 524 de SEQ ID NO: 2.
Los fragmentos peptídicos adicionales más de Sp35 a los que se unen determinados anticuerpos, o fragmentos de unión a antígeno, variantes, o derivados de éstos de la presente descripción incluyen, pero no están limitados a, aquellos fragmentos que comprenden, consisten esencialmente en, o consisten en los aminoácidos 1 a 33 de SEQ ID NO: 2; 1 a 35 de SEQ ID NO: 2; 34 a 64 de SEQ ID NO: 2; 36 a 64 de SEQ ID NO: 2; 66 a 89 de SEQ ID NO: 2; 90 a 113 de SEQ ID NO: 2; 114 a 137 de SEQ ID NO: 2; 138 a 161 de SEQ ID NO: 2; 162 a 185 de SEQ ID NO: 2; 186 a 209 de SEQ ID NO: 2; 210 a 233 de SEQ ID NO: 2; 234 a 257 de SEQ ID NO: 2; 258 a 281 de SEQ ID NO: 2; 282 a 305 de SEQ ID NO: 2; 306 a 329 de SEQ ID NO: 2; 330 a 353 de SEQ ID NO: 2; 363 a 416 de SEQ ID NO: 2; 417 a 424 de SEQ ID NO: 2; 419 a 493 de SEQ ID NO: 2; y 494 a 551 de SEQ ID NO: 2.
Incluso adicionalmente, los fragmentos peptídicos de Sp35 a los que se unen determinados anticuerpos, o fragmentos de unión a antígeno, variantes, o derivados de éstos de la presente descripción incluyen, pero no están limitados a, aquellos fragmentos que comprenden, consisten esencialmente en, o consisten en los aminoácidos 1 a 33 de SEQ ID NO: 2; 1 a 35 de SEQ ID NO: 2; 1 a 64 de SEQ ID NO: 2; 1 a 89 de SEQ ID NO: 2; 1 a 113 de SEQ ID NO: 2; 1 a 137 de SEQ ID NO: 2; 1 a 161 de SEQ ID NO: 2; 1 a 185 de SEQ ID NO: 2; 1 a 209 de SEQ ID NO: 2; 1 a 233 de SEQ ID NO: 2; 1 a 257 de SEQ ID NO: 2; 1 a 281 de SEQ ID NO: 2; 1 a 305 de SEQ ID NO: 2; 1 a 329 de SEQ ID NO: 2; 1 a 353 de SEQ ID NO: 2; 1 a 416 de SEQ ID NO: 2; 1 a 424 de SEQ ID NO: 2; 1 a 493 de SEQ ID NO: 2; 1 a 551 de SEQ ID NO: 2; 1 a 531 de SEQ ID NO: 2 y 1 a 532 de SEQ ID NO: 2.
Los fragmentos peptídicos adicionales de Sp35 a los que se unen determinados anticuerpos, o fragmentos de unión a antígeno, variantes, o derivados de éstos de la presente descripción incluyen, pero no están limitados a, aquellos fragmentos que comprenden, consisten esencialmente en, o consisten en los aminoácidos 34 a 64 de SEQ ID NO: 2; 34 a 89 de SEQ ID NO: 2; 34 a 113 de SEQ ID NO: 2; 34 a 137 de SEQ ID NO: 2; 34 a 161 de SEQ ID NO: 2; 34 a 185 de SEQ ID NO: 2; 34 a 209 de SEQ ID NO: 2; 34 a 233 de SEQ ID NO: 2; 34 a 257 de SEQ ID NO: 2; 34 a 281 de SEQ ID NO: 2; 34 a 305 de SEQ ID NO: 2; 34 a 329 de SEQ ID NO: 2; 34 a 353 de SEQ ID NO: 2; 34 a 416 de SEQ ID NO: 2; 34 a 424 de SEQ ID NO:2;34 a 493 de SEQ ID NO: 2; y 34 a 551 de SEQ IDNO: 2.
Más fragmentos peptídicos adicionales de Sp35 a los que se unen determinados anticuerpos, o fragmentos de unión a antígeno, variantes, o derivados de éstos de la presente descripción incluyen, pero no están limitados a, aquellos fragmentos que comprenden, consisten esencialmente en, o consisten en los aminoácidos 34 a 530 de SEQ ID NO: 2; 34 a 531 de SEQ ID NO: 2; 34 a 532 de SEQ ID NO: 2; 34 a 533 de SEQ ID NO: 2; 34 a 534 de SEQ ID NO: 2; 34 a 535 de SEQ ID NO: 2; 34 a 536 de SEQ ID NO: 2; 34 a 537 de SEQ ID NO: 2; 34 a 538 de SEQ ID NO: 2; 34 a 539 de SEQ ID NO: 2; 30 a 532 de SEQ IDNO: 2; 31 a 532 de SEQ ID NO: 2; 32 a 532 de SEQ ID NO: 2; 33 a 532 de SEQ ID NO: 2; 34 a 532 de SEQ ID NO: 2; 35 a 532 de SEQ ID NO: 2; 36 a 532 de SEQ ID NO: 2; 30 a 531 de SEQ ID NO: 2; 31 a 531 de SEQ ID NO: 2; 32 a 531 de SEQ ID NO: 2; 33 a 531 de SEQ ID NO: 2; 34 a 531 de SEQ ID NO: 2; 35 a 531 de SEQ ID NO: 2; y 36 a 531 de SEQ ID NO: 2.
Incluso adicionalmente, los fragmentos peptídicos de Sp35 a los que se unen determinados anticuerpos, o fragmentos de unión a antígeno, variantes, o derivados de éstos de la presente descripción incluyen, pero no están limitados a, aquellos fragmentos que comprenden, consisten esencialmente en, o consisten en los aminoácidos 36 a 64 de SEQ ID NO: 2; 36 a 89 de SEQ ID NO: 2; 36 a 113 de SEQ ID NO: 2; 36 a 137 de SEQ ID NO: 2; 36 a 161 de SEQ ID NO: 2; 36 a 185 de SEQ ID NO: 2; 36 a 209 de SEQ ID NO: 2; 36 a 233 de SEQ ID NO: 2; 36 a 257 de SEQ ID NO: 2; 36 a 281 de SEQ ID NO: 2; 36 a 305 de SEQ ID NO: 2; 36 a 329 de SEQ ID NO: 2; 36 a 353 de SEQ ID NO: 2; 36 a 416 de SEQ ID NO: 2; 36 a 424 de SEQ ID NO: 2; 36 a 493 de SEQ ID NO: 2; y 36 a 551 de SEQ ID NO: 2.
Los fragmentos peptídicos adicionales de Sp35 a los que se unen determinados anticuerpos, o fragmentos de unión a antígeno, variantes, o derivados de éstos de la presente descripción incluyen, pero no están limitados a, aquellos fragmentos que comprenden, consisten esencialmente en, o consisten en los aminoácidos 36 a 530 de SEQ ID NO: 2; 36 a 531 de SEQ ID NO: 2; 36 a 532 de SEQ ID NO: 2; 36 a 533 de SEQ ID NO: 2; 36 a 534 de SEQ ID NO: 2; 36 a 535 de SEQ ID NO: 2; 36 a 536 de SEQ ID NO: 2; 36 a 537 de SEQ ID NO: 2; 36 a 538 de SEQ ID NO: 2; y36 a 539 de SEQ ID NO: 2.
Más fragmentos peptídicos de Sp35 a los que se unen determinados anticuerpos, o fragmentos de unión a antígeno, variantes, o derivados de éstos de la presente descripción incluyen, pero no están limitados a, aquellos fragmentos que comprenden, consisten esencialmente en, o consisten en los aminoácidos 417 a 493 de SEQ ID NO: 2; 417 a 494 de SEQ ID NO: 2; 417 a 495 de SEQ ID NO: 2; 417 a 496 de SEQ ID NO: 2; 417 a 497 de SEQ ID NO: 2; 417 a 498 de SEQ ID NO: 2; 417 a 499 de SEQ ID NO: 2; 417 a 500 de SEQ ID NO: 2; 417 a 492 de SEQ ID NO: 2; 417 a 491 de SEQ ID NO: 2; 412 a 493 de SEQ ID NO: 2; 413 a 493 de SEQ ID NO: 2; 414 a 493 de SEQ ID NO: 2; 415 a 493 de SEQ ID NO: 2; 416 a 493 de SEQ ID NO: 2; 411 a 493 de SEQ ID NO: 2; 410 a 493 de SEQ ID NO: 2; 410 a 494 de SEQ ID NO: 2; 411 a 494 de SEQ ID NO: 2; 412 a 494 de SEQ ID NO: 2; 413 a 494 de SEQ ID NO: 2; 414 a 494 de SEQ IDNO:2; 415 a494 de SEQ ID NO: 2; 416 a 494deSEQ ID NO: 2; 417 a494 deSEQ IDNO:2; y418 a494de SEQ ID NO: 2.
En un caso adicional, los fragmentos peptídicos de Sp35 a los que se unen determinados anticuerpos, o fragmentos de unión a antígeno, variantes, o derivados de éstos de la presente descripción incluyen, un polipéptido Sp35 que comprende, consiste esencialmente en, o consiste en péptidos del dominio Ig de Sp35 o fragmentos, variantes o derivados de dichos polipéptidos. Específicamente, los polipéptidos que comprenden, consisten esencialmente en, o consisten en las secuencias de polipéptido siguientes: ITX1X2X3 (SEQ ID NO: 287), ACX1X2X3 (SEQ ID NO: 288), VCX1X2X3 (SEQ ID NO: 289) y SPX1X2X3 (SEQ ID NO: 290) en el que X1 es lisina, arginina, histidina, glutamina o asparagina, X2 es lisina, arginina, histidina, glutamina o asparagina y X3 es lisina, arginina, histidina, glutamina o asparagina. Por ejemplo, los fragmentos peptídicos de Sp35 a los que se unen determinados anticuerpos, o fragmentos de unión a antígeno, variantes, o derivados de éstos de la presente descripción incluyen aquellos fragmentos que comprenden, consisten esencialmente en, o consisten en las secuencias de polipéptido siguientes: SPRKH (SEQ ID NO: 291), SPRKK (SEQ ID NO: 292), SPRKR (SEQ ID NO: 293), SPKKH (SEQ ID NO: 294), SPHKH (SEQ ID NO: 295), SPRRH (SEQ ID NO: 296), SPRHH (SEQ ID NO: 297), SPRRR (SEQ ID NO: 298), SPHHH (SEQ ID NO: 299), SPKKK (SEQ ID NO: 300), LSPRKH (SEQ ID NO: 301), LSPRKK (SEQ ID NO: 302), LSPRKR (SEQ ID NO: 303), LSPKKH (SEQ ID NO: 304), LSPHKH (SEQ ID NO: 305), LSPRRH (SEQ ID NO: 306), LSPRHH (SEQ ID NO: 307), LSPRRR (SEQ ID NO: 308), LSPHHH (SEQ ID NO: 309), LSPKKK (SEQ ID NO: 310), WLSPRKH (SEQ ID NO: 311), WLSPRKK (SEQ ID NO: 312), WLSPRKR (SEQ ID NO: 313), WLSPKKH (SEQ ID NO: 314), WLSPHKH (SEQ ID NO: 315), WLSPRRH (SEQ ID NO: 316), WLSPRHH (SEQ ID NO: 317), WLSPRRR (SEQ ID NO: 318), WLSPHHH (SEQ ID NO: 319), WLSPKKK (SEQ ID NO: 320). Estos polipéptidos Sp35 incluyen el “bucle RKH” básico (Arginina-Lisina-Histidina, aminoácidos 456-458) en el dominio Ig de Sp35. Los péptidos Sp35 adicionales que incluyen un tripéptido básico son ITPKRR (SEQ ID NO: 321), ACHHK (SEQ ID NO: 322) y VCHHK (SEQ ID NO: 323).
Los fragmentos peptídicos adicionales de Sp35 a los que se unen determinados anticuerpos, o fragmentos de unión a antígeno, variantes, o derivados de éstos de la presente descripción incluyen, un polipéptido Sp35 que comprende, consiste esencialmente en, o consiste en péptidos del dominio Ig de Sp35 o fragmentos, variantes o derivados de dichos polipéptidos. Específicamente, los péptidos que comprenden, consisten esencialmente en, o consisten en las secuencias de polipéptido siguientes: X4X5RKH (SEQ ID NO: 324), X4X5RRR (SEQ ID NO: 325), X4X5KKK (SEQ ID NO: 326), X4X5HHH (SEQ ID NO: 327), X4X5RKK (SEQ ID NO: 328), X4X5RKR (SEQ ID NO: 329), X4X5KKH (SEQ ID NO: 330), X4X5HKH (SEQ ID NO: 331), X4X5RRH (SEQ ID NO: 332) y X4X5RHH (SEQ ID NO: 333) en los que X4 es cualquier aminoácido y X5 es cualquier aminoácido.
En otros casos, los fragmentos peptídicos de Sp35 a los que se unen determinados anticuerpos, o fragmentos de unión a antígeno, variantes, o derivados de éstos de la presente descripción incluyen, un polipéptido Sp35 que comprende, consiste esencialmente en, o consiste en péptidos del dominio Ig de Sp35 o fragmentos, variantes o derivados de dichos polipéptidos. Específicamente, los polipéptidos que comprenden, consisten esencialmente en, o consisten en las secuencias de polipéptido siguientes: ITX6X7X8 (SEQ ID NO: 334), ACX6X7X8 (SEQ ID NO: 335), VCX6X7X8 (SEQ ID NO: 336) y SPX6X7X8 (SEQ ID NO: 337) en los que X6 es lisina, arginina, histidina, glutamina o asparagina, X7 es cualquier
aminoácido y X8 es lisina, arginina, histidina, glutamina o asparagina. Por ejemplo, un polipéptido que comprende, consiste esencialmente en, o consiste en la secuencia de polipéptido siguiente: SPRLH (SEQ ID NO: 338).
Los fragmentos peptídicos de Sp35 a los que se unen determinados anticuerpos, o fragmentos de unión a antígeno, variantes, o derivados de éstos de la presente descripción incluyen, un polipéptido Sp35 que comprende, consiste esencialmente en, o consiste en péptidos que contienen los aminoácidos 452-458 del dominio Ig de Sp35, o derivados de éstos, en los que el aminoácido 452 es un residuo de triptófano o fenilalanina.
Los fragmentos peptídicos adicionales de Sp35 a los que se unen determinados anticuerpos, o fragmentos de unión a antígeno, variantes, o derivados de éstos de la presente descripción incluyen, un polipéptido Sp35 que comprende, consiste esencialmente en, o consiste en péptidos del dominio básico de Sp35. Específicamente, los péptidos que comprenden, consisten esencialmente en, o consisten en las secuencias de polipéptido siguientes: RRARIRDRK (SEQ ID NO: 339), KKVKVKEKR (SEQ ID NO: 340), RRLRLRDRK (SEQ ID NO: 341), RRGRGRDRK (SEQ ID NO: 342) y RRIRARDRK (SEQ ID NO: 343).
Los polipéptidos Sp35 solubles ejemplares adicionales y los métodos y materiales para obtener estas moléculas para producir anticuerpos o fragmentos de anticuerpo de la presente descripción pueden encontrarse, por ejemplo, en la Publicación PCT WO 2004/085648.
Los métodos para preparar anticuerpos son muy conocidos en la técnica y se describen en la presente memoria. Una vez se han producido los anticuerpos frente a varios fragmentos de, o el Sp35 de longitud completa sin la secuencia señal, la determinación de a qué aminoácidos, o epítopo, de Sp35 se une el anticuerpo o fragmento de unión a antígeno puede determinarse por protocolos de mapeo de epítopos como se describe en la presente memoria así como métodos conocidos en la técnica (por ejemplo, ELISA sándwich de doble anticuerpo como se describe en “Capítulo 11-Immunology”, Current Protocols in Molecular Biology, Ed. Ausubel et al., v.2, John Wiley & Sons, Inc. (1996)). Los protocolos adicionales de mapeo de epítopos pueden encontrarse en Morris, G. Epitope Mapping Protocols, Nueva Jersey: Humana Press (1996). El mapeo de epítopos también puede realizarse por medios disponibles comercialmente (es decir, ProtoPROBE, Inc. (Milwaukee, Wisconsin)).
Además, los anticuerpos producidos que se unen a cualquier parte de Sp35 pueden cribarse para su capacidad de actuar como un antagonista de Sp35 y estimular así el crecimiento de neuritas, supervivencia, proliferación y diferenciación neuronal y de oligodendrocitos así como estimular la mielinización. Los anticuerpos pueden cribarse para supervivencia de oligodendrocitos/neuronal usando el método como se describe en los Ejemplos 10 y 11. Además, los anticuerpos pueden cribarse para su capacidad de estimular la mielinización usando el método del Ejemplo 9. Finalmente, los anticuerpos pueden cribarse para su capacidad de estimular la proliferación y diferenciación de oligodendrocitos, así como el crecimiento de neuritas usando el método como se describe en el Ejemplo 7. Otras funciones antagonistas de los anticuerpos de la presente descripción pueden ensayarse usando otros ensayos como se describe en los Ejemplos de la presente memoria.
En otros casos, la presente descripción incluye un anticuerpo, o fragmento de unión a antígeno, variante o derivado de éste, que se une específicamente o preferentemente al menos a un epítopo de Sp35, en el que el epítopo comprende, consiste esencialmente en o consiste en al menos aproximadamente cuatro a cinco aminoácidos de SEQ ID NO: 2, al menos siete, al menos nueve, o entre al menos aproximadamente 15 a aproximadamente 30 aminoácidos de SEQ ID NO: 2. Los aminoácidos de un epítopo dado de SEQ ID NO: 2 como se describe pueden ser, pero no necesitan ser, contiguos o lineales. En determinados casos, el al menos un epítopo de Sp35 comprende, consiste esencialmente en o consiste en un epítopo no lineal formado por el dominio extracelular de Sp35 expresado en la superficie de una célula o como un fragmento soluble, por ejemplo, fusionado con una región Fc de IgG. Así, en determinados casos, el al menos un epítopo de Sp35 comprende, consiste esencialmente en o consiste en al menos 4, al menos 5, al menos 6, al menos 7, al menos 8, al menos 9, al menos 10, al menos 15, al menos 20, al menos 25, entre aproximadamente 15 a aproximadamente 30, o al menos 10, 15, 20, 25, 30, 35, 40, 45, 50, 55, 60, 65, 70, 75, 80, 85, 90, 95 ó 100 aminoácidos contiguos o no contiguos de SEQ ID NO: 2, en los que los aminoácidos no contiguos forman un epítopo mediante plegamiento proteico.
En otros casos, la presente descripción incluye un anticuerpo, o fragmento de unión a antígeno, variante o derivado de éste, que se une específicamente o preferentemente al menos a un epítopo de Sp35, en el que el epítopo comprende, consiste esencialmente en o consiste en, además de uno, dos, tres, cuatro, cinco, seis o más aminoácidos contiguos o no contiguos de SEQ ID NO: 2 como se ha descrito anteriormente, y puede incluirse un resto adicional que modifica la proteína, por ejemplo, un resto carbohidrato de manera que el anticuerpo Sp35 se une con una mayor afinidad a la proteína diana modificada de lo que lo hace a la versión no modificada de la proteína. Alternativamente, el anticuerpo Sp35 no se une en absoluto a la versión no modificada de la proteína diana.
En determinados casos, la presente descripción está dirigida a un anticuerpo, o fragmento de unión a antígeno, variante
o derivado de éste, que se une específicamente a un polipéptido Sp35 o fragmento de éste, o un polipéptido variante
Sp35, con una afinidad caracterizada por una constante de disociación (KD) que es menor que la KD para dicho anticuerpo monoclonal de referencia.
En determinados casos, un anticuerpo, o fragmento de unión a antígeno, variante o derivado de éste de la descripción se une específicamente al menos a un epítopo de Sp35 o fragmento o variante descrita anteriormente, es decir, se une a dicho epítopo más fácilmente de lo que se uniría a un epítopo no relacionado, o al azar; se une preferentemente al menos a un epítopo de Sp35 o fragmento o variante descrita anteriormente es decir, se une a dicho epítopo más fácilmente de lo que se uniría a un epítopo relacionado, similar, homólogo o análogo; inhibe competitivamente la unión de un anticuerpo de referencia que en sí mismo se une específicamente o preferentemente a un determinado epítopo de Sp35 o fragmento o variante descrita anteriormente; o se une al menos a un epítopo de Sp35 o fragmento o variante descrita anteriormente con una afinidad caracterizada por una constante de disociación KD de menos de aproximadamente 5 X 10-2 M, aproximadamente 10-2 M, aproximadamente 5 X 10-3 M, aproximadamente 10-3 M, aproximadamente 5 X 10-4 M, aproximadamente 10-4 M, aproximadamente 5 X 10-5 M, aproximadamente 10-5 M, aproximadamente 5 X 10-6 M, aproximadamente 10-6 M, aproximadamente 5 X 10-7 M, aproximadamente 10-7 M, aproximadamente 5 X 10-8 M, aproximadamente 10-8 M, aproximadamente 5 X 10-9 M, aproximadamente 10-9 M, aproximadamente 5 X 10-10 M, aproximadamente 10-10 M, aproximadamente 5 X 10-11 M, aproximadamente 10-11 M, aproximadamente 5 X 10-12 M, aproximadamente 10-12 M, aproximadamente 5 X 10-13 M, aproximadamente 10-13 M, aproximadamente 5 X 10-14 M, aproximadamente 10-14 M, aproximadamente 5 X 10-15 M o aproximadamente 10-15 M. En un caso particular, el anticuerpo o fragmento de éste se une preferentemente a un polipéptido Sp35 humano o fragmento de éste, respecto a un polipéptido Sp35 murino o fragmento de éste.
Tal y como se usa en el contexto de constantes de disociación de la unión de un anticuerpo, el término “aproximadamente” permite el grado de variación inherente en los métodos utilizados para medir la afinidad del anticuerpo. Por ejemplo, dependiendo del nivel de precisión de la instrumentación usada, el error estándar basado en el número de muestras medido y el error de redondeo, el término “aproximadamente 10-2 M” podría incluir, por ejemplo, de 0,05 M a 0,005 M.
En casos específicos, un anticuerpo, o fragmento de unión a antígeno, variante, o derivado de éste de la descripción se une a polipéptidos Sp35 o fragmentos o variantes de éstos con una velocidad de disociación (k(off)) de menos de o igual a 5 X 10-2 seg-1, 10-2 seg-1, 5 X 10-3 seg-1 ó 10-3 seg-1. Alternativamente, un anticuerpo, o fragmento de unión a antígeno, variante, o derivado de éste de la descripción se une a polipéptidos Sp35 o fragmentos o variantes de éstos con una velocidad de disociación (k(off)) de menos de o igual a 5 X 10-4 seg-1, 10-4 seg-1, 5 X 10-5 seg-1 ó 10-5 seg-1, 5 X 10-6 seg-1, 10-6 seg-1, 5 X 10-7 seg-1 ó 10-7 seg-1.
En otros casos, un anticuerpo, o fragmento de unión a antígeno, variante, o derivado de éste de la descripción se une a polipéptidos Sp35 o fragmentos o variantes de éstos con una velocidad de asociación (k(on)) mayor de o igual a 103 M-1 seg-1, 5 X 103 M-1 seg-1, 104 M-1 seg-1 ó 5 X 104 M-1 seg-1. Alternativamente, un anticuerpo, o fragmento de unión a antígeno, variante, o derivado de éste de la descripción se une a polipéptidos Sp35 o fragmentos o variantes de éstos con una velocidad de asociación (k(on)) mayor de o igual a 105 M-1 seg-1, 5 X 105 M-1 seg-1, 106 M-1 seg-1 ó 5 X 106 M-1 seg-1 ó 107 M-1 seg-1.
En varios casos, un anticuerpo Sp35, o fragmento de unión a antígeno, variante, o derivado de éste como se describe en la presente memoria es un antagonista de la actividad de Sp35. En determinados casos, por ejemplo, la unión de un anticuerpo Sp35 antagonista a Sp35, expresado en neuronas, bloquea la inhibición del crecimiento de neuritas asociado con mielina o la muerte de células neuronales. En otros casos, la unión del anticuerpo Sp35 a Sp35, expresado en oligodendrocitos, bloquea la inhibición del crecimiento o diferenciación de oligodendrocitos o bloquea la desmielinización
o dismielinización de las neuronas del SNC.
A no ser que se indique específicamente, tal y como se usa en la presente memoria un “fragmento de éste” respecto a un anticuerpo se refiere a un fragmento de unión a antígeno, es decir, una parte del anticuerpo que se une específicamente al antígeno. En un caso, un anticuerpo Sp35, por ejemplo, un anticuerpo de la descripción es un anticuerpo Sp35 biespecífico, polipéptido de unión o anticuerpo, por ejemplo, un anticuerpo biespecífico, minicuerpo, anticuerpo con dominio delecionado o proteína de fusión que tiene especificidad de unión para más de un epítopo, por ejemplo, más de un antígeno o más de un epítopo en el mismo antígeno. En un caso, un anticuerpo Sp35 biespecífico, polipéptido de unión o anticuerpo tiene al menos un dominio de unión específico para al menos un epítopo en un polipéptido diana descrito en la presente memoria, por ejemplo, Sp35. En otro caso, un anticuerpo Sp35 biespecífico, polipéptido de unión o anticuerpo tiene al menos un dominio de unión específico para un epítopo en un polipéptido diana y al menos un dominio de unión diana específico para un fármaco o toxina. En otro caso más, un anticuerpo Sp35 biespecífico, polipéptido de unión o anticuerpo tiene al menos un dominio de unión específico para un epítopo en un polipéptido diana descrito en la presente memoria y al menos un dominio de unión específico para un profármaco. Un anticuerpo Sp35 biespecífico, polipéptido de unión o anticuerpo puede ser un anticuerpo tetravalente que tiene dos dominios de unión diana específicos para un epítopo de un polipéptido diana descrito en la presente memoria y dos
dominios de unión diana específicos para una segunda diana. Así, un anticuerpo Sp35 biespecífico tetravalente, polipéptido de unión o anticuerpo puede ser bivalente para cada especificidad.
Los anticuerpos Sp35, o fragmentos de unión a antígeno, variantes o derivados de éstos de la descripción, como conocen los expertos en la técnica, pueden comprender una región constante que media una o más funciones efectoras. Por ejemplo, la unión del componente C1 del complemento a una región constante de un anticuerpo puede activar el sistema del complemento. La activación del complemento es importante en la opsonización y lisis de los patógenos celulares. La activación del complemento también estimula la respuesta inflamatoria y también puede estar implicada en la hipersensibilidad autoinmune. Además, los anticuerpos se unen a receptores en varias células a través de la región Fc, con un sitio de unión al receptor Fc en la región Fc del anticuerpo que se une a un receptor Fc (FcR) en una célula. Existen varios receptores Fc que son específicos para diferentes clases de anticuerpos, incluyendo IgG (receptores gamma), IgE (receptores épsilon), IgA (receptores alfa) e IgM (receptores mu). La unión del anticuerpo a los receptores Fc en las superficies celulares desencadena varias respuestas biológicas importantes y diversas incluyendo engullimiento y destrucción de las partículas recubiertas por anticuerpo, aclaramiento de los complejos inmunes, lisis de las células diana recubiertas por anticuerpo por las células asesinas (denominada citotoxicidad mediada por células dependiente de anticuerpo o ADCC), liberación de mediadores inflamatorios, transferencia placentaria y control de la producción de inmunoglobulinas.
De acuerdo con esto, determinados casos de la descripción incluyen un anticuerpo Sp35, o fragmento de unión a antígeno, variante o derivado de éste, en el que al menos una fracción de uno o más de los dominios de región constante ha sido delecionada o alterada de otra manera de manera que se proporcionen características bioquímicas deseadas tales como funciones efectoras reducidas, la capacidad de dimerización no covalente, capacidad incrementada de localizarse en el sitio de un tumor, vida media sérica reducida o vida media sérica incrementada cuando se compara con un anticuerpo completo, inalterado de aproximadamente la misma inmunogenicidad. Por ejemplo, determinados anticuerpos para usarse en los métodos de diagnóstico y tratamiento descritos en la presente memoria son anticuerpos con dominios delecionados que comprenden una cadena polipeptídica similar a una cadena pesada de inmunoglobulina, pero que carecen al menos de una parte de uno o más dominios de cadena pesada. Por ejemplo, en determinados anticuerpos, un dominio entero de la región constante del anticuerpo modificado estará delecionado, por ejemplo, todo o parte del dominio CH2 estará delecionados.
En determinados anticuerpos Sp35, o fragmentos de unión a antígeno, variantes o derivados de éstos descritos en la presente memoria, la parte Fc puede estar mutada para disminuir la función efectora usando técnicas conocidas en la técnica. Por ejemplo, la deleción o inactivación (mediante mutaciones puntuales u otros medios) de un dominio de región constante puede reducir la unión al receptor Fc del anticuerpo modificado circulante incrementando de esta manera la localización tumoral. En otros casos puede ser que las modificaciones en la región constante consistentes con la descripción, moderan la unión al complemento y reducen así la vida media sérica y la asociación no específica de una citotoxina conjugada. Otras modificaciones más de la región constante pueden usarse para modificar las uniones disulfuro o restos oligosacarídicos que permiten la localización aumentada debido a una especificidad de antígeno o flexibilidad del anticuerpo incrementadas. El perfil fisiológico, biodisponibilidad y otros efectos bioquímicos resultantes de las modificaciones, tales como localización tumoral, biodistribución y vida media sérica, pueden medirse y cuantificarse fácilmente usando técnicas inmunológicas muy conocidas sin experimentación excesiva.
Las formas modificadas de los anticuerpos Sp35, o fragmentos de unión a antígeno, variantes o derivados de éstos de la descripción pueden prepararse a partir de anticuerpos precursores o parentales completos usando técnicas conocidas en la técnica. Las técnicas ejemplares se discuten con más detalle en la presente memoria.
En determinados casos, tanto las regiones variables como constantes de los anticuerpos Sp35, o fragmentos de unión a antígeno, variantes o derivados de éstos son totalmente humanas. Los anticuerpos totalmente humanos pueden prepararse usando técnicas que son conocidas en la técnica y como se describe en la presente memoria. Por ejemplo, los anticuerpos totalmente humanos frente a un antígeno específico pueden prepararse administrando el antígeno a un animal transgénico que se ha modificado para producir dichos anticuerpos en respuesta a un pulso antigénico, pero cuyos loci endógenos se han inhabilitado. Las técnicas ejemplares que pueden usarse para preparar dichos anticuerpos se describen en las patentes US: 6.150.584; 6.458.592; 6.420.140. Otras técnicas son conocidas en la técnica. Los anticuerpos totalmente humanos pueden producirse asimismo por varias tecnologías de exposición, por ejemplo, exposición en fagos u otros sistemas de exposición virales, como se describe con más detalle en otro lugar de la presente memoria.
Los anticuerpos Sp35, o fragmentos de unión a antígeno, variantes o derivados de éstos de la descripción pueden prepararse o fabricarse usando técnicas que son conocidas en la técnica. En determinados casos, las moléculas de anticuerpo o fragmentos de éstas se “producen recombinantemente”, es decir, se producen usando tecnología de ADN recombinante. Las técnicas ejemplares para preparar moléculas de anticuerpo o fragmentos de éstas se discuten con más detalle en otro lugar de la presente memoria.
Los anticuerpos Sp35, o fragmentos de unión a antígeno, variantes o derivados de éstos de la descripción también incluyen derivados que están modificados, por ejemplo, por la unión covalente de cualquier tipo de molécula al anticuerpo de manera que la unión covalente no evita que el anticuerpo se una específicamente a su epítopo cognado. Por ejemplo, pero no como limitación, los derivados del anticuerpo incluyen anticuerpos que han sido modificados, por ejemplo, por glicosilación, acetilación, pegilación, fosforilación, amidación, derivatización con grupos protectores/bloqueantes conocidos, escisión proteolítica, unión a un ligando celular u otra proteína, etc. Cualquiera de varias modificaciones químicas puede llevarse a cabo por técnicas conocidas, incluyendo, pero no limitado a escisión química específica, acetilación, formilación, síntesis metabólica de tunicamicina, etc. Además, el derivado puede contener uno o más aminoácidos no clásicos.
En determinados casos, los anticuerpos Sp35, o fragmentos de unión a antígeno, variantes o derivados de éstos de la descripción no incitarán una respuesta inmune perjudicial en el animal que se va a tratar, por ejemplo, en un ser humano. En un caso, los anticuerpos Sp35, o fragmentos de unión a antígeno, variantes o derivados de éstos de la descripción se modifican para reducir su inmunogenicidad usando técnicas reconocidas en la técnica. Por ejemplo, los anticuerpos pueden humanizarse, primatizarse, desinmunizarse o pueden prepararse anticuerpos quiméricos. Estos tipos de anticuerpos se derivan de un anticuerpo no humano, típicamente un anticuerpo murino o de primate, que retiene
o retiene sustancialmente las propiedades de unión a antígeno del anticuerpo parental, pero que es menos inmunogénico en los seres humanos. Esto puede conseguirse por varios métodos, incluyendo (a) injertar los dominios variables no humanos completos en regiones constantes humanas para generar anticuerpos quiméricos; (b) injertar al menos una parte de una o más de las regiones determinantes de la complementariedad (CDR) no humanas en regiones marco y constantes humanas con o sin la retención de residuos marco críticos; o (c) trasplantar los dominios variables no humanos completos, pero “ocultándolos” con una sección semejante a humana por reemplazo de residuos superficiales. Dichos métodos se describen en Morrison et al., Proc. Natl. Acad. Sci. 81: 6851-6855 (1984); Morrison et al., Adv. Immunol. 44: 65-92 (1988); Verhoeyen et al., Science 239: 1534-1536 (1988); Padlan, Molec. Immun. 28: 489-498 (1991); Padlan, Molec. Immun. 31: 169-217 (1994) y Pat. U.S. Nos. 5.585.089, 5.693.761, 5.693.762 y 6.190.370.
La des-inmunización también puede usarse para disminuir la inmunogenicidad de un anticuerpo. Tal y como se usa en la presente memoria, el término “des-inmunización” incluye la alteración de un anticuerpo para modificar los epítopos de las células T (véanse, por ejemplo, WO9852976A1, WO0034317A2). Por ejemplo, se analizan las secuencias de VH y VL del anticuerpo de partida y se “mapea” un epítopo de células T humano para cada región V que muestra la localización de los epítopos respecto a las regiones determinantes de la complementariedad (CDR) y otros residuos clave en la secuencia. Los epítopos de células T individuales del mapa de epítopos de células T se analizan con el fin de identificar sustituciones de aminoácidos alternativas con un riesgo bajo de alterar la actividad del anticuerpo final. Se diseña un rango de secuencias de VH y VL alternativas que comprenden combinaciones de sustituciones de aminoácidos y estas secuencias se incorporan posteriormente en un rango de polipéptidos de unión, por ejemplo, anticuerpos específicos de Sp35 o fragmentos inmunoespecíficos de éstos para usarse en los métodos de diagnóstico y tratamiento descritos en la presente memoria, que se ensayan entonces para función. Típicamente, se generan y ensayan entre 12 y 24 anticuerpos variantes. Los genes de cadena pesada y ligera completos que comprenden regiones modificadas V y C humanas se clonan en vectores de expresión y los plásmidos posteriores se introducen en líneas celulares para la producción de anticuerpos completos. Los anticuerpos se comparan en ensayos bioquímicos y biológicos apropiados y se identifica la variante óptima.
Los anticuerpos Sp35, o fragmentos de unión a antígeno, variantes o derivados de éstos de la descripción pueden generarse por cualquier método adecuado conocido en la técnica. Pueden producirse anticuerpos policlonales frente a un antígeno de interés por varios procedimientos muy conocidos en la técnica. Por ejemplo, un anticuerpo Sp35, por ejemplo, un polipéptido de unión, por ejemplo, un anticuerpo específico de Sp35 o fragmento inmunoespecífico de éste puede administrarse a varios animales huésped incluyendo, pero no limitado a, conejos, ratones, ratas, pollos, hámsters, cabras, burros, etc., para inducir la producción de suero que contiene anticuerpos policlonales específicos para el antígeno. Pueden usarse varios adyuvantes para incrementar la respuesta inmunológica, dependiendo de la especie huésped, e incluyen pero no están limitados a, de Freund (completo e incompleto), geles minerales tales como hidróxido de aluminio, sustancias superficiales activas tales como lisolecitina, polioles plurónicos, polianiones, péptidos, emulsiones de aceite, hemocianinas de lapa, dinitrofenol y adyuvantes humanos potencialmente útiles tales como BCG (bacilo de Calmette-Guerin) y Corynebacterium parvum. Dichos adyuvantes también son muy conocidos en la técnica.
Pueden prepararse anticuerpos monoclonales usando una amplia variedad de técnicas conocidas en la técnica incluyendo el uso de tecnologías de hibridoma, recombinantes y de exposición en fagos o una combinación de éstas. Por ejemplo, pueden producirse anticuerpos monoclonales usando técnicas de hibridoma incluyendo aquellas conocidas en la técnica y enseñadas, por ejemplo, en Harlow et al., Antibodies: A Laboratory Manual, Cold Spring Harbor Laboratory Press, 2ª ed. (1988); Hammerling et al., en: Monoclonal Antibodies and T-Cell Hybridomas Elsevier, N.Y., 563-681 (1981). El término “anticuerpo monoclonal” tal y como se usa en la presente memoria no está limitado a anticuerpos producidos mediante la tecnología de hibridoma. El término “anticuerpo monoclonal” se refiere a un anticuerpo que deriva de un único clon, incluyendo cualquier clon eucariota, procariota o de fago, y no al método por el que se produce.
Así, el término “anticuerpo monoclonal” no está limitado a anticuerpos producidos mediante la tecnología de hibridoma. Los anticuerpos monoclonales pueden prepararse usando ratones con inactivación de Sp35 para incrementar las regiones de reconocimiento de epítopo. Los anticuerpos monoclonales pueden prepararse usando una amplia variedad de técnicas conocidas en la técnica incluyendo el uso de tecnología de hibridoma y recombinante y de exposición en fagos como se describe en otro lugar de la presente memoria.
Usando protocolos reconocidos en la técnica, en un ejemplo, se producen anticuerpos en mamíferos por múltiples inyecciones subcutáneas o intraperitoneales del antígeno relevante (por ejemplo, antígenos purificados asociados a tumor tal como Sp35 o células o extractos celulares que comprenden dichos antígenos) y un adyuvante. Esta inmunización incita típicamente una respuesta inmune que comprende la producción de anticuerpos reactivos frente a antígeno a partir de esplenocitos o linfocitos activados. Aunque los anticuerpos resultantes pueden recogerse del suero del animal para proporcionar preparaciones policlonales, frecuentemente es deseable aislar linfocitos individuales del bazo, ganglios linfáticos o sangre periférica para proporcionar preparaciones homogéneas de anticuerpos monoclonales (MAbs). Preferiblemente, los linfocitos se obtienen del bazo.
En este proceso muy conocido (Kohler et al., Nature 256: 495 (1975)) los linfocitos con una vida relativamente corta o mortales de un mamífero al que se ha inyectado un antígeno se fusionan con una línea celular tumoral inmortal (por ejemplo, una línea celular de mieloma), produciendo así células híbridas o "hibridomas" que son tanto inmortales como capaces de producir el anticuerpo codificado genéticamente de la célula B. Los híbridos resultantes se segregan en cepas genéticas únicas por selección, dilución y recrecimiento comprendiendo cada cepa individual genes específicos para la formación de un único anticuerpo. Producen anticuerpos que son homogéneos frente a un antígeno deseado y, respecto a su linaje genético puro, se denominan "monoclonales".
Las células de hibridoma así preparadas se siembran y crecen en un medio de cultivo adecuado que contiene preferiblemente una o más sustancias que inhiben el crecimiento o supervivencia de las células de mieloma no fusionadas, parentales. Los expertos en la técnica apreciarán que los reactivos, líneas celulares y medios para la formación, selección y crecimiento de los hibridomas están disponibles comercialmente a partir de varias fuentes y protocolos estandarizados muy establecidos. Generalmente, el medio de cultivo en el que se crecen las células de hibridoma se ensaya para la producción de anticuerpos monoclonales frente al antígeno deseado. Preferiblemente, la especificidad de unión de los anticuerpos monoclonales producidos por las células de hibridoma se determina por ensayos in vitro tales como inmunoprecipitación, radioinmunoensayo (RIA) o ensayo inmunoabsorbente ligado a enzima (ELISA). Después de identificar las células de hibridoma que producen anticuerpos de la especificidad, afinidad y/o actividad deseadas, los clones pueden subclonarse por procedimientos de dilución limitante y crecerse por métodos estándar (Goding, Monoclonal Antibodies: Principles and Practice, Academic Press, p 59-103 (1986)). Se apreciará además que los anticuerpos monoclonales secretados por los subclones pueden separarse del medio de cultivo, fluido de ascitis o suero por procedimientos de purificación convencionales tales como, por ejemplo, proteína-A, cromatografía de hidroxilapatito, electroforesis en gel, diálisis o cromatografía de afinidad.
Los fragmentos de anticuerpo que reconocen epítopos específicos pueden generarse por técnicas conocidas. Por ejemplo, los fragmentos Fab y F(ab')2 pueden producirse por escisión proteolítica de moléculas de inmunoglobulina, usando enzimas tales como papaína (para producir fragmentos Fab) o pepsina (para producir fragmentos F(ab')2). Los fragmentos F(ab')2 contienen la región variable, la región constante de cadena ligera y el dominio CH1 de la cadena pesada.
Los expertos en la técnica también apreciarán que el ADN que codifica anticuerpos o fragmentos de anticuerpo (por ejemplo, sitios de unión a antígeno) también puede derivar de bibliotecas de anticuerpos, tales como bibliotecas de exposición en fagos. En particular, dicho fago puede utilizarse para exponer dominios de unión a antígeno expresados a partir de una biblioteca de anticuerpos repertorio o combinatoria (por ejemplo, humana o murina). Los fagos que expresan un dominio de unión a antígeno que se une al antígeno de interés pueden seleccionarse o identificarse con el antígeno, por ejemplo, usando antígeno marcado o antígeno unido o capturado en una superficie o lecho sólido. Los fagos usados en estos métodos son típicamente fagos filamentosos incluyendo los dominios de unión fd y M13 expresados a partir de fagos con dominios de anticuerpo Fab, Fv OE DAB (región Fv individual de cadenas ligeras o pesadas) o Fv estabilizado con disulfuro fusionados recombinantemente con el gen III o gen VIII de la proteína del fago. Los métodos ejemplares se muestran, por ejemplo, en EP 368 684 B1; patente U.S. 5.969.108, Hoogenboom, H.R. y Chames, Immunol. Today 21: 371 (2000); Nagy et al. Nat. Med. 8: 801 (2002); Huie et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 98: 2682 (2001); Lui et al., J. Mol. Biol. 315: 1063 (2002). Varias publicaciones (por ejemplo, Marks et al., Bio/Technology 10: 779-783 (1992)) han descrito la producción de anticuerpos humanos con alta afinidad por intercambio de cadenas, así como infección combinatoria y recombinación in vivo como una estrategia para construir grandes bibliotecas de fagos. En otro caso, puede usarse la exposición Ribosomal para reemplazar al bacteriófago como la plataforma de exposición (véase, por ejemplo, Hanes et al., Nat. Biotechnol. 18: 1287 (2000); Wilson et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 98: 3750 (2001); o Irving et al., J. Immunol. Methods 248: 31 (2001)). En otro caso más, pueden cribarse bibliotecas de superficie celular para anticuerpos (Boder et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 97: 10701 (2000); Daugherty et al., J. Immunol.
Methods 243: 211 (2000)). Dichos procedimientos proporcionan alternativas a las técnicas de hibridoma tradicionales para el aislamiento y clonación posterior de anticuerpos monoclonales.
En los métodos de exposición en fagos, los dominios de anticuerpo funcionales se exponen en la superficie de las partículas de fago que portan las secuencias polinucleotídicas que los codifican. Por ejemplo, las secuencias de ADN que codifican las regiones VH y VL se amplifican a partir de bibliotecas de ADNc de animales (por ejemplo, bibliotecas de ADNc humano o murino de tejidos linfoides) o bibliotecas de ADNc sintético. En determinados casos, el ADN que codifica las regiones VH y VL se unen entre sí por un conector scFv por PCR y se clonan en un vector fagémido (por ejemplo, pCANTAB 6 o pComb 3 HSS). El vector se electropora en E. coli y la E. coli se infecta con el fago auxiliar. Los fagos usados en estos métodos son típicamente fagos filamentosos incluyendo fd y M13 y las regiones VH o VL habitualmente se fusionan recombinantemente al gen III o gen VIII del fago. Los fagos que expresan un dominio de unión a antígeno que se une a un antígeno de interés (es decir, un polipéptido Sp35 o un fragmento de éste) pueden seleccionarse o identificarse con el antígeno, por ejemplo, usando antígeno marcado o antígeno unido o capturado a una superficie o lecho sólido.
Los ejemplos adicionales de métodos de exposición en fagos que pueden usarse para preparar los anticuerpos incluyen aquellos descritos en Brinkman et al., J. Immunol. Methods 182: 41-50 (1995); Ames et al., J. Immunol. Methods 184: 177-186 (1995); Kettleborough et al., Eur. J. Immunol. 24: 952-958 (1994); Persic et al., Gene 187: 9-18 (1997); Burton et al., Advances in Immunology 57: 191-280 (1994); publicaciones PCT WO 1992/001047; WO 90/02809; WO 91/10737; WO 92/01047; WO 92/18619; WO 93/11236; WO 95/15982; WO 95/20401; y Pat. U.S. Nos. 5.698.426; 5.223.409; 5.403.484; 5.580.717; 5.427.908; 5.750.753; 5.821.047; 5.571.698; 5.427.908; 5.516.637; 5.780.225; 5.658.727;
5.733.743 y 5.969.108.
Como se describe en las referencias anteriores, después de la selección de los fagos, las regiones codificadoras del anticuerpo del fago pueden aislarse y usarse para generar anticuerpos completos, incluyendo anticuerpos humanos, o cualquier otro fragmento de unión a antígeno deseado, y expresarse en cualquier huésped deseado, incluyendo células de mamíferos, células de insectos, células de plantas, levaduras y bacterias. Por ejemplo, las técnicas para producir recombinantemente fragmentos Fab, Fab' y F(ab')2 también pueden emplearse usando los métodos conocidos en la técnica tales como los descritos en la publicación PCT WO 92/22324; Mullinax et al., BioTechniques 12(6): 864-869 (1992); y Sawai et al., AJRI 34: 26-34 (1995); y Better et al., Science 240: 1041-1043 (1988).
