CN112877370A - 经修饰的微生物和使用其制造丁二烯的方法 - Google Patents

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Abstract

本申请涉及经修饰的微生物和使用其制造丁二烯的方法。本发明大体上涉及微生物，其包含一或多种编码一或多种路径中催化可发酵碳源向丁二烯转化的酶的多核苷酸。还提供在工业过程中使用所述微生物的方法，包括用于制造丁二烯和衍生自其的产物。

Description

经修饰的微生物和使用其制造丁二烯的方法
本申请是申请日为2012年12月17日、申请号为201280069265.6、发明名称为“经修饰的微生物和使用其制造丁二烯的方法”的发明专利申请的分案申请。
技术领域
本发明大体上涉及经修饰的微生物和使用其制造丁二烯的方法。
背景技术
丁二烯(1,3-丁二烯，CH2＝CH-CH＝CH2，CAS 106-99-0)是典型地通过蒸汽裂解石油基烃制造(与其它4-碳分子一起)的直链、共轭4-碳烃。此工艺涉及苛刻条件和高温(至少约850℃)。其它丁二烯制造方法涉及有毒和/或昂贵的催化剂、高度可燃和/或气态碳来源以及高温。全世界每年制造几百万吨含丁二烯的聚合物。丁二烯可以聚合以形成聚丁二烯，或在镍催化剂存在下与氰化氢(氢氰酸)反应以形成己二腈(一种尼龙前驱体)。然而，更通常地，丁二烯与其它烯烃聚合以形成共聚物，例如丙烯腈-丁二烯-苯乙烯(ABS)、丙烯腈-丁二烯(ABR)或苯乙烯-丁二烯(SBR)共聚物。
发明内容
本发明大体上涉及微生物(例如非天然存在的微生物，在本文中也称为被修饰的微生物)，其包含一或多种编码一或多种路径中催化碳源向丁二烯转化的酶的多核苷酸；和所述微生物在工业过程中的用途，包括用于制造丁二烯和衍生自其的产物。
本发明提供从可发酵碳源制造丁二烯的方法，其包含：提供可发酵碳源；使所述可发酵碳源与微生物在发酵培养基中接触，所述微生物包含一或多种编码在丁二烯制造路径中路径中催化所述可发酵碳源向一或多种中间物转化的酶的多核苷酸，和一或多种编码路径中催化所述一或多种中间物向丁二烯转化的酶的多核苷酸；以及使所述一或多种编码在所述丁二烯制造路径中所述路径中催化所述可发酵碳源向一或多种中间物转化的所述酶的多核苷酸、和所述一或多种编码路径中催化所述一或多种中间物向丁二烯转化的酶的多核苷酸在所述微生物中表达，以制造丁二烯。
在一些可以与上文或下文提及的实施例中的任一者组合的实施例中，在所述丁二烯制造路径中催化所述可发酵碳源向一或多种中间物转化的所述酶陈列于表1-3中的任一者中。
在一些可以与上文或下文提及的实施例中的任一者组合的实施例中，催化所述一或多种中间物向丁二烯转化的所述酶陈列于表1-3中的任一者中。
在一些可以与上文或下文提及的实施例中的任一者组合的实施例中，丁二烯经由乙酰CoA和丙酰CoA中间物；巴豆酰CoA中间物；和/或甲酸中间物来制造。
在一些可以与上文或下文提及的实施例中的任一者组合的实施例中，所述一或多种编码路径中催化乙酰CoA和丙酰CoA向酮戊酰CoA转化的酶的多核苷酸编码酮硫解酶，包括例如由如SEQ ID NO:58-78中的任一者陈列的多核苷酸编码的酮硫解酶。
在一些可以与上文或下文提及的实施例中的任一者组合的实施例中，所述一或多种编码路径中催化酮戊酰CoA向(R)或(S)3-羟基戊酰CoA转化的酶的多核苷酸编码氧化还原酶，包括例如由如SEQ ID NO:103-123中的任一者陈列的多核苷酸编码的氧化还原酶。
在一些可以与上文或下文提及的实施例中的任一者组合的实施例中，所述一或多种编码路径中催化(R)或(S)羟基戊酰CoA向2-戊烯酰CoA转化的酶的多核苷酸编码脱水酶，包括例如由如SEQ ID NO:37-55中的任一者陈列的多核苷酸编码的脱水酶。
在一些可以与上文或下文提及的实施例中的任一者组合的实施例中，所述一或多种编码路径中催化2-戊烯酰CoA向2-戊烯酸转化的酶的多核苷酸编码转移酶或水解酶，包括例如分别由如SEQ ID NO:1-28或29-33中的任一者陈列的多核苷酸编码的转移酶或水解酶。
在一些可以与上文或下文提及的实施例中的任一者组合的实施例中，所述一或多种编码路径中催化2-戊烯酸向丁二烯转化的酶的多核苷酸编码脱羧酶，包括例如由如SEQID NO:79-98中的任一者陈列的多核苷酸编码的脱羧酶。
在一些可以与上文或下文提及的实施例中的任一者组合的实施例中，所述一或多种编码路径中催化2-戊烯酸向4-戊烯酸转化的酶的多核苷酸编码异构酶，包括例如由如SEQ ID NO:99-102中的任一者陈列的多核苷酸编码的异构酶。
在一些可以与上文或下文提及的实施例中的任一者组合的实施例中，所述一或多种编码路径中催化4-戊烯酸向丁二烯转化的酶的多核苷酸编码脱羧酶，包括例如由如SEQID NO:79-98中的任一者陈列的多核苷酸编码的脱羧酶。
在一些可以与上文或下文提及的实施例中的任一者组合的实施例中，所述一或多种编码路径中催化2-戊烯酰CoA向戊-2,4-二烯酰CoA转化的酶的多核苷酸编码脱氢酶，包括例如由如SEQ ID NO:124-139中的任一者陈列的多核苷酸编码的脱氢酶。
在一些可以与上文或下文提及的实施例中的任一者组合的实施例中，所述一或多种编码路径中催化戊-2,4-二烯酰CoA向戊-2,4-二烯酸转化的酶的多核苷酸编码转移酶或水解酶，包括例如分别由如SEQ ID NO:1-28或29-33中的任一者陈列的多核苷酸编码的转移酶或水解酶。
在一些可以与上文或下文提及的实施例中的任一者组合的实施例中，所述一或多种编码路径中催化2,4-戊烯酸向丁二烯转化的酶的多核苷酸编码脱羧酶，包括例如由如SEQ ID NO:79-98中的任一者陈列的多核苷酸编码的脱羧酶。
在一些可以与上文或下文提及的实施例中的任一者组合的实施例中，所述一或多种编码路径中催化巴豆酰CoA向巴豆醇转化的酶的多核苷酸编码氧化还原酶，包括例如由如SEQ ID NO:103-123中的任一者陈列的多核苷酸编码的氧化还原酶。
在一些可以与上文或下文提及的实施例中的任一者组合的实施例中，所述一或多种编码路径中催化巴豆酰CoA向巴豆醛转化的酶的多核苷酸编码氧化还原酶，包括例如由如SEQ ID NO:103-123中的任一者陈列的多核苷酸编码的氧化还原酶。
在一些可以与上文或下文提及的实施例中的任一者组合的实施例中，所述一或多种编码路径中催化巴豆醛向巴豆醇转化的酶的多核苷酸编码氧化还原酶或CoA合成酶，包括例如分别由如SEQ ID NO:103-123或SEQ ID NO 34-36中的任一者陈列的多核苷酸编码的氧化还原酶或合成酶。
在一些可以与上文或下文提及的实施例中的任一者组合的实施例中，所述一或多种编码路径中催化巴豆醇向丁二烯转化的酶的多核苷酸编码脱水酶，包括例如由如SEQ IDNO:37-55中的任一者陈列的多核苷酸编码的脱水酶。
在一些可以与上文或下文提及的实施例中的任一者组合的实施例中，所述一或多种编码路径中催化CO2向甲酸转化的酶的多核苷酸编码脱氢酶，包括例如由如SEQ ID NO:124-139中的任一者陈列的多核苷酸编码的脱氢酶。
在一些可以与上文或下文提及的实施例中的任一者组合的实施例中，所述一或多种编码路径中催化丙酮酸酯和CoA向乙酰CoA和甲酸转化的酶的多核苷酸编码酮硫解酶，包括例如由如SEQ ID NO:58-78中的任一者陈列的多核苷酸编码的酮硫解酶。
在一些可以与上文或下文提及的实施例中的任一者组合的实施例中，所述一或多种编码路径中催化甲酸向甲酰CoA转化的酶的多核苷酸编码转移酶或CoA合成酶，包括例如分别由如SEQ ID NO:1-28或34-36中的任一者陈列的多核苷酸编码的转移酶或CoA合成酶。
在一些可以与上文或下文提及的实施例中的任一者组合的实施例中，所述一或多种编码路径中催化2乙酰CoA向乙酰乙酰CoA转化的酶的多核苷酸编码酮硫解酶，包括例如由如SEQ ID NO:58-78中的任一者陈列的多核苷酸编码的酮硫解酶。
在一些可以与上文或下文提及的实施例中的任一者组合的实施例中，所述一或多种编码路径中催化乙酰乙酰CoA和甲酰CoA向3,5-酮戊酰CoA转化的酶的多核苷酸编码酮硫解酶，包括例如由如SEQ ID NO:58-78中的任一者陈列的多核苷酸编码的酮硫解酶。
在一些可以与上文或下文提及的实施例中的任一者组合的实施例中，所述一或多种编码路径中催化3,5-酮戊酰CoA向(R)或(S)-5-羟基-3-酮戊酰CoA转化的酶的多核苷酸编码氧化还原酶，包括例如由如SEQ ID NO:103-123中的任一者陈列的多核苷酸编码的氧化还原酶。
在一些可以与上文或下文提及的实施例中的任一者组合的实施例中，所述一或多种编码路径中催化(R)或(S)-5-羟基-3-酮戊酰CoA向(R)或(S)-3,5-二羟基戊酰CoA转化的酶的多核苷酸编码氧化还原酶，包括例如由如SEQ ID NO:103-123中的任一者陈列的多核苷酸编码的氧化还原酶。
在一些可以与上文或下文提及的实施例中的任一者组合的实施例中，所述一或多种编码路径中催化(R)或(S)-3,5-二羟基戊酰CoA向(R)或(S)3-羟基-4-戊烯酰CoA转化的酶的多核苷酸编码脱水酶，包括例如由如SEQ ID NO:37-55中的任一者陈列的多核苷酸编码的脱水酶。
在一些可以与上文或下文提及的实施例中的任一者组合的实施例中，所述一或多种编码路径中催化(R)或(S)-3-羟基-4-戊烯酰CoA向3-羟基-4-戊烯酸转化的酶的多核苷酸编码转移酶或水解酶，包括例如分别由如SEQ ID NO:1-28或29-33中的任一者陈列的多核苷酸编码的转移酶或水解酶。
在一些可以与上文或下文提及的实施例中的任一者组合的实施例中，所述一或多种编码路径中催化3-羟基-4-戊烯酸向丁二烯转化的酶的多核苷酸编码脱羧酶，包括例如由如SEQ ID NO:79-98中的任一者陈列的多核苷酸编码的脱羧酶。
在一些可以与上文或下文提及的实施例中的任一者组合的实施例中，所述微生物是选自由以下组成的属的细菌：伯克霍尔德菌属(Burkholderia)、丙酸杆菌属(Propionibacterium)、丙酸螺菌属(Propionispira)、梭菌属(Clostridium)、芽孢杆菌属(Bacillus)、埃希氏菌属(Escherichia)、暗杆菌属(Pelobacter)或乳杆菌属(Lactobacillus)。
在一些可以与上文或下文提及的实施例中的任一者组合的实施例中，所述微生物是真核生物，其是酵母、丝状真菌、原生动物或藻类。
在一些可以与上文或下文提及的实施例中的任一者组合的实施例中，所述酵母是酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)、运动发酵单胞菌(Zymomonas mobilis)或巴斯德毕赤酵母(Pichia pastoris)。
在一些可以与上文或下文提及的实施例中的任一者组合的实施例中，所述碳源是甘蔗汁、甘蔗糖蜜、水解淀粉、水解木质纤维素材料、葡萄糖、蔗糖、果糖、乳酸酯、乳糖、木糖、丙酮酸酯或甘油，呈其任何形式或混合物形式。
在一些可以与上文或下文提及的实施例中的任一者组合的实施例中，所述碳源是单糖、寡糖或多糖。
在一些可以与上文或下文提及的实施例中的任一者组合的实施例中，所述丁二烯由所述微生物分泌到所述发酵培养基中。
在一些可以与上文或下文提及的实施例中的任一者组合的实施例中，所述方法可以进一步包含从所述发酵培养基回收所述丁二烯。
在一些可以与上文或下文提及的实施例中的任一者组合的实施例中，所述微生物已经被遗传修饰，以使所述一或多种编码在所述丁二烯制造路径中路径中催化所述可发酵碳源向一或多种中间物转化的酶的多核苷酸、和所述一或多种编码路径中催化一或多种中间物向丁二烯转化的酶的多核苷酸表达。
在一些可以与上文或下文提及的实施例中的任一者组合的实施例中，所述可发酵碳源向丁二烯的所述转化是ATP阳性(例如每分子制造的丁二烯产生净ATP)，并且可以与NADH消耗路径组合以提供丁二烯制造的厌氧工艺。
本发明还提供微生物，其包含一或多种编码在丁二烯制造路径中路径中催化可发酵碳源向一或多种中间物转化的酶的多核苷酸、和一或多种编码路径中催化所述一或多种中间物向丁二烯转化的酶的多核苷酸。
在一些可以与上文或下文提及的实施例中的任一者组合的实施例中，在所述丁二烯制造路径中催化所述可发酵碳源向一或多种中间物转化的所述酶陈列于表1-3中的任一者中。
在一些可以与上文或下文提及的实施例中的任一者组合的实施例中，催化所述一或多种中间物向丁二烯转化的所述酶陈列于表1-3中的任一者中。
在一些可以与上文或下文提及的实施例中的任一者组合的实施例中，丁二烯经由乙酰CoA和丙酰CoA中间物；巴豆酰CoA中间物；和/或甲酸中间物来制造。
在一些可以与上文或下文提及的实施例中的任一者组合的实施例中，所述微生物是选自由以下组成的属的细菌：伯克霍尔德菌属、丙酸杆菌属、丙酸螺菌属、梭菌属、芽孢杆菌属、埃希氏菌属、暗杆菌属或乳杆菌属。
在一些可以与上文或下文提及的实施例中的任一者组合的实施例中，所述微生物是真核生物，其是酵母、丝状真菌、原生动物或藻类。
在一些可以与上文或下文提及的实施例中的任一者组合的实施例中，所述酵母是酿酒酵母、运动发酵单胞菌或巴斯德毕赤酵母。
在一些可以与上文或下文提及的实施例中的任一者组合的实施例中，所述微生物已经被遗传修饰，以使所述一或多种编码在所述丁二烯制造路径中路径中催化所述可发酵碳源向一或多种中间物转化的酶的多核苷酸、和所述一或多种编码路径中催化一或多种中间物向丁二烯转化的酶的多核苷酸表达。
本发明的这些和其它实施例将更详细揭示于下文中。
附图说明
本发明的以上发明内容以及以下具体实施方式当结合附图阅读时将得到更好理解。出于说明本发明的目的，图中展示本发明优选的实施例。然而，应理解，本发明不限于所示的确切配置、实例和手段。
图1描绘经由乙酰CoA和丙酰CoA中间物从可发酵碳源制造丁二烯的一例示性路径。
图2描绘经由巴豆酰CoA中间物从可发酵碳源制造丁二烯的一例示性路径。
图3描绘经由甲酸中间物从可发酵碳源制造丁二烯的一例示性路径。
具体实施方式
本发明大体上涉及微生物(例如非天然存在的微生物；被修饰的微生物)，其包含被遗传修饰的路径；和所述微生物用于将可发酵碳源转化为丁二烯的用途(参看图1-3)。所述微生物包含一或多种编码经由新颖酶路径催化可发酵碳源向丁二烯转化的酶的多核苷酸。任选地，所制造的丁二烯接着可以转化为聚丁二烯或许多其它含丁二烯的聚合物。
本发明部分提供新颖酶路径(包括例如新颖酶路径组合)的发现，其用于从碳源(例如可发酵碳源)制造丁二烯。本文中揭示的酶路径允许经由以下来酶促制造丁二烯：乙酰CoA和丙酰CoA中间物；巴豆酰CoA中间物；和/或甲酸中间物。
本文中提供的方法提供类似于灭菌的最后结果而无典型地为建立和在整个制造工艺期间维持无菌所需的高资金支出和持续较高管理成本。在此方面，大多数工业规模的丁二烯制造工艺因其工艺的好氧性质而在可测量数目的细菌污染物存在下操作。据信，丁二烯制造工艺的细菌污染导致产物产率降低和制造丁二烯的微生物的生长抑制。由于制造的丁二烯的有毒性质减少制造工艺中的污染物，因此现有方法的所述缺陷通过本发明揭示的方法来避免。
本文中揭示的酶路径与先前已知酶路径相比对于制造丁二烯来说是有利的，由于本文中揭示的酶路径是ATP阳性并且当与NADH消耗路径组合时它可以提供丁二烯的厌氧路径。虽然有可能使用好氧工艺制造丁二烯，但厌氧工艺因当在发酵工艺(尤其丁二烯发酵)期间烯烃(其本质上是爆炸性的)与氧气混合时招致的风险而是优选的。此外，在发酵器中补充氧气和氮气需要空气压缩机、发酵器(泡罩塔或气提发酵器)、温度控制和氮气的额外投资。氧气的存在还可以催化丁二烯的聚合并且可以促进发酵器培养液中好氧污染物的生长。另外，制造丁二烯的好氧发酵工艺在工业规模下呈现出几个缺陷(其中它对于维持无菌条件是技术上有挑战的)，例如以下事实：(i)获得更多生物质，对于所要产物来说降低碳的总产率；(ii)氧气的存在促进污染物的生长(韦斯特许斯(Weusthuis)等人,2011,生物技术动向(Trends in Biotechnology),2011,第29卷,第4期,153-158)；和(iii)氧气与气态化合物(例如丁二烯)的混合物造成严重爆炸风险；(iv)氧气可能会催化不期望的烯烃聚合反应；以及最终(v)在好氧条件下的较高发酵和纯化成本。另外，通过本文中揭示的工艺制造的丁二烯未搀入O2和N2，因此防止所制造的丁二烯的高成本并且费时的纯化。
应理解，本文中描述的任何和所有方法中涉及的步骤可以按任何次序进行并且不限制或局限于具体叙述的次序。举例来说，本发明提供从可发酵碳源制造丁二烯的方法，其包含：提供可发酵碳源；使所述可发酵碳源与微生物在发酵培养基中接触，所述微生物包含一或多种编码在丁二烯制造路径中路径中催化所述可发酵碳源向一或多种中间物转化的酶的多核苷酸，和一或多种编码路径中催化所述一或多种中间物向丁二烯转化的酶的多核苷酸；以及使所述一或多种编码在所述丁二烯制造路径中所述路径中催化所述可发酵碳源向一或多种中间物转化的所述酶的多核苷酸、和一或多种编码路径中催化所述一或多种中间物向丁二烯转化的酶的多核苷酸在所述微生物中表达，以制造丁二烯。因此，使所述一或多种编码在所述丁二烯制造路径中所述路径中催化所述可发酵碳源向一或多种中间物转化的所述酶的多核苷酸、和一或多种编码路径中催化所述一或多种中间物向丁二烯转化的酶的多核苷酸在所述微生物中表达以制造丁二烯可以在使所述可发酵碳源与微生物在发酵培养基中接触之前或之后进行，所述微生物包含一或多种编码在所述丁二烯制造路径中路径中催化所述可发酵碳源向一或多种中间物转化的酶的多核苷酸、和一或多种编码路径中催化所述一或多种中间物向丁二烯转化的酶的多核苷酸。
还应理解，本文中揭示的微生物可以包含图1-3中的任一者中揭示的整个路径，包括、包含所有编码催化可发酵碳源向丁二烯转化的酶的多核苷酸。或者，还应理解，本文中揭示的微生物可以包含一或多种编码图1-3中的任一者中的催化可发酵碳源向丁二烯转化的酶的多核苷酸(例如微生物可以包含2、3、4、5、6、7、8、9、10或10个以上编码如图1-3中的任一者中所揭示的催化可发酵碳源向丁二烯转化的酶的多核苷酸)。
在一些实施例中，所制造的丁二烯的克数与可发酵碳源的克数的比率是0.20、0.21、0.22、0.23、0.24、0.25、0.26、0.27、0.28、0.29、0.30、0.31、0.32、0.33、0.34、0.35、0.36、0.37、0.38、0.39、0.40、0.41、0.42、0.43、0.44、0.45、0.46、0.47、0.48、0.49、0.50、0.51、0.52、0.53、0.54、0.55、0.56、0.57、0.58、0.59、0.60、0.61、0.62、0.63、0.64、0.65、0.66、0.67、0.68、0.69、0.70、0.71、0.72、0.73、0.74、0.75、0.76、0.77、0.78、0.79、0.80、0.81、0.82、0.83、0.84、0.85、0.86、0.87、0.88、0.89、0.90、0.91、0.92、0.93、0.94、0.95、0.96、0.97、0.98、0.99或1.00。
在一些实施例中，所制造的丁二烯中的碳的摩尔数目构成可发酵碳源中的碳的摩尔数目的20％、21％、22％、23％、24％、25％、26％、27％、28％、29％、30％、31％、32％、33％、34％、35％、36％、37％、38％、39％、40％、41％、42％、43％、44％、45％、46％、47％、48％、49％、50％、51％、52％、53％、54％、55％、56％、57％、58％、59％、60％、61％、62％、63％、64％、65％、66％、67％、68％、69％、70％、71％、72％、73％、74％、75％、76％、77％、78％、79％、80％、81％、82％、83％、84％、85％、86％、87％、88％、89％、90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％、99％或100％。
如本文中所用，“丁二烯”旨在意指丁-1,3-二烯或1,3-丁二烯(CAS 106-99-0)，通式是CH2＝CH-CH＝CH2，并且分子质量是54.09g/mol。
如本文中所用，术语“生物活性”或“功能活性”当提及蛋白质、多肽或肽时，可以意指所述蛋白质、多肽或肽展现关于某一生物过程、路径或反应适用的功能或性质。生物或功能活性可以指例如与另一多肽或分子相互作用或缔合(例如结合)的能力，或它可以指催化或调节其它蛋白质或分子的相互作用(例如酶促反应)的能力。
如本文中所用，术语“培养”可以指使细胞(例如微生物细胞)群体在适用于生长的条件下在液体培养基中或在固体培养基上生长。
如本文中所用，术语“衍生自”可以涵盖术语源自、获自、可获自、分离自和产生自，并且一般来说表示一种规定物质在另一规定物质中得到其来源或具有可以参考另一规定物质描述的特征。
如本文中所用，术语“表达载体”可以指含有编码多肽或蛋白质的多核苷酸或核酸序列(例如可操作地连接于一或多个能够影响宿主中的编码序列表达的适合控制序列的DNA编码序列(例如基因顺序))的DNA构建体。所述控制序列包括影响转录的启动子、控制所述转录的任选的操纵序列、编码适合mRNA核糖体结合位点的序列以及控制转录和翻译的终止的序列。载体可以是质粒、噬菌体颗粒或仅仅是可能的基因组插入物。在转型到适合宿主中后，载体可以复制并且独立于宿主基因组而起作用(例如独立载体或质粒)，或在一些情况下，可以自身整合到基因组中(例如整合的载体)。质粒是最常用的表达载体形式。然而，本发明旨在包括这样的其它表达载体形式，以便提供等效功能并且在本领域中已知或变得已知。
如本文中所用，术语“表达”可以指基于编码多肽(例如基因)的核酸序列制造多肽的过程。所述过程包括转录和翻译。
如本文中所用，术语“基因”可以指制造多肽或蛋白质(例如融合蛋白)中涉及的DNA区段，并且包括在编码区之前和之后的区以及个别编码区段(外显子)之间的介入序列(内含子)。
如本文中所用，术语“异源”关于核酸、多核苷酸、蛋白质或肽可以指非天然存在于规定细胞(例如宿主细胞)中的核酸、多核苷酸、蛋白质或肽。希望所述术语涵盖由天然存在的基因、突变基因和/或合成基因编码的蛋白质。相比之下，术语同源关于核酸、多核苷酸、蛋白质或肽是指天然存在于细胞中的核酸、多核苷酸、蛋白质或肽。
如本文中所用，术语“宿主细胞”可以指细胞或细胞系，包括细胞，例如重组表达载体可以被转染用于表达多肽或蛋白质(例如融合蛋白)的微生物。宿主细胞包括单一宿主细胞的子代，并且子代因天然、意外或蓄意突变而可以不必与初始母细胞完全一致(在形态方面或在总基因组DNA互补序列方面)。宿主细胞可以包括用表达载体进行体内转染或转型的细胞。
如本文中所用，术语“引入”在将核酸序列或多核苷酸序列插入到细胞中的情形下，可以包括转染、转型或转导并且指将核酸序列或多核苷酸序列并入到真核或原核细胞中，其中核酸序列或多核苷酸序列可以被并入到细胞的基因组(例如染色体、质粒、质体或线粒体DNA)中、转化为自主复制子或瞬时表达。
如本文中所用，术语“非天然存在”在关于本发明的微生物体或微生物使用时旨在意指微生物体具有至少一个在所参考物种的天然存在菌株(包括所参考物种的野生型菌株)中并不常见的基因改变。基因改变包括例如引入编码代谢多肽的可表达核酸的修饰、其它核酸添加、核酸缺失和/或微生物体遗传物质的其它功能性破坏。所述修饰包括例如所参考物种的异源、同源或异源与同源多肽的编码区和其功能片段。其它修饰包括例如修饰改变了基因或操纵子的表达的非编码调节区。本发明的非天然存在的微生物体可以含有稳定基因改变，其是指可以被培养五代以上而无改变损失的微生物。一般来说，稳定基因改变包括持续10代以上的修饰，具体地说稳定修饰将持续约25代以上，并且更具体地说稳定遗传修饰将持续50代以上，包括无限期。本领域的技术人员应理解，包括本文中例示的代谢修饰的基因改变参考适合宿主生物体(例如大肠杆菌(E.coli))和其相应代谢反应或所要遗传物质(例如所要代谢路径的基因)的适合来源生物体来描述。然而，考虑到多种生物体的完整基因组定序和基因组学领域中的高技术水平，本领域的技术人员将能够容易地将本文中提供的教示和指导应用于基本上所有其它生物体。举例来说，本文中例示的大肠杆菌代谢改变可以通过并有来自不同于所参考物种的物种的相同或类似编码核酸容易地应用于其它物种。所述基因改变大体上包括例如物种同源物的基因改变，和尤其直系同源物、旁系同源物或非直系同源基因置换。
如本文中所用，“丁二烯”旨在意指一种共轭直链二烯，分子式是C4H6，通式是CH2＝CH-CH＝CH2，并且分子质量是54.09g/mol。丁二烯在本领域中还称为1,3-丁二烯、丁-1,3-二烯、联乙烯、刺桐烯、二乙烯和乙烯基乙烯。
如本文中所用，术语“可操作地连接”可以指规定元件的并置或配置，其使所述元件一齐起作用以实现一种效果。举例来说，启动子在它控制编码序列的转录时可以可操作地连接于编码序列。
如本文中所用，术语“启动子”可以指结合RNA聚合酶以引发基因转录中涉及的调节序列。启动子可以是诱导性启动子或组成性启动子。诱导性启动子是在环境或发育调节条件下活性的启动子。
如本文中所用，术语“多核苷酸”或“核酸序列”可以指具有任何长度和任何三维结构并且单链或多链(例如单链、双链、三螺旋等)的核苷酸聚合形式，其含有脱氧核糖核苷酸、核糖核苷酸和/或脱氧核糖核苷酸或核糖核苷酸的类似物或被修饰的形式，包括被修饰的核苷酸或碱基或其类似物。所述多核苷酸或核酸序列可以编码氨基酸(例如多肽或蛋白质，例如融合蛋白)。因为遗传密码是简并的，所以一个以上密码子可以用以编码具体氨基酸，并且本发明涵盖编码具体氨基酸序列的多核苷酸。可以使用任何类型的被修饰的核苷酸或核苷酸类似物，只要多核苷酸在使用条件下维持所要功能即可，包括增加核酸酶抗性的修饰(例如脱氧、2'-O-Me、硫代磷酸酯等)。还可以出于检测或捕获例如放射性或非放射性标记或锚定(例如生物素)的目的并入标记。术语多核苷酸还包括肽核酸(PNA)。多核苷酸可以是天然存在的或非天然存在的。术语多核苷酸、核酸和寡核苷酸在本文中可互换使用。多核苷酸可以含有RNA、DNA或两者和/或其被修饰的形式和/或类似物。核苷酸的序列可以杂有非核苷酸组分。一或多个磷酸二酯键联可以置换为替代性键联基团。这些替代性键联基团包括(但不限于)其中磷酸酯置换为P(O)S(硫代酯)、P(S)S(二硫代酯)、(O)NR2(酰胺化物)、P(O)R、P(O)OR'、COCH2(甲缩醛)的实施例，其中每个R或R'独立地是H或被取代或未被取代的烷基(1-20个C)，任选地含有乙醚(-O-)键联、芳基、烯基、环烷基、环烯基或芳醛基。多核苷酸中并非所有键联都需要相同。多核苷酸可以是直链或环状或包含直链和环状部分的组合。
如本文中所用，术语“蛋白质”或“多核苷酸”可以指包含氨基酸并且由本领域的技术人员公认为蛋白质的组合物。本文中使用氨基酸残基的常规一字母或三字母编码。术语蛋白质和多肽在本文中可互换用以指具有任何长度的氨基酸聚合物，包括包含键联(例如融合)肽/多肽(例如融合蛋白)的那些。聚合物可以是直链或支链的，它可以包含被修饰的氨基酸，并且它可以杂有非氨基酸。所述术语还涵盖已经被天然地或通过介入而修饰的氨基酸聚合物；例如二硫键形成、糖基化、脂化、乙酰化、磷酸化或任何其它操纵或修饰，例如与标记组分结合。定义内还包括例如含有一或多种氨基酸(包括例如非天然氨基酸等)类似物以及本领域中已知的其它修饰的多肽。
如本文中所用，相关蛋白质、多肽或肽可以涵盖变异蛋白质、多肽或肽。变异蛋白质、多肽或肽在少量氨基酸残基方面不同于母体蛋白质、多肽或肽和/或彼此。在一些实施例中，不同氨基酸残基的数目是以下中的任一者：约1、2、3、4、5、10、20、25、30、35、40、45或50个。在一些实施例中，变异体相差约1到约10个氨基酸。或者或另外，变异体与参考蛋白或核酸可以具有规定程度的序列一致性，例如如使用序列比对工具(例如BLAST、ALIGN和CLUSTAL)测定(参看下文)。举例来说，变异蛋白质或核酸与参考序列可以具有至少约35％、40％、45％、50％、55％、60％、65％、70％、75％、80％、85％、86％、87％、88％、89％、90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％、99％或甚至99.5％氨基酸序列一致性。
如本文中所用，术语“回收”、“隔离”、“纯化”和“分离”可以指从至少一种组分移出的物质(例如蛋白质、肽、核酸、多核苷酸或细胞)，其与所述组分天然地相关。举例来说，这些术语可以指实质上或基本上不含如其天然状态下可见的通常伴随其的组分(例如完整生物系统)的物质。
如本文中所用，术语“重组”可以指已经由人操纵以使得其与如天然所见的核酸、多肽和细胞不相同的核酸序列或多核苷酸、多肽或蛋白质以及基于其的细胞。重组还可以指已经被修饰以改变其序列或表达特征(例如通过使编码序列突变以制造改变的多肽、使编码序列与另一编码序列或基因融合、在不同启动子控制下放置基因、使基因在异源生物体中表达、使基因以降低或提升的水平表达、使基因有条件地或组成性地以不同于其天然表达谱的方式表达等)的遗传物质(例如核酸序列或多核苷酸、其编码的多肽或蛋白质以及包含所述核酸序列或多核苷酸的载体和细胞)。
如本文中所用，术语“选择性标记”或“可选择标记”可以指能够表达于宿主细胞中的基因，其提供那些含有引入的核酸序列、多核苷酸或载体的宿主的选择便利性。可选择标记的实例包括(但不限于)抗微生物物质(例如潮霉素、博莱霉素或氯霉素)和/或赋予宿主细胞代谢优势(例如营养优势)的基因。
如本文中所用，术语“实质上类似”和”实质上一致”在至少两个核酸、多核苷酸、蛋白质或多肽的情形下，可以意指核酸、多核苷酸、蛋白质或多肽包含与参考(例如野生型)核酸、多核苷酸、蛋白质或多肽相比具有至少约35％、40％、45％、50％、55％、60％、65％、70％、75％、80％、85％、86％、87％、88％、89％、90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％、99％或甚至99.5％序列一致性的序列。序列一致性可以使用已知程序(例如BLAST、ALIGN和CLUSTAL)使用标准参数测定。(参看例如阿特休尔(Altshul)等人(1990)分子生物学杂志(J.Mol.Biol.)215:403-410；亨尼科夫(Henikoff)等人(1989)国家科学院院刊(Proc.Natl.Acad.Sci.)89:10915；卡林(Karin)等人(1993)国家科学院院刊90:5873；和希金斯(Higgins)等人(1988)基因(Gene)73:237)。可在国家生物技术信息中心(theNational Center for Biotechnology Information)公开获得用于执行BLAST分析的软件。此外，可以使用FASTA搜寻数据库(珀森(Person)等人(1988)国家科学院院刊85:2444-2448)。在一些实施例中，实质上一致多肽不同之处仅是一或多个保守氨基酸取代。在一些实施例中，实质上一致多肽是可免疫交叉反应的。在一些实施例中，实质上一致核酸分子在严格条件下(例如在一系列高严格性的培养基内)彼此杂交。
如本文中所用，术语“转染”或“转型”可以指将外源核酸或多核苷酸插入到宿主细胞中。外源核酸或多核苷酸可以维持为非整合载体(例如质粒)形式，或者，可以整合到宿主细胞基因组中。术语转染(transfecting或transfection)旨在涵盖用于将核酸或多核苷酸引入到宿主细胞中的所有常规技术。转染技术的实例包括(但不限于)磷酸钙沉淀、DEAE-右旋糖酐介导的转染、脂质体转染、电穿孔和显微注射。
如本文中所用，术语“转型”、“稳定转型”和“转基因”可以指具有非天然(例如异源)核酸序列或多核苷酸序列整合到其基因组中或为游离型质粒形式维持多代的细胞。
如本文中所用，术语“载体”可以指经设计以将核酸引入到一或多种细胞类型中的多核苷酸序列。载体包括克隆载体、表达载体、穿梭载体、质粒、噬菌体颗粒、单链和双链盒等。
如本文中所用，术语“野生型”、“天然”或“天然存在的”蛋白质可以指天然所见的那些蛋白质。术语野生型序列是指天然所见或天然存在的氨基酸或核酸序列。在一些实施例中，野生型序列是蛋白质工程化计划(例如制造变异蛋白质)的起点。
除非另作定义，否则在本文中，本文中所用的所有技术与科学术语都具有如本发明所属的本领域的普通技术人员通常理解的相同含义。辛格尔顿(Singleton)等人,微生物学与分子生物学词典(Dictionary of Microbiology and Molecular Biology),第二版,约翰威利父子公司(John Wiley and Sons),纽约(New York)(1994)和黑尔&马卡姆(Hale&Markham),哈珀柯林斯生物学词典(The Harper Collins Dictionary of Biology),哈珀永久公司(Harper Perennial),纽约(1991)给技术人员提供本发明中所用的许多术语的通用词典。此外，应理解本文中路径中的任一者中揭示的底物中的任一者可以或者包括底物的阴离子或阳离子。
本文中提供的数值范围包括界定所述范围的数目。
除非另外说明，否则对应地，核酸序列以5'到3'定向左到右地书写；氨基酸序列以氨基到羧基定向左到右地书写。
虽然本发明能够以各种形式形式体现，但以下对几个实施例的描述在以下理解下进行：本发明应视为本发明的例证，并且不旨在将本发明限于说明的具体实施例。标题仅为了方便起见而提供并且不应视为以任何方式限制本发明。任何标题下说明的实施例都可以与任何其它标题下说明的实施例组合。
除非另外明确指示，否则本申请案中规定的各个数量值中的数值的使用陈述为仿佛所述范围内的最小和最大值前面都有词语“约”的近似值。此外，本发明的范围预期为连续范围，包括所述最小与最大值之间的每个值以及可以通过所述值形成的任何范围。本文中还揭示可以通过用揭示的数值除任何其它揭示的数值而形成的任何和所有比率(和任何所述比率的范围)。因此，技术人员应理解，许多所述比率、范围和比率范围可以明确衍生自本文中呈现的数值，并且在所有情况下，所述比率、范围和比率范围都表示本发明的各个实施例。
微生物的修饰
微生物可以通过本领域中已知的任何方法修饰(例如遗传工程化)以包含和/或表达(例如包括过表达)一或多种编码一或多种路径中能够将可发酵碳源转化为丁二烯的酶的多核苷酸(例如异源多核苷酸和/或非异源多核苷酸)。微生物可以天然地表达一或多种路径中将可发酵碳源转化为丁二烯所需的全部酶，或可以被修饰以表达(包括例如过表达)一或多种路径中的一或多种酶。在一些实施例中，微生物可以包含所述路径中的少于全部酶，并且编码缺少的酶的多核苷酸可以被遗传引入到微生物中。举例来说，被修饰的微生物可以被修饰以包含一或多种编码丁二烯制造路径中催化可发酵碳源(例如葡萄糖)向一或多种中间物(例如乙酰CoA和丙酰CoA；巴豆酰CoA；和/或甲酸)转化的酶的多核苷酸。另外或或者，被修饰的微生物可以被修饰以包含一或多种编码催化一或多种中间物(例如乙酰CoA和丙酰CoA；巴豆酰CoA；和/或甲酸)向丁二烯转化的酶的多核苷酸。在一些实施例中，多核苷酸可以编码丁二烯制造路径中催化一或多种中间物转化的酶。在一些实施例中，多核苷酸可以被修饰(例如遗传工程化)以调节(例如增大或减小)编码的酶的底物特异性，或多核苷酸可以被修饰以改变编码的酶的底物特异性(例如编码对一底物具有特异性的酶的多核苷酸可以被修饰以使得酶对另一底物具有特异性)。优选的微生物可以包含编码如表1-3和图1-3中的任一者中陈列的酶的多核苷酸。
微生物可以包含一或多种编码路径中催化乙酰CoA和丙酰CoA向丁二烯转化的酶的多核苷酸。在一些实施例中，一或多种编码路径中催化乙酰CoA和丙酰CoA向丁二烯转化的酶的多核苷酸可以包括(但不限于)：
-一或多种编码路径中催化乙酰CoA和丙酰CoA向酮戊酰CoA转化的酶(例如硫解酶)的多核苷酸；
-一或多种编码路径中催化酮戊酰CoA向(R)或(S)3-羟基戊酰CoA转化的酶(例如羟基戊酰CoA脱氢酶)的多核苷酸；
-一或多种编码路径中催化(R)或(S)羟基戊酰CoA向2-戊烯酰CoA转化的酶(例如羟基戊酰CoA脱水酶)的多核苷酸；
-一或多种编码路径中催化2-戊烯酰CoA向2-戊烯酸转化的酶(例如戊烯酰CoA水解酶或转移酶)的多核苷酸；
-一或多种编码路径中催化2-戊烯酸向丁二烯转化的酶(例如2-戊烯酸脱羧酶)的多核苷酸；
-一或多种编码路径中催化2-戊烯酸向4-戊烯酸转化的酶(例如移位C＝C键异构酶)的多核苷酸；
-一或多种编码路径中催化4-戊烯酸向丁二烯转化的酶(例如4-戊烯酸脱羧酶)的多核苷酸；
-一或多种编码路径中催化2-戊烯酰CoA向戊-2,4-二烯酰CoA转化的酶(例如戊烯酰CoA脱氢酶)的多核苷酸；
-一或多种编码路径中催化戊-2,4-二烯酰CoA向戊-2,4-二烯酸转化的酶(例如戊-2,4-二烯酰CoA水解酶或转移酶)的多核苷酸；和/或
-一或多种编码路径中催化2,4-戊烯酸向丁二烯转化的酶(例如戊-2,4-二烯酸脱羧酶)的多核苷酸。
在一些实施例中，微生物进一步包含一或多种编码路径中催化可发酵碳源(例如葡萄糖)向甲基丙二酰CoA和/或丙烯酰CoA转化的酶的多核苷酸。
在一些实施例中，提供一种微生物，其包含一或多种以上多核苷酸，包括所有的以上多核苷酸。
将乙酰CoA和丙酰CoA转化为丁二烯的例示性酶以及其作用的底物和其制造的产物呈现于下表1中。表1中表示的酶编号与图1中所用的酶编号有关，所述图示意地表示可发酵碳源经由乙酰CoA和丙酰CoA中间物向丁二烯的酶促转化。
表1：经由乙酰CoA和丙酰CoA中间物制造丁二烯.
Figure BDA0002918905670000151
微生物可以包含一或多种编码路径中催化巴豆酰CoA向丁二烯转化的酶的多核苷酸。在一些实施例中，一或多种编码路径中催化巴豆酰CoA向丁二烯转化的酶的多核苷酸可以包括(但不限于)：
-一或多种编码路径中催化巴豆酰CoA向巴豆醇转化的酶(例如巴豆酰CoA还原酶(双官能))的多核苷酸；
-一或多种编码路径中催化巴豆酰CoA向巴豆醛转化的酶(例如巴豆醛脱氢酶)的多核苷酸；
-一或多种编码路径中催化巴豆醛向巴豆醇转化的酶(例如巴豆醇脱氢酶)的多核苷酸；和/或
-一或多种编码路径中催化巴豆醇向丁二烯转化的酶(例如巴豆醇脱水酶)的多核苷酸。
在一些实施例中，提供一种微生物，其包含一或多种以上多核苷酸，包括所有的以上多核苷酸。
在优选实施例中，微生物进一步包含一或多种编码路径中催化可发酵碳源(例如葡萄糖)向巴豆酰CoA转化的酶的多核苷酸。
在一些实施例中，微生物可以进一步包含一或多种编码路径中催化可发酵碳源(例如葡萄糖)向3-羟基丁酰CoA和/或4-羟基丁酰CoA转化的酶的多核苷酸。在所述实施例中，微生物进一步包含一或多种编码路径中催化3-羟基丁酰CoA向巴豆酰CoA转化的酶的多核苷酸和/或一或多种编码路径中催化4-羟基丁酰CoA向巴豆酰CoA转化的酶的多核苷酸。
将巴豆酰CoA转化为丁二烯的例示性酶以及其作用的底物和其制造的产物呈现于下表2中。表2中表示的酶编号与图2中所用的酶编号有关，所述图示意地表示可发酵碳源经由巴豆酰CoA中间物向丁二烯的酶促转化。
表2：经由巴豆酰CoA中间物制造丁二烯.
Figure BDA0002918905670000161
微生物可以包含一或多种编码路径中催化甲酸向丁二烯转化的酶的多核苷酸。在一些实施例中，一或多种编码路径中催化甲酸向丁二烯转化的酶的多核苷酸可以包括(但不限于)：
-一或多种编码路径中催化CO2向甲酸转化的酶(例如甲酸脱氢酶)的多核苷酸；
-一或多种编码路径中催化丙酮酸酯和CoA向乙酰CoA和甲酸转化的酶(例如乙酰CoA:甲酸C-乙酰转移酶)的多核苷酸；
-一或多种编码路径中催化甲酸向甲酰CoA转化的酶(例如甲酰CoA转移酶或合成酶)的多核苷酸；
-一或多种编码路径中催化2乙酰CoA向乙酰乙酰CoA转化的酶(例如乙酰乙酰COA硫解酶)的多核苷酸；
-一或多种编码路径中催化乙酰乙酰CoA和甲酰CoA向3,5-酮戊酰CoA转化的酶(例如3,5-酮戊酰CoA硫解酶)的多核苷酸；
-一或多种编码路径中催化3,5-酮戊酰CoA向(R)或(S)-5-羟基-3-酮戊酰CoA转化的酶(例如3,5-酮戊酰CoA脱氢酶)的多核苷酸；
-一或多种编码路径中催化(R)或(S)-5-羟基-3-酮戊酰CoA向(R)或(S)-3,5-二羟基戊酰CoA转化的酶(例如5-羟基-3-酮戊酰CoA脱氢酶)的多核苷酸；
-一或多种编码路径中催化(R)或(S)-3,5-二羟基戊酰CoA向(R)或(S)3-羟基-4-戊烯酰CoA转化的酶(例如3,5-羟基戊酰CoA脱水酶)的多核苷酸；
-一或多种编码路径中催化(R)或(S)-3-羟基-4-戊烯酰CoA向3-羟基-4-戊烯酸转化的酶(例如3-羟基-4-戊烯酰CoA水解酶、转移酶或合成酶)的多核苷酸；和/或
-一或多种编码路径中催化3-羟基-4-戊烯酸向丁二烯转化的酶(例如3-羟基-4-戊烯酸脱羧酶)的多核苷酸。
在一些实施例中，微生物进一步包含一或多种编码路径中催化可发酵碳源(例如葡萄糖)向丙酮酸酯转化的酶的多核苷酸。
在一些实施例中，提供一种微生物，其包含一或多种以上多核苷酸，包括所有的以上多核苷酸。
将甲酸转化为丁二烯的例示性酶以及其作用的底物和其制造的产物呈现于下表3中。表3中表示的酶编号与图3中所用的酶编号有关，所述图示意地表示可发酵碳源经由甲酸中间物向丁二烯的酶促转化。
表3：经由甲酸中间物制造丁二烯.
