ES2219649T3 - Repliegue de polipeptidos similares al factor de crecimiento similar a insulina recombinante (igf-i). - Google Patents
Repliegue de polipeptidos similares al factor de crecimiento similar a insulina recombinante (igf-i).Info
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Abstract
SE SUMINISTRA UNA COMPOSICION QUE COMPRENDE ENTRE 0.1 Y 15 MG/ML DE UN POLIPEPTIDO EN UN NEUTRALIZADOR QUE TIENE UN PH DE ALREDEDOR DE ENTRE 7-12 QUE COMPRENDE ENTRE UN 5% Y UN 40% (V/V) DE UN SOLVENTE APROTICO ALCOHOLICO O POLAR, ENTRE 0.2 Y 3 M DE TIERRA ALCALINA, METAL ALCALI O SAL DE AMONIO, ENTRE 0.1 Y 9 M DE AGENTE CAOTROPICO, Y ENTRE 0.01 Y 15 {MI}M DE SAL DE COBRE O DE MANGANESO. EL NEUTRALIZADOR SE USA DE FORMA ADECUADA EN UN METODO PARA REPLEGAR IMPROPIAMENTE POLIPEPTIDOS PLEGADOS.
Description
Repliegue de polipéptidos similares al factor de
crecimiento similar a insulina recombinante
(IG-I).
La presente invención hace referencia a
soluciones tampón especiales y a su utilización para el
replegamiento de polipéptidos.
Para la producción comercial de muchos
polipéptidos y proteínas, las técnicas del DNA recombinante se han
convertido en el procedimiento de elección debido a las grandes
cantidades que pueden producirse en bacterias y otros huéspedes
celulares. La producción de proteína recombinante implica la
transfección o la transformación de células huésped con el DNA que
codifica la proteína exógena deseada y el crecimiento de las
células en condiciones que favorecen la expresión de la proteína
recombinante. E. coli y levaduras son los huéspedes
preferidos porque pueden ser inducidos a producir proteínas
recombinantes a títulos elevados.
Entre las numerosas patentes americanas sobre la
expresión general de las proteínas codificadas por DNA
recombinante, se incluyen: la patente americana U.S. 4.565.785
sobre una molécula de DNA recombinante que comprende un gen
bacteriano para una proteína transportadora extracelular o
periplásmica y un gen no bacteriano; U.S. 4.673.641 sobre la
coproducción de un polipéptido foráneo con un polipéptido formador
de agregados; U.S. 4.738.921 sobre un vector de expresión con un
promotor/operador trp y una fusión de trp LE con un polipéptido
como el factor de crecimiento similar a la insulina
(IGF-I); 4.795.706 sobre la expresión de secuencias
control a incluir junto con una proteína foránea; y U.S. 4.710.473
sobre plásmidos de DNA circulares y específicos como los que
codifican para IGF-I.
En ciertas condiciones, algunas proteínas
heterólogas expresadas en grandes cantidades en bacterias huéspedes
precipitan dentro de la célula en densos agregados, reconocidos
como manchas brillantes visibles dentro de las células con el
microscopio de contraste de fases. Estos agregados o proteínas
precipitadas son referidos como "cuerpos refráctiles" y
constituyen una porción significativa de la proteína celular total.
Brems y col., Biochemistry, 24:7662 (1985). Por otra parte, los
agregados proteicos pueden no ser visibles con el microscopio de
contraste de fases y el término "cuerpos de inclusión" se
utiliza a menudo para referirse a los agregados de proteína
visibles o no con el microscopio de contraste de fases.
Se ha observado que las proporciones solubles de
proteína expresada a niveles elevados en E. coli se
incrementan drásticamente al disminuir la temperatura de
fermentación por debajo de los 30ºC. De este modo, una fracción
considerable de varias proteínas foráneas, como por ejemplo, el
interferón-alfa humano
(IFN-\alpha2), el interferón-gamma
(IFN-\gamma) y la proteína murina MX [Schein y
Notebron, Bio/Technology, 6:291-294 (1988)] y el
IFN-\beta humano [Mmizukami y col., Biotechnol.
Lett., 8:605-610 (1986)] se mantienen en solución.
Este proceso representa una alternativa a la renaturalización de
proteínas recuperadas de los cuerpos de inclusión, pero requiere un
sistema de expresión que se induzca eficientemente a temperaturas
inferiores a los 30ºC. El proceso, en consecuencia, no es eficaz
para todas las proteínas.
Para artículos de revisión general, véase
Marston, supra; Mitraki y king, Bio/Technology, 7:690 (1989);
Marston y Hartley, Methods in Enzymol., 182:264-276
(1990); Wetzel, "Protein Aggregation In vitro: Bacterial
Inclusion Bodies and Mammalian Amyloid", en ``Stability of
Protein Pharmaceuticals: In vivo Pathways of Degradation and
Strategies for Protein Stabilization, Ahern and Manning (ed.)
(Plenum Press, 1991); y Wetzel, "Enhanced Folding and
Stabilization of Proteins by Suppression of Aggregation in
vitro and in vivo", en Protein
Engineering-A Practical Approach, Rees, A.R. y col.
(eds). (IRL Press en Oxford University Press, Oxford, 1991).
La recuperación de estas proteínas a partir de
estos cuerpos ha presentado numerosos problemas, por ejemplo cómo
separar la proteína encajada dentro de la célula del material
celular y de las proteínas que la cobijan y cómo recuperar la
proteína del cuerpo de inclusión en la forma biológica activa. Las
proteínas recuperadas están predominantemente en la forma biológica
inactiva debido a que se han plegado en una conformación
tridimensional distinta de la proteína activa. Por ejemplo, el
IGF-I plegado incorrectamente con parejas de enlaces
disulfuro distintas a las halladas en el IGF-I
nativo tiene significativamente una actividad biológica reducida.
Raschdorf y col., Biomedical and Environmental Mass Espectroscopy,
16:3-8 (1988). El plegamiento erróneo puede tener
lugar en la célula tanto durante la fermentación como durante el
proceso de aislamiento. Los procedimientos para el replegamiento de
las proteínas en la conformación correcta y biológicamente activa
son esenciales para obtener proteínas funcionales.
Otra propiedad experimentada por las proteínas
durante el replegamiento es la tendencia para producir dímeros,
trímeros y multímeros unidos por puentes disulfuro. Morris y col.,
Biochem. J., 268:803-806 (1990); Toren y col., Anal.
Biochem., 169:287-299 (1988); Frank y col., en
Peptides:
synthesis-structure-function, ``ed.
D.H. Rich y E. Gross, pág. 729-738 (Pierce Chemical
Company, Rockford, Illinois, 1981). Este fenómeno de asociación es
muy común durante el replegamiento proteico, en particular a
concentraciones proteicas elevadas, y parece a menudo implicar la
asociación a través de interacción hidrofóbica de intermediarios
plegados parcialmente. Cleland y Wang, Biochemistry,
29:11072-11078 (1990).
El plegamiento proteico está influenciado por la
naturaleza del medio que contiene la proteína y por una combinación
de fuerzas débiles o fuerzas intramoleculares repelentes implicadas
en los enlaces de hidrógeno, enlaces iónicos e interacciones
hidrofóbicas. Cuando parejas de residuos de cisteína se llevan a
una proximidad estrecha a medida que el esqueleto se pliega, se
forman enlaces disulfuro covalentes fuertes entre las cisteínas,
sirviendo para cerrar su conformación terciaria. Se han diseñado
protocolos para romper enlaces disulfuro incorrectos, bloquear
enlaces disulfuros aleatorios y permitir el replegamiento y los
enlaces disulfuros correctos en condiciones favorables para la
formación de la conformación activa.
Una serie de técnicas para recuperar la proteína
activa de los cuerpos de inclusión implica la solubilización de los
cuerpos de inclusión en soluciones fuertemente desnaturalizantes y
a continuación, y opcionalmente, cambiar las soluciones altamente
desnaturalizantes por soluciones débilmente desnaturalizantes (o
diluir la solución fuertemente desnaturalizante), o utilizar
técnicas de centrifugación a alta velocidad o de cribaje molecular.
Dichos procedimientos de recuperación, descritos, p.ej., en las
patentes americanas 4.512.922, 4.518.256, 4.511.502 y 4.511.503, se
consideran de aplicación universal, con sólo pequeñas
modificaciones para la recuperación de proteínas recombinantes
biológicamente activas de los cuerpos de inclusión. Estos
procedimientos pretenden eliminar los enlaces disulfuro aleatorios
antes de inducir que la proteína recombinante adopte su
conformación biológicamente activa gracias a sus fuerzas de
estabilización.
En un procedimiento para la recuperación de
proteína de los cuerpos de inclusión, la proteína desnaturalizada
que se desea replegar se purifica además en condiciones reductoras,
de modo que se mantienen las porciones de cisteína de la proteína
como grupos sulfidrilos libres. El agente reductor se diluye
entonces en una solución acuosa para permitir que la proteína se
repliegue para formar los enlaces disulfuro adecuados en presencia
de aire o algún otro agente oxidante. Esto permite incorporar
fácilmente el replegamiento en los procesos de generales de
purificación.
En otra aproximación, el replegamiento de la
proteína recombinante tiene lugar en presencia de ambas formas, la
reducida (R-SH) y la oxidada
(R-S-S-R) de un
compuesto sulfidrilo. Esto permite que los grupos sulfidrilos libres
y los disulfuros se formen y reformen constantemente durante el
proceso de purificación. Las formas reducidas y las oxidadas del
compuesto sulfidrilo se proporcionan en un tampón con un poder
suficientemente desnaturalizante, de modo que todas las
conformaciones intermedias de la proteína permanecen solubles
durante el proceso de desnaturalización y replegamiento. Se ha
sugerido la urea como medio tampón adecuado. La tercera alternativa
en esta serie está diseñada para romper cualquier enlace disulfuro
que pueda haberse formado incorrectamente durante el aislamiento de
los cuerpos de inclusión y a continuación modificar los grupos
sulfidrilos libres disponibles de la proteína recombinante. Este
objetivo se logra mediante la sulfonación de la proteína para
bloquear las parejas disulfuro aleatorias, permitiendo que la
proteína se repliegue correctamente en una solución débilmente
desnaturalizante, y a continuación desulfonar la proteína, en
condiciones favorecedoras de uniones disulfuro correctas. La
desulfonación tiene lugar en presencia de un compuesto sulfidrilo y
de una pequeña cantidad de su forma oxidada correspondiente para
asegurar que los enlaces disulfuro adecuados permanecerán intactos.
El pH se eleva a un valor en el que el compuesto sulfidrilo esté
por lo menos parcialmente en una forma ionizada para incrementar el
desplazamiento nucleofílico del sulfonato.
Estos protocolos de replegamiento, aunque
prácticos por su utilidad universal, no se ha demostrado
necesariamente que sean eficientes al máximo con, por ejemplo, el
IGF-I recombinante.
La recuperación de la actividad biológica
requiere un procedimiento de renaturalización monitorizado
cuidadosamente, lo que puede ser bastante difícil dependiendo de la
proteína en cuestión. Existen diversas publicaciones que tratan
sobre los intentos de replegamiento de proteínas individuales
producidas en huéspedes bacterianos o de proteínas que se hallan en
una forma no-nativa o desnaturalizada. Por ejemplo,
en la patente internacional WO 88/8003 y por Halenbeck y col.,
Biotechnology, 7:710-715 (1989), se describe la
formación de un factor estimulador de la formación de colonias de
macrófagos activo biológicamente (M-CSF), dimérico
después de la expresión en E. coli. Los procesos descritos
implican las etapas de: (i) solubilización inicial de los monómeros
de M-CSF aislados de los cuerpos de inclusión en
condiciones reductoras en un entorno caotrópico con urea o
hidrocloruro de guanidina, (ii) replegamiento que se logra mediante
diluciones seriadas de los agentes caotrópicos y (iii) una
oxidación final de las moléculas replegadas en presencia de aire o
un sistema redox.
En la patente americana U.S. 4.923.967 y la
europea EP 361.830 se describe un protocolo para la solubilización y
sulfitolisis de la proteína refráctil en un solvente
desnaturalizante y a continuación un cambio de solvente para
precipitar la proteína. La proteína se resolubiliza en una solución
desnaturalizante y se deja replegar en presencia de agente
reductor. Las etapas múltiples requeridas para lograr el
plegamiento correcto requieren mucho tiempo.
Se han publicado procedimientos para el
replegamiento de proteínas para algunas proteínas como la
interleucina-2 (IL-2) [Tsuji y col.,
Biochemistry, 26:3129-3134 (1987); patente
internacional WO 88/8849 (que describe en la página 17 la
utilización de concentraciones elevadas de cobre como oxidante], la
hormona de crecimiento de diversas fuentes [George y col., DNA,
4:273-281 (1984); Gil y col., Bio/Technology,
3:643-646 (1985); Sekine y col., Proc. Natl. Acad.
Sci. USA, 82: 4306-4310 (1985); patente americana
U.S. 4.985.544, implicando esta última referencia la adición de un
agente desnaturalizante y de un agente reductor para solubilizar la
proteína, la eliminación del agente reductor, la oxidación de la
proteína y la eliminación del agente desnaturalizante], la
proquimosina [Green y col., J. Dairy Res.,
52:281-286 (1985)], la uroquinasa [Winkler y col.,
Bio/Technology, 3:990-1000 1095)], la somatotropina
[U.S. patente americana 4.652.630, en la que se utiliza la urea
para la solubilización y un agente oxidante para el replegamiento],
el interferón-beta [patente europea EP 360.937,
publicada el 4 de abril de 1990] y el activador del plasminógeno
tisular [Rudolph y col., en "623º Biochem Soc. Meeting",
Canterbury (1987)]. Ver también, Marston, Biochemical J.,
240:1-12 (1986). Otro proceso de plegamiento
utiliza la prosecuencia del polipéptido natural para promover el
plegamiento de un polipéptido biológicamente inactivo en su forma
activa, ejemplificado por la subtilina, se describe en la patente
americana U-S. 5.191.063.
En algunas técnicas de recuperación, se ha
obtenido por lo menos el 60% de la proteína foránea. Ver, p.ej.,
Boss y col., Nucl. Acids. Res., 12:3791-3806
(1984); Cabilly y col., Proc. Natl. Acad. Sci. USA,
81:3273-3277 (1984); Marston y col.,
Bio/Technology, 2:800-804 (1984); Rudolph y col.,
supra.
La literatura adicional y representativa del
replegamiento de proteínas no-nativas derivadas de
fuentes distintas incluye un informe en el que la
IL-2 y el
interferón-\beta(IFN-\beta)
se han replegado utilizando SDS para la solubilización e iones
Cu^{+2} como promotores de la oxidación de las proteínas
completamente reducidas. Patente americana U-S.
4.572.798. Un proceso para aislar proteínas refráctiles
recombinantes tal como se describe en la patente americana U.S.
4.620.948 implica la utilización de soluciones fuertemente
desnaturalizantes para solubilizar las proteínas, de condiciones
solubilizantes para facilitar el plegamiento correcto y la
sustitución del desnaturalizante en presencia de aire u otros
agentes oxidantes para formar de nuevo los enlaces disulfuros. En
las proteínas a las que se puede aplicar el proceso se incluyen la
uroquinasa, la hormona de crecimiento humana, porcina y bovina, el
interferón, el activador del plasminógeno tisular, la proteína de la
cubierta en la enfermedad de la boca y pies (FMD), la
pro-renina y una proteína src.
En la patente internacional WO 86/5809, se
describe un procedimiento para la renaturalización de proteínas no
plegadas incluye el citocromo c, la ovalbúmina y el inhibidor de
tripsina mediante unión reversible de la proteína desnaturalizada a
una matriz sólida y la renaturalización por etapas mediante
dilución del desnaturalizante. Una forma monomérica modificada del
factor de crecimiento derivado de plaquetas humano (PDGF) expresado
en E. coli se ha S-sulfonado durante la
purificación para proteger las porciones tioles y luego se ha
dimerizado en presencia de agentes oxidantes para producir la
proteína activa. Hoope y col., Biochemistry,
28:2956-2960 (1989).
Adicionalmente, la patente europea EP 433.225
publicada el 19 de junio de 1991 describe un proceso para producir
el factor-\beta de crecimiento transformante
biológicamente activo o una sal de lo mismo, en donde la forma
monomérica desnaturalizada de la proteína se somete a condiciones de
replegamiento que incluyen un agente solubilizante, como por
ejemplo un detergente suave, un solvente miscible en agua y
orgánico y/o un fosfolípido. La patente americana U.S. 4.705.848
describe el aislamiento de la hormona de crecimiento activa
biológicamente a partir de cuerpos de inclusión, utilizando una
etapa desnaturalizante con una sal de guanidina y una etapa
renaturalizante. Véase también, Bowden y col., Bio/Technology, 9:
725-730 (1991) sobre los cuerpos de inclusión
citoplasmáticos y periplásmicos de la
\beta-lactamasa y en Samuelsson y col.,
Bio/Technology, 9:73d1 (1991) sobre el replegamiento de los
mutantes interferón-gamma humanos. Además, Hejnaes y
col., Protein Engineering, 5:797-806 (1992)
describen la utilización de un agente caotrópico con el
IGF-I.
Existen diversas referencias bibliográficas sobre
la producción de IGF-I en bacterias. Estas incluyen
la patente europea EP 128.733 publicada el 19 de diciembre de 1984
y la patente europea EP 135.094 publicada el 27 de marzo de 1985,
que dirige la expresión de IGF-I en bacterias. La
patente europea EP 288.451 dirige la utilización de la señal lamB u
ompF para secretar el IGF-I en bacterias; Obukowicz
y col., Mol. Gen. Genet., 215:19-25 (1988) y Wong y
col., Gene, 68:193-203 (1988) describe procesos
similares. La patente europea EP 286.345 describe la fermentación
del IGF-I utilizando un promotor lambda.
Además, se han sugerido procedimientos para
preparar el IGF-I como una proteína de fusión. Por
ejemplo, la patente europea EP 130, 166 describe la expresión de
péptidos de fusión en bacterias y en la patente americana U.S.
5.019.500 y la patente europea 219.814, se describe una fusión de
IGF-I con un polipéptido protector para su
expresión en bacterias. La patente europea EP 264.074 describe un
vector de expresión met-IGF-I doble
cistrónico con un péptido protector de 500-50.000
Da de peso molecular (véase también la patente americana 5.028.531 y
Saito y col., J. Biochem., 101:1281-1288 (1987)].
Otras técnicas de fusión del IGF-I incluyen el
péptido protector al que se le ha eliminado el gen rop [patente
europea 219.814], la expresión del multímero IGF-I
[Schulz y col., J. Bacteriol., 169:5385-5392
(1987)], la fusión de IGF-I con la hormona
luteinizante (LH) gracias a un residuo metionil o triptófano
hidrolizable en el sitio de unión [Saito y col., J. Biochem.,
101:123-134 (1987)], y la fusión con superóxido
dismutasa. La patente europea EP 196.056. Niwa y col., Ann. NY Acad.
