KR102194349B1

KR102194349B1 - 제주 흑우 친자 감별용 단일염기다형성 마커 및 이의 용도

Info

Publication number: KR102194349B1
Application number: KR1020200051293A
Authority: KR
Inventors: 박세필; 김종주; 이윤미; 이승은
Original assignee: 제주대학교 산학협력단
Priority date: 2020-04-28
Filing date: 2020-04-28
Publication date: 2020-12-23
Also published as: WO2021221383A1

Abstract

본 발명은 단일염기다형성 마커를 포함하는 제주 흑우 친자 감별용 조성물 및 이를 포함하는 키트와 단일염기다형성 마커를 이용한 제주 흑우 친자 감별 방법을 제공한다.

Description

제주 흑우 친자 감별용 단일염기다형성 마커 및 이의 용도{Single nucleotide polymorphism markers for parentage testing in Jeju black cattle and the uses thereof}

본 발명은 단일염기다형성 마커를 포함하는 제주 흑우 친자 감별용 조성물에 관한 것이다.

제주 흑우는 일반 한우와 달리 검은 모색을 가진 한우의 한 품종으로, 선사시대 이후 제주도에서만 사육되어 온 토종 자원이다. 2002년 8월 동물유전자원 관련 국제기구 FAO에 제주 흑우가 우리나라 한우 품종 4종 중 1개 품종으로 등록되어 있으며, 일반 한우에 비해 몸에 유익한 지방산 성분이 일반 한우보다 많고 마블링이 뛰어나 각광받고 있다.

소의 모색은 품종의 특징을 구성하는 주요 심사대상 형질이며 개체 및 품종을 식별하는 수단으로도 이용될 수 있는 대표적인 질적 형질의 하나이다. 그러나, 외래종인 앵거스, 흑모화우, 홀스타인 역시 대표적인 흑모색 품종에 해당하여 모색만으로는 제주 흑우와 명확한 구별이 어려우며, 다른 품종의 소고기가 제주 흑우로 둔갑하는 일이 빈번하게 일어나는 문제가 있다.

이에, 제주 흑우의 도축, 유통, 소비 단계에서 소비자의 신뢰를 얻고, 생산이력제를 효율적으로 운용하기 위해, 제주 흑우의 개체 인식 능력과 혈통 확인 능력이 우수한 친자 감별용 마커의 개발이 요구되는 실정이다.

대한민국 공개특허 제10-2017-0073065호

본 발명의 목적은, 서열번호 1 내지 서열번호 125 중 단일염기다형성(single nucleotide polymorphism, SNP) 마커군을 검출 또는 증폭할 수 있는 제제를 포함하는, 제주 흑우 친자 감별용 마커 조성물을 제공하는 것이다.

본 발명의 다른 목적은, 상기 제주 흑우 친자 감별용 마커 조성물을 포함하는, 제주 흑우 친자 감별용 키트를 제공하는 것이다.

본 발명의 또 다른 목적은, 제주 흑우 친자 감별 방법을 제공하는 것이다.

본 발명의 일 실시예에 따르면, 서열번호 1 내지 125의 단일염기다형성(single nucleotide polymorphism, SNP) 마커군을 검출 또는 증폭할 수 있는 제제를 포함하는, 제주 흑우 친자 감별용 마커 조성물이 제공된다.

본 발명에서 "단일염기다형성(single nucleotide polymorphism, SNP) 마커"란, 개체 또는 종을 식별하기 위해 이용되는 DNA 서열 상의 단일 염기 다형성 대립인자 염기쌍을 의미한다. SNP는 비교적 그 빈도가 높고 안정하며 유전체 전체에 분포되어 있고 이에 의하여 개체의 유전적 다양성이 발생하므로, SNP 마커는 개체 간의 유전적 근접성을 알려주는 지표의 역할을 할 수 있다. SNP 마커는 일반적으로 단일 염기 다형성에 수반되는 표현형의 변화를 포함하지만 경우에 따라 그렇지 않을 수도 있다.

본 발명의 마커 조성물에서, 상기 제제는 상기 마커군을 구성하는 각각의 단일염기다형성 마커와 혼성화될 수 있는 프로브일 수 있다. 또한, 상기 제제는 상기 마커군을 구성하는 각각의 단일염기다형성 마커와 혼성화될 수 있는 125개의 프로브를 포함하고, 상기 프로브는 상기 각각의 마커의 단일염기다형성 부위의 염기를 포함하는 영역과 혼성화될 수 있다.

본 발명에서 "프로브"는 특정 뉴클레오타이드 서열에 혼성화될 수 있는 디옥시리보뉴클레오타이드 및 리보뉴클레오타이드를 포함하는 자연 또는 변형되는 모노머 또는 결합을 갖는 선형의 올리고머를 의미한다. 상기 혼성화는 SNP 마커를 검출 또는 증폭을 통해 구현될 수 있다. 바람직하게는, 상기 프로브는 유전자의 변이부위를 특이적으로 증폭할 수 있는 프라이머, 혼성화를 통해 검출 가능한 신호를 발생할 수 있는 앱타머 또는 상보적인 폴리뉴클레오타이드 등을 포함할 수 있다.

본 발명에서 “프라이머”는 짧은 자유 3’-말단 수산화기(Free 3’-OH기)를 가지는 염기서열로 상보적인 템플레이트(Template)와 염기쌍(base pair)을 형성할 수 있고 주형가닥의 복사를 위한 시작 지점으로 기능을 하는 짧은 서열을 의미한다.

또한, 상기 프로브로는, 상기 SNP 서열에 완전하게 상보적인 서열이 이용될 수 있으나, 특이적 혼성화를 방해하지 않는 범위 내에서 실질적으로 (substantially) 상보적인 서열을 이용하는 것도 가능하다.

본 발명의 다른 일 실시예에 따르면, 제주 흑우 친자 감별용 마커 조성물을 포함하는, 제주 흑우 친자 감별용 키트가 제공된다.

상기 키트는 RT-PCR(Reverse transcription polymerase chain reaction) 또는 DNA 칩일 수 있고, 필요에 따라 프라이머, 프로브, dNTP 및 완충용액을 더 포함할 수 있다.

예를 들어, RT-PCR 키트는, SNP 마커에 대한 특이적인 각각의 프라이머 쌍 외에도 테스트 튜브 또는 다른 적절한 컨테이너, 반응 완충액(pH 및 마그네슘 농도는 다양), 데옥시뉴클레오타이드(dNTPs), Taq-폴리머라아제 및 역전사효소와 같은 효소, DNase, RNAse 억제제, DEPC-수(DEPCwater), 멸균수 등을 포함할 수 있다. 또한 정량 대조군으로 사용되는 유전자에 특이적인 프라이머 쌍을 포함할 수 있다.

