CN111601894B - M23a家族蛋白酶的制造方法 - Google Patents

M23a家族蛋白酶的制造方法 Download PDF

Info

Publication number
CN111601894B
CN111601894B CN201980008312.8A CN201980008312A CN111601894B CN 111601894 B CN111601894 B CN 111601894B CN 201980008312 A CN201980008312 A CN 201980008312A CN 111601894 B CN111601894 B CN 111601894B
Authority
CN
China
Prior art keywords
sequence
seq
protease
polynucleotide
subfamily
Prior art date
Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
Active
Application number
CN201980008312.8A
Other languages
English (en)
Other versions
CN111601894A (zh
Inventor
日置贵大
山下大智
东畑正敏
Current Assignee (The listed assignees may be inaccurate. Google has not performed a legal analysis and makes no representation or warranty as to the accuracy of the list.)
Kao Corp
Original Assignee
Kao Corp
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Priority claimed from JP2018005193A external-priority patent/JP7057140B2/ja
Priority claimed from JP2018005194A external-priority patent/JP7158149B2/ja
Priority claimed from JP2018219142A external-priority patent/JP7233203B2/ja
Application filed by Kao Corp filed Critical Kao Corp
Publication of CN111601894A publication Critical patent/CN111601894A/zh
Application granted granted Critical
Publication of CN111601894B publication Critical patent/CN111601894B/zh
Active legal-status Critical Current
Anticipated expiration legal-status Critical

Links

Classifications

    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N9/00Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
    • C12N9/14Hydrolases (3)
    • C12N9/48Hydrolases (3) acting on peptide bonds (3.4)
    • C12N9/50Proteinases, e.g. Endopeptidases (3.4.21-3.4.25)
    • C12N9/64Proteinases, e.g. Endopeptidases (3.4.21-3.4.25) derived from animal tissue
    • C12N9/6421Proteinases, e.g. Endopeptidases (3.4.21-3.4.25) derived from animal tissue from mammals
    • C12N9/6489Metalloendopeptidases (3.4.24)
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N9/00Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
    • C12N9/14Hydrolases (3)
    • C12N9/48Hydrolases (3) acting on peptide bonds (3.4)
    • C12N9/50Proteinases, e.g. Endopeptidases (3.4.21-3.4.25)
    • C12N9/52Proteinases, e.g. Endopeptidases (3.4.21-3.4.25) derived from bacteria or Archaea
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09Recombinant DNA-technology
    • C12N15/11DNA or RNA fragments; Modified forms thereof; Non-coding nucleic acids having a biological activity
    • C12N15/62DNA sequences coding for fusion proteins
    • C12N15/625DNA sequences coding for fusion proteins containing a sequence coding for a signal sequence
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09Recombinant DNA-technology
    • C12N15/63Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
    • C12N15/74Vectors or expression systems specially adapted for prokaryotic hosts other than E. coli, e.g. Lactobacillus, Micromonospora
    • C12N15/75Vectors or expression systems specially adapted for prokaryotic hosts other than E. coli, e.g. Lactobacillus, Micromonospora for Bacillus

Landscapes

  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Plant Pathology (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Enzymes And Modification Thereof (AREA)
  • Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)

Abstract

本发明提供一种高效地制造M23A家族蛋白酶的方法。一种M23A家族蛋白酶的制造方法,其中,包括如下步骤:培养导入有编码M23A家族蛋白酶的前蛋白的多核苷酸的芽孢杆菌属菌,从而在该芽孢杆菌属菌的细胞外制造成熟型M23A家族蛋白酶。