Sci., 469:31-52 (1986) describe la síntesis
química, el clonaje y la expresión satisfactoria de los genes para
el IGF-I fusionado a otro polipéptido. Sin embargo,
estos procedimientos que utilizan proteínas de fusión requieren en
general una secuencia líder relativamente larga y están dirigidos
para mejorar la expresión de la proteína del cuerpo de inclusión,
pero no para mejorar el replegamiento de la proteína recombinante
desnaturalizada.
La patente americana U.S. 5.158.875 describe un
procedimiento para el replegamiento del IGF-I
recombinante que implica el clonaje del gen IGF-I
con una secuencia líder cargada positivamente antes de la
transfección del DNA en la célula huésped. La carga positiva
adicional sobre el extremo amino-terminal del
IGF-I recombinante corrige el replegamiento cuando
la proteína solubilizada se agita durante 2-16
horas en una solución desnaturalizante. Después del replegamiento,
la secuencia líder se corta y se purifica la proteína recombinante
activa. Sin embargo, este proceso en múltiples etapas es largo,
requiere materiales extras y el esfuerzo adicional que representa el
clonar una secuencia líder heteróloga delante del gen
IGF-I y luego eliminarla de la proteína
purificada.
Otro procedimiento para facilitar el
replegamiento in vitro del IGF-I
recombinante implica la utilización de una pareja de fusión de
afinidad solubilizada que consiste de dos dominios de unión IgG
(ZZ) derivados de la proteína A staphylococal. Véase Samuelsson y
col., supra. Este procedimiento utiliza el dominio de la
proteína A como un solubilizador del IGF-I
multimérico y mal plegado. Aunque este procedimiento no utiliza
agentes desnaturalizantes o agentes químicos redox, implica etapas
extras de fusión del gen IGF-I y otro gen por
separado y la eliminación del polipéptido codificado por dicho gene
después de la expresión del gen de fusión.
Otros investigadores han descrito estudios sobre
el replegamiento del IGF-I que implica el equilibrio
de intercambio de disulfuros de los intermediarios de
replegamiento. Por ejemplo, se investigó el replegamiento del
IGF-I utilizando tampones redox y se caracterizaron
las formas de IGF-I producidas por Hober y col.,
Biochemistry, 31:1749-1756 (1992).
El intercambio de disulfuros puede también ser
modulado utilizando el agente adicional de la peptidil disulfuro
isomerasa (PDI) o la peptidil prolil isomerasa (PPI). Véase, por
ejemplo, la patente japonesa JP 63294796 publicada el 1 de
diciembre de 1988; la patente europea EP 413.440 publicada el 20 de
febrero de 1991 y la patente europea 293.793 publicada el 7 de
diciembre de 1988.
Se ha publicado un aumento de la formación de
enlaces disulfuros por adición de metanol al 50% al tampón a baja
fuerza iónica por Snyder, J. Biol. Chem.,
259:7468-7472 (1984). La estrategia implica aumentar
la formación de enlaces disulfuros ajustando los factores
electrostáticos en el medio para favorecer la yuxtaposición de
aminoácidos cargados que limitan los residuos de cisteína
seleccionados. Véase también, Tamura col., resumen y póster
presentados en el Onceavo Simposio Americano el 11 de Julio de
1989, en donde aconsejan la adición de acetonitrilo, DMSO, metanol
o etanol para mejorar la producción de IGF-I
plegado correctamente.
En la patente internacional WO 92/03477,
publicada el 5 de marzo de 1992, se describe un procedimiento para
el plegamiento de AlaGlu-IGF-I que
implica el cambio del potencial redox mediante diálisis frente a un
tampón que contiene de un 20-40% de etanol v/v
durante un período de hasta cinco horas y la acidificación de la
mezcla.
El metanol se utilizó a determinadas
concentraciones en la desnaturalización de la ribonucleasa. Lustig
y Fink, Biochim. Biophys. Acta, 1119:205-210 (1992).
Los estudios de otros laboratorios indican que concentraciones
moderadas de alcohol pueden reducir la asociación de los péptidos
similares a la insulina en condiciones que promueven la
desestabilización de la estructura. Bryant y col., Biochemistry,
31:5692-5698 (1992); Hua y Weiss, Biochim. Biophys.
Acta, 1078:101-110 (1991); Brems y col.,
Biochemistry, 29:9289-9293 (1990); Ueda y col., JP
62-190199 publicada el 20 de julio de 1987.
Otros investigadores demostraron que la polaridad
de la solución influencia la propensión de los péptidos a adquirir
cierta estructura secundaria. Jackson y Mantsch, Biochim Biophys.
Acta, 1118: 139-143 (1992); Shibata y col.,
Biochemistry, 31:5728-5733 (1992); Zhong y Johson,
Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 89:4462-4465 (1992). En
general, la polaridad de la solución parece favorecer la formación
de hélice alfa en péptidos cortos. Jackson y Mantsch, supra.,
en estudios espectroscópicos de la insulina también indican que las
concentraciones moderadas de los alcoholes incrementan el contenido
de hélice alfa. Hua y Weiss, supra.
Se necesitan procedimientos eficaces y no
costosos para realizar el replegamiento de polipéptidos, incluyendo
el IGF-I plegado incorrectamente e insoluble entre
otros, en una conformación correcta para que la actividad biológica
del polipéptido pueda restaurarse.
Según ello, es un objetivo de la presente
invención el proporcionar un procedimiento de replegamiento eficaz
para los polipéptidos.
Otro objetivo es el proporcionar un procedimiento
de replegamiento que no utilice reactivos de intercambio de
disulfuros costosos como el glutatión.
Un objetivo más es proporcionar condiciones de
replegamiento que no produzcan un producto que contenga disulfuros
adicionales.
Otro objetivo más es proporcionar unas
condiciones de replegamiento que sean reproducibles al máximo,
robustas y escalables.
Estos y otros objetivos serán evidentes para un
experto en la materia.
Se ha observado que la utilización de
concentraciones bajas de cobre o manganeso facilita en gran manera
la oxidación de los disulfuros polipeptídicos. Según ello, la
presente invención proporciona una composición que comprende
aproximadamente 0,1 a 15 mg/ml de un polipéptido en un tampón de pH
7-12 que comprende aproximadamente
5-40% (v/v) de un solvente alcohólico o aprótico
polar, aproximadamente 0,2-3 M de metal
alcalino-térreo, metal alcalino o sal amoniacal,
aproximadamente 0,1-9 M de un agente caotrópico y
aproximadamente 0,01 a 15 \muM de una sal de cobre o
manganeso.
En otro aspecto, la presente invención
proporciona un procedimiento para aumentar el rendimiento de un
replegamiento correcto de un polipéptido mal plegado en células
huésped, en donde la etapa de replegamiento del polipéptido está
presente a una concentración de aproximadamente 0,1 a 15 mg/ml en un
tampón a pH 7-12, que comprende aproximadamente el
5-40% (v/v) de un solvente alcohólico o aprótico
polar, aproximadamente 0,2-3 M de un metal
alcalino-térreo, metal alcalino o sal amoniacal,
aproximadamente 0,1-9 M de un agente caotrópico y
aproximadamente 0,01 a 15 \muM de una sal de cobre o
manganeso.
La esencia de la invención es utilizar un tampón
que contenga una concentración mínima de cobre o manganeso para
aumentar el replegamiento de polipéptidos mal plegados. La
utilización de sales de cobre como catalizador de la oxidación
elimina la necesidad de utilizar agentes caros de intercambio de
disulfuros como el glutatión. Además, el procedimiento elimina la
posibilidad de producir el polipéptido que contiene disulfuros
adicionales que pueden producirse cuando se utilizan agentes de
intercambio de disulfuros. En una realización preferida, se
identifican las condiciones de la solución que son favorables para
el replegamiento del IGF-I mal plegado, recuperado
de los cuerpos refráctiles periplásmicos de procariotas para
obtener un alto rendimiento de IGF-I plegado
correctamente.
En particular, dicho proceso es preferible para
polipéptidos de mamífero no nativos producidos de forma
recombinante en células procariotas, como las bacterias, incluyendo
E. coli, que forma cuerpos refráctiles en el periplasma de
las células. Además, la presente invención produce rendimientos
mayores de proteína independientemente de la concentración proteica
utilizada en la mezcla de reacción.
La Figura 1 muestra un mapa de restricción para
el plásmido p200, utilizado para producir pLamBIGF, un plásmido
intermedio en la producción de pLBIGFTsc, utilizado para preparar
pBKIGF-2, un plásmido intermedio en la preparación
de un vector de expresión que codifica IGF-I,
denominado pBKIGF-2B.
La Figura 2 muestra las secuencia nucleotídica
del fragmento EcoRI-EcoRI (desde las posiciones
1149 a 1633) de p200 que contiene las secuencias MF alfa I prepro y
del gen IGF-I (SEC ID Nº. 1).
La Figura 3 muestra la construcción del plásmido
pLamBGF a partir de los fragmentos plasmídicos y un trozo del DNA
sintético (SEC ID Nº. 2 y 3). El plásmido pLamBIGF es un plásmido
intermedio en la producción de pLBIGFTsc, utilizado para preparar
pBKIGF-2.
La Figura 4 muestra la construcción del plásmido
intermedio pLBIGFTsc a partir de pLamBIGF.
La Figura 5 muestra la construcción del plásmido
intermedio pRanTsc utilizado en la producción de
pBKIG-2.
La Figura 6 muestra la construcción de
pBKIGF-2 a partir de pLS32Tsc, pLBIGFTsc, pLS33Tsc y
pRanTsc.
La Figura 7 muestra la construcción de
pBKIGF-2A, utilizado para preparar
pBKIGF-2B, a partir de pLBIGFTsc,
pBKIGF-2 y un fragmento del DNA sintético (SEC ID
Nº 4 y 5).
La Figura 8 muestra la construcción de pLamBRan,
utilizado para preparar pBKIGF-2B, a partir de
pLS33LamB, pRANTES y un fragmento del DNA sintético (SEC ID Nº 6 y
7).
La Figura 9 muestra la construcción del vector de
expresión pBKIGF-2B a partir de
pBKIGF-2, pBKIGF-2A, pLamBRan y un
fragmento del DNA sintético (SEC ID Nº 8 y 9).
La Figura 10 es una serie de tres cromatogramas
de HPLC que muestra la evolución de especies de
IGF-I (de izquierda a derecha, IGF-I
plegado incorrectamente, correctamente y reducido) durante el
replegamiento. Estos cromatogramas se tomaron al inicio del
plegamiento (cromatograma inferior), al cabo de 1 hora de iniciarse
el plegamiento (cromatograma del medio) y al cabo de 3 horas de
haberse iniciado el plegamiento (cromatograma superior).
La Figura 11 es un diagrama de fases que describe
los sistemas de dos fases acuosas producidos mediante adición de
sal y un polímero a un extracto entero que contiene urea, DTT,
IGF-I no nativo y sólidos asociados a células. Los
símbolos se utilizaron para indicar los sistemas de dos fases
(círculos vacíos), sistemas monofásicos (círculos rellenos),
sistemas de dos fases con sólidos flotando (p) y puntos binodales
publicados (X). Las curvas se utilizaron para mostrar la posición
aproximada del binodal (sólido), el límite para la sedimentación de
los sólidos (sombreado) y el límite de la proporción de fases que
permite que los sólidos se hallen en la fase inferior (punteado). La
región sombreada indica la región óptima de separación del
IGF-I y los sólidos asociados a células.
La Figura 12 muestra el efecto de la
concentración de cobre sobre la cinética de replegamiento del
IGF-I. El replegamiento se llevó a cabo a 25ºC con
concentraciones traza de cloruro de cobre (astas) del orden de 0,013
\muM (círculo vacío), 0,052 \muM (círculo relleno), 0,13 \muM
(cuadrado abierto), 0,52\muM (asterisco), 1,3 \muM (triángulo
abierto), 5,2 \muM (triángulo relleno) y 13 \muM (cuadrado
relleno).
Tal como se utiliza aquí, "polipéptido de
interés" hace referencia generalmente a péptidos y proteínas que
tienen más de aproximadamente diez aminoácidos. Los polipéptidos
pueden ser homólogos a la célula huésped, o preferentemente, pueden
ser exógenos, lo que significa que son heterólogos, es decir,
foráneos, a la célula huésped que se utiliza, como una proteína
humana producida por una célula de ovario de hámster Chino o por
una bacteria, o un polipéptido de levaduras producido por una
levadura distinta o una bacteria o célula de mamífero.
Preferentemente, se utilizan polipéptidos de mamífero (polipéptidos
derivados originariamente de un organismo mamífero), más
preferentemente los producidos en células procariotas, más
preferentemente como cuerpos de inclusión en células bacterianas,
especialmente a partir del periplasma de la bacteria.
Ejemplos de polipéptidos bacterianos incluyen,
p.ej., la fosfatasa alcalina y la
\beta-lactamasa. Ejemplos de polipéptidos de
mamífero incluyen las moléculas como, p.ej., la renina, una hormona
de crecimiento, incluyendo la hormona de crecimiento humana; la
hormona de crecimiento bovina; el factor liberador de la hormona de
crecimiento; la hormona paratiroidea; la hormona estimuladora del
tiroides; las lipoproteínas; la \alpha-1
anti-tripsina; la cadena A de la insulina; la
cadena B de la insulina; la proinsulina; la hormona estimuladora del
folículo; la calcitonina; la hormona luteinizante; el glucagón; los
factores de coagulación como el factor VIIIC, el factor IX, el
factor tisular y el factor de von Willebrand; los factores
anti-coagulantes como la Proteína C; el factor
natriurético atrial; el tensioactivo pulmonar; el activador del
plasminógeno, como la uroquinasa o el activador del plasminógeno de
tipo tisular (t-PA); la bombesina; la trombina; el
factor de crecimiento hematopoyético; el factor de necrosis
tumoral-alfa y beta; la encefalinasa; una albúmina
sérica como la seroalbúmina humana; la sustancia inhibidora
mulleriana; la cadena A de la relaxina; la cadena B de la relaxina;
el péptido asociado a gonadotropina de ratón; una proteína
microbiana, como la beta-lactamasa; la DNasa; la
inhibina; la activina; el factor de crecimiento endotelial vascular;
los receptores de hormonas o factores de crecimiento; la integrina;
la proteína A o D; los factores reumatoides; un factor neurotrófico
como el factor neurotrófico derivado del hueso (BDNF), la
neurotrofina-3, -4, -5, o -6 (NT-3,
NT-4, NT-5, o NT-6),
o un factor de crecimiento neuronal como el
NGF-\beta; el factor de crecimiento derivado de
plaquetas (PDGF); el factor de crecimiento de fibroblastos como el
aFGF y el bFGF; el factor de crecimiento epitelial (EGF); el factor
de crecimiento transformante (TGF) como el TGF-alfa
y el TGF-beta, incluyendo el
TGF-\beta1, TGF-\beta2,
TGF-\beta3, TGF-\beta4, o el
TGF-\beta5; el factor de crecimiento similar a la
insulina -I y -II (IGF-I e IGF-II);
des(1-3)-IGF-I
(IGF-I de cerebro), las proteínas de unión al
factor de crecimiento similar a la insulina; las proteínas CD como
el CD-3, CD-4, CD-8
y CD-19; la eritropoyetina, los factores
osteoinductivos; las inmunotoxinas; una proteína morfogenética del
hueso (BMP); un interferón como el interferón alfa, -beta y -gamma;
los factores estimuladores de la formación de colonias (CSFs),
p.ej., M-CSF, GM-CSF, y
G-CSF; las interleucinas (ILs), p.ej.,
IL-1 a IL-10; la superóxido
dismutasa; los receptores de la célula T; las proteínas de
superficie de membrana; el factor acelerador del declive; el
antígeno antiviral como, por ejemplo, un fragmento de la cubierta
del SIDA; las proteínas transportadoras; los receptores
autoguiados; las adresinas; las proteínas reguladoras; los
anticuerpos; y fragmentos de cualquiera de los polipéptidos citados
anteriormente.
Los polipéptidos preferidos de interés son
aquellos que se producen fácilmente en las células procariotas con
un mínimo de proteolisis y no necesitan ser glicosilados para su
utilización pretendida. Ejemplos de polipéptidos de mamífero
incluyen el IGF-I, IGF-II, el
IGF-I de cerebro, la hormona de crecimiento, las
cadenas de la relaxina, el factor de liberación de la hormona de
crecimiento, las cadenas de la insulina o la
pro-insulina, la uroquinasa, las inmunotoxinas, el
NGF, NT-5 y antígenos. Polipéptidos de mamífero
especialmente preferidos incluyen el IGF-I, el
IGF-I de cerebro, la hormona de crecimiento y una
neurotrofina como el NGF, NT-3,
NT-4, NT-5 y NT-6,
incluyendo el NT-5, siendo el polipéptido de
mamífero más preferido el IGF-I.
Tal como se utiliza aquí,
"IGF-I" hace referencia al factor de
crecimiento similar a la insulina de cualquier especie, incluyendo
la bovina, ovina, porcina, equina y preferentemente la humana, en
una secuencia nativa o en una forma variante y producida de forma
recombinante. En la patente europea EP 128.733, publicada el 19 de
diciembre de 1984, se describe un procedimiento para la producción
de IGF-I.
Tal como se utiliza aquí, el término "en una
conformación no nativa" describe los polipéptidos que adoptan
una estructura secundaria, terciaria y/o cuaternaria que no es
equivalente a la nativa. El polipéptido puede hallarse en una tal
conformación en cualquier momento del proceso reivindicado, bien
antes de la etapa de contacto o durante o después del contacto con
el agente caotrópico y las especies formadoras de fases. El
polipéptido en esta conformación no nativa puede ser soluble, pero
hallarse en una forma inactiva o puede ser una proteína de membrana
no nativa, o puede ser insoluble y hallarse en una conformación
inactiva biológicamente con enlaces disulfuro mal o no formados.
Este polipéptido insoluble, se hallará preferentemente, aunque no de
forma indispensable, contenido en los cuerpos refráctiles, es
decir, puede ser o no visible con el microscopio de contraste de
fases.
Tal como se utiliza aquí, el término
"polipéptidos ``plegados incorrectamente" hace referencia a
polipéptidos precipitados o agregados que están contenidos dentro
de los cuerpos refráctiles. Los polipéptidos
no-nativos se obtienen de polipéptidos plegados
incorrectamente e incluyen material plegado correcta e
incorrectamente.
El término "cuerpos de inclusión" o
"cuerpos refráctiles" hace referencia a masas intracelulares
densas de polipéptidos agregados de interés, que constituyen una
porción significativa de la proteína celular total, incluyendo
todos los componentes celulares. En algunos casos, pero no en todos,
estos agregados de polipéptidos pueden reconocerse como manchas
brillantes visibles dentro de la célula con el microscopio de
contraste de fases a un aumento inferior a 1000.