상기 DNA 칩 키트는, 일반적으로 편평한 고체 지지판, 전형적으로는 현미경용 슬라이드보다 크지 않은 유리표면에 핵산 종을 격자형 배열(gridded array)로 부착한 것으로, 칩 표면에 핵산이 일정하게 배열되어, DNA 칩상의 핵산과 칩 표면에 처리된 용액 내에 포함된 상보적인 핵산 간에 다중 혼성화(hybridization) 반응이 일어나 대량 병력 분석이 가능하도록 한다.

본 발명의 다른 일 실시예에 따르면, 제주 흑우 친자 감별용 마커 조성물을 포함하는, 제주 흑우 친자 감별용 마이크로어레이가 제공된다.

본 발명의 또 다른 일 실시예에 따르면, 서열번호 1 내지 서열번호 125로 표시되는 염기서열로 이루어진 군으로부터 선택되는 어느 하나 이상의 폴리뉴클레오티드를 포함하는, 제주 흑우 친자 감별용 단일염기다형성 마커 조성물이 제공된다.

본 발명에서 “단일염기다형성(Single Nucleotide Polymorphism, SNP)는 유전체 상에서 A, T, C, G로 구성되는 염기서열 중 어느 하나의 염기가 다른 염기로 변한 것을 의미한다.

본 발명에서 “마커”란 제주 흑우의 개체 인식 및 혈통 확인이 가능하여 친자 판별을 할 수 있는 물질을 의미한다.

본 발명의 일 실시예에 따르면,

개체의 시료로부터 핵산 분자를 분리하는 단계; 및

상기 핵산 분자에서 서열번호 1 내지 서열번호 125로 표시되는 염기서열 중 어느 한 서열의 36번째 뉴클레오티드의 유전자형을 확인하는 단계를 포함하는, 제주 흑우의 친자 감별 방법이 제공된다.

본 발명에서 "개체"는, 제주 흑우의 생산 이력을 확인하거나, 친자 관계를 확인하고자 하는 대상인 소를 의미한다.

상기 개체로부터 얻어진 시료는 개체의 근육, 표피, 혈액, 뼈 또는 장기로부터 수득되는 것일 수 있고, 바람직하게는 근육 또는 혈액으로부터 수득 되는 것이나, 이에 한정되는 것은 아니다.

상기 시료로부터 핵산 분자를 분리하는 것은 당업자에게 알려진 어떠한 방법이든 사용 가능하다. 상기 "핵산 분자" DNA(gDNA 및 cDNA) 및 RNA 분자를 포괄적으로 포함하는 의미를 가지며, 핵산 분자에서 기본 구성 단위인 뉴클레오티드는 자연의 뉴클레오티드뿐만 아니라, 당 또는 염기 부위가 변형된 유사체(analogue)도 포함한다.

상기 유전자형을 확인하는 단계는, 특정 서열을 규명하는 데 이용되는 당업계에 공지된 다양한 방법을 이용하여 수행될 수 있고, 예를 들어 마이크로어레이 방식 또는 유전자 증폭 방식으로 수행되는 것일 수 있으나, 이에 한정되는 것은 아니다.

상기 증폭은, 바람직하게는 PCR을 이용하는 것이며, PCR에 의한 증폭 반응의 조건 및 사용되는 시약과 효소 등은 당업계에서 통상적으로 공지된 것을 사용할 수 있다. 이 경우, 본 발명의 SNP 마커를 확인하기 위해 서열 특이적인 프라이머를 디자인하는 것이 중요하다.

본 발명의 제주 흑우 친자 감별용 단일염기다형성 마커를 이용하면, 99.999% 이상의 높은 정확도로 제주 흑우의 개체 확인 및 친자 감별을 간편하게 수행할 수 있으므로, 제주 흑우의 생산 이력제 시스템에 유용하게 이용될 수 있다.

도 1은 선발된 125개의 SNP마커에 대해 진알렉스 소프트웨어(GenAlex software)를 이용하여 제주 흑우 개체 인식 및 혈통 확인의 정확도를 평가한 것이다.
도 2는 선발된 125개의 SNP마커의 친자 검정 능력을 나타내는 부관 부정률(Probability of Exclusion, PE)을 평가한 것이다.

이하에서, 첨부된 도면을 참조하여 실시예들을 상세하게 설명한다. 그러나, 실시예들에는 다양한 변경이 가해질 수 있어서 특허출원의 권리 범위가 이러한 실시예들에 의해 제한되거나 한정되는 것은 아니다. 실시예들에 대한 모든 변경, 균등물 내지 대체물이 권리 범위에 포함되는 것으로 이해되어야 한다.

실시예에서 사용한 용어는 단지 설명을 목적으로 사용된 것으로, 한정하려는 의도로 해석되어서는 안된다. 단수의 표현은 문맥상 명백하게 다르게 뜻하지 않는 한, 복수의 표현을 포함한다. 본 명세서에서, "포함하다" 또는 "가지다" 등의 용어는 명세서 상에 기재된 특징, 숫자, 단계, 동작, 구성요소, 부품 또는 이들을 조합한 것이 존재함을 지정하려는 것이지, 하나 또는 그 이상의 다른 특징들이나 숫자, 단계, 동작, 구성요소, 부품 또는 이들을 조합한 것들의 존재 또는 부가 가능성을 미리 배제하지 않는 것으로 이해되어야 한다.

다르게 정의되지 않는 한, 기술적이거나 과학적인 용어를 포함해서 여기서 사용되는 모든 용어들은 실시예가 속하는 기술 분야에서 통상의 지식을 가진 자에 의해 일반적으로 이해되는 것과 동일한 의미를 가지고 있다. 일반적으로 사용되는 사전에 정의되어 있는 것과 같은 용어들은 관련 기술의 문맥 상 가지는 의미와 일치하는 의미를 가지는 것으로 해석되어야 하며, 본 출원에서 명백하게 정의하지 않는 한, 이상적이거나 과도하게 형식적인 의미로 해석되지 않는다.

또한, 첨부 도면을 참조하여 설명함에 있어, 도면 부호에 관계없이 동일한 구성 요소는 동일한 참조부호를 부여하고 이에 대한 중복되는 설명은 생략하기로 한다. 실시예를 설명함에 있어서 관련된 공지 기술에 대한 구체적인 설명이 실시예의 요지를 불필요하게 흐릴 수 있다고 판단되는 경우 그 상세한 설명을 생략한다.

또한, 실시 예의 구성 요소를 설명하는 데 있어서, 제1, 제2, A, B, (a), (b) 등의 용어를 사용할 수 있다. 이러한 용어는 그 구성 요소를 다른 구성 요소와 구별하기 위한 것일 뿐, 그 용어에 의해 해당 구성 요소의 본질이나 차례 또는 순서 등이 한정되지 않는다.

어느 하나의 실시 예에 포함된 구성요소와, 공통적인 기능을 포함하는 구성요소는, 다른 실시 예에서 동일한 명칭을 사용하여 설명하기로 한다. 반대되는 기재가 없는 이상, 어느 하나의 실시 예에 기재한 설명은 다른 실시 예에도 적용될 수 있으며, 중복되는 범위에서 구체적인 설명은 생략하기로 한다.