Los ejemplos de técnicas que pueden usarse para producir Fv y anticuerpos de cadena única incluyen aquellos descritos en Pat. U.S. Nos. 4.946.778 y 5.258.498; Huston et al., Methods in Enzymology 203: 46-88 (1991); Shu et al., PNAS 90: 7995-7999 (1993); y Skerra et al., Science 240: 1038-1040 (1988). Para algunos usos, incluyendo el uso in vivo de anticuerpos en seres humanos y ensayos de detección in vitro, puede ser preferible usar anticuerpos quiméricos, humanizados o humanos. Un anticuerpo quimérico es una molécula en la que diferentes partes del anticuerpo derivan de especies diferentes de animales, tales como anticuerpos que tienen una región variable derivada de un anticuerpo monoclonal murino y una región constante de inmunoglobulina humana. Los métodos para producir anticuerpos quiméricos son conocidos en la técnica. Véase, por ejemplo, Morrison, Science 229: 1202 (1985); Oi et al., BioTechniques 4: 214 (1986); Gillies et al., J. Immunol. Methods 125: 191-202 (1989); Pat. U.S. Nos. 5.807.715; 4.816.567; y 4.816.397. Los anticuerpos humanizados son moléculas de anticuerpo derivadas de un anticuerpo de una especie no humana que se unen al antígeno deseado que tiene una o más regiones determinantes de la complementariedad (CDR) de la especie no humana y regiones marco de una molécula de inmunoglobulina humana. Frecuentemente, los residuos marco en las regiones marco humanas se sustituirán por el residuo correspondiente de la CDR del anticuerpo donante para alterar, preferiblemente mejorar, la unión al antígeno. Estas sustituciones marco se identifican por métodos muy conocidos en la técnica, por ejemplo, por modelado de las interacciones de los residuos CDR y marco para identificar residuos marco importantes para la unión al antígeno y comparación de secuencias para identificar residuos marco inusuales en posiciones particulares. (Véase, por ejemplo, Queen et al., Pat. U.S. No. 5.585.089; Riechmann et al., Nature 332: 323 (1988)). Los anticuerpos pueden humanizarse usando una variedad de técnicas conocidas en la técnica, incluyendo, por ejemplo, injerto de CDR (EP 239.400; publicación PCT WO 91/09967; Pat. U.S. Nos. 5.225.539; 5.530.101; y 5.585.089), recubrimiento o modificación en superficie (EP 592.106; EP 519.596; Padlan, Molecular Immunology 28(4/5): 489-498 (1991); Studnicka et al., Protein Engineering 7(6): 805-814 (1994); Roguska et al., PNAS 91: 969-973 (1994)), e intercambio de cadenas (Pat. U.S. No. 5.565.332).
Los anticuerpos completamente humanos son particularmente deseables para el tratamiento terapéutico de pacientes humanos. Los anticuerpos humanos pueden prepararse por una variedad de métodos conocidos en la técnica incluyendo métodos de exposición en fagos descritos anteriormente usando bibliotecas de anticuerpos derivadas de secuencias de inmunoglobulina humana. Véase también, Pat. U.S. Nos. 4.444.887 y 4.716.111; y publicaciones PCT WO 98/46645, WO 98/50433, WO 98/24893, WO 98/16654, WO 96/34096, WO 96/33735 y WO 91/10741.
Los anticuerpos humanos también pueden producirse usando ratones transgénicos que son incapaces de expresar inmunoglobulinas endógenas funcionales, pero que pueden expresar genes de inmunoglobulinas humanas. Por ejemplo,
los complejos de genes de cadena pesada y ligera de inmunoglobulinas humanas pueden introducirse aleatoriamente o por recombinación homóloga en células madre embrionarias de ratón. Alternativamente, la región variable, región constante y región de diversidad humanas pueden introducirse en células madre embrionarias de ratón además de los genes de cadena pesada y ligera humanas. Los genes de cadena pesada y ligera de inmunoglobulinas de ratón pueden convertirse en no funcionales separadamente o simultáneamente con la introducción de loci de inmunoglobulinas humanas por recombinación homóloga. En particular, la deleción homocigota de la región JH evita la producción endógena de anticuerpos. Las células madre embrionarias modificadas se expanden y microinyectan en blastocitos para producir ratones quiméricos. Los ratones quiméricos se crían para producir descendencia homocigota que expresa anticuerpos humanos. Los ratones transgénicos se inmunizan de forma normal con un antígeno seleccionado, por ejemplo, todo o una parte de un polipéptido diana deseado. Los anticuerpos monoclonales dirigidos frente al antígeno pueden obtenerse a partir de los ratones transgénicos inmunizados usando tecnología de hibridoma convencional. Los transgenes de inmunoglobulinas humanas albergados por los ratones transgénicos se reorganizan durante la diferenciación de las células B y experimentan posteriormente un cambio de clase y mutación somática. Así, usando dicha técnica, es posible producir anticuerpos IgG, IgA, IgM e IgE terapéuticamente útiles. Para una visión global de esta tecnología para producir anticuerpos humanos, véase Lanberg y Huszar Int. Rev. Immunol. 13: 65-93 (1995). Para una discusión detallada de esta tecnología para producir anticuerpos humanos y anticuerpos monoclonales humanos y protocolos para producir dichos anticuerpos, véase, por ejemplo, las publicaciones PCT WO 98/24893; WO 96/34096; WO 96/33735; Pat. U.S. Nos. 5.413.923; 5.625.126; 5.633.425; 5.569.825; 5.661.016; 5.545.806; 5.814.318; y
5.939.598. Además, empresas tales como Abgenix, Inc. (Freemont, Calif.) y GenPharm (San Jose, Calif.) pueden estar involucradas para proporcionar anticuerpos humanos dirigidos frente a un antígeno seleccionado usando tecnología similar a la descrita anteriormente.
Los anticuerpos completamente humanos que reconocen un epítopo seleccionado pueden generarse usando una técnica referida como una "selección guiada". En esta estrategia, un anticuerpo monoclonal no humano seleccionado, por ejemplo, un anticuerpo de ratón, se usa para guiar la selección de un anticuerpo completamente humano que reconoce el mismo epítopo. (Jespers et al., Bio/Technology 12: 899-903 (1988). Véase, también, Patente U.S. No.
5.565.332.
Además, los anticuerpos para tomar como diana polipéptidos de la descripción pueden utilizarse, a su vez, para generar anticuerpos anti-idiotipo que "mimetizan" los polipéptidos diana usando técnicas muy conocidas para los expertos en la técnica. (Véase, por ejemplo, Greenspan y Bona, FASEB J. 7(5): 437-444 (1989) y Nissinoff, J. Immunol. 147(8): 24292438 (1991)). Por ejemplo, los anticuerpos que se unen a e inhiben competitivamente la multimerización polipeptídica y/o la unión de un polipéptido de la descripción a un ligando pueden usarse para generar anti-idiotipos que "mimetizan" la multimerización polipeptídica y/o el dominio de unión y, consecuentemente, se unen a y neutralizan el polipéptido y/o su ligando. Dichos anti-idiotipos neutralizantes o fragmentos Fab de dichos anti-idiotipos pueden usarse en regímenes terapéuticos para neutralizar el ligando del polipéptido. Por ejemplo, dichos anticuerpos anti-idiotípicos pueden usarse para unirse a un polipéptido diana deseado y/o para unirse a sus ligandos/receptores y, de esta manera, bloquear su actividad biológica.
El ADN que codifica los anticuerpos monoclonales deseados puede aislarse y secuenciarse fácilmente usando procedimientos convencionales (por ejemplo, usando sondas oligonucleotídicas que son capaces de unirse específicamente a genes que codifican las cadenas pesada y ligera de anticuerpos murinos). Las células de hibridoma aisladas y subclonadas sirven como una fuente preferente de dicho ADN. Una vez aislado, el ADN puede ponerse en vectores de expresión, que se transfectan en células huésped procariotas o eucariotas tales como células de E.coli, células COS de simio, células de Ovario de Hámster Chino (CHO) o células de mieloma que no producen de otra forma las inmunoglobulinas. Más particularmente, el ADN aislado (que puede ser sintético como se describe en la presente memoria) puede usarse para clonar secuencias de región constante y variable para la fabricación de anticuerpos como se describe en Newman et al., Pat. U.S. No, 5.658.570, presentada el 25 de enero, 1995. Esencialmente, esto conlleva la extracción de ARN de las células seleccionadas, conversión a ADNc y amplificación por PCR usando cebadores específicos de Ig. Los cebadores adecuados para este propósito también se describen en Pat. U.S. No. 5.658.570. Como se discutirá con más detalle más adelante, las células transformadas que expresan el anticuerpo deseado pueden crecerse en cantidades relativamente grandes para proporcionar suministros clínicos y comerciales de la inmunoglobulina.
En un caso, un anticuerpo Sp35 de la descripción comprende al menos una CDR de cadena pesada o ligera de una molécula de anticuerpo. En otro caso, un anticuerpo Sp35 de la descripción comprende al menos dos CDR de una o más moléculas de anticuerpo. En otro caso, un anticuerpo Sp35 de la descripción comprende al menos tres CDR de una o más moléculas de anticuerpo. En otro caso, un anticuerpo Sp35 de la descripción comprende al menos cuatro CDR de una o más moléculas de anticuerpo. En otro caso, un anticuerpo Sp35 de la descripción comprende al menos cinco CDR de una o más moléculas de anticuerpo. En otro caso, un anticuerpo Sp35 de la descripción comprende al menos seis CDR de una o más moléculas de anticuerpo. Las moléculas de anticuerpo ejemplares que comprenden al menos una CDR que pueden incluirse en los anticuerpos Sp35 sujeto se describen en la presente memoria.
En un caso específico, la secuencia de aminoácidos de los dominios variables de la cadena pesada y/o ligera pueden inspeccionarse para identificar las secuencias de las regiones determinantes de la complementariedad (CDR) por métodos que son muy conocidos en la técnica, por ejemplo, por comparación con secuencias de aminoácidos conocidas de otras regiones variables de la cadena pesada y ligera para determinar las regiones de hipervariabilidad de secuencia. Usando técnicas de ADN recombinante rutinarias, una o más de las CDR pueden insertarse en regiones marco, por ejemplo, en regiones marco humanas para humanizar un anticuerpo no humano. Las regiones marco pueden ser naturales o regiones marco consenso y preferiblemente regiones marco humanas (véase, por ejemplo, Chothia et al., J. Mol. Biol. 278: 457-479 (1998) para un listado de regiones marco humanas). Preferiblemente, el polinucleótido generado por la combinación de las regiones marco y CDR codifica un anticuerpo que se une específicamente al menos a un epítopo de un polipéptido deseado, por ejemplo, Sp35. Preferiblemente, pueden hacerse una o más sustituciones de aminoácidos en las regiones marco y, preferiblemente, las sustituciones de aminoácidos mejoran la unión del anticuerpo a su antígeno. Además, dichos métodos pueden usarse para preparar sustituciones o deleciones de aminoácidos de uno
o más residuos de cisteína de la región variable que participan en un enlace disulfuro intracadena para generar moléculas de anticuerpo que carecen de uno o más enlaces disulfuro intracadena. Otras alteraciones en el polinucleótido están englobadas por la presente descripción y se encuentran en la técnica.
Además, pueden usarse las técnicas desarrolladas para la producción de "anticuerpos quiméricos" (Morrison et al., Proc. Natl. Acad. Sci. 81: 851-855 (1984); Neuberger et al., Nature 312: 604-608 (1984); Takeda et al., Nature 314: 452-454 (1985)) mediante el corte y empalme de genes de una molécula de anticuerpo de ratón con una especificidad de antígeno apropiada junto con genes de una molécula de anticuerpo humana con la actividad biológica apropiada. Tal y como se usa en la presente memoria, un anticuerpo quimérico es una molécula en la que diferentes partes derivan de especies de animales diferentes, tales como aquellos que tienen una región variable derivada de un anticuerpo monoclonal murino y una región constante de inmunoglobulina humana, por ejemplo, anticuerpos humanizados.
Alternativamente, pueden adaptarse las técnicas descritas para la producción de anticuerpos de cadena única (Pat. U.S. No. 4.694.778; Bird, Science 242: 423-442 (1988); Huston et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 85: 5879-5883 (1988); y Ward et al., Nature 334: 544-554 (1989)) para producir anticuerpos de cadena única. Los anticuerpos de cadena única se forman por la unión de los fragmentos de cadena pesada y ligera de la región Fv mediante un puente de aminoácido, lo que resulta en un anticuerpo de cadena única. También pueden usarse las técnicas para el ensamblaje de fragmentos Fv funcionales en E. coli (Skerra et al., Science 242: 1038-1041 (1988)).
Otros casos adicionales de la presente descripción comprenden la generación de anticuerpos humanos o sustancialmente humanos en animales transgénicos (por ejemplo, ratones) que son incapaces de la producción endógena de inmunoglobulinas (véase, por ejemplo, Pat. U.S. Nos. 6.075.181, 5.939.598, 5.591.669 y 5.589.369). Por ejemplo, se ha descrito que la deleción homocigota de la región de unión de la cadena pesada del anticuerpo en ratones quiméricos y mutantes de la línea germinal resulta en la inhibición completa de la producción endógena de anticuerpos. La transferencia de una matriz génica de inmunoglobulinas humanas a dichos ratones mutantes de la línea germinal resultará en la producción de anticuerpos humanos después del pulso con el antígeno. Otro medio preferido para generar anticuerpos humanos usando ratones SCID se describe en Pat. U.S. No. 5.811.524. Se apreciará que el material genético asociado con estos anticuerpos humanos también puede aislarse y manipularse como se describe en la presente memoria.
Otro medio altamente eficaz adicional para generar anticuerpos recombinantes está descrito por Newman, Biotechnology
10: 1455-1460 (1992). Específicamente, esta técnica resulta en la generación de anticuerpos primatizados que contienen dominios variables de mono y secuencias constantes humanas. Además, esta técnica también está descrita en las Pat.
U.S. Nos. 5.658.570, 5.693.780 y 5.756.096 asignadas comúnmente.
En otro caso, los linfocitos pueden seleccionarse por micromanipulación y aislarse los genes variables. Por ejemplo, pueden aislarse células mononucleares de sangre periférica de un mamífero inmunizado y cultivarse durante aproximadamente 7 días in vitro. Los cultivos pueden cribarse para IgG específicas que cumplan los criterios del cribado. Las células de pocillos positivos pueden aislarse. Las células B productoras de IgG individuales pueden aislarse por FACS o identificándolas en un ensayo en placa hemolítico mediado por complemento. Las células B productoras de Ig pueden micromanipularse en un tubo y los genes VH y VL pueden amplificarse usando, por ejemplo, RT-PCR. Los genes VH y VL pueden clonarse en un vector de expresión de anticuerpo y transferirse a células (por ejemplo, células eucariotas
o procariotas) para expresión.
Alternativamente, las líneas celulares productoras de anticuerpos pueden seleccionarse y cultivarse usando técnicas muy conocidas para el experto en la técnica. Dichas técnicas se describen en una variedad de manuales de laboratorio y publicaciones importantes. A este respecto, las técnicas adecuadas para uso en la descripción como se describe más adelante se describen en Current Protocols in Immunology, Coligan et al., Eds., Green Publishing Associates and Wiley-Interscience, John Wiley and Sons, Nueva York (1991).
Los anticuerpos para uso en los métodos de diagnóstico y terapéuticos descritos en la presente memoria pueden producirse por cualquier método conocido en la técnica para la síntesis de anticuerpos, en particular, por síntesis química o, preferiblemente, por técnicas de expresión recombinante como se describe en la presente memoria.
En un caso, un anticuerpo Sp35, o fragmento de unión a antígeno, variante o derivado de éste de la descripción comprende una región constante sintética en la que uno o más dominios están parcialmente o totalmente delecionados ("anticuerpos con dominio delecionado"). En determinados casos, anticuerpos modificados compatibles comprenderán construcciones o variantes con dominio delecionado en los que se ha eliminado el dominio CH2 entero (construcciones ΔCH2). Para otros casos, puede utilizarse un péptido conector corto para sustituir el dominio delecionado para proporcionar flexibilidad y libertad de movimiento a la región variable. Los expertos en la técnica apreciarán que dichas construcciones son particularmente preferidas debido a las propiedades reguladoras del dominio CH2 en la velocidad catabólica del anticuerpo. Las construcciones con dominio delecionado pueden derivarse usando un vector (por ejemplo, de Biogen IDEC Incorporated) que codifica un dominio constante humano de IgG1 (véase, por ejemplo, WO 02/060955 A2 y WO02/096948A2). Este vector ejemplar se preparó por ingeniería para delecionar el dominio CH2 y proporcionar un vector sintético que expresa una región constante de IgG1 con dominio delecionado.
En determinados casos, los anticuerpos Sp35, o fragmentos de unión a antígeno, variantes o derivados de éstos de la descripción son minicuerpos. Los minicuerpos pueden prepararse usando métodos descritos en la técnica (véase, por ejemplo, patente US 5.837.821 o WO 94/09817A1).
En un caso, un anticuerpo Sp35, o fragmento de unión a antígeno, variante o derivado de éste de la descripción comprende una cadena pesada de inmunoglobulina que tiene deleción o sustitución de unos pocos o incluso un único aminoácido siempre que permita la asociación entre las subunidades monoméricas. Por ejemplo, la mutación de un único aminoácido en áreas seleccionadas del dominio CH2 puede ser suficiente para reducir sustancialmente la unión de Fc y de esta manera incrementar la localización tumoral. De manera similar, puede ser deseable delecionar simplemente la parte de uno o más dominios de región constante que controla la función efectora (por ejemplo, unión del complemento) que se va a modular. Dichas deleciones parciales de las regiones constantes pueden mejorar características seleccionadas del anticuerpo (vida media en suero) mientras deja otras funciones deseables asociadas con el dominio de región constante sujeto intactas. Además, como se ha aludido anteriormente, las regiones constantes de los anticuerpos descritos pueden ser sintéticas mediante la mutación o sustitución de uno o más aminoácidos que aumenta el perfil de la construcción resultante. A este respecto, puede ser posible disrumpir la actividad proporcionada por un sitio de unión conservado (por ejemplo, unión de Fc) mientras se mantiene sustancialmente la configuración y perfil inmunogénico del anticuerpo modificado. Otros casos adicionales comprenden la adición de uno o más aminoácidos a la región constante para aumentar características deseables tales como función efectora o proporcionar más unión de citotoxina o carbohidrato. En dichos casos, puede ser deseable insertar o replicar secuencias específicas derivadas de dominios de región constante seleccionados.
La presente descripción también proporciona anticuerpos que comprenden, consisten esencialmente en o consisten en variantes (incluyendo derivados) de moléculas de anticuerpo (por ejemplo, las regiones VH y/o regiones VL) descritas en la presente memoria, uniéndose inmunoespecíficamente estos anticuerpos o fragmentos de éstos a un polipéptido Sp35
o fragmento o variante de éste. Las técnicas estándar conocidas para los expertos en la técnica pueden usarse para introducir mutaciones en la secuencia de nucleótidos que codifica un anticuerpo Sp35, incluyendo, pero no limitado a, mutagénesis dirigida a sitio y mutagénesis mediada por PCR que resultan en sustituciones de aminoácidos. Preferiblemente, las variantes (incluyendo derivados) codifican menos de 50 sustituciones de aminoácidos, menos de 40 sustituciones de aminoácidos, menos de 30 sustituciones de aminoácidos, menos de 25 sustituciones de aminoácidos, menos de 20 sustituciones de aminoácidos, menos de 15 sustituciones de aminoácidos, menos de 10 sustituciones de aminoácidos, menos de 5 sustituciones de aminoácidos, menos de 4 sustituciones de aminoácidos, menos de 3 sustituciones de aminoácidos o menos de 2 sustituciones de aminoácidos respecto a la región VH de referencia, VHCDR1, VHCDR2, VHCDR3, región VL, VLCDR1, VLCDR2 o VLCDR3. Una "sustitución de aminoácidos conservativa" es una en la que el residuo de aminoácido se reemplaza por un residuo de aminoácido que tiene una cadena lateral con una carga similar. Las familias de residuos de aminoácidos que tienen cadenas laterales con cargas similares se han definido en la técnica. Estas familias incluyen aminoácidos con cadenas laterales básicas (por ejemplo, lisina, arginina, histidina), cadenas laterales ácidas (por ejemplo, ácido aspártico, ácido glutámico), cadenas laterales polares no cargadas (por ejemplo, glicina, asparagina, glutamina, serina, treonina, tirosina, cisteína), cadenas laterales no polares (por ejemplo, alanina, valina, leucina, isoleucina, prolina, fenilalanina, metionina, triptófano), cadenas laterales con ramificación beta (por ejemplo, treonina, valina, isoleucina) y cadenas laterales aromáticas (por ejemplo, tirosina, fenilalanina, triptófano, histidina). Alternativamente, pueden introducirse mutaciones aleatoriamente a lo largo de toda o parte de la secuencia codificadora, tal como por mutagénesis de saturación, y los mutantes resultantes pueden cribarse para actividad biológica para identificar los mutantes que retienen la actividad (por ejemplo, la capacidad de unirse a un polipéptido Sp35).
Por ejemplo, es posible introducir mutaciones sólo en las regiones marco o sólo en regiones CDR de una molécula de anticuerpo. Las mutaciones introducidas pueden ser mutaciones silenciosas o sustitutivas neutras, es decir, no tienen ningún efecto o tienen poco efecto en la capacidad de un anticuerpo de unirse al antígeno. Estos tipos de mutaciones pueden ser útiles para optimizar el uso de codones o mejorar la producción de anticuerpos de un hibridoma. 5 Alternativamente, las mutaciones sustitutivas no neutras pueden alterar la capacidad de un anticuerpo de unirse al antígeno. La localización de la mayor parte de las mutaciones silenciosas y sustitutivas neutras probablemente sea en las regiones marco, mientras que la localización de la mayor parte de las mutaciones sustitutivas no neutras probablemente sea en CDR, aunque esto no es un requerimiento absoluto. Un experto en la técnica será capaz de diseñar y ensayar moléculas mutantes con propiedades deseadas tales como ausencia de alteración en la actividad de
10 unión al antígeno o alteración en la actividad de unión (por ejemplo, mejoras en la actividad de unión al antígeno o cambio en la especificidad del anticuerpo). Después de la mutagénesis, la proteína codificada puede expresarse rutinariamente y la actividad funcional y/o biológica de la proteína codificada (por ejemplo, la capacidad de unirse inmunoespecíficamente al menos a un epítopo de un polipéptido Sp35) puede determinarse usando técnicas descritas en la presente memoria o modificando rutinariamente técnicas conocidas en la técnica.
15 IV. Polinucleótidos que codifican anticuerpos Sp35
La presente descripción también proporciona moléculas de ácido nucleico que codifican anticuerpos Sp35, o fragmentos de unión a antígeno, variantes o derivados de éstos de la descripción.
En un caso, la presente descripción proporciona un polinucleótido aislado que comprende, consiste esencialmente en o consiste en un ácido nucleico que codifica una región variable de cadena pesada de inmunoglobulina (VH), en la que al 20 menos una de las CDR de la región variable de la cadena pesada o al menos dos de las CDR de la región variable de la cadena pesada son al menos 80%, 85%, 90% ó 95% idénticas a las secuencias de aminoácidos de CDR1, CDR2 o CDR3 de la cadena pesada de referencia de anticuerpos Sp35 monoclonales descritos en la presente memoria. Alternativamente, las regiones CDR1, CDR2 y CDR3 de la VH son al menos 80%, 85%, 90% ó 95% idénticas a las secuencias de aminoácidos de CDR1, CDR2 y CDR3 de la cadena pesada de referencia de anticuerpos Sp35
25 monoclonales descritos en la presente memoria. Así, según este caso una región variable de la cadena pesada de la descripción tiene secuencias polipeptídicas de CDR1, CDR2 o CDR3 relacionadas con las secuencias polipeptídicas mostradas en la Tabla 4:
En determinados casos, un anticuerpo o fragmento de unión a antígeno que comprende la VH codificada por el polinucleótido se une específicamente o preferentemente a Sp35.
En otro caso, la presente descripción proporciona un polinucleótido aislado que comprende, consiste esencialmente en o consiste en un ácido nucleico que codifica una región variable de cadena pesada (VH) de inmunoglobulina en la que las regiones CDR1, CDR2 y CDR3 tienen secuencias polipeptídicas que son idénticas a los grupos CDR1, CDR2 y CDR3 mostrados en la Tabla 4. En determinados casos, un anticuerpo o fragmento de unión a antígeno que comprende la VH codificada por el polinucleótido se une específicamente o preferentemente a Sp35.
En un caso adicional de la descripción, la presente descripción proporciona un polinucleótido aislado que comprende, consiste esencialmente en o consiste en un ácido nucleico que codifica una región variable de cadena pesada (VH) de inmunoglobulina en la que las regiones CDR1, CDR2 y CDR3 están codificadas por secuencias de nucleótidos al menos 80%, 85%, 90%, 95% ó 100% idénticas a las regiones CDR1, CDR2 y CDR3 de VH del polipéptido de cadena pesada de inmunoglobulina producido por el hibridoma 2.P3B5.2 (Designación de Depósito ATCC PTA-8106) o las regiones CDR1, CDR2 y CDR3 de VH del polipéptido de cadena pesada de inmunoglobulina producido por el hibridoma 7.P1D5.1.G9 (Designación de Depósito ATCC PTA-8107).
En un caso más, la presente descripción proporciona un polinucleótido aislado que comprende, consiste esencialmente en o consiste en un ácido nucleico que codifica una región variable de cadena pesada (VH) de inmunoglobulina en la que las regiones CDR1, CDR2 y CDR3 están codificadas por secuencias de nucleótidos que son idénticas a las secuencias de nucleótidos que codifican los grupos CDR1, CDR2 y CDR3 mostrados en la Tabla 4. En determinados casos, un anticuerpo o fragmento de unión a antígeno que comprende la VH codificada por el polinucleótido se une específicamente o preferentemente a Sp35.
En un caso adicional de la descripción, la presente descripción proporciona un polinucleótido aislado que comprende, consiste esencialmente en o consiste en un ácido nucleico que codifica una región variable de cadena pesada (VH) de inmunoglobulina en la que las regiones CDR1, CDR2 y CDR3 están codificadas por secuencias de nucleótidos al menos 80%, 85%, 90%, 95% ó 100% idénticas al polinucleótido que codifica las regiones CDR1, CDR2 y CDR3 de VH de la cadena pesada de inmunoglobulina producida por el hibridoma 2.P3B5.2 (Designación de Depósito ATCC PTA-8106) o el polinucleótido que codifica las regiones CDR1, CDR2 y CDR3 de VH de la cadena pesada de inmunoglobulina producida por el hibridoma 7.P1D5.1.G9 (Designación de Depósito ATCC PTA-8107)
En determinados casos, un anticuerpo o fragmento de unión a antígeno de éste que comprende, consiste esencialmente en o consiste en una VH codificada por uno o más de los polinucleótidos descritos anteriormente se une específicamente
o preferentemente al mismo epítopo que un anticuerpo monoclonal seleccionado del grupo que consiste en: 201’, 3A3, 3A6, 1A7, 1G7, 2B10, 2C11, 2F3, 3P1D10.2C3, 3P1E11.3B7, 3P2C6.3G10.2H7, 3P2C9.2G4, 3P4A6.1D9, 3P4A1.2B9, 3P4C2.2D2, 3P4C5.1D8, 3P4C8.2G9, 30-C12 (Li01), 38-D01 (Li022), 35-E04 (Li033), 36-C09 (Li04), 30-A11 (Li05), 34-F02 (Li06), 29-E07 (Li07), 34-G04 (Li08), 36-A12 (Li09), 28-D02 (Li10), 30-B01 (Li11), 34-B03 (Li12), Li13, Li32, Li33, Li34, 3383 (L1a.1), 3495 (L1a.2), 3563 (L1a.3), 3564 (L1a.4), 3565 (L1a.5), 3566 (L1a.6), 3567 (L1a.7), 3568 (L1a.8), 3569 (L1a.9), 3570 (L1a.10), 3571 (L1a.11), 3582 (L1a.12), 1968 (L1a.13), 7P1D5.1G9, 3B5.2 y Li81, o inhibirá competitivamente la unión de dicho anticuerpo monoclonal a Sp35.
En determinados casos, un anticuerpo o fragmento de unión a antígeno de éste que comprende, consiste esencialmente en o consiste en una VH codificada por uno o más de los polinucleótidos descritos anteriormente se une específicamente
o preferentemente a un polipéptido Sp35 o fragmento de éste, o un polipéptido variante Sp35, con una afinidad caracterizada por una constante de disociación (KD) no mayor de 5 X 10-2 M, 10-2 M, 5 X 10-3 M, 10-3 M, 5 X 10-4 M, 10-4 M, 5 X 10-5M, 10-5M, 5 X 10-6M, 10-6M, 5 X 10-7M, 10-7M, 5 X 10-8M, 10-8M, 5 X 10-9M, 10-9M, 5 X 10-10 M, 10-10 M, 5 X 10-11 M, 10-11 M, 5 X 10-12 M, 10-12 M, 5 X 10-13 M, 10-13 M, 5 X 10-14 M, 10-14 M, 5 X 10-15 M ó 10-15 M.
En otro caso, la presente descripción proporciona un polinucleótido aislado que comprende, consiste esencialmente en o consiste en un ácido nucleico que codifica una región variable de cadena ligera (VL) de inmunoglobulina, en la que al menos una de las CDR de la región variable de la cadena ligera o al menos dos de las CDR de la región variable de la cadena ligera son al menos 80%, 85%, 90% ó 95% idénticas a las secuencias de aminoácidos de CDR1, CDR2 o CDR3 de la cadena ligera de referencia de anticuerpos Sp35 monoclonales descritos en la presente memoria. Alternativamente, las regiones CDR1, CDR2 y CDR3 de la VL son al menos 80%, 85%, 90% ó 95% idénticas a las secuencias de aminoácidos de CDR1, CDR2 y CDR3 de la cadena ligera de referencia de anticuerpos Sp35 monoclonales descritos en la presente memoria. Así, según este caso una región variable de la cadena ligera de la descripción tiene secuencias polipeptídicas de CDR1, CDR2 o CDR3 relacionadas con las secuencias polipeptídicas mostradas en la Tabla 5:
En determinados casos, un anticuerpo o fragmento de unión a antígeno que comprende la VL codificada por el polinucleótido se une específicamente o preferentemente a Sp35.
En un caso adicional de la descripción, la presente descripción proporciona un polinucleótido aislado que comprende, consiste esencialmente en o consiste en un ácido nucleico que codifica una región variable de cadena ligera (VL) de inmunoglobulina en la que las regiones CDR1, CDR2 y CDR3 están codificadas por secuencias de nucleótidos al menos 80%, 85%, 90%, 95% ó 100% idénticas a las regiones CDR1, CDR2 y CDR3 de VL del polipéptido de cadena ligera de inmunoglobulina producido por el hibridoma 2.P3B5.2 (Designación de Depósito ATCC PTA-8106) o las regiones CDR1, CDR2 y CDR3 de VL del polipéptido de cadena ligera de inmunoglobulina producido por el hibridoma 7.P1D5.1.G9 (Designación de Depósito ATCC PTA-8107)
En otro caso, la presente descripción proporciona un polinucleótido aislado que comprende, consiste esencialmente en o consiste en un ácido nucleico que codifica una región variable de cadena ligera (VL) de inmunoglobulina en la que las regiones CDR1, CDR2 y CDR3 tienen secuencias polipeptídicas que son idénticas a los grupos CDR1, CDR2 y CDR3 mostrados en la Tabla 5. En determinados casos, un anticuerpo o fragmento de unión a antígeno que comprende la VL codificada por el polinucleótido se une específicamente o preferentemente a Sp35.
En un caso más, la presente descripción proporciona un polinucleótido aislado que comprende, consiste esencialmente en o consiste en un ácido nucleico que codifica una región variable de cadena ligera (VL) de inmunoglobulina en la que las regiones CDR1, CDR2 y CDR3 están codificadas por secuencias de nucleótidos que son idénticas a las secuencias de nucleótidos que codifican los grupos CDR1, CDR2 y CDR3 mostrados en la Tabla 5. En determinados casos, un anticuerpo o fragmento de unión a antígeno que comprende la VL codificada por el polinucleótido se une específicamente o preferentemente a Sp35.
En un caso adicional de la descripción, la presente descripción proporciona un polinucleótido aislado que comprende, consiste esencialmente en o consiste en un ácido nucleico que codifica una región variable de cadena ligera (VL) de inmunoglobulina en la que las regiones CDR1, CDR2 y CDR3 están codificadas por secuencias de nucleótidos al menos 80%, 85%, 90%, 95% ó 100% idénticas al polinucleótido que codifica las regiones CDR1, CDR2 y CDR3 de VL de la cadena ligera de inmunoglobulina producido por el hibridoma 2.P3B5.2 (Designación de Depósito ATCC PTA-8106) o el polinucleótido que codifica las regiones CDR1, CDR2 y CDR3 de VL de la cadena ligera de inmunoglobulina producido por el hibridoma 7.P1D5.1.G9 (Designación de Depósito ATCC PTA-8107)
En determinados casos, un anticuerpo o fragmento de unión a antígeno de éste que comprende, consiste esencialmente en o consiste en una VL codificada por uno o más de los polinucleótidos descritos anteriormente se une específicamente
o preferentemente al mismo epítopo que un anticuerpo monoclonal seleccionado del grupo que consiste en 201’, 3A3, 3A6, 1A7, 1G7, 2B10, 2C11, 2F3, 3P1D10.2C3, 3P1E11.3B7, 3P2C6.3G10.2H7, 3P2C9.2G4, 3P4A6.1D9, 3P4A1.2B9, 3P4C2.2D2, 3P4C5.1D8, 3P4C8.2G9, 30-C12 (Li01), 38-D01 (Li02), 35-E04 (Li03), 36-C09 (Li04), 30-A11 (Li05), 34-F02 (Li06), 29-E07 (Li07), 34-G04 (Li08), 36-A12 (Li09), 28-D02 (Li10), 30-B01 (Li11), 34-B03 (Li12), Li13, Li32, Li33, Li34, 3383 (L1a.1), 3495 (L1a.2), 3563 (L1a.3), 3564 (L1a.4), 3565 (L1a.5), 3566 (L1a.6), 3567 (L1a.7), 3568 (L1a.8), 3569 (L1a.9), 3570 (L1a.10), 3571 (L1a.11), 3582 (L1a.12), 1968 (L1a.13), 7P1D5.1G9, 3B5.2 y Li81, o inhibirá competitivamente la unión de dicho anticuerpo monoclonal a Sp35.
En determinados casos, un anticuerpo o fragmento de unión a antígeno de éste que comprende, consiste esencialmente en o consiste en una VL codificada por uno o más de los polinucleótidos descritos anteriormente se une específicamente
o preferentemente a un polipéptido Sp35 o fragmento de éste, o un polipéptido variante Sp35, con una afinidad caracterizada por una constante de disociación (KD) no mayor de 5 X 10-2 M, 10-2 M, 5 X 10-3 M, 10-3 M, 5 X 10-4 M, 10-4 M, 5 X 10-5M, 10-5M, 5 X 10-6M, 10-6M, 5 X 10-7M, 10-7M, 5 X 10-8M, 10-8M, 5 X 10-9M, 10-9M, 5 X 10-10 M, 10-10 M, 5 X 10-11 M, 10-11 M, 5 X 10-12 M, 10-12 M, 5 X 10-13 M, 10-13 M, 5 X 10-14 M, 10-14 M, 5 X 10-15 M ó 10-15 M.
En un caso adicional, la presente descripción incluye un polinucleótido aislado que comprende, consiste esencialmente en o consiste en un ácido nucleico que codifica una VH al menos 80%, 85%, 90% ó 95% idéntica a una secuencia polipeptídica de VH de referencia seleccionada del grupo que consiste en SEQ ID NOs: 158 a 172, 372, 376, 380, 384 y 416, mostradas en la Tabla 6. En determinados casos, un anticuerpo o fragmento de unión a antígeno que comprende la VH codificada por el polinucleótido se une específicamente o preferentemente a Sp35.
En otro caso, la presente descripción incluye un polinucleótido aislado que comprende, consiste esencialmente en o consiste en una secuencia de ácido nucleico que codifica una VH que tiene una secuencia polipeptídica seleccionada del grupo que consiste en SEQ ID NOs: 158 a 172, 372, 376, 380, 384 y 416 mostradas en la Tabla 6. En determinados casos, un anticuerpo o fragmento de unión a antígeno que comprende la VH codificada por el polinucleótido se une específicamente o preferentemente a Sp35.
TABLA 6 - Secuencias polipeptídicas de VH
En un caso adicional, la presente descripción incluye un polinucleótido aislado que comprende, consiste esencialmente en o consiste en un ácido nucleico que codifica una VH al menos 80%, 85%, 90% ó 95% idéntica a una secuencia polipeptídica de VH de referencia seleccionada del grupo que consiste en SEQ ID NOs: 158-172, 372, 376, 380, 384 y
416. En determinados casos, un anticuerpo o fragmento de unión a antígeno que comprende la VH codificada por el polinucleótido se une específicamente o preferentemente a Sp35.
En otro caso, la presente descripción incluye un polinucleótido aislado que comprende, consiste esencialmente en o consiste en una secuencia de ácido nucleico que codifica una VH de la descripción seleccionada del grupo que consiste
en SEQ ID NOs: 158-172, 372, 376, 380, 384 y 416. En determinados casos, un anticuerpo o fragmento de unión a antígeno que comprende la VH codificada por el polinucleótido se une específicamente o preferentemente a Sp35.
En un caso adicional, la presente descripción incluye un polinucleótido aislado que comprende, consiste esencialmente en o consiste en un ácido nucleico que codifica una VH al menos 80%, 85%, 90%, 95% ó 100% idéntica a una secuencia polipeptídica VH de referencia seleccionada del grupo que consiste en el polipéptido de cadena pesada de inmunoglobulina producido por el hibridoma 2.P3B5.2 (Designación de Depósito ATCC PTA-8106) y el polipéptido de cadena pesada de inmunoglobulina producido por el hibridoma 7.P1D5.1.G9 (Designación de Depósito ATCC PTA8107).
En determinados casos, un anticuerpo o fragmento de unión a antígeno de éste que comprende, consiste esencialmente en o consiste en una VH codificada por uno o más de los polinucleótidos descritos anteriormente se une específicamente
o preferentemente al mismo epítopo que un anticuerpo monoclonal seleccionado del grupo que consiste en (201’) 3A3, 3A6, 1A7, 1G7, 2B10, 2C11, 2F3, 3P1D10.2C3, 3P1E11.3B7, 3P2C6.3G10.2H7, 3P2C9.2G4, 3P4A6.1D9, 3P4A1.2B9, 3P4C2.2D2, 3P4C5.1D8, 3P4C8.2G9, 30-C12 (Li01), 38-D01 (Li02), 35-E04 (Li03), 36-C09 (Li04), 30-A11 (Li05), 34-F02 (Li06), 29-E07 (Li07), 34-G04 (Li08), 36-A12 (Li09), 28-D02 (Li10), 30-B01 (Li11), 34-B03 (Li12), Li13, Li32, Li33, Li34, 3383 (L1a.1), 3495 (L1a.2), 3563 (L1a.3), 3564 (L1a.4), 3565 (L1a.5), 3566 (L1a.6), 3567 (L1a.7), 3568 (L1a.8), 3569 (L1a.9), 3570 (L1a.10), 3571 (L1a.11), 3582 (L1a.12), 1968 (L1a.13), 7P1D5.1G9 y 3B5.2, o inhibirá competitivamente la unión de dicho anticuerpo monoclonal a Sp35.
En determinados casos, un anticuerpo o fragmento de unión a antígeno de éste que comprende, consiste esencialmente en o consiste en una VH codificada por uno o más de los polinucleótidos descritos anteriormente se une específicamente
o preferentemente a un polipéptido Sp35 o fragmento de éste, o un polipéptido variante Sp35, con una afinidad caracterizada por una constante de disociación (KD) no mayor de 5 X 10-2 M, 10-2 M, 5 X 10-3 M, 10-3 M, 5 X 10-4 M, 10-4 M, 5 X 10-5M, 10-5M, 5 X 10-6M, 10-6M, 5 X 10-7M, 10-7M, 5 X 10-8M, 10-8M, 5 X 10-9M, 10-9M, 5 X 10-10 M, 10-10 M, 5 X 10-11 M, 10-11 M, 5 X 10-12 M, 10-12 M, 5 X 10-13 M, 10-13 M, 5 X 10-14 M, 10-14 M, 5 X 10-15 M ó 10-15 M.
En casos adicionales, la presente descripción incluye un polinucleótido aislado que codifica una cadena pesada de inmunoglobulina que comprende, consiste esencialmente en o consiste en un ácido nucleico que codifica una cadena pesada al menos 80%, 85%, 90%, 95% ó 100% idéntica al polinucleótido de SEQ ID NO: 420 como se muestra más adelante. En determinados casos, un anticuerpo o fragmentos de unión a antígeno que comprende la cadena pesada codificada por el polinucleótido se une específicamente o preferentemente a Sp35 y o al mismo epítopo que el anticuerpo monoclonal 3B5.2.
Secuencia de polinucleótido de cadena pesada de inmunoglobulina para el anticuerpo monoclonal quimérico humano murino 3B5.2:
En casos adicionales, la presente descripción incluye un polinucleótido aislado que codifica una región variable de cadena pesada (VH), en la que el polinucleótido comprende una secuencia de ácido nucleico de VH seleccionada del grupo que consiste en SEQ ID NOs 173 a 184, 370, 374, 378, 382 y 422, como se muestra en la Tabla 7. En determinados casos, un anticuerpo o fragmento de unión a antígeno que comprende la VH codificada por el polinucleótido se une específicamente o preferentemente a Sp35.
TABLA 7 - Secuencias polinucleotídicas de VH
En un caso adicional, la presente descripción incluye un polinucleótido aislado que comprende, consiste esencialmente en o consiste en un ácido nucleico que codifica una VH al menos 80%, 85%, 90% ó 95% idéntico a una secuencia de ácido nucleico de referencia seleccionada del grupo que consiste en SEQ ID NOs: 173-184, 370, 374, 378, 382 y 422 de
5 la Tabla 7. En determinados casos, el polinucleótido codifica un polipéptido VH que se une específicamente o preferentemente a Sp35.
En determinados casos, un anticuerpo o fragmento de unión a antígeno de éste que comprende, consiste esencialmente en o consiste en una VH codificada por uno o más de los polinucleótidos descritos anteriormente se une específicamente
o preferentemente al mismo epítopo que un anticuerpo monoclonal seleccionado del grupo que consiste en (201’) 3A3,
10 3A6, 1A7, 1G7, 2B10, 2C11, 2F3, 3P1D10.2C3, 3P1E11.3B7, 3P2C6.3G10.2H7, 3P2C9.2G4, 3P4A6.1D9, 3P4A1.2B9, 3P4C2.2D2, 3P4C5.1D8, 3P4C8.2G9, 30-C12 (Li01), 38-D01 (Li02), 35-E04 (Li03), 36-C09 (Li04), 30-A11 (Li05), 34-F02 (Li06), 29-E07 (Li07), 34-G04 (Li08), 36-A12 (Li09), 28-D02 (Li10), 30-B01 (Li11), 34-B03 (Li12), Li13, Li32, Li33, Li34, 3383 (L1a.1), 3495 (L1a.2), 3563 (L1a.3), 3564 (L1a.4), 3565 (L1a.5), 3566 (L1a.6), 3567 (L1a.7), 3568 (L1a.8), 3569
(L1a.9), 3570 (L1a.10), 3571 (L1a.11), 3582 (L1a.12), 1968 (L1a.13), 3B5.2 y Li81 o inhibirá competitivamente la unión de dicho anticuerpo monoclonal a Sp35.
En determinados casos, un anticuerpo o fragmento de unión a antígeno de éste que comprende, consiste esencialmente en o consiste en una VH codificada por uno o más de los polinucleótidos descritos anteriormente se une específicamente
o preferentemente a un polipéptido Sp35 o fragmento de éste, o un polipéptido variante Sp35, con una afinidad caracterizada por una constante de disociación (KD) no mayor de 5 X 10-2 M, 10-2 M, 5 X 10-3 M, 10-3 M, 5 X 10-4 M, 10-4 M, 5 X 10-5M, 10-5M, 5 X 10-6M, 10-6M, 5 X 10-7M, 10-7M, 5 X 10-8M, 10-8M, 5 X 10-9M, 10-9M, 5 X 10-10 M, 10-10 M, 5 X 10-11 M, 10-11 M, 5 X 10-12 M, 10-12 M, 5 X 10-13 M, 10-13 M, 5 X 10-14 M, 10-14 M, 5 X 10-15 M ó 10-15 M.
En un caso adicional, la presente descripción incluye un polinucleótido aislado que comprende, consiste esencialmente en o consiste en un ácido nucleico que codifica una VH al menos 80%, 85%, 90%, 95% ó 100% idéntica a una secuencia de polinucleótido de VH de referencia seleccionada del grupo que consiste en el polinucleótido que codifica la cadena pesada de inmunoglobulina producida por el hibridoma 2.P3B5.2 (Designación de Depósito ATCC PTA-8106) y el polinucleótido que codifica la cadena pesada de inmunoglobulina producida por el hibridoma 7.P1D5.1.G9 (Designación de Depósito ATCC PTA-8107).
En un caso adicional, la presente descripción incluye un polinucleótido aislado que comprende, consiste esencialmente en o consiste en un ácido nucleico que codifica una VL al menos 80%, 85%, 90%, ó 95% idéntica a una secuencia polipeptídica VL de referencia seleccionada del grupo que consiste en SEQ ID NOs: 273 a 286, 373, 377, 381, 385 y 417, mostradas en la Tabla 8. En determinados casos, un anticuerpo o fragmento de unión a antígeno que comprende la VL codificada por el polinucleótido se une específicamente o preferentemente a Sp35.
En otro caso, la presente descripción incluye un polinucleótido aislado que comprende, consiste esencialmente en o consiste en una secuencia de ácido nucleico que codifica una VL que tiene una secuencia polipeptídica seleccionada del grupo que consiste en SEQ ID NOs: 273 a 286, 373, 377, 381, 385 y 417, mostradas en la Tabla 8. En determinados casos, un anticuerpo o fragmento de unión a antígeno que comprende la VL codificada por el polinucleótido se une específicamente o preferentemente a Sp35.
TABLA 8 -Secuencias Polipeptídicas de VL
En un caso adicional, la presente descripción incluye un polinucleótido aislado que comprende, consiste esencialmente en o consiste en un ácido nucleico que codifica una VL al menos 80%, 85%, 90% ó 95% idéntica a una secuencia polipeptídica de VL de referencia seleccionada del grupo que consiste en SEQ ID NOs: 273 a 286, 373, 377, 381, 385 y 417, como se muestra en la Tabla 8. En determinados casos, un anticuerpo o fragmento de unión a antígeno que comprende la VL codificada por el polinucleótido se une específicamente o preferentemente a Sp35.
En otro caso, la presente descripción incluye un polinucleótido aislado que comprende, consiste esencialmente en o consiste en una secuencia de ácido nucleico que codifica una VL de la descripción seleccionada del grupo que consiste en SEQ ID NOs: 273 a 286, 373, 377, 381, 385 y 417. En determinados casos, un anticuerpo o fragmento de unión a antígeno que comprende la VL codificada por el polinucleótido se une específicamente o preferentemente a Sp35.
En un caso adicional, la presente descripción incluye un polinucleótido aislado que comprende, consiste esencialmente en o consiste en un ácido nucleico que codifica una VL al menos 80%, 85%, 90%, 95% ó 100% idéntica a una secuencia polipeptídica de VL de referencia seleccionada del grupo que consiste en el polipéptido de cadena ligera de inmunoglobulina producido por el hibridoma 2.P3B5.2 (Designación de Depósito ATCC PTA-8106) y el polipéptido de cadena ligera de inmunoglobulina producido por el hibridoma 7.P1D5.1.G9 (Designación de Depósito ATCC PTA-8107).
