CN106868174A - 检测adamts13基因全外显子的试剂盒和方法 - Google Patents
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Abstract
本发明公开了检测ADAMTS13基因全外显子的试剂盒和方法,所述试剂盒包括扩增覆盖ADAMTS13基因全外显子序列的26对正、反向引物,所述PCR扩增的上游引物5’端和下游引物5’端分别加了一段长18bp的M13‑F引物序列和长16bp的M13‑R引物序列。基于采用Sanger测序法,利用1对通用引物M13为测序引物,检测ADAMTS13基因全外显子序列的突变情况,应用于血栓性血小板减少性紫癜患者的基因诊断。
Description
技术领域
本发明属生命科学和生物技术领域,特别涉及检测ADAMTS13基因全外显子突变的试剂盒和方法。
背景技术
1924年,Eli Moschcowitz最初详述了血栓性血小板减少性紫癜(thromboticthrombocytopenicpurpura,TTP),其在临床上主要表现为典型的三联征:即血小板减少,微血管病性溶血性贫血,神经系统损伤;若同时伴有肾脏损害及发热,则形成TTP经典的“五联征”。1997年,慢性复发性TTP患者缓解期血浆中的超大分子量vWF多聚体与vWF裂解酶的缺失之间的联系正式确立。此后,研究者们将这种水解蛋白酶纯化,对先天性TTP家族成员进行了全基因组连锁分析。ADAMTS13基因位于9q34,长度为37kb,包含29个外显子。Zheng等首次对ADAMTS13进行了克隆,并将其列为ADAMTS家族的新成员,称为ADAMTS13。先天性TTP的发病率小于5%,由于严重的ADAMTS13缺乏所致,与ADAMTS13基因突变有关。
现已报道的ADAMTS13突变已经超过140种,包括错义突变、小片段缺失和插入、无义突变以及结合点突变等等。ADAMTS13的基因突变波及整个ADAMTS13蛋白,主要是降低其分泌和(或)酶活性。获得性TTP80%的TTP患者属于获得性TTP,通常由于循环ADAMTS13自身抗体所致。这些抗体能够抑制ADAMTS13蛋白的活性,但是也有10%-15%的患者体内没有抑制性抗体,而是由于增加了抗体调节的ADAMTS13清除率导致ADAMTS13活性严重减低所致。
直接突变检测通过DNA测序仪对ADAMTS13基因直接测序,找出突变的确切位置,可提供更为准确的信息。由于实现了自动化操作,我们采用的PCR结合DNA直接测序方法,因而大大缩短了诊断时间,节省了的人力和物力,测序效率高,能够确定基因突变的位置和形式,结果也更为明确。
多种基因突变检测技术包括蛋白截断试验(PTT)、单链构象多态性(SSCP)、异源双链分析(HA)、变性梯度凝胶电泳(DGGE)和温度梯度凝胶电泳(TGGE)等方法,但所有这些方法均有一定的局限性,从而限制了基因突变的检出率。目前常用的基因突变检测的方法是基因测序和荧光定量PCR等。由于ADAMTS13容量大、突变类型多、突变位点散在分布,故而阻止了对ADAMTS13基因突变的深入研究,荧光定量PCR法并不适用。
本发明采用Sanger测序法检测ADAMTS13基因全外显子序列的突变,并且设计的引物可以扩展全外显子序列,通过测序结果的分析,可以很直观的了解ADAMTS13基因全外显子的基因突变情况,并不受ADAMTS13的基因突变多样化以及没有突变热点的影响,并且很大程度的节省了检测成本。
发明内容
本发明提供检测ADAMTS13基因全外显子的引物,采用Sanger测序法,可用于快速检测ADAMTS13基因全外显子突变的情况,用于TTP的基因诊断。
本发明的目的在于提供检测ADAMTS13基因全外显子的引物,包括:扩增覆盖检测ADAMTS13基因全外显子突变的26对正、反向引物;其碱基序列为:
进一步地,引物序列ADAMTS13-1F、ADAMTS13-1R是扩增ADAMTS13基因第1号外显子序列的引物,引物序列ADAMTS13-2F、ADAMTS13-3R是扩增ADAMTS13基因第2号外显子序列的引物,引物序列ADAMTS13-5-6F、ADAMTS13-5-6R是扩增ADAMTS13基因第5和6号外显子序列的引物,以此类推,引物序列ADAMTS13-17-18F、ADAMTS13-17-18R是扩增ADAMTS13基因第17和18号外显子序列的引物,引物序列ADAMTS13-29F、ADAMTS13-29R是扩增ADAMTS13基因第29号外显子序列的引物。
进一步地,所述26对正、反向引物的使用浓度为1:1;
本发明的目的还在于提供一种检测ADAMTS13基因全外显子的方法,其包括如下步骤:
(1)提取样品DNA;