Figure BDA0002918905670000171
Figure BDA0002918905670000181
还提供一种微生物，其包含一或多种编码路径中催化可发酵碳源向乙酰CoA和丙酰CoA转化的酶的多核苷酸、和一或多种编码路径中催化乙酰CoA和丙酰CoA向丁二烯转化的酶的多核苷酸，其包括(但不限于)：一或多种编码路径中催化可发酵碳源(例如葡萄糖)向丙酮酸酯转化的酶的多核苷酸；一或多种编码路径中催化丙酮酸酯向甲基丙二酰CoA转化的酶的多核苷酸；一或多种编码路径中催化甲基丙二酰CoA向丙酰CoA转化的酶的多核苷酸；一或多种编码路径中催化丙酮酸酯向丙烯酰CoA转化的酶的多核苷酸；一或多种编码路径中催化丙烯酰CoA向丙酰CoA转化的酶的多核苷酸；一或多种编码路径中催化乙酰CoA和丙酰CoA向酮戊酰CoA转化的酶(例如硫解酶)的多核苷酸；一或多种编码路径中催化酮戊酰CoA向(R)或(S)3-羟基戊酰CoA转化的酶(例如羟基戊酰CoA脱氢酶)的多核苷酸；一或多种编码路径中催化(R)或(S)3-羟基戊酰CoA向2-戊烯酰CoA转化的酶(例如羟基戊酰CoA脱水酶)的多核苷酸；一或多种编码路径中催化2-戊烯酰CoA向2-戊烯酸转化的酶(例如戊烯酰CoA水解酶、戊烯酰CoA转移酶或戊烯酰CoA合成酶)的多核苷酸；一或多种编码路径中催化2-戊烯酸向4-戊烯酸转化的酶(例如移位C＝C键异构酶)的多核苷酸；和/或一或多种编码路径中催化4-戊烯酸向丁二烯转化的酶(例如4-戊烯酸脂肪酸脱羧酶或2-戊烯酸脱羧酶)的多核苷酸。在一些实施例中，提供一种微生物，其包含一或多种以上多核苷酸，包括所有的以上多核苷酸。
还提供一种微生物，其包含一或多种编码路径中催化可发酵碳源向乙基-丙二酰CoA转化的酶的多核苷酸、和一或多种编码路径中催化乙基-丙二酰CoA向丁二烯转化的酶的多核苷酸，其包括(但不限于)：一或多种编码路径中催化可发酵碳源(例如葡萄糖)向丙酮酸酯转化的酶的多核苷酸；一或多种编码路径中催化丙酮酸酯向乙酰CoA转化的酶的多核苷酸；一或多种编码路径中催化乙酰CoA向乙酰乙酰CoA转化的酶(例如乙酰乙酰COA硫解酶)的多核苷酸；一或多种编码路径中催化乙酰乙酰CoA向3-羟基丁酰CoA转化的酶(例如3-羟基丁酰CoA脱氢酶)的多核苷酸；一或多种编码路径中催化3-羟基丁酰CoA向巴豆酰CoA转化的酶(例如巴豆酸酶)的多核苷酸；一或多种编码路径中催化巴豆酰CoA向乙基-丙二酰CoA转化的酶(例如巴豆酰CoA羧化酶/还原酶)的多核苷酸；一或多种编码路径中催化巴豆酰CoA向丁酸转化的酶(例如丁酰CoA脱氢酶)的多核苷酸；一或多种编码路径中催化丁酸向乙基-丙二酰CoA转化的酶(例如丁酰CoA:二氧化碳连接酶)的多核苷酸；一或多种编码路径中催化乙基-丙二酰CoA向2-(甲醛)丁酸转化的酶(例如乙基-丙二酰CoA还原酶(形成醛))的多核苷酸；一或多种编码路径中催化2-(甲醛)丁酸向2-(羟甲基)丁酸转化的酶(例如2-(甲酰基)丁酸还原酶(形成醇))的多核苷酸；一或多种编码路径中催化乙基丙二酰CoA向2-(羟甲基)丁酸转化的酶(例如乙基-丙二酰CoA还原酶(形成醇))的多核苷酸；一或多种编码路径中催化2-(羟甲基)丁酸向2-(磷烷氧基甲基)丁酸转化的酶(例如2-(羟甲基)丁酸激酶)的多核苷酸；一或多种编码路径中催化2-(磷烷氧基甲基)丁酸向2-(二磷烷氧基甲基)丁酸转化的酶(例如2-(磷烷氧基甲基)丁酸激酶)的多核苷酸；一或多种编码路径中催化2-(二磷烷氧基甲基)丁酸向[(E)-丁-2-烯氧基]-磷烷基-膦转化的酶(例如2-(二磷烷氧基甲基)丁酸脱羧酶)的多核苷酸；和/或一或多种编码路径中催化[(E)-丁-2-烯氧基]-磷烷基-膦向丁二烯转化的酶(例如丁二烯合成酶)的多核苷酸。在一些实施例中，提供一种微生物，其包含一或多种以上多核苷酸，包括所有的以上多核苷酸。
还提供一种微生物，其包含一或多种编码路径中催化可发酵碳源向4-羟基丁酰CoA和3-羟基丁酰CoA转化的酶的多核苷酸、和一或多种编码路径中催化4-羟基丁酰CoA和3-羟基丁酰CoA向丁二烯转化的酶的多核苷酸，其包括(但不限于)：一或多种编码路径中催化可发酵碳源(例如葡萄糖)向PEP转化的酶的多核苷酸；一或多种编码路径中催化PEP向草酰乙酸酯转化的酶(例如PEP羧激酶或PEP羧化酶)的多核苷酸；一或多种编码路径中催化PEP向丙酮酸酯转化的酶的多核苷酸；一或多种编码路径中催化丙酮酸酯向乙酰CoA(例如丙酮酸脱氢酶或丙酮酸铁氧还蛋白氧化还原酶)或草酰乙酸酯(例如PEP羧激酶或PEP羧化酶)转化的酶的多核苷酸；一或多种编码路径中催化乙酰CoA向乙酰乙酰CoA转化的酶(例如乙酰乙酰CoA硫解酶)的多核苷酸；一或多种编码路径中催化乙酰乙酰CoA向3-羟基丁酰CoA转化的酶(例如3-羟基丁酰CoA脱氢酶)的多核苷酸；一或多种编码路径中催化草酰乙酸酯向苹果酸酯转化的酶(例如苹果酸脱氢酶)的多核苷酸；一或多种编码路径中催化苹果酸酯向富马酸酯转化的酶(例如富马酸酶)的多核苷酸；一或多种编码路径中催化富马酸酯向琥珀酸酯转化的酶(例如富马酸还原酶)的多核苷酸；一或多种编码路径中催化琥珀酸酯向琥珀酰CoA转化的酶(例如琥珀酰CoA转移酶或琥珀酰CoA合成酶)的多核苷酸；一或多种编码路径中催化琥珀酰CoA向琥珀酰半醛转化的酶(例如琥珀酰CoA还原酶)的多核苷酸；一或多种编码路径中催化琥珀酰半醛向4-羟基丁酸酯转化的酶(例如4-羟基丁酸脱氢酶)的多核苷酸；一或多种编码路径中催化琥珀酸酯向4-羟基丁酸酯转化的酶(例如琥珀酸还原酶、磷酸泛酰巯基乙胺化酶或4-羟基丁酸脱氢酶)的多核苷酸；一或多种编码路径中催化4-羟基丁酸酯向4-羟基丁酰CoA转化的酶(例如4-羟基丁酰CoA转移酶或4-羟基丁酰CoA合成酶)的多核苷酸；一或多种编码路径中催化4-羟基丁酰CoA向巴豆酰CoA转化的酶(例如4-羟基丁酰CoA脱水酶)的多核苷酸；一或多种编码路径中催化3-羟基丁酰CoA向巴豆酰CoA转化的酶(例如巴豆酸酶)的多核苷酸；一或多种编码路径中催化巴豆酰CoA向巴豆醛转化的酶(例如巴豆醛脱氢酶)的多核苷酸；一或多种编码路径中催化巴豆醛向巴豆醇转化的酶(例如醇脱氢酶)的多核苷酸；一或多种编码路径中催化巴豆酰CoA向巴豆醇转化的酶(例如巴豆酰CoA还原酶(双官能))的多核苷酸；和/或一或多种编码路径中催化巴豆醇向丁二烯转化的酶(例如巴豆醇脱水酶)的多核苷酸。在一些实施例中，提供一种微生物，其包含一或多种以上多核苷酸，包括所有的以上多核苷酸。
还提供一种微生物，其包含一或多种编码路径中催化可发酵碳源向丙烯酰CoA和乙酰CoA转化的酶的多核苷酸、和一或多种编码路径中催化丙烯酰CoA和乙酰CoA向丁二烯转化的酶的多核苷酸，其包括(但不限于)：一或多种编码路径中催化可发酵碳源(例如葡萄糖)向丙酮酸酯转化的酶的多核苷酸；一或多种编码路径中催化丙酮酸酯向乳酸酯转化的酶(例如乳酸脱氢酶)的多核苷酸；一或多种编码路径中催化乳酸酯向乳酰CoA转化的酶(例如乳酰CoA转移酶或合成酶)的多核苷酸；一或多种编码路径中催化乳酰CoA向丙烯酰CoA转化的酶的多核苷酸；一或多种编码路径中催化丙酮酸酯向乙酰CoA转化的酶的多核苷酸；一或多种编码路径中催化丙烯酰CoA和乙酰CoA向3-酮基-4-戊烯酰CoA转化的酶(例如硫解酶)的多核苷酸；一或多种编码路径中催化3-酮基-4-戊烯酰CoA向(R)或(S)3-羟基-4-戊烯酰CoA转化的酶(例如3-酮基-4-戊烯酰CoA脱氢酶)的多核苷酸；一或多种编码路径中催化(R)或(S)3-羟基-4-戊烯酰CoA向3-羟基-4-戊烯酸转化的酶(例如3-羟基-4-戊烯酰CoA转移酶、水解酶或合成酶)的多核苷酸；和/或一或多种编码路径中催化3-羟基-4-戊烯酸向丁二烯转化的酶(例如3-羟基-4-戊烯酸脱羧酶)的多核苷酸。在一些实施例中，提供一种微生物，其包含一或多种以上多核苷酸，包括所有的以上多核苷酸。
还提供一种微生物，其包含一或多种编码路径中催化可发酵碳源(例如葡萄糖)向乙酰CoA和3-羟基丙酰CoA转化的酶的多核苷酸、和一或多种编码路径中催化乙酰CoA和3-羟基丙酰CoA向丁二烯转化的酶的多核苷酸，其包括(但不限于)：一或多种编码路径中催化可发酵碳源(例如葡萄糖)向丙酮酸酯转化的酶的多核苷酸；一或多种编码路径中催化丙酮酸酯向乳酸酯转化的酶的多核苷酸；一或多种编码路径中催化乳酸酯向乳酰CoA转化的酶(例如乳酰CoA转移酶或合成酶)的多核苷酸；一或多种编码路径中催化乳酰CoA向丙烯酰CoA转化的酶(例如乳酰CoA脱水酶)的多核苷酸；一或多种编码路径中催化丙烯酰CoA向3-羟基丙酰CoA转化的酶(例如丙烯酰CoA水合酶)的多核苷酸；一或多种编码路径中催化丙酮酸酯向3-羟基丙酸酯转化的酶的多核苷酸；一或多种编码路径中催化3-羟基丙酸酯向3-羟基丙酰CoA转化的酶的多核苷酸；一或多种编码路径中催化乙酰CoA和3-羟基丙酰CoA向5-羟基-3-酮戊酰CoA转化的酶(例如硫解酶)的多核苷酸；一或多种编码路径中催化5-羟基-3-酮戊酰CoA向(R)或(S)3,5-二羟基-戊酰CoA转化的酶(例如5-羟基-3-酮戊酰CoA脱氢酶)的多核苷酸；一或多种编码路径中催化(R)或(S)3,5-二羟基-戊酰CoA向(R)或(S)3-羟基-4-戊烯酰CoA转化的酶(例如3,5-羟基戊酰CoA脱水酶)的多核苷酸；一或多种编码路径中催化(R)或(S)3-羟基-4-戊烯酰CoA向3-羟基-4-戊烯酸转化的酶(例如3-羟基-4-戊烯酰CoA水解酶、转移酶或合成酶)的多核苷酸；和/或一或多种编码路径中催化3-羟基-4-戊烯酸向丁二烯转化的酶(例如3-羟基-4-戊烯酸脱羧酶)的多核苷酸。在一些实施例中，提供一种微生物，其包含一或多种以上多核苷酸，包括所有的以上多核苷酸。
还提供一种微生物，其包含一或多种编码路径中催化可发酵碳源(例如葡萄糖)向乙酰乙酰CoA和甲酰CoA转化的酶的多核苷酸、和一或多种编码路径中催化乙酰乙酰CoA和甲酰CoA向丁二烯转化的酶的多核苷酸，其包括(但不限于)：一或多种编码路径中催化可发酵碳源(例如葡萄糖)向丙酮酸酯转化的酶的多核苷酸；一或多种编码路径中催化丙酮酸酯向乙酰CoA和甲酸酯转化的酶(例如丙酮酸甲酸裂解酶)的多核苷酸；一或多种编码路径中催化乙酰CoA向乙酰乙酰CoA转化的酶(例如硫解酶)的多核苷酸；一或多种编码路径中催化CO2向甲酸酯转化的酶(例如甲酸脱氢酶)的多核苷酸；一或多种编码路径中催化甲酸酯向甲酰CoA转化的酶(例如甲酰CoA转移酶或甲酰CoA合成酶)的多核苷酸；一或多种编码路径中催化甲酰CoA和乙酰乙酰CoA向3,5-酮戊酰CoA转化的酶(例如硫解酶)的多核苷酸；一或多种编码路径中催化3,5-酮戊酰CoA向5-羟基-3-酮戊酰CoA转化的酶的多核苷酸；一或多种编码路径中催化5-羟基-3-酮戊酰CoA向(R)或(S)3,5-二羟基-戊酰CoA转化的酶(例如5-羟基-3-酮戊酰CoA脱氢酶)的多核苷酸；一或多种编码路径中催化(R)或(S)3,5-二羟基-戊酰CoA向(R)或(S)3-羟基-4-戊烯酰CoA转化的酶(例如3,5-羟基戊酰CoA脱水酶)的多核苷酸；一或多种编码路径中催化(R)或(S)3-羟基-4-戊烯酰CoA向3-羟基-4-戊烯酸转化的酶(例如3-羟基-4-戊烯酰CoA水解酶、转移酶或合成酶)的多核苷酸；和/或一或多种编码路径中催化3-羟基-4-戊烯酸向丁二烯转化的酶(例如3-羟基-4-戊烯酸脱羧酶)的多核苷酸。在一些实施例中，提供一种微生物，其包含一或多种以上多核苷酸，包括所有的以上多核苷酸。
还提供一种微生物，其包含一或多种编码路径中催化可发酵碳源(例如葡萄糖)向乙酰CoA和3-羟基丙酰CoA转化的酶的多核苷酸、和一或多种编码路径中催化乙酰CoA和3-羟基丙酰CoA向丁二烯转化的酶的多核苷酸，其包括(但不限于)：一或多种编码路径中催化可发酵碳源(例如葡萄糖)向丙酮酸酯转化的酶的多核苷酸；一或多种编码路径中催化丙酮酸酯向丙烯酰CoA转化的酶的多核苷酸；一或多种编码路径中催化丙烯酰CoA向3-羟基丙酰CoA转化的酶的多核苷酸；一或多种编码路径中催化丙酮酸酯向3-羟基丙酸酯转化的酶的多核苷酸；一或多种编码路径中催化3-羟基丙酸酯向3-羟基丙酰CoA转化的酶的多核苷酸；一或多种编码路径中催化乙酰CoA和3-羟基丙酰CoA向5-羟基-3-酮戊酰CoA转化的酶(例如硫解酶)的多核苷酸；一或多种编码路径中催化5-羟基-3-酮戊酰CoA向(R)或(S)3,5-二羟基-戊酰CoA转化的酶(例如5-羟基-3-酮戊酰CoA脱氢酶)的多核苷酸；一或多种编码路径中催化(R)或(S)3,5-二羟基-戊酰CoA向3,5-羟基戊酸转化的酶(例如3,5-羟基戊酸激酶)的多核苷酸；一或多种编码路径中催化3,5-羟基戊酸向3,5-羟基戊酸磷酸酯转化的酶(例如3,5-羟基戊酸激酶)的多核苷酸；一或多种编码路径中催化3,5-羟基戊酸磷酸酯向3,5-羟基戊酸二磷酸酯转化的酶(例如3,5-羟基戊酸磷酸激酶)的多核苷酸；一或多种编码路径中催化3,5-羟基戊酸二磷酸酯向1-丁烯基-4-二磷酸酯转化的酶(例如羟基戊酸二磷酸脱羧酶)的多核苷酸；和/或一或多种编码路径中催化1-丁烯基-4-二磷酸酯向丁二烯转化的酶(例如丁二烯合成酶)的多核苷酸。在一些实施例中，提供一种微生物，其包含一或多种以上多核苷酸，包括所有的以上多核苷酸。
还提供一种微生物，其包含一或多种编码路径中催化可发酵碳源(例如葡萄糖)向乙基-丙二酰CoA转化的酶的多核苷酸、和一或多种编码路径中催化乙基-丙二酰CoA向丁二烯转化的酶的多核苷酸，其包括(但不限于)：一或多种编码路径中催化可发酵碳源(例如葡萄糖)向丙酮酸酯转化的酶的多核苷酸；一或多种编码路径中催化丙酮酸酯向乙酰CoA转化的酶的多核苷酸；一或多种编码路径中催化乙酰CoA向乙酰乙酰CoA转化的酶(例如乙酰乙酰CoA硫解酶)的多核苷酸；一或多种编码路径中催化乙酰乙酰CoA向3-羟基丁酰CoA转化的酶(例如3-羟基丁酰CoA脱氢酶)的多核苷酸；一或多种编码路径中催化3-羟基丁酰CoA向巴豆酰CoA转化的酶(例如巴豆酸酶)的多核苷酸；一或多种编码路径中催化巴豆酰CoA向乙基-丙二酰CoA转化的酶(例如巴豆酰CoA羧化酶/还原酶)的多核苷酸；一或多种编码路径中催化巴豆酰CoA向丁酸转化的酶(例如丁酰CoA脱氢酶)的多核苷酸；一或多种编码路径中催化丁酸向乙基-丙二酰CoA转化的酶(例如丁酰CoA:二氧化碳连接酶)的多核苷酸；一或多种编码路径中催化乙基-丙二酰CoA向2-羟甲基-丁酸转化的酶(例如乙基-丙二酰CoA还原酶、醇脱氢酶或醛脱氢酶))的多核苷酸；一或多种编码路径中催化2-羟甲基-丁酸向2-丁烯基4-二磷酸酯转化的酶(例如2-羟甲基-丁酸激酶、羟甲基丁酸-磷酸激酶或2-羟甲基丁酸-二磷酸脱羧酶)的多核苷酸；一或多种编码路径中催化2-羟甲基-丁酸向2-丁烯基4-磷酸酯转化的酶的多核苷酸；一或多种编码路径中催化2-丁烯基4-磷酸酯向丁二烯转化的酶的多核苷酸；和/或一或多种编码路径中催化2-丁烯基4-二磷酸酯向丁二烯转化的酶(例如丁二烯合成酶)的多核苷酸。在一些实施例中，提供一种微生物，其包含一或多种以上多核苷酸，包括所有的以上多核苷酸。
还提供一种微生物，其包含一或多种编码路径中催化可发酵碳源(例如葡萄糖)向乳酸酯和乙酰CoA和草乙酸酯转化的酶的多核苷酸、和一或多种编码路径中催化乳酸酯和乙酰CoA和草乙酸酯向丁二烯转化的酶的多核苷酸，其包括(但不限于)：一或多种编码路径中催化可发酵碳源(例如葡萄糖)向PEP转化的酶的多核苷酸；一或多种编码路径中催化PEP向丙酮酸酯转化的酶的多核苷酸；一或多种编码路径中催化丙酮酸酯向乙酰CoA转化的酶的多核苷酸；一或多种编码路径中催化乳酸酯向乳酰CoA转化的酶(例如乳酸CoA转移酶)的多核苷酸；一或多种编码路径中催化乳酰CoA向丙烯酰CoA转化的酶(例如乳酰CoA脱水酶)的多核苷酸；一或多种编码路径中催化丙烯酰CoA向丙酰CoA转化的酶(例如丙烯酰CoA氧化还原酶)的多核苷酸；一或多种编码路径中催化丙酰CoA向酮戊酰CoA转化的酶(例如硫解酶)的多核苷酸；一或多种编码路径中催化酮戊酰CoA向2-戊烯酰CoA转化的酶(例如酮戊酰CoA脱水酶)的多核苷酸；一或多种编码路径中催化2-戊烯酰CoA向2-戊烯酸转化的酶(例如戊烯酰CoA水解酶、转移酶或合成酶)的多核苷酸；一或多种编码路径中催化2戊烯酸向丁二烯转化的酶(例如4-戊烯酸脱羧酶)的多核苷酸；一或多种编码路径中催化2-戊烯酸向4-戊烯酸转化的酶(例如移位C＝C键异构酶)的多核苷酸；一或多种编码路径中催化4-戊烯酸向丁二烯转化的酶(例如4-戊烯酸脱羧酶)的多核苷酸；一或多种编码路径中催化草乙酸酯向苹果酸酯转化的酶(例如苹果酸脱氢酶)的多核苷酸；一或多种编码路径中催化苹果酸酯向富马酸酯转化的酶(例如富马酸酶)的多核苷酸；一或多种编码路径中催化富马酸酯向琥珀酸酯转化的酶(例如富马酸还原酶)的多核苷酸；一或多种编码路径中催化琥珀酸酯向琥珀酰CoA转化的酶(例如琥珀酰CoA转移酶合成酶)的多核苷酸；一或多种编码路径中催化琥珀酰CoA向琥珀酸酯半醛转化的酶(例如琥珀酰CoA还原酶)的多核苷酸；一或多种编码路径中催化琥珀酸酯半醛向4-羟基丁酸酯转化的酶(例如4-羟基丁酸脱氢酶)的多核苷酸；一或多种编码路径中催化4-羟基丁酸酯向4-羟基丁酰CoA转化的酶(例如4-羟基丁酰CoA转移酶或4-羟基丁酰CoA合成酶)的多核苷酸；一或多种编码路径中催化4-羟基丁酰CoA向巴豆酰CoA转化的酶(例如4-羟基丁酰CoA脱水酶)的多核苷酸；一或多种编码路径中催化巴豆酰CoA向巴豆醛转化的酶(例如巴豆醛脱氢酶)的多核苷酸；一或多种编码路径中催化巴豆酰CoA向巴豆醇转化的酶(例如巴豆酰CoA还原酶或双官能醇脱氢酶)的多核苷酸；一或多种编码路径中催化巴豆醛向巴豆醇转化的酶(例如醇脱氢酶)的多核苷酸；和/或一或多种编码路径中催化巴豆醇向丁二烯转化的酶(例如巴豆醇脱水酶)的多核苷酸。
本文中提供的微生物中的任一者可以任选地包含一或多种编码允许可发酵碳源向丁二烯氧化还原平衡转化的酶的多核苷酸。
微生物可以是古细菌、细菌或真核生物。在一些实施例中，细菌是丙酸杆菌属、丙酸螺菌属、梭菌属、芽孢杆菌属、埃希氏菌属、暗杆菌属或乳杆菌属，包括例如丙酸暗杆菌(Pelobacter propionicus)、丙酸梭菌(Clostridium propionicum)、丙酮丁醇梭菌(Clostridium acetobutylicum)、乳杆菌属、产丙酸丙酸杆菌(Propionibacteriumacidipropionici)或费氏丙酸杆菌(Propionibacterium freudenreichii)。在一些实施例中，真核生物是酵母、丝状真菌、原生动物或藻类。在一些实施例中，所述酵母是酿酒酵母、运动发酵单胞菌或巴斯德毕赤酵母。
在一些实施例中，本发明涵盖本文中提供的一或多种酶的修饰(例如工程化)。可以进行所述修饰以再设计酶的底物特异性和/或以修饰(例如降低)其针对其它底物的活性以便增加其对于既定底物的选择性。另外或或者，本文中提供的一或多种酶可以被工程化以改变(例如增强，包括例如增加其催化活性或其底物特异性)其一或多种性质。
酶中的任一者(例如编码酶的多核苷酸)可以通过本领域中已知的任何方法修饰(例如诱变化或多样化)以扩大或改变其底物特异性(例如将酶的底物特异性从一种底物变到另一底物)。所述方法包括(但不限于)EpPCR(普里查德(Pritchard)等人,理论生物学杂志(J.Theor.Biol.)234:497-509(2005))；易错滚环扩增(epRCA)(藤井(Fujii)等人,核酸研究(Nucleic Acids Res.)32:e145(2004)；和藤井等人,自然实验手册(Nat.Protoc.)1:2493-2497(2006))；DNA或家族改组(施特默尔(Stemmer),美国国家科学院院刊(Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A.)91:10747-10751(1994)；和施特默尔,自然(Nature)370:389-391(1994))；交错延伸(StEP)(赵(Zhao)等人,自然生物技术(Nat.Biotechnol.)16:258-261(1998))；和/或随机引发重组(RPR)(邵(Shao)等人,核酸研究26:681-683(1998))。
用于诱变多核苷酸的其它例示性方法包括异双螺旋重组(沃尔科夫(Volkov)等人,核酸研究27:e18(1999)；和沃尔科夫等人,酶学方法(Methods Enzymol.)328:456-463(2000))；过渡模板随机嵌合(RACHITT)(科科(Coco)等人,自然生物技术19:354-359(2001))；截短模板重组延伸(RETT)(李(Lee)等人,分子催化杂志(J.Molec.Catalysis)26:119-129(2003))；简并寡核苷酸基因改组(DOGS)(伯奎斯特(Bergquist)和吉布斯(Gibbs),分子生物学方法(Methods Mol.Biol.)352:191-204(2007)；伯奎斯特等人,生物分子工程学(Biomol.Eng.)22:63-72(2005)；吉布斯等人,基因271:13-20(2001))；用于杂交酶产生的增量截短(ITCHY)(奥斯特迈尔(Ostermeier)等人,美国国家科学院院刊96:3562-3567(1999)；和奥斯特迈尔等人,自然生物技术17:1205-1209(1999))；用于杂交酶产生的硫代增量截短(THIO-ITCHY)(卢茨(Lutz)等人,核酸研究29:E16(2001))；SCRATCHY(卢茨等人,美国国家科学院院刊98:11248-11253(2001))；随机漂变诱变(RNDM)(伯奎斯特等人,生物分子工程学22:63-72(2005))；序列饱和诱变(SeSaM)(王(Wong)等人,生物技术杂志(Biotechnol.J.)3:74-82(2008)；王等人,核酸研究32:e26(2004)；和王等人,分析生物化学(Anal.Biochem.)341:187-189(2005))；合成改组(内斯(Ness)等人,自然生物技术20:1251-1255(2002))；核苷酸交换与切除技术NexT(穆勒(Muller)等人,核酸研究33:e117(2005))。其它例示性方法包括序列同源性非依赖性蛋白质重组(SHIPREC)(西贝尔(Sieber)等人,自然生物技术19:456-460(2001))；Gene Site Saturation MutagenesisTM(GSSMTM)(克雷茨(Kretz)等人,酶学方法388:3-11(2004))；组合盒式诱变(CCM)(雷达哈尔-奥尔森(Reidhaar-Olson)等人酶学方法208:564-586(1991)；和雷达哈尔-奥尔森等人科学(Science)241:53-57(1988))；组合多盒式诱变(CMCM)(雷茨(Reetz)等人,应用化学国际版(英语)(Angew.Chem.Int.Ed Engl.)40:3589-3591(2001))；和致突变菌株技术(谢利佛诺瓦(Selifonova)等人,应用与环境微生物学(Appl.Environ.Microbiol.)67:3645-3649(2001)；(洛)等人,分子生物学杂志260:359-3680(1996))。其它例示性方法包括精确诱变(LTM)(拉吉帕尔(Rajpal)等人,美国国家科学院院刊102:8466-8471(2005))；基因重装配(由Verenium Corporaiton)供应的Tunable GeneReassemblyTM(TGRTM)技术，计算机模拟蛋白质自动设计(PDA)(海耶斯(Hayes)等人,美国国家科学院院刊99:15926-15931(2002))；和迭代饱和诱变(ISM)(雷茨等人,自然实验手册2:891-903(2007)；和雷茨等人,应用化学国际版(英语)45:7745-7751(2006))。
在一些实施例中，蛋白质的序列比对和比较模型化可以用以改变一或多种本文中揭示的酶。同源性模型化或比较模型化是指从所要蛋白质的一级氨基酸序列构建其原子级分辨率模型和类似蛋白质的实验三维结构。此模型可以允许酶底物结合位点得以界定并且鉴别可以置换为其它天然氨基酸以便再设计其底物特异性的具体氨基酸位置。
与编码如本文中揭示的酶的多核苷酸具有实质一致性或同源性的变异体或序列可以用于实践本发明。所述序列可以称为变异体或被修饰的序列。就是说，多核苷酸序列可以被修饰然而仍维持编码展现所要活性的多肽的能力。所述变异体或被修饰的序列因此是等效物。一般来说，变异体或被修饰的序列可以包含与原生序列相比至少约40％-60％、优选地约60％-80％、更优选地约80％-90％并且甚至更优选地约90％-95％序列一致性。
在一些实施例中，微生物可以被修饰以表达(包括例如过表达)一或多种如本文中提供的酶。微生物可以通过遗传工程化技术(即重组技术)、传统微生物技术或所述技术的组合来修饰，并且还可以包括天然存在的基因变异体以制造被遗传修饰的微生物。一些所述技术一般揭示于例如萨姆布鲁克(Sambrook)等人,1989,分子克隆：实验手册(MolecularCloning:A Laboratory Manual),冷泉港实验室出版社(Cold Spring Harbor LabsPress)中。
微生物可以包括如下微生物，其中多核苷酸已经被插入、缺失或修饰(即突变；例如通过插入、缺失、取代和/或反转核苷酸)，以这种方式使得所述修饰提供一或多种如本文中提供的酶在微生物内的所要表达(例如过表达)作用。导致基因表达或功能增加的遗传修饰可以称为基因的扩增、过量产生、过表达、活化、增强、添加或上调。添加克隆的基因以增加基因表达可以包括将克隆的基因维持在复制质粒上或将克隆的基因整合到制造生物体的基因组中。此外，增加所要克隆的基因的表达可以包括使克隆的基因可操作地连接于天然或异源转录控制元件。
必要时，一或多种本文中提供的酶的表达在调节序列的控制下，所述调节序列在发酵反应期间以时间依赖性方式直接或间接控制酶的表达。
在一些实施例中，微生物用遗传媒介物转型或转染，所述遗传媒介物例如包含编码本文中提供的酶的外源多核苷酸序列的表达载体。
制备用于引入到原核或真核宿主中的多核苷酸构建体可以典型地(但并不总是)包含由宿主识别的复制系统(即载体)，包括编码所要多肽的预期多核苷酸片段，并且可以优选地(但不必须)还包括可操作地连接于多肽编码区段的转录和翻译起始调节序列。表达系统(表达载体)可以包括例如复制起点或自主复制序列(ARS)和表达控制序列、启动子、增强子和必需加工信息位点(例如核糖体结合位点、RNA剪接位点、聚腺苷酸化位点)、转录终止序列、mRNA稳定化序列、与宿主染色体DNA同源的核苷酸序列和/或多克隆位点。适当时还可以包括优选地来自相同或相关物种的分泌型多肽的信号肽，其允许蛋白质穿过和/或固留在细胞膜中或由细胞分泌。
载体可以使用标准方法构建(参看例如萨姆布鲁克等人,分子生物学：实验手册,冷泉港,纽约州(N.Y.)1989；和奥苏贝尔(Ausubel)等人,当前分子生物学实验指南(Current Protocols in Molecular Biology),格林出版公司(Greene Publishing,Co.)纽约州,1995)。
包括编码一或多种本文中揭示的酶的多核苷酸的本发明多核苷酸的操纵典型地在重组载体中进行。众多载体可公开获得，包括细菌质粒、噬菌体、人造染色体、游离型载体和基因表达载体，其全部能够使用。根据本发明有用的载体可经选择以适应具有所要大小的蛋白质编码序列。适合的宿主细胞在体外克隆操纵之后用载体转化。宿主细胞可以是原核的，例如许多细菌株中的任一者；或可以是真核的，例如酵母或其它真菌细胞、昆虫或两栖动物细胞、或哺乳动物细胞，包括例如啮齿动物、猿或人类细胞。每个载体含有各种功能性组分，其一般包括克隆位点、复制起点和至少一个可选择标记基因。如果既定载体是表达载体，那么它另外具有以下中的一或多者：增强子元件、启动子、转录终止和信号序列，各自定位在克隆位点附近，以使得其可操作地连接到根据本发明编码多肽文库成员的基因。
载体(包括克隆和表达载体)可以含有使得载体能够在一或多种所选宿主细胞中复制的核酸序列。举例来说，序列可以是使得载体能够独立于宿主染色体DNA而复制的序列，并且可以包括复制起点或自主复制序列。所述序列熟知用于多种细菌、酵母和病毒。举例来说，来自质粒pBR322的复制起点适用于大多数革兰氏阴性(Gram-negative)细菌，2微米质粒起点适用于酵母，并且各种病毒起点(例如SV 40，腺病毒)适用于哺乳动物细胞中的克隆载体。一般来说，复制起点不为哺乳动物表达载体所需，除非其用于能够复制高水平的DNA的哺乳动物细胞(例如COS细胞)中。
克隆或表达载体可以含有也称为可选择标记的选择基因。此基因编码为在选择性培养基中生长的经转化宿主细胞存活或生长所需的蛋白质。未用含有选择基因的载体转化的宿主细胞因此将不能在培养基中存活。典型选择基因编码赋予对抗生素和其它毒素(例如安比西林、新霉素、甲氨喋呤、潮霉素、硫链丝菌素、安普霉素或四环素)的抗性、补充营养缺陷型不足或供应生长培养基中不可获得的关键营养素的蛋白质。
载体的复制可以在大肠杆菌(例如菌株TB1或TG1、DH5α、DH10β、JM110)中进行。可以使用大肠杆菌可选择标记，例如赋予对抗生素安比西林的抗性的β-内酰胺酶基因。这些可选择标记可以获自大肠杆菌质粒(例如pBR322)或pUC质粒(例如pUC18或pUC19或pUC119)。
表达载体可以含有由宿主生物体识别的启动子。启动子可以可操作地连接于所关注的编码序列。这种启动子可以是诱导性或组成性的。多核苷酸当多核苷酸呈允许其以其预期方式起作用的关系时可操作地连接。
适合在原核宿主情况下使用的启动子可以包括例如α-内酰胺酶和乳糖启动子系统、碱性磷酸酶、色氨酸(trp)启动子系统、红霉素启动子、安普霉素启动子、潮霉素启动子、次甲霉素启动子和杂交启动子(例如tac启动子)。此外，可以使用宿主组成性或诱导性启动子。用于细菌系统的启动子一般也将含有可操作地连接于编码序列的夏因-达尔加诺(Shine-Dalgarno)序列。
获自病毒基因组的病毒启动子包括来自以下的启动子：多形瘤病毒、鸡痘病毒、腺病毒(例如腺病毒2或5)、单纯疱疹病毒(胸苷激酶启动子)、牛乳头状瘤病毒、禽肉瘤病毒、巨细胞病毒、反转录病毒(例如MoMLV或RSV LTR)、B型肝炎病毒、骨髓增生肉瘤病毒启动子(MPSV)、VISNA和猿猴病毒40(SV40)。异源哺乳动物启动子包括例如肌动蛋白启动子、免疫球蛋白启动子、热休克蛋白启动子。
SV40病毒的早期和晚期启动子宜以还含有SV40病毒复制起点的限制性片断形式获得(参看例如菲尔斯(Fiers)等人,自然,273:113(1978)；马利根(Mulligan)和伯格(Berg),科学,209:1422-1427(1980)；和帕夫拉基斯(Pavlakis)等人,美国国家科学院院刊,78:7398-7402(1981))。人类巨细胞病毒(CMV)的即刻早期启动子宜以Hind III E限制性片断形式获得(参看例如格里纳韦(Greenaway)等人,基因,18:355-360(1982))。广泛宿主范围启动子(例如SV40早期启动子或劳斯肉瘤病毒(Rous sarcoma virus)LTR)适用于本发明表达载体中。
一般来说，强启动子可以用以提供所要产物的高水平转录和表达。已经被鉴别为用于高水平表达的强启动子的真核启动子中有SV40早期启动子、腺病毒主要晚期启动子、小鼠金属硫蛋白-I启动子、劳斯肉瘤病毒长末端重复序列和人类巨细胞病毒即刻早期启动子(CMV或CMV IE)。在一实施例中，启动子是SV40或CMV早期启动子。
所用启动子可以是组成性的或可调节的，例如诱导性的。例示性诱导性启动子包括jun、fos和金属硫蛋白和热休克启动子。转录单位的一个或两个启动子可以是诱导性启动子。在一实施例中，GFP由组成性启动子表达，而诱导性启动子驱动编码一或多种如本文中揭示的酶的基因和/或可扩增可选择标记的转录。
高等真核生物中的转录调节区可以包含增强子序列。许多来自哺乳动物基因的增强子序列已知例如来自球蛋白、弹性蛋白酶、白蛋白、α-胎蛋白和胰岛素基因。适合的增强子是来自真核细胞病毒的增强子。实例包括在复制起点晚期的SV40增强子(bp100-270)、巨细胞病毒即刻早期启动子的增强子(波沙特(Boshart)等人细胞(Cell)41:521(1985))、在复制起点晚期的多形瘤增强子和腺病毒增强子(还参看例如关于用于活化真核启动子的增强元件的雅尼夫(Yaniv),自然,297:17-18(1982))。增强子序列可以在所关注基因的位置5'或3'处引入到载体中，但优选地位于启动子的5'位点。
酵母和哺乳动物表达载体可以含有促进载体在细菌中繁殖的原核序列。因此，载体可以具有其它组分，例如复制起点(例如使得载体能够在一或多种所选宿主细胞中复制的核酸序列)、用于在细菌中选择的抗生素抗性基因和/或可以允许翻译以遍读密码子的琥珀终止密码子。可以并入其它真核可选择基因。一般来说，在克隆载体中，复制起点是使得载体能够独立于宿主染色体DNA而复制的复制起点，并且包括复制起点或自主复制序列。所述序列是熟知的，例如细菌中的ColE1复制起点。各种病毒起点(例如SV40、多形瘤、腺病毒、VSV或BPV)适用于哺乳动物细胞中的克隆载体。一般来说，真核复制子不为在哺乳动物细胞中表达所需，除非预期染色体外(游离型)复制(例如典型地可以使用SV40起点，只是因为它含有早期启动子)。
为了促进编码如本文中揭示的酶的不同基因从构建体和表达载体的插入和表达，构建体可以设计有至少一个克隆位点用于插入编码本文中揭示的任何酶的任何基因。克隆位点可以是多克隆位点，例如含有多个限制位点。
质粒可以在细菌宿主细胞中繁殖以制备DNA储备物用于亚克隆步骤或用于引入到真核宿主细胞中。真核宿主细胞的转染可以是由本领域中熟知的任何方法进行的任何转染。转染方法包括脂质体转染、电穿孔、磷酸钙共同沉淀、氯化铷或聚阳离子介导的转染、原生质体融合和显微注射。优选地，转染是稳定转染。提供最优转染频率和构建体在具体宿主细胞系和类型中的表达的转染方法是有利的。适合的方法可以通过常规程序确定。对于稳定转染子来说，构建体是整合的以便稳定维持在宿主染色体内。
载体可以通过为本领域的技术人员所知的许多适合方法中的任一者引入到所选宿主细胞中。举例来说，载体构建体可以通过用于质粒载体的许多转型方法中的任一者引入到适当细胞。举例来说，标准氯化钙介导的细菌转型仍常用以将裸DNA引入到细菌(参看例如萨姆布鲁克等人,1989,分子克隆：实验手册,冷泉港实验室出版社,冷泉港,纽约州)，但可以使用电穿孔和结合(参看例如奥苏贝尔等人,1988,当前分子生物学实验指南,约翰威利父子公司,纽约,纽约州)。
为了将载体构建体引入到酵母或其它真菌细胞，可以使用化学转型方法(例如罗斯(Rose)等人,1990,酵母遗传学方法(Methods in Yeast Genetics),冷泉港实验室出版社,冷泉港,纽约州)。转型的细胞可以在适合于所用可选择标记的选择性培养基上分离。或者或另外，板或从板提起的过滤器可以针对GFP荧光进行扫描以鉴别转型的无性系。
为了将包含差异性地表达的序列的载体引入到哺乳动物细胞，所用方法可以取决于载体的形式。质粒载体可以通过许多转染方法中的任一者引入，所述方法包括例如脂质介导的转染(“脂质体转染”)、DEAE-右旋糖酐介导的转染、电穿孔或磷酸钙沉淀(参看例如奥苏贝尔等人,1988,当前分子生物学实验指南,约翰威利父子公司,纽约,纽约州)。
适用于多种转型的和非转型的或初级细胞的过渡转染的脂质体转染试剂和方法是广泛可获得的，使得脂质体转染成为将构建体引入到培养物中的真核并且具体地说哺乳动物细胞的有吸引力的方法。举例来说，可用LipofectAMINETM(生命技术(LifeTechnologies))或LipoTaxiTM(斯特拉塔吉涅(Stratagene))试剂盒。其它提供用于脂质体转染的试剂和方法的公司包括伯乐实验室(Bio-Rad Laboratories)、克伦技术(CLONTECH)、格伦研究(Glen Research)、英杰(InVitrogen)、JBL科学(JBL Scientific)、MBI费尔门塔斯(MBI Fermentas)、潘瓦拉(PanVera)、普洛麦格(Promega)、量子生物技术(Quantum Biotechnologies)、西格玛-奥德里奇(Sigma-Aldrich)和美国和光化学品(WakoChemicals USA)。
宿主细胞可能能够表达编码所要蛋白质的构建体、加工蛋白质并且将分泌的蛋白质输送到用于分泌的细胞表面。加工包括翻译同时和翻译后修饰，例如前导肽裂解、GPI连接、糖基化、泛素化和二硫键形成。经受转染和体外细胞培养并且具有遗传工程化中典型地所用的种类的永生化宿主细胞培养物是优选的。有用的哺乳动物宿主细胞系的实例是由SV40转型的猴肾CV1系(COS-7，ATCC CRL 1651)；人类胚肾系(适合于生长于悬浮培养物中的293或293衍生物，格雷厄姆(Graham)等人,普通病毒学杂志(J.Gen Virol.),36:59(1977)；幼仓鼠肾细胞(BHK，ATCC CCL 10)；DHFR-中国仓鼠卵巢细胞(ATCC CRL-9096)；dp12.CHO细胞，CHO/DHFR-的衍生物(1989年3月15日公开的EP307,247)；小鼠塞尔托利细胞(TM4，马瑟(Mather),繁殖生物学(Biol.Reprod.),23:243-251(1980))；猴肾细胞(CV1ATCC CCL 70)；非洲绿猴肾细胞(VERO-76，ATCC CRL-1587)；人类宫颈癌细胞(HELA，ATCCCCL 2)；犬肾细胞(MDCK，ATCC CCL 34)；水牛鼠肝细胞(BRL 3A，ATCC CRL 1442)；人类肺细胞(W138，ATCC CCL 75)；人类肝细胞(Hep G2，HB 8065)；小鼠乳房肿瘤(MMT 060562，ATCCCCL51)；TRI细胞(马瑟等人,纽约科学院年报(Annals N.Y.Acad.Sci.),383:44-68(1982))；PEER人类急性成淋巴细胞细胞系(拉维德(Ravid)等人国际癌症杂志(Int.J.Cancer)25:705-710(1980))；MRC 5细胞；FS4细胞；人类肝肿瘤系(Hep G2)、人类HT1080细胞、KB细胞、JW-2细胞、Detroit 6细胞、NIH-3T3细胞、融合瘤和骨髓瘤细胞。用于产生转基因动物的胚细胞也是适合的(例如接合子和胚胎干细胞)。
适用于在载体中克隆或表达多核苷酸(例如DNA)的宿主细胞可以包括例如原核生物、酵母或高等真核生物细胞。适用于此目的的原核生物包括真细菌，例如革兰氏阴性或革兰氏阳性(Gram-positive)生物体，例如肠杆菌科(Enterobacteriaceae)，例如埃希氏菌属(例如大肠杆菌)、肠杆菌属(Enterobacter)、欧文氏菌属(Erwinia)、克雷伯氏菌属(Klebsiella)、变形杆菌属(Proteus)、沙门氏菌属(Salmonella)(例如鼠伤寒沙门氏菌(Salmonella typhimurium))、沙雷氏菌属(Serratia)(例如粘质沙雷氏菌(Serratiamarcescans))和志贺氏菌属(Shigella)以及芽孢杆菌属(例如枯草芽孢杆菌(B.subtilis)和地衣芽孢杆菌(B.licheniformis)(例如1989年4月12日公开的DD 266,710中揭示的地衣芽孢杆菌41P))、假单胞菌属(Pseudomonas)(例如绿脓假单胞菌(P.aeruginosa))和链霉菌属(Streptomyces)。一种优选的大肠杆菌克隆宿主是大肠杆菌294(ATCC 31,446)，但其它菌株(例如大肠杆菌B、大肠杆菌X1776(ATCC 31,537)、大肠杆菌JM110(ATCC 47,013)和大肠杆菌W3110(ATCC 27,325))是适合的。
除了原核生物之外，真核微生物(例如丝状真菌或酵母)可以是适用于包含编码一或多种酶的多核苷酸的载体的克隆或表达宿主。在低等真核宿主微生物之中，最常用酿酒酵母或常见面包酵母。然而，本文中通常可获得并且使用许多其它属、物种和菌株，例如粟酒裂殖酵母(Schizosaccharomyces pombe)；克鲁维酵母属(Kluyveromyces)宿主，例如乳酸克鲁维酵母(K.lactis)、脆壁克鲁维酵母(K.fragilis)(ATCC 12,424)、保加利亚克鲁维酵母(K.bulgaricus)(ATCC 16,045)、威克克鲁维酵母(K.wickeramii)(ATCC 24,178)、瓦提克鲁维酵母(K.waltii)(ATCC 56,500)、果蝇克鲁维酵母(K.drosophilarum)(ATCC36,906)、耐热克鲁维酵母(K.thermotolerans)和马克斯克鲁维酵母(K.marxianus)；耶氏酵母属(yarrowia)(EP 402,226)；巴斯德毕赤酵母(Pichia pastors)(EP 183,070)；假丝酵母属(Candida)；里氏木霉(Trichoderma reesia)(EP 244,234)；粗糙脉孢菌(Neurosporacrassa)；许旺酵母属(Schwanniomyces)，例如西方许旺酵母(Schwanniomycesoccidentalis)；和丝状真菌，例如脉孢菌属(Neurospora)、青霉属(Penicillium)、弯颈霉属(Tolypocladium)和曲霉属(Aspergillus)宿主(例如沟巢曲霉(A.nidulans)和黑曲霉(A.niger)。
当酶糖基化时，适用于表达的宿主细胞可以衍生自多细胞生物体。无脊椎动物细胞的实例包括植物和昆虫细胞。已经鉴别了众多杆状病毒株和变异体和来自例如草地贪夜蛾(Spodoptera frugiperda)(毛虫)、埃及伊蚊(Aedes aegypti)(蚊子)、白纹伊蚊(Aedesalbopictus)(蚊子)、黑腹果蝇(Drosophila melanogaster)(果蝇)和家蚕(Bombyx mori)(蚕蛾)的宿主的相应受纳昆虫宿主细胞。多种用于转染的病毒株是可公开获得的，例如苜蓿银纹夜蛾(Autographa californica)NPV的L-1变异体和家蚕NPV的Bm-5病毒株，并且所述病毒可以用作本文中根据本发明的病毒，具体地说用于转染草地贪夜蛾细胞。
棉花、玉米、马铃薯、大豆、矮牵牛、番茄、烟草、浮萍和其它植物细胞的植物细胞培养物也可以用作宿主细胞。
有用的哺乳动物宿主细胞的实例是中国仓鼠卵巢细胞，包括CHOK1细胞(ATCCCCL61)、DXB-11、DG-44和中国仓鼠卵巢细胞/-DHFR(CHO，乌尔劳布(Urlaub)等人,美国国家科学院院刊77:4216(1980))；由SV40转型的猴肾CV1系(COS-7，ATCC CRL1651)；人类胚肾系(被亚克隆用于生长于悬浮培养物中的293或293细胞(格雷厄姆等人,普通病毒学杂志36:59,1977)；幼仓鼠肾细胞(BHK，ATCC CCL 10)；小鼠塞尔托利细胞(TM4，马瑟,繁殖生物学23:243-251,1980)；猴肾细胞(CV1 ATCC CCL 70)；非洲绿猴肾细胞(VERO-76，ATCC CRL-1587)；人类宫颈癌细胞(HELA，ATCC CCL 2)；犬肾细胞(MDCK，ATCC CCL 34)；水牛鼠肝细胞(BRL 3A，ATCC CRL 1442)；人类肺细胞(W138，ATCC CCL 75)；人类肝细胞(Hep G2，HB8065)；小鼠乳房肿瘤(MMT 060562，ATCC CCL51)；TRI细胞(马瑟等人,纽约科学院年报383:44-68(1982))；MRC 5细胞；FS4细胞；和人类肝肿瘤系(Hep G2)。
宿主细胞用用于制造一或多种如本文中揭示的酶的上述表达或克隆载体或用编码一或多种如本文中揭示的酶的多核苷酸转型或转染，并且在适当时被修饰用于诱导启动子、选择转型体或扩增编码所要序列的基因的常规营养培养基中进行培养。
含有编码所揭示的酶的所要核酸序列的宿主细胞可以在多种培养基中进行培养。例如以下的市售培养基适用于培养宿主细胞：Ham's F10(西格玛(Sigma))、最低必需培养基((MEM)，西格玛)、RPMI-1640(西格玛)和达尔伯克氏改良伊格尔培养基((DMEM)，西格玛)。另外，哈姆(Ham)等人,酶学方法58:44,(1979)；巴尔内斯(Barnes)等人,分析生物化学102:255(1980)；美国专利第4,767,704号；第4,657,866号；第4,927,762号；第4,560,655号；或第5,122,469号；WO90103430；WO 87/00195；或美国专利参考第30,985号中所述的培养基中的任一者可以用作宿主细胞的培养基。这些培养基中的任一者可以视需要补充有激素和/或其它生长因子(例如胰岛素、转铁蛋白或表皮生长因子)、盐(例如氯化钠、钙、镁和磷酸盐)、缓冲剂(例如HEPES)、核苷酸(例如腺苷和胸苷)、抗生素(例如GENTAMYCINTM药物)、痕量元素(定义为通常以微摩尔范围的最终浓度存在的无机化合物)和葡萄糖或等效能量来源。任何其它必需补充物也可以按本领域的技术人员已知的适当浓度包括在内。培养条件(例如温度、pH等)是先前在被选择用于表达的宿主细胞的情况下所用的那些，并且将对普通技术人士显而易见。
多核苷酸和编码的酶
编码能够催化酶促转化的酶或其变异体(包括例如如表1-3或图1-3中的任一者中陈列的酶)的任何已知多核苷酸(例如基因)预期用于本发明。所述多核苷酸可以被修饰(例如遗传工程化)以调节(例如增大或减小)编码的酶的底物特异性，或多核苷酸可以被修饰以改变编码的酶的底物特异性(例如编码对一底物具有特异性的酶的多核苷酸可以被修饰以使得酶对一替代性底物具有特异性)。优选的微生物可以包含编码如表1-3和图1-3中的任一者中陈列的酶的多核苷酸。
在一些实施例中，微生物可以包含氧化还原酶，例如羟基戊酰CoA脱氢酶、巴豆酰CoA还原酶(双官能)、巴豆醛脱氢酶、巴豆醇脱氢酶、3,5-酮戊酰CoA脱氢酶或如SEQ ID NO:103-123中陈列的氧化还原酶。在一些实施例中，微生物可以包含转移酶，例如戊烯酰CoA转移酶、戊-2,4-二烯酰CoA转移酶、甲酰CoA转移酶、3-羟基-4-戊烯酰CoA转移酶或如SEQ IDNO:1-28中陈列的转移酶。在一些实施例中，微生物可以包含水解酶，例如戊烯酰CoA水解酶、戊-2,4-二烯酰CoA水解酶、3-羟基-4-戊烯酰CoA水解酶或如SEQ ID NO:29-33中陈列的水解酶。在一些实施例中，微生物可以包含CoA合成酶，例如甲酰CoA合成酶或如SEQ ID NO:34-36中陈列的CoA合成酶。在一些实施例中，微生物可以包含酮硫解酶，例如硫解酶、乙酰CoA:甲酸C-乙酰转移酶、乙酰乙酰CoA硫解酶、3,5-酮戊酰CoA硫解酶或如SEQ ID NO:58-78中陈列的酮硫解酶。在一些实施例中，微生物可以包含脱氢酶，例如戊烯酰CoA脱氢酶、甲酸脱氢酶或如SEQ ID NO:124-139中陈列的脱氢酶。在一些实施例中，微生物可以包含脱水酶，例如羟基戊酰CoA脱水酶、巴豆醇脱水酶、3,5-羟基戊酰CoA脱水酶或如SEQ ID NO:37-55中陈列的脱水酶。在一些实施例中，微生物可以包含异构酶，例如移位C＝C键异构酶或如SEQ ID NO:99-102中陈列的异构酶。在一些实施例中，微生物可以包含脱羧酶，例如2-戊烯酸脱羧酶、4-戊烯酸脱羧酶、戊-2,4-二烯酸脱羧酶、3-羟基-4-戊烯酸脱羧酶或如SEQ IDNO:79-98中陈列的脱羧酶。
图1-3中用于催化转化的酶在表4中由酶学委员会(Enzyme Commission，EC)编号、功能和图1-3中的其催化转化的步骤分类(表4)。
表4：所用酶的EC编号
Figure BDA0002918905670000331
Figure BDA0002918905670000341
图1的步骤D和I以及图3中的步骤C和I可以由EC 2.8.3中的转移酶(包括例如催化CoA部分从一个分子可逆转移到另一分子的转移酶)催化。编码CoA转移酶的任何已知多核苷酸(包括例如下表5中陈列的那些多核苷酸)预期用于本发明。
表5：编码EC 2.8.3中的酶的例示性基因
Figure BDA0002918905670000342
图1的步骤D和I以及图3的步骤I可以由EC 3.1.2中的水解酶(包括例如具有广泛底物范围、能够将2-戊烯酰CoA、2,4-戊烯酰CoA和3-羟基戊烯酰CoA水解为其相应酸的水解酶)催化。编码水解酶的任何已知多核苷酸(包括例如下表6中陈列的那些多核苷酸)预期用于本发明。
表6：编码EC 3.1.2中的酶的例示性基因.
基因 基因ID 生物体 SEQ ID NO:
Orf1 23664428 埃文固氮弧菌(Azoarcus evansii) 29
COG0824 46200680 趋磁磁螺菌(Magnetospirillum magnetotacticum) 30
Jann_0674 89052491 简纳西氏菌种(Jannaschia sp.)CCS1 31
SSE37_24444 126729407 星箭头菌(Sagittula stellata) 32
entH 1786813 大肠杆菌 33
图3中的步骤C可以由EC 6.2.1.中的CoA合成酶(包括例如具有广泛底物范围、能够将甲酸活化为甲酰CoA的CoA合成酶)催化。编码CoA合成酶的任何已知多核苷酸(包括例如下表7中陈列的那些多核苷酸)预期用于本发明。
表7：编码EC 6.2.1中的酶的例示性基因.
基因 基因ID(GI) 生物体 SEQ ID NO:
acs 8434601 巴氏醋杆菌(Acetobacter pasteurianus) 34
Avin_10660 7760010 棕色固氮菌(Azotobacter vinelandii) 35
acs 8657923 脱卤拟球菌种(Dehalococcoides sp.) 36
双键的水合可以由EC 4.2.1中的水合酶催化，并且形成双键的水移除可以由EC4.2.1中的脱水酶催化。水合酶有时是可逆的并且也可以催化脱水。同样，脱水酶有时是可逆的并且也可以催化水合。从既定底物添加或移除水为图1中的步骤C、图2中的步骤D和图3中的步骤H所需。编码水合酶或脱水酶的任何已知多核苷酸(包括例如下表7中陈列的那些多核苷酸)预期用于本发明。
表8：编码EC 4.2.1中的酶的例示性基因.
Figure BDA0002918905670000351
Figure BDA0002918905670000361
来自解芳烃卡斯特兰尼氏菌株65Phen的沉香醇脱水酶-异构酶催化β-香叶烯立体特异性水合为(3S)-沉香醇、(3S)-沉香醇异构化为香叶醇，并且参与单萜β-香叶烯的厌氧降解的初始步骤。另外，此沉香醇脱水酶-异构酶催化逆反应，即香叶醇异构化为沉香醇和沉香醇脱水为香叶烯。在此方面，从香叶醇形成香叶烯可以视为单萜醇的解毒过程。其它脱水酶-异构酶包括4-羟基丁酰CoA脱水酶/乙烯基乙酰CoA-Δ异构酶。脱水酶/异构酶可以通过标准方法工程化以接受巴豆醇作为底物，因此代表适用于以下图2中的这些步骤D的候选物：
表9：可以被工程化为巴豆醇脱水酶的例示性基因.
基因 基因ID 生物体 SEQ ID NO:
ldi 302064203 解芳烃卡斯特兰尼氏菌 56
abdD 1453964 硫磺矿硫化叶菌(Sulfolobus solfataricus) 57
图1的步骤A以及图3的步骤C、D和E需要乙酰CoA或乙酰乙酰CoA与甲酰CoA或丙酰CoA缩合。这种缩合可以用EC 2.3.1中陈列的酮硫解酶催化。然而，编码酮硫解酶的任何已知多核苷酸(包括例如下表10中陈列的那些多核苷酸)预期用于本发明。
表10：编码EC 2.3.1中的酶的例示性基因.
Figure BDA0002918905670000362
Figure BDA0002918905670000371
图1中的步骤E、G和J以及图2中的步骤J可以由如EC类别4.1.1中陈列的脱羧酶催化。众多脱羧酶已经被表征并且展示可使结构上类似的底物脱羧为2-戊烯酸、2,4-戊二烯酸(图1)和3-羟基戊烯酸(图3)。用于图1的步骤J的例示性酶包括如EC 4.1.1.16中陈列的山梨酸脱羧酶和乌头酸脱羧酶。用于图1的步骤G和E的例示性酶可以包括来自咸海鲜球菌属(Jeotgalicoccus)的p450脂肪酸脱羧酶。用于图3的步骤J的例示性酶可以包括如EC4.1.1.33中陈列的那些酶，例如二磷酸甲羟戊酸脱羧酶。然而，编码脱羧酶的任何已知多核苷酸(包括例如下表11中陈列的那些多核苷酸)预期用于本发明。
表11：编码EC 4.1.1中的酶的例示性基因.
Figure BDA0002918905670000372
Figure BDA0002918905670000381
图1的步骤F涉及如EC 5.3.3中陈列的异构酶。用于所述步骤的例示性酶包括异戊烯基-二磷酸Δ异构酶。然而，编码异构酶的任何已知多核苷酸(包括例如下表12中陈列的那些多核苷酸)预期用于本发明。
表12：编码EC 5.3.3中的酶的例示性基因.
基因 基因ID 生物体 SEQ ID NO:
Idi 12930440 大肠杆菌 99
Idi1 855986 酿酒酵母 100
fni 1028286 变异链球菌(Streptococcus mutans) 101
fni 938985 枯草芽孢杆菌 102
图1的步骤B、图2的步骤A、B和C、以及图3的步骤F和G涉及使酮还原为醇并且可以由EC类别1.1.1中的氧化还原酶催化。然而，编码氧化还原酶的任何已知多核苷酸(包括例如下表13中陈列的那些多核苷酸)预期用于本发明。
表13：编码EC 1.1.1中的酶的例示性基因.
Figure BDA0002918905670000382
Figure BDA0002918905670000391
图1的步骤I和图3的步骤A涉及如EC 1.3.1或1.2.99中陈列的脱氢酶。然而，编码脱氢酶的任何已知多核苷酸(包括例如下表14中陈列的那些多核苷酸)预期用于本发明。
表14：编码EC 1.3.1或1.2.99中的酶的例示性基因.