En determinados casos, un anticuerpo o fragmento de unión a antígeno de éste que comprende, consiste esencialmente en o consiste en una VL codificada por uno o más de los polinucleótidos descritos anteriormente se une específicamente
o preferentemente al mismo epítopo que un anticuerpo monoclonal seleccionado del grupo que consiste en 201’, 3A3, 3A6, 1A7, 1G7, 2B10, 2C11, 2F3, 3P1D10.2C3, 3P1E11.3B7, 3P2C6.3G10.2H7, 3P2C9.2G4, 3P4A6.1D9, 3P4A1.2B9, 3P4C2.2D2, 3P4C5.1D8, 3P4C8.2G9, 30-C12 (Li01), 38-D01 (Li02), 35-E04 (Li03), 36-C09 (Li04), 30-A11 (Li05), 34-F02 (Li06), 29-E07 (Li07), 34-G04 (Li08), 36-A12 (Li09), 28-D02 (Li10), 30-B01 (Li11), 34-B03 (Li12), Li13, Li32, Li33, Li34, 3383 (L1a.1), 3495 (L1a.2), 3563 (L1a.3), 3564 (L1a.4), 3565 (L1a.5), 3566 (L1a.6), 3567 (L1a.7), 3568 (L1a.8), 3569 (L1a.9), 3570 (L1a.10), 3571 (L1a.11), 3582 (L1a.12), 1968 (L1a.13), 7P1D5.1G9, 3B5.2 y Li81, o inhibirá competitivamente la unión de dicho anticuerpo monoclonal a Sp35.
En determinados casos, un anticuerpo o fragmento de unión a antígeno de éste que comprende, consiste esencialmente en o consiste en una VL codificada por uno o más de los polinucleótidos descritos anteriormente se une específicamente
o preferentemente a un polipéptido Sp35 o fragmento de éste, o un polipéptido variante Sp35, con una afinidad caracterizada por una constante de disociación (KD) no mayor de 5 X 10-2 M, 10-2 M, 5 X 10-3 M, 10-3 M, 5 X 10-4 M, 10-4 M, 5 X 10-5M, 10-5M, 5 X 10-6M, 10-6M, 5 X 10-7M, 10-7M, 5 X 10-8M, 10-8M, 5 X 10-9M, 10-9M, 5 X 10-10 M, 10-10 M, 5 X 10-11 M, 10-11 M, 5 X 10-12 M, 10-12 M, 5 X 10-13 M, 10-13 M, 5 X 10-14 M, 10-14 M, 5 X 10-15 M ó 10-15 M.
En casos adicionales, la presente descripción incluye un polinucleótido aislado que codifica una cadena ligera de inmunoglobulina, en el que el polinucleótido un polinucleótido aislado que comprende, consiste esencialmente en o consiste en un ácido nucleico que codifica una cadena ligera al menos 80%, 85%, 90%, 95% ó 100% idéntica al polinucleótido de SEQ ID NO: 421 como se muestra más adelante. En determinados casos, un anticuerpo o fragmento de unión a antígeno que comprende la cadena ligera codificada por el polinucleótido se une específicamente o preferentemente a Sp35 y o al mismo epítopo que el anticuerpo monoclonal 3B5.2
Secuencia de polinucleótido de cadena ligera de inmunoglobulina para el anticuerpo quimérico murino y humano 3B5.2:
En casos adicionales, la presente descripción incluye un polinucleótido aislado que codifica una región variable de cadena ligera (VL) en el que el polinucleótido comprende una secuencia de ácido nucleico de VL seleccionada del grupo que consiste en SEQ ID NOs 185 a 194, 371, 375, 379, 383 y 423, como se muestra en la Tabla 9. En determinados casos, un anticuerpo o fragmento de unión a antígeno que comprende la VL codificada por el polinucleótido se une específicamente o preferentemente a Sp35.
TABLA 9 - Secuencias polinucleotídicas de VL
En un caso adicional, la presente descripción incluye un polinucleótido aislado que comprende, consiste esencialmente en o consiste en un ácido nucleico que codifica una VL al menos 80%, 85%, 90% ó 95% idéntica a un polinucleótido VL seleccionado del grupo que consiste en SEQ ID NOs: 185-194, 371, 375, 379, 383 y 423 de la Tabla 9. En determinados casos, el polinucleótido codifica un polipéptido VL que se une específicamente o preferentemente a Sp35.
En determinados casos, un anticuerpo o fragmento de unión a antígeno de éste que comprende, consiste esencialmente en o consiste en una VL codificada por uno o más de los polinucleótidos descritos anteriormente se une específicamente
o preferentemente al mismo epítopo que un anticuerpo monoclonal seleccionado del grupo que consiste en 201’, 3A3, 3A6, 1A7, 1G7, 2B10, 2C11, 2F3, 3P1D10.2C3, 3P1E11.3B7, 3P2C6.3G10.2H7, 3P2C9.2G4, 3P4A6.1D9, 3P4A1.2B9, 3P4C2.2D2, 3P4C5.1D8, 3P4C8.2G9, 30-C12 (Li01), 38-D01 (Li02), 35-E04 (Li03), 36-C09 (Li04), 30-A11 (Li05), 34-F02 (Li06), 29-E07 (Li07), 34-G04 (Li08), 36-A12 (Li09), 28-D02 (Li10), 30-B01 (Li11), 34-B03 (Li12), Li13, Li32, Li33, Li34, 3383 (L1a.1), 3495 (L1a.2), 3563 (L1a.3), 3564 (L1a.4), 3565 (L1a.5), 3566 (L1a.6), 3567 (L1a.7), 3568 (L1a.8), 3569 (L1a.9), 3570 (L1a.10), 3571 (L1a.11), 3582 (L1a.12), 1968 (L1a.13), 3B5.2 y Li81, o inhibirá competitivamente la unión de dicho anticuerpo monoclonal a Sp35.
En determinados casos, un anticuerpo o fragmento de unión a antígeno de éste que comprende, consiste esencialmente en o consiste en una VL codificada por uno o más de los polinucleótidos descritos anteriormente se une específicamente
o preferentemente a un polipéptido Sp35 o fragmento de éste, o un polipéptido variante Sp35, con una afinidad caracterizada por una constante de disociación (KD) no mayor de 5 X 10-2 M, 10-2 M, 5 X 10-3 M, 10-3 M, 5 X 10-4 M, 10-4 M, 5 X 10-5M, 10-5M, 5 X 10-6M, 10-6M, 5 X 10-7M, 10-7M, 5 X 10-8M, 10-8M, 5 X 10-9M, 10-9M, 5 X 10-10 M, 10-10 M, 5 X 10-11 M, 10-11 M, 5 X 10-12 M, 10-12 M, 5 X 10-13 M, 10-13 M, 5 X 10-14 M, 10-14 M, 5 X 10-15 M ó 10-15 M.
En un caso adicional, la presente descripción incluye un polinucleótido aislado que comprende, consiste esencialmente en o consiste en un ácido nucleico que codifica una VL al menos 80%, 85%, 90%, 95% ó 100% idéntica a una secuencia de polinucleótido de VL de referencia seleccionada del grupo que consiste en el polinucleótido que codifica la cadena ligera de inmunoglobulina producido por el hibridoma 2.P3B5.2 (Designación de Depósito ATCC PTA-8106) y el polinucleótido que codifica la cadena ligera de inmunoglobulina producido por el hibridoma 7.P1D5.1.G9 (Designación de Depósito ATCC PTA-8107).
Cualquiera de los polinucleótidos descritos anteriormente puede incluir además ácidos nucleicos adicionales que codifican, por ejemplo, un péptido señal para dirigir la secreción del polipéptido codificado, regiones constantes de anticuerpo como se describe en la presente memoria, u otros polipéptidos heterólgos como se describe en la presente memoria.
También, como se describe con más detalle en otro lugar de la presente memoria, la descripción incluye composiciones que comprenden los polinucleótidos que comprenden uno o más de los polinucleótidos descritos anteriormente. En un caso, la descripción incluye composiciones que comprenden un primer polinucleótido y segundo polinucleótido en el que dicho primer polinucleótido codifica un polipéptido VH como se describe en la presente memoria y en el que dicho segundo polinucleótido codifica un polipéptido VL como se describe en la presente memoria. Específicamente, una composición que comprende, consiste esencialmente en o consiste en un polinucleótido VH, como se muestra en la Tabla 7 y un polinucleótido VL, como se muestra en la Tabla 9, en el que dicho polinucleótido VH y dicho polinucleótido VL se seleccionan del grupo que consiste en:
i) SEQ ID NO: 173 y SEQ ID NO: 185;
ii) SEQ ID NO: 174 y SEQ ID NO: 186;
iii) SEQ ID NO: 175 y SEQ ID NO: 187;
iv) SEQ ID NO: 176 y SEQ ID NO: 188;
v) SEQ ID NO: 178 y SEQ ID NO: 189;
vi) SEQ ID NO: 179 y SEQ ID NO: 190;
vii) SEQ ID NO: 180 y SEQ ID NO: 191;
viii) SEQ ID NO: 181 y SEQ ID NO: 192;
ix) SEQ ID NO: 182 y SEQ ID NO: 193;
x) SEQ ID NO: 183 y SEQ ID NO: 194;
xi) SEQ ID NO: 370 y SEQ ID NO: 371;
xii) SEQ ID NO: 374 y SEQ ID NO: 375;
xiii) SEQ ID NO: 378 y SEQ ID NO: 379;
xiv) SEQ ID NO: 382 y SEQ ID NO: 385;
xv) SEQ ID NO: 422 y SEQ ID NO: 423;
xvi) SEQ ID NO: 448 y SEQ ID NO: 449; y
xvii) SEQ ID NO: 450 y SEQ ID NO: 449.
La presente descripción también incluye fragmentos de los polinucleótidos de la descripción descritos en otro lugar. Además, los polinucleótidos que codifican polinucleótidos de fusión, fragmentos Fab y otros derivados, como se describe en la presente memoria, también están contemplados por la descripción.
Los polinucleótidos pueden producirse o fabricarse por cualquier método conocido en la técnica. Por ejemplo, si la secuencia nucleotídica del anticuerpo es conocida, puede ensamblarse un polinucleótido que codifica el anticuerpo a partir de oligonucleótidos sintetizados químicamente (por ejemplo, como se describe en Kutmeier et al., BioTechniques
17: 242 (1994)), que, brevemente, implica la síntesis de oligonucleótidos superpuestos que contienen partes de la secuencia que codifica el anticuerpo, hibridar y ligar estos oligonucleótidos y amplificar los oligonucleótidos ligados por PCR.
Alternativamente, un polinucleótido que codifica un anticuerpo Sp35, o fragmento de unión a antígeno, variante o derivado de éste puede generarse a partir de un ácido nucleico de una fuente adecuada. Si no está disponible un clon que contiene un ácido nucleico que codifica un anticuerpo particular pero se conoce la secuencia de la molécula de anticuerpo, un ácido nucleico que codifica el anticuerpo puede sintetizarse químicamente u obtenerse de una fuente adecuada (por ejemplo, una biblioteca de ADNc de anticuerpos o una biblioteca de ADNc generada a partir de, o ácido nucleico, preferiblemente ARN poli A+, aislado a partir de, cualquier tejido o células que expresan el anticuerpo u otro anticuerpo Sp35, tal como células de hibridoma seleccionadas para expresar un anticuerpo) por amplificación con PCR usando cebadores sintéticos que pueden hibridar con los extremos 3' y 5' de la secuencia o por clonación usando una sonda oligonucleotídica específica para la secuencia génica particular que se quiere identificar, por ejemplo, un clon de ADNc de una biblioteca de ADNc que codifica el anticuerpo u otro anticuerpo Sp35. Los ácidos nucleicos amplificados generados por PCR pueden clonarse en vectores de clonación replicables usando cualquier método muy conocido en la técnica.
Una vez que se ha determinado la secuencia de nucleótidos y secuencia de aminoácidos correspondiente del anticuerpo Sp35, o fragmento de unión a antígeno, variante o derivado de éste, su secuencia de nucleótidos puede manipularse usando métodos muy conocidos en la técnica para la manipulación de secuencias de nucleótidos, por ejemplo, técnicas de ADN recombinante, mutagénesis dirigida a sitio, PCR, etc. (véase, por ejemplo, las técnicas descritas en Sambrook et al., Molecular Cloning, A Laboratory Manual, 2ª Ed., Cold Spring Harbor Laboratory, Cold Spring Harbor, N.Y. (1990) y Ausubel et al., eds., Current Protocols in Molecular Biology, John Wiley & Sons, NY (1998), para generar anticuerpos que tienen una secuencia de aminoácidos diferente, por ejemplo, para crear sustituciones, deleciones y/o inserciones de aminoácidos.
Un polinucleótido que codifica un anticuerpo Sp35, o fragmento de unión a antígeno, variante o derivado de éste puede estar compuesto por cualquier polirribonucleótido o polidesoxirribonucleótido, que puede ser ARN o ADN no modificado,
o ARN o ADN modificado. Por ejemplo, un polinucleótido que codifica un anticuerpo Sp35 o fragmento de unión a antígeno, variante o derivado de éste puede estar compuesto por ADN mono y bicatenario, ADN que es una mezcla de regiones mono y bicatenarias, ARN mono y bicatenario y ARN que es una mezcla de regiones mono y bicatenarias, moléculas híbridas que comprenden ADN y ARN que pueden ser monocatenarias o, más típicamente, bicatenarias o una mezcla de regiones mono y bicatenarias. Además, un polinucleótido que codifica un anticuerpo Sp35 o fragmento de unión a antígeno, variante o derivado de éste puede estar compuesto por regiones tricatenarias que comprenden ARN o ADN o tanto ARN como ADN. Un polinucleótido que codifica un anticuerpo Sp35 o fragmento de unión a antígeno, variante o derivado de éste también puede contener una o más bases modificadas o núcleos de ADN o ARN modificados para estabilidad o para otras razones. Bases "modificadas" incluye, por ejemplo, bases tritiladas y bases inusuales tales como inosina. Pueden hacerse una variedad de modificaciones en el ADN y ARN; así, "polinucleótido" engloba las formas modificadas químicamente, enzimáticamente o metabólicamente.
Puede crearse un polinucleótido aislado que codifica una variante no natural de un polipéptido derivado de una inmunoglobulina (por ejemplo, una parte de cadena pesada o parte de cadena ligera de inmunoglobulina) introduciendo una o más sustituciones, adiciones o deleciones de nucleótidos en la secuencia de nucleótidos de la inmunoglobulina de manera que se introducen una o más sustituciones, adiciones o deleciones de aminoácidos en la proteína codificada.
Las mutaciones pueden introducirse por técnicas estándar, tal como mutagénesis dirigida a sitio y mutagénesis mediada por PCR. Preferiblemente, se hacen sustituciones de aminoácidos conservativas en uno o más residuos de aminoácidos no esenciales.
V. Polipéptidos de anticuerpos Sp35
La presente descripción está dirigida además a polipéptidos aislados que componen los anticuerpos Sp35, o fragmentos de unión a antígeno, variantes o derivados de éstos. Los anticuerpos Sp35 de la presente descripción comprenden polipéptidos, por ejemplo secuencias de aminoácidos que codifican regiones de unión a antígeno específicas de Sp35 derivadas de moléculas de inmunoglobulina. Una secuencia polipeptídica o de aminoácidos "derivada de" una proteína designada se refiere al origen del polipéptido. En determinados casos, la secuencia polipeptídica o de aminoácidos que deriva de una secuencia polipeptídica o de aminoácidos de partida particular tiene una secuencia de aminoácidos que es esencialmente idéntica a la de la secuencia de partida, o una parte de ésta, en el que la parte consiste en al menos 1020 aminoácidos, al menos 20-30 aminoácidos, al menos 30-50 aminoácidos o que un experto en la técnica puede identificar de otra manera que tiene su origen en la secuencia de partida.
En un caso, la presente descripción proporciona un polipéptido aislado que comprende, consiste esencialmente en o consiste en una región variable de cadena pesada (VH) de inmunoglobulina, en la que al menos una de las CDR de la región variable de cadena pesada o al menos dos de las CDR de la región variable de cadena pesada son al menos 80%, 85%, 90% ó 95% idénticas a las secuencias de aminoácidos de CDR1, CDR2 o CDR3 de la cadena pesada de referencia de anticuerpos Sp35 monoclonales descritos en la presente memoria. Alternativamente, las regiones CDR1, CDR2 y CDR3 de la VH son al menos 80%, 85%, 90% ó 95% idénticas a las secuencias de aminoácidos de CDR1, CDR2 y CDR3 de la cadena pesada de referencia de anticuerpos Sp35 monoclonales descritos en la presente memoria. Así, según este caso una región variable de cadena pesada de la descripción tiene secuencias polipeptídicas de CDR1, CDR2 y CDR3 relacionadas con los grupos mostrados en la Tabla 4, más arriba. En determinados casos, un anticuerpo
o fragmento de unión a antígeno que comprende el polipéptido VH se une específicamente o preferentemente a Sp35.
En otro caso, la presente descripción proporciona un polipéptido aislado que comprende, consiste esencialmente en o consiste en una región variable de cadena pesada (VH) de inmunoglobulina, en la que las regiones CDR1, CDR2 y CDR3 tienen secuencias polipeptídicas que son idénticas a los grupos CDR1, CDR2 y CDR3 mostrados en la Tabla 4. En determinados casos, un anticuerpo o fragmento de unión a antígeno que comprende el polipéptido VH se une específicamente o preferentemente a Sp35.
En un caso, la presente descripción proporciona un polipéptido aislado que comprende, consiste esencialmente en o consiste en una región variable de cadena pesada (VH) de inmunoglobulina, en la que al menos una de las CDR de la región variable de cadena pesada o al menos dos de las CDR de la región variable de cadena pesada son al menos 80%, 85%, 90%, 95% ó 100% idénticas a las secuencias de aminoácidos de CDR1, CDR2 y CDR3 de la cadena pesada de referencia seleccionadas del grupo que consiste en las secuencias de aminoácidos de CDR1, CDR2 y CDR3 de VH de la cadena pesada de inmunoglobulina producida por el hibridoma 2.P3B5.2 (Designación de Depósito ATCC PTA8106) y las secuencias de aminoácidos de CDR1, CDR2 y CDR3 de VH de la cadena pesada de inmunoglobulina producida por el hibridoma 7.P1D5.1.G9 (Designación de Depósito ATCC PTA-8107).
En un caso adicional, la presente descripción incluye un polipéptido aislado que comprende, consiste esencialmente en o consiste en un polipéptido VH al menos 80%, 85%, 90%, 95% ó 100% idéntico a una secuencia polipeptídica VH de referencia seleccionada del grupo que consiste en SEQ ID NOs: 158 a 172, 372, 376, 380, 384, 416 y 433, como se muestra en la Tabla 6 y SEQ ID NO: 435. En determinados casos, un anticuerpo o fragmento de unión a antígeno que comprende el polipéptido VH se une específicamente o preferentemente a Sp35.
En otro caso, la presente descripción incluye un polipéptido aislado que comprende, consiste esencialmente en o consiste en un polipéptido VH seleccionado del grupo que consiste en SEQ ID NOs: 158 a 172, 372, 376, 380, 384, 416 y 433, como se muestra en la Tabla 6 y SEQ ID NO: 435. En determinados casos, un anticuerpo o fragmento de unión a antígeno que comprende el polipéptido VH se une específicamente o preferentemente a Sp35.
En un caso más, la presente descripción incluye un polipéptido aislado que comprende, consiste esencialmente en o consiste en un polipéptido VH al menos 80%, 85%, 90%, 95% ó 100% idéntico a una secuencia polipeptídica VH de referencia seleccionada del grupo que consiste en la cadena pesada de inmunoglobulina producida por el hibridoma 2.P3B5.2 (Designación de Depósito ATCC PTA-8106) y la cadena pesada de inmunoglobulina producida por el hibridoma 7.P1D5.1.G9 (Designación de Depósito ATCC PTA-8107).
En determinados casos, un anticuerpo o fragmento de unión a antígeno de éste que comprende, consiste esencialmente en o consiste en uno o más de los polipéptidos VH descritos anteriormente se une específicamente o preferentemente al mismo epítopo que un anticuerpo monoclonal seleccionado del grupo que consiste en 201’, 3A3, 3A6, 1A7, 1G7, 2B10, 2C11, 2F3, 3P1D10.2C3, 3P1E11.3B7, 3P2C6.3G10.2H7, 3P2C9.2G4, 3P4A6.1D9, 3P4A1.2B9, 3P4C2.2D2,
3P4C5.1D8, 3P4C8.2G9, 30-C12 (Li01), 38-D01 (Li02), 35-E04 (Li03), 36-C09 (Li04), 30-A11 (Li05), 34-F02 (Li06), 29-E07 (Li07), 34-G04 (Li08), 36-A12 (Li09), 28-D02 (Li10), 30-B01 (Li11), 34-B03 (Li12), Li13, Li32, Li33, Li34, 3383 (L1a.1), 3495 (L1a.2), 3563 (L1a.3), 3564 (L1a.4), 3565 (L1a.5), 3566 (L1a.6), 3567 (L1a.7), 3568 (L1a.8), 3569 (L1a.9), 3570 (L1a.10), 3571 (L1a.11), 3582 (L1a.12), 1968 (L1a.13), 7P1D5.1G9, 3B5.2 y Li81, o inhibirá competitivamente la unión de dicho anticuerpo monoclonal a Sp35.
En determinados casos, un anticuerpo o fragmento de unión a antígeno de éste que comprende, consiste esencialmente en o consiste en uno o más de los polipéptidos VH descritos anteriormente se une específicamente o preferentemente a un polipéptido Sp35 o fragmento de éste, o un polipéptido Sp35 variante, con una afinidad caracterizada por una constante de disociación (KD) no mayor de 5 X 10-2 M, 10-2 M, 5 X 10-3 M, 10-3 M, 5 X 10-4 M, 10-4 M, 5 X 10-5 M, 10-5 M, 5 X 10-6 M, 10-6 M, 5 X 10-7 M, 10-7 M, 5 X 10-8 M, 10-8 M, 5 X 10-9 M, 10-9 M, 5 X 10-10 M, 10-10 M, 5 X 10-11 M, 10-11 M, 5 X 1012 M, 10-12 M, 5 X 10-13 M, 10-13 M, 5 X 10-14 M, 10-14 M, 5 X 10-15 M ó 10-15 M.
En otro caso, la presente descripción proporciona un polipéptido aislado que comprende, consiste esencialmente en o consiste en una región variable de cadena ligera (VL) de inmunoglobulina, en la que al menos una de las CDR de la región variable de cadena ligera o al menos dos de las CDR de la región variable de cadena ligera son al menos 80%, 85%, 90% ó 95% idénticas a las secuencias de aminoácidos de CDR1, CDR2 o CDR3 de la cadena pesada de referencia de anticuerpos Sp35 monoclonales descritos en la presente memoria. Alternativamente, las regiones CDR1, CDR2 y CDR3 de la VL son al menos 80%, 85%, 90% ó 95% idénticas a las secuencias de aminoácidos de CDR1, CDR2 y CDR3 de la cadena ligera de referencia de anticuerpos Sp35 monoclonales descritos en la presente memoria. Así, según este caso una región variable de cadena ligera de la descripción tiene secuencias polipeptídicas de CDR1, CDR2 y CDR3 relacionadas con los polipéptidos mostrados en la Tabla 5, más arriba. En determinados casos, un anticuerpo o fragmento de unión a antígeno que comprende el polipéptido VL se une específicamente o preferentemente a Sp35.
En otro caso, la presente descripción proporciona un polipéptido aislado que comprende, consiste esencialmente en o consiste en una región variable de cadena ligera (VL) de inmunoglobulina, en la que las regiones CDR1, CDR2 y CDR3 tienen secuencias polipeptídicas que son idénticas a los grupos CDR1, CDR2 y CDR3 mostrados en la Tabla 5. En determinados casos, un anticuerpo o fragmento de unión a antígeno que comprende el polipéptido VL se une específicamente o preferentemente a Sp35.
En un caso, la presente descripción proporciona un polipéptido aislado que comprende, consiste esencialmente en o consiste en una región variable de cadena ligera (VL) de inmunoglobulina, en la que al menos una de las CDR de la región variable de cadena ligera o al menos dos de las CDR de la región variable de cadena ligera son al menos 80%, 85%, 90%, 95% ó 100% idénticas a las secuencias de aminoácidos de CDR1, CDR2 y CDR3 de la cadena ligera de referencia seleccionadas del grupo que consiste en las secuencias de aminoácidos de CDR1, CDR2 y CDR3 de VL de la cadena ligera de inmunoglobulina producida por el hibridoma 2.P3B5.2 (Designación de Depósito ATCC PTA-8106) y las secuencias de aminoácidos de CDR1, CDR2 y CDR3 de VL de la cadena ligera de inmunoglobulina producida por el hibridoma 7.P1D5.1.G9 (Designación de Depósito ATCC PTA-8107).
En un caso adicional, la presente descripción incluye un polipéptido aislado que comprende, consiste esencialmente en o consiste en un polipéptido VL al menos 80%, 85%, 90% ó 95% idéntico a una secuencia polipeptídica VL de referencia seleccionada del grupo que consiste en SEQ ID NOs: 273 a 286, 373, 377, 381, 385, 417 y 434, mostrado en la Tabla 8. En determinados casos, un anticuerpo o fragmento de unión a antígeno que comprende el polipéptido VL se une específicamente o preferentemente a Sp35.
En otro caso, la presente descripción incluye un polipéptido aislado que comprende, consiste esencialmente en o consiste en un polipéptido VL seleccionado del grupo que consiste en SEQ ID NOs: 273 a 286, 373, 377, 381, 385, 417 y 434, mostrado en la Tabla 8. En determinados casos, un anticuerpo o fragmento de unión a antígeno que comprende el polipéptido VL se une específicamente o preferentemente a Sp35.
En un caso más, la presente descripción incluye un polipéptido aislado que comprende, consiste esencialmente en o consiste en un polipéptido VL al menos 80%, 85%, 90%, 95% ó 100% idéntico a una secuencia polipeptídica VL de referencia seleccionada del grupo que consiste en la VL de la cadena ligera de inmunoglobulina producida por el hibridoma 2.P3B5.2 (Designación de Depósito ATCC PTA-8106) y la VL de la cadena ligera de inmunoglobulina producida por el hibridoma 7.P1D5.1.G9 (Designación de Depósito ATCC PTA-8107).
En determinados casos, un anticuerpo o fragmento de unión a antígeno de éste que comprende, consiste esencialmente en o consiste en uno o más de los polipéptidos VL descritos anteriormente se une específicamente o preferentemente al mismo epítopo que un anticuerpo monoclonal seleccionado del grupo que consiste en 201’, 3A3, 3A6, 1A7, 1G7, 2B10, 2C11, 2F3, 3P1D10.2C3, 3P1E11.3B7, 3P2C6.3G10.2H7, 3P2C9.2G4, 3P4A6.1D9, 3P4A1.2B9, 3P4C2.2D2, 3P4C5.1D8, 3P4C8.2G9, 30-C12 (Li01), 38-D01 (Li02), 35-E04 (Li03), 36-C09 (Li04), 30-A11 (Li05), 34-F02 (Li06), 29-E07 (Li07), 34-G04 (Li08), 36-A12 (Li09), 28-D02 (Li10), 30-B01 (Li11), 34-B03 (Li12), Li13, Li32, Li33, Li34, 3383
(L1a.1), 3495 (L1a.2), 3563 (L1a.3), 3564 (L1a.4), 3565 (L1a.5), 3566 (L1a.6), 3567 (L1a.7), 3568 (L1a.8), 3569 (L1a.9), 3570 (L1a.10), 3571 (L1a.11), 3582 (L1a.12), 1968 (L1a.13), 7P1D5.1G9, 3B5.2 y Li81, o inhibirá competitivamente la unión de dicho anticuerpo monoclonal a Sp35.
En determinados casos, un anticuerpo o fragmento de unión a antígeno de éste que comprende, consiste esencialmente en o consiste en uno o más de los polipéptidos VL descritos anteriormente se une específicamente o preferentemente a un polipéptido Sp35 o fragmento de éste, o un polipéptido Sp35 variante, con una afinidad caracterizada por una constante de disociación (KD) no mayor de 5 X 10-2 M, 10-2 M, 5 X 10-3 M, 10-3 M, 5 X 10-4 M, 10-4 M, 5 X 10-5 M, 10-5 M, 5 X 10-6 M, 10-6 M, 5 X 10-7 M, 10-7 M, 5 X 10-8 M, 10-8 M, 5 X 10-9 M, 10-9 M, 5 X 10-10 M, 10-10 M, 5 X 10-11 M, 10-11 M, 5 X 1012 M, 10-12 M, 5 X 10-13 M, 10-13 M, 5 X 10-14 M, 10-14 M, 5 X 10-15 M ó 10-15 M.
En otros casos, un anticuerpo o fragmento de unión a antígeno de éste comprende, consiste esencialmente en o consiste en un polipéptido VH, como se muestra en la Tabla 6, y un polipéptido VL, como se muestra en la Tabla 8, seleccionado del grupo que consiste en: i) SEQ ID NO: 170 y SEQ ID NO: 283; ii) SEQ ID NO: 171 y SEQ ID NO: 284; iii) SEQ ID NO: 172 y SEQ ID NO: 285; iv) SEQ ID NO: 172 y SEQ ID NO: 286; v) SEQ ID NO: 158 y SEQ ID NO: 273; vi) SEQ ID NO: 159 y SEQ ID NO: 274; vii) SEQ ID NO: 160 y SEQ ID NO: 275; viii) SEQ ID NO: 161 y SEQ ID NO: 276; ix) SEQ ID NO: 163 y SEQ ID NO: 277; x) SEQ ID NO: 164 y SEQ ID NO: 278; xi) SEQ ID NO: 165 y SEQ ID NO: 279; xii) SEQ ID NO: 166 y SEQ ID NO: 280; xiii) SEQ ID NO: 167 y SEQ ID NO: 281; xiv) SEQ ID NO: 168 y SEQ ID NO: 282; xv) SEQ ID NO: 372 y SEQ ID NO: 373; xvi) SEQ ID NO: 376 y SEQ ID NO: 377; xvii) SEQ ID NO: 380 y SEQ ID NO: 381; xviii) SEQ ID NO: 384 y SEQ ID NO: 385, xix) SEQ ID NO: 416 y SEQ ID NO: 417; xx) SEQ ID NO: 433 y SEQ ID NO: 434; xxi) SEQ ID NO: 435 y SEQ ID NO: 434. En otros casos, un anticuerpo o fragmento de unión a antígeno de éste comprende, consiste esencialmente en o consiste en un polipéptido VH y un polipéptido VL seleccionados del grupo que consiste en el polipéptido VH y el polipéptido VL producidos por el hibridoma 2.P3B5.2 (Designación de Depósito ATCC PTA-8106) y el polipéptido VH y el polipéptido VL producidos por el hibridoma 7.P1D5.1.G9 (Designación de Depósito ATCC PTA-8107). Cualquiera de los polipéptidos descritos anteriormente puede incluir además polipéptidos adicionales, por ejemplo, un péptido señal para dirigir la secreción del polipéptido codificado, regiones constantes de anticuerpo como se describe en la presente memoria u otros polipéptidos heterólogos como se describe en la presente memoria. Además, los polipéptidos de la descripción incluyen fragmentos de polipéptidos como se describe en otro lugar. Además, los
polipéptidos de la descripción incluyen polipéptidos de fusión, fragmentos Fab y otros derivados, como se describe en la presente memoria.
También, como se describe con más detalle en otro lugar de la presente memoria, la presente descripción incluye composiciones que comprenden los polipéptidos descritos anteriormente.
Un experto en la técnica también entenderá que los polipéptidos de anticuerpo Sp35 como se describe en la presente memoria pueden modificarse de manera tal que varíen en la secuencia de aminoácidos respecto al polipéptido de unión natural del que derivan. Por ejemplo, una secuencia polipeptídica o de aminoácidos derivada de una proteína designada puede ser similar, por ejemplo, tener un porcentaje de identidad determinado respecto a la secuencia de partida, por ejemplo, puede ser 60%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90% ó 95% idéntica a la secuencia de partida.
Además, pueden hacerse sustituciones, deleciones o inserciones de nucleótidos o aminoácidos que dan lugar a sustituciones o cambios conservativos en regiones de aminoácidos "no esenciales". Por ejemplo, una secuencia polipeptídica o de aminoácidos derivada de una proteína designada puede ser idéntica a la secuencia de partida excepto por una o más sustituciones, inserciones o deleciones de aminoácidos individuales, por ejemplo, una, dos, tres, cuatro, cinco, seis, siete, ocho, nueve, diez, quince, veinte o más sustituciones, inserciones o deleciones de aminoácidos individuales. En determinados casos, una secuencia polipeptídica o de aminoácidos derivada de una proteína designada tiene una a cinco, una a diez, una a quince o una a veinte sustituciones, inserciones o deleciones de aminoácidos individuales respecto a la secuencia de partida.
Determinados polipéptidos de anticuerpo Sp35 de la presente descripción comprenden, consisten esencialmente en o consisten en una secuencia de aminoácidos derivada de una secuencia de aminoácidos humana. Sin embargo, determinados polipéptidos de anticuerpo Sp35 comprenden uno o más aminoácidos contiguos derivados de otra especie de mamíferos. Por ejemplo, un anticuerpo Sp35 de la presente descripción puede incluir una parte de cadena pesada, parte de bisagra o región de unión a antígeno de primate. En otro ejemplo, uno o más aminoácidos derivados de murino pueden estar presentes en un polipéptido de anticuerpo no murino, por ejemplo, en un sitio de unión a antígeno de un anticuerpo Sp35. En determinadas aplicaciones terapéuticas, los anticuerpos específicos de Sp35, o fragmentos de unión a antígeno, variantes o análogos de éstos se diseñan de manera que no sean inmunogénicos en el animal al que se administra el anticuerpo.
En determinados casos, un polipéptido de anticuerpo Sp35 comprende una secuencia de aminoácidos o uno o más restos que normalmente no están asociados con un anticuerpo. Las modificaciones ejemplares se describen con más detalle más adelante. Por ejemplo, un fragmento de anticuerpo fv de cadena única de la descripción puede comprender una secuencia conectora flexible, o puede estar modificado para añadir un resto funcional (por ejemplo, PEG, un fármaco, una toxina o un marcaje).
Un polipéptido de anticuerpo Sp35 puede comprender, consistir esencialmente en o consistir en una proteína de fusión. Las proteínas de fusión son moléculas quiméricas que comprenden, por ejemplo, un dominio de unión a antígeno de inmunoglobulina con al menos un sitio de unión diana y al menos una parte heteróloga, es decir, una parte con la que no está unida naturalmente en la naturaleza. Las secuencias de aminoácidos pueden existir normalmente en proteínas separadas que se ponen en contacto en el polipéptido de fusión o que pueden existir normalmente en la misma proteína pero están situadas en una nueva reorganización en el polipéptido de fusión. Las proteínas de fusión pueden crearse, por ejemplo, por síntesis química o creando y traduciendo un polinucleótido en el que las regiones del péptido están codificadas en la relación deseada.
El término "heterólogo" según se aplica a un polinucleótido o un polipéptido, significa que el polinucleótido o polipéptido deriva de una entidad distinta de la del resto de la entidad con la que se está comparando. Por ejemplo, tal y como se usa en la presente memoria, un "polipéptido heterólogo" que se va a fusionar a un anticuerpo Sp35, o un fragmento de unión a antígeno, variante o análogo de éste deriva de un polipéptido no de inmunoglobulina de la misma especie o un polipéptido de inmunoglobulina o no de inmunoglobulina de una especie diferente.
Una "sustitución de aminoácidos conservativa" es una en la que el residuo de aminoácido se reemplaza por un residuo de aminoácido que tiene una cadena lateral similar. Las familias de residuos de aminoácidos que tienen cadenas laterales similares se han definido en la técnica, incluyendo cadenas laterales básicas (por ejemplo, lisina, arginina, histidina), cadenas laterales ácidas (por ejemplo, ácido aspártico, ácido glutámico), cadenas laterales polares no cargadas (por ejemplo, glicina, asparagina, glutamina, serina, treonina, tirosina, cisteína), cadenas laterales no polares (por ejemplo, alanina, valina, leucina, isoleucina, prolina, fenilalanina, metionina, triptófano), cadenas laterales con ramificación beta (por ejemplo, treonina, valina, isoleucina) y cadenas laterales aromáticas (por ejemplo, tirosina, fenilalanina, triptófano, histidina). Así, un residuo de aminoácido no esencial en un polipéptido de inmunoglobulina se reemplaza preferiblemente por otro residuo de aminoácido de la familia con la misma cadena lateral. En otro caso, una cadena de aminoácidos puede reemplazarse por una cadena estructuralmente similar que se diferencia en el orden y/o composición de los miembros de la familia de cadena lateral.
Alternativamente, en otro caso, pueden introducirse mutaciones aleatoriamente a lo largo de toda o parte de la secuencia codificadora de la inmunoglobulina, tal como por mutagénesis de saturación, y los mutantes resultantes pueden incorporarse en anticuerpos Sp35 para uso en los métodos de diagnóstico y tratamiento descritos en la presente memoria y cribarse para su capacidad de unirse al antígeno deseado, por ejemplo, Sp35.
VI. Proteínas de fusión y conjugados de anticuerpos
Como se discute con más detalle en otro lugar de la presente memoria, los anticuerpos Sp35, o fragmentos de unión a antígeno, variantes o derivados de éstos de la descripción pueden fusionarse además recombinantemente a un polipéptido heterólogo en el extremo N o C terminal o conjugarse químicamente (incluyendo conjugaciones covalentes y no covalentes) con polipéptidos u otras composiciones. Por ejemplo, los anticuerpos Sp35 específicos de Sp35 pueden fusionarse o conjugarse recombinantemente a moléculas útiles como etiquetas en ensayos de detección y moléculas efectoras tales como polipéptidos heterólogos, fármacos, radionúclidos o toxinas. Véase, por ejemplo, publicaciones PCT WO 92/08495; WO 91/14438; WO 89/12624; Patente U.S. No. 5.314.995; y EP 396.387.
Los anticuerpos Sp35, o fragmentos de unión a antígeno, variantes o derivados de éstos de la descripción incluyen derivados que están modificados, es decir, por la unión covalente de cualquier tipo de molécula al anticuerpo de manera que la unión covalente no evite que el anticuerpo se una a Sp35. Por ejemplo, pero no como limitación, los derivados de anticuerpo incluyen anticuerpos que se han modificado, por ejemplo, por glicosilación, acetilación, pegilación, fosfilación, fosforilación, amidación, derivatización con grupos protectores/bloqueantes conocidos, escisión proteolítica, unión a un ligando celular u otra proteína, etc. Puede llevarse a cabo cualquiera de numerosas modificaciones químicas por técnicas conocidas, incluyendo, pero no limitado a escisión química específica, acetilación, formilación, síntesis metabólica de tunicamicina, etc. Además, el derivado puede contener uno o más aminoácidos no clásicos.
Los anticuerpos Sp35, o fragmentos de unión a antígeno, variantes o derivados de éstos de la descripción pueden estar compuestos por aminoácidos unidos entre sí por enlaces peptídicos o enlaces peptídicos modificados, es decir, isósteros peptídicos, y pueden contener aminoácidos distintos de los 20 aminoácidos codificados por genes. Los anticuerpos específicos de Sp35 pueden modificarse por procesos naturales, tales como procesamiento posterior a la traducción, o por técnicas de modificación química que son muy conocidas en la técnica. Dichas modificaciones están bien descritas en textos básicos y en monografías más detalladas, así como en una bibliografía de investigación voluminosa. Las modificaciones pueden producirse en cualquier lugar en el anticuerpo específico de Sp35, incluyendo el núcleo peptídico, las cadenas laterales de los aminoácidos y el extremo amino o carboxi, o en restos tales como carbohidratos. Se apreciará que puede estar presente el mismo tipo de modificación en el mismo grado o grados distintos en varios sitios en un anticuerpo específico de Sp35 dado. También, un anticuerpo específico de Sp35 dado puede contener muchos tipos de modificaciones. Los anticuerpos específicos de Sp35 pueden ser ramificados, por ejemplo, como resultado de ubiquitinación, y pueden ser cíclicos, con o sin ramificación. Los anticuerpos específicos de Sp35 cíclicos, ramificados y cíclicos ramificados pueden resultar de procesos naturales posteriores a la traducción o pueden prepararse por métodos sintéticos. Las modificaciones incluyen acetilación, acilación, ADP-ribosilación, amidación, unión covalente de flavina, unión covalente de un resto hemo, unión covalente de un nucleótido o derivado de nucleótido, unión covalente de un lípido o derivado lipídico, unión covalente de fosfatidilinositol, entrecruzamiento, ciclación, formación de enlace disulfuro, desmetilación, formación de entrecruzamientos covalentes, formación de cisteína, formación de piroglutamato, formilación, gamma-carboxilación, glicosilación, formación de anclaje GPI, hidroxilación, yodación, metilación, miristoilación, oxidación, pegilación, procesamiento proteolítico, fosforilación, prenilación, racemización, selenoilación, sulfatación, adición mediada por ARN de transferencia de aminoácidos a proteínas tales como arginilación y ubiquitinación. (Véase, por ejemplo, Proteins - Structure And Molecular Properties, T.E. Creighton, W.H. Freeman and Company, Nueva York, 2ª Ed., (1993); Posttranslational Covalent Modification Of Proteins, B.C. Johnson, Ed., Academic Press, Nueva York, págs. 1-12 (1983); Seifter et al., Meth Enzymol 182: 626-646 (1990); Rattan et al., Ann NY Acad Sci
663: 48-62 (1992)).
La presente descripción también proporciona proteínas de fusión que comprenden un anticuerpo Sp35, o fragmento de unión a antígeno, variante o derivado de éste y un polipéptido heterólogo. El polipéptido heterólogo al que se fusiona el anticuerpo puede ser útil para la función o es útil para tomar como diana las células que expresan el polipéptido Sp35. En un caso, una proteína de fusión de la descripción comprende, consiste esencialmente en o consiste en un polipéptido que tiene la secuencia de aminoácidos de una cualquiera o más de las regiones VH de un anticuerpo de la descripción o la secuencia de aminoácidos de una cualquiera o más de las regiones VL de un anticuerpo de la descripción o fragmentos o variantes de éstos, y una secuencia polipeptídica heteróloga. En otro caso, una proteína de fusión para uso en los métodos de diagnóstico y tratamiento descritos en la presente memoria comprende, consiste esencialmente en o consiste en un polipéptido que tiene la secuencia de aminoácidos de una cualquiera, dos, tres de las CDR de VH de un anticuerpo específico de Sp35, o fragmentos, variantes o derivados de éste, o la secuencia de aminoácidos de una cualquiera, dos, tres de las CDR de VL de un anticuerpo específico de Sp35, o fragmentos, variantes o derivados de éste, y una secuencia polipeptídica heteróloga. En un caso, la proteína de fusión comprende un polipéptido que tiene la secuencia de aminoácidos de una CDR3 de VH de un anticuerpo específico de Sp35 de la presente descripción, o
fragmento, derivado o variante de éste, y una secuencia polipeptídica heteróloga, en el que la proteína de fusión se une específicamente al menos a un epítopo de Sp35. En otro caso, una proteína de fusión comprende un polipéptido que tiene la secuencia de aminoácidos de al menos una región de VH de un anticuerpo específico de Sp35 de la descripción y la secuencia de aminoácidos de al menos una región de VL de un anticuerpo específico de Sp35 de la descripción o fragmentos, derivados o variantes de éstos y una secuencia polipeptídica heteróloga. Preferiblemente, las regiones VH y VL de la proteína de fusión corresponden a una única fuente de anticuerpo (o fragmento scFv o Fab) que se une específicamente al menos a un epítopo de Sp35. En otro caso adicional, una proteína de fusión para uso en los métodos de diagnóstico y tratamiento descritos en la presente memoria comprende un polipéptido que tiene la secuencia de aminoácidos de una cualquiera, dos, tres o más de las CDR de VH de un anticuerpo específico de Sp35 y la secuencia de aminoácidos de una cualquiera, dos, tres o más de las CDR de VL de un anticuerpo específico de Sp35, o fragmentos
o variantes de éste, y una secuencia polipeptídica heteróloga. Preferiblemente, dos, tres, cuatro, cinco, seis o más de las CDR de VH o CDR de VL corresponden a una única fuente de anticuerpo (o fragmento scFv o Fab) de la descripción. Las moléculas de ácido nucleico que codifican estas proteínas de fusión también están englobadas por la descripción.
Las proteínas de fusión ejemplares reportadas en la bibliografía incluyen fusiones del receptor de células T (Gascoigne et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 84: 2936-2940 (1987)); CD4 (Capon et al., Nature 337: 525-531 (1989); Traunecker et al., Nature 339: 68-70 (1989); Zettmeissl et al., DNA Cell Biol. USA 9: 347-353 (1990); y Byrn et al., Nature 344: 667-670 (1990)); L-selectina (receptor de direccionamiento) (Watson et al., J. Cell. Biol. 110: 2221-2229 (1990); y Watson et al., Nature 349: 164-167 (1991)); CD44 (Aruffo et al., Cell 61: 1303-1313 (1990)); CD28 y B7 (Linsley et al., J. Exp. Med 173: 721-730 (1991)); CTLA-4 (Lisley et al., J. Exp. Med. 174: 561-569 (1991)); CD22 (Stamenkovic et al., Cell 66: 1133-1144 (1991)); receptor de TNF (Ashkenazi et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 88: 10535-10539 (1991); Lesslauer et al., Eur. J. Immunol. 27: 2883-2886 (1991); y Peppel et al., J. Exp. Med. 174: 1483-1489 (1991)); y receptor de IgE a (Ridgway y Gorman, J. Cell. Biol. Vol. 115, Resumen No. 1448 (1991)).
En determinados casos, los anticuerpos Sp35, fragmentos de anticuerpo, derivados y variantes de éstos comprenden además un resto de direccionamiento. Los restos de direccionamiento incluyen una proteína o un péptido que dirige la localización a una parte determinada del cuerpo, por ejemplo, al cerebro o compartimentos de éste. En determinados casos, los anticuerpos Sp35, fragmentos de anticuerpo, derivados y variantes de éstos se unen o fusionan a un resto de direccionamiento cerebral. Los restos de direccionamiento cerebral están unidos covalentemente (por ejemplo, fusión directa de traducción o por unión química bien directamente o a través de una molécula espaciadora, que puede ser opcionalmente escindible) o unidos no covalentemente (por ejemplo, a través de interacciones reversibles tales como avidina, biotina, proteína A, IgG, etc.). En otros casos, los anticuerpos Sp35, fragmentos de anticuerpo, derivados y variantes de éstos están unidos a uno o más restos de direccionamiento cerebral. En casos adicionales, el resto de direccionamiento cerebral está unido a una pluralidad de anticuerpos Sp35, fragmentos de anticuerpo, derivados y variantes de éstos.
Un resto de direccionamiento cerebral asociado con un anticuerpo Sp35, fragmento de anticuerpo, derivado o variante de éste aumenta la administración cerebral de dichos anticuerpos Sp35, fragmentos de anticuerpo, derivados y variantes de éstos. Se han descrito varios polipéptidos que, cuando se fusionan con una proteína o agente terapéutico, administran la proteína o agente terapéutico a través de la barrera hematoencefálica (BBB). Los ejemplos no limitativos incluyen el anticuerpo de dominio único FC5 (Abulrob et al. (2005) J. Neurochem. 95, 1201-1214); mAB 83-14, un anticuerpo monoclonal frente al receptor de insulina humano (Pardridge et al. (1995) Pharmacol. Res. 12, 807-816); los péptidos B2, B6 y B8 que se unen al receptor de transferrina humano (hTfR) (Xia et al. (2000) J. Virol. 74, 11359-11366); el anticuerpo monoclonal OX26 frente al receptor de transferrina (Pardridge et al. (1991) J. Pharmacol. Exp. Ther. 259, 66-70); y SEQ ID NOs: 1-18 de la Patente U.S. No. 6.306.365.