Description

M23A家族蛋白酶的制造方法
技术领域
本发明涉及一种M23A家族蛋白酶的制造方法。
背景技术
蛋白酶的M23家族是MEROPS数据库中被定义为能够分解Gly-Gly键的蛋白酶的蛋白酶家族。M23家族蛋白酶还具有分解弹性蛋白及细菌细胞壁的蛋白聚糖的活性,也被称为溶菌酶。M23家族蛋白酶分类为M23A亚族和M23B亚族这两个亚族,各亚族分别包含多种类型的酶。
在酶等蛋白质的商业化生产中,通常,培养导入有目标蛋白质的基因的大肠杆菌等宿主以表达该蛋白质,并回收由宿主生产的成熟型蛋白质。在多数蛋白酶中,前蛋白最先表达,它经过自加工(self-processing)转换为成熟型蛋白质,并在细胞或培养物中积累,作为目标物被回收。然而,M23A亚族蛋白酶不会通过自加工(self-processing)向成熟体转换,从而不能从大肠杆菌宿主中回收成熟型蛋白质(非专利文献1、2)。因此,作为M23A亚族蛋白酶的生产方法,探讨了培养天然的M23A亚族蛋白酶生产菌株的方法。非专利文献1中记载了使天然生产作为目标的M23A亚族蛋白酶的野生型菌株生产该M23A亚族蛋白酶的方法,并且,为了降低生产成本,进一步探讨了提高蛋白酶生产効率的培养条件。另外,在非专利文献3中,为了降低生产成本,从自然界获得了比现有的M23A亚族蛋白酶生产菌显示出更高的生产性的菌株。
另一方面,专利文献1中记载了从水解无色杆菌(Achromobacter lyticus)中分离的属于M23A亚族的β-裂解蛋白酶,另外还记载了使大肠杆菌、芽孢杆菌属菌等宿主表达该酶而进行制造。然而,专利文献1中实际上并未记载使用异源宿主生产该酶的内容。专利文献1中指出了β-裂解蛋白酶进行自加工(self-processing)的可能性。但是,如上述的非专利文献1、2中所公开那样,在随后的研究中报道了M23A亚族蛋白酶不能进行自加工(self-processing),因此,很明显,专利文献1并未解决上述的异源表达系统中M23A亚族蛋白酶缺乏自加工(self-processing)的问题。此外,如非专利文献3所记载,专利文献1之后报道了β-裂解蛋白酶相对于枯草芽孢杆菌等革兰氏阳性菌具有很强的溶菌活性。因此,非专利文献1~3中所示的见解说明了如下事实:专利文献1中公开的β-裂解蛋白酶在大肠杆菌、芽孢杆菌属菌中的异源表达并不现实,这种异源表达反而是非常困难的。
综上所述,M23A亚族蛋白酶虽然具有优异的特征,但由于缺乏自加工(self-processing)、溶菌活性,只能通过培养天然的M23A亚族蛋白酶生产菌株的方法来获得成熟型酶。实际上至今尚未报道有M23A亚族蛋白酶成功地以成熟型异源表达的例子。
专利文献1:日本特开平4-108387号公报
非专利文献1:《分子》(Molecules),2014,19:4779-4790
非专利文献2:《细菌学杂志》(Journal of bacteriology),1996,178:6608-6617
非专利文献3:《生物科学与生物工程杂志》(Journal of bioscience andbioengineering),2003,95:27-34
发明内容
本发明提供一种M23A家族蛋白酶的制造方法,其中,包括如下步骤:培养导入有编码M23A家族蛋白酶的前蛋白的多核苷酸的芽孢杆菌属菌,从而在该芽孢杆菌属菌的细胞外制造成熟型M23A家族蛋白酶。
附图说明
图1为重组枯草芽孢杆菌的培养上清的FRET-GGGGG分解活性。
图2为重组枯草芽孢杆菌的培养上清的SDS-PAGE图像。
图3为重组枯草芽孢杆菌168株及Dpr9株的培养上清的FRET-GGGGG分解活性。
图4为重组枯草芽孢杆菌168株及Dpr9株的培养上清的蛋白质印迹图像。
图5为导入有编码各种M23A亚族蛋白酶的前蛋白的基因的重组枯草芽孢杆菌的培养上清的FRET-GGGGG分解活性。
具体实施方式
在本说明书中,核苷酸序列及氨基酸序列的同一性是通过利普曼-皮尔森(Lipman-Pearson)法(《科学》(Science),1985,227:1435-1441)来进行计算。具体而言,通过使用基因信息处理软件Genetyx-Win的同一性分析(Search homology)程序,将要比较的单位大小(Unit size to compare)(ktup)设为2进行分析而算出。
在本说明书中,有关氨基酸序列或核苷酸序列的“至少80%的同一性”是指同一性为80%以上、优选85%以上、更优选90%以上、进一步优选95%以上、进一步优选96%以上、进一步优选97%以上、进一步优选98%以上、进一步优选99%以上。
在本说明书中,关于氨基酸序列及核苷酸序列上的“相当于…的位置”或“相当于…的区域”,是通过以赋予各氨基酸序列或核苷酸序列中存在的保守氨基酸残基或核苷酸最大同源性的方式对准(比对(alignment))目标序列与参照序列(例如,序列号1的核苷酸序列)来确定。关于比对,能够使用公知的算法来执行,其流程是本领域技术人员公知的。例如,能够在默认设置下使用Clustal W多重比对程序(《核算研究》(Nucleic AcidsRes.),1994,22:4673-4680),由此进行比对。或者,也能够使用作为Clustal W修订版的Clustal W2、Clustal omega。Clustal W、Clustal W2及Clustal omega能够在例如欧洲生物信息学研究所研究所(European Bioinformatics Institute:EBI[www.ebi.ac.uk/index.html])、或日本国立遗传学研究所所运营的日本DNA数据库(DDBJ[www.ddbj.nig.ac.jp/Welcome-j.html])的网站上使用。通过上述的比对以对应于参照序列的任意的区域的方式对齐的目标序列的位置或区域被看做“相当于”该任意的区域的“位置”或“区域”。
在本说明书中,控制区与基因的“可操作地连接”是指基因与控制区以该基因能够在该控制区的制御下进行表达的方式连接。基因与控制区的“可操作地连接”的流程是本领域技术人员熟知的。
在本说明书中,有关基因的“上游”及“下游”是指该基因的转录方向的上游及下游。例如,“配置于启动子的下游的基因”表示在DNA正义链(sense strand)上该基因存在于启动子的3’侧,基因的上游表示DNA正义链上的该基因的5’侧的区域。
在本说明书中,针对细胞的功能、特性、性状所使用的术语“本来”用于表示该细胞原本就存在该功能、特性、性状。相反,术语“外源”用于表示该细胞原本不存在而从外部导入的功能、特性、性状。例如,“外源”基因或多核苷酸是从外部导入细胞中的基因或多核苷酸。外源基因或多核苷酸既可以是来自与其所导入的细胞同源的生物,也可以是来自异源的生物(即,异源基因或多核苷酸)。
本说明书中记载的枯草芽孢杆菌的基因的名称基于日本枯草芽孢杆菌功能分析网络(JAFAN:Japan Functional Analysis Network for Bacillus subtilis)(BSORF DB)中网络公开的([bacillus.genome.ad.jp/],2006年1月18日更新)枯草芽孢杆菌基因组数据。本说明书中所记载的枯草芽孢杆菌的基因编号表示BSORF DB中注册的基因编号。
本发明提供M23A家族蛋白酶的制造方法。
针对M23A亚族蛋白酶不能在异源宿主中转换为成熟体这一现有的见解(例如,非专利文献1、2),本发明人等惊奇地发现:通过将M23A家族蛋白酶基因导入到芽孢杆菌属菌宿主中并进行培养,从而能够从培养物中高效地回收成熟型M23A家族蛋白酶。
M23A亚族蛋白酶除了具有分解弹性蛋白及细菌细胞壁的活性之外,还具有清除角质污垢的能力,由于这一优异的特征,有望在各种产业中得到应用(日本特愿2018-005193)。根据本发明的方法,通过使用芽孢杆菌属菌宿主,能够以简便的流程高效地制造成熟型M23A家族蛋白酶。根据本发明,能够解决现有的M23A家族蛋白酶的生产中的问题,例如,天然的表达成熟型M23A家族蛋白酶的野生型菌株的生产性低下的问题,及大肠杆菌宿主中缺乏成熟体的问题等。
本发明的M23A亚族蛋白酶的制造方法包括:培养导入有编码目标M23A亚族蛋白酶的前蛋白的多核苷酸的芽孢杆菌属菌(Bacillus)的步骤。
通过本发明制造的M23A亚族蛋白酶是具有肽序列中的甘氨酸-甘氨酸键的分解活性的成熟体酶。作为通过本发明制造的M23A亚族蛋白酶的优选例,可列举:β-裂解金属肽酶(beta-lytic metallopeptidase;BLP)、LasA蛋白质(Las A protein;LasA,也称为葡萄球菌溶血素(Staphylolysin))及嗜水气单胞菌蛋白酶(Aeromonas hydrophila proteinase;AhP,也称为Mername-AA291peptidase)。它们在MEROPS数据库([http://merops.sanger.ac.uk])中作为属于M23A亚族的蛋白酶被公开。BLP(MEROPS ID:M23.001)是由序列号1的氨基酸序列构成的多肽。LasA(MEROPS ID:M23.002)是由序列号4的氨基酸序列构成的多肽。AhP(MEROPS ID:M23.003)是由序列号7的氨基酸序列构成的肽。BLP、LasA及AhP是具有肽序列中的甘氨酸-甘氨酸键的分解活性的酶。
作为通过本发明制造的M23A亚族蛋白酶的其它优选例,可列举与上述BLP、LasA及AhP具有同等的功能的多肽。作为具有与该BLP、LasA及AhP具有同等的功能的多肽的例子,可列举:由与序列号1、4及7中任意一种的氨基酸序列具有至少80%的同一性的氨基酸序列构成,且具有肽序列中的甘氨酸-甘氨酸键的分解活性的多肽。作为具有与BLP同等的功能的多肽的优选例子,可列举:由与序列号1的氨基酸序列具有至少80%的同一性的氨基酸序列构成,且具有肽序列中的甘氨酸-甘氨酸键分解活性的多肽,其中,优选地,所述氨基酸序列在相当于序列号1的氨基酸序列的22位、121位及123位的位置具有His,在相当于36位的位置具有Asp。作为具有与LasA同等的功能的多肽的优选例子,可列举:由与序列号4的氨基酸序列具有至少80%的同一性的氨基酸序列构成,且具有肽序列中的甘氨酸-甘氨酸键分解活性的多肽,其中,优选地,所述氨基酸序列在相当于序列号4的氨基酸序列的23位、120位及122位的位置具有His,在相当于36位的位置具有Asp。作为具有与AhP同等的功能的多肽的优选例子,可列举:由与序列号7的氨基酸序列具有至少80%的同一性的氨基酸序列构成,且具有肽序列中的甘氨酸-甘氨酸键分解活性的多肽,其中,优选地,在相当于序列号7的氨基酸序列的21位、118位及120位的位置具有His,在相当于34位的位置具有Asp。
作为通过本发明制造的M23A亚族蛋白酶的再一优选例子,可列举:来自胶状溶杆菌(Lysobacter gummosus)的BLP同源物(WP_057941690.1,在以下的本说明书中称为LgBLP)、及来自抗生素溶杆菌(Lysobacter antibioticus)的BLP同源物(WP_057970430.1,在以下的本说明书中称为LaBLP)。LgBLP是由序列号10的氨基酸序列构成的多肽。LaBLP是由序列号13的氨基酸序列构成的多肽。LgBLP及LaBLP是具有肽序列中的甘氨酸-甘氨酸键的分解活性的酶。
作为通过本发明制造的M23A亚族蛋白酶的再一优选例子,可列举具有与上述LgBLP及LaBLP同等的功能的多肽。作为具有与LgBLP同等的功能的多肽的优选例子,可列举:由与序列号10的氨基酸序列具有至少80%的同一性的氨基酸序列构成,且具有肽序列中的甘氨酸-甘氨酸键分解活性的多肽。作为具有与LaBLP同等的功能的多肽的优选例子,可列举:由与序列号13的氨基酸序列具有至少80%的同一性的氨基酸序列构成,且具有肽序列中的甘氨酸-甘氨酸键分解活性的多肽。
优选地,通过本发明制造的M23A亚族蛋白酶为选自上述BLP、LasA、AhP、LgBLP、LaBLP、及具有与它们同等的功能的多肽中的至少一种。
本发明中使用的导入于芽孢杆菌属菌的编码M23A亚族蛋白酶的前蛋白的多核苷酸,是包含编码通过上述的本发明的方法制造的目标M23A亚族蛋白酶的前区的序列和编码成熟型蛋白质的序列的多核苷酸。M23A亚族蛋白酶的前区,是指有助于“在前蛋白上位于该前区的下游的M23A亚族蛋白酶成熟型蛋白质区域”的三维结构的形成的区域。作为编码该前蛋白的多核苷酸的例子,可列举:编码BLP的前蛋白的多核苷酸(序列号2)、编码LasA的前蛋白的多核苷酸(序列号5)、编码AhP的前蛋白的多核苷酸(序列号8)、编码LgBLP的前蛋白的多核苷酸(序列号11)、及编码LaBLP的前蛋白的多核苷酸(序列号14)。作为编码该前蛋白的多核苷酸的其它例子,可列举:编码包含分泌信号的BLP的前蛋白的多核苷酸(序列号3)、编码包含分泌信号的LasA的前蛋白的多核苷酸(序列号6)、编码包含分泌信号的AhP的前蛋白的多核苷酸(序列号9)、编码包含分泌信号的LgBLP的前蛋白的多核苷酸(序列号12)、及编码包含分泌信号的LaBLP的前蛋白的多核苷酸(序列号15)。
在序列号2的多核苷酸中,523~1062号核苷酸区域编码BLP的成熟型蛋白质,其上游编码前区。在序列号3的多核苷酸中,595~1134号核苷酸区域编码BLP的成熟型蛋白质,在其上游具有前区的编码区,进一步,其上游编码分泌信号。关于编码分泌信号的区域,能够通过SignalP(www.cbs.dtu.dk/services/SignalP/)等工具来确定。基于利用SignalP的预测的序列号3的多核苷酸上的BLP的分泌信号编码区为1~72号核苷酸区域。
在序列号5的多核苷酸中,616~1164号核苷酸区域编码LasA的成熟型蛋白质,其上游编码前区。在序列号6的多核苷酸中,709~1257号核苷酸区域编码LasA的成熟型蛋白质,在其上游具有前区的编码区,进一步,其上游编码分泌信号。基于利用SignalP的预测的序列号6的多核苷酸上的LasA的分泌信号编码区为1~93号核苷酸区域。
在序列号8的多核苷酸中,565~1104号核苷酸区域编码AhP的成熟型蛋白质,其上游编码前区。在序列号9的多核苷酸中,625~1164号核苷酸区域编码AhP的成熟型蛋白质,在其上游具有前区的编码区,进一步,其上游编码分泌信号。基于利用SignalP的预测的序列号9的多核苷酸上的AhP的分泌信号编码区为1~60号核苷酸区域。
在序列号11的多核苷酸中,529~1065号核苷酸区域编码LgBLP的成熟型蛋白质,其上游编码前区。在序列号12的多核苷酸中,628~1164号核苷酸区域编码LgBLP的成熟型蛋白质,在其上游具有前区的编码区,进一步,其上游编码分泌信号。基于利用SignalP的预测的序列号12的多核苷酸上的LgBLP的分泌信号编码区为1~99号核苷酸区域。
在序列号14的多核苷酸中,550~1086号核苷酸区域编码LaBLP的成熟型蛋白质,其上游编码前区。在序列号15的多核苷酸中,628~1164号核苷酸区域编码LaBLP的成熟型蛋白质,在其上游具有前区的编码区,进一步,其上游编码分泌信号。基于利用SignalP的预测的序列号15的多核苷酸上的LaBLP的分泌信号编码区为1~78号核苷酸区域。
被上述的多核苷酸编码的前区对位于其下游的成熟型蛋白质区域的三维结构的形成作出贡献。
因此,作为编码目标M23A亚族蛋白酶的前蛋白的多核苷酸的再一例子,可列举:包含编码M23A亚族蛋白酶的前区的多核苷酸和连接于其下游的编码M23A亚族蛋白酶的成熟型蛋白质的多核苷酸的多核苷酸。作为编码该M23A亚族蛋白酶的前区的多核苷酸的例子,可列举由下列序列构成的多核苷酸:序列号2的1~522号核苷酸区域的序列、序列号5的1~615号核苷酸区域的序列、序列号8的1~564号核苷酸区域的序列、序列号11的1~528号核苷酸区域的序列、序列号14的1~549号核苷酸区域的序列、或与它们具有至少80%同一性的序列。被这些多核苷酸编码的前区有助于位于其下游的M23A亚族蛋白酶的成熟型蛋白质区域的三维结构的形成。作为编码该M23A亚族蛋白酶的成熟型蛋白质的多核苷酸的例子,可列举:编码上述的BLP、LasA、AhP、LgBLP、LaBLP、及具有与它们同等的功能的多肽的多核苷酸。
作为编码目标M23A亚族蛋白酶的前蛋白的多核苷酸的再一例子,可列举以下的多核苷酸:
由与序列号2的核苷酸序列具有至少80%同一性的核苷酸序列构成,且在相当于序列号2的523~1062号核苷酸区域的区域具有编码BLP、LasA、AhP、LgBLP、LaBLP、或具有与它们同等的功能的多肽(优选BLP或具有与其同等的功能的多肽)的核苷酸序列的多核苷酸;
具有序列号2的1~522号核苷酸区域的序列或与该序列具有至少80%同一性且编码M23A亚族蛋白酶的前区的序列、及连接于其下游的编码M23A亚族蛋白酶成熟型蛋白质(BLP、LasA、AhP、LgBLP、LaBLP、或具有与它们同等的功能的多肽,优选BLP或具有与其同等的功能的多肽)的序列的多核苷酸;
由与序列号3的核苷酸序列具有至少80%同一性的核苷酸序列构成,且在相当于序列号3的595~1134号核苷酸区域的区域具有编码BLP、LasA、AhP、LgBLP、LaBLP、或具有与它们同等的功能的多肽(优选BLP或具有与其同等的功能的多肽)的核苷酸序列的多核苷酸;
具有序列号3的1~594号核苷酸区域的序列或与该序列具有至少80%同一性且编码M23A亚族蛋白酶的分泌信号及前区的序列、及连接于其下游的编码M23A亚族蛋白酶成熟型蛋白质(BLP、LasA、AhP、LgBLP、LaBLP、或具有与它们同等的功能的多肽,优选BLP或具有与其同等的功能的多肽)的序列的多核苷酸;
由与序列号5的核苷酸序列具有至少80%同一性的核苷酸序列构成,且在相当于序列号5的616~1164号核苷酸区域的区域具有编码BLP、LasA、AhP、LgBLP、LaBLP、或具有与它们同等的功能的多肽(优选LasA或具有与其同等的功能的多肽)的核苷酸序列的多核苷酸;
具有序列号5的1~615号核苷酸区域的序列或与该序列具有至少80%同一性且编码M23A亚族蛋白酶的前区的序列、及连接于其下游的编码M23A亚族蛋白酶成熟型蛋白质(BLP、LasA、AhP、LgBLP、LaBLP、或具有与它们同等的功能的多肽,优选LasA或具有与其同等的功能的多肽)的序列的多核苷酸;
由与序列号6的核苷酸序列具有至少80%同一性的核苷酸序列构成,且在相当于序列号6的709~1257号核苷酸区域的区域具有编码BLP、LasA、AhP、LgBLP、LaBLP、或具有与它们同等的功能的多肽(优选LasA或具有与其同等的功能的多肽)的核苷酸序列的多核苷酸;
具有序列号6的1~708号核苷酸区域的序列或与该序列具有至少80%同一性且编码M23A亚族蛋白酶的分泌信号及前区的序列、及连接于其下游的编码M23A亚族蛋白酶成熟型蛋白质(BLP、LasA、AhP、LgBLP、LaBLP、或具有与它们同等的功能的多肽,优选LasA或具有与其同等的功能的多肽)的序列的多核苷酸;
由与序列号8的核苷酸序列具有至少80%同一性的核苷酸序列构成,且在相当于序列号8的565~1104号核苷酸区域的区域具有编码BLP、LasA、AhP、LgBLP、LaBLP、或具有与它们同等的功能的多肽(优选AhP或具有与其同等的功能的多肽)的核苷酸序列的多核苷酸;
具有序列号8的1~564号核苷酸区域的序列或与该序列具有至少80%同一性且编码M23A亚族蛋白酶的前区的序列、及连接于其下游的编码M23A亚族蛋白酶成熟型蛋白质(BLP、LasA、AhP、LgBLP、LaBLP、或具有与它们同等的功能的多肽,优选AhP或具有与其同等的功能的多肽)的序列的多核苷酸;
由与序列号9的核苷酸序列具有至少80%同一性的核苷酸序列构成,且在相当于序列号9的625~1164号核苷酸区域的区域具有编码BLP、LasA、AhP、LgBLP、LaBLP、或具有与它们同等的功能的多肽(优选AhP或具有与其同等的功能的多肽)的核苷酸序列的多核苷酸;
具有序列号9的1~624号核苷酸区域的序列或与该序列具有至少80%同一性且编码M23A亚族蛋白酶的分泌信号及前区的序列、及连接于其下游的编码M23A亚族蛋白酶成熟型蛋白质(BLP、LasA、AhP、LgBLP、LaBLP、或具有与它们同等的功能的多肽,优选AhP或具有与其同等的功能的多肽)的序列的多核苷酸;
由与序列号11的核苷酸序列具有至少80%同一性的核苷酸序列构成,且在相当于序列号11的529~1065号核苷酸区域的区域具有编码BLP、LasA、AhP、LgBLP、LaBLP、或具有与它们同等的功能的多肽(优选LgBLP或具有与其同等的功能的多肽)的核苷酸序列的多核苷酸;
具有序列号11的1~528号核苷酸区域的序列或与该序列具有至少80%同一性且编码M23A亚族蛋白酶的前区的序列、及连接于其下游的编码M23A亚族蛋白酶成熟型蛋白质(BLP、LasA、AhP、LgBLP、LaBLP、或具有与它们同等的功能的多肽,优选LgBLP或具有与其同等的功能的多肽)的序列的多核苷酸;
由与序列号12的核苷酸序列具有至少80%同一性的核苷酸序列构成,且在相当于序列号12的628~1164号核苷酸区域的区域具有编码BLP、LasA、AhP、LgBLP、LaBLP、或具有与它们同等的功能的多肽(优选LgBLP或具有与其同等的功能的多肽)的核苷酸序列的多核苷酸;
具有序列号12的1~627号核苷酸区域的序列或与该序列具有至少80%同一性且编码M23A亚族蛋白酶的分泌信号及前区的序列、及连接于其下游的编码M23A亚族蛋白酶成熟型蛋白质(BLP、LasA、AhP、LgBLP、LaBLP、或具有与它们同等的功能的多肽,优选LgBLP或具有与其同等的功能的多肽)的序列的多核苷酸;
由与序列号14的核苷酸序列具有至少80%同一性的核苷酸序列构成,且在相当于序列号14的550~1086号核苷酸区域的区域具有编码BLP、LasA、AhP、LgBLP、LaBLP、或具有与它们同等的功能的多肽(优选LaBLP或具有与其同等的功能的多肽)的核苷酸序列的多核苷酸;
具有序列号14的1~549号核苷酸区域的序列或与该序列具有至少80%同一性且编码M23A亚族蛋白酶的前区的序列、及连接于其下游的编码M23A亚族蛋白酶成熟型蛋白质(BLP、LasA、AhP、LgBLP、LaBLP、或具有与它们同等的功能的多肽,优选LaBLP或具有与其同等的功能的多肽)的序列的多核苷酸;
由与序列号15的核苷酸序列具有至少80%同一性的核苷酸序列构成,且在相当于序列号15的628~1164号核苷酸区域的区域具有编码BLP、LasA、AhP、LgBLP、LaBLP、或具有与它们同等的功能的多肽(优选LaBLP或具有与其同等的功能的多肽)的核苷酸序列的多核苷酸;以及
具有序列号15的1~627号核苷酸区域的序列或与该序列具有至少80%同一性且编码M23A亚族蛋白酶的分泌信号及前区的序列、及连接于其下游的编码M23A亚族蛋白酶成熟型蛋白质(BLP、LasA、AhP、LgBLP、LaBLP、或具有与它们同等的功能的多肽,优选LaBLP或具有与其同等的功能的多肽)的序列的多核苷酸。
作为上述多核苷酸中所含的编码BLP、LasA、AhP、LgBLP及LaBLP、以及具有与它们同等的功能的多肽的核苷酸序列的例子,可列举:序列号2的523~1062号的序列、序列号5的616~1164号的序列、序列号8的565~1104号的序列、序列号11的529~1065号的序列、及序列号14的550~1086号的序列、以及与这些中的任意之一具有至少80%的同一性的核苷酸序列。被这些核苷酸序列编码的多肽均具有肽序列中的甘氨酸-甘氨酸键分解活性。
关于编码该前蛋白的多核苷酸,能够按照常规方法来制备。例如,通过常规方法从本来生产目标M23A亚族蛋白酶的微生物中提取基因组DNA、或提取RNA并通过逆转录而合成cDNA,由此能够制备编码该前蛋白的多核苷酸。例如,关于编码BLP的前蛋白的多核苷酸(序列号2及3),能够从溶杆菌属(Lysobacter sp.)(NBRC 12725或NBRC12726),Achromobacterlyticus M497-1,溶杆菌属(Lysobacter sp.)IB-9374,胶状溶杆菌(Lysobactergummosus)DSMZ 6980等进行制备。关于编码LasA的前蛋白的多核苷酸(序列号5及6),能够从绿脓杆菌(Pseudomonas aeruginosa)PA01,绿脓杆菌(Pseudomonas aeruginosa)ATCC10145,绿脓杆菌(Pseudomonas aeruginosa)FRD1等进行制备。关于编码AhP的前蛋白的多核苷酸(序列号8及9),能够从嗜水气单胞菌嗜水亚种(Aeromonas hydrophilasubsp.hydrophila)ATCC 7966,嗜水气单胞菌(Aeromonas hydrophila)(Chester)Stanier(ATCC 51307)等进行制备。关于编码LgBLP的前蛋白的多核苷酸(序列号11及12),能够从胶状溶杆菌(Lysobacter gummosus)等进行制备。关于编码LaBLP的前蛋白的多核苷酸(序列号14及15),能够从抗生素溶杆菌(Lysobacter antibioticus)等进行制备。能够从公共微生物保存机构购入上述微生物。
对通过上述流程获得的编码前蛋白的多核苷酸进一步进行位点特异性突变导入,由此也可以制备编码目标M23A亚族蛋白酶的前蛋白的多核苷酸。或者,关于编码目标M23A亚族蛋白酶的前蛋白的多核苷酸,也可以基于该前蛋白的氨基酸序列通过化学合成而得到。
编码该前蛋白的多核苷酸可以可操作地与控制区连接。在本说明书中,“控制区”是具有对配置于其下游的基因在细胞内的表达进行控制的功能的区域,优选是具有使配置与其下游的基因组成型表达或过表达的功能的区域。更具体而言,控制区被定义为如下:存在于基因的编码区的上游,并具有与RNA聚合酶相互作用而控制编码该区的转录的功能的区域。优选地,本说明书中的控制区是指基因的编码区的上游200~600个核苷酸左右的区域。控制区包含转录起始控制区及/或翻译起始控制区、或者从转录起始控制区至翻译起始控制区的区域。转录起始控制区是包含启动子及转录起始点的区域,翻译起始控制区是相当于与起始密码子共同形成核糖体键合位点的Shine-Dalgarno(SD)序列的位点(Shine,J.,Dalgarno,L.,Proc.Natl.Acad.Sci.USA.,1974,71:1342-1346)。
作为该控制区的优选例子,可列举在芽孢杆菌属菌中起作用的控制区,例如,来自芽孢杆菌属细菌的α-淀粉酶基因、蛋白酶基因、aprE基因或spoVG基因的控制区、芽孢杆菌KSM-S237株的纤维素酶基因(日本特开2000-210081号公报)的控制区、芽孢杆菌KSM-64株的纤维素酶基因(日本特开2011-10387公报)的控制区、以及来自金黃葡萄球菌(Staphylococcus aureus)的卡那霉素抗性基因或氯霉素抗性基因的控制区(均参见日本特开2009-089708号公报)等,但不做特别限定。作为该控制区的更优选例子,可列举:芽孢杆菌KSM-S237株的纤维素酶基因的启动子(序列号16)、芽孢杆菌KSM-64株的纤维素酶基因的启动子(序列号17)。另外,作为优选的控制区,可列举与序列号16或17至少具有80%的同一性,且具有控制基因的转录及翻译的功能的核苷酸序列。
