CN102057271A - 质量分析数据解析方法以及质量分析数据解析装置 - Google Patents

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Abstract

提供一种对出现来自目标化合物的多价离子峰的质谱进行解析处理并算出目标化合物的质量的方法和装置。首先,解析质谱上的各峰来检测同位素簇,求出各同位素簇的价数和代表点(m/z值)(S1~S3)。由于在离子化时加合到化合物上或者从化合物上脱离的成分的m/z值的范围受到限制,因此利用该情况来推定来自相同化合物的同位素簇,根据其组合来推定加合/脱离成分的m/z值的候选(S5)。对于所举出的多个候选,利用m/z值的分散程度、各同位素簇的代表点的相对强度的相似性等多个条件,排除明显异常的候选(S6~S9)。并且,最终选定m/z值的分散最小的候选或者代表点的相对强度的相似性最高的候选来决定加合/脱离成分的m/z值,然后计算化合物的质量(S10~S16)。

Description

质量分析数据解析方法以及质量分析数据解析装置
技术领域
本发明涉及对通过质量分析所收集的质谱数据(mass spectrum data)进行解析处理的质量分析数据解析方法以及质量分析数据解析装置,更详细地说,涉及对出现来自具有两个以上电荷的多价离子的峰的质谱进行解析处理来求出目标化合物的分子量或者鉴定目标化合物的质量分析数据解析方法以及质量分析数据解析装置。
背景技术
为了将通过液体试样、液相色谱仪进行成分分离而得到的洗出液中的分析对象成分离子化来进行质量分析,而利用大气压离子化界面。作为代表的大气压离子化法,已知有电喷雾离子化法(ESI)、大气压化学离子化法(APCI)等。通常,这种大气压离子化界面常常与四极型质量分析装置、离子阱型质量分析装置或者飞行时间型质量分析装置组合来使用。
大气压离子化界面、特别是ESI界面具有在目标化合物离子化的过程中容易产生带有多个电荷的多价离子的特性。相对于原本的化合物的分子量,多价离子的m/z值相应于其价数而变小,因此具有可以将分析对象的m/z值的范围限定在相对低的范围内这种优点。特别是,在对蛋白质、肽等较大分子量的化合物进行分析的情况下,有时1价离子的m/z值会超出质量分析装置的可测定范围,而通过利用多价离子能够将m/z值控制在质量分析装置的可测定范围内。由此,利用多价离子的质量分析在分子量较大的化合物的鉴定中发挥着较大威力。
当然,在对具有较大分子量的化合物进行质量分析的情况下,来自各种价数的离子的峰出现在质谱中。另外,在对各种化合物混合而成的试样进行分析时,来自各化合物的峰在质谱上混合存在。因此,针对这种质谱的数据分析处理变得复杂。将从可观察到这种多个多价离子峰的质谱中分离/提取目标化合物的峰来求出其m/z值的方法称为反卷积(Deconvolution)(参照非专利文献1等)。
在通过ESI等进行离子化时,各种离子加合到目标化合物上或者从目标化合物脱离而产生多价离子。例如在正离子测定模式中,除了在目标化合物上加合一个质子(H+)而得到的质子化离子以外,还能够检测出存在于在液相色谱仪中使用的流动相中的离子,由其配管的金属产生的离子、例如钠(Na)、氨(NH4)、质子与甲醇这两者等各种成分加合到目标化合物而得到的离子(加合离子,adduct ion)。另一方面,在负离子测定模式中,除了一个质子从目标化合物上脱离而得到的去质子化离子以外,还能够检测出流动相中的醋酸(CH3COOH)、甲酸(HCOOH)等成分加合到目标化合物上而得到的加合离子。
即使是相同价数的加合离子,根据加合到目标化合物上或者从目标化合物脱离的物质不同,加合离子的m/z值也会不同。因而,在对出现多价离子的峰的质谱进行反卷积处理时,需要确定何种成分加合到目标化合物上或者从目标化合物上脱离。因此,在专利文献1等中记载的现有的反卷积处理中,按照如下步骤来实施处理。即,首先,在执行解析处理之前,用户输入在离子化时加合到目标化合物上或者从目标化合物上脱离的成分(离子)的种类。接收之后,数据解析处理装置在将n设定为自然数、将A设定为所加合的离子的质量(m/z值、即质量/电荷比的值)、将M设定为目标化合物的质量时,在质谱上观测到的多价离子的峰的m/z值为(M/n)-A这种n、M的组合有序地构成的序列,利用该情况,将来自相同的质量M的化合物的多个峰汇总到一起。然后,根据其结果来决定目标化合物的质量M,从而鉴定该化合物。
然而,对于上述在化合物上的离子加合反应、脱离反应的种类、产生难易度,其趋势由于化合物的性质、离子化的条件等而不同。另外,也难以控制这种离子的加合反应、脱离反应。因此,在事先预测会检测出哪种加合离子是相当困难的作业。这种作业需要丰富的知识、经验,因此现状是由具有较高技能的担当人员来承担解析作业,存在知识、经验不足的人员无法进行精度较高的解析这种问题。另外,即使在有经验的分析担当人员进行解析作业的情况下,也需要某种程度的反复试验的作业,因此还存在作业费时、吞吐量(through put)较低这种问题。
并且,在对各种化合物混合而成的试样进行分析的情况下,会在质谱上观察到来自多个化合物的多个峰。因此,有可能偶然地决定错误的价数n,由此导致最终的质量计算错误。
专利文献1:美国专利第5130538号说明书
非专利文献1:「[技術分類]2-4-1-4質量分析全般技術/デ一タ処理/スペクトル処理/デコンボリユ一シヨン」、[online]、特許庁、[平成20年5月1日検索]、インタ一ネツト<URL:http://www.jpo.go.jp/shiryou/s_sonota/hyoujun_gijutsu/mass/2-4-1.pdf>
