CN109661573B - 质谱分析数据处理装置、质谱分析数据处理方法及质谱分析数据处理程序 - Google Patents
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Abstract
质谱分析数据处理装置(2)具备将各种化合物的质谱数据与该化合物的名称及质谱分析条件一起保存的数据库(21),质谱分析数据处理装置(2)还具备:质谱数据接收部(22),其接收与化合物名称及质谱分析条件相关联的质谱数据的输入;判定部(25),其判定所述质谱数据中是否存在满足规定基准的质量峰;以及数据库登记部(31),其将被判定为存在所述满足规定基准的质量峰的质谱数据、或基于被判定为存在所述满足规定基准的质量峰的质谱数据的质谱数据,与化合物名称及质谱分析条件一起登记到所述数据库中。
Description
技术领域
本发明涉及用于构建在对试样中包含的成分进行鉴定时使用的化合物数据库的质谱分析数据处理装置、质谱分析数据处理方法及质谱分析数据处理程序。
背景技术
在使用色谱质谱联用仪进行的试样中的成分的鉴定(定性分析)中,用色谱仪的柱将该试样中的成分在时间上分离,将从该柱洗脱出的成分导入到质谱分析装置中,来对源自各成分的离子边质量扫描边进行测定。通过该测定得到总离子色谱和质谱。然后,将获取到的总离子色谱上的峰所在的保留时间以及质谱上的质量峰所在的质荷比及其强度与在化合物数据库中预先保存的已知化合物的保留时间以及质荷比及强度进行对照,基于它们的一致度来鉴定试样中的成分。利用通过测定得到的质谱的质量峰的质荷比及其强度(谱图案)来将多个质谱进行对照的方法被称为图案匹配(例如专利文献1)。
色谱质谱联用仪的质谱分析部包括单四极杆型质谱分析装置、三重四极杆型质谱分析装置、IT-TOF(离子阱-飞行时间)型质谱分析装置等各种结构的装置,能够获取的质谱的种类根据装置的结构的不同而不同。单四极杆型质谱分析装置为仅具备一个质量分离部的最简单的结构的质谱分析装置,通过对源自从色谱仪的柱洗脱出的成分的离子直接进行质量扫描并进行测定,从而仅得到质谱(MS1谱)。另外,三重四极杆型质谱分析装置为隔着碰撞室在前后具有质量分离部的质谱分析装置,通过从源自试样中的成分的离子中筛选具有特定质荷比的离子(前体离子),对使该前体离子断裂而生成的产物离子边质量扫描边进行测定,从而能够得到产物离子谱(MS2谱)。并且,IT-TOF型质谱分析装置为具有离子阱和飞行时间型质量分离部的质谱分析装置,通过在将前体离子的筛选和断裂重复进行一次或多次后,对生成的产物离子边质量扫描边进行测定,从而能够得到MSn谱(n为2以上的整数)。关于分子结构单纯的成分,有时能够通过对MS1谱进行图案匹配来一次性地鉴定该成分。另一方面,在像蛋白质、源自生物体的成分那样分子结构复杂的成分的情况下,对前体离子不同的多个MSn谱进行图案匹配来确定局部结构,从而进行该成分的鉴定。
上述对照中使用的化合物数据库如下那样构建。
首先,将要登记在数据库中的化合物导入到色谱质谱联用仪,在该化合物从色谱仪流出的时间内重复进行质量扫描并测定源自该化合物的离子,获取各时间点的质谱。然后,将各时间点的质谱的总离子强度进行累计并沿时间轴方向标绘,从而获取总离子色谱。此处所说的质谱中,除了有上述MS1谱、MSn谱之外,还有前体离子谱、中性丢失谱等各种谱,通常对于一个化合物获取多个种类的质谱并保存在数据库中。
另外,同一种类的质谱通常是在多个不同的测定条件下获取的。例如在MSn谱的情况下,使质荷比不同的多个前体离子分别在多个不同的断裂能量条件下断裂,在各条件下获取MSn谱。这是因为所生成的离子的种类和/或量根据前体离子的种类与断裂能量条件的组合而不同。