另外,编码该前蛋白的多核苷酸可以与编码分泌信号的序列(称为分泌信号序列)可操作地连接,其中,该分泌信号具有使被表达的蛋白质向细胞外分泌的功能。作为该分泌信号序列的优选例子,可列举在芽孢杆菌属菌中起作用的分泌信号序列,例如,来自芽孢杆菌属菌的分泌信号序列。作为来自芽孢杆菌属菌的分泌信号序列的优选例子,可列举:芽孢杆菌KSM-S237株的纤维素酶基因的分泌信号序列(序列号18)、芽孢杆菌KSM-64株的纤维素酶基因的分泌信号序列(序列号19)、枯草芽孢杆菌淀粉酶基因amyE的分泌信号序列(序列号20)等。作为来自芽孢杆菌属菌的分泌信号序列的再一例,可列举:与序列号18~20中的任意之一具有至少80%的同一性,且具有使被表达的蛋白质向细胞外分泌的功能的核苷酸序列。与这些来自芽孢杆菌属菌的分泌信号序列连接的编码该前蛋白的序列可以包含或不包含天然型M23A亚族蛋白酶的分泌信号序列(例如,上述的序列号3、6、9、12或15中所含的分泌信号序列)。
因此,对于编码该前蛋白的多核苷酸而言,除了包含开放阅读框(ORF,OpenReading Frame)之外,还可以包含非翻译区(UTR,untranslated region)的核苷酸序列。例如,该多核苷酸可以包含上述的启动子、分泌信号序列及终止子。
能够按照常规方法向芽孢杆菌属菌导入编码该前蛋白的多核苷酸。例如,将编码该前蛋白的多核苷酸或包含该多核苷酸的载体导入宿主芽孢杆菌属菌细胞中,从而能够向该宿主细胞的基因组中整合该多核苷酸。或者,也可以将包含该多核苷酸的表达载体导入宿主芽孢杆菌属菌细胞中。
向宿主芽孢杆菌属菌细胞导入多核苷酸或载体时,例如,能够使用感受态细胞法、电穿孔法、原生质体法、粒子枪法、PEG法等公知的转化技术。
通过常规方法将编码该前蛋白的多核苷酸、及根据需要使用的控制区或者分泌信号序列插入并连接于任意的载体中,由此能够构建包含编码该前蛋白的多核苷酸的载体。对于该载体的种类不作特别限定,可以为质粒、噬菌体、噬菌粒、粘粒、病毒、YAC载体、穿梭载体等任意的载体。另外,该载体优选为能够在宿主细胞内扩增的载体,更优选为表达载体。作为优选的载体的例子,没有限定,可列举:pHA3040SP64、pHSP64R或pASP64(日本特许第3492935号)、pHY300PLK(能够转化大肠杆菌和枯草芽孢杆菌两者的表达载体;Jpn JGenet,1985,60:235-243)、pAC3(《核酸研究》(Nucleic Acids Res),1988,16:8732)等穿梭载体;pUB110(《细菌学》(J Bacteriol),1978,134:318-329),pTA10607(《质粒》(Plasmid),1987,18:8-15)等能够用于芽孢杆菌属细菌的转化的质粒等。另外,也能够使用来自大肠杆菌的质粒(例如,pET22b(+)、pBR322、pBR325、pUC57、pUC118、pUC119、pUC18、pUC19、pBluescript等)。
作为被导入编码该前蛋白的多核苷酸的芽孢杆菌属菌,不作特别限制,但优选枯草芽孢杆菌或其突变株。优选地,该芽孢杆菌属菌向细胞外分泌或伴随着溶菌而释放(下面,将该过程简称为“释放”)目标M23A亚族蛋白酶以外的其它蛋白酶。作为该其它蛋白酶的例子,可列举:选自被aprE、epr、wprA、mpr、nprB、bpr、nprE、vpr、aprX、及相当于这些的基因所编码的细胞外蛋白酶中的至少一种。目前已经掌握了这些细胞外蛋白酶是降低重组酶的生产性的主要原因,也报道有在缺失了这些细胞外蛋白酶的枯草芽孢杆菌株中重组酶的生产性得到了提高(日本特开2006-174707号公报)。与此相对,在本发明提供的M23A家族蛋白酶的制造方法中,反而优选将保持这些细胞外蛋白酶的芽孢杆菌属菌用作用于生产酶的宿主。
aprE、epr、wprA、mpr、nprB、bpr、nprE、vpr及aprX为枯草芽孢杆菌基因。将这些基因的基因编号及所编码的蛋白质的功能示于表1中。作为相当于aprE、epr、wprA、mpr、nprB、bpr、nprE、vpr、及aprX的基因,可列举:在核苷酸序列中分别与epr、wprA、mpr、nprB、bpr、nprE、vpr、及aprX具有至少80%的同一性,且编码(如表1所示)相同功能的蛋白质的来自芽孢杆菌属菌的基因。关于这些基因,能够在上述的BSORF DB中检索。
[表1]
因此,被导入编码该前蛋白的多核苷酸的该芽孢杆菌属菌优选具有细胞外蛋白酶活性。关于微生物的细胞外蛋白酶活性,能够通过测定该微生物的培养上清的偶氮酪蛋白分解活性来检测。关于培养上清的偶氮酪蛋白分解活性,能够根据后述的实施例5(5-2)中所示的方法来测定。对于培养上清具有偶氮酪蛋白分解活性的微生物,将其判断为具有细胞外蛋白酶活性。
优选地,被导入编码该前蛋白的多核苷酸的该芽孢杆菌属菌是表达选自下述基因中的至少一种基因,且向细胞外分泌或释放被该基因编码的细胞外蛋白酶的枯草芽孢杆菌或其突变株,其中,所述基因是:aprE或相当于其的基因、epr或相当于其的基因、wprA或相当于其的基因、mpr或相当于其的基因、nprB或相当于其的基因、bpr或相当于其的基因、nprE或相当于其的基因、vpr或相当于其的基因、及aprX或相当于其的基因。更优选地,该芽孢杆菌属菌是表达下述基因,且向细胞外分泌或释放被该基因编码的细胞外蛋白酶的枯草芽孢杆菌或其突变株,其中,所述基因是:aprE或相当于其的基因、epr或相当于其的基因、wprA或相当于其的基因、mpr或相当于其的基因、nprB或相当于其的基因、bpr或相当于其的基因、nprE或相当于其的基因、vpr或相当于其的基因、及aprX或相当于其的基因。
在本发明的方法中,培养重组芽孢杆菌属菌,该重组芽孢杆菌属菌是通过如上所述的流程获得的且其中导入有编码目标M23A亚族蛋白酶的前蛋白的多核苷酸。对于该芽孢杆菌属菌,通过通常的芽孢杆菌属菌的培养方法进行培养即可。例如,用于培养芽孢杆菌属菌的培养基包含菌体的生长所需的碳源及氮源。作为碳源,例如,可列举:葡萄糖、葡聚糖、可溶性淀粉、蔗糖、甲醇等。作为氮源,例如,可列举:铵盐类、硝酸盐类、氨基酸、玉米浆、蛋白胨、酪蛋白、肉膏、豆粕、马铃薯提取液等。该培养基中根据需要还可以包含其它营养素,例如,无机盐(例如,氯化钠、氯化钙、磷酸二氢钠、氯化镁)、维生素类、抗生素(例如,四环素、新霉素、卡那霉素、大观霉素(spectinomycin)、红霉素等)等。关于培养条件,例如,温度、通气搅拌条件、培养基的pH及培养时间等,可以根据菌种、性状、培养规模等而适当地进行选择。
在本发明的方法中,通过培养该重组芽孢杆菌属菌来表达目标M23A亚族蛋白酶的前蛋白。表达后的前蛋白被分泌或释放至细胞外,并在此通过该芽孢杆菌属菌分泌或释放的其它细胞外蛋白酶的作用而被加工,从而转换为具有酶活性的成熟型M23A亚族蛋白酶。因此,在本发明的方法中,在该重组芽孢杆菌属菌的细胞外制造成熟型M23A家族蛋白酶。所制造的成熟型M23A亚族蛋白酶积累在培养物的细胞外成分中。
按照以上的流程,通过本发明的方法制造成熟型M23A亚族蛋白酶。对于所制造的M23A亚族蛋白酶,能够按照常规方法从培养物中进行回收。在本发明的方法中,所制造的M23A亚族蛋白酶积累在细胞外,因此能够在不破坏细胞的情况下回收目标酶。例如,通过离心分离或过滤等从培养物中除去细胞,并通过通常的方法从所收集的上清或滤液中回收酶,其中,该通常的方法为利用硫酸铵等的盐或乙醇等的有机溶剂的沉淀、使用超滤膜等的浓缩或脱盐、离子交换或凝胶过滤等各种使用色谱法的精制等。
另外,作为示例的实施方式,本发明还包含以下的物质、制造方法、用途、方法等。但本发明不限定于这些实施方式。
[1]一种M23A家族蛋白酶的制造方法,其中,包含如下步骤:培养导入有编码M23A家族蛋白酶的前蛋白的多核苷酸的芽孢杆菌属菌,从而在该芽孢杆菌属菌的细胞外制造成熟型M23A家族蛋白酶。
[2]根据[1]所述的方法,其中,优选所述M23A家族蛋白酶是:由序列号1、4、7、10或者13的氨基酸构成的多肽;或者,由与序列号1、4、7、10及13中任意一种的氨基酸序列具有至少80%的同一性的氨基酸序列构成,且具有肽序列中的甘氨酸-甘氨酸键的分解活性的多肽。
[3]根据[2]所述的方法,其中,优选所述编码M23A家族蛋白酶的前蛋白的多核苷酸为以下的多核苷酸,:
由序列号2、3、5、6、8、9、11、12、14及15中任意一种的核苷酸序列构成的多核苷酸;或
包含编码M23A亚族蛋白酶的前区的多核苷酸与连接于其下游的编码M23A亚族蛋白酶的多核苷酸的多核苷酸;
优选地,编码该M23A亚族蛋白酶的前区的多核苷酸为由序列号2的1~522号核苷酸区域的序列、序列号5的1~615号核苷酸区域的序列、序列号8的1~564号核苷酸区域的序列、序列号11的1~528号核苷酸区域的序列、序列号14的1~549号核苷酸区域的序列、或与它们具有至少80%同一性的序列构成,且有助于位于其下游的M23A亚族蛋白酶的成熟型蛋白质区域的三维结构的形成的多核苷酸。
[4]根据[2]所述的方法,其中,优选所述编码M23A家族蛋白酶的前蛋白的多核苷酸为以下的多核苷酸:
由与序列号2的核苷酸序列具有至少80%同一性的核苷酸序列构成,且在相当于序列号2的523~1062号核苷酸区域的区域具有编码所述M23A家族蛋白酶的核苷酸序列的多核苷酸;
具有序列号2的1~522号核苷酸区域的序列或与该序列具有至少80%同一性且编码M23A亚族蛋白酶的前区的序列、及连接于其下游的编码所述M23A家族蛋白酶的序列的多核苷酸;
由与序列号3的核苷酸序列具有至少80%同一性的核苷酸序列构成,且在相当于序列号3的595~1134号核苷酸区域的区域具有编码所述M23A家族蛋白酶的核苷酸序列的多核苷酸;
具有序列号3的1~594号核苷酸区域的序列或与该序列具有至少80%同一性且编码M23A亚族蛋白酶的分泌信号及前区的序列、及连接于其下游的编码所述M23A家族蛋白酶的序列的多核苷酸;
由与序列号5的核苷酸序列具有至少80%同一性的核苷酸序列构成,并且在相当于序列号5的616~1164号核苷酸区域的区域具有编码所述M23A家族蛋白酶的核苷酸序列的多核苷酸;
具有序列号5的1~615号核苷酸区域的序列或与该序列具有至少80%同一性且编码M23A亚族蛋白酶的前区的序列、及连接于其下游的编码所述M23A家族蛋白酶的序列的多核苷酸;
由与序列号6的核苷酸序列具有至少80%同一性的核苷酸序列构成,且在相当于序列号6的709~1257号核苷酸区域的区域具有编码所述M23A家族蛋白酶的核苷酸序列的多核苷酸;
具有序列号6的1~708号核苷酸区域的序列或与该序列具有至少80%同一性且编码M23A亚族蛋白酶的分泌信号及前区的序列、及连接于其下游的编码所述M23A家族蛋白酶的序列的多核苷酸;
由与序列号8的核苷酸序列具有至少80%同一性的核苷酸序列构成,且在相当于序列号8的565~1104号核苷酸区域的区域具有编码所述M23A家族蛋白酶的核苷酸序列的多核苷酸;
具有序列号8的1~564号核苷酸区域的序列或与该序列具有至少80%同一性且编码M23A亚族蛋白酶的前区的序列、及连接于其下游的编码所述M23A家族蛋白酶的序列的多核苷酸;
由与序列号9的核苷酸序列具有至少80%同一性的核苷酸序列构成,且在相当于序列号9的625~1164号核苷酸区域的区域具有编码所述M23A家族蛋白酶的核苷酸序列的多核苷酸;
具有序列号9的1~624号核苷酸区域的序列或与该序列具有至少80%同一性且编码M23A亚族蛋白酶的分泌信号及前区的序列、及连接于其下游的编码所述M23A家族蛋白酶的序列的多核苷酸;
由与序列号11的核苷酸序列具有至少80%同一性的核苷酸序列构成,且在相当于序列号11的529~1065号核苷酸区域的区域具有编码所述M23A家族蛋白酶的核苷酸序列的多核苷酸;
具有序列号11的1~528号核苷酸区域的序列或与该序列具有至少80%同一性且编码M23A亚族蛋白酶的前区的序列、及连接于其下游的编码所述M23A家族蛋白酶的序列的多核苷酸;
由与序列号12的核苷酸序列具有至少80%同一性的核苷酸序列构成,且在相当于序列号12的628~1164号核苷酸区域的区域具有编码所述M23A家族蛋白酶的核苷酸序列的多核苷酸;
具有序列号12的1~627号核苷酸区域的序列或与该序列具有至少80%同一性且编码M23A亚族蛋白酶的分泌信号及前区的序列、及连接于其下游的编码所述M23A家族蛋白酶的序列的多核苷酸;
由与序列号14的核苷酸序列具有至少80%同一性的核苷酸序列构成,且在相当于序列号14的550~1086号核苷酸区域的区域具有编码所述M23A家族蛋白酶的核苷酸序列的多核苷酸;
具有序列号14的1~549号核苷酸区域的序列或与该序列具有至少80%同一性且编码M23A亚族蛋白酶的前区的序列、及连接于其下游的编码所述M23A家族蛋白酶的序列的多核苷酸;
由与序列号15的核苷酸序列具有至少80%同一性的核苷酸序列构成,且在相当于序列号15的628~1164号核苷酸区域的区域具有编码所述M23A家族蛋白酶的核苷酸序列的多核苷酸;或者
具有序列号15的1~627号核苷酸区域的序列或与该序列具有至少80%同一性且编码M23A亚族蛋白酶的分泌信号及前区的序列、及连接于其下游的编码所述M23A家族蛋白酶的序列的多核苷酸。
[5]根据[1]~[4]中任一项所述的方法,其中,优选所述编码M23A家族蛋白酶的前蛋白的多核苷酸进一步包含分泌信号区。
[6]根据[5]所述的方法,其中,优选所述分泌信号区为来自芽孢杆菌属菌的分泌信号区。
[7]根据[1]~[6]中任一项所述的方法,其中,优选所述芽孢杆菌属菌为向细胞外分泌蛋白酶或伴随溶菌而释放蛋白酶的菌。
[8]根据[7]所述的方法,其中,优选所述芽孢杆菌属菌具有细胞外蛋白酶活性。
[9]根据[7]或[8]所述的方法,其中,优选所述蛋白酶为选自被aprE、epr、wprA、mpr、nprB、bpr、nprE、vpr、aprX及相当于这些的基因编码的细胞外蛋白酶中的至少一种。
[10]根据[1]~[9]中任一项所述的方法,其中,优选所述芽孢杆菌属菌为枯草芽孢杆菌或其突变株。
[11]根据[1]~[10]中任一项所述的方法,其中,优选进一步包括:从获得的培养物中回收M23A家族蛋白酶的步骤。
实施例
以下,使用实施例更具体地说明本发明。但是,本发明的技术范围并不限定于这些实施例。
将以下的实施例中使用的引物的序列示于表2中。
[表2]
引物名称 序列 序列编号
BLP_S237signal_F gaaggaaacactcgtatgaaaaaaatctcaaaagc 21
BLP_S237signal_R aactagtttaatagattagttcggtccaggattcac 22
vector-F tctattaaactagttatagggttatctaaagg 23
vector-sig-R acgagtgtttccttctgctgc 24
ΔBLPsig_F tgcagcatctgctcagggacatggattaa 25
ΔBLPsig_R tgagcagatgctgcaagagctgccggaa 26
BLPsig_F ttaggaggtaatatgatgaaaaaaatctcaaaagctggtctgg 27
BLPsig_R catattacctcctaaatatttttaaagtaattgaatc 28
Δpro_F ttgcagcatctccgaatggactgcttca 29
Δpro_R tcggagatgctgcaagagctgccggaa 30
ΔBLPsig2_F tctgctcagggacatggattaag 31
amyEsig(BLP)_F ttaggaggtaatatgatgtttgcaaaacgattcaaaacctctttactg 32
amyEsig(BLP)_R atgtccctgagcagaagcactcgcagccgccggt 33
BLP_FLAG_F acaaagatgatgatgataaataatctattaaactagttatagggttatctaaagg 34
BLP_FLAG_R catcatcatctttgtaatcgttcggtccaggattcac 35
LasA_F gcagctcttgcagcacatgatgatggcctg 36
LasA_CR tagtttaatagattagtggtggtggtggtgcagagccagtcccgg 37
pHY_just_F taatctattaaactagttatagggttatctaaagg 38
pHY_just_R_NEW tgctgcaagagctgccggaaa 39
LasA_Chis_n_R cagagccagtcccggattatac 40
AhP_F ttaggaggtaatatgatgtctcgtccgatcc 41
AhP_R aactagtttaatagattagtcgattccgtt 42
vector-R catattacctcctaaatatttttaaagtaattg 43
LgBLP_F gcagctcttgcagcagcggaacgtggtctgagc 44
LgBLP_R tagtttaatagattagtgacccggattggtgaacc 45
LaBLP_F gcagctcttgcagcaggcggtcgtgatgcgaatg 46
LaBLP_R tagtttaatagattacggattggtgaagtagccg 47
ΔS237N_fw tgcagcaatgaaaaaaatctcaaaagctggtctgg 48
ΔS237N_rv tttttcattgctgcaagagctgccggaa 49
2R_bacillus-Chis aactagtttaatagattagtggtggtggtggtggtcgattccgtt 50
实施例1:利用重组枯草芽孢杆菌生产BLP
(1-1)BLP表达质粒的构建
利用GenScript公司的人工基因合成服务,制备将BLP基因(序列号3)插入于质粒pUC57中的产物(BLP/pUC57)。以BLP/pUC57为模板,使用引物对BLP_S237signal_F/BLP_S237signal_R(序列号21及22)及PrimeSTAR Max Premix(TaKaRa Bio公司)进行PCR。以WO2006/068148A1的实施例7中记载的质粒pHY-S237为模板,使用引物对vector-F/vector-sig-R(序列号23及24),同样地进行PCR。利用DpnI(New England Biolabs公司)对PCR产物分别进行DpnI处理。使用获得的片段,按照In-Fusion、HD Cloning kit(Clontech公司)的工序进行In-Fusion反应。将In-Fusion反应液转化至ECOSTM Competent E.coli DH5α(NIPPON GENE CO.,LTD.,310-06236)中,从而构建质粒(pHY-BLP)。
(A)pHY-BLP2
以pHY-BLP为模板,使用引物对ΔBLPsig_F/ΔBLPsig_R(序列号25及26)进行PCR。将PCR产物转化至E.coli HST08 Premium Competent Cells(TaKaRa Bio公司),从而构建质粒(pHY-BLP2)。pHY-BLP2是由BLP基因表达用序列和pHY300PLK载体序列构成,其中,BLP基因表达用序列是由S237启动子序列(序列号16)、S237分泌信号序列(序列号18)、编码BLP前蛋白(前区+成熟体)的序列、S237终止子序列依次连接而成。
(B)pHY-BLP3
以pHY-BLP为模板,使用引物对BLPsig_F/BLPsig_R(序列号27及28)进行PCR。将PCR产物转化至E.coli HST08 Premium Competent Cells(TaKaRa Bio公司),从而构建质粒(pHY-BLP3)。pHY-BLP3是由BLP基因表达用序列和pHY300PLK载体序列构成,其中,BLP基因表达用序列是由S237启动子序列(序列号16)、编码BLP前原蛋白(分泌信号+前区+成熟体)的序列、S237终止子序列依次连接而成。
(C)pHY-BLP4
以pHY-BLP2为模板,使用引物对Δpro_F/Δpro_R(序列号29及30)进行PCR。将PCR产物转化至E.coli HST08 Premium Competent Cells(TaKaRa Bio公司),从而构建质粒(pHY-BLP4)。pHY-BLP4是由BLP基因表达用序列和pHY300PLK载体序列构成,其中,BLP基因表达用序列是由S237启动子序列(序列号16)、S237分泌信号序列(序列号18)、编码BLP成熟蛋白质的序列、S237终止子序列依次连接而成。
(D)pHY-BLP5
以pHY-BLP为模板,使用引物对ΔBLPsig2_F/BLPsig_R(序列号31及28)进行PCR。以枯草芽孢杆菌168株(Bacillus subtilis Marburg No.168株:《自然》(Nature),1997,390,p.249)基因组DNA为模板,使用引物对amyEsig(BLP)_F/amyEsig(BLP)_R(序列号32及33),同样地进行PCR。使用所获得的片段进行In-Fusion反应,从而构建质粒(pHY-BLP5)。pHY-BLP5是由BLP基因表达用序列和pHY300PLK载体序列构成,其中,BLP基因表达用序列是由S237启动子序列(序列号16)、amyE分泌信号序列(序列号20)、编码BLP前蛋白(前区+成熟体)的序列、S237终止子序列依次连接而成。
(1-2)重组枯草芽孢杆菌的制作
使用枯草芽孢杆菌168株作为宿主。通过以下的方法将(1-1)中获得的BLP表达质粒pHY-BLP2~5及空载体pHY300PLK(TaKaRa Bio公司)分别导入到宿主中。向1mL的LB培养基中接种枯草芽孢杆菌168株,在30℃、200spm下震荡培养一晩。将获得的培养液10μL接种于1mL的新的LB培养基中,在37℃、200spm下培养3小时。对培养液进行离心分离,回收颗粒物。向颗粒物中添加包含4mg/mL的溶菌酶(SIGMA公司)的SMMP(0.5M蔗糖、20mM马来酸二钠、20mM氯化镁六水合物、35%(w/v)抗生素培养基3号(Antibiotic medium 3,Difco公司))500μL,并在37℃下孵育1小时。接着,通过离心分离回收颗粒物,并悬浮于400μL的SMMP。将悬浮液33μL、各质粒20ng混合,再加入100μL的40%(w/v)PEG并搅拌,进一步加入350μL的SMMP之后,在30℃下震荡1小时。将获得的液200μL涂抹在包含四环素(15μg/mL,SIGMA公司)的DM3再生琼脂培养基(其中包含:0.8%琼脂(和光纯药)、0.5%琥珀酸二钠六水合物、0.5%酪蛋白氨基酸(Casamino Acids,工业级(Technical),Difco公司)、0.5%酵母抽提物、0.35%磷酸一钾、0.15%磷酸二钾、0.5%葡萄糖、0.4%氯化镁六水合物、0.01%牛血清白蛋白(SIGMA公司)、0.5%羧甲基纤维素、0.005%台盼蓝(trypan blue,Merck公司)及氨基酸混合液(色氨酸、赖氨酸、蛋氨酸各10μg/mL);%表示(w/v)%)上,在30℃下孵育3天,从而获得所形成的菌落。
(1-3)重组枯草芽孢杆菌的培养及培养上清的获得
向以最终浓度为15ppm的方式添加有四环素的LB培养基1mL中接种(1-2)中获得的重组枯草芽孢杆菌菌落,然后,在30℃、150spm下培养一晩。第二天,将培养液400μL接种于2×L-麦芽糖培养基(其中包含:2%胰蛋白胨、1%酵母抽提物、1%NaCl、7.5%麦芽糖、7.5ppm硫酸锰五水合物、21μM ZnSO4、15ppm四环素;%表示(w/v)%)5mL中,在30℃、150spm下培养2天后,通过离心分离回收培养上清。
(1-4)培养上清中的酶活性的测定
作为底物,使用荧光基团Nma与淬火基团Lys(Dpn)之间为五甘氨酸的FRET底物[以下称为FRET-GGGGG](由PH日本公司接单生产)。在此,Nma是指2-(N-甲基氨基)苄基(Nma)。另外,Lys(Dpn)是指在赖氨酸(Lys)的侧链上具有2,4-二硝基苯基(Dnp)的物质。在96孔检测板(AGCTECHNO GALSS公司,3881-096)中添加(1-3)中获得的培养上清(适当稀释)2μL、20mM Tris-HCl(pH7.5)200μL,再添加FRET-GGGGG溶液(1mM FRET-GGGGG,100mM Tris-HCl(pH7.5))10μL,从而制备反应液。使用infinite M200(TECAN公司),在温度30℃、激励波长340nm、测定波长440nm下经时地测定反应液的荧光强度。在相同反应条件下,测定反应液(该反应液使用20mM Tris-HCl(pH7.5)代替酶溶液,使用FRETS-25-STD1及FRETS-25-STD2(株式会社肽研究所)的等摩尔溶液代替FRET-GGGGG)的荧光强度,并制作校正曲线。将1单位(U)的活性定义为如下:在将包含1μmol FRETS-25-STD1及1μmol FRETS-25-STD2的溶液的荧光强度设为X时,显示X/min的荧光强度的变化所需的酶量。求得培养上清的FRET-GGGGG分解活性(U/mL)。
将测定的结果示于图1中。在导入有空载体的重组株的培养上清中,未检测到FRET-GGGGG分解活性,但在导入有编码BLP前蛋白的质粒(pHY-BLP2、3、5)的重组株的培养上清中,检测到了FRET-GGGGG分解活性。由此显示:在导入有编码BLP前蛋白的多核苷酸的重组枯草芽孢杆菌的培养上清中,存在具有甘氨酸-甘氨酸键的分解活性的酶。另外,与导入有包含BLP的本来的分泌信号的质粒(pHY-BLP3)的重组株相比,在导入有包含S237分泌信号的质粒(pHY-BLP2)及包含amyE分泌信号的质粒(pHY-BLP5)的重组株中,培养上清的FRET-GGGGG分解活性更高。由此显示:通过将在枯草芽孢杆菌中高效地起作用的分泌信号连接于前蛋白,提高了BLP的生产性。另外,在导入有不包含BLP的前区的质粒(pHY-BLP4)的重组株的培养上清中,未检测到FRET-GGGGG分解活性,由此显示:前区是BLP成熟体的生产中所必须的。
(1-5)SDS-PAGE
向(1-3)中获得的培养上清中混合最终浓度为2mM的苯甲基磺酰氟(Nacalaitesque公司)。将该混合液与添加有25mM的二硫苏糖醇(Thermo Fisher Scientific公司)的2×Laemmli Sample Buffer(Bio-Rad公司)以1:1混合,并在100℃下加热5分钟。将获得的溶液作为样品,使用Any kDTMMini-PROTEANTGXTM免染胶(Bio-Rad公司)进行SDS-PAGE。标志物使用Precision Plus ProteinTM未着色标准品(Bio-Rad公司)。
SDS-PAGE的结果显示:在导入有编码BLP前蛋白的质粒(pHY-BLP2、3)的重组枯草芽孢杆菌的培养上清中,在BLP成熟体(19.3kDa)的位置处检测到条带(图2)。
实施例2:细胞外蛋白酶对成熟BLP生产的影响