基因 基因ID 生物体 SEQ ID NO:
Msed_1426 5104797 勤奋金属球菌(Metallosphaera sedula) 124
ST0480 1458422 托科达硫化叶菌(Sulfolobus tokodaii) 125
Mcup_0809 10493000 铜绿金属球菌(Metallosphaera cuprina) 126
RBRH_02090 9986550 棒状链霉菌(Streptomyces clavuligerus) 127
RSP_1434 3718801 类球红细菌(Rhodobacter sphaeroides) 128
acrA JN244654.1 丙酸梭菌 129
acrB JN244655 丙酸梭菌 130
Fdh1 2276464 博伊丁假丝酵母(Candida boidinii) 131
Fdh1 854570 酿酒酵母 132
Fdh2 1370568 酿酒酵母 133
fdsC 4248880 钩虫贪铜菌 134
fdsA 4248878 钩虫贪铜菌 135
fdsB 4248879 钩虫贪铜菌 136
fdsD 4248881 钩虫贪铜菌 137
fdsG 4248882 钩虫贪铜菌 138
fdsR 4248883 钩虫贪铜菌 139
制造丁二烯的方法
丁二烯(例如发酵产物)可以通过使一或多种本文中提供的被遗传修饰的微生物与可发酵碳源接触来制造。所述方法优选地可以包含使可发酵碳源与微生物在发酵培养基中接触(包括在充分条件下和持续适合时间段)，所述微生物包含一或多种编码路径中催化可发酵碳源向表1-3或图1-3中提供的中间物中的任一者转化的酶的多核苷酸、和一或多种编码路径中催化表1-3或图1-3中提供的一或多种中间物向丁二烯转化的酶的多核苷酸；和使一或多种编码路径中催化可发酵碳源向表1-3或图1-3中提供的一或多种中间物转化的酶的多核苷酸、和一或多种编码路径中催化表1-3或图1-3中提供的一或多种中间物向丁二烯转化的酶的多核苷酸在微生物中表达，以制造丁二烯。在一些实施例中，可发酵碳源向丁二烯的转化是ATP阳性(例如每分子制造的丁二烯产生净ATP；产生ATP作为副产物)，并且当与NADH消耗路径组合时它可以提供丁二烯制造的厌氧工艺。举例来说，可发酵碳源(例如葡萄糖或果糖)向丁二烯的转化可以每一mol制造的丁二烯产生净的1mol ATP。
例示性可发酵碳源可以包括(但不限于)甘蔗汁、甘蔗糖蜜、水解淀粉、水解木质纤维素材料、葡萄糖、蔗糖、果糖、乳酸酯、乳糖、木糖、丙酮酸酯或甘油，呈其任何形式或混合物形式。在一些实施例中，所述碳源是单糖、寡糖或多糖。
导致制造工业上重要化合物(例如丁二烯)的代谢路径涉及氧化还原(氧还)反应。举例来说，在发酵期间，葡萄糖在一系列酶促反应中氧化为较小分子，伴随有能量释放。释放的电子经由通用电子载体从一个反应转移到另一反应，所述电子载体例如烟酰胺腺嘌呤二核苷酸(NAD)和磷酸烟酰胺腺嘌呤二核苷酸(NAD(P))，其充当氧化还原酶的辅因子。在微生物分解代谢中，葡萄糖由酶使用氧化形式的辅因子(NAD(P)+和/或NAD+)作为辅因子氧化，因此产生呈还原的辅因子形式的还原等效物(NAD(P)H和NADH)。为了使发酵持续，需要氧还平衡的代谢，即辅因子必须通过使微生物细胞代谢化合物还原而再生。在某一实施例中，本文中揭示的新颖路径由于其提供可发酵碳源经由将终点产物再分布以达到氧还平衡的路径向丁二烯的转化而是有利的。
通过一或多种如本文中揭示的被修饰的微生物使可发酵碳源有效发酵的一些关键参数包括：使微生物生长到更大细胞密度的能力、增加的所要产物产率、增加的容积生产率量、移除不期望的共代谢物、改进的对廉价碳和氮源的利用、调适以改变发酵器条件、增加的初级代谢产物产量、增加的次级代谢产物产量、增加的对酸性条件的耐受性、增加的对碱性条件的耐受性、增加的对有机溶剂的耐受性、增加的对高盐条件的耐受性和增加的对高或低温的耐受性。这些参数中的任一者的低效率可能会导致高制造成本、不能捕获或维持市场份额和/或无法使发酵最终产物进入市场。
本发明的方法可能适合于常规发酵生物反应器(例如分批、分批馈入、细胞再循环和连续发酵)。在一些实施例中，如本文中提供的微生物(例如被遗传修饰的微生物)在液体发酵培养基(即浸没培养物)中培养，其导致发酵产物排泄到发酵培养基中。发酵可以在被配置为搅拌槽、泡罩塔、气提反应器或本领域中已知的任何其它适合配置的生物反应器中进行。在一个实施例中，发酵最终产物可以使用本领域中已知的任何适合方法从发酵培养基分离。
在一些实施例中，发酵产物的形成可以在微生物的初始快速生长时期期间发生。在一个实施例中，发酵产物的形成可以在培养被维持在缓慢生长或非生长状态的第二时期期间发生。在一个实施例中，发酵产物的形成可以在微生物的一个以上生长时期期间发生。在所述实施例中，每单位时间形成的发酵产物的量一般来说随微生物的代谢活性、生理培养条件(例如pH、温度、培养基组成)和发酵工艺中存在的微生物的量而变化。
在一些实施例中，将发酵产物以分泌的代谢物形式从周质或培养基回收。在一个实施例中，例如当微生物缺乏对应于发酵产物的分泌信号时，将发酵产物从微生物萃取。在一个实施例中，使微生物破裂，并且将培养基或溶解物离心以移除微粒细胞碎片。然后可以在必要时分离膜和可溶性蛋白质部分。然后可以将所关注的发酵产物通过例如蒸馏、分馏、色谱、沉淀、过滤等由剩余上清液溶液或悬浮液纯化。在一个实施例中，将发酵产物通过以下中的一或多者萃取：蒸馏、反应性蒸馏、共沸蒸馏和萃取蒸馏。
本发明的方法优选地在厌氧条件下进行。产物的还原程度以及其合成的ATP需求两者确定了制造工艺能够好氧地还是厌氧地进行。为了经由厌氧微生物转化或至少通过使用氧消耗减少的工艺制造丁二烯，应避免氧还不平衡。几种类型的代谢转化步骤涉及氧还反应，包括如表1-3或图1-3中陈列的一些转化。所述氧还反应涉及由氧还辅因子(例如NADH、NADPH和铁氧还蛋白)的参与介导的电子转移。因为细胞中的氧还辅因子的量限于允许代谢过程持续，所以辅因子必须进行再生。为了避免所述氧还不平衡，可以使辅因子再生的替代性方法工程化，并且在一些情况下，可以提供其它的ATP产生来源。或者，氧化与还原过程可以在生物电化学系统中空间分离(拉贝(Rabaey)和罗森达尔(Rozendal),2010,自然综述：微生物学(Nature reviews,Microbiology),第8卷:706-716)。
在一些实施例中，可以通过使用氧化程度更大或还原程度更大的底物(例如可发酵碳源)来避免氧还不平衡。举例来说，如果利用一底物导致电子不足或过剩，那么可以分别通过使用还原或氧化程度更大的底物规避对氧的需求。举例来说，是生物柴油制造的主要副产物的甘油比糖的还原程度更大，并且因此更适用于合成其从糖的制造导致辅因子氧化的化合物(例如琥珀酸)。在一些实施例中，如果底物向产物的转化导致电子不足，那么可以添加充当电子供体的共底物(巴别塔(Babel)2009,生命科学工程学(Eng.Life Sci.)9,285-290)。厌氧使用共底物的重要准则在于其氧还电势高于NADH的氧还电势(吉尔特曼(Geertman)等人,2006,欧洲微生物学会联合会酵母研究(FEMS Yeast Res.)6,1193-1203)。如果底物向产物的转化导致电子过剩，那么可以添加充当电子受体的共底物。
从丁二烯制造聚丁二烯和其它化合物的方法
丁二烯在室温下或在发酵条件(20-45℃)下是气态的，并且其从发酵工艺的制造产生可能会聚结在发酵槽的顶部空间并且被虹吸和浓缩的气体。丁二烯可以通过溶剂萃取、低温工艺、蒸馏、分馏、色谱、沉淀、过滤等从气体(包括气态醇、CO2和其它化合物)的发酵纯化。
经由本文中揭示的工艺或方法中的任一者制造的丁二烯可以转化为聚丁二烯。或者，经由本文中揭示的方法制造的丁二烯可以与其它烯烃聚合以形成共聚物，例如丙烯腈-丁二烯-苯乙烯(ABS)、丙烯腈-丁二烯(ABR)或苯乙烯-丁二烯(SBR)共聚物、BR丁基橡胶(RB)、聚丁二烯橡胶(PBR)、丁腈橡胶和聚氯丁烯(氯丁橡胶(Neoprene))。那些合成橡胶或塑料弹性体应用包括制造轮胎、塑料材料、鞋底、鞋跟、技术物品、家庭用具、氯丁橡胶、纸张涂料、手套、密封垫和密封件。
在无进一步描述的情况下，据信本领域的普通技术人员可以使用以上描述和以下说明性实例制造和利用本发明的试剂并且实践所主张的方法。提供以下工作实例以促进本发明的实践，并且不应理解为以任何方式限制本发明的剩余部分。
实例
实例1：修饰微生物用于制造丁二烯.
微生物(例如细菌)可以被遗传修饰以从可发酵碳源(包括例如葡萄糖)制造丁二烯。
在一例示性方法中，微生物可以通过本领域中已知的任何方法遗传工程化以包含：i.)一或多种编码路径中催化可发酵碳源向乙酰CoA和丙酰CoA转化的酶的多核苷酸，和/或一或多种编码路径中催化乙酰CoA和丙酰CoA向丁二烯转化的酶的多核苷酸；ii.)一或多种编码路径中催化可发酵碳源向巴豆酰CoA转化的酶的多核苷酸，和/或一或多种编码路径中催化巴豆酰CoA向丁二烯转化的酶的多核苷酸；或iii.)一或多种编码路径中催化可发酵碳源向甲酸转化的酶的多核苷酸，和/或一或多种编码路径中催化甲酸向丁二烯转化的酶的多核苷酸。
或者，缺乏一或多种使可发酵碳源向丁二烯转化的酶(例如一或多种催化活性的功能酶)的微生物可以被遗传修饰以包含一或多种编码微生物缺乏的路径中催化可发酵碳源向丁二烯转化的酶(例如功能酶，包括例如本文中揭示的任何酶)的多核苷酸。
实例2：通过被遗传修饰的微生物使碳源发酵以制造丁二烯.
如以上实例1中制造的被遗传修饰的微生物可以用以使碳源发酵以制造丁二烯。
在一例示性方法中，将包含可发酵碳源(例如9g/L葡萄糖，1g/L KH2PO4，2g/L(NH4)2HPO4，5mg/L FeSO4·7H2O，10mg/L MgSO4·7H2O，2.5mg/L MnSO4·H2O，10mg/LCaCl2·6H2O，10mg/L CoCl2·6H2O，和10g/L酵母提取物)的预先灭菌的培养基馈入生物反应器中。
在发酵期间，通过例如喷射氮气到培养基来维持厌氧条件。使用本领域中已知的任何方法维持适用于发酵的温度(例如约30℃)。通过例如自动添加氢氧化钠维持近似生理pH(例如约6.5)。在例如约50rpm下搅拌生物反应器。使发酵运行到完成。
然后使用常规方法从培养基回收制造的丁二烯。当通过蒸馏回收发酵产物时，可以任选地使丁二烯馏份聚合以形成聚丁二烯。可以使含有其它沿着丁二烯路径的中间物(如果有的话)的蒸馏馏份在生物反应器中进行后续发酵以制造额外丁二烯。
除非另外说明，否则本说明书和权利要求书中所用的表示成分量、例如分子量的性质、反应条件等的所有数字都应理解为在所有情况下都由术语“约”修饰。因此，除非与此相反地指示，否则本说明书和所附权利要求书中陈列的数值参数是近似值，其可以取决于试图通过本发明获得的所要性质而改变。最低限度并且并非试图限制权利要求书范围的等效物原则的应用地，至少应根据所报道有效数字的数值和通过应用普通舍入技术来理解每个数值参数。
尽管陈列本发明的广泛范围的数值范围和参数是近似值，但尽可能精确地报道具体实例中所陈列的数值。然而，任何数值固有地含有某些必然由其各别测试测量中所见的标准偏差产生的误差。
除非本文中另外说明或上下文明确矛盾，否则在描述本发明的情形下(尤其在以下权利要求书的情形下)所用的术语“一个/种(a/an)”、“所述(the)”和类似指示物应视为涵盖单数和复数两者。本文中值的范围的叙述仅旨在充当个别地提及处于所述范围内的每个单独值的简写方法。除非本文中另外说明，否则每个个别格并入本说明书中，如同它在本文中个别地叙述一般。除非本文中另外说明或上下文明确矛盾，否则本文中描述的所有方法都可以按任何适合次序进行。使用本文中提供的任何和所有实例或例示性语言(例如“例如”)仅旨在较佳地说明本发明，并且不对另外主张的本发明的范围造成限制。本说明书中没有语言应视为指示实践本发明所必需的任何未主张要素。
本文中揭示的本发明的替代性要素或实施例的分组不应视为限制性。每个群组成员可以个别地或以与其它群组成员或本文中存在的其它要素的任何组合形式来提及和主张。预期出于便利性和/或专利性原因，可以将一或多个群组成员包括在一群组中或从一群组删去。当出现任何所述包括或删除时，将本说明书视为含有如修饰由此满足随附权利要求书中所用的所有马库西(Markush)群组的书面描述的群组。
本文中描述本发明的某些实施例，包括本发明人已知用于实现本发明的最佳方式。当然，对这些描述的实施例的改变对于本领域的普通技术人员来说在阅读以上描述后将变得显而易见。本发明人期望技术人士适当时使用所述改变，并且本发明人预期本发明与本文中具体描述不同地实践。因此，本发明包括随附于其的权利要求书中叙述的主题的如由适用法律准许的所有修改和等效物。此外，除非本文中另外说明或上下文明确矛盾，否则上述要素呈其所有可能变化形式的任何组合由本发明涵盖。
本文中揭示的具体实施例可以在权利要求书中使用由……组成和基本上由……组成语言来进一步限制。当用于权利要求书中时，无论是在申请时还是根据修正添加，过渡术语“由……组成”都排除权利要求书中未规定的任何要素、步骤或成分。过渡术语“基本上由……组成”将权利要求书的范围限制于规定的物质或步骤和不会本质上影响基础和新颖特征的那些。如此主张的本发明的实施例在本文中固有或明确地描述并且能够实现。
应理解，本文中揭示的本发明的实施例说明了本发明的原理。可以使用的其它修改在本发明的范围内。因此，举例来说(但非限制性地)，可以根据本文中的教示使用本发明的替代性配置。因此，本发明不限于如精确展示和描述者。
虽然本发明已经在本文中通过参考各种具体物质、程序和实例进行描述和说明，但应理解，本发明不局限于选择用于那个目的的物质和程序的具体组合。如本领域的技术人员将了解，可能意味着所述细节的众多改变。希望说明书和实例仅视为例示性，本发明的真实范围和精神由以下权利要求书指示。本申请案中提及的所有参考文献、专利和专利申请案都以全文引用的方式并入本文中。
序列表
<110> 布拉斯科南美公司
<120> 经修饰的微生物和使用其制造丁二烯的方法
<130> 0812275.00323
<160> 139
<170> PatentIn version 3.5
<210> 1
<211> 651
<212> DNA
<213> 大肠杆菌K12
<400> 1
atggatgcga aacaacgtat tgcgcgccgt gtggcgcaag agcttcgtga tggtgacatc 60
gttaacttag ggatcggttt acccacaatg gtcgccaatt atttaccgga gggtattcat 120
atcactctgc aatcggaaaa cggcttcctc ggtttaggcc cggtcacgac agcgcatcca 180
gatctggtga acgctggcgg gcaaccgtgc ggtgttttac ccggtgcagc catgtttgat 240
agcgccatgt catttgcgct aatccgtggc ggtcatattg atgcctgcgt gctcggcggt 300
ttgcaagtag acgaagaagc aaacctcgcg aactgggtag tgcctgggaa aatggtgccc 360
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atgtggctca ccgaaattgc cgacgggtgt gatttagcca ccgtgcgtgc caaaacagaa 600
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<210> 2
<211> 663
<212> DNA
<213> 大肠杆菌K12
<400> 2
atgaaaacaa aattgatgac attacaagac gccaccggct tctttcgtga cggcatgacc 60
atcatggtgg gcggatttat ggggattggc actccatccc gcctggttga agcattactg 120
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tggctgctcg aacgcccact gcgcgccgac ctggcgctaa ttcgcgctca tcgttgcgac 480
acacttggca acctgaccta tcaacttagc gcccgcaact ttaaccccct gatagccctt 540
gcggctgata tcacgctggt agagccagat gaactggtcg aaaccggcga gctgcaacct 600
gaccatattg tcacccctgg tgccgttatc gaccacatca tcgtttcaca ggagagcaaa 660
taa 663
<210> 3
<211> 1509
<212> DNA
<213> 谷氨酸棒杆菌ATCC 13032
<400> 3
atgtctgatc gcattgcttc agaaaagctg cgctccaagc tcatgtccgc cgacgaggcg 60
gcacagtttg ttaaccacgg tgacaaggtt ggtttctccg gcttcaccgg cgctggctac 120
ccaaaggcac tgcctacggc aatcgctaac cgggctaaag aagcacacgg tgcaggcaac 180
gactacgcaa tcgacctgtt cactggcgca tcgaccgccc ctgactgcga tggcgtactt 240
gcagaagctg acgctatccg ctggcgcatg ccatacgcat ctgatccaat catgcgtaac 300
aagatcaact ccggctccat gggatactcc gatatccacc tgtcccactc cggccagcag 360
gttgaagagg gcttcttcgg ccagctcaac gtagctgtca ttgaaatcac ccgcatcact 420
gaagagggct acatcatccc ttcttcctcc gtgggtaaca acgttgagtg gctcaacgct 480
gcagagaagg tcatcctcga ggttaactct tggcagtctg aagacctcga aggtatgcac 540
gacatctggt ctgttcctgc cctgccaaac cgcattgccg tgccaatcaa caagccaggc 600
gaccgcatcg gtaagaccta catcgagttc gacaccgaca aggttgttgc tgttgttgag 660
accaacaccg cagaccgcaa cgcaccattc aagcctgtcg acgacatctc taagaagatc 720
gctggcaact tcctcgactt cctggaaagc gaagttgctg caggtcgcct gtcctacgac 780
ggctacatca tgcagtccgg cgtgggcaac gtgccaaacg cggtgatggc aggcctgctg 840
gaatccaagt ttgagaacat ccaggcctac accgaagtta tccaggacgg catggtggac 900
ctcatcgacg ccggcaagat gaccgttgca tccgcaactt ccttctccct gtctcctgag 960
tacgcagaga agatgaacaa cgaggctaag cgttaccgcg agtccattat cctgcgccca 1020
cagcagatct ctaaccaccc agaggtcatc cgccgcgttg gcctgatcgc caccaacggt 1080
ctcatcgagg ctgacattta cggcaacgtc aactccacca acgtttctgg ctcccgcgtc 1140
atgaacggca tcggcggctc cggcgacttc acccgtaacg gctacatctc cagcttcatc 1200
accccttcag aggcaaaggg cggcgcaatc tctgcgatcg ttcctttcgc atcccacatc 1260
gaccacaccg agcacgatgt catggttgtt atctctgagt acggttacgc agaccttcgt 1320
ggtctggctc cacgtgagcg cgttgccaag atgatcggcc tggctcaccc tgattaccgc 1380
ccactgctcg aggagtacta cgctcgcgca acctccggtg acaacaagta catgcagacc 1440
cctcatgatc ttgcaaccgc gtttgatttc cacatcaacc tggctaagaa cggctccatg 1500
aaggcataa 1509
<210> 4
<211> 378
<212> DNA
<213> 谷氨酸棒杆菌ATCC 13032
<400> 4
atgaatggta tcggcggctc gggcgatttc acgcgtaacg cctttgcttc cacatttatc 60
tctccctcgg cagccaaagt tgatgcgatt tccgcgattg tgcctttcgc gtcccatatc 120
gatcacacgg aacatgatgc gatggttgtc attactgaat atggctacgc agacctgcgc 180
gggctatcgc caaaacaacg agtccccaaa atgattgcca tcgcccaccc ggactatcga 240
ccactgctgg aagcatactt tgaccgggcg ctgaacagtg ctgattccta tcagcacacc 300
ctgcatgatc tgcgcaccgc cttcgatttc cataatcgct tgaactcaca aggaaccatg 360
aaaatcgaaa aagcatag 378
<210> 5
<211> 657
<212> DNA
<213> 丙酮丁醇梭菌
<400> 5
atgaactcta aaataattag atttgaaaat ttaaggtcat tctttaaaga tgggatgaca 60
attatgattg gaggtttttt aaactgtggc actccaacca aattaattga ttttttagtt 120
aatttaaata taaagaattt aacgattata agtaatgata catgttatcc taatacaggt 180
attggtaagt taatatcaaa taatcaagta aaaaagctta ttgcttcata tataggcagc 240
aacccagata ctggcaaaaa actttttaat aatgaacttg aagtagagct ctctccccaa 300
ggaactctag tggaaagaat acgtgcaggc ggatctggct taggtggtgt actaactaaa 360
acaggtttag gaactttgat tgaaaaagga aagaaaaaaa tatctataaa tggaacggaa 420
tatttgttag agctacctct tacagccgat gtagcattaa ttaaaggtag tattgtagat 480
gaggccggaa acaccttcta taaaggtact actaaaaact ttaatcccta tatggcaatg 540
gcagctaaaa ccgtaatagt tgaagctgaa aatttagtta gctgtgaaaa actagaaaag 600
gaaaaagcaa tgacccccgg agttcttata aattatatag taaaggagcc tgcataa 657
<210> 6
<211> 666
<212> DNA
<213> 丙酮丁醇梭菌
<400> 6
atgattaatg ataaaaacct agcgaaagaa ataatagcca aaagagttgc aagagaatta 60
aaaaatggtc aacttgtaaa cttaggtgta ggtcttccta ccatggttgc agattatata 120
ccaaaaaatt tcaaaattac tttccaatca gaaaacggaa tagttggaat gggcgctagt 180
cctaaaataa atgaggcaga taaagatgta gtaaatgcag gaggagacta tacaacagta 240
cttcctgacg gcacattttt cgatagctca gtttcgtttt cactaatccg tggtggtcac 300
gtagatgtta ctgttttagg ggctctccag gtagatgaaa agggtaatat agccaattgg 360
attgttcctg gaaaaatgct ctctggtatg ggtggagcta tggatttagt aaatggagct 420
aagaaagtaa taattgcaat gagacataca aataaaggtc aacctaaaat tttaaaaaaa 480
tgtacacttc ccctcacggc aaagtctcaa gcaaatctaa ttgtaacaga acttggagta 540
attgaggtta ttaatgatgg tttacttctc actgaaatta ataaaaacac aaccattgat 600
gaaataaggt ctttaactgc tgcagattta ctcatatcca atgaacttag acccatggct 660
gtttag 666
<210> 7
<211> 1753
<212> DNA
<213> 罗斯氏菌种A2-183
<400> 7
agaaatctgc tacgaactgg gaacctattt tgtgggacag cgcgactacg cggaagcggt 60
tctctggttc tacaatgccg cctatgagac ggaaagcatc ctggacgttc acacaagcgg 120
ggatcttccg ctgctcggtc ttgtcgaatg ttacgagacg ctcctcgccg gggaggaagc 180
caaaattcct tccgacacag cgcttaccat ccagtacgaa atgatgctcg acaaataccg 240
ggaggcttcc agagactggc ggatgccgga ggagacctga tcttacaaat ctccggaaat 300
acgctccggc agggcttgta aaatacgaca taaagtgata ggatgaaact atggtaaaat 360
tttaacaatc ttttgtgtgg gaggtatttg agatggattt tcgtgaagaa tacaaacaga 420
agcttgtctc cgcagatgag gcggtaaagc tcatcaaatc cggagactgg gtagattacg 480
gctggtgcac caacaccgtt gacgcactgg atcaggctct cgcaaagcgc accgacgaac 540
tgacagacgt caagctgcgc ggcggtatcc tgatgaagcc gctggctgtt tttgcacgtg 600
aggatgcagg tgagcatttc tgctggaact cctggcatat gtccggtatc gagcgcaaga 660
tgataaacag aggcgtggct tactactgtc cgatccgcta ctccgagctg ccgcgctact 720
accgcgagct tgactgcccg gatgacgttg ccatgttcca ggttgctccg atggatgcgc 780
acggctactt taacttcggt ccgagtgcct cacatctggg tgcaatgtgc gagcgcgcaa 840
agcacatcat cgtagaagtc aatgaaaata tgccacgctg cctcggcggt accgagtgtg 900
gcatccacat ttccgatgtc acctacatcg tggaaggctc caacccgcca atcggtgaac 960
tgggtgcagg cggtcctgct acagatgtgg ataaggctgt cgcaaagctg atcgtcgatg 1020
agattccgaa cggtgcctgc ttacagctcg gtatcggcgg catgccaaac gctgtcggtt 1080
ccctgattgc agagtccgac ttgaaggatc tcggcgttca cactgagatg tacgtggatg 1140
catttgtcga tattgcaaag gcaggtaaga tcaacggttc caaaaagaat atcgaccgtt 1200
accgccagac ctacgctttc ggcgccggca ccaagaaaat gtacgattat ctggacgaca 1260
acccggaact gatgagcgct ccggtcgact acacgaacga catccgctcg atctccgcac 1320
tggataactt tatttccatc aacaatgccg tggatattga tctctatggt caggtaaatg 1380
cagagtctgc aggcatcaag cagatcagcg gcgcaggcgg acagcttgac ttcgtgctcg 1440
gagcttatct gtccaagggc ggcaagagct ttatctgctt atcctctacc ttcaagacca 1500
aggacggtca ggtgcagtcc cgtatccgcc cgacgctggc aaacggttcc atcgttaccg 1560
acgcaagacc gaatacacac tatgttgtaa ccgaatacgg caaggtgaac ttaaagggtc 1620
tgtctacctg gcagagagcc gaggctctga tctcgatcgc gcatcccgat ttccgcgacg 1680
acctcatcaa agaggcggag cagatgcaca tctggagaag aagcaaccgc tagtaccgga 1740
ggacgactga cgg 1753
<210> 8
<211> 1000
<212> DNA
<213> 丙酸梭菌
<400> 8
gaattcaaaa ttgctatcgt tgatgacgat ttggctcagg aatccagaca gattcgtgtt 60
gacgttctgg atggcgaagg tggccctctt tatagaatgg caaaagcttg gcagcaaatg 120
tacggttgct ctcttgcaac tgatacaaag aaaggccgcg gcagaatgct gatcaacaag 180
acaattcaga caggtgcaga tgctatcgtt gttgcgatga tgaaattctg tgatcctgaa 240
gaatgggatt accctgtaat gtacagagaa tttgaagaaa aaggcgttaa gagtctgatg 300
atcgaagttg atcaggaagt ttcttccttc gaacagatca agacaagact gcagtctttc 360
gtagaaatgc tgtaatttga acaatcgttt gctgaaaaac tgtacactgg ggtgggtgac 420
tgctccagtg tattgtaata agcaaataag caaaaatcga taagatttag gaggattttc 480
gacaatgaga aaggttccca ttattaccgc agatgaggct gcaaagctta ttaaagacgg 540
tgatacagtt acaacaagtg gtttcgttgg aaatgcaatc cctgaggctc ttgatagagc 600
tgtagaaaaa agattcttag aaacaggcga acccaaaaac attacatatg tttattgtgg 660
ttctcaaggt aacagagacg gaagaggtgc tgagcacttt gctcatgaag gccttttaaa 720
acgttacatc gctggtcact gggctacagt tcctgctttg ggtaaaatgg ctatggaaaa 780
taaaatggaa gcatataatg tatctcaggg tgcattgtgt catttgttcc gtgatatagc 840
ttctcataag ccaggcgtat ttacaaaggt aggtatcggt actttcattg accccagaaa 900
tggcggcggt aaagtaaatg atattaccaa agaagatatt gttgaattgg tagagattaa 960
gggtcaggaa tatttattct accctgcttt tcctattcat 1000
<210> 9
<211> 1554
<212> DNA
<213> 拜氏梭菌
<400> 9
gtgagaaaag taaaagtttt aacaagtcgc gaagcagtac aaatagtgaa ggatggagat 60
gtgttagtaa ctggcggatt tgttggtagt tgtgcacctg aaactcttag ttgtgcttta 120
gaaaaacgtt tcattgaaac aaatcatccg caaaatataa ctttatttca tgcagcagga 180
caaggcgata gtaaggggaa aggttcagat cattatgccc acgaaggctt acttaagaga 240
gtggttgcag gtcattataa tttagcaccg aaaattggaa agttaattaa tgaaaataaa 300
atagaagctt ataatctacc acaagggaca atttctcaat tatttagaga tattgcggga 360
aaaagaattg ggacaataac tcacgttgga ttgaatacat ttgtggatcc aagaattagt 420
ggtggaaaat taaatgaaaa aacaaaagaa gatctagtaa agctaataaa tatagaaggt 480
gaagaaaaat tattatacaa atcaattcca gttaatgtct gcttcttaag aggatctttt 540
gcagatgaat acggtaatgt atcattagaa aaagaaatag ctacacttga ggatacgtca 600
atagcccaag cttgtaagaa taatggcgga aaagtaatag ttcaagtaga aaaagtagtt 660
gaagcaggat ctttagaccc acgtcttata aaaattccag gtatatatgt agatgcggtt 720
gtaatctcaa ctcccgaaga gcatgaacaa tccttcgaat gcccatttaa tccagcagta 780
acaggtgaaa tgagaattcc attaaacagt gtagaaaaag ctccattaaa tgagagaaag 840
ataattgcga gaagagcagc tatggaatta aagaaagata cggtagtaaa tttaggtata 900
gggataccag aagttatttc tttagttgcg aatgaagaag gaattggtga atatatgaca 960
ttaactgtag aagccggtcc aataggaggt ataccacaag gatgcacagc ttttggagcg 1020
agtataaatc cagaagctat tatagatcag ccatatcaat ttgattttta tgatggtgga 1080
ggcgtcgata tagcattttt aggactagct caggttgatg aacatggaaa tttgaatgta 1140
agtaagtttg ggcctagaat tgctggatgt ggtggattca taaatataac tcaaaatgct 1200
aagaaagtgt tattttgtgg aacattcact gcaggaggct taaaagtagt aacaggagat 1260
ggcaaattag aaattaaaca agaaggaaaa gctaaaaaat tcattaagga tgtagagcaa 1320
attacattta gtggagatta tgcaagaagg atggatcaac aagttatgta tataactgag 1380
agagcagtat ttgagttaag gaaagatgga ttatacctta cagaaatagc gcctgggata 1440
gatctaaaaa aggatgtatt ggatttaatg gatttcaaac ctaaaatgga tggagtacct 1500
agactaatga atggaagaat attttatgat aagttgatgg gattaaggga gtaa 1554
<210> 10
<211> 687
<212> DNA
<213> 不动杆菌种ADP1
<400> 10
atgatagata aaagtgcagc gaccctaacg gaagcgctct cccagatcca cgacggtgcc 60
accatcctga ttggtggttt tggaacagcc ggccaacccg ccgagctgat tgacggactg 120
attgaactag gtcgcaagaa cctaaccatc gtcagcaaca acgccggcaa tggagactat 180
ggactggcca agctgctaaa aactggcgcc gtcaaaaaga tcatctgttc cttcccacgt 240
caggccgact cctacgtatt tgacgagcta taccgtgcgg gcaaaattga acttgaaatc 300
gtgccgcagg gcaatctggc ctgtcgtata caggccgccg gcatggggct ggggccgatc 360
tacaccccaa ccggttttgg cactttactc gcagaaggta aacctaccct gaactttgat 420
ggcaaagact acgtactgga aaacccgatc aaggccgact ttgccctgat caaagcctac 480
aagggcgacc gctggggcaa tctggtctat cgcaaatcag cacgaaactt cggcccgatc 540
atggccatgg ccgccaacgt gaccatcgca caagtgagcg aagtggtggc actaggagaa 600
ctcgacccgg aaaacgtggt gaccccaggc atctttgttc aacacgttgt accagtccaa 660
tctaccccag caagcgctgc accataa 687
<210> 11
<211> 654
<212> DNA
<213> 不动杆菌种ADP1
<400> 11
atgagttatc acaaactgac ccgtgaccag atcgcccagc gcgttgccca agacattccg 60
gaaggctcct atgtcaatct tggcattggc ctgccgacca agattgccag ctatctgcct 120
gccgacaaag acgtatttct acattcagaa aacggactgc tggcctttgg cccaccacca 180
gcggccggcg aagaagatcc ggaactgatc aacgcaggca aagaatacgt aaccatgctc 240
gaaggcggtt gcttctttca ccatggcgac tccttcgcca tgatgcgcgg tggacatctg 300
gatatctgcg tattaggcgc attccagatc gccgccaatg gagacctggc caactggcac 360
accggtgcac cggatgccat accgtcggtc ggtggagcca tggatcttgc ggttggggca 420
aaaaaagttt ttgtaaccac cgatcatgtc accaaaaaag gtgagccgaa gattgtagct 480
gaactgacgt atccagccac gggtcagaaa tgtgtcgacc ggatctacac cgacctgtgc 540
atcatcgatg tggtgccaga aggactgaaa gtgatcgaga aagtcgaagg cttaagcttt 600
gaagaactac aacgcctgac cggtgcaaca ctgatcgatg cgacacaagg ctaa 654
<210> 12
<211> 696
<212> DNA
<213> 恶臭假单胞菌
<400> 12
ttgatcaata aaacgtacga gtccatcgcc agcgcggtgg aagggattac cgacggttcg 60
accatcatgg tcggtggctt cggcacggct ggcatgccgt ccgagctgat cgatggcctc 120
attgccaccg gtgcccgcga cctgaccatc atcagcaaca acgccggcaa cggcgagatc 180
ggcctggccg ccctgctcat ggcaggcagc gtgcgcaagg tggtctgctc gttcccgcgc 240
cagtccgact cctacgtgtt cgacgaactg taccgcgccg gcaagatcga gctggaagtg 300
gtcccgcagg gcaacctggc cgagcgtatc cgcgccgcag gctccggcat tggtgcgttc 360
ttctcgccaa ccggctacgg caccctgctg gccgagggca aggaaacccg tgagatcgat 420
ggccgcatgt acgtgctgga aatgccgctg cacgccgact tcgcactgat caaggcgcac 480
aagggtgacc gttggggcaa cctgacctac cgcaaggccg cccgcaactt cggcccgatc 540
atggccatgg ctgccaagac cgccatcgcc caggtcgacc aggtcgtcga actcggtgaa 600
ctggacccgg aacacatcat caccccgggt atcttcgtcc agcgcgtggt cgccgtcacc 660
ggtgctgccg cttcttcgat tgccaaagct gtctga 696
<210> 13
<211> 642
<212> DNA
<213> 恶臭假单胞菌
<400> 13
atgaccatca ccaaaaagct ctcccgcacc gagatggccc aacgcgtggc cgcagacatc 60
caggaaggcg cgtatgtaaa cctgggtatc ggcgcaccaa ccctggtggc caactacctg 120
ggcgacaagg aagtgttcct gcacagcgaa aacggcctgc tgggcatggg cccaagccct 180
gcgccgggcg aggaagacga tgacctgatc aacgccggca agcagcacgt caccctgctg 240
accggtggtg ccttcttcca ccatgccgat tcgttctcga tgatgcgtgg cggccacctg 300
gacatcgccg tactgggtgc cttccaggtg tcggtcaagg gcgacctggc caactggcac 360
acgggtgccg aaggttcgat cccggccgta ggcggcgcaa tggacctggc caccggcgcc 420
cgccaggtgt tcgtgatgat ggaccacctg accaagaccg gcgaaagcaa gctggtgccc 480
gagtgcacct acccgctgac cggtatcgcg tgcgtcagcc gcatctacac cgacctggcc 540
gtgctggaag tgacaccgga agggctgaaa gtggtcgaaa tctgcgcgga catcgacttt 600
gacgaactgc agaaactcag tggcgtgccg ctgatcaagt aa 642
<210> 14
<211> 717
<212> DNA
<213> 枯草芽孢杆菌
<400> 14
atgggaaaag tgctgtcatc aagcaaggaa gctgcgaaac tgattcatga tggggatacg 60
ctgatcgcgg gagggtttgg gctgtgcggc atccctgaac agctcatttt gtctataaga 120
gatcagggag taaaggattt aaccgttgtc agcaataact gcggagtcga tgactggggg 180
cttggtttgc ttctggctaa caagcaaatc aagaaaatga tcgcttccta tgtcggtgaa 240
aataaaattt ttgagcggca gtttttaagc ggagagcttg aggtagagct tgttccccaa 300
ggaacgctcg ctgagagaat tcgtgcaggc ggtgcaggca taccgggatt ttatacggcg 360
acaggcgtcg gcacctccat agccgaggga aaagaacata aaacattcgg cggccggact 420
tatgtgctgg agcgaggcat taccggcgat gtggcgatcg tcaaagcgtg gaaagcggac 480
accatgggca atttgatttt taggaaaacg gcgagaaatt tcaatcccat tgccgccatg 540
gcaggcaaga tcacgattgc cgaggcggaa gaaatcgtgg aagcaggaga gctcgatcca 600
gatcacatcc atacgccggg aatttacgta cagcatgtcg tgcttggcgc gagccaagaa 660
aaacggattg aaaaacgaac agttcagcaa gcatcgggaa agggtgaggc caagtga 717
<210> 15
<211> 651
<212> DNA
<213> 枯草芽孢杆菌
<400> 15
gtgaaggaag cgagaaaacg aatggtcaaa cgggctgtac aagaaatcaa ggacggcatg 60
aatgtgaatc tcgggattgg aatgccgacg cttgtcgcaa atgagatacc cgatggcgtt 120
cacgtcatgc ttcagtcgga aaacggcttg ctcggaattg gcccctatcc tctggaagga 180
acggaagacg cggatttgat caatgcggga aaggaaacga tcactgaagt gacaggcgcc 240
tcttattttg acagcgctga gtcattcgcg atgataagag gcgggcatat cgatttagct 300
attctcggcg gaatggaggt ttcggagcag ggggatttgg ccaattggat gatcccgggc 360
aaaatggtaa aagggatggg cggcgccatg gatctcgtca acggggcgaa acgaatcgtt 420
gtcatcatgg agcacgtcaa taagcatggt gaatcaaagg tgaaaaaaac atgctccctt 480
ccgctgacag gccagaaagt cgtacacagg ctgattacgg atttggctgt atttgatttt 540
gtgaacggcc gcatgacact gacggagctt caggatggtg tcacaattga agaggtttat 600
gaaaaaacag aagctgattt cgctgtaagc cagtctgtac tcaattctta a 651
<210> 16
<211> 1617
<212> DNA
<213> 克氏梭菌
<400> 16
atgagtaaag ggataaagaa ttcacaattg aaaaaaaaga atgtaaaggc tagtaatgtg 60
gcagaaaaga ttgaagagaa agttgaaaaa acagataagg ttgttgaaaa ggcagctgag 120
gttacagaaa aacgaattag aaacttgaag cttcaggaaa aagttgtaac agcagatgtg 180
gcagctgata tgatagaaaa cggtatgatt gttgcaatta gcggatttac tccttccggg 240
tatcctaaag aagtacctaa agcattgact aaaaaagtta atgccttaga ggaagaattc 300
aaggtaacac tttatacagg ttcatctaca ggagccgata tagacggaga atgggcaaaa 360
gcaggaataa tagaaagaag aattccatat cagacaaatt ctgatatgag gaaaaaaata 420
aatgatggtt ctattaagta tgctgatatg catttaagcc atatggctca atatattaat 480
tattctgtaa ttcctaaagt agatatagct ataatagagg cagtagctat tacagaagaa 540
ggggatatta ttccttcaac aggaattgga aatacagcta cttttgtgga aaatgcagat 600
aaggtaatag tggaaattaa tgaggctcaa ccgcttgaat tggaaggtat ggcagatata 660
tatacattaa aaaaccctcc aagaagagag cccataccta tagttaatgc aggcaatagg 720
atagggacca catatgtgac ctgtggttct gaaaaaatat gcgctatagt gatgacaaat 780
acccaggata aaacaagacc tcttacagaa gtgtctcctg tatctcaggc tatatccgat 840
aatcttatag gatttttaaa taaagaggtt gaagagggaa aattacctaa gaacctgctt 900
cctatacagt caggagttgg aagtgtagca aatgcagttt tggccggact ttgtgaatca 960
aattttaaaa atttgagttg ttatacagaa gttatacagg attctatgct gaagcttata 1020
aaatgtggta aagcagatgt ggtgtcaggc acttccataa gtccttcacc ggagatgttg 1080
cctgagttca taaaggacat aaatttcttt agagaaaaga tagtattaag accacaggaa 1140
ataagtaata atccagagat agcaagaaga ataggagtta tatccataaa cactgctttg 1200
gaagtagata tatatggtaa tgtaaactcc actcatgtta tgggaagcaa aatgatgaat 1260
ggtataggcg gttctggaga ctttgccaga aatgcatatt tgactatatt cactacagag 1320
tctatcgcca aaaaaggaga tatatcatct atagttccta tggtatccca tgtggatcat 1380
acagaacatg atgtaatggt aattgttaca gaacagggag tagcagattt aagaggtctt 1440
tctcctaggg aaaaggccgt ggctataata gaaaattgtg ttcatcctga ttacaaggat 1500
atgcttatgg aatattttga agaggcttgt aagtcatcag gtggaaatac accacataat 1560
cttgaaaaag ctctttcctg gcatacaaaa tttataaaaa ctggtagtat gaaataa 1617
<210> 17
<211> 1290
<212> DNA
<213> 克氏梭菌
<400> 17
atggagtggg aagagatata taaagagaaa ctggtaactg cagaaaaagc tgtttcaaaa 60
atagaaaacc atagcagggt agtttttgca catgcagtag gagaacccgt agatttagta 120
aatgcactag ttaaaaataa ggataattat ataggactag aaatagttca catggtagct 180
atgggcaaag gtgaatatac aaaagagggt atgcaaagac attttagaca taatgcttta 240
tttgtaggcg gatgtactag agatgcagta aattcaggaa gagcagatta tacaccttgt 300
tttttctatg aagtgccaag tttgtttaaa gaaaaacgtt tgcctgtaga tgtagcactt 360
attcaggtaa gtgagccaga taaatatggc tactgcagtt ttggagtttc caatgactat 420
accaagccag cagcagaaag tgctaagctt gtaattgcag aagtgaataa aaacatgcca 480
agaactcttg gagattcttt tatacatgta tcagatattg attatatagt ggaagcttca 540
cacccattgt tagaattgca gcctcctaaa ttgggagatg tagaaaaagc cataggagaa 600
aactgtgcat ctttaattga agatggagct actcttcagc ttggaatagg tgctatacca 660
gatgcggtac ttttattctt aaagaacaaa aagaatttag gaatacattc tgagatgata 720
tcagatggtg tgatggaact ggtgaaggca ggggttatca ataacaagaa aaagaccctc 780
catccaggca aaatagttgt aacattttta atgggaacaa aaaaattata tgattttgta 840
aacaataatc caatggtaga aacttattct gtagattatg taaataatcc actggtaatt 900
atgaaaaatg acaatatggt ttcaataaat tcttgtgttc aagtagactt aatgggacaa 960
gtatgttctg aaagtatagg attgaaacag ataagtggag tgggaggcca ggtagatttt 1020
attagaggag ctaatctatc aaagggtgga aaggctatta tagctatacc ttccacagct 1080
ggaaaaggaa aagtttcaag aataactcca cttctagata ctggtgctgc agttacaact 1140
tctagaaatg aagtagatta tgtagttact gaatatggtg ttgctcatct taagggcaaa 1200
actttaagaa atagggcaag agctctaata aatatcgctc atccaaaatt cagagaatca 1260
ttaatgaatg aatttaaaaa gagattttag 1290
<210> 18
<211> 1314
<212> DNA
<213> 克氏梭菌
<400> 18
atggttttta aaaattggca ggatctttat aaaagtaaaa ttgttagtgc agacgaagct 60
gtatctaaag taagctgtgg agatagcata attttaggca atgcttgtgg agcatctctt 120
acacttttag atgccttggc tgcaaataag gaaaagtata agagtgtaaa gatacacaat 180
cttatactta attataaaaa tgatatatat actgatccgg aatcagaaaa gtatattcat 240
ggaaatactt tctttgtaag tggaggtaca aaggaagcag ttaattgtaa tagaacagat 300
tatactccat gcttttttta tgaaatacca aaattattaa aacaaaagta tataaatgca 360
gatgtagctt ttattcaagt aagtaagcct gatagccatg gatactgtag ctttggagta 420
tcaaccgatt attcacaggc aatggtacag tctgcaaagc ttataattgc agaagtaaac 480
gatcagatgc caagagtttt aggagacaat tttatacaca tttctgatat ggattacata 540
gtagaaagtt cacgtccaat tctagaattg actcctccta aaataggaga agtagagaag 600
acaataggaa aatactgtgc atctcttgta gaagatggtt ctacacttca gcttggaata 660
ggagctattc cagatgcagt acttttattc ttgaaggata aaaaggattt gggtatacat 720
tcagaaatga tatccgatgg tgttgttgaa ttagttgaag caggggtaat tacaaataag 780
aaaaagtccc ttcatccagg aaaaataatt attacattct taatgggaac taagaaatta 840
tatgatttca taaatgataa tcctatggta gaaggatacc ctgtagatta tgtaaatgat 900
cctaaggtta ttatgcaaaa ttctaagatg gtatgtataa actcctgtgt agaagtggat 960
ttcacaggac aagtgtgtgc tgaaagtgta ggatttaaac aaataagcgg tgtaggtgga 1020
caagttgatt acatgagagg agctagcatg gctgatggag gaaaatcaat tcttgctata 1080
ccatctactg cagctggcgg caaaatttca agaatagttc ctattttaac tgaaggagcg 1140
ggggttacta cttcaagata tgatgttcaa tatgttgtta cagaatatgg tattgcactt 1200
ctcaagggca aatccataag agaaagagct aaggagctta taaaaattgc acatcctaaa 1260
tttagggaag aattaacagc tcaatttgaa aaaagattca gttgtaagct ttaa 1314
<210> 19
<211> 963
<212> DNA
<213> 发酵氨基酸球菌
<400> 19
ttgagtaaag taatgacgtt aaaagacgca atcgccaagt atgtgcacag tggtgatcac 60
attgctctgg gtggttttac gacggaccgt aaaccctatg cggctgtgtt cgaaatcctg 120
agacagggta tcacggatct gaccggtctg ggcggcgctg ccggcggcga ctgggatatg 180
ctgatcggca acggccgtgt gaaagcctac atcaactgct acaccgccaa ctccggtgtg 240
accaacgttt ccagacggtt cagaaaatgg ttcgaagccg gcaaactgac catggaagac 300
tattcccagg atgttatcta catgatgtgg catgccgccg ctctgggcct gcccttcctg 360
cctgtaaccc tgatgcaggg ctccggcctg accgatgaat ggggcatcag caaggaagtc 420
cgtaaaaccc tggacaaagt tcctgatgac aaattcaaat acatcgacaa ccccttcaaa 480
ccgggtgaaa aagtcgtggc tgttcctgtt ccgcaggttg atgtggccat catccatgcc 540
cagcaggctt ctcccgatgg caccgttcgc atctggggcg gcaaattcca ggatgtggat 600
attgctgaag cagccaaata caccatcgtt acctgcgaag aaatcatttc tgatgaagaa 660
atcagaagag atcccaccaa gaacgatatc cccggcatgt gcgtagatgc tgttgtcctg 720
gctccttacg gtgcacatcc ttctcagtgc tatggcctgt acgactacga caatccgttc 780
ctgaaagtct atgacaaggt ctccaagacc caggaagact tcgatgcctt ctgcaaggaa 840
tgggtgttcg acctgaagga tcatgacgaa tacctgaaca aactgggtgc cactcgtctg 900
atcaacctga aggttgttcc tggtctgggc taccacatcg acatgacgaa ggaggacaaa 960
taa 963
<210> 20
<211> 963
<212> DNA
<213> 发酵氨基酸球菌
<400> 20
ttgagtaaag taatgacgtt aaaagacgca atcgccaagt atgtgcacag tggtgatcac 60
attgctctgg gtggttttac gacggaccgt aaaccctatg cggctgtgtt cgaaatcctg 120
agacagggta tcacggatct gaccggtctg ggcggcgctg ccggcggcga ctgggatatg 180
ctgatcggca acggccgtgt gaaagcctac atcaactgct acaccgccaa ctccggtgtg 240
accaacgttt ccagacggtt cagaaaatgg ttcgaagccg gcaaactgac catggaagac 300
tattcccagg atgttatcta catgatgtgg catgccgccg ctctgggcct gcccttcctg 360
cctgtaaccc tgatgcaggg ctccggcctg accgatgaat ggggcatcag caaggaagtc 420
cgtaaaaccc tggacaaagt tcctgatgac aaattcaaat acatcgacaa ccccttcaaa 480
ccgggtgaaa aagtcgtggc tgttcctgtt ccgcaggttg atgtggccat catccatgcc 540
cagcaggctt ctcccgatgg caccgttcgc atctggggcg gcaaattcca ggatgtggat 600
attgctgaag cagccaaata caccatcgtt acctgcgaag aaatcatttc tgatgaagaa 660
atcagaagag atcccaccaa gaacgatatc cccggcatgt gcgtagatgc tgttgtcctg 720
gctccttacg gtgcacatcc ttctcagtgc tatggcctgt acgactacga caatccgttc 780
ctgaaagtct atgacaaggt ctccaagacc caggaagact tcgatgcctt ctgcaaggaa 840
tgggtgttcg acctgaagga tcatgacgaa tacctgaaca aactgggtgc cactcgtctg 900
atcaacctga aggttgttcc tggtctgggc taccacatcg acatgacgaa ggaggacaaa 960
taa 963
<210> 21
<211> 1251
<212> DNA
<213> 大肠杆菌
<400> 21
atgtcaactc cacttcaagg aattaaagtt ctcgatttca ccggtgtgca atctggccca 60
tcttgtactc aaatgctggc ctggtttggc gctgacgtta ttaaaattga acgtcccggc 120
gttggtgacg taacgcgtca ccagctgcga gatattcctg atatcgatgc gctttacttc 180
accatgctta acagtaacaa acgttctatt gagttaaata ccaaaacagc ggaaggcaaa 240
gaggtaatgg aaaagctgat ccgcgaagct gatatcttag tcgagaactt tcatccaggg 300
gccattgatc acatgggctt cacctgggag catattcaag aaatcaatcc acgtctgatt 360
tttggttcga tcaaagggtt tgatgagtgt tcgccttatg tgaatgtaaa agcctatgaa 420
aacgttgctc aggcagcggg tggcgcggca tccactacgg gtttttggga tggtccgccg 480
ctggtaagcg ctgcagcgtt gggtgacagc aacaccggaa tgcatttgct gatcggttta 540
cttgctgctt tgctgcatcg cgaaaaaacg gggcgtgggc aacgagtcac catgtcaatg 600
caggatgccg tattgaacct ttgccgcgtg aaattacgtg accagcagcg tctcgataaa 660
ttgggttatc tggaagaata cccgcagtat ccgaatggta catttggtga tgcagttccc 720
cgcggtggta atgcaggtgg tggcggtcag cctggctgga tcctgaaatg taaaggctgg 780
gaaaccgatc ctaacgccta tatttatttc actattcagg agcaaaactg ggaaaacacc 840
tgtaaagcca tcggcaaacc agaatggatt accgatccgg catacagtac agcccatgca 900
cgacagccac atattttcga tatttttgct gaaatcgaaa aatacactgt cactattgat 960
aaacatgaag cggtggccta tttgactcag tttgatattc cttgtgcacc ggttttaagt 1020
atgaaagaaa tttcacttga tccctctttg cgccaaagtg gcagtgttgt tgaagtggaa 1080
caaccgttgc gtggaaaata tctgaccgtt ggttgtccaa tgaaattctc tgcctttacg 1140
ccggatatta aagctgcgcc gctattaggt gaacataccg ctgctgtatt gcaggagctg 1200
ggttatagcg acgatgaaat tgctgcaatg aagcaaaacc acgccatctg a 1251
<210> 22
<211> 1278
<212> DNA
<213> 慢生根瘤菌种
<400> 22
atgaccaagg cgctcgaggg cgttcgcatt ctcgacttca cccacgtcca gtccggaccg 60
acctgcaccc agctgctggc ctggttcggc gccgacgtga tcaaggtcga gcggccgggc 120
gtgggtgaca tcacccgcgg ccagctgcag gacattccca acgtggacag cctgtatttc 180
acgatgctga accacaacaa gcggtcgatc acgctcgaca ccaagaaccc caagggcaag 240
gaggttctga ccgagctgat caagaagtgc gacgtgctgg tcgagaattt cggccccggc 300
gtgcttgacc gcatgggctt cccctgggag aagatccagg ccatcaaccc gaagatgatc 360
gtcgcctcga tcaagggttt cggccctggc ccttacgagg actgcaaggt ctacgagaac 420
gtcgcgcagt gcaccggcgg cgccgcctcg accaccggct tccgtgacgg cctgccgctg 480
gtcaccggcg cgcagatcgg cgattccggc accggcctgc acctcgcgct cggcatcgtc 540
accgcgctct atcagcgcac ccataccggc aagggccagc gcgtcacggc tgcgatgcag 600
gacggcgtgc tcaacctctg ccgtgtcaag ctgcgcgacc agcagcgcct ggagcgcggc 660
ccgctcaagg aatacagcca gttcggtgag ggcgttccgt tcggcgacgc cgtgccgcgc 720
gccggcaacg attccggcgg tggccagccg ggccgcatcc tgaagtgcaa gggctgggag 780
accgacccga acgcctacat ctacttcatc acccaggccc cggtctggga gaagatctgc 840
gacgtgatcg gcgagcccac ctggaagacc gatccgaact acgccaagcc ggccgcccgc 900
ctgccgcgcc tgaacgagat cttcggccgc atcgagcagt ggaccatgac caagaccaag 960
ttcgaggcca tggacatcct caacgagttc gacatcccct gcggcccgat cctgtcgatg 1020
aaggagatcg ccgaggacga gtcgctgcgc aagaccggca ccctggtcga ggtcgaccac 1080
ccgacccgcg gcaaatatct ctcggtcggc aacccgatca agctgtcgga cagcccggcc 1140
gaggtgaccc gctcgccttt gctcggcgag cacaccgatg agatcctgcg ccaggtgctt 1200
ggcttcagcg accaccaggt cgccgagatc cacgactccg gcgcgctcga tccaccgcgt 1260
aaggaagctg cggagtaa 1278
<210> 23
<211> 1326
<212> DNA
<213> 沼泽红假单胞菌
<400> 23
atgggagaga tgccgcttcg gcgcgcaaga gacaacagga gcacgaccat gaccaaggcg 60
ctcgacggcg ttcgcgttct cgacttcacc cacgtccaat ccggcccgac ctgcacgcag 120
ctcttggcgt ggttcggtgc cgacgtgatc aaggtggagc gccccggcag cggcgacatc 180
acccgcggtc agctgcagga catcccgaag gtggacagcc tgtatttcac catgctgaac 240
cacaacaagc ggtcgatcac gctcgacacc aagaacccga agggcaagga ggtgctgacc 300
gcgctgatcc gcacctgcga cgtgctggta gagaatttcg gccccggtgt gctcgaccgg 360
atgggcttca cctgggagaa gatccaggag atcaacccgc ggatgatcgt cgcctcgatc 420
aagggcttcg gtcccggccc gtatgaagac tgcaaggtgt acgagaacgt tgcgcagtgc 480
accggcggcg ccgcctcgac caccggattc cgcgaaggcc tgccgctggt caccggcgcg 540
cagatcggcg atagcggcac cggcctgcat ctcgcgctcg gcatcgtcac cgcgctgtat 600
cagcgccacc acaccggccg cggccagcgc gtcaccgcgg cgatgcagga cggcgtgctg 660
aacctctgcc gcgtcaagct gcgcgatcag cagcgcctcg accatggtcc gctgaaggaa 720
tacagccagt tcggcgaagg catcccgttc ggcgatgcgg tgccgcgtgc cggcaacgat 780
tccggtggcg gccagcccgg ccgcatcctg aagtgcaagg gctgggagca ggatccgaac 840
gcctacatct acgtcatcac ccaggcgccg gtgtgggaga agatctgcga cgtgatcggc 900
gagaccggct ggaagacgca ccccgactac gccacgccgc cggcgcggct gtcgcggctc 960
aacgagatct tcgcgcgcat tgagcaatgg accatgacca agaccaagtt cgaggccatg 1020
gagatcctca acgccgacga catcccctgc ggcccgatcc tgtcgatgaa ggaactcgcc 1080
gaagatcagt cgctgcgcgc caccggcacc atcgtcgagg tcgatcaccc gacccgcggc 1140
aagtatctgt cggtcggcaa cccgatcaag ctgtcggact ccccgaccga ggtgaagcgc 1200
tcgccgctac tcggtgaaca caccgacgaa atcctgcgcg acgtcctcgg ctacagcgac 1260
gcgcacgtcg cagagatcca cgactccggc gcgaccgctc cgccgcgcaa gcaagcggcg 1320
gagtaa 1326
<210> 24
<211> 1251
<212> DNA
<213> 痢疾志贺氏菌
<400> 24
atgtcaactc cacttcaagg aattaaagtt ctcgatttca ccggtgtgca atctggccca 60
tcttgtactc aaatgctggc ctggtttggc gctgacgtca ttaaaattga acgccccggc 120
gttggtgacg taacgcgtca ccagctgcga gatattcctg atatcgatgc gctttacttc 180
accatgctta acagtaacaa acgttctatt gagttaaata ccaaaacagc ggaaggcaaa 240
gaggtaatgg aaaagctgat ccgcgaagct gatatcttag tcgagaactt tcatccaggg 300
gccattgatc acatgggctt cacctgggag catattcaag aaatcaatcc acgtctgatt 360
tttggttcga tcaaagggtt tgacgagtgt tcgccttatg tgaatgtaaa agcctatgaa 420
aacgttgctc aggcagcggg tggcgcggca tccactacgg gtttttggga cggtccgccg 480
ctggtaagcg ctgcagcgtt aggagacagc aacaccggaa tgcatttgct gatcggttta 540
cttgctgctt tgctgcatcg cgaaaaaacg gggcgtgggc aacgagtcac catgtcaatg 600
caggatgccg tattgaacct ttgccgcgtg aaattacgcg accagcagcg tctcgataaa 660