发明内容
发明要解决的问题
本发明是为了解决上述问题而完成的,其目的在于提供可节省用户用于推定将目标化合物离子化时加合或者脱离的成分的劳力,从而使即使是缺乏高度的化学知识、分析经验的人员也能够高精度且高效率地对目标化合物的质量进行确定、鉴定的质量分析数据解析方法以及质量分析数据解析装置。
用于解决问题的方案
用于解决上述问题而完成的第一发明是一种质量分析数据解析方法,其特征在于,其对通过质量分析获取的、出现多价离子的峰的质谱数据进行解析处理,由此求出目标化合物的m/z值,该质量分析数据解析方法具有以下步骤:a)价数推定步骤,检测质谱上的同位素簇,推定各同位素簇的价数;b)代表点决定步骤,对于每个检测出的上述同位素簇,求出代表该同位素簇的m/z值;c)候选提取步骤,根据推定为来自相同的目标化合物的两个以上的同位素簇的代表点以及价数的组合,求出在离子化时加合到目标化合物上或者从目标化合物上脱离的成分的候选m/z值;d)加合/脱离成分选定步骤,对于通过多个同位素簇的不同组合得到的多个上述候选m/z值,对该候选m/z值或者作为其计算基础的同位素簇的组合的确实性进行评价,由此最终选定一个候选m/z值;以及e)化合物推定步骤,根据所选定的加合/脱离成分的m/z值和价数来推定目标化合物的m/z值。
另外,实现第一发明的质量分析数据解析方法的第二发明是一种质量分析数据解析装置,其特征在于,其对通过质量分析获取的、出现多价离子的峰的质谱数据进行解析处理,由此求出目标化合物的m/z值,具备以下单元:a)价数推定单元,其检测质谱上的同位素簇,推定各同位素簇的价数;b)代表点决定单元,其对于每个检测出的上述同位素簇,求出代表该同位素簇的m/z值;c)候选提取单元,其根据推定为来自相同的目标化合物的两个以上的同位素簇的代表点以及价数的组合,求出在离子化时加合到目标化合物上或者从目标化合物上脱离的成分的候选m/z值;d)加合/脱离成分选定单元,其对于通过多个同位素簇的不同组合而得到的多个上述候选m/z值,对该候选m/z值或者作为其计算基础的同位素簇的组合的确实性进行评价,由此最终选定一个候选m/z值;以及化合物推定单元,其根据所选定的加合/脱离成分的m/z值和价数来推定目标化合物的m/z值。
另外,通过将第一发明的质量分析数据解析方法记述为在计算机上执行的程序,在计算机上执行该程序能够实现第二发明的质谱数据解析装置。
在此所利用的质谱仪需要较高的质量分辨率、质量精度。具体地说,要求较高分辨率、精度来达到能够充分观测构成同位素簇的多个同位素峰的程度。从这一点来看,通常,优选使用飞行时间型质量分离器(TOF-MS)作为质量分离器。
另外,作为质量分析装置的离子源,从容易得到出现多价离子的峰的质谱这一点来看,使用以电喷雾离子化离子源为代表的大气压离子源。
在通过第二发明的质量分析数据解析装置来实现的第一发明的质量分析数据解析方法中,为了从质谱中检测出同位素簇,例如,可以利用本申请的申请人在国际申请号PCT/JP2006/308909(国际公开号WO2006/12928号公报)中提出的方法。即,首先,生成将质谱上的各峰表示为代表其峰的重心的m/z值以及其峰面积这两个值的重心数据。并且,利用在该重心数据上的峰的出现模式来检测质谱上的同位素簇,并且根据构成同位素簇的多个峰的m/z间隔来推定价数。
在试样含有单一化合物的情况下,来自该单一化合物的多价离子的峰出现于质谱。因而,会检测出来自单一化合物的价数不同的多个同位素簇。另一方面,在试样为多种化合物的混合物的情况下,来自各化合物的多价离子的峰出现于质谱。因而,由于多种化合物中的每一种都可能存在价数不同的同位素簇,因此质谱变得更复杂。
代表点决定步骤对各同位素簇的每一个决定代表点的m/z值。已知由相同物质形成的同位素簇即使在价数不同的情况下也会形成大致相同的分布形状。因此,通常,常常将出现在同位素簇中的开头的峰、显示最大强度的峰作为代表点。然而,出现在开头的峰在分子量较大的情况下强度较低,有可能被噪音掩盖。因此,有可能选择后一个峰而不是开头的峰。另外,关于最大强度的峰,在最大强度与第二大强度接近的情况下,可容易地想到最大强度会与第二大强度相调换。因此,作为优选的一个方式,为了稳定地求出代表点,优选将最大强度峰附近的多个峰的重心m/z值决定为代表点。或者,也可以利用单一同位素峰离子的m/z值。这样来决定各同位素簇的价数和代表点。
对于来自相同化合物的多价离子,可以不拘泥于其价数,而假设其为相同成分加合到化合物上或者从化合物上脱离而生成的离子。当然,对于不同的化合物,有时是其他成分加合到不同的化合物上或者从不同的化合物上脱离而生成多价离子。由于能够在某种程度上假设加合到化合物上或者从化合物上脱离来产生加合离子的成分的种类,该m/z值不会太大,因此能够限定可取的m/z值的范围。
在候选提取步骤中,对于多个同位素簇,考虑上述加合/脱离成分的可取的m/z值的范围,根据各自的价数和代表点来提取推定为来自相同化合物的两个以上的同位素簇,根据这些同位素簇的组合来计算加合/脱离成分的m/z值,将该m/z值作为加合/脱离成分的候选m/z值。即使是推定为来自相同化合物的同位素簇的组合,也会由于质量的误差、所选择的峰的错误等而使候选m/z值不同。因而,通常,价数不同的多价离子越多,所得到的候选的数量也越多。
在加合/脱离成分选定步骤中,对于多个加合/脱离成分的候选,评价各候选的确实性,由此选定一个候选。在进行该选定时,能够利用多个评价基准。例如,在首先排除根据某个评价基准推定为明显异常的候选之后,对于剩余的候选,能够应用其他评价基准来选择最确实的候选。