(2-1)BLP-FLAG表达质粒的构建
以(1-1)中获得的质粒pHY-BLP2为模板,使用引物对BLP_FLAG_F/BLP_FLAG_R(序列号34及35)及PrimeSTAR Max Premix(TaKaRa Bio公司)进行PCR。利用DpnI(NewEngland Biolabs公司)对PCR产物进行DpnI处理,将反应液转化至ECOSTM CompetentE.coli DH5α(NIPPON GENE CO.,LTD.,310-06236),从而构建质粒(pHY-BLP-FLAG)。质粒HY-BLP-FLAG是由BLP-FLAG基因表达用序列和pHY300PLK载体序列构成,其中,BLP-FLAG基因表达用序列是由S237启动子序列(序列号16)、S237分泌信号序列(序列号18)、C端追加有FLAG(注册商标)标签(DYKDDDDK的氨基酸序列)的编码BLP前蛋白的序列、S237终止子序列依次连接而成。
(2-2)重组枯草芽孢杆菌的制作及培养上清的获得
作为宿主,使用枯草芽孢杆菌168株、及缺失9种细胞外蛋白酶基因(aprE、epr、wprA、mpr、nprB、bpr、nprE、vpr及aprX)的枯草芽孢杆菌Dpr9株(日本特开2006-174707号公报的实施例1~5中制作的Kao9株)。通过与(1-2)相同的流程将(2-1)中获得的质粒pHY-BLP-FLAG及空载体pHY300PLK(TaKaRa Bio公司)分别导入宿主中,获得重组枯草芽孢杆菌的菌落。对于获得的重组枯草芽孢杆菌菌落,通过与(1-3)相同的流程进行培养,得到培养上清。
(2-3)培养上清中的酶活性的测定及蛋白质印迹
通过与(1-4)相同的流程测定(2-2)中获得的培养上清的酶活性。另外,使用(2-2)中获得的培养上清,通过与(1-5)相同的流程进行SDS-PAGE。使用Trans-Blot TurboTM系统(Bio-Rad公司)和Trans-Blot TurboTM Mini PVDF转录包(Bio-Rad公司)将SDS-PAGE后的凝胶转录至PVDF膜。使用iBind Western System(Life Technologies公司)使转录后的薄膜与HRP标记抗DYKDDDDK抗体(CST)进行反应,然后,使用ImmunoStarTMZeta(富士薄膜和光纯药)检测目标蛋白质。
酶活性的测定的结果如下:在168株重组体中检测到了FRET-GGGGG分解活性,但在缺失细胞外蛋白酶的Dpr9株的重组体中,未检测到FRET-GGGGG分解活性(图3)。另外,免疫印迹的结果显示:在168株的重组体中,在BLP成熟体(19.3kDa)的位置处检测到了条带;在Dpr9株的重组体中,在BLP前蛋白(38.1kDa)的位置处检测到了条带(图4)。这些结果显示:培养物中的细胞外蛋白酶在活性型BLP成熟体的生产中承担了重要的作用,特别是作用于BLP的成熟化。
另一方面,针对9株的蛋白酶缺失株(Δepr株、ΔwprA株、Δmpr株、ΔnprB株、Δbpr株、ΔnprE株、Δvpr株、ΔaprE株、及ΔaprX株),从全部株的重组体的培养上清中测定到了FRET-GGGGG分解活性。其中,8株的活性相对于168株为80%以上。剩余1株也相对于168株具有50%以上的FRET-GGGGG分解活性。这些结果及上述Dpr9株的结果表明:细胞外蛋白酶有助于活性型BLP成熟体的生产。
实施例3:利用重组枯草芽孢杆菌生产各种M23A亚族蛋白酶-1
(3-1)LasA表达质粒的构建
利用GenScript公司的人工基因合成服务,制备将LasA基因(序列号6)插入于质粒pUC57中的产物(LasA/pUC57)。以LasA/pUC57为模板,使用引物对LasA_F/LasA_CR(序列号36及37),按照PrimeSTAR Max Premix(TaKaRa Bio公司)的工序进行PCR。以pHY-S237(WO2006/068148A1)为模板,使用引物对pHY_just_F/pHY_just_R_NEW(序列号38及39),同样地进行PCR。利用DpnI(New England Biolabs公司)对各个PCR产物进行DpnI处理。使用获得的片段,按照In-Fusion、HD Cloning kit(Clontech公司)的工序进行In-Fusion反应。将反应液转化至E.coli HST08 Premium Competent Cells(TaKaRa Bio公司),从而构建质粒(pHY-LasA)。以pHY-LasA为模板,使用引物对pHY_just_F/LasA_Chis_n_R(序列号38及40)及KOD-Plus-Mutagenesis Kit(TOYOBO公司)进行PCR、DpnI消化及连接(ligation)。将反应液转化至E.coli HST08 Premium Competent Cells(TaKaRa Bio公司),从而构建质粒(pHY-LasA2)。pHY-LasA2是由LasA基因表达用序列和pHY300PLK载体序列构成,其中,LasA基因表达用序列是由S237启动子序列(序列号16)、S237分泌信号序列(序列号18)、编码LasA前蛋白(前区+成熟体)的序列、S237终止子序列依次连接而成。
(3-2)AhP表达质粒的构建
利用GenScript公司的人工基因合成服务,制备将AhP基因(序列号9)插入于质粒pUC57中的产物(AhP/pUC57)。以AhP/pUC57为模板,使用引物对AhP_F/AhP_R(序列号41及42),按照PrimeSTAR Max Premix(TaKaRa Bio公司)的工序进行PCR。以pHY-S237(WO2006/068148A1)为模板,使用引物对vector-F/vector-R(序列号23及43),同样地进行PCR。利用DpnI(New England Biolabs公司)对各个PCR产物进行DpnI处理。使用所获得的片段,按照In-Fusion、HD Cloning kit(Clontech)的工序进行In-Fusion反应。将反应液转化至E.coli HST08 Premium Competent Cells(TaKaRa Bio公司),从而构建质粒(pHY-AhP)。pHY-AhP是由AhP基因表达用序列和pHY300PLK载体序列构成,其中,AhP基因表达用序列是由S237启动子序列(序列号16)、AhP分泌信号序列、编码AhP前蛋白(前区+成熟体)的序列、S237终止子序列依次连接而成。
(3-3)LgBLP表达质粒的构建
利用GenScript公司的人工基因合成服务,制备将来自胶状溶杆菌(Lysobactergummosus)的BLP同源物(WP_057941690.1,以下也称为LgBLP)的基因(LgBLP基因、序列号11)插入于质粒pUC57的产物(LgBLP/pUC57)。以LgBLP/pUC57为模板,使用引物对LgBLP_F/LgBLP_R(序列号44及45),按照PrimeSTAR Max Premix(TaKaRa Bio公司)的工序进行PCR。以pHY-S237(WO2006/068148A1)为模板,使用引物对pHY_just_F/pHY_just_R_NEW(序列号38及39),同样地进行PCR。利用DpnI(New England Biolabs公司)对各自的PCR产物进行DpnI处理。使用获得的片段,按照In-Fusion、HD Cloning kit(Clontech)的工序进行In-Fusion反应。将反应液转化至E.coli HST08 Premium Competent Cells(TaKaRa Bio公司),从而构建质粒(pHY-LgBLP)。pHY-LgBLP是由LgBLP基因表达用序列和pHY300PLK载体序列构成,其中,LgBLP基因表达用序列是由S237启动子序列(序列号16)、S237分泌信号序列(序列号18)、编码LgBLP前蛋白(前区+成熟体)的序列、S237终止子序列依次连接而成。
(3-4)LaBLP表达质粒的构建
利用GenScript公司的人工基因合成服务,制备将来自抗生素溶杆菌(Lysobacterantibioticus)的BLP同源物(WP_057970430.1,以下也称为LaBLP)的基因(LaBLP基因、序列号14)插入于质粒pUC57的产物(LaBLP/pUC57)。以LaBLP/pUC57为模板,使用引物对LaBLP_F/LaBLP_R(序列号46及47),按照PrimeSTAR Max Premix(TaKaRa Bio公司)的工序进行PCR。以pHY-S237(WO2006/068148A1)为模板,使用引物对pHY_just_F/pHY_just_R_NEW(序列号38及39),同样地进行PCR。利用DpnI(New England Biolabs公司)对各个PCR产物进行DpnI处理。使用获得的片段,按照In-Fusion、HD Cloning kit(Clontech公司)的工序进行In-Fusion反应。将反应液转化至E.coli HST08 Premium CompetentCells(TaKaRa Bio公司),从而构建质粒(pHY-LaBLP)。pHY-LaBLP是由LaBLP基因表达用序列和pHY300PLK载体序列构成,其中,LaBLP基因表达用序列是由S237启动子序列(序列号16)、S237分泌信号序列(序列号18)、编码LaBLP前蛋白(前区+成熟体)的序列、S237终止子序列依次连接而成。
(3-5)重组枯草芽孢杆菌的制作
作为宿主使用枯草芽孢杆菌168株。通过与(1-2)相同的流程将(3-1)~(3-4)中获得的各质粒及空载体pHY300PLK(TaKaRa Bio公司)分别导入于宿主中,从而获得重组枯草芽孢杆菌的菌落。
(3-6)重组枯草芽孢杆菌的培养及培养上清的获得
通过与(1-3)相同的流程培养(3-5)中获得的重组枯草芽孢杆菌菌落,得到培养上清。
(3-7)培养上清的酶活性的测定
通过与(1-4)相同的流程测定(3-6)中获得的培养上清的酶活性。需要说明的是,在LasA活性的测定中使用的是将空载体导入株及LasA表达质粒导入株的培养上清用Amicon Ultra 10K(Merck Millipore公司)浓缩至20倍而得到的产物。测定结果显示:对于全部的M23A亚族蛋白酶,在导入有编码前蛋白的多核苷酸的重组枯草芽孢杆菌的培养上清中,检测到了比空载体导入枯草芽孢杆菌的培养上清更高的FRET-GGGGG分解活性(图5)。
实施例4:利用重组枯草芽孢杆菌生产各种M23A亚族蛋白酶-2
(4-1)包含BLP的培养上清的制备
(4-1-1)表达载体的制作
利用GenScript公司的人工基因合成服务,制备将BLP基因(序列号3)插入于质粒pUC57中的产物(BLP/pUC57)。以BLP/pUC57为模板,使用引物对BLP_S237signal_F/BLP_S237signal_R(序列号21及22)及PrimeSTAR Max Premix(TaKaRa Bio公司)进行PCR反应。以WO2006/068148 A1的实施例7中记载的质粒pHY-S237为模板,使用引物对vector-F/vector-sig-R(序列号23及24),同样地进行PCR反应。利用DpnI(New England Biolabs公司)对各个PCR产物进行DpnI处理。接着,按照In-Fusion、HD Cloning kit(Clontech公司)的工序进行In-Fusion反应。
使用In-Fusion反应液转化ECOSTMCompetent E.coli DH5α(NIPPON GENE CO.,LTD.,310-06236)。将转化处理后的细胞涂抹在含有氨苄西林的LB板上,并在37℃下培养一晩。将板上所形成的菌落接种于包含氨苄西林的LB培养基中,培养一晩后,回收菌体并使用高纯质粒分离试剂盒(High Pure Plasmid Isolation Kit,Roche公司)提取质粒(BLP/pHY)。以提取的BLP/pHY为模板,使用引物对ΔS237N_fw/ΔS237N_rv(序列号48及49)进行PCR反应。将该PCR产物转化至E.coli HST08 Premium Competent Cells(TaKaRa Bio公司)。将转化处理后的细胞涂抹于包含氨苄西林的LB板上,并在37℃下培养一晩。将板上所形成的菌落接种于包含氨苄西林的LB培养基中,培养一晩后,回收菌体并使用高纯质粒分离试剂盒(High Pure Plasmid Isolation Kit,Roche公司)提取质粒(BLP2/pHY)。
(4-1-2)酶生产转化株的制作
在1mL的LB培养基上接种枯草芽孢杆菌168株(Bacillus subtilis MarburgNo.168株:《自然》(Nature),390,1997,p.249),在30℃、200rpm下震荡培养一晩。在1mL的新的LB培养基上接种该培养液10μL,在37℃、200rpm下培养3小时。离心分离该培养液,回收颗粒物。向颗粒物中添加包含4mg/mL的溶菌酶(SIGMA公司)的SMMP[0.5M蔗糖、20mM马来酸二钠、20mM氯化镁六水合物、35%(w/v)抗生素培养基3号(Antibiotic Medium 3,Difco公司)]500μL,并在37℃下孵育1小时。接着,通过离心分离回收颗粒物,并悬浮于400μL的SMMP。将悬浮液13μL、(4-1-1)中获得的质粒BLP2/pHY溶液(10mM Tris-HCl,pH8.5,34.2ng/μL)2μL、SMMP20μL混合,再加入100μL的40%PEG并搅拌,进一步加入SMMP 350μL之后,在30℃下震荡1小时。将该液体200μL涂抹在包含四环素(15μg/mL,SIGMA)的DM3再生琼脂培养基[其中包含:0.8%琼脂(和光纯药)、0.5%琥珀酸二钠六水合物、0.5%酪蛋白氨基酸(Casamino Acids,工业级(Technical),Difco公司)、0.5%酵母抽提物、0.35%磷酸一钾、0.15%磷酸二钾、0.5%葡萄糖、0.4%氯化镁六水合物、0.01%牛血清白蛋白(SIGMA公司)、0.5%羧甲基纤维素、0.005%台盼蓝(trypan blue,Merck公司)及氨基酸混合液(色氨酸、赖氨酸、蛋氨酸各10μg/mL);%表示(w/v)%]上,在30℃下孵育3天,从而获得所形成的菌落。
(4-1-3)利用转化株制造酶
向LB培养基中以最终浓度成为15ppm的方式添加四环素。向该培养基5mL中接种(4-1-2)中获得的枯草芽孢杆菌转化体菌落,然后,在30℃、250rpm下培养一晩。第二天,将该培养液400μL接种于2×L-麦芽糖培养基(2%胰蛋白胨、1%酵母抽提物、1%NaCl、7.5%麦芽糖、7.5ppm硫酸锰五水合物、15ppm四环素、6ppm硫酸锌七水合物;%表示(w/v)%)20mL,在32℃、230rpm下培养2天后,通过离心分离回收包含由菌体产生的酶的培养上清。
(4-2)包含LasA的培养上清的制备
利用GenScript公司的人工基因合成服务,制备将LasA基因(序列号6)插入于质粒pUC57中的产物(LasA/pUC57)。以LasA/pUC57为模板,使用引物对LasA_F/LasA_CR(序列号36及37),按照PrimeSTAR Max Premix(TaKaRa Bio公司)的工序进行PCR反应。以WO2006/068148 A1的实施例7中记载的质粒pHY-S237为模板,使用引物对pHY_just_F/pHY_just_R_NEW(序列号38及39),同样地进行PCR反应。利用DpnI(New England Biolabs公司)对各个PCR产物进行DpnI处理。接着,按照In-Fusion,HD Cloning kit(Clontech公司)的工序进行In-Fusion反应,从而得到质粒(LasA/pHY)溶液。
使用获得的质粒(LasA/pHY)溶液,通过与上述(4-1-2)相同的流程进行枯草芽孢杆菌prsA基因表达强化株(日本特开2007-49986号公报的实施例1中制作的prsA-Kc株)的转化,从而获得枯草芽孢杆菌转化体菌落。向2×L液体培养基中以最终浓度成为15ppm的方式添加四环素。向该培养基5mL中接种枯草芽孢杆菌转化体菌落之后,在30℃、250rpm下培养一晩。从培养液中回收颗粒物,从颗粒物中提取质粒LasA/pHY。以所提取的质粒LasA/pHY为模板,使用引物对pHY_just_F/LasA_Chis_n_R(序列号38及40)、以及KOD-Plus-Mutagenesis Kit(TOYOBO公司),进行PCR反应、利用Dpn I的质粒消化、及连接,从而得到质粒(LasA2/pHY)。
使用获得的质粒(LasA2/pHY),通过与上述(4-1-2)相同的方法进行转化。此时,使用枯草芽孢杆菌prsA基因表达强化株(日本特开2007-49986号公报的实施例1中制作的prsA-Kc株)作为宿主。接着,对于所获得的转化株通过与(4-1-3)相同的流程进行培养,回收包含由菌体产生的酶的培养上清。
(4-3)包含AhP的培养上清的制备
利用GenScript公司的人工基因合成服务,制备将AhP基因(序列号9)插入于质粒pUC57中的产物(AhP/pUC57)。以AhP/pUC57为模板,使用引物对AhP_F/2R_bacillus-Chis(序列号41及50),按照PrimeSTAR Max Premix(TaKaRa Bio公司)的工序进行PCR反应。以WO2006/068148 A1的实施例7中记载的质粒pHY-S237为模板,使用引物对vector-F/vector-R(序列号23及43),同样地进行PCR反应。利用DpnI(New England Biolabs公司)对每个PCR产物进行DpnI处理。接着,按照In-Fusion,HD Cloning kit(Clontech公司)的工序进行In-Fusion反应,从而得到质粒(AhP/pHY)溶液。
使用获得的质粒(AhP/pHY),通过与上述(4-1-2)相同的方法进行转化。此时,使用枯草芽孢杆菌168株作为宿主。接着,对于获得的转化株通过与(4-1-3)相同的流程进行培养,回收包含由菌体产生的酶的培养上清。
(4-4)由培养上清制备蛋白酶
由(4-1)~(4-3)中获得的培养上清制备目标蛋白酶。使用Amicon Ultra截留分子量10K(Merck Millipore公司),通过BufferA对培养上清进行缓冲液交换。使用AKTAexplorer 10S(GE Healthcare公司)由缓冲液交换後的液体制备酶。首先,将通过该缓冲液交换所得到的液体通入柱子1,接着,使用BufferB使柱子1的吸附成分洗脱。从洗脱截留中回收确认到FRET-GGGGG的分解活性的截留液。接下来,通过使用20mM Tris-HCl(pH7.5)、200mM NaCl的溶液平衡后的柱子2对所回收的截留液进行体积排阻色谱(Size ExclusionChromatography),并回收确认到FRET-GGGGG的分解活性的截留液。使用Amicon Ultra截留分子量10K,通过20mM Tris-HCl(pH7.5)溶液对所回收的截留液进行缓冲液交换,得到包含目标蛋白酶的酶溶液。用于各培养上清的BufferA、BufferB、柱子1、及柱子2如表3所述。
[表3]
实施例5:枯草芽孢杆菌细胞外蛋白酶活性的测定
(5-1)枯草芽孢杆菌的培养及培养上清的获得
将枯草芽孢杆菌168株、9株的细胞外蛋白酶缺失株(Δepr株、ΔwprA株、Δmpr株、ΔnprB株、Δbpr株、ΔnprE株、Δvpr株、ΔaprE株、及ΔaprX株)及Dpr9株分别接种于LB培养基1mL,然后,在30℃、150spm下培养一晩。第二天,将培养液400μL接种于2×L-麦芽糖培养基(2%胰蛋白胨、1%酵母抽提物、1%NaCl、7.5%麦芽糖、7.5ppm硫酸锰五水合物、21μMZnSO4;%表示(w/v)%)5mL,在30℃、150spm下培养2天后,通过离心分离回收培养上清。
(5-2)培养上清的偶氮酪蛋白分解活性的测定
使用偶氮酪蛋白(SIGMA公司)作为测定培养上清中所含的蛋白酶的活性的底物。向底物溶液(1%(w/v)偶氮酪蛋白、50mM Tris-HCl(pH7.5))中添加(5-1)中获得的培养上清50μL,并在37℃下使其反应18小时。添加5%三氯乙酸水溶液2mL淬灭反应,在15000rpm、4℃下离心5分钟。适当稀释上清后,使用光路长度为1cm的比色杯测定340nm的吸光度。颠倒培养上清和5%三氯乙酸水溶液的添加顺序,并将其作为对照组。将检测到的吸光度与对照组相比统计学上显著地(t检验,p<0.05)增加的培养上清,判定为具有偶氮酪蛋白分解活性。测定的结果显示:在168株及9株的细胞外蛋白酶缺失株(Δepr株、ΔwprA株、Δmpr株、ΔnprB株、Δbpr株、ΔnprE株、Δvpr株、ΔaprE株、及ΔaprX株)的培养上清中,检测到了偶氮酪蛋白分解活性;另一方面,在Dpr9株的培养上清中,未检测到(检测限界以下)。该结果与每株的活性型BLP生产能力一致(表4)。
[表4]
培养上清的偶氮酪蛋白分解活性 活性型BLP生产能力
168 + +
Δepr + +
ΔwprA + +
Δmpr + +
ΔnprB + +
Δbpr + +
ΔnprE + +
Δvpr + +
ΔaprE + +
ΔaprX + +
Dpr9 - -
实施例6:与天然BLP生产菌的BLP生产性的比较
(6-1)BLP生产菌的培养及培养上清的获得
目前为止,作为生产活性型BLP的方法,得到验证的只有培养单独分离的天然BLP生产菌的方法。在本实施例中,使天然BLP生产菌生产BLP,并将其生产性与实施例1的BLP生产性重组枯草芽孢杆菌进行比较。
将天然BLP生产菌水解无色杆菌(Achromobacter lyticus)M497-1株接种于LB培养基1mL之后,在30℃、150spm下培养一晩。第二天,将培养液400μL接种于2×L-麦芽糖培养基(2%胰蛋白胨、1%酵母抽提物、1%NaCl、7.5%麦芽糖、7.5ppm硫酸锰五水合物、21μMZnSO4;%表示(w/v)%)5mL,在30℃、150spm下培养2天后,通过离心分离回收培养上清。
(6-2)培养上清的酶活性的测定
通过与(1-4)相同的流程测定(6-1)中获得的培养上清的酶活性。测定的结果显示,从水解无色杆菌(Achromobacter lyticus)M497-1株的培养上清中检测到了14U/mL的FRET-GGGGG分解活性。这一值远远小于实施例1的成熟BLP表达重组枯草芽孢杆菌的活性(图1,分别为43、594及613U/mL)。需要说明的是,迄今为止的报道中最高效地生产BLP的菌株为非专利文献3中记载的溶杆菌属(Lysobacter sp.)IB-9374株。但是,其生产性是水解无色杆菌(Achromobacter lyticus)M497-1株的2.4倍,远远不及实施例1的重组枯草芽孢杆菌的BLP生产性。综上可知:本发明不仅在异源表达上相比现有技术具有很大优势,它还是一种在其生产性方面也相比现有技术具有很大优势的技术。
以上,对本发明的实施方式进行了说明,但是需要注意的是:它们不是旨在将本发明限定于所说明的特定实施方式。本领域技术人员能够理解属于本发明的范围内的各种其它的变更及修改。本说明书中引用的文献及专利申请作为参考引用,与完全记载于本说明书中相同。
序列表
<110> 花王株式会社
<120> M23A家族蛋白酶的制造方法
<130> KS1612
<150> JP 2018-005193
<151> 2018/01/16
<150> JP 2018-005194
<151> 2018/01/16
<150> JP 2018-219142
<151> 2018/11/22
<160> 50
<170> PatentIn version 3.5
<210> 1
<211> 179
<212> PRT
<213> 水解无色杆菌(Achromobacter lyticus)
<220>
<223> β-裂解金属肽酶(BLP)成熟蛋白质
<400> 1
Ser Pro Asn Gly Leu Leu Gln Phe Pro Phe Pro Arg Gly Ala Ser Trp
1 5 10 15
His Val Gly Gly Ala His Thr Asn Thr Gly Ser Gly Asn Tyr Pro Met
20 25 30
Ser Ser Leu Asp Met Ser Arg Gly Gly Gly Trp Gly Ser Asn Gln Asn
35 40 45
Gly Asn Trp Val Ser Ala Ser Ala Ala Gly Ser Phe Lys Arg His Ser
50 55 60
Ser Cys Phe Ala Glu Ile Val His Thr Gly Gly Trp Ser Thr Thr Tyr
65 70 75 80
Tyr His Leu Met Asn Ile Gln Tyr Asn Thr Gly Ala Asn Val Ser Met
85 90 95
Asn Thr Ala Ile Ala Asn Pro Ala Asn Thr Gln Ala Gln Ala Leu Cys
100 105 110
Asn Gly Gly Gln Ser Thr Gly Pro His Glu His Trp Ser Leu Lys Gln
115 120 125
Asn Gly Ser Phe Tyr His Leu Asn Gly Thr Tyr Leu Ser Gly Tyr Arg
130 135 140
Ile Thr Ala Thr Gly Ser Ser Tyr Asp Thr Asn Cys Ser Arg Phe Tyr
145 150 155 160
Leu Thr Lys Asn Gly Gln Asn Tyr Cys Tyr Gly Tyr Tyr Val Asn Pro
165 170 175
Gly Pro Asn
<210> 2
<211> 1062
<212> DNA
<213> 水解无色杆菌(Achromobacter lyticus)
<400> 2
tctgctcagg gacatggatt aagcggcgaa gatctggttt actcttacga tgaaatgttt 60
gattttgata tcgatgccta cctggcaaaa catgcgccgc atctgcataa acatagcgaa 120
gaaatctctc attgggccgg atattctggc atttcaccga aagttcttat cgcattaatg 180
gaacaacagt caggagctgt gagcgccaaa agagcaacaa atcgcccgtt tggcaaactt 240
gccagagcag atggatttgg cgcccaaaca cgcgaagtgg cgttagctct gagagaatct 300
ctttatgaac gcgatccgga tggagccaaa ggcccggtca cattagccag agcaaacccg 360