실시예 1. 제주 흑우 시료 수집

시료는 제주 흑우 1,255두의 시료를 수집하여 DNA를 추출하여 제주흑우 맞춤형 150K SNP array를 이용하였다.

실시예 2. 유전자형 분석

상기 실시예 1에서 수집한 제주 흑우의 DNA를 고밀도 제주 흑우 맞춤형 Affymetrix bovine 150K SNPs 어레이를 이용하여 분석하였다. 정확한 분석을 위해 데이터의 실험 오류를 제외하고자 SNP Call Rate 와 ID Call Rate가 0.9 이하인 것은 제거하였다.

생산 이력제에 활용하기에 적합한 SNP는 제주 흑우에서 빈도가 높게 관찰되어야 하므로, Minor Allele Frequency(MAF)>0.4, Hardy Weinberg equilibrium(HWE)<0.1 인 조건을 만족하는 마커를 선별하였다. 또한, 선별된 마커에 대해 동일한 정보를 가진 SNP를 제외하기 위해 LD 분석을 통해 r²> 0.2 인 마커를 제거하였다. 마지막으로 C/G 또는 A/T 형의 SNP를 제거하여 DNA 염기서열을 역으로 읽었을 때 나타날 수 있는 오류도 제거하였다.

이와 같은 과정을 통해 선별된 마커 중 개체 선별의 정확도를 위하여 SNP Call Rate가 100%인 125 SNPs를 최종 선별하였다. 최종 선정된 125개의 SNP 마커는 minor allele frequency 평균이 0.44이며 Call Rate는 100%로 genotyping의 정확도가 매우 높은 것으로 나타났다. 또한, 선별된 마커들은 염색체별로 고르게 분포하여 제주 흑우 유전체 전체의 특성을 반영할 수 있도록 하였으며, SNP의 염색체 분포는 하기 표 1에 나타낸 바와 같다.

CHR	SNP 개수	MAF 평균	Call Rate (%)
1	5	0.43	100
2	3	0.47	100
3	5	0.44	100
4	4	0.44	100
5	6	0.45	100
6	6	0.43	100
7	9	0.45	100
8	6	0.44	100
9	3	0.42	100
10	1	0.46	100
11	2	0.44	100
12	4	0.46	100
13	5	0.45	100
14	4	0.45	100
15	4	0.44	100
16	9	0.45	100
17	7	0.43	100
18	6	0.43	100
19	4	0.45	100
20	2	0.41	100
21	5	0.46	100
22	5	0.46	100
23	5	0.44	100
24	4	0.44	100
25	3	0.44	100
26	1	0.41	100
27	4	0.43	100
28	2	0.43	100
29	1	0.48	100
	125	0.44	100

실시예 3. SNP 마커의 개체 인식 능력 및 혈통 확인 능력 평가

상기 실시예 2에서 선발된 125개의 SNP에 대해, GenAlex software를 이용하여 개체 인식 능력 및 혈통 확인 능력을 검증하였다. 무작위 교배집단과 반형매 교배집단을 가정하여 SNP 유전자형이 동일한 개체 출현 확률(Probability of identity(PI), Probability of identity from half sibs(PIsibs))을 추정한 결과, PI는 2.29×10^-53, PIsibs는 1.46×10^- ²⁸으로 나타났다(도 1 참조).

이러한 추정치는 제주 흑우 집단을 적은 두수의 보증종 모우들의 절대적 유전적 기여에 의한 거대한 반형매 집단으로 가정하고 제주 흑우의 전체 사육두수를 고려하더라도 동일개체가 출현할 확률이 없는 것으로 보아도 무방하다는 것을 의미한다.

다음으로, 수집된 제주 흑우 집단에 대해, SNP 마커의 조합의 친자 감별 능력을 나타내는 부권 부정률(exclusion probability, PE)을 조사하여 그 결과를 도 2에 나타냈다. 도 2에서 P1Exc Pop1, P2Exc Pop1, P3Exc Pop1은 각각 부모에 대한 정보가 전혀 없는 경우(P1Exc Pop1), 한쪽 부모를 유전자형 정보를 알고 있을 때의 부권 부정율(P2Exc Pop1), 양친의 유전자형을 모두 알고 있을 때의 부권 부정률(P3Exc Pop1)을 의미한다. 부권 부정률의 값이 높을수록 우수한 SNP 세트 구성임을 나타내며, 정확한 부모와 자식 판정이 가능하다는 것을 뜻한다.

도 1 및 도 2의 결과를 참고하면, 제주 흑우 친자 감별용 유전자 검사에 필요한 SNP 마커는 125개로 충분하며, 상기 마커를 친자 감별 및 개체 인식에 사용할 경우 정확도 99.999% 이상으로 친자 감별 및 개체 식별이 가능하다는 것을 알 수 있다.

상기의 과정들을 통해 유의성이 검증된 제주 흑우 친자 감별용 SNP의 염기서열을 하기 표 2에 나타냈다. 표 2에서, [A/B]란 염기 A가 염기 B로 돌연변이된 SNP임을 의미하고, 본 발명에서 125개의 단일염기다형성 마커군을 형성하는 각각의 마커는 서열목록에 기재된 서열번호 1 내지 125이다.