Tal como se utiliza aquí, el término
"células" hace referencia a cualquier célula. Las células de
quienes se recupera el polipéptido de interés se pueden tratar con
reactivos formadores de fase y reactivos de replegamiento sin
importar su estado. Por ejemplo, la invención abarca las células en
cultivo (todo el cultivo, en donde las células no están separadas
independientemente del tanque en donde crecen), así como aquellas
que se han sometido a homogenización o centrifugación. El término
"cultivo celular" hace referencia no sólo a cultivos de
células de mamífero, sino también a cultivos de cualquier tipo de
células, incluyendo las células procariotas y de levaduras.
El término "variaciones conformacionales"
hace referencia a polipéptidos que difieren únicamente en los
enlaces disulfuros intramoleculares. Por ejemplo, el
IGF-I tiene 70 aminoácidos y seis residuos de
cisteína que forman enlaces disulfuros intramoleculares. La
variación conformacional del IGF-I activa y
correcta tiene enlaces disulfuro entre los residuos aminoacídicos
C6-C48, C47-C52 y
C18-C61. El otro polipéptido principal es una
variación conformacional menos activa biológicamente que tiene
enlaces disulfuros entre los residuos aminoacídicos
C6-C47, C48-C52 y
C18-C61.
Tal como se utiliza aquí, el término
"recipiente de fermentación" hace referencia a un tanque u
otro aparato en donde tiene lugar el cultivo del huésped procariota
para producir el polipéptido de interés. El caldo de fermentación o
medio es el medio de cultivo utilizado por las células.
Tal como se utiliza aquí, "agente
caotrópico" hace referencia a un compuesto que, en una
concentración adecuada en solución acuosa, es capaz de cambiar la
configuración o la conformación espacial de los polipéptidos a
través de alteraciones en la superficie para convertir el
polipéptido en soluble en el medio acuoso. Las alteraciones pueden
tener lugar cambiando, p.ej., el estado de hidratación, el entorno
del solvente, o la interacción de
solvente-superficie. La concentración de agente
caotrópico afectará directamente a su fuerza y eficacia. Una
solución caotrópica fuertemente desnaturalizante contiene un agente
caotrópico en grandes concentraciones que, en solución, de hecho
desplegarán un polipéptido que se halle en la solución. La
desnaturalización será relativamente amplia, pero reversible. Una
solución caotrópica moderadamente desnaturalizante contiene un
agente caotrópico que, en concentraciones suficientes en solución,
permiten el plegamiento parcial de una forma polipeptídica a partir
de cualquier conformación retorcida que haya adoptado el polipéptido
mediante sus intermediarios solubles en la solución, en la
conformación espacial en la que se halle cuando se trabaja en su
forma activa en condiciones fisiológicas endógenas u homólogas.
Ejemplos de agentes caotrópicos incluyen el hidrocloruro de
guanidina, la urea y los hidródroxidos como el hidróxido sódico o
potásico. Los agentes caotrópicos incluyen una combinación de estos
reactivos, como por ejemplo una mezcla de una base con urea o
hidrocloruro de guanidina.
Tal como se utiliza aquí, el término "agente
reductor" hace referencia a un compuesto que, en una
concentración adecuada en solución acuosa, mantiene grupos
sulfidrilo con lo que se rompen químicamente los enlaces disulfuro
intra- o intermoleculares. Ejemplos representativos de agentes
reductores adecuados incluyen el ditiotreitol (DTT), el
ditioeritritol (DTE), el beta-mercaptoetanol (BME),
la cisteína, la cisteamina, el tioglicolato, el glutatión y el
borohidruro de sodio.
Tal como se utiliza aquí, los términos
"especies formadoras de fases" o "reactivos formadores de
fases" hacen referencia a moléculas que actúan para formar
múltiples fases cuando se añaden a una solución acuosa. Una solución
"acuosa" es una en la que la mayor parte de la solución (es
decir, más de aproximadamente el 50%) está constituido por agua.
Así, por ejemplo, etanol al 40%, que contiene aproximadamente el
60% de agua, es un solvente adecuado para una especie formadora de
fases. Ejemplos de especies formadoras de fases incluyen las
combinaciones de polímero-polímero, las
combinaciones de solvente-sal, las combinaciones de
polímero-sal y las combinaciones de
polímero-solvente. La más preferida aquí es la
combinación polímero-sal.
Tal como se utiliza aquí, el término "sólidos y
ácidos nucleicos de biomasa" hacen referencia a sólidos
determinados (no disueltos) que son el resultado (o se originan) de
células o cultivo celular en donde se produce el polipéptido, así
como los ácidos nucleicos (DNA, RNA). Esto incluiría todas las
fuentes distintas a las de solubilización y adición del componente
de extracción líquido. Dichos sólidos incluyen, por ejemplo,
células, restos celulares, componentes del medio, membranas
celulares y vesículas y proteínas endógenas a la célula que no son
proteínas solubles u otros componentes insolubles de la célula.
Después de realizar el procedimiento de la presente invención, los
sólidos de biomasa y los ácidos nucleicos se hallan en una fase
opuesta de la del polipéptido.
Tal como se utiliza aquí, el término
"múltiple" al aplicarse a las fases significa más de una fase,
preferentemente de dos a cuatro fases, y más preferentemente dos
fases. Una fase ``enriquecida en el polipéptido y empobrecida en
"sólidos de biomasa" hace referencia a una fase en donde el
polipéptido tiene un coeficiente de partición superior a uno y los
sólidos de biomasa tienen un coeficiente de partición inferior a
uno, en donde el coeficiente de partición se referencia a la fase
de interés. Por ejemplo, si la fase inferior está enriquecida en
producto, entonces el coeficiente de partición es la concentración
en la fase inferior dividida por la concentración en la fase
superior.
Tal como se utiliza aquí, "osmolito" hace
referencia a un agente que proporciona la osmolalidad a la solución
tamponada o afecta la hidratación o la tensión superficial.
Ejemplos incluyen los polioles y los azúcares como el glicerol,
eritritol, arabitol, sorbitol, manitol, xilitol, mannisidomanitol,
glicosil, glicerol, glucosa, fructosa, sacarosa, trehalosa y
isofluorósido; polímeros como los dextranos, levanos y polietilén
glicol; y algunos aminoácidos y derivados de lo mismo como la
glicina, alanina, \beta-alanina, prolina, taurina,
betaína, octopina, glutamato, sarcosina y ácido
\gamma-aminobutírico y el óxido
N-trimetilamina (TMAO), tal como se describe de
forma más detallada en Yancey y col., Science,
217:1214-1222 (1982) y Schein, Bio/Technology,
8:308-315 (1990).
Tal como se utiliza aquí, el término
"tampón" hace referencia a una solución tamponada que resiste
los cambios del pH por la acción de sus componentes conjugados
ácido-base.
Tal como se utiliza aquí, "solvente" hace
referencia a los alcoholes y solventes polares apróticos. Los
alcoholes se indican según la terminología comúnmente utilizada, y
son preferentemente alcoholes de 1 a 10 átomos de carbono, más
preferentemente el metanol, etanol, iso-propanol,
n-propanol, o t-butanol, así como
el glicerol, propilén glicol, etilén glicol, polipropilén glicol y
polietilén glicol y más preferentemente el etanol o el isopropanol.
Dichos alcoholes son solventes que al añadirse a una solución
acuosa incrementan la hidrofobicidad de la solución al disminuir la
polaridad de la solución. Los solventes apróticos polares son
moléculas como el dimetil sulfóxido (DMSO), dimetil formamida
(DMF), N-metilpirrolidona (NMP), tetrahidrofurano
(THF), dioxano, acetonitrilo, etc., que pueden utilizarse en lugar
de o en adición al alcohol.
Tal como se utiliza aquí, el término "sal de
metal alcalino, de metal alcalino-térreo o sal
amoniacal" hace referencia a una sal que tiene un catión
procedente de elementos metálicos alcalinos o
alcalino-térreos o un catión amoniacal y un anión
inorgánico u orgánico (de base hidrocarbonada). Ejemplos de dichas
sales incluyen el cloruro sódico, el cloruro amónico, el citrato
sódico, el citrato potásico, el cloruro potásico, el cloruro
magnésico, el cloruro cálcico, el fosfato sódico, el fosfato
cálcico, el fosfato amónico, el fosfato magnésico, el fosfato
potásico, el sulfato disódico, el sulfato amónico, el sulfato
potásico, el sulfato magnésico, el sulfato cálcico, etc. Las sales
preferidas en la presente invención son los cloruros o los sulfatos,
siendo la más preferida el cloruro sódico.
Tal como se utiliza aquí, el término "sal de
cobre o manganeso" hace referencia a una sal de cobre o
manganeso con cualquier anión, incluyendo los aniones orgánicos,
que es responsable de estimular la oxidación de los residuos de
cisteína. Los aniones adecuados incluyen los sulfatos y los
cloruros, siendo el cloruro cúprico el preferido. El cobre o el
manganeso pueden añadirse exógenamente o pueden ser residuales de
la fermentación o ya estar presentes en la solución que contiene el
polipéptido de interés.
La presente invención hace referencia a un
procedimiento para aumentar los rendimientos del replegamiento del
polipéptido a partir de células huésped utilizando una cantidad
mínima de sal de cobre o manganeso como catalizador en un tampón.
Este tampón está a un pH de aproximadamente 7 a 12, dependiendo
principalmente del tipo de polipéptido y del agente reductor,
preferentemente a aproximadamente un pH de 8-11,
más preferentemente a pH 8,5-11 y más
preferentemente a 8,5-10,5.
Un ingrediente clave del tampón es un solvente
aprótico polar o alcohólico a una concentración de aproximadamente
5-40% (p/v), preferentemente al
10-30% (volumen/volumen) de la solución,
dependiendo, p.ej., del tipo de polipéptido y del solvente y de la
concentración del agente caotrópico, siendo la concentración más
preferida del 20% (v/v) aproximadamente.
Un segundo ingrediente clave a este tampón es una
sal de metal alcalino, metal alcalino-térreo o
amoniacal, que está presente a una concentración de aproximadamente
0,2 a 3 M, preferentemente a 0,2-2 M, dependiendo
principalmente de la concentración caotrópica, de la concentración
del solvente y del tipo de sal de metal alcalino,
alcalino-térreo y del polipéptido utilizado. Por
ejemplo, si el catión es el sodio, potasio o amoníaco, la
concentración es de aproximadamente 0,5 a 3 M, pero si el catión es
el magnesio, la concentración es de aproximadamente 0,2 a 1 M.
Un tercer ingrediente del tampón es una cierta
cantidad de agente caotrópico. La cantidad de dicho caótropo
dependerá principalmente de la concentración de sal de metal
alcalino, alcalino-térreo o amoniacal, de la
concentración de solvente, del tipo específico de sal de metal
alcalino, alcalino-térreo o amoniacal utilizada,
del tipo específico de agente caotrópico utilizado y del tipo de
polipéptido, así como también del pH del tampón, pero en general se
hallará en un intervalo de aproximadamente 0,1 a 9 M,
preferentemente a aproximadamente 0,5 a 6 M y más preferentemente a
aproximadamente 1,5 a 4 M. Referente a caotropos específicos,
preferentemente a aproximadamente 0,1 a 2 M de hidrocloruro de
guanidinio y preferentemente a aproximadamente 1-3
M, más preferentemente a aproximadamente 1-2,5 m y
todavía más preferentemente se utiliza urea 2 M.
Un cuarto ingrediente del tampón es una cantidad
eficaz de una sal de metal de transición seleccionada a partir de
sales de cobre y de manganeso para que se produzca la oxidación y
el replegamiento resultante. La cantidad de sales de cobre o
manganeso depende finalmente del tipo de metal de transición y del
polipéptido utilizado y del nivel de oxígeno presente. Cuanto más
baja es la tasa de adición de oxígeno o el nivel de oxígeno, mayor
es la cantidad de sal de cobre o manganeso que se puede utilizar.
La concentración de sal de cobre o manganeso es de generalmente de
0,01 a 15 \muM, preferentemente de aproximadamente 0,01 a 10
\muM, más preferentemente de aproximadamente 0,01 a 5 \muM y
aún más preferentemente de 0,01 a 0,5 \muM. Los intervalos
preferidos anteriores se recomiendan especialmente para el
IGF-I. Si la concentración se aumenta por encima de
los 15 \muM, el rendimiento del polipéptido plegado correctamente
disminuye dramáticamente. Más preferentemente, la concentración de
sal de cobre o manganeso es de aproximadamente 0,5 \muM. La sal
de metal de transición puede estar presente en el tampón sin adición
de sal de metal de transición exógena, por ejemplo, si es residual
de la fermentación, o puede añadirse al tampón o a ambos.
Las células huésped adecuadas para la expresión
del DNA que codifica el polipéptido deseado son las procariotas,
levaduras o las eucariotas superiores. En las procariotas adecuadas
para este propósito se incluyen las bacterias como las
arqueobacterias y las eubacterias. Las bacterias preferidas son
eubacterias, como los organismos Gram-negativos o
Gram-positivos, por ejemplo. Las enterobacteriáceas
como Escherichia coli, p.ej., E. coli,
Enterobacter, Erwinina, Klebsiella,
Proteus, Salmonella, p.ej., Salmonella
typhimurium, Serratia, p.ej., Serratia
marcescans y Shigella; Bacilli como B.
subtilis y B. licheniformis (p.ej., B.
licheniformis, 41P descrito en la patente DD 266.710,
publicada el 12 de abril de 1989); Pseudomonas como P.
aeruginosa, Streptmyces; Azotobacter; Rhizobia; Vitreoscilla y
Paracoccus. Huéspedes de E. coli adecuados incluyen
E. coli W3110 (ATCC 27.325), E.coli 294 (ATCC
31.446), E. coliB y E. coliX1776 (ATCC 31.537). Estos
ejemplos son ilustrativos en lugar de limitantes.
También pueden emplearse las células mutantes de
cualquiera de las bacterias anteriormente mencionadas. Desde luego
es necesario seleccionar la bacteria adecuada teniendo en
consideración la replicabilidad del replicón en las células de una
bacteria. Por ejemplo, para suministrar el replicón, se utilizan
E coli, Serratia, o especies de Salmonella pueden
ser adecuadas como huésped cuando plásmidos bien conocidos como el
pBR322, pBR325, pACYA177, o pKN410.
La cepa E. coli W3110 es un huésped
preferido o huésped parental ya que es una cepa huésped común para
fermentaciones del producto del DNA recombinante. Preferentemente,
la célula huésped debería secretar cantidades mínimas de enzimas
proteolíticas. Por ejemplo, la cepa W3110 puede modificarse para
generar una mutación genética en los genes que codifican proteínas,
por ejemplo dichos huéspedes incluyen la cepa 27C7 de E.
coli W3110. el genotipo completo de 27C7 es tonA\Delta
ptr3 phoA\DeltaE15\Delta
(argF-lac) 169 ompT\Delta
degP41kan^{r}. La cepa 27C7 se depositó el 30 de octubre
de 1991, en el American Type Culture Collection como ATCC 55.244.
Alternativamente, se puede utilizar la cepa de E. coli que
tiene una proteasa periplásmica mutante se describe en la patente
americana 5.946.783, publicada el 7 de agosto de 1990.
Alternativamente, son adecuados procedimientos in vitro de
clonaje, p.ej., PCR u otras reacciones de la polimerasa de ácidos
nucleicos.
Por ejemplo, la cepa W3110 puede modificarse para
producir una mutación genética en los genes que codifican proteínas
endógenas del huésped, por ejemplo huéspedes como la cepa 1A2 de
E. coli W3110, que tiene el genotipo completo
tonA\Delta; la cepa 9E4 de E. coli W3110, que tiene
el genotipo completo de tonA\Delta ptr3; la cepa
27C7 de E. coli W3110 (ATCC 55.244), que tiene el genotipo
completo tonA\Delta ptr3
phoA\DeltaE15 \Delta (argF-lac)
169 ompT\Delta degP41Kan^{r}; la cepa 37D6 de E.
coli W3110 que tiene el genotipo completo de
tonA\Delta ptr3 phoA\DeltaE15 \Delta
(argF-lac) 169 ompT\Delta
degP41Kan^{r}rbs7\Delta ilvG; la cepa 40B4
de E. coli W3110, que es una cepa 37D6 con una mutación por
deleción degP y no resistente a la kanamicina; y una cepa de E.
coli que tiene una proteasa periplásmica mutante descrita en la
patente americana 4.946.783, publicada el 7 de agosto de 1990.
Además de los microbios procariotas, los
eucariotas como los hongos filamentosos o las levaduras también son
adecuados como huéspedes de clonaje y expresión para vectores
codificantes de polipéptidos. Saccharomyces cerevisiae, o la
levadura común del pan, es la más comúnmente utilizada entre los
microorganismos huéspedes eucariotas inferiores. Sin embargo, están
generalmente disponibles y son de utilidad en la presente invención
otros géneros, especies y cepas como por ejemplo,
Schizosaccharomyces pombe [Beach y Nurse, Nature, 290:140
(1981); patente europea EP 139.383 publicada el 2 de mayo de 1985];
huéspedes de Kluyveromyces (patente americana U.S.
4.943.529; Fleer y col., supra), como por ejemplo K.
lactis [MW98-8C, CBS683, CBS4574; Lovencourt y
col., J. Bacteriol., 737 (1983)], K. fragilis (ATCC 12.424),
K. bulgaricus (ATCC 16.045), K. wickeramii (ATCC 24.178),
K. waltii (ATCC 56.500), K. drosophilarum (ATCC
36.906; Van der Berg y col., supra), K.
thermoctolerans y K. marxianus; Yarrowia [patente
europea EP 402.226]; Pichia pastoris [patente europea EP
183.070; Sreekrishna y col., J. Basic Microbiol.,
28:265-278 (1988)]; Candida; Trichoderma
reesia [Patente europea EP 244.234]; Neurospora crassa
[Case y col., Proc. Natl. Acad. Sci. USA,
76:5259-5263 (1979)]; Schawanniomyces como
Schawanniomyces occidentalis [patente europea EP 394.538,
publicada el 31 de octubre de 1990], y los hongos filamentosos como
p.ej., Neurospora; Penicillium, Tolypocladium
[patente internacional WO 91/00357, publicado el 10 de enero de
1991] y huéspedes de Aspergillus como A. nidulans
[Ballance y col., Biochem. Biophys. Res. Commun.,
112:284-289 (1983); Tilburn y col., Gene,
26:205-221 (1983); Yelton y col., Proc. Natl. Acad.
Sci. USA, 81:1470-1474 (1984)] y A. niger [Kelly y
Hynes, EMBO J., 4:475-479 (1985)].