举出具体示例来进行说明,能够对多个候选m/z值应用统计方法,选定确实性较高的候选或者排除确实性较低的候选。统计方法是指例如使用多个候选m/z值的分散程度,判断为分散程度较小的候选的确实性较高。
另外,即使是价数不同的两个以上的同位素簇,如果存在多个来自相同化合物的峰,则其代表点的相对强度比具有较强的相关性。因此,在质谱上,也可以对跨价数的、代表点的或者距离代表点最近的峰的强度比的相似性进行评价,由此对同位素簇的组合的确实性进行评价,选定确实性较高的候选或者排除确实性较低的候选。
如果这样确定了加合/脱离成分的m/z值,则在化合物推定步骤中,根据该加合/脱离成分的m/z值、以及作为该m/z值的计算基础的同位素簇中的价数和代表点来推定目标化合物的m/z值,从而鉴定目标化合物。
发明的效果
根据第一发明的质量分析数据解析方法以及第二发明的质量分析数据解析装置,不需要由用户输入与离子化时加合到目标化合物上或者从目标化合物上脱离的成分相关的信息,可以自动找到最确实的加合/脱离成分。因而,即使是缺乏化学知识、分析经验的人员也能够进行质量分析作业,而且能够得到可靠度、再现性较高的分析结果。另外,在进行质谱解析时不再进行反复试验的作业,因此能够实现解析作业的有效化,能够提高解析的吞吐量。
附图说明
图1是本发明的一个实施例的LC/IT-TOFMS的主要部分的结构图。
图2是表示本实施例的LC/IT-TOFMS中的质谱解析处理的过程的流程图。
图3是用于说明本实施例的LC/IT-TOFMS中的质谱解析处理的概念图。
图4是表示图2示出的质谱解析处理中的同位素簇检测以及价数判断的处理过程的流程图。
图5是用于说明同位素簇检测的概念图。
附图标记说明
1:液相色谱仪(LC)部;11:流动相容器;12:送液泵;13:进样器;14:柱;2:质量分析(MS)部;21:离子化室;22:ESI喷嘴;23:脱溶剂管;24、27:中间真空室;25、28:离子导向器;26:分离器;29:分析室;30:离子阱;31:飞行时间型质量分离器(TOF);32:反射电极;33:离子检测器;34:信号处理部;40:数据处理部;41:质谱生成部;42:反卷积处理部;43:数据存储部;50:分析控制部;51:中央控制部;52:操作部;53:显示部。
具体实施方式
参照附图来说明将实现本发明的质量分析数据解析方法的质量分析数据解析装置应用于液相色谱仪/离子阱飞行时间型质量分析装置(LC/IT-TOFMS)的一个实施例。
图1是本实施例的LC/IT-TOFMS的主要部分的结构图。该LC/IT-TOFMS大致包括液相色谱仪(LC)部1以及质量分析(MS)部2,在连接LC部1与MS部2的大气压离子化界面中使用电喷雾离子化(ESI)界面。
在液相色谱仪(LC)部1中,送液泵12吸引存储在流动相容器11内的流动相,按照一定流量通过进样器13供给柱14。当通过进样器13注入试样时,试样随着流动相的流动而被导入到柱14中。在通过柱14期间,试样中的各种成分分离,在时间上错开而从柱14的出口洗脱并被导入到质量分析(MS)部2。
MS部2具有维持为大气压气氛的离子化室21、以及通过涡轮分子泵(未图示)进行真空排气而维持为高真空气氛的分析室29,在离子化室21与分析室29之间配置有真空度逐级提高的第一级中间真空室24和第二级中间真空室27。离子化室21与第一级中间真空室24通过细径的脱溶剂管23来连通,第一级中间真空室24与第二级中间真空室27通过穿过圆锥形状分离器26的顶部而设置的小直径的孔口来连通。
当从LC部1供给的含有试样成分的洗脱液到达作为离子源的ESI喷嘴22时,通过从高压电源(未图示)施加的直流高电压而赋予洗脱液以电荷。并且,在离子化室21内喷雾成带电的微小液滴。该带电液滴与来自大气的气体分子相撞而粉碎成更微细的液滴,迅速干燥(脱溶剂化),从而试样分子气化。该试样分子产生离子蒸发反应而离子化。该ESI具有在离子化时容易产生带多个电荷的多价离子的特性。含有所产生的离子的微小液滴由于差压而被引入到脱溶剂管23内,在通过脱溶剂管23内的期间进一步脱溶剂化,产生离子。离子一边分别被离子导向器25、28收敛一边经过两个中间真空室24、27而被送到分析室29。在分析室29内,离子被导入到三维四极离子阱30的内部。
在离子阱30中,通过利用由电源(未图示)施加于各电极的高频电压而形成的四极电场来暂时捕获和积累离子。在规定的时间对积累在离子阱30的内部的各种离子一起赋予动能,使各种离子向作为质量分离器的飞行时间型质量分离器(TOF)31放出。也就是说,离子阱30成为离子向TOF31飞行的出发点。TOF31具备被直流电源(未图示)施加直流电压的反射电极32,离子在由此形成的直流电场的作用下在飞行过程中折返而到达离子检测器33。对于同时从离子阱30射出的离子,质量(严格地说是m/z)越小的离子飞行得越快,以与m/z相应的时间差到达离子检测器33。离子检测器33输出与所到达的离子数相应的电流作为检测信号。
该检测信号在信号处理部34中被转换为电压信号,在被转换为数字值之后被输入到数据处理部40。数据处理部40包括作为其功能的质谱生成部41、反卷积处理部42等。质谱生成部41如下生成质谱:对从离子同时自离子阱30射出的时刻至到达离子检测器33的每个时间内的离子信号强度进行测定,将该时间信息换算成m/z值,生成以横轴为m/z值、以纵轴为信号强度的质谱。按规定的时间反复进行从离子阱30向TOF31的离子的射出、以及在TOF31和离子检测器33中的离子的质量分离和检测,每次生成一个质谱。将构成所生成的质谱的质谱数据存储到数据存储部43,例如在质量分析结束之后提供给利用反卷积处理部42进行的数据分析处理。
