DE10362020B4 - Testsystem zur Untersuchung der Biofilmhydrolyse - Google Patents
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Abstract
Description
- Die Erfindung betrifft ein Testsystem zur Untersuchung der Biofilmhydrolyse, bei dem aus repräsentativen, auch in Haushaltsbiofilmen auftretenden Mikroorganismen ein Biofilm gezüchtet wird, der anschließend dem auf seine Wirksamkeit hin zu untersuchenden enzymhaltigen Reinigungsmittel ausgesetzt wird.
- Als Biofilm bezeichnet man den Bewuchs von Oberflächen durch Mikroben und vor allem die von ihnen kollektiv abgegebene und sie umhüllende gallertartige Schutzschicht. Dieser Schleim ist gleichzeitig der Grund dafür, daß unter realen Bedingungen lebende Bakterien, wie auch andere Biofilme produzierende Mikroorganismen, wesentlich widerstandsfähiger gegenüber – auch biozidhaltigen – Reinigungsmitteln sind als Laborkulturen, die normalerweise aus einzelnen frei schwimmenden Bakterien, sog. planktonischen Zellen, bestehen. Biofilme führen in technischen Systemen zu massiven Beeinträchtigungen und können in der Medizin hartnäckige Infektionen hervorrufen, die gegenüber herkömmlichen Antibiotika weitgehend resistent sind. Im Haushalt sind die durch Biofilme hervorgerufenen Beeinträchtigungen sowohl hygienischer als auch ästhetischer Natur.
- Die Bekämpfung von Biofilmen durch Biozide ist nur bedingt möglich, da die größtenteils aus Polysacchariden bestehende Schleimmatrix die Zellen vor der Einwirkung der Biozide schützt (sog. Pseudoresistenz). Um überhaupt eine Wirkung zu erzielen, müßten die Biozide daher wesentlich höher dosiert eingesetzt werden, als es für eine vergleichbare Menge unassoziiert vorliegender Bakterien vonnöten wäre. Der Einsatz von Bioziden im Haushalt ist jedoch unter ökologischen Gesichtspunkten ungünstig, so daß die Bestrebungen eher dahin gehen, Reinigungsmittel mit nur geringen Konzentrationen oder völlig ohne Biozide bereitzustellen. Dies ließ sich jedoch bislang nicht mit dem Wunsch nach einer möglichst vollständigen Entfernung bakterieller Biofilme – und damit optimaler Hygiene – in Einklang bringen.
- Die europäische Patentschrift
EP 946 207 B1 WO 98/26807 A1 -
EP 388 115 A1 - In der
WO 01/09295 A1 - Auch die
WO-Schrift 96/36569 A1 WO 96/17632 A1 - Die internationale Anmeldung
WO 01/53010 A1 - Die Wirksamkeit der in der Literatur beschriebenen Systeme wurde stets nur an Biofilmen getestet, die im Labor gezüchtet waren und nur von einigen wenigen ausgewählten Bakterienarten gebildet wurden, so daß diese Systeme nur bedingt auf reale Bedingungen übertragbar sind.
- Die Aufgabe dieser Erfindung ist es, ein Testsystem bereitzustellen, welches die Überprüfung der Wirksamkeit von Reinigungsmitteln gegenüber Biofilmen auf harten Oberflächen in zuverlässiger und reproduzierbarer Weise ermöglicht.
- Die Zusammensetzung bakterieller Biofilme auf Haushaltsoberflächen ist bislang wenig erforscht worden; die wenigen Forschungsergebnisse erlauben auch keine Aussage über etwaige Unterschiede zwischen Biofilmen auf Flächen in der Industrie und in Privathaushalten. Entsprechend war auch die Beurteilung der Wirksamkeit eines Mittels problematisch und die Vergleichbarkeit einzelner Ergebnisse keineswegs immer gegeben.