También se pueden obtener células huéspedes
adecuadas de organismos multicelulares, para la expresión del DNA
codificante del polipéptido deseado. Dichos huéspedes son capaces
de realizar procesamientos complejos y de actividades de
glicosilación. En principio, es adecuado cualquier cultivo celular
de eucariota superior, bien sean cultivos de vertebrados o de
invertebrados. Ejemplos de células de invertebrados incluyen las
células de plantas e insectos. Se han identificado numerosas cepas
de baculovirus y de variantes y las células huésped de insectos
permisivas como Spodoptera frugiperda (oruga), Aedes
aegypti (mosquito), Aedes albopictus (mosquito),
Drosophila melanogaster (mosca de la fruta) y Bombyx mori.
Véase por ejemplo, Luckow y col., Bio/Technology,
6:47-55 (1988); Miller y col., in Genetic
Engineering, Setlow, J.K. y col., eds., vol 8 (Plenum Publishing,
1986), pág. 277-279; y Maeda y col., Nature,
315:592-594 (1985). Están disponibles diversas
cepas víricas para la transfección, p.ej, la variante
L-1 de Autographa californica NPV y la cepa
Bm-5 de Bombyx mori NPV, pudiéndose utilizar
dichos virus como los virus de la presente invención, en particular
para la transfección de células de Spodoptera frugiperda.
Pueden utilizarse como huéspedes os cultivos de
células vegetales de algodón, maíz, patata, soja, petunia, tomate y
tabaco. De forma característica, las células vegetales se
transfectan incubándose con determinadas cepas de la bacteria
Agrobacterium tumefaciens, que previamente se ha manipulado
para contener el DNA que codifica el polipéptido deseado. Durante
la incubación de las células vegetales con A. tumefaciens,
el DNA que codifica para el polipéptido deseado se transfiere a la
célula vegetal huésped de modo que se transfecta y en condiciones
adecuadas expresa el DNA que codifica el polipéptido deseado.
Además, están disponibles las secuencias reguladoras y la señal
compatible con las células vegetales, como el promotor de la
nopalina sintasa y las secuencias señal de poliadenilación.
Depicker yc ol., J. Mol. Appl. Gen., 1:561 (1982). Además, los
segmentos de DNA aislados de la región cadena arriba del gen 780
T-DNA son capaces de activar o aumentar los niveles
de transcripción de genes expresables en plantas en el tejido
vegetal que contenga el DNA recombinante. Patente europea 321.196,
publicada el 21 de junio de 1989.
Ejemplos de líneas celulares huésped de mamífero
útiles son la línea CV1 de riñón de mono transformada con SV40
(COS-7, ATCC CRL 1651); la línea de riñón embrional
humano (células 293 ó 293 subclonadas para su crecimiento en el
cultivo en suspensión, Graham y col., J. Gen. Virol., 36:59 [1977]);
células de riñón de bebé de hámster (BHK, ATCC CCL 10); células de
ovario de hámster chino-DHFR (CHO; Urlaub y Chasin,
Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 77:4216 [1980]); células de sertoli de
ratón (TM4, Mather, Biol. Reprod., 23:243-251
[1980]); células de riñón de mono, 23.243-251
[1980]); células de riñón de mono (CV1 ATCC CCL 70); células de
riñón de mono verde africano (VERO-76, ATCC
CRL-1587); células de carcinoma cervical (HELA,
ATCC CCL 2); células de riñón canino (MDK; ATCC CCL34); células de
hígado de rata búfalo [BRL 3A, ATCC CRL 1442); células de pulmón
humano (W138, ATCC CCL 75); células de hígado humano (Hep G2, HB
8065); tumor mamario de ratón (MMT 060562, ATCC CCL51); células TRI
(Mather y col., Annals N.Y. Acad. Sci., 383:44-68
[1982]); células MRC 5; células FS4; y una línea de hepatoma humano
(Hep G2).
Las células huésped se transfectan y transforman
preferentemente con los vectores de expresión y clonaje
anteriormente descritos de la presente invención y se cultivan en
medio nutritivo convencional modificado según sea necesario para la
inducción de promotores, selección de transformantes, o
amplificación de genes que codifican para las secuencias
deseadas.
La transfección hace referencia a la
incorporación de un vector de expresión por un huésped
independientemente de que las secuencias codificantes se expresen.
Existen muchos procedimientos que son conocidos por un experto en la
materia, como por ejemplo, el método del CaPO_{4} y la
electroporación. Se reconoce una transfección satisfactoria cuando
tiene lugar cualquier operación de este vector dentro de la célula
huésped.
La transformación hace referencia a la
introducción del DNA en un organismo para que dicho DNA se
replique, bien como un elemento extracromosómico o como un
integrante cromosómico. Dependiendo de la célula huésped utilizada,
la transformación se realiza utilizando técnicas adecuadas a dichas
células. El tratamiento del calcio que utiliza cloruro cálcico, tal
como se describe en la sección 1.82 de Sambrook y col., Molecular
Cloning: A Laboratory Manual [New York; Cold Spring Harbor
Laboratory Press, 1989], o la electroporación se utilizan
generalmente para células procariotas u otras células que contengan
paredes celulares importantes. La infección con Agrobacterium
tumefaciens se utiliza para la transformación de células de
plantas, tal como se describe por Shaw y col., Gene, 23:315 (1983)
y la patente internacional WO 89/05859 publicada el 29 de junio de
1989. Además, las plantas pueden transformarse utilizando el
tratamiento con ultrasonidos, tal como se describe en la patente
internacional WO 91/00358, publicada el 10 de enero de 1991.
Para células de mamífero sin dichas paredes
celulares, es preferible el procedimiento del fosfato cálcico de
Graham y van der Eb, Virology, 52:456-457 (1978).
Los aspectos generales de las transformaciones del sistema de
células huésped de mamífero están descritos por Axel en la patente
americana U.S. 4.399.216, publicada el 16 de agosto de 1983. Las
transformaciones en levaduras se llevan a cabo de forma
característica de acuerdo con el procedimiento de Van Solingen y
col., J.Bact., 130:946 (1977) y Hsiao y col., Proc. Natl. Acad. Sci.
(USA), 76:3829 (1979). Sin embargo, también pueden utilizarse otros
procedimientos para la introducción de DNA en las células, tal como
la microinyección nuclear, la electroporación, la fusión de
protoplastos bacterianos con células intactas, o los policationes,
p.ej., el polibreno, la poliornitina,etc.,. Para algunas de las
técnicas de transformación en mamíferos, véase Keown y col.,
Methods in Enzymology (1989), Keown y col., Methods in Enzymology
(1990), vol. 185:527-537 y Mansour y col., Nature,
336:348-352 (1988).
Si se utilizan células procariotas para producir
el polipéptido de interés de acuerdo con el procedimiento de la
presente invención, éstas se cultivan en medios adecuados en donde
el promotor pueda ser inducido constitutiva o artificialmente, tal
como se describe de forma general en, por ejemplo, Sambrook y col.,
Molecular Cloning: A Laboratory Manual (Cold Spring Harbor
Laboratory Press, NY 1989). Ejemplos de medios adecuados se
proporcionan en la sección se ejemplos.
También se puede incluir cualquier otro
suplemento además de las fuentes de carbono, nitrógeno y fosfato
inorgánico a la concentración adecuada, sólo o como una mezcla
junto con otros suplementos o medios, como por ejemplo una fuente de
un complejo nitrogenado. El pH del medio puede ser cualquier pH de
aproximadamente 5-9, dependiendo principalmente del
organismo huésped.
Si para producir el polipéptido de la presente
invención se utilizan las células huésped de mamífero, éstas se
pueden cultivar en diversos tipos de medios. Los medios disponibles
comercialmente como el HamF10 (Sigma), el Medio Mínimo Esencial
(MEM de Sigma), el RPMI-1640 (Sigma) y el Medio de
Eagle Modificado por Dulbecco (DMEM, Sigma) son adecuados para el
cultivo de células huésped. Además, cualquiera de los medios
descritos en Ham y Wallace, Meth. Enz., 58:44 (1979), Barnes y
Sato, Anal. Biochem., 102:255 (1988), patente americana U.S.
4.767.704; 4.657.866; o 4.560.655; patente internacional WO
90/03430; patente internacional WO 87/00195; patente americana U.S.
Pat Re. 30.985; o patente americana U.S. 5.122.469, pueden
utilizarse como medio de cultivo para las células huésped.
Cualquiera de estos medios puede suplementarse según sea necesario
con hormonas y/o otros factores de crecimiento (como la insulina,
la transferrina, o el factor epitelial de crecimiento), sales (como
el cloruro sódico, el calcio, el magnesio y el fosfato), tampones
(como el HEPES), nucleósidos (como la adenosina y la timidina),
antibióticos (como el fármaco Gentamicina^{TM}), oligoelementos
(definidos como compuestos inorgánicos generalmente presentes a
concentraciones finales del orden de micromolar) y glucosa o una
fuente de energía equivalente. También se puede añadir cualquier
otro suplemento a concentración adecuada, conocido por los expertos
en la materia. Las condiciones de cultivo, como la temperatura, el
pH y similares, son las previamente utilizadas con el huésped
seleccionado para la expresión y serán evidentes para un experto en
la materia.
En general, los principios, protocolos y técnicas
prácticas para maximizar la productividad de cultivos de células de
mamífero in vitro se pueden hallar en Mammalian Cell
Biotechnology: A Practical Approach, M. Butler, ed. (IRL Press en
Oxford University Press, Oxford, 1991).
Los anteriores procedimientos se pueden utilizar
si el polipéptido se halla en el espacio intracelular o en el
periplásmico. Las condiciones preferidas, que se proporcionan en la
presente invención para el aislamiento de un polipéptido, se
dirigen en especial a los cuerpos de inclusión localizados en el
espacio periplásmico.
A menudo es preferible purificar el polipéptido
de interés de proteínas o polipéptidos celulares recombinantes para
obtener preparaciones que sean esencialmente homogéneas en el
polipéptido de interés antes de su replegamiento. En una
realización, las fracciones proteicas pueden separarse si es
necesario. El polipéptido puede entonces purificarse a partir de la
proteína soluble y de la fracción de membranas del lisado del
cultivo, dependiendo de si está o no unido a membrana, de si es
soluble, o si está presente en una forma agregada. Después de ello,
el polipéptido se solubiliza y a continuación se repliega
utilizando un tampón adecuado. Los detalles para este primer
procedimiento de aislamiento se describen más adelante.
El polipéptido no nativo e insoluble se aísla de
las células huésped procariotas en un tampón de aislamiento
adecuado mediante cualquier técnica adecuada, p.ej., una que
implique la exposición de las células a un tampón de fuerza iónica
adecuada para solubilizar mejor las proteínas del huésped, pero en
el que el polipéptido agregado sea esencialmente insoluble,
rompiendo las células para liberar los cuerpos de inclusión y
hacerlos accesibles para su recuperación mediante, por ejemplo,
centrifugación. Esta técnica es bien conocida y se describe en, por
ejemplo, la patente americana U.S. 4.511.503.
En resumen, las células se resuspenden en el
tampón (de forma característica a pH 5-9;
preferentemente a 6-8, utilizando una fuerza iónica
de aproximadamente 0,01 a 2 M, preferentemente a
0,1-0,2 M). Cualquier sal adecuada, incluyendo el
cloruro sódico, es útil para mantener un valor de fuerza iónica
suficiente. Las células, mientras están resuspendidas en dicho
tampón, se rompen mediante lisis utilizando técnicas comunes como,
por ejemplo, los procedimientos mecánicos, p.ej., una prensa de
Manton-Gaulin, una prensa francesa, o un oscilador
sónico, o mediante procedimientos químicos o enzimáticos.
Ejemplos de procedimientos químicos o enzimáticos
para la rotura de células incluyen la formación de esferoplastos,
que conlleva la utilización de lisozima para lisar la pared
bacteriana [Neu y col., Biochem. Biophys. Res. Comm., 17:215
(1964)), y el choque osmótico, que implica el tratamiento de células
viables con una solución de alta tonicidad y con un lavado en agua
fría de baja tonicidad para liberar los polipéptidos [Neu y col.,
J. Biol. Chem., 240:3685-3692 (1965)]. Un tercer
procedimiento, se describe en la patente americana U.S. 4.680.262,
publicada el 14 de julio de 1987, e implica el contacto de las
células bacterianas con una cantidad efectiva de un alcanol inferior
con 2-4 átomos de carbono durante el tiempo y
temperatura suficientes para destruir y lisar las células.
Después de romper las células, la suspensión se
centrifuga de forma característica para sedimentar los cuerpos de
inclusión. En una realización, esta etapa se lleva a cabo a
aproximadamente 500-15.000 xg, preferentemente a
unas 12.000 xg en una centrífuga estándar durante el tiempo
suficiente, que dependerá del volumen y del diseño de la
centrífuga, generalmente unos 10 minutos a 0,5 horas. El sedimento
resultante contiene esencialmente toda la fracción polipeptídica
insoluble, pero si el proceso de rotura celular no se completa,
también puede contener células intactas o fragmentos de células
rotas. Se puede analizar si la rotura celular ha sido completa,
resuspendiendo el sedimento en una pequeña cantidad de la misma
solución tampón y examinando la suspensión con un microscopio de
contraste de fases. La presencia de fragmentos de células rotas o
de células enteras indica que es necesaria una rotura adicional
para eliminar los fragmentos o células y los polipéptidos
no-refráctiles asociados. Después de dicha rotura
celular, si es necesario, se centrifuga de nuevo la suspensión
celular, se recupera el sedimento y se resuspende. El proceso se
repite hasta que el examen visual pone de manifiesto la ausencia de
fragmentos de células rotas en el material sedimentado o hasta que
un tratamiento adicional no logra reducir el tamaño del sedimento
resultante.
En una realización alternativa, el polipéptido de
interés, preferentemente exógeno, se aísla mediante solubilización
en un tampón adecuado. Este procedimiento puede ser una
solubilización in situ implicando la adición directa de
reactivos al recipiente de fermentación después de que el
polipéptido se haya producido de forma recombinante, eliminando así
etapas extras de cosecha, homogeneización y centrifugación para
obtener el polipéptido. Las partículas restantes pueden eliminarse
mediante centrifugación o filtración, o mediante combinaciones de
lo mismo. Alternativamente, y más preferentemente, se puede
utilizar un sistema de aislamiento/extracción en fases múltiples
para purificar los polipéptidos a partir de las partículas
restantes.
En el sistema de aislamiento en fases múltiples
acuosas, se añaden uno o más agentes desnaturalizantes (agentes
caotrópicos), como la urea, el cloruro de guanidinio y/o una bases
y un agente reductor, como el ditiotreitol o la cisteína, al medio
que contiene el polipéptido a un pH básico y luego se añaden las
especies formadoras de fases al caldo. Una vez que se añade este
segundo grupo de reactivos al caldo, se forman fases múltiples, con
lo que una fase se enriquece en el polipéptido y se ve mermada en
sólidos de biomasa y "ácidos nucleicos". Preferentemente, el
sistema tiene de dos a cuatro fases, y más preferentemente dos
fases, una enriquecida en el polipéptido y la otra enriquecida en
sólidos de biomasa y ácidos nucleicos. Preferentemente, el
polipéptido deseado se reparte en la fase superior a fin de que la
fase superior se enriquezca en el polipéptido y disminuya en
sólidos de biomasa y ácidos nucleicos.
En consecuencia, después de finalizar la
fermentación, el cultivo celular se pone en contacto con uno o más
agentes caotrópicos, un agente reductor opcional y reactivos
formadores de fases para que se formen fases múltiples, una de las
cuales se enriquecerá en el polipéptido de interés. Es preferible
añadir el agente caotrópico o reductor antes de extraer el
polipéptido de la célula y mantener su solubilidad en el medio
antes de añadir los reactivos formadores de fases. También, aunque
el polipéptido de interés pueda extraerse de cualquier fase
(enriquecida en dicho polipéptido), se recupera preferentemente de
la fase superior.
Más preferentemente, el agente caotrópico y el
agente reductor opcional se añaden directamente al caldo de
fermentación en el recipiente de fermentación antes del aislamiento
del polipéptido para que los reactivos permeabilicen las células y
el polipéptido se solubilice y difunda al medio envolvente.
Ejemplos de agentes reductores adecuados incluyen
el ditiotreitol (DTT), el \beta-mercaptoetanol
(BME), la cisteína, el tioglicolato y el borohidruro sódico. La
cantidad de agente reductor en el tampón dependerá principalmente
del tipo de agente reductor y del agente caotrópico, del tipo y pH
del tampón utilizado y del tipo y concentración del polipéptido en
el tampón. Una cantidad efectiva de agente reductor es la
suficiente para eliminar la agregación mediada por disulfuros
intermoleculares. Por ejemplo, de 0,5-6 mg/ml de
IGF-I en una solución tamponada a pH
7,5-10,5 que contenga urea 1-4 M,
DTT a aproximadamente 1-20 mM y cisteína
10-50 mM. El agente reductor preferido es DTT a
aproximadamente 2-10 mM o cisteína a
30-50 mM.
Los agentes caotrópicos adecuados para la
práctica de la presente invención incluyen, p.ej., la urea y las
sales de guanidina o tiocianato, más preferentemente la urea, la el
cloruro de guanidina, o el tiocianato de sodio. La cantidad de
agente caotrópico necesaria para estar presente en el tampón
depende, por ejemplo, del tipo de agente caotrópico y del
polipéptido presente. La cantidad de agente caotrópico a añadir al
caldo de fermentación será suficientemente elevada para extraer el
polipéptido de la célula y mantener su solubilidad en el medio. Si
el polipéptido ha de extraerse de la fase superior, la cantidad de
agente caotrópico debe ser suficientemente baja para que después de
la adición de las especies formadoras de fases la densidad no se
incremente a un punto en donde los sólidos se localicen en la parte
superior en lugar de depositarse en la inferior. En general, la
concentración de agente caotrópico es de aproximadamente 0,1 a 9 M,
preferentemente de aproximadamente 0,5-9 M, más
preferentemente de 0,5 a 6 M, y más preferentemente de 0,5 a 3 M.
También se añade, de preferencia, el agente caotrópico al medio de
cultivo antes de añadir los reactivos formadores de fases. El
agente caotrópico preferido es la urea a aproximadamente
1,5-2,5 M, más preferentemente a aproximadamente 2 M
o el cloruro de guanidina a aproximadamente 0,5-3
M. De preferencia, el agente caotrópico es la urea.
La concentración del polipéptido en la solución
acuosa a la cual el agente caotrópico y el reductor se añaden debe
ser tal que el polipéptido se recuperará con el rendimiento máximo.