分析控制部50根据来自中央控制部51的指示来控制LC部1和MS部2的各部的动作以执行LC/MS分析。在中央控制部51上连接有作为用户界面的操作部52和显示部53,接收操作员利用操作部52进行的操作来将用于分析的各种命令输出到分析控制部50、数据处理部40,并且将质谱等的分析结果输出到显示部53。此外,中央控制部51、分析控制部50以及数据处理部40的功能的一部分或者大部分能够通过在个人计算机上执行规定的控制/处理软件来实现。
另外,作为上述装置,具体地说,例如能够利用岛津制作所制造的液相色谱质谱仪LCMS-IT-TOF(参照因特网<http://www.an.shimadzu.co.jp/products/lcms/it-tof.htm>)等。
在上述质量分析装置中,ESI是一种比较软的离子化方法,产生比较多的在液体试样中的目标化合物上加合流动相(溶剂)中的物质或者加合其他金属等而得到的加合离子。举例进行说明,在正离子中,除了加合质子的质子化离子以外还容易产生氨加合离子、钠加合离子等。另一方面,在负离子中,除了质子脱离的去质子化离子以外还容易产生氯加合离子、醋酸加合离子、甲酸加合离子等。另外,此时容易产生具有多个电荷(负电荷或者正电荷)的多价离子。因此,在质谱中会出现来自目标化合物的多价的加合离子的峰。这样的加合离子中的哪一种会出现取决于化合物的性质、流动相的种类、夹杂物的有无或者除此以外的分析条件等。
在以往的质谱解析处理中,需要由用户来输入设定生成上述加合离子的加合/脱离成分的种类等。与此相对,在本实施例的LC/IT-TOFMS的由反卷积处理部42实施的质谱解析处理中,不需要由用户进行这种输入设定。
接着,参照图2~图5来说明该特征性的质谱解析处理。图2是表示质谱解析处理的过程的流程图,图3是用于说明质谱解析处理的概念图,图4是表示质谱解析处理中的同位素簇检测以及价数判断的处理过程的流程图,图5是用于说明同位素簇检测的概念图。
当开始进行解析处理时,反卷积处理部42首先对出现在解析对象的质谱上的同位素簇进行检测,求出各同位素簇的价数n(步骤S1、S2)。同位素簇是指由来自具有相同元素结构的离子的、因离子中的同位素组合的不同而显示不同的m/z值的多个峰构成的峰群。实际在质谱上,如图3的(b)所示地出现一个同位素簇。
在截取同位素簇时,需要将出现在质谱上的多个峰划分为属于相同同位素簇的峰,因而需要确定构成同位素簇的多个峰。作为其具体的方法的一例,如上所述,可以利用本申请的申请人在国际申请号PCT/JP2006/308909(国际公开号WO2006/12928号公报)中提出的方法。根据图4、图5来说明该方法的概要。
首先,将质谱的轮廓数据(profile data)转换来生成重心数据(centroid data)(步骤S21)。图3的(c)是将图3的(b)的轮廓数据转换为重心数据的图。重心数据包括各峰的m/z值、强度,在为同位素峰的情况下还包括包含其同位素簇的ID编号、价数等信息的结构体的表(其中,在分析前的状态下,同位素簇ID编号、价数未知,因此是空白的)。
为了按照强度顺序存取上述重心数据,生成将重心数据上的各峰的强度按照降序排列的各峰的索引表(强度降序索引表)(步骤S22)。接着,将当前要查找的同位素簇的ID编号以及上述强度降序索引表的索引值初始化(步骤S23、S24),在重心数据上决定作为基准的峰(基准峰)的候选峰以检测同位素簇模式(步骤S25)。在此,按照强度从大到小的顺序选择作为基准峰的峰。在最初的处理中,基峰(在所测定的峰中具有最大强度的峰,图5中的A的峰)为基准峰。在第二次以后的处理中,从基准峰的选择对象中排除通过之前的处理已经被鉴定为属于同位素簇的峰的峰。
接着,以上述基准峰为中心,检查其周围的峰型,判断各价数的同位素簇中的峰的出现模式是否与该峰型一致(步骤S26)。作为该价数图案匹配时的参数,将价数范围、质量分辨率的允许范围、构成同位素簇的峰数的最小值等设定为适当的值。
价数图案匹配如下进行:从基准峰的m/z值的位置起,检查在按照步幅d依次分开的位置上是否存在峰,所述步幅d为假定该基准峰被包括在各价数的同位素簇中时所假设的步幅。例如在基准峰被包括在1价的同位素簇中的情况下,属于该同位素簇的多个峰显示m/z值分别差1的峰型,步幅d为1。在被包括在2价的同位素簇中的情况下,属于该同位素簇的峰显示m/z值分别差0.5的峰型,因此步幅d为0.5。由于价数n是1/d,价数n是整数,因此在1/d不是整数的情况下,将值适当地四舍五入来整数化。
在步骤S26中基准峰的周围不存在任何作为同位素簇而匹配的峰型的情况下(步骤S27:“否”),跳过步骤S28~S30而进到S31。在存在匹配的峰型的情况下,通过选择与以基准峰为中心的峰型相匹配的同位素簇价数图案中的匹配分辨率(寻找属于同位素簇的各峰时的测定值与预测值之差的标准偏差)最小的同位素簇价数图案,从而鉴定同位素簇(步骤S28)。此外,在仅存在一个相匹配的价数图案的情况下,将其鉴定为同位素簇即可。
接着,将通过步骤S28而选择的价数图案的价数决定为属于所鉴别的同位素簇的各峰的价数,将与属于所鉴定的同位素簇的各峰的簇ID编号、价数等有关的信息作为追加信息反映到上述重心数据上(步骤S29)。之后,分别递增簇索引值与强度降序索引表的索引值(S30、S31)。并且,判断强度降序索引表的索引值是否在重心数据上的数据数以上,由此判断对全部基准峰的处理是否结束(步骤S32),如果存在未处理的基准峰则回到步骤S25。由此,对重心数据中的全部峰执行步骤S25~S31的处理。
