CN104480219A - 一种用于支气管败血波氏杆菌实时荧光定量pcr方法的引物 - Google Patents

一种用于支气管败血波氏杆菌实时荧光定量pcr方法的引物 Download PDF

Info

Publication number
CN104480219A
CN104480219A CN201510033460.9A CN201510033460A CN104480219A CN 104480219 A CN104480219 A CN 104480219A CN 201510033460 A CN201510033460 A CN 201510033460A CN 104480219 A CN104480219 A CN 104480219A
Authority
CN
China
Prior art keywords
primer
pcr method
bordetella
pcr
real
Prior art date
Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
Pending
Application number
CN201510033460.9A
Other languages
English (en)
Inventor
何海
郝成武
贺笋
李延涛
Current Assignee (The listed assignees may be inaccurate. Google has not performed a legal analysis and makes no representation or warranty as to the accuracy of the list.)
XINJIANG TECON ANIMAL HUSBANDRY BIOLOGICAL TECHNOLOGY Co Ltd
Original Assignee
XINJIANG TECON ANIMAL HUSBANDRY BIOLOGICAL TECHNOLOGY Co Ltd
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by XINJIANG TECON ANIMAL HUSBANDRY BIOLOGICAL TECHNOLOGY Co Ltd filed Critical XINJIANG TECON ANIMAL HUSBANDRY BIOLOGICAL TECHNOLOGY Co Ltd
Priority to CN201510033460.9A priority Critical patent/CN104480219A/zh
Publication of CN104480219A publication Critical patent/CN104480219A/zh
Pending legal-status Critical Current

Links

Classifications

    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6876Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
    • C12Q1/6888Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for detection or identification of organisms
    • C12Q1/689Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for detection or identification of organisms for bacteria
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6844Nucleic acid amplification reactions
    • C12Q1/6851Quantitative amplification

Landscapes

  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Analytical Chemistry (AREA)
  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
  • Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
  • Investigating Or Analysing Materials By The Use Of Chemical Reactions (AREA)

Abstract

本发明属于生物技术领域,特别涉及一种用于支气管败血波氏杆菌实时荧光定量PCR方法的引物,所述的引物包括上、下游引物,具体如下:上游引物:5’‐GCGCCTGCCCTATCCCG‐3’如SEQ ID NO.1所示;下游引物:5’‐GCCGCCCATTCGTAACATCG‐3’ 如SEQ ID NO.2所示。本发明利用荧光定量PCR方法替代普通PCR的方法筛选试猪,利用荧光定量PCR溶解曲线吸收峰的特异性原理对样本进行检测,使试猪筛选更准确。