La cantidad exacta a utilizar dependerá, p.ej., del tipo de
polipéptido y de la concentración y tipos de otros ingredientes en
la solución acuosa, en particular del agente reductor, agente
caotrópico, especies formadoras de fases y pH. Para los
polipéptidos, en general, la concentración preferida del
polipéptido es de aproximadamente 0,1 a 15 mg/ml. La concentración
preferida de IGF-I (que da como resultado un
rendimiento máximo de IGF-I desnaturalizado o no
nativo) se halla en el intervalo de 0,5-6 mg por ml,
más preferentemente de 1,5-5 mg/ml.
Los tipos de especies formadoras de especies a
utilizar en la presente invención dependen de muchos factores,
incluyendo el tipo de polipéptido y de los ingredientes en el caldo
de fermentación que se trata. Las especies deben seleccionarse para
que los polipéptidos no precipiten y una fase sea más hidrofóbica
que la otra con lo que el polipéptido se localizará en la fase más
hidrofóbica y los sólidos de biomasa y ácidos nucleicos se
depositarán en la fases menos hidrofóbica.
Las especies formadoras de fases pueden ser una
combinación de agentes, incluyendo las combinaciones de polímeros
(polímero-polímero), combinaciones de
polímero-sal, solvente-sal y
combinaciones de polímero-solvente. Polímeros
adecuados son tanto los polímeros altamente hidrofílicos como los
menos hidrofílicos, es decir, cualquier polímero formador de fases
conocido en la materia. Ejemplos incluyen el polietilén glicol o
sus derivados, incluyendo diversos pesos moleculares de PEG como el
PEG 4000, PEG 6000 y el PEG 8000, los derivados del PEG descritos,
por ejemplo, en Grunfeld y col., supra, polivinilpirrolidona
(PVP) a un peso molecular preferible en el intervalo de
aproximadamente 36.000 a 360.000, almidones como el dextrano (p.ej.,
el dextrano 70 y el 500), las dextrinas y las maltodextrinas
(preferentemente con un peso molecular de aproximadamente 600 y
5.000), la sacarosa y el polímero de
Ficoll-400^{TM} (un copolímero de sacarosa y
epiclorhidrina). El polímero preferido en la presente invención es
el polietilén glicol, el propilén glicol, la polivinilpirrolidona,
o un polisacárido como un dextrano. El polímero más preferido aquí
es el PEG de pesos moleculares distintos o una combinación de
PEG-polipropilén glicol o copolímero.
Ejemplos de solventes orgánicos adecuados
incluyen el etilén glicol, el glicerol, el dimetil sulfóxido, el
polivinilalcohol, la dimetil formamida, el dioxano y los alcoholes
como el metanol, el etanol y el 2-propanol. Dichos
solventes son tales que al añadirse a la solución acuosa,
incrementan la hidrofobicidad de la solución.
Las sales pueden ser inorgánicas u orgánicas y
preferentemente no actúan para precipitar el polipétido. No son
preferibles las sales que contengan elementos de transición ya que
tienden a precipitar el polipéptido. Los aniones se seleccionan
para que tengan el potencial para formar sistemas de fases
múltiples. En los ejemplos se incluyen el sulfato amónico, el
fosfato dibásico sódico, el sulfato sódico, el fosfato amónico, el
citrato potásico, el fosfato magnésico, el fosfato sódico, el
fosfato cálcico, el fosfato potásico, el sulfato potásico, el
sulfato magnésico, el sulfato cálcico, el citrato sódico, el
sulfato de manganeso, el fosfato de manganeso, etc. Los tipos de
sales que son útiles para la formación de sistemas acuosos
bifásicos se evalúan más completamente en Zaslavski y col., J.
Chrom., supra. Las sales preferidas en la presente invención
son los sulfatos, los fosfatos, o los citratos y de metales
alcalinos o alcalino-térreos. Más preferidos son los
sulfatos y los citratos y todavía más preferidos son los sulfatos
ya que presentan pocas limitaciones de pH. Las sales más preferidas
son el sulfato sódico y el citrato sódico.
Son bien conocidos en la materia las cantidades
de especies formadoras de fases a añadir al polipéptido de interés
para obtener un sistema de fases múltiples satisfactorio. La
cantidad de especies formadoras de especies añadidas al polipéptido
dependerá de dichos factores, por ejemplo, la cantidad de agente
caotrópico y de agente reductor, si lo hubiera, ya presente en el
caldo de fermentación, la naturaleza del medio de cultivo celular,
el tipo de células utilizadas en la fermentación, el tipo de
polipéptido que se trata, si el polipéptido se ha de recuperar de
la fase inferior o superior y del tipo(s) de especies
formadoras de fases que se añaden. La concentración general del
polímero utilizado es de aproximadamente el 5% (p/p) hasta el límite
de solubilidad para el polímero y la concentración de sal utilizada
es de aproximadamente el 3% (p/p) hasta el límite de solubilidad
para la sal, dependiendo de la magnitud de la proporción
fase-volumen que se requiera. La proporción
fase-volumen debe ser suficiente para acomodar los
sólidos de biomasa. Los tipos y cantidades efectivas de especies
formadoras de fases se pueden determinar mediante diagramas de fase
y evaluar el resultado final, es decir, el grado de pureza y el
rendimiento del polipéptido de interés. Si las especies formadoras
de fases son una combinación de polímero-sal, la
concentración de sal será preferentemente del 4-15%
(p/p) y la concentración del polímero del 5-18%
(p/p), para que el polipéptido deseado se halle en una fase opuesta
a la fase en donde se hallen los sólidos de biomasa y ácidos
nucleicos.
Si el sistema que se desea corresponde a uno en
donde el polipéptido se distribuye en la fase superior y los
sólidos de biomasa y ácidos nucleicos se distribuyen en la fase
inferior, entonces existe una ventana de concentraciones de
especies formadoras de fases. Cuando se añaden cantidades superiores
de agentes caotrópicos para mantener la solubilización, mayor es la
cantidad de especies formadoras de fases que se necesita. Sin
embargo, una concentración superior de todos estos reactivos
incrementará la densidad de la solución. Una densidad elevada
causará que los sólidos de biomasa sedimenten menos rápidamente.
Una densidad alta superpuesta causará que los sólidos de biomasa
floten en la superficie. En consecuencia, las concentraciones de
agente caotrópico y de especies formadoras de fases deben ser
suficientemente altas para mantener un polipéptido completamente
solubilizado, pero lo suficientemente bajas para permitir que los
sólidos de biomasa y los ácidos nucleicos sedimenten en la fase
opuesta (inferior).
Si el polipéptido se ha de recuperar en la fase
superior, la concentración de sal típica será de aproximadamente
4-7% (p/p) y la concentración del polímero de
aproximadamente 12-18% (p/p), dependiendo, p.ej.,
del tipo de sal, polímero y polipéptido. Si se añade un solvente
orgánico como una especie formadora de fases, como el etanol, es
preferible añadir en una cantidad de aproximadamente el
10-30% (volumen/volumen) de la solución,
dependiendo, p.ej., del tipo de polipéptido y de alcohol y si está
presente alguna de las especies formadoras de fases,
preferentemente a una concentración de aproximadamente el 20%
(v/v).
Las condiciones exactas para poner en contacto el
cultivo de células con los diversos reactivos dependerá de, p.ej.,
el pH del tampón, los tipos de reactivos formadores de fases y del
tipo y concentración del polipéptido y agentes caotrópico y
reductor. Generalmente, La temperatura de reacción es de
aproximadamente 20-40ºC y preferentemente, a
temperatura ambiente. La etapa de contacto se llevará a cabo
generalmente durante al menos 30 minutos, preferentemente de 30
minutos a 12 horas dependiendo de que existan reacciones
secundarias, más preferentemente de unos 30 minutos a 8 horas y más
preferentemente, de 30 minutos a 1,5 horas.
Si el polipéptido se pliega incorrectamente, el
grado de plegado incorrecto se determinará mediante cromatografía
del polipéptido no-nativo, incluyendo la
cromatografía de interacción hidrofóbica o la de intercambio iónico.
Un incremento del área para el material no-nativo
es indicativo de cuánto polipéptido no-nativo está
presente.
Una vez se ha establecido el sistema de fases
múltiples, una fase se enriquecerá en el polipéptido y se
empobrecerá en partículas rotas y células que comprenden los
sólidos de biomasa y ácidos nucleicos. En un sistema de dos fases,
la fase superior se enriquece preferentemente en el polipéptido,
mientras que la fase inferior se enriquece en las partículas rotas
y restos celulares. El polipéptido se puede recuperar fácilmente
mediante separación de las fases. Esta etapa de recuperación puede
completarse decantando la fase superior, drenando la fase superior,
o centrifugando. El polipéptido puede entonces aislarse de la fase
en la que se halla mediante un cambio de pH para precipitar el
polipéptido o mediante adición de un solvente adecuado, después de
lo cual el polipéptido precipitado se recupera adecuadamente
mediante centrifugación o filtración o como un lodo.
Alternativamente, el polipéptido puede recuperarse de la fase que
contiene el polímero mediante re-extracción
añadiendo un polímero adecuado, una sal o un solvente. En el caso
del IGF-I, el polipéptido se recupera de la fase
del polímero aislado disminuyendo el pH para que el
IGF-I precipite, dando como resultado un
rendimiento de IGF-I igual o superior a
aproximadamente el 97%.
Una vez obtenido de la fase líquida del sistema
de fases múltiples, o en un estadio posterior de purificación, el
polipéptido se repliega adecuadamente en una conformación activa
utilizando el procedimiento de la presente invención.
Si el polipéptido ya no está en la forma soluble
antes de que se vuelva a plegar, puede ser solubilizado mediante
incubación en un tampón alcalino que contenga un agente caotrópico
y un agente reductor en las cantidades necesarias para solubilizar
esencialmente el polipéptido. Esta incubación tiene lugar en
condiciones de concentración polipeptídica, tiempo de incubación y
temperatura de incubación que permitirán la solubilización del
polipéptido en un tampón alcalino.
La cuantificación del grado de solubilización del
polipéptido en el tampón se lleva a cabo mediante la determinación
de la turbidez, analizando el fraccionamiento del polipéptido entre
el sobrenadante y el sedimento después de la centrifugación en
geles de SDS reductores, mediante el ensayo de cuantificación
proteica (p.ej., el equipo de ensayo proteico de
Bio-Rad), o mediante HPLC.
El intervalo de pH del tampón alcalino para la
solubilización es generalmente de por lo menos 7,5, siendo un
intervalo preferido de 8-11. Ejemplos de tampones
adecuados que proporcionen un pH dentro de este último intervalo
incluyen la glicina, CAPSO (ácido
3-[ciclohexylamino]-2-hidroxi-1-propansulfónico),
AMP
(2-amino-2-metil-1-propanol),
CAPS (ácido
3-[ciclohexilamino]-1-propansulfónico),
CHES (ácido
2-[N-Ciclohexilamino]-etansulfónico)
y el Tris-HCl
(Tris[hidroximetil]aminometano) hidrocloruro. El
tampón preferido aquí es el de glicina o el CAPSO, preferentemente
a una concentración de aproximadamente 20 mM, a un pH de
aproximadamente 8,5 a 11, preferentemente a
10-11.
La concentración del polipéptido en la solución
tamponada para la solubilización debe ser tal que el polipéptido se
solubilizará o reducirá y desnaturalizará completa o parcialmente.
Alternativamente, el polipéptido puede estar inicialmente
insoluble. La cantidad exacta a utilizar dependerá, p.ej., de las
concentraciones y tipos de otros ingredientes en la solución
tamponada, en particular del tipo de polipéptido utilizado, del
tipo y cantidad de agente reductor, del tipo y cantidad de agente
caotrópico y del pH del tampón. Por ejemplo, la concentración del
IGF-I puede incrementarse por lo menos tres veces si
la concentración del agente reductor, p.ej., DTT se aumenta
simultáneamente, para mantener una proporción de
DTT:IGF-I de aproximadamente 3:1 a 10:1. Es
deseable producir una solución de proteína solubilizada más
concentrada antes de diluir para el replegamiento. En consecuencia,
la concentración preferida del polipéptido es de por lo menos 30
mg/ml, siendo un intervalo más preferido de 30-50
mg/ml. Por ejemplo, el IGF-I se puede solubilizar a
una concentración de aproximadamente 30-50 mg/ml en
urea 2M, DTT 10 mM y diluir a, por ejemplo, 1 mg/ml para el
replegamiento.
Después de solubilizar el polipéptido, éste se
coloca o diluye en un tampón que contiene el solvente, un agente
caotrópico y sales, tal como se describió anteriormente. El tampón
puede ser cualquiera de los enunciados anteriormente para la
primera solución tamponada, preferiblemente CAPSO, glicina y CAPS, a
pH 8,5-11, en particular a una concentración de
aproximadamente 20 mM y más preferentemente CAPSO y glicina. El
polipéptido puede diluirse con el tampón de replegamiento,
preferentemente al menos cinco veces y más preferentemente diez
veces por lo menos. Alternativamente, el polipéptido puede
dializarse contra el tampón de replegamiento. El replegamiento se
lleva a cabo de forma característica a aproximadamente
0-45ºC, preferentemente a unos
20-40ºC, más preferentemente a
23-37ºC, todavía más preferentemente a unos
25-37ºC y todavía más preferentemente a unos 25ºC
durante por lo menos una hora. La temperatura preferida no se ve
afectada en apariencia por los niveles de sal, solvente y agente
caotrópico, pero sí por la presencia de sacarosa y glicerol, en
cuyo caso se debería mantener por encima de aproximadamente 20ºC. La
solución también contiene originalmente un agente reductor y un
osmolito.
El agente reductor se selecciona adecuadamente a
partir de los descritos anteriormente para la etapa de
solubilización en el intervalo dado de concentraciones. Su
concentración dependerá esencialmente de las concentraciones de sal
de metal alcalino, de metal alcalino-térreo, del
polipéptido y del solvente. Preferentemente, la concentración del
agente reductor es de aproximadamente 0,5 a 8 mM, más
preferentemente de aproximadamente 1-5 mM, aún
preferentemente de 0,5-2 mM. Los agentes reductores
preferidos son el DTT y la cisteína.
El osmolito opcional es preferentemente la
sacarosa (a una concentración de aproximadamente
0,25-1 M) o el glicerol (a una concentración de
aproximadamente 1-4 M). Más preferentemente, la
concentración de sacarosa es de 1 M y la de glicerol de 4 M.
La concentración inicial del polipéptido en el
tampón de replegamiento es tal que se maximizará la proporción de
la molécula recuperada con una conformación plegada correctamente
respecto a la plegada incorrectamente, según se determine por HPLC,
RIA o bioensayo. La concentración exacta dependerá, por ejemplo,
del tipo de polipéptido utilizado. La concentración preferida del
polipéptido (que resulta en un máximo rendimiento de la molécula
plegada correctamente) se halla en el intervalo de aproximadamente
0,1 a 15 mg/ml, más preferentemente de aproximadamente 0,1 a 6
mg/ml y más preferentemente a aproximadamente 0,2 a 5 mg/ml.
Además, una fuente de oxígeno como el aire o el
gas oxígeno se introduce en el tampón para ejercer una oxigenación
junto con la sal de cobre o manganeso. El oxígeno puede estar
presente en tampón en cualquier momento, incluso antes de añadir el
polipéptido o cualquier otro reactivo al tampón.
La cantidad de oxígeno introducida dependerá,
p.ej., del tipo de recipiente utilizado, del tipo y concentración
de polipéptido, del tipo de fuente de oxígeno, del tipo y cantidad
de sal de cobre y manganeso y del tipo y cantidad de agente
reductor presente, si lo hubiera, y del tipo y cantidad de agente
caotrópico presente, así como del pH del tampón. En general, la
fuente de oxígeno se introducirá mediante medios pasivos (p.ej.,
aire en el espacio superior en una proporción de espacio aireado
respecto al volumen líquido de 2:1) utilizando un agitador.
Alternativamente, la fuente de oxígeno puede introducirse mediante
burbujeo. La velocidad de introducción del oxígeno debe ser
suficiente para permitir que el replegamiento se complete en
preferentemente 1-12 horas, más preferentemente en
aproximadamente 1-6 horas, y más preferentemente en
aproximadamente 1 a 3 horas. La adición de oxígeno molar es
proporcional a la concentración del agente reductor y a la
concentración del polipéptido, pero inversamente proporcional a la
concentración de sal de cobre o de magnesio. La velocidad de
oxidación está limitada por el nivel del catalizador, no por la
velocidad de adición de oxígeno. Es necesaria una velocidad de
burbujeo superior para el plegamiento de volúmenes mayores.
El grado de replegamiento que tiene lugar tras
esta segunda incubación se determina de forma adecuada mediante
titulación por RIA del polipéptido o mediante análisis de HPLC
utilizando, p.ej., una columna Vydac o Baker C-18.
Un aumento del título RIA o del tamaño del pico del polipéptido
plegado correctamente se correlaciona directamente con cantidades
aumentadas del polipéptido activo biológicamente y plegado
correctamente presente en el tampón. La incubación se lleva a cabo
para maximizar el rendimiento del polipéptido plegado correctamente
y de la proporción de polipéptido plegado correctamente respecto al
plegado incorrectamente que se recupera, según se determine mediante
RIA o HPLC, y para minimizar el rendimiento del polipéptido
asociado y multimérico, tal como se determina mediante equilibrio
de masas.
Después de replegar el polipéptido, se procede a
su purificación. A continuación se muestran ejemplos de
procedimientos de purificación adecuada para obtener una mayor
pureza: fraccionamiento en columnas de intercambio iónico o de
inmunoafinidad; precipitación con etanol; HPLC de fase inversa;
cromatografía de interacción hidrofóbica; cromatografía en sílice o
resina de intercambio iónico como la S-sepharose y
DEA; cromatoenfoque; SDS-PAGE; precipitación con
sulfato amónico; y filtración en gel utilizando, por ejemplo,
Sephadex G-75.
La invención será mejor comprendida mediante los
siguientes ejemplos, que pretenden ilustrar la invención pero sin
limitar su ámbito. Todas las citas literarias y las patentes se han
incorporado aquí expresamente como referencias.
El huésped utilizado para producir el
IGF-I humano recombinante en la fermentación
descrita en este ejemplo fue un derivado de E. coliW3110,
denominado 37D6. El genotipo completo de 37D6 es tonA\Delta ptr3
phoA\DeltaE15 \Deltarbs ilvG\Delta
(argF-lac)169 ompT\Delta degP41Kan^{r}.
La derivación de la cepa 27C, que es una cepa parental para 37D6
tiene el genotipo tonA\Delta ptr3 phoA\DeltaE15
(argF-lac)169 ompT\Delta degP41Kan^{r},
se describe en la patente internacional WO 93/11240, publicada el
10 de junio de 1993, cuya descripción se incorpora aquí mediante
referencias. La capa 27C7 se depositó el 30 de octubre de 1991, en
el American Type Culture Collection como ATCC 55.244.