ctgcaggcac tttttgaacg ctcaggagat aatgaaccgg cagcggcttt aagaggagat 420
ggcgaatttc aacttgtcta cggcagatta tttaacgaac cgcgccaggc aaaagccgca 480
agcgatagat ttgcgaaagc tggaccggat gttcaaccgt tatctccgaa tggactgctt 540
cagtttccgt ttccgagagg cgcatcttgg catgtgggcg gagctcatac aaacacagga 600
tcaggcaatt atccgatgtc aagcctggat atgtcaagag gcggaggctg gggaagcaat 660
caaaacggca attgggtttc agcgagcgcg gctggatctt ttaaacgcca ttcttcatgc 720
tttgctgaaa ttgttcatac aggcggctgg tcaacaacat actaccatct gatgaacatc 780
cagtacaata caggcgcgaa cgttagcatg aatacagcca tcgcaaaccc ggctaataca 840
caagcgcagg ctctgtgcaa cggaggccaa agcacaggac cgcatgaaca ttggtcactg 900
aaacagaacg gctcatttta ccatctgaac ggaacatacc tttcaggcta tagaatcaca 960
gcgacaggca gctcttatga tacaaattgt agccgctttt atttgacaaa aaatggacag 1020
aactactgct atggttatta tgtgaatcct ggaccgaact aa 1062
<210> 3
<211> 1134
<212> DNA
<213> 水解无色杆菌(Achromobacter lyticus)
<400> 3
atgaaaaaaa tctcaaaagc tggtctggga ctggctctgg tctgtgctct ggcgacgatt 60
ggaggcaacg catctgctca gggacatgga ttaagcggcg aagatctggt ttactcttac 120
gatgaaatgt ttgattttga tatcgatgcc tacctggcaa aacatgcgcc gcatctgcat 180
aaacatagcg aagaaatctc tcattgggcc ggatattctg gcatttcacc gaaagttctt 240
atcgcattaa tggaacaaca gtcaggagct gtgagcgcca aaagagcaac aaatcgcccg 300
tttggcaaac ttgccagagc agatggattt ggcgcccaaa cacgcgaagt ggcgttagct 360
ctgagagaat ctctttatga acgcgatccg gatggagcca aaggcccggt cacattagcc 420
agagcaaacc cgctgcaggc actttttgaa cgctcaggag ataatgaacc ggcagcggct 480
ttaagaggag atggcgaatt tcaacttgtc tacggcagat tatttaacga accgcgccag 540
gcaaaagccg caagcgatag atttgcgaaa gctggaccgg atgttcaacc gttatctccg 600
aatggactgc ttcagtttcc gtttccgaga ggcgcatctt ggcatgtggg cggagctcat 660
acaaacacag gatcaggcaa ttatccgatg tcaagcctgg atatgtcaag aggcggaggc 720
tggggaagca atcaaaacgg caattgggtt tcagcgagcg cggctggatc ttttaaacgc 780
cattcttcat gctttgctga aattgttcat acaggcggct ggtcaacaac atactaccat 840
ctgatgaaca tccagtacaa tacaggcgcg aacgttagca tgaatacagc catcgcaaac 900
ccggctaata cacaagcgca ggctctgtgc aacggaggcc aaagcacagg accgcatgaa 960
cattggtcac tgaaacagaa cggctcattt taccatctga acggaacata cctttcaggc 1020
tatagaatca cagcgacagg cagctcttat gatacaaatt gtagccgctt ttatttgaca 1080
aaaaatggac agaactactg ctatggttat tatgtgaatc ctggaccgaa ctaa 1134
<210> 4
<211> 182
<212> PRT
<213> 绿脓杆菌(Pseudomonas aeruginosa)
<220>
<223> Las A 蛋白质 (LAS) 成熟蛋白质
<400> 4
Ala Pro Pro Ser Asn Leu Met Gln Leu Pro Trp Arg Gln Gly Tyr Ser
1 5 10 15
Trp Gln Pro Asn Gly Ala His Ser Asn Thr Gly Ser Gly Tyr Pro Tyr
20 25 30
Ser Ser Phe Asp Ala Ser Tyr Asp Trp Pro Arg Trp Gly Ser Ala Thr
35 40 45
Tyr Ser Val Val Ala Ala His Ala Gly Thr Val Arg Val Leu Ser Arg
50 55 60
Cys Gln Val Arg Val Thr His Pro Ser Gly Trp Ala Thr Asn Tyr Tyr
65 70 75 80
His Met Asp Gln Ile Gln Val Ser Asn Gly Gln Gln Val Ser Ala Asp
85 90 95
Thr Lys Leu Gly Val Tyr Ala Gly Asn Ile Asn Thr Ala Leu Cys Glu
100 105 110
Gly Gly Ser Ser Thr Gly Pro His Leu His Phe Ser Leu Leu Tyr Asn
115 120 125
Gly Ala Phe Val Ser Leu Gln Gly Ala Ser Phe Gly Pro Tyr Arg Ile
130 135 140
Asn Val Gly Thr Ser Asn Tyr Asp Asn Asp Cys Arg Arg Tyr Tyr Phe
145 150 155 160
Tyr Asn Gln Ser Ala Gly Thr Thr His Cys Ala Phe Arg Pro Leu Tyr
165 170 175
Asn Pro Gly Leu Ala Leu
180
<210> 5
<211> 1164
<212> DNA
<213> 绿脓杆菌(Pseudomonas aeruginosa)
<400> 5
catgatgatg gcctgccggc atttcgttat tcagccgaac tgctgggtca actgcagctg 60
ccgtctgtgg cactgccgct gaatgatgac ctgtttctgt atggccgtga tgcggaagca 120
tttgatctgg aagcgtatct ggcactgaat gcaccggcac tgcgtgataa aagcgaatat 180
ctggaacatt ggtcaggcta ttattctatt aatccgaaag ttctgctgac actgatggtc 240
atgcaaagcg gtccgctggg tgcaccggat gaacgtgcac tggcagcacc gctgggccgt 300
ctgtcagcca aacgcggttt tgatgcgcag gtgcgcgatg ttctgcagca gctgtctcgc 360
cgttattatg gctttgaaga atatcaactg cgccaggcag cagcacgtaa agcagttggc 420
gaagatggtc tgaatgcagc atctgcagcg ctgctgggcc tgctgcgtga aggtgcaaaa 480
gtcagcgcag tgcagggcgg taatccgctg ggtgcatatg cccagacctt tcagcgcctg 540
tttggtacac cggcggcaga actgctgcag ccgtcaaatc gtgttgcacg tcaactgcag 600
gcaaaagcgg cactggcacc gccgagcaac ctgatgcagc tgccgtggcg tcagggctat 660
tcatggcagc cgaatggtgc acatagcaac acgggctcag gttatccgta tagctcattt 720
gatgccagct atgattggcc gcgttggggc tctgcaacct atagcgtggt tgcagcccat 780
gcgggtacag tccgcgtgct gtctcgttgc caagttcgtg tcacacatcc gtctggttgg 840
gcaaccaatt attatcatat ggatcagatt caggtgagca acggtcagca ggtttcagca 900
gatacgaaac tgggcgttta tgcaggtaat atcaacacag ccctgtgcga aggcggttct 960
agcacgggcc cgcatctgca tttttctctg ctgtataatg gtgcgtttgt ctcactgcag 1020
ggcgcatctt ttggtccgta tcgcatcaac gtgggcacca gcaattatga taacgattgt 1080
cgccgttatt acttctacaa tcagtctgct ggaacaaccc actgtgcctt tagaccgctg 1140
tataatccgg gactggctct gtaa 1164
<210> 6
<211> 1257
<212> DNA
<213> 绿脓杆菌(Pseudomonas aeruginosa)
<400> 6
atgcaacata aaagaagccg tgcgatggcg agcccgagaa gcccgttcct gtttgtgctg 60
ctggccctgg cggtgggtgg tactgccaac gcgcatgatg atggcctgcc ggcatttcgt 120
tattcagccg aactgctggg tcaactgcag ctgccgtctg tggcactgcc gctgaatgat 180
gacctgtttc tgtatggccg tgatgcggaa gcatttgatc tggaagcgta tctggcactg 240
aatgcaccgg cactgcgtga taaaagcgaa tatctggaac attggtcagg ctattattct 300
attaatccga aagttctgct gacactgatg gtcatgcaaa gcggtccgct gggtgcaccg 360
gatgaacgtg cactggcagc accgctgggc cgtctgtcag ccaaacgcgg ttttgatgcg 420
caggtgcgcg atgttctgca gcagctgtct cgccgttatt atggctttga agaatatcaa 480
ctgcgccagg cagcagcacg taaagcagtt ggcgaagatg gtctgaatgc agcatctgca 540
gcgctgctgg gcctgctgcg tgaaggtgca aaagtcagcg cagtgcaggg cggtaatccg 600
ctgggtgcat atgcccagac ctttcagcgc ctgtttggta caccggcggc agaactgctg 660
cagccgtcaa atcgtgttgc acgtcaactg caggcaaaag cggcactggc accgccgagc 720
aacctgatgc agctgccgtg gcgtcagggc tattcatggc agccgaatgg tgcacatagc 780
aacacgggct caggttatcc gtatagctca tttgatgcca gctatgattg gccgcgttgg 840
ggctctgcaa cctatagcgt ggttgcagcc catgcgggta cagtccgcgt gctgtctcgt 900
tgccaagttc gtgtcacaca tccgtctggt tgggcaacca attattatca tatggatcag 960
attcaggtga gcaacggtca gcaggtttca gcagatacga aactgggcgt ttatgcaggt 1020
aatatcaaca cagccctgtg cgaaggcggt tctagcacgg gcccgcatct gcatttttct 1080
ctgctgtata atggtgcgtt tgtctcactg cagggcgcat cttttggtcc gtatcgcatc 1140
aacgtgggca ccagcaatta tgataacgat tgtcgccgtt attacttcta caatcagtct 1200
gctggaacaa cccactgtgc ctttagaccg ctgtataatc cgggactggc tctgtaa 1257
<210> 7
<211> 179
<212> PRT
<213> 嗜水气单胞菌(Aeromonas hydrophila)
<220>
<223> 嗜水气单胞菌蛋白酶(AhP)成熟蛋白质
<400> 7
Ala Gly Gly Gln Phe Gln Leu Pro Trp Arg Gln Gly Tyr Ser Trp Lys
1 5 10 15
Ala Asn Gly Ala His Ser His Thr Gly Ser Gly Tyr Pro Tyr Ser Ser
20 25 30
Ile Asp Val Ser Tyr Asp Trp Pro Gly Trp Gly Gly Ala Thr Tyr Thr
35 40 45
Val Thr Ala Ala Asn Ser Gly Thr Val Thr Val Phe Ser Arg Cys Gln
50 55 60
Val Arg Val Thr Ala Thr Asn Gly Trp Ala Thr Asn Tyr Tyr His Met
65 70 75 80
Ser Gly Ile Ser Val Arg Ser Gly Asp Tyr Val Ala Ala Asp Thr Pro
85 90 95
Ile Gly Thr Tyr Ala Ser Asn Arg Asn Glu Ala Leu Cys Glu Gly Gly
100 105 110
Ser Ser Thr Gly Pro His Leu His Phe Ser Leu Leu Tyr Asn Gly Val
115 120 125
Phe Gln Ser Leu Gln Gly Gln Arg Leu Ser Ser Tyr Ala Val Asn Val
130 135 140
Gly Ala Ser Asn Tyr Asp Asp Asn Cys Asn Arg Phe Trp Leu Tyr Asn
145 150 155 160
Gln Arg Asn Gly Gln Arg Tyr Cys Ala Trp Gln Pro Leu Tyr Asn Asn
165 170 175
Gly Ile Asp
<210> 8
<211> 1104
<212> DNA
<213> 嗜水气单胞菌(Aeromonas hydrophila)
<400> 8
ggcgatattc acgctccgct ggctccgtat cattttacgg cgcagcaact ggcagcatct 60
caaaccccgg cactgccgct ggatgaagca cattttgttt ttggcgaagc cgcgatggca 120
tttgatctgc atgattttct gctgcagcag gccccgcatc tgctgccgaa agaagaagtc 180
attctgcatt ggagcggtat cacgtcactg aatccgcagc tgctgctggc cctgatggaa 240
gcgagctcac agctgatttc agcaccgtct gaacaggcca tggcagcccc gtttgcgaaa 300
ctggtgaatg cacgtggctt tgataaccag ctggaactga tggcccgcca gctgtctgaa 360
cgtttttatc aggcacgcgc ccagcagaaa ctgatgcaac gttctgcacc ggcactggcc 420
ccgcaggcgg cacatcaggc cgcgctggca tcaatgctgt ctaccagcat gcagcgtcag 480
ctgggcgaac agtggcagac cctgtttggt caagatgcaa tgacaagccc gcgcggcggt 540
gcagcagcac cggcagcccc gctggcaggc ggtcaatttc agctgccgtg gcgtcagggc 600
tattcttgga aagcgaatgg tgcacattct catacaggca gcggttatcc gtattctagc 660
atcgatgtca gctatgattg gccgggttgg ggcggtgcga cctatacagt gacggcggca 720
aactcaggta ccgtgacagt gtttagccgt tgccaggtcc gtgtgacagc aaccaatggc 780
tgggcgacaa actattatca tatgagcggc atttcagtgc gttctggtga ttatgttgcc 840
gcggatacac cgatcggcac gtatgcctca aatcgcaacg aagcgctgtg cgaaggcggt 900
tcatctacgg gtccgcatct gcattttagc ctgctgtata atggcgtttt tcagtcactg 960
cagggtcagc gtctgagctc atatgcagtt aatgtcggcg ccagcaacta tgatgataat 1020
tgtaaccgct tttggctgta taaccaaaga aacggacaac gctactgtgc ttggcaaccg 1080
ctgtataata acggaatcga ctaa 1104
<210> 9
<211> 1164
<212> DNA
<213> 嗜水气单胞菌(Aeromonas hydrophila)
<400> 9
atgtctcgtc cgatcccgtc cctgctgatg ctggctctgc tgccggctgc tggttgggct 60
ggcgatattc acgctccgct ggctccgtat cattttacgg cgcagcaact ggcagcatct 120
caaaccccgg cactgccgct ggatgaagca cattttgttt ttggcgaagc cgcgatggca 180
tttgatctgc atgattttct gctgcagcag gccccgcatc tgctgccgaa agaagaagtc 240
attctgcatt ggagcggtat cacgtcactg aatccgcagc tgctgctggc cctgatggaa 300
gcgagctcac agctgatttc agcaccgtct gaacaggcca tggcagcccc gtttgcgaaa 360
ctggtgaatg cacgtggctt tgataaccag ctggaactga tggcccgcca gctgtctgaa 420
cgtttttatc aggcacgcgc ccagcagaaa ctgatgcaac gttctgcacc ggcactggcc 480
ccgcaggcgg cacatcaggc cgcgctggca tcaatgctgt ctaccagcat gcagcgtcag 540
ctgggcgaac agtggcagac cctgtttggt caagatgcaa tgacaagccc gcgcggcggt 600
gcagcagcac cggcagcccc gctggcaggc ggtcaatttc agctgccgtg gcgtcagggc 660
tattcttgga aagcgaatgg tgcacattct catacaggca gcggttatcc gtattctagc 720
atcgatgtca gctatgattg gccgggttgg ggcggtgcga cctatacagt gacggcggca 780
aactcaggta ccgtgacagt gtttagccgt tgccaggtcc gtgtgacagc aaccaatggc 840
tgggcgacaa actattatca tatgagcggc atttcagtgc gttctggtga ttatgttgcc 900
gcggatacac cgatcggcac gtatgcctca aatcgcaacg aagcgctgtg cgaaggcggt 960
tcatctacgg gtccgcatct gcattttagc ctgctgtata atggcgtttt tcagtcactg 1020
cagggtcagc gtctgagctc atatgcagtt aatgtcggcg ccagcaacta tgatgataat 1080
tgtaaccgct tttggctgta taaccaaaga aacggacaac gctactgtgc ttggcaaccg 1140
ctgtataata acggaatcga ctaa 1164
<210> 10
<211> 178
<212> PRT
<213> 胶状溶杆菌(Lysobacter gummosus)
<220>
<223> LgBLP 成熟蛋白质
<400> 10
Ser Pro Asn Gly Leu Leu Gln Phe Pro Phe Pro Arg Gly Ala Arg Trp
1 5 10 15
His Val Gly Gly Ala His Thr Asn Thr Gly Ser Gly Asn Tyr Pro Met
20 25 30
Ser Ser Leu Asp Met Ser Leu Gly Gly Gly Trp Gly Ser Asn Gln Ser
35 40 45
Asn Thr Trp Val Ser Ala Ser Ala Asn Gly Ser Phe Lys Arg His Ser
50 55 60
Ser Cys Phe Ala Glu Ile Val His Ser Gly Gly Trp Ser Thr Thr Tyr
65 70 75 80
Tyr His Leu Met Asn Ile Arg Tyr Asn Thr Gly Ala Asn Val Gly Ser
85 90 95
Asn Thr Ala Ile Ala Asn Pro Ala Asn Thr Arg Ala Gln Ala Leu Cys
100 105 110
Asn Gly Gly Ser Ser Thr Gly Pro His Glu His Trp Ser Leu Lys Leu
115 120 125
Asn Gly Ser Phe Tyr His Leu Asn Gly Ala Tyr Leu Ser Gly Tyr Arg
130 135 140
Ile Thr Ala Thr Gly Ser Ser Tyr Asp Thr Asn Cys Ser Arg Phe Tyr
145 150 155 160
Leu Ala Lys Asn Gly Gln Asn Tyr Cys Ser Gly Trp Phe Thr Asn Pro
165 170 175
Gly His
<210> 11
<211> 1065
<212> DNA
<213> 胶状溶杆菌(Lysobacter gummosus)
<400> 11
gcggaacgtg gtctgagcgg ccaggacctg gtttatagct acgatgaaat gtttgatttc 60
gacattgatg cgtacctggc gaaaaacgcg ccgcatctga gccgtcacgc ggaaagcatc 120
agccattggg cgggttatag cggcattagc ccgaaagtgc tgatcgcgct gatggaacag 180
caaagcggcg cgattacccg taaacatgca gcagcagatg cagcaaaacg tccgtttggt 240
gcactggcga aagcgaaaga tttcaatggt cagacccgtg aagttgcgca agcgctgcgt 300
gaagcgctgt acgaaaacga cggtccggat gcaaagggtg cagttaccgt ggcacgtgca 360
aatccgctgc aggcactgtt tgaacgtgcg ggtgcaagcc aagcaagcgc aaaactgagc 420
ggtgacggcg aatttcagct ggtgtatggt cgtctgttca acgaaccgcg tcaggcacag 480
gcaccgagcg cacgttttgc aaaagcgggt ccggatgttc agccgctgag cccgaatggc 540
ctgctgcaat ttccgtttcc gcgtggtgcg cgttggcatg tgggcggtgc gcacaccaac 600
accggtagcg gcaattaccc gatgagcagc ctggacatga gcctgggcgg tggctggggc 660
