CZ2001149A3 - Prostředky a způsoby pro terapii a diagnostiku karcinomu prostaty - Google Patents

Prostředky a způsoby pro terapii a diagnostiku karcinomu prostaty Download PDF

Info

Publication number
CZ2001149A3
CZ2001149A3 CZ2001149A CZ2001149A CZ2001149A3 CZ 2001149 A3 CZ2001149 A3 CZ 2001149A3 CZ 2001149 A CZ2001149 A CZ 2001149A CZ 2001149 A CZ2001149 A CZ 2001149A CZ 2001149 A3 CZ2001149 A3 CZ 2001149A3
Authority
CZ
Czechia
Prior art keywords
seq
yippee
cdna sequence
patient
polynucleotide
Prior art date
Application number
CZ2001149A
Other languages
English (en)
Inventor
David Clifford Dillon
Susan Louise Harlocker
Jiang Yuqiu
Jiangchun Xu
Jennifer Lynn Mitcham
Original Assignee
Corixa Corporation
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Priority claimed from US09/116,134 external-priority patent/US7008772B1/en
Priority claimed from US09/115,453 external-priority patent/US6657056B2/en
Priority claimed from US09/159,812 external-priority patent/US6613872B1/en
Priority claimed from US09/232,149 external-priority patent/US6465611B1/en
Priority claimed from US09/232,880 external-priority patent/US7270980B2/en
Application filed by Corixa Corporation filed Critical Corixa Corporation
Publication of CZ2001149A3 publication Critical patent/CZ2001149A3/cs

Links

Classifications

    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K14/00Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • C07K14/435Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K14/00Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • C07K14/435Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
    • C07K14/46Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans from vertebrates
    • C07K14/47Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans from vertebrates from mammals
    • C07K14/4701Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans from vertebrates from mammals not used
    • C07K14/4748Tumour specific antigens; Tumour rejection antigen precursors [TRAP], e.g. MAGE
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K39/00Medicinal preparations containing antigens or antibodies
    • A61K39/46Cellular immunotherapy
    • A61K39/461Cellular immunotherapy characterised by the cell type used
    • A61K39/4611T-cells, e.g. tumor infiltrating lymphocytes [TIL], lymphokine-activated killer cells [LAK] or regulatory T cells [Treg]
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K39/00Medicinal preparations containing antigens or antibodies
    • A61K39/46Cellular immunotherapy
    • A61K39/464Cellular immunotherapy characterised by the antigen targeted or presented
    • A61K39/4643Vertebrate antigens
    • A61K39/4644Cancer antigens
    • A61K39/464493Prostate associated antigens e.g. Prostate stem cell antigen [PSCA]; Prostate carcinoma tumor antigen [PCTA]; Prostatic acid phosphatase [PAP]; Prostate-specific G-protein-coupled receptor [PSGR]
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P35/00Antineoplastic agents
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K2239/00Indexing codes associated with cellular immunotherapy of group A61K39/46
    • A61K2239/46Indexing codes associated with cellular immunotherapy of group A61K39/46 characterised by the cancer treated
    • A61K2239/58Prostate
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K39/00Medicinal preparations containing antigens or antibodies
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K2319/00Fusion polypeptide

Landscapes

  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Public Health (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • Veterinary Medicine (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Pharmacology & Pharmacy (AREA)
  • Animal Behavior & Ethology (AREA)
  • Cell Biology (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Epidemiology (AREA)
  • Mycology (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Toxicology (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Developmental Biology & Embryology (AREA)
  • Oncology (AREA)
  • Gastroenterology & Hepatology (AREA)
  • Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
  • Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
  • General Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Peptides Or Proteins (AREA)
  • Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
  • Medicines That Contain Protein Lipid Enzymes And Other Medicines (AREA)
  • Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
  • Medicines Containing Antibodies Or Antigens For Use As Internal Diagnostic Agents (AREA)
  • Medicines Containing Material From Animals Or Micro-Organisms (AREA)
  • Pharmaceuticals Containing Other Organic And Inorganic Compounds (AREA)