通过以上处理,按照质谱上的峰的强度顺序,依次进行以该峰为中心的同位素簇的匹配,从而决定属于所鉴定的同位素簇的峰的价数。由此,如图3的(a)、图5所示,可区分各价数的同位素簇。
在计算目标化合物离子化时加合到目标化合物上或者从目标化合物上脱离的成分(离子)的m/z值时,各同位素簇的m/z值较重要。在本实例的处理中,为了快速计算,算出各同位素簇的代表点,利用该代表点的m/z值。
通常,在通过ESI等对高分子化合物进行离子化和质量分析而得到的质谱中,同位素簇的峰波形形状如图3的(b)所示,成泊松分布略为走样的形状。因此,峰极大的位置仅存在一处,也能够将给出该极大强度的m/z值作为代表点来使用。然而,在同位素簇中最大强度与第二大强度之间仅存在微小强度差的情况下,很可能是由测定上的误差、各种可变因素而引起了最大强度与第二大强度相调换。因此,为了提高可靠性,在构成同位素簇的多个峰中,对给出最大强度的峰(例如图3的(c)中的P1)的m/z值与给出第二大强度的峰的m/z值的成为重心的m/z值进行计算,将该m/z值决定为该同位素簇的代表点(步骤S3)。
通过上述处理,得到各同位素簇的价数和代表点的m/z值。应利用该价数和m/z值来推定加合到化合物上的离子的m/z值,但是在不存在两个以上同位素簇的情况下,无法应用后述的方法。因此,判断同位素簇的数量是否为2以上(步骤S4),在同位素簇的数量为1的情况下,跳过步骤S5~S14而进到S15。
如果同位素簇的数量为2以上则进到步骤S5以后。当将同位素簇的价数设为n、将代表点的m/z值设为m、将加合到目标化合物上的成分(离子)的m/z值设为Q时,利用以下式(1)来对每个同位素簇来求出目标化合物的质量M(此外,在某一个成分从目标化合物脱离的情况下,能够将Q设为负的值来同样地考虑)。
M=n×(m-Q)...(1)
离子化时加合到化合物上或者从化合物上脱离的成分在某种程度上受到限制,因此该成分的m/z值Q不会太大。因而,可以预先决定可取Q的范围。
由于能够推定相同的成分加合到相同的化合物上或者从相同的化合物上脱离,因此上述式(1)中,在M相同的情况下Q也相同。如果如上所述地决定了Q的范围,则还可以缩小能够将某一同位素簇视为与其他价数的同位素簇来自相同化合物(即,式(1)的M相同)的m/z值的范围。因此,通过能够视为来自相同化合物的两个以上的同位素簇的组合,选择出加合/脱离成分的m/z值Q的候选(步骤S5)。通常,同位素簇的数量越多,被认为来自相同化合物的同位素簇的组合的数量也增加,因此会选出多个候选。此外,在试样包含多种化合物的情况下,需要在辨别来自相同化合物的不同价数的同位素簇之后进行上述处理。
对于加合/脱离成分的m/z值举出多个(通常为多个)候选之后,为了选择一个确实性最高的候选,首先通过以下三个过程来进行范围缩小操作以排除明显异常的候选(步骤S6)。
在来自相同化合物的同位素簇存在三个以上(即价数存在三种以上)的情况下,会得到多个加合/脱离成分的候选m/z值。由于上述理由,理想的情况下它们应该是一致的,但是实际上,由于测定上的误差、选作代表点的峰的错误等原因,m/z值常常不一致。在误差较大的情况下、所选择的峰错误的情况下,根据它们算出的候选m/z值与其他候选m/z值相比有可能极端偏离。因此,检查多个候选m/z值的分散度,根据该分散度来排除m/z值极端偏离的候选(步骤S7)。
如果属于价数不同的同位素簇的几个峰来自相同化合物,则这些同位素簇的代表点的相对强度能够视为具有很强的相关性。因此,利用该情况对不同同位素簇的代表点的相对强度设定类似度阈值,排除根据具有低于该阈值的代表点的同位素簇的组合而得到的候选(步骤S8)。
另外认为,在不同同位素簇之间,构成同位素簇的多个峰的分布形状(强度图案)的相似性较高的同位素簇的候选可靠性较高。利用该情况,能够排除根据峰的分布形状的相似性较低的同位素簇的组合而得到的候选(步骤S9)。具体地说,可以求出不同同位素簇之间的峰分布形状的相关系数等指标值,利用该指标值来排除相关性较低的候选,而在此采用更简便的方法。
如上所述,各同位素簇的代表点的位置(m/z值)为给出最大强度的位置与给出第二大强度的位置的重心点。因而,最大强度与第二大强度点的位置关系及其强度比反映在重心点的位置上。因此,排除根据代表点、最大点以及给出第二大强度的点的位置关系存在较大偏差的同位素簇而得到的候选。由此,实际上能够排除根据峰分布形状大不相同的同位素簇的组合而得到的候选。
通过进行如上所述的三个阶段的范围缩小来减少候选的数量。此外,步骤S7~S8的执行顺序没有特别的意义,能够进行调换。接着,最终选定一个确实性最高的候选(步骤S10)。首先,判断同位素簇的数量是否为3以上(步骤S11),如果同位素簇的数量为3以上则选定在上述步骤S7的挑选基准中条件最佳的候选。即,选定多个候选中m/z值的分散度最小的候选(步骤S12)。
如果步骤S11中同位素簇的数量低于3(事实上只有2),则选定在上述步骤S8的挑选基准中条件最佳的候选。即,针对各同位素簇找出代表点的相对强度的相似性最高的同位素簇的组合,选定根据该组合而得到的候选(步骤S13)。
通过步骤S12或者S13,确定目标化合物离子化时加合到该化合物上或者从该化合物上脱离的成分的m/z值Q(步骤S14)。此外,在步骤S4中判断为“否”的情况下,即在没有产生多价离子而仅存在一个同位素簇的情况下,无法通过上述方法来求出加合/脱离成分的m/z值。在这种情况下,通过向用户要求输入所推定的加合/脱离成分等其他方法来决定加合/脱离成分(步骤S15)。如果这样决定了加合/脱离成分的m/z值,则根据上述式(1)来计算目标化合物的质量,并将其结果输出到显示部53等(步骤S16)。