서열번호	SNP	서열
1	AX-169399588	AGTAGCTGTGAATGGGGCGTATGCTTCAGGGTGCT[C/T]AGGGTTCGGTAACTGCGGCATGCAGGCTCAGTACT
2	AX-106739323	CTAGATACTAATAGTCTAGAATGGCCTGACATCCA[A/G]TGGAAATGGCAAACAGAAAAAGAGCTTTAACTCAG
3	AX-106735064	CAGTGCTGCTGCTGTAAACTAACCAGGAAAATTTC[A/G]GAGGGGCCACAAGGAAGGACGACACACCAACCCAT
4	AX-169392357	TAGGGGGCATTGCTGCCTTAGTCACATGATCTGAA[A/C]CTACAAATTGCTGAATTTGAGGTTTTTTTAATCCT
5	AX-169462869	TGTTTTGCTATCCAACTTAGGGTCTGAGTCTCTTT[A/G]AATCAGCAAACATGTTTATTTGCCATGGATTGAGG
6	AX-169473292	TTATGGCTGAAATTTTCCCAAACCTGAAAAAGAGA[C/T]ATCCAAGGACAGGAAGCATAGACGGTTCCAAACAA
7	AX-169458575	CTGTTCCCGTTCTGGTTATTCACCACTGCTCACTG[A/C]TCAACTTTTGTTCCATCTGTTCTCCTGACTCTATC
8	AX-106760541	TGTGATTTATAAAGGTATGGTTAGAACCTATAAGA[C/T]GGTTAGATTTTAGAGTTCTCTATCCATGCACATAG
9	AX-106744286	GAGGAAGGAAACTCATATTGGTAAGACTTCTCTTT[A/G]GGCCTTCATTACTTTGGACCATCATTACTTTAGGC
10	AX-115104994	CCAGCTACTTCTCAGTTAAACACACTTGAGAGGTC[A/G]GCCTTGAACAGTTGTCTGAGCAAGGTTTTTTTCCT
11	AX-169405089	TAAAAAGGTCCCTTCTGCTATAGCTCAGACTCTAT[C/T]GGTGTGTGATGCCCAGCTATTAAATATACTATCAC
12	AX-169394562	ATAAAAATCACGTCGGAAGCTGTAACATAAAATTC[A/G]ACCAACTTACAAGATACACACACACATGCCCCCAT
13	AX-169390323	GCCCAGAGCAGTGCCTGGCACAGGGTAGGACTTCA[A/G]TAAATCTTTGTTAAATCAATCACCCTCCTATCGGT
14	AX-169487309	AGTACCATTTACCTTCATAACTTTTGGCATTTTCA[C/T]AACACATGAACACTGATATTATATTGGATACCGCA
15	AX-169388426	CTCACAACTGGCTCTGGCTTTAGTTATCCCATCTC[C/T]GTCCTACCTTCCATCAAGGTGACAGCTACCAACAA
16	AX-124380434	GGCTAGCATAAAGACATAGAATATCAGCATGGATT[G/T]ATGGAGGCCTTTTCTTTTCCCATTACTCCGAATGA
17	AX-25775078	CTCTCTGTCTACTGCTTGGAGTTTGGTAATTTGCC[A/C]GTCTCGTGGAAGTGGTATCTACAGCCATGCCATCA
18	AX-169471905	TGTGAGTCACATAAGCAAATTATAGAACCTGAAGA[A/C]GGCATATGGAGACTTCTGAAGCCAGTCCCTCAGAA
19	AX-169409094	TGTCTTGCTCTGTAAGTTTCTTCCTAAAGGAGACA[A/G]CCAGACACTTTACTACACTTACATTCCCCAAGAGA
20	AX-106766828	ACCGTTTGTCTGCATTTCTTGATGAAATTCACACA[A/C]AGAGGTATAAGAAGTATCACCATTGCTTAAGCTTT
21	AX-169407122	AATAAGTGTGTGTGCTCTTGCAATTATTATTCAAC[A/G]CAGTTTTGGAAGTCCTAGGCATAGCAATCAAAGAA
22	AX-169479744	AAGTTAACAGAGAGAAAGATCCAGGATTCAGTCTG[A/G]GAATAGATAGATTTAAGGCTATGGCCTGGCCAGAC
23	AX-169401113	ACTGGTTCCTTAAGAGACAGATGAATAGTAGGCAG[C/T]GGCTTGCAGCCTAGAACTTCTATATCAACTCACAA
24	AX-169378306	CCGATAAGGAAACAGGAACGCTGACACCTATTGTT[A/G]CTATTATCTTTTTGTCAACTATATCACAAAAACAG
25	AX-169407598	ACTTGCAGTTGCCAGTAGAGTATAATGAAACTGCA[A/G]TGATGTACTTCCCCACTACTGTCTCCTGAACCTTC
26	AX-106746057	GCCAGCTGGAAGCCGAGCCAGTTTCCGCAGCCCGA[A/G]CCCGGGGCCCCCTCCCGGGAGGGAAGACTGAGTCA
27	AX-26384898	TGCATTCCTTAAGGACTTCTCTCTAAATGCATTGA[A/G]GAGAATGGGCTTAAAGTTTGAAGTCATTAAAAGTT
28	AX-106722342	AAGTGGCTGCTCCAACAGGCCGGATAAGACAAGCC[A/G]GCTGTTTGGACTATGGTGGTGGCAGTGGAAGAGAG
29	AX-169370003	GCAGGCTTCCAAATTATTCTCTTTCCTTAGGACTT[C/T]ATTCTCTGAAACTCTTTCTGTCTTCATGTCACCTG
30	AX-115119066	TTACCTGGGGTATAGGTGCCCACAGGGTCTGGAGG[C/T]GGGGTTTTCAGGCCCTGTGTGCGCGGAGTGGGGAC
31	AX-169396729	TAAATGTATGTCTGTGCTTTCAAGTTTCTGTTTCT[A/G]TTTTGGTCTTGCCTTAACCCTATAACAGCTCATTC
32	AX-124385339	TTTAGCACTGAATCACATTCCATTGTTTGAATGTT[C/T]CACACTTTTGTTTCTTTTTACCTGCTGAAGGATGT
33	AX-169407580	GCTCCCTCTGGTGAGTTTTTCTAGATCTAAATGTA[C/T]CCCACCCAAAAGTCTCTCCTTTCTTTTTTTTTTCT
34	AX-169414806	TTGAAATGGATTAAATAAAGCTATCAAATTCTAAG[C/T]ATCTCCTTCCATTTTTATTTTTGCCAAGTTGGGAA
35	AX-169382286	CTGGGACATCATTTTACTAAACTTTTACACAACAT[A/G]ACAACAAATTTGGTGCCTACCGATAATGTAAGTCA
36	AX-169417416	ATACTTGATGCTTTTTCACAAGCTTTTCTCACCAT[C/T]AGTACAGCTAACATATGTTGAGACAAAGTTGATAC
37	AX-106733853	CACGAGCTATGGCTCTAAAAGGGACAGTAAAGCAT[G/T]TAACCCTGAGACTAATCCAGATACTTAATTTCTTT
38	AX-169479586	CACGACTGAAGCAACTTAGCAGCAGCATGTCTTCC[C/T]GGTACTCCAAGCTCATGACTTGTTTTTTGTTGCTG
39	AX-169411915	ATGCTGTGGTTGAAGTAAAGGCATGAGCTATCTGA[A/G]GGATGGGCATTGCCTGGGCTCTAAGAGACTCTTAT
40	AX-169385122	GAGGTGTTTATGCTGTAAATGCTTCGTTGTCGGGA[A/G]ACCACACCCATGAGCATCGTGGGGACAGAGGCAGT
41	AX-169460385	ATAAAATGGGATATTATTCTGAATCATGAAACAGA[A/G]TGGAAAACATCAACAATTAGATTAGGTTAAATTGA
42	AX-115111295	TTATTGATTTGAGTATCTCAAACTCCCCCTTTTTA[C/T]TGCTGTATACTTAGCCTAGCTTATGCAGTATGCAT
