ES2262228T3 - Produccion fermentativa de compuestos valiosos a escala industrial empleando medios quimicamente definidos. - Google Patents
Produccion fermentativa de compuestos valiosos a escala industrial empleando medios quimicamente definidos.Info
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Abstract
La presente invención describe el uso de medios químicamente definidos para la producción fermentativa de compuestos valiosos a escala industrial. Las cepas microbianas que son adecuadas para fermentación a escala industrial utilizando un medio químicamente definido incluyen cepas fúngicas, de levaduras y bacterianas. Las cepas adecuadas pueden obtenerse como cepas de tipo natural o mediante cribado y selección después de tratamiento mutagénico o transformación de ADN.
Description
Producción fermentativa de compuestos valiosos a
escala industrial empleando medios químicamente definidos.
La presente invención se refiere al campo de la
fermentación, es decir a la producción fermentativa de compuestos
valiosos, tales como metabolitos primarios o secundarios, péptidos o
proteínas farmacéuticas, o enzimas industriales.
Muchos compuestos valiosos son fabricados
mediante producción fermentativa en grandes fermentadores, a escala
industrial, es decir el microorganismo que produce un compuesto
valioso de interés es cultivado bajo condiciones controladas en un
fermentador de 10 a 300 m^{3}. En los procesos actuales de
fermentación a escala industrial, típicamente el organismo de
producción es fermentado en un medio de fermentación complejo. Se
entiende por medio de fermentación complejo un medio que comprende
una fuente compleja de nitrógeno y/o de carbono, tal como harina de
soja, harina de semilla de algodón, licor de maíz macerado, extracto
de levadura, hidrolizado de caseína, melaza, y similares.
Las ventajas de los medios complejos son que las
materias primas complejas constituyentes no son costosas, son
fáciles de adquirir y forman una fuente completa o casi completa de
nutrientes para los microorganismos, conteniendo una fuente de
carbono y nitrógeno así como de vitaminas y minerales. Además, la
mezcla de macromoléculas biológicas, como las que se encuentran en
las materias primas complejas, al igual que en las proteínas,
carbohidratos, lípidos, y similares, necesitan ser degradadas por
las enzimas excretadas por los microorganismos antes de su consumo.
Como consecuencia, pequeñas moléculas consumibles pueden hacerse
disponibles incluso a través del fermentador y durante el proceso
de fermentación, evitando así los gradientes de concentración y los
problemas de mezclado y manteniendo el nivel de esas pequeñas
moléculas consumibles por debajo de concentraciones controlables.
Además, esas macromoléculas así como los ácidos orgánicos también
presentes en los medios complejos, proporcionan al medio una
capacidad reguladora, que de esta manera facilita el control del
pH.
Además de estas ventajas, los medios de
fermentación complejos tienen varias desventajas importantes. La más
significativa es que las materias primas complejas tienen una
composición químicamente indefinida y una calidad variable, entre
otras cosas debido a la variación de las estaciones y al origen
geográfico diferente. Ya que la composición del medio de
fermentación tiene una influencia importante en parámetros de la
fermentación tales como la viscosidad, la transferencia de calor y
la transferencia de oxígeno, los materiales de materias primas
complejas son la causa principal de la variabilidad del proceso.
Adicionalmente, obstaculizan el buen desarrollo del proceso y
pueden influir negativamente en la calidad del producto final. Por
ejemplo, los caldos de fermentación, en particular los
microorganismos filamentosos, pueden mostrar una filtrabilidad
disminuida cuando se emplean materias primas complejas.
Las materias primas complejas también pueden
contener compuestos que involuntariamente se acumulan en o se
aíslan conjuntamente con el producto final. Los metales pesados, los
pesticidas o los herbicidas son ejemplos de los compuestos
indeseables que pueden estar presentes en las materias primas
complejas. Además, las materias primas complejas pueden contener o
pueden conducir a la formación de toxinas.
Otras desventajas son que los medios complejos
generan un olor desagradable durante la esterilización y producen
corrientes de residuos no deseadas.
A pesar de las desventajas identificadas
anteriormente asociadas al uso de los medios complejos, estos medios
continúan siendo los preferidos para los procesos industriales de
fermentación a gran escala. Existen varias razones por las que los
medios que no contienen materias primas complejas, es decir los
medios químicamente definidos, no han sido considerados para el uso
en los procesos de fermentación a escala industrial. Una razón
obvia es la encontrada en las ventajas asociadas con el uso de
medios complejos. Lo que es más importante, se consideró que los
rendimientos del producto que serían obtenidos usando medios
químicamente definidos a escala industrial serían típicamente
sustancialmente inferiores que aquellos obtenidos usando medios que
contienen materias primas complejas. Además, las cepas microbianas
de alta producción que han sido desarrolladas por procesos
industriales en los medios complejos no pueden conservar su buen
rendimiento en los medios químicamente definidos. Una razón para
que tengan un rendimiento no satisfactorio en un medio químicamente
definido, pudiera ser que las cepas industriales actuales han
sufrido varias series de mutagénesis y selecciones, sin considerar
su ejecución en los medios químicamente
definidos.
definidos.
Los medios químicamente definidos de esta manera
han sido muy aplicados sólo para fines investigativos, es decir en
cultivos de laboratorio en placas Petri y/o frascos de agitación o a
una escala fermentativa relativamente pequeña que típicamente no
excede un volumen de alrededor de 20-40 L. Ver por
ejemplo la producción fermentativa de metabolitos secundarios, tal
como la penicilina (Jarvis y Johnson, J. Am. Chem. Soc. 69,
3010-3017 (1947); Stone, y Farrell, Science 104,
445-446 (1946); White y otros, Arch. Biochem.
8, 303-309 (1945)), clavulanic acid (Romero y
otros, Appl. Env. Microbiol. 52, 892-897 (1986)
y erythromycin (Bushell y otros, Microbiol. 143,
475-480 (1997)).
Sin embargo, las investigaciones sobre el uso de
los medios químicamente definidos a tales escalas de investigación
pequeñas no proporcionan ninguna enseñanza a la persona experta en
el arte con respecto al campo de aplicación de esos medios en los
procesos de fermentación industrial a gran escala con fines
productivos, que típicamente tienen una escala de volumen de
alrededor de 10 m^{3} o mayor.
Para evitar los problemas asociados con el uso
de las recetas convencionales para los medios complejos en la
práctica industrial actual, sería deseable aplicar las recetas
definidas químicamente para las fermentaciones a escala
industrial.
Aquí, se describe el uso de los medios
químicamente definidos para los procesos de fermentación a escala
industrial, permitiendo -en combinación con una cepa apropiada- la
producción de compuestos valiosos, tales como metabolitos primarios
o secundarios, péptidos o proteínas farmacéuticas, o enzimas
industriales, con un rendimiento económicamente atractivo.
La presente invención describe un proceso
industrial para la producción de un compuesto valioso, que comprende
los pasos de fermentación de una cepa microbiana en un medio de
fermentación que es un medio químicamente definido compuesto
esencialmente por constituyentes químicamente definidos y la
recuperación del compuesto valioso a partir del caldo de
fermentación.
La presente invención describe además un método
para preparar y/o mejorar una cepa microbiana que produce un
compuesto valioso de interés que es capaz de ser fermentado a escala
industrial en un medio químicamente definido, que comprende los
pasos de:
- \bigstar
- someter una cepa madre apropiada a un tratamiento mutagénico seleccionado del grupo de medios físicos y mutágenos químicos, y/o a la transformación del ADN,
- \bigstar
- clasificar los transformantes y/o mutantes resultantes según su grado de crecimiento en un medio químicamente definido y su nivel de producción de dicho compuesto valioso de interés.
- \bigstar
- seleccionar los mutantes que tienen un grado de crecimiento mejorado o similar en un medio químicamente definido y/o un nivel de producción mejorado de dicho compuesto valioso de interés en comparación con dicha cepa madre.
La presente invención describe el uso de los
medios de fermentación químicamente definidos para la fermentación
a escala industrial de una cepa microbiana apropiada, dicha cepa
microbiana apropiada siendo capaz de producir un compuesto
valioso.
A lo largo de la descripción de la invención, se
entiende que un proceso de fermentación a escala industrial o un
proceso industrial incluye un proceso de fermentación a una escala
de volumen que es \geq 10 m^{3}, preferiblemente \geq 25
m^{3}, más preferiblemente \geq 50 m^{3}, lo más preferido
\geq 100 m^{3}.
Se entiende que el término "químicamente
definido" debe usarse para los medios de fermentación que están
compuestos esencialmente por constituyentes químicamente definidos.
Un medio de fermentación que está esencialmente compuesto por
constituyentes químicamente definidos incluye un medio que no
contiene una fuente compleja de carbono y/o nitrógeno, es decir que
no contiene materias primas complejas que tengan una composición
químicamente indefinida. Un medio de fermentación que esté
compuesto esencialmente por constituyentes químicamente definidos
puede incluir además un medio que comprenda una cantidad
esencialmente pequeña de una fuente compleja de nitrógeno y/o de
carbono, una cantidad como la que se define a continuación, la cual
típicamente no es suficiente para mantener el crecimiento del
microorganismo y/o para garantizar la formación de una cantidad
suficiente de biomasa.