- Daher wurden zunächst Versuche zur Charakterisierung von WC-Biofilmen unternommen. Anhand der erhaltenen Ergebnisse wurden dann Modellbiofilme aus mehreren Mikroorganismen gezüchtet, die die tatsächlichen Verhältnisse auf Haushaltsoberflächen genauer widerspiegeln als die bislang meist untersuchten Biofilme aus einzelnen im Labor verfügbaren Bakterienstämmen. Mit diesen Modellbiofilmen lag nun erstmals ein zuverlässiges Testsystem vor, welches zur Überprüfung der Wirksamkeit von Reinigungsmitteln mit oder ohne Biozide gegenüber Biofilmen auf harten Oberflächen im Haushalt geeignet ist.
- Diese Modellbiofilme wurden dann der Wirkung verschiedener Enzyme ausgesetzt, um den Abbau zu untersuchen; dabei wurde überraschend festgestellt, daß bereits die Wirkung der Polysaccharidasen und/oder der Proteasen ausreicht, um den Biofilm aufzubrechen und die Zellen abzulösen. Diese können dann einfach abgespült werden, so daß es im Gegensatz zu den im Stand der Technik beschriebenen Methoden zur Entfernung von Biofilmen keiner bakterientötenden Oxidoreductasen oder stärkeren Biozide bedarf. Es ist daher eine umweltschonende Methode zur Reinigung und Desinfektion vor allem feuchter, wasserumspülter Oberflächen im Haushalt zugänglich geworden.
- Zur Überprüfung der Wirksamkeit der Mittel gegenüber Biofilmen wurden nach einer detaillierten Untersuchung von WC-Biofilmen entsprechende Testsysteme aufgebaut. Bislang war im Gegensatz zu industriellen Systemen die Struktur von Biofilmen auf Haushaltsoberflächen wenig erforscht. Während Finch et al. (J. Appl. Bacteriology, 45, 357–364, 1978) überwiegend gram-positive Micrococci und Bacilli im und am WC fanden, wurden von Scott et al. (J. Hygiene, 89, 279–293, 1982) überwiegend gram-negative Enterobacterien, daneben vereinzelt Pseudomonaden und Staphylococcen, bei ihrer Untersuchung des Hygienestatus von 250 Haushalten gefunden. Beide Untersuchungen bezogen sich jedoch weder thematisch noch durch die Art der Probenahme speziell auf die Haushaltsbiofilmen zugrundeliegenden Mikroorganismen. Mit einem anderen Probenahmesystem konnten Pitts et al. (Biofouling, 13, 19–30, 1998) in 3 Haushalten 50 verschiedene mikrobielle Isolate nachweisen, von denen einige gram-negativ waren (hierbei handelte es sich vor allem um Pseudomonaden), andere gram-positiv, einige konnten zudem nicht charakterisiert werden.
- Da also die Zusammensetzung bakterieller Biofilme auf Haushaltsoberflächen bislang wenig erforscht war und die wenigen Forschungsergebnisse auch keine Aussage über etwaige Unterschiede zwischen Biofilmen auf Flächen in der Industrie und in Privathaushalten erlaubten, wurden zunächst Versuche zur Charakterisierung von WC-Biofilmen unternommen. Anhand der erhaltenen Ergebnisse wurden dann Modellbiofilme aus mehreren Mikroorganismen gezüchtet, die die tatsächlichen Verhältnisse auf Haushaltsoberflächen genauer widerspiegeln als die bislang meist untersuchten Biofilme aus einzelnen im Labor verfügbaren Bakterienstämmen. Diese Modellbiofilme wurden dann der Wirkung verschiedener Enzyme ausgesetzt.
- Charakterisierung von WC-Biofilmen
- Die Probenahme erfolgte durch mechanische Entfernung des Belags, der sich unter dem Toilettenrand befand, an verschiedenen WC-Standorten. Aus der Biomasse wurde die DNA direkt nach einer Standardmethode extrahiert (DNA Tissue Kit der Firma Qiagen, Hilden). Die vorliegenden 16 S-RNA-Genfragmente wurden mittels PCR-Methoden unter Einsatz zweier spezifischer Primer (mt12S/1: GTG GAT CCA GGA TTA GAT ACC C; SSU2: ACT GGT ACC TTG TTA CGA CTT) amplifiziert und in den Vektor pGEM-Teasy (Firma Promega) kloniert. Die Sequenzierung der Fragmente einzelner Klone erfolgte nach Standardmethoden.