如此得到的MSn谱中,不仅包含以足够的强度得到了该化合物的特征性的离子的质量峰的质谱,还包含在上述图案匹配中不存在有效的质谱的质谱。当这种无法在图案匹配中使用的质谱也登记到数据库中时,在数据库中登记的质谱的数量变得庞大,数据库的容量变得过大。另外,在数据库中登记的质谱的数量越多,图案匹配越耗费时间。因此,操作员对在不同的测定条件下获取到的MSn谱分别进行确认,基于该化合物的特征性的离子的质量峰以足够的强度出现等,来筛选对分析有用的MSn谱并登记到数据库中。
专利文献1:日本特开2005-265697号公报
发明内容
发明要解决的问题
近年来,质谱分析装置用于各种各样的领域,作为分析对象的化合物的种类增加。为了应对这种状况,需要将许多化合物的质谱数据依次登记到数据库中,此时存在以下问题:在操作员自己针对各个化合物逐一确认在多个不同的测定条件下得到的质谱并进行筛选上耗费时间和劳力。
本发明要解决的课题在于,提供能够从在多个不同的质谱分析条件下获取到的质谱中简便地筛选对分析有用的质谱并登记到数据库中的质谱分析数据处理装置、质谱分析数据处理方法及质谱分析数据处理程序。
用于解决问题的方案
为了解决上述课题而做出的本发明的第一方式为一种质谱分析数据处理装置,具备将各种化合物的质谱数据与该化合物的名称及质谱分析条件一起保存的数据库,所述质谱分析数据处理装置具备:
a)质谱数据接收部,其接收与化合物名称及质谱分析条件相关联的质谱数据的输入;
b)判定部,其判定所述质谱数据中是否存在满足规定基准的质量峰;以及
c)数据库登记部,其将被判定为存在所述满足规定基准的质量峰的质谱数据、或基于被判定为存在所述满足规定基准的质量峰的质谱数据的质谱数据,与化合物名称及质谱分析条件一起登记到所述数据库中。
所述规定基准是指例如具有预先决定的阈值以上的强度。
上述质谱数据中包括如下的数据:通过对源自化合物的离子边质量扫描边进行测定而得到的质谱(MS1谱);通过在从源自化合物的离子中选择具有特定质荷比的离子作为前体离子并使前体离子进行一次或多次断裂而生成产物离子后,对这些产物离子边扫描质荷比边进行测定而得到的产物离子谱(MSn谱。n为2以上的整数);通过对前体离子边质量扫描边进行筛选并测定特定质荷比的产物离子而得到的前体离子谱;通过对于前体离子和产物离子这两者在保持质荷比之差恒定的同时进行质量扫描并测定而得到的中性丢失谱。
另外,所述数据库登记部能够设为:将被判定为存在满足规定基准的质量峰的质谱数据直接登记到数据库中;将该质谱数据进行加工(例如将强度标准化)并登记到数据库中;或者,如后述那样根据被判定为存在满足规定基准的质量峰的多个质谱数据制作新的质谱数据并登记到数据库中。
在本发明所涉及的质谱分析数据处理装置中,判定与化合物名称及质谱分析条件相关联的质谱数据中是否存在满足规定基准的质量峰,将存在这种质量峰的质谱数据或者基于这种质谱数据的质谱数据与化合物名称及质谱分析条件一起登记到数据库中。由此,仅筛选对图案匹配等有用的质谱数据并登记到数据库中。在本发明所涉及的质谱分析数据处理装置中,能够将对分析有用的质谱数据简便地登记到数据库中,而不需要操作员自己确认并筛选质谱数据。
在本发明所涉及的质谱分析数据处理装置中,能够采取如下构成:除了如上所述那样将包含具有预先决定的阈值以上的强度的质量峰的质谱数据登记到数据库之外,还根据质谱分析条件进行不同的各种处理。例如也能够采取如下构成:从在多个不同的断裂能量下获取到的MS2以上的质谱数据之中,将包含在规定断裂能量下测定到的质量峰的质谱数据登记到数据库中,或者,制作将多个质谱的质量峰的强度进行累计所得到的整合质谱数据等并登记到数据库中。另外,能够采取如下构成:对于通过测定包含多个化合物的试样所得到的质谱数据,将从色谱仪的柱中洗脱的洗脱时间(保留时间)处于预先决定的范围内的质谱数据(即,包含在规定的保留时间测定到的质量峰的质谱数据)登记到数据库中。还能够构成为:对于包含同位素元素的化合物的质谱数据,将包含与预期的同位素模式对应的质量峰的质谱数据登记到数据库中。
另外,为了解决上述课题而做出的本发明的第二方式为一种在将各种化合物的质谱数据与该化合物的名称及质谱分析条件一起保存的数据库中登记质谱数据的方法,所述方法包括以下步骤:
