KR20170073065A - 단일염기다형성 마커를 포함하는 한우 품종 판별용 조성물 - Google Patents
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Abstract
본 발명은 단일염기다형성 마커를 포함하는 한우 품종 판별용 조성물에 관한 것으로, 단일염기다형성 마커를 이용하여 칡소, 흑우, 한우 품종을 판별함에 있어서 비용을 최소화하고, 높은 판별 정확도를 제공하는 효과가 있다.
Description
본 발명은 단일염기다형성 마커를 포함하는 한우 품종 판별용 조성물에 관한 것이다.
현재 우리나라 한우 품종에는 순수 한우인 누렁이 한우, 하난 칡소, 그리고 흑우가 있다. 일반적으로 우리가 알고 있는 소가 누렁이 한우이면, 범무늬 같다고 해서 범소, 호반우 또는 칡소라 부르기도 한다. 한우의 차별화를 위해서 국가기관에서 보증 씨르를 많이 보급하고 있다고 한다. 칡소는 불포화 지방산인 올레인산이 누렁소 보다 많아서 맛이 더 좋다. 마지막으로 흑우는 검은 소로 지방층이 더 두꺼워서 고기가 부드럽다. 성격이 온순하고 일본에 있는 화우 보다 덩치가 조금 작고 다리가 짧은 것이 특징이다.
한우의 차별화를 위해 대용량 SNP정보를 활용해 한우, 칡소, 흑우 종의 집단유전학적 특성을 규명할 필요가 있다.
본 발명의 목적은 단일염기다형성 마커를 이용하여 한우 품종 판별용 조성물을 제공하는 것이다.
본 발명의 다른 목적은 상기 한우 품종 판별용 조성물을 포함하는 키트 또는 마이크로어레이를 제공하는 것이다.
본 발명의 또 다른 목적은 상기 한우 품종 판별용 키트 또는 마이크로어레이를 이용한 한우 품종의 판별 방법을 제공하는 것이다.
상기 목적을 달성하기 위하여, 본 발명은 서열번호 1 내지 285로 표시되는 단일염기다형성(single nucleotide polymorphism) 마커군과 혼성화될 수 있는 프로브를 포함하는 한우 품종 판별용 조성물을 제공한다.
또한, 본 발명은 상기 한우 품종 판별용 조성물을 포함하는 한우 품종 판별용 키트를 제공한다.
또한, 본 발명은 상기 한우 품종 판별용 조성물을 포함하는 한우 품종 판별용 마이크로어레이를 제공한다.
본 발명은 또한, 상기 한우 품종 판별용 키트 또는 마이크로 어레이를 이용하여 소 개체에서 분리된 핵산분자의 단일염기다형성 마커군의 존재 여부를 확인하고, 상기 단일염기다형성 마커군의 존재가 확인되는 경우 한우 품종으로 판별하는 단계를 포함하는 한우 품종의 판별 방법을 제공한다.
본 발명은 한우, 칡소, 흑우 종의 집단유전학적 특성을 제공하여 한우 품종 판별을 신속하게 할 수 있어, 한우 산업에 유용하게 사용될 수 있다.
도 1은 한우, 흑우, 칡소 3가지 품종에서 추정된 Cluster K=3의 Bar plot을 나타낸 것이다.
도 2는 유전적 거리를 기반으로 나타낸 개체의 Triangle plot을 나타낸 것이다.
도 2는 유전적 거리를 기반으로 나타낸 개체의 Triangle plot을 나타낸 것이다.
이하, 본 발명의 구성을 구체적으로 설명한다.
본 발명은 본 발명은 SNP 명칭으로 표시되는 285개의 단일염기다형성(single nucleotide polymorphism) 마커군과 혼성화될 수 있는 프로브를 포함하는 한우 품종 판별용 조성물에 관한 것이다.
본 명세서에서, 용어 “단일염기다형성(SNP, single nucleotide polymorphism)”은 유전체 상에서 A, T, C, G로 구성되는 염기서열의 한 개가 다른 염기서열로 변한 것을 의미한다.
본 명세서에서, 용어“마커”란 한우 품종을 판별할 수 있는 물질로, 285개의 폴리뉴클레오타이드를 포함한다.
본 발명의 일 구체예에 따르면, 한우 품종을 판별할 수 있는 SNP 마커는 다음의 과정을 거쳐 선발할 수 있다.
한우, 흑우, 칡소를 대상으로 고밀도 Affymetrix Bovine 640K SNPs 어레이를 이용하여 SNP를 분석하고, 각각의 SNP에 대하여 형질과 고정/빈도의 차이 정도를 품종별로 비교 분석하고 한우-칡소, 한우-흑우, 칡소-흑우 각각의 품종간의 대립인자 빈도 차이를 내림차순으로 정렬하여 각 품종을 잘 설명할 SNP 리스트를 확인한다. 품종 간에서 주어진 대립인자 빈도 차이가 0.6 이상인 SNPs를 품종별 100개씩 선별하여 (한우-칡소 0.61 이상, 한우-흑우 0.66 이상, 칡소-흑우 0.83 이상) 중복된 SNPs를 제거하여 285개의 SNPs를 발굴하였고 발굴된 285개의 SNPs 마커를 이용하였을 때 한우와 흑우 칡소 품종을 유전적으로 얼마나 잘 분리시키는지 확인하기 위하여 STRUCTURE program ver. 2.3.4를 이용하여 각 개체간의 유전적 관계 및 집단 안의 유전적 유사성(genetic relationships and genetic similarities)을 확인하고, 개체별 3가지 clustering 비율의 평균을 품종별로 내었으며, 이를 선별한다.
본 명세서에서, 용어 "SNP 명칭"이란, Illumina Porcine SNP 60 BeadChip (WG-410)의 데이터베이스에 개시된 reporter name으로, 상기 데이터베이스에는 SNP의 위치와 서열이 기재되어 있고 하기 표 3에서 이들의 염기서열이 개시되어 있는바 당업자는 SNP 명칭을 통해 상기 데이터베이스로부터 용이하게 확인할 수 있다. 따라서, 명세서의 과도한 기재를 피하기 위해 청구범위에서는 SNP 명칭으로 기재하나 당업자 수준에서 이해 가능한 범주로 고려된다.
본 명세서에서, 용어 "프로브"는 특정 뉴클레오타이드 서열에 혼성화될 수 있는 디옥시리보뉴클레오타이드 및 리보뉴클레오타이드를 포함하는 자연 또는 변형되는 모노머 또는 결합을 갖는 선형의 올리고머를 의미한다. 상기 혼성화는 SNP 마커를 검출 또는 증폭을 통해 구현될 수 있다. 바람직하게는, 상기 프로브는 유전자의 변이 부위를 특이적으로 증폭할 수 있는 프라이머, 혼성화를 통해 검출 가능한 신호를 발생할 수 있는 앱타머 또는 상보적인 폴리뉴클레오타이드 등을 포함할 수 있다.
상기 프로브는 본 발명의 SNP를 포함하는 서열에 완전하게 (perfectly) 상보적인 서열이 이용될 수 있으나, 특이적 혼성화를 방해하지 않는 범위 내에서 실질적으로 (substantially) 상보적인 서열이 이용될 수도 있다.
상기 "프라이머"란, 짧은 자유 3' 말단 수산화기(free 3' hydroxyl group)를 가지는 염기 서열로 상보적인 주형(template)과 염기쌍(base pair)을 형성할 수 있고 주형 가닥 복사를 위한 시작 지점으로 기능을 하는 짧은 서열을 의미한다. 프라이머는 적절한 완충용액 및 온도에서 중합반응(즉, DNA 폴리머레이즈 또는 역전사효소)을 위한 시약 및 상이한 4가지 뉴클레오사이드 트리포스페이트의 존재 하에서 DNA 합성을 개시할 수 있다. 이때, PCR 조건, 센스 및 안티센스 프라이머의 길이는 당업계에 공지된 것을 기초로 변형할 수 있다.
본 발명의 프라이머는 포스포르아미다이트 고체 지지체 방법, 또는 기타 널리 공지된 방법을 사용하여 화학적으로 합성할 수 있다. 이러한 핵산 서열은 또한 당해 분야에 공지된 많은 수단을 이용하여 변형시킬 수 있다. 이러한 변형의 비-제한적인 예로는 메틸화, "캡화", 천연 뉴클레오타이드 하나 이상의 동족체로의 치환, 및 뉴클레오타이드 간의 변형, 예를 들면, 하전되지 않은 연결체(예: 메틸 포스포네이트, 포스포트리에스테르, 포스포로아미데이트, 카바메이트 등) 또는 하전된 연결체(예: 포스포로티오에이트, 포스포로디티오에이트 등)로의 변형이 있다.
또한, 상기 혼성화를 통해 검출 가능한 신호를 발생할 수 있는 상기 SNP 마커를 검출하기 위한 프로브 폴리뉴클레오타이드는 핵산의 상보성 가닥에 서열 특이적으로 결합할 수 있는 올리고뉴클레오티드를 의미한다. 본 발명의 프로브 폴리뉴클레오타이드는 대립유전자 특이적 프로브로서, 같은 종의 두 구성원으로부터 유래한 핵산 단편 중에 다형성 부위가 존재하여, 한 구성원으로부터 유래한 DNA 단편에는 혼성화하나, 다른 구성원으로부터 유래한 단편에는 혼성화하지 않는다.
이 경우 혼성화 조건은 대립유전자 간의 혼성화 강도에 있어서 유의한 차이를 보여, 대립유전자 중 하나에만 혼성화 하도록 충분히 엄격해야 한다. 이렇게 함으로써 다른 대립유전자 형태 간에 좋은 혼성화 차이를 유발할 수 있다. 본 발명의 상기 프로브는 대립유전자를 검출하여 한우 품종의 판별 방법 등에 사용될 수 있다. 상기 판별 방법에는 서던 블롯 등과 같은 핵산의 혼성화에 근거한 검출방법들이 포함되며, DNA 칩을 이용한 방법에서 DNA 칩의 기판에 미리 결합된 형태로 제공될 수도 있다. 상기 혼성화란 엄격한 조건, 예를 들면 1M 이하의 염 농도 및 25 ℃ 이상의 온도 하에서 보통 수행될 수 있다. 예를 들면, 5×SSPE(750 mM NaCl, 50 mM Na Phosphate, 5 mM EDTA, pH 7.4) 및 25-30℃의 조건이 대립유전자 특이적 프로브 혼성화에 적합할 수 있다.
본 발명은 또한, 상기 한우 품종 판별용 조성물을 포함하는 한우 품종 판별용 키트에 관한 것이다.
상기 키트는 RT-PCR 키트 또는 DNA 분석용 (예, DNA 칩) 키트일 수 있다.
본 발명의 키트는 한우 품종 판별용 마커인 SNP 마커의 증폭을 통해 확인함으로써 한우 품종을 판별할 수 있다.
일 구체예에서, 본 발명의 한우 품종 판별용 키트는 SNP 마커 증폭을 위한 RT-PCR을 수행하기 위해 필요한 필수 요소를 포함하는 키트일 수 있다. RT-PCR 키트는, SNP 마커에 대한 특이적인 각각의 프라이머 쌍 외에도 RT-PCR 키트는 테스트 튜브 또는 다른 적절한 컨테이너, 반응 완충액(pH 및 마그네슘 농도는 다양), 데옥시뉴클레오타이드(dNTPs), Taq-폴리머라아제 및 역전사효소와 같은 효소, DNase, RNAse 억제제, DEPC-수(DEPC-water), 멸균수 등을 포함할 수 있다. 또한 정량 대조군으로 사용되는 유전자에 특이적인 프라이머 쌍을 포함할 수 있다.