Description

一种用于支气管败血波氏杆菌实时荧光定量PCR方法的引物
技术领域
本发明属于生物技术领域,特别涉及一种用于支气管败血波氏杆菌实时荧光定量PCR方法的引物。
背景技术
常规测定试猪中支气管败血波氏杆菌(Bordetellabronchiseptica,Bb)抗原的方法是将从试猪身上采集的鼻拭子进行培养,再利用培养基分离鉴定,或者通过普通的PCR方法进行检测。其中,培养基分离鉴定法在实际操作中非常繁复,且易受杂菌干扰影响;而普通PCR方法相较于传统的分离鉴定检测法,虽然较为灵敏快捷,但是对目标菌在菌液中的含量以及杂菌数量等方面要求较为严格,且有可能出现假阴性与假阳性等结果,使筛选出的萎缩性鼻炎阴性猪或者感染猪出现偏差;同时,这种方法耗时费力。
本发明的目的在于:通过设计高特异性引物,采用实时荧光定量PCR方法,测定试猪鼻拭子中的支气管败血性波氏杆菌抗原含量,从而替代普通PCR的方法筛选试猪;并利用荧光定量PCR溶解曲线吸收峰的特异性原理对样本进行检测,使试猪筛选更准确和高效。
发明内容
本发明的目的在于:设计一对高特异性荧光定量PCR检测引物,便于优化支气管败血波氏杆菌抗原检测,简化待测样本制备工作,从而提高抗原检测效率。
本发明的目的是这样实现的:一种用于支气管败血波氏杆菌实时荧光定量PCR方法的引物,所述的引物包括上、下游引物,具体如下:上游引物:5’‐GCGCCTGCCCTATCCCG‐3’如SEQ ID NO.1所示;下游引物:5’‐GCCGCCCATTCGTAACATCG‐3’ 如SEQ  ID  NO.2所示。
有益效果:本发明采用的高特异引物,使用荧光定量PCR法,在细菌含量在10时即可准确的检测出来,且不受杂菌干扰影响;采用的实时荧光定量PCR法检测猪萎缩性鼻炎支气管败血波氏杆菌抗原,具有方便、准确、高灵敏度的特点。
附图说明
下面结合附图对本发明作进一步说明。
图1为 普通PCR对Bb抗原检测图;附图1说明:如图1所示:1:108 CFU Bb菌体;2:107 CFU Bb菌体;3:106 CFU Bb菌体;4:105 CFU Bb菌体;5:104 CFU Bb菌体;6:103 CFU Bb菌体;7:102 CFU Bb菌体;8:10 CFU Bb菌体;9:1 CFU Bb菌体;10:Maker2000;11:阳性对照。
具体实施方式
实施例1、一种用于支气管败血波氏杆菌实时荧光定量PCR方法的引物,所述的引物包括上、下游引物,具体如下:上游引物:5’‐GCGCCTGCCCTATCCCG‐3’如SEQ ID NO.1所示;下游引物:5’‐GCCGCCCATTCGTAACATCG‐3’ 如SEQ  ID  NO.2所示。
 具体实践验证:荧光定量PCR检测猪萎缩性鼻炎病原体抗原(支气管败血波氏杆菌)的方法步骤:
1抗原检测
1.1制作鼻拭子 将竹签一头缠绕脱脂棉,制作鼻拭子,不同日龄的试猪使用相应长度的棉签,制作好的鼻拭子高压灭菌。
1.2采样 保定试猪,将制作好的鼻拭子轻轻旋转插入试猪鼻孔,避免误伤试猪,取出鼻拭子放入事先分装的BHI培养基中;
1.3菌液制备 将接入鼻拭子的BHI培养基放入37℃摇床,在200rpm条件下,过夜培养16h;另取保存菌种Bb,经过复苏、菌落计数后梯度稀释为不同浓度作为阳性对照。
1.4荧光定量PCR 将培养好的菌液作为模板,使用SYBR Green荧光定量PCR试剂盒(TaKaRa公司)配制PCR体系,并使用荧光定量PCR仪(BioRad公司)进行反应。
1.5 观察荧光定量PCR结果,将待测样本与阴阳性对照的出峰时间与峰值大小进行对比,记录结果。
其中,为便于使用荧光定量PCR方法鉴定支气管败血波氏杆菌抗原,包括待测抗原样本制备与检测引物特异性;其中1、待测样本制备:使用鼻拭子采集试猪鼻腔内菌体,BHI液体培养;2、在波氏杆菌基因组高度保守区域内设计高特异性引物如下:
Bb上游引物:5’‐GCGCCTGCCCTATCCCG‐3’;Bb下游引物:5’‐GCCGCCCATTCGTAACATCG‐3’;
(1)RT-PCR反应体系
SYBR Premix  12.5ul
Primer F      1ul;
Primer R      1ul
模板          2ul
Water         8ul
总体积        25ul
(2)RT-PCR反应程序
Stage 1: 预变性
Raps:1    (95℃ 30秒)
Stage 2: PCR反应
Raps:40   (95℃ 5秒) (56/59℃ 30秒)
Stage 3: Melt Curve
(3)普通PCR反应体系
Taqmix        12.5ul
Primer F      0.5ul
Primer R      0.5ul
模板          2ul
Water         9.5ul
总体积        25ul
(4)普通PCR反应程序
Stage 1: 预变性
Raps:1    (95℃ 5min)
Stage 2: PCR反应
Raps:30   (95℃ 30秒) (56/59℃ 45秒)(72℃30秒)
Stage 3: 4℃
实时荧光定量PCR所用的试剂盒为TAKARA公司生产。
2 传统方法对比验证
2.1 分离鉴定 取步骤1.3制备的菌液,接入不同的分离培养基分离鉴定。
2.2 普通PCR鉴定 使用与步骤1.4同样的模板,用普通PCR进行对比验证,普通PCR结果见附图1。
验证结果显示:普通分离鉴定培养法中杂菌大量生长,遮盖了生长速度较慢的产毒型巴氏杆菌,无法分离;普通PCR法鉴定灵敏度较低,在细菌含量大于104CFU时才能检测到;采用的荧光定量PCR法,在细菌含量在10时即可准确的检测出来,且不受杂菌干扰影响;采用的实时荧光定量PCR法检测猪萎缩性鼻炎病原体抗原,具有方便,准确,高灵敏度的特点。

Claims (1)

1.一种用于支气管败血波氏杆菌实时荧光定量PCR方法的引物,其特征在于,所述的引物包括上、下游引物,具体如下:上游引物:5’‐GCGCCTGCCCTATCCCG‐3’如SEQ ID NO.1所示;下游引物:5’‐GCCGCCCATTCGTAACATCG‐3’ 如SEQ  ID  NO.2所示。
CN201510033460.9A 2015-01-22 2015-01-22 一种用于支气管败血波氏杆菌实时荧光定量pcr方法的引物 Pending CN104480219A (zh)

Priority Applications (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
CN201510033460.9A CN104480219A (zh) 2015-01-22 2015-01-22 一种用于支气管败血波氏杆菌实时荧光定量pcr方法的引物

Applications Claiming Priority (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
CN201510033460.9A CN104480219A (zh) 2015-01-22 2015-01-22 一种用于支气管败血波氏杆菌实时荧光定量pcr方法的引物

Publications (1)