ttgggttatc tggaagaata cccgcagtat ccgaatggta catttggtga tgcagttccc 720
cgcggaggta atgcgggtgg tggcggtcaa cctggatgga tcctgaaatg taaaggctgg 780
gaaacagatc ctaacgccta tatttatttc actattcagg agcaaaactg ggaaaacacc 840
tgtaaagcca tcggcaaacc agattggatt accgatccgg catacagtac agcccatgcc 900
cgacagccac atattttcga tatttttgct gaaatcgaaa aatacactgt cactattgat 960
aaacatgaag cggtggccta tttgactcag tttgatattc cttgtgcacc ggttttaagt 1020
atgaaagaaa tttcacttga tccctcttta cgccaaagtg gcagtgttgt cgaagtggaa 1080
caaccgttgc gtggaaaata tctgacagtt ggttgtccaa tgaaattctc tgcctttacg 1140
ccagatatta aagctgcgcc gctattaggt gaacataccg ctgctgtatt acaggagctg 1200
ggttatagcg acgatgaaat tgctgcaatg aagcaaaacc acgccatctg a 1251
<210> 25
<211> 1278
<212> DNA
<213> 沼泽红假单胞菌
<400> 25
atgaccaagg cgctcgacgg cgttcgcatt ctcgatttca cccacgtcca gtccggcccg 60
acctgcaccc agttgctggc gtggttcggc gccgacgtca tcaaggtcga gcgtcccggc 120
accggcgaca tcacccgcgg gcagttgcag gacatcccga aggtggacag cctgtatttc 180
accatgctga accacaacaa gcgctcgatc acgctcgaca ccaagaaccc caagggcaag 240
gaggtgctga ccgcgctgat ccgctcctgc gacgtgctgg tggagaattt cggccccggc 300
gtgctcgatc gcatgggctt cacctgggac aagatccagg agatcaaccc gcggatgatc 360
gtcgcctcga tcaagggttt cggcccgggt ccctatgaag actgcaaggt ctacgagaac 420
gtcgcgcaat gcaccggcgg cgccgcctcg accaccggct tccgcgacgg cccgccgctg 480
gtcaccggcg cacagatcgg cgactcgggc accgggctgc atctcgcgct cggcatcgtc 540
accgcgctgt atcagcgcca tcacaccggc cgcggccagc gcgtcaccgc cgcgatgcag 600
gacggcgtgc tcaatttgtc gcgcgtcaag ctgcgcgatc agcagcgcct cgcccacggc 660
ccgctcaagg aatacagcca gttcggcgaa ggcattccgt tcggcgacgc ggtgccgcgc 720
gccggcaatg attccggcgg cggccagccc ggccgcatcc tgaaatgcaa gggctgggag 780
accgatccca acgcctacat ctacttcatc gcgcaggccc cggtgtggga gaagatctgc 840
gacgtgatcg gcgagaccgg ctggaagacc catccggact acgcgacgcc gccggcgcgg 900
ctgaagcacc tcaacgacat cttcgcccgc atcgaacaat ggaccatgac caagaccaag 960
ttcgaggcga tggacatcct caacagggac gacattccct gcgggccgat cctgtcgatg 1020
aaggaactcg ccgaggacgc ctcgctgcgc gccaccggca cgatcgtcga ggtcgatcat 1080
ccgacccgcg gcaaatatct gtcggtcggc aacccgatca aactgtcgga ctcgccgacc 1140
catgtcgagc gctcgccgct tctcggcgag cacaccgacg aaattctgcg cgacgtcctc 1200
ggcttcaacg atcatcaggt cgctgaaatc cacgattccg gcgcactcgc tccgccgcgc 1260
aagcaggccg cagagtaa 1278
<210> 26
<211> 1290
<212> DNA
<213> 扭脱甲基杆菌
<400> 26
atgagcaagg caccgggcaa ggccctcgag ggcgttcgca tcctcgattt cacccatgtt 60
caatcggggc cgacctgcac gcaattgctc gcgtggttcg gggccgacgt catcaaggtc 120
gagcggccgg gtgcgggcga cgcgacgcgc cagcagcttc aggaccttcc cggcgtggac 180
agcctctatt tcacgatgct gaaccacaac aagcgttcga tcacgctcga cggcaagaac 240
cccaagggca acgcgatcct ctggcggctc attgccgagt gcgacgtgct ggtcgagaac 300
ttcgcccccg gtgcgctcga ccgcatgggg ctgacctggg agaagctgca ggccgccaat 360
ccgggcctga tcctggcctc ggtgaagggc ttcgggcccg gccgctacca ggattgcaag 420
gtctacgaga acgtcgccca atgcgtcggc ggcgcggcct ccaccaccgg ctggcgcgac 480
ggcgtgccga tggtgtcggg ggcgcagatc ggcgattccg gcaccggcct gcatctggcg 540
ctcggcatcg tcacggccct ctaccagcgc acccagacgg ggcagggcca gcgcgtcgat 600
tgtgccatgc aggacggggt gctcaacctc tgccgggtga agctgcggga ccagcagcgc 660
ctcgcccacg gcccgctgat ggaatacagc cagtacggcg agggcgtccc cttcggcgag 720
gcggtgccgc gggccggcaa cgattccggc ggggggcagc ccggccgcat cctcaagtgc 780
aagggctggg agcaggatcc caacgcttac atctacttca tcacgcaggg cgcggtctgg 840
gggccgatct gcgacatcat cggcgagccg gactggaaga ccgatccggc ctacgcgacg 900
ccgaaagccc gcctgccgca tctcaacgag atcttcacgc gcatcgaagc gtggacgatg 960
aagcacgaca agctcgaggc gatggagatc ctcaacgcct acgagatccc gtgcggaccg 1020
atcctgtcga tgcgggagat cgccgaggat ccgatgctgc gggcgaacgg cacggtggtc 1080
gaggtcgagc acccgacccg cggggcctat ctgacggtgg gcaacccgat caagctgtcg 1140
gcgagcccca ccgagatcac ccgcgcgccg ctgctcggcg agcataccga cgagatcctg 1200
cgcgaggtgc tgggctgcac cgatacggaa atcagcgaca tcctcggttc gggtgcggtg 1260
ggcggcgtcc accgcatcgc cgcggagtag 1290
<210> 27
<211> 1251
<212> DNA
<213> 富养罗尔斯通氏菌H16
<400> 27
gtgaacctcc cactcaacgg catcaagatc atcgacttca cgcacgtcca ggccggtccc 60
gcctgcacgc agcttctcgc gtggttcggt gcggacgtga tcaaggtcga gcgccccggt 120
tccggcgacg tgacgcgcac ccagctgcgc gacatcccgg atgtcgatgc cctgtacttc 180
accatgctca acagcaacaa gcgcagcctg acgctggata ccaagaagcc ggaaggcaag 240
aagatcctgg agcagctgat ccgcgagtcg gacgtgctgg tcgagaactt cggcccgggc 300
gcgctggacc gcatggggtt ctcgtgggaa cgcatcaacg aactgaaccc gaagatgatc 360
gtggcttcgg tcaagggctt cagcgacggc caccactatg aagacctgaa ggtctacgag 420
aacgtggccc agtgcgccgg cggcgcggcc tcgaccaccg gcttctggga tggcccgccg 480
acggtgtccg ccgcggcgct gggcgattcc aacaccggca tgcacctggc catcggcatc 540
ctcaccgcgc tgatcggccg cgacaagacc ggcaagggcc agaaggtggc tgtgtcgatg 600
caggatgcgg tgctgaacct gtgccgggtc aagctgcgcg accagcagcg cctggaccgc 660
ctgggctacc tggaggagta cccgcagtat ccgcacggca gcttcagcga cgtggtgccg 720
cgcggcggca acgcgggcgg cggcggccag ccgggctggg tgctgaagtg caaggggtgg 780
gaaaccgacc ccaacgccta tatctacttc accatccagg gccatgcctg ggagccgatc 840
tgcaaggcgc tgggcaagcc ggaatggatt tccgatccca actacgccac cgccaaggct 900
cgccagccgc atatcttcga tatcttcaac accatcgagg aatggctggc cgacaagacc 960
aagtacgagg ccgtggacat cctgcgcaag ttcgacatcc cgtgctcgcc ggtgctgtcg 1020
atgaaggaaa tcgccgccga tccgtcgctg cgcgccagcg gcagcatcac cgaggtgccg 1080
cacaaggagc gcggtaccta cctgacggtg ggcagcccga tcaagttctc cgacctcaag 1140
ccggagatca ccgggtcgcc actgctgggc gagcatagcg aagaggtgct ggccggcctg 1200
ggctacggcg cggacgacat caagcgcctg cgcgagtccc aggtgatctg a 1251
<210> 28
<211> 1251
<212> DNA
<213> 色诺佛兰斯伯克霍尔德菌
<400> 28
atgaccaaac ctctcgaagg catccggatc atcgacttca cccatgttca agccggccct 60
gcatgcaccc agttgctcgc ctggttcggc gcggacgtca tcaaggttga acggccgggt 120
tcgggcgacg tgacgcgcaa ccagttgcgc gatattcccg acgccgacgc gttgtacttc 180
acgatgctca acagcaacaa gaaatcgctg acgttggaca caaaaaaacc cgaaggcaag 240
gaagtactcg aaaagctgat tcgcgaatcc gacgtgctgg tggagaattt cggcccgggc 300
gcgttggacc gcatgggctt ttcgtgggaa cggctgaatg aactcaatcc gaagatgatc 360
gtcgcctcgg tgaaaggctt cagcgacggc caccactacg acgacctgaa ggtctacgaa 420
aacgtggcgc aatgcgcggg cggtgcggcc tccaccaccg gcttctggga cggtccgccc 480
accatcagcg ccgccgcgct cggcgacagc aataccggta tgcatctggc catcggcatt 540
ctgaccgcgc tgctcggtcg cgacaaaacc ggcaaaggcc agaaggtcgc agtgtccatg 600
caggacagcg tgctgaatct gtgccgcgtg aagcttcgtg accagcagcg gctggaacgc 660
gttggctatc tcgaggagta tccgcaatat ccgcacggcg aattcagcga cgtggtaccg 720
cgcggcggca atgcaggcgg cggcggccag ccgggttggg tgctcaaatg caaaggctgg 780
gaaacggatc cgaacgccta catctacttc acgattcagg gccatgcgtg ggagcccatc 840
tgcaaggcgc tcggcaagcc cgagtggatc gacgacccgg cctacaagac tgcggaagcg 900
cgtcaaccgc atatcttcga tatcttccag accatcgaaa cctggctcgc ggacaaaacc 960
aagttcgaag cggtcgacat cttgcgcaag ttcgacattc cgtgcgcacc ggtgctgacc 1020
atgaaggaac tggccaacga tccgtcgttg cgcgcgagcg gcacgatcgt cgaagtaccg 1080
cacaagaaac gcggcacgta tctgactgtc ggcagcccga tcaagttttc ggatctgaag 1140
ccggaagtca ccgcgtcgcc gctgctcggc gaacacaccg acgaggtgct ggcgagcctt 1200
ggctacagcc agcagcaaat cttcaacctg cgcgaagtca aggcagttta a 1251
<210> 29
<211> 423
<212> DNA
<213> 埃文固氮弧菌
<400> 29
tcagtccttc ggcggttcca gatagcgccc gaagcgctcg cgccattcgt cgtcgatcaa 60
ggtcgcgcgc ggggcgccgc cgaggtcggc ccacacgacc gtctgcttcg cgcggaagcg 120
cacctgctcg cccatcgacg cggtcgtgac gatgtccatc gagctgccgc cgatgcgcgc 180
gacgtagagc gtgaaggtga gctcatcgcc gtgcatgctc ggtgcgaaaa agtcgacttc 240
gaggtggcgc atcggcacgc cgcggcggat ctccgcgtgc agcttgtaga agtccacgcc 300
gatgccgcgg tcgaaccagt cctcgaccac ctcattgcac agcaccaggc actgcgggta 360
gaagacgatg ccggccgggt cgcagtggtg gaaacggatg gatttcttgc attcgaagat 420
cat 423
<210> 30
<211> 432
<212> DNA
<213> 趋磁磁螺菌
<400> 30
tcattgggcc gcaacctcca ccagccgggt gcgataggct tccaggcgtt cgcgcatggg 60
accgggcatg ggaaccgcct tcaccttttc ctgatcggcg acgacacaga cgaaactggt 120
ctcgaaggcc accacgccgt caccccgcgc gccgatggtg cggaaatgaa tggaagagcc 180
ccccaccctg tccaccagga ccgagatatc cacccggtcg ccgggccgaa gcggcgattt 240
gatctccatg ccgatcttga cgaagggcgt gccgaagccg tgttccttgt tgatggtgta 300
ccagtcatag ccgatgacat cggccatgaa gacctccagc gcctccatgg cgtattccag 360
gaagcggggc gtatagacga tgcgcgccgc gtcggaatcg ccgaaatgga cccggcggcg 420
gtgaatgaac ac 432
<210> 31
<211> 411
<212> DNA
<213> 简纳西氏菌种CCS1
<400> 31
atgacccacc tctggcccct gcgcgtctac tatgaagacg tcgatctggc ggggatcgtc 60
tactacgcca actacctgaa atacctggag cgggggcgct ctgaaatggt gcgtgaggcc 120
ggcatttccc agctcgacat gaaagctgcg gggctggtct ttgccgtgcg gcgggtggag 180
gcggaatacc tcaaacccgc caaatacgat gatgagctgg tcgtggagac gcagctggac 240
cgcctgaaag gggccagttt cgacatgccc cagcgggtcc tgcgcggcga tgacgtgctg 300
ctggacgcgc ggatcaaggt tgtgatcctc aacgcggacg gccgggcggc gcgacttccg 360
gcggatattc gcgcaaaagt cacagccgtc gcggcaagtg atggcccgta a 411
<210> 32
<211> 432
<212> DNA
<213> 星箭头菌
<400> 32
atgtcgcagg aggaagccgt ggggcagccg ttcgagcatg agatccgggt gacctggggg 60
gactgcgatc ccgcgcggat cgcctatacg gcgcgcatcc cctggttcgc gctggatgcg 120
atcaacgcct ggtgggagga gaagctgggc ggcggctggt tccagatgga gctggaccgc 180
ggtgtcggca cgccgttcgt caacatgacc atcgatttcc gcagtccggt cacgccgcgc 240
caccggctgc tctgcgccgt gcgcccggtg cggctgggcg agacctcggt cagtttcgaa 300
gtgctgggac ggcaggacgg tgtgctgtgt ttcgaggggc ggttcacctg cgtgttcatc 360
gccgtgccgc gttttcgcaa ggcgccgccg ccggaggata tccgggcggt ggtggaggcg 420
catctgaact ag 432
<210> 33
<211> 414
<212> DNA
<213> 大肠杆菌
<400> 33
atgatctgga aacgccattt aacgctcgac gaactgaacg ccaccagcga taacacaatg 60
gtggcgcatc tgggaattgt gtatacccgt ctgggcgatg atgtgctgga agccgaaatg 120
ccggttgata cccgtactca tcagccgttc ggtttactac atggcggcgc gtcggcggcg 180
ctggcggaaa cgctgggatc gatggccgga tttatgatga cccgcgacgg acagtgtgtg 240
gtaggcacag aacttaatgc aacacaccat cgcccggtgt ctgagggaaa ggtacgcggc 300
gtctgccagc cgctgcatct tggtcggcaa aatcagagct gggaaatcgt cgttttcgat 360
gaacaggggc ggcgttgctg cacttgtcgg ctgggtacgg cagttttggg atga 414
<210> 34
<211> 1989
<212> DNA
<213> 巴氏醋杆菌
<400> 34
atgtcggaaa acatcactat cctgcctaca cagtatgcag attacccggc tctgatgcca 60
cctgcggaac tggccgccat gcagcgctat gcacgccgag acccggatgg tttttggctg 120
caacaggccc ggcgtgtgca ctggcaccgc aagcctaggc gaggctttac gggcagcttt 180
acgggtgatg tgtccataag ctggtttgaa gatggcctta tcaacgcatc cgtatgctgt 240
attgataagc atctgacaga caaggctgat cagattgccc ttatcagcca ccgtgaaggc 300
cgggccgagg cagaaaaaat tacatatgcc atgctgcatg aacgggtttg ccgcctgtct 360
aacgcgctgg tgcatttggg ggtggaggaa gggcaccgcg ttgccatttg cctgcccatg 420
atttcagaag ccgtggtggc catgctggcc tgtgcgcgta ttggcgcggt gcatgtggtg 480
ctgtttggtg gtttttcggc agaaggtatt gcagaacgta ttatagatag cggcgcagtt 540
gcggtaatta ccgccagcga aagcatgcgc ggcaacaaga tcgtgccctt taaagcgatt 600
atggatgaag ccctgtgcaa ggcaggtgca gaaagtggcg tgcgggctgt tctagttgtg 660
cgcacgtctg atgcacctgt tcccatgctg cctggtaggg attacgattt tcatgatttt 720
gtagattcgt ttgaggcaga ttttgtgccc gttgtcatgc gggcagaagc accattattt 780
atgctctaca catctggcag cacaggcaag cccaaagcag ttgtgcatgc cactggtggc 840
tatatggtgt gggcagctta cactatggac atggtgtacc atcatcaacc tggtgatgtg 900
ctgtggtgca cggcagatgt ggcatggata accgggcata catccgttgt gtatggcccg 960
ctggccaatg gcggaaccac catgatttcc gatagcctgc cttcataccc cgctccgggc 1020
agatggttgg atctgataga tgagcataag gtgaccatgc tgtttaccgc ccccacagcc 1080
gtgcgcgcca tgatggccga tggtgatgat gtggtgaacg cccgcaatct ggagtctctg 1140
cgtttgctgg gtgtggcggg ggagcccata agcccggatg cgtggctatg gtatcacgat 1200
gttgtgggta aaaagcgttg ccccgtggtg gatacatggt ggcagacaga aaccgccggc 1260
attgtgctgg ggccagtgcc gggtgtgcaa ccgcttaaac ccggctctgc cagcacgccg 1320
ctgccggggt tggaaatggt catagccgat acgcagggca ggccggtgca ggggcctgca 1380
gaaggtagcc tgtgcattgc gcgttcatgg ccggggcagg cccgcacaat ctggaaagat 1440
catgctcgct tctgccagac atattttggt atggttccgg ggcattattt cacgggtgat 1500
ggcgcacggc gagatgccga tggctattac tggattacgg ggcgcatgga cgatgttatc 1560
aatattgcag ggcaccgttt gggtacagca gaagtggaag atgcgttggc agcagatcat 1620
cgtattgtgg aatctgctgc agtgggcatc ccgcacccgg taaaggggca ggcgctggcg 1680
gtatttgtta tccagcgcca gaacgtggct acggaactga cagaaaaagg cataagccgc 1740
cttatctccg gtatgttggg gcgttatgcc acgccagagg ccgtttatct ggtgccagat 1800
ctgcctcgca cgcgctctgg caagattgta cgccgcctgc tgcgcaaaat tgccagtggg 1860
gaaatggata atctgggaga tctttcatcg ctgaatgatc cttccatcgt gcgtatgctg 1920
tgtgacagag tatggagcca catggctttt gatgaggaat ctgcacctcg cacacaggca 1980
agggcctga 1989
<210> 35
<211> 1890
<212> DNA
<213> 棕色固氮菌
<400> 35
atgaactatc agcactacca tgaacgctcc atcgccgatc ccgccggttt ctgggccgaa 60
caggcgcagg ccgtgcgctg gttccgccag ccgacggaaa ttctccgcgc cctggcggac 120
ggcacgcacc agtggttcgc cgacggccgg ttgaacagtt gctatctggc cctggatcat 180
cagatcgaac agggccgtgg cgagcagacg gccctgatcc acgactcgcc ggtcaccggc 240
ggcaaggccc gctacagcta ccgcgaactg cgcgacgaag tggcgcgcct ggccggcgcc 300
ctgcgcgagc tgggcgtgga aaagggcgac cgggtcatca tctacatgcc gatggtgccg 360
caagcggcca tggccatgct cgcctgcgcg cggatcggcg cggtgcactc ggtggtgttc 420
ggcggcttcg cccctcacga actggcgctg cgcatcgacg acgcccggcc caaactgctg 480
ctcaccgcgt cctgcggcct ggagttcgac cgggtcatcg aatacaaacc gctggtcgac 540
aaggccctgg aactggccag ccaccagccc gggcacgtac tggtgctgca acggccacaa 600
gcgagcgccg cgctgctccc agggcgcgac ctggactggc aggccagggt cccgctggcc 660
gcgccggtgg agcccgtgcc cctggacagc ggcgatccgc tgtacatcat gtacacctcc 720
ggcaccaccg gaaaacccaa gggcgtcgtg cgcgacaacg gcggcaacgc ggtggccctg 780
agcttcgcca tgcgccatgt ctacgccatg cgggccggcg acgtctggtg gggcatctcc 840
gacgtcggct gggtggtcgg ccattcgctg atcgtctacg gcccgctgat gaacggatgc 900
accagcatcc tctacgaagg caagccggtc cgcacgcccg acgccggcgc ctactggcgg 960
gtgatcgagg aatacggcgt caacggcctg ttctgcgcgc cgacggcgat ccgcgccatg 1020
cgcaaggaag atccttcggg cgaactgagc gggcgccacg acctgggctc gctgcggcac 1080
ctgttcctgg ccggcgagaa gctcgattcg agcacccacc ggtggctgga ggaactgacc 1140
gggaagccgg tgcacgacca ctggtggcag accgagaccg gctggccggt caccgctccc 1200
tgcgccgggc tggagggcca caccgcacgc cacggttcga gcaaccgccc ggtgcccggc 1260
tatcgcgtcc aggtgatgga cgaacagggt cacctgctcg gagcgaaccg gcagggctcg 1320
atcgtcatcg ccctgcccct gccgccgggc tgcgcgcaga ccctgtggaa cgaccacgag 1380
cgctatctgc gctcttatct gagctcctat cccggctact accacaccgg cgacggcggc 1440
tacctggacg acgagggctt cgtctacatc atgggccgca ccgacgacgt gataaacgtg 1500
gccggccacc gcctctccac cggagaaatg gaagacctgg tggcccggca tccggcggtg 1560
gccgaatgcg cggtgatcgg catccccgac gcgatcaagg gacaggtgcc gctgggcctg 1620
atcgtcctca aggacggcag ccgaatccgc gaggagcaac tgcagcggga gttgaccgcc 1680
tcgatccgcg agcagatcgg cgcgctggcc tgcttccagc ggatagcgac ggtcaagcgc 1740
ctgccgaaga cccgttcggg caaaatcctc cgggcggtgc tgcgcaagat cgccaacggc 1800
gaggaggtgg ccacgcccat gaccatcgac gatccggcga tactcgggga aatcggcgcc 1860
gccctggcgt tgtacacgcg cgccagttga 1890
<210> 36
<211> 1959
<212> DNA
<213> 脱卤拟球菌种
<400> 36
atgagtaccg aagaaaagaa gtttgacacg caaaacctgc ctaccaagac ttatttctgg 60
ccgctgaaaa gataccagga cctttataac agctcactgg ctgacccgga ggctttctgg 120
gccaaacact cagacgtgct ttcatgggaa aagccttggg aaaaagtact ggactggaat 180
ccgccttatg cccgctggtt tgtaggcggc aagctgaata tgtcttacca atgcgtagac 240
cgccatgcca aaagctggcg taagagcaag gtagctatct attgggaagg cgaaaacggg 300
gatacccaga ccataagcta ttcagacctt tacgaaaatg taaaccgtta tgcatccgtc 360
ctgaaaaagc tgggcatatg caagggtgac agggtaactg tctacctgcc catgatacct 420
gaaatggtct atattctatt agcctgcaac cgggttggag ccgtccataa cgtaatattc 480
tcaggtttct cttcccagtc tatcgcagac agggtaaatg actccggttc aaaaatggtt 540
gttaccgcca gcggcggaca ccgccgcggt aagatactgc ctcttaaaga aatcgtagat 600
gaggctgtaa aatccacccc gactatagaa catgtactgg ttattaaata taccggccac 660
gaagtagcca tggaccccac cagagacgta tgggcacatg atctgctgaa agatgcagat 720
aaatacgtag cccctgaagc tatggaatcc accgacccgc tttttatcct gtacacctca 780
ggcactaccg gtaaaccgaa gggtattctg catggtaccg gcggctacgg cgtctgggcg 840
tgcaataccc ttaagtgggc tttcaaaccc acggacgaat cagtcttctg gtgcacggca 900
gacgtaggct ggattaccgg gcacacatat gttgtatatg ccccgctggc gctgggactt 960
acccaggtta tttacgaggg agctccggat tatccttcag tagaccgctg gtgggagatt 1020
attgataaat acggggtaag catattctat acctcgccta ccgccatacg catgtttatg 1080
cgccacggcg aggagttgcc tgccagacac gaccttggca ctctggaaat gctgggaagc 1140
gtgggcgaac ccattaaccc tgaagcctgg gaatggtatt acaagaatat aggccatgag 1200
aactgcccca tttccgatac ttggtggcag accgaaacag gcggttttat gattaccccc 1260
tgccccggca tacaatcctt cccgctcaaa ccgggctcag ccactttgcc tctaccggga 1320
gttgacccgg tagtggtaga tgctgaaggc aaggaactgc cggctaatga aaccgggttt 1380
attgccatcc gcaaaccttg gccgggcata atgctgggta tatataacgg tgatgaactt 1440
tataaaaaga cctactggag ccgtttcccc ggctggtatt gtccgggaga cttttcaatg 1500
aaagattctg acggatatct gtggctgctg ggacgggctg acgaagttat caaggtagcc 1560
ggtcaccgca taagcaccgc cgaattggag catgctctgg taggccatag ttcagttgcc 1620
gaagcggcag tagcctcccg ccctgacgaa gtaaagggtg aagctattgt ggttttcgtc 1680
accctgaaaa aaggtgtaga agcctctgcg gaagtaaaga gagagcttac ccatcacctc 1740
cgctctgcta tcggcactat agccaccccg gaagagatca ttttcgtgga gaaactgccc 1800
aaaacccgtt cgggcaagat tatgcgccgc ctgctgaagg ccgttgccaa cgaagtaccc 1860
attggtgata ccactacact tgatgatgag acttcggtaa atgaggccag agcggctttt 1920
gatgaactgc tggcagcacg caaacaccac aaacactaa 1959
<210> 37
<211> 810
<212> DNA
<213> 大肠杆菌
<400> 37
atgacgaagc atactcttga gcaactggcg gcggatttac gccgcgccgc agagcagggc 60
gaagcgattg caccgctgcg cgatctgatt ggtatcgata acgctgaagc ggcttacgcc 120
attcagcaca taaatgtgca acatgacgtt gcgcaggggc gtcgcgtggt agggcgtaaa 180
gtgggcctga cacatccgaa agtgcaacaa caactgggcg ttgatcaacc ggattttggg 240
acgttatttg ccgacatgtg ttatggcgat aacgaaatca ttcctttttc ccgtgttctg 300
caaccccgca ttgaagcgga gatcgcactg gtgttgaacc gcgatttgcc cgcaaccgat 360
atcaccttcg acgaattgta taacgccatt gaatgggtac ttccggcgct ggaagtggtg 420
gggagccgca ttcgcgactg gtcgattcag tttgtcgata ccgtggcaga taacgcctcc 480
tgtggggtgt atgtcatcgg cggtccggcg caacgtccgg cggggttaga cctgaaaaac 540
tgcgccatga agatgacgcg taataacgaa gaggtttcta gcgggcgcgg cagcgaatgc 600
ctgggacatc cgcttaatgc ggccgtctgg ctggcacgca aaatggccag tctgggtgaa 660
ccgctgcgca ccggagatat cattcttacc ggggcattag gtccgatggt ggcggtgaat 720
gcgggcgatc gttttgaagc ccatattgaa ggcataggtt cagttgctgc gacattttca 780
agcgcagccc caaaaggaag tctgtcatga 810
<210> 38
<211> 789
<212> DNA
<213> 恶臭假单胞菌
<400> 38
atgaatgaag ccaacgtgat tgcgaacctg ttatgggatg cgcagcggca aaagctgccc 60
tgtgcaccgg tgcgggaata tttcgagggg aagagcgagg ttgaccaggc gctattggcc 120
tatgccgtac agcaggtgaa tgttcagcgc caggtggagg gcggccgacg tatcgtcggt 180
cgcaagatcg gccttacctc tccggcagtg cagaagcaat tgggtgtaga tcggccggac 240
ttcggcacgt tgctggacga catggcgatc gtcgatggcg agccgatcaa cactgcgcgt 300
cttctgcagc ccaaggtcga agctgagatc gccctggtac tcgagcgtga cctcgatcgg 360
gagcgtcata cagtcgccga cctgatcgac gcgacagcgt atgcacttgc tgcaatcgag 420
gtggtggata gccgtatcac cggttggaac atccgctttg ttgacaccgt ggcagacaac 480
gcctcatcgg gcttgttcgt actcggtact cagcctgttg gcctgtcgaa gcttgatctg 540
gccggtatgt cgatgcgcat ggcgcgtggc gaagagcttg tatcgcaagg ggctggagct 600
gcctgccttg gcaacccgtt gaacgcagcg cgttggcttg ctgacacgtt ggtccaagtg 660
ggcacgccat tgcgtgccgg cgatgtggtt ctgaccggcg ctctggggcc aatggtcgcg 720
gtcgagtccg gtcacaccta tacggcatgg atcgatggct tcgccccggt acgagcaatt 780
ttctcctga 789
<210> 39
<211> 807
<212> DNA
<213> 恶臭假单胞菌
<400> 39
atgagcgaac tagataccgc gcggacaggt gccgtgcgta aagctgccga cctgctgtac 60
gaagccaccc ggtccggtgt ggccgtggtg ccggtgcgca atctgatcgg cgagacggat 120
ttggaggcag cctatgcagt acaggaggtt aatacacaga gagcattggt tgccgggcgg 180
cgcctggttg gacgcaagat tgggctgacc tctgtcgctg tacagaagca gctcggagtg 240
gaacagcccg actatggcat gttgttcgca gacatggcgc gtaccgaggg ggaggaaatc 300
gcccttgatg acgtgctcca acctaaagtc gaagccgaga tcgcctttgt cctgggacgt 360
gacctcgatg gcgatcaatt gacggtggcc gacctctttc gcgccatcga gttcgccgtt 420
ccggcgatcg agatcgtggg ttcgcggata accaattggg atatccgtat cacggacacc 480
attgctgaca atgcttcgtc tggcctgtat gtgctgggct ccacgccgaa gcgcttgtgc 540
gattttgact cgcgccaggc aggcatggtg atggagcggc aaggcatacc ggtgtcttcc 600
ggggtagggg ccgcctgcct tggagcgcct ctcaacgcag tcctttggtt ggccagggtc 660
atggctcgag cgggccgtcc gttgcgcact ggcgacacgg tgctttccgg tgcgctgggc 720
cccatggtgc cagtggcagg aggagatgta ttcgatgtgc ggatagccgg gcttggatcg 780
gtgaccgccg cttttgcaaa ggcataa 807
<210> 40
<211> 804
<212> DNA
<213> 肺炎克雷伯氏菌
<400> 40
atgctcgata aacagacccg taccctgatt gcccagcggc tgaaccaggc cgaaaagcag 60
cgtgaacaga tccgcgcgat ctcgctggat tatccgtcga tcaccattga ggacgcctac 120
gccgtccagc gcgagtgggt cgagatgaag atcgccgaag gccgcgtgct caaaggccac 180
aagatcggcc tgacctctaa agcgatgcag gccagttcgc agatcagcga gccggactac 240
ggcgcgctgc tcgacgatat gttcttccac gacggcagcg atattcccac cgaccgcttt 300
atcgttccgc gtatcgaagt cgagctggcc ttcgtgctgg ccaaaccgct gcgcggcccg 360
aactgtacgc tgtttgatgt ctacaacgcc accgactacg ttatcccggc gctggagctt 420
atcgacgcgc gctgccacaa catcgacccg gaaacccagc gtccgcgcaa agtgttcgac 480
accatctccg acaacgccgc caacgccggg gtgatcctcg gcggccggcc gattaaaccg 540
gacgagctcg acctgcgctg gatctccgcc ctgctgtatc gcaacggcgt aattgaagag 600
accggcgtcg ccgcgggcgt actcaatcat ccggccaacg gcgtggcctg gctggccaac 660
aagctggcgc cgtacgatgt ccagctcgaa gccgggcaga ttatcctcgg cggctccttc 720
acccgcccgg tcccggcgcg caagggcgat accttccacg tcgactacgg caacatgggc 780
gtcatcagct gccggtttgt ctag 804
<210> 41
<211> 804
<212> DNA
<213> 大肠杆菌
<400> 41
atgttcgaca aacacaccca caccctgatc gcccagcgtc tggatcaggc agaaaaacag 60
cgcgaacaga tccgcgcgat ctcgctggat tacccggaga tcaccatcga agacgcttac 120
gcggtgcagc gtgaatgggt tcgactgaaa atcgccgaag gtcgcacgct gaaaggccac 180
aaaatcggcc tgacttcgaa agcgatgcag gccagctcgc agatcagcga accggattac 240
ggtgcactgc tggacgacat gttcttccac gatggcagcg atatcccgac cgatcgcttt 300
atcgtgccgc gcattgaagt ggagctggct tttgtgctgg caaaaccgct gcgtggacca 360
aactgcacgc tgttcgacgt ttacaacgcc acggactatg tgatcccggc gctggagctg 420
atcgacgctc gctgccacaa catcgatccg gaaacccagc gcccgcgtaa agtgttcgac 480
accatttctg ataacgccgc caatgccggg gtgatcctcg gtggtcgtcc cattaagccc 540
gatgagttgg atctacgttg gatctccgcc ctgatgtatc gcaatggcgt gattgaagaa 600
accggcgtcg ccgctggcgt gctgaatcat ccggcaaacg gcgtggcctg gctggcgaac 660
aaactcgccc cctatgacgt acaactggaa gccgggcaaa tcattctcgg cggttcgttc 720
acccgcccgg ttccggcgcg taagggcgac accttccacg tcgattacgg caacatgggc 780
tccattagct gccgctttgt ttaa 804
<210> 42
<211> 840
<212> DNA
<213> 睾丸酮丛毛单胞菌
<400> 42
atgaaccgaa cacaagccaa agtagtcgaa ggcaaatttc ccacacagaa caccatggac 60
aactccaaga tccagcacta cggcgacgag ctctaccagt cgctgctcga ccgccaaccc 120
gtcgctccgc tgaccgaccg cgaagcggac atcaccatcg aggacgccta ccagatccag 180
ctgcgcatga tccagcgccg gctggacgcg ggcgagcgcg tggtgggcaa gaaaataggc 240
gtgacgagca aggtcgtgat ggacatgctc aaggtcaacc agcccgactt cggccacctg 300
ctctcgggca tggtctacaa cgaaggccag cccatcccgg tgagcagcat gatcgcgccc 360
aaggccgagg cagaggtcgc cttcatcctg gcgcgcgacc tcgaaggccc cggcgtcacc 420
gcggccgacg tgctgcgcgc caccgactgc gtgatgccgt gcttcgagat cgtcgactcg 480
cgcatcaagg actggaagat caagatccag gacaccgtgg ccgacaacgc ctcctgcggc 540
gtgctcacgc tcggcggcct gcgcaagagc ccgcgcgacc tcgacctcgc gctggccggc 600
atggtgctgg aaaagaacgg cgaaatcatc agcacgtcct gcggcgcatc ggtgcagggc 660
tcgccggtca acgcggtggc ctggctggcc aacacgctcg gccgtctggg catcggcctc 720
aaggccggcg acatcatcct ctctggctcg cagtcgccgc tggtgccggt ggtcgcgggc 780
gacagcctgt attgcagcgt cggcggcctg ggcggcacgt cggtgcgttt cgtcgcctga 840
<210> 43
<211> 507
<212> DNA
<213> 詹氏甲烷球菌
<400> 43
atgagaagta taataaaggg aagagtttgg aagtttggaa ataacgtaga tacagatgct 60
atattaccag caaggtattt agtttataca aaaccagagg aattagctca gtttgttatg 120
actggggcag acccagattt tccaaagaag gttaagccag gagatataat agttggagga 180
aagaactttg gatgtggttc aagtagagag catgccccat taggattaaa aggagctgga 240
atcagctgtg ttattgctga gagcttcgca agaatatttt atagaaatgc cataaatgtt 300
ggattaccat taattgaatg taagggcatt tcagagaaag tcaatgaagg ggatgagtta 360
gaggttaatt tagagactgg agagattaaa aacttaacca ctggagaggt tttaaaaggt 420
caaaaattac cagaattcat gatggaaatt ttagaggctg gaggattaat gccatactta 480
aagaaaaaga tggctgaaag ccaataa 507
<210> 44
<211> 1263
<212> DNA
<213> 粘液真杆菌
<400> 44
ttgggtatga caatgactca gaaaatattg gcggcacatg ctggtctgga atccgtaaaa 60
ccgggtgatt tgatcatggc agacctggat ctggtgttgg ggaatgatat tacctcaccg 120
gtagccatca atgtttttaa aaatattaat aaggaaaccg tttttgacaa agacaaggtt 180
gcgctggtcc cagaccattt tgcgccgaac aaggatatta aggctgcgga gcagtgcaaa 240
caggtgcgct gttttgcctg tgagcaggat gtcaccaact attttgaaat cggcgaaatg 300
ggtgtagagc atgctctgct gccggaaaag ggactggtcg ttgccggcga tgtcgtgatt 360
ggggcagatt cgcacacctg tacctatggt gcgcttgggg ctttctcaac cggtgtgggt 420
tctaccgaca tggccgttgg tatggcaacc ggtaaagcct ggtttaaggt accgtctgcc 480
attaaattca atctgactgg cgctttcaaa gaaggtgttt caggaaaaga cctgattctt 540
cacattatcg gaatgattgg tgtggatggt gcgctttata aatcaatgga atttgccgga 600
gagggtgtgt caagcctgac gatggatgat cgcttcacca ttgcgaatat ggccattgaa 660
gctggcggta aaaatggtat cttccctgtc gacgataaga ccatcgaata tatgaaggag 720
cattctacca aggaatacaa ggcctttgaa gcagacgcag acgccgagta tgacgctgtg 780
tacgatatta atctggcaga tatcaagtct acggtagcat tcccgcactt gcctgaaaac 840
actaaaaccg ttgatgaaat tactgaaccg gttaagattg accaggttgt tatcggctca 900
tgcaccaatg gacgtttctc agactttaaa aaggccgcag atctgatgcg cggtaagcat 960
gttgccaaag gaatccgtgt tttgattatc ccagcaactc agcagattta cctggattgt 1020
atggaagcgg gatatttaaa agactttatt gaagcgggcg caacggtgag cacaccgacc 1080
tgcgggccat gcctgggcgg acatatgggg attctggcag cgggagaacg ctgcgtttcc 1140
acaacaaacc gtaactttgt cggacgcatg ggccatgtgg actcggaagt ctatctggcg 1200
agccccgagg ttgcggcggc atctgctatc ctgggccgta ttgccggacc agaagaatta 1260
taa 1263
<210> 45
<211> 492
<212> DNA
<213> 粘液真杆菌
<400> 45
atgaaagcaa aaggaaaagt atttagatat ggcaacaatg ttgatacaga cgttattatt 60
cccgcaagat acctgaacac cagcgatcct ctggaattag cggagcattg tatggaggat 120
attgacaagg attttataaa acgcgtggag gacggcgata tcatcgtcgc tgatgataat 180
tttggctgcg gctcttcaag agagcatgcg cccattgcca tcaaagcctc aggtgtctcc 240
tgtgtaatcg ccaatagctt tgcgcgtatt ttttatcgca attccatcaa tatcgggctg 300
ccgattctgg aatgtccgga agcggtggca gcgattgaag caggcgacga agtagaagtg 360
gattttgact ctggcgttat cactgacgtg accaagggac agagcttcca gggacaggca 420
ttccctgaat ttatgcagaa gctgatcgca gcaggcggcc tggtaaatta cgtcaacgag 480
aatctcattt ag 492
<210> 46
<211> 1770
<212> DNA
<213> 溶酪巨球菌
<400> 46
atgtactata gtaatggaaa ctatgaagca tttgcaagac cgaagaagcc ggaaggggta 60
gataataagt ctgcatattt agttggttct ggtttagcgt cattagcagc ggcaagtttt 120
ttaatacgag atggtcaaat gaaaggtgaa aatattcata tattagaaga actcgatctc 180
cctggaggaa gcttggatgg aatattgaat cctgaacgtg gctatataat gcgtggcggt 240
cgtgagatgg agaatcattt tgaatgttta tgggatttat ttcgttcagt accatcattg 300
gaagtcgaag atgcttctgt tctggatgaa ttttactggt taaataaaga agatccaaac 360
tattcgaagt gccgcgtaat agaaaatcgt ggacaacgcc tagaatcaga tggaaaaatg 420
actctaacaa aaaaagcaaa taaagaaatt atccagctgt gcttaatgaa agaagaacag 480
ctgaatgatg tgaagatctc tgatgtcttc agtaaagact tcttagactc aaacttctgg 540
atctactgga aaacgatgtt tgcatttgaa ccttggcatt ctgctatgga gatgcgtcga 600
tatttaatgc gtttcatcca tcatattggt ggacttgcag acttttcagc tctaaaattt 660
acgaagttca atcagttcga atcacttgtt atgcctctga ttgagcatct taaagcgaag 720
aacgttacat ttgaatatgg tgtaactgtt aagaatatac aagttgaatg ttcaaaagag 780
tcaaaagttg caaaggcaat agacatcgtg cgcagaggta acgaggaatc aattccttta 840
actgaaaatg atttagtatt tgtaacaaat ggcagtatca ctgaaagtac tacttatgga 900
gataatgaca cacctgcacc gcctacatca aaacctggtg gcgcatggca actatgggaa 960
aacttaagta cgcaatgtga ggagtttggt aatccagcta aattctataa agatttacca 1020
gaaaaaagct ggttcgtgtc tgctacagca acaacaaata acaaagaagt tatagattat 1080
attcaaaaaa tttgtaaacg cgatccatta tcaggtcgta cagtaactgg cggtatcgtt 1140
actgtagatg attcaaattg gcagttaagc tttacgctaa atcgacaaca gcagtttaaa 1200
aatcaacctg atgatcaagt gagtgtatgg atttacgcac tttattcaga tgaacgtgga 1260
gaacgtacaa ataaaacaat tgttgagtgt tctggtaaag aaatttgtga agaatggctt 1320
tatcatatgg gtgttcctga agagaagatt tcagcactag cagcagaatg taatacaatt 1380
ccaagctata tgccgtacat taccgcttac tttatgccgc gtaaagaagg agatcgtcct 1440
ttagtagtac cacatggttc aaagaatatt gcatttatag gtaactttgc agaaacagaa 1500
agagataccg tatttacaac agaatattca gtaagaactg ctatggaagc ggtgtataaa 1560
cttctagaag tagaccgtgg agtgcctgaa gtattcgctt cagtatacga tgtgagaatt 1620
ttattacatg cgttatctgt actgaatgat ggcaagaaac tagatgaaat tgatatgcca 1680
ttctatgaaa gattggtaga aaaacgcttg ttgaagaaag catctggtac gttcattgaa 1740
gaactgttag aagaagcaaa tttgatataa 1770
<210> 47
<211> 831
<212> DNA
<213> 恶臭假单胞菌
<400> 47
atgagcaaat acgaaggccg ctggaccacc gtgaaggtcg aactggaagc gggcatcgcc 60
tgggtgaccc tcaatcgccc ggaaaaacgc aatgccatga gccccaccct gaaccgggaa 120
atggtcgacg tgctggaaac ccttgagcag gacgctgacg ctggcgtgct ggtattgacc 180
ggtgccggcg agtcctggac cgccggcatg gacctgaagg agtacttccg cgaggtggac 240
gccggcccgg aaatcctcca ggaaaagatt cgtcgcgaag cctcgcaatg gcaatggaag 300
ttgctgcgtc tgtatgccaa accgaccatc gccatggtca acggctggtg cttcggcggc 360
ggcttcagcc cactggtggc atgcgacctg gcgatctgcg ccaacgaagc gaccttcggc 420
ctgtcggaaa tcaactgggg catcccgcct ggtaacctgg tcagcaaggc catggccgat 480
accgttggcc atcgtcagtc gctgtactac atcatgaccg gcaagacctt cgatggtcgc 540
aaggctgccg agatgggcct ggtgaacgac agtgtgccgc tggccgagct gcgtgaaacc 600
acccgcgagt tggcgctgaa cctgctggaa aagaacccgg tggtgctgcg tgccgcgaag 660
aatggcttca agcgttgccg cgagctgacc tgggaacaga acgaggacta cctctacgcc 720
aagctcgacc agtcgcgcct gctggacact accggcggcc gcgagcaggg catgaagcag 780
ttcctcgacg acaagagcat caagccaggc ctgcaggcct acaagcgctg a 831
<210> 48
<211> 786
<212> DNA
<213> 丙酮丁醇梭菌
<400> 48
atggaactaa acaatgtcat ccttgaaaag gaaggtaaag ttgctgtagt taccattaac 60
agacctaaag cattaaatgc gttaaatagt gatacactaa aagaaatgga ttatgttata 120
ggtgaaattg aaaatgatag cgaagtactt gcagtaattt taactggagc aggagaaaaa 180
tcatttgtag caggagcaga tatttctgag atgaaggaaa tgaataccat tgaaggtaga 240
aaattcggga tacttggaaa taaagtgttt agaagattag aacttcttga aaagcctgta 300
atagcagctg ttaatggttt tgctttagga ggcggatgcg aaatagctat gtcttgtgat 360
ataagaatag cttcaagcaa cgcaagattt ggtcaaccag aagtaggtct cggaataaca 420
cctggttttg gtggtacaca aagactttca agattagttg gaatgggcat ggcaaagcag 480
cttatattta ctgcacaaaa tataaaggca gatgaagcat taagaatcgg acttgtaaat 540
aaggtagtag aacctagtga attaatgaat acagcaaaag aaattgcaaa caaaattgtg 600
agcaatgctc cagtagctgt taagttaagc aaacaggcta ttaatagagg aatgcagtgt 660
gatattgata ctgctttagc atttgaatca gaagcatttg gagaatgctt ttcaacagag 720
gatcaaaagg atgcaatgac agctttcata gagaaaagaa aaattgaagg cttcaaaaat 780
agatag 786
<210> 49
<211> 792
<212> DNA
<213> 恶臭假单胞菌
<400> 49
atgactttcc agcacatcct gttttccatc gaggacggcg ttgccttcct ttcattgaac 60
cgccccgagc agctgaacag cttcaatacg gccatgcacc tggaggtgcg cgaagcgctc 120
agacaagtgc gccagagcag tgacgcgcgg gtgctgctgc tgacggctga aggccgcggc 180
ttctgcgccg gccaggacct gtccgaccgc aacgttgccc caggcgccga gatgccagac 240
ctgggccagt cgatcgacaa gttctacaac ccgctggtgc gcaccctgcg cgacctgcct 300
ttgccggtga tatgtgcggt caacggcgtg gcggccggtg ccggtgccaa cattcccttg 360
gcctgcgacc tggtgctggc cgcccgctcg gccagtttca tccaggcctt ctgcaagatc 420
ggcctggtgc cggactccgg cggtacttgg ctgctgccgc gcttggtcgg catggcccgg 480
gccaaggcgc tggccatgct gggcgagcgc cttggcgccg aacaggccga gcaatggggg 540
ctgatctacc gcgtggtgga tgatgcagcg ctgcgtgatg aagccctcac cctcgcccgc 600
cacctcgccg cccagcccac ctacggcctg acactgatca agcgcagcct caatgccagt 660
ttcgacaatg gttttgaggc gcagctggag ctggagcgcg acctgcagcg cctggcaggg 720
cgcagcgagg actaccgcga aggcgtgaac gccttcatga acaaacgcac gccagccttc 780
aaggggcgct ga 792
<210> 50
<211> 1164
<212> DNA
<213> 大肠杆菌
<400> 50
atggaacagg ttgtcattgt cgatgcaatt cgcaccccga tgggccgttc gaagggcggt 60
gcttttcgta acgtgcgtgc agaagatctc tccgctcatt taatgcgtag cctgctggcg 120
cgtaacccgg cgctggaagc ggcggccctc gacgatattt actggggttg tgtgcagcag 180
acgctggagc agggttttaa tatcgcccgt aacgcggcgc tgctggcaga agtaccacac 240
tctgtcccgg cggttaccgt taatcgcttg tgtggttcat ccatgcaggc actgcatgac 300
gcagcacgaa tgatcatgac tggcgatgcg caggcatgtc tggttggcgg cgtggagcat 360
atgggccatg tgccgatgag tcacggcgtc gattttcacc ccggcctgag ccgcaatgtc 420
gccaaagcgg cgggcatgat gggcttaacg gcagaaatgc tggcgcgtat gcacggtatc 480
agccgtgaaa tgcaggatgc ctttgccgcg cggtcacacg cccgcgcctg ggccgccacg 540
cagtcggccg catttaaaaa tgaaatcatc ccgaccggtg gtcacgatgc cgacggcgtc 600
ctgaagcagt ttaattacga cgaagtgatt cgcccggaaa ccaccgtgga agccctcgcc 660
acgctgcgtc cggcgtttga tccagtaaac ggtatggtaa cggcgggcac atcttctgca 720
ctttccgatg gcgcagctgc catgctggtg atgagtgaaa gccgcgccca tgaattaggt 780
cttaagccgc gcgctcgtgt gcgttcgatg gcggtcgttg gttgtgaccc atcgattatg 840
ggttacggcc cggttccggc ctcgaaactg gcgctgaaaa aagcggggct ttctgccagc 900
gatatcggcg tgtttgaaat gaacgaagcc tttgccgcgc agatcctgcc atgtattaaa 960
gatctgggac taattgagca gattgacgag aagatcaacc tcaacggtgg cgcgatcgcg 1020
ctgggtcatc cgctgggttg ttccggtgcg cgtatcagca ccacgctgct gaatctgatg 1080
gaacgcaaag acgttcagtt tggtctggcg acgatgtgta tcggtctggg tcagggtatt 1140
gcgacggtgt ttgagcgggt ttaa 1164
<210> 51
<211> 2190
<212> DNA
<213> 大肠杆菌
<400> 51
atgctttaca aaggcgacac cctgtacctt gactggctgg aagatggcat tgccgaactg 60
gtatttgatg ccccaggttc agttaataaa ctcgacactg cgaccgtcgc cagcctcggc 120
gaggccatcg gcgtgctgga acagcaatca gatctaaaag ggctgctgct gcgttcgaac 180
aaagcagcct ttatcgtcgg tgctgatatc accgaatttt tgtccctgtt cctcgttcct 240
gaagaacagt taagtcagtg gctgcacttt gccaatagcg tgtttaatcg cctggaagat 300
ctgccggtgc cgaccattgc tgccgtcaat ggctatgcgc tgggcggtgg ctgcgaatgc 360
gtgctggcga ccgattatcg tctggcgacg ccggatctgc gcatcggtct gccggaaacc 420
aaactgggca tcatgcctgg ctttggcggt tctgtacgta tgccacgtat gctgggcgct 480
gacagtgcgc tggaaatcat tgccgccggt aaagatgtcg gcgcggatca ggcgctgaaa 540
atcggtctgg tggatggcgt agtcaaagca gaaaaactgg ttgaaggcgc aaaggcggtt 600
ttacgccagg ccattaacgg cgacctcgac tggaaagcaa aacgtcagcc gaagctggaa 660
ccactaaaac tgagcaagat tgaagccacc atgagcttca ccatcgctaa agggatggtc 720
gcacaaacag cggggaaaca ttatccggcc cccatcaccg cagtaaaaac cattgaagct 780
gcggcccgtt ttggtcgtga agaagcctta aacctggaaa acaaaagttt tgtcccgctg 840
gcgcatacca acgaagcccg cgcactggtc ggcattttcc ttaacgatca atatgtaaaa 900
ggcaaagcga agaaactcac caaagacgtt gaaaccccga aacaggccgc ggtgctgggt 960
gcaggcatta tgggcggcgg catcgcttac cagtctgcgt ggaaaggcgt gccggttgtc 1020
atgaaagata tcaacgacaa gtcgttaacc ctcggcatga ccgaagccgc gaaactgctg 1080
aacaagcagc ttgagcgcgg caagatcgat ggtctgaaac tggctggcgt gatctccaca 1140
atccacccaa cgctcgacta cgccggattt gaccgcgtgg atattgtggt agaagcggtt 1200
gttgaaaacc cgaaagtgaa aaaagccgta ctggcagaaa ccgaacaaaa agtacgccag 1260
gataccgtgc tggcgtctaa cacttcaacc attcctatca gcgaactggc caacgcgctg 1320
gaacgcccgg aaaacttctg cgggatgcac ttctttaacc cggtccaccg aatgccgttg 1380
gtagaaatta ttcgcggcga gaaaagctcc gacgaaacca tcgcgaaagt tgtcgcctgg 1440
gcgagcaaga tgggcaagac gccgattgtg gttaacgact gccccggctt ctttgttaac 1500
cgcgtgctgt tcccgtattt cgccggtttc agccagctgc tgcgcgacgg cgcggatttc 1560
cgcaagatcg acaaagtgat ggaaaaacag tttggctggc cgatgggccc ggcatatctg 1620
ctggacgttg tgggcattga taccgcgcat cacgctcagg ctgtcatggc agcaggcttc 1680
ccgcagcgga tgcagaaaga ttaccgcgat gccatcgacg cgctgtttga tgccaaccgc 1740
tttggtcaga agaacggcct cggtttctgg cgttataaag aagacagcaa aggtaagccg 1800
aagaaagaag aagacgccgc cgttgaagac ctgctggcag aagtgagcca gccgaagcgc 1860
gatttcagcg aagaagagat tatcgcccgc atgatgatcc cgatggtcaa cgaagtggtg 1920
cgctgtctgg aggaaggcat tatcgccact ccggcggaag cggatatggc gctggtctac 1980
ggcctgggct tccctccgtt ccacggcggc gcgttccgct ggctggacac cctcggtagc 2040
gcaaaatacc tcgatatggc acagcaatat cagcacctcg gcccgctgta tgaagtgccg 2100