43	AX-106752180	GTTTTTTCCTTAGAATTCTAGCATTAAGTCATAAG[A/G]GGATGATGAAAAGGAAGGCTAATGTAATTCAAAGG
44	AX-169468768	TGTGCCTCAGTTTCTCTTTCTGAAACACGAGGGTC[A/G]TAGCAGACACCTCAAATCCCATAGACCTTGTGAGA
45	AX-169420377	TCTGAGAACGCACTTGAGGGAGCATCTCATAAAGT[C/T]AATGTGATCCTTGAAACCAACAATCTGGGCTCGAA
46	AX-117084650	TGGCATATAGTGATTCCTTGCCTTTCTGCCACTCA[A/G]GCTTGATGGTTCATATTCTTGGTGCTCAGGGATAT
47	AX-106769745	CAAGTGAGACGGCTTCAAATAAAACAGCTCCAAGC[G/T]TCCAAGAAACAGTTAAGAGAAGGCAGAGACGAACA
48	AX-169407596	GTGGGGCGGGACCAGTTTCTACGATTCCTGGAGTC[A/G]GAATTCAGTTCAGAAAACCTCAGGTACACCTCTCC
49	AX-169399065	ACTGGATGGCAGGTTGGGAACAGAGAAGGAAAGCC[C/T]TACAGTTGAGGCCTGCAAGAAACCCCCTTCTCTGG
50	AX-19480048	CGTCAGGCTGCTGCAAGCCCCGCTGAGGGGCTGGG[C/T]GGTCCCTAAGGCACACATCACTGCCAAGCCAGCCA
51	AX-169398266	GGAAGAACTGAGCTTCTGAAAATCAATCTTCGTGA[A/G]GTTGAGCTGGATCCAGATATTCAACTGGAAGATAT
52	AX-169394644	AAACCCTGTGGTCTGGCCCACACAGCTGTGCACTG[C/T]GAGTCCCCTCCACTGCCCGCCTTGGGAAGGACACA
53	AX-169388265	TTCACTTGCTTACTTGGATTTAAGTGGTGAAAGGC[A/C]CTATTGCCTATGGGCTGATCTGGGAGTGGATATGA
54	AX-106740005	CTCCTGTCTGTCACCTGAATCTTTGCTCTTGAGAA[C/T]GTGGTTTCAGGTGGGGGCTGGCGGCCTCTTGACCC
55	AX-169463826	TTTTTCAAGGTTTACTGCGAGAAAACATTTTTGCT[A/G]CTTTACTTGTATGCTTTTTTATTCACCTAATCAAA
56	AX-169487276	CAAGTGATTGCTAGAGCCAATTAAGTGAAGTGAAA[A/G]TCCCTCAGCCGTGTCCAACTCTTTGCAACCCCATG
57	AX-169414212	AGGGGAAGGGTAATAATAAGCACACATGAAACTAC[A/G]CAAAGCCACTTTTGATTGTGGAGTTCAAGGCTGAT
58	AX-106724000	ACAGTATGAAAAGGCAACAATGATAAGACAACCGC[C/T]TTCCTGACTTTCCAAACGAAACTGAGTGCTAAGTC
59	AX-19967733	GCTTCATAGTTTATTAGAAAGCCTTCATAAGCAAG[A/G]TCAGAGTCAGCCACAAATGTAAGCCTTACTGAGTT
60	AX-115111938	GGGGGTGAAGGTTTCTTGCAGCCCAGACATCCCAG[A/G]ATTCTACACTTCTGAGCCAAAGGCCACTGTTCCTG
61	AX-106738277	CCTTAAATCACCCAGAGTCACACTCTCATAGATGG[C/T]GGGACTGGGGTTAAAACATACATTGGTTTGAACCC
62	AX-106724792	ACCTTTGACTGCCTTGCTGCATTTTTCCTTATCCC[A/G]TAAATGCCACAAGCACCTTGCCTTCTGGGAAGTGG
63	AX-169485049	GTCATATTAATGTATGTCTACTATGTCACTTGGGC[C/T]TGAACACCCTTTGCATTATCCAATTATCAGCTTCA
64	AX-106752121	GTTTTATGCTTATATCCTTGGAGAGTGCATGCAGT[A/C]TTATGGCATTAAATGCAACTTATATGCCAATAATT
65	AX-169359746	TTCATTTACTTAATCACATATTCAATATTAGTAGC[A/G]GTTTCTCAATTTTGGTGTTATCTGTTATTTGAATA
66	AX-106760500	TGTGACACTTCCCACTGGCCCGAGCCTTGGTCCCC[C/T]TCTGCTGAGAGGCAGCCTCTTGTAGCTTCTGCAGT
67	AX-169461889	AGTGACTAACACTTTCATTTTCACACATTTGCTTC[C/T]TGGTTTCTGTAATGGACTGAATTATATTGGCCCCA
68	AX-169372843	CCAGGCGTGTGACTGGGGTCGAGAGCTTGAGAAAC[A/G]GGGCTGGAGAGGTAAGGAGGAGTCAGAGCTCCGCC
69	AX-169363936	CTGCCACCAAGGAGCAGACTGGAGCCTCACCTGTA[A/G]CACATAGTCCGCACTGGTGAGTGTGTAGGCTTTGC
70	AX-106764183	TTTCTTGAGAAGAGTGTGAGCTTTTAGGAATGTAA[C/T]AAAGGAAGAAAGTTACACACACAAACACATATACA
71	AX-117084640	TGGATTCAAAGAGGATGCACACCTGAGGACCACCC[A/C]CCGCCCAACGCCCTGTCCTGGCTGAGTCTAAGGTT
72	AX-169474778	TAAAATAGTTGCAGAATCTTTCTTCAAGCCTTAGC[A/G]TGGAGTCCTAGTTGAACCTTATTGAGAAGTCGTAA
73	AX-117121378	AATTGTTTAATATTTTTAGGGTTTTCGAGGACCAC[A/G]TCAAGTGCCAAAGAAAATGGTTATTACAGAAAATA
74	AX-106754935	TCAAGTGCCACTGTAGCAAAGCAAGCAAAATGGTC[C/T]GATTCTTTGGCAACGACCAGGGGCCCATGAGAAGA
75	AX-106728417	AGGTGTGTAGAAGGCGAGGAACTTCCAGGCCCCTC[A/G]TAGTAGCCACTCTTCCAGCACATCCACATGTTCAC
76	AX-169476005	TCTTGAGTCCGCACATGCAATGATGAGTTAGTCTG[C/T]GGTGAAGATGGGAAGAACCGCCAGGTCACGTGGTC
77	AX-106746018	GCCACCACAAGAAACTTGTGAAGAAGGAAGATTCT[C/T]GGGCCCCAGCCCAGACCCACCAGAAACGGGGGTCC
78	AX-169384029	GCAGGAAAGTGAAAGAATTTCCCCTACAAACTCTT[C/T]GCTCCACAGAACTAAATGTTAAATATCTTCATGGT
79	AX-117088291	CTACATTTGACAAGAAGAGGCAAGGGGAAGGCCCA[G/T]AACTGCACTGAACAAAATAATTCCAGGGAATGCCA
80	AX-21227739	CCCAGCAACTCTGGGCAGAGCTGGCAGAGGTTCTA[C/T]CAACTAACCAAGCTTCTGGACTCCATGCATGACGT
81	AX-169385308	TGGAATTGCTCCATCCTTCTCTTTTCTCGGTATCA[A/G]TATACTCTTTTCTTCCCCAGCTTTTAAAACACAGT
82	AX-169420054	GAAAGTTTCAAGTTTGTACGACTCTTCCCACTAAA[C/T]CAGCAAGATGTCCCAGATAAGTTTAAGGCAAGAGT
83	AX-95695457	ATCTTTTCTGATCCTTTCTTCTGTTTGCAGTTGCT[G/T]CTCCAATAGAAAAAACAATATCCAGTGAAAAAGCA
84	AX-169403868	CTATTTTATACACAGTAGTTTGTGTCTCTTGATCC[C/T]ATTCCCTGAATTTGCTCTCCTTTCCTGCTTCCCCT