또한, 본 발명의 키트는 DNA 칩을 수행하기 위해 필요한 필수 요소를 포함하는 한우 품종 판별용 키트일 수 있다. DNA 칩 키트는, 수십만 개의 DNA의 각 염기를 한 번에 확인할 수 있는 DNA 마이크로어레이의 하나를 의미하며, 일반적으로 편평한 고체 지지판(또는 고상 담체), 전형적으로는 현미경용 슬라이드보다 크지 않은 유리 표면에 핵산 종을 격자형 배열(gridded array)로 부착한 것으로, 칩 표면에 핵산이 일정하게 배열되어, DNA 칩 상의 핵산과 칩 표면에 처리된 용액 내에 포함된 상보적인 핵산 간에 다중 혼성화(hybridization) 반응이 일어나 대량 병렬 분석이 가능하도록 하는 도구이다.
본 발명은 또한 상기 한우 품종 판별용 SNP 마커의 폴리뉴클레오타이드를 포함하는 한우 품종 판별용 마이크로어레이를 제공한다.
상기 마이크로어레이는 DNA 또는 RNA 폴리뉴클레오타이드를 포함하는 것일 수 있다. 상기 마이크로어레이는 프로브 폴리뉴클레오타이드에 본 발명의 폴리뉴클레오타이드를 포함하는 것을 제외하고는 통상적인 마이크로어레이로 이루어진다.
프로브 폴리뉴클레오타이드를 기판상에 고정화하여 마이크로어레이를 제조하는 방법은 당업계에 잘 알려져 있다.
본 발명의 한우 품종 판별과 연관된 프로브 폴리뉴클레오타이드를 기판 상에 고정화하는 과정도 또한 이러한 종래 기술을 사용하여 용이하게 수행할 수 있다.
또한, 마이크로어레이 상에서의 핵산의 혼성화 및 혼성화 결과의 검출은 당업계에 잘 알려져 있다. 상기 검출은 예를 들면, 핵산 시료를 형광물질을 포함하는 검출 가능한 신호를 발생시킬 수 있는 표지물질로 표지한 다음, 마이크로어레이 상에 혼성화하고 상기 표지물질로부터 발생하는 신호를 검출함으로써 혼성화 결과를 검출할 수 있다. 상기 형광물질은 파이렌, 텍사스 레드, 플루오레신(fluorescein), 보디피(BODYPY), 테트라메틸로드아민(Trtramethylrhodamine), 알렉사(Alexa), 시아닌(Cyanine), 알로피코시아닌(allopicocyanine), 닐 블루, 닐 레드 또는 기타의 형광을 발생시키는 형광물질이 사용될 수 있다. 또한, 양자 수득량(quantaum yield)이 높은 형광물질을 사용할 수 있다. 또한, 친수성 또는 소수성 염료일 수 있다.
본 발명은 또한 상기 한우 품종 판별용 키트 또는 마이크로어레이를 이용하여 소 개체에서 분리된 핵산분자의 단일염기다형성 마커군의 존재 여부를 확인하고, 상기 단일염기다형성 마커군의 존재가 확인되는 경우 한우 품종으로 판별하는 단계를 포함하는 한우 품종의 판별 방법에 관한 것이다.
본 명세서에서, 용어 "핵산분자"는 DNA (gDNA 및 cDNA) 그리고 RNA 분자를 포괄적으로 포함하는 의미를 가지면, 핵산 분자에서 기본 구성 단위인 뉴클레오타이드는 자연의 뉴클레오타이드뿐만 아니라, 당 또는 염기 부위가 변형된 유사체(analogue)도 포함한다 (Scheit, Nucleotide Analogs, John Wiley, New York(1980); Uhlman 및 Peyman, ChemicalReviews, 90:543-584(1990)).
상기 핵산분자는 소 개체의 다양한 소스로부터 얻을 수 있으며, 예컨대, 근육, 표피, 혈액, 뼈, 장기로부터 얻을 수 있고, 더 구체적으로, 근육 또는 혈액으로부터 얻는다.
본 발명의 방법에서 출발물질이 gDNA인 경우, gDNA의 분리는 당업계에 공지된 통상의 방법에 따라 실시될 수 있다 (참조: Rogers & Bendich (1994)).
출발물질이 mRNA인 경우에는, 당업계에 공지된 통상의 방법에 총 RNA를 분리하여 실시된다(참조: Sambrook, J. et al., Molecular Cloning. A Laboratory Manual, 3rd ed. Cold Spring Harbor Press(2001); Ausubel, F.M. et al., Current Protocols in Molecular Biology, John Willey & Sons(1987); 및 Chomczynski, P. et al., Anal. Biochem. 162:156(1987)). 분리된 총 RNA는 역전사 효소를 이용하여 cDNA로 합성된다. 상기 총 RNA는 동물세포로부터 분리된 것이기 때문에, mRNA의 말단에는 폴리-A 테일을 갖고 있으며, 이러한 서열 특성을 이용한 올리고 dT 프라이머 및 역전사 효소를 이용하여 cDNA을 용이하게 합성할 수 있다 (참조: PNAS USA, 85:8998(1988); Libert F, et al., Science, 244:569(1989); 및 Sambrook, J. et al., Molecular Cloning. A Laboratory Manual, 3rd ed. Cold Spring Harbor Press(2001)).
상기 핵산분자로부터 SNP 마커의 다형성 부위를 증폭하는 단계는 당업자에게 알려진 방법을 제한 없이 사용할 수 있다. 예를 들면, 표적 핵산을 PCR을 통하여 증폭하고 이를 정제하여 얻을 수 있다. 그 외 리가제 연쇄 반응(LCR)(Wu 및 Wallace, Genomics 4, 560(1989), Landegren 등, Science 241, 1077(1988)), 전사 증폭(transcription amplification)(Kwoh 등, Proc. Natl.Acad. Sci. USA 86, 1173(1989)) 및 자가유지 서열 복제(Guatelli 등, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 87, 1874(1990)) 및 핵산에 근거한 서열 증폭(NASBA)이 사용될 수 있다.
상기 방법 중 증폭된 다형성 부위의 염기를 결정하는 것은 서열 분석, 마이크로어레이(microarray)에 의한 혼성화, 대립유전자 특이적인 PCR(allele specific PCR), 다이나믹 대립유전자 혼성화 기법(dynamic allele-specifichybridization, DASH), PCR 연장 분석, PCR-SSCP, PCR-RFLP 분석 또는 TaqMan 기법, SNPlex 플랫폼(Applied Biosystems), 질량 분석법(예를 들면, Sequenom의 MassARRAY 시스템), 미니-시퀀싱(mini-sequencing) 방법, Bio-Plex 시스템(BioRad), CEQ and SNPstream 시스템(Beckman), Molecular Inversion Probe 어레이 기술(예를 들면, Affymetrix GeneChip), 및 BeadArray Technologies(예를 들면, Illumina GoldenGate 및 Infinium 분석법) 등을 이용하여 수행될 수 있으나, 특별히 이에 제한되지는 않는다. 상기 방법들 또는 본 발명이 속하는 기술분야의 당업자에게 이용 가능한 다른 방법에 의해 확인할 수 있다. 이와 같은 변이 부위의 염기를 결정하는 것은 바람직하게는 DNA 칩을 통해 수행할 수 있다.
또한, SNP 마커의 검출은 상술한 프로브 폴리뉴클레오타이드를 이용한 검출 방법을 사용하여 고상 담체상에 고정된 프로브와 소 개체에서 분리된 핵산분자의 혼성화에 따른 신호 검출로부터 확인할 수 있다.
본 발명의 이점 및 특징, 그리고 그것들을 달성하는 방법은 상세하게 후술되어 있는 실시예들을 참조하면 명확해질 것이다. 그러나 본 발명은 이하에서 개시되는 실시예들에 한정되는 것이 아니라 서로 다른 다양한 형태로 구현될 것이며, 단지 본 실시예들은 본 발명의 개시가 완전하도록 하고, 본 발명이 속하는 기술 분야에서 통상의 지식을 가진 자에게 발명의 범주를 완전하게 알려주기 위해 제공되는 것이며, 본 발명은 청구항의 범주에 의해 정의될 뿐이다.
[
실시예
]
실시예
1: 한우 시료 수집
시료는 한우(황색) 439두를 안성소재 축산연구원 도축장에서 흑우 및 칡소 각각 18두의 시료를 경북축산기술연구소에서 수집하여 DNA를 추출하여 Affymetrix bovine 640K SNP array를 이용하였다.
실시예
2: 유전자형 분석
상기 실시예 1에서 수집한 한우, 흑우, 칡소를 대상으로 고밀도 Affymetrix Bovine 640K SNPs 어레이를 이용하여 분석하였다. 각 SNP들의 구조, 즉 대립인자(allele) 고정/빈도의 차이 정도를 품종별로 비교 분석하였다.
한우-칡소, 한우-흑우, 칡소-흑우 각각의 품종 간의 대립인자 빈도 차이를 내림차순으로 정렬하여 각 품종을 잘 설명할 SNP 리스트를 확인하였다.
한우-칡소, 한우-흑우, 칡소-흑우 각 품종 간의 대립인자 빈도 차이를 하기 표 1에 나타내었다.