La administración cerebral aumentada de un anticuerpo Sp35, fragmento de anticuerpo, derivado o variante de éste se determina por varios medios bien establecidos en la técnica. Por ejemplo, administración a un animal de un anticuerpo Sp35, fragmento de anticuerpo, derivado y variante de éste marcado con radiactividad, enzimáticamente o fluorescentemente, unido a un resto de direccionamiento cerebral; determinación de la localización cerebral; y comparación de la localización con un anticuerpo Sp35, fragmento de anticuerpo, derivado o variante de éste marcado con radiactividad, enzimáticamente o fluorescentemente equivalente que no está asociado con un resto de direccionamiento cerebral. Otros medios para determinar el direccionamiento aumentado se describen en las referencias anteriores.
Como se discute en otro lugar de la presente memoria, los anticuerpos Sp35, o fragmentos de unión a antígeno, variantes o derivados de éstos de la descripción pueden fusionarse a polipéptidos heterólogos para incrementar la vida media in vivo de los polipéptidos o para uso en inmunoensayos usando métodos conocidos en la técnica. Por ejemplo, en un caso, puede conjugarse PEG con los anticuerpos Sp35 de la descripción para incrementar su vida media in vivo. Leong, S.R., et al., Cytokine 16: 106 (2001); Adv. in Drug Deliv. Rev. 54: 531 (2002); o Weir et al., Biochem. Soc. Transactions 30: 512 (2002).
Además, los anticuerpos Sp35, o fragmentos de unión a antígeno, variantes o derivados de éstos de la descripción pueden fusionarse a secuencias marcadoras, tales como un péptido para facilitar su purificación o detección. En casos preferidos, la secuencia de aminoácidos marcadora es un péptido hexa-histidina, tal como la etiqueta proporcionada en una vector pQE (QIAGEN, Inc., 9259 Eton Avenue, Chatsworth, Calif., 91311), entre otras, muchas de las cuales están disponibles comercialmente. Como se describe en Gentz et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 86: 821-824 (1989), por ejemplo, la hexa-histidina proporciona la purificación conveniente de la proteína de fusión. Otras etiquetas peptídicas útiles para la purificación incluyen, pero no están limitadas a, la etiqueta "HA", que corresponde a un epítopo derivado de la proteína hemaglutinina de influenza (Wilson et al., Cell 37: 767 (1984)) y la etiqueta "flag".
Las proteínas de fusión pueden prepararse usando métodos que son muy conocidos en la técnica (véase por ejemplo las Patentes US Nos. 5.116.964 y 5.225.538). El sitio preciso en el que se hace la fusión puede seleccionarse empíricamente para optimizar las características de secreción o unión de la proteína de fusión. El ADN que codifica la proteína de fusión se transfiere a una célula huésped para expresión.
Los anticuerpos Sp35, o fragmentos de unión a antígeno, variantes o derivados de éstos de la presente descripción pueden usarse en forma no conjugada o pueden conjugarse con al menos una de una variedad de moléculas, por ejemplo, para mejorar las propiedades terapéuticas de la molécula, para facilitar la detección de la diana, o para formación de imágenes o terapia del paciente. Los anticuerpos Sp35, o fragmentos de unión a antígeno, variantes o derivados de éstos de la descripción pueden marcarse o conjugarse bien antes o después de la purificación, cuando se realiza purificación.
En particular, los anticuerpos Sp35, o fragmentos de unión a antígeno, variantes o derivados de éstos de la descripción pueden conjugarse con agentes terapéuticos, profármacos, péptidos, proteínas, enzimas, virus, lípidos, modificadores de la respuesta biológica, agentes farmacéuticos o PEG.
Los expertos en la técnica apreciarán que los conjugados también pueden ensamblarse usando una variedad de técnicas dependiendo del agente seleccionado que se va a conjugar. Por ejemplo, los conjugados con biotina se preparan, por ejemplo, haciendo reaccionar un polipéptido de unión con un éster activado de biotina tal como el éster de N-hidroxisuccinimida de biotina. De manera similar, los conjugados con un marcador fluorescente pueden prepararse en presencia de un agente de acoplamiento, por ejemplo, aquellos listados en la presente memoria, o por reacción con un isotiocianato, preferiblemente fluoresceína-isotiocianato. Los conjugados de los anticuerpos Sp35, o fragmentos de unión a antígeno, variantes o derivados de éstos de la descripción se preparan de una manera análoga.
La presente descripción engloba además anticuerpos Sp35, o fragmentos de unión a antígeno, variantes o derivados de éstos de la descripción conjugados con un agente de diagnóstico o terapéutico. Los anticuerpos Sp35 pueden usarse para diagnóstico, por ejemplo, para monitorizar el desarrollo o progresión de una enfermedad neurológica como parte de un procedimiento de ensayo clínico, por ejemplo, para determinar la eficacia de un tratamiento y/o régimen de prevención dado. La detección puede facilitarse acoplando el anticuerpo Sp35, o fragmento de unión a antígeno, variante
o derivado de éste a una sustancia detectable. Los ejemplos de sustancias detectables incluyen varias enzimas, grupos prostéticos, materiales fluorescentes, materiales luminiscentes, materiales bioluminiscentes, materiales radiactivos, metales que emiten positrones usando varias tomografías de emisión de positrones y iones metálicos paramagnéticos no radiactivos. Véase, por ejemplo, Pat. U.S. No. 4.741.900 para iones metálicos que pueden conjugarse con anticuerpos para uso como diagnósticos según la presente descripción. Los ejemplos de enzimas adecuadas incluyen peroxidasa de rábano, fosfatasa alcalina, β-galactosidasa, o acetilcolinesterasa; los ejemplos de complejos de grupo prostético adecuado incluyen estreptavidina/biotina y avidina/biotina; los ejemplos de materiales fluorescentes adecuados incluyen umbeliferona, fluoresceína, isotiocianato de fluoresceína, rodamina, diclorotriazinilamina fluoresceína, cloruro de dansilo
o ficoeritrina; un ejemplo de un material luminiscente incluye luminol; los ejemplos de materiales bioluminiscentes incluyen luciferasa, luciferina y acuorina; y los ejemplos de material radiactivo adecuado incluyen 125I, 131I, 111In o 99Tc.
Un anticuerpo Sp35, o fragmento de unión a antígeno, variante o derivado de éste también puede marcarse de forma detectable acoplándolo a un compuesto quimioluminiscente. La presencia del anticuerpo Sp35 etiquetado con quimioluminiscencia se determina detectando la presencia de luminiscencia que surge durante el curso de una reacción química. Los ejemplos de compuestos marcadores quimioluminiscentes particularmente útiles son luminol, isoluminol, éster de acridinio teromático, imidazol, sal de acridinio y éster de oxalato.
Una de las formas en las que un anticuerpo Sp35, o fragmento de unión a antígeno, variante o derivado de éste puede marcarse de forma detectable es uniendo el mismo a una enzima y usando el producto unido en un inmunoensayo enzimático (EIA) (Voller, A., "The Enzyme Linked Immunoabsorbent Assay (ELISA)" Microbiological Associates Quaterly Publication, Walkersville, Md., Diagnostic Horizons 2: 1-7 (1978)); Voller et al., J. Clin. Pathol. 31: 507-520 (1978); Butler, J.E., Meth. Enzymol. 73: 482-523 (1981); Maggio, E. (ed.), Enzyme Immunoassay, CRC Press, Boca Raton, Fla., (1980); Ishikawa, E. et al., (eds.), Enzyme Immunoassay, Kgaku Shoin, Tokio (1981). La enzima, que está unida al anticuerpo Sp35 reaccionará con un sustrato apropiado, preferiblemente un sustrato cromogénico, de tal manera que produce un
resto químico que puede detectarse, por ejemplo, por medios espectrofotométricos, fluorimétricos o visuales. Las enzimas que pueden usarse para marcar de forma detectable el anticuerpo incluyen, pero no están limitadas a, malato deshidrogenasa, nucleasa estaphylococcal, isomerasa delta-5-esteroide, alcohol deshidrogenasa de levaduras, alfaglicerofosfato, deshidrogenasa, triosa fosfato isomerasa, peroxidasa de rábano, fosfatasa alcalina, asparaginasa, glucosa oxidasa, beta-galactosidasa, ribonucleasa, ureasa, catalasa, glucosa-6-fosfato deshidrogenasa, glucoamilasa y acetilcolinesterasa. Además, la detección puede conseguirse por métodos colorimétricos que emplean un sustrato cromogénico para la enzima. La detección también puede conseguirse por comparación visual del grado de reacción enzimática de un sustrato en comparación con estándares preparados de manera similar.
La detección también puede conseguirse usando cualquiera de una variedad de otros inmunoensayos. Por ejemplo, marcando radiactivamente el anticuerpo Sp35, o fragmento de unión a antígeno, variante o derivado de éste, es posible detectar el anticuerpo mediante el uso de un radioinmunoensayo (RIA) (véase, por ejemplo, Weintraub, B., Principles of Radioimmunoassays, Seventh Training Course on Radioligand Assay Techniques, The Endocrine Society, (marzo, 1986)). El isótopo radiactivo puede detectarse por medios que incluyen, pero no están limitados a, un contador gamma, un contador de centelleo o autorradiografía.
Un anticuerpo Sp35, o fragmento de unión a antígeno, variante o derivado de éste también puede marcarse de forma detectable usando metales que emiten fluorescencia tales como 152Eu, u otros de la serie lantánido. Estos metales pueden unirse al anticuerpo usando grupos quelantes de metales tales como ácido dietilentriaminopentaacético (DTPA)
o ácido etilendiaminotetraacético (EDTA).
Las técnicas para conjugar varios restos a un anticuerpo Sp35, o fragmento de unión a antígeno, variante o derivado de éste son muy conocidas, véase, por ejemplo, Arnon et al., "Monoclonal Antibodies For Immunotargeting Of Drugs In Cancer Therapy", en Monoclonal Antibodies And Cancer Therapy, Reisfeld et al. (eds.), p. 243-56 (Alan R. Liss, Inc. (1985); Hellstrom et al., "Antibodies For Drug Delivery", en Controlled Drug Delivery (2ª Ed.), Robinson et al. (eds.), Marcel Dekker, Inc., p. 623-53 (1987); Thorpe, "Antibody Carriers Of Cytotoxic Agents In Cancer Therapy: A Review", en Monoclonal Antibodies '84: Biological And Clinical Applications, Pinchera et al. (eds.), p. 475-506 (1985); "Analysis, Results, And Future Prospective Of The Therapeutic Use Of Radiolabeled Antibody In Cancer Therapy", en Monoclonal Antibodies For Cancer Detection And Therapy, Baldwin et al. (eds.), Academic Press p. 303-16 (1985), y Thorpe et al., "The Preparation And Cytotoxic Properties Of Antibody-Toxin Conjugates", Immunol. Rev. 62: 119-58 (1982).
VII. Expresión de polipéptidos de anticuerpo
Como es bien conocido, el ARN puede aislarse de las células de hibridoma originales o de otras células transformadas por técnicas estándar, tales como extracción con isotiocianato de guanidinio y precipitación seguido de centrifugación o cromatografía. Cuando es deseable, el ARNm puede aislarse del ARN total por técnicas estándar tales como cromatografía en oligo dT celulosa. Las técnicas adecuadas son familiares en la técnica.
En un caso, los ADNc que codifican las cadenas ligera y pesada del anticuerpo pueden prepararse, bien simultáneamente o separadamente, usando transcriptasa inversa y ADN polimerasa según métodos muy conocidos. La PCR puede iniciarse con cebadores de región constante consenso o con cebadores más específicos basados en las secuencias publicadas de ADN y aminoácidos de la cadena pesada y ligera. Como se ha discutido anteriormente, la PCR también puede usarse para aislar clones de ADN que codifican las cadenas ligera y pesada del anticuerpo. En este caso, las bibliotecas pueden cribarse con cebadores consenso o sondas homólogas mayores, tales como sondas de región constante de ratón.
El ADN, típicamente ADN plasmídico, puede aislarse de las células usando técnicas conocidas en la técnica, mapearse por restricción y secuenciarse según técnicas estándar muy conocidas mostradas con detalle, por ejemplo, en las referencias anteriores referentes a técnicas de ADN recombinante. Por supuesto, el ADN puede ser sintético en cualquier punto durante el proceso de aislamiento o análisis posterior.
Después de la manipulación del material genético aislado para proporcionar anticuerpos Sp35, o fragmentos de unión a antígeno, variantes o derivados de éstos de la descripción, los polinucleótidos que codifican los anticuerpos Sp35 se insertan típicamente en un vector de expresión para introducción en células huésped que pueden usarse para producir la cantidad deseada de anticuerpo Sp35.
La expresión recombinante de un anticuerpo, o fragmento, derivado o análogo de éste, por ejemplo, una cadena pesada
o ligera de un anticuerpo que se une a una molécula diana descrita en la presente memoria, por ejemplo, Sp35, requiere la construcción de un vector de expresión que contiene un polinucleótido que codifica el anticuerpo. Una vez que se ha obtenido un polinucleótido que codifica una molécula de anticuerpo o una cadena pesada o ligera de un anticuerpo, o parte de éste (que preferiblemente contiene el dominio variable de cadena pesada o ligera) de la descripción, el vector para la producción de la molécula de anticuerpo puede producirse por tecnología de ADN recombinante usando técnicas muy conocidas en a técnica. Así, los métodos para preparar una proteína mediante la expresión de un polinucleótido que
contiene una secuencia de nucleótidos que codifica un anticuerpo se describen en la presente memoria. Pueden usarse métodos que son muy conocidos para los expertos en la técnica para construir vectores de expresión que contienen secuencias codificadoras de anticuerpo y señales apropiadas de control de la transcripción y traducción. Estos métodos incluyen, por ejemplo, técnicas de ADN recombinante in vitro, técnicas sintéticas y recombinación genética in vivo. La descripción proporciona así vectores replicables que comprenden una secuencia de nucleótidos que codifica una molécula de anticuerpo de la descripción, o una cadena pesada o ligera de éste, o un dominio variable de cadena pesada o ligera, unida de manera operativa a un promotor. Dichos vectores pueden incluir la secuencia de nucleótidos que codifica la región constante de la molécula de anticuerpo (véase, por ejemplo, la Publicación PCT WO 86/05807; Publicación PCT WO 89/01036; y la Pat. U.S. No. 5.122.464) y el dominio variable del anticuerpo puede clonarse en dicho vector para expresión de la cadena pesada o ligera completa.
La célula huésped puede co-transfectarse con dos vectores de expresión de la descripción, codificando el primer vector un polipéptido derivado de la cadena pesada y codificando el segundo vector un polipéptido derivado de la cadena ligera. Los dos vectores pueden contener marcadores seleccionables idénticos que permiten la misma expresión de los polipéptidos de cadena pesada y ligera. Alternativamente, puede usarse un único vector que codifica los dos polipéptidos, de cadena pesada y ligera. En dichas situaciones, la cadena ligera se sitúa ventajosamente antes de la cadena pesada para evitar un exceso de cadena pesada libre tóxica (Proudfoot, Nature 322: 52 (1986); Kohler, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 77: 2197 (1980)). Las secuencias codificadoras para las cadenas pesada y ligera pueden comprender ADNc o ADN genómico.
El término "vector" o "vector de expresión" se usa en la presente memoria para significar vectores usados según la presente descripción como un vehículo para introducir en y expresar un gen deseado en una célula huésped. Como conocen los expertos en la técnica, dichos vectores pueden seleccionarse fácilmente del grupo que consiste en plásmidos, fagos, virus y retrovirus. En general, los vectores compatibles con la descripción comprenderán un marcador de selección, sitios de restricción apropiados para facilitar la clonación del gen deseado y la capacidad de entrar y/o replicarse en células eucariotas o procariotas.
Para los propósitos de esta descripción, pueden emplearse numerosos sistemas de vectores de expresión. Por ejemplo, una clase de vector utiliza elementos de ADN que derivan de virus animales tales como virus de papiloma bovino, virus de polioma, adenovirus, virus de vaccinia, baculovirus, retrovirus (RSV, MMTV o MOMLV) o virus SV40. Otros implican el uso de sistemas policistrónicos con sitios de unión a ribosomas internos. Además, las células que han integrado el ADN en sus cromosomas pueden seleccionarse introduciendo uno o más marcadores que permitan la selección de las células huésped transfectadas. El marcador puede proporcionar prototrofía a un huésped auxótrofo, resistencia a biocidas (por ejemplo, antibióticos) o resistencia a metales pesados tal como cobre. El gen del marcador seleccionable puede unirse directamente a las secuencias de ADN que se van a expresar o introducirse en la misma célula por cotransformación. También pueden necesitarse elementos adicionales para la síntesis óptima de ARNm. Estos elementos pueden incluir secuencias señal, señales de corte y empalme, así como promotores, potenciadores y señales de terminación de la transcripción.
En casos particularmente preferidos, los genes de región variable clonados se insertan en un vector de expresión junto con los genes de la región constante de la cadena pesada y ligera (preferiblemente humanos) sintéticos como se ha discutido anteriormente. En un caso, esto se efectúa usando un vector de expresión patentado de Biogen IDEC, Inc., referido como NEOSPLA (patente U.S. 6.159.730). Este vector contiene el promotor/potenciador de citomegalovirus, el promotor principal de beta globina de ratón, el origen de replicación de SV40, la secuencia de poliadenilación de la hormona de crecimiento bovina, el exón 1 y exón 2 de la neomicina fosfotransferasa, el gen de la dihidrofolato reductasa y secuencia líder. Se ha encontrado que este vector resulta en un nivel de expresión muy alto de anticuerpos después de la incorporación de los genes de la región variable y constante, transfección en células CHO, seguido de selección en medio que contiene G418 y amplificación con metotrexato. Por supuesto, puede usarse en la presente descripción cualquier vector de expresión que sea capaz de incitar la expresión en células eucariotas. Los ejemplos de vectores adecuados incluyen, pero no están limitados a, los plásmidos pcDNA3, pHCMV/Zeo, pCR3.1, pEF1/His, pIND/GS, pRc/HCMV2, pSV40/Zeo2, pTRACER-HCMV, pUB6/V5-His, pVAX1 y pZeoSV2 (disponibles en Invitrogen, San Diego, CA) y el plásmido pCI (disponible en Promega, Madison, WI). En general, el cribado de grandes números de células transformadas para aquellas que expresan niveles adecuadamente altos de cadenas pesada y ligera de inmunoglobulina es experimentación rutinaria que puede llevarse a cabo, por ejemplo, con sistemas robóticos. Los sistemas de vectores también se enseñan en las Pat. U.S. Nos. 5.736.137 y 5.658.570. Este sistema proporciona altos niveles de expresión, por ejemplo, > 30 pg/célula/día. Otros sistemas de vectores ejemplares se describen, por ejemplo, en Patente U.S.
6.413.777.
En otros casos preferidos, los anticuerpos Sp35, o fragmentos de unión a antígeno, variantes o derivados de éstos de la descripción pueden expresarse usando construcciones policistrónicas tales como las descritas en la Publicación de Solicitud de Patente de los Estados Unidos No. 2003-0157641 A1, presentada el 18 de noviembre, 2002. En estos sistemas nuevos de expresión, pueden producirse múltiples productos génicos de interés tales como cadenas pesadas y
ligeras de anticuerpos a partir de una única construcción policistrónica. Estos sistemas usan ventajosamente un sitio de entrada de ribosoma interno (IRES) para proporcionar niveles relativamente altos de anticuerpos Sp35, por ejemplo, polipéptidos de unión, por ejemplo, anticuerpos específicos de Sp35 o fragmentos inmunoespecíficos de éstos en células huésped eucariotas. Las secuencias IRES compatibles se describen en Pat. U.S. No. 6.193.980. Los expertos en la técnica apreciarán que dichos sistemas de expresión pueden usarse para producir eficazmente el rango completo de anticuerpos Sp35 descrito en la presente solicitud.
Más generalmente, una vez que se ha preparado el vector o secuencia de ADN que codifica una subunidad monomérica del anticuerpo Sp35, el vector de expresión puede introducirse en una célula huésped apropiada. La introducción del plásmido en la célula huésped puede conseguirse por varias técnicas muy conocidas para los expertos en la técnica. Éstas incluyen, pero no están limitadas a, transfección (incluyendo electroforesis y electroporación), fusión de protoplastos, precipitación con fosfato de calcio, fusión celular con ADN recubierto, microinyección e infección con virus intactos. Véase, Ridgway, A.A.G. "Mammalian Expression Vectors" Vectors, Rodriguez y Denhardt, Eds., Butterworths, Boston, Mass., Capítulo 24.2, p. 470-472 (1988). Típicamente, la introducción de plásmidos en el huésped es mediante electroporación. Las células huésped que albergan la construcción de expresión se crecen en condiciones apropiadas para la producción de las cadenas ligeras y cadenas pesadas y se ensayan para la síntesis de proteínas de cadena pesada y/o ligera. Las técnicas de ensayo ejemplares incluyen ensayo inmunoabsorbente ligado a enzima (ELISA), radioinmunoensayo (RIA) o análisis de separación celular activada por fluorescencia (FACS), inmunohistoquímica y semejantes.
El vector de expresión se transfiere a una célula huésped mediante técnicas convencionales y las células transfectadas se cultivan mediante técnicas convencionales para producir un anticuerpo para uso en los métodos descritos en la presente memoria. Así, la descripción incluye células huésped que contienen un polinucleótido que codifica un anticuerpo de la descripción o una cadena pesada o ligera de éste, unido de manera operativa a un promotor heterólogo. En casos preferidos para la expresión de anticuerpos de doble cadena, los vectores que codifican tanto las cadenas pesada como ligera pueden co-expresarse en la célula huésped para la expresión de la molécula de inmunoglobulina completa, como se detalla más adelante.
Tal y como se usa en la presente memoria, "células huésped" se refiere a células que albergan vectores construidos usando técnicas de ADN recombinante y que codifican al menos un gen heterólogo. En las descripciones de los procesos para el aislamiento de anticuerpos a partir de huéspedes recombinantes, los términos "célula" y "cultivo celular" se usan indistintamente para indicar la fuente del anticuerpo a no ser que se especifique claramente otra cosa. En otras palabras, la recuperación del polipéptido de las "células" puede significar bien a partir de la centrifugación de las células completas o del cultivo celular que contiene tanto el medio como las células suspendidas.
Puede utilizarse una variedad de sistemas de huésped-vector de expresión para expresar moléculas de anticuerpo para uso en los métodos descritos en la presente memoria. Dichos sistemas huésped-expresión representan vehículos por los cuales las secuencias codificadoras de interés pueden producirse y purificarse posteriormente, pero también representan células que pueden, cuando se transforman o transfectan con las secuencias de nucleótidos codificadoras apropiadas, expresar una molécula de anticuerpo de la descripción in situ. Éstas incluyen pero no están limitadas a microorganismos tales como bacterias (por ejemplo, E. coli, B. subtilis) transformadas con vectores de expresión de ADN de bacteriófago recombinante, ADN plasmídico o ADN de cósmido que contienen secuencias codificadoras de anticuerpo; levaduras (por ejemplo, Saccharomyces, Pichia) transformadas con vectores de expresión de levadura recombinantes que contienen secuencias codificadoras de anticuerpo; sistemas de células de insecto infectadas con vectores de expresión de virus recombinantes (por ejemplo, baculovirus) que contienen secuencias codificadoras de anticuerpo; sistemas de células de plantas infectadas con vectores de expresión de virus recombinantes (por ejemplo, virus de mosaico de coliflor, CaMV; virus de mosaico de tabaco, TMV) o transformadas con vectores de expresión plasmídicos recombinantes (por ejemplo, plásmido Ti) que contienen secuencias codificadoras de anticuerpo; o sistemas de células de mamíferos (por ejemplo, células COS, CHO, BLK, 293, 3T3) que albergan construcciones de expresión recombinantes que contienen promotores derivados del genoma de células de mamíferos (por ejemplo, promotor de metalotioneína) o de virus de mamíferos (por ejemplo, el promotor tardío de adenovirus; el promotor 7,5K del virus vaccinia). Preferiblemente, se usan células bacterianas tales como Escherichia coli, y más preferiblemente, células eucariotas, especialmente para la expresión de molécula de anticuerpo recombinante completa, para la expresión de una molécula de anticuerpo recombinante. Por ejemplo, las células de mamífero tales como células de ovario de hámster chino (CHO), conjuntamente con un vector tal como el elemento promotor principal del gen intermedio temprano de citomegalovirus humano es un sistema de expresión eficaz para anticuerpos (Foecking et al., Gene 45: 101 (1986); Cockett et al., Bio/Technology 8: 2 (1990)).
La línea celular huésped usada para la expresión de proteínas tiene frecuentemente un origen mamífero; los expertos en la técnica están acreditados con la capacidad de determinar preferentemente las líneas celulares huésped particulares que son las más adecuadas para que se exprese en ellas el producto génico deseado. Las líneas celulares huésped ejemplares incluyen, pero no están limitadas a, CHO (Ovario de Hámster Chino), DG44 y DUXB11 (líneas de Ovario de Hámster Chino, DHFR menos), HELA (carcinoma cervical humano), CVI (línea de riñón de mono), COS (un derivado de
CVI con antígeno T de SV40), VERY, BHK (riñón de cría de hámster), MDCK 293, WI38, R1610 (fibroblasto de hámster chino), BALBC/3T3 (fibroblasto de ratón), HAK (línea de riñón de hámster), SP2/O (mieloma de ratón), P3x63-Ag3.653 (mieloma de ratón), BFA-1c1BPT (células endoteliales bovinas), RAJI (linfocito humano) y 293 (riñón humano). Se prefrieren particularmente las células CHO. Las líneas celulares huésped están típicamente disponibles en servicios comerciales, la American Tissue Culture Collection o en la bibliografía publicada.
Además, puede elegirse una cepa de célula huésped que modula la expresión de las secuencias insertadas o que modifica y procesa el producto génico de la forma específica deseada. Dichas modificaciones (por ejemplo, glicosilación) y procesamiento (por ejemplo, escisión) de los productos proteicos pueden ser importantes para la función de la proteína. Diferentes células huésped tienen mecanismos característicos y específicos para el procesamiento y modificación posteriores a la traducción de proteínas y productos génicos. Pueden elegirse líneas celulares o sistemas de huésped apropiados para asegurar la modificación y procesamiento correctos de la proteína extraña expresada. Para este fin, pueden usarse células huésped eucariotas que poseen la maquinaria celular para el procesamiento apropiado del transcrito primario, glicosilación y fosforilación del producto génico.
Para la producción con alto rendimiento a largo plazo de proteínas recombinantes, se prefiere la expresión estable. Por ejemplo, pueden prepararse por ingeniería líneas celulares que expresan de forma estable la molécula de anticuerpo. En lugar de usar vectores de expresión que contienen orígenes de replicación virales, las células huésped pueden transformarse con ADN controlado por elementos de control de la expresión apropiados (por ejemplo, secuencias promotoras, potenciadoras, terminadores de la transcripción, sitios de poliadenilación, etc.) y un marcador seleccionable. Después de la introducción del ADN extraño, las células preparadas por ingeniería se crecen durante 1-2 días en un medio enriquecido y después se cambian a un medio selectivo. El marcador seleccionable en el plásmido recombinante confiere resistencia a la selección y permite a las células integrar de manera estable el plásmido en sus cromosomas y crecer para formar focos que a su vez pueden clonarse y expandirse en líneas celulares. Este método puede usarse ventajosamente para preparar por ingeniería líneas celulares que expresan de manera estable la molécula de anticuerpo.
Pueden usarse varios sistemas de selección, incluyendo pero no limitado a los genes de timidina quinasa del virus del herpes simple (Wigler et al., Cell 11: 223 (1977)), hipoxantina-guanina fosforibosiltransferasa (Szybalska y Szybalski, Proc. Natl. Acad, Sci. USA 48: 202 (1992)), y adenina fosforibosiltransferasa (Lowy et al., Cell 22: 817 1980) pueden emplearse en células tk-, hgprt- o aprt-, respectivamente. También, puede usarse resistencia a antimetabolitos como la base de la selección para los genes siguientes: dhfr, que confiere resistencia a metotrexato (Wigler et al., Natl. Acad. Sci. USA 77: 357 (1980); O'Hare et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 78: 1527 (1981)); gpt, que confiere resistencia a ácido micofenólico (Mulligan y Berg, Proc. Natl. Acad, Sci. USA 78: 2072 (1981)); neo, que confiere resistencia al aminoglicósido G-418 Clinical Pharmacy 12: 488-505; Wu y Wu, Biotherapy 3: 87-95 (1991); Tolstoshev, Ann. Rev. Pharmacol. Toxicol. 32: 573-596 (1993); Mulligan, Science 260: 926-932 (1993); y Morgan y Anderson, Ann. Rev. Biochem. 62: 191-217 (1993); TIB TECH 11(5): 155-215 (mayo, 1993); e hygro, que confiere resistencia a higromicina (Santerre et al., Gene 30: 147 (1984). Los métodos conocidos comúnmente en la técnica de la tecnología de ADN recombinante que pueden usarse se describen en Ausubel et al. (eds.), Current Protocols in Molecular Biology, John Wiley & Sons, NY (1993); Kriegler, Gene Transfer and Expression, A Laboratory Manual, Stockton Press, NY (1990); y en los Capítulos 12 y 13, Dracopoli et al. (eds.), Current Protocols in Human Genetics, John Wiley & Sons, NY (1994); Colberre-Garapin et al., J. Mol. Biol. 150: 1 (1981).
Los niveles de expresión de una molécula de anticuerpo pueden incrementarse por amplificación del vector (para una revisión, véase Bebbington y Hentschel, The use of vectors based on gene amplification for the expression of cloned genes in mammalian cells en DNA cloning, Academic Press, Nueva York, Vol. 3. (1987)). Cuando un marcador en el sistema de vector que expresa el anticuerpo es amplificable, el incremento en el nivel de inhibidor presente en el cultivo de la célula huésped incrementará el número de copias del gen marcador. Como la región amplificada está asociada con el gen de anticuerpo, también se incrementará la producción del anticuerpo (Crouse et al., Mol. Cell. Biol. 3: 257 (1983)).
La producción in vitro permite el aumento de escala para proporcionar grandes cantidades de los polipéptidos deseados. Las técnicas para el cultivo de células de mamífero en condiciones de cultivo tisular son conocidas en la técnica e incluyen cultivo en suspensión homogéneo, por ejemplo, en un reactor aireado o en un reactor con agitación continua, o cultivo celular inmovilizado o atrapado, por ejemplo, en fibras huecas, microcápsulas o microlechos de agarosa o cartuchos cerámicos. Si es necesario y/o se desea, las disoluciones de polipéptidos pueden purificarse por los métodos de cromatografía habituales, por ejemplo, filtración en gel, cromatografía de intercambio iónico, cromatografía en DEAEcelulosa o cromatografía de (inmuno-)afinidad, por ejemplo, después de la biosíntesis preferente de un polipéptido sintético de la región bisagra o antes de o posteriormente a la etapa de cromatografía HIC descrita en la presente memoria.
Los genes que codifican los anticuerpos Sp35, o fragmentos de unión a antígeno, variantes o derivados de éstos de la descripción también pueden expresarse en células no de mamífero tales como células de bacterias o levaduras o
plantas. Las bacterias que captan fácilmente ácidos nucleicos incluyen miembros de las enterobacteriaceae, tales como cepas de Escherichia coli o Salmonella; Bacillaceae, tales como Bacillus subtilis; Pneumococcus; Streptococcus y Haemophilus influenzae. Además se apreciará que, cuando se expresan en bacterias, los polipéptidos heterólogos típicamente se vuelven parte de cuerpos de inclusión. Los polipéptidos heterólogos deben aislarse, purificarse y ensamblarse en moléculas funcionales. Cuando se desean formas tetravalentes de anticuerpos, las subunidades se auto-ensamblarán en anticuerpos tetravalentes (WO02/096948A2).
En los sistemas bacterianos, pueden seleccionarse ventajosamente varios vectores de expresión dependiendo del uso pretendido para la molécula de anticuerpo que se está expresando. Por ejemplo, cuando se quiere producir una gran cantidad de dicha proteína, para la generación de composiciones farmacéuticas de una molécula de anticuerpo, pueden ser deseables vectores que dirigen la expresión de altos niveles de productos de proteína de fusión que se purifican fácilmente. Dichos vectores incluyen, pero no están limitados a, el vector de expresión de E. coli pUR278 (Ruther et al., EMBO J. 2: 1791 (1983)), en el que la secuencia codificadora del anticuerpo puede ligarse individualmente en el vector en marco con la región codificadora lacZ de manera que se produce una proteína de fusión; vectores pIN (Inouye e Inouye, Nucleic Acids Res. 13: 3101-3109 (1985); Van Heeke y Schuster, J. Biol. Chem. 24: 5503-5509 (1989)); y semejantes. Los vectores pGEX también pueden usarse para expresar polipéptidos extraños como proteínas de fusión con glutatión S-transferasa (GST). En general, dichas proteínas de fusión son solubles y pueden purificarse fácilmente de las células lisadas por adsorción y unión a una matriz de glutatión-lechos de agarosa seguido de elución en presencia de glutatión libre. Los vectores pGEX se diseñan para incluir sitios de escisión de la proteasa trombina o factor Xa de manera que el producto génico diana clonado puede liberarse del resto GST.
Además de los procariotas, también pueden usarse microbios eucariotas. Saccharomyces cerevisiae, o levadura de panadero común, es el usado más comúnmente entre los microorganismos eucariotas aunque varias cepas adicionales están disponibles comúnmente, por ejemplo, Pichia pastoris.
Para la expresión en Saccharomyces, se usa comúnmente el plásmido YRp7, por ejemplo (Stinchcomb, et al., Nature
282: 39 (1979); Kingsman et al., Gene 7: 141 (1979); Tschemper et al., Gene 10: 157 (1980)). Este plásmido contiene ya el gen TRP1 que proporciona un marcador de selección para una cepa mutante de levadura que carece de la capacidad de crecer en triptófano, por ejemplo ATCC No. 44076 o PEP4-1 (Jones, Genetics 85: 12 (1977)). La presencia de la lesión trp1 como una característica del genoma de la célula huésped de levadura proporciona un entorno eficaz para detectar la transformación por el crecimiento en ausencia de triptófano.
En un sistema de insecto, se usa típicamente el virus de polihedrosis nuclear de Autographa californica (AcNPV) como un vector para expresar genes extraños. El virus crece en células de Spodoptera frugiperda. La secuencia codificadora del anticuerpo puede clonarse individualmente en regiones no esenciales (por ejemplo, el gen de polihedrina) del virus y ponerse bajo el control de un promotor de AcNPV (por ejemplo, el promotor de polihedrina).
Una vez que una molécula de anticuerpo de la descripción se ha expresado recombinantemente, puede purificarse por cualquier método conocido en la técnica para la purificación de una molécula de inmunoglobulina, por ejemplo, por cromatografía (por ejemplo, intercambio iónico, afinidad, particularmente por afinidad para el antígeno específico por Proteína A y cromatografía de tamaño en columna), centrifugación, solubilidad diferencial, o por cualquier otra técnica estándar para la purificación de proteínas. Alternativamente, un método preferido para incrementar la afinidad de los anticuerpos de la descripción se describe en US 2002 0123057 A1.
VIII. Métodos de tratamiento usando anticuerpos Sp35 terapéuticos
Como se describe en la presente memoria, los anticuerpos Sp35, o fragmentos de unión a antígeno, variantes o derivados de éstos de la descripción, pueden aliviar la inhibición mediada por NgR1 de la extensión axonal que normalmente tiene lugar en las neuronas del SNC. Esto es beneficioso en situaciones en las que se necesita la extensión neuronal o el brote de neuritas en el cerebro o médula espinal. La lesión de la médula espinal, incluyendo aplastamiento o ruptura parcial o completa, ejemplifica una situación en la que se necesita la extensión axonal, pero normalmente está inhibida a través de la operación de la ruta Nogo. Los ejemplos de enfermedades o trastornos en los que sería beneficiosa la extensión axonal y/o el brote de neuritas en el cerebro incluyen ictus, esclerosis múltiple y otras enfermedades o trastornos neurodegenerativos tales como esclerosis múltiple (MS), leucoencefalopatía multifocal progresiva (PML), encefalomielitis (EPL), mielinolisis pontina central (CPM), adrenoleucodistrofia, enfermedad de Alexander, enfermedad de Pelizaeus Merzbacher (PMZ), Leucodistrofia de células Globoides (enfermedad de Krabbe) y Degeneración Walleriana, neuritis óptica, mielitis transversa, esclerosis lateral amiotrófica (ALS), enfermedad de Huntington, enfermedad de Alzheimer, enfermedad de Parkinson, lesión en la médula espinal, lesión cerebral traumática, lesión posterior a radiación, complicaciones neurológicas de la quimioterapia, ictus, neuropatía, neuropatía óptica isquémica aguda, deficiencia de vitamina E, síndrome de deficiencia de vitamina E aislado, AR, síndrome de Bassen-Kornzweig, síndrome de Marchiafava-Bignami, leucodistrofia metacromática, neuralgia del trigémino, parálisis de Bell, lesión de la médula espinal y todas las enfermedades neurológicas relacionadas con la muerte de células neuronales.
Los inventores han descubierto además que Sp35 se expresa en oligodendrocitos y contribuye a la biología de los oligodendrocitos. Los derivados solubles de Sp35, determinados polinucleótidos (por ejemplo, ARNi), así como determinados anticuerpos que se unen específicamente a Sp35, como se describe en la presente memoria actúan como antagonistas de la función de Sp35 en los oligodendrocitos, estimulando la proliferación, diferenciación y supervivencia de oligodendrocitos y estimulando la mielinización de neuronas in vitro e in vivo. Esto es beneficioso para enfermedades, trastornos o afecciones que implican desmielinización y dismielinización. Los ejemplos de enfermedades o trastornos en los que la proliferación, diferenciación y supervivencia de oligodendrocitos y/o la mielinización o remielinización sería beneficiosa incluyen esclerosis múltiple (MS), leucoencefalopatía multifocal progresiva (PML), encefalomielitis (EPL), mielinolisis pontina central (CPM), adrenoleucodistrofia, enfermedad de Alexander, enfermedad de Pelizaeus Merzbacher (PMZ), Leucodistrofia de células Globoides (enfermedad de Krabbe), Degeneración Walleriana, neuritis óptica, mielitis transversa, esclerosis lateral amiotrófica (ALS), enfermedad de Huntington, enfermedad de Alzheimer, enfermedad de Parkinson, lesión en la médula espinal, lesión cerebral traumática, lesión posterior a radiación, complicaciones neurológicas de la quimioterapia, ictus, neuropatía óptica isquémica aguda, deficiencia de vitamina E, síndrome de deficiencia de vitamina E aislado, AR, síndrome de Bassen-Kornzweig, síndrome de Marchiafava-Bignami, leucodistrofia metacromática, neuralgia del trigémino y parálisis de Bell.
De acuerdo con esto, un caso de la presente descripción proporciona métodos para tratar lesión de la médula espinal, enfermedades o trastornos asociados con la inhibición del crecimiento neuronal en el SNC, enfermedades o trastornos asociados con la inhibición del crecimiento o diferenciación de oligodendrocitos y enfermedades que implican la desmielinización o dismielinización de neuronas del SNC en un animal que padece dicha lesión o enfermedad o que está predispuesto a contraer dicha enfermedad, comprendiendo, consistiendo esencialmente en o consistiendo el método en administrar al animal una cantidad eficaz de un anticuerpo Sp35, o fragmento de unión a antígeno, variante o derivado de éste. Los anticuerpos de la descripción se describen en la presente memoria e incluyen los anticuerpos monoclonales listados en la Tabla 3A y 3B, anticuerpos que se unen específicamente al mismo epítopo que los anticuerpos monoclonales listados en la Tabla 3A y 3B, anticuerpos que inhiben competitivamente la unión de los anticuerpos monoclonales listados en la Tabla 3A y 3B a Sp35 y anticuerpos que comprenden polipéptidos derivados de los anticuerpos monoclonales listados en la Tabla 3A y 3B.
Un anticuerpo Sp35 terapéutico para usarse en los métodos de tratamiento descritos en la presente memoria puede prepararse y usarse como un agente terapéutico que estimula el crecimiento de neuritas en el SNC, supervivencia neuronal, orientación de axones y regeneración de axones, que estimula la supervivencia, crecimiento y/o diferenciación de oligodendrocitos, y que estimula la mielinización o remielinización de las neuronas del SNC. Las características de los anticuerpos Sp35 terapéuticos adecuados incluyen: unión a epítopos de Sp35 que resulta en el bloqueo de la actividad de Sp35, unión a Sp35 con una afinidad suficiente para incitar un efecto terapéutico y unión a Sp35 preferentemente a parejas de unión normales, por ejemplo, Receptor Nogo.
Los anticuerpos Sp35 terapéuticos pueden ser anticuerpos monoclonales, quiméricos o humanizados, o fragmentos de anticuerpos que se unen específicamente a Sp35. Los anticuerpos pueden ser anticuerpos monovalentes, bivalentes, polivalentes o bifuncionales. Los fragmentos de anticuerpo incluyen sin limitación fragmentos Fab F(ab')2 y Fv.
Los anticuerpos Sp35 terapéuticos, o fragmentos de unión a antígeno, variantes o derivados de éstos según la descripción pueden usarse en forma no marcada o no conjugada o pueden acoplarse o unirse a fármacos, marcadores o agentes de estabilización que pueden o no ejercer efectos terapéuticos adicionales.
Una dosificación y régimen de tratamiento específico para cualquier paciente particular dependerá de una variedad de factores, incluyendo el anticuerpo Sp35 particular, o fragmento de unión a antígeno, variante o derivado de éste usado, la edad, peso corporal, salud general, sexo y dieta del paciente y el momento de la administración, velocidad de excreción, combinación de fármacos y la gravedad de la enfermedad particular que se está tratando. El juicio de dichos factores por los responsables médicos está dentro de la experiencia ordinaria en la técnica. La cantidad también dependerá del paciente individual que se va a tratar, la ruta de administración, el tipo de formulación, las características del compuesto usado, la gravedad de la enfermedad y el efecto deseado. La cantidad usada puede ser determinada por principios farmacológicos y farmacocinéticos muy conocidos en la técnica.
En los métodos de la descripción, los anticuerpos Sp35, o fragmentos de unión a antígeno, variantes o derivados de éstos pueden administrarse directamente en el sistema nervioso, intracerebroventricularmente o intratecalmente, por ejemplo, en una lesión crónica de MS, como se discute con más detalle más adelante.
En varios casos, un anticuerpo Sp35 como se ha descrito anteriormente es un antagonista de la actividad de Sp35. En determinados casos, por ejemplo, la unión de un anticuerpo antagonista de Sp35 a Sp35, según de expresa en neuronas, bloquea la inhibición del crecimiento de neuritas asociado con mielina o la muerte de células neuronales. En otros casos, la unión del anticuerpo Sp35 a Sp35, según se expresa en oligodendrocitos, bloquea la inhibición del
crecimiento o diferenciación de los oligodendrocitos o bloquea la desmielinización o dismielinización de las neuronas del SNC.
En los métodos de la presente descripción, un anticuerpo Sp35, o un fragmento de unión a antígeno, variante o derivado de éste, en particular los anticuerpos Sp35 descritos en la presente memoria, puede administrarse directamente como un polipéptido preformado, o indirectamente mediante un vector de ácido nucleico, para permitir el crecimiento axonal beneficioso, estimular la proliferación, diferenciación y supervivencia de oligodendrocitos y/o estimular la mielinización o remielinización.
En determinados casos, un sujeto puede tratarse con una molécula de ácido nucleico que codifica un anticuerpo Sp35, o un fragmento de unión a antígeno, variante o análogo de éste, por ejemplo, en un vector. Las dosis para ácidos nucleicos que codifican polipéptidos varían de aproximadamente 10 ng a 1 g, 100 ng a 100 mg, 1 μg a 10 mg ó 30-300 μg de ADN por paciente. Las dosis para vectores virales infecciosos varían de 10-100, o más, viriones por dosis.
En algunos casos de la presente descripción, un anticuerpo Sp35, o un fragmento de unión a antígeno, variante o derivado de éste se administra en un método de tratamiento que incluye: (1) transformar o transfectar una célula huésped implantable con un ácido nucleico, por ejemplo, un vector, que expresa un anticuerpo Sp35, o un fragmento de unión a antígeno, variante o derivado de éste; y (2) implantar la célula huésped transformada en un mamífero, en el sitio de una enfermedad, trastorno o lesión. Por ejemplo, la célula huésped transformada puede implantarse en el sitio de una lesión de la médula espinal o en un sitio de dismielinización. En algunos casos de la descripción, la célula huésped implantable se extrae de un mamífero, se cultiva temporalmente, se transforma o transfecta con un ácido nucleico aislado que codifica un anticuerpo Sp35 y se implanta de nuevo en el mismo mamífero del que extrajo. La célula puede extraerse, pero no se requiere, del mismo sitio en el que se implanta. Dichos casos, algunas veces conocidos como terapia génica ex vivo, pueden proporcionar un suministro continuo del polipéptido Sp35, localizado en el sitio del sitio de acción, durante un periodo de tiempo limitado.
Los métodos para tratar la lesión de la médula espinal, enfermedades o trastornos asociados con la inhibición del crecimiento neuronal en el SNC, enfermedades o trastornos asociados con la inhibición del crecimiento o diferenciación de oligodendrocitos y enfermedades que implican la desmielinización o dismielinización de neuronas del SNC que comprenden la administración de un anticuerpo Sp35, o un fragmento de unión a antígeno, variante o derivado de éste se ensayan típicamente in vitro, y después in vivo en un modelo animal aceptable, para la actividad terapéutica o profiláctica deseada, antes de su uso en seres humanos. Los modelos animales adecuados, incluyendo animales transgénicos, son muy conocidos para los expertos en la técnica. Por ejemplo, los ensayos in vitro para demostrar la utilidad terapéutica de un anticuerpo Sp35 descrito en la presente memoria incluyen el efecto de un anticuerpo Sp35 en una línea celular o una muestra tisular de un paciente. El efecto del anticuerpo Sp35 en la línea celular y/o muestra tisular puede determinarse utilizando técnicas conocidas para los expertos en la técnica, tales como los ensayos descritos en otro lugar de la presente memoria. Según la descripción, los ensayos in vitro que pueden usarse para determinar si la administración de un anticuerpo Sp35 específico está indicada, incluyen ensayos de cultivo celular in vitro en los que una muestra tisular de un paciente se crece en cultivo y se expone a o se le administra de otra forma un compuesto y se observa el efecto de dicho compuesto en la muestra tisular.
En las composiciones de la descripción pueden incorporarse compuestos activos suplementarios. Por ejemplo, un anticuerpo Sp35, o fragmento de unión a antígeno, variante o derivado de éste de la descripción puede coformularse con y/o coadministrarse con uno o más agentes terapéuticos adicionales.
La descripción engloba cualquier método de administración adecuado para un anticuerpo Sp35, o fragmento de unión a antígeno, variante o derivado de éste de la descripción a un tejido diana seleccionado, incluyendo inyección en bolo de una disolución acuosa o implante de un sistema con liberación controlada. El uso de un implante con liberación controlada reduce la necesidad de inyecciones repetidas.
IX. Composiciones farmacéuticas y métodos de administración
Los métodos para preparar y administrar los anticuerpos Sp35, o fragmentos de unión a antígeno, variantes o derivados de éstos de la descripción a un sujeto que los necesita son muy conocidos para o se determinan fácilmente por los expertos en la técnica. La ruta de administración del anticuerpo Sp35, o fragmento de unión a antígeno, variante o derivado de éste puede ser, por ejemplo, oral, parenteral, por inhalación o tópica. El término parenteral tal y como se usa en la presente memoria incluye, por ejemplo, administración intravenosa, intraarterial, intraperitoneal, intramuscular, subcutánea, rectal o vaginal. Mientras todas estas formas de administración se contemplan claramente como dentro del alcance de la descripción, una forma para la administración sería una disolución para inyección, en particular para inyección intravenosa o intraarterial o goteo. Habitualmente, una composición farmacéutica adecuada para inyección puede comprender un tampón (por ejemplo, tampón acetato, fosfato o citrato), un tensioactivo (por ejemplo, polisorbato), opcionalmente un agente estabilizador (por ejemplo, albúmina humana), etc. Sin embargo, en otros métodos compatibles
con las enseñanzas de la presente memoria, los anticuerpos Sp35, o fragmentos de unión a antígeno, variantes o derivados de éstos pueden administrarse directamente al sitio de la población celular adversa incrementando de esta manera la exposición del tejido enfermo al agente terapéutico.
