CN107058582A - 基于KASP检测β‑酪蛋白基因型的方法 - Google Patents
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Abstract
本发明涉及一种基于KASP检测β‑酪蛋白基因型的方法,包括如下步骤:S1:根据β‑酪蛋白的碱基序列,设计至少一种引物;S2:建立PCR体系,该PCR体系包括DNA、KASP Master Mix以及由步骤S1中的至少一种引物组成的混合引物;S3:设置空白对照;S4:PCR扩增;S5:扫描数据,得到β‑酪蛋白的基因型。本发明DNA样本需求低,成本低,检测结果准确,并且可支持低、中或高通量研究以及单个重复实验,灵活性强。
Description
技术领域
本发明涉及基因工程技术领域,具体涉及一种基于KASP检测β-酪蛋白基因型的方法。
背景技术
A2β-酪蛋白是现代乳牛β-酪蛋白的天然原型。基于A2β-酪蛋白制成的配方奶粉,可能与母乳更接近,更有利于促进婴幼儿的生长发育。而且,A2奶已经对澳大利亚、英国及美国等国家的奶业产生重大影响,对于奶牛育种者来说,构建A2核心群是最具成本效益的。
β-酪蛋白是人乳和牛奶内的一种主要蛋白,且广泛存在于各钟奶制品中。牛奶中的β-酪蛋白有两个主要的变异型,A1和A2,及一些罕见的亚变异型。由于自然基因突变,出现了A1蛋白质的变体,而且通过广泛牧养,今天全球乳牛均普遍含A1β-酪蛋白。A1和A2β-酪蛋白的蛋白质结构存在差异,A1型β-酪蛋白的第67位为组氨酸,因此其前7个氨基酸残基可以被裂解产生β-酪啡肽-7(BCM-7)。A2型的第67位则为脯氨酸,则不会生成BCM-7。正是这种结构差异,使A2β-酪蛋白比A1更接近天然母乳中的蛋白质。实验证明A2β-酪蛋白有潜力改善宝宝的消化功能,促进宝宝对营养物质的吸收,呵护宝宝稚嫩的消化系统;含有A2β-酪蛋白的配方,从源头上最大程度地避免了(由A1酪蛋白引起的)不良的健康反应。这个观点已得到全球100多项科学论文的支持和认同。
目前检测β-酪蛋白基因型的方法有酶切、测序、荧光定量PCR技术等,然而,上述方法费事、费力且成本高。
因此,现有的β-酪蛋白基因型的检测方法仍有改善的必要。
发明内容
第一代分子标记的代表是RFLP,即限制性片段长度多态性,在对研究样品基因组信息不清楚的情况下,使用随机选择性酶切以后进行电泳,利用众多条带的多态性进行区分,目前已基本被淘汰;
第二代分子标记是SSR和STR,即简单序列重复数,目前还被广泛应用,但存在等位基因数目过多,人工判别不准确,实验可重复性差,分布密度不足等问题,正在被第三代标记技术替代;
随着进入后基因组时代,第三代分子标记应运而生,就是SNP,即单核苷酸多态性。它是指在基因组水平上由单个核苷酸的变异而引起的一种DNA序列多态性。与第一二代不同,SNP具有分布密度高、遗传稳定性好、二等位基因型等特点,就如二进位制相对于十进位制,更适合于计算机算法一样,更容易实现高通量和自动化检测。KASP是竞争性等位基因特异性PCR(Kompetitive Allele Specific PCR)的缩写,可在广泛的基因组DNA样品中(甚至是一些复杂基因组的DNA样品),对SNPs和特定位点上的InDels进行精准的双等位基因判断。
为解决现有技术存在的不足,本发明结合第三代分子标记技术,提供了一种基于KASP检测β-酪蛋白基因型的方法,包括如下步骤:
S1:根据β-酪蛋白的碱基序列,设计至少一种引物;
S2:建立PCR体系,该PCR体系包括DNA、KASP Master Mix以及由步骤S1中的至少一种引物组成的混合引物;
S3:设置空白对照;
S4:PCR扩增;
S5:扫描数据,得到β-酪蛋白的基因型。
其中,所述步骤S1中,所设计的引物包括如下两种:
Master mix:5’-GAT GTT TTG TGG GAG GCT GTT AG-3’
5’-GGA TGT TTT GTG GGA GGC TGT TAT-3’
Primer mix:5’-TCT ATC CCT TCC CTG GGC CCA T-3’。