- Die Identifizierung der Keime erfolgte nach Abgleich mit der Sequenzdatenbank BLAST N2.2.1. Die gefundenen Isolate sind in Tabelle 1 dargestellt. Tabelle 1: Keime aus Haushaltstoiletten
Organismen Accession number Identität (bp) Identität (%) Standort Taxonomie 1 Nitrosomonas spec. AF272418 387/392 98 1 β-Proteobakterien 2 Aeromicrobium erythreum AF005021 471/484 97 1 Actinobakterien 3 Agrobacterium sanguineum AB021493 460/462 99 1 α-Proteobakterien α-Proteobacterium APR271042 460/462 99 Porphyrobacter neustonensis AB033327 460/462 99 4 Rhodanobacter lindanoclasticus AF039167 464/466 99 1 γ-Proteobakterien 5 Rhodanobacter lindanoclasticus AF039167 461/463 99 1 γ-Proteobakterien 6 Cellulomonas cellasea X79459 452/464 97 1 Actinobakterien 7 Unidentified bacterium wb 1 AF317774 458/462 99 1 α-Proteobakterien Mesorhizobium sp. USDA 4003 AF282929 458/462 99 Rhizobium sp. CJ15 U50168 458/462 99 8 Knoellina sinensis AJ294413 458/463 98 1 Actinobakterien 9 Uncultured bacterium GKS2-106 AJ290025 433/460 94 1 CFB 10 Uncultured sludge bacterium S6 AF234751 437/461 94 1 Grampositive 11 Uncultured eubacterium WD2106 AJ292671 463/464 99 1 β-Proteobakterien Uncultured eubacterium WD2109 AJ292646 463/464 99 Uncultured eubacterium WD289 AJ292645 463/464 99 12 Dermacoccus nishinomiyaensis X87757 447/460 97 1 Actinobakterien 13 Unidentified bacterium wb1_I18 AF317774 460/460 100 1 α-Proteobakterien α-Proteobacterium ,Mena 25/4-1' Y11584 460/460 100 14 Brachybacterium tyrofermentans X91657 451/460 98 1 Actinobakterien 15 Brevundimonas sp. AJ227800 472/473 99 2 α-Proteobakterien Brevundimonas vesicularis AJ227780 472/473 99 16 Afipia genosp. 9 strain G8993 U87780 464/464 100 2 α-Proteobakterien Afipia genosp. 9 strain G8990 U87779 464/464 100 17 Bradyrhizobium japonicum strain USDA 59 AF293378 469/479 97 2 α-Proteobakterien Rhodopseudomonas sp. g-c AF123086 469/479 97 Afipia genosp. 4 strain G7812 U87770 469/479 97 18 Stenotrophomonas sp. BO AF156709 466/472 98 2 γ-Proteobakterien 19 Bradyrhizobium japonicum strain USDA 59 AF293378 468/479 97 2 α-Proteobakterien Rhodopseudomonas sp. g-c AF123086 468/479 97 Afipia genosp. 4 strain G7812 U87770 468/479 97 20 Xanthomonas campestris AF290420 385/387 99 2 γ-Proteobakterien Xanthomonas albinileans X95918 385/387 99 21 Caulobacter spec. AF245033 410/421 97 2 α-Proteobakterien 22 α-Proteobacterium MBIC1549 AB017110 470/490 95 2 α-Proteobakterien 23 Sphingobacterium mizutae M58796 437/446 97 2 CFB 24 Sphingobacterium mizutae D14024 447/460 97 2 CFB 25 Leucobacter komagatae D45063 451/463 97 2 Actinobakterien 26 Stenotrophomonas maltophila Isolat VUN 10,075 AF100733 461/461 100 2 γ-Proteobakterien 27 Pseudomonas pavonaceae D84019 463/463 100 2 γ-Proteobakterien - Aus dieser Tabelle geht hervor, daß die Diversität sehr groß war. Es wurden an beiden Standorten Vertreter aus fast allen taxonomischen Gruppen nachgewiesen.