En tal sentido, las materias primas complejas
tienen una composición químicamente indefinida debido al hecho de
que, por ejemplo, esas materias primas contienen muchos compuestos
diferentes, entre ellos los compuestos heteropoliméricos complejos,
y tienen una composición variable debido a la variación de las
estaciones y las diferencias en el origen geográfico. Ejemplos
típicos de materias primas complejas que funcionan como una fuente
compleja de carbono y/o nitrógeno en la fermentación son harina de
soja, harina de semilla de algodón, licor de maíz macerado,
extracto de levadura, hidrolizado de caseína, melaza, y
similares.
Una cantidad esencialmente pequeña de una fuente
compleja de carbono y/o nitrógeno pudiera estar presente en el
medio químicamente definido de acuerdo a la invención, por ejemplo
como arrastre desde el inóculo para la fermentación principal. El
inóculo para la fermentación principal no es necesariamente obtenido
por fermentación en un medio químicamente definido. Lo más
frecuente, el arrastre del inóculo será detectado mediante la
presencia de una pequeña cantidad de una fuente compleja de
nitrógeno en un medio químicamente definido para la fermentación
principal.
Puede ser ventajoso usar una fuente compleja de
carbono y/o nitrógeno en el proceso de fermentación del inóculo
para la fermentación principal, por ejemplo para agilizar la
formación de la biomasa, es decir aumentar la tasa de crecimiento
del microorganismo, y/o facilitar el control interno del pH. Por la
misma razón, puede ser ventajoso adicionar una cantidad
esencialmente pequeña de una fuente compleja de carbono y/o
nitrógeno, por ejemplo extracto de levadura, a la etapa inicial de
la fermentación principal, especialmente para agilizar la formación
de biomasa en la etapa temprana del proceso de fermentación.
Una cantidad esencialmente pequeña de una fuente
compleja de carbono y/o nitrógeno la cual puede estar presente en
el medio químicamente definido de acuerdo con la invención es
definida como una cantidad de a lo máximo alrededor de 10% de la
cantidad total de carbono y/o nitrógeno (Kjeldahl N) que está
presente en el medio químicamente definido, preferiblemente una
cantidad de a lo máximo 5% de la cantidad total de carbono y/o
nitrógeno, más preferiblemente una cantidad de a lo máximo 1% de la
cantidad total de carbono y/o nitrógeno. Lo más preferido es que no
esté presente ninguna fuente compleja de carbono y/o nitrógeno en el
medio químicamente definido de acuerdo a la invención.
Se entiende que el término "medio químicamente
definido" como es usado en la presente invención incluye un
medio en el que todos los componentes necesarios son adicionados al
medio antes de comenzar el proceso de fermentación, y además
incluye un medio donde parte de los componentes necesarios son
adicionados antes del comienzo y parte son adicionados al medio
durante el proceso de fermentación.
La presente invención describe además que las
cepas microbianas son capaces de convertir, a escala industrial,
las materias primas simples del medio químicamente definido en una
cantidad económicamente atractiva del producto valioso. Es
sorprendente encontrar que la productividad de las cepas microbianas
en el medio químicamente definido, cuando es medida a escala
industrial, pueda ser comparable a o en algunos casos incluso mayor
que su productividad en el medio complejo.
Una ventaja adicional del uso del medio
químicamente definido en comparación con el uso del medio complejo
es que la transferencia de oxígeno de la fase gaseosa a la fase
líquida y la transferencia de dióxido de carbono de la fase líquida
a la gaseosa es sustancialmente mejorada. Como es conocido por los
expertos en el arte, las concentraciones de dióxido de carbono
disuelto y oxígeno disuelto son dos factores importantes en el
escalado de un proceso de fermentación, y pueden determinar la
factibilidad económica de un proceso industrial. La transferencia
de masa mejorada obtenida usando el medio químicamente definido
puede ser atribuido a la ausencia en estos medios de cantidades
importantes de compuestos que promueven la coalescencia de burbujas
de gas. Los compuestos promotores de la coalescencia por ejemplo
pueden ser encontrados entre ciertos compuestos hidrofóbicos y/o
poliméricos presentes en las materias primas complejas. La
coalescencia de burbujas de gas típicamente resulta en un
coeficiente de transferencia de masa más bajo (van 't Riet y
Tramper, en: Basic Bioreactor Design, pp 236-273
(1991)).
Frecuentemente la transferencia de oxígeno es un
factor limitante en los procesos de fermentación, especialmente en
las fermentaciones de microorganismos filamentosos. La capacidad de
transferencia de oxígeno mejorada obtenida cuando la fermentación
es realizada usando un medio químicamente definido de acuerdo con la
invención proporciona una vía mucho más barata de optimización de
la productividad que las inversiones en equipamiento, la entrada de
energía, el enriquecimiento de oxígeno del aire de entrada o la
presión del fermentador.
En los procesos de fermentación industriales,
los microorganismos filamentosos, como las bacterias filamentosas
tal como Actinomycetes u hongos filamentosos tales como el
Penicillium o el Aspergillus, típicamente son cultivados teniendo
una morfología de gránulo. En este sentido, las proteínas y los
péptidos presentes en el medio de fermentación complejo tienen la
tendencia a producir gránulos esponjosos, los cuales fácilmente se
desintegran sobre el micelio dispersado con hifas muy largas y
ramificadas como consecuencia de las altas tasas de crecimiento que
típicamente son obtenidas usando medios complejos. Por tanto, una
morfología de gránulo esponjosa generalmente puede causar una
viscosidad del caldo indeseablemente alta. El uso de medios
químicamente definidos tiene una influencia favorable en la
morfología, por ejemplo produciendo un gránulo más rígido que no se
desintegra fácilmente durante la fermentación. De esta forma, una
disminución significativa de la viscosidad de los caldos de
fermentación filamentosos puede ser obtenida usando medios
químicamente definidos. Ya que una baja viscosidad del caldo de
fermentación es ventajosa para la formación del producto, el control
de la viscosidad es de suma importancia en el proceso de
fermentación a escala industrial.
Otra ventaja del uso de los medios químicamente
definidos es encontrada en el proceso aguas abajo del producto.
Para ciertas combinaciones de producto-cepa,
especialmente cuando las cepas filamentosas son fermentadas, el
proceso aguas abajo es mejorado significativamente usando medios
químicamente definidos.
Un medio químicamente definido a ser usado en el
proceso de la invención típicamente debe contener los así llamados
elementos estructurales y catalíticos.
Los elementos estructurales son aquellos
elementos que están constituidos por macromoléculas microbianas, es
decir hidrógeno, oxígeno, carbono, nitrógeno, fósforo y azufre. Los
elementos estructurales hidrógeno, oxígeno, carbono y nitrógeno
típicamente están contenidos dentro la fuente de carbono y
nitrógeno. El fósforo y el azufre típicamente son adicionados como
iones tiosulfatos y/o sulfatos y fosfatos.
El tipo de fuente de carbono y nitrógeno que es
usada en el medio químicamente definido no es decisivo para la
invención, a condición de que la fuente de carbono y nitrógeno tenga
un esencialmente un carácter químicamente definido.
Preferiblemente, una fuente de carbono es
seleccionada del grupo que consiste de carbohidratos tales como
glucosa, lactosa, fructosa, sacarosa, maltodextrina, almidón e
inulina, glicerol, aceites vegetales, hidrocarburos, alcoholes
tales como el metanol y el etanol, ácidos orgánicos como el acetato
y los ácidos alcanoicos superiores. Más preferiblemente, una fuente
de carbono es seleccionada del grupo que consiste de glucosa,
sacarosa y aceite de soja. Lo más preferido, la fuente de carbono
es glucosa. Se entiende que el término "glucosa" incluye
siropes de glucosa, es decir composiciones de glucosa que contienen
oligómeros de glucosa en cantidades definidas.
Preferiblemente, una fuente de nitrógeno es
seleccionada del grupo que consiste de urea, amoníaco, nitrato,
sales de amonio tales como el sulfato de amonio, el fosfato de
amonio y el nitrato de amonio, y aminoácidos tales como el
glutamato y la lisina. Más preferiblemente, una fuente de nitrógeno
es seleccionada a partir del grupo que consiste de amoníaco,
sulfato de amonio y fosfato de amonio. Lo más preferido, la fuente
de nitrógeno es amoníaco. El uso de amoníaco como fuente de
nitrógeno tiene la ventaja de que el amoníaco adicionalmente puede
funcionar como un agente controlador del pH. En el caso de que el
sulfato de amonio y/o el fosfato de amonio se usen como fuente de
nitrógeno, parte o todo el requerimiento de azufre y/o fósforo del
microorganismo puede ser satisfecho.
Los elementos catalíticos son aquellos elementos
los cuales son constituyentes de las enzimas o cofactores de
enzimas. Estos elementos son por ejemplo magnesio, hierro, cobre,
calcio, manganeso, zinc, cobalto, molibdeno, selenio, bario.
Junto a estos elementos estructurales y
catalíticos, cationes tales como iones de potasio y sodio debieran
estar presentes para actuar como ión contador y para el control del
pH intracelular y la osmolaridad.
Los compuestos que pueden opcionalmente estar
incluidos en un medio químicamente definido son los agentes
quelatantes, tal como el ácido cítrico, y los agentes buffer tal
como el fosfato de mono- y dipotasio, el carbonato de calcio, y
similares. Los agentes buffer preferiblemente son adicionados cuando
se trata de procesos sin un control de pH externo. Además, un
agente antiespumante puede ser dosificado antes y/o durante el
proceso de fermentación.
Las macromoléculas y los ácidos orgánicos que
están presentes en los medios complejos proporcionan una capacidad
buffer en estos medios. Debido a la ausencia de estos compuestos en
los medios químicamente definidos, se el control del pH es más
difícil en los medios químicamente definidos que en los complejos.