其中,所述步骤S2中,所述PCR体系介于4-6uL,其中,DNA的含量介于2-3uL,KASPMaster Mix的含量介于2-3uL,混合引物的含量介于0.03-0.10uL。
其中,所述步骤S2中,所述PCR体系为5.07uL,其中包括2.5uL DNA、2.5uL KASPMaster Mix以及0.07uL混合引物;所述混合引物由Master mix、Primer mix以及ddH2O组成,其中,Master mix、Primer mix以及ddH2O的体积份数分别介于20-30份、25-35份以及40-55份,且Master mix中,两条末端碱基不同的等位基因正向引物的量相同。
其中,所述步骤S3中,所述空白对照体系为将PCR体系中的DNA以等量ddH2O代替所得。
其中,所述步骤S4中,PCR扩增包括:
S41:在90-100摄氏度的温度下激活10-20分钟,90-100摄氏度的温度下变性15-25秒,50-65摄氏度的温度下退火和延伸55-65秒,进行8-12个循环;
S42:在90-100摄氏度的温度下变性15-25秒,50-60摄氏度的温度下退火和延伸55-65秒,进行25-30个循环;
S43:在90-100摄氏度的温度下变性15-25秒,50-60摄氏度的温度下退火和延伸55-65秒,进行2-5个循环。
其中,所述步骤S2中,PCR体系中的DNA选自奶牛血液,其制备方法如下:
S21:取离心管,加入预定体积的细胞裂解液,取溶化后的血块样品置于离心管中;
S22:匀浆仪磨碎、离心、弃上清,取底部的细胞核沉淀;
S23:重复步骤S21-S22,进一步离心弃上清;
S24:加缓冲液GS、Proteinase K溶液、涡旋混匀,加入缓冲液GB,再次涡旋混匀,置于分子杂交炉中消化预定时间;
S25:加入无水乙醇,充分混匀直至出现絮状沉淀;
S26:取吸附柱CB3,置于一收集管中,将步骤S25得到的带有絮状沉淀的溶液加入到吸附柱中,离心、弃废液;
S27:向吸附柱中加入已加入无水乙醇的缓冲液GD、离心、弃废液;
S28:向吸附柱中加入已加入无水乙醇的漂洗液PW、离心、弃废液;
S29:重复步骤S28;
S210:空甩离心、弃废液;
S211:将吸附柱转入新的EP离心管中,室温下开盖放置数分钟,将残余的漂洗液挥发掉;
S212:向吸附柱膜中间位置悬空加入洗脱缓冲液TB,室温放置数分钟,使DNA沉淀充分溶解;
S213:离心、弃吸附柱,收集DNA溶液,通过琼脂糖凝胶电泳和核酸分析仪检测DNA溶液的质量和浓度。
其中,所述步骤S2中,PCR体系中的DNA提取自奶牛血液,其制备方法如下:
S21:取若干2毫升EP离心管,每支加入700-800uL的细胞裂解液,取溶化后的血块样品置于离心管中,血块样品的体积介于0.3-0.6mL;
S22:匀浆仪磨碎、离心、弃上清,取底部的细胞核沉淀;
S23:重复步骤S21-S22,每支离心管再加入400-600uL的细胞裂解液,进一步离心弃上清;
S24:加200-300uL缓冲液GS、20-30uL Proteinase K溶液、涡旋混匀,加入200-300uL缓冲液GB,再次涡旋混匀,置于分子杂交炉中消化3-5h;
S25:加入150-250uL无水乙醇,充分混匀直至出现絮状沉淀;
S26:取吸附柱CB3,置于一收集管中,将步骤S25得到的带有絮状沉淀的溶液加入到吸附柱中,离心、弃废液;
S27:向吸附柱中加入400-600uL已加入无水乙醇的缓冲液GD、离心、弃废液;
S28:向吸附柱中加入600-800uL已加入无水乙醇的漂洗液PW、离心、弃废液;
S29:重复步骤S28;
S210:空甩离心、弃废液;
S211:将吸附柱转入新的EP离心管中,室温下开盖放置数分钟,将残余的漂洗液挥发掉;
S212:向吸附柱膜中间位置悬空加入80-100uL洗脱缓冲液TB,室温放置数分钟,使DNA沉淀充分溶解;
S213:离心、弃吸附柱,收集DNA溶液,通过琼脂糖凝胶电泳和核酸分析仪检测DNA溶液的质量和浓度。
其中,所述步骤S2中,PCR体系中的DNA提取自奶牛精液,其制备方法如下:
S21:取离心管,加冻精及生理盐水,涡旋混匀,离心、弃上清;
S22:再次加入生理盐水,离心、弃上清;