(2)利用26对扩增引物ADAMTS13-1F与ADAMTS13-1R;ADAMTS13-2F与ADAMTS13-2R;ADAMTS13-3F与ADAMTS13-3R;ADAMTS13-4F与ADAMTS13-4R;ADAMTS13-5-6F与ADAMTS13-5-6R;ADAMTS13-7F与ADAMTS13-7R;ADAMTS13-8F与ADAMTS13-8R;ADAMTS13-9F与ADAMTS13-9R;ADAMTS13-10-11F与ADAMTS13-10-11R;ADAMTS13-12F与ADAMTS13-12R;ADAMTS13-13F与ADAMTS13-13R;ADAMTS13-14F与ADAMTS13-14R;ADAMTS13-15F与ADAMTS13-15R;ADAMTS13-16F与ADAMTS13-16R;ADAMTS13-17-18F与ADAMTS13-17-18R;ADAMTS13-19F与ADAMTS13-19R;ADAMTS13-20F与ADAMTS13-20R;ADAMTS13-21F与ADAMTS13-21R;ADAMTS13-22F与ADAMTS13-22R;ADAMTS13-23F与ADAMTS13-23R;ADAMTS13-24F与ADAMTS13-24R;ADAMTS13-25F与ADAMTS13-25R;ADAMTS13-26F与ADAMTS13-26R;ADAMTS13-27F与ADAMTS13-27R;ADAMTS13-28F与ADAMTS13-28R;ADAMTS13-29F与ADAMTS13-29R对(1)中的DNA分别进行扩增,获得覆盖检测ADAMTS13基因全外显子的扩增产物;
(3)利用1对测序引物M13-F与M13-R对(2)中的扩增产物进行正向和反向测序,获得所述扩增产物的基因序列;
(4)将(3)中的基因序列与野生型ADAMTS13基因序列进行比较,确定突变位点是否存在;其中所述引物序列为:
本发明的目的还在于提供一种检测ADAMTS13基因全外显子的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒包括样品DNA抽提试剂;无水乙醇;检测体系PCR反应液、测序体系反应液、阳性对照品、阴性对照品和空白对照品,其中检测体系PCR反应液包括26对扩增引物ADAMTS13-1F与ADAMTS13-1R;ADAMTS13-2F与ADAMTS13-2R;ADAMTS13-3F与ADAMTS13-3R;ADAMTS13-4F与ADAMTS13-4R;ADAMTS13-5-6F与ADAMTS13-5-6R;ADAMTS13-7F与ADAMTS13-7R;ADAMTS13-8F与ADAMTS13-8R;ADAMTS13-9F与ADAMTS13-9R;ADAMTS13-10-11F与ADAMTS13-10-11R;ADAMTS13-12F与ADAMTS13-12R;ADAMTS13-13F与ADAMTS13-13R;ADAMTS13-14F与ADAMTS13-14R;ADAMTS13-15F与ADAMTS13-15R;ADAMTS13-16F与ADAMTS13-16R;ADAMTS13-17-18F与ADAMTS13-17-18R;ADAMTS13-19F与ADAMTS13-19R;ADAMTS13-20F与ADAMTS13-20R;ADAMTS13-21F与ADAMTS13-21R;ADAMTS13-22F与ADAMTS13-22R;ADAMTS13-23F与ADAMTS13-23R;ADAMTS13-24F与ADAMTS13-24R;ADAMTS13-25F与ADAMTS13-25R;ADAMTS13-26F与ADAMTS13-26R;ADAMTS13-27F与ADAMTS13-27R;ADAMTS13-28F与ADAMTS13-28R;ADAMTS13-29F与ADAMTS13-29R,测序体系反应液包括1对测序引物M13-F与M13-R。
进一步地,所述检测体系PCR反应液还包括2×PCR Buffer;dNTPs;KOD FX DNAPolymerase。
进一步地,所述测序体系反应液还包括测序纯化液、EDTA、无水乙醇、75%乙醇、HIDI和Bigdye Terminator V3.1。
进一步地,所述测序纯化液包括虾碱性磷酸酶和核酸外切酶I。
有益效果:本发明设计了扩增覆盖检测ADAMTS13基因全外显子序列的26对正、反向引物,并在PCR扩增的上游引物5’端和下游引物5’端分别加了一段长18bp的M13-F引物序列和长16bp的M13-R引物序列。这样扩增产物两端都会带上所引入的M13-F及M13-R引物序列,随后进行测序反应的时候,所有的扩增产物可以使用统一的M13-F和M13-R引物进行正反向测序。因为ADAMTS13基因有29个外显子,每个样本检测需要扩增26个PCR产物,如果每个产物使用各自的测序引物进行测序,操作将会十分繁琐,也极易引起污染。而本试剂盒这样的设计有效的避免了这一问题,大大简化了测序反应的操作步骤,使整个过程非常便捷。同时通过调整正反向引物的浓度、退火温度等反应条件,可使扩增效率达到最佳。
利用本发明所述扩展引物和测序引物,可以扩展整个全外显子序列,通过测序结果的分析,可以很直观的了解ADAMTS13基因全外显子的基因突变情况,并不受ADAMTS13突变多样化以及没有突变热点的影响,可覆盖待检测的所有突变位点;具有很高的特异性及准确性;采用PCR方法扩增目的基因并测序检测其基因多态性,具有灵敏度高,操作简单、成本低等优点。
具体实施方式
下面结合具体实施例,进一步阐述本发明。应当注意的是,实施例中未说明的常规条件和方法,通常按照所属领域实验人员常规采用方法:譬如,奥斯柏和金斯顿主编的《精编分子生物学实验指南》第四版,或者按照制造厂商所建议的步骤和条件。