gaaggtctgc gtaataaagc gcgtcataac gaaccgtact atcctccggt tgagccagcc 2160
cgtccggttg gcgacctgaa aacggcttaa 2190
<210> 52
<211> 702
<212> DNA
<213> 大肠杆菌
<400> 52
atgacaacct taagctgtaa agtgacctcg gtagaagcta tcacggatac cgtatatcgt 60
gtccgcatcg tgccagacgc ggccttttct tttcgtgctg gtcagtattt gatggtagtg 120
atggatgagc gcgacaaacg tccgttctca atggcttcga cgccggatga aaaagggttt 180
atcgagctgc atattggcgc ttctgaaatc aacctttacg cgaaagcagt catggaccgc 240
atcctcaaag atcatcaaat cgtggtcgac attccccacg gagaagcgtg gctgcgcgat 300
gatgaagagc gtccgatgat tttgattgcg ggcggcaccg ggttctctta tgcccgctcg 360
attttgctga cagcgttggc gcgtaaccca aaccgtgata tcaccattta ctggggcggg 420
cgtgaagagc agcatctgta tgatctctgc gagcttgagg cgctttcgtt gaagcatcct 480
ggtctgcaag tggtgccggt ggttgaacaa ccggaagcgg gctggcgtgg gcgtactggc 540
accgtgttaa cggcggtatt gcaggatcac ggtacgctgg cagagcatga tatctatatt 600
gccggacgtt ttgagatggc gaaaattgcc cgcgatctgt tttgcagtga gcgtaatgcg 660
cgggaagatc gcctgtttgg cgatgcgttt gcatttatct ga 702
<210> 53
<211> 2145
<212> DNA
<213> 大肠杆菌
<400> 53
atggaaatga catcagcgtt tacccttaat gttcgtctgg acaacattgc cgttatcacc 60
atcgacgtac cgggtgagaa aatgaatacc ctgaaggcgg agtttgcctc gcaggtgcgc 120
gccattatta agcaactccg tgaaaacaaa gagttgcgag gcgtggtgtt tgtctccgct 180
aaaccggaca acttcattgc tggcgcagac atcaacatga tcggcaactg caaaacggcg 240
caagaagcgg aagctctggc gcggcagggc caacagttga tggcggagat tcatgctttg 300
cccattcagg ttatcgcggc tattcatggc gcttgcctgg gtggtgggct ggagttggcg 360
ctggcgtgcc acggtcgcgt ttgtactgac gatcctaaaa cggtgctcgg tttgcctgaa 420
gtacaacttg gattgttacc cggttcaggc ggcacccagc gtttaccgcg tctgataggc 480
gtcagcacag cattagagat gatcctcacc ggaaaacaac ttcgggcgaa acaggcatta 540
aagctggggc tggtggatga cgttgttccg cactccattc tgctggaagc cgctgttgag 600
ctggcaaaga aggagcgccc atcttcccgc cctctacctg tacgcgagcg tattctggcg 660
gggccgttag gtcgtgcgct gctgttcaaa atggtcggca agaaaacaga acacaaaact 720
caaggcaatt atccggcgac agaacgcatc ctggaggttg ttgaaacggg attagcgcag 780
ggcaccagca gcggttatga cgccgaagct cgggcgtttg gcgaactggc gatgacgcca 840
caatcgcagg cgctgcgtag tatctttttt gccagtacgg acgtgaagaa agatcccggc 900
agtgatgcgc cgcctgcgcc attaaacagc gtggggattt taggtggtgg cttgatgggc 960
ggcggtattg cttatgtcac tgcttgtaaa gcggggattc cggtcagaat taaagatatc 1020
aacccgcagg gcataaatca tgcgctgaag tacagttggg atcagctgga gggcaaagtt 1080
cgccgtcgtc atctcaaagc cagcgaacgt gacaaacagc tggcattaat ctccggaacg 1140
acggactatc gcggctttgc ccatcgcgat ctgattattg aagcggtgtt tgaaaatctc 1200
gaattgaaac aacagatggt ggcggaagtt gagcaaaatt gcgccgctca taccatcttt 1260
gcttcgaata cgtcatcttt accgattggt gatatcgccg ctcacgccac gcgacctgag 1320
caagttatcg gcctgcattt cttcagtccg gtggaaaaaa tgccgctggt ggagattatt 1380
cctcatgcgg ggacatcggc gcaaaccatc gctaccacag taaaactggc gaaaaaacag 1440
ggtaaaacgc caattgtcgt gcgtgacaaa gccggttttt acgtcaatcg catcttagcg 1500
ccttacatta atgaagctat ccgcatgttg acccaaggtg aacgggtaga gcacattgat 1560
gccgcgctag tgaaatttgg ttttccggta ggcccaatcc aacttttgga tgaggtagga 1620
atcgacaccg ggactaaaat tattcctgta ctggaagccg cttatggaga acgttttagc 1680
gcgcctgcaa atgttgtttc ttcaattttg aacgacgatc gcaaaggcag aaaaaatggc 1740
cggggtttct atctttatgg tcagaaaggg cgtaaaagca aaaaacaggt cgatcccgcc 1800
atttacccgc tgattggcac acaagggcag gggcgaatct ccgcaccgca ggttgctgaa 1860
cggtgtgtga tgttgatgct gaatgaagca gtacgttgtg ttgatgagca ggttatccgt 1920
agcgtgcgtg acggggatat tggcgcggta tttggcattg gttttccgcc atttctcggt 1980
ggaccgttcc gctatatcga ttctctcggc gcgggcgaag tggttgcaat aatgcaacga 2040
cttgccacgc agtatggttc ccgttttacc ccttgcgagc gtttggtcga gatgggcgcg 2100
cgtggggaaa gtttttggaa aacaactgca actgacctgc aataa 2145
<210> 54
<211> 720
<212> DNA
<213> 大肠杆菌
<400> 54
atggtcatta aggcgcaaag cccggcgggt ttcgcggaag agtacattat tgaaagtatc 60
tggaataacc gcttccctcc cgggactatt ttgcccgcag aacgtgaact ttcagaatta 120
attggcgtaa cgcgtactac gttacgtgaa gtgttacagc gtctggcacg agatggctgg 180
ttgaccattc aacatggcaa gccgacgaag gtgaataatt tctgggaaac ttccggttta 240
aatatccttg aaacactggc gcgactggat cacgaaagtg tgccgcagct tattgataat 300
ttgctgtcgg tgcgtaccaa tatttccact atttttattc gcaccgcgtt tcgtcagcat 360
cccgataaag cgcaggaagt gctggctacc gctaatgaag tggccgatca cgccgatgcc 420
tttgccgagc tggattacaa catattccgc ggcctggcgt ttgcttccgg caacccgatt 480
tacggtctga ttcttaacgg gatgaaaggg ctgtatacgc gtattggtcg tcactatttc 540
gccaatccgg aagcgcgcag tctggcgctg ggcttctacc acaaactgtc ggcgttgtgc 600
agtgaaggcg cgcacgatca ggtgtacgaa acagtgcgtc gctatgggca tgagagtggc 660
gagatttggc accggatgca gaaaaatctg ccgggtgatt tagccattca ggggcgataa 720
<210> 55
<211> 1000
<212> DNA
<213> 解芳烃卡斯特兰尼氏菌
<400> 55
atgcggttca cattgaagac gacggcgatt gtgtcggccg ccgccctgct ggccggtttc 60
gggccgccgc cccgcgcggc ggaactgccg ccggggcggc tcgccaccac cgaggactat 120
ttcgcgcagc aggcgaagca ggccgtcacc cccgacgtga tggcccagct ggcctacatg 180
aactacatcg atttcatctc gcccttctac agccggggct gctccttcga ggcctgggag 240
ctcaagcaca cgccgcagcg ggtcatcaag tattcgatcg ccttctatgc gtatggcctg 300
gccagcgtgg cgctcatcga cccgaagctg cgtgcgctcg ccggccatga cctggacatc 360
gcggtctcca agatgaagtg caagcgggtc tggggcgact gggaggaaga cgggttcggc 420
accgacccga tcgagaaaga gaacatcatg tacaagggcc acctgaacct gatgtacggc 480
ctctatcagc tggtgaccgg cagccgccgg tacgaagccg agcatgccca cctcacccgc 540
atcatccatg acgagatcgc ggccaacccc tttgccggca tcgtctgcga gccggacaat 600
tattttgtcc agtgcaattc ggtcgcctac ctgagcctgt gggtctatga ccggctgcat 660
ggcaccgact accgggcggc caccagggcc tggctggatt tcatccagaa ggacctgatc 720
gatcccgagc ggggcgcctt ctacctgtcc tatcaccccg agtccggcgc ggtgaagccg 780
tggatctcgg cgtatacgac agcctggacg ctcgccatgg tgcacggcat ggaccccgcc 840
ttttccgagc gctactaccc ccggttcaag cagaccttcg tcgaggtcta cgacgagggc 900
cgcaaggccc gggtgcgcga gacggccggc acggacgacg cggatggcgg ggtgggcctg 960
gcttcggcgt tcaccctgct gctggcccgc gagatgggcg 1000
<210> 56
<211> 1000
<212> DNA
<213> 解芳烃卡斯特兰尼氏菌
<400> 56
atgcggttca cattgaagac gacggcgatt gtgtcggccg ccgccctgct ggccggtttc 60
gggccgccgc cccgcgcggc ggaactgccg ccggggcggc tcgccaccac cgaggactat 120
ttcgcgcagc aggcgaagca ggccgtcacc cccgacgtga tggcccagct ggcctacatg 180
aactacatcg atttcatctc gcccttctac agccggggct gctccttcga ggcctgggag 240
ctcaagcaca cgccgcagcg ggtcatcaag tattcgatcg ccttctatgc gtatggcctg 300
gccagcgtgg cgctcatcga cccgaagctg cgtgcgctcg ccggccatga cctggacatc 360
gcggtctcca agatgaagtg caagcgggtc tggggcgact gggaggaaga cgggttcggc 420
accgacccga tcgagaaaga gaacatcatg tacaagggcc acctgaacct gatgtacggc 480
ctctatcagc tggtgaccgg cagccgccgg tacgaagccg agcatgccca cctcacccgc 540
atcatccatg acgagatcgc ggccaacccc tttgccggca tcgtctgcga gccggacaat 600
tattttgtcc agtgcaattc ggtcgcctac ctgagcctgt gggtctatga ccggctgcat 660
ggcaccgact accgggcggc caccagggcc tggctggatt tcatccagaa ggacctgatc 720
gatcccgagc ggggcgcctt ctacctgtcc tatcaccccg agtccggcgc ggtgaagccg 780
tggatctcgg cgtatacgac agcctggacg ctcgccatgg tgcacggcat ggaccccgcc 840
ttttccgagc gctactaccc ccggttcaag cagaccttcg tcgaggtcta cgacgagggc 900
cgcaaggccc gggtgcgcga gacggccggc acggacgacg cggatggcgg ggtgggcctg 960
gcttcggcgt tcaccctgct gctggcccgc gagatgggcg 1000
<210> 57
<211> 1392
<212> DNA
<213> 硫磺矿硫化叶菌
<400> 57
atgagatcaa aagaagattt cctaaagtcc ttaaaagatg gaagaaattt gtattatagg 60
gggaagttag tagaagatat aacaacacat cagatcttaa agacagccgc attgcacgca 120
gctaagttat atgaatacgc tgatagagtc tatgaggata ataaaatggg aaaaatgagc 180
aagttcttta aggtaccttg gacatctcaa gatttgctag atagacataa actaatttac 240
gatttaacga tgtattgtaa tggggtattt aacatttcac aagcaatagg aagtgatgcg 300
atctttgccc ttatgatcac ggcaaaacaa gttgatagaa aatacggaac tgattactca 360
aaacgtgttg aaaaatattt tgagagagtt gctaaagaag atttaacgtt agccactgcc 420
cagactgacg ttaagggaga tcgaagtaag aggccttctg aacaagttga tccagatatg 480
tatgttagag tagttgatgt gaaaagcgat ggaatagttg ttagaggagc aaaggctcat 540
acaactcaat ctgcggtatc tgatgagatt attgtcatac caaccagagt aatgagggat 600
agcgataaag attacgcagt agcctttgcg gttccagcta atactaaagg tttgaagatg 660
tatattagac caattgatga aattgagggc aattcctcct cagtactcag tagaaaagat 720
tatgagctag aaacattaac cgtcttcaac gacgttttcg ttccttggga tagggtattt 780
ttatttaagg aatacgacta cgctggaaca ttggctatgc tatttgcaac cttccatagg 840
tttactgcat tatcgtatag gtcagcgacc atgaatctat atttgggagc atctaaagtg 900
gcatctcaag taaatggcat tgagaatgaa aagcatgtga gagatgatat agttgatata 960
attctctaca aggaaattat gaggagtagc gcgatagctg cggctgtgta tccagtaaac 1020
atggagggta tagctgtgcc caacccgctt tttactaatg ttggtaaatt atactccaat 1080
atgcatttcc atgatgttgt aagagattta attgacattg ctggggggat aatagctact 1140
atgccctctc aagaagattt ggaaagtgat gaaggaaaga atattgttaa atatttaagg 1200
ggctcagttg atggagagga aagagcaaaa gtgttaaaac tagctaagga attaggggct 1260
agtacgttta ctggctattt gctaactggt atgatacatg cggaaggttc tatggaagct 1320
agcaaaatag agctattcag aagttataat tttaaggagg ccgagaactt agttaaaagg 1380
gtattaagct ag 1392
<210> 58
<211> 1206
<212> DNA
<213> 大肠杆菌
<400> 58
atgcgtgaag cctttatttg tgacggaatt cgtacgccaa ttggtcgcta cggcggggca 60
ttatcaagtg ttcgggctga tgatctggct gctatccctt tgcgggaact gctggtgcga 120
aacccgcgtc tcgatgcgga gtgtatcgat gatgtgatcc tcggctgtgc taatcaggcg 180
ggagaagata accgtaacgt agcccggatg gcgactttac tggcggggct gccgcagagt 240
gtttccggca caaccattaa ccgcttgtgt ggttccgggc tggacgcact ggggtttgcc 300
gcacgggcga ttaaagcggg cgatggcgat ttgctgatcg ccggtggcgt ggagtcaatg 360
tcacgggcac cgtttgttat gggcaaggca gccagtgcat tttctcgtca ggctgagatg 420
ttcgatacca ctattggctg gcgatttgtg aacccgctca tggctcagca atttggaact 480
gacagcatgc cggaaacggc agagaatgta gctgaactgt taaaaatctc acgagaagat 540
caagatagtt ttgcgctacg cagtcagcaa cgtacggcaa aagcgcaatc ctcaggcatt 600
ctggctgagg agattgttcc ggttgtgttg aaaaacaaga aaggtgttgt aacagaaata 660
caacatgatg agcatctgcg cccggaaacg acgctggaac agttacgtgg gttaaaagca 720
ccatttcgtg ccaatggggt gattaccgca ggcaatgctt ccggggtgaa tgacggagcc 780
gctgcgttga ttattgccag tgaacagatg gcagcagcgc aaggactgac accgcgggcg 840
cgtatcgtag ccatggcaac cgccggggtg gaaccgcgcc tgatggggct tggtccggtg 900
cctgcaactc gccgggtgct ggaacgcgca gggctgagta ttcacgatat ggacgtgatt 960
gaactgaacg aagcgttcgc ggcccaggcg ttgggtgtac tacgcgaatt ggggctgcct 1020
gatgatgccc cacatgttaa ccccaacgga ggcgctatcg ccttaggcca tccgttggga 1080
atgagtggtg cccgcctggc actggctgcc agccatgagc tgcatcggcg taacggtcgt 1140
tacgcattgt gcaccatgtg catcggtgtc ggtcagggca tcgccatgat tctggagcgt 1200
gtttga 1206
<210> 59
<211> 1221
<212> DNA
<213> 恶臭假单胞菌
<400> 59
atgaatgaac cgacccacgc cgatgccttg atcatcgacg ccgtgcgcac gcccattggc 60
cgctatgccg gggccctgag cagcgtgcgc gccgacgacc tggcggccat cccgctcaaa 120
gccttgatcc agcgtcaccc cgaactggac tggaaagcca ttgatgacgt tatcttcggc 180
tgtgccaacc aggctggcga agacaaccgc aacgtggccc acatggcgag cctgctggcc 240
gggctgccac tcgaagtacc agggaccacg atcaaccgcc tgtgcggttc cggtctggat 300
gccatcggta atgcggcacg tgccctgcgc tgcggtgaag cggggctcat gctggccggt 360
ggtgtggagt ccatgtcgcg tgcaccgttt gtgatgggta agtcggagca ggcattcggg 420
cgtgcggccg agctgttcga caccaccatc ggctggcgtt tcgtcaaccc gctgatgaag 480
gccgcctacg gcatcgattc gatgccggaa acggctgaaa acgtggccga acagttcggc 540
atctcgcgcg ccgaccagga tgcctttgcc ctgcgcagcc agcacaaagc cgcagcagct 600
caggcccgcg gccgcctggc gcgggaaatc gtgccggtcg aaatcccgca acgcaaaggc 660
ccagccaaag tggtcgagca tgacgagcac ccgcgcggcg acacgaccct ggagcagctg 720
gctcggctcg ggacgccgtt tcgtgaaggc ggcagcgtaa cggcgggtaa tgcctccggc 780
gtgaatgacg gcgcttgcgc cctgctgctg gccagcagcg ccgcggcccg ccgccatggg 840
ttgaaggccc gcggccgcat cgtcggcatg gcggtggccg gggttgagcc caggctgatg 900
ggcattggtc cggtgcctgc gacccgcaag gtgctggcgc tcaccggcct ggcactggct 960
gacctggatg tcatcgaact caatgaggcc tttgccgccc aagggctggc cgtgttgcgc 1020
gagctgggcc tggccgacga cgacccgcga gtcaaccgca acggcggcgc catcgccctg 1080
ggccatcccc tgggcatgag cggtgcccgg ttggtgacca ctgccttgca cgagcttgaa 1140
gaaacggccg gccgctacgc cctgtgcacc atgtgcatcg gcgtaggcca aggcattgcc 1200
atgatcatcg agcgcctctg a 1221
<210> 60
<211> 1203
<212> DNA
<213> 恶臭假单胞菌
<400> 60
atgcacgacg tattcatctg tgacgccatc cgtaccccga tcggccgctt cggcggcgcc 60
ctggccagcg tgcgggccga cgacctggcc gccgtgccgc tgaaggcgct gatcgagcgc 120
aaccctggcg tgcagtggga ccaggtagac gaagtgttct tcggctgcgc caaccaggcc 180
ggtgaagaca accgcaacgt ggcccgcatg gcactgctgc tggccggcct gccggaaagc 240
atcccgggcg tcaccctgaa ccgtctgtgc gcgtcgggca tggatgccgt cggcaccgcg 300
ttccgcgcca tcgccagcgg cgagatggag ctggtgattg ccggtggcgt cgagtcgatg 360
tcgcgcgccc cgttcgtcat gggcaaggct gaaagcgcct attcgcgcaa catgaagctg 420
gaagacacca ccattggctg gcgtttcatc aacccgctga tgaagagcca gtacggtgtg 480
gattccatgc cggaaaccgc cgacaacgtg gccgacgact atcaggtttc gcgtgctgat 540
caggacgctt tcgccctgcg cagccagcag aaggctgccg ctgcgcaggc tgccggcttc 600
tttgccgaag aaatcgtgcc ggtgcgtatc gctcacaaga agggcgaaat catcgtcgaa 660
cgtgacgaac acctgcgccc ggaaaccacg ctggaggcgc tgaccaagct caaaccggtc 720
aacggcccgg acaagacggt caccgccggc aacgcctcgg gcgtgaacga cggtgctgcg 780
gcgatgatcc tggcctcggc cgcagcggtg aagaaacacg gcctgactcc gcgtgcccgc 840
gttctgggca tggccagcgg cggcgttgcg ccacgtgtca tgggcattgg cccggtgccg 900
gcggtgcgca aactgaccga gcgtctgggg atagcggtaa gtgatttcga cgtgatcgag 960
cttaacgaag cgtttgccag ccaaggcctg gcggtgctgc gtgagctggg tgtggctgac 1020
gatgcgcccc aggtaaaccc taatggcggt gccattgccc tgggccaccc cctgggcatg 1080
agcggtgcac gcctggtact gactgcgttg caccagctgg agaagagtgg cggtcgcaag 1140
ggcctggcga ccatgtgtgt gggtgtcggc caaggtctgg cgttggccat cgagcgggtt 1200
tga 1203
<210> 61
<211> 1212
<212> DNA
<213> 醋酸钙不动杆菌
<400> 61
atgacattaa aaaacgctta tatcatcgat gccatccgta ctccattcgg tcgttatgcc 60
ggtggccttg cacctgtccg tgcagatgac cttggtgctg tgccgattaa agccctcatg 120
caacgtaacc caagtgtaga ttgggaacag gtcgatgatg tgatctatgg ctgtgccaac 180
caagccggtg aagataaccg taatgtcggt cgtatgtcag cacttcttgc aggtttacca 240
tatcaggtac cggcaaccac tattaaccgt ttatgcggtt cttcactcga tgccattgcc 300
attgcagccc gtgctattaa agcaggtgaa gcgaacttgg tgattgcagg tggtgtagaa 360
agcatgagcc gtgcgcctta tgtaatgggt aagtcagaca gtgcttttgg ccgtagccag 420
aagattgaag acaccaccat gggctggcgt tttattaacc caaaacttaa agaattgtat 480
ggtgtagaca ccatgcccca gactgccgaa aacgtggctg aacagtttaa cgtcaatcgt 540
gcagatcagg accagtttgc cttggtgagc caacaacgca ccgcaagcgc gcaagccaaa 600
ggcttttttt ctaaagaaat cgtggcagtt gaaatccctc agcgtaaggg tgatgctgtt 660
gtgattgata ctgatgaaca tccacgtgca tcaaccaccc ttgaaggttt aagcaaactt 720
aaatctgtgg ttaaagcaga tggcacagta acagcaggca atgcttcagg tattaatgat 780
ggtgcagcag ctctactgat tgcttctgat gaagcagttc aggcatacaa cctaaaaccc 840
cgcgccaaga ttattgcttc aacagcggtg ggtgtagaac cacggattat gggctttgct 900
ccagcaccag ccattaaaaa attacttaaa caagctaacc tgactttaga tcagatggat 960
gtaattgagc tcaatgaagc ttttgctgct caggctttgg cagtgacccg tgatttaggt 1020
ttgccagatg attctcacaa ggtaaaccca aatggtggtg ccattgcttt gggtcatcca 1080
cttggtgctt caggtgcacg catcgtgact acagccttga accagcttga acaaacaggt 1140
ggtcgctacg ctttgtgttc aatgtgtatt ggggtgggcc aaggcatcgc attgattatt 1200
gagagagtct aa 1212
<210> 62
<211> 1164
<212> DNA
<213> 嗜水气单胞菌
<400> 62
atgaaagacg tagtcattgt cgactgtatc cggaccccga tgggccggtc caagggcggc 60
gccttccgca acgtgcgtgc agaagacttg tccgcgcacc tgatgaaatc catcctgctg 120
cgcaacccca acctcgaccc gaacgagatc gaggatatct actggggctg cgtgcagcag 180
accctggagc agggcttcaa catcgcccgc aacgcagcct tgctggccgg cattcccaag 240
caggtggggg cggtcaccgt caaccgcctg tgcggctcca gcatgcaggc gctgcacgat 300
gcctcccgcg ccattcaggt aggtgatggg gatatcttca tcatcggcgg tgtcgagcac 360
atgggccacg tgccgatgag ccacggggtg gacttccacc ccggcatggc caagtcggtg 420
gcgaaagcct ccggcatgat ggggctgacc gccgagatgc tcggcaagct gcacggcatc 480
agtcgtcagc agcaggacga gtttgccgcc cgctcccatc gtcgcgctca cgccgccacc 540
gtggaaggac gtttcgccaa ggagatcgtc gggctggaag gccatgacgc cagcggcgcc 600
cgcttcttct acgactacga cgaggtgatc cgccccgaga ccacggtgga aaccctgagc 660
cagctgcgcc cggtgttcga cccggtcaac ggcaccgtca ccgccggcac ctcgtcggcc 720
ctgtccgatg gcgccgccgc catgctggtg atgagtgcgg accgcgccaa ggcgctcggc 780
ctcaccccgc gcgccaagat acgtgccatg gccgtcgccg gctgcgatgc cgccatcatg 840
ggttacggcc cggtaccggc cacccagaag gcgctcaagc gggccggcct gaccatcggc 900
gacatcgacc tgttcgagct gaacgaggcg tttgccgccc agtccctgcc ttgcgtgaag 960
gatctgggtc tgcaagacgt ggtggatgag aaggtgaacc tgaacggcgg cgccatcgcc 1020
ctgggtcacc cgctcggctg ctccggcgcc cgcatctcca ccaccctgct caacctgatg 1080
gaagagaagg acgccaccct gggggttgcc accatgtgca tcggcctggg tcagggcatc 1140
gccaccgtgt tcgaacgagt gtaa 1164
<210> 63
<211> 1005
<212> DNA
<213> 杀鲑气单胞菌
<400> 63
atggatattg tgattgttgc ggccaagcgt acccccatgg gggccttcca gggagccttg 60
gccaacctga ctgcccccga gcttggcgct tgcgccattg ctgccgccat agcacaagcc 120
gggctcaagg gggagcagat cgatgaagcc tacatgggca atgtgctcag tgccggggtg 180
gggcaggcac ccgcccgtca ggctgtgttg aaggcaggtt tgccggagag tgtgccatgc 240
accactgtca acaaggtgtg tggttccggc atgaaggcgg tgatgctggc ggcagacagc 300
ttgcgtctgg gtgacaccga catagtgatc gccggtggca tggagagcat gagccgggcg 360
ccttacctgc tcgacaaggc gcgcagcggt tttcgcatgg ggcatcagag cgtgctggat 420
catatgttcc tcgatggctt gcaggatgct tacgaaggcc agttgatggg gcattatgcc 480
cagttgagtg cggatcgcgc cggtctggcc cgctccgaca tggacgcttt tgccatcgct 540
tccctgacgc gtgcgctggc tgcccagcag agcggtgctt tcaaggccga gctggcccag 600
gttactgtcg gtgacaccct gctgctcgcc gaggatgagc agcctgccaa ggccaggccc 660
gacaagatcc ctcatctgaa accggcattc agcaagcagg gcaccataac ggctgccaat 720
gccagctcca tctcggacgg agcggcggcg ctcatcctga tgcgagccga gacggcggcg 780
cagctgggcc tgcctgtgct ggccatggcg ggttgcaacc tgcctcatga caaggtgaac 840
gtgaacggcg gggcctgcgc actggggcat ccactggggg cgagtggtgc ccgtattctg 900
gttacgctca ttcatgcact gcatgcgcgc agtctgaaac ggggtgtggc aagcctgtgt 960
atcggtggag gggaggcgac tgccgtcgcc atcgagttga gctaa 1005
<210> 64
<211> 1206
<212> DNA
<213> 产气假单胞菌
<400> 64
atgagccgcg aggtattcat ctgcgatgcc gtgcgcacgc cgatcggccg tttcggcggc 60
agtctttccg cggtgcgcgc cgacgacctc gcggcggtgc cgctgaaggc cctggtcgag 120
cgcaacccgg gggtcgactg gtcggcgctg gacgaggtgt tcctcggctg cgccaaccag 180
gccggcgagg acaaccgtaa cgtggcgcgc atggcgctgc tgctggccgg tttgccggag 240
agcgtgcccg gcgtcaccct caaccgcctc tgcgcctcgg ggatggacgc catcggcacg 300
gcgttccgcg ccatcgcctg cggcgagatg gagctggcca tcgccggcgg cgtcgagtcg 360
atgtcgcgcg cgccgtacgt gatgggcaag gccgatagcg ccttcgggcg cggccagaag 420
atcgaggaca ccaccatcgg ctggcgcttc gtcaacccgc tgatgaagga gcagtacggc 480
atcgacccga tgccgcagac cgccgacaac gtcgccgacg actatcgcgt gtcgcgtgcc 540
gaccaggatg ccttcgccct gcgcagccag cagcgcgccg gcagggcgca ggcggccggt 600
ttcttcgccg aggaaatcgt cccggtgacg attcgcgggc gcaagggcga caccctggtc 660
gagtacgacg agcatccgcg tcccgacacc accctggagg cgctggcccg gctcaagccg 720
gtcaacgggc cggagaagac cgtcaccgcc ggcaacgcgt ccggggtcaa cgacggcgcc 780
gccgcgctgg tcctggcctc cgccgaggca gtggagaagc acggcctgac tccgcgcgcg 840
cgggtgctgg gcatggccag cgccggcgtc gccccacgga tcatgggcat cggcccggtg 900
ccggcggtgc gcaagctgct gcggcgcctg gacctggcga tcgacgcctt cgacgtgatc 960
gaactcaacg aagccttcgc cagccagggc ctggcctgcc tgcgcgaact gggcgtggcc 1020
gacgacagtg agaaggtcaa cccgaacggc ggtgccatcg ccctcggcca cccgctgggg 1080
atgagcggtg cgcggctggt cctcaccgcg ctccatcaac ttgagaagag cggcggccgg 1140
cgcggcctgg cgaccatgtg cgtaggcgtc ggccaaggcc tggcgctggc catcgagcgg 1200
gtctga 1206
<210> 65
<211> 1185
<212> DNA
<213> 富养罗尔斯通氏菌
<400> 65
atgacgcgtg aagtggtagt ggtaagcggt gtccgtaccg cgatcgggac ctttggcggc 60
agcctgaagg atgtggcacc ggcggagctg ggcgcactgg tggtgcgcga ggcgctggcg 120
cgcgcgcagg tgtcgggcga cgatgtcggc cacgtggtat tcggcaacgt gatccagacc 180
gagccgcgcg acatgtatct gggccgcgtc gcggccgtca acggcggggt gacgatcaac 240
gcccccgcgc tgaccgtgaa ccgcctgtgc ggctcgggcc tgcaggccat tgtcagcgcc 300
gcgcagacca tcctgctggg cgataccgac gtcgccatcg gcggcggcgc ggaaagcatg 360
agccgcgcac cgtacctggc gccggcagcg cgctggggcg cacgcatggg cgacgccggc 420
ctggtcgaca tgatgctggg tgcgctgcac gatcccttcc atcgcatcca catgggcgtg 480
accgccgaga atgtcgccaa ggaatacgac atctcgcgcg cgcagcagga cgaggccgcg 540
ctggaatcgc accgccgcgc ttcggcagcg atcaaggccg gctacttcaa ggaccagatc 600
gtcccggtgg tgagcaaggg ccgcaagggc gacgtgacct tcgacaccga cgagcacgtg 660
cgccatgacg ccaccatcga cgacatgacc aagctcaggc cggtcttcgt caaggaaaac 720
ggcacggtca cggccggcaa tgcctcgggc ctgaacgacg ccgccgccgc ggtggtgatg 780
atggagcgcg ccgaagccga gcgccgcggc ctgaagccgc tggcccgcct ggtgtcgtac 840
ggccatgccg gcgtggaccc gaaggccatg ggcatcggcc cggtgccggc gacgaagatc 900
gcgctggagc gcgccggcct gcaggtgtcg gacctggacg tgatcgaagc caacgaagcc 960
tttgccgcac aggcgtgcgc cgtgaccaag gcgctcggtc tggacccggc caaggttaac 1020
ccgaacggct cgggcatctc gctgggccac ccgatcggcg ccaccggtgc cctgatcacg 1080
gtgaaggcgc tgcatgagct gaaccgcgtg cagggccgct acgcgctggt gacgatgtgc 1140
atcggcggcg ggcagggcat tgccgccatc ttcgagcgta tctga 1185
<210> 66
<211> 1188
<212> DNA
<213> 沼泽红假单胞菌
<400> 66
atgaccgagg ccgttatcgt ttcaaccgcg cgcacgccga tcggcaaggc gtatcgcggc 60
gccctcaacg ccaccgaggg tgccacactg ctcggccacg ccatcgagca cgcggtgaag 120
cgcgccggta tcgacccgaa ggaggtcgag gacgtggtga tgggcgcggc gatgcagcag 180
ggcgccaccg gcggcaacat cgcccgcaag gcgctgctgc gcgccggcct gccggtgact 240
accgccggca ccaccatcga tcggcagtgc gcctccggcc tgcaggcgat cgcgctcgcc 300
gctcgctcgg tgctgttcga cggcgtcgag atcgcggtcg gcggtggcgg cgagtcgatc 360
tcgctcgtcc agaacgacaa gatgaacacc ttccacgccg tcgatccggc gctcgaggcg 420
atcaagggcg acgtctacat ggcgatgctc gacaccgccg aaaccgtggc gaagcgctac 480
ggcatctcgc gcgagcgcca ggacgagtat tcgctggaaa gccagcgccg caccgcggct 540
gcgcagcagg gcggcaagtt caacgacgag atcgcgccga tctcgaccaa gatgggcgtc 600
gtcgacaagg ccaccggcgc ggtgtcgttc aaggatatca cgctgtcgca ggacgaaggc 660
ccgcggccgg aaaccaccgc tgaaggtctc gccggtctta aggccgtgcg tggtgaaggc 720
ttcaccatca ctgccggcaa tgccagccag ctgtcggacg gcgcctcggc cacggtgatc 780
atgagcgaca agacggcggc cgcgaagggc ctcaagccgc tcggcatctt ccgcggcatg 840
gtctcctacg gctgcgagcc ggacgagatg ggcatcggcc cggtgttcgc ggtgccgcgc 900
ctgttgaagc gccatggtct cagcgtcgac gacatcggtc tgtgggagct gaacgaagcc 960
ttcgccgtgc aggtgctgta ctgccgcgac aagctcggca tcgatccgga gaagctcaat 1020
gtcaacggcg gcgcgatctc ggtcggccac ccctacggca tgtcgggtgc acgcctcgcc 1080
ggccacgcgc tgatcgaagg ccgtcgccgc aaggcgaagt acgcggtggt cacgatgtgc 1140
gtcggcggcg gcatgggctc cgccggcctg ttcgagatcg tgcactga 1188
<210> 67
<211> 1293
<212> DNA
<213> 酸养互营菌
<400> 67
atgaaagatg tcgtcatcgt aagcggcgcc agaaccgccg tgggtgcttt tggcggatcg 60
ctgaaaggcg tgagagttac ggatttggga gcgctggtca tcaaagaggc catcaagaga 120
gcggggctgc ggccggccat cagtgaagaa gtgaaaggct gccgttgcga taccttcgga 180
gaattcgaca agaccgaaat caacaagaaa tattatgatt acgatgaatc cctgaccccc 240
gtttatttcg acgagtgcat catggggaac tgcctgatcg ccggcctggg acagaatccc 300
ggccgtcagt ccagcatcta tgccggtctg cccgaagaaa cgaacaccat cacagtgaac 360
aaggtctgcg catccggcat gaaagccatc accctggccg cccagatcat caaagccggc 420
gatgccgaca tcatggtggc cggcggcatg gaaaacatga gcaatgtacc ctacgccctg 480
cccgacgccc gctggggata ccggatgaac atgcctacgg gttccatcat cgacctcatg 540
gttcatgatg gtctctggga aatcttcaac ggctatcaca tgggattcac ggcggaaaat 600
atcgcctccc gttatggaat cagccgtcag gcccaggacg agctggccct catgagccat 660
cagcgcgccc gtgcggccat cgccagcggc gccgtcgccg atgaaatcat ccccgttccg 720
ctgcccgtga agaaaggcgc ggctccgcag tttttctccg tcgacgagcg tcccatggac 780
accagcctgg aaaagatggc gaagctggcc ccagtcttca agaaggacgg aaccgtcacg 840
gcggccaacg cctcgggtat caatgacggt gcggcggctg tcgtcgtgat gagcgccgac 900
aaggcaaagg aactgggcct caaaccgctg gcgaagatcc tcggctatgc ctccggcggc 960
gtcgatccgg catacatggg tctgggtccg attccggcaa cccgcaaggt cttcaagaaa 1020
ctcggcctga ccatgaagga catggacatc gtggaactga acgaggcctt tgcatcccag 1080
gccctgggct gcgtccagga aatgggtgtg gatctggaca aaaccaatct caacggcagc 1140
gggatctcca tcggtcaccc cgtcggctgc accggcgccc ggatcaccta cagcttggcc 1200
atgcagctgc agaagaagaa cgcgcacctc ggactcgcca cgctgtgtat cggtggcgga 1260
caggggatgg ccattgtcct ggaaagagtg taa 1293
<210> 68
<211> 1209
<212> DNA
<213> 钩虫贪铜菌
<400> 68
atgcgcagag ctgcaatcgt cactcccctc cgcacgcccg tcggcacctt cggcggcagc 60
ctgcgcccgg tgcccgtgga ggagctggcc gccaccgccg tgcgcgccgt ggtggaacgc 120
agcggcatcg atcccgcgcg tatcgatgac gtggtctttg cccagtccta cgccaacagc 180
gaagtgccct gcgtcggccg ctgggccgcg ctgcaggccg gcctgccggt cgaagtgccg 240
ggcatgcagc tggaccgccg ctgcggcggc ggcctgcagg ccatcgtcac ggcctcgatg 300
atggtgcaaa gcggcgccgc cgacgtggtg atcgcgggcg gcgtcgagag catgagcaat 360
atcgagtact acaccaccga catgcgctgg ggcgcgcgct cgggcaatgt gcgcttcttc 420
gaccgcctcg accgcggccg tgaacgctcc cagccggtcg agcgcttcgg caagatctcc 480
gggatgatcg agacggccga gaacctggcg cgcgactacg gcatcagccg cgaagcggcc 540
gatgtcttcg ccgcccgcag ccacgcacgc gccgcggcag cctgggaggc cggccgcttc 600
gatgccgagg tcgtccccgt gcaggtgccc cagcgcaagg gcgatccggt gcggttcgcg 660
cgcgacgaag gtttccgccc ggaaaccacg cgtgaaagcc tgggcaagct gcgcacgctg 720
atgccgaacg gtaccgtcac cgccggcaac gccagccagc agaacgacgc ctcggccgcg 780
tgcctgatcg tggccgaaga caagctggcc gaattgggcc tcacccccat ggcctcgctg 840
gtgggctggg cggcggctgg ctgcgagccc tcgcacatgg gcatcggccc ggtgcccgcg 900
gtgaagaagc tgctggcgcg cctgaacctg acgctggacc ggatggacct ggtcgagctg 960
aacgaagcct tcgcctgcca ggtgctggcc gtgctcaagg gctgggaatg gcatgaccag 1020
gacgcgatcg agcagaagct caacgtgaac ggctcgggca tctcgcttgg ccatccgatc 1080
ggcgccaccg gcgtgcgcat cctggccacg ctgctgcacg aactgcagcg ccgcggcggc 1140
cgctatggcc tggaaaccat gtgcatcggc ggcggccagg gtattgccgc ggtcttcgaa 1200
cgctactga 1209
<210> 69
<211> 1185
<212> DNA
<213> 大肠杆菌
<400> 69
atgaaaaatt gtgtcatcgt cagtgcggta cgtactgcta tcggtagttt taacggttca 60
ctcgcttcca ccagcgccat cgacctgggg gcgacagtaa ttaaagccgc cattgaacgt 120
gcaaaaatcg attcacaaca cgttgatgaa gtgattatgg gtaacgtgtt acaagccggg 180
ctggggcaaa atccggcgcg tcaggcactg ttaaaaagcg ggctggcaga aacggtgtgc 240
ggattcacgg tcaataaagt atgtggttcg ggtcttaaaa gtgtggcgct tgccgcccag 300
gccattcagg caggtcaggc gcagagcatt gtggcggggg gtatggaaaa tatgagttta 360
gccccctact tactcgatgc aaaagcacgc tctggttatc gtcttggaga cggacaggtt 420
tatgacgtaa tcctgcgcga tggcctgatg tgcgccaccc atggttatca tatggggatt 480
accgccgaaa acgtggctaa agagtacgga attacccgtg aaatgcagga tgaactggcg 540
ctacattcac agcgtaaagc ggcagccgca attgagtccg gtgcttttac agccgaaatc 600
gtcccggtaa atgttgtcac tcgaaagaaa accttcgtct tcagtcaaga cgaattcccg 660
aaagcgaatt caacggctga agcgttaggt gcattgcgcc cggccttcga taaagcagga 720
acagtcaccg ctgggaacgc gtctggtatt aacgacggtg ctgccgctct ggtgattatg 780
gaagaatctg cggcgctggc agcaggcctt acccccctgg ctcgcattaa aagttatgcc 840
agcggtggcg tgccccccgc attgatgggt atggggccag tacctgccac gcaaaaagcg 900
ttacaactgg cggggctgca actggcggat attgatctca ttgaggctaa tgaagcattt 960
gctgcacagt tccttgccgt tgggaaaaac ctgggctttg attctgagaa agtgaatgtc 1020
aacggcgggg ccatcgcgct cgggcatcct atcggtgcca gtggtgctcg tattctggtc 1080
acactattac atgccatgca ggcacgcgat aaaacgctgg ggctggcaac actgtgcatt 1140
ggcggcggtc agggaattgc gatggtgatt gaacggttga attaa 1185
<210> 70
<211> 1179
<212> DNA
<213> 丙酮丁醇梭菌
<400> 70
atgaaagaag ttgtaatagc tagtgcagta agaacagcga ttggatctta tggaaagtct 60
cttaaggatg taccagcagt agatttagga gctacagcta taaaggaagc agttaaaaaa 120
gcaggaataa aaccagagga tgttaatgaa gtcattttag gaaatgttct tcaagcaggt 180
ttaggacaga atccagcaag acaggcatct tttaaagcag gattaccagt tgaaattcca 240
gctatgacta ttaataaggt ttgtggttca ggacttagaa cagttagctt agcagcacaa 300
attataaaag caggagatgc tgacgtaata atagcaggtg gtatggaaaa tatgtctaga 360
gctccttact tagcgaataa cgctagatgg ggatatagaa tgggaaacgc taaatttgtt 420
gatgaaatga tcactgacgg attgtgggat gcatttaatg attaccacat gggaataaca 480
gcagaaaaca tagctgagag atggaacatt tcaagagaag aacaagatga gtttgctctt 540
gcatcacaaa aaaaagctga agaagctata aaatcaggtc aatttaaaga tgaaatagtt 600
cctgtagtaa ttaaaggcag aaagggagaa actgtagttg atacagatga gcaccctaga 660
tttggatcaa ctatagaagg acttgcaaaa ttaaaacctg ccttcaaaaa agatggaaca 720
gttacagctg gtaatgcatc aggattaaat gactgtgcag cagtacttgt aatcatgagt 780
gcagaaaaag ctaaagagct tggagtaaaa ccacttgcta agatagtttc ttatggttca 840
gcaggagttg acccagcaat aatgggatat ggacctttct atgcaacaaa agcagctatt 900
gaaaaagcag gttggacagt tgatgaatta gatttaatag aatcaaatga agcttttgca 960
gctcaaagtt tagcagtagc aaaagattta aaatttgata tgaataaagt aaatgtaaat 1020
ggaggagcta ttgcccttgg tcatccaatt ggagcatcag gtgcaagaat actcgttact 1080
cttgtacacg caatgcaaaa aagagatgca aaaaaaggct tagcaacttt atgtataggt 1140
ggcggacaag gaacagcaat attgctagaa aagtgctag 1179
<210> 71
<211> 1179
<212> DNA
<213> 丙酮丁醇梭菌
<400> 71
atgagagatg tagtaatagt aagtgctgta agaactgcaa taggagcata tggaaaaaca 60
ttaaaggatg tacctgcaac agagttagga gctatagtaa taaaggaagc tgtaagaaga 120
gctaatataa atccaaatga gattaatgaa gttatttttg gaaatgtact tcaagctgga 180
ttaggccaaa acccagcaag acaagcagca gtaaaagcag gattaccttt agaaacacct 240
gcgtttacaa tcaataaggt ttgtggttca ggtttaagat ctataagttt agcagctcaa 300
attataaaag ctggagatgc tgataccatt gtagtaggtg gtatggaaaa tatgtctaga 360
tcaccatatt tgattaacaa tcagagatgg ggtcaaagaa tgggagatag tgaattagtt 420
gatgaaatga taaaggatgg tttgtgggat gcatttaatg gatatcatat gggagtaact 480
gcagaaaata ttgcagaaca atggaatata acaagagaag agcaagatga attttcactt 540
atgtcacaac aaaaagctga aaaagccatt aaaaatggag aatttaagga tgaaatagtt 600
cctgtattaa taaagactaa aaaaggtgaa atagtctttg atcaagatga atttcctaga 660
ttcggaaaca ctattgaagc attaagaaaa cttaaaccta ttttcaagga aaatggtact 720
gttacagcag gtaatgcatc cggattaaat gatggagctg cagcactagt aataatgagc 780
gctgataaag ctaacgctct cggaataaaa ccacttgcta agattacttc ttacggatca 840
tatggggtag atccatcaat aatgggatat ggagcttttt atgcaactaa agctgcctta 900
gataaaatta atttaaaacc tgaagactta gatttaattg aagctaacga ggcatatgct 960
tctcaaagta tagcagtaac tagagattta aatttagata tgagtaaagt taatgttaat 1020
ggtggagcta tagcacttgg acatccaata ggtgcatctg gtgcacgtat tttagtaaca 1080
ttactatacg ctatgcaaaa aagagattca aaaaaaggtc ttgctactct atgtattggt 1140
ggaggtcagg gaacagctct cgtagttgaa agagactaa 1179
<210> 72
<211> 1197
<212> DNA
<213> 酿酒酵母
<400> 72
atgtctcaga acgtttacat tgtatcgact gccagaaccc caattggttc attccagggt 60
tctctatcct ccaagacagc agtggaattg ggtgctgttg ctttaaaagg cgccttggct 120
aaggttccag aattggatgc atccaaggat tttgacgaaa ttatttttgg taacgttctt 180
tctgccaatt tgggccaagc tccggccaga caagttgctt tggctgccgg tttgagtaat 240
catatcgttg caagcacagt taacaaggtc tgtgcatccg ctatgaaggc aatcattttg 300
ggtgctcaat ccatcaaatg tggtaatgct gatgttgtcg tagctggtgg ttgtgaatct 360
atgactaacg caccatacta catgccagca gcccgtgcgg gtgccaaatt tggccaaact 420
gttcttgttg atggtgtcga aagagatggg ttgaacgatg cgtacgatgg tctagccatg 480
ggtgtacacg cagaaaagtg tgcccgtgat tgggatatta ctagagaaca acaagacaat 540
tttgccatcg aatcctacca aaaatctcaa aaatctcaaa aggaaggtaa attcgacaat 600
gaaattgtac ctgttaccat taagggattt agaggtaagc ctgatactca agtcacgaag 660
gacgaggaac ctgctagatt acacgttgaa aaattgagat ctgcaaggac tgttttccaa 720
aaagaaaacg gtactgttac tgccgctaac gcttctccaa tcaacgatgg tgctgcagcc 780
gtcatcttgg tttccgaaaa agttttgaag gaaaagaatt tgaagccttt ggctattatc 840
aaaggttggg gtgaggccgc tcatcaacca gctgatttta catgggctcc atctcttgca 900
gttccaaagg ctttgaaaca tgctggcatc gaagacatca attctgttga ttactttgaa 960
ttcaatgaag ccttttcggt tgtcggtttg gtgaacacta agattttgaa gctagaccca 1020
tctaaggtta atgtatatgg tggtgctgtt gctctaggtc acccattggg ttgttctggt 1080
gctagagtgg ttgttacact gctatccatc ttacagcaag aaggaggtaa gatcggtgtt 1140
gccgccattt gtaatggtgg tggtggtgct tcctctattg tcattgaaaa gatatga 1197
<210> 73
<211> 2283
<212> DNA
<213> 大肠杆菌
<400> 73
atgtccgagc ttaatgaaaa gttagccaca gcctgggaag gttttaccaa aggtgactgg 60
cagaatgaag taaacgtccg tgacttcatt cagaaaaact acactccgta cgagggtgac 120
gagtccttcc tggctggcgc tactgaagcg accaccaccc tgtgggacaa agtaatggaa 180
ggcgttaaac tggaaaaccg cactcacgcg ccagttgact ttgacaccgc tgttgcttcc 240
accatcacct ctcacgacgc tggctacatc aacaagcagc ttgagaaaat cgttggtctg 300
cagactgaag ctccgctgaa acgtgctctt atcccgttcg gtggtatcaa aatgatcgaa 360
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taccgtaaaa ctcacaacca gggcgtgttc gacgtttaca ctccggacat cctgcgttgc 480
cgtaaatctg gtgttctgac cggtctgcca gatgcatatg gccgtggccg tatcatcggt 540
gactaccgtc gcgttgcgct gtacggtatc gactacctga tgaaagacaa actggcacag 600
ttcacttctc tgcaggctga tctggaaaac ggcgtaaacc tggaacagac tatccgtctg 660
cgcgaagaaa tcgctgaaca gcaccgcgct ctgggtcaga tgaaagaaat ggctgcgaaa 720
tacggctacg acatctctgg tccggctacc aacgctcagg aagctatcca gtggacttac 780
ttcggctacc tggctgctgt taagtctcag aacggtgctg caatgtcctt cggtcgtacc 840
tccaccttcc tggatgtgta catcgaacgt gacctgaaag ctggcaagat caccgaacaa 900
gaagcgcagg aaatggttga ccacctggtc atgaaactgc gtatggttcg cttcctgcgt 960
actccggaat acgatgaact gttctctggc gacccgatct gggcaaccga atctatcggt 1020
ggtatgggcc tcgacggtcg taccctggtt accaaaaaca gcttccgttt cctgaacacc 1080
ctgtacacca tgggtccgtc tccggaaccg aacatgacca ttctgtggtc tgaaaaactg 1140
ccgctgaact tcaagaaatt cgccgctaaa gtgtccatcg acacctcttc tctgcagtat 1200
gagaacgatg acctgatgcg tccggacttc aacaacgatg actacgctat tgcttgctgc 1260
gtaagcccga tgatcgttgg taaacaaatg cagttcttcg gtgcgcgtgc aaacctggcg 1320
aaaaccatgc tgtacgcaat caacggcggc gttgacgaaa aactgaaaat gcaggttggt 1380
ccgaagtctg aaccgatcaa aggcgatgtc ctgaactatg atgaagtgat ggagcgcatg 1440
gatcacttca tggactggct ggctaaacag tacatcactg cactgaacat catccactac 1500
atgcacgaca agtacagcta cgaagcctct ctgatggcgc tgcacgaccg tgacgttatc 1560
cgcaccatgg cgtgtggtat cgctggtctg tccgttgctg ctgactccct gtctgcaatc 1620
aaatatgcga aagttaaacc gattcgtgac gaagacggtc tggctatcga cttcgaaatc 1680
gaaggcgaat acccgcagtt tggtaacaat gatccgcgtg tagatgacct ggctgttgac 1740
ctggtagaac gtttcatgaa gaaaattcag aaactgcaca cctaccgtga cgctatcccg 1800
actcagtctg ttctgaccat cacttctaac gttgtgtatg gtaagaaaac gggtaacacc 1860
ccagacggtc gtcgtgctgg cgcgccgttc ggaccgggtg ctaacccgat gcacggtcgt 1920
gaccagaaag gtgcagtagc ctctctgact tccgttgcta aactgccgtt tgcttacgct 1980
aaagatggta tctcctacac cttctctatc gttccgaacg cactgggtaa agacgacgaa 2040
gttcgtaaga ccaacctggc tggtctgatg gatggttact tccaccacga agcatccatc 2100
gaaggtggtc agcacctgaa cgttaacgtg atgaaccgtg aaatgctgct cgacgcgatg 2160
gaaaacccgg aaaaatatcc gcagctgacc atccgtgtat ctggctacgc agtacgtttc 2220
aactcgctga ctaaagaaca gcagcaggac gttattactc gtaccttcac tcaatctatg 2280
taa 2283
<210> 74
<211> 741
<212> DNA
<213> 大肠杆菌
<400> 74
atgtcagtta ttggtcgcat tcactccttt gaatcctgtg gaaccgtaga cggcccaggt 60
attcgcttta tcaccttttt ccagggctgc ctgatgcgct gcctgtattg tcataaccgc 120
gacacctggg acacgcatgg cggtaaagaa gttaccgttg aagatttgat gaaggaagtg 180
gtgacctatc gccactttat gaacgcttcc ggcggcggcg ttaccgcatc cggcggtgaa 240
gcaatcctgc aagctgagtt tgttcgtgac tggttccgcg cctgcaaaaa agaaggcatt 300
catacctgtc tggacaccaa cggttttgtt cgtcgttacg atccggtgat tgatgaactg 360
ctggaagtaa ccgacctggt aatgctcgat ctcaaacaga tgaacgacga gatccaccaa 420
aatctggttg gagtttccaa ccaccgcacg ctggagttcg ctaaatatct ggcgaacaaa 480
aatgtgaagg tgtggatccg ctacgttgtt gtcccaggct ggtctgacga tgacgattca 540
gcgcatcgcc tcggtgaatt tacccgtgat atgggcaacg ttgagaaaat cgagcttctc 600
ccctaccacg agctgggcaa acacaaatgg gtggcaatgg gtgaagagta caaactcgac 660
ggtgttaaac caccgaagaa agagaccatg gaacgcgtga aaggcattct tgagcagtac 720
ggtcataagg taatgttcta a 741
<210> 75
<211> 2364
<212> DNA
<213> 乳酸乳球菌
<400> 75
atgaaaaccg aagttacgga aaatatcttt gaacaagctt gggatggttt taaaggaacc 60
aactggcgcg ataaagcaag cgttactcgc tttgtacaag aaaactacaa accatatgat 120
ggtgatgaaa gctttcttgc tgggccaaca gaacgtacac ttaaagtaaa gaaaattatt 180
gaagatacaa aaaatcacta cgaagaagta ggatttccct tcgatactga ccgcgtaacc 240
tctattgata aaatccctgc tggatatatc gatgctaatg ataaagaact tgaactcatc 300
tatgggatgc aaaatagcga acttttccgc ttgaatttca tgccaagagg tggacttcgt 360
gttgctgaaa agattttgac agaacacggt ctctcagttg acccaggctt gcatgatgtt 420