S23:向沉淀中加入牛冻精裂解液及SDS以溶解沉淀,之后加入Proteinase K溶液,混匀;
S24:将步骤S23所得溶液在分子杂交炉中消化预定时间;
S25:加入饱和食盐水,混匀,低温静置后低温离心,收集上清、弃沉淀;
S26:在上清液中加入低温无水乙醇,混匀,离心、弃上清;
S27:加入乙醇溶液,混匀,离心、弃上清;
S28:再次加入乙醇溶液,混匀,离心、弃上清,之后开盖放置预定时间,残余的乙醇彻底挥发;
S29:加入TB溶液,低温下过夜溶解DNA沉淀;
S210:通过琼脂糖凝胶电泳和核酸分析仪检测DNA溶液的质量和浓度。
其中,所述步骤S2中,PCR体系中的DNA选择奶牛精液,其制备方法如下:
S21:取2毫升EP离心管,加冻精及400-600uL生理盐水,涡旋混匀,离心、弃上清;
S22:再次加入400-600uL生理盐水,离心、弃上清;
S23:向沉淀中加入300-500uL牛冻精裂解液及80-120uL SDS以溶解沉淀,之后加入10-30uL Proteinase K溶液,混匀;
S24:将步骤S23所得溶液在分子杂交炉中消化预定时间;
S25:加入200-400uL饱和食盐水,混匀,低温静置后低温离心,收集上清、弃沉淀;
S26:在上清液中加入800-1200uL低温无水乙醇,混匀,离心、弃上清;
S27:加入400-600uL乙醇溶液,混匀,离心、弃上清;
S28:再次加入400-600uL乙醇溶液,混匀,离心、弃上清,之后开盖放置预定时间,使残余的乙醇彻底挥发;
S29:加入150-250uL TB溶液,低温下过夜溶解DNA沉淀;
S210:通过琼脂糖凝胶电泳和核酸分析仪检测DNA溶液的质量和浓度。
本发明提供的基于KASP检测β-酪蛋白基因型的方法,DNA样本需求低,成本低,检测结果准确,并且可支持低、中或高通量研究以及单个重复实验,灵活性强。
附图说明
图1:根据本发明的基因型检测得到的β-酪蛋白的基因型。
具体实施方式
为了对本发明的技术方案及有益效果有更进一步的了解,下面结合详细说明本发明的技术方案及其产生的有益效果。
本发明提供的基于KASP检测β-酪蛋白基因型的方法,具体实施时,本发明提供了如下的两个优选实施例:
实施例1:
S1:根据β-酪蛋白的碱基序列,设计引物:
Master mix:5’-GAT GTT TTG TGG GAG GCT GTT AG-3’
5’-GGA TGT TTT GTG GGA GGC TGT TAT-3’
Primer mix:5’-TCT ATC CCT TCC CTG GGC CCA T-3’。
S2:建立PCR体系,该PCR体系包括2.5uL DNA、2.5uL KASP Master Mix(LGCGenomics,Hoddeston,UK)以及0.07uL混合引物。
S3:将PCR体系中的DNA以等量ddH2O代替,以作为空白对照。
S4:进行PCR扩增:
S41:在94摄氏度的温度下激活15分钟,94摄氏度的温度下变性20秒,55-61摄氏度的温度下退火和延伸60秒,进行10个循环;
S42:在94摄氏度的温度下变性20秒,55摄氏度的温度下退火和延伸60秒,进行26个循环;
S43:在94摄氏度的温度下变性20秒,57摄氏度的温度下退火和延伸60秒,进行3个循环。
S5:参照《ABI7900HT Fast RealTime PCR system实验操作规程》进行数据扫描,得到β-酪蛋白的基因型。
其中,所述步骤S2中,PCR体系中的DNA选自奶牛血液,本实施例中利用天根生化科技有限公司(北京)的血液基因组DNA提取试剂盒DP318从血块中提取牛的基因组DNA,在获取DNA之前,需要先在缓冲液GD和漂洗液PW中加入相应体积的无水乙醇
所述奶牛血液中的DNA的具体获取方法如下:
S21:取若干2毫升EP离心管,每支加入750uL的细胞裂解液CL,取牛血块样品,溶化后剪取大约0.5mL置于离心管中;
S22:匀浆仪磨碎、10000r/min离心1min、弃上清,取底部的细胞核沉淀;
S23:重复步骤S21-S22,每支离心管再加入500uL的细胞裂解液CL,使用涡旋仪混匀,进一步离心弃上清;