- Dabei wurden lediglich zwei Isolate doppelt gefunden. Die taxonomische Zuordnung der Isolate ergab sich wie folgt:
α-Proteobacterien: 9 β-Proteobacterien: 2 γ-Proteobacterien: 6 CFB-Gruppe: 3 Actinobakterien (Gram-positive): 7 - Aufbau des Testsystems
- Basierend auf der Erkenntnis, daß Haushalts- und WC-Biofilme offenbar nicht überwiegend aus Enterobakterien bestehen, sondern vielmehr eine breite Diversität bezüglich der Mikroorganismen aufweisen, wurde ein Biofilmtestsystem aufgebaut, das Vertreter aller taxonomisch relevanten Gruppen enthalten sollte. Dabei wurden möglichst Organismen verwendet, die als gute Biofilmbildner auftreten und zudem in definierter Form von Stammsammlungen bezogen werden können. So wurden Modellbiofilme mit einer Mischpopulation angezogen, bestehend aus:
Dermacoccus nishinomiyaensis DSM Nr. 20448 (Actinobacterium) Bradyrhizobium japonicum DSM Nr. 1982 (α-Proteobacterium) Aquabacterium commune DSM Nr. 11901 (β-Proteobacterium) Xanthomonas campestris DSM Nr. 1526 (γ-Proteobacterium) - Anzucht der Stämme:
- D. nishinomiyaensis, B. japonicum und X. campestris wurden in 50 ml Flüssigkultur (pro Liter 10 g Trypton, 5 g Hefeextrakt, 5 g NaCl) bei 30°C und 150 rpm für 16 h inkubiert.
- Angeimpft wurde mit einer Einzelkolonie von einer Agarplatte (pro Liter 10 g Trypton, 5 g Hefeextrakt, 5 g NaCl, 10 g Agarose).
- A. commune wächst in 50 ml CASO-Medium (Merck) (pro Liter 17 g Pepton aus Casein, 3 g Pepton aus Soja, 5 g NaCl, 2,5 g D(+)-Glucose, 2,5 g di-Kaliumhydrogenphosphat), das 1:10 mit DGHM-Wasser (Deutsche Gesellschaft für Hygiene und Mikrobiologie, DIN 10511 (5,3 ml 6,71% CaCl2·2H2O-Lösung, 1,52 ml 10% MgSO4·7H2O-Lösung, 1000 ml H2Obidest)) verdünnt wurde (Inkubation 2 Tage bei 28°C, 100 rpm). Angeimpft wurde mit einer Einzelkolonie von Plate Count-Agar.
- Die optische Dichte (600 nm) der Kulturen nach 16 h betrug:
Dermacoccus nishinomiyaensis 7,2 Bradyrhizobium japonicum 6,6 Aquabacterium commune 0,33 Xanthomonas campestris 2,5 - Anschließend wurden die Kulturen zusammengegeben, gemischt und mit 50% sterilem Glycerin versetzt, so daß die Endkonzentration 10% Glycerin betrug. Der Kultur-Mix wurde portioniert und bei –20°C eingefroren.
- Die Anzucht des Biofilms erfolgte in 48 well-Mikrotiterplatten.
- Je 750 μl TBY-Medium wurden mit je 75 μl der wie oben zubereiteten Mischung aus Biofilm produzierenden Kulturen pro well versetzt, die Platten wurden mit Airpore-Sheets (Qiagen) und Kunststoffdeckel verschlossen. Anschließend wurde bei 30°C und 60 rpm für 66 h inkubiert, der Überstand vorsichtig abgesaugt und die Platten bei Raumtemperatur mindestens 24 h getrocknet.
- Diese Platten dienten als Substrat für die Untersuchung der enzymatischen Hydrolyse.
- Hydrolyse von Biofilmen
- Die Abkürzungen „M” und „mM” stehen im Folgenden für die Einheiten mol/l bzw. mmol/l, bezeichnen also Molaritäten; die Bezeichnung „Unit” steht für „Einheit”. Die Abkürzung „Uhb” steht für „Protease-Einheit”.