Publication Number Publication Date
CN104480219A true CN104480219A (zh) 2015-04-01

Family

ID=52754821

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
CN201510033460.9A Pending CN104480219A (zh) 2015-01-22 2015-01-22 一种用于支气管败血波氏杆菌实时荧光定量pcr方法的引物

Country Status (1)

Country Link
CN (1) CN104480219A (zh)

Citations (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
JPH04179480A (ja) * 1990-11-09 1992-06-26 Zenkoku Nogyo Kyodo Kumiai Rengokai ボルデテラ・ブロンキセプチカの16SrRNA遺伝子、プローブ用DNA断片及びそれらを用いるボルデテラ・ブロンキセプチカの検出法
CN102925547A (zh) * 2012-08-02 2013-02-13 四川农业大学 用环介导等温扩增方法检测支气管败血波氏杆菌的试剂盒及其方法

Patent Citations (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
JPH04179480A (ja) * 1990-11-09 1992-06-26 Zenkoku Nogyo Kyodo Kumiai Rengokai ボルデテラ・ブロンキセプチカの16SrRNA遺伝子、プローブ用DNA断片及びそれらを用いるボルデテラ・ブロンキセプチカの検出法
CN102925547A (zh) * 2012-08-02 2013-02-13 四川农业大学 用环介导等温扩增方法检测支气管败血波氏杆菌的试剂盒及其方法

Non-Patent Citations (4)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
DANIELA HOZBOR,ET AL: "Detection of Bordetella bronchiseptica by the polymerase chain reaction", 《RES. MICROBIOL.》 *
HOZBOR,D.,ET AL: "Bordetella bronchiseptica gene encoding flagellin,5"flanking region", 《GENBANK AJ012319》 *
袁翠霞等: "支气管败血波氏杆菌的鉴定及药敏试验", 《动物医学进展》 *
袁翠霞等: "猪支气管败血波氏杆菌FlaA基因克隆与序列分析", 《山地农业生物学报》 *

Similar Documents

Publication Publication Date Title
CN109680084A (zh) 一种用于荧光定量pcr检测结核分枝杆菌复合群的引物探针及方法
CN103509877A (zh) 一种用于检测prv的荧光定量pcr试剂盒及其应用
CN101974522B (zh) 用于马鹿茸真伪鉴别的引物及探针、试剂盒和方法
CN109468395A (zh) 一种检测支原体的引物、试剂盒、检测方法和应用
CN106868224A (zh) 检测猪蓝耳病毒经典毒株、高致病性变异毒株和nadc‑30毒株的rt‑pcr方法
CN104774967A (zh) 一种用于多杀性巴氏杆菌实时荧光定量pcr方法的引物及检测方法
CN106167831A (zh) 检测枣疯病、槐树丛枝病或樱桃致死黄化植原体的lamp引物组及其试剂盒和应用
CN102453762A (zh) 检测猪增生性肠病病原菌胞内劳森菌的试剂盒和方法
CN103627812B (zh) 奶牛乳房炎主要致病菌四重pcr快速检测试剂盒
CN103993101A (zh) 一种同时检测人的冠状病毒229e、oc43、nl63的方法及试剂盒
CN103014152A (zh) 一种用于检测大豆疫霉的lamp引物、试剂盒及其检测方法
CN104263845B (zh) 一种同时检测猪肺炎支原体、猪多杀性巴氏杆菌和副猪嗜血杆菌的三重pcr方法
CN104531885A (zh) 维氏气单胞菌快速检测引物、试剂盒及应用
CN104232783B (zh) 牛种布氏菌弱毒疫苗株a19的快速检测方法
CN106521036A (zh) 一种鉴别犬细小病毒、犬瘟热病毒、犬副流感病毒和犬腺病毒2型的四重pcr检测方法
CN105112558B (zh) 口蹄疫病毒O、A和AsiaⅠ型三重实时荧光定量RT‑PCR检测试剂盒
CN103205494B (zh) 一种检测副猪嗜血杆菌的lamp方法
CN104313128A (zh) 基于环介导等温扩增技术检测禾谷镰孢菌的方法及引物组合物
CN106755336B (zh) 一种肺炎克雷伯菌特异基因的应用
CN104480219A (zh) 一种用于支气管败血波氏杆菌实时荧光定量pcr方法的引物
CN102337352B (zh) 一种pcr微阵列检测多种流感病毒的试剂盒
CN103981270B (zh) 美人鱼发光杆菌快速检测引物、试剂盒及应用
CN102618635A (zh) 鼠伤寒沙门氏菌的特异性fq-pcr检测方法
CN104212896B (zh) 一种烟草角斑病菌的分子鉴定引物及鉴定方法
CN104388567B (zh) 针对单增李斯特菌inlB毒力基因的一种快速检测方法

Legal Events

Date Code Title Description
C06 Publication
PB01 Publication
C10 Entry into substantive examination
SE01 Entry into force of request for substantive examination
C12 Rejection of a patent application after its publication
RJ01 Rejection of invention patent application after publication

Application publication date: 20150401