Como se ha discutido previamente, los anticuerpos Sp35, o fragmentos de unión a antígeno, variantes o derivados de éstos pueden administrarse en una cantidad farmacéuticamente eficaz para el tratamiento in vivo de lesión de la médula espinal en mamíferos, enfermedades o trastornos asociados con la inhibición del crecimiento neuronal en el SNC, enfermedades o trastornos asociados con la inhibición del crecimiento o diferenciación de oligodendrocitos y enfermedades que implican la desmielinización o dismielinización del SNC. A este respecto, se apreciará que los anticuerpos descritos se formularán de manera que se facilite la administración y se estimule la actividad del agente activo. Preferiblemente, las composiciones farmacéuticas según la presente descripción comprenden un vehículo estéril, no tóxico, farmacéuticamente aceptable tal como disolución salina fisiológica, tampones no tóxicos, conservantes y semejantes. Para los propósitos de la presente solicitud, una cantidad farmacéuticamente eficaz de un anticuerpo Sp35,
o fragmento de unión a antígeno, variante o derivado de éste, conjugado o no conjugado, se espera que signifique una cantidad suficiente para conseguir la unión eficaz a una diana y para conseguir un beneficio, por ejemplo, para mejorar los síntomas de una enfermedad o trastorno o para detectar una sustancia o una célula.
Las composiciones farmacéuticas usadas en esta descripción comprenden vehículos farmacéuticamente aceptables, incluyendo, por ejemplo, intercambiadores de iones, alúmina, estearato de aluminio, lecitina, proteínas séricas, tales como albúmina de suero humano, sustancias tampón tales como fosfatos, glicina, ácido sórbico, sorbato de potasio, mezclas de glicéridos parciales de ácidos grasos vegetales saturados, agua, sales o electrolitos, tales como sulfato de protamina, hidrógeno fosfato de disodio, hidrógeno fosfato de potasio, cloruro de sodio, sales de cinc, sílice coloidal, trisilicato de magnesio, polivinil pirrolidona, sustancias basadas en celulosa, polietilen glicol, carboximetilcelulosa de sodio, poliacrilatos, ceras, polímeros en bloque polietilen-polioxipropileno, polietilen glicol y grasa de lana.
Las preparaciones para administración parenteral incluyen disoluciones, suspensiones y emulsiones estériles acuosas o no acuosas. Los ejemplos de disolventes no acuosos son propilen glicol, polietileno glicol, aceites vegetales tales como aceite de oliva, y ésteres orgánicos inyectables tales como oleato de etilo. Los vehículos acuosos incluyen agua, disoluciones, emulsiones o suspensiones alcohólicas/acuosas, incluyendo disolución salina y medios tamponados. En la descripción objeto, los vehículos farmacéuticamente aceptables incluyen, pero no están limitados a, 0,01-0,1M y preferiblemente 0,05M tampón fosfato ó 0,8% disolución salina. Otros vehículos parenterales comunes incluyen disoluciones de fosfato de sodio, dextrosa de Ringer, dextrosa y cloruro de sodio, Ringer lactato o aceites fijados. Los vehículos intravenosos incluyen reponedores de fluidos y nutrientes, reponedores de electrolitos, tales como aquellos basados en dextrosa de Ringer, y semejantes. También pueden estar presentes conservantes y otros aditivos tales como por ejemplo, antimicrobianos, antioxidantes, agentes quelantes y gases inertes y semejantes.
Más particularmente, las composiciones farmacéuticas adecuadas para uso inyectable incluyen disoluciones acuosas estériles (solubles en agua) o dispersiones y polvos estériles para la preparación extemporánea de disoluciones o dispersiones estériles inyectables. En dichos casos, la composición debe ser estéril y debe ser fluida hasta el grado de que exista una fácil jeringabilidad. Debe ser estable en las condiciones de fabricación y almacenamiento y se preservará preferiblemente frente a la acción contaminante de microorganismos, tales como bacterias y hongos. El vehículo puede ser un disolvente o medio de dispersión que contiene, por ejemplo, agua, etanol, poliol (por ejemplo, glicerol, propilenglicol y polietilen glicol líquido y semejantes) y mezclas adecuadas de éstos. La fluidez apropiada puede mantenerse, por ejemplo, por el uso de un recubrimiento tal como lecitina, por el mantenimiento del tamaño de partícula requerido en el caso de dispersión y por el uso de tensioactivos. Las formulaciones adecuadas para uso en los métodos terapéuticos descritos en la presente memoria se describen en Remington's Pharmaceutical Sciences, Mack Publishing Co., 16ª ed. (1980).
La prevención de la acción de microorganismos puede conseguirse mediante varios agentes antibacterianos y antifúngicos, por ejemplo, parabenos, clorobutanol, fenol, ácido ascórbico, timerosal y semejantes. En muchos casos, será preferible incluir agentes isotónicos, por ejemplo, azúcares, polialcoholes, tales como manitol, sorbitol, o cloruro de sodio en la composición. La absorción prolongada de las composiciones inyectables puede producirse incluyendo en la composición un agente que retrasa la absorción, por ejemplo, monoestearato de aluminio y gelatina.
En cualquier caso, las disoluciones inyectables estériles pueden prepararse incorporando un compuesto activo (por ejemplo, un anticuerpo Sp35, o fragmento de unión a antígeno, variante o derivado de éste, en sí mismo o en combinación con otros agentes activos) en la cantidad requerida en un disolvente apropiado con uno o una combinación de ingredientes enumerados en la presente memoria, según se requiera, seguido de esterilización por filtración. Generalmente, las dispersiones se preparan incorporando el compuesto activo en un vehículo estéril, que contiene un medio de dispersión básico y los demás ingredientes requeridos de aquellos enumerados anteriormente. En el caso de polvos estériles para la preparación de disoluciones estériles inyectables, los métodos preferidos de preparación son secado en vacío y liofilización, que rinde un polvo de un ingrediente activo más cualquier ingrediente deseado adicional
de una disolución previamente esterilizada por filtración de éste. Las preparaciones para inyecciones se procesan, se utilizan para rellenar contenedores tales como ampollas, bolsas, botellas, jeringas o viales, y se sellan en condiciones asépticas según métodos conocidos en la técnica. Además, las preparaciones pueden envasarse y venderse en la forma de un kit tal como aquellos descritos en U.S.S.N. en tramitación con la presente 09/259.337 (US-2002-0102208 A1). Dichos artículos de fabricación tendrán preferiblemente etiquetas o prospectos indicando que las composiciones asociadas son útiles para tratar a un sujeto que padece, o está predispuesto a, trastornos autoinmunes o neoplásicos.
Las formulaciones parenterales pueden ser una única dosis en bolo, una infusión o una dosis de carga en bolo seguido de una dosis de mantenimiento. Estas composiciones pueden administrarse a intervalos específicos o variables fijados, por ejemplo, una vez al día o en una base "según se necesite".
Determinadas composiciones farmacéuticas usadas en esta descripción pueden administrarse oralmente en una forma de dosificación aceptable incluyendo, por ejemplo, cápsulas, comprimidos, suspensiones o disoluciones acuosas. Determinadas composiciones farmacéuticas también pueden administrarse por aerosol nasal o inhalación. Dichas composiciones pueden prepararse como disoluciones en disolución salina, empleando alcohol bencílico u otros conservantes adecuados, promotores de la absorción para aumentar la biodisponibilidad y/o otros agentes solubilizantes
o dispersantes convencionales.
La cantidad de un anticuerpo Sp35, o fragmento, variante o derivado de éste que puede combinarse con los materiales vehiculares para producir una forma de dosificación única variará dependiendo del huésped tratado y el modo particular de administración. La composición puede administrarse como una única dosis, múltiples dosis o durante un periodo de tiempo establecido en una infusión. Los regímenes de dosificación también pueden ajustarse para proporcionar la respuesta óptima deseada (por ejemplo, una respuesta terapéutica o profiláctica).
Los anticuerpos Sp35, o fragmentos de unión a antígeno, variantes o derivados de éstos pueden administrarse a un ser humano u otro animal según los métodos de tratamiento mencionados anteriormente en una cantidad suficiente para producir un efecto terapéutico. Los anticuerpos Sp35, o fragmentos de unión a antígeno, variantes o derivados de éstos pueden administrarse a dicho ser humano u otro animal en una forma de dosificación convencional preparada combinando el anticuerpo con un vehículo o diluyente farmacéuticamente aceptable convencional según técnicas conocidas. Un experto en la técnica reconocerá que la forma y carácter del vehículo o diluyente farmacéuticamente aceptable se dictan por la cantidad de ingrediente activo con el que se va a combinar, la ruta de administración y otras variables muy conocidas. Los expertos en la técnica apreciarán además que puede resultar que una mezcla que comprende una o más especies de anticuerpos Sp35, o fragmentos de unión a antígeno, variantes o derivados de éstos sea particularmente eficaz.
Las dosis eficaces de las composiciones de la presente descripción para el tratamiento de lesión en la médula espinal, enfermedades o trastornos asociados con la inhibición del crecimiento neuronal en el SNC, enfermedades o trastornos asociados con la inhibición del crecimiento o diferenciación de oligodendrocitos y enfermedades que implican la desmielinización o dismielinización del SNC varían dependiendo de muchos factores diferentes, incluyendo medio de administración, sitio diana, estado fisiológico del paciente, si el paciente es un ser humano o un animal, otras medicaciones administradas y si el tratamiento es profiláctico o terapéutico. Habitualmente, el paciente es un ser humano pero también pueden tratarse mamíferos no humanos incluyendo mamíferos transgénicos. Las dosificaciones del tratamiento pueden titularse usando métodos rutinarios conocidos para los expertos en la técnica para optimizar la seguridad y eficacia.
Para el tratamiento de lesión en la médula espinal, enfermedades o trastornos asociados con la inhibición del crecimiento neuronal en el SNC, enfermedades o trastornos asociados con la inhibición del crecimiento o diferenciación de oligodendrocitos y enfermedades que implican la desmielinización o dismielinización del SNC con un anticuerpo Sp35, o fragmento de unión a antígeno, variante o derivado de éste, la dosificación puede variar, por ejemplo, de aproximadamente 0,0001 a 100 mg/kg y más habitualmente 0,01 a 5 mg/kg (por ejemplo, 0,02 mg/kg, 0,25 mg/kg, 0,5 mg/kg, 0,75 mg/kg, 1 mg/kg, 2 mg/kg, etc.) del peso corporal del huésped. Por ejemplo, las dosificaciones pueden ser 1 mg/kg de peso corporal ó 10 mg/kg de peso corporal o en el intervalo de 1-10 mg/kg, preferiblemente al menos 1 mg/kg. También se pretende que las dosis intermedias en los intervalos anteriores estén en el alcance de la descripción. Dichas dosis pueden administrarse a los sujetos diariamente, en días alternativos, semanalmente o según cualquier otro esquema determinado por análisis empírico. Un tratamiento ejemplar conlleva la administración en dosificaciones múltiples durante un periodo prolongado, por ejemplo, de al manos seis meses. Los regímenes de tratamiento ejemplares adicionales conllevan la administración una vez cada dos semanas o una vez al mes o una vez cada 3 a 6 meses. Los esquemas de dosificación ejemplares incluyen 1-10 mg/kg ó 15 mg/kg en días consecutivos, 30 mg/kg en días alternos ó 60 mg/kg semanalmente. En algunos métodos, dos o más anticuerpos monoclonales con diferentes especificidades de unión se administran simultáneamente, en cuyo caso la dosificación de cada anticuerpo administrado se encuentra en los intervalos indicados.
Los anticuerpos Sp35, o fragmentos de unión a antígeno, variantes o derivados de éstos pueden administrarse en múltiples ocasiones. Los intervalos entre las dosificaciones únicas pueden ser diariamente, semanalmente, mensualmente o anualmente. Los intervalos también pueden ser irregulares según se indica por la medición de los niveles sanguíneos del polipéptido diana o molécula diana en el paciente. En algunos métodos, la dosificación se ajusta para conseguir una concentración plasmática de polipéptido de 1-1.000 μg/ml y en algunos métodos 25-300 μg/ml. Alternativamente, los anticuerpos Sp35, o fragmentos de unión a antígeno, variantes o derivados de éstos pueden administrarse como una formulación de liberación sostenida, en cuyo caso se requiere una administración menos frecuente. La dosificación y frecuencia varían dependiendo de la vida media del anticuerpo en el paciente. La vida media de un anticuerpo Sp35 también puede prolongarse mediante la fusión a un polipéptido o resto estable, por ejemplo, albúmina o PEG. En general, los anticuerpos humanizados muestran la vida media más larga, seguidos de los anticuerpos quiméricos y los anticuerpos no humanos. En un caso, los anticuerpos Sp35, o fragmentos de unión a antígeno, variantes o derivados de éstos de la descripción pueden administrarse en forma no conjugada. En otro caso, los anticuerpos Sp35, o fragmentos de unión a antígeno, variantes o derivados de éstos de la descripción pueden administrarse múltiples veces en forma conjugada. En otro caso más, los anticuerpos Sp35, o fragmentos de unión a antígeno, variantes o derivados de éstos de la descripción pueden administrarse en forma no conjugada, después en forma conjugada, o viceversa.
Las composiciones de la presente descripción pueden administrarse por cualquier método adecuado, por ejemplo, parenteralmente, intraventricularmente, oralmente, por pulverización con inhalación, tópicamente, rectalmente, nasalmente, bucalmente, vaginalmente o mediante un reservorio implantado. El término "parenteral" tal y como se usa en la presente memoria incluye inyección subcutánea, intravenosa, intramuscular, intra-articular, intra-sinovial, intraesternal, intratecal, intrahepática, intralesional e intracraneal o técnicas de infusión. Como se ha descrito previamente, los anticuerpos Sp35, o fragmentos de unión a antígeno, variantes o derivados de éstos actúan en el sistema nervioso para estimular la supervivencia, proliferación y diferenciación de oligodendrocitos y mielinización de neuronas y supervivencia neuronal, regeneración de axones y orientación de axones. De acuerdo con esto, en los métodos de la descripción, los anticuerpos Sp35, o fragmentos de unión a antígeno, variantes o derivados de éstos se administran de una manera tal que cruzan la barrera hemato-encefálica. Este cruce puede resultar de las propiedades físico-químicas inherentes en la molécula del anticuerpo Sp35 en sí misma, de otros componentes en una formulación farmacéutica o del uso de un dispositivo mecánico tal como una aguja, cánula o instrumentos quirúrgicos para traspasar la barrera hemato-encefálica. Cuando el anticuerpo Sp35 es una molécula que no cruza de manera inherente la barrera hemato-encefálica, por ejemplo, una fusión a un resto que facilita el cruce, las rutas adecuadas de administración son, por ejemplo, intratecal o intracraneal, por ejemplo, directamente en una lesión crónica de MS. Cuando el anticuerpo Sp35 es una molécula que cruza de manera inherente la barrera hemato-encefálica, la ruta de administración puede ser por una o más de las varias rutas descritas más adelante. En algunos métodos, los anticuerpos se administran como una composición o dispositivo de liberación sostenida, tal como un dispositivo Medipad™. La administración a través de la barrera hemato-encefálica puede aumentarse por una molécula vehicular, tal como un anti-receptor Fc, transferrina, antireceptor de insulina o un conjugado con toxina o potenciador de la penetración.
Los anticuerpos Sp35, o fragmentos de unión a antígeno, variantes o derivados de éstos usados en los métodos de la descripción pueden infundirse directamente en el cerebro. Se conocen varios implantes para la infusión directa al cerebro de los compuestos y son eficaces en la administración de compuestos terapéuticos a pacientes humanos que padecen trastornos neurológicos. Éstos incluyen infusión crónica en el cerebro usando una bomba, implantado estereotácticamente, catéteres intersticiales temporales, implantes de catéter intracraneal permanente e implantes biodegradables implantados quirúrgicamente. Véase, por ejemplo, Gill et al., "Direct brain infusion of glial cell line-derived neurotrophic factor in Parkinson disease", Nature Med. 9: 589-95 (2003); Scharfen et al., "High Activity Iodine-125 Interstitial Implant For Gliomas", Int. J. Radiation Oncology Biol. Phys. 24(4): 583-91 (1992); Gaspar et al., "Permanent 125I Implants for Recurrent Malignant Gliomas", Int. J. Radiation Oncology Biol. Phys. 43(5): 977-82 (1999); capítulo 66, páginas 577-580, Bellezza et al., "Stereotactic Interstitial Brachytherapy", en Gildenberg et al., Textbook of Stereotactic and Functional Neurosurgery, McGraw-Hill (1998); y Brem et al., "The Safety of Interstitial Chemotherapy with BCNU-Loaded Polymer Followed by Radiation Therapy in the Treatment of Newly Diagnosed Malignant Gliomas: Phase I Trial",
J. Neuro-Oncology 26: 111-23 (1995).
Las composiciones también pueden comprender un anticuerpo Sp35 dispersado en un material vehicular biocompatible que funciona como un sistema de administración o soporte adecuado para los compuestos. Los ejemplos adecuados de vehículos de liberación sostenida incluyen matrices de polímero semipermeables en la forma de artículos con forma tales como supositorios o cápsulas. Las matrices de liberación sostenida implantables o microcapsulares incluyen poliláctidos (Patente U.S. No. 3.773.319; EP 58.481), copolímeros de ácido L-glutámico y gamma-etil-L-glutamato (Sidman et al., Biopolymers 22: 547-56 (1985)); poli(2-hidroxietil-metacrilato), etilen vinil acetato (Langer et al., J. Biomed. Mater. Res.
15: 167-277 (1981); Langer, Chem. Tech. 12: 98-105 (1982)) o ácido poli-D-(-)-3hidroxibutírico (EP 133.988).
En algunos casos de la descripción, un anticuerpo Sp35, o fragmento de unión a antígeno, variante o derivado de éste de la descripción se administra a un paciente por infusión directa en una región apropiada del cerebro. Véase, por
ejemplo, Gill et al., supra. Están disponibles y pueden aplicarse técnicas alternativas para administrar un anticuerpo Sp35 según la descripción. Por ejemplo, el posicionamiento estereotáctico de un catéter o implante puede conseguirse usando la unidad Riechert-Mundinger y la unidad de localización multipropósito ZD (Zamorano-Dujovny). Un escaneo con tomografía computerizada (CT) con contraste aumentado, inyectando 120 ml de omnipaque, 350 mg yodo/ml, con un espesor de corte de 2 mm puede permitir la planificación de tratamiento multiplanar tridimensional (STP, Fischer, Freiburg, Alemania). Este equipamiento permite la planificación tomando como base estudios de formación de imágenes por resonancia magnética, aunando la información diana de CT y MRI para la confirmación clara de la diana.
El sistema estereotáctico Leksell (Downs Surgical, Inc., Decatur, GA) modificado para uso con un escáner GE CT (General Electric Company, Milwaukee, WI) así como el sistema estereotáctico Brown-Roberts-Wells (BRW) (Radioionics, Burlington, MA) puede usarse para este propósito. Así, en la mañana del implante, el anillo anular de la base del marco estereotáctico BRW puede unirse al cráneo del paciente. Pueden obtenerse secciones seriadas de CT a intervalos de 3 mm a través de la región (tejido diana) con un marco localizador de varilla de grafito fijado a la placa base. Puede ejecutarse un programa de planificación de tratamiento computerizado en un ordenador VAX 11/780 (Digital Equipment Corporation, Maynard, Mass.) usando coordenadas de CT de las imágenes de varilla de grafito para mapear entre el espacio CT y el espacio BRW.
Los anticuerpos Sp35, o fragmentos de unión a antígeno, variantes o derivados de éstos de la descripción pueden administrarse opcionalmente en combinación con otros agentes que son eficaces en el tratamiento del trastorno o afección que necesita tratamiento (por ejemplo, profiláctico o terapéutico).
X. Diagnóstico
La descripción proporciona además un método de diagnóstico útil durante el diagnóstico de trastornos o lesiones neuronales, que implica medir el nivel de expresión de la proteína o transcrito Sp35 en tejido u otras células o fluido corporal de un individuo y comparar el nivel de expresión medido con unos niveles de expresión estándar de Sp35 en tejido o fluido corporal normal, mediante lo cual un incremento en el nivel de expresión comparado con el estándar es indicativo de un trastorno.
Los anticuerpos específicos de Sp35 pueden usarse para ensayar niveles de proteína en una muestra biológica usando métodos inmunohistológicos clásicos conocidos para los expertos en la técnica (por ejemplo, véase Jalkanen et al., J. Cell. Biol. 101: 976-985 (1985); Jalkanen et al., J. Cell. Biol. 105: 3087-3096 (1987)). Otros métodos basados en anticuerpos útiles para detectar la expresión de proteínas incluyen inmunoensayos, tal como el ensayo inmunoabsorbente ligado a enzima (ELISA), inmunoprecipitación o transferencia western. Los ensayos adecuados se describen con más detalle en otro lugar de la presente memoria.
Por "ensayar el nivel de expresión del polipéptido Sp35" se pretende medir o estimar cualitativamente o cuantitativamente el nivel del polipéptido Sp35 en una primera muestra biológica bien directamente (por ejemplo, determinando o estimando el nivel absoluto de proteínas) o relativamente (por ejemplo, comparando con el nivel del polipéptido asociado a cáncer en una segunda muestra biológica). Preferiblemente, el nivel de expresión del polipéptido Sp35 en la primera muestra biológica se mide o estima y se compara con un nivel de polipéptido Sp35 estándar, tomándose el estándar de una segunda muestra biológica obtenida de un individuo que no tiene el trastorno o habiéndose determinado promediando niveles de una población de individuos que no tienen el trastorno. Como se apreciará en la técnica, una vez que se conoce el nivel de polipéptido Sp35 "estándar", puede usarse repetidamente como un estándar para comparación.
Por "muestra biológica" se pretende cualquier muestra biológica obtenida de un individuo, línea celular, cultivo tisular u otra fuente de células que potencialmente expresan Sp35. Los métodos para obtener biopsias tisulares y fluidos corporales de mamíferos son muy conocidos en la técnica.
Los anticuerpos Sp35 para uso en los métodos de diagnóstico descritos anteriormente incluyen cualquier anticuerpo Sp35 que se une específicamente a un producto génico Sp35, como se describe en otro lugar de la presente memoria.
XI. Inmunoensayos
Los anticuerpos Sp35, o fragmentos de unión a antígeno, variantes o derivados de éstos de la descripción pueden ensayarse para unión inmunoespecífica por cualquier método conocido en la técnica. Los inmunoensayos que pueden usarse incluyen pero no están limitados a sistemas de ensayo competitivos y no competitivos usando técnicas tales como transferencias western, radioinmunoensayos, ELISA (ensayo inmunoabsorbente ligado a enzima), inmunoensayos en "sandwich", ensayos de inmunoprecipitación, reacciones con precipitina, reacciones de difusión de precipitina en gel, ensayos de inmunodifusión, ensayos de aglutinación, ensayos de fijación del complemento, ensayos inmunoradiométricos, inmunoensayos fluorescentes, inmunoensayos con proteína A, por nombrar sólo algunos. Dichos ensayos son rutinarios y muy conocidos en la técnica (véase, por ejemplo, Ausubel et al., eds, Current Protocols in
Molecular Biology, John Wiley & Sons, Inc., Nueva York, Vol. 1 (1994). Los inmunoensayos ejemplares se describen brevemente más adelante (pero no se pretenden como limitación).
Los protocolos de inmunoprecipitación comprenden generalmente lisar una población de células en un tampón de lisis tal como tampón RIPA (1% NP-40 o Tritón X-100, 1% desoxicolato de sodio, 0,1% SDS, 0,15 M NaCl, 0,01 M fosfato de sodio a pH 7,2, 1% Trasilol) suplementado con inhibidores de proteína fosfatasa y/o proteasa (por ejemplo, EDTA, PMSF, aprotinina, vanadato de sodio), añadir el anticuerpo de interés al lisado celular, incubar durante un periodo de tiempo (por ejemplo, 1-4 horas) a 4 grados C., añadir lechos de sefarosa de proteína A y/o proteína G al lisado celular, incubar durante aproximadamente una hora o más a 4 grados C., lavar los lechos en tampón de lisis y resuspender los lechos en SDS/tampón de muestra. La capacidad del anticuerpo de interés de inmunoprecipitar un antígeno particular puede evaluarse, por ejemplo, por análisis de transferencia western. Un experto en la técnica conocerá los parámetros que pueden modificarse para incrementar la unión del anticuerpo a un antígeno y disminuir el fondo (por ejemplo, preaclaramiento del lisado celular con lechos de sefarosa). Para una discusión adicional respecto a los protocolos de inmunoprecipitación véase, por ejemplo, Ausubel et al., eds, Current Protocols in Molecular Biology, John Wiley & Sons, Inc., Nueva York, Vol. 1 (1994) en 10.16.1.
El análisis por transferencia western comprende generalmente preparar muestras de proteínas, electroforesis de las muestras de proteínas en un gel de poliacrilamida (por ejemplo, 8%-20% SDS-PAGE dependiendo del peso molecular del antígeno), transferir la muestra de proteínas del gel de poliacrilamida a una membrana tal como nitrocelulosa, PVDF
o nilon, bloquear la membrana en disolución de bloqueo (por ejemplo, PBS con 3% BSA o leche desnatada), lavar la membrana en tampón de lavado (por ejemplo, PBS-Tween 20), bloquear la membrana con anticuerpo primario (el anticuerpo de interés) diluido en tampón de bloqueo, lavar la membrana en tampón de lavado, bloquear la membrana con un anticuerpo secundario (que reconoce el anticuerpo primario, por ejemplo, un anticuerpo anti-humano) conjugado con un sustrato enzimático (por ejemplo, peroxidasa de rábano o fosfatasa alcalina) o molécula radiactiva (por ejemplo, 32p ó 125I) diluida en tampón de bloqueo, lavar la membrana en tampón de lavado y detectar la presencia del antígeno. Un experto en la técnica conocerá los parámetros que pueden modificarse para incrementar la señal detectada y para reducir el ruido de fondo. Para una discusión adicional respecto a los protocolos de transferencia western véase, por ejemplo, Ausubel et al., eds, Current Protocols in Molecular Biology, John Wiley & Sons, Inc., Nueva York, Vol. 1 (1994) en 10.8.1.
Los ELISA comprenden preparar el antígeno, recubrir el pocillo de una placa de microtitulación de 96 pocillos con el antígeno, añadir el anticuerpo de interés conjugado con un compuesto detectable tal como un sustrato enzimático (por ejemplo, peroxidasa de rábano o fosfatasa alcalina) al pocillo e incubar durante un periodo de tiempo y detectar la presencia del antígeno. En los ELISA, el anticuerpo de interés no tiene que estar conjugado a un compuesto detectable; en lugar de esto, puede añadirse al pocillo un segundo anticuerpo (que reconoce el anticuerpo de interés) conjugado con un compuesto detectable. Además, en lugar de recubrir el pocillo con el antígeno el anticuerpo puede utilizarse para recubrir el pocillo. En este caso, puede añadirse un segundo anticuerpo conjugado con un compuesto detectable después de la adición del antígeno de interés al pocillo recubierto. Un experto en la técnica conocerá los parámetros que pueden modificarse para incrementar la señal detectada así como otras variaciones de los ELISA conocidas en la técnica. Para una discusión adicional respecto a los ELISA véase, por ejemplo, Ausubel et al., eds, Current Protocols in Molecular Biology, John Wiley & Sons, Inc., Nueva York, Vol. 1 (1994) en 11.2.1.
La afinidad de unión de un anticuerpo a un antígeno y la velocidad de disociación de una interacción anticuerpo-antígeno puede determinarse por ensayos de unión competitiva. Un ejemplo de un ensayo de unión competitiva es un radioinmunoensayo que comprende la incubación de antígeno marcado (por ejemplo, 3H o 125I) con el anticuerpo de interés en presencia de cantidades crecientes de antígeno no marcado, y la detección del anticuerpo unido al antígeno marcado. La afinidad del anticuerpo de interés para un antígeno particular y las velocidades de disociación de la unión pueden determinarse a partir de los datos por análisis de representaciones scatchard. La competición con un segundo anticuerpo también puede determinarse usando radioinmunoensayos. En este caso, el antígeno se incuba con el anticuerpo de interés que se conjuga con un compuesto marcado (por ejemplo, 3H o 125I) en presencia de cantidades crecientes de un segundo anticuerpo no marcado.
Los anticuerpos Sp35, o fragmentos de unión a antígeno, variantes o derivados de éstos de la descripción pueden emplearse, además, histológicamente, como en inmunofluorescencia, microscopía inmunoelectrónica o ensayos no inmunológicos, para la detección in situ de productos génicos antigénicos de cáncer o variantes conservadas o fragmentos peptídicos de éstos. La detección in situ puede conseguirse extrayendo una muestra histológica de un paciente y aplicando a ésta un anticuerpo Sp35 marcado, o fragmento de unión a antígeno, variante o derivado de éste, preferiblemente aplicado por superposición del anticuerpo marcado (o fragmento) en una muestra biológica. Mediante el uso de dicho procedimiento, es posible determinar no sólo la presencia de la proteína Sp35, o variantes conservadas o fragmentos peptídicos, sino también su distribución en el tejido examinado. Usando la presente descripción, los expertos en la técnica percibirán fácilmente que cualquiera de una amplia variedad de métodos histológicos (tal como procedimientos de tinción) puede modificarse con el fin de conseguir dicha detección in situ.
Los inmunoensayos y no inmunoensayos para los productos génicos Sp35 o variantes conservadas o fragmentos peptídicos de éstos comprenderán típicamente incubar una muestra, tal como un fluido biológico, un extracto tisular, células recogidas recientemente o lisados de células que se han incubado en cultivo celular, en presencia de un anticuerpo marcado de manera detectable capaz de unirse a Sp35 o variantes conservadas o fragmentos peptídicos de éste y detectar el anticuerpo unido por cualquiera de varias técnicas muy conocidas en la técnica.
La muestra biológica puede ponerse en contacto con e inmovilizarse en un soporte o vehículo de fase sólida tal como nitrocelulosa, u otro soporte sólido que es capaz de inmovilizar células, partículas celulares o proteínas solubles. El soporte puede lavarse entonces con tampones adecuados seguido de tratamiento con el anticuerpo Sp35 marcado de manera detectable, o fragmento de unión a antígeno, variante o derivado de éste. El soporte de fase sólida puede lavarse entonces con el tampón una segunda vez para eliminar el anticuerpo no unido. Opcionalmente, el anticuerpo se marca posteriormente. La cantidad de marca unida en el soporte sólido puede detectarse por medios convencionales.
Por "soporte o vehículo en fase sólida" se pretende cualquier soporte capaz de unir un antígeno o un anticuerpo. Los soportes o vehículos muy conocidos incluyen vidrio, poliestireno, polipropileno, polietileno, dextrano, nilon, amilasas, celulosas naturales y modificadas, poliacrilamidas, gabbros y magnetita. La naturaleza del vehículo puede ser bien soluble en algún grado o insoluble para los propósitos de la presente descripción. El material de soporte puede tener virtualmente cualquier configuración estructural posible siempre que la molécula acoplada sea capaz de unirse a un antígeno o anticuerpo. Así, la configuración del soporte puede ser esférica, como en un lecho, o cilíndrica, como en la superficie interna de un tubo de ensayo, o la superficie externa de una varilla. Alternativamente, la superficie puede ser plana tal como una lámina, tira de ensayo, etc. Los soportes preferidos incluyen lechos de poliestireno. Los expertos en la técnica conocerán muchos otros vehículos adecuados para unir anticuerpo o antígeno, o serán capaces de establecer los mismos por uso de experimentación rutinaria.
La actividad de unión de un lote dado de anticuerpo Sp35, o fragmento de unión a antígeno, variante o derivado de éste puede determinarse según métodos muy conocidos. Los expertos en la técnica serán capaces de determinar las condiciones de ensayo operativas y óptimas para cada determinación empleando experimentación rutinaria.
Existe una variedad de métodos disponibles para medir la afinidad de una interacción anticuerpo-antígeno, pero relativamente pocos para determinar las constantes de velocidad. La mayor parte de los métodos se basa en el marcaje del anticuerpo o antígeno, lo que complica inevitablemente las mediciones rutinarias e introduce incertidumbres en las cantidades medidas.
La resonancia de plasmón superficial (SPR) según se realiza en BIAcore ofrece varias ventajas sobre los métodos convencionales de medición de la afinidad de interacciones anticuerpo-antígeno: (i) no requiere marcar el anticuerpo o antígeno; (ii) los anticuerpos no necesitan ser purificados previamente, puede usarse directamente el sobrenadante del cultivo celular; (iii) se posibilitan las mediciones en tiempo real, lo que permite la comparación semi-cuantitativa rápida de diferentes interacciones de anticuerpos monoclonales y son suficientes para muchos propósitos de evaluación; (iv) puede regenerarse una superficie bioespecífica de manera que una serie de diferentes anticuerpos monoclonales pueden compararse fácilmente en condiciones idénticas; (v) los procedimientos analíticos están totalmente automatizados y pueden realizarse series de mediciones extensas sin intervención del usuario. BIAapplications Handbook, versión AB (reimpreso 1998), BIACORE código No. BR-1001-86; BIAtechnology Handbook, versión AB (reimpreso 1998), BIACORE código No. BR-1001-84.
Los estudios de unión basados en SPR requieren que un miembro de una pareja de unión esté inmovilizado en una superficie sensora. La pareja de unión inmovilizada se refiere como el ligando. La pareja de unión en disolución se refiere como el analito. En algunos casos, el ligando se une indirectamente a la superficie a través de la unión de otra molécula inmovilizada, que se refiere como la molécula de captura. La respuesta de SPR refleja un cambio en la concentración de masa en la superficie detectora al unirse o disociarse los analitos.
Tomando como base el SPR, las mediciones de BIAcore en tiempo real monitorizan directamente las interacciones cuando se producen. La técnica es muy apropiada para la determinación de parámetros cinéticos. La clasificación de la afinidad comparativa es extremadamente sencilla de realizar y tanto las constantes cinéticas como de afinidad pueden derivarse de los datos del sensograma.
Cuando se inyecta analito en un pulso discreto a través de una superficie de ligando, el sensograma resultante puede dividirse en tres fases esenciales: (i) Asociación del analito con ligando durante la inyección de la muestra; (ii) Equilibrio
o estado estacionario durante la inyección de la muestra, en el que la velocidad de unión del analito está equilibrada por disociación del complejo; (iii) Disociación del analito de la superficie durante el flujo de tampón.
Las fases de asociación y disociación proporcionan información sobre las cinéticas de la interacción analito-ligando (ka y kd, las velocidades de la formación y disociación del complejo, Kd/ka= KD). La fase de equilibrio proporciona información sobre la afinidad de la interacción analito-ligando (KD).
El software BIAevaluation proporciona facilidades exhaustivas para el ajuste de curvas usando tanto integración numérica como algoritmos de ajuste global. Con el análisis adecuado de los datos, pueden obtenerse constantes separadas de velocidad y afinidad para la interacción a partir de investigaciones sencillas BIAcore. El intervalo de afinidades mensurable mediante esta técnica es muy amplio variando de mM a pM.
La especificidad de epítopo es una característica importante de un anticuerpo monoclonal. El mapeo de epítopos con BIAcore, a diferencia de las técnicas convencionales que usan radioinmunoensayo, ELISA u otros métodos de adsorción a superficie, no requiere el marcaje de o anticuerpos purificados y permite ensayos de especificidad multi-sitio usando una secuencia de varios anticuerpos monoclonales. Además, pueden procesarse automáticamente grandes números de análisis.
Los experimentos de unión por parejas ensayan la capacidad de dos MAb de unirse simultáneamente al mismo antígeno. Los MAb dirigidos frente a epítopos separados se unirán independientemente, mientras que los MAb dirigidos frente a epítopos idénticos o muy relacionados interferirán con la unión del otro. Estos experimentos de unión con BIAcore son sencillos de realizar.
Por ejemplo, se puede usar una molécula de captura para unir el primer Mab, seguido de la adición de antígeno y segundo MAb secuencialmente. Los sensogramas revelarán: 1. cuánto del antígeno se une al primer Mab, 2. en qué grado el segundo MAb se une al antígeno unido a la superficie, 3. si el segundo MAb no se une, si revertir el orden del ensayo por parejas altera los resultados.
La inhibición peptídica es otra técnica usada para el mapeo de epítopos. Este método puede complementar los estudios de unión de anticuerpo por parejas y puede relacionar epítopos funcionales con características estructurales cuando se conoce la secuencia primaria del antígeno. Los péptidos o fragmentos de antígeno se ensayan para inhibición de la unión de diferentes MAb a antígeno inmovilizado. Se asume que los péptidos que interfieren con la unión de un MAb dado están relacionados estructuralmente con el epítopo definido por ese MAb.
La práctica de la presente descripción empleará, a no ser que se indique otra cosa, técnicas convencionales de biología celular, cultivo celular, biología molecular, biología transgénica, microbiología, ADN recombinante e inmunología, que están dentro de la experiencia de la técnica. Dichas técnicas se explican completamente en la bibliografía. Véase, por ejemplo, Molecular Cloning A Laboratory Manual, 2ª Ed., Sambrook et al., ed., Cold Spring Harbor Laboratory Press: (1989); Molecular Cloning A Laboratory Manual, Sambrook et al., ed., Cold Springs Harbor Laboratory, Nueva York (1992), DNA Cloning, D.N. Glover ed., Volúmenes I y II (1985); Oligonucleotide Synthesis, M.J. Gait ed., (1984); Mullis et al., Pat. U.S. No. 4.683.195; Nucleic Acid Hybridization, B.D. Hames & S.J. Higgins eds. (1984); Transcription And Translation, B.D. Hames & S.J. Higgins eds. (1984); Culture Of Animal Cells, R.I. Freshney, Alan R. Liss, Inc., (1987); Immobilized Cells And Enzymes, IRL Press, (1986); B. Perbal, A Practical Guide To Molecular Cloning (1984); el tratado, Methods In Enzymology, Academic Press, Inc., N.Y.; Gene Transfer Vectors For Mammalian Cells, J.H. Miller y M.P. Calos eds., Cold Spring Harbor Laboratory (1987); Methods In Enzymology, Vols. 154 y 155 (Wu et al. eds.); Immunochemical Methods In Cell And Molecular Biology, Mayer y Walker, eds., Academic Press, Londres (1987); Handbook Of Experimental Immunology, Volúmenes I-IV, D.M. Weir y C.C. Blackwell, eds., (1986); Manipulating the Mouse Embryo, Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor, N.Y., (1986); y en Ausubel et al., Current Protocols in Molecular Biology, John Wiley and Sons, Baltimore, Maryland (1989).
Los principios generales de preparación de anticuerpos por ingeniería se muestran en Antibody Engineering, 2ª edición,
C.A.K. Borrebaeck, Ed., Oxford Univ. Press (1995). Los principios generales de preparación de proteínas por ingeniería se muestran en Protein Engineering, A Practical Approach, Rickwood, D., et al., Eds., IRL Press en Oxford Univ. Press, Oxford, Ing. (1995). Los principios generales de anticuerpos y unión anticuerpo-hapteno se muestran en: Nisonoff, A., Molecular Immunology, 2ª ed., Sinauer Associates, Sunderland, MA (1984); y Steward, M.W., Antibodies, Their Structure and Function, Chapman y Hall, Nueva York, NY (1984). Además, se siguen generalmente los métodos estándar en inmunología conocidos en la técnica y no descritos específicamente como en Current Protocols in Immunology, John Wiley & Sons, Nueva York; Stites et al. (eds), Basic and Clinical-Immunology (8ª ed.), Appleton & Lange, Norwalk, CT (1994) y Mishell y Shiigi (eds), Selected Methods in Cellular Immunology, W.H. Freeman and Co., Nueva York (1980).
Los trabajos de referencia estándar que muestran principios generales de inmunología incluyen Current Protocols in Immunology, John Wiley & Sons, Nueva York; Klein, J., Immunology: The Science of Self-Nonself Discrimination, John Wiley & Sons, Nueva York (1982); Kennett, R., et al., eds., Monoclonal Antibodies, Hybridoma: A New Dimension in Biological Analyses, Plenum Press, Nueva York (1980); Campbell, A., "Monoclonal Antibody Technology" en Burden, R., et al., eds., Laboratory Techniques in Biochemistry and Molecular Biology, Vol. 13, Elsevere, Amsterdam (1984), Kuby Immunology 4ª ed. Ed. Richard A. Goldsby, Thomas J Kindt y Barbara A. Osborne, H. Freemand & Co. (2000); Roitt, L., Brostoff, J. y Male D., Immunology 6ª ed. Londres: Mosby (2001); Abbas A., Abul, A. y Lichtman, A., Cellular and Molecular Immunology Ed. 5, Elsevier Health Sciences Division (2005); Kontermann y Dubel, Antibody Engineering, Springer Verlan (2001); Sambrook y Russell, Molecular Cloning: A Laboratory Manual. Cold Spring Harbor Press (2001);
Lewin, Genes VIII, Prentice Hall (2003); Harlow y Lane, Antibodies: A Laboratory Manual, Cold Spring Harbor Press (1988); Dieffenbach y Dveksler, PCR Primer Cold Spring Harbor Press (2003).
Ejemplos
Ejemplo 1
Sp35 está implicado en la biología de los oligodendrocitos
Los oligodendrocitos maduran a través de varios estadios de desarrollo desde células progenitoras A2B5 (que expresan A2B5), que se diferencian en oligodendrocitos pre-mielinizantes (que expresan O1 y O4) y finalmente en oligodendrocitos mielinizantes maduros (que expresan O1, O4 y MBP). Así, mediante la monitorización de la presencia y ausencia de los marcadores A2B5, O1, O4 y MBP es posible determinar el estadio de desarrollo de una célula dada y evaluar el papel de Sp35-Fc en la biología de los oligodendrocitos. Para una revisión general de la biología de los oligodendrocitos, véase, por ejemplo, Baumann y Pham-Dinh, Physiol. Rev. 81: 871-927 (2001).
Los anticuerpos monoclonales frente a O4, MBP y CNPasa fueron de Sternberger Monoclonals; el anticuerpo frente a APC (clon CC-1; ref. 29) fue de Calbiochem. Otros anticuerpos fueron frente a βIII tubulina (Covance), Sp35 (Biogen Idec), Fyn (Santa Cruz Biotechnology) y fosfo-Fyn (Biosource). Los anticuerpos monoclonales frente a A2B5 están disponibles en Chemicon.
Sp35 se expresa en oligodendrocitos
La expresión de Sp35 en cultivos de neuronas de rata purificadas P13 CG, oligodendrocito P2 y astrocitos P4 se analizó por la reacción en cadena de la polimerasa después de transcripción inversa (RT-PCR). Se usó un kit de Ambion, Inc. para extraer ARNm de células de cerebro de rata según las instrucciones del fabricante. Se llevó a cabo RT-PCR semicuantitativa usando el cebador directo 5' AGAGACATGCGATTGGTGA 3' (SEQ ID NO: 344) y el cebador inverso 5' AGAGATGTAGACGAGGTCATT 3' (SEQ ID NO: 345) mostró expresión alta en neuronas, expresión más baja en oligodendrocitos y ausencia de expresión en astrocitos.
La expresión de Sp35 en oligodendrocitos se confirmó por hibridación in situ en secciones derivadas de nervio óptico de ratas adultas. Las secciones de nervio óptico de rata se prepararon y procesaron como se describe en Mi et al., "Sp35 is a component of the Nogo-66 receptor/p75 signalling complex", Nat. Neurosci. 7: 221-28 (2004) y se probó con ARN de Sp35 antisentido o con sentido marcados con digoxigenina usando los primeros 500 nucleótidos de la secuencia codificadora de Sp35. Las secciones se tiñeron según las instrucciones del fabricante usando un kit de Amplificación de la Señal Tiramida (Amersham Biosciences) y un kit de anticuerpo anti-digoxigenina conjugado fluorescente (Perkin Elmer). Para los análisis combinados in situ y de inmunofluorescencia, las secciones se probaron en primer lugar con ARN marcados con digoxigenina y después con anticuerpos, por ejemplo, anticuerpo CC1 (Calbiochem; un marcador de oligodendrocitos maduros) o anticuerpo anti-Sp35. Observamos que los oligodendrocitos que hibridaban con un sonda Sp35 antisentido también se coteñían con un anticuerpo frente a CC1 (datos no mostrados). No se observó un marcaje específico usando una sonda Sp35 con sentido. La expresión de Sp35 en oligodendrocitos también se confirmó por estudios de inmunohistoquímica de secciones de tejido de la región de ventrículo lateral de corteza de rata P7. Una mayoría de células corticales que se marcaron con anticuerpo CC1 también se marcaron con anticuerpo anti-Sp35. Datos no mostrados. La especificidad de la interacción se confirmó por preadsorción del anticuerpo anti-Sp35 con Sp35-Fc (véase el Ejemplo 2), lo que eliminó la señal.
La inactivación con ARNi específico de Sp35 de la expresión de Sp35 estimula el crecimiento y diferenciación de los oligodendrocitos.
Se usó ARNi específico de Sp35 para suprimir la expresión de Sp35 en células precursoras de oligodendrocitos para examinar cómo contribuye Sp35 al crecimiento y diferenciación de los oligodendrocitos. Se infectaron 50.000 células precursoras de oligodendrocitos A2B5 con lentivirus que portaba secuencia de ARNi específico de Sp35 o ARNi control preparados como sigue.
Se compararon secuencias de ADN de Sp35 murinas y de rata para encontrar regiones homólogas para uso para ARN en horquilla pequeños (ARNsh) candidatos. Se construyó CH324, para la expresión en lentivirus de ARNi de Sp35, hibridando los oligonucleótidos LV1-035 y LV1-036 y ligando a pLL3.7 digerido con HpaI y XhoI. El vector pLL3.7, la metodología adicional y la producción de virus fueron como se describe en Rubinson et al., Nat. Genet. 33, 401-06 (2003). Los oligonucleótidos de ARNi de Sp35 se adquirieron en MWG y tienen las secuencias siguientes: LV1-035 (oligo con sentido) 5' - TGA TCG TCA TCC TGC TAG ACT TCA AGA GAG TCT AGC AGG ATG ACG ATC TTT TTT C - 3' (SEQ ID NO: 346) y LV1-036 (oligo antisentido) 5' -TCG AGA AAA AAG ATC GTC ATC CTG CTA GAC TCT CTT GAA GTC TAG CAG GAT GAC GAT CA - 3' (SEQ ID NO: 347).
El ARNi control se diseñó con las mismas secuencias oligonucleotídicas excepto para los cambios de nucleótidos indicados en letras minúsculas: 5' - TGA TCc TCA TcC ttC Tat ACT TCA AGA GAG TgT AGC AGG ATG AcG ATC TTT TTT CTC GA - 3' (SEQ ID NO: 348) y 5' -TCG AGA AAA AAG ATC GTC ATC CTG CTA GAC TCT CTT GAA GTa TAG aAG GAT GAC GAT CA -3' (SEQ ID NO: 349).