La cepa 37D6 es la misma que la 27C7 descrita
anteriormente excepto que tiene una deleción rbs7 (no utilización
de ribosa) y con un locus ilvG restaurado. Ambos marcadores
se pueden introducir mediante transducción con
P1.
P1.
En el plásmido de expresión de
IGF-I pBKIGF-2B, las secuencias
transcripcionales y de traducción requeridas para la expresión del
gen IGF-I en E. coli se proporcionan
mediante el promotor de la fosfatasa alcalina y la secuencia de
Shine-Dalgarno. El terminador t_{0}
transcripcional se sitúa adyacente al codón de terminación. La
secreción de la proteína a partir del citoplasma está dirigida por
la secuencia señal lamB o alternativamente por la secuencia señal
STII. La mayoría de rhIGF-I se halla en el espacio
periplásmico celular. El plásmido pBKIGF-2B
confiere resistencia a la tetraciclina en el huésped
transformado.
El plásmido pBKIGF-2B se
construyó en varias etapas utilizando los plásmidos intermedios
pLS32Tsc, PLBIGFTsc, PLS3Tsc y pRanTsc.
\newpage
Etapa
1
El plásmido de secreción pLS32Tsc contiene el gen
IGF-I. Las secuencias de transcripción y traducción
necesarias para la expresión del gen IGF-I en E.
coli se proporcionan por el promotor de la fosfatasa alcalina y
la secuencia Shine-Dalgarno de trp. El terminador
transcripcional t0 de lambda está situado adyacente al codón de
finalización. La secreción de la proteína a partir del citoplasma
está dirigida por la secuencia señal lamB o alternativamente por la
secuencia señal STII. La mayor parte del IGF-I se
halló en el espacio periplásmico. El plásmido pLS32Tsc confiere
resistencia a la tetraciclina al huésped transformado.
El plásmido pLS32Tsc se construyó en diversas
etapas utilizando los plásmidos intermedios pLS32, pAPlamB,
pLS321amB, pLS331amB y pLS33Tsc tal como se describe con mayor
detalle en la patente internacional WO 93/11240, supra.
Etapa
2
Etapa
a
Para la primera parte de la ligación, se aisló el
fragmento del vector EcoRI-PstI a partir de PBR322.
Para la segunda parte de la ligación, se aisló un fragmento
PstI-NcoI de 1244 pb a partir del pAPLamB. Para la
tercera parte de la ligación, el fragmento
HaeII-EcoRI de 196 pb que contiene el gen
IGF-I excepto el extremo 5' terminal se aisló del
plásmido p200. El p200 es un plásmido derivado de pBR322 que tiene,
en el orden 5' a 3', el promotor de quelatina, la secuencia señal
prepro alfa I MF, el DNA que codifica para el IGF-I
maduro y el terminador 2-\mu. Contiene el origen
ColE1 de replicación en bacterias y el origen
2-\mu para levaduras. Un diagrama de restricción
del plásmido p200 proporciona en la figura 1. La secuencia
nucleotídica (SEC ID Nº 1) del fragmento EcoRI (iniciándose en la
posición 1149) al EcoRI (iniciándose en la posición 1628) de p200
que contiene el prepro alfa I MF y el gen IGF-I se
proporciona en la Figura 2. Las dianas de restricción Haeii, PstI,
BamHI y SalI que se hallan también en el diagrama de la Figura 2
están señaladas mediante subrayado. Un fragmento del DNA sintético
que une la secuencia señal con el gen IGF-I (NcoI a
HaeII) se preparó con la siguiente secuencia:
5'-CATG GCC GGT CCG
GAA ACT CTG TGC GGC GC (SEC ID Nº
29).
3'- CGG CCA CTT TGA GAC ACG C (SEC
ID Nº
3).
Los tres fragmentos plasmídicos y el DNA
sintético se ligaron para formar pLamBIGF, tal como se muestra en
la Figura 3.
Etapa
b
El fragmento del vector
XbaI-BamHI se aisló a partir del pLS18 como el
primer fragmento de ligación. La segunda parte de la ligación se
preparó mediante digestión con EcoRI del pLaBIGF, seguido de
tratamiento con el fragmento Klenow de la DNA polimerasa, seguido
por una digestión XbaI. A continuación se aisló el fragmento de 302
pb resultante. Los tres fragmentos se ligaron para producir el
pLBIGFTsc, tal como se muestra en la Figura 4.
Etapa
3
El fragmento XbaI-BamHI de pLS18
se aisló como el primer fragmento de ligación. La segunda parte de
la ligación fue un fragmento de 412 pb StuI-BamHI
del plásmido pdH108-4, descrito anteriormente. La
tercera parte de la ligación se preparó a partir de pRANTES. El
pRANTES es un plásmido derivado de pBR322 que contiene un fragmento
de un adaptador XbaI seguido por la secuencia señal STII, seguido
por el cDNA que codifica RANTES [tal como publicó Schall y col., J.
Immunol., 141:1018 (1988)], seguido por el adaptador BamHI. El
tercer fragmento se preparó mediante digestión de RANTES con BamHI,
seguido por el tratamiento con el fragmento Klenow de la DNA
polimerasa, seguido por una digestión con XbaI. A continuación se
aisló el fragmento resultante de 303 pb. Estos tres fragmentos se
ligaron para generar pRanTsc, tal como se muestra en la Figura
5.
\newpage
Etapa
4
Tal como se muestra en la Figura 6, el fragmento
EcoRI-PstI de 540 pb que contenía el promotor de la
fosfatasa alcalina, la secuencia señál de lamB y el DNA que
codifica los primeros 15 aminoácidos del IGF-I se
extrajeron de pLS32Tsc. El fragmento Pst-Bsp1286I
(\sim70 pb) que contenía el DNA codificante de los aminoácidos
16-38 de IGF-I se obtuvo de
pLBIGFTsc. El fragmento Bsp12861-HindIII (\sim179
pb) conteniendo el DNA que codifica los aminoácidos
39-70 de IGF-I, el terminador lambda
y el promotor Tc se obtuvo de pLS33Tsc. Por último, el fragmento del
vector (derivado de pBR322) de \sim4331 pb
EcoRI-HindIII se obtuvo de pRanTsc. Estos cuatro
fragmentos se ligaron para generar pBKIGF-2, que
contenía el promotor AP, la secuencia señal lamB, el DNA que
codifica para toda la proteína IGF-I, el terminador
transcripcional, el promotor Tc y los marcadores de resistencia a
tetraciclina y ampicilina.
Etapa
5
El pBKIGF-2 se digirió con PstI y
ClaI y a continuación se aisló el fragmento de \sim245 pb. Este
fragmento contiene los aminoácidos 16-70 del
IGF-I y el terminador lambda t_{o}. El pLBIGFTsc
se digirió con NcoI y ClaI y se aisló el fragmento del vector. Este
fragmento contiene el promotor AP, la secuencia señal lamB y el gen
Tet^{r}. Estos dos fragmentos se ligaron en un uno sólo del DNA
sintético que remplaza el extremo 5' del DNA de
IGF-I desde NcoI a PstI con codones derivados
sintéticamente siguientes:
5'-CATGGCC GGT CCC
GAA ACT CTG TGC GGT GCT GAA CTG GTT GAC GCT CTG
CA-3'
3'-CGG CCA GGG CTT
TGA GAC ACG CCA CGA CTT GAC CAA CTG CGA
G-5'
(SEC ID Nº 4 y 5,
respectivamente).
El plásmido resultante se denominó
pBKIGF-2A. La construcción se muestra en la Figura
7.
Etapa
6
Este plásmido se preparó mediante digestión de
pLS33LamB con NcoI y BamHI y se aisló el fragmento del vector. El
pLS33LamB es un plásmido derivado de pBR322 en el que se ha
insertado el promotor AP, la secuencia señal lamB y el gen
IGF-I. BamHI corta en la porción Tc del plásmido y
NcoI corta en el extremo 5' del gen IGF-I. El
segundo fragmento se generó mediante digestión de pRANTES con BsaJI
y BamHI y se aisló el fragmento resultante \sim 200 pb. El tercer
fragmento fue una porción de DNA sintético para unir el gen RANTES
con la secuencia señal de NcoI a BsaJI. Este DNA sintético tiene la
secuencia siguiente:
NcoI
\hskip3,9cmBsaJI
5'-CATGGCCTCCCCATATTC-3'
\hskip0,1cm3'-CGGAGGGGTATAAGGAGC-5'
(SEC ID Nº 6 y 7,
respectivamente).
El vector resultante se denominó pLamBRan y su
construcción se muestra en la Figura 8.
Etapa
7
La construcción de este plásmido se muestra en la
Figura 9. El pLamBRan se digirió con NcoI y SphI y se aisló el
fragmento del vector que contenía el promotor y la secuencia señal.
El pBKIGF-2 se digirió con DdeI y SphiI y se aisló
el fragmento de \sim 600 pb que contenía el terminador de
transcripción y el extremo 5' del gen Tet^{R}. El
pBKIGF-2A se digirió con NcoI y Bsp12861 y se aisló
el fragmento que contenía el DNA que codifica los aminoácidos
1-38 de IGF-I. Estos tres
fragmentos se ligaron junto con el DNA sintético que codifica los
aminoácidos 39-70 de IGF-I para
producir pBKIGF-2B. Este adaptador sintético tiene
la secuencia siguiente:
5'-TTCGTCGTGCTCCC
CAG ACT ATT GTT GAC GAA TGC TGC TTT CGT TCT NTGC GAC CTG CGT GGT
CTG-3'
(SEC ID Nº
8)
3'-AGA ACG CTG GAC
GCA GCA GAC CTT TAC ATA ACG GGA GGG GAC TTT GGG
CGATTTAGACGAATCTTCGAGG-5'
Las células competentes de E. coli 27C7 se
transformaron con pBKIGF-2B mediante técnicas de
transformación estándares. Los transformantes se seleccionaron y
purificaron en placas de LB que contenían 20 mg/l de tetraciclina.
La composición del medio fue la siguiente: 10g/l de
Bacto-triptona, 5 g/l de extracto de levadura, 10g/l
de cloruro sódico y 20 mg/l de
tetraciclina-HCl.
Se preparó un inóculo para el fermentador de 10
l, en primer lugar se inoculó un frasco de agitación de 2 litros
con aproximadamente 500 ml de medio LB estéril con tetraciclina con
el vial de cultivo de 1-2 ml recién descongelado.
Este frasco se incubó a 35-39ºC durante 8 horas y se
transfirió a un fermentador de 10 l que contenía el medio de
producción en el intervalo descrito en la Sección C de este
Ejemplo. El inóculo del fermentador de 10-litros se
incubó a 35-39ºC a pH 7,1-7,5
durante 6-12 horas. La velocidad de agitación fue
de 650-1000 rpm y la velocidad de aireación de
0,7-1,5 volúmenes de aire por volumen de cultivo
por minuto. El inóculo se transfirió asépticamente a un recipiente
de fermentación de 1000-l en donde se introdujo
glucosa desde la base.
El inóculo de 10-l se creció de
igual forma que el de 500 ml en un recipiente de cultivo en
agitación hasta una fase de crecimiento exponencial (cultivo del
lote). Toda la glucosa se añadió al fermentador de 10 l al inicio de
la fermentación. Únicamente la fermentación de
1000-l utilizó alimentación de glucosa.
El recipiente de 1000-l contenía
inicialmente 600-800 litros de medio de fermentación
compuesto de la manera siguiente:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(Tabla pasa a página
siguiente)
El proceso de fermentación se realizó a
35-39ºC a pH 7,1-7,5 durante
24-48 horas. La velocidad de agitación se ajustó a
200 rpm y la velocidad de aireación a 0,7-1,5
volúmenes de aire por volumen de aire del cultivo por minuto. La
producción de IGF-I tuvo lugar después de disminuir
el fosfato ene l medio. Este procedimiento dio como resultado el
caldo de fermentación que contenía aproximadamente el 18% de
volumen celular empaquetado y unos 3 g/l de IGF-I,
que se halló principalmente en el espacio periplásmico con niveles
inferiores en el medio extracelular.
Al término de la fermentación, se desconectaron
todos los alimentadores y controladores, con excepción del de
temperatura. La temperatura se mantuvo a 37ºC. Las líneas de
aspersión y el espacio superior del fermentador ce donde brota el
gas nitrógeno, primero a una velocidad de 150 lpm durante 1 min,
luego a 50 lpm durante el resto del proceso. A continuación se
bombeó rápidamente unos 220 l del barro que contenía 174 Kg de urea
en el fermentador, y seguidamente unos 8 l de hidróxido sódico al
50% (p/p), lo suficiente para ajustar el pH a 10,0. A continuación
se añadieron unos 20 l de solución que contenía 2,9 Kg de
ditiotreitol y el pH se reajustó a 10,0 con aproximadamente 3 litros
adicionales de hidróxido sódico al 50%. El lote se mantuvo en
agitación a 37ºC durante 60 minutos, después de lo cual se enfrió a
22ºC y se transfirió a un tanque de retención para extracción de
fases acuosas. Los ensayos mediante HPLC de fase inversa mostraron
que el título inicial de IGF-I fue de 3,8 g/l y que
después de la solubilización se liberaba una cantidad significativa
de IGF-I de las células.
La temperatura del lote se mantuvo a 22ºC y la
parte superior del tanque se inyectó con nitrógeno. Al caldo
tratado, con un volumen de 1450 l, se añadieron 250 Kg de
PEG-8000 y 90 Kg de sulfato sódico. El lote se
mezcló durante aproximadamente 40 minutos. La centrifugación y el
análisis de las muestras mostraron que la proporción
fase-volumen (Kv) se estabilizó a 2,6 y que el
coeficiente de distribución del IGF-I (Kc) fue de
8,5. El lote se separó utilizando un separador SB-7
de Westfalia, produciendo aproximadamente 1300 l de fase ligera y
550 l de fase pesada. Los ensayos de HPLC de fase inversa mostraron
que la fase ligera aislada contenía aproximadamente el 88% del
IGF-I en los 1450 l iniciales de caldo tratado. La
fase ligera se mantuvo en nitrógeno y se descartó la fase
pesada.
Se añadieron aproximadamente 36 l de ácido
fosfórico 2 M a la fase ligera para ajustar el pH a 7,0 a 22ºC. El
lote se mantuvo aproximadamente 8 horas con ligera agitación. Al
cabo de dicho tiempo, el ensayo de HPLC de fase inversa mostró que
aproximadamente el 96% del IGF-I había precipitado.
El sedimento se recogió a continuación utilizando un clarificador
Westfalia SB-7. La masa del barro sedimentado fue
de aproximadamente 88 Kg.
Una alícuota del barro sedimentado, con una masa
de 17,6 Kg, se disolvió añadiendo urea sólida suficiente para llevar
la concentración final a 2 M, añadiendo ditiotreitol suficiente
para llevar la concentración a 10 mM y ajustando el pH a 10,0 con
hidróxido sódico al 50% (p/p). A continuación se añadieron 700 l de
tampón de plegamiento con una composición de urea 2M, cloruro
sódico 1 M, etanol al 19% (v/v), glicina 20 mM, cobre 0,5 \muM, pH
10,5. La concentración final de ditiotreitol se ajustó a
continuación a 1 mM. El plegamiento se llevó a cabo a 22ºC con
ligera agitación inyectando gas oxígeno a 280 ml/minuto. El
progreso de plegamiento se controló mediante HPLC de fase inversa.
Los cromatogramas de HPLC tomados al inicio, en la mitad y después
de terminar el plegamiento se muestran en la Figura 10. Al cabo de
aproximadamente 3 horas, el plegamiento se finalizó al cesar la
inyección de oxígeno y añadir aproximadamente 1,6 ml de ácido
fosfórico para titular el lote a pH 3,5. El ensayo de HPLC por fase
inversa mostró que el rendimiento de plegamiento fue del 50%.
La construcción huésped, la construcción del
plásmido y la fermentación se llevaron a cabo tal como se describió
en el Ejemplo 1, apartados A-C. La solubilización
in situ se llevó a cabo tal como se describió en el Ejemplo
I, apartado D, excepto en la que se utilizó DTT, el caldo de cultivo
se redujo mediante adición de L-cisteína suficiente
para llevar la concentración final a 50 mM (aproximadamente 8,8
Kg). Al término de la solubilización, el ensayo de HPLC de fase
inversa mostró que el 93% del IGF-I se liberó de las
células.
El aislamiento siguiente se llevó a cabo en
versiones reducidas de las operaciones descritas en el Ejemplo I,
apartados E-G.
El IGF-I nativo se preparó
utilizando el huésped, el plásmido, el procedimiento de
fermentación y de solubilización in situ descritos en el
Ejemplo I, apartados A-D.
Los sistemas de dos fases se produjeron
utilizando el procedimiento siguiente: (1) se colocaron las
especies formadoras de fases en un tubo de cultivo de poliestireno
de 15 ml graduado; (2) se añadieron 7 ml del extracto completo de
la solubilización in situ, se mezclaron los contenidos y la
parte superior se inyectó con nitrógeno; (3) la composición se
incubó durante dos horas a temperatura ambiente o 37ºC con un
mezclado vertical. Se añadieron los polímeros de las soluciones
madre (PEG al 50% p/p con un PM de 3350, PEG al 50% p/p con un PM
de 8000 y DOW Poliglicol (15-200TM de marca del
polímero) al 100% p/p, mientras que las sales se añadieron como
reactivos químicos secos. Los componentes se añadieron para lograr
una composición predeterminada según el peso, asumiendo que el
extracto completo tiene una densidad de 1 g/ml.
Las fases se separaron mediante centrifugación a
25ºC o 37ºC aproximadamente 1300 g durante 20 minutos. La
concentración de IGF-I en la fase superior se
determinó mediante análisis de HPLC de fase inversa. La
concentración del IGF-I en la fase inferior se
calculó asumiendo un equilibrio de masas.
Se llevaron a cabo tres experimentos en los que
se varió la concentración y el tipo de polímero formador de fases,
concentración y tipo de sal formadora de fases, concentración y
tipo de sal no formadora de fases y la temperatura. Los sistemas
resultantes pudieron caracterizarse visualmente en una de las cinco
categorías enunciadas: (1) sistemas de una fase, (2) sistemas de dos
fases en los que los sólidos sedimentan en la fase inferior, (3)
sistemas de dos fases en los que algunos sólidos flotan en el fase
inferior, (4) sistemas de dos fases en los que los sólidos se
distribuyen a través de las fases superior e inferior y (5) sistemas
de dos fases en los que los sólidos se distribuyen en la fase
superior.