实施例1
检测ADAMTS13基因全外显子的引物,包括:扩增覆盖检测ADAMTS13基因全外显子的26对正、反向引物;所述扩展引物的碱基序列为:
所述引物还包括1对测序引物,其碱基序列为
M13-F:TGTAAAACGACGGCCAGT
M13-R:AACAGCTATGACCATG
在检测中,先利用上述26对正、反向扩增引物对覆盖检测ADAMTS13基因全外显子的DNA片段进行扩增,获得扩增产物,然后利用上述1对测序引物对扩增产物进行测序,获得扩增产物的基因序列。
在引物设计上,所设计的每对引物都位于所要扩增的外显子序列两侧,即扩增区域包括了该外显子的全部序列。因为ADAMTS13的突变位点很多,突变类型不定。因此本发明所述引物既能将所述全部外显子序列都扩增出来,也保证无论外显子的何处位置发生突变,都不会出现漏检的情况。因为第5和6号外显子、第10和11号外显子、第17和18号外显子序列都较短,中间的内含子序列也很短,因此本发明在检测第5和6号外显子、10和11号外显子、17和18号外显子时,分别采用一对扩增引物,为ADAMTS13-5-6F和ADAMTS13-5-6R、ADAMTS13-10-11F和ADAMTS13-10-11R、ADAMTS13-17-18F和ADAMTS13-17-18F。通过如上创新性的用一对引物检测连续的两个外显子,减少了实验的操作步骤,缩短了检测时间,减少了人力的投入,同时引物数量的减少,降低了检测成本。
检测ADAMTS13基因全外显子的试剂盒,包括:组织DNA抽提试剂盒(例如使用天根生物的提取试剂盒)、无水乙醇、检测体系PCR反应液、测序体系反应液、阳性对照品、阴性对照品和空白对照品,其中
检测体系PCR反应液包括:2×PCR Buffer;2mM dNTPs;KOD FX DNA Polymerase(1U/μl);检测目的基因用的26对上、下游引物ADAMTS13-1F(10μm)与ADAMTS13-1R(10μm);ADAMTS13-2F(10μm)与ADAMTS13-2R(10μm);ADAMTS13-3F(10μm)与ADAMTS13-3R(10μm);ADAMTS13-4F(10μm)与ADAMTS13-4R(10μm);ADAMTS13-5-6F(10μm)与ADAMTS13-5-6R(10μm);ADAMTS13-7F(10μm)与ADAMTS13-7R(10μm);ADAMTS13-8F(10μm)与ADAMTS13-8R(10μm);ADAMTS13-9F(10μm)与ADAMTS13-9R(10μm);ADAMTS13-10-11F(10μm)与ADAMTS13-10-11R(10μm);ADAMTS13-12F(10μm)与ADAMTS13-12R(10μm);ADAMTS13-13F(10μm)与ADAMTS13-13R(10μm);ADAMTS13-14F(10μm)与ADAMTS13-14R(10μm);ADAMTS13-15F(10μm)与ADAMTS13-15R(10μm);ADAMTS13-16F(10μm)与ADAMTS13-16R(10μm);ADAMTS13-17-18F(10μm)与ADAMTS13-17-18R(10μm);ADAMTS13-19F(10μm)与ADAMTS13-19R(10μm);ADAMTS13-20F(10μm)与ADAMTS13-20R(10μm);ADAMTS13-21F(10μm)与ADAMTS13-21R(10μm);ADAMTS13-22F(10μm)与ADAMTS13-22R(10μm);ADAMTS13-23F(10μm)与ADAMTS13-23R(10μm);ADAMTS13-24F(10μm)与ADAMTS13-24R(10μm);ADAMTS13-25F(10μm)与ADAMTS13-25R(10μm);ADAMTS13-26F(10μm)与ADAMTS13-26R(10μm);ADAMTS13-27F(10μm)与ADAMTS13-27R(10μm);ADAMTS13-28F(10μm)与ADAMTS13-28R(10μm);ADAMTS13-29F(10μm)与ADAMTS13-29R(10μm)。
测序体系反应液包括:测序纯化液、EDTA(125mmol)、无水乙醇、75%乙醇、HIDI(高度去离子甲酰胺)、测序引物:M13-F(3.2μm)与M13-R(3.2μm),以及Bigdye TeRminatoRV3.1(购买自美国Applied Biosystems公司),其中测序纯化液包括虾碱性磷酸酶(SAP)0.6U和核酸外切酶I(EXONI)1.2U。
阳性对照品:含有野生型ADAMTS13序列的溶液。
阴性对照品:无野生型ADAMTS13序列的溶液。
空白对照品:2μl生理盐水或不加任何物质。
实施例2
(1)抽提血液中的基因组DNA(按照血液DNA抽提试剂盒(天根生物)的说明书操作):
1)抽取500ul血液加入1000ul红细胞裂解液,颠倒混匀,室温放置5分钟,期间再颠倒混匀几次。3000Rpm离心5分钟,吸去上清,留下白细胞沉淀,加200ul缓冲液GA,振荡至彻底混匀。
2)加入20μl蛋白酶K溶液,混匀。