S24:加250uL缓冲液GS、25uL Proteinase K溶液、涡旋混匀,加入250uL缓冲液GB,再次涡旋混匀,置于56℃分子杂交炉中消化4h;
S25:加入150-250uL无水乙醇,充分混匀直至出现絮状沉淀;
S26:取吸附柱CB3,置于一收集管中,将步骤S25得到的带有絮状沉淀的溶液加入到吸附柱中,12000r/min离心1min、弃废液;
S27:向吸附柱中加入500uL已加入无水乙醇的缓冲液GD、12000r/min离心1min、弃废液;
S28:向吸附柱中加入700uL已加入无水乙醇的漂洗液PW、12000r/min离心1min、弃废液;
S29:重复步骤S28;
S210:空甩,12000r/min离心2min、弃废液;
S211:将吸附柱转入新的1.5ml EP离心管中,室温下开盖放置数分钟,将残余的漂洗液挥发掉;
S212:向吸附柱膜中间位置悬空加入80-100uL洗脱缓冲液TB(56℃提前预热),室温放置10min,使DNA沉淀充分溶解;
S213:12000r/min离心2min、弃吸附柱,收集DNA溶液,通过1%琼脂糖凝胶电泳和核酸分析仪检测DNA溶液的质量和浓度。
将检测合格的基因组DNA置于-20℃长期保存备用。
实施例2:
S1:根据β-酪蛋白的碱基序列,设计引物:
Master mix:5’-GAT GTT TTG TGG GAG GCT GTT AG-3’
5’-GGA TGT TTT GTG GGA GGC TGT TAT-3’
Primer mix:5’-TCT ATC CCT TCC CTG GGC CCA T-3’。
S2:建立PCR体系,该PCR体系包括2.5uL DNA、2.5uL KASP Master Mix(LGCGenomics,Hoddeston,UK)以及0.07uL混合引物。
S3:将PCR体系中的DNA以等量ddH2O代替,以作为空白对照。
S4:进行PCR扩增:
S41:在94摄氏度的温度下激活15分钟,94摄氏度的温度下变性20秒,55-61摄氏度的温度下退火和延伸60秒,进行10个循环;
S42:在94摄氏度的温度下变性20秒,55摄氏度的温度下退火和延伸60秒,进行26个循环;
S43:在94摄氏度的温度下变性20秒,57摄氏度的温度下退火和延伸60秒,进行3个循环。
S5:参照《ABI7900HT Fast RealTime PCR system实验操作规程》进行数据扫描,得到β-酪蛋白的基因型。
本实施例中,所述步骤S2中,PCR体系中的DNA选择奶牛精液,其制备方法如下:
S21:取2毫升EP离心管,加冻精一支及500uL生理盐水,涡旋混匀,12000r/min离心1min、弃上清;
S22:再次加入500uL生理盐水,12000r/min离心1min、弃上清;
S23:向沉淀中加入400uL牛冻精裂解液(先加入60ml双蒸水后加0.5mol/L的EDTA(pH=8.0)2ml,1mol/L的Tris.Cl(pH=8.0)1ml,10%的SDS 10ml,DTT 0.77g,NaCl 0.29g,定容至80ml),及100uL20%的SDS以溶解沉淀,室温放置1-2分钟,涡旋,使沉淀完全溶于裂解液,之后加入20uL Proteinase K溶液,混匀;
S24:将步骤S23所得溶液在56℃分子杂交炉中消化20-22h;
S25:取出已消化好的样品,加入300uL饱和食盐水,混匀,低温下(冰箱)静置10分钟后4℃离心机中12000r/min离心10min,收集上清、弃沉淀;
S26:在上清液中加入1000uL低温无水乙醇,混匀,12000r/min离心1min、弃上清;
S27:加入500uL75%的乙醇溶液,混匀,12000r/min离心2min、弃上清;
S28:再次加入500uL75%的乙醇溶液,混匀,12000r/min离心2min、弃上清,之后开盖放置预定时间,使残余的乙醇彻底挥发;
S29:加入200μL 56℃的TB溶液,低温下过夜溶解DNA沉淀;
S210:通过1%琼脂糖凝胶电泳和核酸分析仪检测DNA溶液的质量和浓度。
将检测合格的基因组DNA置于-20℃长期保存备用。