Antes de producir los lentivirus, el ADN de pLL3.7 o ARNsh candidato en pLL3.7 se cotransfectaron con plásmido murino Sp35 etiquetado con HA a una proporción de 5 a 1 en células CHO en un formato de 6 pocillos. La inactivación se analizó por la detección por transferencia western de Sp35-etiqueta HA de lisados de células CHO transfectadas así como por transferencia northern de ARN total preparado a partir de pocillos duplicados. La transferencia se probó con un fragmento de ADNc de Sp35. Los ensayos se realizaron 48 horas después de la transfección. Como se esperaba, hubo una reducción de 10 veces en el ARNm Sp35 en las células CHO tratadas con ARNi CH324 respecto a las células tratadas control. Datos no mostrados. Se generaron lentivirus con ARNi que portaban proteína verde fluorescente (GFP) como se describe en Rubinson et al. En los cultivos tratados con ARNi control o ARNi Sp35, aproximadamente el 80% de los oligodendrocitos fueron positivos para GFP. El número total de células no se alteró por los tratamientos con ARNi. Para cuantificar los efectos de ARNi en la diferenciación, sólo se contaron los oligodendrocitos que expresaban GFP.
Se crecieron poblaciones enriquecidas de oligodendrocitos de ratas hembra Long Evans P2 como se describe por Conn, Meth. Neurosci. 2: 1-4 (Academic Press; 1990) con modificaciones como sigue. Brevemente, el prosencéfalo se diseccionó y se puso en disolución de sal tamponada de Hank (HBSS; Invitrogen). El tejido se cortó en fragmentos de 1 mm y se incubó a 370C durante 15 min en 0,01% tripsina y 10 μg/ml ADNasa. Las células disociadas se plaquearon en frascos de cultivo tisular T75 recubiertos con poli-L-lisina y se crecieron a 370C durante 10 d en medio DMEM con 20% suero fetal de ternera (Invitrogen). Los precursores de oligodendrocitos (A2B5+) se recogieron agitando el frasco toda la noche a 200 rpm a 370C, lo que resulta en una población 95% pura. Los cultivos se mantuvieron en medio de Eagle modificado por Dulbecco con alta glucosa (DMEM) con FGF/PDGF (10 ng/ml; Peprotech) durante 1 semana. La eliminación de FGF/PDGF permitió que las células A2B5+ se diferenciaran en oligodendrocitos premielinizantes O4+ después de 3-7 d y que se diferenciaran en oligodendrocitos O4+ y MBP+ maduros después de 7-10 d.. Estos estados de diferenciación son evidentes fácilmente a partir de cambios en la morfología: las células A2B5+ tienen forma bipolar, los oligodendrocitos premielinizantes O4+ tienen procesos más largos y más ramificados y los oligodendrocitos maduros MBP+ contienen estructuras de láminas de mielina entre los procesos.
Las células precursoras de oligodendrocitos A2B5 se infectaron con el lentivirus que contiene el ARNi CH324. Las células resultantes se cultivaron durante 3 días y se contó el número de oligodendrocitos positivos para O4 (un marcador para la diferenciación de los oligodendrocitos). La expresión endógena de Sp35 se redujo por infección con lentivirus ARNi Sp35 y se confirmó por RT-PCR. La reducción de Sp35 resultó en oligodendrocitos más altamente diferenciados, maduros comparado con las células control infectadas, como fue evidente por incrementos en la longitud de los procesos celulares y por la presencia de estructuras de lámina de mielina abundantes (datos no mostrados). En las células que expresaban ARNi Sp35, hubo tres veces más oligodendrocitos maduros (positivos para O4) que en los cultivos control. Estos datos indican que Sp35 puede regular negativamente la diferenciación de los oligodendrocitos.
Sp35 dominante negativo estimula el crecimiento y diferenciación de los oligodendrocitos
Se construyeron vectores lentivirales que expresan Sp35 de tipo salvaje y una forma dominante-negativa de Sp35. Las secuencias de ADN que codifican Sp35 de longitud completa de ratón (FL-Sp35, residuos de aminoácidos 34-614 de SEQ ID NO: 2) se amplificó por PCR usado los cebadores 5' - GAG GAT CTC GAC GCG GCC GCA TGG AGA CAG ACA CAC TCC TG - 3' (SEQ ID NO: 350) y 5' -GGG GCG GAA TTG GAT CCT CAC AGA TCC TCT TCT GAG ATG AG
-
3' (SEQ ID NO: 351) y se insertó en el vector lentiviral HRST-IRESeGFP en los sitios NotI y BamHI. De manera similar, la secuencia de ADN que codifica Sp35 dominante negativo (DN-Sp35, residuos de aminoácidos 34-581 de SEQ ID NO: 2) se amplificó por PCR usando los cebadores 5' - GAG GAT CTC GAC GCG GCC GCA TGG AGA CAG ACA CAC TCC TG - 3' (SEQ ID NO: 352) y 5' - GAT ACG GAT CCT CAG CCT TTG CCC CGG CTC CAT AGA AAC AGC - 3' (SEQ ID NO: 353). Los plásmidos FL-Sp35 y DN-Sp35 se transfectaron en células 293 para producir lentivirus como se describe por Rubinson et al., "A lentivirus-based system to functionally silence genes in primary mammalian cells, stem cells and transgenic mice by RNA interference", Nat. Genet. 33: 401-06 (2003). Los oligodendrocitos se infectaron con lentivirus a 2 MOI por célula y se confirmó la expresión de FL-Sp35 y DN-Sp35 por transferencia western.
DN-Sp35 estimuló la diferenciación de los oligodendrocitos, lo que produjo un incremento en el número de oligodendrocitos maduros. Por el contrario, la sobreexpresión de Sp35 de longitud completa (FL-Sp35) tuvo el efecto opuesto e inhibió la diferenciación, como fue evidente por una reducción en el número de oligodendrocitos maduros comparado con el control (datos no mostrados).
Ejemplo 2
Construcción y purificación de la proteína de fusión Sp35-Fc
Se hizo una construcción fusionando la parte extracelular de Sp35 humano (residuos 1-532) a la región bisagra y Fc de IgG1 humana para estudiar la función biológica de Sp35. Se obtuvo una secuencia codificadora parcial de Sp35 humano por PCR a partir del clon 227.2 usando el cebador directo 5' - CAG CAG GTC GAC GCG GCC GCA TGC TGG CGG GGG GCG T - 3' (SEQ ID NO: 354) y el cebador inverso 5' - CAG CAG GTC GAC CTC GCC CGG CTG GTT GGC CAA CCA GCC GGG CGA GGT CGA CCT CGA GG - 3' (SEQ ID NO: 355).
El producto de PCR con extremos romos se subclonó en el sitio SrfI del vector de PCR SCRIPT AMP (Stratagene) para crear PCR SCRIPT AMP-Sp35. Se aisló un fragmento SalI de PCR SCRIPT AMP-Sp35 y se subclonó en el vector PCRCAMP Ig (derivado del vector de Stratagene PCR SCRIPT AMP). En el vector PCRCAMP Ig, la secuencia bisagra y Fc gamma se subclona como un fragmento SalI(5') a NotI(3'). El fragmento SalI Sp35 se subclonó en el sitio SalI del vector PCRCAMP Ig fusionando de esta manera la secuencia señal de Sp35 y el dominio extracelular (codones 1-532) en marco con las secuencias que codifican la región bisagra y Fc de Ig1 humana. Los aislados correctos se identificaron y un fragmento NotI que engloba el fragmento Sp35 Fc se subclonó en el único sitio de clonación NotI del vector de expresión CHO, PV90 (Biogen Idec). El plásmido resultante se confirmó por secuenciación de ADN y se designó GT123.
Se generaron líneas celulares estables que expresan la proteína de fusión Sp35-Fc por electroporación de células huésped CHO DG44 con el plásmido GT123. Las células CHO transfectadas se cultivaron en MEM alpha minus en presencia de 10% suero dializado y 4 mM glutamina para seleccionar el crecimiento independiente de nucleósido. Catorce días después de la transfección, las células se alimentaron con medio fresco. Para cribar para células que expresan Sp35-Fc, las células CHO se marcaron con anti-IgG humana de cabra marcada con ficoeritrina (PE) (Jackson Labs) y se sometieron a separación por citometría con flujo de alta velocidad en un FACS Mo-Flo (Cytomation). Se seleccionaron las células que expresaban los niveles más altos de Sp35-Fc. Estas células se expandieron en cultivo durante 7 días, se volvieron a marcar y se volvieron a separar. Las células que expresaban los niveles más altos de Sp35-Fc se aislaron como clones individuales en placas de 96 pocillos. Estos clones se crecieron durante dos semanas y se alimentaron con medio fresco un día antes del análisis FACS para comprobar los niveles de expresión. Los clones que expresaban los niveles más altos de Sp35-Fc se expandieron y se establecieron bancos celulares congelados. Las líneas celulares se adaptaron para crecer en cultivo en suspensión en el medio sin suero BCM16. La titulación de Sp35-Fc producido por estos clones se determinó creciendo líneas celulares a 370C durante 4-5 propagaciones, creciendo las células hasta 50% la densidad celular máxima y cultivándolas durante 10-15 días a 280C hasta que la densidad de las células viables cayó hasta 75%. En este momento, el medio de cultivo se recogió, se aclaró de células y restos celulares por centrifugación y los sobrenadantes de los cultivos se titularon para niveles de Sp35-Fc por análisis por transferencia Western usando un anticuerpo anti-Ig humana (Jackson Lab) como sonda.
La proteína de fusión Sp35-Fc se purificó del medio de cultivo aclarado como sigue: se añadieron 9 ml de 1M HEPES pH 7,5 a 900 ml de medio condicionado. El medio de cargó por lotes durante 3 hr a 40C en 3 ml de Proteína A Sefarosa (Amersham Bioscience). La resina se recogió en una columna de 1,5 cm (D.I.) y se lavó cuatro veces con 3 ml de PBS, dos veces con 4 ml de PBS que contenía 800 mM NaCl, y de nuevo con 3 ml de PBS. La Sp35-Fc se eluyó de la columna con 25 mM NaH2PO4, pH 2,8 y 100 mM NaCl en fracciones de 1,5 ml y se neutralizó añadiendo 75 μl de 0,5 M NaH2PO4, pH 8,6. Las fracciones que contenían los picos de proteína se identificaron por absorbancia a 280 nm, se combinaron y se sometieron a purificación adicional en una columna de Proteína A de 1 mL. Antes de la carga, se añadió NaCl a 600 mM y HEPES, pH 7,5 a 50 mM. La columna se lavó dos veces con 600 μl de 10 mM HEPES pH 7,5 y 1 M NaCl y con 1 ml PBS. Sp35-Fc se eluyó de la columna con 25 mM NaH2PO4, pH 2,8 y 100 mM NaCl, recogiendo fracciones de 0,5 mL y neutralizando por la adición de 25 μl de 0,5 M NaH2PO4, pH 8,6. Las fracciones que contenían los picos de proteína se identificaron por absorbancia a 280 nm y se combinaron. Mediante SDS-PAGE reductora, la proteína Sp35-Fc migró como una banda única (>95% pura) con una masa aparente de 90 kDa. En condiciones no reductoras, la proteína corrió como un dímero con una masa aproximada de 180 kDa. La proteína Sp35-Fc purificada se alicuotó y almacenó a -700C.
Ejemplo 3
Producción de anticuerpos monoclonales específicos de Sp35
Los anticuerpos anti-Sp35 que se unen específicamente a un polipéptido Sp35 se prepararon usando los métodos y procedimientos siguientes.
A. Ensayos de cribado de anticuerpos
1. Ensayo ELISA
Se añadió Sp35-Fc (0,5 μg en 50 μl de 0,1 M tampón bicarbonato de sodio, pH 9,0) a cada pocillo de placas de 96 pocillos MaxiSorp™ (Nunc™). Las placas se incubaron a 370C durante 1 hora ó 40C durante 16 horas. Los sitios de unión no específica en las placas se bloquearon usando 25 mM HEPES, pH 7,4 que contenía 0,1% BSA, 0,1% ovoalbúmina, 0,1% (5% p/v) leche desnatada seca en 150 mM NACE) y 0,001% azida. Se añadieron diluciones de suero
o sobrenadantes de hibridoma (por ejemplo, diluciones seriadas de tres veces) a lo largo de cada fila de la placa y se incubó a 250C durante 1 hora. Después de lavar tres veces con PBS, se añadieron 50 μl de una dilución 1:10.000 de anticuerpo secundario anti-ratón de cabra conjugado con peroxidasa de rábano (Jackson ImmunoResearch Inc.) a cada pocillo y se incubó adicionalmente durante 1 hora. Después de tres lavados, se desarrolló color mediante TMB (Pierce) y se paró con 2 M ácido sulfúrico. La intensidad del color se monitorizó en un espectrofotómetro a 450 nm.
2. Ensayo FACS
Se marcaron células COS-7 o células CHO con 0,1 μM CellTracker™ Green CMFDA (Molecular Probes, Eugene, OR) como describe el proveedor. Se mezclaron volúmenes iguales de células control marcadas con CellTracker™ con células Sp35-COS-7 o células Sp35-CHO lavadas (producidas por la transfección temporal de vector de expresión Sp35) antes de incubar con suero de ensayo o sobrenadantes de hibridoma anti-Sp35. Cincuenta microlitros de la mezcla celular se dispensaron en cada pocillo de una placa de poliestireno de 96 pocillos con fondo en V (Costar® 3877, Corning, NY) y se añadieron 100 μl de suero de ratón, sobrenadante de hibridoma o un anticuerpo anti-Sp35 control. Después de incubar a 40C durante 30 minutos, las células se lavaron y se incubaron con 50 μl de anticuerpo secundario específico anti-Fc gamma de IgG de ratón de cabra fragmento (F(ab')2 purificado por afinidad conjugado con ficoeritrina (1:200, Jackson ImmunoResearch Laboratory, West Grove, PA) en PBS. Al final de la incubación, las células se lavaron dos veces con PBS y se suspendieron en 200 μl de PBS que contenía 1% suero fetal bovino (FBS) y se sometieron a análisis FACS. Alternativamente, se mezclaron células Sp35-COS-7 o células Sp35-CHO con suero de ratón o sobrenadante de hibridoma y se trataron con anticuerpo secundario anti-ratón de cabra conjugado con R-ficoeritrina y se sometieron directamente a análisis FACS estándar.
B. Producción a partir de hibridomas de anticuerpos monoclonales murinos anti-Sp35
Se inmunizaron ratones hembra RBF de ocho semanas de edad (Jackson Labs, Bar Harbor, ME) intraperitonealmente con una emulsión que contenía 50 μg Sp35-Fc (aminoácidos 34 a 532 de SEQ ID NO: 2 fusionados a la región bisagra y Fc de IgG1 humana), producido como se ha descrito en el Ejemplo 2 o se inmunizaron intraperitonealmente con una emulsión que contenía 50 μg de Sp35-Fc humano y 50 μl de adyuvante completo de Freund (Sigma® Chemical Co., St. Louis, MO) una vez cada dos semanas. Los sueros de los ratones inmunizados se recogieron antes de la primera inmunización y 1 semana después de la segunda y tercera inmunizaciones y las titulaciones del anticuerpo anti-Sp35 se midieron por ensayo FACS en células COS-7 que expresaban Sp35 como se ha descrito anteriormente. Se proporcionó una dosis final de refuerzo después de la tercera inmunización y tres días antes de cuando se iniciaron las fusiones de hibridomas.
Los sueros de ratones inmunizados con los diferentes péptidos Sp35 se cribaron por ELISA como se ha descrito anteriormente. Los ratones que fueron positivos para los anticuerpos que se unieron específicamente a células COS-7 que expresaban Sp35 se identificaron por citometría de flujo (FACS) como se ha descrito anteriormente y se sacrificaron. Se aislaron los esplenocitos de los ratones y se fusionaron con el mieloma FL653 (un derivado APRT de un mieloma de ratón Balb/c Ig-/HGPRT-, mantenido en DMEM que contenía 10% FBS, 4.500 mg/mL glucosa, 4 mM L-glutamina y 20 mg/ml 8-azaguanina) como se describe en Monoclonal Antibodies. Hybridomas: A New Dimension in Biological Analyses, ed. Kennett, R.H., McKearn, T.J. y Bechtol, K.B. Nueva York: Plenum Press (1982). Las células fusionadas se plaquearon en placas de 24 ó 48 pocillos (Corning Glass Works, Corning, NY) y se alimentaron con medio de cultivo que contenía adenina, aminopterina y timidina (AAT, disponible en Sigma® Chemical Co., St. Louis, MO). Los cultivos resistentes a AAT se cribaron por ELISA o citometría de flujo como se ha descrito anteriormente para unión a células Sp35-COS-7 o a Sp35-Fc. Los hibridomas positivos se subclonaron adicionalmente por dilución limitante.
Se aislaron diecisiete líneas celulares de hibridoma que producían anticuerpos monoclonales producidos a partir de ratones inmunizados con Sp35-Fc. Las propiedades de los anticuerpos monoclonales derivados de los hibridomas se muestran en las Tablas 3A y 3B.
Los polinucleótidos que codifican los dominios variables (VH y VL) de los anticuerpos monoclonales 1A7, 2F3, 3P1D10.2C3 y 3P1E11.3B7 se aislaron por PCR, se clonaron y se sometieron a análisis de secuencia por el método siguiente. Se extrajo el ARN total de células de hibridoma usando el mini kit RNeasy® de Qiagen® y se generó ADNc a partir del ARN aislado por RT PCR, usando condiciones estándar. Se usó una mezcla de cebadores para la RT-PCR. Un conjunto preferido de cebadores incluyó un cebador con el 5' del cebador que hibrida con la secuencia señal y el extremo 3' del cebador que hibrida con el dominio constante 3' de la unión FR4/dominio constante. Esto permite la amplificación de un dominio variable intacto sin ambigüedades acerca del extremo N y la unión V/C del anticuerpo monoclonal. Un experto en la técnica reconocerá los conjuntos de cebadores que se necesitan modificar para amplificar diferentes moldes y para diferentes condiciones de PCR. Ocasionalmente, puede producirse la presencia muy abundante de mensajes no productivos (por ejemplo, la cadena ligera no productiva con marco modificado CDR3-FR4 de la pareja de fusión) o mensajes productivos no específicos y complica la clonación de las cadenas variables. Una solución es usar datos de secuencia N-terminal del anticuerpo auténtico purificado para diseñar un cebador degenerado
para permitir la clonación. Alternativamente, se puede usar cebadores "de marco universal ", tales como los descritos en Orlandi et al, PNAS 86: 3833 (1989), que "fijan" el extremo N y C de los dominios variables (es decir, el extremo N de FR1 y el extremo C de FR4 se determinan por el cebador).
Además, pueden obtenerse datos de la secuencia, para diseñar cebadores más eficaces, a partir de los productos en masa de RT-PCR que se han purificado en gel y secuenciado. El producto de PCR también puede subclonarse usando, por ejemplo, el Kit de Clonación TOPO (Invitrogen) y secuenciarse. Los datos de la secuencia se obtienen a partir de múltiples subclones independientes o fragmentos purificados en gel para establecer firmemente la secuencia consenso.
La secuencia de la cadena ligera de P1E11.3B7 se determinó usando una mezcla de cebadores 5' de la secuencia señal de la cadena ligera kappa murina: (i) 5' GGG GAT ATC CAC CAT GGA TTT TCA GGT GCA GAT TTT CAG 3' (SEQ ID NO: 356), (ii) 5' GGG GAT ATC CAC CAT GRA GTC ACA KAC YCA GGT CTT YRT A 3' (SEQ ID NO: 357), (iii) 5' GGG GAT ATC CAC CAT GAA GTT GCC TGT TAG GCT GTT G 3' (SEQ ID NO: 358) y (iv) 5' GGG GAT ATC CAC CAT GAG GKC CCC WGC TCA GYT YCT KGG A 3' (SEQ ID NO: 359), con un único cebador 3' de dominio constante kappa murino: 5' GCG TCT AGA ACT GGA TGG TGG GAG ATG GA 3' (SEQ ID NO: 4), en los que K= G/T, R= A/G, W= A/T e Y= C/T. El producto de PCR resultante se subclonó y se secuenciaron múltiples subclones independientes. La secuencia consenso deducida fue consistente con los datos de secuenciación por degradación de Edman. La secuenciación indicó que el cebador 5' de la secuencia señal degenerada 5' GGG GAT ATC CAC CAT GRA GTC ACA KAC YCA GGT CTT YRT A 3' (SEQ ID NO: 357) fue el que había rendido el dominio variable de la cadena ligera de 3P1E11.3B7 durante la amplificación.
La secuencia de la cadena pesada de 3P1E11.3B7 se determinó usando una mezcla de cebadores de PCR 5' de la secuencia señal de la cadena pesada murina: (i) 5' GGG GAT ATC CAC CAT GGR ATG SAG CTG KGT MAT SCT CTT 3', (SEQ ID NO: 360) (ii) 5' GGG GAT ATC CAC CAT GRA CTT CGG GYT GAG CTK GGT TTT 3' (SEQ ID NO: 361), y
(iii) 5' GGG GAT ATC CAC CAT GGC TGT CTT GGG GCT GCT CTT CT 3' (SEQ ID NO: 362), con un cebador 3' del dominio constante de IgG CH1 murino degenerado 5' AGG TCT AGA AYC TCC ACA CAC AGG RRC CAG TGG ATA GAC 3' (SEQ ID NO: 363), en los que K= G/T, M= A/C, R= A/G e Y= C/T. La PCR usando esta mezcla de cebadores, con una variedad de diferentes condiciones de ciclación, no rindió una secuencia de dominio variable de la cadena pesada en el que el extremo N deducido fuera consistente con el determinado por la secuencia de degradación de Edman del anticuerpo 3P1E11.3B7 purificado. Por lo tanto, usamos los cebadores universales de cadena pesada: FR1 5' AGG TSM ARC TGC AGS AGT CWG G 3' (SEQ ID NO: 364) y FR4 5' TGA GGA GAC GGT GAC CGT GGT CCC TTG GCC CCA G 3' (SEQ ID NO: 365), en los que M= A/C, R= A/G, S= C/G y W= A/T. Este conjunto rindió un dominio variable de la cadena pesada murina cuya secuencia deducida fue consistente con los datos empíricos de 3P1E11.3B7.
Con el fin de verificar que los extremos N y C del dominio variable de la cadena pesada eran auténticos y no determinados por el cebador, se realizó otra reacción de PCR con un cebador de secuencia señal degenerado 5' ATG GAR TGY AAY TGG ATH CTN CCN TTY A 3' (SEQ ID NO: 366) y el cebador 3' del dominio constante mencionado anteriormente 5' AGG TCT AGA AYC TCC ACA CAC AGG RRC CAG TGG ATA GAC 3' (SEQ ID NO: 367), en los que H= A/C/T, N= A/C/G/T, R= A/G e Y= C/T. El diseño del cebador de la secuencia señal degenerado se basó en secuencias señal de los mejores aciertos derivados de una búsqueda TFASTA de la base de datos de secuencias de roedor Genbank en la que se buscó la secuencia consenso deducida FR1 de 3P1E11.3B7 de la reacción de PCR con el "cebador universal" descrito anteriormente. Esta PCR rindió un producto con un dominio variable de la cadena pesada murino completo.
Los dominios variables murinos de 3P1E11.3B7 completos se usaron (con mutagénesis silenciosa según fue necesario para introducir sitios de restricción) conjuntamente con ADNc de IgG1 humana y dominio constante kappa para construir ADNc quiméricos de cadena pesada y ligera, respectivamente. Los ADNc de inmunoglobulina de longitud completa se subclonaron en un vector de expresión denominado pNE001, un derivado del vector de expresión episomal de células de mamífero EBV comercial, pCEP4. Los vectores de expresión de cadena pesada y ligera (denominados pXW372 y pXW363, respectivamente) se co-transfectaron en células 293-EBNA. Los análisis por transferencia western (probados con reactivos específicos de IgG humana) del medio condicionado de células transfectadas temporalmente confirmaron la expresión de mAb quimérico 3P1E11.3B7-huIgG1, kappa. Las secuencias polipeptídicas VH y VL de 3P1E11.3B7 resultantes se muestran en las Tablas 6 y 8 y son SEQ ID NOs: 173 y 209, respectivamente. Las secuencias de cadena pesada y ligera para los anticuerpos monoclonales 1A7, 2F3 y 3P1D10.2C3 se determinaron mediante métodos similares.
C. Identificación de anticuerpos monoclonales anti-Sp35 por exposición en fagos
Los fragmentos Fab del anticuerpo monoclonal anti-Sp35 se identificaron y aislaron de bibliotecas de exposición en fagos como se describe en Hoet et al., Nat. Biotech. 23: 344-348 (2005); Rauchenberger, et al., J. Biol. Chem. 278: 194205 (2003); y Knappik, et al., J. Mol. Biol. 296: 57-86 (2000).
La biblioteca de exposición en fagos MorphoSys Fab HuCAL® GOLD ("Biblioteca de Exposición en Fagos-2" en la Tabla 3B), que comprende regiones variables de anticuerpo sintético humanizado se cribaron frente a proteína Sp35-Fc soluble humana recombinante por métodos de cribado ELISA e IHC estándar. Véase, por ejemplo, Ostendorp, R., Frisch, C. y Urban, M., "Generation, engineering and production of human antibodies using HuCAL®". Antibodies, Volumen 2 Novel Technologies and Therapeutic Use. Nueva York: Kluwer Academic/Plenum 13-52 (2004). Los fagos Fab que se unieron específicamente a Sp35 se purificaron y caracterizaron. Las propiedades de estos fragmentos Fab de anticuerpo monoclonal derivados de exposición en fagos se muestran en la Tabla 3B como "fragmentos Fab monoclonales derivados de la biblioteca de exposición en fagos-2". El fago Fab 1968 aislado se seleccionó para análisis adicional.
Ejemplo 4
Inmunoprecipitación de Sp35 por anticuerpos monoclonales anti-Sp35
Para realizar la inmunoprecipitación, se produjeron células COS-1 que expresan Sp35, fusionadas a una etiqueta de hemaglutinina (HA) en el extremo N, por transfección temporal de células COS-1 con una construcción de ADN que expresa la proteína Sp35 de longitud completa con una etiqueta HA. Las células se recogieron 48 hr después de la transfección y se lisaron en 1 ml de tampón de lisis (50 mM HEPES, pH 7,5, 150 mM NaCl, 1,5 mM MgCl2, 1 mM EGTA, 1% Tritón X-100 y 10% glicerol) durante 30 min a 40C. Después de centrifugar a 14.000xg durante 15 min, los sobrenadantes se incubaron con lechos de ProteínaA/G-Sefarosa (Santa Cruz) a 40C durante 1 hr y se incubaron a 40C durante 1 hr bien con el anticuerpo monoclonal murino anti-Sp35 1A7 o el 2F3. Los lechos se lavaron 3 veces con tampón de lisis, se hirvieron en tampón de muestra Laemmli, se sometieron a SDS-PAGE 4-20% y se analizaron por transferencia Western usando un anticuerpo que reconoce la etiqueta HA. Como se muestra en el gel SDS-PAGE, los anticuerpos monoclonales 1A7 y 2F3, inmunoprecipitaron Sp35 humano y murino (Fig. 1). Como se muestra en la Fig. 1, el anticuerpo monoclonal 2F3 inmunoprecipitó fuertemente tanto Sp35 humano como murino, mientras que el anticuerpo monoclonal 1A7, que inmunoprecipitó fuertemente Sp35 humano, reconoció la proteína Sp35 murina sólo débilmente. De manera similar, los anticuerpos monoclonales 1G7, 2B10, 2F3, 3P4C2.2D2, 3P4C8.2G9, Li01, Li03, Li05, Li06, Li07, Li08, Li11, Li12, 7P1D5.1G9 y 3B5.2 inmunoprecipitaron Sp35 humano o de ratón o humano y de ratón (Véase la Tabla 3B y 3C). Además, Li08 inmunoprecipita AP-Sp35 y los anticuerpos monoclonales 1B6.4 y 3E3.1 inmunoprecipitan Sp35 endógeno (Véase la Tabla 3B).
Ejemplo 5
El anticuerpo anti-Sp35 se une específicamente a Sp35 determinado por ELISA
Con el fin de determinar qué regiones del polipéptido Sp35 se unían por los diferentes anticuerpos monoclonales derivados de hibridoma y exposición en fagos producidos en el Ejemplo 2, se realizó un ensayo ELISA usando un panel de polipéptidos Sp35 truncados, cada uno fusionado a las regiones bisagra y Fc de IgG1 mediante los métodos descritos en el Ejemplo 1. El panel consistió en los fragmentos de Sp35 siguientes: aminoácidos 34-425 de SEQ ID NO: 2, aminoácidos 417-532 de SEQ ID NO: 2, aminoácidos 417-493 de SEQ ID NO: 2 y aminoácidos 34-532 de SEQ ID NO:
2. Como controles se usaron ovoalbúmina y BSA. Como se muestra en la Tabla 3B, los mAbs derivados de hibridoma 2F3, 2B10, 3A3, 3P4c2.2d2 y 3P4c8.2g9, y los mAbs derivados de fago Fab 3383, 3563, 3564, 3565, 3568, 3569, 3570 y 3582 todos se unieron específicamente a los fragmentos de Sp35 1-417 y 1-534, lo que sugiere que estos anticuerpos se unen a epítopos en la región LRR de Sp35. Los Mabs derivados de hibridoma 1A7, 3P1B11F9, 3P1D10.2C3, 3P1E11.3B7, 3P2C63G10.2H7, 2P2C9.2G4, 3P4A61D9 y 394C51D8 y los Mabs derivados de Fab fago 3495, 3566, 3567 y 1968 se unieron específicamente al fragmento de Sp35 34-532 y se unieron débilmente al 417-532 de Sp35, lo que sugiere que estos anticuerpos se unen probablemente a epítopos que al menos incluyen una parte del extremo C de la región LRR de Sp35. En experimentos similares, estos últimos anticuerpos también se unieron específicamente a un polipéptido Sp35 que consistía en los aminoácidos 34-534 de Sp35 humano y con baja afinidad a Sp35 de ratón y rata. La afinidad de estos últimos anticuerpos para Sp35 de ratón y rata se restauró al nivel observado usando Sp35 humano cuando el aminoácido 419 de Sp35 de ratón o rata se cambia de histidina (H) a arginina (R). La arginina es el aminoácido en la posición 419 en Sp35 humano. Se determinó que la KD para el anticuerpo monoclonal 1A7 es 10 nM (1 x 10-9M) para la unión a Sp35 humano y 20 μM (2 x 10-5 M) para la unión a Sp35 murino. Para ELISA Ap-Sp35 para detectar los anticuerpos unidos a la región 417 a 532, el ELISA se realizó como sigue: Los Mab se recubrieron en placas de ELISA, se incubaron bien con una proteína de fusión Sp35-AP a 40C toda la noche seguido de anti-humano ligado a AP (H+L) (1:5.000, Jackson ImmunoResearch) a RT durante 1 hr, o con AP-proteínas de fusión a 40C toda la noche. El sustrato AP se desarrolló con 10 mg/ml 4NPP en 0,1 M Glicina, 1 mM MgCl2, 1 mM ZnCl2, pH 10,5 y se leyó a D.O. 405.
En experimentos similares, los anticuerpos monoclonales 3B5.2 y 7P1D5.1G9, así como el fragmento Fab del anticuerpo 7P1D5.1G9 se ensayaron en ensayos ELISA para su capacidad de unir Sp35 humano, la región LRR completa de Sp35, la región Ig de Sp35 y Sp35 murino. Como se muestra en la Tabla 3C, 3B5.2, 7P1D5.1G9 y el fragmento Fab de 7P1D5.1G9 se unieron a Sp35 humano y murino. Los anticuerpos monoclonales 3B5.2 y 7P1D5.1G9 también se unieron a la región LRR de Sp35. Véase la Tabla 3C.
En un ensayo de unión de Sp35 con 3B5.5 monoclonal fijado en el fondo de un pocillo de cultivo tisular, los anticuerpos siguientes no bloquearon la unión de 3B5.2 a Sp35: Li03, Li05, Li08, Li011 y el fragmento Fab de Li03.
Ejemplo 6
El anticuerpo anti-Sp35 se une específicamente a Sp35 determinado por FACS
Para caracterizar adicionalmente las propiedades de unión de los mAb anti-Sp35 derivados de hibridoma 1A7 y 2F3 producidos como se describe en el Ejemplo 3, se comparó la unión a células COS-7 ó 293 tanto fijadas como vivas que expresan Sp35 de ratón o humano. Las células transfectadas y no transfectadas con Sp35 se fijaron y se sometieron a análisis FACS (FACS: Las células transfectadas con Sp35 humano o de ratón o vector control se disociaron de las placas de cultivo, se lavaron con 2% FBS/PBS y se incubaron con anticuerpo primario a 1 μg/ml en hielo durante 1 hr. Las células se lavaron 3 veces con 2% FBS/PBS y se incubaron con anticuerpo secundario marcado con PE (1:100, JacksonImmunoResearch) en hielo durante 30 min. Después de 2 lavados con 2% FBS/PBS, las células se fijaron en 2% PFA y se sometieron a análisis FACS por PE). El resultado de FACS mostró que los MAbs 1A7 y 2F3 se unían a células COS-7 y 293 que expresaban Sp35 pero no se unían a las células control sin expresión de Sp35 (Fig. 2).
En experimentos similares, se usaron células CHO transfectadas de manera estable con Sp35 en análisis FACS para caracterizar adicionalmente las propiedades de unión de 3B5.2 y 7P1D5.1G9. Como se muestra en la FIG. 11, 3B5.2 y 7P1D5.1G9 se unieron a Sp35 en células CHO transfectadas. Específicamente, los anticuerpos 3B5.2 y 7P1D5.1G9 se ensayaron para su capacidad de unirse a células CHO transfectadas con, y que expresan, Sp35 humano o murino. Como se muestra en la FIG. 11, el número de células al que se unieron los anticuerpos 3B5.2 y 7P1D5.1G9, según se mide por la fluorescencia media (MCF), incrementó con la concentración de anticuerpos usada. Además, el anticuerpo 3B5.2 se unió a más células según se mide por la fluorescencia media (MCF) que 7P1D5.1G9.
Ejemplo 7
Ensayo de crecimiento de neuritas
Para ensayar la capacidad de los anticuerpos monoclonales derivados de hibridoma y derivados de Fab-fago producidos anteriormente para revertir el efecto inhibidor de los inhibidores de mielina del SNC, por ejemplo, OMgp, en neuronas, se recubrieron portas de cultivo Lab-Tek® (4 pocillos) con 0,1 mg/ml poli-D-lisina (Sigma®). Ap-OMgp (1 μg/mancha) o PBS se distribuyeron como gotas de 3 μl. Los portas Lab-Tek® se lavaron y recubrieron con 10 μg/ml laminina (Gibco™). Se disociaron los ganglios de la raíz dorsal (DRG) de crías de rata Sprague Dawley P6-7 con 1 mg/ml colagenasa tipo 1 (Worthington), se trituraron con pipetas Pasteur pulidas al fuego, se pre-plaquearon para enriquecimiento en células neuronales y finalmente se plaquearon a 10.000 células/pocillo en los portas de cultivo pre-recubiertos Lab-Tek®. Se añadieron diez μg/ml de mAb 1A7 ó 2F3 inmediatamente después de plaquear los DRG. El medio de cultivo fue F12 (disponible en Gibco/Invitrogen) que contenía 5% suero de caballo donante inactivado con calor, 5% suero fetal bovino inactivado con calor y 50 ng/ml factor de crecimiento nervioso de ratón (NGFm) y se incubó a 370C y 5% CO2 durante 6 horas. Después de la incubación, los portas se fijaron en 4% paraformaldehído/20% sacarosa y se tiñeron con anticuerpo anti-βIII-tubulina TUJ1 (Covance) después de 16 horas.
Se añadió a los portas como anticuerpo secundario anti-ratón Alexa-Fluor® 594 (Molecular Probes) diluido 1:300 y se incubó durante 2 horas a temperatura ambiente. Los portas se cubrieron con cubreobjetos con Gel/Mount™ (Biomeda™). Se adquirieron imágenes digitales 5x con software OpenLab™ (Improvision, Inc., Lexington, MA) y las imágenes se analizaron para la cuantificación de crecimiento de neuritas usando software OPENLAB™, todo según los parámetros especificados por el fabricante.
Los dos MAbs, 1A7 y 2F3, protegieron a las neuronas DRG de la inhibición del crecimiento de las neuritas mediada por OMgp (Fig. 3). 3B5.2 también protegió a las neuronas DRG de la inhibición del crecimiento de las neuritas mediada por OMgp (datos no mostrados).
Ejemplo 8
El anticuerpo monoclonal 1A7 estimula la recuperación funcional en el modelo de Lesión de Médula Espinal en la rata
Se indujo lesión en la médula espinal ("SCI") por hemi-sección dorsal como sigue, modificado a partir de los métodos descritos previamente (Li, S. et al., J. Neurosci. 24, 10511-10520 (2004)). Se proporcionó a ratas hembra Long Evans (7 semanas de edad, Charles River) anestesiadas analgesia pre-operatoria (Buprenorfina/Buprenex, 0,05 mg/kg s.c.) y tranquilizantes (Midazolam, 2,5 mg/kg i.p.) y se realizó una hemi-sección dorsal en las vértebras torácicas 6/7 interrumpiendo completamente el tracto dorsomedial principal y corticoespinal dorsolateral (CST). Los componentes dorsal y dorso-lateral del tracto corticoespinal (CST) se interrumpieron completamente y la parte ventral del CST se dejó
intacta. El puente de tejido ventral que permaneció después de la hemi-sección constituía aproximadamente el 20% de la médula en ambos grupos de tratamiento (datos no mostrados).
La función de las extremidades posteriores se cuantificó usando el método de puntuación de campo abierto de Basso- Beattie-Bresnahan (BBB) (Eby, M.T. et al., J. Biol. Chem. 275, 15336-15342 (2000) y todos los animales sufrieron déficits funcionales marcados después de SCI, con una parálisis casi completa de las extremidades posteriores el día posterior a la cirugía. Inmediatamente después de la transección CST, se insertó un catéter intratecal en el espacio subaracnoide en T7 y se conectó a una bomba mini-osmótica cebada (Alzet modelo 2004, Alza Corp) insertada en el espacio subcutáneo. Las bombas mini-osmóticas administraron proteína control de isotipo IgG humana (5 mg/ml) o anticuerpo monoclonal 1A7 (4,8 mg/ml) continuamente a una velocidad de 0,25 μl/h durante 5 semanas. Los animales control (tratados con IgG humana) recuperaron una función sustancial durante las 5 semanas de duración del experimento, pero alcanzaron un plató a las 3-4 semanas, consiguiendo finalmente una puntuación BBB media de 9 ± 0,45 (Fig. 7). Por el contrario, la infusión intratecal continua de 1A7 durante 5 semanas después de la transección de la médula espinal resultó en unas puntuaciones BBB significativamente mejoradas sobre los animales control en las 5 semanas con una mejora continuada de la función en el marco de tiempo de 2-5 semanas, alcanzando una puntuación BBB media de 11,1 ± 0,7 (Fig. 4). Estos resultados demuestran que el tratamiento con el anticuerpo monoclonal anti-Sp35 1A7 estimuló la recuperación de la función después de la lesión en la médula espinal como se demuestra por un incremento en la puntuación BBB, regeneración de axones y menor retracción de axones observadas por tinción inmunohistoquímica de los axones. El anticuerpo 3B5.2 también estimuló la recuperación después de la lesión de la médula espinal (datos no mostrados).
Ejemplo 9
Los anticuerpos anti-Sp35 1A7, 2F3, 3P1D10.2C3, 3P1E11.3B7, 6P4F4.1D3, 6P4F4.1F9, 7P1D5.1G9, Li05, Li06, Li08, Li13, Li28, Li33, D05, D08 y 3B5.2 estimulan la mielinización in vitro
El papel de los anticuerpos anti-Sp35 1A7 y 2F3 en la mielinización se investigó in vitro tratando co-cultivos de neuronas del ganglio de la raíz dorsal (DRG) y oligodendrocitos con los anticuerpos anti-Sp35 1A7 y 2F3 y ensayando para la mielinización por inmunohistoquímica y transferencia Western. Para estos estudios, fue necesario generar en primer lugar cultivos primarios de neuronas DRG y de oligodendrocitos.
Se cultivaron ganglios de la raíz dorsal embrionarios de rata hembra Long Evans E14-E17 como se describe por Plant et al., J. Neurosci. 22: 6083-91 (2002). Los DRG diseccionados se plaquearon en cubreobjetos recubiertos con poli-L-lisina (100 μg/ml) durante 2 semanas. Las células se incubaron en presencia de fluorodesoxiuridina durante los días 2-6 en medio NLA que contenía 1 x B27, 100 ng/ml NGF (Gibco) durante los días 8-11.
Se cultivaron oligodendrocitos de ratas hembra Long Evans en el día 2 post-natal (P2) como se describe por Conn, Meth. Neurosci. 2: 1-4 (Academic Press; 1990) con modificaciones como sigue. Brevemente, se extirpó el prosencéfalo de ratas P2 y se puso en medio HBSS frío (Gibco). Los fragmentos tisulares se cortaron en partes de 1 mm y se incubó a 370C durante 15 min en 0,01% tripsina y 10μg/ml ADNasa. Las células disociadas se plaquearon en frascos de cultivo tisular T75 recubiertos con poli-L-lisina y se crecieron en DMEM con 20% suero bovino fetal a 370C durante 10 días. Los oligodendrocitos positivos para A2B5 se recogieron agitando los frascos toda la noche a 200 rpm a 370C. Los oligodendrocitos A2B5 se cultivaron durante 7 días en DMEM (Gibco) que contenía 25 mM D-glucosa, 4 mM Lglutamina, 1 mM piruvato de sodio, 50 μg/ml apo-transferrina humana, 5 μ/gml insulina pancreática bovina, 30 nM selenato de sodio, 10 nM hidrocortisona, 10 nM D-biotina, 1 mg/ml BSA, 10 ng/ml FGF y PDGF (Peprotech). Las células se recogieron por tripsinización. Las células se co-cultivaron con las neuronas DRG en presencia o ausencia de 1, 3, 10 ó 30 μg/ml de los anticuerpos monoclonales anti Sp35 1A7 ó 2F3, o un anticuerpo control negativo en medio NLA que contenía 2% suero fetal bovino, 50 μg/ml ácido ascórbico, 100 ng/ml NGF (Gibco). Se ha determinado que una dosis eficaz de anticuerpo para administrarse en dicho ensayo está en el intervalo de 0,1 μg/ml a 10 μg/ml, dependiendo del anticuerpo. Un experto en la técnica será capaz de determinar una dosis eficaz usando los ensayos descritos en la presente memoria.
El medio de cultivo se cambió y los diferentes anticuerpos monoclonales se repusieron cada tres días. Después de 30 días a 370C, las células co-cultivadas se tiñeron por tinción inmunohistoquímica ("IHC") para neurofilamentos con anticuerpo anti-βIII-tubulina para identificar axones o anticuerpo anti-MBP para identificar oligodendrocitos (Fig. 4A-E). Las células co-cultivadas también se lisaron y se sometieron a análisis por transferencia Western para cuantificar la MBP (Fig. 4G). Tomando como base los análisis IHC y transferencia Western, las células co-cultivadas tratadas con los anticuerpos anti-Sp35 1A7 y 2F3 mostraron una supervivencia incrementada de oligodendrocitos y neuronas, números incrementados de axones empaquetados y números incrementados de células positivas para MBP (Fig. 4F, 10 veces más células positivas para MBP cuando se compara con co-cultivos tratados con anticuerpo control).
En un experimento similar, se incubaron co-cultivos de oligodendrocitos y DRG en presencia o ausencia de los anticuerpos anti-Sp35 Li05 y Li06 o un anticuerpo control negativo. Las células co-cultivadas se lisaron y se sometieron a
análisis por transferencia Western para cuantificar la MBP (Fig. 8). Tomando como base los análisis por transferencia Western, las células co-cultivadas tratadas con los anticuerpos anti-Sp35 Li05 y Li06 mostraron números incrementados de células positivas para MBP, similares a células co-cultivadas tratadas con 3, 10 y 30 μg de Sp35-Fc (LINGO-1-Fc).
En experimentos similares, se incubaron co-cultivos de oligodendrocitos y DRG en presencia o ausencia de los anticuerpos anti-Sp35 3B5.2, 3P1D10.2C3, 3P1E11.3B7, 6P4F4.1D3, 6P4F4.1F9, 7P1D5.1G9, Li08, Li13, Li28 y Li33 y también estimularon la mielinización. De manera similar, los anticuerpos de longitud completa D05 y D08 también estimularon la mielinización. La dosis eficaz más baja de los anticuerpos 3B5.2 y 7P1D5.1G9 necesaria para estimular la mielinización en el experimento de co-cultivo de DRG fue 0,1 μg/ml.
Además, el fragmento Fab de 7P1D5.1G9 se ensayó en un ensayo similar de mielinización in vitro. El fragmento Fab de 7P1D5.1G9 estimuló la mielinización a una concentración de 1,0 μg/ml.
Estos resultados indicaron que el tratamiento de co-cultivos de DRG-oligodendrocitos con los anticuerpos anti-Sp35 1A7, 2F3, 3P1D10.2C3, 3P1E11.3B7, 6P4F4.1D3, 6P4F4.1F9, 7P1D5.1G9, Li05, Li06, Li08, Li13, Li28, Li33, D05, D08 y 3B5.2 estimuló las interacciones de axones de oligodendrocitos maduros y la mielinización comparado con co-cultivos tratados con anticuerpo control.
Ejemplo 10
Los anticuerpos anti-Sp35 y fragmentos Fab estimulan la supervivencia de oligodendrocitos y mielinización in vivo
Se alimentaron ratones macho adultos C57B1/6 de tipo salvaje con cuprizona (0,2% molido con pienso de ratón picado en peso) durante 6 semanas para inducir la desmielinización en el cuerpo calloso según el método descrito por Morell P et al., Mol Cell Nuerosci. 12: 220-7 (1998). Brevemente, el anticuerpo monoclonal anti-Sp35 1A7 se inyectó estereotácticamente en el cuerpo calloso desmielinizante en las semanas 2, 2,5 y 3 semanas de alimentación con cuprizona, por el método descrito más adelante. A los ratones control se les inyectó estereotácticamente en los mismos intervalos medio esterilizado que contenía anticuerpo control. Después de que las 6 semanas de alimentación con cuprizona se hubieron completado, los ratones volvieron a la dieta normal durante 2, 4 y 6 semanas (sólo pienso de ratón picado) para permitir la remielinización.
Los anticuerpos monoclonales 1A7 y control se administraron como sigue. Los ratones tratados con cuprizona se anestesiaron con ketamina (80 mg/kg de peso corporal) y xilazina (10 mg/kg de peso corporal) y se pusieron en un aparato de inmovilización diseñado para cirugía estereotáctica (David Kopf Instruments). Se abrió el cuero cabelludo y se inyectaron los compuestos estériles (1 μM en 1 ml de HBSS) unilateralmente en el cuerpo calloso fuertemente desmielinizado del ratón receptor de tipo salvaje con una jeringa Hamilton de 10 μl usando coordenadas estereotácticas de 0,7 mm posterior y 0,3 mm lateral al bregma a una profundidad de 1,7 mm (Messier et al., Pharmacol. Biochem. Behav. 63: 313-18 (1999)). A los ratones receptores control adicionales se les inyectó estereotácticamente HBSS que no contenía compuestos. La apertura en el cráneo se rellenó con Gelfoam y el área se frotó con penicilina y estreptomicina (Gibco) y la herida se suturó. Los ratones se sacrificaron cada semana del experimento después de la inyección y sus cerebros se extrajeron y procesaron para análisis molecular, bioquímico e histológico.