3)加入200μl缓冲液GB,充分颠倒混匀,70℃放置10分钟,溶液应变清亮,短暂离心以去除管盖内壁的水珠。
4)加入200μl无水乙醇,充分振荡混匀15秒,此时可能会出现絮状沉淀,短暂离心以去除管盖内壁的水珠。
5)将上一步所得溶液和絮状沉淀都加入一个吸附柱CB3中(吸附柱放入收集管中),12,000Rpm(13,400×g)离心30秒,倒掉废液,将吸附柱CB3放回收集管中。
6)向吸附柱CB3中加入500μl缓冲液GD(使用前请先检查是否已加入无水乙醇),12,000Rpm(13,400×g)离心30秒,倒掉废液,将吸附柱CB3放入收集管中。
7)向吸附柱CB3中加入700μl漂洗液PW(使用前请先检查是否已加入无水乙醇),12,000Rpm(13,400×g)离心30秒,倒掉废液,将吸附柱CB3放入收集管中。
8)向吸附柱CB3中加入500μl漂洗液PW,12,000Rpm(13,400×g)离心30秒,倒掉废液。
9)将吸附柱CB3放回收集管中,12,000Rpm(13,400×g)离心2分钟,倒掉废液。将吸附柱CB3置于室温放置数分钟,以彻底晾干吸附材料中残余的漂洗液。
10)将吸附柱CB3转入一个干净的离心管中,向吸附膜的中间部位悬空滴加100μl洗脱缓冲液TE,室温放置2-5分钟,12,000Rpm(13,400×g)离心2分钟,将溶液收集到离心管中。
(2)试剂配置:按检测人份数配置检测体系PCR反应液各Xμl,每人份18μl分装:
X=18μl反应液×(n份标本+1份阳性对照+1份阴性对照+1份空白对照)
n为检测标本数。
检测体系PCR反应液配制如下:
其中,F与R选自ADAMTS13-1F与ADAMTS13-1R;ADAMTS13-2F与ADAMTS13-2R;ADAMTS13-3F与ADAMTS13-3R;ADAMTS13-4F与ADAMTS13-4R;ADAMTS13-5-6F与ADAMTS13-5-6R;ADAMTS13-7F与ADAMTS13-7R;ADAMTS13-8F与ADAMTS13-8R;ADAMTS13-9F与ADAMTS13-9R;ADAMTS13-10-11F与ADAMTS13-10-11R;ADAMTS13-12F与ADAMTS13-12R;ADAMTS13-13F与ADAMTS13-13R;ADAMTS13-14F与ADAMTS13-14R;ADAMTS13-15F与ADAMTS13-15R;ADAMTS13-16F与ADAMTS13-16R;ADAMTS13-17-18F与ADAMTS13-17-18R;ADAMTS13-19F与ADAMTS13-19R;ADAMTS13-20F与ADAMTS13-20R;ADAMTS13-21F与ADAMTS13-21R;ADAMTS13-22F与ADAMTS13-22R;ADAMTS13-23F与ADAMTS13-23R;ADAMTS13-24F与ADAMTS13-24R;ADAMTS13-25F与ADAMTS13-25R;ADAMTS13-26F与ADAMTS13-26R;ADAMTS13-27F与ADAMTS13-27R;ADAMTS13-28F与ADAMTS13-28R;ADAMTS13-29F与ADAMTS13-29R。
(3)加样:加入3个检测体系PCR反应液中各2μl DNA;阳性对照和阴性对照直接加2μl阳性对照品和阴性对照品;空白对照加2μl生理盐水或不加任何物质。其中阳性对照品是含有野生型ADAMTS13序列的溶液,阴性对照品是无野生型ADAMTS13序列的溶液,空白对照品是2μl生理盐水或不加任何物质。
(4)扩增:检测在常规PCR仪上进行,可用仪器包括ABI veRiti(美国AppliedBiosystems公司)等。反应条件如下:
(5)Sanger测序:
取9μl PCR产物与2μl纯化体系。按照以下程序进行纯化:
将1μl纯化产物分别与测序引物:M13-F(3.2μm)与M13-R(3.2μm),按照如下体系进行混合:
测序反应程序:
沉淀环节:
向完成测序反应的产物中加入2μl 125mmol的EDTA,静置5min;加入15ml无水乙醇,漩涡混匀;3700Rpm离心30min;倒置离心15sec,加入50ml 70%乙醇,漩涡混匀;3700Rpm离心15min;倒置离心15sec,置于95℃金属浴上;加入10μl HIDI后进行变性试验。变性程序:
变性程序结束后,上测序仪(ABI3730)测序。
(7)结果判断:将测序结果与野生型参考序列(GeneBank No.:NG_011934.2)进行比对,根据实际突变情况对结果进行报告。
实施例3
取临床患者样本8份,8份样本都确定是患有TTP,检测该8份样本是否存在ADAMTS13突变。按实施例2所述方法提取基因组、配制试剂并检测。每份样品2μl加入检测体系PCR反应液中。同时做阳性对照,阴性对照,空白对照各一份。检测结果如下所述:
阳性对照品的测序结果与野生型ADAMTS13序列(GeneBank No.:NG_011934.2)进行对比,发现两者完全一致,证明所用引物可以准确扩增出ADAMTS13基因的全部外显子,使用其引物进行扩增和测序的方法准确可靠,符合基因扩增和测序要求。
阴性对照品和空白对照品未出现测序结果,说明上述引物不会产生非特异性扩增,测序结果真实可靠。