85	AX-169382045	CAAACAGGGCAGAAAGGACTGAATGATTTTCAGTG[C/T]TGGGAGAAGGGGCAGGCATCTCAGCTCACAGCTTC
86	AX-169412608	ATGATTTGATGTGACTTACAGAGCAATTAGGTTAG[A/C]GTGATCACTGTTAAAGTGTAGTCCCTGGACCACAT
87	AX-106727123	AGCCACTTTACCTCCAGCCACGACCAGGTGAGAGA[C/T]GGAGCCGGGGAGTTCTCTCTGCCCGCAGGCGCGCG
88	AX-169386676	TTTAAATCAATTAACGTTTTAAAATTCAGTCCTTC[A/G]GTCACATGAGTCCGTACACGTGGCTAGCTGCCACG
89	AX-169359660	TGCATCTAAATGGTGTCTCTTCAGAGCGAGTGCTC[C/T]GGTGGCTGAGGAGGACAGAAGTCTTCTGGAAAGCT
90	AX-169389502	TCTAGGAGCTGAAACTTACCTCACTGACACTTGTC[C/T]TACTTTTGCACTTACCCAGCCCATGTAGTCCTGCT
91	AX-106751313	GTGGTGGCGGTGGTGGGGAGTAACATGGCTAGTGC[A/G]TGTGGCCATGCCTTCCCCAGCTGTGCATTTGAAAA
92	AX-95716449	GAAGAGGAGGCTGCTCCTTTACCTTCTAGTCTCCC[A/G]ATCATCAAAAACAATGGCCAGGTGTACACATACCC
93	AX-169381267	CAGGCACCTTCTTTAGAGGCTCAGAACTCCCAGTC[A/G]TCCACCTCCAGCTCTTCCAGGTTTGTTACCAGGCC
94	AX-106752661	TAACTTTAGAAGTGCTATCGTCATAAAGTACTGGG[A/G]AACAGCAGAAAATGTGGGCCTAGATCTGTAGAAGT
95	AX-169416254	AGTTACAATCCAACTTTTTGCCTTTCAGTGTACTC[C/T]CTTCAGTAATTGTCAAACCTAAGGACACACACACA
96	AX-169374874	ACATTTGACTTATTTTTATGTTTGCTATCAGGCTC[A/G]CATCAGCCCCACCACTAGAATGGGGCCACCATGAC
97	AX-106763352	TTGTAGTAAGTTTTAAAGTCAGATAGAATGACTCT[C/T]CCAGTTTTGTTTTTCCAAATGATTTGGGCTATTCT
98	AX-106735982	CCAAAACTCCCAAAAGCGTTTCCTGCTGTGAGAGG[G/T]TTTCTTGCTGTTTGGAATCTTCTCCTTCACAACTC
99	AX-106730303	ATCAAAGCACACACAGACACTTTAATGAACGGGTA[C/T]GCGGCCTTGCCCTGCATTTGCCACACAGGAATTCA
100	AX-115113151	TAAGGGGGCCAGGCCAGGAAGCATGAAATTAGTTA[C/T]GGTCCTGTGCGGACGTGTCCACACTGCCTGTGTGT
101	AX-169373235	AAAAACATGCCACTTTCTCAGGAGTTGCTCACCAG[C/T]CCACTTCTCTGACCTTATCTTATACTCCCTTCCAA
102	AX-106736126	CCAAGTGCATATAAAAATTATGTTTATACTATGCT[A/G]TAGTCTATCATCAATGTACAGTGGCATTATGTCTT
103	AX-106744145	GAGCATCTGTACACTGGGGGTTGCAAACTCTGGCC[C/T]TCACCCTGCTTTATATAAATAAAGTTTTATTGGAG
104	AX-169370452	CAGACACTCATGCTCTTAGAGTCAGCCTGTGCTCA[A/G]GATCCTAGAAGCAGGAACTTACATGGACCAGGGAG
105	AX-106754246	TATATTTTCTCATTGGCTCTTTTTCCAACCTATCA[C/T]TTCTCATAGTTTTCCAATTTCTAGATGAAACTTTC
106	AX-169460508	TTTGGCAAGCCACAAAGTCAGGAAGTTCTACAAAC[G/T]GCAAGAAAGATAAATTGAGAAAACAAAAACACTAA
107	AX-23475966	AGCTCTTGGAAAGACTCAACAAAGACTTAAACATC[C/T]TTGAAACACAACCAGGTAAATTCTATGACCCCAAA
108	AX-169403043	AATCCAGATGACTGTGCTGGGCACCAGTGTCAGAA[C/T]GGGGGCACCTGCCAGGATGGGCTGGGCACCTACAC
109	AX-106720584	AAATATTATTCAAGTAAAATGCTATCTATCATAGC[C/T]GCATACGAATAATTAAAGCTCTGGGCTTCAACCTG
110	AX-106737190	CCCCCCCAGGGCCCACTCGGGCGGAGACCCTGTGG[C/T]GATCCAGAAGGTGTCTGTGCCCCTGCTATGCTCTG
111	AX-115099982	GCCATGTGACATTCCACAGGGAACAGGATTCGTCT[C/T]GCTCCTCCTGCCTGGGGGCCGAGCATAGAGAAGGC
112	AX-169369356	ATGAATTCGGAGGGGGAGCACAAGCCTTCAGATCA[C/T]GGCAGGATTTACTGAGAATAACTGAACCCCTTTGG
113	AX-169380265	TGACCAGGCAGTGATCTGATTTGATGGGTGACTAG[C/T]TGAAATAACTGGACTGACAGTTTCCACAGATGACA
114	AX-169369388	CTTTCACTTTCCAAGGAAAAGAAACCAAAGGTATG[C/T]CTTATTTTCCTTGGAGATAATGTCCAATCACTTAT
115	AX-106739527	CTATTCGAGGCCTGGGATGCATTTAGCTTGGGAGA[A/G]TAAGAACTCCTCATTCGTATCCCGAGCCCCAGAGG
116	AX-169388346	GAGAAGAGCATCTTCTTGAAGACCATGTTTGGGGT[C/T]ACGGGGCTCTGTCTCTTGTTCACGCTTTTGGAGCT
117	AX-124347768	AAATCAGAAAGGACAGATAATGCCAGTAAAAAAGG[A/G]AAAAAACCCTCAGCCGGCCACAAAGCATCCCTCCG
118	AX-169475222	GCTGCCTCTTCCAGGATAGGGGGAAAGTTTTAGAC[A/G]GCAGTGGTGTGGAGGAGTCACGAGGGGTCAAGGCT
119	AX-169461233	GCAAGCTGGGGCTGGGGTGAGGAAACACTTGAAAC[A/C]GGGCCGGAGTATTAGTTCCAGAGATGATGGAGCCA
120	AX-169480180	ATGAGGTCTGAAACCCTGAATATACCAGGATGATC[A/G]CCATTTCTAGCCAGTGTGAGGAGCTATTATTGGAT
121	AX-169367329	TCCAATTATGAGAAATCTGCAGAAAAGGACAGCAG[A/G]GAATGGCAGGTGTGACATTAAACCTTTGGGTAATA
122	AX-106728885	AGTGATGTAAGAAAGCAATTCTACAGCTGGGAATA[C/T]ACTTTTAAAAACTGGCCACTGAGCATTTATGAAGA
123	AX-106721199	AACCTCGGTGCGGGCCCCCCACAAGGAGGAGGCCA[C/T]GAACAGCAGGATCCCAACTCAATGAAAGCTCCTGT
124	AX-115112368	TTACCAGATGAGATACTAATATGCTGGGAAGGCCA[C/T]TGAGACACTTTAGGAAATGAAGCAGGCAGCCACAT
125	AX-106759659	TGGGAGGCGACACCCACCCAGACAAAGCACCCCCA[C/T]GGGCCTGCGAGCTCTTAGAATCCAGTTCACGGTAT