La presente invención muestra que un control de pH donde un ácido o
una base pueden ser dosificados, en dependencia del desarrollo del
pH en el cultivo, permite un perfil de pH apropiado en los procesos
químicamente definidos a escala industrial.
Vitaminas se refiere a un grupo de componentes
orgánicos estructuralmente no relacionados necesarios para el
metabolismo normal de los microorganismos. Los microorganismos son
conocidos que varían ampliamente en cuanto a su capacidad de
sintetizar las vitaminas que requieren. Una vitamina debe ser
adicionada al medio de fermentación de un microorganismo incapaz de
sintetizar dicha vitamina. Típicamente, los medios de fermentación
químicamente definidos para levaduras o bacterias o para ciertos
hongos inferiores, por ejemplo, Mucorales, pueden ser suplementados
con una o más vitaminas. Los hongos superiores lo más frecuentemente
no tienen requerimientos de vitaminas.
Las vitaminas son seleccionadas del grupo de
tiamina, riboflavina, piridoxal, ácido nicotínico o nicotinamida,
ácido pantoténico, cianocobalamina, ácido fólico, biotina, ácido
lipoideo, purinas, pirimidinas, inositol, colina y hemina.
Los elementos estructurales y catalíticos y,
opcionalmente, las vitaminas son necesarios para el crecimiento del
microorganismo, es decir para la formación de la biomasa.
La cantidad de compuestos necesarios, es decir
compuestos que comprenden elementos estructurales y catalíticos y,
opcionalmente, vitaminas, a ser adicionadas al medio químicamente
definido, dependerá fundamentalmente de la cantidad de biomasa a
ser formada en el proceso de fermentación. La cantidad de biomasa
formada puede variar ampliamente, típicamente desde alrededor de 10
a alrededor de 150 g/l del caldo de fermentación. En general, las
fermentaciones que producen una cantidad de biomasa menor que
alrededor de 10 g/l no tienen importancia desde el punto de vista
industrial.
Además, la cantidad óptima de cada constituyente
de un medio definido, así como los compuestos que son esenciales y
los no esenciales, dependerán del tipo de microorganismo que se
someta a la fermentación en un medio definido, o de la cantidad de
biomasa y del producto que se forme. El uso de los medios
químicamente definidos de esta manera ventajosamente permiten una
variación de la concentración de cada componente del medio
independientemente de los otros componentes, posibilitando así la
optimización de la composición del medio.
Para la formación del producto, puede que sea
necesario suplementar el medio químicamente definido con compuestos
adicionales y/o aumentar la concentración de ciertos compuestos ya
presentes en el medio químicamente definido por encima del nivel
que es necesario para el crecimiento de los microorganismos. La
función de dichos compuestos puede ser inducir y/o mejorar la
producción de un compuesto deseado por el microorganismo, o hacer
que funcionen como un precursor para un compuesto deseado.
Ejemplos de compuestos a ser suplementados y/o a
ser adicionados en una cantidad incrementada a un medio
químicamente definido son: sulfato en una cantidad incrementada para
la producción de compuestos de \beta-lactama,
compuestos que contengan nitrógeno en una cantidad incrementada para
la producción de aminoácidos, especialmente aminoácidos básicos,
ácido fenilacético para la producción de penicilina G, ácido
fenoxiacético para la producción de penicilina V, ácido adípico
para la producción de adipil-7-ADCA
y adipil-7-ACA, ácido propiónico
para la producción de eritromicina.
En un proceso de fermentación industrial de
acuerdo con la invención, la cantidad total de fuente de carbono
adicionada al medio químicamente definido, expresada como cantidad
de carbono/litro del medio, puede variar desde 10 a 200 g C/l
preferiblemente desde 20 a 200 g C/l.
La cantidad total de fuente de nitrógeno
adicionada al medio químicamente definido puede variar desde 0.5
hasta 50 g N/l, preferiblemente desde 1 hasta 25 g N/l, donde N se
expresa como nitrógeno de Kjekdahl.
La proporción entre la fuente de carbono y
nitrógeno en una fermentación puede variar considerablemente, donde
un determinante para la proporción óptima entre la fuente de carbono
y de nitrógeno es la composición elemental del producto a ser
formado.
Los compuestos adicionales requeridos para el
crecimiento de un microorganismo, como el fosfato, el sulfato o los
oligoelementos, deben ser adicionados usando los rangos de
concentración indicados en la Tabla 1 como una guía. Los rangos de
concentración de estos compuestos adicionales pueden variar entre
las diferentes clases de microorganismos, es decir entre hongos,
levaduras y bacterias.
Generalmente, las concentraciones de vitaminas
caen dentro del rango de 0.1 (biotina) a 500
(mio-inositol) mg/l.
Típicamente, la cantidad de componentes del
medio necesarios para el crecimiento de un microorganismo puede ser
determinado en relación con la cantidad de fuente de carbono usada
en la fermentación, ya que la cantidad de biomasa formada será
determinada principalmente por la cantidad de fuente de carbono
usada.
\vskip1.000000\baselineskip
Hongo | Levaduras | Bacteria | |
(Actinomycetes) | |||
PO_{4}^{1,5} | 1-20 | ||
SO_{4}^{2,5} | |||
MgSO_{4}.7aq^{3} | 0.5-10 | 0.5-2 | 0.5-2 |
CaCl_{2}.2aq^{3} | 0.01-0.1 | 0.1-1 | 0.05-0.5 |
FeSO_{4}.7aq^{3} | 0.1-1.0 | 0.1-0.5 | 0.1-0.5 |
ZnSO_{4}.7aq^{3} | 0.0005-0.1 | 0.002-1 | 0.002-0.1 |
MnSO_{4}.1aq^{3} | 0.0005-0.1 | 0.002-1 | 0.002-0.1 |
CuSO_{4}.5aq^{3,4} | \leq 0.005 | 0.001-0.01 | 0.001-0.01 |
CoSO_{4}.7aq^{3,4} | \leq 0.01 | \leq0.01 | \leq0.01 |
Na_{2}MoO_{4}.2aq^{4} | \leq 0.0005 | 0.001-0.005 | 0.001-0.005 |
H_{3}BO_{3}^{4} | \leq 0.0005 | 0.001-0.005 | 0.001-0.005 |
KI^{4} | \leq0.002 | \leq0.002 | |
^{1} \begin{minipage}[t]{155mm} La cantidad basal de fosfato necesaria será de 0.5-1% del peso seco de la biomasa. Para los procesos por lote a escala relativamente pequeña, fosfato extra será requerido para el control del pH.\end{minipage} | |||
^{2} El sulfato también puede ser dosificado a través del reactivo de valoración, como el K^{+} y Na^{+}. | |||
^{3} \begin{minipage}[t]{155mm} El sulfato puede ser reemplazado (parcialmente) por cloruro como ión contador en los oligoelementos, o viceversa.\end{minipage} | |||
^{4} \begin{minipage}[t]{155mm} Los límites inferiores son difíciles de definir para algunos oligoelementos. Por ejemplo sus requerimientos pueden conocerse por su presencia en otros componentes del medio, por ejemplo sulfato ferroso, agua, cantidades pequeñas de extracto de levadura, etc.\end{minipage} | |||
^{5} \begin{minipage}[t]{155mm} El fosfato y el sulfato son adicionados como sales de potasio, amonio y/o sodio, con una preferencia de K > NH_{4} > Na.\end{minipage} |
\newpage
Un proceso de fermentación industrial de acuerdo
a la invención que usa un medio químicamente definido puede ser
realizado como un proceso de fermentación por lote, por lote
repetido, por lote de alimentación, por lote de alimentación
repetido, o como un proceso continuo.
En un proceso por lote, todos los componentes
del medio son adicionados al medio directamente, como un todo,
antes de comenzar el proceso de fermentación.
En un proceso por lote repetido, tiene lugar una
cosecha parcial del caldo acompañada de una suplementación parcial
del medio completo, opcionalmente repetida varias veces.
En un proceso por lote de alimentación, ninguno
o parte de los compuestos que incluyen uno o más de los elementos
estructurales y/o catalíticos es adicionada al medios antes del
comienzo de la fermentación y/o todo o la parte remanente,
respectivamente de los compuestos que comprenden uno o más de los
elementos estructurales y/o catalíticos son alimentados durante el
proceso de fermentación. Los compuestos que son seleccionados para
la alimentación pueden ser alimentados juntos o separados uno del
otro al proceso de fermentación.
Especialmente en un proceso de fermentación
donde el medio de fermentación original es diluido alrededor dos
veces o más mediante una alimentación de los componentes que
comprenden uno o más de los elementos estructurales, la
alimentación puede adicionalmente comprender, elementos catalíticos
y componentes adicionales del medio, junto a los elementos
estructurales.
En un proceso por lote de alimentación repetido
o en un proceso de fermentación continua, el medio de partida
completo es adicionalmente alimentado durante la fermentación. El
medio de partida puede ser alimentado junto con o separado de
la(s) alimentación(es) del (de los) elemento(s)
estructural(es). En un proceso por lote de alimentación
repetido, parte del caldo de fermentación que comprende la biomasa
es eliminado a intervalos de tiempo regulares, mientras en un
proceso continuo, la eliminación de parte del caldo de fermentación
ocurre de manera continua. El proceso de fermentación es de esta
manera rellenado con una porción nueva del medio que se corresponde
a la cantidad de caldo de fermentación eliminado.