本发明中,所谓的“Proteinase K溶液”,是指蛋白酶K溶液;所谓的缓冲液GS、缓冲液GB、缓冲液GD以及漂洗液PW,均选自天根试剂盒自带试剂DP318。
图1为根据本发明的基因型检测得到的β-酪蛋白的基因型图,结合图1可知:本发明利用KASP进行β-酪蛋白的基因型检测,对DNA样本的需求低,适于大批量样本检测,独立评价的准确性可达99.8%以上,且可支持低、中或高通量研究以及单个重复实验。
虽然本发明已利用上述较佳实施例进行说明,然其并非用以限定本发明的保护范围,任何本领域技术人员在不脱离本发明的精神和范围之内,相对上述实施例进行各种变动与修改仍属本发明所保护的范围,因此本发明的保护范围以权利要求书所界定的为准。
Claims (10)
1.一种基于KASP检测β-酪蛋白基因型的方法,其特征在于,包括如下步骤:
S1:根据β-酪蛋白的碱基序列,设计至少一种引物;
S2:建立PCR体系,该PCR体系包括DNA、KASP Master Mix以及由步骤S1中的至少一种引物组成的混合引物;
S3:设置空白对照;
S4:PCR扩增;
S5:扫描数据,得到β-酪蛋白的基因型。
2.如权利要求1所述的基于KASP检测β-酪蛋白基因型的方法,其特征在于:所述步骤S1中,所设计的引物包括如下两种:
Master mix:5’-GAT GTT TTG TGG GAG GCT GTT AG-3’
5’-GGA TGT TTT GTG GGA GGC TGT TAT-3’
Primer mix:5’-TCT ATC CCT TCC CTG GGC CCA T-3’。
3.如权利要求2所述的基于KASP检测β-酪蛋白基因型的方法,其特征在于:所述步骤S2中,所述PCR体系介于4-6uL,其中,DNA的含量介于2-3uL,KASP Master Mix的含量介于2-3uL,混合引物的含量介于0.03-0.10uL。
4.如权利要求3所述的基于KASP检测β-酪蛋白基因型的方法,其特征在于:所述步骤S2中,所述PCR体系为5.07uL,其中包括2.5uL DNA、2.5uL KASP Master Mix以及0.07uL混合引物;所述混合引物由Master mix、Primer mix以及ddH2O组成,其中,Master mix、Primermix以及ddH2O的体积份数分别介于20-30份、25-35份以及40-55份,且Master mix中,两条末端碱基不同的等位基因正向引物的量相同。
5.如权利要求1所述的基于KASP检测β-酪蛋白基因型的方法,其特征在于:所述步骤S3中,所述空白对照体系为将PCR体系中的DNA以等量ddH2O代替所得。
6.如权利要求1-5中任一项所述的基于KASP检测β-酪蛋白基因型的方法,其特征在于:所述步骤S4中,PCR扩增包括:
S41:在90-100摄氏度的温度下激活10-20分钟,90-100摄氏度的温度下变性15-25秒,50-65摄氏度的温度下退火和延伸55-65秒,进行8-12个循环;
S42:在90-100摄氏度的温度下变性15-25秒,50-60摄氏度的温度下退火和延伸55-65秒,进行25-30个循环;
S43:在90-100摄氏度的温度下变性15-25秒,50-60摄氏度的温度下退火和延伸55-65秒,进行2-5个循环。
7.如权利要求1所述的基于KASP检测β-酪蛋白基因型的方法,其特征在于:所述步骤S2中,PCR体系中的DNA提取自奶牛血液,其制备方法如下:
S21:取离心管,加入预定体积的细胞裂解液,取溶化后的血块样品置于离心管中;
S22:匀浆仪磨碎、离心、弃上清,取底部的细胞核沉淀;
S23:重复步骤S21-S22,进一步离心弃上清;
S24:加缓冲液GS、Proteinase K溶液、涡旋混匀,加入缓冲液GB,再次涡旋混匀,置于分子杂交炉中消化预定时间;
S25:加入无水乙醇,充分混匀直至出现絮状沉淀;
S26:取吸附柱CB3,置于一收集管中,将步骤S25得到的带有絮状沉淀的溶液加入到吸附柱中,离心、弃废液;
S27:向吸附柱中加入已加入无水乙醇的缓冲液GD、离心、弃废液;
S28:向吸附柱中加入已加入无水乙醇的漂洗液PW、离心、弃废液;