8份临床患者样本中,根据其测序结果与野生型ADAMTS13序列(GeneBank No.:NG_011934.2)进行对比,未发现突变,说明8份样本不存在ADAMTS13突变。
SEQUENCE LISTING
<110> 杭州艾迪康医学检验中心有限公司
<120> 检测ADAMTS13基因全外显子的试剂盒和方法
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<160> 54
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<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 12
aacagctatg accatgggtt ggacggaggg gtgggttgga 40
<210> 13
<211> 42
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 13
tgtaaaacga cggccagtcc actcctccgt cccgcctcct cc 42
<210> 14
<211> 40
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 14
aacagctatg accatggggc ccagtcaaac aaaaatgttg 40
<210> 15
<211> 43
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 15
tgtaaaacga cggccagtcg gtgcagagtg ttggctgtgt cag 43
<210> 16
<211> 41
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 16
aacagctatg accatgctct ctgccccata ctggtcctgc c 41
<210> 17
<211> 43
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 17
tgtaaaacga cggccagtcc tgaggatgtt gggggactct ctg 43
<210> 18
<211> 41
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 18
aacagctatg accatgctca aatgtgtcct ggtgtgaacc a 41
<210> 19
<211> 43
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 19
tgtaaaacga cggccagtgc tgaggccaca cccacatctt gat 43
<210> 20
<211> 41
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 20
aacagctatg accatgggat gccagagcct gaaccacttt g 41
<210> 21
<211> 43
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 21
tgtaaaacga cggccagtag atagaaaccc ttgccccaga tgc 43
<210> 22
<211> 41
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 22
aacagctatg accatgagat ccttttcccc agcaccactc c 41
<210> 23
<211> 43
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 23
tgtaaaacga cggccagtgg cagggctgca gagtcattga ggc 43
<210> 24
<211> 41
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 24
aacagctatg accatgcaga agggtggcga agtggaagag g 41
<210> 25
<211> 43
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 25
tgtaaaacga cggccagtag ctccctttgt ctgtggtgtg gtg 43
<210> 26
<211> 40
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 26
aacagctatg accatgcaac tatcaagcct gagggtggtt 40
<210> 27
<211> 43
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 27
tgtaaaacga cggccagttg gggaccccgg gaaggagagt cac 43