En una realización preferida de la invención, un
proceso por lote de alimentación o lote de alimentación repetido es
aplicado, donde la fuente de carbono y/o nitrógeno y/o el fosfato
son alimentadas al proceso de fermentación. En una realización más
preferida, la fuente de carbono y nitrógeno es alimentada al proceso
de fermentación. Lo más preferido, la fuente de carbono y
nitrógeno, así como el fosfato son alimentados. En este sentido,
una fuente de carbono preferida es la glucosa y una fuente de
nitrógeno preferida es el amoníaco y/o las sales de amonio.
Típicamente el uso de un proceso por lote de
alimentación permite el uso de una cantidad considerablemente
superior de fuente de carbono y nitrógeno que la que se usa en un
proceso por lotes. Específicamente, la cantidad de fuente de
carbono y nitrógeno aplicada en un proceso por lote de alimentación
puede ser al menos alrededor de dos veces mayor que la cantidad
máxima aplicada en un proceso por lote. Esto, a su vez, conduce a
una cantidad considerablemente mayor de biomasa formada en un
proceso por lote de alimentación.
Un aspecto adicional de la presente invención
concierne a la opción del proceso aguas abajo del caldo de
fermentación. Después que finaliza el proceso de fermentación,
opcionalmente el producto valioso puede ser recuperado del caldo de
fermentación, usando una tecnología estándar desarrollada para el
compuesto valioso de interés. La tecnología del proceso aguas abajo
relevante a aplicada depende de esta forma de la ubicación natural y
celular del compuesto valioso. Ante todo, la biomasa es separada
del fluido de fermentación usando por ejemplo centrifugación o
filtración. El compuesto valioso entonces es recuperado de la
biomasa, en caso de que el producto valioso se haya acumulado
dentro o esté asociado a las células microbianas. Por el contrario,
cuando el producto valioso es excretado de la célula microbiana,
este es recuperado desde el fluido de fermentación.
El uso de un medio químicamente definido en la
producción fermentativa industrial de un compuesto valioso de
interés produce una gran ventaja en el proceso aguas abajo, ya que
la cantidad de bioproductos es sustancialmente menor que cuando se
usan medios complejos. Además, la calidad del producto es mejorada,
debido a que ningún bioproducto indeseado es
co-aislado con el compuesto de interés.
En aún otro aspecto adicional de la presente
invención, una cepa apropiada para un proceso de fermentación
industrial usando un medio químicamente definido es
identificada.
Una cepa microbiana apropiada para un proceso de
fermentación industrial, que usa un medio químicamente definido
puede ser cualquier cepa de tipo natural que produzca un compuesto
valioso de interés, a condición que dicha cepa de tipo natural
tenga un buen grado de crecimiento en un medio químicamente
definido. Además, una cepa microbiana apropiada para un proceso de
fermentación industrial que usa un medio químicamente definido puede
ser una cepa que es obtenida y/o mejorada sometiendo una cepa madre
de interés a un tratamiento mutagénico clásico o a la
transformación del ADN recombinante, también con la condición de que
el mutante resultante o la cepa microbiana transformada tenga un
buen grado de crecimiento en un medio químicamente definido. Por lo
tanto dependerá del grado de crecimiento de la cepa madre en un
medio químicamente definido el hecho de que el mutante resultante o
las cepas transformadas tengan un grado de crecimiento similar o
mejorado en un medio químicamente definido en comparación con aquel
de la cepa madre.
Se entiende que una cepa microbiana tendrá un
buen grado de crecimiento en un medio químicamente definido si
dicha cepa tiene una tasa de crecimiento específico (\mu) en un
medio químicamente definido que es \geq 0.05
h^{-1},preferiblemente \geq 0.1 h^{-1}, más preferiblemente
\geq 0.2 h^{-1}, lo más preferido 0.4 h^{-1}. El grado de
crecimiento de una cepa microbiana en un medio químicamente definido
es analizado convenientemente mediante la fermentación de dicha
cepa en un medio químicamente definido a una escala relativamente
pequeña, por ejemplo en un cultivo en un frasco de agitación y/o una
fermentación a escala de laboratorio de 10 L. Es preferido incluir
una fermentación a escala de laboratorio de 10 L, con un control de
pH, de temperatura y de concentración de oxígeno, en el análisis de
dicho grado de crecimiento.
En una realización de la invención, cepas
microbianas capaces de ser fermentadas en un medio químicamente
definido son obtenidas y/o mejoradas sometiendo una cepa madre de
interés a un tratamiento mutagénico clásico usando medios físicos,
tales como irradiación UV, o un mutágeno químico apropiado, tal como
el
N-metil-N'-nitro-N-nitrosoguanidina
o sulfonato de etilmetano. En otra realización de la invención,
cepas microbianas que son capaces de ser fermentadas en un medio
químicamente definido son obtenidas y/o mejoradas sometiendo una
cepa madre de interés a la
tecnología del ADN recombinante, donde la cepa madre es transformada con uno o más genes funcionales de interés.
tecnología del ADN recombinante, donde la cepa madre es transformada con uno o más genes funcionales de interés.
En general, la presente invención prevé dos
grupos de cepas madres de interés que serán sometidas a la
mutagénesis clásica y/o a la transformación del ADN. En una
realización de la invención, una cepa madre de interés es
seleccionada del grupo de cepas que tienen un buen grado de
crecimiento en un medio químicamente definido, pero que necesita
ser mejoradas con respecto a su nivel de producción de un compuesto
de interés. En otra realización de la invención, una cepa madre de
interés es seleccionada del grupo de cepas que tiene un nivel de
producción alto de un compuesto de interés, pero que tiene un grado
de crecimiento relativamente malo en un medio químicamente
definido. Se considera que las cepas microbianas con una tasa de
crecimiento específico menor a alrededor de 0.05 h^{-1} tienen un
grado de crecimiento relativamente malo en un medio químicamente
definido.
Ambos procesos, el tratamiento mutagénico
clásico así como el proceso de transformación de ADN, son seguidos
por una clasificación de los transformantes o mutantes resultantes
por su grado de crecimiento en un medio químicamente definido así
como por su nivel de producción de un compuesto de interés. Las
cepas mutantes o los transformantes son seleccionados que tengan un
buen grado de crecimiento en un medio químicamente definido y/o un
mejor nivel de producción mejorado de un compuesto de interés en
comparación con la cepa madre.
Debe ser notado que algunas cepas microbianas,
en particular cepas industriales, que ya han sido sometidas a un
tratamiento mutagénico extensivo para mejorar sus niveles de
producción, pueden tener un mal desempeño o puede que no crezcan en
lo absoluto en un medio químicamente definido. Tal mal desempeño o
la falta de crecimiento de una cepa mutagenizada puede ser
provocado por el hecho de que el crecimiento en un medio
químicamente definido nunca fue aplicado como un criterio para la
selección de mutantes apropiados. Por ejemplo, es posible que una
cepa mutagenizada
posea una mutación que provoque un requerimiento de crecimiento desconocido (mutación auxotrópica desconocida).
posea una mutación que provoque un requerimiento de crecimiento desconocido (mutación auxotrópica desconocida).
Cepas microbianas que son apropiadas para la
fermentación industrial usando un medio químicamente definido
incluyen las cepas filamentosas y no filamentosas. Por ejemplo,
cepas microbianas que son apropiadas para la fermentación en un
medio químicamente definido incluyen cepas de hongos, tales como
Aspergillus, Penicillium o Mucorales, cepas de levadura, tales como
cepas Saccharomyces, Pichia, Phaffia o Kluyveromyces y cepas
bacterianas, tal como Actinomycetes. El uso del medio químicamente
definido de acuerdo a la invención es especialmente ventajoso para
la fermentación industrial de microorganismos filamentosos.
El proceso de acuerdo a la invención que usa un
medio químicamente definido es apropiado para la producción
fermentativa a una escala industrial de cualquier compuesto valioso
de interés, incluyendo los metabolitos primarios o secundarios,
péptidos o proteínas farmacéuticas, o enzimas industriales. Los
compuestos valiosos preferidos son los metabolitos secundarios, tal
antibióticos o compuestos \beta-lactama,
especialmente los antibióticos \beta-lactama.
Ejemplos de combinaciones
producto-cepa incluyen A. niger, por ejemplo
A. niger CBS 513.88, para amiloglucosidasa, A. oryzae
para \alpha-amilasa, A. terreus, por
ejemplo A. terreus CBS 456.95, para lovastatina,
Mortierella alpina para ácido araquidónico o lípido que
contiene ácido araquidónico, Mucor miehei para proteasa,
P. chrysogenum, por ejemplo P. chrysogenum CBS 455.95
u otras cepas apropiadas, para los compuestos
\beta-lactama (penicilina G o V), Streptomyces
clavuligerus, por ejemplo S. clavuligerus ATCC 27064,
para ácido clavulánico, Pichia ciferrii, por ejemplo P.
ciferrii NRRL Y-1031
F-60-10, para
tetracetil-fitosfingosina, Phaffia rodozima,
por ejemplo P. rodozima CBS 6938, para astaxantina,
Sacaropoliespora eritraea para eritromicina, K. lactis
para lactasa, Streptomyces natalensis para natamicina.
La presente invención también considera el uso
de cepas microbianas que son transformadas con uno o más genes
funcionales de interés, que trae como resultado una cepa
transformada que puede sobre-expresar un producto
que ya es producido por dicha cepa, o trae como resultado una cepa
transformada que puede expresar un producto que no es producido de
forma natural por dicha cepa.