S29:重复步骤S28;
S210:空甩离心、弃废液;
S211:将吸附柱转入新的EP离心管中,室温下开盖放置数分钟,将残余的漂洗液挥发掉;
S212:向吸附柱膜中间位置悬空加入洗脱缓冲液TB,室温放置数分钟,使DNA沉淀充分溶解;
S213:离心、弃吸附柱,收集DNA溶液,通过琼脂糖凝胶电泳和核酸分析仪检测DNA溶液的质量和浓度。
8.如权利要求7所述的基于KASP检测β-酪蛋白基因型的方法,其特征在于:所述步骤S2中,PCR体系中的DNA提取自奶牛血液,其制备方法如下:
S21:取若干2毫升EP离心管,每支加入700-800uL的细胞裂解液,取溶化后的血块样品置于离心管中,血块样品的体积介于0.3-0.6mL;
S22:匀浆仪磨碎、离心、弃上清,取底部的细胞核沉淀;
S23:重复步骤S21-S22,每支离心管再加入400-600uL的细胞裂解液,进一步离心弃上清;
S24:加200-300uL缓冲液GS、20-30uL Proteinase K溶液、涡旋混匀,加入200-300uL缓冲液GB,再次涡旋混匀,置于分子杂交炉中消化3-5h;
S25:加入150-250uL无水乙醇,充分混匀直至出现絮状沉淀;
S26:取吸附柱CB3,置于一收集管中,将步骤S25得到的带有絮状沉淀的溶液加入到吸附柱中,离心、弃废液;
S27:向吸附柱中加入400-600uL已加入无水乙醇的缓冲液GD、离心、弃废液;
S28:向吸附柱中加入600-800uL已加入无水乙醇的漂洗液PW、离心、弃废液;
S29:重复步骤S28;
S210:空甩离心、弃废液;
S211:将吸附柱转入新的EP离心管中,室温下开盖放置数分钟,将残余的漂洗液挥发掉;
S212:向吸附柱膜中间位置悬空加入80-100uL洗脱缓冲液TB,室温放置数分钟,使DNA沉淀充分溶解;
S213:离心、弃吸附柱,收集DNA溶液,通过琼脂糖凝胶电泳和核酸分析仪检测DNA溶液的质量和浓度。
9.如权利要求1所述的基于KASP检测β-酪蛋白基因型的方法,其特征在于:所述步骤S2中,PCR体系中的DNA提取自奶牛精液,其制备方法如下:
S21:取离心管,加冻精及生理盐水,涡旋混匀,离心、弃上清;
S22:再次加入生理盐水,离心、弃上清;
S23:向沉淀中加入牛冻精裂解液及SDS以溶解沉淀,之后加入Proteinase K溶液,混匀;
S24:将步骤S23所得溶液在分子杂交炉中消化预定时间;
S25:加入饱和食盐水,混匀,低温静置后低温离心,收集上清、弃沉淀;
S26:在上清液中加入低温无水乙醇,混匀,离心、弃上清;
S27:加入乙醇溶液,混匀,离心、弃上清;
S28:再次加入乙醇溶液,混匀,离心、弃上清,之后开盖放置预定时间,残余的乙醇彻底挥发;
S29:加入TB溶液,低温下过夜溶解DNA沉淀;
S210:通过琼脂糖凝胶电泳和核酸分析仪检测DNA溶液的质量和浓度。
10.如权利要求9所述的基于KASP检测β-酪蛋白基因型的方法,其特征在于:所述步骤S2中,PCR体系中的DNA选择奶牛精液,其制备方法如下:
S21:取2毫升EP离心管,加冻精及400-600uL生理盐水,涡旋混匀,离心、弃上清;
S22:再次加入400-600uL生理盐水,离心、弃上清;
S23:向沉淀中加入300-500uL牛冻精裂解液及80-120uL SDS以溶解沉淀,之后加入10-30uL Proteinase K溶液,混匀;
S24:将步骤S23所得溶液在分子杂交炉中消化预定时间;
S25:加入200-400uL饱和食盐水,混匀,低温静置后低温离心,收集上清、弃沉淀;
S26:在上清液中加入800-1200uL低温无水乙醇,混匀,离心、弃上清;
S27:加入400-600uL乙醇溶液,混匀,离心、弃上清;
S28:再次加入400-600uL乙醇溶液,混匀,离心、弃上清,之后开盖放置预定时间,使残余的乙醇彻底挥发;
S29:加入150-250uL TB溶液,低温下过夜溶解DNA沉淀;
S210:通过琼脂糖凝胶电泳和核酸分析仪检测DNA溶液的质量和浓度。
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