a)判定与化合物名称及质谱分析条件相关联的质谱数据中是否存在满足规定基准的质量峰;
b)将被判定为存在所述满足规定基准的质量峰的质谱数据、或基于被判定为存在所述满足规定基准的质量峰的质谱数据的质谱数据,与化合物名称及质谱分析条件一起登记到所述数据库中。
并且,为了解决上述课题而做出的本发明的第三方式为用于在数据库中登记质谱数据的质谱分析数据处理程序,所述数据库用于将各种化合物的质谱数据与该化合物的名称及质谱分析条件一起保存,所述质谱分析数据处理程序使计算机作为如下的部件进行动作:
a)质谱数据接收部,其接收与化合物名称及质谱分析条件相关联的质谱数据的输入;
b)判定部,其判定所述质谱数据中是否存在满足规定基准的质量峰;以及
c)数据库登记部,其将被判定为存在所述满足规定基准的质量峰的质谱数据、或基于被判定为存在所述满足规定基准的质量峰的质谱数据的质谱数据,与化合物名称及质谱分析条件一起登记到所述数据库中。
发明的效果
通过使用本发明所涉及的质谱分析数据处理装置、质谱分析数据处理方法或质谱分析数据处理程序,能够从在多个不同的质谱分析条件下获取到的质谱之中简便地筛选对分析有用的质谱并登记到数据库中。
附图说明
图1为本发明所涉及的质谱分析数据处理装置的一实施例的主要部分构成图。
图2为本发明所涉及的质谱分析数据处理方法的一实施例所涉及的流程图。
图3为通过使用色谱质谱联用仪的测定而获取的三维数据的一例。
图4为本实施例中的数据处理条件设定画面的一例。
图5为对于本实施例中的质量峰强度判定进行说明的图。
图6为对于本实施例中的整合质谱数据的制作进行说明的图。
图7为说明对本实施例中的质谱数据赋予了标志的状态的图。
图8为本实施例中的数据处理条件设定画面的另一例。
图9为关于本实施例的质谱分析数据处理方法的另一流程图。
图10为通过使用色谱质谱联用仪的测定而获取的三维数据的另一例。
具体实施方式
以下,参照附图对于本发明所涉及的质谱分析数据处理装置、质谱分析数据处理方法和质谱分析数据处理程序的实施例进行说明。本实施例的质谱分析数据处理装置2用于将由液相色谱质谱联用仪(LCMS)1获取到的质谱数据登记到化合物数据库中。图1中示出其主要部分构成。
液相色谱质谱联用仪1包括:色谱仪部,其具备用于将试样中包含的成分在时间上分离的柱;以及质谱分析部,其用于对通过该柱分离出的成分进行质谱分析。本实施例的液相色谱质谱联用仪1的质谱分析部为三重四极杆型的质谱分析部。在三重四极杆型的质谱分析部中,隔着碰撞室在前后具有质量分离部,对源自试样中的成分的离子边在后级质量分离部中进行质量扫描边进行测定,从而能够得到质谱(MS1谱),另外,对于使由前级质量分离部筛选出的具有特定质荷比的离子(前体离子)在碰撞室中断裂而生成的产物离子,边利用后级质量分离部进行质量扫描边进行测定,从而能够得到产物离子谱(MS2谱)。
在本实施例中,使用三重四极杆型的质谱分析部,但也能够使用其它结构的质谱分析部(例如单四极杆型的质谱分析部、离子阱飞行时间(IT-TOF)型的质谱分析部)。
单四极杆型质谱分析装置为仅具备一个质量分离部的通用的质谱分析装置,通过对源自从色谱仪部的柱洗脱出的成分的离子直接进行质量扫描并测定,从而得到质谱(MS1谱)。
三重四极杆型质谱分析装置为隔着碰撞室在前后具有质量分离部的质谱分析装置,从源自试样中的成分的离子中筛选具有特定质荷比的离子(前体离子),对使该前体离子断裂而生成的产物离子边质量扫描边进行测定,从而得到产物离子谱(MS2谱)。
IT-TOF型质谱分析装置为具有离子阱和飞行时间型质量分离部的质谱分析装置,在将前体离子的筛选和断裂重复进行一次或多次后,对生成的产物离子边质量扫描边进行测定,从而得到MSn谱(n为2以上的整数)。
另外,在本实施例中,使质谱分析数据处理装置与色谱质谱联用仪构成为一体,但也能够将由单独的色谱质谱联用仪获取到的质谱数据输入到质谱分析数据处理装置中来进行处理。