<210> 28
<211> 40
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 28
aacagctatg accatgctgt aagtgaccgc tgaatgaata 40
<210> 29
<211> 43
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 29
tgtaaaacga cggccagttt ggccaggctg gagtgctatg ttg 43
<210> 30
<211> 41
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 30
aacagctatg accatgtgca gaatgggggc actcacagag c 41
<210> 31
<211> 43
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 31
tgtaaaacga cggccagttc accagcctgt gattcggttg tcc 43
<210> 32
<211> 41
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 32
aacagctatg accatgtaag gaactctgac agcagcactt a 41
<210> 33
<211> 43
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 33
tgtaaaacga cggccagttc ctctttgggc tcctggatgt tgg 43
<210> 34
<211> 40
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 34
aacagctatg accatgggca atgggtgctc ctcgttctcc 40
<210> 35
<211> 42
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 35
tgtaaaacga cggccagtgc aaggataccc gctgcgagac cg 42
<210> 36
<211> 41
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 36
aacagctatg accatgtcag ccaatcaaca cccacatttg a 41
<210> 37
<211> 43
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 37
tgtaaaacga cggccagtac ccatgcgggc cttatgtgct aga 43
<210> 38
<211> 40
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 38
aacagctatg accatggctc tgggttgcag tcctcaaagg 40
<210> 39
<211> 43
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 39
tgtaaaacga cggccagtaa gggggcctcc agaaagagaa cct 43
<210> 40
<211> 41
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 40
aacagctatg accatgctgt gttgcccagg ttggacttgc a 41
<210> 41
<211> 42
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 41
tgtaaaacga cggccagtgg gctcagtggc tgcactttcc at 42
<210> 42
<211> 40
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 42
aacagctatg accatgcttc cagcgtcccc aaacctaagg 40
<210> 43
<211> 43
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 43
tgtaaaacga cggccagtgt gacagggacc cagacttgaa tta 43
<210> 44
<211> 41
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 44
aacagctatg accatgtcaa gttacttccc cttgatagta g 41
<210> 45
<211> 43
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 45
tgtaaaacga cggccagtct ctgcatgtgc cccctcttgc tgg 43