ttgtcacaaa caatgacttc tgtaaatgat ggaatctttc gtgcttatac ttcagcaatt 480
cgtaaagcac gtcatgctca tactgtaaca ggtttgccag atgcttactc tcgtggacgt 540
atcattggtg tctatgcacg tcttgccctt tacggtgctg attaccttat gaaggaaaaa 600
gcaaaagaat gggatgcaat cactgaaatt aacgaagaaa acattcgtct taaagaagaa 660
attaatatgc aataccaagc tttgcaagaa gttgtaaact ttggtgcttt atatggtctt 720
gatgtttcac gtccagctat gaacgtaaaa gaagcaatcc aatgggttaa catcgcttat 780
atggcagtat gtcgtgtcat taatggagct gcaacttcac ttggacgtgt tccaatcgtt 840
cttgatatct ttgcagaacg tgaccttgct cgtggaacat ttactgaaca agaaattcaa 900
gaatttgttg atgatttcgt tttgaagctt cgtacaatga aatttgcgcg tgcagctgct 960
tatgatgaac tttattctgg tgacccaaca ttcatcacaa catctatggc tggtatgggt 1020
aatgacggac gtcaccgtgt cactaaaatg gactaccgtt tcttgaacac acttgataca 1080
atcggaaatg ctccagaacc aaacttgaca gtcctttggg attctaaact tccttactca 1140
ttcaaacgtt attcaatgtc tatgagccac aagcattctt ctattcaata tgaaggtgtt 1200
gaaacaatgg ctaaagatgg atatggcgaa atgtcatgta tctcttgttg tgtctcacca 1260
cttgatccag aaaatgaaga aggacgtcat aacctccaat actttggtgc gcgtgtaaac 1320
gtcttgaaag caatgttgac tggtttgaac ggtggttatg atgacgttca taaagattat 1380
aaagtattcg acatcgaacc tgttcgtgac gaaattcttg actatgatac agttatggaa 1440
aactttgaca aatctctcga ctggttgact gatacttatg ttgatgcaat gaatatcatt 1500
cattacatga ctgataaata taactatgaa gcagttcaaa tggccttctt gcctactaaa 1560
gttcgtgcta acatgggatt tggtatctgt ggattcgcaa atacagttga ttcactttca 1620
gcaattaaat atgctaaagt taaaacattg cgtgatgaaa atggctatat ctacgattac 1680
gaagtagaag gtgatttccc tcgttatggt gaagatgatg atcgtgctga tgatattgct 1740
aaacttgtca tgaaaatgta ccatgaaaaa ttagcttcac acaaacttta caaaaatgct 1800
gaagctactg tttcactttt gacaattaca tctaacgttg cttactctaa acaaactggt 1860
aattctccag tacataaagg agtattcctc aatgaagatg gtacagtaaa taaatctaaa 1920
cttgaattct tctcaccagg tgctaaccca tctaataaag ctaagggtgg ttggttgcaa 1980
aatcttcgct cattggctaa gttggaattc aaagatgcaa atgatggtat ttcattgact 2040
actcaagttt cacctcgtgc acttggtaaa actcgtgatg aacaagtgga taacttggtt 2100
caaattcttg atggatactt cacaccaggt gctttgatta atggtactga atttgcaggt 2160
caacacgtta acttgaacgt aatggacctt aaagatgttt acgataaaat catgcgtggt 2220
gaagatgtta tcgttcgtat ctctggttac tgtgtcaata ctaaatacct cacaccagaa 2280
caaaaacaag aattaactga acgtgtcttc catgaagttc tttcaaacga tgatgaagaa 2340
gtaatgcata cttcaaacat ctaa 2364
<210> 76
<211> 2325
<212> DNA
<213> 马肠链球菌
<400> 76
atggcgactg ttaaaacaaa tgcagatgtt tttgaaaaag cctgggaagg ctttaaaggt 60
actgactgga aagaaaaagc cagcgtttct cgcttcgttc aagctaacta cacaccatat 120
gatggtgatg aaagcttctt agcaccagct actgaacgct ctcttaaaat caagaaaatc 180
attgaagaca ctaaagctga atacgaagca actcgtttcc caatggacac tcgtccaaca 240
tcaatcgcag atattcctgc cggctatatt caaaaagacg atgaattaat ctacggtatt 300
caaaatgatg agttgttcaa attgaatttc atgccaaaag gtggtatccg tatggcagaa 360
acagcactta aagaacatgg ttatgaacca gatcctgctg ttcatgaaat tttcacaaaa 420
tacactacta cagtaaatga cggaattttc cgcgcttata catctaatat ccgccgtgcc 480
cgtcacgctc acacagtaac tggtcttcca gatgcttact cacgcggacg tatcatcggt 540
gtttatgctc gtcttgctct ttatggtgca gactacttga tgcaagaaaa agttaacgac 600
tggaacgcta tcacagaaat cgacgaagaa tctattcgtc ttcgcgaaga agttaacatg 660
caataccaag ctcttggtga agttgttaaa cttggtgacc tttacggact tgatgtccgt 720
aaaccagcca tgaacgttaa agaagctatc caatgggtaa acatcgcctt catggccgta 780
tgtcgtgtta tcaacggtgc tgctacttct cttggacgtg tgccaatcgt tcttgatatc 840
tttgctgaac gtgaccttgc tcgtggtact ttcacagaat cagaaatcca agaatttgtc 900
gatgactttg tcttgaaact tcgtactgta aaatttgctc gtactaaagc ttacgacgaa 960
ctttactctg gtgacccaac attcatcact acatctatgg ctggtatggg tgctgacggt 1020
cgtcaccgtg ttactaaaat ggactaccgt ttcttgcaca cacttgataa tatcggtaac 1080
gctccagaac caaacttgac agttctttgg actgataaat tgccatattc attccgtcgc 1140
tactgtatga aaatgtcaca caaacactcg tcaatccaat acgaaggtgt gacaacaatg 1200
gctaaagatg gttacggtga aatgtcatgt atctcatgtt gtgtatcacc acttgaccca 1260
gaaaacgaag aacaacgtca caacatccaa tactttggtg ctcgtgtaaa cgtccttaaa 1320
gctcttctta ctggtttgaa cggtggttat gacgacgtcc acaaagacta caaagtattt 1380
gatatcgaac cagttcgtga tgaaatcctt gatttcgaaa cggttaaagc taatttcgaa 1440
aaatctcttg attggttgac ttcaacttac gtagatgccc ttaacatcat tcactacatg 1500
actgataaat acaactacga agctgttcaa atggcattct tgccaactaa acaacgtgcc 1560
aacatgggat tcggtatctg tggtttcgct aataccgttg atactttatc agcaatcaaa 1620
tacgctactg ttaaaccaat ccgtgacgaa gatggttaca tctacgacta cgaaacaact 1680
ggtgacttcc ctcgttgggg tgaagatgac cctcgttcta acgaacttgc tgaatggttg 1740
gtagaagctt acactactcg tcttcgtagc cacaaacttt acaagaacgc tgaagctact 1800
gtatcacttc ttacaatcac ttcaaacgtt gcttattcta aacaaactgg taactctcca 1860
gttcacaaag gtgtttacct taacgaagat ggtactgtaa acctttctaa acttgaattc 1920
ttctcaccag gtgccaaccc atctaacaaa gctcgtggtg gttggttgca aaacttgaac 1980
tctcttgcaa gccttgactt ctcatatgct gcagatggta tctcacttac aactcaagtt 2040
tctccacgcg ctcttggtaa gacatttgat gaacaagttg ataacttggt aactatcctt 2100
gatggttact tcgaaaacgg tggacaacac gttaacttga acgtcatgga ccttaaagat 2160
gtttatgaca agattatgaa tggtgaagat gttatcgttc gtatatcagg ttactgtgtc 2220
aacactaaat accttactaa agaacaaaag acagaattga cacaacgcgt cttccacgaa 2280
gttctttcaa tggatgatgt tgctgaaact gttgctgcta aataa 2325
<210> 77
<211> 789
<212> DNA
<213> 马肠链球菌
<400> 77
atgactgaaa tagattacgg aaaagtgaca ggaatgattc attcaacaga aagttttggt 60
tctgtggatg ggcctggtgt tcgctttgtc atttttatgc aaggctgcaa gatgcgttgc 120
caatattgtc acaatccaga tacttgggca ttagagacaa ataattctcg tgaacgcact 180
gttgatgatg ttttagcaga agctttgcgt tatcgacatt tctggggtga aaatggtggg 240
attaccgttt caggtggtga agccatgttg caaattgagt ttgtaacagc cctttttacc 300
aaggctaaag aattaggaat tcattgcacg cttgatacgt gtggttttac gttccgagat 360
acgcctgaat atcacgaaat tgtggataag ttactagctg tgacggattt agttctttta 420
gatttaaaag aaatcaatcc taaacaacac attgttgtaa cacgtcaacc caatactaat 480
attctagctt ttgctcgtta tttgtctgat aagggtgttc cagtctggat tcgtcatgtc 540
ttggttccag gattgaccga ttttgatgaa gacttaattg agctagggaa atttgttgaa 600
acgttaaaaa acgtggataa atttgaaatt ttgccttatc ataccttggg tgaattcaag 660
tggcgtgaat tgggaattcc ttataccctt gaaggggtta aaccaccgac tagagaacgt 720
gtccaaaatg ctaaaaagct tatgcataca gagtcttaca cagactacat gaaacgcatt 780
catcactag 789
<210> 78
<211> 717
<212> DNA
<213> 热纤梭菌
<400> 78
atgacattaa agggcaggat acactcattt gaatcttttg ggacactgga cggaccgggt 60
ataagatttg tggttttcat gcagggctgt cccttgcgtt gtatatattg ccacaacagg 120
gatacctggg atgttaatgc ggggagtgag tacactcccc ggcaagtaat tgatgaaatg 180
atgaaataca tagactatat aaaggtctcc ggaggcggaa taactgttac cggcggggag 240
cctgttctcc aggccgattt tgtggccgag gtgttcagac ttgcaaaaga gcagggagtg 300
catacggcgc tggataccaa tggatttgct gacatagaga aggttgaaag gcttataaaa 360
tacaccgatc ttgtattgct ggatataaag catgcccggg aggataaaca taagataatt 420
accggtgtgt ccaacgaaaa aatcaagcgt tttgcgctgt atctttcgga ccagggagtg 480
cctatctgga taagatatgt ccttgtcccc ggatataccg acgatgaaga tgaccttaaa 540
atggcggctg atttcataaa aaagcttaaa acggtggaaa aaatcgaagt tcttccttat 600
cacaacatgg gagcatacaa atgggaaaaa cttggtcaga aatacatgct tgaaggagta 660
aaggggccga gtgcgcaaga ggtggaaaaa gcaaagagga ttctgtcagg caaataa 717
<210> 79
<211> 1269
<212> DNA
<213> 咸海鲜球菌种；ATCC8456
<400> 79
atggcaacac ttaagaggga taagggctta gataatactt tgaaagtatt aaagcaaggt 60
tatctttaca caacaaatca gagaaatcgt ctaaacacat cagttttcca aactaaagca 120
ctcggtggta aaccattcgt agttgtgact ggtaaggaag gcgctgaaat gttctacaac 180
aatgatgttg ttcaacgtga aggcatgtta ccaaaacgta tcgttaatac gctttttggt 240
aaaggtgcaa tccatacggt agatggtaaa aaacacgtag acagaaaagc attgttcatg 300
agcttgatga ctgaaggtaa cttgaattat gtacgagaat taacgcgtac attatggcat 360
gcgaacacac aacgtatgga aagtatggat gaggtaaata tttaccgtga atctatcgta 420
ctacttacaa aagtaggaac acgttgggca ggcgttcaag caccacctga agatatcgaa 480
agaatcgcaa cagacatgga catcatgatc gattcattta gagcacttgg tggtgccttt 540
aaaggttaca aggcatcaaa agaagcacgt cgtcgtgttg aagattggtt agaagaacaa 600
attattgaga ctcgtaaagg gaatattcat ccaccagaag gtacagcact ttacgaattt 660
gcacattggg aagactactt aggtaaccca atggactcaa gaacttgtgc gattgactta 720
atgaacacat tccgcccatt aatcgcaatc aacagattcg tttcattcgg tttacacgcg 780
atgaacgaaa acccaatcac acgtgaaaaa attaaatcag aacctgacta tgcatataaa 840
ttcgctcaag aagttcgtcg ttactatcca ttcgttccat tccttccagg taaagcgaaa 900
gtagacatcg acttccaagg cgttacaatt cctgcaggtg taggtcttgc attagatgtt 960
tatggtacaa cgcatgatga atcactttgg gacgatccaa atgaattccg cccagaaaga 1020
ttcgaaactt gggacggatc accatttgac cttattccac aaggtggtgg agattactgg 1080
acaaatcacc gttgtgcagg tgaatggatc acagtaatca tcatggaaga aacaatgaaa 1140
tactttgcag aaaaaataac ttatgatgtt ccagaacaag atttagaagt ggacttaaac 1200
agtatcccag gatacgttaa gagtggcttt gtaatcaaaa atgttcgcga agttgtagac 1260
agaacataa 1269
<210> 80
<211> 684
<212> DNA
<213> 黑曲霉
<400> 80
atgttcaact cacttctatc cggtactact acaccaaact ccggccgtgc atctcctccc 60
gccagcgaaa tgcccatcga taatgatcac gtggccgttg cccgtccagc tccccgccgc 120
cgccgcattg tagtagccat gacgggtgcc actggagcca tgctcggcat caaagtccta 180
attgctctgc gccgtctaaa tgtggagaca cacctggtga tgagtaaatg ggcggaggct 240
acgatcaaat acgagactga ctaccatccc tcaaacgtgc gagcgctggc cgactacgtg 300
cacaacatca atgacatggc cgccccagta tccagcggct cattccgcgc ggacggaatg 360
attgtggtac cgtgcagcat gaaaacattg gctgctatcc actcgggctt ttgcgacgat 420
ctcatttcaa ggacagcaga tgtgatgctc aaggagcgca ggcggttggt gctagtagcg 480
cgggagacgc cattgagcga gatccatctg cgaaacatgt tggaggttac acgcgctggg 540
gcagtcatct tccccccagt accggcgttc tacatcaagg ccggaagtat cgaggacctc 600
atcgaccaga gtgttggacg aatgttggat ttatttgacc tcgacacggg ggattttgaa 660
cgttggaatg gatgggaaaa ataa 684
<210> 81
<211> 1555
<212> DNA
<213> 黑曲霉
<400> 81
atgtctgcgc aacctgctca cctgtgtttc cgctccttcg tcgaagccct caaggtcgac 60
aacgaccttg ttgaaatcaa taccccaatt gaccccaatc tcgaagctgc tgctattacc 120
cgccgagtat gtgagaccaa cgacaaggct cctttattca acaacctcat cggcatgaaa 180
aatggcctct tccgtatact tggggctcct ggctctctca ggaagtcgtc tgctgatcgc 240
tacggccgcc ttgctcgtca cctagccctc ccacctacgg cctcaatgcg tgagattctc 300
gataagatgc tctccgccag cgatatgcct cccatccctc cgaccattgt tcccaccggg 360
ccatgcaagg agaacagctt agatgactct gaattcgacc ttaccgaact ccccgttcct 420
cttattcaca aatcggatgg tggtaaatac atccaaacct atggcatgca cattgtgcag 480
tctccggatg gaacctggac caactggtct attgcccgtg cgatggtcca tgacaagaac 540
catctgaccg gcctggttat tccccctcag cacatctggc agattcacca gatgtggaag 600
aaggaaggcc gcagtgacgt tccctgggct ttggcctttg gtgtcccacc cgctgccatt 660
atggcctcta gcatgcctat tcccgatggt gtcaccgaag ctgggtacgt gggagctatg 720
acgggatcct ccctggagct tgttaaatgt gatacgaacg atctatatgt ccccgctacc 780
tcagaaatcg ttctcgaggg cacactctct atcagcgaga caggcccaga gggacctttc 840
ggtgagatgc atggttacat cttccccggg gatactcacc tcggcgccaa atacaaggtt 900
aaccggatca cctaccgcaa caacgccatc atgcccatgt cttcttgtgg ccgcttgacg 960
gatgaaacgg taagtttagt ccctgtcctg ccatttatag ccaaggacta acacggtcta 1020
gcacaccatg atcggctctc tggctgcggc ggagatccgt aagctctgcc agcagaatga 1080
cctccctatc actgatgcct tcgctccttt cgagtctcaa gttacctggg ttgctctgcg 1140
ggtcgatact gagaagctac gtgccatgaa gacaacgtct gagggattcc gcaagagagt 1200
gggagacgtc gtcttcaacc acaaggccgg atacaccatt catcgtctgg tgttggtcgg 1260
tgacgacatt gatgtctatg aaggaaagga tgtgctctgg gcgttctcca cccgttgccg 1320
tcctggtatg gacgagactt tgtttgagga tgttcgtggg ttccccttga ttccgtatat 1380
gggacacggg aatgggcccg cccaccgcgg cggaaaggtt gtgtccgacg ctcttatgcc 1440
gactgagtac accactggtc gcaactggga ggctgctgac ttcaaccaat cttatcccga 1500
ggatctgaag cagaaggtgt tggacaactg gacgaagatg ggtttcagca actaa 1555
<210> 82
<211> 2224
<212> DNA
<213> 黑曲霉
<400> 82
atgggcaccc cgataaatcg tgaagagatt gaccgcgtgc tgcgaatgaa acgcaatcag 60
cgcgaggctc gagcgtgtta tccttgccgc cagcgcaagg tgaaatgcga cagcactcag 120
ccgtgtcgaa catgtcgccg acgaggccat ccccaaatat gtgtgtatga ccaagattcg 180
tctgggtcta aaaaggctcg tagcaccggc caaagacgtt cctctgctgc ttctcgtgga 240
acaaatcaga caccaaccgc cgagcaggca ttcgatgccg aaccacaatc tctgccctca 300
gcgcgcagtt taccagaagt ccagccaaaa acaagacagt actatagtac tcgaatcccg 360
tcttccgatg gccccgataa tgatcttatc tactcgggcg acaactcggt attgtcttat 420
ttgcgcaacc ggacgcaaga taccaatggc tccatgaccc gtgaggtggg ctctgttcta 480
ggcctgcaaa atacctacgg cagttatcca tttatggact ttcggacacc ccaggaccgg 540
tggaaggagc ttctacgtat tattccgcag cgagcggaac tgttgaagta agcacatctt 600
attgttgttt ttgataacct ctaacggata gcaggttctt ccatttctac agaatatcag 660
cttacccttt caatccgatc atacttgaca ttgagagatt tgagcaagat gtgtgttcat 720
acctcaatga tcttgcagca ggagagctgc agaacacttc aaagatttgc gaacgttggg 780
ccactgatcg gtctgtcggg ctgatcagcc tgctacttgc ggccttggct tccggtgcgc 840
attattctga cctggattac atgcaaagaa cagagctatg ccaggatttt ggtacgtaac 900
cagtatcttt acctatgcat gtttgactaa acaggagaag caaaacgatc ctttcaagct 960
cttcgactag ccaattttct tttccgtccg acgatggata taatacaagc acttctaatc 1020
ataggaaaca ctctgcaaaa caatggccag tctgatgcag catgggtttt gttagggaca 1080
acagtccgtc tcgcgcagac attaggtctt cacacagaaa agagtgtagc acgcctaccg 1140
gatcatgtca aatacaaagc acgaaagcta tggtacataa accatgctac aggtaacgac 1200
acaagctgac gcggctacag gtacactgtc gtttggcaag attgcctgct ctgtttatgt 1260
tacgaccggc ctcgcgtagt ctctatgacc gggtgggctc cagattattc aatcctctcg 1320
agcagcgaac tatctttcac agaagctatg tattttctat gccaaactgc cttaaatatg 1380
atcacaacag acggaccgga gatatcggaa aatgcgcgac agcttgacat tttggccacg 1440
attgatagcc tcaaccaacg cactcagcca tatctgcgtg accgccagga atgcaaaacc 1500
ctccaacaca atctggagca cctggcgtta cgaatgcaca tgtctctagt tatttccgtc 1560
ctgacacgtc cagcactgaa gcgcactgta atgcaagacg cgtcctatga catcttgcgc 1620
acccgcgcca aattgagcct gatcgacgcc tctagggcct ttttggattt tcaggctctg 1680
agtgtggtac ccctccgaag ctggtcaatg gtgcacacgg tgcttagttc cactttactt 1740
ctctgcattt gggaggagac ccgaaacgat cccgagtgtc gtgatttaca gcaaaaggtg 1800
attgaggtct tttctgccgc tggcacagtg ggcacagtgg agaacacagc atcggagaat 1860
gggcaatggc tatcggaacg gcatatacga gcgctaatca cactgcgcaa ttcggtccga 1920
acggcagtcg aacgtgaaaa gggggaggca agcgttggga cagaacgcgc ggagcagccc 1980
cagccttttt ttcctgtcta tgggtatgtg cacccgctat tgtctgataa gtggagctgt 2040
gcgatggatg ctgattttgc agtatgccga acgggatccc ggatgacttc ggtcaagact 2100
tctcaccagc aagctatctt gactccatta tgaacggtat gctgaggctc ccgactattt 2160
atcgatcgaa ctaaccgtcg tagtacccat gtttgactta tcccaagagc tgggttttct 2220
ttga 2224
<210> 83
<211> 723
<212> DNA
<213> 米曲霉
<400> 83
atgctctcct ccttccttcc ttccggcacc aacacatcaa actccggtca tcacagcccc 60
gacaatgcat ccgaaacaca atcaaccaca cagtccgcac cactcgagca catatccacc 120
gcaatgccac cagtcccaac caaaggtcga cgcaaacgaa tcgtcgtagc catgaccgga 180
gccaccggct caatcctggg aatcaaagtc ctcatcgccc ttcgccgcct caacatcgaa 240
acccacctcg taatcagcaa atgggccgaa gcaaccataa aatacgaaac agactatcac 300
ccgcggaatg ttcgtgccct agccgactac gtccacaaca taaacgacat ggcggcaccc 360
atatccagcg ggtccttcaa gaccgacggc atgatcgtcg tcccatgttc catgaaaaca 420
ctcgccgcta tcaactccgg gttctgtgaa gatctcatct cccggactgc agacgtcatg 480
ctcaaggagc gcaggaagct ggttcttgtt gctagggaaa cgcctcttag tgatattcat 540
cttcgcaata tgctttctgt gtctcaggct ggggctatta tcttcccgcc tgtgccggcg 600
tactatatca aggcggcgtc tgtggatgaa cttgtggatc agagtgttgg gcgcatgttg 660
gatctgtttg atctggatac ggctgatttt gctagatggg agggttggaa gaaggataac 720
tga 723
<210> 84
<211> 1512
<212> DNA
<213> 米曲霉
<400> 84
atggccgcga ttaacgaagt cgatcattcc ttccgcgcct ttgtcgaagc cctcaaggcc 60
gacgatgact tggtcgagat caacaccgag atcgactcta acctggaagc cgccgcgatc 120
actcgtcttg tctgcgagac cgatgacaaa gcccccctct tcaataacct caaaggcatg 180
ggaaagaatg gcctcttccg tatcctgggc gctccgggct ctctcagaaa gtccaaacgt 240
gaccgctacg gccggctcgc ccgccacctg gcgctgcctc ctactgccag catgaaggaa 300
atccttgaca agatgctctc cgcctctcag ctacctccca ttgaccctaa gattgtagag 360
actggtcctg tgaaggacaa ttcccttgaa ggcgacgaaa tcgacctcac tgcgctccca 420
gtgcccatgg tgcacaagtc tgacggcggc aaatatctac aaacatacgg aatgcatgtc 480
gtgcagtctc ctgatggaaa gtggacgaac tggtctatcg cccgtgcgat ggtcaaggac 540
aagaaccatt tgacaggcct ggttattgag ccccagcata tttggcaaat ccaccagatg 600
tggaaaaagg agggaaagga tgtcccgtgg gctctatgct tcggagttcc tcctgccgct 660
atcatggcat catcgatgcc catcccggat ggtgtaactg aggctggcta cgttggtgcc 720
atgactggtc gcgccttgga gctcgtcaag tgcgacacca accatctcta cgtccctgcc 780
aatgcggaga ttgtcctcga gggtaccctc tccatcactg aaaccgccga tgaaggcccc 840
ttcggtgaga tgcacggcta cgtcttcccc ggcgatagcc acaagtgtcc cgtttacaaa 900
gttaacaaga tcacctaccg caccgatgct atcctgccca tgtccgcctg cggtcgtctt 960
accgacgaga cccatactat gattggctcg ttggctgccg ctgagattcg taaaatttgc 1020
caactggccg gcctccccat caccgacacc ttttctccct tcgaggcaca ggttacctgg 1080
gtggctctca aagttgacac cgcaaagctt cgtcaaatga agctagcccc taaagagctt 1140
cagaaatggg tcggagacgt ggtctttaac cacaaggctg ggtacactat ccaccgcctg 1200
gtcctggttg gcgatgatat tgacccgtat gagtggaagg atgtcatgtg ggctttcgca 1260
acacggtgtc gacccaatgc tgatgaaatg ttctttgaag acgtccgtgg tttccccctt 1320
atcccgtata tgggtcacgg cacggggtcg cccaccaagg gtggtaaggt ggtttccgac 1380
gctctgatgc ccacagagta taccacaggt gctgattggg aagctgctga ctttgagcac 1440
tcctatccgg aggagatcaa ggccaaggtg agggccaact gggaggcttt gggattcaga 1500
aaacaggatt aa 1512
<210> 85
<211> 723
<212> DNA
<213> 米曲霉
<400> 85
atgctctcct ccttccttcc ttccggcacc aacacatcaa actccggtca tcacagcccc 60
gacaatgcat ccgaaacaca atcaaccaca cagtccgcac cactcgagca catatccacc 120
gcaatgccac cagtcccaac caaaggtcga cgcaaacgaa tcgtcgtagc catgaccgga 180
gccaccggct caatcctggg aatcaaagtc ctcatcgccc ttcgccgcct caacatcgaa 240
acccacctcg taatcagcaa atgggccgaa gcaaccataa aatacgaaac agactatcac 300
ccgcggaatg ttcgtgccct agccgactac gtccacaaca taaacgacat ggcggcaccc 360
atatccagcg ggtccttcaa gaccgacggc atgatcgtcg tcccatgttc catgaaaaca 420
ctcgccgcta tcaactccgg gttctgtgaa gatctcatct cccggactgc agacgtcatg 480
ctcaaggagc gcaggaagct ggttcttgtt gctagggaaa cgcctcttag tgatattcat 540
cttcgcaata tgctttctgt gtctcaggct ggggctatta tcttcccgcc tgtgccggcg 600
tactatatca aggcggcgtc tgtggatgaa cttgtggatc agagtgttgg gcgcatgttg 660
gatctgtttg atctggatac ggctgatttt gctagatggg agggttggaa gaaggataac 720
tga 723
<210> 86
<211> 1050
<212> DNA
<213> 干热嗜酸菌
<400> 86
ttgaatgatc ttaatgttta tggtgaaaaa ataagaaata tgcttcttga acttggcatt 60
tataataaat cagatgatta ttcacctgat attaaataca ataaaacgtt ccacgcaaat 120
ggatacccaa taacaggtct ttataaattc cttggatact atgataggga taataacata 180
gccaactttc catcgatatc gttcacaacg aacttttcat catgtgatgt tacatgcagg 240
gtattaagat caggcaatga caggatcata ttcaacggga aaaacaatga aaagtattac 300
aaaagggctg aaaaggccct gtcatttctc aggaaaaaat atagaataga tgcagcattt 360
gagtttaaca tcaggataaa tagaagatac agggatgcca aaggccttgg agaatcggca 420
gccgtggcat cggcaaccgc cagggccgtt gccgcagcag tctttggcat ggatgctgca 480
aaagacaggg gttttgtatc atacctggcc aggcatgtct ctggctccgg taccagatct 540
gcggcaggaa acctttcaat gtggctttca tatcctggaa tagacgattt atcttcaatt 600
ggcttcgaaa taagaaaaga cgatttattc catttctatg ccataccaat gagatcaaga 660
atagagacat taaatgcaca tgattatgca tcctcatcaa ttttttataa tgcatgggtc 720
aaatcaaaat tttttgatat aatagacatc attgaaaaca aattcaatac aaggatgatg 780
cttgaatact ccatgaagga tatgtacagg ctgcaggcgc ttttaatatc ctctggatat 840
atcatatatg aaaagcatta tttagacatt ataagaaaat taagatcatc attaaataac 900
tacaaaaacg tttatttcac atctgataca ggaacaagca ttgttgttat gtcaacatca 960
atgaatgagc tttcaaggtt cgttaacgat cttgatcttg atggtataag cggcaatttt 1020
ccagagaaga tcattataga ggaactatga 1050
<210> 87
<211> 975
<212> DNA
<213> 干热嗜酸菌
<400> 87
atggaaaatt acaatgttaa gacaagggcg ttcccaacaa taggcataat actgcttggt 60
gggatctcgg ataaaaagaa caggataccg ctgcatacaa cggcaggcat agcatatact 120
ggtataaaca atgatgttta cactgagaca aagctttatg tatcaaaaga tgaaaaatgc 180
tatattgatg gaaaggaaat tgatttaaat tcagatagat caccatcgaa ggttattgat 240
aaattcaagc atgaaatact tatgagagta aatcttgatg atgaaaataa cctttcaatt 300
gattcaagga actttaatat attaagtggc agctcagatt ctggggccgc tgcactggga 360
gagtgcatag aatcaatttt tgaatacaat ataaatatat ttacatttga aaacgatctt 420
cagaggatat cagaaagtgt tggaagaagc ctttacggtg gtttaacagt aaactatgcc 480
aatggcaggg aatcattaac agagccatta cttgagcctg aggcatttaa taactttaca 540
ataattggtg cacattttaa cattgataga aaaccatcaa atgagattca tgaaaatatc 600
ataaaacatg aaaattacag ggaaagaata aaaagtgctg agagaaaggc gaaaaaactt 660
gaggagctat caaggaatgc aaacataaag ggtatctttg aacttgcaga atccgataca 720
gtggaatacc ataaaatgct ccatgatgtt ggcgttgaca taataaatga tagaatggag 780
aacctcattg aaagggtaaa agaaatgaaa aataacttct ggaattcata catagttacc 840
ggcggcccga acgtttttgt aataacagag aaaaaggacg ttgataaggc aatggaagga 900
ttaaatgatc tgtgcgatga tataagatta ttaaaagttg caggaaagcc acaggtcatt 960
tcaaaaaact tttaa 975
<210> 88
<211> 1191
<212> DNA
<213> 酿酒酵母
<400> 88
atgaccgttt acacagcatc cgttaccgca cccgtcaaca tcgcaaccct taagtattgg 60
gggaaaaggg acacgaagtt gaatctgccc accaattcgt ccatatcagt gactttatcg 120
caagatgacc tcagaacgtt gacctctgcg gctactgcac ctgagtttga acgcgacact 180
ttgtggttaa atggagaacc acacagcatc gacaatgaaa gaactcaaaa ttgtctgcgc 240
gacctacgcc aattaagaaa ggaaatggaa tcgaaggacg cctcattgcc cacattatct 300
caatggaaac tccacattgt ctccgaaaat aactttccta cagcagctgg tttagcttcc 360
tccgctgctg gctttgctgc attggtctct gcaattgcta agttatacca attaccacag 420
tcaacttcag aaatatctag aatagcaaga aaggggtctg gttcagcttg tagatcgttg 480
tttggcggat acgtggcctg ggaaatggga aaagctgaag atggtcatga ttccatggca 540
gtacaaatcg cagacagctc tgactggcct cagatgaaag cttgtgtcct agttgtcagc 600
gatattaaaa aggatgtgag ttccactcag ggtatgcaat tgaccgtggc aacctccgaa 660
ctatttaaag aaagaattga acatgtcgta ccaaagagat ttgaagtcat gcgtaaagcc 720
attgttgaaa aagatttcgc cacctttgca aaggaaacaa tgatggattc caactctttc 780
catgccacat gtttggactc tttccctcca atattctaca tgaatgacac ttccaagcgt 840
atcatcagtt ggtgccacac cattaatcag ttttacggag aaacaatcgt tgcatacacg 900
tttgatgcag gtccaaatgc tgtgttgtac tacttagctg aaaatgagtc gaaactcttt 960
gcatttatct ataaattgtt tggctctgtt cctggatggg acaagaaatt tactactgag 1020
cagcttgagg ctttcaacca tcaatttgaa tcatctaact ttactgcacg tgaattggat 1080
cttgagttgc aaaaggatgt tgccagagtg attttaactc aagtcggttc aggcccacaa 1140
gaaacaaacg aatctttgat tgacgcaaag actggtctac caaaggaata a 1191
<210> 89
<211> 1182
<212> DNA
<213> 粟酒裂殖酵母
<400> 89
atggacaaaa aggtttatca atgcaccgtt agtgcgcctg ttaatattgc agtaattaaa 60
tactggggaa agagagatgt ggcattgaac ttgcctacca atagctcgat cagtgtgacc 120
ctttctcaag atgacttacg tactgttact acagctagtt gtagcgagaa gtttgagaat 180
gatacactgt ggttaaatgg aaacgctgag gaaatctttg ccaataaacg acttcgtgtc 240
tgtgtagagg aactgcgtaa agctagatta gatctcgaag aggaaaatga tgatcttgac 300
aagattggtg cattgaagct tcatgtcgtt tcagaaaaca acttccctac tgctgctggt 360
ttggcatctt cagctgctgg ttatgctgct ttttgtgaag caatcgctag attgtacgat 420
ttaccatgga cacccactca attatctcgc attgctagac aggggtctgg aagtgcttgt 480
cgtagcttgt ttgggggcta tgtagcctgg gagatgggcg agcttcatag cggtgctgat 540
agtgtagcag ttcaagttga acctgttgaa aattggcccg aaatacgtgt tgctgtttta 600
gtagcgtccg ctgccaaaaa aggggtttcc tcaacagctg gcatgcaagc tacagttgca 660
tcttctacct tgttccaaca tcgtattcaa aacatcgttc cacaacgtat ccaagaaatg 720
aagaccgcca ttcgtgagcg tgattttgag acttttgcga agcttaccat gactgattcc 780
aatcaattcc atgcgtgctg ccttgatact tttcccccta tcttttactt gaacgatact 840
tcacgtgcgg ttatccgagt tgttgagaat ataaatgcta ctgctggaaa gaccattgct 900
gcctatacat ttgatgctgg cccaaatgct gttatttact tcttggaaga aaactccgag 960
attgtattaa atacacttta tgctgttact aaaaatgctg aaggatggag caagcagtat 1020
ggctcttccc ccgttactgt tgattctgct gcagccaata ttgtatcatc tggtataagc 1080
cgagttatct taactcgagt gggtaatggg cctcgagttt tgacgattga cgaatctttg 1140
atcgatgcat ctggcaaccc taaatttata ggaagtcatt aa 1182
<210> 90
<211> 972
<212> DNA
<213> 犹他盐棍菌
<400> 90
atgaaagcga cagcgacggc ccacccgatc caggggctgg tgaagtacca cgggatacgc 60
gaccccgaac tccggacgcc gtatcacgat tcgatcagcc tctgcactgc gccgagtaac 120
tccacgacga cggtcgcctt cgaacccgag cgtcccgagg acgagtacgt catcgacggc 180
gaacacatcg acgggcgcgg ggccgagcgc atccggaccg tcgtcgataa cgttcgcgaa 240
cgggccgatc tcgacgagcg cgtccgcgtc gcaagtgaga acaacttccc gtcgaacgtc 300
ggctttggct cctcggcgtc gggattcgcg gcgctggcga ctgctctcgt tgaggccgct 360
ggcctggacc tctcacgccc ggagatctcg acgattgccc gccgcggctc gacctcggcg 420
gcgcgggcgg tcacgggtgg cttttcggat ctgcgggcgg gcagtaacga cgccgactgc 480
cgttcgaagc gactcgacgt ccccttggag gatgacgttc gcatcgtcgg cgcagtgatt 540
cctgcataca aagagaccga ggcggcccac gaggaggccg ccgagagcca catgttcgag 600
ggccgactcg cccacgtcca cgagcaactc gcggacatgc gcgacgcgct cggtcgcggg 660
gacttcgagc ggtccttcga gatcgccgaa cacgacacac tctcgctggc ggcgacgacg 720
atgaccggac cgagcggctg ggtctactgg caacccgaga gcctcgaagt cttcgagacg 780
gttcgggacc ttcgcgacga cggggttccc gtctacttct ccggggatac cggcgcaagc 840
atctacgtca acaccacggc cgagtacgtc gaccgcgtcg aatcggcgat cgaaaccctc 900
gggatcgaga cgctcacctg gcgcgtcggt ggccccgcgc gcgtccgtga tcccgagaag 960
gcactgttct ga 972
<210> 91
<211> 984
<212> DNA
<213> 土库曼盐栖菌
<400> 91
atgaaagcga ccgccatggc ccacccgatt caggggctgg tcaagtatca cgggatgcga 60
gacgagatcg agcgcctgcc gtatcacgac agtatcagtc tctgtacggc cccgagccac 120
actcgcacga ccgtggagtt ctcgatggac tacgaggagg acacgttcgt cgtcgacggc 180
gaggaactcg acggccgggc ctacgagcgc gtcgaagccg tcgtcgagaa ggctcgttcg 240
aagtccgacg cggcccacac cgtctatccg gttcgcctcg agagcgagaa cagtttcccg 300
tcgaacgtcg ggctgggctc ctcttcctcg ggcttcgccg ccgccgcgat ggcgctggcc 360
gaggccgccg aactcgacgc ctcccgccag gagatttcga cgatcgctcg cgtcggctcg 420
gcgtcggccg cccgcgcggt caccggcgcg ttttcgcaac tgcacacggg tctgaacgac 480
gaggattgtc gctcgcggcg catcccgagt gaccttcacg aggacctgaa gatcgtcgtc 540
ggcctcgtcc cctaccacaa ggagaccgag gacgcccacc gcgaggccgc cgacagccac 600
atgttccagg cccgcaacgc ccacatccac ggccagatcg ccgagatgcg cgacgccctg 660
cggaacaacg agttcgaccg cgccttcgaa ctcgccgagc aggactccct ctcgctggcc 720
gcgacgacga tgaccggccc ctccgggtgg gtctactggc agcccgctac cctgaagatc 780
ttcaatacgg tgcgggaact ccgcgaggag gaggacatcc ccgtctactt ctcgacggac 840
accggcgcca gcgtctacgt caacaccacc gaggaacacg tcgacgaggt cgaggaggcg 900
gtctcggatt gcggcgtctc caccaccgtc tgggacgtcg gcggccctgc gaagctgcta 960
gacgaggaaa agcacctgtt ctag 984
<210> 92
<211> 951
<212> DNA
<213> 泡菜明串珠菌
<400> 92
atgcctacaa cagccacagc acatactaat attgcattta ttaaatattg gggtaaaaaa 60
gatgcgcgct taaatttacc gacaaccagt tctttatccc taacactctc acaattttat 120
acaacaacaa cagtcacaca aaacaccgac aaagatcaac ttgttttaaa cggtgagcta 180
gccgacccta ctagaataca tcatttttta aatacaatac gtgatatcct tggtgatttt 240
cctgctgtga cagtcacttc agaaaaccat gtgccaacca gtgcaggtct agcctcttcg 300
gcttcatctt tcgctgcgct aacaggtgca gtaacaagag aaatgggatt tgatttgtct 360
aatcaatcct tatctcggtt agcacgccgt ggatctggtt ccgcctcacg atcgttttac 420
agtcactttg ctatctggca tgctggtatg gatgatgcct catcttttgc tgaaagttta 480
aatgcccctg acatgccgat tgcccttgtc gttgccgaag tgtccacttc agcaaagaaa 540
gtgagctcaa gtgatggcat gcaacgtgca atcacttcac caaactacga tgattggctc 600
aaccgcagcg cgacacaatt tatggatatg cagtctgcca ttcaacaatc agacatcgaa 660
aaaattggta cgcttgctga agaaaacgct ttagctatgc atgcgcttaa tctcactgca 720
cgccataaac cattcaccta tttcacgcaa gaaacccaac aaatacttgc cctagtatca 780
gatttacgac gacaagggat cctagccttc gcaacaatgg atgctggtcc aaacgtcaaa 840
attataacga ctttaaatga tgcaccaaaa attgttacag cactacattc tgctttacca 900
tatatccatc tcgaaactgc tacaagcgga tcaggtatta cctatgacta a 951
<210> 93
<211> 1005
<212> DNA
<213> 嗜盐盐杆菌
<400> 93
atgcgcgcga cacccccgca tcgacgtatg aaagcaaccg cgcgcgcaca ccccatccag 60
ggcctcgtga aataccacgg gatgcgcgac gagtcgcttc gcatgccgta ccacgactcc 120
atcagcgtct gcaccgcgcc cagcaacacc acgacgaccg tcgagttcga tcccgaccgc 180
gacgccgacc agtacgtcgt cgacggcgac acggtcaccg gtcacggcgc ggaccgcatc 240
cgcagtgtgg tcgatgcggt ccgcgaccgc gccgggttcg accaccgcgt gcgcctggag 300
agccagaaca gcttccccac gaacatcggc ctggggtcgt cgtcgtcggg gttcgcggcg 360
gccgcgctgg cgtgcgtccg cgccgccggc ctggatctgg acctcccgac ggtgtcgacg 420
gtcgcgcgcc gcggatcggc gtcggcggcc cgcgccgtca cgggcgggtt ctcggatctg 480
cacgcgggat tgaacgacgc cgactgccgc agcgaacgcc tcgacgcccc cgcggagttc 540
gcgtccgatc tgcgcatcgt cgtgggcgaa gtgcccgcgt acaaggagac ggagtctgcc 600
cacgccgagg ccgccgacag ccacatgttc gacgcgcggc tggcacacgt ccagggccaa 660
ctcgcggaga tgcgtgacgc cgtccgcgcg ggcgacttcc agcgcgtctt cgagaccgcc 720
gaacacgact cgctgtcgct cgcggcgacg acgatgacgg ggccgtccgg gtgggtgtac 780
tggaagcccg agacgctctc gatattcgag accgtgcggg agctccgggc ggacggcgtg 840
ccgacgtact tctcgacgga taccggcgcg acagtgtacg tgaacaccac tgcgagtcac 900
gccgacgagg tcgaggctgc ggtcgccgac tgcggcgtcg acaccgccgt ctgggaggtc 960
ggcgggcctg cccacgaact cgacgagcgc gacgcgatct tctga 1005
<210> 94
<211> 1300
<212> DNA
<213> 棒状曲霉
<400> 94
atggcggctg cggactcttc ggtctatagg gccaccacta ctgcccctgt caatattgct 60
gtcatcaagt aagttgactg cccccccccc ctaaataaac caaccgcctc cttttcttct 120
atcattaaat ttgtactaac gctgggactt ctctagatac tggggaaaac gggacgcaac 180
tctgaacctg cccaccaatt cttccctctc tgtgaccctt tcccagcgtt cgctccgcac 240
cctcaccacc gcctcctgtt ctgctatcta ccccaccgca gatgagctta tcctcaatgg 300
caagcctcaa gatatccaat cctccaagcg tacgctcgcc tgtctctcca gcctgcgctc 360
tcttcgccag gcgctggaat ctacagactc atcgttgccg aaattatcta cacttccctt 420
gcggattgtt tccgagaaca atttccccac ggccgctggt cttgctagct cagctgctgg 480
gtttgcagcc ctcgttcgtg ctgtagcgaa cctctaccaa cttccgcaat cacctcggga 540
gctcagccgt atcgctcgtc agggatctgg ctctgcttgc cggtctctga tgggcggcta 600
cgtggcttgg cgcgctggag agttggagga cggcagcgat agtcttgctg aggaggttgc 660
acctgcctca cactggcctg agatgcgtgc cattgtcctg gtggtcagcg ccgagaagaa 720
ggatgtcccc agtaccgagg gcatgcagac gacggtcgct acctcgagtc tcttcgctac 780
cagagcgaca tctgttgttc ccgagcggat ggctgccatt gagacagcaa tcctgaacaa 840
ggactttcct gccttcgccg aactcaccat gcgcgactct aacggcttcc acgccacctg 900
ccttgactcc tggcccccaa ttttctatat gaacgacgtt tcccgggctg ctgtcagaat 960
tgtccacgat atcaaccgtg ctattggccg aactgtgtgt gcgtacacct ttgatgctgg 1020
accgaatgct gttatctatt atctggaaaa ggattcggag ctggtcgcag gaactgtcaa 1080
ggcaatcttg accaccaaca ctgacggctg gaatggtcct ttctacgata ttctgaagga 1140
cgtcactgcc ccgggtgttt ctttggataa gattgactct agagccgttg aagttctcaa 1200
ggagggagtc agccgcgtga ttctgaccgg tgttggtgag ggtcctgtca gtgtagaaga 1260
ccacctggtc agcgcaactg gagatgttct ttcgcactaa 1300
<210> 95
<211> 1283
<212> DNA
<213> 费希新萨托菌
<400> 95
atggcggcta cttctgatca taccgtctat cgtgctacca ctaccgcccc ggtcaatatt 60
gctgttatta agtgagttga ctatcgcccc ctaatccgtc ctgtggtgat tcttgtttcc 120
tcctaacagg gtcctctagg tattggggta aaagagatgc gtctctgaat ctgccaacca 180
attcctccct ctctgttacc ctctctcagc gctccctccg aaccctcact accgcctcct 240
gctcagctat ctaccccgcc gcagacgagc tcatcttgaa cggcaagcca caggatattc 300
agtcctccaa acgcacactc gcttgtctct ccaacctacg ttccctccgt caggctctcg 360
aaaatgccga cccctcattg cctaaactgt ctgctctccc attgcgaatt gtttccgaga 420
acaacttccc caccgctgct ggtctcgcga gctcagctgc tggtttcgca gcccttgtcc 480
gtgctatagc agatctttat cagcttccac aatctcctct ggagctcagc cgtattgccc 540
gtcagggttc cggctctgct tgtcggtctc tgatgggcgg ttatgttgcc tggcgtgctg 600
gcgagcggga agatggtagc gacagtctgg ctgaggaagt cgctcccgca tctcattggc 660
ctgagatgcg tgcaattatc ctggtggtta gtgccgagaa gaaagacgtc cccagtacag 720
agggtatgca gactacagtt gctacctcga gtctctttgc tacccgggcc gcatctgttg 780
tccctgagcg gatggccgcc attgagacgg caatccagaa caaggacttc gctacctttg 840
cggaaatcac catgcgtgac tctaacagtt tccacgcaac ttgcctcgac tcctggcctc 900
cgatcttcta catgaacgac gtctccagag ctgccgtgag actcgtccac gacatcaacc 960
gtgctgttgg ccggactgtg tgtgcttaca cattcgacgc tggcccgaat gccgttatct 1020
actaccttga gaaagactcg gaggtggtcg caggaaccgt caaggctatt ttgggcccca 1080
acaccgaagg gttcgacggc ccattctatg atatcttgaa gaatgtcact gcttcagtcg 1140
tgcctctgga gaatgttgac tctagagctg tagaagtctt gaagaacggc atcagccgcg 1200
tcattctgac tggtgtcggg gagggtccta tcagcgtgga ggatcacctt gtgagcgcga 1260
cgggtgatat cctcgcttct tga 1283
<210> 96
<211> 954
<212> DNA
<213> 假肺炎链球菌
<400> 96
atggatagag agcctgtaac agtacgttcc tacgcaaata ttgctattat caaatattgg 60
ggaaagaaaa aagaaaaaga gatagtgcct gctactagca gtatttctct aactttggaa 120
aatatgtata cagagacgac cttgtcgcct ttaccagcca atgtaacagc tgacgaattt 180
tacatcaatg ctcagctaca aaatgaggtc gagcatgcca agatgagtaa gattattgac 240
cgttatcgtc cagctggtga gggctttgtc cgtatcgata ctcaaaataa tatgcctacg 300
gcagcgggcc tgtcctcaag ttctagtggt ttgtccgccc tggtcaaggc ttgtaatgct 360
tatttccagc ttggtttgtc tcggagtcag ttggcacagg aggctaagtt tgcctcaggt 420
tcttcttctc ggagttttta tggaccacta ggtgcctggg acaaggatag tgggggaatt 480
taccctgtag agacaaactt gaaactagct atgatcatgt tggtgctaga ggacaagaaa 540
aaaccaatct ctagccgtga cgggatgaaa ctttgtgtgg agacttcgac gacttttgac 600
gactgggttc gtcagtctga gaaggactat caggatatgc tgatttatct caaggaaaat 660
gactttgcca agattggaga attaacggag aaaaatgctc ttgctatgca cgctacgaca 720
aaaacagcat caccagcctt ttcttatctg accgattcat cttatgaagc gatggacttt 780
gttcgtcaac ttcgcgagca aggagaggcc tgctacttta ctatggatgc cggtcctaat 840
gtcaaagttc tttgtcaaga gaaagacttg gagcatttat caaaaatctt cggtcaacgt 900
taccgcttga ttgtgtcaaa aacaaaggat ttgagtcaag atgattgctg ttaa 954
<210> 97
<211> 1005
<212> DNA
<213> 鼠李糖乳杆菌
<400> 97
atgacaactt atgcacgtgc gcacactaac attgcattga tcaaatattg gggcaaagca 60
aataagcaac tgatgctgcc ggcaaccagc agtatttcgc ttaccttgaa tgacttttac 120
acggacacgg cggtaacttt tgaccctgca ctcgatcagg atcaattcac gttaaatcac 180
caaatgcagt cgcctactgc tgtcagccgc tttttggatc atgttcggca cctggcccaa 240
attgatacac gcgctcgggt caactcgttg aatcatgtac cgactgctgc cggtttggcc 300
agttcggctt ctgcgtttgc ggcactggca ctggctacaa gtcgcgcggc tggcctaaat 360
ttaaccccta ccgctttgtc acggttggca cgtcgcggct cagggtcggc cacccgttca 420
atctttggcg gagcggtaat ttggcaccgt ggcagcgatg atcaatcctc gtttgccgaa 480
cccttaacca ttcagccaac tctgccgctg cggatgttgg tcgtcacggt ttccgatcag 540
aaaaaggcag tcagctcccg caccggcatg gccaacacgg ttgcgaccag cccttattac 600
caggcatggg tacaatcgaa tgaagcgtta atttcaccta tgatcacggc attggccgaa 660
aatgatctga cgacgattgg tgcactcacc gaattatcga gtatgcgcat gcacgctgcc 720
attatggctg aggagccgcc gttcacctac tttttgccgg aaactttacg cgcctggcaa 780
ttggtgcaag aacaacgggc actcggcatt ccggcgtttg ccacgatgga tgccggaccc 840
aacgtcaaga tcctcacaac cgcaccgtac gtggatgttc tcatgaccgc cttgcagcct 900
gtttttggcg accggatttt gagcacccgc ctcggcccgg acgcgcaagt gattacaaag 960
gagcaattta atgacacaga gtcagcaatc acatcgcaag gatga 1005
<210> 98
<211> 939
<212> DNA
<213> 阿弗西尼疏螺旋体
<400> 98
atgaaagtaa agtgtaaagc caatgcaagc ttggctttaa ttaaatattg gggaaagaag 60
gatgtttttt taaacattcc agcgacttct agtcttgctg ttagtgttga taaattttat 120
tcaataagtg agcttgaact ttcagatcga gatgaaataa ttttaaattc aaagccagtt 180
atattgcaaa atagagaaaa ggtgtttttt gattatgcaa gaaaaattct tagtgaaccg 240
aatgttagat ttaaaattaa aagtgaaaac aattttccaa cagcagcagg ccttgcaagt 300
tcaagttcag gatttgcttc tattgctgct tgtattttga aatattttga taaatattct 360
tttaatagtg catctaatct tgcaagagta ggatcagctt ctgcagcaag ggctatttac 420
ggagggttta ctattttgaa agaaggttca aaagaatctt ttcaattaag agatgaatct 480
tattttaatg atttgcgcat aatatttgcc ataattgata gtagtgaaaa agaattgtcc 540
tcaagagccg caatgaatat ttgcaaacac catggatttt attatgatgc ttggattgct 600
tctagtaaaa agatttttaa agatgcttta tatttttttt taaaaaaaga ttttgtgcat 660
tttggagcaa ctattgtaaa aagttatcag aatatgtttg ctttaatgtt tgcatcttct 720
attttttatt ttaaaaatag cacaatagat ttaattaaat atgccgctta tttaagaaat 780
aaaggaattt tggtatttga gacaatggat gcgggccccc aagtgaagtt tctttgtttg 840
gagaaaaatt taaatactat tttaaaagga cttaagcaga attttactga cattgagttt 900
attgtttcaa aggttggatg tgacttagaa tggatttga 939
<210> 99
<211> 549
<212> DNA
<213> 大肠杆菌
<400> 99
atgcaaacgg aacacgtcat tttattgaat gcacagggag ttcccacggg tacgctggaa 60