이상과 같이 실시예들이 비록 한정된 도면에 의해 설명되었으나, 해당 기술분야에서 통상의 지식을 가진 자라면 상기를 기초로 다양한 기술적 수정 및 변형을 적용할 수 있다. 예를 들어, 설명된 기술들이 설명된 방법과 다른 순서로 수행되거나, 및/또는 설명된 시스템, 구조, 장치, 회로 등의 구성요소들이 설명된 방법과 다른 형태로 결합 또는 조합되거나, 다른 구성요소 또는 균등물에 의하여 대치되거나 치환되더라도 적절한 결과가 달성될 수 있다.

그러므로, 다른 구현들, 다른 실시예들 및 특허청구범위와 균등한 것들도 후술하는 청구범위의 범위에 속한다.

<110> JEJU UNIVERSITY <120> Single nucleotide polymorphism markers for parentage testing in Jeju black cattle and the uses thereof <130> APC-2020-0244 <160> 125 <170> KoPatentIn 3.0 <210> 1 <211> 71 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> AX-169399588 <400> 1 aatagtacct atgacttgta taccatcccc aaggatgctg actcccagaa tcctgatggt 60 aggcattctc t 71 <210> 2 <211> 71 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> AX-106739323 <400> 2 tttgctgtag ttgattctct ggtgacattt gaatcgatgc aagggaatca ggcctgatct 60 caagtgtacg g 71 <210> 3 <211> 71 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> AX-106735064 <400> 3 cagtgctgct gctgtaaact aaccaggaaa atttcggagg ggccacaagg aaggacgaca 60 caccaaccca t 71 <210> 4 <211> 71 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> AX-169392357 <400> 4 tagggggcat tgctgcctta gtcacatgat ctgaacctac aaattgctga atttgaggtt 60 tttttaatcc t 71 <210> 5 <211> 71 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> AX-169462869 <400> 5 tgttttgcta tccaacttag ggtctgagtc tctttgaatc agcaaacatg tttatttgcc 60 atggattgag g 71 <210> 6 <211> 71 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> AX-169473292 <400> 6 ttatggctga aattttccca aacctgaaaa agagatatcc aaggacagga agcatagacg 60 gttccaaaca a 71 <210> 7 <211> 71 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> AX-169458575 <400> 7 cttgcgcaga cggtacttgt ccaccgcgcc cagcgggcgg ccgcgggccc gctcggcctc 60 gtggtagcgc g 71 <210> 8 <211> 71 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> AX-106760541 <400> 8 tgtgatttat aaaggtatgg ttagaaccta taagatggtt agattttaga gttctctatc 60 catgcacata g 71 <210> 9 <211> 71 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> AX-106744286 <400> 9 gaggaaggaa actcatattg gtaagacttc tctttgggcc ttcattactt tggaccatca 60 ttactttagg c 71 <210> 10 <211> 71 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> AX-115104994 <400> 10 ccagctactt ctcagttaaa cacacttgag aggtcggcct tgaacagttg tctgagcaag 60 gtttttttcc t 71 <210> 11 <211> 71 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> AX-169405089 <400> 11 taaaaaggtc ccttctgcta tagctcagac tctattggtg tgtgatgccc agctattaaa 60 tatactatca c 71 <210> 12 <211> 71 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> AX-169394562 <400> 12 ataaaaatca cgtcggaagc tgtaacataa aattcgacca acttacaaga tacacacaca 60 catgccccca t 71 <210> 13 <211> 71 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> AX-169390323 <400> 13 gcccagagca gtgcctggca cagggtagga cttcagtaaa tctttgttaa atcaatcacc 60 ctcctatcgg t 71 <210> 14 <211> 71 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> AX-169487309 <400> 14 agtaccattt accttcataa cttttggcat tttcataaca catgaacact gatattatat 60 tggataccgc a 71 <210> 15 <211> 71 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> AX-169388426 <400> 15 ctcacaactg gctctggctt tagttatccc atctctgtcc taccttccat caaggtgaca 60 gctaccaaca a 71 <210> 16 <211> 71 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> AX-124380434 <400> 16 ggctagcata aagacataga atatcagcat ggatttatgg aggccttttc ttttcccatt 60 actccgaatg a 71 <210> 17 <211> 71 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> AX-25775078 <400> 17 ctctctgtct actgcttgga gtttggtaat ttgcccgtct cgtggaagtg gtatctacag 60 ccatgccatc a 71 <210> 18 <211> 71 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> AX-169471905 <400> 18 tgtgagtcac ataagcaaat tatagaacct gaagacggca tatggagact tctgaagcca 60 gtccctcaga a 71 <210> 19 <211> 71 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> AX-169409094 <400> 19 tgtcttgctc tgtaagtttc ttcctaaagg agacagccag acactttact acacttacat 60 tccccaagag a 71 <210> 20 <211> 71 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> AX-106766828 <400> 20 accgtttgtc tgcatttctt gatgaaattc acacacagag gtataagaag tatcaccatt 60 gcttaagctt t 71 <210> 21 <211> 71 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> AX-169407122 <400> 21 aataagtgtg tgtgctcttg caattattat tcaacgcagt tttggaagtc ctaggcatag 60 caatcaaaga a 71 <210> 22 <211> 71 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> AX-169479744 <400> 22 aagttaacag agagaaagat ccaggattca gtctgggaat agatagattt aaggctatgg 60 cctggccaga c 71 <210> 23 <211> 71 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> AX-169401113 <400> 23 actggttcct taagagacag atgaatagta ggcagtggct tgcagcctag aacttctata 60 tcaactcaca a 71 <210> 24 <211> 71 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> AX-169378306 <400> 24 ccgataagga aacaggaacg ctgacaccta ttgttgctat tatctttttg tcaactatat 60 cacaaaaaca g 71 <210> 25 <211> 71 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> AX-169407598 <400> 25 acttgcagtt gccagtagag tataatgaaa ctgcagtgat gtacttcccc actactgtct 60 cctgaacctt c 71 <210> 26 <211> 71 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> AX-106746057 <400> 26 gccagctgga agccgagcca gtttccgcag cccgagcccg gggccccctc ccgggaggga 60 agactgagtc a 71 <210> 27 <211> 71 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> AX-26384898 <400> 27 tgcattcctt aaggacttct ctctaaatgc attgaggaga atgggcttaa agtttgaagt 60 cattaaaagt t 71 <210> 28 <211> 71 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> AX-106722342 <400> 28 aagtggctgc tccaacaggc cggataagac aagccggctg tttggactat ggtggtggca 60 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109 aaatattatt caagtaaaat gctatctatc atagctgcat acgaataatt aaagctctgg 60 gcttcaacct g 71 <210> 110 <211> 71 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> AX-106737190 <400> 110 cccccccagg gcccactcgg gcggagaccc tgtggtgatc cagaaggtgt ctgtgcccct 60 gctatgctct g 71 <210> 111 <211> 71 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> AX-115099982 <400> 111 gccatgtgac attccacagg gaacaggatt cgtcttgctc ctcctgcctg ggggccgagc 60 atagagaagg c 71 <210> 112 <211> 71 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> AX-169369356 <400> 112 atgaattcgg agggggagca caagccttca gatcatggca ggatttactg agaataactg 60 aacccctttg g 71 <210> 113 <211> 71 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> AX-169380265 <400> 113 tgaccaggca gtgatctgat ttgatgggtg actagttgaa ataactggac tgacagtttc 60 cacagatgac a 71 <210> 114 <211> 71 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> AX-169369388 <400> 114 ctttcacttt ccaaggaaaa gaaaccaaag gtatgtctta ttttccttgg agataatgtc 60 caatcactta t 71 <210> 115 <211> 71 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> AX-106739527 <400> 115 ctattcgagg cctgggatgc atttagcttg ggagagtaag aactcctcat tcgtatcccg 60 agccccagag g 71 <210> 116 <211> 71 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> AX-169388346 <400> 116 gagaagagca tcttcttgaa gaccatgttt ggggttacgg ggctctgtct cttgttcacg 60 cttttggagc t 71 <210> 117 <211> 71 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> AX-124347768 <400> 117 aaatcagaaa ggacagataa tgccagtaaa aaagggaaaa aaccctcagc cggccacaaa 60 gcatccctcc g 71 <210> 118 <211> 71 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> AX-169475222 <400> 118 gctgcctctt ccaggatagg gggaaagttt tagacggcag tggtgtggag gagtcacgag 60 gggtcaaggc t 71 <210> 119 <211> 71 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> AX-169461233 <400> 119 gcaagctggg gctggggtga ggaaacactt gaaaccgggc cggagtatta gttccagaga 60 tgatggagcc a 71 <210> 120 <211> 71 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> AX-169480180 <400> 120 atgaggtctg aaaccctgaa tataccagga tgatcgccat ttctagccag tgtgaggagc 60 tattattgga t 71 <210> 121 <211> 71 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> AX-169367329 <400> 121 tccaattatg agaaatctgc agaaaaggac agcagggaat ggcaggtgtg acattaaacc 60 tttgggtaat a 71 <210> 122 <211> 71 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> AX-106728885 <400> 122 agtgatgtaa gaaagcaatt ctacagctgg gaatatactt ttaaaaactg gccactgagc 60 atttatgaag a 71 <210> 123 <211> 71 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> AX-106721199 <400> 123 aacctcggtg cgggcccccc acaaggagga ggccatgaac agcaggatcc caactcaatg 60 aaagctcctg t 71 <210> 124 <211> 71 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> AX-115112368 <400> 124 ttaccagatg agatactaat atgctgggaa ggccattgag acactttagg aaatgaagca 60 ggcagccaca t 71 <210> 125 <211> 71 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> AX-106759659 <400> 125 tgggaggcga cacccaccca gacaaagcac ccccatgggc ctgcgagctc ttagaatcca 60 gttcacggta t 71