agcaaccaaa gcaatacctg ggttagcgcg agcgcgaacg gtagctttaa acgtcatagc 720
agctgcttcg cggaaattgt gcacagcggt ggctggagca ccacctatta ccatctgatg 780
aacattcgtt acaataccgg tgcgaacgtt ggcagcaata ccgcgattgc aaatccggca 840
aatacccgtg cacaggcact gtgcaatggt ggcagcagca ccggcccgca tgaacactgg 900
agcctgaaac tgaacggtag cttttatcat ctgaatggtg cgtatctgag cggctaccgt 960
atcaccgcga ccggcagcag ctatgatacc aactgcagcc gtttttacct ggcgaaaaac 1020
ggtcaaaatt attgcagcgg ctggttcacc aatccgggtc actaa 1065
<210> 12
<211> 1164
<212> DNA
<213> 胶状溶杆菌(Lysobacter gummosus)
<400> 12
atgtctaaca aaacaggatc taaccaggca ttttctaaaa tgggattagc attattaaca 60
tgctgcgttt tagcagcaat ctctggagga gcaggagcag cggaacgtgg tctgagcggc 120
caggacctgg tttatagcta cgatgaaatg tttgatttcg acattgatgc gtacctggcg 180
aaaaacgcgc cgcatctgag ccgtcacgcg gaaagcatca gccattgggc gggttatagc 240
ggcattagcc cgaaagtgct gatcgcgctg atggaacagc aaagcggcgc gattacccgt 300
aaacatgcag cagcagatgc agcaaaacgt ccgtttggtg cactggcgaa agcgaaagat 360
ttcaatggtc agacccgtga agttgcgcaa gcgctgcgtg aagcgctgta cgaaaacgac 420
ggtccggatg caaagggtgc agttaccgtg gcacgtgcaa atccgctgca ggcactgttt 480
gaacgtgcgg gtgcaagcca agcaagcgca aaactgagcg gtgacggcga atttcagctg 540
gtgtatggtc gtctgttcaa cgaaccgcgt caggcacagg caccgagcgc acgttttgca 600
aaagcgggtc cggatgttca gccgctgagc ccgaatggcc tgctgcaatt tccgtttccg 660
cgtggtgcgc gttggcatgt gggcggtgcg cacaccaaca ccggtagcgg caattacccg 720
atgagcagcc tggacatgag cctgggcggt ggctggggca gcaaccaaag caatacctgg 780
gttagcgcga gcgcgaacgg tagctttaaa cgtcatagca gctgcttcgc ggaaattgtg 840
cacagcggtg gctggagcac cacctattac catctgatga acattcgtta caataccggt 900
gcgaacgttg gcagcaatac cgcgattgca aatccggcaa atacccgtgc acaggcactg 960
tgcaatggtg gcagcagcac cggcccgcat gaacactgga gcctgaaact gaacggtagc 1020
ttttatcatc tgaatggtgc gtatctgagc ggctaccgta tcaccgcgac cggcagcagc 1080
tatgatacca actgcagccg tttttacctg gcgaaaaacg gtcaaaatta ttgcagcggc 1140
tggttcacca atccgggtca ctaa 1164
<210> 13
<211> 178
<212> PRT
<213> 抗生素溶杆菌(Lysobacter antibioticus)
<220>
<223> LaBLP 成熟蛋白质
<400> 13
Ala Gly Pro Ala Asn Gly Phe Leu Gln Phe Pro Tyr Pro Arg Gly Ala
1 5 10 15
Ser Trp His Val Gly Gly Ala His Thr Asn Thr Gly Ser Gly Asn Tyr
20 25 30
Pro Met Ser Ser Leu Asp Met Ser Arg Gly Gly Gly Trp Gly Ser Asn
35 40 45
Gln Ser Gly Asn Trp Val Ser Ala Ser Ala Gly Gly Ser Phe Lys Arg
50 55 60
His Ser Ser Cys Phe Ala Glu Val Val His Ser Gly Gly Trp Ser Thr
65 70 75 80
Thr Tyr Tyr His Met Met Asn Leu Gln Tyr Gly Thr Gly Ala Ser Val
85 90 95
Ala Ala Asn Ser Arg Ile Gly Asn Pro Ala Asn Thr Arg Ala Gln Ala
100 105 110
Leu Cys Asn Gly Gly Ala Ser Thr Gly Pro His Glu His Trp Ser Leu
115 120 125
Lys Tyr Asn Gly Ser His Tyr His Leu Asn Gly Val Tyr Leu Ser Gly
130 135 140
Tyr Gln Ile Thr Ala Leu Gly Ser Ser Tyr Asp Thr Asn Cys Ser Arg
145 150 155 160
Phe Tyr Leu Ser Lys Asn Gly Ser Arg Tyr Cys Ser Gly Tyr Phe Thr
165 170 175
Asn Pro
<210> 14
<211> 1086
<212> DNA
<213> 抗生素溶杆菌(Lysobacter antibioticus)
<400> 14
ggcggtcgtg atgcgaatgc agcagcaggt ctgagcggtc aggatctggt ttatagctac 60
gacgaaatgt ttgatttcga caccgcggcg tatctggcga aacatgcgcc gcacctggtt 120
cgtcatagcg aaagcattag ccactgggcg ggttacagca gcattagccc gaaagtgctg 180
atcgcgctga tggaacagca aagcggtgtt gtgagccgtc aacgtgcaag cgcagatgca 240
atgcgtcgtc cgtttggcaa actgagcgcg gcgaaagact tcaatagcca gacccgtgaa 300
gttgcgaccg cgctgcgtca ggcgctgtat gaacaagaag atgcgagcct ggcgccgcaa 360
ggtcgtgttc cgctggcacg tagcaacccg ctgcaggcgc tgtatctgca agcaggtgaa 420
agccaggcaa gcgcagcact gcgtggtgac ggcgaatttc agcaagtgta cggtcgtctg 480
ttcaatgaac cgcgtaaggc agcaccggca agcgcacgtt ttgcagatac cagcgatgtt 540
aatgcactgg caggtccggc gaatggcttt ctgcagttcc cgtatccgcg tggcgcgagc 600
tggcatgtgg gcggtgcgca caccaacacc ggtagcggca attacccgat gagcagcctg 660
gatatgagcc gtggcggtgg ctggggtagc aaccaaagcg gcaattgggt tagcgcgagc 720
gcgggtggca gctttaaacg tcatagcagc tgcttcgcgg aagttgtgca cagcggtggc 780
tggagcacca cctattacca tatgatgaac ctgcaatatg gtaccggtgc gagcgtggca 840
gcaaatagcc gtattggtaa tccggcaaat acccgtgcac aggcactgtg caatggtggc 900
gcgagcaccg gtccgcatga acactggagc ctgaaatata acggcagcca ttaccacctg 960
aatggtgttt atctgagcgg ctaccaaatc accgcgctgg gcagcagcta tgacaccaac 1020
tgcagccgtt tttacctgag caaaaatggt agccgttatt gcagcggcta cttcaccaat 1080
ccgtaa 1086
<210> 15
<211> 1164
<212> DNA
<213> 抗生素溶杆菌(Lysobacter antibioticus)
<400> 15
atgaaagcaa tctctaaagc aagattagga ttattagcat gctgcatcgc agcagcaatc 60
ggaggaacag caacagcagg cggtcgtgat gcgaatgcag cagcaggtct gagcggtcag 120
gatctggttt atagctacga cgaaatgttt gatttcgaca ccgcggcgta tctggcgaaa 180
catgcgccgc acctggttcg tcatagcgaa agcattagcc actgggcggg ttacagcagc 240
attagcccga aagtgctgat cgcgctgatg gaacagcaaa gcggtgttgt gagccgtcaa 300
cgtgcaagcg cagatgcaat gcgtcgtccg tttggcaaac tgagcgcggc gaaagacttc 360
aatagccaga cccgtgaagt tgcgaccgcg ctgcgtcagg cgctgtatga acaagaagat 420
gcgagcctgg cgccgcaagg tcgtgttccg ctggcacgta gcaacccgct gcaggcgctg 480
tatctgcaag caggtgaaag ccaggcaagc gcagcactgc gtggtgacgg cgaatttcag 540
caagtgtacg gtcgtctgtt caatgaaccg cgtaaggcag caccggcaag cgcacgtttt 600
gcagatacca gcgatgttaa tgcactggca ggtccggcga atggctttct gcagttcccg 660
tatccgcgtg gcgcgagctg gcatgtgggc ggtgcgcaca ccaacaccgg tagcggcaat 720
tacccgatga gcagcctgga tatgagccgt ggcggtggct ggggtagcaa ccaaagcggc 780
aattgggtta gcgcgagcgc gggtggcagc tttaaacgtc atagcagctg cttcgcggaa 840
gttgtgcaca gcggtggctg gagcaccacc tattaccata tgatgaacct gcaatatggt 900
accggtgcga gcgtggcagc aaatagccgt attggtaatc cggcaaatac ccgtgcacag 960
gcactgtgca atggtggcgc gagcaccggt ccgcatgaac actggagcct gaaatataac 1020
ggcagccatt accacctgaa tggtgtttat ctgagcggct accaaatcac cgcgctgggc 1080
agcagctatg acaccaactg cagccgtttt tacctgagca aaaatggtag ccgttattgc 1140
agcggctact tcaccaatcc gtaa 1164
<210> 16
<211> 575
<212> DNA
<213> 芽孢杆菌KSM-S237(Bacillus sp. KSM-S237)
<220>
<223> KSM-S237 启动子
<400> 16
gatttgccga tgcaacaggc ttatatttag aggaaatttc tttttaaatt gaatacggaa 60
taaaatcagg taaacaggtc ctgattttat ttttttgagt tttttagaga actgaagatt 120
gaaataaaag tagaagacaa aggacataag aaaattgcat tagttttaat tatagaaaac 180
gcctttttat aattatttat acctagaacg aaaatactgt ttcgaaagcg gtttactata 240
aaaccttata ttccggctct tttttaaaac agggggtaaa aattcactct agtattctaa 300
tttcaacatg ctataataaa tttgtaagac gcaatatgca tctctttttt tacgatatat 360
gtaagcggtt aaccttgtgc tatatgccga tttaggaagg ggggtagatt gagtcaagta 420
gtaataatat agataactta taagttgttg agaagcagga gagcatctgg gttactcaca 480
agttttttta aaactttaac gaaagcactt tcggtaatgc ttatgaattt agctatttga 540
ttcaattact ttaaaaatat ttaggaggta atatg 575
<210> 17
<211> 617
<212> DNA
<213> 芽孢杆菌KSM-64(Bacillus sp. KSM-64)
<220>
<223> KSM-64启动子
<400> 17
gaacaagtac ttaccatttt agagtcaaaa gatagaagcc aagcaggatt tgccgatgca 60
accggcttat atttagaggg aatttctttt taaattgaat acggaataaa atcaggtaaa 120
caggtcctga ttttattttt ttgaattttt ttgagaacta aagattgaaa tagaagtaga 180
agacaacgga cataagaaaa ttgtattagt tttaattata gaaaacgctt ttctataatt 240
atttatacct agaacgaaaa tactgtttcg aaagcggttt actataaaac cttatattcc 300
ggctcttttt ttaaacaggg ggtgaaaatt cactctagta ttctaatttc aacatgctat 360
aataaatttg taagacgcaa tatacatctt ttttttatga tatttgtaag cggttaacct 420
tgtgctatat gccgatttag gaagggggta gattgagtca agtagtcata atttagataa 480
cttataagtt gttgagaagc aggagagaat ctgggttact cacaagtttt ttaaaacatt 540
atcgaaagca ctttcggtta tgcttatgaa tttagctatt tgattcaatt actttaataa 600
ttttaggagg taatatg 617
<210> 18
<211> 87
<212> DNA
<213> 芽孢杆菌KSM-S237(Bacillus sp. KSM-S237)
<220>
<223> KSM-S237信号(KSM-S237 signal)
<400> 18
atgttaagaa agaaaacaaa gcagttgatt tcttccattc ttattttagt tttacttcta 60
tctttatttc cggcagctct tgcagca 87
<210> 19
<211> 87
<212> DNA
<213> 芽孢杆菌KSM-64(Bacillus sp. KSM-64)
<220>
<223> KSM-64信号(KSM-64 signal)
<400> 19
atgttaagaa agaaaacaaa gcagttgatt tcttccattc ttattttagt tttacttcta 60
tctttatttc cgacagctct tgcagca 87
<210> 20
<211> 74
<212> DNA
<213> 枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis)
<220>
<223> amyE信号(amyE signal)
<400> 20
atgtttgcaa aacgattcaa aacctcttta ctgccgttat tcgctggatt tttattgctg 60
tttcatttgg ttct 74
<210> 21
<211> 35
<212> DNA
<213> 人工的(Artificial); BLP_S237signal_F
<400> 21
gaaggaaaca ctcgtatgaa aaaaatctca aaagc 35
<210> 22
<211> 36
<212> DNA
<213> 人工的(Artificial)
<220>
<223> BLP_S237signal_R
<400> 22
aactagttta atagattagt tcggtccagg attcac 36
<210> 23
<211> 32
<212> DNA
<213> 人工的(Artificial)
<220>
<223> vector-F
<400> 23
tctattaaac tagttatagg gttatctaaa gg 32
<210> 24
<211> 21
<212> DNA
<213> 人工的(Artificial)
<220>
<223> vector-sig-R
<400> 24
acgagtgttt ccttctgctg c 21
<210> 25
<211> 29
<212> DNA
<213> 人工的(Artificial)
<220>
<223> delta-BLPsig_F
<400> 25
tgcagcatct gctcagggac atggattaa 29
<210> 26
<211> 28
<212> DNA
<213> 人工的(Artificial)
<220>
<223> delta-BLPsig_R
<400> 26
tgagcagatg ctgcaagagc tgccggaa 28
<210> 27
<211> 43
<212> DNA
<213> 人工的(Artificial)
<220>
<223> BLPsig_F
<400> 27
ttaggaggta atatgatgaa aaaaatctca aaagctggtc tgg 43
<210> 28
<211> 37
<212> DNA
<213> 人工的(Artificial)
<220>
<223> BLPsig_R
<400> 28
catattacct cctaaatatt tttaaagtaa ttgaatc 37
<210> 29
<211> 28
<212> DNA
<213> 人工的(Artificial)
<220>
<223> delta-pro_F
<400> 29
ttgcagcatc tccgaatgga ctgcttca 28
<210> 30
<211> 27
<212> DNA
<213> 人工的(Artificial)
<220>
<223> delta-pro_R
<400> 30
tcggagatgc tgcaagagct gccggaa 27
<210> 31
<211> 23
<212> DNA
<213> 人工的(Artificial)
<220>
<223> delta-BLPsig2_F
<400> 31
tctgctcagg gacatggatt aag 23
<210> 32
<211> 48
<212> DNA
<213> 人工的(Artificial)
<220>
<223> amyEsig(BLP)_F
<400> 32
ttaggaggta atatgatgtt tgcaaaacga ttcaaaacct ctttactg 48
<210> 33
<211> 34
<212> DNA
<213> 人工的(Artificial)
<220>
<223> amyEsig(BLP)_R
<400> 33
atgtccctga gcagaagcac tcgcagccgc cggt 34
<210> 34
<211> 55
<212> DNA
<213> 人工的(Artificial)
<220>
<223> BLP_FLAG_F
<400> 34
acaaagatga tgatgataaa taatctatta aactagttat agggttatct aaagg 55
<210> 35
<211> 37
<212> DNA
<213> 人工的(Artificial)
<220>
<223> BLP_FLAG_R
<400> 35
catcatcatc tttgtaatcg ttcggtccag gattcac 37
<210> 36
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工的(Artificial)
<220>
<223> LasA_F
<400> 36
gcagctcttg cagcacatga tgatggcctg 30
<210> 37
<211> 45
<212> DNA
<213> 人工的(Artificial)
<220>
<223> LasA_CR
<400> 37
tagtttaata gattagtggt ggtggtggtg cagagccagt cccgg 45
<210> 38
<211> 35
<212> DNA
<213> 人工的(Artificial)
<220>
<223> pHY_just_F
<400> 38
taatctatta aactagttat agggttatct aaagg 35
<210> 39
<211> 21
<212> DNA
<213> 人工的(Artificial)
<220>
<223> pHY_just_R_NEW
<400> 39
tgctgcaaga gctgccggaa a 21
<210> 40
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工的(Artificial)
<220>
<223> LasA_Chis_n_R
<400> 40
cagagccagt cccggattat ac 22
<210> 41
<211> 31
<212> DNA
<213> 人工的(Artificial)
<220>
<223> AhP_F
<400> 41
ttaggaggta atatgatgtc tcgtccgatc c 31
<210> 42
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工的(Artificial)
<220>
<223> AhP_R
<400> 42
aactagttta atagattagt cgattccgtt 30
<210> 43
<211> 33
<212> DNA
<213> 人工的(Artificial)
<220>
<223> vector-R
<400> 43
catattacct cctaaatatt tttaaagtaa ttg 33
<210> 44
<211> 33
<212> DNA
<213> 人工的(Artificial)
<220>
<223> LgBLP_F
<400> 44
gcagctcttg cagcagcgga acgtggtctg agc 33
<210> 45
<211> 35
<212> DNA
<213> 人工的(Artificial)
<220>
<223> LgBLP_R
<400> 45
tagtttaata gattagtgac ccggattggt gaacc 35
<210> 46
<211> 34
<212> DNA
<213> 人工的(Artificial)
<220>
<223> LaBLP_F
<400> 46
gcagctcttg cagcaggcgg tcgtgatgcg aatg 34
<210> 47
<211> 34
<212> DNA
<213> 人工的(Artificial)
<220>
<223> LaBLP_R
<400> 47
tagtttaata gattacggat tggtgaagta gccg 34
<210> 48
<211> 35
<212> DNA
<213> 人工的(Artificial)
<220>
<223> delta-S237N_fw
<400> 48
tgcagcaatg aaaaaaatct caaaagctgg tctgg 35
<210> 49
<211> 28
<212> DNA
<213> 人工的(Artificial)
<220>
<223> delta-S237N_rv
<400> 49
tttttcattg ctgcaagagc tgccggaa 28
<210> 50
<211> 45
<212> DNA
<213> 人工的(Artificial)
<220>
<223> 2R_bacillus-Chis
<400> 50
aactagttta atagattagt ggtggtggtg gtggtcgatt ccgtt 45