aagtatgccg cacacacggc agacacccgc ttacatctcg cgttctccag ttggctgttt 120
aatgccaaag gacaattatt agttacccgc cgcgcactga gcaaaaaagc atggcctggc 180
gtgtggacta actcggtttg tgggcaccca caactgggag aaagcaacga agacgcagtg 240
atccgccgtt gccgttatga gcttggcgtg gaaattacgc ctcctgaatc tatctatcct 300
gactttcgct accgcgccac cgatccgagt ggcattgtgg aaaatgaagt gtgtccggta 360
tttgccgcac gcaccactag tgcgttacag atcaatgatg atgaagtgat ggattatcaa 420
tggtgtgatt tagcagatgt attacacggt attgatgcca cgccgtgggc gttcagtccg 480
tggatggtga tgcaggcgac aaatcgcgaa gccagaaaac gattatctgc atttacccag 540
cttaaataa 549
<210> 100
<211> 867
<212> DNA
<213> 酿酒酵母
<400> 100
atgactgccg acaacaatag tatgccccat ggtgcagtat ctagttacgc caaattagtg 60
caaaaccaaa cacctgaaga cattttggaa gagtttcctg aaattattcc attacaacaa 120
agacctaata cccgatctag tgagacgtca aatgacgaaa gcggagaaac atgtttttct 180
ggtcatgatg aggagcaaat taagttaatg aatgaaaatt gtattgtttt ggattgggac 240
gataatgcta ttggtgccgg taccaagaaa gtttgtcatt taatggaaaa tattgaaaag 300
ggtttactac atcgtgcatt ctccgtcttt attttcaatg aacaaggtga attactttta 360
caacaaagag ccactgaaaa aataactttc cctgatcttt ggactaacac atgctgctct 420
catccactat gtattgatga cgaattaggt ttgaagggta agctagacga taagattaag 480
ggcgctatta ctgcggcggt gagaaaacta gatcatgaat taggtattcc agaagatgaa 540
actaagacaa ggggtaagtt tcacttttta aacagaatcc attacatggc accaagcaat 600
gaaccatggg gtgaacatga aattgattac atcctatttt ataagatcaa cgctaaagaa 660
aacttgactg tcaacccaaa cgtcaatgaa gttagagact tcaaatgggt ttcaccaaat 720
gatttgaaaa ctatgtttgc tgacccaagt tacaagttta cgccttggtt taagattatt 780
tgcgagaatt acttattcaa ctggtgggag caattagatg acctttctga agtggaaaat 840
gacaggcaaa ttcatagaat gctataa 867
<210> 101
<211> 996
<212> DNA
<213> 变异链球菌
<400> 101
atgacaaata gaaaagatga tcatataaaa tatgccttag actatcgttc gccatataat 60
agtttcgatg acatagaact cattcatcat tctttaccag attatgattt agccgagatt 120
gatttgtcta cacattttgc tggtcaggat tttgattttc ctttttatat caacgctatg 180
acaggcggaa gccaaaaagg gaaagaagtt aatgaaaaat tagctcaggt agcggacacc 240
tgtggtcttc tttttgtaac aggttcttac agcacagctc ttaaaaatcc agacgatact 300
tcttatcagg taaaaaaatc cagacctcat ttattactag caaccaatat cggccttgac 360
aaaccttatc aggctggctt acaggcagtt agggatttac agcctttatt tcttcaagtt 420
catattaatc ttatgcaaga gctccttatg ccagaggggg aacgcgaatt taggtcttgg 480
aagaaacatt tatctgacta tgcgaagaaa ctacaacttc cttttatttt aaaagaagtt 540
ggttttggta tggacgttaa aacaatccaa actgctattg acctaggggt taaaactgtc 600
gatatttctg gccgaggcgg aactagtttt gcttatatcg aaaatagacg tggcggaaat 660
cgttcttatc ttaatcaatg gggacaaacc acagcgcaag ttctattaaa tgctcagccg 720
cttatggata aggtagaaat cctggctagc ggcgggattc gtcatccatt ggacataata 780
aaagctttgg tccttggagc caaagcggtc ggtttatctc gaacgatgtt agaattagtt 840
gaacagcatt ctgttcatga agtcattgct attgtaaatg gttggaaaga agatttgcgc 900
ctgatcatgt gcgcccttaa ctgtcaaacg attgcagaac ttcgaaatgt tgactatctt 960
ttatatgggc gcttaagaga aggacagaga caataa 996
<210> 102
<211> 1050
<212> DNA
<213> 枯草芽孢杆菌
<400> 102
gtgactcgag cagaacgaaa aagacaacac atcaatcatg ccttgtccat cggccagaag 60
cgggaaacag gtcttgatga tattacgttt gttcacgtca gtctgcccga tcttgcatta 120
gaacaagtag atatttccac aaaaatcggc gaactttcaa gcagttcgcc gatttttatc 180
aatgcaatga ctggcggcgg cggaaaactt acatatgaga ttaataaatc gcttgcgcga 240
gcggcttctc aggctggaat tccccttgct gtgggatcgc aaatgtcagc attaaaagat 300
ccatcagagc gtctttccta tgaaattgtt cgaaaggaaa acccaaacgg gctgattttt 360
gccaacctgg gaagcgaggc aacggctgct caggcaaagg aagccgttga gatgattgga 420
gcaaacgcac tgcagatcca cctcaatgtg attcaggaaa ttgtgatgcc tgaaggggac 480
agaagcttta gcggcgcatt gaaacgcatt gaacaaattt gcagccgggt cagtgtaccg 540
gtcattgtga aagaagtcgg cttcggtatg agcaaagcat cagcaggaaa gctgtatgaa 600
gctggtgctg cagctgttga cattggcggt tacgggggaa caaatttctc gaaaatcgaa 660
aatctccgaa gacagcggca aatctccttt tttaattcgt ggggcatttc gacagctgca 720
agtttggcgg aaatccgctc tgagtttcct gcaagcacca tgatcgcctc tggcggtctg 780
caagatgcgc ttgacgtggc aaaggcaatt gcgctggggg cctcttgcac cggaatggca 840
gggcattttt taaaagcgct gactgacagc ggtgaggaag gactgcttga ggagattcag 900
ctgatccttg aggaattaaa gttgattatg accgtgctgg gtgccagaac aattgccgat 960
ttacaaaagg cgccccttgt gatcaaaggt gaaacccatc attggctcac agagagaggg 1020
gtcaatacat caagctatag tgtgcgataa 1050
<210> 103
<211> 939
<212> DNA
<213> 大肠杆菌
<400> 103
atgaaagtcg cagtcctcgg cgctgctggc ggtattggcc aggcgcttgc actactgtta 60
aaaacccaac tgccttcagg ttcagaactc tctctgtatg atatcgctcc agtgactccc 120
ggtgtggctg tcgatctgag ccatatccct actgctgtga aaatcaaagg tttttctggt 180
gaagatgcga ctccggcgct ggaaggcgca gatgtcgttc ttatctctgc aggcgtagcg 240
cgtaaaccgg gtatggatcg ttccgacctg tttaacgtta acgccggcat cgtgaaaaac 300
ctggtacagc aagttgcgaa aacctgcccg aaagcgtgca ttggtattat cactaacccg 360
gttaacacca cagttgcaat tgctgctgaa gtgctgaaaa aagccggtgt ttatgacaaa 420
aacaaactgt tcggcgttac cacgctggat atcattcgtt ccaacacctt tgttgcggaa 480
ctgaaaggca aacagccagg cgaagttgaa gtgccggtta ttggcggtca ctctggtgtt 540
accattctgc cgctgctgtc acaggttcct ggcgttagtt ttaccgagca ggaagtggct 600
gatctgacca aacgcatcca gaacgcgggt actgaagtgg ttgaagcgaa ggccggtggc 660
gggtctgcaa ccctgtctat gggccaggca gctgcacgtt ttggtctgtc tctggttcgt 720
gcactgcagg gcgaacaagg cgttgtcgaa tgtgcctacg ttgaaggcga cggtcagtac 780
gcccgtttct tctctcaacc gctgctgctg ggtaaaaacg gcgtggaaga gcgtaaatct 840
atcggtaccc tgagcgcatt tgaacagaac gcgctggaag gtatgctgga tacgctgaag 900
aaagatatcg ccctgggcga agagttcgtt aataagtaa 939
<210> 104
<211> 990
<212> DNA
<213> 大肠杆菌
<400> 104
atgaaactcg ccgtttatag cacaaaacag tacgacaaga agtacctgca acaggtgaac 60
gagtcctttg gctttgagct ggaatttttt gactttctgc tgacggaaaa aaccgctaaa 120
actgccaatg gctgcgaagc ggtatgtatt ttcgtaaacg atgacggcag ccgcccggtg 180
ctggaagagc tgaaaaagca cggcgttaaa tatatcgccc tgcgctgtgc cggtttcaat 240
aacgtcgacc ttgacgcggc aaaagaactg gggctgaaag tagtccgtgt tccagcctat 300
gatccagagg ccgttgctga acacgccatc ggtatgatga tgacgctgaa ccgccgtatt 360
caccgcgcgt atcagcgtac ccgtgacgct aacttctctc tggaaggtct gaccggcttt 420
actatgtatg gcaaaacggc aggcgttatc ggtaccggta aaatcggtgt ggcgatgctg 480
cgcattctga aaggttttgg tatgcgtctg ctggcgttcg atccgtatcc aagtgcagcg 540
gcgctggaac tcggtgtgga gtatgtcgat ctgccaaccc tgttctctga atcagacgtt 600
atctctctgc actgcccgct gacaccggaa aactaccatc tgttgaacga agccgccttc 660
gatcagatga aaaatggcgt gatgatcgtc aataccagtc gcggtgcatt gattgattct 720
caggcagcaa ttgaagcgct gaaaaatcag aaaattggtt cgttgggtat ggacgtgtat 780
gagaacgaac gcgatctgtt ctttgaagat aaatccaacg acgtgatcca ggatgacgta 840
ttccgtcgcc tgtctgcctg ccacaacgtg ctgtttaccg ggcaccaggc attcctgaca 900
gcagaagctc tgaccagtat ttctcagact acgctgcaaa acttaagcaa tctggaaaaa 960
ggcgaaacct gcccgaacga actggtttaa 990
<210> 105
<211> 1050
<212> DNA
<213> 富养罗尔斯通氏菌
<400> 105
atgaagatct ccctcaccag cgcccgccag cttgcccgcg acatcctcgc cgcgcagcag 60
gtgcccgccg acatcgctga cgacgtggcc gagcacctgg tcgaatccga ccgctgcggc 120
tatatcagcc acggcctgtc gatcctgccc aactaccgca ccgccctcga cggccacagc 180
gtcaacccgc aaggccgcgc caaatgcgtg ctggaccagg gcacgctgat ggtgttcgac 240
ggcgacggcg gcttcggcca gcacgtgggc aagtccgtga tgcaagcagc gatcgagcgc 300
gtgcgccagc atggccactg catcgtcact ctgcgccgct cgcaccatct cggccgcatg 360
ggccactacg gcgagatggc ggccgccgcc ggctttgtgc tgctgagctt caccaacgtg 420
atcaaccgcg cgccggtggt ggcgccgttc ggcggccgcg tggcgcggct caccaccaac 480
ccgctgtgtt tcgccggccc gatgcccaac gggcggccgc ctctggtggt ggacatcgcc 540
accagcgcga ttgccatcaa caaggcccgt gtgctggccg agaaaggcga gccggcgccc 600
gaaggcagca tcatcggcgc cgacggcaac cccaccaccg acgcgtcaac catgttcggc 660
gaacaccccg gcgcgctgct gccctttggc ggccacaagg gctacgcact gggcgttgtg 720
gccgagctgc tggcgggcgt gctgtccggc ggcggtacca tccagccaga caatccgcgc 780
ggcggcgtgg ccaccaacaa cctgttcgcg gtgctgctca atcccgcgct ggacctgggc 840
ctggactggc agagcgccga ggtcgaggcg ttcgtgcgct acctgcacga cacaccgccg 900
gcgccgggcg tcgaccgcgt gcagtacccc ggcgagtacg aggccgccaa ccgggcgcag 960
gccagcgaca cgctaaacat caacccggcc atctggcgca atcttgagcg cctggcgcag 1020
tcgctcaacg tggccgtccc cacggcctga 1050
<210> 106
<211> 1056
<212> DNA
<213> 拜氏梭菌
<400> 106
atgaaaggtt ttgcaatgct aggtattaat aagttaggat ggatcgaaaa agaaaggcca 60
gttgcgggtt catatgatgc tattgtacgc ccattagcag tatctccgtg tacatcagat 120
atacatactg tttttgaggg agctcttgga gataggaaga atatgatttt agggcatgaa 180
gctgtaggtg aagttgttga agtaggaagt gaagtgaagg attttaaacc tggtgacaga 240
gttatagttc cttgtacaac tccagattgg agatctttgg aagttcaagc tggttttcaa 300
cagcactcaa acggtatgct cgcaggatgg aaattttcaa atttcaagga tggagttttt 360
ggtgaatatt ttcatgtaaa tgatgcggat atgaatcttg cgattctacc taaagacatg 420
ccattagaaa atgctgttat gataacagat atgatgacta ctggatttca tggagcagaa 480
cttgcagata ttcaaatggg ttcaagtgtt gtggtaattg gcattggagc tgttggctta 540
atgggaatag caggtgctaa attacgtgga gcaggtagaa taattggagt ggggagcagg 600
ccgatttgtg ttgaggctgc aaaattttat ggagcaacag atattctaaa ttataaaaat 660
ggtcatatag ttgatcaagt tatgaaatta acgaatggaa aaggcgttga ccgcgtaatt 720
atggcaggcg gtggttctga aacattatcc caagcagtat ctatggttaa accaggagga 780
ataatttcta atataaatta tcatggaagt ggagatgctt tactaatacc acgtgtagaa 840
tggggatgtg gaatggctca caagactata aaaggaggtc tttgtcctgg gggacgtttg 900
agagcagaaa tgttaagaga tatggtagta tataatcgtg ttgatctaag taaattagtt 960
acacatgtat atcatggatt tgatcacata gaagaagcac tgttattaat gaaagacaag 1020
ccaaaagact taattaaagc agtagttata ttataa 1056
<210> 107
<211> 1059
<212> DNA
<213> 布氏嗜热厌氧杆菌
<400> 107
atgaaaggtt ttgcaatgct cagtatcggt aaagttggct ggattgagaa ggaaaagcct 60
gctcctggcc catttgatgc tattgtaaga cctctagctg tggccccttg cacttcggac 120
attcataccg tttttgaagg cgccattggc gaaagacata acatgatact cggtcacgaa 180
gctgtaggtg aagtagttga agtaggtagt gaggtaaaag attttaaacc tggtgatcgc 240
gttgttgtgc cagctattac ccctgattgg cggacctctg aagtacaaag aggatatcac 300
cagcactccg gtggaatgct ggcaggctgg aaattttcga atgtaaaaga tggtgttttt 360
ggtgaatttt ttcatgtgaa tgatgctgat atgaatttag cacatctgcc taaagaaatt 420
ccattggaag ctgcagttat gattcccgat atgatgacca ctggttttca cggagctgaa 480
ctggcagata tagaattagg tgcgacggta gcagttttgg gtattggccc agtaggtctt 540
atggcagtcg ctggtgccaa attgcgtgga gccggaagaa ttattgccgt aggcagtaga 600
ccagtttgtg tagatgctgc aaaatactat ggagctactg atattgtaaa ctataaagat 660
ggtcctatcg aaagtcagat tatgaatcta actgaaggca aaggtgtcga tgctgccatc 720
atcgctggag gaaatgctga cattatggct acagcagtta agattgttaa acctggtggc 780
accatcgcta atgtaaatta ttttggcgaa ggagaggttt tgcctgttcc tcgtcttgaa 840
tggggttgcg gcatggctca taaaactata aaaggcgggc tatgccccgg tggacgtcta 900
agaatggaaa gactgattga ccttgttttt tataagcgtg tcgatccttc taagctcgtc 960
actcacgttt tccggggatt tgacaatatt gaaaaagcct ttatgttgat gaaagacaaa 1020
ccaaaagacc taatcaaacc tgttgtaata ttagcataa 1059
<210> 108
<211> 2537
<212> DNA
<213> 赤红球菌
<400> 108
ctgcagggct tcaccctcgg ccactacacc cacgtcttcc ccgagttcgc ggcgaagatg 60
gggccgtggc tcgcggccgg cgacgtggtg ttcgacgaga cgatcgtcga cggcatcggc 120
aactcggtcg atgccttcct cgacctcatg cgcgggcgca acgtcggcaa gatgctcgtc 180
cgaaccgcct gacgtccgga gccggaacgg ccggcgtcgt gcagcggaag attcgctcca 240
gtgccgggcg ggcgcacctt cccggccgta gagtcgggcg catgaaagcc ctccagtaca 300
ccgagatcgg ctccgagccg gtcgtcgtcg acgtccccac cccggcgccc gggccgggtg 360
agatcctgct gaaggtcacc gcggccggct tgtgccactc ggacatcttc gtgatggaca 420
tgccggcaga gcagtacatc tacggtcttc ccctcaccct cggccacgag ggcgtcggca 480
ccgtcgccga actcggcgcc ggcgtcaccg gattcgagac gggggacgcc gtcgccgtgt 540
acgggccgtg ggggtgcggt gcgtgccacg cgtgcgcgcg cggccgggag aactactgca 600
cccgcgccgc cgagctgggc atcaccccgc ccggtctcgg ctcgcccggg tcgatggccg 660
agtacatgat cgtcgactcg gcgcgccacc tcgtcccgat cggggacctc gaccccgtcg 720
cggcggttcc gctcaccgac gcgggcctga cgccgtacca cgcgatctcg cgggtcctgc 780
ccctgctggg acccggctcg accgcggtcg tcatcggggt cggcggactc gggcacgtcg 840
gcatccagat cctgcgcgcc gtcagcgcgg cccgcgtgat cgccgtcgat ctcgacgacg 900
accgactcgc gctcgcccgc gaggtcggcg ccgacgcggc ggtgaagtcg ggcgccgggg 960
cggcggacgc gatccgggag ctgaccggcg gtgagggcgc gacggcggtg ttcgacttcg 1020
tcggcgccca gtcgacgatc gacacggcgc agcaggtggt cgcgatcgac gggcacatct 1080
cggtggtcgg catccatgcc ggcgcccacg ccaaggtcgg cttcttcatg atcccgttcg 1140
gcgcgtccgt cgtgacgccg tactggggca cgcggtccga gctgatggac gtcgtggacc 1200
tggcccgtgc cggccggctc gacatccaca ccgagacgtt caccctcgac gagggaccca 1260
cggcctaccg gcggctacgc gagggcagca tccgcggccg cggggtggtc gtcccgggct 1320
gacacgacga cgaaggctcc gcactcggat cgagtgcgga gccttcgtcg ggtacgggga 1380
tcagcgagcg aacagcagcg cgcgcttgac ctcctggatc gccttcgtca cctggatgcc 1440
gcgcgggcac gcgtcggtgc agttgaaggt ggtgcggcag cgccacacgc cctcgacgtc 1500
gttgaggatg tcgagacgct cggcggcgcc ctcgtcacgg ctgtcgaaga tgaaccggtg 1560
cgcgttgacg atggcggcgg gaccgaagta gctgccgtcg ttccagtaca ccgggcacga 1620
ggtggtgcag cacgcgcaca ggatgcactt ggtggtgtcg tcgaaccggg cacggtcggc 1680
ctgcgactgg atccgctcgc gggtgggctc gttgcccgtg gcgatgagga acggcttcac 1740
ggcgcggaac gcgtcgaaga agggctccat gtcgacgacg aggtccttct cgaccggcag 1800
gccgcggatc ggctcgacgg tgatggtcac cggcttgccg tccttgggca gcatgtcctt 1860
catcaggatc ttgcaggcca ggcggttgac gccgttgatc cgcatggcgt ccgagccgca 1920
caccccgtgc gcgcagctgc ggcggaacgt gagggtgccg tcgaggtagc ccttcacgta 1980
gagcagcagg ttgagcatgc ggtccgacgg cagcgccgga acctggaagc tgtcccagtg 2040
ctgacccttg ccgtcctcgg ggttgaaccg cgcgatcttg agggtgacca tcgtggcgcc 2100
ctcgggcacg ggtggcaggt tcgagacgtc ggcttcgttc ttctcgaggg ttgtcatcaa 2160
gtacttccgc tccatcggct cgtagcgggt ctgcaccacc ggcttgtagt ccaggcggat 2220
gggggagatc agctccgtcc cctccttgta ggccatggtg tgcttgagga acttctcgtc 2280
gtcgcgcttc gggaagtcct cgcgggcgtg accgccgcgc gattccttcc ggttgagcgc 2340
accggcgacg gtgacctcgg ccatctcgag caggaagccc agctcgacgg cctcgagcag 2400
gtcgctgttg tagcgcttgc ccttgtcctg gacggtgatg ttcttgtacc gctccttcag 2460
cgcgtggatg tcctcgagcg ccttggtgag cgtctcctcg gtgcggaaca ccgaggcgtt 2520
gttgtccatg gactgca 2537
<210> 109
<211> 1173
<212> DNA
<213> 激烈火球菌
<400> 109
atgtttgaga tatcaattta tcttcccaca gaaatagttt ttggtcctgg gaagcttgaa 60
atgcttccta aactagtgaa gaagcatggg ctttctggga aggccctaat agtaactgga 120
aggagaagca caaaggaaac tggagttctt tatagagttc aagaactact taagcaagct 180
ggggtagaga gcatagtttt tgacaaaatt attccaaatc caatatctac tcatgtggat 240
gaaggggcag agatagcgag aaaagaaaat gttagctttg ttgttggctt gggtggtgga 300
agtgcgatag atagtgcaaa agctatagca atgactgccg ccagtggagg taaatattgg 360
gactatgttc cagctgtggg aggaggaaag aagcctactg gagcgcttcc aatagttgca 420
attccaacaa cccacgggac tggaacggag gctgatcctt atgctgttat aactaatcct 480
gaaacaaagg agaagcaggg aattggatat gatgttctct tccccaaatt ctctatagtt 540
gatccagaac ttatgcttac tcttccaaaa gatcaaacag tgtacacttc aatggatgct 600
ttctaccact ccattgaggc ctttcttaat gttagagcaa atccatattc ggatgttctg 660
gctctcgact caatgaggcg cattgttaca taccttccat tggcctacga aaacttgaga 720
aatcttgaag caagaacgca acttgcctgg gcaagtactg aggctggaat aacggaaacg 780
gtaacgggag ttgtggcaaa tcatgcactt gagcatggtc taagtggatt ctatcctgaa 840
gtgcctcatg gtctgggcct ctgcattcta ggaccctacc tctttgaata cattctcgac 900
tatgcctatg aaaagttggc gatagtcgga agagaggtat ttggagttta cgagccaaat 960
gacagaaagg cagcagagct agctattaag aagctacgtg acttccagag cctctttgga 1020
gtaaacaaga agctcagaga attaggggtt aaagaggaag acattccaga gatggctagg 1080
actgcttata gaatgatgaa acctgttata gaggcaacac cgggagattt gaaagttgaa 1140
gacttggaag agatctatag aagagcatac taa 1173
<210> 110
<211> 2676
<212> DNA
<213> 大肠杆菌
<400> 110
atggctgtta ctaatgtcgc tgaacttaac gcactcgtag agcgtgtaaa aaaagcccag 60
cgtgaatatg ccagtttcac tcaagagcaa gtagacaaaa tcttccgcgc cgccgctctg 120
gctgctgcag atgctcgaat cccactcgcg aaaatggccg ttgccgaatc cggcatgggt 180
atcgtcgaag ataaagtgat caaaaaccac tttgcttctg aatatatcta caacgcctat 240
aaagatgaaa aaacctgtgg tgttctgtct gaagacgaca cttttggtac catcactatc 300
gctgaaccaa tcggtattat ttgcggtatc gttccgacca ctaacccgac ttcaactgct 360
atcttcaaat cgctgatcag tctgaagacc cgtaacgcca ttatcttctc cccgcacccg 420
cgtgcaaaag atgccaccaa caaagcggct gatatcgttc tgcaggctgc tatcgctgcc 480
ggtgctccga aagatctgat cggctggatc gatcaacctt ctgttgaact gtctaacgca 540
ctgatgcacc acccagacat caacctgatc ctcgcgactg gtggtccggg catggttaaa 600
gccgcataca gctccggtaa accagctatc ggtgtaggcg cgggcaacac tccagttgtt 660
atcgatgaaa ctgctgatat caaacgtgca gttgcatctg tactgatgtc caaaaccttc 720
gacaacggcg taatctgtgc ttctgaacag tctgttgttg ttgttgactc tgtttatgac 780
gctgtacgtg aacgttttgc aacccacggc ggctatctgt tgcagggtaa agagctgaaa 840
gctgttcagg atgttatcct gaaaaacggt gcgctgaacg cggctatcgt tggtcagcca 900
gcctataaaa ttgctgaact ggcaggcttc tctgtaccag aaaacaccaa gattctgatc 960
ggtgaagtga ccgttgttga tgaaagcgaa ccgttcgcac atgaaaaact gtccccgact 1020
ctggcaatgt accgcgctaa agatttcgaa gacgcggtag aaaaagcaga gaaactggtt 1080
gctatgggcg gtatcggtca tacctcttgc ctgtacactg accaggataa ccaaccggct 1140
cgcgtttctt acttcggtca gaaaatgaaa acggcgcgta tcctgattaa caccccagcg 1200
tctcagggtg gtatcggtga cctgtataac ttcaaactcg caccttccct gactctgggt 1260
tgtggttctt ggggtggtaa ctccatctct gaaaacgttg gtccgaaaca cctgatcaac 1320
aagaaaaccg ttgctaagcg agctgaaaac atgttgtggc acaaacttcc gaaatctatc 1380
tacttccgcc gtggctccct gccaatcgcg ctggatgaag tgattactga tggccacaaa 1440
cgtgcgctca tcgtgactga ccgcttcctg ttcaacaatg gttatgctga tcagatcact 1500
tccgtactga aagcagcagg cgttgaaact gaagtcttct tcgaagtaga agcggacccg 1560
accctgagca tcgttcgtaa aggtgcagaa ctggcaaact ccttcaaacc agacgtgatt 1620
atcgcgctgg gtggtggttc cccgatggac gccgcgaaga tcatgtgggt tatgtacgaa 1680
catccggaaa ctcacttcga agagctggcg ctgcgcttta tggatatccg taaacgtatc 1740
tacaagttcc cgaaaatggg cgtgaaagcg aaaatgatcg ctgtcaccac cacttctggt 1800
acaggttctg aagtcactcc gtttgcggtt gtaactgacg acgctactgg tcagaaatat 1860
ccgctggcag actatgcgct gactccggat atggcgattg tcgacgccaa cctggttatg 1920
gacatgccga agtccctgtg tgctttcggt ggtctggacg cagtaactca cgccatggaa 1980
gcttatgttt ctgtactggc atctgagttc tctgatggtc aggctctgca ggcactgaaa 2040
ctgctgaaag aatatctgcc agcgtcctac cacgaagggt ctaaaaatcc ggtagcgcgt 2100
gaacgtgttc acagtgcagc gactatcgcg ggtatcgcgt ttgcgaacgc cttcctgggt 2160
gtatgtcact caatggcgca caaactgggt tcccagttcc atattccgca cggtctggca 2220
aacgccctgc tgatttgtaa cgttattcgc tacaatgcga acgacaaccc gaccaagcag 2280
actgcattca gccagtatga ccgtccgcag gctcgccgtc gttatgctga aattgccgac 2340
cacttgggtc tgagcgcacc gggcgaccgt actgctgcta agatcgagaa actgctggca 2400
tggctggaaa cgctgaaagc tgaactgggt attccgaaat ctatccgtga agctggcgtt 2460
caggaagcag acttcctggc gaacgtggat aaactgtctg aagatgcatt cgatgaccag 2520
tgcaccggcg ctaacccgcg ttacccgctg atctccgagc tgaaacagat tctgctggat 2580
acctactacg gtcgtgatta tgtagaaggt gaaactgcag cgaagaaaga agctgctccg 2640
gctaaagctg agaaaaaagc gaaaaaatcc gcttaa 2676
<210> 111
<211> 3015
<212> DNA
<213> 丙酮丁醇梭菌
<400> 111
attttacttt attctaataa tacgtaatac acccacttat aactagtatt tggcaataaa 60
aatagttata atcattaatt attgttaaat gtttgacaat ctttaattac tgttatataa 120
taatattata gaaaataaaa tgactgcata attttactat agaaatacaa gcgttaaata 180
tgtacatatc aacggtttat cacattagaa gtaaataatg taaggaaacc acactctata 240
atttataagg catcaaagtg tgttatataa tacaataagt tttatttgca atagtttgtt 300
aaatatcaaa ctaataataa attttataaa ggagtgtata taaatgaaag ttacaaatca 360
aaaagaacta aaacaaaagc taaatgaatt gagagaagcg caaaagaagt ttgcaaccta 420
tactcaagag caagttgata aaatttttaa acaatgtgcc atagccgcag ctaaagaaag 480
aataaactta gctaaattag cagtagaaga aacaggaata ggtcttgtag aagataaaat 540
tataaaaaat cattttgcag cagaatatat atacaataaa tataaaaatg aaaaaacttg 600
tggcataata gaccatgacg attctttagg cataacaaag gttgctgaac caattggaat 660
tgttgcagcc atagttccta ctactaatcc aacttccaca gcaattttca aatcattaat 720
ttctttaaaa acaagaaacg caatattctt ttcaccacat ccacgtgcaa aaaaatctac 780
aattgctgca gcaaaattaa ttttagatgc agctgttaaa gcaggagcac ctaaaaatat 840
aataggctgg atagatgagc catcaataga actttctcaa gatttgatga gtgaagctga 900
tataatatta gcaacaggag gtccttcaat ggttaaagcg gcctattcat ctggaaaacc 960
tgcaattggt gttggagcag gaaatacacc agcaataata gatgagagtg cagatataga 1020
tatggcagta agctccataa ttttatcaaa gacttatgac aatggagtaa tatgcgcttc 1080
tgaacaatca atattagtta tgaattcaat atacgaaaaa gttaaagagg aatttgtaaa 1140
acgaggatca tatatactca atcaaaatga aatagctaaa ataaaagaaa ctatgtttaa 1200
aaatggagct attaatgctg acatagttgg aaaatctgct tatataattg ctaaaatggc 1260
aggaattgaa gttcctcaaa ctacaaagat acttataggc gaagtacaat ctgttgaaaa 1320
aagcgagctg ttctcacatg aaaaactatc accagtactt gcaatgtata aagttaagga 1380
ttttgatgaa gctctaaaaa aggcacaaag gctaatagaa ttaggtggaa gtggacacac 1440
gtcatcttta tatatagatt cacaaaacaa taaggataaa gttaaagaat ttggattagc 1500
aatgaaaact tcaaggacat ttattaacat gccttcttca cagggagcaa gcggagattt 1560
atacaatttt gcgatagcac catcatttac tcttggatgc ggcacttggg gaggaaactc 1620
tgtatcgcaa aatgtagagc ctaaacattt attaaatatt aaaagtgttg ctgaaagaag 1680
ggaaaatatg ctttggttta aagtgccaca aaaaatatat tttaaatatg gatgtcttag 1740
atttgcatta aaagaattaa aagatatgaa taagaaaaga gcctttatag taacagataa 1800
agatcttttt aaacttggat atgttaataa aataacaaag gtactagatg agatagatat 1860
taaatacagt atatttacag atattaaatc tgatccaact attgattcag taaaaaaagg 1920
tgctaaagaa atgcttaact ttgaacctga tactataatc tctattggtg gtggatcgcc 1980
aatggatgca gcaaaggtta tgcacttgtt atatgaatat ccagaagcag aaattgaaaa 2040
tctagctata aactttatgg atataagaaa gagaatatgc aatttcccta aattaggtac 2100
aaaggcgatt tcagtagcta ttcctacaac tgctggtacc ggttcagagg caacaccttt 2160
tgcagttata actaatgatg aaacaggaat gaaataccct ttaacttctt atgaattgac 2220
cccaaacatg gcaataatag atactgaatt aatgttaaat atgcctagaa aattaacagc 2280
agcaactgga atagatgcat tagttcatgc tatagaagca tatgtttcgg ttatggctac 2340
ggattatact gatgaattag ccttaagagc aataaaaatg atatttaaat atttgcctag 2400
agcctataaa aatgggacta acgacattga agcaagagaa aaaatggcac atgcctctaa 2460
tattgcgggg atggcatttg caaatgcttt cttaggtgta tgccattcaa tggctcataa 2520
acttggggca atgcatcacg ttccacatgg aattgcttgt gctgtattaa tagaagaagt 2580
tattaaatat aacgctacag actgtccaac aaagcaaaca gcattccctc aatataaatc 2640
tcctaatgct aagagaaaat atgctgaaat tgcagagtat ttgaatttaa agggtactag 2700
cgataccgaa aaggtaacag ccttaataga agctatttca aagttaaaga tagatttgag 2760
tattccacaa aatataagtg ccgctggaat aaataaaaaa gatttttata atacgctaga 2820
taaaatgtca gagcttgctt ttgatgacca atgtacaaca gctaatccta ggtatccact 2880
tataagtgaa cttaaggata tctatataaa atcattttaa aaaataaaga atgtaaaata 2940
gtctttgctt cattatatta gcttcatgaa gcacatagac tattttacat tttactcttg 3000
ttttttatct ttcaa 3015
<210> 112
<211> 2685
<212> DNA
<213> 肠膜明串珠菌
<400> 112
atgagcaagt aaaggagcaa agattatggc agaagcaatt gcaaagaaac ccgcaaaaaa 60
ggttttgacc cctgaagaaa aagcggaatt acaaacacaa gctgagaaga tgactgttgt 120
attgattgaa aaatcacaaa aggcattgtc tgaattttca acattttcgc aagaacaagt 180
tgataaaatt gttgcagcta tggccttggc aggttctgag aattcacttc tgttagccca 240
tgctgctcac gacgagactg gacgtggggt tgtggaagat aaggatacga aaaatcgttt 300
cgcctcagaa tcagtttata acgctattaa gtttgataag actgtgggtg ttattagtga 360
agacaagatt caaggtaagg tagaattagc agccccactt ggtattttgg ctggaatcgc 420
tccaacgaca aatccaacgt cgacaactat tttcaaatca atgttgacag caaagacacg 480
taacacaatt atctttgctt tccatcccca gcctcaaaaa gcatcggttc ttgctgcaaa 540
aattgtttat gatgctgctg ttaaagcagg cgcaccggaa aactttatcc aatggattga 600
aaagccttca ctttatgcaa caagtgcgct gatacaaaat cctcacattg cttcaattct 660
agctactggt gggccatcaa tggttaatgc agctttgaag tcaggaaatc catccatggg 720
tgtcggtgct ggaaacggtg cagtttatat tgatgcaact gttgacacag atcgtgccgt 780
gtctgatttg ttgttatcaa agcgtttcga taatggcatg atttgtgcca cagaaaactc 840
agccgttatt caagcaccaa tctatgacga aattttaact aagttacaag aacaaggtgc 900
ataccttgtt cctaagaaag actacaagaa aattgctgat tatgtcttta agcctaacgc 960
agagggattt ggtattgctg gtcctgttgc tggtatgtca ggacgttgga ttgctgagca 1020
agcaggcgta aagattcctg atggtaaaga tgtacttttg ttcgaattag atcagaagaa 1080
cataggtgaa gcgttatctt ctgaaaagtt atcgccatta ctttcaattt ataaagttga 1140
gaagcgtgaa gaagctattg agactgttca atccttgtta aactatcaag gcgcagggca 1200
caacgcagca attcaaattg gttcacaaga tgatccattc attaaagagt atgctgacgc 1260
tattggtgca tcacgtattt tggttaacca acctgactca atcggtggcg ttggggatat 1320
ttatacagat gctatgcgtc catcgttgac acttggtacc ggatcatggg ggaagaattc 1380
attgtctcat aacttatcaa catacgactt acttaatatt aagaccgtgg ctcgccgccg 1440
taatcgtcct caatgggttc gtttacctaa ggaagtttac tacgaaacca atgccattac 1500
ttacttacaa gacttgccta ctataaaccg tgcatttatt gtcgctgatc ctggtatggt 1560
tcagttcgga tttgttggca gagtactagg tcaacttaag ttacgtcaag aacaggttga 1620
aacaaatatc tatggttcag ttaagcctga cccaactttg tcacaagctg ttgaaattgc 1680
tcgccaaatg gcagacttca aaccagatac agttatttta cttggcggtg gttcggcact 1740
tgacgctggt aaaattggtc ggttcttgta cgaatactcg acacgccatg aaggaatttt 1800
agaagatgac gaggcgatta aagagctatt cttagaacta caacaaaagt ttatggatat 1860
tcgtaagcga atcgttaagt tttaccacgc acgtttgaca caaatggttg cgattccaac 1920
aacttcaggt actggatcag aagtcacacc atttgccgtt attacagatg atgaaacaca 1980
tgtaaagtat ccactagccg attatgaatt gacaccggaa gttgctattg ttgatccaga 2040
atttgttatg accgtaccac aacacacggt atcttggtca ggattagatg ctttgtcaca 2100
tgctttggaa tcgtatgtct cagtgatggc ttctgaattc tcacgtcctt gggcattaca 2160
agctattaag ttgatttttg ataacttaac aaattcatac aattatgatc ctaaacaccc 2220
aactaaggaa ggtcagaatg cacgcacaaa gatgcactat gcgtcaacat tggctggtat 2280
gtcatttgcg aatgccttct tgggacttaa ccactcacta gcacacaaaa ctggtggaga 2340
attcggacta cctcacggta tggcaatcgc tattgcaatg ccacatgtga ttaagtttaa 2400
tgcggtaaca ggaaatgtaa agcgcacacc atacccacga tacgaaacct atacagcaca 2460
aaaagattat gctgatattg cacgttactt aggtttgaaa ggtgaaacag atgctgaatt 2520
ggtcgatgta ttgattgcag aaatcaagaa gttggctgca tcagtgggtg tcaatcaaac 2580
actatctggc aacggtgttt caaagcatga ctttgataca aagttagaaa agatgattga 2640
cttagtttac aatgaccaat gcacgccggg aaaccctcgc caacc 2685
<210> 113
<211> 3164
<212> DNA
<213> 酿酒酵母
<400> 113
atgccgccgc tattcaaggg actgaaacag atggcaaagc caattgccta tgtttcaaga 60
ttttcggcga aacgaccaat tcatataata cttttttctc taatcatatc cgcattcgct 120
tatctatccg tcattcagta ttacttcaat ggttggcaac tagattcaaa tagtgttttt 180
gaaactgctc caaataaaga ctccaacact ctatttcaag aatgttccca ttactacaga 240
gattcctctc tagatggttg ggtatcaatc accgcgcatg aagctagtga gttaccagcc 300
ccacaccatt actatctatt aaacctgaac ttcaatagtc ctaatgaaac tgactccatt 360
ccagaactag ctaacacggt ttttgagaaa gataatacaa aatatattct gcaagaagat 420
ctcagtgttt ccaaagaaat ttcttctact gatggaacga aatggaggtt aagaagtgac 480
agaaaaagtc ttttcgacgt aaagacgtta gcatattctc tctacgatgt attttcagaa 540
aatgtaaccc aagcagaccc gtttgacgtc cttattatgg ttactgccta cctaatgatg 600
ttctacacca tattcggcct cttcaatgac atgaggaaga ccgggtcaaa tttttggttg 660
agcgcctcta cagtggtcaa ttctgcatca tcacttttct tagcattgta tgtcacccaa 720
tgtattctag gcaaagaagt ttccgcatta actctttttg aaggtttgcc tttcattgta 780
gttgttgttg gtttcaagca caaaatcaag attgcccagt atgccctgga gaaatttgaa 840
agagtcggtt tatctaaaag gattactacc gatgaaatcg tttttgaatc cgtgagcgaa 900
gagggtggtc gtttgattca agaccatttg ctttgtattt ttgcctttat cggatgctct 960
atgtatgctc accaattgaa gactttgaca aacttctgca tattatcagc atttatccta 1020
atttttgaat tgattttaac tcctacattt tattctgcta tcttagcgct tagactggaa 1080
atgaatgtta tccacagatc tactattatc aagcaaacat tagaagaaga cggtgttgtt 1140
ccatctacag caagaatcat tttaaagcag aaaagaaatc cgtatcttct ttcttaaatc 1200
tcagtgtggt tgtcattatc atgaaactct ctgtcatact gttgtttgtc ttcatcaact 1260
tttataactt tggtgcaaat tgggtcaatg atgccttcaa ttcattgtac ttcgataagg 1320
aacgtgtttc tctaccagat tttattacct cgaatgcctc tgaaaacttt aaagagcaag 1380
ctattgttag tgtcacccca ttattatatt acaaacccat taagtcctac caacgcattg 1440
aggatatggt tcttctattg cttcgtaatg tcagtgttgc cattcgtgat aggttcgtca 1500
gtaaattagt tctttccgcc ttagtatgca gtgctgtcat caatgtgtat ttattgaatg 1560
ctgctagaat tcataccagt tatactgcag accaattggt gaaaactgaa gtcaccaaga 1620
agtcttttac tgctcctgta caaaaggctt ctacaccagt tttaaccaat aaaacagtca 1680
tttctggatc gaaagtcaaa agtttatcat ctgcgcaatc gagctcatca ggaccttcat 1740
catctagtga ggaagatgat tcccgcgata ttgaaagctt ggataagaaa atacgtcctt 1800
tagaagaatt agaagcatta ttaagtagtg gaaatacaaa acaattgaag aacaaagagg 1860
tcgctgcctt ggttattcac ggtaagttac ctttgtacgc tttggagaaa aaattaggtg 1920
atactacgag agcggttgcg gtacgtagga aggctctttc aattttggca gaagctcctg 1980
tattagcatc tgatcgttta ccatataaaa attatgacta cgaccgcgta tttggcgctt 2040
gttgtgaaaa tgttataggt tacatgcctt tgcccgttgg tgttataggc cccttggtta 2100
tcgatggtac atcttatcat ataccaatgg caactacaga gggttgtttg gtagcttctg 2160
ccatgcgtgg ctgtaaggca atcaatgctg gcggtggtgc aacaactgtt ttaactaagg 2220
atggtatgac aagaggccca gtagtccgtt tcccaacttt gaaaagatct ggtgcctgta 2280
agatatggtt agactcagaa gagggacaaa acgcaattaa aaaagctttt aactctacat 2340
caagatttgc acgtctgcaa catattcaaa cttgtctagc aggagattta ctcttcatga 2400
gatttagaac aactactggt gacgcaatgg gtatgaatat gatttctaaa ggtgtcgaat 2460
actcattaaa gcaaatggta gaagagtatg gctgggaaga tatggaggtt gtctccgttt 2520
ctggtaacta ctgtaccgac aaaaaaccag ctgccatcaa ctggatcgaa ggtcgtggta 2580
agagtgtcgt cgcagaagct actattcctg gtgatgttgt cagaaaagtg ttaaaaagtg 2640
atgtttccgc attggttgag ttgaacattg ctaagaattt ggttggatct gcaatggctg 2700
ggtctgttgg tggatttaac gcacatgcag ctaatttagt gacagctgtt ttcttggcat 2760
taggacaaga tcctgcacaa aatgttgaaa gttccaactg tataacattg atgaaagaag 2820
tggacggtga tttgagaatt tccgtatcca tgccatccat cgaagtaggt accatcggtg 2880
gtggtactgt tctagaacca caaggtgcca tgttggactt attaggtgta agaggcccgc 2940
atgctaccgc tcctggtacc aacgcacgtc aattagcaag aatagttgcc tgtgccgtct 3000
tggcaggtga attatcctta tgtgctgccc tagcagccgg ccatttggtt caaagtcata 3060
tgacccacaa caggaaacct gctgaaccaa caaaacctaa caatttggac gccactgata 3120
taaatcgttt gaaagatggg tccgtcacct gcattaaatc ctaa 3164
<210> 114
<211> 1290
<212> DNA
<213> 睾丸酮丛毛单胞菌
<400> 114
atggccgtcg attcgcgtct tcccaatttc cgagctctca cccccgcaca gcgctgggag 60
catgtcgcca ccgcatgcaa tctcagcgcc gaagaacgca atctactgac ccaggcgggc 120
gccctgcccg ccaccttggc tgacggcatg atcgaaaatg tggtgggcac gttcgagcta 180
cccatgggca tcgcaggcaa cttccgcatc aacggtcgcg atgtgctgat tccgctcgca 240
gtggaagagc cctccatcat cgctgctgct tcgtatatgg ccaagctggc ccgtgaagac 300
ggaggctttg aaacgtcgag caccttgccg ctgatgcgtg cgcaggtgca aatcgtcggc 360
atcagcgacc cctatggtgc aagactggcg ttgttcaagg cccgcgatga gatcctcgcg 420
caagccaata gccgagacaa ggtgctgatc agcctgggcg gtggctgcaa ggacatcgaa 480
atccacgtct tcccagattc tccgcgcggc cctatggtcg tgatgcactt gatcgtggac 540
gtgcgcgatg ccatgggtgc caacaccgtg aacaccatgg ccgaatcagt ctcgccactg 600
gtggaaaaga ttaccggtgg ttcggtgcgc ctgcgcattc tctcgaacct ggcagacctg 660
cgcctggccc gtgctcgtgt acgcctgaca ccgcaaacct tggccaccaa agagcgcagc 720
ggcgaagcaa ttattgaagg cgtgctcgac gcctacactt tcgccgccat tgacccctac 780
cgcgccgcta cccacaacaa gggcatcatg aacggtatcg accccgtcat cgtcgctaca 840
ggcaacgatt ggcgcgcggt cgaagccggt gcccatgcct atgccagccg caacggccaa 900
tacacctcgc tgacgcactg ggaaaaagac aatgccggcg ccttggtggg aacgatcgag 960
ctacccatgc ccgtgggctt ggtgggcggt gccaccaaga cccatccgct ggcgcgcctg 1020
gcgctcaaga tcatggaggt gaagtctgcc caggaactgg gcgagattgc cgccgcagtg 1080
ggtctggccc agaacctggg tgctttgcgc gcgctggcca ccgaaggcat tcagcgcggc 1140
catatggcac ttcatgctcg caatattgcg caggtcgcag gagccgtggg tgaagaagta 1200
gagatcgtcg ccaagcgcct ggctaccgag catgacgtgc gcaccgatcg cgcactggaa 1260
gtgctgcaag aaattcgcgc ccagcgctaa 1290
<210> 115
<211> 1284
<212> DNA
<213> 勘察肯西斯除硫球菌
<400> 115
atggagaaga caagccgtat acagggcttc tacaagcttc cccttgaaga aagacggagg 60
atagtctgcg agtgggctgg gctaacagag gaagagtgca ggacactgag cgaattcggt 120
aatctaccag ttaagatagg ggacagcatg attgagaacg ttataggcgc gatgagctat 180
cccttcgcag tagcgacaaa cttcctgatc aatgggaggg attaccttgt cccaatggtt 240
atagaggaga caagcgtcgt agcggctgca agcaatgcgg ccaggatgct taggcatggg 300
aaagggatac ttgcaaatgc tgagagacag gagatgatca gccaaataca cctggttaaa 360
gtaaactccc cacgctttaa agccatgaag attatcgagg ccaagaagga gctactggac 420
tacgcggcac agcaggatcc aaccctgcta aagtacggcg ggggtcccag ggacctcgag 480
gtaagagcaa tggagcaccc tgctttaggc ggggtcataa tagtccacct agtagtagac 540
gtcagagacg ccatgggtgc taacactgtt aacacgatgg ctgaagcgat agccccgctt 600
ctagagaaga taacgggtgg ggaagcaagg ctcagaatag tttcaaacca cgcagtatac 660
agggttacac gggcatgggc tgcgacacct gtcgaagaag tgggaggcct tgaagtagcc 720
aggaggataa tggaggcatc tatactcgcc gagatagatc cctatagggc ggtaacccat 780
aacaagggca taatgaatgg agtaatagca gtagccctcg cgacgggaca ggatcaccgc 840
gccatagagg ctggagccca tgcatacgcc tctagaacgg gggtctacaa gcccctcagc 900
tactgggagg taacaagcga taactatctt gcgggaagcc ttgagatacc tctccaaata 960
ggcgttgttg gaggagcagt caaggtacac cctgtggcaa agatagcatt gaagatccta 1020
ggggtaaaca cggctaggga gctcgccgag gtaatggctg cggtagggct agcccagaac 1080
ctagccgctc taagagccct cgtgacagag ggtattcaga aaggccatat gaggctccac 1140
gccagaaacc tcgctataat ggctggtgca tcaggagatc taatagataa gatagccgag 1200
aaaatgatca gggacggtag aataagatac gactacgcta aacaactagt agagaaagca 1260
ctacagggcg agccattaga ctag 1284
<210> 116
<211> 1281
<212> DNA
<213> 金黄色葡萄球菌
<400> 116
atgcaaaatt tagataagaa ttttcgacat ttatctcgta aagaaaagtt acaacaattg 60
gttgataagc aatggttatc agaagaacaa ttcgacattt tactgaatca tccattaatc 120
gatgaagaag tagccaatag tttaattgaa aatgtcatcg cgcaaggtgc attacccgtt 180
ggattattac cgaatatcat tgtggacgat aaggcatatg ttgtacctat gatggtggaa 240
gagccttcag ttgtcgctgc agctagttat ggtgcaaagc tagtgaatca gactggcgga 300
tttaaaacgg tatcttctga acgtattatg ataggtcaaa tcgtctttga tggcgttgac 360
gatactgaaa aattatcagc agacattaaa gctttagaaa agcaaattca taaaattgcg 420
gatgaggcat atccttctat taaagcgcgt ggtggtggtt accaacgtat agcgattgat 480
acatttcctg agcaacagtt actatcttta aaagtatttg ttgatacgaa agatgctatg 540
ggcgctaata tgcttaatac gattttagag gccataactg catttttaaa aaatgaattt 600
ccgcaaagcg acattttaat gagtatttta tccaatcatg caacagcgtc cgttgttaaa 660
gttcaaggcg aaattgatgt taaagattta gcaaggggcg agagaactgg agaagaggtt 720
gccaaacgaa tggaacgtgc ttctgtattg gcacaagtag atattcatcg tgcagcaaca 780
cataataaag gtgttatgaa tggcatacat gctgttgttt tagcaacagg aaatgatacg 840
cgtggtgcag aagcaagtgc gcatgcatac gcaagtcgtg acggacagta tcgtggtatt 900
gctacatggc gttacgatca agatcgtcaa cgattgattg gtacaattga agtgcctatg 960
acattggcaa ttgttggggg tggtacgaaa gtattaccaa tagctaaagc ttcattagag 1020
ctactaaatg tagagtcagc acaagaatta ggtcatgtag ttgctgccgt tggtttagcg 1080
caaaactttg cagcatgtcg cgcgcttgtg tcagaaggta ttcaacaagg tcatatgagt 1140
ttacaatata aatcattagc tattgttgta ggagcaaaag gtgatgaaat tgctaaagta 1200
gctgaagctt tgaaaaaaga accccgtgca aatacacaag cagcggaacg tattttacaa 1260
gatttaagaa gccaacaata g 1281
<210> 117
<211> 1236
<212> DNA
<213> 约氏乳杆菌
<400> 117
atgaaattag aagaatcatc taaaaagaaa ttttatcaat ggttaccaga ggaaagaaga 60
gtctttttaa ctgaaaaagg aattaaacta agtgagattg agtctgaaac tttggaaaga 120
ctagataaac ttagtgaaaa tgtaattggt caagtccgtc ttcctcttgg tgtgcttcct 180
aagttaatag ttaacgggaa agattatcaa gtaccaatgg ccgtagaaga accatcggtt 240
gttgcagcag caaaccatgc agctaaaatt tttaatcaaa atggtggagc agtagctgat 300
agtagacgaa atggaatata tggtcaaatt gttttagagg taactgataa ttttgattta 360
actaagttta ctactgaatt tcctcaatta attagcttag ctaataaaaa attcgttagc 420
ttagtcaagc atggtggagg agttcgtaaa attgaagctt ctcaaaaaga aaatttagtt 480
tttcttagag ttttggttga cccagcagaa gctatgggag ctaataaaac aaatgctatt 540
ttagaatttt taggaaatga attagagaag cagccagata ttgaacaaac tctgtatgca 600
attttgtcta attatcctac gcaattgact agtgctaaag taagtctttc aattgacagt 660
gtaggaggat taaaagttgc taaaaagata gctttattga gtaaaatagg acaaactgat 720
atttaccggg cagtgactaa taataaagga attatgaatg gtattgatag tgtattggtt 780
gcaactggta atgattatcg tggagttgaa gcagcaactg ctgtttgggc taataaaaat 840
ggtgcctata catctttgag taagtggaaa attgaagaag atagactagt ggggactgta 900