Claims

서열번호 1 내지 125로 이루어지는 단일염기다형성(single nucleotide polymorphism, SNP) 마커를 검출 또는 증폭할 수 있는 제제를 포함하는, 제주 흑우 친자 감별용 마커 조성물로서,
상기 서열번호 1 내지 125 중 각 서열의 36번째에 단일염기다형성이 나타나는 것을 특징으로 하는, 제주 흑우 친자 감별용 마커 조성물.
제1항에 있어서,
상기 제제는 상기 단일염기다형성 마커와 혼성화될 수 있는 프로브인, 제주 흑우 친자 감별용 마커 조성물.
제1항 또는 제2항의 조성물을 포함하는, 제주 흑우 친자 감별용 키트.
제3항에 있어서,
상기 키트는 RT-PCR 또는 DNA 칩인, 제주 흑우 친자 감별용 키트.
제3항에 있어서,
상기 키트는 프라이머, 프로브, dNTP 및 완충용액을 더 포함하는, 제주 흑우 친자 감별용 키트.
제1항의 조성물을 포함하는, 제주 흑우 친자 감별용 마이크로어레이.
서열번호 1 내지 서열번호 125로 이루어지는 폴리뉴클레오티드를 포함하는, 제주 흑우 친자 감별용 단일염기다형성 마커 조성물에 있어서, 상기 서열번호 1 내지 서열번호 125 중 각 서열의 36번째에 단일염기다형성이 나타나는 것을 특징으로 하는, 제주 흑우 친자 감별용 단일염기다형성 마커 조성물.
개체의 시료로부터 핵산 분자를 분리하는 단계; 및
상기 핵산 분자에서 서열번호 1 내지 서열번호 125 중 각 서열의 36번째 뉴클레오티드의 유전자형을 확인하는 단계; 를 포함하는, 제주 흑우의 친자 감별 방법.
제8항에 있어서,
상기 시료는 개체의 근육, 표피, 혈액, 뼈 또는 장기로부터 수득되는 것인, 방법.
제8항에 있어서,
상기 유전자형을 확인하는 단계는 마이크로어레이 방식 또는 유전자 증폭 방식으로 수행되는 것인, 방법.