De esta manera se deja a elección de la persona
experta qué cepa será seleccionada para la transformación, a
condición de que dicha cepa seleccionada tenga un buen grado de
crecimiento en un medio químicamente definido. Por ejemplo, una
cepa puede ser seleccionada para la transformación que ya ha sido
sometida a uno o más tratamientos mutagénicos. Alternativamente,
una cepa no mutagenisada o de tipo natural puede ser seleccionada.
Junto al análisis del nivel de expresión de un compuesto deseado,
los transformantes obtenidos después de la transformación de una
cepa seleccionada con uno o más genes funcionales de interés deben
ser analizados por su grado de crecimiento en un medio químicamente
definido.
Ejemplos de cepas recombinantes que producen un
producto que de manera natural no son producidos por dicha cepa
son:
- \bigstar
- Streptomyces lividans, por ejemplo S. lividans TK21, que contiene un casete de expresión que permite la expresión de glucosa isomerasa, el gen que codifica para la glucosa isomerasa originándose a partir de por ejemplo Actinoplanes missouriensis,
- \bigstar
- Penicillium chrysogenum, por ejemplo P. chrysogenum CBS 455.95, que contiene uno o más casetes de expresión que permiten la expresión de una expandasa, y opcionalmente, una hidroxilasa y/o una acetiltransferasa, los genes que codifican para la expandasa, hidroxilasa y acetiltransferasa originándose a partir de por ejemplo Acremonium chrysogenum o Streptomyces clavuligerus, permitiendo la producción de compuestos de cefalosporina, tales como el 7-ADCA ó 7-ACA, usando ácido adípico (ver EP 532341) o ácido 3-carboximetiltio-propiónico (vea WO95/04148) como precursor de la cadena lateral,
- \bigstar
- Aspergillus níger, por ejemplo Aspergillus níger CBS 513.88, que contiene un casete de expresión que permite la expresión de lactoferrina humana (vea WO93/22348) o de quimosina bovina.
- \bigstar
- Kluyveromyces lactis, que contiene un casete de expresión que permite la expresión de la quimosina bovina o fosfolipasa A_{2,} insulina o albúmina humana recombinante.
Ejemplos de cepas recombinantes que
sobre-producen una enzima ya producida por dicha
cepa, son:
- \bigstar
- A. niger, por ejemplo A. niger CBS 513.88, que contiene un casete de expresión que permite la sobre-expresión de fitasa (ver EP 420358) o de endoxilanasa I (ver EP 463706).
La presente invención es ejemplificada por un
proceso de fermentación a escala industrial usando un medio
químicamente definido para la producción de glucosa isomerasa por
una cepa de Streptomyces recombinante, y por el uso ventajoso de
medios químicamente definidos para una fermentación de Penicillium a
gran escala en comparación con los medios complejos.
Ejemplos adicionales están dirigidos a medios
químicamente definidos que pueden ser usados para medir el grado de
crecimiento y la productividad de una cepa de interés cuando es
cultivada en dicho medio a pequeña escala, para identificar las
cepas microbianas que son apropiadas para la producción fermentativa
de un compuesto valioso a escala industrial en un medio
químicamente definido.
Figura 1. Esquema de pWGx.GIT.
Figura 2. Desarrollo de una glucosa isomerasa
total producida durante la fermentación.
Ejemplo
1
El gen de la glucosa isomerasa de
Actinoplanes missouriensis fue clonado originalmente como un
fragmento ADN de 5.0 kb en la cepa K12 de E. coli JM101.
Un fragmento de 1.7 kb dentro del fragmento de
5.0 kb, fue encontrado que representa la secuencia de codificación
completa de glucosa isomerasa de A. missouriensis y su región
reguladora aguas arriba (ver también a Amore y Hollenbert (1989),
Nucl. Acids Res. 17, 7515).
Un mutante de glucosa isomerasa que exhibe
termo-estabilidad mejorada fue obtenido cambiando
dentro del gen de la glucosa isomerasa la tripleta AAG que codifica
para la lisina en la posición 253 de la proteína de glucosa
isomerasa por la CGG que codifica para la arginina (Quax y otros
(1991), Bio/Technology 9, 738-742).
Para la clonación el plásmido pIJ486 de
Streptomyces fue usado como un vector (Ward y otros (1986), Mol.
Gen. Genet. 203, 468-478). El fragmento de
ADN del par base 1737 de A. missouriensis que codifica para
la glucosa isomerasa fue combinado con el fragmento de ADN largo
Pst I de pIJ486. El plásmido resultante, llamado pWGx.GIT contenía
esencialmente la región de replicación del plásmido pIJ101, el gen
resistente a la tiostreptona, y el fragmento de ADN de A.
missouriensis que codifica para GIT. Un mapa esquemático de
pWGx.GIT es dado en la Figura 1.
La cepa que produce glucosa isomerasa fue
costruida mediante la transformación de la cepa TK21 de
Streptomyces lividans (Hopwood y otros (1985), Genetic
Manipulation of Streptomyces: A Laboratory Manual. The John Innes
Foundation, Norwich, Inglaterra) con el plásmido pWGx.GIT.
Un banco de células de trabajo de una cepa de
producción construida como se mencionó en el Ejemplo 1 fue preparada
tomando una colonia resistente a la tiostreptona y cultivándola en
20 ml de Caldo de Tryptone Soytone que contiene tiostreptona (50
mg/L) en un frasco de agitación de 100 ml a 30ºC durante
40-48 horas y agitando
280 rpm.
280 rpm.
El micelio equivalente a 1 ml del banco de
células de trabajo (fresco o almacenado como micelio congelado a
-80ºC) es inoculado en 100 ml de un medio de crecimiento inóculo en
un frasco de agitación de 500 ml, que contiene 16 g/L de
Bactopeptona (Difco 0123/01), 4 g/L de Bacto soitona (Difco
0436/01), 20 g/L de hidrolizado de Caseína (Merck 2239), 10 g/L de
fosfato de dipotasio.3aq (Merck. Reactivo de Anal.), 16.5 g/L de
glucosa.laq, 0.6 g/L de aceite de soja y 50 mg/L de tiostreptona.
El pH del medio es ajustado a 7.0 con hidróxido de sodio y/o ácido
sulfúrico antes de la esterilización. La glucosa y la tiostreptrona
son adicionadas por separado después de la esterilización, la
Tiostreptona se disuelve en DMSO en una concentración de 50 g/l y se
filtra esterilizada a través de un filtro de Nalgene 0.2 \mum. El
cultivo es cultivado durante 24 horas a 30ºC en un agitador de
incubadora a 280 rpm.
50 ml del cultivo completamente crecido es
transferido a 6 L del medio de crecimiento inóculo de la segunda
fase que tiene una composición similar al medio mencionado
previamente, con excepción de una doble concentración de glucosa
(33 g/L de glucosa.laq), antiespumante extra (SAG5693, 0.6 g/L; un
antiespumante de silicio de la compañía Basildon) y sin
tiostreptona. La glucosa es esterilizada de nuevo por separado en
una solución al 50% y adicionada después de la esterilización del
medio (60 minutos, 121ºC). El cultivo es cultivado durante 36 horas
en una columna de burbujas esterilizada aireada con 840 L de aire
esterilizado/h con un inyector que contiene 4 orificios con un
diámetro de 2 mm y la temperatura es mantenida a 22ºC.
Alternativamente, esta fase puede llevarse a cabo en frascos de
agitación (por ejemplo, 12x 500 ml del medio en frascos Erlenmeyer
con deflector de 2 L) con proporciones de inoculación similares y
agitadas a 280 rpm en un incubador agitador orbital.
El cultivo completamente crecido es transferido
asépticamente a un fermentador inóculo que contiene 4.5 m^{3} del
medio inóculo que contiene 16.3 kg de ácido cítrico.laq, 70.8 gr de
sulfato ferroso.7aq, 109 gr de sulfato de zinc.7aq, 109 gr de
sulfato de manganeso.laq, 32.7 gr de dicloruro de cobalto.6aq, 5.45
gr de molibdato de disodio.2aq, 5.45 gr de ácido bórico, 5.45 gr de
sulfato de cobre.5aq, 10.9 kg de sulfato de diamonio, 10.9 kg de
sulfato de magnesio.7aq, 463 gr de cloruro de calcio.2aq, 1090 gr de
aceite de soja, 21.8 kg de fosfato de monopotasio y 139 kg de
glucosa.1aq y 5.9 kg de extracto de levadura (levadura para la
fabricación de cerveza con 10% de nitrógeno Kjeldahl en base al
peso seco). El medio se prepara como sigue: todos los componentes
excepto la glucosa son cargados en la secuencia indicada en
aproximadamente 2700 L de agua corriente. El pH es fijado en 4.5
con hidróxido de sodio y/o ácido fosfórico y el medio es
esterilizado a 122ºC durante 60 minutos. La glucosa es esterilizada
en 1000 L de agua a pH 4.5 durante 60 minutos a 122ºC en un
recipiente separado. Después de enfriadas ambas porciones, la
glucosa es transferida asépticamente al recipiente inóculo. Después
de la mezcla de ambas porciones el pH es ajustado en 7.0 con
amoníaco y el volumen es ajustado con agua esterilizada a 4.5
m^{3}. La temperatura de la fermentación es controlada a 30ºC y el
fermentador es aireado a 0.5-1.0 vvm, mientras el
pH es mantenido a 7.0 +/- 0.1 con amoníaco gaseoso y la
sobre-presión es mantenida a
1.3-1.4 bar. La espuma es controlada si es necesario
con una mezcla esterilizada de aceite de soja y antiespumante de
silicio, como el SAG5693, en una proporción de 3:1. La concentración
de oxígeno es mantenida por encima de 25% de la saturación del aire
ajustando la velocidad del agitador (0.5 a 3 Kw/ m^{3}). El
cultivo es transferido a la fermentación principal antes de que se
consuma toda la glucosa (al igual que en todas las fases de
crecimiento previas) y antes de que la tasa de entrada de oxígeno
exceda el nivel de 30 mmol/l del volumen.h. de caldo.