Description

Prostředky a způsoby pro terapii
Oblast techniky
Předkládaný vynález se obecně zhoubných nádorů, jako je karcinom prostaty. Přesněji se předkládaný vynález týká polypeptidů obsahujících alespoň část prostatického nádorového proteinu a polynukleotidů kódujících takové polypeptidy. Takové polypeptidy a polynukleotidy mohou být použity ve vakcínách a farmaceutických prostředcích pro prevenci a léčbu karcinomu prostaty a pro diagnostiku a sledování takových karcinomů.
Dosavadní stav techniky
Karcinom prostaty je nejčastějších karcinomem u mužů, s incidencí 30% u mužů ve věku nad 50 let. Klinická pozorování naznačují, že karcinom prostaty má tendenci k metastasování do kostí a že onemocnění progresivně postupuje od androgen-dependentního k androgen-refraktornímu stavu, což vede ke zvyšující se mortalitě pacientů. Toto onemocnění je druhou nej častější příčinou smrti na nádorové onemocnění u mužů v USA.
I přes značný výzkum týkající se terapie karcinomu prostaty je toto onemocnění stále obtížně léčitelné. Obvykle je léčba založena na chirurgické a/nebo radioterapeutické terapii, ale tyto metody jsou neúčinné ve významném procentu případů. Dva dříve identifikované proteiny specifické pro prostatu - prostatický specifický antigen (PSA) a prostatická kyselá fosfatasa (PAP) mají omezený terapeutický a diagnostický potenciál. Například, PSA nekoreluje dobře s přítomností karcinomu prostaty a je pozitivní v určitém procentu nenádorových postižení prostaty, včetně benigní hyperplasie prostaty (BHP). Dále, měření PSA koreluje s objemem • · · · • · prostaty a neodhaluje přítomnost metastas.
I přes intenzivní -výzkum terapie pro toto a jiná nádorová onemocnění je karcinom prostaty stále obtížně diagnostikovatelný a účinně léčitelný. Proto existuje potřeba zlepšení metod pro detekci a léčbu takových nádorových onemocnění. Předkládaný vynález splňuje tuto potřebu adále poskytuje další výhody.
Podstata vynálezu
Stručně řečeno poskytuje předkládaný vynález prostředky a způsoby pro diagnostiku a terapii zhoubných nádorů, jako je karcinom prostaty. V jednom aspektu poskytuje předkládaný vynález polypeptidy obsahující alespoň část prostatického nádorového proteinu, nebo jeho varianty. Některé části a jiné varianty jsou imunogenní, takže není narušena schopnost varianty reagovat s antisérem specifickým pro antigen. V některých provedeních obsahuje polypeptid alespoň imunogenní část prostatického nádorového proteinu, nebo jeho varianty, kde nádorový protein obsahuje aminokyselinou sekvenci, která je kódovaná polynukleotidovou sekvencí vybranou ze skupiny zahrnující: (a) sekvence uvedené v SEQ ID NO: 1-111, 115-171, 173-175, 177, 179-305, 307-315, 326, 328, 330, 332335, 340-375, 381, 382 nebo 384-472; (b) sekvence, které hybridizují na jakoukoliv z výše uvedených sekvencí za podmínek středně přísné hybridizace; a (c) sekvence komplementární k jakékoliv ze sekvencí uvedených pod bodem (a) a (b). V některých určitých provedeních takový polypeptid obsahuje alespoň část, nebo variantu, nádorového proteinu, který obsahuje aminokyselinovou sekvenci vybranou ze skupiny skládající se ze sekvencí uvedených v SEQ ID NO: 112-114, 172, 176, 178, 327, 329, 331, 336, 339, 376-380 a 383.
Předkládaný vynález dále poskytuje polynukleotidy kódující · · ···· · · • · · 4 · · «
polypeptidy popsané výše, nebo jejich části (jako je část kódující alespoň 15 aminokyselinových zbytků prostatického nádorového proteinu), expresní vektory obsahující takové polynukleotidy a hostitelské buňky transformované nebo transfektované takovými expresními vektory.
V jiném aspektu předkládaný vynález poskytuje farmaceutické prostředky obsahující polypeptid nebo polynukleotid popsaný výše a fyziologicky přijatelný nosič.
V podobném aspektu poskytuje předkládaný vynález vakcíny. Takové vakcíny obsahují polypeptid nebo polynukleotid popsaný výše a činidlo nespecificky zesilující imunitní reakci.
Předkládaný vynález dále poskytuje farmaceutické prostředky, které obsahují: (a) protilátku nebo její vaezbný fragment pro antigen, které se specificky váží na prostatický nádorový protein; a (b) fyzilogicky přijatelný nosič.
V dalším aspektu předkládaný vynález poskytuje farmaceutické prostředky obsahující: (a) buňky prezentující antigen, které exprimují polypeptid popsaný výše; a (b) farmaceuticky přijatelný nosič nebo přísadu. Mezi buňky prezentující antigen patří dendrititické buňky, makrofágy, monocyty, fibroblasty a B-lymfocyty.
V podobném aspektu poskytuje předkládaný vynález vakcíny, které obsahují: (a) buňky prezentující antigen, které exprimují polypeptid popsaný výše; a (b) činidlo nespecificky zesilující imunitní reakci.
V dalších aspektech předkládaný vynález poskytuje fúsní proteiny, které obsahují alespoň jeden polypeptid popsaný výše, • · · · · ·
stejně jako polynukleotidy kódující takové fúsní proteiny.
V dalších aspektech předkládaný vynález poskytuje farmaceutické prostředky obsahující fúsní protein nebo polynukleotid kódující fúsní protein, v kombinaci s fyziologicky přijatelným nosičem.
V dalších aspektech předkládaný vynález poskytuje vakcíny obsahující fúsní protein nebo polynukleotid kódující fúsní protein, v kombinaci s činidlem nespecificky zesilujícím imunitní reakci.
V dalších aspektech předkládaný vynález poskytuje způsoby pro inhibici vývoje zhoubného nádoru u pacienta, které zahrnují podání farmaceutického prostředku nebo vakcíny podle předkládaného vynálezu pacientovi.
V dalších aspektech předkládaný vynález poskytuje způsoby pro odstranění nádorových buněk z biologického vzorku, které zahrnují kontaktování biologického vzorku s T lymfocyty, které specificky reagují s prostatickým nádorovým proteinem, kde krok kontaktování je proveden za podmínek a doby dostatečné pro umožnění odstranění buněk exprimujících protein ze vzorku.
V dalších aspektech předkládaný vynález poskytuje způsoby pro inhibici vývoje zhoubného nádoru u pacienta, které zahrnují podání biologického vzorku zpracovaného způsobem uvedeným výše pacientovi.
V dalších aspektech předkládaný vynález poskytuje způsoby pro stimulaci a/nebo expansi T lymfocytů specifických pro prostatický nádorový protein, které zahrnují kontaktování T lymfocytů s jedním nebo více z: (i) polypeptidů podle předkládaného vynálezu; (b) polynukleotidů kódujících takové polypeptidy; a/nebo (iii) buňkami
9 99 ·· «··· • *
9 9 9 ♦ · · • 9 • ·
9 99 • · · 9 9
• · 9 · • · · · 9 9
·· ·· ·· · 9 · • ·
prezentujícími antigen, které exprimují takové polypeptidy; za podmínek a po dobu dostatečnou pro stimulaci a/nebo expansi T lymfocytů. Vynález také poskytuje izolovanou populaci T lymfocytů obsahující T lymfocyty připravené způsobem uvedeným výše.
V dalších aspektech předkládaný vynález poskytuje způsoby pro inhibici vývoje zhoubného nádoru u pacienta, které zahrnují podání účinného množství populace T lymfocytů uvedené výše pacientovi.
Předkládaný vynález dále poskytuje způsoby pro inhibici vývoje zhoubného nádoru u pacienta, které zahrnují kroky: (a) inkubaci CD4* a/nebo CD8* T lymfocytů izolovaných od pacienta s jedním nebo více z: (i) polypeptidů obsahujících alespoň imunogenní část prostatického nádorového proteinu; (b) polynukleotidů kódujících takové polypeptidy; a/nebo (iii) buňkami prezentujícími antigen, které exprimují takové polypeptidy; a (b) podání účinného množství proliferovaných T lymfocytů pacientovi, což způsobí inhibici vývoje nádoru u pacienta. Proliferované buňky mohou být, ale nemusí, klonovány před podáním pacientovi.
V dalších aspektech předkládaný vynález poskytuje způsoby pro stanovení přítomnosti nebo nepřítomnosti nádoru u pacienta, který zahrnuje: (a) kontaktování biologického vzorku od pacienta s vazebným činidlem, které váže polypeptid podle předkládaného vynálezu; (b) detekování množství polypeptidů, které se váže na vazebné činidlo ve vzorku; a (c) srovnání množství polypeptidů s předem určenou hraniční hodnotou a z toho stanovení přítomnosti nebo nepřítomnosti nádorového onemocnění u pacienta. Ve výhodných provedeních je vazebným činidle protilátka, lépe monoklonální protilátka. Nádorem může být karcinom prostaty.
V dalších aspektech předkládaný vynález poskytuje způsoby pro sledování progrese nádorového onemocnění u pacienta. Takové ·* ··*« ·· »····*· 9 99 • 9 9 9 9 999 ·♦· »· ·· «t* způsoby zahrnují kroky: (a) kontaktování biologického vzorku od pacienta v prvním časovém bodě s vazebným činidlem, které se váže na polypeptid podle předkládaného vynálezu; (b) detekování množství polypeptidu, které se váže na vazebné činidlo ve vzorku;
(c) opakování kroků (a) a (b) za použití biologického vzorku získaného od pacienta v jiné časovém bodě; a (d) srovnání množství polypeptidu detekovaného v kroku (c) s množstvím polypeptidu detekovaným v bodě (b) a podle toho sledování progrese onemocnění u pacienta.
V dalších aspektech předkládaný vynález poskytuje způsoby pro stanovení přítomnosti nebo nepřítomnosti nádorového onemocnění u pacienta, které zahrnují kroky: (a) kontaktování biologického vzorku od pacienta s oligonukleotidem, který hybridizuje na polynukleotid, který kóduje prostatický specifický protein; (b) detekování množství polynukleotidu, výhodně mRNA, které hybridizuje na oligonukleotid ve vzorku; a (c) srovnání množství polynukleotidu, který hybridizuje na oligonukleotid, s předem určenou hraniční hodnotou a z toho stanovení přítomnosti nebo nepřítomnosti nádorového onemocnění u pacienta. V některých provedeních je množství mRNA detekováno polymerasovou řetězovou reakcí, za použití, například, alespoň jednoho oligonukleotidového primeru, který hybridizuje na polynukleotid kódující polypeptid uvedený výše, nebo sekvenci komplementární k uvedenému polynukleotidu. V jiných provedeních je množství mRNA detekováno hybridizační technikou, za použití oligonukleotidové sondy, která hybridizuje na polynukleotid kódující polypeptid uvedený výše, nebo sekvenci komplementární k uvedenému polynukleotidu.
V příbuzných aspektech předkládaný vynález poskytuje způsoby pro sledování progrese nádorového onemocnění u pacienta. Takové způsoby zahrnují kroky: (a) kontaktování biologického vzorku od pacienta s oligonukleotidem, který hybridizuje na polynukleotid, • ·
který kóduje prostatický specifický protein; (b) detekování množství polynukleotidů, které hybridizuje na oligonukleotid; (c) opakování kroků (a) a (b) za použití biologického vzorku získaného od pacienta v jiné časovém bodě; a (d) srovnání množství polynukleotidů detekovaného v kroku (c) s množstvím polynukleotidů detekovaným v bodě (b) a podle toho sledování progrese onemocnění u pacienta.
V dalších aspektech předkládaný vynález poskytuje protilátky, jako jsou monoklonální protilátky, které se váží na polypeptidy popsané výše, stejně jako diagnostické kity obsahující takové protilátky. Vynález také poskytuje diagnostické kity obsahující jednu nebo více oligonukleotidových sond nebo primerů popsaných výše..
Tyto a další aspekty předkládaného vynálezu budou zřejmé z následujícího podrobného popisu a připojených výkresů. Všechny citace jsou zde uvedeny ve své úplnosti.
Popis obrázků na připojených výkresech
Obr. 1 ilustruje schopnost T lymfocytů zabíjet fibroblasty exprimující representativní prostatický nádorový polypeptid P502S, ve srovnání s kontrolními fibroblasty. Procento lýzy je uvedeno jako serie poměrů efektorové buňky: cílové buňky.
Obr. 2A a 2B ukazují schopnost T lymfocytů rozpoznávat buňky exprimující representativní prostatický nádorový polypeptid P502S. Pro každý případ je uveden počet gamma-interferonových skvrn pro různé počty respoderů. Na obr. 2A jsou uvedena data pro fibroblasty pulsované P1S-12 peptidem, ve srovnání s fibroblasty pulsovanými kontrolním E75 peptidem. Na obr. 2B jsou uvedena data pro fibroblasty exprimující P502S, ve srovnání s fibroblasty • · · ·
exprimující HER-2/neu.
Obr. 3 ukazuje test kompetitivní peptidové vazby ukazující, že P1S10 peptid, odvozený od P501S, se váže na HLA-A2. Peptid P1S10 inhibuje HLA-A2 restrihovanou prezentaci fluM58 peptidu CTL klonu D150M58 v biologickém testu uvolňování TNF. D150M58 CTL je specifický pro matricový peptid fluM58 chřipkového viru vážící se na HLA-A.
Obr. 4 ilustruje schopnost linie T lymfocytů odvozené od myší imunizovaných P1S1O specificky lyžovat Jurkat A2Kb buňky pulsované PIS10 a Jurkat A2Kb buňky transdukované P501S, ve srovnání s Jurkat A2Kb buňkami transdukovanými EGFP. Procento lýzy je uvedeno jako serie poměrů efektorové buňky: cílové buňky.
Obr. 5 ilustruje schopnost klonu T lymfocytů rozpoznávat a specificky lyžovat Jurkat A2Kb buňky exprimující representativní prostatický nádorový polypeptid P501S, což demonstruje, že peptid P1S10 může být přirozeně zpracovaným epitopem P501S polypeptidu.
Obr. 6A a 6B jsou grafy ilustrující specificitu CDS-*· buněčné linie (3A-1) pro representativní prostatický nádorový antigen (P501S).
Obr. 6A ukazuje výsledky testu uvolňování 51Cr. Obr. 6B ukazuje produkci interferonu gamma 3A-1 buňkami stimulovanými autologní B-LCL transdukovanou P5501S, v různých poměrech efektorových
buněk: cílových buněk, jak je uvedeno.
SEQ ID NO: 1 je určená cDNA sekvence pro Fl- -13 .
SEQ ID NO: 2 je určená 3 ' CDNA sekvence pro Fl-12.
SEQ ID NO: 3 je určená 5' CDNA sekvence pro Fl-12.
SEQ ID NO: 4 je určená 3 ' CDNA sekvence pro Fl-16.
SEQ ID NO: 5 je určená 3 ' CDNA sekvence pro Hl-1.
SEQ ID NO: 6 je určená 3' CDNA sekvence pro Hl-9 .
• ·
SEQ ID NO: 7 je určená 3 cDNA sekvence pro Hl-4.
SEQ ID NO: 8 je určená 3 cDNA sekvence pro JI-17.
SEQ ID NO: 9 je určená Ξ cDNA sekvence pro JI-17.
SEQ ID NO: 10 je určená 3 cDNA sekvence pro Ll-12.
SEQ ID NO: 11 je určená 5 CDNA sekvence pro Ll-12.
SEQ ID NO: 12 je určená 3 CDNA sekvence pro Nl-1862.
SEQ ID NO: 13 je určená 5 CDNA sekvence pro Nl-1862.
SEQ ID NO: 14 je určená 3 CDNA sekvence pro JI-13.
SEQ ID NO: 15 je určená 5 CDNA sekvence pro Jl-13.
SEQ ID NO: 16 je určená 3 CDNA sekvence pro Jl-19.
SEQ ID NO: 17 je určená 5 CDNA sekvence pro Jl-19.
SEQ ID NO: 18 je určená 3 CDNA sekvence pro Jl-25.
SEQ ID NO: 19 je určená 5 CDNA sekvence pro Jl-25 .
SEQ ID NO: 20 je určená 5 CDNA sekvence pro Jl-24.
SEQ ID NO: 21 je určená 3 CDNA sekvence pro Jl-24 .
SEQ ID NO: 22 je určená 5 cDNA sekvence pro Kl-58.
SEQ ID NO: 23 je určená 3 CDNA sekvence pro Kl-58.
SEQ ID NO: 24 je určená 5 CDNA sekvence pro Kl-63 .
SEQ ID NO: 25 je určená 3 CDNA sekvence pro Kl-63.
SEQ ID NO: 26 je určená 5 cDNA sekvence pro Ll-4 .
SEQ ID NO: 27 je určená 3 CDNA sekvence pro Ll-4 .
SEQ ID NO: 28 je určená 5' CDNA sekvence pro Ll-14.
SEQ ID NO: 29 je určená 3 CDNA sekvence pro Ll-14.
SEQ ID NO: 30 je určená 3 CDNA sekvence pro Jl-12.
SEQ ID NO: 31 je určená 3 CDNA sekvence pro Jl-16.
SEQ ID NO: 32 je určená 3 cDNA sekvence pro Jl-21.
SEQ ID NO: 33 je určená 3 CDNA sekvence pro Kl-48.
SEQ ID NO: 34 je určená 3 CDNA sekvence pro Kl-55.
SEQ ID NO: 35 je určená 3 CDNA sekvence pro Ll-2 .
SEQ ID NO: 36 je určená 3 CDNA sekvence pro Ll-6 .
SEQ ID NO: 37 je určená 3 CDNA sekvence pro Nl-1858.
SEQ ID NO: 38 je určená 3 CDNA sekvence pro Nl-1860.
SEQ ID NO: 39 je určená 3 CDNA sekvence pro Nl-1861.
• · • · · · • ·
SEQ ID NO: 40 je určená 3' cDNA sekvence pro Nl-1894
SEQ ID NO: 41 je určená cDNA sekvence pro P5.
SEQ ID NO: 42 je určená CDNA sekvence pro P8 .
SEQ ID NO: 43 je určená CDNA sekvence pro P9 .
SEQ ID NO: 44 je určená CDNA sekvence pro P18 .
SEQ ID NO: 45 je určená CDNA sekvence pro P20 .
SEQ ID NO: 46 je určená CDNA sekvence pro P29.
SEQ ID NO: 47 je určená CDNA sekvence pro P30 .
SEQ ID NO: 48 je určená CDNA sekvence pro P34 .
SEQ ID NO: 49 je určená cDNA sekvence pro P36.
SEQ ID NO: 50 je určená CDNA sekvence pro P38.
SEQ ID NO: 51 je určená CDNA sekvence pro P39 .
SEQ ID NO: 52 je určená CDNA sekvence pro P42 .
SEQ ID NO: 53 je určená CDNA sekvence pro P47 .
SEQ ID NO: 54 je určená CDNA sekvence pro P49 .
SEQ ID NO: 55 je určená CDNA sekvence pro P50 .
SEQ ID NO: 56 je určená CDNA sekvence pro P53 .
SEQ ID NO: 57 je určená CDNA sekvence pro P55 .
SEQ ID NO: 58 je určená CDNA sekvence pro P60.
SEQ ID NO: 59 je určená CDNA sekvence pro P64 .
SEQ ID NO: 60 je určená CDNA sekvence pro P65 .
SEQ ID NO: 61 je určená CDNA sekvence pro P73 .
SEQ ID NO: 62 je určená CDNA sekvence pro P75 .
SEQ ID NO: 63 je určená CDNA sekvence pro P76 .
SEQ ID NO: 64 je určená CDNA sekvence pro P79 .
SEQ ID NO: 65 je určená CDNA sekvence pro P84 .
SEQ ID NO: 66 je určená CDNA sekvence pro P68 .
SEQ ID NO: 67 je určená CDNA sekvence pro P80 .
SEQ ID NO: 68 je určená CDNA sekvence pro P82 .
SEQ ID NO: 69 je určená CDNA sekvence pro Ul-3064.
SEQ ID NO: 70 je určená CDNA sekvence pro Ilr-3065 .
SEQ ID NO: 71 je určená CDNA sekvence pro Vl-3692 .
SEQ ID NO: 72 je určená CDNA sekvence pro 1A-3905.
SEQ ID NO: 73 je určená cDNA sekvence pro Vl-3686.
SEQ ID NO: 74 je určená CDNA sekvence pro Rl-2330 .
SEQ ID NO: 75 je určená CDNA sekvence pro 1B-3976.
SEQ ID NO: 76 je určená CDNA sekvence pro Vl-3679.
SEQ ID NO: 77 je určená CDNA sekvence pro 1G-4736.
SEQ ID NO: 78 je určená CDNA sekvence pro 1G-4738.
SEQ ID NO: 79 je určená CDNA sekvence pro 1G-4741.
SEQ ID NO: 80 je určená CDNA sekvence pro 1G-4744.
SEQ ID NO: 81 je určená CDNA sekvence pro 1G-4734.
SEQ ID NO: 82 je určená CDNA sekvence pro 1H-4774.
SEQ ID NO: 83 je určená CDNA sekvence pro 1H-4781.
SEQ ID NO: 84 je určená CDNA sekvence pro 1H-4785.
SEQ ID NO: 85 je určená cDNA sekvence pro 1H-4787.
SEQ ID NO: 86 je určená CDNA sekvence pro 1H-4796.
SEQ ID NO: 87 je určená CDNA sekvence pro 11-4807.
SEQ ID NO: 88 je určená CDNA sekvence pro 11-4810.
SEQ ID NO: 89 je určená CDNA sekvence pro 11-4811.
SEQ ID NO: 90 je určená CDNA sekvence pro 1J-4876.
SEQ ID NO: 91 je určená CDNA sekvence pro 1J-4876.
SEQ ID NO: 92 je určená cDNA sekvence pro 1K-4896.
SEQ ID NO: 93 je určená CDNA sekvence pro 1G-4761.
SEQ ID NO: 94 je určená CDNA sekvence pro 1G-4762.
SEQ ID NO: 95 je určená CDNA sekvence pro 1H-4766.
SEQ ID NO: 96 je určená CDNA sekvence pro 1H-4770.
SEQ ID NO: 97 je určená CDNA sekvence pro 1H-4771.
SEQ ID NO: 98 je určená CDNA sekvence pro 1H-4772.
SEQ ID NO: 99 je určená CDNA sekvence pro 1D-4297.
SEQ ID NO: 100 je určená CDNA sekvence pro 1D-4309.
SEQ ID NO: 101 je určená CDNA sekvence pro ID.1-4278.
SEQ ID NO: 102 je určená CDNA sekvence pro 1D-4288.
SEQ ID NO: 103 je určená CDNA sekvence pro 1D-4283.
SEQ ID NO: 104 je určená CDNA sekvence pro 1D-4304.
SEQ ID NO: 105 je určená CDNA sekvence pro 1D-4296.
♦♦ ····
SEQ ID NO: 106 je určená cDNA sekvence pro 1D-4280.
SEQ ID NO: 107 je určená kompletní cDNA sekvence pro Fl-12 (
označovaný jakc i P504S).
SEQ ID NO: 108 je předpokládaná aminokyselinová sekvence pro
Fl-12.
SEQ ID NO: 109 je určená kompletní CDNA sekvence pro Jl-17.
SEQ ID NO: 110 je určená kompletní cDNA sekvence pro Ll-12.
SEQ ID NO: 111 je určená kompletní cDNA sekvence pro Nl-1862
SEQ ID NO: 112 je předpokládaná aminokyselinová ; sekvence pro
Jl-17.
SEQ ID NO: 113 je předpokládaná aminokyselinová sekvence pro
Ll- 12 .
SEQ ID NO: 114 je předpokládaná aminokyselinová sekvence pro
Nl- 1862 .
SEQ ID NO: 115 je určená cDNA sekvence pro P89.
SEQ ID NO: 116 je určená cDNA sekvence pro P90.
SEQ ID NO: 117 je určená CDNA sekvence pro P92 .
SEQ ID NO: 118 je určená CDNA sekvence pro P95 .
SEQ ID NO: 119 je určená CDNA sekvence pro P98 .
SEQ ID NO: 120 je určená CDNA sekvence pro P102 .
SEQ ID NO: 121 je určená CDNA sekvence pro P110 .
SEQ ID NO: 122 je určená CDNA sekvence pro Plil.
SEQ ID NO: 123 je určená CDNA sekvence pro P114 .
SEQ ID NO: 124 je určená CDNA sekvence pro P115 .
SEQ ID NO: 125 je určená CDNA sekvence pro P116 .
SEQ ID NO: 126 je určená CDNA sekvence pro P124 .
SEQ ID NO: 127 je určená CDNA sekvence pro P126 .
SEQ ID NO: 128 je určená CDNA sekvence pro P130 .
SEQ ID NO: 129 je určená CDNA sekvence pro P133 .
SEQ ID NO: 130 je určená CDNA sekvence pro P138 .
SEQ ID NO: 131 je určená cDNA sekvence pro P143 .
SEQ ID NO: 132 je určená CDNA sekvence pro P151.
SEQ ID NO: 133 je určená CDNA sekvence pro P156 .
SEQ ID NO: 134 je určená cDNA sekvence pro P157 .
SEQ ID NO: 135 je určená CDNA sekvence pro P166 .
SEQ ID NO: 136 je určená CDNA sekvence pro P176.
SEQ ID NO: 137 je určená CDNA sekvence pro P178 .
SEQ ID NO: 138 je určená CDNA sekvence pro P179 .
SEQ ID NO: 139 je určená CDNA sekvence pro P185 .
SEQ ID NO: 140 je určená CDNA sekvence pro P192 .
SEQ ID NO: 141 je určená CDNA sekvence pro P201.
SEQ ID NO: 142 je určená CDNA sekvence pro P204 .
SEQ ID NO: 143 je určená CDNA sekvence pro P208 .
SEQ ID NO: 144 je určená CDNA sekvence pro P211.
SEQ ID NO: 145 je určená CDNA sekvence pro P213 .
SEQ ID NO: 146 je určená CDNA sekvence pro P219 .
SEQ ID NO: 147 je určená CDNA sekvence pro P237 .
SEQ ID NO: 148 je určená CDNA sekvence pro P239 .
SEQ ID NO: 149 je určená CDNA sekvence pro P248 .
SEQ ID NO: 150 je určená CDNA sekvence pro P251.
SEQ ID NO: 151 je určená CDNA sekvence pro P255 .
SEQ ID NO: 152 je určená CDNA sekvence pro P256 .
SEQ ID NO: 153 je určená CDNA sekvence pro P259 .
SEQ ID NO: 154 je určená CDNA sekvence pro P260.
SEQ ID NO: 155 je určená CDNA sekvence pro P263 .
SEQ ID NO: 156 je určená CDNA sekvence pro P264 .
SEQ ID NO: 157 je určená CDNA sekvence pro P266 .
SEQ ID NO: 158 je určená CDNA sekvence pro P270 .
SEQ ID NO: 159 je určená CDNA sekvence pro P272 .
SEQ ID NO: 160 je určená CDNA sekvence pro P278 .
SEQ ID NO: 161 je určená CDNA sekvence pro P105 .
SEQ ID NO: 162 je určená CDNA sekvence pro P107.
SEQ ID NO: 163 je určená cDNA sekvence pro P137 .
SEQ ID NO: 164 je určená CDNA sekvence pro P194 .
SEQ ID NO: 165 je určená CDNA sekvence pro P195 .
SEQ ID NO: 166 je určená CDNA sekvence pro P196 .
*· ·«»· »· ·
SEQ ID NO: 167 je určená cDNA sekvence pro P220 .
SEQ ID NO: 168 je určená CDNA sekvence pro P234 .
SEQ ID NO: 169 je určená CDNA sekvence pro P235.
SEQ ID NO: 170 je určená CDNA sekvence pro P243 .
SEQ ID NO: 171 je určená CDNA sekvence pro P70P-DE1.
SEQ ID NO: 172 je předpokládaná aminokyselinová sekvence pro
P703P-DE1.
SEQ ID NO: 173 je určená cDNA sekvence pro P703P-DE2.
SEQ ID NO: 174 je určená CDNA sekvence pro P703P-DE6.
SEQ ID NO: 175 je určená CDNA sekvence pro P703P-DE13.
SEQ ID NO: 176 je předpokládaná aminokyselinová sekvence pro
P703P-DE13.
SEQ ID NO: 177 je určená cDNA sekvence pro P703P-DE14.
SEQ ID NO: 178 je určená cDNA sekvence pro P703P-DE14.
SEQ ID NO: 179 je určená prodloužená cDNA sekvence pro 1G-4736
SEQ ID NO: 180 je určená prodloužená CDNA sekvence pro 1G-4738
SEQ ID NO: 181 je určená prodloužená CDNA sekvence pro 1G-4741
SEQ ID NO: 182 je určená prodloužená CDNA sekvence pro 1G-4744
SEQ ID NO: 183 je určená prodloužená cDNA sekvence pro 1H-4774
SEQ ID NO: 184 je určená prodloužená CDNA sekvence pro 1H-4781
SEQ ID NO: 185 je určená prodloužená CDNA sekvence pro 1H-4785
SEQ ID NO: 186 je určená prodloužená CDNA sekvence pro 1H-4787
SEQ ID NO: 187 je určená prodloužená CDNA sekvence pro 1H-4796
SEQ ID NO: 188 je určená prodloužená CDNA sekvence pro 11-4807
SEQ ID NO: 189 je určená 3' cDNA sekvence pro 11-4810.
SEQ ID NO: 190 je určená 3' cDNA sekvence pro 11-4811.
SEQ ID NO: 191 je určená prodloužená CDNA sekvence pro 1J-4876
SEQ ID NO: 192 je určená prodloužená CDNA sekvence pro 1K-4884
SEQ ID NO: 193 je určená prodloužená CDNA sekvence pro 1K-4896
SEQ ID NO: 194 je určená prodloužená cDNA sekvence pro 1G-4761
SEQ ID NO: 195 je určená prodloužená CDNA sekvence pro 1G-4762
SEQ ID NO: 196 je určená prodloužená CDNA sekvence pro 1H-4766
SEQ ID NO: 197 je určená 3' cDNA sekvence pro 1H-4770.
SEQ ID NO: 198 je určená 3' cDNA sekvence pro 1H-4771.
SEQ ID NO: 199 je určená prodloužená cDNA sekvence pro 1H-4772.
SEQ ID NO: 200 je určená prodloužená cDNA sekvence pro 1D-4309.
SEQ ID NO: 201 je určená prodloužená cDNA sekvence pro ID.1-4278
SEQ ID NO: 202 je určená prodloužená cDNA sekvence pro 1D-4288.
SEQ ID NO: 203 je určená prodloužená cDNA sekvence pro 1D-4283.
SEQ ID NO: 204 je určená prodloužená cDNA sekvence pro 1D-4304.
SEQ ID NO: 205 je určená prodloužená cDNA sekvence pro 1D-4296.
SEQ ID NO: 206 je určená prodloužená cDNA sekvence pro 1D-4280.
SEQ ID NO: 207 je určená CDNA sekvence pro 10-d8fwd.
SEQ ID NO: 208 je určená CDNA sekvence pro 10-H10con.
SEQ ID NO: 209 je určená CDNA sekvence pro ll-C8rev.
SEQ ID NO: 210 je určená CDNA sekvence pro 7.g6fwd.
SEQ ID NO: 211 je určená CDNA sekvence pro 7.g6rev.
SEQ ID NO: 212 je určená CDNA sekvence pro 8-b6fwd.
SEQ ID NO: 213 je určená CDNA sekvence pro 8-b5rev.
SEQ ID NO: 214 je určená CDNA sekvence pro 8-b6fwd.
SEQ ID NO: 215 je určená CDNA sekvence pro 8-b6rev.
SEQ ID NO: 216 je určená CDNA sekvence pro 8-d4fwd.
SEQ ID NO: 217 je určená CDNA sekvence pro 8-d9rev.
SEQ ID NO: 218 je určená CDNA sekvence pro 8-g3fwd.
SEQ ID NO: 219 je určená CDNA sekvence pro 8-g3rev.
SEQ ID NO: 220 je určená CDNA sekvence pro 8-hllrev.
SEQ ID NO: 221 je určená CDNA sekvence pro g-f12fwd.
SEQ ID NO: 222 je určená CDNA sekvence pro g-f3rev.
SEQ ID NO: 223 je určená CDNA sekvence pro P509S.
SEQ ID NO: 224 je určená CDNA sekvence pro P510S.
SEQ ID NO: 225 je určená CDNA sekvence pro P703DE5.
SEQ ID NO: 226 je určená CDNA sekvence pro 9-A11.
SEQ ID NO: 227 je určená CDNA sekvence pro 8-C6.
SEQ ID NO: 228 je určená CDNA sekvence pro 8-H7 .
SEQ ID NO: 229 je určená CDNA sekvence pro JPTPN13.
SEQ ID NO: 230 je určená CDNA sekvence pro JPTPN14.
SEQ ID NO: 231 je určená cDNA sekvence pro JPTPN23.
SEQ ID NO: 232 je určená CDNA sekvence pro JPTPN24.
SEQ ID NO: 233 je určená CDNA sekvence pro JPTPN25.
SEQ ID NO: 234 je určená CDNA sekvence pro JPTPN30.
SEQ ID NO: 235 je určená CDNA sekvence pro JPTPN34.
SEQ ID NO: 236 je určená cDNA sekvence pro PTPN35.
SEQ ID NO: 237 je určená CDNA sekvence pro JPTPN36.
SEQ ID NO: 238 je určená CDNA sekvence pro JPTPN3 8.
SEQ ID NO: 239 je určená CDNA sekvence pro JPTPN39.
SEQ ID NO: 240 je určená CDNA sekvence pro JPTPN40.
SEQ ID NO: 241 je určená CDNA sekvence pro JPTPN41.
SEQ ID NO: 242 je určená CDNA sekvence pro JPTPN42.
SEQ ID NO: 243 je určená CDNA sekvence pro JPTPN45.
SEQ ID NO: 244 je určená CDNA sekvence pro JPTPN46.
SEQ ID NO: 245 je určená CDNA sekvence pro JPTPN51.
SEQ ID NO: 246 je určená CDNA sekvence pro JPTPN56.
SEQ ID NO: 247 je určená CDNA sekvence pro PTPN64.
SEQ ID NO: 248 je určená CDNA sekvence pro JPTPN65.
SEQ ID NO: 249 je určená CDNA sekvence pro JPTPN67.
SEQ ID NO: 250 je určená CDNA sekvence pro JPTPN76.
SEQ ID NO: 251 je určená CDNA sekvence pro JPTPN84.
SEQ ID NO: 252 je určená CDNA sekvence pro JPTPN85.
SEQ ID NO: 253 je určená CDNA sekvence pro JPTPN86.
SEQ ID NO: 254 je určená CDNA sekvence pro JPTPN87.
SEQ ID NO: 255 je určená CDNA sekvence pro JPTPN88.
SEQ ID NO: 256 je určená CDNA sekvence pro JP1F1.
SEQ ID NO: 257 je určená CDNA sekvence pro JP1F2.
SEQ ID NO: 258 je určená CDNA sekvence pro JP1C2.
SEQ ID NO: 259 je určená CDNA sekvence pro JP1B1.
SEQ ID NO: 260 je určená CDNA sekvence pro JP1B2.
SEQ ID NO: 261 je určená CDNA sekvence pro JP1D3.
SEQ ID NO: 262 je určená CDNA sekvence pro JP1A4.
SEQ ID NO: 263 je určená CDNA sekvence pro JP1F5.
SEQ ID NO: 264 je určená cDNA sekvence pro JP1E6.
SEQ ID NO: 265 je určená cDNA sekvence pro JP1D6.
SEQ ID NO: 266 je určená CDNA sekvence pro JP1B5.
SEQ ID NO: 267 je určená CDNA sekvence pro JP1A6.
SEQ ID NO: 268 je určená CDNA sekvence pro JP1E8.
SEQ ID NO: 269 je určená cDNA sekvence pro JP1D7.
SEQ ID NO: 270 je určená CDNA sekvence pro JP1D9.
SEQ ID NO: 271 je určená CDNA sekvence pro JP1C10.
SEQ ID NO: 272 je určená CDNA sekvence pro JP1A9.
SEQ ID NO: 273 je určená CDNA sekvence pro JP1F12.
SEQ ID NO: 274 je určená CDNA sekvence pro JP1E12.
SEQ ID NO: 275 je určená cDNA sekvence pro JP1D11.
SEQ ID NO: 276 je určená CDNA sekvence pro JP1C11.
SEQ ID NO: 277 je určená CDNA sekvence pro JP1C12.
SEQ ID NO: 278 je určená CDNA sekvence pro JP1B12.
SEQ ID NO: 280 je určená cDNA sekvence pro JP8G2.
SEQ ID NO: 281 je určená cDNA sekvence pro JP8H1.
SEQ ID NO: 282 je určená CDNA sekvence pro JP8H2.
SEQ ID NO: 283 je určená CDNA sekvence pro JP8A3.
SEQ ID NO: 284 je určená CDNA sekvence pro JP8A4.
SEQ ID NO: 285 je určená CDNA sekvence pro JP8C3.
SEQ ID NO: 286 je určená CDNA sekvence pro JP8G4.
SEQ ID NO: 287 je určená CDNA sekvence pro JP8B6.
SEQ ID NO: 288 je určená CDNA sekvence pro JP8D6.
SEQ ID NO: 289 je určená CDNA sekvence pro JP8F5.
SEQ ID NO: 290 je určená CDNA sekvence pro JP8A8.
SEQ ID NO: 291 je určená CDNA sekvence pro JP8C7.
SEQ ID NO: 292 je určená CDNA sekvence pro JP8D7.
SEQ ID NO: 293 je určená CDNA sekvence pro P8D8 .
SEQ ID NO: 294 je určená CDNA sekvence pro JP89E7.
SEQ ID NO: 295 je určená CDNA sekvence pro JP8F8.
SEQ ID NO: 296 je určená CDNA sekvence pro JP8G8.
SEQ ID NO: 297 je určená CDNA sekvence pro JP8B10.
SEQ ID NO: 298 je určená cDNA sekvence pro JP8C10.
SEQ ID NO: 299 je určená cDNA sekvence pro JP8E9.
SEQ ID NO: 300 je určená CDNA sekvence pro JP8E10.
SEQ ID NO: 301 je určená cDNA sekvence pro JP8F9.
SEQ ID NO: 302 je určená CDNA sekvence pro JP8H9.
SEQ ID NO: 303 je určená cDNA sekvence pro JP8C12.
SEQ ID NO: 304 je určená CDNA sekvence pro JP8E11.
SEQ ID NO: 305 je určená cDNA sekvence pro JP8E12.
SEQ ID NO: 306 je aminokyselinová sekvence pro peptid PS212.
SEQ ID NO: 307 je určená CDNA sekvence pro P711P.
SEQ ID NO: 308 je určená CDNA sekvence pro P712P.
SEQ ID NO: 309 je určená CDNA sekvence pro CLONĚ23.
SEQ ID NO: 310 je určená CDNA sekvence pro P774P.
SEQ ID NO: 311 je určená CDNA sekvence pro P775P.
SEQ ID NO: 312 je určená CDNA sekvence pro P715P.
SEQ ID NO: 313 je určená CDNA sekvence pro P710P.
SEQ ID NO: 314 je určená CDNA sekvence pro P767P.
SEQ ID NO: 315 je určená CDNA sekvence pro P768P.
SEQ ID NO: 316- 325 jsou určené : cDNA sekvence pro dříve izolované
geny.
SEQ ID NO: 326 je určená cDNA sekvence pro P703PDE5.
SEQ ID NO: 327 je předpokládaná aminokyselinová sekvence pro
P703PDE5.
SEQ ID NO: 328 je určená cDNA sekvence pro P703P6.26.
SEQ ID NO: 329 je předpokládaná aminokyselinová sekvence pro
P703P6. .26.
SEQ ID NO: 330 je určená cDNA sekvence pro P703PX-23.
SEQ ID NO: 331 je předpokládaná aminokyselinová sekvence pro P703PX-23.
SEQ ID NO: 332 je určená kompletní cDNA sekvence pro P509S.
SEQ ID NO: 333 je určená prodloužená cDNA sekvence pro P707P (též označovaný jako 11-C9).
SEQ ID NO: 334 je určená cDNA sekvence pro P714P.
SEQ ID NO: 335 je určená cDNA sekvence pro P705P (též označovaný jako 9-F3).
SEQ ID NO: 336 je předpokládaná aminokyselinová sekvence pro
P705P.
SEQ ID NO: 337 je aminokyselinová sekvence peptidu P1S10.
SEQ ID NO: 338 je aminokyselinová sekvence peptidu p5.
SEQ ID NO: 339 je předpokládaná aminokyselinová sekvence pro P509S.
SEQ ID NO: 340 je určená cDNA sekvence pro P778P.
SEQ ID NO: 341 je určená CDNA sekvence pro P786P.
SEQ ID NO: 342 je určená CDNA sekvence pro P789P.
SEQ ID NO: 343 je určená CDNA sekvence pro klon vykazující
homologii s Homo sapiens MM46 mRNA.
SEQ ID NO: 344 je určená CDNA sekvence pro klon vykazující
homologii s Homo sapiens mRNA pro ABC protein stimulovaný TNF-alfa (ABC50).
SEQ ID NO: 345 je určená cDNA sekvence pro klon vykazující homologii s Homo sapiens mRNA pro E-kadherin.
SEQ ID NO: 346 je určená cDNA sekvence pro klon vykazující homologii s mRNA pro lidskou mitochondriální serin-hydroxymethyltransferasu kodovanou v jádru.
SEQ ID NO: 347 je určená cDNA sekvence pro klon vykazující homologii s Homo sapiens makrofágovým proteinem 2 asociovaným s přirozenou resistencí (NRAMP2).
SEQ ID NO: 348 je určená cDNA sekvence pro klon vykazující homologii s Homo sapiens proteinem příbuzným fosfoglukomutase (PGMRP).
SEQ ID NO: 349 je určená cDNA sekvence pro klon vykazující
homologii s Homo i sapiens mRNA pro proteasomovou podjednotku
SEQ ID NO: 350 je určená CDNA sekvence pro P777P.
SEQ ID NO: 351 je určená CDNA sekvence pro P779P.
SEQ ID NO: 352 je určená CDNA sekvence pro P790P.
SEQ ID NO: 353 je určená CDNA sekvence pro P784P.
SEQ ID NO: 354 je určená CDNA sekvence pro P776P.
SEQ ID NO: 355 je určená CDNA sekvence pro P780P.
SEQ ID NO: 356 je určená CDNA sekvence pro P544S.
SEQ ID NO: 357 je určená CDNA sekvence pro P745S.
SEQ ID NO: 358 je určená CDNA sekvence pro P782P.
SEQ ID NO: 359 je určená cDNA sekvence pro P783P.
SEQ ID NO: 360 je určená CDNA sekvence pro neznámý 17984 .
SEQ ID NO: 361 je určená CDNA sekvence pro P787P.
SEQ ID NO: 362 je určená CDNA sekvence pro P788P.
SEQ ID NO: 363 je určená CDNA sekvence pro neznámý 17994.
SEQ ID NO: 364 je určená CDNA sekvence pro P781P.
SEQ ID NO: 365 je určená CDNA sekvence pro P785P.
SEQ ID NO: 366- -37Ξ jsou určené cDNA sekvence pro sestřihové
varianty B305D.
SEQ ID NO: 376 je předpokládaná aminokyselinová sekvence kódovaná sekvencí SEQ ID NO: 366.
SEQ ID NO: 377 je předpokládaná aminokyselinová sekvence kódovaná sekvencí SEQ ID NO: 372.
SEQ ID NO: 378 je předpokládaná aminokyselinová sekvence kódovaná sekvencí SEQ ID NO: 373.
SEQ ID NO: 379 je předpokládaná aminokyselinová sekvence kódovaná sekvencí SEQ ID NO: 374.
SEQ ID NO: 380 je předpokládaná aminokyselinová sekvence kódovaná sekvencí SEQ ID NO: 375.
SEQ ID NO: 381 je určená cDNA sekvence pro B716P.
SEQ ID NO: 382 je určená kompletní cDNA sekvence pro P711P.
SEQ ID NO: 383 je předpokládaná aminokyselinová sekvence pro
P711P.
SEQ ID NO: 384 je CDNA sekvence pro P1000C.
SEQ ID NO: 385 je CDNA sekvence pro CGI-82.
SEQ ID NO: 386 je CDNA sekvence pro 23320.
SEQ ID NO: 387 je CDNA sekvence pro CGI-69.
SEQ ID NO: 388 je CDNA sekvence pro L-iditol-2-dehydrogenasu
SEQ ID NO: 389 je CDNA sekvence pro 23379.
SEQ ID NO: 390 je CDNA sekvence pro 23381.
SEQ ID NO: 391 je CDNA sekvence pro KIAA0122.
SEQ ID NO: 392 je CDNA sekvence pro 23399.
SEQ ID NO: 393 je CDNA sekvence pro dříve identifikované geny.
SEQ ID NO: 394 je cDNA sekvence pro HCLBP.
SEQ ID NO: 395 je CDNA sekvence pro transglutaminasu.
SEQ ID NO: 396 je CDNA sekvence pro dříve identifikované geny.
SEQ ID NO: 397 je CDNA sekvence pro PAP.
SEQ ID NO: 398 je CDNA sekvence pro Ets transkripční faktor PDEF.
SEQ ID NO: 399 je CDNA sekvence pro hTGR.
SEQ ID NO: 400 je CDNA sekvence pro KIAA0295.
SEQ ID NO: 401 je cDNA sekvence pro 22545.
SEQ ID NO: 402 je CDNA sekvence pro 22547.
SEQ ID NO: 403 je CDNA sekvence pro 22548.
SEQ ID NO: 404 je cDNA sekvence pro 22550.
SEQ ID NO: 405 je CDNA sekvence pro 22551.
SEQ ID NO: 406 je CDNA sekvence pro 22552 .
SEQ ID NO: 407 je CDNA sekvence pro 22553 .
SEQ ID NO: 408 je CDNA sekvence pro 22558 .
SEQ ID NO: 409 je CDNA sekvence pro 22562.
SEQ ID NO: 410 je CDNA sekvence pro 22565.
SEQ ID NO: 411 je CDNA sekvence pro 22567.
SEQ ID NO: 412 je CDNA sekvence pro 22568.
SEQ ID NO: 413 je CDNA sekvence pro 22570.
SEQ ID NO: 414 je CDNA sekvence pro 22571.
SEQ ID NO: 415 je CDNA sekvence pro 22572 .
SEQ ID NO: 416 je CDNA sekvence pro 22573 .
SEQ ID NO: 417 je CDNA sekvence pro 22573.
SEQ ID NO: 418 je CDNA sekvence pro 22575.
SEQ ID NO: 419 je CDNA sekvence pro 22580.
SEQ ID NO: 420 je CDNA sekvence pro 22581.
SEQ ID NO: 421 je CDNA sekvence pro 22582.
SEQ ID NO: 422 je cDNA sekvence pro 22583.
SEQ ID NO: 423 je CDNA sekvence pro 22584 .
SEQ ID NO: 424 je CDNA sekvence pro 22585.
SEQ ID NO: 425 je CDNA sekvence pro 22586 .
SEQ ID NO: 426 je CDNA sekvence pro 22587.
SEQ ID NO: 427 je CDNA sekvence pro 22588.
SEQ ID NO: 428 je CDNA sekvence pro 22589.
SEQ ID NO: 429 je CDNA sekvence pro 22590.
SEQ ID NO: 430 je cDNA sekvence pro 22591.
SEQ ID NO: 431 je CDNA sekvence pro 22592 .
SEQ ID NO: 432 je CDNA sekvence pro 22593 .
SEQ ID NO: 433 je cDNA sekvence pro 22594.
SEQ ID NO: 434 je CDNA sekvence pro 22595.
SEQ ID NO: 435 je CDNA sekvence pro 22596.
SEQ ID NO: 436 je cDNA sekvence pro 22847.
SEQ ID NO: 437 je CDNA sekvence pro 22848.
SEQ ID NO: 438 je cDNA sekvence pro 22849.
SEQ ID NO: 439 je cDNA sekvence pro 22851.
SEQ ID NO: 440 je cDNA sekvence pro 22852.
SEQ ID NO: 441 je cDNA sekvence pro 22853 .
SEQ ID NO: 442 je cDNA sekvence pro 22854.
SEQ ID NO: 443 je CDNA sekvence pro 22855.
SEQ ID NO: 444 je CDNA sekvence pro 22856.
SEQ ID NO: 445 je CDNA sekvence pro 22857.
SEQ ID NO: 446 je CDNA sekvence pro 23601.
SEQ ID NO: 447 je CDNA sekvence pro 23602.
SEQ ID NO: 448 je CDNA sekvence pro 23605 .
SEQ ID NO: 449 je CDNA sekvence pro 23606.
SEQ ID NO: 450 je CDNA sekvence pro 23612.
SEQ ID NO: 451 je CDNA sekvence pro 23614.
SEQ ID NO: 452 je CDNA. sekvence pro 23618 .
SEQ ID NO: 453 je cDNA sekvence pro 23622 .
SEQ ID NO: 454 je CDNA sekvence pro folathydrolasu
SEQ ID NO: 455 je CDNA sekvence pro LIM protein.
SEQ ID NO: 456 je CDNA sekvence pro známý gen.
SEQ ID NO: 457 je CDNA sekvence pro známý gen.
SEQ ID NO: 458 je CDNA sekvence pro dříve identifikovaný gen
SEQ ID NO: 459 je CDNA sekvence pro 23045.
SEQ ID NO: 460 je CDNA sekvence pro 23032.
SEQ ID NO: 461 je CDNA sekvence pro 23054.
SEQ ID NO: 462- -467 jsou cDNA sekvence pro známé geny.
SEQ ID NO: 468- -471 j sou cDNA sekvence pro P710P.
SEQ ID NO: 472 je CDNA sekvence pro P1001C
Podrobný popis vynálezu
Jak bylo uvedeno výše, předkládaný vynález je obecně zaměřen na prostředky a způsoby pro diagnostiku a terapii nádorů, jako je karcinom prostaty. Prostředky podle předkládaného vynálezu mohou obsahovat prostatické nádorové polypeptidy, polynukleotidy kódující takové polypeptidy, vazebná činidla jako jsou protilátky, buňky prezentující antigen (APC) a/nebo buňky imunitního systému (například T-lymfocyty). Polypeptidy podle předkládaného vynálezu obvykle obsahují alespoň část (jako je imunogenní část) prostatického nádorového proteinu nebo jeho varianty. Prostatický nádorový protein je protein, který je exprimován v prostatických nádorových buňkách v úrovni, která je alespoň dvakrát vyšší, lépe alespoň pětinásobná, ve srovnání s expresí v normální tkáni, jak se stanoví representativním testem, který je zde popsán. Některé prostatické nádorové proteiny jsou nádorové proteiny, které reagují detekovatelně (v imunotestu, jako je ELISA. nebo westernová hybridizace) s antisérem pacienta postiženého karcinomem prostaty. Polynukleotidy podle předkládaného vynálezu obvykle obsahují DNA nebo RNA sekvenci, která kóduje celý nebo část takového polypeptidů, nebo která je komplementární k takové sekvenci. Protilátky jsou obecně proteiny imunitního systému nebo jejich • ·· ····«· ·· • · ♦ ♦ ·· · · · · • ·· · · · · <
··· ··· · · · ··· ·· ·· · ·· ··« vazebné fragmenty, které jsou schopné vazby na polypeptid, jak je popsáno výše. Mezi buňky prezentující antigen patří dendritické buňky, makrofágy, monocyty, fibroblasty a B-lymfocyty exprimující polypeptid, jak byl popsán výše. T-lymfocyty, které mohou být použity v takových prostředcích, jsou obvykle T-lymfocyty, které jsou specifické pro polypeptid podle předkládaného vynálezu.
Předkládaný vynález je založen na objevu lidských prostatických nádorových proteinů. Sekvence polynukleotidů kódujících některé nádorové proteiny, nebo jejich části, jsou uvedeny v SEQ ID NO: 1-111, 115-171, 173-175, 177, 179-305, 326, 328, 330, 332-335, 340-375, 381, 382 nebo 384-472. Sekvence polypeptidů obsahujících alespoň část nádorového proteinu jsoou uvedeny v SEQ ID NO: 112-114, 172, 176, 178, 327, 329, 331, 336, 339, 376-380 a 383.
Polynukleotidy pro prostatický nádorový protein
Jakýkoliv polynukleotid, který kóduje prostatický nádorový protein nebo jeho část nebo jeho variantu, jak je zde popsána, spadá do rozsahu předkládaného vynálezu. Výhodné polynukleotidy obsahují alespoň 15 sousedních nukleotidů, lépe alespoň 30 sousedních nukleotidů a nejlépe alespoň 45 sousedních nukleotidů, které kódují část prostatického nádorového proteinu. Lépe kóduje polynukleotid imunogenní část prostatického nádorového proteinu. Polynukleotidy komplementární k jakékoliv takové sekvenci také spadají do rozsahu předklládaného vynálezu. Polynukleotidy mohou být jednořetězcové (kódující nebo protismyslné) nebo dvouřetězcové a mohou bý DNA (genomové, cDNA nebo syntetické) nebo RNA molekuly. Mezi RNA molekuly patří HnRNA, která obsahuje introny a odpovídá DNA molekule a mRNA molekuly, neobsahující introny. Další kódující nebo nekódující sekvence mohou být, ale nemusí, přítomny v Λ 1 , ,1, Ί Λ Λ ~ Ί ~ kJ < J _L y 11U. JX. -L « t J L- _L LJL U. _L tť
-----kJJL. UUAl CltÁCllltťllLJ V V 11CÍ_L « Z. U
8. pOlynilrCd-GOu j_d ιιΓϋ-ΖΘ, ale nemusí, být navázaný na jiné molekuly a/nebo nosiče.
Polynukleotidy mohou obsahovat přirozené sekvence (t.j. endogenní sekvence kódující prostatický nádorový protein nebo jeho část) nebo mohou obsahovat varianty takových sekvencí. Polynukleotidová varianty mohou obsahovat jednu nebo více substitucí, adicí, delecí a/nebo insercí takových, které nesnižují imunogenicitu kódovaného polypeptidu ve srovnání s přirozeným nádorovým proteinem. Efekt na imunogenicitu kódovaného polypeptidu může být hodnocen zde popsaným způsobem, arianty vykazují výhodně alespoň 70% identitu, lépe alespoň 80% identitu a nejlépe alespoň 90% identitu s polynukleotidovou sekvencí, která kóduje přirozený prostatický nádorový protein nebo jeho část.
Dvě polynukleotidová nebo polypeptidové sekvence jsou identické, pokud je sekvence nukleotidů nebo aminokyselin ve dvou sekvencích shodná, jsou-li přiřazeny k sobě navzájem. Srovnání mezi dvěma sekvencemi jsou obvykle prováděny srovnáním sekvencí ve srovnávacím oknu pro identifikaci a srovnání lokálních regionů podobnosti sekvencí. Termín srovnávací okno, jak je zde použit, označuje segment alespoň 20 následujících pozicí, obvykle 30 až 75, 40 až 50, ve kterých může být sekvence srovnávána s refrenční sekvencí o stejném počtu sousedních pozic poté, co jsou obě sekvence optimálně přiřazeny k sobě.
Optimální přiřazení sekvencí pro srovnání může být provedeno za použití megalign programu v Lasergene suitě of bioinformatics softwaru (DNASTAR lne., Madison, WI), za použití chybových parametrů. Tento program provádí několik přiřazovacích schémat popsaných v následujících odkazech: Dayhoff, M.O. (1978) A model of evolutionary change in proteins - Matrices for detecting distant relationships, v Dayhoff, M.O. (ed.), Atlas of Protein Sequences and Structure, National Biomedical Research Foundation, Washington DC, svazek 5, Suppl. 3, str. 345-358; Hein J., (1990),
Unified Approach to Alignment and Phylogenes str. 624-645, Methods in Enzymology, svazek 183, Academie Press lne., San Diego, CA;
Higgins, D.G. and Sharp, P.M. (1989), CABIOS 5:151-153; Myers,
E.W. and Muller, W., (1988), CABIOS 4:11-17; Robonson, E.D. (1971)
Comb. Theor. 11:105; Santou, N., Nes, M. (1987), Mol. Biol. Evol. 4: 406-425; Sneath, P.H.A. and Sokal, R.R. (1973) Numerical Taxonomy - the Princip!es and Practice of Numerical Taxonomy, Freeman Press, San Francisko, CA; Wilbur, W.J. and Lipman, D.J. (1983), Proč. Nati. Acad. Sci. USA 80: 726-730.
Výhodně je procento identity sekvence určeno srovnáním dvou optimálně přiřazených sekvencí v okénku srovnávajícím alespoň 20 pozic, kde část polynukleotidové nebo polypeptidové sekvence ve srovnávacím okénku může obsahovat adice nebo delece (t-j- mezery) tvořící 20% nebo méně, obvykle 5-15% nebo 10-12%, ve srovnání s referenční sekvencí (která neobsahuje adice nebo delece), pro optimální přiřazení dvou sekvencí. Procento identity se vypočítá určením počtu pozic, ve kterých jsou identické baze pro nukleové kyseliny nebo identické aminokyselinové zbytky v oboou sekvencích, čímž se stanoví počet~odpovídajících pozic, který se vydělí celkovým počtem pozic v referenční sekvenci (t.j. velikostí okna a výsledek se vynásobí 100.
Varianty mohou být také, nebo alternativně, v podstatě homologní k přirozenému genu nebo jeho části nebo komplementární sekvenci. Takové polynukleotidové varianty mohou hybridizovat za středně přísných podmínek na přirozenou DNA sekvenci kódující přirozený prostatický nádorový protein (nebo komplementární sekvence). Vhodnými středně přísnými podmínkám i jsou předpromytí v roztoku 5X SCO, 0,5% SDS, 1,0 mM EDTA (pH 8,0); hybridizace při 50 °C - 65 °C, 5X SCC přes noc; a potom promytí dvakrát při 65 °C po dobu 20 minut každým z 2X, 0,5X a 0,2X SSC obsahujícím 0,1% SDS.
Odborníkům v oboru bude jasné, že v důsledku degenerace genetického kódu existuje mnoho nukleotidových sekvencí, které kódují polypeptid podle předkládaného vynálezu. Některé z těchto polynukleotidů mají minimální homologii s nukleotidovou sekvencí jakéhokoliv přirozeného genu. Nicméně, polynukleotidy, které se liší ve využitelnosti kodonů, spadají do rozsahu předkládaného vynálezu. Dále do rozsahu předkládaného vynálezu spadají alely genů obsahující polynukleotidové sekvence podle předkládaného vynálezu. Alely jsou endogenní geny, které jsou změněny v důsledku jedné nebo více mutací, jako jsou delece, adice a/nebo substituce nukleotidů. Výsledná mRNA a protein mohou, ale nemusí, mít změněnou strukturu a nebo funkci. Alely mohou být identifikovány za použití standardních technik (jako je hybridizace, amplifikace a/nebo srovnání sekvencí v databázi).
Polynukleotidy mohou být připraveny jakoukoliv ze známých technik. Například mohou být polynukleotidy identifikovány - jak je podrobněji popsáno dále - prohledáváním mikrosestavy cDNA na expresi spojenou s nádorem (t.j. expresi, která je alespoň pětkrát vyšší v nádoru prostaty než v normální tkáni, jak se určí zde popsaným testem). Taková vyšetření mohou být provedena za použití Synteni mikrosestavy (PaloAlto, CA) podle návodu výrobce (a v podstatě tak, jak je popsáno ve Schena et al., Proč. Nati. Acad. Sci. USA 93: 10614-10619, 1996; a Heller et al., Proč. Nati. Acad. Sci. USA 94: 2150-2155, 1997). Alternativně mohou být polypeptidy amplifikovány z cDNA připravených z buněk exprimujících proteiny popsané v předkládaném vynálezu, jako jsou buňky karcinomu prostaty. Takové polynukleotidu mohou být amplifikovány polymerasovou řetězovou reakcí (PCR). Pro tento účel mohou být primery specifické pro sekvenci navrženy podle sekvencí zde uvedených a mohou být zakoupeny nebo syntetizovány.
Amplifikovaná část může být použita pro izolaci kompletního ·«·· genu z vhodné knihovny (například cDNA knihovny karcinomu prostaty) za použití známých technik. V takových technikách je knihovna (cDNA nebo genomová) vyšetřována za použití jedné nebo více polynukleotidových sond nebo primerů vhodných pro amplifikaci. Výhodně obsahuje knihovna větší molekuly. Náhodně primed knihovny mohou být také vhodné pro identifikaci 5' regionů genů a regionů před geny. Genomové knihovny se přednostně použijí pro získání intronů a prodloužení 5' sekvencí.
Pro hybridizační techniky může být část sekvence značená (například translací se zářezy nebo značením konce 32P) za použití dobře známých technik. Bakteriální nebo bakteriofágová knihovna je potom vyšetřována hybridizací filtrů obsahujících denaturované bakteriální kolonie (nebo fágové plaky) značenou sondou (viz Sambrook et al., Molecular Cloning: A Laboratory Manual, Cold Spring Harbor Laboratories, Cold Spring Harbor, NY, 1989). Vyberou se hybridizuící kolonie a ty se expandují a DNA se izoluje pro další analýzu. cDNA klony mohou být analyzovány pro stanovení množství další sekvence například PCR za použití primerů pro částečnou sekvenci a primerů z vektoru. Mohou být vytvořeny restrikční mapy a částečné sekvence pro identifikaci jednoho nebo více překrývajících se klonů. Kompletní sekvence může být potom určena za použití standardních technik, které mohou obsahovat tvorbu serie delečních klonů. Výsledné překrývající se sekvence jsou potom sestaveny do jediné kontinuální sekvence. Kompletní cDNA molekula může být připravena ligací vhodných fragmentů, za použití dobře známých technik.
Alternativně, existuje mnoho amplifikačních technik pro získání kompletní kódující sekvence z částečné cDNA sekvence. V takových technikách je amplifikace obvykle provedena PCR. Pro provedení amplifikace může být použit jakýkoliv z mnoha komerčně dostupných kitů. Primery mohou být navrženy například za použití softwaru
• ·* • 0 ♦ ··· ·· ·
Φ· * 9 « · • Φ
• ·· * li «
• · ·
·* ···
dobře známého v oboru. Primery mají výhodně délku 22-30 nukleotidů, obsah GC alespoň 50% a tepelně se váží na cílové sekvence při teplotách okolo 68-72 °C. Amplifikovaný region může být sekvenován způsobem popsaným výše a překrývaj ící se sekvence mohou být sestaveny do kontinuální sekvence.
Jednou takovou amplifikační technikou je inverzní PCR (viz Triglia et al., Nucl. Acids Res. 16: 8186, 1988), která využívá restrikční enzymy pro generování fragmentu ve známém regionu genu. Fragment je potom cirkularizován intramolekulovou ligací a je použit jako templát pro PCR s divergentními primery odvozenými od známého regionu. V alternativním postupu mohou být sekvence sousedící s částečnou sekvencí získány amplifikací s primerem pro spojovací sekvenci a primerem specifickým pro známý region. Amplifikované sekvence jsou obvykle zpracovány ve druhém kole amplifikace se stejným spojovacím primerem a druhým primerem specifickým pro známý region. Varianta této techniky, která využívá dvou primerů, které iniciují prodloužení v opačných směrech ze známé sekvence, je popsána ve WO 96/38591. Jiná taková technika je známá jako rychlá amplifikace cDNA konců neboli RACE. Tato technika obsahuje využití vnitřního primeru a vnějšího primeru, který hybridizuje na polyA region nebo vektorovou sekvenci, pro identifikaci sekvencí, které jsou 5' a 3' od známé sekvence. Mezi další techniky patří zachycovací PCR (Lagerstrom et al., PCR Methods Applic. 1: 111-19, 1991) a procházecí PCR (Parker et al., Nucl. Acids Res. 19: 3055-60, 1991). Pro získání kompletní cDNA sekvence mohou být použity i jiné metody využívající amplifikace.
V některých případech je možné získat kompletní cDNA sekvenci analýzou sekvencí získaných z databáze exprimovaných koncových sekvencí (EST), která je dostupná od GenBank. Vyhledávání překrývajících se EST může být provedeno za použití dobře známých
9 9
9 programů (např. NCBI BLAST vyhledávání) a takové EST mohou být použit pro tvorbu kontinuální kompletní sekvence.
Některé sekvence nukleových kyselin cDNA molekul kódujících alespoň část prostatického nádorového proteinu jsou uvedeny v SEQ ID NO: 1-111, 115-171, 173-175, 177, 179-305, 326, 328, 330, 332-335, 340-375, 381, 382 nebo 384-472. Izolace takových polynukleotidů je popsána dále. Každý z těchto prostatických nádorových proteinů byl nadměrně exprimován v nádorech prostaty.
Polynukleotidové varianty mohou být připraveny jakýmkoliv v oboru známým způsobem, včetně chemické syntézy, například fosforoamiditové syntézy na pevné fázi. Modifikace mohou být do polynukleotidové sekvence vloženy pomocí standardních mutagenních technik, jako je oligonukleotidy řízená místně cílená mutagenese (viz Adelman et al., DNA 2: 183, 1983). Alternativně může být RNA molekula připravena in vitro nebo in vivo transkripcí DNA sekvence kódující prostatický nádorový protein nebo jeho část, pod podmínkou, že DNA je inkorporována do vektoru s vhodným RNA polymerasovým promotorem (jako je T7 nebo SP6). Některé části mohou být použity pro přípravu kódovaného polypeptidu, jak je zde popsáno. Dále, nebo alternativně, část může být podána pacientovi, takže kódovaný polypeptid je tvořen in vivo (například pomocí transfekce buněk prezentujících antigen, jako jsou dendritické buňky, DNA konstruktem kódujícím prostatický nádorový polypeptid, a podáním transfektováných buněk pacientovi).
Část sekvence komplementární ke kódující sekvenci (t.j. protismyslný polynukleotid) může být také použita jako sonda nebo pro modulování exprese genu. cDNA konstrukt, který byl transkribován do protismyslné RNA, může být také vložen do buněk tkáně pro usnadnění produkce protismyslné RNA. Protismyslný polynukleotid může být použit, jak je zde popsáno, pro inhibici exprese nádorového proteinu. Protismyslná technologie může být použita pro kontrolu genové exprese prostřednictvím tvorby trojšroubovice, která narušuje schopnost dvoušroubovíce dostatečně se oddělit pro vazbu na polymerasy, transkripční faktory nebo regulační molekuly (viz Gee et al., v Huber and Carr, Molecular and Immunologic Approaches, Futura Publishing Co. (Mt. Kisco, NY, 1994)). Alternativně, protismyslná molekula může být navržena tak, aby hybridizovala na kontrolní region genu (například promotor, zesilovač transkripce nebo transkripční iniciační místo) a blokovala transkripci genu; nebo blokovala translaci inhibici vazby transkriptu na ribosomy.
Část kódující sekvence nebo komplementární sekvence, může být také navržena jako sonda nebo primer pro detekci exprese genu. Sonda může být značena různými reportérovými skupinami, jako jsou radionuklidy a enzymy, a má výhodně délku alespoň 10 nukleotidů, lépe 20 nukleotidů a nejlépe 30 nukleotidů. Primery, jak bylo uvedeno výše, mají výhodně délku 22-30 nukleotidů.
Jakýkoliv polynukleotid může být dále modifikován pro zvýšení stability in vivo. Mezi možné modifikace patří, například, adice soousedních sekvencí na 5’ a/nebo 3' koncích; použití fosforothioatových nebo 2' O-methylových vazeb místo fosfodiesterasových vazeb ve skeletu; a/nebo použití netradičních baží jako je inosin, quenosin a wybutosin, stejně jako acetylové, methylové, thio- a jiné modifikované formy adeninu, cytidinu, thyminu a uridinu.
Nukleotidové sekvence podle předkládaného vynálezu mohou být navázány na různé jiné nukleotidové sekvence za použití běžných .... technik rekombinantní DNA. Například, polynukleotid může být klonován do jakéhokoliv z mnoha různých klonovacích vektorů, včetně plasmidů, fagemidů, derivátů fágu lambda a kosmidů.
• · · ·
Důležitými vektory jsou expresní vektory, replikační vektory, vektory vytvářející sondy a sekvenační vektory. Obecně vektor obsahuje sekvenci rozpoznávající počátek replikace funkční v alespoň jednoom organismu, běžná rozpoznávací místa pro endonukleasy a jeden nebo více selektovatelných markérů. Další složky závisí na předpokládaném použití a jsou známé odborníkům v oboru.
V některých provedeních mohou být polynukleotidu připraveny tak, že mohou vstupovat do savčích buněk a mohou v nich být exprimovány. Takové přípravky jsou zejména vhodné pro terapeutické účely, jak je popsáno dále. Odborníkům v oboru bude jasné, že existuje mnoho způsobů pro dosažení exprese polynukleotidu v cílové buňce a že může být použita jakákoliv vhodná technika. Například, polynukleotid může být inkorporován do virového vektoru, jako je například adenovirus, adeno-asociovaný virus, retrovirus nebo virus vakcinie nebo jiný pox virus (například ptačí pox virus). Techniky pro inkorporaci DNA do takových vektorů jsou dobře známé v oboru. Retrovirový gen může dále obsahovat gen pro selektovatelný markér (pro identifikaci nebo selekci transdukovaných buněk) a/nebo zaměřovači skupinu, jako je gen kódující ligand pro receptor na specifických cílových buňkách, pro dosažení specificity vektoru. Zaměření může být také provedeno pomocí protilátky, jak je v oboru dobře známo.
Mezi další přípravky pro terapeutické účely patří koloidní disperzní systémy, jako jsou makromolekulové komplexy, nanokapsle, mikrosféry, korálky a lipidové systémy včetně emulsí olej ve vodě, micel, směsných micel a liposomů. Výhodný koloidní systém pro použití jako přepravní vehikulum in vitro a in vivo je liposom (t.j. artificiální membránová vesikula). Příprava a použití takových systémů je dobře známá v oboru.
* · · · φ • · · ·
Prostatické nádorové polypeptidy
V kontextu předkládaného vynálezu mohou polypeptidy obsahovat alespoň imunogenní část prostatického nádorového proteinu nebo jeho varianty, jak je zde popsán. Jak bylo uvedeno výše, prostatický nádorový protein je protein, který je exprimován buňkami nádoru prostaty. Proteiny, které jsou prostatickými nádorovými proteiny, také detekovatelně reagují v imunotestu (jako je ELISA) s antisérem od pacienta s karcinomem prostaty. Polypeptidy podle předkládaného vynálezu mohou mít jakoukoliv délku. Mohou obsahovat další sekvence odvozené od přirozeného proteinu a/nebo heterologní sekvence a takové sekvence mohou mít (ale nemusí) další imunogenní nebo antigenní vlastnosti.
Termín imunogenní část, jak je zde použit, označuje část proteinu, která je rozpoznávána (t.j. specificky vázána) receptorem pro antigen B-lymfocytů a/nebo T-lymfocytů. Taková imunogenní část obvykle obsahuje alespoň 5 aminokyselin, lépe alepoň 10 a nejlépe alespoň 20 aminokyselin prostatického nádorového proteinu nebo jeho varianty. Některé výhodné imunogenní části zahrnují peptidy, ve kterých byla deletována N-koncová vedoucí sekvence a/nebo transmembránová doména. Jiné výhodné imunogenní části mohou obsahovat malé N- a/nebo C-koncové delece (například 1-30 aminokyselin, lépe 5-15 aminokyselin, vzhledem ke zralému proteinu).
Imunogenní část může být obvykle identifikována za použití dobře známých technik, jako jsou techniky uvedené v Paul, Fundamental Immunology, 3. vydání, 243-247 (Raven Press, 1993) a citovaných odkazech. Takové techniky zahrnují skríning polypeptidů na jejich schopnost reagovat s protilátkami specifickými pro antigen, antisérem a/nebo liniemi nebo klony T-lymfocytů. Antisérum nebo protilátky jsou specifické pro antigen, pokud se ·· ·♦ ··♦· • · · · · ·· · · · • · · · · · • · · · · • · · · · • · specificky váží na antigen (t.j. reagují s proteinem v ELISA nebo jiném imunotestu, a nereagují detekovatelně s nepříbuznými proteiny). Takové antisérum a protilátky mohoou být připraveny způsobem, který je zde popsán, a za použití známých technik. Imunogenní část přirozeného prostatického nádorového proteinu je část, která reaguje s takovým antisérem a/nebo T-lymfocyty na úrovni, která není významně nižší než reaktivita kompletního polypeptidu (například v ELISA testu nebo v testu na reaktivitu T-lymfocytů). Takové imunogenní části mohou reagovat v takových testech v úrovni, která je podobná nebo vyšší než reaktivita kompletního polypeptidu. Takové testy mohou být provedeny za použití metod dobře známých v oboru, jak jsou popsány v Harlow and Lané, Antibodies: A Laboratory Manaul, Cold Spring Harbor Laboratory, 1988. Například může být polypeptid imobilizován na pevném nosiči a může být kontaktován s antisérem pacienta pro umožnění vazby protilátek v séru na imobilizovaný polypeptid. Nenavázané sérum může být potom odstraněno a navázané protilátky mohou být detekovány, například, proteinem A značeným 12SI.
Jak bylo uvedeno výše, prostředek může obsahovat variantu přirozeného prostatického nádorového proteinu. Termín varianta polypeptidu, jak je zde použit, označuje polypeptid, který se liší od přirozeného prostatického nádorového proteinu jednou nebo více substitucemi, delecemi, adicemi a/nebo insercemi tak, že imunogenicita polypeptidu není významně snížena. Jinými slovy, schopnost varianty reagovat s antisérem specifickým pro antigen může být zesílena nebo nezměněna, vzhledem k přirozenému proteinu, nebo může být snížena o méně než 50%, lépe 20%, vzhledem k přirozenému proteinu. Takové varianty mohou být obvykle identifikovány modifikací jedné z výše uvedených polypeptidových sekvencí a hodnocením reaktivity modifikovaného polypeptidu s protilátkou nebo antisérem specifickým pro antigen. Výhodnými variantami jsou ty, ve kterých byla odstraněna jedna nebo více • · · · částí, jako například N-koncová vedoucí sekvence nebo transmebránová doména. Jinými výhodnými variantami jsou ty, ve kterých byla odstraněna malá část (například 1-30 aminokyselin, lépe 5-15 aminokyselin), z N- a/nebo C-konce zralého proteinu. Varianty polypeptidů mají výhodně alespoň 70%, lépe alespoň 90% a nejlépe alespoň 95% identitu (stanovenou způsobem uvedeným výše) s identifikovanými polypeptidy.
Výhodně obsahuje varianta konzervativní substituce. Konzervativní substituce je taková, při které je aminokyselina substituována za aminokyselinu podobných vlastností, takže lze předpokládat, že sekundární struktura a hydropatický charakter polypeptidu zůstanou nezměněny. Aminokyselinové substituce mohou být provedeny na základě podobnosti v polaritě, náboji, rozpustnosti, hydrofobnosti, hydrofilnosti a/nebo amfipatickém charakteru zbytku. Například, mezi aminokyseliny s negativním nábojem patří kyselina asparagová a glutamová; aminokyseliny s pozitivním nábojem patří lysin a arginin; a aminokyseliny s nenabitými polárními skupinami mající podobnou hydrofilnost patří leucin, isoleucin a valin; glycin a alanin; asparagin a glutamin; a serin, threonin, fenylalanin a tyrosin. Další skupiny aminokyselin, které mohou představovat konzervativní substituce, jsou: (1) ala, pro, gly, glu, asp, gin, asn, ser, thr; (2) cys, ser, tyr, thr; (3) val, ile, leu, met, ala, phe; (4) lys, arg, his. Varianta může také, nebo alternativně, obsahovat nekonzervativní změny. Ve výhodných provedeních se polypeptidová varianta liší od přirozené sekvence substitucemi, delecemi nebo adicemi pěti nebo méně aminokyselin. Varianty mohou být také, nebo alternativně, modifikovány, například delecí nebo adicí aminokyselin, které mají minimální vliv na imunogenicitu, sekundární strukturu a hydropatický charakter polypeptidu.
Jak bylo uvedeno výše, polypeptidy mohou obsahovat signální • · · · ·· · · · • · · · · ·
(nebo vedoucí) sekvence na N-konci proteinu, které ko-translačně nebo post-translačně řídí transport proteinu. Polypeptid může být také konjugovaný na spojovací nebo jiné sekvence pro usnadnění syntézy, přečištění a identifikace polypeptidu (například poly-His), nebo pro zesílení vazby polypeptidu na pevný nosič. Například může být polypeptid konjugovaný na Fc region imunoglobulinů.
Polypeptidy mohou být připraveny pomocí jakékoliv z mnoha známých technik. Rekombinantní polypeptidy kódované DNA sekvecemi podle předkládaného vynálezu mohou být snadno připraveny z těchto DNA sekvencí za použití jakéhokoliv z mnoha expresních vektorů známých odborníkům v oboru. Exprese může být provedena v jakékoliv vhodné hostitelské buňce, která byla transformována nebo transfektována expresním vektorem obsahujícím DNA molekulu kódující rekombinantní polypeptid. Mezi vhodné hostitelské buňky patří prokaryotické buňky, kvasinky a vyšší eukaryotické buňky. Výhodně jsou použitými hostitelskými buňkami E. coli, kvasinky nebo savčí buněčné linie, jako je COS a CHO. Supernatant z vhodných systémů hostitel/vektor, které secernují rekombinantní protein nebo polypeptid do kultivačního media, může být nejprve koncentrován za použití komerčně dostupného filtru. Po koncentrování se koncentrát aplikuje na vhodnou přečištovací matrici, jako je afinitní matrice nebo iontoměničová pryskyřice. Pro další přečištění rekombinantního polypeptidu se potom použije jeden nebo více stupňů HPLC s reversní fází.
Část nebo varianta mající méně než přibližně 100 aminokyselin, a obyčejně méně než 50 aminokyselin, může být také připravena synteticky, za použití technik dobře známých odborníkům v oboru. Například mohou být takové polypeptidy syntetizovány za použití komerčně dostupné techniky syntézy na pevné fázi, jako je Merrifieldova technika syntézy na pevné fázi, ve které jsou
aminokyseliny sekvenčně navazovány na rostoucí aminokyselinový řetězec. Viz Merrifield, J. Am. Chem. Soc. 85: 2149-2146, 1963.
Vybavení pro automatickou syntézu polypeptidů je komerčně dostupné od dodavatelů jako je Perkin Elmer/Applied BioSystems Division (Foster City, CA), a může být použito podle návodu výrobce.
V některých specifických provedeních může být polypeptid fúsní protein, který obsahuje více polypeptidů podle předkládaného vynálezu, nebo který obsahuje jeden polypeptid podle předkládaného vynálezu a nepříbuznou sekvenci, jako je například známý nádorový protein. Fúsní partner může, například, napomáhat v dodání epitopů pro T-helper lymfocyty rozpoznávaných u člověka, nebo může napomáhat při expresi proteinu (působit jako zesilovač exprese) pro dosažení vyšších hladin než je možno dosáhnout při použití přirozeného rekombinantního proteinu. Některé výhodné partnery pro fúsi zesilují jak imunologické vlastnosti, tak expresi. Jiné partnery pro fúsi mohou být vybrány tak, aby zvyšovaly rozpustnost proteinu nebo aby umožňovaly nasměrování proteinu do vybraného intracelulárního kompartmentu. Ještě dalšími partnery pro fúsi jsou afinitní koncovky, které usnadňují přečištění proteinu.
Fúsní proteiny mohou být obvykle připraveny za použití standardních technik, včetně chemické konjugace. Výhodně je fúsní protein exprimován jako rekombinantní protein, což umožňuje produkci v expresním systému v relativně vyšších hladinách vzhledem k nefúsnímu proteinu. Stručně, DNA sekvence kódující složky polypeptidu mohou být připraveny samostatně a mohou být ligovány do vhodného expresního vektoru. 3' konec DNA sekvence kódující jednu složku polypeptidu je ligován, s nebo bez peptidové spojovací sekvence, na 5' konec DNA sekvence kódující druhou složku polypeptidu tak, že čtecí rámce sekvencí jsou ve fázi. Toto umožňuje translaci do jediného fúsního proteinu, který s zachovává biologickou aktivitu obou složek polypeptidu.
Peptidová spojovací sekvence může být použita pro oddělení první a druhé složky polypeptidů takovou vzdáleností, která umožní správné složení obou složek polypeptidů do jejich sekundárních a terciálních struktur. Takové peptidové spojovací sekvence jsou inkorporovány do fúsního proteinu za použití technik dobře známých v oboru. Vhodné peptidové spojovací sekvence mohou být vybrány podle následujících faktorů: (1) jejich schopnosti přijímat flexibilní rozšířenou konformaci; (2) jejich neschopnosti přijímat sekundární strukturu, která by mohla interagovat s funkčními epitopy na prvním a druhém polypeptidů; a (3) chybění hydrofobních nebo nabitých zbytků, které by mohly interagovat s funkčními epitopy polypeptidů. Výhodné peptidové spojovací sekvence obsahují Gly, Asn a Ser zbytky. Ve spojovacích sekvencích mohou být také použity jiné, téměř neutrální aminokyseliny, jako je Thr a Ala. Aminokyselinové sekvence, které mohou být použity jako spojoací sekvence, jsu popsány v Maratea et al., Gene 40: 39-46, 1985; Murphy et al., Proč. Nati. Acad. Sci. USA 83: 8258-8262, 1986; US patentu č. 4935233 a US patentu č. 4751180. Spojovací sekvence má obvykle délku od 1 do 50 aminokyselin. Spojovací sekvence nejsou nutné, když obsahují první a druhý polypeptid neesenciální N-koncové aminokyselinové regiony, které mohou být použity pro separování funkčních domén a pro zabránění sterické interferenci.
Ligované DNA sekvece se operabilně navážou na vhodné transkripčni nebo translační regulační elementy. Regulační elementy odpovědné za expresi DNA jsou umístěny pouze 5' k DNA sekvenci kódující první polypeptid. Podobně, stop kodony nutné pro ukončení translace a transkripčni terminační signály jsou přítomné pouze 3' k DNA sekvenci kódující druhý polypeptid.
Vynález také poskytuje fúsní proteiny, které obsahují polypeptid podle předkládaného vynálezu společně s nepříbuzným imunogenním proteinem. Výhodně může imunogenní protein vyvolat • ·
recall reakci. Příklady takových proteinů zahrnují proteiny tetanu, tuberkulosy a hepatitidy (viz například Stoute et al., New
England J. Med. 336: 86-91, 1997).
Ve výhodných provedeních je imunologický fúsní partner odvozen od proteinu D, povrchového proteinu gram negativní bakterie Haemophilus infuenzae B (WO 91/18926) . Výhodně obsahuje derivát proteinu D alespoň první třetinu proteinu (například prvních N-koncových 100-110 aminokyselin) a derivát proteinu D může být lipidovaný. V některých výhodných provedeních je na N-konci přítomno prvních 109 zbytků lipoproteinu D, za vzniku polypeptidu s dalším exogenním epitopem pro T-lymfocyty a se zvýšenou úrovní exprese v E. coli (takže působí jako zesilovač exprese). Lipidová koncovka zajišťuje optimální prezentaci antigenu buňkám prezentujícím antigen. Mezi další fúsní partnery patří nestrukturální protein z viru chřipky, NS1 (hemaglutinin). Obvykle se použije 81 N-koncových aminokyselin, ačkoliv mohou být použity různé fragmenty obsahující epitopy pro T-lymfocyty.
V jiném provedení je imunologickým fúsním partnerem protein známý jako LYTA nebo jeho část (výhodně C-koncová část). LYTA je odvozen od Streptococcus pneumoniae, který syntetizuje
N-acetyl-L-alanin amidasu známou jako amidasa LYTA (kódovanou LytA genem; Gene 43: 265-292, 1986). LYTA je autolysin, který specificky degraduje některé vazby v peptidoglykanovém skeletu. C-koncová doména LYTA proteinu je odpovědná za afinitu k cholinu a některým analogům cholinu, jako je DEAE. Tato vlastnost byla využita pro vývoj E. coli C-LYTA exprimujících plasmidů použitelných pro expresi fúsních proteinů. Bylo popsáno přečištění hybridních proteinů obsahujíích C-LYTA fragment na amino-konci (viz Biotechnology 10:795-798, 1992) . Ve výhodném provedneí může být do fúsního proteinu inkorporována opakující se část LYTA. Opakující se část se nachází na C-konci od zbytku 178. Zejména • · ·· ♦ · · • ·
•· ··· • · · •· ·♦ ·· výhodná opakující se část je tvořena zbytky 188-305,
Obecně, polypeptidy (včetně fúsních proteinů) a polynukleotidy podle předkládaného vynálezu jsou izolované. Izolovaný polypeptid nebo polynukleotid je takový, který je odebrán ze svého přirozeného prostředí. Například přirozený protein je izolová, pokud je separován od všech materiálů současně přítomných v přirozeném systému. Výhodně mají takové polypeptidy čistotu 90%, lépe 95% a nejlépe 99%. Polynukleotid je považován za izolovaný tehdy, pokud je, například, klonovaný do vektoru, který není součástí přirozeného prostředí.
Vazebná činidla
Předkládaný vynález dále poskytuje činidla, jako jsou protilátky nebo jejich vazebné fragmenty, které se specificky váží na prostatický nádorový protein. Protilátka nebo její vazebný fragment pro antigen se specificky váže na prostatický nádorový protein tehdy, pokud detekovatelně reaguje (například v ELISA) s prostatickým nádorovým proteinem, a nereaguje detekovatelně s nepříbuznými proteiny za podobných podmínek. Termín vazba, jak je zde použit, označuje nekovalentní asociaci mezi dvěma samostatnými molekulami, takže vzniká komplex. Schopnost vazby může být hodnocena, například, stanovením vazebné konstanty pro tvorbu komplexu, vazebná konstanta je hodnota získaná dělením koncentrace komplexu koncentracemi složek. Obecně, dvě součeniny se váží, podle předkládaného vynálezu, pokud je vazebná konstanta pro tvorbu komplexu vyšší než přibližně 103 1/mol. Vazebná konstanta může být určena za použití metod dobře známých v oboru.
Vazebná činidla mohou dále rozlišovat mezi pacienty s nádorem a bez nádoru, jako je například karcinom prostaty, za použití representativních testů podle předkládaného vynálezu. Jinými • »··♦ « · slovy, protilátky nebo jiná vazebná činidla, která se vážou na prostatický nádorový protein, budou generovat signál ukazující na přítomnost nádoru u alespoň 20% pacientů s onemocněním, a budou generovat negativní signál ukazující na nepřítomnost onemocnění u alespoň 90% jedinců bez nádorového onemocnění. Pro určení toho, zda vazebné činidlo splňuje tyto požadavky, se biologické vzorky (například krev, sérum, moč a/nebo tkáň nádoru) od pacientů s a bez nádoru (jak je určeno běžnými klinickými vyšetřeními) testuje způsobem podle předkládaného vynálezu na přítomnost polypeptidů, které se váží na vazebné činidlo. Je jasné, že by mel být testován statisticky významný počet vzorků s a bez onemocnění. Každé vazebné činidlo by mělo splňovat výše uvedená kriteria; nicméně, odborníkům v oboru bude jasné, že vazebná činidla mohou být použita v kombinaci pro zvýšení sensitivity.
Jakékoliv činidlo, které splňuje výše uvedená kriteria, může být vazebným činidlem. Například může být vazebným činidlem ribosom, s nebo bez peptidové složky, RNA molekula nebo polypeptid. Ve výhodném provedení je vazebným činidlem protilátka nebo její vazebný fragment pro antigen. Protilátky mohou být připraveny jakoukoliv technikou známou v oboru. Viz například Harlow and Lané, Antibodies: A Laboratory Manaul, Cold Spring Harbor Laboratory, 1988. Obecně, protilátky mohou být produkovány technikami buněčných kultur, včetně přípravy monoklonálních protilátek, jak je zde popsána, nebo transfekcí vhodných genů pro protilátky do vhodné bakteriální nebo savčí hostitelské buňky pro produkci rekombinantních protilátek. V jedné technice je imunogen obsahující polypeptid nejprve injikován různým savcům (například myším, krysám, králíkům, ovcím nebo kozám). V tomto kroku může polypeptid podle předkládaného vynálezu sloužit jako imunogen bez další modifikace. Alternativně, zejména pro menší polypeptidy, může být lepší imunitní odpověď vyvolána tehdy, pokud je polypeptid navázán na proteinový nosič, jako je hovězí sérový ·» ··«· albumin nebo přílipkový hemokyanin. Imunogen je injekčně podáván zvířeti, výhodně podle předem určeného protokolu zahrnujícího dosycovací imunizace, a zvířeti je periodicky odebírána krev. Z antiséra mohou být potom přečištěny polyklonální protilátky specifické pro polypeptid, například pomocí afinitní chromatografie využívající polypeptid navázaný na vhodný pevný nosič.
Monoklonální protilátky specifické pro dané antigenní polypeptidy mohou být připraveny, například, technikou podle Kohlera a Milsteina (Eur. J. Immunol. 6: 511-519, 1976) a jejích modifikací. Stručně, tato metoda vyžaduje přípravu imortalizovaných buněčných linií schopných produkce protilátek s požadovanou specificitou (t.j. reaktivitou s požadovaným polypeptidem). Takové buněčné linie mohou být připraveny, například, z buněk sleziny získaných od zvířat imunizovaných způsobem popsaným výše. Buňky sleziny se potom imortalizují, například, fúsí s myelomovými buňkami, výhodně syngenními s imunizovaným zvířetem. Mohou být použity různé fúsní techniky. Například mohou být buňky sleziny a myelomové buňky kombinovány v neionické detergentním činidle na dobu několika minut a potom mohou být umístěny v nízké hustotě na selektivní medium, které podporuje růst hybridních buněk, ale ne myelomových buněk. Výhodnou selekční technikou je HAT (hypoxantin, aminopterin, thymidin) selekce. Po dostatečné době, obvykle po jednom až dvou týdnech, se pozorují kolonie hybridů. Vyberou se jednotlivé kolonie a jejich supernatanty se testují na vazebnou aktivitu pro polypeptid. Výhodné jsou hybridomy s vysokou reaktivitou a specificitou.
Monoklonální protilátky mohou být izolovány ze supernatantů kultivovaných hybridních kolonií. Pro zvýšení výnosu mohou být použity různé techniky, jako je injekce hybridomní buněčné linie
• *· · • • » • · • • · • * · • Φ • 9 • · ···· ♦ « · • ·· * · • · * · • • · • •
»9 9 46·
do peritoneální dutiny vhodného obratlovce, jako je například myš. Monoklonální protilátky mohou být potom získány z ascitu nebo z krve. Kontaminující složky mohou být odstraněny běžnými technikami, jako je chromatografie, gelová filtrace, srážení a extrakce. Při přečištění mohou být také použity polypeptidy podle předkládaného vynálezu, například při afinitní chromatografii.
V některých provedeních může být výhodné použití vazebných fragmentů protilátek pro antigen. Mezi takové fragmenty patří Fab fragmenty, které mohou být připraveny standardními technikami. Stručně, imunoglobuliny mohou být přečištěny z králičího séra afinitní chromatografií na kolonách naplněných korálky s proteinem A (Harlow and Lané, Antibodies: A Laboratory Manaul, Cold Spring Harbor Laboratory, 1988) a mohou být tráveny papainem za zisku Fab a Fc fragmentů. Fab a Fc fragmenty mohou být separovány afinitní chromatografií na kolonách naplněných korálky s proteinem A.
Monoklonální protilátky podle předkládaného vynálezu mohou být navázány na jedno nebo více terapeutických činidel. Vhodnými činidly jsou radionuklidy, induktory diferenciace, léky, toxiny a jejich deriváty. Výhodnými radionuklidy jsou 9OY, X23I, X25I, Χ3ΧΙ, XS6Re, X8SRe, 2x:LAt a 2X2Bi. Výhodnými léky jsou methotrexat a analogy pyrimidinu a purinu. Výhodnými induktory diferenciace jsou estery forbolu a kyseliny máselné. Výhodnými toxiny jsou ricin, abrin, difterický toxin, cholera toxin, geloni, Pseudomonadový exotoxin, Shigella toxin a antivirový protein z líčidla amerického.
Terapeutické činidlo může být navázáno (například kovalentně navázáno) na vhodnou monoklonální protilátku přímo nebo nepřímo (například prostřednictvím spojovací skupiny). Přímá reakce mezi činidlem a protilátkou je možná tehdy, pokud každá složka obsahuje substituenty schopné vzájemné reakce. Například nukleofilní • · • · · · skupina, jako je amino- nebo sulfhydrylová skupina, na jedné složce může reagovat se skupinou obsahující karbonyl, jako je anhydrid nebo halogenid kyseliny, nebo s alkylovou skupinou obsahující snadno odštěpitelnou skupinu (například halogenid) na druhé složce.
Alternativně může být žádoucí navázat terapeutické činidlo a protilátku prostřednictvím spojovací skupiny. Spojovací skupina může oddělovat protilátku od činidla, aby nedošlo k interferenci s vazebnou schopností. Spojovací skupina může také sloužit pro zvýšení chemické reaktivity substituentů na činidle nebo na protilátce, což zvýší účinnost vazebné reakce. Zvýšení chemické reaktivity může také usnadnit použití činidel, nebo funkčních skupin činidel, které by jinak nebylo možné.
Odborníkům v oboru bude jasné, že jako spojovací skupina mohou být použita různá bifunkční nebo polyfunkční činidla, jako homo-, tak heterofunkční činidla (jako jsou činidla popsaná v katalogu Pierce Chemical Co., Rocford, IL). Kopulační reakce může být provedena, například, prostřednictvím amino- skupin, karboxylových skupin, sulfyhdrylových skupin nebo oxidovaných uhlovodíkových zbytků. Existuje mnoho prací popisujících tyto metody, viz například US patent č. 4671958 (Rodwell et al.).
Pokud je terapeutické činidlo účinější, když není navázáno na protilátkovou část imunokonjugátu podle předkládaného vynálezu, může být žádoucí použití spojovací skupiny, která se odštěpí během nebo po internalizaci do buněk. Je popsáno mnoho různých odštěpítelných spojovacích skupin. Mechanismy pro intracelulárni uvolnění činidel z ětchto spojovacích skupin zahrnují štěpení redukcí disulfidové vazby (například US patent č. 4489710 (Spitler)), ozáření fotolabilní vazby (například US patent č. 4625014 (Sentler et al.)), hydrolýzu derivatizovaných vedlejších
řetězců aminokyselin (například US patent č. 4638045 (Kohn et al.)) , hydrolýzu zprosteřdkovanou sérovým komplementem (například
US patent č. 4671958 (Rodwell et al.)), a hydrolýzu katalyzovanou kyselinou (například US patent 45699789, Blattler et al.).
Může být žádoucí navázání více než jednoho činidla na protilátku. V jednom provedení je více molekul činidla navázáno na jednu molekulu protilátky. V jiném provedení může být na protilátku navázán více než jeden typ činidla. Bez ohledu na určitá provedení mohou být imunokonjugáty s více než jedním činidlem připraveny různými způsoby. Například, více než jedno činidlo může být navázáno přímo na molekuly protilátky, nebo může být použita spojovací skupina dodávající více míst pro navázání. Alternativně může být použit nosič.
Nosič může nést činidla různým způsobem, včetně přímé kovalentní vazby nebo prostřednictvím spojovací skupiny. Mezi vhodné nosiče patří albuminy (například US patent 4507234, Kato et al.), peptidy a polysacharidy jako je aminodextran (například US patent č. 4699784, Shin et al.). Nosič může také přenášet činidlo pomocí nekovalentní vazby nebo enkapsulace, jak je tomu například v liposomech (například US patenty č. 4429008 a 4873088). Nosiče specifické pro radionuklidy zahrnují radiohalogenované malé molekuly a chelatační sloučeniny. Například US patent č. 4735792 popisuje reprezentativní radiohalogenované malé molekuly a jejich syntézu. Chelát radionuklidu může být tvořen z chelatačních sloučenin, mezi které patří ty sloučeniny, které obsahují atomy dusíku a síry jako donory pro vazbu kovu nebo oxidu kovu, radionuklidu. Například US patent č. 4673562 (Davison et al.) popisuje representativní chelatační sloučeniny a jejich syntézu.
Pro protilátky a imunokonjugáty mohou být použity různé způsoby podání. Obvykle je podání intravenosní, intramuskulární, podkožní
nebo do lůžka resekovaného nádoru. Je jasné, že přesná dávka protilátky/imunokonjugátu velmi závisí na typu použité protilátky, hustotě antigenu na nádoru a na klírens protilátky.
T lymfocyty
Imunoterepeutické prostředky mohou také, nebo alternativně, obsahovat T lymfocyty specifické pro prostatický nádorový protein. Takové buňky mohou být připraveny in vitro nebo ex vivo, za použití standardních technik. Například mohou být T lymfocyty izolovány z kostní dřeně, periferní krve nebo frakce kostní dřeně nebo periferní krve od pacienta, za použití komerčně dostupných separačních systémů, jako je CEPRATE™ dostupný od CellPro lne., Bothell WA (viz též US patent č. 5240856; US patent č. 5215926; WO 89/06280; WO 91Ú16116; a WO 92/07243). Alternativně mohou být T lymfocyty získány od příbuzných nebo nepříbuzných lidí, savců jiných než člověk, z buněčných kultur nebo linií.
T lymfocyty mohou být stimulovány prostatickým nádorovým polypeptidem, polynukleotidem kódujícím prostatický nádorový polypeptid a/nebo buňkami prezentujícími antigen, které exprimují takový polypeptid. Taková stimulace je provedena za podmínek a po dobu dostatečnou pro generování T lymfocytů, které jsou specifické pro polypeptid. Výhodně je prostatický nádorový polypeptid nebo polynukleotid prezentován v transportním vehikulu, jako je mikrosféra, pro usnadnění tvorby specifických T lymfocytů.
T lymfocyty jsou považovány za specifické pro prostatický nádorový polypeptid tehdy, pokud usmrcují cílové buňky potažené polypeptidem nebo exprimující gen kódující polypeptid. Specificita T lymfocytů může být hodnocena za použití různých standardních technik. Například, když v testu uvolňování chrómu nebo proliferačním testu ukazuje stimulační index více než dvojnásobné « ·φ ·♦ ···· · · ···· ·· · · · ·
zvýšení v lýze a/nebo proliferaci, ve srovnání s negativními kontrolami, tak lze hovořit o specificitě T lymfocytu.. Takové testy mohou být provedeny, například, způsobem, který popisuje Chen et al., Cancer Research 54: 1065-1070, 1994. Alternativně může být detekce proliferace T lymfocytů provedena různými známými technikami. Například může být proliferace T lymfocytů detekována měřením zvýšené rychlosti syntézy DNA (například pulsním značením kultur T lymfocytů tritiovaným thymidinem a měřením množství tritiovaného thymidinu inkorporovaného do DNA). Kontakt s prostatickým nádorovým polypeptidem (100 ng/ml - 100 ug/ml, lépe 200 ng/ml -25 ug/ml) po dobu 3-7 dnů by měl vést k alespoň dvojnásobnému zvýšení proliferace T lymfocytů. Kontakt po dobu 2-3 hodin by měl vést k aktivaci T lymfocytů, která může být měřena pomocí standardních cytokinových testů, ve kterých dvojnásobné zvýšení uvolňování cytokinů (například TNF nebo IFN-gamma) naznačuje aktivaci T lymfocytů (viz Coligan et al., Current Protocols in Immunology, svazek 1, Wiley Interscience (Greene 1998)) . T lymfocyty, které byly aktivovány v odpovědi na prostatický nádorový polypeptid, polynukleotid nebo APC exprimující polypeptid, mohou být CD4* a/nebo CD8·. T lymfocyty specifické pro prostatický nádorový protein mohou být expandovány za použití standardních technik. Ve výhodných provedeních jsou T lymfocyty získány od pacienta nebo od příbuzného či nepříbuzného dárce a jsou podány pacientovi po stimulaci a expansi.
Pro terapeutické účely mohou být CD4* nebo CD8- T lymfocyty, které proliferují v reakci na prostatický nádorový polypeptid, polynukleotid nebo APC, namnoženy in vitro nebo in vivo. Proliferace takových T lymfocytů může být provedena různými způsoby. Například mohou být T lymfocyty opakovaně vystaveny působení prostatickému nádorovému polypeptidu nebo krátkému peptidu odpovídajícímu imunogenní části takového polypeptidu, s nebo bez přidání růstových faktorů pro T lymfocyty, jako je
• • · 4 • · 4 4*4 • · 4 • 9 · 4 4 4 4
4 4 4 • · 4 4 4 4
• · · · *4 · 4 · «4
interleukin 2, a/nebo působení stimulačních buněk, které syntetizují prostatický nádorový polypeptid. Alternativně může být jedna nebo více T lymfocytů, které proliferují v reakci na přítomnost prostatického nádorového proteinu, namnoženy klonováním. Způsoby pro klonování jsou dobře známé v oboru a patří mezi ně limitní ředění.
Farmaceutické prostředky a vakcíny
V některých aspektech mohou být polypeptidy, polynukleotidy, T lymfocyty a/nebo vazebná činidla podle předkládaného vynálezu inkorporována do farmaceutických prostředků nebo imunogenních prostředků (t.j. vakcín). Farmaceutické prostředky obsahují jednu nebo více takových sloučenin a fyziologicky přijatelný nosič. Vakcíny mohou obsahovat jednu nebo více takových sloučenin a činidlo nespecificky zesilující imunitní reakci. Činidlem nespecificky zesilujícím imunitní reakci může být jakákoliv substance, která zesiluje imunitní odpověď na exogenní antigen. Příkladem činidel nespecificky zesilujících imunitní odpověď jsou adjuvans, biodegradovatelné mikrosféry (například polylaktid galaktid) a liposomy (do kterých je sloučenina inkorporována; viz například Fullertion, US patent č. 4235877). Příprava vakcín je obecně popsána, například, v M.F. Powell and M.J. Newman, eds., Vaccine Design (the subunit and adjuvant approach), Plenům Press (NY, 1995) . Farmaceutické prostředky a vakcíny podle předkládaného vynálezu mohou obsahovat také jiné sloučeniny, které mohou být biologicky aktivní nebo inaktivní. Například, v prostředku nebo ve vakcíně může být přítomno jedna nebo více imunogenních částí jiných nádorových antigenů, buď ve formě fúsního polypeptidu nebo ve formě samostatných sloučenin.
Farmaceutické prostředky nebo vakcíny mohou obsahovat DNA kódující jeden nebo více polypeptidů popsaných výše, takže je ··· ·· ·· · takový polypeptid generován in šitu. Jak bylo uvedeno výše, DNA může být přítomna v jakémkoliv transportním systému známém v oboru, včetně nukleokyselinových expresních systémů, bakteriálních a virových expresních systémů. Mnoho technik pro přenos genů je dobře známo v oboru, jako jsou techniky popsané v Rolland, Crit. Rev. Therap. Drug Carrier Systems 15: 143-198, 1998, a odkazy zde citované. Vhodné nukleokyselinové expresní systémy obsahují DNA sekvence nutné pro expresi u pacienta (jako je vhodný promotor a terminační signál). Bakteriální transportní systémy zahrnují podání bakterie (jako je Bacillus Calmette-Guerrin), která exprimuje imunogenní část polypeptidu na povrchu buněk nebo jí secernuje. Ve výhodných provedeních může být DNA vložena pomocí virového expresního systému (například viru vakcinie nebo jiného pox viru, retroviru nebo adenoviru), který může využívat nepatogenní (defektní) viry schopné replikace. Vhodné systémy jsou popsány, například, ve Fisher-Hoch et al., Proč. Nati. Acad. Sci. USA 86: 317-321, 1989; Flexner et al., Ann. N.Y. Acad. Sci. 560: 86-103, 1989; Flexner et al., vaccine 8: 17-21, 1990; US patent Č.4603112, 4769330 a 5017487; WO 89/01973; US patent č.4777127; GB 2200651; EP 0345242; WO 91/02805; Berkner, Biotechniques 6: 616-627, 1988; Rosenfeld et al., Science 252: 431-434, 1991; Kolls
et al., Proč. Nati. Acad . Sci . USA 91: 215-219, 1994; Kas-Eisler
et al., Proč. Nati. Acad . Sci . USA 90: 11498-11502, 1993 ; Guzman
et al. , Circulation 88: : 2838- 2848, 1993 ; a Guzman et al., Cir.
Res. 73: 1202-1207, 1993. Techniky pro inkorporování DNA do atkových expresních systémů jsou dobře známé v oboru. DNA může být také holá, jak je popsáno například v Ulmer et al., Science 259: 1745-1749, 1993 a Cohen, Science 259: 1691-1692, 1993. Vychytávání holé DNA může být zvýšeno potažením DNA na biodegradovatelné korálky, které jsou účinně transportovány do buněk.
Ačkoliv může být ve farmaceutických prostředcích podle předkládaného vynálezu použit jakýkoliv nosič známý v oboru,
999999
9 · · 9 ¥ »9 · 9 9 99
99 99· závisí typ nosiče na způsobu podání. Prostředky podle předkládaného vynálezu mohou připraveny pro jakýkoliv vhodný způsob podání, včetně, například, lokálního, orálního, nasálního, intravenosního, intrakraniálního, intraperitoneálního, podkožního nebo intramuskulárního podání. Pro parenterální podání, jako je podkožní injekce, obsahuje nosič obvykle vodu, salinický roztok, alkohol, tuk, vosk nebo pufr. Pro orální podání může být použit jakýkoliv z výše uvedených nosičů nebo pevný nosič, jako je manitol, laktosa, škrob, stearan hořečna tý, sacharin sodný, talek, celulosa, glukosa, sacharosa a uhličitan hořečnatý. Jako nosiče pro farmaceutické prostředky podle předkládaného vynálezu mohou být také použity biodegradovatelné mikrosféry (například polylaktat-polyglykolat). Vhodné biodegradovatelné mokrosféry jsou popsány, například, v US patentech č. 4897268 a 5075109.
prostředky mohou také obsahovat pufry (například pufrované salinické roztoky nebo fosfátem pufrované roztoky), uhlovodany (například glukosu, mannosu, nebo dextrany), manitol, proteiny, polypeptidy nebo antioxidační činidla, chelatační
Takové neutrální salinické sacharosu aminokyseliny jako je glycin, činidla jako je EDTA nebo glutathion, adjuvans (například hydroxid hlinitý) a/nebo konzervační činidla. Alternativně může být prostředek podle předkládaného vynálezu připraven jako lyofilizat. Sloučeniny mohou být také obaleny v liposomech, za použití dobře známých technik.
Ve vakcínách podle předkládaného vynálezu může být použito jakékoliv známé činidlo nespecificky zesilující imunitní odpověď. Například může být použito adjuvans. Většina adjuvans obsahuje substance navržené tak, aby chránily antigen před rychlým katabolismem, jak to dělá hydroxid hlinitý nebo minerální olej, a aby stimulovaly imunitní odpověď, jako například lipid A, proteiny odvozené od Bordetella pertussis nebo Mycobacterium tuberculosis.
Vhodná adjuvans jsou komerčně dostupná jako, například, Freundovo nekompletní adjuvans a kompletní adjuvans (Difco Laboratories, Detroit, MI); Měrek Adjuvant 65 (Měrek and Company, lne., Rahway, NJ); soli hliníku, jako je gel hydroxidu hlinitého (kamenec) nebo fosfáty hliníku; soli vápníku, železa nebo zinku; nerozpustné suspenze acylovaného tyrosinu; acylované sacharidy; kationicky nebo anionicky derivátizované polysacharidy; polyfosfazeny; biodegradovatelné mikrosféry; monofosforyllipid A a quil A. Jako adjuvans mohou být také použity cytokiny, jako je GM-CSF nebo interleukin 2, 7 nebo 12.
Ve vakcínách podle předkládaného vynálezu je složení adjuvans obvykle vybráno tak, aby indukovalo imunitní odpověď převážně Thl typu. Vysoké koncentrace cytokinů Thl typu (například IFN-gamma, IL-2 a IL-12) upřenostňují indukci buněčné imunitní reakce na podaný antigen. Naopak, vysoké koncentrace cytokinů Th2 typu (například IL-4, IL-5, IL-6, IL-10 a TNF-beta) přednostně vyvolávají protilátkovou imunitní odpověď. Po odání vakcíny podle předkládaného vynálezu je u pacienta indukována imunitní odpověď zahrnující odpověď Thl i Th2 typu, ve výhodných provedeních, ve kterých je reakce převážně Thl typu, se hladiny cytokinů Thl typu zvyšují více než hladiny cytokinů Th2 typu. Koncentrace těchto cytokinů mohou být snadno hodnoceny za použití standardních testů. Pro přehled cytokinových rodin viz Mosmann and Coffman, Ann. Rev. Immunol. 7: 145-173, 1989.
Mezi výhodná adjuvans pro vyvolání imunitní reakce převážně Thl typu patří, například, kombinace monofosforyllipidu A, výhodně
3-de-O-acylovaného monofosforyllipidu A (3D-MPL) se solí hliníku. MPL adjuvans jsou dostupná od Ribi ImmunoChem Research lne. (Hamilton, MT; viz US patenty Č. 4436727; 4877611; 4866034; a 4912094) . Oligonukleotidy obsahující CpG (ve kterých je CpG dinukleotid nemethylováný) také indukují přednostně Thl odpověď.
Takové oligonukleotidy jsou dobře známé a jsou popsané, například, ve WO 96/02555. Jiným výhodným adjuvans je saponin, výhodně QS21, který může být použit samostatně nebo v kombinaci s jinými adjuvans. Například, systém s vyšší účinností se skládá z kombinace monofosforyllipidu A a derivátu saponinu, jako je kombinace QS21 a 3D-MPL, která je popsána ve WO 94/00153, nebo méně reaktogenní prostředek, ve kterém je QS21 ztlumen cholesterolem, jak je popsáno ve WO 96/33739. Mezi další výhodné prostředky patří emulse olej ve vodě a tokoferol. Zvláště účinný adjuvantní přípravek obsahující QS21, 3D-MPL a tokoferol v emulsi olej ve vodě je popsán ve WO 95/17210. jakákoliv vakcína podle předkládaného vynálezu může být připravena za použití dobře známých technik, jejichž výsledkem je kombinace antigenu, činidla zesilujícího imunitní odpověď a vhodného nosiče nebo přísady.
Prostředky podle předkládaného vynálezu mohou být podány jako součást prostředku se zpomaleným uvolňováním (t.j. prostředku jako je kapsle nebo houba, která zpomaluje uvolňování sloučeniny po podání). Takové prostředky mohou být obvykle připraveny za použití dobře známých technik a mohou být podány například orálně, rektálně nebo podkožní implantací nebo implantací do cílového místa. Prostředky se zpomaleným uvolňováním mohou obsahovat polypeptid, polynukleotid nebo protilátku v nosičové matrici a/nebo v zásobníku obaleném membránou kontrolující rychlost uvolňování. Nosič epro použití v takových prostředcích jsou biokompatibilní a mohou být také biodegradovatelné; výhodně umožňuje takový prostředek dosažení relativně konstantní rychlosti uvolňování aktivní složky. Množství aktivní složky obsažené v prostředku se zpomaleným uvolňováním závisí na místě implantace, rychlosti a předpokládané době uvolňování a na charakteru léčeného stavu nebo stavu, kterému má být zabráněno.
Ve farmaceutických prostředcích a vakcínách podle předkládaného vynálezu může být použito jakékoliv z mnoha transportních vehikul vhodných pro usnadnění produkce antigen-specifické imunitní odpovědi cílené k nádorovým buňkám. Mezi transportní vehikula patří buňky prezentující antigen (APC), jako jsou dendritické buňky, makrofágy, B-lymfocyty, monocyty a jiné buňky, které mohou být upraveny tak, aby byly účinnými APC. Takové buňky mohou být, ale nemusí, geneticky modifikovány pro zvýšení schopnosti pro prezentaci antigenu, pro zlepšení aktivace a/nebo udržování odpovědi T-lymfocytů, aby měly protinádorový účinek sami o sobě a/nebo aby byly imunologicky kompatibilní s příjemcem (t.j. aby měly odpovídající HLA haplotyp). ABC mohou být izolovány z různých biologických kapalin a orgánů, včetně nádorů a perinádorové tkáně, a mohou být autologiní, allogenní, syngenní nebo xenogenní.
Některá provedení předkládaného vynálezu využívají dendritických buněk nebo jejich progenitorů jako buněk prezentujících antigen. Dendritické buňky jsou vysoce účinné APC (Bancherau and Steinman, Nátuře 392: 245-251, 1998) a bylo porkázáno, že jsou účinné jako fyziologické adjuvans pro vyvolání profylaktické nebo terapeutické protinádorové imunity (viz Timmerman and Levý, Ann. Rev. Med. 50: 507-529, 1999). Obecně, dendritické buňky mohou být identifikovány podle svého atypického tvaru (hvězdicového in šitu, se zřetelnými cytoplasmatickými výběžky (dendrity) viditelnými in vitro) a podle chybění diferenciačních markérů B lymfocytů (CD19 a CD20), T-lymfocytů (CD3), monocytů (CD14) a přirozených zabíječů (CD56), jak se určí pomocí standardních testů. Dendritické buňky mohou být upraveny tak, aby exprimovaly specifické buněčné povrchové receptory nebo ligandy, které se obvykle nenacházejí na dendritických buňkách in vivo nebo ex vivo, a takové upravené dendritické buňky spadají do rozsahu předkládaného vynálezu. Alternativně k dendritickým buňkám mohou být ve vakcínách použity sekreční vesikuly dendritických • · · ······ ·« 0 ···· ·« · · · · « ··· ··· · · · ······· ··· · • · · · ♦ · · · · buněk naplněné antigenem (viz Zitvogel et al., Nátuře Med. 4: 594-600, 1998).
Dendritické buňky a jejich progenitory mohou být získány z periferní krve, kostní dřeně, buněk infiltrujících nádor, buněk infiltrujících tkáně okolo nádoru, lymfatických uzlin, sleziny, kůže, pupečníkové krve nebo z jakékoliv jiné vhodné tkáně nebo tekutiny, například mohou být dendritické buňky diferencovány ex vivo přidáním kombinace cytokinů, jako je GM-CSF, IL-4, IL-13 a/nebo TNFalfa do kultury monocytů získaných z periferní krve. Alternativně mohou být CD34 pozitivní buňky získané z periferní krve, pupečníkové krve nebo kostní dřeně diferencovány na dendritické buňky přidáním kombinace GM-CSF, IL-3, TNFalfa, CD40 ligandu, LPS, flt3 a/nebo jiných sloučenin indukujících zrání a proliferaci dendritických buněk, do kultivačního media.
Dendritické buňky jsou běžně děleny na nezralé a zralé buňky, což umožňuje rozlišení mezi dvěma dobře charakterizovanými fenotypy. Nicméně, toto rozdělení nevylučuje všechna možná mezistadia diferenciace. Nezralé dendritické buňky jsou charakterizovány jako APC s vysokou kapacitou pro vychytávání a zpracování antigenu, což koreluje s vysokou expresí Fcgamma receptorů, mannosového receptorů a DEC-205 markéru. Zralý fenotyp je typicky charakterizován nízkou expresí těchto markérů, ale vysokou expresí buněčných povrchových molekul odpovědných za aktivaci T-lymfocytů, jako jsou molekuly MHC třídy I a II, adhesní molekuly (například CD54 a CDU) a ko-stimulační molekuly (například CD40, CD80 a CD86).
APC mohou být obvykle transfektovány polynukleotidem kódujícím prostatický nádorový protein (nebo jeho část nebo variantu) tak, že prostatický nádorový polypeptid, nebo jeho imunogenní část, je exprimován na povrchu buněk. Takové transfekce může být provedena ·· ·· ···· ·· • · · · · ··· ·· · · · · · ex vivo a prostředky nebo vakcíny obsahující takové transfektováné buňky mohou být potom použity pro terapeutické účely, jak je zde popsáno. Alternativně může být transportní vehikulum pro gen vyhledávající dendritické buňky nebo jiné buňky prezentující antigen podáno pacientovi, což vede k transfekci in vivo. Transfekce dendritických buněk in vivo a ex vivo může být provedena, například, za použití metod známých v oboru, jako jsou metody popsané ve WO 97/24447, nebo pomocí genového děla, jak je popsáno v mahvi et al., Immunology and Cell Biology 75: 456-460, 1997. Vložení antigenu do dendritických buněk může být provedeno inkubací dendritických buněk nebo progenitořových buněk s prostatickým nádorovým polypeptidem, DNA (holou nebo v plasmidovém vektoru) nebo RNA; a nebo s rekombinantními bakteriemi či viry exprimujícími antigen (například virem vakcinie, virem drůbežích neštovic, adenovirem nebo lentivirem). Před vložením může být polypeptid kovalentně konjugován na imunologického partnera, který napomáhá T-lymfocytům (například nosič). Alternativně může být dendritická buňka pulsována nekonjugovaným imunologickým partnerem, samostatně nebo za přítomnosti polypeptidů.
Protinádorová terapie
V dalším aspektu vynálezu mohou být prostředky podle předkládaného vynálezu použity pro imunoterapii nádorů, jako je karcinom prostaty. V takových způsobech jsou farmaceutické prostředky a vakcíny obvykle podány pacientovi. Termín pacient, jak je zde použit, označuje teplokrevného živočicha, obvykle člověka. Pacient může a nemusí být postižen nádorem. Tak mohou být farmaceutické prostředky a vakcíny použity pro prevenci vzniku nádoru nebo pro léčbu pacienta postiženého nádorem. Nádor může být dignostikován za použití kriterií přijímaných v oboru, včetně potvrzení přítomnosti maligního nádoru. Farmaceutické prostředky a vakcíny mohou být podány před chirurgickým odstraněním primárních
ΦΦΦ φ φ · · · φφφφ· · · φ ·· nádorů a/nebo před léčbou jako je radioterapie nebo chemoterapie.
V některých provedeních může být imunoterapií aktivní imunoterapie, při které léčba spočívá v in vivo stimulaci imunitního systému pacienta pro reakci proti nádoru pomocí podání činidel modifikujících imunitní odpověď (jako jsou polypeptidy a polynukleotidy podle předkládaného vynálezu).
V jiných provedeních může být imunoterapií pasivní imunoterapie, která spočívá v podání činidel s určenou reaktivitou proti nádoru (jako jsouefektorové buňky nebo protilátky), která mohou přímo nebo nepřímo zprostředkovat protinádorový účinek a nezávisí nutně na intaktním imunitním systému pacienta. Příklady efektorových buněk jsou T-lymfocyty, jak byly popsány výše, y (jako jsou CD8* cytotoxické T-lymfocyty a CD4 T- tumor infiltrující lymfocyty), zabíječi (jako jsou přirození zabíječi a lymfokiny aktivovaní zabíječi), B-lymfocyty a buňky prezentující antigen (jako jsou dendritické buňky a makrofágy) exprimující polypeptid podle předkládaného vynálezu. Receptory T-lymfocytů a protilátkové receptory specifické pro polypeptidy podle předkládaného vynálezu mohou být klonovány, exprimovány a přeneseny do jiných vektorů nebo efektorových buněk pro adoptivní imunoterapií. Polypeptidy podle předkládaného vynálezu mohoou být také použity pro přípravu protilátek nebo anti-idiotypových protilátek (jak jsou popsány výše a v US patentu č. 4918164) pro pasivní imunoterapií.
Efektorové buňky mohou být získány v dostatečném množství pro adoptivní imunoterapií kultivací in vitro, jak je zde popsána. Kultivační podmínky pro namnožení jediné efektorové buňky specifické pro antigen na počet několika bilionů za zachování rozpoznávání antigenu in vivo jsou dobře známé v oboru. Takové kultivační podmínky in vitro obvykle využívají intermitentní • ·« ·♦ ···· ·· • · · · ·· · ··· • · · ··· ·· • · ··· ·· « · · • · · · · · · · stimulace antigenem, často za přítomnosti cytokinů (jako je IL-12) a nedělících se pomocných buněk. Jak bylo uvedeno výše, imunoreaktivní polypeptidy podle předkládaného vynálezu mohou být použity pro rychlé namnožení kultur T-lymfocytů specifických pro antigen pro přípravu dostatečného počtu buněk pro imunoterapii. Konkrétně, buňky prezentující antigen, jako jsou dendritické buňky, makrofágy, monocyty, fibroblasty nebo B-lymfocyty, mohou být pulsovány imunoreaktivními polypeptidy nebo jedním nebo více polynukleotidy za použití standardních technik dobře známých v oboru. Například mohou být buňky prezentující antigen transfektovány polynukleotidem obsahujícím promotor vhodný pro zvýšení exprese v rekombinantním viru nebo j iném expresním systému. Kultivované efektorové buňky vhodné pro terapii musí dobře růst a musí se dobře distribuovat a musí dlouho přežívat in vivo. Studie ukázaly, že kultivované efektorové buňky mohou být indukovány k růstu in vivo a mohou dlouhodobě přežívat ve významném počtu při opakované stimulaci antigenem společně s IL-2 (viz například Cheever et al., Immunological Reviews, 157: 177, 1997) .
Alternativně může být vektor exprimující polypeptid podle předkládaného vynálezu vložen do buňky prezentující antigen odebrané od pacienta a ta může být klonálně propagována ex vivo pro zpětnou transplantaci pacientovi. Transfektováné buňky mohou být zpětně podány pacientovi jakýmkoliv způsobem známým v oboru, výhodně ve sterilní formě intravenosní, intrakavitární, intraperitoneální nebo intranádorovou injekcí.
Způsoby a frekvence podání terapeutických prostředků podle předkládaného vynálezu, stejně jako dávkování, se velmi liší mezi jedinci a může být stanoveno běžnými způsoby. Obecně, farmaceutické prostředky a vakcíny mohou být podány injekcí (například intramuskulární, intradermální, intravenosní nebo • · · · · ··· ·· ·· · ·· ··· podkožní), intranasálně (například aspirací) nebo orálně. Výhodně je podáno během 52-týdenního období 1 až 10 dávek. Výhodně je podáno 6 dávek, v intervalu 1 měsíc, a potom mohou být periodicky aplikovány dosycovací vakcinace. Pro jiné pacienty může být vhodný alternativní protokol. Vhodná dávka je takové množství sloučeniny, které - je-li podáno způsobem popsaným výše - může navodit protinádorovou imunitní reakci, která je vyšší alespoň o 10-50% než základní (t.j. neléčená) reakce. Takové odpověď může být sledována měřením protinádorových protilátek u pacienta nebo měřením počtu cytolytických efektorových buněk vzniklých v důsledku vakcinace, které mohou usmrcovat nádorové buňky pacienta in vitro. Takové vakcíny by měly vyvolat imunitní odpověď, která vede ke zlepšení klinického stavu vakcinovaných pacientů (t.j. častější remise, kompletní nebo parciální, nebo delší interval bez onemocnění) ve srovnání s nevakcinovanými pacienty. Obecně, pro farmaceutické prostředky a vakcíny obsahující jeden nebo více polypeptidů je množství každého polypeptidu v rozmezí od přibližně 100 ug do přibližně 5 mg na kg tělesné hmotnosti pacienta. Vhodné velikosti dávky se liší podle velikosti pacienta, ale obvykle jsou v rozmezí od 0,1 ml do 5 ml.
Obecně, vhodná dávka a režim podávání dodává aktivní sloučenin v množství dostatečném pro dosažení terapeutického a/nebo profylaktckého účelu. Taková odpověď může být sledována podle klinického stavu (například podle častějších remisí, kompletních nebo parciálních, nebo delších intervalů bez onemocnění) u léčených pacientů ve srovnání s neléčenými pacienty. Zvýšení preexistující imunitní odpovědi na prostatický nádorový protein obvykle koreluje se zlepšením klinického stavu. Takové imunitní odpovědi mohou být hodnoceny pomocí stadardních testů na proliferaci, cytotoxicitu nebo cytokiny, které mohou být provedeny za použití vzorků od pacientů získaných před a po léčbě.
Způsoby pro detekci nádorů
Obecně, nádor může být detekován u pacienta podle přítomnosti jednoho nebo více prostatických nádorových proteinů a/nebo polynukleotidů kódujících takové proteiny v biologickém vzorku (jako je krev, sérum, moč a/nebo biopsie z nádoru) od pacienta. Jinými slovy, takové proteiny mohou být použity jako markéry ukazující na přítomnost nebo nepřítomnost nádoru, jako je karcinom prostaty. Kromě toho mohou být takové proteiny použitelné pro detekci jiných nádorů, vazebná činidla podle předklládaného vynálezu umožňují detekci koncentrace antigenů, které se váží na činidlo v biologickém vzorku. Polynukleotidové primery a sondy mohou být použity pro detekci koncentrace mRNA kódujícínádorový protein, což také ukazuje na přítomnost nebo nepřítomnost nádoru. Obecně, prostatická nádorová sekvence by měla být přítomna v koncentraci, která je alespoň třikrát vyšší v nádoru než v okolní tkáni.