本实施例的质谱分析数据处理装置2除了具备存储部20、化合物数据库21之外,还具备质谱数据接收部22、色谱峰提取部23、质谱制作部24、质量峰提取部25、质量峰强度判定部26、整合质谱制作部27、质谱分析条件判定部28、保留时间判定部29、同位素判定部30以及数据库登记部31,来作为功能块。质谱分析数据处理装置2的实体为个人计算机,这些功能块是通过在计算机上执行质谱分析数据处理程序来具现化的。另外,质谱分析数据处理装置2连接有输入部3、显示部4。
以下,参照图2的流程图说明如下的例子:在本实施例的质谱分析数据处理装置2中,利用MS2扫描分析中的、多种前体离子(此处为离子A和离子B)与使各前体离子断裂时的多个碰撞能量值(从5V至50V,以5V为增量,10种值)的组合不同的、20种的质谱分析条件,对化合物进行质谱分析,来获取三维数据(相对于时间轴和质荷比轴这两个轴的离子检测强度的数据),对它们进行处理。
当决定目标化合物的质谱分析条件并指示开始测定时,该化合物的标准品被导入到液相色谱质谱联用仪1的色谱仪部。被导入到色谱仪部的目标化合物在其保留时间段(以该化合物的保留时间为中心的时间段)从色谱仪部的柱中洗脱,并被导入到离子化部。由离子化部生成的离子在被导入到前级质量分离部来从它们之中筛选前体离子A(或B)后,被导入到施加了碰撞能量(5V~50V)的碰撞室中。在碰撞室中,前体离子断裂而生成产物离子,对该产物离子在后级质量分离部中进行质量扫描并进行测定。通过在上述20种质谱分析条件中的各质谱分析条件下执行上述操作,来针对各质谱分析条件得到三维数据。图3中示出三维数据的一例。将所得到的三维数据与化合物名称及质谱分析条件相关联地保存到质谱分析数据处理装置2的存储部20中。
当用户指定存储部20中保存的三维数据并指示开始该数据的处理时,质谱数据接收部22显示如图4所示的数据处理条件设定画面。
数据处理条件设定画面具备:用于选择三维数据是否为通过测定标准品所得到的数据的输入部、以及用于决定三维数据的处理的类型(强度判定、整合质谱数据的制作、质谱分析条件判定)的输入部。此处,对以所有类型处理三维数据的情况的例子进行说明,但并不一定必须以所有类型进行数据处理。
当用户在数据处理条件设定画面上进行上述设定并按下开始按钮时(步骤S1),质谱数据接收部22读取所指定的三维数据(步骤S2)。接着,色谱峰提取部23通过对三维数据的时间轴上的各时间点的离子的测定强度进行总计来制作总离子色谱(TIC)数据,从总离子色谱数据提取峰(步骤S3)。关于色谱的峰的提取,能够通过例如将色谱的斜率变成预先决定的值以上的时间点设为峰开始点,然后将色谱的斜率变成预先决定的值以下的时间点设为峰结束点等以往公知的方法进行。
当提取出总离子色谱的峰时,质谱制作部24在总离子色谱的峰顶的保留时间处将所述三维数据沿质荷比轴方向切出,来制作质谱数据(步骤S4)。或者,也可以通过将在以峰顶的保留时间为中心的规定时间范围内获取到的多次的质谱数据沿时间轴方向进行平均,来制作质谱数据。能够由用户适当地决定通过哪种方法来制作质谱数据、以及后者的方法中的时间范围。在本实施例中,为了处理三维数据,而包括了制作总离子色谱和质谱数据的工序,但在对预先制作出的质谱数据进行处理的情况下不需要步骤S3和S4的处理。
在本实施例中,如上所述,以进行强度判定的方式决定了数据处理条件(步骤S5中为“是”)。当针对各质谱分析条件的三维数据生成质谱数据时,质量峰提取部25提取各质谱数据中强度最大的质量峰(基峰、图2中记载为“BP”)。接着,质量峰强度判定部26判定所提取出的基峰的强度是否超过预先决定的阈值(即,判定是否存在超过阈值的强度的质量峰),对于包含超过该阈值的质量峰(步骤S51中为“是”)的质谱数据(图5的(a))赋予峰强度标志(图7)。利用数据库登记部31将赋予了该标志的质谱数据与化合物名称及质谱分析条件一起登记到化合物数据库21(图2中记载为“DB”)中(步骤S52)。不将基峰的强度为阈值以下(步骤S51中为“否”)的质谱数据(图5的(b))登记到化合物数据库21中。赋予了峰强度标志并被保存到化合物数据库21中的质谱数据例如用于在对试样中包含的未知成分进行鉴定时的图案匹配。在将质谱数据登记到化合物数据库21中时,可以将实测强度的质谱数据直接登记,或者也可以以使基峰的强度成为规定值的方式使质谱数据整体进行标准化并登记。此外,在数据处理条件中不包含强度判定的情况下(步骤S5中为“否”)直接进入后续的步骤S6。