El medio de fermentación principal contiene
245.1 kg de ácido cítrico.1aq, 1062 gr de sulfato ferroso.7aq, 1634
gr de sulfato de zinc.7aq, 1634 gr de sulfato de manganeso.1aq, 490
gr de dicloruro de cobalto.6aq, 82 gr de molibdato de disodio.2aq,
82 gr de ácido bórico, 82 gr de sulfato de cobre.5aq, 163.4 kg de
sulfato de di-amonio, 163.4 kg de sulfato de
magnesio.7aq, 6.94 kg de dicloruro de calcio.2aq, 16.3 kg de aceite
de soja, 327 kg de fosfato de monopotasio, 880 kg de extracto de
levadura para cerveza (10% Kj-N en base al peso
seco) y 556 kg de glucosa.1aq. El medio es preparado como es
descrito para la fermentación inócula (la glucosa se esteriliza por
separado). Para la glucosa un sirope de azúcar DE-95
puede ser usado alternativamente. El volumen del medio antes de la
inoculación es de 65 m^{3} después que se corrija el pH a 7.0 con
amoníaco.
Una alimentación de glucosa es preparada a 275 a
550 g de glucosa/L de solución de alimentación, ya sea como
glucosa.1aq o como equivalentes de glucosa de un sirope DE >90.
El pH es ajustado a 4.5-5.0 con una solución de
ácido fosfórico. La esterilización es hecha por lote (122ºC, 45
minutos) o de manera continua mediante un choque de calor o un
conjunto de filtros.
La fermentación principal es controlado a 30ºC
+/- 0.5 y pH 7.0 +/- 0.1 (mediante un control de pH usando amoníaco
y ácido fosfórico). El flujo de aire es fijado a
0.5-1.5 vvm, preferiblemente 0.7 vvm, la
sobrepresión es de 0.5-1.5 bar y el fermentador es
agitado con turbinas de Rushton a una intensidad de 0.5 a 3
Kw/m^{3} para evitar que la concentración de oxígeno disminuya a
menos de 0.2 mmol/L, medida en la altura inferior del agitador. La
alimentación de glucosa comienza cuando tiene lugar un descenso
repentino de la tasa de entrada de oxígeno, y aumenta la
concentración de oxígeno disuelto, así como el pH que aumenta de 6.9
a 7.1. En este momento, la concentración de glucosa en el caldo
debería ser de <<0.2 g/L.
La tasa de alimentación de glucosa es
equivalente a 93 kg de glucosa/h aumentando inicialmente de manera
lineal a 186 kg/h en 64 horas después de iniciado la alimentación.
Después de 100 horas de alimentación a 186 kg/h la tasa de
aliemtación es aumentada a 298 kg de glucosa/h hasta aproximadamente
las 200 horas de alimentación.
La espuma es controlada dosificando aceite de
soja estéril a 5.5 kg/h o alternativamente en disparos de 45 kg
cada 8 horas durante las primeras 100 horas de la fermentación. Si
fuera necesario un control adicional de la espuma es efectuado con
una mezcla de aceite de soja y un antiespumante de silicio como el
SAG471 (antiespumante de silicio de Basildon) en una proporción de
3:1.
La concentración de amoníaco es mantenida entre
750 y 1500 mg/L midiendo cada 12 horas y adicionando sulfato de
amonio estéril en porciones equivalentes a 500 mg de amoníaco/L, tan
pronto como el nivel haya descendido por debajo de 1000 mg/L.
La concentración de fosfato en el filtrado del
cultivo debe ser mantenida por encima de 500 mg PO_{4}/L
adicionando fosfato de monopotasio estéril en porciones equivalentes
a 500 mg/L.
La producción de glucosa isomerasa puede ser
medida como proteína cosechada y purificada a partir del caldo
seguida por los métodos de determinación de la proteína conocidos en
el arte o ensayados en un ensayo enzimático aplicado en una muestra
de caldo estabilizada. Las muestras de caldo son estabilizadas
pesando 2 gr de caldo y adicionando 5 ml de solución estabilizadora
que contiene 12 g/L de trishidroximetilaminometano y 2.4 g/L de
CoCl_{2}.6aq que es subsiguientemente calentada durante 30 minutos
a 73ºC. Después de enfriar 0.42 ml de muestra estabilizada son
mezclados con 0.8 ml de solución de glucosa (que contiene 27.25 g/L
de Tris/buffer de HCl pH 8.2, 67.56 g/L de glucosa, MgCl_{2.}6aq,
22,33 g/L Na_{2}-EDTA.2aq y 5 mg/L Triton
X-100) e incubada a 60ºC. La actividad es
determinada midiendo las tasas de conversión de glucosa en fructosa
y expresada en GU/g. (1 GU es la cantidad de enzima requerida para
la formación de 1 \mumole de fructosa/min.). Usando la actividad
específica de 12 Unidades por mg de proteína, la cantidad de
proteína por kg de caldo puede ser determinada.
En la Figura 2 la cantidad total de enzima
producida es indicada.
Como es demostrado en este ejemplo 850 kg de la
enzima pueden ser fabricados en un ciclo de producción por lote de
alimentación.
Ejemplo
2
Las conidiosporas de un P. chrysogenum
CBS 455.95 (u otra cepa apropiada derivada de Wisconsin 54.1255 por
mutación y selección para mayor productividad, preferiblemente en la
receta que aparece a continuación) son inoculadas a
10E5-10E6 conidia/ml en un medio de producción que
contiene (g/l): glucosa.H_{2}O, 5; lactosa.H_{2}O, 80;
(NH_{2})_{2}CO, 4.5; (NH_{4})_{2}SO_{4,}
1.1; Na_{2}SO_{4}, 2.9; KH_{2}PO_{4}, 5.2;
K_{2}HPO_{4.}3H_{2}O_{,} 4.8;_{ }solución de
oligoelementos (ácido cítrico.H_{2}O, 150; FeSO_{4.}7H_{2}O,
15; MgSO_{4}.7H_{2}O, 150; H_{3}BO_{3,} 0.0075_{;}
CuSO_{4.}5H_{2}O, 0.24; CoSO_{4}.7H_{2}O, 0.375;
ZnSO_{4}.7H_{2}O, 1.5; MnSO_{4}.H_{2}O, 2.28;
CaCl_{2.}2H_{2}O, 0.99), 10 (ml/l); 10% solución de
fenoxiacetato de potasio, pH 7, 75 (ml/l). (pH antes de la
esterilización 6.5).
El cultivo es incubado a 25ºC en un agitador
orbital a 280 rpm durante 144-168 horas. Al
finalizar esta fermentación, el micelio es eliminado por
centrifugación o filtración y se cuantifica la cantidad, y el medio
es ensayado para la penicilina formada por métodos de HPLC bien
conocidos en el arte.
Ejemplo
3
El Penicillium chrysogenum Wisconsin
54.1255 fue optimizado para el cultivo y la producción de penicilina
en un medio químicamente definido por mutación y selección en medio
definido como se describió en el Ejemplo 2. Se realizaron
fermentaciones por lote de alimentación a escala de 60 m^{3} con
un medio complejo como lo describió Hersbach y otros (Biotechnology
of Industrial Antibiotics pp 45-140, Marcel Dekker
Inc. 1984, Tabla 4, Medio B, que incluye las sales como se menciona
en el Medio A) que contiene 50 kg/m^{3} de Sólidos de Maíz
Macerado. Paralelamente a esto, una fermentación fue llevada a cabo
en un medio definido como es dado en el Ejemplo 2, donde las
dosificaciones fueron dobladas debido al carácter elevado de la
densidad celular de estas fermentaciones por lote de alimentación
mientras la lactosa y la urea fueron omitidas. La glucosa fue
alimentada al fermentador manteniendo la concentración de glucosa
por debajo de 2g/L para evitar la represión de la glucosa. Amonio,
sulfato de di-amonio y ácido fenilacético fueron
alimentados al fermentador con el fin de controlar el pH y las
concentraciones de amonio, sulfato y ácido fenilacético en los
rangos deseados (Hersbach 1984).
Debido a que la transferencia de oxígeno es un
parámetro importante que determina la factibilidad económica de un
proceso de fermentación industrial, el resultado del proceso de
fermentación anterior fue analizado determinando la magnitud de la
transferencia de oxígeno en cada proceso.
Una buena medida de la transferencia de oxígeno
obtenida en un proceso de fermentación es el valor relativo de
k_{L}a determinado dentro de un sistema. k_{L}a es definido como
el coeficiente de transferencia de oxígeno y se calcula de acuerdo
a van't Riet y Tramper (Basic Bioreactor Design, Marcel Dekker Inc.
(1991), pp. 236-273).
La capacidad de transferencia de oxígeno
calculada como el valor de k_{L}a fue encontrado que está entre
el 10 y 20% superior en el medio químicamente definido que en el
medio complejo, durante la parte principal de la fermentación.