- Nach der Trocknung wurde der Biofilm mit der enzymhaltigen Lösung inkubiert. Es wurden je 1 ml pro well bei einer Konzentration von 2,5 mg/ml bzw. 50 μl/ml bei Flüssigenzymen eingesetzt. Die Inkubation erfolgte bei 30°C und 450 rpm für 16 h entweder bei pH 4 (62 ml 0,1 M Citronensäure, 38 ml 0,2 M Na2HPO4·2H2O, 0,02% NaN3) oder bei pH 7,4 (1 × PBS (Phosphate Buffered Saline, Gibco)) (pro Liter 0,21 g KH2PO4, 9,00 g NaCl, 0,726 g Na2HPO4·7H2O, 0,02% NaN3). Danach wurde der Überstand abgesaugt und einmal mit PBS pH 7,4 gewaschen. Nach dem Anfärben mit einer 0,01%igen Lösung von Safranin O (15 Minuten bei Raumtemperatur) wurde der Überstand erneut abgesaugt. Der Farbstoff wurde daraufhin 30 Minuten bei Raumtemperatur unter Schütteln (600 rpm) in Dimethylsulfoxid extrahiert; eine Extinktionsmessung erfolgte in der Mikrotiterplatte bei 492 nm.
- Die Ergebnisse sind in Tabelle 2 dargestellt. Angegeben sind die Extinktion E nach Inkubation eines Biofilms mit einem Enzym (EInk), die Extinktion bei einer Referenzplatte ohne Enzymbehandlung (ERef) und die prozentuale Entfernung des Biofilms bei den verschiedenen Enzymen. Bei pH 4 wurden Biofilmablösungen im Bereich von 9 bis 70% beobachtet, bei pH 7,4 wurden 11 bis 62% der Biofilme entfernt.
- Bei den eingesetzten Enzymen handelte es sich um die folgenden: (Angegeben sind die Einsatzmengen pro ml Inkubationslösung. Die Angabe der Units bezieht sich auf die jeweiligen Herstellerangaben.)
Corolase® PN-L (saure Protease, AB Enzymes, vormals Röhm Enzyme; E. C. 3.4.21.63) Einsatz je ml: 15 Uhb
Dextranase 3F (ASA Enzyme; E. C. 3.2.1.11), Einsatz je ml: 1500 Units
Cellulase aus A. niger (Sigma C1184, E. C. 3.2.1.4) Einsatz je ml: 1.25 Units
Acid Xylanase P (AB Enzymes, E. C. 3.2.1.8) Einsatz je ml: 304 kUnits
Econase BG 300 (β-Glucanase, AB Enzymes, E. C. 3.2.1.6.) Einsatz je ml: 15 kUnits Tabelle 2: Entfernung von Biofilmen durch EnzymepH 4 pH 7,4 Enzym EInk ERef Biofilmentfernung [%] EInk ERef Biofilmentfernung [%] Corolase 0,885 1,343 34,1 0,453 1,210 62,6 Dextranase 1,195 1,311 8,8 0,877 1,144 23,3 Cellulase 1,237 1,366 9,4 1,027 1,154 11,0 Glucanase 0,656 1,414 53,6 0,493 0,863 42,9 Xylanase 0,406 1,375 70,5 0,923 1,164 20,7 - Als besonders vorteilhaft erwiesen sich die Xylanase und die Glucanase bei pH 4 sowie die Corolase und wiederum die Glucanase bei pH 7,4
- Eine weitere Steigerung läßt sich durch eine Kombination aus verschiedenen Enzymaktivitäten erzielen. Dabei können einerseits einzelne Enzyme gezielt miteinander gemischt werden, wodurch sich teilweise deutliche Leistungssteigerungen erzielen lassen, andererseits sind aber auch kommerziell erhältliche Enzymgemische für den erfindungsgemäßen Einsatz geeignet. Beispielhaft sei hier das von der Firma Novozyme angebotene Viscozyme® genannt, eine flüssige Enzymzubereitung aus Aspergillus sp., die aus verschiedenen Polysaccharidasen zusammengesetzt ist, u. a. aus Arabanase, Cellulase, β-Glucanase, Hemicellulase und Xylanase.