在本实施例中,如上所述,以进行整合质谱数据的制作的方式决定了数据处理条件(步骤S6中为“是”)。于是,整合质谱制作部27判定所指定的质谱数据是否包含化合物名称及前体离子的种类相同而仅碰撞能量值不同的质量峰(步骤S61)。然后,制作将符合的质谱数据的峰强度进行累计所得到的整合质谱数据21(步骤S62。图6),赋予整合数据标志(图7)。利用数据库登记部31还将赋予了该标志的质谱数据与化合物名称及质谱分析条件一起登记到化合物数据库21中(步骤S63)。该整合质谱数据成为穷尽地包含与从目标化合物生成的离子对应的质量峰的质谱数据。整合质谱数据被赋予整合标志并被保存到化合物数据库中。此外,在数据处理条件中不包含整合谱的制作的情况下(步骤S6中为“否”),直接进入后续的步骤S7。
赋予了整合标志的整合质谱数据例如用于基于未知成分的实测质谱上的质量峰是否全部被包含在整合质谱数据中等来鉴定该成分等目的。此时,当对于未知成分也将在多个质谱分析条件下分别获取到的实测质谱数据进行整合来制作整合实测质谱数据,并将其与保存在化合物数据库21中的整合质谱数据进行比较时,能够以更高精度鉴定未知成分。此外,关于由整合质谱制作部27进行的整合质谱数据的制作,除了如上所述那样对全部质谱数据的质量峰强度进行累计之外,还能够求出相同质荷比的质量峰的平均强度,或者从相同质荷比的质量峰之中提取最大强度的质量峰。关于在制作整合质谱数据时进行的这些处理,可以直接使用实测的质量峰强度来进行,或者也可以将实测的质量峰强度进行标准化后进行。例如,在要整合的质谱间的质量峰强度的偏差大的情况下,优选在将质量峰强度进行标准化(例如以使各质谱的基峰的强度变得相同的方式变更强度)后进行整合。
在本实施例中,如上所述,以进行质谱分析条件判定的方式决定了数据处理条件(步骤S7中为“是”)。于是,质谱分析条件判定部28判定各质谱数据的质谱分析条件中设定的碰撞能量(本实施例中为10种CE值)是否与预先决定的值(此处为10V、30V、50V这三个)一致(步骤S71),对一致的质谱数据赋予碰撞能量(CE)标志(图7)。利用数据库登记部31还将赋予了该标志的质谱数据与化合物名称及质谱分析条件一起登记到化合物数据库21中(步骤S72)。在将质谱数据登记到化合物数据库21中时,可以直接登记实测强度的质谱数据,或者也可以以使基峰的强度成为规定值的方式将质谱数据整体标准化并登记。例如为了决定在将试样中的目标成分进行定量时进行的多反应监测(MRM:MultipleReactionMonitoring)测定中的最佳的碰撞能量值,而参考赋予了CE标志的质谱数据。上述预先决定的碰撞能量值也可以由用户每次在上述数据处理条件设定画面上决定。
在上述实施例中,说明了将使用目标化合物的标准品测定到的质谱数据登记到化合物数据库中的流程,但存在像生物体代谢产物或环境试样等中包含的化合物那样难以获取标准品、或者标准品的纯度低的情况。以下,说明在这种情况下进行的数据处理。在该情况下,用户在数据处理条件设定画面选择“非标准品”,接受该选择并在数据处理条件设定画面显示图4所示的各项目以及用于选择保留时间判定和同位素判定的输入部(图8)。此处,参照图9的流程图说明进行保留时间判定和同位素判定这两者的例子。
当将还包含除目标化合物以外的化合物的试样导入到色谱仪部时,将目标化合物和除其以外的化合物(污染化合物)利用柱在时间上分离,导入到质谱分析装置。当将从柱中洗脱出的成分在上述20种质谱分析条件下进行测定时,针对目标化合物和污染化合物这两者,得到包含色谱的峰和质量峰的三维数据。将其一例示于图10。