如上所述,根据该质谱解析处理,能够根据出现基于多价离子的峰的质谱,自动地确定离子化时加合到目标化合物上或者从目标化合物上脱离的成分,利用其结果来求出目标化合物的质量。由此,不需要由分析担当人员来推定加合到化合物上或者从化合物上脱离的成分,因此即使是缺乏这种推定所需的化学知识、经验的人员也能够进行解析作业。
此外,上述实施例仅是本发明的一例,在本发明的宗旨的范围内适当地进行变更、修改、追加也包括在本申请的权利要求的范围内,这是显而易见的。

Claims (11)

1.一种质量分析数据解析方法,其特征在于,其对通过质量分析获取的、出现多价离子的峰的质谱数据进行解析处理,由此求出目标化合物的m/z值,该质量分析数据解析方法具有以下步骤:
a)价数推定步骤,检测质谱上的同位素簇,推定各同位素簇的价数;
b)代表点决定步骤,对于每个检测出的所述同位素簇,求出代表该同位素簇的m/z值;
c)候选提取步骤,根据推定为来自相同的目标化合物的两个以上的同位素簇的代表点以及价数的组合,求出在离子化时加合到目标化合物上或者从目标化合物上脱离的成分的候选m/z值;
d)加合/脱离成分选定步骤,对于通过多个同位素簇的不同组合得到的多个所述候选m/z值,对该候选m/z值或者作为其计算基础的同位素簇的组合的确实性进行评价,由此最终选定一个候选m/z值;以及
e)化合物推定步骤,根据所选定的加合/脱离成分的m/z值和价数来推定目标化合物的m/z值。
2.根据权利要求1所述的质量分析数据解析方法,其特征在于,
在所述加合/脱离成分选定步骤中,对多个候选m/z值应用统计方法,选定确实性较高的候选m/z值或者排除确实性较低的候选m/z值。
3.根据权利要求2所述的质量分析数据解析方法,其特征在于,
在所述加合/脱离成分选定步骤中,对多个候选m/z值的分散程度进行评价,选定确实性较高的候选m/z值或者排除确实性较低的候选m/z值。
4.根据权利要求1所述的质量分析数据解析方法,其特征在于,
在所述加合/脱离成分选定步骤中,对跨价数的、代表点的或者距离代表点最近的峰的强度比的相似性进行评价,选定确实性较高的候选m/z值或者排除确实性较低的候选m/z值。
5.根据权利要求1所述的质量分析数据解析方法,其特征在于,
在所述加合/脱离成分选定步骤中,对于不同的同位素簇,对构成该同位素簇的多个峰的全部或者一部分的图案形状的相似性进行评价,选定确实性较高的候选m/z值或者排除确实性较低的候选m/z值。
6.根据权利要求1所述的质量分析数据解析方法,其特征在于,
在所述代表点决定步骤中,将同位素簇中的最大强度峰附近的多个峰的重心的m/z值作为代表点。
7.一种质量分析数据解析装置,其特征在于,其对通过质量分析获取的、出现多价离子的峰的质谱数据进行解析处理,由此求出目标化合物的m/z值,其具备以下单元:
a)价数推定单元,其检测质谱上的同位素簇,推定各同位素簇的价数;
b)代表点决定单元,其对于每个检测出的所述同位素簇,求出代表该同位素簇的m/z值;
c)候选提取单元,其根据推定为来自相同的目标化合物的两个以上的同位素簇的代表点以及价数的组合,求出在离子化时加合到目标化合物上或者从目标化合物上脱离的成分的候选m/z值;
d)加合/脱离成分选定单元,其对于通过多个同位素簇的不同组合而得到的多个所述候选m/z值,对该候选m/z值或者作为其计算基础的同位素簇的组合的确实性进行评价,由此最终选定一个候选m/z值;以及
e)化合物推定单元,其根据所选定的加合/脱离成分的m/z值和价数来推定目标化合物的m/z值。
8.根据权利要求7所述的质量分析数据解析装置,其特征在于,
所述加合/脱离成分选定单元对多个候选m/z值应用统计方法,选定确实性较高的候选m/z值或者排除确实性较低的候选m/z值。
9.根据权利要求8所述的质量分析数据解析装置,其特征在于,
所述加合/脱离成分选定单元对多个候选m/z值的分散程度进行评价,选定确实性较高的候选m/z值或者排除确实性较低的候选m/z值。
10.根据权利要求7所述的质量分析数据解析装置,其特征在于,
所述加合/脱离成分选定单元对跨价数的、代表点的或者距离代表点最近的峰的强度比的相似性进行评价,选定确实性较高的候选m/z值或者排除确实性较低的候选m/z值。
11.根据权利要求7所述的质量分析数据解析装置,其特征在于,
所述加合/脱离成分选定单元对于不同的同位素簇,对构成该同位素簇的多个峰的全部或者一部分的图案形状的相似性进行评价,选定确实性较高的候选m/z值或者排除确实性较低的候选m/z值。
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Cited By (8)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN105008908A (zh) * 2013-02-22 2015-10-28 株式会社岛津制作所 数据处理装置以及数据处理方法
CN106062548A (zh) * 2014-03-05 2016-10-26 株式会社岛津制作所 质谱分析方法及质谱分析装置
CN106662551A (zh) * 2014-07-03 2017-05-10 株式会社岛津制作所 质谱分析数据处理装置
CN107679052A (zh) * 2016-06-09 2018-02-09 株式会社岛津制作所 大数据分析方法以及利用了该分析方法的质谱分析系统
CN111587374A (zh) * 2018-02-02 2020-08-25 株式会社岛津制作所 成像质谱分析用数据处理装置