- Untersuchung zur Stabilität in WC-Reinigerformulierungen
- Es wurden verschiedene Reinigungsmittel hergestellt, die Enzyme zur Biofilmentfernung enthielten. (Angabe in % (w/v), Ausnahme gekennzeichnet)
Rezeptur E1 E2 E3 E4 E5 C8-10-Alkylpolyglucosid, DP 1,5 3,00% 3,00% 1,20% 3,50% 3,00% C12-14-Fettalkoholsulfat-Na - - 1,00% 2,50% - Natriumcitrat - - 1,60% 1,10% - Citronensäure·1H2O 3,00% - 3,00% 4,60% - Ethanol - - - 0,50% - Milchsäure - 3,00% - - 1,60% Salicylsäure - - 0,2% - - Ameisensäure - - - - 0,35% Natriumformiat - - - - 2,04% Xanthan Gum - - 0,25% 0,25% - Parfüm 0,3 0,3% 0,40% 0,30% 0,30% Farbstoff 0,012% 0,012% < 0,01% < 0,001% - Natriumhydroxid 0,83% 0,81% - - 1,20% Isobutan Propan n-Butan - - 4,30% 1,40% 0,30% - - flüssige Enzymzubereitung (Corolase PN-L, 250 Uhb/g)) (in % v/v) 2,5% 2,5% 2,5% 2,5% 2,5% Wasser Ad 100% ad 100% ad 100% ad 100% ad 100% pH-Wert 4,2 4,2 3,4 3,0 3,8 - Dabei handelte es sich bei E1 und E2 um flüssige WC-Reiniger, bei E3 um einen WC-Reiniger in Aerosolform, bei E4 um ein Badreiniger-Konzentrat und bei E5 um einen Badreiniger zur Dosierung mit einer Schaumpistole. Alle zeigten eine gute Reinigungsleistung und insbesondere eine gute Biofilmablösung.
- Die Stabilität des Enzyms in der Reinigerformulierung wurde folgendermaßen bestimmt:
Zur Kontrolle wurde das Enzym einem 100 mM Na-Phosphatpuffer (pH-Wert 7,0) in einer Konzentration von 2,5% zugesetzt. Die Reinigerformulierungen bzw. Kontrolllösung wurden für jeweils 10 bzw. 30 Minuten bei 40°C inkubiert. Je 1 μl der Proben wurden anschließend im Aktivitätstest nach Del Mar et al. (Del Mar et al, 1979, Anal. Biochem. 99, 316–320) unter Verwendung des synthetischen Substrates AAPF (Ala-Ala-Pro-Phe-Nitroanilid) eingesetzt und die Aktivität gemessen in μmol/ml·min bestimmt: Tabelle 3: Stabilität von Corolase in Reinigern (Angaben in μmol/ml·min)10 min, 40°C 30 min, 40°C Phosphatpuffer 607 ± 1,4 612 ± 24,2 E1 587 ± 29,9 460 ± 12,6 E2 545 ± 91,5 516 ± 76,9
Claims (2)
- Testsystem zur Untersuchung der Biofilmhydrolyse, dadurch gekennzeichnet, daß mit einer Mischpopulation aus repräsentativen, durch DNA-Analyse taxanomisch gruppierten Mikroorganismen, die in Haushaltsbiofilmen auftreten, ein Biofilm angezüchtet wird, der mit der jeweils zu untersuchenden Enzymzubereitung inkubiert wird und anschließend mit biochemischen und optischen Methoden auf die gegebenenfalls erfolgte Hydrolyse untersucht wird.
- Testsystem gemäß Anspruch 1, dadurch gekennzeichnet, daß es einen oder mehrere Organismen der Gattungen Dermacoccus, Bradyrhizobium, Aquabacterium und Xanthomonas, insbesondere der Species Dermacoccus nishinomiyaensis, Bradyrhizobium japonicum, Aquabacterium commune und Xanthomonas campestris enthält.
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