V oboru existuje mnoho testů využívajících vazebné činidlo pro detekci polypeptidových markérů ve vzorku. Viz Harlow and Lané, Antibodies: A Laboratory Manaul, Cold Spring Harbor Laboratory, 1988. Obecně, přítomnost nebo nepřítomnost nádoru u pacienta může být detekována (a) kontaktováním biologického vzorku od pacienta s vazebným činidlem; (b) detekováním množství polypeptidu, který se váže ve vzorku na vazebné činidlo; a (c) srovnání koncentrace polypeptidu s předem určenou hraniční hodnotou.
Ve výhodném provedení test zahrnuje použití vazebného činidla imobilizovaného na pevném nosiči pro navázání a odstranění polypeptidu ze vzorku. Navázaný polypeptid může být potom detekován pomocí detekčního činidla, které obsahuje reportérovou skupinu a které se specificky váže na komplex vazebného činidla/polypeptidu. Takovými detekčními činidly jsou, například, • 4 • 4 4444 vazebná činidla, která se specificky váží na polypeptid , nebo protilátky nebo jiná činidla, která se spefcificky váží na vazebné činidlo, jako jsou antiimunoglobulin, protein G, protein A nebo lektin. Alternativně může být použit kompetitivní test, ve kterém je polypeptid označen reportérovou skupinou a nechá se vázat na imobilizované vazebné činidlo po inkubaci vazebného činidla se vzorkem. Rozsah, ve kterém vzorek inhibuje vazbu značeného polypeptidů na vazebné činidlo, ukazuje reaktivitu vzorku s imobilizovaným vazebným činidlem. Mezi polypeptidy vhodné pro použití v takových testech patří prostatické nádorové proteiny a jejich části, na které se vazebná činidla váží, jak byly popsány výše.
Pevným nosičem může být jakýkoliv materiál známý v oboru, na který může být navázán nádorový protein. Pevným nosičem může být například testovací jamka mikrotitrační plotny nebo nitrocelulosová nebo jiná vhodná membrána. Alternativně může být nosičem korálek nebo disk, ze skla, skelného vlákna, latexu nebo plasu, jako je polystyren nebo polyvinylchlorid. Nosičem může být také magnetická částice nebo sensor optického vlákna, jak je popsáno například v US patentu č. 5359681. Vazebné činidlo může být imobilizováno na pevném nosiči za použití technik známých v oboru, které jsou popsané v patentové a odborné literatuře. V předkládaném vynálezu označuje termín imobilizace jak nekovalentní asociaci, jako je adsorpce, tak kovalentní navázání (které může být prostřednictvím přímé vazby mezi činidlem a funkčními skupinami na nosiči nebo prostřednictvím zesilovacího činidla). Výhodná je imobilizace adsorpcí na jamku mikrotitrační plotny nebo na membránu. V takových případech může být adsorpce provedena kontakováním vazebného činidla, ve vhodném pufru, s pevným nosičem, po dostatečně dlouhou dobu. Doba kontaktu se liší podle teploty, ale obvykle je mezi 1 hodinou a 1 dnem. Obvykle je kontaktování jamky plastové mikrotitrační plotny (polystyrénové ♦ ♦ · φ φφφφ φ φ φ φ φ · φ φ · φ φφ •φ φφφ φφφ ·· φφφ φφφ ♦· ♦· φ *· φφφ nebo polyvinylchloridové) s vazebným činidlem v množství od 10 ng do 10 ug, lépe 100 ng až 1 ug, dostatečné pro imobilizaci adekvátního množství vazebného činidla.
Kovaletní navázání vazebného činidla na pevný nosič může být provedeno nejprve reakcí nosiče s bifunkčním činidlem, které reaguje jak s nosičem, tak s funkční skupinou, jako je hydroxylová nebo amino skupina, na vazebném činidle. Například může být vazebné činidlo kovlentně navázáno na nosič mající vhodný polymerový potah pomocí benzochinonu nebo kondenzací aldehydové skupiny na nosiči s aminem a aktivním vodíkem na vazebném činidlu (viz například Pierce Immunotechnology Catalog and Handbook, 1991, at A12-A13).
V některých provedeních je testem dvouprotilátkový sandwichový test. Tento test může být proveden nejprve kontaktováním protilátky, která byla imobilizována na pevném nosiči, obvykle jamce mikrotitrační plotny, se vzorkem tak, že polypeptidy ve vzorku se mohou navázat na imobilizovanou protilátku. Nenavázaný vzorek se potom odstraní od imobilizovaných komplexů polypeptid-protilátka a přidá se detekční činidlo (výhodně druhá protilátka, která se váže na jiné místo polypeptidu) obsahující reportérovou skupinu. Množství detekčního činidla, které zůstává navázáno na pevný nosič, se potom určí metodami vhodnými pro specifické reportérové skupiny.
Přesněji, poté, co se protilátka imobilizuje na nosiči, jak je popsáno výše, se zbývající vazebná místa pro protein na nosiči obvykle blokují. Může se použít jakékoliv blokovací činidlo známé v oboru, jako je hovězí sérový albumin nebo Tween 20™ (Sigma Chemical Co., St. Louis, MO). Imobilizovaná protilátka se potom inkubuje se vzorkem a polypeptid se nechá navázat na protilátku. Vzorek se může ředit vhodným ředidlem, jako je fosfátem pufrovaný
999« «· • · · 9 9 9 ·« •9 9 · · 99 • · 9 · 9·· *· 99 9 99· salinický roztok (PBS), před inkubací. Obecně, vhodná doba kontaktu je doba, která je dostatečná pro detekci přítomnosti polypeptidů ve vzorku od jedince s karcinomem prostaty. Výhodně je doba kontaktu dostatečná pro dosažení vazby, která je alespoň 95% doby dosažení rovnováhy mezi navázaným a nenavázaným polypeptidem. Odborníkům v oboru bude jasné, že doba nutná pro dosažení rovnováhy může být snadno zjištěna určením závislosti vazby na čase. Při pokojové teplotě je obvykle dosatečná doba 30 minut.
Nenavázaný vzorek může být potom odstraněn promytím pevného nosiče vhodným pufrem, jako je PBS obsahující 0,1% Tween 20™. Potom se může přidat k pevnému nosiči druhá protilátka obsahujíc reportérovou skupinu. Výhodnými reportérovými skupinami jsou skupiny popsané výše.
Detekční činidlo se potom inkubuje s imobilizovaným komplexem protilátka-polypeptid po dobu dostatečnou pro detekci navázaného polypeptidů. Dostatečná doba může být obvykle určena určením závislosti vazby na čase. Nenavázané detekční činidlo se potom odstraní a navázané detekční činidlo se detekuje pomocí reportérové skupiny. Způsob použitý pro detekci reportérové skupiny závisí na charakteru reportérové skupiny, pro radioaktivní skupiny jsou vhodné scintilační metody nebo autoradiografické metody. Spektroskopické metody mohou být použity pro detekci barviv, luminiscenčních skupin a fluorescenčních skupin, biotin může být detekován pomocí avidinu, navázaného na různé reportérové skupiny (obvykle na radioaktivní nebo fluorescenční skupinu nebo enzym). Enzymové reportérové skupiny mohou být obvykle detekovány přidáním substrátu (obvykle na určenou dobu), po kterém se provede spektroskopická nebo jiná analýza reakčních produktů.
Pro stanovení přítomnosti nebo nepřítomnosti nádoru, jako je karcinom prostaty, je obvykle signál detekovaný z reportérové ♦« *» 9999 99 • · ·>· · fr · « ·*···· · 9 » ν·» Μ « »· ««» skupiny zůstávající navázané na pevném nosiči obvykle srovnáván se signálem odpovídajícím předem určené hraniční hodnotě, v jednom provedení je hraniční hodnota pro detekci nádoru průměrným signálem získaným při inkubaci imobilizované protilátky se vzorky od pacientů bez nádoru. Obecně, vzorek dávající signál, který je o tři standardní odchylky vyšší než předem určená hraniční hodnota, je považován za pozitivní pro nádor. V alternativním výhodném provedení je hraniční hodnota určena za použití Receiver operátor Curve, způsobem podle Sackett et al., Clinical Epidemiology: A Basic Science for Clinical Medicine, Little Brown and Co., 1985, str. 106-107. Stručně, v tomto provedení je hraniční hodnota určena z grafu párů skutečně pozitivních -výsledků (t.t. sensitivity) a falešně pozitivních výsledků (100% specificita), které odpovídají každé možné hraniční hodnotě pro diagnostický výsledek testu. Hraniční hodnota v grafu, která je nejvíce vlevo nahoře (t.t. hodnota ohraničující největší plochu), je potom nejpřesnější hraniční hodnota a vzorek generující signál vyšší než tato hraniční hodnota může být považován za pozitivní. Alternativně může být hraniční hodnota posunuta v grafu doleva, pro minimalzaci falešně pozitivních výsledků, nebo vpravo, pro monimalizaci falešně negativních výsledků. Obecně, vzorek dávající signál vyšší než je hraniční hodnota stanovená touto metodou, je považován za pozitivní na karcinom.
V příbuzném provedení je test proveden v průtokovém nebo proužkovém formátu, ve kterém je vazebné činidlo imobilizováno na membráně, například na nitrocelulosové membráně. V průtokovém testu se polypeptidy ve vzorku váží na imobilizované vazebné činidlo při průchodu vzorku membránou. Druhé, značené vazebné činidlo se potom váže na komplex vazebné činidlo-polypeptid při průtoku roztoku obsahujícího druhé vazebné činidlo membránou. Detekce navázaného druhého vazebného činidla může být potom provedena zppsobem popsaným výše. V proužkovém testu se jeden
• ·· • ·♦ ·* • ♦ • o • b ·· * ·> • · ♦ ·
·· a • ·
konec membrány, na který je navázáno vazebné činidlo, ponoří do roztoku obsahujícího vzorek. Vzorek migruje membránou oblastí obsahující druhé vazebné činidlo a do oblasti obsahující imobilizované vazebné činidlo. Koncentrace druhého vazebného činidla v oblasti imobilizované protilátky ukazuje na přítomnost nádoru. Obvykle vytváří koncentrace druhého vazebného činidla v tomto místě nějaký znak, jako je proužek, který může být snadno vizualizován. nepřítomnost takové znaku znamená negativní výsledek. Obvykle je množství vazebného činidla imobilizovaného na membráně vybráno tak, aby byl generován vizuálně rozpoznatelný znak, pokud vzorek obsahuje takové množství polypeptidu, které je dostatečné pro tvorbu pozitivního signálu ve dvouprotilátkovém sandwichovém testu, jak byl popsán výše. Výhodnými vazebnými činidly pro použití v takových testech jsou protilátky a jejich vazebné fragmenty pro antigen. Výhodně je množství imobilizované na membráně v rozsahu od 25 ng do 1 ug, lépe od 50 ng do 500 ng. Takové testy mohou být obvykle provedeny na velmi malých množstvích biologického vzorku.
Existuje mnoho jiných testovacích protokolů, které jsou vhodné pro použití s nádorovými proteiny a vazebnými činidly podle předkládaného vynálezu. Výše uvedený popis je pouze exemplární. Odborníkům v oboru bude jasné, že výše uvedené protokoly mohou být jednoduše modifikovány pro použití prostatických nádorových polypeptidů pro detekci protilátek, které se váží na takové polypeptidy, v biologickém vzorku. Detekce takových protilátek specifických pro prostatické nádorové proteiny může korelovat s přítomností nádoru.
Nádor může být také, nebo alternativně, detekován podle přítomnosti T-lymfocytů, které specificky reagují s prostatickým nádorovým proteinem v biologickém vzorku. V některých provedeních je biologický vzorek obsahující CD4* a/nebo CD8 T-lymfocyty
····« ·· · ·· · · · izolované od pacienta inkubován s prostatickým nádorovým polypeptidem, polynukleotidem kódujícím takové polypeptid a/nebo APC, které exprimují alespoň imunogenní část takového polypeptidu, a detekuje s epřítomnost nebo nepřítomnost specifické aktivace T-lymfocytů. Vhodným biologickým vzorkem jsou, například, izolované T-lymfocyty. T-lymfocyt mohou být izolovány od pacientů pomocí běžných technik (jako je Ficoll/Hypaque gradientově odstředění lymfocytů periferní krve). T-lymfocyty mohou být inkubovány in vitro po dobu 2-9 dnů (obvykle 4 dnů) při 37 °C s prostatickým nádorovým polypeptidem (například 5-25 ug/ml). Pro kontrolu může být vhodná inkubace jiného podílu T-lymfocytů za nepřítomnosti prostatického nádorového polypeptidu. Pro CD4* T-lymfocyty je aktivace výhodně detekována hodnocením proliferace T-lymfocytů. Pro CD8* T-lymfocyty je aktivace výhodně detekována hodnocením cytotoxické aktivity. Úroveň proliferace, která je alespoň dvakrát vyšší, a/nebo úroveň cytotoxické aktivity, která je alespoň o 20% vyšší, než u pacientů bez onemocnění, ukazuje na přítomnost nádoru u pacienta.
Jak bylo uvedeno výše, nádor může být také, nebo alternativně, detekován podle koncentrace mRNA kódující prostatický nádorový protein v biologickém vzorku. Například, alespoň dva oligonukleotidové primery mohou být použity v polymerasové řetězové reakci (PCR) pro amplifikaci části prostatické nádorové cDNA z biologického vzorku, kde alespoň jeden oligonukleotidový primer je specifický pro (t.j. hybridizuje na) polypeptid kódujíc prostatický nádorový protein. Amplifikovaná cDNA se potom separuje a detekuje za použití technik dobře známých v oboru, jako je gelová elektroforésa. Podobně, oligonukleotidové sondy specificky hybridizující na polynukleotid kódující prostatický nádorový protein, mohou být použity v hybridizačním testu pro detekci přítomnosti polynukleotidu kódujícího nádorový protein v biologickém vzorku.
• · · · ···· · · ·· · · · ··· φφφ φφφ · φ · ·♦· Φ· ·· · ·· ···
Pro hybridizaci za testovacích podmínek by měly oligonukleotidové primery a sondy obsahovat oligonukleotidovou sekvenci, která má alespoň 60%, lépe alespoň 75% a nejlépe alespoň 90% identitu s částí polynukleotidu kódujícího prostatický nádorový protein, která má délku alespoň 10 nukleotidů, lépe 20 nukleotidů. Výhodně budou oligonukleotidové primery a/nebo sondy hybridizovat na polynukleotid kódující polypeptid podle předkládaného vynálezu za středně přísných podmínek, jak byly definovány výše. Oligonukleotidové primery a/nebo sondy, které mohou být použity v diagnostických metodách podle předkládaného vynálezu, mají délku alespoň 10-40 nukleotidů. Ve výhodném provedení obsahují oligonukleotidové sondy alespoň 10 kontinuálních nukleotidů, lépe alespoň 15 kontinuálních nukleotidů, DNA molekuly mající sekvencei uvedenou v SEQ ID NO: 1-111, 115-171, 173-175, 177, 179-305, 307-315, 326, 328, 330, 332-335, 340-375 a 381. Techniky pro PCR testy a hybridizační testy jsou dobře známé v oboru (viz například Mullis et al., Cold Spring Harbor Symp. Quant. Biol. 51: 263, 1987; Erlich, ed., PCR Technology, Stockton Press, NY, 1989).
Jeden z výhodných testů využívá RT-PCR, ve kterém je PCR využita společně s reverzní transkripcí. Obvykle je RNA extrahována z biologického vzorku, jako je tkáňová biopsie, a je reverzně transkribována za vzniku cDNA molekul. PCR amplifikace využívající alespoň jednoho specifického primerů vytváří cDNA molekulu, která může být separována a vizualizována například gelovou elektroforesou. Amplifikace může být provedena na biologickém vzorku od testovaného pacienta a od jedince, který není postižen nádorem. AMplifikační reakce může být provedena na několika ředěním cDNA v rozsahu dvou řádů. Dvojnásobné nebo vyšší zvýšení exprese v několika ředěním vzorku testovaného pacienta ve srovnání se stejnými ředěními nenádorového vzorku je obvykle považováno za pozitivní.
V jednom provedení mohou být popsané prostředky použity jako markéry progrese nádoru. V tomto provedení mohou být testy popsané výše prováděny během určitého období a hodnotí se změna koncentrace reaktivního polypeptidů nebo polynukleotidů. Například mohou být testy prováděny každých 24-72 hodin po dobu 6 měsíců až 1 roku a potom podle potřeby, obecně, nádor progreduje u těch pacientů, u kterých se zvyšuje koncentrace polypeptidů nebo polynukleotidů v čase. Naopak, nádor neprogreduje, pokud koncentrace reaktivního polypeptidů nebo polynukleotidů zůstávají v čase konstantní nebo klesají.
Některé diagnostické testy in vivo mohou být provedeny přímo na nádoru. Jeden takový test obsahuje kontaktování nádorových buněk s vazebným činidlem. Navázané vazebné činidlo může být potom detekováno přímo nebo nepřímo prostřednictvím reportérové skupiny. Taková vazebná činidla mohou být také použita v histologických aplikacích. Alternativně mohou být v takových aplikacích použity polynukleotidové sondy.
Jak bylo uvedeno výše, pro zlepšení sensitivity může být v daném vzorku testováno více prostatických nádorových makerových proteinů. Je jasné, že vazebná činidla specifická pro různé proteiny podle předkládaného vynálezu mohou být kombinována v jednom testu. Dále, více primerů a sond může být použito současně. Výběr proteinových nádorových markérů je založen na běžném experimentování pro stanovení kombinací dávajících optimální sensitivitu. Dále, testy na nádorové proteiny podle předkládaného vynálezu mohou být kombinovány sw testy na jiné známé nádorové antigeny.
Diagnostické kity
Předkládaný vynález dále poskytuje kity pro použití v jakékoliv
z výše uvedených diagnostických metod. Takové kity obvykle obsahují dvě nebo více složek nutných pro provedení diagnostického testu. Složkami mohou být sloučeniny, činidla, zásobníky a/nebo vybavení. Například, jeden zásobník v kitu může obsahovat monoklonální protilátku nebo její fragment, která se specificky váže na prostatický nádorový protein. Takové protilátky nebo fragmenty mohou být navázány na nosič, jak byl popsaný výše. Jeden nebo více dalších zásobníků může obsahovat prvky, jako jsou činidla nebo pufry, pro použití v testu, takové kity mohou také, nebo alternativně, obsahovat detekční činidlo, jak bylo popsáno výše, které obsahuje reportérovou skupinu vhodnou pro přímou nebo nepřímou detekci vazby protilátky.
Alternativně může být kit určen pro detekci koncentrace mRNA kódující prostatický nádorový protein v biologickém vzorku. Takové kity obvykle obsahují alespoň jednu oligonukleotidovou sondu nebo primer, jak byly popsány výše, které hybridizují na polynukleotid kódující prostatický nádorový protein. Takový oligonukleotid může být použit, například, v PCR nebo hybridizačním testu. Další složky, které mohou být přítomné v takových křtech, jsou druhý oligonukleotid a/nebo diagnostické činidlo nebo zásobník pro usnadnění detekce polynukleotidu kódujícího prostatický nádorový protein.
Následující příklady jsou pouze ilustrativní a nijak neomezují rozsah vynálezu.
Příklady provedení vynálezu
Příklad 1: Izolace a charakterizace prostatických nádorových polypeptidů
Tento příklad popisuje izolaci některých prostatických • ·· ·· ···· ·· • · · · « · · · · · • ·· · · · · · nádorových polypeptidů z cDNA knihovny nádoru prostaty.
cDNA knihovna lidského nádoru prostaty se připraví z póly A*RNA nádoru prostaty za použití Superscript Plasmid Systém pro syntézu cDNA a Plasmid Cloning kitu (BRL Life Technologies, Gaithersburg, MD 20897) podle návodu výrobce. Konkrétně, tkáň nádoru prostaty se homogenizuje na polytronu (Kinematica, Switzerland) a celková RNA se extrahuje za použití Trizol činidla (BRL Life Technologies) podle návodu výrobce. Póly A* RNA se potom přečistí za použití Qiagen oligotex spin kolony pro přečištění mRNA (Qiagen, Santa Clarita, CA 91355) podle návodu výrobce. První řetězec cDNA se syntetizuje za použití NotI/01igo-dT18 primeru. Syntetizuje se dvouřetězcová DNA, liguje se s EcoRI/BAXI adaptory (Invitrogen, San Diego, CA) a tráví se Notl. Po frakcionaci podle velikosti na Chromá Spin-1000 kolonách (Clontech, Palo Alto, CA) se cDNA liguje do EcoRI/Notl místa pCDNA3.1 (Invitrogen) a transformuje se do ElectroMax E. coli CH10B buněk (BRL Life Technologies) elektroporací.
Stejným postupem se připraví ze souboru šesti vzorků tkáně (Clontech) normální lidská pankreatická cDNA expresní knihovna. cDNA knihovny se charakterizují počtem nezávislých kolonií, procentem klonů nesocích insert, průměrnou velikostí insertu a analýzou sekvence. Knihovna nádoru prostaty obsahovala 1,64 x ÍO-7 nezávislých kolonií, 70% koňů obsahovalo insert a průměrná velikost insertu byla 1745 párů baží. Knihovna normální pankreatické cDNA obsahovala 3,3 x 10e nezávislých kolonií, 69% koňů obsahovalo insert a průměrná velikost insertu byla 1120 párů baží. Pro obě knihvony analýza sekvence ukázala, že většina klonů má kompletní cDNA sekvenci a že knihovny byly syntetizovány z mRNA, s minimální kontaminací rRNA a mitochondriální DNA.
Odečtení cDNA knihoven bylo provedeno za použití cDNA knihoven
tumoru prostaty a normálního pankreatu, způsobem popsaným v Hara et al. (Blood, 84: 189-199, 1994), s určitými modifikacemi. Přesněji, odečtěná cDNA knihovna specifická pronádor prostaty byly připravena následujícím způsobem. Normální pankreatická cDNA knihovna (70 ug) se trávila EcoRI, Notl a Sful a potom se provedlo doplnění Klenowovým fragmentem DNA polymerasy. Po extrakci fenolem-chloroformem a srážení ethanolem se DNA rozpustila ve 100 ul H20, denaturovala se teplem a smísila se se 100 ul (100 ug) Photoprobe biotinem (Vector Laboratories, Burlingame, CA). Podle doporučení výrobce se získaná směs ozařovalo po dobu 20 minut na ledu 270 W lampou. Přidal se další Photoprobe biotin (50 ul) a biotinylační reakce se opakovala. Po pěti extrakcích butanolem se DNA vysrážela ethanolem a rozpustila se ve 23 ul H20 za zisku řídící DNA.
Pro přípravu kopírovaná DNA se 10 ug cDNA knihovny nádoru prostaty trávilo BamHI a Xhol, provedela se extrakce fenol-chloroformem a směs se zpracovala na Chromá Spin-400 kolonách (Clontech). Po srážení ethanolem se kopírovaná DNA rozpustila v 5 ul H2O. Kpírovaná DNA se smísila s 15 ul řídící DNA a 20 ul 2x hybridizačního pufru (1,5 M NaCl/10 mM EDTA/50 mM HEPES, pH 7,5/0,2% dodecyl síran sodný), převrstvila se minerálním olejem a zcela se denaturovala teplem. Vzorek se ihned přenesl do vodní lázně (68 °C) a inkuboval se po dobu 20 hodin (dlouhá hybridizace (LH)). Reakčni směs se potom zpracovala streptavidinem a potom se provedla extrakce fenolem/chloroformem. Odečtená DNA se vysrážela, rozpustila se ve 12 ul H20, smísila se s 8 ul řídící DNA a 20 ul 2x hybridizačního pufru a provedla se hybridizace při 68 °C po dobu 2 hodin (krátká hybridizace (SH)). Po odstranění biotinylované dvouřetězcové DNA se odečtená DNA ligovala so BamHl/Xhol místa pBCSK·1· resistentních na chloramfenikol (Stratagene, La Jolla, CA 92037) a transformovala se do ElectroMax E. coli DH10B buněk elektroporací za zisku odečtené cDNA knihovny
specifické pro nádor prostaty (zde označované jako prostatická odečtená knihovna 1) .
Pro analýzu odečtené cDNA knihovny se plasmidová DNA připravila ze 100 nezávislých klonů, náhodně odebraných z kniovny specifické pro nádor prostaty a rozdělených do skupi podle velikosti insertu. Representativní cDNA klony byly potom dále charakterizovány DNA sekvencováním na Perkin Elmer/Applied Biosystems Division Automat Sequencer Model 373A (Foster City, CA). Bylo zjištěno šest klonů, zde označených jako Fl-13, Fl-12, Fl-16, Hl-1, Hl-9 a Hl-4, které byly početné v odečtené cDNA knihovně specifikcé pro prostatu. Určené 3' a 5' cDNA sekvence pro Fl-12 jsou uvedeny v SEQ ID NO: 2 a 3, v příslušném pořadí, a 3' cDNA sekvence pro Fl-13, Fl-16, Hl-1, Hl-9 a Hl-4 jsou uvedeny v SEQ ID NO: 1 a 4-7, v příslušném pořadí.
cDNA sekvence pro izolované klony byly srovnávány se známými sekvencemi v genových bankách za použití EMBL a GenBank databází (uvolnění 96). bylo zjištěno, že čtyři klony cDNA nádoru prostaty, Fl-13, Fl-16, Hl-1 a Hl-4, kódují dříve identifikované proteiny: prostatický specifický antigen (PSA), lidský glandulární kallikrein, lidský gen se zvýšenou expresí v nádorech a podjednotku II mitochondriální cytochrom C oxidasy. Hl-9 byl shledán identickým s dříve identifikovanou lidskou autonomně se replikující sekvencí. Nebyla zjištěna žádný významná homologie pro cDNA sekvenci pro Fl-12.
Další pokusy vedly k izolaci kompletní cDNA sekvence pro Fl-12. Tato sekvence je uvedena v SEQ ID NO: 107 a příslušná aminokyselinová sekvence je uvedena v SEQ ID NO: 108.
Pro klonování méně hojných genů specifických pro nádor prostaty bylo odečtení cDNA knihovny provedeno pomocí odečtení cDNA
knihovny pro nádor prostaty a normální pankreatické cDNA knihovny a tří nejhojnějších genů v dříve odečtené cDNA knihovně specifické pro nádor prostaty, který byly gen pro lidský glandulární kallikrein, gen pro prostatický specifický antigen (PSA) a gen pro podjednotku II mitochondriální cytochrom C oxidasy, kde cDNA v pCDNA3.1 byly přidány k řídící DNA s odečtení bylo provedeno způsobem popsaným výše za zisku druhé odečtené cDNA knihovny, která je zde označována jako odečtená cDNA knihovna specifická pro nádor prostaty s vrcholem.
Z odečtené cDNA knihovna specifické pro nádor prostaty s vrcholem bylo izolováno 22 cDNA klonů. Určené 3' a 5’ cDNA sekvence pro klony označené Jl-17, Ll-12, Nl-1862, Jl-13, Jl-19, Jl-25, Kl-58, Kl-63, Ll-4 a Ll-14 jsou uvedeny v SEQ ID NO: 8-9, 10-11, 12-13, 14-15, 16-17, 18-19, 20-21, 22-23, 24-25, 26-27 a 28-29, v příslušném pořadí. Určené 3' cDNA sekvence pro klony označené Jl-12, Jl-16, Jl-21, Kl-48, Kl-55, Ll-2, Ll-6, Nl-1858, Nl-1860, Nl-1861, Nl-1864, jsou uvedeny v SEQ ID NO: 30-40, v příslušném pořadí. Srovnání těchto sekvencí se sekvencemi v genových bankách uvedených výše neodhalilo žádné významné homologie se třemi z pěti nejčastějších typů DNA (Jl-17, Ll-12 a Nl-1862; SEQ ID NO: 8-9, 10-11 a 12-13, v příslušném pořadí). Ze zbývajících dvou nejčastějších typů byl jeden (Jl-12; SEQ ID NO: 30) identický s dříve identifikovaným lidským proteinem asociovaným s plicním surfaktantem, a druhý (Kl-48; SEQ ID NO: 33) měl určitou homologii s R. norvegicus mRNA pro 2-arylpropionyl-CoA epimerasu. ze 17 méně hojných cDNA klonů izolovaných z odečtené cDNA knihovna specifické pro nádor prostaty s vrcholem byly 4 (Jl-16, Kl-55, Ll-6 a Nl-1864; SEQ ID NO: 31, 34, 36 a 40, v příslušném pořadí) identické s dříve identifikovanými sekvencemi, 2 (Jl-21 a Nl-1860; SEQ ID NO: 32 a 38, v příslušném pořadí) vykazovaly určitou homologii s non-lidskými druhy, a 2 (Ll-2 a Nl-1861; SEQ ID NO: 35 a 39, v příslušném pořadí) vykazovaly
určitou homologii se známými lidskými sekvencemi. Žádné významné homologie nebyly zjištěny pro polypeptidy Jl-13, Jl-19, Jl-24,
Kl-58, Kl-63, Ll-4, Ll-14 (SEQ ID NO: 14-15, 16-17, 20-21, 18-19,
22-23, 24-25, 26-27, 28-29, v příslušném pořadí).
Další pokusy vedly k izolaci kompletní cDNA sekvence pro Jl-17, Ll-12 a Nl-1862 (SEQ ID NO: 109-11, v příslušném pořadí). Příslušná aminokyselinová sekvence je uvedena v SEQ ID NO: 112-114. Ll-12 je také označován jako P501S.
V dalším pokusu byly čtyři další klony identifikovány odečtením prostatické nádorové cDNA knihovny a normální prostatické cDNA připravené ze tří normální prostatických póly A+ RNA (zde označováno jako prostatická odečtená knihovna 2). Určené cDNA sekvence pro tyto klony, označené jako Ul-3064, Ul-3065, Vl-3692 a 1A-3905, jsou uvedeny v SEQ ID NO: 69-72, v příslušném pořadí. Srovnání určených sekvencí se sekvencemi v genových bankách neodhalilo žádné -významné homologie pro Ul-3065.
Další odečtení s vrcholem (označené jako prostatické odečtení s vrcholem 2) bylo provedeno odečtením cDNA knihovny specifické pro nádor prostaty a normální pankreatické cDNA knihovny a dále s geny pro PSA, Jl-17, protein asociovaný s plicním surfaktantem, genem pro podjednotku II mitochondriální cytochrom C oxidasy, Nl-1862, autonomně se replikující sekvencí, Ll-12 a genem se zesílenou expresí v nádorech, byly izolovány čtyři další klony, zde označené jako Vl-3686, Rl-2330, 1B-3976 a Vl-3679. Určené cDNA sekvence pro tyto klony jsou uvedeny v SEQ ID NO: 73-76, v příslušném pořadí. Srovnání určených sekvencí se sekvencemi v genových bankách neodhalilo žádné významné homologie pro
Vl-3686 a Rl-2330.
Další analýzy třech prostatických odečtů popsaných výše
(prostatického odečtu 2, odečtení cDNA specifické pro nádor prostaty s vrcholem, a prostatického odečtu s vrcholem 2) vedly k identifikaci 16 dalších klonů, označených jako 1G-4736, 1G-4738, 1G-4741, 1G-4744, 1G-4734, 1H-4774, 1H-4781, 1H-4785, 1H-4787, 1H-4796, 11-4810, 11-4811, 1J-4876, 1K-4884 a 1K-4896. Určené CDNA sekvence pro tyto klony jsou uvedeny v SEQ ID NO: 77-92, v příslušném pořadí. Srovnání určených sekvencí se sekvencemi v genových bankách neodhalilo žádné významné homologie pro 1G-4771, 1G-4734, 11-4807, 1J-4876 a 1K-4896 (SEQ ID NO: 79, 81, 87, 90 a 92, v příslušném pořadí). Další analýza izolovaných klonů vedla ke stanovení rozšířených cDNA sekvencí pro 1G-4736, 1G-4738, 1G-4741, 1G-4744, 1G-4734, 1H-4774, 1H-4781, 1H-4785, 1H-4787, 1H-4796, 11-4807, 1J-4876, 1K-4884 a 1K-4896, které jsou uvedeny v SEQ ID NO: 179-188 a 191-193, v příslušném pořadí, a ke stanovení dalších částečných cDNA sekvencí pro 11-4810 a 11-4811, uvedených v SEQ ID NO: 189 až 190, v příslušném pořadí.
Další pokusy s prostatickým odečtem s vrcholem 2 vedly k izolaci tří dalších klonů. Jejich sekvence byly stanoveny způsobem uvedeným výše a byly srovnávány s nejnovější GenBank. Bylo zjištěno, že všechny tři klony mají homologii s neznámými geny, kterými jsou protein bohatý na cystein, KIAA0242 a KIAA0280 (SEQ ID NO: 317, 319 a 320, v příslušném pořadí). Další analýza těchto klonů pomocí Synteni mikrosestavy (Synteni, Palo Alto, CA) prokázala, že všechny tři klony byly andměrně exprimovány ve většiěn nádorů prostaty a většině BHP, stejně jako ve většině testovaných normálních tkání prostaty, ale jejich exprese v jiných normálních tkáních byla nízká.
Další odečtení bylo provedeno odečetním normální prostatické cDNA knihovny s normální pankreatickou cDNA (toto odečtení je označeno jako prostatické odečtení 3). Toto odečtení vedlo k identifikaci šesti dalších klonů označených jako 1G-4761, 1G-4762,
1H-4766, 1H-4770, 1H-4771 a 1H-4772 (SEQ ID NO: 93-98) . Srovnání určených sekvencí se sekvencemi v genových bankách neodhalilo žádné významné homologie pro 1G-4761 a 1H-4771 (SEQ ID NO: 93 a 97, v příslušném pořadí). Další analýza izolovaných klonů vedla ke stanovení rozšířených cDNA sekvencí pro 1G-4761, 1G-4762, 1H-4766 a 1H-4772, které jsou uvedeny v SEQ ID NO: 194-196 a 199, v příslušném pořadí, a ke stanovení dalších částečných cDNA sekvencí pro 1H-4770 a 1H-4771, uvedených v SEQ ID NO: 197 až 198, v příslušném pořadí.
Odečtení prostatické nádorové cDNA knihovny, připravené ze souboru polyA+ RNA od tří pacientů s karcinomem prostaty, s normální pankreatickou cDNA (toto odečtení je označeno jako prostatické odečtení 4), vedlo k identifikaci osmi dalších klonů označených jako 1D-4297, 1D-4309, ID.1-4278, 1D-4288, 1D-4283, 1D-4304, 1D-4296 a 1D4280 (SEQ ID NO: 99-107). Tyto sekvence byly srovnávány se sekvencemi v genových bankách, jak bylo popsáno výše. Žádné významné homologie nebylyzjištěny pro 1D-4283 a 1D-4304 (SEQ ID NO: 103 a 104, v příslušném pořadí). Další analýza izolovaných klonů vedla ke stanovení rozšířených cDNA sekvencí pro 1D-4309, ID.1-4278, 1D-4288, 1D-4283, 1D-4304, 1D-4296 a 1D4280, které jsou uvedeny v SEQ ID NO: 200-206, v příslušném pořadí.
cDNA klony izolované v prostatickém odečtu 1 a prostatickém odečtu 2 popsaném výše byly amplifikovaný PCR a exprese mRNA v nádorech prostaty, normálních prostatách a různých jiných normálních tkáních byly určeny pomocí mikrosestavové technologie (Syntheni, Palo Alto, CA). Stručně, produkty PCR amplifikace byly naneseny na blány v určitém uspořádání, kde každý produkt obsadil jedinečné místo v sestavě. mRNA byla extrahována z testovaného vzorku tkáně, byla reversně transkribována a byly připraveny fluorescenčně značené cDNA sondy. Mikrosestavy byly sondovány
• ♦* 99 ·· 9
99 9 9 9 < « 4 99
• ·· 9 4 • · 9
9
• · · 9 • * 4
999 99 • · 99 999
značenými cDNA sondami, blány byly skenovány a měřila se intenzita fluorescence, tato intenzita koreluje s intenzitou hybridizace. Bylo zjištěno, že dva klony (označené jako P509S a P510S) byly nadměrně exprimovány s nádorech prostaty a normálních prostatách a jejich exprese byla nízká ve všech dalších normálních testovaných tkáních (játrech, slinivce břišní, kůži, kostní dřeni, mozku, mléčných žlázách, nadledvinách, močovém měchýři, varlatech, slinných žlázách, tlustém střevu, ledvinách, vaječníkách, plících, míše, kosterním svalu a tlustém střevu). Určené cDNA sekvence pro P509S a P510S jsou uvedeny v SEQ ID NO: 223 a 224, v příslušném pořadí. Srovnání těchto sekvencí se sekvencemi v genových bankách uvedených výše ukázalo určitou homologii s dříve identifikovanými EST.
Další pokusy vedly k izolaci kompletní cDNA sekvence pro P509S. Tato sekvence je uvedena v SEQ ID NO: 332 a příslušná předpokládaná aminokyselinová sekvence je uvedena v SEQ ID NO: 339.
Příklad 2: Určení tkáňové specificity prostatických nádorových polypeptidů
Za použití genově specifických primerů byla testována úroveň exprese mRNA pro representativní prostatické nádorové polypeptidy Fl-16, Hl-1, Jl-17 (též označovaný jako P502S), Ll-12 (též označovaný jako P501S), Fl-12 (též označovaný jako P504S) a Nl-1862 (též označovaný jako P503S) v mnoha normálních a nádorových tkáních, za použití RT-PCR.
Stručně, celková RNA byla extrahována z různých normálních a nádorových tkání pomocí Triazolového činidla, způsobem popsaným výše. Syntéza prvního řetězce byla provedena za použití 1-2 ug celkové RNA se SuperScript II reversní transkriptasou (BRL Life
Technologies) při 42 °C po dobu 1 hodiny. cDNA byla potom amplifikována PCR s genově specifickými primery. Pro azjištění semi-kvantitativního charakteru RT-PCR byl beta-aktin použit jako vnitřní kontrola pro každou vyšetřovanou tkáň. Nejprve byla připravena sériová ředění cDNA a RT-PCR byla provedena za použití primerů specifických pro beta-aktin. Potom bylo vybráno ředění umožňující lineární amplifikaci beta-aktinového templátu a dostatečně sensitivní pro zobrazení rozdílů v počátečním počtu kopií. Za použití těchtopodmínek byly stanoveny koncentrace beta-aktinu pro každou reversní transkripci z každé tkáně. Kontaminace DNA byla minimalizována zpracováním DNAsou a zajištěním negativních PCR výsledků při použití prvního řetězce cDNA, který byl připraven bez použití reversní transkriptasy.
Úrovně exprese mRNA byly vyšetřovány ve čtyřech různých typech nádorové tkáně (nádoru prostaty od 2 pacientů, nádoru prsu od 3 pacientů, nádoru tlustého střeva, nádoru plic) a v 16 různých normálních tkáních, včetně prostaty, tlustého střeva, ledviny, jater, plic, vaječníků, slinivky břišní, kosterního svalu, kůže, žaludku, varlat, kostní dřeně a mozku. Bylo zjištěno, že Fl-16 je exprimován ve vysoké úrovni v nádorech prostaty, nádoru tlustého střeva a normální prostatě, a v nízké úrovni v normálních játrech, kůži a varlatech, a v ostatních vyšetřovaných tkáních nebyla exprese detekovatelná. Hl-4 byl exprimován ve vysoké úrovni v nádorech prostaty, nádoru plic, nádoru prsu, normální prostatě, normálním tlustém střevu a normálním mozku, v mnohem nižší úrovni v normálních plíchc, slinivce břišní, kosterním svalu, kůži, tenkém střevu, kostní dřeni, a v ostatních vyšetřovaných tkáních nebyla exprese detekovatelná.JI-17 (P502S) a Ll-12 (P501S) byly specificky nadměrně exprimovány v prostatě, kde oba geny byly exprimovány ve vysoké úrovni v nádorech prostaty a normální prostatě, ale jejich exprese nebyla detekovatelná v ostatních vyšetřovaných tkáních. Nl-1862 (P503S) byl nadměrně exprimován v ·· ···· ·· « • · · · · · ·
60% nádorů prostaty a byl detekovatelný v normálním tlustém střevu a ledvině. Výsledky RT-PCR proto ukazují, že Fl-16, Hl-1, JI-17 (P502S), Ll-12 (P501S), Fl-12 (P504S) aNl-1862 (P503S) jsou buď specifické pro prostatu nebo jsou exprimovány ve významně vyšších hladinách v prostatě.
Další RT-PCR testy ukázaly, že Fl-12 (P504S) je nadměrně exprimován v 60% nádorů prostaty, detekovatelný v normálních ledvinách ale nedetekovatelný ve všech ostatních testovaných tkáních podobně testy ukázaly, že Rl-2330 je nadměrně exprimován ve 40% nádorů prostaty, detekovatelný v normálních ledvinách a játrech, ale nedetekovatelný ve všech ostatních testovaných tkáních. Ul-3064 byl nadměrně exprimován v 60% nádorů prostaty a také v nádorech prsu a tlustého střeva, ale nedetekovatelný ve všech ostatních testovaných tkáních.
RT-PCR analýza Rl-2330, U-3064 a 1D-4279 ukázala, že ytto tři antigeny jsou nadměrně exprimovány v prostatě a/nebo v nádorech prostaty.
Northenova hybridozace se čtyřmi nádory prostaty, dvěma vzorky normální prostaty, dvěma prostatami s BHP a normálním tlustým střevem, ledvinou, plícemi, slinivkou břišní, kosterním svalem, mozkem, žaludkem, varlaty, tenkým střevem a kostní dření ukázaly, že Ll-12 (P501S) je nadměrně exprimován v nádorech prostaty a normální prostatě, zatímco není detekovatelný v jiných normálních testovaných tkáních. Jl-17 (P502S) byl detekován ve dvou nádorech prostaty a ne v jiných testovaných tkáních. Nl-1862 (P503S) byl nadměrně exprimován ve třech nádorech prostaty a byl exprimován v normální prostatě, tlustém střevu a ledvině, ale ne v jiných testovaných tkáních. Fl-12 (P504S) byl nadměrně exprimován ve dvou nádorech prostaty a normální prostatě, ale enbyl detekovatelný v jiných normálních testovaných tkáních.
• *· 9 9 »»tt»» • · ♦ · ·· · ··· • · · · · · e · ·· • · · ··· ·· ····· · · ♦ ·9·
Technika mikrosestav popsaná výše byla použita pro stanovení úrovní exprese representativních antigenů v nádoru prostaty, nádoru prsu a a následujících normálních tkáních: prostatě, játrech, slinivce břišní, kůži, kostní dřeni, mozku, prsu, nadledvině, močovém měchýři, slinných žlázách, tenkém střevu, ledvině, vaječníku, míše, kosterním svalu a tlustém střevu. Bylo zjištěno, že Ll-12 (P501S) je nadměrně exprimován v normální prostatě a v nádoru prostaty, s určitou detekovatelnou expresí v normálním kosterním svalu. Jak Jl-12, tak Fl-12 (P504S) byly nadměrně exprimovány v nádoru prostaty, s nízkou nebo nedetekovatelnou expresí v ostatních testovaných tkáních. Nl-1862 (503S) byl nadměrně exprimován v nádoru prostaty a v normální prostatě, slabě exprimován v normálním tlustém střevu, s nedetekovatelnou expresí v ostatních testovaných tkáních. Rl-2330 byl nadměrně exprimován v nádoru prostaty a v normální prostatě a slabě exprimován v ostatních testovaných tkáních. ID-4279 byl nadměrně exprimován v nádoru prostaty a v normální prostatě, slabě exprimován v normální míše, s nedetekovatelnou expresí v ostatních testovaných tkáních.
Další analýza využívající mikrosestav byla provedena pro určení rozsahu, ve kterém je P501S (SEQ ID NO: 110) exprimován v nádoru prsu a ukázala střední silnou nadměrnou expresi nejen v nádoru prsu, ale také v metastatickém nádoru prsu (2/31), se zanedbatelně nízkou expresí v normálních tkáních. Tato data naznačují, že P501S může být nadměrně exprimován v různých nádorech prsu, stejně jako v nádorech prostaty.
Úrovně exprese 32 EST (exprimovaných koncovek sekvence), popsaných Vasmatzis et al. (Proč. Nati. Acad. Sci. USA 95: 300-304, 1998) v různých nádorových a normálních tkáních, byly vyšetřovány pomocí techniky mikrosestav popsané výše. Bylo zjištěno, že dva z těchto klonů (označené jako P1000C a P1001C)
jsou nadměrně exprimované v nádorech prostaty a normální prostatě, s nízkou až nedetekovatelnou expresí ve všech ostatních testovaných tkáních (normální aortě, thymu, klidových a aktivovaných PBMC, epitelových buňkách, míše, nadledvině, fetálních tkáních, kůži, slinné žláze, tlustém střevu, kostní dřeni, játrech, plících, dendritických buňkách, žaludku, lymfatických uzlinách, mozku, srdci, tenkém střevu, kosterním svalu, tlustém střevu a ledvině. Určené sekvence cDNA pro P1000C a P1001C jsou uvedeny v SEQ ID NO: 384 a 472, v příslušném pořadí. Bylo zjištěno, ež sekvence P1001C má určitou homologii s dříve izolovanou lidskou mRNA pro JM27 protein. Pro sekvenci P1000C nebyla zjištěna žádná významná homologie.
Exprese poylpeptidu kódovaného kompletní cDNA sekvencí pro Fl-12 (též P504S; SEQ ID NO: 108) byla zkoumána imunohistochemickou analýzou. Králičí anti-P504S polyklonální protilátky byly připraveny proti kompletnímu P504S proteinu běžným způsobem. Následná izolace a charakterizace polyklonálních protilátek byla také provedena technikami známými v oboru. Imunohistochemická analýza ukázala, že P504S polypeptid je exprimován ve 100% testovaných vzorků karcinomu prostaty (n = 5).
Králičí anti-P504S polyklonální protilátka se nevázala na benigní buňky prostaty se stejným cytoplasmatickým granulárním barvením, a spíše se vázala společně s světlým jaderným barvením. Analýza normálních tkání ukázala, že kódovaný polypeptid je exprimován v některých, ale ne ve všech normálních lidských tkáních. Pozitivní cytoplasmatické barvení s králičí anti-P504S polyklonální protilátkou bylo zjištěno v normální lidské ledvině, játrech, mozku, tlustém střevu a plicních makrofágách, zatímco srdce a kostní dřeň byly negativní.
Tato data naznačují, že P504S polypeptid je přítomen ve tkáních
karcinomu prostaty a že existují kvantitativní a kvalitativní odlišnosti v barvení mezi tkáněmi benigní hyperplasie prostaty a nádoru prostaty, což naznačuje, že tento polypeptid může být selektivně detekován v nádorech prostaty a proto může být užitečný pro diagnostiku nádorů prostaty.
Příklad 3: Izolace a charakterizace prostatických nádorových polypeptidu pomocí odečtu zaloežného na PCR
Odečtená cDNA knihovna, obsahující cDNA z normální prostaty, od které bylo odečteno deset normálních tkáňových cDNA (mozková, srdeční, ledvinná, jaterní, plicní, vaječníková, placentární, kosterního svalu, sleziny a thymu) a která byla potom zpracována první PCR amplifikaci, byla zakoupena od Clontech. Tato knihovna byla zpracována druhou PCR amplifikaci, podle návodu výrobce. Vzniklé cDNA fragmenty byly subklonovány do vektoru pT7 Blue T-vektor (Novagen, Madison, WI) a byly transformovány do XL-1 Blue MRF’ E. coli (Strategene). DNA byla izolována z nezávislých klonů a byla sekvencována za použití Perkin Elmer/Applied Biosystems Division Automat Sequencer Model 373A.
Bylo sekvencováno 59 pozitivních klonů. Srovnání DNA sekvencí těchto klonů se sekvencemi vgenových bankách, jak bylo popsáno výše, neodhalilo žádné významné homologie pro 25 těchto klonů, které jsou označeny jako P5, P8, P9, P18, P20, P30, P34, P36, P38, P39, P42, P49, P50, P53, P55, P60, P64, P65, P73, P75, P76, P79 a P84. Určené cDNA sekvence pro tyto klony jsou uvedeny v SEQ ID NO: 41-45, 47-52 a 54-65, v příslušném pořadí. Bylo zjištěno, že P29, P47, P68, P80 a P82 (SEQ ID NO: 46, 53 a 66-68, v příslušném pořadí) mají určitou homologii s dříve identifikovanými DNA sekvencemi. Podle znalostí předkladatelů vynálezu nebyla žádná z těchto sekvencí dříve zjištěna v prostatě.
Další pokusy za použití techniky založené na PCR, jak byla popsána výše, vedly k izolaci více než 180 dalších klonů, z nichž 23 mělo významné homologie se známými sekvencemi. Určené cDNA sekvence pro tyto klony jsou uvedeny v SEQ ID NO: 115-123, 127, 131, 137, 15, 147-151, 153, 156-158 a 160. Bylo zjištěno, že 23 klonů (SEQ ID NO: 124-126, 128-130, 132-136, 138-144, 146, 152, 154, 155 a 159) vykazuje určitou homologii s dříve identifikovanými EST. Bylo zjištěno, že dalších 10 klonů (SEQ ID NO: 161-170) má určitou homologii se známými geny. Větší cDNA klony obsahující P20 sekvenci představují sestřihové varianty genu označovaného jako P703P. Určené DNA sekvence pro tyto varianty označené jako DE1, DE13 a DE14 jsou uvedeny v SEQ ID NO: 171, 175 a 177, v příslušném pořadí, a předpokládané aminokyselinové sekvence jsou uvedeny v SEQ ID NO: 172, 176 a 178, v příslušném pořadí. Určená cDNA sekvence pro rozšířenou alternativně sestřiženou formu P703 je uvedena v SEQ ID NO: 225. DNA sekvence pro alternativně sestřižené varianty označené jako DE2 a DE6 jsou uvedeny v SEQ ID NO: 173 a 174, v příslušném pořadí.
Úrovně exprese mRNA pro representativní klony v nádorové tkáni (prostaty (n=5), prsu (n=2), tlustého střeva a plic), normálních tkáních (prostaty (n=5), tlustého střeva, ledvin, jater, plic (n=2), vaječníků (n=2), kosterního svalu, kůže, žaludku, tenkého střeva a mozku) a aktivovaných a neaktivovaných PBMC), byly stanoveny způsobem popsaným výše. Exprese byla vyšetřována v jednom vzorku každého typu tkáně, pokud není uvedeno jinak.
Bylo zjištěno, že P9 je značně exprimován v normální prostatě a v nádorech prostaty ve srovnání se všemi ostatními normálními tkáněmi kromě tlustého střeva, ve kterém byla detekována srovnatelná exprese. P20, část genu P703P, byl značně exprimován v normální prostatě a v nádorech prostaty, ve srovnání se všemi 12 ostatními normálními tkáněmi. Bylo pozorováno mírné zvýšení
exprese P20 v nádorech prsu (n=2), nádoru tlustého střeva a nádoru plic, ve srovnání s normálními tkáněmi s výjimkou plic (1 ze 2). Zvýšená exprese P18 byla zjištěna v normální prostatě, nádoru prostaty a nádoru prsu, ve srovnání s normálními tkáněmi s výjimkou plic a žaludku. Bylo pozorováno mírné zvýšení exprese P5 v normální prostatě, ve srovnání s normálními tkáněmi. Nicméně, určité zvýšení exprese bylo pozorováno také v normálních plících a PBMC. Zvýšená exprese P5 byla pozorována také v nádorech prostaty (2 ze 5), nádoru prsu a jednom nádoru plic. Pro P30 byly podobné úrovně exprese pozorovány v normální prostatě a v nádorech prostaty, ve srovnání s šesti z dvanácti testovaných normálních tkání. Zvýšená exprese byla pozorována v nádorech prsu, jednom nádoru plic a jenom nádoru tlustého střeva a také v normálních PBMC. P29 byl nadměrně exprimován v nádoru prostaty (5 z 5) a normální prostatě (5 z 5), ve srovnání s většinou normálních tkání. Nicméně, významná exprese P29 byla pozorována v normálním tlustém střevu a normálních plících (2 z 2). P80 byl nadměrně exprimován v nádoru prostaty (5 z 5) a normální prostatě (5 z 5), ve srovnání s většinou normálních tkání, a zvýšená exprese byla pozorována také v nádoru tlustého střeva.
Další pokusy vedly k izolaci 12 dalších klonů, zde označených jako 10-d8, 10-hl0, ll-c8, 7-g6, 8-b5, 8-d4, 8-d9, 8-g3, 8-hll, 9-fl2 a 9-f3. Určené DNA sekvence pro 10-d8, 10-hl0, ll-c8, 8-d4,
8-d9, 8-g3, 8-hll, 9-fl2 a 9-f3 jsouo uvedeny v SEQ ID NO: 207, 208, 209, 216, 217, 220, 221 a 222, v příslušném pořadí. Určené kódující a reverzní DNA sekvence pro 7-g6, 8-b5, 8-b6 a 8-g3 jsou uvedeny v SEQ ID NO: 210 a 211; 212 a 213; 214 a 215; a 218 a 219, v příslušném pořadí. Srovnání DNA sekvencí těchto klonů se sekvencemi vgenových bankách, jak bylo popsáno výše, neodhalilo žádné významné homologie pro 9-f3. bylo zjištěno, že klony 10-d8, 11-C8 a 8-hll vykazují určitou homologii s dříve izolovanými EST, zatímco 10-hl0, 8-b5, 8-b6, 8-d4, 8-d9, 8-g3 a 9-fl2 vykazují
určitou homologii s dříve identifikovanými geny. Další charakterizace 7-g6 a 8-G3 ukázala identitu se známými geny PAP a
PSA, v příslušném pořadí.
Úrovně exprese mRNA pro tyto klony byly stanoveny za použití technologie mikrosestav, jak byla popsána výše. Klony 7-G6, 8-G3,
8-B5, 8-B6, 8-D4, 8-D9, 9-F3, 9-F12, 9-H3, 10-A2, 10-A4, 11-C9 a 11-F2 byly nadměrně exprimovány v nádoru prostaty a v normální prostatě, s expresí nedetekovatelnou nebo nízkou v ostatních testovaných tkáních. Zvýšená exprese 8-F11 byla pozorována v nádoru prostaty a normální prostatě, močovém měchýři, kosterním svalu a tlustém střevu. Zvýšená exprese 10-H10 byla pozorována v nádoru prostaty a normální prostatě, močovém měchýři, plíci, tlustém střevu a mozku. Zvýšená exprese 9-B1 byla pozorována v nádoru prostaty, nádoru prsu a normální prostatě, slinné žláze, tlustém střevu a kůži a a zvýšená exprese 11-C8 byla pozorována v nádoru prostaty a normální prostatě a tlustém střevu.
Další cDNA fragment získaný z PCR odečtu normální prostatické knihovny, jak byl popsán výše, byl specifický pro prostatu jak v analýze pomocí mikrosestav, tak RT-PCR. Určená cDNA sekvence pro tento klon (označený jako 9-Ά11) je uvedena v SEQ ID NO: 226. Srovnání sekvence se sekvencemi v databázích odhalilo 99% identitu se známým genem H0XB13.
Další pokusy vedly k izolaci klonů 8-C6 a 8-H7. Určené cDNA sekvence pro tyto klony jsou uvedeny v SEQ ID NO: 227 a 228, v příslušném pořadí. Bylo zjištěno, že tyto sekvence vykazují určitou homologii s dříve izolovanými EST.
PCR a hybridizační techniky byly použity pro získání delších cDNA sekvencí pro klon P20 (též označovaný jako P703P), za zisku tří dalších cDNA fragmentů s progresivně prodlouženým 5' koncem ♦ ♦ · ♦ ···· ·· • · · · · · · ·· · · ♦ · ·
genu. Tyto fragmenty, označené jako P703PDE5, P703P6.26 a P703PX-23 (SEQ ID NO: 326, 328 a 330, s příslušnými předpokládanými aminokyselinovými sekvencemi uvedenými v SEQ ID NO: 327, 329 a 331, v příslušném pořadí) obsahovaly další 5' sekvenci. P703PDE5 byl získán skríningem cDNA knihovny (č. 141-26) za použití části P703P jako sondy. P703P6.26 byl získán ze směsi tří cDNA nádoru prostaty a P703PX_23 byl získán z cDNA knihovny (č. 438-48). Dohromady tyto další sekvence zahrnují domnělou zralou serin-proteasu společně s částí domnělé signální sekvence. Další studie za použití PCR-odečtové knihovny tvořené odečtem prostativké nádorové knihovny pd sestavy normálních tkání (označené jako JP:PCR odečet) vedly k izolaci 13 dalších klonů, z nichž 7 nevykazovalo žádnou homologii se známými sekvencemi v GenBank. Určené cDNA sekvence pro těchto 7 klonů (P711P, P712P, nový 23, P774P, P775P, P710P a P768P) jsou uvedeny v SEQ ID NO: 307-311, 313 a 315, v příslušném pořadí. Zbývajících 6 klonů (SEQ ID NO: 316 a 321-325) vykazovalo určitou homologii se známými geny. Analýzou pomocí mikrosestav bylo zjištěno, že všech 13 klonů vykazuje troj- nebo vícenásobou nadměrnou expresi v prostatě, včetně nádorů prostaty, BHP a normální prostaty, ve srovnání s ostatními tkáněmi. Klony P711P, P712P, nový 23 a P768P vykazovaly nadměrnou expresi ve většině testovaných nádorů prostaty a BHP (n=29) a ve většině normálních prostat (n=4), ale pouze nízkou expresi ve všech normálních tkáních. Klony P774P, P775P a P710P vykazují srovnatelně nízkou expresi a expresi v menším počtu nádorů prostaty a BHP, s negativní nebo nízkou expresí v normální prostatě.
Kompletní cDNA pro P711P byla získána za použití částečné sekvence SEQ ID NO: 307 pro prohledávání knihovny prostatické cDNA. Přesněji, směrované klonovaná knihovna prostatické cDNA byla připravena za použití standardních technik. Jeden milion kolonií této knihovny byl umístěn na LB/Amp plotny. Filtry z nylonové membrány byly použity pro přenos těchto kolonií a cDNA, které byly získány z těchto filtrů, byly denaturovány na navázány na filtry UV světlem. P7111P cDNA fragment SEQ ID NO: 307 byla radioaktivně značen a byl použit pro hybridizaci s těmito filtry. Pozitivní klony byly selektovány a byla připravena cDNA, která byla sekvencována na Perkin Elmer/Applied Biosystems sekvenátoru. Určená kompletní sekvence pro P711P je uvedena v SEQ ID NO: 382 a odpovídající předpokládaná aminokyselinová sekvence je uvedena v SEQ ID NO: 383.
PCR a hybridizačními technikami byly získány další informace o sekvenci cDNA pro dva klony popsané výše, 11-C9 a 9-F3, které jsou zde také označovány jako P707P a P714P, v příslušném pořadí (SEQ ID NO: 333 a 334). Po srovnání s nejnovější GenBank databází bylo zjištěno, že P707P je variantou s alternativním sestřihem známého genu HoxB13. Naopak, nebyly zjištěny žádné významné homologie pro P714P.
Bylo zjištěno, že klony 8-B3, P89, P98, P130 a P201 (jak jsou popsány v US patentu č. 09/020956, podaném 9.2.1998), jsou obsaženy v jedné kontinuální sekvenci, označené jako P705P (SEQ ID NO: 335, s předpokládanou aminokyselinovou sekvencí uvedenou v SEQ ID NO: 336), která je variantou s alternativním sestřihem známého genu NKX 3.1.
Příklad 4: Syntéza polypeptidů
Polypeptidy mohou být syntetizovány na Perkin Elmer/Applied Biosystems 430A peptidovém syntezátoru za použití FMOC techniky s HPTU (O-benzotriazol-N,N,Ν',Ν'-tetramethyluroniumhexafluorfosfatovou) aktivací. Gly-Cys-Gly sekvence může být navázána na amino- konec peptidu pro konjugaci, vazbu na imobilizovaný povrch nebo značení peptidu. Štěpení peptidů z pevných nosičů může být provedeno za použití následující štěpící směsi: kyselina trifluoroctová: ethandithiol: thioanisol: voda: fenol (40:1:2:2:3). Po štěpení trvající 2 hodiny mohou být peptidy vysráženy v chladném methyl-t-butyl-etheru. Peptidové pelety mohou být potom rozpuštěny ve vodě obsahující 0,1% kyselinu trifluoroctovou (TFA) a mohou být lyofilizovány před přečištěním C18 HPLC s reverzní fází. Pro eluování peptidů může být použit gradient 0%-60% acetonitrilu (obsahujícího 0,1% TFA) ve vodě (obsahující 0,1% TFA). Po lyofilizaci čisté frakce mohou být peptidy charakterizovány za použití elektrosprejové nebo jiné hmotnostní spektrometrie a aminokyselinové analýzy.
Příklad 5: Další izolace a charakterizace prostatických nádorových polypeptidů PCR-odečtem cDNA knihovna připravená z mRNA nádoru prostaty, jak byla popsaná výše, byla odečtena s cDNA z normální prostaty. Odečet byl proveden PCR technikou (Clontech), která byla modifikována tak, aby byly generovány větší fragmenty. V tomto protokolu byly testovací a řídící dvouřetězcová cDNA odděleně tráveny pěti restrikčními enzymy, které rozpoznávají šestinukleotidová restrikční místa (Mlul, MscI, PvuII, Sáli a Stul). Toto trávení vedlo k zisku cDNA průměrné velikosti 600 bp, místo průměrné velikosti 300 bp, které bylo dosaženo trávením Rsal podle Clontech protokolu. Tato modifikace neovlivnila účinnost odečtu. Dvě testované populace byly potom opatřeny různými adaptéry a řídící knihovna byla ponechána bez adaptérů.
Testovací a řídící knihovny byly potom hybridizovány za použití nadbytku řídící cDNA. V prvním stupni hybridizace byla řídící knihovna odděleně hybridizována každou ze dvou testovaných populací cDNA. Toto vedlo k zisku populací: (a) nehybridizované testovací cDNA, (b) testovací cDNA hybridizované na jinou
• 4 • 9 9 ·· • 9 99 9 9 9 9 9 9 9 9 9
• · « · • 9 9 9 • ·· 9 9 9 9 99 9 9 9 9 9 9 9 4 • 4 9 9
testovací cDNA, (c) testovací cDNA hybridizované na řídící cDNA, a (d) nehybridizované řídící cDNA. Dvě samostatné hybridizační reakce byly potom kombinovány a byla provedena rehybridizace za přítomnosti další denaturované řídící cDNA. Po této druhé hybridizaci byla kromě populací (a) až (d) vytvořena pátá populace (e) , ve které byla testovací cDNA s jedním adaptérem hybridizována na testovací cDNA s druhým adaptérem. Proto vedla druhá hybridizace k obohacení diferenciálně exprimovaných sekvencí, které mohou být použity jako templáty pro PCR amplifikaci s primery specifickými pro adaptéry.
Konce byly doplněny a PCR amplifikace byla provedena za použití primerů specifických pro adaptéry. Pouze populace /eú, které obsahovala testovací cDNA nehybridizující na řídící cDNA, byla amplifikována exponenciálně. Potom se provedl druhý amplifikační krok za účelem redukce pozadí a dalšího obohacení diferenciálně exprimovaných sekvencí.
Tato PCR-odečítací technika normalizuje diferenciálně exprimované cDNA tak, že mohou být získány vzácné transkripty, které jsou nadměrně exprimovány v prostatické nádorové tkáni. Takové transkripty by bylo obtížné získat tradičními odečítacími technikami.
Kromě genů, o kterých bylo známo, že jsou nadměrně exprimovány v prostatické tkáni, bylo identifikováno 77 dalších klonů. Sekvence těchto částečných cDNA jsou uvedeny v SEQ ID NO: 29 až 305. Většina z těchto klonů nevykazuje významnou homologii se sekvencemi v databázích. Výjimkou byly JPTPN23 (SEQ ID NO: 231; podobnost s prasečím proteinem obsahujícím valosin); JPTPN30 (SEQ ID NO: 234; podobnost s krysí mRNA pro proteasomovou podjednotku); JPTPN45 (SEQ ID NO: 243; podobnost s krysí norvegicus cytosolovou NADP-dependentní isocitrat-dehydrogenasou), JPTPN46 (SEQ ID NO:
• ♦ · • ·· • · • • • · • f » • · •
• • • •
• · * • ·
• · ·· • · ♦ * 44
244; podobnost s lidskou DNA sekvencí subklonu H8 4 d4); JP1D6 (SEQ ID NO: 265; podobnost s G. gallus lehkým řetězcem A dyneinu), JP8D6 (SEQ ID NO: 288; podobnost s lidským BAC koněm RG016J04), JP8F5 (SEQ ID NO: 289; podobnost s lidskou DNA sekvencí subklonu H8 3 b5) a JP8E9 (SEQ ID NO: 299; podobnost s lidskou Alu sekvencí).
Další pokusy za použití PCR odečtové knihovny skládající se z prostatického nádorového souboru odečteného proti normálnímu prostatickému souboru (zde označováno jso PT-PN PCR odečet) vedly k zisku tří dalších klonů. Srovnání cDNA sekvencí těchto klonů se sekvencemi v GenBank neukázala žádnou významnou homologii pro dva klony označené jako P715P a P767P (SEQ ID NO: 312 a 314). Zbývající klon vykazoval určitou homologii se známým genem KIAA0056 (SEQ ID NO: 318). Pomocí analýzy založené na mikrosestavách pro měření úrovně exprese mRNA v různých tkáních bylo zjištěno, že všechny tři klony jsou nadměrně exprimovány v nádorech prostaty a v tkáních BHP. Přesněji, klon P715P byl nadměrně exprimován ve většině nádorů prostaty a BHP, trojnásobně nebo vícenásobně, a zvýšená exprese byla také pozorována ve většině vzorků z normálních prostat a ve fetální tkáni, ale ve všech ostatních normálních tkáních byla exprese malá nebo žádná. Klon 767P byl nadměrně exprimován v několika nádorech prostaty a BHP tkáních, se střední expresí v polovině normálních prostatických tkání a s nízkou expresí ve všech ostatních testovaných normálních tkáních.
Další pokusy využívají techniky mikrosestav popsané výše provedené na PT-PN PCR odečtené knihovně a na DNA odečtové knihovně obsahující cDNA z prostatického nádoru odečtenou proti souboru normální tkáňové DNA, vedly k izolaci 27 dalších klonů (SEQ ID NO: 340-365 a 381), které byly nadměrně exprimovány v nádorech prostaty. Klony SEQ ID NO: 341, 342, 345, 347, 348, 349,
• · · • · • · · • · ·· ·
351, 355-359, 361, 362 a 364 byly také nadměrně exprimovány v normální prostatě. Exprese všech 26 klonů v různých normální tkáních byla nízká nebo nedetekovatelná, s výjimkou P544S (SEQ ID NO: 356), který byl exprimován v tenkém střevu. Z 26 klonů vykazovalo 10 (SEQ ID NO: 340-349) určitou homologii s dříve identifikovanými sekvencemi. Žádné významné homologie nebyly zjištěny pro klony SEQ ID NO: 350-356.
Příklad 6: Priming myší peptidem a propagace CTL linií
6.1. Tento příklad ilustruje přípravu CTL buněčné linie specifické pro buňky exprimující P502S gen.
Myši exprimující transgen pro lidský HLA A2.1 (získané od DrL. Sherman, The Scripps Research Institute, La Jolla, CA) byly imunizované P2S12 peptidem (VLGWVAEL; SEQ ID NO: 306), který je odvozen od P502S genu (zde též označovaného jako Jl-17; SEQ ID NO: 8), způsobem popsaným v Theobalt et al., Proč. Nati. Acad. Sci. USA 92: 11993-11997, 1995, s následujícími modifikacemi. Myši byly imunizované 100 ug P2S12 a 120 ug I-Ato vazebného peptidů odvozeného od proteinu viru hepatitidy B emulsifikovaného v nekompletním Freundově adjuvans. O tři týdny později byly myši utraceny a za použití nylonového síta byla připravena suspenze jednotlivých buněk. Buňky se potom resuspendovaly v koncentraci 6 x 106 buněk/ml v kompletním mediu (RPMI-1640, Gibco BRL, Gaithersburg, MD) obsahujícím 10% FCS, 2 mM glutaminu (Gibco BRL), pyruvat sodný (Gibco BRL), neesenciální aminokyseliny (Gibco BRL), 2 x 10-5 M 2-merkaptoethanolu, 50 U/ml penicilinu a streptomycinu, a provedla se kultivace za přítomnosti ozářených (3000 rad) P2S12-pulsovaných (5 mg/ml P2S12 a 10 mg/ml beta^-mikroglobulinu) LPS blastů (A2 transgenní splenické buňky kultivované za přítomnosti 7 ug/ml dextransíranu a 25 ug/ml LPS po dobu 3 dnů). 0 šest dnů později se buňky (5χ10Ξ ml) restimulovaly 2,5 x 105/ml
peptidem pulsovaných ozářených (20000 rad) EL4A2Kb buněk /Sherman et al., Science 258: 815-818, 1992) a 3 x 106/ml A2 transgenních splenických vyživovacích buněk. Buňky se kultivovaly za přítomnosti 20 U/ml IL-2. Buňky se restimulovaly popsaným způsobem jednou týdně pro přípravu pro klonování linie.
P2S12 linie byla klonována analýzou s limitním ředěním s peptidem pulsovanými E14A2Kb nádorovými buňkami (lxlO4 buněk/jamku) jako stimulátory a A2 transgenními splenickými buňkami jako vyživovacími buňkami (5xl05 buněk/jamku) kultivovanými za přítomnosti 30 U/ml IL-2. V den 14 byly buňky restimulovány způsobem popsaným -výše. V den 21 byly rostoucí klony izolovány a dále kultivovány. Několik z těchto klonů vykazovalo významně vyšší reaktivitu (lýzu) pro lidské fibroblasty (exprimující HLA A2.1) transdukované P502S než pro kontrolní fibroblasty. Příklad je uveden na obr. 1.
Tato data naznačují, že P2S12 představuje přirozeně zpracovávaný epitop P502S proteinu, který je exprimován v kontextu s lidskou HLA A2.1 molekulou.
6.2 Tento příklad ilustruje přípravu myších CTI linií a CTL klonů specifických pro buňky exprimující P501S gen.
Tato serie pokusů byla provedena podobnějak bylo popsáno výše. Myši byly imunizované P1S10 peptidem (SEQ ID NO: 337), který je odvozen od P501S genu (který je zde též označován jako Ll-12, SEQ ID NO: 110). P1S10 peptid byl získán analýzou předpokládané polypeptidové sekvence pro P501S na potenciální vazebné sekvence pro HLA-A, jak jsou definovány publikovanými vazebnými motivy pro HLA-A (Parker, A.C. et al., J. Immunol. 152: 163, 1994). P1S10 peptid byl syntetizován způsobem popsaným v příkladu 4 a byl empiricky testován na vazbu na HLA-A2 za použití T-lymfocytárního
kompetičního testu. Předpokládané vazebné peptidy pro A2 byly testovány na jejich schopnost soutěžit s HLA-A2 specifickou prezentací peptidů na HLA-A2 restrihovaném CTL klonu (D150M58), který je specifický pro peptid fluM58 matrice chřipkového viru vážící se na HLA-A2. D150M58 CTL secernují TNF v reakci na vlastní prezentaci peptidů fluM58. V kompetičním testu se peptidy v koncentraci 100-200 ug/ml přidají do kultur D150M58 CTL pro vazbu HLA-A2 na CTL. Po 30 minutách kultivace CTL s testovanými peptidy nebo kontrolními petidy se testuje jejich odpověď na dávku antigenu (fluM58 peptidů) ve standardních TNF-biotestu. Jak je uvedeno na obr. 3, peptid P1S10 soutěží s HLA-A2 restrihovanou prezentací fluM58, což dokazuje, že se peptid P1S10 váže na HLA-A2.
Myši exprimující transgen pro lidský HLA A2.1 se imunizovaly způsobem popsaným v Theobalt et al., Proč. Nati. Acad. Sci. USA 92: 11993-11997, 1995, s následujícími modifikacemi. Myši byly imunizované 62,5 ug P2S10 a 120 ug I-A13 vazebného peptidů odvozeného od proteinu viru hepatitidy B emulsifikovaného v nekompletním Freundově adjuvans. O tři týdny později byly myši utraceny a za použití nylonového síta byla připravena suspenze jednotlivých buněk. Buňky se potom resuspendovaly v koncentraci 6 x 106 buněk/ml v kompletním mediu (jak bylo popsáno výše) a provedla se kultivace za přítomnosti ozářených (3000 rad) P2S10-pulsovaných (2 ug/ml P2S10 a 10 mg/ml betaz-mikroglobulinu) LPS blastů (A2 transgenní splenické buňky kultivované za přítomnosti 7 ug/ml dextransíranu a 25 ug/ml LPS po dobu 3 dnů). O šest dnů později se buňky (5 x 105 ml) restimulovaly 2,5 x 10s/ml peptidem pulsovaných ozářených (20000 rad) EL4A2Kb buněk (jak byly popsány výše) a 3 x 106/ml A2 transgenních splenických vyživovacích buněk. Buňky se kultivovaly za přítomnosti 20 U/ml IL-2. Buňky se restimulovaly popsaným způsobem jednou týdně pro přípravu pro klonování linie. Po třech kolech stimulací in vitro ·· ·· ···· ·· • · · · · · · · ·· · · · · · • · · · · · · ·· ·· · ·· · se získala jedna linie, která rozpoznávala P1S10 pulsované Jurkat
A2Kb cílové buňky a P5011S transdukované Jurkat cílové buňky, jak j e uvedeno na obr. 4.
P2S10-specifická CTL linie byla klonována analýzou s limitním ředěním s peptidem pulsovanými E14A2Kb nádorovými buňkami (lxlO4 buněk/jamku) jako stimulátory a A2 transgenními splenickými buňkami jako vyživovacími buňkami (5xlOs buněk/jamku) kultivovanými za přítomnosti 30 U/ml IL-2. V den 14 byly buňky restimulovány způsobem popsaným výše. V den 21 byly rostoucí klony izolovány a dále kultivovány. Jak je uvedeno na obr. 5, pět z těchto klonů vykazovalo specifickou cytolytickou reaktivitu pro P501S-transdukované Jurkat A2Kb cílové buňky. Tato data ukazují, že P1S10 představuje přirozeně zpracovávaný epitom P501S proteinu, který je exprimován v kontextu s lidskou HLA A2.1 molekulou.
Příklad 7: Schopnost lidských T-lymfocytů rozpoznávat prostatické nádorové polypeptidy
Tento příklad ilustruje schopnost T-lymfocytů specifických pro prostatický nádorový polypeptid rozpoznávat lidský nádor.
Lidské CD8* T-lymfocyty byly aktivovány in vitro P2S-12 peptidem (SEQ ID NO: 306) odvozeným z P502S (též označovaným jako Jl-17) za použití dendritických buněk podle protokolu popsaného v Van Tsai et al., Critical Reviews in Immunology 18: 65-75, 1988) . Získané mikrokultury CD8+ T-lymfocytů byly testovány na jejich schopnost rozpoznávat P2S-12 peptid prezentovaný autologiními fibroblasty nebo fibroblasty, které byly transdukované tak, aby exprimovaly P502S gen, v gamma-interferonovém ELISPOT testu (viz Lalvani et al., J. Exp. Med. 186: 859-865, 1997). Stručně, titrování počtu T-lymfocytů bylo provedeno dvojmo na 104 fibroblastech za přítomnosti 3 ug/ml lidského beta2-mikroglobulinu ··· ··· ··· ····· ·· · ·· · · · a 1 ug/ml P2S-12 peptidů nebo kontrolního E75 peptidů. Dále byly T-lymfocyty simultáně testovány na autologních fibroblastech transdukovaných P502S genem nebo - pro kontrolu - na fibroblastech transdukovaných HER-2/neu. Před testem byly fibroblasty zpracovány 10 ng/ml gamma-interferonu po dobu 48 hodin pro zvýšení exprese antigenů MHC třídy I. Jedna z mikrokultur (č.5) vykazovala silné rozpoznávání jak fibroblastů pulsovaných peptidem, tak transdukovaných fibroblastů v gamma-interferonovém ELISPOT testu. Obr. 2A ukazuje, že došlo ke značnému zvýšení počtu gamma-interferonových skvrn se zvýšeným počtem T-lymfocytů na fibroblastech pulsovaných P2S-12 peptidem (plné sloupce), ale ne pulsovaných kontrolním E75 peptidem (prázdné sloupce). Toto ukazuje na schopnost těchto T-lymfocytů specificky rozpoznávat P2S-12 peptid. Jak je uvedeno na obr. 2B, tato mikrokultura také prokázala zvýšení počtu gamma-interferonových skvrn se zvýšeným počtem T-lymfocytů na fibroblastech transdukovaných tak, aby exprimovaly P502S gen, ale ne HER-2/neu gen. Tyto výsledky poskytují další důkaz, že P2S-12 peptid je přirozeně zpracovávaný epitop P502S proteinu. Dále také dokazují, že u člověka existují v populaci T-lymfocytů vysoce-afinitni T-lymfocyty, které mohou rozpoznávat tento epitop. Tyto T-lymfocyty by měly být také schopné rozpoznávat lidské nádory exprimující P502S gen.
Příklad 8: Aktivace CTL in vivo za použití imunizace holou DNA s prostatickým antigenem
Prostatický nádorový antigen LI-12, jak je popsán výše, je také označován jako P501S. HLA A2Kb Tg myši (získané od DrL. Sherman, The Scripps Research Institute, La Jolla, CA) byly imunizované 100 ug VR10132-P501S buď intramuskulárně, nebo intradermálně. Myši byly imunizované třikrát, s dvoutýdením intervaelm mezi imunizacemi. Dva týdny po poslední imunizaci byly imunitní buňky sleziny kultivovány s Jurkat A2Kb-P501S
transdukovanými stimulačními buňkami. CTL linie byly stimulovány jednou týdně. Po dvou týdnech stimulace in vitro byla hodnocena aktivita CTL proti cílovým buňkám transdukovaným P501S. U dvou 2 osmi myší se vyvinula silná odpověď proti P501S. Tyto výsledky ukazují, že P501S obsahuje alespoň jeden přirozeně zpracovávaný CTL epito restrihovaný A2.
Příklad 9: Příprava lidských CTL in vitro za použití aktivace celým genem a stimulačních technik s prostatickým nádorovým antigenem
Za použití in vitro aktivace celým genem s P501S-retrovirově transdukovanými autologními fibroblasty (viz například Yee et al., The Journal of Immunology, 157(9): 4079-86, 1996), byly připraveny lidské CTL linie, které specificky rozpoznávají autologní fibroblasty transdukované P501S (též Ll-12), jak bylo určeno v gamma-interferonovém ELISPOT testu, který byl popsán výše. Pomocí panelu fibroblastových linií s chybným HLA transdukovaných P501S bylo prokázáno, že tyto CTL linie jsou restrihovány alelou HLA-A2 třídy I. Přesněji, dendritické buňky (DC) se diferencovaly z kultur monocytů získaných z PBMC normálních lidských dárců kultivací po dobu 5 dnů v RPMI mediu obsahujícím 10% lidské sérum, 50 ng/ml lidského GM-CSF a 30 ng/ml lidského IL-4. Po kultivaci se DC infikovaly přes noc rekombinantním P501S virem vakcinie (5 moi) a nechaly se dozrát přes noc za přidání 3 ug/ml CD40 ligandu. Virus se inaktivoval ozářením UV světlem. CD8+ T-lymfocyty se izolovaly pomocí magnetických korálků a aktivování kultur se zahájilo standardním způsobem. Kultury se restimulovaly každých
7-10 dnů za použití autologních primárních fibroblastů retrovirově transdukovaných P501S. Po čtyř cyklech stimulace se identifikovaly linie CD8+ T-lymfocytů, které specificky produkovaly interferon-gamma po stimulaci autologními fibroblasty transdukovanými P501S. P501S specifická aktivita mohla být prodloužena kontinuální stimulací kultur fibroblasty transdukovanými P501S za přítomnosti IL-15. Byl připraven panel fibroblastových linií s chybnými HLA antigeny transdukovaných P501S, aby mohla být definována restrikční alela reakce, odle měření interferonu gamma v ELISPOT testu je odpověď specifická pro P501S restrihována HLA-A2. Tyto výsledky ukazují, že může být vyvolána CD8+ CTL odpověď na P501S.
Příklad 10: Identifikace přirozeně zpracovávaného CTL epitopu v prostatickém nádorovém antigenu
9-merový peptid p5 (SEQ ID NO: 338) byl odvozen z P703P antigenu (též označovaného jako P20). p5 peptid je imunogenní u lidských HLA-A2 dárců a jedná se přirozeně zpracovávaný epitop. CD8+ T-lymfocyty specifické pro antigen mohou být aktivovány po opakovaných in vitro stimulacích s monocyty pulsovanými p5 peptidem. Tyto CTL specificky rozpoznávají p5-pulsované cílové buňky jak v ELISPOT (jak je popsán výše), tak v testu uvolňování chrómu. Dále, imunizace HLA-A2 transgenních myší p5 vedla k přípravě CTL linií rozpoznávajících různé cílové buňky transdukované P703P exprimující buď HLA-A2Kb nebo HLA-A2. Přesněji, HLA-A2 transgenní myši byly imunizovány podkožně v oblasti tlapky 100 ug p5 peptidu spolu se 140 ug jaderného proteinu viru hepatitidy B (Th peptid) ve Freundově nekompletním adjuvans. Tři týdny po imunizaci byly buňky sleziny od imunizovaných myší stimulovány in vitro s LPS blasty pulsovanými peptidem. Aktivita CTL byla měřena testem uvolňování chrómu pět dnů po první stimulaci in vitro. Buňky transdukované retrovirem exprimující kontrolní antigen P703P a HLA-A2Kb byly použity jako cíle. Byly identifikovány CTL linie, která specificky rozpoznávaly jak cílové buňky pulsované p5, tak cíle exprimující P703P.
Lidské in vitro aktivační pokusy prokázaly, že p5 peptid je
imunogenní u člověka. Dendritické buňky (DC) se diferencovaly z kultur monocytů získaných z PBMC normálních lidských dárců kultivací po dobu 5 dnů v RPMI mediu obsahujícím 10% lidské sérum, 50 ng/ml lidského GM-CSF a 30 ng/ml lidského IL-4. Po kultivaci se DC pulsovaly p5 peptidem a kultivovaly se s GM-CSF a IL-4 spolu s PBMC obohacenými o CD8+ T-lymfocyty. CTL linie se restimulovaly každý týden za použití monocytů pulsovaných p5. Pět až šest týdnů po iniciaci CTL kultur bylo prokázáno rozpoznávání p5-pulsovaných cílových buněk CTL.
Příklad 11: Exprese antigenu odvozeného z nádoru prsu v prostatě
Izolace antigenu B305D znádoru prsu diferenciálním zobrazením je popsáno v US patentové přihlášce č. 08/700014, 20.8.1196. Izolovalo se několik forem tohoto antigenu s alternativním sestřihem. Určené cDNA sekvence pro tyto formy s alternativním sestřihem jsou uvedeny v SEQ ID NO: 366-375, s předpokládanými aminokyselinovými sekvencemi odpovídajícími SEQ ID NO: 292, 298 a 301-303 uvedenými v SEQ ID NO: 299-306, v příslušném pořadí.
Úrovně exprese B305D v různých nádorech a normálních tkáních byly vyšetřovány PCR v reálném čase a Northernovou hybridizací. Výslekdky ukazují, že B305D je vysoce exprimován v nádoru prsu, nádoru prostaty, normální prostatě a normálních varlatech, s nízkou nebo nedetekovatelnou expresí ve všech osatních vyšetřovaných tkáních (nádoru tlustého střeva, nádoru plic, nádoru vaječníku a normální kostní dřeni, tlustém střevu, ledvinách, játrech, plících, vaječníkách, kůži,, tenkém střevu, žaludku.
Příklad 12: Vyvolání CTL odpovědí specifických pro prostatický nádorový antigen v lidské krvi
Tento příklad ilustruje schopnost prostatického nádorového
·· · · • · · · · • · · · ·· ·· antigenu vyvolávat CTL odpověď v krvi normálních lidí.
Autologní dendritické buňky (DC) se diferencovaly z kultur monocytů získaných z PBMC normálních lidských dárců kultivací po dobu 5 dnů v RPMI mediu obsahujícím 10% lidské sérum, 50 ng/ml lidského GM-CSF a 30 ng/ml lidského IL-4. Po kultivaci se DC infikovaly přes noc rekombinantním P501S-exprimujícím virem vakcinie (5 moi) a nechaly se dozrát během 8 hodin za přidání 2 ug/ml CD40 ligandu. Virus se inaktivoval ozářením UV světlem. CD8+ T-lymfocyty se izolovaly pomocí magnetických korálků a aktivování kultur se zahájilo ve 24-jamkových plotnách. Po 5 cyklech stimulace se identifikovaly linie CD8+ buněk, které specificky produkovaly interferon-gamma po stimulaci autologními fibroblasty transdukovanými P501S. P501S specifická aktivita buněčné linie 3A-1 mohla být udržována dalšími stimulačními cykly na autologních B-LCL transdukovaných P501S. Bylo prokázáno, že linie 3A-1 specificky rozpoznává autologní B-LCL transdukované pro expresi P501S, ale ne autologní B-LCL transdukované RGFP, pomocí testu cytotoxicity (uvolňování 51Cr) a produkce interferonu gamma (Interferon-gamma Elispot; viz výše a Lalvani et al., J. Exp. Med. 186: 859-865, 1977). Výsledky těchto testů jsou uvedeny na obr. 6A a 6b.
Příklad 13: Identifikace prostatických nádorových antigenů analýzou využívající mikrosestav
Tento příklad ilustruje izolaci některých prostatických nádorových polypeptidů z cDNA knihovny nádoru prostaty.
Lidská prostatická nádorová cDNA knihovna, jak byla popsána výše, byla prohledávána za použití analýzy využívající mikrosestav pro identifikaci klonů, které vykazují alespoň trojnásobnou nadměrnou expresi v nádorech prostaty a/nebo normální prostatické ·· ··♦· tkáni, ve srovnání s neprostatickými normálními tkáněmi (bez varlat). Identifikovalo se 372 klonů a 319 z nich bylo úspěšně sekvencováno. Tabulka 1 uvádí souhrn těchto klonů, které jsou popsány v SEQ ID NO: 385-400. Z těchto sekvencí odpovídají SEQ ID NO: 386, 389, 390 a 392 novým genům a SEQ ID NO: 393 a 396 odpovídají sekvencím identifikovaným dříve. Další sekvence (SEQ ID NO: 385, 387, 388, 391, 394, 395 a 397-400) odpovídají známým sekvencím, jak je uvedeno v tabulce 1.
Tabulka 1: Souhrn prostatických nádorových antigenů
Známé geny Dříve identifikované geny Nové geny
Gamma řetězec P504S 23379 (SEQ ID
T-lymfocytů NO: 389)
Kallikrein P1000C 23399 (SEQ ID NO:
392)
Vektor P501S 23320 (SEQ ID NO:
386)
mRNA pro CGI-82 P503S 23381 (SEQ ID NO:
protein (23319; 390)
SEQ ID NO: 385)
PSA P501S
Aid. 6 dehydrogenasa P784P
L-iditol-2-dehydro- P502S
genasa (23376;
SEQ ID NO: 388)
100
Ets transkripční faktor PDEF (22672;
SEQ ID NO: 398) hTGR (22678; SEQ ID
NO: 399)
ΚΙΆΑ0295 (22685;
SEQ ID NO: 400)
Prostatická kyselá fosfatasa (22655;
SEQ ID NO: 397)
Transglutaminasa (22611; SEQ ID NO: 395)
HDLBP (23508; SEQ ID
NO: 394)
CGI-69 protein (23376
SEQ ID NO: 387)
ΚΙΆΑ0122 (23383;
SEQ ID NO: 391)
P706P
19142.2, bangur. sekv. (22621; SEQ ID NO: 396)
5566.1 Wang (23404;
SEQ ID NO: 393)
P712P
P778P
TEEG
CGI-82 vykazoval 4,06-násobnou nadměrnou expresi v prostatických tkáních ve srovnání s jinými testovanými normálními tkáněmi. Byl nadměrně exprimován ve 43% nádorů prostaty, 25% normálních prostat a nebyl detekován v ostatních ··*« • Μ • Φ
4· * · «» * · ·
101 ··
testovaných normálních tkáních. L-iditol-2-dehydrogenasa vykazovala 4, 94-násobnou nadměrnou expresi v prostatických tkáních ve srovnání s jinými testovanými normálními tkáněmi. Byla nadměrně exprimována ve 90% nádorů prostaty, 100% normálních prostat a nebyla detekována v ostatních testovaných normálních tkáních. Ets transkripční faktor PDEF vykazoval 5,55-násobnou nadměrnou expresi v prostatických tkáních ve srovnání s jinými testovanými normálními tkáněmi. Byl nadměrně exprimován ve 47% nádorů prostaty, 25% normálních prostat a nebyl detekován v ostatních testovaných normálních tkáních. hTGRl vykazoval 9, 11-násobnou nadměrnou expresi v prostatických tkáních ve srovnání s jinými testovanými normálními tkáněmi. Byl nadměrně exprimován v 63% nádorů prostaty a nebyl detekován v ostatních testovaných normálních tkáních. KIAA0295 vykazoval 5,59-násobnou nadměrnou expresi v prostatických tkáních ve srovnání s jinými testovanými normálními tkáněmi. Byl nadměrně exprimován v 47% nádorů prostaty a nebyl detekovatelný nebo byl nízký v testovaných normálních tkáních včetně normálních tkání prostaty. Prostatická kyselá fosfatasa vykazovala 9,14-násobnou nadměrnou expresi v prostatických tkáních ve srovnání s jinými testovanými normálními tkáněmi. Byla nadměrně exprimována ve 67% nádorů prostaty, 50% normálních prostat a nebyla detekována v ostatních testovaných normálních tkáních. Transglutaminasa vykazovala 14, 84-násobnou nadměrnou expresi v prostatických tkáních ve srovnání s jinými testovanými normálními tkáněmi. Byla nadměrně exprimována v 30% nádorů prostaty, 50% normálních prostat a nebyla detekována v ostatních testovaných normálních tkáních. Vazebný protein pro lipoprotein s vysokou densitou vykazoval 28,06-násobnou nadměrnou expresi v prostatických tkáních ve srovnání s jinými testovanými normálními tkáněmi. Byl nadměrně exprimován v 97% nádorů prostaty, 75% normálních prostat a nebyl detekován v ostatních testovaných normálních tkáních. CGI-69 vykazoval 3,56-násobnou nadměrnou expresi v prostatických tkáních ve srovnání s jinými testovanými
102 málo četný gen a byl detekován ve více v 75% normálních prostat. Exprese tohoto byla velmi nízká. KIAA.0122 vykazoval 4, • · · · · · • · · · ·· · · • · · · · ·♦ ·· · normálními tkáněmi. Jde o než 90% nádorů prostaty a genu v normálních tkáních
24-násobnou nadměrnou expresi v prostatických tkáních ve srovnání s jinými testovanými normálními tkáněmi. Byl nadměrně exprimován v 57% nádorů prostaty a nebyl detekovatelný v testovaných normálních tkáních včetně normálních tkání prostaty. 19142.2 bangur vykazoval 23,25-násobnou nadměrnou expresi v prostatických tkáních ve srovnání s normálními tkáněmi. Byl nadměrně exprimován v a ve 100% normálních prostat. Nebyl detekován
3, ve srovnání exprimován také břišní
Nebyl detekován
Nový klon 23399 prostatických tkáních tkáněmi. Byl nadměrně j inými test ovánými 97% nádorů prostaty v ostatních testovaných normálních tkáních. 5566.1 Wang vykazoval 31-násobnou nadměrnou expresi v prostatických tkáních s j inými testovanými normálními tkáněmi. Byl nadměrně v 97% nádorů prostaty, v 75% normálních prostat a byl nadměrně exprimován v normální kostní dřeni, slinivce a aktivovaných PBMC. Nový klon 23379 vykazoval 4,86-násobnou nadměrnou expresi v prostatických tkáních ve srovnání s jinými testovanými normálními tkáněmi. Byl nadměrně exprimován v 97% nádorů prostaty a v 75% normálních prostat, v ostatních testovaných normálních tkáních, vykazoval 4,09-násobnou nadměrnou expresi v ve srovnání s jinými testovanými normálními exprimován ve 27% nádorů prostaty a nebyl detekován v ostatních testovaných normálních tkáních včetně normálních prostat. Nový klon 23320 vykazoval 3,15-násobnou nadměrnou expresi v prostatických tkáních ve srovnání s jinými testovanými normálními tkáněmi. Byl detekovatelných ve všech nádorech prostaty, byl také exprimován v normálním tlustém střevu a průdušnici. Další normální tkáně neexprimovaly tento gen ve vysokých úrovních, a nebyl detekován v ostatních testovaných normálních tkáních.
103
Příklad 14: Identifikace prostatických nádorových antigenů elektronickým odečtem
Tento příklad popisuje použití elektronického odečtu pro identifikaci prostatických nádorových antigenů.
Potenciální geny specifické pro prostatu uvedené v GenBank lidských EST databázích byly identifikovány elektronickým odečtem {podobně jak je popsáno v Vasmatizis et al., Proč. Nati. Acad. Sci. USA, 95:300-304, 1998). Sekvence EST klonů (43482) odvozených z různých prostatických knihoven byly získány z GenBank veřejné databáze lidských EST. Každá prostatická EST sekvence byla použita jako dotazová sekvence v BLASTN (National Center Biotechnology Information) vyhledávání v lidské EST databázy. Všechny zjištěné sekvence považované za identické (délka odpovídající sekvence je větší než 100 párů baží, densita identických párů v tomto regionu je větší než 70%) byly seskupeny dohromady v seskupení. Seskupení obsahující více než 200 EST byly odstraněny, protože pravděpodobně představují repetitivní elementy nebo vysoce exprimované geny, jako jsou geny pro ribosomální proteiny. Pokud sdílela dvě nebo více seskupení společné EST, byla tato seskupení sdružena do superseskupení, za vzniku 4345 prostatických superseskupení.
Záznamy pro 479 lidských cDNA knihoven uvedených v GenBank byly použity pro 'vytvoření databáze těchto záznamů cDNA knihoven. Těchto 479 cDNA knihoven bylo rozděleno do 3 skupin. Plus (normální prostatická a prostatická nádorová knihovna a buněčná linie nádoru prsu, ve které je exprese žádoucí), minus (knihovny z jiných normálních dospělých tkání, ve kterých je exprese nežádoucí) a Jiné (fetální tkáně, dětské tkáně, tkáně -vyskytující se pouze u žen, jiné nádory než nádory prostaty a jiné buněčné linie než prostatické buněčné linie, ve kterých je exprese považována za irelevantní. Souhrn těchto skupin knihoven je
104
uvedena v Tabulce 2.
Tabulka 2: Prostatické cDNA knihovny a EST
Knihovna počet knihoven počet EST
Plus 25 43482
Normální 11 18875
Nádorová 11 21769
Buněčné linie 3 2838
Minus 166
Jiné 287
Každé supersekupení bylo analyzováno na EST v supersekupení. Zaznamenal se tkáňový zdroj každého EST klonu a použil se pro klasifikaci supersekupení do čtyř skupin-, typ 1-EST klonů vyskytující se pouze v Plus skupině knihoven, bez detekovatelné exprese v Minus nebo Jiné skupině knihoven; typ 2-EST klonů vyskytující se pouze v Plus a Jiné skupině knihoven, bez detekovatelné exprese v Minus skupině knihoven; typ 3-EST klonů vyskytující se v Plus, Minus a Jiné skupině knihoven, kde exprese v Plus skupině je vyšší než v Minus nebo Jiné skupině; a typ 4-EST klon vyskytující se v Plus, Minus a Jiné skupině knihoven, kde exprese v Plus skupině je vyšší než v Minus skupině. Tato analýza identifikovala 4345 seskupení pro prs (viz tabulka 3). Z těchto seskupení bylo 3172 EST klonů objednáno od Research Genetics lne., a byly získány ve formě zmrazených glycerolových zásobníků v 96-jamkových plotnách.
105
Tabulka 3
Typ počet superseskupení počet objednaných EST
1 688 677
2 2899 2484
3 85 11
4 673 0
Celkem 4345 3172
Inserty byly amplifikovány PCR za použití amino-vázaných PCR primerů pro Syntheni analýzu využívající mikrosestav. Když byl pro jednotlivý klon získán více než jeden PCR produkt, tak nebyl tento PCR produkt použit pro analýzu exprese. Celkem bylo 2528 klonů získaných elektronickým odečtem analyzováno pomocí mikrosestav pro identifikaci klonů z prsu, které měly vysoký poměr nádorové vs, normální tkáňové mRNA. Tato vyhledávání byla provedena za použití Syntheni (Palo ALto, CA) mikrosestavy, podle návodu výrobce (a v podstatě způsobem popsaným v Schena et al., Proč. Nati. Acad. Sci. USA 93: 10614-10619, 1996, a Heller et al,, Proč. Nati. Acad. Sci. USA 94: 2150-2155, 1997). V těchto analýzách byly klony uspořádány na čipu, který byl potom sondován fluorescenčními sondami generovanými z normální a nádorové prostatické cDNA, stejně jako z j iných normálních tkání. Membrány se skenovaly a měřila se intenzita fluorescence.
Klony s poměrem exprese vyšším než 3 (t.j. ve kterých byla hladina v prostatické nádorové cDNA alespoň třikrát vyšší než v normální prostatické cDNA) byly identifikovány jako sekvence specifické pro nádory prostaty (tabulka 4). Sekvence těchto klonů
106 • ·
jsou uvedeny v SEQ ID NO: 401-453, kde některé nové sekvence jsou uvedeny v SEQ ID NO: 407, 413, 416-419, 422, 426, 427 a 450.
Tabulka 4: Klony specifické pro nádory prostaty
SEQ ID NO: Označení sekvence Komentář
401 22545 dříve identifikovaný P1000C
402 22547 dříve identifikovaný P704P
403 22548 známý
404 22550 známý
405 22551 PSA
406 22552 prostatický sekreční protein 94
407 22553 nový
408 22558 dříve identifikovaný P509S
409 22562 glandulární kallikrein
410 22565 dříve identifikovaný P1000C
411 22567 PAP
412 22568 B1006C (antigen nádoru prsu)
413 22570 nový
414 22571 PSA
415 22572 dříve identifikovaný P706P
416 22573 nový
417 22574 nový
418 22575 nový
419 22580 nový
420 22581 PAP
421 22582 prostatický sekreční protein 94
422 22583 nový
423 22584 prostatický sekreční protein 94
424 22585 prostatický sekreční protein 94
425 22586 známý
107
426 22587 nový
427 22588 nový
428 22589 PAP
429 22590 známý
430 22591 PSA
431 22592 známý
432 22593 dříve identifikovaný P777P
433 22594 gamma řetězec receptoru T-lymfocytů
434 22595 dříve identifikovaný P705P
435 22596 dříve identifikovaný P707P
436 22847 PAP
437 22848 známý
438 22849 prostatický sekreční protein 57
439 22851 PAP
440 22852 PAP
441 22853 PAP
442 22854 dříve identifikovaný P509S
443 22855 dříve identifikovaný P705P
444 22856 dříve identifikovaný P774P
445 22857 PSA
446 23601 dříve identifikovaný P777P
447 23602 PSA
448 23605 PSA
449 23606 PSA
450 23612 nový
451 23614 PSA
452 23618 dříve identifikovaný P1000C
453 23622 dříve identifikovaný P705P
Příklad 15: Další identifikace prostatických nádorových antigenů pomocí analýzy využívající mikrosestav
108
Tento příklad popisuje izolaci dalších prostatických nádorových polypeptidů z prostaticné nádorové cDNA knihovny.
Lidská prostatická nádorová cDNA knihovna, jak byla popsána výše, byla prohledávána za použití analýzy využívající mikrosestav pro identifikaci klonů, které vykazují alespoň trojnásobnou nadměrnou expresi v nádorech prostaty a/nebo normální prostatické tkáni, ve srovnání s neprostatickými normálními tkáněmi (bez varlat). Identifikovalo se a sekvecovalo 142 klonů. Některé z těchto klonů jsou uvedeny v SEQ ID NO: 454-467. Z těchto sekvencí odpovídají SEQ ID NO: 459-461. Další sekvence (SEQ ID NO: 454-458 a 461-167) odpovídají známým sekvencím.
Příklad 16: Další charakterizace prostatického nádorového antigenu P710P
Tento příklad popisuje klonování úplného P710P.
Prostatická cDNA knihovna, popsaná výše, byla analyzována pomocí P710P fragmentu popsaného výše. Jeden milion kolonií se umístil na LB/Ampicilinové plotny. Nylonové membrány se použily pro přenos těchto kolonií a DNA přenesená na tyto filtry se potom denaturovaly a navázaly se na membrány UV světlem. P710P fragmen se radioaktivně označil a použil se pro hybridizaci s filtry. Pozitivní cDNA klony se selektovaly a získala se jejich cDNA a ta se sekvencovala pomocí automatizovaného ABI Sequencer. Získaly se čtyři sekvence, které jsou uvedeny v SEQ ID NO: 468-471.
Z uvedeného popisu je jasné, že ačkoliv byla popsána při popisu vynálezu výhodná provedení, mohou být provedeny různé modifikace, které se neodchylují od rozsahu a duchu vynálezu. V souladu s tím je vynález omezen pouze připojenými patentovými nároky.
__J • · · · • ·
109
Seznam sekvencí <110> Corixa Corporation <120> Prostředky a způsoby pro terapii a diagnostiku karcinomu prostaty <130> 210121.42701PC <140> PCT <141> 1999-07-08 <160> 472 <170> FastSEQ pro Windows verze 3.0 <210> 1 <211> 814 <212> DNA <213> Homo sapiens <220>
<221> různé vlastnosti <222> (1)...(814) <223> n = A, T, C nebo G <400> 1
tttttttttt tttttcacag tataacagct ctttatttct gtgagttcta ctaggaaatc 60
atcaaatctg agggttgtct ggaggacttc aatacacctc cccccatagc gaatcagctt 120
ccagggggtc cagtccctct ccttacttca tccccatccc atgccaaagg aagaccctcc 180
ctccttggct cacagccttc tctaggcttc ccagtgcctc caggacagag tgggttatgt 240
tttcagctcc atccttgctg tgagtgtctg gtgcgttgtg cctccagctt ctgctcagtg 300
cttcatggac agtgtccagc acatgtcact ctccactctc tcagtgtgga tccactagtt 360
ctagagcggc cgccaccgcg gtggagctcc agcttttgtt ccctttagtg agggttaatt 420
gcgcgcttgg cgtaatcatg gtcataactg tttcctgtgt gaaattgtta tccgctcaca 480
attccacaca acatacgagc cggaagcata aagtgtaaag cctggggtgc ctaatgagtg 540
anctaactca cattaattgc gttgcgctca ctgnccgctt tccagtcngg aaaactgtcg 600
tgccagctgc attaatgaat cggccaacgc ncggggaaaa gcggtttgcg ttttgggggc 660
tcttccgctt ctcgctcact nantcctgcg ctcggtcntt cggctgcggg gaacggtatc 720
actcctcaaa ggnggtatta cggttatccn naaatcnggg gatacccngg aaaaaanttt 780
aacaaaaggg cancaaaggg cngaaacgta aaaa 814
<210> 1
<211> 814
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> různé vlastnosti
<222> (1)..·(814)
<223> n = A, T, C nebo G
<400> 1
acagaaatgt tggatggtgg agcacctttc tatacgactt acaggacagc agatggggaa ttcatggctg ttggagcaat agaaccccag ttctacgagc tgctgatcaa aggactrgga
120
110 ctaaagtctg aagtttgcag acagatgcct aaggaacggg ctgctgttaa gccgccaccg ggcgtaatca aacatacgag cattaattgc ttantgaatc tcgctcattg ggtntnccgg atgaacttcc atgtatttgc gtgtgactcc gctcgtttat acaccccagc cggtggagct tggtcatagc ccggaacata gttgcgctca ngccaccccc atcctngcnc ttatccccaa caatcagatg aaagaagacg ggttctgact caccagtgag catcccttct ccagcttttg tgtttcctgt aagtgttaag ctgcccgctt cgggaaaagg ccggtcttcg acnggggata agcatggatg aaggcagagt tttgaggagg gagcaggacg ttcaaaaggg ttccctttag gtgaaattgt cctggggtgc tccagtcggg cggttgcntt gctgcggnga cccnga attggccaga ggtgtcaaat ttgttcatca tgagcccccg atccactagt tgagggttaa tatccgctca ctaatgantg aaaactgtcg ttgggcctct acggttcact aatgaagaag ctttgacggc tgatcacaac ccctgcacct tctagaagcg ttgcgcgctt caattccccc agctaactcn tgccactgcn tccgctttcc cctcaaaggc
1Θ0
240
300
360
420
480
540
600
660
720
780
816 <210> 3 <211> 773 <212> DNA <213> Homo sapien <220>
<221> různé vlastnosti <222> (1)...(773) <223> n = A,T,C neboG <400 cttttgaaag tcctgctcct tcctcaaaag tctgccttcg tccatgctca tcgtagaact gtcgtataga ccaattcgcc gtgactggga ccagctgggc gaatgggnaa acccccacnt cttcccttcc • 3 aagggatggc cactggtgat tcagaaccgg tcttctttgc tctgattggg ggggttctat aaggtgctcc ctatantgag aaaccctggg gtaatancga atgggacccc nnaccgctta tttcncnccn tggggtgttt aaacgagccc ágtcacacag aaatacatct aagttcatca tgctccaaca accatccaac tcgtattacg cgttaccaac aaaggcccgc cctgttaccg cactttgcca ctttcccccg aacagcagag cgttccttgt gcatctgtgc gcaaacttct gactttagtc gccatgaatt atgttctgtc cgcgctcact ttaatcgcct accgatcgcc cgcattnaac gcgccttanc gggtttcccc gtgcagggcg tgtgatcatg cgtcaaagat tcttcatttc canntccttt ccccatctgc ctcgaggggg ggccgtcgtt tgcagcacat cttccaacag ccccgcnggg gcccgctccc cntcaaaccc ggggctcacg atgaacaacc ttgacaccac tggccaatca gatcagcagc tgtcčtgtaa ggcccggtac ttacaacgtc ccccctttcg ttgcgcacct tttngttgtt tttcnccttt cna
120
180
240
300
360
420
480
540
600
660
720
773 <210> 4 <211> 828 <212> DNA <213> Homo sapien <220>
< 2 21 > i různé vlastnosti <222> (1)...(828) <223> n = A,T,C neboG <400> cctcctgagt aatgggcaga tcggaacact acgtgggtga agagtggaca acaatgcatg cctactgacc cacaggtgta ggctgtctct ccatgttgtt gtgacacaag aggcacacac tgtgctttct tgccaatgtt gaagacttct tgtggggtgc gtggacactc acagcaagga ggtgtggagt tctgaaatgg cgctcagttt agagatggga tctacagatc tgacnctgta ccagggctgc gtataatttc cagtgaggac ggggtggggc actgaggata aacatagccc taggaaaagg gtcctctcct acacacaaag ccaccctgga agctggagcc acgctgtcct
120
180
240
300
360
111 gngggcactg ctanagcggc gcgcgcttgg attccacaca ctaactcaca ccncttgcat tccgcttcct accncctcca ggaagcctan cgccaccgcg cntaatcatg acatacganc ttaattgcgt tnatgaatcn cnctcantta aagggggtat atnaggccgt gtgganctcc gtcatanctn cggaaacata tgcgctcact gccaaccccc ntccctncnc tccggtttcc gagcanaaag ancttttgtt tttcctgtgt aantgtaaac gcccgctttc ggggaaaagc tcggtcattc ccnaatccgg aaggggagga ccctttagtg gaaattgtta ctggggtgcc caatcnggaa gtttgcgttt cggctgcngc gganancc tccactagtt agggttaatt tccgctcaca taatgantga acctgtcttg tgggcgctct aaaccggttc
420
480
540
600
660
720
780
828 <210> 5 <211> 834 <212> DNA <213> Homo sapien <220>
<221> různé_vlastnosti <222> (1) . . . (834) <223> n = A,T,C neboG <400 tttttttttt agttttaatt attttataac tgaagtaaat acatttggca taggccataa aatagaatac cattcagttt tgaaaacaag tcaccaaccc ttattttaaa gatattggtc tgnatnacag tgttattttg . 5 tttttactga gcatccaaag aatcaacacc ctagccatgc taaacaataa tcatatacag cttggcctct tcaaagtagg tagaaaatga ctcagttata ttagtgctaa atttttacca tgttccanag ttaaaaatta tagatggaat tactaacaaa tgtggctttt ttttaaaaaa taaaacaatc tataaggaaa atgcaaatat agacaggttc tgagttgatt aaaaattttc atggattaag gcttctaaat ttncaaccta aattttaacc ttattaagct aactctagca aaaatttggt tgctttaggt acaatttaat aggtggtagt gtctagacac tacagtatca tttattaatg aagttatatt tgaagacaac ctnaactttc ctggaacatt tggtggaaaa tttcacatgt atcaagaatg tttcataaga cactccaagc aaataacaaa gttgagtaag tttgattcac ttttacagtt cattacatcc agtcatataa aatggtcccc aggcttttga acagtgtgct ataatttgaa gatagcacat gcagcatgtt taatttatac ttggcagtta tacaacattg cagttattag tcagccctga tccaacacat tcaagagtta cttggtgtgc taatgtgatt actggaacat tgattcaaaa atna
120 180 240 300 360 420 480 540 600 660 720 780 834 <210> 6 <211> 818 <212> DNA <213> Homo sapien <220>
<221> různé vlastnosti* <222> (1)...(818) ~ <223> n = a,t,c cnebo G <400> tttttttttt aaccacatct tgtaaagtga gacgtgaagt aatggtgaag taaaattgta gtgagctcag ttctagggga aggggctagg tttttttttt acaaaatgcc aatattagtt ccgtggaagc ggagactcga ataagcagtg gtgattgata tttagcgggg ctggagtggt aagaccctca agtatcaggc ggcggatgaa ctgtggctac agtactctga cttgaattat ctcctgatgc tgatgcctgt aaaaggctca tcaatagatg ggcggcttcg gcagatagtg aaaaaatgtt ggcttgtagg ttggtttcgg gagtaatacg tgggggccag gaaaaatcct gagacataca aagccaaagt aggaaagttg gagccgtaga agggtaaaat ttgttttcta gatgtgttta tgccctccta gcgaagaaaa gaaatagtca gatgtttgga agccaataat tgccgtcgga agagacccag ttagactatg ggagtgggac gttggggggt aaacttctga
120
180
240
300
360
420
480
540
112 ggtaataaat ttggtatgtg ttantanggc gtcattanga ggaatncncc aggattatcc ctttctcgtg ctantatgaa nggctnaaaa ccccggacna cgtatcgaag ttacatcgcg gaacttttgg ggccctgtta ntgnatccct gcctttttgg ccatcattgg antggaatta ngggtctggg attcttaa acaggtggtg tatatggtta aatcaatngc
Ctnggtttta tgtggtggcc gtgtgttggg ttggccggaa cccnacccat
600
660
720
780
818 <210> 7 <211> 817 <212> DNA <213> Homo sapien <220>
< 2 21 > různé vlastnosti <222> (1)...(817) <223> n = A,T,C <neboG <400 tttttttttt cgggccctat ggtttgctcc aagtggtttg ctcatgagtg gtactactcg gaagtatgta attggtggcc aggatncctt tcaaacngtc gaatnttnng cnttatcntn acnattggat cttnantgan tttttttttt ttcaaagatt acagatttca gtttagacgt caagacgtct attgtcaacg ggaattgaag aattgatttg ngggatggga tctanttcct gaaaagggct aaaggtnata nccccanttc ggttattcnc tggctctaga tttaggggaa gagcattgac ccgggaattg tgtgatgtaa tcaaggagtc attaatccgc atggtaaggg aggcnatnaa gaaacgtctg tacaggacta accnctccta canaaanggc ccctngcntt gggggtagag ttaattctag cgtagtatac catctgtttt ttattatacn gcaggtcgcc cgtagtcggt gagggatcgt ggactangga aaatgttaat gaaaccaaat tnatcccacc cnccccccgg atcancc ggggtgctat gacgatgggt ccccggtcgt taagcctaat aatgggggct tggttctagg gttctcctag tgaactcgtc tnaatggcgg aanaattaan angaaaanta caatngnatt tgnannccnc agggtaaata atgaaactgt gtagcggtga gtggggacag tcaatcggga aataatgggg gttcaatacc tgttatgtaa gcangatatt tttngttatt atnntaangg ccccacncnn cttttgttcc
120
180
240
300
360
420
480
540
600
660
720
780
817 <210> 8 <211> 799 <212> DNA <213> Homo sapien <220>
<221> různé vlastnosti <222> (1)...(799) <223> n = A,T,C nebo G <400: catttccggg cataaggaga ctgaagcgca tacgaacagc tgggtggccg acctgcctgg ggattttgct tctttgangt ctccttacaa caagncctgn tccttttcnt gttnaaattg tttactttct actttctgct cgtcccagaa gcctgaaagt angcctganc gtccaaacac cctanantaa gagccccatg ccacannatg atccactnnt tnagggttaa ttangcnccc aaggaaagcc ggcacgcgct ggtggacttg gctggagcgg cgctctgcct tgagccctgc ggctcatctg tccatctggg cccggctcct nctanaaccg tnncgccttg nccnntcccn gagcggaagc agggacaagc gcactgaaac gaggtccagc tgctgccccc tggcggactt ggcctcggcc ccactgtcng cccggaaacc gccnccnccg gccttnccan cnncnncnan tgctaacgtg gggagagcga agctgggaca agtgtagccg angtgggccg caagganaac cccccacctg gaccaccttt antcccancc cngtggaacc ngtcctncnc cccgacccnn ggaatcggtg ctccgagcgt catccgcgag cgtcctgggg ccaccccctg ccccacangg gttggccttg ngggagtgtt tgngaaggat cnccttntgt nttttccnnt annttnnann
120
180
240
300
360
420
480
0
600
660
720
113 ncctgggggt nccnncngat tgacccnncc nccctntant tgcnttnggg nncnntgccc ctttccctct nggganncg
780
799 <210> 9 <211> 801 <212> DNA <213> Homo sapien <220>
< 2 21 > různé vlastnosti, <222> (1) . . . (801) <223> n = A,T,c nebo G <400> acgccttgat taangatgac . caaggacaag < aatcccctgt < caggtcatgg < cacccatccc . ttcntacccg i ctacatacgc > cnccntantg < ggttganccc i gctgaantcc < gggaanancc > ncccnnntng > ccanccctcg .
• 9 cctcccaggc actcccaaag gccaccaggt gggggcttct ggttgtngnc angacgcggc cgnatntgtc ccggantcnc caccnattcc cggaaaatnc ccatnaccnn ctcgnccntn gcntntnann aaatcggccn tgggactggt gtggtcctga gcgggggccg ccttgaagtc caactggggg tacactnctg ccanctgttt nctcccgctt cacntttnnc cccaaagggg gnctcnatgg cccccnttaa cnaaaaaggc c tctgggagga cagtggccca aagcccacat cgccancagg ccncaacgca gacctcccnc cngtgccnac tgtccctatc agntttccnc gggggccngg anccntccnt tcccnccttg ccnnnancaa gccgggcatg gatggacatg gatccttact gctcagtctt aaanggcnca tccaccactt tccancttct cacgtnccan nncgngcttc tacccaactn tttaannacn cnangnncnt tctcctnncn ctgtggtttg gggctcacct ctatgagcaa tggacccang gggcctcngn tcatgcgctg nggacgtgcg caacaaattt cttntaaaag ccccctnata ttctnaactt cccccnntcc cctcanttcg
120
180
240
300
360
420
480
540
600
660
720
780
801 <210> 10 <211> 789 <212> DNA <213> Homo sapien <220>
< 2 21 > různé vlastnosti <222> (1) . . . (789) <223> n = A,T,C neboG <400> 10 cagtctatnt ggccagtgtg gcagctttcc ctgtggctgc cggtgccaca tgcctgtccc acagtgtggc cgtggtgaca gcttcagccg ccctcaccgg gttcaccttc tcagccctgc agatcctgcc ctacacactg gcctccctct accaccggga gaagcaggtg ttcctgccca aataccgagg ggacactgga ggtgctagca gtgaggacag cctgatgacc agcttcctgc caggccctaa gcctggagct cccttcccta atggacacgt gggtgctgga ggcagtggcc tgctcccacc tccacccgcg ctctgcgggg cctctgcctg tgatgtctcc gtacgtgtgg tggtgggtga gcccaccgan gccagggtgg ttccgggccg gggcatctgc ctggacctcg ccatcctgga tagtgcttcc tgctgtccca ngtggcccca tccctgttta tgggctccat tgtccagctc agccagtctg tcactgccta tatggtgtct gccgcaggcc tgggtctggt cccatttact ttgctacaca ggtantattt gacaagaacg anttggccaa atactcagcg ttaaaaaatt ccagcaacat tgggggtgga aggcctgcct cactgggtcc aactccccgc tcctgttaac cccatggggc tgccggcttg gccgccaatt tctgttgctg ccaaantnat gtggctctct gctgccacct gttgctggct gaagtgcnta cngcncanct nggggggtng ggngttccc
120
180
240
300
360
420
480
540
600
660
720
780
789
114 <210> 11 <211> 772 <212> DNA <213> Homo sapien <220>
<221> různé vlastnosti;
<222> (1)...(772) <223> η = A,T,C neboG <400 cccaccctac tttgttaaat accaacaggc tgtgggctga actttcatat ctacattaaa tattcagctc ctgagcctgg ctccctgtat aactggggaa gcacagggtg accccggcac ggcccnccac • 11 ccaaatatta aaataagtta cacatcctga ggggacctgg gttcaaatcc cgaagctgca ccaaaaaccc gtaatccacc aagtccagac aaaagaaaag gcagcaaaaa cccnangggg cccnaatntt gacaccaaca aatatttaaa taaaaggtaa ttcttgtgtg catggaggag ggttaagggg ttctctaggt tgcagagtcc tgaaaccccc gacgccccan aaccacttta gttaacagga gctgggaaat cagaaaagct tgcctgtgtc gaggggggtg ttgcccctca tgtttcatcc cttanagatg gtgtctcaac ccgcattcca ttggaaggnc cccccagctg ctttggcaca ancngggnaa ttttcctccc agcaatggat tctgtgatgg gatcagcaaa ggactcttcc tagaaactcc ggaaaccagg taggaggcta gtgcatggaa tccagtcagg tgcanctacg aacaaaaact cntggaaccc ctaaattntt tcccttctac caacagaagg aagacagtgc cctacaaata catgcaagag tgactgagtt gctgttaacc cccttctggc cagccctana cacctcaaca ngggggggca aattnaggca tc
120
180
240
300
360
420
480
540
600
660
720
772 <210> 12 <211> 751 <212> DNA <213> Homo sapien <220>
< 2 21 > různé vlastnosti <222> (1) . . . (751) <223> n = a,t,c nebo G <400: gccccaattc agctgattga ttggctgtgt aagtanggtg atggtggtgt ggcactacca agcagctgcn acacttgctc cnccggctgc agtggcccna ccaacagggg tnatnaacnt aangaactcn • 12 cagctgccac agcaaccctc tggtgacgtt agtcctcaaa tccacacttg gcaacgtcag acctcagcaa tcagtcttan gatgaagaaa aaaatcttca ctgccccacn gaaccctgcn gaagncccca accacccacg tactttttgg gtcattgcaa atccgtatag agtgaagtct ggaagtgctc tgaagatgan caccatanca tnaccccncg aaaaggatgc cncnnaacga tngtggctcc cngganannc gtgactgcat tcgtgagcct cagaatgggg ttggtgaagc tcctgggaac agccattgtg gaggangatg gcccntgaaa ttgacaaact cccatcnatt tganccnatt tgttcaggnc g tagttcggat tttgcttggt gaaaggcact cacagcactt cataatcttt gtgtacacca aagaagaacg accaananca tgcatggcac gaccccccaa gnacaagatc cnnggcctga gtcatacaaa gcaggtttca gttctctttg gagccctttc cttgatggca aggcgaccac tcncgagggc aagaccacna tggganccac atgcccactg tncntggtct cttctnaann
120 180 240 300 360 420 480 540 600 660 720 751 <210> 13 <211> 729 <212> DNA <213> Homo sapien
115 <220> .
<221> různé ture <222> (1)...(729) <223> n = A,T,C neboG <400> 13 gagccaggcg tgtggancct accatgcagt ctgtgtggtg ctgaagatct ctcatcgcag actgagagca gaggttgcaa tgctggtaat gttggaacac gaagantcac acgtccccaa tccctctgcc cagcagtncc gcttcagctt cagccctgtt tcgggccact ccggcgttgt agtgtgccct tgctgtggtc gcctgccatc caccatgaaa ctacttcaaa cacagccaat tgcccactca ctctttcaga cattaagacc ggcagtgggc gtcgtccagt ggtcttagct cgtgacgttc gccttggtgt aanaaaagat gggctcaagt gaaaanagtg tgaaaacctg gtggcaacac actcantgcc atgatgatcc atctgggtgt gccatgcagt ctaggtttcc ttcttcatcc acaccacaat tatgggttcc gctgtggctt cctttccccc cacccaaccc ccgggagctg aaganccctg tcttcaattt caatcgatgg ttgtcaacgt tgggctgcta tcctcctcat ggctgagcac caggaanact cnnccaacta atttctgttg aaangggtcc ttttgtcctt aacaggagcc gctcatcttt ggcatccttt gggctacttc tggtgctaag cttcattgct ttcctgacgt tcactcaagt tacggatttt caattgacaa ccaaccanaa
120
180
240
300
360
420
480
540
600
660
720 attnaaggg
729 <210> 14 <211> 816 <212> DNA <213> Homo sapien <220>
<221> i různé vlastnosti <222> (1) . . .(816) < 2 2 3 > π = A, T, c < nebo G <400: tgctcttcct tgttcgctga ggcaggtcca ccactcgtgt tcacactcca cangtgccag tganccccan atcttcttcc gcanatctgc caancttgtt ctgtnnanct gggacaaggt cncnctccta cacaaccctn • 14 . caaagttgtt aggggttgta cgcagtgccc atttttcaca ggaaactgtc agcacactgg anctgcctct cgaaaggtag tccgnggggg tggatncgaa ttagnccntg aantngccnt ccccagaaan ccccacccac cttgttgcca gtaccagcgc tttgtcactg ggcagcctcg natgcagcag atggcgcctt caaangcccc ttnttcttgt tcntantacc gcnataatct gtcctcntgg cctttnaatt nccgtgttcc gggttcngnt taacaaccac gggatgctct gggaaatgga tccgacgcgt ccattgctgc tccatgnnan accttgcaca tgcccaancc ancgtgggaa nctnttctgc gttgnncttg cccnancntn cccccaacta ggttng cataggtaaa ccttgcagag tgcgctggag cggggcagtt agcggaactg gggccctgng ccccgacagg anccccntaa aagaacccca ttggtggaca aacctaatcn ccccctggtt ggggccnaaa gcgggcgcag tcctgtgtct ctcgtcaaag gggggtgtct ggtgggctga ggaaagtccc ctagaatgga acaaactctt ggcngcgaac gcaccantna ccnntcaact tggggttttn ccnnttnttc
120
180
240
300
360
420
480
540
600
660
720
780
816
<210> 15
<211> 783
<212> DNA
<213> Homo sapien
<220>
<221> různé vlastnosti
<222> (1) . ..(783)
<223> n = A,T,c nebo G
<400> 15
116 ccaaggcctg atgtggaaaa aagacccaaa cagtgactag ccaagcagac tcccacgctg gcttgggcaa tgcaaggtgg ccatggaaag ncaatggctg ccctcccaac cncctccntt tctnccnngg ccc ggcaggcata cacagattgg ccaggtggaa ctcagaccac agaagactac gtactatgac caagaacaac gcctttgana gcgccatcca ctgcatcnac aaagcttccc ttccccnntn aaaaantncc nacttgaagg cgcctactgc ctgtggggac ccagaggaca tgcctcgcat cccacggagc taccttcggg ngcanctctg ntgttctctg antttcctng tgttnaaaaa aacaaagggc ccccctggtt tacaacccca ggggtgacac tcaaggaang cggccaacgt ccaacaangt agatctgcaa aagaagagtg gggctcangc gcacctgtca aattgtgaca •tacnccantt nctngcnttt cctnnaancc ggaacccctg ggatgtcagg cacctacctg cacagtcact gggtcgctgc gagtttcgtt cattctancc gactttcccc gcccacccag acacccccca ggcttttnac gaactgcccn cctccncnaa gtgctgaagg gtagagagga ttccagctga gtgctgtcca cggggctctt tatggaggct tgtcngggtg cagggcccct ttccgctgca ntgcccccaa aaacncccgg aacccnggaa anctnccccc
120
180
240
300
360
420
480
540
600
660
720
780
783 <210> 16 <211> 801 <212> DNA <213> Homo sapien <220>
<221> různé vlastnosti· <222> (1)....(801) <223> n = A,T,C neboG <400: gccccaattc agctgattga ttggctgtgt aagtagggtg atggtggtgt ggcactacca gcagctgcaa cacttgctct ccngctgcga tggcccgaan cnacagggct tgaactgaaa aaggaacngc ggccaaggan cagctgccac agcaaccctc tggtgacgtt agtcctcaaa tccacacttg gcaacgtcag cctcagcaat ccgtcttagc atgaaagaaa atcttcagaa gcnccncncn ccntgcatgg ntnagccccc ccctgccccn accacccacg tactttttgg gtcattgcaa atccgtatag agtgaagtct gaagtgctca gaagatgagg accatagcag ntacccacgt aagggatgcc gaaagaatga tggcccctgt ccaaangana 9 gtgactgcat tcgtgagcct cagaatgggg ttggtgaagc tcctgggaac gccattgtgg aggaggatga cccangaaac tgacaaactg ccatcgattg gccattgaag tcagggctct aaacaccccc tagttcggat tttgcttggt gaaaggcact cacagcactt cataatcttt tgtacaccaa agaagaacgt caagagcaaa catggccact aacacccana aaggatcntc tggcagtgaa gggtgttgcc gtcatacaaa gcaggtttca gttctctttg gagccctttc cttgatggca ggcgaccaca cncgagggca gaccacaacg ggacgacagt tgcccactgc ntggtcttaa ttctganaaa ctgaattggc
120
180
240
300
360
420
480
540
600
660
720
780
801 <210> 17 <211> 740 <212> DNA <213> Homo sapien <220>
<221> r. různý vlastnosti <222> (1)...(740) <223> n = A,T,C nebo G <400> 17 gtgagagcca ggcgtccctc tgcctgccca ctcagtggca acacccggga gctgttttgt ·· 9999
117 cctttgtgga agccaccatg ctttctgtgt ctttctgaag cttcctcatc taagacggag tgctgaagtt gacgttgctg aantntggaa gaattttgaa tgcaatgaaa caaaaaaant gcctcagcag cagtgcttca ggtgcagccc atcttcgggc gcagccggcg agcaagtgtg gcagctgctg gtantgcctg caccnccatg agantcnccc acntcccaan nnaagggttn ttccctcttt gcttcattaa tgttggcagt cactgtcgtc ttgtggtctt ccctcgtgac tggtcgcctt ccatcaanaa aaaagggctc tacttccaaa acngccaatn cagaactcac gaccatgatg gggcatctgg cagtgccatg tgctcttggt gttcttcttc ggtgtacacc agattatggg caatttctgn aaaaaanant aaaacctgcc tgccaagagc atcctcttca gtgtcaatcg cagtttgtca ttcctgggct atcctcctcc acaatggctg ttcccaggaa tggcttcccc tgcctttncc cnnncaaaaa cctgaacagg atttgctcat atggggcatc acgtgggcta gctatggtgc tcatcttcat aaccattcct aaattcactc aactataccg cccnttctgt ggntcncaaa
120
180
240
300
360
420
480
540
600
660
720
740 <210> 18 <211> 802 <212> DNA <213> Homo sapien <220>
< 2 21 > různé vlastností <222> (1)...(802) <223> n = A,T,C nebo G <400: ccgctggttg caaggtcttc ggatacactt gagcctctgt aagcaaacac cattgggcat ggatgagtgt ggttctgccc gctcaggatg gtcggctccc aancttcgtc aaccggncgc acccttnncg tnccanccnc cgctggtcca cagctgccgc tactttagca tagtggagga tgtgagcagc gtccagcagt ggccagcgct tgtcaccttc tccagagacg gccgantgng nggcccatgg caccgcnnnt ttaccttggt atangaagcc gngnagccac acattacgca gccagggtga agattccggg cggaaggtag tctccaaaca gcccccttgg acttccgcac tggttccgcc ttcgtcgtnc aattcaccnc ggaactccac ccaaaccntn ng gaagcacgtc gggcaagagc caactgagag cttcagctaa aggcaaagtc cgtagacacc ccgacttggc tcatcactgc ccctcnctta ctgggtcagg accggaactn tcttnttncc ccntgtgtcg agcatacaca ctccagcaac gtgtcgaagc gtagtcagcg actctcagcc agnggcctcc taggagcaga actgagtgtg atgacaccgn gtctgctggc gtangatcca tttacttgag anatngtnaa gcctcaatca actgcatatg ttattcttct tatgtcccat agctctctaa agcacctgat aattgctcct ggggacttgg ccanncaacc cnctacttgc ctnnttctat ggttaaggtc tcnggnccna
120 180 240 300 360 420 480 540 600 660 720 780 802 <210> 19 <211> 731 <212> DNA <213> Homo sapien <220>
<221> ' různé vlastnosti <222> (1) . . .(731) <223> n = A,T,C nebo G <400> cnaagcttcc gagcccaccg cntgacccca caggaaccaa gcncatccnt aggtnacggg tcacgnggng actccccncc gancaaannc cnagtgctgn ccgcnaancc gngtctttat ncncantgca tgctccnntc aaagccccnn tgacccnagg nggagggggc gtgatgagtg caagtcggcn cctgtctact tancanaang ggagccacat cagaactgaa nagggggcgg tgtttggaga cagncngcgg cnctggacnt ggtnacgtgg ggctggccac acngcnnnga