Los animales que recibieron tratamiento con el anticuerpo anti-Sp35 1A7 mostraron una supervivencia incrementada de oligodendrocitos maduros (basado en tinción de anticuerpos CC1, Fig. 5A) y mielinización de axones por IHC usando anticuerpo anti-proteína MBP o luxol fast blue (Fig 5B). Los oligodendrocitos positivos para el anticuerpo CC1 se cuantificaron a las cuatro semanas y 6 semanas (Fig. 5C). Estos resultados indicaron que el tratamiento con el anticuerpo anti-Sp35 1A7 estimuló la supervivencia de oligodendrocitos maduros y la mielinización de axones comparado con ratones tratados con anticuerpo control. De manera similar, los animales que recibieron el anticuerpo 1A7 ó 1 μg/ml del fragmento Fab de 7P1D5.1G9 en un modelo de lisolecitina de desmielinización también estimularon la mielinización de axones comparado con los animales control.
Ejemplo 11
El anticuerpo anti-Sp35 1A7 estimula la supervivencia de células del ganglio retinal (RGC) en el modelo de transección del nervio óptico
El anticuerpo anti-Sp35 1A7 se ensayó en un modelo de transección del nervio óptico, que investiga factores que afectan la función neuronal. Se usaron en este estudio ratas hembras adultas jóvenes Sprague Dawley (SD). El nervio óptico derecho de cada animal se transeccionó intraorbitalmente 1,5 mm desde el disco óptico. Se aplicó una pieza de gelfoam empapada con 6% Fluoro-Gold (FG) al sitio recién transeccionado justo detrás del disco óptico para marcar las células del ganglio retinal (RGC) supervivientes. Los animales se dividieron en tres grupos (n= 6 en cada grupo) que recibieron bien el anticuerpo anti-Sp35 1A7, anticuerpo control o sólo PBS, por inyección intravítrea. El volumen de cada inyección
intravítrea fue 4 μl mientras que la dosificación de cada inyección fue 2 μg. Las inyecciones intravítreas se realizaron inmediatamente después de la transección del nervio óptico.
Se permitió que todos los animales sobrevivieran durante 1 semana. Dos días antes de sacrificar a los animales, el nervio óptico izquierdo de cada animal se transeccionó y se administró 6% FG como se ha descrito anteriormente para marcar las RGC supervivientes, para que sirva como el control interno. Los animales se sacrificaron con una sobredosis de Nembutal y las retinas se diseccionaron en 4% paraformaldehído. Se hicieron cuatro cortes radiales para dividir las retinas en cuatro cuadrantes (superior, inferior, nasal y temporal). Las retinas se fijaron posteriormente en el mismo fijador durante 1 hora antes de montarlas horizontalmente con medio de montaje (Dako). Los portaobjetos se examinaron en un microscopio de fluorescencia usando un filtro ultravioleta (longitud de onda de excitación= 330-380 nm). Las RGC marcadas se contaron a lo largo de la línea media de cada cuadrante empezando desde el disco óptico hasta el borde periférico de la retina a intervalos de 500 μm, bajo una cuadrícula ocular de 200 X 200 μm2. El porcentaje de RGC supervivientes que resultó de cada tratamiento se expresó comparando el número de RGC supervivientes en los ojos lesionados con sus ojos contra-laterales. Todos los datos se expresaron como media ± SEM. La significancia estadística se evaluó por ANOVA de una vía, seguido de un ensayo post hoc de Tukey-Kramer. Las diferencias se consideraron significativas para p<0,05. Los animales tratados con el anticuerpo anti-Sp35 1A7 mostraron más supervivencia neuronal (80%) cuando se comparan con los animales tratados con el anticuerpo control o PBS, mostrando cada uno sólo aproximadamente 50% de supervivencia neuronal (Fig. 6).
Ejemplo 12
Ensayo de los anticuerpos anti-Sp35 para remielinización en el modelo de aplastamiento del nervio óptico
El nervio óptico derecho recibe aplastamiento completo con forceps #5 durante 10 segundos alrededor de 1,5 mm por detrás del globo ocular intraorbitalmente justo antes de la administración de 2 μl del anticuerpo monoclonal 1A7, 2F3, Li05 y Li06 en 2 ml por inyección intravítrea.
Los animales reciben una segunda inyección intravítrea del mismo tratamiento una semana después de la cirugía. Dos semanas después de la cirugía, los animales se perfunden con fijadores EM, se fijan posteriormente y se procesan para secciones semidelgada y ultradelgada. Las secciones longitudinales del nervio óptico se tiñen y se preparan para observación de mielina. La mielinización de las partes próxima y distal del nervio óptico aplastado se comparan entre los diferentes grupos de tratamiento. Los animales tratados con Sp35-Fc y 1A7, 2F3, Li05 y Li06, así como los controles apropiados, se analizarán para remielinización en la parte distal del nervio óptico comparado con los controles.
Ejemplo 13
Ensayo de los anticuerpos anti-Sp35 para regeneración de axones en el modelo de aplastamiento del nervio óptico
El nervio óptico derecho se aplastó con forceps #5 durante 10 segundos alrededor de 1,5-2 mm por detrás del globo ocular intraorbitalmente justo antes de la administración de 2 μg del anticuerpo monoclonal 1A7 en PBS mediante inyección intravítrea. Se ensayaron 4 ratas con el anticuerpo 1A7 y se usaron 8 ratas como animales control. Los animales recibieron una segunda inyección intravítrea del mismo tratamiento una semana después de la cirugía. Tres días antes del sacrificio de los animales de ensayo (día 11 del experimento), se inyectaron intravítreamente 2 ml de CTB-FITC para marcar, anterógrado, los axones del nervio óptico regenerativos. En el día 14 después de la cirugía, los animales se perfundieron y fijaron posteriormente. El nervio óptico aplastado se procesó para secciones longitudinales congeladas. Los axones marcados con CTB-FITC, que cruzan el sitio de la lesión, se contaron como fibras regenerativas a varias distancias más allá del sitio de aplastamiento. Cuando 1A7 se inyectó en el ojo, la regeneración de los axones se observó hasta 250 μm más allá del sitio de aplastamiento. Véase la Fig. 10.
Ejemplo 14
Los anticuerpos anti-Sp35 estimulan la remielinización y reparación en el nervio óptico usando el modelo EAE inducido por MOG en rata
Para estos experimentos, se usó el modelo de Encefalomielitis Autoinmune Experimental (EAE) inducida por Glicoproteína Mielínica de Oligodendrocitos (MOG) en rata. Éste es el modelo animal para la esclerosis múltiple humana. Se emulsionaron 50 μl de 200 ng de adyuvante completo de Freund (Chondrex Inc.) más 50 μl de 50 μg MOG en disolución salina (1:1) y se mantuvo en hielo antes de inyectarlo intradérmicamente en la base de la cola de cada animal. Para todos los experimentos se usaron ratas hembra marrones Norway, de 8-10 semanas de edad. La observación general en la técnica indica que el modelo de EAE se induce aproximadamente 15 días después de la inyección de MOG. Las ratas se puntuaron para signos clínicos de EAE. Los signos se puntuaron como sigue: grado 0,5, paresia distal de la cola; grado 1, parálisis completa de la cola; grado 1,5, paresia de la cola y paresia leve de la pata trasera; grado 2,0, paresia unilateral grave de la pata trasera; grado 2,5, paresia bilateral grave de la extremidad posterior; grado
3,0, parálisis bilateral completa de la extremidad posterior; grado 3,5, parálisis bilateral completa de la extremidad posterior y paresia de una extremidad anterior; parálisis de grado completo (tetraplejia), estado moribundo o muerte. Los animales reciben tratamiento una vez que se induce el modelo de EAE.
Se inyectaron intravítreamente 2 μg/μl de anticuerpo anti-Sp35 (1A7) en el día 15 después de la inducción de EAE por MOG. Se inyectaron 2 μg/μl del anticuerpo anti-Sp35, 1A7, dos veces adicionales en el día 22 y día 28. Después de la finalización del experimento, los animales se perfundieron con 4% PFA. Los nervios ópticos se fijaron posteriormente en 1% OsO4, se deshidrataron y se incluyeron en Epon. Se cortaron secciones semidelgadas (1 μM) y se tiñeron con azul de Toluidina para evaluación de mielinización. Los nervios ópticos de los animales tratados se compararon con los animales no tratados para regeneración de axones y remielinización en el nervio óptico. Todos los procedimientos se realizaron siguiendo un protocolo aprobado por el comité institucional para el cuidado y uso de animales (IACUC).
Los animales que reciben tratamiento con el anticuerpo anti-Sp35 1A7 mostraron remielinización y reparación del nervio óptico comparado con los nervios ópticos normales o animales que se sometieron a EAE inducida por MOG, pero que no recibieron tratamiento (Fig. 9). En la Fig. 9C, las flechas apuntan a los exones mielinizados. Los animales que reciben un anticuerpo que reconoce el dominio III de la Proteína G de Streptococcus (MOPC21), no específico para Sp35, no mostraron signos de remielinización o reparación del nervio óptico comparado con los nervios ópticos normales o los nervios ópticos de los animales no tratados (datos no mostrados). El anticuerpo antagonista de Sp35 1A7 estimuló la remielinización y reparación de los nervios ópticos en un modelo de neuritis óptica de EAE inducida por MOG en rata (Fig. 9).
Ejemplo 15
Ensayo de los anticuerpos anti-Sp35 para estimulación de la remielinización del SNC usando el modelo de EAE inducida por MOG en ratón
La EAE se induce en la cepa de ratón mixta 129B6 por inmunización intradérmica (día 0) con 100 μg de proteína MOG1125 emulsionada con adyuvante completo de Freund (CFA). El volumen inyectado es 100 μl por ratón y se distribuye en 3 sitios (pabellón auricular, espalda y piel). La emulsión se prepara en la base de una proporción de volumen 1:1 y contiene 1 mg/ml MOG1-125 y 2 mg/ml M. tuberculosis (cepa H37Ra, Chondrex). Se administra intraperitonealmente toxina pertussis (200 ng/ratón) en el momento de la inmunización y 2 días posteriormente. El peso corporal y las puntuaciones clínicas de EAE (0= sin signos clínicos; 1= cola fláccida; 2= debilidad en las extremidades posteriores, reflejo de enderezamiento alterado o marcha inestable; 3= parálisis completa de las extremidades posteriores o reflejo de enderezamiento ausente; 4= parálisis completa de las extremidades posteriores con algún grado de implicación de las extremidades anteriores; 5= animal totalmente paralizado; 6= moribundo o muerto) se registran diariamente. Todos los procedimientos se realizan siguiendo un protocolo aprobado por nuestro comité institucional para el cuidado y uso de animales (IACUC). Los animales reciben el tratamiento con los anticuerpos monoclonales 1A7, 2F3, Li05 y Li06 o anticuerpo control en el día 0 del estudio. Se toman muestras de sangre a diferentes tiempos a lo largo de los experimentos por la técnica de sangrado retro-orbital. El plasma se separa de PBMC por centrifugación y se realiza el fenotipado celular por tinción FACS. El perfilado de la respuesta humoral de anticuerpo anti-MOG se realiza por ELISA usando mAbs específicos de subclase/isotipo (Pharmingen). Al final de cada experimento, se recogen el cerebro, médula espinal, nervios ópticos y nervios ciáticos después de la perfusión.
Este mismo protocolo se usa para inducir la EAE en ratones con Sp35 inactivado y compañeros de camada. Los ratones con Sp35 inactivado muestran típicamente una puntuación EAE menor (1,5) y sin recaída comparado con el control (durante un periodo de 45 días), después compañeros de camada de tipo salvaje (puntuación EAE 3,5).
Los animales tratados con Sp35-Fc y 1A7, 2F3 se analizarán para remielinización comparando con el control.
La proteína MOG1-125 etiquetada con His se expresó en Pichia pastoris usando un promotor TetO-AOX1 inducible por Doxiciclina (M. Levesque, D. Krushinskie y K. Strauch, manuscrito en preparación). La secuencia codificadora extracelular (Gly1 a Gly125 de la proteína madura después de la eliminación de la secuencia señal) de MOG de rata se amplificó por PCR usando los cebadores siguientes: 5' GGGGTATCTCTCGAGAAAAGAGAGCATCATCATCATCATCATATGGGACAGTTCAGAGTGATAGGG 3' (SEQ ID NO: 368) y 5' TTCGCGGCCGCTATTAGCCAGGGTTGATCCAGTAGAAGGG 3' (SEQ ID NO: 369).
Ejemplo 16
Construcción de la Variante de 3B5.2
Lo siguiente es la secuencia de aminoácidos para la cadena ligera variable (VL) del anticuerpo 3B5.2, las CDR están subrayadas y el sitio de glicosilación ligado a N está en negrita y con subrayado doble: QIVLTQSPAI MSASPGEKVT MTCSASSRVS YVHWYQQKSG TSPKRWLYDT SNLASGVPAR FGGNGSGTSY SLTISSMEAE DAATYYCQQW
STNPPTFGGG TKLEIK (SEQ ID NO: 417). Para determinar si la expresión del anticuerpo 3B5.2 y/o la unión del anticuerpo a Sp35 estaba afectada por la eliminación del sitio de glicosilación, se construyó una variante de 3B5.2. Específicamente, las posiciones Kabat 63-68 en FR3 se mutaron a la secuencia de cadena ligera kappa consenso humana y murina SGSGSG (SEQ ID NO: 418). La cadena ligera variable de 3B5.2 mutante resultante es como sigue, los aminoácidos mutados están en negrita y con doble subrayado: QIVLTQSPAI MSASPGEKVT MTCSASSRVS YVHWYQQKSG TSPKRWLYDT SNLASGVPAR FSGSGSGTSY SLTISSMEAE DAATYYCQQW STNPPTFGGG TKLEIK (SEQ ID NO: 419).
La capacidad tanto del anticuerpo 3B5.2 como del anticuerpo 3B5.2 variante para unirse a la proteína Sp35 fueron las mismas cuando se ensayaron. Además, tomando como base los datos de movilidad electroforética, parece que la cadena ligera variable de 3B5.2 está glicosilada, mientras que la cadena ligera variante no. Finalmente, los niveles de expresión de ambos anticuerpos en células transfectadas fueron los mismos.
Ejemplo 17
Construcción de anticuerpo 1A7 humanizado
Secuencias de cadenas ligera y pesada de 1A7
Cadena ligera:
Cadena pesada:
En negrita subrayado: residuos de CDR de Kabat
En cursiva subrayado: residuos de CDR Chotia
La numeración es según el esquema de Kabat
Análisis de las regiones variables murinas
Las regiones determinantes de la complementariedad (CDR) contienen los residuos que más probablemente se unen al antígeno y deben retenerse en el anticuerpo remodelado. Las CDR se definen por secuencia según Kabar et al (1991) Sequences of Proteins of Immunological Interest. 5ª Edición, U.S. Dept. Health and Human Services. U.S. Govt. Printing Office. Las CDR se encuentran en clases canónicas (Chothia, C., Lesk, A.M., Tramontano, A., Levitt, M., Smith-Gill, S.J., Air, G., Sheriff, S., Padlan, E.A., Davies, D., Tulip, W.R., Colman, P.M., Spinelli, S., Alzari, P.M. y Poljak, R.J. (1989) Nature 342: 877-883) en los que los residuos clave determinan en gran medida la conformación estructural del bucle CDR. Estos residuos se retienen casi siempre en el anticuerpo remodelado. Las CDR de la cadena pesada y ligera se clasificaron en clases canónicas como sigue:
Cadena ligera: Cadena pesada:
L1: 10 residuos Clase 1 H1: 5 residuos Clase 1
L2: 7 residuos Clase 1 H2: 17 residuos Clase 2 L3: 9 residuos Clase 1 H3: 7 residuos No clase canónica Los residuos canónicos importantes para estas clases de CDR se indican en la Tabla 10. Tabla 10
5 L1 Clase 1 2(I) 25(A) 30(V) 33(M) 71(Y) L2 Clase 1 48(I) 51(T) 52(S) 64(G) L3 Clase 1 90 (Q) 95(P) H1 Clase 1 24(A), 26(G), 27(F), 29(F), 34(M), 94(R) H2 Clase 2 52a(T) 55(G) 71(L)
10 H3 No clase canónica Las cadenas variables ligera y pesada se compararon con las secuencias consenso (Kabat et al, 1991) y de línea germinal (Brensing-Kuppers J, Zocher I, Thiebe R, Zachau HG. (1997). Gene. 191(2): 173-81 y Matsuda F, Ishii K, Bourvagnet P, Kuma K, Hayashida H, Miyata T, Honjo T. (1998) J Exp Med. 188(11): 2151-62) para subgrupos murino y humano usando el programa BLAST y bases de datos de secuencias de proteínas blast consenso y de línea germinal 15 compiladas internamente. La cadena ligera variable es un miembro del subgrupo murino Kappa 6 con un 94% de identidad en una superposición de 109 aminoácidos y originada a partir de la línea germinal murina kk4 (100% ID) (Véase más adelante)
La cadena pesada variable es un miembro del subgrupo murino HVMS con un 55% de identidad en superposición de 20 132 aminoácidos y originada a partir de la línea germinal murina VGK6 (92% ID) (Véase más adelante)
La cadena ligera variable corresponde al subgrupo humano Kappa 3 con un 67% de identidad en superposición de 109 aminoácidos y es la más cercana a la línea germinal humana L6 (64% ID) (Véase más adelante)
La cadena pesada variable corresponde al subgrupo humano MHV1 con un 59% de identidad en superposición de 129 aa y es la más cercana a la línea germinal humana huVH7-81 (70% ID) (Véase más adelante)
Modelado de la estructura de las regiones variables
Para esta humanización construimos el modelo de las regiones variables P1A7 tomando como base las estructuras de cristal de los anticuerpos OKT3 (PDB ID 1SY6 - usado para el modelado de la cadena ligera) y TE33 (PDB ID 1TET. usado para el modelado de la cadena pesada).
Análisis de las regiones variables remodeladas
Intentamos encontrar las secuencias de anticuerpo expresadas humanas más similares, que no necesitan ser retromutadas en las posiciones (L4,38,43,44,58,62,65-69,73,85,98 y H2,4,36,39,43,45,69,70,74,92) (véase, por ejemplo, la Patente U.S. No. 6.407.213) y usarlas como los marcos de anticuerpo. Usamos la base de datos de secuencias de anticuerpo verificada internamente y herramientas de búsqueda para identificar moldes adecuados que tienen la mayor similitud con las secuencias P1A7 murinas en residuos de la zona canónica, interfase y recubrimiento para minimizar el número de retromutaciones. Las secuencias de línea germinal completadas con residuos consenso en la región FR4 se consideraron separadamente. Después de haber considerado múltiples marcos, las secuencias de línea germinal huL6 y VH7-81 se seleccionaron como marcos aceptores para cadenas pesada y ligera respectivamente.
Se han diseñado tres versiones de la cadena ligera variable remodelada y tres versiones de la cadena pesada variable remodelada. La primera versión contiene el menor número de retromutaciones y la tercera versión contiene el mayor número (es decir, la menos "humanizada").
Retromutaciones en VL remodelada
huL6 E1Q Q1 apunta hacia el antígeno y el cambio de carga puede alterar la unión. Presente en la versión 2 y 3. L46R R46 es un residuo inusual en la interfase VH/VL que soporta CDR-L1 y CDR-H3. Presente en todas las versiones. L47W - W47 está localizado en una agrupación por debajo de CDR-L2. Presente sólo en la versión 3. I58V - V58 está localizado en una agrupación por debajo de CDR-L2. Presente sólo en la versión 3. F71Y -Y71 es un residuo canónico importante para soportar CDR-L1 y CDR-L3. Presente en todas las versiones.
Retromutaciones en VH remodelada
huVH7-81
P38K K38 soporta CDR-H2. Presente en las versiones 2 y 3. E46K K46 soporta CDR-H2. Presente en las versiones 2 y 3 M71L L71 es un residuo canónico que soporta CDR-H1. Presente en todas las versiones A78V V78 está hipermutado de la línea germinal A y soporta CDR-H1
5 I82F F82 es un residuo de empaquetamiento de núcleo. Presente sólo en la versión 3 Y91F F91 es un residuo en la interfase VH/VL. Presente sólo en la versión 3
Diseños de humanización para P1A7
Marco tomado de las secuencias: Cadena ligera: huL6
10 Cadena pesada: huVH7-81 Las retromutaciones están en minúscula fuente negrita Las CDR están subrayadas > Variante 1 de cadena ligera
15 > Variante 2 de cadena ligera
> Variante 3 de cadena ligera
> Variante 1 pesada
> Variante 2 pesada
> Variante 3 pesada
Secuencia de longitud completa de polipéptido y polinucleótido de cadena pesada para la variante 2 pesada Secuencia de ADN de la cadena pesada huP1A7-IgG1 H2 (pXW465)
Secuencia de proteína predicha de la cadena pesada huP1A7 H2 (la secuencia señal está subrayada)
Secuencia de longitud completa de polipéptido y polinucleótido de cadena pesada para la variante 1 ligera Secuencia de ADN de la cadena ligera kappa huP1A7 L1 (pXW480)
Secuencia de proteína predicha de la cadena ligera huP1A7 L1 (la secuencia señal está subrayada)
Secuencia de longitud completa de polipéptido y polinucleótido de cadena pesada para la variante 2 ligera Secuencia de ADN de la cadena ligera kappa huP1A7 L2 (pXW476)
Secuencia de proteína predicha de la cadena ligera huP1A7 L2 (la secuencia señal está subrayada)
La secuencia de polipéptido y polinucleótido de cadena pesada y ligera de un anticuerpo quimérico murino y humano 1A7 sigue:
Secuencia de ADN de la cadena ligera kappa de chP1A7 (pEAG2110)
Secuencia de proteína predicha de la cadena ligera de chP1A7 (la secuencia señal está subrayada)
Secuencia de ADN de la cadena pesada de chP1A7 huIgG1 (pEAG2112)
Secuencia de proteína predicha de la cadena pesada de chP1A7 (la secuencia señal está subrayada)
Ejemplo 18
Reingeniería de Li33Ig2 para reducir la función efectora, glicación y agregación
Se hicieron varias mutaciones en Li33 con el fin de reducir potencialmente la función efectora, glicación y agregación. Se determinó el efecto de cada una de estas mutaciones en la expresión de la proteína, solubilidad, actividad de anticuerpo en el ensayo de co-cultivo de oligodendrocito-DRG y glicación o unión a CD32. Los resultados se resumen más adelante en la Tabla 11.

Tabla 11: Reingeniería de LI33IG2
Función Efectora
Construcción Expresada Solubilidad (mg/mL) CI50 de la unión de CD32 ( g/mL) Ensayo de actividad (cocultivo)
Li33Ig2wt
Y >20 4,3 +
Li33Ig2 agli
Y 0,3 25 +
Li33Ig2 Rinat
Y >5 9,5 +
Li33Ig2 PDL
Y 5,8 >100 +
Li33Ig2 Alexion
En progreso ND ND ND
Glicación
Construcción Expresada Solubilidad (mg/mL) % Glicación Ensayo de actividad (cocultivo)
Li33wt
Y >20 25 +
Li33Ig2 PDL
Y 5,8 15(5) +
Li33Ig2 PDLW94G
Y ND >2 -
Li33Ig2 PDLW94V
Y ND <2 +
Li33Ig2 PDLW94Q
Y ND <2 -
Li33Ig2 PDLW93N
Y ND <2 -
Li33Ig2 PDLK93R
Y 0,4 <2 +
Agregación
Construcción Expresada Solubilidad (mg/mL) % Glicación Ensayo de actividad (cocultivo)
Li33Ig1a94V 157P
Y ND ND +
Li33Ig1a94V 157S
Y ND ND +
Li33Ig1a94V 157T
Y ND ND -
Li33Ig1a94V 157V
Y ND ND +
Li33Ig2PDL94V 157S
Y ND ND +
Li33Ig2PDL94V 157A
Y ND ND +
Li33Ig2PDL94V W103Q
Y ND ND -
Li33Ig2PDL94V W103A
Y ND ND -
Li33Ig2PDL94V 103Q57S
Y ND <2 +
Li33Ig2PDL94V 103Q57A
Y ND <2 +
Ejemplo 19
Construcción de una variante de Li81
El anticuerpo Li81 es una versión madurada por afinidad del anticuerpo Li13. Se creó una versión aglicosilada del 5 anticuerpo Li81 cambiando un único aminoácido en la secuencia de cadena pesada de Li81. Lo siguiente es la secuencia de aminoácidos para la cadena pesada variable (VH) de la variante aglicosilada.
La secuencia líder (los primeros 19 aminoácidos), que no estará presente en la proteína madura, se muestra en negrita y las CDRS están subrayadas. El cambio de un único aminoácido comparado con la secuencia de la cadena pesada 10 variable de Li81 (SEQ ID NO: 433) se muestra en negrita y con doble subrayado. Lo siguiente es la secuencia de nucleótidos para la cadena pesada variable (VH) de la variante aglicosilada.
Listado de secuencias
<110> Biogen Idee MA Inc.
5
<120> Anticuerpos SP35 y usos de éstos
<130> 2159.128PC01
10
<150> US 60/879,324 <151>
<160> 474
15 20
<170> Patentln versión 3.3 <210> 1 <211> 1845 <212> ADN <213> Homo sapiens <400> 1
<210> 2
<211> 614
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 2
<210> 3
<211> 6
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 3
<210> 4
<211> 29
<212> ADN
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Cebador sintético usado para determinar la cadena ligera de P1E11.3B7
<400> 4
<210> 5
<211> 15
<212> ADN
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo Li10 que codifica VH-CDR1
<400> 5
<210> 6
<211> 5
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo Li10 que codifica VH-CDR1
<400> 6
<210> 7
<211> 51
<212> ADN
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo Li10 que codifica VH-CRD2
<400> 7
<210> 8
<211> 17
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo Li10 que codifica VH-CDR2
<400> 8
<210> 9
<211> 33
<212> ADN
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo Li10 que codifica VH-CDR3
25 <400> 9
<210> 10
<211> 11
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220> 35 <223> Secuencia sintética del anticuerpo Li10 que codifica VH-CDR3
<400> 10
<210> 11
<211> 15
<212> ADN
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo Li07 que codifica VH-CDR1
<400> 11
<210> 12
<211> 5
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo Li07 que codifica VH-CDR1
<400> 12
<210> 13
<211> 51 15 <212> ADN
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo Li07 que codifica VH-CDR2
<400> 13
25 <210> 14
<211> 17
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo Li07 que codifica VH-CDR2
<400> 14
<210> 15
<211> 21
<212> ADN
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo Li07 que codifica VH-CDR3
45 <400> 15
<210> 16
<211> 7
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo Li07 que codifica VH-CDR3
<400> 16
<210> 17
<211> 14
<212> ADN
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo Li05 que codifica VH-CDR1
<400> 17
<210> 18
<211> 5
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo Li05 que codifica VH-CDR1
<400> 18
<210> 19
<211> 51
<212> ADN
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo Li05 que codifica VH-CDR2
<400> 19
<210> 20
<211> 17
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo Li05 que codifica VH-CDR2
<400> 20
<210> 21
<211> 27
<212> ADN
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo Li05 que codifica VH-CDR3
<400> 21
<210> 22
<211> 9
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo Li05 que codifica VH-CDR3
<400> 22
<210> 23
<211> 15
<212> ADN
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo Li11 que codifica VH-CDR1
<400> 23
<210> 24
<211> 5
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo Li11 que codifica VH-CDR1
<400> 24
<210> 25
<211> 51
<212> ADN
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo Li11 que codifica VH-CDR2
<400> 25
<210> 26
<211> 17 15 <212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo Li11 que codifica VH-CDR2
<400> 26
25 <210> 27
<211> 36
<212> ADN
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo Li11 que codifica VH-CDR3
<400> 27
<210> 28
<211> 12
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo Li11 que codifica VH-CDR3
45 <400> 28
<210> 29
<211> 15
<212> ADN
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo Li01 que codifica VH-CDR1
<400> 29
<210> 30
<211> 5
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo Li01 que codifica VH-CDR1
<400> 30
<210> 31
<211> 51
<212> ADN
<213> Secuencia artificial
25 <220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo Li01 que codifica VH-CDR2
<400> 31
<210> 32
<211> 17
<212> PRT 35 <213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo Li01 que codifica VH-CDR2
<400> 32
<210> 33 45 <211> 27
<212> ADN
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo Li01 que codifica VH-CDR3
<400> 33
<210> 34
<211> 9
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo Li01 que codifica VH-CDR3
<400> 34
<210> 35
<211> 15
<212> ADN
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo Li12 que codifica VH-CDR1
<400> 35
<210> 36
<211> 5
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo Li12 que codifica VH-CDR1
<400> 36
<210> 37
<211> 51
<212> ADN
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo Li12 que codifica VH-CDR2
<400> 37
<210> 38
<211> 17
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo Li12 que codifica VH-CDR2
<400> 38
<210> 39
<211> 69
<212> ADN
<213> Secuencia artificial 15
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo Li12 que codifica VH-CDR3
<400> 39 20
<210> 40
<211> 23 25 <212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo Li12 que codifica VH-CDR3 30
<400> 40
35 <210> 41
<211> 15
<212> ADN
<213> Secuencia artificial
40 <220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo Li06 que codifica VH-CDR1
<400> 41
<210> 42
<211> 5
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo Li06 que codifica VH-CDR1
<400> 42
<210> 43
<211> 51
<212> ADN
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo Li06 que codifica VH-CDR2
<400> 43
<210> 44
<211> 17
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo Li06 que codifica VH-CDR2
<400> 44
<210> 45
<211> 27
<212> ADN
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo Li06 que codifica VH-CDR3
<400> 45
<210> 46
<211> 9
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo Li06 que codifica VH-CDR3
<400> 46
<210> 47
<211> 15
<212> ADN
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo Li08 que codifica VH-CDR1
<400> 47
<210> 48
<211> 5
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo Li08 que codifica VH-CDR1
<400> 48
<210> 49
<211> 51
<212> ADN
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo Li08 que codifica VH-CDR2
<400> 49
<210> 50
<211> 17
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo Li08 que codifica VH-CDR2
<400> 50
<210> 51
<211> 27
<212> ADN
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo Li08 que codifica VH-CDR3
<400> 51
<210> 52
<211> 9
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo Li08 que codifica VH-CDR3
<400> 52
<210> 53
<211> 15
<212> ADN
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo Li03 que codifica VH-CDR1
<400> 53
<210> 54
<211> 5
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo Li03 que codifica VH-CDR1
<400> 54
<210> 55
<211> 51
<212> ADN
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo Li03 que codifica VH-CDR2
<400> 55
<210> 56
<211> 17
<212> PRT 15 <213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo Li03 que codifica VH-CDR2
<400> 56
<210> 57 25 <211> 30
<212> ADN
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo Li03 que codifica VH-CDR3
<400> 57
<210> 58
<211> 10
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo Li03 que codifica VH-CDR3
<400> 58 45
<210> 59
<211> 15
<212> ADN
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo Li09 que codifica VH-CDR1
<400> 59
<210> 60
<211> 5
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo Li09 que codifica VH-CDR1
<400> 60
<210> 61
<211> 51
<212> ADN
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo Li09 que codifica VH-CDR2
<400> 61
<210> 62
<211> 17 35 <212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo Li09 que codifica VH-CDR2
<400> 62
45 <210> 63
<211> 69
<212> ADN
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo Li09 que codifica VH-CDR3
<400> 63
<210> 64
<211> 23
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo Li09 que codifica VH-CDR3
<400> 64
<210> 65
<211> 15
<212> ADN
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo Li04 que codifica VH-CDR1
<400> 65
<210> 66
<211> 5
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo Li04 que codifica VH-CDR1
<400> 66
<210> 67
<211> 51
<212> ADN
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo Li04 que codifica VH-CDR2
<400> 67
<210> 68
<211> 17
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo Li04 que codifica VH-CDR2
<400> 68
<210> 69
<211> 27
<212> ADN
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo Li04 que codifica VH-CDR3
<400> 69 25
<210> 70
<211> 9
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo Li04 que codifica VH-CDR3
<400> 70
<210> 71
<211> 15
<212> ADN
<213> Secuencia artificial
45 <220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo Li02 que codifica VH-CDR1
<400> 71
<210> 72
<211> 5
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo Li02 que codifica VH-CDR1
<400> 72
<210> 73
<211> 48
<212> ADN 15 <213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo Li02 que codifica VH-CDR2
<400> 73
<210> 74 25 <211> 17
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo Li02 que codifica VH-CDR2
<400> 74
<210> 75
<211> 51
<212> ADN
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo Li02 que codifica VH-CDR3
<400> 75 45
<210> 76
<211> 17
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo Li02 que codifica VH-CDR3
<400> 76
<210> 77
<211> 5 10 <212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo 1A7 que codifica VH-CDR1 15
<400> 77
<210> 78
<211> 17
<212> PRT
<213> Secuencia artificial 25
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo 1A7 que codifica VH-CDR2
<400> 78 30
<210> 79
<211> 7 35 <212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo 1A7 que codifica VH-CDR3 40
<400> 79
45 <210> 80
<211> 7
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo 2F3 que codifica VH-CDR1
<400> 80
<210> 81
<211> 19
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo 2F3 que codifica VH-CDR2
<400> 81
<210> 82
<211> 4
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo 2F3 que codifica VH-CDR3
<400> 82
<210> 83
<211> 5
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo 3P1D10.2C3 ó 3P1E11.3B7 que codifica VH-CDR1
<400> 83
<210> 84
<211> 17
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo 3P1D10.2C3 ó 3P1E11.3B7 que codifica VH-CDR2
<400> 84
<210> 85
<211> 8 10 <212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo 3P1D10.2C3 ó 3P1E11.3B7 que codifica VH-CDR3 15
<400> 85
20 <210> 86
<211> 33
<212> ADN
<213> Secuencia artificial
25 <220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo Li10 que codifica VL-CDR1
<400> 86
<210> 87
<211> 11
<212> PRT 35 <213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo Li10 que codifica VL-CDR1
40 <400> 87
<210> 88 45 <211> 21
<212> ADN
<213> Secuencia artificial
<220> 50 <223> Secuencia sintética del anticuerpo Li10 que codifica VL-CDR2
<400> 88
<210> 89
<211> 7
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo Li10 que codifica VL-CDR2
<400> 89
<210> 90
<211> 27
<212> ADN
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo Li10 que codifica VL-CDR3
<400> 90
<210> 91
<211> 9
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo Li10 que codifica VL-CDR3
<400> 91
<210> 92
<211> 33
<212> ADN
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo Li07 que codifica VL-CDR1
<400> 92
<210> 93
<211> 11
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo Li07 que codifica VL-CDR1
<400> 93
<210> 94
<211> 21
<212> ADN
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo Li07 que codifica VL-CDR2
<400> 94
<210> 95
<211> 7
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo Li07 que codifica VL-CDR2
<400> 95
<210> 96
<211> 24
<212> ADN
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo Li07 que codifica VL-CDR3
<400> 96
<210> 97
<211> 8
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo Li07 que codifica VL-CDR3
<400> 97
<210> 98
<211> 33
<212> ADN
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo Li05 que codifica VL-CDR1
<400> 98
<210> 99
<211> 11
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo Li05 que codifica VL-CDR1
<400> 99
<210> 100
<211> 21
<212> ADN
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo Li05 que codifica VL-CDR2
<400> 100
<210> 101
<211> 7
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo Li05 que codifica VL-CDR2
<400> 101
<210> 102
<211> 33
<212> ADN
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo Li05 que codifica VL-CDR3
<400> 102
<210> 103
<211> 11
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo Li05 que codifica VL-CDR3
<400> 103
<210> 104
<211> 33
<212> ADN
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo Li11 que codifica VL-CDR1
<400> 104
<210> 105
<211> 11
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo Li11 que codifica VL-CDR1
<400> 105
<210> 106
<211> 21
<212> ADN
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo Li11 que codifica VL-CDR2
<400> 106
<210> 107
<211> 7
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo Li11 que codifica VL-CDR2
<400> 107
<210> 108
<211> 27
<212> ADN
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo Li11 que codifica VL-CDR3
<400> 108
<210> 109
<211> 9
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo Li11 que codifica VL-CDR3
<400> 109
<210> 110
<211> 32
<212> ADN
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo Li01 que codifica VL-CDR1
<400> 110
<210> 111
<211> 11
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo Li01 que codifica VL-CDR1
<400> 111
<210> 112
<211> 21
<212> ADN
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo Li01 que codifica VL-CDR2
<400> 112
<210> 113
<211> 7
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo Li01 que codifica VL-CDR2
<400> 113
<210> 114
<211> 30
<212> ADN
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo Li01 que codifica VL-CDR3
<400> 114
<210> 115
<211> 10
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo Li01 que codifica VL-CDR3
<400> 115
<210> 116
<211> 33
<212> ADN
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo Li06 que codifica VL-CDR1
<400> 116
<210> 117
<211> 11
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo Li06 que codifica VL-CDR1
<400> 117
<210> 118
<211> 21
<212> ADN
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo Li06 que codifica VL-CDR2
<400> 118
<210> 119
<211> 7
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo Li06 que codifica VL-CDR2
<400> 119
<210> 120
<211> 27
<212> ADN
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo Li06 que codifica VL-CDR3
<400> 120
<210> 121
<211> 9
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo Li06 que codifica VL-CDR3
<400> 121
<210> 122
<211> 33
<212> ADN
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo Li08 que codifica VL-CDR1
<400> 122
<210> 123
<211> 11
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo Li08 que codifica VL-CDR1
<400> 123
<210> 124
<211> 21
<212> ADN
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo Li08 que codifica VL-CDR2
<400> 124
<210> 125
<211> 7
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo Li08 que codifica VL-CDR2
<400> 125
<210> 126
<211> 27
<212> ADN
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo Li08 que codifica VL-CDR3
<400> 126
<210> 127
<211> 9
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo Li08 que codifica VL-CDR3
<400> 127
<210> 128
<211> 32
<212> ADN
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo Li03 que codifica VL-CDR1
<400> 128
<210> 129 <2ll> 11
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo Li03 que codifica VL-CDR1
<400> 129
<210> 130
<211> 21
<212> ADN
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo Li03 que codifica VL-CDR2
<400> 130
<210> 131
<211> 7
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<22 3> Secuencia sintética del anticuerpo Li03 que codifica VL-CDR2
<400> 131
<210> 132
<211> 27
<212> ADN
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo Li03 que codifica VL-CDR3
<400> 132
<210> 133
<211> 9
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo Li03 que codifica VL-CDR3
<400> 133
<210> 134
<211> 33
<212> ADN
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo Li09 que codifica VL-CDR1
<400> 134
<210> 135
<211> 11
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo Li09 que codifica VL-CDR1
<400> 135
<210> 136
<211> 21
<212> ADN
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo Li09 que codifica VL-CDR2
<400> 136
<210> 137
<211> 7
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo Li09 que codifica VL-CDR2
<400> 137
<210> 138
<211> 26
<212> ADN
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo Li09 que codifica VL-CDR3
<400> 138
<210> 139
<211> 9
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo Li09 que codifica VL-CDR3
<400> 139
<210> 140
<211> 33
<212> ADN
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo Li02 que codifica VL-CDR1
<400> 140
<210> 141
<211> 11
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo Li02 que codifica VL-CDR1
<400> 141
<210> 142
<211> 21
<212> ADN
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo Li02 que codifica VL-CDR2
<400> 142
<210> 143
<211> 7
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo Li02 que codifica VL-CDR2
<400> 143
<210> 144
<211> 27
<212> ADN
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo Li02 que codifica VL-CDR3
<400> 144
<210> 145
<211> 9
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo Li02 que codifica VL-CDR3
<400> 145
<210> 146
<211> 10
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo 1A7 que codifica VL-CDR1
<400> 146
<210> 147
<211> 7
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo 1A7 que codifica VL-CDR2
<400> 147
<210> 148
<211> 9
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo 1A7 que codifica VL-CDR3
<400> 148
<210> 149
<211> 11
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo 2F3 que codifica VL-CDR1
<400> 149
<210> 150
<211> 7
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo 2F3 que codifica VL-CDR2
<400> 150
<210> 151
<211> 9
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo 2F3 que codifica VL-CDR3
<400> 151
<210> 152
<211> 17 5 <212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo 3P1D10.2C3 que codifica VL-CDR1 10
<400> 152
15 <210> 153
<211> 7
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
20 <220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo 3P1D10.2C3 que codifica VL-CDR2
<400> 153
<210> 154
<211> 10
<212> PRT 30 <213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo 3P1D10.2C3 que codifica VL-CDR3
35 <400> 154
<210> 155 40 <211> 17
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220> 45 <223> Secuencia sintética del anticuerpo 3P1E11.3B7 que codifica VL-CDR1
<400> 155
<210> 156
<211> 7
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo 3P1E11.3B7 que codifica VL-CDR2
<400> 156
<210> 157
<211> 10
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo 3P1E11.3B7 que codifica VL-CDR3
<400> 157
<210> 158
<211> 133
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética de la cadena pesada variable de Li02
<400> 158
<210> 159
<211> 145 5 <212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética de la cadena pesada variable de Li09 10
<400> 159
<210> 160 5 <211> 131
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220> 10 <223> Secuencia sintética de la cadena pesada variable de Li06
<400> 160
<210> 161 5 <211> 131
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220> 10 <223> Secuencia sintética de la cadena pesada variable de Li05
<400> 161
<210> 162
<211> 131 5 <212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética de la cadena pesada variable de Li04 10
<400> 162
<210> 163
<211> 131 5 <212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética de la cadena pesada variable de Li08 10
<400> 163
<210> 164
<211> 134 5 <212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética de la cadena pesada variable de Li11 10
<400> 164
<210> 165 5 <211> 133
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220> 10 <223> Secuencia sintética de la cadena pesada variable de Li10
<400> 165
<210> 166
<211> 131 5 <212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética de la cadena pesada variable de Li01 10
<400> 166
<210> 167
<211> 129 5 <212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética de la cadena pesada variable de Li07 10
<400> 167
<210> 168
<211> 132 5 <212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética de la cadena pesada variable de Li03 10
<400> 168
<210> 169 5 <211> 145
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220> 10 <223> Secuencia sintética de la cadena pesada variable de Li12
<400> 169
<210> 170 5 <211> 116
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220> 10 <223> Secuencia sintética de la cadena pesada variable de 1A7
<400> 170
<210> 171
<211> 115 5 <212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética de la cadena pesada variable de 2F3 10
<400> 171
<210> 172
<211> 117 5 <212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética de la cadena pesada variable de 3P1D10.2C3 y 3P1E11.3B7 10
<400> 172
<210> 173 5 <211> 399
<212> ADN
<213> Secuencia artificial
<220> 10 <223> Secuencia sintética de la cadena pesada variable de Li02
<400> 173
<210> 174
<211> 435
<212> ADN
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética de la cadena pesada variable de Li09
<400> 174
<210> 175
<211> 393
<212> ADN
<213> Secuencia artificial 15
<220>
<223> Secuencia sintética de la cadena pesada variable de Li06
<400> 175 20
<210> 176
<211> 393 25 <212> ADN
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética de la cadena pesada variable de Li05 30
<400> 176
<210> 177
<211> 393 5 <212> ADN
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética de la cadena pesada variable de Li04 10
<400> 177
<210> 178
<211> 393
<212> ADN
<213> Secuencia artificial 20
<220>
<223> Secuencia sintética de la cadena pesada variable de Li08
<400> 178 25
<210> 179
<211> 402 5 <212> ADN
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética de la cadena pesada variable de Li11 10
<400> 179
15 <210> 180
<211> 399
<212> ADN
<213> Secuencia artificial
20 <220>
<223> Secuencia sintética de la cadena pesada variable de Li10
<400> 180
<210> 181
<211> 393 5 <212> ADN
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética de la cadena pesada variable de Li01 10
<400> 181
15 <210> 182
<211> 387
<212> ADN
<213> Secuencia artificial
20 <220>
<223> Secuencia sintética de la cadena pesada variable de Li07
<400> 182
<210> 183
<211> 396 5 <212> ADN
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética de la cadena pesada variable de Li03 10
<400> 183
15 <210> 184
<211> 435
<212> ADN
<213> Secuencia artificial
20 <220>
<223> Secuencia sintética de la cadena pesada variable de Li12
<400> 184
<210> 185
<211> 357
<212> ADN
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética de la cadena ligera variable de Li02
<400> 185
<210> 186
<211> 360
<212> ADN 15 <213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética de la cadena ligera variable de Li09
20 <400> 186
<210> 187 25 <211> 360
<212> ADN
<213> Secuencia artificial
<220> 30 <223> Secuencia sintética de la cadena ligera variable de Li06
<400> 187
<210> 188
<211> 363 5 <212> ADN
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética de la cadena ligera variable de Li05 10
<400> 188
15 <210> 189
<211> 360
<212> ADN
<213> Secuencia artificial
20 <220>
<223> Secuencia sintética de la cadena ligera variable de Li08
<400> 189
<210> 190
<211> 360
<212> ADN 5 <213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética de la cadena ligera variable de Li11
10 <400> 190
15 <210> 191
<211> 366
<212> ADN
<213> Secuencia artificial
20 <220>
<223> Secuencia sintética de la cadena ligera variable de Li10
<400> 191
<210> 192
<211> 363
<212> ADN 30 <213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética de la cadena ligera variable de Li01
35 <400> 192
<210> 193
<211> 354 5 <212> ADN
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética de la cadena ligera variable de Li07 10
<400> 193
15 <210> 194
<211> 360
<212> ADN
<213> Secuencia artificial
20 <220>
<223> Secuencia sintética de la cadena ligera variable de Li03
<400> 194
<210> 195
<211> 10 5 <212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo L1a.01 que codifica VH-CDR1 10
<400> 195
15 <210> 196
<211> 17
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
20 <220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo L1a.01 que codifica VH-CDR2
<400> 196
<210> 197
<211> 10
<212> PRT 30
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo L1a.01 que codifica VH-CDR3 35
<400> 197
<210> 198
<211> 10
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo L1a.02 que codifica VH-CDR1
<400> 198
<210> 199
<211> 14
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo L1a.02 que codifica VH-CDR2
<400> 199
<210> 200
<211> 8
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo L1a.02 que codifica VH-CDR3
<400> 200
<210> 201
<211> 10
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo L1a.03 que codifica VH-CDR1
<400> 201
<210> 202
<211> 17
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo L1a.03 que codifica VH-CDR2
<400> 202
<210> 203 10 <211> 13
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220> 15 <223> Secuencia sintética del anticuerpo L1a.03 que codifica VH-CDR3
<400> 203
<210> 204
<211> 10
<212> PRT
<213> Secuencia artificial 25
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo L1a.04 que codifica VH-CDR1
<400> 204 30
<210> 205
<211> 17 35 <212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo L1a.04 que codifica VH-CDR2 40
<400> 205
45 <210> 206
<211> 11
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo L1a.04 que codifica VH-CDR3
<400> 206
<210> 207
<211> 10
<212> PRT 15 <213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo L1a.05 que codifica VH-CDR1
20 <400> 207
<210> 208 25 <211> 17
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220> 30 <223> Secuencia sintética del anticuerpo L1a.05 que codifica VH-CDR2
<400> 208
<210> 209
<211> 7
<212> PRT 40 <213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo L1a.05 que codifica VH-CDR3
45 <400> 209
<210> 210
<211> 10
<212> PRT 5 <213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo L1a.06 que codifica VH-CDR1
10 <400> 210
<210> 211 15 <211> 17
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220> 20 <223> Secuencia sintética del anticuerpo L1a.06 que codifica VH-CDR2
<400> 211
<210> 212
<211> 17
<212> PRT
<213> Secuencia artificial 30