Ejemplo
4
El proceso descrito en el Ejemplo 2 es
modificado mediante el uso de un P.chrysogenum CBS 455.95 (u
otras cepas apropiadas derivadas del Wisconsin 54.1255 por mutación
y selección para una mayor productividad, preferiblemente en la
receta establecida a continuación) el cual es transformado con un
casete de expresión de expandasa donde la región de codificación de
la expandasa está provista del promotor IPNS, como se describe en EP
532341, y usando una solución de adipato de potasio al 10% en lugar
de fenoxiacetato y usando una modificación del medio antes
mencionado que contiene 400 ml de una solución de adipato de potasio
al 10%, pH 5.5 en lugar de fenoxiacetato (pH del medio antes de la
esterilización 5.5 en lugar de 6.5).
El
adipoil-7-ADCA resultante
subsiguientemente es convertido a 7-ADCA usando el
proceso de deacilación enzimática esencialmente como es descrito en
el Ejemplo 4 o 5 de WO95/04148.
Ejemplo
5
Las conidioesporas o la cepa de Aspergillus
terreus CBS 456.95 (o cepas derivadas de las mismas por mutación
o selección para mayor productividad, preferiblemente en cualquiera
de las recetas establecidas a continuación) son inoculadas a
10E5-10E6 conidia/ml en un medio de producción que
contiene (g/l): dextrosa, 40; CH_{3}COONH_{4}, 2.2;
Na_{2}SO_{4}, 4; KH_{2}PO_{4}, 3.6;
K_{2}HPO_{4}.3H_{2}O, 35.1; solución de los oligoelementos
(ver anteriormente, Ej. 2), 10 (ml/l).
El cultivo es incubado a 28ºC en un agitador
orbital a 220 rpm durante 144-168 horas. Al final de
la fermentación, el micelio es eliminado por centrifugación o
filtración y se cuantifica la cantidad, y el medio es ensayado para
lovastatina formada por métodos de HPLC bien conocidos en el
arte.
Ejemplo
6
La cepa de Streptomyces clavuligerus ATCC
27064 o un mutante de la misma es inoculada en un medio de
precultivo que consiste de (g/l): (NH_{4})2SO_{4,} 2.75;
KH_{2}PO_{4,} 0.5; MgSO_{4.}7H_{2}O, 0.5;
CaCl_{2.}2H_{2}O, 0.01; 3-(N-morfolino), ácido
propanosulfúrico, 21; glicerol, 19.9; succinato de sodio, 5.5;
solución de oligoelementos; (ZnSO_{4}.7H_{2}O, 2.8; citrato de
amoniaco férrico, 2.7; CuSO_{4}.5H_{2}O, 0.125;
MnSO_{4}.H_{2}O, 1; CoCl_{2}.6H_{2}O, 0.1;
Na_{2}B_{4}O7.10H_{2}O, 0.16; Na_{2}MoO_{4}.2H_{2}O,
0.054), 0.06 (ml/l).
El cultivo es incubado en un agitador orbital a
220 rpm a 28ºC durante 48-72 horas y usado para
inocular 20 volúmenes de un medio de producción que contiene (g/l):
(NH_{4})2SO_{4}, 2; asparagina, 4; KH_{2}PO_{4},
1.5; MgSO_{4}.7H_{2}O, 0.5; CaCl_{2}.2H_{2}O, 0.01;
3-(N-morfolino), ácido propanosulfónico, 21;
glicerol, 19.9; succinato de sodio, 5.5; solución de oligoelementos
(ver anteriormente), 0.06 (ml/l); FeSO_{4}.7H_{2}O, 0.5;
MnCl_{2}.4H_{2}O, 0.1; ZnSO_{4}.7H_{2}O, 0.1.
La incubación es continuada durante 144 horas,
preferiblemente en un frasco Erlenmeyer de 500 ml con deflectores,
que contiene 50 ml de volumen de cultivo. Al finalizar la
fermentación, el micelio es eliminado por centrifugación o
filtración y se cuantifica la cantidad, y el filtrado es ensayado
por métodos de HPLC bien conocidos en el arte.
Ejemplo
7
La cepa de Aspergillus níger CBS 513.88 o
un mutante de la misma es inoculada a
10^{5}-10^{6} condioesporas/ml en un medio de
germinación que consiste de (g/l): K_{2}HPO_{4}.3H_{2}O, 0.75;
KH_{2}PO_{4,} 6.6_{;} Na3citrato.3H_{2}O, 5.3; ácido
cítrico.H_{2}O, 0.45; glucosa.H_{2}O, 25;
(NH_{4})2SO_{4}, 8; NaCl, 0.5; MgSO_{4}.7H_{2}O,
0.5; FeSO_{4}.7H_{2}O, 0.1; ZnSO_{4}.7H_{2}O, 0.05;
CaCl_{2}, 0.005; CuSO_{4.}5H_{2}O, 0.0025;
MnSO_{4}.4H_{2}O, 0.0005; H_{3}BO_{3}, 0.0005;
Na_{2}MoO_{4}.2H_{2}O, 0.0005; EDTA, 0.13; Tween80,3. Si es
necesario, 50\mug/ml de arginina y/o prolina pueden ser
adicionados para mejorar la germinación.
El cultivo se incuba en un agitador orbital
durante 48-72 horas a 33ºC, 295 rpm y luego usado
para inocular 10-20 volúmenes de un medio de
producción que consiste de (g/l): KH_{2}PO_{4},
1-5; NaH_{2}PO_{4}.H_{2}O, 0.5;
Na3citrato.3H_{2}O, 53; ácido cítrico.H_{2}O, 4.05; polímeros de
dextrosa 70; (NH_{4})2SO_{4}, 8; (NaCl,
MgSO_{4}.7H_{2}O, FeSO_{4.}7H_{2}O, ZnSO_{4}.7H_{2}O,
CaCl_{2}, CuSO_{4.}5H_{2}O, MnSO_{4}.4H_{2}O,
H_{3}BO_{3}, Na_{2}MoO_{4}.2H_{2}O, EDTA): el mismo del
medio de germinación.
La incubación es continuada durante 96 horas,
preferiblemente en un frasco Erlenmeyer de 500 ml, que contiene 100
ml del medio. Al finalizar la fermentación, el micelio es eliminado
por centrifugación o filtración y se cuantifica la cantidad y el
filtrado es ensayado para una actividad amilolítica.
Ejemplo
8
La cepa de Phaffia rhodozyma CBS 6938 o
un mutante de la misma es inoculada en 25 ml de un medio de
precultivo que contiene (g/l) de extracto de levadura, 10; peptona,
20; glucosa, 20.
El cultivo es incubado durante 72 horas a 20ºC,
en un frasco Erlenmeyer de 100 ml con deflector, en un agitador
orbital a 275 rpm.
1 ml del precultivo es entonces usado para
inocular 100 ml de un medio de producción que contiene (g/l):
glucosa, 30; NH_{4}Cl, 4.83; MgSO_{4}.7H_{2}O, 0.88; NaCl,
0.06; CaCl_{2}.6H_{2}O, 0.15; solución de oligoelementos (ácido
cítrico.H_{2}O, 50;
(NH_{4})2Fe(SO_{4})2.6H_{2}O, 90;
ZnSO_{4}.7H_{2}O, 16.7; CuSO4.5H_{2}O, 2.5;
MnSO_{4.}4H_{2}O, 2; H_{3}BO_{3}, 2;
Na_{2}MoO_{4}.2H_{2}O, 2; KI, 0.5; en 0.4N H_{2}SO_{4}),
0.3 (ml/l); solución de vitaminas (mio-inositol, 40;
ácido nicotínico, 2;
Ca-D-pantotenato,
2; vitamina B1, 2: ácido p. aminobenzoico, 1.2; vitamina B6, 0.2;
biotina 0.008; en 0.07N H_{2}SO_{4}) 1-5
(ml/l); plurónico, 0.04; KH_{2}PO_{4}, 1; ftalato de hidrógeno
potasio, 20 (pH antes de la esterilización
5.4).
5.4).
La incubación es continuada durante 96 horas
preferiblemente en un frasco Erlenmeyer de 500 ml con deflector. Al
finalizar la fermentación, el contenido de astaxantina de la biomasa
(cantidad cuantificada) es determinado mediante la extracción del
solvente y se mide la densidad óptica del extracto a
470-490 nm.
Ejemplo
9
Un frasco de 1 ml de una suspensión de la cepa
de Mortierella alpina ATCC 16266 almacenada a -80ºC es
abierto asépticamente y el contenido es usado para inocular 500 ml
de un medio de producción que contiene (g/l):
glucosa, 70; extracto de levadura 0.5;
NH_{4}NO_{3} 3.0; KH_{2}PO_{4} 7.2; MgSO_{4}.7H_{2}O
1.5; solución de oligoelementos (ácido cítrico.H_{2}O 50;
(NH_{4})_{2}Fe(SO_{4})2.6H_{2}O, 90;
ZnSO_{4}.7H_{2}O, 16.7; CuSO_{4}.5H_{2}O, 2.5;
MnSO_{4.}4H_{2}O, 2; H_{3}BO_{3}, 2;
Na_{2}MoO_{4}.2H_{2}O, 2; KI, 0.5; en 0.4N H_{2}SO_{4}),
0.3 (ml/l); (pH antes de la esterilización 7.0).