120
180
240
300
360
420
480
540
600
660
720
731 fc ♦· ••fcfc fcfc • fcfc fcfc • · fcfc* · • fcfc · » «·· fcfc fcfc ·· ····
118 catgcccagn cgngtntgct ccactaagct aagtgtaccc gaagacctat cnncnntcca cccccnggcc nnaatccncc gttanataac tagnggacat cagaacaaaa catncccaat caattnaagc agggggggnc cggcctttta t nggcngagag aacctgacta aacttcgaca gtntgctnga tatgtttctg ggcccccaat cnancntcnn tnantttgcc cttaactgaa ccactcantt ngctctgncc actgcctctt ccccccaacc nnacngggna tctcccttcc cccnngaatc gtcacctgnc tgcnttangt gctccctgna ntnaattnan aaaccnnngc ggctgcgcan tnccncccct tgctcaagta tcggtcctgg acaancnacc tttanccccn tttncccaac <210> 20 <211> 754 <212> DNA <213> Homo sapien <220>
<221> různé vlastnosti <222> (1)...(754) <223> n = A,T,C nebo G <400: tttttttttt caaccccctc annttaaatt tnancttnaa aaatngttna nnccaattgt ggnnancccc gancccncgg ggttngggnc ccaggntgag ggggcctggg tttgntcnnc agtccnttgn tttttttttt ntccaaatnn aaatnttnnt tncctggaaa nggaaaaccc ttttngccac ggttantnaa gaattaacgg aggncnnaat nntngggttt attttntttc ggccccnccn agggntaaan taaaaacccc ccntttccgg tggnggnnna ccngtngntt aanttctcnt gcctgaatta tccccccnnc ggnnnntccc tgtttaaggg nccccccccc ccctnttncc aaganctttn ggccccctnn ctccattnaa gngggggttc anccnaatgt ccaaaaatnt aaggttgttt attggnttcc cccaattata tnttgggggg tccgaaaaat canggcccct tccccccccc ccganttnan cggg tgnaaacttc caaacccaan nangaaagtt ttaaccctta gaaggntnaa gntgttttcc ccganttttt cnggnncccc ccctccnaga ctcgnanagt ccnggganag ttaaatccnt cgaaattgtc ttanntttgg naacccanta antccctccg tnaaaanccc nttaaaanaa ttngaattgg ccccntcggg aaaaaanctc tggggtttgg aggttngngt gcctnggcga
120 180 240 300 360 420 480 540 600 660 720 754
<210> 21
<211> 755
<212> DNA
<213> Homo sapien
<220>
<221> různé vlastnosti
<222> (1) . ..(755)
<223> n = A,T, C nebo G
<400> 21
atcancccat nngtnagnnc nncanatncc ccagctgtcc nncnncanat cgaaggcnct aactcanccn aaaaanatcn ttagnggtcc ctttcngaca gaccccnaac actncnnttn actganngcg nanaangcct gattttcctn ggnccnaagg nattacncgc gatacaaaat ntnaancntc gcatnttttg nngggaccnc natcacnccc cgangtngan nnnatacngg anccgattac nngcgncncc ttcntgagta aatncaagcc ctaatacttc gttcccnntt tcanccggnc cnccnactac ngagaaanct nnnatccaat ccntnccccc ccgctagntc tcactccccg tgnttatnac cagtctncct gggttcttan nnncnaccnc gcccncnanc nataccanag ntgnancctc tancccctcc cccnncaagt aatctcaccc actntgactg tcnccaattt ngaattgccc cggccnatca cnacgcncta ncaccanacn cnaagtattn cccccaacna cncncnccta tactcaactc ggtctctatt ccnaanggct ttcntngaac
120
180
240
300
360
420
480
540
600 • · · ·
119 gggctcntct tttccttcgg ttancctggn ttcnnccggc cagttattat ttcccntttt aaattcntnc cntttantct tggcnttcna aacccccggc cttgaaaacg gccccctggt aaaaggttgt tttganaaaa tttttgtttt gttcc <210> 22 <211> 849 <212> DNA <213> Homo sapien <220>
< 2 21 > různé vlastnosti <222> (1)...(849) <223> n = A,T,C neboG <400> 22 tttttttttt tttttangtg tngtcgtgca ggtagaggct tactacaant gtgaanacgt acgctnggan taangcgacc cganttctag ganncnccct aaaatcanac Cgtgaagatn atcctgnnna cggaanggtc accggnngat nntgctaggg tgnccnctcc cannncnttn cataactcng nggccctgcc caccaccttc ggcggcccng ngnccgggcc cgggtcattn gnnttaaccn cactnngcna ncggtttccn nccccnncng acccnggcga tccggggtnc tctgtcttcc cctgnagncn anaaantggg ccncggnccc ctttacccct nnacaagcca cngccntcta nccncngccc cccctccant nngggggact gccnanngct ccgttnctng nnaccccnnn gggtncctcg gttgtcgant cnaccgnang ccanggattc cnaaggaagg tgcgttnttg gcccctaccc ttcgctncgg nncacccttc ccgacnanga nccgctcccg cncnncgnng cctcncctcg caacacccgc nctcntcngt ncggnnnccc ccccacccgc nccctcncnc ngncgnancn ctccnccncc gtctcannca ccaccccgcc ccgccaggcc ntcanccacn ggnngacnng nagcncnntc gcnccgcgcn gcgncnccct cgccncngaa ctncntcngg ccantnncgc tcaanccnna cnaaacgccg ctgcgcggcc cgnagcgncc ncctccncga gtcctcccgn cttccnaccc angnnttccn cgaggacacn nnaccccgcc nncangcgg <210> 23 <211> 872 <212> DNA <213> Homo sapien <220>
< 2 21 > různé vlastnosti <222> (1)...(872) <223> n = A,T,C neboG <400> 23 gcgcaaacta tacttcgctc gnadtcgtgc gcctcgctnc tcttttcctc cgcaaccatg tctgacnanc ccgattnggc ngatatcnan aagntcganc agtccaaact gantaacaca cacacncnan aganaaatcc nctgccttcc anagtanacn attgaacnng agaaccangc nggcgaatcg taatnaggcg tgcgccgcca atntgtcncc gtttattntn ccagcntcnc ctnccnaccc tacntcttcn nagctgtcnn acccctngtn cgnacccccc naggtcggga tcgggtttnn nntgaccgng cnncccctcc ccccntccat nacganccnc ccgcaccacc nanngcncgc nccccgnnct cttcgccncc ctgtcctntn cccctgtngc ctggcncngn accgcattga ccctcgccnn ctncnngaaa ncgnanacgt ccgggttgnn annancgctg tggsnnngcg tctgcnccgc gttccttccn ncnncttcca ccatcttcnt tacngggtct ccncgccntc tcnnncacnc cctgggacgc tntcctntgc cccccttnac tccccccctt cgncgtgncc cgnccccacc ntcatttnca nacgntcttc acaannncct ggntnnctcc cnancngncn gtcanccnag ggaagggngg ggnnccnntg nttgacgttg nggngangtc cgaanantcc tcnccntcan cnctacccct cgggcgnnct ctcngttncc aacttancaa
660
720
755
120
180
240
300
360
420
480
540
600
660
720
780
840
849
120
180
240
300
360
420
480
540
600
660
720
780 ntctcccccg ngngcncntc tcagcctcnc ccnccccnct ctctgcantg tnctctgctc tnaccnntac gantnttcgn cnccctcttt cc ·» ··♦·
120
840
872 <210> 24 <211> 815 <212> DNA <213> Homo sapien <220>
<221> různé vlastnosti!
<222> (1) . . . (815) <223> n = A,T,C neboG <400> 24 gcatgcaagc nctgncttcc tcntncatta cgcattcncn gcnccctgac aananccccc aacctgcgtc gatcccgtcc gtgtccnanc gaacccccta cccnccctac ccccaccggt accggncctn nccnacngnt ttgagtattc tgtgtcaaat gtaacaantg gcncantatn tggnagagat cgcngnccac aganncatca aggnttnacc cnctcaacat gggggantna ccnnctttgg nnccntgggg ggncgaanng agntcccccc tatagngtca gtatacnaan tnntgtccat taatngggaa ggatnanttc cggttngnng aacntgggaa atcccttcnc ganacgcgcc tncaaanccc gacngtgacc gggtgaanct ancnntcnga cngggtncgg cctaaatanc tanatatgaa cctgtcngan ntcnnntnnn tnntntgacc cnagccnntc acccgcnncc agcgccccct agnccanccg caggattgtc aantcccgga cngnntcanc agngccncnt aangg ttggcntaat tctnatntga canattccca ncaccnncat nacatgttca ccaagacctc angtnnaagt ttngtgcctt caattnggca cncncangaa gtnccagtcc cngncgaggn cgtataaccc catggtcnta caaganngta tnnattncgn ctatcntncc tcttggattn ctgtggaggt ngnnncanan anagngnagc caatgtcgnc atcccncanc ggccngnctc ntcgnaagga cccctcncca
120
180
240
300
360
420
480
540
600
660
0
780
815 <210> 25 <211> 775 <212> DNA <213> Homo sapien <220>
< 2 21 > různé vlastnosti <222> (1) . . . (775) <223> n = A,T,C neboG <400> 25 ccgagatgtc tcgctccgtg gccttagctg tgctcgcgct actctctctt tctggcctgg aggctatcca gcgtactcca aagattcagg tttactcacg tcatccagca gagaatggaa agtcaaattt cctgaattgc tatgtgtctg ggtttcatcc atccgacatt gaanttgact tactgaagaa tgganagaga attgaaaaag tggagcattc agacttgtct ttcagcaagg actggtcttt ctatctcntg tactacactg aattcacccc cactgaaaaa gatgagtatg cctgccgtgt gaaccatgtg actttgtcac agcccaagat agttaagtgg gatcgagaca tgtaagcagn cnncatggaa gtttgaagat gccgcatttg gattggatga attccaaatt ctgcttgctt gcnttttaat antgatatgc ntatacaccc taccctttat gnccccaaat tgtaggggtt acatnantgt tcncntngga catgatcttc ctttataant ccnccnttcg aattgcccgt cncccngttn ngaatgtttc cnnaaccacg gttggctccc ccaggtcncc tcttacggaa gggcctgggc cnctttncaa ggttggggga accnaaaatt tcncttntgc ccncccncca cnntcttgng nncncanttt ggaacccttc cnattcccct tggcctcnna nccttnncta anaaaacttn aaancgtngc naaanntttn acttcccccc ttacc
120
180
240
300
360
420
480
540
600
660
720
775 <210> 26 ♦* 0990
121 <211> 820 <212> DNA <213> Homo sapien <220>
< 2 21 > různé vlastnosti <222> (1) . . . (820) <223> n = A,T,C neboG <400> 26 anattantac agtgtaatct tttcccagag gtgtgtanag ggaacggggc ctagaggcat60 cccanagata ncttatanca acagtgcttt gaccaagagc tgctgggcac atttcctgca120 gaaaaggtgg cggtccccat cactcctcct ctcccatagc catcccagag gggtgagtag180 ccatcangcc ttcggtggga gggagtcang gaaacaacan accacagagc anacagacca240 ntgatgacca tgggcgggag cgagcctctt ccctgnaccg gggtggcana nganagccta300 nctgaggggt cacactataa acgttaacga ccnagatnan cacctgcttc aagtgcaccc360 ttcctacctg acnaccagng accnnnaact gcngcctggg gacagcnctg ggancagcta420 acnnagcact cacctgcccc cccatggccg tncgcntccc tggtcctgnc aagggaagct480 ccctgttgga attncgggga naccaaggga nccccctcct ccanctgtga aggaaaaann540 gatggaattt tncccttccg gccnntcccc tcttccttta cacgccccct nntactcntc600 tccctctntt ntcctgncnc acttttnacc ccnnnatttc ccttnattga tcggannctn660 ganattccac tnncgcctnc cntcnatcng naanacnaaa nactntctna cccnggggat720 gggnncctcg ntcatcctct ctttttcnct accnccnntt ctttgcctct ccttngatca
780tccaaccntc gntggccntn cccccccnnn tcctttnccc 820 <210> 27 <211> 818 <212> DNA <213> Homo sapien <220>
<221> různé vlastnosti <222> (1)...(818) <223> n = A,T,C nebo G <400> 27 tctgggtgat ggcctcttcc tcctcaggga cctctgactg ctctgggcca aagaatctct60 tgtttcttct ccgagcccca ggcagcggtg attcagccct gcccaacctg attctgatga120 ctgcggatgc tgtgacggac ccaaggggca aatagggtcc cagggtccag ggaggggcgc180 ctgctgagca cttccgcccc tcaccctgcc cagcccctgc catgagctct gggctgggtc240 tccgcctcca gggttctgct cttccangca ngccancaag tggcgctggg ccacactggc300 ttcttcctgc cccntccctg gctctgantc tctgtcttcc tgtcctgtgc angcnccttg360 gatctcagtt tccctcnctc anngaactct gtttctgann tcttcantta actntgantt420 tatnaccnan tggnctgtnc tgtcnnactt taatgggccn gaccggctaa tccctccctc480 nctcccttcc anttcnnnna accngcttnc cntcntctcc ccntancccg ccngggaanc540 ctcctttgcc ctnaccangg gccnnnaccg cccntnnctn ggggggcnng gtnnctncnc600 ctgntnnccc cnctcncnnt tncctcgtcc cnncnncgcn nngcannttc ncngtcccnn660 tnnctcttcn ngtntcgnaa ngntcncntn tnnnnngncn ngntnntncn tccctctcnc720 cnnntgnang tnnttnnnnc ncngnncccc nnnncnnnnn nggnnntnnn tctncncngc780 cccnnccccc ngnattaagg cctccnntct ccggccnc818 <210> 28 <211> 731 <212> DNA
122 <213> Homo sapien <220>
<221> různé vlastnosti Ξ <222> (1).7.(731) <223> n = A,T,C nebo G <400> 28 aggaagggcg gagggatatt gtangggatt gagggatagg agnataangg gggaggtgtg 60 tcccaacatg anggtgnngt tctcttttga angagggttg ngtttttann ccnggtgggt 120 gattnaaccc cattgtatgg agnnaaaggn tttnagggat ttttcggctc ttatcagtat 180 ntanattcct gtnaatcgga aaatnatntt tcnncnggaa aatnttgctc ccatccgnaa 240 attnctcccg ggtagtgcat nttngggggn cngccangtt tcccaggctg ctanaatcgt 300 actaaagntt naagtgggan tncaaatgaa aacctnncac agagnatccn tacccgactg 360 tnnnttncct tcgccctntg actctgcnng agcccaatac ccnngngnat gtcncccngn 420 nnngcgncnc tgaaannnnc tcgnggctnn gancatcang gggtttcgca tcaaaagcnn 480 cgtttcncat naaggcactt tngcctcatc caaccnctng ccctcnncca tttngccgtc 540 nggttcncct acgctnntng cncctnnntn ganattttnc ccgcctnggg naancctcct 600 gnaatgggta gggncttntc ttttnaccnn gnggtntact aatcnnctnc acgcntnctt 660 tctcnacccc cccccttttt caatcccanc ggcnaatggg gtctccccnn cgangggggg 720 nnncccannc c 731 <210> 29 <211> 822 <212> DNA <213> Homo sapien <220>
<221> různé vlastnosti <222> (1) . . . (822) <223> n = A,T,C neboG <400> 29 actagtccag tgtggtggaa ttccattgtg ttggggncnc ttctatgant antnttagat 60 cgctcanacc tcacancctc ccnacnangc ctataangaa nannaataga nctgtncnnt 120 atntntacnc tcatanncct cnnnacccac tccctcttaa cccntactgt gcctatngcn 180 tnnctantct ntgccgcctn cnanccaccn gtgggccnac cncnngnatt ctcnatctcc 240 tcnccatntn gcctananta ngtncatacc ctatacctac nccaatgcta nnnctaancn 300 tccatnantt annntaacta ccactgacnt ngactttcnc atnanctcct aatttgaatc 360 tactctgact cccacngcct annnattagc ancntccccc nacnatntct caaccaaatc 420 ntcaacaacc tatctanctg ttcnccaacc nttncctccg atccccnnac aacccccctc 480 ccaaataccc nccacctgac ncctaacccn caccatcccg gcaagccnan ggncatttan 540 ccactggaat cacnatngga naaáaaaaac ccnaactctc tancncnnat ctccctaana 600 aatnctcctn naatttactn ncantnccat caancccacn tgaaacnnaa cccctgtttt 660 tanatccctt ctttcgaaaa ccnacccttt annncccaac ctttngggcc cccccnctnc 720 ccnaatgaag gncncccaat cnangaaacg nccntgaaaa ancnaggcna anannntccg 780 canatcctat cccttanttn ggggnccctt ncccngggcc cc 822 <210> 30 <211> 787 <212> DNA <213> Homo sapien <220>
< 2 21 > i různé vlastnosti
123 <222> (1).,.(787) <223> n = A,T,cneboG <400> 30 cggccgcctg ctctggcaca tgcctcctga atggcatcaa aagtgatgga ctgcccattg ctagagaaga ccttctctcc tactgtcatt atggagccct gcagactgag ggctcccctt gtctgcagga tttgatgtct gaagtcgtgg agtgtggctt ggagctcctc atctacatna gctggaagcc ctggagggcc tctctcgcca gcctccccct tctctccacg ctctccangg acaccagggg ctccaggcag cccattattc ccagnangac atggtgtttc tccacgcgga cccatggggc ctgnaaggcc agggtctcct ttgacaccat ctctcccgtc ctgcctggca ggccgtggga tccactantt ctanaacggn cgccaccncg gtgggagctc cagcttttgt tcccnttaat gaaggttaat tgcncgcttg gcgtaatcat nggtcanaac tntttcctgt gtgaaattgt ttntcccctc ncnattccnc ncnacatacn aacccggaan cataaagtgt taaagcctgg gggtngcctn nngaatnaac tnaactcaat taattgcgtt ggctcatggc ccgctttccn ttcnggaaaa ctgtcntccc ctgcnttnnt gaatcggcca ccccccnggg aaaagcggtt tgcnttttng ggggntcctt ccncttcccc cctcnctaan ccctncgcct cggtcgttnc nggtngcggg gaangggnat nnnctcccnc naagggggng agnnngntat ccccaaa <210> 31 <211> 799 <212> DNA <213> Homo sapien <220>
< 2 21 > různé vlastnosti <222> (1)...(799) <223> n = A,T,C neboG <400> 31 fttttttttt tttttttggc gatgctactg tttaattgca ggaggtgggg gtgtgtgtac catgtaccag ggctattaga agcaagaagg aaggagggag ggcagagcgc cctgctgagc aacaaaggac tcctgcagcc ttctctgtct gtctcttggc gcaggcacat ggggaggcct cccgcagggt gggggccacc agtccagggg tgggagcact acanggggtg ggagtgggtg gtggctggtn cnaatggcct gncacanatc cctacgattc ttgacacctg gatttcacca ggggaccttc tgttctccca nggnaacttc ntnnatctcn aaagaacaca actgtttctt cngcanttct ggctgttcat ggaaagcaca ggtgtccnat ttnggctggg acttggtaca tatggttccg gcccacctct cccntcnaan aagtaattca cccccccccn ccntctnttg cctgggccct taantaccca caccggaact canttantta ttcatcttng gntgggcttg ntnatcnccn cctgaangcg ccaagttgaa aggccacgcc gtncccnctc cccatagnan nttttnncnt canctaatgc ccccccnggc aacnatccaa tccccccccn tgggggcccc agcccanggc ccccgnctcg ggnnnccngn cncgnantcc ccaggntctc ccantcngnc ccnnngcncc cccgcacgca gaačanaagg ntngagccnc cgcanrmnnn nggtnncnac ctcgcccccc ccnncgnng ' <210> 32 <211> 789 <212> DNA <213> Homo sapien <220>
<221> různé vlastnosti <222> (1) . . . (789) <223> n = A,T,C nebo G
120
180
240
300
360
420
480
540
600
660
720
780
787
120 180 240 300 360 420 480 540 600 660 720 780 799 <400> 32
124 tttttttttt ttttnccnag ggcaacaggc cgctcccgct ggtgggcacc nattaggaat gcggctccgg nccngccaca ggnccatgtc ccaaaagttc ccccttggcc tggnnggcaa ntcctnnnca ccccccncg tttttttttt ggcaggttta tccggcggcg tgatnttcct ctgggatttn agtggtntta catctggtct atcatnactc ttnncggggt ttgnggcccn cccaaatcct gntggntccc ccatcccccc tttttttttt ttgacaacct gcggcggcgg ctgcagctgc aatttccacg cccnccnccg taaaccttgc agactggcnc tgctgcnatn caaaaaanct ccccccgntt ccttcgggcc nngnnacgnc tttttttttt cncgggacac ccctacctgc aggatgccnt ggcacaatgc ttggcncact aaacnctggg gggctggccc tncatcacct ccggggggnc nctgggtttg cccggtgggc tancaangna tttttttttt aancaggctg ggtaccaaat aaaacagggc ggtcgcancc ccccntggaa gccctctttt caaaaaancn cccgggcnca ccagtttcaa ggaacccacg ccnnctctaa tccctttttt tttttttttt gggacaggac ntgcagcctc ctcggccntn cctcaccacc accacttntc tggttantnt ccccaaaacc ncaggncaac caaagtcatc cctctnnctt ngaaaacncc tanaaacggg
120
180
240
300
360
420
480
540
600
660
720
780
789 <210> 33 <211> 793 <212> DNA <213> Homo sapien <220>
<221> ^ůznévlastnosti <222> (1)...(793) <223> n = A,T,C neboG <400> 33 gacagaacat aattcatggc gactaaagtc agaagtttgc gcacagatgc acaangaacg ctctgctgtt ggncgccacc tggcgtaatc acaacatacg nactcacatt gccagctgcc cgcncttccc acggtatcna gttggatggt tgttggagca tgatgaactt agatgtattt ctgtgtgact gggctcgttt aaacacccca gcggtggagc atggtcatan anccggaagc aattggcttt nttaatgaat gctttctcgc cct ggagcacctt atanaacccc cccaatcaga gcaaagaaga ccggttctga atcaccantg gccatccctt tccagctttt ctgtttcctg atnaaatttt gcgctcactg cnggccaccc ttcctgaant tctatacgac agttctacga tgagcatgga cgaaggcaga cttttgagga aggagcagga ctttcaaaag gttcccttta tgtgaaattg aaagcctggn cccgctttcc cccggggaaa ccttcccccc ttacaggaca gctgctgatc tgattggcca gtggtgtcaa ggttgttcat cgtgagcccc ggatccacta gtgagggtta ttatccgctc ggtngcctaa agtccggaaa aggcngtttg ggtctttcgg gcagatgggg aaaggacttg gaaatgaana atctttgacg catgatcaca cgccctgcac cttctagagc attgcgcgct acaattccac tgantgaact acctgtcctt cttnttgggg cttgcggcna
120
180
240
300
360
420
480
540
600
660
720
780
793 <210> 34 <211> 756 <212> DNA <213 > Homo sapien <220>
< 2 21 > různé vlastnosti <222> (1)...(756) <223> n = A,T,C neboG <400> 34 gccgcgaccg ancaagtgcg gcatgtacga gggaanagct gcaactcaag gggtcgactc ggcgagtgga aagctagttc accgtaaaag ttctggagct ccccaatctt caacttcttg
120
125 ccaaccacag atcggggccc cagctcaaat cagctcttgg acgganttgg gtgtcctgga catcccccgc aaaatcgcng atncnctagt ttactgaggg aattnttaac ggaccaagct aatggagcat gctactactt gcctcaacct ancggctgcc gcaatactga cgagagctac ggttgctcca nctagaatcg ttnattgccg cccccacaat gaccaaacag cctacgcaan tgattacaan cctcttcctg tgcccaanga tgganggcag accttcttca gaaaggctnc gcccgccatc cccttggcgt tccacgccna cagctaattc gacatcccct gagcagctcc ctgtcccaga catacanacc ctaccncaaa ttgacatcct aanaanatcc gcggtgganc tatcatggtc cattng tggcccgtga ccttcgagcg ccgagtcagc accgggtggc aatgtctaca gtnttcctgg gctcgacact ttttcnctga ctccaacctt acnccngttn catactggag ctacatggcc ctatatgcac tgantnccac tcnaccacca ccnagggtaa atcagggatg aggcccccgg tcgttnccct cctgtgttga
180
240
300
360
420
480
540
600
660
720
756 <210> 35 <211> 834 <212> DNA <213> Homo sapien <220>
<221> různé_vlastnosti>
<222> (1) .. . (834) <223> n = a,t,C nebo G <400 ggggatctct aacaggatct tagtcagaca aatcttcngg aaantccanc cttctnnaan ggaaactgat ggcncaaatc nncaangact ttcttcagcc ggaanccgtc acntnctggg nccnaacttt gctnttggcc anatcnacct tgcccttgaa cnctcttggg gctgtctgct angttctcct angannancc cccaaatggt cgactccccn ctnccgctnc agttcacnat tctcccttcc ccgggttcaa ttccttcccc antcccctgg gnatgcatgg gctctcggct caaaaaacan cggtgaactc tggtgacctc canctttgtc atgtcatcca tccttgaaag cccntccnng nttcatcagc tgaannaact antccctccn cnccccncgg gggcntntan ttgtcggtgt gctgtnttta caggatntga gatgacnang cccttcaaag gagctggnat tcgcctctgc aagccnatca cagggttggt ccctctgcca ttgaccgtng ttgncnntcn ngtttggntt cnccccctnt ggtcgctgtc agttgctcag gtcttgattt ggcagctggt .ttgttccggc ttgganaaca tgcctgcaaa cacccccctc ggcannccgg gctgttntat gaatagccgc cctcgggcca tttcatnggg ggtcccntng gatgaanatg tctgccgtca cacctccaat tgtgtntgat cttcatcaaa cgtcaccgtt aaacttgctt cctggactcc gcccntgcgc tccttggggg gcntcnccnt ttctggattt ccccaactct ggcc
120
180
240
300
360
420
480
540
600
660
720
780
834
<210> 36 <211> 814 <212> DNA <213> Homo sapien
<220>
< 2 21 > různé vlastnosti
<222> (1) .. . (814)
<223> n = A,T,CneboG
<400> 36
cggncgcttt cctagnaaac naacgccaac ggaaaggcct aatggaaaaa ctaaaacanc ccngccgcgc attaatgggt tcaggccatt gccttgtaag aaaaataaac ccagcgctca cccgtttcca tgctctacta cctaccaaag acaccacaat aanaggtttt cttctgcttg tgacnaaggc atacatcata gaagaaaggc ncggctgaat gttctcatgg ganaaatatt tcccttcang cnaaccagta tggtctctcc ctnaagtctt ctgcccaccg ctttgctctt ttaaatacnn agcctgccca accccctgta gtgttttact cagcctggca ttggacatca
120
180
240
300
360
420
480
540
600
660
720
780
814
126 ggcttgatgg antganctgg aggggangtc gcccctgaac cttccggtct tgtnttggac atttganttt ggngaactca tatcactgcc aaggcctgaa ntttncagtg ganatgcttc gatccnaaag ccntgctngn cntaaattct agaaggtctn acntttccac ncttagtctc gatctgccaa cancancctt gaatgttcct atnacccaan ctgccctacn ngaaaaacca ccagctgggc caaaagtctc anantacccn taagacccat gggtcccant tganatcccc nctgaaagca cncn ncccttcccc ngcccacaag tatcatcnnt aatcctngaa. ccctcctttg ngaagcaccc cnattccctn catntttgtc accggccacc gaataaaaag ccatggtgcc ttncttacgt tncccctggc ggcnccnaan <210> 37 <211> 760 <212> DNA <213> Homo sapien <220>
< 2 21 > různé v lastnosú <222> (1)...(760) <223> n = A,T,C nebo G <400> 37 gcatgctgct gcgcagtgtt gtgtctggca tcnaanccac gtgtcgtcac gggctgacag cncctnancc actcttcttc ttgcaaaatc ganccncctt caattgaact actggaaaaa ctcctctncc cttcctcaaa cgctgaaggg ggtccacgca tcgtgtattt actccactaa gtgccagaac caaactgcct ccaaaggtag tgctccgtgg gtttgaatgc gttaacnttg ggtangtgcc ctaaaaatcg gttgttcttg gttgtagtac atgccctttg ttcacangca actgtcgatn acactggatn ctcaaaggcc ttgtrcttgt gggtcatnnn naaggnaata ggccgngttc ttccttgaat tnttcccccc ttgccataac cagcgcggga tcactgggga gcctcctccg cancagccca ggcctttcca accttgcaca tgcccaagca taccanggtt atcctcctgt cnctngggtg tcccaaantt ccntanggcg aaccaccata tgctctcctt aatggatgcg aagcntccgg ttgctgcagc tggaagggcc ccccgacagg ncctccanca ggggaaanaa cttgcttggg gtctgaaact cccctngntt ggtaaagcgg gcagagtcct ctggagctcg gcagttgggg ggaactgggt tgggggaaat ctagaaatgc aaccaaaanc acccggcngn tggaanagca aatcaccgtc tgggtnnttt
120
180
240
300
360
420
480
540
600
660
720
760 <210> 38 <211> 724 <212> DNA <213> Homo sapien <220>
<221> různé vlastnosti a <222> (1)/..(724) <223> n = A,T,C < nebo G <400> tttttttttt cttccnaaat caaattaatt aatttaaccc cttaaatccc ngatttaaac tcctnttaan tttttgaatt cccnctttcg aaaaaactcc tttttttttt tgtccaaccc ttgganttta attatnaact tccgaaattg ccccttnant cntnggtaac ggaaattccn gggtttgggn caagnnttaa tttttttttt cctcnnccaa aattaaatnt taaatncctn ntaanggaaa tnttttnacc tcccgntaat ngggaattna ntaggttgaa ttngaatntc tttttaaaaa atnnccattt tnattngggg gaaacccntg accaaattcn cnngnctnaa gaannnccct ccggggtttt tttttnnang ccccttccca ccccctccat ccgggggggg aanaanccaa gnttccaaaa cctaaggctn ntatttngnt aanccaatta tcccntttgg ncccaaaaaa ggccttttgg tgaatgaaaa gttccaaacc atgtnaagaa atttttaacc tttgaaggtt tccggtgttt aaccgaattt gggccatncc ncccccaana gaaaggnggg
120
180
240
300
360
420
480
540
600
127 tttntggggg ngnntttggt gccg ccngggantt ttttgggccc cnttcccccn cttnanggac ttnccncccc cttccggatn ccccccnggt gaaattaaat aaanggttat ccccgggncg
660
720
724 <210> 39 <211> 751 <212> DNA <213> Homo sapien <220>
<221> různé vlastnosti:
<222> (1)...(751) <223> n = A,T,C neboG <400 tttttttttt caacacaata tttatttatt ggccgcctta cgcaaaatca ttaactgctt cttgggggtt tcccggcnnt tgaagggtta ccctcaancn cacccccnga cnnagactnt nnnncncctc • 39 tttttctttg tttatttcat tttactgaaa agctttctaa ctcgggggaa gtacaattac ccctccccan cnttgaaaca ccatntttaa aattnctnng anncnntnnc cctcnncnan cnctngtccn ctcacattta ttgtttcttt gtgagaggga atttggaaca nggaaaggtt ntttcacttt accaaccccn cacngcngaa cnccacctcc ccccggtcnc naacnaaatt cncaattttc naatcnccan atttttattt tatttcattt acttttgtgg tctaagcaag gctttgttaa taattaattg ctgacaaaaa ngttctcatt acntggcnnn gcntnngtcc ccgaaaatat ttttnntcac c tgattttttt tatttgtttg ccttttttcc ctgaanggaa tcatgcccta tgctnaangc gtgccngccc ntccccncnc gcctgaatcc cncccgggct tcccnntcnc gaacncgnnc taatgctgca ctgctgctgt tttttctgta aagggggttt tggtgggtga tttaattana tcaaatnatg caggtnaaaa tcnaaaancn ccgggaantn tcaattcccc cnnaaaatgn
120
180
240
300
360
420
480
540
600
660
720
751 <210> 40 <211> 753 <212> DNA <213> Homo sapien <220>
< 2 21 > různé vlastnosti, <222> (1)...(753) <223> n = A,T,C nebo G <400: gtggtatttt agatgaaaac cgccctatgc tggtctggaa tctcaaagtt cggtcataan ataaaaggtg cnaacccacc ttctnctgat aaancacccn ggancccata ttcccncccg tnccctatct ctgtaagatc ccccccgaga acagctgggc gcggcggctg ccaggcaacn cgcggtggcg cgcccccgca accannccgg gccctanctg cctcctcntt tctcnaccan ncctctggcc gnaccccncn aggtgttcct cagcagcact ccttgagaca tacctgcgta tcgttgcgac tcgtcgctgg ccgttcanct acttccttga gttgcccngn tcatctgggt tactcaccnt cntcaaanan tttgtctcan ccctcgtagg gcaactgcca gcagggcttc ggggcacacc acaccggaga gagctggcag cgcacttctc nggaattccc atgccaanca tnttntcccc ncccccccnt gcttncacna tnt tttagaggaa agcagccggg gatgtcaggc gtcagggccc ccaggtgatn ggcctcccgc naanaccatg aaatctcttc nccccaancc ggaccntggt gnnacccanc cctgggtctg acaccctcat gtaggagggg tcgatgtcaa accaggaact agcttggggt aggaaggcna angttgggct gntcttgggc ccggggtcct tcctctcaag cttctanngn ccttcccccc
120
180
240
300
360
420
480
540
600
660
720
753 <210> 41
128
<211> <212> <213> 341 DNA Homo sapien
<400> 41
actatatcca agtgaaccca ttctttaaac tatagcttgt tgttaaactg ttttactttt tcacaacaga tccttgattt cttgttcatt ttacgtagta tgatttttaa tgattaattg catgcttcat atatacatat atgaacactg agtttttgaa aaaatatcat tgttttatat cccatagact atgttctcag aaaataggaa gtctacattc ttgagaatat attagggtag tcttgacata tattttggga tttgtgaaga aatccagaca tctttcagag t gcttcaaatg gcctttccac gttaaaaagt cttagttgag gtattttcat
120
180
240
300
341
<210> 42 <211> 101 <212> DNA <213> Homo sapien
<400> 42
acttactgaa gtttcaaaca tttagttctg ttctaaataa tgctcttcct ataattttca tatttagtgt gtggcttcat tgtatcataa a
atactttgat
101
<210> 43 <211> 305 <212> DNA <213> Homo sapien
<400> 43
acatctttgt tccagggtgg tcagatgcct cctcttgaga tggatacaga tcgaa tacagtctaa tctcacactg tgctaagtct ggtcagtaaa acgagagtta gatgtgttct taatcagagc agagttctag gaggacttaa tcctggataa taaatcacca tattgaggag agttatgttt tatttcatat ctcagagctg ttccttcctg tctttacagc cagaaagtct ctacaaaatg agtacctgcc gtcctcaccc aaattaagat aagaaaccca accacaggat cgggggccgc
120
180
240
300
305 <210> 44 <211> 852 <212> DNA <213> Homo sapien <220>
< 2 21 > , různé vlastnosti <222> (1) . . . (852) <223> n = A,T,C nebo G <400> 44 acataaatat gattatttgg ctctccatcc ccagaatttc tgctgttgtt agacgccctc ggatgtcgcg acttggcagg tggtggttgt tgctaccata cagagaaaag tgtgtgtttt tcgggcattc tcttttgtag cttcttttta agatcggtct gatgaattcc ggggtcttgc catggagatc gttggtgtca tagtctttga ggtttgtgtc ttcccaaatt taatatctca ccccatagct tcccatttta cataagtgag tcctttttca tgagcccggc tataaatagt aatatttacg caaagtattg tatataccag tagctcggct gagccactgc ttaatcctgg tccctctcgg tatcaggtga agaaagtttt tctngtcttt tccaggagtt gcagcttcag tcttcgtcca gagcttttca ctctgatttc gttcttgtct gttgtgcttt ctctgcaaca gctgtccaac ccaggtgttc ctttgtttct ttttcatttt tccacacgct taggtcatgc aagaacctga gggttcaaga ttggtgtggc ggaaggtgac aaatctactg atgatggaag
120
180
240
300
360
420
480
540
600 gctcagtttg actggccgtt ccgcccgggt cntggaaagg cccacacctg
660
720
780
840
852 tcactactgc gccgtccctg atgtcgaact tggagccact
129 ttcagtcttg ccacttcaga gaactcctgc gatacaattg gt acaatgacat tgctgcaagt aaactcatgc gcatccagct tgtgtgtgga tgctgtagag tgcaaaggtg ggttggtgtc ctggaacagg gagntgcccc ctcgccgttg caggaggtga
<210> 45 <211> 234 <212> DNA <213> Homo sapien
<400> 45
acaacagacc agtctgacac gcctcgtttc tgaacgtgtc cttgctcgct catccggagc tggctggggt ggtggtgtct aacgacctca atcagcattg ctgctggcga gaggaggtct tgctcatcaa cttcgcagtg acggcagaat gcagtaagct gttggacgaa ccctaccgcg gcctaccgtg ctatgacccg tccgtgtccg gggaactctt ctgcagtgcg ctgt
120
180
234 <210>
<211>
<212>
<213>
590
DNA
Homo sapien <220>
<221>
<222>
<223>
různé vlastnosti (1) . ..(590) n = A,T,C nebo G <400> actttttatt atttgatagc , aagaagataa tgantataac aaagctttca caggataaan ttacaatggc tggtctctaa ggctcctgtt gccttccttt i taaatgttta aatattttgg tatattccaa taattgacaa aaanaaanaa aactgaaggg ttaaatgcan tctgccttac atatccacaa gaggagactt taaggcagat agattacaga gcanatacaa tggaaaatca ttattgcagt canaaagaat ggaaaaagca tctttgggtg tcccagcagc catctcactg ctatgagaat gttttagtaa aatatctaat attttaatgt ctanttaatt taattttcac gtggaagtag tggctttgat aagatgaagg gccaacactc gatagaaaac ttaccaatta gaaagatcaa gaattgcaca caaacagtgt ttcatgtaac ggaagtantc cctctggaga gatgaaaaag agtcacatgt atggtgtgta cacagttaaa ggcaggaaaa ttatccttta taaatggtat ncacccanat aaggtctttc cagctgccag gacacatgct
120
180
240
300
360
420
480
540
590
<210> 47
<211> 774
<212> DNA
<213> Homo sapien
<220>
<221> různé vlastnosti;
<222> (i) . ..(774)
<223> n = A,T,C ' nebo G
<400> 47
acaagggggc tgaacagaat gcttcactgc cattacagac aacatcaaag ataatgaagg tttcctgnac ttgaaactta gggactctgg aaaggaaggt agtggggana aacggggctt aatggatgtg gaggaaggat ggcgtcatac gattttaaag caaaataatt ggacanaatt aaacagaaag ctcccagcct aaggaaaaaa ttcttgggga ttctgtaatg gggacaaagg acacagttct aacgaggccc ggttcaagac accctgaggg ctaatcccaa ccagggctct
120
180
240
300
360
420
480
540
600
660
720
774 • <9 ·· <»W999 • 999 · · 9 >9 *
99 9 · *··
999 999 9 99
9 · 9 9 99 · 9999«
130 cctcatccct ctggctcctg ccacactcct cctacttccg acggcatggg ttccccactc aggctgctgg tcacttctat ggaggacgac gtcttcagcc tgaacacaca agatgccttg aagcctttct cttagaggca cttcaaattn gggcntcatt agtggaggaa cccagctctg tccccaggtt ctccctgcag gacttgcctg agatagggtg tggctcattt ttgttctacc caactgacca gaagcccacc atattcctgg cctgtcaaaa attactccag gttaagagta acgagctatg tgcaaaatgg tgtccccagg ctctgctgat acatggctga tcccactcac catcttggaa gggctggacc ggaccttggg gggataataa ctcctgtgtg cctgcgtggc acctcctatt cctccaaacc caatccctga acttggagcc caagtnatct tagt <210>
<211>
<212>
<213>
124
DNA
Homo sapien <220>
<221>
<222>
<223>
různé vlastnosti (1)...(124) n = A,T,C nebo G <400>
canaaattga aattttataa ttgcaantat anaaatgtgt tggt aaaggcattt cataaattat ttctcttata aatgttcctt tccataaaat aattacagct gatataattt caacgcaact
120
124
<210> 49
<211> 147
<212> DNA
<213> Homo sapien
<220>
<221> různé ; vlastnosti
<222> (1) . . - (147)
<223> n = A,T, C neb0 q
<400> 49
gccgatgcta ctattttatt gcaggaggtg tgtggctaca ggtggtgtct gactgcatna ttagggcacc catatcccaa gcantgt ggggtgtttt aaaanttttt tattattctc tacgggtgat tcaacagctt tgcaaaaatt
120
147
<210> 50 <211> 107 <212> DNA <213> Homo sapien
<400> 50
acattaaatt aataaaagga ctgttggggt atggtttgag gttaggagga gttaggcata tctgctaaaa tgttttggga cacatggctt gaggggt gatatattgc
107
<210> 51
<211> 204
<212> DNA
<213> Homo sapien
<400> 51
gtcctaggaa gtctagggga cacacgactc tggggtcacg gggccgacac acttgcacgg φ
«« tm
« t í » ·
·· • · 4
Φ « ♦ ♦ ·
• W · ·
·· ·
« ·«·
131 cgggaaggaa gccttgcaag cctccctttt aggcagagaa gtcagaaagg gggaccagca gtgacaccgt ggactcaggg atgt cagggggaaa cttccaccac tgacagaaag agccctgccc gaaaatcaag cacttggcca
120
180
204 <210> 52 <211> 491 <212> DNA <213> Homo sapien <220>
<221> irůzné vlastnosti <222> (1)...(491) <223> n = A,T,C neboG <400 acaaagataa gggtattttc ccatcagaca aaaacttctt ccanaaacac atgttgctca atgcaacagt caattttatt atcactcttg • 52 catttatctt caaaagacta ggtttttaaa gtatcaattt ttcctcaaaa gataaataaa gtcttttctt tggataacaa t ataacaaaaa aagagataac aaacaacata cttttgttca attttcaana tctcgtgaga tnctttttct agggtctcca tttgatagtt tcaggtaaaa ttacaaaatt aaatgactga tggtagcttt acttaccacc tttttttttt aattatattg ttaaaggtta agttagaaat agacaatcat cttaantatt canatgtncc caccacaagc ttacaggcac aaaaataaat gtattgtgta gtataaaaca ccttaaaaaa tttaaatatt ctcagtccca tttctggggc agaaactcat ccaagttaat
120
180
240
300
360
420
480
491 <210> 53 <211> 484 <212> DNA <213> Homo sapien <220>
<221> různé vlastnosti >
<222> (1) . . . (484) <223> n = A,T,C neboG <400> acataattta gtattaacag actacagaac caatcaaatc gcactagtat agctttgant aatgattggc tancttgant cant gcagggctaa ttgctgaagt ccttaaggac tctacataac anaccgctcc ttctttgtgc aggtcnggta ctgtgtattc ttaccataag ttggtatttt actgaaaatt actatagtaa tgtcaggata tgatangagg aatřiccaaaa caggancagg atgctattta tatgcagcat agtaagtaaa ttaaaacgtt anactgcttt. aaaggctgaa catattccaa cggatggaat ttaanaggtn tttctttttg gttcagaaac aaaaaaaagt ggaacagaaa ttaccttgtt ctcaacactt gggccagccc tatgatctga ctttgataac attagctgct gttgaaatct gggaaaaanc gcctctccct cttttccncg ncggatgttc
12 0 180 240 300 360 420 480 484
<210> 54 <211> 151 <212> DNA <213> Homo sapien
<400> 54
actaaacctc gtgcttgtga actccataca ccactgggta tactgctgac aaccgcaaca tctatgtcct ctcaagtgcc tttttgtttg
120
151 gaaaacggtg ccatccctga acacggctgg acaaaaacac aaatccttgg cactggctag t
132
<210> 55 <211> 91 <212> DNA <213 > Homo sapien <400>
acctggcttg tctccgggtg gttcccggcg gccctccagt ggatactcga gccaaagtgg ccccccacgg t tccccagaac ggacactttc
<210> 56
<211> 133
<212> DNA
<213> Homo sapien
<400> 56
ggcggatgtg cgttggttat atacaaatat tggatttttg gtatctgtgg gttgggggga aagggacaac tgt gtcattttat cggtccagga gtaagggact accaataccc tgagtatact catggatacc
120
133 <210> 57 <211> 147 <212> DNA <213> Homo sapien <220>
< 2 21 > různé vlastnosti;
<222> (1)...(147) <223> n = A,T,C nebo G <400> 57 actctggaga gactgggagc tcccantggg acctgagccg tgagcccttc ctggatncat ctgctccgcc cctttgcgcc gcagggt tctgggatga tgcctcagag ggtgatgcan gattgttgcc gcngtggcgc gacntgcana
120
147 <210> 5Θ <211> 198 <212> DNA <213> Homo sapien <220>
< 2 21 > různé vlastnosti <222> (1)...(198) <223> n = A,T,C ne},0 q <400> 58 acagggatat aggtttnaag ttattgtnat tgtaaaatac attgaatttt ctgtatactc60 tgattacata catttatcct ttaaaaaaga tgtaaatctt aatttttatg ccatctatta120 atttaccaat gagttacctt gtaaatgaga agtcatgata gcactgaatt ttaactagtt180 ttgacttcta agtttggt198 <210> 59 <211> 330 <212> DNA <213> Homo sapien
120
180
240
300
330
133 <400 acaacaaatg ccattgaaaa cacctgtgct tacagtcaat cagaaggaat tttcgtcttt • 59 ggttgtgagg ttatcattaa agcttgctaa aaatgacaaa ctattttatc attggacttc aagtcttatc tgattttaaa aatgggagtt gccagggcct acatggatct tttgaagagt agcaaaactg tgacaagtta aactctagag acaggtggtt ccgtctgtgc gtgatggcta tcaaaaactc caaatatagt tccagacttt tcaaaatacc ctgaaaagat actcaatttt atcttctgaa ccagacccag taatgatatt
<210> 60 <211> 175 <212> DNA <213> Homo sapien
<400> 60
accgtgggtg gtcgtgggct tcctggaacc ccttctacat ccttcctctt agcggtggct tcctgacggc catcctcatc gggcaaggcc tccttcacca cagctggtgc gaggagtgcg acatctggtt tgctcatcga attcccgtgc ctacttcggc ctttgcgcac ctggt
120
175
<210> 61 <211> 154 <212> DNA <213> Homo sapien
<400> 61
accccacttt ggttgttgct tggactgcac tcctcctgtg cttcaacagt agccccgggg agcagtctgg atcctcccct ctccacattg acttctcact ttccggatct ctgt gctacatgat gctgagccgg gagggtgagt acagcagtgc
120
154
<210> 62
<211> 30
<212> DNA
<213> Homo sapien
<400> 62
cgctcgagcc ctatagtgag tcgtattaga
<210> 63 <211> 89 <212> DNA <213> Homo sapien
<400> 63
acaagtcatt tcagcaccct ttgctcttca ctgtatgaat aaaaatggtt atgtcaagt aaactgacca tcttttatat ttaatgcttc
<210> 64 <211> 97 <212> DNA <213> Homo sapien
<400> 64
accggagtaa ctgagtcggg acgctgaatc aatcagcgca tccaggattg gtccttggat tgaatccacc ctggggt aataaataaa ggttctgcag
134 • · · · • · · ·· 9 9 • · •· •· •· <210>
<211>
<212>
<213>
377
DNA
Homo sapien <220>
<221>
<222>
<223>
různé vlastnosti;
(1) . . .(377) nebo G η = Α,Τ, C <400> acaacaanaa : gcatggcgtc ccaaccctgg tcggtcataa : ggtgctgttt < tgggggtgaa , gggcgggagg .
ntcccttctt ctaggccttg tctacccaca natgaaatcc gctcagccag ctacccccan agcatgt taggccactg acacagcggc nttctggcta caanggggac aaaacagctg gaggaatcat atggaaacct tggggtttgg tgggctgtct agaggtcagt cctggcattc gcctgggcga ggaaccccct gctntcccaa ctgccactga agaggaagct gccgctgaac tgcaanggtg tttgatggca accgcacacc acatcagggt caatgagaaa tatgaacccg ccaacaggag
120
180
240
300
360
377
<210> 66 <211> 305 <212> DNA <213> Homo sapien
<400> 66
acgcctttcc agaacccgtg aggaactaac tcctccactc ttatatattt tgttt ctcagaattc tgccccttcc tgcaccctgg taagggatat tttaataaga agggaagaga caccatatcc tcctctcccc caacactgcc tgcactttat cctccctccg catctttgaa tcaccctcca gccctgaatt aataaagtct ttgttgcgtg ctcaaacacg tccctcacct tatgtggttt gaagaattac
120
180
240
300
305
<210> 67 <211> 385 <212> DNA <213> Homo sapien
<400> 67
actacacaca ggtcggacca cccttttaaa tgtgctgtgc ctgggcagtc cctctcccag catagtttct ctccacttgc gccacatctc aaaggggact tggagattca ttgcacatga ggccccagcc gtgctagtgg ccttgtgaga atgtgcaaga tgcttaaaaa cttttgagag gatggggctg tggccacacc accgt cactttgtcc ttgcccagca agaagtctag agttctcctc gtctgatctc tgcttacagg cagcacttta gacatcaggt ccacgattgt tgagacctga agcactcctt gcactctcag ggaatgctga ctgagagttc gtagagcagc tctttagagg agtctgcttg atgcccatac
120
180
240
300
360
385
<210> 68 <211> 73 <212> DNA <213> Homo sapien
<400> 68
acttaaccag atatattttt accccagatg gtttttttaa tgg gggatattct ttgtaaaaaa tgaaaataaa • · · · • · ··
135 <210> 69 <211> 536 <212> DNA <213> Homo sapien <220>
<221> rfůzné vlastnosti <222> (1)...(536) <223> n = A,T,C neboG <400 actagtccag tccagctttg cctgctggcc cccgggtggc cgccatcagc actaagagcc ccgaaccata agaactgcag gaangtccct • 69 tgtggtggaa tgctctgcct accctagctg atctataacg gagtataaca aggcaacaga tgtaccaagt aagaaacagt gggtgaaatc ttccattgtg ctgaggagac tggccctggc cagacctcaa aggccaccaa ccgtcggggg cccagcccaa tgtgctcttc caggtgtcaa ttgggggctc catggcccag ctggagcccc tgatgagtgg agatgactac ggtgaattac cttggacacc cgagatctac gaaatcctan tcaccctcct catctgagta aaggaggagg gtacagcgtg tacagacgtc ttcttcgacg tgtgccttcc gaagttccct ggatctgttg ctcctgcagc ccctgctgct ataggataat cccttcactt cgctgcgggt tagaggtggg atgaacagcc ggggagaaca ccaggc
120
180
240
300
360
420
480
536 <210> 70 <211> 477 <212> DNA <213> Homo sapien <400> 70 atgaccccta tcacttccac ccaatgatgg ccaaaaaggc agggattttt actggccccc ccgtattact accgaaacca acaggggccc tccataacgc cgcgatgtaa cttcgatacg ctgagccttt aacaggcatc cgcatcagga aattattcaa tctcagccct tcctcatact cacgagaaag ggataatcct taccactcca accccgctaa gtatcaatca agcactgctt cctaatgacc aggcctacta cacataccaa atttattacc gcctagcccc atcccctaga cctgagctca attacaattt tccggcctag accaacacac ggccaccaca tcagaagttt taccccccaa agtcccactc ccatagtcta tactgggtct ccatgtgatt taaccatata caccacctgt ttttcttcgc ctaggagggc ctaaacacat atagaaaaca ctatttt
120
180
240
300
360
420
477 <210> 71 <211> 533 <212> DNA <213> Homo sapien <220>
<221> různé vlastnosti <222> (1)...(533) ’ <223> n = A,T,C neboG <400> agagctatag aggtattaat tgtgatttta attatttcca taaataaagg aaataggtgt agtcagtttg cttcgtaatt taaaaaaaaa gtacagtgtg agatatgtaa gtggtatttt taacttaaaa tttgtcatct gaccctacta ccttgaaaaa ttggagtang aattcacaac atctcagctt agaaagaaat tggcaccctt agtgagtttg ttaaaaatac ataattatta tatcaaatat aggttccctc agtatataag tgcaaacaca cacaccatta atatatgttt aaaaagaaaa agcaatatgt gaaatacatt aactcttaga ctcaattttg gctgtaaaat ttttctacat ataatggtaa tccaaacttt tctccagcaa gactttttaa taaaaacatc gaaatgtaca tatttttaaa gaagaattct agatagtact gattggttta cagcagtgat gcatctcatt aaaagctgtc gagtacctca taaaagaatg aagtacatgg gcc
120
180
240
300
360
420
480
533
136 <210> 72 <211> 511 <212> DNA <213> Homo sapien <220>
<221> různévlastnosti <222> (1)...(511) <223> η = A,T,C nebo G <400> 72 tattacggaa aaacacacca cataattcaa ctancaaaga anactgcttc agggcgtgta aaatgaaagg cttccaggca gttatctgat taaagaacac taaaagaggg acaaggctaa aagccgcagg atgtctacac tatancaggc gctatttggg ttggctggag gagctgtgga aaacatggan agattggtgc tgganatcgc cgtggctatt cctcattgtt attacanagt gaggttctct gtgtgcccac tggtttgaaa accgttctnc aataatgata gaatagtaca cacatgagaa ctgaaatggc ccaaacccag aaagaaagcc caactagatc ctcagaanac gcttctaggg acaataaccg atgaagaaaa gatggcctcc ttgtgccccc gtctgttatg atttctctcc attgcagcna naaacccgtt cttctaagca aacncaggtg atgatggcna aaatacaccc cctcttgaag naccnggagg a
120
180
240
300
360
420
480
511 <210> 73 <211> 499 <212> DNA <213> Homo sapien <220>
< 2 21 > různé vlastnosti <222> (1)...(499) <223> n = A,T,C nebo G <400> 73 cagtgccagc actggtgcca gtaccagtac caataacagt cagtggtggc ttcagtgctg gtgccagcct gaccgccact tggccttggt ggagctggtg ccagcaccag cggcagctct caagtgagat tttagatatt gttaatcctg ccagtctttc ctcagaaacc tactcaacac agcactctag gcagccacta ctctgcatta aatctatttg ccatttctga aaaaaaaaaa antctagagg gcccgtttaa acccgctgat cagcctcgac catctgttgt ttgcccctcc cccgntgcct tccttgaccc gtcctttcct aantaaaat gccagtgcca ctcacatttg ggtgcctgtg tcttcaagcc tcaatcaatt aaaaaaaggg tgtgccttct tggaaagtgc gtgccagcac ggctcttcgc gtttctccta agggtgcatc gaagttgaca cggccgctcg anttgccagc cactcccact
120
180
240
300
360
420
480
499 <210> 74 <211> 537 <212> DNA <213> Homo sapien <220>
<221> různévlastnosti <222> (1)...(537) <223> n = A,T,C neboG <400> 74 tttcatagga gaacacactg aggagatact tgaagaattt ggattcagcc gcgaagagat
120
180
240
300
360
420
480
537 • · · · · · ·· 9 · · · ·
137 ttatcagctt aactcagata aaatcattga aagtaataag gtaaaagcta gtctctaact tccaggccca cggctcaagt gaatttgaat actgcattta cagtgtagag taacacataa cattgtatgc atggaaacat ggaggaacag tattacagtg tcctaccact ctaatcaaga aaagaattac agactctgat tctacagtga tgattgaatt ctaaaaatgg taatcattag ggcttttgat ttataanact ttgggtactt atactaaatt atggtagtta tactgccttc cagtttgctt gatatatttg ttgatattaa gattcttgac ttatattttg aatgggttct actgaaaaan gaatgatata ttcttgaaga catcgatata catttattta cactcttgat tctacaatgt agaaaatgaa ggaaatgccc caaattgtat ggtgataaaa gtcccgt <210> 75 <211> 467 <212> DNA <213> Homo sapien <220>
< 2 21 > různé vlastnosti <222> (1)...(467) <223> n = a,t,C nebo G <400> 75 caaanacaat tgttcaaaag atgcaaatga tacactactg ctgcagctca caaacacctc60 tgcatattac acgtacctcc tcctgctcct caagtagtgt ggtctatttt gccatcatca120 cctgctgtct gcttagaaga acggctttct gctgcaangg agagaaatca taacagacgg180 tggcacaagg aggccatctt ttcctcatcg gttattgtcc ctagaagcgt cttctgagga240 tctagttggg ctttctttct gggtttgggc catttcantt ctcatgtgtg tactattcta300 tcattattgt ataacggttt tcaaaccngt gggcacncag agaacctcac tctgtaataa360 caatgaggaa tagccacggt gatctccagc accaaatctc tccatgttnt tccagagctc420 ctccagccaa cccaaatagc cgctgctatn gtgtagaaca tccctgn467 <210> 76 <211> 400 <212> DNA <213> Homo sapien <220>
< 2 21 > různé vlastnosti <222> (1).7.(400) <223> n = A,T,C nebo G <400> 76 aagctgacag cattcgggcc gagatgtctc gctccgtggc cttagctgtg ctcgcgctac60 tctctctttc tggcctggag gctatccagc gtactccaaa gattcaggtt tactcacgtc120 atccagcaga gaatggaaag tcaaatttcc tgaattgcta tgtgtctggg tttcatccat180 ccgacattga agttgactta ctgaagaatg gagagagaat tgaaaaagtg gagcattcag240 acttgtcttt cagcaaggac tggtctttct atctcttgta ctacactgaa ttcaccccca300 ctgaaaaaga tgagtatgcc tgccgtgtga accatgtgac tttgtcacag cccaagatng360 ttnagtggga tcganacatg taagcagcan catgggaggt400 <210> 77 <211> 248 <212> DNA <213> Homo sapien <400> 77 ctggagtgcc ttggtgtttc.aagcccctgc aggaagcaga atgcaccttc tgaggcacct 60
138 ccagctgccc cggcggggga tgcgaggctc ggagcaccct tgcccggctg tgattgctgc 120 caggcactgt tcatctcagc ttttctgtcc ctttgctccc ggcaagcgct tctgctgaaa 180 gttcatatct ggagcctgat gtcttaacga ataaaggtcc catgctccac ccgaaaaaaa 240 aaaaaaaa 248 <210> 78 <211> 201 <212> DNA <213> Homo sapien <400> 78 actagtccag tgtggtggaa ttccattgtg ttgggcccaa cacaatggct acctttaaca 60 tcacccagac cccgccctgc ccgtgcccca cgctgctgct aacgacagta tgatgcttac 120 tctgctactc ggaaactatt tttatgtaat taatgtatgc tttcttgttt ataaatgcct 180 gatttaaaaa aaaaaaaaaa a 201 <210> 79 <211> 552 <212> DNA <213> Homo sapien <220>
<221> i různé vlastnosti <222> (1)...(552) <223> n = A,T,C nebo G <400> tccttttgtt tttaggcagt cctctttctt tgtgatagta atgcaagtta ctgttccttg taatattcta ttcccaggaa cngttttggt aaaaaaaaaa aggtttttga gctagtaatt ctgaagatta taagtatcta gtaattactc gctagaaaaa tgttctaaaa tatggggttc taatacgtta aa gacaacccta tcctcgtaat atgaagttga agtgcagatg agggttaact attataaaca gttgggctat atttatgaat atatgtcctn gacctaaact gattctgtta aaattgaggt aaagtgtgtt aaattacttt ggactttgtt acataaanta antacccggg aatnaacaag gtgtcacaga tcactttcct ggataaatac atatatatcc aatatgctgt agtttgggaa tnaagaaata anagaagttt gcntgactta cttctgaatg attctttatt aaaaaggtag artcaaaatt tgaacctact gccaaattga tggaatttta tgantnaaac tttccaaaaa
120 180 240 300 360 420 480 540 552 <210> 80 <211> 476 <212> DNA <213> Homo sapien <220>
< 2 21 > různé vlastnosti <222> (1) . . . (476) <223> n = A,T,C neboG <400> acagggattt ggggaaaatg cacacagact gcaattcacg aggttaaact tcttctaagt gagatgctaa gggcctagaa cccgagtagc ttgccacctc ttcccaccca cctcttccag ggccccagag gttacagagc tgggactaca caacttaaac gaaaaggcaa cctcactttg atcgtttgat atctagctgg ggcacacagt attcttcata cttagataaa agtcctcctt ccaaccctct tgcgctggca cactgaagca tgtgatgtcc atcttagagt gggggttgat tattttcaga cccctggcct ggccctgttt ttagtcacta actttcatac aggaantntc
120
180
240
300
360
139 tcttggcttt gctgaaaaaa ctcaataaaa ttaaaatgtt tctctatcca ctggtttcnc tctcatgttt tttaaaaaaa aatttggtac aaaaaaaaaa gcntaaaaat aaaaaa
420
476 <210> 81 <211> 232 <212> DNA <213> Homo sapien <220>
<221> různé vlastnosti <222> (1)...(232) <223> n = a,t,c neboG <400> 81 tttttttttg tatgccntcn ctgtggngtt attgttgctg ccaccctgga ggagcccagt 60 ttcttctgta tctttctttt ctgggggatc ttcctggctc tgcccctcca ttcccagcct 120 ctcatcccca tcttgcactt ttgctagggt tggaggcgct ttcctggcag cccctcagag 180 actcagtcag cgggaataag tcctaggggt ggggggtgtg gcaagccggc ct 232 <210> 82 <211> 383 <212> DNA <213> Homo sapien <220>
<221> různé vlastnosti <222> (1)...(383) <223> n = A,T,C neboG <400> 82 aggcgggagc agaagctaaa gccaaagccc aagaagagtg gcagtgccag cactggtgcc60 . agtaccagta ccaataacat gccagtgcca gtgccagcac cagtggtggc ttcagtgctg120 gtgccagcct gaccgccact ctcacatttg ggctcttcgc tggccttggt ggagctggtg180 ccagcaccag tggcagctct ggtgcctgtg gtttctccta caagtgagat tttagatatt240 gttaatcctg ccagtctttc tcttcaagcc agggtgcatc ctcagaaacc tactcaacac300 agcactctng gcagccacta tcaatcaatt gaagttgaca ctctgcatta aatctatttg360 ccatttcaaa aaaaaaaaaa aaa383 <210> 83 <211> 494 <212> DNA <213> Homo sapien <220>
< 2 21 > různé vlastnosti <222> (1)...(494) <223> n = A,T,C neboG <400> accgaattgg gggagatcga ccatcctgct acgcttcaag atgtcttttc agccctgatg gaccgctggc gtctatacgc cggttctccc gtgctcatga tgccacctgt cctttttgcc ttataagcga tgaagaaatt cagatgacaa cccagcaacc tacccctcgg agccatactc tcatgtcctc tgacccgatg atactctcga gcgccctgtc agactccgta tttggcntcc cagtattacc ggacaacaga caccgaatca ctctgagggt accaaactct agtctctcgt tcaacgagca cctgctcagc ccatcaagaa ccttaaactg tcggactgtg ggcgattgat
120
180
0
300
360
140 tatgcttgtg tttcncatat aaaaaaaaaa tgaggcaatc tttaaattac aaaa atggtggcat naccagaata cacccatnaa nttcagaata gggaacacat aatgaattga ttganttttt aaaactctta
420
480
494 <210> 84 <211> 380 <212> DNA <213> Homo sapien <220>
<221> různé vlastnosti;
<222> (1)...(380) <223> n = A,T,C neboG <400> 84 gctggtagcc tatggcgtgg ccacggangg gctcctgagg cacgggacag tgacttccca agtatcctgc gccgcgtctt ctaccgtccc tacctgcaga tcttcgggca gattccccag gaggacatgg acgtggccct catggagcac agcaactgct cgtcggagcc cggcttctgg gcacaccctc ctggggccca ggcgggcacc tgcgtctccc agtatgccaa ctggctggtg gtgctgctcc tcgtcatctt cctgctcgtg gccaacatcc tgctggtcac ttgctcattg ccatgttcag ttacacattc ggcaaagtac agggcaacag cnatctctac tgggaaggcc agcgttnccg cctcatccgg <210> 85 <211> 481 <212> DNA <213> Homo sapien <220>
< 2 21 > různé vlastnosti <222> (1)...(481) <223> n = A,T,cneboG <400> 85 gagttagctc ctccacaacc ttgatgaggt cgtctgcagt ggcctctcgc ttcataccgc tnccatcgtc atactgtagg tttgccacca cctcctgcat cttggggcgg ctaatatcca ggaaactctc aatcaagtca ccgtcnatna aacctgtggc tggttctgtc ttccgctcgg tgtgaaagga tctccagaag gagtgctcga tcttccccac acttttgatg actttattga gtcgattctg catgtccagc aggaggttgt accagctctc tgacagtgag gtcaccagcc ctatcatgcc nttgaacgtg ccgaagaaca ccgagccttg tgtggggggt gnagtctcac ccagattctg cattaccaga nagccgtggc aaaaganatt gacaactcgc ccaggnngaa aaagaacacc tcctggaagt gctngccgct cctcgtccnt tggtggnngc gcntnccttt t
120
180
240
300
360
380
120
180
240
300
360
420
480
481 <210> 86 <211> 472 <212> DNA <213> Homo sapien <220>
< 2 21 > různé vlastnosti <222> (1) . . .(472) <223> n = A,T,C nebo G <400> 86
120
180
240
300
360
420
472
141 aacatcttcc acttggaaaa taaacagtgt ccctattcac cacaagtccg catgggacag atatntgagc tgttnacnaa tgtataatgc gcaacttnaa gtcaatctgc acctgttaaa aaaaaagcaa agccatttga ggaagantag agttatgtct tgtgtaatat gcctggacac tcccttactt agggcgctaa aagtaaacag tttaaaaagc cctttctact cttacagatg cgatccgatn tggtattaaa tgtcatcacc gcatttttga ttnttaattt aaattgcata tcaccagaca ggatgctttt ttgtctgctg attcacaata agtctgggaa ttcaacatct gttagccaat atattgagct caactcct.tt gtggcaattc agaattcatt tgcaacactt taagggtatg ttttttttga tcactttctt ttgggagctg catattggga tg <210> 87 <211> 413 <212> DNA <213> Homo sapien <220>
<221> různé vlastnosti <222> (1) ...(413) <223> n = A,T,C nebo G <400 agaaaccagt tgtgtgtgcg cctctttggt ttgtcttctg tttattcgac ggggacaaag acagaaattg • 87 atctctnaaa cgcatattat atctatatct tgtaaatggt atgaaggaaa aaaagcanaa ggtngtatat acaacctctc atagacaggc gtgaaagttt actagagaaa tttccagatn ctgaacatna tgaaananng ataccttgtg acatcttttt taatgatctg acacctatnt acaacactna gaaacaattn catcattnaa gacctaattt tacttttgta ccataatgtc tatgagtcaa caaactctcc cctggtgaga acgttttttt tgtgtgcgtg aaagcttatg ttggggaccc r.ctagttngt cttgactagg aatcncataa ttt
120
180
240
300
360
413 <210> 88 <211> 448 <212> DNA <213> Homo sapien <220>
<221> ,různé vlastnosti <222> (1) . . . (448) <223> n = A,T,C neboG <400> cgcagcgggt gtcctagccn cgtggccctg gggaggccca tcggcnanta cccaancaaa tttaccagaa gaancantcc cctctctatc accatggccg gccgtgagcc tggaccccgc caacaaaccc ttgttactng ccnagccaat tgntcttttc tagctccagc ggcccccgcg ccgcggccgg gtggaagaag gcaacnactt gggtaantaa tngaacaatt caaatttt ctctcgcctg cgccccgctg ctccagtccc aaggtgtgcg ttaccnagcn ttcttggaag ncccctccat ccccactccc ctcctgctgg ggcaagccgc gcgtgcactg cgcgctgcag ttgaacctgg aacagcccct cgcgtcccgc ccatcctggc cgcgcctggt gactttgccg gttgtgccgc gccaaacnng tttaaaaagg
120
180
240
300
360
420
448 <210> 89 <211> 463 <212> DNA <213> Homo sapien <220>
< 2 21 > různé vlastnosti
120
180
240
300
360
420
463
142 <222> (1)...(463) <223> n = A,T,c neboG <400> 89 gaattttgtg cactggccac tgtgatggaa ccattgggcc aggatgcttt gagtttatca gtagtgattc tgccaaagtt ggtgttgtaa catgagtatg taaaatgtca aaaaattagc agaggtctag gtctgcatat cagcagacag tttgtccgtg tattttgtag ccttgaagtt ctcagtgaca agttnnttct gatgcgaagt tctnattcca gtgttttagt cctttgcatc tttnatgttn agacttgcct ctntnaaatt gcttttgtnt tctgcaggta ctatctgtgg tttaacaaaa tagaannact tctctgcttn gaanatttga atatcttaca tctnaaaatn aattctctcc ccatannaaa acccangccc ttggganaat ttgaaaaang gntccttcnn aattcnnana anttcagntn tcatacaaca naacngganc ccc <210> 90 <211> 400 <212> DNA <213> Homo sapien <220>
<221> různé vlastnosti · <222> (1)...(400) <223> n = A,T,cneboG <400> 90 agggattgaa ggtctnttnt actgtcggac tgttcancca ccaactctac aagotgctgt cttccactca ctgtctgtaa gcntnttaac ccagactgta tcttcataaa tagaacaaat tcttcaccag tcacatcttc taggaccttt ttggattcag tcagtataag ctcttccact tcctttgtta agacttcatc tggtaaagtc ttaagttttg tagaaaggaa tttaattgct cgttctctaa caatgtcctc tccttgaagt atttggctga acaacccacc tnaagtccct ttgtgcatcc attttaaata tacttaatag ggcattggtn cactaggtta aattctgcaa gagtcaCctg tctgcaaaag ttgcgttagt atatctgcca <210> 91 <211> 480 <212> DNA <213> Homo sapien <220>
<221> různé vlastnosti <222> (1)...(480) <223> n = A,T,C neboG <400> 91 gagctcggat ccaataatct ttgtctgagg gcagcacaca tatncagtgc catggnaact ggtctacccc acatgggagc agcatgccgt agntatataa ggtcattccc tgagtcagac atgcctcttt gactaccgtg tgccagtgct ggtgattctc acacacctcc nnccgctctt tgtggaaaaa ctggcacttg nctggaacta gcaagacatc acttacaaat tcacccacga gacacttgaa aggtgtaaca aagcgactct tgcattgctt tttgtccctc cggcaccagt tgtcaatact aacccgctgg tttgcctcca tcacatttgt gatctgtagc tctggataca tctcctgaca gtactgaaga acttcttctt ttgtttcaaa agcaactctt ggtgcctgtt ngatcaggtt cccatttccc agtccgaatg ttcacatggc atatnttact tcccacaaaa <210> 92 <211> 477 <212> DNA
120
180
240
300
360
400
120
180
240
300
360
420
480 •9 »···
143 <213 > Homo sapien <220>
<221> různé vlastnosti <222> (1)...(477) <223> n = A, T,C nebo G <400> 92 atacagccca natcccacca cgaagatgcg cttgttgact gagaacctga tgcggtcact 60 ggtcccgctg tagccccagc gactctccac ctgctggaag cggttgatgc tgcactcctt 120 cccacgcagg cagcagcggg gccggtcaat gaactccact cgtggcttgg ggttgacggt 180 taantgcagg aagaggctga ccacctcgcg gtccaccagg argcccgact gtgcgggacc 240 tgcagcgaaa ctcctcgatg gtcatgagcg ggaagcgaat gangcccagg gccttgccca 300 gaaccttccg cctgttctct ggcgtcacct gcagctgctg ccgctnacac tcggcctcgg 360 accagcggac aaacggcgtt gaacagccgc acctcacgga tgcccantgt gtcgcgctcc 420 aggaacggcn ccagcgtgtc caggtcaatg tcggtgaanc ctccgcgggt aatggcg 477 <210> 93 <211> 377 <212> DNA <213> Homo sapien <220>
<221> ,různé vlastnosti <222> (1) . . .(377) <223> n = A,T,C neboG <400> 93 gaacggctgg accttgcctc gcattgcgct gctggcagga ataccttggc aagcagctcc 60 agtccgagca gccccagacc gctgccgccc gaagctaagc ccgcctctgg ccttcccctc 120 cgccccaatg cagaaccant agtgggagca ctgtgtttag agttaagagt gaacactgtn 180 tgattttact tgggaatttc ctctgttata tagcttttcc caatgctaat ttccaaacaa 240 caacaacaaa ataacatgtt tgcctgttna gttgtataaa agtangtgat tctgtatnta 300 aagaaaatat tactgttaca tatactgctt gcaanttctg tatttattgg tnctctggaa 360 ataaatatat tattaaa 377 <210> 94 <211> 495 <212> DNA <213> Homo sapien <220>
<221> 1 různé vlastnosti <222> (1)...(495) <223> n = A,T,C neboG <400> 94 ccctttgagg ggttagggtc cagttcccag tggaagaaac aggccaggag aantgcgtgc 60 cgagctgang cagatttccc acagtgaccc cagagccctg ggctatagtc tctgacccct 120 ccaaggaaag accaccttct ggggacatgg gctggagggc aggacctaga ggcaccaagg 180 gaaggcccca ttccggggct gttccccgag gaggaaggga aggggctctg tgtgcccccc 240 acgaggaana ggccctgant cctgggatca nacacccctt cacgtgtatc cccacacaaa 300 tgcaagctca ccaaggtccc ctctcagtcc cttccctaca ccctgaacgg ncactggccc 360 acacccaccc agancancca cccgccatgg ggaatgtnct caaggaatcg cngggcaacg 420 tggactctng tcccnnaagg gggcagaatc tccaatagan gganngaacc cttgctnana 480 • ·
144
aaaaaaaana aaaaa
495 <210> 95 <211> 472 <212> DNA <213> Homo sapien <220>
<221> různévlastnosti <222> (1)...(472) <223> n = A,T,C neboG <400 ggttacttgg cctctggaag tagctgtttt tatttattat atgatgaaaa atcggcaaaa ttggttattt tttanttcan tttcattgcc ccttgcgcag gagttgattc cttgtgaaaa gcaatagata tgtggagtgt tattgtaaat taatttcttt accacttagt agcggacttt gcaccactgc gtatacaatg tatattcttt atgttctttt gaattacaaa ccttgtttac ggatgtcatt gtaattgttg accacaactc aaaattttgt tattatgttn cacagtaata attcttaatt gttaattttg tagaaccatt gagaataact aatatgaaaa tcatactgta aattatgatt tatgcctttt taagaaaatg aaaagaatgc ttgtctgctc gctgaatttt ctatttnact tttatcaagt gccattatta gtaacttcac gtangttata at
120
180
240
300
360
420
472 <210> 96 <211> 476 <212> DNA <213> Homo sapien <220>
<221 > různévlastnosti <222> (1)...(476) <223> n = A,T,C nebo G <400> ctgaagcatt gtggtgaaat ttttaactca attcttcaca agctggatac tgtgttagtc gcaggtactc tacaaagtct tcttcaaact ttcaaaatta tgatttttac gtagatgatg atacngtggg tcaattccta ctccagaaaa atcttcctca tntctacttt tatgtaactt acacacaatc aaagagtcct agttctataa ccacactgag acngacaggg nangtctgtn tgtcattgat ctactagttt cagaacttat ccagtgtctt actcatacct ggagcctccc caggcttgca aaggaacaat acctgtagta tactttctcc tatatagcct gngcanaatg cagtgggact aaatcactat tgaaaaagtn ttaatcttct agttgacaat cccaagtctt ctaagtcttt ttctagntat naaccaaaat attcttatct acatctgcgt agcttt
120
180
240
300
360
420
476 <210> 97 <211> 479 <212> DNA <213> Homo sapien <220>
<221> různévlastnosti <222> (1) . . . (479) <223> n = A,T,C nebo G <400> 97 actctttcta aaataatgct atgctgatat gcaaacttaa gatcttgagt tgttcttatg ataagaatgc caaaatggaa atatgtcact cgctaatgaa agaatggata acacagctca
120 ·« ··· ·
180
240
300
360
420
479
145 caatcgcaaa gattgtgctc caggctacta gtgattatna ntnnttttta ttcnatctta tcaaaactca cttcggatat gaattctgtt aattaatcac natcaaagta ttttttcccn caagtgctca gattgtttct attggatatn aaatttcact ttttgtgttt gacnactant tctgttgtag canatcttgg tgagagcatg tatacctgct ggaantgtnn tnctttttta atttagtgta gcaatnttcc aaatttttaa atcagcagct aaatgaaatc gggnctattc ataagactta ttagtcaaat naatacactt agaaaaacat tgaatgtggg tganccatc
<210> 98
<211> 461
<212> DNA
<213> Homo sapien
<400> 98
agtgacttgt tgctagttcc tcaactccag agtgattcag tgaagccact ttacctggag ttaagaaaaa tttggaataa cctccaacaa tgtcatctat ctggattatt tttcctctac ctgaacacgc aaaagaggct ctaccacatg tcttgacgct aaccccttga tcgctactaa ttggagcctg ggatgagaga tggttatcta ttggctgggg ttgtgtatcc cctgaacttg tcaagtttgt atgcagactg caaatctatt ctggctcaag gatgagaaca accatcccat tggtgccggc ctcctctgcg ggcactgaca gaggggacca cctacttgta aatatcctca gagaaataaa tgaaccttct cgtttatgaa a atcagaccta aaaaggggca cggactttga tgcagcttta gtcagaaaat cttaaggact ctgaccaccc
120
180
240
300
360
420
461
<210> 99
<211> 171
<212> DNA
<213> Homo sapien
<400> 99
gtggccgcgc cggcgcctct cggtgagaaa gcaggtgttt gcgggcccga agccttctct cctcgtaccg ggaggagcgg agcgatctga cagggccccc ctggcgggtg gaggcgtgcc tcccttcccc gggggagtgt ttgggggtac aggcgtccct gacccaccct c
120
171
<210> 100
<211> 269
<212> DNA
<213> Homo sapien
<400> 100
cggccgcaag cgactgcgac aaggctgagc cagccggaac cgagagatac tgcaactcca gacggcggcg tgacgccgca agagcccggt gcaggtgcag gctggggccg gcgacagtcg gaggtcgtgt gaagcgggag gtggccgcc tgcggacgaa caggtgcagc cacgtcccac gcctcgggga gattctgcca gcgggcgcct gaccttgacg gcccctcggg gcagttggtc ggggtcttgc ccgtcgggga aagggcggcc
120
180
240
269
<210> 101 <211> 405 <212> DNA <213> Homo sapien
<400> 101
tttttttttt gctagcaagg ttgattggtt agtgggtgca tgaccgtcat ttttggaatc taacagggta tgtctttatg ccctccctgt tttcttgaca tactgcgagc gggcatggtt ggggcggggt agaacctggt tcaatgttat acagcaggtc acatgttcag ggggtagggg tacaaagctt tagaagtcag agcaacaagt gtcaacttcc aaacgaagca ggggcagttc gatatctttt ttattttgca tttgtcgtgg aataacatgg acctggtctg agagagtcca
120
180
240
300
146 ctgttctgga gatgatcagt gggagattag acgaataccg ggtttcttgc aggcatattc caaatccaac tcatatcggt aaaatccact ggcca gaaaaagttg
360
405 <210> 102 <211> 470 <212> DNA <213> Homo sapien <400> 102 tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt 60 ggcacttaat ccatttttat ttcaaaatgt ctacaaattt aatcccatta tacggtattt 120 tcaaaatcta aattattcaa attagccaaa tccttaccaa ataataccca aaaatcaaaa 180 atatacttct ttcagcaaac ttgttacata aattaaaaaa atatatacgg ctggtgtttt 240 caaagtacaa ttatcttaac actgcaaaca ttttaaggaa ctaaaataaa aaaaaacact 300 ccgcaaaggt taaagggaac aacaaattct tttacaacac cattataaaa atcatatctc 360 aaatcttagg ggaatatata cttcacacgg gatcttaact tttactcact ttgtttattt 420 ttttaaacca ttgtttgggc ccaacacaat ggaatccccc ctggactagt 470 <210> 103 <211> 581 <212> DNA <213> Homo sapien <400> 103 tttttttttt ttttttttga cccccctctt ataaaaaaca agttaccatt ttattttact 60 tacacatatt tattttataa ttggtattag atattcaaaa ggcagctttt aaaatcaaac 120 taaatggaaa ctgccttaga tacataattc ttaggaatta gcttaaaatc tgcctaaagt 180 gaaaatcttc tctagctctt ttgactgtaa atttttgact cttgtaaaac atccaaattc 240 atttttcttg tctttaaaat tatctaatct ttccattttt tccctattcc aagtcaattt 300 gcttctctag cctcatttcc tagctcttat ctactattag taagtggctt ctttcctaaa 360 agggaaaaca ggaagagaaa tggcacacaa aacaaacatt ttatattcat atttctacct 420 acgttaataa aatagcattt tgtgaagcca gctcaaaaga aggcttagat ccttttatgt 480 ccattttagt cactaaacga tatcaaagtg ccagaatgca aaaggtttgt gaacatttat 540 tcaaaagcta atataagata tttcacatac tcatctttct g 581 <210> 104 <211> 578 <212> DNA <213> Homo sapien <400> 104 tttttttttt cactctctag ctcttatgct aggaaatctg gaggtttttc ttcatgcaaa caaaactgct aaatcacatt aaaggaacat tgaattcaca tttttttttt atagggcatg atatcatatt ttcattcttc ttctctattt ctagaaaata caaattgttt tacgacagca ttttagcctg tgttattatt tttttctctt aagaaaactc ttaagttaaa tcattcatat acacatatat atgtttcttt gttaagttat ataataaaac ggtataatta cctagcccaa cttttttttt atctttccag ctaatgagtc agttatatca ttccatgtga tgcataagag ccattataat tgaagtacca gctaattcac cacaatgg gaaatgagga ctttaaaata actggcttat agtactacct atttgtatca aagagaacaa tagttggcag gttaaatatc tttacaagca tcgagttttt acaatcaaat cttctcctga tgcatattga aacctttatt tatagcatta gagctaatac caaaataatt tttattagaa
120
180
240
300
360
420
480
540
578 <210> 105 <211> 538 <212> DNA *« ····
120
180
240
300
360
420
480
538
147 •·♦ ·· » · <♦ • ·· 99
9 · · ··
9 9 99
99· 99 *· <213> Homo sapien <400> 105 tttttttttt gaaaagtgcc gtcttgaaca aagatcatag aaatccacta ggggtgtcac tgtactttgc ggcgagaaat agatatgttt tttttcagta ttacatttaa ccaatattaa agcttgtaag ttagcaaata tggtaaacca taatacgtgg gaggaagaaa cctttgccaa ataatcagaa taaaagtttg tttgaggaaa tgaaaagata aattactatg acacattctg atatgagttg agaaaaggat tattaaaaaa caatatttat tttctcaaag atacaccaaa aaatttgacc gacttcttgc aaggatacat acaagtttct tacgcatact ataataatgt ttttatattt tgatcagagg atacattaag tcagaaactc tttaattttg tacttagtga ctttcttcaa gttctttcta ttactactag aaaattcata aattagatat taaattattt tgagcattaa tgatgaatat tagattctta tcttttaagg tggaaggatt tgaaaccc
<210> 106
<211> 473
<212> DNA
<213> Homo sapien
<400> 106
tttttttttt atttattagc tttataaatg tctcccacca gcaaacgcta aatgcatcac agactgtgtc ccgcttcctc ttttttagtc tctgcaactt taaggtgcca actaatgaac attctcttct aatctacaat tgtctgaatc aaaggcgctg aagtttctat acatatttaa ttattgagta agcaacatta ccatccccat caacagcaag aaatgatctg ccacatttgtggctctttgc ttttattata attaaagaaa atatattcct gtttaatttt gtgatattgt atgaagctag acctatcctc
attaaagtct tggtcatttc 60
cgttttagac aactgtacaa 120
ccaagagtgg atgtgtccct 180
attagtagat. atacactgct 240
gtatatgtgt gagttggtag 300
gctgggcttt cggtgaaaat 360
ggtggcaaga actcttcgaa 420
acttgttcca aaa 473
<210> 107
<211> 1621
<212> DNA
<213> Homo sapien
<400> 107
cgccatggca ctgtgctatg ccgctacgac gccgcgggga cttccgccgc tccaaggctt agctggccac tggtgagaat gtgtgcactg cattgatgca gaaatcgagt ctatacgact gttctacgag gagcatggat gaaggcagag ttttgaggag ggagcaggac tttcaaaagg cagccgcgaa agctagtctc tagagtaaca ctgcagggca gtcctggctg gtgagccgct gccgccgtgc ggtgtcatgg atttatgcca gatatcaact ccgtatgccc ggcattataa aatatggtgg ctgtgggaag tacaggacag ctgctgatca gattggccag tggtgtcaaa gttgttcatc gtgagccccc gatcctttca gagatttatc taacttccag cataacattg tctcggtcat acttcggggc tgggccgggg tgcggcgtct agaaactcca ggctgagtgg atttggcttt cgctgaatct tggctctttt aaggaacagc cacctcgagg cagatgggga aaggacttgg aaatgaagaa tctttgacgg atgatcacaa gccctgcacc taggagaaca agcttaactc gcccacggct tatgcatgga ggcctggccc cgcgtggacc ctagtgctgg tcggatgtgc gagattctgc tcaggaagct ctctcaaaaa tttgctggtg cgcactgaca tcttttctgt ttggatggtg gttggagcaa gatgaacttc gatgtatttg tgtgtgactc ggctcgttta aacaccccag atacttgaag attgaaagta tgaatactgc aacagtatta cgggcccgtt ggcccggctc acctgaagca tgctggagcc agcgggaaaa tctgccggtt ttggcagaag gtggccttat agggtcaggt ggaaaactca gagcaccttt tagaacccca ccaatcagat caaagaagac cggttctgac tcaccagtga ccatcccttc aatttggatt ataaggtaaa atttacagtg cagtgtccta
120
180
240
300
360
420
480
540
600
660
720
780
840
900
960 1020 1080 1140 1200 1260 • · • v
1320
1380
1440
1500
1560
1620
1621 ccactctaat aatggttatc agttattctg ttttgaatgg atttacactc aaaagtcacg a caagaaaaga attagggctt ccttccagtt gttctagtga ttgattctac tgaaacaaaa attacagact ttgatttata tgcttgatat aaaaggaatg aatgtagaaa aaaaaaaaaa ctgattctac aaactttggg atttgttgat atatattctt atgaggaaat aaaaaaaaaa agtgatgatt tacttatact attaagattc gaagacatcg gccacaaatt aaaaaaaaaa gaattctaaa aaattatggt ttgacttata atatacattt gtatggtgat aaaaaaaaaa <210> 108 <211> 382 <212> PRT <213> Homo sapien <400> 108
Met Ala Leu Gin Gly Ile Ser Val Met Glu Leu Ser Gly Leu Ala Pro
1 5 10 15
Gly Pro Phe Cys Ala Met Val Leu Ala Asp Phe Gly Ala Arg Val Val
20 25 30
Arg Val Asp Arg Pro Gly Ser Arg Tyr Asp Val Ser Arg Leu Gly Arg
35 40 45
Gly Lys Arg Ser Leu Val Leu Asp Leu Lys Gin Pro Arg Gly Ala Ala
50 55 60
Val Leu Arg Arg Leu Cys Lys Arg Ser Asp Val Leu Leu Glu Pro Phe
65 70 75 80
Arg Arg Gly Val Met Glu Lys Leu Gin Leu Gly Pro Glu Ile Leu Gin
85 90 95
Arg Glu Asn Pro Arg Leu Ile Tyr Ala Arg Leu Ser Gly Phe Gly Gin
100 105 110
Ser Gly Ser Phe Cys Arg Leu Ala Gly His Asp Ile Asn Tyr Leu Ala
115 120 125
Leu Ser Gly Val Leu Ser Lys Ile Gly Arg Ser Gly Glu Asn Pro Tyr
130 135 140
Ala Pro Leu Asn Leu Leu Ala Asp Phe Ala Gly Gly Gly Leu Met Cys
145 150 155 160
Ala Leu Gly Ile Ile Met Ala Leu Phe Asp Arg Thr Arg Thr Asp Lys
165 170 175
Gly Gin Val Ile Asp Ala Asn Met Val Glu Gly Thr Ala Tyr Leu Ser
180 185 190
Ser Phe Leu Trp Lys Thr Gin Lys Ser Ser Leu Trp Glu Ala Pro Arg
195 200 205
Gly Gin Asn Met Leu Asp Gly Gly Ala Pro Phe Tyr Thr Thr Tyr Arg
210 215 220
Thr Ala Asp Gly Glu Phe Met Ala Val Gly Ala Ile Glu Pro Gin Phe
225 230 235 240
Tyr Glu Leu Leu Ile Lys Gly Leu Gly Leu Lys Ser Asp Glu Leu Pro
245 250 255
Asn Gin Met Ser Met Asp Asp Trp Pro Glu Met Lys Lys Lys Phe Ala
260 265 270
Asp Val Phe Ala Lys Lys Thr Lys Ala Glu Trp Cys Gin Ile Phe Asp
275 280 285
Gly Thr Asp Ala Cys Val Thr Pro Val Leu Thr Phe Glu Glu Val Val
290 295 300
His His Asp His Asn Lys Glu Arg Gly Ser Phe Ile Thr Ser Glu Glu
305 310 315 320
Gin Asp Val Ser Pro Arg Pro Ala Pro Leu Leu Leu Asn Thr Pro Ala
149
325 330 335
Ile Pro Ser Phe Lys Arg Asp Pro Phe Ile Gly Glu His Thr Glu Glu
340 345 350
Ile Leu Glu Glu Phe Gly Phe Ser Arg Glu Glu Ile Tyr Gin Leu Asn
355 360 365
Ser Asp Lys Ile Ile Glu Ser Asn Lys Val Lys Ala Ser Leu
370 375 380
<210> 109 <211> 1524 <212> DNA <213> Homo sapien <400> 109 ggcacgaggc gggcctggcc cagtgcgacc ggtttgtacc ctgcttcaca atgatgaagg gtggccacgg gtcttctacc gccctcatgg gcccaggcgg atcttcctgc acattcggca atccgggaat cgcctcctgc ctcgagcatt tcggtgcata gagcgtctga cgcgagtacg ctggggtggg ccccctgacc ccacagggga gccttgtcct gtgtcatcct ggatcaaggc cagggaccac cagaggaaaa tgcgccaggg atgcctcact tagtggctct acctgggccg tcttcacggt acgtgttctt aggggctcct gtccctacct agcacagcaa gcacctgcgt tcgtggccaa aagtacaggg tccactctcg tcaggcaatt tccgggttta aggagaactt agcgcacgtc aacagcgcct tggccgaggc tgcctgggtc ttttgctcct tgaggtgagc tacaaaccac ctggatcccg agacccctca aaaaaaaaaa cctgagcgga gagccagcgc cacctgcttc cactgtčctc caacaaacag cttcctcttc gaggccacgg gcagatcttc ctgctcgtcg ctcccagtat catcctgctg caacagcgat gcccgcgctg gtgcaggcga cctttctaag tctgctggca ccagaaggtg gaaagtgctg cctgagccgc caaagactga agagtaaggc cccatgtcca agcatgcccg ggccgttatc ccactcacag aaaa ggcgggggca ctgcgcctct ctcctgggcg tgcatcgact ctggggccca ttcctcggcg gacagtgact gggcagattc gagcccggct gccaactggc gtcaacttgc ctctactgga gccccgccct ccccggagcc gaagccgagc cgcgctaggg gacttggcac gagcgggagg tctgccttgc gccctgctgg tcatctgggc tctgggccac gctcctccca catctggagg attcctcaca gcctcgccag acctcgccga tgggctgccg tcatggtttt agatcgtcat tgtggctggt tcccaagtat cccaggagga tctgggcaca tggtggtgct tcattgccat aggcgcagcg ttatcgtcat cccagccgtc ggaagctgct acaagcggga tgaaacagct tccagcagtg tgcccccagg cggacttcaa ctcggccccc tgtcaggacc gaaccagtcc ctgcagggtc ctggggaaat cgggggcccc cagctggaac gctgaccccg cacggtgcgg cgtgagcaag agcctatggc cctgcgccgc catggacgtg ccctcctggg gctcctcgtc gttcagttac ttaccgcctc ct.cccacttg ctccccggcc aacgtgggaa gagcgactcc gggacacatc tagccgcgtc tgggccgcca ggagaagccc gcacctggtg acctttggga cagcctggga cttggggtaa aaagccattt
120
180
240
300
360
420
480
540
600
660
720
780
840
900
960 1020 1080 1140 1200 1260 1320 1380 1440 1500 1524
<210> 110
<211> 3410
<212> DNA
<213> Homo sapien
<400> 110
gggaaccagc gtgatgagac aagctggacc ggcggcagca gagtgcctga ggtgagccgc tggcctggag gggggtagag ctgcacgcgc gtgtccccac ggcaccaaag aggaggagag acggccccct ctgctgcggc gtgtgtttgg gagaagttca tggctccggg tgaggtgccc ggctggcaga gccgcagctt gagccctacc accggaaagc ccgcaggcat tgaccatggt tgacagccgc cacagcagca aatgggcgcc ctggagcaga cgcctggccc ccagctcttg cacctatgtg gctgggcatt gcgcctcggc ggtgttgagc tggctgattc gccgagacga actatggtcc ctggtcaacc ccgcctctgc ggtccagtgc caggatctga atgggctgag ctaggcagtt agcagttctg agaggctgtg tgctaacctt tgctggaagt tgggcctggt
120
180
240
300
360
420
480 ···· ·· · ···
150 ctgtgtcccg ctcctaggct cagccagtga ccactggcgt ggacgctatg gccgccgccg540 gcccttcatc tgggcactgt ccttgggcat cctgctgagc ctctttctca tcccaagggc600 cggccggcta gcagggctgc tgtgcccgga tcccaggccc ctggagctgg cactgctcat660 cctgggcgtg gggctgctgg acttctgtgg ccaggtgtgc ttcactccac tggaggccct720 gctctctgac ctcttccggg acccggacca ctgtcgccag gcctactctg tctatgcctt780 catgatcagt cttgggggct gcctgggcta cctcctgcct gccattgact gggacaccag840 tgccctggcc ccctacctgg gcacccagga ggagtgcctc tttggcctgc tcaccctcat900 cttcctcacc tgcgtagcag ccacactgct ggtggctgag gaggcagcgc tgggccccac960 cgagccagca gaagggctgt cggccccctc cttgtcgccc cactgctgtc catgccgggc1020 ccgcttggct ttccggaacc tgggcgccct gcttccccgg ctgcaccagc tgtgctgccg1080 catgccccgc accctgcgcc ggctcttcgt ggctgagctg tgcagctgga tggcactcat1140 gaccttcacg ctgttttaca cggatttcgt. gggcgagggg ctgtaccagg gcgtgcccag1200 agctgagccg ggcaccgagg cccggagaca čtatgatgaa ggcgttcgga tgggcagcct1260 ggggctgttc ctgcagtgcg ccatctccct ggtcttctct ctggtcatgg accggctggt1320 gcagcgattc ggcactcgag cagtctattt ggccagtgtg gcagctttcc ctgtggctgc1380 cggtgccaca tgcctgtccc acagtgtggc cgtggtgaca gcttcagccg ccctcaccgg1440 gttcaccttc tcagccctgc agatcctgcc ctacacactg gcctccctct accaccggga1500 gaagcaggtg ttcctgccca aataccgagg ggacactgga ggtgctagca gtgaggacag1560 cctgatgacc agcttcctgc caggccctaa gcctggagct cccttcccta atggacacgt1620 gggtgctgga ggcagtggcc tgctcccacc tccacccgcg ctctgcgggg cctctgcctg1680 tgatgtctcc gtacgtgtgg tggtgggtga gcccaccgag gccagggtgg ttccgggccg1740 gggcatctgc ctggacctcg ccatcctgga tagtgccttc ctgctgtccc aggtggcccc1800 . atccctgttt atgggctcca ttgtccagct cagecagtct gtcactgcct atatggtgr.c1860 tgccgcaggc ctgggtctgg tcgccattta ctttgc.taca caggtagtat ttgacaagag1920 cgacttggcc aaatactcag cgtagaaaac ttccagcaca ttggggtgga gggcctgcct1980 cactgggtcc cagctccccg ctcctgttag ccccatgggg ctgccgggct ggccgccagt2040 ttctgttgct gccaaagtaa tgtggctctc tgctgccacc ct.gtgctgct gaggtgcgta2100 gctgcacagc tgggggctgg ggcgtccctc tcctctctcc ccagtctcta gggctgcccg2160 actggaggcc ttccaagggg gtttcagtct ggacttatac agcgaggcca gaagggctcc2220 atgcactgga atgcggggac tctgcaggtg gattacccag gctcagggtt aacagctagc2280 ctcctagttg agacacacct agagaagggt ttttgggagc tgaataaact cagtcacctg2340 gtttcccatc tctaagcccc ttaacctgca gcttcgttta atgtagctct tgcatgggag2400 tttctaggat gaaacactcc tccatgggat ttgaacatat gacttattta taggggaaga2460 gtcctgaggg gcaacacaca agaaccaggt cccctcagcc cacagcactg tctttttgct2520 gatccacccc cctcttacct tttatcagga tgtggcctgt tggtccttct gttgccatca2580 cagagacaca ggcatttaaa tatttaactt atttatttaa caaagtagaa gggaatccat2640 tgctagcttt tctgtgttgg tgtctaatat ttgggtaggg tgggggatcc ccaacaatca2700 ggtcccctga gatagctggt cattgggctg atcattgcca gaatcttctt ctcctggggt2760 ctggcccccc aaaatgccta acccaggacc ttggaaattc. tactcatccc aaatgataat2820 tccaaatgct gttacccaag gttagggtgt tgaaggaagg tagagggtgg ggcttcaggt2880 ctcaacggct tccctaacca cccctcttct cttggcccag cctggttccc cccacttcca2940 ctcccctcta ctctctctag gactgggctg atgaaggcac tgcccaaaat ttcccctacc3000 cccaactttc ccctaccccc aactttcccc accagctcca caaccctgtt tggagctact3060 gcaggaccag aagcacaaag tgcggtttcc caagcctttg tccatctcag cccccagagt3120 atatctgtgc ttggggaatc tcacacagaa actcaggagc accccctgcc tgagctaagg3180 gaggtcttat ctctcagggg gggtttaagt gccgtttgca ataatgtcgt cttatttatt3240 tagcggggtg aatattttat actgtaagtg agcaatcaga gtataatgtt tatggtgaca3300 aaattaaagg ctttcttata tgtttaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa3360 aaaaaaaara aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaataa aaaaaaaaaa3410 <210> 111 <211> 1289 <212> DNA <213> Homo sapien • · • · · · • · · · · · · • · · · · • · · ·· · · ·
151 <400> 111 agccaggcgt ccctctgcct gcccactcag tggcaacacc cgggagctgt tttgtccttt60 gtggagcctc agcagttccc tctttcagaa ctcactgcca agagccctga acaggagcca120 ccatgcagtg cttcagcttc attaagacca tgatgatcct cttcaatttg ctcatctttc180 tgtgtggtgc agccctgttg gcagtgggca tctgggtgtc aatcgatggg gcatcctttc240 tgaagatctt cgggccactg tcgtccagtg ccatgcagtt tgtcaacgtg ggctacttcc300 tcatcgcagc cggcgttgtg gtctttgctc ttggtttcct gggctgctat ggtgctaaga360 ctgagagcaa gtgtgccctc gtgacgttct tcttcatcct cctcctcatc ttcattgctg420 aggttgcagc tgctgtggtc gccttggtgt acaccacaat ggctgagcac ttcctgacgt480 tgctggtagt gcctgccatc aagaaagatt atggttccca ggaagacttc actcaagtgt540 ggaacaccac catgaaaggg ctcaagtgct gtggcttcac caactatacg gattttgagg600 actcacccta cttcaaagag aacagtgcct ttcccccatt ctgttgcaat gacaacgtca660 ccaacacagc caatgaaacc tgcaccaagc aaaaggctca cgaccaaaaa gtagagggtt720 gcttcaatca gcttttgtat gacatccgaa ctaatgcagt caccgtgggt ggtgtggcag780 ctggaattgg gggcctcgag ctggctgcca tgattgtgtc catgtatctg tactgcaatc840 tacaataagt ccacttctgc ctctgccact actgctgcca catgggaact gtgaagaggc900 accctggcaa gcagcagtga ttgggggagg ggacaggatc taacaatgtc acttgggcca960 gaatggacct gccctttctg ctccagactt ggggctagat agggaccact ccttttagcg1020 atgcctgact ttccttccat tggtgggtgg atgggtgggg ggcattccag agcctctaag1080 gtagccagtt ctgttgccca ttcccccagt ctattaaacc cttgatatgc cccctaggcc1140 tagtggtgat cccagtgctc tactggggga tgagagaaag gcattttata gcctgggcat1200 aagtgaaatc agcagagcct ctgggtggat gtgtagaagg cacttcaaaa tgcataaacc1260 ' tgttacaatg ttaaaaaaaa aaaaaaaaa1289 <210> 112 <211> 315 <212> PRT <213> Homo sapien <400> 112
Met Val Phe Thr Val Arg Le.u Leu His Ile Phe. Thr Val Asn Lys Gin
1015
Leu Gly Pro Lys Ile Val Ile Val Ser Lys Met Met Lys Asp Val Phe
2530
Phe Phe Leu Phe Phe Leu Gly Val Trp Leu Val Ala Tyr Gly Val Ala
4045
Thr Glu Gly Leu Leu Arg Pro Arg Asp Ser Asp Phe Pro Ser Ile Leu
5560
Arg Arg Val Phe Tyr Arg Pro Tyr Leu Gin Ile Phe Gly Gin IlePro
70 7580
Gin Glu Asp Met Asp Val Ala Leu Met Glu His Ser Asn Cys SerSer
9095
Glu Pro Gly Phe Trp Ala His Pro Pro Gly Ala Gin Ala Gly Thr Cys
100 105110
Val Ser Gin Tyr Ala Asn Trp Leu Val Val Leu Leu Leu Val Ile Phe
115 120125
Leu Leu Val Ala Asn Ile Leu Leu Val Asn Leu Leu Ile Ala Met Phe
130 135140
Ser Tyr Thr Phe Gly Lys Val Gin Gly Asn Ser Asp Leu Tyr TrpLys
145 150 155160
Ala Gin Arg Tyr Arg Leu Ile Arg Glu Phe His Ser Arg Pro AlaLeu
165 170175
Ala Pro Pro Phe Ile Val Ile Ser His Leu Arg Leu Leu Leu Arg Gin
180 185190
Leu Cys Arg Arg Pro Arg Ser Pro Gin Pro Ser Ser Pro Ala Leu Glu ··
152
195 200 205
His Phe Arg Val Tyr Leu Ser Lys Glu Ala Glu Arg Lys Leu Leu Thr
210 215 220
Trp Glu Ser Val His Lys Glu Asn Phe Leu Leu Ala Arg Ala Arg Asp
225 230 235 240
Lys Arg Glu Ser Asp Ser Glu Arg Leu Lys Arg Thr Ser Gin Lys Val
245 250 255
Asp Leu Ala Leu Lys Gin Leu Gly His Ile Arg Glu Tyr Glu Gin Arg
260 265 270
Leu Lys Val Leu Glu Arg Glu Val Gin Gin Cys Ser Arg Val Leu Gly
275 280 285
Trp Val Ala Glu Ala Leu Ser Arg Ser Ala Leu Leu Pro Pro Gly Gly
290 295 300
Pro Pro Pro Pro Asp Leu Pro Gly Ser Lys Asp
305 310 315
<210> 113 <211> 553 <212> PRT <213> Homo sapien <400> 113
Met Val Gin Arg Leu Trp Val Ser Arg Leu Leu Arg His Arg Lys Ala
1 5 10 15
Gin Leu Leu Leu Val Asn Leu Leu Thr Phe Gly Leu Glu Val Cys Leu
20 25 30
Ala Ala Gly Ile Thr Tyr Val Pro Pro Leu Leu Leu Glu Val Gly Val
35 40 45
Glu Glu Lys Phe Met Thr Met Val Leu Gly Ile Gly Pro Val Leu Gly
50 55 60
Leu Val Cys Val Pro Leu Leu Gly Ser' Ala Ser Asp His Trp Arg Gly
65 70 75 80
Arg Tyr Gly Arg Arg Arg Pro Phe Ile Trp Ala Leu Ser Leu Gly Ile
85 90 95
Leu Leu Ser Leu Phe Leu Ile Pro Arg Ala Gly Trp Leu Ala Gly Leu
100 105 110
Leu Cys Pro Asp Pro Arg Pro Leu Glu Leu Ala Leu Leu Ile Leu Gly
115 120 125
Val Gly Leu Leu Asp Phe Cys Gly Gin Val Cys Phe Thr Pro Leu Glu
130 135 140
Ala Leu Leu Ser Asp Leu Phe Arg Asp Pro Asp His cys Arg Gin Ala
145 150 155 160
Tyr Ser Val Tyr Ala Phe Met Ile Ser Leu Gly Gly Cys Leu Gly Tyr
165 170 175
Leu Leu Pro Ala Ile Asp Trp Asp Thr Ser Ala Leu Ala Pro Tyr Leu
180 185 190
Gly Thr Gin Glu Glu Cys Leu Phe Gly Leu Leu Thr Leu Ile Phe Leu
195 200 205
Thr Cys Val Ala Ala Thr Leu Leu Val Ala Glu Glu Ala Ala Leu Gly
210 215 220
Pro Thr Glu Pro Ala Glu Gly Leu Ser Ala Pro Ser Leu Ser Pro His
225 230 235 240
Cys Cys Pro Cys Arg Ala Arg Leu Ala Phe Arg Asn Leu Gly Ala Leu
245 250 255
Leu Pro Arg Leu His Gin Leu Cys Cys Arg Met Pro Arg Thr Leu Arg
260 265 270
153
Arg Leu Phe 275 Val Ala Glu Leu Cys 280 Ser Trp Met Ala Leu 285 Met Thr Phe
Thr Leu Phe Tyr Thr Asp Phe Val Gly Glu Gly Leu Tyr Gin Gly Val
290 295 300
Pro Arg Ala Glu Pro Gly Thr Glu Ala Arg Arg His Tyr Asp Glu Gly
305 310 315 320
Val Arg Met Gly Ser Leu Gly Leu Phe Leu Gin cys Ala Ile Ser Leu
325 330 335
Val Phe Ser Leu Val Met Asp Arg Leu Val Gin Arg Phe Gly Thr Arg
340 345 350
Ala Val Tyr Leu Ala Ser Val Ala Ala Phe Pro Val Ala Ala Gly Ala
355 360 365
Thr Cys Leu Ser His Ser Val Ala Val Val Thr Ala Ser Ala Ala Leu
370 375 380
Thr Gly Phe Thr Phe Ser Ala Leu Gin Ile Leu Pro Tyr Thr Leu Ala
385 390 395 400
Ser Leu Tyr His Arg Glu Lys Gin Val Phe Leu Pro Lys Tyr Arg Gly
405 410 415
Asp Thr Gly Gly Ala Ser Ser Glu Asp Ser Leu Met Thr Ser Phe Leu
420 425 430
Pro Gly Pro Lys Pro Gly Ala Pro Phe Pro Asn Gly His Val Gly Ala
435 440 44 5
Gly Gly Ser Gly Leu Leu Pro Pro Pro Pro Ala Leu Cys Gly Ala Ser
450 455 460
Ala Cys Asp Val Ser Val Arg Val Val Val Gly Glu Pro Thr Glu Ala
465 470 475 480
Arg Val Val Pro Gly Arg Gly Ile Cys Leu Asp Leu Ala Ile Leu Asp
485 490 495
Ser Ala Phe Leu Leu Ser Gin Val Ala Pro Ser Leu Phe Met Gly Ser
500 505 510
Ile Val Gin Leu Ser Gin Ser Val Thr Ala Tyr Met Val Ser Ala Ala
515 520 525
Gly Leu Gly Leu Val Ala Ile Tyr Phe Ala Thr Gin Val Val Phe Asp
530 535 540
Lys Ser Asp Leu Ala Lys Tyr Ser Ala
545 550
<210> 114
<211> 241
<212> PRT
<213> Homo sapien
<400> 114
Met Gin Cys Phe Ser Phe Ile Lys Thr Met Met Ile Leu Phe Asn Leu
1 5 10 15
Leu Ile Phe Leu Cys Gly Ala Ala Leu Leu Ala Val Gly Ile Trp Val
20 25 30
Ser Ile Asp Gly Ala Ser Phe Leu Lys Ile Phe Gly Pro Leu Ser Ser
35 40 45
Ser Ala Met Gin Phe Val Asn Val Gly Tyr Phe Leu Ile Ala Ala Gly
50 55 60
Val Val Val Phe Ala Leu Gly Phe Leu Gly Cys Tyr Gly Ala Lys Thr
65 70 75 80
Glu Ser Lys Cys Ala Leu Val Thr Phe Phe Phe Ile Leu Leu Leu Ile
• · · ·
154
85 90 95
Phe Ile Ala Glu Val Ala Ala Ala Val Val Ala Leu Val Tyr Thr Thr
100 105 110
Met Ala Glu His Phe Leu Thr Leu Leu Val Val Pro Ala Ile Lys Lys
115 120 125
Asp Tyr Gly Ser Gin Glu Asp Phe Thr. Gin Val Trp Asn Thr Thr Met
130 135 140
Lys Gly Leu Lys Cys Cys Gly Phe Thr Asn Tyr Thr Asp Phe Glu Asp
145 150 155 160
Ser Pro Tyr Phe Lys Glu Asn Ser Ala Phe Pro Pro Phe Cys Cys Asn
165 170 175
Asp Asn Val Thr Asn Thr Ala Asn Glu Thr Cys Thr Lys Gin Lys Ala
180 185 190
His Asp Gin Lys Val Glu Gly Cys Phe Asn Gin Leu Leu Tyr Asp Ile
195 200 205
Arg Thr Asn Ala val Thr Val Gly Gly Val Ala Ala Gly Ile Gly Gly
210 215 220
Leu Glu Leu Ala Ala Met Ile Val Ser Met Tyr Leu Tyr Cys Asn Leu
225 230 235 240
Gin
<210>
<211>
<212>
<213>
115
366
DNA
Homo sapien <400> gctctttctc catttcactg ttggtttgtg . actggtagaa i tctcagaacc ; tctctacatg i ttagtc
115 tcccctcctc tgatgtatat aatccatctt aaacatctga atttcaccca cataacaaac tgaatttaat tgtgttgcaa gctttttccc agagctagtc gacagcctgt cctgctccaa tctttcaact aaaaaaaaaa cattggaact tatcagcatc ttctatcctg tctgtcacat tgcaatttgc gtgtctttgt agtcattaac tgacaggtga tttaataaat aaaagtctgt aaggattaca ttaaaattac ccatctctga attggatggt tagtttgggt gacttgaagt
120
180
240
300
360
366 <210>
<211>
<212>
<213>
116
282
DNA
Homo sapien <220>
<221>
<222>
<223>
různé vlastnosti (1)...(282) nebo G η = A, Τ, C <400> acaaagatga gagaaatgag agactttact atacgttaaa tcaatctnga
116 accatttcct atnaaacaca attttcatat caaaggataa actatctana atattatagc atnttataaa tttaagacac tgtgaacagc tcacagacat aaaattaaaa gtctacttag atgatttatc agagaggatt ttctattcct tctacccgta agaagatcaa ctattttagt tgttggcaga tt ttctaatatt gtgacctcaa aacctggttc aaatctatgt
120
180
240
282 <210> 117 <211> 305
155 <2125» DNA <213> Homo sapien <220>
<221> různé vlastnosti:
<222>
<223>
(1)...(305) nebo G η = A,T,C <400> acacatgtcg tatttatcct aataaggcaa tactgatccc gactgcccca < tgggt
117 cttcactgcc ccctcctgaa aatatatgaa tgatcactgt gcttactgcc ttcttagatg acaattgcaa acaacaggtc cctaatgcag tgtagagagt cttctggtca aataanacaa tcgagatatt gatgtgggaa ttctangctg acatanagga aatatatgaa ggaaatcagt acagatgagg cagttcagac acagggacca acaattgcaa caatgaagga tcacctctgt agggagaaat
120
180
240
300
305
<2105· 118
<2115» 71
<212> DNA
<213> Homo sapien
<220s>
<221; různé vlastnosti = <222> (1) . . . (71) <223> n = A,T,C or
118 <400>
accaaggtgt ntgaatctct gacgtgggga aantcctggg t tctctgattc ccgcacaatc tgagtggaaa <210>
<2115» <2125» <213>
119
212
DNA
Homo sapien <220>
<221>
<222>
<223>
různé vlastnosti (1) . . . (212) nebo G n = A,T,C <400> actccggttg gaaaatgggg agtaagctgg aatggantca
119 gtgtcagcag tgaaattggc cccttctaat aganactccc cacgtggcat caactttcta aaaagaaaat aggcctcagc tgaacatngc tnaacttatg tgaaaggttt gt aatgtggagc ttggcaantt ctcactaanc ccaaaccaca tgccaccaac ggaattaant
120
180
212 <210> 120 <211> 90 <212> DNA <213> Homo sapien <220>
<221> různé vlastnosti <222> (1) . . . (90) <223> n = A,T,C neboG ·· ··· ·
156 <400> 120 actcgttgca natcaggggc cccccagagt ctccgccggc gcagaacatg ctggggtggt caccgttgca ggagtccttc tggtcttgcc <210>
<211>
<212>
<213>
121
218
DNA
Homo sapien <220>
<221>
<222>
<223>
různévlastností (1) . . . (218) n = A,T,C nebo G <400> tgtancgtga gaataagatt atatncangt . agcatanact nagggttgtc tttggggcta atgaattcat atancagcta aaaaatggag aaacatggtt ggttcttttg cccttgta aanccttgaa attgggagac ggaattcctt gtcattttga atttctgaag tacgatngcc
120
180
218
<210> 122
<211> 171
<212> DNA
<213> Homo sapien
<400> 122
taggggtgta tgcaactgta aggacaaaaa catttgttag ctcatggaac aggaagtcgg caccaccccg gcggggtcat ctgtgccaca ttgagactca atggtggggc ggtccctgtt actggcttaa atcttcagtg gacagtgcgg ccaataaagg ctgcatgagt t
120
171
<210> 123
<211> 76
<212> DNA
<213> Homo sapien
<220>
<221> různé vlastnosti
<222> (1) .. . (76)
<223> n - A ,T, C nebo G
<400> 123
tgtagcgtga agacnacaga atggtgtgtg ttatcaanta ttgtgt ctgtgctatc caggaacaca tttattatca <210>
<211>
<212>
<213>
124
131
DNA
Homo sapien <400>
acctttcccc aaggccaatg tcctgtgtgc caatgtgctg ggtcatatgg aggggaggag ttaagatttg t taactggccg actctaaaat agctgcaatt attctcttgg
120
131
124 gctgcaggac agccaatttt • * • · ··
157
<210> 125
<211> 432
<212> DNA
<213> Homo sapien
<400> 125
actttatcta cttgaaaaag ctacagtctg ttgcctcacc ctcttgaagt catggtgggg caggaaacat ctctttgctt ctggctatga aggtgatagc catttggcag aaacaaaagt atcagtcact gtcttgcatc cagaaccact gt aatagatggt ccttcagagg aaatgaagat gaaacaactg tttgagaatg tgtaagaatg attttctagc ggaaaattgc acttgtgact gaatttggat agagaaaatt tttcttagtt gaattgattt cctctgtcag gttaccaact tttgctcaga taaatgagga ttcaggaaaa actgcatact tgcttttgca agcaaacctc ataccactgg tgctgaagaa tgctgaagat aagacagtgg tcatggatcc agaatctcag agtgcctctc
120
180
240
300
360
420
432
<210> 126
<211> 112
<212> DNA
<213> Homo sapien
<400> 126
acacaacttg aatagtaaaa tagaaactga agtaagaatg atatttcccc ccagggatca gctgaaattt ccaaatattt ctaattcact ataaaaattt ttctaaccat gt
112
<210> 127 <211> 54 <212> DNA <213> Homo sapien
<400> 127
accacgaaac cacaaacaag atggaagcat caatccactt gccaagcaca gcag
<210> 128
<211> 323
<212> DNA
<213> Homo sapien
<400> 128
acctcattag acctgagata ttctctctga ccaaagcatt ttcctgcaaa aggctgcctt taattgtttt acagaatgaa agtctaggtt tggacagttt aggctcactc cttttccatg gttgtttcat aatggaagga acccattttg cttgttgtgt agtcčcttgc tcc ttttttctaa cagccagatt gggacccatt tttagaatgg ttgctcagtg tgtctcccct tctcctttgc ataggcaata ttttcctttt gactgggctc ctaccagctc tctctgctca aacacagttc tcttagcctt cccagggcct
120
180
240
300
323 <210> 129 <211> 192 <212> DNA <213> Homo sapien <220>
<221 > různé vlastnosti <222> (1)...(192) <223> n = A,T,C neboG • 9 ····
9·« · ·· 9 9 9
158 acatacatgt gtgtatattt ttaaatatca cttttgtatc actctgactt tttagcatac tgaaaacaca ctaacataat ttntgtgaac catgatcaga tacaacccaa atcattcatc tagcacattc atctgtgata naaagatagg tgagtttcat ttccttcacg ttggccaatg gataaacaaa gt • 9·· • 9 9 9 9· • 9 9 99 <400> 129
120
180
192 <210> 130 <211> 362 <212> DNA <213> Homo sapien <220>
< 2 21 > různé vlastnosti <222> (1) ...(362) <223> n = A,T,C neboG <400> 130 ccctttttta tggaatgagt agactgtatg tttgaanatt tanccacaac ctctttgaca60 tataatgacg caacaaaaag gtgctgttta gtcctatggt tcagtttatg cccctgacaa120 gtttccattg tgttttgccg atcttctggc taatcgtggt atcctccatg ttattagtaa180 ttctgtattc cattttgtta acgcctggta gatgtaacct gctangaggc taactttata240 cttatttaaa agctcttatt ttgtggtcat taaaatggca atttatgtgc agcactttat300 tgcagcagga agcacgtgtg ggttggttgt aaagctcttt gctaatctta aaaagtaatg360
99362 <210> 131 <211> 332 <212> DNA <213> Homo sapien <220>
<221> i různé vlastnosti <222> (1)...(332) <223> n = A,T,C nebo G <400> 131 ctttttgaaa gatcgtgtcc actcctgtgg acatcttgtt ttaatggagt ttcccatgca60 gtangactgg tatggttgca gctgtccaga taaaaacatt tgaagagctc caaaatgaga120 gttctcccag gttcgccctg ctgctccaag tctcagcagc agcctctttt aggaggcatc180 ttctgaacta gattaaggca gcttgtaaat ctgatgtgat ttggtttatt atccaactaa240 cttccatctg ttatcactgg agaaagccca gactccccan gacnggtacg gattgtgggc300 atanaaggat tgggtgaagc tggcgttgtg gt332 <210> 132 <211> 322 <212> DNA <213> Homo sapien <220>
< 2 21 > i různé vlastnosti <222> (1) . . . (322) <223> n = A,T,C nebo G <400> 132 acttttgcca ttttgtatat ataaacaatc ttgggacatt ctcctgaaaa ctaggtgtcc 60 ·· ···· t
159 tctgaaagga aaaatgaggg aggcttattt aaataggaat aaaccagcat aggacctttg atcaacaaag gctnaatcct gacacagaat tatctcgggt agaagagttg agggaagcct agtggctaag ctcaaattcc tttagcaagt ggatgcttct gtaacaatct agaactcgat caaacagggg taaaatgaan aaaaaaaact acaattggtc ttcaagcaat ctctgtggga atgacaggaa ttggtagaga ca
120
180
240
300
322 <210>
<211>
<212>
<213>
133
278
DNA
Homo sapien <220>
<221>
<222>
<223>
různévlastnosti (1)...(278) nebo G η = A,T,C <400> acaagccttc cttgtttttc ctatttaaaa ctattcctgt cccacgaaac
133 acaagtttaa tttccatctg aaaatcacaa tttgtcaaag actaataaaa ctaaattggg gctcctgggt atctttccct aaattatatt accacagaga attaatcttt tgacaatttg ttaagctatg tttcaaaata ccagcctg ctgtanttat tggaaacaac ttnaattcaa tgtntatttg ctgcataatt tctattgcta actattcctg tttgatgggt
120
180
240
278
<210> 134
<211> 121
<212> DNA
<213> Homo sapien
<220>
<221> různévlastnostl·
<222> (i) .. .(121)
<223> n = A , T, Cnebo G
<400> 134
gtttanaaaa cttgtttagc tccatagagg tgattctctg aggttaaact tggttttcaa t aaagaatgtt atgttatttt aaactttgta tacttgtatt ttttaaaaca ttgcttttgg
120
121 <210> 135 <211> 350 <212> DNA <213> Homo sapien <220>
<221> různé vlastnosti <222> (1) . .. (350) <223> n = A,T,C neboG <400> acttanaacc atancaagtg aaacttgata gggtgccccc ccacctcaat ttcccaagga
135 atgcctagca gtgactggtt cttttgttct caactcctgc caagccctgg tgcaaagcct catcagaatc aagcgtgcga aagtaggaac agccgctcct gccatgctac ggtgctcaac atcctatacc acttgtgtgc tggtactcca aactttcgct gtttgctgag
120
180
240
300
350 cctcaaagaa caaaggtcag tagtatacag ctgtgccagn ctgcaattgg tcctggggcg catcagtata ctggcacatt tncctaggan ccctgnaagg ctgaacaaac tcaactcagt
4* *444
160 <210> 136 <211> 399 <212> DNA <213> Homo sapien <220>
<221> různé_vlastnosti; <222> (1) . . . (399) <223> η = A,T,C neboG <400> tgtaccgtga gctgtgattg gcagacttgt cctggcggcc aaaactgcag tcccaggaac ggtgcagang
136 agacgacaga tatccgaata gtctgccttc agccagccag aggcccaggg ccgggcaaag gatgaagcag agttgcatgg ntcctcgtga aanaagccag ccacaggtgg tcaggtgtna gccatcccca ccagntgttc cagggacagg gaaaagataa acaggaaggc gcttcttcct gtgggtangt cctacagcca tgctgtggt gcagggccga tgagatgacg cctgcctgcc tttgtggtga gaccataaaa gcatgcccac ggccagggtt tgagcagcct ttggctctga caacnccaag caccaggtgc tggcgtgatg
120
180
240
300
360
399 <210> 137 <211> 165 <212> DNA <213> Homo sapien <220>
<221> různé vlastnosti <222> (1) . . .(165) <223> n = A,T,C CneboG <400> 137 actggtgtgg tngggggtga tgctggtggt ggaggaagtg tgtgaacgta gggatgtaga ttggctggtc ccactggtgg tcactgtcat anaagttgan gtgacttcan gatggtgtgt ngttttggcc gtgctaaatg agcttcggga tggtggggtt cctgt
120
165 <210> 138 <211> 338 <212> DNA <213> Homo sapien <220>
< 2 21 > různé vlastnosti <222> (1)...(338) <223> n = A,T,CneboG <400> actcactgga ttaacttctc tgctgggcag tcatgtgttt cangcctcag aaaaactgat
138 atgccacatt cagtaagaat tctcccatgc ccagccacac gaagcctcaa gccttttttt cacaacagaa cagggacttg cttccacagt caaaaggtgc gttccattca tttttttttg taatggctcc acatgcccaa acatccaatg catananggt ccatntttaa
120
180
240
300
338 <210> 139 <211> 382 tcagaggtct aaatggaaac gaaagggctt ttggggtgga gctttgccac taaaattc gtgaaaacat gttaacagcc gagaaaaatc gggctggggg tgtacattcc
161 • φφ φφ Φ φ ·φ φ φφ ·*
Φ η · * ·Φ φφφ ·φ φφφ φφφ· •Φ φφφφ <212> DNA <213> Homo sapien <400 gggaatcttg gaaagggact attcaaacag atttgcctta ccttatttgt •gtcagctatg gcctggaact • 139 gtttttggca tcgagtaaga acctcgtcat ctcaggtgct cttctacacc tgccccatcc tgtttaaagt aggtgattta tcctggtgtg accggactct ccacagggcc tccttcatgc gt ctatagccga cagccagcct agcctggtcg ggcccctgat ccctacttct cctccctccc ggccactttg agtgcccgaa gctcaccgcc gtctgtagtt tcggatgtgt tttcctacca acagaacaaa gtgaaggaga tatcatctgc tcacaggatg ttttaataat ctgctgagtg
120
180
240
300
360
382 <210> 140 <211> 200 <212> DNA <213> Homo sapien <220>
< 2 21 > irůzné vlastnosti <222> (1)...(200) <223> n = A,T,C neboG <400> accaaanctt acttttcatt ttttcacatt atattcagca
140 ctttctgttg taacancttt tcaacttgta taaaggagaa tgttngattt tgttaagtgt tgtgtttgtc tactataggg caggctgcac tcttanagca gtttngcttn tttgctccat ttggtgaaat ttctaaanat anaattattg cacatatttt
120
180
2C0 <210> 141 <211> 335 <212> DNA <213> Homo sapien <220>
< 2 21 > . různé vlastnosti <222> (1) . . . (335) <223> n = A,T,C 'neboG <400> actttatttt gggtgctgac atgcatgtag aatggttctg tttttctacc attcacaaac
141 caaaacactc taaacttcaa agaacccaaa agaaccatcc agttcagaga caagtaattt atatgttgca gtcacagact ctaatttatt aattcacctg tnggttaatg taaacaaaga aaaaacacat tttatgtgac aaacaggata tcagatgctg actanttcca cactt agaaaaataa agattggagc gaaacaggct atanactagc atggggaaaa agtttggtgg agggtttgtt gtctgggtga tcttcagatg agcaagatgg
120
180
240
300
335
<210> 142
<211> 459
<212> DNA
<213> Homo sapien
<220>
<221> různé vlastnosti
<222> (i) . . . (459)
<223> n = A,T,C neboG
<400> 142 accaggttaa gggttgttta ctgatggaga cacatggtcc ttcaaacatc tcaacacctc agctaccagt cagcangggt tattgccaca aagacaaccc aaacactgag aacaacactc atagccaatg agtggccacc ctgagcacta gggaggaacc tatatccttt agcttaatat ttttgacaaa aaataataaa atgccccgct aaaccattca ttgactatnt agctcaacct ccaattgcgg caagagaaat tcttatttta tcaaatatna tgcctataat gcacagcttc ttttcangct tggcgtant gctaaacaga tgtgaccttt ttcagatagc tcagatgtta ctctccgaca cttaactgtg ctgaatagct cgtgtattta catggagtat agtctgatca aagattggtc taaaaccaca agctgtttga ctagggatct
120
180
240
300
360
420
459 <210> 143 <211> 140 <212> DNA <213> Homo sapien <400> 143 acatttcctt aaatccaaac accatccgac ccaccaagtc agtctctcct ttccctgtgt aggactcctg agaaaggaat gcttctgtgg agtgtcacca gagttcttat accccaccca cacctgaggg tctccctgag
120
140
<210> 144
<211> 164
<212> DNA
<213> Homo sapien
<220>
<221> různé vlastnosti
<222> (1)...(164)
<223> n = A,T,C neboG
<400> 144
acttcagtaa caacatacaa taacaacatt aagtgtatat tgccatcttt gtcattttct 60
atctatacca ctctcccttc tgaaaacaan aatcactanc caatcactta tacaaatttg 120
aggcaattaa tccatatttg ttttcaataa ggaaaaaaag atgt 164
<210> 145 <211> 303 <212> DNA <213> Homo sapien <220>
< 2 21 > různé vlastnosti <222> (1)...(303) <223 > n = A,T,C neboG <400> 145 acgtagacca tccaactttg tatttgtaat ggcaaacatc cagnagcaat tcctaaacaa60 actggagggt atttataccc aattatccca ttcattaaca tgccctcctc ctcaggctat120 gcaggacagc tatcataagt cggcccaggc atccagatac taccatttgt ataaacttca180 gtaggggagt ccatccaagt gacaggtcta atcaaaggag gaaatggaac ataagcccag240 tagtaaaatn ttgcttagct gaaacagcca caaaagactt accgccgtgg tgattaccat300 caa303 <210> 146
163 <211> 327 <212> DNA <213> Homo sapien <220>
<221> irůznévlastnosti <222> (1)...(327) <223> n = A,T,C neboG <400> 146 actgcagctc aattagaagt ggtctctgac tttcatcanc ttctccctgg gctccatgac actggcctgg agtgactcat tgctctggtt ggttgagaga gctcctttgc caacaggcct ccaagtcagg gctgggattt gtttcctttc cacattctag caacaatatg ctggccactt cctgaacagg gagggtggga ggagccagca tggaacaagc tgccactttc taaagtagcc agacttgccc ctgggcctgt cacacctact gatgaccttc tgtgcctgca ggatggaatg taggggtgag ctgtgtgact ctatggt <210> 147 <211> 173 <212> DNA <213> Homo sapien <220>
<221>; různé vlastnosti <222> (1) .. . (173) <223> n = A,T,C neboG <400> 147 acattgtttt tttgagataa agcattgana gagctctcct taacgtgaca caatggaagg actggaacac atacccacat ctttgttctg agggataatt ttctgataaa gtcttgctgt atattcaagc acatatgtta tatattattc agttccatgt ttatagccta gtt <210> 14Θ <211> 477 <212> DNA <213> Homo sapien <220>
< 2 21 > různé vlastnosti <222> (1)···(477) <223> n = A,T,C neboG <400> 148 acaaccactt tatctcatcg aatttttaac ccaaactcac tcactgtgcc tttctatcct atgggatata ttatttgatg ctccatttca tcacacatat atgaataata cactcatact gccctactac ctgctgcaat aatcacattc ccttcctgtc ctgaccctga agccattggg gtggtcctag tggccatcag tccangcctg caccttgagc ccttgagctc cattgctcac nccancccac ctcaccgacc ccatcctctt acacagctac ctccttgctc tctaacccca tagattatnt ccaaattcag tcaattaagt tactattaac actctacccg acatgtccag caccactggt aagccttctc cagccaacac acacacacac acacncacac acacacatat ccaggcacag gctacctcat cttcacaatc acccctttaa ttaccatgct atggtgg <210> 149 <211> 207 <212> DNA
120
180
240
300
327
120
173
120
180
240
300
360
420
477 • · • · · ·
164 ttgcaatgag ctgtggggag ggtggtgtgg agcatttaag tgggatgtaa tatgggcaca agggaagaac ggtggggcct gtgaagaaca <213> Homo sapien acagttgtat taacgtattt gatgataaat tttcaggcag <400> 149 tataatatca tagagagcca aagagtcagc agggaacagc agaaataaac aggaaggttt caggtaagtg agtgaaa
120
180
207 <210>
<211>
<212>
<213>
150
111
DNA
Homo sapien <220>
<221>
<222>
<223>
různé vlastnosti (1)...(111) n = A,T,C neboG
150 <400>
accttgattt cattgctgct cactťaaatg tggtcagtgt ctgatggaaa ttggacttgt cccaactatc taactantgg taatttagct catctttggg aaaacatggg t
111
<210> 151
<211> 196
<212> DNA
<213> Homo sapien
<400> 151
agcgcggcag agcaagatgg ggataccaac gtgcatccgg gtcatattga acattccaga ctttgaactc agggtcacca cggaaaaccc ctatcccgca ctcagt tacctatcat ccagctattg cagcccactg tactcgatgc gaccttacta tggtccccac tgttgataac tgaaaaccat tgtctacgag
120
180
196
<210> 152
<211> 132
<212> DNA
<213> Homo sapien
<400> 152
acagcacttt cacatgtaag aagggagaaa cttccccttt tcatctagtg gtggaaacct gagggagttt gt ttcctaaatg gatgctttat taggagaaag gttgacagga ataacagaac atagaaccag
120
132 acaanaccca nganaggcca ctggccgtgg tgtcatggcc tccaaacatg aaagtgtcag <210> 153 <211> 285 <212> DNA <213> Homo sapien <220>
<221> různévlastnosti <222> (1)...(285) <223> n = A,T,C neboG <400> 153 • · φ φ φ
φ
165 φφ cttctgctct tatgtcctca tctgacaact ctttaccatt tttatcctcg ctcagcagga 120 gcacatcaat aaagtccaaa gtcttggact tggccttggc ttggaggaag tcatcaacac 180 cctggctagt gagggtgcgg cgccgctcct ggatgacggc atctgtgaag tcgtgcacca 240 gtctgcaggc cctgtggaag cgccgtccac acggagtnag gaatt 285 <210> 154 <211> 333 <212> DNA <213> Homo sapien <400> 154 accacagtcc tgttgggcca gggcttcatg accctttctg tgaaaagcca tattatcacc 60 accccaaatt tttccttaaa tatctttaac tgaaggggtc agcctcttga ctgcaaagac 120 cctaagccgg ttacacagct aactcccact ggccctgatt tgtgaaattg ctgctgcctg 180 attggcacag gagtcgaagg tgttcagctc ccctcctccg tggaacgaga ctctgatttg 240 agtttcacaa attctcgggc cacctcgtca ttgctcctct gaaataaaat ccggagaatg 300 gtcaggcctg tctcatccat atggatcttc cgg 333 <210> 155 <211> 308 <212> DNA <213> Homo sapien <220>
< 2 21 > různé vlastnosti <222> (1) . . . (308) <223> n = A,T,C neboG <400> 155 actggaaata ataaaaccca catcacagtg ttgtgtcaaa gatcatcagg gcatggatgg 60 gaaagtgctt tgggaactgt aaagtgccta acacatgatc gatgattttt gttataatat 120 ttgaatcacg gtgcatacaa actctcctgc ctgctcctcc tgggccccag ccccagcccc 180 atcacagctc actgctctgt tcatccaggc ccagcatgta gtggctgatt cttcttggct 240 gcttttagcc tccanaagtt tctctgaagc caaccaaacc tctangtgta aggcatgctg 300 gccctggt 308 <210> 156 <211> 295 <212> DNA <213> Homo sapien <400> 156 accttgctcg gtgcttggaa catattagga actcaaaata tgagatgata acagtgccta 60 ttattgatta ctgagagaac tgttagacat ttagttgaag attttctaca caggaactga 120 gaataggaga ttatgtttgg ccctcatatt ctctcctatc ctccttgcct cattctatgt 180 ctaatatatt ctcaatcaaa taaggttagc ataatcagga aatcgaccaa ataccaatat 240 aaaaccagat gtctatcctt aagattttca aatagaaaac aaattaacag actat 295
<210> 157 <211> 126 <212> DNA <213> Homo sapien
<400> 157
acaagtttaa atagtgctgt cactgtgcat gtgctgaaat gtgaaatcca ccacatttct 60
PCT7US99/15838 gaagagcaaa acaaattctg tcatgtaatc tctatcttgg gtcgtgggta tatctgtccc cttagt
WO 00/04149
166
Λ*
120
126 <210> 158 <211> 442 <212> DNA <213> Homo sapien <220>
<221> misc_feature <222> (1) . . . (442) <223> n = A,T,C or G <400 acccactggt aanccagcag gcctgggtaa ctggtggttc natgtttgta ccaaccctgt nacagacggg tgttcattct
158 cttggaaaca gctgccccta ttcaccatta tgaccaaagc gccttgcata tttcccagtc ctctttgcag ctgatgtcct cccatcccta gtcagtcctt atttcctccc aggtcatggt cttagccctt cacgtagaca agccgggact gt atacgatgat ccttccagag ccaaactctc ttgttgagca cccacgcaca gattcacagt ctgagangga ttttctgtcg aaaaagagat tgagtcttcc tttgggatcc aacggágtgg gcggaattct catgagggcc tgtgaaaatg ttaagaaagt cttaatattt cagtgaagta cagagtggtg ggaagctgga tctgcctctg
120
180
240
300
360
420
442 <210> 159 <211> 498 <212> DNA <213? Homo sapien <220>
<221? misc_feature <222> (1)...(498) <223> n = A,T,C or G <400> 159 acttccaggt tccaacaaga gctgctgtgg gtgtgttgtt tgctgtggtg antanattct cgaaccagtg tcaggtaana aacgttgttg actgaggttg actgttgttg gganttgagc ccgggangcg tcctgaaggc ctgctgtggg atgtggtttc tttccgttga cagagcgggt attcctcact tcgggcggct aangtgttgt cagcgcttgt tgggtgtana agtgtccctg gcctgaactg agggaagagt acggcccaag gtggtaggtt gtcacttgag ggagctggca tcctccacaa ggcngctgtg atgggtgacg gctgttccag gttgtggaac gtgggctctt cttggccagc ngggtcantg agcctgaagt gaaggttgta ttgtaggttc ttgcacctgg tggcanaaag caacaggggc tctggaaagt ttgtgtgtaa tatggtgtcn nattgtcacc aagggaataa gctgtggt
120
180
240
300
360
420
480
498 <210> 160 <211> 380 <212> DNA <213> Homo sapien <220>
<221> misc_feature <222> (1)...(380) <223> n = A,T,C or G <400> 160
167 gaagagcaaa acaaattctg tcatgtaatc tctatcttgg gtcgtgggta tatctgtccc cttagt <210> 158 <211> 442 <212> DNA <213> Homo sapien <220>
<221 > různé vlastnosti <222> (1) . . . (442) <223> n = A,T,C nebo G <400> 158 acccactggt cttggaaaca cccatcctta atacgatgat ttttctgtcg tgtgaaaatg aanccagcag gctgccccta gtcagtcctt ccttccagag aaaaagagat ttgagaaagt gcctgggtaa ttcaccatta atttcctccc ccaaactctc tgagtcttcc cttaatattt ctggtggttc tgaccaaagc aggtcatggt ttgttgagca tttgggatcc cagtgaagta natgtttgta gccttgcata cttagccctt cccacgcaca aacggagtgg cagagtggtg ccaaccctgt tttcccagtc cacgtagaca gattcacagt gcggaattct ggaagctgga nacagacggg ctctttgcag agccgggact ctgagangga catgagggcc tctgcctctg tgttcattct ctgatgtcct gt <210> 159 <211> 498 <212> DNA <213> Homo sapien <220>
<221> různé vlastnosti <222> (1)...(498) <223> n = A,T,C meboG <400> 159 acttccaggt aacgttgttg tttccgttga gcctgaactg atgggtgacg ttgtaggttc tccaacaaga actgaggttg cagagcgggt agggaagagt gctgttccag ttgcacctgg gctgctgtgg actgttgttg attcctcact acggcccaag gttgtggaac tggcanaaag gtgtgttgtt gganttgagc tcgggcggct gtggtaggtt gtgggctctt caacaggggc tgctgtggtg ccgggangtg aangtgttgt gtcacttgag cttggccagc tctggaaagt antanattct tcctgaaggc cagcgcttgt ggagctggca ngggtcantg ttgtgtgtaa cgaaccagtg ctgctgtggg tgggtgtana tcctccacaa agcctgaagt tatggtgtcn tcaggtaana atgtggtttc agtgtccctg ggcngctgtg gaaggttgta nattgtcacc aagggaataa gctgtggt <210> 160 <211> 380 <212> DNA <213> Homo sapien <220>
<221> různé vlastnosti <222> (1) ... (380) <223> n = A,T,C nebo G
120
126
120
180
240
300
360
420
442
120
180
240
300
360
420
480
498 <400> 160
168
acctgcatcc agcttcagga ggagcatggc cactagacat ccacccttac gagaaaaatg cttgtagaat agcttccctg tacttccagg atagaggaag ctcatcagcc ctccatctca gcagtttgac gaagcctgga ccaaactcac agacagagcc ctganaaatg acttgtgtga cacacttgag cgaacctgtt aaggagacat accagcagca tggggtctga agagatgccc ctttccactc cacaacggta caacctctag aaacaaatat ggaagccatt catgacccca tgtataattc gaggctgatt acagggaaac tcccatgcct tgagtctggc gatgcctctc taacatcctg tctaacgaaa
120
180
240
300
360
380
<210> 161
<211> 114
<212> DNA
<213> Homo sapien
<400> 161
actccacatc ccctctgagc aggcggttgt cactgtccac tggcccctta tccacttggt cgttcaaggt gcttaatccc gtatttggcc tcgaaagagc ttgcctgtca atgt
114
<210> 162
<211> 177
<212> DNA
<213> Homo sapien
<400> 162
actttctgaa tcgaatcaaa tgatacttag gttttactac tctgataatt ttgtaaacca tggtgatata taacttggca ataacccagt tgtagtttta ggtaaccaga ctggtgatac atatcctcat acatccagtc ataaaactac atatatcaaa at.acagcttt tcactgt
120
177 <210>
<211>
<212>
<213>
163
137
DNA
Homo sapien <220>
<221>
<222>
<223>
t různé vlastnosti (1) . . . (137) nebo G η = A,T,C
163 <400>
catttataca gacaggcgtg canagaaggc agctacggct catcagcggc atgatgt aagacattca actcctacat cgacaaaaac cctggcgtgg gcgaaattct gtggccttcg atcccgtgac cctgcacctt
120
137 <210>
<211>
<212>
<213>
164
469
DNA
Homo sapien <220>
<221>
<222>
<223>
různý vlastnosti (1)...(469) nebo G η = A,T,C
164 cttatcacaa tgaatgttct tgcaatgcat catgctattt cctgggcagc catacctaat gttgtgatct gagggagttc cgtgacttta aaccaggaaa <400>
ttgccacctt caggagattc
120
169
tgcatggatc gagacatgca ggttatgaca gtggagaaga tctagtaggc gattgtgtag tcaaaggaaa cttgctacga aagacaactg aggacccaaa acagggctcc ccatgcctat caaacaccca aacagaaatt ccaaagaatc aaagacctgt caggccaggc cagtaaaaag ataaactcgg tcatgttgca ttcaagaagg tctgtcagtg ctcattctcc atntttgagc agtggcagac cccttgtttc aggactgcaa aatggataat tctggcctct aaacacttt tgacaactgt tacacctgtg gtatatcgtg ctaatgtgct aatagtcaat
180
240
300
360
420
469 <210> 165 <211> 195 <212> DNA <213> Homo sapien <220>
<221> i různé vlastnosti <222> (1)...(195) <223> n = A,T,c neboG <400> acagtttttt atccgctgtc tgcaggccgc tcctctgaga
165 atanatatcg atccactatt ccgcccgtag tgagt acattgccgg ccttggctag ttctcgttcc cacttgtgtt agtaaaaatt agtcgtcttg cagtttcata attcttatag gcacacaggg aagctggtgg cccatgtccc tgccaggact
120
180
195 <210> 166 <211> 383 <212> DNA <213> Homo sapien <220>
<221> různé_vlastnosti <222> (1)...(383) <223> n = a,t,C nebo G <400> acatcttagt cgaggtcgga ttggagaagg tttgcagacc gatgccaacc gangatctta nggggccttt
166 agtgtggcac gtccacacca gatatgctgc agcctgagca tcgtctangg taaagaggct ttggtgaact atcagggggc ccggtgtagg acacacatgt aggggcggat tccgtgggaa ccnagataaa ttc catcagggtc tgtgctcaat ccacaaagcc gttcagcttc gctggtgtcc ctccacgaaa acagtcactc cttgggcttg tgtgaactcg agctcctcct acntcaccta cttctctggg atagcctcgc gcgcccacct ccaaagaatt tcgtcaggtg caacctgggc agctgctagt
120
180
240
300
360
383 <210> 167 <211> 247 <212> DNA <213> Homo sapien <220>
< 2 21 > různé vlastnosti <222> (1)...(247) <223> n = A,T,C neboG acagagccag tggagcagaa accttggcca actggagcaa taaatgaanc gaagtgggcc agagattaag tggggctgaa aagtcganat aggccactgc <400> 167 actaaacccc gtagagacca
120
170 tatanccata tcaatctgan cacagagcca tccaaagtgg actctcaggc tggctggaac
caaggcnatg actggtcatg gttggggcag acanaggcag anccagagac tgactctgac
180
240 tgangtc
247 <210> 168 <211> 273 <212> DNA <213> Homo sapien <220>
<221 > irůzné vlastnosti <222> (1) . . . (273) <223> n = A,T,C neboG <400> acttctaagt aatccctcan gctgacacct aattcccaac agtcccagat
168 tttctagaag ccttgttctt gagcctgnat ttccttgcca acactcatgg tggaaggatt cacnactgtc tttcactcat caagcttccc gctgccctgg gtantcatcc tatactgana ccctgagaag aggctttctc gca tgaaaatggg gtgtcatgtt ccctttccag ccctggaaaa tttacttcaa tccacaaagg tagggtgggc ctccagcttg
120
180
240
273 <210> 169 <211> 431 <212> DNA <213> Homo sapien <220>
<22i> irůzné vlastnosti <222> (1) . . . (431) <223> n = A,T,C nebo G <400> acagccttgg agctcagacc ctactgtcaa ggcagcagaa cttgccatgg acgcacatca aaagtgacct tcgaacactg
169 cttccccaaa agggtcaaag atgacccccc agggggtant gcaaaggccc ctgacaaccg gatactggat a ctccacagtc gatgtgacat atacttcctc tactgatgga ctaccacaaa ggatggaaaa tcttaattac tcagtgcaga caacagtttc aaaggctgtg caccatcttc aacaatagga agaantgcca cttcaaaagc aagatcatct tggtttcaga gtaagttttg tctgtatact tcactgctgg actttcatac ttctgggggc tccagcagtc acaggttcta cacaggtgag ccacactgac gcaccagctc atccaactgg catcagctgc
120
180
240
300
360
420
431 <210> 170 <211> 266 <212> DNA <213> Homo sapien <220>
<221> různé vlastnosti^ <222> (1) .. . (266) <223> n = A,T,C nebo G <400> 170 acctgtgggc tgggctgtta tgcctgtgcc tcaaggagct ctgcaggcat tttgccaanc ccccgctaga aagacaccag attggagtcc ggctgctgaa agggagttca gaggtggagc ctctccanag canagggagc aacctacact tgggaggggg agttggggtg ggcatttgat
120
180
171
gtatacttgt cacctgaatg aangagccag agaggaanga gacgaanatg anattggcct tcaaagctag gggtctggca ggtgga
240
266 <210> 171 <211> 1248 <212> DNA <213> Homo sapien <220>
<221> různé vlastnosti <222> (1) . . .(1248) <223> n = A,T,CneboG <400 ggcagccaaa ctggtcatgg tcagccgcac cacagtcttg cggcacccag gaatccgtgt gcggggaact gtgctgcagt ccgctgtacc aacggtgact ggaaaagccc actgagtgga attgaccccc ccctcaggcc cccagcccct ccaggagtcc ctcagaccca ccaacccntc gcggtccaat aaccttacca aagagaagng • 171 tcataaacgg aaaacgaatt actgtttcca aggccgacca agtacaacag ccgagtctga cttgcctcgt gcgtgaacgt accccagcat ctggggggcc cgtgtggcca tagagaaaac aaatacatcc caggagtcca cctccctcag agcccctcct ggggtccagg attccccaga gccacctaga gttggttttt caaaaaaaaa cgaggactgc gttctgctcg gaagtgagtg agagccaggg acccttgctc caccatccgg ttctggctgg gtcggtggtg gttctgcgcc cctgatctgc agttggcgtg cgtccaggcc tgcggaagga ggcccccagc acccaggagt ccctcagacc cccccaaccc cccagaggtc ctntccctgt catttttngt aaaaaaaaaa agcccgcact ggcgtcctgg cagagctcct agccagatgg gctaacgacc agcatcagca ggtctgctgg tctgaggagg ggcggagggc aacgggtact ccaggtgtct agttaactct attcaggaat ccctcctccc ccagaccccc caggagtcca ctcctccctc caggtcccag acacagtgcc ccctttcccc aaaaaaaaaa cgcagccctg tgcatccgca acaccatcgg tggaggccag tcatgctcat ttgcttcgca cgaacggcag tctgcagtaa aagaccagaa tgcagggcct acaccaacct ggggactggg atctgttccc tcaaaccaag cagcccctcc gaccccccag agactcagag cccctcntcc cccttgtggc tagatccaga aaaaaaaa gcaggcggca gtgggtgctg gctgggcctg cctctccgta caagttggac gtgccctacc aatgcctacc gctctatgac ggactcctgc tgtgtctttc ctgcaaattc aacccatgaa agcccctcct ggtacagatc tccctcagac cccctcctcc gtccaagccc ctcagaccca acgttgaccc aataaagttt
120
180
240
300
360
420
480
540
600
660
0
780
840
900
960
1020
1080
1140
1200
1248 <210> 172 <211> 159 <212> PRT <213> Homo sapien <220>
<221> VARIANT <222> (1)...(159) <223> Xaa = jakákoliv aminokyselina <400> 172
Met Val Glu Ala Ser Leu Ser Val
1 5
Leu Leu Ala Asn Asp Leu Met Leu
20
Glu Ser Asp Thr Ile Arg Ser Ile
35 40
Ala Gly Asn Ser Cys Leu Val Ser
50 55
Arg His Pro Glu Tyr Asn Arg 15 Pro
10
Ile 25 Lys Leu Asp Glu Ser 30 Val Ser
Ser Ile Ala Ser Gin 45 Cys Pro Thr
Gly Trp Gly Leu 60 Leu Ala Asn Gly
172
Arg Met Pro Thr Val Leu Gin Cys Val Asn Val Ser Val Val Ser Glu
70 75 80
Glu Val Cys Ser Lys Leu Tyr Asp Pro Leu Tyr His Pro Ser Met Phe
90 95
Cys Ala Gly Gly Gly Gin Xaa Gin Xaa Asp Ser Cys Asn Gly Asp Ser
100 105110
Gly Gly Pro Leu Ile Cys Asn Gly Tyr Leu Gin Gly Leu Val Ser Phe
115 120125
Gly Lys Ala Pro Cys Gly Gin Val Gly Val Pro Gly Val Tyr Thr Asn
130 135140
Leu Cys Lys Phe Thr Glu Trp Ile Glu Lys Thr Val Gin Ala Ser
145 150155 <210> 173 <211> 1265 <212> DNA <213> Homo sapien <220>
<221> různé vlastnosti <222> (1)...(1265) <223> n = A,T,c nebo G <400> 173 ggcagcccgc actcgcagcc ctggcaggcg gcactggtca tggaaaacga attgttctgc60 tcgggcgtcc tggtgcatcc gcagtgggtg ctgtcagccg cacactgttt ccagaactcc120 tacaccatcg ggctgggcct gcacagtctt gaggccgacc aagagccagg gagccagatg180 gtggaggcca gcctctccgt acggcaccca gagtacaaca gacccttgct cgctaacgac240 ctcatgctca tcaagttgga cgaatccgtg tccgagtctg acaccatccg gagcatcagc300 attgcttcgc agtgccctac cgcggggaac tcttgcctcg cttctggctg gggtctgctg360 gcgaacggtg agctcacggg tgtgtgtctg ccctcttcaa ggaggtcctc tgcccagtcg420 cgggggctga cccagagctc tgcgtcccag gcagaatgcc taccgtgctg cagtgcgtga480 acgtgtcggt ggtgtctgag gaggtctgca gtaagctcta tgacccgctg taccacccca540 gcatgttctg.cgccggcgga gggcaagacc agaaggactc ctgcaacggt gactctgggg 600 ggcccctgat ctgcaacggg tacttgcagg gccttgtgtc tttcggaaaa gccccgtgtg660 gccaagttgg cgtgccaggt gtctacacca acctctgcaa attcactgag tggatagaga720 aaaccgtcca ggccagttaa ctctggggac tgggaaccca tgaaattgac ccccaaatac780 atcctgcgga aggaattcag gaatatctgt tcccagcccc tcctccctca ggcccaggag840 tccaggcccc cagcccctcc tccctcaaac caagggtaca gatccccagc ccctcctccc900 tcagacccag gagtccagac cccccagccc ctcctccctc agacccagga gtccagcccc960 tcctccntca gacccaggag tccagacccc ccagcccctc ctccctcaga cccaggggtt1020 gaggccccca acccctcctc cttcagagtc agaggtccaa gcccccaacc cctcgttccc1080 cagacccaga ggtnnaggtc ccagcccctc ttccntcaga cccagnggtc caatgccacc1140 tagattttcc ctgnacacag tgcccccttg tggnangttg acccaacctt accagttggt1200 ttttcatttt tngtcccttt cccctagatc cagaaataaa gtttaagaga ngngcaaaaa1260 aaaaa1265 <210> 174 <211> 1459 <212> DNA <213> Homo sapien <220>
<221> různévlastnosti <222> (1)...(1459)
173 <223> η = A,T,C nebo G <400> 174 ggtcagccgc acactgtttc cagaagtgag tgcagagctc ctacaccatc gggctgggcc tgcacagtct tgaggccgac caagagccag ggagccagat ggtggaggcc agcctctccg tacggcaccc agagtacaac agacccttgc tcgctaacga cctcatgctc atcaagttgg acgaatccgt gtccgagtct gacaccatcc ggagcatcag cattgcttcg cagtgcccta ccgcggggaa ctcttgcctc gtttctggct ggggtctgct ggcgaacggt gagctcacgg gtgtgtgtct gccctcttca aggaggtcct ctgcccagtc gcgggggctg acccagagct ctgcgtccca ggcagaatgc ctaccgtgct gcagtgcgtg aacgtgtcgg tggtgtctga ngaggtctgc antaagctct atgacccgct gtaccacccc ancatgttct gcgccggcgg agggcaagac cagaaggact cctgcaacgt gagagagggg aaaggggagg gcaggcgact cagggaaggg tggagaaggg ggagacagag acacacaggg ccgcatggcg agatgcagag atggagagac acacagggag acagtgacaa ctagagagag aaactgagag aaacagagaa ataaacacag gaataaagag aagcaaagga agagagaaac agaaacagac atggggaggc agaaacacac acacatagaa atgcagttga ccttccaaca gcatggggcc tgagggcggt gacctccacc caatagaaaa tcctcttata acttttgact ccccaaaaac ctgactagaa atagcctact gttgacgggg agccttacca ataacataaa tagtcgattt atgcatacgt tttatgcatt catgatatac ctttgttgga attttttgat atttctaagc tacacagttc gtctgtgaat ttttttaaat tgttgcaact ctcctaaaat ttttctgatg tgtttattga aaaaatccaa gtataagtgg acttgtgcat tcaaaccagg gttgttcaag ggtcaactgt gtacccagag ggaaacagtg acacagattc atagaggtga aacacgaaga gaaacaggaa aaatcaagac tctacaaaga ggctgggcag ggtggctcat gcctgtaatc ccagcacttt gggaggcgag gcaggcagat cacttgaggt aaggagttca agaccagcct ggccaaaatg gtgaaatcct gtctgtacta aaaatacaaa agttagctgg atatggtggc aggcgcctgt aatcccagct acttgggagg ctgaggcagg agaattgctt gaatatggga ggcagaggtt gaagtgagtt gagatcacac cactatactc cagctggggc aacagagtaa gactctgtct caaaaaaaaa aaaaaaaaa <210> 175 <211> 1167 <212> DNA <213> Homo sapien <220>
<221> různé vlastnosti <222> (1) . . . (1167) <223> n = A,T,C nebo G <400> 175 gcgcagccct ggcaggcggc actggtcatg gaaaacgaat tgttctgctc gggcgtcctg gtgcatccgc agtgggtgct gtcagccgca cactgtttcc agaactccta caccatcggg ctgggcctgc acagtcttga ggccgaccaa gagccaggga gccagatggt ggaggccagc ctctccgtac ggcacccaga gtacaacaga ctcttgctcg ctaacgacct catgctcatc aagttggacg aatccgtgtc cgagtctgac accatccgga gcatcagcat tgčttcgcag tgccctaccg cggggaactc ttgcctcgtn tctggctggg gtctgctggc gaacggcaga atgcctaccg tgctgcactg cgtgaacgtg tcggtggtgt ctgaggangt ctgcagtaag ctctatgacc cgctgtacca ccccagcatg ttctgcgccg gcggagggca agaccagaag gactcctgca acggtgactc tggggggccc ctgatctgca acgggtactt gcagggcctt gtgtctttcg gaaaagcccc gtgtggccaa cttggcgtgc caggtgtcta caccaacctc tgcaaattca ctgagtggat agagaaaacc gtccagncca gttaactctg gggactggga acccatgaaa ttgaccccca aatacatcct gcggaangaa ttcaggaata tctgttccca gcccctcctc cctcaggccc aggagtccag gcccccagcc cctcctccct caaaccaagg gtacagatcc ccagcccctc ctccctcaga cccaggagtc cagacccccc agcccctcnt ccntcagacc caggagtcca gcccctcctc cntcagacgc aggagtccag accccccagc