CN112334264A (zh) * 2018-06-22 2021-02-05 三菱电机株式会社 激光加工装置
CN115516301A (zh) * 2020-05-28 2022-12-23 株式会社岛津制作所 色谱质量分析数据处理方法、色谱质量分析装置以及色谱质量分析数据处理用程序
US11940426B2 (en) 2019-03-27 2024-03-26 Shimadzu Corporation Chromatograph mass spectrometer

Families Citing this family (7)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
GB201002445D0 (en) * 2010-02-12 2010-03-31 Micromass Ltd Improved differentiation and determination of ionic conformations by combining ion mobility and hydrogen deuterium exchange reactions
GB201002447D0 (en) * 2010-02-12 2010-03-31 Micromass Ltd Mass spectrometer
JP5527438B2 (ja) * 2011-02-10 2014-06-18 株式会社島津製作所 質量分析装置
WO2017025893A2 (en) * 2015-08-13 2017-02-16 Dh Technologies Development Pte. Ltd. Library search tolerant to isotopes
JP6718694B2 (ja) * 2016-02-10 2020-07-08 日本電子株式会社 マススペクトル解析装置、マススペクトル解析方法、および質量分析装置
US10605842B2 (en) * 2016-06-21 2020-03-31 International Business Machines Corporation Noise spectrum analysis for electronic device
JP6994921B2 (ja) * 2017-12-05 2022-01-14 日本電子株式会社 質量分析データ処理装置および質量分析データ処理方法

Citations (6)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US5130538A (en) * 1989-05-19 1992-07-14 John B. Fenn Method of producing multiply charged ions and for determining molecular weights of molecules by use of the multiply charged ions of molecules
JP3200476B2 (ja) * 1992-10-08 2001-08-20 株式会社日立製作所 質量分析装置
JP2004132946A (ja) * 2002-04-01 2004-04-30 Jeol Ltd 質量スペクトルの解析方法および装置
JP2004271185A (ja) * 2003-03-05 2004-09-30 Shimadzu Corp 質量分析装置用データ処理装置
CN1898674A (zh) * 2003-10-20 2007-01-17 瑟诺生物科学有限责任公司 用于校准质谱仪(ms)与其它仪器系统和用于处理ms与其它数据的方法
CN101115991A (zh) * 2005-05-13 2008-01-30 株式会社岛津制作所 质量分析数据解析装置及程序

Family Cites Families (12)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CA2032490A1 (en) * 1989-05-19 1990-11-20 Chin Kai Meng Multiply charged ions and a method for determining the molecular weight of large molecules
JP3504819B2 (ja) * 1997-03-31 2004-03-08 株式会社日立製作所 質量分析方法及び装置
DE19803309C1 (de) * 1998-01-29 1999-10-07 Bruker Daltonik Gmbh Massenspektrometrisches Verfahren zur genauen Massenbestimmung unbekannter Ionen
US6104027A (en) * 1998-06-05 2000-08-15 Hewlett-Packard Company Deconvolution of multiply charged ions
SE0000754D0 (sv) * 2000-03-07 2000-03-07 Amersham Pharm Biotech Ab Mass spectral peak identification