| No. | SNP ID | Allele | |한우-칡소| | SNP ID | Allele | |한우-흑우| | SNP ID | Allele | |칡소-흑우| |
| 1 | AX-21315504 | G | 0.942 | AX-26528297 | C | 0.888 | AX-26528297 | C | 1.000 |
| 2 | AX-26892321 | C | 0.857 | AX-27324206 | T | 0.779 | AX-25166729 | C | 0.944 |
| 3 | AX-18289050 | G | 0.821 | AX-21315504 | G | 0.775 | AX-20882505 | A | 0.938 |
| 4 | AX-24500097 | A | 0.767 | AX-23733968 | G | 0.767 | AX-19444367 | C | 0.917 |
| 5 | AX-27272516 | G | 0.726 | AX-24819595 | C | 0.765 | AX-27136986 | A | 0.917 |
| 6 | AX-23343886 | C | 0.724 | AX-23733708 | C | 0.762 | AX-19444438 | G | 0.917 |
| 7 | AX-19003790 | A | 0.714 | AX-24819597 | C | 0.762 | AX-19316876 | A | 0.917 |
| 8 | AX-24375033 | G | 0.703 | AX-23733916 | T | 0.754 | AX-26932708 | G | 0.889 |
| 9 | AX-24375029 | A | 0.702 | AX-23733411 | G | 0.745 | AX-26421323 | T | 0.889 |
| 10 | AX-27299002 | G | 0.692 | AX-21432365 | C | 0.743 | AX-21584895 | T | 0.889 |
| 11 | AX-20032146 | A | 0.690 | AX-23733875 | G | 0.738 | AX-27148614 | G | 0.889 |
| 12 | AX-18060829 | G | 0.690 | AX-23733391 | C | 0.737 | AX-27946290 | A | 0.889 |
| 13 | AX-27136986 | A | 0.684 | AX-23733983 | G | 0.736 | AX-23986030 | G | 0.889 |
| 14 | AX-20187585 | T | 0.682 | AX-19495157 | T | 0.735 | AX-21366447 | T | 0.889 |
| 15 | AX-27708338 | G | 0.680 | AX-27711617 | A | 0.734 | AX-22492392 | T | 0.889 |
| 16 | AX-23246683 | G | 0.680 | AX-21722598 | T | 0.731 | AX-18643557 | T | 0.887 |
| 17 | AX-27350081 | G | 0.678 | AX-23343886 | C | 0.724 | AX-20882489 | A | 0.885 |
| 18 | AX-18203703 | C | 0.677 | AX-23733783 | A | 0.722 | AX-21404499 | G | 0.884 |
| 19 | AX-23262572 | A | 0.673 | AX-21432359 | C | 0.720 | AX-27092960 | A | 0.883 |
| 20 | AX-25048882 | T | 0.666 | AX-27320946 | T | 0.718 | AX-25754323 | C | 0.879 |
| 21 | AX-25341233 | A | 0.666 | AX-23733589 | G | 0.716 | AX-27669231 | G | 0.875 |
| 22 | AX-18310962 | A | 0.663 | AX-25853771 | T | 0.715 | AX-20882885 | A | 0.863 |
| 23 | AX-18060831 | G | 0.660 | AX-24638023 | C | 0.715 | AX-19702405 | A | 0.861 |
| 24 | AX-27582760 | C | 0.659 | AX-21722297 | C | 0.714 | AX-21116702 | T | 0.861 |
| 25 | AX-25156114 | T | 0.653 | AX-21939699 | A | 0.714 | AX-24449108 | G | 0.861 |
| 26 | AX-25054392 | C | 0.651 | AX-21758658 | A | 0.714 | AX-23801348 | T | 0.861 |
| 27 | AX-27272469 | C | 0.651 | AX-24087883 | C | 0.710 | AX-25102064 | G | 0.861 |
| 28 | AX-26887972 | G | 0.649 | AX-22490936 | G | 0.710 | AX-27148663 | C | 0.861 |
| 29 | AX-24512026 | T | 0.649 | AX-21355291 | T | 0.707 | AX-21570731 | T | 0.861 |
| 30 | AX-18095090 | A | 0.649 | AX-28516889 | G | 0.706 | AX-21404467 | G | 0.861 |
| 31 | AX-18039577 | G | 0.648 | AX-22490920 | T | 0.706 | AX-21404513 | G | 0.861 |
| 32 | AX-23262449 | C | 0.647 | AX-24616982 | T | 0.706 | AX-25885232 | A | 0.861 |
| 33 | AX-27350180 | T | 0.647 | AX-25854353 | G | 0.704 | AX-26257462 | C | 0.861 |
| 34 | AX-27272505 | C | 0.647 | AX-28480806 | C | 0.702 | AX-21433801 | G | 0.861 |
| 35 | AX-19966562 | A | 0.645 | AX-21855019 | C | 0.702 | AX-20389536 | G | 0.861 |
| 36 | AX-25156107 | G | 0.643 | AX-22326136 | A | 0.702 | AX-21855019 | C | 0.861 |
| 37 | AX-27540351 | G | 0.641 | AX-20464333 | G | 0.701 | AX-26787045 | T | 0.861 |
| 38 | AX-27086319 | T | 0.638 | AX-20464345 | C | 0.701 | AX-18332038 | A | 0.861 |
| 39 | AX-19984954 | A | 0.637 | AX-25853835 | C | 0.701 | AX-21354030 | T | 0.861 |
| 40 | AX-18060887 | G | 0.637 | AX-19352356 | C | 0.699 | AX-21404498 | G | 0.861 |
| 41 | AX-20187285 | T | 0.636 | AX-20464346 | T | 0.699 | AX-21404468 | T | 0.861 |
| 42 | AX-27141137 | C | 0.635 | AX-27409336 | A | 0.699 | AX-23668034 | T | 0.861 |
| 43 | AX-24512034 | C | 0.635 | AX-23589537 | C | 0.698 | AX-21855148 | G | 0.861 |
| 44 | AX-23262560 | T | 0.634 | AX-24053527 | T | 0.698 | AX-19365585 | C | 0.861 |
| 45 | AX-18373303 | G | 0.634 | AX-23986030 | G | 0.696 | AX-24449089 | G | 0.861 |
| 46 | AX-18506445 | G | 0.633 | AX-24090508 | A | 0.696 | AX-23801359 | A | 0.861 |
| 47 | AX-21737105 | G | 0.631 | AX-21655043 | C | 0.695 | AX-19506800 | T | 0.861 |
| 48 | AX-19961147 | A | 0.631 | AX-21855148 | G | 0.695 | AX-21961270 | T | 0.861 |
| 49 | AX-23613259 | G | 0.631 | AX-23105330 | A | 0.694 | AX-22731758 | T | 0.861 |
| 50 | AX-23613324 | A | 0.630 | AX-25648889 | C | 0.693 | AX-21124152 | G | 0.861 |
| 51 | AX-27087114 | T | 0.630 | AX-23594925 | C | 0.693 | AX-21404475 | T | 0.859 |
| 52 | AX-18249074 | G | 0.630 | AX-26892321 | C | 0.692 | AX-24113615 | A | 0.858 |
| 53 | AX-19961583 | C | 0.629 | AX-24729372 | A | 0.691 | AX-23416743 | T | 0.856 |
| 54 | AX-26889875 | G | 0.628 | AX-21654834 | T | 0.691 | AX-23801358 | A | 0.856 |
| 55 | AX-19112353 | T | 0.627 | AX-22732616 | G | 0.691 | AX-24500097 | A | 0.856 |
| 56 | AX-18296559 | C | 0.627 | AX-23241793 | C | 0.690 | AX-26919959 | C | 0.855 |
| 57 | AX-23668085 | T | 0.627 | AX-18851951 | C | 0.688 | AX-22273664 | A | 0.853 |
| 58 | AX-18458500 | C | 0.626 | AX-27335283 | A | 0.688 | AX-20883010 | A | 0.853 |
| 59 | AX-26889827 | G | 0.626 | AX-25754451 | G | 0.687 | AX-24536164 | G | 0.849 |
| 60 | AX-20779023 | T | 0.625 | AX-24361903 | A | 0.686 | AX-19112353 | T | 0.844 |
| 61 | AX-27183993 | C | 0.625 | AX-22769789 | C | 0.685 | AX-25317751 | C | 0.839 |
| 62 | AX-21219977 | A | 0.625 | AX-23189200 | A | 0.685 | AX-24279830 | T | 0.833 |
| 63 | AX-22789407 | T | 0.624 | AX-25875330 | C | 0.683 | AX-18534333 | C | 0.833 |
| 64 | AX-27272454 | T | 0.624 | AX-21760952 | A | 0.683 | AX-26046311 | C | 0.833 |
| 65 | AX-18246345 | T | 0.623 | AX-22769786 | G | 0.683 | AX-27149025 | A | 0.833 |
| 66 | AX-27597820 | C | 0.623 | AX-21532895 | C | 0.682 | AX-19076256 | T | 0.833 |
| 67 | AX-22257566 | A | 0.622 | AX-18463475 | T | 0.682 | AX-25199234 | C | 0.833 |
| 68 | AX-23234384 | T | 0.622 | AX-22397069 | A | 0.681 | AX-25199280 | C | 0.833 |
| 69 | AX-21511369 | G | 0.621 | AX-21532904 | A | 0.679 | AX-23063835 | C | 0.833 |
| 70 | AX-25075350 | A | 0.621 | AX-19112040 | G | 0.679 | AX-25770166 | C | 0.833 |
| 71 | AX-27122829 | G | 0.620 | AX-25855142 | T | 0.679 | AX-24113635 | T | 0.833 |
| 72 | AX-21508920 | C | 0.620 | AX-23734216 | A | 0.679 | AX-26919976 | C | 0.833 |
| 73 | AX-26917001 | G | 0.620 | AX-19826772 | C | 0.678 | AX-26919925 | C | 0.833 |
| 74 | AX-22221089 | G | 0.620 | AX-19365593 | T | 0.678 | AX-25167349 | G | 0.833 |
| 75 | AX-18060851 | T | 0.620 | AX-24087867 | A | 0.677 | AX-18902454 | T | 0.833 |
| 76 | AX-22257613 | C | 0.620 | AX-27206354 | G | 0.677 | AX-19729961 | C | 0.833 |
| 77 | AX-23263024 | A | 0.620 | AX-24090505 | T | 0.677 | AX-21195581 | G | 0.833 |
| 78 | AX-24374734 | C | 0.619 | AX-25687226 | T | 0.676 | AX-27701334 | T | 0.833 |
| 79 | AX-20039423 | G | 0.618 | AX-20061148 | T | 0.676 | AX-20113327 | C | 0.833 |
| 80 | AX-27753185 | T | 0.617 | AX-25138970 | G | 0.675 | AX-27077932 | T | 0.833 |
| 81 | AX-27448018 | C | 0.617 | AX-27180085 | C | 0.675 | AX-19076676 | A | 0.833 |
| 82 | AX-22257503 | G | 0.616 | AX-24090502 | G | 0.675 | AX-23668048 | T | 0.833 |
| 83 | AX-25122080 | C | 0.616 | AX-21433822 | A | 0.674 | AX-25875330 | C | 0.833 |
| 84 | AX-19340910 | T | 0.615 | AX-23733754 | A | 0.674 | AX-21433822 | A | 0.833 |
| 85 | AX-22386865 | A | 0.615 | AX-18793395 | A | 0.672 | AX-20280572 | G | 0.833 |
| 86 | AX-24571577 | G | 0.615 | AX-24641350 | C | 0.671 | AX-19135426 | A | 0.833 |
| 87 | AX-18060989 | T | 0.614 | AX-22326126 | A | 0.671 | AX-24536167 | G | 0.833 |
| 88 | AX-19112382 | C | 0.613 | AX-25525428 | G | 0.670 | AX-20256225 | T | 0.833 |
| 89 | AX-19112425 | A | 0.612 | AX-21722384 | A | 0.670 | AX-26839534 | G | 0.833 |
| 90 | AX-19112459 | C | 0.612 | AX-23595280 | A | 0.669 | AX-27669332 | C | 0.833 |
| 91 | AX-27350126 | C | 0.612 | AX-24361822 | A | 0.669 | AX-27776095 | G | 0.833 |
| 92 | AX-22069557 | G | 0.611 | AX-27349486 | T | 0.667 | AX-23226255 | C | 0.833 |
| 93 | AX-27788736 | G | 0.610 | AX-23594926 | G | 0.667 | AX-23851703 | G | 0.833 |
| 94 | AX-23595553 | G | 0.610 | AX-20301117 | C | 0.667 | AX-19111057 | G | 0.833 |
| 95 | AX-22257579 | G | 0.610 | AX-24090520 | A | 0.666 | AX-24789456 | A | 0.833 |
| 96 | AX-22221101 | G | 0.610 | AX-19076256 | T | 0.665 | AX-24113625 | G | 0.833 |
| 97 | AX-26659193 | A | 0.610 | AX-20109716 | T | 0.665 | AX-26927181 | A | 0.833 |
| 98 | AX-26527336 | G | 0.609 | AX-27150254 | G | 0.665 | AX-24113632 | C | 0.833 |
| 99 | AX-25033107 | T | 0.607 | AX-27336997 | G | 0.665 | AX-22491239 | A | 0.833 |
| 100 | AX-19203595 | T | 0.607 | AX-21105040 | C | 0.664 | AX-25433473 | A | 0.833 |
품종 간에서 주어진 대립인자 빈도차이가 0.6 이상인 SNPs를 품종별 100개씩 선별하여 (한우-칡소 0.61 이상, 한우-흑우 0.66 이상, 칡소-흑우 0.83 이상) 중복된 SNPs를 제거하여 285개의 SNPs를 발굴하였고 발굴된 285개의 SNPs마커를 이용하였을 때 한우와 흑우 칡소 품종을 유전적으로 얼마나 잘 분리시키는지 확인하기 위하여 STRUCTURE program ver. 2.3.4를 이용하여 각 개체간의 유전적 관계 및 집단안의 유전적 유사성 (genetic relationships and genetic similarities) 을 확인하였다.
각 3가지 클러스터 집단에 속하는 한우, 흑우, 칡소 집단의 비율을 하기 표 2에 나타내었다.
| 품종 |
추정된 클러스터 | 개체 수 | ||
| 1 | 2 | 3 | ||
| 한우 | 0.965 | 0.016 | 0.019 | 439 |
| 칡소 | 0.132 | 0.859 | 0.009 | 18 |
| 흑우 | 0.106 | 0.023 | 0.872 | 18 |
몇 퍼센트로 품종을 분류하는지를 확인하기 위하여 개체별 3가지 clustering 비율의 평균을 품종별로 내었으며, 이때 해당 SNPs set는 한우 품종을 약 96% 이상 구별해 낼 것으로 기대하며, 또한 칡소와 흑우도 85% 이상 구별능이 있을 것으로 예상된다. 도 1과 도 2로 나타내었다.