120
180
240
300
360
420
480
540
600
660
720
780
840
900
960 1020 1080 1140 1200 1260 1320 1380 1440 1459
120 180 240 300 360 420 480 540 600 660 720 780 840 900 * ·· ·«··*· ·· • · · · · · * *·· • *· · * · * *
174 ccccaacccc ccagaggtnc tntccctgta attttttgtc ··* «·· ··· ····· ·· · ·· ·«· ccntcntccg tccaagcccc tcagacccag ngttgaccca ataaagtnta tcagacccag caacccctcg cggtccaatg accttaccag agagaagcgc gggtgcaggc ttccccagac ccacctagan ttggtttttc aaaaaaa tcntccntca aggtcccagc cacagtgccc cctttcccct gagtcagagg ccctcctccc ccttgtggca agatccagaa
960 1020 1080 1140 1167 <210> 176 <211> 205 <212> PRT <213> Homo sapien <220>
<221> VARIANT <222> (1)...(205) <223> Xaa = jakákoliv aminokyselina <400> 176
Met 1 Glu Asn Glu Leu 5 Phe Cys Ser Gly Val 10 Leu Val His Pro Gin 15 Trp
Val Leu Ser Ala Ala His Cys Phe Gin Asn Ser Tyr Thr Ile Gly Leu
20 25 30
Gly Leu His Ser Leu Glu Ala Asp Gin Glu Pro Gly Ser Gin Met Val
35 40 45
Glu Ala Ser Leu Ser Val Arg His Pro Glu Tyr Asn Arg Leu Leu Leu
50 55 60
Ala Asn Asp Leu Met Leu Ile Lys Leu Asp Glu Ser Val Ser Glu Ser
65 70 75 80
Asp Thr Ile Arg Ser Ile Ser Ile Ala Ser Gin Cys Pro Thr Ala Gly
85 90 95
Asn Ser Cys Leu Val Ser Gly Trp Gly Leu Leu Ala Asn Gly Arg Met
100 105 110
Pro Thr Val Leu His Cys Val Asn Val Ser Val Val Ser Glu Xaa Val
115 120 125
Cys Ser Lys Leu Tyr Asp Pro Leu Tyr His Pro Ser Met Phe Cys Ala
130 135 140
Gly Gly Gly Gin Asp Gin Lys Asp Ser Cys Asn Gly Asp Ser Gly Gly
145 150 155 160
Pro Leu Ile Cys Asn Gly Tyr Leu Gin Gly Leu Val Ser Phe Gly Lys
165 170 175
Ala Pro Cys Gly Gin Leu Gly Val Pro Gly Val Tyr Thr Asn Leu Cys
180 185 190
Lys Phe Thr Glu Trp Ile Glu Lys Thr Val Gin Xaa Ser
195 200 205
<210> 177
<211> 1119
<212> DNA
<213> Homo sapien
<400> 177
gcgcactcgc agccctggca ggcggcactg gtcatggaaa acgaattgtt ctgctcgggc 60
gtcctggtgc atccgcagtg ggtgctgtca gccgcacact gtttccagaa ctcctacacc 120
atcgggctgg gcctgcacag tcttgaggcc gaccaagagc cagggagcca gatggtggag 180
gccagcctct ccgtacggca cccagagtac aacagaccct tgctcgctaa cgacctcatg 240
ctcatcaagt tggacgaatc cgtgtccgag tctgacacca tccggagcat cagcattgct 300
• ·· ·· *«·· *· · ·· · · · · · ·« ·· *·· · · » · · «;
»······ · · · ·
- ~ r- ··· « « · · ·· / o ··· ·» .· . ··*·· tcgcagtgcc ctaccgcggg gaactcttgc ctcgtttctg gctggggtct gctggcgaac360 gatgctgtga ttgccatcca gtcccagact gtgggaggct gggagtgtga gaagctttcc420 caaccctggc agggttgtac catttcggca acttccagtg caaggacgtc ctgctgcatc480 ctcactgggt gctcactact gctcactgca tcacccggaa cactgtgatc aactagccag540 caccatagtt ctccgaagtc agactatcat gattactgtg ttgactgtgc tgtctattgt600 actaaccatg ccgatgttta ggtgaaatta gcgtcacttg gcctcaacca tcttggtatc660 cagttatcct cactgaattg agatttcctg cttcagtgtc agccattccc acataatttc720 tgacctacag aggtgaggga tcatatagct cttcaaggat gctggtactc ccctcacaaa780 ttcatttctc ctgttgtagt gaaaggtgcg ccctctggag cctcccaggg tgggtgtgca840 ggtcacaatg atgaatgtat gatcgtgttc ccattaccca aagcctttaa atccctcatg900 ctcagtacac caggacaggt ctagcatttc ttcatttagt gtatgctgtc cattcatgca960 accacctcag gactcctgga ttctctgcct agttgagctc ctgcatgctg cctccttggg1020 gaggtgaggg agagggccca tggttcaatg ggatctgtgc agttgtaaca cattaggtgc1080 ttaataaaca gaagctgtga tgttaaaaaa aaaaaaaaa1119 <210> 178 <211> 164 <212> PRT <213> Homo sapien <220>
<221> VARIANT <222> (1)...(164) <223> Xaa = /jakákoliv aminokyselina <400> 178
Met Glu Asn Glu Leu Phe Cys Ser Gly Val Leu Val His Pro Gin Trp
1015
Val Leu Ser Ala Ala His Cys Phe Gin Asn Ser Tyr Thr Ile Gly Leu
2530
Gly Leu His Ser Leu Glu Ala Asp Gin Glu Pro Gly Ser Gin Met Val
4045
Glu Ala Ser Leu Ser Val Arg His Pro Glu Tyr Asn Arg Pro Leu Leu
5560
Ala Asn Asp Leu Met Leu Ile Lys Leu Asp Glu Ser Val Ser GluSer
70 7580
Asp Thr Ile Arg Ser Ile Ser Ile Ala Ser Gin Cys Pro Thr AlaGly
9095
Asn Ser Cys Leu Val Ser Gly Trp Gly Leu Leu Ala Asn Asp Ala Val
100 105110
Ile Ala Ile Gin Ser Xaa Thr Val Gly Gly Trp Glu Cys Glu Lys Leu
115 120125
Ser Gin Pro Trp Gin Gly Cys Thr Ile Ser Ala Thr Ser Ser Ala Arg
130 135140
Thr Ser Cys Cys Ile Leu Thr Gly Cys Ser Leu Leu Leu Thr Ala Ser
145 150 155160
Pro Gly Thr Leu <210> 179 <211> 250 <212> DNA <213> Homo sapien <400> 179
176
ctggagtgcc ccagctgccc gccaggcact aagttcatat ttggtgtttc ccggccgggg gttcatctca ctggagcctg aagcccctgc gatgcgaggc gcttttctgt atgtcttaac aggaagcaga tcggagcacc ccctttgctc gaataaaggt atgcaccttc cttgcccggc ccggcaagcg cccatgctcc tgaggcacct tgtgattgct cttctgctga acccgaaaaa
120
180
240 aaaaaaaaaa
250
<210> 180 <211> 202 <212> DNA <213> Homo sapien
<400> 180
actagtccag tcacccagac ctctgctact tgatttaaaa tgtggtggaa cccgcccctg cggaaactat aaaaaaaaaa ttccattgtg cccgtgcccc ttttatgtaa aa ttgggcccaa acgctgctgc ttaatgtatg cacaatggct taacgacagt ctttcttgtt acctttaaca atgatgctta tataaatgcc
120
180
202 <210> 181 <211> 558 <212> DNA <213> Homo sapien <220>
<221> různé_ylastnosti <222> (1) . . . (558) <223> n = A,T,c nebo G <400> tccytttgkt aatgtttagg ttattcctct ggtagtgtga aaattatgca ctactctgtt attgataata ttttattccc aaaaycagtt caaaaaaaaa
181 naggtttkkg cagtgctagt ttcttctgaa tagtataagt agttagtaat ccttggctag ttctatgttc aggaatatgg ttggtwaata aaaaaaaa agacamccck aatttcytcg gattaatgaa atctaagtgc tactcagggt aaaaaattat taaaagttgg kgttcatttt ygtwaatatg agacctwaan taatgattct gttgaaaatt agatgaaagt taactaaatt aaacaggact gctatacata atgaatatta tcmtaaataa ctgtgtcaca gttattactt gaggtggata gtgttatata actttaatat ttgttagttt aattattaag cscrggatag acaakgctot gacttcyngg tcctnattct aatacaaaaa tatccattca gctgttgaac gggaagccaa aaatatggaw awgtwtgagt gacttatttc
0
180
240
300
360
420
480
540
558
<210> 182
<211> 479
<212> DNA
<213> Homo sapien
<220>
<221> různé vlastnosti
<222> (1)...(479)
<223> n = A,T,Cnebo G
<400> 182
acagggwttk agaggggaaa cstcacacag ttwgcaattc ctaaggttaa grggatgcta atggggccta astcccgagt acgttgccac actttcccac agsccccrga gaagttacag agctgggact ctccaactta ccagaaaagg gcttwttttc gcacccctgg gcaggccctg tccttagtca agtactttca
120
180
240
300 rwtygtttga mscatytagy acaggcacac aacattcttc caacttagat tccaaccctg tggtgcgmtg agtcactgaa atatgtgatg aaaatcttag ·· tactmttcta agtcctcttc ntctcttggc tttctcaata awtgstgara aaattaaaat cagcctcact kkgagtcctm aartctctat ycatctcatg gttctggtty 'mactttaaaa cytgggggtt gataggaant tttaatttgg tacgcatara araaaaaaaa aaaaaaaaa
360
420
479
<210> 183
<211> 384
<212> DNA
<213> Homo sapien
<400> 183
aggcgggagc agtaccagta ggtgccagcc gccagcacca tgttaatcct cagcactcta gccatttcaa agaagctaaa ccaataacag tgaccgccac gtggcagctc gccagtcttt ggcagccact aaaaaaaaaa gccaaagccc tgccagtgcc tctcacattt tggtgcctgt ctcttcaagc atcaatcaat aaaa aagaagagtg agtgccagca gggctcttcg ggtttctcct cagggtgcat tgaagttgac gcagtgccag ccagtggtgg ctggccttgg acaagtgaga cctcagaaac actctgcatt cactggtgcc cttcagtgct tggagctggt ttttagatat ctactcaaca aratctattt
120
180
240
300
360
384 <210> 184 <211> 496 <212> DNA <213> Homo sapien <220>
<221 > ' různé vlastnosti <222> (1)...(496) <223> n - A,T,C nebo O <400> accgaattgg agggagatcg cccatcctgc aacgcttcaa tgatgtcttt tgagccctga attatgcttg tttttctcat taaaaaaaaa
184 gaccgctggc agtctatacg tcggttctcc ggtgctcatg tctgccacct tgcctttttg tgtgaggcaa attttaaatt aaaaaa ttataagcga ctgaagaaat ccagatgaca acccagcaac gttacccctc ccagccatac tcatggtggc actacmagaw tcatgtyynt ttgacccgat aatactctsg cgcgccctgt ggagactccg tctttggcat atcacccata tattwmagaw ccrgtatkac gggacaacag acaccgaatc cctctgaggg taaccaaact ccagtctctc aagggaacac waaatgawtt ctcaacgagc acctgctcag accatcaaga tcccttaaac cttcggactg gtggcgattg atttgacttt gaaaaactst
120
180
240
300
360
420
480
496
<210> 185
<211> 384
<212> DNA
<213> Homo sapien
<400> 185
gctggtagcc caagtatcyt aggaggacat gggcacaccc tggtgctgct ttgccatgtt gcgcagcgtt tatggcgkgg gcgcsgcgtc ggacgtggcc tcctggggcc cctcgtcatc cagttacaca accgcctcat cccacggagg ttctaccgtc ctcatggagc caggcgggca ttcctgctcg ttcggcaaag ccgg agtgacttcc cagattcccc cccggcttct aactggctgg aacttgctca tactgggaag
120
180
240
300
360
384 <210> 186 <211> 577 ggctcctgag cctacctgca acagcaactg cctgcgtctc tggccaacat tacagggcaa gccacggrac gatcttcggg ytcgtcggag ccagtatgcc cctgctggtc cagcgatctc
178
<212> DNA <213> Homo sapien <220>
< 2 21 > různé vlastnosti <222> (1) . . .(577) <223> n = A,T,C neboG <400> 186 gagttagctc tnccatcgtc ccaggaaact tcggtgtgaa attgagtcga cagccctatc ctcacccaga gtggaaaaag tccttttgac aagatntcgc ctccacaacc atactgtagg ctcaatcaag aggatctccc ttctgcatgt atgccgttga ttctgcatta amcamctcct acacaaacaa acagcactna ttgatgaggt tttgccacca tcaccgtcga agaaggagtg ccagcaggag mcgtgccgaa ccagagagcc ggargtgctn gttaaaggca tccagttggg cgtctgcagt cytcctggca tgaaacctgt ctcgatcttc gttgtaccag garcaccgag gtggcaaaag gccgctcctc ttttcagccc attaaat ggcctctcgc tcttggggcg gggctggttc cccacacttt ctctctgaca ccttgtgtgg acattgacaa gtcmgttggt ccagaaantt ttcataccgc gcntaatatt tgtcttccgc tgatgacttt gtgaggtcac gggkkgaagt actcgcccag ggcagcgctw gtcatcatcc
120
180
240
300
360
420
480
540
577 <210> 187 <211> 534 <212> DNA <213> Homo sapien <220>
< 2 21 > různé vlastnosti <222> (1)...(534) <223> n = A,T,c neboG <4G0> 187
aacatcttcc tgtataatgc tgtgtaatat cgatccgatn ttgtctgstg agaatycatw 60
actkggaaaa gmaacattaa agcctggaca ctggtattaa aattcacaat atgcaacact 120
ttaaacagtg tgtcaatctg ctcccyynac tttgtcatca ccagtctggg aakaagggta 180
tgccctattc acacctgtta aaagggcgct aagcattttt gattcaacat cttttttttt 240
gacacaagtc cgaaaaaagc aaaagtaaac agttatyaat ttgttagcca attcactttc 300
ttcatgggac agagccatyt gatttaaaaa gcaaattgca taatattgag cttygggagc 360
tgatatttga gcggaagagt agcctttcta cttcaccaga cacaactccc tttcatattg 420
ggatgttnac naaagtwatg tctctwacag atgggatgct tttgtggcaa ttctgttctg 480
aggatctccc agtttattta ccacttgcac aagaaggcgt tttcttcctc aggc 534
<210? • 188
<211> 761
<212> DNA
<213> • Homo sapien
<220>
<221> • různé vlastnosti
<222 = • (1) ... (761)
<223 = • n = A,T,C nebo G
<400 = 188
agaaaccagt atctctnaaa acaacctctc ataccttgtg gacctaattt tgtgtgcgtg 60
tgtgtgtgcg cgcatattat atagacaggc acatcttttt tacttttgta aaagcttatg 120
cctctttggt atctatatct gtgaaagttt taatgatctg ccataatgtc ttggggacct 180
179
·· 44 • •44 »4
4 · 4 4 « ·
44 4 4 4
4 4 4 4
4 ·· • 4 • ·
ttgtcttctg tgtaaatggt actagagaaa acacctatnt tatgagtcaa tctagttngt tttattcgac atgaaggaaa tttccagatn acaacactna caaactctcc ctkgackarg ggggacaaag aaaagcaaaa ctgamcataa raaacaatwa cctggtgaga arttgcataa acagaaatwr ggtagtatat tgaarnacag catcattaaa rmgttwtktt wttctccctt gcaaaaaaca tgtacngact tcccgttgag taatgccaag ttgttttttt tatnataaaa cttgcccttc attacatgtt tnaaagtggt gtggtgggcc aaaatattga aatgatggaa ctgactgata aagctgtaca aataagcagt gtgcctaaca agcaacacag taatgttgac atgcttaatt cacaaatgct aatttcatta taaatgtttg ctaaaataca ctttgaacta tttttctgtn ttcccagagc tgagatntta gattttatgt agtatnaagt gaaaaantac gaaaataata acattgaaga aaaananaaa aaanaaaaaa a <210> 189 <211> 482 <212> DNA <213> Homo sapien <220>
<221 > rfůzné vlastnosti <222> (1) . . . (482) <223 > n = A,T,C nebo G <400> 189 tttttttttt tttgccgatn ctactatttt attgcaggan gtgggggtgt atgcaccgca caccggggct atnagaagca agaaggaagg agggagggca cagccccttg ctgagcaaca aagccgcctg ctgccttctc tgtctgtctc ctggtgcagg cacatgggga gaccttcccc aaggcagggg ccaccagtcc aggggtggga atacaggggg tgggangtgr gcataagaag tgataggcac aggccacccg gtacagaccc ctcggctcct gacaggtnga tttcgaccag gtcattgtgc cctgcccagg cacagcgtan atctggaaaa gacagaatgc tttccctttc aaatttggct ngtcatngaa ngggcanttt tccaanttng gctnggtctt ggtacncttg gttcggccca gctccncgtc caaaaantat tcacccnnct ccnaattgct tgcnggnccc cc <210> 190 <211> 471 <212> DNA <213> Homo sapien <220>
< 2 21 > různé vlastnosti <222> (1)...(471) <223> n = A,T,C nebo G <400> 190 tttttttttt ttttaaaaca gtttttcaca acaaaattta ttagaagaat agtggttttg aaaactctcg catccagtga gaactacoat acaccacatt acagctngga atgtnctcca aatgtctggt caaatgatac aatggaacca ttcaatctta cacatgcacg aaagaacaag cgcttttgac atacaatgca caaaaaaaaa aggggggggg gaccacatgg attaaaattt taagtactca tcacatacat taagacacag ttctagtcca gtcnaaaatc agaactgcnt tgaaaaattt catgtatgca atccaaccaa agaacttnat tggtgatcat gantnctcta ctacatcnac cttgatcatt gccaggaacn aaaagttnaa ancacncngt acaaaaanaa tctgtaattn anttcaacct ccgtacngaa aaatnttnnt tatacactcc c <210> 191 <211> 402 <212> DNA
240
300
360
420
480
540
600
660
720
761
120
180
240
300
360
420
480
482
120
180
240
300
360
420
471
180 ·· «··· <213> Homo sapien <220>
< 2 21 > různé vlastnosti <222> (1)...(402) <223> n = A,T,C neboG <400> 191 gagggattga aggtctgttc tastgtcggm ctgttcagcc accaactcta acaagttgct 60 gtcttccact cactgtctgt aagcttttta acccagacwg tatcttcata aatagaacaa 120 attcttcacc agtcacatct tctaggacct ttttggattc agttagtata agctcttcca 180 cttcctttgt taagacttca tctggtaaag tcttaagttt tgtagaaagg aattyaattg 240 ctcgttctct aacaatgtcc tctccttgaa gtatttggct gaacaaccca cctaaagtcc 300 ctttgtgcat ccattttaaa tatacttaat agggcattgk tncactaggt taaattctgc 360 aagagtcatc tgtctgcaaa agttgcgtta gtatatctgc ca 402 <210> 192 <211> 601 <212> DNA <213> Homo sapien <220>
< 2 21 > různé vlastnosti <222> (1)...(601) <223> n = A,T,C neboG <400> 192 gagctcggat ccaataatct ttgtctgagg gcagcacaca tatncagtgc catggnaact 60 ggtctacccc acatgggagc agcatgccgt agntatataa ggtcattccc tgagrcagac 120 atgcytyttt gaytaccgtg tgccaagtgc tggtgattct yaacacacyt ccatcccgyt 180 cttttgtgga aaaactggca cttktctgga actagcarga catcacttac aaattcaccc 240 acgagacact tgaaaggtgt aacaaagcga ytcttgcatt gctttttgtc cctccggcac 300 cagttgtcaa tactaacccg ctggtttgcc tccatcacat ttgtgatctg tagctctgga 360 tacatctcct gacagtactg aagaacttct tcttttgttt caaaagcarc tcttggtgcc 420 tgttggatca ggttcccatt tcccagtcyg aatgttcaca tggcatattt wacttcccac 480 aaaacattgc gatttgaggc tcagcaacag caaatcctgt tccggcattg gctgcaagag 540 cctcgatgta gccggccagc gccaaggcag gcgccgtgag ccccaccagc agcagaagca 600 g 601 <210> 193 <211> 608 <212> DNA <213> Homo sapien <220>
<221 > i různé vlastnosti <222> (1) . . . (608) <223> n = A,T,C neboG <400> 193 atacagccca natcccacca cgaagatgcg cttgttgact gagaacctga tgcggtcact 60 ggtcccgctg tagccccagc gactctccac ctgctggaag cggttgatgc tgcactcytt 120 cccaacgcag gcagmagcgg gsccggtcaa tgaactccay tcgtggcttg gggtkgacgg 180 tkaagtgcag gaagaggctg accacctcgc ggtccaccag gatgcccgac tgtgcgggac 240 ctgcagcgaa actcctcgat ggtcatgagc gggaagcgaa tgaggcccag ggccttgccc 300 ·» ···« φ φ φ *
181 • · ·♦ • Φ ·<
• · φ φ· • <· w« **· φ agaaccttcc gcctgttctc tggcgtcacc tgcagctgct gccgctgaca ctcggcctcg gaccagcgga caaacggcrt tgaacagccg cacctcacgg atgcccagtg tgtcgcgctc caggammgsc accagcgtgt ccaggtcaat gtcggtgaag ccctccgcgg gtratggcgt ctgcagtgtt tttgtcgatg ttctccaggc acaggctggc cagctgcggt tcatcgaaga gtcgcgcctg cgtgagcagc atgaaggcgt tgtcggctcg cagttcttct tcaggaactc cacgcaat <210> 194 <211> 392 <212 > DNA <213> Homo sapien <220>
<221> irůzné vlastnosti <222> (1) . . . (392) <223> n = A,T,C ne5oG <400> 194 gaacggctgg accttgcctc gcattgtgct tgctggcagg gaataccttg gcaagcagyt ccagtccgag cagccccaga ccgctgccgc ccgaagctaa gcctgcctct ggccttcccc tccgcctcaa tgcagaacca gtagtgggag cactgtgttt agagttaaga gtgaacactg tttgatttta cttgggaatt tcctctgtta tatagctttt cccaatgcta atttccaaac aacaacaaca aaataacatg tttgcctgtt aagttgtata aaagtaggtg attctgtatt taaagaaaat attactgtta catatactgc ttgcaatttc tgtatttatt gktnctstgg aaataaatat agttattaaa ggttgtcant cc <210> 195 <211> 502 <212> DNA <213> Homo sapien <220>
<221 > různé vlastnosti <222> (1)...(502) <223> n = A,T,C nebo G <400> 195 ccsttkgagg ggtkaggkyc cagttyccga gtggaagaaa caggccagga gaagtgcgtg ccgagctgag gcagatgttc ccacagtgac ccccagagcc stgggstata gtytctgacc cctcncaagg aaagaccacs ttctggggac atgggctgga gggcaggacc tagaggcacc aagggaaggc cccattccgg ggstgttccc cgaggaggaa gggaaggggc tctgtgtgcc ccccasgagg aagaggccct gagtcctggg atcagacacc ccttcacgtg tatccccaca caaatgcaag ctcaccaagg tcccctctca gtccccttcc stacaccctg amcggccact gscscacacc cacccagagc acgccacccg ccatggggar tgtgctcaag gartcgcngg gcarcgtgga catctngtcc cagaaggggg cagaatctcc aatagangga ctgarcmstt gctnanaaaa aaaaanaaaa aa <210> 196 <211> 665 <212> DNA <213> Homo sapien
360
420
480
540
600
608
120
180
240
300
360
392
120
180
240
300
360
420
480
502 <220>
< 2 21 > různé vlastnosti <222> (1)...(665)
182 • ·· ·« · · · « • *·· ·
9 · 9 9« • * · 99
4* · »♦·· <223> η = A,T,C neboG <400> 196 ggttacttgg cctctggaag wagctgtttk actwatttat aagtatgatg attaatcggc tcacttggtt watatttatt tcttgacaga ttcttagaat tttgcaatca aagtg tttcattgcc ccttgcgcag gagttgatts tatcttgtga aaaagcaawa aaaatgtgga attttattgt tcattaattt aatcgatctt gtataaaggt ggctgaaatg accacttagt agcggacttt gcaccactgc aaagtataac gatatatatt gtgtatgttc aaatgartta ctttcctkgt gatgctgtgg tgtagcccat tggcatgctn ggatgtcatt gtaattgttg acccacaact aatgaaaatt cttttattat ttttcacagt caaaattctt ttacgtwaat aagtagtttg cnaacttcaa ttctaattcc tagaaccatt gagaataact tcaatatgaa ttgttcatac gttaaattat aatatatgcc aatttaagar tttgaaaaga acccacatcc agaaaaaaat aactttacaa ttgtctgctc gctgaatttt aacyawttga tgtattkatc gattgccatt ttttgtaact aatggtatgt wtgcatgatt ctatgagttt gaccacatac actagcaaan
120
180
240
300
360
420
480
540
600
660
665 <210> 197 <211> 492 <212> DNA <213> Homo sapien <220>
<221> různé vlastnosti· <222> (1)...(492) <223> n = A,T,C neboG <400> ttttnttttt atgtttattg aaggcagatt aattatagtc caaaattcta attctcttct tgttcaaaag catttcactc ancntggctt
197 ttttttttgc gagcgatcca cacagaacat naaccagtaa ccctgaaact gaactttaga tacaacnaag ccatcacggg aa aggaaggatt ttatcagtga gctngtscngc acnaggaatt tactccatcc ttttctagaa caatgttccc agtcaatgct ccatttattg aaagtatcaa ttgcagtttt tacttttcaa aaatattgga aaatatgtaa ttaccatagg acctgggaca tggatgcart gtgtttataa acctcgtana aagattaaat ataanagtca tagtgatcag ccttaattca cttgtatttt ttcacaatat natttttagg gatnacagag ccaaactgaa gcagtgatac gaagagctct aactttgatc gttcatnctg
120
180
240
300
360
420
480
492 <210> 198 <211> 478 <212> DNA <213> Homo sapien <22 0>
<221> různé vlastnosti <222> (1)...(478) <223> n = A,T,CneboG <400> tttnttttgn tgtntccacn tgagtatatt tatacatggc natatatgtc gagttgtggc agcattctag
198 atttcantct acaaatcatn ttgaaaagga ttgattgata aatcngattt tttatgttta tacctctact gtannaanta ttacntnagt caagtttaaa tttagcacag aagatacaaa ctgaaagtca ccatggttaa aaaatatnaa caacatacac atancacatt agaaanaaat catcntgtag gatggccgta catatgtnca
120
180
240
300
360
420 ttttcattat aagaggccan gtanacncat canaaactga acagatccta atgcagttcc gaatcgtaca gtttattana ctacattgta attgccganc gtgagttacc tggtacatan tgtacaaaga cttatgttta
183
·· 99 ···· 99
»· · 9 9 • ·
9 • · 9
• 9 • * 9 9 • · 9
• · 9 9 9 9 9
»··» 99 9 ·· 99
gggtaagaat tgtgttaagt naanttatgg agaggtccan gagaaaaatt tgatncaa
478 <210> 199 <211> 482 <212> DNA <213> Homo sapien <220>
<221> různé vlastnosti <222> (1)...(482) <223> n = A,T,C nebo G <400> 199 agtgacttgt tgctagttcc tcaactccag agtgattcag tgaagccnac aaatttacct anggacttta aacntngacn cctccaacaa tgtcatctat ctggattatt tttcctctac tctgaacacg ggangaaaag agaanaaact ncacccttnt aaccccttga tcgctactaa ttggagcctg ggatgagaga ctggttatct aggctttngg accacatgtn ggaatanant tcaagtttgt atgcagactg caaatctatt ctggctcaag nagatgagaa ctggggacca tgtngtatcc cttgacngcn ggcactgaca gaggggacca cctacttgta aatatcctca ncagagaaat tcccattgaa tggtgccngg tcctgaactt atcagaccta aaaaggggca cggactttga tgcagcttta aaagtcnaga ccttctctta ccgtttantg gctcctctgc
120
180
240
300
360
420
480 ga
482 <210> 200 <211> 270 <212> DNA <213> Homo sapien <220>
<221> různévlastnosti <222> (1)...(270) <223> n = A,T,C nebo G <400> cggccgcaag cgactgcgac aaggctgagc cagccggaac ccgagagata
200 tgcaactcca gacggcggcg tgacgccgca agagcccggt cgcaggtgca gctggggccg gcgacagtcg gaggtcgtgt gaangcggga ggtggccgcc tgcggacgaa caggtgcagc cacgtcccac ggcctcgggg gattctgcca gcgggcgcct gaccttgacg agcccctcgg gcagttggtc ggggtcttgc ccgtcgggga gaagggcggc
120
180
240
270 <210> 201 <211> 419 <212> DNA <213> Homo sapien <220>
< 2 21 > různé vlastnosti· <222> (1) . . . (419) <223> n = A,T,c neboG <400> 201 tttttttttt gctagcaagg ttgattggtt tggagtgggt ttttggaatc taacagggta tgtctttatg gcaccctccc tactgcgagc gggcatggtt ggggcggggt tgtagaacct acagcaggtc acatgttcag ggggtagggg ggttacnaaa ttattttgca tttgtcgtgg anaantaaca gttcacctgg
120
180
240 agcaacaagt gtcaacttcc aaancgaagc gcttggggca • · • « · ·
184
300
360
419 tctgtgaccg tcattttctt gacatcaatg ttattagaag tcaggatatc ttttagagag tccactgtnt ctggagggag attagggttt cttgccaana tccaancaaa atccacntga aaaagttgga tgatncangt acngaatacc ganggcatan ttctcatant cggtggcca <210> 202 <211> 509 <212> DNA <213> Homo sapien <220>
<221> různé vlastnosti <222> (1) . . . (509) <223> n = A,T,C neboG <400> 202 tttntttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tggcacttaa tccattttta tttcaaaatg tctacaaant ttnaatncnc cattatacng gtnattttnc aaaatctaaa nnttattcaa atntnagcca aantccttac ncaaatnnaa tacncncaaa aatcaaaaat atacntntct ttcagcaaac ttngttacat aaattaaaaa aatatatacg gctggtgttt tcaaagtaca attatcttaa cactgcaaac atntttnnaa ggaactaaaa taaaaaaaaa cactnccgca aaggttaaag ggaacaacaa attcntttta caacancnnc nattataaaa atcatatctc aaatcttagg ggaatatata cttcacacng ggatcttaac ttttactnca ctttgtttat ttttttanaa ccattgtntt gggcccaaca caatggnaat nccnccncnc tggactagt <210> 203 <211> 583 <212> DNA <213> Homo sapien <220>
< 2 21 > různé vlastnosti <222> (1) . . .(583) <223> n = A,T,C nebo G <400> 203 tttttttttt ttttttttga cccccctctt ataaaaaaca agttaccatt ttattttact tacacatatt tattttataa ttggtattag atattcaaaa ggcagctttt aaaatcaaac taaatggaaa ctgccttaga tacataattc ttaggaatta gcttaaaatc tgcctaaagt gaaaatcttc tctagctctt ttgactgtaa atttttgact cttgtaaaac atccaaattc atttttcttg tctttaaaat tatctaatct ttccattttt tccctattcc aagtcaattt gcttctctag cctcatttcc tagctcttat ctactattag taagtggctt ttttcctaaa agggaaaaca ggaagagana atggcacaca aaacaaacat tttatattca tatttctacc tacgttaata aaatagcatt ttgtgaagcc agctcaaaag aaggcttaga tccttttatg tccattttag tcactaaacg atatcnaaag tgccagaatg caaaaggttt gtgaacattt attcaaaagc taatataaga tatttcacat actcatcttt ctg <210> 204 <211> 589 <212> DNA <213> Homo sapien
120
180
240
300
360
420
480
509
120
180
240
300
360
420
480
540
583 <220>
<221> různé vlastnosti <222> (1)...(589) • ·
185
<223> η = A,T,C neboG <400> 204 ttttttttnt tttcactctc aatctcttat tgaaggaaat tgagaggttt attttcatgc cattacaaaa ctaatacaaa aaaataatta ttattnagaa tttttttttt tagatagggc gctatatcat ctgttcattc ttcttctcta aaactagaaa ctgctcaaat tcacatttac aaggaacatt tgaattcaca ttttttnctc atgaagaaaa attttaagtt ttctcattca tttacacata ataatgtntt tgtttgttaa ngacnagcaa tttagcctgg tgttattatt ttcttttttt ctcatctttc aaactaatga tatagttata tatttccatg cttttgcata gnttatccat taataaaact gtataattag ccntagccca ttganaatga cagctttaaa gtcactggct tcaagtacta tgaatttgta agagaagaga tataattagt gaagtaccag ctaattcact acacaatgg ggatcgagtt ataacaatca tatottctcc ccttgcatat tcaaaccttt acaatatnag tnggcaggag ttaaatatcc ttacaagcat
120
180
240
300
360
420
480
540
589 <210> 205 <211> 545 <212> DNA <213> Homo sapien <220>
<221> irůzné vlastnosti <222> (1)...(545) <223> n = A,T,cneboG <400> tttttntttt agaaaagtgc tngtcttgaa ttaagatcat aaaaatccac atggggtgtc tatgtacttt aaggggcnga aaggattaga aaccc
205 ttttttcagt cttacattta caccaatatt agagcttgta tattagcaaa actggtaaac gctanatnac ngaaatgagg tatgtttcct aataatcaga ataaaagttt aatttgagga agtgaaaaga taaattacta caacacattc gtggatatga aagaaaagaa ttgccaatat acaatattta gtttctcaaa aaatacacca taaaatttga tggacttctt tgaaggatac gttgacaagt aaggattacg taaaaaaata tttttatatt gtgatcagag aaatacatta cctcagaaac gctttaattt attacttagt ttctctttct catactgttc ataatgttta taaaattcat gaattagata agtaaattat tctgagcatt tgtgatgaat gatagattct tcaatctttt tttctatngg ctactagtga
120
180
240
300
360
420
480
540
545 <210> 206 <211> 487 <212> DNA <213> Homo sapien <220>
<221> různévlastnosti <222> (1) . . . (487) <223> n = A,T,CneboG <400> tttttttttt catttattag caatttataa cccttctccc actgctgcaa ttggtnagaa tcggtgaaaa aactcttcga
206 ttttttagtc ctctgcaact atgtaaggtg accaactaat acgctaattc tgcatcanca tagactgtgt accgcttcct aagtttctna tacatattta ccattattga gaancagcaa tcttctccat atctnacaat ctgtctgaat caaaggcngc tttttattat aattaaagaa gtanatatat cattagttta ccccatgtng caacagcaag caaatgatct tgccacattt aattaaagtc acgttnttag tcctccaaga attttattag atattgtgta atgaagctag gacctatcct gtggcntctn ttggtcattt acaactgtna gtggatgtgt tagatnatac tatgtgtgag gcntgggctt cggtggcaag ttgcacttgt
120
180
240
300
360
420
480 • ·
186 ttcaaaa
487 • · • ·· •· •· • · · <210>
<211>
<212>
<213>
207
332
DNA
Homo sapien <220>
<221>
<222>
<223>
různé vlastnosti (1) . . . (332) <nebo G η = A,T, C <400> tgaattggct , tacatagcat gcatttatag ' atctttgcat gaaatgaagg < aaaagaaggc .
• 207 aaaagactgc taaatcccaa gaccttctgg gcagaggagg ggccaggctt agcctaggcc atttttanaa atcctattta tggttctgct taaaaggtat actgagcttg ctggggagcc ctagcaactc aagacctgac gttacntttg tggattttca tccactggag ca ttatttcttt agcttgagaa aantctgaca cagaggaana ggctcatggg cctttaaaaa ggtcactact atccttgana acacagcgca tgggacatgg
120
180
240
300
332 <210>
<211>
<212>
<213>
208
524
DNA
Homo sapien <220>
<221>
<222>
<223>
irůzné vlastnosti (1) .. . Í524) n = A,T,C nebo G <400> agggcgtggt gttgtgttcc tttaaaggac tcccgcgtga tttggcagaa gtaaatagaa atgagcccag tgtcatcaga aaaccattac
208 gcggagggcg ggccccatcc atggagcttg ttcacattta tacttnttga gtgggtcata acactgacat caggaggctg ctgatccact ttactgtttt aaccacgaag tcacaatgtc gcaaccaaca aacttgcaga atattaatta caaactaagc tcaccttgac tccggtaatg gtctcagtaa ttgatttctc acaatgtcac atagctcatg tgataactaa cctgttcaca ccacttagac caaattctca caccaccttg caataaatac ttgtgtgcag agtgtgaagg agtccatact gatccaagat tcagcttcca tcctcaccac ccagtcaatc gtga aaaaagactg agtgactgat gcacactcac tgtaaatact atttcccaaa tttacaagtc cagtctgtcc atctatccaa
120
180
240
300
360
420
480
524
<210> 209 <211> 159 <212> DNA <213> Homo sapien
<400> 209
gggtgaggaa atccagagtt gccatggaga tggccctctc ctacactctg gccagagata caaaggactc tcgacccaaa ctgccccaga aaattccagt ccacagtcaa ccctctcca gtcagcattc acctggagcc ttgctccttg aaaaaggaca
120
159 <210>
<211>
<212>
<213>
210
256
DNA
Homo sapien
187
<220>
< 2 21 > různé vlastnosti <222> (1)...(256) <223> n = A,T,C neboG <400 actccctggc actgaatttc tggggagatt ttgcagggtg ccaggatgct
210 agacaaaggc tttccacttg ttanccaatt naaatgggan aaatca agaggagaga gactattaca tangtntgta ggctggtttg gctctgttag tgccanttga aatggggaga ttanatgaac ttctgtgttg gggactaatg ctggggcagg agggacatag ttgaactgcc gaaaaacgta cgggagagat gaggtaggca
120
180
240
256 <210> 211 <211> 264 <212> DNA <213> Homo sapien <220>
< 2 21 > různé vlastnosti <222> (1)...(264) <223> n = A,T,cneboG <400> acattgtttt actggaacac atattcaagc ggggagatac aaaaaaggag
211 tttgagataa atacccacat acatatgtta attcngaaag caaatgagaa agcattgaga ctttgttctg tatattattc aggactgaaa gcct gagctctcct agggataatt agttccatgt gaaatactca taacgtgaca ttctgataaa ttatagccta agtnggaaaa caatggaagg gtcttgctgt gttaaggaga cagaaaaaga
120
180
240
264 <210> 212 <211> 328 <212> DNA <213> Homo sapien <220>
< 2 21 > irůzné vlastnosti <222> (1) . . . (328) <223> n = A,T,C neboG <400> acccaaaaat ggatttaatg gtttatatat ttnaatttca cccctacnac tttttttttc
212 ccaatgctga ttgtctcagc gcagcaacaa ttcccattga tctttactct ctttattcct atatttggct ttgggcactt tattcaagcg cttgggatcc ctgganaggg ttgtcaga tcattattcc cagttaggac cgacaacagg ttatcatcag ccagtggtgg canattcttt ctaaggatgc ttattgaact ccagagagat tagctataag gattgtcaaa cagccggcag tgcccgccag tgaaaattta cttggccaca
120
180
240
300
328 <210> 213 <211> 250 <212> DNA <213> Homo sapien <220>
< 2 21 > různé vlastnosti • · · · · ·
188 <222> (1)...(250) <223> n = A,T,C nebo G <400> 213 acttatgagc agagcgacat atccnagtgt agactgaata aaactgaatt ctctccagtt taaagcattg ctcactgaag ggatagaagt gactgccagg agggaaagta agccaaggct cattatgcca aagganatat acatttcaat tctccaaact tcttcctcat tccaagagtt ttcaatattt gcatgaacct gctgataanc catgttaana aacaaatatc tctctnacct tctcatcggt <210> 214 <211> 444 <212> DNA <213> Homo sapien <220>
< 2 21 > i různé vlastnosti <222> (1) . . . (444) <223> n = A,T,C cnebo G <400> 214 acccagaatc caatgctgaa tatttggctt cattattccc agattctttg attgtcaaag gatttaatgt tgtctcagct tgggcacttc agttaggacc taaggatgcc agccggcagg tttatatatg cagcaacaat attcaagcgc gacaacaggt tattgaactt gcccgccagt tgaatttcat tcccattgac ttgggatcct tatcatcagc canagagatt gaaaatttac ccctacgact ctttactctc tggagagggc cagtggtggt agctataagc ttggccacat ttttttttcc tttattcctt tgtcagagat gcgattcatc catatgctan aaaccaacag agcgactttt acaaaattcc tataganatt gtgaataaaa ccttacctat agttgccatt actttgctct ccctaatata cctc <210> 215 <211> 366 <212> DNA <213> Homo sapien <220>
<221> i různé vlastnosti <222> (1) . . . (366) <223> n = A,T,C neboG <400> 215 acttatgagc agagcgacat atccaagtgt anactgaata aaactgaatt ctctccagtt taaagcattg ctcactgaag ggatagaagt gactgccagg agggaaagta agccaaggct cattatgcca aagganatat acatttcaat tctccaaact tcttcctcat tccaagagtt ttcaatattt gcatgaacct gctgataagc catgttgaga aacaaatatc tctctgacct tctcatcggt aagcagaggc tgtaggcaac atggaccata gcgaanaaaa aacttagtaa tccaagctgt tttctacact gtaaccaggt ttccaaccaa ggtggaaatc tcctatactt ggtgcc <210> 216 <211> 260 <212> DNA <213> Homo sapien
120
180
240
250
120
180
240
300
360
420
444
120
180
240
300
360
366 <220>
< 2 21 > různé vlastnosti <222> (1) . . . (260) <223> n = A,T,c neboG <400> ctgtataaac caagacaggg taataaaaag atcaaaaatt aattcttcct
216 agaactccac gcctaaggag tnnaaaaggc tcctnaagtt tccctccttt tgcangaggg ggtctccaca ctcttctcaa ntcaagctat agggccgggc ctgctnntaa cttttttccc catatatact caggagaatc gggctnttnc ttnggctgga ntatcctgaa tccgcttgtc atttttttat aaatttaaaa aaagcaacat
120
180
240
260 <210>
<211>
<212>
<213>
217
262
DNA
Homo sapien <220>
<221>
<222>
<223>
i různé vlastnosti (1) ... (262) n = A,T, C nebo G <400> acctacgtgg ' tcttgcctat . ggcattctac atgaataatc atatccttca '
217 gtaagtttan aattttctat agtttgagca tgtatgatta tgcttgtaaa aaatgttata tttaataagg aaatgcaatt tatgtctcta gt atttcaggaa aaatagcaaa aaatgtggaa gagtagattt naggaacgca ttggggtggg ggacagcact ataattagcc tataattgta gggaatgtag gaaaaatttt acttacccta
120
180
240
262 <210>
<211>
<212>
<213>
218
205
DNA
Homo sapien <220>
<221>
<222>
<223>
různé vlastnosti (1)...(205) n = A, T, C nebo G <400> accaaggtgg cccctatcaa aggcctcccc anaaatcagc
218 tgcattaccg ctcccttttg agttctactg agacacaggt gaantggatc tagtaaactt acctttgtcc gtaáa aangacacca ggaaccttgg ttangtntna tcgtggccaa aaatgaccag ngtccagggt cccctgagca gccaagactc tgctaggaaa
120
180
205
<210> 219 <211> 114 <212> DNA <213> Homo sapien
<400> 219
tactgttttg tctcagtaac aataaataca accacgaagt tgatttctct tgtgtgcaga gccccatcca tgga
114 <210> 220 <211> 93 aaaagactgg gtgactgatt ttgtgttccg ttaaaggaca <212>
<213>
DNA
Homo sapien
220 <400>
actagccagc acaaaaggca gggtagcctg aaataagcat ttagtgctca gtccctactg <210>
<211>
<212>
<213>
221
167
DNA
Homo sapien • <»· ·· · ·
190,:.
aattgctttc agt
tgctctttac atttctttta <220>
<221>
<222>
<223>
r různé vlastnosti (1) ...(167) n = A,T,C 'nebo G
221 <400>
actangtgca ggtgcgcaca tcttttgccc agcctgtggc cccccactac cttccctgac aatatttgtc tctactgtag gctccccana gatattccct taagtttctg aatcacccaa tcatcttgga ctgatgagga cctctgt ttccatgagg gccagnatgc
120
167
<210> 222
<211> 351
<212> DNA
<213> Homo sapien
<400> 222
agggcgtggt gttcttcacc atgtttgctg ttttctcttt taggtgagca ctcgtatcaa gcggagggcg tgtcccccaa aattaaagga tatatttcta tgattagaga aacaatagat gtactgacct tccttaaaag tggatgaaaa gaagaagttt gcttgtaggt tggtaaaggt cattagtagg gccatactgc aaattaataa ctttgagcct tgcttttaca ggtattattg aggatgcatt ataaagtcaa tgaatttttg attagatccc tatatctggc tattgataag ctggcacccc caacagataa cataatccaa gggaatcttt atatttgagt t
120
180
240
300
351 <210>
<211>
<212>
<213>
223
383
DNA
Homo sapien <220>
<221>
<222>
<223>
i různé vlastnosti (1)./.(383) nebo G n = A,T,C <400> aaaacaaaca tggtaattat ttaaaatgtc tgccaaagga taaaagattt ataggaccac accattaagc
223 aacaaaaaaa ggtcaattta tgtgccaaaa agtctaagga tgatttcctg agtcttcact tatatgttta acaattcttc atwrtrttkt ttttgtattt attagtagtg gaatgacaat tctgatactt aaa attcagaaaa ggggcatttc tatttggaga ttcccmtcac tatattttaa gtaaattaat attatcttag cttacattgt cttcttatca ttgtttggag ctttggtggg cttttattgc ggactgatat cttgacaaga aaagtaatgc tgtgctattc ggaaanagtt acttgttttg
120
180
240
300
360
383 <210> 224
191 • · · · ·· · · · · <211> 320 <212> DNA <213> Homo sapien <400> 224 cccctgaagg cttcttgtta gaaaatagta cagttacaac caataggaac aacaaaaaga60 aaaagtttgt gacattgtag tagggagtgt gtacccctta ctccccatca aaaaaaaaat120 ggatacatgg ttaaaggata raagggcaat attttatcat atgttctaaa agagaaggaa180 gagaaaatac tactttctcr aaatggaagc ccttaaaggt gctttgatac tgaaggacac240 aaatgtggcc gtccatcctc ctttaragtt gcatgacttg gacacggtaa ctgttgcagt300 tttaractcm gcattgtgac320 <210> 225 <211> 1214 <212> DNA <213> Homo sapien <400> 225 gaggactgca gcccgcactc gcagccctgg caggcggcac tggtcatgga aaacgaattg60 ttctgctcgg gcgtcctggt gcatccgcag tgggtgctgt cagccgcaca ctgtttccag120 aactcctaca ccatcgggct gggcctgcac agtcttgagg ccgaccaaga gccagggagc180 cagatggtgg aggccagcct ctccgtacgg cacccagagt acaacagacc cttgctcgct240 aacgacctca tgctcatcaa gttggacgaa tccgtgtccg agtctgacac catccggagc300 atcagcattg cttcgcagtg ccctaccgcg gggaactctt gcctcgtttc tggctggggt360 ctgctggcga acggcagaat gcctaccgtg ctgcagtgcg tgaacgtgtc ggtggtgtct420 gaggaggtct gcagtaagct ccatgacccg ctgtaccacc ccagcatgtt ctgcgccggc480 ggagggcaag accagaagga ctcctgcaac ggtgactctg gggggcccct gatctgcaac540 gggtacttgc agggccttgt gtctttcgga aaagccccgt gtggccaagt tggcgtgcca600 ggtgtctaca ccaacctctg caaattcact gagtggatag agaaaaccgt ccaggccagt660 taactctggg gactgggaac ccatgaaatt gacccccaaa tacatcctgc ggaaggaatt720 caggaatatc tgttcccagc ccctcctccc tcaggcccag gagtccaggc ccccagcccc780 tcctccctca aaccaagggt acagatcccc agcccctcct ccctcagacc caggagtcca840 gaccccccag cccctcctcc ctcagaccca ggagtccagc ccctcctccc tcagacccag900 gagtccagac cccccagccc ctcctccctc agacccaggg gtccaggccc ccaacccctc960 ctccctcaga ctcagaggtc caagccccca acccctcctt ccccagaccc agaggtccag1020 gtcccagccc ctcctccctc agacccagcg gtccaatgcc acctagactc tccctgtaca1080 cagtgccccc ttgtggcacg ttgacccaac cttaccagtt ggtttttcat tttttgtccc1140 tttcccctag atccagaaat aaagtctaag agaagcgcaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 1200 aaaaaaaaaa aaaa1214 <210> 226 <211> 119 <212> DNA <213> Homo sapien <400> 226 acccagtatg tgcagggaga cggaacccca tgtgacagcc cactccacca gggttcccaa 60 agaacctggc ccagtcataa tcattcatcc tgacagtggc aataatcacg ataaccagt 119 <210> 227 <211> 818 <212> DNA <213> Homo sapien <400> 227
192
acaattcata tttttgctac acggacggtt aattttcctc gagaaagcca gcttgtcccc agggcctcct ggaaagggtg acctgctggc gccatccact gacaggctct aaagccattc caagaggata gtccacttct gggacgacca atatggggtc cttagcacaa ctctggagga cgctcggcct ttccaatcag caggagcagt caccctcagc tgtcttggga ggacatgaag gccctcaagc ccacaaatcc tgaggactgt aggttttcag atgaggacag ccttttcatt tttgtgaaat aaggtggtga tctctgaacc ccacttctga ccaagagttt agagaagccg tgcgcccagc ctgaggacac cggctgaggg agaccatacc ctcagcctgg cctagatggg ggaatgaacc ctttgcaaaa ctgtgtaraa ttgacaggca aggatggaac gaacccccat tcaaagataa agagcttaac ctttgagagg tgggcttcaa cagcaaccac atgaagcaac ctttgggctg agtcgtgt
cggctctccc ccagccctga 60
acactgggtt ttctgagaac 120
ccgggctttg caggggagat 180
gggagacagt gacaaggcta 240
ggcagacccc tgaaaacgaa 300
ctaacttcct actggaaaag 360
cgtgacaact accatctaga 420
tctggtcgtt tccagagaca 480
ccactacccc atgaacttct 540
cactgagttg tcatgagagg 600
tctcctcccc tttctcacgc 660
gagacccaaa cagtttggct 720
acaccatgca cacacacaag 780 818
<210> 228
<211> 744
<212> DNA
<213> Homo sapien
<400> 228
actggagaca gtcatgacgt tcgtggccga taggaaaagt tgctcggtgc accagattct gctggcagct gagaaggcta ccagacggtg ccgtggtatg ttcttttcgt ttgggagatg cttcactctg ctgttgaact ttgacatacc cctggcctct ggcttcgtaa acattggggt aggccagttt gaatggcttg ggatgcttgt ttggccactc ccttggccca taatgttcct tggaccagag aagtagctgg tgatcaagac tttggaacga cctggcctgt aatagaagag gctttgggat gttccactga ccggtggctc ctagtgttct ccttctaaaa ttccagcagt ctgtgttgtc atccactcct tggt ccagaccacc gcctcctcct ttcttaagat cagtcactgt aaaagattta agcttttccc tgtggcaaga tagctgtcac cacaggcgcc cccagttatg agctgtcttc taagaaccag ccaggtctcc tggaagatgg gcggagtcac ggaactacca tgagccaact acagcagtcc tcacactgag gttggctcct ctcctggtga catttcaagt atttcctggg tggcgaaaga ttcgtgggat aagaccgtgt atttcaatgg aatggcgaga attctctggc acctctgcag atcgatgggt tccaggttgg cagtgacccg ttggggtttg ctaagcagca cactttcttt
0
180
240
300
360
420
480
540
600
660
720
744
<210> 229
<211> 300
<212> DNA
<213> Homo sapien
<400> 229
cgagtctggg cattacacat tgcagggttg ttgtatgtga cactaggctc ttttgtctat cgaaataaaa ttgtttttta cagccaactc ctccttgccc aaagtttgat gaaaggtggc attattattg tgagaaggtc tcacactgga ccctcctttt agacttgccc ttagaaacgt ctatttttcc gtctccgcca ctcatccaaa aacgccaggc cacccacagt acctgcagag gtgtgggtgc tcatgtgaac tgacatgtgc ccctgttaat gatccagtct ccactgacat
120
180
240
300
<210> 230
<211> 301
<212> DNA
<213> Homo sapien
<400> 230
cagcagaaca aatacaaata tgaagagtgc gagcgacagt tcaaggagga gaagcttgca aaagatctca gagcagctca gctgaggaat ggagctcagg
120 taaaatctat agcaagctga
193
caatataaag tcctggttca cactcaggaa cgagagctga cccagttaag ggagaagttg 1Θ0 cgggaaggga gagatgcctc cctctcattg aatgagcatc tccaggccct cctcactccg 240 gatgaaccgg acaagtccca ggggcaggac ctccaagaaa cagacctcgg ccgcgaccac 300 g 301 <210> 231 <211> 301 <212> DNA <213> Homo sapien <400> 231 gcaagcacgc tggcaaatct ctgtcaggtc agctccagag aagccattag tcattttagc 60 caggaactcc aagtccacat ccttggcaac tggggacttg cgcaggttag ccttgaggat 120 ggcaacacgg gacttctcat caggaagtgg gatgtagatg agctgatcaa gacggccagg 180 tctgaggatg gcaggatcaa tgatgtcagg ccggttggta ccgccaatga tgaacacatt 240 tttttttgtg gacatgccat ccatttctgt caggatctgg ttgatgactc ggtcagcagc 300 c 301 <210> 232 <211> 301 <212> DNA <213> Homo sapien <400> 232 agtaggtatt tcgtgagaag ttcaacacca aaactggaac atagttctcc ttcaagtgtt 60 ggcgacagcg gggcttcctg attctggaat ataactttgt gtaaattaac agccacctac 120 agaagagtcc atctgctgtg aaggagagac agagaactct gggttccgtc gtcctgtcca 180 cgtgctgtac caagtgctgg tgccagcctg ttacctgttc ocactgaaaa tctggctaat 240 gctctngtgt atcacttctg attctgacaa tcaatcaatc aatggcctag agcactgact 300 g 301 <210> 233 <211> 301 <212> DNA <213> Homo sapien <400> 233 atgactgact tcccagtaag gctctctaag gggtaagtag gaggatccac aggatttgag 60 atgctaaggc cccagagatc gtttgatcca accctcttat tttcagaggg gaaaatgggg 120 cctagaagtt acagagcatc tagctggtgc gctggcaccc ctggcctcac acagactccc 180 gagtagctgg gactacaggc acacagtcac tgaagcaggc cctgttagca attctatgcg 240 tacaaattaa catgagatga gtagagactt tattgagaaa gcaagagaaa atcctatcaa 300 c 301 <210> 234 <211> 301 <212> DNA <213> Homo sapien <400> 234 aggtcctaca cattttattc tcaatttcag cgcctcatga ttgatcacca catcgagact atcatgatgc caacatactt cagcaagttc gcttaatggt catccatgat tttcttttgt ctcaatttct aatgtttttg cagatcatct caagcaaaga tttttctttt ggattgatct caggagtgcc atagttcttc
120
180
0
300 tgatatgaat ttcttctttt tcaggattta ccacctgact gcttcaatgg ttaaaaatta cgttttcttc aaatcttgag gaaccacttc cttcgtcagt
194 t 301 <210> 235 <211> 283 <212> DNA <213> Homo sapien <400> 235 tggggctgtg catcaggcgg gtttgagaaa tattcaattc tcagcagaag ccagaatttg 60 aattccctca tcttttaggg aatcatttac caggtttgga gaggattcag acagctcagg 120 tgctttcact aatgtctctg aacttctgtc cctctttgtt catggatagt ccaataaata 180 atgttatctt tgaactgatg ctcataggag agaatataag aactctgagt gatatcaaca 240 ttagggattc aaagaaatat tagatttaag ctcacactgg tca 283 <210> 236 <211> 301 <212> DNA <213> Homo sapien <400> 236 aggtcctcca ccaactgcct gaagcacggt taaaattggg aagaagtata gtgcagcata 60 aatactttta aatcgatcag atttccctaa cccacatgca atcttcttca ccagaagagg 120 tcggagcagc atcattaata ccaagcagaa tgcgtaatag ataaatacaa tggtatatag 180 tgggtagacg gcttcatgag tacagtgtac tgtggtatcg taatctggac ttgggttgta 240 aagcatcgtg taccagtcag aaagcatcaa tactcgacat gaacgaatat aaagaacacc 300 a 301 <210> 237 <211> 301 <212> DNA <213> Homo sapien <400> 237 cagtggtagt ggtggtggac gtggcgttgg tcgtggtgcc ttttttggtg cccgtcacaa 60 actcaatttt tgttcgctcc tttttggcct tttccaattt gtccatctca attttctggg 120 ccttggctaa tgcctcatag taggagtcct cagaccagcc atggggatca aacatatcct 180 ttgggtagtt ggtgccaagc tcgtcaatgg cacagaatgg atcagcttct cgtaaatcta 240 gggttccgaa attctttctt cctttggata atgcagttca tatsccattcc ctcctttatc 300 t 301 <210> 238 <211> 301 <212> DNA <213> Homo sapien <400> 238 gggcaggttt tttttttttt ttttttgatg gtgcagaccc ttgctttatt tgtctgactt 60 gttcacagtt cagccccctg ctcagaaaac caacgggcca gctaaggaga ggaggaggca 120 ccttgagact tccggagtcg aggctctcca gggttcccca gcccatcaat cattttctgc 180 accccctgcc tgggaagcag ctccctgggg ggtgggaatg ggtgactaga agggatttca 240 gtgtgggacc cagggtctgt tcttcacagt aggaggtgga agggatgact aatttcttca 300 t 301 <210> 239 <211> 239
195
<212> DNA <213> Homo sapien <400 ataagcagct ttctgtcaaa cataatacct attcagccag
239 agggaattct ccatgatact tagagatcaa tgagtagagt ttatttagta gagctttgtg gaaacattta gtgaatgcca atgtcctaac acaacccaga cacagttcaa gcatacacag ataaaagttc aataactaag ctgtttaaaa tatacaggtc acataactgc agaaggcaaa atagctcaac cttcaggga
120
180
239
<210> 240 <211> 300 <212> DNA <213> Homo sapien
<400> 240
ggtcctaatg gggatctgcc gctgggtgag ctzgccaggtt gctgtgggtg aagcagcagc ctccagtgga ccagatgact tttaaaatca tactttgatg ttccacattt accttttaag tctgttccct tgcttcatct aaaataccca taacgcaggt gaagaagtgg ggtcactttc tgaagcacac ctttgttggc ttacggtgat gcccaagcta ttcaatgggg ggtcacttca ctttctgaag actgtccttt agttccacat cgaatggggg ccctcctcac ctaCaatgtc
120
180
240
300
<210> 241
<211> 301
<212> DNA
<213> Homo sapien
<400> 241
gaggtctggt cctctttgga ctcctccatg tgtgaagaac tcctcctcct g gctgaggtct ggaaactcca tattggaaaa cagcctgagg gtcatacggt ctgggctagg gcagctatgt ctgcaaactg tgacagaaac ctctctcaag aagaggagtt tggtgtctct gactcaactg ggaagcaaac catcctttgt ctgtggagct gagggaatgc gaaggaagtg aggaacagcc tgtcaggggc ggaagccaga aacaaggctg ctgctgccag agtcttttct ctaaaaggga
120
180
240
300
301
<210> 242
<211> 301
<212> DNA
<213> Homo sapien
<400> 242
ccgaggtcct tgtggcattt gtcttcaaga cttaatatca taagtaccca a gggatgcaac cctcattttc atatatcatt acaaatatat aagttttata caatcactct tacáttgtag cctttttcac caagcaaact aatcaaaagc gtttcacgtg aatcaagagt tagaacccat ggaaggcaga cctaatgata acttttatca gtaaataaat tcaaaatata ataactacca accattttta ccatacaatt gtatatcgat agtcaagaat taatttagta gaattcaatc
120
180
240
300
301
<210> 243
<211> 301
<212> DNA
<213> Homo sapien
<400> 243
aggtaagtcc ggtggcccaa cagtttgaag gctatgaaat ctcaaaagat cagagggagg ccggtatgag cttcatctgg tcgacgacat actatgatgg
120 cataggctca gcctgtaaaa • · • · · · · ·
196 tgacgtgcag tcggactctg tggcccaagg gtatggctct ctcggcatga tgaccagcgt gctggtttgt ccagatggca agacagtaga agcagaggct gcccacggga ctgtaacccg tcactaccgc atgttccaga aaggacagga gacgtccacc aatcccattg cttccatttt t
180
240
300
301 • · · · ♦ · ·
<210> 244 <211> 300 <212> DNA <213> Homo sapien <400> 244 gctggtttgc aagaatgaaa tgaatgattc.tacagctagg acttaacctt gaaatggaaa60 gtcatgcaat cccatttgca ggatctgtct gtgcacatgc ctctgtagag agcagcattc120 ccagggacct tggaaacagt tgacactgta aggtgcttgc tccccaagac acatcctaaa180 aggtgttgta atggtgaaaa cgtcttcctt ctttattgcc ccttcttatt tatgtgaaca240 actgtttgtc ttttgtgtat cttttttaaa ctgtaaagtt caattgtgaa aatgaatatc300 <210> 245 <211> 301 <212> DNA <213> Homo sapien <400> 245 gtctgagtat ttaaaatgtt attgaaatta tccccaacca atgttagaaa agaaagaggt60 tatatactta gataaaaaat gaggtgaatt actatccatt gaaatcatgc tctcagaatt120 aaggccagga gatattgtca ttaatgtara cttcaggaca ctagagtata gcagccctat180 gttttcaaag agcagagatg caattaaata ttgtttagca tcaaaaaggc cactcaatac240 agctaataaa atgaaagacc taatttctaa agcaattctt tataatttac aaagttttaa300 g301 <210> 246 <211> 301 <212> DNA <213> Homo sapien <400> 246 ggtctgtcct acaatgcctg cttcttgaaa gaagtcggca ctttctagaa tagctaaata60 acctgggctt attttaaaga actatttgta gctcagattg gttttcctat ggctaaaata120 agtgcttctt gtgaaaatta aataaaacag ttaattcaaa gccttgatat atgttaccac180 taacaatcat actaaatata ttttgaagta caaagtttga catgctctaa agtgacaacc240 caaatgtgtc ttacaaaaca cgttcctaac aaggtatgct ttacactacc aatgcagaaa300
C301 <210> 247 <211> 301 <212> DNA <213> Homo sapien <400> 247 aggtcctttg gcagggctca tggatcagag ctcaaactgg agggaaaggc atttcgggta60 gcctaagagg gcgactggcg gcagcacaac caaggaaggc aaggttgttt cccccacgct120 gtgtcctgtg ttcaggtgcg acacacaatc ctcatgggaa caggatcacc catgcgctgc180 ccttgacgat caaggttggg gcttaagtgg attaagggag gcaagttctg ggttccttgc240 cttttcaaac catgaagtca ggctctgtat ccctcctttt cctaactgat attctaacta300 a301
197
<210> 248 <211> 301 <212> DNA <213> Homo sapien <400> 248 aggtccttgg agatgccatt tcagccgaag gactcttctw ttcggaagta caccctcact 60 attaggaaga ttcttagggg taatttttct gaggaaggag aactagccaa cttaagaatt 120 acaggaagaa agtggtttgg aagacagcca aagaaataaa agcagattaa attgtatcag 180 gtacattcca gcctgttggc aactccataa aaacatttca gattttaatc ccgaatttag 240 ctaatgagac tggatttttg ttttttatgt tgtgtgtcgc agagctaaaa actcagttcc 300 c 301 <210> 249 <211> 301 <212> DNA <213> Homo sapien <400> 249 gtccagagga agcacctggt gctgaactag gcttgccctg ctgtgaactt gcacttggag 60 ccctgacgct gctgttctcc ccgaaaaacc cgaccgacct ccgcgatctc cgtcccgccc 120 ccagggagac acagcagtga ctcagagctg gtcgcacact gtgcctccct cctcaccgcc 180 catcgtaatg aattattttg aaaattaatt ccaccatcct ttcagattct ggatggaaag 240 actgaatctt tgactcagaa ttgtttgctg aaaagaatga tgtgactttc ttagtcattt 300 a 301 <210> 250 <211> 301 <212> DNA <213> Homo sapien <400> 250 ggtctgtgac aaggacttgc aggctgtggg aggcaagtga cccttaacac tacacttctc 60 cttatcttta ttggctcgat aaacataatt atttctaaca ctagcttatt tccagttgcc 120 cataagcaca tcagtacttt tctctggctg gaatagtaaa ctaaagtatg gtacatctac 180 ctaaaagact actatgtgga ataatacata ctaatgaagt attacatgat ttaaagacta 240 caataaaacc aaacatgctt ataacattaa gaaaaacaat aaagatacat gattgaaacc 300 a 301 <210> 251 <211> 301 <212> DNA <213> Homo sapien <400> 251 gccgaggtcc tacatttggc ccagtttccc cctgcatcct ctccagggcc cctgcctcat 60 agacaacctc atagagcata ggagaactgg ttgccctggg ggcaggggga ctgtctggat 120 ggcaggggtc ctcaaaaatg ccactgccac tgccaggaaa tgcttctgag cagtacacct 180 cattgggatc aatgaaaagc ttcaagaaat cttcaggctc actctcttga aggcccggaa 240 cctctggagg ggggcagtgg aatcccagct ccaggacgga tcctgtcgaa aagatatcct 300 c 301 <210> 252 <211> 301 • · · · • ·
198 tatcaccata taaatgtata aatataagtc ctaccataat tttttagaat
<212 <213 <400 gcaaccaatc ttttctacat tcattccttt atatatcaag tttataaatc a
DNA • Homo sapi
252 actctgtttc tgtagaatca ttcactagga caaactggaa aaaagcccta acgtgacttt agagtgtaaa acccattcaa ggcagaataa atgataacca caatttgtgg tcgatgtctt aagaatctta ttagtataag tcaatcatca catttcctca caagaatata atatcaacaa tacccaaagt ctgtagaatc
120
180
240
300
301
<210> 253
<211> 301
<212> DNA
<213> Homo sapien
<400> 253
ttccctaaga caactaaaaa tggtctgat.t gatttttttt tccatagtgc g agatgttatt aaaaaaataa gttttcagac cttagagaac ccacagggta ttgttgggtt agaaaaaatg cttaaaatat cacaaaacat ttcctcacat ttgttccccc tgctgcgttc aaacttgttt aaaaggagca tttctccata tccatctcga tgaaaaataa cacaagcttt agtcggactg ggaaaatgct ttctcgtacc ctccttagct aatccatgtg aatacctgtt ttttcccaag
120
180
240
300
301
<210> 254
<211> 301
<212> DNA
<213> Homo sapien
<400> 254
cgctgcgcct aacttgacca ccaaatctct gaaaaaaata acttaaactg t ttcccútggg attcccttga tcatcttacc aagctttgga agccaggaaa ggaggggcaa agcgggtggg ctggtggact cttttcaagg agctgcagat ggccagaggg ttaaaccctg cctgactgta ttgcttaaca ttattaatgg ggtccaagtg taaatgggaa gaattttttg ggtactgaaa gtgtgttagt cagcacgagg caaaatcccc gttgaaacaa gactggcctc gtgcagtgcc
120
180
0
300
301 <210> 255 <211> 302 <212> DNA <213> Homo sapien <400> 255 agcttttttt tttttttttt tttttttttt ttcattaaaa aatagtgctc tttattataa attactgaaa tgtttctttt ctgaatataa atataaatat gtgcaaagtt tgacttggat tgggattttg ttgagttctt caagcatctc ctaataccct caagggcctg agtagggggg aggaaaaagg actggaggtg gaatctttat aaaaaacaag agtgattgag gcagattgta aacattatta aaaaacaaga aacaaacaaa Saaatagaga aaaaaaccac cccaacacac aa
120
180
240
300
302 <210> 256 <211> 301 <212> DNA <213> Homo sapien
199 aagtctaact aaaccatcca cagttatgac cctggtttgt tcagggtagg
120
180
240
300
301
<220>
< 2 21 > různé vlastnosti <222> (1) . . .(301) <223> n = A,T,C neboG <400 gttccagaaa aggaccctcc acccccaaaa aggcaaatag gtggcctctc t • 256 acattgaagg tccccacacc gcctggacac ctgctggcaa ggcctggtta tggcttccca tcaatccacc cttgagcaca actggcatta gcaagaacat agggataccc taatgcaccc caggacagac ggggatgggg cctaagttan cctctagcct agataggccc tcatctctat gggcaagtgt tcgtgttagt
<210> 257
<211> 301
<212> DNA
<213> Homo sapien
<400> 257
gttgtggagg tccccactta tcttacctag gtcacattac tcttaatctt c aactctggct tttttgtctt tccagtctac tcccttcagt cacatcttta tgctcattaa tcactatcgc cccctggagt gatttcttgt atcttatctc gtcctactga aggccttaga tagaatggcc agaagtgcca tttgactcct ttttcactat agaggtctac atcctgaagt atccctgaat ctttacaccg cccctgaatt ctgcctccag gaaaagtaat gccaccaaga gagaaggctc
120
180
240
300
301 <210> 258 <211> 301 <212> DNA <213> Homo sapien <220>
< 2 21 > různé vlastnosti <222> (1)...(301) <223> n = A,T,C nebo G <400> cagcagtagt aggggcccag cccagggcaa atgtctcggg tggtgatccc t
258 agatgccgta ccaccaggcg caagaatcca cattgaggct tgggagcgcc tgccagcacg cagaagcaag ataccaggac gtcaataana ggtggagtaa cccagcactc ataaacagta tgggcaaaat cgctgatccc cgttggtcca ccaggatcag ggctcaagac cttcaaagat ctgctgtatg tggaaagcag caccagcacc cagagccacc cttaacactg gtggtgtcat cgcccacaac
120
180
240
300
301 <210> 259 <211> 301 <212> DNA <213> Homo sapien <220>
< 2 21 > i různé vlastnosti <222> (1)...(301) <223> n = A,T,C ineboG <400> 259
200 tcatatatgc gtgtcctgaa gcaaagccat tccágctcac ccctcccatc c aaacaaatgc gtgatttgga aaggaagccc atctcatctg ttctcaagca agactangcc cccctgaggg aggattcctt catgcagcac gtgtccttgt tcaggcagag cagacaccta gtgatcagga ggaccggatg tgagccattt actaaaggac agtaggaatc agtgggccag cgcccactgg gcatccttgg atctcttggg ccagtgggaa gaaggtctgt gtcttggctt ctccaggtgg
120
180
240
300
301
<210> 260
<211> 301
<212> DNA
<213> Homo sapien
<400> 260
ttttttttct aaggtgtctt agaactgtaa tagggcaaaa actgagacat c ccctaaggaa aacttgaaaa cagccacagt taaataagtg cagtacctgc aaagaaggaa agattaggag tggccatttc tgtggaagcc ccgggcggcc caagtctcat tcactggttt atgccaatgg ctgataagtg gctcgagccg aaaaccaaat acaagttata cagcaaacaa cttaataaac aattctgcag aagcaatggt attgaatgaa caggattaac agactgattc atatccatca
120
180
240
300
301
<210> 261
<211> 301
<212> DNA
<213> Homo sapien
<400> 261
aaatattcga tctgcttcca agcaccaact ggtgacatcc ggcatgatga a gcaaatcctg tccacgattc attccataca aatttcttct tcatccaaag taactaatgt tagcaatgac attcatcagc gataatttag cccagtggtc gtctccataa ctctcggaca aggaaataaa attcctcaca acttactcca aaggctttga tcaaagctcc ggctcttcag accttcctag gactttctgc actcagtgaa tcttaaggtt aaggttcaat ttaagtgaag aatgaagatc
120
180
240
300
301
<210> 262
<211> 301
<212> DNA
<213> Homo sapien
<400> 262
gaggagagcc tgtgagcttc cctagacttc gggctttctg catcattacc tgttacagca ttgccgcaag ctaaaccaga gtgcacacct cccacattat tttgtaagca tctctcagaa tčctctgggg aattttgtgc aatgggatag cagaatactc atttaaaaag ctggaacctg atctttgccc attcagagca caggagtatt atgcaaatcc gcactctgca taaatcctgg gatactctcc tgtaattgtc ctgagtcacc tttgtaatga attagtgccc agcaaagaat
120
180
240
300
301 <210> 263 <211> 301 <212> DNA <213> Homo sapien <220>
<221> nrůzné vlastnosti <222> (1)...(301) <223> n = A,T,C neboG
ΦΦΦ • Φ Φ ΦΦ
201
Φ
<400> 263 tttagcttgt ggtaaatgac tcacaaaact gattttaaaa tcaagttaat gtgaattttg 60 aaaattacta cttaatccta attcacaata acaatggcat taaggtttga cttgagttgg 120 ttcttagtat tatttatggt aaataggctc ttaccacttg caaataactg gccacatcat 180 taatgactga cttcccagta aggctctcta aggggtaagt angaggatcc acaggatttg 240 agatgctaag gccccagaga tcgtttgatc caaccctctt attttcagag gggaaaatgg 300 g 301 <210> 264 <211> 301 <212> DNA <213> Homo sapien <400> 264 aaagacgtta aaccactcta ctaccacttg tggaactctc aaagggtaaá tgacaaascc 60 aatgaatgac tctaaaaaca atatttacat ttaatggttt gtagacaata aaaaaacaag .120 gtggatagat ctagaattgt aacattttaa gaaaaccata scatttgaca gatgagaaag 180 ctcaattata gatgcaaagt tataactaaa ctactatagt agtaaagaaa tacatttcac 240 acccttcata taaattcact atctcggctt gaggcactcc ataaaatgta tcacgtgcat 300 a 301 <210> 265 <211> 301 <212> DNA <213> Homo sapien <400> 265 tgcccaagtt atgtgtaagt gtatccgcac ccagaggtaa aactacactg ccatctttgt 60 cttcttgtga cgcagtattt cttctctggg gagaagccgg gaagtcttct cctggctcta 120 catattcttg gaagtctcta atcaactttt gttccatttg tttcatttct tcaggaggga 180 ttttcagttt gtcaacatgt tctctaacaa cacttgccca tttctgtaaa gaatccaaag 240 cagtccaagg ctttgacatg tcaacaacca gcataactag agtatccttc agagatacgg 300 c 301 <210> 266 <211> 301 <212> DNA <213> Homo sapien <400> 266 taccgtctgc ccttcctccc atcfcaggcca tctgcgaatc tacatgggtc ctcctattcg 60 acaccagatc actctttcct ctacccacag gcttgctatg agcaagagac acaacctcct 120 ctcttctgtg ttccagcttc ttttcctgtt cttcccaccc cttaagctct attcctgggg 180 atagagacac caatacccat aacctctctc ctaagcctcc ttataaccca gggtgcacag 240 cacagactcc tgacaactgg taaggccaat gaactgggag ctcacagctg gctgtgcctg 300 a 301 <210> 267 <211> 301 <212> DNA <213> Homo sapien <400> 267 aaagagcaca ggccagctca gcctgccctg gccatctaga ctcagcctgg ctccatgggg 60 gttctcagtg ctgagtccat ccaggaaaag ctcacctaga ccttctgagg ctgaatcttc 120 atcctcacag gcagcttctg agagcctgat attcctagcc ttgatggtct ggagtaaagc 180 ctcattctga ttzcctctcct tcttttcttt caagttggct ttccteacat ccctctgttc 240 aattcgcttc agcttgtctg ctttagccct catttccaga agcttcttct cttCggcatc 300 t 301
202 <210> 268 <211> 301 <212> DNA <213> Homo sapien <400> 268 aatgtctcac tcaactactt cccagcctac cgtggcctaa ttctgggagt tttcttctta 60 gatcttggga gagctggttc ttctaaggag aaggaggaag gacagatgta actttggatc 120 tcgaagagga agtctaatgg aagtaattag tcaacggtcc ttgtttagac tcttggaata 180 tgctgggtgg ctcagtgagc ccttttggag aaagcaagta ttattcttaa ggagtaacca 240 cttcccattg ttctactttc taccatcatc aattgtatat tatgtattct ttggagaact 300 a 301 <210> 269 <211> 301 <212> DNA <213> Homo sapien <400> 269 taacaatata cactagctat ctttttaact gtccatcatt agcaccaatg aagattcaat 60 aaaattacct ttattcacac atctcaaaac aattctgcaa attcttagtg aagtttaact 120 atagtcacag accttaaata ttcacattgt tttctatgtc tactgaaaat aagttcacta 180 cttttctgga tattctttac aaaatcttat taaaattcct ggtattatca cccccaatta 240 tacagtagca caaccacctt atgtagtttt tacatgatag ctctgtagaa gtttcacatc 300 t 301 <210> 270 <211> 301 <212> DNA <213> Homo sapien <400> 270 cattgaagag cttttgcgaa acatcagaac acaagtgctt ataaaattaa ttaagcctta 60 cacaagaata catattcctt ttatttctaa ggagttaaac atagatgtag ctgatgtgga 120 gagcttgctg gtgcagtgca tattggataa cactattcat ggccgaattg atcaagtcaa 180 ccaactcctt gaactggatc atcagaagaa gggtggtgca cgatatactg cactagataa 240 tggaccaacc aactaaattc tctcaccagg ctgtatcagt aaactggctt aacagaaaac 300 a 301
<210> 271
<211> 301
<212> DNA
<213> Homo sapien
<220>
<221> různé vlastnosti
<222> (1) . . . (301)
<223> n = Α,τ,c nebo G
τ taaatatttg gttcatgctt gctccaattc ccttggtgac cccacatttt atagaacatt cccttgctgt tctataaagt tgccttcacc gggttttata ctttctcatt tcttgatcca gggtccaagg ccatganggt gaagcagtca
203 <400> 271 aaaaggttct tttatagctc gaattgcaat tgaaccacag tctctcctcc cataagatta atctttaggg cacttcatca agccacagca agatganaac acaatttaaa ttgatattca gcctgtattc cacctctttc tgatcatgcg
120
180
240
300
301
<210> 272
<211> 301
<212> DNA
<213> Homo sapien
<400> 272
taaattgcta ttatcagaaa tccaataatt gcatcttctc ctaaggactt 9 agccacagat accaaatgag ccctcatgat caacaaatat ccattgcatc aacaccaatc cctggaatct gagcaagaaa aaccttgagt tcctacaata aaatggaaca tcataatacc aattctttgc ggcttcttgt ttttctctac aatcactgtc taaacatgcc gcacccctcc aatctatgtt gcaccactag ttcaaatgtc gtatttagga tgcatccaca ctttgttttc aattaagcag
120
180
240
300
301 <210> 273 <211> 301 <212> DNA <213> Homo sapien <220>
< 2 21 > i různé vlastnosti <222> (1) . . . (301) <223> n = A,T,C neboG <400> acatgtgtgt agagangctg gaaccgtcta ttyttcctgt gggacttnty t
273 atgtgtatct ggacatggat aaaataaaat ccagagagag tttacngagm ttgggaaaan aatcacwtaa ttaccatgtc tatcagtgac accctgcccg aanaagacat tttgctayta dtatattcct ananatttma sgcgccctcg cttgtttayt tyactttaat tatagtatgc gggtgaamac makcngantt atttttttgg ctgactygaa ttatttcacc atgmattggt ccgcsananc
120
180
240
300
301 <210> 274 <211> 301 <212> DNA <213> Homo sapien <220>
< 2 21 > různé vlastnosti <222> (1) . .. (301) <223> n = A,T,C nebo G <400> cttatatact aacagtaaat tgattctctt tctaggtatg aattgtgctt
274 ctttctcaga gattattaga tggaatctga gttgcattct cttttgataa ggcaaaagag gagaangaat atgagatcaa cgtcttcttt gaagctttct ttctttgagg aacttgtaaa gaaaagtcca aaccgaaggc aganaaagtc
120
180
240
300 gagatgggta ggaccaagga gaggccagct tccgcagtag tggtcatatc atgtagacaa gacagaaatt ttagcttgtg ataatgaggt aggaaattcc
204
301 <210>
<211>
<212>
<213>
275
301
DNA
Homo sapien <220>
<221>
<222>
<223>
různé vlastnosti (1) . . .(301) nebo G η = A,T,C <400> tcggtgtcag gggtgaaatt ' tggcccttct . tcaagagact < agatatccat a • 275 cagcacgtgg ggccaacttt aataaaagaa cccaggcctc cacactggcg cattgaacat ctatcaactt aattgaaagg agcgtacctg gncgctcgan tgcaatgtgg atgttggcaa tttctcacta cccgggcggc catgcatcta agcccaaacc ttttgccacc aacggaatta cgctcgaagc gaaggnccaa acagaaaatg aacagtaagc agtagtggag cgaattctgc ttcgccctat
120
180
240
300
301
<210> 276 <211> 301 <212> DNA <213> Homo sapien
<400> 276
tgtacacata ttatcatgtg taaagagaca caatacattt aaaactattc 9 ctcaataaat acttctaatt gaagatagac aaacatttgg agtacgtttc aaatgactgc agaaaatgta actaacagat gaaatgaggg ccttgcttca attgtggtat tccaaaagca aaggcaactt ggacaaatgg tgtctgagaa tattactata aaacagcaga atacattgag aagccagatc ggctctcctt ctgattatat tatacaaaat aatccaaatc aaatttgtgt caatggggat
120
180
240
300
301
<210> 277
<211> 301
<212> DNA
<213> Homo sapien
<220>
<221> růzm évlastnosti
<222> (1) . . . (301)
<223> n = A,T, C nebo G
<400> 277
tttgttgatg atacagagga gaatcatggc caccatagtg gttcnctgtc c tcagtatttt cttggaggaa actcctgata gggagactaa gattacatct attacttgcg gcagagcaac ctttcccaaa agtggccacg gaccagtctc ttatgagtgc tgaatttaat tcaacactct gatttgcctt ctttttccga tcacctggga ttaaaagaag caatgcccca angtgtgcag agtccntccg aattctaaag gaaaacattg ccctcgtcct tgcgctctga ttcaatctcg
120
180
240
300
301 <210> 278 <211> 301 <212> DNA <213> Homo sapien • 49«
205 <220>
< 2 21 > i různé vlastnosti <222> (1)...(301) <223> n = A,T,C tneboG <400> taccactaca aacatatcaa cagtctctac aatgaacatc tatgtgttct c
278 ctccagcctg atgaaacagg tgttattatg tcatgtgtgc tcgtaacttt ggcaacagag gaaaatgaag cattacctgg tcacaatgtt atggantagg caagacctgt ctgacaattt gaatttatat ctggcactat tactcggccg ctcaaagcat atggaagcca aagcccttaa tataagtgct cgaacacgct aaaatggaat gggcttgtca taataatgcc tcacaggttt aagccgaatt
120
180
240
300
301 <210> 279 <211> 301 <212> DNA <213> Homo sapien <220>
<221>různé vlastnostře <222> (1) . . . (301) <223> n = A,T,C neboG <400 aaagcaggaa gttatattaa ttagacctxtt atacatgtgt catctgtttt a
279 tgacaaagct ttgccaatat accttccagc agttccaaag cacatgaaat tgcttttctg aagtaaatat cacccoacag cacataagct gccacacaca gtatgttcta agattatata tgcttgatat agaanaanaa tagaactcca ggtgtattgt tgtatagtgt ttcagagtca atatttctag acatcaattt gacttttact ttcacaaagc gtcattggtt ggagcactac cattgcacag
120
180
240
300
301
<210> 280
<211> 301
<212> DNA
<213> Homo sapien
<400> 280
ggtactggag tagaaaggtg tgagaaaaaa gtttgatata cagactatta t ttttcctccc gtggaaccaa acctaagatt gtttagggtt actccacagt ctgtgaaaac attgtggtca agcccaggta ggggttagac taattaagga gtaactactg atggaaatag gttgcctgta taagatctaa ggtatgttcc ttgggagtga gagaatatgg acttcagttt attacaccag atgtttattt attgaggatg ttctcactct ttctgcctgg gacaaagaga gttaaagcag
120
180
240
300
301
<210> 281
<211> 301
<212> DNA
<213> Homo sapien
<400> 281
aggtacaaga gccgagcaat atgtggtagc tgtgtagcac aggggaatgg ccaaatcctg aatggcttta actgcgatta gaaagagctg aatgaagggg tcgggttata cagctaaata ttggatattc ctgaatctca tggagagaaa tttgcatttc
120
180
240 ctgctgtggc catcttctga cggatgagaa acccgtattt attgttcaac aaaaggagat gaactccctt gtgtgtcacg tgacaagtga aacaggatct tacgatggag ttttgtatga aaacaaagtt gcagtacctc • 94 44 44·* 444 • 9 44 99 9 9944 *4* 9 1 ·999 ο η Γ 99 ♦ 9 ♦ 99 99 99
Z U Ό 9 9 4 999 999
99999 99 4 9 «494
300
301 <210> 282 <211> 301 <212> DNA <213> Homo sapien <400> 282 caggtactac agaattaaaa tactgacaag caagtagttt cttggcgtgc acgaattgca 60 tccagaaccc aaaaattaag aaattcaaaa agacattttg tgggcacctg ctagcacaga 120 agcgcagaag caaagcccag gcagaaccat gctaacctta cagctcagcc tgcacagaag 180 cgcagaagca aagcccaggc agaaccatgc'taaccttaca gctcagcctg cacagaagcg 240 cagaagcaaa gcccaggcag aacatgctaa ccttacagct cagcctgcac agaagcacag 300 a 301 <210> 283 <211> 301 <212> DNA <213> Homo sapien <400> 283 atctgtatac ggcagacaaa ctttatarag tgtagagagg tgagcgaaag gatgcaaaag 60 cactttgagg gctttataat aatatgctgc ttgaaaaaaa aaatgtgtag ttgatactca 120 gtgcatctcc agacatágta aggggttgct ctgaccaatc aggtgatcat tttttctatc 180 acttcccagg ttttatgcaa aaattttgtt aaattctata atggtgatat gcatctttta 240 ggaaacatat acatttttaa aaatctattt tatgtaagaa ctgacagacg aatttgcttt 300 9 301 <210> 284 <211> 301 <212> DNA <213> Homo sapien <400> 284 caggtacaaa acgctattaa gtggcttaga atttgaacat ttgtggtctt tatttacttt 60 gcttcgtgtg tgggcaaagc aacatcttcc ctaaatatat attaccaaga aaagcaagaa 120 gcagattagg tttttgacaa aacaaacagg ccaaaagggg gctgacctgg agcagagcat 180 ggtgagaggc aaggcatgag agggcaagtt tgttgtggac agatctgtgc ctactttatt 240 actggagtaa aagaaaacaa agttcattga tgtcgaagga tatatacagt gttagaaatt 300 a 301 <210> 285 <211> 301 <212> DNA <213> Homo sapien <220>
<221> různé vlastnosti· <222> (1)...(301) <223> n = A,T,C nebo G <400> 285 acatcaccat aacgaccatt gatcggatcc agtgttttaa cccacccatt aaaaaatact atacgttgta gaaaactcct aatactcttc aatctctaac
120 tgcttacata tctgcatccc
aagccctccc cacgactagg tgtgaacacg
180
240
300
301
207
·> ·· ···· ·«
•» · • · « • ·
·· fc · · • ·
• « • · • · · • « ·
• fc • fcfc fc fc
fcfc · • fc ·· 4 fc*
caggaaagca attaaatatg caaaagctgt t aatgctattt tctgacttct ttgaagagtc acagacctgc tttgaggtca aaagccccca tcaaacnaaa caaatgctat atttctggac ctatttctgg ttacgatctg cctgtaacag
<210> 286
<211> 301
<212> DNA
<213> Homo sapien
<400> 286
taccactgca tgtatattat atcaaaatgt aaaataagct gtttctgttc t ttccagcctg ttttgcctta gtcatgccag accacatagc attgtgtatg ggtgacagag cagtggatca taagagatgt ttataagtct cttcatcacc tgagactccg ttctagtagg tatattcttt caaatttttg tatattaggc tctccaaaaa aaaggacagt tctcatttct ccttttacta aaattccatt aaactttgct aagatttttt tccccaccca aaatgtgatt ttttcccttg
120
180
240
300
301
<210> 287
<211> 301
<212> DNA
<213> Homo sapien
<400> 287
tacagatctg cccagaagga aaatgatttg ccgtggttat gttgcatgtc t ggaactaaat acgtagagat gttatgaacg ctcctcccca ttgtgaagcc attaaaaatg cagatattac cacagtttag gcttggctgc atcaagattt agtgtggctg aacagctttg gcagcagggc ctcatgttat tctcgtctgt gatatatgga ttttgagggt cagaatcctg cacagtattc tttcctctca gaatgttggg tagaaatatg accctctgcc cattttgttt ttggtsaatgc
120
180
240
300
301
<210> 288
<211> 301
<212> DNA
<213> Homo sapien
<400> 288
gtacacctaa agtcaacagg gatctttaaa aaaagcatct tctgccttaa ctgcaaggac aagacaaatt gacaatttca gcttttgtga ttttggatga agctgaggaa ccagttccag agagaatatt tttaatttag atgcatgatg tgtaatgggc ctcagtctgg tccttaaagt ctcatctggc gaaattcaat agccgctttt gtatctgcaa tggcaatttg cactggaaga aatttagaaa aaagaagtag agctgcaaaa gagatcatac atccaaacag gttaaaaaaa
120
180
240
300
301 <210> 289 <211> 301 <212> DNA <213> Homo sapien <220>
< 2 21 > i různé vlastnosti <222> (1) . .. (301) <223> n = A, T, C neboG <400> 289 • ·· ·· φ · · · • ·· · · • · · · · · • · · · · ·«· ΛΦ ·· cattgctacc atttaactct ctttgacaaa tgcccatggt ttccaatgct tggaaactta atcatctttg cctgacttaa aagagaaaga aaccagngga φ* ····
208 ggtacactgt gcttttgatg ccaagtaaga cgttctataa tgtgttttgt a ttccatgtta tccccaagta gtggtggcct atgaatgtgc tttggactct tgtttctaca gtccaccttc atttcagctg tgaagcaaag ctgtggtccc tcagtgctcc ttgaaaccgt atgactggct ggcggcgaan gtgggtttcc
120
180
2.4 0
300
301 <210> 290 <211> 301 <212> DNA <213> Homo sapien <220?
<221> různévlastnosti <222> (1)...(301) <223> n = A,T,C neboG <400 acactgagct tgactgatct ttctgaccťc gagttctatc cgccttgaac a • 290 cttcttgata gttcatttct cttttctaat aagaggcaga aaaaacattt aatatacaga ctcacagctc cacagtaggg aacagcacag ctccatgtct atgcttggca ttacccccaa atagaggcag aatcccagtt cattttcttc tatacaagat aagcttttcc anccacctac ttaccattcg atgcctcaag
Cctatactac accctaagtg aatgaacatg ctagcagtgc taacagtgag
120
180
240
300
301
<210> 291 <211> 301 <212 > DNA <213> Homo sapien
<400> 291
caggtaccaa tatatcagct tttactcttt agccatggct acatgagctt a tttcttctat agattttttt tgtttatagg gtttacttca cacttcccca cctagaaaca tctatgcttt tgaatcacaa tttaatttat ctaactaatt tttcatttta acctgctatg aacgtatttt ttagcataaa agcatctgtt tgttgttgaa gaaaatttga tatgtattct gacattatga atttcttaac acataacaac cacattctgc gtagttcaat aaaggcctaa cgtaatgcct
120
180
240
300
301 <210> 292 <211> 301 <212> DNA <213> Homo sapien <220>
< 2 21 > různé vlastnosti <222> (1) . . . (301) <223> n = A,T,C neboG <400> 292 accttttagt agtaatgtct aataataaat aagaaatcaa ttttataagg tccatatagc tgtattaaat aatttttaag tttaaaagat aaaataccat cattttaaat gttggtattc aaaaccaaag natataaccg aaaggaaaaa cagatgagac ataaaacgat ttgcnagatg ggaaatatag tasctyacga atgttnatta aattccagtt ataatagtgg ctacacactc tcactacaca cacagacccc acagtcctat atgccacaaa cacatttcca taacttgaaa a
120
180
240
300
301 * · · · • ·
209.
<210> 293 <211> 301 <212> DNA <213> Homo sapien
<400> 293
ggtaccaagt ttgtgtagtc aacacaaacg gtgagaattt ccgcgaccac gctggtgcca acttctgatt tcactagcaa tttaaaaggc gctaagccga gcctgttacc ctgacaatca agtagcaaca tacttgtata attctgcaga tgttctcact atcaatcaat gctttaagtc ataacccttg tatccatcac gaaaagtctg ggcctagagc taaatacaaa tcatttttaa actggcggcc gctaatgctc actgactgtt gctgttctgt tgtacctcgg gctcgagcat
120
180
240
300
301 <210>
<211>
<212>
<213>
294
301
DNA
Homo sapien <220>
<221>
<222>
<223>
i různé vlastnosti (1) . . . (301) n = A, 1, C nebo G <400> tgacccataa attcaataaa tttaactata ' tccactactt cccaattata t
294 caatatacac attaccttta gtcacaganc ttctgggata cagtagcaca tagctatctt ttcacacatc ttaaatattc ttctttacaa accaccutat tttaactgtc tcaaaacaat acattgtttt aatcttatta gtagctttta catcattagc tctgcaaatt ctatgtctac aaattcctgg catgatagct accaatgaag cttagtgaag tgaaaataag tattatcacc ctgtagaggt
120
180
240
300
301
<210> 295 <211> 305 <212> DNA <213> Homo sapien
<400> 295
gtactctttc cacatttcac ttggtttgtg actggtagaa tctcagaacc tctct tctcccctcc tgtgatgtat aatccatctt aaacrtctga atttcaccca tctgaattta attgtgttgc gctttttccc agagctagtc gacagcccgt attctttcaa aaaaaaaaaa cattggaact tatcagcatc ttctatcctg cttgcaattt gtgtctttgt agtcattaac tgacaggtga tttaataaat gcaaggatta tcaaaattac ccatctctga attggatggt tagtttgggt
120
180
240
300
305
<210> 296
<211> 301
<212> DNA
<213> Homo sapien
<400> 296
aggtactatg cacctagtag attaaataga tttgaaaaag ggaagctgct taaactaaaa attaataaac tgattgaacg aaaataatat ataaactgaa caatacgagg aaccacttag ttgatagtaa actttatgga aaacatgaaa ctttcagatg
aagtatgtaa tgtgctatct 60
atctgaagtt attttccttg 120
ccatgcaatc tactatcaac 130
atgaacactg ataagtcatt 240
• ·
210
300
301 tgtcattact ataaatttca aaatctgtta ataagatggc ctatagggag gaaaaagggg c
<210> 297 <211> 300 <212> DNA <213> Homo sapien <220>
<221> různé vlastnosti?
<222> (1)...(300) <223> n = A,T,C tneboG <400> 297 actgagtttt aactggacgc caagcaggca aggctggaag gttttgctct ctttgtgcta aaggttttga aaaccttgaa ggagaatcat tttgacaaga agtacttaag agtctagaga acaaagangt gaaccagctg aaagctctcg ggggaanctt acatgtgttg ttaggcctgt tccatcattg ggagtgcact ggccatccct caaaatttgt ctgggctggc ctgagtggtc accgcacctc ggccgcgacc acgctaagcc gaattctgca gatatccatc acactggcgg <210> 298 <211> 301 <212> DNA <213> Homo sapien <220>
<221 > různé vlastnosti:
<222> (1) . . . (301) <223> n = A,r,c nebo G <400> 298 tatggggttt gtcacccaaa agctgatgct gagaaaggcc tccctggggc ccctcccgcg ggcatctgag agacctggtg ttccagtgtt tctggaaatg ggtcccagtg ccgccggctg tgaagctctc agatcaatca cgggaagggc ctggcggtgg tggccacctg gaaccaccct gtcctgtctg tttacatttc actaycaggt tttctctggg cattacnatc tgttccccta caacagtgac ctgtgcattc tgctgtggcc tgctgtgtct gcaggtggct ctcagcgagg t <210> 299 <211> 301 <212> DNA <213> Homo sapien <400> 299 gttttgagac ggagtttcac tcttgttgcc cagactggac tgcaatggca gggtctctgc tcactgcacc ctctgcctcc caggttcgag caattctcct gcctcagcct cccaggtagc tgggattgca ggctcacgcc accataccca gctaattttt ttgtattttt agtagagacg gagtttcgcc atgttggcca gctggtctca aactcctgac ctcaagcgac ctgcctgcct cggcctccca aagtgctgga attataggca tgagtcaaca cgcccagcct aaagatattt t
120
180
240
300
120
180
240
300
301
120
180
240
300
301 <210> 300 <211> 301 <212> DNA <213> Homo sapien
211 <400 attcagtttt tatgtcccac gctgcattcc gtaaagcaag tataaagcct g • 300 atttgctgcc acccactggg acaaggttct accatgacat gcctctaaca ccagtatctg aaaggctccc cagcctaatg tcccccacgg gtccttgctt taaccaggag acctggctac agtttcacta aaatcagagt cttcacacca tgccacaaaa ttcctctatc cctgccagtc ttgccccacc atcccgagcg tcttgccaga agctgggtca tcaaaactta gtcttgttac catcccccat
120 íeo 240
300
301
<210> 301
<211> 301
<212> DNA
<213> Homo sapien
<400> 301
ttaaattttt agaggacccc gggaactcac ctcagagctg cacaacagca t gagaggataa aggtctccaa aaagaccctc agacacccac cctcgttcag aaaggacaaa gcaaccacat agagctgaga aacagtggga ctgccacatg taatctagaa ggtcaagggc cacccacaac gctcacaaag tgtgaataag atgtgtcttc atgaataatt agtgggagct accctcagag gatgcaatgt ttcagtctgc aaaagttggt cacaaagacc ctgagacacc ccagaagtgt
120
180
240
300
301
<210> 302
<211> 301
<212> DNA
<213> Homo sapien
<400> 302
aggtacacat tgaattctga ttgagttggt ccacatcatt caggatttga g ttagcttgtg aaatcactac tcttagtatt aatgactgac gatgctaagg gtaaatgact ttaatcctaa atttatggta ttcccagtaa ccccagagat cacaaaactg ttcacaataa aataggctct ggctctctaa cgtttgatcc attttaaaat caatggcatt taccacctgc ggggtaagta aaccctctta caagttaatg aaggtttgac aaataactgg ggaggatcca ttttcagagg
120
180
240
300
301
<210> 303 <211> 301 <212> DNA <213> Homo sapien
<400> 303
aggtaccaac atattgtttt tggctaatgg agtaacgggt catcgatttt tgtggaaata ttgacagttt aactaccgct atgtttttct atatctgggg ggtačjaggat aacacatctt tgcatgttaa aactgatctt tctagaaaag cattttttct cttctgtcag aaatggtggt ttgctcgttc gagttaatct ttccatatca agatcctttc ttgtgaaatg caaagggacc gttttccctc actaagttgt acaatagcac atcataggcc tcaagacttc ataaattcac
120
180
240
300
301
<210> 304 <211> 301 <212> DNA <213> Homo sapien
<400> 304
acatggatgt tattctgcag actgtcaacc tgaatttgta tttgcttgac atcgcctaat ·« ···«
4 ttgtctgcaa cacattggtt ggccatatgt tgaagattct catgcaraas tgtgccatta ctccactgca ttgagatgag agacagtgcc ctggtgcagt aaattactga gtatatatct
212 tattagtttc ctttttagtg gactttcagc ttttcctttt c agtttcagct tatcatatca cacttgggta gtaattaata tacccacttt ggaatcatct aggtggagtt agtgtgtgtg
120
180
240
300
301 <210> 305 <211> 301 <212> DNA <213> Homo sapien <220>
<221> nrůzné vlastnosti <222> (1)...(301) <223> n = A,T,C nebo G <400 gangtacagc cagggggaca taaaggagga aatattggta ttctgggatt a • 305 gtggtcaagg gacctggaca gaaacagata gaaacaagaa taagttggat taacaagaag gacacgttgt caaaatctcc tacattcata accaangaaa aaaaaaatgt catttgctgc aactcagtat tggcaaataa ttgtattaaa gagtggcatc tgtgggtagg taaggtattc ctaaccatgg agagctgttc ctgggatgag aaaatgggcg tcatgcctag tggaacaaaa atggaataag
120
180
240
300
301 <210> 306 <211> 8 <212> PRT <213> Homo sapien <400> 306
Val Leu Gly Trp 1
Val Ala Glu Leu <210> 307 <211> 637 <212> DNA <213> Homo sapien <400: acagggratg ttgtgatcag attgaggaat cacaccattg cacatagcac gcaggaggac aagaagcaag tttccgtggg actcatcagg ggtgggagcc ttacagatac • 307 aagggaaagg gtggtctatg gatacttgag gtgagggagg cggagatatg gcttgcacac gactgttaga ggaatgtcat ctgagaacct tttcccagtg tggggcagca gagaggatga gggcttatcc ccchaagagc gattaccacc agatcaacag catgcaggat ggcaggcttt ggtcttgctt tgtggaatgc ggtgtgggac aataaaactg ggaagccccc ctacaaagaa attcaatcat ctggggttat tttcttagcc gacatggggg atagtaacaa tactaagttt acttgaccca atatctggca aatcttg ctggggattt gaatccagaa tgttttattt gaagatggtt atagagattc atgcgctcgg gacggtgggg tgagactggc sctgatagag agattttgtg ggtttggtcc ataggggcac gccttmtttt gaacacccca acagcccaga gattggtgtg caaactctga aggtagtgaa gaagtagcca gcactcctgg
120 180 240 300 360 420 480 540 600 637 <210> 308 <211> 647 <212> DNA <213> Homo sapien • ·* «··· ·· ···· * · 9 «·· • ·· · · · 4 ♦ • · ··· · · · · ·
213 <220>
<221> různévlastnosti <222> (1).7.(647) <223 > n = A,T,C neboG <400> 308 acgattttca ttatcatgta aatcgggtca ctcaaggggc caaccacagc tgggagccac60 tgctcagggg aaggttcata tgggactttc tactgcccaa ggttctatac aggatataaa120 ggngcctcac agtatagatc tggtagcaaa gaagaagaaa caaacactga tctctttctg180 ccacccctct gaccctttgg aactcctctg accctttaga acaagcctac ctaatatctg240 ctagagaaaa gaccaacaac ggcctcaaag gatctcttac catgaaggtc tcagctaatt300 cttggctaag atgtgggttc cacattaggt tctgaatatg gggggaaggg tcaatttgct360 cattttgtgt gtggataaag tcaggatgcc caggggccag agcagggggc tgcttgcttt420 gggaacaatg gctgagcata taaccatagg ttatggggaa caaaacaaca tcaaagtcac480 tgtatcaatt gccatgaaga cctgagggac ctgaatctac cgattcatct taaggcagca540 ggaccagttt gagtggcaac aatgcagcag cagaatcaat ggaaacaaca gaatgattgc600 aatgtcctxt tttttctcct gcttctgact tgataaaagg ggaccgt647 <210> 309 <211> 460 <212> DNA <213> Homo sapien <400> 309 actttatagt ttaggctgga cattggaaaa aaaaaaaagc cagaacaaca tgtgatagat60 aatatgattg gctgcacact tccagactga tgaatgatga acgtgatgga ctattgtatg120 gagcacatct tcagcaagag ggggaaatac tcatcatttt tggccagcag ttgtttgatc180 accaaacatc atgccagaat actcagcaaa ccttcttagc tcttgagaag tcaaagtccg240 ggggaattta ttcccggcaa ttttaattgg actccttatg tgagagcagc ggctacccag300 ctggggtggt ggagcgaacc cgtcactagt ggacatgcag tggcagagct cctggtaacc360 acctagagga atacacaggc acatgtgtga tgccaagcgt gacacctgta gcactcaaat420 ttgtcttgtt tttgtctttc ggtgtgtaag attcttaagt460 <210> 310 <211> 539 <212> DNA <213> Homo sapien <400> 310 acgggactta tcaaataaag ataggaaaag aagaaaactc aaatattata ggcagaaatg60 ctaaaggttt taaaatatgt caggattgga agaaggcatg gataaagaac aaagttcagt120 taggaaagag aaacacagaa ggaagagaca caataaaagt cattatgtat tctgtgagaa180 gtcagacagt aagatttgtg ggaaatgggt tggtttgttg tatggtatgt attttagcaa240 taatctttat ggcagagaaa gctaaaatcc tttagcttgc gtgaatgatc acttgctgaa300 ttcctcaagg taggcatgat gaaggagggt ttagaggaga cacagacaca atgaactgac360 ctagatagaa agccttagta tactcagcta ggaatagtga ttctgagggc acactgtgac420 atgattatgt cattacatgt atggtagtga tggggatgat aggaaggaag aacttatggc480 atattttcac ccccacaaaa gtcagttaaa tattgggaca ctaaccatcc aggtcaaga539 <210> 311 <211> 526 <212> DNA <213> Homo sapien
·· r
« · 4 • • · • · • · « · • • · · • · V · * * • · • · * · « · r · · • 9
·· · • t ·· ·· ť 99
214 <220>
<221> různé vlastnosti <222> (1) .. . (526) <223> n = A,T,c nebo G <400 caaatttgag ttttgacgtt catttacagc attaaacatg tttttcacaa aaaatgggga tctctttaca acagcaagag agttctataa
311 ccaatgacat ttctctaaac atttaaaatg gaataaagat gtgaagcatt aactctgaag gggagctcct cttctcatct actgtagtnt agaattttac tactaaagag tgttcagcat ttgtccttaa cttataaagt ggttttaagt gcagccccta aaaccctttc acttatttta aaatcaagaa gcattaatga gaaatattag atataatcta gtcataacct atcttacctg cagaaatgag cctttttagt atccccaaag gcttattctg tccataaatt ctacagggga caagaagact ttttggggaa aagctacaga tggctgagat atctgtgtat cacagt gggccatttc atattatcta agctaaataa ttgatattcg actatgggaa ctccataacc tcttgattgc caagtataaa
120
180
240
300
360
420
480
526 <210> 312 <211> 500 <212> DNA <213> Homo sapien <220>
< 2 21 > r různé vlastnosti <222> (1) . . . (500) <223> n = A,T,C neboG <400> cctctctctc tcatttctga ccatttctct gcattaagga gcttcttagg tgcagatgtc tgctaatgtg ctgaacgtgt tagtcttaat
312 cccaccccct aagcagttga ttcccttcca cattatgctt aaaatatttt tagcagcttc gtttcctttg ggtaaagatt tatctattgg gactctagag gccactttat cctgccagtt cttcgattct tcttccaaaa agacatttgg taaaccanga tttgtgtttg aactgggttt tccaaagtac ttgctgactc gaagacaggc tcagtaggaa ttaagaaccc ttcttatttg aatataggag tctcccagta actgcagatg tcaacttgtc cctgctcatg atctaaactt atgggaaaaa nctggtatag aaatcagttt ctccagcaat ttcaaactct atgagtgtaa gatgactctg atcccctctt aaaaaatcct aatatcagct gctgaaaagt
120
180
240
300
360
420
480
500 <210> 313 <211> 718 <212> DNA <213> Homo sapien <220>
<221> různé vlastnosti <222> (1)...(718) <223> n = A,T,C neboG <400> ggagatttgt tgatgataca ctgctgaaat gtagtgacat aaaaggaagc gcctcgccct ttccttaaag
313 gtggtttgca gaggtgagaa ggagataatt gtttttgcac acagagatcc gtgcctgntc gatggcagga gccgagggag ataagaaagg aacatcacta atttccagcc ctgggagaaa ccgcttgtga aaacagatcc accaggaaga ctgctgactt gaaacagcaa cttttaaata tgcccggccg gggaaggaca tgttgtggat gggaaggacc ggccacacat taatgtctaa caggaagcac tcatcgatga aattgatgtg acgggattac
120
180
240
300
360
420 tctgcatggt taccatctga gatgacaata tccacacaca ccatcttggg ttagaaaatg atttatttga • · • · · · • ·
215 agatttgaaa cttgatggtt aactggggag cgttatacca ttcttntggc tgaagtcaca cacaagacat gagataccac atcatttcta ccacattttc aagtgagcat gcaacaaaca ggggcagagg tttctaccct atnatccacc taccaatgag aaatggaata tcaggattct caaacaagct ccntcntttt aggaaaacag ctgtgatgac ggccctgctg gtngaatatc aannttantc acgagaaaat acgagcagcc cctaactgtg tgacttacgg caaantgt
480
540
600
660
718
<210> 314
<211> 358
<212> DNA
<213> Homo sapien
<400> 314
gtttatttac cataatcaaa caacatgtgt gctctcggta ttgttgtatt tctggggcat attacagaaa tatagctgta agatctcttg gtccagccac gctgaactgt ttccttgtga aaacatcaag gtacatgttt tcttattctt tgtgaaacat agtgccctgt tgcagaggac acaatgtata tcattggtgt ttgtctataa gctcccttta attttgcttc caccacacag ctatttcaaa agattaccac tactgtattg gattaacctc tgtctgtgaa atgacagcaa tatatccata aaatgcaagg tgtagtccaa gtggacgctc ttctgttgct tctgaatt
120
180
240
300
358
<210> 315 <211> 341 <212> DNA <213> Homo sapien
<400> 315
taccacctcc ataggtgatg gacccccatt agtcaccagc tagcttctgc gagggggcgg ccgctggcac atgaggacat ctgaagatgt tccccgacca tgtaagaggg tagatgcagc tgatgagccg ggaatgggcc ctggaacctc gccggatatc tgttgtcccg acatggtgaa catcaccatg cccaaggatg taccagcagg gtccttaggg ggggctcgtg gcagatgatg gtcaccagca gtctgtccaa atgatgatag gtcatgtagg cggttattgg t ccatgaaggc agaagcgagt ccccaatgac cttcctgaag tcctgggctt
120
180
240
300
341
<210> 316
<211> 151
<212> DNA
<213> Homo sapien
<400> 316
agactgggca tgtgggcctt cattcaggga agactcttac tctcgagttt gctctggttg gccccacact ctgattataa caatattagt gcaatttggt acaccactgg t cttgttgccg agcgatgtgt tatccattta tgactggact
120
151
<210> 317 <211> 151 <212> DNA <213> Homo sapien
<400> 317
agaactagtg atcttcattt ccagggctct gatcctaatg atctctggcc gttcttgcca aaatacctga ttaaccctgg cacctgcttg aatggctcaa agatcccagg
120
151 <210> 318 <211> 151 <212> DNA aacatatatt ctcctgaggc a
ggcatttatc tgcggccagc • · <213> Homo sapien <400> 318 actggtggga ggcgctgttt agttggctgt gctgcaggct ggagtgtctt tattcctggc tgggggcggt ttatcaggca gtgataaaca <210>
<211>
<212>
<213>
319
151
DNA
Homo sapien <400>
319 aactagtgga tccagagcta taggtacagt catagatagt actaggtatt aatagatatg taagattggg tttatgtgat tttagtgggt
<210> 320 <211> 150 <212> DNA <213> Homo sapien
<400> 320
aactagtgga tccactagtc cagtgtggtg gagcggctgc cctttttttt tttttttttg gagtgttcta cagcttacag taaataccat
<210> 321 <211> 151 <212> DNA <213> Homo sapien
<400> 321
agcaactttg tttttcatcc aggttatttt tagggtggca ttgtaaccag ctatggcata tgcctctgag aaatcaaagt cttcatacac <210>
<211>
<212>
<213>
322
151
DNA
Homo sapien
216 tttcagaggg gtctttcgga gggagaccgc acattccact t gtgatctcag taaagaaaga a ctttgcaaac aatcacacca gggacctcct gctgaggctg acattttcta ttaataatgg gaattccatt ggggggaatt gtgttggggt tttttttttt tctagatcgc aatagttatt
120
151
120
151
120
150 aggcttagga ggtgttaacc t tttcctctca aaaggctgag cactgcagtt taaacatggg
120
151 <220>
<221>
<222>
<223>
r různé vlastnosti (i) n = A,T,C (151) nebo G <400> atccagcatc ttctcctgtt tttgggcttg gtcagtttgc attgtgcagg gctcgcttca tcttgccttc cacagggctt nacttccagt ctgcttgagg ggcattcggc
120
151 <210> 323 <211> 151 <212> DNA
322 ctttttcttc ggagatggtg t
ttcttasatt acagtcttct • ·
217 <213> Homo sapien <220>
<221> různé vlastnosti <222> ‘(1) . . . (151) <223> n = A,T,C neboG <400> 323 tgaggacttg tkttcttttt ctttattttt nagactcant tactacccag ttcgtggttt gttcaatyaa aaagacactt ancccatgtg aatcctctta ckttgtaaat atattgccta twtgggagaa atgtaactgg acagttagct 9
120
151 <210> 324 <211> 461 <212> DNA <213> Homo sapien <220>
<221> různé vlastnosti <222> (1} .. . (461) <223> n = A,T,C neboG <400> acctgtgtgg agaagtggtc agagttacta gcgaacctca ctcatacagg cacacaaatg gccaccatgc aaaaacgcac
324 aatttcagct agctaaagga cgaatcccat cttctagact gatatcaaaa caatagttgg accatggcat aagagcccct ttcctcatgc atccaggttg cttggttcca ttcacggtgg taccctttgt tcactgcatt gccagagttc gccctgccct aaaaggattt ttggttggac gctatatcac gacgaaacgg gctacccagg tttacctgaa aacactgttg agctgangca tgtatccccg tgttaatacc tgacagcatg gtxcagaaac ccctggggaa ccaaagctaa ctcttgaaaa c gcctacttga tttgatgaaa gtagaagact tgccaggggc tcaggtgact acccggtgtt ttgggtctga
120
180
240
300
360
420
461 <210> 325 <211> 400 <212> DNA <213> Homo sapien <400: acactgtttc tttgatgtct agtaagagtg tctataaatg gttttgtttt gtcccttttg ctggccaagc • 325 catgttatgt ccaagtagtc gtggcctatt aatgtgctga ggactctctg cattgccaag aggctggttt ttctacacat caccttcatt tcagctgctt agcaaagtgc tggtcccttc tgccataacc gcaagaatga tgctacctca taactctttg tgacaaaatg ccatggtggc caatgctgtg atgagcacta aatgaatgat gtgcrcctgg aaactgtatc actggctcct ggcgaagaag ggtttccaac cgctaccat.g aaacttagct atctttgcca gacttaacgt agaaagatgt caggggaagg gttctgcctc
120
180
240
300
360
400 <210> 326 <211> 1215 <212> DNA <213> Homo sapien <400> 326 ggaggactgc agcccgcact cgcagccctg gttctgctcg ggcgtcctgg tgcatccgca gaactcctac accatcgggc tgggcctgca gcaggcggca ctggtcatgg aaaacgaatt gtgggtgctg tcagccgcac actgtttcca cagtcttgag gccgaccaag agccagggag
120
180 v*
218 ccagatggtg gaggccagcc tctccgtacg gcacccagag tacaacagac ccttgctcgc240 taacgacctc atgctcatca agttggacga atccgtgtcc gagtctgaca ccatccggag300 catcagcatt gcttcgcagt gccctaccgc ggggaactct tgcctcgttt ctggctgggg360 tctgctggcg aacggcagaa tgcctaccgt gctgcagtgc gtgaacgtgt cggtggtgtc420 tgaggaggtc tgcagtaagc tctatgaccc gctgtaccac cccagcatgt tctgcgccgg480 cggagggcaa gaccagaagg actcctgcaa cggtgactct ggggggcccc tgatctgcaa540 cgggtacttg cagggccttg tgtctttcgg aaaagccccg tgtggccaag ttggcgtgcc600 aggtgtctac accaacctct gcaaattcac tgagtggata gagaaaaccg tccaggccag660 ttaactctgg ggactgggaa cccatgaaat tgacccccaa atacatcctg cggaaggaat720 tcaggaatat ctgttcccag cccctcctcc ctcaggccca ggagtccagg cccccagccc780 ctcctccctc aaaccaaggg tacagatccc cagcccctcc tccctcagac ccaggagtc.c84 0 agacccccca gcccctcctc ccccagaccc -aggagtccag cccctcctcc ctcagaccca900 ggagtccaga ccccccagcc cctcctccct cagacccagg ggtccaggcc cccaacccct960 cctccctcag actcagaggt ccaagccccc aacccctcct tccccagacc cagaggtcca1020 ggtcccagcc cctcctccct cagacccagc ggtccaatgc cacctagact ctccctgtac1080 acagtgcccc cttgtggcac gttgacccaa ccttaccagt tggtttttca ttttttgtcc1140 ctttccccta gatccagaaa taaagtctaa gagaagcgca aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa1200 aaaaaaaaaa aaaaa1215 <210> 327 <211> 220 <212> PRT <213 > Homo sapien <400> 327
Glu Asp Cys Ser Pro His Ser Gin Pro Trp Gin Ala Ala Leu Val Met
1015
Glu Asn Glu Leu Phe Cys Ser Gly Val Leu Val His Pro Gin Trp Val
2530
Leu Ser Ala Ala His Cys Phe Gin Asn Ser Tyr Thr Ile Gly Leu Gly
4045
Leu His Ser Leu Glu Ala Asp Gin Glu Pro Gly Ser Gin Met Val Glu
5560
Ala Ser Leu Ser Val Arg His Pro Glu Tyr Asn Arg Pro Leu LeuAla
70 7580
Asn Asp Leu Met Leu Ile Lys Leu Asp Glu Ser Val Ser Glu SerAsp
9095
Thr Ile Arg Ser Ile Ser Ile Ala Ser Gin Cys Pro Thr Ala Gly Asn
100 105110
Ser Cys Leu Val Ser Gly Trp Gly Leu Leu Ala Asn Gly Arg Met Pro
115 120125
Thr Val Leu Gin Cys Val Aisn Val Ser Val Val Ser Glu Glu Val Cys
130 135140
Ser Lys Leu Tyr Asp Pro Leu Tyr His Pro Ser Met Phe Cys AlaGly
145 150 155160
Gly Gly Gin Asp Gin Lys Asp Ser Cys Asn Gly Asp Ser Gly GlyPro
165 170175
Leu Ile Cys Asn Gly Tyr Leu Gin Gly Leu Val Ser Phe Gly Lys Ala
180 185190
Pro Cys Gly Gin Val Gly Val Pro Gly Val Tyr Thr Asn Leu Cys Lys
195 200205
Phe Thr Glu Trp Ile Glu Lys Thr Val Gin Ala Ser <210> 328
219 <211> 234 <212> DNA <213> Homo sapien <400 cgctcgtctc agccctggca atccgcagtg gcctgcacag • 328 tggtagctgc ggcggcactg ggtgctgtca tcttgaggcc agccaaatca gtcatggaaa gccacacact gaccaagagc taaacggcga acgaattgtt gtttccagaa cagggagcca ggactgcagc ctgctcgggc ctcctacacc gatggtggag ccgcactcgc gtcctggtgc atcgggctgg gcca
120
180
234 <210> 329 <211> 77 <212> PRT <213> Homo sapien <400> 329
Leu Val Ser Gly Ser Cys Ser Gin Ile Ile Asn Gly Glu Asp Cys Ser
1 5 10 15
Pro His Ser Gin Pro Trp Gin Ala Ala Leu Val Met Glu Asn Glu Leu
20 25 30
Phe Cys Ser Gly Val Leu Val His Pro Gin Trp Val Leu Ser Ala Thr
35 40 45
His Cys Phe Gin Asn Ser Tyr Thr Ile Gly Leu Gly Leu His Ser Leu
50 55 60
Glu Ala Asp Gin Glu Pro Gly Ser Gin Met Val Glu Ala
65 70 75
<210> 330 <211> 70 <212> DNA <213> Homo sapien <400> 330 cccaacacaa tggcccgatc ccatccctga ctccgccctc aggatcgctc gtctctggta gctgcagcca <210> 331 <211> 22 <212> PRT <213> Homo sapien <400> 331
Gin His Asn Gly Pro Ile Pro Ser Leu Thr Pro Pro Ser Gly Ser Leu 15 10 15
Val Ser Gly Ser Cys Ser <210> 332 <211> 2507 <212> DNA <213> Homo sapien <400> 332 tggtgccgct gcagccggca gagatggttg agctcatgtt tgcccttcct tctgtatatg gctgcgcccc aaatcaggaa cccgctgttg ctcctccttc aatgctgtcc agtggggtgt
120 • ΦΦΦ • · φ
φ φ
φφ φφ φ φ φ φφφ
220 gtacatcaac tcgggaagga gggatgtgga aggtgttggt gcttcttagc gtccgtactc acttcctcct taaatgtgtc agaaattcta cccaggaact gcacagtcca tctccttttt cagaaggtct ctgcccaagc tgggcctccc ctacacagta agagagcaaa agattcgtct ctagagatat ctgaaagaaa gaactagctt ggccacactg cccaggcatg aaccccacct agggagtatt ccatccagcc aactacccac tggaagataa actagttaag agggcaagca aaaaaaaaaa attatcttag cttacattgt cttcttatca ttgtttggag ctttggtggg cttttattgc aaattagaaa attgaactgt aataaaaacg tgttcagctt gacagccaaa aaagggggaa gcggaaactg tgaggaaaag gaagacagca aacccatctg ttccctcgca caatgcaggc ggcccggaga atctgaactg catcaagact tgagattcta tcgtaatgag aatagactaa cttcttgtca accttccagc aaatgtctgt cataatagga ctactaccta ctttgttcac caacctcagc gtggatcacc ctactaaaaa ttcacaaagt tttatgcaaa caagagcaca tgcacaaaat gattaatagc cccaggactg aaaaatccta ggactgatat cttgacaaga aaagtaatgc tgtgctattc ggaaagagtt acttgttttg aattctgata caatgacaaa taagaattaa ccegggaaag gagctggctc ttggtggcca gacctgtctg cacctccacg gatggctttg ctgctagaga catcacctgg ctggcctact ctaaaaggcc gttcggcact cctcagcagg agtgggaatc actatagcaa caggcagtgc aaatgattct cttgcctgct catgtccaga taagaagacc ggagaatcta aattcagttc ttaacatgaa ggaggtcagt ttgtgtatat tcaaaacagc tgaaatgctg tgggtagcag gaagggacta aaaagayatt atgaggtctt aaaacaaaca tggtaattat ttaaaatgtc tgccaaagga taaaagattt ataggaccac accattaagc atagtgcaga taaaaattct aagtttgatt tagttgtggt agagaggagc aagagatcca atactaagtc ttttgatcaa agatgcacat aactaaagga gaaggatcca gtcacagcaa ctggcgttac catctttcat gagcccagac atttcagtga ggcggctgtg cagttggacc ccttcaaggt tggtgtccag tttactttgc ctcatatgac agctatagca ctcccaacca taacaaagac agttcaagac ctttgtgtgt cacaataatc caaagggaag ggaagaagta gttaaggatt aaatatgcta aacaaaaacc aacaaaaaaa ggtcaattta tgtgccaaaa agtctaagga tgatttcctg agtcttcact tatatgttta ataaatgaat ttttgattat acaaaaaaaa cacaggagct tcgagtatat gaccacgaca tattcgagct caatgcagga aggagtcaac atcagcccca cttccataac gctagccaac gacgtattct gagatggatg cagcctgcac ctgtcatgtg ggacgtcagt caagagaaga tttscaaaacc ttaaaactca ttctgttacc ctgcacagct gggatgattt accagtcttc tggctcagga cagcctggcc cttcctgttt agagatggag cagattctgt aaaaaagaga aactagccct acatagctat agtgtggcaa acaattcttc ataatatttt ttttgtactt attagtagtg gaatgacaat tctgatactt gaaatggtca taatgtttta ttcttgtttt aaaaaaa aatacaggta ttagcttgcc gggaaccagc tttgctaagg gtgatgatgt cacttgggtc tcaaggatag ctgcagggcg atcctcttca gtacaccctg tggtggcttt tgtgccttaa gcatgggtct tgtgacctgc ctgcagcaga tttagcacaa gcgtactgcc gccagagtta cattttcctt atgcaaattt actccaagag gcagggcttg aacatggtga atgtgtgcca caaaccagta atatgttgqt aggagaatac ttaaggatta ggaggaattg aaaaaaaaaa attcagaaaa ggggcatttc tatttggaga ttcccatcac tatattttaa gtaaattaat ttttacggaa cttaatttat catttaccag
180
240
300
360
420
480
540
600
660
720
780 840
900
960 1020 1080 1140 1200 1260 1320 1380 1440 1500 1560 1620 1680 174 0 1800 1860 1920 1980 2040 2100 2160 2220 2280 2340 2400 2460 2507
<210> 333 <211> 3030 <212> DNA <213> Homo sapien
<400> 333
gcaggcgact ggagagcgag gctccatgga tgggagcggg cgcctacgct cgccaaagca cttatggtta cctgtgccca tgcgagctgg ctgggtgccc gcccggcaat aggggggcgg gatgcctgct atgccaccca ctttggaggc ggcagccacc gagcgattta cctagattcc tatgccacct aatctggtcg gtcaactatg tgccctgggg gggtactact ctggccgcgt aaacgctttg ccgcccccgc tggatggagc cccactcccc cccccttgga tgccccaggg cctgccgagt accccgcgga gattcccccg acctcatgag caaggatatc tctgaccagc tctgccaggc gacgtcccca gtcccggagc gactcccacg gcctgggtgg ccgaccctcg gaaggcttgc cacccagcgg tcggcggagc gctcccgtgc tcgctgaaac gccggggaag
120
180
240
300
360
420
480
• φ
221 agtaccccag ctatggccag gacatgactc acagccagat ttgcagactc aacgcattcc agttcatcac agattaccat agaacagcgc gtcctgggga cccctagaga tgggtaccca cccaaagaac cagtactagc ttagaaaccg cagggaagct gactgaggag tctcagctga ccaccccata ctgtcgtgtg agagatttga tcttccctta ggatcccagt gagtggcaga aattctggaa agggcctctg gactcatctc aggctggggg ctggacaacc tggcgagcag gccagctctc gggtgggatc acacctacaa tgagtgcatg tttcctgatt cgccgctcag ggtagctttc gatcgggcaa tgggcctgtg ttggagagag gtagagacct ctatcagaaa aacaaaaaaa ycgccccact ttacctggac cctgttgcct gtgttgccag cagcgggcag gtacagcaag caaggacaag ctggtttcag taccccttaa gaccaggaac caacaccctt: gtatgtgcag ctggcccagt tgccatgatc ctttcatgaa ttctctcaga aggggaacgg cagctgggta gggtgtaccc aaaatgaagc gaaagtgcct atatttctgg gaagtagatg gtggtgccaa gctggagaca cctctgtgtt ctggccgcgc tggggggcct cgcagaaccg ttggtggtgg ctagaaaccc ctagccctgt atctatttac cggactgggg taaaaaatcg agcaggtcac aatatcgcag gtaaaccccc gggagggggc gaaaaaggcc ttgggggtct cttaaacttg aaaaaaaaaa gagtttgcct gtgtctgtgg gtggacagtt ggagaacaga caccctcctg gggcagttgc aggcgcaaga aaccgccggg gagatctcct ctgccaagcc cccaggccac ggagacggaa cataatcatt gttagcctca ttgagctaat cccccttcca gcagattcgt ggtggacaac actggtcttg cagcaggctg gggtaattca tggttctgac tttgtagcct ccccgttttc gacgggctct catcctctga agcaaagcca gccggcgcat aagctccgag gccgcggccg cgcggcggcc ctcctctcct caaagaggag gttcagggga tccaagcccc tttctgcctt gttctcactc tccctcgccg aagatagatg acaagagggg ggaacctctg aggattttct aaaactcgag tctatccggg tgcagactct accagtcttg acccaccagg acgcctgcgc gggagctgga tctcggcagc tcaaagagaa tgcctgggtg caggctgggg tggctgctgg ccccatgtga catcctgaca tattttctat tatgaataaa ttacacctct tgtgtggctg tgtagaggct gaagcaccca cccctagtca ccattaattt caaagcaggt tgcatactta ccagtccacg ttgcagagcc tgtcctgtac gcgggttcgt tctccacgat cagcgggtcg ccactacctc gccgcagcca gggaaggagt cccgggactg agaggacgag gtggtccagc ccacgtcctc ctctgcctct acttcggaac agggggagcg ctgccaccgc gactccccat ctgtttttca atatccggga gggtgctcct ggctctcgct tcccttttgg ctttcgtcgc gcgggagtat caccagcctc gaaggttctc ggaggagcga ccaaggactc actgttcctc cagcccactc gtggcaataa ctagagctct tttggaaggc caccctggta tgatgtccgt gtctcttcct tccttaatac gtccttcctt cctcccccaa catggtttgt gcccttccca tagacagatt gggactctga ctgggctcag gctggtcctt tgagcgcaca gtggcgagta gaggacattt agtgtttatg gagggtggga agggaaaagg gaagaggaag ttaaggtcct cttcaaggaa ataagctcaa tggcgagagt gcatggtgcg cactaacgga gctctaactc ctcgcaataa acctaccagc ggagaaccgc ggtggctgga aaggcagcat ggccgcaaga gcggctaaca tcggagcgcc gccaaggtga aagtgggggt tgctgagagg aggagcggcc caccagggtt tcacgataac gtagagcact gatccctttg acagcaggaa ttagcatttt ccctccttgt gatgattttt ccagagaaaa actctctgag tgagcatttg ggcacaaacg cacagtgcgg gagggacatg tgcccggtgg cctgcacctt ggcctgaagt gtggggtcgg ccctcccgga gcccgcggtc cgtgacttag ccaaagagtg atgaggtcga cggttacatg gccccatgtg acccaccaac tcagcgcaga gggtgacccc gatggccctg ccacactctg aytcagagca
540
600
660 720
780
840 900
960 1020 1080 1140 1200 1260 1320 1380 1440 1500 1560 1620 1680 1740 1800 1850 1920 1980 2040 2100 2160 2220 2280 2340 2400 2460 2520 2580 2640 2700 2760 2820 2880 2940 3000 3030
<210> 334 <211> 2417 <212> DNA <213> Homo sapien
<400> 334
ggcggccgct ctagagctag ggagttttac. ctgtattgtt agtttacaaa tgaggaaaca agagccaaga gaatgctgac cattgaggat tttgagccca tgggatcccc ttaatttcaa ggtgcaaaaa gttatgtctg atctaaactt cgggctgcac caagcctgag ggttgttacc atgaacttag agaccaattg cgagtgagtt aaatgtaccc cgcatgtggc tcaaacttct ccaagactat
120
180
240
300 gaattcggca gaccagccac tgtcaaaggt cctatgctct cattttccct
222 ttacttatca tatgccagat cccgggatct atgcaaaaat ttgttgactt cagaatgcat agctgggcat gcttcagccc aatcaatcaa tgtggtagct gcccagaagt aatgaataca acaaatctct gtgttgagga aatcaacccg tagacggaac tattcaatgt aaaccatgac ttacaaagtg ggagattgga cacagactgg ccacgatcaa tggccaccct gggacagagg acctgggcca tggccaagat cagggatctg cagagcccat cctcaccgac ggactcccag ctggggagga acagcctgtc atcaggcttc ggtactgaga ctgtctacat tagagatatg atacaataat atatgtaaaa aataggctca tcattattaa tatgcagtat cctcctacta ggtggatcat aggagttcaa tgccctgtct catgcctata tcaagaccag tacataagga tggacctaaa tacagaatat aggcaaggca ctgactctgg aaaaggataa caactaatta tacccactgt atgtttcttt gaggcttaag ggtgcaggaa cccactgcgt gaaagagaag ctttggccca aaagcaacag ctcatcagtg gcaaggtggc ctggtgatgc aaaaggagac actgggggcc ctgccagctg ccggagctgg caatattgtc ctataatcac ttatact accaccttta gcaacctaca aagaaacttc tttttttcat ggccttttaa atgaggtcag gcctgtaatc gaccagcctg ttgaaaataa atacagcact cctgggcaac aagataaaaa agtatttttg ctaagcccag aaaatgagac tctattaagc aaactctcta tggggaatca taatcacttt cctgttgtat taacagaaat aggcaggctt gctcacatga gagagggaac ggcactgtgg aaaaatgtcc tggggacctc agcagcagaa tggacactgc ccagctgctc tggttctggg gatccccagt tcttgggaag ataaattcaa tatgcatact ccaatctatt agctctctaa ttctagaaat ccatccttta ggattggggg tacacatttg tcaacattgg ggcaacatag aactctttaa ttgggaggct aagtgacacc gaaaagttta ttcaagccaa gaaactgagc taactaatca gacaactttc aaactaaaaa taaaatatga aaacattaat tagttggctc tcatttctca cattctgagg cctctttgtg tctctggtgt ggtggggggt aaagctgtgc caagtcggcc gaagggaatt gatgaatggt aggtggctgc tcagagagca cccggtcaac ccagccctgg tgcgcccttg agtctttgtt gttttgatac tcatgctcac ataaaagaga attcagcaaa acaggtgaag cattttaaaa aaggccaagg aaagacccca gaaaggttta gaggcaggag tcatctcaat atgaaagaat atattgtgaa agaaagttca atccgaggca cctctgttgt caatgtttgt ctgtatgaga gaacttaaaa aggctgccat cagttctggg cccctctctt ctcctggaaa ctcgtctttc tgtggct.gct agcaaagaca accctgaagg gtccctgt.cc aatgtggatg aaatcattac gcccagtgag cagtaatcaa ggtgagttgg tatccctttt agtgtttcta gagactcaaa ctaaaagatt aaattggatt catttatctg aacggggtgc tgccctgtcc caggaggatt tctctcaatc atgggcaggg gatcacttta trtttaataa acagtataaa tcacctctct tgtactaact aggggcaaat atttttcttt caggagttac tcttgatggt atgaatttac aacaaaatac ggctggaagt ggctcacatg gagggtgtgg aaggacccta ctgctctgag agccaccgaa caagccccca ttggcacatt agaatatgat agccttcatc ggtgagagct ggctgagcag ctcctgctgt tcttttttat ttcmacttaa
360 420 480 540 600 660 720 780 840 900 960 1020 1080 1140 1200 1260 1320 1380 1440 1500 1560 1620 1680 1740 1800 1860 1920 1980 2040 2100 2160 2220 2280 2340 2400 2417 <210> 335 <211> 2984 <212> DNA <213> Homo sapien <400: atccctcctt aaaacacttc cccgagctgc agtacctgtc aagtgaagat agctgggaga gggcctccct gcagctggag ctgccttccc tgtgcacacc aatgaaacaa taggtcattt
335 ccccactctc aggcgccctt cttctcccac ggcccctgaa atggttccag cttggagaag ggtctccgtg cccagctttt cagggtgtct aaagctattg cagagacagt tttttgcttc ctttccagaa ccaaggcttc actcaggtga cgggcccacc aacagacgct cactcctctt tataacagct tggtaatgcc ctatgaaaag gagatttgcg gaaagtttta tggctacctg ggcacttggg cccaaacccc tcgagttgga tggccaagaa ataagactaa tgccggccct atccttacta agctcaggtg cacaaggggc tggaaatctc atacctaagt tttgaagggg gtcttatctg taagcagccg gaggaagttc cctcaagctc gcgaaagcag gaaagaggag cccatacctg acaaccatta caaggtcagg asattcttca cattccccca agagagggaa ttggactctg cagaagcgct agccatcaga acggagaccc ctctcctcgg gccttctccc tactgcgtgg tgatcaaaaa gagcaagagg ctggtgagac gtgcatactg aatcaagtgg
120
180
240
300
360
420
480
540
600
660
720
223 tattttccag actccatcct gacaaccagg gccttggaat ctccaagaga ggagatgaaa ttaagtattt gctgtataaa ccaagacagg ttagtagaaa tcagaagttt ttcttccttc gcttcatttt cccgagatct ttgacttttt aaactagcaa ttaaagacct gctgttacgt tattggattt tccagtggag cagtccactg gaaaaccatt cctataatgg ggagaaatct agacatcaga agtctctrga agaagggcca aatttcaccc ctgacaccga tctttacatt tcccctcctc tgatgtatat tgaatccatc aaaaacatct ccatttcacc tgcataacaa cacccccacc aaagtaccca cactttgtat cctgtgtcac atgaggatgt atggccaagg acgccctcat atatcagctt acagggtggc cagaactcca ggcctaagga gtggaaaggc cctggagttt cctcctttta agtccagatt ggtctttttt aaaaaagttt ctcttatttc gacagcttga ttgaagtctg tcacagagga ggctcatggg agcaagcaag ctaaaacaca gtccccaaaa ggctgtcctt aaaaaatgaa ctccactact gcttactgtt cattttctgt ccggagtact tcttttaaaa tgaatttaat tgtgttgcaa ttgctttttc gaagagctag cagacagcct accctgctcc aaactttatt tgtctttatt gattttggat tgaatatcaa caccaactga ctctctctgt gctcagcaca ttcttattcc ccaaatagaa ctgcaagagg gggtctccac ctcttctcaa tcaggctatc aaattttgtg tttagtctgg tttttttttt gggggcagat tttcctttaa gaaggtcact acaatccttg agaacacagc tgggacatgg ggactgagtg acaagaaact tgggtaacct ccattttcat acaacaaaac taattccgtc ggtggcaaaaggtttgggct agccagcaca taagcattta tctttcaact aaaaaaaaaa cccattggaa tctatcagca gtttctatcc aatctgtcac tttctatgtg agaaaaaaaa gagctgtaca ctctgaaaga attaaactta ccctgtaaaa tatttgcatg tttttattcc caagatgcac gggggccggg actgctgcta cttttttccc atatatactg ttcctttttg ctgcacctaa tttttccgtc tctgaattgg aaatacatag actgcattta agaatctttg gcagaatgaa aaaagaaggc agccttttgc gtccaaatgc agacttcaga tctgttatct aattactaat tagtgagaaa ttgccaacat ccacattgca aaaggcaggg gtgctcagtc tgcaatttgc aagtgtcttt ctagtcatta tctgacaggt tgtttaataa ataaaagtct ttttttgcaa aaaaaaaaaa cccaaggatt gcaaacctaa agtccagaag gagaggggca ggagggggag ttttaaaatg tcgctgtgat ccaggagaat ggggctgttg ttgggctgga tatcctgaaa cagcaattac cttatgcctc tccccaaagc ctaaaagaca cattaaatcc taggaccttc catgcagagg gggccaggct agcctaggcc aggaaaaggc tttgggaact gagaatgagc caggtgagct gaggtacgct cctttcaatt aagttaatag atgttcaatg tagcctgaat cctactgagt aaggattaca gtttaaaatt acccatctct gaattggatg attagtttgg gtgactr.gaa catatgagtg aaaa ctgttctgca caggagaaag cctcctgttg aatagagagt atgggtggga gtatgccaac tttaagacaa ctccgcttgt cattttttta gaatttagaa ggcaacataa tcactaaagg gcttatttag tttatctgtc tgcattttta caaatcctat tggtggttct aggtaagagg tactgagctg ctggggagcc taagaaaaag gtgtttattg agagagcaaa ggtagagqgg gaggcctggg tccttttatt aaagttggcc ccacgtgctg tgctttctgc actctttctc catttcactg acttggtttg gaactggtag gttctcagaa gttctctaca gtttagtcag ttttgaaaat
780 840 900 960
1020 1080 114 0 1200 1260 1320 1380 1440 1500 1560 1620 1680 1740 1800 1860 1920 1980 2040 2100 2160 2220 2280 2340 2400 2460 2520 2580 2640 2700 2760 2820 2880 2940 2984 <210> 336 <211> 147 <212> PRT <213> Homo sapien <400> 336
Pro Ser Phe Pro Thr Leu Leu Ser Arg Arg His Leu Gly Ser Tyr Leu
1 5 10 15
Leu Asp Ser Glu Asn Thr Ser Gly Ala Leu Pro Arg Leu Pro Gin Thr
20 25 30
Pro Lys Gin Pro Gin Lys Arg Ser Arg Ala Ala Phe Ser His Thr Gin
35 40 45
Val Ile Glu Leu Glu Arg Lys Phe Ser His Gin Lys Tyr Leu Ser Ala
50 55 60
Pro Glu Arg Ala His Leu Ala Lys Asn Leu Lys Leu Thr Glu Thr Gin
65 70 75 80
224
Val Lys Ile Trp Phe 85 Gin Asn Arg Arg Tyr Lys Thr Lys Arg Lys Gin
90 95
Leu Ser Ser Glu Leu Gly Asp Leu Glu Lys His Ser Ser Leu Pro Ala
100 105 110
Leu Lys Glu Glu Ala Phe Ser Arg Ala Ser Leu Val Ser Val Tyr Asn
115 120 125
Ser Tyr Pro Tyr Tyr Pro Tyr Leu Tyr Cys Val Gly Ser Trp Ser Pro
130 135 140
Ala Phe Trp
145
<210> 337
<211> 9
<212> PRT
<213> Homo sapien
<400> 337
Ala Leu Thr Gly Phe Thr Phe Ser Ala
1 5
<210> 338
<211> 9
<212> PRT
<213> Homo sapien
<400> 338
Leu Leu Ala Asn Asp Leu Met Leu Ile
1 5
<210> 339
<211> 318
<212> PRT
<213> Homo sapien
<400> 339
Met Val Glu Leu Met Phe Pro Leu Leu Leu Leu Leu Leu Pro Phe Leu
1 5 ' 10 15
Leu Tyr Met Ala Ala Pro Gin Ile Arg Lys Met Leu Ser Ser Gly Val
20 25 30
Cys Thr Ser Thr Val Gin Leu Pro Gly Lys Val Val Val Val Thr Gly
35 40 45
Ala Asn Thr Gly Ile Gly Lys Glu Thr Ala Lys Glu Leu Ala Gin Arg
50 55 60
Gly Ala Arg Val Tyr Leu Ala Cys Arg Asp Val Glu Lys Gly Glu Leu
65 70 75 80
Val Ala Lys Glu Ile Gin Thr Thr Thr Gly Asn Gin Gin Val Leu Val
85 90 95
Arg Lys Leu Asp Leu Ser Asp Thr Lys Ser Ile Arg Ala Phe Ala Lys
100 105 110
Gly Phe Leu Ala Glu Glu Lys His Leu His Val Leu Ile Asn Asn Ala
115 120 125
Gly Val Met Met Cys Pro Tyr Ser Lys Thr Ala Asp Gly Phe Glu Met
130 135 140
His Ile Gly Val Asn His Leu Gly His Phe Leu Leu Thr His Leu Leu
225
145 150 155 160
Leu Glu Lys Leu Lys Glu Ser Ala Pro Ser Arg Ile Val Asn Val Ser
165 170 175
Ser Leu Ala His His Leu Gly Arg Ile His Phe His Asn Leu Gin Gly
180 185 190
Glu Lys Phe Tyr Asn Ala Gly Leu Ala Tyr Cys His Ser Lys Leu Ala
195 200 205
Asn Ile Leu Phe Thr Gin Glu Leu Ala Arg Arg Leu Lys Gly Ser Gly
210 215 220
Val Thr Thr Tyr Ser Val His Pro Gly Thr Val Gin Ser Glu Leu Val
225 230 235 240
Arg His Ser Ser Phe Met Arg Trp Met Trp Trp Leu Phe Ser Phe Phe
245 250 255
Ile Lys Thr Pro Gin Gin Gly Ala Gin Thr Ser Leu His Cys Ala Leu
260 265 270
Thr Glu Gly Leu Glu Ile Leu Ser Gly Asn His Phe Ser Asp Cys His
275 280 285
Val Ala Trp Val Ser Ala Gin Ala Arg Asn Glu Thr Ile Ala Arg Arg
290 295 300
Leu Trp Asp Val Ser Cys Asp Leu Leu Gly Leu Pro Ile Asp
305 310 315 <210> 340 <211> 483 <212> DNA <213> Homo sapien <400> 340 gccgaggtct tggacactgg ctcctgctgc ggttgtgggg ccttcaattt gctccaaacg tgctcaatct ttttctgggc ctg gccttcacac tgggaggcgc aggctggagt gcggtttatc tctctttggc tgacatcact cgccattcga ttccagaatt ggaggacacg tgtttagttg gtctttattc aggcagtgat tgacgacgga gatgctcttc ctcttgctcc taaagtgaaa agactgcttc gctgttttca ctggcgggag aaacataaga gtccgtggtg tcgggggtgc aaactgtatg ggcagcactc ctcaagggct gaggggtctt accgcacatt tgtcatttcc tcccgatgta tgatggcccg aagacacctg ctaagctccg cctgcctgcc tcggagggac ccactgctga ttgactccgg actgacccct cttggtcacg actgcacgtt actccgatgc
120
180
240
300
360
420
480
483 <210> 341 <211> 344 <212> DNA <213> Homo sapien <400: ctgctgctga tatttttact gctgccttac attaatttaa aatttactta ctgattctta
341 gtcacagatt aaccattcta aagtattaaa taatttctga atgaaaaact acattgtctt tcattataaa tttttataga tattttactt tgatggtttt gaagagaaca taatgaccac aaggaaaata agtttctaaa agagtagctc atatgtatat ccactagcac acag cactgaatgc ccaactctct aaaatatgca catctattag ttaagtactc
120
180
240
300
344 <210> 342 <211> 592 <212> DNA <213> Homo sapien tagcctccct aatagctgag ctttccataa atctgcagta aaatttgtaa aagacaacca ·♦ · · * ·
226 <400> 342 acagcaaaaa agaaactgag aagcccaaty tgctttcttg ttaacatcca cttatccaac caatgtggaa acttcttata cttggttcca ttatgaagtt ggacaattgc tgctatcaca cctggcaggt aaaccaatgc caagagagtg atggaaacca ttggcaagac tttgttgatg accaggattg gaattttata aaaatattgt tgatgggaag ttgctaaagg gtgaattact tccctcagaa gagtgtaaag aaaagtcaga gatgctataa tagcagctat tttaattggc aagtgccact gtggaaagag ttcctgtgtg tgctgaagtt ctgaagggca gtcaaattca tcagcatggg ctgtttggtg caaatgcaaa agcacaggtc tttttagcat gctggtctct cccgtgtcct tatgcaaata atcgtcttct tctaaatttc tcctaggctt cattttccaa agttcttctc ggtttgtgat gtcttttctg ctttccatta attctataaa atagtatggc ttcagccacc cactcttcgc cttagcttga ccgtgagtct cggctgccgc tg <210> 343 <211> 382 <212> DNA <213> Homo sapien <400> 343 ttcttgacct cctcctcctt caagctcaaa caccacctcc cttattcagg accggcactt cttaatgttt gtggctttct ctccagcctc tcttaggagg ggtaatggtg gagttggcat cttgtaactc tcctttctcc tttcttcccc tttctctgcc cgcctttccc atcctgctgt agacttcttg attgtcagtc tgtgtcacat ccagtgattg ctttggtttc tgttcccttt ctgactgccc aaggggctca gaaccccagc aatcccttcc totcactacc ttcttttttg ggggtagttg gaagggactg aaattgtggg gggaaggtag aaggcacatc aataaagagg aaaccaccaa gctgaaaaaa aa <210> 344 <211> 536 <212> DNA <213> Homo sapien <400> 344 ctgggcctga agctgtaggg taaatcagag gcaggcttct gagtgatgag agtcctgaga caataggcca cataaacttg gctggatgga acctcacaat aaggtggtca cctcttgttt gtttaggggg atgccaagga taaggccagc tcagttatat gaagagaagc agaacaaaca agtctttcag agaaatggat gcaatcagag tgggatcccg gtcacatcaa ggtcacactc caccttcatg tgcctgaatg gttgccaggt cagaaaaatc caccccttac gagtgcggct tcgaccctat atcccccgcc cgcgtccctt tctccataaa attcttctta gtagctatta ccttcttatt atttgatcta gaaattgccc tccttttacc cctaccatga gccctacaaa caactaacct gccactaata gttatgtcat ccctcttatt aatcatcatc ctagccctaa gtctggccta tgagtgacta caaaaaggat tagactgagc cgaataacaa aaaaaa <210> 345 <211> 251 <212> DNA <213> Homo sapien <400> 345 accttttgag gtctctctca ccacctccac agccaccgtc accgtgggat gtgctggatg tgaatgaagc ccccatcttt gtgcctcctg aaaagagagt ggaagtgtcc gaggactttg gcgtgggcca ggaaatcaca tcctacactg cccaggagcc agacacattt atggaacaga aaataacata tcggatttgg agagacactg ccaactggct ggagattaat ccggacactg gtgccatttc c
120
180
240
300
360
420
480
540
592
120
180
240
300
360
382
120
180
240
300
360
420
480
536
120
180
240
251
227
<210> <211> <212> <213> 346 282 DNA Homo sapien
<220>
<221 > různé vlastnosti <222> (1) . . . (282) <223> n = A,T, C neboG <400> 346 cgcgtctctg ctaagtcttg agggagacta agaaaggctt ggtctcattt acactgtgat ttaccaaaaa tacctggctc tctatttcac cccaaggtgc catgacaggg aaggaaaaag ttgccctaag tggcccaggC cttcaatgct gttcaaacag aaaagatctt tgagaggtct agggggaagg catnaaaacc aaagtgcctg ctcagttaca tccctcccgc agagtaactt aa ggccctcctt aattctggga accaaaaaat tgagtctgtg
120
180
240
282 <210> 347 <211> 201 <212> DNA <213> Homo sapien <220>
< 2 21 > nrůzné vlastnosti <222> (1) . . . (201) <223> n = A,T,C nebo G <400 acacacataa taaatataac tctgagactg tataaagaat
347 tattataaaa ttttaaaana actggaccca ttttttttgt tgccatctaa ntactancag cccagaccca c ttggaaggag cttttaccta gggcaaagat ctttctatca ngctcctaaa acatgttacc ttgcaagtca tgcttgtaaa atatcatctt
120
180
201 <210> 348 <211> 251 <212> DNA <213> Homo sapien <400> 348 ctgttaatca agagagaaca aggagacact ggggaaggtt gccctgcctc caacatttgt gtgccagaat cccagcatgg ttattataga c gcatcacttg gaaactgacc aggagggttt actcccaaca tgccaagtga ctaagtccca atcttttcat gcccacctca gaaaatgttc ggtgcccctg cctaggtcag ctcctgccac taaaatcaca ggcaggcaga gtctacaatg ccacccgatg
120
180
240
251
<210> 349
<211> 251
<212> DNA
<213> Homo sapien
<400> 349
taaaaatcaa aacccctgag cagaagggtc agcaattttg gccatttaat gatgccagag tgaaccctac taaaatacca tgtatctttg ctatgggtcc gtgttaccag gaaacagacc aaggtaaaca agaacatggt agaacataat ccaagagtct gctggatcac caacagagtt cattccactt ggaaaattca
120
180
240 atatatggga gtggtattat gcaattcatg ttcaagatga • · • ΦΦΦ
228 actcctggtt t
251
<210> 350 <211> 908 <212> DNA <213 > Homo sapien
<400> 350
ctggacactt agcccgcccg cggctggaat cacctgtaaa gttcaagtgc tgagtgttac aggatcatgt ctgtgatatt gtgtaatatt ttatgataat catgtctttg ttatgcaaga ccacatacct tatcaatatg aaaaaaggac aaccgcag tgcgagggct gtgaagctcg tgctctggtc tttgatgggg aacaatgact ctgcgacagg gccacagtcc tgccagtttg gactgttctc gcatgccaaa ggtcgacgtc acagattatg tgtccggaac caggagccat tacagtgttc tttgctggct ctgctttccc atgatgacag aatgtttaag atgtgcctgt ctgcatgcaa atgaaggctc gtgcagaatg aaaccaactt tcaaagaagc aagataacac cagagaatgc attacaatgg cttgcaggtg tatacgttgt gctgctgctg tacctcctta agaaaatgat aattggagac gtgtggctcc acagcagagt tggagaaact tgacgaagat caatcccctc atcgtgtcag aactacaact taacaaatta cttctgcatg tgatgctggt tcccggtcct cccgtcatgc agtgactgcc ctcttcctct actgtgactt aatggggaga gagatacttg agtcaaaagg gccgaggatg tgcgcttctg aaacaggaga actaagtctg gaagaaagtg catgggaagt tatactggac gtacgatttc tactcatcgt aaacgcccac gtgacaccaa gcgtctgtca gctaccagaa tggtgtcaga agacatccac tctggtgtgt atgggaaatc aaattgaagt aagatgggca ccagagaaca gtgagcattc aacactgtga agtatgtctt
120 180 240 300 360 420 480 540 600 660 720 780 840 900 908
<210> 351 <211> 472 <212> DNA <213> Homo sapien
<400> 351
ccagttattt gtcaaacctt cattaacttg tatgataaaa atatatcctt gatctgtcca tcagccccct gtaatatata gcaagtggta aatgccattg attctaaaat acaaccattg cgacatcaat caacaaactt tttggcctgt tttagggaag agagcctatt ttattgtgaa cagwtttgyg tattcctgtt gaactttgtt gccctctcat ttgttttgtc atgttgcttt taccataaat ttaggattaa agtcatttac tttctaaaca ttcttttact gccttgcctc aaaaacctaa gcccacacac aatactaaga gtagtaattt cacaagctaa gtcctaattt ccagtaataa tcaccatgct tctgcttctt gaagcaaagt accaactcaa tcaaaattca atgtgtacac ctaacactgt agtaggcaca ctgctccagg gcttttcttg aa
120
180
240
300
360
420
472
<210> 352
<211> 251
<212> DNA
<213> Homo sapien
<400> 352
ctcaaagcta tgtggataag caggctgcgt atacatggaa aataagcaca atctctcggg gccaggtcaa tccgtcctta aggaggggga a aatcaaacca tggctgcaag cgatgaagac agccaaccca gcatggtgga tcggagcgtg ttgccactac ctgggatacc
120
180
240
251 <210>
<211>
<212>
353
436
DNA aggatcttag aagaggtaca tttccaaaca ttctctaatc gaaaagggca catgcagaga cacgatgcag gaaatgggct ·· 4·· ·