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo L1a.06 que codifica VH-CDR3
<400> 212 35
<210> 213
<211> 10 40 <212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo L1a.07 que codifica VH-CDR1 45
<400> 213
<210> 214
<211> 17 5 <212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo L1a.07 que codifica VH-CDR2 10
<400> 214
15 <210> 215
<211> 11
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
20 <220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo L1a.07 que codifica VH-CDR3
<400> 215
<210> 216
<211> 12
<212> PRT 30 <213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo L1a.08 que codifica VH-CDR1
35 <400> 216
<210> 217 40 <211> 18
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220> 45 <223> Secuencia sintética del anticuerpo L1a.08 que codifica VH-CDR2
<400> 217
<210> 218
<211> 10 5 <212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo L1a.08 que codifica VH-CDR3 10
<400> 218
15 <210> 219
<211> 10
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
20 <220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo L1a.09 que codifica VH-CDR1
<400> 219
<211> 17
<212> PRT
<213> Secuencia artificial 30
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo L1a.09 que codifica VH-CDR2
<400> 220 35
<210> 221
<211> 11 40 <212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo L1a.09 que codifica VH-CDR3 45
<400> 221
5 <210> 222
<211> 10
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
10 <220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo L1a.10 que codifica VH-CDR1
<400> 222
<210> 223
<211> 17
<212> PRT 20 <213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo L1a.10 que codifica VH-CDR2
25 <400> 223
<210> 224 30 <211> 9
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220> 35 <223> Secuencia sintética del anticuerpo L1a.10 que codifica VH-CDR3
<400> 224
<210> 225
<211> 10
<212> PRT
<213> Secuencia artificial 45
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo L1a.11 que codifica VH-CDR1
<400> 225
5 <210> 226
<211> 17
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
10 <220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo L1a.11 que codifica VH-CDR2
<400> 226
<210> 227
<211> 11
<212> PRT 20 <213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo L1a.11 que codifica VH-CDR3
25 <400> 227
<210> 228 30 <211> 12
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220> 35 <223> Secuencia sintética del anticuerpo L1a.12 que codifica VH-CDR1
<400> 228
<210> 229
<211> 18
<212> PRT
<213> Secuencia artificial 45
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo L1a.12 que codifica VH-CDR2
<400> 229
<210> 230 5 <211> 16
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220> 10 <223> Secuencia sintética del anticuerpo L1a.12 que codifica VH-CDR3
<400> 230
<210> 231
<211> 10
<212> PRT
<213> Secuencia artificial 20
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo L1a.13 que codifica VH-CDR1
<400> 231 25
<210> 232
<211> 17 30 <212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo L1a.13 que codifica VH-CDR2 35
<400> 232
40 <210> 233
<211> 10
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo L1a.13 que codifica VH-CDR3
<400> 233
<210> 234
<211> 11
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo L1a.01 que codifica VL-CDR1
<400> 234
<210> 235
<211> 7
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo L1a.01 que codifica VL-CDR2
<400> 235
<210> 236
<211> 8
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo L1a.01 que codifica VL-CDR3
<400> 236
<210> 237
<211> 12
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo L1a.02 que codifica VL-CDR1
<400> 237
<210> 238
<211> 7
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo L1a.02 que codifica VL-CDR2
<400> 238
<210> 239
<211> 8
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo L1a.02 que codifica VL-CDR3
<400> 239
<210> 240
<211> 11
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo L1a.03 que codifica VL-CDR1
<400> 240
<210> 241
<211> 7
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo L1a.03 que codifica VL-CDR2
<400> 241
<210> 242
<211> 8
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo L1a.03 que codifica VL-CDR3
<400> 242
<210> 243
<211> 14
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo L1a.04 que codifica VL-CDR1
<400> 243
<210> 244
<211> 7
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo L1a.04 que codifica VL-CDR2
<400> 244
<210> 245
<211> 8
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo L1a.04 que codifica VL-CDR3
<400> 245
<210> 246
<211> 11
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo L1a.05 que codifica VL-CDR1
<400> 246
<210> 247
<211> 7
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo L1a.05 que codifica VL-CDR2
<400> 247
<210> 248
<211> 10
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo L1a.05 que codifica VL-CDR3
<400> 248
<210> 249
<211> 16
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo L1a.06 que codifica VL-CDR1
<400> 249
<210> 250
<211> 7
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo L1a.06 que codifica VL-CDR2
<400> 250
<210> 251
<211> 8
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo L1a.06 que codifica VL-CDR3
<400> 251
<210> 252
<211> 12
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo L1a.07 que codifica VL-CDR1
<400> 252
<210> 253
<211> 7
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo L1a.07 que codifica VL-CDR2
<400> 253
<210> 254
<211> 8
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo L1a.07 que codifica VL-CDR3
<400> 254
<210> 255
<211> 11
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo L1a.08 que codifica VL-CDR1
<400> 255
<210> 256
<211> 7
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo L1a.08 que codifica VL-CDR2
<400> 256
<210> 257
<211> 9
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo L1a.08 que codifica VL-CDR3
<400> 257
<210> 258
<211> 11
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo L1a.09 que codifica VL-CDR1
<400> 258
<210> 259
<211> 7
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo L1a.09 que codifica VL-CDR2
<400> 259
<210> 260
<211> 10
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo L1a.09 que codifica VL-CDR3
<400> 260
<210> 261
<211> 11
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo L1a.10 que codifica VL-CDR1
<400> 261
<210> 262
<211> 7
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo L1a.10 que codifica VL-CDR2
<400> 262
<210> 263
<211> 8
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo L1a.10 que codifica VL-CDR3
<400> 263
<210> 264
<211> 11
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo L1a.11 que codifica VL-CDR1
<400> 264
<210> 265
<211> 7
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo L1a.11 que codifica VL-CDR2
<400> 265
<210> 266
<211> 8
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo L1a.11 que codifica VL-CDR3
<400> 266
<210> 267
<211> 11
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo L1a.12 que codifica VL-CDR1
<400> 267
<210> 268
<211> 7
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo L1a.12 que codifica VL-CDR2
<400> 268
<210> 269
<211> 8
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo L1a.12 que codifica VL-CDR3
<400> 269
<210> 270
<211> 14
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo L1a.13 que codifica VL-CDR1
<400> 270
<210> 271
<211> 7
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo L1a.13 que codifica VL-CDR2
<400> 271
<210> 272
<211> 10
<212> PRT 5 <213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo L1a.13 que codifica VL-CDR3
10 <400> 272
<210> 273 15 <211> 119
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220> 20 <223> Secuencia sintética de la cadena ligera variable de Li02
<400> 273
<210> 274
<211> 120
<212> PRT
<213> Secuencia artificial 5
<220>
<223> Secuencia sintética de la cadena ligera variable de Li09
<400> 274 10
<210> 275
<211> 120 15 <212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética de la cadena ligera variable de Li06 20
<400> 275
<210> 276
<211> 121 5 <212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética de la cadena ligera variable de Li05 10
<400> 276
<210> 277 5 <211> 120
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220> 10 <223> Secuencia sintética de la cadena ligera variable de Li08
<400> 277
<210> 278
<211> 120 5 <212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética de la cadena ligera variable de Li11 10
<400> 278
<210> 279
<211> 122 5 <212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética de la cadena ligera variable de Li10 10
<400> 279
<210> 280 5 <211> 121
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220> 10 <223> Secuencia sintética de la cadena ligera variable de Li01
<400> 280
<210> 281
<211> 118 5 <212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética de la cadena ligera variable de Li07 10
<400> 281
<210> 282
<211> 120 5 <212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética de la cadena ligera variable de Li03 10
<400> 282
<210> 283 5 <211> 106
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220> 10 <223> Secuencia sintética de la cadena ligera variable de 1A7
<400> 283
<210> 284
<211> 108 5 <212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética de la cadena ligera variable de 2F3 10
<400> 284
<210> 285
<211> 114 5 <212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética de la cadena ligera variable de 3P1D10.2C3 10
<400> 285
<210> 286
<211> 114 5 <212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética de la cadena ligera variable de 3P1E11.3B7 10
<400> 286
15 <210> 287
<211> 5
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Fragmento de péptido Sp35 sintético
<220>
<221> CARACTERÍSTICA_MISC
<222> (3)..(5)
<223> Xaa puede ser lisina, arginina, histidina, glutamina o asparagina
<400> 287
<210> 288
<211> 5
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Fragmento de péptido Sp35 sintético
<220>
<221> CARACTERÍSTICA_MISC
<222> (3)..(5)
<223> Xaa puede ser lisina, arginina, histidina, glutamina, o asparagina
<400> 288
<210> 289
<211> 5
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Fragmento de péptido Sp35 sintético
<220>
<221> CARACTERÍSTICA_MISC
<222> (3)..(5)
<223> Xaa puede ser lisina, arginina, histidina, glutamina o asparagina
<400> 289
<210> 290
<211> 5
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Fragmento de péptido Sp35 sintético
<220>
<221> CARACTERÍSTICA_MISC
<222> (3)..(5)
<223> Xaa puede ser lisina, arginina, histidina, glutamina o asparagina
<400> 290
<210> 291
<211> 5
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Fragmento de péptido Sp35 sintético
<400> 291
<210> 292
<211> 5
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Fragmento de péptido Sp35 sintético
<400> 292
<210> 293
<211> 5
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Fragmento de péptido Sp35 sintético
<400> 293
<210> 294
<211> 5
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Fragmento de péptido Sp35 sintético
<400> 294
<210> 295
<211> 5
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Fragmento de péptido Sp35 sintético
<400> 295
<210> 296
<211> 5
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Fragmento de péptido Sp35 sintético
<400> 296
<210> 297
<211> 5
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Fragmento de péptido Sp35 sintético
<400> 297
<210> 298
<211> 5
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Fragmento de péptido Sp35 sintético
<400> 298
<210> 299
<211> 5
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Fragmento de péptido Sp35 sintético
<400> 299
<210> 300
<211> 5
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Fragmento de péptido Sp35 sintético
<400> 300
<210> 301
<211> 6
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Fragmento de péptido Sp35 sintético
<400> 301
<210> 302
<211> 6
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Fragmento de pé ptido Sp35 sintético
<400> 302
<210> 303
<211> 6
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Fragmento de péptido Sp35 sintético
<400> 303
<210> 304
<211> 6
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Fragmento de péptido Sp35 sintético
<400> 304
<210> 305
<211> 6
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Fragmento de péptido Sp35 sintético
<400> 305
<210> 306
<211> 6
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Fragmento de péptido Sp35 sintético
<400> 306
<210> 307
<211> 6
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Fragmento de péptido Sp35 sintético
<400> 307
<210> 308
<211> 6
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Fragmento de péptido Sp35 sintético
<400> 308
<210> 309
<211> 6
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Fragmento de péptido Sp35 sintético
<400> 309
<210> 310
<211> 6
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Fragmento de péptido Sp35 sintético
<400> 310
<210> 311
<211> 7
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Fragmento de péptido Sp35 sintético
<400> 311
<210> 312
<211> 7
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Fragmento de péptido Sp35 sintético
<400> 312
<210> 313
<211> 7
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Fragmento de péptido Sp35 sintético
<400> 313
<210> 314
<211> 7
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Fragmento de péptido Sp35 sintético
<400> 314
<210> 315
<211> 7
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Fragmento de péptido Sp35 sintético
<400> 315
<210> 316
<211> 7
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Fragmento de péptido Sp35 sintético
<400> 316
<210> 317
<211> 7
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Fragmento de péptido Sp35 sintético
<400> 317
<210> 318
<211> 7
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Fragmento de péptido Sp35 sintético
<400> 318
<210> 319
<211> 7
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Fragmento de péptido Sp35 sintético
<400> 319
<210> 320
<211> 7
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Fragmento de péptido Sp35 sintético
<400> 320
<210> 321
<211> 6
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Fragmento de péptido Sp35 sintético
<400> 321
<210> 322
<211> 5
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Fragmento de péptido Sp35 sintético
<400> 322
<210> 323
<211> 5
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Fragmento de péptido Sp35 sintético
<400> 323
<210> 324
<211> 5
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Fragmento de péptido Sp35 sintético
<220>
<221> CARACTERÍSTICA_MISC
<222> (1)..(2)
<223> Xaa puede ser cualquier aminoácido
<400> 324
<210> 325
<211> 5
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Fragmento de péptido Sp35 sintético
<220>
<221> CARACTERÍSTICA_MISC
<222> (1)..(2)
<223> Xaa puede ser cualquier aminoácido
<400> 325
<210> 326
<211> 5
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Fragmento de péptido Sp35 sintético
<220>
<221> CARACTERÍSTICA_MISC
<222> (1)..(2)
<223> Xaa puede ser cualquier aminoácido
<400> 326
<210> 327
<211> 5
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Fragmento de péptido Sp35 sintético
<220>
<221> CARACTERÍSTICA_MISC
<222> (1)..(2)
<223> Xaa puede ser cualquier aminoácido
<400> 327
<210> 328
<211> 5
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Fragmento de péptido Sp35 sintético
<220>
<221> CARACTERÍSTICA_MISC
<222> (1)..(2)
<223> Xaa puede ser cualquier aminoácido
<400> 328
<210> 329
<211> 5
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Fragmento de péptido Sp35 sintético
<220>
<221> CARACTERÍSTICA_MISC
<222> (1)..(2)
<223> Xaa puede ser cualquier aminoácido
<400> 329
<210> 330
<211> 5
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Fragmento de péptido Sp35 sintético
<220>
<221> CARACTERÍSTICA_MISC
<222> (1)..(2)
<223> Xaa puede ser cualquier aminoácido
<400> 330
<210> 331
<211> 5
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Fragmento de péptido Sp35 sintético
<220>
<221> CARACTERÍSTICA_MISC
<222> (1)..(2)
<223> Xaa puede ser cualquier aminoácido
<400> 331
<210> 332
<211> 5
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Fragmento de péptido Sp35 sintético
<220>
<221> CARACTERÍSTICA_MISC
<222> (1)..(2)
<223> Xaa puede ser cualquier aminoácido
<400> 332
<210> 333
<211> 5
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Fragmento de péptido Sp35 sintético
<220>
<221> CARACTERÍSTICA_MISC
<222> (1)..(2)
<223> Xaa puede ser cualquier aminoácido
<400> 333
<210> 334
<211> 5
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Fragmento de péptido Sp35 sintético
<220>
<221> CARACTERÍSTICA_MISC
<222> (3)..(3)
<223> Xaa puede ser lisina, arginina, histidina, glutamina o asparagina
<220>
<221> CARACTERÍSTICA_MISC
<222> (4)..(4)
<223> Xaa puede ser cualquier aminoácido
<220>
<221> CARACTERÍSTICA_MISC
<222> (5)..(5)
<223> Xaa puede ser lisina, arginina, histidina, glutamina o asparagina
<400> 334
<210> 335
<211> 5
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Fragmento de péptido Sp35 sintético
<220>
<221> CARACTERÍSTICA_MISC
<222> (3)..(3)
<223> Xaa puede ser lisina, arginina, histidina, glutamina o asparagina
<220>
<221> CARACTERÍSTICA_MISC
<222> (4)..(4)
<223> Xaa puede ser cualquier aminoácido
<220>
<221> CARACTERÍSTICA_MISC
<222> (5).. (5)
<223> Xaa puede ser lisina, arginina, histidina, glutamina o asparagina
<400> 335
<210> 336
<211> 5
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Fragmento de péptido Sp35 sintético
<220>
<221> CARACTERÍSTICA_MISC
<222> (3)..(3)
<223> Xaa puede ser lisina, arginina, histidina, glutamina o asparagina
<220>
<221> CARACTERÍSTICA_MISC
<222> (4)..(4)
<223> Xaa puede ser cualquier aminoácido
<220>
<221> CARACTERÍSTICA_MISC
<222> (5)..(5)
<223> Xaa puede ser lisina, arginina, histidina, glutamina o asparagina
<400> 336
<210> 337
<211> 5
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Fragmento de péptido Sp35 sintético
<220>
<221> CARACTERÍSTICA_MISC
<222> (3)..(3)
<223> Xaa puede ser lisina, arginina, histidina, glutamina o asparagina
<220>
<221> CARACTERÍSTICA_MISC
<222> (4)..(4)
<223> Xaa puede ser cualquier aminoácido
<220>
<221> CARACTERÍSTICA_MISC
<222> (5)..(5)
<223> Xaa puede ser lisina, arginina, histidina, glutamina o asparagina
<400> 337
<210> 338
<211> 5
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Fragmento de péptido Sp35 sintético
<400> 338
<210> 339
<211> 9
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Fragmento de péptido Sp35 sintético
<400> 339
<210> 340
<211> 9
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Fragmento de péptido Sp35 sintético
<400> 340
<210> 341
<211> 9
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Fragmento de péptido Sp35 sintético
<400> 341
<210> 342
<211> 9
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Fragmento de péptido Sp35 sintético
<400> 342
<210> 343
<211> 9
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Fragmento de péptido Sp35 sintético
<400> 343
<210> 344
<211> 19
<212> ADN
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Cebador sintético directo usado para mostrar la expresión de Sp35
<400> 344
<210> 345
<211> 21
<212> ADN
<213> Secuencia artificial
<220>
<22 3> Cebador sintético inverso usado para mostrar la expresión de Sp35
<400> 345
<210> 346
<211> 55
<212> ADN
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Nucleótido ARNi de Sp35 sintético
<400> 346
<210> 347
<211> 59
<212> ADN
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Nucleótido ARNi de Sp35 sintético
<400> 347
<210> 348
<211> 59
<212> ADN
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Nucleótido ARNi de Sp35 sintético
<400> 348
<210> 349
<211> 59
<212> ADN
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Nucleótido ARNi de Sp35 sintético
<400> 349
<210> 350
<211> 41
<212> ADN
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Cebador sintético usado para amplificar Sp35 de ratón de longitud completa
<400> 350
<210> 351
<211> 41
<212> ADN
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Cebador sintético usado para amplificar Sp35 de ratón de longitud completa
<400> 351
<210> 352
<211> 41
<212> ADN
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Cebador sintético usado para amplificar Sp35 negativo dominante
<400> 352
<210> 353
<211> 42
<212> ADN
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Cebador sintético usado para amplificar Sp35 negativo dominante
<400> 353
<210> 354
<211> 37
<212> ADN
<213> Secuencia artificial
<220>
<22 3> Cebador sintético usado para obtener la secuencia codificadora parcial para Sp35 humano
<400> 354
<210> 355
<211> 59
<212> ADN
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Cebador sintético usado para obtener la secuencia codificadora parcial para Sp35 humano
<400> 355
<210> 356
<211> 39
<212> ADN
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Cebador sintético usado para determinar la secuencia de la cadena ligera de P1E11.3B7
<400> 356
<210> 357
<211> 40
<212> ADN
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Cebador sintético usado para determinar la secuencia de la cadena ligera de P1E11.3B7
<400> 357
<210> 358
<211> 37
<212> ADN
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Cebador sintético usado para determinar la secuencia de la cadena ligera de P1E11.3B7
<400> 358
<210> 359
<211> 40
<212> ADN
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Cebador sintético usado para determinar la secuencia de la cadena ligera de P1E11.3B7
<400> 359
<210> 360
<211> 39
<212> ADN
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Cebador sintético usado para determinar la secuencia de la cadena pesada de P1E11.3B7
<400> 360
<210> 361
<211> 39
<212> ADN
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Cebador sintético usado para determinar la secuencia de la cadena pesada de P1E11.3B7
<400> 361
<210> 362
<211> 38
<212> ADN
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Cebador sintético usado para determinar la secuencia de la cadena pesada de P1E11.3B7
<400> 362
<210> 363
<211> 39
<212> ADN
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Cebador sintético usado para determinar la secuencia de la cadena pesada de P1E11.3B7
<400> 363
<210> 364
<211> 22
<212> ADN
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Cebador sintético universal de cadena pesada
<400> 364
<210> 365
<211> 34
<212> ADN
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Cebador sintético universal de cadena pesada
<400> 365
<210> 366
<211> 28
<212> ADN
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Cebador sintético degenerado de secuencia señal
<220>
<221> característica_misc
<222> (21)..(21)
<223> n puede ser cualquier nucleótido
<220>
<221> característica_misc
<222> (24)..(24)
<223> n puede ser cualquier nucleótido
<400> 366
<210> 367
<211> 39
<212> ADN
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Cebador sintético de dominio constante
<400> 367
<210> 368
<211> 66
<212> ADN
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Cebador sintético usado para amplificar MOG de rata
<400> 368
<210> 369
<211> 40
<212> ADN
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Cebador sintético usado para amplificar MOG de rata
<400> 369
<210> 370
<211> 354
<212> ADN 10 <213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética de cadena pesada variable de Li13
15 <400> 370
<210> 371 20 <211> 324
<212> ADN
<213> Secuencia artificial
<220> 25 <223> Secuencia sintética de cadena ligera variable de Li13
<400> 371
<210> 372
<211> 118
<212> PRT
<213> Secuencia artificial 35
<220>
<223> Secuencia sintética de cadena pesada variable de Li13
<400> 372
<210> 373
<211> 108
<212> PRT 10 <213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética de cadena ligera variable de Li13
15 <400> 373
<210> 374
<211> 354 5 <212> ADN
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética de cadena pesada variable de Li32 10
<400> 374
15 <210> 375
<211> 321
<212> ADN
<213> Secuencia artificial
20 <220>
<223> Secuencia sintética de cadena ligera variable de Li32
<400> 375
<210> 376
<211> 118
<212> PRT
<213> Secuencia artificial 10
<220>
<223> Secuencia sintética de cadena pesada variable de Li32
<400> 376 15
<210> 377
<211> 107
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética de cadena ligera variable de Li32
<400> 377
<210> 378
<211> 357
<212> ADN 15 <213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética de cadena pesada variable de Li33
20 <400> 378
<210> 379
<211> 321 5 <212> ADN
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética de cadena ligera variable de Li33 10
<400> 379
15 <210> 380
<211> 119
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
20 <220>
<223> Secuencia sintética de cadena pesada variable de Li33
<400> 380
<210> 381
<211> 107 5 <212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética de cadena ligera variable de Li33 10
<400> 381
<210> 382
<211> 357 5 <212> ADN
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética de cadena pesada variable de Li34 10
<400> 382
15 <210> 383
<211> 321
<212> ADN
<213> Secuencia artificial
20 <220>
<22 3> Secuencia sintética de cadena ligera variable de Li34
<400> 383
<210> 384
<211> 119
<212> PRT 10 <213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética de cadena pesada variable de Li34
15 <400> 384
<210> 385
<211> 107
<212> PRT
<213> Secuencia artificial 5
<220>
<223> Secuencia sintética de cadena ligera variable de Li34
<400> 385 10
<210> 386
<211> 11 15 <212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo Li13 que codifica VL-CDR1 20
<400> 386
25 <210> 387
<211> 7
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo Li13 que codifica VL-CDR2
<400> 387
<210> 388
<211> 10
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo Li13 que codifica VL-CDR3
<400> 388
<210> 389
<211> 5
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo Li13 que codifica VH-CDR1
<400> 389
<210> 390
<211> 17
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo Li13 que codifica VH-CDR2
<400> 390
<210> 391
<211> 9
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo Li13 que codifica VH-CDR3
<400> 391
<210> 392
<211> 11
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo Li32 que codifica VL-CDR1
<400> 392
<210> 393
<211> 7
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo Li32 que codifica VL-CDR2
<400> 393
<210> 394
<211> 9
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo Li32 que codifica VL-CDR3
<400> 394
<210> 395
<211> 5
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo Li32 que codifica VH-CDR1
<400> 395
<210> 396
<211> 17
<212> PRT
<213> Secuencia artificial 10
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo Li32 que codifica VH-CDR2
<400> 396 15
<210> 397
<211> 9 20 <212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<22 3> Secuencia sintética del anticuerpo Li32 que codifica VH-CDR3 25
<400> 397
30 <210> 398
<211> 11
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
35 <220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo Li33 que codifica VL-CDR1
<400> 398
<210> 399
<211> 7
<212> PRT 45 <213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo Li33 que codifica VL-CDR2
<400> 399
<210> 400
<211> 9
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo Li33 que codifica VL-CDR3
<400> 400
<210> 401
<211> 5
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo Li33 que codifica VH-CDR1
25 <400> 401
<210> 402
<211> 17
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220> 35 <223> Secuencia sintética del anticuerpo Li33 que codifica VH-CDR2
<400> 402
<210> 403
<211> 10
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo Li33 que codifica VH-CDR3
<400> 403
<210> 404
<211> 11
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<22 3> Secuencia sintética del anticuerpo Li34 que codifica VL-CDR1
<400> 404
<210> 405
<211> 7
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo Li34 que codifica VL-CDR2
<400> 405
<210> 406
<211> 9
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo Li34 que codifica VL-CDR3
<400> 406
<210> 407
<211> 5
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo Li34 que codifica VH-CDR1
<400> 407
<210> 408
<211> 17
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo Li34 que codifica VH-CDR2
<400> 408
<210> 409
<211> 10
<212> PRT 15 <213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo Li34 que codifica VH-CDR3
20 <400> 409
<210> 410 25 <211> 5
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220> 30 <223> Secuencia sintética del anticuerpo 3B5.2 que codifica VH-CDR1
<400> 410
<210> 411
<211> 17
<212> PRT
<213> Secuencia artificial 40
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo 3B5.2 que codifica VH-CDR2
<400> 411 45
<210> 412
<211> 11
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo 3B5.2 que codifica VH-CDR3
<400> 412
<210> 413
<211> 10
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo 3B5.2 que codifica VL-CDR1
<400> 413
<210> 414
<211> 7
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo 3B5.2 que codifica VL-CDR2
<400> 414
<210> 415
<211> 9
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo 3B5.2 que codifica VL-CDR3
<400> 415
<210> 416
<211> 120 5 <212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética de cadena pesada variable de 3B5.2 10
<400> 416
15 <210> 417
<211> 106
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
20 <220>
<223> Secuencia sintética de cadena ligera variable de 3B5.2
<400> 417
<210> 418
<211> 6 5 <212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia consenso sintética de cadena ligera kappa humana y murina 10
<400> 418
15 <210> 419
<211> 106
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
20 <220>
<22 3> Secuencia sintética de cadena ligera variable de 3B5.2 mutante
<400> 419
<210> 420
<211> 1404 5 <212> ADN
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética de anticuerpo 3B5.2 quimérico murino y humano 10
<400> 420
<210> 421 5 <211> 708
<212> ADN
<213> Secuencia artificial
<220> 10 <223> Secuencia sintética de anticuerpo 3B5.2 quimérico murino y humano
<400> 421
<210> 422
<211> 360
<212> ADN
<213> Secuencia artificial 10
<220>
<223> Secuencia sintética de cadena pesada variable de 3B5.2
<400> 422 15
<210> 423
<211> 318 20 <212> ADN
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética de cadena ligera variable de 3B5.2 25
<400> 423
5 <210> 424
<211> 15
<212> ADN
<213> Secuencia artificial
10 <220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo 3B5.2 que codifica VH-CDR1
<400> 424
<210> 425
<211> 51
<212> ADN 20 <213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo 3B5.2 que codifica VH-CDR2
25 <400> 425
<210> 426 30 <211> 33
<212> ADN
<213> Secuencia artificial
<220> 35 <223> Secuencia sintética del anticuerpo 3B5.2 que codifica VH-CDR3
<400> 426
<210> 427
<211> 30
<212> ADN
<213> Secuencia artificial 45
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo 3B5.2 que codifica VL-CDR1
<400> 427
<210> 428
<211> 21
<212> ADN
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo 3B5.2 que codifica VL-CDR2
<400> 428
<210> 429
<211> 27
<212> ADN
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo 3B5.2 que codifica VL-CDR3
<400> 429
<210> 430
<211> 106
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Variante 1 de cadena ligera sintética
<400> 430
<210> 431
<211> 106 5 <212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Variante 2 de cadena ligera sintética 10
<400> 431
<210> 432 5 <211> 116
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220> 10 <223> Variante 2 de cadena pesada sintética
<400> 432
<210> 433
<211> 447 5 <212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética de cadena pesada variable de Li81 10
<400> 433
<210> 434
<211> 215 5 <212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética de cadena ligera variable de Li81 10
<400> 434
<210> 435
<211> 447
<212> PRT 5 <213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética de cadena pesada variable aglicosilada de Li81
10 <400> 435
<210> 436
<211> 5
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo Li81 que codifica VH-CDR1
<400> 436
<210> 437
<211> 17
<212> PRT 10 <213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo Li81 que codifica VH-CDR2
15 <400> 437
<210> 438 20 <211> 9
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220> 25 <223> Secuencia sintética del anticuerpo Li81 que codifica VH-CDR3
<400> 438
30 <210> 439
<211> 15
<212> ADN
<213> Secuencia artificial
35 <220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo Li81 que codifica VH-CDR1
<400> 439
<210> 440
<211> 51
<212> ADN 45 <213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo Li81 que codifica VH-CDR2
<400> 440
<210> 441
<211> 27
<212> ADN
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo Li81 que codifica VH-CDR3
<400> 441
<210> 442
<211> 11
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo Li81 que codifica VL-CDR1
<400> 442
<210> 443
<211> 7
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo Li81 que codifica VL-CDR2
<400> 443
<210> 444
<211> 10
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo Li81 que codifica VL-CDR3
<400> 444
<210> 445
<211> 33
<212> ADN
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo Li81 que codifica VL-CDR1
<400> 445
<210> 446
<211> 21
<212> ADN
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo Li81 que codifica VL-CDR2
<400> 446
<210> 447
<211> 30
<212> ADN
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética del anticuerpo Li81 que codifica VL-CDR3
<400> 447
<210> 448
<211> 1341
<212> ADN
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética de cadena pesada variable de Li81
<400> 448
<210> 449 5 <211> 648
<212> ADN
<213> Secuencia artificial
<220> 10 <223> Secuencia sintética de cadena ligera variable de Li81
<400> 449
<210> 450
<211> 1341 5 <212> ADN
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética de cadena pesada variable aglicosilada de Li81 10
<400> 450
<210> 451
<211> 94 5 <212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética de cadena ligera variable subgrupo kappa 6 murina 10
<400> 451
<210> 452 5 <211> 96
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
10 <223> Secuencia sintética de cadena pesada variable subgrupo HVMS murina
<400> 452
<210> 453
<211> 96
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia de consenso murina sintética
<220>
<221> CARACTERÍSTICA_MISC
<222> (2)..(2)
<223> Xaa es isoleucina o valina
<220>
<221> CARACTERÍSTICA_MISC
<222> (54)..(54)
<223> Xaa es aspartato o glutamato
<220>
<221> CARACTERÍSTICA_MISC
<222> (61)..(61)
<223> Xaa es treonina o alanina
<220>
<221> CARACTERÍSTICA_MISC
<222> (62)..(62)
<223> Xaa es glutamato o aspartato
<220>
<221> CARACTERÍSTICA_MISC
<222> (65)..(65)
<223> Xaa es glutamina o lisina
<220>
<221> CARACTERÍSTICA_MISC
<222> (79)..(79)
<223> Xaa es valina o alanina
<220>
5 <221> CARACTERÍSTICA_MISC
<222> (83)..(83)
<223> Xaa es fenilalanina o isoleucina
<400> 453 10
<210> 454 15 <211> 96
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220> 20 <223> Línea germinal VGK6 murina
<400> 454
<210> 455
<211> 94 5 <212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética de cadena ligera variable subgrupo kappa 3 humana 10
<400> 455
<210> 456
<211> 95
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia de consenso sintética
<220>
<221> CARACTERÍSTICA_MISC
<222> (1)..(1)
<22 3> Xaa puede ser glutamina o glutamato
<220>
<221> CARACTERÍSTICA_MISC
<222> (10)..(10)
<223> Xaa puede ser isoleucina o treonina
<220>
<221> CARACTERÍSTICA_MISC
<222> (11)..(11)
<223> Xaa puede ser metionina o leucina
<220>
<221> CARACTERÍSTICA_MISC
<222> (13)..(13)
<223> Xaa puede ser alanina o leucina
<220>
<221> CARACTERÍSTICA_MISC
<222> (18)..(18)
<223> Xaa puede ser lisina o arginina
<220>
<221> CARACTERÍSTICA_MISC
<222> (19)..(19)
<223> Xaa puede ser valina o alanina
<220>
<221> CARACTERÍSTICA_MISC
<222> (21)..(21)
<223> Xaa puede ser metionina o leucina
<220>
<221> CARACTERÍSTICA_MISC
<222> (22)..(22)
<223> Xaa puede ser treonina o serina
<220>
<221> CARACTERÍSTICA_MISC
<222> (24)..(24)
<223> Xaa puede ser serina o arginina
<220>
<221> CARACTERÍSTICA_MISC
<222> (27)..(27)
<223> Xaa puede ser serina o glutamina
<220>
<221> CARACTERÍSTICA_MISC
<222> (31)..(31)
<223> Xaa puede ser serina o no está presente
<220>
<221> CARACTERÍSTICA_MISC
<222> (33)..(33)
<223> Xaa puede ser metionina o leucina
<220>
<221> CARACTERÍSTICA_MISC
<222> (34)..(34)
<223> Xaa puede ser histidina o alanina
<220>
<221> CARACTERÍSTICA_MISC
<222> (40)..(40)
<223> Xaa puede ser serina o prolina
<220>
<221> CARACTERÍSTICA_MISC
<222> (42)..(42)
<223> Xaa puede ser treonina o glutamina
<220>
<221> CARACTERÍSTICA_MISC
<222> (43)..(43)
<223> Xaa puede ser serina o alanina
<220>
<221> CARACTERÍSTICA_MISC
<222> (45)..(45)
<223> Xaa puede ser lisina o arginina
<220>
<221> CARACTERÍSTICA_MISC
<222> (46)..(46)
<223> Xaa puede ser arginina o leucina
<220>
<221> CARACTERÍSTICA_MISC
<222> (47)..(47)
<223> Xaa puede ser triptófano o leucina
<220>
<221> CARACTERÍSTICA_MISC
<222> (51)..(51)
<22 3> Xaa puede ser treonina o alanina
<220>
<221> CARACTERÍSTICA_MISC
<222> (53)..(53)
<223> Xaa puede ser lisina o asparagina
<220>
<221> CARACTERÍSTICA_MISC
<222> (54)..(54)
<223> Xaa puede ser leucina o arginina
<220>
<221> CARACTERÍSTICA_MISC
<222> (56)..(56)
<223> Xaa puede ser serina o treonina
<220>
<221> CARACTERÍSTICA_MISC
<222> (58)..(58)
<223> Xaa puede ser valina o isoleucina
<220>
<221> CARACTERÍSTICA_MISC
<222> (70)..(70)
<223> Xaa puede ser serina o aspartato
<220>
<221> CARACTERÍSTICA_MISC
<222> (71)..(71)
<223> Xaa puede ser tirosina o fenilalanina
<220>
<221> CARACTERÍSTICA_MISC
<222> (72)..(72)
<223> Xaa puede ser serina o treonina
<220>
<221> CARACTERÍSTICA_MISC
<222> (78)..(78)
<223> Xaa puede ser metionina o leucina
<220>
<221> CARACTERÍSTICA_MISC
<222> (80)..(80)
<223> Xaa puede ser alanina o prolina
<220>
<221> CARACTERÍSTICA_MISC
<222> (83)..(83)
<223> Xaa puede ser alanina o fenilalanina
<220>
<221> CARACTERÍSTICA_MISC
<222> (85)..(85)
<223> Xaa puede ser treonina o valina
<220>
<221> CARACTERÍSTICA_MISC
<222> (91)..(91)
<22 3> Xaa puede ser triptófano o arginina
<220>
<221> CARACTERÍSTICA_MISC
<222> (93)..(93)
<223> Xaa puede ser serina o asparagina
<220>
<221> CARACTERÍSTICA_MISC
<222> (94)..(94)
<223> Xaa puede ser asparagina o triptófano
<400> 456
<210> 457
<211> 95 5 <212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Línea germinal L6 humana 10
<400> 457
<210> 458
<211> 98 5 <212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<22 3> Secuencia sintética de cadena pesada variable subgrupo MHV1 humana 10
<400> 458
15 <210> 459
<211> 98
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
20 <220>
<223> Secuencia de consenso sintética
<220>
<221> CARACTERÍSTICA_MISC 25 <222> (9)..(9)
<223> Xaa puede ser prolina o histidina
<220>
<221> CARACTERÍSTICA_MISC
<222> (11)..(11)
<223> Xaa puede ser leucina o valina
<220>
<221> CARACTERÍSTICA_MISC
<222> (13)..(13)
<223> Xaa puede ser lisina o glutamina
<220>
<221> CARACTERÍSTICA_MISC
<222> (16)..(16)
<223> Xaa puede ser glutamato o alanina
<220>
<221> CARACTERÍSTICA_MISC
<222> (17)..(17)
<223> Xaa puede ser treonina o serina
<220>
<221> CARACTERÍSTICA_MISC
<222> (20)..(20)
<223> Xaa puede ser isoleucina o valina
<220>
<221> CARACTERÍSTICA_MISC
<222> (28)..(28)
<223> Xaa puede ser treonina o serina
<220>
<221> CARACTERÍSTICA_MISC
<222> (31)..(31)
<223> Xaa puede ser arginina o treonina
<220>
<221> CARACTERÍSTICA_MISC
<222> (38)..(38)
<223> Xaa puede ser lisina o prolina
<220>
<221> CARACTERÍSTICA_MISC
<222> (43)..(43)
<223> Xaa puede ser lisina o glutamina
<220>
<221> CARACTERÍSTICA_MISC
<222> (46)..(46)
<223> Xaa puede ser lisina o glutamato
<220>
<221> CARACTERÍSTICA_MISC
<222> (51)..(51)
<223> Xaa puede ser isoleucina o fenilalanina
<220>
<221> CARACTERÍSTICA_MISC
<222> (54)..(54)
<223> Xaa puede ser aspartato o tirosina
<220>
<221> CARACTERÍSTICA_MISC
<222> (57)..(57)
<223> Xaa puede ser glutamato o arginina
<220>
<221> CARACTERÍSTICA_MISC
<222> (61)..(61)
<223> Xaa puede ser treonina o alanina
<220>
<221> CARACTERÍSTICA_MISC
<222> (62)..(62)
<223> Xaa puede ser glutamato o glutamina
<220>
<221> CARACTERÍSTICA_MISC
<222> (63)..(63)
<223> Xaa puede ser aspartato o glicina
<220>
<221> CARACTERÍSTICA_MISC
<222> (65)..(65)
<22 3> Xaa puede ser glutamina o treonina
<220>
<221> CARACTERÍSTICA_MISC
<222> (69)..(69)
<223> Xaa puede ser alanina o valina
<220>
<221> CARACTERÍSTICA_MISC
<222> (72)..(72)
<223> Xaa puede ser leucina o metionina
<220>
<221> CARACTERÍSTICA_MISC
<222> (73)..(73)
<223> Xaa puede ser glutamato o aspartato
<220>
<221> CARACTERÍSTICA_MISC
<222> (79)..(79)
<223> Xaa puede ser valina o alanina
<220>
<221> CARACTERÍSTICA_MISC
<222> (83)..(83)
<223> Xaa puede ser fenilalanina o isoleucina
<220>
<221> CARACTERÍSTICA_MISC
<222> (84)..(84)
<223> Xaa puede ser arginina o serina
<220>
<221> CARACTERÍSTICA_MISC
<222> (85)..(85)
<223> Xaa puede ser arginina o serina
<220>
<221> CARACTERÍSTICA_MISC
<222> (88)..(88)
<223> Xaa puede ser arginina o alanina
<220>
<221> CARACTERÍSTICA_MISC
<222>
(91)..(91) 5 <22 3> Xaa puede ser treonina o metionina
<220>
<221> CARACTERÍSTICA_MISC
<222>
(93)..(93) 10 <223> Xaa puede ser treonina o metionina
<220>
<221> CARACTERÍSTICA_MISC
<222>
(95)..(95) 15 <223> Xaa puede ser fenilalanina o tirosina
<400> 459
20
<210> 460
<211> 98
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
25
<220>
<223> Línea germinal huVH7-81 humana
<400> 460
30
<210> 461 5 <211> 1395
<212> ADN
<213> Secuencia artificial
<220> 10 <223> Secuencia de cadena pesada H2 de huP1A7-IgG1 humano
<400> 461
<210> 462 5 <211> 464
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220> 10 <22 3> Secuencia de cadena pesada H2 de huP1A7 humano
<400> 462
<210> 463 5 <211> 708
<212> ADN
<213> Secuencia artificial
<220> 10 <223> Secuencia de cadena ligera kappa L1 de huP1A7 humano
<400> 463
<210> 464
<211> 235 5 <212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia de cadena ligera L1 de huP1A7 humano 10
<400> 464
<210> 465
<211> 708 5 <212> ADN
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia de cadena ligera kappa L2 de huP1A7 humano 10
<400> 465
15 <210> 466
<211> 235
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
20 <220>
<22 3> Secuencia de cadena ligera L2 de huP1A7 humano
<400> 466
<210> 467
<211> 708 5 <212> ADN
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia de cadena ligera kappa de chP1A7 quimérico murino y humano 10
<400> 467
5 <210> 468
<211> 235
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
10 <220>
<223> Secuencia de cadena ligera de chP1A7 quimérico murino y humano
<400> 468
<210> 469
<211> 1395 5 <212> ADN
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia de cadena pesada de chP1A7 hulgG1 quimérico murino y humano 10
<400> 469
<210> 470 5 <211> 464
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220> 10 <223> Secuencia de cadena pesada de chP1A7 quimérico murino y humano
<400> 470
<210> 471
<211> 106 5 <212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Variante 3 sintética de cadena ligera 10
<400> 471
<210> 472 5 <211> 116
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220> 10 <223> Variante 1 sintética de cadena pesada
<400> 472
<210> 473
<211> 116 5 <212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<22 3> Variante 3 sintética de cadena pesada 10
<400> 473
<210> 474
<211> 466 5 <212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia sintética de cadena pesada variable aglicosilada de Li81 10
<400> 474

Claims (14)

  1. REIVINDICACIONES
    1. Un anticuerpo aislado o fragmento de unión a antígeno de éste que puede unirse específicamente a un polipéptido Sp35, en el que el anticuerpo o fragmento de éste comprende
    una región VH que comprende las secuencias CDR1, CDR2 y CDR3 de la VH de SEQ ID NO: 436, SEQ ID NO: 437 y SEQ ID NO: 438, respectivamente; y
    una región VL que comprende las secuencias CDR1, CDR2 y CDR3 de la VL de SEQ ID NO: 442, SEQ ID NO: 443 y SEQ ID NO: 444, respectivamente
    en el que el anticuerpo o fragmento de éste se une a un polipéptido Sp35 con una afinidad caracterizada por una constante de disociación no mayor de 5 x 10-10M según se mide usando FACS en células CHO transfectadas de manera estable con Sp35 humano.
  2. 2.
    El anticuerpo o fragmento de éste de la reivindicación 1, en el que el anticuerpo comprende la secuencia de aminoácidos mostrada en SEQ ID NO: 434 y la secuencia de aminoácidos mostrada en SEQ ID NO: 433.
  3. 3.
    El anticuerpo o fragmento de éste de la reivindicación 1, en el que el anticuerpo comprende la forma madura de la secuencia de aminoácidos mostrada en SEQ ID NO: 474 y opcionalmente la secuencia de aminoácidos mostrada en SEQ ID NO: 434.
  4. 4.
    El anticuerpo o fragmento de éste de una cualquiera de las reivindicaciones 1-3, que es un antagonista de la muerte de células neuronales mediada por Sp35.
  5. 5.
    El anticuerpo o fragmento de éste de una cualquiera de las reivindicaciones 1-3, que es un antagonista de la inhibición de la mielinización mediada por Sp35.
  6. 6.
    El anticuerpo o fragmento de éste de una cualquiera de las reivindicaciones 1-3, que es un antagonista de la inhibición de la diferenciación de oligodendrocitos mediada por Sp35.
  7. 7.
    Uso del anticuerpo Sp35 aislado o fragmento de éste de una cualquiera de las reivindicaciones 1-3 en la preparación de un medicamento para tratar una lesión en el SNC en un animal.
  8. 8.
    Uso del anticuerpo Sp35 aislado o fragmento de éste de una cualquiera de las reivindicaciones 1-3 en la preparación de un medicamento para tratar una enfermedad seleccionada del grupo que consiste en: esclerosis múltiple (MS), leucoencefalopatía multifocal progresiva (PML), encefalomielitis (EPL), mielinolisis pontina central (CPM), adrenoleucodistrofia, enfermedad de Alexander, enfermedad de Pelizaeus Merzbacher (PMZ), Leucodistrofia de células Globoides (enfermedad de Krabbe) y Degeneración Walleriana, neuritis óptica, mielitis transversa, esclerosis lateral amiotrófica (ALS), enfermedad de Huntington, enfermedad de Alzheimer, enfermedad de Parkinson, lesión en la médula espinal, lesión cerebral traumática, lesión posterior a radiación, complicaciones neurológicas de la quimioterapia, ictus, neuropatía óptica isquémica aguda, deficiencia de vitamina E, síndrome de deficiencia de vitamina E aislado, síndrome de Bassen-Kornzweig, síndrome de Marchiafava-Bignami, leucodistrofia metacromática, neuralgia del trigémino y parálisis de Bell en un animal.
  9. 9.
    El uso de la reivindicación 8, en el que la enfermedad o trastorno es esclerosis múltiple.
  10. 10.
    El anticuerpo Sp35 aislado o fragmento de éste de una cualquiera de las reivindicaciones 1-3, para uso en el tratamiento de una lesión en el SNC en un animal.
  11. 11.
    El anticuerpo Sp35 aislado o fragmento de éste de una cualquiera de las reivindicaciones 1-3, para uso en el tratamiento de una enfermedad seleccionada del grupo que consiste en: esclerosis múltiple (MS), leucoencefalopatía multifocal progresiva (PML), encefalomielitis (EPL), mielinolisis pontina central (CPM), adrenoleucodistrofia, enfermedad de Alexander, enfermedad de Pelizaeus Merzbacher (PMZ), Leucodistrofia de células Globoides (enfermedad de Krabbe) y Degeneración Walleriana, neuritis óptica, mielitis transversa, esclerosis lateral amiotrófica (ALS), enfermedad de Huntington, enfermedad de Alzheimer, enfermedad de Parkinson, lesión en la médula espinal, lesión cerebral traumática, lesión posterior a radiación, complicaciones neurológicas de la quimioterapia, ictus, neuropatía óptica isquémica aguda, deficiencia de vitamina E, síndrome de deficiencia de vitamina E aislado, síndrome de Bassen-Kornzweig, síndrome de Marchiafava-Bignami, leucodistrofia metacromática, neuralgia del trigémino y parálisis de Bell en un animal.
  12. 12.
    El anticuerpo Sp35 aislado o fragmento de éste de la reivindicación 11, en el que la enfermedad o trastorno es esclerosis múltiple.
  13. 13.
    Un método in vitro para inhibir la transducción de la señal por NgR1, que comprende poner en contacto el NgR1 con una cantidad eficaz del anticuerpo Sp35 aislado o fragmento de éste de una cualquiera de las reivindicaciones 1-3.
  14. 14.
    Una célula huésped que comprende;
    (a)
    dos vectores de expresión,
    en el que el primer vector de expresión codifica la región VH del anticuerpo o fragmento de una cualquiera de las reivindicaciones 1-3 y el segundo vector de expresión codifica la región VL del anticuerpo o fragmento de una cualquiera de las reivindicaciones 1-3; o
    (b)
    un único vector de expresión que codifica tanto la región VH del anticuerpo o fragmento de una cualquiera de las reivindicaciones 1-3 como la región VL del anticuerpo o fragmento de una cualquiera de las reivindicaciones 1-3.
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