본 연구를 통해 수득한 한우 품종 판별용 SNP 염기서열을 하기 표 3에 나타내었다. 하기 표 3에서 [A/B]란 염기 A가 염기 B로 돌연변이된 SNP임을 의미한다.
| SNP | 서열 | 서열번호 |
| AX-18039577 | TTCAGTTGGCCTATCTGTTTAGCTT[G/T]GTTTAAAACATGTGGTGTCAAAGAC | 1 |
| AX-18060829 | GTTTCTCTTTCTCCAACTCTATTTC[A/G]CTTTAGTGGATTATTTTTGGGAACT | 2 |
| AX-18060831 | GGAATTCCTAGTTGGCTTTAAAATA[G/T]ATGGTAGTCCATTAATTTTACGCTC | 3 |
| AX-18060851 | CCTTCCTTTTAATAAAGAGAAAGTG[C/T]GCACAGCTTATATATTTTGAACAGA | 4 |
| AX-18060887 | ATAGAGAATGAAAAGAAGAGAAAGC[G/T]AAGAATAGGTCTTCAGGGAACACTG | 5 |
| AX-18060989 | ATAAATATTATTTTAATAGTATCCA[A/G]CCTCAAAGTCTTGTCTCACTTTATA | 6 |
| AX-18095090 | AGTGAATGAAAACCTAGCAATCTTC[A/G]ATCTACTCTGAATAAGAAGTTTTTA | 7 |
| AX-18203703 | AAGGTTATGGGAAATAATAAATGAA[G/T]ACAGAAGATGAGATCTTTGCAACCT | 8 |
| AX-18246345 | GATAGAAGTAAGATATACCACAAAA[C/T]ATTAACTAAAAATAAATTGGTTTAT | 9 |
| AX-18249074 | GCAAGGCTCCCTTTTCATTCTCTAG[G/T]TCTACCACTCTCTTCTGCAAAAAGG | 10 |
| AX-18289050 | TACTGCTAGGCGTTTTGAACTATGC[A/G]AATGTATTATCTGCATAAAATAACT | 11 |
| AX-18296559 | CAATAATGAGGGATAAAGATGGTCA[C/T]CAATGTCAATAAACATGAGAAGTGA | 12 |
| AX-18310962 | CCAGTAAGCTATCCTGTGGACATTG[A/G]CAAAGTGATTCTAAACTTTATATGG | 13 |
| AX-18332038 | TGTTTTTCTTTCCATTTTGATCACA[A/G]CTGTTACTTCTTACACAATTTTATT | 14 |
| AX-18373303 | TATGCAAACTCTACGATGCTTGTAG[A/G]GAATCCAGCAAAGTGTTTATATTTC | 15 |
| AX-18458500 | CACCATGTCAAGAAGTATAATTTCC[C/T]ATTAGAATAGCTTTAAGTGTCCAAC | 16 |
| AX-18463475 | acttaatactgtgctTGAATAAGCT[C/T]GATAACACTGATTTGATGAATATGC | 17 |
| AX-18506445 | TCCTTTAACAGATTTCCCTATACTC[G/T]CAGCATCTAAATGATGAAACTGAAT | 18 |
| AX-18534333 | TTTGGCACAAACATGTACTGAGCCC[C/T]TACCCTCTGCCAGTGGTTGTGATAA | 19 |
| AX-22069557 | GAAACAGTTGAATGGAAGAACCCAA[G/T]GTTGTAATTAATGGGTTTCTAACAA | 20 |
| AX-22221089 | AGATGAAGAAGATCAGGCAAGACAG[A/G]AAGCTGGTCTTCAAAGATACTGGAC | 21 |
| AX-22221101 | TAATTTAAATAGCAAGCATTAAGAC[A/G]TCTAATACCACACCTGGAACCTATC | 22 |
| AX-22257503 | GGTTAAATGTGCAATTGAAACTGTG[A/G]TAGCTGTTTCATGTAAAGACACATC | 23 |
| AX-22257566 | CCACTGCACCACCTGGGAAACCCCT[A/G]TGCATGTACCACATCTATAATTATT | 24 |
| AX-22257579 | TATAGCTGTGTATGTCAAAGCTTCT[A/G]AACAAGGCCTCTGGAATCATTGAGA | 25 |
| AX-22257613 | GAGGTTCAGACAAAGAGGTAAAGTA[C/T]TGGGGATCAATTAGTGGAGAGCAGA | 26 |
| AX-22273664 | CACCTCACGGTGAGACTTTTTCTAA[A/G]ATAACTCAATTGGTGCCCCGTTTCT | 27 |
| AX-22326126 | TCTTCTCTCTCTCTCTATGTAATCC[A/C]TGCTAATGCAGAAAATTTCTTACTA | 28 |
| AX-22326136 | GCTGCTAAATCCAACTTTCCATTCA[A/G]TGTCTGAGCCTTTTTCAGGTACCGT | 29 |
| AX-22386865 | TGGTCGTGGCATATTTATTTTCACC[A/G]AACTATTTTTCTAACAGCTACTGCA | 30 |
| AX-22397069 | ATCATTTCGTAATGTGTGTGTGTGC[A/G]TTCAGTTGCTTCAGTTCAGTTCAGT | 31 |
| AX-22490920 | TTAATATATTGGAATTCTGCTTTAC[A/G]CATCAGTTCCTTGTGCCAGCCTGCT | 32 |
| AX-22490936 | TATTGCTGTAAAAGTGTAAACCTAG[A/G]AACAACCAAAATGTTCATCAAAGAG | 33 |
| AX-22491239 | CCCTCTAGACTCATACAGAGTCTTA[A/G]GCCCCTTTTAAAATCTTCATTCTAC | 34 |
| AX-22492392 | GGGAAAGTTGCTGGTTCTAGGACAA[C/T]AAGCAGGGAACAGGCCCAAAGAAAC | 35 |
| AX-25033107 | TACTGTAATGCAGGCAAAGTGTATA[C/T]GTGAGGAGCCTAACCTTTACTTATG | 36 |
| AX-25048882 | AGTTACATTATTCATATGTGTGGAA[G/T]ACAGATCCTGAAATTATCCACAGCG | 37 |
| AX-25054392 | ATTCATTGGCAAAATCCTCAGATTC[C/T]ATCTTAAGAACTATTTCCAACAGAA | 38 |
| AX-25075350 | TATCCTCATTCACAGTGCCTGGTCC[A/G]GGGTAAATGGTCCATAAAAGTTATT | 39 |
| AX-25102064 | TCTAGATTTAGACCTTCTTGAGGGC[G/T]GAGACCATGGCATTGCCTAAGTATT | 40 |
| AX-25122080 | ATGTCCAGCTTCTTCCAGGGGATAC[C/T]CTGGTTCAGTTAAAAAAAAAAAAGA | 41 |
| AX-25138970 | TCTCTTTCACTTCTAACTCCTTCTT[A/G]GCATCTGCTTCTAACTCAGATTTAC | 42 |
| AX-25156107 | TAGAGGAAATAAGACATAGATACAC[A/G]AGAAATACTGTACTCATGTTTGAAT | 43 |
| AX-25156114 | ACTGGACCACCAGGGAATCCCAGGA[C/T]ATAAATTTTTGAAGGTGTCTCCCCT | 44 |
| AX-25166729 | CAGTTGACAACTTTGGCTCCCCAGA[C/T]GTAGAACTATATCAGCACTACTTTT | 45 |
| AX-25167349 | ATTTGGCCCCCAAATAATCTGGATG[G/T]TGGAGAATTTGATAATCCCTATAGA | 46 |
| AX-25199234 | GCCTTTCATTCATTCACTTGTTCTT[C/T]ACCCATTCATCCAGGAACTATTTAT | 47 |
| AX-25199280 | TTGAACTTGATTCCAAAATCTCCAT[C/T]GGGTCCTCCTGGGTTGTGGCTGGCT | 48 |
| AX-25317751 | CAAACTGGCGAAATGAAACTTTAGG[A/C]AACGGGAATTACCTTATTACTATTA | 49 |
| AX-25341233 | GGGAACCTTGTGAGCATTGAAGGTT[C/T]TGGCCAGTGGTGTGGGAGCCAGCTC | 50 |
| AX-25433473 | AATCCTAACTCCATCTCCCCACAAA[A/G]CTTCCTTGCTCTATCCCAGATTCTC | 51 |
| AX-25525428 | CTGGGTTTGTTATTCAAAAGTAATG[A/G]GGATTGATGGAAATCTCTACTACTA | 52 |
| AX-25648889 | CCTCTCTTTCAAATAACATCTTTTA[C/T]CTTTCCTCCTCCACCTAGCACATGC | 53 |
| AX-25687226 | GGTATGGTGTGCTTGTTTATTTAAT[A/G]AAAGGCCACTACCTGTGTGTTTTGC | 54 |
| AX-25754323 | GGCTGGTTGGCTTTCTCTTTGCTAA[C/T]AGGTTTTAGTGCCTTGAATACTAAA | 55 |
| AX-25754451 | AATCCCACAGGGTGATCTGCAAACA[A/G]AGTTTCCTCAGTCTGGATACACAGT | 56 |
| AX-25770166 | TGCTATAACAACTTGCCACTCATTT[C/T]GACTTTACACCAATAACCCAAAGAC | 57 |
| AX-25853771 | GAGTATATGTTTTCTTCATATTCAG[G/T]TCAGTGCAGTCACTCAGTCGTGTCC | 58 |
| AX-25853835 | CTTGCATGTTTATGACATTCCTGAC[C/T]ATTTCCATTTGCTGTGACCCTAACC | 59 |
| AX-25854353 | TACCGAGGGCAGAAGCCTTACCTTA[G/T]TCTTCCATCTTCAGTACTACTGGTA | 60 |
| AX-25855142 | AAGTGGAAATCCTTTTATCAGGCAA[C/T]GTGCCCGGTTACCAAATTTAATATA | 61 |
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| AX-25885232 | ATTTAGATCTTAGTTTCTTGTGACT[A/G]GTTGGAGACTCTAATCTTTAAATCA | 63 |
| AX-26046311 | CTCTCAGGCTTACAGCACTGGGGAT[C/G]TCCAGCAGGGCTTGGGAAAGAAATA | 64 |
| AX-26257462 | CTGACAAACAATTTTTAAAGCTGGC[C/T]GCCCCATATTACCATTGTGCCAAAA | 65 |
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| AX-26527336 | AATTTAGTTAAATTAAAAATAAAGT[A/G]TTATTGACATTAGCTTCAGAAGATA | 67 |
| AX-26528297 | TTTACATTCCATATTTCATCATTTT[C/T]CTTTCCATTTTCTGCTGGCACAATG | 68 |
| AX-26659193 | TGATGAGTTTTAAATGTTTTATTCC[A/C]CTGATATTTATTGGAAGACCATAAA | 69 |
| AX-26787045 | GTGTTTCTTTTACAAAAATGGTGGC[-/T]TCTTAGGGATTGCTCTAAAAAACCA | 70 |
| AX-26839534 | TTAGGCACATGGACTTTGGTGTGAA[A/G]CAGATGAGCTAAAATCTAGGATGCT | 71 |
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| AX-26889875 | AAGTGTTAGCATGAAAGAGGGACTC[A/G]TGTTTTATCCGAAGAGAATCACAGA | 74 |
| AX-26892321 | TGAATCTGTTAGTGCCATTAGTCTG[C/T]TAGTGACATTTTCCAACAGTTCTTG | 75 |
| AX-26917001 | AATGGGGTTCTAAACCTACTCTGGG[A/G]AGATCCCCTAGAGAAGGAAGTGGCA | 76 |
| AX-26919925 | TGACCATCTCATCCACTGTCATCTG[A/C]GCAAATACAGACCACTGGCCTCCAC | 77 |
| AX-26919959 | TAAAGACAGAGACAAAGAATGTTGC[A/C]CAGGTGAAACAATGTAATATTATTA | 78 |
| AX-26919976 | AGAAGGCCAAAGATGAAGAGGGTGA[C/T]GAAGGGTTAAAGAGAAACTGTCCAG | 79 |
| AX-26927181 | TTTCTCTATGACCATAAAAGCCTAG[A/G]ATACTTGAGCACAAATCCCAAGCAA | 80 |
| AX-26932708 | CAGGTTTTGCCTCAGGGCAGCCTTC[G/T]CTTGCCTGCTTTCTGGATTACAAAC | 81 |
| AX-27086319 | AAGTGAAGTGTGTATTCTTTTATTG[C/T]TGGCTAGAGTCCATTCATATCAATT | 82 |
| AX-27087114 | GGTGGTATACTCCAAACTCTATGGG[A/G]AAAGAAGCTCCTGTGTTTGGACCCT | 83 |
| AX-27092960 | ACATATTTCCTTCTCATTATCTCTC[A/G]CCATGTATTATTTTCAAGCTGTCAA | 84 |
| AX-27122829 | CCATAATAGAATAAAATCTGACGAA[A/C]CGTGATTGCTAAGAACAGACACTAT | 85 |
| AX-27136986 | TGATGAAGTTCTGAGCAATACAAAC[A/G]CTGGCTTTTTGTCTCCTGTGCCTCC | 86 |
| AX-27141137 | TTTGAGCAGTTCATGGACTTATAAC[A/C]CCAAATTTCTGCTTTCTGTAAGAAA | 87 |
| AX-27148614 | CTTGGTTTATAATTTAAGTATGTTC[A/G]ATTCAAGATTAGTTTTTCCACACAA | 88 |
| AX-27148663 | CAAATATCCTCTACCATTCAGTACA[C/T]GGCCTTTTTCAATTTGTTGATAGTT | 89 |
| AX-27149025 | TTAAAAGGAAGCATAACTGAAACAA[A/G]GACACGTGATAACATTTCTCAGATT | 90 |
| AX-27150254 | TGAGAAAAGTTAGATATTTCACTCA[A/G]AACTTCACATCTAGAGATTGGTAGA | 91 |
| AX-27183993 | AGTCTGTAAATAACAAATTATGGAG[A/G]GGGTGTGAAGAAAAGGGATATTATG | 92 |
| AX-27206354 | AACCTCGTGCTTTTCTGGTGGTAAC[C/T]TAAGTGGATGAGGCCACTGGCCGCT | 93 |
| AX-27272454 | attttaggcctactgttaagTACTA[C/T]AAGCGATGTGGGTTCAATACTACTG | 94 |
| AX-27272469 | CAATGCTGACAATCCAAACAACACT[A/C]GACTTTGTTTACAGAATAGCAGCCA | 95 |
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| AX-27272516 | GGGAGGGCCTTTTGTTTTTGGCTAC[A/G]GCTGTGTTCAggatctttgctctgg | 97 |
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| AX-27708338 | GTCTGAGGATGGTGAAGTCCAGGCT[G/T]GGAACACCACGAGTCACGGAGGCCT | 116 |
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| AX-18643557 | TGAAATCTGGGTTTAATATAAGGAC[C/T]TGTGGATGAAACTCTTAAGAAATCT | 122 |
| AX-18851951 | AATGCAGGTCTAAACTCATTCACTC[A/G]ATGGACTATAAGTAGTGGTGCTGCT | 123 |
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| AX-19003790 | GTTGGCTAGAGTATGACCCAGTACC[A/G]ACAGCTAGCTCCCCGCATTACCAAA | 125 |
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| AX-19506800 | GCATCTAGTCAAGTGATGGGTAAAT[C/G/T]ATGAATGGTATCATTCTGCTTTCCT | 144 |
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| AX-19984954 | TTTTCAATATTCCCCTAGAGAACTC[A/C]CACGAAAGTTTAGAATAACATAAAG | 151 |
| AX-20032146 | TAGTTACAGTCTCTTTGAAGATCAT[A/G]TGTGCTTGATATTCATGCTACTGCT | 152 |
| AX-20039423 | AAGACACATACTTAAATATTTCAAC[A/G]TTAACTGTCATGATGTGCGAAACTT | 153 |
| AX-20061148 | ATTTGTTTAGTTTTGTGAAGCATCT[G/T]GTTTTACTCCCAGCAAAAACACTTC | 154 |
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| AX-20280572 | TTTCACGCGCATGGGGCCTTTCTCA[G/T]CCAGCCTGGCTCCTTCGTGTTCTGA | 160 |
| AX-20301117 | CATGTGAAGATGCCAGGCACACAAG[A/G]GTGACTCGATTATGAATCACTGATT | 161 |
| AX-20389536 | GTGATTGTAACTGTGAAACAAAACT[G/T]CACATCATGTAGTAAGGGAAATCAC | 162 |
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199 |
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200 |
| AX-21722598 | AGTCCTTCAATTCCTCGAAATGTTT[C/T]TCTGCTTGTGTCAAGATATCCTTGC |
201 |
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202 |
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208 |
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209 |
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210 |
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| AX-22789407 | TGTGGCATTTTCTCAGTGATGCGAA[C/T]CTCTGATCTACACTCAGTTTATGAC |
213 |
| AX-23063835 | GGTGCTAGCAATTTCCTTGAATCGC[C/T]AATCTCACTGTCCTCTGTTTGTCTT |
214 |
| AX-23105330 | TGGGTGGCTCCTGCCCAAGACCCGG[A/G]TAATCTCCTCACATATTAGTGCTGA |
215 |
| AX-23189200 | GTTCTGTGTCATAGAGGATCATGTC[A/G]TCTGGAAATAGTTGTAACTCTTCCT |
216 |
| AX-23226255 | GGCATCTATTAGGTAGAAATGTTAG[C/T]TAGGAACCAAATTTCCTTATAAAAT |
217 |
| AX-23234384 | AAGACAGTAAATGATGTAAATGTTG[C/T]AGATTTTAAAAGAACGAATCATGTG |
218 |
| AX-23241793 | CTTTCACTTCAAGTTCTAAATCATT[C/T]ACTTCTCCACATCTGCTATAATTCT |
219 |
| AX-23246683 | GGAAAGGCTCATGGGAGTGTGTGAT[A/G]TAAGAGTTTACTGTGAGGCTGATGC |
220 |
| AX-23262449 | ATCTAGGCTGCTATATGGAGACTAC[C/T]AATTAAAAACCATGGATGTCAGAGG |
221 |
| AX-23262560 | TTTTGATGCCCTGCCAAAAAGCACA[C/T]GATCACCATTtatgctaggtattaa |
222 |
| AX-23262572 | ATAAATTAGAATTTCAATGTAAATT[A/G]CAGTAATTACACCTCAACCTAATCT |
223 |
| AX-23263024 | TCTCTCGAAAAGCAATTCTGACAAC[A/C]CTGTTTCTCAACCATGGATTGTTAT |
224 |
| AX-23343886 | GCCATGGACATGATTTCAGGGGGGG[A/G]GATTTTTCATCTTCTGATTTCCAGA |
225 |
| AX-23416743 | TTCCAATGCCATTCTTACTTCTCCC[C/T]GCTCACCTGTAAACATCAGTTCAGA |
226 |
| AX-23589537 | TTCTCAGTCTTCCACTGATTGAACA[A/C]GATTCTGCGCATACACCAATTCCAT |
227 |
| AX-23594925 | GCATCAGTTTCAGTGGACTAAAAAA[C/T]CTAGTTGCTGTAGGGCTGTCAATCC |
228 |
| AX-23594926 | CATCTTCAGAACCAACAATGGCAAG[G/T]TGAGTCCTTCTGGGACCTGAAATCG |
229 |
| AX-23595280 | AAAAACAGCTCTATGGTCAGGTCAC[A/G]TTGAAGGTAAAACATGTACTGTCTG |
230 |
| AX-23595553 | AAATGGGCGGCAGCGTTCTGCAGTC[A/G]GTATTGGTTAAGTGCCTCCTCTGTA | 231 |
| AX-23613259 | GGTGTGTGTCCGTCAGCAGTAAGAG[C/G]GAAAGTAAAGTCTGTATGATCCACA |
232 |
| AX-23613324 | GAATTTGAAGACTCTGGACTCTTAG[A/C]CTCATCTCCCTATTCCCAATTTCTG |
233 |
| AX-23668034 | GGGAAAACTGAGATAGAATTTGGAA[A/G]ATCTTTCACCTATGTAATTATTTTT |
234 |
| AX-23668048 | TTGCATTTGTGCTATTATTTGCTCA[C/T]GTGGAGTGTTTTAAATCCTGTTATC |
235 |
| AX-23668053 | AAGGGTGAAGGTACCCTACTATTTG[C/T]ACCATGGGTAATACAAACCAAGGAG |
236 |
| AX-23668085 | ATACTTTGCCAAAAATCAAAGAAGG[C/T]GGAGTGCTGGAGAATTGATGCTTTT |
237 |
| AX-23733391 | ATTGAATTTCGTGGCATTTAAGTTG[C/T]GACAGAAAGGATGTGTAGACTTACA |
238 |
| AX-23733411 | AGGAAGAACAGCAAACACCAACTCA[A/G]TCAGAGAAACAGACAGACTTTGTTT |
239 |
| AX-23733589 | GAGGATGAGAGGTAAGAGGTATTGG[A/G]TCATGGACTGTGATGGATGTATATC |
240 |
| AX-23733708 | AAATTAAATCAAATTTACTGGTGCT[C/G]TGAAGCAAGGAAATTAGTATAATAG |
241 |
| AX-23733754 | ATGGTGCCCTGCGTGTAGATTCTGC[A/G]GAGTAAACACGAATAGACTGAAATG |
242 |
| AX-23733783 | CTTTAGAATAAGCAGGCTTCAAGAT[A/G]CACACAGTCAATTTGGGATAACAAA |
243 |
| AX-23733875 | TTCAAGGTGAAGGAGCCTGAAGAAT[A/G]ACAGGTAAGCCAGTTTCCCTGAAAA |
244 |
| AX-23733916 | AAAGTGTAAGTGCAATGATTGAAGA[C/T]GCATCAGATACAACATAGTTGGCAG |
245 |
| AX-23733968 | AAATAACAAAGCAAACACTTCCTTC[A/G]ACACATGATTCATAACAATCTGCAA |
246 |
| AX-23733983 | CATATGGTGTAGGTACAAGATGGAG[G/T]AATTTCATTTGTcctgccttggact |
247 |
| AX-23734216 | AGAATACCAGAGTGGGTATTGCCAT[A/G]CTTAGAAGAAGTTAAATGTGAACTG |
248 |
| AX-23801348 | TCTTGTGGTGCCTTTAAGTGCGTAA[C/T]GTAGATTGAAGTCAAGGAAGGAGAT |
249 |
| AX-23801358 | TATCAGGGTCACCCATAGCACCCAA[A/G]ACTTGGTGGCTACTAATATACCCTT |
250 |
| AX-23801359 | AGTACAAATTTTCTGCATTCACACT[A/G]AAACTGCAATGTTTTACCCAAAACA |
251 |
| AX-23851703 | GGCTGAGGCTGTGCTATAGTTGTTC[G/T]ACCAGGATTTTATAATCTGTTATCT |
252 |
| AX-23986030 | TCTCCAGGCTGTTCCTACAGATAAA[A/G]AGTTTGGTCTCATTTAAGAGGATGT |
253 |