229 <213> Homo sapien <400> 353 tttttttttt tttttttttt ttttttacaa caatgcagtc atttatttat tgagtatgtg 60 cacattatgg tattattact atactgatta tatttatcat gtgacttcta attaraaaat 120 gtatccaaaa gcaaaacagc agatatacaa aattaaagag acagaagata gacattaaca 180 gataaggcaa cttatacatt gacaatccaa atccaataca tttaaacatt tgggaaatga 240 gggggacaaa tggaagccar atcaaatttg tgtaaaacta ttcagtatgt ttcccttgct 300 tcatgtctga raaggctctc ccttcaatgg ggatgacaaa ctccaaatgc cacacaaatg 360 ttaacagaat actagattca cactggaacg ggggtaaaga agaaattatt ttctataaaa 420 gggctcctaa tgtagt 436 <210> 354 <211> 854 <212> DNA <213> Homo sapien <400> 354 ccttttctag ttcaccagtt ttctgcaagg atgctggtta gggagtgtct gcaggaggag 60 caagtctgaa accaaatcta ggaaacatag gaaacgagcc aggcacaggg ctggtgggcc 120 atcagggacc accctttggg ttgatatttt gcttaatctg catcttttga gtaagatcat 180 ctggcagtag aagctgttct ccaggtacat ttctctagct catgtacaaa aacatcctga 240 aggactttgt caggtgcctt gctaaaagcc agatgcgttc ggcacttcct tggtctgagg 300 ttaattgcac acctacaggc actgagctca tgctttcaag tattttgtcc tcactttagg 360 gtgagtgaaa gatccccatt ataggagcac ttgggagaga tcatataaaa gctgactctt 420 gagtacatgc agtaatgggg tagatgtgtg tggtgtgtct tcattcctgc aagggtgctt 480 gttagggagt gtttccagga ggaacaagtc tgaaaccaat catgaaataa atggtaggtg 540 tgaactggaa aactaattca aaagagagat cgtgatatca gtgtggttga tacaccttgg 600 caatatggaa ggctctaatt tgcccatatt tgaaataata attcagcttt ttgtaataca 660 aaataacaaa ggattgagaa tcatggtgtc taatgtataa aagacccagg aaacataaat 720 atatcaactg cataaatgta aaatgcatgt gacccaagaa ggccccaaag tggcagacaa 780 cattgtaccc attttccctt ccaaaatgtg agcggcgggc crgctgcttt caaggctgtc 840 acacgggatg tcag 854 <210> 355 <211> 676 <212> DNA <213> Homo sapien <400> 355 gaaattaagt atgagctaaa ttccctgtta aaacctctag gggtgacaga tctcttcaac 60 caggtcaaag ctgatctttc tggaatgtca ccaaccaagg gcctatattt atcaaaagcc 120 atccacaagt catacctgga tgtcagcgaa gagggcacgg aggcagcagc agccactggg 180 gacagcatcg ctgtaaaaag cctaccaatg agagctcagt tcaaggcgaa ccaccccttc 240 ctgttcttta taaggcacac tcataccaac acgatcctat tctgtggcaa gcttgcctct 300 ccctaatcag atggggttga gtaaggctca gagttgcaga tgaggtgcag agacaatcct 360 gtgactttcc cacggccaaa aagctgttca cacctcacgc acctctgtgc ctcagtttgc 420 tcatctgcaa aataggtcta ggatttcttc caaccatttc atgagttgtg aagctaaggc 480 tttgttaatc atggaaaaag gtagacttat gcagaaagcc tttctggctt tcttatctgt 540 ggtgtctcat ttgagtgctg cccagtgaca tgatcaagcc aatgagtaaa attttaaggg 600 attagatttt cttgacttgt atgtatctgt gagatcttga ataagtgacc tgacatctct 660 gcttaaagaa aaccag 676 <210> 356 <211> 574 • ft «···
230 <212> DNA <213> Homo sapien <400 tttttttttt catgtggcac caagcttccc gtctcttagg aaaagtccac gagttctttt ttcttctgtc agatacaagc gatagacggc agctttgcag • 356 tttttcagga ctgactggca atttgtagat gaggcttaaa aaaactgcag cttgggcaac tctgcctaga tcgtttacat acagggagct cctttgtgca aaacattctc tcaaaccaaa ctcagtgcct tctgtctcag tctttgctgg agataaccag ctggaataaa gtgatagatc cttaggtcag acagtacttt ttactttatt gttcgtaggc atgagtatct gtgtgctaag gatagtaagc acaggactct aagccaatct taacaaaggc cgctgctggt ccca tgcatctcag caacaaagat gacacctgtt agtgccagcc caagcagtgc aatcgtgctc ctctcgtggc atctaccgaa tggaggacat caaaggttct gggccactca cctctcttca caaggkggtc ctggacagca ttattcaaca acagggaagg gtctggtctg tcctgagtcc
120
180
240
300
360
420
480
540
574
<210> 357 <211> 393 <212> DNA <213> Homo sapien
<400> 357
tttttttttt taatatggkg aagccacaac atagatataa araarataag gcataatctg tttttttctt tttttttttt kcttgttcac caaracttaa ttattccagt tgttatatgg tacaaaatta tttctgtttt tttttttttt tatacttaaa ttttatcaac ttttttaaaa aaagaagggc aactgtcctt tttttttttt tacagaatat aatgcaccac aaaaacccct cttaaaarat attcaagcac tttggcattt tac aratgcttta tcataaatat aaatataaac attccattgc actaaaraaa taacaaattt tcactgkact ttaattcagc ggsaaaaaag cgaattaara cctgaggkaa gcaacgktct
120
180
240
300
360
393 <210> 358 <211> 630 <212> DNA <213> Homo sapien <400: acagggtaaa ttaatgttta gcatagagta gagtttaaac gtagaacaat gaaagagagc attaaagatg tcactgaagg gggtagactg gaaagacaaa caagccagag
358 caggaggatc taggaaaatg gggaagctaa tgagagaagc ttgggcagag tagaacagct tgaagattaa gagtaatgtg gactaggtaa aataagtggg gttcctccac cttgctctca atgagtttat tccagcacag aagtgcttaa ggaaccttat ggagccgttc gatcttggtg acattacttt gactggaggc gaaattcagg aacaaccagt cggagcttac gacaaaggaa ggaggtcaca actgaaggat agaccctaag tccggtgtaa gcattcaggg tcacttcagg aggtagacct ggatagtgaa attctagcag gtagatagtg gagacatccc gtgttgaaga gtgggaaggt agaggagtca attggcactt atggccattc cttctaaggc aatcagtagg gaggacaata ttttacaaga taaggaagtg agaagggaga tcaaagaact aagagataag ctacaagaaa taactccagg ctgcgatagt acttaatgag
120
180
240
300
360
420
480 .540
600
630 <400> 359 acagcattcc aaaatataca tctagagact aarrgtaaat gctctatagt gaagaagtaa taattaaaaa atgctactaa tatagaaaat ttataatcag aaaaataaat attcagggag
120 <210> 359 <211> 620 <212> DNA <213> Homo sapien ·« «««4
• φ Φ Φ ®ΦΦ « ΦΦ
231 ctcaccagaa gaataaagtg ctctgccagt tattaaagga ttactgctgg tgaattaaat atggcattcc ccaagggaaa tagagagatt cttctggatt atgttcaata tttatttcac aggattaact gttttaggaa cagatataaa gcttcgccac ggaagagatg gacaaagcac aaagacaaca tgatacctta ggaagcaaca ctaccctttc aggcataaaa tttggagaaa tgcaacatta tgcttcatga ataatatgta gaaagaaggt ctgatgaaaa tgacatcctt aatgtaagat aactttataa gaattctggg tcaaataaaa ttctttgaag aaaacatcca aatgtcattg acttatcaaa tactatcttg gcatataacc tatgaaggca aaactaaaca aacaaaaagc tcacaccaaa caaaaccatc aacttatttt gtattctata acatacgaga ctgtaaagat gtgacagtgt <210> 360 <211> 431 <212> DNA <213> Homo sapien <400> 360 aaaaaaaaaa agccagaaca acatgtgata gataatatga ttggctgcac acttccagac tgatgaatga tgaacgtgat ggactattgt atggagcaca tcttcagcaa gagggggaaa tactcatcat ttttggccag cagttgtttg atcaccaaac atcatgccag aatactcagc aaaccttctt agctcttgag aagtcaaagt ccgggggaat ttattcctgg caattttaat tggactcctt atgtgagagc agcggctacc cagctggggt ggtggagcga acccgtcact agtggacatg cagtggcaga gctcccggta accacctaga ggaatacaca ggcacatgtg tgatgccaag cgtgacacct gtagcactca aatttgtctt gtttttgtct ttcggtgtgt agattcttag t <210> 361 <211> 351 <212> DNA <213> Homo sapien <400> 361 acactgattt ccgatcaaaa gaatcatcat ctttaccttg acttttcagg gaattactga actttcttct cagaagatag ggcacagcca ttgccttggc ctcacttgaa gggtctgcat ttgggtcctc tggtctcttg ccaagtttcc cagccactcg agggagaaat atcgggaggt ttgacttcct ccggggcttt cccgagggct tcaccgtgag ccctgcggcc ctcagggctg caatcctgga ttcaatgtct gaaacctcgc tctctgcctg ctggacttct gaggccgtca ctgccactct gtcctccagc tctgacagct cctcatctgt ggtcctgttg t <210> 362 <211> 463 <212> DNA <213 > Homo sapien <400> 362 acttcatcag gccataatgg gcgcctcccg tgagaatcca agcacctttg gactgcgcga tgtagatgag ccggctgaag atctcgcgca tgcgcggctt cagggcgaag ttcttggcgc ccccggtcac agaaatgacc aggttgggtg ttttcaggtg ccagtgctgg gtcagcagct cgtaaaggat ttccgcgtcc gtgtcgcagg acagacgtat atactcccct ttcttcccca gtgtctcaaa ctgaatatcc ccaaaggcgt cggtaggaaa ttccttggtg tgtttcttgt agttccattt ctcactttgg ttgatctggg tgccttccat gtgctggccc tgggcatagc cacacttgca cacattctcc ctgataagca cgatggtgtg gacaggaagg aaggatttca ttgagcctgc ttacggaaac tggtattgtt agcttaaata gac <210> 363 <211> 653
180
240
300
360
420
480
540
600
620
120
180 240 300 360 420 431
120
180
240
300
351
120
180
240
300
360
420
463
·· 4« ·♦··
9· · • · ·
·· • · ·
• · • · · · • ·
• · • · ·
·· · ·· ·· · ··
232 <212> DNA <213> Homo sapien <220>
<221> r.ůzné vlastnosti <222> (1)...(653) <223> n = A,T,C neboG <400 acccccgagt ctcttggnga tgggaggcac ctaacgaaac ccaacagcaa tagcaagatg ggtctgcaca ctgaggccga ntgggccctg attttggaga cccgctccag • 363 ncctgnctgg ttctgggcga tacgcaagat ttctcaccta ccccccggaa naagtgtcga gttcatggag agcccgggct gagctgggat tccntggtcc attccctcag catactgnga catcttcatg gggactgcgt tgagttgcaa gtatgagttc gantcattgc gctgcagatg gaagcaagaa gacattgagt agaattccat acctttgccg acgaccaacg aatggcaacc cctggggtga agcagaaata ctctrgggcc agaggttcag aggccttgga cccgcatggg ttgagctgct ttaccttctg gtcccattat acacacccaa gtgccagwga gacatcctct cctgnactac tccgttccta aaaagagacc tgctctggat aattggagat gacctgggat ggccagatac tggtcstggt gctcggcctc ggctgtcctc ccttggagat agacgagtgc ccatgagasc cntcgtgacc gctgctgcag gaggctgtgt gaggaaggag caccagaatg ggt
120
180
240
300
360
420
480
540
600
653 <210> 364 <211> 401 <212> DNA <213> Homo sapien <400 actagaggaa acaaagccaa aaaacaaggt tgagaaagct catttcacac acgtgcatag aagtggatgc
364 agacgttaaa tgaatgactc ggatagatct caattataga ccttcatata taaatcttta gcggaaaatg ccactctact taaaaacaat agaattgtaa tgcaaagtta aattcactat tatttgctat aaatcttctt accacttgtg atttacatr.t catcttaaga taactaaact cttggcttga ggcgttgcac caatagccca gaactctcaa aatggtttgt aaaccatagc actatagtag ggcactccat tagaggactt g agggtaaatg agacaataaa atttgacaga taaagaaata aaaatgtatc ggactgcaac
120
180
240
300
360
401 <210> 365 <211> 356 <212> DNA <213> Homo sapien <400: ccagtgtcat atgtttcagt taccagagca ctctccatcc gactgtcacg acattcggca
365 atttgggctt gctagagcgt tcaagtctct cctggctttg atgtgtatag atgtcccctt aaaatttcaa aggaatagac gcagcaggtc gcttcggcct tacagtttga tgtagccagt gaagggcact cctggcgtcc attcttgggt tgcgttttcg caagcctggg ttcttcttcg tcaaatggct actgtgagat aaagaaatga gcatcatctc tccatacaga agctcccgga ttgcatttgc gttcttcagc cttccacaaa cgttaatggt ccgctggaga gagcag
120
180
240
300
356 <400> 366 tcatcaccat tgccagcagc ggcaccgtta gtcaggtttt ctgggaatcc cacatgagta <210> 366 <211> 1851 <212> DNA <213> Homo sapien ··· ··· · · · ······· · « · · • · · ·#· · · · • · · ·· · · · ·· · · ·
233 cttccgtgtt cttcattctt cttcaatagc cataaatctt ctagctctgg ctggctgttt120 tcacttcctt taagcctttg tgactcttcc tctgatgtca gctttaagtc ttgttctgga180 ttgctgtttt cagaagagat ttttaacatc tgtttttctt tgtagtcaga aagtaactgg240 caaattacat gatgatgact agaaacagca tactctctgg ccgtctttcc agatcttgag300 aagatacatc aacattttgc tcaagtagag ggctgactat acttgctgat ccacaacata360 cagcaagtat gagagcagtt cttccatatc tatccagcgc atttaaattc gcttttttct420 tgattaaaaa tttcaccact tgctgttttt gctcatgtat accaagtagc agtggtgtga480 ggccatgctt gttttttgat tcgatatcag caccgtataa gagcagtgct ttggccatta540 atttatcttc attgtagaca gcatagtgta gagtggtatt tccatactca tctggaatat600 ttggatcagt gccatgttcc agcaacatta acgcacattc atcttcctgg cattgtacgg660 cctttgtcag agctgtcctc tttttgttgt caaggacatt aagttgacat cgtctgtcca720 gcacgagttt tactacttct gaattcccat tggcagaggc cagatgtaga gcagtcctct780 tttgcttgtc cctcttgttc acatccgtgt ccctgagcat gacgatgaga tcctttctgg840 ggactttacc ccaccaggca gctctgtgga gcttgtccag atcttctcca tggacgtggt900 acctgggatc catgaaggcg ctgtcatcgt agtctcccca agcgaccacg ttgctcttgc960 cgctcccctg cagcagggga agcagtggca gcaccacttg cacctcttgc tcccaagcgt1020 cttcacagag gagtcgttgt ggtctccaga agtgcccacg ttgctcttgc cgctccccct1080 gtccatccag ggaggaagaa atgcaggaaa tgaaagatgc atgcacgatg gtatactcct1140 cagccatcaa acttctggac agcaggtcac ttccagcaag gtggagaaag ctgtccaccc1200 acagaggatg agatccagaa accacaatat ccattcacaa acaaacactt ttcagccaga1260 cacaggtact gaaatcatgt catctgcggc aacatggtgg aacctaccca atcacacatc1320 aagagatgaa gacactgcag tatatctgca caacgtaata ctcttcatcc ataacaaaat1380 aatataattt tcctctggag ccatatggat gaactatgaa ggaagaactc cccgaagaag1440 ccagtcgcag agaagccaca ctgaagctct gtcctcagcc atcagcgcca cggacaggar1500 tgtgtttctt ccccagtgat gcagcctcaa gttatcccga agctgccgca gcacacggtg1560 gctcctgaga aacaccccag ctcttccggt ctaacacagg caagtcaata aatgtgataa1620 tcacataaac agaattaaaa gcaaagtcac ataagcatct caacagacac agaaaaggca1680 tttgacaaaa tccagcatcc ttgtatttat tgttgcagtt ctcagaggaa atgcttctaa1740 cttttcccca tttagtatta tgttggctgt gggcttgtca taggtggttt ttattacttt1800 aaggtatgtc ccttctatgč ctgttttgct gagggr.ttta attctcgtgc c1851 <210> 367 <211> 668 <212> DNA <213> Homo sapien <400> 367 cttgagcttc caaataygga agactggccc ttacacasgt caatgttaaa atgaatgcat60 ttcagtattt tgaagataaa attrgtagat ctataccttg ttttttgatt cgatatcagc120 accrtataag agcagtgctt tggccattaa tttatctttc attrtagaca gcrtagtgya180 gagtggtatt tccatactca tctggaatat ttggatcagt gccatgttcc agcaacatta240 acgcacattc atcttcctgg cattgtacgg cctgtcagta ttagacccaa aaacaaatta300 catatcttag gaattcaaaa taacattcca cagctttcac caactagtta tatttaaagg360 agaaaactca tttttatgcc atgtattgaa atcaaaccca cctcatgctg atatagttgg420 ctactgcata cctttatcag agctgtcctc tttttgttgt caaggacatt aagttgacat480 cgtctgtcca gcaggagttt tactacttct gaattcccat tggcagaggc cagatgtaga540 gcagtcctat gagagtgaga agacttttta ggaaattgta gtgcactagc tacagccata600 gcaatgattc atgtaactgc aaacactgaa tagcctgcta ttactctgcc ttcaaaaaaa660 aaaaaaaa668 <210> 368 <211> 1512 <212> DNA <213> Homo sapien ·· · · · · ·
234 <400> 368 gggtcgccca gggggsgcgt gggctttcct cgggtgggtg tgggttttcc ctgggtgggg60 tgggctgggc trgaatcccc tgctggggtt ggcaggtttt ggctgggatt gacttttytc120 ttcaaacaga ttggaaaccc ggagttacct gctagttggt gaaactggtt ggtagacgcg180 atctgttggc tacťactggc ttctcctggc tgttaaaagc agatggtggt tgaggttgat240 tccatgccgg ctgcttcttc tgtgaagaag ccatttggtc tcaggagcaa gatgggcaag300 tggtgctgcc gttgcttccc ctgctgcagg gagagcggca agagcaacgt gggcacttct360 ggagaccacg acgactctgc tatgaagaca ctcaggagca agatgggcaa gtggtgccgc420 cactgcttcc cctgctgcag ggggagtggc aagagcaacg tgggcgcttc tggagaccac480 gacgaytctg ctatgaagac actcaggaac aagatgggca agtggtgctg ccactgcttc540 ccctgctgca gggggagcrg caagagcaag gtgggcgctt ggggagacta cgatgacagt600 gccttcatgg agcccaggta ccacgtccgt ggagaagatc tggacaagct ccacagagct660 gcctggtggg gtaaagtccc cagaaaggat ctcatcgtca tgctcaggga cactgacgtg720 aacaagaagg acaagcaaaa gaggactgct ctacatctgg cctctgccaa tgggaattca780 gaagtagtaa aactcstgct ggacagacga tgtcaactta atgtccttga caacaaaaag '840 aggacagctc tgayaaaggc cgtacaatgc caggaagatg aatgtgcgtt aatgttgctg900 gaacatggca ctgatccaaa tattccagat gagtatggaa ataccactct rcactaygct960 rtctayaatg aagataaatt aatggccaaa gcactgctct tatayggtgc tgatatcgaa1020 tcaaaaaaca aggtatagat ctactaattt tatcttcaaa atactgaaat gcattcattt1080 taacattgac gtgtgtaagg gccagtcttc cgtatttgga agctcaagca taacttgaat1140 gaaaatattt tgaaatgacc taattatctm agactttatt ttaaatattg ttattttcaa1200 agaagcatta gagggtacag tttttttttt ttaaatgcac ttctggtaaa tactttcgtt1260 gaaaacactg aatttgtaaa aggtaatact tactattttt caatttttcc ctcctaggat1320 ttttttcccc taatgaatgt aagatggcaa aatttgccct gaaataggtt ttacatgaaa1380 actccaagaa aagttaaaca tgtttcagtg aatagagatc ctgctccttt ggcaagttcc1440 taaaaaacag taatagatac gaggtgatgc gcctgtcagt ggcaaggttt aagatatttc 1500 tgatctcgtg cc1512 <210> 369 <211> 1853 <212> DNA <213> Homo sapien <400> 369 gggtcgccca gggggsgcgt gggctttcct cgggtgggtg tgggttttcc ctgggtgggg60 tgggctgggc trgaatcccc tgctggggtt ggcaggtttt ggctgggatt gacttttytc120 ttcaaacaga ttggaaaccc ggagttacct gctagttggt gaaactggtt ggtagacgcg180 atctgttggc tactactggc ttctcctggc tgttaaaagc agatggtggt tgaggttgat240 tccatgccgg ctgcttcttc tgtgaagaag ccatttggtc tcaggagcaa gatgggcaag300 tggtgctgcc gttgcttccc ctgctgcagg gagagcggca agagcaacgt gggcacttct360 ggagaccacg acgactctgc tatgaagaca ctcaggagca agatgggcaa gtggtgccgc420 cactgcttcc cctgctgcag ggggagtggc aagagcaacg tgggcgcttc tggagaccac480 gacgaytctg ctatgaagac actcaggaac aagatgggca agtggtgctg ccactgcttc540 ccctgctgca gggggagcrg caagagcaag gtgggcgctt ggggagacta cgatgacagy600 gccttcatgg akcccaggta ccacgtccrt ggagaagatc tggacaagct ccacagagct660 gcctggtggg gtaaagtccc cagaaaggat ctcatcgtca tgctcaggga cackgaygtg720 aacaagargg acaagcaaaa gaggactgct ctacatctgg cctctgccaa tgggaattca780 gaagtagtaa aactcstgct ggacagacga tgtcaactta acgtccttga caacaaaaag840 aggacagctc tgayaaaggc cgtacaatgc caggaagatg aatgtgcgtt aatgttgctg900 gaacatggca ctgatccaaa tattccagat gagtatggaa ataccactct rcactaygct960 rtctayaatg aagataaatt aatggccaaa gcactgctct tatayggtgc tgatatcgaa1020 tcaaaaaaca agcatggcct cacaccactg ytacttggtr tacatgagca aaaacagcaa1080 gtsgtgaaat ttttaatyaa gaaaaaagcg aatttaaaat gcrctggata gatatggaag1140 ractgctctc atacttgctg tatgttgtgg atcagcaagt atagtcagcc ytctacttga1200 gcaaaatrtt gatgtatctt ctcaagatct ggaaagacgg ccagagagta tgctgtttct1260 ···· ·· ····· ··· ··· · ·· ······» · · ·· •••••· · ·· ····· ®· · »· ···
235 agtcatcatc atgtaatttg ccagttactt tctgactaca aagaaaaaca gatgttaaaa1320 atctcttctg aaaacagcaa tccagaacaa gacttaaagc tgacatcaga ggaagagtca1380 caaaggctta aaggaagtga aaacagccag ccagaggcat ggaaactttt aaatttaaac1440 ttttggttta atgttttttt tttttgcctt aataatatta gatagtccca aatgaaatwa1500 cctatgagac taggctttga gaatcaatag attctttttt taagaatctt ttggctagga1560 gcggtgtctc acgcctgtaa ttccagcacc ttgagaggct gaggtgggca gatcacgaga1620 tcaggagatc gagaccatcc tggctaacac ggtgaaaccc catctctact aaaaatacaa1680 aaacttagct gggtgtggtg gcgggtgcct gtagtcccag ctactcagga rgctgaggca1740 ggagaacggc atgaacccgg gaggtggagg ttgcagtgag ccgagatccg ccactacact1800 ccagcctggg tgacagagca agactctgtc tcaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaa1853 <210> 370 <211> 2184 <212> DNA <213> Homo sapien <400> 370 ggcacgagaa ttaaaaccct cagcaaaaca ggcatagaag ggacatacct taaagtaata60 aaaaccacct atgacaagcc cacagccaac ataatactaa atggggaaaa gttagaagca120 tttcctctga gaactgcaac aataaataca aggatgctgg attttgtcaa atgccttttc180 tgtgtctgtt gagatgctta tgtgactttg cttttaattc tgtttatgtg attatcacat240 ttattgactt gcctgtgtta gaccggaaga gctggggtgt ttctcaggag ccaccgtgtg300 ctgcggcagc ttcgggataa cttgaggctg catcactggg gaagaaacac aytcctgtcc360 gtggcgccga tggctgagga cagagcttca gtgtggcttc tctgcgactg gcttcctcgg420 ggagttcttc cttcatagct catccatatg gctccagagg aaaattatac tattttgtta480 tggatgaaga gtattacgtt gtgcagatat actgcagtgt cttcatctcc ťgatgtgtga540 ttgggtaggt tccaccatgt tgccgcagat gacatgattt cagtacctgt gtctggctga600 aaagtgtttg tttgtgaatg gatattgtgg tttctggatc tcatcctctg tgggtggaca660 gctttctcca ccttgctgga agtgacctgc tgcccagaag tttgatggct gaggagtata720 ccatcgtgca tgcatctttc atttcctgca tttcttcctc cctggatgga cagggggagc780 ggcaagagca acgcgggcac ttctggagac cacaacgact cctctgtgaa gacgcttggg840 agcaagaggt gcaagtggtg ctgccactgc ttcccctgct gcaggggagc ggcaagagca900 acgtggtcgc ttggggagac tacgatgaca gcgccttcat ggatcccagg taccacgtcc960 atggagaaga tccggacaag ctccacagag ctgcctggtg gggtaaagtc cccagaaagg1020 atctcatcgt catgctcagg gacacggatg tgaacaagag ggacaagcaa aagaggactg1080 ctctacatct ggcctctgcc aatgggaatt cagaagtagt aaaactcgtg ctggacagac1140 gatgtcaact taatgtcctt gacaacaaaa agaggacagc tctgacaaag gccgtacaat1200 gccaggaaga tgaatgtgcg ttaatgttgc tggaacatgg cactgatcca aatattccag1260 atgagtatgg aaataccact ctacactatg ctgtctacaa tgaagataaa ttaatggcca1320 aagcactgct cttatacggt gctgatatcg aatcaaaaaa caagcatggc ctcacaccac1380 tgctacttgg tatacatgag caaaaacagc aagtggtgaa atttttaatc aagaaaaaag1440 cgaatttaaa tgcgctggat agátatggaa gaactgctct catacttgct gtatgttgtg1500 gatcagcaag tatagtcagc cctctacttg agcaaaatgt tgatgtatct tctcaagatc1560 tggaaagacg gccagagagt atgctgtttc tagtcatcat catgtaattt gccagttact1620 ttctgactac aaagaaaaac agatgtcaaa aatctcttct gaaaacagca atccagaaca1680 agacttaaag ctgacatcag aggaagagtc acaaaggctt aaaggaagtg aaaacagcca1740 gccagaggca tggaaacctt taaacttaaa cttttggttc aatgtttttt ttttttgcct1800 taataatatt agatagtccc aaatgaaatw acctatgaga ctaggccttg agaatcaata1860 gattcttttt ttaagaatct tttggctagg agcggtgtct cacgcctgta attccagcac1920 cttgagaggc tgaggtgggc agatcacgag atcaggagat cgagaccacc ctggctaaca1980 cggtgaaacc ccatctctac taaaaataca aaaacttagc tgggtgtggt ggcgggtgcc2040 tgtagtccca gctactcagg argctgaggc aggagaatgg catgaacccg ggaggtggag2100 gttgcagtga gccgagatcc gccactacac tccagcctgg gtgacagagc aagactctgt 2160 ctcaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaa2184 • · · · · · ► · · · · ♦ 9 · · »
236 <210> 371 <211> 1855 <212> DNA <213> Homo sapien <220>
<221> různé vlastnosti <222> (1) . . . (1855) <223> η = A,T,C nebo θ <400> 371 tgcacgcatc ggccagtgtc tgtgccacgt acactgacgc cccctgagat gtgcacgccg60 cacgcgcacg ttgcacgcgc ggcagcggct tggctggctt gtaacggctt gcacgcgcac120 gccgcccccg cataaccgtc agactggcct gtaacggctt gcaggcgcac gccgcacgcg180 cgtaacggct tggctgccct gtaacggctt gcacgtgcat gctgcacgcg cgttaacggc240 ttggctggca tgtagccgct tggcttggct ttgcattytt tgctkggctk ggcgttgkty300 tcttggattg acgcttcctc cttggatkga cgtttcctcc ttggatkgac gtttcytyty360 tcgcgttcct ttgctggact tgacctttty tctgctgggt ttggcattcc tttggggtgg420 gctgggtgtt ttctccgggg gggktkgccc ttcctggggt gggcgtgggk cgcccccagg480 gggcgtgggc tttccccggg tgggtgtggg ttttcctggg gtggggtggg ctgtgctggg540 atccccctgc tggggttggc agggattgac ttttttcttc aaacagattg gaaacccgga600 gtaacntgct agttggtgaa actggttggt agacgcgatc tgctggtact actgtttctc660 ctggctgtta aaagcagatg gtggctgagg ttgattcaat gccggctgct tcttctgtga720 agaagccatt tggtctcagg agcaagatgg gcaagtggtg cgccactgct tcccctgctg780 cagggggagc ggcaagagca acgtgggcac ttctggagac cacaacgact cctctgtgaa840 gacgcttggg agcaagaggt gcaagtggtg ctgcccactg cttcccctgc tgcaggggag900 cggcaagagc aacgtggkcg cttggggaga ctacgatgac agcgccttca ťgqakcccag.960 gtaccacgtc crtggagaag atctggacaa gctccacaga gctgcctggt ggggtaaagt1020 ccccagaaag gatctcatcg tcatgctcag ggacactgay gtgaacaaga rggacaagca1080 aaagaggact gctctacatc tggcctctgc caatgggaat tcagaagtag taaaactcgt1140 gctggacaga cgatgtcaac ttaatgtcct tgacaacaaa aagaggacag ctctgacaaa1200 ggccgtacaa tgccaggaag atgaatgtgc gttaatgttg ctggaacatg gcactgatcc1260 aaatatťcca gatgagtatg gaaataccac tctacactat gctgtctaca atgaagataa1320 attaatggcc aaagcactgc tcttatacgg tgctgatatc gaatcaaaaa acaaggtata1380 gatctactaa ttttatcttc aaaatactga aatgcattca ttttaacatt gacgtgtgta1440 agggccagtc ttccgtattt ggaagctcaa gcataacttg aatgaaaata ttttgaaatg1500 acctaattat ctaagacttt attttaaata ttgttatttt caaagaagca ttagagggta1560 cagttttttt tttttaaatg cacttctggt aaatactttt gttgaaaaca ctgaatttgt1620 aaaaggtaat acttactatt tttcaatttt tccctcctag gatttttttc ccctaatgaa1680 tgtaagatgg caaaatttgc cctgaaatag gttttacatg aaaactccaa gaaaagttaa1740 acatgtttca gtgaatagag atcctgctcc tttggcaagt tcctaaaaaa cagtaatága1800 tacgaggtga tgcgcctgtc agtggcaagg tttaagatat ttctgatctc gtgcc1855 <210> 372 <211> 1059 <212> DNA <213> Homo sapien <400> 372 gcaacgtggg cacttctgga gaccacaacg actcctctgt gaagacgctt gggagcaaga60 ggtgcaagtg gtgctgccca ctgcttcccc tgctgcaggg gagcggcaag agcaacgtgg120 gcgcttgrgg agactmcgat gacagygcct tcatggagcc caggtaccac gtccgtggag180 aagatctgga caagctccac agagctgccc tggtggggta aagtccccag aaaggatctc240 atcgtcatgc tcagggacac tgaygtgaac aagarggaca agcaaaagag gactgctcta300 catctggcct ctgccaatgg gaattcagaa gtagtaaaac tcstgctgga cagacgatgt360
237 caacttaatg gaagatgaat tatggaaata ctgctcttat cttcaaaata atttggaagc ctttatttta aatgcacttc tatttttcaa ttgccctgaa agagatcccg tgtcagtggc tccttgacaa gtgcgttaat ccactctrca ayggtgctga ctgaaacgca tcaagcataa aatattgtta tggtaaatac tttttccctc ataggtttta ctccttcggc aaggtttaag caaaaagagg gttgctggaa ctaygctrtc tatcgaatca ttcattttaa cttgaatgaa ttttcaaaga ttttgttgaa ctaggatttt catgaaaact aagttcctaa atatttctga acagctctga catggcactg tayaatgaag aaaaacaagg cattgacgcg aatattttga agcattagag aacactgaat tttcccctaa ccaagaaaag aaaacagtaa tctcgtgcc yaaaggccgt atccaaatat ataaattaat tatagatcta tgtaagggcc aatgacctaa ggtacagttt ttgtaaaagg tgaatgtaag ttaaacatgt tagatacgag acaatgccag tccagatgag ggccaaagca ctaattttat agtcttccgt ttatctaaga ttttttttta taatacttac atggcaaaat ttcagtgaat gtgatgcgcc
420
480
540
600
660
720
780
840
900
960
1020
1059 <210> 373 <211> 1155 <212> DNA <213> Homo sapien <400> atggtggttg aggagcaaga agcaacgtgg atgggcaagt ggcgcttctg tggtgctgcc ggagactacg gacaagctcc ctcagggaca tctgccaatg gtccttgaca tgtgcgttaa accactctgc tatggtgctg catgagcaaa ctggatagat gtcagccttc gccagagagt aaagaaaaac accagaaata
373 aggttgattc tgggcaagtg gcacttctgg ggtgccgcca gagaccacga actgcttccc atgacagtgc acagagctgc ctgacgtgaa ggaattcaga acaaaaagag tgttgctgga actacgctat atatcgaatc aacagcaagt atggaaggac tacttgagca atgctgtttc agatgctaaa aataa catgccggct gtgctgccgt agaccacgac ctgcttcccc cgactctgct ctgctgcagg cttcatggag ctggtggggt caagaaggac agtagtaaaa gacagctctg acatggcact ctataatgaa aaaaaacaag cgtgaaattt tgctctcata aaatattgat tagtcatcat aatctcttct gcctcttctg tgcttcccct gactctgcta tgctgcaggg atgaagacac gggagcggca cccaggtacc aaagtcccca aagcaaaaga ctcctgctgg ataaaggccg gatccaaata gataaattaa catggcctca ttaatcaaga cttgctgtat gtatcttctc catgtaattt gaaaacagca tgaagaagcc gctgcaggga tgaagacact ggagtggcaa tcaggaacaa agagcaaggt acgtccgtgg gaaaggatct ggactgctct acagacgatg tacaatgcca ttccagatga tggccaaagc caccactgtt aaaaagcgaa gttgtggatc aagatctatc gccagttact atccagaaaa atttggtctc gagcggcaag caggagcaag gagcaacgtg gatgggcaag gggcgcttgg agaagatctg catcgtcatg acatctggcc tcaacttaat ggaagatgaa gtatggaaat actgctctta acttggtgta tttaaatgca agcaagtata tggacagacg ttctgactac tgtctcaaga
120
180
240
300
360
420
480
540
600
660
720
780
840
900
960 1020 1080 1140 1155 <210> 374 <211> 2000 <212> DNA <213> Homo sapien <400> 374 atggtggttg aggagcaaga agcaacgtgg atgggcaagt ggcgcttctg tggtgctgcc ggagactacg gacaagctcc ctcagggaca aggttgattc tgggcaagtg gcacttctgg ggtgccgcca gagaccacga actgcttccc atgacagtgc acagagctgc ctgacgtgaa catgccggct gtgctgccgt agaccacgac ctgcttcccc cgactctgct ctgctgcagg cttcatggag ctggtggggt caagaaggac gcctcttctg tgcttcccct gactctgcta tgctgcaggg atgaagacac gggagcggca cccaggtacc aaagtcccca aagcaaaaga tgaagaagcc gctgcaggga tgaagacact ggagtggcaa tcaggaacaa agagcaaggt acgtccgtgg gaaaggatct ggactgctct atttggtctc gagcggcaag caggagcaag gagcaacgtg gatgggcaag gggcgcttgg agaagatctg catcgtcatg acatctggcc
120
180
240
300
360
420
480
540 • · • · · • · • · • · · i
·· ·· · ·
238 tctgccaatg gtccttgaca tgtgcgttaa accactctgc tatggtgctg catgagcaaa ctggatagat gtcagccttc gccagagagt aaagaaaaac ctgacatcag atgtctcaag aagcatgaaa aatggtgata cctgacaacg aaacagatgc tcagaggaag tttatggcta ctgactaatg agaacacctg caaaatgata attctgattc cttagttgta gccatgctaa aaaaaaaaaa ggaattcaga acaaaaagag tgttgctgga actacgctat atatcgaatc aacagcaagt atggaaggac tacttgagca atgctgtttc agatgctaaa aggaagagtc aaccagaaat gtaataatgt atggattaat aaagtgaaga caaaatactc agtcacaaag tcgaagaaat gtgccactgc aaagccagca ctcagaagca atgaagaaaa agaaagaaaa gactggagct aaaaaaaaaa agtagtaaaa gacagctctg acatggcact ctataatgaa aaaaaacaag cgtgaaattt tgctctcata aaatattgat tagtcatcat aatctcttct acaaaggttc aaataaggat gggattacta tcctcaaagg gtatcacaga ttctgaaaac gcttgagggc gaagaagcac tggcaatggt atttcctgac attttgtgaa gcagatagaa agacatcttg agacacaatg ctcctgctgg ataaaggccg gatccaaata gataaattaa catggcctca ttaatcaaga ctcgctgtat gtatcttctc catgtaattt gaaaacagca aaaggcagtg ggtgatagag gaaaacctga aagagcagaa atttgcgaat agcaacccag agtgaaaatg ggaagtactc gatgatggat actgagaatg gaacagaaca gtggttgaaa catgaaaata aaacatcaga acagacgatg tacaatgcca ttccagatga tggccaaagc caccactgtt aaaaagcgaa gttgtggatc aagatctatc gccagttact atccagaaca aaaatagcca aggttgaaga ctaatggtgt cacctgaaaa tagtttctga aacaagactt gccagccaga atgtcggatt taattcctcc aagagtatca ctggaatatt aaatgaattc gtacgttgcg gccagctaaa tcaacttaat ggaagatgaa gtatggaaat actgctctta acttggtgta tttaaatgca agcaagtata tggacagacg ttctgactac agacttaaag gccagagaaa agaaatgaag cactgctggc tcagcaattt ctacaaagaa aaagctgaca gctagaaaat cccagaaaac aaggaagagc cagtgacgaa acacgatgag tgagctttct ggaagaaatt aaaaaaaaaa
600 660 720 780 840
900
960 1020 1080 1140 1200 1260 1320 1380 1440 1500 1560 1620 1680 1740 1800 1860 1920 1980 2000
<210> 375 <211> 2040 <212> DNA <213> Homo sapien
<400> 375
atggtggttg aggagcaaga agcaacgtgg atgggcaagt ggcgcttctg tggtgctgcc ggagactacg gacaagctcc ctcagggaca tctgccaatg gtccttgaca tgtgcgttaa accactctgc tatggtgctg catgagcaaa ctggatagat gtcagccttc gccagagagt aaagaaaaac ctgacatcag atgtctcaag aagcatgaaa aatggtgata aggttgattc tgggcaagtg gcacttctgg ggtgccgcca gagaccacga actgcttccc atgacagtgc acagagctgc ctgacgtgaa ggaattcaga acaaaaagag tgttgctgga actacgctat atatcgaatc aacagcaagt atggaaggac tacttgagca atgctgtttc agatgctaaa aggaagagtc aaccagaaat gtaataatgt atggattaat catgccggct gtgctgccgt agaccacgac ctgcttcccc cgactctgct ctgctgcagg cttcatggag ctggtggggt caagaaggac agtagtaaaa gacagctctg acatggcact ctataatgaa aaaaaacaag cgtgaaattt tgctctcata aaatatcgat tagtcatcat aatctcttct acaaaggttc aaataaggat gggattacta tcctcaaagg gcctcttctg tgcttcccct gactctgcta tgctgcaggg atgaagacac gggagcggca cccaggtacc aaagtcccca aagcaaaaga ctcctgctgg ataaaggccg gatccaaata gataaattaa catggcctca ttaatcaaga cttgctgcat gtatcttctc catgtaattt gaaaacagca aaaggcagtg ggtgatagag gaaaacctga aagagcagaa tgaagaagcc gctgcaggga tgaagacact ggagtggcaa tcaggaacaa agagcaaggt acgtccgtgg gaaaggatct ggactgctct acagacgatg tacaatgcca ttccagatga tggccaaagc caccactgtt aaaaagcgaa gttgtggatc aagatctatc gccagttact atccagaaca aaaatagcca aggttgaaga ctaatggtgt cacctgaaaa atttggtctc gagcggcaag caggagcaag gagcaacgtg gatgggcaag gggcgcttgg agaagatctg catcgtcatg acatctggcc tcaacttaat ggaagatgaa gtatggaaat actgctctta acttggtgta tttaaatgca agcaagtata tggacagacg ttctgactac agacttaaag gccagagaaa agaaatgaag cactgctggc tcagcaattt
120
180
240
300
360
420
480
540
600
660
720
780
840
900
960 1020 1080 1140 1200 1260 1320 1380
239 cctgacaacg aaacagatgc tcagaggaag caagaaccag gaaatgaaga actgctggca cagcaatttc aagcaatttt gaaaagcaga gaaaaagaca gagctagaca aaagtgaaga caaaatactc agtcacaaag aaataaataa agcacggaag atggtgatga ctgacactga gtgaagaaca tagaagtggt tcttgcatga caatgaaaca gtatcacaga ttctgaaaac gcttgagggc ggatggtgat tactcatgtc tggattaatt gaatgaagag gaacactgga tgaaaaaatg aaatagtacg tcagagccag atttgcgaat agcaacccag agtgaaaatg agagagctag ggattcccag cctccaagga tatcacagtg atattacacg aattctgagc ttgcgggaag ctaaaaaaaa tagtttctga aacaagactt gccagccaga aaaattttat aaaacctgac agagcagaac acgaacaaaa atgagattct tttctcttag aaattgccat aaaaaaaaaa ctacaaagaa aaagctgaca gaaaagatct ggctatcgaa taatggtgcc acctgaaagc tgatactcag gattcatgaa ttgtaagaaa gctaagactg aaaaaaaaaa
1440 1500 1560 1620 1680 1740 1800 1860 1920 1980 2040 <210> 376 <211> 329 <212> PRT <213> Homo sapien <400> 376
Met Asp Ile Val Val Ser Gly Ser His Pro Leu Trp Val Asp Ser Phe
1 5 10 15
Leu His Leu Ala Gly Ser Asp Leu Leu Ser Arg Ser Leu Met Ala Glu
20 25 30
Glu Tyr Thr Ile Val His Ala Ser Phe Ile Ser Cys Ile Ser Ser Ser
35 40 45
Leu Asp Gly Gin Gly Glu Arg Gin Glu Gin Arg Gly His Phe Trp Arg
50 55 60
Pro Gin Arg Leu Leu Cys Glu Asp Ala Trp Glu Gin Glu Val Gin Val
65 70 75 80
Val Leu Pro Leu Leu Pro Leu Leu Gin Gly Ser Gly Lys Ser Asn Val
85 90 95
Val Ala Trp Gly Asp Tyr Asp Asp Ser Ala Phe Met Asp Pro Arg Tyr
100 105 110
His Val His Gly Glu Asp Leu Asp Lys Leu His Arg Ala Ala Trp Trp
115 120 125
Gly Lys Val Pro Arg Lys Asp Leu Ile Val Met Leu Arg Asp Thr Asp
130 135 140
Val Asn Lys Arg Asp Lys Gin Lys Arg Thr Ala Leu His Leu Ala Ser
145 150 155 160
Ala Asn Gly Asn Ser Glu Val Val Lys Leu Val Leu Asp Arg Arg Cys
165 170 175'
Gin Leu Asn Val Leu Asp Asn Lys Lys Arg Thr Ala Leu Thr Lys Ala
180 185 190
Val Gin Cys Gin Glu Asp Glu Cys Ala Leu Met Leu Leu Glu His Gly
195 200 205
Thr Asp Pro Asn Ile Pro Asp Glu Tyr Gly Asn Thr Thr Leu His Tyr
210 215 220
Ala Val Tyr Asn Glu Asp Lys Leu Met Ala Lys Ala Leu Leu Leu Tyr
225 230 235 240
Gly Ala Asp Ile Glu Ser Lys Asn Lys His Gly Leu Thr Pro Leu Leu
245 250 255
Leu Gly Ile His Glu Gin Lys Gin Gin Val Val Lys Phe Leu Ile Lys
260 265 270
Lys Lys Ala Asn Leu Asn Ala Leu Asp Arg Tyr Gly Arg Thr Ala Leu
275 280 285
Ile Leu Ala Val Cys Cys Gly Ser Ala Ser Ile Val Ser Pro Leu Leu
290 295 300
Glu Gin Asn Val Asp Val Ser Ser Gin Asp Leu Glu Arg Arg Pro Glu
305 310 315 320
Ser Met Leu Phe Leu Val Ile Ile Met
325 <210> 377 <211> 148 <212> PRT <213> Homo sapien <220>
<221> VARIANT <222> (1)...(148) <223> Xaa = jakákoliv aminokyselina <400> 377
Met 1 Thr Xaa Pro Ser 5 Trp Ser Pro Gly Thr Thr 10 Ser Val Glu Lys 15 Ile
Trp Thr Ser Ser Thr Glu Leu Pro Trp Trp Gly Lys Val Pro Arg Lys
20 25 30
Asp Leu Ile Val Met Leu Arg Asp Thr Asp Val Asn Lys Xaa Asp Lys
35 40 45
Gin Lys Arg Thr Ala Leu His Leu Ala Ser Ala Asn Gly Asn Ser Glu
50 55 60
Val Val Lys Leu Xaa Leu Asp Arg Arg Cys Gin Leu Asn Val Leu Asp
65 70 75 80
Asn Lys Lys Arg Thr Ala Leu Xaa Lys Ala Val Gin Cys Gin Glu Asp
85 90 95
Glu Cys Ala Leu Met Leu Leu Glu His Gly Thr Asp Pro Asn Ile Pro
100 105 110
Asp Glu Tyr Gly Asn Thr Thr Leu His Tyr Ala Xaa Tyr Asn Glu Asp
115 120 125
Lys Leu Met Ala Lys Ala Leu Leu Leu Tyr Gly Ala Asp Ile Glu Ser
130 135 140
Lys Asn Lys Val
145 <210> 378 <211> 1719 <212> PRT <213> Homo sapien <400> 378
Met Val 1 Val Glu Val Asp Ser Met 5 Pro Ala Ala Ser Ser Val Lys Lys
10 15
Pro Phe Gly Leu Arg Ser Lys Met Gly Lys Trp Cys Cys Arg Cys Phe
20 25 30
Pro Cys Cys Arg Glu Ser Gly Lys Ser Asn Val Gly Thr Ser Gly Asp
35 40 45
His Asp Asp Ser Ala Met Lys Thr Leu Arg Ser Lys Met Gly Lys Trp
50 55 60
Cys Arg His Cys Phe Pro Cys Cys Arg Gly Ser Gly Lys Ser Asn Val
65 70 75 80
Gly Ala Ser Gly Asp His Asp Asp Ser Ala Met Lys Thr Leu Arg Asn
• · 4 · 4
241
85 90 95
Lys Met Gly Lys Trp Cys Cys His Cys Phe Pro Cys Cys Arg Gly Ser
100 105 110
Gly Lys Ser Lys Val Gly Ala Trp Gly Asp Tyr Asp Asp Ser Ala Phe
115 120 125
Met Glu Pro Arg Tyr His Val Arg Gly Glu Asp Leu Asp Lys Leu His
130 135 140
Arg Ala Ala Trp Trp Gly Lys Val Pro Arg Lys Asp Leu Ile Val Met
145 150 155 160
Leu Arg Asp Thr Asp Val Asn Lys Lys Asp Lys Gin Lys Arg Thr Ala
165 170 175
Leu His Leu Ala Ser Ala Asn Gly Asn Ser Glu val Val Lys Leu Leu
180 185 190
Leu Asp Arg Arg Cys Gin Leu Asn Val Leu Asp Asn Lys Lys Arg Thr
195 200 205
Ala Leu Ile Lys Ala Val Gin Cys Gin Glu Asp Glu Cys Ala Leu Met
210 215 220
Leu Leu Glu His Gly Thr Asp Pro Asn Ile Pro Asp Glu Tyr Gly Asn
225 230 235 240
Thr Thr Leu His Tyr Ala Ile Tyr Asn Glu Asp Lys Leu Met Ala Lys
245 250 255
Ala Leu Leu Leu Tyr Gly Ala Asp Ile Glu Ser Lys Asn Lys His Gly
260 265 270
Leu Thr Pro Leu Leu Leu Gly Val His Glu Gin Lys Gin Gin Val Val
275 280 285
Lys Phe Leu Ile Lys Lys Lys Ala Asn Leu Asn Ala Leu Asp Arg Tyr
290 295 300
Gly Arg Thr Ala Leu Ile Leu Ala Val Cys Cys Gly Ser Ala Ser Ile
305 310 315 320
Val Ser Leu Leu Leu Glu Gin Asn Ile Asp Val Ser Ser Gin Asp Leu
325 330 335
Ser Gly Gin Thr Ala Arg Glu Tyr Ala Val Ser Ser His His His Val
340 345 350
Ile Cys Gin Leu Leu Ser Asp Tyr Lys Glu Lys Gin Met Leu Lys Ile
355 360 365
Ser Ser Glu Asn Ser Asn Pro Glu Asn Val Ser Arg Thr Arg Asn Lys
370 375 380
Pro Arg Thr His Met Val Val Glu Val Asp Ser Met Pro Ala Ala Ser
385 390 395 400
Ser Val Lys Lys Pro Phe Gly Leu Arg Ser Lys Met Gly Lys Trp Cys
405 410 415
Cys Arg Cys Phe Pro Cys Cys Arg Glu Ser Gly Lys Ser Asn Val Gly
420 425 430
Thr Ser Gly Asp His Asp Asp Ser Ala Met Lys Thr Leu Arg Ser Lys
435 440 445
Met Gly Lys Trp Cys Arg His Cys Phe Pro Cys Cys Arg Gly Ser Gly
450 455 460
Lys Ser Asn Val Gly Ala Ser Gly Asp His Asp Asp Ser Ala Met Lys
465 470 475 480
Thr Leu Arg Asn Lys Met Gly Lys Trp Cys Cys His Cys Phe Pro Cys
485 490 495
Cys Arg Gly Ser Gly Lys Ser Lys Val Gly Ala Trp Gly Asp Tyr Asp
500 505 510
Asp Ser Ala Phe Met Glu Pro Arg Tyr His Val Arg Gly Glu Asp Leu
515 520 525
• 4
242
Asp Lys 530 Leu His Arg Ala Ala Trp Trp Gly Lys Val Pro Arg Lys Asp
535 540
Leu Ile Val Met Leu Arg Asp Thr Asp Val Asn Lys Lys Asp Lys Gin
545 550 555 560
Lys Arg Thr Ala Leu His Leu Ala Ser Ala Asn Gly Asn Ser Glu Val
565 570 575
Val Lys Leu Leu Leu Asp Arg Arg Cys Gin Leu Asn Val Leu Asp Asn
580 585 590
Lys Lys Arg Thr Ala Leu Ile Lys Ala Val Gin Cys Gin Glu Asp Glu
595 600 605
Cys Ala Leu Met Leu Leu Glu His Gly Thr Asp Pro Asn Ile Pro Asp
610 615 620
Glu Tyr Gly Asn Thr Thr Leu His Tyr Ala Ile Tyr Asn Glu Asp Lys
625 630 635 640
Leu Met Ala Lys Ala Leu Leu Leu Tyr Gly Ala Asp Ile Glu Ser Lys
645 650 655
Asn Lys His Gly Leu Thr Pro Leu Leu Leu Gly Val His Glu Gin Lys
660 665 670
Gin Gin Val Val Lys Phe Leu Ile Lys Lys Lys Ala Asn Leu Asn Ala
675 680 685
Leu Asp Arg Tyr Gly Arg Thr Ala Leu Ile Leu Ala Val Cys Cys Gly
690 695 700
Ser Ala Ser Ile Val Ser Leu Leu Leu Glu Gin Asn Ile Asp Val Ser
705 710 715 720
Ser Gin Asp Leu Ser Gly Gin Thr Ala Arg Glu 730 Tyr Ala Val Ser. 735 Ser
725
His His His Val Ile Cys Gin Leu Leu Ser Asp Tyr Lys Glu Lys Gin
740 745 750
Met Leu Lys Ile Ser Ser Glu Asn Ser Asn Pro Glu Gin Asp Leu Lys
755 760 765
Leu Thr Ser Glu Glu Glu Ser Gin Arg Phe Lys Gly Ser Glu Asn Ser
770 775 780
Gin Pro Glu Lys Met Ser Gin Glu Pro Glu Ile Asn Lys Asp Gly Asp
785 790 795 800
Arg Glu Val Glu Glu Glu Met Lys Lys His Glu Ser Asn Asn Val Gly
805 810 815
Leu Leu Glu Asn Leu Thr Asn Gly Val Thr Ala Gly Asn Gly Asp Asn
820 825 830
Gly Leu Ile Pro Gin Arg Lys Ser Arg Thr Pro Glu Asn Gin Gin Phe
835 840 845
Pro Asp Asn Glu Ser Glu Glu Tyr His Arg Ile Cys Glu Leu Val Ser
850 855 860
Asp Tyr Lys Glu Lys Gin Meť Pro Lys Tyr Ser Ser Glu Asn Ser Asn
865 870 875 880
Pro Glu Gin Asp Leu Lys Leu Thr Ser Glu Glu Glu Ser Gin Arg Leu
885 890 895
Glu Gly Ser Glu Asn Gly Gin Pro Glu Leu Glu Asn Phe Met Ala Ile
900 905 910
Glu Glu Met Lys Lys His Gly Ser Thr His Val Gly Phe Pro Glu Asn
915 920 925
Leu Thr Asn Gly Ala Thr Ala Gly Asn Gly Asp Asp Gly Leu Ile Pro
930 935 940
Pro Arg Lys Ser Arg Thr Pro Glu Ser Gin Gin Phe Pro Asp Thr Glu
945 950 955 960
Asn Glu Glu Tyr His Ser Asp Glu Gin Asn Asp Thr Gin Lys Gin Phe
965 970 975
243
Cys Glu Glu Gin Asn 980 Thr Gly Ile Leu 985 His Asp Glu Ile Leu 990 Ile His
Glu Glu Lys Gin Ile Glu Val Val Glu Lys Met Asn Ser Glu Leu Ser
995 1000 1005
Leu Ser Cys Lys Lys Glu Lys Asp Ile Leu His Glu Asn Ser Thr Leu
1010 1015 1020
Arg Glu Glu Ile Ala Met Leu Arg Leu Glu Leu Asp Thr Met Lys His
1025 1030 1035 104
Gin Ser Gin Leu Pro Arg Thr His Met Val Val Glu Val Asp Ser Met
1045 1050 1055
Pro Ala Ala Ser Ser Val Lys Lys Pro Phe Gly Leu Arg Ser Lys Met
1060 1065 1070
Gly Lys Trp Cys Cys Arg Cys Phe Pro Cys Cys Arg Glu Ser Gly Lys
1075 1080 1085
Ser Asn Val Gly Thr Ser Gly Asp His Asp Asp Ser Ala Met Lys Thr
1090 1095 1100
Leu Arg Ser Lys Met Gly Lys Trp Cys Arg His Cys Phe Pro Cys Cys
1105 1110 1115 112
Arg Gly Ser Gly Lys Ser Asn Val Gly Ala Ser Gly Asp His Asp Asp
1125 1130 1135
Ser Ala Met Lys Thr Leu Arg Asn Lys Met Gly Lys Trp Cys Cys His
1140 1145 1150
Cys Phe Pro Cys Cys Arg Gly Ser Gly Lys Ser Lys Val Gly Ala Trp
1155 1160 1165
Gly Asp Tyr Asp Asp Ser Ala Phe Met Glu Pro Arg Tyr His Val Arg
1170 1175 1180
Gly Glu Asp Leu Asp Lys Leu His Arg Ala Ala Trp Trp Gly Lys Val
1185 1190 1195 120
Pro Arg Lys Asp Leu Ile Vál Met Leu Arg Asp Thr Asp Val Asn Lys
1205 1210 1215
Lys Asp Lys Gin Lys Arg Thr Ala Leu His Leu Ala Ser Ala Asn Gly
1220 1225 1230
Asn Ser Glu Val Val Lys Leu Leu Leu Asp Arg Arg Cys Gin Leu Asn
1235 1240 1245
Val Leu Asp Asn Lys Lys Arg Thr Ala Leu Ile Lys Ala Val Gin Cys
1250 1255 1260
Gin Glu Asp Glu Cys Ala Leu Met Leu Leu Glu His Gly Thr Asp Pro
1265 1270 1275 128
Asn Ile Pro Asp Glu Tyr Gly Asn Thr Thr Leu His Tyr Ala Ile Tyr
1285 1290 1295
Asn Glu Asp Lys Leu Met Ala Lys Ala Leu Leu Leu Tyr Gly Ala Asp
1300 1305 1310
Ile Glu Ser Lys Asn Lys His Gly Leu Thr Pro Leu Leu Leu Gly Val
1315 1320 1325
His Glu Gin Lys Gin Gin Val Val Lys Phe Leu Ile Lys Lys Lys Ala
1330 1335 1340
Asn Leu Asn Ala Leu Asp Arg Tyr Gly Arg Thr Ala Leu Ile Leu Ala
1345 1350 1355 136
Val Cys Cys Gly Ser Ala Ser Ile Val Ser Leu Leu Leu Glu Gin Asn
1365 1370 1375
Ile Asp Val Ser Ser Gin Asp Leu Ser Gly Gin Thr Ala Arg Glu Tyr
1380 1385 1390
Ala Val Ser Ser His His His Val Ile Cys Gin Leu Leu Ser Asp Tyr
1395 1400 1405 ♦ Φ • 4 ··«<
244
Lys Glu Lys 1410 Gin Met Leu Lys Ile Ser Ser Glu Asn Ser Asn Pro Glu
1415 1420
Gin Asp Leu Lys Leu Thr Ser Glu Glu Glu Ser Gin Arg Phe Lys Gly
1425 1430 1435 144
Ser Glu Asn Ser Gin Pro Glu Lys Met Ser Gin Glu Pro Glu Ile Asn
1445 1450 1455
Lys Asp Gly Asp Arg Glu Val Glu Glu Glu Met Lys Lys His Glu Ser
1460 1465 1470
Asn Asn Val Gly Leu Leu Glu Asn Leu Thr Asn Gly Val Thr Ala Gly
1475 1480 1485
Asn Gly Asp Asn Gly Leu Ile Pro Gin Arg Lys Ser Arg Thr Pro Glu
1490 1495 1500
Asn Gin Gin Phe Pro Asp Asn Glu Ser Glu Glu Tyr His Arg Ile Cys
1505 1510 1515 152
Glu Leu Val Ser Asp Tyr Lys Glu Lys Gin Met Pro Lys Tyr Ser Ser
1525 1530 1535
Glu Asn Ser Asn Pro Glu Gin Asp Leu Lys Leu Thr Ser Glu Glu Glu
1540 1545 1550
Ser Gin Arg Leu Glu Gly Ser Glu Asn Gly Gin Pro Glu Lys Arg Ser
1555 1560 1565
Gin Glu Pro Glu Ile Asn Lys Asp Gly Asp Arg Glu Leu Glu Asn Phe
1570 1575 1580
Met Ala Ile Glu Glu Met Lys Lys His Gly Ser Thr His Val Gly Phe
1585 1590 1595 160
Pro Glu Asn Leu Thr Asn Gly Ala Thr Ala Gly Asn Gly Asp Asp Gly
1605 ' 1610 1615
Leu Ile Pro Pro Arg Lys Ser Arg Thr Pro Glu Ser Gin Gin Phe Pro
1620 1625 1630
Asp Thr Glu Asn Glu Glu Tyr His Ser Asp Glu Gin Asn Asp Thr Gin
1635 1640 1645
Lys Gin Phe Cys Glu Glu Gin Asn Thr Gly Ile Leu His Asp Glu Ile
1650 1655 1660
Leu Ile His Glu Glu Lys Gin Ile Glu Val Val Glu Lys Met Asn Ser
1665 1670 1675 168
Glu Leu Ser Leu Ser Cys Lys Lys Glu Lys Asp Ile Leu His Glu Asn
1685 1690 1695
Ser Thr Leu Arg Glu Glu Ile Ala Met Leu Arg Leu Glu Leu Asp Thr
1700 1705 1710
Met Lys His Gin Ser Gin Leu
1715
<210> 379
<211> 656
<212> PRT
<213> Homo sapien
<400> 379
Met Val Val Glu Val Asp Ser Met Pro Ala Ala Ser Ser Val Lys Lys
1 5 10 15
Pro Phe Gly Leu Arg Ser Lys Met Gly Lys Trp Cys Cys Arg Cys Phe
20 25 30
Pro Cys Cys Arg Glu Ser Gly Lys Ser Asn Val Gly Thr Ser Gly Asp
35 40 45
His Asp Asp Ser Ala Met Lys Thr Leu Arg Ser Lys Met Gly Lys Trp
50 55 60
245
Cys Arg His Cys Phe Pro Cys Cys Arg Gly Ser Gly Lys Ser Asn Val
65 70 75 80
Gly Ala Ser Gly Asp His Asp Asp Ser Ala Met Lys Thr Leu Arg Asn
85 90 95
Lys Met Gly Lys Trp Cys Cys His Cys Phe Pro Cys Cys Arg Gly Ser
100 105 110
Gly Lys Ser Lys Val Gly Ala Trp Gly Asp Tyr Asp Asp Ser Ala Phe
115 120 125
Met Glu Pro Arg Tyr His Val Arg Gly Glu Asp Leu Asp Lys Leu His
130 135 140
Arg Ala Ala Trp Trp Gly Lys Val Pro Arg Lys Asp Leu Ile Val Met
145 150 155 160
Leu Arg Asp Thr Asp Val Asn Lys Lys Asp Lys Gin Lys Arg Thr Ala
165 170 175
Leu His Leu Ala Ser Ala Asn Gly Asn Ser Glu Val Val Lys Leu Leu
180 185 190
Leu Asp Arg Arg Cys Gin Leu Asn Val Leu Asp Asn Lys Lys Arg Thr
195 200 205
Ala Leu Ile Lys Ala Val Gin Cys Gin Glu Asp Glu Cys Ala Leu Met
210 215 220
Leu Leu Glu His Gly Thr Asp Pro Asn Ile Pro Asp Glu Tyr Gly Asn
225 230 235 240
Thr Thr Leu His Tyr Ala Ile Tyr Asn Glu Asp Lys Leu Met Ala Lys
245 250 255
Ala Leu Leu Leu Tyr Gly Ala Asp Ile Glu Ser Lys Asn Lys His Gly
260 265 270
Leu Thr Pro Leu Leu Leu Gly Val His Glu Gin Lys Gin Gin Val Val
275 280 285
Lys Phe Leu Ile Lys Lys Lys Ala Asn Leu Asn Ala Leu Asp Arg Tyr
290 295 300
Gly Arg Thr Ala Leu Ile Leu Ala Val Cys Cys Gly Ser Ala Ser Ile
305 310 315 320
Val Ser Leu Leu Leu Glu Gin Asn Ile Asp Val Ser Ser Gin Asp Leu
325 330 335
Ser Gly Gin Thr Ala Arg Glu Tyr Ala Val Ser Ser His His His Val
340 345 350
Ile Cys Gin Leu Leu Ser Asp Tyr Lys Glu Lys Gin Met Leu Lys Ile
355 360 365
Ser Ser Glu Asn Ser Asn Pro Glu Gin Asp Leu Lys Leu Thr Ser Glu
370 375 380
Glu Glu Ser Gin Arg Phe Lys Gly Ser Glu Asn Ser Gin Pro Glu Lys
385 390 395 400
Met Ser Gin Glu Pro Glu Ile Asn Lys Asp Gly Asp Arg Glu Val Glu
405 410 415
Glu Glu Met Lys Lys His Glu Ser Asn Asn Val Gly Leu Leu Glu Asn
420 425 430
Leu Thr Asn Gly Val Thr Ala Gly Asn Gly Asp Asn Gly Leu Ile Pro
435 440 445
Gin Arg Lys Ser Arg Thr Pro Glu Asn Gin Gin Phe Pro Asp Asn Glu
450 455 460
Ser Glu Glu Tyr His Arg Ile Cys Glu Leu Val Ser Asp Tyr Lys Glu
465 470 475 480
Lys Gin Met Pro Lys Tyr Ser Ser Glu Asn Ser Asn Pro Glu Gin Asp
485 490 495
Leu Lys Leu Thr Ser Glu Glu Glu Ser Gin Arg Leu Glu Gly Ser Glu
»» ··«» ··· J
246
500 505 510
Asn Gly Gin Pro Glu Leu Glu Asn Phe Met Ala Ile Glu Glu Met Lys
515 520 525
Lys His Gly Ser Thr His Val Gly Phe Pro Glu Asn Leu Thr Asn Gly
530 535 540
Ala Thr Ala Gly Asn Gly Asp Asp Gly Leu Ile Pro Pro Arg Lys Ser
545 550 555 560
Arg Thr Pro Glu Ser Gin Gin Phe Pro Asp Thr Glu Asn Glu Glu Tyr
565 570 575
His Ser Asp Glu Gin Asn Asp Thr Gin Lys Gin Phe Cys Glu Glu Gin
580 5Θ5 590
Asn Thr Gly Ile Leu His Asp Glu Ile Leu Ile His Glu Glu Lys Gin
595 600 605
Ile Glu Val Val Glu Lys Met Asn Ser Glu Leu Ser Leu Ser Cys Lys
610 615 620
Lys Glu Lys Asp Ile Leu His Glu Asn Ser Thr Leu Arg Glu Glu Ile
625 630 635 640
Ala Met Leu Arg Leu Glu Leu Asp Thr Met Lys His Gin Ser Gin Leu
645 650 655
<210> 380 <2I1> 671 <212> PRT <213> Homo sapien
<400> 380
Met Val Val Glu Val Asp Ser Met Pro Ala Ala Ser Ser Val Lys Lys
1 5 10 15
Pro Phe Gly Leu Arg Ser Lys Met Gly Lys Trp Cys Cys Arg Cys Phe
20 25 30
Pro Cys Cys Arg Glu Ser Gly Lys Ser Asn Val Gly Thr Ser Gly Asp
35 40 45
His Asp Asp Ser Ala Met Lys Thr Leu Arg Ser Lys Met Gly Lys Trp
50 55 60
Cys Arg His Cys Phe Pro Cys Cys Arg Gly Ser Gly Lys Ser Asn Val
65 70 75 80
Gly Ala Ser Gly Asp His Asp Asp Ser Ala Met Lys Thr Leu Arg Asn
85 90 95
Lys Met Gly Lys Trp Cys Cys His Cys Phe Pro Cys Cys Arg Gly Ser
100 105 110
Gly Lys Ser Lys Val Gly Ala Trp Gly Asp Tyr Asp Asp Ser Ala Phe
115 120 125
Met Glu Pro Arg Tyr His Val Arg Gly Glu Asp Leu Asp Lys Leu His
130 135 140
Arg Ala Ala Trp Trp Gly Lys Val Pro Arg Lys Asp Leu Ile Val Met
145 150 155 160
Leu Arg Asp Thr Asp Val Asn Lys Lys Asp Lys Gin Lys Arg Thr Ala
165 170 175
Leu His Leu Ala Ser Ala Asn Gly Asn Ser Glu Val Val Lys Leu Leu
180 185 190
Leu Asp Arg Arg Cys Gin Leu Asn Val Leu Asp Asn Lys Lys Arg Thr
195 200 205
Ala Leu Ile Lys Ala Val Gin Cys Gin Glu Asp Glu Cys Ala Leu Met
210 215 220
Leu Leu Glu His Gly Thr Asp Pro Asn Ile Pro Asp Glu Tyr Gly Asn
*· ···· • fcfc * · · · ·· • fcfc ·· • « 9 9 9 9 ···· fc • fcfc fcfc fcfc
225 230 235 240
Thr Thr Leu His Tyr Ala Ile Tyr Asn Glu Asp Lys Leu Met Ala Lys
245 250 255
Ala Leu Leu Leu Tyr Gly Ala Asp Ile Glu Ser Lys Asn Lys His Gly
260 265 270
Leu Thr Pro Leu Leu Leu Gly Val His Glu Gin Lys Gin Gin Val Val
275 280 285
Lys Phe Leu Ile Lys Lys Lys Ala Asn Leu Asn Ala Leu Asp Arg Tyr
290 295 300
Gly Arg Thr Ala Leu Ile Leu Ala Val Cys Cys Gly Ser Ala Ser Ile
305 310 315 320
Val Ser Leu Leu Leu Glu Gin Asn Ile Asp Val Ser Ser Gin Asp Leu
325 330 335
Ser Gly Gin Thr Ala Arg Glu Tyr Ala Val Ser Ser His His His Val
340 345 350
Ile Cys Gin Leu Leu Ser Asp Tyr Lys Glu Lys Gin Met Leu Lys Ile
355 360 365
Ser Ser Glu Asn Ser Asn Pro Glu Gin Asp Leu Lys Leu Thr Ser Glu
370 375 380
Glu Glu Ser Gin Arg Phe Lys Gly Ser Glu Asn Ser Gin Pro Glu Lys
385 390 395 400
Met Ser Gin Glu Pro Glu Ile Asn Lys Asp Gly Asp Arg Glu Val Glu
405 410 415
Glu Glu Met Lys Lys His Glu Ser Asn Asn Val Gly Leu Leu Glu Asn
420 425 430
Leu Thr Asn Gly Val Thr Ala Gly Asn Gly Asp Asn Gly Leu Ile Pro
435 440 445
Gin Arg Lys Ser Arg Thr Pro Glu Asn Gin Gin Phe Pro Asp Asn Glu
450 455 460
Ser Glu Glu Tyr His Arg Ile Cys Glu Leu Val Ser Asp Tyr Lys Glu
465 470 475 480
Lys Gin Met Pro Lys Tyr Ser Ser Glu Asn Ser Asn Pro Glu Gin Asp
485 490 495
Leu Lys Leu Thr Ser Glu Glu Glu Ser Gin Arg Leu Glu Gly Ser Glu
500 505 510
Asn Gly Gin Pro Glu Lys Arg Ser Gin Glu Pro Glu Ile Asn Lys Asp
515 520 525
Gly Asp Arg Glu Leu Glu Asn Phe Met Ala Ile Glu Glu Met Lys Lys
530 535 540
His Gly Ser Thr His Val Gly Phe Pro Glu Asn Leu Thr Asn Gly Ala
545 550 555 560
Thr Ala Gly Asn Gly Asp Asp Gly Leu Ile Pro Pro Arg Lys Ser Arg
565 570 575
Thr Pro Glu Ser Gin Gin Phe Pro Asp Thr Glu Asn Glu Glu Tyr His
580 585 590
Ser Asp Glu Gin Asn Asp Thr Gin Lys Gin Phe Cys Glu Glu Gin Asn
595 600 605
Thr Gly Ile Leu His Asp Glu Ile Leu Ile His Glu Glu Lys Gin Ile
610 615 620
Glu Val Val Glu Lys Met Asn Ser Glu Leu Ser Leu Ser Cys Lys Lys
625 630 635 640
Glu Lys Asp Ile Leu His Glu Asn Ser Thr Leu Arg Glu Glu Ile Ala
645 650 655
Met Leu Arg Leu Glu Leu Asp Thr Met Lys His Gin Ser Gin Leu
660 665 670
• · • · · · • ·
<210> 381
<211> 251
<212> DNA
<213> Homo sapien
<400> 381
ggagaagcgt ctgctggggc aggaaggggt ttccctgccc tctcacctgt ccctcaccaa ggtaacatgc ttcccctaag ggtatcccaa cccaggggcc tcaccatgac ctctgagggg ccaatatccc aggagaagca ttggggagtt gggggcaggt gaaggaccca ggactcacac atcctgggcc tccaaggcag aggagagggt cctcaagaag gtcaggagga aaatccgtaa caagcagtca g <210> 382 <211> 3279 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 382 cttcctgcag cccccatgct ggtgaggggc acgggcagga acagtggacc caacatggaa 60 atgctggagg gtgtcaggaa gtgatcgggc tctggggcag ggaggagggg tggggagtgt 120 cactgggagg ggacatcctg cagaaggtag gagtgagcaa acacccgctg caggggaggg 180 gagagccctg cggcacctgg gggagcagag ggagcagcac ctgcccaggc ctgggaggag 240 gggcctggag ggcgtgagga ggagcgaggg ggotgcatgg ctggagtgag ggatcaqggg 300 cagggcgcga gatggcctca cacagggaag agagggcccc tcctgcaggg cctcacctgg 360 gccacaggag gacactgctt ttcctctgag gagtcaggag ctgtggatgg tgctggacag 420 aagaaggaca gggcctggct caggtgtcca gaggcxgtcg ctggcttccc tttgggatca 480 gactgcaggg agggagggcg gcagggttgt ggggggagtg acgatgagga tgacctgggg 540 gtggctccag gccttgcccc tgcctgggcc ctcacccagc ctccctcaca gtctcctggc 600 cctcagtctc tcccctccac tccatcctcc atctggcctc agtgggtcat tctgatcact 660 gaactgacca tacccagccc tgcccacggc cctccatggc tccccaatgc cctggagagg 720 ggacatctag tcagagagta gtcccgaaga ggtggcctct gcgatgtgcc tgtgggggca 780 gcatcctgca gatggtcccg gccctcatcc tgctgacctg tctgcaggga ctgtcctcct 840 ggaccttgcc ccttgtgcag gagctggacc ctgaagtccc ctccccatag gccaagactg 900 gagccttgtt ccctctgttg gactccctgc ccatattctt gtgggagtgg gttctggaga 960 catttctgtc tgttcctgag agctgggaat tgctctcagt catctgcctg cgcggttctg 1020 agagatggag ttgcctaggc agttattggg gccaatcttt ctcactgtgt ctctcctcct 1080 ttacccttag ggtgattctg ggggtccact tgtctgtaat ggtgtgcttc aaggtatcac 1140 atcatggggc cctgagccat gtgccctgcc tgaaaagcct gctgtgtaca ccaaggtggt 1200 gcattaccgg aagtggatca aggacaccat cgcagccaac ccctgagtgc ccctgtccca 1260 cccctacctc tagtaaattt aagtccacct cacgttctgg catcacttgg cctttctgga 1320 tgctggacac ctgaagcttg gaactcacct ggccgaagct cgagcctcct gagtcctact 1380 gacctgtgct ttctggtgtg gagtccaggg ctgctaggaa aaggaatggg cagacacagg 1440 tgtatgccaa tgtttctgaa atgggtataa tttcgtcctc tccttcggaa cactggctgt 1500 ctctgaagac ttctcgctca gtttcagtga ggacacacac aaagacgtgg gtgaccatgt 1560 tgtttgtggg gtgcagagat gggaggggtg gggcccaccc tggaagagtg gacagtgaca 1620 caaggtggac actctctaca gatcactgag gataagctgg agccacaatg catgaggcac 1680 acacacagca aggttgacgc tgtaaacata gcccacgctg tcctgggggc actgggaagc 1740 ctagataagg ccgtgagcag aaagaagggg aggatcctcc tatgttgttg aaggagggac 1800 tagggggaga aactgaaagc tgattaatta caggaggttt gttcaggtcc cccaaaccac 1860 cgtcagattt gatgatttcc tagcaggact tacagaaata aagagctatc atgctgtggt 1920 ttattatggt ttgttacatt gataggatac atactgaaat cagcaaacaa aacagatgta 1980 tagattagag tgtggagaaa acagaggaaa acttgcagtt acgaagactg gcaacttggc 2040 tttactaagt tttcagactg gcaggaagtc aaacctatta ggctgaggac cttgtggagt 2100 gtagctgatc cagctgatag aggaactagc caggtggggg cctttccctt tggatggggg 2160
120
180
240
251 • · · · ·
249
gcatatccga caaggatgta gtgtccaggg tgaagtcctc cagatgtaca ggcccaaggc atctcccagg gcagggctgc aagcccccct aaagaagaat atcattgttt gttatgaaga tagccataga ggggatgcgc acaagacggt gttttgagac cccagctgat ggcaagattt gttttcagac cagttattct tgataatatg tttttactgg agacctgagg aaaacaggga cccaagtata agttattcaa tgagtcaacc ggggatttgg ccagaaatag tatttgcctt tggttgaaca gattcacagc tcgggattgg ggggcaaact tggcaggtag agaggaagta tgtggcactc cttaaaaaaa ctccaagtgg tacaaagtaa gggtctgtag ttccctagag ttcatcacaa tcaaggcact gggtgagccc ttttattgta tttggtcttg gggcacattg cttttcacac ccccacacat ccagagcagg tgtgaagaag ctgatttccg tgaaactcar gccaggtggg ctggttacag aaaaaaaaaa agacttacgg ttccaactga gacgagtatg ttcaaacaga atcccatctt tgggcagaac tttacttggg caggggatga tgatcaggtg aggaatgata cattggtgag agcaccggag aggacgctgc caaggactgt tgggggaatg taggctgaga agcctttccc atactggggc aaaagtttt acagcatata attctccctg 2220 ggaagctcac ctgatcctta 2280 gagtacttga ataattgacc 2340 tacagcatgg tccagagtcc 2400 tagcatgaag ggtctggcat 2460 atgccaagga atcaaatgtc 2520 atgtacaggc tttgagcagt 2580 gggaaaggga gaggatgagg 2640 gtctatgggg ctatccctac 2700 ctgagcccaa agagcattca 2760 ggagggatta ccaccctggg 2820 atatgagatc aacagtttct 2880 acaccatgca ggatgacatg 2940 tagaggcagg ctttatagta 3000 tcatggtctt gctttactaa 3060 accttgtgga atgcagctga 3120 agtgggtgtg ggacatatct 3180 agcaaataaa actgaatctt 3240 3279 <210> 383 <211> 155 <212> PRT <213> Homo sapiens <400> 383
Met Ala Gly Val Arg Asp Gin Gly Gin Gly Ala Arg Trp Pro His Thr
5 10 15
Gly Lys Arg Gly Pro Leu Leu Gin Gly Leu Thr Trp Ala Thr Gly Gly
20 25 30
His Cys Phe Ser Ser Glu Glu Ser Gly Ala Val Asp Gly Ala Gly Gin
35 40 45
Lys Lys Asp Arg Ala Trp Leu Arg Cys Pro Glu Ala Val Ala Gly Phe
50 55 60
Pro Leu Gly Ser Asp Cys Arg Glu Gly Gly Arg Gin Gly Cys Gly Gly
65 70 75 80
Ser Asp Asp Glu Asp Asp Leu Gly Val Ala Pro Gly Leu Ala Pro Ala
85 90 95
Trp Ala Leu Thr Gin Pro Pro Ser Gin Ser Pro Gly Pro Gin Ser Leu
100 105 110
Pro Ser Thr Pro Ser Ser Ile Trp Pro Gin Trp Val Ile Leu Ile Thr
115 120 125
Glu Leu Thr Ile Pro Ser Pro Ala His Gly Pro Pro Trp Leu Pro Asn
130 135 140
Ala Leu Glu Arg Gly His Leu Val Arg Glu 145 150 ·· · · ···· ·· • · ·· « ··· ·· · · · · ·
250 <210> 384 <211> 557 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 384 ggatcctcta aaagatgtgt ggggaagggt tctgcctcct acttaacctt ctctgtagag tccccaagac ccttcttatt tcaattgtga aaaaaaaaaa gagcggccgc tttgttttgg cccttttgca ggccaagcag gaaatggaaa agcagcattc acatcctaaa tatgtgaaca aaatgaatat aaaaaaa ctactactac actctctgtg ttgccaagtg gctggtttgc gtcttgcaat ccagggacct aggtgttgta actgtttgtc catgcaaata taaattcgcg gtcccttcca ccataaccat aagaatgaaa cccatttgca tggaaacagt atggtgaaaa tttttttgta aattatgcga gccgcgtcga cgaagaagag 60 atgctgtggg tttccaacca 120 gagcactact ctaccatggt 180 tgaatgattc tacagctagg 240 ggatccgtct tggcactgta cgtcttcctt tcttttttaa tttttttttc gtgcacatgc a99tgettgc ctttattgcc actgtaaagt aaagtaaaaa
300
360
420
480
540
557 <210> 385 <211> 337 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 385 ttcccaggtg atgtgcgagg gaagacacat gtttctctag cagcagatgg gttaggagga tctcaaagcc atctgctgtc ttcgagtacg aaacgtggag gtgcttttcc tcagctaaga tatcagacag gtccagtttc cgcaccaaca ctttggccac caattccccc ttttccacat <210> 386 <211> 300 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 386 gggcccgcta ccggcccagg ccccgcctcg gcccgctcgg cccagagggt gggcgcgggg gcgaccttgg cccgaaggct ctagcaagga gcggactttg cccggtgtgt ggggcggagc atgttagcct tcgctgccag gaccgtggac <210> 387 <211> 537 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 387 gggccgagtc gggcaccaag ggactctttg ccccctcctg tgccatcatg atcagcacct tgaaccagga ccggcttctg ggcggctgaa ccacggatgg ggagagggca ggaggagacc gagggggctt gtttcccttc cctcccggcg ttactatcct tgatggggct gatrccttta 60 agtgacccaa gtggttgact cctatgtgca 120 gacacatcat cactcctgca ttgttgatca 180 agcccttagc aaaagctcga atagacttag 240 cctgctggtt ccctgtcgtg gtotggatct 300 cccggca 337 cgagtcctcc tccccgggtg cctgcccgca 60 ctgcctctac cggctggcgg ctgtaactca 120 cccaccgacc ccagccgcgg cggcggcggc 180 ggactgcgtg tccgcggacg ggcagcgaag 240 cgatcccagg gctgtggtgt aacctcagcc 300 caggcttcct tcctcggatc atcaaggctg 60 atgagttcgg caaaagcttc ttccagaggc 120 aggggcaagg aggcaaggac cccgtctctc 180 cagccaagtg ccttttcctc agcactgagg 240 acaagctcca gggcagggct gtccctctgg 300
251 gcggcccagc acttcctcag acacaacttc ttcctgctgc tccagtcgtg gggatcatca 360 cttacccacc ccccaagttc aagaccaaat cttccagctg cccccttcgt gtttccctgt 420 gtttgctgta gctgggcatg tctccaggaa ccaagaagcc ctcagcctgg tgtagtctcc 480 ctgacccttg ttaattcctt aagtctaaag atgatgaact tcaaaaaaaa aaaaaaa 537 <210> 388 <211> 520 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 38Θ aggataattt ttaaaccaat caaatgaaaa aaacaaacaa acaaaaaagg aaatgtcatg60 tgaggttaaa ccagtttgca ttcccctaat gtggaaaaag taagaggact actcagcact120 gtttgaagat tgcctcttct acagcttctg agaattgtgt tatttcactt gccaagtgaa180 ggaccccctc cccaacatgc cccagcccac ccctaagcat ggtcccctgt caccaggcaa240 ccaggaaact gctacttgtg gacctcacca gagaccagga gggtttggtt agctcacagg300 acttccccca ccccagaaga ttagcatccc atactagact catactcaac tcaactaggc360 tcatactcaa ttgatggtta ttagacaatt ccatttcttt ctggttatra taaacagaaa420 atctttcctc ttctcattac cagtaaaggc tcttggtatc tttctgttgg aatgatttct480 atgaacttgt cttattttaa tggtgggttt tttttctggt520 <210> 389 <211> 365 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 389 cgttgcccca gtttgacaga aggaaaggcg gagcttattc aaagtctaga gggagtggag 60 gagttaaggc tggatttcag atctgcctgg ttccagccgc agtgtgccct crgctccccc 120 aacgactttc caaataatct caccagcgcc ttccagctca ggcgtcctag aagcgtcttg 180 aagcctatgg ccagctgtct ttgtgttccc tctcacccgc ctgtcctcac agctgagact 240 cccaggaaac cttcagacta ccttcctctg ccttcagcaa ggggcgttgc ccacattctc 300 tgagggtcag tggaagaacc tagactccca ttgctagagg tagaaagggg aagggtgctg 360 gggag 365 <210> 390 <211> 221 <212> DNA <213> Homo sapiens <220>
<221> různé_ylastnosti <222> (1)...(221) <223> n = A,T,C neboG <400> 390 tgcctctcca tcctggcccc gacttctctg tcaggaaagt ggggatggac cccatctgca 60 tacacggntt ctcatgggtg tggaacatct ctgcttgcgg tttcaggaag gcctctggct 120 gctctangag tctgancnga ntcgttgccc cantntgaca naaggaaagg cggagcttat 180 tcaaagtcta gagggagtgg aggagttaag gctggatttc a 221 <210> 391 <211> 325 <212> DNA <213> Homo sapiens
• · ··· · ·· • · φ · · · • · · · · · φφ φ «φ φφφ
252 <220>
<221 > různé vlastnosti <222> (1) . . .(325) <223> η = A,T,C nebo G <400> 391 tggagcaggt cccgaggcct ccctagagcc tggggccgac tctgtgncga tgcangcttt 60 ctctcgcgcc cagcctggag ctgctcctgg catctaccaa caatcagncg aggcgagcag 120 tagccagggc actgctgcca acagccagtc cnnataccat catgtnaccc ggtgngctct 180 naanttngat ntccanagcc ctacccatcn tagttctgct ctcccaccgg ntaccagccc 240 cactgcccag gaatcctaca gccagtaccc tgtcccgacg tctctaccta ccagtacgat 300 gagacctccg gctactacta tgacc 325 <210> 392 <211> 277 <212> DNA <213> Homo sapiens <220>
< 2 21 > různé vlastnosti· <222> (1)...(277) <223> n = A,T,C nebo G <400> 392 atattgttta actccttcct ttatatcttt taacattttc atggngaaag gt.tcacatct 60 agtctcactt nggcnagngn ctcctacttg agtctcttcc ccggcctgnn ccagtngnaa 120 antaccanga accgncatgn cttaanaacn ncctggtttn tgggttnntc aatgactgca 180 tgcagtgcac caccctgtcc actacgtgat gctgtaggat taaagtctca cagtgggcgg 240 ctgaggatac agcgccgcgt cctgtgttgc tggggaa 277 <210> 393 <211> 566 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 393 actagtccag tgtggtggaa ttcgcggccg cgtcgacgga caggtcagct gtctggctca 60 gtgatctaca ttctgaagtt gtctgaaaat gtcttcatga ttaaattcag cctaaacgtt 120 ttgccgggaa cactgcagag acaatgctgt gagtttccaa ccttagccca tctgcgggca 180 gagaaggtct agtttgtcca tcagcattat catgatatca ggactggtta cttggttaag 240 gaggggtcta ggagatctgt cccttttaga gacaccttac ttataatgaa gtatttggga 300 gggtggtttt caaaagtaga aatgtcctgt attccgatga tcatcctgta aacattttat 360 catttattaa tcatccctgc ctgtgtctat tattatattc atatctctac gctggaaact 420 ttctgcctca atgtttactg tgcctttgtt tttgctagtt tgtgttgttg aaaaaaaaaa 480 cattctctgc ctgagtttta atttttgtcc aaagttattt taatctatac aattaaaagc 540 ttttgcctat caaaaaaaaa aaaaaa 566 <210> 394 <211> 384 <212> DNA <213> Homo sapiens <220>
< 2 21 > různé vlastnosti
253 <222> (1)...(384) <223> n = A,TZC <nebo G <400> 394 ctgagctgca aggctggact ggagttttaa agggggcagt aggacgatgg aagctgccag acgt gaacatacat tgcaaattng gcaggaggac tcccaagatt gaacatccag agggtacgaa tgagcagatg gtcccggcac gaccgggcca cgggctttaa atcgggagaa tttcctgata aagaacacag gtttctgagg gtctgacatc atcgccatca cgggcctcgc 60 gctggagcgt gtgaaggagc tacaggccna 120 gctgagtgtc actgtagacc ccaaatacca 180 aattacccaa atccggttgg agcatgacgt 240 gaaccagccc caggaccaaa ttaccatcac 300 ggatgctata ctgagaattg tgggtqaact 360
384 <210> 395 <211> 399 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 395 ggcaaaactg tctgaccttg tatcagaggt attcacgtct ccagctactt caagttctct gcagcctggt tgtgacctca gactccaaga ttcatcattg ttccagtacc gtctgcaatt ttggaaagcc gagaccatcc ataagacctc cctacatcaa cggaaattgt ctgagttctc gtatcttcaa tgggcatctc aatcccaaat gcagatccaa cagcctggct ggagtctaag tatagagttg gaataccctg ctcactacag aaaatgcac ggtcaagtat atattagatg gaaatcatgg cctaacacag gccatccctt acctctgacc cagaagtgac atgagccagt cctctgaagt gcagaattgg tgactgacgt atgggacggt
120
180
240
300
360
399 <210> 396 <211> 403 <212> DNA <213> Homo sapiens <220>
<221> různé vlastnosti <222> (1) . . . (403) <223> n = A,T,c nebo G <400> 396 tggagttntc agtgcaaaca agccataaag.cttcagtagc aaattactgt čtcacagaaa 60 gacattttca acttctgctc cagctgctga taaaacaaat catgtgttta gcttgactcc 120 agacaaggac aacctgttcc ttcataactc tctagagaaa aaaaggagtt gttagtagat 180 actaaaaaaa gtggatgaat aatctggata tttttcctaa aaagattcct tgaaacacat 240 taggaaaatg gagggcctta tgatcagaat gctagaatta gtccattgtg ctgaagcagg 300 gtttagggga gggagtgagg gataaaagaa ggaaaaaaag aagagtgaga aaacctattt 360 atcaaagcag gtgctatcac tcaatgttag gccctgctct ttt 403 <210> 397 <211> 100 <212> DNA <213> Homo sapiens <220>
<221> různé vlastnosti <222> (1)...(100) <223> n = A,T,C neboG • · · · · • · '·
254
<400> 397 actagtncag tgtggtggaa ttcgcggccg cgtcgaccta naanccatct ctatagcaaa 60 100
tccatccccg ctcctggttg gtnacagaat gactgacaaa
<210> 398
<211> 278
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> různé vlastnosti
<222> (i) .. . . (278)
<223> n = A,T,C nebo G
<400> 398
gcggccgcgt cgacagcagt tccgccagcg ctcgcccctg ggtggggatg tgctgcacgc 60
ccacctggac atctggaagt cagcggcctg gatgaaagag cggacttcac ctggggcgat 120
tcactactgt gcctcgacca gtgaggagag ctggaccgac agcgaggtgg actcatcatg 180
ctccgggcag cccatccacc tgtggcagtt cctcaaggag ttgctactca agccccacag 240
ctatggccgc ttcattangt ggctcaacaa ggagaagg 278
<210> 399
<211> 298
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> různé vlastnosti.
<222> (i) ..(298)
<223> n = A,T,C neboG
<400> 399
acggaggtgg aggaagcgnc cctgggatcg anaggatggg tcctgncatt gaccncctcn 60
ggggtgccng catggagcgc atgggcgcgg gcctgggcca cggcatggat cgcgtgggct 120
ccgagatcga gcgcatgggc ctggtcatgg accgcatggg ctccgtggag cgcatgggct 180
ccggcattga gcgcatgggc ccgctgggcc tcgaccacat ggcctccanc attgancgca 240
tgggccagac catggagcgc attggctctg gcgtggagcn catgggtgcc ggcatggg 298
<210> 400
<211> 548
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 400
acatcaacta cttcctcatt ttaaggtatg gcagttccct tcatcccctt ttcctgcctt 60
gtacatgtac atgtatgaaa tttccttctc ttaccgaact ctctccacac atcacaaggt 120
caaagaacca cacgcttaga agggtaagag ggcaccctat gaaatgaaat ggtgatttct 180
tgagtctctt ttttccacgt ttaaggggcc atggcaggac ttagagttgc gagttaagac 240
tgcagagggc tagagaatta tttcatacag gctttgaggc cacccatgtc acttatcccg 300
tataccctct caccatcccc ttgtctactc tgatgccccc aagatgcaac tgggcagcta 360
gttggcccca taattctggg cctttgttgt ttgttttaat tacttgggca tcccaggaag 420
ctttccagtg atctcctacc atgggccccc ctcctgggat caagcccctc ccaggccctg 480
tccccagccc ctcctgcccc agcccacccg cttgccttgg tgctcagccc tcccattggg 540
agcaggtt
548
255
<210> 401
<211> 355
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> nrůzné vlastnosti
<222> (1) - - . (355)
<223> η = A,T,C neboG <400> 401 actgtttcca tgttatgttt ctacacattg ctacctcagt gctcctggaa acttagcttt60 tgatgtctcc aagtagtcca ccttcattta actctttgaa actgtatcat ctttgccaag120 taagagtggt ggcctatttc agctgctttg acaaaatgac tggctcctga cttaacgttc180 tataaatgaa tgtgctgaag caaagtgccc atggtggcgg cgaagaagan aaagatgtgt240 tttgttttgg actctctgtg gtcccttcca atgctgnggg tttccaacca ggggaagggt300 cccttttgca ttgccaagtg ccataaccat gagcactact ctaccatggn tctgc355 <210> 402 <211> 407 <212> DNA <213> Homo sapiens <220>
<221> mrůzné vlastnosti <222> (1)...(407) <223> n = A,T,C neboG <400> 402 atggggcaag ctggataaag aaccaagacc cactggagta tgctgtcttc aagaaaccca 60 tctcacatgc ggtggcatac ataggctcaa aataaaggaa tggagaaaaa tatttcaagc 120 aaatggaaaa cagaaaaaag caggtgttgc actcctactt tctgacaaaa cagactatgc 180 gaataaagat aaaaaagaga aggacattac aaaggtggtc ctgacctttg ataaatctca 240 ttgcttgata ccaacctggg ctgttttaat tgcccaaacc aaaaggataa tttgctgagg 300 ttgtggagct tctcccctgc agagagtccc tgatctccca aaatttggtt gagatgtaag 360 gntgattttg ctgacaactc cttttctgaa gttttactca tttccaa 407 <210> 403 <211> 303 <212> DNA <213> Homo sapiens <22 0>
<221> různé vlastnosti <222> (1).7.(303) <223> n = A,T,C neboG <400> 403 cagtatttat agccnaactg aaaagctagt agcaggcaag tctcaaatcc aggcaccaaa 60 tcctaagcaa gagccatggc atggtgaaaa tgcaaaagga gagtctggcc aatctacaaa 120 tagagaacaa gacctactca gtcatgaaca aaaaggcaga caccaacatg gatctcatgg 180 gggattggat attgtaatta tagagcagga agatgacagt gatcgtcatt tggcacaaca 240 tcttaacaac gaccgaaacc cattatttac ataaacctcc attcggtaac catgttgaaa 300 gga 303
<210> 404 <211> 225 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 404 aagtgtaact tttaaaaatt tagtggattt tgaaaattct tagaggaaag taaaggaaaa60 attgttaatg cactcattta cctttacatg gtgaaagttc tctcttgatc ctacaaacag120 acattttcca ctcgtgtttc catagttgtt aagtgtatca gatgtgttgg gcatgtgaat180 ctccaagtgc ctgtgtaata aataaagtat ctttatttca ttcat225 <210> 405 <211> 334 <212> DNA <213 > Homo sapiens <220>
<221> r různé vlastnosti <222> (1)...(334) <223> n = A,T,C neboG <400> 405 gagctgttat actgtgagtt ctactaggaa atcatcaaat ctgagggttg tctggaggac 60 ttcaatacac ctccccccat agtgaatcag cttccagggg gtccagtccc tctccttact 120 tcatccccat. cccatgccaa aggaagaccc tccctccttg gctcacagcc ttctctaggc 18Q ttcccagtgc ctccaggaca gagtgggtta tgttttcagc tccatccttg ctgtgagtgt 240 ctggtgcggt tgtgcctcca gcttctgctc agtgcttcat ggacagtgtc cagcccatgt 300 cactctccac tctctcanng tggatcccac ccct 334 <210> 406 <211> 216 <212> DNA <213> Homo sapiens <220>
<221> různé vlastnosti <222> (1)...(216) <223> n = A,T,c 'neboG <400> 406 tttcatacct aatgagggag ttganatnac atnnaaccag gaaatgcatg gatctcaang 60 gaaacaaaca cccaataaac tcggagtggc agactgacaa ctgtgagaca tgcacttgct 120 acnaaacaca aatttnatgt tgcačccttg tttctacacc tgtgggttat gacaaagaca 180 actgccaaag aatnttcaag aaggaggact gccant 216 <210> 407 <211> 413 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 407 gctgacttgc tagtatcatc tgcattcatt gaagcacaag aacttcatgc cttgactcat60 gtaaatgcaa taggattaaa aaataaattt gatatcacat ggaaacagac aaaaaatatt120 gtacaacatt gcacccagtg tcagattcta cacctggcca ctcaggaagc aagagttaat180 cccagaggtc tatgtcctaa tgtgttatgg caaatggatg tcatgcacgt accttcattt240
257
ggaaaattgt catttgtcca tgtgacagtt gatacttatt cacatttcat atsggcaacc 300
tgccagacag gagaaagtct tcccatgtta aaagacattt attatcttgt tttcctgtca 360
tgggagttcc agaaaaagtt aaaacagaca atgggccagg ttctgtagta aag 413
<210> 408
<211> 183
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> různé vlastnosti
<222> (1) .. . .(183)
<223> n = a,t,c nebo G
<400> 408
ggagctngcc ctcaattcct ccatntctat gttancatat ttaatgtctt ttgnnattaa 60
tncttaacta gttaatcctt aaagggctan ntaatcctta actagtccct ccattgtgag 120
cattatcctt ccagtattcn ccttctnttt tatttactcc ttcctggcta cccatgtact 180
ntt 183 <210> 409 <211> 250 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> i <221> různé vlastnosti <222> (1) . . . (250) <223> n = A,T,C neboG <400> 409 cccacgcatg ataagctctt tatttctgta agtcctgcta ggaaatcatc aaatctgacg 60 gtggtttggg ggacctgaac aaacctcctg taattaatca gctttcagtt tctcccccta 120 gtccctcctt caacaacata ggaggatcct ccccttcttt ctgctcacgg ccttatctag 180 gcttcccagt gcccccagga cagcgtgggc tatgtttaca gcgcntcctt gctggggggg 240 ggccntatgc 250 <210> 410 <211> 306 <212> DNA <213> Homo sapiens <220>
<221> irůzné vlastnosti <222> (1) . . . (306) <223> n = A,T,C neboG <400> 410 ggctggtttg caagaatgaa atgaatgatt ctacagctag gacttaacct tgaaatggaa 60 agtcttgcaa tcccatttgc aggatccgtc tgtgcacatg cctctgtaga gagcagcatt 120 cccagggacc ttggaaacag ttggcactgt aaggtgcttg ctccccaaga cacatcctaa 180 aaggtgttgt aatggtgaaa accgcttcct tctttattgc cccttcttat ttatgtgaac 240 nactggttgg ctttttttgn atctttttta aactggaaag ttcaattgng aaaatgaata 300 tcntgc 306 • · ··9·
258
<210> 411 <211> 261 <212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> různé vlastnosti
<222> (1) .. .(261)
<223> η = A, T,C nebo G <400> 411 agagatattn cttaggtnaa agttcataga gttcccatga actatatgac tggccacaca 60 ggatcttttg tatttaagga ttctgagatt tťgcttgagc aggattagat aaggctgttc 120 tttaaatgtc tgaaatggaa cagatttcaa aaaaaaaccc cacaatctag ggtgggaaca 180 aggaaggaaa gatgtgaata ggctgatggg caaaaaacca atttacccat cagttccagc 240 cttctctcaa ggngaggcaa a 261 <210> 412 <211> 241 <212> DNA <213> Homo sapiens <220>
<221> různé vlastnosti' <222> (1)...(241) <223> n = A,T,C neboG <400> 412 gttcaatgtt acctgacatt tctacaacac cccactcacc gatgtattcg ttgcccagtg 60 ggaacatacc agcctgaatt tggaaaaaat aattgtgttt cttgcccagg aaatactacg 120 actgactttg atggctccac aaacataacc cagtgtaaaa acagaagatg tggaggggag 180 ctgggagatt tcactgggta cattgaattc ccaaactacc cangcaatta cccagccaac 240 a 241 <210> 413 <211> 231 <212> DNA <213> Homo sapiens <220>
<221> i různé vlastnosti <222> (1) (231' ,„ <223> n = A,T,C ne^oG <400> 413 aactcttaca atccaagtga ctcatctgtg tgcttgaatc ctttccactg tctcatctcc60 ctcatccaag tttctagtac cttctctttg ttgtgaagga taatcaaact gaacaacaaa120 aagtttactc tcctcatttg gaacctaaaa actctcttct tcctgggtct gagggctcca180 agaatccttg aatcanttct cagatcattg gggacaccan atcaggaacc t231 <210> 414 <211> 234 <212> DNA <213> Homo sapiens • · 4 ·
259 <400> 414 actgtccatg aagcactgag cagaagctgg aggcacaacg caccagacac tcacagcaag 60 gatggagctg aaaacataac ccactctgtc ctggaggcac tgggaagcct agagaaggct 120 gtgagccaag gagggagggt cttcctttgg catgggatgg ggatgaagta aggagaggga 180 ctggaccccc tggaagctga ttcactatgg ggggaggtgt attgaagtcc tcca 234 <210> 415 <211> 217 <212> DNA <213> Homo sapiens <220>
<221> různé vlastnosti <222> (1) . . . (217) <223> n = A,T,CneboG <400> 415 gcataggatt aagactgagt atcttttcta cattctttta actttctaag gggcacttct 60 caaaacacag accaggtagc aaatctccac tgctctaagg ntctcaccac cactttctca 120 cacctagcaa tagtagaatt cagtcctact tctgaggcca gaagaatggt tcagaaaaat 180 antggattat aaaaaataac aattaagaaa aataatc 217 <210> 416 <211> 213 <212> DNA <213> Homo sapiens <220>
< 2 21 > různé vlastnosti <222> (1)...(213) <223> n = A,T,c neboG <400> 416 atgcatatnt aaagganact gcctcgcttt tagaagacat ctggnctgct ctctgcatga 60 ggcacagcag taaagctctt tgattcccag aatcaagaac cctccccttc agactattac 120 cgaatgcaag gtggttaatt gaaggccact aattgatgct caaatagaag gatattgact 180 atattggaac agatggagtc tctactacaa aag 213 <210> 417 <211> 303 <212> DNA <213> Homo sapiens <220>
<221> trůzné vlastnosti <222> (1) . . . (303) <223> n = A,T,C neboG <400> 417 nagtcttcag gcccatcagg gaagttcaca ctggagagaa gtcatacata tgtactgtat 60 gtgggaaagg ctttactctg agttcaaatc ttcaagccca tcagagagtc cacactggag 120 agaagccata caaatgcaat gagtgtggga agagcttcag gagggattcc cattatcaag 180 ttcatctagt ggtccacaca ggagagaaac cctataaatg tgagatatgt gggaagggct 240 tcantcaaag ttcgtatctt caaatccatc ngaaggncca cagtatanan aaacctttta 300 agt 303
4« 4444444 4
4444 4* 4 4 ·4 • 44 *44 44
444 444 4 ·4
44444 4 4 4 44·· 4
260 <210> 418 <211> 328 <212> DNA <213> Homo sapiens <220>
<221> různé vlastnosti <222> (1) . . . (328) <223> η = A,T,C <nebo G <400> 418 tttttggcgg tggtggggca gggacgggac angagtctca ctctgttgcc caggctggag 60 tgcacaggca tgatctcggc tcactacaac ccctgcctcc catgtccaag cgattcttgt 120 gcctcagcct tccctgtagc tagaattaca ggcacatgcc accacaccca gctagttttt 180 gtatttttag tagagacagg gtttcaccat gttggccagg ctggtctcaa actcctnacc 240 tcagnggtca ggctggtctc aaactcctga cctcaagtga tctgcccacc tcagcctccc 300 aaagtgctan gattacaggc cgtgagcc 328 <210> 419 <211> 389 <212> DNA <213> Homo sapiens <220>
<221> různé_vlastnosti <222> (1)...(389) <223> n = A,T,C nebo G <400> 419 cctcctcaag acggcctgtg gtccgcctcc cggcaaccaa gaagcctgca gtgccatatg60 acccctgagc catggactgg agcctgaaag gcagcgtaca ccctgctcct gatcttgctg120 cttgtttcct ctctgtggct ccattcatag cacagttgtt gcactgaggc ttgtgcaggc180 cgagcaaggc caagctggct caaagagcaa ccagtcaact ctgccacggt gtgccaggca240 ccggttctcc agccaccaac ctcactcgct cccgcaaatg gcacatcagt tcttctaccc300 taaaggtagg accaaagggc atctgctttt ctgaagtcct ctgctctatc agccatcacg360 tggcagccac tcnggctgtg tcgacgcgg389 <210> 420 <211> 408 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 420 gttcctccta actcctgcca gaaacagctc tcctcaacat gagagctgca cccctcctcc 60 tggccagggc agcaagcctt agccttggct tcttgtttct gctttttttc tggctagacc 120 gaagtgtact agccaaggag ttgaagtttg tgactttggt gtttcggcat ggagaccgaa 180 gtcccattga cacctttccc actgacccca taaaggaatc ctcatggcca caaggatttg 240 gccaactcac ccagctgggc atggagcagc attatgaact tggagagtat ataagaaaga 300 gatatagaaa attcttgaat gagtcctata aacatgaaca ggtttatatt cgaagcacag 360 acgttgaccg gactttgatg aagtgctatg acaaacctgg caagcccg 408 <210> 421 <211> 352 <212> DNA
C φφ φφ φ · φ φ
Φ C
261 <213> Homo sapiens <220>
< 2 21 > různé vlastnosti <222> (1)...(352)
<400> 421 gctcaaaaat ctttttactg atnggcatgg ctacacaatc attgactatt acggaggcca60 gaggagaatg aggcctggcc tgggagccct gtgcctacta naagcacatt agattatcca120 ttcactgaca gaacaggtct tttttgggtc cttcttctcc accacnatat acttgcagtc180 ctccttcttg aagattcttt ggcagttgtc tttgtcataa cccacaggtg tagaaacaag240 ggtgcaacat gaaatttctg tttcgtagca agtgcatgtc tcacaagttg gcangtctgc300 cactccgagt ttattgggtg tttgtttcct ttgagatcca tgcatttcct gg352 <210> 422 <211> 337 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 422 atgccaccat gctggcaatg cagcgggcgg tcgaaggcct gcatatccag cccaagctgg 60 cgatgatcga cggcaaccgt tgcccgaagt tgccgatgcc agccgaagcg gtggtcaagg 120 gcgatagcaa ggtgccggcg atcgcggcgg cgtcaatcct ggccaaggtc agccgtgatc 180 gtgaaatggc agctgtcgaa ttgatctacc cgggttatgg catcggcggg cataagggct 240 atccgacacc ggtgcacctg gaagccttgc agcggctggg gccgacgccg attcaccgac 300 gcttcttccg ccggtacggc tggcctatga aaattat 337 <210> 423 <211> 310 <212> DNA <213> Homo sapiens <220>
<221> různé vlastnost?
<222> (1)...(310) <223> n = a,t,C neboG <400> 423 gctcaaaaat ctttttactg atatggcatg gctacacaat. cattgactat tagaggccag 60 aggagaatga ggcctggcct gggagccctg tgcctactan aagcncatta gattatccat 120 tcactgacag aacaggtctt ttttgggtcc ttcttctcca ccacgatata cttgcagtcc 180 tccttcttga agattctttg gcagttgtct ttgtcataac ccacaggtgt anaaacaagg 240 gtgcaacatg aaatttctgt ttcgtagcaa gtgcatgtct cacagttgtc aagtctgccc 300 tccgagttta 310 <210> 424 <211> 370 <212> DNA <213> Homo sapiens <220>
< 2 21 > různé vlastnosti <222> (1)...(370) <223> n = A,T,C neboG
·· ·· ···· «4 4
44 · 4 4 4 4 4 ·
• 4 • 4 4 4
• 4 • · · 4 • ·
• 4 4 4 *
*4 4 4« 4 4«. 44
262 <400> 424 gctcaaaaat ctttttactg ataggcatgg ctacacaatc attgactatt agaggccaga 60 ggagaatgag gcctggcctg ggagccctgt gcctactaga agcacattag attatccatt 120 cactgacaga acaggtcttt tttgggtcct tcttctccac cacgatatac ttgcagtcct 180 ccttcttgaa gattctttgg cagttgtctt tgtcataacc cacaggtgta gaaacatcct 240 ggttgaatct cctggaactc cctcattagg tatgaaatag catgatgcat tgcataaagt 300 cacgaaggtg gcaaagatca caacgctgcc cagganaaca ttcattgtga taagcaggac 360 tccgtcgacg 370 <210> 425 <211> 216 <212> DNA <213> Homo sapiens <220>
< 2 21 > τ různé vlastnosti <222> (1) . . .(216) <223> n = A,T,C neboG <400> 425 aattgctatn ntttattttg ccactcaaaa taattaccaa aaaaaaaaaa tsnttaaatga 60 taacaacnca acatcaaggn aaananaaca ggaatggntg accntgcata aatnggccga 120 anattatcca ttatnttaag ggttgacttc aggntacagc acacagacaa acatgcccag 180 gaggntntca ggaccgctcg atgtnttntg aggagg 216 <210> 426 <211> 596 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 426 cttccagtga ggataaccct gttgccccgg gccgaggttc tccattaggc tctgattgat60 tggcagtcag tgatggaagg gtgttctgat cattccgact gccccaaggg tcgctggcca120 gctctctgtt ttgctgagtt ggcagtagga cctaatttgt taattaagag tagatggtga180 gctgtccttg tattttgatt aacctaatgg ccttcccagc acgactcgga ttcagctgga240 gacatcacgg caacttttaa tgaaatgatt tgaagggcca ttaagaggca cttcccgtta300 ttaggcagtt catctgcact gataacttct tggcagctga gctggtcgga gctgtggccc360 aaacgcacac ttggcttttg gttttgagat acaactctta atcttttagt catgcttgag420 ggtggatggc cttttcagct ttaacccaat ttgcactgcc ttggaagtgt ágccaggaga480 atacactcat atactcgtgg gcttagaggc cacagcagat gtcattggtc tactgcctga540 gtcccgctgg tcccatccca ggaccttcca tcggcgagta cctgggagcc cgtgct596 <210> 427 <211> 107 <212> DNA <213> Homo sapiens <220>
<221> irůzné vlastnosti <222> (1) . . . (107) <223> n = A,T,c nebo G <400> 427 gaagaattca agttaggttt attcaaaggg cttacngaga atcctanacc caggncccag 60 cccgggagca gccttanaga gctcctgttt <210>
<211>
<212>
<213>
428
DNA
Homo sapiens
263 gactgcccgg ctcagng
107 <220>
<221>
<222>
<223>
různé vlastnosti!
(1) . . . (38) n = a,t,c neboG
428 <400> gaacttccna anaangactt tattcactat tttacatt <210>
<211>
<212>
<213>
429
544
DNA
Homo sapiens
429 <400> ctttgctgga attgaagagc atatccacga tttggatggt gccttccact agatactaag tgatgtgcag gagtttagtt acctcaacaa ttat cggaataaaa ggctgcagcc actcttgaag ggctcatcac tcagttacac cccacatttg ttaaaaaatc caaagcagta gttagagaga gtggacgcaa ctgcggttca gactttctga ctgtagaacc ctcactcacc agatgcagca tgccctttta ttcagcgatt tatgcatatc gcatgacctc gattaaaatc tttatccaca tgacttggcc atcctctcct gccatctccc tgatgtcctt tcaagagaag cagggatttt ctgatgaggg cgagaattgt atcaaatcat gtggctggaa gttggttctg ccaattcctc gatgttctca ttttttattt ttgccaggtg cgctgcattt atagacgccg cggttttcag tccactcgtt tgctgcttca ctgtccatcc tcaagcccac ttgctttgac gtaggagaga
120
180
240
300
360
420
480
540
544 <210>
<211>
<212>
<213>
430
507 DNA
Homo sapiens <220>
<221>
<222>
<223>
různé vlastnosti (1)...(507) n = A,T,C neboG
430 <400> cttatcncaa gaacactgac gagcatcaat ccttcgtgac attcaaccag caagaaggag tgtcagtgaa cattctcctc ttttgagcaa tggggctccc acccatcttc ttaaaaagct tttatgcaat gatgtttcta gactgcaagt tggataatct tggcctctaa aaaaaaaaaa aaacttggct caccccgaca gcccagaatg gcatcatgct cncctgtggg atatcgtggt aatgtgcttc tagtcaatga aaaaaaa gtgcagtgga ctctgattta ttntcctggg atttcatacc ttatgacaaa ggagaagaag tagtaggcac ttgtgtagcc aactccgggg attgggctgc cagcgttgtg taatgaggga gacaactgcc gacccaaaaa agggctccca atgcctatca gaattttgaa agtgagaaca atctttgccn gttccaggag aaagaatntt agacctgttc ggccaggcct gtaaaaagat
120
180
240
300
360
420
480
507 <210> 431 <211> 392 • · · ·· w
264 <212> DNA <213> Homo sapiens <220>
< 2 21 > různé vlastnosti <222> (1) . . . (392) <223> n = A,T,C nebo G <400> 431 gaaaattcag aatggataaa aacaaatgaa gtacaaaata tttcagattt acatagcgat 60 aaacaagaaa gcacttatca ggaggactta caaatggaag tacactctan aaccatcatc 120 tatcatggct aaatgtgaga ttagcacagc tgtattattt gtacattgca aacacctaga 180 aagagatggg aaacaaaatc ccaggagttt tgtgtgtgga gtcctgggtt ttccaacaga 240 catcattcca gcattctgag attagggnga ttggggatca ttctggagtt ggaatgttca 300 acaaaagtga tgttgttagg taaaatgtac aacttctgga tctatgcaga cattgaaggt 360 gcaatgagtc tggcttttac tctgctgttt ct 392 <210> 432 <211> 387 <212> DNA <213> Homo sapiens <220>
< 2 21 > různé vlastnosti <222> (1) . . . (387) <223> n = A,T,C nebo G <400> 432 ggtatccnta cataatcaaa tatagctgta gtacatgttt tcattggngt agattaccac 60 aaatgcaagg caacatgtgt agatctcttg tcttattctt ttgtctataa tactgtattg 120 ngtagtccaa gctctcggna gtccagccac tgngaaacat gctcccttta gattaacctc 180 gtggacnctn ttgttgnatt gtctgaactg tagngccctg tattttgctt ctgtctgnga 240 attctgttgc ttctggggca tttccttgng atgcagagga ccaccacaca gatgacagca 300 atctgaattg ntccaatcac agctgcgatt aagacatact gaaatcgtac aggaccggga 360 acaacgtata gaacactgga gtccttt 387 <210> 433 <211> 281 <212> DNA <213> Homo sapiens <220>
<221> irůzné vlastnosti <222> (1) . . . (281) <223> n = A,T,CneboG <400> 433 ttcaactagc anagaanact gcttcagggn gtgtaaaatg aaaggcttcc acgcagttat 60 ctgattaaag aacactaaga gagggacaag gctagaagcc gcaggatgtc tacactatag 120 caggcnctat ttgggttggc tggaggagct gtggaaaaca tggagagatt ggcgctggag 180 atcgccgtgg ctattcctcn ttgntattac accagngagg ntctctgtnt gcccactggt 240 tnnaaaaccg ntatacaata atgatagaat aggacacaca t 281 <210> 434 <211> 484
265 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 434 ttttaaaata agcatttagt gctcagtccc tactgagtac tctttctctc ccctcctctg 60 aatttaattc tttcaacttg caatttgcaa ggattacaca tttcactgtg atgtatattg 120 tgttgcaaaa aaaaaaaagt gtctttgttt aaaattactt ggtttgtgaa tccatcttgc 180 tttttcccca ttggaactag tcattaaccc atctctgaac tggtagaaaa acatctgaag 240 agctagtcta tcagcatctg acaggtgaat tggatggttc tcagaaccat ttcacccaga 300 cagcctgttt ctatcctgtt taataaatta gtttgggttc tctacatgca taacaaaccc 360 tgctccaatc tgtcacataa aagtctgtga cttgaagttt agtcagcacc cccaccaaac 420 tttatttttc tatgtgtttt ttgcaacata tgagtgtttt gaaaataaag tacccatgtc 480 ttta 484 <210> 435 <211> 424 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 435 gcgccgctca gagcaggtca ctttctgcct tccacgtcct ccttcaagga agccccatgt 60 gggtagcttt caatatcgca ggttcttact cctctgcctc tataagctca aacccaccaa 120 cgatcgggca agtaaacccc ctccctcgcc gacttcggaa ctggcgagag ttcagcgcag 180 atgggcctgt ggggaggggg caagatagat gagggggagc ggcatggtgc ggggtgaccc 240 cttggagaga ggaaaaaggc cacaagaggg gctgccaccg ccactaacgg agatggccct 300 ggtagagacc tttgggggtc tggaacctct ggactcccca tgctctaact cccacactct 360 gctatcagaa acttaaactt gaggattttc tctgtttttc actcgcaata aaftcagagc 420 aaac 424 <210> 436 <211> 667 <212> DNA <213> Homo sapiens <220>
<221> irůzné vlastnosti <222> (1)...(667) <223> n = A,T,C neboG <400> 436 accttgggaa nactctcaca atataaaggg tcgtagactt tactccaaat tccaaaaagg 60 tcctggccat gtaatcctga aagttttccc aaggtagcta taaaatcctt ataagggtgc 120 agcctcttct ggaattcctc tgatťtcaaa gtctcactct caagttcttg aaaacgaggg 180 cagttcctga aaggcaggta tagcaactga tcttcagaaa gaggaactgt gtgcaccggg 240 atgggctgcc agagtaggat aggattccag atgctgacac cttctggggg aaacagggct 300 gccaggtttg tcatagcact catcaaagtc cggtcaacgt ctgtgcttcg aatataaacc 360 tgttcatgtt tataggactc attcaagaat tttctatatc tctttcttat atactctcca 420 agttcataat gctgctccat gcccagctgg gtgagttggc caaatccttg tggccatgag 480 gattccttta tggggtcagt gggaaaggtg tcaatgggac ttcggtctcc atgccgaaac 540 accaaagtca caaacttcaa ctccttggct agtacacttc ggtctagcca gaaaaaaagc 600 agaaacaaga agccaaggct aaggcttgct gccctgccag gaggaggggt gcagctctca 660 tgttgag 667 <210> 437 <211> 693
266 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 437
ctacgtctca accctcattt ttaggtaagg aatcttaagt ccaaagatat taagtgactc 60
acacagccag gtaaggaaag ctggattggc acactaggac tctaccatac cgggttttgt 120
taaagctcag gttaggaggc tgataagctt ggaaggaact tcagacagct ttttcagatc 180
ataaaagata attcttagcc catgttcttc tccagagcag acctgaaatg acagcacagc 240
aggtactcct ctattttcac ccctcttgct tctactctct ggcagtcaga cctgtgggag 300
gccatgggag aaagcagctc tctggatgtt tgtacagatc atggactatt ctctgtggac 360
catttctcca ggttacccta ggtgtcacta ttggggggac agccagcatc tttagctttc 420
atttgagttt ctgtctgtct tcagtagagg aaacttttgc tcttcacact tcacatctga 480
acacctaact gctgttgctc ctgaggtggt gaaagacaga tatagagctt acagtattta 540
tcctatttct aggcactgag ggctgtgggg taccttgtgg tgccaaaaca gatcctgttt 600
taaggacatg ttgcttcaga gatgtctgta actatctggg ggctctgttg gctctttacc 660
ctgcatcatg tgctctcttg gctgaaaatg acc 693
<210> 438
<211> 360
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 438
ctgcttatca caatgaatgt tctcctgggc agcgttgtga tctttgccac cttcgtgact 60
ttatgcaatg catcatgcta tttcatacct aatgagggag ttccaggaga ttcaaccagg 120
atgtttctac acctgtgggt tatgacaaag acaactgcca aagaatcttc aagaaggagg 180
actgcaagta tatctggtgg agaagaagga cccaaaaaag acctgttctg tcagtgaatg 240
gataatctaa tgtgcttcta gtaggcacag ggctcccagg ccaggcctca ttctcctctg 300
gcctctaata gtcaataatt gcgtagccat gcctatcagt aaaaagattt ttgagcaaac 360
<210> 439
<211> 431
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> i různé vlastnosti
<222> (1) . . . . (43D
<223> n = A,T,C neboG
<400> 439
gttcctnnta actcctgcca gaaacagctc tcctcaacat gagagctgca cccctcctcc 60
tggccagggc agcaagcctt agccťtggct tcttgtttct gctttttttc tggctagacc 120
gaagtgtact agccaaggag ttgaagtttg tgactttggt gtttcggcat ggagaccgaa 180
gtcccattga cacctttccc actgacccca taaaggaatc ctcatggcca caaggatttg 240
gccaactcac ccagctgggc atggagcagc attatgaact tggagagtat ataagaaaga 300
gatatagaaa attcttgaat gagtcctata aacatgaaca ggtttatatt cgaagcacag 360
acgttgaccg gactttgatg agtgctatga caaacctggc agcccgtcga cgcggccgcg 420
aatttagtag t 431
<210> 440 <211> 523 <212 > DNA <213> Homo sapiens
267 <400> 440 agagataaag ggatcttttg tttaaatgtc aggaaggaaa cttctctcaa actggaaaac taaaaattaa acaaaaatca tatatatatc cttaggtcaa tatttaagga tgaaatggaa gatgtgaata ggagaggcaa tgctactatc aacctctttg aactttacag atagcaaata agttcataga ttctgagatt cagatttcaa ggctgatggg agaaaggaga tgtttttata tgtcccttgg aaagatttga agtcatctga gttcccatga ttgcttgagc aaaaaaaccc caaaaaacca tacagtggag tttctgttaa tcctggaaca tgtatgtaat tgagaacaag actatatgac aggattagat cacaatctag atttacccat acatctggaa aatatatgag tttatgttcc acatatagca cta tggccacaca aaggctgttc ggtgggaaca cagttccagc agttttctcc gctacagaac ttttaaagaa gctcttgaag
120
180
240
300
360
420
480
523 <210>
<211>
<212>
<213>
441
430
DNA
Homo sapiens
441 <400> gttcctccta tggccagggc gaagtgtact gtcccattga gccaactcac gatatagaaa acgttgaccg aatttagtag actcctgcca agcaagcctt agccaaggag cacctttccc ccagctgggc attcttgaat gactttgatg gaaacagctc agccttggct ttgaagtttg actgacccca atggagcagc gagtcctata agtgctatga tcctcaacat tcttgtttct tgactttggt taaaggaatc attatgaact aacatgaaca caaacctggc gagagctgca gctttttttc gtttcggcat ctcatggcca tggagagtat ggtttatatt agcccgtcga cccctcctcc tggctagacc ggagaccgaa caaggatttg ataagaaaga cgaagcacag cgcggccgcg
120
180
240
300
360
420
430 <210>
<211>
<212>
<213>
442
362
DNA
Homo sapiens
442 <400> ctaaggaatt tttcctggaa cttcacttct atgtttagaa aatgaattaa tgattatttt tc agtagtgttc tgacaattat gatacttgta atggtcattt tgttttactt ttgttttcat ccatcacttg attttaactt aattaatctt tacggaaaaa aatttatatt ttaccagaat tttggagtgt tggtggggga ttattgcact ttagaaaaat gaactgtcaa aaaaactaag gctattctaa aagagttata tgttttgacc tctgataata tgacaaataa aattaaaagt aagattttga ggaccacagt attaagctat gtgcagaata aaattctttt ttgattacag
120
180
240
300
360
362 <210>
<211>
<212>
<213>
443
624
DNA
Homo sapiens <220>
<221>
<222>
<223>
různé_vlastnosti>
(1) . ..(624) n = A,T,C ,neboG
443 <400> tttttttttt ttgaaagaat aatgcttatt tgctggctag gcaacacaat taaattcaga ttaaaagaaa tactccggtc atacatcaca ggaggggaga tgtaaagagc ggtgtcagca gtgaaatgtg gaaagagtac agaaagcaat gcacgtggca aaattgcaag ctgagcacta ctgccttttg caatgtggag
120
180
240 taatccttgc tcagtaggga tcaggctacc ttgaacattg
268 cccaaaccac agaaaatggg gtgaaattgg ccaactttct attaacttgg cttcctgttt 300 tataaaatat tgtgaataat atcacctact tcaaagggca gttatgaggc ttaaatgaac 360 taacgcctac aaaacactta aacatagata acataggtgc aagtactatg tatctggtac 420 atggtaaaca tccttattat taaagtcaac gctaaaatga atgtgtgtgc atatgctaat 480 agtacagaga gagggcactt aaaccaacta agggcctgga gggaaggttt cctggaaaga 540 ngatgcttgt gctgggtcca aatcttggtc tactatgacc ttggccaaat tatttaaact 600 ttgtccctat ctgctaaaca gatc 624 <210> 444 <211> 425 <212> DNA <213> Homo sapiens <220>
<221> různé vlastnosti <222> (1) . . . (425) <223> n = A,T,c neboG <400> 444 gcacatcatt nntcttgcat tctttgagaa taagaagatc agtaaatagt tcagaagtgg 60 gaagctttgt ccaggcccgt gtgtgaaccc aatgttttgc ttagaaatag aacaagtaag 120 ttcattgcta tagcataaca caaaatttgc ataagtggtg gtcagcaaat ccttgaatgc 180 tgcttaatgt gagaggttgg taaaatcctt tgtgcaacac tctaactccc tgaatgtttt 240 gctgtgctgg gacctgtgca tgccagacaa ggccaagctg gctgaaagag caaccagcca 300 cctctgcaat ctgccacctc ctgctggcag gatttgtttt tgcatcctgt gaagagccaa 360 ggaggcacca gggcacaagt gagtagactt atggtcgacg cggccgcgaa tttagtagta 420 gtaga 425 <210> 445 <211> 414 <212> DNA <213> Homo sapiens <220>
< 2 21 > i různé vlastnosti <222> (1) . . . (414) <223> n = A,T,C 'neboG <400> 445 catgtttatg nttttggatt actttgggca cctagtgttt ctaaatcgtc tatcattctt60 ttctgttttt caaaagcaga gatggccaga gtctcaacaa actgtatctt caagtctttg120 tgaaattctt tgcatgtggc agattattgg atgtagtttc ctttaactag catataaatc180 tggtgtgttt cagataaatg aacagcaaaa tgtggtggaa ttaccatttg gaacattgtg240 aatgaaaaat tgtgtctcta gattatgtaa caaataacta tttcctaacc attgatcttt300 ggatttttat aatcctactc acaaatgact aggcttctcc tcttgtattt tgaagcagtg360 tgggtgctgg attgataaaa aaaaaaaaag tcgacgcggc cgcgaattta gtag414 <210> 446 <211> 631 <212> DNA <213> Homo sapiens <220>
<221> r různé vlastnosti <222> (1)...(631)
269 <223> η = A,T,C or G <400> 446 acaaattaga anaaagtgcc agagaacacc acataccttg tccggaacat tacaatggct60 tctgcatgca tgggaagtgt gagcattcta tcaatatgca ggagccatct tgcaggtgtg120 atgctggtta tactggacaa cactgtgaaa aaaaggacta cagtgttcta tacgttgttc180 ccggtcctgt acgatttcag tatgtcttaa tcgcagctgt gattggaaca attcagattg240 ctgtcatctg tgtggtggtc ctctgcatca caagggccaa actttaggta atagcattgg300 actgagattt gtaaactttc caaccttcca ggaaatgccc cagaagcaac agaattcaca360 gacagaagca aaatacaggg cactacagtt cagacaatac aacaagagcg tccacgaggt420 taatctaaag ggagcatgtt tcacagtggc tggactaccg agagcttgga ctacacaata480 cagtattata gacaaaagaa taagacaaga gatctacaca tgttgccttg catttgtggt540 aatctacacc aatgaaaaca tgtactacag ctatatttga ttatgtatgg atatatttga600 aatagtatac attgtcttga tgttttttct g631 <210> 447 <211> 585 <212> DNA <213> Homo sapiens <220>
<221> i různé vlastnosti <222> (1)...(585) <223> n = a,t,c neboG <400> 447 ccttgggaaa antntcacaa tataaagggt cgtagacttt actccaaatt ccaaaaaggt 60 cctggccatg taatcctgaa agttttccca aggtagctat aaaatcctta taagggtgca 120 gcctcttctg gaattcctct gatttcaaag tctcactctc aagttcttga aaacgagggc 180 agttcctgaa aggcaggtat agcaactgat cttcagaaag aggaactgtg tgcaccggga 240 tgggctgcca gagtaggata ggattccaga tgctgacacc ttctggggga aacagggctg 300 ccaggtttgt catagcactc atcaaagtcc ggtcaacgtc tgtgcttcga atataaacct 360 gttcatgttt ataggactca ttcaagaatt ttctatatct ctttcttata tactctccaa 420 gttcataatg ctgctccatg cccagctggg tgagttggcc aaatccttgt ggccatgagg 480 attcctttat ggggtcagtg ggaaaggtgt caatgggact tcggtctcca tgccgaaaca 540
ccaaagtcac aaacttcaac tccttggcta gtacacttcg gtcta 585
<210> 448
<211> 93
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> různé vlastnosti
<222> (1) .. . (93)
<223> n = A,T,c neboG
<400> 448
tgctcgtggg tcattctgan nnccgaactg accntgccag ccctgccgan gggccnccat 60
ggctccctag tgccctggag agganggggc tag 93
<210> 449 <211> 706 <212> DNA <213> Homo sapiens * ··
270 <220>
< 2 21 > různé vlastnosti; <222> (1)...(706) <223> n = A,T,C neboG <400> 449 ccaagttcat ttctgancac cctggagagg cggggacagc gttgggaagg gtgctgcaag cgacggccag cgtacgtaag cgacgtggga cactgagcag aacaggttga gcatggatga gctntgtgct cgaactgacc aggtgtctag atcctgcaga gcgatcggtg gcgattaagt tgaattgaat cttggatcct tccncactga aagctggagg acctgggagg cagagtgaaa ggacgctgga atgccagccc tcagagagta tggtcgggcg cgggcctctt tgggtaacgc ttaggtgacn ctagagcggc gagagtggag cacaacgcnc tggaggttgc ctccatctta cagggggcaa aagcnnttgc tcgtgggtca 60 tgccgatggt cctccatggc tccctagtgc 120 gtcctggaag gtggcctctg ngaggagcca 180 cgtcccattc gccattcagg ctgcgcaact 240 cgctattacg ccagctggcg aaagggggat 300 cagggttttc ccagtcncga cgttgtaaaa 360 ctatagaaga gctatgacgt cgcatgcacg 420 cgcctactac tactaaattc gcggccgcgt 480 agtgacatgt gctggacnct gtccatgaag 540 cagacactca cagctactca ggaggctgag 600 aatgagctga gatcaggccn ctgcncccca 660 aaaaaaaaaa aaaaaa 706 <210> 450 <211> 493 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 450 gagacggagt acagttttaa aaatgaggct agcctaagta caagtcaggt agagacactg tcaagtcaac tacacatcag gcgaatttag gtcactctgt aaggtaaaac gagaacttta taagaacaac agtgaaatgg tcagagagtt acatctgtga aatcacctgg tag tgcccaggct aacataaaaa caaagggatc ctttggggag gtggaattaa aaaaagtgag actcacagac agagctttac ggagtgcagc aagacactgt coaagaaaaa 60 gaaatatcct atagtggaaa taagagagtc 120 ttacagacat gtcgccaata tcactqcatg 180 aaaccatcat ttgacagtga ggtacaattc 240 actcaaatta atcctgccag ctgaaacgca 300 ttctatcoat gaggtgattc cacagtcttc 360 caagttctta aaccactgtt caaactctgc 420 aaactcccat tgccgagggt cgacgcggcc 480 493 <210> 451 <211> 501 <212> DNA <213> Homo sapiens <220>
<221> různé vlastnosti <222> (1)/..(501) <223> n = A,T,C neboG <400> 451 gggcgcgtcc ctcttcgcta aacgccaggg tgacnctata gcggccgcct tggagagtga cgcnccagac gttgcaatga cattcgccat ttacgccagc ttttcccagt gaagagctat actactacta catgtgctgg actcacagct gctgagatca tcaggctgcg tggcgaaagg cncgacgttg gacgtcgcat aattcgcggc acnctgtcca actcaggagg ggccnctgcn caactgttgg gggatgtgct taaaacgacg gcacgcgtac cgcgtcgacg tgaagcactg ctgagaacag ccccagcatg gaagggcgat gcaaggcgat gccagtgaat gtaagcttgg tgggatccnc agcagaagct gttgaacctg gatgacagag cggtgcgggc 60 taagttgggt 120 tgaatttagg 180 atcctctaga 240 actgagagag 300 ggaggcacaa 360 ggaggtggag 420 tgaaactcca 480 tcttaaaaaa aaaaaaaaaa a
501 <210>
<211>
<212>
<213>
• ·♦ ······ ·· • · Φ · ·· · · · · • ·· · · · · · • · · · · · · · · ··· ·· ·· · ♦· ·♦·
271
452
DNA
Homo sapiens <220>
<221>
<222>
<223>
různé vlastnosti (1) - - - (51) n = A,T,C neboG
452 <400>
agacggtttc accnttacaa cnccttttag gatgggnntt ggggagcaag <210>
<211>
<212>
<213>
453
317
DNA
Homo sapiens <220>
<221>
<222>
<223>
různé vlastnosti (1) . . .(317) n = a,t,c neboG
453 <400> tacatcttgc acatctgaag ttcacccana taacaaaccc cccaccaaac tacccatgtc tttttcccca agctagtcta cagcctgttt tgctccaatc tttatttttc tttatta ttggaactag tcagcatctg ctatcctgtt tgtcacataa tatgtgtttt tcattaaccc gcaagtgaat taataaatta aagtctgtga ttgcaacata atctctgaac tggatggttc gtttgggttc cttgaagttt tgagtgtttt tggtagaaaa tcagaaccat tctacatgca antcagcacc gaaaataagg
120
180
240
300
317 <210>
<211>
<212>
<213>
454
231 DNA Homo sapiens
454 <400> ttcgaggtac taagccacgc agaagaccaa ccttcctttt aatcaactct cacgctcttg attcttctgc tcagtgttcc cagagtgtag aaggagtctt atcccagctt aaagctcctc tttccttcta gaattctcct gcaaacaaaa acaatttcat tagatgagtc ctgctcactc ttgttcttct gaacaacagc agcattaata agtagaacca aggtctccac t
120
180
231 <210>
<211>
<212>
<213>
455
231 DNA Homo sapiens <400> taccaaagag cattgttccg gtttcaacgc caaagaattt
455 ggcataataa aatgggcttt attgatgact ctcatagcac tcagtctcac ccacaggcta tctccaagga agctcacaat agtagggttc cacacacaaa tcttcctttg acagggctcc aagtgaaaaa tgccaagttt cattcagggg a
120
180
231 accatcctcc acaggaaaca gcatcgacca tttctcctct taccttatgc gagaaaccct acatagccac ccctgactga gttattaggt gtctgtttac tatttacaaa cattgccaag ggaataatca tgtaaccttt gccattggaa t
272 <210>
<211>
<212>
<213>
456
231
DNA
Homo sapiens
456 <400> ttggcaggta ttccattcag tgcactcaaa cctttttatt cccttacaaa tattatcgtt ttcctttatc tggtgcagct gaagacacca attattcttg aggaataact gctagtcagt
120
180
231 <210>
<211>
<212>
<213>
457
231
DNA
Homo sapiens <220>
<221>
<222>
<223>
různé vlastnosti (1)...(231) n = A,T, C neb0 q
457 <400> cgaggtaccc gcattcctta tatttgattt agttgtctaa aggggtctga atatgatctt tattagcaat atcgatgcct aaatctctnn gctataatta ctctttcaga catttcctct tttantagtc gatttttctc agacccttga gaggtgtcgc gatagcaaaa cattagagtt gatcattaag tggcttttgc ttgttcatca catacagttt ctttgtatcc g
120
130
231 <210>
<211>
<212>
<213>
458
231
DNA
Homo sapiens
458 <400> aggtctggtt agaagagggg acaccctaac ggtcctgggt ccccccactt tggttaggga cttgggtaac taggcatttt ccactcccct agccgttgag agcatttgga ggggggccag ctactctctc acctgaagcc attatcattt accccaggag taggactggg ccaccctcta gggatgagta aagaagattc ctgggccaag ccttccttca gaatttccaa t
120
180
231 <210>
<211>
<212>
<213>
459
231 DNA
Homo sapiens
459 ctcgctgaca acctgtggtg gttttccctc gaaaggaatg caggacagag tcattggctc gccagccaca agacagagca tgtgctttcc
120
180 cagagaaacc gcccaccagt caccacagcc ccaacgcgag cctaacggga atcctgtccc <400> ggtaccgagg ccttcgcgaa gccctgcact
actatacaca gtcaccgtcc caatgagaaa caagaaggag caccctccac a 231
<210> 460 <211> 231 <212> DNA <213> Homo sapiens
<400> 460 • · ♦ · · · gactaggaac tcacagtgat ggagcccaca ctaccaggct ggccggtgac catgaagcct gaagggtcct taaggataga atggggaggg 60 agcagcaaat cctgcagcca a
273 gcaggtataa cctatcaccc cccacctccc gtggagcttg catgctgcaa tattcttggg cacacgcaca gtccagcctc caacagatgt ggctgcttct cggccagcct cagtccaccc
120
180
231 <210>
<211>
<212>
<213>
461
231
DNA
Homo sapiens <400> cgaggtttga gcgtgtgctc gtggggttca agggggattc
461 gaagctctaa cagaagagtg gtgaggagtg catggcactg tgtgcagggg tgtgcatgcc ggaaattggt atagagccct agccgagaag agaggggaaa tcagcagaac atagtttcag caggcggcct caggcgcctg caagccgttg agctgggaat agggagggtc tgtgtcctgg ggtgaataag t
120
180
231 <210>
<211>
<212>
<213>
462
231
DNA
Homo sapiens
462 <400> aggtaccctc gggtcatgca gaagaactgt tctagaggag attgtagcca agtataaaaa tagagagacc gtatttaatt tgggaaaatt ttaaaaaaaa aacagggtag tcttctcact gatgttcagt aagacttcat tgggttagag catccagtgt ggggatcagt gcccaatctc atttccagag tgtatttagg gaattaaatg atatgatgtg tcttacattt a
120
180
231 <210>
<211>
<212>
<213>
463
231
DNA
Homo sapiens
463 <400> tactccagcc actgagtaga catttgacag tggggaggtg tggtgacaga caggtgtcct gtgtcttttc gatcttccag gcgagaccct cttggcatgg ctctggacct tcgaagcggt atcaccgccc taagtcttaa cggtgtcccc atagaagccc cccaccccac gtcccctccc atctgagtga gtgtgaaaag caaaaaaaaa agatctgtga gaaaaggcag c
120
180
231 <210>
<211>
<212>
<213>
464
231 DNA
Homo sapiens
464 <400> gtactctaag aaggacatca cctgcttcag ggtgccagcg attttatcta catatgaaga tgactgtgtg caccagctag agttgccttt atgtttaagt cctgtagtcc atgctctgta tctgggtggg tggaggtggc cagctactcg acttctaggc aaagtttaac aacgtgaatt ggagtctgtg cccattttcc cttagtgact gcaaacaggg tgaggccagg c
120
180
231 <210> 465 <211> 231 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 465
274 catgttgttg gtggcaaatt aggatggcac taaactggag tagctgtggt agcaacaaat aatttttgct acatgcagga aatgctggct tctgacat.ca tgtgttcata cattagggta gcatctcaga tatttatggt atatactcag gtgttgtagc cagggttaac ttctgtatct attagttcag tctggtaatg ttcagctcct ttgttgatga ctccatcaga a
120
180
231 <210>
<211>
<212>
<213>
466
231
DNA
Homo sapiens
466 <400>
caggtacctc ggccttcgaa cctgtgcaat aataatggag tttccattgg cagaacttgc caaatattgt accagtccca atactgtgct cacataccca ggagaattcc caagatgaca agcaagcatg ggtataatag ctagctggag accagtcgtt ctctccgggg tttctaacat aagtcacaaa gtgtgcggct tttttttaat ttgcccagga gactataggc 9
120
180
231 <210>
<211>
<212>
<213>
467
311
DNA
Homo sapiens
467 <400> gtacaccctg tggc-ggcttt tgtgccttaa gcatgggtct tgtgacctgc ctgcagcaga gcacagtcca tctccttttt cagaaggtct ctgcccaagc tgggcctccc c atctgaactg catcaagact tgagattcta tcgtaatgag aatagactaa catctttcat gagcccagac atttcagcga ggcggctgtg cagttggacc gagatggatg cagcctgcac ctatcatgtg ggacgtcagt caagagaaga
120
180
240
300
311 <210>
<211>
<212>
<213>
468 3112 DNA
Homo sapiens
468 <400> cattgtgttg aagatctgca tggaaggcac atgggatggc cgaggacttg gtgaatgtgg aaatgggata atttgaagga catttggtgg gattatcatt aaattgaact tttccattcc gaagttttaa gattaaataa aattttctgg attaaatggc ggatgttcct acctgtgaga tccaaagcca tagtacatct ggagaaaaac tggtgggaag tggatgcctg cagagacaca gaattgcatg atgattggat cacagtatga tgaattgaga aactgagaaa caatctcata gttaacaaag agttggcttc catttctcca agaacttgag atgggcaata aatggacaaa tagtcactta ttaaggctct acgtcgaatt ttcttatggg atgcacttat agaggggaga gacctgatga atgatgaagt ggagatgagt gagctggagc gatcatttct tctataaagt taaťttattt tggcataaca gttttgtcat gaatctctgg ttgggtttgc gtgatttttt aagaacaggt cttatgttca gtgaaaaact aaggagaact ttgtggggaa ttgaaacata tttgtgtggc tacagagttt ggactttcaa tggagcaagc tgaagtttag catctctgag gggatatagt caggtgccta ccaaatttaa ggcccaattt tcctgggtaa tagctgcatc tatctcacct ttcattaaac caggaaatgc tagacttttt gaaaaatagc ggacaaagat tcaaagctct gaaaaatggt tgcagccgag gataggagac actggggcac tcaataacaa cccaattgtt cctcaggttc atgatctact gaacaatgcc tatatgtcag atcctcactt tggctgagca actagtcatc ttgaagatac ataaaatcaa tttaaaatat tttttttttt agtgagttcc ctgtaaattt tcttcaagac ggctgtcaac ggagaccagg aattaaaggc tactgaaacg agtggttcaa tactagttga cccatccata tcactgggtt cagattagta atgttactat gtgcctcaac ccactgagca ttaaataaat tatgttatgt tgtagacgca gcagaagata ggaagtatct acataatcca acagtttcct aaataatcta atctagtcac
120
180
240
300
360
420
480
540
600
660
720
780
840
900
960
1020
1080
1140
1200 • · · · Λ» «
275 tttagctctc aaaatggttc attttaagag aaagttttag aatctcatat ttattcctgt 1260 ggaaggacag cattgtggct tggactttat aaggtcttta ttcaactaaa taggtgagaa 1320 ataagaaagg ctgctgactt taccatctga ggccacacat ctgctgaaat ggagataatt 1380 aacatcacta gaaacagcaa gatgacaata taatgtctaa gtagtgacat gtttttgcac 1440 atttccagcc cctttaaata tccacacaca caggaagcac aaaaggaagc acagagatcc 1500 ctgggagaaa tgcccggccg ccatcttggg tcatcgatga gcctcgccct gtgcctggtc 1560 ccgcttgtga gggaaggaca ttagaaaatg aattgatgtg ttccttaaag gatgggcagg 1620 aaaacagatc ctgttgtgga tatttatttg aacgggatta cagatttgaa atgaagtcac 1680 aaagtgagca ttaccaatga gaggaaaaca gacgagaaaa tcttgatggc ttcacaagac 1740 atgcaacaaa caaaatggaa tactgtgatg acatgaggca gccaagctgg ggaggagata 1800 accacggggc agagggtcag gattctggcc ctgctgccta aactgtgcgt tcataaccaa 1860 atcatttcat atttctaacc ctcaaaacaa agctgttgta atatctgatc tctacggttc 1920 cttctgggcc caacattctc catatatcca gccacactca tttttaatat ttagttccca 1980 gatctgtact gtgacctttc tacactgtag aataacatta ctcattttgt tcaaagaccc 2040 ttcgtgttgc tgcctaatat gtagctgact gtttttccta aggagtgttc tggcccaggg 2100 gatctgtgaa caggctggga agcatctcaa gatctttcca gggttatact tactagcaca 2160 cagcatgatc attacggagt gaattatcta atcaacatca tcctcagtgt ctttgcccat 2220 actgaaattc atttcccact tttgtgccca ttctcaagac ctcaaaatgt cattccatta 2280 atatcacagg attaactttt ttttttaacc tggaagaatt caatgttaca tgcagctatg 2340 ggaatttaat tacatatttt gttttccagt gcaaagatga ctaagtcctt tatccctccc 2400 ctttgtttga ttttttttcc agtataaagt taaaatgctt agccttgtac tgaggctgta 2460 tacagccaca gcctctcccc atccctccag ccttatctgt catcaccatc aacccctccc 2520 atgcacctaa acaaaatcta acttgtaatt ccttgaacat gtcaggcata cattattcct 2580 tctgcctgag aagctcttcc ttgtctctta aatctagaat gatgtaaagt tttgaataag 2640 ttgactatct tacttcatgc aaagaaggga cacatatgag attcatcatc acatgagaca 2700 gcaaatacta aaagtgtaat ttgattataa gagtttagat aaatatatga aatgcaagag 2760 ccacagaggg aatgtttatg gggcacgttt gtaagcctgg gatgtgaagc aaaggcaggg 2820 aacctcatag tatcttatat aatatacttc atttctctat ctctatcaca atatccaaca 2880 agcttttcac agaattcatg cagtgcaaat ccccaaaggt aacctttatc catttcatgg 2940 tgagtgcgct ttagaatttt ggcaaatcat actggtcact tatctcaact ttgagatgtg 3000 tttgtccttg tagttaattg aaagaaatag ggcactcttg tgagccactt tagggttcac 3060 tcctggcaat aaagaattta caaagagcaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aa 3112 <210> 469 <211> 2229 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 469 agctctttgt tatttctttc tgatttgcca tttgcactgc aagtatatta aacgtgcccc tataatcaaa ccttctttgc agagacaagg ttacaagtta ggagggatgg tttatactgg tggaaaacaa ttaaaaaaaa gcacaaaagt ataattcact aaattcttta aattaactac aaattctaaa atgaattctg tataagatac ataaacattc tacactttta atgaagtaag aagagcttct gattttgttt ggagaggctg aaaaaaaatc aatatgtaat agttaatcct gggaaatgaa ccgtaatgat ttgccaggag aaggacaaac gcgcactcac tgaaaagctt tatgaggttc cctctgtggc gtatttgctg atagtcaact caggcagaag aggtgcatgg tggctgtata aaacaaaggg taaattccca gtgatattaa tttcagtatg catgctgtgt tgaaccctaa acatctcaaa catgaaatgg gttggatatt cctgcctttg tcttgcattt tctcatgtga tattcaaaac gaataatgta gaggggttga cagcctcagt gagggataaa tagctgcatg tggaatgaca ggcaaagaca gctagtaagt agtggctcac gttgagataa ataaaggtta gtgatagaga cttcacatcc catatattta tgatgaatct tttacatcat tgcctgacat tggtgatgac acaaggctaa ggacttagtc taacattgaa ttttgaggtc ctgaggatga ataaccctgg aagagtgccc gtgaccagta cctttgggga tagagaaatg caggcttaca tctaaactct catatgtgtc tctagattta gttcaaggaa agataaggct gcattttaac atctttgcac ttcttccagg ttgagaatgg tgttgattag aaagatcttg
120
180
240
300
360
420
480
540
600
660
720
780
840
900
960
9« ··*♦ • Φ
276 agatgcttcc cagcctgttc acagatcccc tgggccagaa cactccttag gaaaaacagt 1020 cagctacata ttaggcagca acacgaaggg tctttgaaca aaatgagtaa tgttattcta 1080 cagtgtagaa aggtcacagt acagatctgg gaactaaata ttaaaaatga gtgtggctgg 1140 atatatggag aatgttgggc ccagaaggaa ccgtagagat cagatattac aacagctttg 1200 ttttgagggc tagaaatatg aaatgatttg gttatgaacg cacagtttag gcagcagggc 1260 cagaatcctg accctctgcc ccgtggttat ctcctcccca gcttggctgc ctcatgtcat 1320 cacagtattc cattttgttt gttgcatgtc ttgtgaagcc atcaagattt tctcgtctgt 1380 tttcctctca ttggtaatgc tcactttgtg acttcatttc aaatctgtaa tcccgttcaa 1440 ataaatatcc acaacaggat ctgttttcct gcccatcctt taaggaacac atcaattcat 1500 tttctaatgt ccttccctca caagcgggac caggcacagg gcgaggctca tcgatgaccc 1560 aagatggcgg ccgggcattt ctcccaggga tctctgtgct tccttttgtg cttcctgtgt 1620 gtgtggatat ttaaaggggc tggaaatgtg caaaaacatg tcactactta gacattatat 1680 tgtcatcttg ctgtttctag tgatgttaat tatctccatt tcagcagatg tgtggcctca 1740 gatggtaaag tcagcagcct ttcttatttc tcacctggaa atacatacga ccatttgagg 1800 agacaaatgg caaggtgtca gcataccctg aacttgagtt gagagctaca cacaatatta 1860 ttggtttccg agcatcacaa acaccctctc tgtttcttca ctgggcacag aattttaata 1920 cttatttcag tgggctgttg gcaggaacaa atgaagcaat ctacataaag tcactagtgc 1980 agtgcctgac acacaccatt ctcttgaggt cccctctaga gatcccacag gtcatatgac 2040 ttcttgggga gcagtggctc acacctgtaa tcccagcact ttgggaggct gaggcaggtg 2100 ggtcacctga ggtcaggagt tcaagaccag cctggccaat atggtgaaac cccatctcta 2160 ctaaaaatac aaaaattagc tgggcgtgct ggtgcatgcc tgtaatccca gccccaacac 2220 aatggaatt 2229 <210> 470 <211> 2426 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 470 gtaaattctt tattgccagg agtgaaccct tcaattaact acaaggacaa acacatctca caaaattcta aagcgcactc accatgaaat gcatgaattc tgtgaaaagc ttgttggata tatataagat actatgaggt tccctgcctt ccataaacat tccctctgtg gctcttgcat aattacactt ttagtatttg ctgtctcatg tgcatgaagt aagatagtca acttattcaa aggaagagct tctcaggcag aaggaataat ttagattttg tttaggtgca tgggaggggt tggggagagg ctgtggctgt atacagcctc tggaaaaaaa atcaaacaáa ggggagggat caaaatatgt aattaaattc ccatagctgc aaaaagttaa tcctgtgata ttaatggaat aagtgggaaa tgaatttcag tatgggcaaa cactccgtaa tgatcatgct gtgtgctagt ttcccagcct gttcacagat cccctgggcc catattaggc agcaacacga agggtctttg agaaaggtca cagtacagat ctgggaacta ggagaatgtt gggcccagaa ggaaccgtag gggttagaaa tatgaaatga tttggttatg cctgaccctc tgccccgtgg ttatctcctc attccatttt gtttgttgca tgtcttgtga ctcattggta atgctcactt tgtgacttca atccacaaca ggatctgttt tcctgcccat atgtccttcc ctcacaagcg ggaccaggca aaagtggctc acaagagtgc cctatttctt 60 aagttgagat aagtgaccag tatgatttgc 120 ggataaaggt tacctttggg gatttgcact 180 ttgtgataga gatagagaaa tgaagtatat 240 tgcttcacat cccaggctta caaacgtgcc 300 ttcatatatt tatctaaact cttataatca 360 tgatgatgaa tctcatatgt gtcccttctt 420 aactttacat cattctagat ttaagagaca 480 gtatgcctga catgttcaag gaattacaag 540 tgatggtgat gacagataag gctggaggga 600 agtacaaggc taagcatttt aactttatac 660 aaaggactta gtcatctttg cactggaaaa 720 atgtaacatt gaattcttcc aggttaaaaa 780 gacattttga ggtcttgaga atgggcacaa 840 gacactgagg atgatgttga ttagataatt 900 aagtataacc ctggaaagat cttgagatgc 960 agaacactcc ttaggaaaaa cagtcagcta 1020 aacaaaatga gtaatgttat tctacagtgt 1080 aatattaaaa atgagtgtgg ctggatatat 1140 agatcagata ttacaacagc tttgttttga 1200 aacgcacagt ttaggcagca gggccagaat 1260 cccagcttgg ctgcctcatg tcatcacagt 1320 agccatcaag attttctcgt ctgttttcct 1380 tttcaaatct gtaatcccgt tcaaataaat 1440 cctttaagga acacatcaat tcattttcta 1500 cagggcgagg ctcatcgatg acccaagatg 1560 «··· « ·· ·· *· * ·· • »· · * • · « · ·· • · · ·· «·· »* *· gcggccgggc atttctccca gggatctctg tgcttccttt tgtgcttcct gtgtgtgtgg 1620 atatttaaag gggctggaaa tgtgcaaaaa catgtcacta cttagacatt atattgtcat 1680 cttgctgttt ctagtgatgt taattatctc catttcagca gatgtgtggc ctcagatggt 1740 aaagtcagca gcctttctta tttctcacct ggaaatacat acgaccattt gaggagacaa 1800 atggcaaggt gtcagcatac cctgaacttg agttgagagc tacacacaat attattggtt 1860 tccgagcatc acaaacaccc tctctgtttc ttcactgggc acagaatttt aatacttatt 1920 tcagtgggct gttggcagga acaaatgaag caatctacat aaagtcacta gtgcagtgcc 1980 tgacacacac cattctcttg aggtcccctc tagagatccc acaggtcata tgacttcttg 2040 gggagcagtg gctcacacct gtaatcccag cactttggga ggctgaggca ggtgggtcac 2100 ctgaggtcag gagttcaaga ccagcctggc caatatggtg aaaccccatc tctactaaaa 2160 acacaaaaat tagctgggcg tgctggtgca tgcctgtaat cccagctact tgggaggctg 2220 aggcaggaga attgctggaa catgggaggc ggaggttgca gtgagctgta attgtgccat 2280 tgcactcgaa cctgggcgac agagtggaac tctgtttcca aaaaacaaac aaacaaaaaa 2340 ggcatagtca gatacaacgt gggtgggatg tgtaaataga agcaggatat aaagggcatg 2400 gggtgacggt tttgcccaac acaatg 2426 <210> 471 <211> 812 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 471 gaacaaaatg aaatattaaa gagatcagat gaacgcacag ccccagcttg aagccatcaa atttcaaatc tcctttaagg acagggcgag gtgcttcctt acatgtcact ccatttcagc tctgtatcat cacaaatctc agtaatgtta aatgagtgtg attacaacag tttaggcagc gctgcctcat gattttctcg tgtaatcccg aacacatcaa gctcatcgat ttgtgcttcc acttagacat agatgtgtgg caggtccttc ccctctgttt ttctacagtg gctggatata ctttgttttg agggccagaa gtcatcacag tctgttttcc ttcaaataaa ttcattttct gacccaagat tgtgtgtgtg tatattgtca cctcagatgg ccaccatgca ttctgatgcc tagaaaggtc tggagaatgt agggttagaa tcctgaccct tattccattt tctcattggt tatccacaac aatgtccttc ggcggccggg gatatttaaa tcttgctgtt taaagtcagc gatcttcctg ag acagtacaga tgggcccaga atatgaaatg ctgccccgtg tgtttgttgc aatgctcact aggatctgtt cctcacaagc catttctcoc ggggctggaa tctagtgatg agcctttctt gtctccctcg tctgggaact aggaaccgta atttggttat gttatctcct atgtcttgtg ttgtgacttc ttcctgccca gggaccaggc agggatctct atgtgcaaaa ttaattatct atttctcacc gctgcagcca
120
180
240
300
360
420
480
540
600
660
720
780
812 <210> 472 <211> 515 <212> DNA <213> Homo sapiens <220>
< 2 21 > různé vlastnosti <222> (1) . . . (515) <223> n = Á,T,C neboG <400> 472 acggagactt cttatgactt gttccagaat caatcaggat agtagaaggt ctctgatgta agatgggcag attttctgat tcctatcatg tattggtcct attgaacctg gattgccagg aaagagaaga ccataagtta attgtctgca cttattaata tgcagcccgg gacaagagag aaatggatct ctccacctaa aaaagaagac tggaaatagt atgaaaatgg caccaactga aagaacgtaa gtggagatgg aagaagcagg gctgatgtca
120
180
240
300
360
420 tatgtatgtt aataatacag tgaatctcag agaaggaaca ggaaaagact tcctaagcat aagctgaagc tttaagagtc cccagagaag caagaggaac cctccgatcg cggagtgagc gctaagacta tacacacatg
cattgaaaat gtgactgaaa atttgaaaat tctctcaata aagtttgagt tttctctgaa 480 gaaaaaaaaa naaaaaaaaa aaanaaaaan aaaaa515
JODr. PW fctaÉý advokát, /X, xý-XíXÁzjí? y / v/f/