acagttccct tagcaatcgg tgtagtaggt ggctcaatta aggctcgtcg agacgttcaa 960
caaagcttta gtttattagg taatatatct gccaagcaac tagcagaagt tattgcgaca 1020
actggcttag caaataactt ttcagctctt ttagcaattt ctactaaggg aattcaagct 1080
gggcatatga aattgcaggc gagaaattta gtagcaacct taaaagctag tgaaggtgaa 1140
aaagcaatag ttttaaaaaa attgcaggaa agtaaaaaat atactcaaga agcagctttt 1200
gaatttttaa gcgaaataag aaaggatcaa aaataa 1236
<210> 118
<211> 912
<212> DNA
<213> 不动杆菌种ADP1
<400> 118
ttgatatcaa tcagggaaaa acgcgtgaac aaaaaacttg aagctctctt ccgagagaat 60
gtaaaaggta aagtggcttt gatcactggt gcatctagtg gaatcggttt gacgattgca 120
aaaagaattg ctgcggcagg tgctcatgta ttattggttg cccgaaccca agaaacactg 180
gaagaagtga aagctgcaat tgaacagcaa gggggacagg cctctatttt tccttgtgac 240
ctgactgaca tgaatgcgat tgaccagtta tcacaacaaa ttatggccag tgtcgatcat 300
gtcgatttcc tgatcaataa tgcagggcgt tcgattcgcc gtgccgtaca cgagtcgttt 360
gatcgcttcc atgattttga acgcaccatg cagctgaatt actttggtgc ggtacgttta 420
gtgttaaatt tactgccaca tatgattaag cgtaaaaatg gccagatcat caatatcagc 480
tctattggtg tattggccaa tgcgacccgt ttttctgctt atgtcgcgtc taaagctgcg 540
ctggatgcct tcagtcgctg tctttcagcc gaggtactca agcataaaat ctcaattacc 600
tcgatttata tgccattggt gcgtacccca atgatcgcac ccaccaaaat ttataaatac 660
gtgcccacgc tttccccaga agaagccgca gatctcattg tctacgccat tgtgaaacgt 720
ccaaaacgta ttgcgacgca cttgggtcgt ctggcgtcaa ttacctatgc catcgcacca 780
gacatcaata atattctgat gtcgattgga tttaacctat tcccaagctc aacggctgca 840
ctgggtgaac aggaaaaatt gaatctgcta caacgtgcct atgcccgctt gttcccaggc 900
gaacactggt aa 912
<210> 119
<211> 1670
<212> DNA
<213> 贝氏不动杆菌
<400> 119
cagaagatat ggttcggtta tcggttggga ttgaacatat tgatgatttg attgcagatc 60
tggaacaagc attggccaca gtttgagcgt aaattttata aaaaacctct gcaatttcag 120
aggttttttt atatttgctt tattatcgta tgatgttcat aattgatcta gcaaataata 180
aaaattagag caattactct aaaaacattt gtaatttcag atacttaaca ctagattttt 240
taaccaaatc actttagatt aactttagtt ctggaaattt tatttccctt taaccgtctt 300
caatccaaat acaataatga cagcctttac agtttgatat caatcaggga aaaacgcgtg 360
aacaaaaaac ttgaagctct cttccgagag aatgtaaaag gtaaagtggc tttgatcact 420
ggtgcatcta gtggaatcgg tttgacgatt gcaaaaagaa ttgctgcggc aggtgctcat 480
gtattattgg ttgcccgaac ccaagaaaca ctggaagaag tgaaagctgc aattgaacag 540
caagggggac aggcctctat ttttccttgt gacctgactg acatgaatgc gattgaccag 600
ttatcacaac aaattatggc cagtgtcgat catgtcgatt tcctgatcaa taatgcaggg 660
cgttcgattc gccgtgccgt acacgagtcg tttgatcgct tccatgattt tgaacgcacc 720
atgcagctga attactttgg tgcggtacgt ttagtgttaa atttactgcc acatatgatt 780
aagcgtaaaa atggccagat catcaatatc agctctattg gtgtattggc caatgcgacc 840
cgtttttctg cttatgtcgc gtctaaagct gcgctggatg ccttcagtcg ctgtctttca 900
gccgaggtac tcaagcataa aatctcaatt acctcgattt atatgccatt ggtgcgtacc 960
ccaatgatcg cacccaccaa aatttataaa tacgtgccca cgctttcccc agaagaagcc 1020
gcagatctca ttgtctacgc cattgtgaaa cgtccaacac gtattgcgac gcacttgggt 1080
cgtctggcgt caattaccta tgccatcgca ccagacatca ataatattct gatgtcgatt 1140
ggatttaacc tattcccaag ctcaacggct gcactgggtg aacaggaaaa attgaatctg 1200
ctacaacgtg cctatgcccg cttgttccca ggcgaacact ggtaaaattt ataaaagaag 1260
cctctcatac cgagaggctt ttttatggtt acgaccatca gccagattta gaggaaattg 1320
acttttcctg tttttacatc ataaatcgca ccaacaatat caatttcttt gcgatccagc 1380
atatctttaa gtacagaact atgctgaata atgtattgaa tattatagtg aacattcata 1440
gcagtcacct gatcaataaa tgctttgctt aattcacgcg gttgcataat atcaaataca 1500
ctgccaaccg aatgcatgag tggcccaagc acgtattgga tgtgtggcat ttcctgaata 1560
tcggaaatct gcttatgttg caatcttaac tggcatgcgc tggtgaccgc accacagtcg 1620
gtatgtccca aaaccagaat cactttggaa cctttggctt gacaggcaaa 1670
<210> 120
<211> 1362
<212> DNA
<213> 克氏梭菌
<400> 120
atgagtaatg aagtatctat aaaagaatta attgaaaagg caaaggtggc acaaaaaaaa 60
ttggaagcct atagtcaaga acaagttgat gtactagtaa aagcactagg aaaagtggtt 120
tatgataatg cagaaatgtt tgcaaaagaa gcagttgaag aaacagaaat gggtgtttat 180
gaagataaag tagctaaatg tcatttgaaa tcaggagcta tttggaatca tataaaagac 240
aagaaaactg taggcataat aaaagaagaa cctgaaaggg cacttgttta tgttgctaag 300
ccaaagggag ttgtggcagc tactacgcct ataactaatc cagtggtaac tcctatgtgt 360
aatgcaatgg ctgctataaa gggcagaaat acaataatag tagcaccaca tcctaaagca 420
aagaaagttt cagctcatac tgtagaactt atgaatgctg agcttaaaaa attgggagca 480
ccagaaaata tcatacagat agtagaagca ccatcaagag aagctgctaa ggaacttatg 540
gaaagtgctg atgtagttat tgctacaggc ggtgctggaa gagttaaagc tgcttactcc 600
agtggaagac cagcttatgg cgttggacct ggaaattcac aggtaatagt tgataaggga 660
tacgattata acaaagctgc acaggatata ataacaggaa gaaaatatga caatggaatt 720
atatgttctt cagagcaatc agttatagct cctgctgaag attatgataa ggtaatagca 780
gcttttgtag aaaatggggc attctatgta gaagatgagg aaacagtaga aaagtttaga 840
tcaactttat ttaaagatgg aaaaataaac agcaagatta taggtaaatc cgtccaaatt 900
attgcggatc ttgcaggagt aaaagtacca gaaggtacta aggttatagt acttaagggt 960
aaaggtgcag gagaaaaaga tgtactttgt aaagaaaaaa tgtgtccagt tttagtagca 1020
ttgaaatatg atacttttga agaagcagtt gaaatagcta tggctaatta tatgtatgaa 1080
ggagctggtc atacagcagg catacattct gacaatgacg agaacataag atatgcagga 1140
actgtattac ctataagcag attagttgta aatcagcctg caactactgc tggaggaagt 1200
ttcaataatg gatttaaccc tactactaca ctaggctgcg gatcatgggg cagaaacagt 1260
atttcagaaa atcttactta cgagcatctt ataaatgttt caagaatagg gtatttcaat 1320
aaagaagcaa aagttcctag ctatgaggaa atatggggat aa 1362
<210> 121
<211> 1356
<212> DNA
<213> 牙龈卟啉单胞菌
<400> 121
atggaaatca aagaaatggt gagccttgca cgcaaggctc agaaggagta tcaagctacc 60
cataaccaag aagcagttga caacatttgc cgagctgcag caaaagttat ttatgaaaat 120
gcagctattc tggctcgcga agcagtagac gaaaccggca tgggcgttta cgaacacaaa 180
gtggccaaga atcaaggcaa atccaaaggt gtttggtaca acctccacaa taaaaaatcg 240
attggtatcc tcaatataga cgagcgtacc ggtatgatcg agattgcaaa gcctatcgga 300
gttgtaggag ccgtaacgcc gacgaccaac ccgatcgtta ctccgatgag caatatcatc 360
tttgctctta agacctgcaa tgccatcatt attgcccccc accccagatc caaaaaatgc 420
tctgcacacg cagttcgtct gatcaaagaa gctatcgctc cgttcaacgt accggaaggt 480
atggttcaga tcatcgaaga acccagcatc gagaagacgc aggaactcat gggcgccgta 540
gacgtagtag ttgctacggg tggtatgggc atggtgaagt ctgcatattc ttcaggaaag 600
ccttctttcg gtgttggagc cggtaacgtt caggtgatcg tggatagcaa catcgatttc 660
gaagctgctg cagaaaaaat catcaccggt cgtgctttcg acaacggtat catctgctca 720
ggcgaacaga gcatcatcta caacgaggct gacaaggaag cagttttcac agcattccgc 780
aaccacggtg catatttctg tgacgaagcc gaaggagatc gggctcgtgc agctatcttc 840
gaaaatggag ccatcgcgaa agatgtagta ggtcagagcg ttgccttcat tgccaagaaa 900
gcaaacatca atatccccga gggtacccgt attctcgttg ttgaagctcg cggcgtagga 960
gcagaagacg ttatctgtaa ggaaaagatg tgtcccgtaa tgtgcgccct cagctacaag 1020
cacttcgaag aaggtgtaga aatcgcacgt acgaacctcg ccaacgaagg taacggccac 1080
acctgtgcta tccactccaa caatcaggca cacatcatcc tcgcaggatc agagctgacg 1140
gtatctcgta tcgtagtgaa tgctccgagt gccactacag caggcggtca catccaaaac 1200
ggtcttgccg taaccaatac gctcggatgc ggatcatggg gtaataactc tatctccgag 1260
aacttcactt acaagcacct cctcaacatt tcacgcatcg caccgttgaa ttcaagcatt 1320
cacatccccg atgacaaaga aatctgggaa ctctaa 1356
<210> 122
<211> 1407
<212> DNA
<213> 糖乙酸多丁醇梭菌
<400> 122
atgattaaag acacgctagt ttctataaca aaagatttaa aattaaaaac aaatgttgaa 60
aatgccaatc taaagaacta caaggatgat tcttcatgtt tcggagtttt cgaaaatgtt 120
gaaaatgcta taagcaatgc cgtacacgca caaaagatat tatcccttca ttatacaaaa 180
gaacaaagag aaaaaatcat aactgagata agaaaggccg cattagaaaa taaagagatt 240
ctagctacaa tgattcttga agaaacacat atgggaagat atgaagataa aatattaaag 300
catgaattag tagctaaata cactcctggg acagaagatt taactactac tgcttggtca 360
ggagataacg ggcttacagt tgtagaaatg tctccatatg gcgttatagg tgcaataact 420
ccttctacga atccaactga aactgtaata tgtaatagta taggcatgat agctgctgga 480
aatactgtgg tatttaacgg acatccaggc gctaaaaaat gtgttgcttt tgctgtcgaa 540
atgataaata aagctattat ttcatgtggt ggtcctgaga atttagtaac aactataaaa 600
aatccaacta tggactctct agatgcaatt attaagcacc cttcaataaa actactttgc 660
ggaactggag ggccaggaat ggtaaaaacc ctcttaaatt ctggtaagaa agctataggt 720
gctggtgctg gaaatccacc agttattgta gatgatactg ctgatataga aaaggctggt 780
aagagtatca ttgaaggctg ttcttttgat aataatttac cttgtattgc agaaaaagaa 840
gtatttgttt ttgagaacgt tgcagatgat ttaatatcta acatgctaaa aaataatgct 900
gtaattataa atgaagatca agtatcaaag ttaatagatt tagtattaca aaaaaataat 960
gaaactcaag aatactctat aaataagaaa tgggtcggaa aagatgcaaa attattctta 1020
gatgaaatag atgttgagtc tccttcaagt gttaaatgca taatctgcga agtaagtgca 1080
aggcatccat ttgttatgac agaactcatg atgccaatat taccaattgt aagagttaaa 1140
gatatagatg aagctattga atatgcaaaa atagcagaac aaaatagaaa acatagtgcc 1200
tatatttatt caaaaaatat agacaaccta aataggtttg aaagagaaat cgatactact 1260
atctttgtaa agaatgctaa atcttttgcc ggtgttggtt atgaagcaga aggctttaca 1320
actttcacta ttgctggatc cactggtgaa ggaataactt ctgcaagaaa ttttacaaga 1380
caaagaagat gtgtactcgc cggttaa 1407
<210> 123
<211> 1407
<212> DNA
<213> 拜氏梭菌
<400> 123
atgaataaag acacactaat acctacaact aaagatttaa aagtaaaaac aaatggtgaa 60
aacattaatt taaagaacta caaggataat tcttcatgtt tcggagtatt cgaaaatgtt 120
gaaaatgcta taagcagcgc tgtacacgca caaaagatat tatcccttca ttatacaaaa 180
gagcaaagag aaaaaatcat aactgagata agaaaggccg cattacaaaa taaagaggtc 240
ttggctacaa tgattctaga agaaacacat atgggaagat atgaggataa aatattaaaa 300
catgaattgg tagctaaata tactcctggt acagaagatt taactactac tgcttggtca 360
ggtgataatg gtcttacagt tgtagaaatg tctccatatg gtgttatagg tgcaataact 420
ccttctacga atccaactga aactgtaata tgtaatagca taggcatgat agctgctgga 480
aatgctgtag tatttaacgg acacccatgc gctaaaaaat gtgttgcctt tgctgttgaa 540
atgataaata aggcaattat ttcatgtggc ggtcctgaaa atctagtaac aactataaaa 600
aatccaacta tggagtctct agatgcaatt attaagcatc cttcaataaa acttctttgc 660
ggaactgggg gtccaggaat ggtaaaaacc ctcttaaatt ctggtaagaa agctataggt 720
gctggtgctg gaaatccacc agttattgta gatgatactg ctgatataga aaaggctggt 780
aggagcatca ttgaaggctg ttcttttgat aataatttac cttgtattgc agaaaaagaa 840
gtatttgttt ttgagaatgt tgcagatgat ttaatatcta acatgctaaa aaataatgct 900
gtaattataa atgaagatca agtatcaaaa ttaatagatt tagtattaca aaaaaataat 960
gaaactcaag aatactttat aaacaaaaaa tgggtaggaa aagatgcaaa attattctta 1020
gatgaaatag atgttgagtc tccttcaaat gttaaatgca taatctgcga agtaaatgca 1080
aatcatccat ttgttatgac agaactcatg atgccaatat tgccaattgt aagagttaaa 1140
gatatagatg aagctattaa atatgcaaag atagcagaac aaaatagaaa acatagtgcc 1200
tatatttatt ctaaaaatat agacaaccta aatagatttg aaagagaaat agatactact 1260
atttttgtaa agaatgctaa atcttttgct ggtgttggtt atgaagcaga aggatttaca 1320
actttcacta ttgctggatc tactggtgag ggaataacct ctgcaaggaa ttttacaaga 1380
caaagaagat gtgtacttgc cggctaa 1407
<210> 124
<211> 999
<212> DNA
<213> 勤奋金属球菌
<400> 124
atgaaagctg tcgtagtgaa aggacataaa cagggttatg aggtcaggga agttcaggac 60
ccgaaacctg cttcaggaga agtaatcatc aaggtcagga gagcagccct gtgttatagg 120
gaccttctcc agctacaggg gttctaccct agaatgaagt accctgtggt tctaggacat 180
gaggttgttg gggagatact ggaggtaggt gagggagtga ccggtttctc tccaggagac 240
agagtaattt cactcctcta tgcgcctgac ggaacctgcc actactgcag acagggtgaa 300
gaggcctact gccactctag gttaggatac tctgaggaac tagatggttt cttctctgag 360
atggccaagg tgaaggtaac cagtctcgta aaggttccaa cgagagcttc agatgaggga 420
gccgttatgg ttccctgcgt cacaggcatg gtgtacagag ggttgagaag ggccaatcta 480
agagagggtg aaactgtgtt agttacggga gcaagcggtg gagttggaat acatgccctg 540
caagtggcaa aggccatggg agccagggta gtgggtgtca cgacgtcgga ggagaaggca 600
tccatcgttg gaaagtatgc tgatagggtc atagttggat cgaagttctc ggaggaggca 660
aagaaagagg acattaacgt ggtaatagac accgtgggaa cgccaacctt cgatgaaagc 720
ctaaagtcgc tctggatggg aggtaggata gtccaaatag gaaacgtgga cccaacccaa 780
tcctatcagc tgaggttagg ttacaccatt ctaaaggata tagccataat tgggcacgcg 840
tcagccacaa ggagggatgc agagggagca ctaaagctga ctgctgaggg gaagataaga 900
ccagtggttg cgggaactgt tcacctggag gagatagaca agggatatga aatgcttaag 960
gataagcaca aagtggggaa agtactcctt accacgtaa 999
<210> 125
<211> 1005
<212> DNA
<213> 托科达硫化叶菌
<400> 125
atgaaagcaa ttgtagttcc aggacctaag caagggtata aacttgaaga ggtacctgat 60
cctaagccgg gaaaagatga agtaataatt agggtagata gagctgctct ttgttataga 120
gatttgcttc aactacaagg atattatcca agaatgaaat acccagttat actagggcat 180
gaagttgtag gaaccataga agaagtcgga gaaaatataa agggatttga agtaggtgat 240
aaagtaattt ctttattata tgcaccagat ggtacatgcg aatattgcca aataggtgag 300
gaagcatatt gtcatcatag gttaggctac tcagaagagc tagacggatt ttttgcagag 360
aaagctaaaa ttaaagtaac tagcttagta aaggttccaa aaggtacccc agatgaggga 420
gcagtacttg taccttgtgt aaccggaatg atatatagag gtattagaag ggctggtggt 480
atacgtaaag gggagctagt gttagttact ggtgccagtg gtggagtagg aatacatgca 540
attcaagttg ctaaggcctt aggtgctaaa gttatagggg taacaacatc agaagaaaaa 600
gcaaagataa ttaagcagta tgcggattat gtcatcgttg gtacaaagtt ttctgaagaa 660
gcaaagaaga taggtgatgt tactttagtt attgatactg tgggtactcc tactttcgat 720
gaaagcttaa agtcattgtg gatgggcgga aggattgttc aaatagggaa tgtcgaccct 780
tctcaaatct ataatttaag attgggctac ataatattaa aagatttaaa gatagttggt 840
catgcctcag ctaccaaaaa agatgctgaa gatacactaa aattaacaca agagggaaaa 900
attaaaccag ttattgcagg aacagtcagt cttgaaaata ttgatgaagg ttataaaatg 960
ataaaggata agaataaagt aggcaaagtc ttagtaaaac cataa 1005
<210> 126
<211> 999
<212> DNA
<213> 铜绿金属球菌
<400> 126
atgaaagctg ttatcgttaa gggagccaaa caaggttatg aagtcagaga cgttcaagat 60
ccgaaacctc aacctgatga ggtagtaata aaggttaaca gagctgccct atgttacaga 120
gatctccttc aacttcaggg gttttacccc aggatgaaat acccagtggt tctgggacac 180
gaagtgatag gcgaaatcgt tgacgtaggt agagacgtga aggggttcgc cataggggat 240
agagtcatat ccttacttta cgctcctgac ggtagctgtc actactgtaa aaggggagag 300
gaggcatact gtcactctag actgggctat tctgaggagc ttgatggatt cttcgcggag 360
atggcaaggg ttaaagtaag tagcctcgtt aaggtacctc ctggagtttc cgatgagggg 420
ggagtcatgg taccttgcgt aaccgggatg atatatagag gtttaagaag agctaactta 480
agcgaagggg agaccgtttt agtgacaggg gccagtggag gagtcggaat acacgccctg 540
caagtcgcga aaggaatggg ggccagagtg attggggtga cgacttcaga ggagaagagt 600
tcgattatag cgaagtactc tgacagggta atagtaggtt ccaagttctc ggaagaggcc 660
aagaaagagg acgtcaacgt gatcattgat accgttggaa ctcctacgtt tgaggaaagc 720
ctcagatcgt tatggatggg aggtagaata gtccagattg gtaacgtaga tcctacacag 780
gcttaccaat tgagattagg ctacacgatt ctcaaagata ttgccataat tgggcatgcc 840
tcagctacca aacgcgatgc tgaagccgct ttaaaactaa cttcagaagg caaggtaagg 900
ccgatagtag ctggaaccgt cagcttagag gagatagata agggttacga aatcctcaag 960
gacaaacaca aagtagggaa ggtattgcta aagccttag 999
<210> 127
<211> 1788
<212> DNA
<213> 棒状链霉菌
<400> 127
atgggacagt acgctgcacc gttgcgcgac atgcaattcg tcttgcacga attgctgaac 60
gtcgaagccg aactgaagca actgcctaag cacgcggatc tggatgccga tacgatcaat 120
gcggtgctgc aggaggcggg caagttctgc tccgaggtcc tgtttccgtt gaaccaggtt 180
ggcgaccagc agggttgtac gtatgtcggc gacggcgtgg tgaccacgcc cgagggcttc 240
aagcaagcgt accagcagta tatcgaggcc ggctggccgg cgttgggctg cgatccggcc 300
tatggcggcc agggcttgcc cgcgttcgtg aacaacgcgc tgtacgagat gctcaattcg 360
gcgaaccagg catggaccat gtatcctggc ctgtcgcacg gcgcgtacga atgcctgcac 420
gcgcacggca cgccggagct tcaacagcgg tatctaccga agctggtatc cggtcagtgg 480
accggcacga tgtgcttgac cgagccgcat tgcggcaccg accttgggat cttgcgcacg 540
cgggccgagc ccaacggcga cggctcgtac tcgattaccg gcacgaagat ctttatttcg 600
agcggcgagc acgacctcgc cgacaacatc gtccacctgg tgctcgcgcg gttgccggac 660
gcgccggcgg ggaccaaggg catttcattg ttcatcgtgc ccaagttcat cccggacgac 720
aacggcgagc ctgggcagcg caacggcgtc aagtgtggct cgatcgagca caagatgggc 780
atccatggca atgcgacgtg cgtaatcaat ctggatgatg ccaggggctg gctggtcggc 840
gagccgaaca agggcttgaa tgcgatgttc gtgatgatga atgcggcgcg gctcggcgtg 900
ggcatgcaag gcctggggct gaccgaagtc gcgtaccaga actcgctcgc ctacgcgagg 960
cagcggctgc agatgcgctc gcttagcggt cctaaggcgc cggacaaggc ggccgacccg 1020
atcatcgtgc acccggatgt gcgacgcatg ttgttgacgc agaaggccta cgtcgaggcg 1080
gggcgcgcgt tcacgtactg ggcggctctg cagatcgaca aggaactgtc gcacgaggac 1140
gaggcggtgc gccgggatgc ggccgacctg gttgcgttgc tcacaccggt catcaaggcg 1200
ttcctgaccg acaacgcgtt cgaggcgacc aacaacgcca tgcaggtgtt gggcggccat 1260
ggctatatcg ctgagtgggg catcgagcaa tatgtgcgtg atgcgcgcat caacatgatt 1320
tacgaaggca ctaacacgat tcagtcgctg gacctgctgg ggcgcaaggt gctcggcgac 1380
atgggcgcga agctgaagaa gtttggcaag ctcgtgcagg attttgtcca ggccgagggc 1440
atcaaccccg acatgcagga gttcgtcaat ccgctggcgg acatcggcga aaaggtacag 1500
aagctgacga tggaaatcgg catgaaggcg atgcagagcc cggacgaagt tggcgccgcg 1560
gcggtaccgt acctgcgcac ggtcgggcat ttagtgttct cgtacttttg ggcgcgcatg 1620
gcccgtctgg cgctggacaa gcaaggtagc ggcgacccat tctaccggtc caagctcgcg 1680
accgcgcggt tctactttgc gaagctgtta cccgagacgg ccttcacgat ccgcgccgcg 1740
cgtgccggag ccaagccgct gaccgagatc gacgaagcgc tgttttaa 1788
<210> 128
<211> 981
<212> DNA
<213> 类球红细菌
<400> 128
gtgagagccg ttctgataga gaaatccgac gatacgcagt ccgtttcggt gacggagctt 60
gccgaggacc agctgcccga gggcgacgtt ctggtcgacg tcgcctattc gaccttgaac 120
tacaaggacg cgctggcgat caccggcaag gcgccggtcg tgcggcgctt ccccatggtg 180
ccgggcatcg acttcacggg cacggtggca caaagcagcc atgccgattt caagcccggc 240
gaccgggtca tcctgaatgg ctggggcgtg ggggaaaaac actggggcgg gctggccgaa 300
cgggcacggg tccgcggcga ctggctggtt ccgctgccgg cgcccctcga cttgcggcag 360
gcggcgatga tcggcacggc gggctatacg gccatgctct gcgttctggc gctcgagcgg 420
cacggggtcg tgcccggcaa tggcgagatc gtcgtgagcg gcgccgctgg cggtgtcggc 480
agcgttgcga cgacacttct tgccgcgaag ggctacgaag ttgctgcggt caccggccgt 540
gcctccgagg cggagtatct gcgcggtctg ggcgccgcgt cggtgatcga ccgcaacgaa 600
ctgaccggca aggtccgtcc gctggggcag gagcgttggg ccggcggcat cgatgttgcg 660
ggcagcacgg tgctggcgaa catgctctcg atgatgaaat accggggcgt cgtcgcggcc 720
tgcggtcttg ccgcgggaat ggatctgccc gcgtcggtgg cgcccttcat cctgcgcggt 780
atgaccctgg ccggggtcga cagcgtcatg tgcccgaaaa ccgaccgcct tgcggcctgg 840
gctcggctcg ccagcgatct cgatccggca aagctcgagg agatgacgac cgaactgccc 900
ttctccgagg tcatcgagac cgccccgaag ttccttgacg ggaccgtccg aggacgcatc 960
gtcattccgg tcaccccctg a 981
<210> 129
<211> 1104
<212> DNA
<213> 丙酸梭菌
<400> 129
atggctttta acagtgctga tataaattcg tttcgagata tttgggtatt ttgcgaacag 60
agagaaggca agcttattaa tacagatttt gagctgattt cagaaggaag aaagctcgct 120
gatgagcggg gctcaaaatt ggttggtatt ttattaggac atgaggtaga agagattgca 180
aaagagctag gtggatatgg tgcagataaa gtgattgttt gcgaccatcc cgaattaaaa 240
ttttatacca cagatgctta tgccaaggta ctttgtgatg tggttatgga ggagaaaccc 300
gaggttattt tgattggtgc aacaaatatt ggccgtgatt taggccccag atgtgcagca 360
cgcttacata cgggtttaac agcagattgt acccatttgg atattgatat gaacaaatat 420
gtggactttc tttccacctc ctcaacattg gatatatcat ccatgacctt tcctatggag 480
gacacaaatt taaaaatgac ccgtcctgcc tttggcggac atttgatggc aactatcatt 540
tgccctagat tccgcccttg tatgtctact gtaagacccg gggttatgaa aaaagcagag 600
tttagccagg aaatggctca ggcttgtcag gttgttacac gccatgtaaa tttatctgat 660
gaggacttaa agacgaaagt aatcaatatt gtgaaagaaa ctaaaaaaat tgttgattta 720
atcggcgccg aaattattgt ttctgttgga cgtggaatca gcaaggatgt gcaagggggc 780
attgccctag cagaaaagct tgccgatgcg tttgggaatg gtgttgttgg cggttctcgt 840
gcggttattg attccggttg gctccctgcg gatcatcagg ttgggcagac gggaaaaacc 900
gtgcatccta aggtatatgt tgcccttggt atttccggcg ccattcagca taaggcaggt 960
atgcaggatt cagagttgat tattgcggta aataaagacg agactgctcc tattttcgat 1020
tgtgctgatt atggtataac aggggatttg tttaaaattg taccaatgat gattgatgca 1080
attaaggaag gtaaaaatgc ttga 1104
<210> 130
<211> 804
<212> DNA
<213> 丙酸梭菌
<400> 130
atgagaattt atgtttgtgt aaaacaagtt ccggatacat cgggaaaggt tgctgtaaac 60
cccgatggaa ccttaaaccg tgcatctatg gcggctatta ttaatcccga tgatatgagt 120
gccattgagc aggccttaaa gttgaaggat gaaacaggct gtcaagttac agcccttacc 180
atggggccac ctcctgcgga gggaatgttg cgggaaatta tcgcaatggg cgcagatgat 240
ggcgttttaa tttccgccag agagttcggt ggttccgata ccttcgcaac ctctcaaatt 300
atatcggcgg cgatacataa attagggctt tccaatgagg atatgatttt ttgcggtagg 360
caggcaattg atggagatac agcacaggta ggaccgcaaa ttgcagaaaa attaagcatt 420
cctcaggtga cttatggggc agggattaaa aaaagcggag atttggtttt ggtaaagcgc 480
atgctggaag atggatatat gatgatagag gtggaaacac cctgcttgat tacttgcatt 540
caggataagg ctgtaaaacc acgctatatg actttgaatg gaattatgga atgctatagc 600
aagcctcttt tggtattaga ttatgaagcc cttaaggatg aacccctaat cgaattggat 660
acgatcggtc tgaaaggttc tcctacaaat atatttaaat cctttacgcc gccacaaaag 720
ggtgtaggcg ttatgcttca aggaacagac aaagaaaaag ttgaagattt ggtggacaaa 780
ttgatgcaga agcatgtcat ttaa 804
<210> 131
<211> 1562
<212> DNA
<213> 博伊丁假丝酵母
<400> 131
ttcaactaaa aattgaacta tttaaacact atgatttcct tcaattatat taaaatcaat 60
ttcatatttc cttacttctt tttgctttat tatacatcaa taactcaatt aactcattga 120
ttatttgaaa aaaaaaaaca tttattaact taactccccg attatatatt atattattga 180
ctttacaaaa tgaagatcgt tttagtctta tatgatgctg gtaagcacgc tgctgatgaa 240
gaaaaattat atggttgtac tgaaaataaa ttaggtattg ctaattggtt aaaagatcaa 300
ggtcatgaac taattactac ttctgataaa gaaggtgaaa caagtgaatt ggataaacat 360
atcccagatg ctgatattat catcaccact cctttccatc ctgcttatat cactaaggaa 420
agacttgaca aggctaagaa cttaaaatta gtcgttgtcg ctggtgttgg ttctgatcac 480
attgatttag attatattaa tcaaacaggt aagaaaatct cagtcttgga agttacaggt 540
tctaatgttg tctctgttgc tgaacacgtt gtcatgacca tgcttgtctt ggttagaaat 600
ttcgttccag cacatgaaca aattattaac cacgattggg aggttgctgc tatcgctaag 660
gatgcttacg atatcgaagg taaaactatt gctaccattg gtgctggtag aattggttac 720
agagtcttgg aaagattact cccttttaat ccaaaagaat tattatacta cgattatcaa 780
gctttaccaa aagaagctga agaaaaagtt ggtgctagaa gagttgaaaa tattgaagaa 840
ttagttgctc aagctgatat cgttacagtt aatgctccat tacacgcagg tacaaaaggt 900
ttaattaata aggaattatt atctaaattt aaaaaaggtg cttggttagt caataccgca 960
agaggtgcta tttgtgttgc tgaagatgtt gcagcagctt tagaatctgg tcaattaaga 1020
ggttacggtg gtgatgtttg gttcccacaa ccagctccaa aggatcaccc atggagagat 1080
atgagaaata aatatggtgc tggtaatgcc atgactcctc actactctgg tactacttta 1140
gatgctcaaa caagatacgc tgaaggtact aaaaatatct tggaatcatt ctttactggt 1200
aaatttgatt acagaccaca agatattatc ttattaaatg gtgaatacgt tactaaagct 1260
tacggtaaac acgataagaa ataaattttc ttaacttgaa aactataatt gctataacaa 1320
ttcttcaatt tctctttttc ttcctttttt tgaagaattt ttaacaatca aaattttgac 1380
tctttgattt cccgcaatct ctgagctcag catactcatt attattttat tattattatt 1440
attattactt ttattattat tatattttty cttctttaac gatatcgttt gtgttttatc 1500
ttttatgatt taaattttat acgaatttat gaatacaaca aaatatttaa gtttacacaa 1560
tg 1562
<210> 132
<211> 1131
<212> DNA
<213> 酿酒酵母
<400> 132
atgtcgaagg gaaaggtttt gctggttctt tacgaaggtg gtaagcatgc tgaagagcag 60
gaaaagttat tggggtgtat tgaaaatgaa cttggtatca gaaatttcat tgaagaacag 120
ggatacgagt tggttactac cattgacaag gaccctgagc caacctcaac ggtagacagg 180
gagttgaaag acgctgaaat tgtcattact acgccctttt tccccgccta catctcgaga 240
aacaggattg cagaagctcc taacctgaag ctctgtgtaa ccgctggcgt cggttcagac 300
catgtcgatt tagaagctgc aaatgaacgg aaaatcacgg tcaccgaagt tactggttct 360
aacgtcgttt ctgtcgcaga gcacgttatg gccacaattt tggttttgat aagaaactat 420
aatggtggtc atcaacaagc aattaatggt gagtgggata ttgccggcgt ggctaaaaat 480
gagtatgatc tggaagacaa aataatttca acggtaggtg ccggtagaat tggatatagg 540
gttctggaaa gattggtcgc atttaatccg aagaagttac tgtactacga ctaccaggaa 600
ctacctgcgg aagcaatcaa tagattgaac gaggccagca agcttttcaa tggcagaggt 660
gatattgttc agagagtaga gaaattggag gatatggttg ctcagtcaga tgttgttacc 720
atcaactgtc cattgcacaa ggactcaagg ggtttattca ataaaaagct tatttcccac 780
atgaaagatg gtgcatactt ggtgaatacc gctagaggtg ctatttgtgt cgcagaagat 840
gttgccgagg cagtcaagtc tggtaaattg gctggctatg gtggtgatgt ctgggataag 900
caaccagcac caaaagacca tccctggagg actatggaca ataaggacca cgtgggaaac 960
gcaatgactg ttcatatcag tggcacatct ctggatgctc aaaagaggta cgctcaggga 1020
gtaaagaaca tcctaaatag ttacttttcc aaaaagtttg attaccgtcc acaggatatt 1080
attgtgcaga atggttctta tgccaccaga gcttatggac agaagaaata a 1131
<210> 133
<211> 438
<212> DNA
<213> 酿酒酵母
<400> 133
atgtcgaagg gaaaggtttt gctggttctt tatgaaggtg gtaagcatgc tgaagagcag 60
gaaaagttat tggggtgtat tgaaaatgaa cttggtatca gaaatttcat tgaagaacag 120
ggatacgagt tggttactac cattgacaag gaccctgagc caacctcaac ggtagacagg 180
gagttgaaag acgctgaaat tgtcattact acgccctttt tccccgccta catctcgaga 240
aacaggattg cagaagctcc taacctgaag ctctgtgtaa ccgctggcgt cggttcagac 300
catgtcgatt tagaagctgc aaatgaacgg aaaatcacgg tcaccgaagt tactggttct 360
aacgtcgttt ctgtcgcaga gcacgttatg gccacaattt tggttttgat aagaaactat 420
aatggtggtc atcaataa 438
<210> 134
<211> 867
<212> DNA
<213> 钩虫贪铜菌
<400> 134
atgatgcgct gcatgcagtc accggaggtg catccggccg cggccggaga cgccgagccg 60
cccactcaca gcaccttcgc cgtcagccgc tggcgccgcg gcgagctgat gctgagcccc 120
gatgaagtgg ccgaggaagt gccggtcgcg ctggtgtaca acggcatctc gcacgcggtg 180
atgctggcga cgccggccga cctggaggac ttcgcactcg gcttcagcct gagcgaaggc 240
atcgttaccc gtgccagcga cgtctatgac atcgagatcg acacgcgcga gcacggcatc 300
gccgtgcagc tggagatcgc atcggaagcc ttcatgcggc tcaaggaccg ccgccgctcg 360
ctggccgggc gcaccggctg cgggctgtgc ggcaccgaat cgctggaaca ggtgatgcgc 420
ctgccggcac cggtgcgcag cgatgccagc ttccataccg acgtgatcca ggccgcgttc 480
gtgcaactgc aactgcggca ggaactgcag caacacacgg gtgcgacgca cgctgccgca 540
tggctgcgtg ccgatggcca tgtatcactg gtgcgtgaag acgtgggccg ccacaacgcg 600
ctggacaagc tggcgggcgc gctcgccagc agcggcgagg acatctccag cggcgcggtg 660
ctggtgacca gccgcgccag ctatgaaatg gtgctgaaga ccgccgccat cggcgccggc 720
gtgctcgccg cagtgtccgc accgacggcg ctggccgtgc ggcttgccga acaagccagc 780
atcaccctgg ccggcttcgt gcgcgccggc gcgcacgtgg tctatgccca tccccaacgc 840
ctgcagcacg aagcgagcct ggcatga 867
<210> 135
<211> 2880
<212> DNA
<213> 钩虫贪铜菌
<400> 135
atgaacgccc gcaacgagat cgatttcggc acgcccgcca gcccatccac cgaactggtc 60
accctggagg tcgatggcgt cagcgtcacc gtgcccgccg gcacctcggt gatgcgcgcc 120
gcgatggaag cgcagatcgc cgtccccaag ctgtgcgcca ccgacagcct cgaagccttc 180
ggctcgtgcc ggctgtgcct ggtcgagatc gaagggcgcc gcggctatcc ggcatcgtgc 240
accacgccgg tcgaagccgg catgaaggtc aagacccaga gcgacaagct ggccgacctg 300
cgccgcggcg tgatggagct gtatatctcc gaccacccgc tcgattgcct gacctgcccg 360
accaacggca actgcgagct gcaggacatg gccggcgtgg tcggcctgcg tgaagtgcgc 420
tacaacgacg gcggcccgga agctgcgccg atcgcgaccc acacgcagat gaagaaggac 480
gaatccaatc cttacttcac ctacgacccc tccaagtgca tcgtctgcaa ccgctgcgtg 540
cgcgcctgcg aggaaacgca gggcaccttc gccctgacca tcagcggccg cggcttcgat 600
tcccgcgtct cgcccggaac cagccagtcg ttcatggaat cggactgcgt ctcgtgcggc 660
gcctgcgtgc aggcgtgccc gaccgcgacg ctgaccgaga cctcggtgat caagttcggc 720
cagccctcgc acagcaccgt gaccacctgt gcctattgcg gcgtgggctg ttcgttcaag 780
gccgagatga agggcaatga agtggtgcgc atggtgccgt acaaggacgg caaggccaat 840
gaaggccacg cctgcgtcaa gggccgcttt gcctggggct acgccacgca caaggaccgc 900
atcctcaagc cgatgatccg cgccaagatc accgatccgt ggcgcgaggt gtcgtgggaa 960
gaggcgatcg actatgccgc gtcgcagttc aagcgtatcc aggccgagca cggcaaggac 1020
tccatcggcg gcatcgtgtc gtcgcgctgc accaatgaag agggctacct ggtgcagaag 1080
ctggtgcgcg cagccttcgg caacaacaac gtcgacacct gcgcgcgcgt gtgccattcg 1140
ccgaccggct acggcctgaa gcagaccctg ggcgaatcgg ccggcacgca gaccttcaag 1200
tcggtggaga aggccgacgt gatcatggtg atcggtgcca acccgaccga cggccacccg 1260
gtctttgcgt cgcgcatgaa gaagcgcctg cgcgccggcg ccaggctgat cgtggtcgat 1320
ccgcgccgca tcgacctggt cgactccccg catatccgtg ccgactatca cctgcaactg 1380
cgcccgggca ccaacgtggc gctggtgacc tcgctggccc acgtgatcgt caccgaaggc 1440
ctgctcaacg aagctttcat cgccgagcgc tgcgaggacc gcgccttcca gcaatggcgc 1500
gatttcgtct cgctgccgga gaactcgccg gaggcgatgg aaagcgtgac cggcattccg 1560
gcggaacagc tgcgcggtgc cgcacgcctg tatgccaccg gcggcaacgc tgcgatctac 1620
tacggcctgg gcgtgaccga gcatgcgcaa ggctcaacca ccgtgatggg cattgccaac 1680
ctcgccatgg ccaccggcaa tatcggccgc gaaggcgtgg gtgtgaaccc gctgcgcggg 1740
cagaacaatg tgcagggctc gtgcgacatc ggttcgttcc cgcatgagct gccgggctat 1800
cgccacgtgt cggactcgac cacgcgcggt ctgttcgaag ccgcgtggaa tgtcgagatc 1860
agccccgagc cgggcctgcg catccccaat atgtttgaag ccgcgctggc cggcagcttc 1920
aagggcctct actgccaggg cgaggacatt gtccagtccg acccgaacac gcagcacgtg 1980
tccgaggcgc tgtcatcgat ggaatgcatc gtggtgcagg acatcttcct gaacgagacc 2040
gccaagtacg cgcacgtgtt cctgccgggc tcgtccttcc tggaaaagga cggcaccttc 2100
accaacgccg agcgccgcat ctcgcgcgtg cgcaaggtga tgccgcccaa ggcgcgctat 2160
gccgactggg aagccaccat cctgctggcc aatgcgctgg gctacccgat ggactacaag 2220
catccgtcgg agatcatgga cgagatcgcg cgcctgacgc cgaccttcgc cggtgtcagc 2280
tacaagcgcc tggaccagct cggcagcatc cagtggccgt gcaacgccga cgcgccggaa 2340
ggcacgccga ccatgcatat cgacaccttc gtgcgcggca agggcaagtt catcatcacc 2400
aagtacgtgc ccaccaccga gaagatcacg cgcgccttcc cgctgatcct gaccaccggc 2460
cgcatcctgt cgcaatacaa cgtcggcgcg cagacgcgcc gtaccgacaa cgtctactgg 2520
catgccgagg accggctcga gatccatccg cacgatgccg aggagcgcgg catcaaggac 2580
ggcgactggg tcggggtgca gagccgtgcc ggcgacacgg tgctgcgcgc gatcgtcagc 2640
gagcgcatgc agccgggcgt ggtctacacc accttccact tcccggaatc cggcgccaac 2700
gtgatcacca ccgacaactc cgactgggcc accaactgcc cggagtacaa ggtgaccgcg 2760
gtgcaggtgc tgccggtggc gcagccgtcg gcgtggcagc gggagtacca ggagttcaac 2820
gcccagcagc tgcaactgct ggaagccgcc agcgccgacc cggcgcaggc cgtacgctga 2880
<210> 136
<211> 1563
<212> DNA
<213> 钩虫贪铜菌
<400> 136
atgatcacga tcaccaccat cttcgtgccg cgcgattcca ccgcgctggc actgggcgcc 60
gacgacgtcg cccgcgccat cgcgcgtgaa gccgcggcgc gcaacgagca cgtgcgcatt 120
gtgcgcaatg gctcgcgcgg catgttctgg ctggagccgc tggtcgaggt gcagaccgga 180
gccggccgcg tggcctatgg cccggtcagc gccgcagacg tgccggggct gttcgacgcc 240
ggcttgctgc aaggcggcga gcacgcgctg tcgcagggcg tcaccgaaga gatccccttc 300
ctgaagcagc aggagcgcct gaccttcgcc cgcgtcggca tcaccgatcc gctgtcgctg 360
gacgactacc gcgcgcatga gggctttgcc ggcctggagc gcgcgctggc gatgcagccc 420
gccgagatcg tgcaggaggt caccgactcc ggcctgcgcg gccgcggcgg cgcggcgttc 480
ccgaccggca tcaagtggaa gaccgtgctg ggcgcgcagt ccgcggtcaa gtacatcgtc 540
tgcaatgccg acgagggcga ctcgggcacg ttctccgatc gcatggtgat ggaagacgac 600
ccgttcatgc tgatcgaagg catgaccatt gccgcgcttg cggtgggtgc ggagcagggc 660
tacatctact gccgttccga atacccgcac gcgattgccg tgctggaaag cgcgattggt 720
atcgccaacg ccgccggctg gctcggcgac gacatccgcg gcagcggcaa gcgcttccac 780
ctcgaagtgc gcaagggcgc cggcgcctat gtctgcggcg aggaaaccgc gctgctggaa 840
agcctggaag gacggcgcgg cgtggtgcgc gccaagccgc cgctgccggc gctgcagggg 900
ctgttcggca agcccacggt gatcaacaac gtgatctcgc tggccaccgt gccggtgatc 960
ctggcgcgcg gcgcgcagta ctaccgcgac tacggcatgg gccgttcgcg cggcacgctg 1020
ccgttccagc ttgccggcaa catcaagcag ggcggactgg tggaaaaggc gttcggcgtg 1080
acgctgcgcg agctgctggt cgactacggc ggcggcacgc gcagcggccg cgccatccgc 1140
gcggtgcagg tgggcgggcc gctgggcgcc tacctgcccg agtcgcgctt cgacgtgccg 1200
ctggactatg aagcctatgc cgcgttcggc ggcgtggtcg gccacggcgg catcgtggtg 1260
ttcgatgaaa ccgtcgacat ggcaaagcag gcccgctacg cgatggagtt ctgcgcgatc 1320
gaatcgtgcg gcaagtgcac cccgtgccgg atcggctcga cccgcggcgt cgaagtgatg 1380
gaccgcatca tcgccggcga gcagccggtc aagcacgtcg ccctggtgcg cgacctgtgc 1440
gacaccatgc tcaacggctc gctgtgcgcg atgggcggca tgaccccgta cccggtgctg 1500
tccgcgctga atgaattccc cgaggacttc ggcctcgcct ccaacccagc caaggccgcc 1560
tga 1563
<210> 137
<211> 225
<212> DNA
<213> 钩虫贪铜菌
<400> 137
atgaagatcg acaacctcat caccatggcc aaccagatcg gcagcttctt cgaggccatg 60
ccggatcggg aagaggccgt ctctgatatt gcagggcata tcaagcggtt ttgggagccg 120
cgcatgcgca aggccttgct ggggcatgtg gatgccgagg cagggagcgg gctgctggac 180
atcgtgcgcg aggcgctggg gcggcatcgg gcgatgctgg agtag 225
<210> 138
<211> 531
<212> DNA
<213> 钩虫贪铜菌
<400> 138
atgccagaaa tttcccccca cgcaccggca tccgccgatg ccacgcgcat cgccgccatc 60
gtggccgcgc gccaggacat accgggcgcc ttgctgccga tcctgcatga gatccaggac 120
acacagggct atatccccga cgccgccgtg cccgtcattg cccgcgcgct gaacctgtcg 180
cgcgccgagg tgcacggcgt gatcaccttc taccaccatt tccgccagca gccggccggg 240
cgccacgtgg tgcaggtctg ccgcgccgaa gcctgccagt cggtcggcgc cgaagcgctg 300
gccgagcatg cgcagcgcgc acttggctgt ggctttcatg aaaccaccgc ggacgggcag 360
gtgacgctgg agccggttta ttgcctgggc cagtgcgcct gcggccccgc cgtgatggtc 420
ggcgagcagc tgcacggcta tgtcgatgcc aggcgcttcg acgcgctggt gcgctcgctg 480
cgcgagtcgt ccgcggaaaa gaccacggaa gccgcggagg cacaggcatg a 531
<210> 139
<211> 1095
<212> DNA
<213> 钩虫贪铜菌
<400> 139
atgattcgca tctcgatcca cccgcacctg cagatccggg acgacgccag ccccggtggc 60
gaggccctgg acgtgtcccg cctggtggcc ctgctcggcc atatcgagga atccggcagc 120
atcagccact cggcgcaggc ggtatcgctg tcctaccgct acgcctgggg catcctgcgc 180
gatgccgagg cgctgttcgg cggcccgctg atcgacaaga cccgcgggcg cggcagcgcg 240
ctgacgccgc tggcgcagca gttggtgtgg gccagcaagc ggatcggcgc gcggctgtcg 300
ccgacgctgg acagcctggc gtccgagctg gagatcgagt tgaagaagct gatggaccag 360
cccgaagcca cggcgcggct gcatgccagc cacggcttcg cggtggcggc gctgcgcgac 420
ttcctcgacg agcagcaggt gcggcacgac ctgaagtact gcggcagcgt cgaggccgtg 480
gcggcactgg ccgaaggcgc ctgcgatatc gccggcttcc atgtgccggt gggcgagttc 540
gagcacggca tgtggcggca tttcaccacc tggctcaagc cggacaccca ctgcctggtg 600
cacctggcgg tgcgcagcca gggactgttc gtgcggccgg acaacccgct tggcatccac 660
acgctggaag acctgacccg gcgcgaggtg cgcttcgtca accgccaggt gggctcgggc 720
acgcgcctgc tgctggacct gatgctggcc gcgcgcggca tcgacacggc ccgcatcgag 780
ggctacagca acggtgaatt cacccacgcc gcggtggccg cgtatatcgg cagcggcatg 840
gccgacgtgg gctttggcgt ggaaaccgcg gcgcggcgct tcgggctggc gttcgtgccg 900
gtgatcaagg agcgctactt ctttgcgatc gagcgcgcca agctgcgcag cgcggcactg 960
gccggcgcgg tggacgcgct taccagcgaa gccttccgcc agcgcgtcaa tgcactgccc 1020
ggctacgacg gcacgctgac cggcaccgtg ctgacgctgg aagaagcgtt cccggattac 1080
gctgaggcgc gctag 1095

Claims (17)

1.一种从可发酵碳源制造丁二烯的方法，所述方法包含：
a.)提供可发酵碳源；
b.)使所述可发酵碳源与微生物在发酵培养基中接触，所述微生物包含一或多种编码路径中催化所述可发酵碳源向在丁二烯制造路径中的一或多种中间物转化的酶的多核苷酸，和一或多种编码路径中催化所述一或多种中间物向丁二烯转化的酶的多核苷酸；以及
c.)使所述一或多种编码所述路径中催化所述可发酵碳源向在丁二烯制造路径中的一或多种中间物转化的所述酶的多核苷酸、和所述一或多种编码路径中催化所述一或多种中间物向丁二烯转化的酶的多核苷酸在所述微生物中表达，以制造丁二烯，
其中所述丁二烯制造路径中的所述一或多种中间物是巴豆酰CoA中间物；
其中所有酶都需要来自(i)巴豆酰CoA还原酶(双官能)(E.C.1.1.1)和巴豆醇脱水酶(E.C.4.2.1)或(ii)巴豆醛脱氢酶(E.C.1.2.1)、巴豆醇脱氢酶(E.C.1.1.1,1.1.1.1)和巴豆醇脱水酶(E.C.4.2.1)，其中所述巴豆醇脱水酶是来自解芳烃卡斯特兰尼氏菌株65Phen的沉香醇脱水酶-异构酶(SEQ ID NO:56)；以及
其中(i)中的酶分别用于将巴豆酰CoA转化为巴豆醇，以及将巴豆醇转化为丁二烯；(ii)中的酶分别用于将巴豆酰CoA转化为巴豆醛、将巴豆醛转化为巴豆醇，以及将巴豆醇转化为丁二烯。
2.根据权利要求1所述的方法，其中所述微生物是选自由以下组成的属的细菌：伯克霍尔德菌属(Burkholderia)、丙酸杆菌属(Propionibacterium)、丙酸螺菌属(Propionispira)、梭菌属(Clostridium)、芽孢杆菌属(Bacillus)、埃希氏菌属(Escherichia)、暗杆菌属(Pelobacter)或乳杆菌属(Lactobacillus)。
3.根据权利要求1所述的方法，其中所述微生物是真核生物，其是酵母、丝状真菌、原生动物或藻类。
4.根据权利要求3所述的方法，其中所述酵母是酿酒酵母(Saccharomycescerevisiae)、运动发酵单胞菌(Zymomonas mobilis)或巴斯德毕赤酵母(Pichiapastoris)。
5.根据权利要求1所述的方法，其中所述碳源是甘蔗汁、甘蔗糖蜜、水解淀粉、水解木质纤维素材料、葡萄糖、蔗糖、果糖、乳酸酯、乳糖、木糖、丙酮酸酯或甘油，呈其任何形式或混合物形式。
6.根据权利要求1所述的方法，其中所述碳源是单糖、寡糖或多糖。
7.根据权利要求1所述的方法，其中所述丁二烯由所述微生物分泌到所述发酵培养基中。
8.根据权利要求7所述的方法，其进一步包含从所述发酵培养基回收所述丁二烯。
9.根据权利要求1所述的方法，其中所述可发酵碳源向所述丁二烯的转化是在厌氧条件下进行。
10.一种经遗传修饰的微生物，其包含一或多种编码路径中催化可发酵碳源向在丁二烯制造路径中的一或多种中间物转化的酶的多核苷酸、和一或多种编码路径中催化所述一或多种中间物向丁二烯转化的酶的多核苷酸，其中所述丁二烯制造路径中的所述一或多种中间物是巴豆酰CoA中间物；
其中所有酶都需要来自(i)巴豆酰CoA还原酶(双官能)(E.C.1.1.1)和巴豆醇脱水酶(E.C.4.2.1)或(ii)巴豆醛脱氢酶(E.C.1.2.1)、巴豆醇脱氢酶(E.C.1.1.1,1.1.1.1)和巴豆醇脱水酶(E.C.4.2.1)，其中所述巴豆醇脱水酶是来自解芳烃卡斯特兰尼氏菌株65Phen的沉香醇脱水酶-异构酶(SEQ ID NO:56)。
11.根据权利要求10所述的微生物，其中所述微生物是选自由以下组成的属的细菌：伯克霍尔德菌属、丙酸杆菌属、丙酸螺菌属、梭菌属、芽孢杆菌属、埃希氏菌属、暗杆菌属或乳杆菌属。
12.根据权利要求10所述的微生物，其中所述微生物是真核生物，其是酵母、丝状真菌、原生动物或藻类。
13.根据权利要求11所述的微生物，其中所述酵母是酿酒酵母、运动发酵单胞菌或巴斯德毕赤酵母。
14.根据权利要求1所述的方法，其中所述酶是巴豆酰CoA还原酶(双官能)(E.C.1.1.1)和巴豆醇脱水酶(E.C.4.2.1)，其中所述巴豆醇脱水酶是来自解芳烃卡斯特兰尼氏菌株65Phen的沉香醇脱水酶-异构酶(SEQ ID NO:56)。
15.根据权利要求1所述的方法，其中所述酶是巴豆醛脱氢酶(E.C.1.2.1)、巴豆醇脱氢酶(E.C.1.1.1,1.1.1.1)和巴豆醇脱水酶(E.C.4.2.1)，其中所述巴豆醇脱水酶是来自解芳烃卡斯特兰尼氏菌株65Phen的沉香醇脱水酶-异构酶(SEQ ID NO:56)。
16.根据权利要求10所述的微生物，其中所述酶是巴豆酰CoA还原酶(双官能)(E.C.1.1.1)和巴豆醇脱水酶(E.C.4.2.1)，其中所述巴豆醇脱水酶是来自解芳烃卡斯特兰尼氏菌株65Phen的沉香醇脱水酶-异构酶(SEQ ID NO:56)。
17.根据权利要求10所述的微生物，其中所述酶是巴豆醛脱氢酶(E.C.1.2.1)、巴豆醇脱氢酶(E.C.1.1.1,1.1.1.1)和巴豆醇脱水酶(E.C.4.2.1)，其中所述巴豆醇脱水酶是来自解芳烃卡斯特兰尼氏菌株65Phen的沉香醇脱水酶-异构酶(SEQ ID NO:56)。
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