Claims (10)

1.一种M23A亚族蛋白酶的制造方法,其中,
包括如下步骤:
培养导入有编码M23A亚族蛋白酶的前蛋白的多核苷酸的芽孢杆菌属菌,从而在该芽孢杆菌属菌的细胞外制造成熟型M23A亚族蛋白酶,
所述M23A亚族蛋白酶为由序列号1、4、7、10或者13的氨基酸构成的多肽,
所述芽孢杆菌属菌为枯草芽孢杆菌或其突变株,该枯草芽孢杆菌的突变株是缺失了9种细胞外蛋白酶基因aprE、epr、wprA、mpr、nprB、bpr、nprE、vpr和aprX中的任一种基因的枯草芽孢杆菌。
2.一种M23A亚族蛋白酶的制造方法,其中,
包括如下步骤:
培养导入有由序列号2、3、5、6、8、9、11、12、14及15中任意一种的核苷酸序列所示的多核苷酸的芽孢杆菌属菌,从而在该芽孢杆菌属菌的细胞外制造成熟型M23A亚族蛋白酶,
所述M23A亚族蛋白酶为由序列号1、4、7、10或者13的氨基酸构成的多肽,
所述芽孢杆菌属菌为枯草芽孢杆菌或其突变株,该枯草芽孢杆菌的突变株是缺失了9种细胞外蛋白酶基因aprE、epr、wprA、mpr、nprB、bpr、nprE、vpr和aprX中的任一种基因的枯草芽孢杆菌。
3.根据权利要求1所述的方法,其中,
所述编码M23A亚族蛋白酶的前蛋白的多核苷酸为以下的多核苷酸:
由序列号2的1~522号核苷酸区域的序列、及连接于其下游的编码所述M23A亚族蛋白酶的序列构成的多核苷酸;
由序列号3的1~594号核苷酸区域的序列、及连接于其下游的编码所述M23A亚族蛋白酶的序列构成的多核苷酸;
由序列号5的1~615号核苷酸区域的序列、及连接于其下游的编码所述M23A亚族蛋白酶的序列构成的多核苷酸;
由序列号6的1~708号核苷酸区域的序列、及连接于其下游的编码所述M23A亚族蛋白酶的序列构成的多核苷酸;
由序列号8的1~564号核苷酸区域的序列、及连接于其下游的编码所述M23A亚族蛋白酶的序列构成的多核苷酸;
由序列号9的1~624号核苷酸区域的序列、及连接于其下游的编码所述M23A亚族蛋白酶的序列构成的多核苷酸;
由序列号11的1~528号核苷酸区域的序列、及连接于其下游的编码所述M23A亚族蛋白酶的序列构成的多核苷酸;
由序列号12的1~627号核苷酸区域的序列、及连接于其下游的编码所述M23A亚族蛋白酶的序列构成的多核苷酸;
由序列号14的1~549号核苷酸区域的序列、及连接于其下游的编码所述M23A亚族蛋白酶的序列构成的多核苷酸;
由序列号15的1~627号核苷酸区域的序列、及连接于其下游的编码所述M23A亚族蛋白酶的序列构成的多核苷酸。
4.根据权利要求1或3所述的方法,其中,
所述编码M23A亚族蛋白酶的前蛋白的多核苷酸进一步包含分泌信号区。
5.根据权利要求4所述的方法,其中,
所述分泌信号区为来自芽孢杆菌属菌的分泌信号区。
6.根据权利要求1~3中任一项所述的方法,其中,
所述芽孢杆菌属菌为向细胞外分泌蛋白酶或伴随溶菌而释放蛋白酶的菌。
7.根据权利要求6所述的方法,其中,
所述芽孢杆菌属菌具有细胞外蛋白酶活性。
8.根据权利要求6所述的方法,其中,
所述蛋白酶为选自被aprE、epr、wprA、mpr、nprB、bpr、nprE、vpr及aprX所编码的细胞外蛋白酶中的至少一种。
9.根据权利要求7所述的方法,其中,
所述蛋白酶为选自被aprE、epr、wprA、mpr、nprB、bpr、nprE、vpr及aprX所编码的细胞外蛋白酶中的至少一种。
10.根据权利要求1~3中任一项所述的方法,其中,
进一步包括:从获得的培养物中回收M23A亚族蛋白酶的步骤。
CN201980008312.8A 2018-01-16 2019-01-15 M23a家族蛋白酶的制造方法 Active CN111601894B (zh)