El cultivo es incubado en un frasco de agitación
de 2 litros con deflectores, a 25ºC durante 72 horas en un agitador
orbital a 250 rpm. Al finalizar la fermentación, la cantidad de
biomasa y el contenido de ácido araquidónico de la biomasa es
determinado, después de la centrifugación, el secado por congelación
y la extracción del solvente, utilizando métodos GC bien conocidos
en el arte.
Ejemplo
10
La cepa de Saccharopolyspora erithraea
NRRL2338 o un mutante de la misma (seleccionada para mayor
productividad, preferiblemente en la receta establecida a
continuación) es inoculada en 25 ml de un medio de precultivo que
contiene (g/l):
Almidón soluble, 15; NaCl, 5; harina de soja,
15; CaCO_{3}, 10; Extracto de levadura, 5, Sólidos de maíz
macerado, 5; CoCl_{2}.6H2O, 670 \mul de una solución de 1
g/l.
El cultivo es incubado en un frasco de agitación
de 100 ml sin deflectores a 32-34ºC durante 3 días
en un incubador agitador a 250 RPM.
0.4 ml del cultivo son inoculados en 25 ml de un
medio de producción estéril que contiene (g/l):
Ácido cítrico.H_{2}O, 2;
(NH_{4})_{2}SO_{4,} 2; MgSO_{4}.7H_{2}O, 2;
CaCl_{2}.2H_{2}O, 0.085; KH_{2}PO_{4}, 0.25; HEPES (=
N-(2-hidroxietilo)piperazina-N'-(2-ácido
etanosulfónico)), 5; Glucosa, 1.5; Almidón soluble, 20; Aceite de
soja, 0.4; solución de oligoelementos (gramo en 250 ml de agua
destilada: Ácido cítrico.H_{2}O, 62.5, FeSO_{4}.7H_{2}O,
0.8215; CuSO_{4}.5H_{2}O, 0.0625; CoCl_{2}.H_{2}O, 0.375;
H_{3}BO_{3}, 0.0625; ZnSO_{4.}7H_{2}O, 1.25;
MnSO_{4.}H_{2}O, 1.25; Na_{2}MoO_{4}.2H_{2}O, 0.0625),
3.6 ml/l. pH=7.0. A cada frasco, 0.25 ml de
n-propanol son adicionados.
El cultivo es incubado en un frasco de agitación
de 100 ml con deflectores a 32-34ºC durante 5 días
en un incubador agitador a 300 RPM. Al finalizar la fermentación,
el caldo es centrifugado y se cuantifica la cantidad de biomasa. El
contenido de la eritromicina del sobrenadante se mide por métodos de
HPLC conocidos en el arte.
Ejemplo
11
Una suspensión de espora de Blakeslea
trispora CBS 130.59 es usada para inocular 114 ml del medio de
precultivo (extracto de levadura 10 g/l; peptona 20 g/l; glucosa 20
g/l) en un frasco de agitación de 500 ml sin deflectores. El
precultivo es incubado durante 42 h en un agitador rotatorio a 250
rpm a 26ºC. La biomasa es cosechada por filtración, y se lava 3
veces con 100 ml de agua desmineralizada estéril para eliminar los
componentes del medio de precultivo. Subsiguientemente la biomasa
es homogenizada por mezclado, hasta que sólo queden pequeños
fragmentos, y es resuspendida en 40 ml de agua desmineralizada.
El medio de producción es preparado en porciones
de 100 ml en frascos de agitación de 500 ml con deflectores. La
composición del medio de producción es como sigue (en g/l): glucosa,
40; monohidrato de asparagina, 2; KH_{2}PO_{4,} 0.5;
MgSO_{4}.7H_{2}O, 0.25. Además una solución de oligoelementos
(0.3 ml/l) es adicionada con la siguiente composición (en g/l):
ácido cítrico.H_{2}O, 50;
(NH_{4})_{2}Fe(SO_{4})_{2}.6H_{2}O,
90; ZnSO_{4}.7H_{2}O, 16.7; CuSO_{4}.5H_{2}O, 2.5;
MnSO_{4.}4H_{2}O, 2; H_{3}BO_{3}, 2;
Na_{2}MoO_{4}.2H_{2}O, 2; KI, 0.5; en 0.4N H_{2}SO_{4}.
Antes de la esterilización el pH del medio es ajustado a 6.2. Los
frascos son esterilizados durante 20 minutos a 120ºC, y después de
la esterilización 0.05 ml de una solución de 1 mg/ml de
hidrocloruro de tiamina en agua desmineralizada (esterilizada por
filtración) son adiciondados.
Los cultivos de producción son inoculados con
0.5 a 10 ml de la suspensión del micelio fragmentado preparado
anteriormente. Los cultivos son incubados durante 139 h en un
agitador rotatorio (250 rpm; 26ºC). La biomasa fúngica es cosechada
por filtración, lavada con agua desmineralizada para eliminar los
componentes del medio y se cuantifica.
La cantidad de \beta-caroteno
producida es determinada mediante la extracción de acetona y la
medición de la extinción a 450 nm de la fracción de acetona en un
espectrofotómetro.
Claims (18)
1. Un proceso para la producción de un compuesto
de \beta-lactama, que comprende los pasos de:
- \bigstar
- fermentación de una cepa microbiana filamentosa a una escala industrial en un medio de fermentación que es un medio químicamente definido esencialmente compuesto de constituyentes químicamente definidos, y
- \bigstar
- recuperación del compuesto de \beta-lactama del caldo de fermentación.
2. El proceso de la reivindicación 1, donde el
medio químicamente definido contiene una cantidad de una fuente
compleja de carbono y/o nitrógeno de a lo máximo alrededor de 10%
del total de la cantidad de carbono y/o nitrógeno (Kjeldahl N) que
está presente en el medio químicamente definido.
3. El proceso de la reivindicación 1 o 2, donde
los constituyentes químicamente definidos del medio químicamente
definido comprenden una fuente de carbono seleccionada del grupo que
consiste de carbohidratos como glucosa, lactosa, fructosa,
sacarosa, maltodextrina, almidón e inulina, glicerol, aceites
vegetales, hidrocarburos, alcoholes tales como el metanol y el
etanol, ácidos orgánicos tales como el acetato y los ácidos
alcanoicos superiores, y una fuente de nitrógeno seleccionada del
grupo que consiste de urea, amoníaco, nitrato, sales de amonio,
tales como el sulfato de amonio, el fosfato de amonio y el nitrato
de amonio, y aminoácidos tales como el glutamato y la lisina.
4. El proceso de la reivindicación 3, donde la
fuente de carbono es glucosa y la fuente de nitrógeno es amoníaco
y/o una sal de amonio.
5. El proceso de cualquiera de las
reivindicaciones 1 a 4 donde la fermentación ocurre mediante un
proceso de fermentación por lote, por lote repetido, por lote de
alimentación, por lote de alimentación repetido o conti-
nuo.
nuo.
6. El proceso de la reivindicación 5, donde la
fermentación ocurre mediante de un proceso por lote de
alimenta-
ción.
ción.
7. El proceso de la reivindicación 6, donde una
fuente de carbono y/o una de nitrógeno es alimentada al
proceso.
proceso.
8. El proceso de la reivindicación 7, donde la
fuente de carbono es glucosa y la fuente de nitrógeno es amoníaco
y/o una sal de amonio.
9. El proceso de acuerdo a cualquiera de las
reivindicaciones 1 a 8, donde la cepa filamentosa es un hongo.
10. El proceso de la reivindicación 9, donde el
hongo es una cepa de Penicillium.
11. El proceso de la reivindicación 10, donde el
hongo es Penicillium chrysogenum.
12. El proceso de acuerdo a cualquiera de las
reivindicaciones 1 a 8, donde la cepa filamentosa es una
bacteria.
13. El proceso de la reivindicación 12, donde la
bacteria es un Actinomycete.
14. El proceso de la reivindicación 13, donde el
Actinomycete es Streptomyces clavulliegerus y el compuesto
de \beta-lactama es ácido clavulánico.
15. Un método para preparar y/o mejorar una cepa
microbiana filamentosa que produce un compuesto de
\beta-lactama de interés, la cual es capaz de ser
fermentada a escala industrial en un medio químicamente definido,
que comprende las etapas de:
- \bigstar
- someter una cepa madre apropiada a un tratamiento mutagénico seleccionado del grupo de medios físicos y mutágenos químicos, y/o a una transformación de ADN,
- \bigstar
- clasificar los transformantes y/o mutantes resultantes por su grado de crecimiento en un medio químicamente definido y su nivel de producción del compuesto de \beta-lactama de interés,
- \bigstar
- seleccionar los transformantes y/o mutantes que tengan un buen grado de crecimiento en un medio químicamente definido y/o un nivel de producción mejorado del dicho compuesto de \beta-lactama de interés en comparación con dicha cepa madre.
16. El método de la reivindicación 15, donde la
cepa madre es seleccionada del grupo que consiste de cepas que
tienen un buen grado de crecimiento en un medio químicamente
definido, pero que necesitan ser mejoradas en cuanto al nivel de
producción.
17. El método de la reivindicación 15, donde la
cepa madre es seleccionada del grupo que consiste de cepas que
tienen un nivel de producción alto de un compuesto de
\beta-lactama deseado, pero un grado de
crecimiento relativamente malo en un medio químicamente
definido.
18. Uso de un medio de fermentación químicamente
definido para la producción de un compuesto de
\beta-lactama por fermentación de una cepa
microbiana filamentosa a escala industrial.
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