Claims (79)

1. Izolovaný polypeptid obsahující alespoň imunogenní část prostatického nádorového proteinu, nebo jeho varianty, kde nádorový protein obsahuje aminokyselinou sekvenci, která je kódovaná polynukleotidovou sekvencí vybranou ze skupiny zahrnuj ící:
(a) sekvence uvedené v jakékoliv ze SEQ ID NO: 2, 3, 8-29,
41-45, 47-52, 54-65, 70, 73-74, 79, 81, 87, 90, 92, 93, 97, 103, 104, 107, 109-111, 115-160, 171, 173-175, 177, 181, 188, 191, 193, 194, 198, 203, 204, 207, 209 , 220, 222-225, 227-305, 307-315, 326, 328, 330, 332, 334, 350-365, 381, 382, 384, 386, 389 , 390, 392, 393, 396, 401, 402, 407, 408 , 410, 413, 415 -419, 422 , 426, 427, 432, 434, 435, 442-444, 446, 450, 452, 453, 459-461, 468-471 nebo 472 ;
(b) sekvence, které hybridizují na jakoukoliv z výše uvedených sekvencí za podmínek středně přísné hybridizace; a (c) sekvence komplementární k jakékoliv ze sekvencí uvedených pod bodem (a) a (b).
2. Izolovaný polypeptid podle nároku 1, kde polypeptid obsahuje aminokyselinou sekvenci, která je kódovaná polynukleotidovou sekvencí vybranou ze skupiny zahrnující sekvence uvedené v jakékoliv ze SEQ ID NO: 2, 3, 8-29, 41-45, 47-52, 54-65, 70, 73-74, 79, 81, 87, 90, 92, 93, 97, 103, 104, 107, 109-111, 115-160, 171, 173-175, 177, 181, 188, 191, 193, 194, 198, 203, 204, 207, 209, 220, 222-225, 227-305, 307-315, 326, 328, 330, 332, 334, 350-365, 381, 382, 384, 386, 389, 390, 392, 393, 396, 401, 402, 407, 408, 410, 413, 415-419, 422, 426, 427, 432, 434, 435, 442-444, 446, 450, 452, 453, 459-461, 468-471 nebo 472, nebo sekvence komplementární k jakékoliv uvedené polynukleotidové sekvence.
3. Izolovaný polypeptid obsahující sekvenci uvedenou v jakékoliv
280 • · · · ···· ·· • · · · · ··· ·· · · · · · ze SEQ ID NO: 108, 112, 113, 114, 172, 176, 178, 327, 329, 331,
339 a 383.
4. Izolovaný polynukleotid kódující alespoň 15 aminokyselinových zbytků prostatického nádorového proteinu nebo jeho varianty, která se liší v jedné nebo více substitucích, delecích, adicích a/nebo insercích tak, že schopnost varianty reagovat s antisérem specifickým pro antigen není významně snížena, kde nádorový protein obsahuje aminokyselinou sekvenci, která je kódovaná polynukleotidem vybraným ze skupiny zahrnující sekvence uvedené v jakékoliv ze SEQ ID NO: 2, 3, 8-29, 41-45, 47-52, 54-65, 70, 73-74, 79, 81, 87, 90, 92, 93, 97, 103, 104, 107, 109-111, 115-160, 171, 173-175, 177, 181, 188, 191, 193, 194, 198, 203, 204, 207, 209, 220, 222-225, 227-305, 307-315, 326, 328, 330, 332, 334, 350-365, 381, 382, 384, 386, 389, 390, 392, 393, 396, 401, 402, 407, 408, 410, 413, 415-419, 422, 426, 427, 432, 434, 435, 442-444, 446, 450, 452, 453, 459-461, 468-471 nebo 472, nebo sekvence komplementární k jakékoliv uvedené polynukleotidové sekvence.
5. Izolovaný polynukleotid kódující prostatický nádorový protein nebo jeho variantu, kde uvedený nádorový protein obsahuje aminokyselinou sekvenci, která je kódovaná polynukleotidem vybraným ze skupiny zahrnující sekvence uvedené v jakékoliv ze SEQ ID NO: 2, 3, 8-29, 41-45, 47-52, 54-65, 70, 73-74, 79, 81, 87, 90, 92, 93, 97, 103, 104, 107, 109-111, 115-160, 171, 173-175, 177, 181, 188, 191, 193, 194, 198, 203, 204, 207, 209, 220, 222-225, 227-305, 307-315, 326, 328, 330, 332, 334, 350-365, 381, 382, 384, 386, 389, 390, 392, 393, 396, 401, 402, 407, 408, 410, 413, 415-419, 422, 426, 427, 432, 434, 435, 442-444, 446, 450, 452, 453, 459-461, 468-471 nebo 472, nebo sekvence komplementární k jakékoliv uvedené polynukleotidové sekvence.
6. Izolovaný polynukleotid obsahující sekvenci vybranou z SEQ ID
281
NO: 2, 3, 8-29, 41-45, 47-52, 54-65, 70, 73-74, 79, 81, 87, 90, 92, 93, 97, 103, 104, 107, 109-111, 115-160, 171, 173-175, 177, 181, 188, 191, 193, 194, 198, 203, 204, 207, 209, 220, 222-225, 227-305, 307-315, 326, 328, 330, 332, 334, 350-365, 381, 382, 384, 386, 389, 390, 392, 393, 396, 401, 402, 407, 408, 410, 413, 415-419, 422, 426, 427, 432, 434, 435, 442-444, 446, 450, 452, 453, 459-461, 468-471 nebo 472.
7. Izolovaný polynukleotid obsahující sekvenci, která hybridizuje, za středně přísných podmínek, na sekvenci uvedenou v jakékoliv z SEQ ID NO: 2, 3, 8-29, 41-45, 47-52, 54-65, 70, 73-74, 79, 81, 87, 90, 92, 93, 97, 103, 104, 107, 109-111, 115-160, 171, 173-175, 177, 181, 188, 191, 193, 194, 198, 203, 204, 207, 209, 220, 222-225, 227-305, 307-315, 326, 328, 330, 332, 334, 350-365, 381, 382, 384, 386, 389, 390, 392, 393, 396, 401, 402, 407, 408, 410, 413, 415-419, 422, 426, 427, 432, 434, 435, 442-444, 446, 450, 452, 453, 459-461, 468-471 nebo 472.
8. Izolovaný polynukleotid komplementární k polynukleotidu podle jakéhokoliv z nároků 4-7.
9. Expresní vektor obsahující polynukleotid podle jakéhokoliv z nároků 4-7.
10. Hostitelská buňka transformovaná nebo transfektováná expresním vektorem podle nároku 9.
11. Expresní vektor obsahující polynukleotid podle nároku 8.
12. Hostitelská buňka transformovaná nebo transfektováná expresním vektorem podle nároku 11.
13. Farmaceutický prostředek vyznačující se tím
282 že obsahuje polypeptid podle nároku 1 v kombinaci s fyziologicky přijatelným nosičem.
14. Vakcína vyznačující se tím, že obsahuje polypeptid podle nároku 1 v kombinaci s činidlem nespecificky zesilujícím imunitní odpověď.
15. Vakcína podle nároku 14 vyznačuj ící se tím, že činidlem nespecificky zesilujícím imunitní odpověď je adjuvans.
16. Vakcína podle nároku 14 vyznačující se tím, že činidlo nespecificky zesilující imunitní odpověď indukuje především odpověď typu I.
17. Farmaceutický prostředek vyznačující se tím, že obsahuje polynukleotid podle nároku 4 v kombinaci s fyziologicky přijatelným nosičem.
18. Vakcína vyznačující se tím, že obsahuje polynukleotid podle nároku 4 v kombinaci s činidlem nespecificky zesilujícím imunitní odpověď.
19. Vakcína podle nároku 18 vyznačující se tím, že činidlem nespecificky zesilujícím imunitní odpověď je adjuvans.
20. Vakcína podle nároku 18 vyznačující se tím, že činidlo nespecificky zesilující imunitní odpověď indukuje především odpověď typu I.
21. Izolovaná protilátka nebo její vazebný fragment pro antigen, která se specificky váže na prostatický nádorový protein obsahující aminokyselinovou sekvenci kódovanou polynukleotidovou sekvencí uvedenou v jakékoliv ze SEQ ID NO: 2, 3, 8-29, 41-45,
283
109-111,
181, 188,
107,
198,
203,
204,
115-160, 171, 173-175, 177,
220, 222-225, 227-305, 307-315,
207
330,
396,
332,
401,
334,
402,
434,
435,
103, 104,
191, 193, 194,
326, 328,
381, 382, 384389, 390, 392, 393,
407, 408, 410, 413, 415-419, 422, 426, 427, 432, 442-444, 446, 450, sekvence komplementární sekvence.
350
22. Farmaceutický prostředek vyznačující se tím, že obsahuje protilátku nebo její fragment podle nároku 18 v kombinaci s fyziologicky přijatelným nosičem.
23. Farmaceutický prostředek vyznačující se tím, že obsahuje buňky prezentující antigen, které exprimují polypeptid podle nároku 1 v kombinaci s fyziologicky přijatelným nosičem nebo přísadou.
24. Farmaceutický prostředek podle nároku 23 vyznačuj ící se t í m, že buňkou prezentující antigen je dendritická buňka nebo makrofág.
25. Vakcína vyznačující se tím, že obsahuje buňky prezentující antigen, které exprimují polypeptid podle nároku 1, v kombinaci s činidlem nespecificky zesilujícím imunitní odpověď.
26. Vakcína podle nároku 25 vyznačuj ící se tím, že činidlem nespecificky zesilujícím imunitní odpověď je adjuvans.
27. Vakcína podle nároku 25 vyznačující se tím, že činidlo nespecificky zesilující imunitní odpověď indukuje především odpověď typu I.
284
28. Vakcína podle nároku 25 vyznačující se tím, že buňkou prezentující antigen je dendritická buňka.
29. Způsob pro inhibici vzniku nádorového onemocnění u pacienta vyznačující se tím, že zahrnuje podání účinného množství polypeptidu podle nároku 1 pacientovi a tím inhibici vzniku nádorového onemocnění u pacienta.
30. Způsob pro inhibici vzniku nádorového onemocnění u pacienta vyznačující se tím, že zahrnuje podání účinného množství polynukleotidu podle nároku 4 pacientovi a tím inhibici vzniku nádorového onemocnění u pacienta.
31. Způsob pro inhibici vzniku nádorového onemocnění u pacienta vyznačující se tím, že zahrnuje podání účinného množství protilátky nebo jejího vazebného fragmentu pro antigen podle nároku 21 pacientovi a tím inhibici vzniku nádorového onemocnění u pacienta.
32. Způsob pro inhibici vzniku nádorového onemocnění u pacienta vyznačující se tím, že zahrnuje podání účinného množství buněk prezentujících antigen, které exprimují polypeptid podle nároku 1, pacientovi a tím inhibici vzniku nádorového onemocnění u pacienta.
33. Způsob podle nároku 32 vyznačující se tím, že buňkami prezentujícími antigen jsou dendritické buňky.
34. Způsob podle jakéhokoliv z nároků 29-32 vyznačuj ící se t í m, že nádorem je karcinom prostaty.
35. Fúzní protein obsahující alespoň jeden polypeptid podle nároku
285 • · ·· ···· ·· ···· · · * · ·· » · » * ·
1.
36. Fúzní protein podle nároku 35, který obsahuje zesilovač exprese zvyšující expresi fúzního proteinu v hostitelské buňce transfektováné polynukleotidem kódujícím fúzní protein.
37. Fúzní protein podle nároku 35, který obsahuje epitop pro T-pomocné lymfocyty, který není přítomen v polypeptidu podle nároku 1.
38. Fúzní protein podle nároku 35, který obsahuje afinitní koncovku.
39. Izolovaný polynukleotid kódující fúzní protein podle nároku
35 .
40. Farmaceutický prostředek vyznačující se tím, že obsahuje fúzní protein podle nároku 32 v kombinaci s fyziologicky přijatelným nosičem.
41. Vakcína vyznačující se tím, že obsahuje fúzní protein podle nároku 35, v kombinaci s činidlem nespecificky zesilujícím imunitní odpověď.
42. Vakcína podle nároku 41 vyznačuj ící se tím, že činidlem nespecificky zesilujícím imunitní odpověď je adjuvans.
43. Vakcína podle nároku 41 vyznačující se tím, že činidlo nespecificky zesilující imunitní odpověď indukuje především odpověď typu I.
44. Farmaceutický prostředek vyznačující se tím, že obsahuje polynukleotid podle nároku 40, v kombinaci s fyziologicky
286 přijatelným nosičem.
45. Vakcína vyznačující se tím, že obsahuje polynukleotid podle nároku 40, v kombinaci s činidlem nespecificky zesilujícím imunitní odpověď.
46. Vakcína podle nároku 45 vyznačující se tím, že činidlem nespecificky zesilujícím imunitní odpověď je adjuvans.
47. Vakcína podle nároku 45 vyznačuj ící se tím, že činidlo nespecificky zesilující imunitní odpověď indukuje především odpověď typu I.
48. Způsob pro inhibici vzniku nádorového onemocnění u pacienta vyznačující se tím, že zahrnuje podání účinného množství farmaceutického prostředku podle nároků 40 nebo 44 pacientovi.
49. Způsob pro inhibici vzniku nádorového onemocnění u pacienta vyznačující se tím, že zahrnuje podání účinného množství vakcíny podle nároků 41 nebo 45 pacientovi.
50. Způsob pro odstranění nádorových buněk z biologického vzorku vyznačující se tím, že zahrnuje kontaktování biologického vzorku s T-lymfocyty, které specificky reagují s prostatickým nádorovým proteinem, kde nádorový protein obsahuje aminokyselinovou sekvenci, která je kódovaná polynukleotidovou sekvencí vybranou ze skupiny skládající se z:
(i) polynukleotidů uvedených v SEQ ID NO: 1-111, 115-171, 173-175, 177, 179-305, 307-315, 326, 328, 330, 332-335, 340-375, 381, 382 nebo 384-472; a (ii) sekvencí komplementárních k uvedeným nukleotidům;
287 kde krok kontaktování je proveden za podmínek a po dobu dostatečnou pro odstranění buněk exprimujících prostatický nádorový protein ze vzorku.
51. Způsob podle nároku 50 vyznačující se tím, že biologický vzorek je krev nebo její frakce.
52. Způsob pro inhibici vzniku nádorového onemocnění u pacienta vyznačuj ícísetím, že zahrnuje podání biologického vzorku zpracovaného způsobem podle nároku 50 pacientovi.
53. Způsob pro stimulaci a/nebo expansi T lymfocytů specifických pro prostatický nádorový protein vyznačující se tím, že zahrnuje kontaktování T lymfocytů s jedním nebo více z:
(i) polypeptidem podle nároku 1;
(ii) polypeptidem kódovaným polynukleotidem obsahujícím sekvenci uvedenou v kterékoliv ze SEQ ID NO: 1-111, 115-171, 173-175, 177, 179-305, 307-315, 326, 328, 330, 332-335, 340-375, 381, 382 nebo 384-472;
(iii) polynukleotidem kódujícím polypeptid podle bodu (i) nebo (ii); a/nebo (iv) buňkou prezentující antigen exprimující polypeptid podle bodu (i) nebo (ii);
za podmínek a po dobu dostatečnou pro stimulaci a/nebo expansi T lymfocytů.
54. Izolovaná populace T lymfocytů, která obsahuje T lymfocyty
288 připravené způsobem podle nároku 53.
55. Způsob pro inhibici vzniku nádorového onemocnění u pacienta vyznačuj ícísetím, že zahrnuje podání účinného množství populace T lymfocytů podle nároku 54 pacientovi.
56. Způsob pro inhibici vzniku nádorového onemocnění u pacienta vyznačující se tím, že zahrnuje kroky:
(a) inkubaci CD4* a/nebo CD8* T lymfocytů izolovaných od pacienta s alespoň jednou složkou vybranou ze skupiny zahrnující:
(i) polypeptid podle nároku 1;
(ii) polypeptid kódovaný polynukleotidem obsahujícím sekvenci uvedenou v kterékoliv ze SEQ ID NO: 1-111, 115-171, 173-175, 177, 179-305, 307-315, 326, 328, 330, 332-335, 340-375, 381, 382 nebo 384-472;
(iii) polynukleotid kódující polypeptid podle bodu (i) nebo (ii); a/nebo (iv) buňku prezentující antigen exprimující polypeptid podle bodu (i) nebo (ii);
tak, že T-lymfocyty proliferují;
(b) podání účinného množství proliferovaných T lymfocytů pacientovi a tím inhibici vzniku nádoru u pacienta.
57. Způsob pro inhibici vzniku nádorového onemocnění u pacienta vyznačující se tím, že zahrnuje kroky:
(a) inkubaci CD4* a/nebo CD8* T lymfocytů izolovaných od pacienta s alespoň jednou složkou vybranou ze skupiny zahrnující:
• ·
289 (i) polypeptid podle nároku 1;
(ii) polypeptid kódovaný polynukleotidem obsahujícím sekvenci uvedenou v kterékoliv ze SEQ ID NO: 1-111, 115-171, 173-175, 177, 179-305, 307-315, 326, 328, 330, 332-335, 340-375, 381, 382 nebo 384-472;
(iii) polynukleotid kódující polypeptid podle bodu (i) nebo (ii); a/nebo (iv) buňku prezentující antigen exprimující polypeptid podle bodu (i) nebo (ii);
tak, že T-lymfocyty proliferují;
(b) klonování alespoň jedné proliferované buňky;
(c) podání účinného množství proliterovaných T lymfocytů pacientovi a tím inhibici vzniku nádoru u pacienta.
58. Způsob pro určení přítomnosti nebo nepřítomnosti nádoru u pacienta vyznačující se tím, že zahrnuje kroky:
(a) kontaktování biologického vzorku získaného od pacienta s vazebným činidlem, které se váže na prostatickým nádorový protein, kde nádorový protein obsahuje aminokyselinovou sekvenci, která je kódovaná polynukleotidovou sekvencí vybranou ze skupiny skládaj ící se z:
(i) polynukleotidů uvedených v SEQ ID NO: 1-111, 115-171, 173-175, 177, 179-305, 307-315, 326, 328, 330, 332-335, 340-375, 381, 382 nebo 384-472; a (ii) sekvencí komplementárních k uvedeným polynukleotidům;
290 (b) detekování množství polypeptidu, které se váže na vazebné činidlo ve vzorku; a (c) srovnání množství polypeptidu s předem určenou hraniční hodnotou a z toho určení přítomnosti nebo nepřítomnosti nádoru u pacienta.
59. Způsob podle nároku 58 vyznačuj ící vazebným činidlem je protilátka.
60. Způsob podle nároku 59 vyznačuj ící protilátkou je monoklonální protilátka.
61. Způsob podle nároku 58 vyznačuj ící se t í m, že se t í m, že tím, že nádorem je karcinom prostaty.
62. Způsob pro sledování progrese nádoru u pacienta vyznačující se tím, že zahrnuje kroky:
(a) kontaktování biologického vzorku získaného od pacienta v prvním časovém bodě s vazebným činidlem, které se váže na prostatickým nádorový protein, kde nádorový protein obsahuje aminokyselinovou sekvenci, která je kódovaná polynukleotidovou sekvencí vybranou ze skupiny skládající se z SEQ ID NO: 1-111,
115-171, 173-175, 177, 179-305, 307-315, 326, 328, 330, 332-335,
340-375, 381, 382 nebo 384-472 nebo sekvencí komplementárních k uvedeným polynukleotidům;
(b) detekování množství polypeptidu, které se váže na vazebné činidlo ve vzorku;
(c) opakování kroků (a) a (b) za použití biologického vzorku získaného od pacienta v dalším časovém bodě; a
291 (d) srovnání množství polypeptidu detekovaného v kroku (c) s množstvím detekovaným v kroku (b) a z toho sledování progrese nádorového onemocnění u pacienta.
63. Způsob podle nároku 62 vyznačuj ící se tím, že vazebným činidlem je protilátka.
64. Způsob podle nároku 63 vyznačuj ící se tím, že protilátkou je monoklonální protilátka.
65. Způsob podle nároku 628 vyznačující se tím, že nádorem je karcinom prostaty.
66. Způsob pro určení přítomnosti nebo nepřítomnosti nádoru u pacienta vyznačující se tím, že zahrnuje kroky:
(a) kontaktování biologického vzorku získaného od pacienta s oligonukleotidem, který hybridizuje na polynukleotid kódující prostatickým nádorový protein, kde nádorový protein obsahuje aminokyselinovou sekvenci, která je kódovaná polynukleotidovou sekvencí vybranou ze skupiny skládající se ze SEQ ID NO: 1-111, 115-171, 173-175, 177, 179-305, 307-315, 326, 328, 330, 332-335, 340-375, 381, 382 nebo 384-472,nebo sekvencí komplementárních k uvedeným polynukleotidům;
(b) detekování množství polynukleotidu, který hybridizuje na oligonukleotid;
(c) srovnání množství polynukleotidu, který hybridizuje na oligonukleotid, s předem určenou hraniční hodnotou a z toho určení přítomnosti nebo nepřítomnosti nádoru u pacienta.
67. Způsob podle nároku 66 vyznačuj ící se tím, že
• «9 ··*· ♦ · · c * ♦ • · • · • ·· • · • · 292 * * · · · · • · · · a • • • · · • * • • ··« ·♦ • · «·
množství polynukleotidu, který hybridizuje na oligonukleotid, je určeno polymerasovou řetězovou reakcí.
68. Způsob podle nároku 66 vyznačuj ící se tím, že množství polynukleotidu, který hybridizuje na oligonukleotid, je určeno hybridizačním testem.
69. Způsob pro sledování progrese nádoru u pacienta vyznačující se tím, že zahrnuje kroky:
(a) kontaktování biologického vzorku získaného od pacienta s oligonukleotidem, který kóduje prostatický nádorový protein, kde nádorový protein obsahuje aminokyselinovou sekvenci, která je kódovaná polynukleotidovou sekvencí vybranou ze skupiny skládající se z SEQ ID NO: 1-111, 115-171, 173-175, 177, 179-305, 307-315, 326, 328, 330, 332-335, 340-375, 381, 382 nebo 384-472 nebo sekvencí komplementárních k uvedeným polynukleotidům;
(b) detekování množství polynukleotidu, který hybridizuje na oligonukleot id;
(c) opakování kroků (a) a (b) za použití biologického vzorku získaného od pacienta v dalším časovém bodě; a (d) srovnání množství polynukleotidu detekovaného v kroku (c) s množstvím detekovaným v kroku (b) a z toho sledování progrese nádorového onemocnění u pacienta.
70. Způsob podle nároku 69 vyznačuj ící se tím, že množství polynukleotidu, který hybridizuje na oligonukleotid, je určeno polymerasovou řetězovou reakcí.
71. Způsob podle nároku 69 vyznačuj ící se tím, že
293 množství polynukleotidu, který hybridizuje na oligonukleotid, je určeno hybridizačním testem.
72. Diagnostický kit vyznačující se tím, že obsahuje:
(a) jednu nebo více protilátek podle nároku 21; a (b) detekční činidlo zahrnující reportérovou skupinu.
73. Kit podle nároku 72 vyznačující se tím, že protilátky jsou imobilizovány na pevném nosiči.
74. Kit podle nároku 73 vyznačující se tím, že pevný nosič obsahuje nitrocelulosový, latexový nebo plastový materiál.
75. Kit podle nároku 72 vyznačující se tím, že detekční činidlo obsahuje anti-imunoglobulin, protein G, protein A nebo lektin.
76. Kit podle nároku 72 vyznačující se tím, že reporterová skupina je vybrána ze skupiny zahrnující radioizotopy, fluorescenční skupiny, luminiscenční skupiny, enzymy, biotin a barviva.
77. Oligonukleotid obsahující 10 až 40 nukleotidů, který hybridizuje za středně přísných podmínek na polynukleotid kódující prostatický nádorový protein, kde nádorový protein obsahuje aminokyselinou sekvenci, která je kódovaná polynukleotidovou sekvencí vybranou ze skupiny zahrnující sekvence uvedené v jakékoliv ze SEQ ID NO: 2, 3, 8-29, 41-45, 47-52, 54-65, 70,
73-74, 79, 81, 87, 90, 92, 93, 97, 103, 104, 107, 109-111,
294
115-160, 171, 173-175, 177, 181, 188, 191, 193, 194, 198, 203, 204, 207, 209, 220, 222-225, 227-305, 307-315, 326, 328, 330, 332, 334, 350-365, 381, 382, 384, 386, 389, 390, 392, 393, 396, 401, 402, 407, 408, 410, 413, 415-419, 422, 426, 427, 432, 434, 435, 442-444, 446, 450, 452, 453, 459-461, 468-471 nebo 472 nebo sekvence komplementární k jakémukoliv z uvedených polynukleotidů.
78. Oligonukleotid podle nároku 77, který obsahuje 10-40 nukleotidů uvedených v jakékoliv ze SEQ ID NO: 2, 3, 8-29, 41-45,
47-52 54 -65, 70, 73-74, 79, 81, 87, 90, 92, 93, 97, 103, 104, 107, 109- 111, 115-160, 171, 173-175, 177, 181, 188, 191, 193, 194, 198, 203, 204, 207, 209, 220, 222-225, 227-305, 307- 315, 326, 328, 330, 332, 334, 350-365, 381, 382, 384, 386, 389 , 390, 392, 393, 396, 401, 402, 407, 408, 410, 413, 415-419, 422 , 426, 427, 432, 434, 435, 442-444, 446, 450, 452, 453, 459-461, 468-471 nebo 472.
79. Diagnostický kit vyznačující setím, že obsahuj e:
(a) oligonukleotid podle nároku 77; a (b) diagnostické činidlo pro použití v polymerasové řetězové reakci nebo hybridizačním testu.
CZ2001149A 1998-07-14 1999-07-14 Prostředky a způsoby pro terapii a diagnostiku karcinomu prostaty CZ2001149A3 (cs)