US7457708B2 (en) * 2003-03-13 2008-11-25 Agilent Technologies Inc Methods and devices for identifying related ions from chromatographic mass spectral datasets containing overlapping components
JP4515819B2 (ja) * 2003-08-13 2010-08-04 株式会社日立ハイテクノロジーズ 質量分析システム
DE10358366B4 (de) * 2003-12-10 2008-04-03 Bruker Daltonik Gmbh Massenspektrometrische Substanzidentifizierung
US6936813B2 (en) * 2004-02-02 2005-08-30 Agilent Technologies, Inc. Dynamic library searching
US7117103B2 (en) * 2004-06-03 2006-10-03 Agilent Technologies, Inc. Rapid automatic target compound confirmation using deconvolution and spectral matching
DE102004036621B4 (de) 2004-07-28 2007-04-26 A. Raymond Et Cie Spreizniet
JP2006308909A (ja) 2005-04-28 2006-11-09 Nikon Corp 波長変換光学系及びレーザ装置

Patent Citations (6)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US5130538A (en) * 1989-05-19 1992-07-14 John B. Fenn Method of producing multiply charged ions and for determining molecular weights of molecules by use of the multiply charged ions of molecules
JP3200476B2 (ja) * 1992-10-08 2001-08-20 株式会社日立製作所 質量分析装置
JP2004132946A (ja) * 2002-04-01 2004-04-30 Jeol Ltd 質量スペクトルの解析方法および装置
JP2004271185A (ja) * 2003-03-05 2004-09-30 Shimadzu Corp 質量分析装置用データ処理装置
CN1898674A (zh) * 2003-10-20 2007-01-17 瑟诺生物科学有限责任公司 用于校准质谱仪(ms)与其它仪器系统和用于处理ms与其它数据的方法
CN101115991A (zh) * 2005-05-13 2008-01-30 株式会社岛津制作所 质量分析数据解析装置及程序

Cited By (12)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN105008908A (zh) * 2013-02-22 2015-10-28 株式会社岛津制作所 数据处理装置以及数据处理方法
CN105008908B (zh) * 2013-02-22 2017-10-13 株式会社岛津制作所 数据处理装置以及数据处理方法
CN106062548A (zh) * 2014-03-05 2016-10-26 株式会社岛津制作所 质谱分析方法及质谱分析装置
CN106662551A (zh) * 2014-07-03 2017-05-10 株式会社岛津制作所 质谱分析数据处理装置
CN106662551B (zh) * 2014-07-03 2019-09-03 株式会社岛津制作所 质谱分析数据处理装置
CN107679052A (zh) * 2016-06-09 2018-02-09 株式会社岛津制作所 大数据分析方法以及利用了该分析方法的质谱分析系统
CN111587374A (zh) * 2018-02-02 2020-08-25 株式会社岛津制作所 成像质谱分析用数据处理装置
CN111587374B (zh) * 2018-02-02 2024-02-06 株式会社岛津制作所 成像质谱分析用数据处理装置
CN112334264A (zh) * 2018-06-22 2021-02-05 三菱电机株式会社 激光加工装置
CN112334264B (zh) * 2018-06-22 2022-07-05 三菱电机株式会社 激光加工装置
US11940426B2 (en) 2019-03-27 2024-03-26 Shimadzu Corporation Chromatograph mass spectrometer
CN115516301A (zh) * 2020-05-28 2022-12-23 株式会社岛津制作所 色谱质量分析数据处理方法、色谱质量分析装置以及色谱质量分析数据处理用程序

Also Published As

Publication number Publication date
JP5273144B2 (ja) 2013-08-28
US20110125416A1 (en) 2011-05-26
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