| AX-24053527 | AGGTGAGGTGACACACGGCCACACC[A/C]TTCAGCCTGTCACAGGGCAGGTGAG |
254 |
| AX-24087867 | AATTTTAAGCTCAGCAGATACACTT[C/T]GATGAAATCCTAGTGAGAATCCAGT |
255 |
| AX-24087883 | ATAAAGTGACTAAAAGGAGGGCCA[C/T]GAGGCAGAGGAAACAGTGAGCAGCC |
256 |
| AX-24090502 | CTTAGATTTGTAAGTTCAGGCCAAG[A/G]AATTGTACATGTTTAACATTTAAAT |
257 |
| AX-24090505 | TGACTCACAGCTCAATTTAGAAAGA[C/T]AGGATTTATGGAGAAATATATTTTC |
258 |
| AX-24090508 | AAAATGTGTTGACTCTAGCAGCTTT[A/C]TGCATCTTTGTCCCTCTGAAATTTT |
259 |
| AX-24090520 | TTATTTCTAACATAGAGAATGTGGA[A/C]TAGAATTTAGAGTATAACCTAGATA |
260 |
| AX-24113615 | TGACAGGACTGAGTGACTAACACTT[C/T]CACGTTCACTTCACAAATTAAAAAG |
261 |
| AX-24113625 | ATAATTAAAATATGTTCTCTGGTGG[A/G]AAAGAGCAGGGTGCTATGAGAACGT |
262 |
| AX-24113632 | GCAAGCCTGTTTCAGAATCACTGAC[A/G]TTACACACTGGAATATGGCCCATGA |
263 |
| AX-24113635 | GTATCAGGTGGGAACACCGAGGGGG[A/G]AGAATTTGGACATCTGACTCAAAAG |
264 |
| AX-24279830 | CACAGTGATGGGGAGATGGGGACCA[C/T]GTCACGACATCAGAGGCATGTAGCG |
265 |
| AX-24361822 | CTTGCTCTCGTGACTGAACAAGCAC[A/G]TGTTTGCTAATACATCTCTCTGGAT |
266 |
| AX-24361903 | TAGTAAAAAGGGCAGATATTTTCAT[A/G]GCAATGTATGTTCATCTTTCATCTC |
267 |
| AX-24374734 | GTTTGACCAACTTACATGAAATTTT[C/T]TGCCTTTAGTGAACTTATAACTTTT |
268 |
| AX-24375029 | CAGAGCCTCATGTTTCTTAGGTAGA[A/C]ATGTGTCAGAGCTGAGGCCAATTAG |
269 |
| AX-24375033 | GCACCTCTGGCCATGTACAAAGCCA[G/T]TGTGATTATTGCCCAATATCGATGC |
270 |
| AX-24449089 | AAGTTCATTTGTTCTAGAGACACTC[A/G]TCAAGCAGTATTTATCTTTCTCACA |
271 |
| AX-24449108 | TGGCCTGCAGGTGTCCAAGCAGTAA[C/G]TGGGCAGTTAGTCTGGATATTGAAC |
272 |
| AX-24500097 | AGGGTCGTAAGCATGACTTTGGAAA[A/G]TGCACCTCTTTAATGCCCTAGTACA |
273 |
| AX-24512026 | AGGTTTTCAACAATAGGATTGCAGC[G/T]ATTCCAAAGGAAGGCTTAATCCATT |
274 |
| AX-24512034 | AAACGTGCAGCCTTTTGGACGCCCC[C/T]GCGATTTCTATAGCATTCACTCATA |
275 |
| AX-24536164 | CAAAAAAAATTTTTTTTAACATGCA[A/G]CCTGCCAAATGCAGATAGATTTTAC |
276 |
| AX-24536167 | CAACCCCACCATATACTTCTTGCAG[A/G]TTTTAATTCCCAAGGATAGGTTGTT |
277 |
| AX-24571577 | AATACCAAAATCTGAGGATGCTCAA[A/G]TTCCCTATATAAAATTGTTTGCTGC |
278 |
| AX-24616982 | TAACACCATTTCTACACGATCTCTT[C/T]CAAAAAATAGATGAGGGAAGCTGCC |
279 |
| AX-24638023 | GCTCTAATAATTTTTTGTGTAAGAT[C/T]GTTAGGGTTTTCTATGTATAGTATC |
280 |
| AX-24641350 | AAAAGTCACTGGTTTTCAGGTTCTC[C/T]AGTTTTTCTTGTTGTAAGGATAGGA |
281 |
| AX-24729372 | TAAAGCCTCCTTTTTGGGGTTGCCA[A/G]TTTAACATGCTAAACATTGTGCATT |
282 |
| AX-24789456 | GCATCATTTCAAGGACTTGTTAGCC[A/G]TTAAGATGTCCCTTTCTATGAACTA |
283 |
| AX-24819595 | TTTGAGAATGTTATAACAAATGTCA[C/T]GTGGGTCCTGAAGAAACATCACCCA |
284 |
| AX-24819597 | GAAACAACCATAAAAGTGAGGGAAA[C/T]TGAACAAAGACAACCATCTGAGAAC |
285 |
<110> Research Cooperation Foundation of Yeungnam University
<120> Composition for identifying breed Hanwoo comprising single
nucleotide polymorphism markers
<130> P15U10C1451
<160> 285
<170> KopatentIn 2.0
<210> 1
<211> 51
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> SNP name: AX-18039577
<400> 1
ttcagttggc ctatctgttt agctttgttt aaaacatgtg gtgtcaaaga c 51
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<211> 51
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> SNP name: AX-18060829
<400> 2
gtttctcttt ctccaactct atttcgcttt agtggattat ttttgggaac t 51
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<211> 51
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> SNP name: AX-18060831
<400> 3
ggaattccta gttggcttta aaatatatgg tagtccatta attttacgct c 51
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<211> 51
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> SNP name: AX-18060851
<400> 4
ccttcctttt aataaagaga aagtgtgcac agcttatata ttttgaacag a 51
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<211> 51
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> SNP name: AX-18060887
<400> 5
atagagaatg aaaagaagag aaagctaaga ataggtcttc agggaacact g 51
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<211> 51
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> SNP name: AX-18060989
<400> 6
ataaatatta ttttaatagt atccagcctc aaagtcttgt ctcactttat a 51
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<211> 51
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
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<400> 7
agtgaatgaa aacctagcaa tcttcgatct actctgaata agaagttttt a 51
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<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
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aaggttatgg gaaataataa atgaatacag aagatgagat ctttgcaacc t 51
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<211> 51
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> SNP name: AX-18246345
<400> 9
gatagaagta agatatacca caaaatatta actaaaaata aattggttta t 51
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<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> SNP name: AX-18249074
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gcaaggctcc cttttcattc tctagttcta ccactctctt ctgcaaaaag g 51
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<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> SNP name:AX-18289050
<400> 11
tactgctagg cgttttgaac tatgcgaatg tattatctgc ataaaataac t 51
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<211> 51
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
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<400> 12
caataatgag ggataaagat ggtcatcaat gtcaataaac atgagaagtg a 51
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<211> 51
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
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<400> 13
ccagtaagct atcctgtgga cattggcaaa gtgattctaa actttatatg g 51
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<211> 51
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
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<400> 14
tgtttttctt tccattttga tcacagctgt tacttcttac acaattttat t 51
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<211> 51
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> SNP name:AX-18373303
<400> 15
tatgcaaact ctacgatgct tgtagggaat ccagcaaagt gtttatattt c 51
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<211> 51
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> SNP name:AX-18458500
<400> 16
caccatgtca agaagtataa tttcctatta gaatagcttt aagtgtccaa c 51
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<211> 51
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> SNP name:AX-18463475
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acttaatact gtgcttgaat aagcttgata acactgattt gatgaatatg c 51
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<211> 51
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
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tcctttaaca gatttcccta tactctcagc atctaaatga tgaaactgaa t 51
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<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> SNP name:AX-18534333
<400> 19
tttggcacaa acatgtactg agcccttacc ctctgccagt ggttgtgata a 51
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<211> 51
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> SNP name:AX-22069557
<400> 20
gaaacagttg aatggaagaa cccaatgttg taattaatgg gtttctaaca a 51
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<211> 51
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> SNP name:AX-22221089
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agatgaagaa gatcaggcaa gacaggaagc tggtcttcaa agatactgga c 51
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<211> 51
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> SNP name:AX-22221101
<400> 22
taatttaaat agcaagcatt aagacgtcta ataccacacc tggaacctat c 51
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<211> 51
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
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ggttaaatgt gcaattgaaa ctgtggtagc tgtttcatgt aaagacacat c 51
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<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
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ccactgcacc acctgggaaa cccctgtgca tgtaccacat ctataattat t 51
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<211> 51
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> SNP name:AX-22257579
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tatagctgtg tatgtcaaag cttctgaaca aggcctctgg aatcattgag a 51
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<211> 51
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
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gaggttcaga caaagaggta aagtattggg gatcaattag tggagagcag a 51
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<211> 51
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> SNP name:AX-22273664
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cacctcacgg tgagactttt tctaagataa ctcaattggt gccccgtttc t 51
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<211> 51
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
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tcttctctct ctctctatgt aatccctgct aatgcagaaa atttcttact a 51
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<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> SNP name:AX-22326136
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gctgctaaat ccaactttcc attcagtgtc tgagcctttt tcaggtaccg t 51
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<211> 51
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> SNP name:AX-22386865
<400> 30
tggtcgtggc atatttattt tcaccgaact atttttctaa cagctactgc a 51
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<211> 51
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> SNP name:AX-22397069
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atcatttcgt aatgtgtgtg tgtgcgttca gttgcttcag ttcagttcag t 51
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<211> 51
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> SNP name:AX-22490920
<400> 32
ttaatatatt ggaattctgc tttacgcatc agttccttgt gccagcctgc t 51
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<211> 51
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> SNP name:AX-22490936
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tattgctgta aaagtgtaaa cctaggaaca accaaaatgt tcatcaaaga g 51
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<211> 51
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
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ccctctagac tcatacagag tcttaggccc cttttaaaat cttcattcta c 51
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<211> 51
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> SNP name:AX-22492392
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gggaaagttg ctggttctag gacaataagc agggaacagg cccaaagaaa c 51
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<211> 51
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
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tactgtaatg caggcaaagt gtatatgtga ggagcctaac ctttacttat g 51
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<211> 51
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> SNP name:AX-25048882
<400> 37
agttacatta ttcatatgtg tggaatacag atcctgaaat tatccacagc g 51
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<211> 51
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> SNP name:AX-25054392
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attcattggc aaaatcctca gattctatct taagaactat ttccaacaga a 51
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<211> 51
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> SNP name:AX-25075350
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tatcctcatt cacagtgcct ggtccggggt aaatggtcca taaaagttat t 51
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<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> SNP name:AX-25102064
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tctagattta gaccttcttg agggctgaga ccatggcatt gcctaagtat t 51
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<211> 51
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> SNP name:AX-25122080
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atgtccagct tcttccaggg gatactctgg ttcagttaaa aaaaaaaaag a 51
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<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
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tctctttcac ttctaactcc ttcttggcat ctgcttctaa ctcagattta c 51
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<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> SNP name:AX-25156107
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tagaggaaat aagacataga tacacgagaa atactgtact catgtttgaa t 51
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<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> SNP name:AX-25156114