Applications Claiming Priority (7)

Application Number Priority Date Filing Date Title
JP2018005193A JP7057140B2 (ja) 2018-01-16 2018-01-16 角質汚れ洗浄剤
JP2018-005193 2018-01-16
JP2018-005194 2018-01-16
JP2018005194A JP7158149B2 (ja) 2018-01-16 2018-01-16 角質汚れ分解能の評価方法
JP2018-219142 2018-11-22
JP2018219142A JP7233203B2 (ja) 2018-11-22 2018-11-22 M23aファミリープロテアーゼの製造方法
PCT/JP2019/000894 WO2019142773A1 (ja) 2018-01-16 2019-01-15 M23aファミリープロテアーゼの製造方法

Publications (2)

Publication Number Publication Date
CN111601894A CN111601894A (zh) 2020-08-28
CN111601894B true CN111601894B (zh) 2024-05-14

Family

ID=67301498

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
CN201980008312.8A Active CN111601894B (zh) 2018-01-16 2019-01-15 M23a家族蛋白酶的制造方法

Country Status (4)

Country Link
US (1) US11371034B2 (zh)
EP (1) EP3741856A4 (zh)
CN (1) CN111601894B (zh)
WO (1) WO2019142773A1 (zh)

Families Citing this family (4)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO2019142774A1 (ja) * 2018-01-16 2019-07-25 花王株式会社 角質汚れ洗浄剤、及び角質汚れ分解能の評価方法
WO2021085563A1 (ja) 2019-10-30 2021-05-06 花王株式会社 皮革改質剤
JP2022073146A (ja) 2020-10-30 2022-05-17 花王株式会社 変異プロテアーゼ及びその利用
WO2023027066A1 (ja) * 2021-08-26 2023-03-02 花王株式会社 硬質表面処理剤

Citations (15)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
JPH04108387A (ja) * 1990-08-29 1992-04-09 Wako Pure Chem Ind Ltd β―リティック プロテアーゼ遺伝子及びその遺伝子産物の製造法
US6300117B1 (en) * 1997-09-15 2001-10-09 Genencor International, Inc. Proteases from gram-positive organisms
JP2003116563A (ja) * 2001-10-11 2003-04-22 Wako Pure Chem Ind Ltd キサントモナス産生β−溶菌酵素産生遺伝子及びその用途
CN1980692A (zh) * 2003-07-24 2007-06-13 麦克公司 用于诱导针对金黄色葡萄球菌的保护性免疫反应的多肽
WO2009059054A2 (en) * 2007-10-30 2009-05-07 The Trustees Of The University Of Pennsylvania Bacteria strains an d bacteriocin produced therefrom
CN102369211A (zh) * 2009-02-13 2012-03-07 诺瓦提斯公司 编码非核糖体肽合酶的生物合成簇的核酸分子及其用途
CN103443278A (zh) * 2011-03-23 2013-12-11 诺维信公司 生产分泌型多肽的方法
CN104630123A (zh) * 2013-11-12 2015-05-20 华中农业大学 地衣芽胞杆菌表达宿主
CN105992817A (zh) * 2014-02-07 2016-10-05 帝斯曼知识产权资产管理有限公司 改良的芽孢杆菌宿主
JP2019123803A (ja) * 2018-01-16 2019-07-25 花王株式会社 角質汚れ洗浄剤
JP2019122300A (ja) * 2018-01-16 2019-07-25 花王株式会社 角質汚れ分解能の評価方法
CN111601892A (zh) * 2018-01-12 2020-08-28 花王株式会社 蛋白质的制造方法
CN111615559A (zh) * 2018-01-16 2020-09-01 花王株式会社 角质污垢清洁剂及角质污垢分解能力的评价方法
CN114616348A (zh) * 2019-10-30 2022-06-10 花王株式会社 皮革改性剂
CN114686462A (zh) * 2022-04-01 2022-07-01 山东仕达思医疗科技有限公司 能瓦解细菌生物被膜和杀灭细菌的蛋白酶LasA及应用

Family Cites Families (11)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
JPS492935B1 (zh) 1968-10-07 1974-01-23
JP2000210081A (ja) 1999-01-21 2000-08-02 Kao Corp 耐熱性アルカリセルラ―ゼ遺伝子
WO2004111219A1 (en) * 2003-06-19 2004-12-23 Novozymes A/S Improved proteases and methods for producing them
JP4485341B2 (ja) 2004-12-20 2010-06-23 花王株式会社 組換え微生物
JP4839143B2 (ja) 2005-07-21 2011-12-21 花王株式会社 組換え微生物
EP2196534B1 (en) 2007-09-20 2016-08-24 Kao Corporation A recombinant microorganism and method for producing poly-gamma-glutamic acid
JP5445746B2 (ja) 2009-06-23 2014-03-19 ダイヤモンド電機株式会社 フルブリッジ型電力変換回路及びフルブリッジ型dc−dcコンバータ
BR112013024157A2 (pt) * 2011-03-22 2016-12-06 Mucosis Bv composições imunogênicas em forma particulada e métodos para produção destas
WO2015158719A1 (en) 2014-04-15 2015-10-22 Aalborg Universitet Composition and method for degradation of keratinaceous materials
JP6103116B1 (ja) 2016-07-08 2017-03-29 富士ゼロックス株式会社 画像形成装置および定着装置
JP7034724B2 (ja) 2018-01-16 2022-03-14 花王株式会社 ケラチン断片の製造方法

Patent Citations (15)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
JPH04108387A (ja) * 1990-08-29 1992-04-09 Wako Pure Chem Ind Ltd β―リティック プロテアーゼ遺伝子及びその遺伝子産物の製造法
US6300117B1 (en) * 1997-09-15 2001-10-09 Genencor International, Inc. Proteases from gram-positive organisms
JP2003116563A (ja) * 2001-10-11 2003-04-22 Wako Pure Chem Ind Ltd キサントモナス産生β−溶菌酵素産生遺伝子及びその用途
CN1980692A (zh) * 2003-07-24 2007-06-13 麦克公司 用于诱导针对金黄色葡萄球菌的保护性免疫反应的多肽
WO2009059054A2 (en) * 2007-10-30 2009-05-07 The Trustees Of The University Of Pennsylvania Bacteria strains an d bacteriocin produced therefrom
CN102369211A (zh) * 2009-02-13 2012-03-07 诺瓦提斯公司 编码非核糖体肽合酶的生物合成簇的核酸分子及其用途
CN103443278A (zh) * 2011-03-23 2013-12-11 诺维信公司 生产分泌型多肽的方法
CN104630123A (zh) * 2013-11-12 2015-05-20 华中农业大学 地衣芽胞杆菌表达宿主
CN105992817A (zh) * 2014-02-07 2016-10-05 帝斯曼知识产权资产管理有限公司 改良的芽孢杆菌宿主
CN111601892A (zh) * 2018-01-12 2020-08-28 花王株式会社 蛋白质的制造方法
JP2019123803A (ja) * 2018-01-16 2019-07-25 花王株式会社 角質汚れ洗浄剤
JP2019122300A (ja) * 2018-01-16 2019-07-25 花王株式会社 角質汚れ分解能の評価方法
CN111615559A (zh) * 2018-01-16 2020-09-01 花王株式会社 角质污垢清洁剂及角质污垢分解能力的评价方法
CN114616348A (zh) * 2019-10-30 2022-06-10 花王株式会社 皮革改性剂
CN114686462A (zh) * 2022-04-01 2022-07-01 山东仕达思医疗科技有限公司 能瓦解细菌生物被膜和杀灭细菌的蛋白酶LasA及应用

Non-Patent Citations (5)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
Hans-Peter Hohmann等.Host Organisms: Bacillus subtilis.Industrial Biotechnology: Microorganisms.2017,第221倒数第1-2段和第222页第1段、第229页7.3.2.3节. *
Insights into the Function of a Second, Nonclassical Ahp Peroxidase, AhpA, in Oxidative Stress Resistance in Bacillus subtilis;Nicole J. Broden等;Journal of Bacteriology;20160119;1044-1057 *
Takahiro Hioki等.Heterologous production of active form of beta-lytic protease by Bacillus subtilis and improvement of staphylolytic activity by protein engineering.Microb Cell Fact.2021,1-13页. *
赵慧琳.深海新型M23家族蛋白酶pseudoalterin降解肽聚糖和弹性蛋白的分子机制、生态学功能及应用潜力评价.中国博士学位论文全文数据库基础科学辑.2013,A006-63. *
靳永新等.铜绿假单胞菌水解弹性蛋白能力相关基因的筛选与鉴定.微生物学报.2008,1623-1628页. *

Also Published As

Publication number Publication date
WO2019142773A1 (ja) 2019-07-25
CN111601894A (zh) 2020-08-28
US11371034B2 (en) 2022-06-28
EP3741856A4 (en) 2021-10-27
US20210207116A1 (en) 2021-07-08
EP3741856A1 (en) 2020-11-25

Similar Documents

Publication Publication Date Title
CN111601894B (zh) M23a家族蛋白酶的制造方法
Rossmann et al. Maturation of the large subunit (HYCE) of Escherichia coli hydrogenase 3 requires nickel incorporation followed by C‐terminal processing at Arg537
JP3601835B2 (ja) 超耐熱性プロテアーゼ発現系
CN101107361B (zh) 二硫桥连双链形式的蛋白质的重组表达
EP2440573B1 (en) Bacillus strain for increased protein production
AU2018354067B2 (en) Method for production of recombinant Erwinia asparaginase
KR20100107591A (ko) 류코노스톡 락티스로부터 유래된 글루칸수크라제 및 그 제조방법
Beukes et al. Self-protection against cell wall hydrolysis in Streptococcus milleri NMSCC 061 and analysis of the millericin B operon
JP4839144B2 (ja) 宿主微生物
JP7233203B2 (ja) M23aファミリープロテアーゼの製造方法
JP6059416B2 (ja) 溶菌が抑制された微生物、当該微生物の製造方法、当該微生物を用いたタンパク質等の製造方法、及び微生物の溶菌抑制方法
JP4839143B2 (ja) 組換え微生物
CN114540385B (zh) 一种利用大肠杆菌产溶葡萄球菌酶的方法
EP4098748A1 (en) Method for producing heavy chain variable domain of heavy-chain antibody
JPH06501396A (ja) ストレプトミセスリビダンス由来の新規なプロテアーゼの単離及び特徴分析
JP2006345860A (ja) 組換えバチルス属細菌
JP4736085B2 (ja) 宿主微生物
Engel et al. Enzymatic preparation of 1, 6-anhydro-muropeptides by immobilized murein hydrolases from Escherichia coli fused to staphylococcal protein A
WO2008047936A1 (fr) INHIBITEUR D&#39;ENZYMES LYTIQUES, INHIBITEUR DE LYSE, INHIBITEUR DE LA DÉGRADATION DE L&#39;ACIDE POLY-γ-GLUTAMIQUE, ET PROCÉDÉ DE PRODUCTION DE L&#39;ACIDE POLY-γ-GLUTAMIQUE
CN111278979B (zh) 重组大肠杆菌天冬酰胺酶的生产方法
JP7389640B2 (ja) アルカリプロテアーゼ
WO2021200784A1 (ja) 大腸菌を用いた外来タンパク質の製造方法
JP2009038985A (ja) 微生物及びこれを用いたタンパク質又ポリペプチドの製造方法
Cannio et al. Identification of a cell-bound extracellular protease overproduced by Sulfolobus solfataricus in peptide-rich media
KR101576355B1 (ko) 덱스트라나아제 활성을 갖는 신규 미생물 및 이의 용도

Legal Events

Date Code Title Description
PB01 Publication
PB01 Publication
SE01 Entry into force of request for substantive examination
SE01 Entry into force of request for substantive examination
GR01 Patent grant
GR01 Patent grant