<210> 46
<211> 41
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 46
aacagctatg accatgactg ggcacatcac ttaatctctc c 41
<210> 47
<211> 43
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 47
tgtaaaacga cggccagtat gtgcattccc acctgtagtt tgc 43
<210> 48
<211> 41
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 48
aacagctatg accatgcctc cctggcacgt gcagactgac a 41
<210> 49
<211> 43
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 49
tgtaaaacga cggccagtaa ccagagccca gaacatttag cct 43
<210> 50
<211> 41
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 50
aacagctatg accatggagc cactatttca ctcttgtagg t 41
<210> 51
<211> 43
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 51
tgtaaaacga cggccagtgt gtgtccttgg ggaagtgatg taa 43
<210> 52
<211> 41
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 52
aacagctatg accatgctga ttggattttc ttcctggata g 41
<210> 53
<211> 18
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 53
tgtaaaacga cggccagt 18
<210> 54
<211> 16
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 54
aacagctatg accatg 16
Claims (4)
1.检测ADAMTS13基因全外显子的试剂盒,其特征在于,包括:扩增覆盖检测ADAMTS13基因全外显子的正、反向引物,其碱基序列为:
2.根据权利要求1所述的试剂盒,其特征在于,还包括一对测序引物M13-F和M13-R,其碱基序列为:
M13-F:TGTAAAACGACGGCCAGT
M13-R:AACAGCTATGACCATG。
3.根据权利要求1所述的试剂盒,其特征在于,所述26对正、反向引物的使用浓度比为:ADAMTS13-F:ADAMTS13-R=1:1。
4.一种检测ADAMTS13基因全外显子序列的方法,其包括如下步骤:
(1)提取样品DNA;
(2)利用26对扩增引物ADAMTS13-1F与ADAMTS13-1R;ADAMTS13-2F与ADAMTS13-2R;ADAMTS13-3F与ADAMTS13-3R;ADAMTS13-4F与ADAMTS13-4R;ADAMTS13-5-6F与ADAMTS13-5-6R;ADAMTS13-7F与ADAMTS13-7R;ADAMTS13-8F与ADAMTS13-8R;ADAMTS13-9F与ADAMTS13-9R;ADAMTS13-10-11F与ADAMTS13-10-11R;ADAMTS13-12F与ADAMTS13-12R;ADAMTS13-13F与ADAMTS13-13R;ADAMTS13-14F与ADAMTS13-14R;ADAMTS13-15F与ADAMTS13-15R;ADAMTS13-16F与ADAMTS13-16R;ADAMTS13-17-18F与ADAMTS13-17-18R;ADAMTS13-19F与ADAMTS13-19R;ADAMTS13-20F与ADAMTS13-20R;ADAMTS13-21F与ADAMTS13-21R;ADAMTS13-22F与ADAMTS13-22R;ADAMTS13-23F与ADAMTS13-23R;ADAMTS13-24F与ADAMTS13-24R;ADAMTS13-25F与ADAMTS13-25R;ADAMTS13-26F与ADAMTS13-26R;ADAMTS13-27F与ADAMTS13-27R;ADAMTS13-28F与ADAMTS13-28R;ADAMTS13-29F与ADAMTS13-29R对(1)中的DNA分别进行扩增,获得覆盖检测ADAMTS13基因全外显子的扩增产物;
(3)利用1对测序引物M13-F与M13-R对(2)中的扩增产物分别进行正向和反向测序,获得所述扩增产物的基因序列;
(4)将(3)中的基因序列与野生型ADAMTS13基因序列进行比较,确定突变位点是否存在。
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