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actggaccac cagggaatcc caggatataa atttttgaag gtgtctcccc t 51
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<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> SNP name:AX-25166729
<400> 45
cagttgacaa ctttggctcc ccagatgtag aactatatca gcactacttt t 51
<210> 46
<211> 51
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> SNP name:AX-25167349
<400> 46
atttggcccc caaataatct ggatgttgga gaatttgata atccctatag a 51
<210> 47
<211> 51
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> SNP name:AX-25199234
<400> 47
gcctttcatt cattcacttg ttctttaccc attcatccag gaactattta t 51
<210> 48
<211> 51
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> SNP name:AX-25199280
<400> 48
ttgaacttga ttccaaaatc tccattgggt cctcctgggt tgtggctggc t 51
<210> 49
<211> 51
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> SNP name:AX-25317751
<400> 49
caaactggcg aaatgaaact ttaggcaacg ggaattacct tattactatt a 51
<210> 50
<211> 51
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> SNP name:AX-25341233
<400> 50
gggaaccttg tgagcattga aggttttggc cagtggtgtg ggagccagct c 51
<210> 51
<211> 51
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> SNP name:AX-25433473
<400> 51
aatcctaact ccatctcccc acaaagcttc cttgctctat cccagattct c 51
<210> 52
<211> 51
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> SNP name:AX-25525428
<400> 52
ctgggtttgt tattcaaaag taatggggat tgatggaaat ctctactact a 51
<210> 53
<211> 51
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> SNP name:AX-25648889
<400> 53
cctctctttc aaataacatc ttttatcttt cctcctccac ctagcacatg c 51
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<211> 51
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> SNP name:AX-25687226
<400> 54
ggtatggtgt gcttgtttat ttaatgaaag gccactacct gtgtgttttg c 51
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<211> 51
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
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<400> 55
ggctggttgg ctttctcttt gctaataggt tttagtgcct tgaatactaa a 51
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<211> 51
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> SNP name:AX-25754451
<400> 56
aatcccacag ggtgatctgc aaacagagtt tcctcagtct ggatacacag t 51
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<211> 51
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
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<400> 57
tgctataaca acttgccact cattttgact ttacaccaat aacccaaaga c 51
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<211> 51
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
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<400> 58
gagtatatgt tttcttcata ttcagttcag tgcagtcact cagtcgtgtc c 51
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<211> 51
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> SNP name:AX-25853835
<400> 59
cttgcatgtt tatgacattc ctgactattt ccatttgctg tgaccctaac c 51
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<211> 51
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> SNP name:AX-25854353
<400> 60
taccgagggc agaagcctta ccttattctt ccatcttcag tactactggt a 51
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<211> 51
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> SNP name:AX-25855142
<400> 61
aagtggaaat ccttttatca ggcaatgtgc ccggttacca aatttaatat a 51
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<211> 51
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> SNP name:AX-25875330
<400> 62
ttttatgcca caacaatcaa gagcatggcc agtggactca tcttgttgga c 51
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<211> 51
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> SNP name:AX-25885232
<400> 63
atttagatct tagtttcttg tgactggttg gagactctaa tctttaaatc a 51
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<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
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<400> 64
ctctcaggct tacagcactg gggatgtcca gcagggcttg ggaaagaaat a 51
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<211> 51
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
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ctgacaaaca atttttaaag ctggctgccc catattacca ttgtgccaaa a 51
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<211> 51
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
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gatcctagct ctccccagta aacacttaac ctggactcac tcattggact g 51
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<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
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aatttagtta aattaaaaat aaagtgttat tgacattagc ttcagaagat a 51
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<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
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tttacattcc atatttcatc atttttcttt ccattttctg ctggcacaat g 51
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<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
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tgatgagttt taaatgtttt attcccctga tatttattgg aagaccataa a 51
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<211> 51
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
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gtgtttcttt tacaaaaatg gtggcttctt agggattgct ctaaaaaacc a 51
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<211> 51
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> SNP name:AX-26839534
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ttaggcacat ggactttggt gtgaagcaga tgagctaaaa tctaggatgc t 51
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<211> 51
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
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aaagacagtg aagtaaaatc tgaatgagga caatgaagaa ggacacagag g 51
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<211> 51
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
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<400> 73
ccaaaaaaag ttaacttgag aagcagtggt ttcacattat gggatatgga a 51
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<211> 51
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> SNP name:AX-26889875
<400> 74
aagtgttagc atgaaagagg gactcgtgtt ttatccgaag agaatcacag a 51
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<211> 51
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
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<400> 75
tgaatctgtt agtgccatta gtctgttagt gacattttcc aacagttctt g 51
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<211> 51
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> SNP name:AX-26917001
<400> 76
aatggggttc taaacctact ctggggagat cccctagaga aggaagtggc a 51
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<211> 51
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
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<400> 77
tgaccatctc atccactgtc atctgcgcaa atacagacca ctggcctcca c 51
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<211> 51
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> SNP name:AX-26919959
<400> 78
taaagacaga gacaaagaat gttgcccagg tgaaacaatg taatattatt a 51
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<211> 51
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> SNP name:AX-26919976
<400> 79
agaaggccaa agatgaagag ggtgatgaag ggttaaagag aaactgtcca g 51
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<211> 51
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
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<400> 80
tttctctatg accataaaag cctaggatac ttgagcacaa atcccaagca a 51
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<211> 51
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
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caggttttgc ctcagggcag ccttctcttg cctgctttct ggattacaaa c 51
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<211> 51
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
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<400> 82
aagtgaagtg tgtattcttt tattgttggc tagagtccat tcatatcaat t 51
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<211> 51
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
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<400> 83
ggtggtatac tccaaactct atggggaaag aagctcctgt gtttggaccc t 51
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<211> 51
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
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<400> 84
acatatttcc ttctcattat ctctcgccat gtattatttt caagctgtca a 51
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<211> 51
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
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ccataataga ataaaatctg acgaaccgtg attgctaaga acagacacta t 51
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<211> 51
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
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<400> 86
tgatgaagtt ctgagcaata caaacgctgg ctttttgtct cctgtgcctc c 51
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<211> 51
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
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<400> 87
tttgagcagt tcatggactt ataaccccaa atttctgctt tctgtaagaa a 51
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<211> 51
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
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cttggtttat aatttaagta tgttcgattc aagattagtt tttccacaca a 51
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<211> 51
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
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<400> 89
caaatatcct ctaccattca gtacatggcc tttttcaatt tgttgatagt t 51
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<211> 51
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
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<400> 90
ttaaaaggaa gcataactga aacaaggaca cgtgataaca tttctcagat t 51
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<211> 51
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
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<400> 91
tgagaaaagt tagatatttc actcagaact tcacatctag agattggtag a 51
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<211> 51
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
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<400> 92
agtctgtaaa taacaaatta tggagggggt gtgaagaaaa gggatattat g 51
<210> 93
<211> 51
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
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<400> 93
aacctcgtgc ttttctggtg gtaacttaag tggatgaggc cactggccgc t 51
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<211> 51
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
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attttaggcc tactgttaag tactataagc gatgtgggtt caatactact g 51
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<211> 51
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> SNP name:AX-27272469
<400> 95
caatgctgac aatccaaaca acactcgact ttgtttacag aatagcagcc a 51
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<211> 51
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
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<400> 96
gttaataaga gagcaggcaa tctgttttct ggtgtggtgg tggtttagtt g 51
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<211> 51
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
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<400> 97
gggagggcct tttgtttttg gctacggctg tgttcaggat ctttgctctg g 51
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<211> 51
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
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tattgacgta ttctggttaa aaatagtaga ctgaacacat agttacctca g 51
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<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
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<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
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<400> 100
gacaaaatta aagtgctttt ccaccgtcac cgattgttcc ccctttgaag g 51
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<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
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ccaaaagcaa aaaagaatta ccaggtcaag tgactgggaa aaactgctac t 51
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<211> 51
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
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tgacgtttga gtattttcca gctttgagct ctgtcttgta aacctgagtc t 51
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<211> 51
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