当用户在数据处理条件设定画面进行上述设定并按下开始按钮时(步骤S1),质谱数据接收部22读取三维数据(步骤S2)。然后,色谱峰提取部23制作将各时间点的质荷比轴方向的值进行总计所得到的总离子色谱数据(步骤S3),从总离子色谱数据提取峰。在该时间点提取与试样中包含的化合物分别对应的多个峰。
当从总离子色谱数据提取出多个峰时,质谱制作部24通过在总离子色谱的各峰顶的保留时间处切出三维数据,从而制作质谱数据(步骤S4)。或者,也可以通过将在以峰顶的保留时间为中心的规定时间范围内获取到的多次的质谱数据沿时间轴方向进行平均,从而制作质谱数据。由此,制作多个质谱数据。步骤S1至S4与图2的流程图同样。
在本实施例中,如上所述,以进行保留时间判定的方式决定了数据处理条件(步骤S8中为“是”)。此处,保留时间判定部29确认获取到各质谱数据的时间(保留时间),判定是否与预先设定的目标化合物的保留时间(RT)一致(步骤S81)。然后,对保留时间一致的质谱数据赋予保留时间标志,并登记到化合物数据库21中(步骤S82)。由此,还从对包含污染化合物的试样进行质谱分析所得到的三维数据中,将目标化合物的质谱数据正确地登记到化合物数据库21中。在本例中,在制作总离子质量色谱数据后基于保留时间选择出目标化合物的质谱数据,但也可以在色谱的指定了峰顶的时间点仅选择出目标化合物的峰(执行步骤S81),基于该峰制作质谱数据。
通常,在目标化合物的保留时间未知的情况下判定同位素模式,但在本实施例中,如上所述,以除了进行保留时间判定之外还进行同位素模式判定的方式决定了数据处理条件(步骤S9中为“是”)。于是,同位素模式判定部30判定通过上述工序制作出的质谱数据中是否存在反映了根据目标化合物中包含的元素预测的同位素模式的质量峰(步骤S91)。然后,对反映了所预测的同位素模式的质谱数据赋予同位素确认标志,并登记到化合物数据库21中(步骤S92)。该同位素确认标志也与上述保留时间标志同样地,意味着判定为该质谱数据是目标化合物的质谱数据。
上述实施例为一例,可以遵照本发明的主旨适当地变更。
在上述实施例中,依次执行了强度判定、整合质谱数据的制作、分析条件判定,但它们的顺序能够适当地变更。保留时间判定和同位素判定也同样地能够适当地变更顺序。
在上述实施例中,说明了对由液相色谱质谱联用仪获取到的三维数据进行处理的例子,但对于由气相色谱质谱联用仪获取到的三维数据也能够同样地进行处理。另外,对于通过不使用色谱仪而仅利用质谱分析装置进行测定所获取到的质谱数据,也能够与上述同样地处理。在该情况下,不需要基于总离子色谱数据制作质谱数据的处理。此外,在该情况下,无法进行保留时间判定,因此理想的是使用标准品的化合物来获取质谱数据。
附图标记说明
1:液相色谱质谱联用仪;2:质谱分析数据处理装置;20:存储部;21:化合物数据库;22:质谱数据接收部;23:色谱峰提取部;24:质谱制作部;25:质量峰提取部;26:质量峰强度判定部;27:整合质谱制作部;28:质谱分析条件判定部;29:保留时间判定部;30:同位素模式判定部;31:数据库登记部;3:输入部;4:显示部。
Claims (7)
1.一种质谱分析数据处理装置,具备将各种化合物的质谱数据与该化合物的名称及质谱分析条件一起保存的数据库,所述质谱分析数据处理装置的特征在于,具备:
a)质谱数据接收部,其接收与化合物名称及质谱分析条件相关联的质谱数据的输入;
b)判定部,其判定所述质谱数据中是否存在满足规定基准的质量峰;以及
c)数据库登记部,其将被判定为存在所述满足规定基准的质量峰的质谱数据、或基于被判定为存在所述满足规定基准的质量峰的质谱数据的质谱数据,与化合物名称及质谱分析条件一起登记到所述数据库中,
其中,所述质谱数据为通过对产物离子进行测定而获取到的多个MSn谱数据,所述产物离子是使前体离子断裂一次或多次而生成的,n为2以上的整数,