El trazado que se muestra en la Fig. 11 ilustra
esta relación entre la composición de los sistemas y la disposición
para los sistemas compuestos únicamente de extracto completo,
PEG-8000 y Na_{2}SO_{4}. En este trazado,
"sistemas bifásicos con sólidos flotando" representan todos los
sistemas bifásicos en donde los sólidos no sedimentan en la fase
inferior. El trazado también indica que el límite que describe los
sistemas en los que los sólidos sedimentan en una fase inferior que
es suficientemente amplio para acomodar su volumen. Los sistemas más
preferidos son aquellos en donde los sólidos sedimentan en la parte
inferior, estando contenidos en la región sombreada el volumen de
fase inferior suficiente para acomodar los sólidos y el cociente de
fase-volumen superior a aproximadamente.
Estos tres experimentos también proporcionan
resultados que permiten que los sistemas bifásicos distintos se
comparen cuantitativamente tal como se muestra en la Tabla I. Para
reducir el error y permitir que el efecto de un cambio dado sea más
evidente, se obtuvo el promedio de los resultados de la proporción
volumétrica y del coeficiente de partición para sistemas distintos,
tal como se indicó. Los resultados de este análisis indican algunas
tendencias. Los polímeros PEG-8K y
PEG-4K (con valores de PM de 8000 y 3350,
respectivamente) de sistemas que tienen proporciones volumétricas
similares y en similares particiones de IGF-I no
nativo. Incluso el NaCl en los sistemas de fases examinados no
afecta la proporción volumétrica, pero sí disminuye el coeficiente
de partición de IGF-I. Añadiendo aleatoriamente el
polietilén glicol, copolímero de glicol polipropileno DOW
Poliglicol de marca comercial 15-200TM
(PM-2500) no se altera la proporción volumétrica o
el coeficiente de partición. Incluyendo la sal de citrato formadora
de fases en PEG-8000 y Na_{2}SO_{4} se desplaza
la posición de la curva binodal pero no se afecta la partición de
IGF-I. Realizando la extracción bifásica acuosa a
37ºC se disminuye la proporción volumétrica y el coeficiente de
partición relativo a los 25ºC.
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(Tabla pasa a página
siguiente)
Se preparó el IGF-I no nativo
utilizando el huésped, el plásmido, la fermentación y el
procedimiento de solubilización in situ descritos en el
Ejemplo I, apartados A-D.
Los sistemas bifásicos acuosos se produjeron tal
como se describe en el Ejemplo III con la excepción de que el
PEG-8000 se añadió en seco en lugar de una solución
madre. Las concentraciones de IGF-I en la fase
líquida superior y la inferior se determinaron mediante análisis
por HPLC de fase inversa. La fase líquida inferior se sometió a
filtración con 0,2 \mum antes de analizarse para eliminar los
sólidos resuspendidos residuales.
Los resultados de la determinación directa del
coeficiente de partición del IGF-I no nativo en los
sistemas bifásicos acuosos se muestran en la Tabla I. Con
concentraciones condicionantes de Na_{2}SO_{4} (p/p) al 50%,
PEG-8000 al 14% (p/p), el coeficiente de
distribución tiene una magnitud de 9 a 10. Un incremento del 1%
(p/p) en la concentración de sal o un incremento del 2% (p/p) en la
concentración del polímero doblan su magnitud. Aumentos combinados
en las concentraciones de sal y polímero conducen a un incremento
de cuatro veces, dando como resultado un valor cercano a 40. Esta
última combinación da como resultado la formación de un sistema
bifásico con sólidos flotando.
El IGF-I no nativo se preparó
utilizando los procedimientos de fermentación, solubilización in
situ y de extracción bifásica acuosa descritos en el Ejemplo I,
apartados A-E. Para la precipitación del
IGF-I, una porción de la fase ligera se dividió en
varias alícuotas que se titularon a aproximadamente pH 6 utilizando
uno de los ácidos siguientes: fosfórico 2N, acético 2N, sulfúrico
2N, clorhídrico 2N, cítrico 2N, nítrico 2N. A continuación, las
alícuotas se centrifugaron rápidamente a aproximadamente 5000 xg
durante 15 minutos y se decantaron los sobrenadantes. Los ensayos
de HPLC en fase inversa mostraron que, en todos los casos, al menos
el 93% del IGF-I inicial se recuperó en el
sedimento. El plegamiento consiguiente de la proteína de los
sedimentos se llevó a cabo mediante una versión reducida del
procedimiento descrito en el Ejemplo I, apartado G.
El IGF-I no nativo se preparó
utilizando los procedimientos de fermentación, in situ
solubilización y extracción bifásica acuosa descritos en el Ejemplo
I, apartados A-E.
Una muestra de fase ligera del apartado E del
Ejemplo I se dividió en varias alícuotas pequeñas y se inició la
precipitación ácida titulando estas alícuotas a pH 10, 4,5, 4,0
3,5, o 3,0 con ácido sulfúrico 2M. Cada uno de estas cinco
soluciones madre se dividieron posteriormente en cinco alícuotas,
las cuales recibieron suficiente sulfato sódico sólido para
proporcionar una concentración final de 3, 4, 5, 6, o 7% en peso.
Las muestras se incubaron durante dos horas a 25ºC con ligera
agitación. Las fases se separaron después de centrifugarlas
aproximadamente 5000 xg durante 20 minutos. Se analizó la
concentración de IGF-I en ambas fases mediante HPLC
de fase inversa.
Para todos los niveles de sulfato sódico a pH 10,
más del 95% de IGF-I permaneció en la fase
superior. Para el resto de pHs (4,5 a 3,0), más del 98% del
IGF-I se recuperó en la fase inferior.
El IGF-I no nativo se preparó
utilizando los procedimientos de fermentación, solubilización in
situ, extracción bifásica acuosa y precipitación por
neutralización descritos en el Ejemplo I, apartados
A-G.
Una suspensión que contenía IGF-I
reducido se preparó a partir del sedimento de IGF-I
obtenido mediante precipitación por neutralización. Para producir
esta suspensión, 30 g del sedimento húmedo que contenía el
IGF-I se resuspendió en una solución que contenía
glicina 20 mM (pH 10,5), urea 2 M y DTT 10 mM a un volumen final de
100 ml. El pH de la suspensión resultante se ajustó a pH 10,5
mediante adición suficiente de NaOH y HCl. Los análisis de HPLC de
fase inversa de la suspensión indicaron que contenían 35 mg/ml del
IGF-I.
Los tampones de replegamiento se prepararon en
tubos de cultivo de 15 ml de poliestireno mediante adición de las
cantidades adecuadas de las siguientes soluciones madre: glicina 1M
(pH 10,5) y CuCl_{2} 25 \muM, urea 9M, etanol al 100%,
Na_{2}SO_{4} 1,8 M, PEG-3350 al 20% (p/p) y
PEG-8000 al 20% (p/p). Cada tubo recibió 0,1 ml de
la solución tampón madre 50X que contenía glicina y CuCl_{2}.
Otras soluciones madre se añadieron para alcanzar la concentración
indicada a un volumen final de 5 ml. Cada tubo que contenía los
componentes tampón de replegamiento se llevó a un volumen final de
4 ml.
El replegamiento del IGF-I se
inició mediante dilución de 1 ml de la suspensión de
IGF-I reducido en los tampones de replegamiento
preparados anteriormente, proporcionando una concentración inicial
de IGF-I de 7 mg/ml. Los tubos se taparon y se
agitaron horizontalmente en un agitador orbital. Cada tubo contenía
5 ml de líquido y 10 ml de aire. El replegamiento se dejó que
tuviera lugar durante tres horas, después de lo cual se
recolectaron las muestras, se diluyeron por un factor de 10 en un
tampón acídico con glicina 20 mM (pH 3), urea 2 M se analizaron
mediante HPLC de fase inversa para determinar el contenido de
IGF-I plegado correctamente.
El objetivo de este ejemplo es mostrar el efecto
de los componentes formadores de fases acuosas sobre el rendimiento
del IGF-I plegado correctamente obtenido durante el
replegamiento. Los componentes de fases específicas investigados
fueron el Na_{2}SO_{4}, PEG-3350,
PEG-8000 y el etanol. Las concentraciones
examinadas fueron consistentes con aquellas que podían producirse
mediante dilución de una fase acuosa aislada mediante un factor de
10 a 15.
Los resultados que se muestran en la Tabla III,
indican que el rendimiento del IGF-I plegado
correctamente aumenta mediante replegamiento del
IGF-I en presencia de componentes formadores de
fases, etanol y Na_{2}SO_{4}.El rendimiento del
IGF-I no se vio afectado por la presencia de los
componentes formadores de fases PEG-3350 o
PEG-8000.
Se preparó el IGF-I no nativo
utilizando los procedimientos de fermentación, solubilización in
situ, extracción bifásica acuosa y precipitación por
neutralización descritos en el Ejemplo I, apartados
A-G.
Una suspensión que contenga el
IGF-I reducido se preparó a partir del
IGF-I sedimentado obtenido mediante precipitación
por neutralización. Para producir esta suspensión, se
resuspendieron 10 g de sedimento húmedo que contenía
IGF-I en 45 ml de una solución que contenía glicina
20 mM (pH 10,5), urea 2M y DTT 10 mM. El pH de la suspensión
resultante se ajustó a pH 10,5 mediante adición de NaOH. El
análisis de HPLC de fase inversa de la suspensión de pH ajustado
indicó que contenía 15 mg/ml de IGF-I. La
suspensión de pH ajustado se salpicó con una solución de DTT
concentrada para obtener una concentración de DTT final de 15 mM.
La suspensión de IGF-I reducida resultante contenía
15 mg/ml de IGF-I, glicina 20 mM (pH 10,5), urea 2M
y DTT 15 mM.
Los tampones de replegamiento se prepararon en
tubos de cultivo de poliestireno de 15 ml mediante adición de
cantidades adecuadas de varias soluciones madre y reactivos
químicos secos. Cada tubo recibió 0,1 ml de una solución madre de
tampón 50X que contenía glicina 1 M (pH 10,5) y CuCl_{2} 25
\muM. Se añadieron cantidades adecuadas de otros reactivos
químicos hasta alcanzar la concentración indicada a un volumen
final de 5 ml. El etanol y el glicerol se añadieron como líquidos.
La urea, el NaCl y el Na_{2}SO_{4} se añadieron en forma seca.
Cada tubo que contenía los componentes del tampón de replegamiento
se llevaron a un volumen final de 4,7 ó 3,7 ml, dependiendo de si
el replegamiento se debía llevar a cabo a 1 ó 4 mg/ml de
IGF-I, respectivamente.
El replegamiento del IGF-I se
inició diluyendo 0,3 a 1,3 ml de la suspensión de
IGF-I reducida, para el replegamiento a 1 ó 4 mg/ml
de IGF-I, respectivamente, en tampones de
replegamiento preparados con anterioridad. Los tubos se cerraron y
se agitaron horizontalmente en un agitador orbital. Cada tubo
contenía 5 ml de líquido y 10 ml de aire. El replegamiento se dejó
que sucediera durante 8 horas, después de lo cual se recolectaron
las muestras, se acidificaron y se analizaron mediante HPLC de fase
inversa para determinar el contenido del IGF-I
plegado correctamente.
Se investigaron los aspectos siguientes de la
composición del tampón de replegamiento: tipo y concentración de sal
(NaCl 0,05M, 1,0 M; o Na_{2}SO_{4} 0,6 M); la concentración del
solvente (0, 10, 20% de etanol v/v), la concentración del osmolito
(0, 20, 30% de glicerol v/v) y la concentración inicial de
IGF-I (1,4 mg/ml). Los rendimientos obtenidos con
las combinaciones seleccionadas de estos componentes se muestran en
la Tabla IV. La inspección muestra que el mayor rendimiento del
IGF-I plegado correctamente se obtuvo mediante
replegamiento en las condiciones siguientes: 1 mg/ml de
IGF-I, glicina 20 mM (pH 10,5), urea 2 M, NaCl 1 M,
etanol al 20% (v/v) y CuCl_{2} 0,5 \muM
(muestra #0).
(muestra #0).
El experimento descrito en este ejemplo se diseñó
para permitir el análisis estadístico multifactorial del
IGF-I plegado correctamente produjera resultados 5
con el fin de valorar la importancia de todos los factores
independientemente y de todas las interacciones de dos factores.
Los resultados de este análisis estadístico se muestran en las
Tablas V y VI. La inspección de estos resultados muestra que, en
las condiciones experimentales utilizadas, las siguientes
tendencias fueron evidentes: (1) se obtuvieron los mejores
rendimientos mediante replegamiento a una concentración baja de
IGF-I; (2) la inclusión de sal a una concentración
de aproximadamente 1 M mejora el replegamiento y especialmente en
presencia de etanol; (3) el NaCl es una sal más preferida que el
Na_{2}SO_{4}; (4) se obtuvo un rendimiento mejor con el
replegamiento con urea 2-3 M en relación con una
concentración menor de urea, aunque la diferencia fue menor en
presencia de etanol; (5) se obtuvo un mejor rendimiento en
presencia de etanol al 20% (v/v) en relación con la ausencia de
solvente; y (6) la inclusión de glicerol mejora el rendimiento pero
su ventaja se redujo en presencia de etanol.
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(Tabla pasa a página
siguiente)
Se preparó una solución madre de
IGF-I reducido a partir del IGF-I
plegado correctamente y altamente purificado. Se colocó una solución
de IGF-I 1 mg/ml, glicina 20 mM (pH 10,5), citrato
2 mM, NaCl 0,1 M y urea 2M en un vial tapado y se inyectó gas argón
en la parte superior durante aproximadamente una hora con
turbulencia ocasional. Después de oxigenar la solución, se añadió
DTT mediante una jeringa a partir de una solución madre a 117 mM a
una concentración final de 1,17 mM. Después de la adición de DTT,
la solución se incubó durante dos horas con inyección continua de
argón en la parte superior.
Las soluciones de replegamiento se prepararon a
partir de una solución tampón común que contenía glicina 20 mM (pH
10,5), NaCl 0,1 M y urea 2 M. Esta solución madre tampón se
dispensó en viales y se añadió separadamente CuCl_{2},
NiCl_{2}, ZnCl_{2}, CoCl_{2}, MnCl_{2} y FeCl_{3} a partir
de soluciones madre a 1,3 mM. Los viales que contenían las
soluciones resultantes se cerraron con tapones, inyectándose
continuamente argón u oxígeno humidificados.
Para iniciar una reacción de replegamiento, se
diluyó rápidamente una alícuota de una solución madre de
IGF-I por un factor de 10 en una solución de
replegamiento. La solución madre de IGF-I reducida
se transfirió mediante una jeringa para iniciar el replegamiento.
Las reacciones de control del replegamiento (carentes de sales de
metal de transición) y de análisis del replegamiento se llevaron a
cabo simultáneamente y compartieron una fuente común de gas.
Al cabo de 18 minutos de oxidación, se recogieron
muestras con jeringa y se añadieron rápidamente a microviales con un
septo de separación en donde se hallaba una pequeña cantidad de HCl
6 N. La magnitud del replegamiento del IGF-I se
determinó mediante el análisis de las muestras por HPLC de fase
inversa.
Tal como se muestra en la Tabla VII, la
exposición de IGF-I reducido a oxígeno en presencia
de CuCl_{2} o MnCl_{2} condujo tanto a la oxidación del
IGF-I reducido como a la formación de
IGF-I plegado correctamente. La presencia de
CoCl_{2} condujo a la oxidación del IGF-I
reducido, pero a la formación de menos IGF-I
plegado correctamente. Tanto el NiCl_{2} como el FeCl_{3} dieron
como resultado una menor oxidación de IGF-I
reducido y a la formación de IGF-I plegado
correctamente. La respuesta a ZnCl2 no fue distinta a la de los
oligoelementos.
Se preparó una solución madre de
IGF-I a partir de IGF-I plegado
correctamente y altamente purificado tal como se describe en el
Ejemplo IX.
Las soluciones de replegamiento se prepararon a
partir de una solución madre de tampón corriente que contenía
glicina 20 mM (pH 10,5), NaCl 0,1 M y urea 2 M. Este tampón madre
se dispensó en viales y se añadió CuCl_{2} separadamente para
obtener soluciones madres a 1,3, 0,13, 0,013 y 0,0013 mM obtenidas
previamente mediante dilución seriada. Después de añadir el
CuCl_{2}, los viales se cerraron con tapones y se inyectó de
forma continuada argón u oxígeno humidificados.
Para iniciar la reacción de replegamiento, se
diluyó rápidamente una alícuota de una solución madre de
IGF-I reducido por un factor de diez en una solución
de replegamiento. La solución madre de IGF-I
reducido se transfirió mediante una jeringa para iniciar el proceso
de replegamiento. Se llevaron a cabo reacciones control del
replegamiento (sin CuCl_{2}) y de análisis del replegamiento
simultáneamente, compartiendo una fuente de gas común.
La muestras de las reacciones de replegamiento se
obtuvieron con una jeringa a intervalos predeterminados y se añadió
rápidamente a los viales divididos con un septo en donde se hallaba
una pequeña cantidad de HCl 6 N. Este tratamiento disminuye el pH
de la muestra a pH 3 y para de forma eficaz la reacción de
replegamiento. Se paró la reacción de las muestras y se recogieron
éstas a los siguientes intervalos de tiempo después del inicio del
replegamiento: 0, 2, 4, 6, 10, 20, 40, 0, 100 y 200 minutos. La
magnitud del replegamiento del IGF-I se determinó
con el tiempo analizando las muestras a diversos tiempos mediante
HPLC de fase inversa.
Se investigaron las siguientes concentraciones de
CuCl_{2}: trazas, 0,013 \muM, 0,052 \muM, 0,13 \muM, 0,52
\muM, 1,3 \muM y 13 \muM de CuCl_{2}. En la Figura 12, se
muestra un trazado de la evolución del IGF-I
plegado correctamente durante la catálisis de oxidación aeróbica a
dichas concentraciones de CuCl_{2}.
Los resultados muestran que durante la catálisis
de oxidación aeróbica, una concentración baja de CuCl_{2} (entre
0,05 \muM y 15 \muM, preferentemente entre 0,05 y 0,5 \muM)
proporciona un mayor rendimiento del polipéptido plegado
correctamente que concentraciones superiores (mayores de 15 \muM)
y proporciona cinéticas de oxidación más rápidas y reproducibles
que la catálisis de oligoelementos.
Los resultados mostrados en la Figura 12 se
obtuvieron mediante replegamiento de IGF-I en
soluciones carentes de un solvente alcohólico o aprótico polar. Los
experimentos adicionales mostraron que la inclusión de alcohol en el
tampón de replegamiento no influencia la dependencia de las
cinéticas de replegamiento del IGF-I ni del
rendimiento con una concentración CuCl_{2}, y por lo tanto no se
espera que alteren la dependencia de la concentración de otros
metales de transición. Los experimentos también demostraron que la
inclusión de EDTA (proporción molar 1:1 respecto al CuCl_{2}), o
la fenantrolina (proporción molar 3:1 respecto al CuCl_{2}) en
soluciones de replegamiento con CuCl_{2} 1,3 \muM no afecta las
cinéticas de oxidación aeróbica del IGF-I
catalizada con CuCl_{2}.