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ctcctaagtg ctatttcctc aaaagtgaaa cacatgggtc aagaaggcat c 51
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<211> 51
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
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gaaaatatca gagaacgtta cggaagcctc acaggcgagc tccacatgat c 51
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<211> 51
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
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atagaacctt ggggaaccca tccagtcact ctaagcctct gctcacccaa c 51
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<211> 51
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> SNP name:AX-27350180
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gaggctgggg aagcaaatgg tccccttctc catggctttg tagtagatgg c 51
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<211> 51
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
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<400> 107
tatttttaac ttttggaatg aaaacgtcat tttctgggaa cccggccaag g 51
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<211> 51
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> SNP name:AX-27448018
<400> 108
ttttctgaga gcacggagaa agatgtaaag tattcttgaa atgaaaaatc a 51
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<211> 51
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> SNP name:AX-27540351
<400> 109
ctaattattg cttttctata taggaggatt ttcagtcaat gacttatgga t 51
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<211> 51
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
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<400> 110
tttccaacca gagtccccct ctatggcttc ttgttccatg ggagattggg a 51
<210> 111
<211> 51
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> SNP name:AX-27582760
<400> 111
gatctttacc agtgcagtag gtgaagaaaa ccatatccca tgatagtttt t 51
<210> 112
<211> 51
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
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<400> 112
gatctttacc agtgcagtag gtgaagaaaa ccatatccca tgatagtttt t 51
<210> 113
<211> 51
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
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<400> 113
agaaagcagt ttgagggctg gaaccgtctt gaatgctata gtcccaagca c 51
<210> 114
<211> 51
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
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<400> 114
tgattatact tacaattata cttacgattt acctgattgt cctttgctta c 51
<210> 115
<211> 51
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
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<400> 115
tcaacaacaa acctgtctcg attcttttag ctgccactgc ttaatgactc t 51
<210> 116
<211> 51
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
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<400> 116
gtctgaggat ggtgaagtcc aggcttggaa caccacgagt cacggaggcc t 51
<210> 117
<211> 51
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
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caggaagaag tgatgaaagg acaatgtcat aagagttatt acagatgcaa a 51
<210> 118
<211> 51
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> SNP name:AX-27753185
<400> 118
ttgagtgtgc catgggctat gtgaatgctc cacctttcca gaaagaaacc a 51
<210> 119
<211> 51
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> SNP name:AX-27776095
<400> 119
tatggaggaa aaataactaa tatgtgatat agacatggga tgagttcaaa a 51
<210> 120
<211> 51
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
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<400> 120
caaattaacc tccaacataa gtgccgtgtt tctctaactg atagcaatgt t 51
<210> 121
<211> 51
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
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<400> 121
ggaatactcc actgggaata caatagtagt tctgttgaat tggaagatga c 51
<210> 122
<211> 51
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> SNP name:AX-18643557
<400> 122
tgaaatctgg gtttaatata aggacttgtg gatgaaactc ttaagaaatc t 51
<210> 123
<211> 51
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> SNP name:AX-18851951
<400> 123
aatgcaggtc taaactcatt cactcgatgg actataagta gtggtgctgc t 51
<210> 124
<211> 51
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> SNP name:AX-18902454
<400> 124
agcaggcatg agggaaatcc tgagctccac ttagatcatg tgggggtgaa g 51
<210> 125
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<213> Artificial Sequence
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gttggctaga gtatgaccca gtaccgacag ctagctcccc gcattaccaa a 51
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<211> 51
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
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<223> SNP name:AX-19076256
<400> 126
ttcagtgtct aaaacatgcg ggacatagct cctttgtata aatcaggcga g 51
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<213> Artificial Sequence
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<213> Artificial Sequence
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tgcactgtga tcacttctga ggcacggaag ttataactgg atttatcgta t 51
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<213> Artificial Sequence
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tggtggatct gttcaggcag aaagagactg ggccattctc aaagtattcc t 51
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<213> Artificial Sequence
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tgagaagatg caaaggcata ttaaatatga atcctgagct caagaatctt a 51
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<213> Artificial Sequence
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acatccttga tggccaaagc aatgctgtta cattttcctt tcagtgagat g 51
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<213> Artificial Sequence
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tcactcttgg tggtgtacaa ccaatggatt tggacaaatg ttatagtgac t 51
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agaggaatta aagctaaagc agatatcata taggtctgaa accaggattt t 51
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<213> Artificial Sequence
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caggtggaca gcagggtgag caccattgat agggaaatag tcctggaaat t 51
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<213> Artificial Sequence
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<213> Artificial Sequence
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ttttttcttg aagcatgtga attacttgat ctggcttaat ttccccagtt t 51
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<213> Artificial Sequence
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<213> Artificial Sequence
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<213> Artificial Sequence
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<212> DNA
<213> Artificial Sequence
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<213> Artificial Sequence
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gtgattgtaa ctgtgaaaca aaacttcaca tcatgtagta agggaaatca c 51
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<213> Artificial Sequence
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tggaccagca aaggaaggaa gtcctgaaga aaccttcaca tggctacagc t 51
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<213> Artificial Sequence
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<213> Artificial Sequence
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tactcattta ggcctggagc agagatggag ggcagagccc tgtgctcagg a 51
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<213> Artificial Sequence
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aataaaccta tagacttaga actgataaaa tgtaaggaag ttcctttaag g 51
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cattagttta ttggttatta ggaatcgtgt tacttaactt ccaatatgtt t 51
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<213> Artificial Sequence
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<213> Artificial Sequence
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<213> Artificial Sequence
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tatgtattga ctcttttatt tcttcgaggt ctttatttat tgcatcttct c 51
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<213> Artificial Sequence
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<213> Artificial Sequence
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ggcctgtgtg gctgaggtcc ccagctcagc ctgcttgaag cccaggctct g 51
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<213> Artificial Sequence
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<213> Artificial Sequence
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<213> Artificial Sequence
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tgatttcctt taggatggac tggttggatc tccttaaagg caatggtaag t 51
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<213> Artificial Sequence
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gcgtcttcag tgatgtagag caagtgtgat gtaaaagtgc ctatcctgtg g 51
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<213> Artificial Sequence
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<213> Artificial Sequence
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<213> Artificial Sequence
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<213> Artificial Sequence
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agagttgtga gcagagatca gctgagaggg agggaacgac agagtgagaa a 51
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<213> Artificial Sequence
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cgccttgcct ttcagagacc tggacggcaa atcacacaaa cctctgcccc t 51
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acctgtgggg gaagggcagc atgcctgtcg tcctcaacaa cccgtactca g 51
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ggaaagcaag ttccactgat gctctggaat gtcccatcct cccccacgaa g 51
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<213> Artificial Sequence
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tgtatttagg taaaggagtg ttgctgatgg tcatattgct catgtgaggc t 51
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<212> DNA
<213> Artificial Sequence
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gcatggattc caggccctca aagttcccat ttttttcccc attccaggtc t 51
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<211> 51
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<213> Artificial Sequence
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<223> SNP name: AX-21404513
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aagagggatg ggccccaaga taatcgcagg atttctcaaa attaattcat a 51
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<212> DNA
<213> Artificial Sequence
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gagagtgtct gtgaatggtg acgtctgaat gaaactttct ctgctgaccc t 51
<210> 188
<211> 51
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> SNP name: AX-21432365
<400> 188
accttgatta cctgaggaga agggttgact tcaaacaagg tattaaagtt c 51
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<211> 51
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<213> Artificial Sequence
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<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> SNP name: AX-21433822
<400> 190
atgaagattc ccaatctctc caatcggaat ttctggttga ggaggaagcc t 51
<210> 191
<211> 51
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> SNP name: AX-21508920
<400> 191
tcttccatct cattaactct cccaatgctg ttagacaagt actatcactc c 51
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<211> 51
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> SNP name: AX-21511369
<400> 192
ctggcagcct cacctgaggg cctcagtaag acgagacatg tatttgccgt t 51
<210> 193
<211> 51
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> SNP name: AX-21532895
<400> 193
ggttggtaat ttcttgtcct ggggtttctc tgtcaacttt cctgtcaagg t 51
<210> 194
<211> 51
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> SNP name: AX-21532904
<400> 194
gggtgatttt tggtttcaca tatacgtgag tcaaattaga ctagattaca a 51
<210> 195
<211> 51
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> SNP name: AX-21570731
<400> 195
attcaccttc tgctccccag acccatcttt cataatccca catgctacat a 51
<210> 196
<211> 51
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> SNP name: AX-21584895
<400> 196
ttctcatacc aggttcagtt ccccatgatt aggtcaccct ttgggaacag a 51
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<211> 51
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
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<223> SNP name: AX-21654834
<400> 197
agaagaaatg ggacttccct atcactggag gaattcaaac ttaagaggat a 51
<210> 198
<211> 51
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
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<400> 198
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<211> 51
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<213> Artificial Sequence