所述判定部判定质谱数据是否为仅质谱分析条件中的用于使前体离子断裂的断裂能量的值不同的质谱数据,
所述数据库登记部制作整合质谱数据,该整合质谱数据是将仅所述断裂能量的值不同的质谱数据进行整合而成的。
2.根据权利要求1所述的质谱分析数据处理装置,其特征在于,
所述规定基准是具有超过预先决定的阈值的强度。
3.根据权利要求1所述的质谱分析数据处理装置,其特征在于,
所述判定部判定所述质谱分析条件中的用于使前体离子断裂的断裂能量的值是否为预先决定的值,
所述数据库登记部将所述断裂能量的值为预先决定的值的质谱数据登记到所述数据库中。
4.根据权利要求1所述的质谱分析数据处理装置,其特征在于,
所述质谱数据为通过色谱质谱联用仪获取到的包含时间轴的数据的三维数据,
所述判定部判定质谱数据是否为在预先决定的保留时间获取到的质谱数据,
所述数据库登记部将所述在预先决定的保留时间获取到的质谱数据登记到所述数据库中。
5.根据权利要求1所述的质谱分析数据处理装置,其特征在于,
所述化合物为包含同位素元素的化合物,
所述判定部判定是否包含根据所述同位素元素预想的质量峰,
所述数据库登记部将包含所述预想的质量峰的质谱数据登记到所述数据库中。
6.一种质谱分析数据处理方法,在将各种化合物的质谱数据与该化合物的名称及质谱分析条件一起保存的数据库中登记质谱数据,所述质谱分析数据处理方法的特征在于,包括以下步骤:
a)判定与化合物名称及质谱分析条件相关联的质谱数据中是否存在满足规定基准的质量峰,
b)将被判定为存在所述满足规定基准的质量峰的质谱数据、或基于被判定为存在所述满足规定基准的质量峰的质谱数据的质谱数据,与化合物名称及质谱分析条件一起登记到所述数据库中,
c)判定所述质谱数据是否为仅质谱分析条件中的用于使前体离子断裂的断裂能量的值不同的质谱数据,
d)制作整合质谱数据,该整合质谱数据是将仅所述断裂能量的值不同的质谱数据进行整合而成的,
其中,所述质谱数据为通过对产物离子进行测定而获取到的多个MSn谱数据,所述产物离子是使前体离子断裂一次或多次而生成的,n为2以上的整数。
7.一种非易失性计算机可读介质,存储质谱分析数据处理程序,所述质谱分析数据处理程序用于在将各种化合物的质谱数据与该化合物的名称及质谱分析条件一起保存的数据库中登记质谱数据,所述非易失性计算机可读介质的特征在于,所述质谱分析数据处理程序使计算机作为如下的部件进行动作:
a)质谱数据接收部,其接收与化合物名称及质谱分析条件相关联的质谱数据的输入;
b)判定部,其判定所述质谱数据中是否存在满足规定基准的质量峰;以及
c)数据库登记部,其将被判定为存在所述满足规定基准的质量峰的质谱数据、或基于被判定为存在所述满足规定基准的质量峰的质谱数据的质谱数据,与化合物名称及质谱分析条件一起登记到所述数据库中,
其中,所述质谱数据为通过对产物离子进行测定而获取到的多个MSn谱数据,所述产物离子是使前体离子断裂一次或多次而生成的,n为2以上的整数,
所述判定部判定质谱数据是否为仅质谱分析条件中的用于使前体离子断裂的断裂能量的值不同的质谱数据,
所述数据库登记部制作整合质谱数据,该整合质谱数据是将仅所述断裂能量的值不同的质谱数据进行整合而成的。
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Citations (3)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
CN101263391A (zh) * | 2005-09-12 | 2008-09-10 | 菲诺梅诺米发现公司 | 通过测量维生素e-相关的代谢物诊断结肠直肠癌和卵巢癌的方法 |
CN105051526A (zh) * | 2013-03-26 | 2015-11-11 | 株式会社岛津制作所 | 质量分析装置 |
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