Applications Claiming Priority (7)

Application Number Priority Date Filing Date Title
US09/116,134 US7008772B1 (en) 1997-02-25 1998-07-14 Compounds for immunodiagnosis of prostate cancer and methods for their use
US09/115,453 US6657056B2 (en) 1997-02-25 1998-07-14 Compounds for immunotherapy of prostate cancer and methods for their use
US15982298A 1998-09-23 1998-09-23
US09/159,812 US6613872B1 (en) 1997-02-25 1998-09-23 Compounds for immunotherapy of prostate cancer and methods for their use
US09/232,149 US6465611B1 (en) 1997-02-25 1999-01-15 Compounds for immunotherapy of prostate cancer and methods for their use
US09/232,880 US7270980B2 (en) 1997-02-25 1999-01-15 Compounds for immunodiagnosis of prostate cancer and methods for their use
US28894699A 1999-04-09 1999-04-09

Publications (1)

Publication Number Publication Date
CZ2001149A3 true CZ2001149A3 (cs) 2002-02-13

Family

ID=27568734

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
CZ2001149A CZ2001149A3 (cs) 1998-07-14 1999-07-14 Prostředky a způsoby pro terapii a diagnostiku karcinomu prostaty

Country Status (17)

Country Link
EP (2) EP1870466A3 (cs)
JP (1) JP2002520054A (cs)
KR (2) KR20010083111A (cs)
CN (1) CN100419079C (cs)
AU (2) AU762812B2 (cs)
BR (1) BR9912007A (cs)
CA (1) CA2334038A1 (cs)
CZ (1) CZ2001149A3 (cs)
HU (1) HUP0203035A3 (cs)
IL (1) IL140845A0 (cs)
NO (1) NO20010196L (cs)
NZ (1) NZ509178A (cs)
PL (1) PL200772B1 (cs)
SA (1) SA99200618B1 (cs)
TR (1) TR200100916T2 (cs)
TW (2) TW200532020A (cs)
WO (1) WO2000004149A2 (cs)

Families Citing this family (137)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US7241876B2 (en) 1996-01-11 2007-07-10 Corixa Corporation Compositions and methods for the therapy and diagnosis of breast cancer
US6828431B1 (en) * 1999-04-09 2004-12-07 Corixa Corporation Compositions and methods for the therapy and diagnosis of breast cancer
US6943236B2 (en) 1997-02-25 2005-09-13 Corixa Corporation Compositions and methods for the therapy and diagnosis of prostate cancer
US20030185830A1 (en) * 1997-02-25 2003-10-02 Corixa Corporation Compositions and methods for the therapy and diagnosis of prostate cancer
US6329505B1 (en) 1997-02-25 2001-12-11 Corixa Corporation Compositions and methods for therapy and diagnosis of prostate cancer
US6818751B1 (en) 1997-08-01 2004-11-16 Corixa Corporation Compositions and methods for the therapy and diagnosis of prostate cancer
US7033827B2 (en) 1997-02-25 2006-04-25 Corixa Corporation Prostate-specific polynucleotide compositions
US6894146B1 (en) 1997-02-25 2005-05-17 Corixa Corporation Compositions and methods for the therapy and diagnosis of prostate cancer
US6630305B1 (en) 1999-11-12 2003-10-07 Corixa Corporation Compositions and methods for the therapy and diagnosis of prostate cancer
US7202342B1 (en) 1999-11-12 2007-04-10 Corixa Corporation Compositions and methods for the therapy and diagnosis of prostate cancer
US6620922B1 (en) 1997-02-25 2003-09-16 Corixa Corporation Compositions and methods for the therapy and diagnosis of prostate cancer
US6657056B2 (en) 1997-02-25 2003-12-02 Corixa Corporation Compounds for immunotherapy of prostate cancer and methods for their use
US6800746B2 (en) 1997-02-25 2004-10-05 Corixa Corporation Compositions and methods for the therapy and diagnosis of prostate cancer
US6465611B1 (en) 1997-02-25 2002-10-15 Corixa Corporation Compounds for immunotherapy of prostate cancer and methods for their use
US6759515B1 (en) 1997-02-25 2004-07-06 Corixa Corporation Compositions and methods for the therapy and diagnosis of prostate cancer
US7517952B1 (en) 1997-02-25 2009-04-14 Corixa Corporation Compositions and methods for the therapy and diagnosis of prostate cancer
JP3981416B2 (ja) 1997-04-10 2007-09-26 ユニバーシティ メディカル センター ナイメーヘン Pca3タンパク質、pca3遺伝子、及びこれらの用途
US6365369B1 (en) 1998-04-01 2002-04-02 Human Genome Sciences, Inc. Prostate specific secreted protein
US6861215B1 (en) 1998-05-21 2005-03-01 Diadexus, Inc. Method of diagnosing, monitoring, and staging prostate cancer
US20060052321A1 (en) 2002-04-05 2006-03-09 Raitano Arthur B Nucleic acid and corresponding protein entitled 98P4B6 useful in treatment and detection of cancer
EP1086223B1 (en) 1998-06-01 2009-07-29 Agensys, Inc. Novel serpentine transmembrane antigens expressed in human cancers and uses thereof
US7037667B1 (en) 1998-06-01 2006-05-02 Agensys, Inc. Tumor antigen useful in diagnosis and therapy of prostate and colon cancer
US6833438B1 (en) 1999-06-01 2004-12-21 Agensys, Inc. Serpentine transmembrane antigens expressed in human cancers and uses thereof
US20040141975A1 (en) 1998-06-01 2004-07-22 Raitano Arthur B. Nucleic acid and corresponding protein entitled 98P4B6 useful in treatment and detection of cancer
US20030149531A1 (en) 2000-12-06 2003-08-07 Hubert Rene S. Serpentine transmembrane antigens expressed in human cancers and uses thereof
CA2344552A1 (en) * 1998-10-02 2000-04-13 Urogenesys, Inc. Human gene expressed in cancers of prostate, bladder, pancreas and colon, 36p1a6
US6902892B1 (en) 1998-10-19 2005-06-07 Diadexus, Inc. Method of diagnosing, monitoring, staging, imaging and treating prostate cancer
US6528054B1 (en) * 1998-12-28 2003-03-04 Corixa Corporation Compositions and methods for the therapy and diagnosis of breast cancer
KR20020026418A (ko) * 1999-04-09 2002-04-10 길리스 스티브 유방암을 치료 및 진단하기 위한 조성물 및 방법
US6943235B1 (en) 1999-04-12 2005-09-13 Agensys, Inc. Transmembrane protein expressed in prostate cancer
WO2000065067A2 (en) * 1999-04-23 2000-11-02 University Of Washington Prostate-specific polynucleotides, polypeptides and their methods of use
AU5416700A (en) * 1999-05-20 2000-12-12 Fahri Saatcioglu Differentially expressed genes in prostate cancer
AU6158700A (en) * 1999-07-13 2001-01-30 Corixa Corporation Vaccine
ATE321857T1 (de) 1999-09-29 2006-04-15 Diagnocure Inc Pca3 mrna in gutartigen und bösartigen prostatageweben
WO2001023577A2 (en) * 1999-09-30 2001-04-05 Institut Pasteur Hybrid or chimeric polynucleotides, proteins, and compositions comprising hepatitis b virus sequences
AU7994200A (en) * 1999-10-04 2001-05-10 Corixa Corporation Compositions and methods for therapy and diagnosis of prostate cancer
US7208280B2 (en) 1999-10-05 2007-04-24 Agensys, Inc. Nucleic acid and corresponding protein entitled 101P3A41 useful in treatment and detection of cancer
US7361338B2 (en) 1999-10-05 2008-04-22 Agensys, Inc. Methods to inhibit growth of prostate cancer cells
JP4272376B2 (ja) * 1999-10-05 2009-06-03 アジェンシス,インコーポレイテッド 前立腺ガンにおいてアップレギュレートされるgタンパク質結合レセプターおよびその使用
US6790631B1 (en) 1999-10-05 2004-09-14 Agensys, Inc. G protein-coupled receptor up-regulated in prostate cancer and uses thereof
WO2001025446A1 (en) * 1999-10-07 2001-04-12 Schering Aktiengesellschaft Dna encoding prost 07 polypeptide
EP1230364A2 (en) * 1999-11-12 2002-08-14 Corixa Corporation Compositions and methods for the therapy and diagnosis of prostate cancer
US20020048777A1 (en) 1999-12-06 2002-04-25 Shujath Ali Method of diagnosing monitoring, staging, imaging and treating prostate cancer
MXPA02006934A (es) * 2000-01-14 2003-01-28 Corixa Corp Composiciones y metodos para la terapia y diagnostico de cancer de prostata.
WO2001059110A2 (en) * 2000-02-08 2001-08-16 Agensys, Inc. 34p3d7: a tissue specific protein highly expressed in prostate cancer
WO2001060860A2 (en) * 2000-02-17 2001-08-23 Millennium Predictive Medicine, Inc. Genes differentially expressed in human prostate cancer and their use
US20030165831A1 (en) * 2000-03-21 2003-09-04 John Lee Novel genes, compositions, kits, and methods for identification, assessment, prevention, and therapy of ovarian cancer
US7611892B2 (en) 2000-03-24 2009-11-03 President And Fellows Of Harvard College Prostate-specific or testis-specific nucleic acid molecules, polypeptides, and diagnostic and therapeutic methods
JP2004504808A (ja) * 2000-03-27 2004-02-19 コリクサ コーポレイション 前立腺癌の治療及び診断のための組成物及び方法
GB0015736D0 (en) * 2000-06-27 2000-08-16 Smithkline Beecham Biolog Vaccine
GB0015722D0 (en) * 2000-06-27 2000-08-16 Smithkline Beecham Sa Vaccine
PT2266603E (pt) 2000-10-18 2012-11-02 Glaxosmithkline Biolog Sa Vacinas tumorais
US7048931B1 (en) 2000-11-09 2006-05-23 Corixa Corporation Compositions and methods for the therapy and diagnosis of prostate cancer
EP1343912A2 (en) 2000-11-28 2003-09-17 Wyeth Expression analysis of kiaa nucleic acids and polypeptides useful in the diagnosis and treatment of prostate cancer
JP2004526425A (ja) 2000-11-28 2004-09-02 ワイス 前立腺癌の診断および治療に有用なfkbp核酸およびポリペプチドの発現分析
EP1573024A4 (en) 2001-04-10 2007-08-29 Agensys Inc NUCLEIC ACIDS AND SUITABLE PROTEINS SUITABLE FOR THE TREATMENT AND EVIDENCE OF VARIOUS CANCER DISEASES
JP2005504513A (ja) * 2001-05-09 2005-02-17 コリクサ コーポレイション 前立腺癌の治療及び診断のための組成物及び方法
US6897024B2 (en) 2001-05-31 2005-05-24 Stichting Katholieke Universiteit More Particularly The University Medical Centre Nijmegen Nucleic acid molecules comprising the promoter for PCA3, and uses thereof
ES2537074T3 (es) 2001-09-06 2015-06-02 Agensys, Inc. Ácido nucleico y proteína correspondiente denominados STEAP-1 útiles en el tratamiento y la detección de cáncer
US7494646B2 (en) 2001-09-06 2009-02-24 Agensys, Inc. Antibodies and molecules derived therefrom that bind to STEAP-1 proteins
CA2480811A1 (en) * 2002-04-01 2003-10-16 Agensys, Inc. Nucleic acid and corresponding protein entitled 213p1f11 useful in treatment and detection of cancer
AU2003250828A1 (en) * 2002-06-11 2003-12-22 Glaxo Group Limited Immunogenic compositions comprising a xenogenic prostate protein p501s
MXPA04012443A (es) * 2002-06-11 2005-04-19 Glaxosmithkline Biolog Sa Composiciones inmunogenicas.
WO2004016733A2 (en) 2002-08-16 2004-02-26 Agensys, Inc. Nucleic acid and corresponding protein entitled 251p5g2 useful in treatment and detection of cancer
JP4824540B2 (ja) 2003-02-07 2011-11-30 ダイアノキュアー インク. サンプル中の前立腺癌を検出する方法
WO2005014642A2 (en) 2003-07-21 2005-02-17 Transgene S.A. Novel multifunctional cytokines
NZ550816A (en) 2004-04-22 2009-12-24 Agensys Inc Antibodies and molecules derived therefrom that bind to STEAP-1 proteins
CA2491067A1 (en) 2004-12-24 2006-06-24 Stichting Katholieke Universiteit Mrna rations in urinary sediments and/or urine as a prognostic marker for prostate cancer
CA2622295C (en) 2005-09-12 2019-01-15 The Regents Of The University Of Michigan Recurrent gene fusions in prostate cancer
US9957569B2 (en) 2005-09-12 2018-05-01 The Regents Of The University Of Michigan Recurrent gene fusions in prostate cancer
TWI457133B (zh) 2005-12-13 2014-10-21 Glaxosmithkline Biolog Sa 新穎組合物
WO2008016111A1 (en) 2006-08-04 2008-02-07 Ajinomoto Co., Inc. Method for evaluation of lung cancer, lung cancer evaluation apparatus, lung cancer evaluation method, lung cancer evaluation system, lung cancer evaluation program, and recording medium
PT2486938T (pt) 2006-09-26 2018-06-12 Infectious Disease Res Inst Composição para vacina contendo adjuvante sintético
US20090181078A1 (en) 2006-09-26 2009-07-16 Infectious Disease Research Institute Vaccine composition containing synthetic adjuvant
EP2061814B1 (en) 2006-10-27 2012-06-06 Genentech, Inc. Antibodies and immunoconjugates and uses therefor
WO2008075662A1 (ja) 2006-12-21 2008-06-26 Ajinomoto Co., Inc. 乳癌の評価方法、ならびに乳癌評価装置、乳癌評価方法、乳癌評価システム、乳癌評価プログラムおよび記録媒体
JP5746811B2 (ja) 2006-12-21 2015-07-08 味の素株式会社 大腸癌の評価方法、ならびに大腸癌評価装置、大腸癌評価方法、大腸癌評価システム、大腸癌評価プログラムおよび記録媒体
CA2692793C (en) 2007-07-06 2014-05-20 The Regents Of The University Of Michigan Mipol1-etv1 gene rearrangements
WO2009020521A2 (en) 2007-08-03 2009-02-12 The Brigham And Women's Hospital, Inc. Identification and treatment of estrogen responsive prostate tumors
KR100976218B1 (ko) 2008-05-26 2010-08-17 한국표준과학연구원 비행시간이차이온질량분광법을 이용한 질병의 진단 방법,질병 지표의 스크린 방법, 및 질병 지표
KR101821551B1 (ko) * 2008-06-20 2018-01-25 아지노모토 가부시키가이샤 전립선 질환의 평가 방법
BRPI0912462B1 (pt) * 2008-08-05 2022-03-22 Toray Industries, Inc Uso de um agente indutor de imunidade, uso de um polipeptídeo e uso de um vetor recombinante
DK2325648T3 (da) 2008-08-05 2014-07-28 Toray Industries Fremgangsmåde til detektering af cancer
RU2498819C2 (ru) 2008-08-05 2013-11-20 Торэй Индастриз, Инк. Фармацевтическая композиция для лечения и профилактики злокачественных опухолей
US8778621B2 (en) * 2009-05-12 2014-07-15 Koninklijke Philips N.V. Phosphodiesterase 4D7 as marker for malignant, hormone-sensitive prostate cancer
TWI494125B (zh) 2009-06-05 2015-08-01 Infectious Disease Res Inst 合成的葡萄吡喃糖基脂質佐劑
JP5800817B2 (ja) 2009-09-17 2015-10-28 ザ リージェンツ オブ ザ ユニバーシティ オブ ミシガン 前立腺癌における再発性遺伝子融合
MX342291B (es) 2010-02-04 2016-09-23 Toray Industries Composicion farmaceutica para el tratamiento y/o prevencion del cancer.
AU2011211682B2 (en) 2010-02-04 2015-08-13 Toray Industries, Inc. Pharmaceutical composition for treating and/or preventing cancer
JP5742714B2 (ja) 2010-02-04 2015-07-01 東レ株式会社 癌の治療及び/又は予防用医薬組成物
ES2691738T3 (es) 2010-02-04 2018-11-28 Toray Industries, Inc. Agente farmacéutico para el tratamiento y/o la prevención de cáncer
PL2532743T3 (pl) 2010-02-04 2015-09-30 Toray Industries Kompozycja farmaceutyczna do leczenia i/lub zapobiegania raka
US8945556B2 (en) 2010-11-19 2015-02-03 The Regents Of The University Of Michigan RAF gene fusions
AU2012217723A1 (en) 2011-02-15 2013-08-29 Immune Design Corp. Methods for enhancing immunogen specific immune responses by vectored vaccines
AU2012243039B2 (en) 2011-04-08 2017-07-13 Immune Design Corp. Immunogenic compositions and methods of using the compositions for inducing humoral and cellular immune responses
PT2741085T (pt) 2011-08-04 2017-06-30 Toray Industries Método para a deteção de cancro prancreático
HUE039219T2 (hu) 2011-08-04 2018-12-28 Toray Industries Gyógyászati készítmény rák kezelésére és/vagy megelõzésére
AU2012290949B2 (en) 2011-08-04 2017-03-02 Toray Industries, Inc. Pharmaceutical composition for treatment and/or prevention of pancreatic cancer
PT2740795T (pt) 2011-08-04 2017-01-09 Toray Industries Composição de fármaco para o tratamento e/ou a prevenção de cancro
US9180188B2 (en) 2011-08-04 2015-11-10 Toray Industries, Inc. Pharmaceutical composition for treatment and/or prophylaxis of cancer
AU2012290957B2 (en) 2011-08-04 2017-04-20 Toray Industries, Inc. Pharmaceutical composition for treatment and/or prophylaxis of cancer
AU2012290955B2 (en) 2011-08-04 2017-04-27 Toray Industries, Inc. Drug composition for cancer treatment and/or prevention
PL2811981T3 (pl) 2012-02-07 2019-09-30 Infectious Disease Research Institute Ulepszone formulacje adiuwantowe zawierające agonistę TLR4 oraz sposoby ich zastosowania
JP6187255B2 (ja) 2012-02-21 2017-08-30 東レ株式会社 癌の治療及び/又は予防用医薬組成物
KR102005786B1 (ko) 2012-02-21 2019-07-31 도레이 카부시키가이샤 암의 치료 및/또는 예방용 의약 조성물
CA2865020C (en) 2012-02-21 2021-01-26 Toray Industries, Inc. Pharmaceutical composition for treatment and/or prevention of cancer
EP2818481B1 (en) 2012-02-21 2019-08-07 Toray Industries, Inc. Pharmaceutical composition for treatment and/or prevention of cancer
PT2832366T (pt) 2012-03-30 2018-01-25 Toray Industries Composição farmacêutica para o tratamento e/ou a prevenção de cancro de vesícula biliar
BR112014023937A2 (pt) 2012-03-30 2018-04-17 Toray Industries composição farmacêutica, agente farmacêutico de combinação e método de tratamento
EA034351B1 (ru) 2012-05-16 2020-01-30 Иммьюн Дизайн Корп. Трехкомпонентная вакцина против впг-2 и способы ее применения
WO2013176916A1 (en) * 2012-05-25 2013-11-28 Roman Galetto Use of pre t alpha or functional variant thereof for expanding tcr alpha deficient t cells
EP2876447B1 (en) 2012-07-19 2019-11-20 Toray Industries, Inc. Method for detecting cancer
CN104471403B (zh) 2012-07-19 2017-03-01 东丽株式会社 癌的检测方法
SG10201701866QA (en) 2012-09-11 2017-04-27 Oncotherapy Science Inc Ube2t peptides and vaccines containing the same
WO2014066443A1 (en) 2012-10-23 2014-05-01 Emory University Gm-csf and il-4 conjugates, compositions, and methods related thereto
BR112015025709A2 (pt) 2013-04-18 2017-07-18 Immune Design Corp monoterapia com gla para uso em tratamento de câncer
US9463198B2 (en) 2013-06-04 2016-10-11 Infectious Disease Research Institute Compositions and methods for reducing or preventing metastasis
MX360671B (es) 2013-08-09 2018-11-13 Toray Industries Composición farmacéutica para el tratamiento y/o prevención del cáncer.
PT3089754T (pt) 2013-12-31 2021-07-23 Infectious Disease Res Inst Formulações de vacina de dose única
JP2017522312A (ja) 2014-07-15 2017-08-10 イミューン デザイン コーポレイション Tlr4アゴニストアジュバント及びレンチウイルスベクターを用いたプライム・ブーストレジメン
JOP20200228A1 (ar) * 2015-12-21 2017-06-16 Novartis Ag تركيبات وطرق لخفض تعبير البروتين tau
CN108472350A (zh) * 2016-01-08 2018-08-31 瓦西博迪公司 新表位rna癌症疫苗
CA3020542A1 (en) 2016-04-11 2017-10-19 Board Of Regents, The University Of Texas System Methods and compositions for detecting single t cell receptor affinity and sequence
CA3023672A1 (en) 2016-05-16 2017-11-23 Infectious Disease Research Institute Pegylated liposomes and methods of use
US11344619B2 (en) 2016-05-16 2022-05-31 Access To Advanced Health Institute Formulation containing TLR agonist and methods of use
AU2017273650B2 (en) 2016-06-01 2022-08-18 Access To Advanced Health Institute Nanoalum particles containing a sizing agent
SG11201909218RA (en) 2017-04-03 2019-11-28 Hoffmann La Roche Antibodies binding to steap-1
MX2019015076A (es) 2017-06-15 2020-08-03 Infectious Disease Res Inst Portadores lípidos nanoestructurados y emulsiones estables y usos de los mismos.
CA3078223A1 (en) 2017-09-08 2019-03-14 Infectious Disease Research Institute Liposomal formulations comprising saponin and methods of use
JP2022512921A (ja) * 2018-11-07 2022-02-07 アコーオス インコーポレイテッド 有毛細胞の分化を誘導する組成物及び方法
CN111000858B (zh) * 2019-05-10 2021-04-09 常州市第二人民医院 Nupr1抑制剂在制备膀胱癌治疗药物中的用途
MX2021014363A (es) 2019-05-25 2022-02-21 Infectious Disease Res Inst Composicion y metodo para secar por pulverizacion una emulsion de vacuna adyuvante.
CN111968751B (zh) * 2020-06-29 2021-10-19 金电联行(北京)信息技术有限公司 一种使用多基线校正模型的传染病趋势预测方法与系统
CA3174411A1 (en) 2020-09-04 2022-03-10 Ryan M. Kramer Co-lyophilized rna and nanostructured lipid carrier
WO2022051024A1 (en) 2020-09-04 2022-03-10 Infectious Disease Research Institute Genetically-adjuvanted rna vaccines
JP2024501949A (ja) 2020-12-23 2024-01-17 アクセス ツー アドバンスト ヘルス インスティチュート ソラネソールワクチンアジュバント及びその調製方法
WO2024052882A1 (en) 2022-09-09 2024-03-14 Access To Advanced Health Institute Immunogenic vaccine composition incorporating a saponin

Family Cites Families (7)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US5041289A (en) * 1987-11-13 1991-08-20 Becton Dickinson And Company Method of purging residual tumor cells in vitro with lymphokine activated cytotoxic cells
CA2030212A1 (en) * 1989-11-22 1991-05-23 Judson V. Edwards Peptides
CA2215737A1 (en) * 1995-04-28 1996-10-31 Koichi Kato Lh-rh receptor antagonists
NZ331866A (en) * 1996-03-15 2000-05-26 Corixa Corp Compounds for immunotherapy and immunodiagnosis of prostate cancer
CO4870792A1 (es) * 1997-02-25 1999-12-27 Corixa Corp Compuestos y conjunto de medios de diagnostico para detectar y vigilar la progresion de cancer de prostata
HUP0002095A3 (en) * 1997-02-25 2002-02-28 Corixa Corp Seattle Compounds for immunotherapy of prostate cancer and methods for their use
US6130043A (en) * 1997-05-02 2000-10-10 Abbott Laboratories Reagents and methods useful for detecting diseases of the prostate

Also Published As

Publication number Publication date
IL140845A0 (en) 2002-02-10
NO20010196D0 (no) 2001-01-12
WO2000004149A2 (en) 2000-01-27
JP2002520054A (ja) 2002-07-09
NZ509178A (en) 2004-04-30
BR9912007A (pt) 2002-01-29
EP1870466A3 (en) 2008-03-19
TR200100916T2 (cs) 2002-06-21
AU5314899A (en) 2000-02-07
KR20070112860A (ko) 2007-11-27
CN1315998A (zh) 2001-10-03
AU2003248213A1 (en) 2003-10-30
NO20010196L (no) 2001-03-12
CN100419079C (zh) 2008-09-17
TW200728465A (en) 2007-08-01
HUP0203035A3 (en) 2007-12-28
SA99200618B1 (ar) 2007-01-20
TW200532020A (en) 2005-10-01
KR20010083111A (ko) 2001-08-31
WO2000004149A3 (en) 2000-07-20
EP1870466A2 (en) 2007-12-26
PL346359A1 (en) 2002-02-11
AU762812B2 (en) 2003-07-03
PL200772B1 (pl) 2009-02-27
EP1097208A2 (en) 2001-05-09
CA2334038A1 (en) 2000-01-27
HUP0203035A2 (hu) 2002-12-28

Similar Documents

Publication Publication Date Title
AU762812B2 (en) Compositions and methods for therapy and diagnosis of prostate cancer
US6664377B1 (en) Compounds for immunotherapy of prostate cancer and methods for their use
US6329505B1 (en) Compositions and methods for therapy and diagnosis of prostate cancer
US6261562B1 (en) Compounds for immunotherapy of prostate cancer and methods for their use
AU731840B2 (en) Compounds for immunotherapy of prostate cancer and methods for their use
CN1436234A (zh) 用于前列腺癌治疗和诊断的组合物及方法
US20020081580A1 (en) Compounds for immunodiagnosis of prostate cancer and methods for their use
US6395278B1 (en) Prostate specific fusion protein compositions
CA2391369A1 (en) Compositions and methods for the therapy and diagnosis of prostate cancer
CA2446788A1 (en) Compositions and methods for the therapy and diagnosis of prostate cancer
CA2403909A1 (en) Compositions and methods for the therapy and diagnosis of prostate cancer
TWI250208B (en) Compositions and methods for therapy and diagnosis of prostate cancer
US6613872B1 (en) Compounds for immunotherapy of prostate cancer and methods for their use
US6657056B2 (en) Compounds for immunotherapy of prostate cancer and methods for their use
US20020182596A1 (en) Compounds for immunodiagnosis of prostate cancer and methods for their use
MXPA01000432A (en) Compositions and methods for therapy and diagnosis of prostate cancer
TW200815476A (en) Compositions and methods for therapy and diagnosis of prostate cancer
US7048931B1 (en) Compositions and methods for the therapy and diagnosis of prostate cancer
TWI228593B (en) Compounds for immunodiagnosis of prostate cancer and methods for their use
MXPA99007831A (en) Compounds for immunotherapy of prostate cancer and methods for their use
CN1690077A (zh) 用于前列腺癌免疫疗法的化合物及其用途
MXPA99007858A (en) Compounds for immunodiagnosis of prostate cancer and methods for their use