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<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
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<210> 201
<211> 51
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
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<211> 51
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<213> Artificial Sequence
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<400> 202
ttctcactga aatttcttcc tgccgtgtca ccattaaagc tgataaacac g 51
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<213> Artificial Sequence
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<400> 203
attgggaatg agaaaatgca gtacggggtg catttaaaac tttacctcgc a 51
<210> 204
<211> 51
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> SNP name: AX-21760952
<400> 204
tcaaggccct tgtaccacaa cttagttcag tcattagtga ggggatgttt t 51
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<211> 51
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> SNP name: AX-21855019
<400> 205
tgatttcctc ccaccacagc aaatcttctt ctctgacatt gagacacttc a 51
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<211> 51
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> SNP name: AX-21855148
<400> 206
acagtagtgt gtgacttttt atgaattggc taaattgttt tctaaagtgg t 51
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<211> 51
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> SNP name: AX-21939699
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cctctgataa tatttctaag gagtttcatt ctttttaaaa acacggaaat g 51
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<212> DNA
<213> Artificial Sequence
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tcagcaggtt ccaagtcgtc atccgtccct tctacctgac caactccacg g 51
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<212> DNA
<213> Artificial Sequence
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aactgagtct ggaactatgc ctccataccc cttaaaatta agatacaatt c 51
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<213> Artificial Sequence
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taagaattaa ttaaacaagg aggccgttag actggtatgg ctctaaggta t 51
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<213> Artificial Sequence
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<213> Artificial Sequence
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<213> Artificial Sequence
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tgtgctagag ctaaatgcaa aagacgaaga gttgtaagaa ctgagtttgc c 51
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<213> Artificial Sequence
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<213> Artificial Sequence
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<213> Artificial Sequence
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<213> Artificial Sequence
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<213> Artificial Sequence
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<213> Artificial Sequence
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ctttcacttc aagttctaaa tcatttactt ctccacatct gctataattc t 51
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<211> 51
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> SNP name: AX-23246683
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<213> Artificial Sequence
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atctaggctg ctatatggag actactaatt aaaaaccatg gatgtcagag g 51
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<213> Artificial Sequence
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<213> Artificial Sequence
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<212> DNA
<213> Artificial Sequence
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<213> Artificial Sequence
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<213> Artificial Sequence
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<212> DNA
<213> Artificial Sequence
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<223> SNP name: AX-23594926
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<213> Artificial Sequence
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<213> Artificial Sequence
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<223> SNP name: AX-23613324
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gaatttgaag actctggact cttagcctca tctccctatt cccaatttct g 51
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<213> Artificial Sequence
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<212> DNA
<213> Artificial Sequence
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<213> Artificial Sequence
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<212> DNA
<213> Artificial Sequence
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atactttgcc aaaaatcaaa gaaggtggag tgctggagaa ttgatgcttt t 51
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<213> Artificial Sequence
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<213> Artificial Sequence
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<212> DNA
<213> Artificial Sequence
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<213> Artificial Sequence
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<213> Artificial Sequence
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atggtgccct gcgtgtagat tctgcggagt aaacacgaat agactgaaat g 51
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<213> Artificial Sequence
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<213> Artificial Sequence
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<213> Artificial Sequence
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<213> Artificial Sequence
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<213> Artificial Sequence
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<213> Artificial Sequence
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<213> Artificial Sequence
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<212> DNA
<213> Artificial Sequence
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<223> SNP name: AX-23801359
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<213> Artificial Sequence
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<212> DNA
<213> Artificial Sequence
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<213> Artificial Sequence
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<213> Artificial Sequence
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<213> Artificial Sequence
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<223> SNP name: AX-24087883
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<213> Artificial Sequence
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<213> Artificial Sequence
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<213> Artificial Sequence
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<213> Artificial Sequence
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ataattaaaa tatgttctct ggtgggaaag agcagggtgc tatgagaacg t 51
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<213> Artificial Sequence
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<212> DNA
<213> Artificial Sequence
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<223> SNP name: AX-24113635
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gtatcaggtg ggaacaccga ggggggagaa tttggacatc tgactcaaaa g 51
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<213> Artificial Sequence
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<400> 265
cacagtgatg gggagatggg gaccatgtca cgacatcaga ggcatgtagc g 51
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<211> 51
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<213> Artificial Sequence
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<212> DNA
<213> Artificial Sequence
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<213> Artificial Sequence
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<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
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<211> 51
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
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<400> 270
gcacctctgg ccatgtacaa agccattgtg attattgccc aatatcgatg c 51
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<212> DNA
<213> Artificial Sequence
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<211> 51
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
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<223> SNP name: AX-24449108
<400> 272
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<212> DNA
<213> Artificial Sequence
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<210> 274
<211> 51
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
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<223> SNP name: AX-24512026
<400> 274
aggttttcaa caataggatt gcagctattc caaaggaagg cttaatccat t 51
<210> 275
<211> 51
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> SNP name: AX-24512034
<400> 275
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<211> 51
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
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<212> DNA
<213> Artificial Sequence
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<223> SNP name: AX-24536167
<400> 277
caaccccacc atatacttct tgcaggtttt aattcccaag gataggttgt t 51
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<212> DNA
<213> Artificial Sequence
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<212> DNA
<213> Artificial Sequence
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<213> Artificial Sequence
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<210> 281
<211> 51
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> SNP name: AX-24641350
<400> 281
aaaagtcact ggttttcagg ttctctagtt tttcttgttg taaggatagg a 51
<210> 282
<211> 51
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> SNP name: AX-24729372
<400> 282
taaagcctcc tttttggggt tgccagttta acatgctaaa cattgtgcat t 51
<210> 283
<211> 51
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> SNP name: AX-24789456
<400> 283
gcatcatttc aaggacttgt tagccgttaa gatgtccctt tctatgaact a 51
<210> 284
<211> 51
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> SNP name: AX-24819595
<400> 284
tttgagaatg ttataacaaa tgtcatgtgg gtcctgaaga aacatcaccc a 51
<210> 285
<211> 51
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> SNP name: AX-24819597
<400> 285
gaaacaacca taaaagtgag ggaaattgaa caaagacaac catctgagaa c 51
Claims (10)
- 서열번호 1 내지 서열번호 185로 표시되는 단일염기다형성(single nucleotide polymorphism) 마커군과 혼성화될 수 있는 프로브를 포함하는 한우 품종 판별용 조성물:
- 제 1 항에 있어서,
상기 프로브는 SNP 마커를 검출 또는 증폭할 수 있는 제제인, 한우 품종 판별용 조성물.
- 제 1 항의 한우 품종 판별용 조성물을 포함하는 한우 품종 판별용 키트.
- 제 3 항에 있어서,
상기 키트는 RT-PCR 또는 DNA 칩인, 한우 품종 판별용 키트.
- 제 1 항의 한우 품종 판별용 조성물을 포함하는 한우 품종 판별용 마이크로어레이.
- 제 3 항의 한우 품종 판별용 키트 또는 제 5 항의 마이크로어레이를 이용하여 소 개체에서 분리된 핵산분자의 단일염기다형성 마커군의 존재 여부를 확인하고, 상기 단일염기다형성 마커군의 존재가 확인되는 경우 한우 품종으로 판별하는 단계를 포함하는 한우 품종의 판별 방법.
- 제 6 항에 있어서,
단일염기다형성 마커군의 존재 여부는 다형성 부위의 증폭을 통해 확인하는 것인, 한우 품종의 판별 방법.
- 제 6 항에 있어서,
단일염기다형성 마커군의 존재 여부는 고상 담체 상에 고정된 프로브와 소 개체에서 분리된 핵산분자의 혼성화에 따른 신호 검출로부터 확인하며, 상기 프로브는 단일다형성다형성 마커군과 혼성화할 수 있고, 형광물질로 표지된 폴리뉴클레오타이드인, 한우 품종의 판별 방법.
- 제 8 항에 있어서,
상기 형광물질은 파이렌, 텍사스 레드, 플루오레신(fluorescein), 보디피(BODYPY), 테트라메틸로드아민(Trtramethylrhodamine), 알렉사(Alexa), 시아닌(Cyanine), 알로피코시아닌(allopicocyanine), 닐 블루, 닐 레드 및 양자점(quantum dots)으로 이루어진 군으로부터 선택된 하나 이상인, 한우 품종의 판별 방법.
- 제 6 항에 있어서,
상기 소는 흑우, 칡소 및 한우 중에서 선택된 것인, 한우 품종의 판별 방법.
Priority Applications (1)
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|---|---|---|---|
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Applications Claiming Priority (1)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
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Publications (2)
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ID=59280942
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
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Country Status (1)
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Cited By (2)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| KR102043119B1 (ko) * | 2018-07-24 | 2019-11-11 | 제주대학교 산학협력단 | 제주우 판별용 단일염기다형성 마커 조성물, 이를 포함하는 키트 및 이를 이용한 판별 방법 |
| KR102194349B1 (ko) | 2020-04-28 | 2020-12-23 | 제주대학교 산학협력단 | 제주 흑우 친자 감별용 단일염기다형성 마커 및 이의 용도 |
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-
2015
- 2015-12-18 KR KR1020150181498A patent/KR101823209B1/ko active IP Right Grant
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| Publication number | Publication date |
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| KR101823209B1 (ko) | 2018-01-29 |
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