La construcción del plásmido de expresión phGH4R
utilizado para la expresión y secreción de hGH se detalla en Chang y
col., Gene, 55:189-196 (1987).
La cepa 40G3 de E. coli es un derivado de
E. coli W3110. El genotipo completo de 40G3 es tonA\Delta
phoA\DeltaE15 \Delta(argF-lac) 169 deoC
\DeltaompT degP41 (\DeltaPstI-Kan^{r})
ilvG2096^{R} phn(EcoB). La cepa 40G3 puede derivarse de la
cepa E. coliW3110 16C9, que tiene el genotipo tonA\Delta
phoA\DeltaE15 \Delta(argF-lac)169
deoC. La deleción ompT se introdujo mediante cotransducción con P1
con una inserción Tn10 unida en el gen purE. Esta cepa se transdujo
a prototrofía de purina al eliminar el transposón. La mutación
degP41(\DeltaPst-Kanr) se introdujo
mediante selección para resistencia a kanamicina. El gen ilvG2096R
se introdujo reparando un auxótrofo de isoleucina/valina a
prototrofía utilizando la transducción con P1. Por último, el
operón phn(EcoB) se introdujo en el huésped mediante
transducción con P1 de los genes phn de E. coli.
Las células competentes de E. coli 40G3 se
transformaron con phGH4R mediante técnicas de transformación
estándares. Los transformantes se seleccionaron y purificaron en
placas de LB que contenían tetraciclina a 20 mg/ml. Este medio
tenía la composición siguiente: 10 g/l de
Bacto-triptona, 5 g/l de extracto de levadura, 10
g/l de cloruro sódico y 20 mg/l de
tetraciclina-HCl.
Se preparó un inóculo en un fermentador de 10 L
inoculando en primer lugar un frasco de dos litros que contenía
aproximadamente 500 ml de medio LB estéril que contenía 5 mg/l de
tetraciclina con 0,5 ml de cultivo madre recién descongelado. Este
frasco se cultivó a 35-39ºC durante 8 horas y se
transfirió a un fermentador de 10 litros que contenía el medio de
producción en las cantidades que se describen a continuación.
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(Tabla pasa a página
siguiente)
El cultivo de 10 litros se incubó a
35-39ºC a pH 7,2-7,4 durante
42-48 horas. La velocidad de agitación se ajustó a
650-1000 rpm y la velocidad de aireación a
0,7-1,5 volúmenes de aire por volumen de cultivo por
minuto.
El cultivo de 10 l se creció con adición continua
de glucosa durante la fermentación. La producción de hGH tuvo lugar
después de que disminuir el fosfato del medio.
La hGH del caldo de fermentación anterior se
solubilizó añadiendo 240 g de urea, 20 ml de glicina 1 M (pH 10) y
10 ml de ditiotreitol 1 M (DTT) a 1 l del caldo de fermentación
contenido en una botella de 2l. El pH de la mezcla resultante se
ajustó a pH 10 añadiendo NaOH 1 N. Durante la incubación, la mezcla
se agitó continuamente con un motor sumergido conducido por un
impulsor y la parte superior se inyectó con nitrógeno. Al cabo de 2
horas de incubación, se recogió una alícuota, se centrifugó para
sedimentar los sólidos y se analizó el sobrenadante para conocer su
contenido en hGH. El análisis de HPLC inversa mostró que el 31% de
la hGH total se hallaba en el sobrenadante de la centrifugación.
La hGH se extrajo a continuación añadiendo 308 g
de PEG-8000 y 103 g de Na_{2}SO_{4} para
solubilizar la mezcla. El sistema de fases resultante se incubó con
mezclado continuo y adición de nitrógeno durante una hora adicional.
La inspección de una alícuota centrifugada de 14,5 ml del sistema
de fases mostró que contenía 11,2 ml de fase ligera clara y 3,3 ml
de fase pesada conteniendo los sólidos. Después de la incubación,
el sistema de fases se dividió entre dos botellas de 1 l y se
centrifugó para separar las fases. La decantación de las fases
separadas produjo como resultado 1,2 l de fase ligera clara. El
análisis de HPLC de fase inversa mostró que la fase ligera contenía
el 82% de la hGH del sobrenadante de la solubilización.
La hGH se precipitó a partir de la fase ligera
aislada ajustando el pH a 4. Se colocó una alícuota de la
suspensión precipitada en un tubo con tapón de 15 ml y se
centrifugó para clarificar la alícuota. Después de la
centrifugación, el sobrenadante claro se decantó en un nuevo tubo y
el sedimento se resuspendió con 2,5 ml de
guanidina-HCl 6 M, Tris-HCl 50 mM
(pH 9), DTT 0,1 M. El análisis de HPLC de fase inversa mostró que
el sedimento resuspendido contenía el 92% de la hGH contenida
originalmente en la fase ligera, mientras que el sobrenadante
contenía menos de un 1%.
La fase ligera que contiene la hGH nativa se
preparó utilizando los procedimientos de solubilización y
extracción acuosa descritos anteriormente. Los tampones de
replegamiento se prepararon en tubos de cultivo de poliestireno de
15 ml mediante adición de cantidades adecuadas de los siguientes
reactivos químicos secos: urea, guanidina-HCl,
NaCl, Na_{2}SO_{4} y etanol de grado reactivo. Cada tubo
recibió 0,1 ml de una solución madre de tampón 50X que contenía
Tris-HCl 1 M (pH 8,0), CuCl_{2} 25 \muM o
glicina 1 M (pH 10), CuCl_{2} 25 \muM. Se añadieron otros
reactivos químicos para obtener la concentración indicada a un
volumen final de 5 ml. Cada tubo que contenía los componentes del
tampón de replegamiento se llevó a un volumen final de 4,5 ml con
agua purificada.
El replegamiento de la hGH se inició diluyendo
0,5 ml de la fase ligera que contenía la hGH reducida en los
tampones de replegamiento preparados con antelación lo que
proporcionó una concentración inicial de hGH de aproximadamente
0,05 mg/ml. Los tubos se cerraron con tapones y se agitaron
horizontalmente en un orbital. Cada tubo contenía 5 ml de líquido y
10 ml de aire. Se dejó que el replegamiento tuviera lugar durante
12 horas, después de lo cual se recogieron las muestras, se
diluyeron por un factor de 2 en un tampón acidificado que contenía
ácido acético 50 mM (pH 3), NaCl 50 mM y se analizaron por HPLC de
fase inversa para determinar el contenido de la hGH plegada
correctamente.
El objetivo de este experimento es mostrar el
efecto de la composición del tampón de replegamiento sobre el
rendimiento de la hGH plegada correctamente y obtenida durante el
replegamiento. Se investigaron los siguientes aspectos de la
composición del tampón de replegamiento: tipo y concentración de sal
(0,2 M Na_{2}SO_{4}, NaCl 0,5 M), tipo y concentración del
caotropo (urea 0,5, 4 M; o guanidina-HCl 0,5, 2 M),
concentración del solvente (0,10% [v/v] etanol) y tipo de tampón y
pH (Tris-HCl pH 8, glicina pH 10). Los rendimientos
obtenidos con las combinaciones de estos componentes se muestran en
la Tabla VIII. La inspección muestra que los mayores rendimientos
de la hGH plegada correctamente se obtuvieron mediante
replegamiento en las condiciones siguientes: glicina 20 mM (pH 10),
guanidina 0,5 M, NaCl 0,5 M, etanol al 10% (v/v) y CuCl_{2} 0,5
\muM (muestra #5).
El experimento descrito en este ejemplo se diseñó
para permitir el análisis estadístico multifactorial de los
resultados del rendimiento de hGH plegada correctamente con el fin
de valorar la importancia de todos los factores independientemente.
Los resultados de este análisis estadístico se muestran en la Tabla
IX.
Los resultados anteriores muestran que la hGH
recombinante se puede solubilizar y excretar de las células
añadiendo caotropo y reductor al caldo de fermentación (rendimiento
de aproximadamente el 30% de promedio). Se pueden obtener promedios
superiores durante la solubilización si las células se lisan antes
de la adición de agentes de solubilización (aproximadamente una
mejora del 50% de rendimiento). Otras pequeñas diferencias durante
la solubilización incluyen un rendimiento superior con guanidina
que con urea (aproximadamente una mejora del 10% del rendimiento) y
rendimientos superiores con una concentración de caotropo moderada
que con una concentración de caotropo baja (aproximadamente una
mejora del rendimiento del 20% utilizando una concentración de 4 M
en lugar de una 2 M).
El procedimiento de extracción acuosa fue
prácticamente el mismo durante la separación de la hGH
no-nativa a partir de la biomasa que durante la
separación del IGF-I no-nativo a
partir de biomasa. La única diferencia a remarcar implica una
pequeña preferencia para una concentración del caotropo superior
durante la extracción (aproximadamente una mejora del rendimiento
del 5% utilizando urea 4 M en lugar de 2 M). La inclusión de una
concentración de caotropo superior durante la extracción no afecta
significativamente la concentración del polímero y de sal requerida
en un sistema de dos fases en el que la fase ligera se enriquece en
un polipéptido no-nativo deseado y los sólidos de
biomasa sedimentan en la fase pesada. De igual manera, la lisis
mecánica de células antes de la solubilización no afecta la
realización de la extracción acuosa.
Considerando estas diferencias en conjunto, se
indica que la proteína hGH prefiere condiciones caotrópicas más
fuertemente desnaturalizantes para su solubilización y se secreta
menos fácilmente a partir de células permeabilizadas que la
proteína más pequeña IGF-I.
En conclusión, los resultados descritos
anteriormente para hGH muestran claramente que el procedimiento
reivindicado es aplicable al aislamiento de la hGH
no-nativa, así como también al
IGF-I. El IGF-I y la hGH son
esencialmente proteínas distintas ya que difieren esencialmente en
muchas de sus propiedades. Específicamente, tienen secuencias
aminoacídicas distintas, pesos moleculares distintos, número y
patrones de enlaces disulfuros distintos y puntos isoeléctricos
distintos. A pesar de estas diferencias, el IGF-I y
la hGH presentan un comportamiento distinto durante la separación
extractiva de sólidos de biomasa por el procedimiento de la
presente invención.
(1) INFORMACIÓN GENERAL:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- SOLICITANTE:
\vskip0.800000\baselineskip
- Genentech, Inc.
\vskip0.800000\baselineskip
- Builder, Stuart
\vskip0.800000\baselineskip
- Hart Roger
\vskip0.800000\baselineskip
- Lester, Phillip
\vskip0.800000\baselineskip
- Reifsnyder, David
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TÍTULO DE LA INVENCIÓN: Replegamiento de polipéptidos
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- NÚMERO DE SECUENCIAS:9
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- DIRECCIÓN DE LA CORRESPONDENCIA
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- DIRECCIÓN: Genentech, Inc.
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CALLE: 460, Point San Bruno Blvd
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- CIUDAD: South San Francisco
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- ESTADO: California
\vskip0.500000\baselineskip
- (E)
- PAÍS: USA
\vskip0.500000\baselineskip
- (F)
- CÓDIGO POSTAL: 94080
\vskip0.800000\baselineskip
- (v)
- FORMATO INFORMÁTICO:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- TIPO MEDIO: 5,25 pulgadas, 360 Kb disco flexible
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- ORDENADOR: IBM PC compatible
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- SISTEMA OPERATIVO: PC-DOS/MS-DOS
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- PROGRAMA: patin (Genentech)
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- RESULTADOS ACTUALES DE LA SOLICITUD:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NÚMERO DE LA SOLICITUD:
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- FECHA DE SOLICITUD:
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- CLASIFICACIÓN:
\vskip0.800000\baselineskip
- (vii)
- FECHA DE LA SOLICITUD ANTERIOR:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NÚMERO DE LA SOLICITUD: 08/110664
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- FECHA DE SOLICITUD: 20-agosto-1993
\vskip0.800000\baselineskip
- (viii)
- ABOGADO/ DEL INFORMACIÓN AGENTE:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE: Hasak, Janet E.
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- NÚMERO DE REGISTRO: 28.616
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- NÚMERO DE REFERENCIA/SUMARIO: 804p1pct
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- INFORMACIÓN DE TELECOMUNICACIÓN:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- TELÉFONO: 415/225-1896
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TELEFAX: 415/952-9881
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TÉLEX: 910/371-7168
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID Nº 1:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 485 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº 1:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID Nº 2:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 30 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº 2:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipCATGGCCGGT CCGGAAACTC TGTGCGGCGC
\hfill30
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID Nº 3:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 22 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº 3:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipCGGCCAGGCC TTTGAGACAC GC
\hfill22
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID Nº 4:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 51 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº 4:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipCATGGCCGGT CCCGAAACTC TGTGCGGTGC TGAACTGGTT GACGCTCTGC
\hfill50
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID Nº 5:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 43 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº 5:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipCGGCCAGGGC TTTGAGACAC GCCACGACTT GACCAACTGC GAG
\hfill43
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID Nº 6:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 18 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº 6:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipCATGGCCTCC CCATATTC
\hfill18
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID Nº 7:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 18 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº 7:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipCGGAGGGGTA TAAGGAGC
\hfill18
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID Nº 8:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 67 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº 8:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipTCGTCGTGCT CCCCAGACTG GTATTGTTGA GGAATGCTGC TTTCGTTCTT
\hfill50
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipGCGACCTGCG TCGTCTG
\hfill67
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID Nº 9:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 70 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº 9:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipAGAACGCTGG ACGCAGCAGA CCTTTACATA ACGCGAGGGG ACTTTGGGCG
\hfill50
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipATTTAGACGA ATCTTCGAGG
\hfill70
Claims (16)
1. Composición que comprende aproximadamente 0,1
a 15 mg/ml de un polipéptido plegado incorrectamente, seleccionado a
partir del grupo que consiste en: el IGF-I, la
hormona de crecimiento y una neurotropina en un tampón de pH
7-12 que comprende aproximadamente el
5-40% (v/v) de un solvente alcohólico o aprótico
polar, una concentración de 0,2 a 3 M de una sal de metal alcalino,
de metal alcalino térreo o una sal amónica, una concentración de
0,1 a 9 M de un agente caotrópico y una concentración de 0,01 a 15
\muM de una sal de cobre o manganeso.
2. Composición de acuerdo con la reivindicación
1, en donde la concentración del solvente es aproximadamente del
10-30% (v/v) y/o la concentración del polipéptido
es aproximadamente de 0,1 a 6 mg/ml y/o la concentración de la sal
de metal alcalino, alcalino-térreo o amónica es
aproximadamente de 0,2 a 2 M y/o la concentración del agente
caotrópico es aproximadamente de 0,5 a 6 M y/o la concentración de
sal de cobre o manganeso es aproximadamente de 0,01 a 5 \muM o
aproximadamente de 0,01 a 0,5 \muM.
3. Composición de acuerdo con la reivindicación 1
o la 2, en donde el solvente es metanol, etanol,
isopropanol,n-propanol; t-butanol,
dimetilsulfóxido, dimetilformamida,
N-metilpirrolidona, tetrahidrofurano, dioxano,
glicerol, acetonitrilo o propilén glicol.
4. Composición de acuerdo con cualquiera de las
reivindicaciones 1 a 3, en donde el agente caotrópico es la
urea.
5. Composición de acuerdo con cualquiera de las
reivindicaciones anteriores, en donde la sal de metal alcalino,
alcalino-térreo o amónica es una sal de sodio,
potasio o amoníaco a aproximadamente 0,5 a 2 M, o una sal de
magnesio a 0,2 a 1 M.
6. Composición de acuerdo con cualquiera de las
reivindicaciones anteriores, en donde la sal de cobre o manganeso
es un cloruro o un sulfato.
7. Composición de acuerdo con la reivindicación
6, en donde la sal de cobre está presente en una concentración de
aproximadamente 0,5 \muM.
8. Composición de acuerdo con cualquiera de las
reivindicaciones anteriores, en donde el tampón también comprende
un osmolito y un agente reductor.
9. Composición de acuerdo con cualquiera de las
reivindicaciones anteriores, en donde el tampón es glicina, CAPS, o
CAPSO.
10. Composición de acuerdo con la reivindicación
8 o la 9, en donde el agente reductor es la cisteína o el
ditiotreitol en una concentración de aproximadamente
1-5 mM.
11. Procedimiento para aumentar el rendimiento de
un replegamiento correcto de un polipéptido plegado
incorrectamente, seleccionado a partir del grupo que consiste en:
el IGF-I, la hormona de crecimiento humana y una
neurotropina contenida en las células huéspedes; comprendiendo
dicho procedimiento la etapa de contacto de dicho polipéptido
plegado incorrectamente con un tampón y en donde durante dicho
proceso el mencionado polipéptido plegado incorrectamente se
desnaturaliza y pliega de nuevo en su conformación activa
biológicamente, y en donde dicho polipéptido se halla a una
concentración de aproximadamente 0,1 a 15 mg/ml del tampón y dicho
tampón tiene un pH de 7-12 y comprende
aproximadamente un 5-40% (v/v) de un solvente
alcohólico o aprótico polar, aproximadamente 0,2 a 3 M de una sal
de metal alcalino, alcalino-térreo o amónica,
aproximadamente 0,1 a 9 M de un agente caotrópico a y
aproximadamente de 0,01 a 15 \muM de una sal de cobre o
manganeso.
12. Procedimiento de acuerdo con la
reivindicación 11, en donde la sal de metal alcalino,
alcalino-térreo o amoniacal es aproximadamente una
sal de sodio, potasio o amónica 0,5-2 M, o una sal
de magnesio 0,2-1 M.
13. Procedimiento de acuerdo con la
reivindicación 11 ó 12, en donde el tampón comprende además un
agente reductor y un osmolito.
14. Procedimiento de acuerdo con cualquiera de
las reivindicaciones 11 a 13, en donde la sal de cobre es el
cloruro cúprico.
15. Procedimiento de acuerdo con la
reivindicación 13 ó 14, en donde el tampón es CAPSO o glicina tiene
un pH de aproximadamente 8 a 11, el agente caotrópico es urea a una
concentración de aproximadamente 1-3 M, la sal es el
cloruro sódico, el solvente es etanol o isopropanol a una
concentración de aproximadamente el 20% (v/v), el polipéptido es
el IGF-I, el agente reductor es el ditiotreitol o
la cisteína y el osmolito es la sacarosa o el glicerol.
16. Procedimiento de acuerdo con cualquiera de
las reivindicaciones 11 ó 15, en donde se aíslan a partir de
células eucariotas el IGF-I, la hormona de
crecimiento humana o una neurotropina.
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US08/110,664 US5663304A (en) | 1993-08-20 | 1993-08-20 | Refolding of misfolded insulin-like growth factor-I |
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